Фосфатаза PPZ1P и эффективность нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Иванов, Максим Сергеевич

• Иванов, Максим Сергеевич
• кандидат биологических наук
• 2009

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Иванов, Максим Сергеевич

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

Роль генетических и эпигенетических факторов в регуляции эффективности нонсенс-супрессии у эукариот.

1.1. Характеристика процесса трансляции у эукариот и типы ошибок, возникающих в ходе трансляции.

1.2. Генетический контроль точности трансляции. Факторы, влияющие на считывание стоп кодонов.

1.2.1. Роль мутантных и естественных нонсенс-супрессорных тРНК в считывании стоп-кодонов.

1.2.2. Роль факторов терминации в распознавании стоп-кодонов

1.2.2.1. Характеристика факторов терминации трансляции eRF 1 и eRF3.

1.2.2.2. Эффекты мутаций в генах, кодирующих eRF3 и eRFl

1.2.2.3. Взаимодействие факторов терминации с другими белками.

1.2.3. Роль рРНК и рибосомных белков в поддержании точности трансляции.

1.2.4. Роль факторов элонгации в контроле точности трансляции.

1.2.5. Роль компонентов системы NMD в регуляции уровня нонсенс-супрессии.

1.2.6. Другие факторы, влияющие на считывание стоп-кодонов.

1.3. Эпигенетический контроль точности трансляции.

1.3.1. Прионное превращение белков.

1.3.2. Фактор [Р57+] и его влияние на считывание стоп-кодонов.

1.4. Роль фосфорилирования в контроле точности трансляции.

1.4.1. Фосфатазы дрожжей-сахаромицетов.

1.4.2. Фосфатаза Ppzlp и ее роль в контроле эффективности нонсенс-супрессии.

1.4.3. Влияние фосфатазы Ppqlp на уровень нонсенс-супрессии

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Фосфатаза PPZ1P и эффективность нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae»

Считывание триплетов мРНК аппаратом белкового синтеза в соответствии с генетическим кодом — основополагающее свойство живой клетки, обеспечивающее ее стабильное функционирование. Как и другие матричные процессы, трансляция характеризуется некоторым уровнем неточного считывания, в результате которого может происходить переосмысление значащих триплетов, считывание стоп-кодонов как значащих, сдвиг рамки считывания. В соответствии с принципом поливариантности матричных процессов, способность к прочтению одного и того же триплета более чем одним способом является неотъемлемым свойством белок-синтезирующей системы клетки (Инге-Вечтомов, 1969).

Одним из возможных следствий поливариантности трансляции может быть гетерогенность синтезированных полипептидов. В этом случае говорят о неоднозначности трансляции. Неоднозначность трансляции может проявляться практически на всех этапах этого процесса, однако наиболее показательна с этой точки зрения терминация трансляции.

Как известно, в большинстве белок-синтезирующих систем в качестве сигналов терминации трансляции используются триплеты UAA, UAG и UGA, называемые также стоп-кодонами (нонсенс-кодонами). При мутационном возникновении стоп-кодона в кодирующей части гена должно происходить преждевременное прекращение синтеза соответствующего полипептида. Вместе с тем, проявление нонсенс-мутаций может быть нейтрализовано различными способами, так или иначе приводящими к считыванию стоп-кодона, возникшего в результате мутации. Это явление получило название нонсенс-супрессии.

Нонсенс-супрессия является классической моделью для изучения молекулярных механизмов, регулирующих считывание стоп-кодонов как значащих (Инге-Вечтомов et al., 1971; Инге Вечтомов, 1976). Увеличение или уменьшение эффективности нонсенс-супрессии может быть связано с нарушениями в работе как тРНК и белковых компонентов аппарата элонгации и терминации трансляции, так и компонентов системы нонсенс-зависимой деградации мРНК (NMD).

Кроме того, на эффективность считывания стоп-кодонов, по крайней мере, у низших эукариот, могут влиять и факторы эпигенетической природы. Хорошо известным примером такого рода является фактор [P.ST] дрожжей-сахаромицетов — наследственный детерминант белковой природы, или прион, представляющий собой функционально неактивный конформационный изомер фактора терминации трансляции eRF3, кодируемого геном SUP35. Переход активной формы фактора терминации eRF3 в неактивную, прионную, способствует считыванию стоп-кодонов как значащих, поэтому штаммы [PST] проявляют нонсенс-супрессорный фенотип.

В нашей лаборатории идентифицирован новый эпигенетический детерминант дрожжей [ZSP+]. Фактор [ZSP+] также влияет на считывание стоп-кодонов, однако в отличие от [Р571"] он проявляется как антисупрессор по отношению к некоторым мутациям sup35 (причем для проявления антисупрессорного эффекта [ZSP"1"] необходимо наличие криптических мутаций sup45). Ряд фактов (обратимое излечивание на среде, содержащей хлорид гуанидина, неменделевское наследование при тетрадном анализе, возможность передачи при цитодукции) указывает на то, что детерминант [/.SP*], возможно, также является прионом.

В ходе поиска генов, оказывающих влияние на индукцию, поддержание либо проявление [ZSP+], был проведен скрининг трех геномных библиотек - 1) экспрессионной библиотеки на основе вектора pRS316, содержащего индуцируемый промотор GAL1\ 2) дизрупционной библиотеки на основе дрожжевого минитранспозона тТпЗ, и 3) библиотеки на основе центромерного вектора Ycp50.

Каждый из этих подходов позволил выявить по несколько генов, поразному влияющих на свойства [7£Р+] (,SUP45, HAL3, UPFJ, UPF2, SFP1, APD1, HSP150, RPS24A). В частности, ген SFP1, идентифицированный при скрининге инсерционной библиотеки и кодирующий транскрипционный фактор Sfplp, по всей видимости, является структурным геном [7&Р*]. Делеция этого гена приводит к необратимой потере [/SP+], сверхэкспрессия — к индукции [75Р+] с высокой частотой (Rogoza et al., 2008). При использовании гибридных конструкций, в которых ген SFP1 слит с геном, кодирующим белок GPF, было показано наличие агрегатов Sfplp в штаммах [7£Р+] in vivo. Таким образом, белок Sfplp, по-видимому, способен к прионной конверсии, и переход Sfplp в неактивную конформацию обуславливает антисупрессорный эффект [75!Р+].

В результате скрининга центромерной библиотеки были изолированы гены SUP45 и HAL3. Аллель дикого типа гена SUP45 при низкокопийной экспрессии приводит к изменению фенотипа штамма [7£Р+] с Sup" на Sup+. Роль гена SUP45 в проявлении [ZST^] связана с тем, что использовавшиеся штаммы, как выяснилось, содержат криптические мутации sup45 (sup45-400 в штамме, несущем аллель sup35-25, и sup45-75 в штамме, несущем аллель sup35-10). Эти мутации sup45 не имеют собственного фенотипического проявления, но при этом необходимы для проявления антисупрессорного эффекта [7£Р+] в штаммах, несущих мутации sup35-10 или sup35-25. В связи с этим при трансформации центромерной плазмидой, несущей аллель дикого типа SUP45, происходит фенотипическая маскировка антисупрессорного эффекта [7SP+] (Аксенова и др., 2006).

Отправной точкой» для настоящего исследования послужили факты, полученные при изучении эффектов сверхэкспрессии второго гена, выявленного при скрининге центромерного банка — HAL3. Было показано, что HAL3 при низкокопийной экспрессии увеличивает частоту спонтанной потери [75Р+]. Далее было показано, что сверхэкспрессия HAL3 приводит к изменению фенотипа штамма [7&Р+] с несупрессорного (Sup') на супрессорный (Sup+), а у штамма [«/?"], имеющего фенотип Sup+, эффективность супрессии усиливается.

Делеция гена HAL3 приводит к изменению фенотипа штамма [isp~] с Sup+ на Sup"; в штамме [ISP+], несущем делецию HAL3, антисупрессия проявляется более четко, чем в штамме без делеции. Важно отметить также, что в штамме [ZS75+] количество белка На13р значительно снижено по сравнению с его [isp~] производным. Это указывает на то, что На13р каким-то образом опосредует фенотипическое проявление [/<S"P+] ( Aksenova et al., 2007).

Известно, что белок На13р является негативной регуляторной субъединицей фосфатазы Ppzlp (de Nadal et al., 1998). Поэтому были изучены и эффекты сверхэкспрессии/делеции гена PPZ1. Как и следовало ожидать, эти эффекты противоположны эффектам HAL3: сверхэкспрессия PPZ1 проявляет антисупрессорный эффект в штамме [/£/>"], несущем мутацию sup35-25, а делеция гена PPZ1 изменяет фенотип штамма [ISP+] с Sup" на Sup+. При этом антисупрессия, наблюдаемая при сверхэкспрессии PPZ1 в штамме [isp~], связана с увеличением фосфатазной активности Ppzlp, поскольку этот эффект не наблюдается при сверхэкспрессии мутантной аллели ppzl-R451L, кодирующей каталитически неактивный белок.

Наше внимание обратил на себя тот факт, что эффекты сверхэкспрессии и делеции HAL3 и PPZ1 проявляются не только в штамме [/SP*], но и в штамме [isp~]. Из этого следовало, что белковый комплекс Hal3/Ppzlp участвует не только в контроле проявления прионного детерминанта [/5!Р+], но и в контроле эффективности нонсенс-супрессии.

В настоящее время участие фосфатаз в генетическом контроле трансляции практически не изучено. В связи с этим целью работы явилось изучение связи между функцией фосфатазы Ppzlp и процессом трансляции, на модели нонсенс-супрессии у дрожжей Saccharomyces cerevisiae.

В рамках этой цели были сформулированы следующие задачи- работы:

1) Изучение влияния фосфатазы Ppzlp на проявление нонсенс-супрессорных мутаций в генах SUP35 и SUP45;

2) Изучение влияния фосфатазы Ppzlp и ее регуляторной субъединицы

На13р на проявление фактора [Р&Г];

3) Выяснение роли фосфатазы Ppz2p в генетическом контроле считывания стоп-кодонов;

4) Поиск белков-мишеней фосфатазы Ppzlp, опосредующих влияние этой фосфатазы на эффективность нонсенс-супрессии.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Иванов, Максим Сергеевич

ВЫВОДЫ

1) Эффективность нонсенс-супрессии, обусловленной мутациями в генах SUP35 и SUP45, а также дрожжевым прионом [PS!/*], зависит от активности фосфатазы Ppzlp;

2) Сверхпродукция каталитически активной формы Ppzlp обладает антисупрессорным эффектом, а сверхпродукция мутантного белка, лишенного фосфатазной активности, проявляет аллосупрессорный эффект;

3) Показано, что родственная Ppzlp фосфатаза Ppz2p также вовлечена в детерминацию эффективности нонсенс-супрессии; при этом ее активность регулируется общей с Ppzlp регуляторной субъединицей На13р;

4) Модификация фенотипического проявления фактора [Р57+] в зависимости от активности Ppzlp не связана с влиянием этой фосфатазы на прионное превращение белка Sup35p;

5) Уровень фосфорилированности фактора элонгации трансляции EFlBa влияет на фенотипическое проявление фактора [PST*], хотя и в незначительной степени, но не влияет на проявление эффектов сверхпродукции нормальной и мутантной формы фосфатазы Ppzlp;

6) Эффективность нонсенс-супрессии в штамме [PS74"] не зависит от уровня фосфорилированности фактора терминации eRFl;

7) Влияние фосфатазы Ppzlp на эффективность нонсенс-супрессии не связано с активностью компонентов системы нонсенс-зависимой деградации мРНК;

8) Делеция гена SLA1 характеризуется аллосупрессорным эффектом по отношению к фактору [Р£7+], но не влияет на проявление эффектов сверхпродукции нормальной и каталитически неактивной форм Ppzlp;

9) Аллосупрессорный эффект каталитически неактивной формы Ppzlp по отношению к фактору [Р£Г] может быть объяснен ее взаимодействием с шаперонами Ssblp и Ssb2p.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Итак, мы проанализировали эффекты сверхэкспрессии гена PPZ1 и мутантной аллели ppzl-R451L на фоне ряда мутаций sup35 и sup45, а также фактора [PSF]. Полученные данные свидетельствуют о том, что сверхэкспрессия PPZ1 приводит к антисупрессии, а сверхэкспрессия ppzl-R451L - к аллосупрессии по отношению к некоторым мутантным аллелям sup45 и sup45, а также к фактору [Р£Г]. Было показано, что в проявлении эффектов сверхпродукции Ppzlp важную роль играет уровень нонсенс-супрессии в штамме, обусловленный мутациями в генах, кодирующих факторы терминации трансляции. В используемой нами системе оценки эффективности нонсенс-супрессии эффекты сверхэкспрессии PPZ1 и ppzl-R451L могут быть зафиксированы только на фоне умеренного нонсенс-супрессорного фенотипа штамма. Кроме того, было показано, что аллелеспецифичность эффектов PPZ1 и ppzl-R451L в отношении мутаций sup45 не может быть объяснена только зависимостью от уровня нонсенс-супрессии в штамме.

Дальнейшее изучение роль белкового комплекса Hal3/Ppzlp в контроле эффективности нонсенс-супрессии позволили показать, что На13р является негативной регуляторной субъединицей не только фосфатазы Ppzlp, но и гомологичной ей фосфатазы Ppz2p. Также было впервые показано, что фосфатаза Ppz2p может оказывать влияние на уровень нонсенс-супрессии, хотя роль Ppz2p в регуляции супрессии менее значима, чем роль Ppzlp.

Далее мы проверили предположения о возможном участии ряда фосфобелков, взаимодействующих с аппаратом трансляции, в проявлении эффектов сверхпродукции Ppzlp. Было показано, что дефосфорилирование фактора элонгации трансляции EFlBa лишь частично опосредует антисупрессорный эффект сверхэкспрессии PPZ1. Таким образом, Ppzlp дефосфорилирует также и какой-то другой белок, участвующий в контроле эффективности нонсенс-супрессии. Было показано, что фосфобелки Sup45p, Upflp, Upf2, Slalp, Ssblp и Ssb2p не являются мишенями фосфатазной активности Ppzlp, опосредующими влияние сверхпродукции Ppzlp на уровень нонсенс-супрессии. Тем не менее, белки Ssblp и Ssb2p все же принимают участие в проявлении эффектов сверхпродукции Ppzlp, поскольку делеция SSB1 и SSB2 блокирует аллосупрессорный эффект сверхэкспрессии ppzl-R451L. На основании этих данных было высказано предположение о том, что фосфатаза Ppzlp может оказывать влияние на функционирование аппарата трансляции не только за счет дефосфорилирования EFlBa и какого-то другого, в настоящее время неизвестного фосфобелка, но также и за счет взаимодействия in vivo с шаперонами Ssblp и Ssb2p, причем это взаимодействие на связано с фосфатазной активностью Ppzlp.

Безусловно, изучение роли фосфатазы Ppzlp в контроле эффективности нонсенс-супрессии требует дальнейших исследований. Наиболее важной задачей является поиск белка-мишени Ppzlp, опосредующего EFlBa-независимую составляющую антисупрессорного эффекта сверхэкспрессии PPZ1. Не исключено, что этот в настоящее время неизвестный фосфобелок также принимает участие в проявлении описанного ранее антисупрессорного эффекта сверхэкспрессии гена PPQ1, кодирующего фосфатазу Ppqlp, гомологичную Ppzlp.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Иванов, Максим Сергеевич, 2009 год

1. Андрианова В.М., Миронова Л.Н., Инге-Вечтомов С.Г. Температурочувствительность дрожжей, обусловленная полудоминантной супрессорной мутацией // Вестник ЛГУ. 1973. Т. 2. С. 130-135.

2. Борхсениус А.С., Инге-Вечтомов С.Г. О роли генов SUP35 и SUP45 в контроле клеточного цикла дрожжей-сахаромицетов // Доклады РАН. 1997. Т. 353. С. 553-556.

3. Захаров И.А., Кожин С.А., Кожина Т.Н., Федорова И.В. Сборник методик по генетике дрожжей-сахаромицетов // Л.: Наука. 1984. 143 с.

4. Инге Вечтомов С.Г. Принцип поливариантности матричных процессов //Исследования по генетике. 1976. Т. 7. С. 3-54.

5. Инге-Вечтомов С.Г. Реверсии к прототрофности у дрожжей, нуждающихся в аденине // Вестник ЛГУ. 1964. Т. 9. С. 112-117.

6. Инге-Вечтомов С.Г. Точность реализации генетической информации // Вестник АН СССР. 1969. Т. 8. С. 25-30.

7. Инге-Вечтомов С.Г., Андрианова В.М. Рецессивные супер-супрессоры у дрожжей//Генетика. 1970. Т. 6. С. 103-115.

8. Инге-Вечтомов С.Г., Кожин С. А., Симаров Б.В., Сойдла Т.Р. Неоднозначность действия гена // Исследования по генетике. 1971. Т. 4. С. 13-35.

9. Миронова Л.Н., Тер-Аванесян М.Д. Циклогексимидзависимые мутанты у дрожжей Saccharomyces cerevisiae II Генетика. 1983. Т. 19. С. 1925-1933.

10. Тер-Аванесян М.Д., Инге-Вечтомов С.Г. Генетический контроль синтеза белка // Изд-во Ленингр. ун-та. 1988. 295 с.

11. Шабельская С.В. Молекулярно-генетическая характеристика супрессорных мутантов по гену SUP35 дрожжей Saccharomyces cerevisiae 11 Автореферат канд. дисс., Санкт-Петербург, 2005.

12. Aksenova A., Munoz I., Volkov К., Arino J., Mironova L. The Hal3-Ppzl dependent regulation of nonsense suppression efficiency in yeast and its influence on manifestation of the yeast prion-like determinant ISP+. // Genes Cells. 2007. V. 12. P. 435-445.

13. Alberti S., Halfmann R., King O., Kapila A., Lindquist S. A systematic survey identifies prions and illuminates sequence features of prionogenicproteins // Cell. 2009. V. 137. P. 146-158.

14. Alkalaeva E.Z., Pisarev A.V., Frolova L.Y., Kisselev L.L. and Pestova T.V. In vitro reconstitution of eukaryotic translation reveals cooperativity between release factors eRFl and eRF3 // Cell. 2006. V. 125. P. 1125-1136.

15. Amrani N., Ganesan R., Kervestin S., Mangus D.A., Ghosh S., Jacobson A. A faux З'-UTR promotes aberrant termination and triggers nonsense-mediated mRNA decay // Nature. 2004. V. 432. P. 112-118.

16. Andersen G.R., Nyborg J. Structural studies of eukaryotic elongation factors // Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 2001. V. 66. P. 425-437.

17. Andersen G.R., Nissen P., Nyborg J. Elongation factors in protein biosynthesis //Trends Biochem. Sci. 2003. V. 28. P. 434-441.

18. Arino J. Novel protein phosphatases in yeast // Eur. J. Biochem. 2002. V. 269. P. 1072-1077.

19. Baker K.E., Parker R. Nonsense-mediated mRNA decay: terminating erroneous gene expression // Curr. Opin. Cell Biol. 2004. V. 16. P. 293299.

20. Barford D. Molecular mechanisms of the protein serine/threonine phosphatases // Trends Biochem. Sci. 1996. V. 21. P. 407-412.

21. Beier H., Grimm M. Misreading of termination codons in eukaryotes by natural nonsense suppressor tRNAs // Nucleic Acids Res. 2001. V. 29. P.4767-4782.

22. Bertram G., Bell H.A., Ritchie D.W., Fullerton G., Stansfield I. Terminating eukaryote translation: domain 1 of release factor eRFl functions in stop codon recognition // RNA. 2000. V. 6. P. 1236-1247.

23. Bertram G., Innes S., Minella O., Richardson J., Stansfield I. Endless possibilities: translation termination and stop codon recognition // Microbiology. 2001. V. 147. P. 255-269.

24. Bonetti В., Fu L., Moon J., Bedwell D.M. The efficiency of translation termination is determined by a synergistic interplay between upstream and downstream sequences in Saccharomyces cerevisiae II J. Mol. Biol. 1995. V. 251. P. 334-345.

25. Borchsenius A.S., Tchourikova A.A., Inge-Vechtomov S.G. Recessive mutations in SUP35 and SUP45 genes coding for translation release factors affect chromosome stability in Saccharomyces cerevisiae II Curr. Genet. 2000. V. 37. P. 285-291.

26. Bou G., Remacha M., Ballesta J.P. Ribosomal stalk protein phosphorylating activities in Saccharomyces cerevisiae II Arch. Biochem. Biophys. 2000. V. 375. P. 83-89.

27. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding //Anal. Biochem. 1976. V. 72. P. 248-254.

28. Breining P., Piepersberg W. Yeast omnipotent supressor supl {sup45)\ nucleotide sequence of the wildtype and a mutant gene // Nucleic Acids Res. 1986. V. 14. P. 5187-5197.

29. Carr-Schmid A., Valente L., Loik V.I., Williams Т., Starita L.M., Kinzy T.G. Mutations in elongation factor lbeta, a guanine nucleotide exchange factor, enhance translational fidelity //Mol. Cell. Biol. 1999. V. 19. P. 5257-5266.

30. Chabelskaya S., Gryzina V., Moskalenko S., Le Goff C., Zhouravleva G. Inactivation of NMD increases viability of sup45 nonsense mutants in

31. Saccharomyces cerevisiae II BMC Mol. Biol. 2007. V. 8. P. 71.

32. Chabelskaya S., Kiktev D., Inge-Vechtomov S., Philippe M., Zhouravleva G. Nonsense mutations in the essential gene SUP35 of Saccharomyces cerevisiae are non-lethal // Mol. Genet. Genomics. 2004. V. 272. P. 297307.

33. Chacinska A., Szczesniak В., Kochneva-Pervukhova N.V., Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D., Boguta M. Ssbl chaperone is a PSI+. prion-curing factor I I Curr. Genet. 2001. V. 39. P. 62-67.

34. Chernoff'Y.O., Derkach I.L., Inge-Vechtomov S.G. Multicopy SUP35 gene induces de novo appearance of PSI-like factors in the yeast Saccharomyces cerevisiae II Curr. Genet. 1993. V. 24. P. 268-270.

35. Chernoff Y.O., Lindquist S.L., Ono В., Inge-Vechtomov S.G., Liebman S.W. Role of the chaperone protein Hspl04 in propagation of the yeast prion-like factor PSI+. II Science. 1995. V. 268. P. 880-884.

36. Chernoff Y.O., Newnam G.P., Kumar J., Allen K., Zink A.D. Evidence for a protein mutator in yeast: role of the Hsp70-related chaperone Ssb in formation, stability, and toxicity of the Р&Г. prion // Mol. Cell. Biol. 1999. V. 19. P. 8103-8112.

37. Clotet J., Posas F., de Nadal E., Arino J. The NH2-terminal extension of protein phosphatase Ppzl has an essential functional role // J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 26349-26355.

38. Cohen P. The structure and regulation of protein phosphatases // Annu. Rev. Biochem. 1989. V. 58. P. 453-508. •

39. Condeelis J. Elongation factor 1 alpha, translation and the cytoskeleton // Trends Biochem. Sci. 1995. V. 20. P. 169-170.

40. Coustou V., Deleu C., Saupe S., Begueret J. The protein product of the Het-s heterokaryon incompatibility gene of the fungus Podospora anserina behaves as a prion analog // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997. V. 94. P. 9773-9778.

41. Cox B. Psi, a cytoplasmic suppressor of super-suppressor in yeast // Heredity. 1965. V. 20. P. 505-521.

42. Cox B. Allosuppressors in yeast // Genet. Res. 1977. V. 30. P. 187-202.

43. Cox B.S. A recessive lethal super-suppressor mutation in yeast and other psi phenomena // Heredity. 1971. V. 26. P. 211-232.

44. Cox B.S., Tuite M.F., McLaughlin C.S. The .PSI+. factor of yeast: a problem in inheritance //Yeast. 1988. V. 4. P. 159-178.

45. Cui Y., Hagan K.W., Zhang S., Peltz S.W. Identification and characterization of genes that are required for the accelerated degradation of mRNAs containing a premature translational termination codon // Genes Dev. 1995. V. 9. P. 423-436.

46. Cyert M.S., Thorner J. Putting it on and taking it off: phosphoprotein phosphatase involvement in cell cycle regulation // Cell. 1989. V. 57. P. 891-893.

47. Czaplinski K., Majlesi N., Banerjee Т., Peltz S.W. Mttl is a Upf 1-like helicase that interacts with the translation termination factors and whose overexpression can modulate termination efficiency // RNA. 2000. V. 6. P. 730-743.

48. Derkatch I.L., Bradley M.E., Hong J.Y., Liebman S.W. Prions affect the appearance of other prions: the story of РЖ+. // Cell. 2001. V. 106. P. 171182.

49. Derkatch I.L., Bradley M.E., Masse S.V., Zadorsky S.P., Polozkov G.V., Inge-Vechtomov S.G., Liebman S.W. Dependence and independence of PSI+. and [i№]: a two-prion system in yeast? // EMBO J. 2000. V. 19. P. 1942-1952.

50. Derkatch I.L., Bradley M.E., Zhou P., Chernoff Y.O., Liebman S.W. Genetic and environmental factors affecting the de novo appearance of the P57+. prion in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1997. V. 147. P. 507-519.

51. Derkatch I.L., Chernoff Y.O., Kushnirov V.V., Inge-Vechtomov S.G., Liebman S.W. Genesis and variability of /\S7+. prion factors in Saccharomyces cerevisiae И Genetics. 1996. V. 144. P. 1375-1386.

52. Di Como С .J., Bose R., Arndt K.T. Overexpression of SIS2, which contains an extremely acidic region, increases the expression of SWI4, CLN1 and CLN2 in SIT4 mutants // Genetics. 1995. V. 139. P. 95-107.

53. Doel S.M., McCready S.J., Nierras C.R., Cox B.S. The dominant PNM2 mutation which eliminates the PST. factor of Saccharomyces cerevisiae is the result of a missense mutation in the SUP35 gene // Genetics. 1994. V. 137. P. 659-670.

54. Dong H., Kurland C.G. Ribosome mutants with altered accuracy translatewith reduced processivity // J. Mol. Biol. 1995. V. 248. P. 551-561.

55. Du Z., Park K., Yu H., Fan Q., Li L. Newly identified prion linked to the chromatin-remodeling factor Swil in Saccharomyces cerevisiae II Nat. Genet. 2008. V. 40. P. 460-465.

56. Edelman I., Culbertson M.R. Exceptional codon recognition by the glutamine tRNAs in Saccharomyces cerevisiae II EMBO J. 1991. V. 10. P. 1481-1491.

57. Eggertsson G., Soil D. Transfer ribonucleic acid-mediated suppression of termination codons in Escherichia coli II Microbiol. Rev. 1988. V. 52. P. 354-374.

58. Eurwilaichitr L., Graves F.M., Stansfield I., Tuite M.F. The C-terminus of eRFl defines a functionally important domain for translation termination in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Microbiol. 1999. V. 32. P. 485-496.

59. Ferrando A., Kron S.J., Rios G., Fink G.R., Serrano R. Regulation of cation transport in Saccharomyces cerevisiae by the salt tolerance gene HAL3 II Mol. Cell. Biol. 1995. V. 15. P. 5470-5481.

60. Ferreira P.C., Ness F., Edwards S.R., Cox B.S., Tuite M.F. The elimination of the yeast P57+. prion by guanidine hydrochloride is the result of Hspl04 inactivation // Mol. Microbiol. 2001. V. 40. P. 1357-1369.

61. Firoozan M., Grant C.M., Duarte J.A., Tuite M.F. Quantitation ofreadthrough of termination codons in yeast using a novel gene fusion assay//Yeast. 1991. V. 7. P. 173-183.

62. Frolova L., Le Goff X., Zhouravleva G., Davydova E., Philippe M., Kisselev L. Eukaryotic polypeptide chain release factor eRF3 is an eRfl-and ribosome-dependent guanosine triphosphatase // RNA. 1996. V. 2. P. 334-341.

63. Gautschi M., Mun A., Ross S., Rospert S. A functional chaperone triad on the yeast ribosome // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002. V. 99. P. 42094214.

64. Gietz D., St Jean A., Woods R.A., Schiestl R.H. Improved method for high efficiency transformation of intact yeast cells // Nucleic Acids Res. 1992. V. 20. P. 1425.

65. Gietz R.D., Sugino A. New yeast -Escherichia coli shuttle vectors constructed with in vitro mutagenized yeast genes lacking six-base pair restriction sites // Gene. 1988. V. 74. P. 527-534.

66. Glover J.R., Kowal A.S., Schirmer E.C., Patino M.M., Liu J.J., Lindquist S. Self-seeded fibers formed by Sup35, the protein determinant of PST., a heritable prion-like factor of S. cerevisiae // Cell. 1997. V. 89. P. 811-819.

67. Goldstein A.L., McCusker J.H. Three new dominant drug resistance cassettes for gene disruption in Saccharomyces cerevisiae I I Yeast. 1999. V.15. P. 1541-1553.

68. Gonzalez C.I., Bhattacharya A., Wang W., Peltz S.W. Nonsense-mediated mRNA decay in Saccharomyces cerevisiae II Gene. 2001. V. 274. P. 15-25.

69. Grewal S.I.S., Jia S. Heterochromatin revisited // Nat. Rev. Genet. 2007. V. 8. P. 35-46.

70. Griffith J.S. Self-replication and scrapie // Nature. 1967. V. 215. P. 10431044.

71. Harger J.W., Dinman J.D. Evidence against a direct role for the Upf proteins in frameshifting or nonsense codon readthrough // RNA. 2004. V. 10. P. 1721-1729.

72. Harrison P.M., Gerstein M. A method to assess compositional bias in biological sequences and its application to prion-like glutamine/asparagine-rich domains in eukaryotic proteomes // Genome Biol. 2003. V. 4. P. R40.

73. Hatfield D.L., Smith D.W., Lee B.J., Worland P.J., Oroszlan S. Structure and function of suppressor tRNAs in higher eukaryotes // Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 1990. V. 25. P. 71-96.

74. Hatin I., Fabret C., Namy O., Decatur W.A., Rousset J. Fine-tuning of translation termination efficiency in Saccharomyces cerevisiae involves two factors in close proximity to the exit tunnel of the ribosome // Genetics. 2007. V. 177. P. 1527-1537.

75. Hershey J.W. Protein phosphorylation controls translation rates // J. Biol. Chem. 1989. V. 264. P. 20823-20826.

76. Hershey J.W., Asano K., Naranda Т., Vornlocher H.P., Hanachi P., Merrick W.C. Conservation and diversity in the structure of translation initiation factor eIF3 from humans and yeast // Biochimie. 1996. V. 78. P. 903-907.

77. Hiraga K., Suzuki K., Tsuchiya E., Miyakawa T. Cloning and characterization of the elongation factor EF-Г beta homologue of Saccharomyces cerevisiae. EF-1 beta is essential for growth // FEBS Lett. 1993. V. 316. P. 165-169.

78. Hirokawa G., Demeshkina N., Iwakura N., Kaji H., Kaji A. The ribosome-recycling step: consensus or controversy? // Trends Biochem. Sci. 2006. V. 31. P. 143-149.

79. Hosoda N., Kobayashi Т., Uchida N., Funakoshi Y., Kikuchi Y., Hoshino S., Katada T. Translation termination factor eRF3 mediates mRNA decay through the regulation of deadenylation // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. P. 38287-38291.

80. Hughes V., Miiller A., Stark M.J., Cohen P.T. Both isoforms of protein phosphatase Z are essential for the maintenance of cell size and integrity in Saccharomyces cerevisiae in response to osmotic stress // Eur. J. Biochem. 1993. V. 216. P. 269-279.

81. Inge-Vechtomov S., Zhouravleva G., Philippe M. Eukaryotic release factors (eRFs) history // Biol. Cell. 2003. V. 95. P. 195-209.

82. Ingebritsen T.S., Cohen P. Protein phosphatases: properties and role in cellular regulation // Science. 1983. V. 221. P. 331-338.

83. Inoue H., Nojima H., Okayama H. High efficiency transformation of Escherichia coli with plasmids // Gene. 1990. V. 96. P. 23-28.

84. Ito K., Ebihara K., Uno M., Nakamura Y. Conserved motifs in prokaryoticand eukaryotic polypeptide release factors: tRNA-protein mimicry hypothesis // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996. V. 93. P. 5443-5448.

85. Ito К., Uno M., Nakamura Y. Single amino acid substitution in prokaryote polypeptide release factor 2 permits it to terminate translation at all three stop codons // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998. V. 95. P. 8165-8169.

86. Janssen G.M., Moller W. Kinetic studies on the role of elongation factors 1 beta and 1 gamma in protein synthesis // J. Biol. Chem. 1988. V. 263. P. 1773-1778. •

87. Jung G., Masison D.C. Guanidine hydrochloride inhibits Hspl04 activity in vivo\ a possible explanation for its effect in curing yeast prions // Curr. Microbiol. 2001. V. 43. P. 7-10.

88. Kahvejian A., Roy G, Sonenberg N. The mRNA closed-loop model: the function of PABP and PABP-interacting proteins in mRNA translation // Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 2001. V. 66. P. 293-300.

89. Kaiser C., Michaelis S., Mitchell A. Methods in yeast genetics // N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1994. V. . P. 234 p.

90. Kandl K.A., Munshi R., Ortiz P.A., Andersen G.R., Kinzy T.G., Adams A.E.M: Identification of a role for actin in translational fidelity in yeast // Mol. Genet Genomics. 2002. V. 268. P. 10-18.

91. Kawakami K., Nakamura Y. Autogenous suppression of an opal mutation in the gene encoding peptide chain release factor 2 // Proc. Natl. Acad. Sci.

92. U.S.A. 1990. V. 87. P. 8432-8436.

93. Kikuchi Y., Shimatake H., Kikuchi A. A yeast gene required for the Gl-to-S transition encodes a protein containing an A-kinase target site and GTPase domain//EMBO J. 1988. V. 7. P. 1175-1182.

94. King C.Y., Tittmann P., Gross H., Gebert R., Aebi M., Wtithrich K. Prion-inducing domain 2-114 of yeast Sup35 protein transforms in vitro into amyloid-like filaments // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997. V. 94. P. 6618-6622.

95. Kinzy T.G., Ripmaster T.L., Woolford J.L.J. Multiple genes encode the translation elongation factor EF-1 gamma in Saccharomyces cerevisiae И Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. P. 2703-2707.

96. Kobayashi Т., Funakoshi Y., Hoshino S., Katada T. The GTP-binding release factor eRF3 as a key mediator coupling translation termination to mRNA decay // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. P. 45693-45700.

97. Kodama H., Ito K., Nakamura Y. The role of N-terminal domain of translational release factor eRF3 for the control of functionality and stability in S. cerevisiae И Genes Cells. 2007. V. 12. P. 639-650.

98. Kryndushkin D.S., Alexandrov I.M., Ter-Avanesyan M.D., Kushnirov V.V. Yeast P57+. prion aggregates are formed by small Sup35 polymers fragmented by Hspl04 // J. Biol. Chem. 2003. V. 278. P. 49636-49643.

99. Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D. Structure and replication of yeast prions // Cell. 1998. V. 94. P. 13-16.

100. Kushnirov V.V., Alexandrov I.M., Mitkevich O.V., Shkundina I.S., Ter-Avanesyan M.D. Purification and analysis of prion and amyloid aggregates //Methods. 2006. V. 39. P. 50-55.

101. Kushnirov V.V., Kryndushkin D.S., Boguta M., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. Chaperones that cure yeast artificial J\S7+. and their prion-specific effects // Curr. Biol. 2000. V. 10. P. 1443-1446.

102. Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D., Telckov M.V., Surguchov A.P., Smirnov V.N., Inge-Vechtomov S.G. Nucleotide sequence of the SUP2 (SUP35) gene of Saccharomyces cerevisiae И Gene. 1988. V. 66. P. 45-54.

103. Le Goff X., Philippe M., Jean-Jean O. Overexpression of human release factor 1 alone has an antisuppressor effect in human cells // Mol. Cell. Biol. 1997. V. 17. P. 3164-3172.

104. Lee B.S., Culbertson M.R. Identification of an additional gene required for eukaryotic nonsense mRNA turnover // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995. V. 92. P. 10354-10358.

105. Lee K.S., Hines L.K., Levin D.E. A pair of functionally redundant yeast genes {PPZ1 and PPZ2) encoding type 1-related protein phosphatases function within the Plccl-mediated pathway // Mol. Cell. Biol. 1993. V. 13. P. 5843-5853.

106. Leeds P., Peltz S.W., Jacobson A., Culbertson M.R. The product of theyeast UPF1 gene is required for rapid turnover of mRNAs containing a tpremature translational termination codon // Genes Dev. 1991. V. 5. P. 2303-2314.

107. Liebman S.W., Sherman R Extrachromosomal PSF. determinant suppresses nonsense mutations in yeast // J. Bacteriol. 1979. V. 139. P. 1068-1071.

108. Liu R., Liebman S.W. A translational fidelity mutation in the universally conserved sarcin/ricin domain of 25S yeast ribosomal RNA // RNA. 1996. V. 2. P. 254-263.

109. Maderazo A.B., He R, Mangus D.A., Jacobson A. Upflp control of nonsense mRNA translation is regulated by Nmd2p and Upf3p // Mol. Cell. Biol. 2000. V. 20. P. 4591-4603.

110. Mangus D.A., Evans M.C., Jacobson A. PolyA-binding proteins: multifunctional scaffolds for the post-transcriptional control of gene expression // Genome Biol. 2003. V. 4. P. 223.

111. Marintchev A., Wagner G. Translation initiation: structures, mechanisms and evolution // Q. Rev. Biophys. 2004. V. 37. P. 197-284.

112. Merkulova T.I., Frolova L.Y., Lazar M., Camonis J., Kisselev L.L. C-terminal domains of human translation termination factors eRFl and eRF3 mediate their in vivo interaction // FEBS Lett. 1999. V. 443. P. 41-47.

113. Mermoud J.E., Cohen P., Lamond' A.I. Ser/Thr-specific protein phosphatases are required for both catalytic steps of pre-mRNA splicing // Nucleic Acids Res. 1992. V. 20. P. 5263-5269.

114. Michelitsch M.D., Weissman J.S. A census of glutamine/asparagine-rich regions: implications for their conserved function and the prediction of novel prions // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000. V. 97. P. 11910-11915.

115. Morris K.V. Role of RNA in the regulation of gene expression // Nutr. Rev. 2008. V. 66 Suppl 1. P. S31-2.

116. Moskalenko S.E., Chabelskaya S.V., Inge-Vechtomov S.G., Philippe M., Zhouravleva G.A. Viable nonsense mutants for the essential gene SUP45 of Saccharomyces cerevisiae II BMC Mol. Biol. 2003. V. 4. P. 2.

117. Muramatsu Т., Heckmann K., Kitanaka C., Kuchino Y. Molecular mechanism of stop codon recognition by eRFl: a wobble hypothesis for peptide anticodons // FEBS Lett. 2001. V. 488. P. 105-109.

118. Nakamura Y., Ito K., Ehrenberg M. Mimicry grasps reality in translation termination // Cell. 2000. V. 101. P. 349-352.

119. Namy O., Duchateau-Nguyen G., Rousset J. Translational readthrough of the PDE2 stop codon modulates camp levels in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Microbiol. 2002. V. 43. P. 641-652.

120. Naqvi A.R., Islam M.N., Choudhury N.R., Haq Q.M.R. The fascinating world of RNA interference //Int. J. Biol. Sci. 2009. V. 5. P. 97-117.

121. Nemecek J., Nakayashiki Т., Wickner R.B. A prion of yeast metacaspase homolog (Mcalp) detected by a genetic screen // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2009. V. 106. P. 1892-1896.

122. Nilsson J., Nissen P. Elongation factors on the ribosome // Curr. Opin. Struct. Biol. 2005. V. 15. P. 349-354.

123. Panopoulos P., Dresios J., Synetos D. Biochemical evidence of translational infidelity and decreased peptidyltransferase activity by a sarcin/ricin domain mutation of yeast 25S rRNA // Nucleic Acids Res. 2004. V. 32. P. 5398-5408.

124. Pape Т., Wintermeyer W., Rodnina M. Induced fit in initial selection and proofreading of aminoacyl-tRNA on the ribosome // EMBO J. 1999. V. 18. P. 3800-3807.

125. Patel В., Gavin-Smyth J., Liebman S. The yeast global transcriptional co-repressor protein Cyc8 can propagate as a prion // Nat. Cell Biol. 2009. V. 11. P. 344-349.

126. Patino M.M., Liu J.J., Glover J.R., Lindquist S. Support for the prion hypothesis for inheritance of a phenotypic trait in yeast // Science. 1996. V. 273. P. 622-626.

127. Paushkin S.V., Kushnirov V.V., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. In vitro propagation of the prion-like state of yeast Sup35 protein // Science. 1997. V. 277. P. 381-383.

128. Paushkin S.V., Kushnirov V.V., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. Interaction between yeast Sup45p (eRFl) and Sup35p (eRF3) polypeptide chain release factors: implications for prion-dependent regulation // Mol. Cell. Biol. 1997. V. 17. P. 2798-2805.

129. Paushkin S.V., Kushnirov V.V., Smirnov V.N., Ter-Avanesyan M.D. Propagation of the yeast prion-like PSP. determinant is mediated by oligomerization of the S'f/PiJ-encoded polypeptide chain release factor // EMBO J. 1996. V. 15. P. 3127-3134.

130. Peltz S.W., Brown A.H., Jacobson A. mRNA destabilization triggered by premature translational termination depends on at least three cis-acting sequence elements and one trans-acting factor // Genes Dev. 1993. V. 7. P. 1737-1754.

131. Pont-Kingdon G. Creation of chimeric junctions, deletions, and insertions by PCR//Methods Mol. Biol. 2003. V. 226. P. 511-516.

132. Posas F., Camps M., Arino J. The Ppz protein phosphatases are important determinants of salt tolerance in yeast cells // J. Biol. Chem. 1995. V. 270. P. 13036-13041.

133. Posas F., Casamayor A., Arino J. The Ppz protein phosphatases are involved in the maintenance of osmotic stability of yeast cells // FEBS Lett. 1993. V. 318. P. 282-286.

134. Posas F., Casamayor A., Morral N., Arino J. Molecular cloning and analysis of a yeast protein phosphatase with an unusual amino-terminal region // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 11734-11740.

135. Prusiner S.B. Prions // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998. V. 95. P. 1336313383.

136. Prusiner S.B. Inherited prion diseases // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994. V. 91. P. 4611-4614.

137. Prusiner S.B., Scott M.R. Genetics of prions //Annu. Rev. Genet. 1997. V. 31. P. 139-175.

138. Rajkowitsch L., Vilela C., Berthelot K., Ramirez C.V., McCarthy J.E.G. Reinitiation and recycling are distinct processes occurring downstream of translation termination in yeast // J. Mol. Biol. 2004. V. 335. P. 71-85.

139. Rakwalska M., Rospert S. The ribosome-bound chaperones RAC and

140. Ssbl/2p are required for accurate translation in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol. 2004. V. 24. P. 9186-9197.

141. Rodriguez-Gabriel M.A., Remacha M., Ballesta J.P. Phosphorylation of ribosomal protein pO is not essential for ribosome function but can affect translation//Biochemistry. 1998. V. 37. P. 16620-16626.

142. Rogoza Т., Goginashvili A., Viktorovskaya O., Volkov K., Mironova L. The SFP1 gene is a likely candidate to a role of structural gene encoding the prion-like determinant 7XP+. // XII International Congress on Yeasts, Kyiv, Ukraine. 2008. V. . P. 148.

143. Rospert S., Rakwalska M., Dubaquie Y. Polypeptide chain termination and stop codon readthrough on eukaryotic ribosomes // Rev. Physiol. Biochem. Pharmacol. 2005. V. 155. P. 1-30.

144. Salas-Marco J., Bedwell D.M. GTP hydrolysis by eRF3 facilitates stop codon decoding during eukaryotic translation termination // Mol. Cell. Biol. 2004. V. 24. P. 7769-7778.

145. Salas-Marco J., Fan-Minogue H., Kallmeyer A.K., Klobutcher L.A., Farabaugh P. J., Bedwell D.M. Distinct paths to stop codon reassignment by the variant-code organisms Tetrahymena and Euplotes II Mol. Cell. Biol. 2006. V. 26. P. 438-447.

146. Sambrook J., Fritsch E.F., Maniatis T. Molecular cloning: a laboratory manual //New York: Cold Spring Harbour Laboratory Press. 1989. V. . P. 723 p.

147. Samsonova M.G., Inge-Vechtomov S.G., Taylor P. Structure comparison and evolutionary relations between elongation factors EF-Tu (EF-1 alpha) and Sup2 proteins II Genetica. 1991. V. 85. P. 35-44.

148. Sandbaken M.G., Culbertson M.R. Mutations in elongation factor EF-1 alpha affect the frequency of frameshifting and amino acid misincorporation in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1988. V. 120. P. 923-934.

149. Santoso A., Chien P., Osherovich L.Z., Weissman J.S. Molecular basis of a yeast prion species barrier // Cell. 2000. V. 100. P. 277-288.

150. Schirmaier F., Philippsen P. Identification of two genes coding for the translation elongation factor EF-1 alpha of S. cerevisiae II EMBO J. 1984. V. 3. P. 3311-3315.

151. Seit-Nebi A., Frolova L., Kisselev L. Conversion of omnipotent translation termination factor eRFl into ciliate-like UGA-only unipotent eRFl // EMBO Rep. 2002. V. 3. P. 881-886.

152. Sha K. A mechanistic view of genomic imprinting // Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008. V. 9. P. 197-216.

153. Sherman F., Fink G.R., Hincks J.B. Methods in yeast genetics // N.Y.: Cold Spring Harbor Lab. Press. 1986. V. . P. 367 p.

154. Shkundina I.S., Kushnirov V.V., Tuite M.F., Ter-Avanesyan M.D. The role of the N-terminal oligopeptide repeats of the yeast Sup35 prion protein in propagation and transmission of prion variants // Genetics. 2006. V. 172. P. 827-835.

155. Sikorslci R.S., Hieter P. A system of shuttle vectors and yeast host strains designed for efficient manipulation of DNA in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1989. V. 122. P. 19-27.

156. Singh A., Helms C., Sherman F. Mutation of the non-mendelian suppressor, Psi, in yeast by hypertonic media // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1979. V. 76. P. 1952-1956.

157. Smith M.W., Meskauskas A., Wang P., Sergiev P.V., Dinman J.D. Saturation mutagenesis of 5S rRNA in Saccharomyces cerevisiae II Mol. Cell. Biol. 2001. V. 21. P. 8264-8275.

158. Sondheimer N., Lindquist S. Rnql: an epigenetic modifier of protein function in yeast // Mol. Cell. 2000. V. 5. P. 163-172.

159. Song J.M., Liebman S.W. Allosuppressors that enhance the efficiency of omnipotent suppressors in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 1987. V. 115. P. 451-460.

160. Tarassov K., Messier V., Landry C.R., Radinovic S., Serna Molina M.M., Shames I., Malitskaya Y., Vogel J., Bussey H., Michnick S.W. An in vivo map of the yeast protein interactome // Science. 2008. V. 320. P. 14651470.

161. Ter-Avanesyan M.D., Zimmermann J., Inge-Vechtomov S.G., Sudarikov A.B., Smirnov V.N., Surguchov A.P. Ribosomal recessive suppressors cause a respiratory deficiency in yeast Saccharomyces cerevisiae II Mol. Gen. Genet. 1982. V. 185. P. 319-323.

162. Tuite M.F., Mundy C.R., Cox B.S. Agents that cause a high frequency of genetic change from PSP. to [psf] in Saccharomyces cerevisiae II

163. Genetics. 1981. V. 98. P. 691-711.

164. Valente L,, Kinzy T.G. Yeast as a sensor of factors affecting the accuracy of protein synthesis // Cell. Mol. Life Sci. 2003. V. 60. P. 2115-2130.

165. Valouev I.A., Kushnirov V.V., Ter-Avanesyan M.D. Yeast polypeptide chain release factors eRFl and eRF3 are involved in cytoskeleton organization and cell cycle regulation // Cell Motil. Cytoskeleton. 2002. V. 52. P. 161173.

166. Velichutina I.V., Dresios J., Hong J.Y., Li C., Mankin A., Synetos D., Liebman S.W. Mutations in helix 27 of the yeast Saccharomyces cerevisiae 18S rRNA affect the function of the decoding center of the ribosome 11 RNA. 2000. V. 6. P. 1174-1184.

167. Velichutina I.V., Hong J.Y., Mesecar A.D., Chernoff Y.O., Liebman S.W. Genetic interaction between yeast Saccharomyces cerevisiae release factors and the decoding region of 18S rRNA// J. Mol. Biol. 2001. V. 305. P. 715727.

168. Venturi G.M., Bloecher A., Williams-Hart Т., Tatchell K. Genetic interactions between GLC7, PPZ1 and PPZ2 in Saccharomyces cerevisiae II Genetics. 2000. V. 155. P. 69-83.

169. Vincent A., Newnam G., Liebman S.W The yeast translationalallosuppressor, SAL6: a new member of the PPl-like phosphatase family with a long serine-rich N-terminal extension // Genetics. 1994. V. 138. P. 597-608.

170. Volkov K., Osipov K., Valouev I., Inge-Vechtomov S., Mironova L. N-terminal extension of Saccharomyces cerevisiae translation termination factor eRF3 influences the suppression efficiency of sup35 mutations // FEMS Yeast Res. 2007. V. 7. P. 357-365.

171. Wach A., Brachat A., Pohlmann R., Philippsen P. New heterologous modules for classical or PCR-based gene disruptions in Saccharomyces cerevisiae //Yeast. 1994. V. 10. P. 1793-1808.

172. Wang W., Cajigas I.J., Peltz S.W., Wilkinson M.F., Gonzalez C.I. Role for Upf2p phosphorylation in Saccharomyces cerevisiae nonsense-mediated mRNA decay //Mol. Cell. Biol. 2006. V. 26. P. 3390-3400.

173. Wang W, Czaplinski K., Rao Y., Peltz S.W. The role of Upf proteins in modulating the translation read-through of nonsense-containing transcripts //EMBO J. 2001. V. 20. P. 880-890.

174. Weiss R.B. Molecular model of ribosome frameshifting // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1984. V. 81. P. 5797-5801.

175. Wells S.E., Hillner P.E., Vale R.D., Sachs A.B. Circularization of mRNA by eukaryotic translation initiation factors // Mol. Cell. 1998. V. 2. P. 135-140.

176. Weng Y., Czaplinski K., Peltz S.W. Identification and characterization of mutations in the Upfl gene that affect nonsense suppression and the formation of the Upf protein complex but not mRNA turnover // Mol. Cell. Biol. 1996. V. 16. P. 5491-5506.

177. Wickner R.B. Prions of yeast and heat-shock protein 104: 'coprion' and cure // Trends Microbiol. 1995. V. 3. P. 367-369.

178. Wickner R.B. UKE3. as an altered Ure2 protein: evidence for a prion analog in Saccharomyces cerevisiae II Science. 1994. V. 264. P. 566-569.

179. Wickner R.B., Edskes H.K., Maddelein M.L., Taylor K.L., Moriyama H. Prions of yeast and fungi. Proteins as genetic material // J. Biol. Chem. 1999. V. 274. P. 555-558.

180. Wickner R.B., Masison D.C., Edskes H.K. PSI+. and [URE3] as yeast prions //Yeast. 1995. V. 11. P. 1671-1685.

181. Wilson P.G., Culbertson M.R. SUF12 suppressor protein of yeast. A fusion protein related to the EF-1 family of elongation factors // J. Mol. Biol. 1988. V. 199. P. 559-573.

182. Zeng G., Yu X., Cai M. Regulation of yeast actin cytoskeleton-regulatory complex Panlp/Slalp/End3p by serine/threonine kinase Prklp // Mol. Biol. Cell. 2001. V. 12. P. 3759-3772.

183. Zerfass K., Beier H. The leaky UGA termination codon of tobacco rattle virus RNA is suppressed by tobacco chloroplast and cytoplasmic tRNAsTrp with CMCA anticodon//EMBO J. 1992. V. 11. P. 4167-4173.

184. Zuk D., Belk J.P., Jacobson A. Temperature-sensitive mutations in the Saccharomyces cerevisiae MRT4, GRC5, SLA2 and THS1 genes result in defects in mRNA turnover // Genetics. 1999. V. 153. P. 35-47.

185. Мироновой и Анне Юрьевне Аксеновой за научное руководство и полезные советы. Также автор благодарит Элину Александровну Радченко за помощь в проведении экспериментов, а также весь коллектив лаборатории физиологической генетики за понимание и поддержку.