Фенотипическое и генетическое разнообразие Enterococcus faecalis при инфекционно-воспалительных заболеваниях мочевой системы у детей тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Коменкова Татьяна Сергеевна
Коменкова Татьяна Сергеевна
кандидат наук
2022
- Специальность ВАК РФ03.02.03
- Количество страниц 151
Оглавление диссертации кандидат наук Коменкова Татьяна Сергеевна
(ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1 Характеристика бактерий вида Enterococcus faecalis
1.2 Роль E. faecalis в развитии инфекционной патологии
1.2.1 Структура инфекций, вызванных E. faecal is
1.2.2 Факторы патогенности E. faecalis, участвующие в развитии инфекционной патологии
1.3 Резистентность E. faecal is к антибактериальным препаратам
1.4 Популяционная структура энтерококков
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1 Материалы
2.2 Методы
2.2.1 Идентификация энтерококков
2.2.2 Изучение биологических свойств энтерококков
2.2.3 Статистические методы
ГЛАВА 3. ХАРАКТЕРИСТИКА БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ
E. FAECALIS, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ МОЧИ У ДЕТЕЙ ПРИ ИНФЕКЦИЯХ
МОЧЕВЫВОДЯЩЕЙ СИСТЕМЫ
3.1 Фенотипические особенности биологических свойств E. faecalis, изолированных из мочи детей с ИМС
3.2 Антибиотикорезистентность E. faecalis, полученных из мочи детей с ИМС
3.3 Молекулярно-генетические особенности E. faecalis, выделенных из мочи у детей с ИМС
3.3.1 Молекулярно-генетическая характеристика факторов патогенности
у Е. faecalis, изолированных из мочи детей с ИМС
3.3.2 Молекулярно-генетическая характеристика антибиотикорезистентности у Е. faecalis, полученных из мочи детей
с ИМС
ГЛАВА 4. ПОПУЛЯЦИОННАЯ СТРУКТУРА Е. ЕЛЕСЛЬН,
ИЗОЛИРОВАННЫХ ИЗ МОЧИ ДЕТЕЙ С ИМС
ГЛАВА 5. ЭТИОЛОГИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫЕ И ВЫСОКОВИРУЛЕНТНЫЕ
ШТАММЫ Е. ЕЛЕСЛЬН, ВЫЫДЕЛЕННЫЕ ИЗ МОЧИ ДЕТЕЙ С ИМС
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПРИЛОЖЕНИЕ А
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Особенности инфекции мочевыводящих путей у детей, ассоциированной с Enterococcus faecalis, с учетом его биологических свойств2019 год, кандидат наук Мельникова Елена Александровна
Биологические свойства фекальных изолятов энтерококков, выделенных от животных2015 год, кандидат наук Щепитова, Наталья Евгеньевна
Биологическая характеристика штаммов энтерококков для разработки препаратов с пробиотическими свойствами2021 год, кандидат наук Кочкина Елена Евгеньевна
Характеристика вирулентного потенциала клинических изолятов энтерококков, выделенных от животных2015 год, кандидат наук Пошвина, Дарья Владимировна
Комплексная оценка взаимодействия E. faecalis и Blastocystis spp. в системе ассоциативного симбиоза кишечника человека2013 год, доктор биологических наук Бугеро, Нина Владимировна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Фенотипическое и генетическое разнообразие Enterococcus faecalis при инфекционно-воспалительных заболеваниях мочевой системы у детей»
ВВЕДЕНИЕ
Актуальность темы исследования и степень ее разработанности
Микроорганизмы рода Enterococcus являются представителями нормальной микробиоты желудочно-кишечного тракта человека. Однако наличие широкого спектра факторов патогенности и возможность вызывать разнообразные заболевания способствовали переоценке клинического значения данных микроорганизмов [13, 47, 49, 55]. В настоящее время возрастает этиологическая роль Enterococcus faecalis как возбудителей инфекций кровотока, мочевой системы, кожи, мягких тканей и др. [2, 47, 82, 210].
Инфекция мочевыводящей системы (ИМС) является одной из наиболее частых бактериальных инфекций детского возраста, приводящая к необратимому повреждению ренальной ткани [115]. В последние годы наблюдается изменение этиологической структуры ИМС у детей с увеличением доли E. faecalis [11, 21, 214, 229]. Частота встречаемости E. faecalis как этиологического агента ИМС у детей по данным разным исследований составляет от 6,1% до 75% [14, 38, 41, 229].
Известно, что энтерококки обладают выраженным тропизмом к ренальной ткани [6]. Среди многочисленных факторов, влияющих на развитие ИМС и ее прогноз, немаловажное значение имеют биологические свойства микроорганизмов, колонизирующих почечную ткань [11, 24, 35, 39]. Наиболее распространенными и хорошо описанными генами патогенности, участвующими в инициации и хронизации инфекционного процесса у энтерококков, являются субстанция агрегации (agg, asa 1), цитолизин (cyl), желатиназа (ge/E), гиалуронидаза (hyl), энтеро-кокковый поверхностный белок (esp), коллаген-связывающие адгезины (ace, acm), Enterococcus faecalis антиген A (efaA), пили, ассоциированные с развитием эндокардита и образованием биопленки (ebp) [45, 71, 170, 173].
Устойчивость энтерококков к антибактериальным препаратам является важным признаком патогенности, это связано с локализацией детерминант пато-
генности и антибиотикорезистентности в одних и тех же носителях генетической информации [49, 204, 268]. Особенности генома энтерококков позволяют им формировать устойчивость ко многим АБП, используемым в клинической практике, что приводит к селекции высоковирулентных штаммов [274].
По данным литературы структура популяции Е. faecalis включает в себя множество сиквенс-типов ^Т) и клональных комплексов (СС) [202, 248], с превалированием БТ6, БТ16 и БТ179 среди мочевых изолятов [87, 182]. Принадлежность энтерококков к СС2, СС16, СС87, БТ9, БТ40 ассоциируется с повышенной вирулентностью, устойчивостью к АБП и риском распространения их в больничной среде [79, 150, 202, 248].
Однако, в России работ по изучению фенотипических и молекулярно-генетических особенностей, популяционной структуры Е. faecalis, изолированных из мочи детей с ИМС, недостаточно. Отечественные исследования чаще направлены на биологические свойства энтерококков, выделенных от животных [42, 44, 45].
Учитывая возрастающую этиологическую роль энтерококков, как возбудителей ИМС у детей, представляется актуальным изучение биологических свойств Е. faecalis для выявления их значения и участия в развитии инфекционного процесса.
Цель исследования: Оценить фено- и генотипическое разнообразие Е^вго^^т faecalis, выделенных из мочи детей с инфекцией мочевыделительной системы для выявления микробиологических маркеров характерных для этиологически значимых и высоковирулентных штаммов Е. faвcalis.
Задачи исследования:
1. Оценить фенотипическое разнообразие микробиологических свойств Е. faвcalis, выделенных из мочи у детей с ИМС.
2. Выявить молекулярно-генетические особенности уропатогенных Е. faвcalis, изолированных из мочи у детей с ИМС, дать оценку их вирулентного потенциала.
3. Охарактеризовать структуру популяции Е. faвcalis для оценки их
этиологической значимости.
4. Определить микробиологические диагностические маркеры, характерные для этиологически значимых и высоковирулентных штаммов Е. faecalis.
Новизна исследования:
1. Охарактеризованы фенотипические особенности биологических свойств Е. faecalis, выделенных из мочи у детей с ИМС (биохимическая активность в отношении маннита, ее наличие/отсутствие в отношении лактозы и отсутствие ферментации рамнозы, выявление/отсутствие гемолитической, протеолитической и липолитической активностей).
2. Среди мочевых изолятов Е. faecalis определены различные варианты сочетания генов, кодирующих факторы патогенности и антибиотикорезистентности, с преобладанием (aggA, су1к^, efaA, еер, gelE, вяр) и (tetM и tetM, вгтЕ, ant(6')-Ia) вариантов.
3. Впервые выявлены зависимости между фенотипическими проявлениями биологических свойств, антибиотикорезистентностью и детекцией определенного гена у штаммов Е. faecalis, полученных из мочи детей с ИМС.
4. Установлены этиологически значимые сиквенс-типы ^Т179, ST16 и ST537 (СС16)) с характерными проявлениями биологических свойств (расщепление маннита, лактозы, отсутствие ферментации рамнозы, желатины, «выраженная» гемолитическая активность В-типа, чувствительность к фторхинолонам II и III поколения (норфлоксацину, левофлоксацину), наличие гена cylA, отсутствие aac(6')-Ie-aph(2")-Ia гена) и высоковирулентные - ST6 (разлагающие маннит, не сбраживающие рамнозу, не проявляющие гемолитическую активность, обладающие протеолитической (в отношении молока и желатины), липолитической (в отношении лецитина, твина 20 и твина 80) активностями, резистентные к фторхинолонам II и III поколения (норфлоксацину, ципрофлоксацину, левофлоксацину), аминогликозидам I и II поколения (стрептомицину, гентамицину) и триметопри-му/сульфатометоксазолу, с детекцией генов aggA, aac(6')-Ie-aph(2")-Ia, отсутствием cylA гена); ST774 (расщепляющие маннит, не ферментирующие рамнозу,
не показывающие гемолитическую активность, проявляющие протеолитическую (в отношении молока) активность, устойчивые к фторхинолонам II и III поколения (норфлоксацину, ципрофлоксацину, левофлоксацину), гентамицину, триме-топриму/сульфатометоксазолу, с наличием aggA, отсутствием cylA генов).
5. Предложен алгоритм оценки этиологически значимых и высоковирулентных E. faecalis, изолированных из мочи детей с ИМС.
6. Впервые в России оценены и депонированы в международную базу данных «Enterococcus faecalis MLST Databases» [https://pubmlst.org/efaecalis/] нуклео-тидные последовательности генов E. faecalis (id: 1779-1795, 1926-1949, 2099), что расширяет представления об уропатогенных фекальных энтерококках, выделенных при инфекционно-воспалительных заболеваниях мочевой системы у детей, а также дополняют знания о развитии ИМС энтерококковой этиологии.
Теоретическая и практическая значимость работы:
Разработанные базы данных («Биологическая характеристика штаммов En-terococcus faecalis, участвующих в развитии инфекционной патологии в Приморском крае» и «Фено- и генотипы антибиотикорезистентности клинически значимых Enterococcus faecalis, выделенных из различных биотопов на Дальнем Востоке России») могут служить основой для мониторинга за патогенностью и анти-биотикорезистентностью фекальных энтерококков в медицинских и научно-исследовательских организациях в различных регионах Российской Федерации.
На основе комплексного анализа биологических свойств мочевых изолятов E. faecalis разработан алгоритм оценки этиологически значимых и высоковирулентных штаммов, который может быть использован при микробиологической диагностике выделенного возбудителя.
Депонированные в международную базу данных «Enterococcus faecalis MLST Databases» нуклеотидные последовательности генов E. faecalis, дополняют наше представление о механизмах формирования высоковирулентных штаммов энтерококков.
Результаты исследования внедрены в курс лекций, практических занятий и учебно-методических материалов для обучающихся специальности 31.05.01 Ле-
чебное дело, 31.05.02 Педиатрия по дисциплине «Микробиология, вирусология» на кафедре микробиологии и вирусологии в ФГБОУ ВО ТГМУ Минздрава России и Школы биомедицины ДВФУ.
Методология и методы диссертационного исследования
Настоящее исследование является самостоятельным фрагментом плановой научно-исследовательской работы Федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (№ гос. регистрации АААА-А17-11711270006-0).
Клиническое исследование одобрено локальным Междисциплинарным комитетом по этике ФГБОУ ВО «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Минздрава России (протокол № 3 от 20 ноября 2017 г.).
В исследовании проведено изучение коллекции культур E. faecalis (n=51), изолированных из мочи детей при ИМС. Определение биологических свойств E. faecalis проводилось с использованием классических и современных микробиологических и молекулярно-генетических методов.
Положения, выносимые на защиту:
1. E. faecalis, выделенные из мочи детей с ИМС, обладают особенностями фенотипических проявлений биологических свойств (биохимическая активность в отношении ряда углеводов, ферментативная активность, связанная с патогенно-стью и антибиотикорезистентностью).
2. Мочевые изоляты E. faecalis обладают различными сочетаниями генов патогенности и антибиотикорезистентности с преобладанием (aggA, cylA, efaA, eep, gelE, esp); (tetM) и (tetM, ermB, ant(6')-Ia) вариантов.
3. Установлены диагностические биомаркеры для выявления этиологически значимых E. faecalis (ферментация маннита, лактозы и ее отсутствие в отношении рамнозы, желатины, наличие гемолитической активности, чувствительность к фторхинолонам II и III поколения, детекция cylA и отсутствие aac(6')-Ie-aph(2")-Ia генов) и высоковирулентных штаммов (расщепление маннита, отсутствие ферментации рамнозы и гемолитической активности, наличие гистоповреждающих
субстанций (протеаз), резистентность к трем классам АБП (фторхинолонам, ами-ногликозидам, сульфаниламидам), детекция aggA и отсутствие cylA генов).
Степень достоверности и апробация результатов исследования
Степень достоверности полученных результатов, обоснованность научных положений и выводов базируются на использовании современных методов исследования, воспроизводимости экспериментальных данных. Использованные статистические методы соответствовали поставленным задачам и позволяли охарактеризовать выявленные различия с достаточной степенью достоверности.
Результаты работы представлены на конкурсах молодых ученых, научных конференциях, симпозиумах и конгрессах регионального, всероссийского и международного уровней: Х, XI, XII, XIII, XIV Конкурсах Молодых Ученых XIV, XV, XVI, XVII, XVIII Тихоокеанского медицинского конгресса с международным участием (Владивосток, 2017 (диплом II степени), 2018 (диплом I степени), 2019 (диплом I степени), 2020 (диплом I степени), 2021 (диплом II степени); I Дальневосточном медицинском молодежном форуме с международным участием (Хабаровск, 2017 (диплом I и III степени); Международном медицинском Форуме «ВУЗОВСКАЯ НАУКА. ИННОВАЦИИ» (Москва, 2018 (диплом II степени), 2019 (диплом II степени)); Общероссийском научно-практическом мероприятии «ЭСТАФЕТА ВУЗОВСКОЙ НАУКИ» (Москва, 2020 (диплом I степени, диплом II степени), 2021 (диплом III степени), 2022 (диплом I степени); XXXVII, LVI Международной Научно-Практической Конференции Евразийского Научного Объединения (Москва, 2018, 2019); XX, XXI, XXII, Тихоокеанских научно-практических конференциях студентов и молодых ученых с международным участием «Актуальные проблемы экспериментальной, профилактической и клинической медицины» (Владивосток, 2017 (диплом I степени), 2019, 2020 (диплом II степени), 2021 (диплом II степени)); XX Международном конгрессе МАКМАХ по антимикробной терапии и клинической микробиологии (Москва, 2018); программе «УМНИК» (Владивосток, 2018); «УМНИК ХЕЛСНЕТ НТИ» (Москва, 2019); конкурсе Росмолодежь «Созвездие умов» (Владивосток, 2019) (диплом I степени); II Национальном конгрессе с международным участием «Лабораторные техноло-
гии в репродуктивной медицине и неонатологии: от науки к практике» (Москва, 2020); вебинаре «Микробиологические аспекты внутрибольничных инфекций» (Владивосток, 2020); симпозиуме «Актуальные проблемы клинической микробиологии на Дальнем Востоке» в рамках XVII Тихоокеанского медицинского конгресса с международным участием (Владивосток, 2020); Всероссийском конгрессе по медицинской микробиологии, эпидемиологии, клинической микологии и иммунологии - XXIII Кашкинские чтения (Санкт-Петербург, 2020).
Исследование поддержано грантами:
«Изучение молекулярно-генетического разнообразия клинически значимых штаммов Enterococcus faecalis, выделенных при инфекционно-воспалительных заболеваниях» (№ гос. регистрации AAAA-A18-118031390014-9); «Изучение механизмов формирования резистентности клинически значимых Enterococcus faecalis, выделенных в Дальневосточном регионе России» (№ гос. регистрации АААА-А19-119031190007-2); «Изучение механизмов резистентности к антимикробным препаратам у клинически значимых энтерококков редких фенотипов» (№ гос. регистрации АААА-А20-120032390003-5);
Стипендией Президента Российской Федерации молодым ученым и аспирантам, осуществляющим перспективные научные исследования и разработки по приоритетным направлениям модернизации российской экономики, на 2018-2020 годы (Приказ № 231 от 3 апреля 2018 г.);
Грантом РФФИ «Аспиранты» № 19-315-90036. Победитель конкурса на лучшие проекты фундаментальных научных исследований, выполняемые молодыми учеными, обучающимися в аспирантуре «Особенности биологических свойств клинически значимых уропатогенных Enterococcus faecalis» (№ гос. регистрации АААА-А19-119102290015-3).
Публикации: По теме диссертации опубликовано 27 печатных работ: глава в монографии (в зарубежном издании), 10 статей, из них 3 - в журналах индексируемых Scopus, 6 - в журналах, рекомендованных ВАК, 2 базы данных.
Личный вклад автора заключается в самостоятельном проведении научно-информационного поиска, обобщении данных литературы, получении, оформле-
нии результатов в виде научных докладов и текста диссертации. Планирование научной работы, формулировка рабочей гипотезы, разработка общей концепции и дизайна исследования, анализ и интерпретации полученных данных, подготовка публикаций по теме исследования осуществлялась автором совместно с научным руководителем д-ром мед. наук, доцентом Зайцевой Е.А.
Автор выражает благодарность ст. науч. сотр., руководителю лаборатории биологии вирусов бактерий ФИЦ ПНЦБИ РАН, канд. биол. наук Шадрину А.М., заведующей краевого детского уронефрологического центра КДКБ №1, канд. мед. наук Мельниковой Е.А., врачу-бактериологу, заведующей бактериологической лаборатории ПККБ №1 Вайсеро Н.С., врачу-бактериологу ЦЛД Медицинский центр ДВФУ Трегубовой (Шевцовой) Т.С., старшему преподавателю кафедры физики и математики ФГБОУ ВО ТГМУ Минздрава России Переломовой О.В. за помощь, оказанную при работе над диссертацией.
Структура и объем диссертации. Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, трех глав с результатами собственных исследований, заключения, выводов и списка литературы. Диссертация изложена на 151 странице, содержит 1 приложение, 18 таблиц, иллюстрирована 15 рисунками. Список литературы включает 280 источников, в том числе 50 источников отечественных и 230 зарубежных авторов.
ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ ОБ ЭНТЕРОКОККАХ
(ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)
1.1 Характеристика бактерий вида Enterococcus faecalis
В 1899 году M.E. Thiercelin et al. впервые сообщили о грамположительных диплококках, выделенных из желудочно-кишечного тракта человека, и предложили название «энтерококк», чтобы подчеркнуть его морфологию и кишечное происхождение [255]. У некоторых клеток ученые наблюдали наличие капсулы in situ и описали морфологический и структурный полиморфизм этих микроорганизмов. Позже было установлено, что энтерококк является преобладающим микроорганизмом в желудочно-кишечном тракте пациентов с диареей, который затем переносится из кишечника в кровь, что приводит к септицемии [122].
W.G. MacCallum и T.W. Hastings представили подробный отчет о случае острого эндокардита у 37-летнего пациента, вызванного организмом, который они назвали Micrococcus zymogenes, теперь известным как Enterococcus faecalis. Авторы описали, что эта бактерия была «очень вынослива и живуча» [194]. В настоящее время доказано, что эти признаки являются характерными чертами рода Enterococcus [142, 144].
В 1906 году F.W. Andrewes и T.J. Horder описали микроорганизм, названный Streptococcus faecalis, выделенный из фекалий пациента с эндокардитом, который ферментирует маннит и лактозу, и не разлагает раффинозу. Название «faecalis» было выбрано, чтобы подчеркнуть, что этот микроорганизм характерен для кишечной микрофлоры человека [64].
S. Orla-Jensen охарактеризовал Streptococcus faecium, который отличался по ферментативной активности, описанной для S. faecalis [211]. Третий вид - Streptococcus durans был описан J.M. Sherman et al., похожий на S. faecium, но с более ограниченными ферментационными возможностями [236].
В 1933 году на основе особенностей структуры липотейхоевой кислоты, входящий в состав клеточной стенки, энтерококки отнесены к стрептококкам
группы D [188].
В 1937 J.M. Sherman классифицировал виды Streptococcus на четыре группы: пиогенные «pyogenic», зеленящие «viridans», молочные «lactic» и энтерококки «enterococcus» [237].
С развитием молекулярно-генетических методов исследования было установлено, что виды Streptococcus faecium и Streptococcus faecalis были достаточно далеки от других стрептококков и в 1984 году они были отнесены в отдельный род Enterococcus [235]. В настоящее время род Enterococcus включает более 60 видов [154].
Бактерии вида Enterococcus faecalis являются грамположительными, овальными кокками размером 0,6-2,0*0,6-2,5 мкм, располагающиеся одиночно, парами, короткими цепочками или группами [144]. Большинство выделенных штаммов фекальных энтерококков неподвижны [5, 79].
Данные микроорганизмы неспорообразующие, каталазоотрицательны, но обладают пероксидазой и супероксиддисмутазой, ферментами функционально идентичными каталазам [5, 140].
Некоторые штаммы E. faecalis образуют капсулу, что повышает их устойчивость к фагоцитозу [259]. Идентифицировано четыре серотипа капсульных полисахаридов E. faecalis, названных CPS-A, -B, -C и -D [184].
По типу дыхания относятся к факультативным анаэробам, по типу питания - к хемоорганотрофам [245].
Имеют гомоферментативный метаболизм, молочная кислота является основным конечным продуктом ферментации углеводов [245]. Энтерококки способны образовывать кислоту из маннита, D-фруктозы, D-маннозы, глюкозы, лактозы, сахарозы, рамнозы, мелецитозы, рибозы, трегалозы, мальтозы, галактозы, ß-генциобиозы, целлобиозы, N-ацетилглюкозамина, салицина; метил ß-D-глюкозида, амигдалина и арбутина, но не продуцируют кислоту из D-арабинозы, эритрита, D- и L-фукозы, инозита, метил-а^-ксилозида и L-ксилозы, адонита, дульцита, L-сорбозы, мелибиозы [5, 225]. Способность к ферментации широкого спектра углеводов дает энтерококкам преимущество в колонизации конкурентных
сред [225].
В тоже время ферментация углеводов не является четким признаком, многие метаболические гены и пути различаются в пределах одного вида [225].
Имеются единичные сообщения о различии биохимической активности фекальных энтерококков в зависимости от биотопа выделения. Некоторые E. faecalis, изолированные из клинического материала, не способны сбраживать маннит, лактозу, сахарозу, трегалозу и глицерин [138, 257]. Большинство энтерококков с измененной биохимической активностью являются уропатогенными [257]. Показано, что кишечные изоляты E. faecalis, при сокультивировании с бла-стоцистами, значительно снижают способность гидролизовать углеводы [4].
Энтерококки растут в широком диапазоне температур от 5 до 60°С (оптимальная температура роста - 37°С) [80, 144]. Термостойкость энтерококков зависит от фазы и температуры роста [198]. Длительная инкубация при высоких температурах (40 - 45°С) приводит к изменению профиля жирных кислот в мембране энтерококков, что значительно снижает термостойкость энтерококков [198].
Признаками, которые отличают фекальные энтерококки от стрептококков, являются их способность выживать при нагревании до 60°С в течение 30 минут, гидролизовать эскулин в присутствии 40% желчных солей [5, 79] и расти в бульоне, содержащем 6,5% №0 [5, 80]. Устойчивость E. faecalis к широкому диапазону значений рН от 4,6 до 9,9 (оптимум - 7,5) обусловлена непроницаемостью их мембраны для кислот и щелочей [228]. Энтерококки имеют катионный гомеостаз, который способствует их толерантности к рН, солям, металлам и высыханию [141].
На плотных питательных средах энтерококки образуют мелкие, круглые, выпуклые, блестящие колонии размером 0,5-2 мм, с влажным внешним видом и четким краем, при густом посеве сливаются в сплошной нежный налет [144]. На средах с молоком, кровью или сывороткой образуют пигмент белого цвета.
Некоторые штаммы фекальных энтерококков способны разжижать желатину [5, 170], продуцировать гиалуронидазу [5], деградировать ДНК [8], сбраживать лецитин [273].
На кровяном агаре большинство фекальных энтерококков не лизируют эритроциты, гемолиз В-типа встречается от 40 до 46,4% клинических изолятов Е. faecalis [5, 155, 258]. Способность энтерококков лизировать эритроциты зависит от вида эритроцитов. Эритроциты человека, лошади, собаки, кролика и мыши более восприимчивы к лизису, в сравнении с эритроцитами овец и гусей [260].
Фекальные энтерококки проявляют редуцирующие свойства по отношению к лакмусу и метиленовой сини, способны к деградации водного раствора 2,3,5-трифенилтетразолия хлорида (ТТХ) до формазана [5]. Большинство энтерококков гидролизуют пирролидонил-Р-нафтиламида и производят лейцинаминопептидазу [144].
Энтерококки устойчивы к антисептикам, дезинфицирующим средствам и УФ-излучению [141, 160, 176, 227]. Длительно сохраняют жизнеспособность при отсутствии питательных веществ на различных поверхностях, в том числе предметов домашнего обихода и медицинского оборудования [142].
В литературе имеются единичные сообщения о связи биологических свойств Е. faecalis между собой. Большинство штаммов Е. faecalis проявляющих гемолиз также экспрессируют субстанцию агрегации. Совместная экспрессия данных признаков приводит к значительному увеличению случаев летальных исходов на животной модели [218].
Фекальные энтерококки, имеющие серотип капсульных полисахаридов СРБ-С более вирулентны, чаще обладают четырьмя или более признаками пато-генности и тремя или более признаками устойчивости к антибактериальным препаратам [146].
1.2 Роль Е. /авсаШ в развитии инфекционной патологии
До 70 годов ХХ века бактерии рода ЕМвтососсш считали комменсальными кишечными организмами с минимальной клинической значимостью, но в последнее время энтерококки признаны одними из ведущих оппортунистических, нозо-комиальных патогенов, способными инициировать различные инфекционные процессы. Большинство энтерококковых инфекций обусловлено Е. faecalis [5, 122, 200].
1.2.1 Структура инфекций, вызванных E. faecalis
Являясь условно-патогенными микроорганизмами Е. faecalis способны вызывать разнообразные инфекционные процессы, в том числе бактериемию, инфекционный эндокардит [178], внутрибрюшные и тазовые инфекции, кожные инфекции [210], инфекции центральной нервной системы [185], инфекции мочевы-водящей системы [16, 92]. Тяжелые системные инфекции энтерококкокковой этиологии чаще развиваются у больных с ослабленным иммунитетом [2, 28, 169, 246]. Частота выделения фекальных энтерококков у пациентов отделений реанимации и интенсивной терапии составляет от 7% до 18% [30, 200].
Внутрибрюшные, тазовые и послеоперационные раневые инфекции считаются вторыми по частоте среди всех энтерококковых инфекций [215, 242]. При негонококковых и нехламидийных воспалительных заболеваниях шейки матки энтерококки E. faecalis высеваются до 24% [277], при негонококковых уретритах - от 16% до 37% [17, 37].
В этиологической структуре инфекций области хирургического вмешательства E. faecalis занимает третье место после Escherichia coli и Staphylococcus aureus, выявляясь от 7,5% до 19,5% по данным разных авторов [15, 54, 69, 70]. Из содержимого трофических язв у больных сахарным диабетом фекальные энтерококки выделяются в 30% случаев [31, 238]. Инфекции в данных локусах чаще являются полимикробными [54].
Фекальные энтерококки является третьим по значимости возбудителем инфекций кровотока (ИК) [172, 174] и инфекционного эндокардита (ИЭ) [178, 279], демонстрируя высокие показатели заболеваемости и смертности [139]. Считается, что большинство случаев энтерококковых бактериемий являются результатом их транслокации из кишечника в кровоток [140, 174, 277]. В ретроспективном исследовании E.O. Billington et al. (2014), отмечено, что инфекции кровотока энтеро-кокковой этиологии часто связаны с оказанием медицинской помощи (32,0%) [174].
Повозрастная кривая энерококковых бактериемий имеет бимодальную структуру [174]. Первый пик заболеваемости соответствует периоду новорожден-
ности. Второй наступает после 70 лет, с преобладанием у лиц мужского пола [174].
В последнее время отмечается значительный рост числа энтерококковых эндокардитов. Среди бактерий рода Enterococcus, фекальные энтерококки является наиболее частой причиной инфекций кровотока и эндокардитов, вызывая от 65 до 70% инфекций, с ограниченными вариантами лечения из-за распространения штаммов с множественной лекарственной устойчивостью [51, 139, 172, 174, 209].
Среди всех инфекций, вызванных E. faecalis, инфекция мочевыводящей системы является наиболее распространенной и регистрируется как у госпитализированных, так и амбулаторных пациентов [92, 132, 205].
ИМС энтерококковой этиологии обычно возникают в возрасте до 10 и после 60 лет, когда чаще встречаются пороки развития мочеполовой системы и обструк-тивная уропатия [78, 114, 266]. По данным метаанализа, проведенного N. Shaikh et al. (2008), общая распространенность ИМС составляет 7% среди младенцев с лихорадкой в возрасте от 0 до 24 месяцев и 7,8% среди детей от 0 до 19 лет [222]. Распространенность инфекций мочевыводящей системы у детей в России составляет от 18 до 22 на 1000 детского населения [22].
Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК
Эпидемиология инфекций, вызванных ванкомицин-резистентными энтерококками в отделениях для новорожденных детей2023 год, кандидат наук Червякова Маргарита Александровна
Биологические эффекты антимикробных веществ животного и бактериального происхождения2016 год, доктор наук Сычева Мария Викторовна
«Фенотипические и генотипические особенности Enterococcus spp., выделенных из крови больных с гематологическими заболеваниями»2022 год, кандидат наук Фёдорова Анастасия Владимировна
Фенотипические и генотипические характеристики микробиоты мочи при рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей2020 год, кандидат наук Джалагония Ксения Теймуразовна
Разработка подходов к оптимизации актимикробной терапии инфекционного эндокардита на основе анализа реальной практики ведения пациентов в Российской Федерации2018 год, кандидат наук Данилов, Андрей Игоревич
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Коменкова Татьяна Сергеевна, 2022 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1) Антибиотикорезистентность возбудителей амбулаторных инфекций мочевых путей / Н. Э. Хайдаршина, Л. И. Бахарева, Е. И. Катаева [и др.] // Клин. микробиология и антимикроб. химиотерапия. - 2018. - Т. 20, № S1. - С. 44.
2) Антибиотикорезистентность госпитальных штаммов Enterococcus spp., выделенных из гемокультуры больных опухолями системы крови: результаты многоцентрового исследования / Г. А. Клясова, А. В. Федорова, И. Н. Фролова [и др.] // Клин. микробиология и антимикроб. химиотерапия. - 2018. - Т. 20, № 2. - С. 142-149.
3) Бактериологический анализ мочи : руководство по клинической лабораторной диагностики [Электронный ресурс] / Р. С. Козлов, В. В. Меньшиков, В. С. Михайлова [и др.]. - М., 2013. - 33 с. - Режим доступа: http://antimicrob.net/wp-content/uploads/Bakteriologicheskiy-analiz-mochi_metodicheskie-rekomendacii.pdf (дата обращения: 24.08.2021).
4) Бугеро, Н. В. Симбиотические ассоциации бактерий-простейших и их биологические свойства / Н. В. Бугеро, Н. А. Ильина // The Scientific Heritage. -2020. - № 49-4 (49). - С. 16-19.
5) Бухарин, О. В. Биология и экология энтерококков : монография / О. В. Бухарин, А. В. Валышев ; Российская акад. наук, Уральское отд-ние. -Екатеринбург : Ин-т клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН, 2012. -222 с.
6) Бухарин, О. В. Факторы уропатогенности бактерий : роль в патогенезе и значение в диагностике пиелонефрита / О. В. Бухарин, В. А. Гриценко, А. А. Вялкова // Нефрология и диализ. - 2001. - Т. 3, № 4. - С. 469-475.
7) Бриллиантова, А. Н. Молекулярная гетерогенность госпитальных штаммов ванкомицин-устойчивых Enterococcus faecium в гематологии : дис. ... канд. биол. наук : 14.01.21 / Бриллиантова Анна Николаевна , [Гематологический научный центр РАМН]. - М., 2010. - 112 с.
8) Валышев, А. В. Факторы патогенности энтерококков кишечной микрофлоры человека / А. В. Валышев, Н. В. Герцен // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2012. - № 4. - С. 41-44.
9) Валышева, И. В. Биологические свойства фекальных энтерококков / И. В. Валышева, М. В. Сычева, Б. Я. Усвяцов // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2011. - № 2-3. - С. M13-M13a.
10) Выбор антимикробных препаратов при инфекции мочевыводящих путей / Т. С. Перепанова, Р. С. Козлов, А. В. Дехнич [и др.] // Урология. - 2012. -№ 2. - С. 4-8.
11) Вялкова, А. А. Инфекция мочевой системы у детей: современные аспекты этиологической диагностики и лечения / А. А. Вялкова, В. А. Гриценко // Рос. вестн. перинатологии и педиатрии. - 2017. - Т. 62, № 1. - С. 99-108.
12) Генетическое разнообразие пенициллинустойчивых Streptococcus pneumoniae / Т. А. Савинова, О. Ю. Филимонова, С. А. Грудинина, С. В. Сидоренко // Журнал инфектологии. - 2009. - Т. 1. - № 4. - С. 66-71.
13) Гены патогенности бактерий рода Enterococcus, выделенные из вагинального биотопа женщин с хроническим эндометритом и репродуктивными нарушениями / Е. А. Кунгурцева, М. А. Даренская, Е. И. Иванова [и др.] // Acta Biomedica Scientifica (East Siberian. Biomed. J.). - 2017. - Т. 2, № 5-1 (117). - С. 8892.
14) Гнедина, Н. А. Проблемы этиотропной терапии пиелонефрита у детей / Н. А. Гнедина, А. С. Новикова, С. А. Шураева // Смоленский мед. альманах. -2018. - № 1. - С. 66-68.
15) Грушевская, Е. А. Комплексный подход к профилактике и лечению инфекции области хирургического вмешательства : дис. ... канд. мед. наук : 14.01.17 / Грушевская Екатерина Александровна ; [ФГБУ ВО «Башкирский гос. мед. ун-т» Минздрава РФ]. - Уфа, 2020. - 155 с.
16) Дифференцированные подходы к лечению инфекции мочевой системы у детей с учетом этиологического фактора Enterococcus faecalis / Е. А. Мельникова, Е. А. Зайцева, В. Н. Лучанинова [и др.] // Тихоокеанский мед. журн.
- 2019. - № 4 (78). - С. 60-65.
17) Дифференцированный подход к терапии больных с негонококковыми уретритами, ассоциированными с Enterococcus faecalis / А. П. Горбунов, Н. И. Скидан, Н. П. Евстигнеева [и др.] // Междунар. журн. прикладных и фундам. исследований. - 2015. - № 1-1. - С. 32-38.
18) Зайцева, Е. А. Система анализа микробиологических и молекулярно-генетических маркеров для выявления высоковирулентных штаммов Listeria monocytogenes : дис. ... докт. мед. наук : 03.02.03 / Зайцева Елена Александровна ; [НИИ эпидемиологии и микробиологии СО РАМН. (г. Владивосток), НИИ эпидемиологии и микробиологии им. Н. Ф. Гамалеи РАМН (г. Москва)]. - М., 2010. - 312 с.
19) Изменение микрофлоры мочи у детей с внебольничной инфекцией мочевыводящих путей, госпитализированных в период с 1990 по 2015 гг.: ретроспективное сплошное исследование серии случаев / О. А. Жданова, Т. Л. Настаушева, И. В. Гребенникова [и др.] // Вопр. соврем. педиатрии. - 2018. - Т. 17, № 3. - С. 208-214.
20) Инфекции мочевой системы у детей города Барнаула / Н. М. Михеева, Ю. Ф. Лобанов, Г. И. Выходцева [и др.] // Фундам. исследования. - 2012. - № 4-1.
- С. 88-91.
21) Клинико-микробиологические аспекты инфекции мочевой системы, ассоциированной с Enterococcus faecalis / Е. А. Зайцева, В. Н. Лучанинова, Е. А. Мельникова [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2021. - Т. 11. - № 1. - С. 184-190.
22) Коровина, Н. А. Практические рекомендации по антибактериальной терапии инфекций мочевой системы внебольничного происхождения у детей / Н. А. Коровина, И. Н. Захарова, Л. С. Страчунский // Клин. микробиология и антимикроб. химиотерапия. - 2002. - Т. 4, № 4. - С. 337-346.
23) Красная, Ю. В. Значение бактерий рода Enterococcus в жизнедеятельности человека / Ю. В. Красная, А. С. Нестеров, Н. И. Потатуркина-Нестерова // Соврем. проблемы науки и образования. - 2014. - № 6. - С. 49-51.
24) Механизмы развития инфекции мочевых путей и бессимптомной
бактериурии / И. Н. Захарова, Э. Б. Мумладзе, Е. Б. Мачнева, А. Н. Касьянова // Consilium Medicum. Педиатрия. - 2018. - № 1. - С. 106-110.
25) Мироненко, Л. Г. Биологические свойства музейных штаммов микроорганизмов рода Enterococcus / Л. Г. Мироненко, Е. Г. Перетятко // Вестник проблем биологии и медицины. - 2014. - Т. 4. - № 4(116). - С. 204-207.
26) Мироненко, Л. Г. Изучение желатиназной активности на генетическом и фенотипическом уровне у Enterococcus, выделенных из разных экотопов / Л. Г. Мироненко, Е. Г. Перетятько // Вюн. проблем бюлогп i медицини. - 2013. - Вип. 4 (104). - С. 239-242.
27) Мониторинг чувствительности возбудителей инфекции мочевой системы у детей первых пяти лет жизни г. Ставрополя / А. Н. Загрубина, А. С. Калмыкова, В. Н. Муравьева [и др.] // Мед. вестн. Северного Кавказа. - 2012. - Т. 25, № 1. - С. 29-32.
28) Основные возбудители гнойно-воспалительных осложнений у больных с заболеваниями почек из отделения реанимации и интенсивной терапии Краевой клинической больницы № 1 / С. А. Бабичев, М. В. Архипенко, Е. Э. Адонина [и др.] // Кубанский науч. мед. вестн. - 2017. - № 2 (163). - С. 18-20.
29) Отдушкина, Л. Ю. Биологические свойства кокковой микрофлоры кишечника у ВИЧ-инфицированных детей / Л. Ю. Отдушкина // Медицина в Кузбассе. - 2015. - Т. 14, № 4. - С. 14-18.
30) Палковский, О. Л. Проблемы терапии нозокомиальной энтерококковой инфекции (обзор литературы) / О. Л. Палковский, Л. А. Алексеева, И. С. Шиманов // Проблемы здоровья и экологии. - 2015. - № 4 (46). -С. 4-8.
31) Перетятько, Е. Г. Адгезивные свойства энтерококков, выделенных из содержимого трофических язв больных сахарным диабетом / Е. Г. Перетятько // Вестн. Харьковского нац. ун-та им. В. Н. Каразина. Серия «Медицина». - 2007. -№ 14 (774). - С. 110-118.
32) Практическое руководство по антиинфекционной химиотерапии / под ред. Л. С. Страчунского, Ю. Б. Белоусова, С. Н. Козлова. - Смоленск : МАКМАХ,
2007. - 462 с.
33) Проблема антибиотикорезистентности микроорганизмов у пациентов с инфекциями мочевыводящих путей / С. В. Котов, С. А. Пульбере, Н. В. Алесина [и др.] // Урология. - 2021. - № 1. - С. 5-12.
34) Региональные особенности возбудителей впервые выявленных внебольничных инфекций мочевыводящих путей у детей грудного и раннего возраста / А. Н. Ни, Т. А. Шуматова, Е. В. Сергеева [и др.] // Доктор.Ру. - 2020. -Т. 19, № 3. - С. 24-28.
35) Роль факторов патогенности ЕМетососсш faecalis в развитии пиелонефрита у детей / Е. А. Зайцева, Е. В. Крукович, Е. А. Мельникова [и др.] // Тихоокеанский мед. журн. - 2017. - № 2. - С. 58-61.
36) Сидоренко, С. В. Молекулярные основы резистентности к антибиотикам / С. В. Сидоренко, В. И. Тишков // Успехи биол. химии. - 2004. - № 44. - С. 263-306.
37) Скидан, Н. И. Терапия пациентов с осложненной формой течения негонококкового уретрита, ассоциированного с условно-патогенными микроорганизмами / Н. И. Скидан, А. П. Горбунов, В. А. Игликов // Лечащий врач. - 2014. - № 9. - С. 12.
38) Современные особенности этиологической структуры пиелонефрита у детей / Т. В. Ярошевская, Е. С. Коренюк, В. А. Минакова, Е. В. Медведская // Здоровье ребенка. - 2016. - № 7 (75). - С. 80-84.
39) Специфическая иммунизация в профилактике рецидивного нефролитиаза после перкутанной нефролитотрипсии / А. М. Пушкарев, К. Р. Хамидуллин, А. О. Папоян [и др.] // Урология. - 2020. - № 6. - С. 82-88.
40) Сравнительный анализ этиологии острого пиелонефрита у детей в возрастном аспекте / У. К. Кукембай, Г. Д. Сармырза, У. А. Мауленкулова [и др.] // Вестн. Казахского нац. мед. ун-та. - 2020. - № 3. - Р. 158-162.
41) Структура и антибиотикорезистентность уропатогенов, выделенных у новорожденных с инфекцией мочевых путей / Е. А. Мельникова, В. Н. Лучанинова, Е. А. Зайцева, О. В. Семешина // Практ. медицина. - 2015. - Т. 2, № 2
(87). - С. 97-100.
42) Сычева, М. В. Биологические свойства энтерококков, выделенных из организма животных и человека: фенотипическая характеристика и генетический контроль / М. В. Сычева // Шаг в науку. - 2021. - № 2. - С. 4-9.
43) Таксономическая структура бактериальных инфекций мочевых путей у онкологическихбольных / Н. В. Дмитриева, И. Н. Петухова, З. В. Григорьевская [и др.] // Сибирский онкол. журн. - 2017. - Т. 16, № 6. - С. 5-10.
44) Характеристика биопрофилей бактерий рода ЕМвтососсш, выделенных от животных / Е. Е. Кочкина, Т. М. Пашкова, М. В. Сычева, О. Л. Карташова // Вестн. Оренбургского гос. ун-та. - 2017. - № 9 (209). - С. 70-75.
45) Характеристика вирулентного потенциала клинических изолятов энтерококков / О. В. Бухарин, И. В. Валышева, О. Л. Карташова, М. В. Сычева // Журн. микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2013. - № 3. - С. 1218.
46) Характеристика возбудителей осложненной инфекции мочевыводящих путей в многопрофильном стационаре / В. Б. Филимонов, Р. В. Васин, С. Н. Давыдова [и др.] // Вестн. Волгоградского гос. мед. ун-та. - 2016. - № 4 (60). - С. 82-85.
47) Хрульнова, С. А. Гены вирулентности у штаммов ЕМвгососсш Брр, выделенных из гемокультуры у больных опухолями системы крови в России / С. А. Хрульнова, А. В. Федорова, Г. А. Клясова // Иммунопатология, аллергология, инфектология. - 2016. - № 1. - С. 78-82.
48) Щепитова, Н. Е. Биологические свойства антагонистически активных энтерококков кишечной микрофлоры животных / Н. Е. Щепитова, М. В. Сычева, О. Л. Карташова // Вестн. Оренбургского гос. ун-та. - 2014. - № 13 (174). - С. 134-138.
49) Энтерококки желудочно-кишечного тракта: особенности, факторы патогенности, антибиотикорезистентность / Е. И. Иванова, Е. А. Кунгурцева, У. М. Немченко, Е. В. Григорова // Инфекц. болезни. - 2017. - Т. 15, № 3. - С. 58-64.
50) Этиология и патогенез острых пиелонефритов у детей / Я. В.
Шикунова, А. В. Гудков, В. С. Бощенко [и др.] // Эксперимент. и клин. урология.
- 2021. - Т. 14, № 1. - С. 135-139.
51) A 27-year experience with infective endocarditis in Lebanon / N. El-Chakhtoura, M. Yasmin, S. S. Kanj [et al.] // J. Infect. Public. Health. - 2017. - Vol. 10, № 6. - P. 734-739.
52) A nonclonal outbreak of vancomycin-sensitive Enterococcus faecalis bacteremia in a neonatal intensive care unit // D. Kotsanas, K. Tan, C. Scott [et al.] // Infect. Control. Hosp. Epidemiol. - 2019. - Vol. 40, № 10. - P. 1116-1122.
53) A novel biomimetic nanosponge protects the retina from the Enterococcus faecalis / A. L. LaGrow, P. S. Coburn, F. C. Miller [et al.] // Cytolysin. mSphere. -2017. - Vol. 2, № 6. - P. e00335-17.
54) A prospective randomised trial of isolated pathogens of surgical site infections (SSI) / K. Alexiou, I. Drikos, M. Terzopoulou [et al.]// Ann. Med. Surg. (Lond.). - 2017. - Vol. 21. - P. 25-29.
55) A review of combination antimicrobial therapy for Enterococcus faecalis bloods tream infections and infective endocarditis / M. Beganovic, M. K. Luther, L. B. Rice [et al.] // Clin. Infect. Dis. - 2018. - Vol. 67, № 2. - P. 303-309.
56) Acceleration of Enterococcus faecalis biofilm formation by aggregation substance expression in an ex vivo model of cardiac valve colonization / O. N. Chuang-Smith, C. L. Wells, M. J. Henry-Stanley, G. M. Dunny // PLoS One. - 2010. - Vol. 5, № 12. - P. e15798.
57) Aggregation substance increases adherence and internalization, but not translocation, of Enterococcus faecalis through different intestinal epithelial cells in vitro / S. Sartingen, E. Rozdzinski, A. Muscholl-Silberhorn, R. Marre // Infect. Immun.
- 2000. - Vol. 68, № 10. - P. 6044-6047.
58) Aggregation substance of Enterococcus faecalis mediates adhesion to cultured renal tubular cells / B. Kreft, R. Marre, U. Schramm, R. Wirth // Infect. Immun. - 1992. - Vol. 60, № 1. - P. 25-30.
59) Aggregation substance promotes adherence, phagocytosis, and intracellular survival of Enterococcus faecalis within human macrophages and suppresses
respiratory burst / S. D. Süssmuth, A. Muscholl-Silberhorn, R. Wirth [et al.] // Infect. Immun. - 2000. - Vol. 68, № 9. - P. 4900-4906.
60) Aggregation substance-mediated adherence of Enterococcus faecalis to immobilized extracellular matrix proteins / E. Rozdzinski, R. Marre, M. Susa [et al.] // Microb. Pathog. - 2001. - Vol. 30, № 4. - P. 211-220.
61) AMRmap: an Interactive web-platform for analysis of antimicrobial resistance surveillance data in Russia / A. Y. Kuzmenkov, I. V. Trushin, A. G. Vinogradova [et al.] // Front. Microbiol. - 2021. - Vol. 12. - P. 620002.
62) An, F. Y. Identification and characterization of a determinant (eep) on the Enterococcus faecalis chromosome that is involved in production of the peptide sex pheromone cAD1 / F. Y. An, M. C. Sulavik, D. B. Clewell // J. Bacteriol. - 1999. - Vol. 181, № 19. - P.5915-5921.
63) Analysis of resistance to macrolide-lincosamide-streptogramin b amongmeca-positive Staphylococcus Aureus isolates / M. Khodabandeh, M. Mohammadi, M. R. Abdolsalehi [et al.] // Osong Public Health Res. Perspect. - 2019. -Vol. 10, № 1. - P. 25-31.
64) Andrewes, F. W. A study of streptococci pathogenic for man / F. W. Andrewes, T. J. Horder // Lancet. - 1906. - Vol. 168, № 4335. - P. 852-855.
65) Antibiotic resistance in Enterococcus spp. Friend or foe? / V. Economou, H. Sakkas, G. Delis, P. Gousia // Foodborne pathogens and antibiotic resistance / ed. O. V. Singh. - first ed. - New York : John Wiley & Sons, Inc., 2017. - P. 365-395.
66) Antibiotic resistance patterns of outpatient pediatric urinary tract infections / R. S. Edlin, D. J. Shapiro, A. L. Hersh, H. L. Copp // J. Urol. - 2013. - Vol. 190, № 1. - P. 222-227.
67) Antimicrobial resistance and virulence genes in Enterococcus faecium andEnterococcus faecalis from humans and retail red meat / M. Golob, M. Pate, D. Kusar [et al.] // Biomed. Res. Int. - 2019. - Vol. 2019. - P. 2815279. -DOI: 10.1155/2019/2815279.
68) Antimicrobial susceptibility testing [Electronic resource] / European Committee Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST), European Society Clinical
Microbiology Infectious Diseases. - URL: https://www.eucast.org/ast_of_bacteria/ (date application: 08.08.2021).
69) Antimicrobial-resistant pathogens associated with healthcare-associated infections: summary of data reported to the National healthcare safety network at the Centers for disease control and prevention, 2011-2014 / L. M. Weiner, A. K. Webb, B. Limbago [et al.] // Infect. Control Hosp. Epidemiol. - 2016. - Vol. 37, № 11. - P. 1288-1301.
70) Antimicrobial-resistant pathogens associated with pediatric healthcare-associated infections: summary of data reported to the National healthcare safety network, 2015-2017 / L. M. Weiner, S. Abner, A. L. Benin [et al.] // Infect. Control Hosp. Epidemiol. - 2020. - Vol. 41, № 1. - P. 19-30.
71) Antisense peptide nucleic acids against ftsZ and efaA genes inhibit growth and biofilm formation of Enterococcus faecalis / H. Narenji, O. Teymournejad, M. A, Rezaee [et al.] // Microb. Pathog. - 2020. - Vol. 139. - P. 103907.
72) Arabestani, M. R. Correlation between infective factors and antibiotic resistance in enterococci clinical isolates in west of Iran / M. R. Arabestani, M. Nasaj, S. M. Mousavi // Chonnam. Med. J. - 2017. - Vol. 53, № 1. - P. 56-63.
73) Assessment of high-level gentamicin and glycopeptide-resistant Enterococcus faecalis and E. faecium clonal structure in a Portuguese hospital over a 3-year period / R. Mato, F. Almeida, R. Pires [et al.] // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2009. - Vol. 28, № 7. - P. 855-859.
74) Assessment of virulence potential of uncharacterized Enterococcus faecalis strains using pan genomic approach - identification of pathogen-specific and habitat-specific genes / U. Bakshi, M. Sarkar, S. Paul, C. Dutta // Sci. Rep. - 2016. - Vol. 6. -P. 38648.
75) Bacterial size matters: Multiple mechanisms controlling septum cleavage and diplococcus formation are critical for the virulence of the opportunistic pathogen Enterococcus faecalis / B. Salamaga, T. K. Prajsnar, A. Jareno-Martinez [et al.] // PLoS Pathog. - 2017. - Vol. 13, № 7. - P. e1006526.
76) Bacteriocin production, antibiotic susceptibility and prevalence of
haemolytic and gelatinase activity in faecal lactic acid bacteria isolated from healthy Ethiopian infants / D. J. Birri, D. A. Brede, G. T. Tessema, I. F. Nes // Microb. Ecol. -2013. - Vol. 65, № 2. - P. 504-516.
77) Banerjee, T. Prevalence of virulence factors and drug resistance in clinical isolates of Enterococci: a study from North India / T. Banerjee, S. Anupurba // J. Pathog. - 2015. - Vol. 2015. - P. 692612.
78) Barros, M. Enterococcal urinary tract infections in a university hospital: clinical studies / M. Barros, R. Martinelli, H. Rocha // Braz. J. Infect. Dis. - 2009. -Vol. 13, № 4. - P. 294-296.
79) Ben Brai'ek, O. Enterococci: between emerging pathogens and potential probiotics / O. Ben Braiek, S. Smaoui // Biomed. Res. Int. - 2019. - Vol. 2019. - P. 5938210.
80) van den Berghe, E. Enterocin A production by Enterococcus faecium FAIR-E 406 is characterised by a temperature- and pH-dependent switch-off mechanism when growth is limited due to nutrient depletion / E. van den Berghe, T. de Winter, L. de Vuyst // Int. J. Food Microbiol. - 2006. - Vol. 107, № 2. - P. 159-170.
81) de Bittencourt, M. E. Occurrence of virulence-associated genes in clinical Enterococcus faecalis strains isolated in Londrina, Brazil // M. E. de Bittencourt, S. Suzart // J. Med. Microbiol. - 2004. - Vol. 53, Pt. 11. - P. 1069-1073.
82) Bloodstream infections with vancomycin-resistant enterococci are associated with a decreased survival in patients with hematological diseases / S. Weber, M. Hogardt, C. Reinheimer [et al.] // Ann Hematol. - 2019. - Vol. 98, № 3. - P. 763773.
83) Cariolato, D. Ocurrence of virulence factors and antibiotic resistances in Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium collected from diary and human samples in North Italy / D. Cariolato, C. Andrighetto, A. Lombardi // Food Control. -2008. - Vol. 19, № 9. - P. 886-892.
84) Catheter-associated urinary tract infection (CAUTI) after term cesarean delivery: incidence and risk factors at a multi-center academic institution / L. Moulton, M. Lachiewicz, X. Liu, O. Goje // J. Matern. Fetal. Neonatal. Med. - 2018. - Vol. 31,
№ 3. - P. 395-400.
85) Chandler, J. R. Characterization of the sequence specificity determinants required for processing and control of sex pheromone by the intramembrane protease Eep and the plasmid-encoded protein PrgY / J. R. Chandler, G. M. Dunny // J. Bacteriol. - 2008. - Vol. 190, № 4. - P. 1172-1183.
86) Characterisation of the plasmidome within Enterococcus faecalis isolated from marginal periodontitis patients in Norway / X. Song, J. Sun, T. Mikalsen [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, № 4. - P. e62248.
87) Characterization of biofilm formation by Enterococcus faecalis isolates derived from urinary tract infections in China / J. X. Zheng, B. Bai, Z. W. Lin [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2018. - Vol. 67, № 1. - P. 60-67.
88) Clewell, D. B. Bacterial sex pheromone-induced plasmid transfer / D. B. Clewell // Cell. - 1993. - Vol. 73, № 1. - P. 9-12.
89) Clinical characteristics and prediction analysis of pediatric urinary tract infections caused by gram-positive bacteria / Y. L. Hsu, S. N. Chang, C. C. Lin [et al.] // Sci. Rep. - 2021. - Vol. 11, № 1. - P. 11010.
90) Clinical characteristics and risk factors of enterococcal infections in Nagasaki, Japan: a retrospective study / T. Kajihara, S. Nakamura, N. Iwanaga [et al.] // BMC Infect. Dis. - 2015. - Vol. 15. - P. 426.
91) Clinical implications of biofilm formation by Enterococcus faecalis in the urinary tract / Y. Seno, R. Kariyama, R. Mitsuhata [et al.] // Acta Med. Okayama. -2005. - Vol. 59, № 3. - P. 79-87.
92) Clinical, etiological and antimicrobial susceptibility profile of pediatric urinary tract infections in a tertiary care hospital of Nepal / L. B. Shrestha, R. Baral, P. Poudel, B. Khanal // BMC Pediatr. - 2019. - Vol. 19, № 1. - P. 36.
93) Clonal expansion within clonal complex 2 and spread of vancomycin-resistant plasmids among different genetic lineages of Enterococcus faecalis from Portugal / A. R. Freitas, C. Novais, P. Ruiz-Garbajosa [et al.] // J. Antimicrob. Chemother. - 2009. - Vol. 63, № 6. - P. 1104-1111.
94) Clonal structure of Enterococcus faecalis isolated from Polish hospitals:
characterization of epidemic clones / M. Kawalec, Z. Pietras, E. Danilowicz [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2007. - Vol. 45, № 1. - P. 147-153.
95) Coburn, P. S. The Enterococcus faecalis cytolysin: a novel toxin active against eukaryotic and prokaryotic cells / P. S. Coburn, M. S. Gilmore // Cell Microbiol. - 2003. - Vol. 5, № 10. - P. 661-669.
96) Collagen degradation and MMP9 activation by Enterococcus faecalis contribute to intestinal anastomotic leak / B. D. Shogan, N. Belogortseva, P. M. Luong [et al.] // Sci Transl Med. - 2015. - Vol. 7, № 286. - P. 286ra68.
97) Colomer-Winter, C. Association of metal homeostasis and (p)ppGpp regulation in the pathophysiology of Enterococcus faecalis / C. Colomer-Winter, A. O. Gaca, J. A. Lemos // Infect. Immun. - 2017. - Vol. 85, № 7. - P. e00260-17.
98) Community-acquired Enterococcal urinary tract infections / M. Bitsori, S. Maraki, M. Raissaki [et al.] // Pediatr. Nephrol. - 2005. - Vol. 20, № 11. - P. 15831586.
99) Community-acquired Enterococcal urinary tract infections in hospitalized children / N. Marcus, S. Ashkenazi, Z. Samra [et al.] // Pediatr. Nephrol. - 2012. - Vol. 27, № 1. - P. 109-114.
100) Community-acquired urinary tract infections in children: Resistance patterns of uropathogens in a tertiary care center in Saudi Arabia / T. Hameed, A. Al Nafeesah, S. Chishti [et al.] // Int. J. Pediatr. Adolesc. Med. - 2019. - Vol. 6, № 2. - P. 51-54.
101) Comparative genomic analysis of pathogenic and probiotic Enterococcus faecalis isolates, and their transcriptional responses to growth in human urine / H. C. Vebo, M. Solheim, L. Snipen [et al.] // PLoS One. - 2010. - Vol. 5, № 8. - P. e12489.
102) Comparative genomics of Enterococcus faecalis from healthy Norwegian infants / M. Solheim, A. Aakra, L. G. Snipen [et al.] // BMC Genomics. - 2009. - Vol. 10. - P. 194.
103) Comparison of genotypes, antimicrobial resistance and virulence profiles of oral and non oral Enterococcus faecalis from Brazil, Japan and the United Kingdom / R. X. Lins, R. J. Hirata, M. Wilson [et al.] // J. Dent. - 2019. - Vol. 84. - P. 49-54.
104) Comprehensive molecular, genomic and phenotypic analysis of a major clone of Enterococcus faecalis MLST ST40 / M. Zischka, C. T. Künne, J. Blom [et al.] // BMC Genomics. - 2015. - Vol. 16, № 1. - P. 175.
105) Correlation between biofilm formation and gelE, esp, and agg genes in Enterococcus spp. clinical isolates / R. O. Soares, A. C. Fedi, K. C. Reiter [et al.] // Virulence. - 2014. - Vol. 5, № 5. - P. 634-637.
106) Cox, C. R. Enterococcal cytolysin: a novel two component peptide system that serves as a bacterial defense against eukaryotic and prokaryotic cells / C. R. Cox, P. S. Coburn, M. S.Gilmore // Curr. Protein Pept. Sci. - 2005. - Vol. 6, № 1. - P. 77-84.
107) Defining the remarkable structural malleability of a bacterial surface protein Rib domain implicated in infection / F. Whelan, A. Lafita, S. C. Griffiths [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci USA. - 2019. - Vol. 116, № 52. - P. 26540-26548.
108) Detection of ß-Lactamase-Producing Enterococcus faecalis and Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium isolates in human invasive infections in the Public hospital of Tandil, Argentina / C. M. Schell, A. P. Tedim, M. Rodríguez-Baños [et al.] // Pathogens. - 2020. - Vol. 9, № 2. - P. 142.
109) Determination of resistance and virulence genes in Enterococcus faecalis and E. faecium strains isolated from poultry and their genotypic characterization by ADSRRS-fingerprinting / A. Nowakiewicz, G. Ziólkowska, A. Troscianczyk [et al.] // Poult Sci. - 2017. - Vol. 96, № 4. - P. 986-996.
110) Development of a rapid, one-step screening method for the isolation of presumptive proteolytic enterococci / K. Graham, R. Rea, P. Simpson, H. Stack // J. Microbiol. Methods. - 2017. - Vol. 132. - P. 99-105.
111) Distribution of aminoglycoside resistance genes in recent clinical isolates of Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium and Enterococcus avium / N. Kobayashi, M. Alam, Y. Nishimoto [et al.] // Epidemiol. Infect. - 2001. - Vol. 126, № 2. - P.197-204.
112) Dogan, G. Comparison of primary and recurrent urinary tract infections in children / G. Dogan, H. ípek // Cureus. - 2020. - Vol. 12, № 2. - P. e7019.
113) Drug resistance determinants in clinical isolates of Enterococcus faecalis in
Bangladesh: identification of oxazolidinone resistance gene optrA in ST59 and ST902 Lineages / S. Roy, M. S. Aung, S. K. Paul [et al.] // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8, № 8. - P. 1240.
114) Dutka-Malen, S. Detection of glycopeptide resistance genotypes and identification to the species level of clinically relevant enterococci by PCR / S. Dutka-Malen, S. Evers, P. Courvalin // J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, № 1. - P. 24-27. - Note: [published correction appears in J. Clin. Microbiol. - 1995. - Vol. 33, № 5. - P. 1434].
115) Early antibiotictreatment for pediatric febrile urinary tract infection and renal scarring / N. Shaikh, T. K. Mattoo, R. Keren [et al.] // JAMA Pediatr. - 2016. -Vol. 170, № 9. - P. 848-854.
116) Eaton, T. J. Molecular screening of Enterococcus virulence determinants and potential for genetic exchange between food and medical isolates / T. J. Eaton, M. J. Gasson // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - Vol. 67, № 4. - P. 1628-1635.
117) Effect of tedizolid on clinical Enterococcus isolates: in vitro activity, distribution of virulence factor, resistance genes and multilocus sequence typing / B. Bai, K. Hu, H. Li [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2018. - Vol. 365, № 3.
118) El-Mahdy, R. High level aminoglycoside resistant enterococci in hospital-acquired urinary tract infections in Mansoura, Egypt / R. El-Mahdy, A. Mostafa, G. El-Kannishy // Germs. - 2018. - Vol. 8, № 4. - P. 186-190.
119) Emergence of high-risk multidrug-resistant Enterococcus faecalis CC2 (ST181) and CC87 (ST28) causing healthcare-associated infections in India / C. Rao, B. Dhawan, S. Vishnubhatla [et al.] // Infect. Genet. Evol. - 2020. - Vol. 85, № 6890. - P. 104519.
120) Enterococcal cytolysin: activities and association with other virulence traits in a pathogenicity island / N. Shankar, P. Coburn, C. Pillar [et al.] // Int. J. Med. Microbiol. - 2004. - Vol. 293, № 7-8. - P. 609-618.
121) Enterococcal infections: host response, therapeutic, and prophylactic possibilities / S. Koch, M. Hufnagel, C. Theilacker, J. Huebner // Vaccine. - 2004. -Vol. 22, № 7. - P. 822-830.
122) Enterococci from commensals to leading causes of drug resistant infection / eds. M. S. Gilmore, D. B. Clewell, I. Yasuyoshi, N. Shankar. - Boston : Massachusetts eye and ear infirmary, 2014. - 674 p.
123) Enterococci, from harmless bacteria to a pathogen / S. Ramos, V. Silva, M. L. E Dapkevicius [et al.] // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8, № 8. - P. 1118.
124) Enterococcus faecalis bearing aggregation substance is resistant to killing by human neutrophils despite phagocytosis and neutrophil activation / R. M. Rakita, N. N. Vanek, K. Jacques-Palaz [et al.] // Infect. Immun. - 1999. - Vol. 67, № 11. - P. 6067-6075.
125) Enterococcus faecalis gelatinase mediates intestinal permeability via protease-activated receptor 2 / N. Maharshak, E. Y. Huh, C. Paiboonrungruang [et al.] // Infect. Immun. - 2015. - Vol. 83, № 7. - P. 2762-2770.
126) Enterococcus faecalis induces aneuploidy and tetraploidy in colonic epithelial cells through a bystander effect / X. Wang, T. D. Allen, R. J. May [et al.] // Cancer Res. - 2008. - Vol. 68, № 23. - P. 9909-9917.
127) Enterococcus faecalis metalloprotease compromises epithelial barrier and contributes to intestinal inflammation / N. Steck, M. Hoffmann, I. G. Sava [et al.] // Gastroenterology. - 2011. - Vol. 141, № 3. - P. 959-971.
128) Enterococcus faecalis overcomes foreign body-mediated inflammation to establish urinary tract infections / P. S. Guiton, T. J. Hannan, B. Ford [et al.] // Infect. Immun. - 2013. - Vol. 81, № 1. - P. 329-339.
129) Enterococcus faecalis pCF10-encoded surface proteins PrgA, PrgB (aggregation substance) and PrgC contribute to plasmid transfer, biofilm formation and virulence / M. Bhatty, M. R. Cruz, K. L. Frank [et al.] // Mol. Microbiol. - 2015. - Vol. 95, № 4. - P. 660-677.
130) Enterococcus faecalis promotes innate immune suppression and polymicrobial catheter-associated urinary tract infection/ B. Y. Q. Tien, H. M. S. Goh, K. K. L. Chong [et al.] // Infect. Immun. - 2017. - Vol. 85, № 12. - P. e00378-17.
131) Enterococcus species in the oral cavity: prevalence, virulence factors and antimicrobial susceptibility / E. Y. Komiyama, L. S. Lepesqueur, C. G. Yassuda [et al.]
// PLoS One. - 2016. - Vol. 11, № 9. - P. e0163001.
132) Etiological and resistance profile of bacteria involved in urinary tract infections in young children / A. Sorlozano-Puerto, J. M. Gomez-Luque, J. D. Luna-Del-Castillo [et al.] // Biomed. Res. Int. - 2017. - Vol. 2017. - P. 4909452.
133) Etiologies of community-onset urinary tract infections requiring hospitalization and antimicrobial susceptibilities of causative microorganisms / C. C. Chiu, T. C. Lin, R. X. Wu [et al.] // J. Microbiol. Immunol. Infect. - 2017. - Vol. 50, № 6. - P. 879-885.
134) Evaluation of the Enterococcus faecalis biofilm-associated virulence factors ahrc and eep in rat foreign body osteomyelitis and in vitro biofilm-associated antimicrobial resistance / K. L. Frank, P. Vergidis, C. L. Brinkman [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10, № 6. - P. e0130187.
135) Evaluation of virulence factors in Enterococcus species / E. Mete, Î. Kaleli, N. Cevahir [et al.] // Mikrobiyol. Bul. - 2017. - Vol. 51, № 2. - P. 101-114.
136) Ex vivo assessment of synergic effect of chlorhexidine for enhancing antimicrobial photodynamic therapy efficiency on expression patterns of biofilm-associated genes of Enterococcus faecalis / B. Bolhari, M. Pourhajibagher, F. Bazarjani, [et al.] // Photodiagnosis Photodyn. Ther. - 2018. - Vol. 22. - P. 227-232.
137) Extracellular gelatinase of Enterococcus faecalis destroys a defense system in insect hemolymph and human serum / S. Y. Park, K. M. Kim, J. H. Lee [et al.] // Infect. Immun. - 2007. - Vol. 75, № 4. - P. 1861-1869.
138) Facklam, R. R. Identification of Enterococcus species isolated from human infections by a conventional test scheme / R. R. Facklam, M. D. Collins // J. Clin. Microbiol. - 1989. - Vol. 27, № 4. - P. 731-734.
139) Falcone, M. Optimizing antibiotic therapy of bacteremia and endocarditis due to staphylococci and enterococci: new insights and evidence from the literature / M. Falcone, A. Russo, M.Venditti // J. Infect. Chemother. - 2015. - Vol. 21, № 5. - P. 330-339.
140) Fiore, E. Pathogenicity of Enterococci / E. Fiore, D. van Tyne, M. S.Gilmore // Microbiol. Spectr. - 2019. - Vol. 7, № 4. - P. 10.
141) Fisher, K. The ecology, epidemiology and virulence of Enterococcus / K. Fisher, C. Phillips // Microbiology (Reading). - 2009. - Vol. 155, Pt. 6. - P. 1749-1757.
142) Gaca, A. O. Adaptation to adversity: the intermingling of stress tolerance and pathogenesis in Enterococci / A. O. Gaca, J. A. Lemos // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2019. - Vol. 83, № 3. - P. e00008-19.
143) Gajdacs, M. Increasing relevance of Gram-positive cocci in urinary tract infections: a 10-year analysis of their prevalence and resistance trends / M. Gajdacs, M. Âbrok, A. Lazar, K. Burian // Sci Rep. - 2020. - Vol. 10, № 1. - P. 17658.
144) Garcia-Solache, M. The Enterococcus: a model of adaptability to its environment / M. Garcia-Solache, L. B. Rice // Clin. Microbiol. Rev. - 2019. - Vol. 32, № 2. - P. e00058-18.
145) Gelatinase contributes to the pathogenesis of endocarditis caused by Enterococcus faecalis / L. R. Thurlow, V. C. Thomas, S. Narayanan [et al.] // Infect. Immun. - 2010. - Vol. 78, № 11. - P. 4936-4943.
146) Genetic diversity among Enterococcus faecalis / S. M. McBride, V. A. Fischetti, D. J. Leblanc [et al.] // PLoS One. - 2007. - Vol. 2, № 7. - P. e582.
147) Genetic diversity and persistent colonization of Enterococcus faecalis on ocular surfaces / D. Todokoro, H. Eguchi, T. Suzuki [et al.] // Jpn. J. Ophthalmol. -2018. - Vol. 62, № 6. - P. 699-705.
148) Genetic heterogeneity of the Spy1336/R28-Spy1337 virulence axis in Streptococcus pyogenes and effect on gene transcript levels and pathogenesis / J. M. Eraso, P. Kachroo, R. J. Olsen [et al.] // PLoS One. - 2020. - Vol. 15, № 3. - P. e0229064.
149) Genomic analysis of Enterococcus spp. isolated from a wastewater treatment plant and its associated waters in umgungundlovu district, South Africa / J. Mbanga, D. G. Amoako, A. L. K. Abia [et al.] // Front. Microbiol. - 2021. - Vol. 12. -P. 648454.
150) Genomic analysisof multidrug-resistant clinical Enterococcus faecalis isolates for antimicrobial resistance genes and virulence factors from the western region of Saudi Arabia / M. Farman, M. Yasir, R. R. Al-Hindi [et al.] // Antimicrob. Resist.
Infect. Control. - 2019. - Vol. 8. - P. 55 [11 p.].
151) Genotype, biofilm formation ability and specific gene transcripts characteristics of endodontic Enterococcus faecalis under glucose deprivation condition / Y. Liu, Y. Ping, Y. Xiong [et al.] // Arch. Oral Biol. - 2020. - Vol. 118. - P. 104877.
152) Genotypic characterization of hospital Enterococcus faecalis strains using multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis / E. Walecka, J. Bania, E. Dworniczek, M. Ugorski // Lett Appl. Microbiol. - 2009. - Vol. 49, № 1. - P. 79-84.
153) Gentamicin induces efaA expression and biofilm formation in Enterococcus faecalis / H. S. Kafil, A. M. Mobarez, M. F. Moghadam [et al.] // Microb. Pathog. - 2016. - Vol. 92. - P. 30-35.
154) Genus Enterococcus [Electronic resource]. - URL: https://www.bacterio.net/genus/Enterococcus (date application: 09.08.2021).
155) Haghi, F. High incidence of virulence determinants, aminoglycoside and vancomycin resistance in enterococci isolated from hospitalized patients in Northwest Iran / F. Haghi, V. Lohrasbi, H. Zeighami // BMC Infect. Dis. - 2019. - Vol. 19, № 1. -P. 744.
156) Hashem, Y. A. Molecular characterization of Enterococcus spp. clinical isolates from Cairo, Egypt / Y. A. Hashem, A. S.Yassin, M. A. Amin // Indian. J. Med. Microbiol. - 2015. - Vol. 33. - P. 80-86.
157) Hew, C. M. Expression of virulence-related genes by Enterococcus faecalis in response to different environments / C. M. Hew, M. Korakli, R. F. Vogel // Syst. Appl. Microbiol. - 2007. - Vol. 30, № 4. - P. 257-267.
158) High genetic diversity of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis clinical isolates by pulsed-field gel electrophoresis and multilocus sequence typing from a hospital in Malaysia / P. L. Weng, R. Ramli, M. N. Shamsudin [et al.] // Biomed. Res. Int. - 2013. - Vol. 2013. - P. 938937.
159) High incidence of virulence factors among clinical Enterococcus faecalis isolates in South-Western Iran / H. Heidari, S. Hasanpour, H. S. Ebrahim-Saraie, M. Motamedifar // Infect. Chemother. - 2017. - Vol. 49, № 1. - P. 51-56.
160) High prevalence of reduced chlorhexidine susceptibility in organisms
causing central line-associated bloodstream infections / N. Suwantarat, K. C. Carroll, T. Tekle [et al.] // Infect. Control. Hosp. Epidemiol. - 2014. - Vol. 35, № 9. - P. 11831186.
161) High-level Gentamicin Resistance and Detection of aac-(6 ')-Ie-aph (2 ")-Ia gene in Enterococci Isolated from Pediatric Hospital in Northwest of Iran / M. Choukhachian, M. R. Nahaei, M. Ahangarzadeh Rezaee, J. Sadeghi // Arch. Clin. Infect. Dis. - 2018. - Vol. 13, № 5. - P. e62921.
162) Hussain, A. Prevalence of Enterococcus faecalis mediated UTI and its current antimicrobial susceptibility pattern in Lahore, Pakistan / A. Hussain, M. Sohail, Z. Abbas // J. Pak. Med. Assoc. -2016. - Vol. 66, № 10. - P.1232-1236.
163) Huycke, M. M. Bacteremia caused by hemolytic, high-level gentamicin-resistant Enterococcus faecalis / M. M. Huycke, C. A. Spiegel, M. S. Gilmore // Antimicrob. Agents Chemother. - 1991. - Vol. 35, № 8. - P. 1626-1634.
164) Huycke, M. M. Enterococcus faecalis produces extracellular superoxide and hydrogen peroxide that damages colonic epithelial cell DNA / M. M. Huycke, V. Abrams, D. R. Moore // Carcinogenesis. - 2002. - Vol. 23, № 3. - P. 529-536.
165) Huycke, M. M. Frequency of aggregation substance and cytolysin genes among enterococcal endocarditis isolates / M. M. Huycke, M. S. Gilmore // Plasmid. -1995. - Vol. 34, № 2. - P. 152-156.
166) Ike, Y. Evidence that the hemolysin/bacteriocin phenotype of Enterococcus faecalis subsp. zymogenes can be determined by plasmids in different incompatibility groups as well as by the chromosome / Y. Ike, D. B. Clewell // J. Bacteriol. - 1992. -Vol. 174, № 24. - P. 8172-8177.
167) Ike, Y. High incidence of hemolysin production by Enterococcus (Streptococcus) faecalis strains associated with human parenteral infections / Y. Ike, H. Hashimoto, D. B. Clewell // J. Clin. Microbiol. - 1987. - Vol. 25, № 8. - P. 1524-1528.
168) Immune evasion of Enterococcus faecalis by an extracellular gelatinase that cleaves C3 and iC3b / S. Y. Park, Y. P. Shin, C. H. Kim [et al.] // J. Immunol. -2008. - Vol. 181, № 9. - P. 6328-6336.
169) Impact of enterococcal urinary tract infections in immunocompromised -
neoplastic patients / X. Giannakopoulos, H. Sakkas, V. Ragos [et al.] // J. BUON. -2019. - Vol. 24, № 5. - P. 1768-1775.
170) Improved detection of esp, hyl, asa1, gelE, cylA virulence genes among clinical isolates of Enterococci / A. Kiruthiga, K. Padmavathy, P. Shabana [et al.] // BMC Res. Notes. - 2020. - Vol. 13, № 1. - P. 1-7.
171) In vitro susceptibility studies of vancomycin-resistant Enterococcus faecalis. / D. F. Sahm, J. Kissinger, M. S. Gilmore [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. - 1989. - Vol. 33, № 9. - P. 1588-1591.
172) Incidence of bloodstream infections: a nationwide surveillance of acute care hospitals in Switzerland 2008-2014 / N. Buetti, A. Atkinson, J. Marschall, A. Kronenberg // BMJ Open. - 2017. - Vol. 7, № 3. - P. e013665.
173) Incidence of virulence determinants in clinical Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolates collected in Bulgaria / T. Strateva, D. Atanasova, E. Savov [et al.] // Braz. J. Infect. Dis. - 2016. - Vol. 20, № 2. - P. 127-133.
174) Incidence, risk factors, and outcomes for Enterococcus spp. blood stream infections: a population-based study / E. O. Billington, S. H. Phang, D. B. Gregson [et al.] // Int. J. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 26. - P. 76-82.
175) Increased Enterococcus faecalis infection is associated with clinically active Crohn disease / Y. Zhou, H. Chen, H. He [et al.] // Medicine (Baltimore). - 2016. - Vol. 95, № 39. - P. e5019.
176) Increasing tolerance of hospitalEnterococcus faecium to handwash alcohols / S. J. Pidot, W. Gao, A. H. Buultjens [et al.] // Sci. Transl. Med. - 2018. - Vol. 10, № 452. - P. eaar6115.
177) Infection-derived Enterococcus faecalis strains are enriched in esp, a gene encoding a novel surface protein / V. Shankar, A. S. Baghdayan, M. M. Huycke [et al.] // Infect. Immun. - 1999. - Vol. 67, № 1. - P. 193-200.
178) Infective endocarditis / T. L. Holland, L. M. Baddour, A. S. Bayer [et al.] // Nat. Rev. Dis. Primers. - 2016. - Vol. 2. - P. 16059.
179) Insight into antimicrobial susceptibility and population structure of contemporary human Enterococcus faecalis isolates from Europe / A. Kuch, R. J.
Willems, G. Werner [et al.] // J. Antimicrob. Chemother. - 2012. - Vol. 67, № 3. - P. 551-558.
180) Intestinal translocation of enterococci requires a threshold level of enterococcal overgrowth in the lumen / C. Archambaud, A. Derre-Bobillot, N. Lapaque [et al.] // Sci Rep. - 2019. - Vol. 9, № 1. - P. 8926.
181) Investigation of antibiotic resistance and virulence factors of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis strains isolated from clinical samples / §. M. Gök, H. Türk Dagi, F. Kara [et al.] // Mikrobiyol. Bul. - 2020. - Vol. 54, № 1. - P. 26-39.
182) Jolley, K. A. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.org website and their applications / K. A. Jolley, J. E. Bray, M. C. J. Maiden // Wellcome Open Res. - 2018. - Vol. 3. - P. 124.
183) Kafil, H. S. Spread of Enterococcal surface protein in antibiotic resistant Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis isolates from urinary tract infections / H. S. Kafil, A. M. Mobarez // Open Microbiol. J. - 2015. - Vol. 9. - P. 14-17.
184) Kalfopoulou, E. Advances and prospects in vaccine development against Enterococci / E. Kalfopoulou, J. Huebner // Cells. - 2020. - Vol. 9, № 11. - P. 2397.
185) Khan, F. Y. Enterococcal meningitis/ventriculitis in Qatar-Experience with eight patients / F. Y. Khan // Qatar Med. J. - 2020. - Vol. 2020, № 3. - P. 46.
186) Kline, K. A. Gram-positive uropathogens, polymicrobial urinary tract infection, and the emerging microbiota of the urinary tract / K. A. Kline, A. L. Lewis // Microbiol. Spectr. - 2016. - Vol. 4, № 2. - 54 p.
187) Klinzing, D. C. Genomic analysis identifies a transcription-factor binding motif regulating expression of the alpha C protein in group B Streptococcus / D. C. Klinzing, L. C. Madoff, K. M.Puopolo // Microb. Pathog. - 2009. - Vol. 46, № 6. - P. 315-320.
188) Lancefield, R. C. A serological differentiation of human and other groups of hemolytic streptococci / R. C. Lancefield // J. Exp. Med. - 1933. - Vol. 57, № 4. - P. 571-595.
189) Langley, J. M. Unique epidemiology of nosocomial urinary tract infection in children / J. M. Langley, M. Hanakowski, J. C. Leblanc// Am. J. Infect. Control. -
2001. - Vol. 29, № 2. - P. 94-98.
190) Lasa, I. Bap: a family of surface proteins involved in biofilm formation / I. Lasa, J. R. Penadés // Res Microbiol. - 2006. - Vol. 157, № 2. - P. 99-107.
191) Leoni, A. F. Community acquired urinary tract infections in older adults / A. F. Leoni, A. Monterisi, P. G. Acuña // Rev. Fac. Cien. Med. Univ. Nac. Cordoba. -2017. - Vol. 74, № 1. - P. 10-17.
192) Lowe, A. M. Cloning of an Enterococcus faecalis endocarditis antigen: homology with adhesins from some oral streptococci / A. M. Lowe, P. A. Lambert, A. W. Smith // Infect. Immun. - 1995. - Vol. 63, № 2. - P. 703-706.
193) Lund, B. Bloodstream isolates of Enterococcus faecium enriched with the enterococcal surface protein gene, esp, show increased adhesion to eukaryotic cells / B. Lund, C.Edlund // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, № 11. - P. 5183-5185.
194) Maccallum, W. G. A case of acute endocarditis caused by micrococcus zymogenes (nov. spec.), with a description of the microorganism / W. G. Maccallum, T. W. Hastings // J. Exp. Med. - 1899. - Vol. 4, № 5-6. - P. 521-534.
195) Makinen, P. L. The Enterococcus faecalis extracellular metalloendopeptidase (EC 3.4.24.30; coccolysin) inactivates human endothelin at bonds involving hydrophobic amino acid residues / P. L. Makinen, K. K. Makinen // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 1994. - Vol. 200, № 2. - P. 981-985.
196) Manganese-dependent regulation of the endocarditis-associated virulence factor EfaA of Enterococcus faecalis / Y. L. Low, N. S. Jakubovics, J. C. Flatman [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2003. - Vol. 52, Pt. 2. - P. 113-119.
197) Marques de, E. B. Occurrence of virulence-associated genes in clinical Enterococcus faecalis strains isolated in Londrina, Brazil / E. B. de Marques, S. Suzart // J. Med. Microbiology. - 2004. - Vol. 53, Pt. 11. - P. 1069-1073.
198) Martínez, S. Thermal inactivation of Enterococcus faecium: effect of growth temperature and physiological state of microbial cells / S. Martínez, M. López, A. Bernardo // Lett Appl Microbiol. - 2003. - Vol. 37, № 6. - P. 475-481.
199) Miyoshi, S. Microbial metalloproteases and pathogenesis / S. Miyoshi, S. Shinoda // Microbes. Infect. - 2000. - Vol. 2, № 1. - P. 91-98.
200) Model systems for the study of Enterococcal colonization and infection / H. M. S. Goh, M. H. A. Yong, K. K. L. Chong, K. A. Kline // Virulence. - 2017. - Vol. 8, № 8. - P. 1525-1562.
201) Molecular characterization of gentamicin-resistant Enterococci in the United States: evidence of spread from animals to humans through food / S. M. Donabedian, L. A. Thal, E. Hershberger [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol. 41, № 3. - P. 1109-1113.
202) Molecular characterization of vancomycin-resistant Enterococcus faecalis among inpatients at Iranian University Hospitals: clonal dissemination of ST6 and ST422 / M. Zalipour, B. N. Esfahani, M. Halaji [et al.] // Infect. Drug Resist. - 2019. -Vol. 12. - P. 3039-3047.
203) Molecular detection of aggregation substance, enterococcal surface protein, and cytolysin genes and in vitro adhesion to urinary catheters of Enterococcus faecalis and E. faecium of clinical origin / A. Hällgren, C. Claesson, B. Saeedi [et al.] // Int. J. Med. Microbiol. - 2009. - Vol. 299, № 5. - P. 323-332.
204) Multidrug-resistant Enterococcal infections: new compounds, novel antimicrobial therapies? / R. M. van Harten, R. J. L. Willems, N. I. Martin, A. P. A. Hendrickx // Trends Microbiol. - 2017. - Vol. 25, № 6. - P. 467-479.
205) Multi-drug-resistant Enterococcus faecalis among Egyptian patients with urinary tract infection / M. Z. Abdelkareem, M. Sayed, N. A. Hassuna [et al.] // J. Chemother. - 2017. - Vol. 29, № 2. - P. 74-82.
206) Multilocus sequence typing scheme for Enterococcus faecalis reveals hospital-adapted genetic complexes in a background of high rates of recombination / P. Ruiz-Garbajosa, M. J. Bonten, D. A. Robinson [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2006. -Vol. 44, № 6. - P. 2220-2228.
207) Multiple functional domains of Enterococcus faecalis aggregation substance Asc10 contribute to endocarditis virulence / O. N. Chuang, P. M. Schlievert, C. L. Wells [et al.] // Infect. Immun. - 2009. - Vol. 77, № 1. - P. 539-548.
208) Multiplex PCR for detection of aminoglycoside resistance genes in enterococci / S. B. Vakulenko, S. M. Donabedian, A. M. Voskresenskiy [et al.] //
Antimicrob. Agents Chemother. - 2003. - Vol. 47, № 4. - P. 1423-1426.
209) Nosocomial vs. community-acquired infective endocarditis in Greece: changing epidemiological profile and mortality risk / E. Giannitsioti, I. Skiadas, A. Antoniadou [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. - 2007. - Vol. 13, № 8. - P. 763-769.
210) Obligate anaerobes are abundant in human necrotizing soft tissue infection samples - a metagenomics analysis / H. H. Zhao-Fleming, J. E. Wilkinson, E. Larumbe [et al.] // APMIS. - 2019. - Vol. 127, № 8. - P. 577-587.
211) Orla-Jensen, S. The lactic acid bacteria. Memoirs of the Academy of the Royal society of Denmark / S. Orla-Jensen // Section Sciences Series. - 1919. - Vol. 85.
- P. 81-197.
212) Padilla, C. Virulence, bacterocin genes and antibacterial susceptibility in Enterococcus faecalis strains isolated from water wells for human consumption / C. Padilla, O. Lobos // Springerplus. -2013 Weber. - Vol. 2, № 1. - P. 43.
213) Padmasini, E. High level aminoglycoside resistance and distribution of aminoglycoside resistant genes among clinical isolates of Enterococcus species in Chennai, India / E. Padmasini, R. Padmaraj, S. S. Ramesh // Scientific World J. - 2014.
- Vol. 2014. - P. 329157.
214) Pathogens causing urinary tract infections in infants: a European overview by the ESCAPE study group / I. Alberici, A. K. Bayazit, D. Drozdz [et al.] // Eur. J. Pediatr. - 2015. - Vol. 174, № 6. - P. 783-790.
215) Peritonitis: episode sequence, microbiological variation, risk factors and clinical outcomes in a North China Peritoneal Dialysis Center / S. Hu, P. Ming, A. R. Qureshi [et al.] // Kidney Blood Press Res. - 2018. - Vol. 43, № 5. - P. 1573-1584.
216) Persistence of a ST6 clone of Enterococcus faecalis genotype vanB2 in two Hospitals in Aragon (Spain). Persistencia de un clon ST6 de Enterococcus faecalis con genotipo vanB2 en dos hospitales de Aragón / C. A. Alonso, A. Rezusta, C. Seral [et al.] // Enferm. Infecc. Microbiol. Clin. - 2017. - Vol. 35, № 9. - P. 578-581.
217) Phenotypic and genotypic study of biofilm formation in Enterococci isolated from urinary tract infections / F. Fallah, M. Yousefi, M. R. Pourmand [et al.] // Microb. Pathog. - 2017. - Vol. 108. - P.85-90.
218) Plasmid-associated hemolysin and aggregation substance production contribute to virulence in experimental enterococcal endocarditis / J. W. Chow, L. A. Thal, M. B. Perri [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. - 1993. - Vol. 37, № 11. -P. 2474-2477.
219) PolyGlcNAc-containing exopolymers enable surface penetration by non-motile Enterococcus faecalis / Y. Ramos, J. Rocha, A. L. Hael [et al.] // PLoS Pathog. -2019. - Vol. 15, № 2. - P. e1007571.
220) Predictive factors for Enterococcus faecalis in complicated community-acquired urinary tract infections in older patients / M. Madrazo, A. Esparcia, J. Alberola [et al.] // Geriatr. Gerontol. Int. - 2020. - Vol. 20, № 3. - P. 183-186.
221) Prevalence of Aminoglycoside Resistance Genes in Enterococcus Strains in Kermanshah, Iran / F. Amini, H. A. Krimpour, M. Ghaderi [et al.] // Iran J Med Sci. -2018. Vol. 43, № 5. - P. 487-493.
222) Prevalence of urinary tract infection in childhood: a meta-analysis / N. Shaikh, N. E. Morone, J. E. Bost, M. H. Farrell // Pediatr Infect Dis J. - 2008. - Vol. 27, № 4. - Р. 302-308.
223) Proteinases of common pathogenic bacteria degrade and inactivate the antibacterial peptide LL-37 / A. Schmidtchen, I. M. Frick, E. Andersson [et al.] // Mol. Microbiol. - 2002. - Vol. 46, № 1. - P. 157-168.
224) Ramakrishnan, V. Combined effect of enterocin and lipase from Enterococcus faecium NCIM5363 against food borne pathogens: mode of action studies / V. Ramakrishnan, B. Narayan, P. M. Halami //Curr. Microbiol. - 2012. - Vol. 65, № 2. - P. 162-169.
225) Ramsey, M. The physiology and metabolism of Enterococci / M. Ramsey, A. Hartke, M. Huycke // Enterococci from commensals to leading causes of drug resistant infection / eds. M. S. Gilmore, D. B. Clewell, I. Yasuyoshi, N. Shankar. -Boston : Massachusetts eye and ear infirmary, 2014. - P. 581-636.
226) Rathnayake, I. U. Antibiotic resistance and virulence traits in clinical and environmental Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolates / I. U. Rathnayake, M. Hargreaves, F. Huygens // Syst. Appl. Microbiol. - 2012. - Vol. 35, №
5. - P. 326-333.
227) Reduced chlorhexidine and daptomycin susceptibility in vancomycin-resistant Enterococcus faecium after serial chlorhexidine exposure / P. Bhardwaj, A. Hans, K. Ruikar [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. - 2017. - Vol. 62, № 1. - P. e01235-17.
228) Resistance to acidic and alkaline environments in the endodontic pathogen Enterococcus faecalis / K. Nakajo, R. Komori, S. Ishikawa [et al.] // Oral Microbiol. Immunol. - 2006. - Vol. 21, № 5. - P. 283-288.
229) Resistance to antibacterial therapy in pediatric febrile urinary tract infections-a single-center analysis / T. Raupach, J. Held, H. U. Prokosch [et al.] // J. Pediatr. Urol. - 2020. - Vol. 16, № 1. - P. 71-79.
230) Review on antibiotic resistance: alarm bells are ringing / S. B. Zaman, M. A. Hussain, R. Nye [et al.] // Cureus. - 2017. - Vol. 9, № 6. - P. e1403.
231) Role of Enterococcus faecalis surface protein Esp in the pathogenesis of ascending urinary tract infection / N. Shankar, C. V. Lockatell, A. S, Baghdayan [et al.] // Infect. Immun. - 2001. - Vol. 69, № 7. - P. 4366-4372.
232) Role of the Enterococcus faecalis GelE protease in determination of cellular chain length, supernatant pheromone levels, and degradation of fibrin and misfolded surface proteins / C. M. Waters, M. H. Antiporta, B. E. Murray, G. M. Dunny // J. Bacteriol. - 2003. - Vol. 185, № 12. - P. 3613-3623.
233) Sava, I. G. Pathogenesis and immunity in enterococcal infections / I. G. Sava, E. Heikens, J. Huebner // Clin. Microbiol. Infect. - 2010. - Vol. 16, № 6. - P. 533-540.
234) Say Coskun, U. S. Investigation of the relationship between virulence factors and antibiotic resistance of Enterococci isolates / U. S. Say Coskun // Cell Mol. Biol. (Noisy-le-grand). - 2019. - Vol. 65, № 2. - P. 14-17.
235) Schleifer, K. H. Transfer of Streptococcus faecalis and Streptococcus faecium to the genus Enterococcus nom. rev. as Enterococcus faecalis comb. nov. And Enterococcus faecium comb. nov / K. H. Schleifer, R. Kilpper-Bälz // Int. J. Syst. Bacteriol. - 1984. - Vol. 34. - P. 31-34.
236) Sherman, J. M. An unnoted hemolytic Streptococcus associated with milk products / J. M. Sherman, H. U. Wing // J. Dairy Science. - 1935. - Vol. 18, № 10. - P. 657-660.
237) Sherman, J. M. The Streptococci / J. M. Sherman // Bacteriol. Rev. - 1937. - Vol. 1, № 1. - P. 3-97.
238) Spectrum and antibiogram of bacteria isolated from patients presenting with infected wounds in a Tertiary Hospital, northern Tanzania. / N. A. Kassam, D. J. Damian, D. Kajeguka [et al.] // BMC Res. Notes. - 2017. - Vol. 10, № 1. - P. 757.
239) Spectrum and antibiotic resistance of uropathogens between 2004 and 2015 in a tertiary care hospital in Hungary / A. Magyar, B. Koves, K. Nagy [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2017. - Vol. 66, № 6. - P. 788-797.
240) Spread of an Enterococcus faecalis sequence type 6 (CC2) clone in patients undergoing selective decontamination of the digestive tract / I. Muruzabal-Lecumberri, C. Girbau, A. Canut [et al.] // APMIS. - 2015. - Vol. 123, № 3. - P. 245-251.
241) Strzelecki, J. Gelatinase-associated phenotypes and genotypes among clinical isolates of Enterococcus faecalis in Poland / J. Strzelecki, W. Hryniewicz, E. Sadowy // Pol. J. Microbiol. - 2011. - Vol. 60, № 4. - P. 287-292.
242) Surgical site infection following abdominal surgery: a prospective cohort study / A. Alkaaki, O. O. Al-Radi, A. Khoja [et al.] // Can. J. Surg. - 2019. - Vol. 62, № 2. - P. 111-117.
243) Survey for Correlation between biofilm formation and virulence determinants in a collection of pathogenic and fecal Enterococcus faecalis isolates / F. Saffari, M. S. Dalfardi, S. Mansouri, R. Ahmadrajabi // Infect. Chemother. - 2017. -Vol. 49, № 3. - P. 176-183.
244) Survey of Virulence Determinants among Vancomycin Resistant Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium Isolated from clinical specimens of hospitalized patients of North west of Iran / Y. Sharifi, A. Hasani, R. Ghotaslou [et al.] // Open Microbiol. J. - 2012. - Vol. 6. - P. 34-39.
245) Svec, P. The genus Enterococcus / P. Svec, C. M. A. P. Franz // Lactic acid bacteria: biodiversity and taxonomy /eds.W. Holzapfel, J. Wood. - Wiley, Chichester,
2014. - P. 175-211.
246) The clinical significance of high antimicrobial resistance in community-acquired urinary tract infections / M. G. Zavala-Cerna, M. Segura-Cobos, R. Gonzalez [et al.] // Can. J. Infect. Dis. Med. Microbiol. - 2020. - Vol. 2020. - P. 2967260.
247) The effect of berberine hydrochloride on Enterococcus faecalis biofilm formation and dispersion in vitro / L. Chen, Q. Bu, H. Xu [et al.] // Microbiol. Res. -2016. - Vol. 186-187. - P. 44-51.
248) The emergence of multi-resistant Enterococcus faecalis clonal complex, CC4, causing nosocomial infections / D. Dai, H. Wang, X. Xu [et al.] // J. Med. Microbiol. - 2018. - Vol. 67, № 8. - P. 1069-1077.
249) The emerging resistance in nosocomial urinary tract infections: from the pediatrics perspective / F. Devrim, E. Serdaroglu, î. Çaglar [et al.] // Mediterr J. Hematol. Infect. Dis. - 2018. - Vol. 10, № 1. - P. e2018055.
250) The Fsr quorum-sensing system of Enterococcus faecalis modulates surface display of the collagen-binding MSCRAMM Ace through regulation of gelE / K. L. Pinkston, P. Gao, D. Diaz-Garcia [et al.] // J. Bacteriol. - 2011. - Vol. 193, № 17. - P. 4317-4325.
251) The gelatinase biosynthesis-activating pheromone binds and stabilises the FsrB membrane protein in Enterococcus faecalis quorum sensing / S. Littlewood, H. Tattersall, C. S. Hughes [et al.] // FEBS Lett. - 2020. - Vol. 594, № 3. - P. 553-563.
252) The occurrence of virulence traits among high-level aminoglycosides resistant Enterococcus isolates obtained from feces of humans, animals, and birds in South Korea / D. Han, T. Unno, J. Jang [et al.] // Int. J. Food Microbiol. - 2011. - Vol. 144, № 3. - P. 387-392.
253) The relationship between antibiotic resistance and virulence factors in urinary Enterococcus isolates / O. Baylan, H. Nazik, B. Bektöre [et al.] // Mikrobiyol. Bul. - 2011. - Vol. 45, № 3. - P. 430-445.
254) The unravelled Enterococcus faecalis zoonotic superbugs: Emerging multiple resistant and virulent lineages isolated from poultry environment / K. A. Hasan, S. A. Ali, M. Rehman [et al.] // Zoonoses Public. Health. - 2018. - Vol. 65, №
8. - P. 921-935.
255) Thiercelin, M. E. Sur un diplococque saprophyte de l'intestin susceptible de devenir pathogene / M. E. Thiercelin, L. Jouhaud // CR Soc. Biol. - 1899. - Vol. 5. - P. 2б9-271.
256) Toru, M. Prevalence and phenotypic characterization of Enterococcus species isolated from clinical samples of pediatric patients in Jimma University Specialized Hospital, south west Ethiopia / M. Toru, G. Beyene, T. Kassa // BMC Research Notes. - 2018. - Vol. 11, № 1. - P. 281.
257) Tuhina, B. Emergence of antimicrobial resistance and virulence factors among the unusual species of enterococci, from North India / B. Tuhina, S. Anupurba, T. Karuna // Indian. J. Pathol. Microbiol. - 201б. - Vol. 59, № 1. - P. 50-55.
258) Tuhina, B. Prevalence of virulence factors and drug resistance in clinical isolates of enterococci: a study from North India / B. Tuhina, A. Shampa // J. Pathog. -2015. - Vol. 2015. - P. 1-7.
259) van Tyne, D. Friend turned foe: evolution of enterococcal virulence and antibiotic resistance / D. van Tyne, M. S. Gilmore // Annu Rev. Microbiol. - 2014. -Vol. б8. - P. 337-35б.
260) van Tyne, D. Structure, function, and biology of the Enterococcus faecalis cytolysin / D. van Tyne, M. J. Martin, M. S. Gilmore // Toxins. (Basel). - 2013. - Vol. 5, № 5. - P. 895-911.
261) Typing of Enterococcus spp. strains in 4 hospitals in the Malopolska region in Poland / K. Talaga, D. Odrow^z-Konduracka, B. Paradowska [et al.] // Adv. Clin. Exp. Med. - 2018. - Vol. 27, № 1. - P. 111-117.
262) Udo, E. E. Frequency of virulence-associated genes in Enterococccus faecalis isolated in Kuwait hospitals / E. E. Udo, N. Al-Sweih // Med. Princ. Pract. -2011. - Vol. 20, № 3. - P. 259-2б4.
263) Understanding the mechanisms and drivers of antimicrobial resistance / A. H. Holmes, L. S. Moore, A. Sundsfjord [et al.] // Lancet. - 201б. - Vol. 3S7, № 10014. - P. 17б-187.
264) Urinary infection in the elderly. Infección urinaria en el anciano / E.
Álvarez Artero, A. Campo Nuñez, M. Garcia Bravo [et al.] / Rev. Clin. Esp. (Barc). -2019. - Vol. 219, № 4. - P.189-193.
265) Urinary tract infections: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options / A. L. Flores-Mireles, J. N. Walker, M. Caparon, S. J. Hultgren // Nat. Rev. Microbiol. - 2015. - Vol. 13, № 5. - P. 269-284.
266) Use of recombinase-based in vivo expression technology to characterize Enterococcus faecalis gene expression during infection identifies in vivo-expressed antisense RNAs and implicates the protease Eep in pathogenesis / K. L. Frank, A. M. Barnes, S. M. Grindle [et al.] // Infect. Immun. - 2012. - Vol. 80, № 2. - P. 539-549.
267) Uterine cervical non-gonococcal and non-chlamydial bacterial flora and its antibiotic sensitivity in women with pelvic inflammatory disease: did it vary over 20 years? / S. Lurie, H. Asaala, O. S. Harari [et al.] // Isr. Med. Assoc. J. - 2010. - Vol. 12, № 12. - P. 747-750.
268) Virulence and Antibiotic Resistance of Enterococci Isolated from Healthy Breastfed Infants / J. M. Landete, Á. Peirotén, M. Medina [et al.] // Microb. Drug Resist. - 2018. - Vol. 24, № 1. - P.63-69.
269) Virulence factors in food, clinical and reference Enterococci: a common trait in the genus? / T. Semedo, M. A. Santos, M. F. Lopes.[et al.] // Syst. Appl. Microbiol. - 2003. - Vol. 26, № 1. - P. 13-22.
270) Virulence genes among Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium isolated from coastal beaches and human and nonhuman sources in Southern California and Puerto-Rico / D. M. Ferguson, G. N. Talavera, L. A. Hernández [et al.] // J. Pathog. - 2016. - Vol. 2016. - P. 3437214.
271) Virulence genes and bacteriocins in Enterococcus faecalis strains isolated from different clinical samples in Maule Region, Chile / E. C. Padilla, A. M. Núñez, G. A. Padilla, G. O. Lobos // Rev. Chilena Infectol. - 2012. - Vol. 29, № 1. - P. 55-61.
272) Virulence genes in biofilm producer Enterococcus faecalis isolates from root canal infections / A. M. Akbari, B. M. H. Soroush, M. Aghazadeh [et al.] // Cell. Mol. Biol. (Noisy-le-grand). - 2017. - Vol. 63, № 5. - P. 55-59.
273) Virulence markers of vancomycin resistant enterococci isolated from
infected and colonized patients / P. P. Biswas, S. Dey, L. Adhikari, A. Sen // J. Glob. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 6, № 4. - P. 157-163.
274) Virulence profiles of vancomycin-resistant enterococci isolated from surface and ground water utilized by humans in the North West Province, South Africa: a public health perspective / D. P. Matlou, M. E. A. Bissong, C. K. Tchatchouang [et al.] // Environ. Sci. Pollut. Res. Int. - 2019. - Vol. 26, № 15. - P. 15105-15114.
275) Waters, C. M. The aggregation domain of aggregation substance, not the RGD motifs, is critical for efficient internalization by HT-29 enterocytes / C. M. Waters, C. L. Wells, G. M. Dunny // Infect. Immun. - 2003. - Vol. 71, № 10. - P. 5682-5689.
276) Weng, P. L. Antibiotic susceptibility patterns, biofilm formation andespgene among clinical enterococci: is there any association? / P. L. Weng, R. Ramli, R. A.Hamat // Int. J. Environ. Res. Public. Health. - 2019. - Vol. 16, № 18. - P. 3439.
277) What is the source of bloodstream infection due to vancomycin-resistant enterococci in persons with mucosal barrier injury? / M. Kamboj, R. Blair, N. Bell [et al.] // Infect. Control. Hosp. Epidemiol. - 2014. - Vol. 35, № 1. - P. 99-101.
278) Willey, J. M. Lantibiotics: peptides of diverse structure and function / J. M. Willey, W. A. van der Donk // Annu Rev. Microbiol. - 2007. - Vol. 61. - P. 477-501.
279) Zhu, W. The changing epidemiology and clinical features of infective endocarditis: a retrospective study of 196 episodes in a teaching hospital in China / W. Zhu, Q. Zhang, J. Zhang// J. BMC Cardiovasc. Disord. - 2017. - Vol. 17, № 1. - P. 113.
280) Zou, J. Surface protein Esp enhances pro-inflammatory cytokine expression through NF-kB activation during enterococcal infection / J. Zou, N. Shankar // Innate Immun. - 2016. - Vol. 22, № 1. - P. 31-39.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.