Адсорбционная иммобилизация клеток алканотрофных родококков тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.07, кандидат биологических наук Криворучко, Анастасия Владимировна

• Криворучко, Анастасия Владимировна
• кандидат биологических наук
• 2008

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Криворучко, Анастасия Владимировна

Введение

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Глава 1. Адсорбционная иммобилизация клеток микроорганизмов: 10 кинетика процесса, механизмы, практическое применение

1.1. Понятие иммобилизации. Физиологические особенности 10 иммобилизованных клеток микроорганизмов

1.2. Иммобилизация в биотехнологии. Биокатализаторы на основе 14 иммобилизованных клеток микроорганизмов

1.3. Способы иммобилизации живых микробных клеток

1.4. Механизмы адсорбционной иммобилизации живых микробных 31 клеток

1.5. Состояние проблемы адсорбционной иммобилизации в 46 отношении углеводородокисляющих актинобактерий рода Якос^ососсиз

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Глава 2. Материалы и методы исследования

2.1. Рабочая коллекция, условия культивирования родококков

2.2. Определение адгезивной активности коллекционных культур 58 родококков

2.3. Получение мутантов для изучения адгезивной активности клеток 59 родококков

2.4. Оценка влияния Шюс1ососсш-биосурфактанта на адсорбцию 61 родококков

2.5. Характеристика используемых носителей

2.6. Кинетика адсорбции клеток родококков. Оценка адсорбционной 64 емкости носителей

2.7. Математическое моделирование процесса адсорбции

2.8. Использование физических и физико-химических методов

2.9. Оценка жизнеспособности и углеводородокисляющей активности 70 свободных и иммобилизованных клеток родококков

2.10. Модельные эксперименты по биоремедиации нефтезагрязненной 71 почвы с использованием иммобилизованных родококков

2.11. Определение содержания остаточных нефтяных углеводородов

2.12. Статистическая обработка результатов исследования

Глава 3. Характеристика адгезивных свойств актинобактерий 75 рода Шгойососст

Глава 4. Взаимодействие клеток родококков с поверхностью 87 твердых носителей

Глава 5. Жизнеспособность и функциональная активность 110 иммобилизованных клеток родококков

Глава 6. Модельные эксперименты по биоремедиации 128 нефтезагрязненной почвы с использованием иммобилизованных родококков

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Адсорбционная иммобилизация клеток алканотрофных родококков»

Актуальность проблемы. Биологическая особенность актинобактерий рода Rhodococcus — способность к окислительной биотрансформации нефтяных углеводородов и ксенобиотиков. Данное свойство наряду со многими другими, как то: олигокарбо- и нитрофилия, выраженная степень гидрофобности клеточной стенки, наличие пилевидных тяжей и шишковидных выростов, способность синтезировать биосурфактанты, повышенная склонность к клеточной дифференциации, колонизации поверхностей, способность к клеточной агрегации и т. д. - определяет интерес к данной группе актинобактерий как объекту промышленного использования и перспективных технологий. Реализация биотехнологического потенциала родококков требует разработки устойчивых биокатализаторов и обеспечения их гарантированной функциональной стабильности. Одним из способов повышения стабильности биокатализаторов на основе живых бактериальных клеток является использование приема адсорбционной иммобилизации. Закрепленные клетки обладают повышенной жизнеспособностью, устойчивостью к действию неблагоприятных факторов внешней среды (колебаниям температуры, концентрации ионов, влажности, антибиотикам, элиминации простейшими), повышенной каталитической активностью (Семченко и др., 2003; McLean et al., 1997; Obuekwe, Al-Muttawa, 2001; Shin et al., 2002; Resch et al., 2005). При этом адсорбционная иммобилизация является наиболее простым способом закрепления бактериальных клеток, не сопровождается стрессовым воздействием на клетки и имитирует их поведение в природе (Сироткин и др., 2007).

Прикладная задача использования иммобилизованных родококков в биотехнологических процессах требует решения фундаментальной проблемы, связанной с изучением закономерностей адгезии живых клеток родококков, поиском физико-химических и биологических факторов, регулирующих адгезию. В отношении родококков, которые являются сравнительно новым объектом биотехнологии, эти процессы изучены очень мало по сравнению, например, с медико-биологическими агентами Streptococcus, Pseudomonas, Mycobacterium (в данных случаях описана адгезия к эпителиальным, иммунным клеткам; достаточно хорошо изучены эти процессы в отношении образования биопленок на медицинском инструментарии) (Норре et al., 1997; Zhang et al., 2005; Landry et al., 2006). В последние годы появились единичные работы (Gertler et al., 2004), посвященные изучению механизмов адгезии родококков. Исследования особенностей процесса адгезии клеток родококков приобретают особую актуальность еще и потому, что родококки сегодня признаются наряду с сульфатредуцирующими бактериями основными участниками биокоррозионных процессов, они обнаруживаются в составе коррозионно-активных биопленок, образующихся на металлических поверхностях (Азизов, 2007; Алехова и др., 2005; Volkland et al., 2000).

Цель настоящей работы — детальное исследование процесса адсорбционной иммобилизации клеток алканотрофных родококков на твердых носителях.

Основные задачи исследования

1. Исследовать адгезивные свойства родококков, принадлежащих к разным видам.

2. Исследовать кинетику и термодинамику процесса адсорбционной иммобилизации клеток родококков на поверхности минеральных и органических носителей. Выявить факторы, определяющие максимальную величину адсорбции клеток родококков.

3. Исследовать жизнеспособность и углеводородокисляющую активность иммобилизованных клеток родококков в отношении индивидуальных углеводородов и сырой нефти.

4. В условиях модельного эксперимента оценить возможность использования иммобилизованных клеток родококков для биоремедиации нефтезагрязненной почвы.

Научная новизна. С помощью мутантов родококков, полученных путем in vitro неспецифического Тп5 мутагенеза и обладающих различной адгезивной и эмульгирующей активностью, исследованы адгезионные характеристики родококков разных видов из Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов (акроним ИЭГМ, www.iegm.ru/iegmcol/). Установлено, что адгезивные свойства клеток родококков зависят от их штаммовой специфичности, эмульгирующей активности и условий культивирования. Выявлено стимулирующее влияние Т?/20б?ососсш,-биосурфактанта на процесс адгезии клеток родококков. Впервые с использованием методов профилометрии высокого разрешения и инфракрасного сканирования исследованы кинетика и термодинамика процесса адсорбции родококков на поверхности твердых носителей. Определены контролируемые условия монослойного распределения клеток родококков на носителе, обеспечивающие высокую каталитическую активность родококков в отношении w-гексадекана (104 мг-л^-ч"1) и сырой нефти (31 Mr-л''-ч"1).

Теоретическое и практическое значение работы. Полученные результаты расширяют представление об особенностях процесса адсорбционной иммобилизации алканотрофных родококков на твердых носителях. В результате проведенных исследований отобраны штаммы Rhodococcus spp. с максимальной (68-85% прикрепленных клеток) степенью адгезивной активности. В качестве носителей испытаны доступные в регионе материалы на основе древесных опилок, куриных перьев и отходов кожевенного производства. Для повышения сродства поверхности адсорбентов к бактериальным клеткам и углеводородному субстрату впервые использован прием гидрофобизации носителей. Экспериментально обосновано, что наиболее эффективными гидрофобизаторами являются Я/20й?ососсг«-биосурфактант (1:0,1) и олифа (1:0,2). Определены оптимальные величины площади поверхности и гидрофобности носителей, обеспечивающие их максимальную (38 мг сухих клеток/г носителя) адсорбционную емкость. На основе иммобилизованных на модифицированных древесных опилках клеток родококков получен эффективный биокатализатор, характеризующийся высокой углеводородокисляющей активностью закрепленных родококков, стабильностью при хранении в течение восьми месяцев и возможностью повторного использования. На основе УФ спектрофотометрии разработан экспрессный метод детекции полициклических ароматических углеводородов в почве. Метод не требует значительных материальных и временных затрат и пригоден для мониторинга данных приоритетных загрязнителей в полевых условиях.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Исследуемые коллекционные штаммы алканотрофных родококков обладают различной адгезивной активностью. Строгой корреляции между видовой принадлежностью родококков и их адгезивной активностью не выявляется. Адгезивные свойства родококков зависят от их штаммовой специфичности, эмульгирующей активности и условий культивирования.

2. Использование приема гидрофобизации поверхности органических носителей способствует существенному увеличению их адсорбционной емкости в отношении клеток алканотрофных родококков. Наиболее эффективными гидрофобизующими агентами являются ЯИ ос1ососсш-биосурфактант и олифа.

3. Клетки родококков, предварительно выращенные в присутствии н-гексадекана и иммобилизованные на гидрофобизованных древесных опилках, характеризуются максимальной углеводородокисляющей активностью.

4. Для ускорения процесса биоремедиации нефтезагрязненной почвы целесообразно применение клеток родококков, закрепленных на гидрофобизованных древесных опилках.

Апробация работы и публикации. Основные положения диссертационной работы доложены и обсуждены на II Региональной конференции молодых ученых "Стратегия взаимодействия микроорганизмов с окружающей средой", Саратов, 2004; II Межрегиональной конференции молодых ученых "Современные проблемы экологии, микробиологии и иммунологии", Пермь, 2007; I и III Всероссийской молодежной школе-конференции «Актуальные аспекты современной микробиологии», Москва, 2005, 2007; II FEMS Congress of European Microbiologists, Мадрид, Испания, 2006; I Всероссийском с международным участием конгрессе студентов и аспирантов-биологов "Симбиоз Россия 2008", Казань, 2008; III Международной конференции "Микробное разнообразие: состояние, стратегия сохранения, биотехнологический потенциал", Пермь-Н. Новгород-Пермь, 2008.

По теме диссертации опубликовано 16 печатных работ, из них четыре в рецензируемых научных журналах.

Объем и структура работы. Работа изложена на 174 страницах машинописного текста, содержит 16 таблиц и 27 рисунков. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, четырех глав собственных исследований, заключения, выводов, списка цитируемой литературы, включающего 226 наименований, в том числе 73 на русском и 153 на английском языках.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Криворучко, Анастасия Владимировна

ВЫВОДЫ

1. Установлено, что исследуемые коллекционные штаммы алканотрофных родококков обладают различной адгезивной активностью. Адгезивные свойства родококков зависят от их штаммовой специфичности, эмульгирующей активности и условий культивирования.

2. Показано, что прием гидрофобизации поверхности органических носителей способствует существенному (от 1,3 до 43,0 раз) увеличению адсорбционной емкости в отношении клеток алканотрофных родококков. Наиболее эффективными гидрофобизаторами являются Rhodococcus-биосурфактант (1:0,1) и олифа (1:0,2).

3. Впервые обоснована возможность использования методов профилометрии высокого разрешения и инфракрасного сканирования для контролирования монослойного распределения клеток родококков на поверхности твердых носителей.

4. Установлено, что клетки родококков, предварительно выращенные в присутствии н-гексадекана и иммобилизованные на гидрофобизованных древесных опилках, характеризуются максимальной (104 мг н-гексадека-на/(л-ч)) углеводородокисляющей активностью.

5. Обоснована целесообразность применения иммобилизованных клеток родококков для ускорения процесса биоремедиации нефтезагрязненной почвы. В модельных экспериментах с использованием иммобилизованных клеток родококков достигнута 65%-ная степень очистки нефтезагрязненной почвы в течение б недель биоремедиации.

6. На основе клеток R. ruber ИЭГМ 231, иммобилизованных на модифицированных древесных опилках, разработан эффективный биокатализатор, характеризующийся высокой углеводородокисляющей активностью закрепленных клеток родококков, стабильностью при хранении в течение восьми месяцев, возможностью повторного использования. На основе УФ спектрофотометрии разработан и апробирован экспрессный метод детекции полициклических ароматических углеводородов в почве. Метод не требует значительных материальных и временных затрат и пригоден для мониторинга данных приоритетных загрязнителей в полевых условиях.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Настоящая работа является первым комплексным исследованием адгезивных свойств актинобактерий рода Ююйососст. В результате проведенных исследований установлено, что исследуемые коллекционные штаммы алканотрофных родококков обладают различной адгезивной активностью. Строгой корреляции между видовой принадлежностью родококков и их адгезивной активностью в отношении твердой поверхности не выявляется. Адгезивные свойства родококков зависят от их штаммовой специфичности, эмульгирующей активности и условий культивирования. Показано, что коллоидный и физико-химический подходы, используемые при описании процессов бактериальной адсорбции, не позволяют выявить все факторы, обусловливающие закрепление клеток родококков на твердой поверхности (Козляк и др., 1991; Воб а1, 1999; УасНПо-ЯосЬ^иег et а1, 2004). По-видимому, основную роль в адгезии родококков играют специфические взаимодействия. Экспериментально доказано стимулирующее влияние Rhodococcus-6víocy^a.ктзш:a на адсорбционный процесс родококков. Так, присутствие биосурфактанта на твердой поверхности способствует 1,8-2,3-кратному увеличению адсорбированных клеток родококков; обнаружена положительная корреляция (Я=0,50, р=0,04) между адгезивной и эмульгирующей активностью Тп5 мутантов родококков.

В литературе адгезивную способность клеток родококков связывают с наличием у них мощной липофильной клеточной стенки (Ившина и др., 1987; Ившина, 1997; Коваленко и др., 1999; ВепсШ^ег et а/., 1993; 8око1оузка а1, 2003). Поэтому особое внимание в работе уделено изучению влияния гидрофобных взаимодействий на адсорбционный процесс алканотрофных родококков. Нами не выявлено статистически достоверной зависимости между показателями гидрофобности (величиной АСадг, водопоглощающей способностью, процентом адсорбции я-гексадекана материалом носителей и расположением носителей в двухфазной системе н-гексадекан/вода) и адсорбционной емкостью используемых носителей в отношении клеток родококков. Однако экспериментально доказано, что гидрофобизация поверхности органических носителей н-гексадеканом, силиконовой эмульсией, олифой 1:0,1 и 1:0,2, а также /?/гос?ососсг^-биосурфактантом приводит к 1,3-43,0-кратному увеличению степени адсорбции и изменению кинетики адсорбционного процесса. Эти эффекты обусловлены появлением множества гидрофобных сайтов на поверхности носителя, характеризующихся высоким сродством к липофильным клеткам родококков. Следует отметить, что прием гидрофобизации с использованием перечисленных агентов был применен нами впервые.

Нами получена физико-химическая модель адсорбции клеток родококков и выявлены основные факторы данного процесса. По нашим данным, основным фактором адсорбции клеток родококков на минеральных и органических носителях является величина удельной поверхности. Это доказывает существование корреляции (11=0,77, р=0,04) между сорбционной влажностью и адсорбционной емкостью носителей в отношении клеток родококков, а также электронограммы поверхности носителей. Впервые для исследования процесса адсорбционной иммобилизации клеток родококков апробированы сугубо физические методы профилометрии высокого разрешения и инфракрасного сканирования, которые позволили нам определить условия монослойного распределения клеток родококков на твердой поверхности, обеспечивающие высокую метаболическую активность иммобилизованных родококков.

Наряду с физико-химической моделью нами получена математическая модель адсорбции клеток родококков, которая позволяет определить оптимальные гидродинамические условия данного процесса. Все выявленные закономерности использованы при подборе штаммов с высокой адгезивной активностью, разработке оптимального способа гидрофобизации носителя и создании эффективного биокатализатора для биоремедиации нефтезагрязненной почвы. По нашим данным, наиболее активными штаммами являются Я. егу^гороШ ИЭГМ 271 и Я. гиЪег ИЭГМ 231, наиболее эффективными адсорбентами родококков — органические материалы на основе древесных опилок. Установлено, что оптимальным способом гидрофобизации является обработка олифой в объемном соотношении носитель:гидрофобизатор, равном 1:0,2, а также Якос1ососсш-биосурфактантом - гидрофобизатором, характеризующимся высокой степенью экологической безопасности. Кроме того, клетки родококков, предварительно выращенные в присутствии н-алканов и иммобилизованные на данные носители проявляют максимальную каталитическую активность, окисляя до 104 мг н-гексадекана/(л-ч).

По нашим данным, использование иммобилизованных клеток алканотрофных родококков в процессах биоремедиации нефтезагрязненных экосистем имеет существенные преимущества по сравнению с применением свободных клеток. Такими преимуществами являются (1) прочное закрепление родококков на поверхности носителя, (2) повышение биодоступности сорбированных углеводородов для ферментных систем микроорганизмов и (3) 2-х-кратное ускорение процесса извлечения нефтяных углеводородов из среды. В модельных экспериментах с использованием иммобилизованных родококков была достигнута 65% степень очистки нефтезагрязненной почвы в течение 13 недель биоремедиации. Кроме того, показано, что иммобилизованные клетки родококков обладают высокой углеводородокисляющей активностью в отношении таких труднодоступных соединений, как ПАУ. При этом в ходе проведенных исследований нами разработан экспрессный метод детекции ПАУ в почве на основе УФ спектрофотометрии.

147

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Криворучко, Анастасия Владимировна, 2008 год

1. АбелянВ.А. Новый метод иммобилизации клеток микроорганизмов поперечной сшивкой / В.А. Абелян // Прикл. биохим. и микробиол. 2000. -Т. 36, №3,-С. 359-364.

2. Азизов Р.Э. Кинетические закономерности формирования коррозионно активных биопленок и подходов к их элиминированию: Автореф. . канд. хим. наук / Р.Э. Азизов. Москва, 2007. - 24 с.

3. Алехова Т. А. Мониторинг микроорганизмов-деструкторов на пилотируемых орбитальных комплексах / Т.А. Алехова, A.A. Александрова, Т.Ю. Новожилова и др. // Прикл. биохим. и микробиол. 2005. - Т. 41, № 4. -С. 435-443.

4. Архипов Г.С. Технология кожи. Учебник для учащихся профессионально-технических училищ / Г.С. Архипов, A.A. Головтеева М.: Легпромбытиздат, 1988. -224 с.

5. Бандман Л. Л. Вредные химические вещества. Углеводороды. Галогенпроизводиые углеводородов; Справ, изд. / А.Л. Бандман, Г.А. Войтенко, Н.В. Волкова и др. // Под ред. В.А. Филова и др. Л.: Химия, 1990.-732 с.

6. Бекер М.Е. Системы с иммобилизованными клетками для получения биогаза и этанола / М.Е. Бекер, А.П. Гринберг, Я.Э. Блумберг, Л.Я. Лабане // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пущино, 1987.-С. 72-86.

7. Веслополова Е.М. Микрометод определения численности колониеобразующих микроорганизмов / Е.М. Веслополова // Микробиология. 1995. - Т. 64, № 2. - С. 279-284.

8. Выдрякова Г.А. Формирование агрегированных структур светящимися бактериями в присутствии углеводов / Г.А. Выдрякова, Т.В. Кирпиченко, A.A. Лифантьева // Микробиология. 2007. - Т. 76, № 2. - С. 282-284.

9. Гвоздяк П.И. Иммобилизованные микроорганизмы в очистке сточных вод от ксенобиотиков / П.И. Гвоздяк // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пущино, 1987. - С. 56-62.

10. Глазачева Л.Е. Клеточные приспособления Rhodococcus rhodochrous и Rhodococcus ruber, усваивающих пропан и н-бутан / Л.Е. Глазачева, И.Б. Ившина, A.A. Оборин // Микробиология. 1990. - Т. 59, вып. 2. -С. 301-306.

11. Гланц С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц // Пер. с англ. Ю.А. Данилова. Под ред. Н.Е. Бузикашвили и Д.В. Самойлова. — М.: Практика, 1999.-459 с.

12. До сон Р. Справочник биохимика / Р. Досон, Д. Эллиот, У. Эллиот, К. Джонс. М.: Мир, 1991. - 544 с.

13. Егоров II.С. Биосшпез биологически активных веществ иммобилизованными клетками микроорганизмов / Н.С. Егоров, Н.С. Ландау, Е.А. Бормап, И.Б. Кочова // Прикл. биохим. и микробиол. 1984. - Т. 20, вып. 5.-С. 579-592.

14. Жубанова A.A. Иммобилизованные клетки микроорганизмов / A.A. Жубанова, М.Х. Шигаева // Биотехнология. Теория и практика. 1997. — №2.-С. 1-10.

15. Звягинцев Д.Г. Почва и микроорганизмы / Д.Г. Звягинцев М.: Изд-во МГУ, 1987.-255 с.

16. Зимои А.Д. Физическая химия / А.Д. Зимон М.: Агар, 2006. - 320 с.

17. Зуева H.H. Высокоэффективные биокатализаторы на основе иммобилизованных клеток микроорганизмов / H.H. Зуева // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". — Пущино, 1987. С. 123-132.

18. Ившина И.Б. Бактерии рода Rhodococcus: иммунодиагностика, детекция, биоразнообразие: Дис. .докт. биол. наук / И.Б. Ившина. Пермь, 1997.- 197 с.

19. Ившина И.Б. Элсктронпомикроскопическое изучение факультативных газоиспользующих Rhodococcus rhodochrous / И.Б. Ившина, O.A. Нестеренко, JI.E. Глазачева, В.П. Шсховцов // Микробиология. 1982. - Т. 51, вып. 3. — С. 477-481.

20. Ившина И.Б. Пропанокисляющие родококки / И.Б. Ившина, P.A. Пшеничнов, A.A. Оборин. Свердловск: УНЦ АН СССР, 1987. - 123 с.

21. Ившина И.Б. Экологические аспекты использования родококков — новых продуцентов биосурфактантов / И.Б. Ившина, М.С. Куюкина, М.И. Рычкова // Экологическая безопасность зон градопромышленных агломераций Западного Урала. Пермь, 1993. — С. 29-30.

22. Ившина И.Б. Применение экологически безопасной экспресс-технологии очистки нефтезагрязненных почв и грунтов (на примере районов нефтедобычи Пермской области) / И.Б. Ившина, М.С. Куюкина, С.М. Костарев // Нефтяное хозяйство. 2003. - № 9. - С. 116-119.

23. Ившииа И.Б. Бпочрансформация ß-ситостерола и сложных эфиров ß-ситостерола актинобактериями рода Rhodococcus / И.Б. Ившина, В.В. Гришко, Е.М. Ноговнципа и др. // Прикл. биохим. и микробиол. 2005. -Т. 41, №6. -С. 626-633.

24. Ившина И.Б. Алкапотрофные родококки как катализаторы процесса биодеструкции не пригодных к использованию лекарственных средств / И.Б. Ившина, М.И. Рычкова, Е.В. Вихарева и др. // Прикл. биохим. и микробиол. — 2006.-№4.-С. 443-447.

25. Илялетдипов АЛ I. Микробиологическая очистка промышленных сточных вод иммобилизованными клетками микроорганизмов-деструкторов / А.Н. Илялетдипов, P.M. Алиева // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пущино, 1987. — С. 62-72.

26. Каталог штаммов региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов / Под ред. И.Б. Ившиной. М.: Наука, 1994.- 163 с.

27. Кестнер А.И. Иммобилизованные растительные клетки / А.И. Кестнер, H.I3. Архангельская // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пущипо, 1987. - С. 39-48.

28. Кирейчева J1.B. Состав для биологической очистки почв от нефти и нефтепродуктов / JI.B. Кирейчева, О.Б. Хохлова // Патент РФ. № 2215596. — 2003.

29. Китова А.Е. Деградация 2,4-динитрофенола свободными и иммобилизованными клетками Rhodococcus erythropolis HL РМ-1 /

30. A.Е. Китова, Т.Н. Кувпчкина, А.Ю. Аринбасарова, А.Н. Решетилов // Прикл. биохим. и микробиол. 2004. - Т. 40. - № 3. - С. 307-311.

31. Коваленко Г. А. Углеродные материалы как адсорбенты для биологически активных веществ и бактериальных клеток / Г.А. Коваленко,

32. B.А. Семиколепов, Е.В. Кузнецова и др. // Коллоидн. журн. 1999. -Т. 61, № б.-С. 787-795.

33. Козляк Е.И. Физико-химические основы иммобилизации клеток методом сорбции (обзор) / Е.И. Козляк, М.М. Якимов, И.Б. Уткин и др. // Прикл. биохим. и микробиол. 1991. - Т. 27, вып. 6. - С. 788-803.

34. Кондратенко В.М. Препарат для очистки воды и почвы от нефти и нефтепродуктов /В.М. Кондратенко, В.П. Холоденко, И.А. Дунайцев и др. // Патент РФ. № 2191753. - 2002.

35. Коронеллн Т.В. Принципы и методы интенсификации биологического разрушения углеводородов в окружающей среде (обзор) / Т.В. Коронелли // Прикл. биохим. и микробиол. 1996. - Т. 32, № 6. - С. 579585.

36. Коронелли Т.В. Поверхностно-активные свойства некоторых штаммов углеводородокисляющих бактерий / Т.В. Коронелли, С.Г. Юферова //Вестн. Моск. ун-та. Сер. 16. Биология. 1990. -№ 1. - С. 14-18.

37. Кощеенко К. Л. Иммобилизация клеток микроорганизмов / К.А. Кощеенко, Г.В. Суходольская // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пуицшо, 1987. - С. 4-15.

38. Кудинов В.И. Способ очистки поверхностей от загрязнений нефтью и нефтепродуктами / В.И. Кудипов, Е.И. Богомольный, Б.М. Сучков и др. // Патент РФ. № 2104103. - 1998.

39. Кузьмичева И.В. Влияние иммобилизации на метаболизм дрожжей / И.В. Кузьмичева, В.В. Плотникова, И.В. Гриц, В.Н. Леонтьев // Прикл. биохим. и микробиол. 1998. - Т. 34, № 3. - С. 251-255.

40. Куюкина М.С. Биосурфактанты актинобактерий рода Rhodococcus: индуцированный биосинтез, свойства, применение: Дис. .докт. биол. наук/ М.С. Куюкина. Пермь, 2006. - 295 с.

41. Ладыгин A.B. Сорбент для очистки природных вод и почвы от нефтяных загрязнений "Москат" / A.B. Ладыгин // Патент РФ. № 2143947. — 2000.

42. Лакин Г.Ф. Биометрия / Г.Ф. Лакип. М. : Высшая шк., 1990. - 352 с.

43. Ландау JT.Д. Статистическая физика. Часть 1. Издание 5-е / Л.Д. Ландау, Е.М. Лифншц. - М.: Физматлит, 2005. - 616 с.

44. Максимов АЛО. Иммобилизация на углеродных сорбентах штамма Rhodococcus ruber gtl, обладающего питрилгидратазной активностью / А.Ю. Максимов, Ю.Г. Максимова, М.В. Кузнецова и др. // Прикл. биохим. и микробиол. 2007. - Т. 43, № 2. - С. 193-198.

45. Максимова Ю.Г. Биотрансформация акрилонитрила иммобилизованными клетками актинобактерий рода Rhodococcus: Автореф. дисс. .канд. биол. паук / Ю.Г. Максимова. Пермь, 2006. - 22 с.

46. Манаков M.II. Мембранный биореактор как метод иммобилизации клеток / М.Н. Манаков, Н.С. Марквичев // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". — Пущино, 1987. С. 157-163.

47. Медведева Н.Г. Иммобилизация уксуснокислых бактерий на углеродных волокнах и использование их для трансформации тиодигликоля / Н.Г. Медведева, Ю.А. Гриднева, A.A. Лысенко, В.И. Сухаревич // Биотехнология. 2001. - № 5. - С. 51-57.

48. Нестерспко O.A. Нокардиоподобные и коринеподобные бактерии / O.A. Нестерепко, Е.И. Квасников, Т.М. Ногина. Киев: Наукова думка, 1985. -336 с.

49. Николаев ТО.И. Регуляция адгезии клеток Pseudomonas fluorescens к стеклу летучими соединениями, выделяемыми культурой / Ю.И. Николаев, Д. Проссер, Р.И. Бич глн // Микробиология. 2000. - Т. 69, № 3. - С. 352-355.

50. Николаев Ю.А. Насыщенные С21-С33 углеводороды авторегуляторы адгезии Pseudomonas fluorescens на сгекле / Ю.А. Николаев, Н.С. Паников, С.М. Лукин, Г.А. Осипов // Микробиология. - 2001. - Т. 70, № 2. - С. 174181.

51. Николаев Ю.А. Внеклеточная протеаза как регулятор обратимой адгезии Pseudomonas fluorescens / Ю.А. Николаев, Н.С. Паииков // Микробиология. 2002. - Т. 71, № 5. - С. 629-634.

52. Ньтс П.С. Общие принципы создания высокоэффективных биокатализаторов па основе клеток микроорганизмов / П.С. Ныс, A.B. Скляренко, П.Л. Заславская, Ю.Э. Бартошевич // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". -Пущино, 1987. С. 27-38.

53. Няпикова Г.Г. Иммобилизация па хитине Bacillus mucilaginosus — продуцента экзополисахарпдов / Г.Г. Няникова, Е.Э. Куприна, О.В. Пестова, С.В. Водолажская // Прикл. биохим. и микробиол. 2002. - Т. 38, №3. -С. 300-304.

54. Пешкур Т.А. Аккумуляция цезия актинобактериями рода Rhodococcus / Т.А. Пешкур // Дисс. .капд. бпол. паук. — Пермь, 2002. 119 с.

55. Пешкур Т.А. Особенности аккумуляции цезия бактериальными клетками Rhodococcus ruber при росте на н-гексадекаие / Т.А. Пешкур, И.Б. Ившина//Экология. -2003,-№ 1.-С. 69-71.

56. Пирог Т.П. Использование иммобилизованных на керамзите клеток нефтеокисляющих микроорганизмов для очистки воды от нефти /

57. Т.П. Пирог, Т.Д. Шевчук, И.Н. Волошина, НИ. Грегирчак // Прикл. биохим. имикробиол. -2005.-Т. 41, № 1.-С. 58-63.

58. Порозова С.Е. Изменение структуры алюмосиликатных материалов в присутствии бактерий рода Rhodococcus sensu stricto / С.Е. Порозова, В.Я. Беккер, И.Б. Ившина и др. // Журн. прикл. химии. 2002. - Т. 75, вып. 3. — С. 443-446.

59. Руководство к практическим занятиям по микробиологии: Практ. пособие / Под ред. Н. С. Егорова. 2-е изд. - М.: Изд-во Моск. ун-та, 1983. — 215 с.

60. Самонип В.В. Изучение закономерностей адсорбции бактериальных клеток па пористых носителях / В.В. Самонип, Е.Е. Еликова // Микробиология.-2004. Т. 73, №6.-С. 810-816.

61. Семчепко Г.Д. Особенности взаимодействия микроорганизмов с кремнеземным сорбентом / Г.Д. Семченко, В.Н. Николаенко, Т.П. Осолодчеико // Огнеупоры и техн. керамика. 2003. - № 11. - С. 20-23.

62. Синицып Д.П. Иммобилизоваипые клетки микроорганизмов / А.П. Синицып, Е.И. Райпипа, В.И. Лозинский, С.Д. Спасов. М.: Изд-во МГУ, 1994.-288 с.

63. Сироткип Д.С. Агрегация микроорганизмов: флокулы, биопленки, микробные гранулы / Д.С. Сироткин, Г.И. Шагинурова, К.Г. Ипполитов. — Казань: Изд-во "Фон" АН РТ, 2007. 160 с.

64. Слабова О.И. Иммобилизация олиготрофных бактерий на пористых носителях методом сорбции / О.И. Слабова, Д.И. Никитин // Микробиология. 2005. - Т. 74, № 3. - С. 430-432.

65. Старостина Н.Г. Селективный отбор культур Escherichia coli и Pseudomonas putida с повышенной устойчивостью к процессу иммобилизации в полпакриламидпом геле / Н.Г. Старостина, К.А. Луста, Б.А. Фихте // Микробиология. 1986. - Т.55, вып. 1.-С. 100-103.

66. Федорович В.В. Разработка феноменологической модели кинетики бактериальной адсорбции па иизкоэнергетических поверхностях /

67. В.В. Федорович, С.В. Калюжный, П. ваи дер Мирен, В. Верстрает // Вестн. Моск. ун-та. Сер. 2. Химия. 2002. - Т. 43, № 6. - С. 417-419.

68. Чугунов В.А. Биопрепарат для очистки воды и почвы от нефти и нефтепродуктов / В.А. Чугунов, В.П. Холоденко, З.М. Ермоленко и др. // Патент РФ. № 2193533. - 2002.

69. Шеховцова Н.В. Кинетика роста Arthrobacter globiformis и Pseudomonas fluorescens на средах со стекловолокном / Н.В. Шеховцова, Д.Г. Звягинцев, Н.С. Паников // Микробиология. 1992. - Т. 61, вып. 6. - С. 995-1004.

70. Штильман М.И. Успехи в использовании полимеров для иммобилизации клеток / М.И. Штильман // Сб. науч. трудов "Иммобилизованные клетки в биотехнологии". Пущино, 1987. - С. 104-114.

71. Abed R.M.M. Bacterial diversity of a cyanobacterial mat degrading petroleum compounds at elevated salinities and temperatures / R.M.M. Abed, A. Al-Thulcair, D. de Beer // FEMS Microbiol. Ecol. 2006. - V. 57, № 2. -P. 290-301.

72. Absolom D.R. Surface thermodynamics of bacterial adhesion / D.R. Absolom, F.V. Lamberti, Z. Policova et al. II Appl. Environ. Microbiology. -1983.-V. 46, № l.-P. 90-97.

73. Abu-Salah K. Microbial degradation of aromatic and polyaromatic toxic compounds adsorbed on powdered activated carbon / K. Abu-Salah, G. Shelef, D. Levanon et al. II J. Biotechnol. 1996. - V. 51. - P. 265-272.

74. Adamczyk Z. Kinetics of localized adsorption of colloid particles / Z. Adamczyk, B. Siwek, M. Zembala, P. Weronski // Langmuir. 1992. — V. 8. — P. 2605-2610.

75. Adamczyk Z. Kinetics of localized adsorption of colloid particles / Z. Adamczyk, B. Siwelc, M. Zembala, P. Belouschek // Adv. Coll. Interface Sei. -1994.-V. 48.-P. 151-280.

76. Adamczyk Z. Irreversible adsorption of colloid particles at heterogeneous surfaces / Z. Adamczyk, B. Siwelc, P. Weronski, E. Musial // Appl. Surf. Sei. -2002.-V. 196.-P. 250-263.

77. Adamczyk Z. Irreversible adsorption of colloid particles on heterogeneous surfaces / Z. Adamczyk, K. Jaszczolt, B. Siwelc // Appl. Surf. Sei. 2005. — V. 252.-P. 723-729.

78. Ahmad S. Cholesterol side-chain cleavage by immobilized cells of Rhodococcus equi DSM 89-133 / S. Ahmad, P.K. Roy, S.K. Basu, B.N. Johri // Indian J. Experim. Biol. 1993. - V. 31, № 4. - P. 319-322.

79. Anton V. Identification of the sugars involved in mycobacterial cell aggregation / V. Anton, P. Rouge, M. Daffe // FEMS Microbiol. Letters. 1996. -V. 144.-P. 167-170.

80. Arenskötter M. Identification and application of plasmids suitable for transfer of foreign DNA to members of the genus Gordonia / M. Arenskötter, D. Baumeister, R. Kalscheuer, A. Steinbüchel // Appl. Environ. Microbiol. 2003. -V. 69, №8.-P. 4971-4974.

81. Arevalo-Ferro C. Biofilm formation of Pseudomonas putida IsoF: the role of quorum sensing as assessed by proteomics / C. Arevalo-Ferro, G. Reil, A. Görg et al. II Syst. Appl. Microbiol. 2005. - V. 28. - P. 87-114.

82. Baikova S.V. The intensification of dimethylphthalate destruction in soil / S.V. Baikova, A.S. Samsonova, Z.M. Aleshchenkova, A.N. Shcherbina // Euras. Soil Sci. 1999. - V. 32, №6.-P. 701-704.

83. Baillif S.A. A new in vitro model to study staphylococcal biofilm formation on intraocular lenses under hydrodynamic conditions / S.A. Baillif, L. Kodjikian, E. Casoli et al. II Invest. Ophtalmol. Vis. Sci. 2005. - V. 46. - P. 5080—B283.

84. Bakker D.P. Multiple linear regression analysis of bacterial deposition to polyurethane coatings after conditioning film formation in the marine environment / D.P. Bakker, H.J. Busscher, J. van Zanten // Microbiology. 2004. - V. 150. - P. 1779-1784.

85. Bastiaens L. Isolation of adherent polycyclic aromatic hydrocarbon (PAH)degrading bacteria using PAH-sorbing carriers / L. Bastiaens, D. Springael, P. Wattiau et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2000. - V. 66, № 5. - P. 18341843.

86. Bavington C. Stopping bacterial adhesion: A novel approach to treating infections / C. Bavington, C. Page // Respiration. 2005. - V. 72. - P. 335-344.

87. Bell K.S. The genus Rhodococcus / K.S. Bell, J.C. Philp, D.W.J. Aw, N. Christofi //J. Appl. Microbiol. 1998. - V. 85. - P. 195-210.

88. Bos R. Physico-chemistry of initial microbial adhesive interactions its mechanisms and methods for study / R. Bos, H.C. van der Mei, H.J. Busscher // FEMS Microbiol. Rev. - 1999. - V. 23. - P. 179-230.

89. Bunt C.R. The effects of pH, ionic strength and polyvalent ions on the cell surface hydrophobicity of Escherichia coli evaluated by the BATH and HIC methods / C.R. Bunt, D.S. Jones, I.G. Tucker 11 Inter. J. Pharmaceutics. 1995. -V. 113.-P. 257-261.

90. Busalmen J.P. Ellipsometric measurement of bacterial films at metal-electrolyte interfaces / J.P. Busalmen, S.R. de Sánchez, D.J. Schiffrin // Appl. Environ. Microbiol. 1998. -V. 64, № 10. - P. 3690-3697.

91. Busalmen J.P. Adhesion of Pseudomonas fluorescens (ATCC 17552) to nonpolarized and polarized thin films of gold / J.P. Busalmen, S.R. de Sánchez // Appl. Environ. Microbiol. 2001. - V. 67, № 7. - P. 3188-3194.

92. Busscher H.J. Kinetics of adhesion of the oral bacterium Streptococcus sanguis CH3 to polymers with different surface free energies / H.J. Busscher, M.H.W.J.C. Uyen, A.W.J, van Pelt et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1986. - V. 51, №5.-P. 910-914.

93. Busscher H.J. Streptococcus thermophilus and its biosurfactants inhibit adhesion by Candida spp. on silicone rubber / H.J. Busscher, C.G. van Hoogmoed, G.l. Geertsema-Doombusch et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1997. - V. 63, № 10.-P. 3810-3817.

94. Carvalho M.F. A GAC biofilm reactor for the continuous degradation of 4-chlorophenol: treatment efficiency and microbial analysis / M.F. Carvalho, I. Vasconcelos, A.T. Bull, P.M.L. Castro // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. -V. 57.-P. 419-426.

95. Chang J.H. Desulfurization of light gas oil in immobilized-cell systems of Gordona sp. CYKS1 and Nocardia sp. CYKS2 // J.H. Chang, Y.K. Chang, H.W. Ryu, H.N. Chang // FEMS Microbiol. Letters. 2000. - V. 182, № 2. - P. 309312.

96. Chen G. Equilibrium and kinetic adsorption of bacteria on alluvial sand and surface thermodynamic interpretation / G. Chen, M. Rockhold, K.A. Strevett // Res. Microbiol.-2003.-V. 154.-P. 175-181.

97. Cloarec O. Improvement of UV spectrophotometry methodology for the determination of polycyclic aromatic compounds in contaminated soils /

98. O. Cloarec, C. Gonzalez, E.M. Touraud, O. Thomas // Analytica Chemica Acta. -2002.-V. 435.-P. 245-252.

99. Colombo A.V. Corynebacterium diphtheriae surface proteins as adhesins to human erythrocytes / A.V. Colombo, J.R. Hirata, C.M.R. de Souza et al II FEMS Microbiol. Letters.-2001.-V. 197.-P. 235-239.

100. Dawson J.J.C. Application of biological indicators to assess recovery of hydrocarbon impacted soils / J.J.C. Dawson, E.J. Godsiffe, LP. Thompson et al. II Soil Biol. Biochem. 2007. - V. 39. - P. 164-177.

101. De Greve H. Combining sites of bacterial fimbriae / I-I. De Greve, L. Wyns, J. Bouckaert // Curr. Opin. Struct. Biol. 2007. - V. 17. - P. 506-512.

102. Edwards J.A. Bordetella bronchiseptica adherence to cilia is mediated by multiple adhesin factors and blocked by surfactant protein A / J.A. Edwards, N.A. Groathouse, S. Boitano // Infect. Immun. 2005. - V. 73, № 6. - P. 3618-3626.

103. ElkinB. Wettability, chemical and morphological data of hydrophobic layers by plasma polymerization on smooth substrates / B. Elkin, J. Mayer, B. Shindler, U. Vohner // Surf. Coat. Techn. 1999. - V. 116-119. - P. 836-840.

104. Ellen R.P. In vitro models that support adhesion specificity in biofilms of oral bacteria / R.P. Ellen, G. Lepine, P.-M. Nghiem // Adv. Dent. Res. 1997. - V. 11, № l.-P. 33-42.

105. Fernandes P.J. Construction of Rhodococcus random mutagenesis libraries using Tn5 transposition complexes / P.J. Fernandes, J.A. Powell, A.C. Archer // Microbiology. 2001. - V. 147. - P. 2529-2536.

106. Fiedler D. New packing materials for bioreactors based on coated and fiber-reinforced biocers / D. Fiedler, A. Thron, U. Soltmann, H. Bottcher // Chem. Mater. 2004. - V 16. - P. 3040-3044.

107. Finnerty W.R. The biology and genetics of the genus Rhodococcus / W.R. Finnerty // An. Rev. Microbiol. 1992. - V. 46. - P. 193-218.

108. Foster T.J. Surface protein adhesins of Staphylococcus aureus / T.J. Foster, M. Hook // Trends Microbiol. 1998. - V. 6, № 12. - P. 484-488.

109. Ganguly S. Enhanced stabilization of nitrile hydratase enzyme from Rhodococcus sp. DAP 96253 and Rhodococcus rhodochrous DAP 96622: A Diss. .Degree of PhD / S. Ganguly Tbilisi: Georgia State University, 2005. - 119 p.

110. Girardeau J. Pilins of fimbrial adhesins of different member species of Enterobacteriaceae are structurally similar to the C-terminal half of adhesin proteins / J. Girardeau, Y. Bertin IIFEBS Letters. 1995. - V. 357. - P. 103-108.

111. Gómez-Suárez C. Influence of extracellular polymeric substances on deposition and redeposition of Pseudomonas aeruginosa to surfaces / C. Gómez-Suárez, J. Pasma, A.J. van der Borden et al. II Microbiology. 2002. - V. 148. -P. 1161-1169.

112. Heilmann C. Characterization of Tn917 insertion mutants of Staphylococcus epidermidis affected in biofilm formation / C. Heilmann, C. Gerke, F. Perdreau-Remington, F. Götz // Infect. Immun. 1996. - V. 64, № 1. - P. 277-282.

113. Hori K. Isolation, characterization and application to off-gas treatment of toluene-degrading bacteria / K. Hori, S. Yamashita, S. Ishii et al. II J. Chem. Eng. Japan. 2001. - V. 34, № 9. - P. 1120-1126.

114. HuberB. The cep quorum-sensing system of Burkholderia cepacia Hill controls biofilm formation and swarming motility / B. Huber, K. Riedel, M. Hentzer et al. II Microbiology. 2001. - V. 147.-P. 2517-2528.

115. Ivshina I.B. Oil desorption from mineral and organic materials using biosurfactant complexes produced by Rhodococcus species / I.B. Ivshina, M.S. Kuyukina, J.C. Philp, N. Christofi // World J. Microbiol. Biotechnol. 1998. -V. 14.-P. 711-717.

116. Iwabuchi N. Relationships between colony morphotypes and oil tolerance in Rhodococcus rhodochrous / N. Iwabuchi, M. Sunairi, H. Anzai et al. II Appl. Environ. Microbiol. -2000. V. 66, № 11.-P. 5073-5077.

117. Jacobs A. Kinetic adhesion of bacterial cells to sand: Cell surface properties and adhesion rate / A. Jacobs, F. Lafolie, J.M. Herry, M. Debroux // Colloids Surf. B: Biointerfaces. 2007. - V. 59. - P. 35-45.

118. Jezequel K. Soil bioaugmentation by free and immobilized bacteria to reduce potentially phytoavailable cadmium / K. Jezequel, T. Lebeau // Bioresour. Technol. 2008. - V. 99. - P. 690-698.

119. Kim D. Regioselective oxidation of xylene isomers by Rhodococcus sp. strain DK17 / D. Kim, Y.-S. Kim, J.W. Jung et al. II FEMS Microbiol. Letters.2003.-V. 223.-P. 211-214.

120. Kim J.-W. Enhanced-rate biodégradation of organophosphate neurotoxin by immobilized nongrowing bacteria / J.-W. Kim, E.I. Rainina, W.W. Mulbry // Biotechnol. Prog. 2002. - V. 18. - P. 429-436.

121. Kovalenko G.A. Bioepoxidation of propylene by non-growing cells of Rhodococcus sp. / G.A. Kovalenko, T.B. Ivshina, E.V. Kuznetsova et al. Il Chemistry for Sustainable Development. 2003. - V. 11. - P. 117-121.

122. Krekeler C. Influence of physicochemical bacterial surface properties on adsorption to inorganic porous supports / C. Krekeler, H. Ziehr, J. Klein // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1991.-V. 35.-P. 484-490.

123. Kubâc D. Biotransformation of nitriles by Rhodococcus equi A4 immobilized in LentiKats® / D. Kubâc, A. Cejkovâ, J. Masâk et al. II J. Mol. Catalysis B: Enzymatic. 2006. - V. 39. - P. 59-61.

124. KuyukinaM.S. Recovery of Rhodococcus biosurfactants using methyl tertiary-butyl ether extraction / M.S. Kuyukina, LB. Ivshina, J.C. Philp et al. Il J. Microbiol. Methods. 2001. - V. 46, №2. - P. 149-156.

125. Kuyukina M.S. Bioremediation of crude oil-contaminated soil using slurry-phase biological treatment and land farming techniques / M.S. Kuyukina,

126. B. Ivshina, M.I. Ritchkova et al. II Soil Sediment Contamination. 2003. - V. 12. -P. 85-99.

127. Lameiras S. Biosorption of Cr (VI) using a bacterial biofilm supported on granular activated carbon and on zeolite / S. Lameiras, C. Quintelas, T. Tavares // Bioresour. Technol. 2008. - V. 99. - P. 801-806.

128. Landry R.M. Mucm-Pseudomonas aeruginosa interactions promote biofilm formation and antibiotic resistance / R.M. Landry, D. An, J.T. Hupp et al. Il Mol. Microbiol.-2006.-V. 59, № l.-P. 142-151.

129. Lang S. Surface-active lipids in rhodococci / S. Lang, J. Philp // Antonie van Leeuwenhoek. 1998. - V. 74. - P. 59-70.

130. Larsen P. Amyloid-like adhesins produced by floc-forming and filamentous bacteria in activated sludge / P. Larsen, J.L. Nielsen, D. Otzen, P.H.Nielsen // Appl. Environ. Microbiol. 2008. - V. 74, № 5. - P. 1517-1526.

131. Li F. Identification of Candida albicans genes that induce Saccharomyces cerevisiae cell adhesion and morphogenesis / F. Li, S.P. Palecelc // Biotechnol. Prog.-2005.- V. 21.-P. 1601-1609.

132. Liang M.N. Measuring the forces involved in polyvalent adhesion of uropathogenic Escherichia coli to mannose-presenting surfaces / M.N. Liang, S.P. Smith, S.J. Métallo et al II PNAS. 2000. - V. 97, № 24. - P. 13092-13096.

133. Loosdrecht M.C.M. The role of bacterial cell wall hydrophobicity in adhesion / M.C.M. van Loosdrecht, J. Lyklema, W. Norde et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1987.-V. 53, № 8.-P. 1893-1897.

134. López A. The interphase technique: a simple method of cell immobilization in gel-beads / A. López, N. Lázaro, A.M. Marqués // J. Microbiol. Methods. -1997.-V. 30.-P. 231-234.

135. Maclcay D. Illustrated Plandbook of physical-chemical properties and environmental fate for organic chemicals, Vol. Ill, Volatile organic chemicals / D. Mackay, W.Y. Shiu, K.C. Ma Chelsea: Lewis publishers Inc., 1993.- 916 p.

136. Mangan M.W. Random insertion mutagenesis of Rhodococcus equi / M.W. Mangan, W.G. Meijer // FEMS Microbiol. Letters. 2001. - V. 205. -P. 243-246.

137. Masak J. Colonization of surfaces by phenolic compounds utilizing microorganisms / J. Masak, A. Cejkova, V. Jirku et al. // Environ. International. -2005.-V. 31, №2.-P. 197-200.

138. Mattos-Guaraldi A.L. Cell surface components and adhesion in Corynebacterium diphtheriae / A.L. Mattos-Guaraldia, L.C.D. Formiga, G.A. Pereira // Microbes Infect. 2000. - V. 2. - P. 1507-1512.

139. McLean R.J.C. Evidence of autoinducer activity in naturally occurring biofilms / R.J.C. McLean, M. Whiteley, D.J. Stickler, W.C. Fuqua // FEMS Microbiol. Letters. 1997. - V. 154. - P. 259-263.

140. Meylheuc T. Adsorption of biosurfactant on solid surfaces and consequences regarding the bioadhesion of Listeria monocytogenes L028 / T. Meylheuc, C.J. van Oss, M.-N. B el lone-Fontaine // J. Appl. Microbiol. 2001. - V. 91. - P. 822832.

141. Microbial biofilms / Ed. by H.M. Lappin-Scott, W. Costerton, J. Lynch. -Cambridge University Press, 2003. 324 p.

142. Mireles J.R. Salmonella enterica serovar typhimurium swarming mutants with altered biofilm-forming abilities: surfactin inhibits biofilm formation / J.R. Mireles, A. Toguchi, R.M. Harshey // J. Bacteriol. 2001. - V. 183, № 20. - P. 5848-5854.

143. Mogensen J.E. Barriers to folding of the transmembrane domain of the Escherichia coli auto transporter adhesin involved in diffuse adherence / J.E. Mogensen, D. Tapadar, M.A. Schmidt, D.E. Otzen // Biochemistry. 2005. -V. 44, № 11.-P. 4533 -4545.

144. Naito M. Long-term repeated biodesulfurization by immobilized Rhodococcus erythropolis KA2-5-1 cells / M. Naito, T. Kawamoto, K. Fujino et al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. - V. 55. - P. 374-378.

145. Nassif X. Gonococcal lipooligosaccharide: an adhesin for bacterial dissemination? / X. Nassif// Trends Microbiol. 2000. - V. 8, № 12. - P. 539540.

146. Neu T.R. Significance of bacterial surface-active compounds in interaction of bacteria with interfaces / T.R. Neu // Microbiol. Rev. 1996. - V. 60, № 1. -P. 151-166.

147. Obuekwe C.O. Self-immobilized bacterial cultures with potential for application as ready-to-use seeds for petroleum bioremediation / C.O. Obuekwe, E.M. Al-Muttawa // Biotechnol. Letters. 2001. - V. 23. - P. 1025-1032.

148. Odenbreit S. Adherence properties of Helicobacter pylori: Impact on pathogenesis and adaptation to the host / S. Odenbreit // Int. J. Med. Microbiol. -2005.-V. 295.-P. 317-324.

149. O'Toole G.A. Initiation of biofilm formation in Pseudomonas fluorescens WCS365 proceeds via multiple, convergent signalling pathways: a genetic analysis /G.A. O'Toole, R. Koltcr//Mol. Microbiol. 1998. - V. 28, №3.-P. 449-461.

150. Owen S.A. Re-cvaluation of the hypothesis that biodégradation surfactants stimulate surface attachment of competent bacteria / S.A. Owen, N.J. Russel, W.A. House, G.F. White // Microbiology. 1997. - V. 143. - P. 3649-3659.

151. Philp J.C. Allcanolrophic Rhodococcas ruber as a biosurfactant producer / J.C. Philp, M.S. Kuyukina, I.B. Ivshina et al. II Appl. Microbiol. Biotechnol. -2002.-V. 59.-P. 318-324.

152. Pretzer G. Biodiversity-based identification and functional characterization of the mannose-specific adhesin oí Lactobacillus plantarum / G. Pretzer, J. Snel, D. Molenaar et al. //J. Bacteriol. -2005. V. 187, № 17.-P. 6128-6136.

153. Prieto M.B. Degradation of phenol by Rhodococcus erythropolis UPV-1 immobilized on Biolilc® in packed-bed reactor / M.B. Prieto, A. Hidalgo, J.L. Serra , M.J. Llama // J. Biotechnol. -2002. V. 97, № 1.-P. 1-11.

154. QuelcE. Rhodococcus sp. F92 immobilized on polyurethane foam shows ability to degrade various petroleum products / E. Quelc, Y. Ting, H.M. Tan // Bioresour. Technol. -2006. V. 97, № 1. - P. 32-38.

155. Rao S. Transposon mutagenesis in Rhodococcus sp. 124 via GentR transposomes / S. Rao // Bug Journal. 2003. - V. 6. - P. 151-156.

156. Resch A. Differential gene expression profiling of Staphylococcus aureus cultivated under biofilm and planlctonic conditions / A. Resch, R. Rosenstein, C. Nerz, F. Gotz // Appl. Environ. Microbiol. 2005. - V. 71, № 5. - P. 2663-2676.

157. Rubinsztein-Dunlop S. Identification of two new Helicobacter pylori surface proteins involved in attachment to epithelial cell lines / S. Rubinsztein-Dunlop, B. Guy, L. Lissolo, H. Fischcr // J. Med. Microbiol. 2005. - V. 54. - P. 427-434.

158. Sadovskaya I. Extracellular carbohydrate-containing polymers of a model bio film-producing strain, Staphylococcus epidermidis RP62A / I. Sadovskaya, E. Vinogradov, S. Flahaut et al. II Infect. Immun. 2005. - V. 73, № 5. - P. 30073017.

159. SafonovaE. Biotrcatmcnt of industrial wastewater by selected algal-bacterial consortia / E. Safonova, K.V. Kvitko, M.I. Iankevitch et al. II Eng. Life Sei.2004. V. 4, № 4. - P. 347-353.

160. Shin M. Evaluation of support materials for the surface immobilization and decolorization of amaranth by Trametes versicilor / M. Shin, T. Nguyen, J. Ramsay // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V. 60. - P. 218-223.

161. Shleeva M.O. Formation and resuscitation of "nonculturable" cells of Rhodococcus rhodochrous and Mycobacterium tuberculosis in prolonged stationary phase / M.O. Shleeva, K. Bagramyan, M.V. Telkov et al. II Microbiology. 2002. - V. 148.-P. 1581-1591.

162. Sokolovska I. Carbon source-induced modifications in the mycolic acid content and cell wall permeability of Rhodococcus erythropolis El / I. Sokolovska, R. Rozenberg, C. Ricz et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2003. - V. 69, № 12. -P. 7019-7027.

163. Sorongon M.L. Hydrophobicity, adhesion, and surface-exposed proteins of gliding bacteria / M.L. Sorongon, R.A. Bloodgood, R.P. Burchard // Appl. Environ. Microbiol. 1991. - V. 57, № 11.-P. 3193-3199.

164. Starks A.M. Assembly of CS1 pili: the role of specific residues of the major pilin, Coo A / A.M. Starks, B.J. Froehlich, T.N. Jones, J.R. Scott // J. Bacteriol. -2006.-V. 188, № l.-P. 231-239.

165. Steffan S. Azo dye biodegradation by microbial cultures immobilized in alginate beads / S. Steffan, L. Bardi, M. Marzona // Environment International. —2005.-V. 31, №2.-P. 201-205.

166. Stoll A. Comparison of the heavy metal sorptive properties of three types of immobilized non-viable Sacchciromyces cerevisiae biomass / A. Stoll, J.R. Duncan // Proc. Biochem. 1997. - V. 32, № 6. - P. 467-472.

167. Sutcliffe I.C. Cell envelope composition and organisation in the genus Rhodococcus / I.C. Sutcliffe // Antonie van Leeuwenhoek. 1998. - V. 74. — P. 49-58.

168. Suzuki T. Immobilization of Prototheca zopfii in calcium-alginate beads for the degradation of hydrocarbons / T. Suzuki, T. Yamaguchi, M. Ishida // Proc. Biochem. 1998.-V. 33, № 5.-P. 541-546.

169. Svensäter G. Protein expression by planktonic and biofilm cells of Streptococcus mutans / G. Svensäter, J. Welin, J.C. Willems et al. II FEMS Microbiol. Letters.-200l.-V. 205.-P. 139-146.

170. Takahashi Y. Contribution of sialic acid-binding adhesin to pathogenesis of experimental endocarditis caused by Streptococcus gordonii DL1 / Y. Takahashi, E. Takashima, K. Shimazu et al. II Infect. Immun. 2006. - V. 74, № 1. - P. 740743.

171. Tatarczak M. Identification of putative adhesin genes in shigatoxigenic Escherichia coli isolated from different sources / M. Tatarczak, K. Wieczorek, B. Posse, J. Oselc // Vet. Microbiol. 2005. - V. 110. - P. 77-85.

172. Thomas W. Catch-bond model derived from allostery explains force-activated bacterial adhesion / W. Thomas, M. Forero, O. Yakovenko et al. Il Biophys. J. 2006. - V. 90. - P. 753-764.

173. Toledo-Arana A. The enterococcal surface protein, Esp, is involved in Enterococcus faecalis biofilm formation / A. Toledo-Arana, J. Valle, C. Solano et al. II Appl. Environ. Mocrobiol.-2001,-V. 67, № 10.-P. 4538-4545.

174. Tolker-Nielsen T. Development and dynamics of Pseudomonas sp. biofilms / T. Tolker-Nielsen, U.C. Brinch, P.C. Ragas et al. II J. Bacteriol. 2000. - V. 182, №22.-P. 6482-6489.

175. Tsuneda S. Extracellular polymeric substances responsible for bacterial adhesion onto solid surface / S. Tsuneda, H. Aikawa, H. Hayashi et al. II FEMS Microbiol. Letters. 2003. - V. 223. - P. 287-292.

176. Uraizee F.A. A model for diffusion controlled bioavailability of crude oil components / F.A. Uraizee, A.D. Venosa, M.T. Suidan // Biodegradation. 1998. -V. 8.-P. 287-296.

177. Vadillo-Rodriguez V. Relations between macroscopic and microscopic adhesion of Streptococcus mitis strains to surfaces / V. Vadillo-Rodriguez, H.J. Busscher, W. Norde et al. II Microbiology. 2004. - V. 150. - P. 1015-1022.

178. Vanhaecke E. Kinetics of Pseudomonas aeruginosa adhesion to 304 and 316-L stainless steel: role of cell surface hydrophobicity / E. Vanhaecke, J.-P. Remon, M. Moors et ai II Appl. Environ. Microbiol. 1990. - V. 56, № 3. -P. 788-795.

179. Volkland LLP. Corrosion inhibition of mild steel by bacteria / H.P. Volkland , H. Harms, K. Knopf et al. II Biofouling. 2000. - V. 15, № 4. -P. 287-297.

180. Walker J.D. Microbial petroleum degradation: use of mixed hydrocarbon substrates / J.D. Walker, R.R. Colwell // Appl. Microbiol. 1974. - V. 6, № 6. -P. 1053-1060.

181. Walker S.L. Influence of growth phase on adhesion kinetics of Escherichia coli D21g / S.L. Walker, J.E. Hill, J.A. Redman, M. Elimelech // Appl. Environ. Microbiol. 2005. - V. 71, № 6. - P. 3093-3099.

182. Walsh P.K. Cell growth patterns in immobilization matrices / P.K. Walsh, D.M. Mai one // Biotcchnol. Adv. — 1995. V. 13. - P. 13-43.

183. Wang B.-E. Biosorption behavior ofazo dye by inactive CMC immobilized Aspergillus fumigatus beads / B.-E. Wang, Y.-Y. Hu, L. Xie, K. Peng // Bioresour. Technol. 2008. - V. 99. - P. 794-800.

184. WarhustA.M. Biotransformations catalyzed by the genus Rhodococcus / A.M. Warhust, C.A. Fcwson // Cr. Rev. Biotechnol. 1994. - V. 14, № 1. - P. 2973.

185. Whyte L.G. Biodegradation of variable-chain-length alkanes at low temperatures by a psychrotrophic Rhodococcus sp. / L.G. Whyte, J. Hawari, E. Zhou et al. II Appl. Environ. Microbiol. 1998. - V. 64, № 7. - P. 2578-2584.

186. Wrenn B.A. Selective enumeration of aromatic and aliphatic hydrocarbon degrading bacteria by a most-probable number procedure / B.A. Wrenn, A.D. Venosa // Can. J. Microbiol. 1996. - V. 42. - P. 252-258.

187. Xu L. Role of the h/xS quorum-sensing system in biofilm formation and virulence of Staphylococcus epidermidis / L. Xu, H. Li, C. Vuong et al. II Infect. Immun. 2006. - V. 74, № 1. - P. 488-496.

188. Yajima A. A. Identification of platelet receptors for the Streptococcus gordonii DL1 sialic-acicl-binding adhesion / Yajima, Y. Takahashi, K. Kohishi // Microbiol. Immunol. 2005. - V. 49, № 8. - P. 795-800.

189. Yousef F. In silico analysis of large microbial surface proteins / F. Yousef, M. Espinosa-Urgel // Res. Microbiol. 2007. - V. 158. - P. 545-550.

190. Yun S. Removal of volatile fatty acids with immobilized Rhodococcus sp. B261 / S. Yun, Y. Ohta // Bioresour. Technol. 2005. - V. 96. - № 1. - P. 41-46.

191. Zhang Y. Inactivation of Streptococcus gordonii SspAB alters expression of multiple adhesin genes / Y. Zhang, Y. Lei, A. Nobbs et al. II Infect. Immun. -2005. V. 73, № 6. - P. 3351-3357.