Энтеробактин и фосфонаты Pectobacterium atrosepticum как факторы, участвующие в функционировании растительно-микробной патосистемы тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Парфирова Ольга Игоревна

• Парфирова Ольга Игоревна
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Парфирова Ольга Игоревна

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Роль низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов бактерий в формировании и развитии растительно-микробных патосистем

1.2. Роль сидерофоров бактерий в растительно-микробных взаимодействиях

1.2.1. Типы сидерофоров бактерий

1.2.2. Биосинтез и транспорт сидерофоров бактерий

1.2.3. Функции сидерофоров бактерий

1.2.4. Сидерофоры бактерий как факторы растительно-микробных взаимодействий

1.3. Фосфонаты микроорганизмов и их влияние на растительно-микробные взаимодействия

1.3.1. Низкомолекулярные фосфонаты: распространение, разнообразие и физиологическое действие

1.3.2. Разнообразие и свойства фосфоноконъюгатов

1.3.3. Метаболизм фосфонатов

1.3.4. Влияние фосфонатов фитопатогенных бактерий на развитие инфекционных процессов у растений-хозяев

1.4. Развитие растительно-микробных патосистем при взаимодействии растений и бактерий рода Pectobacterium

1.4.1. Реакции растений, индуцируемые бактериями рода Pectobacterium

1.4.2. Факторы вирулентности бактерий рода Pectobacterium

и регуляция их продукции

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Выявление кодирующих ферменты биосинтеза низкомолекулярных метаболитов генов Pectobacterium atrosepticum, уровни экспрессии которых выше в условиях растения-хозяина по сравнению с условиями in vitro

2.2. Культивирование дикого и мутантных штаммов Р. atrosepticum

2.3. Конструирование мутантных штаммов Р. atrosepticum по генам е^А и^т1

2.4. Конструирование компенсаторных мутантных штаммов Р. atrosepticum

2.5. Анализ устойчивости дикого и мутантных штаммов Р. atrosepticum к перекиси водорода

2.6. Анализ экстраклеточных ферментативных активностей в культурах дикого и мутантных штаммов Р. atrosepticum

2.7. Выращивание, праймирование и инфицирование растений

2.8. Определение содержания перекиси водорода в растениях

2.9. Выделение РНК и синтез кДНК

2.10. Анализ уровней экспрессии генов

2.11. Детекция низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов в супернатантах культур Р. atrosepticum при помощи ЯМР-спектроскопии

2.12. Установление структуры фосфонатов Р. atrosepticum с помощью масс-спектрометрии и ЯМР-спектроскопии

2.13. Статистическая обработка данных

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Выявление основных кандидатов на роль факторов растительно-микробного взаимодействия среди низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов Ре^оЬа^епит atrosepticum

3.2. Роль сидерофора энтеробактина во взаимодействии Ре^оЬа^епит atrosepticum и растений табака

3.2.1. Влияние нокаут-мутации гена фермента биосинтеза энтеробактина на вирулентность Р. atrosepticum

3.2.2. Влияние нокаут-мутации гена фермента биосинтеза энтеробактина на устойчивость Р. atrosepticum к перекиси водорода

3.2.3. Влияние нокаут-мутации гена фермента биосинтеза энтеробактина на вирулентность Р. atrosepticum в отношении растений с повышенным иммунным статусом

3.3. Роль низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов во взаимодействии

Pectobacterium atrosepticum и растений табака

3.3.1 Анализ способности P. atrosepticum синтезировать низкомолекулярные экстраклеточные фосфонаты

3.3.2. Определение структуры фосфонатов P. atrosepticum

3.3.3. Регуляция продукции низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов P. atrosepticum

3.3.4. Особенности взаимодействия фосфонат-дефицитного мутанта P. atrosepticum с растениями табака

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ПРИНЯТЫХ СОКРАЩЕНИЙ

2-ОПФ - 2-оксопропилфосфонат; АБК - абсцизовая кислота;

АГЛ - ацилированные гомосеринлактоны; АИ-2 - аутоиндуктор второго типа; АФК - активные формы кислорода; ДТ - дикий тип;

ИПТГ - изопропилтиогалактопиранозид; КДГ - 2-кето-дезоксиглюканат; кДНК - комплементарная ДНК; КОЕ - колониеобразующая единица; компAentA - компенсаторный AentA мутант; компА/oml - компенсаторный Afoml мутант; НД - недостоверные различия;

НДЭГ - недифференциально экспрессирующийся ген ОРС - открытая рамка считывания; ПЦР - полимеразная цепная реакция;

ПЦР РВ - полимеразная цепная реакция в реальном времени;

РЭ - растительный экстракт;

СК - салициловая кислота;

СС3Т - система секреции третьего (3) типа;

СС6Т - система секреции шестого (6) типа;

ЯМР - ядерный магнитный резонанс;

3-OH MAME - метиловый эфир 3-гидроксимиристиновой кислоты; 3-OH PAME - метиловый эфир 3-гидроксипальмитиновой кислоты; C-P - углерод-фосфор;

CPEC - circular polymerase extention cloning;

DSF - диффундирующий сигнальный фактор (diffusible signal factor); DspE/F - disease-specific protein E/F;

ERF1 - этилен-регулируемый фактор транскрипции (ethylene response factor); FAAH - гидролаза амидов жирных кислот (fatty acid amide hydrolase); HiVir - high virulence; Km - кассета устойчивости к канамицину; LB - Lysogeny broth;

LOX2 - липоксигеназа 2 (lipoxygenase 2);

MFS - major facilitator subtype;

ММ - минимальная среда (minimal medium);

МММ - модифицированная минимальная среда (modified minimal medium); MS - Murashige-Skoog;

NIS - NRPS-независимые синтетазы (NRPS-independent synthetase); NRPS - нерибосомальные пептидсинтазы (non-ribosomal peptide synthetase); OMR - рецептор внешней мембраны (outer membrane receptor);

Pba - Pectobacterium atrosepticum;

PBP - периплазматический связывающий белок (periplasmic binding protein); pdtc - пиридин-2,6-дитиокарбоновая кислота;

PepM (Foml) - фосфоенолпируватмутаза (phosphoenolpyruvate mutase);

PGPB - бактерии, стимулирующие рост растений (plant growth-promoting bacteria);

PKS - поликетидсинтазы (polyketide synthase);

pLDDT - predicted local distance difference test;

Ppd (Fom2) - фосфонопируват декарбоксилаза (phosphonopyruvate decarboxylase); ppGpp - гуанозинтетрафосфат;

RMSD - среднеквадратичное отклонение позиций атомов (Root Mean Square Deviation);

RND - resistance/nodulated/cell division;

Rsm - регулятор синтеза вторичных метаболитов (regulator secondary metabolite); SBP - сидерофор-распознающий белок (siderophore binding protein).

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Энтеробактин и фосфонаты Pectobacterium atrosepticum как факторы, участвующие в функционировании растительно-микробной патосистемы»

ВВЕДЕНИЕ

Постановка проблемы и ее актуальность. Взаимодействие растений и фитопатогенных микроорганизмов, сопряженное, в частности, с развитием инфекционных заболеваний растений, связано с глубокой интеграцией макро- и микроорганизма в патологическую систему, в рамках которой растительный и микробный «компоненты» функционируют как единое целое (Горшков, 2017). В результате коэволюции определенного вида паразита и хозяина сформировались механизмы, обеспечивающие разнообразие форм их взаимодействия, а не просто один «универсальный» сценарий. Конкретный сценарий растительно-микробного взаимодействия определяется в зависимости от большого набора факторов, в том числе от физиологических реакций «партнеров» друг на друга и от синтезируемых ими метаболитов. Многие метаболиты, производимые растительным или микробным «компонентами» патосистемы, по сути, являются «общими», поскольку влияют не просто на организм продуцента, а на функционирование патологической системы в целом. В частности, существенный вклад в сценарий растительно-микробных взаимоотношений вносят производимые фитопатогенными бактериями низкомолекулярные экстраклеточные метаболиты, среди которых наиболее исследованы фитогормоны микробного происхождения, фитотоксины и сидерофоры (Strobel, 1977; Nakano et al., 2022; Pandey, 2023). Многие из таких низкомолекулярных факторов вирулентности бактерий служат «инструментами» для манипулирования растением-хозяином.

Альтернативные сценарии развития патологических систем достаточно широко описаны на примере взаимодействия растений с фитопатогенными пектолитическими бактериями рода Pectobacterium (пектобактерии) - одними из наиболее вредоносных и исследуемых фитопатогенов (Van Gijsegem et al., 2021). Традиционно эти бактерии воспринимаются как возбудители заболевания мягкие гнили; однако эти микроорганизмы часто вызывают у растений атипичные патологии (не связанные с гнилостными процессами), а наиболее

распространенный сценарий их взаимодействия с растениями-хозяевами связан с развитием латентных (бессимптомных) инфекций (Toth, Birch, 2005; Charkowski, 2006; Marquez-Villavicencio et al., 2011). К развитию симптомов мягких гнилей у инфицированных пектобактериями растений приводят синтезируемые этими микроорганизмами экстраклеточные ферменты, разрушающие полимеры растительных клеточных стенок, в первую очередь, пектиновые вещества (Van Gijsegem et al., 2021). Из-за высокой активности этих ферментов за пектобактериями прочно закрепилось амплуа патогенов «грубой силы» (brute force) (Toth, Birch, 2005; Liu et al., 2008). Однако одной «грубой силой» невозможно объяснить разнообразие сценариев взаимодействия пектобактерий с растениями. «Инструментарий», используемый пектобактериями для манипулирования хозяином и координирования процессов, протекающих при растительно-микробном взаимодействии, очень слабо исследован. Помимо ферментов, разрушающих полимеры растительной клеточной стенки, и белков, индуцирующих гибель клеток растений, среди факторов вирулентности пектобактерий описана только коронафациевая кислота, которая позволяет активировать восприимчивые ответы растений-хозяев в приоритет защитным (Tsers et al., 2023). В связи с этим, существуют предпосылки для «инвентаризации» детерминант взаимодействия пектобактерий с растениями, особенно среди низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов, действие большинства из которых связано не с «грубой силой», а с координированием физиологических процессов, определяющих особенности функционирования патологической системы и конкретный сценарий растительно-микробного взаимодействия.

Цель и задачи исследования. Целью работы было идентифицировать новые детерминанты взаимодействия фитопатогенной бактерии Pectobacterium atrosepticum и растений среди низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов этого микроорганизма и определить роль этих метаболитов в функционировании растительно-микробной патосистемы.

Для достижения цели были поставлены следующие задачи:

1. Определить основных кандидатов на роль новых факторов растительно-микробного взаимодействия среди низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов Р. atrosepticum.

2. Получить мутантные штаммы Р. atrosepticum по генам ферментов биосинтеза низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов, потенциально влияющих на функционирование растительно-микробной патосистемы, и сравнить особенности взаимодействия дикого типа и мутантных штаммов с растениями.

3. Определить, какие регуляторные механизмы обеспечивают активацию продукции низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов Р. atrosepticum, оказывающих влияние на растительно-микробное взаимодействие.

Научная новизна работы.

1. Впервые у фитопатогенных бактерий описано физиологическое действие сидерофора энтеробактина.

2. Впервые у представителя семейства Ре^оЬа^епасеае (Р. atrosepticum) обнаружены экстраклеточные низкомолекулярные фосфонаты.

3. Впервые среди фосфонатов природного происхождения обнаружены такие соединения, как 2-диэтоксифосфорилэтанамин и фенилфосфоновая кислота.

4. Впервые определено, какие регуляторные механизмы обеспечивают активацию продукции фосфонатов.

5. Впервые у представителя семейства Ре^оЬа^епасеае (Р. atrosepticum) определены физиологические свойства низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов.

6. Описан новый принцип регуляции вирулентности фитопатогенных бактерий, связанный с продукцией таких низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов (фосфонаты), которые обеспечивают снижение активности собственных ферментов, разрушающих полимеры растительной клеточной стенки.

7. Впервые у представителя семейства Pectobacteriaceae atrosepticum) определено влияние продукции экстраклеточных фосфонатов и энтеробактина на функционирование растительно-микробной патосистемы.

Научно-практическая значимость работы. Полученные в настоящей работе данные о роли низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов (сидерофора энтеробактина и фосфонатов) пектолитических бактерий в функционировании растительно-микробных патосистем вносят вклад в понимание процессов взаимодействия растений с фитопатогенными бактериями и развития инфекционных заболеваний растений. Получены приоритетные данные о молекулярных событиях, происходящих при переходе бессимптомной инфекции в симптоматичную, что формирует теоретическую основу для разработки подходов для защиты растений. Обнаружены и охарактеризованы метаболиты (фосфонаты), подавляющие активность ключевых факторов вирулентности пектолитических бактерий и вследствие этого представляющие интерес для использования в качестве потенциальных средств, препятствующих развитию мягких гнилей растений.

Экспериментальные данные и методические подходы, изложенные в работе, могут быть использованы в сельскохозяйственных, биологических и биотехнологических учреждениях, а также при чтении курсов лекций по фитопатологии, физиологии растений, микробиологии, генетике и молекулярной биологии в высших учебных заведениях.

Связь работы с научными программами и собственный вклад автора в исследования. Работа проводилась с 2017 по 2025 гг. в соответствии с планом научных исследований КИББ ФИЦ КазНЦ РАН по темам «Развитие геномных и постгеномных исследований для выяснения молекулярных механизмов функционирования живых систем и создания организмов с заданными свойствами» (государственный регистрационный номер АААА-А18-118022790082-2), «Молекулярно-генетические механизмы развития инфекционных заболеваний культурных растений» (государственный

регистрационный номер 121110200046-2), «Молекулярно-генетические исследования возбудителей инфекционных заболеваний растений и механизмов функционирования систем паразит-хозяин» (государственный регистрационный номер 124050300040-5). Исследования по теме диссертационной работы были частично поддержаны мегагрантом Министерства науки и высшего образования РФ «Инфекционные заболевания культурных растений: комплексное исследование и стратегии контроля на примере снежной плесени» (2019-2021 гг., № 075-15-2019-1881) и грантом РНФ «Молекулярные «игроки», детерминирующие переход латентного взаимодействия пектобактерий и растений в манифестные инфекции» (2019-2021 гг. и 2022-2023 гг., № 19-14-00194). Научные положения диссертации и выводы базируются на результатах собственных исследований автора или на данных, полученных при его непосредственном участии.

Положения, выносимые на защиту

1. Синтез сидерофора энтеробактина клетками Р. atrosepticum обеспечивает повышенную устойчивость бактерий к перекиси водорода, полноценную патоген-опосредуемую активацию восприимчивых ответов у инфицированных растений, а также возможность индукции патологического процесса у растений с повышенным иммунным статусом.

2. Фитопатогенные бактерии Р. atrosepticum синтезируют низкомолекулярные экстраклеточные фосфонаты - 2-диэтоксифосфорилэтанамин и фенилфосфоновую кислоту.

3. Синтез низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов клетками Р. atrosepticum отрицательно влияет на экстраклеточную пектатлиазную активность этого микроорганизма и на его способность индуцировать патологический процесс у растений с повышенным иммунным статусом.

4. Синтез низкомолекулярных экстраклеточных фосфонатов Р. atrosepticum индуцируется в присутствии пектиновых веществ при участии ацил гомосеринлактон-опосредуемой системы кворума.

Личное участие автора. Автор принимал личное участие в планировании экспериментов, подготовке образцов и проведении экспериментальной работы, анализе, статистической обработке, интерпретации и обсуждении полученных результатов. Автор участвовал в написании статей, опубликованных по результатам работы, и представлении результатов на научных конференциях. Работа написана автором самостоятельно. Предсказание третичных структур целевых ферментов и сравнение третичных структур белков проводили совместно с м.н.с. Тендюк Н.В. (КИББ ФИЦ КазНЦ РАН). Расшифровку структуры фосфонатов с помощью ЯМР-спектроскопии и масс-спектрометрии проводили в рамках совместных исследований с сотрудниками ФИЦ КазНЦ РАН к.б.н. зав. лаб. Микшиной П.В. (КИББ ФИЦ КазНЦ РАН), к.х.н. с.н.с. Пашагиным А.В. (КИББ ФИЦ КазНЦ РАН) и к.х.н. с.н.с. Смолобочкиным А.В. (ИОФХ им. Арбузова ФИЦ КазНЦ РАН).

Апробация работы. Основные результаты проведенных исследований были представлены в рамках 8-го Конгресса Микробиологов FEMS (Глазго, Шотландия, 2019 г.), ХУШ Конгресса В-МРМ (Глазго, Шотландия, 2019 г.), IX Съезда общества физиологов растений России «Физиология растений - основа создания растений будущего» (Казань, 2019 г.), II Международной научной конференции PLAMIC2020 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» (Саратов, 2020 г.), 3-го Российского микробиологического конгресса (Псков, 2021 г.), 5-го Российского симпозиума с международным участием «Клеточная сигнализация: итоги и перспективы» (Казань, 2021 г.), V Всероссийской школы конференции с международным участием для молодых ученых «Молекулярно-генетические и клеточные аспекты растительно-микробных взаимодействий» (Санкт-Петербург, 2021 г.), Всероссийской научной конференции с международным участием «Физиология растений и феномика как основа современных фитобиотехнологий» (Нижний Новгород, 2022 г.), III Международной научной конференции PLAMIC2022 «Растения и микроорганизмы: биотехнология будущего» (Санкт-Петербург, 2022 г.), 4-го

Российского микробиологического конгресса (Томск, 2023 г.), II Всероссийской школы-конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петербург, 2023 г.), Международной конференции "Plant genetics, genomics, bioinformatics and biotechnology" PlantGen2023 (Казань, 2023 г.), VI Всероссийской научной конференции с международным участием «Устойчивость растений и микроорганизмов к неблагоприятным факторам среды» (Иркутск, п.Большое Голоустное, 2023 г.), III Международной конференции «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петербург, 2024 г.), а также на итоговых конференциях КИББ ФИЦ КазНЦ РАН (2019, 2021, 2022, 2023, 2024 гг.).

Публикации по результатам исследования. Основные результаты диссертационной работы были опубликованы в 21 научной работе, из них 6 научных статей в научных журналах, рекомендованных ВАК, индексируемых в базах данных Scopus, Web of Science и РИНЦ и относящихся к первому и второму квартилям, и 15 тезисов докладов, представленных на всероссийских и международных научных конференциях.

Структура и объем диссертационной работы. Диссертация изложена на 232 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания объектов и методов исследования, изложения и обсуждения результатов, заключения, выводов и списка литературы. Список литературы включает 496 источников, из них 490 зарубежных. В работе представлено 7 таблиц и 28 рисунков.

Благодарности. Автор выражает искреннюю благодарность и глубокую признательность за ценные советы, неоценимую помощь и всестороннюю поддержку при выполнении диссертационной работы научному руководителю -кандидату биологических наук, доценту Горшкову Владимиру Юрьевичу.

Особую благодарность автор выражает к.б.н. Петровой О.Е., к.б.н. Микшиной П.В. и д.б.н. Топорковой Я.Ю. (КИББ ФИЦ КазНЦ РАН) за помощь в проведении экспериментов, ценные советы и всестороннюю поддержку.

Автор искренне признателен всем соавторам своих публикаций, а также выражает благодарность всем сотрудникам лабораторий молекулярной биологии (зав. лабораторией Гоголев Ю.В.) и инфекционных заболеваний растений (зав. лабораторией Горшков В.Ю.) КИББ ФИЦ КазНЦ РАН за помощь и поддержку при написании диссертационной работы.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Роль низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов бактерий в формировании и развитии растительно-микробных патосистем

Взаимоотношения растений и фитопатогенных бактерий формировались в ходе длительной коэволюции организмов, приведшей к их интеграции в единую систему - патосистему (Дьяков и др., 2001; Горшков, 2017). В рамках патосистемы многие метаболиты, производимые микробным и растительным «компонентами», по сути, становятся общими для двух «партнеров», поскольку оказывают влияние на развитие одновременно и макро-, и микроорганизма. Так, например, структурные компоненты полимеров клеточных стенок бактерий оказывают физиологическое действие на растительные клетки, а именно - служат в качестве неспецифичных элиситоров, то есть модуляторов фитоиммунного ответа (Тарчевский, 2002; Henry et al., 2013; Abdul Malik et al., 2020). Синтезируемые бактериями эффекторные белки тоже могут выступать в качестве сильных специфичных элиситоров; но одной из целевых функций этих белков является регуляция целого ряда физиологических реакций растений-хозяев (Bent, Mackey, 2007; del Carmen Orozco-Mosqueda et al., 2023). Бактериальные ферменты, разрушающие полимеры растительных клеточных стенок, приводят к образованию эндогенных элиситоров - олигосахаринов - вызывающих (даже в (суб)наномолярных концентрациях) глобальные перестройки метаболизма растительных клеток (Larskaya, Gorshkova, 2015). Перечисленные широко известные примеры иллюстрируют важную роль экстраклеточных полимеров бактериальной природы в функционировании организма растения-хозяина. При этом существует множество примеров влияния синтезируемых бактериями низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов на состояние растительно-микробной патосистемы. Среди таких метаболитов достаточно широко описаны фитогормоны (производимые бактериями), фитотоксины, медиаторы систем кворума, сидерофоры и, в значительно меньшей степени, фосфонаты.

Взаимодействие фитопатогенов и растений невозможно без существенных физиологических преобразований растения-хозяина, которые в большой степени опосредованы действием фитогормонов (Robert-Seilaniantz et al., 2011; Kazan, Lyons, 2014; Gorshkov, Tsers, 2022). Вероятно, это послужило причиной того, что многие фитопатогенные бактерии в ходе эволюции приобрели способность синтезировать фитогормоны. Среди «бактериальных фитогормонов» в наибольшей степени распространены и исследованы «ростовые» фитогормоны -ауксин и цитокинины. Ауксин синтезируют такие фитопатогенные бактерии, как Pseudomonas savastanoi (Bari, Jones, 2009), Pseudomonas syringae (McClerklin et al., 2018), Erwinia herbicola pv. gypsophilae (Robert-Seilaniantz et al., 2011), Rhodococcus fascians (Benjamins, Scheres, 2008), Pantoea agglomerans (Glick, 2012). Многие бактерии, продуцирующие ауксин, синтезируют и цитокинины: Pseudomonas savastanoi, Pseudomonas syringae, Pseudomonas marginalis (Dankevych et al., 2018), Erwinia herbicola pv. gypsophilae, Rhodococcus fascians (Jameson, 2000; Chalupowicz et al., 2006; Perez-Martinez et al., 2010). Продуктивность синтеза ауксина и цитокининов у ряда фитопатогенов положительно коррелирует с их вирулентностью, в том числе с уровнем продукции ряда детерминант патогенности (таких, например, как фитотоксины и ферменты, разрушающие растительную клеточную стенку) (Dankevych et al., 2018). Мутации в генах ферментов биосинтеза этих фитогормонов существенно снижают или даже полностью подавляют вирулентность таких фитопатогенов как Pantoea agglomerans, Pseudomonas syringae и Pseudomonas savastanoi (Iacobellis et al., 1994; Manulis, Barash, 2003; Chalupowicz et al., 2006; Kazan, Manners 2009; Robert-Seilaniantz et al., 2011; McClerklin et al., 2018).

К продуцентам ауксина и цитокининов часто относят и Agrobacterium tumefaciens, несмотря на то что эта бактерия фитогормоны не производит, но несет в составе Т-ДНК Ti-плазмиды гены ферментов биосинтеза ауксина и цитокининов. В результате трансгенеза, реализуемого при растительно-микробном взаимодействии, эти гены переносятся в геном растения-хозяина, что

приводит к активации продукции этих фитогормонов (Suzuki et al., 2009; Bourras et al., 2015; Zhang et al., 2015). Таким образом, ауксин и цитокинины в составе патоситемы являются продуктами генов Agrobacterium tumefaciens, экспрессия которых осуществляется в составе генома растения-хозяина. Этот пример особенно ярко иллюстрирует глубину интеграции растений и бактерий при формировании патосистемы.

«Популярность» синтеза ауксина и цитокининов у фитопатогенных бактерий объясняется физиологическими последствиями действия этих фитогормонов, которое благоприятствует развитию микроорганизмов in planta, то есть в условиях организма растения-хозяина. Во-первых, поскольку ауксин и цитокинины стимулируют деление и рост растительных клеток, эти фитогормоны обеспечивают приток фотоассимилятов, которые могут использоваться фитопатогенами в качестве ростового субстрата (Ashby, 2000; Walters et al., 2008; Zwack, Rashotte, 2013). Во-вторых, физиологическое действие «ростовых» фитогормонов, в первую очередь ауксина, индуцирующего классическую реакцию «кислого роста», связано с размягчением структуры растительной клеточной стенки, которая служит главным барьером для системного распространения фитопатогенов in planta (Полевой, 1989; Cosgrove, 1999; Медведев, Шарова, 2011). В-третьих, из-за того, что повышение концентрации ауксина и цитокининов приводит к перераспределению ресурсов растительных клеток в приоритет росту и делению, становится невозможной полноценная активация фитоиммунных ответов. Многократно продемонстрировано, что действие и ауксина, и цитокининов приводит к подавлению защитных систем растений (Robinette, Matthysse, 1990; Murphy et al., 1997; Navarro et al., 2006; Ding et al., 2008; Kazan, Manners 2009; Naseem, Dandekar, 2012). В связи с этим, синтез ауксина и цитокининов позволяет бактериям подавлять иммунные ответы растений-хозяев, обеспечивать себя дополнительным питательным субстратом и эффективно распространяться по тканям растения-хозяина. Следствием синтеза бактериями этих фитогормонов в растении часто являются симптомы

гипертрофии клеток и гиперплазии тканей хозяина, которые выражаются образованием наростов, галлов и других новообразований (Jameson, 2000; Chalupowicz et al., 2006; Perez-Martinez et al., 2010). Однако существуют примеры ауксин- и цитокинин-продуцирующих фитопатогенных бактерий (Dickeya dadantii, Ralstonia solonacearum, Pseudomonas syringae), индуцирующих патологические процессы, не связанные с гипертрофией клеток и гиперплазией тканей (Robert-Seilaniantz et al., 2007).

Некоторые фитопатогенные бактерии, по всей видимости, способны синтезировать и третий «ростовой» фитогормон - гиббереллины. У Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, Xanthomonas translucens pv. translucens, Erwinia tracheiphila и Acidovorax avenae subsp. avenae обнаружены опероны генов, кодирующих ферменты полного пути биосинтеза гиббереллинов, и показано, что гетерологичная экспрессия этого набора генов в клетках Escherichia coli приводит к образованию гиббереллинов (Nagel et al., 2017; Nagel, Peters, 2017; Ogonkov et al., 2023). Существует две (не противоречащие друг другу) точки зрения о роли бактериальных гиббереллинов в растительно-микробном взаимодействии. Во-первых, поскольку гиббереллины индуцируют растяжение растительных клеток, высокая концентрация этих фитогомонов приводит к формированию симптомов патологического вытягивания побегов и, как следствие, к их полеганию. Такие симптомы у растений вызывает Acidovorax avenae subsp. avenae (Ogonkov et al., 2023), а также гриб Fusarium fujikoroi (ранее Gibberella fujikoroi), на примере которого гиббереллины были впервые обнаружены и описаны (Kurosawa, 1926; Yabuta et al., 1934). Во-вторых, поскольку гиббереллины являются антагонистами «защитного фитогормона» жасмоновой кислоты, существует точка зрения, что продукция гиббереллинов позволяет бактериям подавлять активацию жасмонат-регулируемых иммунных ответов (Vidhyasekaran, 2015). В пользу этого предположения свидетельствует то, что мутации в генах ферментов биосинтеза гиббереллинов приводили не только к снижению вирулентности Xanthomonas oryzae, но и к повышению уровней экспрессии жасмонат-регулируемых генов у

инфицированных мутантами растений (Lu et al., 2015; Nagel et al., 2017; Nagel, Peters, 2017).

Помимо «ростовых» фитогормонов, некоторые фитопатогенные бактерии синтезируют этилен. Впервые этилен бактериальной природы был обнаружен у фитопатогенной бактерии Ralstonia solanacearum (ранее Pseudomonas solanacearum) (Freebairn, Buddenhagen, 1964). Позднее способность к синтезу этилена была обнаружена у фитопатогенных бактерий родов Xanthomonas и Pseudomonas (Swanson et al., 1979; Fukuda et al., 1993; Weingart, Volksch, 1997). Роль этилена в растительно-микробном взаимодействии неоднозначна. С одной стороны, считается, что этот фитогормон обеспечивает индукцию защитных ответов, подавляющих развитие фитопатогенных микроорганизмов (Thomma et al., 1998; Ellis, Turner, 2001; Ellis et al., 2002; McGrath et al., 2005; Liu, Cheng, 2017). С другой стороны, известно, что этилен служит в качестве фактора восприимчивости растений к ряду фитопатогенов, и активация этилен-регулируемых ответов при растительно-микробных взаимодействиях является необходимым условием для развития патологических процессов (Pegg, Cronshaw, 1976; Goto et al., 1980; Lu et al., 1989; Tsers et al., 2023). Приобретение рядом фитопатогенных бактерий способности синтезировать этилен дополнительно свидетельствует в пользу того, что этот фитогормон вносит существенный вклад в развитие заболеваний или, как минимум, обеспечивает успешную колонизацию микроорганизмами растений-хозяев. На это указывает также то, что у Ralstonia solanacearum синтез этилена корегулируется с продукцией ряда факторов вирулентности (de Pedro-Jove et al., 2021), а у Pseudomonas syringae -способствует подавлению защитных реакций, активируемых «защитным фитогормоном» салициловой кислотой, к которым этот фитопатоген проявляет высокую чувствительность (Weingart, Volksch, 1997; Weingart et al., 2001; Cellini et al., 2021). Таким образом, ряд фитопатогенных бактерий синтезирует различные фитогормоны, которые перестраивают метаболизм растений-хозяев для обеспечения формирования растительно-микробной патосистемы.

Второй группой бактериальных низкомолекулярных экстраклеточных метаболитов, оказывающих влияние на функционирование растительно-микробных патосистем, являются фитотоксины. Само название «фитотоксины» подразумевает, что эти соединения представляют собой своего рода яды, вызывающие гибель растительных клеток. Во многих случаях фитотоксины действительно оказывают летальное влияние на растительные клетки даже в низких концентрациях, но некоторые фитотоксины, не вызывая гибель растительных клеток, проявляют сигнальную, в том числе гормоноподобную, активность. Большинство фитотоксинов описано у фитопатогенных бактерий родов Streptomyces и Pseudomonas (Bender et al., 1999; Bignell et al., 2014).

«Летальные» фитотоксины, синтезируемые бактериями рода Pseudomonas, разделяют на несколько групп в зависимости от механизма их действия. Сирингомицин, сиринготоксин и сирингостатин обладают мембранотропными свойствами, обеспечивая образование пор в мембранах и утечку электролитов (Alattas et al., 2024). Табтоксин, манготоксин и фазеолотоксин подавляют биосинтез орнитина, цитруллина, глутамина, что приводит к накоплению аммония в токсичных для растительных клеток концентрациях (Arrebola et al., 2011; Pfeilmeier et al., 2016). Тагетитоксин ингибирует РНК-полимеразу хлоропластов, что вызывает гибель фотосинтезирующих клеток (Vassylyev et al., 2005).

Фитотоксины, синтезируемые фитопатогенными видами рода Streptomyces (S. scabies и S. acidiscabies), нарушают процессы биосинтеза пуринов и трансляции (хидантоцидин и бластоцидин С) (Duke, Dayan, 2011) и подавляют биосинтез целлюлозы (такстомин А) (Bignell et al., 2014; Clarke et al., 2022). Другие фитотоксины стрептомицетов - боррелидин и конканамицины -способствуют развитию патологических процессов у растений-хозяев, однако механизм действия этих фитотоксинов остается неисследованным (Bignell et al., 2014).

Фитотоксины, не обладающие прямым летальным действием, - сиринголин А и коронатин - описаны у Pseudomonas syringae. Оба эти фитотоксина подавляют салицилат-регулируемые защитные ответы, губительные для псевдомонад, и способствуют поддержанию устьиц в открытом состоянии (Melotto et al., 2006; Melotto et al., 2017). При этом сиринголин А препятствует патоген-индуцируемому закрыванию устьиц (Schellenberg et al., 2010), а коронатин обеспечивает повторное открывание устьиц уже после их патоген-индуцируемого закрывания (re-opening) (Melotto et al., 2006; Mellotto et al., 2017). Механизм действия коронатина достаточно хорошо исследован. Этот фитотоксин является функциональным аналогом жасмонатов (производных жасмоновой кислоты). Коронатин, связываясь с рецепторами жасмонатов, активирует жасмонат-регулируемые ответы, которые в том числе препятствуют индукции реакций, регулируемых салициловой кислотой (Zheng et al., 2012). Таким образом, низкомолекулярные экстраклеточные фитотоксины, синтезируемые фитопатогенными бактериями, оказывают сильное влияние на физиологические процессы растений в составе патосистемы, приводящее либо к гибели растительных клеток, либо к изменению их физиологического состояния.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Парфирова Ольга Игоревна, 2025 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Горшков, В. Ю. Бактериозы растений: молекулярные основы формирования растительно-микробных патосистем / В. Ю. Горшков. — 2017.

2. Дьяков, Ю. Т. Общая и молекулярная фитопатология / Ю. Т. Дьяков, О. Л. Озерецковская, В. Г. Джавахия, С. Ф. Багирова. — 2001.

3. Кузнецова, Д. А. Сидерофоры бактерий: структура, функции и роль в патогенезе инфекций / Д. А. Кузнецова, В. А. Рыкова, О. Н. Подладчикова // Проблемы особо опасных инфекций. — 2022. — N. 3. — С. 14-22.

4. Медведев, С. С. Биология развития растений. В 2-х т. Том 1. Начала биологии развития растений. Фитогормоны / С. С. Медведев, Е. И. Шарова. — Санкт-Петербург: Изд-во Санкт-Петербургского университета, 2011.

5. Полевой, В. В. Физиология растений / В. В. Полевой. — Москва: Высшая школа, 1989.

6. Тарчевский, И. А. Сигнальные системы клеток растений / И. А. Тарчевский. — Наука, 2002.

7. Aalto, M. K. ERD15—an attenuator of plant ABA responses and stomatal aperture / M. K. Aalto, E. Helenius, T. Kariola, V. Pennanen, P. Heino, H. Horak, E. T. Palva // Plant Science. — 2012. — Vol. 182. — P. 19-28.

8. Abdul Malik, N. A. Elicitor and receptor molecules: orchestrators of plant defense and immunity / N. A. Abdul Malik, I. S. Kumar, K. Nadarajah // International Journal of Molecular Sciences. — 2020. — Vol. 21 - N. 3. — P. 963.

9. Achard, M.E. An antioxidant role for catecholate siderophores in Salmonella / M.E. Achard, K.W. Chen, M.J. Sweet, R.E. Watts, K. Schroder, M.A. Schembri, A.G. McEwan // Biochemical Journal. - 2013. - Vol. 454. - N. 3. - P. 543549.

10. Acker, M. Phosphonate production by marine microbes: exploring new sources and potential function / M. Acker, S. L. Hogle, P. M. Berube, T. Hackl, A. Coe, R. Stepanauskas, D. J. Repeta // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2022. — Vol. 119. — N. 11. — P. e2113386119.

11. Adler, C. The alternative role of enterobactin as an oxidative stress protector allows Escherichia coli colony development / C. Adler, N.S. Corbalan, D.R. Peralta, M.F. Pomares, R.E. de Cristóbal, P.A. Vincent // PloS One. — 2014. — Vol. 9.

— N. 1. — P. e84734.

12. Adosraku, R. K. Tetrahymena thermophila: analysis of phospholipids and phosphonolipids by high-field 1H-NMR / R. K. Adosraku, J. D. Smith, A. Nicolaou, W. A. Gibbons // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Lipids and Lipid Metabolism.

— 1996. — Vol. 1299. — N. 2. — P. 167-174.

13. Agarwal, G. Pan-genome-wide analysis of Pantoea ananatis identified genes linked to pathogenicity in onion / G. Agarwal, D. Choudhary, S. P. Stice, B. K. Myers, R. D. Gitaitis, S. N. Venter, B. Dutta // Frontiers in Microbiology. — 2021. — Vol. 12. — P. 684756.

14. Ageichik, A. V. The role of type III secretion system in Erwinia carotovora subsp. atroseptica virulence / A. V. Ageichik, A. N. Evtushenkov, E. A. Nikolaichik // Plant Protection Science. — 2002. — Vol. 38 - N. S2. — P. 523-527.

15. Ahmed, E. Siderophores in environmental research: roles and applications / E. Ahmed, S. J. M. Holmström // Microbial Biotechnology. — 2014. — Vol. 7. - N. 3.

— P. 196-208.

16. Alattas, H. Harnessing Pseudomonas spp. for sustainable plant crop protection / H. Alattas, B. R. Glick, D. V. Murphy, C. Scott // Frontiers in Microbiology. — 2024. — Vol. 15. — P. 1485197.

17. Albarouki, E. Biotrophy-specific downregulation of siderophore biosynthesis in Colletotrichum graminicola is required for modulation of immune responses of maize / E. Albarouki, L. Schafferer, F. Ye, N. von Wirén, H. Haas, H. B. Deising // Molecular Microbiology. — 2014. — Vol. 92. - N. 2. — P. 338-355.

18. Alvarez, A. Activation of shikimate, phenylpropanoid, oxylipins, and auxin pathways in Pectobacterium carotovorum elicitors-treated moss / A. Alvarez, M. Montesano, E. Schmelz, I. Ponce de León // Frontiers in Plant Science. — 2016. — Vol. 7. — P. 328.

19. Andresen, L. The Rcs phosphorelay modulates the expression of plant cell wall degrading enzymes and virulence in Pectobacterium carotovorum ssp. carotovorum / L. Andresen, V. Koiv, T. Alamae, A. Mae // FEMS Microbiology Letters. — 2007. — Vol. 273 - N. 2. — P. 229-238.

20. Arbuzov, A. E. On the structure of phosphonic acid and its derivates: Isometization and transition of bonds from trivalent to pentavalent phosphorus / A. E. Arbuzov // J. Russ. Phys. Chem. Soc. — 1906. — Vol. 38. — P. 687.

21. Arnold, E. Non-classical roles of bacterial siderophores in pathogenesis / E. Arnold // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. — 2024. — Vol. 14. — P. 1465719.

22. Arrebola, E. Chemical and metabolic aspects of antimetabolite toxins produced by Pseudomonas syringae pathovars / E. Arrebola, F. M. Cazorla, A. Perez-Garcia, A. D. Vicente // Toxins. — 2011. — Vol. 3 - N. 9. — P. 1089-1110.

23. Ashby, A. M. Biotrophy and the cytokinin conundrum / A. M. Ashby // Physiological and Molecular Plant Pathology. — 2000. — Vol. 57 - N. 4. — P. 147158.

24. Asif, M. Virulence regulation in plant-pathogenic bacteria by host-secreted signals / M. Asif, X. Xie, Z. Zhao // Microbiological Research. — 2024. — P. 127883.

25. Asselin, J. A. E. Center rot of onion (Allium cepa) caused by Pantoea ananatis requires pepM, a predicted phosphonate-related gene / J. A. E. Asselin, J. M. Bonasera, S. V. Beer // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2018. — Vol. 31. — N. 12. — P. 1291-1300.

26. Aznar, A. New insights into the role of siderophores as triggers of plant immunity: what can we learn from animals? / A. Aznar, A. Dellagi // Journal of Experimental Botany. — 2015. — Vol. 66, N. 11. — P. 3001-3010.

27. Aznar, A. Scavenging iron: a novel mechanism of plant immunity activation by microbial siderophores / A. Aznar, N. W. G. Chen, M. Rigault, N. Riache, D. Joseph, D. Desmaele, G. Mouille, S. Boutet, L. Soubigou-Taconnat, J.-P. Renou, S.

Thomine, D. Expert, A. Dellagi // Plant Physiology. — 2014. — Vol. 164. - N. 4. — P. 2167-2183.

28. Baltenneck, J. Quorum sensing regulation in phytopathogenic bacteria / J. Baltenneck, S. Reverchon, F. Hommais // Microorganisms. — 2021. — Vol. 9 - N. 2. — P. 239.

29. Barber, C. E. A novel regulatory system required for pathogenicity of Xanthomonas campestris is mediated by a small diffusible signal molecule / C. E. Barber, J. L. Tang, J. X. Feng, M. Q. Pan, T. J. G. Wilson, H. Slater, M. J. Daniels // Molecular Microbiology. — 1997. — Vol. 24 - N. 3. — P. 555-566.

30. Bari, R. Role of plant hormones in plant defence responses / R. Bari, J. D. Jones // Plant Molecular Biology. — 2009. — Vol. 69 - N. 4. — P. 473-488.

31. Barnard, A. M. Quorum sensing in Erwinia species / A. M. Barnard, G. P. Salmond // Analytical and Bioanalytical Chemistry. — 2007. — Vol. 387. — P. 415423.

32. Barnes, H. H. Purification of catechol siderophores by boronate affinity chromatography: identification of chrysobactin from Erwinia carotovora subsp. carotovora / H. H. Barnes, C. A. Ishimaru // BioMetals. — 1999. — Vol. 12. — P. 8387.

33. Barras, F. Extracellular enzymes and pathogenesis of soft-rot Erwinia / F. Barras, F. van Gijsegem, A. K. Chatterjee // Annual Review of Phytopathology. — 1994. — Vol. 32 - N. 1. — P. 201-234.

34. Barry, S. M. Recent advances in siderophore biosynthesis / S. M. Barry, G. L. Challis // Current Opinion in Chemical Biology. — 2009. — Vol. 13. - N. 2. — P. 205-215.

35. Basler, A. Type 6 secretion dynamics within and between bacterial cells / A. Basler, J. J. Mekalanos // Science. — 2012. — Vol. 337 - N. 6096. — P. 815.

36. Baumann, H. Structural elucidation of two capsular polysaccharides from one strain of Bacteroides fragilis using high-resolution NMR spectroscopy / H.

Baumann, A. O. Tzianabos, J. R. Brisson, D. L. Kasper, H. J. Jennings // Biochemistry. — 1992. — Vol. 31. — N. 16. — P. 4081-4089.

37. Belisle, R. J. New oomycota fungicides with activity against Phytophthora cinnamomi and their potential use for managing avocado root rot in California / R. J. Belisle, W. Hao, B. McKee, M. L. Arpaia, P. Manosalva, J. E. Adaskaveg // Plant Disease. — 2019. — Vol. 103. — N. 8. — P. 2024-2032.

38. Bell, K. S. Genome sequence of the enterobacterial phytopathogen Erwinia carotovora subsp. atroseptica and characterization of virulence factors / K. S. Bell, M. Sebaihia, L. Pritchard, M. T. G. Holden, L. J. Hyman, M. C. Holeva, N. R. Thomson, S. D. Bentley, L. J. C. Churcher, K. Mungall // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2004. — Vol. 101. — P. 11105-11110.

39. Bellieny-Rabelo, D. Transcriptome and comparative genomics analyses reveal new functional insights on key determinants of pathogenesis and interbacterial competition in Pectobacterium and Dickeya spp. / D. Bellieny-Rabelo, C. K. Tanui, N. Miguel, S. Kwenda, D. Y. Shyntum, L. N. Moleleki // Applied and Environmental Microbiology. — 2019. — Vol. 85 - N. 2. — P. e02050-18.

40. Bellincampi, D. Extracellular H2O2 induced by oligogalacturonides is not involved in the inhibition of the auxin-regulated rolB gene expression in tobacco leaf explants / D. Bellincampi, N. Dipierro, G. Salvi, F. Cervone, G. De Lorenzo // Plant Physiology. — 2000. — Vol. 122. — № 4. — P. 1379-1386.

41. Bender, C. L. Pseudomonas syringae phytotoxins: mode of action, regulation, and biosynthesis by peptide and polyketide synthetases / C. L. Bender, F. Alarcón-Chaidez, D. C. Gross // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 1999. — Vol. 63 - N. 2. — P. 266-292.

42. Benjamin Jr, W. H. The ability of Salmonella typhimurium to produce the siderophore enterobactin is not a virulence factor in mouse typhoid / W.H. Benjamin, C.L. Turnbough, B.S. Posey, D.E. Briles // Infection and Immunity. — 1985. — Vol. 50. - N. 2. — P. 392-397.

43. Benjamini, Y. Controlling the false discovery rate: a practical and powerful approach to multiple testing / Y. Benjamini, Y. Hochberg // Journal of the Royal Statistical Society: Series B (Methodological). — 1995. — Vol. 57. — № 1. — P. 289300.

44. Benjamins, R. Auxin: the looping star in plant development / R. Benjamins, B. Scheres // Annual Review of Plant Biology. — 2008. — Vol. 59. — P. 443-465.

45. Bent, A. F. Elicitors, effectors, and R genes: the new paradigm and a lifetime supply of questions / A. F. Bent, D. Mackey // Annual Review of Phytopathology. — 2007. — Vol. 45 - N. 1. — P. 399-436.

46. Bhatt, G. Ralstonia solanacearum iron scavenging by the siderophore staphyloferrin B is controlled by PhcA, the global virulence regulator / G. Bhatt, T. P. Denny // Journal of Bacteriology. — 2004. — Vol. 186. - N. 23. — P. 7896-7904.

47. Bignell, D. R. D. Phytotoxins produced by plant pathogenic Streptomyces species / D. R. D. Bignell, J. K. Fyans, Z. Cheng // Journal of Applied Microbiology. — 2014. — Vol. 116 - N. 2. — P. 223-235.

48. Black, S. Verification of the chemical convention / S. Black, B. Morel, P. Zapf // Nature. — 1991. — Vol. 351. — N. 6327. — P. 515-516.

49. Blodgett, J. A. Conserved biosynthetic pathways for phosalacine, bialaphos and newly discovered phosphonic acid natural products / J. A. Blodgett, J. K. Zhang, X. Yu, W. W. Metcalf // The Journal of Antibiotics. — 2016. — Vol. 69. — N. 1. — P. 1525.

50. Bobrov, A. G. The Yersinia pestis siderophore, yersiniabactin, and the ZnuABC system both contribute to zinc acquisition and the development of lethal septicaemic plague in mice / A.G. Bobrov, O. Kirillina, J.D. Fetherston, M.C. Miller, J.A. Burlison, R.D. Perry // Molecular Microbiology. — 2014. — Vol. 93. - N. 4. — P. 759-775.

51. Bode, R. Specificity of glyphosate action in Candida maltosa / R. Bode, D. Birnbaum // Biochemie und Physiologie der Pflanzen. — 1989. — Vol. 184. — N. 1-2. — P. 163-170.

52. Bolwell, G. P. The apoplastic oxidative burst in response to biotic stress in plants: a three-component system / G. P. Bolwell, L. V. Bindschedler, K. A. Blee, V. S. Butt, D. R. Davies, S. L. Gardner, S. J. Hammond-Kosack, A. J. Knighton, F. Minibayeva // Journal of Experimental Botany. — 2002. — Vol. 53 - N. 372. — P. 1367-1376.

53. Borisova, S. A. Biosynthesis of rhizocticins, antifungal phosphonate oligopeptides produced by Bacillus subtilis ATCC6633 / S. A. Borisova, B. T. Circello, J. K. Zhang, W. A. van der Donk, W. W. Metcalf // Chemistry & Biology. — 2010. — Vol. 17. — N. 1. — P. 28-37.

54. Bourras, S. Agrobacterium tumefaciens gene transfer: how a plant pathogen hacks the nuclei of plant and nonplant organisms / S. Bourras, T. Rouxel, M. Meyer // Phytopathology. — 2015. — Vol. 105 - N. 10. — P. 1288-1301.

55. Bowden, S. D. Surface swarming motility by Pectobacterium atrosepticum is a latent phenotype that requires O antigen and is regulated by quorum sensing / S. D. Bowden, N. Hale, J. C. Chung, J. T. Hodgkinson, D. R. Spring, M. Welch // Microbiology. — 2013a. — Vol. 159 - N. 11. — P. 2375-2385.

56. Bowden, S. D. Virulence in Pectobacterium atrosepticum is regulated by a coincidence circuit involving quorum sensing and the stress alarmone,(p)ppGpp / S. D. Bowden, A. Eyres, J. C. Chung, R. E. Monson, A. Thompson, G. P. Salmond, M. Welch // Molecular Microbiology. — 20136. — Vol. 90 - N. 3. — P. 457-471.

57. Brader, G. Jasmonate-dependent induction of indole glucosinolates in Arabidopsis by culture filtrates of the nonspecific pathogen Erwinia carotovora / G. Brader, E. Tas, E. T. Palva // Plant Physiology. — 2001. — Vol. 126 - N. 2. — P. 849860.

58. Braud, A. New insights into the metal specificity of the Pseudomonas aeruginosa pyoverdine-iron uptake pathway / I.J. Schalk, G.L. Mislin, K. Brillet // Environmental Microbiology. — 2008. — Vol. 11. - N. 5. — P. 1079-1091.

59. Braud, A. The Pseudomonas aeruginosa pyochelin-iron uptake pathway and its metal specificity / A. Braud, M. Hannauer, G.L.A. Mislin, I.J. Schalk // Journal of Bacteriology. — 2009. — Vol. 191. - N. 11. — P. 3517-3525.

60. Broberg, M. The global response regulator ExpA controls virulence gene expression through RsmA-mediated and RsmA-independent pathways in Pectobacterium wasabiae SCC3193 / M. Broberg, G. W. Lee, J. Nykyri, Y. H. Lee, M. Pirhonen, E. T. Palva // Applied and Environmental Microbiology. — 2014. — Vol. 80 - N. 6. — P. 1972-1984.

61. Buckling, A. Siderophore-mediated cooperation and virulence in Pseudomonas aeruginosa / A. Buckling, F. Harrison, M. Vos, M. A. Brockhurst, A. Gardner, S. A. West, A. Griffin // FEMS Microbiology Ecology. — 2007. — Vol. 62. -N. 2. — P. 135-141.

62. Burr, T. Identification of the central quorum sensing regulator of virulence in the enteric phytopathogen, Erwinia carotovora: the VirR repressor / T. Burr, A. M. Barnard, M. J. Corbett, C. L. Pemberton, N. J. Simpson, G. P. Salmond // Molecular Microbiology. — 2006. — Vol. 59 - N. 1. — P. 113-125.

63. Butler, A. Iron (III)-siderophore coordination chemistry: Reactivity of marine siderophores / A. Butler, R. M. Theisen // Coordination Chemistry Reviews. — 2010. — Vol. 254. - N. 3-4. — P. 288-296.

64. Carroll, C. S. The rhizoferrin biosynthetic gene in the fungal pathogen Rhizopus delemar is a novel member of the NIS gene family / C.S. Carroll, C.L. Grieve, I. Murugathasan, A.J. Bennet, C.M. Czekster, H. Liu, M.M. Moore // The International Journal of Biochemistry & Cell Biology. — 2017. — Vol. 89. — P. 136-146.

65. Case, R. J. AHL-driven quorum-sensing circuits: their frequency and function among the Proteobacteria / R. J. Case, M. Labbate, S. Kjelleberg // The ISME Journal. — 2008. — Vol. 2 - N. 4. — P. 345-349.

66. Cellini, A. A breach in plant defences: Pseudomonas syringae pv. actinidiae targets ethylene signalling to overcome Actinidia chinensis pathogen responses / A. Cellini, I. Donati, B. Farneti, I. Khomenko, G. Buriani, F. Biasioli, F.

Spinelli // International Journal of Molecular Sciences. — 2021. — Vol. 22 - N. 9. — P. 4375.

67. Chalupowicz, L. Comparative anatomy of gall development on Gypsophila paniculata induced by bacteria with different mechanisms of pathogenicity / L. Chalupowicz, I. Barash, M. Schwartz, R. Aloni, S. Manulis // Planta. — 2006. — Vol. 224 - N. 2. — P. 429-437.

68. Charkowski, A. O. The changing face of bacterial soft-rot diseases / A. O. Charkowski // Annual Review of Phytopathology. — 2018. — Vol. 56 - N. 1. — P. 269-288.

69. Charkowski, A. The role of secretion systems and small molecules in softrot Enterobacteriaceae pathogenicity / A. Charkowski, C. Blanco, G. Condemine, D. Expert, T. Franza, C. Hayes, N. Hugouvieux-Cotte-Pattat, E. López Solanilla, D. Low, L. Moleleki, M. Pirhonen, A. Pitman, N. Perna, S. Reverchon, P.R. Palenzuela, M.S. Francisco, I. Toth, S. Tsuyumu, J. van der Waals, J. van der Wolf, F.V. Gijsegem, C. Yang, I. Yedidia // Annual Review of Phytopathology. — 2012. — Vol. 50. — P. 425-449.

70. Charkowski, A. The soft rot Erwinia / A. Charkowski // Plant-associated bacteria. — 2006. — P. 423-505.

71. Chatterjee, A. Inactivation of rsmA leads to overproduction of extracellular pectinases, cellulases, and proteases in Erwinia carotovora subsp. carotovora in the absence of the starvation/cell density-sensing signal, N-(3-oxohexanoyl)-L-homoserine lactone / A. Chatterjee, Y. Cui, Y. Liu, C. K. Dumenyo, A. K. Chatterjee // Applied and Environmental Microbiology. — 1995. — Vol. 61 - N. 5. — P. 1959-1967.

72. Chatterjee, S. A cell-cell signaling sensor is required for virulence and insect transmission of Xylella fastidiosa / S. Chatterjee, C. Wistrom, S. E. Lindow // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2008. — Vol. 105 - N. 7. — P. 2670-2675.

73. Chin, J. P. Microbial transformations in phosphonate biosynthesis and catabolism, and their importance in nutrient cycling / J. P. Chin, J. W. McGrath, J. P. Quinn // Current Opinion in Chemical Biology. — 2016. — Vol. 31. — P. 50-57.

74. Chin, J. P. Phosphate insensitive aminophosphonate mineralisation within oceanic nutrient cycles / J. P. Chin, J. P. Quinn, J. W. McGrath // The ISME Journal. — 2018. — Vol. 12. — N. 4. — P. 973-980.

75. Cioni, J. P. Cyanohydrin phosphonate natural product from Streptomyces regensis / J. P. Cioni, J. R. Doroghazi, K. S. Ju, X. Yu, B. S. Evans, J. Lee, W. W. Metcalf // Journal of Natural Products. — 2014. — Vol. 77. — N. 2. — P. 243-249.

76. Clarke, C. R. The phytotoxin thaxtomin A is the primary virulence determinant for scab disease of beet, carrot, and radish caused by Streptomyces scabiei / C. R. Clarke, C. G. Kramer, R. R. Kotha, D. L. Luthria // Phytopathology. — 2022. — Vol. 112 - N. 11. — P. 2288-2295.

77. Cody, Y. S. Outer membrane protein mediating iron uptake via pyoverdinpss, the fluorescent siderophore produced by Pseudomonas syringae pv. syringae / Y. S. Cody, D. C. Gross // Journal of Bacteriology. — 1987. — Vol. 169. -N. 5. — P. 2207-2214.

78. Cook, A. M. Phosphonate utilization by bacteria / A. M. Cook, C. G. Daughton, M. Alexander // Journal of Bacteriology. — 1978. — Vol. 133. — N. 1. — P. 85-90.

79. Cooley, N. A. Phosphonoacetate biosynthesis: in vitro detection of a novel NADP±dependent phosphonoacetaldehyde-oxidizing activity in cell-extracts of a marine Roseobacter / N. A. Cooley, A. N. Kulakova, J. F. Villarreal-Chiu, J. A. Gilbert, J. W. McGrath, J. P. Quinn // Microbiology. — 2011. — Vol. 80. — P. 335-340.

80. Corbett, M. Identification of a new quorum-sensing-controlled virulence factor in Erwinia carotovora subsp. atroseptica secreted via the type II targeting pathway / M. Corbett, S. Virtue, K. Bell, P. Birch, T. Burr, L. Hyman, M. J. Corbett, C. L. Pemberton, N. J. Simpson, G. P. Salmond // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2005. — Vol. 18 - N. 4. — P. 334-342.

81. Cosgrove, D. J. Enzymes and other agents that enhance cell wall extensibility / D. J. Cosgrove // Annual Review of Plant Biology. — 1999. — Vol. 50 -N. 1. — P. 391-417.

82. Coulthurst, S. J. DsbA plays a critical and multifaceted role in the production of secreted virulence factors by the phytopathogen Erwinia carotovora subsp. atroseptica / S. J. Coulthurst, K. S. Lilley, P. E. Hedley, H. Liu, I. K. Toth, G. P. Salmond // Journal of Biological Chemistry. — 2008. — Vol. 283 - N. 35. — P. 2373923753.

83. Coulthurst, S. J. Genetic and proteomic analysis of the role of luxS in the enteric phytopathogen, Erwinia carotovora / S. J. Coulthurst, K. S. Lilley, G. P. Salmond // Molecular Plant Pathology. — 2006. — Vol. 7 - N. 1. — P. 31-45.

84. Coyne, M. J. Bacteroides fragilis NCTC9343 produces at least three distinct capsular polysaccharides: cloning, characterization, and reassignment of polysaccharide B and C biosynthesis loci / M. J. Coyne, W. Kalka-Moll, A. O. Tzianabos, D. L. Kasper, L. E. Comstock // Infection and Immunity. — 2000. — Vol. 68. — N. 11. — P. 6176-6181.

85. Crepin, A. Quorum sensing signaling molecules produced by reference and emerging soft-rot bacteria (Dickeya and Pectobacterium sp.) / A. Crepin, C. Barbey, A. Beury-Cirou, V. Helias, L. Taupin, S. Reverchon, W. Nasser, D. Faure, A. Dufour, N. Orange, M. Feuilloley, K. Heurlier, J. Burini, X. Latour // PLoS One. — 2012. — Vol. 7 - N. 4. — P. e35176.

86. Crosa, J. H. Genetics and assembly line enzymology of siderophore biosynthesis in bacteria / J. H. Crosa, C. T. Walsh // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 2002. — Vol. 66. - N. 2. — P. 223-249.

87. Crowley, D. E. Microbial siderophores in the plant rhizosphere / D. E. Crowley // Iron Nutrition in Plants and Rhizospheric Microorganisms. — Dordrecht: Springer Netherlands, 2006. — P. 169-198.

88. Cui, Y. Effects of the two-component system comprising GacA and GacS of Erwinia carotovora subsp. carotovora on the production of global regulatory rsmB

RNA, extracellular enzymes, and harpinEcc / Y. Cui, A. Chatterjee, A. K. Chatterjee // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2001. — Vol. 14 - N. 4. — P. 516-526.

89. Cui, Y. Identification of a global repressor gene, rsmA, of Erwinia carotovora subsp. carotovora that controls extracellular enzymes, N-(3-oxohexanoyl)-L-homoserine lactone, and pathogenicity in soft-rotting Erwinia spp. / Y. Cui, A. Chatterjee, Y. Liu, C. K. Dumenyo, A. K. Chatterjee // Journal of Bacteriology. — 1995. — Vol. 177 - N. 17. — P. 5108-5115.

90. Cui, Y. rsmC of the soft-rotting bacterium Erwinia carotovora subsp. carotovora negatively controls extracellular enzyme and harpinEcc production and virulence by modulating levels of regulatory RNA (rsmB) and RNA-binding protein (RsmA) / Y. Cui, A. Mukherjee, C. K. Dumenyo, Y. Liu, A. K. Chatterjee // Journal of Bacteriology. — 1999. — Vol. 181 - N. 19. — P. 6042-6052.

91. Cundliffe, E. Avoidance of suicide in antibiotic-producing microbes / E. Cundliffe, A. L. Demain // Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. — 2010. — Vol. 37. — N. 7. — P. 643-672.

92. Czajkowski, R. Control of blackleg and tuber soft rot of potato caused by Pectobacterium and Dickeya species: a review / R. Czajkowski, M. C. Perombelon, J. A. van Veen, J. M. van der Wolf // Plant Pathology. — 2011. — Vol. 60 - N. 6. — P. 999-1013.

93. Czajkowski, R. Detection, identification and differentiation of Pectobacterium and Dickeya species causing potato blackleg and tuber soft rot: a review / R. Czajkowski, M. C. M. Perombelon, S. Jafra, E. Lojkowska, M. Potrykus, J. M. Van Der Wolf, W. Sledz // Annals of Applied Biology. — 2015. — Vol. 166 - N. 1. — P. 18-38.

94. Dankevych, L. The synthesis of plant growth stimulators by phytopathogenic bacteria as factor of pathogenicity / L. Dankevych, N. Leonova, I. Dragovoz, V. Patyka, A. Kalinichenko, P. P. Wlodarczyk, B. J. Wlodarczyk // Applied Ecology and Environmental Research. — 2018. — Vol. 16 - N. 2.

95. Datsenko, K.A. One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products / K.A. Datsenko, B.L. Wanner // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. — 2000. — Vol. 97. — P. 6640-6645.

96. Dave, B. P. Detection and chemical characterisation of siderophores of rhizobacterial fluorescent Pseudomonas / B. P. Dave, H. C. Dube. — 2000.

97. Davidsson, P. R. Pathogenicity of and plant immunity to soft rot pectobacteria / P. R. Davidsson, T. Kariola, O. Niemi, E. T. Palva // Frontiers in Plant Science. — 2013. — Vol. 4. — P. 191.

98. de Lederkremer, R. M. Complete structure of the glycan of lipopeptidophosphoglycan from Trypanosoma cruzi Epimastigotes / R. M. de Lederkremer, C. Lima, M. I. Ramirez, M. A. Ferguson, S. W. Homans, J. Thomas-Oates // Journal of Biological Chemistry. — 1991. — Vol. 266. — N. 35. — P. 2367023675.

99. de Pedro-Jove, R. Dynamic expression of Ralstonia solanacearum virulence factors and metabolism-controlling genes during plant infection / R. de Pedro-Jove, M. Puigvert, P. Sebastia, A. P. Macho, J. S. Monteiro, N. S. Coll, M. Valls // BMC Genomics. — 2021. — Vol. 22. — P. 1-18.

100. de Souza, L. M. Glyco-and sphingophosphonolipids from the medusa Phyllorhiza punctata: NMR and ESI-MS/MS fingerprints / L. M. de Souza, M. Iacomini, P. A. Gorin, R. S. Sari, M. A. Haddad, G. L. Sassaki // Chemistry and Physics of Lipids. — 2007. — Vol. 145. — N. 2. — P. 85-96.

101. Deb, C. R. Siderophore producing bacteria as biocontrol agent against phytopathogens for a better environment: A review / C. R. Deb, M. Tatung // South African Journal of Botany. — 2024. — Vol. 165. — P. 153-162.

102. del Carmen Orozco-Mosqueda, M. Bacterial elicitors of the plant immune system: An overview and the way forward / M. del Carmen Orozco-Mosqueda, A. E. Fadiji, O. O. Babalola, G. Santoyo // Plant Stress. — 2023. — Vol. 7. — P. 100138.

103. Dellagi, A. Dual role of desferrioxamine in Erwinia amylovora pathogenicity / A. Dellagi, M. N. Brisset, J. P. Paulin, D. Expert // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 1998. — Vol. 11. - N. 8. — P. 734-742.

104. Dellagi, A. Microbial siderophores exert a subtle role in Arabidopsis during infection by manipulating the immune response and the iron status / A. Dellagi, D. Segond, M. Rigault, M. Fagard, C. Simon, P. Saindrenan, D. Expert // Plant Physiology.

— 2009. - Vol. 150. - N. 4. - P. 1687-1696.

105. Dellagi, A. Siderophore-mediated upregulation of Arabidopsis ferritin expression in response to Erwinia chrysanthemi infection / A. Dellagi, M. Rigault, D. Segond, C. Roux, Y. Kraepiel, F. Cellier, J.F. Briat, F. Gaymard, D. Expert // The Plant Journal. - 2005. - Vol. 43. - N. 2. - P. 262-272.

106. Demadis, K. D. Green phosphonate chemistry—Does it exist? / K. D. Demadis, S. K. Adla, J. Timonen, P. A. Turhanen // Green Chemistry. — 2025. — Vol. 27. — № 4. — P. 863-914.

107. Dertz, E. A. Bacillibactin-mediated iron transport in bacillus subtilis / E. A. Dertz, J. Xu, A. Stintzi, K. N. Raymond // Journal of the American Chemical Society.

— 2006. — Vol. 128. - N. 1. — P. 22-23.

108. Deryabin, D. Plant-derived inhibitors of AHL-mediated quorum sensing in bacteria: Modes of action / D. Deryabin, A. Galadzhieva, D. Kosyan, G. Duskaev // International Journal of Molecular Sciences. — 2019. — Vol. 20 - N. 22. — P. 5588.

109. Ding, X. Activation of the indole-3-acetic acid — amido synthetase GH3-8 suppresses expansin expression and promotes salicylate-and jasmonate-independent basal immunity in rice / X. Ding, Y. Cao, L. Huang, J. Zhao, C. Xu, X. Li, S. Wang // The Plant Cell. — 2008. — Vol. 20 - N. 1. — P. 228-240.

110. Dixon, R. A. Genetic manipulation of lignin and phenylpropanoid compounds involved in interactions with microorganisms / R. A. Dixon, C. A. Maxwell, W. Ni, A. Oommen, N. L. Paiva // Genetic engineering of plant secondary metabolism.

— 1994. — P. 153-178.

111. Du, Q. The role of HD-ZIP III transcription factors and miR165/166 in vascular development and secondary cell wall formation / Q. Du, H. Wang // Plant Signaling & Behavior. — 2015. — Vol. 10 - N. 10. — P. e1078955.

112. Duke, S. O. Modes of action of microbially-produced Phytotoxins / S. O. Duke, F. E. Dayan // Toxins. — 2011. — Vol. 3 - N. 8. — P. 1038-1064.

113. Duke, S. O. Overview of herbicide mechanisms of action / S. O. Duke // Environmental Health Perspectives. — 1990. — Vol. 87. — P. 263-271.

114. Dyhrman, S. T. A microbial source of phosphonates in oligotrophic marine systems / S. T. Dyhrman, C. R. Benitez-Nelson, E. D. Orchard, S. T. Haley, P. J. Pellechia // Nature Geoscience. — 2009. — Vol. 2. — N. 10. — P. 696-699.

115. Dyhrman, S. T. Phosphonate utilization by the globally important marine diazotroph Trichodesmium / S. T. Dyhrman, P. D. Chappell, S. T. Haley, J. W. Moffett, E. D. Orchard, J. B. Waterbury, E. A. Webb // Nature. — 2006. — Vol. 439. — N. 7072. — P. 68-71.

116. Ehlert, G. Serratiochelin, a new catecholate siderophore from Serratia marcescens / G. Ehlert, K. Taraz, H. Budzikiewicz // Zeitschrift Für Naturforschung C. — 1994. — Vol. 49. - N. 1-2. — P. 11-17.

117. Ellermann, M. Siderophore-mediated iron acquisition and modulation of host-bacterial interactions / M. Ellermann, J. C. Arthur // Free Radical Biology and Medicine. — 2017. — Vol. 105. — P. 68-78.

118. Ellis, C. The Arabidopsis mutant cevl has constitutively active jasmonate and ethylene signal pathways and enhanced resistance to pathogens / C. Ellis, J. G. Turner // The Plant Cell. — 2001. — Vol. 13 - N. 5. — P. 1025-1033.

119. Ellis, C. The Arabidopsis mutant cevl links cell wall signaling to jasmonate and ethylene responses / C. Ellis, I. Karafyllidis, C. Wasternack, J. G. Turner // The Plant Cell Online. — 2002. — Vol. 14 - N. 7. — P. 1557-1566.

120. Enard, C. Systemic virulence of Erwinia chrysanthemi 3937 requires a functional iron assimilation system / C. Enard, A. Diolez, D. Expert // Journal of Bacteriology. — 1988. — Vol. 170. - N. 6. — P. 2419-2426.

121. Eriksson, A. R. Two-component regulators involved in the global control of virulence in Erwinia carotovora subsp. carotovora / A. R. Eriksson, R. A. Andersson, M. Pirhonen, E. T. Palva // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 1998. — Vol. 11 - N. 8. — P. 743-752.

122. Evans, B. S. Discovery of the antibiotic phosacetamycin via a new mass spectrometry-based method for phosphonic acid detection / B. S. Evans, C. Zhao, J. Gao, C. M. Evans, K.-S. Ju, J. R. Doroghazi, W. A. Van Der Donk, N. L. Kelleher, W. W. Metcalf // ACS Chem. Biol. — 2013. — Vol. 8. — P. 908-913.

123. Falagas, M. E. Fosfomycin / M. E. Falagas, E. K. Vouloumanou, G. Samonis, K. Z. Vardakas // Clinical Microbiology Reviews. — 2016. — Vol. 29. — N. 2. — P. 321-347.

124. Ferreira, R. Zirconium organophosphonates as photoactive and hydrophobic host materials for sensitized luminescence of Eu(III), Tb(III), Sm(III) and Dy(III) / R. Ferreira, P. Pires, B. de Castro, R. A. S. Ferreira, L. D. Carlos, U. Pischel // New Journal of Chemistry. — 2004. — Vol. 28. — № 12. — P. 1506-1513.

125. Fiedler, H. P. Enterobactin: the characteristic catecholate siderophore of Enterobacteriaceae is produced by Streptomyces species / H. P. Fiedler, P. Krastel, J. Müller, K. Gebhardt, A. Zeeck // FEMS Microbiology Letters. — 2001. — Vol. 196. — № 2. — P. 147-151.

126. Figaj, D. The role of proteases in the virulence of plant pathogenic bacteria / D. Figaj, P. Ambroziak, T. Przepiora, J. Skorko-Glonek // International Journal of Molecular Sciences. — 2019. — Vol. 20 - N. 3. — P. 672.

127. Fontana, J. D. Occurrence of ß-D-galactopyranosyl units esterified at O-6 with 2-aminoethylphosphonic acid in the D-galactan of albumen glands of the snail Megalobulimus paranaguensis / J. D. Fontana, J. H. Duarte, C. B. Gallo, M. Iacomini, P. A. Gorin // Carbohydrate Research. — 1985. — Vol. 143. — P. 175-183.

128. Fox, E. M. Phosphonate degradation in microorganisms / E. M. Fox, G. L. Mendz // Enzyme and Microbial Technology. — 2006. — Vol. 40. — N. 1. — P. 145150.

129. Franza, T. Erwinia chrysanthemi requires a second iron transport route dependent of the siderophore achromobactin for extracellular growth and plant infection / T. Franza, B. Mahe, D. Expert // Molecular Microbiology. — 2005. — Vol. 55. - N. 1.

— P. 261-275.

130. Franza, T. Role of iron homeostasis in the virulence of phytopathogenic bacteria: an 'a la carte' menu / T. Franza, D. Expert // Molecular Plant Pathology. — 2013. — Vol. 14. — № 4. — P. 429-438.

131. Freebairn, H. T. Ethylene production by Pseudomonas solanacearum / H. T. Freebairn, I. W. Buddenhagen // Nature. — 1964. — Vol. 202 - N. 4929. — P. 313314.

132. Fukuda, H. Ethylene production by microorganisms / H. Fukuda, T. Ogawa, S. Tanase // Advances in Microbial Physiology. — 1993. — Vol. 35. — P. 275306.

133. Gahungu, M. Synthesis and biological evaluation of potential threonine synthase inhibitors: Rhizocticin A and Plumbemycin A / M. Gahungu, A. Arguelles-Arias, P. Fickers, A. Zervosen, B. Joris, C. Damblon, A. Luxen // Bioorganic & Medicinal Chemistry. — 2013. — Vol. 21. — N. 17. — P. 4958-4967.

134. Gao, J. Use of a phosphonate methyltransferase in the identification of the fosfazinomycin biosynthetic gene cluster / J. Gao, K. S. Ju, X. Yu, J. E. Velasquez, S. Mukherjee, J. Lee, W. A. Van Der Donk // Angewandte Chemie. — 2014. — Vol. 126.

— № 5. — P. 1358-1361.

135. Garcia, P. Product offosC, a gene from Pseudomonas syringae, mediates fosfomycin resistance by using ATP as cosubstrate / P. Garcia, P. Arca, J. Evaristo Suarez // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. — 1995. — Vol. 39. — N. 7. — P. 1569-1573.

136. Gehring, A. M. Enterobactin biosynthesis in Escherichia coli: isochorismate lyase (EntB) is a bifunctional enzyme that is phosphopantetheinylated by EntD and then acylated by EntE using ATP and 2, 3-dihydroxybenzoate / A. M.

Gehring, K. A. Bradley, C. T. Walsh // Biochemistry. — 1997. — Vol. 36. - N. 28. — P. 8495-8503.

137. Gehring, A. M. Iron acquisition in plague: modular logic in enzymatic biogenesis of yersiniabactin by Yersinia pestis / A. M. Gehring, E. DeMoll, J. D. Fetherston, I. Mori, G. F. Mayhew, F. R. Blattner, R. D. Perry // Chemistry & Biology.

— 1998. — Vol. 5. - N. 10. — P. 573-586.

138. Ger, M. J. Ectopically expressed sweet pepper ferredoxin PFLP enhances disease resistance to Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum affected by harpin and protease-mediated hypersensitive response in Arabidopsis / M. J. Ger, G. Y. Louh, Y. H. Lin, T. Y. Feng, H. E. Huang // Molecular Plant Pathology. — 2014. — Vol. 15 - N. 9. — P. 892-906.

139. Ghosh, S. K. Microbial siderophore—A boon to agricultural sciences / S. K. Ghosh, T. Bera, A. M. Chakrabarty // Biological Control. — 2020. — Vol. 144. — P.104214.

140. Glazebrook, J. Contrasting mechanisms of defense against biotrophic and necrotrophic pathogens / J. Glazebrook // Annual Review of Phytopathology. — 2005.

— Vol. 43 - N. 1. — P. 205-227.

141. Glazener, J. A. Phytotoxicity of phaseollin to, and alteration of phaseollin by, cell suspension cultures of Phaseolus vulgaris / J. A. Glazener, H. D. Van Etten // Phytopathology. — 1978. — Vol. 68 - N. 111. — P. 10-1094.

142. Glick, B. R. Plant growth-promoting bacteria: mechanisms and applications / B. R. Glick // Scientifica. — 2012. — Vol. 2012 - N. 1. — P. 963401.

143. Glowacka, I. E. Acyclic nucleoside phosphonates containing the amide bond / I. E. Glowacka, D. G. Piotrowska, G. Andrei, D. Schols, R. Snoeck, A. E. Wr^blewski // Monatshefte für Chemie-Chemical Monthly. — 2016. — Vol. 147. — P. 2163-2177.

144. Godinot, C. On the use of 31P NMR for the quantification of hydrosoluble phosphorus-containing compounds in coral host tissues and cultured zooxanthellae / C.

Godinot, M. Gaysinski, O. P. Thomas, C. Ferrier-Pages, R. Grover // Scientific Reports.

— 2016. — Vol. 6. — № 1. — P. 21760.

145. Gorshkov, V. Dissociation of a population of Pectobacterium atrosepticum SCRI1043 in tobacco plants: formation of bacterial emboli and dormant cells / V. Gorshkov, A. Daminova, M. Ageeva, O. Petrova, N. Gogoleva, N. Tarasova, Y. Gogolev // Protoplasma. — 2014. — Vol. 251. — P. 499-510.

146. Gorshkov, V. Host plant physiological transformation and microbial population heterogeneity as important determinants of the Soft Rot Pectobacteriaceae-plant interactions / V. Gorshkov, O. Parfirova // Seminars in Cell & Developmental Biology. — 2023. — Vol. 148. — P. 33-41.

147. Gorshkov, V. Pectobacterium atrosepticum exopolysaccharides: identification, molecular structure, formation under stress and in planta conditions / V. Gorshkov, B. Islamov, P. Mikshina, O. Petrova, G. Burygin, E. Sigida, Y. Gogolev // Glycobiology. — 2017. — Vol. 27 - N. 11. — P. 1016-1026.

148. Gorshkov, V. Plant susceptible responses: the underestimated side of plant-pathogen interactions / V. Gorshkov, I. Tsers // Biological Reviews. — 2022. — Vol. 97. - N. 1. — P. 45-66.

149. Gorshkov, V. The Modification of plant cell wall polysaccharides in potato plants during Pectobacterium atrosepticum-caused infection / V. Gorshkov, I. Tsers, B. Islamov, M. Ageeva, N. Gogoleva, P. Mikshina, O. Parfirova, O. Gogoleva, Y. Gogolev // Plants. — 2021. — Vol. 10 - N. 7. — P. 1407.

150. Gorshkov, V. Transcriptome profiling helps to identify potential and true molecular switches of stealth to brute force behavior in Pectobacterium atrosepticum during systemic colonization of tobacco plants / V. Gorshkov, R. Gubaev, O. Petrova, A. Daminova, M. Gogoleva, M. Ageeva, O. Parfirova, M. Prokchorchik, Y. Nikolaichik, Y. Gogolev // European Journal of Plant Pathology. — 2018. — Vol. 152.

— P. 957-976.

151. Gorshkov, V. Y. Differential modulation of the lipoxygenase cascade during typical and latent Pectobacterium atrosepticum infections / V. Y. Gorshkov, Y.

Y. Toporkova, I. D. Tsers, E. O. Smirnova, A. V. Ogorodnikova, N. E. Gogoleva, O. I. Parfirova, O. E. Petrova, Y. V. Gogolev // Annals of Botany. — 2022. — Vol. 129 - N. 3. — P. 271-286.

152. Gorshkov, V. Y. Pathogen-induced conditioning of the primary xylem vessels—a prerequisite for the formation of bacterial emboli by Pectobacterium atrosepticum / V. Y. Gorshkov, A. G. Daminova, P. V. Mikshina, O. E. Petrova, M. V. Ageeva, V. V. Salnikov, Y. V. Gogolev // Plant Biology. — 2016. — Vol. 18 - N. 4. — P. 609-617.

153. Goto, M. Ethylene production in citrus leaves infected with Xanthomonas citri and its relation to defoliation / M. Goto, Y. Yaguchi, H. Hyodo // Physiological Plant Pathology. — 1980. — Vol. 16 - N. 3. — P. 343-350.

154. Grinter, N. J. A broad-host-range cloning vector transposable to various replicons / N. J. Grinter // Gene. — 1983. — Vol. 21. — P. 133-143.

155. Gu, S. Competition for iron drives phytopathogen control by natural rhizosphere microbiomes / S. Gu, Z. Wei, Z. Shao, V. P. Friman, K. Cao, T. Yang, A. Jousset // Nature Microbiology. — 2020. — Vol. 5. - N. 8. — P. 1002-1010.

156. Guttman, Y. Ecological adaptations influence the susceptibility of plants in the genus Zantedeschia to soft rot Pectobacterium spp. / Y. Guttman, J. R. Joshi, N. Chriker, N. Khadka, M. Kleiman, N. Reznik, I. Yedidia // Horticulture Research. — 2021. — Vol. 8.

157. Hammer, 0. PAST: paleontological statistics software package for education and data analysis / 0. Hammer, D. A. Harper // Palaeontologia Electronica. — 2001. — Vol. 4. — № 1. — P. 1.

158. Haque, M. M. CytR homolog of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum controls air-liquid biofilm formation by regulating multiple genes involved in cellulose production, c-di-GMP signaling, motility, and type III secretion system in response to nutritional and environmental signals / M. M. Haque, M. M. H. Oliver, K. Nahar, M. Z. Alam, H. Hirata, S. Tsuyumu // Frontiers in Microbiology. — 2017. — Vol. 8. — P. 972.

159. Haselwandter, K. Isolation and identification of hydroxamate siderophores of ericoid mycorrhizal fungi / K. Haselwandter, B. Dobernigg, W. Beck, G. Jung, A. Cansier, G. Winkelmann // Biometals. — 1992. — Vol. 5. — P. 51-56.

160. Hassan, S. PelN is a new pectate lyase of Dickeya dadantii with unusual characteristics / S. Hassan, V. E. Shevchik, X. Robert, N. Hugouvieux-Cotte-Pattat // Journal of Bacteriology. — 2013. — Vol. 195. - N. 10. — P. 2197-2206.

161. Hayward, A. C. Latent infections by bacteria / A. C. Hayward // Annual Review of Phytopathology. — 1974. — Vol. 12 - N. 1. — P. 87-97.

162. He, Y. W. Genome scale analysis of diffusible signal factor regulon in Xanthomonas campestris pv. campestris: identification of novel cell — cell communication-dependent genes and functions / Y. W. He, M. Xu, K. Lin, Y. J. A. Ng, C. M. Wen, L. H. Wang, L. H. Zhang // Molecular Microbiology. — 2006. — Vol. 59 -N. 2. — P. 610-622.

163. Heeb, S. Regulatory roles of the GacS/GacA two-component system in plant-associated and other gram-negative bacteria / S. Heeb, D. Haas // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2001. — Vol. 14 - N. 12. — P. 1351-1363.

164. Helias. Internal colonization pathways of potato plants by Erwinia carotovora ssp. atroseptica / Helias, Andrivon, Jouan // Plant Pathology. — 2000. — Vol. 49 - N. 1. — P. 33-42.

165. Henderson, D. P. Vibrio cholerae iron transport systems: roles of heme and siderophore iron transport in virulence and identification of a gene associated with multiple iron transport systems / D. P. Henderson, S. M. Payne // Infection and Immunity. — 1994. — Vol. 62. - N. 11. — P. 5120-5125.

166. Henry, E. Recognition of bacterial plant pathogens: local, systemic and transgenerational immunity / E. Henry, K. A. Yadeta, G. Coaker // New Phytologist. — 2013. — Vol. 199 - N. 4. — P. 908-915.

167. Herrero, M. Transposon vectors containing non-antibiotic resistance selection markers for cloning and stable chromosomal insertion of foreign genes in

Gram-negative bacteria / M. Herrero, V. De Lorenzo, K. N. Timmis // J. Bacteriol. — 1990. — Vol. 172. — P. 6557-6567.

168. Hider, R. C. Chemistry and biology of siderophores / R. C. Hider, X. Kong // Natural Product Reports. — 2010. — Vol. 27. - N. 5. — P. 637-657.

169. Hikichi, Y. Regulation involved in colonization of intercellular spaces of host plants in Ralstonia solanacearum / Y. Hikichi, Y. Mori, S. Ishikawa, K. Hayashi, K. Ohnishi, A. Kiba, K. Kai // Frontiers in Plant Science. — 2017. — Vol. 8. — P. 967.

170. Hilderbrand, R. L. Phosphonic acids in nature / R. L. Hilderbrand, T. O. Henderson // The Role of Phosphonates in Living Systems. — 2018. — P. 5-29.

171. Hirayama, N. Structure and conformation of a novel inhibitor of angiotensin I converting enzyme—a tripeptide containing phosphonic acid / N. Hirayama, M. Kasai, K. Shirahata // International Journal of Peptide and Protein Research. — 1991. — Vol. 38. — № 1. — P. 20-24.

172. Ho, B. T. Vibrio cholerae type 6 secretion system effector trafficking in target bacterial cells / B. T. Ho, Y. Fu, T. G. Dong, J. J. Mekalanos // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2017. — Vol. 114 - N. 35. — P. 9427-9432.

173. Hoagland, R. E. Microbial allelochemicals and pathogens as bioherbicidal agents / R. E. Hoagland // Weed Technology. — 2001. — Vol. 15. — N. 4. — P. 835857.

174. Holeva, M. C. Use of a pooled transposon mutation grid to demonstrate roles in disease development for Erwinia carotovora subsp. atroseptica putative type III secreted effector (DspE/A) and helper (HrpN) proteins / M. C. Holeva, K. S. Bell, L. J. Hyman, A. O. Avrova, S. C. Whisson, P. R. Birch, I. K. Toth // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2004. — Vol. 17 - N. 9. — P. 943-950.

175. Horiguchi, M. Isolation of 2-aminoethane phosphonic acid from rumen protozoa / M. Horiguchi, M. Kandatstu // Nature. — 1959. — Vol. 184. — N. 4690. — P. 901-902.

176. Horsman, G. P. Phosphonate biochemistry / G. P. Horsman, D. L. Zechel // Chemical Reviews. — 2017. — Vol. 117. — N. 8. — P. 5704-5783.

177. Hove-Jensen, B. Utilization of glyphosate as phosphate source: biochemistry and genetics of bacterial carbon-phosphorus lyase / B. Hove-Jensen, D. L. Zechel, B. Jochimsen // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 2014. — Vol. 78. — N. 1. — P. 176-197.

178. Hu, D. Genome guided investigation of antibiotics producing actinomycetales strain isolated from a Macau mangrove ecosystem / D. Hu, Y. Chen, C. Sun, T. Jin, G. Fan, Q. Liao, M. Y. S. Lee // Scientific Reports. — 2018. — Vol. 8. — N. 1. — P. 14271.

179. Hu, Q. P. A simple double-layered chrome azurol S agar (SD-CASA) plate assay to optimize the production of siderophores by a potential biocontrol agent Bacillus / Q. P. Hu, J. G. Xu // African Journal of Microbiology Research. — 2011. — Vol. 5. - N. 25. — P. 4321-4327.

180. Huang, J. The evolution of microbial phosphonate degradative pathways / J. Huang, Z. Su, Y. Xu // Journal of Molecular Evolution. — 2005. — Vol. 61. — P. 682-690.

181. Iacobellis, N. S. Pathogenicity of Pseudomonas syringae subsp. savastanoi mutants defective in phytohormone production / N. S. Iacobellis, A. Sisto, G. Surico, A. Evidente, E. DiMaio // Journal of Phytopathology. — 1994. — Vol. 140 - N. 3. — P. 238-248.

182. Imbs, A. B. Coral lipids / A. B. Imbs, V. M. Dembitsky // Marine Drugs.

— 2023. — Vol. 21. — N. 10. — P. 539.

183. Ionescu, M. Diffusible signal factor (DSF) synthase RpfF of Xylella fastidiosa is a multifunction protein also required for response to DSF / M. Ionescu, C. Baccari, A. M. Da Silva, A. Garcia, K. Yokota, S. E. Lindow // Journal of Bacteriology.

— 2013. — Vol. 195 - N. 23. — P. 5273-5284.

184. Ishimaru, C. A. High-affinity iron uptake systems present in Erwinia carotovora subsp. carotovora include the hydroxamate siderophore aerobactin / C. A. Ishimaru, J. E. Loper // Journal of Bacteriology. — 1992. — Vol. 174. - N. 9. — P. 2993-3003.

185. Islamov, B. The role of Pectobacterium atrosepticum exopolysaccharides in plant-pathogen interactions / B. Islamov, O. Petrova, P. Mikshina, A. Kadyirov, V. Vorob'ev, Y. Gogolev, V. Gorshkov // International Journal of Molecular Sciences. — 2021. — Vol. 22 - N. 23. — P. 12781.

186. Jameson, P. E. Cytokinins and auxins in plant-pathogen interactions — An overview / P. E. Jameson // Plant Growth Regulation. — 2000. — Vol. 32 - N. 2. — P. 369-380.

187. Jayasimhulu, K. Detection and identification of Bacteriovorax stolpii UKi2 sphingophosphonolipid molecular species / K. Jayasimhulu, S. M. Hunt, E. S. Kaneshiro, Y. Watanabe, J. L. Giner // Journal of the American Society for Mass Spectrometry. — 2007. — Vol. 18. — N. 3. — P. 394-403.

188. Jin, Z. Conditional privatization of a public siderophore enables Pseudomonas aeruginosa to resist cheater invasion / Z. Jin, J. Li, L. Ni, R. Zhang, A. Xia, F. Jin // Nature Communications. — 2018. — Vol. 9. - N. 1. — P. 1383.

189. Johnstone, T. C. Beyond iron: non-classical biological functions of bacterial siderophores / T. C. Johnstone, E. M. Nolan // Dalton Transactions. — 2015.

— Vol. 44. - N. 14. — P. 6320-6339.

190. Jones, A. M. The phytopathogen Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 has three high-affinity iron-scavenging systems functional under iron limitation conditions but dispensable for pathogenesis / A. M. Jones, M. C. Wildermuth // Journal of Bacteriology. — 2011. — Vol. 193. - N. 11. — P. 2767-2775.

191. Joseph, J. D. Lipid composition of marine and estuarine invertebrates: Porifera and Cnidaria / J. D. Joseph // Progress in Lipid Research. — 1979. — Vol. 18.

— N. 1. — P. 1-30.

192. Joshi, J. R. Metabolites from wild potato inhibit virulence factors of the soft rot and blackleg pathogen Pectobacterium brasiliense / J. R. Joshi, L. Yao, A. O. Charkowski, A. L. Heuberger // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2021. — Vol. 34 - N. 1. — P. 100-109.

193. Joshi, J. R. Plant phenolic acids affect the virulence of Pectobacterium aroidearum and P. carotovorum ssp. brasiliense via quorum sensing regulation / J. R. Joshi, S. Burdman, A. Lipsky, S. Yariv, I. Yedidia // Molecular Plant Pathology. — 2016a. — Vol. 17 - N. 4. — P. 487-500.

194. Joshi, J. R. Plant phenolic volatiles inhibit quorum sensing in pectobacteria and reduce their virulence by potential binding to Expl and ExpR proteins / J. R. Joshi, N. Khazanov, H. Senderowitz, S. Burdman, A. Lipsky, I. Yedidia // Scientific Reports. — 20166. — Vol. 6 - N. 1. — P. 38126.

195. Josts, I. Structural insights into a novel family of integral membrane siderophore reductases / I. Josts, K. Veith, V. Normant, I. J. Schalk, H. Tidow // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2021. — Vol. 118. - N. 34. — P. e2101952118.

196. Ju, K. S. Discovery of phosphonic acid natural products by mining the genomes of 10,000 actinomycetes / K. S. Ju, J. Gao, J. R. Doroghazi, K. K. A. Wang, C. J. Thibodeaux, S. Li, W. W. Metcalf // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2015. — Vol. 112. — N. 39. — P. 12175-12180.

197. Ju, K. S. Genomics-enabled discovery of phosphonate natural products and their biosynthetic pathways / K. S. Ju, J. R. Doroghazi, W. W. Metcalf // Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology. — 2014. — Vol. 41. — N. 2. — P. 345356.

198. Kafarski, P. Phosphonates: Their natural occurrence and physiological role / P. Kafarski // Contemporary Topics about Phosphorus in Biology and Materials. — 2020. — P. 1-19.

199. Kamat, S. S. The catalytic mechanism for aerobic formation of methane by bacteria / S. S. Kamat, H. J. Williams, L. J. Dangott, M. Chakrabarti, F. M. Raushel // Nature. — 2013. — Vol. 497. — N. 7447. — P. 132-136.

200. Kaniga, K. A wide-host-range suicide vector for improving reverse genetics in gram-negative bacteria: inactivation of the blaA gene of Yersinia

enterocolitica / K. Kaniga, I. Delor, G. R. Cornelis // Gene. — 1991. — Vol. 109. — № 1. — P. 137-141.

201. Karim, S. AtPTR3, a wound-induced peptide transporter needed for defence against virulent bacterial pathogens in Arabidopsis / S. Karim, K. O. Holmstrom, A. Mandal, P. Dahl, S. Hohmann, G. Brader, M. Pirhonen // Planta. — 2007. — Vol. 225.

— P.1431-1445.

202. Kariola, T. EARLY RESPONSIVE TO DEHYDRATION 15, a negative regulator of abscisic acid responses in Arabidopsis / T. Kariola, G. Brader, E. Helenius, J. Li, P. Heino, E. T. Palva // Plant Physiology. — 2006. — Vol. 142 - N. 4. — P. 1559-1573.

203. Kariotoglou, D. M. Sphingophosphonolipid molecular species from edible mollusks and a jellyfish / D. M. Kariotoglou, S. K. Mastronicolis // Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology. — 2003. — Vol. 136. — N. 1. — P. 27-44.

204. Kariotoglou, D. M. Sphingophosphonolipids, phospholipids, and fatty acids from Aegean jellyfish Aurelia aurita / D. M. Kariotoglou, S. K. Mastronicolis // Lipids.

— 2001. — Vol. 36. — N. 11. — P. 1255.

205. Kaya, K. A novel biosurfactant, 2-acyloxyethylphosphonate, isolated from waterblooms of Aphanizomenon flos-aquae / K. Kaya, L. F. Morrison, G. A. Codd, J. S. Metcalf, T. Sano, H. Takagi, T. Kubo // Molecules. — 2006. — Vol. 11. — N. 7. — P. 539-548.

206. Kazan, K. Intervention of phytohormone pathways by pathogen effectors / K. Kazan, R. Lyons // The Plant Cell. — 2014. — Vol. 26 - N. 6. — P. 2285-2309.

207. Kazan, K. Linking development to defense: auxin in plant-pathogen interactions / K. Kazan, J. M. Manners // Trends in Plant Science. — 2009. — Vol. 14 -N. 7. — P. 373-382.

208. Kazemi-Pour, N. The secretome of the plant pathogenic bacterium Erwinia chrysanthemi / N. Kazemi-Pour, G. Condemine, N. Hugouvieux-Cotte-Pattat // Proteomics. — 2004. — Vol. 4 - N. 10. — P. 3177-3186.

209. Kazuma, K. Studies on the biosynthesis of bialaphos (sf-1293) 12. C-P bond formation mechanism of bialaphos: discovery of a p-methylation enzyme / K. Kazuma, H. Tomomi, I. Satoshi, M. Takeshi, S. Haruo // The Journal of Antibiotics. — 1992. — Vol. 45. — N. 5. — P. 781-787.

210. Keating, T. A. Vibriobactin biosynthesis in Vibrio cholerae: VibH is an amide synthase homologous to nonribosomal peptide synthetase condensation domains / T. A. Keating, C. G. Marshall, C. T. Walsh // Biochemistry. — 2000. — Vol. 39. - N. 50. — P. 15513-15521.

211. Keatinge-Clay, A. T. The structures of type I polyketide synthases / A. T. Keatinge-Clay // Natural Product Reports. — 2012. — Vol. 29. - N. 10. — P. 10501073.

212. Keck, M. Unusual outer membrane lipid composition of the gram-negative, lipopolysaccharide-lacking myxobacterium Sorangium cellulosum So ce56 / M. Keck, N. Gisch, H. Moll, F. J. Vorholter, K. Gerth, U. Kahmann, O. Holst // Journal of Biological Chemistry. — 2011. — Vol. 286. — N. 15. — P. 12850-12859.

213. Kennedy, K. E. Phosphonolipids: localization in surface membranes of Tetrahymena / K. E. Kennedy, G. A. Thompson Jr // Science. — 1970. — Vol. 168. — N. 3934. — P. 989-991.

214. Khan, A. Synthesis, nature and utility of universal iron chelator-Siderophore: A review / A. Khan, P. Singh, A. Srivastava // Microbiological Research.

— 2018. — Vol. 212. — P. 103-111.

215. Khasheii, B. Siderophores: Importance in bacterial pathogenesis and applications in medicine and industry / B. Khasheii, P. Mahmoodi, A. Mohammadzadeh // Microbiological Research. — 2021. — Vol. 250. — P. 126790.

216. Khosla, C. Assembly line polyketide synthases: mechanistic insights and unsolved problems / C. Khosla, D. Herschlag, D. E. Cane, C. T. Walsh // Biochemistry.

— 2014. — Vol. 53. - N. 18. — P. 2875-2883.

217. Kido, Y. Isolation and characterization of I5B2, a new phosphorus containing inhibitor of angiotensin I converting enzyme produced by Actinomadura sp.

/ Y. Kido, T. Hamakado, M. Anno, E. Miyagawa, Y. Motoki, T. Wakamiya, T. Shiba // The Journal of Antibiotics. — 1984. — Vol. 37. — № 9. — P. 965-969.

218. Kieu, N. P. Iron deficiency affects plant defence responses and confers resistance to Dickeya dadantii and Botrytis cinerea / N. P. Kieu, A. Aznar, D. Segond, M. Rigault, E. Simond-Cote, C. Kunz, A. Dellagi // Molecular Plant Pathology. — 2012. — Vol. 13. - N. 8. — P. 816-827.

219. Kim, D. H. Molecular Pharmacology of the Antibiotic Fosfomycin, an Inhibitor of Peptidoglycan Biosynthesis / D. H. Kim, W. J. Lees // Biochemistry. — 2025.

220. Kim, H. S. Pectobacterium carotovorum elicits plant cell death with DspE/F but the P. carotovorum DspE does not suppress callose or induce expression of plant genes early in plant-microbe interactions / H. S. Kim, P. Thammarat, S. A. Lommel, C. S. Hogan, A. O. Charkowski // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2011. — Vol. 24 - N. 7. — P. 773-786.

221. Kim, S. Y. Different biosynthetic pathways to fosfomycin in Pseudomonas syringae and Streptomyces species / S. Y. Kim, K. S. Ju, W. W. Metcalf, B. S. Evans, T. Kuzuyama, W. A. Van Der Donk // Antimicrobial Agents and Chemotherapy. — 2012. — Vol. 56. — N. 8. — P. 4175-4183.

222. Kimura, T. Phosphonothrixin, a Novel Herbicidal Antibiotic Produced by Saccharothrix sp. ST-888 II. Structure Determination / T. Kimura, K. Nakamura, E. Takahashi // The Journal of Antibiotics. — 1995. — Vol. 48. — N. 10. — P. 11301133.

223. Kittredge, J. S. A Carbon-Phosphorus Bond in Nature: A spot on a chromatogram leads to a new field of phosphorus biochemistry / J. S. Kittredge, E. Roberts // Science. — 1969. — Vol. 164. — N. 3875. — P. 37-42.

224. Kittredge, J. S. The occurrence of free 2-aminoethylphosphonic acid in the sea anemone, Anthopleura elegantissima / J. S. Kittredge, E. Roberts, D. G. Simonsen // Biochemistry. — 1962. — Vol. 1. — N. 4. — P. 624-628.

225. Klebba, P. E. ROSET model of TonB action in gram-negative bacterial iron acquisition / P. E. Klebba // Journal of Bacteriology. — 2016. — Vol. 198. - N. 7.

— P. 1013-1021.

226. Klein, I. Homoserine lactones: do plants really listen to bacterial talk? / I. Klein, U. von Rad, J. Durner // Plant Signaling & Behavior. — 2009. — Vol. 4 - N. 1.

— P. 50-51.

227. Kolowith, L. C. Composition and cycling of marine organic phosphorus / L. C. Kolowith, E. D. Ingall, R. Benner // Limnology and Oceanography. — 2001. — Vol. 46. — N. 2. — P. 309-320.

228. Kononova, S. V. Phosphonates and their degradation by microorganisms / S. V. Kononova, M. A. Nesmeyanova // Biochemistry (Moscow). — 2002. — Vol. 67.

— P. 184-195.

229. Korn, E. D. Phosphonoglycan: a major polysaccharide constituent of the amoeba plasma membrane contains 2-aminoethylphosphonic acid and 1-hydroxy-2-aminoethylphosphonic acid / E. D. Korn, D. G. Dearborn, H. M. Fales, E. A. Sokoloski // Biochemistry. — 1973. — Vol. 248. — N. 6. — P. 184-195.

230. Kosegarten, H. Effects of NH4+, NO3- and HCO3- on apoplast pH in the outer cortex of root zones of maize, as measured by the fluorescence ratio of fluorescein boronic acid / H. Kosegarten, F. Grolig, A. Esch, K. H. Glusenkamp, K. Mengel // Planta. — 1999. — Vol. 209. — P. 444-452.

231. Koskiniemi, S. Rhs proteins from diverse bacteria mediate intercellular competition / S. Koskiniemi, J. G. Lamoureux, K. C. Nikolakakis, C. t'Kint de Roodenbeke, M. D. Kaplan, D. A. Low, C. S. Hayes // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2013. — Vol. 110 - N. 17. — P. 7032-7037.

232. Kraepiel, Y. Gram-negative phytopathogenic bacteria, all hemibiotrophs after all? / Y. Kraepiel, M. A. Barny // Molecular Plant Pathology. — 2016. — Vol. 17

— N. 3. — P. 313.

233. Kramer, J. Bacterial siderophores in community and host interactions / J. Kramer, O. Ozkaya, R. Kummerli // Nature Reviews Microbiology. — 2020. — Vol. 18. - N. 3. — P. 152-163.

234. Kravchenko, U. The PhoPQ two-component system is the major regulator of cell surface properties, stress responses and plant-derived substrate utilisation during development of pectobacterium versatile-host plant pathosystems / U. Kravchenko, N. Gogoleva, N. Kalubaka, A. Kruk, Y. Diubo, Y. Gogolev, Y. Nikolaichik // Frontiers in Microbiology. — 2021. — Vol. 11. — P. 621391.

235. Krecmerova, M. Phosphonates and phosphonate prodrugs in medicinal chemistry: Past successes and future prospects / M. Krecmerova, P. Majer, R. Rais, B. S. Slusher // Frontiers in Chemistry. — 2022. — Vol. 10. — P. 889737.

236. Krzysko-Lupicka, T. The ability of soil-borne fungi to degrade organophosphonate carbon-to-phosphorus bonds / T. Krzysko-Lupicka, W. Strof, K. Kubs, M. Skorupa, P. Wieczorek, B. Lejczak, P. Kafarski // Applied Microbiology and Biotechnology. — 1997. — Vol. 48. — P. 549-552.

237. Kuhnel, S. Aiming for the complete utilization of sugar-beet pulp: Examination of the effects of mild acid and hydrothermal pretreatment followed by enzymatic digestion / S. Kuhnel, H. A. Schols, H. Gruppen // Biotechnology for Biofuels. — 2011. — Vol. 4. — P. 1-14.

238. Kurosawa, E. Experimental studies on the nature of the substance secreted by the «bakanae» fungus / E. Kurosawa // Natural History Society of Formosa. — 1926. — Vol. 16. — P. 213-227.

239. Lai, T. Oxidative damage involves in the inhibitory effect of nitric oxide on spore germination of Penicillium expansum / T. Lai, B. Li, G. Qin, S. Tian // Current Microbiology. — 2011. — Vol. 62. — P. 229-234.

240. Lamont, I. L. Siderophore-mediated signaling regulates virulence factor production in Pseudomonas aeruginosa / I. L. Lamont, P. A. Beare, U. Ochsner, A. I. Vasil, M. L. Vasil // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2002. — Vol. 99. - N. 10. — P. 7072-7077.

241. Lapin, D. Susceptibility to plant disease: more than a failure of host immunity / D. Lapin, G. Van den Ackerveken // Trends in Plant Science. — 2013. — Vol. 18 - N. 10. — P. 546-554.

242. Lapwood, D. H. The spread of Erwinia carotovora subsp. atroseptica and subsp. carotovora from stem lesions and degenerating seed tubers to progeny tubers in soil / D. H. Lapwood, R. I. Harris // Potato Research. — 1982. — Vol. 25. — P. 41-50.

243. Larskaya, I. A. Plant oligosaccharides—outsiders among elicitors? / I. A. Larskaya, T. A. Gorshkova // Biochemistry (Moscow). — 2015. — Vol. 80. — P. 881900.

244. Leduc, D. The hotdog thioesterase EntH (YbdB) plays a role in vivo in optimal enterobactin biosynthesis by interacting with the ArCP domain of EntB / D. Leduc, A. Battesti, E. Bouveret // Journal of Bacteriology. — 2007. — Vol. 189. — № 19. — P. 7112-7126.

245. Lee, D. H. Characterization of genes required for the pathogenicity of Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum Pcc21 in Chinese cabbage / D. H. Lee, J. A. Lim, J. Lee, E. Roh, K. Jung, M. Choi, S. Heu // Microbiology. — 2013. — Vol. 159 - N. 7. — P. 1487-1496.

246. Lee, D. S. Arabidopsis GDSL lipase 2 plays a role in pathogen defense via negative regulation of auxin signaling / D. S. Lee, B. K. Kim, S. J. Kwon, H. C. Jin, O. K. Park // Biochemical and Biophysical Research Communications. — 2009. — Vol. 379 - N. 4. — P. 1038-1042.

247. Lee, J. Y. Regulation of petrobactin and bacillibactin biosynthesis in Bacillus anthracis under iron and oxygen variation / J. Y. Lee, K. D. Passalacqua, P. C. Hanna, D. H. Sherman // PLoS One. — 2011. — Vol. 6. - N. 6. — P. e20777.

248. Lee, K. S. Evidence for two phosphonate degradative pathways in Enterobacter aerogenes / K. S. Lee, W. W. Metcalf, B. L. Wanner // Journal of Bacteriology. — 1992. — Vol. 174. — N. 8. — P. 2501-2510.

249. Lehner, S. M. Isotope-assisted screening for iron-containing metabolites reveals a high degree of diversity among known and unknown siderophores produced

by Trichoderma spp / S. M. Lehner, L. Atanasova, N. K. Neumann, R. Krska, M. Lemmens, I. S. Druzhinina, R. Schuhmacher // Applied and Environmental Microbiology. — 2013. — Vol. 79. - N. 1. — P. 18-31.

250. Leinweber, A. The bacterium Pseudomonas aeruginosa senses and gradually responds to interspecific competition for iron / A. Leinweber, M. Weigert, R. Kümmerli // Evolution. — 2018. — Vol. 72. - N. 7. — P. 1515-1528.

251. Leong, S. A. Relationship of siderophore-mediated iron assimilation to virulence in crown gall disease / S. A. Leong, J. B. Neilands // Journal of Bacteriology.

— 1981. — Vol. 147. - N. 2. — P. 482-491.

252. Lewis, T. A. Physiological and molecular genetic evaluation of the dechlorination agent, pyridine-2, 6-bis (monothiocarboxylic acid) (PDTC) as a secondary siderophore of Pseudomonas / T. A. Lewis, L. Leach, S. Morales, P. R. Austin, H. J. Hartwell, B. Kaplan, J. M. Meyer // Environmental Microbiology. — 2004. — Vol. 6. - N. 2. — P. 159-169.

253. Li, S. An inventory of early branch points in microbial phosphonate biosynthesis / S. Li, G. P. Horsman // Microbial Genomics. — 2022. — Vol. 8. — N. 2.

— P. 000781.

254. Liang, C. R. On the distribution and biosynthesis of 2-aminoethylphosphonate in two terrestrial molluscs / C. R. Liang, H. Rosenberg // Comparative Biochemistry and Physiology. — 1968. — Vol. 25. — N. 2. — P. 673681.

255. Liermann, L. J. Production of a molybdophore during metal-targeted dissolution of silicates by soil bacteria / L. J. Liermann, R. L. Guynn, A. Anbar, S. L. Brantley // Chemical Geology. — 2005. — Vol. 220. - N. 3-4. — P. 285-302.

256. Liu, A. C. Pathogen-induced ERF68 regulates hypersensitive cell death in tomato / A. C. Liu, C. P. Cheng // Molecular Plant Pathology. — 2017. — Vol. 18 - N. 8. — P. 1062-1074.

257. Liu, C. M. Degradation of the herbicide glyphosate by members of the family Rhizobiaceae / C. M. Liu, P. A. McLean, C. C. Sookdeo, F. C. Cannon //

Applied and Environmental Microbiology. — 1991. — Vol. 57. — N. 6. — P. 17991804.

258. Liu, H. Quorum sensing coordinates brute force and stealth modes of infection in the plant pathogen Pectobacterium atrosepticum / H. Liu, S. J. Coulthurst, L. Pritchard, P. E. Hedley, M. Ravensdale, S. Humphris, I. K. Toth // PLoS Pathogens.

— 2008. — Vol. 4 - N. 6. — P. e1000093.

259. Liu, M. Comparative transcriptome analysis reveals defense responses against soft rot in Chinese cabbage / M. Liu, F. Wu, S. Wang, Y. Lu, X. Chen, Y. Wang, S. Shen // Horticulture Research. — 2019. — Vol. 6.

260. Liu, S. Conformational flexibility of PEP mutase / S. Liu, Z. Lu, Y. Han, Y. Jia, A. Howard, D. Dunaway-Mariano, O. Herzberg // Biochemistry. — 2004. — Vol. 43. — № 15. — P. 4447-4453.

261. Liu, Y. Characterization of a novel RNA regulator of Erwinia carotovora ssp. carotovora that controls production of extracellular enzymes and secondary metabolites / Y. Liu, Y. Cui, A. Mukherjee, A. K. Chatterjee // Molecular Microbiology. — 1998. — Vol. 29 - N. 1. — P. 219-234.

262. Liu, Y. kdgREcc negatively regulates genes for pectinases, cellulase, protease, HarpinEcc, and a global RNA regulator in Erwinia carotovora subsp. carotovora / Y. Liu, G. Jiang, Y. Cui, A. Mukherjee, W. L. Ma, A. K. Chatterjee // Journal of Bacteriology. — 1999. — Vol. 181 - N. 8. — P. 2411-2421.

263. Liu, Z. Catechol siderophores framed on 2, 3-dihydroxybenzoyl-L-serine from Streptomyces varsoviensis / Z. Liu, T. Huang, Q. Shi, Z. Deng, S. Lin // Frontiers in Microbiology. — 2023. — Vol. 14. — P. 1182449.

264. Loh, J. Quorum sensing in plant-associated bacteria / J. Loh, E. A. Pierson, L. S. Pierson III, G. Stacey, A. Chatterjee // Current Opinion in Plant Biology. — 2002.

— Vol. 5 - N. 4. — P. 285-290.

265. Lomovatskaya, L. A. New Peculiarities in the Virulence Factors of Pectobacterium atrosepticum / L. A. Lomovatskaya, A. M. Goncharova // Applied Biochemistry and Microbiology. — 2025. — Vol. 61 - N. 1. — P. 194-199.

266. Loper, J. E. Siderophores in microbial interactions on plant surfaces / J. E. Loper, J. S. Buyer // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 1991. — Vol. 4. - N. 1.

— P. 5-13.

267. Lu, S. F. In vitro and in vivo ethylene production in relation to pathogenesis of Pseudomonas solanacearum (Smith) Smith on Lycopersicon esculentum M. / S. F. Lu, D. D. Tzeng, S. T. Hsu // Plant Protection Bulletin (Taiwan). — 1989. — Vol. 31 -N. 1. — P. 60-76.

268. Lu, X. An ent-kaurene derived diterpenoid virulence factor from Xanthomonas oryzae pv. oryzicola / X. Lu, D. M. Hershey, L. Wang, A. J. Bogdanove, R. J. Peters // New Phytologist. — 2015. — Vol. 206 - N. 1. — P. 295-302.

269. Luzzatto-Knaan, T. Priming of protein expression in the defence response of Zantedeschia aethiopica to Pectobacterium carotovorum / T. Luzzatto-Knaan, Z. Kerem, A. Doron-Faigenboim, I. Yedidia // Molecular Plant Pathology. — 2014. — Vol. 15 - N. 4. — P. 364-378.

270. Ma, L. AhpC is required for optimal production of enterobactin by Escherichia coli / L. Ma, S. M. Payne // Journal of Bacteriology. — 2012. — Vol. 194.

— № 24. — P. 6748-6757.

271. Mae, A. Transgenic plants producing the bacterial pheromone N-acyl-homoserine lactone exhibit enhanced resistance to the bacterial phytopathogen Erwinia carotovora / A. Mae, M. Montesano, V. Koiv, E. T. Palva // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2001. — Vol. 14 - N. 9. — P. 1035-1042.

272. Majda, M. The role of auxin in cell wall expansion / M. Majda, S. Robert // International Journal of Molecular Sciences. — 2018. — Vol. 19 - N. 4. — P. 951.

273. Manav, M. C. The Abc of phosphonate breakdown: a mechanism for bacterial survival / M. C. Manav, N. Sofos, B. Hove-Jensen, D. E. Brodersen // BioEssays. — 2018. — Vol. 40. — N. 11. — P. 1800091.

274. Mansfield, J. Top 10 plant pathogenic bacteria in molecular plant pathology / J. Mansfield, S. Genin, S. Magori, V. Citovsky, M. Sriariyanum, P. Ronald, G. D. Foster // Molecular Plant Pathology. — 2012. — Vol. 13 - N. 6. — P. 614-629.

275. Manulis, M. The molecular basis for transformation of an epiphyte into a gall-forming pathogen as exemplified by Erwinia herbicola pv. gypsophilae / M. Manulis, I. Barash // Plant-Microbe Interactions. — 2003. — Vol. 6. — P. 19-52.

276. Marquez-Villavicencio, M. D. P. Soft rot disease severity is affected by potato physiology and Pectobacterium taxa / M. D. P. Marquez-Villavicencio, R. L. Groves, A. O. Charkowski // Plant Disease. — 2011. — Vol. 95 - N. 3. — P. 232-241.

277. Martin, J. F. Molecular mechanisms of phosphate sensing, transport and signalling in streptomyces and related actinobacteria / J. F. Martin, P. Liras // International Journal of Molecular Sciences. — 2021. — Vol. 22. — N. 3. — P. 1129.

278. Martinez, A. Widespread known and novel phosphonate utilization pathways in marine bacteria revealed by functional screening and metagenomic analyses / A. Martinez, G. W. Tyson, E. F. DeLong // Environmental Microbiology. — 2010. — Vol. 12. — N. 1. — P. 222-238.

279. Masalha, J. The central role of microbial activity for iron acquisition in maize and sunflower / J. Masalha, H. Kosegarten, O. Elmaci, K. Mengel // Biology and Fertility of Soils. — 2000. — Vol. 30. — P. 433-439.

280. Mason, W. T. Isolation and characterization of the lipids of the sea anemone, Metridium senile / W. T. Mason // Biochimica et Biophysica Acta (BBA) — Lipids and Lipid Metabolism. — 1972. — Vol. 280. — N. 4. — P. 538-544.

281. Mathesius, U. Extensive and specific responses of a eukaryote to bacterial quorum-sensing signals / U. Mathesius, S. Mulders, M. Gao, M. Teplitski, G. Caetano-Anolles, B. G. Rolfe, W. D. Bauer // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2003. — Vol. 100 - N. 3. — P. 1444-1449.

282. Mattinen, L. Host-extract induced changes in the secretome of the plant pathogenic bacterium Pectobacterium atrosepticum / L. Mattinen, R. Nissinen, T. Riipi, N. Kalkkinen, M. Pirhonen // Proteomics. — 2007. — Vol. 7 - N. 19. — P. 3527-3537.

283. Mattinen, L. Host-extract induced changes in the secretome of the plant pathogenic bacterium Pectobacterium atrosepticum / L. Mattinen, R. Nissinen, T. Riipi,

N. Kalkkinen, M. Pirhonen // Proteomics. — 2007. — Vol. 7. — № 19. — P. 35273537.

284. Mattinen, L. Identification and characterization of Nip, necrosis-inducing virulence protein of Erwinia carotovora subsp. carotovora / L. Mattinen, M. Tshuikina, A. Mae, M. Pirhonen // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2004. — Vol. 17 - N. 12. — P. 1366-1375.

285. May, J. J. The dhb operon of Bacillus subtilis encodes the biosynthetic template for the catecholic siderophore 2, 3-dihydroxybenzoate-glycine-threonine trimeric ester bacillibactin / J. J. May, T. M. Wendrich, M. A. Marahiel // Journal of Biological Chemistry. — 2001. — Vol. 276. - N. 10. — P. 7209-7217.

286. McClerklin, S. A. Indole-3-acetaldehyde dehydrogenase-dependent auxin synthesis contributes to virulence of Pseudomonas syringae strain DC3000 / S. A. McClerklin, S. G. Lee, C. P. Harper, R. Nwumeh, J. M. Jez, B. N. Kunkel // PLoS Pathogens. — 2018. — Vol. 14 - N. 1. — P. e1006811.

287. McGrath, J. W. Organophosphonates revealed: new insights into the microbial metabolism of ancient molecules / J. W. McGrath, J. P. Chin, J. P. Quinn // Nature Reviews Microbiology. — 2013. — Vol. 11. — N. 6. — P. 412-419.

288. McGrath, K. C. Repressor-and activator-type ethylene response factors functioning in jasmonate signaling and disease resistance identified via a genome-wide screen of Arabidopsis transcription factor gene expression / K. C. McGrath, B. Dombrecht, J. M. Manners, P. M. Schenk, C. I. Edgar, D. J. Maclean, K. Kazan // Plant Physiology. — 2005. — Vol. 139 - N. 2. — P. 949-959.

289. Melotto, M. Plant stomata function in innate immunity against bacterial invasion / M. Melotto, W. Underwood, J. Koczan, K. Nomura, S. Y. He // Cell. — 2006. — Vol. 126 - N. 5. — P. 969-980.

290. Melotto, M. Stomatal defense a decade later / M. Melotto, L. Zhang, P. R. Oblessuc, S. Y. He // Plant Physiology. — 2017. — Vol. 174 - N. 2. — P. 561-571.

291. Mengel, K. Iron availability in plant tissues — iron chlorosis on calcareous soils / K. Mengel // Developments in Plant and Soil Sciences. — 1995. — Vol. 59. — P. 389.

292. Metcalf, W. W. Biosynthesis of phosphonic and phosphinic acid natural products / W. W. Metcalf, W. A. Van Der Donk // Annual Review of Biochemistry. — 2009. — Vol. 78. — N. 1. — P. 65-94.

293. Metcalf, W. W. Biosynthesis of phosphonic and phosphinic acid natural products / W. W. Metcalf, W. A. Van Der Donk // Annu. Rev. Biochem. — 2009. — Vol. 78. — P. 65-94.

294. Metcalf, W. W. Mutational analysis of an Escherichia coli fourteen-gene operon for phosphonate degradation, using TnphoA'elements / W. W. Metcalf, B. L. Wanner // Journal of Bacteriology. — 1993. — Vol. 175. — N. 11. — P. 3430-3442.

295. Michaelis, A. Ueber das Verhalten der Jodalkyle gegen die sogen. Phosphorigsäureester oder O-Phosphine / A. Michaelis, R. Kaehne // Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft. — 1898. — Vol. 31. — N. 1. — P. 1048-1055.

296. Miethke, M. Siderophore-based iron acquisition and pathogen control / M. Miethke, M. A. Marahiel // Microbiology and Molecular Biology Reviews. — 2007. — Vol. 71. - N. 3. — P. 413-451.

297. Miethke, M. The major facilitator superfamily-type transporter YmfE and the multidrug-efflux activator Mta mediate bacillibactin secretion in Bacillus subtilis / M. Miethke, S. Schmidt, M. A. Marahiel // Journal of Bacteriology. — 2008. — Vol. 190. - N. 15. — P. 5143-5152.

298. Miethke, M. Uptake of xenosiderophores in Bacillus subtilis occurs with high affinity and enhances the folding stabilities of substrate binding proteins / M. Miethke, T. Kraushaar, M. A. Marahiel // FEBS Letters. — 2013. — Vol. 587. - N. 2. — P. 206-213.

299. Miller, G. L. Use of dinitrosalicylic acid reagent for determination of reducing sugar / G. L. Miller // Analytical Chemistry. — 1959. — Vol. 31. — № 3. — P. 426-428.

300. Missinou, M. A. Fosmidomycin for malaria / M. A. Missinou, S. Borrmann, A. Schindler, S. Issifou, A. A. Adegnika, P. B. Matsiegui, P. G. Kremsner // The Lancet. — 2002. — Vol. 360. — N. 9349. — P. 1941-1942.

301. Mohsen, Y. The different types of metallophores produced by Salmonella enterica: a review / Y. Mohsen, N. Tarchichi, R. Barakat, I. Kawtharani, R. Ghandour, Z. Ezzeddine, G. Ghssein // Microbiology Research. — 2023. — Vol. 14. — № 3. — P. 1457-1469.

302. Mole, B. M. Global virulence regulation networks in phytopathogenic bacteria / B. M. Mole, D. A. Baltrus, J. L. Dangl, S. R. Grant // Trends in Microbiology.

— 2007. — Vol. 15. — № 8. — P. 363-371.

303. Moleleki, L. N. A quorum sensing-defective mutant of Pectobacterium carotovorum ssp. brasiliense 1692 is attenuated in virulence and unable to occlude xylem tissue of susceptible potato plant stems / L. N. Moleleki, R. G. Pretorius, C. K. Tanui, G. Mosina, J. Theron // Molecular Plant Pathology. — 2017. — Vol. 18 - N. 1.

— P. 32-44.

304. Moleleki, L. N. A quorum sensing-defective mutant of Pectobacterium carotovorum ssp. brasiliense 1692 is attenuated in virulence and unable to occlude xylem tissue of susceptible potato plant stems / L. N. Moleleki, R. G. Pretorius, C. K. Tanui, G. Mosina, J. Theron // Molecular Plant Pathology. — 2017. — Vol. 18. — № 1.

— P. 32-44.

305. Montesano, M. Multiple defence signals induced by Erwinia carotovora ssp. carotovora elicitors in potato / M. Montesano, G. Brader, I. Ponce de Leon, E. T. Palva // Molecular Plant Pathology. — 2005. — Vol. 6 - N. 5. — P. 541-549.

306. Mosina, G. K. E. Susceptible and tolerant potato leaf-responses post challenge with Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense 1692 / G. K. E. Mosina, L. N. Moleleki // European Journal of Plant Pathology. — 2018. — Vol. 152. — P. 525530.

307. Mukhamedova, K. S. Natural phosphonolipids / K. S. Mukhamedova, A. I. Glushenkova // Chemistry of Natural Compounds. - 2000. - Vol. 36. - P. 329-341.

308. Mukherjee, A. Global regulation in Erwinia species by Erwinia carotovora rsmA, a homologue of Escherichia coli csrA: repression of secondary metabolites, pathogenicity and hypersensitive reaction / A. Mukherjee, Y. Cui, Y. Liu, C. K. Dumenyo, A. K. Chatterjee // Microbiology. — 1996. — Vol. 142 - N. 2. — P. 427434.

309. Muñoz-Hoyos, L. Metabolomics in plant pathogen defense: from single molecules to large-scale analysis / L. Muñoz-Hoyos, R. Stam // Phytopathology. — 2023. — Vol. 113 - N. 5. — P. 760-770.

310. Münzinger, M. Achromobactin, a new citrate siderophore of Erwinia chrysanthemi / M. Münzinger, H. Budzikiewicz, D. Expert, C. Enard, J. M. Meyer // Zeitschrift für Naturforschung C. — 2000. — Vol. 55. — № 5-6. — P. 328-332.

311. Murashige, T. A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures / T. Murashige, F. Skoog // Physiologia Plantarum. — 1962. — Vol. 15. — № 3.

312. Murphy, A. M. Comparison of cytokinin production in vitro by Pyrenopeziza brassicae with other plant pathogens / A. M. Murphy, E. Pryce-Jones, K. Johnstone, A. M. Ashby // Physiological and Molecular Plant Pathology. — 1997. — Vol. 50 - N. 1. — P. 53-65.

313. Murphy, A. R. Transporter characterisation reveals aminoethylphosphonate mineralisation as a key step in the marine phosphorus redox cycle / A. R. Murphy, D. J. Scanlan, Y. Chen, N. B. Adams, W. A. Cadman, A. Bottrill, I. D. Lidbury // Nature Communications. — 2021. — Vol. 12. — N. 1. — P. 4554.

314. Myers, B. K. Genome-wide association and dissociation studies in Pantoea ananatis reveal potential virulence factors affecting Allium porrum and Allium fistulosum x Allium cepa hybrid / B. K. Myers, G. Y. Shin, G. Agarwal, S. P. Stice, R. D. Gitaitis, B. H. Kvitko, B. Dutta // Frontiers in Microbiology. — 2023. — Vol. 13. — P. 1094155.

315. Nagel, R. An operon for production of bioactive gibberellin A4 phytohormone with wide distribution in the bacterial rice leaf streak pathogen

Xanthomonas oryzae pv. oryzicola / R. Nagel, P. C. Turrini, R. S. Nett, J. E. Leach, V. Verdier, M. A. Van Sluys, R. J. Peters // New Phytologist. — 2017. — Vol. 214 - N. 3.

— P. 1260-1266.

316. Nagel, R. Investigating the phylogenetic range of gibberellin biosynthesis in bacteria / R. Nagel, R. J. Peters // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2017. — Vol. 30 - N. 4. — P. 343-349.

317. Naidu, K. R. M. Synthesis of a-Hydroxyphosphonates and Their Antioxidant Properties / K. R. M. Naidu, K. S. Kumar, P. Arulselvan, C. B. Reddy, O. Lasekan // Archiv der Pharmazie. — 2012. — Vol. 345. — № 12. — P. 957-963.

318. Nakamura, K. Synthesis and biological activities of phosphonothrixin / K. Nakamura, T. Kimura, E. Takahashi // Phosphorus, Sulfur, and Silicon and the Related Elements. — 1999. — Vol. 144. — N. 1. — P. 613-616.

319. Nakamura, K. Total synthesis of (±)-Phosphonothrixin, a novel herbicidal antibiotic containing CP bond / K. Nakamura, T. Kimura, H. Kanno, E. Takahashi // The Journal of Antibiotics. — 1995. — Vol. 48. — N. 10. — P. 1134-1137.

320. Nakano, M. Inter-organismal phytohormone networks in plant-microbe interactions / M. Nakano, N. Omae, K. Tsuda // Current Opinion in Plant Biology. — 2022. — Vol. 68. — P. 102258.

321. Naseem, M. The role of auxin-cytokinin antagonism in plant-pathogen interactions / M. Naseem, T. Dandekar // PLoS Pathogens. — 2012. — Vol. 8 - N. 11.

— P.e1003026.

322. Navarro, L. A plant miRNA contributes to antibacterial resistance by repressing auxin signaling / L. Navarro, P. Dunoyer, F. Jay, B. Arnold, N. Dharmasiri, M. Estelle, J. D. Jones // Science. — 2006. — Vol. 312 - N. 5772. — P. 436-439.

323. Neema, C. Iron deficiency induced by chrysobactin in Saintpaulia leaves inoculated with Erwinia chrysanthemi / C. Neema, J. P. Laulhere, D. Expert // Plant Physiology. — 1993. — Vol. 102. - N. 3. — P. 967-973.

324. Newman, K. L. Cell-cell signaling controls Xylella fastidiosa interactions with both insects and plants / K. L. Newman, R. P. Almeida, A. H. Purcell, S. E.

Lindow // Proceedings of the National Academy of Sciences. — 2004. — Vol. 101 - N.

6. — P. 1737-1742.

325. Newton, J. A. Integration of environmental and host-derived signals with quorum sensing during plant-microbe interactions / J. A. Newton, R. G. Fray // Cellular Microbiology. — 2004. — Vol. 6 - N. 3. — P. 213-224.

326. Niere, J. O. The effect of phosphonate on the acid-soluble phosphorus components in the genus Phytophthora / J. O. Niere, G. DeAngelis, B. R. Grant // Microbiology. — 1994. — Vol. 140. — N. 7. — P. 1661-1670.

327. Norman-Setterblad, C. Interacting signal pathways control defense gene expression in Arabidopsis in response to cell wall-degrading enzymes from Erwinia carotovora / C. Norman-Setterblad, S. Vidal, E. T. Palva // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2000. — Vol. 13 - N. 4. — P. 430-438.

328. Notter, R. H. Synthetic lung surfactants containing SP-B and SP-C peptides plus novel phospholipase-resistant lipids or glycerophospholipids / R. H. Notter, R. Gupta, A. L. Schwan, Z. Wang, M. G. Shkoor, F. J. Walther // PeerJ. — 2016. — Vol. 4. — P. e2635.

329. Ntai, I. Biosynthetic Origins of C-P Bond Containing Tripeptide K-26 / I. Ntai, M. L. Manier, D. L. Hachey, B. O. Bachmann // Organic Letters. — 2005. — Vol.

7. — № 13. — P. 2763-2765.

330. Nwokocha, G. C. Regulation of bacterial virulence genes by PecS family transcription factors / G. C. Nwokocha, A. Ghosh, A. Grove // Journal of Bacteriology. — 2024. — Vol. 206 - N. 10. — P. e00302-24.

331. O'Brien, I. G. The structure of enterochelin and related 2, 3-dihydroxy-N-benzoyne conjugates from Escherichia coli / I. G. O'Brien, F. Gibson // Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-General Subjects. — 1970. — Vol. 215. — № 2. — P. 393402.

332. O'Brien, S. Social evolution of toxic metal bioremediation in Pseudomonas aeruginosa / S. O'Brien, D. J. Hodgson, A. Buckling // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. — 2014. — Vol. 281. - N. 1787. — P. 20140858.

333. Ogonkov, A. Not all acidovorax are created equal: gibberellin biosynthesis in the Turfgrass pathogen Acidovorax avenae subsp. avenae / A. Ogonkov, P. E. Brosius, Q. Zeng, S. Sasso, R. Nagel // Molecular Plant-Microbe Interactions. — 2023.

— Vol. 36 - N. 10. — P. 647-655.

334. Olivares, P. Characterization of two late-stage enzymes involved in fosfomycin biosynthesis in pseudomonads / P. Olivares, E. C. Ulrich, J. R. Chekan, W. A. Van Der Donk, S. K. Nair // ACS Chemical Biology. — 2017. — Vol. 12. — N. 2.

— p. 456-463.

335. Omura, S. Phosalacine, a new herbicidal antibiotic containing phosphinothricin fermentation, isolation, biological activity and mechanism of action / S. Omura, M. Murata, H. Hanaki, K. Hinotozawa, R. Oiwa, H. Tanaka // The Journal of Antibiotics. — 1984. — Vol. 37. — N. 8. — P. 829-835.

336. Owen, J. G. Characterization of pyoverdine and achromobactin in Pseudomonas syringae pv. phaseolicola 1448a / J. G. Owen, D. F. Ackerley // BMC Microbiology. — 2011. — Vol. 11. — P. 1-16.

337. Palenik, B. The genome of a motile marine Synechococcus / B. Palenik, B. Brahamsha, F. W. Larimer, M. Land, L. Hauser, P. Chain, J. Waterbury // Nature. — 2003. — Vol. 424. — N. 6952. — P. 1037-1042.

338. Palmer, A. G. Plant responses to bacterial N-acyl L-homoserine lactones are dependent on enzymatic degradation to L-homoserine / A. G. Palmer, A. C. Senechal, A. Mukherjee, J. M. Ane, H. E. Blackwell // ACS Chemical Biology. — 2014. — Vol. 9 - N. 8. — P. 1834-1845.

339. Palva, T. K. Salicylic acid induced resistance to Erwinia carotovora subsp. carotovora in tobacco / T. K. Palva, M. Hurtig, P. Saindrenan, E. T. Palva // MPMI-Molecular Plant Microbe Interactions. — 1994. — Vol. 7 - N. 3. — P. 356-363.

340. Panda, P. Pectobacterium atrosepticum and Pectobacterium carotovorum harbor distinct, independently acquired integrative and conjugative elements encoding coronafacic acid that enhance virulence on potato stems / P. Panda, B. R. Vanga, A. Lu,

M. Fiers, P. C. Fineran, R. Butler, A. R. Pitman // Frontiers in Microbiology. — 2016.

— Vol. 7. — P. 397.

341. Pandey, A. Role of the FeoB protein and siderophore in promoting virulence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae on rice / A. Pandey, R. V. Sonti // Journal of Bacteriology. — 2010. — Vol. 192. - N. 12. — P. 3187-3203.

342. Pandey, S. S. The role of iron in phytopathogenic microbe-plant interactions: Insights into virulence and host immune response / S. S. Pandey // Plants.

— 2023. — Vol. 12. — № 17. — P. 3173.