Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович
Чуланов, Владимир Петрович
кандидат наук
2013
- Специальность ВАК РФ14.02.02
- Количество страниц 380
Оглавление диссертации кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович
ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Гепатит А: общая характеристика и генетическая классификация вируса, клинико-эпидемиологические особенности инфекции
1.1.1. Строение вириона и организация генома вируса гепатита А
1.1.2. Современные особенности эпидемиологии гепатита А
1.1.3. Генетическая гетерогенность популяции вируса гепатита А
1.1.4. Определение генетических характеристик вируса гепатита А
в эпидемиологических исследованиях
1.1.5. Клиническое значение генетического разнообразия вируса гепатита А
1.2. Современные представления о гепатите В: строение и генетическое разнообразие вируса, распространенность и клиническое значение его генетических вариантов
1.2.1. Строение и свойства вируса гепатита В
1.2.2. Эпидемиология острой и хронических форм гепатита В
1.2.3. Генетическое разнообразие вируса гепатита В и его эпидемиологическое значение
1.2.4. Клиническое значение генетических вариантов вируса гепатита В
1.3. Методические подходы к изучению генетической гетерогенности вирусов гепатита АиВ
Глава 2. Материалы и методы исследования
2
2.1. Характеристика групп больных и образцов биологического материала, включенных в исследование
2.2. Общеклинические методы исследования
2.3. Иммунохимические методы исследования
2.4. Молекулярно-биологические методы исследования
2.4.1. Выделение вирусных РНК и ДНК
2.4.2. Обратная транскрипция и ПЦР-амплификация
2.4.3. Электрофоретический анализ
2.4.4. Субтипирование изолятов вируса гепатита А
2.4.5. Генотипирование и субгенотипирование изолятов вируса гепатита В
2.4.6. Секвенирование фрагментов геномов вирусов гепатита А и В
2.5. Определение серотипов вируса гепатита В
2.6. Филогенетический анализ генетических последовательностей вирусов гепатита А и В
2.7. Инструментальные методы исследования
2.8. Статистический анализ данных, полученных в ходе исследования
Глава 3. Современные особенности эпидемического процесса вирусных гепатитов А и В и система эпидемиологического надзора за данными инфекциями в РФ
3.1. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита А в РФ
3.2. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита В в РФ
3.3. Система эпидемиологического надзора за гепатитами А и В в РФ
Глава 4. Распространенность генотипов и субтипов вируса
гепатита А на территории РФ и ряда стран СНГ
4.1. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории РФ
4.2. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории Украины, Таджикистана и Кыргызстана
4.3. Закономерности географической кластеризации штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
4.3.1. Оптимизация методического подхода к идентификации штаммов вируса гепатита А
4.3.2. Филогенетический анализ штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ
4.3.3. Особенности географической кластеризации штаммов
вируса гепатита А, относящихся к субтипам 1А и ША
4.4. Оценка степени генетической гетерогенности штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
Глава 5. Молекулярно-генетические особенности вспышек
гепатита А на территории РФ
5.1. Вспышка гепатита А в Тверской области в 2005 г
5.2. Вспышка гепатита А в г. Нижнем Новгороде в 2005 г
5.3. Вспышки гепатита А в г. Северодвинске (август-сентябрь 2006 г.)
и г. Коряжме (октябрь 2006 г.) Архангельской области
5.4. Вспышки гепатита А в г. Осинники, г. Калтане, г. Междуреченске
и г. Новокузнецке Кемеровской области (август-декабрь 2006 г.)
5.5. Вспышки гепатита А в г. Углегорске (август-ноябрь 2006 г.), г. Южно-Сахалинске и г. Аниве (сентябрь 2007 г.)
Сахалинской области
4
5.6. Вспышки гепатита А в Нерюнгринском районе Республики
Саха (Якутия) (апрель 2007 г.)
5.7. Вспышка гепатита А в г. Махачкале Республики Дагестан
(май 2008 г.)
5.8. Вспышка гепатита А в Тоджинском районе Республики Тыва (ноябрь 2007 г. - февраль 2008 г.)
5.9. Повышенная заболеваемость гепатитом А в ряде районов Республики Тыва в 2010 г
5.10. Вспышка гепатита А в г. Радужном Ханты-Мансийского автономного округа (декабрь 2008 г.- февраль 2009 г.)
5.11. Вспышки гепатита А в Рязанской области
(январь-февраль 2009 г., сентябрь-ноябрь 2009 г.)
5.12. Случай групповой заболеваемости гепатитом А в
г. Калининграде (январь-февраль 2009 г.)
5.13. Вспышки гепатита А в г. Екатеринбурге
(сентябрь-ноябрь 2006 г., июнь-июль 2010 г.)
5.14. Вспышка гепатита А в г. Уфе Республики Башкортостан (апрель-май 2009 г.)
5.15. Вспышка гепатита А в Красноярском крае
(ноябрь-декабрь 2009 г.)
5.16. Вспышка гепатита А в г. Москве и Московской области
(декабрь 2009 г.-март 2010 г.)
Глава 6. Особенности клинического течения гепатита А, вызванного вирусами субтипов IA и IIIA
6.1. Клинико-эпидемиологическая характеристика групп больных гепатитом А, вызванным вирусами различных субтипов
6.2. Динамика лабораторных показателей у больных гепатитом А, вызванным вирусами различных субтипов
Глава 7. Распространенность генотипов и субгенотипов вируса гепатита В на территории РФ и ряда стран СНГ
7.1. Особенности распространенности генотипов вируса гепатита В
на территории РФ
7.2. Распространенность генотипов вируса гепатита В на территории Украины, Республики Армения, Кыргызстана и Таджикистана
7.3. Филогенетический анализ штаммов вируса гепатита В, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
7.4. Анализ генетических характеристик рекомбинантного штамма вируса гепатита В
7.5. Анализ серотипов вируса гепатита В, циркулирующих
на территории РФ
7.6. Особенности проявлений эпидемического процесса гепатита В
на территории Чукотского АО
Глава 8. Молекулярно-генетические подходы к анализу эпидемиологической связи случаев гепатита В
8.1. Общая характеристика эпидемических очагов гепатита В
8.2. Реконструкция филогенетических взаимоотношений генетических последовательностей вируса гепатита В из эпидемических очагов
8.3. Филогенетический анализ изолятов вируса гепатита В, выделенных от больных из семейного очага F1
Глава 9. Клинико-лабораторные особенности хронического гепатита В, вызванного вирусами генотипов А и D
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
б
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
AJ1T - аланинаминотрансфераза
АО - автономный округ
ACT - аспартатаминотрансфераза
ВГ - вирусный гепатит
ВГА - вирус гепатита А
ВГВ - вирус гепатита В
ВГС - вирус гепатита С
ВИЧ - вирус иммунодефицита человека
ВКО - внутренний контрольный образец
ВОЗ - Всемирная организация здравоохранения
ВОС - водоочистная станция
ГОУ - государственное образовательное учреждение
ГУЗ - государственное учреждение здравоохранения
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ДОЛ - детский оздоровительный лагерь
ДОУ - детское образовательное учреждение
ЗАО - закрытое акционерное общество
ИФА - иммуноферментный анализ
кДНК - комплементарная ДНК
КНС - канализационно-насосная станция
мРНК - матричная РНК
МУП - муниципальное унитарное предприятие нт - нуклеотид
ОАО - открытое акционерное общество ОГВ - острый гепатит В
ООО - общество с ограниченной ответственностью
ОРВИ - острая респираторная вирусная инфекция
ПДРФ - анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
п.н. - пара нуклеотидов
РНК - рибонуклеиновая кислота
РФ - Российская Федерация
СанПиН - санитарные правила и нормы
СНГ - Содружество Независимых Государств СОШ - средняя общеобразовательная школа ФАП - фельдшерско-акушерский пункт ФО - федеральный округ ХГВ - хронический гепатит В ЦП - цирроз печени
anti-HAV - антитела к вирусу гепатита А
anit-HBc - антитела к соге-антигену вируса гепатита В
anti-HBe - антитела к е-антигену вируса гепатита В
anti-HBs - антитела к поверхностному антигену вируса гепатита В
anti-HCV - антитела к вирусу гепатита С
anti-HDV - антитела к вирусу гепатита D
anti-HIV - антитела к вирусу иммунодефицита человека
ddNTP - дидезоксирибонуклеотид
dNTP - дезоксирибонуклеотид
HBeAg - е-антиген вируса гепатита В
HBsAg - поверхностный антиген вируса гепатита В
HKY85 - эволюционная модель Hasegawa-Kishino-Yano, 1985 г.
ICTV - International Committee on Taxonomy of Viruses (Международный комитет по
таксономии вирусов)
IgG - иммуноглобулин класса G
IgM - иммуноглобулин класса М
JC69 - эволюционная модель Juke-Cantor, 1969 г.
К80 - эволюционная модель Kimura, 1980 г.
МСМС - метод Монте-Карло марковскими цепями
ME - метод минимальной эволюции
ML - метод максимального правдоподобия
Nested-ПЦР - ПЦР с вложенной парой праймеров («гнездная» ПЦР)
NJ - метод Neighbour-joining
SGS - метод секвенирования единичных геномов
SSCP - метод анализа одноцепочечного конформационного полиморфизма TN93 - эволюционная модель Tamura-Nei, 1993 г.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Комплексная характеристика эпидемического процесса гепатита С и подходы к совершенствованию эпидемиологического надзора2025 год, кандидат наук Кашникова Анна Дмитриевна
Распространенность гепатита С и молекулярно-генетическая характеристика вируса, циркулирующего у населения Нижегородской обл.2013 год, кандидат наук Михайлова, Юлия Владимировна
Современные проявления эпидемического процесса гепатита С в России и пути совершенствования эпидемиологического надзора2019 год, кандидат наук Пименов Николай Николаевич
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ВАРИАНТЫ ВИРУСА ГЕПАТИТА С ТИПА 2k/1b НА ЮГЕ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ2015 год, кандидат наук Чуб Елена Владимировна
Молекулярно-генетические механизмы эволюции вируса гепатита C2013 год, кандидат наук Калинина, Ольга Викторовна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В»
ВВЕДЕНИЕ
Вирусные гепатиты (ВГ) до настоящего времени остаются значимой проблемой здравоохранения как в России, так и в мире. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), в мире ежегодно регистрируется около 1,5 млн случаев гепатита А (ГА) [408], а общее число заболевших в мире может составлять десятки млн в год [240, 403]. По степени экономического ущерба ГА, наряду с гепатитом В (ГВ), занимает одно из ведущих мест после гриппа, ОРВИ и острых кишечных инфекций [48, 49]. Несмотря на то что в течение последних 10 лет в России наблюдается неуклонное снижение заболеваемости ГА, ее показатель в 2012 г. оставался достаточно высоким - 5,5 на 100 тыс. населения. Следует отметить, что, по данным Роспотребнадзора, заболеваемость ГА в субъектах РФ имеет выраженные различия и в ряде территорий превышает среднероссийский показатель (в Астраханской области - 22,5, Республике Дагестан - 50,6, Республике Тыва - 96,8 на 100 тыс. населения). Эта неоднородность обусловливается комплексом факторов, таких как социально-гигиенические и демографические особенности территории, доля восприимчивого населения, биологические особенности возбудителя [18, 34]. Важной характеристикой ГА является его способность вызывать заболевание массового характера с большим числом пострадавших. За последние 5 лет в России было зарегистрировано более 300 вспышек ГА, в том числе в относительно благополучных регионах, таких как г. Москва и Московская область (например, вспышка в 2010 г., во время которой зарегистрировано более 800 пострадавших). Это определяет необходимость дальнейшего изучения особенностей эпидемического процесса ГА с целью совершенствования стратегии профилактики данной инфекции.
Успешное внедрение программ вакцинопрофилактики в РФ позволило
к 2012 г. снизить заболеваемость острым гепатитом В (ОГВ) почти в 30 раз по
сравнению с уровнем заболеваемости в 2000 г. (1,4 и 39,9 случаев на 100 тыс.
населения соответственно). Эти успехи дают основание предполагать
ю
возможность элиминации ОГВ в отдельных регионах РФ, при условии оптимизации и совершенствования эпидемиологического надзора за ОГВ [20]. Гепатит В (ГВ) сохраняет свою высокую актуальность в связи со значительной частотой развития хронических форм болезни. Заболеваемость хроническим гепатитом В (ХГВ) в РФ в 2012 г. составила 12,6, а впервые выявленные носители вируса гепатита В (ВГВ) регистрировались с частотой 21,1 на 100 тыс. населения. В целом заболеваемость хроническими формами инфекции, вызванной ВГВ, в 2012 г. в 23,7 раза превышала заболеваемость ОГВ (1,42 на 100 тыс. населения). Особое внимание к себе привлекает ХГВ в связи с высокой частотой развития неблагоприятных исходов этой инфекции - цирроза печени (ЦП) и гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК) [2, 12, 33, 248, 383]. Согласно данным ВОЗ, ВГВ является причиной 60-80% случаев ГЦК в мире, от которой ежегодно погибает более 320 000 человек [259, 410].
Успехи молекулярной биологии привели к появлению новых данных о биологических особенностях возбудителей ГА и ГВ. В течение последних 20 лет был выделен целый ряд генетических вариантов (генотипов и субтипов) этих вирусов. Так, было описано 6 генотипов вируса ГА (ВГА) [99, 100, 171] и 10 -ВГВ, каждый из которых подразделяется на целый ряд субтипов и имеет характерные особенности географического распространения [57, 307, 328, 390, 394]. Для некоторых возбудителей инфекций, например, вирусов гриппа, кори, полиомиелита, изучение циркуляции генетических вариантов и использование этой информации при осуществлении эпидемиологического надзора уже вошло в рутинную практику [9, 350, 351, 402]. Изучение генетической гетерогенности возбудителей инфекционных болезней используется при расследовании вспышек и анализе эпидемиологической связи случаев заболевания [6, 288, 289]. О распространенности генетических вариантов вирусов ГА и ГВ в России имеются лишь отрывочные сведения в отдельных публикациях [5, 41, 51, 208, 291, 330]. Клиническое значение генотипов некоторых вирусов, например, вируса гепатита С, уже достаточно хорошо изучено. Известно, что течение и
эффективность лечения хронического гепатита С зависит от генотипа и даже от субтипа вируса [216, 221, 413]. О клиническом значении генотипов ВГА и ВГВ сведений в литературе мало и они часто носят противоречивый характер [102, 110, 160, 197, 198, 262]. Систематических исследований, касающихся генетической гетерогенности данных вирусов на территории РФ, значения их генетических вариантов для эпидемиологического надзора и клинической практики, не проводилось.
Цель работы: разработать научные основы молекулярно-генетического компонента системы эпидемиологического надзора за ГА и ГВ; оценить клиническое значение генетической гетерогенности ВГА и ВГВ.
Задачи исследования
1. Провести анализ проявлений эпидемического процесса ГА и ГВ в РФ за период с 2001 по 2011 гг. и современного состояния системы эпидемиологического надзора за данными инфекциями;
2. Определить распространенность генотипов и субтипов ВГА, циркулирующего на территории РФ и ряда стран СНГ с различной интенсивностью эпидемического процесса;
3. Определить распространенность генотипов и субгенотипов ВГВ, циркулирующего на территории РФ и ряда стран СНГ с различной интенсивностью эпидемического процесса;
4. Установить связь между филогенетическими характеристиками ВГА и ВГВ, относящихся к различным генотипам, с особенностями их географической распространенности;
5. Разработать подходы к анализу эпидемиологической связи случаев заболевания ГА и ГВ на основе изучения генетической гетерогенности вирусной популяции;
6. Усовершенствовать систему эпидемиологического надзора за ГА и ГВ на основе внедрения системы молекулярно-генетического мониторинга за возбудителями данных инфекций;
7. Оценить взаимосвязь между генетическими характеристиками ВГА и ВГВ и клинико-лабораторными особенностями течения ГА и ХГВ.
Научная новизна
Проведен анализ проявлений эпидемического процесса ГА и ГВ на территории РФ, свидетельствующий о выраженном снижении его интенсивности, изменении возрастной структуры заболевших с увеличением доли взрослого населения, выраженной территориальной неравномерности показателя заболеваемости ГА, значительном преобладании хронических форм инфекции в структуре заболеваемости ГВ.
Впервые дана характеристика территориальной распространенности генотипов и субтипов ВГА во всех федеральных округах (ФО) РФ и ряде стран СНГ. Установлена циркуляция двух субтипов, 1А и ША, и выявлено их неравномерное распространение на территории страны. Показано доминирование субтипа 1А в большинстве субъектов РФ. Установлено, что распространенность генотипов ВГА в Украине сходна с таковой в европейской части РФ, тогда как в странах Средней Азии (в Таджикистане, Кыргызстане) наблюдаются иные особенности. Изучена генетическая гетерогенность каждого из субтипов вируса и выделены географические кластеры ВГА в пределах субтипов 1А и ША, характерные для территории РФ и некоторых стран СНГ.
Впервые предложены оптимальные маркерные области генома ВГА для использования при расследовании вспышек ГА. Доказано, что ВГА субтипа ША является причиной возникновения многих очагов групповых заболеваний в РФ. Впервые выявлены особенности генетического разнообразия ВГВ на территории всех ФО РФ и ряда стран СНГ. Определены эндемичные для РФ генотипы и субгенотипы вируса, их географическая распространенность. Доказано отсутствие
филогеографических кластеров в пределах генотипов А и Б, позволяющих различать штаммы ВГВ из различных регионов РФ. Выявлен новый, ранее не описанный рекомбинантный вариант ВГВ.
Разработаны научные основы использования молекулярно-генетических методов и филогенетической реконструкции эволюционных взаимоотношений между изолятами вируса, необходимые в качестве дополнительных объективных инструментов в эпидемиологической диагностике при обследовании эпидемических очагов ГА и ГВ.
Впервые изучены особенности клинико-лабораторных характеристик ГА, вызванного вирусами субтипов 1А и IIIА, и ХГВ, вызванного вирусами генотипов АиБ,в РФ.
Практическая значимость
Разработанные положения позволят создать систему молекулярно-генетического мониторинга за ГА и ГВ в РФ.
Для оптимизации информационной подсистемы эпидемиологического надзора предложено внедрить молекулярно-генетический мониторинг с целью слежения за циркулирующими генетическими вариантами ВГА и ВГВ и динамикой изменения генетических характеристик вирусной популяции.
Для повышения качества эпидемиологической диагностики в рамках диагностической подсистемы эпидемиологического надзора рекомендовано использовать данные молекулярно-генетического мониторинга, а также проводить анализ маркерных последовательностей генома вирусов при работе в очагах вирусных гепатитов для установления источника возбудителя инфекции, путей и факторов передачи, а также временных и пространственных границ очагов.
Разработана методика и алгоритм анализа эпидемиологической связи случаев ГА и ГВ на основе филогенетической реконструкции эволюционных взаимоотношений между изолятами вируса. Рекомендованы оптимальные
маркерные области генома ВГА для использования с целью идентификации штаммов.
Выявлены клинико-лабораторные особенности ГА и ХГВ, вызванных различными генотипами вирусов, позволяющие рекомендовать их определение при обследовании больных для уточнения прогноза течения заболевания.
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Гепатит А: общая характеристика и генетическая классификация вируса, клинико-эпидемиологические особенности инфекции
1.1.1. Строение вириона и организация генома вируса гепатита А
Заболевание, вызываемое ВГА, известно сотни лет. Подробное описание болезни было опубликовано в начале XX века и значительно дополнено результатами исследований с экспериментальным заражением добровольцев в 40-60 гг. [275, 371]. К концу 60-х гг. XX века накопилось множество фактов, свидетельствующих о вирусной природе ГА, однако окончательным доказательством этого стало выделение возбудителя из фекалий больного и его описание с помощью электронной микроскопии [153].
Вирус гепатита А относится к семейству Picornaviridae [50, 273, 278, 379]. Пикорнавирусы - мелкие вирусы, лишенные оболочки, имеющие в качестве генома одноцепочечную РНК. Патогенные для человека вирусы включают виды рода Rhinovirus (риновирусы человека) и рода Enterovirus (полиовирусы, вирусы Коксаки, ECHO вирусы и энтеровирусы человека). Хотя у ВГА есть некоторые общие характеристики с представителями других родов семейства Picornaviridae, у него было выявлено достаточное количество отличий, позволивших отнести его к единственному виду рода Hepatovirus [120]. В природе существуют как штаммы, инфицирующие нечеловекообразных обезьян, так и штаммы, патогенные для человека [261, 349]. Вирус гепатита А, в отличие от других представителей семейства Picornaviridae, стабилен в кислой среде (рН 1) и выдерживает нагревание до 56°С в течение 30 минут [199].
Геномы ВГА и пикорнавирусов имеют схожую организацию [120]. Геномом ВГА является одноцепочечная РНК позитивной полярности (т.е. способная к трансляции) длиной 7,5 тыс. оснований, имеющая 5'-нетранслируемую область (740 оснований), кодирующую область (2227
аминокислот) и З'-нетранслируемую область (40-80 оснований) [109, 120, 222].
16
Несмотря на то что ВГА был первым вирусом гепатита, более 20 лет назад успешно адаптированным к культуре клеток [335], его белковый состав до сих пор исследован не полностью [222]. Инфицированные клетки содержат вирус в низком титре, в связи с чем изучение свойств вирусных протеинов ограничено. Область PI кодирует три главных протеина нуклеокапсида - VP1, VP2, VP3. Четвертый протеин нуклеокапсида VP4 необходим для формирования вириона [332] и не обнаруживается в зрелых вирусных частицах. Каждый из белков нуклеокапсида образуется из полипротеина-предшественника с помощью вирусной протеазы ЗС, кодируемой областью РЗ. Естественная конформация капсидных белков VP1 и VP3 образует единый доминантный серологический эпитоп на поверхности нуклеокапсида, к которому вырабатываются нейтрализующие антитела. Неструктурные белки, кодируемые областями Р2 и РЗ, необходимы в процессе синтеза РНК и формирования вириона [155]. Белок VPg, кодируемый также областью РЗ генома вируса, ковалентно связан с 5'-нетранслируемой областью генома и участвует в инициации синтеза РНК [120]. Схема строения генома ВГА приведена на рисунке 1.1.
При экспериментальном инфицировании обезьян человеческим штаммом ВГА вирусный антиген обнаруживался методом иммунофлюоресценции в желудке, тонком и толстом кишечнике не только после начального инфицирования, но и позднее в течение заболевания [319]. Обнаружение вирусных антигенов методом иммунофлюоресценции в клетках кишечных крипт предполагает, что репликация может иметь место в кишечнике [319]. Вирионы предположительно достигают печени по портальной системе (возможно, после системной циркуляции) и захватываются гепатоцитами. Было установлено, что рецепторами для ВГА на поверхности непеченочных клеток обезьян является муциноподобный мембранный гликопротеин первого класса [80, 226, 327], однако его связь с захватом вируса гепатоцитами пока не установлена. После размножения вируса в гепатоцитах и его выхода в желчь происходит захват вирионов клетками кишечного эпителия и перенос их в печень. Этот процесс
носит название кишечно-печеночной циркуляции вируса. Он может продолжаться до полного связывания вируса нейтрализующими антителами.
7 kb
VP4 VP2 VP3 VP1 ? 2А 2В 2С ЗА ЗВ ЗС 3D
VPg
V.
белки нукпеокапсида
J
VPg
протеаза РНК
полимерам
Р1
Р2
РЗ
Рисунок 1.1. Схема организации генома ВГА.
Полипротеин обозначен прямоугольником; Pl, Р2, РЗ - три домена полипротеина; VP1, VP2, VP3, VP4 - структурные белки; 2А, 2В, 2С, ЗА, ЗВ, ЗС, 3D - неструктурные белки. Линейка вверху рисунка показывает длину полипротеина в парах оснований (адаптировано из [222])
Современными исследованиями доказано, что репликация ВГА in vivo имеет место практически исключительно в гепатоцитах и клетках кишечного эпителия, хотя в культуре непеченочных клеток репликация также описана [222]. Геном вируса реплицируется через стадию РНК негативной полярности. Зрелые вирионы содержат РНК позитивной полярности, ковалентно связанную с белком VPg и упакованную в белки нуклеокапсида VP1, VP2, VP3, которые образуют структуру с икосаэдрической симметрией. Вирусные частицы выходят в желчь и кровь, предположительно проходя через апикальную мембрану гепатоцита в желчные канальцы и через базальную мембрану - в кровоток. Механизм высвобождения и секреции вируса до конца неизвестен. Вероятно, он не связан с разрушением печеночных клеток, поскольку вирус обнаруживается в фекалиях в высоком титре до появления каких-либо признаков цитолиза [125, 126, 255].
1.1.2. Современные особенности эпидемиологии гепатита А
Гепатит А - инфекционная болезнь человека, вызываемая вирусом с фекально-оральным механизмом передачи, характеризующаяся
преимущественным поражением печени и клинически проявляющаяся интоксикацией и желтушностью [17, 43, 68]. Источником возбудителя инфекции является больной человек. В ранних исследованиях было показано, что возбудитель обнаруживается в фекалиях больного за 12-14 дней до развития желтухи и продолжает выделяться в течение трех недель желтушного периода [126, 146]. Работы, выполненные позднее с использованием высокочувствительных методов обнаружения вируса на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволили установить, что период экскрециии вируса более длительный и в среднем составляет около 12 недель после начала заболевания [145, 152, 196, 219]. Максимальная концентрация вируса в экскретах больного наблюдается в конце инкубационного и на всем протяжении преджелтушного периодов [88, 231, 338].
Больные с безжелтушными формами ГА являются источниками возбудителя инфекции, имеющими наибольшее значение. Безжелтушные формы, по сравнению с желтушными, встречаются в 10-12 раз чаще у детей и в 2 раза чаще у взрослых. Частота желтушных форм возрастает в период эпидемических вспышек ГА, что объясняется высокой вероятностью заражения большими дозами вируса (феномен доза-эффект) [18]. Полиморфизм клинических проявлений со значительным преобладанием безжелтушных форм болезни является одной из эпидемиологических черт ГА. За счет бессимптомных форм этой инфекции обеспечивается непрерывная циркуляция ВГА [37, 43, 85].
Вирусный гепатит А распространяется посредством фекально-орального механизма, реализующегося с помощью бытового, пищевого и водного путей передачи, среди которых последний является основным [17]. Действие водного фактора может носить как постоянный, так и эпизодический характер. Постоянно действующий водный фактор играет ведущую роль в распространении ГА и
обусловливает его эндемичность в регионах с неудовлетворительным водоснабжением населения [4]. Высокая активность водного пути передачи при ГА связана с тем, что обеззараживание воды на головных водопроводных сооружениях даже при соблюдении санитарных норм и правил не гарантирует ее эпидемиологической безопасности. Это объясняется риском вторичного микробного загрязнения воды в разводящей сети водопроводов, а также в децентрализованных источниках водоснабжения при их неудовлетворительном санитарно-техническом состоянии [4, 18, 34, 37, 43].
Вирус гепатита А имеет малые размеры и, в отличие от бактериальных патогенов, обладает высокой проникающей способностью, в том числе возможностью проникать через различные бактериальные фильтры и слои почвы, недоступные для бактерий. В результате этого ВГА значительно чаще, чем патолгенные кишечные бактерии, контаминирует подземные воды. Способность ВГА загрязнять подземные, и, в первую очередь, высоко стоящие грунтовые воды, которые являются основным источником водоснабжения для хозяйственно-бытовых нужд в Средней Азии, определяет высокую эпидемиологическую значимость грунтовых вод как фактора передачи возбудителя ГА и его гиперэндемичность на этой территории [18, 37].
По данным ВОЗ в мире ежегодно регистрируется около 1,4 млн новых случаев ГА [409]. В последние десятилетия наблюдается тенденция к снижению заболеваемости во всех регионах мира, кроме Африки, что обусловливает снижение частоты выявления специфических антител к ВГА (апй-НАУ ^О) среди населения данных территорий [240, 241]. Наблюдаемый «эпидемиологический переход» объясняется повышением социально-экономического уровня, доступности доброкачественной питьевой воды, уровня коммунального благоустройства и улучшением санитарно-гигиенических условий проживания населения, а в ряде регионов - внедрением в практику здравоохранения эффективных мер вакцинопрофилактики [34, 114, 186, 331, 382].
Вирусный гепатит А распространен во всем мире. В зависимости от уровня заболеваемости выделяют регионы с высокой, средней и низкой распространенностью инфекции. В каждом из регионов наблюдаются свои особенности эпидемиологии ГА [239, 403].
Африка, Азия, Центральная и Южная Америка относятся к регионам с высоким уровнем распространенности ВГА. Как правило, население этих регионов переносит ГА в детском возрасте в легкой форме с формированием естественного защитного иммунитета к вирусу. У взрослых заболевание регистрируется крайне редко [18, 97, 272, 404].
К регионам со средней распространенностью ГА относят Юго-Восточную Азию и Восточную Европу. В этих регионах инфицирование детей происходит в более старшем возрасте, чем в регионах с высокой распространенностью инфекции. Отмечается значительное количество случаев заболевания взрослых. Факторами передачи возбудителя в регионах со средней распространенностью ГА чаще всего являются недоброкачественная питьевая вода и контаминированные вирусом продукты питания. Так, в 1988 г. в Шанхае, вследствие поступления в продажу партии зараженных моллюсков, было отмечено около 300 тыс. случаев заболевания в течение 2 месяцев [35, 136].
Страны Западной Европы, Северной Америки, Австралия и Новая Зеландия относятся к регионам с низкой распространенностью ГА. Здесь отмечено стабильное снижение уровня заболеваемости в течение последних 40 лет. Случаи инфицирования в детском возрасте редки, и часто не удается установить источник инфекции [35, 253, 391, 404].
Европа традиционно является территорией с наиболее низким уровнем заболеваемости ГА по сравнению с другими регионами мира. В странах Европейского союза общий уровень заболеваемости ГА снизился с 15,1 на 100 тыс. населения в 1996 г. до 2,81 в 2007 г. [142]. В период с 2001 по 2008 гг. страны Восточной Европы значительно отличались по уровням и динамике заболеваемости от стран Северной и Западной Европы. В Северной и Западной
Европе показатели находились на относительно низком уровне - менее 3,0 на 100 тыс. населения, однако динамика колебаний показателей была более выражена в северной части (от 0,55 до 2,9 на 100 тыс. населения) по сравнению с западной частью Европы (от 1,5 до 2,3 на 100 тыс. населения). Несмотря на то что в Восточной Европе показатель заболеваемости ГА с 2001 по 2008 гг. снизился более чем в 4 раза (с 24,94 до 5,61 на 100 тыс. населения), в 2008 г. он в 3,4 раза превышал аналогичные показатели Западной Европы (1,67) и в 7,3 раза - данные, зарегистрированные в Северной Европе [142].
Кроме того, в Восточно-Европейском регионе, в отличие от северозападной части Европы, имеет место выраженная территориальная неоднородность уровней заболеваемости ГА. В ряде стран (Эстонии, Литве, Польше, Словении) среднемноголетние показатели заболеваемости (за 8 лет) находятся на низких уровнях (0,63-1,6 на 100 тыс. населения), сопоставимых с уровнями заболеваемости в северной и западной частях Европейского региона. В других странах, таких как Болгария и Румыния, среднемноголетние показатели заболеваемости (53,94 и 43,52 на 100 тыс. населения соответственно) значительно превышают среднемноголетний показатель по Восточно-Европейскому региону в целом (12,48 на 100 тыс. населения) [142].
Объективным способом оценки истинной интенсивности эпидемического процесса ГА на конкретной территории является определение уровня коллективного иммунитета к возбудителю данной инфекции. Крупномасштабное исследование (34 985 образцов сыворотки крови) по изучению восприимчивости к ГА различных возрастных групп населения, проведенное с 1996 по 2004 гг. в 10 странах Европы, показало, что у большинства детей и лиц молодого возраста anti-HAV IgG не обнаруживаются [111]. Наибольшая восприимчивость к ВГА была выявлена среди населения Финляндии, где более чем у 80% лиц моложе 50 лет anti-HAV IgG не выявлялись, а наименьшая - в Румынии, в которой доля восприимчивых к ВГА составляет 42% среди лиц моложе 30 лет и лишь 6% -
среди лиц старше 30 лет. В остальных странах восприимчивость к ВГА у лиц моложе 30 лет и старше 30 лет составила 70-94% и 26-71% соответственно.
Низкий уровень коллективного иммунитета против ВГА отмечается и в других странах Европы [98, 362, 363], что на фоне высокого уровня санитарно-коммунального благополучия обусловливает специфические для данной территории характер и частоту возникновения вспышек ГА. Среди 31 описанных в научной литературе вспышек ГА, возникших в Европе в период с 2001 по 2010 гг., было выявлено 15 вспышек с контактно-бытовым путем передачи возбудителя, 11 - с пищевым путем передачи, 2-е водным и в 3 вспышках наблюдался смешанный характер распространения инфекции (парентеральным путем среди потребителей инъекционных наркотиков и контактно-бытовым путем - среди населения с низким уровнем доходов). Общее число пострадавших при вспышках составило более 8600 человек. Характерной особенностью вспышек с контактно-бытовым путем передачи возбудителя являлось то, что большинство из них (8) было зарегистрировано среди мужчин-гомосексуалистов в странах Западной и Северной Европы [286].
Заболеваемость ГА в России, так же как и в Восточной Европе, в последние годы характеризуется выраженной тенденцией к снижению, что приближает показатели нашей страны к уровням заболеваемости в Восточно-Европейском регионе [11, 36, 40, 42, 54]. Разница между показателями в 2001 г. (79,4 на 100 тыс. населения), когда был зафиксирован последний значимый в РФ подъем заболеваемости ГА, и в 2008 г. (8,14 на 100 тыс. населения) составила 9,8 раз. В последующие 2 года заболеваемость ГА в России еще более сократилась, достигнув в 2010 г. самых низких значений за последние 50 лет наблюдения - 6,3 на 100 тыс. населения. На протяжении многих лет территория России характеризуется выраженными различиями интенсивности эпидемического процесса ГА. Это обусловлено совокупностью демографических, экономических, организационных и других социальных факторов: численностью и возрастной структурой населения, уровнем санитарно-коммунального благоустройства,
активностью миграционных процессов, уровнем развития здравоохранения, соблюдением санитарно-противоэпидемического режима в детских и образовательных организациях и на пищевых предприятиях, общим уровнем санитарной культуры населения, а также реализацией в некоторых регионах программ вакцинопрофилактики.
1.1.3. Генетическая гетерогенность популяции вируса гепатита А 1.1.3.1. Генетическая классификация вируса гепатита А
Впервые генетическая классификация ВГА была предложена В. Robertson в 1992 г. [171]. На основе анализа гомологии нуклеотидной последовательности фрагментов генома VP1/2A длиной 168 нуклеотидов (нт), полученных при секвенировании 152 изолятов вируса, было выделено семь генотипов ВГА. К разным генотипам были отнесены изоляты, имевшие степень генетической гомологии менее или равную 85%. Изоляты в пределах одного генотипа, генетически отличавшиеся друг от друга менее чем на 15%, но более чем на 7,5%, классифицировались как субтипы ВГА [171]. Длина использованного фрагмента генома оказалась слишком мала для достоверного определения филогенетического родства некоторых изолятов вируса, что привело к пересмотру классификации ВГА на основании анализа последовательностей гена VP1 длиной 900 нт, а также полных геномов [295].
Похожие диссертационные работы по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Молекулярно – генетическая характеристика вируса гепатита С в условиях применения препаратов прямого противовирусного действия2025 год, кандидат наук Рейнгардт Диана Эдуардовна
Значение лабораторной диагностики краснушной и парвовирусной инфекций в период элиминации краснухи2013 год, кандидат биологических наук Антипова, Анастасия Юрьевна
Распространённость вируса гепатита С среди условно здорового населения Российской Федерации2020 год, кандидат наук Соболева Наталья Васильевна
Биологическое разнообразие и экологические особенности вирусов гриппа А, выделенных от диких птиц юга Западной Сибири в 2014-2018 годах2021 год, кандидат наук Ли Синьсинь
Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем2002 год, доктор биологических наук Бобкова, Марина Ридовна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович, 2013 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Абдурахманов, Д.Т. Хронический гепатит В и D / Д.Т. Абдурахманов. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010.-288 с.
2. Алкогольные и вирусные циррозы печени у стационарных больных (19962005 гг.): распространенность и исходы / А. Хазанов, C.B. Плюснин, А.П. Васильев [и др.] // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. - 2007. - №2. - С. 19-27.
3. Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. 8 выпуск / ред. В. И. Прокровский, А. Б. Жебрун. - СПб.: ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2011.- 116с.
4. Водная вспышка гепатита А в Нижнем Новгороде / Г.Г. Онищенко, И.В. Шахгильдян, Е.Ю. Петров [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2007. - №3. - С.4-9.
5. Генетическое разнообразие вируса гепатита А в Сибири / В.А. Терновой, Е.В. Чаусов, Т.Ю. Бондаренко [и др.] // Вопросы вирусологии. - 2006. -Т.51, №1. - С.23-27.
6. Генотипирование штаммов вируса лихорадки Западного Нила, циркулирующих на юге России, как метод эпидемического принципа: принципы и результаты / А.Е. Платонов, Л.С. Карань, Т.А. Шопенская [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. -№2. - С.29-37.
7. Гепатит А у яванских и бурых макак при их заражении штаммом вируса гепатита А ЯМ-55 / А.Г. Анджапаридзе, Ю.А. Казачков, М.С. Балаян [и др.] // Вопросы вирусологии. - 1987. - №4. - С.440-448.
8. Гущин, А.Е. Разработка набора реагентов "Амплисенс HCV-генотип" для определения субтипов la, 1Ь, 2а, За вируса гепатита С / А.Е. Гущин, О.М. Носкова, Г.А. Шипулин // Вопросы вирусологии. - 2003. - №3. - С.45-49.
9. Дроздов, С.Г. Полиомиелит / С.Г. Дроздов, O.E. Иванова // Вопросы вирусологии. - 2012. - № Приложение 1. - С.76-90.
10. Зоны санитарной охраны источников водоснабжения и водопроводов питьевого назначения. Санитарные правила и нормы. СанПиН 2.1.4.111002.- 14.03.2002.
11. Курганова, Т.Ю. Эпидемиология и вакцинопрофилактика гепатита А в Вологодской области / Т.Ю. Курганова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.81-84.
12. Кучерявый, Ю.А. Хронический гепатит, цирроз печени и гепатоцеллюлярная карцинома - звенья одной цепи / Ю.А. Кучерявый, Н.Ю. Стукова, M.J1. Ахтаева // Клинические перспективы гастроэнтерологии, гепатологии. - 2012. - №5. - С.3-11.
13. Львов, Д.К. Гепатит В / Д.К. Львов, М.Ю. Щелканов // Медицинская вирусология / ред. Д. К. Львов. -М.: ООО "Медицинское информационное агентство", 2008. - С.472-480.
14. Манзенюк, И.Н. Оценка соответствия медицинских изделий для диагностики in vitro, международный и отечественный опыт / И.Н. Манзенюк, Г.А. Шипулин, В.В. Меньшиков // Клиническая лабораторная диагностика. - 2009. - №10. - С.48-53.
15. Мельникова, A.A. Осуществление эпидемиологического надзора за организацией и проведением иммунопрофилактики населения в Российской Федерации / A.A. Мельникова, Г.Г. Онищенко, В.Ю. Смоленский // Гигиена и санитария. - 2010. - №6. - С.4-12.
16. Мирзабеков, А.Д. Биочипы в биологии и медицине XXI века / А.Д. Мирзабеков // Вестник РАН. - 2003. - №5. - С.412^125.
17. Михайлов, М.И. Гепатит А - актуальная инфекция для России / М.И. Михайлов, И.В. Шахгильдян // Стерилизация и госпитальные инфекции. -2007. - №1. - С.13-16.
18. Михайлов, М.И. Энтеральные вирусные гепатиты (этиология, эпидемиология, диагностика, профилактика) / М.И. Михайлов, И.В. Шахгильдян, Г.Г. Онищенко. -М.: ФГОУ "ВУНМЦ Росздрава", 2007. -352 с.
19. Молекулярно-эпидемиологические особенности вспышки гепатита А в Москве / И.В. Карандашова, H.H. Пименов, А.Д. Неверов [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. -2012. -№3. - С.9-14.
20. О мероприятиях, направленных на ликвидацию острого гепатита В в Российской Федерации. Постановление Главного государственного саниратного врача РФ №34. - 30.05.2012.
21. Онищенко, Г.Г. Актуальные вопросы организации вакцинопрофилактики в Российской Федерации / Г.Г. Онищенко, Е.Б. Ежлова, A.A. Мельникова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. - №5. -С.110-114.
22. Онищенко, Г.Г. Актуальные проблемы профилактики инфекционных болезней на современном этапе / Г.Г. Онищенко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - №4. - С. 13-22.
23. Онищенко, Г.Г. Актуальные проблемы современной эпидемиологии (материалы к докладу на Всероссийской научной конференции "Проблемы современной эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики и профилактики актуальныех инфекций") / Г.Г. Онищенко // Гигиена и санитария. - 2011. - №4. - С.4-13.
24. Питьевая вода. Гигиенические требования к качеству воды централизованных систем питьевого водоснабжения. Контроль качества. Санитарные правила и нормы. СанПиН 2.1.4.559-96. - 18.06.1997.
25. Полимеразная цепная реакция в диагностике вирусных гепатитов / Чуланов, В. П., Шипулин, Г. А., O.E. Шипулина, Е.В. Волчкова [и др.] // Инфекционные болезни. - 2003. - Т.1, №1. - С.43^8.
26. Профилактика вирусного гепатита А. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.2825-10. - 30.12.2010.
27. Профилактика вирусного гепатита В. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.1.2341-08. - 28.02.2008.
28. Профилактика вирусных гепатитов. Общие требования к эпидемиологическому надзору за вирусными гепатитами. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.958-00. - 01.02.2000.
29. Разработка набора реагентов для определения генотипов А, В, С и D вируса гепатита В (HBV) методом полимеразной цепной реакции (ПНР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией "АмплиСенс HBV-генотип-FRT" / И.В. Карандашова, А.Д. Неверов, В.А. Долгин [и др.]: Молекулярная диагностика - 2010.VII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием. - Москва, 2010. - Т.1. - С.224-227.
30. Результаты испытаний препарата "АмплиСенс HBV Монитор-FRT" тест-системы для количественного определения ДНК вируса гепатита В методом ГТЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени" / Е.В. Эльберт, P.A. Волкова, В.Г. Петухов [и др.]: Генодиагностика инфекционных болезней - 2007 (Молекулярная диагностика - 2007). Сб. трудов VI Всерос. науч.-практ. конф. -Москва, 2007.-Т.1.-С.325-326.
31. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. В 2 томах. Том I / ред. В. И. Прокровский. - М.: Медицина, 1993. - 464 с.
32. Ряпис, Л.А. Молекулярная эпидемиология брюшного тифа / Л.А. Ряпис, В.Д. Беляков // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1996. - №4. - С.96-99.
33. Слепцова, С.С. Вирусные гепатиты В и D как основные факторы формирования цирроза и первичного рака печени в Республике Саха (Якутия) / С.С. Слепцова, А.Г. Рахманова, Т.Т. Бугаева // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2012. - №2. - С. 109-115.
34. Современная стратегия контроля за гепатитом А: опыт проведения плановой вакцинации в рамках регионального календаря профилактических прививок / В.И. Шахгильдян, М.И. Михайлов, О.Н. Ершова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2011. - №2. - С.51-55.
35. Современные особенности эпидемического процесса гепатита А в России и странах Европы, определяющие стратегии его профилактики / В.П. Чуланов, H.H. Пименов, И.В. Карандашова, C.B. Комарова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2012. - №3. - С.28-34.
36. Современные эпидемиологические закономерности и эффективность вакцинации против гепатита А в Российской Федерации / И.В. Шахгильдян, М.И. Михайлов, O.E. Попова [и др.] // Инфекционные болезни. -2006. -Т.4, №1. - С.50-57.
37. Солодовников, Ю.П. Вирусный гепатит А / Ю.П. Солодовников, Б.В. Городиский // Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. В 2 томах. Том II / ред. В. И. Прокровский. - М.: Медицина, 1993. - С.104-115.
38. Спонтанный гепатит у яванской макаки, подвергнутой воздействию иммунодепрессантов / А.Г. Анджапаридзе, В.Ф. Полещук, H.A. Замятина [и др.] // Вопросы вирусологии. - 1985. - №4. - С.468-474.
39. Справочник по гепатологии / ред. Н. А. Мухин. -М.: Литтерра, 2009. -416 с.
40. Туркутюков, В.Б. Эпидемиология гепатита А в Приморском крае / В.Б. Туркутюков, В.М. Воронок, Е.М. Ибрагимова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.91-93.
41. Характеристика манифестного и скрытого компонентов эпидемического процесса гепатита А в городах России / C.J1. Мукомолов, Л.И. Шляхтенко, М. Valle [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - №3. - С.35-39.
42. Характеристика современных проявлений эпидемического процесса гепатита А в России и эффективность вакцинации для профилактики и купирования вспышек этой инфекции / И.В. Шахгильдян, М.И. Михайлов, О.Н. Ершова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2006. -№4. - С.21-29.
43. Черкасский, Б.Л. Инфекционные и паразитарные болезни человека: справочник эпидемиолога / Б.Л. Черкасский. -М.: Медицинская газета, 1994.-617 с.
44. Черкасский, Б.Л. Руководство по общей эпидемиологии / Б.Л. Черкасский. -М.: Медицина, 2001. - 560 с.
45. Чуланов, В.П. Проблемы лекарственной резистентности при противовирусной терапии хронического гепатита В / В.П. Чуланов // Клиническая гастроэнтерология и гепатология. - 2011. - №3. - С. 167-172.
46. Чуланов, В.П. Резистентность к противовирусным препаратам при хроническом гепатите В / В.П. Чуланов // Фарматека. - 2010. -№4. - С.20-26.
47. Чуланов, В.П. Роль полимеразной цепной реакции в диагностике острых вирусных гепатитов: автореф. дисс. ... канд. мед. наук. / Чуланов Владимир Петрович; Московская медицинская академия им. И.М. Сеченова. - М., 2003.
48. Шаханина, И.Л. "Стандартные" величины экономического ущерба, наносимого инфекционными болезнями / И.Л. Шаханина, Л.А. Осипова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 1999. - №3. - С. 14.
49. Шаханина, И.JI. Экономический ущерб, наносимый инфекционными болезнями, в Российской Федерации по состоянию на декабрь 2000 г. / И.Л. Шаханина, Л.А. Осипова, О.И. Радуто // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2001. - №6. - С.58.
50. Шахгильдян, И.В. Гепатит А / И.В. Шахгильдян, Д.К. Львов // Медицинская вирусология / ред. Д. К. Львов. -М.: ООО "Медицинское информационное агентство", 2008. - С.369-372.
51. Эпидемиологический и молекулярно-биологический анализ причин подъема заболеваемости гепатитом А в Республике Тыва в 2008 году / О. Попова, К.К. Кюрегян, Л.Ю. Ильченко [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - №3. - С.23-26.
52. Эпидемиологический надзор за гепатитом В. Методические указания. МУ 3.1.2792-10.-20.12.2010.
53. Эпидемиологический надзор и профилактика вирусного гепатита А. Методические указания. МУ 3.1.2837-11.-28.01.2011.
54. Эпидемиололгическая характеристика гепатита А в Сибирском федеральном округе / Г.М. Дмитриева, Л.П. Нурсаянова, Н.И. Шульгина [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.87-90.
55. A case-control study for clinical and molecular biological differences between hepatitis В viruses of genotypes В and C. Japan HBV Genotype Research Group / E. Orito, M. Mizokami, H. Sakugawa [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. -2001.-Vol. 33, №1. - P.218-223.
56. A chromosome 17:7 translocation is associated with a hepatitis В virus DNA integration in human hepatocellular carcinoma DNA / M. Meyer, K.H. Wiedorn, P.H. Hofschneider [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1992. - Vol. 15, №4. - P.665-671.
57. A genetic variant of hepatitis В virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new
genotype J / K. Tatematsu, Y. Tanaka, F. Kurbanov [et al.] // Journal of virology.
- 2009. - Vol. 83, №20. - P. 10538-10547.
58. A large population histology study showing the lack of association between ALT elevation and significant fibrosis in chronic hepatitis B / W.-K. Seto, C.-L. Lai, P.P.C. Ip [et al.] // PloS one. - 2012. - Vol. 7, №2. - P.e32622.
59. A multistate outbreak of hepatitis A associated with semidried tomatoes in Australia, 2009 / E.J. Donnan, J.E. Fielding, J.E. Gregory [et al.] // Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2012. - Vol. 54, №6. - P.775-781.
60. A multistate, foodborne outbreak of hepatitis A. National Hepatitis A Investigation Team / Y.J. Hutin, V. Pool, E.H. Cramer [et al.] // The New England journal of medicine. - 1999. - Vol. 340, №8. - P.595-602.
61. A nationwide molecular epidemiological study on hepatitis B virus in Indonesia: identification of two novel subgenotypes, B8 and C7 / Mulyanto, S. Depamede, K. Surayah [et al.] // Archives of virology. -2009. - Vol. 154, №7. -P.1047-1059.
62. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness / L. Stuyver, G. De, G. Van [et al.] // The Journal of general virology.
- 2000. - Vol. 81, №Pt 1. - P.67-74.
63. A new intertype recombinant between genotypes C and D of hepatitis B virus identified in China / Z. Wang, Z. Liu, G. Zeng [et al.] // The Journal of general virology. - 2005. - Vol. 86, №Pt 4. - P.985-990.
64. A new subtype (subgenotype) Ac (A3) of hepatitis B virus and recombination between genotypes A and E in Cameroon / F. Kurbanov, Y. Tanaka, K. Fujiwara [et al.] // The Journal of general virology. -2005. - Vol. 86, №Pt 7. -P.2047-2056.
65. A novel hepatitis B virus (HBV) subgenotype D (D8) strain, resulting from recombination between genotypes D and E, is circulating in Niger along with
HBV/E strains / C. Abdou, S. Brichler, W. Mansour [et al.] // The Journal of general virology. - 2010. - Vol. 91, №Pt 6. - P. 1609-1620.
66. A novel method for efficient amplification of whole hepatitis B virus genomes permits rapid functional analysis and reveals deletion mutants in immunosuppressed patients / S. Gunther, B.C. Li, S. Miska [et al.] // Journal of virology. - 1995. - Vol. 69, №9. - P.5437-5444.
67. A study of the binding ability of pre-Sl and S2 proteins of hepatitis B virus to human serum albumin / K.Q. Hu, Z.Q. Yu, F.H. Li, L.J. Hao // Hepato-gastroenterology. - 1990. - Vol. 37, №3. - P.338-341.
68. Alavian, S. Hepatitis A / S. Alavian // Australian family physician. -2011. -Vol. 40, №4.-P. 185.
69. Alter, M. Epidemiology and prevention of hepatitis B / M. Alter // Seminars in liver disease. - 2003. - Vol. 23, №1. - P.39-46.
70. An outbreak of hepatitis A among homeless drug users in Rotterdam, The Netherlands / Tjon, G M S, H. Gotz, A.G. Koek [et al.] // Journal of medical virology. - 2005. - Vol. 77, №3. - P.360-366.
71. An outbreak of hepatitis A associated with green onions / C. Wheeler, T. Vogt, G. Armstrong [et al.] // The New England journal of medicine. -2005. -Vol. 353, №9. - P.890-897.
72. An outbreak of hepatitis A associated with green onions / C.M. Dentinger, W.A. Bower, O.V. Nainan [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2001. -Vol. 183, №8. - P.1273-1276.
73. An outbreak of hepatitis A associated with the consumption of raw beef / E. Robesyn, K. de Schrijver, E. Wollants [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. -Vol. 44, №3. - P.207-210.
74. Analysis of full-length hepatitis A virus genome in sera from patients with fulminant and self-limited acute type A hepatitis / K. Fujiwara, O. Yokosuka, K. Fukai [et al.] // Journal of hepatology. - 2001. - Vol. 35, №1. - P. 112-119.
75. Analysis of the entire nucleotide sequence of hepatitis B virus genotype B in the Philippines reveals a new subgenotype of genotype B / F. Nagasaki, H. Niitsuma, J. Cervantes [et al.] // The Journal of general virology. - 2006. - Vol. 87, №Pt 5. -P.1175-1180.
76. Analysis of the full-length genomes of novel hepatitis B virus subgenotypes Cll and C12 in Papua, Indonesia / Mulyanto, S.N. Depamede, A. Wahyono [et al.] // Journal of medical virology. - 2011. - Vol. 83, №1. - P.54-64.
77. Analysis of the genotype-determining region of hepatitis A viral RNA in relation to disease severities / K. Fujiwara, O. Yokosuka, F. Imazeki [et al.] // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. -2003. -Vol. 25, №2.-P. 124-134.
78. Arnheim, N. The polymerase chain reaction / N. Arnheim // Genetic engineering. - 1990.-Vol. 12. - P.115-137.
79. Arzumanyan, A. Pathogenic mechanisms in HBV- and HCV-associated hepatocellular carcinoma / A. Arzumanyan, H.M.G.P.V. Reis, M.A. Feitelson // Nature reviews. - 2013. - Vol. 13, №2. - P. 123-135.
80. Ashida, M. Molecular cloning of the hepatitis A virus receptor from a simian cell line / M. Ashida, C. Hamada // The Journal of general virology. - 1997. - Vol. 78 (Pt 7).-P. 1565-1569.
81. Asian-Pacific consensus statement on the management of chronic hepatitis B: a 2012 update / Y.-F. Liaw, J.-H. Kao, T. Piratvisuth [h £p.] // Hepatology international. - 2012. - T.6, №3. - C.531-561.
82. Association between severity of type A hepatitis and nucleotide variations in the 5' non-translated region of hepatitis A virus RNA: strains from fulminant
hepatitis have fewer nucleotide substitutions / K. Fujiwara, O. Yokosuka, T. Ehata [et al.] // Gut. - 2002. - Vol. 51, №1. - P.82-88.
83. Associations between hepatitis B virus genotype and mutants and the risk of hepatocellular carcinoma / H.-I. Yang, S.-H. Yeh, P.-J. Chen [et al.] // Journal of the National Cancer Institute. - 2008. - Vol. 100, №16. - P. 1134-1143.
84. Attenuation and cell culture adaptation of hepatitis A virus (HAV): a genetic analysis with HAV cDNA /J.I. Cohen, B. Rosenblum, S.M. Feinstone [et al.] // Journal of virology. - 1989. - Vol. 63, №12. - P.5364-5370.
85. Bader, T.F. Viral Hepatitis: practical evaluation and treatment / T.F. Bader. -Seattle, Toronto, Goettingen, Bern: Hogrefe and Huber Publishers, 2000. -266 p.
86. Bancroft, W.H. Detection of additional antigenic determinants of hepatitis B antigen / W.H. Bancroft, F.K. Mundon, P.K. Russell // Journal of immunology (Baltimore, Md. - 1972. - Vol. 109, №4. - P.842-848.
87. Bartholomeusz, A. Hepatitis B virus genotypes: comparison of genotyping methods / A. Bartholomeusz, S. Schaefer // Reviews in medical virology. - 2004. -Vol. 14, №1. - P.3-16.
88. BATTEN, P.J. Infectious hepatitis. Infectiousness during the presymptomatic phase of the disease / P.J. BATTEN, V.E. RUNTE, H.G. SKINNER // American journal of hygiene. - 1963. - Vol. 77. - P.129-136.
89. Bayesian coalescent inference of hepatitis A virus populations: evolutionary rates and patterns / G. Moratorio, M. Costa-Mattioli, R. Piovani [et al.] // The Journal of general virology. - 2007. - Vol. 88, №Pt 11. - P.3039-3042.
90. Bedossa, P. An algorithm for the grading of activity in chronic hepatitis C. The METAVIR Cooperative Study Group / P. Bedossa, T. Poynard // Hepatology (Baltimore, Md. - 1996. - Vol. 24, №2. - P.289-293.
91. Beier, D.R. Single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis as a tool for genetic mapping / D.R. Beier // Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society. - 1993. - Vol. 4, №11.- P.627-631.
92. Box, George E. P. Bayesian inference in statistical analysis / Box, George E. P, G.C. Tiao. - New York: Wiley, 1992. - xviii, 588.
93. Boyd, S.D. Diagnostic applications of high-throughput DNA sequencing / S.D. Boyd // Annual review of pathology. - 2013. - Vol. 8. - P.381-410.
94. Brooks, H.A. Detection and quantification of hepatitis A virus in seawater via real-time RT-PCR / H.A. Brooks, R.M. Gersberg, A.K. Dhar // Journal of virological methods. - 2005. - Vol. 127, №2. - P.109-118.
95. Burke, D.S. Wild Malaysian cynomolgus monkeys are exposed to hepatitis A virus / D.S. Burke, G.B. Heisey // The American journal of tropical medicine and hygiene. - 1984. - Vol. 33, №5. - P.940-944.
96. Changes in different regions of hepatitis B virus gene in hepatitis B 'e' antigen-negative patients with chronic hepatitis B: the effect of long-term lamivudine therapy / M. Buti, R. Jardi, F. Rodriguez-Frias [et al.] // Alimentary pharmacology & therapeutics. - 2005. - Vol. 21, №11. - P. 1349-1356.
97. Changing hepatitis A epidemiology and the need for vaccination in Korea / J.-H. Kang, K.-Y. Lee, C.-H. Kim, D. Sim // Asian Pacific journal of allergy and immunology / launched by the Allergy and Immunology Society of Thailand. -2004. - Vol. 22, №4. - P.237-242.
98. Changing risk profile of hepatitis A in The Netherlands: a comparison of seroprevalence in 1995-1996 and 2006-2007 / L. Verhoef, H.J. Boot, M. Koopmans [et al.] // Epidemiology and infection. -2011. - Vol. 139, №8. -P.1172-1180.
99. Characterization of a genetic variant of human hepatitis A virus / B. Khanna, J.E. Spelbring, B.L. Innis, B.H. Robertson // Journal of medical virology. - 1992. -Vol. 36, №2.-P.l 18-124.
100. Characterization of the complete genomic sequence of genotype II hepatitis A virus (CF53/Berne isolate) / L. Lu, K. Ching, P. de [et al.] // The Journal of general virology. - 2004. - Vol. 85, №Pt 10. - P.2943-2952.
101. Chen, C.J. Epidemiology of hepatitis B virus infection in the Asia-Pacific region / C.J. Chen, L.Y. Wang, M.W. Yu // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2000. - Vol. 15 Suppl. - P.E3-6.
102. Chu, C.-J. Clinical significance of hepatitis B virus genotypes / C.-J. Chu, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2002. - Vol. 35, №5. - P. 1274-1276.
103. Chu, C.-M. Chronic hepatitis B virus infection acquired in childhood: special emphasis on prognostic and therapeutic implication of delayed HBeAg seroconversion / C.-M. Chu, Y.-F. Liaw // Journal of viral hepatitis. - 2007. -Vol. 14, №3. -P.147-152.
104. Classification of hepatitis B virus genotype B into 2 major types based on characterization of a novel subgenotype in Arctic indigenous populations / T. Sakamoto, Y. Tanaka, J. Simonetti [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2007. - Vol. 196, №10. - P.1487-1492.
105. Clinical and molecular characteristics of hepatitis A virus infections during the years 1992-2003 in Ogaki, a centrally located city of Japan / H. Toyoda, T. Kumada, S. Kiriyama [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. - Vol. 44, №2. - P.145-148.
106. Clinical outcomes of hepatitis B virus (HBV) genotypes B and C in Japanese patients with chronic HBV infection / N. Furusyo, H. Nakashima, K. Kashiwagi [et al.] // The American journal of tropical medicine and hygiene. - 2002. -Vol. 67, №2. - P.151-157.
107. Cloning of the hepatitis B virus genome in Escherichia coli / A. Fritsch, C. Pourcel, P. Charnay, P. Tiollais // Comptes rendus hebdomadaires des seances de l'Academie des sciences. - 1978. - T.287, №16. - C.1453-1456.
108. Co-circulation of genotype IA and new variant IB hepatitis A virus in outbreaks of acute hepatitis in Hungary—2003/2004 / G. Reuter, A. Juhasz, L. Kosztolanyi [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. - Vol. 78, №11. - P. 1392-1397.
109. Cohen, J.I. Hepatitis A virus: insights from molecular biology / J.I. Cohen // Hepatology (Baltimore, Md. - 1989. - Vol. 9, №6. - P.889-895.
110. Comparative analysis of disease severity between genotypes IA and IIIA of hepatitis A virus / Y.K. Yoon, J.E. Yeon, J.H. Kim [h £p.] // Journal of Medical Virology. - 2011. - T.83, №8. - C.1308-1314.
111. Comparative hepatitis A seroepidemiology in 10 European countries / S. Kurkela, R. Pebody, G. Kafatos [et al.] // Epidemiology and infection. - 2012. -P.l-10.
112. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains / H. Norder, B. Hammas, S. Lofdahl [et al.] // The Journal of general virology. - 1992.-Vol. 73 (Pt 5). - P. 1201-1208.
113. Complete nucleotide sequence of an attenuated hepatitis A virus: comparison with wild-type virus / J.I. Cohen, B. Rosenblum, J.R. Ticehurst [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1987. - Vol. 84, №8. - P.2497-2501.
114. Control of hepatitis A by universal vaccination of children and adolescents: an achieved goal or a deferred appointment? / D. Martinelli, I. Bitetto, S. Tafuri [et al.] //Vaccine. -2010. - Vol. 28, №41. - P.6783-6788.
115. Convergence and coevolution of hepatitis B virus drug resistance / H. Thai, D.S. Campo, J. Lara [et al.] // Nature communications. - 2012. - Vol. 3. - P.789.
116. Costa-Mattioli, M. Analysis of sequential hepatitis A virus strains reveals coexistence of distinct viral subpopulations / M. Costa-Mattioli, E. Domingo, J. Cristina // The Journal of general virology. -2006. - Vol. 87, №Pt 1. -P.115-118.
117. Courouce, A.M. Australia antigen subtypes identification. Results / A.M. Courouce, J. Drouet, J.Y. Muller // Bibliotheca haematologica. - 1976. - Vol. 42. - P.89-127.
118. Courouce-Pauty, A.M. Distribution of HBsAg subtypes in the world / A.M. Courouce-Pauty, A. Plancon, J.P. Soulier // Vox sanguinis. - 1983. - Vol.44, №4.-P. 197-211.
119. Cowie, B. Is there an optimal genetic target for molecular analysis of hepatitis B virus transmission? / B. Cowie // Journal of clinical microbiology. - 2006. -Vol. 44, №8. - P.3051.
120. Cuthbert, J.A. Hepatitis A: old and new / J.A. Cuthbert // Clinical microbiology reviews.-2001.-Vol. 14, №1. - P.38-58.
121. Cytotoxic T lymphocyte response to a wild type hepatitis B virus epitope in patients chronically infected by variant viruses carrying substitutions within the epitope / A. Bertoletti, A. Costanzo, F.V. Chisari [et al.] // The Journal of experimental medicine. - 1994. - Vol. 180, №3. - P.933-943.
122. Definition of the primary structure of hepatitis B virus (HBV) pre-S hepatocyte binding domain using random peptide libraries / F. D'Mello, C.D. Partidos, M.W. Steward, C.R. Howard // Virology. - 1997. - Vol. 237, №2. - P.319-326.
123. Detection and differentiation of human hepatitis A strains by commercial quantitative real-time RT-PCR tests / G. Sanchez, S. Populaire, S. Butot [et al.] // Journal of virological methods. - 2006. - Vol. 132, №1-2. - P. 160-165.
124. Detection and typing of HPV genotypes in various cervical lesions by HPV oligonucleotide microarray / T.S. Hwang, J.K. Jeong, M. Park [et al.] // Gynecologic oncology. - 2003. - Vol. 90, № 1. - P.51-56.
125. Detection of hepatitis A virus by extraction of viral RNA and molecular hybridization / J.R. Ticehurst, S.M. Feinstone, T. Chestnut [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1987. - Vol. 25, №10. - P. 1822-1829.
126. Detection of hepatitis A virus in the feces of patients with naturally acquired infections / A.G. Coulepis, S.A. Locarnini, N.I. Lehmann, I.D. Gust // The Journal of infectious diseases. - 1980.-Vol. 141, №2. - P.151-156.
127. Detection of pre-Sl proteins in peripheral blood mononuclear cells from patients with HBV infection / F. Zoulim, L. Vitvitski, P. Bouffard [et al.] // Journal of hepatology.- 1991.-Vol. 12, №2. - P. 150-156.
128. Determinants for sustained HBeAg response to lamivudine therapy / R.-N. Chien, C.-T. Yeh, S.-L. Tsai [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. -2003. -Vol. 38, №5. - P.1267-1273.
129. Diagnosis of hepatitis a virus infection: a molecular approach / O.V. Nainan, G. Xia, G. Vaughan, H.S. Margolis // Clinical microbiology reviews. - 2006. -Vol. 19, №1. -P.63-79.
130. Direct sequencing of hepatitis A virus strains isolated during an epidemic in France / V. Apaire-Marchais, B.H. Robertson, V. Aubineau-Ferre [et al.] // Applied and environmental microbiology. - 1995. - Vol.61, №11. -P.3977-3980.
131. Distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes among HBV carriers in the Cote d'lvoire: complete genome sequence and phylogenetic relatedness of HBV genotype E / S. Suzuki, F. Sugauchi, E. Orito [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 69, №4. - P.459^165.
132. Distribution of hepatitis B virus genotypes among American blood donors determined with a PreS2 epitope enzyme-linked immunosorbent assay kit / T. Moriya, I.K. Kuramoto, H. Yoshizawa, P.V. Holland // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №3. - P.877-880.
133. Distribution of hepatitis B virus genotypes among patients with chronic infection in Japan shifting toward an increase of genotype A / K. Matsuura, Y. Tanaka, S. Hige [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47, №5. - P.1476-1483.
134. Diversity of hepatitis B virus infecting Malaysian candidate blood donors is driven by viral and host factors / B.H. Meldal, A.H. Bon, D. Prati [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2011. - Vol. 18, №2. - P.91-101.
135.EASL clinical practice guidelines: Management of chronic hepatitis B virus infection // Journal of hepatology. - 2012. - Vol. 57, №1. - P. 167-185.
136. Ecology and prevention of a shellfish-associated hepatitis A epidemic in Shanghai, China / Z.Y. Xu, Z.H. Li, J.X. Wang [et al.] // Vaccine. - 1992. -Vol. 10 Suppl 1. - P.S67-8.
137. Eight genotypes (A-H) of hepatitis B virus infecting patients from San Francisco and their demographic, clinical, and virological characteristics / H. Kato, R. Gish, N. Bzowej [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №4. - P.516-521.
138. Elucidation of hepatitis C virus transmission and early diversification by single genome sequencing / H. Li, M.B. Stoddard, S. Wang [et al.] // PLoS pathogens. -2012. - Vol. 8, №8. - P.el002880.
139. Epidemiological and genetic analysis of a sustained community-wide outbreak of hepatitis A in the Republic of Korea, 2008: a hospital-based case-control study / Y.K. Yoon, B.C. Chun, H.K. Lee [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. -Vol. 46, №2.-P. 184-188.
140. Epidemiology of hepatitis A virus infections, Germany, 2007-2008 / M.S. Faber, K. Stark, S.C. Behnke [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2009. - Vol. 15, №11. - P.1760-1768.
141. Ethnogeographical structure of hepatitis B virus genotype distribution in Indonesia and discovery of a new subgenotype, B9 / M. Thedja, D. Muljono, N. Nurainy [et al.] // Archives of virology. - 2011. - Vol. 156, №5. - P.855-868.
142. European Centre for Disease Prevention and Control. Annual Epidemiological Report on Communicable Diseases in Europe 2009 / European Centre for Disease Prevention and Control. - Stockholm: ECDC, 2009. - 222 p.
143. Evaluation of intra-host variants of the entire hepatitis B virus genome / S. Ramachandran, X. Zhai, H. Thai [et al.] // PloS one. -2011. - Vol. 6, №9. -P.e25232.
144. Evaluation of the Abbott investigational use only RealTime hepatitis C virus (HCV) assay and comparison to the Roche TaqMan HCV analyte-specific reagent assay / M.T. Pyne, E.Q. Konnick, A. Phansalkar, D.R. Hillyard // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47, №9. - P.2872-2878.
145. Excretion of hepatitis A virus (HAV) in adults: comparison of immunologic and molecular detection methods and relationship between HAV positivity and infectivity in tamarins / L.B. Polish, B.H. Robertson, B. Khanna [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1999. - Vol. 37, №11. - P.3 615-3617.
146. Excretion of hepatitis A virus in the stools of hospitalized hepatitis patients / M. Carl, R.J. Kantor, H.M. Webster [et al.] // Journal of medical virology. - 1982. -Vol. 9, №2. - P.125-129.
147. Expression mechanism of the hepatitis B virus (HBV) C gene and biosynthesis of HBe antigen / O. Jean-Jean, M. Levrero, H. Will [et al.] // Virology. - 1989. -Vol. 170, №1. -P.99-106.
148. Fagan, E.A. Viral hepatitis / E.A. Fagan, T.J. Harrison. -Oxford: BIOS Scientific Publ., 2000. - 311 p.
149. Fattovich, G. Natural history and prognosis of hepatitis B / G. Fattovich // Seminars in liver disease. - 2003. - Vol. 23, №1. - P.47-58.
150. Fattovich, G. Natural history of chronic hepatitis B: special emphasis on disease progression and prognostic factors / G. Fattovich, F. Bortolotti, F. Donato // Journal of hepatology. - 2008. - Vol. 48, №2. - P.335-352.
151. Fattovich, G. Natural history of hepatitis B / G. Fattovich // Journal of hepatology.-2003.- Vol. 39 Suppl 1.-P.S50-8.
152. Fecal shedding of hepatitis A virus in Indian patients with hepatitis A and in experimentally infected Rhesus monkey / S.D. Chitambar, M.S. Joshi, M.A. Sreenivasan, V.A. Arankalle // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. - 2001. - Vol. 19, №3. - P.237-246.
153. Feinstone, S.M. Hepatitis A: detection by immune electron microscopy of a viruslike antigen associated with acute illness / S.M. Feinstone, A.Z. Kapikian, R.H. Purceli // Science (New York, N. - 1973. - Vol. 182, №4116. - P. 10261028.
154. Feitelson, M. Hepatitis B virus infection and primary hepatocellular carcinoma / M. Feitelson // Clinical microbiology reviews. - 1992. - Vol. 5, №3. -P.275-301.
155. Flehmig, B. Hepatitis A / B. Flehmig // Bailliere's clinical gastroenterology. -1990. - Vol. 4, №3. - P.707-720.
156. Follow-up and indications for liver biopsy in HBeAg-negative chronic hepatitis B virus infection with persistently normal ALT: a systematic review / G.V. Papatheodoridis, S. Manolakopoulos, Y.-F. Liaw, A. Lok // Journal of hepatology. - 2012. - Vol. 57, №1. - P. 196-202.
157. Frequent detection of hepatitis A viral RNA in serum during the early convalescent phase of acute hepatitis A / K. Fujiwara, O. Yokosuka, T. Ehata [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1997. - Vol. 26, №6. - P. 1634-1639.
158. Full-length human immunodeficiency virus type 1 genomes from subtype C-infected seroconverters in India, with evidence of intersubtype recombination / K.S. Lole, R.C. Bollinger, R.S. Paranjape [et al.] // Journal of virology. - 1999. -Vol. 73, №1. - P.152-160.
159. Full-length sequences of subgenotype IIIA and IIIB hepatitis A virus isolates: characterization of genotype III HAV genomes / K. Endo, M. Takahashi, K. Masuko [et al.] // Virus research. - 2007. - Vol. 126, №1-2. - P. 116-127.
160. Fung, S. Hepatitis B virus genotypes: do they play a role in the outcome of HBV infection? / S. Fung, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2004. - Vol. 40, №4. - P.790-792.
161. Gandhe, S.S. Hepatitis B virus genotypes and serotypes in western India: lack of clinical significance /S.S. Gandhe, M.S. Chadha, V.A. Arankalle // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 69, №3. - P.324-330.
162. Ganem, D. Hepatitis B virus reverse transcriptase and its many roles in hepadnaviral genomic replication / D. Ganem, J.R. Pollack, J. Tavis // Infectious agents and disease. - 1994. - Vol. 3, №2-3. - P.85-93.
163. Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data / M. Kearse, R. Moir, A. Wilson [et al.] // Bioinformatics (Oxford, England). - 2012. - Vol. 28, №12. - P. 1647-1649.
164. Genetic analysis of HAV strains recovered from patients with acute hepatitis from Southern Italy / M. Chironna, A. Grottola, C. Lanave [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 70, №3. - P.343-349.
165. Genetic analysis of hepatitis A virus isolates from Brazil / de Paula, Vanessa S, L. Lu, C. Niel [et al.] // Journal of medical virology. -2004. - Vol. 73, №3. -P.378-383.
166. Genetic analysis of hepatitis A virus outbreak in France confirms the co-circulation of subgenotypes la, lb and reveals a new genetic lineage / M. Costa-Mattioli, S. Monpoeho, C. Schvoerer [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №2. - P.233-240.
167. Genetic analysis of hepatitis A virus strains recovered from the environment and from patients with acute hepatitis / S. Pina, M. Buti, R. Jardi [et al.] // The Journal of general virology. - 2001. - Vol. 82, №Pt 12. - P.2955-2963.
168. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes / H. Norder, A.-M. Courouce, P. Coursaget [et al.] // Intervirology. - 2004. - Vol. 47, №6. - P.289-309.
169. Genetic relatedness of Cuban HAV wild-type isolates / B.I. Diaz, C.A. Sariol, A. Normann [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol.64, №2. -P.96-103.
170. Genetic relatedness of hepatitis A virus isolates during a community-wide outbreak / B.H. Robertson, F. Averhoff, T.L. Cromeans [et al.] // Journal of medical virology. - 2000. - Vol. 62, №2. - P.144-150.
171. Genetic relatedness of hepatitis A virus strains recovered from different geographical regions / B.H. Robertson, R.W. Jansen, B. Khanna [et al.] // The Journal of general virology. - 1992. - Vol. 73 (Pt 6). - P.1365-1377.
172. Genetic variability of hepatitis A virus in South America reveals heterogeneity and co-circulation during epidemic outbreaks / M. Costa-Mattioli, V. Ferre, S. Monpoeho [et al.] // The Journal of general virology. - 2001. - Vol. 82, №Pt 11. -P.2647-2652.
173. Genomic characterization of HBV genotype F in Bolivia: genotype F subgenotypes correlate with geographic distribution and T(1858) variant / T.T. Huy, H. Ushijima, T. Sata, K. Abe // Archives of virology. -2006. - Vol. 151, №3. - P.589-597.
174. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America / P. Arauz-Ruiz, H. Norder, B. Robertson, L. Magnius // The Journal of general virology. - 2002. - Vol. 83, №Pt 8. - P.2059-2073.
175. Genotype may correlate with liver carcinogenesis and tumor characteristics in cirrhotic patients infected with hepatitis B virus subtype adw / A. Tsubota, Y. Arase, F. Ren [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №2. -P.257-265.
176. Genotype mixtures of hepatitis B virus in patients treated with interferon / C. Hannoun, K. Krogsgaard, P. Horal, M. Lindh // The Journal of infectious diseases. - 2002. - Vol. 186, №6. - P.752-759.
177. Genotype, phylogenetic analysis, and transmission pattern of occult hepatitis B virus (HBV) infection in families of asymptomatic HBsAg carriers / S. Datta, A. Banerjee, P.K. Chandra [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. - Vol. 78, №1. - P.53-59.
178. Genotypes and clinical phenotypes of hepatitis B virus in patients with chronic hepatitis B virus infection / J.-H. Kao, P.-J. Chen, M.-Y. Lai, D.-S. Chen // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №4. - P. 1207-1209.
179. Genotypic dominance and novel recombinations in HBV genotype B and C co-infected intravenous drug users / B.-F. Chen, J.-H. Kao, C.-J. Liu [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №1. - P.13-22.
180. Gish, R.G. Genotyping and genomic sequencing in clinical practice / R.G. Gish, S. Locarnini // Clinics in liver disease. - 2007. - Vol. 11, №4. - P.761-95, viii.
181. Gojobori, T. Molecular clock of viral evolution, and the neutral theory / T. Gojobori, E.N. Moriyama, M. Kimura // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1990. - Vol. 87, №24. -P.10015-10018.
182. Goswami, B.B. Identification of genetic variants of hepatitis A virus / B.B. Goswami, W.3. Burkhardt, T.A. Cebula // Journal of virological methods. - 1997. -Vol. 65, №1. - P.95-103.
183. Green, M.R. Molecular cloning / M.R. Green, J. Sambrook. - Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012. - 1890 c.
184. Grotzinger, T. Sensitive method for identification of minor hepatitis B mutant viruses / T. Grotzinger, H. Will // Virology. - 1992. - Vol. 187, №1. -P.383-387.
185. Guirgis, Bassem S S. Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical implications / Guirgis, Bassem S S, R.O. Abbas, Azzazy, Hassan ME// International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases. -2010. - Vol. 14, №11. -P.e941-53.
186. Gupta, A. Changing epidemiology of hepatitis A infection / A. Gupta, Y. Chawla // The Indian journal of medical research. - 2008. - Vol. 128, №1. - P.7-9.
187. Hall, B.G. Building phylogenetic trees from molecular data with MEGA / B.G. Hall // Molecular biology and evolution. - 2013. - Vol. 30, №5. - P. 1229-1235.
188. Hanada, K. A large variation in the rates of synonymous substitution for RNA viruses and its relationship to a diversity of viral infection and transmission modes / K. Hanada, Y. Suzuki, T. Gojobori // Molecular biology and evolution. -2004. - Vol. 21, №6. - P. 1074-1080.
189. Hannoun, C. Long-term mutation rates in the hepatitis B virus genome / C. Hannoun, P. Horal, M. Lindh // The Journal of general virology. - 2000. -Vol. 81, №Pt 1. - P.75-83.
190. Hasegawa, M. Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA / M. Hasegawa, H. Kishino, T. Yano // Journal of molecular evolution. - 1985. - Vol. 22, №2. - P.160-174.
191. Hayashi, K. PCR-SSCP: a method for detection of mutations / K. Hayashi // Genetic analysis, techniques and applications. - 1992. - Vol. 9, №3. - P.73-79.
192. HBsAg seroclearance in chronic hepatitis B in the Chinese: virological, histological, and clinical aspects / M.-F. Yuen, D.-H. Wong, E. Sablon [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2004. - Vol. 39, №6. - P. 1694-1701.
193. HBV genotype B is associated with better response to interferon therapy in HBeAg(+) chronic hepatitis than genotype C / C. Wai, C.-J. Chu, M. Hussain, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2002. - Vol. 36, №6. - P. 1425-1430.
194. Hepatitis A in Tunisia: phylogenetic analysis of hepatitis A virus from 2001 to 2004 / H. Gharbi-Khelifi, V. Ferre, K. Sdiri [et al.] // Journal of virological methods. - 2006. - Vol. 138, №1-2. - P. 109-116.
195. Hepatitis a molecular epidemiology in the United States, 1996-1997: sources of infection and implications of vaccination policy / O. Nainan, G. Armstrong, X.-H. Han [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2005. - Vol. 191, №6. -P.957-963.
196. Hepatitis A outbreak in a neonatal intensive care unit: risk factors for transmission and evidence of prolonged viral excretion among preterm infants / L.S. Rosenblum, M.E. Villarino, O.V. Nainan [et al.] // The Journal of infectious diseases. - 1991.-Vol. 164, №3. - P.476-482.
197. Hepatitis A viral genotypes and clinical relevance: Clinical and molecular characterization of hepatitis A virus isolates from northern India / Z. Hussain, B. Das, S. Husain [et al.] // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. - 2005. - Vol. 32, №1. - P. 16-24.
198. Hepatitis A virus genotype and its correlation with the clinical outcome of acute hepatitis A in Korea: 2006-2008 / H. Yun, H. Lee, J.-H. Jang [et al.] // Journal of medical virology. - 2011. - Vol. 83, №12. - P.2073-2081.
199. Hepatitis A virus: a test method for virucidal activity / M.H. Wolff, J. Schmitt, M. Rahaus, A. Konig // The Journal of hospital infection. - 2001. - Vol. 48 Suppl A. -P.S18-22.
200. Hepatitis B and Delta virus infection among heterosexuals, homosexuals and bisexual men / A. Mele, E. Franco, F. Caprilli [et al.] // European journal of epidemiology. - 1988. - Vol. 4, №4. - P.488-491.
201. Hepatitis B genotypes and the response to interferon therapy / J.H. Kao, N.H. Wu, P.J. Chen [et al.] // Journal of hepatology. -2000. - Vol. 33, №6. -P.998-1002.
202. Hepatitis B genotypes correlate with clinical outcomes in patients with chronic hepatitis B / J.H. Kao, P.J. Chen, M.Y. Lai, D.S. Chen // Gastroenterology. -2000. - Vol. 118, №3. - P.554-559.
203. Hepatitis B surface antigen (HBsAg) derived from yeast cells (Hansenula polymorpha) used to establish an influence of antigenic subtype (adw2, adr, ayw3) in measuring the immune response after vaccination / R.A. Heijtink, P. van Bergen, K. Melber [et al.] // Vaccine. - 2002. - Vol. 20, №17-18. - P.2191-2196.
204. Hepatitis B virus carrier state in black children in Ovamboland: role of perinatal and horizontal infection / J.F. Botha, M.J. Ritchie, G.M. Dusheiko [et al.] // Lancet. - 1984.-Vol. 1, №8388. -P.1210-1212.
205. Hepatitis B virus core protein mutations are concentrated in B cell epitopes in progressive disease and in T helper cell epitopes during clinical remission / W.F. Carman, W. Boner, G. Fattovich [et al.] // The Journal of infectious diseases. -
1997. - Vol. 175, №5. - P.1093-1100.
206. Hepatitis B virus DNA in saliva, urine, and seminal fluid of carriers of hepatitis B e antigen / P. Karayiannis, D.M. Novick, A.S. Lok [et al.] // British medical journal (Clinical research ed. - 1985. - Vol. 290, №6485. - P. 1853-1855.
207. Hepatitis B virus genotype assignment using restriction fragment length polymorphism patterns / M. Mizokami, T. Nakano, E. Orito [et al.] // FEBS letters. - 1999.-Vol. 450, №1-2. - P.66-71.
208. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 74, №2. - P.221-227.
209. Hepatitis B virus genotype has no impact on hepatitis B e antigen seroconversion after lamivudine treatment / H.L.-Y. Chan, M.-L. Wong, A.Y. Hui [et al.] // World journal of gastroenterology : WJG. - 2003. - Vol. 9, №12. -P.2695-2697.
210. Hepatitis B virus genotypes and hepatocellular carcinoma in Japan / H. Fujie, K. Moriya, Y. Shintani [et al.] // Gastroenterology. -2001. - Vol. 120, №6. -P.1564-1565.
211. Hepatitis B virus genotypes and virologic response in 694 patients in phase III studies of adefovir dipivoxill / C. Westland, W. Delaney, 4th., H. Yang [et al.] // Gastroenterology. - 2003. - Vol. 125, №1. - P.107-116.
212. Hepatitis B virus genotypes B and C do not affect the antiviral response to lamivudine / M.-F. Yuen, D.K.-H. Wong, E. Sablon [et al.] // Antiviral therapy. -2003. - Vol. 8, №6. - P.531-534.
213. Hepatitis B virus genotypes in the United States: results of a nationwide study / C.-J. Chu, E.B. Keeffe, S.-H. Han [et al.] // Gastroenterology. - 2003. - Vol. 125, №2.-P.444-451.
214. Hepatitis B virus: predominance of genotype D in primitive tribes of the Andaman and Nicobar islands, India (1989-1999) / V.A. Arankalle, K.M. Murhekar, S.S. Gandhe [et al.] // The Journal of general virology. -2003. -Vol. 84, №Pt 7. - P.1915-1920.
215. Hepatitis C virus (HCV) circulates as a population of different but closely related genomes: quasispecies nature of HCV genome distribution / M. Martell, J.I. Esteban, J. Quer [et al.] // Journal of virology. - 1992. - Vol.66, №5. -P.3225-3229.
216. Hepatitis C virus genotypes: clinical relevance and therapeutic implications / C.-M. Lee, C.-H. Hung, S.-N. Lu, C.-S. Changchien // Chang Gung medical journal. -2008.-Vol. 31, №1. - P.16-25.
217. Hepatitis C virus transmission from an anesthesiologist to a patient / S. Cody, O. Nainan, R. Garfein [et al.] // Archives of internal medicine. -2002. - Vol. 162, №3. - P.345-350.
218. Hepatitis in Albanian children: molecular analysis of hepatitis A virus isolates / R. Gabrieli, G. Sanchez, A. Macaluso [et al.] // Journal of medical virology. -2004. - Vol. 72, №4. - P.533-537.
219. High and persistent excretion of hepatitis A virus in immunocompetent patients / G. Tjon, R. Coutinho, d. van [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. -Vol. 78, №11. - P.1398-1405.
220. High speed DNA sequencing by capillary electrophoresis / J.A. Luckey, H. Drossman, A.J. Kostichka [et al.] // Nucleic acids research. - 1990. - Vol. 18, №15. - P.4417-4421.
221. Hnatyszyn, H. Chronic hepatitis C and genotyping: the clinical significance of determining HCV genotypes / H. Hnatyszyn // Antiviral therapy. - 2005. -Vol. 10, №1. -P.1-11.
222. Hollinger, F.B. Hepatitis A Virus / F.B. Hollinger, S.U. Emerson // Fields' virology / ed. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley. - Philadelphia, Pa., London: Wolters Kluwer/Lippincott Williams & Wilkins, 2007. - P.912-947.
223. Human liver plasma membranes contain receptors for the hepatitis B virus pre-S1 region and, via polymerized human serum albumin, for the pre-S2 region / P. Pontisso, M.A. Petit, M.J. Bankowski, M.E. Peeples // Journal of virology. -
1989.-Vol. 63, №5. - P.1981-1988.
224. Huy, T.T. New complex recombinant genotype of hepatitis B virus identified in Vietnam / T.T. Huy, T.T. Ngoc, K. Abe // Journal of virology. - 2008. - Vol. 82, №11.- P.5657-5663.
225. Identification and characterization of novel hepatitis B virus subgenotype C10 in Nusa Tenggara, Indonesia / Mulyanto, S.N. Depamede, K. Surayah [et al.] // Archives of virology. - 2010. - Vol. 155, №5. - P.705-715.
226. Identification of a surface glycoprotein on African green monkey kidney cells as a receptor for hepatitis A virus / G. Kaplan, A. Totsuka, P. Thompson [et al.] // The EMBO journal. - 1996. - Vol. 15, №16. - P.4282-4296.
227. Identification of four novel subgenotypes (C13-C16) and two inter-genotypic recombinants (C12/G and C13/B3) of hepatitis B virus in Papua province, Indonesia / Mulyanto, P. Pancawardani, S. Depamede [et al.] // Virus research. -2012.-Vol. 163, №1. - P. 129-140.
228. Identification of polymerized-albumin receptor domain in the pre-S2 region of hepatitis B virus surface antigen M protein / Y. Itoh, S. Kuroda, T. Miyazaki [et al.] // Journal of biotechnology. - 1992. - Vol. 23, №1. - P.71-82.
229. Identification of VP1/2A and 2C as virulence genes of hepatitis A virus and demonstration of genetic instability of 2C / S. Emerson, Y. Huang, H. Nguyen [et al.] // Journal of virology. - 2002. - Vol. 76, №17. - P.8551-8559.
230. Increased circulation of hepatitis A virus genotype IIIA over the last decade in St Petersburg, Russia / S. Mukomolov, M. Kontio, N. Zheleznova [et al.] // Journal of medical virology. - 2012. - Vol. 84, №10. - P. 1528-1534.
231. Infectious hepatitis: detection of virus during the incubation period and in clinically inapparent infection / S. Krugman, R. WARD, J.P. Giles [et al.] // The New England journal of medicine. - 1959. - Vol. 261. - P.729-734.
232. Influence of genotype on hepatitis B surface antigen kinetics in hepatitis B e antigen-negative patients treated with pegylated interferon-alpha2a / R. Moucari, M. Martinot-Peignoux, V. Mackiewicz [et al.] // Antiviral therapy. - 2009. -Vol. 14, №8.-P.l 183-1188.
233. Influence of hepatitis B virus genotype on the long-term outcome of chronic hepatitis B in western patients / J.M. Sanchez-Tapias, J. Costa, A. Mas [et al.] // Gastroenterology. - 2002. - Vol. 123, №6. - P.1848-1856.
234. Influence of hepatitis B virus genotypes on the progression of chronic type B liver disease / H. Sumi, O. Yokosuka, N. Seki [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md.-2003.-Vol. 37, №1.-P. 19-26.
235. Intrahepatic expression of pre-S proteins of hepatitis B virus and its possible relation to liver cell necrosis / K.Q. Hu, L.J. Hao, Y.Y. Zhang, Y.K. Wang // The American journal of gastroenterology. - 1989. - Vol. 84, №12. - P.1538-1542.
236. Investigation of infection with Campylobacter jejuni in a man with hypogammaglobulinemia using PCR-single-stranded conformational polymorphism (PCR-SSCP) typing / J. Moore, M. Curran, D. Wareing [et al.] // International journal of medical microbiology : IJMM. - 2001. - Vol. 291, №1. -P.21-25.
237. Investigation of the presence of different broad-spectrum beta-lactamases among clinical isolates of Enterobacteriacae / E. Nagy, Z. Pragai, Z. Koczian [et al.] // Acta microbiologica et immunologica Hungarica. - 1998. - Vol.45, №3-4. -P.433^46.
238. Is hepatitis B virus subtype testing useful in predicting virological response and resistance to lamivudine? / M. Buti, M. Cotrina, A. Valdes [et al.] // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №3. - P.445-446.
239. Jacobsen, K.H. Declining hepatitis A seroprevalence: a global review and analysis / K.H. Jacobsen, J.S. Koopman // Epidemiology and infection. - 2004. -Vol. 132, №6. - P.1005-1022.
240. Jacobsen, K.H. Hepatitis A virus seroprevalence by age and world region, 1990 and 2005 / K.H. Jacobsen, S.T. Wiersma // Vaccine. - 2010. - Vol. 28, №41. -P.6653-6657.
241. Jacobsen, K.H. The effects of socioeconomic development on worldwide hepatitis A virus seroprevalence patterns / K.H. Jacobsen, J.S. Koopman // International journal of epidemiology. - 2005. - Vol. 34, №3. - P.600-609.
242. Kann, M. Hepatitis B / M. Kann, W.H. Gerlich // Topley and Wilson's microbiology and microbial infections. Volume 1: Virology. / ed. B. W. Mahy, L. Collier, A. Balows, M. Sussman. - London: Edward Arnold, 1998. - P.745-774.
243. Kann, M. Recent studies on replication of hepatitis B virus / M. Kann, X. Lu, W.H. Gerlich // Journal of hepatology. - 1995. - Vol. 22, №1 Suppl. - P.9-13.
244. Kao, J.-H. Hepatitis B viral genotypes and lamivudine resistance / J.-H. Kao, C.-J. Liu, D.-S. Chen // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №2. - P.303-304.
245. Kao, J.-H. Hepatitis B viral genotypes: clinical relevance and molecular characteristics / J.-H. Kao // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2002. -Vol. 17, №6. - P.643-650.
246. Kao, J.-H. Molecular epidemiology of hepatitis B virus / J.-H. Kao // The Korean journal of internal medicine. - 2011. - Vol. 26, №3. - P.255-261.
247. Kato-Maeda, M. Microarray analysis of pathogens and their interaction with hosts / M. Kato-Maeda, Q. Gao, P.M. Small // Cellular microbiology. -2001. -Vol. 3, №11. -P.713-719.
248. Kew, M.C. Epidemiology of chronic hepatitis B virus infection, hepatocellular carcinoma, and hepatitis B virus-induced hepatocellular carcinoma / M.C. Kew // Pathologie-biologie. - 2010. - Vol. 58-60, №4-5. - P.273-277.
249. Kidd-Ljunggren, K. Genetic variability in hepatitis B viruses / K. Kidd-Ljunggren, Y. Miyakawa, A.H. Kidd // The Journal of general virology. - 2002. -Vol. 83, №Pt 6. - P.1267-1280.
250. Kimura, M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences / M. Kimura // Journal of molecular evolution. - 1980. - Vol. 16, №2. - P.l 11-120.
251. Kinetic PCR analysis: real-time monitoring of DNA amplification reactions / R. Higuchi, C. Fockler, G. Dollinger, R. Watson // Bio/technology (Nature Publishing Company). - 1993. - Vol. 11, №9. - P.1026-1030.
252. Klein, D. Quantification using real-time PCR technology: applications and limitations / D. Klein // Trends in molecular medicine. -2002. - Vol. 8, №6. -P.257-260.
253. Koslap-Petraco, M. Hepatitis A: disease burden and current childhood vaccination strategies in the United States / M. Koslap-Petraco, M. Shub, R. Judelsohn // Journal of pediatric health care : official publication of National Association of Pediatric Nurse Associates & Practitioners. -2008. - Vol.22, №1. - P.3-11.
254. Koziel, M.J. Hepatitis B Virus and Hepatitis Delta Virus / M.J. Koziel, C.L. Thio // Mandell, Douglas and Bennett's principles and practice of infectious diseases. Volume 2 / ed. G. L. Mandell, J. E. Bennett, R. Dolin. - New York: Churchill Livingstone, 2010. -P.2059-2086.
255. Krugman, S. The natural history of infectious hepatitis / S. Krugman, R. WARD, J.P. Giles // The American journal of medicine. - 1962. - Vol. 32. -P.717-728.
256. Kwok, S. Avoiding false positives with PCR / S. Kwok, R. Higuchi // Nature. -1989. - Vol. 339, №6221. - P.237-238.
257. Lau, J.Y. Molecular virology and pathogenesis of hepatitis B / J.Y. Lau, T.L. Wright // Lancet. - 1993. - Vol. 342, №8883. - P.1335-1340.
258. Lavanchy, D. Hepatitis B virus epidemiology, disease burden, treatment, and current and emerging prevention and control measures / D. Lavanchy // Journal of viral hepatitis. - 2004. - Vol. 11, №2. - P.97-107.
259. Lavanchy, D. Worldwide epidemiology of HBV infection, disease burden, and vaccine prevention / D. Lavanchy // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2005. - Vol. 34 Suppl 1.-P.S1-3.
260. Le Bouvier, G L. The heterogeneity of Australia antigen / Le Bouvier, G L // The Journal of infectious diseases. - 1971. - Vol. 123, №6. -P.671-675.
261. Lemon, S.M. Genetic, antigenic and biological differences between strains of hepatitis A virus / S.M. Lemon, R.W. Jansen, E.A. Brown // Vaccine. - 1992. -Vol. 10 Suppl 1. - P.S40-4.
262. Lin, C.-L. The clinical implications of hepatitis B virus genotype: Recent advances / C.-L. Lin, J.-H. Kao // Journal of gastroenterology and hepatology. -2011.-Vol. 26 Suppl 1.-P. 123-130.
263. Lok, A.S.F. Chronic hepatitis B: update 2009 / A.S.F. Lok, B.J. McMahon // Hepatology (Baltimore, Md. - 2009. - Vol. 50, №3. - P.661-662.
264. Lok, A.S.-F. Viral hepatitis B and D. / A.S.-F. Lok, H.L.-Y. Chan // Comprehensive clinical hepatology / ed. J. G. O'Grady, J. R. Lake, P. D. Howdle. - London: Mosby, 2000. - P. 12.1-22.
265. Long-term outcome of chronic hepatitis B in Caucasian patients: mortality after 25 years / G. Fattovich, N. Olivari, M. Pasino [et al.] // Gut. -2008. - Vol. 57, №1. - P.84-90.
266. Loss of HBsAg antigen during treatment with entecavir or lamivudine in nucleoside-naive HBeAg-positive patients with chronic hepatitis B / R.G. Gish, T.-T. Chang, C.-L. Lai [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2010. - Vol. 17, №1. -P. 16-22.
267. Mackay, I.M. Real-time PCR in virology / I.M. Mackay, K.E. Arden, A. Nitsche // Nucleic acids research. - 2002. - Vol. 30, №6. - P.1292-1305.
268. Magnius, L.O. Subtypes, genotypes and molecular epidemiology of the hepatitis B virus as reflected by sequence variability of the S-gene / L.O. Magnius, H. Norder // Intervirology. - 1995. - Vol. 38, №1-2. - P.24-34.
269. Mahoney, F.J. Update on diagnosis, management, and prevention of hepatitis B virus infection / F.J. Mahoney // Clinical microbiology reviews. - 1999. -Vol. 12, №2. - P.351-366.
270. Maini, M.K. How can the cellular immune response control hepatitis B virus replication? / M.K. Maini, A. Bertoletti // Journal of viral hepatitis. - 2000. -Vol. 7, №5. - P.321-326.
271. Major human Hepatitis A virus genotype in Hong Kong marine waters and detection by real-time PCR / N. Yang, Chu, Daniel Ling Ho, Wong, Minnie Man Lai [et al.] // Marine pollution bulletin. - 2011. - Vol. 62, №12. - P.2654-2658.
272. Mathur, P. Epidemiological transition of hepatitis A in India: issues for vaccination in developing countries / P. Mathur, N.K. Arora // The Indian journal of medical research. - 2008. - Vol. 128, №6. - P.699-704.
273. Matthews, R.E. The classification and nomenclature of viruses. Summary of results of meetings of the International Committee on Taxonomy of Viruses in The Hague, September 1978 / R.E. Matthews // Intervirology. - 1979. - Vol. 11, №3. - P.133-135.
274. Mayerat, C. Does hepatitis B virus (HBV) genotype influence the clinical outcome of HBV infection? / C. Mayerat, A. Mantegani, P.C. Frei // Journal of viral hepatitis. - 1999. - Vol. 6, №4. - P.299-304.
275. McCollum, R.W. The natural history of hepatitis / R.W. McCollum // Bulletin of the New York Academy of Medicine. - 1969. - Vol. 45, №2. - P. 127-142.
276. McMichael, A.J. Invited commentary~"molecular epidemiology": new pathway or new travelling companion? / A.J. McMichael // American journal of epidemiology. - 1994. -Vol. 140, №1. - P. 1-11.
277. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D. Peterson, N. Peterson [et al.] // Molecular biology and evolution. -2011. -Vol. 28, №10.-P.2731-2739.
278. Melnick, J.L. Classification of hepatitis A virus as enterovirus type 72 and of hepatitis B virus as hepadnavirus type 1 / J.L. Melnick // Intervirology. - 1982. -Vol. 18, №3. - P.105-106.
279. Michielsen, P. Viral hepatitis B and hepatocellular carcinoma / P. Michielsen, E. Ho // Acta gastro-enterologica Belgica. - 2011. - Vol. 74, №1. - P.4-8.
280. Microarray analysis of evolution of RNA viruses: evidence of circulation of virulent highly divergent vaccine-derived polioviruses / E. Cherkasova, M. Laassri, V. Chizhikov [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2003. - Vol. 100, №16. - P.9398-9403.
281. Microarray for hepatitis B virus genotyping and detection of 994 mutations along the genome / M. Gauthier, B. Bonnaud, M. Arsac [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2010. - Vol. 48, №11. - P.4207-4215.
282. Microarrays for genotyping human group a rotavirus by multiplex capture and type-specific primer extension / L. Lovmar, C. Fock, F. Espinoza [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41, №11. - P.5153-5158.
283. Molecular characterization of hepatitis a virus isolates from a transcontinental shellfish-borne outbreak / G. Sanchez, R. Pinto, H. Vanaclocha, A. Bosch // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №11. - P.4148-4155.
284. Molecular characterization of hepatitis A virus isolates from Argentina / M.S. Munne, S. Vladimirsky, L. Otegui [et al.] // Journal of medical virology. - 2007. - Vol. 79, №7. - P.887-894.
285. Molecular cloning and characterization of hepatitis A virus cDNA / J.R. Ticehurst, V.R. Racaniello, B.M. Baroudy [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1983. - Vol. 80, №19. -P.5885-5889.
286. Molecular epidemiological studies show that hepatitis A virus is endemic among active homosexual men in Europe / K. Stene-Johansen, G. Tjon, E. Schreier [et al.] // Journal of medical virology. - 2007. - Vol. 79, №4. - P.356-365.
287. Molecular epidemiology and evolution in an outbreak of fulminant hepatitis B virus / M. Bracho, M. Gosalbes, F. Gonzalez [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44, №4. - P. 1288-1294.
288. Molecular epidemiology of a hepatitis C virus outbreak in a hemodialysis unit / M. Bracho, M. Gosalbes, D. Blasco [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2005. - Vol. 43, №6. - P.2750-2755.
289. Molecular epidemiology of a hepatitis C virus outbreak in a leprosy sanatorium in Japan / H. Teramoto, K. Shiogama, Y. Mizutani [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2011. - Vol. 49, №9. - P.3358-3360.
290. Molecular epidemiology of foodborne hepatitis a outbreaks in the United States, 2003 / J. Amon, R. Devasia, G. Xia [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2005. - Vol. 192, №8. - P.1323-1330.
291. Molecular epidemiology of hepatitis A in St. Petersburg, Russia, 1997-2003 / I. Davidkin, N. Zheleznova, S. Jokinen [et al.] // Journal of medical virology. -2007. - Vol. 79, №6. - P.657-662.
292. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Brazilian Amazon / De Paula, Vanessa Salete, C. Niel, S.C. Teves [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2006. - Vol. 21, №9. - P.1435-1438.
293. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Korea / K.S. Byun, J.H. Kim, K.J. Song [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. -2001. -Vol. 16, №5. - P.519-524.
294. Molecular epidemiology of hepatitis A virus infections in Catalonia, Spain, 2005-2009: circulation of newly emerging strains / U. Perez-Sautu, M. Costafreda, J. Lite [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. -2011. - Vol. 52, №2. -P.98-102.
295. Molecular evolution of hepatitis A virus: a new classification based on the complete VP1 protein / M. Costa-Mattioli, J. Cristina, H. Romero [et al.] // Journal of virology. - 2002. - Vol. 76, №18. - P.9516-9525.
296. Molecular evolution of hepatitis B virus over 25 years / C. Osiowy, E. Giles, Y. Tanaka [et al.] // Journal of virology. - 2006. - Vol. 80, №21. - P. 10307-10314.
297. Molecular evolutionary analysis of the complete nucleotide sequence of hepatitis B virus (HBV) in a case of HBV infection acquired through a needlestick accident / F. Sugauchi, M. Mizokami, E. Orito [et al.] // Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2000. - Vol. 31, №5. - P.l 195-1201.
298. Molecular genotyping and epidemiology of measles virus transmission in the World Health Organization European Region, 2007-2009 / A. Mankertz, M.N. Mulders, S. Shulga [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2011. -Vol. 204 Suppl 1. - P.S335-42.
299. Moolla, N. Regulatory elements of hepatitis B virus transcription / N. Moolla, M. Kew, P. Arbuthnot // Journal of viral hepatitis. - 2002. - Vol. 9, №5. - P.323-331.
300. Morozov, V. Homologous recombination between different genotypes of hepatitis B virus / V. Morozov, M. Pisareva, M. Groudinin // Gene. - 2000. -Vol. 260, №1-2. - P.55-65.
301.Mullis, K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F.A. Faloona // Methods in enzymology. - 1987. -Vol. 155. - P.335-350.
302. Multistate Outbreak of Hepatitis A Associated with Frozen Strawberries / M.T. Niu, L.B. Polish, B.H. Robertson [h ap.] // Journal of Infectious Diseases. -
1992. - T.166, №3. - C.518-524.
303. Mutations of the core promoter and response to interferon treatment in chronic replicative hepatitis B / A. Erhardt, U. Reineke, D. Blondin [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2000. - Vol. 31, №3. - P.716-725.
304. Naumova, A.K. Biological consequences of interactions between hepatitis B virus and human nonhepatic cellular genomes / A.K. Naumova, L.L. Kisselev // Biomedical science. - 1990. - Vol. 1, №3. - P.233-238.
305. Nieselt-Struwe, K. Quartet-mapping, a generalization of the likelihood-mapping procedure / K. Nieselt-Struwe, A. von Haeseler // Molecular biology and evolution. - 2001. - Vol. 18, №7. - P. 1204-1219.
306. Niesters, H.G. Standardization and quality control in molecular diagnostics / H.G. Niesters // Expert review of molecular diagnostics. - 2001. - Vol. 1, №2. -P.129-131.
307. Norder, H. Complete nucleotide sequences of six hepatitis B viral genomes encoding the surface antigen subtypes ayw4, adw4q-, and adrq- and their phylogenetic classification / H. Norder, A.M. Courouce, L.O. Magnius // Archives of virology. - 1993. - Vol. 8. - P.189-199.
308. Novel evidence of HBV recombination in family cluster infections in western China / B. Zhou, Z. Wang, J. Yang [et al.] // PloS one. - 2012. - Vol. 7, №6. -P.e38241.
309. Novel subgenotypes of hepatitis B virus genotypes C and D in Papua, Indonesia / M. Lusida, V. Nugrahaputra, R. Handajani [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2008. - Vol. 46, №7. - P.2160-2166.
310. Nucleotide sequence of the hepatitis B virus genome (subtype ayw) cloned in E. coli / F. Galibert, E. Mandart, F. Fitoussi [et al.] // Nature. - 1979. - Vol. 281, №5733. - P.646-650.
311. On the role of sexual behavior in the spread of hepatitis B infection / W. Szmuness, I. Much, A.M. Prince [et al.] // Annals of internal medicine. - 1975. -Vol. 83, №4. - P.489-495.
312. Ong, Y.-L. Quantitative real-time PCR: a critique of method and practical considerations / Y.-L. Ong, A. Irvine // Hematology (Amsterdam, Netherlands). -2002,- Vol. 7, №1. - P.59-67.
313. Ongoing outbreak of mumps affecting adolescents and young adults in Bavaria, Germany, August to October 2010 / W. Otto, A. Mankertz, S. Santibanez [et al.]
// Euro surveillance : bulletin europeen sur les maladies transmissibles. - 2010. -Vol. 15, №50.
314. Osiowy, C. Evaluation of the INNO-LiPA HBV genotyping assay for determination of hepatitis B virus genotype / C. Osiowy, E. Giles // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41, №12. - P.5473-5477.
315. Outbreak of food-borne infection with hepatitis A virus / Y. Tekeuchi, G. Kobayashi, Y. Matui [et al.] // Japanese journal of infectious diseases. - 2006. -Vol. 59, №5. - P.346.
316. Outbreak of infection with hepatitis A virus (HAV) associated with a foodhandler and confirmed by sequence analysis reveals a new HAV genotype IB variant / M. Chironna, P. Lopalco, R. Prato [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2004. - Vol. 42, №6. - P.2825-2828.
317. Outbreaks of hepatitis A in England and Wales associated with two co-circulating hepatitis A virus strains / S.-L. Ngui, J. Granerod, L.A. Jewes [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. - Vol. 80, №7. - P.l 181-1188.
318. Owiredu, W.K. Hepatitis B virus DNA in serum of healthy black African adults positive for hepatitis B surface antibody alone: possible association with recombination between genotypes A and D / W.K. Owiredu, A. Kramvis, M.C. Kew // Journal of medical virology. - 2001. - Vol. 64, №4. - P.441-454.
319. Pathogenesis of hepatitis A in orally inoculated owl monkeys (Aotus trivirgatus) / L.V. Asher, L.N. Binn, T.L. Mensing [et al.] // Journal of medical virology. -
1995. - Vol. 47, №3. - P.260-268.
320. PCR-single-stranded confirmational polymorphism analysis for non-culture-based subtyping of meningococcal strains in clinical specimens / J. Newcombe, S. Dyer, L. Blackman [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1997. -Vol. 35, №7. - P.1809-1812.
321. PCR-SSCP: a method for the molecular analysis of genetic diseases / V.K. Kakavas, P. Plageras, T.A. Vlachos [et al.] // Molecular biotechnology. - 2008. -Vol. 38, №2. - P.155-163.
322. Pegylated interferon alfa-2b alone or in combination with lamivudine for HBeAg-positive chronic hepatitis B: a randomised trial / Janssen, Harry L A, M. van Zonneveld, H. Senturk [et al.] // Lancet. -2005. - Vol.365, №9454. -P.123-129.
323. Pettersson, E. Generations of sequencing technologies / E. Pettersson, J. Lundeberg, A. Ahmadian // Genomics. - 2009. - Vol. 93, №2. - P.105-111.
324. Phylogenetic analysis of the precore/core gene of hepatitis B virus genotypes E and A in West Africa: new subtypes, mixed infections and recombinations / C. Olinger, V. Venard, M. Njayou [et al.] // The Journal of general virology. - 2006. -Vol. 87, №Pt 5.-P. 1163-1173.
325. Pineiro, y. Evolutionary history of Hepatitis B virus genotype F: an in-depth analysis of Argentine isolates / y. Pineiro, V. Mbayed, R. Campos // Virus genes. - 2003. - Vol. 27, №1. - P.103-110.
326. Point mutation in the S gene of hepatitis B virus for a d/y or w/r subtypic change in two blood donors carrying a surface antigen of compound subtype adyr or adwr / H. Okamoto, M. Imai, F. Tsuda [et al.] // Journal of virology. - 1987. -Vol. 61, №10. - P.3030-3034.
327. Polymorphisms of the hepatitis A virus cellular receptor 1 in African green monkey kidney cells result in antigenic variants that do not react with protective monoclonal antibody 190/4 / D. Feigelstock, P. Thompson, P. Mattoo, G.G. Kaplan // Journal of virology. - 1998. - Vol. 72, №7. - P.6218-6222.
328. Possible new hepatitis B virus genotype, southeast Asia / C. Olinger, P. Jutavijittum, J. Hubschen [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2008. -Vol. 14, №11. - P.1777-1780.
329. Presumed common source outbreaks of hepatitis A in an endemic area confirmed by limited sequencing within the VP1 region / P. Arauz-Ruiz, L. Sundqvist, Z. Garcia [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №3. - P.449-456.
330. Prevalence of HBV genotypes in Central and Eastern Europe / K. Deterding, I. Constantinescu, F.D. Nedelcu [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. -Vol. 80, №10. -P.1707-1711.
331. Prevalence of hepatitis A antibodies in schoolchildren in Catalonia (Spain) after the introduction of universal hepatitis A immunization / A. Dominguez, M. Bruguera, P. Plans [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №2. - P.172-176.
332. Probst, C. Intrinsic signals for the assembly of hepatitis A virus particles. Role of structural proteins VP4 and 2A / C. Probst, M. Jecht, V. Gauss-Muller // The Journal of biological chemistry. - 1999. - Vol. 274, №8. - P.4527^531.
333. Profile, spectrum and significance of HBV genotypes in chronic liver disease patients in the Indian subcontinent / V. Thakur, R.C. Guptan, S.N. Kazim [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. -2002. - Vol. 17, №2. -P. 165170.
334. Prolonged fecal excretion of hepatitis A virus in adult patients with hepatitis A as determined by polymerase chain reaction / H. Yotsuyanagi, K. Koike, K. Yasuda [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1996. - Vol. 24, №1. - P.10-13.
335. Provost, P.J. Propagation of human hepatitis A virus in cell culture in vitro / P.J. Provost, M.R. Hilleman // Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine. - 1979. -Vol. 160, №2. - P.213-221.
336. Quantification and duration of viraemia during hepatitis A infection as determined by real-time RT-PCR / M. Costa-Mattioli, S. Monpoeho, E. Nicand [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2002. - Vol. 9, №2. - P. 101-106.
337. Quantitation of hepatitis B virus genomic DNA by real-time detection PCR / A. Abe, K. Inoue, T. Tanaka [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1999. -Vol. 37, №9. - P.2899-2903.
338. Rakela, J. Fecal excretion of hepatitis A virus in humans / J. Rakela, J.W. Mosley // The Journal of infectious diseases. - 1977. - Vol. 135, №6. -P.933-938.
339. Rapid investigation of hepatitis A virus outbreak by single strand conformation polymorphism analysis / V. Mackiewicz, A.-M. Roque-Afonso, E. Marchadier [et al.] // Journal of medical virology. - 2005. - Vol. 76, №2. - P.271-278.
340. Real-time multiplex PCR assays / C.T. Wittwer, M.G. Herrmann, C.N. Gundry, K.S. Elenitoba-Johnson // Methods (San Diego, Calif. -2001. - Vol. 25, №4. -P.430-442.
341. Real-time PCR for detection and quantitation of hepatitis B virus DNA / R.W. Chen, H. Piiparinen, M. Seppanen [et al.] // Journal of medical virology. - 2001. - Vol. 65, №2. - P.250-256.
342. Recombination between sequences of hepatitis B virus from different genotypes / P.L. Bollyky, A. Rambaut, P.H. Harvey, E.C. Holmes // Journal of molecular evolution. - 1996. - Vol. 42, №2. - P.97-102.
343. Recombination of genotypes B and C in hepatitis B virus isolated from a Vietnamese patient with fulminant hepatitis / H.T.-T. Tran, H. Ushijima, T.T. Ngoc [et al.] // Japanese journal of infectious diseases. - 2003. - Vol. 56, №1. -P.35-37.
344. Recovery and sequence analysis of hepatitis a virus from springwater implicated in an outbreak of acute viral hepatitis / L.A. Tallon, D.C. Love, Z.S. Moore, M.D. Sobsey // Applied and environmental microbiology. -2008. - Vol. 74, №19. -P.6158-6160.
345. Replication strategy of human hepatitis B virus / H. Will, W. Reiser, T. Weimer [et al.] //Journal of virology. - 1987. - Vol. 61, №3. - P.904-911.
346. Risk factors for acute hepatitis B and its progression to chronic hepatitis in Shanghai, China / H.W. Zhang, J.H. Yin, Y.T. Li [et al.] // Gut. -2008. -Vol. 57, №12. - P.1713-1720.
347. Rizzetto, M. Hepatitis D: virology, clinical and epidemiological aspects / M. Rizzetto // Acta gastro-enterologica Belgica. -2000. - Vol. 63, №2. -P.221-224.
348. Robert, C.P. Monte Carlo statistical methods / C.P. Robert, G. Casella. - New York: Springer, 2004. - xxx, 645.
349. Robertson, B.H. Viral hepatitis and primates: historical and molecular analysis of human and nonhuman primate hepatitis A, B, and the GB-related viruses / B.H. Robertson // Journal of viral hepatitis. - 2001. - Vol. 8, №4. - P.233-242.
350. Role of environmental poliovirus surveillance in global polio eradication and beyond / T. Hovi, L.M. Shulman, van der Avoort, H [et al.] // Epidemiology and infection. - 2012. - Vol. 140, №1. - P. 1-13.
351. Rota, P.A. Molecular Epidemiology of Measles Virus / P.A. Rota, D.A. Featherstone, W.J. Bellini // Measles / ed. D. E. Griffin, M. B. A. Oldstone. -Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2009. - P. 129-150.
352. Sanger, F. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A.R. Coulson // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1977. - Vol. 74, №12. - P.5463-5467.
353. Sanger, F. The use of thin acrylamide gels for DNA sequencing / F. Sanger, A.R. Coulson//FEBS letters. - 1978. - Vol. 87, №1. - P. 107-110.
354. Schaller, H. Transcriptional control of hepadnavirus gene expression / H. Schaller, M. Fischer // Current topics in microbiology and immunology. - 1991. -Vol. 168. - P.21-39.
355. Scholtissek, C. Molecular epidemiology of influenza / C. Scholtissek// Archives of virology. - 1997. - Vol. 13. - P.99-103.
356. Seeger, C. Hepadnaviruses / C. Seeger, F. Zoulim, W.S. Mason // Fields' virology / ed. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley. - Philadelphia, Pa., London: Wolters Kluwer/Lippincott Williams & Wilkins, 2007. - P.2978-3030.
357. Seeger, C. Hepatitis B virus biology / C. Seeger, W.S. Mason // Microbiology and molecular biology reviews : MMBR. - 2000. - Vol. 64, №1. - P.51-68.
358. Selecting a genetic region for molecular analysis of hepatitis B virus transmission / S. Datta, A. Banerjee, P.K. Chandra, R. Chakravarty // Journal of clinical microbiology. - 2007. - Vol. 45, №2. - P.687; author reply 688.
359. Sequence analysis of a new hepatitis A virus naturally infecting cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) / O.V. Nainan, H.S. Margolis, B.H. Robertson [et al.] // The Journal of general virology. - 1991. - Vol. 72 (Pt 7). - P. 16851689.
360. Sequence and phylogenetic analysis of hepatitis B virus genotype G isolated in Germany / S. Vieth, C. Manegold, C. Drosten [et al.] // Virus genes. - 2002. -Vol. 24, №2. - P.153-156.
361. Sequential changes in hepatitis A virus genotype distribution in Estonia during 1994 to 2001 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 70, №2. - P. 187-193.
362. Seroepidemiology of hepatitis A among Greek children indicates that the virus is still prevalent: Implications for universal vaccination / A. Kyrka, A. Tragiannidis, D. Cassimos [et al.] // Journal of medical virology. - 2009. -Vol. 81, №4. - P.582-587.
363. Seroepidemiology of hepatitis A and hepatitis B virus in Luxembourg / J. Mossong, L. Putz, S. Patiny, F. Schneider // Epidemiology and infection. - 2006. -Vol. 134, №4. - P.808-813.
364. Serum hepatitis B virus DNA levels and liver histology in inactive FLBsAg carriers / M. Martinot-Peignoux, N. Boyer, M. Colombat [et al.] // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №4. - P.543-546.
365. Significance of hepatitis B viremia levels determined by a quantitative polymerase chain reaction assay in patients with hepatitis B e antigen-negative chronic hepatitis B virus infection / E.K. Manesis, G.V. Papatheodoridis, V. Sevastianos [et al.] // The American journal of gastroenterology. -2003. -Vol. 98, №10. - P.2261-2267.
366. Simian hepatitis A virus (HAV) strain AGM-27: comparison of genome structure and growth in cell culture with other HAV strains / S.A. Tsarev, S.U. Emerson, M.S. Balayan [et al.] // The Journal of general virology. - 1991. -Vol. 72 (Pt 7). - P.1677-1683.
367. Smith, D.B. Review: molecular epidemiology of hepatitis C virus / D.B. Smith, P. Simmonds // Journal of gastroenterology and hepatology. - 1997. - Vol. 12, №7. - P.522-527.
368. Specific enzymatic amplification of DNA in vitro: the polymerase chain reaction / K. Mullis, F. Faloona, S. Scharf [et al.] // Cold Spring Harbor symposia on quantitative biology. - 1986. - Vol. 51 Pt 1. - P.263-273.
369. Stirk, H.J. A topological model for hepatitis B surface antigen / H.J. Stirk, J.M. Thornton, C.R. Howard // Intervirology. - 1992. - Vol. 33, №3. - P.148-158.
370. Strimmer, K. Nucleotide substitution models / K. Strimmer, A. von Haeseler // The phylogenetic handbook / ed. M. Salemi, A.-M. Vandamme. - Cambridge, UK, New York: Cambridge University Press, 2003. - P.72-87.
371. Studies on the agent of infectious hepatitis; the disease produced in human volunteers by the agent cultivated in tissue culture or embryonated hen's eggs / M.E. DRAKE, A.W. KITTS, M.C. BLANCHARD [et al.] // The Journal of experimental medicine. - 1950. - Vol. 92, №3. - P.283-297.
372. Subgenotype diversity of hepatitis B virus American genotype F in Amerindians from Venezuela and the general population of Colombia / M. Devesa, C.L. Loureiro, Y. Rivas [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. - Vol. 80, №1. - P.20-26.
373. Successful treatment with peginterferon alfa-2b of HBeAg-positive HBV non-responders to standard interferon or lamivudine / H.J. Flink, B.E. Hansen, E.J. Heathcote [et al.] // The American journal of gastroenterology. - 2006. -Vol. 101, № 11. - P.2523-2529.
374. Sustained response of hepatitis B e antigen-negative patients 3 years after treatment with peginterferon alpha-2a / P. Marcellin, F. Bonino, Lau, George K K [et al.] // Gastroenterology. - 2009. - Vol. 136, №7. - P.2169-2179.e 1-4.
375. Swerdlow, H. Capillary gel electrophoresis for rapid, high resolution DNA sequencing / H. Swerdlow, R. Gesteland // Nucleic acids research. - 1990. -Vol. 18, №6. - P. 1415-1419.
376. T cell receptor usage of virus-specific CD8 cells and recognition of viral mutations during acute and persistent hepatitis B virus infection / M.K. Maini, S. Reignat, C. Boni [et al.] // European journal of immunology. - 2000. - Vol. 30, №11.-P.3 067-3 078.
377. Tajima, F. Simple methods for testing the molecular evolutionary clock hypothesis / F. Tajima // Genetics. - 1993. - Vol. 135, №2. - P.599-607.
378. Tamura, K. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees / K. Tamura, M. Nei // Molecular biology and evolution. - 1993. - Vol. 10, №3. - P.512-526.
379. Taxonomic classification of hepatitis A virus / I.D. Gust, A.G. Coulepis, S.M. Feinstone [et al.] // Intervirology. - 1983. - Vol. 20, №1. - P. 1-7.
380. Taxonomic classification of human hepatitis B virus / I.D. Gust, C.J. Burrell, A.G. Coulepis [et al.] // Intervirology. - 1986. - Vol. 25, №1. - P. 14-29.
381. Telbivudine versus lamivudine in Chinese patients with chronic hepatitis B: Results at 1 year of a randomized, double-blind trial / J. Hou, Y.-K. Yin, D. Xu [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2008. - Vol. 47, №2. - P.447-454.
382. The changing epidemiological pattern of hepatitis A in an urban population of India: emergence of a trend similar to the European countries / K. Das, A. Jain, S.
Gupta [et al.] // European journal of epidemiology. -2000. - Vol. 16, №6. -P.507-510.
383. The contributions of hepatitis В virus and hepatitis С virus infections to cirrhosis and primary liver cancer worldwide / J.F. Perz, G.L. Armstrong, L.A. Farrington [et al.] // Journal of hepatology. - 2006. - Vol. 45, №4. - P.529-538.
384. The dominant hepatitis В virus genotype identified in Tibet is a C/D hybrid / C. Cui, J. Shi, L. Hui [et al.] // The Journal of general virology. - 2002. - Vol. 83, №Pt 11,- P.2773-2777.
385. The efficacy of entecavir is similar regardless of disease-related baseline subgroups in treatment of nucleoside-naive, HBeAg(+) and HBeAg(-) patients with chronic hepatitis В / Y. Lurie, M.P. Manns, R.G. Gish [et al.] // Journal of hepatology. - 2005. - Vol. 42 Suppl 2. - P. 184.
386. The phylogenetic handbook / ed. P. Lemey, M. Salemi, A.-M. Vandamme. -Cambridge, New York: Cambridge University Press, 2009. - 723 p.
387. The phylogenetic handbook / ред. M. Salemi, A.-M. Vandamme. - Cambridge, UK, New York: Cambridge University Press, 2003. - 406 c.
388. The putative recombination of hepatitis В virus genotype В with pre-C/C region of genotype С / К. Luo, Z. Liu, H. He [et al.] // Virus genes. - 2004. - Vol. 29, №1. - P.31-41.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.