Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович
Чуланов, Владимир Петрович
кандидат наук
2013
- Специальность ВАК РФ14.02.02
- Количество страниц 380
Оглавление диссертации кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович
ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Гепатит А: общая характеристика и генетическая классификация вируса, клинико-эпидемиологические особенности инфекции
1.1.1. Строение вириона и организация генома вируса гепатита А
1.1.2. Современные особенности эпидемиологии гепатита А
1.1.3. Генетическая гетерогенность популяции вируса гепатита А
1.1.4. Определение генетических характеристик вируса гепатита А
в эпидемиологических исследованиях
1.1.5. Клиническое значение генетического разнообразия вируса гепатита А
1.2. Современные представления о гепатите В: строение и генетическое разнообразие вируса, распространенность и клиническое значение его генетических вариантов
1.2.1. Строение и свойства вируса гепатита В
1.2.2. Эпидемиология острой и хронических форм гепатита В
1.2.3. Генетическое разнообразие вируса гепатита В и его эпидемиологическое значение
1.2.4. Клиническое значение генетических вариантов вируса гепатита В
1.3. Методические подходы к изучению генетической гетерогенности вирусов гепатита АиВ
Глава 2. Материалы и методы исследования
2
2.1. Характеристика групп больных и образцов биологического материала, включенных в исследование
2.2. Общеклинические методы исследования
2.3. Иммунохимические методы исследования
2.4. Молекулярно-биологические методы исследования
2.4.1. Выделение вирусных РНК и ДНК
2.4.2. Обратная транскрипция и ПЦР-амплификация
2.4.3. Электрофоретический анализ
2.4.4. Субтипирование изолятов вируса гепатита А
2.4.5. Генотипирование и субгенотипирование изолятов вируса гепатита В
2.4.6. Секвенирование фрагментов геномов вирусов гепатита А и В
2.5. Определение серотипов вируса гепатита В
2.6. Филогенетический анализ генетических последовательностей вирусов гепатита А и В
2.7. Инструментальные методы исследования
2.8. Статистический анализ данных, полученных в ходе исследования
Глава 3. Современные особенности эпидемического процесса вирусных гепатитов А и В и система эпидемиологического надзора за данными инфекциями в РФ
3.1. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита А в РФ
3.2. Современные особенности эпидемического процесса
гепатита В в РФ
3.3. Система эпидемиологического надзора за гепатитами А и В в РФ
Глава 4. Распространенность генотипов и субтипов вируса
гепатита А на территории РФ и ряда стран СНГ
4.1. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории РФ
4.2. Распространенность генотипов и субтипов вируса гепатита А
на территории Украины, Таджикистана и Кыргызстана
4.3. Закономерности географической кластеризации штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
4.3.1. Оптимизация методического подхода к идентификации штаммов вируса гепатита А
4.3.2. Филогенетический анализ штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ
4.3.3. Особенности географической кластеризации штаммов
вируса гепатита А, относящихся к субтипам 1А и ША
4.4. Оценка степени генетической гетерогенности штаммов вируса гепатита А, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
Глава 5. Молекулярно-генетические особенности вспышек
гепатита А на территории РФ
5.1. Вспышка гепатита А в Тверской области в 2005 г
5.2. Вспышка гепатита А в г. Нижнем Новгороде в 2005 г
5.3. Вспышки гепатита А в г. Северодвинске (август-сентябрь 2006 г.)
и г. Коряжме (октябрь 2006 г.) Архангельской области
5.4. Вспышки гепатита А в г. Осинники, г. Калтане, г. Междуреченске
и г. Новокузнецке Кемеровской области (август-декабрь 2006 г.)
5.5. Вспышки гепатита А в г. Углегорске (август-ноябрь 2006 г.), г. Южно-Сахалинске и г. Аниве (сентябрь 2007 г.)
Сахалинской области
4
5.6. Вспышки гепатита А в Нерюнгринском районе Республики
Саха (Якутия) (апрель 2007 г.)
5.7. Вспышка гепатита А в г. Махачкале Республики Дагестан
(май 2008 г.)
5.8. Вспышка гепатита А в Тоджинском районе Республики Тыва (ноябрь 2007 г. - февраль 2008 г.)
5.9. Повышенная заболеваемость гепатитом А в ряде районов Республики Тыва в 2010 г
5.10. Вспышка гепатита А в г. Радужном Ханты-Мансийского автономного округа (декабрь 2008 г.- февраль 2009 г.)
5.11. Вспышки гепатита А в Рязанской области
(январь-февраль 2009 г., сентябрь-ноябрь 2009 г.)
5.12. Случай групповой заболеваемости гепатитом А в
г. Калининграде (январь-февраль 2009 г.)
5.13. Вспышки гепатита А в г. Екатеринбурге
(сентябрь-ноябрь 2006 г., июнь-июль 2010 г.)
5.14. Вспышка гепатита А в г. Уфе Республики Башкортостан (апрель-май 2009 г.)
5.15. Вспышка гепатита А в Красноярском крае
(ноябрь-декабрь 2009 г.)
5.16. Вспышка гепатита А в г. Москве и Московской области
(декабрь 2009 г.-март 2010 г.)
Глава 6. Особенности клинического течения гепатита А, вызванного вирусами субтипов IA и IIIA
6.1. Клинико-эпидемиологическая характеристика групп больных гепатитом А, вызванным вирусами различных субтипов
6.2. Динамика лабораторных показателей у больных гепатитом А, вызванным вирусами различных субтипов
Глава 7. Распространенность генотипов и субгенотипов вируса гепатита В на территории РФ и ряда стран СНГ
7.1. Особенности распространенности генотипов вируса гепатита В
на территории РФ
7.2. Распространенность генотипов вируса гепатита В на территории Украины, Республики Армения, Кыргызстана и Таджикистана
7.3. Филогенетический анализ штаммов вируса гепатита В, циркулирующих на территории РФ и ряда стран СНГ
7.4. Анализ генетических характеристик рекомбинантного штамма вируса гепатита В
7.5. Анализ серотипов вируса гепатита В, циркулирующих
на территории РФ
7.6. Особенности проявлений эпидемического процесса гепатита В
на территории Чукотского АО
Глава 8. Молекулярно-генетические подходы к анализу эпидемиологической связи случаев гепатита В
8.1. Общая характеристика эпидемических очагов гепатита В
8.2. Реконструкция филогенетических взаимоотношений генетических последовательностей вируса гепатита В из эпидемических очагов
8.3. Филогенетический анализ изолятов вируса гепатита В, выделенных от больных из семейного очага F1
Глава 9. Клинико-лабораторные особенности хронического гепатита В, вызванного вирусами генотипов А и D
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
б
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
AJ1T - аланинаминотрансфераза
АО - автономный округ
ACT - аспартатаминотрансфераза
ВГ - вирусный гепатит
ВГА - вирус гепатита А
ВГВ - вирус гепатита В
ВГС - вирус гепатита С
ВИЧ - вирус иммунодефицита человека
ВКО - внутренний контрольный образец
ВОЗ - Всемирная организация здравоохранения
ВОС - водоочистная станция
ГОУ - государственное образовательное учреждение
ГУЗ - государственное учреждение здравоохранения
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
ДОЛ - детский оздоровительный лагерь
ДОУ - детское образовательное учреждение
ЗАО - закрытое акционерное общество
ИФА - иммуноферментный анализ
кДНК - комплементарная ДНК
КНС - канализационно-насосная станция
мРНК - матричная РНК
МУП - муниципальное унитарное предприятие нт - нуклеотид
ОАО - открытое акционерное общество ОГВ - острый гепатит В
ООО - общество с ограниченной ответственностью
ОРВИ - острая респираторная вирусная инфекция
ПДРФ - анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов
ПЦР - полимеразная цепная реакция
п.н. - пара нуклеотидов
РНК - рибонуклеиновая кислота
РФ - Российская Федерация
СанПиН - санитарные правила и нормы
СНГ - Содружество Независимых Государств СОШ - средняя общеобразовательная школа ФАП - фельдшерско-акушерский пункт ФО - федеральный округ ХГВ - хронический гепатит В ЦП - цирроз печени
anti-HAV - антитела к вирусу гепатита А
anit-HBc - антитела к соге-антигену вируса гепатита В
anti-HBe - антитела к е-антигену вируса гепатита В
anti-HBs - антитела к поверхностному антигену вируса гепатита В
anti-HCV - антитела к вирусу гепатита С
anti-HDV - антитела к вирусу гепатита D
anti-HIV - антитела к вирусу иммунодефицита человека
ddNTP - дидезоксирибонуклеотид
dNTP - дезоксирибонуклеотид
HBeAg - е-антиген вируса гепатита В
HBsAg - поверхностный антиген вируса гепатита В
HKY85 - эволюционная модель Hasegawa-Kishino-Yano, 1985 г.
ICTV - International Committee on Taxonomy of Viruses (Международный комитет по
таксономии вирусов)
IgG - иммуноглобулин класса G
IgM - иммуноглобулин класса М
JC69 - эволюционная модель Juke-Cantor, 1969 г.
К80 - эволюционная модель Kimura, 1980 г.
МСМС - метод Монте-Карло марковскими цепями
ME - метод минимальной эволюции
ML - метод максимального правдоподобия
Nested-ПЦР - ПЦР с вложенной парой праймеров («гнездная» ПЦР)
NJ - метод Neighbour-joining
SGS - метод секвенирования единичных геномов
SSCP - метод анализа одноцепочечного конформационного полиморфизма TN93 - эволюционная модель Tamura-Nei, 1993 г.
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Распространенность гепатита С и молекулярно-генетическая характеристика вируса, циркулирующего у населения Нижегородской обл.2013 год, кандидат наук Михайлова, Юлия Владимировна
Современные проявления эпидемического процесса гепатита С в России и пути совершенствования эпидемиологического надзора2019 год, кандидат наук Пименов Николай Николаевич
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ВАРИАНТЫ ВИРУСА ГЕПАТИТА С ТИПА 2k/1b НА ЮГЕ ЗАПАДНОЙ СИБИРИ2015 год, кандидат наук Чуб Елена Владимировна
Молекулярно-генетические механизмы эволюции вируса гепатита C2013 год, кандидат наук Калинина, Ольга Викторовна
Распространённость вируса гепатита С среди условно здорового населения Российской Федерации2020 год, кандидат наук Соболева Наталья Васильевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическое и клиническое значение генетической гетерогенности вирусов гепатита А и В»
ВВЕДЕНИЕ
Вирусные гепатиты (ВГ) до настоящего времени остаются значимой проблемой здравоохранения как в России, так и в мире. По оценкам Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), в мире ежегодно регистрируется около 1,5 млн случаев гепатита А (ГА) [408], а общее число заболевших в мире может составлять десятки млн в год [240, 403]. По степени экономического ущерба ГА, наряду с гепатитом В (ГВ), занимает одно из ведущих мест после гриппа, ОРВИ и острых кишечных инфекций [48, 49]. Несмотря на то что в течение последних 10 лет в России наблюдается неуклонное снижение заболеваемости ГА, ее показатель в 2012 г. оставался достаточно высоким - 5,5 на 100 тыс. населения. Следует отметить, что, по данным Роспотребнадзора, заболеваемость ГА в субъектах РФ имеет выраженные различия и в ряде территорий превышает среднероссийский показатель (в Астраханской области - 22,5, Республике Дагестан - 50,6, Республике Тыва - 96,8 на 100 тыс. населения). Эта неоднородность обусловливается комплексом факторов, таких как социально-гигиенические и демографические особенности территории, доля восприимчивого населения, биологические особенности возбудителя [18, 34]. Важной характеристикой ГА является его способность вызывать заболевание массового характера с большим числом пострадавших. За последние 5 лет в России было зарегистрировано более 300 вспышек ГА, в том числе в относительно благополучных регионах, таких как г. Москва и Московская область (например, вспышка в 2010 г., во время которой зарегистрировано более 800 пострадавших). Это определяет необходимость дальнейшего изучения особенностей эпидемического процесса ГА с целью совершенствования стратегии профилактики данной инфекции.
Успешное внедрение программ вакцинопрофилактики в РФ позволило
к 2012 г. снизить заболеваемость острым гепатитом В (ОГВ) почти в 30 раз по
сравнению с уровнем заболеваемости в 2000 г. (1,4 и 39,9 случаев на 100 тыс.
населения соответственно). Эти успехи дают основание предполагать
ю
возможность элиминации ОГВ в отдельных регионах РФ, при условии оптимизации и совершенствования эпидемиологического надзора за ОГВ [20]. Гепатит В (ГВ) сохраняет свою высокую актуальность в связи со значительной частотой развития хронических форм болезни. Заболеваемость хроническим гепатитом В (ХГВ) в РФ в 2012 г. составила 12,6, а впервые выявленные носители вируса гепатита В (ВГВ) регистрировались с частотой 21,1 на 100 тыс. населения. В целом заболеваемость хроническими формами инфекции, вызванной ВГВ, в 2012 г. в 23,7 раза превышала заболеваемость ОГВ (1,42 на 100 тыс. населения). Особое внимание к себе привлекает ХГВ в связи с высокой частотой развития неблагоприятных исходов этой инфекции - цирроза печени (ЦП) и гепатоцеллюлярной карциномы (ГЦК) [2, 12, 33, 248, 383]. Согласно данным ВОЗ, ВГВ является причиной 60-80% случаев ГЦК в мире, от которой ежегодно погибает более 320 000 человек [259, 410].
Успехи молекулярной биологии привели к появлению новых данных о биологических особенностях возбудителей ГА и ГВ. В течение последних 20 лет был выделен целый ряд генетических вариантов (генотипов и субтипов) этих вирусов. Так, было описано 6 генотипов вируса ГА (ВГА) [99, 100, 171] и 10 -ВГВ, каждый из которых подразделяется на целый ряд субтипов и имеет характерные особенности географического распространения [57, 307, 328, 390, 394]. Для некоторых возбудителей инфекций, например, вирусов гриппа, кори, полиомиелита, изучение циркуляции генетических вариантов и использование этой информации при осуществлении эпидемиологического надзора уже вошло в рутинную практику [9, 350, 351, 402]. Изучение генетической гетерогенности возбудителей инфекционных болезней используется при расследовании вспышек и анализе эпидемиологической связи случаев заболевания [6, 288, 289]. О распространенности генетических вариантов вирусов ГА и ГВ в России имеются лишь отрывочные сведения в отдельных публикациях [5, 41, 51, 208, 291, 330]. Клиническое значение генотипов некоторых вирусов, например, вируса гепатита С, уже достаточно хорошо изучено. Известно, что течение и
эффективность лечения хронического гепатита С зависит от генотипа и даже от субтипа вируса [216, 221, 413]. О клиническом значении генотипов ВГА и ВГВ сведений в литературе мало и они часто носят противоречивый характер [102, 110, 160, 197, 198, 262]. Систематических исследований, касающихся генетической гетерогенности данных вирусов на территории РФ, значения их генетических вариантов для эпидемиологического надзора и клинической практики, не проводилось.
Цель работы: разработать научные основы молекулярно-генетического компонента системы эпидемиологического надзора за ГА и ГВ; оценить клиническое значение генетической гетерогенности ВГА и ВГВ.
Задачи исследования
1. Провести анализ проявлений эпидемического процесса ГА и ГВ в РФ за период с 2001 по 2011 гг. и современного состояния системы эпидемиологического надзора за данными инфекциями;
2. Определить распространенность генотипов и субтипов ВГА, циркулирующего на территории РФ и ряда стран СНГ с различной интенсивностью эпидемического процесса;
3. Определить распространенность генотипов и субгенотипов ВГВ, циркулирующего на территории РФ и ряда стран СНГ с различной интенсивностью эпидемического процесса;
4. Установить связь между филогенетическими характеристиками ВГА и ВГВ, относящихся к различным генотипам, с особенностями их географической распространенности;
5. Разработать подходы к анализу эпидемиологической связи случаев заболевания ГА и ГВ на основе изучения генетической гетерогенности вирусной популяции;
6. Усовершенствовать систему эпидемиологического надзора за ГА и ГВ на основе внедрения системы молекулярно-генетического мониторинга за возбудителями данных инфекций;
7. Оценить взаимосвязь между генетическими характеристиками ВГА и ВГВ и клинико-лабораторными особенностями течения ГА и ХГВ.
Научная новизна
Проведен анализ проявлений эпидемического процесса ГА и ГВ на территории РФ, свидетельствующий о выраженном снижении его интенсивности, изменении возрастной структуры заболевших с увеличением доли взрослого населения, выраженной территориальной неравномерности показателя заболеваемости ГА, значительном преобладании хронических форм инфекции в структуре заболеваемости ГВ.
Впервые дана характеристика территориальной распространенности генотипов и субтипов ВГА во всех федеральных округах (ФО) РФ и ряде стран СНГ. Установлена циркуляция двух субтипов, 1А и ША, и выявлено их неравномерное распространение на территории страны. Показано доминирование субтипа 1А в большинстве субъектов РФ. Установлено, что распространенность генотипов ВГА в Украине сходна с таковой в европейской части РФ, тогда как в странах Средней Азии (в Таджикистане, Кыргызстане) наблюдаются иные особенности. Изучена генетическая гетерогенность каждого из субтипов вируса и выделены географические кластеры ВГА в пределах субтипов 1А и ША, характерные для территории РФ и некоторых стран СНГ.
Впервые предложены оптимальные маркерные области генома ВГА для использования при расследовании вспышек ГА. Доказано, что ВГА субтипа ША является причиной возникновения многих очагов групповых заболеваний в РФ. Впервые выявлены особенности генетического разнообразия ВГВ на территории всех ФО РФ и ряда стран СНГ. Определены эндемичные для РФ генотипы и субгенотипы вируса, их географическая распространенность. Доказано отсутствие
филогеографических кластеров в пределах генотипов А и Б, позволяющих различать штаммы ВГВ из различных регионов РФ. Выявлен новый, ранее не описанный рекомбинантный вариант ВГВ.
Разработаны научные основы использования молекулярно-генетических методов и филогенетической реконструкции эволюционных взаимоотношений между изолятами вируса, необходимые в качестве дополнительных объективных инструментов в эпидемиологической диагностике при обследовании эпидемических очагов ГА и ГВ.
Впервые изучены особенности клинико-лабораторных характеристик ГА, вызванного вирусами субтипов 1А и IIIА, и ХГВ, вызванного вирусами генотипов АиБ,в РФ.
Практическая значимость
Разработанные положения позволят создать систему молекулярно-генетического мониторинга за ГА и ГВ в РФ.
Для оптимизации информационной подсистемы эпидемиологического надзора предложено внедрить молекулярно-генетический мониторинг с целью слежения за циркулирующими генетическими вариантами ВГА и ВГВ и динамикой изменения генетических характеристик вирусной популяции.
Для повышения качества эпидемиологической диагностики в рамках диагностической подсистемы эпидемиологического надзора рекомендовано использовать данные молекулярно-генетического мониторинга, а также проводить анализ маркерных последовательностей генома вирусов при работе в очагах вирусных гепатитов для установления источника возбудителя инфекции, путей и факторов передачи, а также временных и пространственных границ очагов.
Разработана методика и алгоритм анализа эпидемиологической связи случаев ГА и ГВ на основе филогенетической реконструкции эволюционных взаимоотношений между изолятами вируса. Рекомендованы оптимальные
маркерные области генома ВГА для использования с целью идентификации штаммов.
Выявлены клинико-лабораторные особенности ГА и ХГВ, вызванных различными генотипами вирусов, позволяющие рекомендовать их определение при обследовании больных для уточнения прогноза течения заболевания.
Глава 1. Обзор литературы
1.1. Гепатит А: общая характеристика и генетическая классификация вируса, клинико-эпидемиологические особенности инфекции
1.1.1. Строение вириона и организация генома вируса гепатита А
Заболевание, вызываемое ВГА, известно сотни лет. Подробное описание болезни было опубликовано в начале XX века и значительно дополнено результатами исследований с экспериментальным заражением добровольцев в 40-60 гг. [275, 371]. К концу 60-х гг. XX века накопилось множество фактов, свидетельствующих о вирусной природе ГА, однако окончательным доказательством этого стало выделение возбудителя из фекалий больного и его описание с помощью электронной микроскопии [153].
Вирус гепатита А относится к семейству Picornaviridae [50, 273, 278, 379]. Пикорнавирусы - мелкие вирусы, лишенные оболочки, имеющие в качестве генома одноцепочечную РНК. Патогенные для человека вирусы включают виды рода Rhinovirus (риновирусы человека) и рода Enterovirus (полиовирусы, вирусы Коксаки, ECHO вирусы и энтеровирусы человека). Хотя у ВГА есть некоторые общие характеристики с представителями других родов семейства Picornaviridae, у него было выявлено достаточное количество отличий, позволивших отнести его к единственному виду рода Hepatovirus [120]. В природе существуют как штаммы, инфицирующие нечеловекообразных обезьян, так и штаммы, патогенные для человека [261, 349]. Вирус гепатита А, в отличие от других представителей семейства Picornaviridae, стабилен в кислой среде (рН 1) и выдерживает нагревание до 56°С в течение 30 минут [199].
Геномы ВГА и пикорнавирусов имеют схожую организацию [120]. Геномом ВГА является одноцепочечная РНК позитивной полярности (т.е. способная к трансляции) длиной 7,5 тыс. оснований, имеющая 5'-нетранслируемую область (740 оснований), кодирующую область (2227
аминокислот) и З'-нетранслируемую область (40-80 оснований) [109, 120, 222].
16
Несмотря на то что ВГА был первым вирусом гепатита, более 20 лет назад успешно адаптированным к культуре клеток [335], его белковый состав до сих пор исследован не полностью [222]. Инфицированные клетки содержат вирус в низком титре, в связи с чем изучение свойств вирусных протеинов ограничено. Область PI кодирует три главных протеина нуклеокапсида - VP1, VP2, VP3. Четвертый протеин нуклеокапсида VP4 необходим для формирования вириона [332] и не обнаруживается в зрелых вирусных частицах. Каждый из белков нуклеокапсида образуется из полипротеина-предшественника с помощью вирусной протеазы ЗС, кодируемой областью РЗ. Естественная конформация капсидных белков VP1 и VP3 образует единый доминантный серологический эпитоп на поверхности нуклеокапсида, к которому вырабатываются нейтрализующие антитела. Неструктурные белки, кодируемые областями Р2 и РЗ, необходимы в процессе синтеза РНК и формирования вириона [155]. Белок VPg, кодируемый также областью РЗ генома вируса, ковалентно связан с 5'-нетранслируемой областью генома и участвует в инициации синтеза РНК [120]. Схема строения генома ВГА приведена на рисунке 1.1.
При экспериментальном инфицировании обезьян человеческим штаммом ВГА вирусный антиген обнаруживался методом иммунофлюоресценции в желудке, тонком и толстом кишечнике не только после начального инфицирования, но и позднее в течение заболевания [319]. Обнаружение вирусных антигенов методом иммунофлюоресценции в клетках кишечных крипт предполагает, что репликация может иметь место в кишечнике [319]. Вирионы предположительно достигают печени по портальной системе (возможно, после системной циркуляции) и захватываются гепатоцитами. Было установлено, что рецепторами для ВГА на поверхности непеченочных клеток обезьян является муциноподобный мембранный гликопротеин первого класса [80, 226, 327], однако его связь с захватом вируса гепатоцитами пока не установлена. После размножения вируса в гепатоцитах и его выхода в желчь происходит захват вирионов клетками кишечного эпителия и перенос их в печень. Этот процесс
носит название кишечно-печеночной циркуляции вируса. Он может продолжаться до полного связывания вируса нейтрализующими антителами.
7 kb
VP4 VP2 VP3 VP1 ? 2А 2В 2С ЗА ЗВ ЗС 3D
VPg
V.
белки нукпеокапсида
J
VPg
протеаза РНК
полимерам
Р1
Р2
РЗ
Рисунок 1.1. Схема организации генома ВГА.
Полипротеин обозначен прямоугольником; Pl, Р2, РЗ - три домена полипротеина; VP1, VP2, VP3, VP4 - структурные белки; 2А, 2В, 2С, ЗА, ЗВ, ЗС, 3D - неструктурные белки. Линейка вверху рисунка показывает длину полипротеина в парах оснований (адаптировано из [222])
Современными исследованиями доказано, что репликация ВГА in vivo имеет место практически исключительно в гепатоцитах и клетках кишечного эпителия, хотя в культуре непеченочных клеток репликация также описана [222]. Геном вируса реплицируется через стадию РНК негативной полярности. Зрелые вирионы содержат РНК позитивной полярности, ковалентно связанную с белком VPg и упакованную в белки нуклеокапсида VP1, VP2, VP3, которые образуют структуру с икосаэдрической симметрией. Вирусные частицы выходят в желчь и кровь, предположительно проходя через апикальную мембрану гепатоцита в желчные канальцы и через базальную мембрану - в кровоток. Механизм высвобождения и секреции вируса до конца неизвестен. Вероятно, он не связан с разрушением печеночных клеток, поскольку вирус обнаруживается в фекалиях в высоком титре до появления каких-либо признаков цитолиза [125, 126, 255].
1.1.2. Современные особенности эпидемиологии гепатита А
Гепатит А - инфекционная болезнь человека, вызываемая вирусом с фекально-оральным механизмом передачи, характеризующаяся
преимущественным поражением печени и клинически проявляющаяся интоксикацией и желтушностью [17, 43, 68]. Источником возбудителя инфекции является больной человек. В ранних исследованиях было показано, что возбудитель обнаруживается в фекалиях больного за 12-14 дней до развития желтухи и продолжает выделяться в течение трех недель желтушного периода [126, 146]. Работы, выполненные позднее с использованием высокочувствительных методов обнаружения вируса на основе полимеразной цепной реакции (ПЦР), позволили установить, что период экскрециии вируса более длительный и в среднем составляет около 12 недель после начала заболевания [145, 152, 196, 219]. Максимальная концентрация вируса в экскретах больного наблюдается в конце инкубационного и на всем протяжении преджелтушного периодов [88, 231, 338].
Больные с безжелтушными формами ГА являются источниками возбудителя инфекции, имеющими наибольшее значение. Безжелтушные формы, по сравнению с желтушными, встречаются в 10-12 раз чаще у детей и в 2 раза чаще у взрослых. Частота желтушных форм возрастает в период эпидемических вспышек ГА, что объясняется высокой вероятностью заражения большими дозами вируса (феномен доза-эффект) [18]. Полиморфизм клинических проявлений со значительным преобладанием безжелтушных форм болезни является одной из эпидемиологических черт ГА. За счет бессимптомных форм этой инфекции обеспечивается непрерывная циркуляция ВГА [37, 43, 85].
Вирусный гепатит А распространяется посредством фекально-орального механизма, реализующегося с помощью бытового, пищевого и водного путей передачи, среди которых последний является основным [17]. Действие водного фактора может носить как постоянный, так и эпизодический характер. Постоянно действующий водный фактор играет ведущую роль в распространении ГА и
обусловливает его эндемичность в регионах с неудовлетворительным водоснабжением населения [4]. Высокая активность водного пути передачи при ГА связана с тем, что обеззараживание воды на головных водопроводных сооружениях даже при соблюдении санитарных норм и правил не гарантирует ее эпидемиологической безопасности. Это объясняется риском вторичного микробного загрязнения воды в разводящей сети водопроводов, а также в децентрализованных источниках водоснабжения при их неудовлетворительном санитарно-техническом состоянии [4, 18, 34, 37, 43].
Вирус гепатита А имеет малые размеры и, в отличие от бактериальных патогенов, обладает высокой проникающей способностью, в том числе возможностью проникать через различные бактериальные фильтры и слои почвы, недоступные для бактерий. В результате этого ВГА значительно чаще, чем патолгенные кишечные бактерии, контаминирует подземные воды. Способность ВГА загрязнять подземные, и, в первую очередь, высоко стоящие грунтовые воды, которые являются основным источником водоснабжения для хозяйственно-бытовых нужд в Средней Азии, определяет высокую эпидемиологическую значимость грунтовых вод как фактора передачи возбудителя ГА и его гиперэндемичность на этой территории [18, 37].
По данным ВОЗ в мире ежегодно регистрируется около 1,4 млн новых случаев ГА [409]. В последние десятилетия наблюдается тенденция к снижению заболеваемости во всех регионах мира, кроме Африки, что обусловливает снижение частоты выявления специфических антител к ВГА (апй-НАУ ^О) среди населения данных территорий [240, 241]. Наблюдаемый «эпидемиологический переход» объясняется повышением социально-экономического уровня, доступности доброкачественной питьевой воды, уровня коммунального благоустройства и улучшением санитарно-гигиенических условий проживания населения, а в ряде регионов - внедрением в практику здравоохранения эффективных мер вакцинопрофилактики [34, 114, 186, 331, 382].
Вирусный гепатит А распространен во всем мире. В зависимости от уровня заболеваемости выделяют регионы с высокой, средней и низкой распространенностью инфекции. В каждом из регионов наблюдаются свои особенности эпидемиологии ГА [239, 403].
Африка, Азия, Центральная и Южная Америка относятся к регионам с высоким уровнем распространенности ВГА. Как правило, население этих регионов переносит ГА в детском возрасте в легкой форме с формированием естественного защитного иммунитета к вирусу. У взрослых заболевание регистрируется крайне редко [18, 97, 272, 404].
К регионам со средней распространенностью ГА относят Юго-Восточную Азию и Восточную Европу. В этих регионах инфицирование детей происходит в более старшем возрасте, чем в регионах с высокой распространенностью инфекции. Отмечается значительное количество случаев заболевания взрослых. Факторами передачи возбудителя в регионах со средней распространенностью ГА чаще всего являются недоброкачественная питьевая вода и контаминированные вирусом продукты питания. Так, в 1988 г. в Шанхае, вследствие поступления в продажу партии зараженных моллюсков, было отмечено около 300 тыс. случаев заболевания в течение 2 месяцев [35, 136].
Страны Западной Европы, Северной Америки, Австралия и Новая Зеландия относятся к регионам с низкой распространенностью ГА. Здесь отмечено стабильное снижение уровня заболеваемости в течение последних 40 лет. Случаи инфицирования в детском возрасте редки, и часто не удается установить источник инфекции [35, 253, 391, 404].
Европа традиционно является территорией с наиболее низким уровнем заболеваемости ГА по сравнению с другими регионами мира. В странах Европейского союза общий уровень заболеваемости ГА снизился с 15,1 на 100 тыс. населения в 1996 г. до 2,81 в 2007 г. [142]. В период с 2001 по 2008 гг. страны Восточной Европы значительно отличались по уровням и динамике заболеваемости от стран Северной и Западной Европы. В Северной и Западной
Европе показатели находились на относительно низком уровне - менее 3,0 на 100 тыс. населения, однако динамика колебаний показателей была более выражена в северной части (от 0,55 до 2,9 на 100 тыс. населения) по сравнению с западной частью Европы (от 1,5 до 2,3 на 100 тыс. населения). Несмотря на то что в Восточной Европе показатель заболеваемости ГА с 2001 по 2008 гг. снизился более чем в 4 раза (с 24,94 до 5,61 на 100 тыс. населения), в 2008 г. он в 3,4 раза превышал аналогичные показатели Западной Европы (1,67) и в 7,3 раза - данные, зарегистрированные в Северной Европе [142].
Кроме того, в Восточно-Европейском регионе, в отличие от северозападной части Европы, имеет место выраженная территориальная неоднородность уровней заболеваемости ГА. В ряде стран (Эстонии, Литве, Польше, Словении) среднемноголетние показатели заболеваемости (за 8 лет) находятся на низких уровнях (0,63-1,6 на 100 тыс. населения), сопоставимых с уровнями заболеваемости в северной и западной частях Европейского региона. В других странах, таких как Болгария и Румыния, среднемноголетние показатели заболеваемости (53,94 и 43,52 на 100 тыс. населения соответственно) значительно превышают среднемноголетний показатель по Восточно-Европейскому региону в целом (12,48 на 100 тыс. населения) [142].
Объективным способом оценки истинной интенсивности эпидемического процесса ГА на конкретной территории является определение уровня коллективного иммунитета к возбудителю данной инфекции. Крупномасштабное исследование (34 985 образцов сыворотки крови) по изучению восприимчивости к ГА различных возрастных групп населения, проведенное с 1996 по 2004 гг. в 10 странах Европы, показало, что у большинства детей и лиц молодого возраста anti-HAV IgG не обнаруживаются [111]. Наибольшая восприимчивость к ВГА была выявлена среди населения Финляндии, где более чем у 80% лиц моложе 50 лет anti-HAV IgG не выявлялись, а наименьшая - в Румынии, в которой доля восприимчивых к ВГА составляет 42% среди лиц моложе 30 лет и лишь 6% -
среди лиц старше 30 лет. В остальных странах восприимчивость к ВГА у лиц моложе 30 лет и старше 30 лет составила 70-94% и 26-71% соответственно.
Низкий уровень коллективного иммунитета против ВГА отмечается и в других странах Европы [98, 362, 363], что на фоне высокого уровня санитарно-коммунального благополучия обусловливает специфические для данной территории характер и частоту возникновения вспышек ГА. Среди 31 описанных в научной литературе вспышек ГА, возникших в Европе в период с 2001 по 2010 гг., было выявлено 15 вспышек с контактно-бытовым путем передачи возбудителя, 11 - с пищевым путем передачи, 2-е водным и в 3 вспышках наблюдался смешанный характер распространения инфекции (парентеральным путем среди потребителей инъекционных наркотиков и контактно-бытовым путем - среди населения с низким уровнем доходов). Общее число пострадавших при вспышках составило более 8600 человек. Характерной особенностью вспышек с контактно-бытовым путем передачи возбудителя являлось то, что большинство из них (8) было зарегистрировано среди мужчин-гомосексуалистов в странах Западной и Северной Европы [286].
Заболеваемость ГА в России, так же как и в Восточной Европе, в последние годы характеризуется выраженной тенденцией к снижению, что приближает показатели нашей страны к уровням заболеваемости в Восточно-Европейском регионе [11, 36, 40, 42, 54]. Разница между показателями в 2001 г. (79,4 на 100 тыс. населения), когда был зафиксирован последний значимый в РФ подъем заболеваемости ГА, и в 2008 г. (8,14 на 100 тыс. населения) составила 9,8 раз. В последующие 2 года заболеваемость ГА в России еще более сократилась, достигнув в 2010 г. самых низких значений за последние 50 лет наблюдения - 6,3 на 100 тыс. населения. На протяжении многих лет территория России характеризуется выраженными различиями интенсивности эпидемического процесса ГА. Это обусловлено совокупностью демографических, экономических, организационных и других социальных факторов: численностью и возрастной структурой населения, уровнем санитарно-коммунального благоустройства,
активностью миграционных процессов, уровнем развития здравоохранения, соблюдением санитарно-противоэпидемического режима в детских и образовательных организациях и на пищевых предприятиях, общим уровнем санитарной культуры населения, а также реализацией в некоторых регионах программ вакцинопрофилактики.
1.1.3. Генетическая гетерогенность популяции вируса гепатита А 1.1.3.1. Генетическая классификация вируса гепатита А
Впервые генетическая классификация ВГА была предложена В. Robertson в 1992 г. [171]. На основе анализа гомологии нуклеотидной последовательности фрагментов генома VP1/2A длиной 168 нуклеотидов (нт), полученных при секвенировании 152 изолятов вируса, было выделено семь генотипов ВГА. К разным генотипам были отнесены изоляты, имевшие степень генетической гомологии менее или равную 85%. Изоляты в пределах одного генотипа, генетически отличавшиеся друг от друга менее чем на 15%, но более чем на 7,5%, классифицировались как субтипы ВГА [171]. Длина использованного фрагмента генома оказалась слишком мала для достоверного определения филогенетического родства некоторых изолятов вируса, что привело к пересмотру классификации ВГА на основании анализа последовательностей гена VP1 длиной 900 нт, а также полных геномов [295].
Похожие диссертационные работы по специальности «Эпидемиология», 14.02.02 шифр ВАК
Значение лабораторной диагностики краснушной и парвовирусной инфекций в период элиминации краснухи2013 год, кандидат биологических наук Антипова, Анастасия Юрьевна
Биологическое разнообразие и экологические особенности вирусов гриппа А, выделенных от диких птиц юга Западной Сибири в 2014-2018 годах2021 год, кандидат наук Ли Синьсинь
Молекулярно-генетические методы в изучении эпидемиологии инфекций, возбудители которых передаются парентеральным путем2002 год, доктор биологических наук Бобкова, Марина Ридовна
Молекулярно-генетический анализ вариантов вируса Крымской-Конго геморрагической лихорадки, циркулирующих в Российской Федерации2018 год, кандидат наук Волынкина, Анна Сергеевна
Эпидемиологическая и клинико-морфологическая характеристика гепатитов В и С и гетерогенность их возбудителей в Республике Саха "Якутия"2010 год, кандидат медицинских наук Индеева, Любовь Дмитриевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Чуланов, Владимир Петрович, 2013 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Абдурахманов, Д.Т. Хронический гепатит В и D / Д.Т. Абдурахманов. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2010.-288 с.
2. Алкогольные и вирусные циррозы печени у стационарных больных (19962005 гг.): распространенность и исходы / А. Хазанов, C.B. Плюснин, А.П. Васильев [и др.] // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. - 2007. - №2. - С. 19-27.
3. Вирусные гепатиты в Российской Федерации. Аналитический обзор. 8 выпуск / ред. В. И. Прокровский, А. Б. Жебрун. - СПб.: ФБУН НИИЭМ им. Пастера, 2011.- 116с.
4. Водная вспышка гепатита А в Нижнем Новгороде / Г.Г. Онищенко, И.В. Шахгильдян, Е.Ю. Петров [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2007. - №3. - С.4-9.
5. Генетическое разнообразие вируса гепатита А в Сибири / В.А. Терновой, Е.В. Чаусов, Т.Ю. Бондаренко [и др.] // Вопросы вирусологии. - 2006. -Т.51, №1. - С.23-27.
6. Генотипирование штаммов вируса лихорадки Западного Нила, циркулирующих на юге России, как метод эпидемического принципа: принципы и результаты / А.Е. Платонов, Л.С. Карань, Т.А. Шопенская [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. -№2. - С.29-37.
7. Гепатит А у яванских и бурых макак при их заражении штаммом вируса гепатита А ЯМ-55 / А.Г. Анджапаридзе, Ю.А. Казачков, М.С. Балаян [и др.] // Вопросы вирусологии. - 1987. - №4. - С.440-448.
8. Гущин, А.Е. Разработка набора реагентов "Амплисенс HCV-генотип" для определения субтипов la, 1Ь, 2а, За вируса гепатита С / А.Е. Гущин, О.М. Носкова, Г.А. Шипулин // Вопросы вирусологии. - 2003. - №3. - С.45-49.
9. Дроздов, С.Г. Полиомиелит / С.Г. Дроздов, O.E. Иванова // Вопросы вирусологии. - 2012. - № Приложение 1. - С.76-90.
10. Зоны санитарной охраны источников водоснабжения и водопроводов питьевого назначения. Санитарные правила и нормы. СанПиН 2.1.4.111002.- 14.03.2002.
11. Курганова, Т.Ю. Эпидемиология и вакцинопрофилактика гепатита А в Вологодской области / Т.Ю. Курганова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.81-84.
12. Кучерявый, Ю.А. Хронический гепатит, цирроз печени и гепатоцеллюлярная карцинома - звенья одной цепи / Ю.А. Кучерявый, Н.Ю. Стукова, M.J1. Ахтаева // Клинические перспективы гастроэнтерологии, гепатологии. - 2012. - №5. - С.3-11.
13. Львов, Д.К. Гепатит В / Д.К. Львов, М.Ю. Щелканов // Медицинская вирусология / ред. Д. К. Львов. -М.: ООО "Медицинское информационное агентство", 2008. - С.472-480.
14. Манзенюк, И.Н. Оценка соответствия медицинских изделий для диагностики in vitro, международный и отечественный опыт / И.Н. Манзенюк, Г.А. Шипулин, В.В. Меньшиков // Клиническая лабораторная диагностика. - 2009. - №10. - С.48-53.
15. Мельникова, A.A. Осуществление эпидемиологического надзора за организацией и проведением иммунопрофилактики населения в Российской Федерации / A.A. Мельникова, Г.Г. Онищенко, В.Ю. Смоленский // Гигиена и санитария. - 2010. - №6. - С.4-12.
16. Мирзабеков, А.Д. Биочипы в биологии и медицине XXI века / А.Д. Мирзабеков // Вестник РАН. - 2003. - №5. - С.412^125.
17. Михайлов, М.И. Гепатит А - актуальная инфекция для России / М.И. Михайлов, И.В. Шахгильдян // Стерилизация и госпитальные инфекции. -2007. - №1. - С.13-16.
18. Михайлов, М.И. Энтеральные вирусные гепатиты (этиология, эпидемиология, диагностика, профилактика) / М.И. Михайлов, И.В. Шахгильдян, Г.Г. Онищенко. -М.: ФГОУ "ВУНМЦ Росздрава", 2007. -352 с.
19. Молекулярно-эпидемиологические особенности вспышки гепатита А в Москве / И.В. Карандашова, H.H. Пименов, А.Д. Неверов [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. -2012. -№3. - С.9-14.
20. О мероприятиях, направленных на ликвидацию острого гепатита В в Российской Федерации. Постановление Главного государственного саниратного врача РФ №34. - 30.05.2012.
21. Онищенко, Г.Г. Актуальные вопросы организации вакцинопрофилактики в Российской Федерации / Г.Г. Онищенко, Е.Б. Ежлова, A.A. Мельникова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. - №5. -С.110-114.
22. Онищенко, Г.Г. Актуальные проблемы профилактики инфекционных болезней на современном этапе / Г.Г. Онищенко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - №4. - С. 13-22.
23. Онищенко, Г.Г. Актуальные проблемы современной эпидемиологии (материалы к докладу на Всероссийской научной конференции "Проблемы современной эпидемиологии. Перспективные средства и методы лабораторной диагностики и профилактики актуальныех инфекций") / Г.Г. Онищенко // Гигиена и санитария. - 2011. - №4. - С.4-13.
24. Питьевая вода. Гигиенические требования к качеству воды централизованных систем питьевого водоснабжения. Контроль качества. Санитарные правила и нормы. СанПиН 2.1.4.559-96. - 18.06.1997.
25. Полимеразная цепная реакция в диагностике вирусных гепатитов / Чуланов, В. П., Шипулин, Г. А., O.E. Шипулина, Е.В. Волчкова [и др.] // Инфекционные болезни. - 2003. - Т.1, №1. - С.43^8.
26. Профилактика вирусного гепатита А. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.2825-10. - 30.12.2010.
27. Профилактика вирусного гепатита В. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.1.2341-08. - 28.02.2008.
28. Профилактика вирусных гепатитов. Общие требования к эпидемиологическому надзору за вирусными гепатитами. Санитарно-эпидемиологические правила. СП 3.1.958-00. - 01.02.2000.
29. Разработка набора реагентов для определения генотипов А, В, С и D вируса гепатита В (HBV) методом полимеразной цепной реакции (ПНР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией "АмплиСенс HBV-генотип-FRT" / И.В. Карандашова, А.Д. Неверов, В.А. Долгин [и др.]: Молекулярная диагностика - 2010.VII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием. - Москва, 2010. - Т.1. - С.224-227.
30. Результаты испытаний препарата "АмплиСенс HBV Монитор-FRT" тест-системы для количественного определения ДНК вируса гепатита В методом ГТЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией в режиме "реального времени" / Е.В. Эльберт, P.A. Волкова, В.Г. Петухов [и др.]: Генодиагностика инфекционных болезней - 2007 (Молекулярная диагностика - 2007). Сб. трудов VI Всерос. науч.-практ. конф. -Москва, 2007.-Т.1.-С.325-326.
31. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. В 2 томах. Том I / ред. В. И. Прокровский. - М.: Медицина, 1993. - 464 с.
32. Ряпис, Л.А. Молекулярная эпидемиология брюшного тифа / Л.А. Ряпис, В.Д. Беляков // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 1996. - №4. - С.96-99.
33. Слепцова, С.С. Вирусные гепатиты В и D как основные факторы формирования цирроза и первичного рака печени в Республике Саха (Якутия) / С.С. Слепцова, А.Г. Рахманова, Т.Т. Бугаева // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. - 2012. - №2. - С. 109-115.
34. Современная стратегия контроля за гепатитом А: опыт проведения плановой вакцинации в рамках регионального календаря профилактических прививок / В.И. Шахгильдян, М.И. Михайлов, О.Н. Ершова [и др.] // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2011. - №2. - С.51-55.
35. Современные особенности эпидемического процесса гепатита А в России и странах Европы, определяющие стратегии его профилактики / В.П. Чуланов, H.H. Пименов, И.В. Карандашова, C.B. Комарова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2012. - №3. - С.28-34.
36. Современные эпидемиологические закономерности и эффективность вакцинации против гепатита А в Российской Федерации / И.В. Шахгильдян, М.И. Михайлов, O.E. Попова [и др.] // Инфекционные болезни. -2006. -Т.4, №1. - С.50-57.
37. Солодовников, Ю.П. Вирусный гепатит А / Ю.П. Солодовников, Б.В. Городиский // Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. В 2 томах. Том II / ред. В. И. Прокровский. - М.: Медицина, 1993. - С.104-115.
38. Спонтанный гепатит у яванской макаки, подвергнутой воздействию иммунодепрессантов / А.Г. Анджапаридзе, В.Ф. Полещук, H.A. Замятина [и др.] // Вопросы вирусологии. - 1985. - №4. - С.468-474.
39. Справочник по гепатологии / ред. Н. А. Мухин. -М.: Литтерра, 2009. -416 с.
40. Туркутюков, В.Б. Эпидемиология гепатита А в Приморском крае / В.Б. Туркутюков, В.М. Воронок, Е.М. Ибрагимова // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.91-93.
41. Характеристика манифестного и скрытого компонентов эпидемического процесса гепатита А в городах России / C.J1. Мукомолов, Л.И. Шляхтенко, М. Valle [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - №3. - С.35-39.
42. Характеристика современных проявлений эпидемического процесса гепатита А в России и эффективность вакцинации для профилактики и купирования вспышек этой инфекции / И.В. Шахгильдян, М.И. Михайлов, О.Н. Ершова [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2006. -№4. - С.21-29.
43. Черкасский, Б.Л. Инфекционные и паразитарные болезни человека: справочник эпидемиолога / Б.Л. Черкасский. -М.: Медицинская газета, 1994.-617 с.
44. Черкасский, Б.Л. Руководство по общей эпидемиологии / Б.Л. Черкасский. -М.: Медицина, 2001. - 560 с.
45. Чуланов, В.П. Проблемы лекарственной резистентности при противовирусной терапии хронического гепатита В / В.П. Чуланов // Клиническая гастроэнтерология и гепатология. - 2011. - №3. - С. 167-172.
46. Чуланов, В.П. Резистентность к противовирусным препаратам при хроническом гепатите В / В.П. Чуланов // Фарматека. - 2010. -№4. - С.20-26.
47. Чуланов, В.П. Роль полимеразной цепной реакции в диагностике острых вирусных гепатитов: автореф. дисс. ... канд. мед. наук. / Чуланов Владимир Петрович; Московская медицинская академия им. И.М. Сеченова. - М., 2003.
48. Шаханина, И.Л. "Стандартные" величины экономического ущерба, наносимого инфекционными болезнями / И.Л. Шаханина, Л.А. Осипова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 1999. - №3. - С. 14.
49. Шаханина, И.JI. Экономический ущерб, наносимый инфекционными болезнями, в Российской Федерации по состоянию на декабрь 2000 г. / И.Л. Шаханина, Л.А. Осипова, О.И. Радуто // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2001. - №6. - С.58.
50. Шахгильдян, И.В. Гепатит А / И.В. Шахгильдян, Д.К. Львов // Медицинская вирусология / ред. Д. К. Львов. -М.: ООО "Медицинское информационное агентство", 2008. - С.369-372.
51. Эпидемиологический и молекулярно-биологический анализ причин подъема заболеваемости гепатитом А в Республике Тыва в 2008 году / О. Попова, К.К. Кюрегян, Л.Ю. Ильченко [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2010. - №3. - С.23-26.
52. Эпидемиологический надзор за гепатитом В. Методические указания. МУ 3.1.2792-10.-20.12.2010.
53. Эпидемиологический надзор и профилактика вирусного гепатита А. Методические указания. МУ 3.1.2837-11.-28.01.2011.
54. Эпидемиололгическая характеристика гепатита А в Сибирском федеральном округе / Г.М. Дмитриева, Л.П. Нурсаянова, Н.И. Шульгина [и др.] // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2012. - №1. - С.87-90.
55. A case-control study for clinical and molecular biological differences between hepatitis В viruses of genotypes В and C. Japan HBV Genotype Research Group / E. Orito, M. Mizokami, H. Sakugawa [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. -2001.-Vol. 33, №1. - P.218-223.
56. A chromosome 17:7 translocation is associated with a hepatitis В virus DNA integration in human hepatocellular carcinoma DNA / M. Meyer, K.H. Wiedorn, P.H. Hofschneider [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1992. - Vol. 15, №4. - P.665-671.
57. A genetic variant of hepatitis В virus divergent from known human and ape genotypes isolated from a Japanese patient and provisionally assigned to new
genotype J / K. Tatematsu, Y. Tanaka, F. Kurbanov [et al.] // Journal of virology.
- 2009. - Vol. 83, №20. - P. 10538-10547.
58. A large population histology study showing the lack of association between ALT elevation and significant fibrosis in chronic hepatitis B / W.-K. Seto, C.-L. Lai, P.P.C. Ip [et al.] // PloS one. - 2012. - Vol. 7, №2. - P.e32622.
59. A multistate outbreak of hepatitis A associated with semidried tomatoes in Australia, 2009 / E.J. Donnan, J.E. Fielding, J.E. Gregory [et al.] // Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2012. - Vol. 54, №6. - P.775-781.
60. A multistate, foodborne outbreak of hepatitis A. National Hepatitis A Investigation Team / Y.J. Hutin, V. Pool, E.H. Cramer [et al.] // The New England journal of medicine. - 1999. - Vol. 340, №8. - P.595-602.
61. A nationwide molecular epidemiological study on hepatitis B virus in Indonesia: identification of two novel subgenotypes, B8 and C7 / Mulyanto, S. Depamede, K. Surayah [et al.] // Archives of virology. -2009. - Vol. 154, №7. -P.1047-1059.
62. A new genotype of hepatitis B virus: complete genome and phylogenetic relatedness / L. Stuyver, G. De, G. Van [et al.] // The Journal of general virology.
- 2000. - Vol. 81, №Pt 1. - P.67-74.
63. A new intertype recombinant between genotypes C and D of hepatitis B virus identified in China / Z. Wang, Z. Liu, G. Zeng [et al.] // The Journal of general virology. - 2005. - Vol. 86, №Pt 4. - P.985-990.
64. A new subtype (subgenotype) Ac (A3) of hepatitis B virus and recombination between genotypes A and E in Cameroon / F. Kurbanov, Y. Tanaka, K. Fujiwara [et al.] // The Journal of general virology. -2005. - Vol. 86, №Pt 7. -P.2047-2056.
65. A novel hepatitis B virus (HBV) subgenotype D (D8) strain, resulting from recombination between genotypes D and E, is circulating in Niger along with
HBV/E strains / C. Abdou, S. Brichler, W. Mansour [et al.] // The Journal of general virology. - 2010. - Vol. 91, №Pt 6. - P. 1609-1620.
66. A novel method for efficient amplification of whole hepatitis B virus genomes permits rapid functional analysis and reveals deletion mutants in immunosuppressed patients / S. Gunther, B.C. Li, S. Miska [et al.] // Journal of virology. - 1995. - Vol. 69, №9. - P.5437-5444.
67. A study of the binding ability of pre-Sl and S2 proteins of hepatitis B virus to human serum albumin / K.Q. Hu, Z.Q. Yu, F.H. Li, L.J. Hao // Hepato-gastroenterology. - 1990. - Vol. 37, №3. - P.338-341.
68. Alavian, S. Hepatitis A / S. Alavian // Australian family physician. -2011. -Vol. 40, №4.-P. 185.
69. Alter, M. Epidemiology and prevention of hepatitis B / M. Alter // Seminars in liver disease. - 2003. - Vol. 23, №1. - P.39-46.
70. An outbreak of hepatitis A among homeless drug users in Rotterdam, The Netherlands / Tjon, G M S, H. Gotz, A.G. Koek [et al.] // Journal of medical virology. - 2005. - Vol. 77, №3. - P.360-366.
71. An outbreak of hepatitis A associated with green onions / C. Wheeler, T. Vogt, G. Armstrong [et al.] // The New England journal of medicine. -2005. -Vol. 353, №9. - P.890-897.
72. An outbreak of hepatitis A associated with green onions / C.M. Dentinger, W.A. Bower, O.V. Nainan [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2001. -Vol. 183, №8. - P.1273-1276.
73. An outbreak of hepatitis A associated with the consumption of raw beef / E. Robesyn, K. de Schrijver, E. Wollants [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. -Vol. 44, №3. - P.207-210.
74. Analysis of full-length hepatitis A virus genome in sera from patients with fulminant and self-limited acute type A hepatitis / K. Fujiwara, O. Yokosuka, K. Fukai [et al.] // Journal of hepatology. - 2001. - Vol. 35, №1. - P. 112-119.
75. Analysis of the entire nucleotide sequence of hepatitis B virus genotype B in the Philippines reveals a new subgenotype of genotype B / F. Nagasaki, H. Niitsuma, J. Cervantes [et al.] // The Journal of general virology. - 2006. - Vol. 87, №Pt 5. -P.1175-1180.
76. Analysis of the full-length genomes of novel hepatitis B virus subgenotypes Cll and C12 in Papua, Indonesia / Mulyanto, S.N. Depamede, A. Wahyono [et al.] // Journal of medical virology. - 2011. - Vol. 83, №1. - P.54-64.
77. Analysis of the genotype-determining region of hepatitis A viral RNA in relation to disease severities / K. Fujiwara, O. Yokosuka, F. Imazeki [et al.] // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. -2003. -Vol. 25, №2.-P. 124-134.
78. Arnheim, N. The polymerase chain reaction / N. Arnheim // Genetic engineering. - 1990.-Vol. 12. - P.115-137.
79. Arzumanyan, A. Pathogenic mechanisms in HBV- and HCV-associated hepatocellular carcinoma / A. Arzumanyan, H.M.G.P.V. Reis, M.A. Feitelson // Nature reviews. - 2013. - Vol. 13, №2. - P. 123-135.
80. Ashida, M. Molecular cloning of the hepatitis A virus receptor from a simian cell line / M. Ashida, C. Hamada // The Journal of general virology. - 1997. - Vol. 78 (Pt 7).-P. 1565-1569.
81. Asian-Pacific consensus statement on the management of chronic hepatitis B: a 2012 update / Y.-F. Liaw, J.-H. Kao, T. Piratvisuth [h £p.] // Hepatology international. - 2012. - T.6, №3. - C.531-561.
82. Association between severity of type A hepatitis and nucleotide variations in the 5' non-translated region of hepatitis A virus RNA: strains from fulminant
hepatitis have fewer nucleotide substitutions / K. Fujiwara, O. Yokosuka, T. Ehata [et al.] // Gut. - 2002. - Vol. 51, №1. - P.82-88.
83. Associations between hepatitis B virus genotype and mutants and the risk of hepatocellular carcinoma / H.-I. Yang, S.-H. Yeh, P.-J. Chen [et al.] // Journal of the National Cancer Institute. - 2008. - Vol. 100, №16. - P. 1134-1143.
84. Attenuation and cell culture adaptation of hepatitis A virus (HAV): a genetic analysis with HAV cDNA /J.I. Cohen, B. Rosenblum, S.M. Feinstone [et al.] // Journal of virology. - 1989. - Vol. 63, №12. - P.5364-5370.
85. Bader, T.F. Viral Hepatitis: practical evaluation and treatment / T.F. Bader. -Seattle, Toronto, Goettingen, Bern: Hogrefe and Huber Publishers, 2000. -266 p.
86. Bancroft, W.H. Detection of additional antigenic determinants of hepatitis B antigen / W.H. Bancroft, F.K. Mundon, P.K. Russell // Journal of immunology (Baltimore, Md. - 1972. - Vol. 109, №4. - P.842-848.
87. Bartholomeusz, A. Hepatitis B virus genotypes: comparison of genotyping methods / A. Bartholomeusz, S. Schaefer // Reviews in medical virology. - 2004. -Vol. 14, №1. - P.3-16.
88. BATTEN, P.J. Infectious hepatitis. Infectiousness during the presymptomatic phase of the disease / P.J. BATTEN, V.E. RUNTE, H.G. SKINNER // American journal of hygiene. - 1963. - Vol. 77. - P.129-136.
89. Bayesian coalescent inference of hepatitis A virus populations: evolutionary rates and patterns / G. Moratorio, M. Costa-Mattioli, R. Piovani [et al.] // The Journal of general virology. - 2007. - Vol. 88, №Pt 11. - P.3039-3042.
90. Bedossa, P. An algorithm for the grading of activity in chronic hepatitis C. The METAVIR Cooperative Study Group / P. Bedossa, T. Poynard // Hepatology (Baltimore, Md. - 1996. - Vol. 24, №2. - P.289-293.
91. Beier, D.R. Single-strand conformation polymorphism (SSCP) analysis as a tool for genetic mapping / D.R. Beier // Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society. - 1993. - Vol. 4, №11.- P.627-631.
92. Box, George E. P. Bayesian inference in statistical analysis / Box, George E. P, G.C. Tiao. - New York: Wiley, 1992. - xviii, 588.
93. Boyd, S.D. Diagnostic applications of high-throughput DNA sequencing / S.D. Boyd // Annual review of pathology. - 2013. - Vol. 8. - P.381-410.
94. Brooks, H.A. Detection and quantification of hepatitis A virus in seawater via real-time RT-PCR / H.A. Brooks, R.M. Gersberg, A.K. Dhar // Journal of virological methods. - 2005. - Vol. 127, №2. - P.109-118.
95. Burke, D.S. Wild Malaysian cynomolgus monkeys are exposed to hepatitis A virus / D.S. Burke, G.B. Heisey // The American journal of tropical medicine and hygiene. - 1984. - Vol. 33, №5. - P.940-944.
96. Changes in different regions of hepatitis B virus gene in hepatitis B 'e' antigen-negative patients with chronic hepatitis B: the effect of long-term lamivudine therapy / M. Buti, R. Jardi, F. Rodriguez-Frias [et al.] // Alimentary pharmacology & therapeutics. - 2005. - Vol. 21, №11. - P. 1349-1356.
97. Changing hepatitis A epidemiology and the need for vaccination in Korea / J.-H. Kang, K.-Y. Lee, C.-H. Kim, D. Sim // Asian Pacific journal of allergy and immunology / launched by the Allergy and Immunology Society of Thailand. -2004. - Vol. 22, №4. - P.237-242.
98. Changing risk profile of hepatitis A in The Netherlands: a comparison of seroprevalence in 1995-1996 and 2006-2007 / L. Verhoef, H.J. Boot, M. Koopmans [et al.] // Epidemiology and infection. -2011. - Vol. 139, №8. -P.1172-1180.
99. Characterization of a genetic variant of human hepatitis A virus / B. Khanna, J.E. Spelbring, B.L. Innis, B.H. Robertson // Journal of medical virology. - 1992. -Vol. 36, №2.-P.l 18-124.
100. Characterization of the complete genomic sequence of genotype II hepatitis A virus (CF53/Berne isolate) / L. Lu, K. Ching, P. de [et al.] // The Journal of general virology. - 2004. - Vol. 85, №Pt 10. - P.2943-2952.
101. Chen, C.J. Epidemiology of hepatitis B virus infection in the Asia-Pacific region / C.J. Chen, L.Y. Wang, M.W. Yu // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2000. - Vol. 15 Suppl. - P.E3-6.
102. Chu, C.-J. Clinical significance of hepatitis B virus genotypes / C.-J. Chu, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2002. - Vol. 35, №5. - P. 1274-1276.
103. Chu, C.-M. Chronic hepatitis B virus infection acquired in childhood: special emphasis on prognostic and therapeutic implication of delayed HBeAg seroconversion / C.-M. Chu, Y.-F. Liaw // Journal of viral hepatitis. - 2007. -Vol. 14, №3. -P.147-152.
104. Classification of hepatitis B virus genotype B into 2 major types based on characterization of a novel subgenotype in Arctic indigenous populations / T. Sakamoto, Y. Tanaka, J. Simonetti [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2007. - Vol. 196, №10. - P.1487-1492.
105. Clinical and molecular characteristics of hepatitis A virus infections during the years 1992-2003 in Ogaki, a centrally located city of Japan / H. Toyoda, T. Kumada, S. Kiriyama [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. - Vol. 44, №2. - P.145-148.
106. Clinical outcomes of hepatitis B virus (HBV) genotypes B and C in Japanese patients with chronic HBV infection / N. Furusyo, H. Nakashima, K. Kashiwagi [et al.] // The American journal of tropical medicine and hygiene. - 2002. -Vol. 67, №2. - P.151-157.
107. Cloning of the hepatitis B virus genome in Escherichia coli / A. Fritsch, C. Pourcel, P. Charnay, P. Tiollais // Comptes rendus hebdomadaires des seances de l'Academie des sciences. - 1978. - T.287, №16. - C.1453-1456.
108. Co-circulation of genotype IA and new variant IB hepatitis A virus in outbreaks of acute hepatitis in Hungary—2003/2004 / G. Reuter, A. Juhasz, L. Kosztolanyi [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. - Vol. 78, №11. - P. 1392-1397.
109. Cohen, J.I. Hepatitis A virus: insights from molecular biology / J.I. Cohen // Hepatology (Baltimore, Md. - 1989. - Vol. 9, №6. - P.889-895.
110. Comparative analysis of disease severity between genotypes IA and IIIA of hepatitis A virus / Y.K. Yoon, J.E. Yeon, J.H. Kim [h £p.] // Journal of Medical Virology. - 2011. - T.83, №8. - C.1308-1314.
111. Comparative hepatitis A seroepidemiology in 10 European countries / S. Kurkela, R. Pebody, G. Kafatos [et al.] // Epidemiology and infection. - 2012. -P.l-10.
112. Comparison of the amino acid sequences of nine different serotypes of hepatitis B surface antigen and genomic classification of the corresponding hepatitis B virus strains / H. Norder, B. Hammas, S. Lofdahl [et al.] // The Journal of general virology. - 1992.-Vol. 73 (Pt 5). - P. 1201-1208.
113. Complete nucleotide sequence of an attenuated hepatitis A virus: comparison with wild-type virus / J.I. Cohen, B. Rosenblum, J.R. Ticehurst [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1987. - Vol. 84, №8. - P.2497-2501.
114. Control of hepatitis A by universal vaccination of children and adolescents: an achieved goal or a deferred appointment? / D. Martinelli, I. Bitetto, S. Tafuri [et al.] //Vaccine. -2010. - Vol. 28, №41. - P.6783-6788.
115. Convergence and coevolution of hepatitis B virus drug resistance / H. Thai, D.S. Campo, J. Lara [et al.] // Nature communications. - 2012. - Vol. 3. - P.789.
116. Costa-Mattioli, M. Analysis of sequential hepatitis A virus strains reveals coexistence of distinct viral subpopulations / M. Costa-Mattioli, E. Domingo, J. Cristina // The Journal of general virology. -2006. - Vol. 87, №Pt 1. -P.115-118.
117. Courouce, A.M. Australia antigen subtypes identification. Results / A.M. Courouce, J. Drouet, J.Y. Muller // Bibliotheca haematologica. - 1976. - Vol. 42. - P.89-127.
118. Courouce-Pauty, A.M. Distribution of HBsAg subtypes in the world / A.M. Courouce-Pauty, A. Plancon, J.P. Soulier // Vox sanguinis. - 1983. - Vol.44, №4.-P. 197-211.
119. Cowie, B. Is there an optimal genetic target for molecular analysis of hepatitis B virus transmission? / B. Cowie // Journal of clinical microbiology. - 2006. -Vol. 44, №8. - P.3051.
120. Cuthbert, J.A. Hepatitis A: old and new / J.A. Cuthbert // Clinical microbiology reviews.-2001.-Vol. 14, №1. - P.38-58.
121. Cytotoxic T lymphocyte response to a wild type hepatitis B virus epitope in patients chronically infected by variant viruses carrying substitutions within the epitope / A. Bertoletti, A. Costanzo, F.V. Chisari [et al.] // The Journal of experimental medicine. - 1994. - Vol. 180, №3. - P.933-943.
122. Definition of the primary structure of hepatitis B virus (HBV) pre-S hepatocyte binding domain using random peptide libraries / F. D'Mello, C.D. Partidos, M.W. Steward, C.R. Howard // Virology. - 1997. - Vol. 237, №2. - P.319-326.
123. Detection and differentiation of human hepatitis A strains by commercial quantitative real-time RT-PCR tests / G. Sanchez, S. Populaire, S. Butot [et al.] // Journal of virological methods. - 2006. - Vol. 132, №1-2. - P. 160-165.
124. Detection and typing of HPV genotypes in various cervical lesions by HPV oligonucleotide microarray / T.S. Hwang, J.K. Jeong, M. Park [et al.] // Gynecologic oncology. - 2003. - Vol. 90, № 1. - P.51-56.
125. Detection of hepatitis A virus by extraction of viral RNA and molecular hybridization / J.R. Ticehurst, S.M. Feinstone, T. Chestnut [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1987. - Vol. 25, №10. - P. 1822-1829.
126. Detection of hepatitis A virus in the feces of patients with naturally acquired infections / A.G. Coulepis, S.A. Locarnini, N.I. Lehmann, I.D. Gust // The Journal of infectious diseases. - 1980.-Vol. 141, №2. - P.151-156.
127. Detection of pre-Sl proteins in peripheral blood mononuclear cells from patients with HBV infection / F. Zoulim, L. Vitvitski, P. Bouffard [et al.] // Journal of hepatology.- 1991.-Vol. 12, №2. - P. 150-156.
128. Determinants for sustained HBeAg response to lamivudine therapy / R.-N. Chien, C.-T. Yeh, S.-L. Tsai [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. -2003. -Vol. 38, №5. - P.1267-1273.
129. Diagnosis of hepatitis a virus infection: a molecular approach / O.V. Nainan, G. Xia, G. Vaughan, H.S. Margolis // Clinical microbiology reviews. - 2006. -Vol. 19, №1. -P.63-79.
130. Direct sequencing of hepatitis A virus strains isolated during an epidemic in France / V. Apaire-Marchais, B.H. Robertson, V. Aubineau-Ferre [et al.] // Applied and environmental microbiology. - 1995. - Vol.61, №11. -P.3977-3980.
131. Distribution of hepatitis B virus (HBV) genotypes among HBV carriers in the Cote d'lvoire: complete genome sequence and phylogenetic relatedness of HBV genotype E / S. Suzuki, F. Sugauchi, E. Orito [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 69, №4. - P.459^165.
132. Distribution of hepatitis B virus genotypes among American blood donors determined with a PreS2 epitope enzyme-linked immunosorbent assay kit / T. Moriya, I.K. Kuramoto, H. Yoshizawa, P.V. Holland // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №3. - P.877-880.
133. Distribution of hepatitis B virus genotypes among patients with chronic infection in Japan shifting toward an increase of genotype A / K. Matsuura, Y. Tanaka, S. Hige [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47, №5. - P.1476-1483.
134. Diversity of hepatitis B virus infecting Malaysian candidate blood donors is driven by viral and host factors / B.H. Meldal, A.H. Bon, D. Prati [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2011. - Vol. 18, №2. - P.91-101.
135.EASL clinical practice guidelines: Management of chronic hepatitis B virus infection // Journal of hepatology. - 2012. - Vol. 57, №1. - P. 167-185.
136. Ecology and prevention of a shellfish-associated hepatitis A epidemic in Shanghai, China / Z.Y. Xu, Z.H. Li, J.X. Wang [et al.] // Vaccine. - 1992. -Vol. 10 Suppl 1. - P.S67-8.
137. Eight genotypes (A-H) of hepatitis B virus infecting patients from San Francisco and their demographic, clinical, and virological characteristics / H. Kato, R. Gish, N. Bzowej [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №4. - P.516-521.
138. Elucidation of hepatitis C virus transmission and early diversification by single genome sequencing / H. Li, M.B. Stoddard, S. Wang [et al.] // PLoS pathogens. -2012. - Vol. 8, №8. - P.el002880.
139. Epidemiological and genetic analysis of a sustained community-wide outbreak of hepatitis A in the Republic of Korea, 2008: a hospital-based case-control study / Y.K. Yoon, B.C. Chun, H.K. Lee [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2009. -Vol. 46, №2.-P. 184-188.
140. Epidemiology of hepatitis A virus infections, Germany, 2007-2008 / M.S. Faber, K. Stark, S.C. Behnke [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2009. - Vol. 15, №11. - P.1760-1768.
141. Ethnogeographical structure of hepatitis B virus genotype distribution in Indonesia and discovery of a new subgenotype, B9 / M. Thedja, D. Muljono, N. Nurainy [et al.] // Archives of virology. - 2011. - Vol. 156, №5. - P.855-868.
142. European Centre for Disease Prevention and Control. Annual Epidemiological Report on Communicable Diseases in Europe 2009 / European Centre for Disease Prevention and Control. - Stockholm: ECDC, 2009. - 222 p.
143. Evaluation of intra-host variants of the entire hepatitis B virus genome / S. Ramachandran, X. Zhai, H. Thai [et al.] // PloS one. -2011. - Vol. 6, №9. -P.e25232.
144. Evaluation of the Abbott investigational use only RealTime hepatitis C virus (HCV) assay and comparison to the Roche TaqMan HCV analyte-specific reagent assay / M.T. Pyne, E.Q. Konnick, A. Phansalkar, D.R. Hillyard // Journal of clinical microbiology. - 2009. - Vol. 47, №9. - P.2872-2878.
145. Excretion of hepatitis A virus (HAV) in adults: comparison of immunologic and molecular detection methods and relationship between HAV positivity and infectivity in tamarins / L.B. Polish, B.H. Robertson, B. Khanna [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1999. - Vol. 37, №11. - P.3 615-3617.
146. Excretion of hepatitis A virus in the stools of hospitalized hepatitis patients / M. Carl, R.J. Kantor, H.M. Webster [et al.] // Journal of medical virology. - 1982. -Vol. 9, №2. - P.125-129.
147. Expression mechanism of the hepatitis B virus (HBV) C gene and biosynthesis of HBe antigen / O. Jean-Jean, M. Levrero, H. Will [et al.] // Virology. - 1989. -Vol. 170, №1. -P.99-106.
148. Fagan, E.A. Viral hepatitis / E.A. Fagan, T.J. Harrison. -Oxford: BIOS Scientific Publ., 2000. - 311 p.
149. Fattovich, G. Natural history and prognosis of hepatitis B / G. Fattovich // Seminars in liver disease. - 2003. - Vol. 23, №1. - P.47-58.
150. Fattovich, G. Natural history of chronic hepatitis B: special emphasis on disease progression and prognostic factors / G. Fattovich, F. Bortolotti, F. Donato // Journal of hepatology. - 2008. - Vol. 48, №2. - P.335-352.
151. Fattovich, G. Natural history of hepatitis B / G. Fattovich // Journal of hepatology.-2003.- Vol. 39 Suppl 1.-P.S50-8.
152. Fecal shedding of hepatitis A virus in Indian patients with hepatitis A and in experimentally infected Rhesus monkey / S.D. Chitambar, M.S. Joshi, M.A. Sreenivasan, V.A. Arankalle // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. - 2001. - Vol. 19, №3. - P.237-246.
153. Feinstone, S.M. Hepatitis A: detection by immune electron microscopy of a viruslike antigen associated with acute illness / S.M. Feinstone, A.Z. Kapikian, R.H. Purceli // Science (New York, N. - 1973. - Vol. 182, №4116. - P. 10261028.
154. Feitelson, M. Hepatitis B virus infection and primary hepatocellular carcinoma / M. Feitelson // Clinical microbiology reviews. - 1992. - Vol. 5, №3. -P.275-301.
155. Flehmig, B. Hepatitis A / B. Flehmig // Bailliere's clinical gastroenterology. -1990. - Vol. 4, №3. - P.707-720.
156. Follow-up and indications for liver biopsy in HBeAg-negative chronic hepatitis B virus infection with persistently normal ALT: a systematic review / G.V. Papatheodoridis, S. Manolakopoulos, Y.-F. Liaw, A. Lok // Journal of hepatology. - 2012. - Vol. 57, №1. - P. 196-202.
157. Frequent detection of hepatitis A viral RNA in serum during the early convalescent phase of acute hepatitis A / K. Fujiwara, O. Yokosuka, T. Ehata [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1997. - Vol. 26, №6. - P. 1634-1639.
158. Full-length human immunodeficiency virus type 1 genomes from subtype C-infected seroconverters in India, with evidence of intersubtype recombination / K.S. Lole, R.C. Bollinger, R.S. Paranjape [et al.] // Journal of virology. - 1999. -Vol. 73, №1. - P.152-160.
159. Full-length sequences of subgenotype IIIA and IIIB hepatitis A virus isolates: characterization of genotype III HAV genomes / K. Endo, M. Takahashi, K. Masuko [et al.] // Virus research. - 2007. - Vol. 126, №1-2. - P. 116-127.
160. Fung, S. Hepatitis B virus genotypes: do they play a role in the outcome of HBV infection? / S. Fung, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2004. - Vol. 40, №4. - P.790-792.
161. Gandhe, S.S. Hepatitis B virus genotypes and serotypes in western India: lack of clinical significance /S.S. Gandhe, M.S. Chadha, V.A. Arankalle // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 69, №3. - P.324-330.
162. Ganem, D. Hepatitis B virus reverse transcriptase and its many roles in hepadnaviral genomic replication / D. Ganem, J.R. Pollack, J. Tavis // Infectious agents and disease. - 1994. - Vol. 3, №2-3. - P.85-93.
163. Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data / M. Kearse, R. Moir, A. Wilson [et al.] // Bioinformatics (Oxford, England). - 2012. - Vol. 28, №12. - P. 1647-1649.
164. Genetic analysis of HAV strains recovered from patients with acute hepatitis from Southern Italy / M. Chironna, A. Grottola, C. Lanave [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 70, №3. - P.343-349.
165. Genetic analysis of hepatitis A virus isolates from Brazil / de Paula, Vanessa S, L. Lu, C. Niel [et al.] // Journal of medical virology. -2004. - Vol. 73, №3. -P.378-383.
166. Genetic analysis of hepatitis A virus outbreak in France confirms the co-circulation of subgenotypes la, lb and reveals a new genetic lineage / M. Costa-Mattioli, S. Monpoeho, C. Schvoerer [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №2. - P.233-240.
167. Genetic analysis of hepatitis A virus strains recovered from the environment and from patients with acute hepatitis / S. Pina, M. Buti, R. Jardi [et al.] // The Journal of general virology. - 2001. - Vol. 82, №Pt 12. - P.2955-2963.
168. Genetic diversity of hepatitis B virus strains derived worldwide: genotypes, subgenotypes, and HBsAg subtypes / H. Norder, A.-M. Courouce, P. Coursaget [et al.] // Intervirology. - 2004. - Vol. 47, №6. - P.289-309.
169. Genetic relatedness of Cuban HAV wild-type isolates / B.I. Diaz, C.A. Sariol, A. Normann [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol.64, №2. -P.96-103.
170. Genetic relatedness of hepatitis A virus isolates during a community-wide outbreak / B.H. Robertson, F. Averhoff, T.L. Cromeans [et al.] // Journal of medical virology. - 2000. - Vol. 62, №2. - P.144-150.
171. Genetic relatedness of hepatitis A virus strains recovered from different geographical regions / B.H. Robertson, R.W. Jansen, B. Khanna [et al.] // The Journal of general virology. - 1992. - Vol. 73 (Pt 6). - P.1365-1377.
172. Genetic variability of hepatitis A virus in South America reveals heterogeneity and co-circulation during epidemic outbreaks / M. Costa-Mattioli, V. Ferre, S. Monpoeho [et al.] // The Journal of general virology. - 2001. - Vol. 82, №Pt 11. -P.2647-2652.
173. Genomic characterization of HBV genotype F in Bolivia: genotype F subgenotypes correlate with geographic distribution and T(1858) variant / T.T. Huy, H. Ushijima, T. Sata, K. Abe // Archives of virology. -2006. - Vol. 151, №3. - P.589-597.
174. Genotype H: a new Amerindian genotype of hepatitis B virus revealed in Central America / P. Arauz-Ruiz, H. Norder, B. Robertson, L. Magnius // The Journal of general virology. - 2002. - Vol. 83, №Pt 8. - P.2059-2073.
175. Genotype may correlate with liver carcinogenesis and tumor characteristics in cirrhotic patients infected with hepatitis B virus subtype adw / A. Tsubota, Y. Arase, F. Ren [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №2. -P.257-265.
176. Genotype mixtures of hepatitis B virus in patients treated with interferon / C. Hannoun, K. Krogsgaard, P. Horal, M. Lindh // The Journal of infectious diseases. - 2002. - Vol. 186, №6. - P.752-759.
177. Genotype, phylogenetic analysis, and transmission pattern of occult hepatitis B virus (HBV) infection in families of asymptomatic HBsAg carriers / S. Datta, A. Banerjee, P.K. Chandra [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. - Vol. 78, №1. - P.53-59.
178. Genotypes and clinical phenotypes of hepatitis B virus in patients with chronic hepatitis B virus infection / J.-H. Kao, P.-J. Chen, M.-Y. Lai, D.-S. Chen // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №4. - P. 1207-1209.
179. Genotypic dominance and novel recombinations in HBV genotype B and C co-infected intravenous drug users / B.-F. Chen, J.-H. Kao, C.-J. Liu [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №1. - P.13-22.
180. Gish, R.G. Genotyping and genomic sequencing in clinical practice / R.G. Gish, S. Locarnini // Clinics in liver disease. - 2007. - Vol. 11, №4. - P.761-95, viii.
181. Gojobori, T. Molecular clock of viral evolution, and the neutral theory / T. Gojobori, E.N. Moriyama, M. Kimura // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1990. - Vol. 87, №24. -P.10015-10018.
182. Goswami, B.B. Identification of genetic variants of hepatitis A virus / B.B. Goswami, W.3. Burkhardt, T.A. Cebula // Journal of virological methods. - 1997. -Vol. 65, №1. - P.95-103.
183. Green, M.R. Molecular cloning / M.R. Green, J. Sambrook. - Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012. - 1890 c.
184. Grotzinger, T. Sensitive method for identification of minor hepatitis B mutant viruses / T. Grotzinger, H. Will // Virology. - 1992. - Vol. 187, №1. -P.383-387.
185. Guirgis, Bassem S S. Hepatitis B virus genotyping: current methods and clinical implications / Guirgis, Bassem S S, R.O. Abbas, Azzazy, Hassan ME// International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases. -2010. - Vol. 14, №11. -P.e941-53.
186. Gupta, A. Changing epidemiology of hepatitis A infection / A. Gupta, Y. Chawla // The Indian journal of medical research. - 2008. - Vol. 128, №1. - P.7-9.
187. Hall, B.G. Building phylogenetic trees from molecular data with MEGA / B.G. Hall // Molecular biology and evolution. - 2013. - Vol. 30, №5. - P. 1229-1235.
188. Hanada, K. A large variation in the rates of synonymous substitution for RNA viruses and its relationship to a diversity of viral infection and transmission modes / K. Hanada, Y. Suzuki, T. Gojobori // Molecular biology and evolution. -2004. - Vol. 21, №6. - P. 1074-1080.
189. Hannoun, C. Long-term mutation rates in the hepatitis B virus genome / C. Hannoun, P. Horal, M. Lindh // The Journal of general virology. - 2000. -Vol. 81, №Pt 1. - P.75-83.
190. Hasegawa, M. Dating of the human-ape splitting by a molecular clock of mitochondrial DNA / M. Hasegawa, H. Kishino, T. Yano // Journal of molecular evolution. - 1985. - Vol. 22, №2. - P.160-174.
191. Hayashi, K. PCR-SSCP: a method for detection of mutations / K. Hayashi // Genetic analysis, techniques and applications. - 1992. - Vol. 9, №3. - P.73-79.
192. HBsAg seroclearance in chronic hepatitis B in the Chinese: virological, histological, and clinical aspects / M.-F. Yuen, D.-H. Wong, E. Sablon [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2004. - Vol. 39, №6. - P. 1694-1701.
193. HBV genotype B is associated with better response to interferon therapy in HBeAg(+) chronic hepatitis than genotype C / C. Wai, C.-J. Chu, M. Hussain, A. Lok // Hepatology (Baltimore, Md. - 2002. - Vol. 36, №6. - P. 1425-1430.
194. Hepatitis A in Tunisia: phylogenetic analysis of hepatitis A virus from 2001 to 2004 / H. Gharbi-Khelifi, V. Ferre, K. Sdiri [et al.] // Journal of virological methods. - 2006. - Vol. 138, №1-2. - P. 109-116.
195. Hepatitis a molecular epidemiology in the United States, 1996-1997: sources of infection and implications of vaccination policy / O. Nainan, G. Armstrong, X.-H. Han [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2005. - Vol. 191, №6. -P.957-963.
196. Hepatitis A outbreak in a neonatal intensive care unit: risk factors for transmission and evidence of prolonged viral excretion among preterm infants / L.S. Rosenblum, M.E. Villarino, O.V. Nainan [et al.] // The Journal of infectious diseases. - 1991.-Vol. 164, №3. - P.476-482.
197. Hepatitis A viral genotypes and clinical relevance: Clinical and molecular characterization of hepatitis A virus isolates from northern India / Z. Hussain, B. Das, S. Husain [et al.] // Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology. - 2005. - Vol. 32, №1. - P. 16-24.
198. Hepatitis A virus genotype and its correlation with the clinical outcome of acute hepatitis A in Korea: 2006-2008 / H. Yun, H. Lee, J.-H. Jang [et al.] // Journal of medical virology. - 2011. - Vol. 83, №12. - P.2073-2081.
199. Hepatitis A virus: a test method for virucidal activity / M.H. Wolff, J. Schmitt, M. Rahaus, A. Konig // The Journal of hospital infection. - 2001. - Vol. 48 Suppl A. -P.S18-22.
200. Hepatitis B and Delta virus infection among heterosexuals, homosexuals and bisexual men / A. Mele, E. Franco, F. Caprilli [et al.] // European journal of epidemiology. - 1988. - Vol. 4, №4. - P.488-491.
201. Hepatitis B genotypes and the response to interferon therapy / J.H. Kao, N.H. Wu, P.J. Chen [et al.] // Journal of hepatology. -2000. - Vol. 33, №6. -P.998-1002.
202. Hepatitis B genotypes correlate with clinical outcomes in patients with chronic hepatitis B / J.H. Kao, P.J. Chen, M.Y. Lai, D.S. Chen // Gastroenterology. -2000. - Vol. 118, №3. - P.554-559.
203. Hepatitis B surface antigen (HBsAg) derived from yeast cells (Hansenula polymorpha) used to establish an influence of antigenic subtype (adw2, adr, ayw3) in measuring the immune response after vaccination / R.A. Heijtink, P. van Bergen, K. Melber [et al.] // Vaccine. - 2002. - Vol. 20, №17-18. - P.2191-2196.
204. Hepatitis B virus carrier state in black children in Ovamboland: role of perinatal and horizontal infection / J.F. Botha, M.J. Ritchie, G.M. Dusheiko [et al.] // Lancet. - 1984.-Vol. 1, №8388. -P.1210-1212.
205. Hepatitis B virus core protein mutations are concentrated in B cell epitopes in progressive disease and in T helper cell epitopes during clinical remission / W.F. Carman, W. Boner, G. Fattovich [et al.] // The Journal of infectious diseases. -
1997. - Vol. 175, №5. - P.1093-1100.
206. Hepatitis B virus DNA in saliva, urine, and seminal fluid of carriers of hepatitis B e antigen / P. Karayiannis, D.M. Novick, A.S. Lok [et al.] // British medical journal (Clinical research ed. - 1985. - Vol. 290, №6485. - P. 1853-1855.
207. Hepatitis B virus genotype assignment using restriction fragment length polymorphism patterns / M. Mizokami, T. Nakano, E. Orito [et al.] // FEBS letters. - 1999.-Vol. 450, №1-2. - P.66-71.
208. Hepatitis B virus genotype D strains from Estonia share sequence similarity with strains from Siberia and may specify ayw4 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 74, №2. - P.221-227.
209. Hepatitis B virus genotype has no impact on hepatitis B e antigen seroconversion after lamivudine treatment / H.L.-Y. Chan, M.-L. Wong, A.Y. Hui [et al.] // World journal of gastroenterology : WJG. - 2003. - Vol. 9, №12. -P.2695-2697.
210. Hepatitis B virus genotypes and hepatocellular carcinoma in Japan / H. Fujie, K. Moriya, Y. Shintani [et al.] // Gastroenterology. -2001. - Vol. 120, №6. -P.1564-1565.
211. Hepatitis B virus genotypes and virologic response in 694 patients in phase III studies of adefovir dipivoxill / C. Westland, W. Delaney, 4th., H. Yang [et al.] // Gastroenterology. - 2003. - Vol. 125, №1. - P.107-116.
212. Hepatitis B virus genotypes B and C do not affect the antiviral response to lamivudine / M.-F. Yuen, D.K.-H. Wong, E. Sablon [et al.] // Antiviral therapy. -2003. - Vol. 8, №6. - P.531-534.
213. Hepatitis B virus genotypes in the United States: results of a nationwide study / C.-J. Chu, E.B. Keeffe, S.-H. Han [et al.] // Gastroenterology. - 2003. - Vol. 125, №2.-P.444-451.
214. Hepatitis B virus: predominance of genotype D in primitive tribes of the Andaman and Nicobar islands, India (1989-1999) / V.A. Arankalle, K.M. Murhekar, S.S. Gandhe [et al.] // The Journal of general virology. -2003. -Vol. 84, №Pt 7. - P.1915-1920.
215. Hepatitis C virus (HCV) circulates as a population of different but closely related genomes: quasispecies nature of HCV genome distribution / M. Martell, J.I. Esteban, J. Quer [et al.] // Journal of virology. - 1992. - Vol.66, №5. -P.3225-3229.
216. Hepatitis C virus genotypes: clinical relevance and therapeutic implications / C.-M. Lee, C.-H. Hung, S.-N. Lu, C.-S. Changchien // Chang Gung medical journal. -2008.-Vol. 31, №1. - P.16-25.
217. Hepatitis C virus transmission from an anesthesiologist to a patient / S. Cody, O. Nainan, R. Garfein [et al.] // Archives of internal medicine. -2002. - Vol. 162, №3. - P.345-350.
218. Hepatitis in Albanian children: molecular analysis of hepatitis A virus isolates / R. Gabrieli, G. Sanchez, A. Macaluso [et al.] // Journal of medical virology. -2004. - Vol. 72, №4. - P.533-537.
219. High and persistent excretion of hepatitis A virus in immunocompetent patients / G. Tjon, R. Coutinho, d. van [et al.] // Journal of medical virology. - 2006. -Vol. 78, №11. - P.1398-1405.
220. High speed DNA sequencing by capillary electrophoresis / J.A. Luckey, H. Drossman, A.J. Kostichka [et al.] // Nucleic acids research. - 1990. - Vol. 18, №15. - P.4417-4421.
221. Hnatyszyn, H. Chronic hepatitis C and genotyping: the clinical significance of determining HCV genotypes / H. Hnatyszyn // Antiviral therapy. - 2005. -Vol. 10, №1. -P.1-11.
222. Hollinger, F.B. Hepatitis A Virus / F.B. Hollinger, S.U. Emerson // Fields' virology / ed. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley. - Philadelphia, Pa., London: Wolters Kluwer/Lippincott Williams & Wilkins, 2007. - P.912-947.
223. Human liver plasma membranes contain receptors for the hepatitis B virus pre-S1 region and, via polymerized human serum albumin, for the pre-S2 region / P. Pontisso, M.A. Petit, M.J. Bankowski, M.E. Peeples // Journal of virology. -
1989.-Vol. 63, №5. - P.1981-1988.
224. Huy, T.T. New complex recombinant genotype of hepatitis B virus identified in Vietnam / T.T. Huy, T.T. Ngoc, K. Abe // Journal of virology. - 2008. - Vol. 82, №11.- P.5657-5663.
225. Identification and characterization of novel hepatitis B virus subgenotype C10 in Nusa Tenggara, Indonesia / Mulyanto, S.N. Depamede, K. Surayah [et al.] // Archives of virology. - 2010. - Vol. 155, №5. - P.705-715.
226. Identification of a surface glycoprotein on African green monkey kidney cells as a receptor for hepatitis A virus / G. Kaplan, A. Totsuka, P. Thompson [et al.] // The EMBO journal. - 1996. - Vol. 15, №16. - P.4282-4296.
227. Identification of four novel subgenotypes (C13-C16) and two inter-genotypic recombinants (C12/G and C13/B3) of hepatitis B virus in Papua province, Indonesia / Mulyanto, P. Pancawardani, S. Depamede [et al.] // Virus research. -2012.-Vol. 163, №1. - P. 129-140.
228. Identification of polymerized-albumin receptor domain in the pre-S2 region of hepatitis B virus surface antigen M protein / Y. Itoh, S. Kuroda, T. Miyazaki [et al.] // Journal of biotechnology. - 1992. - Vol. 23, №1. - P.71-82.
229. Identification of VP1/2A and 2C as virulence genes of hepatitis A virus and demonstration of genetic instability of 2C / S. Emerson, Y. Huang, H. Nguyen [et al.] // Journal of virology. - 2002. - Vol. 76, №17. - P.8551-8559.
230. Increased circulation of hepatitis A virus genotype IIIA over the last decade in St Petersburg, Russia / S. Mukomolov, M. Kontio, N. Zheleznova [et al.] // Journal of medical virology. - 2012. - Vol. 84, №10. - P. 1528-1534.
231. Infectious hepatitis: detection of virus during the incubation period and in clinically inapparent infection / S. Krugman, R. WARD, J.P. Giles [et al.] // The New England journal of medicine. - 1959. - Vol. 261. - P.729-734.
232. Influence of genotype on hepatitis B surface antigen kinetics in hepatitis B e antigen-negative patients treated with pegylated interferon-alpha2a / R. Moucari, M. Martinot-Peignoux, V. Mackiewicz [et al.] // Antiviral therapy. - 2009. -Vol. 14, №8.-P.l 183-1188.
233. Influence of hepatitis B virus genotype on the long-term outcome of chronic hepatitis B in western patients / J.M. Sanchez-Tapias, J. Costa, A. Mas [et al.] // Gastroenterology. - 2002. - Vol. 123, №6. - P.1848-1856.
234. Influence of hepatitis B virus genotypes on the progression of chronic type B liver disease / H. Sumi, O. Yokosuka, N. Seki [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md.-2003.-Vol. 37, №1.-P. 19-26.
235. Intrahepatic expression of pre-S proteins of hepatitis B virus and its possible relation to liver cell necrosis / K.Q. Hu, L.J. Hao, Y.Y. Zhang, Y.K. Wang // The American journal of gastroenterology. - 1989. - Vol. 84, №12. - P.1538-1542.
236. Investigation of infection with Campylobacter jejuni in a man with hypogammaglobulinemia using PCR-single-stranded conformational polymorphism (PCR-SSCP) typing / J. Moore, M. Curran, D. Wareing [et al.] // International journal of medical microbiology : IJMM. - 2001. - Vol. 291, №1. -P.21-25.
237. Investigation of the presence of different broad-spectrum beta-lactamases among clinical isolates of Enterobacteriacae / E. Nagy, Z. Pragai, Z. Koczian [et al.] // Acta microbiologica et immunologica Hungarica. - 1998. - Vol.45, №3-4. -P.433^46.
238. Is hepatitis B virus subtype testing useful in predicting virological response and resistance to lamivudine? / M. Buti, M. Cotrina, A. Valdes [et al.] // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №3. - P.445-446.
239. Jacobsen, K.H. Declining hepatitis A seroprevalence: a global review and analysis / K.H. Jacobsen, J.S. Koopman // Epidemiology and infection. - 2004. -Vol. 132, №6. - P.1005-1022.
240. Jacobsen, K.H. Hepatitis A virus seroprevalence by age and world region, 1990 and 2005 / K.H. Jacobsen, S.T. Wiersma // Vaccine. - 2010. - Vol. 28, №41. -P.6653-6657.
241. Jacobsen, K.H. The effects of socioeconomic development on worldwide hepatitis A virus seroprevalence patterns / K.H. Jacobsen, J.S. Koopman // International journal of epidemiology. - 2005. - Vol. 34, №3. - P.600-609.
242. Kann, M. Hepatitis B / M. Kann, W.H. Gerlich // Topley and Wilson's microbiology and microbial infections. Volume 1: Virology. / ed. B. W. Mahy, L. Collier, A. Balows, M. Sussman. - London: Edward Arnold, 1998. - P.745-774.
243. Kann, M. Recent studies on replication of hepatitis B virus / M. Kann, X. Lu, W.H. Gerlich // Journal of hepatology. - 1995. - Vol. 22, №1 Suppl. - P.9-13.
244. Kao, J.-H. Hepatitis B viral genotypes and lamivudine resistance / J.-H. Kao, C.-J. Liu, D.-S. Chen // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №2. - P.303-304.
245. Kao, J.-H. Hepatitis B viral genotypes: clinical relevance and molecular characteristics / J.-H. Kao // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2002. -Vol. 17, №6. - P.643-650.
246. Kao, J.-H. Molecular epidemiology of hepatitis B virus / J.-H. Kao // The Korean journal of internal medicine. - 2011. - Vol. 26, №3. - P.255-261.
247. Kato-Maeda, M. Microarray analysis of pathogens and their interaction with hosts / M. Kato-Maeda, Q. Gao, P.M. Small // Cellular microbiology. -2001. -Vol. 3, №11. -P.713-719.
248. Kew, M.C. Epidemiology of chronic hepatitis B virus infection, hepatocellular carcinoma, and hepatitis B virus-induced hepatocellular carcinoma / M.C. Kew // Pathologie-biologie. - 2010. - Vol. 58-60, №4-5. - P.273-277.
249. Kidd-Ljunggren, K. Genetic variability in hepatitis B viruses / K. Kidd-Ljunggren, Y. Miyakawa, A.H. Kidd // The Journal of general virology. - 2002. -Vol. 83, №Pt 6. - P.1267-1280.
250. Kimura, M. A simple method for estimating evolutionary rates of base substitutions through comparative studies of nucleotide sequences / M. Kimura // Journal of molecular evolution. - 1980. - Vol. 16, №2. - P.l 11-120.
251. Kinetic PCR analysis: real-time monitoring of DNA amplification reactions / R. Higuchi, C. Fockler, G. Dollinger, R. Watson // Bio/technology (Nature Publishing Company). - 1993. - Vol. 11, №9. - P.1026-1030.
252. Klein, D. Quantification using real-time PCR technology: applications and limitations / D. Klein // Trends in molecular medicine. -2002. - Vol. 8, №6. -P.257-260.
253. Koslap-Petraco, M. Hepatitis A: disease burden and current childhood vaccination strategies in the United States / M. Koslap-Petraco, M. Shub, R. Judelsohn // Journal of pediatric health care : official publication of National Association of Pediatric Nurse Associates & Practitioners. -2008. - Vol.22, №1. - P.3-11.
254. Koziel, M.J. Hepatitis B Virus and Hepatitis Delta Virus / M.J. Koziel, C.L. Thio // Mandell, Douglas and Bennett's principles and practice of infectious diseases. Volume 2 / ed. G. L. Mandell, J. E. Bennett, R. Dolin. - New York: Churchill Livingstone, 2010. -P.2059-2086.
255. Krugman, S. The natural history of infectious hepatitis / S. Krugman, R. WARD, J.P. Giles // The American journal of medicine. - 1962. - Vol. 32. -P.717-728.
256. Kwok, S. Avoiding false positives with PCR / S. Kwok, R. Higuchi // Nature. -1989. - Vol. 339, №6221. - P.237-238.
257. Lau, J.Y. Molecular virology and pathogenesis of hepatitis B / J.Y. Lau, T.L. Wright // Lancet. - 1993. - Vol. 342, №8883. - P.1335-1340.
258. Lavanchy, D. Hepatitis B virus epidemiology, disease burden, treatment, and current and emerging prevention and control measures / D. Lavanchy // Journal of viral hepatitis. - 2004. - Vol. 11, №2. - P.97-107.
259. Lavanchy, D. Worldwide epidemiology of HBV infection, disease burden, and vaccine prevention / D. Lavanchy // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. - 2005. - Vol. 34 Suppl 1.-P.S1-3.
260. Le Bouvier, G L. The heterogeneity of Australia antigen / Le Bouvier, G L // The Journal of infectious diseases. - 1971. - Vol. 123, №6. -P.671-675.
261. Lemon, S.M. Genetic, antigenic and biological differences between strains of hepatitis A virus / S.M. Lemon, R.W. Jansen, E.A. Brown // Vaccine. - 1992. -Vol. 10 Suppl 1. - P.S40-4.
262. Lin, C.-L. The clinical implications of hepatitis B virus genotype: Recent advances / C.-L. Lin, J.-H. Kao // Journal of gastroenterology and hepatology. -2011.-Vol. 26 Suppl 1.-P. 123-130.
263. Lok, A.S.F. Chronic hepatitis B: update 2009 / A.S.F. Lok, B.J. McMahon // Hepatology (Baltimore, Md. - 2009. - Vol. 50, №3. - P.661-662.
264. Lok, A.S.-F. Viral hepatitis B and D. / A.S.-F. Lok, H.L.-Y. Chan // Comprehensive clinical hepatology / ed. J. G. O'Grady, J. R. Lake, P. D. Howdle. - London: Mosby, 2000. - P. 12.1-22.
265. Long-term outcome of chronic hepatitis B in Caucasian patients: mortality after 25 years / G. Fattovich, N. Olivari, M. Pasino [et al.] // Gut. -2008. - Vol. 57, №1. - P.84-90.
266. Loss of HBsAg antigen during treatment with entecavir or lamivudine in nucleoside-naive HBeAg-positive patients with chronic hepatitis B / R.G. Gish, T.-T. Chang, C.-L. Lai [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2010. - Vol. 17, №1. -P. 16-22.
267. Mackay, I.M. Real-time PCR in virology / I.M. Mackay, K.E. Arden, A. Nitsche // Nucleic acids research. - 2002. - Vol. 30, №6. - P.1292-1305.
268. Magnius, L.O. Subtypes, genotypes and molecular epidemiology of the hepatitis B virus as reflected by sequence variability of the S-gene / L.O. Magnius, H. Norder // Intervirology. - 1995. - Vol. 38, №1-2. - P.24-34.
269. Mahoney, F.J. Update on diagnosis, management, and prevention of hepatitis B virus infection / F.J. Mahoney // Clinical microbiology reviews. - 1999. -Vol. 12, №2. - P.351-366.
270. Maini, M.K. How can the cellular immune response control hepatitis B virus replication? / M.K. Maini, A. Bertoletti // Journal of viral hepatitis. - 2000. -Vol. 7, №5. - P.321-326.
271. Major human Hepatitis A virus genotype in Hong Kong marine waters and detection by real-time PCR / N. Yang, Chu, Daniel Ling Ho, Wong, Minnie Man Lai [et al.] // Marine pollution bulletin. - 2011. - Vol. 62, №12. - P.2654-2658.
272. Mathur, P. Epidemiological transition of hepatitis A in India: issues for vaccination in developing countries / P. Mathur, N.K. Arora // The Indian journal of medical research. - 2008. - Vol. 128, №6. - P.699-704.
273. Matthews, R.E. The classification and nomenclature of viruses. Summary of results of meetings of the International Committee on Taxonomy of Viruses in The Hague, September 1978 / R.E. Matthews // Intervirology. - 1979. - Vol. 11, №3. - P.133-135.
274. Mayerat, C. Does hepatitis B virus (HBV) genotype influence the clinical outcome of HBV infection? / C. Mayerat, A. Mantegani, P.C. Frei // Journal of viral hepatitis. - 1999. - Vol. 6, №4. - P.299-304.
275. McCollum, R.W. The natural history of hepatitis / R.W. McCollum // Bulletin of the New York Academy of Medicine. - 1969. - Vol. 45, №2. - P. 127-142.
276. McMichael, A.J. Invited commentary~"molecular epidemiology": new pathway or new travelling companion? / A.J. McMichael // American journal of epidemiology. - 1994. -Vol. 140, №1. - P. 1-11.
277. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D. Peterson, N. Peterson [et al.] // Molecular biology and evolution. -2011. -Vol. 28, №10.-P.2731-2739.
278. Melnick, J.L. Classification of hepatitis A virus as enterovirus type 72 and of hepatitis B virus as hepadnavirus type 1 / J.L. Melnick // Intervirology. - 1982. -Vol. 18, №3. - P.105-106.
279. Michielsen, P. Viral hepatitis B and hepatocellular carcinoma / P. Michielsen, E. Ho // Acta gastro-enterologica Belgica. - 2011. - Vol. 74, №1. - P.4-8.
280. Microarray analysis of evolution of RNA viruses: evidence of circulation of virulent highly divergent vaccine-derived polioviruses / E. Cherkasova, M. Laassri, V. Chizhikov [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2003. - Vol. 100, №16. - P.9398-9403.
281. Microarray for hepatitis B virus genotyping and detection of 994 mutations along the genome / M. Gauthier, B. Bonnaud, M. Arsac [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2010. - Vol. 48, №11. - P.4207-4215.
282. Microarrays for genotyping human group a rotavirus by multiplex capture and type-specific primer extension / L. Lovmar, C. Fock, F. Espinoza [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41, №11. - P.5153-5158.
283. Molecular characterization of hepatitis a virus isolates from a transcontinental shellfish-borne outbreak / G. Sanchez, R. Pinto, H. Vanaclocha, A. Bosch // Journal of clinical microbiology. - 2002. - Vol. 40, №11. - P.4148-4155.
284. Molecular characterization of hepatitis A virus isolates from Argentina / M.S. Munne, S. Vladimirsky, L. Otegui [et al.] // Journal of medical virology. - 2007. - Vol. 79, №7. - P.887-894.
285. Molecular cloning and characterization of hepatitis A virus cDNA / J.R. Ticehurst, V.R. Racaniello, B.M. Baroudy [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1983. - Vol. 80, №19. -P.5885-5889.
286. Molecular epidemiological studies show that hepatitis A virus is endemic among active homosexual men in Europe / K. Stene-Johansen, G. Tjon, E. Schreier [et al.] // Journal of medical virology. - 2007. - Vol. 79, №4. - P.356-365.
287. Molecular epidemiology and evolution in an outbreak of fulminant hepatitis B virus / M. Bracho, M. Gosalbes, F. Gonzalez [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2006. - Vol. 44, №4. - P. 1288-1294.
288. Molecular epidemiology of a hepatitis C virus outbreak in a hemodialysis unit / M. Bracho, M. Gosalbes, D. Blasco [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2005. - Vol. 43, №6. - P.2750-2755.
289. Molecular epidemiology of a hepatitis C virus outbreak in a leprosy sanatorium in Japan / H. Teramoto, K. Shiogama, Y. Mizutani [et al.] // Journal of clinical microbiology. -2011. - Vol. 49, №9. - P.3358-3360.
290. Molecular epidemiology of foodborne hepatitis a outbreaks in the United States, 2003 / J. Amon, R. Devasia, G. Xia [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2005. - Vol. 192, №8. - P.1323-1330.
291. Molecular epidemiology of hepatitis A in St. Petersburg, Russia, 1997-2003 / I. Davidkin, N. Zheleznova, S. Jokinen [et al.] // Journal of medical virology. -2007. - Vol. 79, №6. - P.657-662.
292. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Brazilian Amazon / De Paula, Vanessa Salete, C. Niel, S.C. Teves [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. - 2006. - Vol. 21, №9. - P.1435-1438.
293. Molecular epidemiology of hepatitis A virus in Korea / K.S. Byun, J.H. Kim, K.J. Song [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. -2001. -Vol. 16, №5. - P.519-524.
294. Molecular epidemiology of hepatitis A virus infections in Catalonia, Spain, 2005-2009: circulation of newly emerging strains / U. Perez-Sautu, M. Costafreda, J. Lite [et al.] // Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. -2011. - Vol. 52, №2. -P.98-102.
295. Molecular evolution of hepatitis A virus: a new classification based on the complete VP1 protein / M. Costa-Mattioli, J. Cristina, H. Romero [et al.] // Journal of virology. - 2002. - Vol. 76, №18. - P.9516-9525.
296. Molecular evolution of hepatitis B virus over 25 years / C. Osiowy, E. Giles, Y. Tanaka [et al.] // Journal of virology. - 2006. - Vol. 80, №21. - P. 10307-10314.
297. Molecular evolutionary analysis of the complete nucleotide sequence of hepatitis B virus (HBV) in a case of HBV infection acquired through a needlestick accident / F. Sugauchi, M. Mizokami, E. Orito [et al.] // Clinical infectious diseases : an official publication of the Infectious Diseases Society of America. - 2000. - Vol. 31, №5. - P.l 195-1201.
298. Molecular genotyping and epidemiology of measles virus transmission in the World Health Organization European Region, 2007-2009 / A. Mankertz, M.N. Mulders, S. Shulga [et al.] // The Journal of infectious diseases. -2011. -Vol. 204 Suppl 1. - P.S335-42.
299. Moolla, N. Regulatory elements of hepatitis B virus transcription / N. Moolla, M. Kew, P. Arbuthnot // Journal of viral hepatitis. - 2002. - Vol. 9, №5. - P.323-331.
300. Morozov, V. Homologous recombination between different genotypes of hepatitis B virus / V. Morozov, M. Pisareva, M. Groudinin // Gene. - 2000. -Vol. 260, №1-2. - P.55-65.
301.Mullis, K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F.A. Faloona // Methods in enzymology. - 1987. -Vol. 155. - P.335-350.
302. Multistate Outbreak of Hepatitis A Associated with Frozen Strawberries / M.T. Niu, L.B. Polish, B.H. Robertson [h ap.] // Journal of Infectious Diseases. -
1992. - T.166, №3. - C.518-524.
303. Mutations of the core promoter and response to interferon treatment in chronic replicative hepatitis B / A. Erhardt, U. Reineke, D. Blondin [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2000. - Vol. 31, №3. - P.716-725.
304. Naumova, A.K. Biological consequences of interactions between hepatitis B virus and human nonhepatic cellular genomes / A.K. Naumova, L.L. Kisselev // Biomedical science. - 1990. - Vol. 1, №3. - P.233-238.
305. Nieselt-Struwe, K. Quartet-mapping, a generalization of the likelihood-mapping procedure / K. Nieselt-Struwe, A. von Haeseler // Molecular biology and evolution. - 2001. - Vol. 18, №7. - P. 1204-1219.
306. Niesters, H.G. Standardization and quality control in molecular diagnostics / H.G. Niesters // Expert review of molecular diagnostics. - 2001. - Vol. 1, №2. -P.129-131.
307. Norder, H. Complete nucleotide sequences of six hepatitis B viral genomes encoding the surface antigen subtypes ayw4, adw4q-, and adrq- and their phylogenetic classification / H. Norder, A.M. Courouce, L.O. Magnius // Archives of virology. - 1993. - Vol. 8. - P.189-199.
308. Novel evidence of HBV recombination in family cluster infections in western China / B. Zhou, Z. Wang, J. Yang [et al.] // PloS one. - 2012. - Vol. 7, №6. -P.e38241.
309. Novel subgenotypes of hepatitis B virus genotypes C and D in Papua, Indonesia / M. Lusida, V. Nugrahaputra, R. Handajani [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2008. - Vol. 46, №7. - P.2160-2166.
310. Nucleotide sequence of the hepatitis B virus genome (subtype ayw) cloned in E. coli / F. Galibert, E. Mandart, F. Fitoussi [et al.] // Nature. - 1979. - Vol. 281, №5733. - P.646-650.
311. On the role of sexual behavior in the spread of hepatitis B infection / W. Szmuness, I. Much, A.M. Prince [et al.] // Annals of internal medicine. - 1975. -Vol. 83, №4. - P.489-495.
312. Ong, Y.-L. Quantitative real-time PCR: a critique of method and practical considerations / Y.-L. Ong, A. Irvine // Hematology (Amsterdam, Netherlands). -2002,- Vol. 7, №1. - P.59-67.
313. Ongoing outbreak of mumps affecting adolescents and young adults in Bavaria, Germany, August to October 2010 / W. Otto, A. Mankertz, S. Santibanez [et al.]
// Euro surveillance : bulletin europeen sur les maladies transmissibles. - 2010. -Vol. 15, №50.
314. Osiowy, C. Evaluation of the INNO-LiPA HBV genotyping assay for determination of hepatitis B virus genotype / C. Osiowy, E. Giles // Journal of clinical microbiology. - 2003. - Vol. 41, №12. - P.5473-5477.
315. Outbreak of food-borne infection with hepatitis A virus / Y. Tekeuchi, G. Kobayashi, Y. Matui [et al.] // Japanese journal of infectious diseases. - 2006. -Vol. 59, №5. - P.346.
316. Outbreak of infection with hepatitis A virus (HAV) associated with a foodhandler and confirmed by sequence analysis reveals a new HAV genotype IB variant / M. Chironna, P. Lopalco, R. Prato [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 2004. - Vol. 42, №6. - P.2825-2828.
317. Outbreaks of hepatitis A in England and Wales associated with two co-circulating hepatitis A virus strains / S.-L. Ngui, J. Granerod, L.A. Jewes [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. - Vol. 80, №7. - P.l 181-1188.
318. Owiredu, W.K. Hepatitis B virus DNA in serum of healthy black African adults positive for hepatitis B surface antibody alone: possible association with recombination between genotypes A and D / W.K. Owiredu, A. Kramvis, M.C. Kew // Journal of medical virology. - 2001. - Vol. 64, №4. - P.441-454.
319. Pathogenesis of hepatitis A in orally inoculated owl monkeys (Aotus trivirgatus) / L.V. Asher, L.N. Binn, T.L. Mensing [et al.] // Journal of medical virology. -
1995. - Vol. 47, №3. - P.260-268.
320. PCR-single-stranded confirmational polymorphism analysis for non-culture-based subtyping of meningococcal strains in clinical specimens / J. Newcombe, S. Dyer, L. Blackman [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1997. -Vol. 35, №7. - P.1809-1812.
321. PCR-SSCP: a method for the molecular analysis of genetic diseases / V.K. Kakavas, P. Plageras, T.A. Vlachos [et al.] // Molecular biotechnology. - 2008. -Vol. 38, №2. - P.155-163.
322. Pegylated interferon alfa-2b alone or in combination with lamivudine for HBeAg-positive chronic hepatitis B: a randomised trial / Janssen, Harry L A, M. van Zonneveld, H. Senturk [et al.] // Lancet. -2005. - Vol.365, №9454. -P.123-129.
323. Pettersson, E. Generations of sequencing technologies / E. Pettersson, J. Lundeberg, A. Ahmadian // Genomics. - 2009. - Vol. 93, №2. - P.105-111.
324. Phylogenetic analysis of the precore/core gene of hepatitis B virus genotypes E and A in West Africa: new subtypes, mixed infections and recombinations / C. Olinger, V. Venard, M. Njayou [et al.] // The Journal of general virology. - 2006. -Vol. 87, №Pt 5.-P. 1163-1173.
325. Pineiro, y. Evolutionary history of Hepatitis B virus genotype F: an in-depth analysis of Argentine isolates / y. Pineiro, V. Mbayed, R. Campos // Virus genes. - 2003. - Vol. 27, №1. - P.103-110.
326. Point mutation in the S gene of hepatitis B virus for a d/y or w/r subtypic change in two blood donors carrying a surface antigen of compound subtype adyr or adwr / H. Okamoto, M. Imai, F. Tsuda [et al.] // Journal of virology. - 1987. -Vol. 61, №10. - P.3030-3034.
327. Polymorphisms of the hepatitis A virus cellular receptor 1 in African green monkey kidney cells result in antigenic variants that do not react with protective monoclonal antibody 190/4 / D. Feigelstock, P. Thompson, P. Mattoo, G.G. Kaplan // Journal of virology. - 1998. - Vol. 72, №7. - P.6218-6222.
328. Possible new hepatitis B virus genotype, southeast Asia / C. Olinger, P. Jutavijittum, J. Hubschen [et al.] // Emerging infectious diseases. - 2008. -Vol. 14, №11. - P.1777-1780.
329. Presumed common source outbreaks of hepatitis A in an endemic area confirmed by limited sequencing within the VP1 region / P. Arauz-Ruiz, L. Sundqvist, Z. Garcia [et al.] // Journal of medical virology. -2001. - Vol. 65, №3. - P.449-456.
330. Prevalence of HBV genotypes in Central and Eastern Europe / K. Deterding, I. Constantinescu, F.D. Nedelcu [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. -Vol. 80, №10. -P.1707-1711.
331. Prevalence of hepatitis A antibodies in schoolchildren in Catalonia (Spain) after the introduction of universal hepatitis A immunization / A. Dominguez, M. Bruguera, P. Plans [et al.] // Journal of medical virology. - 2004. - Vol. 73, №2. - P.172-176.
332. Probst, C. Intrinsic signals for the assembly of hepatitis A virus particles. Role of structural proteins VP4 and 2A / C. Probst, M. Jecht, V. Gauss-Muller // The Journal of biological chemistry. - 1999. - Vol. 274, №8. - P.4527^531.
333. Profile, spectrum and significance of HBV genotypes in chronic liver disease patients in the Indian subcontinent / V. Thakur, R.C. Guptan, S.N. Kazim [et al.] // Journal of gastroenterology and hepatology. -2002. - Vol. 17, №2. -P. 165170.
334. Prolonged fecal excretion of hepatitis A virus in adult patients with hepatitis A as determined by polymerase chain reaction / H. Yotsuyanagi, K. Koike, K. Yasuda [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 1996. - Vol. 24, №1. - P.10-13.
335. Provost, P.J. Propagation of human hepatitis A virus in cell culture in vitro / P.J. Provost, M.R. Hilleman // Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine. - 1979. -Vol. 160, №2. - P.213-221.
336. Quantification and duration of viraemia during hepatitis A infection as determined by real-time RT-PCR / M. Costa-Mattioli, S. Monpoeho, E. Nicand [et al.] // Journal of viral hepatitis. - 2002. - Vol. 9, №2. - P. 101-106.
337. Quantitation of hepatitis B virus genomic DNA by real-time detection PCR / A. Abe, K. Inoue, T. Tanaka [et al.] // Journal of clinical microbiology. - 1999. -Vol. 37, №9. - P.2899-2903.
338. Rakela, J. Fecal excretion of hepatitis A virus in humans / J. Rakela, J.W. Mosley // The Journal of infectious diseases. - 1977. - Vol. 135, №6. -P.933-938.
339. Rapid investigation of hepatitis A virus outbreak by single strand conformation polymorphism analysis / V. Mackiewicz, A.-M. Roque-Afonso, E. Marchadier [et al.] // Journal of medical virology. - 2005. - Vol. 76, №2. - P.271-278.
340. Real-time multiplex PCR assays / C.T. Wittwer, M.G. Herrmann, C.N. Gundry, K.S. Elenitoba-Johnson // Methods (San Diego, Calif. -2001. - Vol. 25, №4. -P.430-442.
341. Real-time PCR for detection and quantitation of hepatitis B virus DNA / R.W. Chen, H. Piiparinen, M. Seppanen [et al.] // Journal of medical virology. - 2001. - Vol. 65, №2. - P.250-256.
342. Recombination between sequences of hepatitis B virus from different genotypes / P.L. Bollyky, A. Rambaut, P.H. Harvey, E.C. Holmes // Journal of molecular evolution. - 1996. - Vol. 42, №2. - P.97-102.
343. Recombination of genotypes B and C in hepatitis B virus isolated from a Vietnamese patient with fulminant hepatitis / H.T.-T. Tran, H. Ushijima, T.T. Ngoc [et al.] // Japanese journal of infectious diseases. - 2003. - Vol. 56, №1. -P.35-37.
344. Recovery and sequence analysis of hepatitis a virus from springwater implicated in an outbreak of acute viral hepatitis / L.A. Tallon, D.C. Love, Z.S. Moore, M.D. Sobsey // Applied and environmental microbiology. -2008. - Vol. 74, №19. -P.6158-6160.
345. Replication strategy of human hepatitis B virus / H. Will, W. Reiser, T. Weimer [et al.] //Journal of virology. - 1987. - Vol. 61, №3. - P.904-911.
346. Risk factors for acute hepatitis B and its progression to chronic hepatitis in Shanghai, China / H.W. Zhang, J.H. Yin, Y.T. Li [et al.] // Gut. -2008. -Vol. 57, №12. - P.1713-1720.
347. Rizzetto, M. Hepatitis D: virology, clinical and epidemiological aspects / M. Rizzetto // Acta gastro-enterologica Belgica. -2000. - Vol. 63, №2. -P.221-224.
348. Robert, C.P. Monte Carlo statistical methods / C.P. Robert, G. Casella. - New York: Springer, 2004. - xxx, 645.
349. Robertson, B.H. Viral hepatitis and primates: historical and molecular analysis of human and nonhuman primate hepatitis A, B, and the GB-related viruses / B.H. Robertson // Journal of viral hepatitis. - 2001. - Vol. 8, №4. - P.233-242.
350. Role of environmental poliovirus surveillance in global polio eradication and beyond / T. Hovi, L.M. Shulman, van der Avoort, H [et al.] // Epidemiology and infection. - 2012. - Vol. 140, №1. - P. 1-13.
351. Rota, P.A. Molecular Epidemiology of Measles Virus / P.A. Rota, D.A. Featherstone, W.J. Bellini // Measles / ed. D. E. Griffin, M. B. A. Oldstone. -Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 2009. - P. 129-150.
352. Sanger, F. DNA sequencing with chain-terminating inhibitors / F. Sanger, S. Nicklen, A.R. Coulson // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1977. - Vol. 74, №12. - P.5463-5467.
353. Sanger, F. The use of thin acrylamide gels for DNA sequencing / F. Sanger, A.R. Coulson//FEBS letters. - 1978. - Vol. 87, №1. - P. 107-110.
354. Schaller, H. Transcriptional control of hepadnavirus gene expression / H. Schaller, M. Fischer // Current topics in microbiology and immunology. - 1991. -Vol. 168. - P.21-39.
355. Scholtissek, C. Molecular epidemiology of influenza / C. Scholtissek// Archives of virology. - 1997. - Vol. 13. - P.99-103.
356. Seeger, C. Hepadnaviruses / C. Seeger, F. Zoulim, W.S. Mason // Fields' virology / ed. B. N. Fields, D. M. Knipe, P. M. Howley. - Philadelphia, Pa., London: Wolters Kluwer/Lippincott Williams & Wilkins, 2007. - P.2978-3030.
357. Seeger, C. Hepatitis B virus biology / C. Seeger, W.S. Mason // Microbiology and molecular biology reviews : MMBR. - 2000. - Vol. 64, №1. - P.51-68.
358. Selecting a genetic region for molecular analysis of hepatitis B virus transmission / S. Datta, A. Banerjee, P.K. Chandra, R. Chakravarty // Journal of clinical microbiology. - 2007. - Vol. 45, №2. - P.687; author reply 688.
359. Sequence analysis of a new hepatitis A virus naturally infecting cynomolgus macaques (Macaca fascicularis) / O.V. Nainan, H.S. Margolis, B.H. Robertson [et al.] // The Journal of general virology. - 1991. - Vol. 72 (Pt 7). - P. 16851689.
360. Sequence and phylogenetic analysis of hepatitis B virus genotype G isolated in Germany / S. Vieth, C. Manegold, C. Drosten [et al.] // Virus genes. - 2002. -Vol. 24, №2. - P.153-156.
361. Sequential changes in hepatitis A virus genotype distribution in Estonia during 1994 to 2001 / T. Tallo, H. Norder, V. Tefanova [et al.] // Journal of medical virology. - 2003. - Vol. 70, №2. - P. 187-193.
362. Seroepidemiology of hepatitis A among Greek children indicates that the virus is still prevalent: Implications for universal vaccination / A. Kyrka, A. Tragiannidis, D. Cassimos [et al.] // Journal of medical virology. - 2009. -Vol. 81, №4. - P.582-587.
363. Seroepidemiology of hepatitis A and hepatitis B virus in Luxembourg / J. Mossong, L. Putz, S. Patiny, F. Schneider // Epidemiology and infection. - 2006. -Vol. 134, №4. - P.808-813.
364. Serum hepatitis B virus DNA levels and liver histology in inactive FLBsAg carriers / M. Martinot-Peignoux, N. Boyer, M. Colombat [et al.] // Journal of hepatology. - 2002. - Vol. 36, №4. - P.543-546.
365. Significance of hepatitis B viremia levels determined by a quantitative polymerase chain reaction assay in patients with hepatitis B e antigen-negative chronic hepatitis B virus infection / E.K. Manesis, G.V. Papatheodoridis, V. Sevastianos [et al.] // The American journal of gastroenterology. -2003. -Vol. 98, №10. - P.2261-2267.
366. Simian hepatitis A virus (HAV) strain AGM-27: comparison of genome structure and growth in cell culture with other HAV strains / S.A. Tsarev, S.U. Emerson, M.S. Balayan [et al.] // The Journal of general virology. - 1991. -Vol. 72 (Pt 7). - P.1677-1683.
367. Smith, D.B. Review: molecular epidemiology of hepatitis C virus / D.B. Smith, P. Simmonds // Journal of gastroenterology and hepatology. - 1997. - Vol. 12, №7. - P.522-527.
368. Specific enzymatic amplification of DNA in vitro: the polymerase chain reaction / K. Mullis, F. Faloona, S. Scharf [et al.] // Cold Spring Harbor symposia on quantitative biology. - 1986. - Vol. 51 Pt 1. - P.263-273.
369. Stirk, H.J. A topological model for hepatitis B surface antigen / H.J. Stirk, J.M. Thornton, C.R. Howard // Intervirology. - 1992. - Vol. 33, №3. - P.148-158.
370. Strimmer, K. Nucleotide substitution models / K. Strimmer, A. von Haeseler // The phylogenetic handbook / ed. M. Salemi, A.-M. Vandamme. - Cambridge, UK, New York: Cambridge University Press, 2003. - P.72-87.
371. Studies on the agent of infectious hepatitis; the disease produced in human volunteers by the agent cultivated in tissue culture or embryonated hen's eggs / M.E. DRAKE, A.W. KITTS, M.C. BLANCHARD [et al.] // The Journal of experimental medicine. - 1950. - Vol. 92, №3. - P.283-297.
372. Subgenotype diversity of hepatitis B virus American genotype F in Amerindians from Venezuela and the general population of Colombia / M. Devesa, C.L. Loureiro, Y. Rivas [et al.] // Journal of medical virology. - 2008. - Vol. 80, №1. - P.20-26.
373. Successful treatment with peginterferon alfa-2b of HBeAg-positive HBV non-responders to standard interferon or lamivudine / H.J. Flink, B.E. Hansen, E.J. Heathcote [et al.] // The American journal of gastroenterology. - 2006. -Vol. 101, № 11. - P.2523-2529.
374. Sustained response of hepatitis B e antigen-negative patients 3 years after treatment with peginterferon alpha-2a / P. Marcellin, F. Bonino, Lau, George K K [et al.] // Gastroenterology. - 2009. - Vol. 136, №7. - P.2169-2179.e 1-4.
375. Swerdlow, H. Capillary gel electrophoresis for rapid, high resolution DNA sequencing / H. Swerdlow, R. Gesteland // Nucleic acids research. - 1990. -Vol. 18, №6. - P. 1415-1419.
376. T cell receptor usage of virus-specific CD8 cells and recognition of viral mutations during acute and persistent hepatitis B virus infection / M.K. Maini, S. Reignat, C. Boni [et al.] // European journal of immunology. - 2000. - Vol. 30, №11.-P.3 067-3 078.
377. Tajima, F. Simple methods for testing the molecular evolutionary clock hypothesis / F. Tajima // Genetics. - 1993. - Vol. 135, №2. - P.599-607.
378. Tamura, K. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees / K. Tamura, M. Nei // Molecular biology and evolution. - 1993. - Vol. 10, №3. - P.512-526.
379. Taxonomic classification of hepatitis A virus / I.D. Gust, A.G. Coulepis, S.M. Feinstone [et al.] // Intervirology. - 1983. - Vol. 20, №1. - P. 1-7.
380. Taxonomic classification of human hepatitis B virus / I.D. Gust, C.J. Burrell, A.G. Coulepis [et al.] // Intervirology. - 1986. - Vol. 25, №1. - P. 14-29.
381. Telbivudine versus lamivudine in Chinese patients with chronic hepatitis B: Results at 1 year of a randomized, double-blind trial / J. Hou, Y.-K. Yin, D. Xu [et al.] // Hepatology (Baltimore, Md. - 2008. - Vol. 47, №2. - P.447-454.
382. The changing epidemiological pattern of hepatitis A in an urban population of India: emergence of a trend similar to the European countries / K. Das, A. Jain, S.
Gupta [et al.] // European journal of epidemiology. -2000. - Vol. 16, №6. -P.507-510.
383. The contributions of hepatitis В virus and hepatitis С virus infections to cirrhosis and primary liver cancer worldwide / J.F. Perz, G.L. Armstrong, L.A. Farrington [et al.] // Journal of hepatology. - 2006. - Vol. 45, №4. - P.529-538.
384. The dominant hepatitis В virus genotype identified in Tibet is a C/D hybrid / C. Cui, J. Shi, L. Hui [et al.] // The Journal of general virology. - 2002. - Vol. 83, №Pt 11,- P.2773-2777.
385. The efficacy of entecavir is similar regardless of disease-related baseline subgroups in treatment of nucleoside-naive, HBeAg(+) and HBeAg(-) patients with chronic hepatitis В / Y. Lurie, M.P. Manns, R.G. Gish [et al.] // Journal of hepatology. - 2005. - Vol. 42 Suppl 2. - P. 184.
386. The phylogenetic handbook / ed. P. Lemey, M. Salemi, A.-M. Vandamme. -Cambridge, New York: Cambridge University Press, 2009. - 723 p.
387. The phylogenetic handbook / ред. M. Salemi, A.-M. Vandamme. - Cambridge, UK, New York: Cambridge University Press, 2003. - 406 c.
388. The putative recombination of hepatitis В virus genotype В with pre-C/C region of genotype С / К. Luo, Z. Liu, H. He [et al.] // Virus genes. - 2004. - Vol. 29, №1. - P.31-41.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.