Микробиологический и электронно-микроскопический анализ деструктивных воздействий на бактериальные биопленки условно патогенных микроорганизмов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Капустина Валентина Викторовна

• Капустина Валентина Викторовна
• кандидат наук
• 2026

Оглавление диссертации кандидат наук Капустина Валентина Викторовна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Бактериальные биоплёнки как особая форма существования микроорганизмов

1.2. Формирование бактериальных биоплёнок условно патогенными микроорганизмами

1.3. Барьерная функция эпителия кишечника и бактериальная транслокация

1.4 Роль пробиотических бактерий в поддержании нормобиоценоза урогенитального тракта

1.5. Образование биоплёнок при инфекциях урогенитального тракта

1.6. Транслокация микроорганизмов из кишечника как одно из направлений развития инфекции мочевыводящих путей

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Объекты исследования

2.2 Микробиологические методы

2.2.1 Культуральные среды и условия роста микроорганизмов

2.2.2 Спектр антимикробной активности и минимальной подавляющей концентрации молочной кислоты. Метод лунок

2.2.3 Определение количества клеток микроорганизмов. Метод Коха

2.2.4 Моделирование условий роста пробиотических лактобактерий при различных значениях рН

2.3 Бактериологические методы исследования клинико-лабораторного материала

2.3.1 Выделение чистых культур микроорганизмов из клинического материала

2.3.2 Идентификация чистых культур микроорганизмов

2.3.3 Определение чувствительности клинических изолятов стафилококков к метициллину на хромогенной среде

2.3.4 Выявление генов hly в клетках клинических изолтов E. coli методом ПЦР в режиме реального времени (Real-Time ПЦР)

2.4 Влияние препаратов Канефрон и Фурамаг на сформированные биопленки условно патогенных микроорганизмов в модельных условиях

2.4.1 Объекты исследования

2.4.2 Определение минимальной подавляющей концентрации (МПК) препаратов, метод серийных разведений

2.4.3 Исследование воздействия препаратов Канефрон и Фурамаг на сформированные биопленки Е. coli М17 и S. aureus 193 в модельных условиях

2.5 Исследование барьерных функций и морфофункциональных характеристик эпителия тощей кишки крыс

2.6 Электронно-микроскопический анализ

2.6.1 Сканирующая электронная микроскопия (СЭМ)

2.6.2 Трансмиссионная электронная микроскопия (ТЭМ)

2.7 Статистические методы

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Развитие бактериальных биопленок на мочевых катетерах детей с сочетанными врожденными пороками развития сердца и почек

3.1.1 Видовое разнообразие культур микроорганизмов из клинико-лабораторного материала

3.1.2 Частота встречаемости генов вирулентности hly в клетках Е. coli, изолированных с поверхности мочевых катетеров

3.1.3 Морфометрический анализ динамики биопленкообразования на катетерах Фолея

3.1.4 Электронно-микроскопический анализ поверхности мочевых катетров у детей с ВПСП после оперативного вмешательства

3.2 Подавление развития бактериальных биопленок условно патогенных бактерий на мочевых катетерах

3.2.1 Определение МПК препаратов Канефрон и Фурамаг при воздействии на суспензионные культуры Е. coli М17 и S. aureus

3.2.2 Определение МПК препаратов Канферон и Фурамаг при воздействии на клетки в сформированных биопленках Е. coli М17 и S. aureus

3.2.3 Воздействие Канефрона и Фурамага на биопленки, сформированные на внутренней поверхности катетеров

3.2.4 Влияние противомикробных препаратов на процесс формирования биопленок на поверхности катетеров

3.2.5 Электронно-микроскопическое исследование влияния канефрона и фурамага на развитие биопленок E. coli М17 и S. aureus 193 на внутренней поверхности катетеров. СЭМ

3.2.6 Электронно-микроскопическое исследование влияния канефрона и фурамага на развитие микробных сообществ E. coli M17 и S. aureus 193 на поверхности катетеров. ТЭМ

3.2.7 Электронно-микроскопическое исследование влияния фурамага на развитие микробных сообществ E. coli М17 на поверхности катетеров, ТЭМ

3.2.8 Ультраструктурные изменения в микробных сообществах УПБ при воздействии Канефрона и Фурамага. ТЭМ

3.3 Влияние пробиотических лактобактерий и молочной кислоты на рост условно патогенных микроорганизмов

3.3.1 Спектр антимикробной активности и МПК молочной кислоты

3.3.2 Влияние молочной кислоты и метаболитов пробиотических лактобактерий на рост условно патогенных микроорганизмов

3.3.3 Рост пробиотических лактобактерий при различных значениях рН в присутствии молочной кислоты

3.3.4 Ультраструктурные изменения пробиотических лактобактерий и УПМ в присутствии молочной кислоты. ТЭМ

3.4 Барьерная роль эпителия при бактериальной транслокации в экспериментальной модели на выведенных сегментах тощей кишки крысы

3.4.1 Ультраструктура и плотные контакты энтероцитов слизистой оболочки тощей кишки крысы. Контроль

3.4.2 Морфофизиологические изменения в клетках энтероцитов при воздействии суспензионной культуры пробиотических лактобактерий L. plantarum 8PA3

3.4.3 Морфофизиологические изменения в клетках эпителиоцитов при воздействии суспензионной культуры пробиотических кишечных палочек E. coli М17

3.4.4 Морфофизиологические изменения в клетках эпителиоцитов при воздействии ЛПС

3.4.5 Морфофизиологические изменения в клетках эпителиоцитов при воздействии ЛПС в комплексе с пробиотическими бактериями

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиологический и электронно-микроскопический анализ деструктивных воздействий на бактериальные биопленки условно патогенных микроорганизмов»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Исследование посвящено одному из новых научных направлений в области медицинской микробиологии - микробной экологии организма человека, практическое выражение которого заключается в исследовании деструктивных воздействий на однородные и смешанные сообщества микроорганизмов -бактериальные биопленки, развивающиеся на слизистых оболочках различных органов и тканей человека.

Согласно современным представлениям абсолютное большинство инфекционных заболеваний связано с образованием биопленок [144]. В биоплёнках клетки находятся в прикрепленном к субстрату состоянии и заключены в матрикс внеклеточных полимерных субстанций, которые продуцируются самими бактериями [203]. Внутри таких сообществ бактериальные клетки гетерогенны по морфофизиологическим свойствам и состоят в особых взаимоотношениях, подчиняясь регуляторной системе Quorum Sensing (QS) [121,182]. Бактериальные биопленки обеспечивают повышенную выживаемость микроорганизмов, по сравнению с их планктонными (суспензионными) формами. Образование биопленок - важная стратегия защиты микроорганизмов от различных неблагоприятных факторов. Особая организация и структура биопленок способствует повышенной устойчивости клеток возбудителей заболеваний к действию антимикробных агентов и факторов иммунной защиты организма хозяина [51,188]. Сложная архитектоника бактериальных биоплёнок создает условия, которые способствуют симбиотической коммуникации между бактериями разных видов.

Борьба с формированием и развитием бактериальных биопленок является одним из важнейших направлений практически во всех областях медицины, что связано с применением инородных инвазивных материалов (катетеры, импланты, искусственные суставы и клапаны, и т.д.) для лечения и диагностики заболеваний [42, 62, 138]. Однако несмотря на все попытки предотвращения

биоплёнкообразования на имплантируемом оборудовании, проблема остается нерешенной [63, 79, 93,188].

На поверхности слизистых оболочек различных биотопов организма-хозяина может происходить смещение равновесия в составе микробиоценоза и формирование бактериальных биоплёнок, основную часть которых составляют условно патогенные микроорганизмы (УПМ). Интенсивное биоплёнкообразование УПМ приводит к развитию и усилению дисбиотического процесса, и, как следствие, изменению морфофункциональных характеристик биотопа, что может способствовать транслокации бактериальных клеток [54, 61, 191, 205]. Несмотря на успехи в понимании многих процессов, в настоящее время отсутствует полное системное научное представление о ключевых механизмах, происходящих при транслокации микроорганизмов из желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) в другие биотопы организма, в том числе в мочевыводящую систему. В силу повышенного внимания к проблеме транслокации, в медицине возникло новое направление исследований для предотвращения распространения микроорганизмов.

Нарастающую в мире тенденцию увеличения доли заболеваний, имеющих склонность к хроническому рецидивирующему течению, также связывают с транслокацией и образованием бактериальных биопленок, роль которых в развитии воспалительных процессов нельзя недооценивать. Бактериальные биопленки, формирующиеся как на поверхности слизистых оболочек, так и внутри различных тканей и органов в виде разнообразных форм бактериальных сообществ, способствуют не только сохранению популяции возбудителя в организме хозяина, но и повышают устойчивость возбудителя к действию антимикробных препаратов [172]. Особую значимость эти исследования приобретают в связи с тем, что в составе биопленки микробные клетки обладают устойчивостью к антимикробным препаратам в 100-1000 раз выше, чем в виде планктонных форм [114].

Нельзя также обойти вниманием проблему поддержания микробного равновесия микробиоты желудочно кишечного тракта (ЖКТ) в период развития инфекционных и соматических заболеваний, при проведении медицинских манипуляций и при снижении иммунного статуса организма в целом.

Таким образом, в связи с существованием нерешенных задач и недостаточности понимания процессов, лежащих в основе транслокации микроорганизмов и функционирования микробных биопленок, важным представляется разработка методов, направленных на коррекцию дисбиотических состояний с целью формирования возможных методических приемов и способов управления процессом траслокации. При этом серьезной проблемой, препятствующей решению указанной задачи, является недостаточность информации, объясняющей феномен транслокации в приложении к биологическим системам.

Новые знания и исследования в области межвидовых взаимоотношений, взаимного влияния условно патогенных микроорганизмов и их метаболитов друг на друга в составе биопленок, воздействии пробиотических бактерий на уже сформированные биопленки в организме человека имеют важное практическое значение и являются одной из наиболее актуальных проблем современной науки.

Цель исследования. Цель настоящей работы - выявление структурно-функциональных особенностей бактериальных биопленок условно патогенных микроорганизмов в остаточном материале клинико-лабораторных исследований и в модельных условиях для оценки возможности применения пробиотических бактерий и их метаболитов для разрушения микробных сообществ и предотвращения бактериальной транслокации.

Задачи исследования В соответствии с поставленной целью проводили анализ развития бактериальных биопленок на различных субстратах, в ходе которого необходимо было решить следующие задачи:

1. Провести микробиологический и электронно-микроскопический анализ остаточного материала клинико-лабораторных исследований, в том числе извлеченных по клиническим показаниям фрагментов катетеров Фолея от пациентов с врожденными пороками развития сердца и почек (ВПРСП)

после хирургического вмешательства для выявления особенностей формирования бактериальных биопленок.

2. Проанализировать влияние микробиоты мочевыводящих путей и желудочно-кишечного тракта на развитие процесса формирования бактериальных биопленок на мочевых катетерах.

3. Выявить возможность подавления формирования биопленок на поверхности мочевых катетеров при воздействии препаратов канефрон и фурамаг.

4. Оценить антагонистический потенциал воздействия пробиотических лактобактерий и молочной кислоты на рост условно патогенных микроорганизмов.

5. Провести анализ морфофункциональных свойств эпителия тощей кишки крыс при введении в просвет кишки пробиотических бактерий для выявления признаков бактериальной транслокации на электронно-микроскопическом уровне.

Научная новизна работы

Впервые на основе комплексного микробиологического и электронно-микроскопического анализа проведено исследование особенностей формирования бактериальных биопленок на мочевых катетерах в остаточном клинико-лабораторном материале от пациентов с ВПРСП после хирургического вмешательства.

Впервые у пациентов с ВПРСП после хирургического вмешательства проанализированы и проиллюстрированы на электронно-микроскопическом уровне этапы формирования микробных сообществ на мочевых катетерах.

При этом разработанная методология анализа количественных и качественных характеристик клеток разных видов условно патогенных микроорганизмов в структуре бактериальных биопленок на поверхности мочевых

катетеров проведена с учетом влияния микробиоты мочевыводящих путей и желудочно-кишечного тракта на процесс формирования бактериальных биопленок на мочевых катетерах.

Впервые проанализирована и выявлена возможность подавления формирования бактериальных биопленок условно патогенных микроорганизмов на поверхности мочевых катетеров при воздействии препаратов Фурамаг и Канефрон с учетом концентрации препаратов и длительности их влияния.

Получены новые данные об ультраструктурных изменениях в клетках Е. coli, ингибируемых препаратами Фурамаг и Канефрон, свидетельствующие об определенной специфичности их воздействия. На электронно-микроскопическом уровне продемострировано, что применение препарата Фурамаг приводило к воздействию на процесс деления клеток кишечных палочек, что в конечном итоге, вызывало подавление развития бактериальных биопленок данных условно патогенных бактерий. Электронно-микроскопическими методами впервые показано, что на фоне применения препарата Канефрон в клетках E. coli возникали деструктивные изменения, затрагивающие ультраструктуру клеточных стенок, цитоплазматической мембраны и цитоплазмы, что приводило к ингибирующему эффекту воздействия данного препарата на развитие бактериальных биопленок.

Впервые получены новые данные о морфофизиологических особенностях условно патогенных микроорганизмов при проявлении по отношению к ним антагонистического потенциала молочной кислоты, продуцируемой пробиотическими лактобактериями. На микробиологическом и электронно-микроскопическом уровнях показано ингибирующее влияние молочной кислоты на рост условно патогенных микроорганизмов и их способность к биопленкообразованию.

Впервые на электронно-микроскопическом уровне применен модифицированный подход для анализа морфофункциональных свойств эпителия тощей кишки крыс при введении в ее просвет пробиотических лактобактерий для выявления и анализа признаков бактериальной транслокации.

Теоретическая и практическая значимость работы

Проведенный анализ фрагментов мочевых катетеров, установленных у детей после оперативного вмешательства, показал наличие бактериальных биопленок УПМ, невыявляемых стандартными методами исследования. На основании полученных данных разработана стратегия эффективного воздействия на биоплёнки условно патогенных бактерий для защиты от развития осложнений при проведении медицинских манипуляций с применением мочевых катетеров. Проанализировано влияние пробиотических бактерий на кишечный барьер в системе in vivo на выведенных фрагментах тощей кишки лабораторных животных. Разработана экспериментальная модель для исследования возможности коррекции роста пробиотических лактобактерий под влиянием молочной кислоты при изменении значений pH.

Основные научные результаты

Одной из наиболее частых медицинских манипуляций является катетеризация мочевого пузыря. Поверхность уретральных катетеров является оптимальной средой для адгезии микробных клеток и образования многослойных биопленок. После адгезии единичных бактерий на стенках катетера уже через 1 час можно наблюдать начальные стадии развития биопленок. Спустя сутки после установки катетера в мочевых путях пациента он представляет собой серьёзную угрозу для развития бактериурии [19].

Катетеры из нейтрального латекса-каучука, покрытые силиконовой смазкой, способствуют адгезии микроорганизмов с последующим развитием бактериальных биопленок, что может стать причиной развития бактериурии или инфекционного поражения мочевыводящей системы при длительном использовании катетера [17].

Оперативное лечение детей с ВПРСП сопровождается различной продолжительностью сроков катетеризации мочевого пузыря. Вероятность развития бактериальных биопленок на стенках мочевого катетера, напрямую зависит от длительности катетеризации. Исследования клинико-лабораторного материала, полученного от пациентов с ВПРСП после хирургического

вмешательства, показали, что наибольшее количество микроорганизмов обнаружено в испражнениях, при этом моча оказалась наименее обсемененным материалом. Бактерии, выявленные на стенках мочевых катетеров детей, представляют особый интерес, поскольку среди этой группы микроорганизмов установлены представители с наиболее высоким патогенным потенциалом. Мониторинг качественного и количественного состава микробиоты необходим на всех этапах проведения хирургических манипуляций, включая предоперационную подготовку с целью предотвращения развития бактериальных осложнений [18].

Клетки изолятов кишечной палочки, обладающие геном биопленкообразования, выделены с катетеров, находившихся в организме детей более 2-х суток. Таким образом, для предотвращения осложнений в послеоперационный период лечения у детей с ВПРСП, необходимо учитывать не только резистентность выделенных культур к антимикробным препаратам (АМП), но и наличие биопленкообразующих штаммов E. coli [20].

Показано, что на поверхности стенок катетеров преобладали смешанные бактериальные культуры, такие как S. aureus, Streptococcus sp., E. coli, Klebsiella oxytoca. Электронно-микроскопическими методами впервые выявлены актиномицетоподобные бактерии на поверхности катетеров в послеоперационный период, чью этиологическую значимость и участие в развитии инфекционных осложнений мочевыводящих путей у детей с ВПРСП еще предстоит выяснить [22].

С целью предупреждения развития бактериальных биопленок УПМ на мочевых катетерах Фолея проанализировано бактерицидное воздействие официнального препарата растительного происхождения Канефрон и препарата нитрофуранового ряда Фурамаг. В сравнении с классическими способами антисептики, их действие позволяет не только подавлять процесс биопленкообразования бактериальных культур Е. coli М17 и S. aureus 193, но и эффективно разрушать уже сформированные биопленки. Местное применение Канефрона и Фурамага лишено недостатков системного применения антибактериальных препаратов. Оно может способствовать предотвращению

развития катетер-ассоциированных инфекций и приводить к ускорению процесса выздоровления пациентов с заболеваниями мочевыводящих путей [34].

Впервые описана экспериментальная модель для проведения фундаментального исследования влияния молочной кислоты (МК) на рост и развитие пробиотических лактобактерий in vitro с учетом рН среды. Показано подавляющее влияние МК и пробиотических бактерий на рост УПМ и возможность применения МК в качестве фактора, регулирующего естественный состав микробиоты влагалища [37].

В исследованиях, направленных на изучение протективных свойств пробиотических бактерий в защите от бактериальной транслокации, показано, что при одновременном введении в просвет тонкой кишки крыс липополисахарида (ЛПС) с E.coli М17 и ЛПС с L.plantarum 8RA-3 происходила нейтрализация воздействия эндотоксина, однако механизмы, включенные в эти процессы, в каждом случае значительно отличались [33, 39, 89].

Отсутствие расширения межклеточного пространства, а также деструктивных изменений в клетках энтероцитов и в области плотных контактов при введении в просвет тонкой кишки крыс пробиотических бактерий L. plantarum 8РА-3 и E. coli М17 позволили предположить, что исследуемые культуры обладают стабилизирующим влиянием на проницаемость кишечного барьера. Показан высокий антагонистический потенциал этих культур в отношении роста и биопленкообразования УПМ. Данная экспериментальная модель может стать основой для дальнейшего исследования значения пробиотических культур при нарушении проницаемости кишечного барьера и бактериальной транслокации УПМ [21].

Положения, выносимые на защиту

1. Проведенное одновременно микробиологическое и электронно-микроскопическое исследование позволило выявить особенности структуры микробиоты на поверхности фрагментов мочевых катетеров

детей с ВПРСП после хирургического вмешательства, не определяемые ранее стандартными лабораторными методами. Видовой состав бактериальных биопленок на поверхности мочевых катетеров, а также наличие поверхностных структур (факторов патогенности) бактериальных клеток позволило предположить возможность бактериальной транслокации из мочевыводящих путей (МВП) и ЖКТ с возможным риском развития инфекции мочевыводящего тракта (ИМТ) и других хирургических осложнений.

2. Установлена способность препарата Фурамаг и препарата растительного происхождения Канефрон не только подавлять бактериальные биопленки условно патогенных бактерий (УПБ) на поверхности мочевых катетеров на разных этапах их развития, но и разрушать уже сформированные биопленки. Использование данных препаратов для деструкции биопленок УПБ на катетерах Фолея имеет ряд преимуществ перед системным применением антибактериальных средств.

3. Микробиологическими и электронно-микроскопическими методами показано ингибирующее воздействие молочной кислоты и пробиотических бактерий на способность биопленкообразования УПМ. Получена экспериментальная модель для исследования морфофизиологических свойств УПМ при воздействии молочной кислоты, продуцируемой пробиотическими лактобактериями при различных значениях pH.

4. Выявлено стабилизирующее воздействие пробиотических бактерий на проницаемость кишечного барьера при введении суспензии бактериальных клеток L. plantarum 8РА-3 и E. coli М17 в просвет тощей кишки крыс. Полученная экспериментальная модель может стать основой для дальнейшего исследования протективного воздействия пробиотических бактерий при бактериальной транслокации.

Апробация результатов

Основные результаты исследований представлены на всероссийских, в том числе с международным участием, научно-практических конференциях. По результатам работы опубликовано 12 тезисов в сборниках материалов научно-практических конференций.

1. Капустина, В. В. Динамика развития бактериальных биопленок на внутренних поверхностях уретральных катетеров / В.В. Капустина // Фундам. наука и клин. мед. - 2015. - Т. XVIII. - C.227-228.

2. Капустина, В. В. Возбудители инфекций мочевыводящих путей у детей с врождёнными пороками развития сердечно-сосудистой системы / В. В. Капустина, Л. Бутиш, А. Ю. Фонтуренко, Г. А. Ершов // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - C.249-250.

3. Капустина, В. В. Молекулярно-генетический анализ генов биопленкообразования уропатогенных кишечных палочек у детей с врожденными пороками развития сердца / В. В. Капустина, А. Ю. Фонтуренко // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - C. 248.

4. Капустина, В. В. Сканирующая электронная микроскопия катетеров из мочевыводящих путей детей с врождёнными пороками развития сердечно-сосудистой системы / В. В. Капустина, А. Ю. Фонтуренко // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - C. 251-252.

5. Капустина, В. В. Бактериальные биопленки в развитии катетер-ассоциированных инфекций / В. В. Капустина // Проблемы медицинской микологии. - 2016. - Т. 18, № 2. - С. 79.

6. Орлова, О. Г. Морфологическая трансформация клеток Candida spp. в присутствии супернатанта Lactobacillusplantarum 8РА-3 / Орлова О.Г., Капустина В.В., Рыбальченко О.В // Успехи медицинской микологии. - 2024. - Т. 26, № 2. - С. 179.

7. Рыбальченко, О. В. Антагонистические взаимоотношения пробиотических лактобактерий и дрожжевых грибов рода Candida / О.

B. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина // Успехи медицинской микологии. - 2023. - Т. 24. - С. 70-74.

8. Орлова, О. Г. Вариабельность лактобактерий в проявлении антагонистических взаимоотношений с условно-патогенными микроорганизмами / О. Г. Орлова, О. В. Рыбальченко, В. В. Капустина, Е. А. Абдуразакова // Проблемы медицинской микологии. - 2021. - Т. 23, № 2. - С. 122.

9. Рыбальченко, О. В. Антагонистическое воздействие Lactobacillus plantarum 8RA-3 и Lactobacillus rhamnosus GG на клетки Escherichia coli M17 и BL21 / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина, И. Л. Потокин // Проблемы медицинской микологии. - 2020. - Т. 22, № 3.

- С. 122.

10. Рыбальченко, О. В. Характер межвидовых взаимоотношений лактобактерий / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина, И. Л. Потокин // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2020. - № 1-2. -

C. 54.

11. Рыбальченко, О. В. Гистологические исследования слизистой оболочки тонкой кишки крысы при воздействии эндотоксина и пробиотических бактерий / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, Е. Д. Королькова [и др.] // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2018. - №2 2. - С. 32-37.

12. Капустина, В. В. Роль бактериальной транслокации пробиотических бактерий в изменении барьерных функций эпителия / В. В. Капустина, О. Г. Орлова, О. В. Рыбальченко // Проблемы медицинской микологии.

- 2025. - Т. 27, № 2. - С. 151.

Работа представлена с устным докладом на 11th PROBIOTICS, PREBIOTICS & NEW FOODS, NUTRACEUTICALS AND BOTANICALS for Nutrition & Human and Microbiota Health, Рим. (Рыбальченко О.В. Variability of Antimicrobial and

Antifungal effect of Lactobacillus plantarum and Lactobacillus acidophilus. / Рыбальченко О.В., Орлова О.Г. Капустина В. В. 2021. C.49)

Устные доклады изложены на Всероссийской конференции по естественным и гуманитарным наукам с международным участием «Наука СПбГУ - 2022» (Капустина В. В. Роль пробиотических бактерий в регуляции проницаемости кишечного барьера. В. В. Капустина, О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова. СПб, 21 ноября 2022 г.), Всероссийской конференции по естественным и гуманитарным наукам с международным участием «Наука СПбГУ - 2023» (Капустина В. В. Микробиологические аспекты развития инфекционного процесса урогенитального тракта. В. В. Капустина, О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова. СПб, 21 ноября 2023 г.) и IX Всероссийском конгрессе по медицинской микробиологии, клинической микологии и иммунологии (XXVIII Кашкинские чтения) (Капустина В. В. Роль бактериальной транслокации пробиотических бактерий в изменении барьерных функций эпителия. В. В. Капустина, О. Г. Орлова, О. В. Рыбальченко. СПб, 06 июня 2025 г.)

Публикации

Основные научные результаты диссертации опубликованы в статьях в рецензируемых научных изданиях:

1. Рыбальченко, О. В. Подавление биопленок условно патогенных бактерий на мочевых катетерах / О. В. Рыбальченко, М. В. Эрман, О. Г. Орлова, Первунина Т.М., Капустина В.В., Парийская Е.Н. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2017. - № 3. - С. 311. - DOI 10.36233/0372-9311-2017-3-3-11.

2. Рыбальченко, О. В. Экспериментальная модель коррекции микробиоты влагалища в условиях воспалительного процесса / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина // Акушерство и гинекология. - 2019. - № 6. -С. 115-125. - DOI 10.18565/aig.2019.6.115-125.

3. Fedorova, A. A. Changes in the Tissue Barrier after Exposure to Lipopolysaccharide on the Apical Side of Enterocytes and the Follicle-Associated Epithelium in Peyer's Patches of the Rat Intestine / A. A. Fedorova, O. V. Rybalchenko, L. S. Okorokova [et al.] // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. - 2024. - Vol. 177, No. 6. - P. 757-762. - DOI 10.1007/s10517-024-06263-0.

4. Федорова, А. А. Изменение тканевого барьера при воздействии липополисахарида с апикальной стороны энтероцитов и фолликул-ассоциированного эпителия Пейеровых бляшек кишки крыс / А. А. Федорова, О. В. Рыбальченко, Л. С. Окорокова [и др.] // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2024. - Т. 177, № 6. - С. 742748. - DOI 10.47056/0365-9615-2024-177-6-742-748.

Личный вклад автора

Автором проведен анализ отечественных и зарубежных источников литературы. Автором определена цель и сформулированы задачи исследования. Проведено планирование и распределен временной интервал на основные этапы работы. Совместно со специалистами автор участвовала в подготовке биоматериала и его лабораторном исследовании. Автором проведен анализ результатов исследования и обобщение материала, выполнена статистическая обработка, сформулированы выводы и основные положения, выносимые на защиту. Доля участия автора в оформлении базы данных - 100%, в сборе и накоплении материала - 80%, в статистической обработке данных - 80%, в обобщении и анализе результатов исследования - 100%.

Структура и объем диссертации

Диссертационная работа изложена на 147 страницах машинописного текста и состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов исследования, заключения, выводов, списка сокращений и списка литературы. Библиографический указатель содержит 224 источника, из них

отечественных - 39, зарубежных - 185. Работа содержит 12 таблиц и иллюстрирована 61 рисунком.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1 Бактериальные биоплёнки как особая форма существования

микроорганизмов

Микроорганизмы, колонизирующие различные биотопы организма человека, формируют особые формы сообществ, которые носят название биоплёнки. Бактериальные биоплёнки - это микробные сообщества, представленные клетками, адсорбированными на субстрате и друг с другом, заключенными в экстрацеллюлярный матрикс полимерных субстанций, которые продуцируют микроорганизмы в соответствии с условиями транскрипции генов [88, 186, 223]. Образование биоплёнок является сложным динамическим процессом, который состоит из нескольких этапов: прикрепления планктонных форм бактерий к поверхностям, необратимой адгезии к субстрату, активного деления клеток, образования защитных структур в виде экзополимерного матрикса и поверхностной пленки [49, 162].

На основании лазерной конфокальной, сканирующей и трансмиссионной электронной микроскопии установлена организация биоплёнок, выявлены ультраструктурные детали ее строения [175, 208].

В отличие от, в основном, хаотичных скоплений планктонных форм клеток, бактерии в биоплёнках образуют структурные формирования, окруженные экзополимерным матриксом [113]. Такая структурная организация позволяет поддерживать концентрацию питательных веществ на определенном уровне, который необходим для роста и развития популяции, а также защищает клетки от неблагоприятного воздействия окружающей среды, в том числе от дегидратации и факторов резистентности макроорганизма [191]. Бактериальные клетки в биоплёнке имеют выраженную гетерогенность, при этом их структура характеризуется определенной цитоархитектоникой [173]. В составе биопленок обнаруживаются физиологически активные клетки и покоящиеся некультивируемые формы, могут появляться разнообразные инволюционные морфологические варианты клеток; например, удлиненные формы у кокковидных

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Капустина Валентина Викторовна, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акимкин, В.Г. Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи (ИСМП) / В.Г. Акимкин, А.В. Тутельян, О.А. Орлова, О.А. Абросимова, Н.В. Сычева, В.С. Овчинникова, Ш.Л. Восканян, Ю.Е. Абрамов // Информационный бюллетень за 2022 г. - М.: - 2023 -57 с.

2. Анохин, В. А. Бактериурия: этиология, механизмы формирования, прогноз. / В. А. Анохин, В. М. Бондаренко, О. К. Поздеев, С. В. Халиуллина. - Казань: Фэн, 2004. - 160 с.

3. Бондаренко В. М. Микробиота матери в формировании микробиоценоза новорожденного: учебно-методическое пособие / В. М. Бондаренко К. Р. Бондаренко, О. В. Рыбальченко [и др.]. — СанктПетербург: СпецЛит, 2018. — 150 с.

4. Бондаренко В. М. Роль условно-патогенных бактерий кишечника в полиорганной патологии человека / В. М. Бондаренко. - Москва; Тверь: Триада, 2007. - 63 с.: ISBN 9785-94789-230-7.

5. Бондаренко, В. М. Бактериальные биопленки условно - патогенных бактерий и их подавление пробиотическими лактобациллами / В. М. Бондаренко, О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова // Лечение и профилактика. - 2014. - № 2 (10). - С. 28-35.

6. Бондаренко, В. М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы. Руководство для врачей / В. М. Бондаренко, Т. В. Мацулевич. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. - 300 с.

7. Бондаренко, В. М. Кишечная микрофлора, ожирение и диабет / В. М. Бондаренко, В. В. Малеев, В. Г. Лиходед // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2014. - № 3. - С. 42-49.

8. Бондаренко, В. М. Механизмы транслокации бактериальной аутофлоры в развитии эндогенной инфекции / В. М. Бондаренко // Бюллетень Оренбургского научного центра УрО РАН. - 2013. - № 3. - C. 1-21.

9. Бондаренко, В. М. Микробный фактор и врожденный иммунитет в патогенезе атеросклероза / В. М. Бондаренко, А. Л. Гинцбург, В. Г. Лиходед. - Тверь: Триада, 2013. -95 с.

10. Бондаренко, В. М. Роль транслокации кишечной бактериальной аутофлоры и ее токсических биомолекул в патологии человека / В. М. Бондаренко, Е. В. Рябиченко // Эксперим. и клин. гастроэнтерол. - 2007. - № 5. - С. 86-93.

11. Бондаренко, В. М. Роль условно-патогенных бактерий при хронических воспалительных процессах различной локализации / В. М. Бондаренко. - М.: Триада, 2011. - 88 с.

12. Бухарин, О.В. Биология и экология энтерококков / О.В. Бухарин, А.В. Валышев // Екатеринбург, 2012. - 227 с.

13. Бухарин, О.В. Симбиоз и его роль в инфекции / О.В. Бухарин, Е.С. Лобакова, Н.Б. Перунова [и др.] // Екатеринбург: УрО РАН, 2011. - 300 с.

14. Бухарин, О.В. Экология микроорганизмов человека / О.В. Бухарин, А.В. Валышев, Ф.Г. Гильмутдинова [и др.] // Екатеринбург: УрО РАН, 2006. - 477 с.

15. Вялкова, А. А. Инфекция мочевой системы у детей - новые решения старой проблемы / А.

A. Вялкова В. А. Гриценко, Л. М. Гордиенко // Нефрология. - 2010. - Т. 14. - № 4. - С. 6376.

16. Гавриленко, Д. И. Транслокация кишечной микрофлоры при циррозе печени: механизм, клиническое значение, маркеры / Д. И. Гавриленко, Н. Н. Силивончик // КМАХ. - 2021. -Т. 23. - №2. - С.147-160.

17. Капустина, В. В. Бактериальные биопленки в развитии катетер-ассоциированных инфекций / В. В. Капустина // Проблемы медицинской микологии. - 2016. - Т. 18, № 2. -С. 79.

18. Капустина, В. В. Возбудители инфекций мочевыводящих путей у детей с врождёнными пороками развития сердечно-сосудистой системы / В. В. Капустина, Л. Бутиш, А. Ю. Фонтуренко, Г. А. Ершов // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - С.249-250.

19. Капустина, В. В. Динамика развития бактериальных биопленок на внутренних поверхностях уретральных катетеров / В.В. Капустина // Фундам. наука и клин. мед. -2015. - Т. XVIII. - С.227-228.

20. Капустина, В. В. Молекулярно-генетический анализ генов биопленкообразования уропатогенных кишечных палочек у детей с врожденными пороками развития сердца / В.

B. Капустина, А. Ю. Фонтуренко // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - С. 248.

21. Капустина, В. В. Роль бактериальной транслокации пробиотических бактерий в изменении барьерных функций эпителия / В. В. Капустина, О. Г. Орлова, О. В. Рыбальченко // Проблемы медицинской микологии. - 2025. - Т. 27, № 2. - С. 151.

22. Капустина, В. В. Сканирующая электронная микроскопия катетеров из мочевыводящих путей детей с врождёнными пороками развития сердечно-сосудистой системы / В. В. Капустина, А. Ю. Фонтуренко // Фундам. наука и клин. мед. - 2016. - Т. XIX. - С. 251-252.

23. Кира, Е. Ф. Биоценоз и функциональная активность эпителия влагалища при местном лечении аэробного вагинита полижинаксом и тержинаном. / Е. Ф. Кира, Артымук Н. В., Гайтукиева А. [и др.] // Журнал акушерства и женских болезней. 2010. 59(5): 127-135.

24. Клинические рекомендации «Бактериологический анализ мочи» // М., 2014. - 33 с.

25. Козлов, Р. С. Бактериологический анализ мочи. / Р.С. Козлов, В. В. Меньшиков, В. С. Михайлова, Б. Ф. Шуляк, Т. И. Долгих, А. Н. Круглов, Е. В. Алиева, В. Е. Маликова. // Клинические рекомендации. М.; 2014. 33 с.

26. Косарева, П.В. Условно-патогенная флора кишечника как источник эндогенного инфицирования при пиелонефрите у детей грудного возраста / П.В. Косарева, В.Ф. Кузнецов, Н.И. Аверьянова // Казанский медицинский журнал. - 2009. - Т. 90. - № 1. - С. 110-111.

27. Орлова, О. Г. Вариабельность лактобактерий в проявлении антагонистических взаимоотношений с условно-патогенными микроорганизмами / О. Г. Орлова, О. В. Рыбальченко, В. В. Капустина, Е. А. Абдуразакова // Проблемы медицинской микологии.

- 2021. - Т. 23, № 2. - С. 122.

28. Орлова, О. Г. Морфологическая трансформация клеток Candida spp. в присутствии супернатанта Lactobacillus plantarum 8РА-3 / Орлова О.Г., Капустина В.В., Рыбальченко О.В // Успехи медицинской микологии. - 2024. - Т. 26, № 2. - С. 179.

29. Попкова, С.М. Микроэкологические сочетания вагинального и кишечного биотопов у женщин с воспалительными заболеваниями нижнего этажа полового тракта и девочек-подростков с дисфункцией яичников. / С.М. Попкова, Е.Б. Ракова, Е.Е. Храмова [и др.] // Бюлл. СО РАМН. 2013. 33(4): 77.

30. Рыбальченко, О. В. Антагонистические взаимоотношения пробиотических лактобактерий и дрожжевых грибов рода Candida / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина // Успехи медицинской микологии. - 2023. - Т. 24. - С. 70-74.

31. Рыбальченко, О. В. Антагонистическое воздействие Lactobacillus plantarum 8RA-3 и Lactobacillus rhamnosus GG на клетки Escherichia coli M17 и BL21 / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина, И. Л. Потокин // Проблемы медицинской микологии. - 2020.

- Т. 22, № 3. - С. 122.

32. Рыбальченко, О. В. Атлас ультраструктуры микробиоты кишечника человека / О. В. Рыбальченко, В. М. Бондаренко, В. П. Добрица. - СПб.: ИИЦ ВМА, 2008. - 102 с.

33. Рыбальченко, О. В. Гистологические исследования слизистой оболочки тонкой кишки крысы при воздействии эндотоксина и пробиотических бактерий / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, Е. Д. Королькова [и др.] // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2018. - № 2. - С. 32-37.

34. Рыбальченко, О. В. Подавление биопленок условно патогенных бактерий на мочевых катетерах / О. В. Рыбальченко, М. В. Эрман, О. Г. Орлова, Первунина Т.М., Капустина В.В., Парийская Е.Н. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2017. - № 3. - С. 3-11. - DOI 10.36233/0372-9311-2017-3-3-11.

35. Рыбальченко, О. В. Характер межвидовых взаимоотношений лактобактерий / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина, И. Л. Потокин // Гастроэнтерология Санкт-Петербурга. - 2020. - № 1-2. - С. 54.

36. Рыбальченко, О. В., Антимикробные пептиды лактобацилл. / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013; (4): 89-100.

37. Рыбальченко, О. В. Экспериментальная модель коррекции микробиоты влагалища в условиях воспалительного процесса / О. В. Рыбальченко, О. Г. Орлова, В. В. Капустина // Акушерство и гинекология. - 2019. - № 6. - С. 115-125. - DOI 10.18565/aig.2019.6.115-125.

38. Симаненков В. И. и др. Синдром повышенной эпителиальной проницаемости в клинической практике. Мультидисциплинарный национальный консенсус //Кардиоваскулярная терапия и профилактика. - 2021. - Т. 20. - №. 1. - С. 121-278.

39. Федорова, А. А. Изменение тканевого барьера при воздействии липополисахарида с апикальной стороны энтероцитов и фолликул-ассоциированного эпителия Пейеровых бляшек кишки крыс / А. А. Федорова, О. В. Рыбальченко, Л. С. Окорокова [и др.] // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. - 2024. - Т. 177, № 6. - С. 742-748. - DOI 10.47056/0365-9615-2024-177-6-742-748.

40. Acheson D. W. K., Luccioli S. Mucosal immune responses //Best Practice & Research Clinical Gastroenterology. - 2004. - Т. 18. - №. 2. - С. 387-404.

41. Ahmed K., Tunaru S., Offermanns S. GPR109A, GPR109B and GPR81, a family of hydroxy-carboxylic acid receptors //Trends in pharmacological sciences. - 2009. - Т. 30. - №. 11. - С. 557-562.

42. Alakomi H. L. et al. Lactic acid permeabilizes gram-negative bacteria by disrupting the outer membrane //Applied and environmental microbiology. - 2000. - Т. 66. - №. 5. - С. 2001-2005.

43. Alav I., Sutton J. M., Rahman K. M. Role of bacterial efflux pumps in biofilm formation // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. - 2018. - Т. 73. - №. 8. - С. 2003-2020.

44. Al-Dasooqi N., Wardill H. R., Gibson R. J. Gastrointestinal mucositis: the role of MMP-tight junction interactions in tissue injury // Pathology & Oncology Research. - 2014. - Т. 20. - С. 485-491.

45. Alizadeh A. et al. Epithelial integrity, junctional complexes, and biomarkers associated with intestinal functions //Tissue barriers. - 2022. - Т. 10. - №. 3. - С. 1996830.

46. Al-Sadi R., Boivin M., Ma T. Mechanism of cytokine modulation of epithelial tight junction barrier //Frontiers in bioscience: a journal and virtual library. - 2009. - Т. 14. - С. 2765.

47. Antonio M. A. D., Hawes S. E., Hillier S. L. The identification of vaginal Lactobacillus species and the demographic and microbiologic characteristics of women colonized by these species //Journal of Infectious Diseases. - 1999. - T. 180. - №. 6. - C. 1950-1956.

48. Anukam K. C. et al. Genome sequence of Lactobacillus pentosus KCA1: vaginal isolate from a healthy premenopausal woman //PloS one. - 2013. - T. 8. - №. 3. - C. e59239.

49. Armbruster C. R., Parsek M. R. New insight into the early stages of biofilm formation //Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2018. - T. 115. - №. 17. - C. 4317-4319.

50. Aroutcheva A. et al. Defense factors of vaginal lactobacilli //American journal of obstetrics and gynecology. - 2001. - T. 185. - №. 2. - C. 375-379.

51. Balducci E. et al. Polysaccharides' structures and functions in biofilm architecture of antimicrobial-resistant (AMR) pathogens //International journal of molecular sciences. - 2023. - T. 24. - №. 4. - C. 4030.

52. Belardi B. et al. A weak link with actin organizes tight junctions to control epithelial permeability //Developmental cell. - 2020. - T. 54. - №. 6. - C. 792-804. e7.

53. Bennett J. E., Dolin R., Blaser M. J. Mandell, Douglas, and Bennett's principles and practice of infectious diseases E-Book: 2-volume set. - Elsevier health sciences, 2019.

54. Berg R. D., Garlington A. W. Translocation of certain indigenous bacteria from the gastrointestinal tract to the mesenteric lymph nodes and other organs in a gnotobiotic mouse model //Infection and immunity. - 1979. - T. 23. - №. 2. - C. 403-411.

55. Berg, R.D. Bacterial translocation from gastrointestinal tract / R.D. Berg // Trends Microbiol. -1995. - Vol. 3, № 4. - P. 149-154.

56. Berg, R.D. Bacterial translocation from the intestines / R.D. Berg // Expt Animals. - 1985. - Vol. 34. - P. 1-16.

57. Bergmann K. R. et al. Bifidobacteria stabilize claudins at tight junctions and prevent intestinal barrier dysfunction in mouse necrotizing enterocolitis //The American journal of pathology. -2013. - T. 182. - №. 5. - C. 1595-1606.

58. Beutel O. et al. Phase separation of zonula occludens proteins drives formation of tight junctions //Cell. - 2019. - T. 179. - №. 4. - C. 923-936.

59. Boris S., Suarez J. E., Barbes C. Characterization of the aggregation promoting factor from Lactobacillus gasseri, avaginal isolate //Journal of applied microbiology. - 1997. - T. 83. - №. 4. - C. 413-420.

60. Boskey E. R. et al. Acid production by vaginal flora in vitro is consistent with the rate and extent of vaginal acidification //Infection and immunity. - 1999. - T. 67. - №. 10. - C. 5170-5175.

61. Camilleri M. The Leaky Gut: Mechanisms, Measurement and Clinical Implications in Humans //Gut. - 2019. - T. 68. - №. 8. - C. 1516.

62. Cangui-Panchi S. P. et al. Biofilm-forming microorganisms causing hospital-acquired infections from intravenous catheter: A systematic review //Current research in microbial sciences. - 2022. - T. 3. - C. 100175.

63. Carter, S. R. Intestinal barrier disruption as a cause of mortality in combined radiation and burn injury / S. R. Carter [et. al.] // Shock. - 2013. - Vol. 40(4). - P. 281-289.

64. Catto C., Cappitelli F. Testing anti-biofilm polymeric surfaces: Where to start? //International Journal of Molecular Sciences. - 2019. - T. 20. - №. 15. - C. 3794.

65. Cauci S. [et al.] Prevalence of bacterial vaginosis and vaginal flora changes in peri-and postmenopausal women //Journal of clinical microbiology. - 2002. - T. 40. - №. 6. - C. 21472152.

66. Cauci S. et al. Among pregnant women with bacterial vaginosis, the hydrolytic enzymes sialidase and prolidase are positively associated with interleukin-1p //American journal of obstetrics and gynecology. - 2008. - T. 198. - №. 1. - C. 132. e1-132. e7.

67. Cesena C. [et al.] Lactobacillus crispatus and its nonaggregating mutant in human colonization trials //Journal of Dairy Science. - 2001. - T. 84. - №. 5. - C. 1001-1010.

68. Chan R. C. [et al.] Competitive exclusion of uropathogens from human uroepithelial cells by Lactobacillus whole cells and cell wall fragments //Infection and immunity. - 1985. - T. 47. -№. 1. - C. 84-89.

69. Charlier C. [et al.] Interactions between Staphylococcus aureus and lactic acid bacteria: an old story with new perspectives //International journal of food microbiology. - 2009. - T. 131. - №. 1. - C. 30-39.

70. Chasov V. [et al.] Gut Microbiota Modulation: A Novel Strategy for Rheumatoid Arthritis Therapy //Biomolecules. - 2024. - T. 14. - №. 12. - C. 1653.

71. Chukamnerd A. et al. Association of biofilm formation, antimicrobial resistance, clinical characteristics, and clinical outcomes among Acinetobacter baumannii isolates from patients with ventilator-associated pneumonia //The Clinical Respiratory Journal. - 2024. - T. 18. - №. 1. - C. e13732.

72. Conti C., Malacrino C., Mastromarino P. Inhibition of herpes simplex virus type 2 by vaginal lactobacilli //J Physiol Pharmacol. - 2009. - T. 60. - №. Suppl 6. - C. 19-26.

73. Coquant G., Grill J. P., Seksik P. Impact of N-acyl-homoserine lactones, quorum sensing molecules, on gut immunity //Frontiers in Immunology. - 2020. - T. 11. - C. 1827.

74. Costerton J. W. Introduction to biofilm //International journal of antimicrobial agents. - 1999. -T. 11. - №. 3-4. - C. 217-239.

75. Costerton J. W., Stewart P. S., Greenberg E. P. Bacterial biofilms: a common cause of persistent infections //science. - 1999. - T. 284. - №. 5418. - C. 1318-1322.

76. Crabtree J. H. et al. The efficacy of silver-ion implanted catheters in reducing peritoneal dialysis-related infections //Peritoneal Dialysis International. - 2003. - T. 23. - №. 4. - C. 368-374.

77. Cribby S., Taylor M., Reid G. Vaginal microbiota and the use of probiotics //Interdisciplinary perspectives on infectious diseases. - 2008. - T. 2008. - №. 1. - C. 256490.

78. Cunningham K. E., Turner J. R. Myosin light chain kinase: pulling the strings of epithelial tight junction function //Annals of the New York Academy of Sciences. - 2012. - T. 1258. - №. 1. -C. 34-42.

79. De Vos W. M. et al. Gut microbiome and health: mechanistic insights //Gut. - 2022. - T. 71. -№. 5. - C. 1020-1032.

80. Devlin H. et al. Enzyme-functionalized mesoporous silica nanoparticles to target Staphylococcus aureus and disperse biofilms //International journal of nanomedicine. - 2021. - C. 1929-1942.

81. Donlan R. M., Costerton J. W. Biofilms: survival mechanisms of clinically relevant microorganisms //Clinical microbiology reviews. - 2002. - T. 15. - №. 2. - C. 167-193.

82. Drutz D. J. Lactobacillus prophylaxis for Candida vaginitis //Annals of internal medicine. - 1992. - T. 116. - №. 5. - C. 419-420.

83. Du Plessis E. M., Dicks L. M. T. Evaluation of random amplified polymorphic DNA (RAPD)-PCR as a method to differentiate Lactobacillus acidophilus, Lactobacillus crispatus, Lactobacillus amylovorus, Lactobacillus gallinarum, Lactobacillus gasseri, and Lactobacillus johnsonii //Current microbiology. - 1995. - T. 31. - C. 114-118.

84. Edwards V. L. [et al.] The cervicovaginal microbiota-host interaction modulates Chlamydia trachomatis infection //MBio. - 2019. - T. 10. - №. 4. - C. 10.1128/mbio. 01548-19.

85. Eschenbach D. A. [et al.] Effects of vaginal intercourse with and without a condom on vaginal flora and vaginal epithelium //The Journal of infectious diseases. - 2001. - T. 183. - №. 6. - C. 913-918.

86. Eschenbach D. A. et al. Influence of the normal menstrual cycle on vaginal tissue, discharge, and microflora //Clinical Infectious Diseases. - 2000. - T. 30. - №. 6. - C. 901-907.

87. Evenepoel P., Poesen R., Meijers B. The gut-kidney axis //Pediatric Nephrology. - 2017. - T. 32. - C. 2005-2014.

88. Fang K., Park O. J., Hong S. H. Controlling biofilms using synthetic biology approaches //Biotechnology advances. - 2020. - T. 40. - C. 107518.

89. Fedorova, A. A. Changes in the Tissue Barrier after Exposure to Lipopolysaccharide on the Apical Side of Enterocytes and the Follicle-Associated Epithelium in Peyer's Patches of the Rat Intestine / A. A. Fedorova, O. V. Rybalchenko, L. S. Okorokova [et al.] // Bulletin of Experimental Biology and Medicine. - 2024. - Vol. 177, No. 6. - P. 757-762. - DOI 10.1007/s 10517-024-06263-0.

90. Flemming H. C. et al. Biofilms: an emergent form of bacterial life //Nature Reviews Microbiology. - 2016. - T. 14. - №. 9. - C. 563-575.

91. Fouts D. E. et al. Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metaproteomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury //Journal of translational medicine. - 2012. - T. 10. - C. 1-17.

92. Foxman B. Urinary tract infection syndromes: occurrence, recurrence, bacteriology, risk factors, and disease burden //Infectious Disease Clinics. - 2014. - T. 28. - №. 1. - C. 1-13.

93. Frank D. N. et al. Culture-independent microbiological analysis of foley urinary catheter biofilms //PloS one. - 2009. - T. 4. - №. 11. - C. e7811.

94. Fulaz S. [et al.] Tailoring nanoparticle-biofilm interactions to increase the efficacy of antimicrobial agents against Staphylococcus aureus //International journal of nanomedicine. -2020. - C. 4779-4791.

95. Fulaz S. et al. Nanoparticle-biofilm interactions: the role of the EPS matrix //Trends in microbiology. - 2019. - T. 27. - №. 11. - C. 915-926.20.

96. Gangwar R. [et al.] Calcium-mediated oxidative stress: a common mechanism in tight junction disruption by different types of cellular stress //Biochemical Journal. - 2017. - T. 474. - №. 5. -C. 731-749.

97. Ghosh S. [et al.] Regulation of intestinal barrier function by microbial metabolites //Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. - 2021. - T. 11. - №. 5. - C. 1463-1482.

98. Graver M. A., Wade J. J. The role of acidification in the inhibition of Neisseria gonorrhoeae by vaginal lactobacilli during anaerobic growth //Annals of Clinical Microbiology and Antimicrobials. - 2011. - T. 10. - C. 1-5.

99. Guyer D. M. [et al.] Sat, the secreted autotransporter toxin of uropathogenic Escherichia coli, is a vacuolating cytotoxin for bladder and kidney epithelial cells //Infection and immunity. - 2002. - T. 70. - №. 8. - C. 4539-4546.

100. Hartmann C. [et al.] Physiological functions of junctional adhesion molecules (JAMs) in tight junctions //Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes. - 2020. - T. 1862. - №. 9. - C. 183299.

101. Hasnaoui A., Trigui R., Giuffrida M. Gut microbiota and mesenteric adipose tissue interactions in shaping phenotypes and treatment strategies for Crohn's disease //World Journal of Gastroenterology. - 2024. - T. 30. - №. 46. - C. 4969.

102. Hilt E. E. [et al.] Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder //Journal of clinical microbiology. - 2014. -T. 52. - №. 3. - C. 871-876.

103. Hoang H. T. et al. A novel finding of intra-genus inhibition of quorum sensing in Vibrio bacteria //Scientific Reports. - 2022. - T. 12. - №. 1. - C. 15203.

104. Holmes P. F. et al. Surface-modified nanoparticles as a new, versatile, and mechanically robust nonadhesive coating: Suppression of protein adsorption and bacterial adhesion //Journal of Biomedical Materials Research Part A: An Official Journal of The Society for Biomaterials, The Japanese Society for Biomaterials, and The Australian Society for Biomaterials and the Korean Society for Biomaterials. - 2009. - T. 91. - №. 3. - C. 824-833.

105. Hooton T. M. et al. Diagnosis, prevention, and treatment of catheter-associated urinary tract infection in adults: 2009 International Clinical Practice Guidelines from the Infectious Diseases Society of America //Clinical infectious diseases. - 2010. - T. 50. - №. 5. - C. 625663.

106. Hooton T. M. Pathogenesis of urinary tract infections: an update //Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2000. - T. 46. - №. suppl_1. - C. 1-7.

107. Horowitz A. [et al.] Paracellular permeability and tight junction regulation in gut health and disease //Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology. - 2023. - T. 20. - №. 7. - C. 417432.

108. Horvath Jr D. J. et al. Morphological plasticity promotes resistance to phagocyte killing of uropathogenic Escherichia coli //Microbes and infection. - 2011. - T. 13. - №. 5. - C. 426437.

109. Jiménez-Guerra G. et al. Urinary tract infection by Acinetobacter baumannii and Pseudomonas aeruginosa: evolution of antimicrobial resistance and therapeutic alternatives //Journal of medical microbiology. - 2018. - T. 67. - №. 6. - C. 790-797.

110. Juárez Tomás M. S. et al. Growth and lactic acid production by vaginal Lactobacillus acidophilus CRL 1259, and inhibition of uropathogenic Escherichia coli //Journal of Medical Microbiology. - 2003. - T. 52. - №. 12. - C. 1117-1124.

111. Justice S. S. et al. Morphological plasticity as a bacterial survival strategy //Nature Reviews Microbiology. - 2008. - T. 6. - №. 2. - C. 162-168.

112. Kaminsky L. W., Al-Sadi R., Ma T. Y. IL-1ß and the intestinal epithelial tight junction barrier //Frontiers in immunology. - 2021. - T. 12. - C. 767456.

113. Karygianni L. [et al.] Biofilm matrixome: extracellular components in structured microbial communities //Trends in microbiology. - 2020. - T. 28. - №. 8. - C. 668-681.

114. Kashket E. R. Bioenergetics of lactic acid bacteria: cytoplasmic pH and osmotolerance //FEMS microbiology reviews. - 1987. - T. 3. - №. 3. - C. 233-244.

115. Khan R. T. et al. Prevention and potential remedies for antibiotic resistance: current research and future prospects //Frontiers in Microbiology. - 2024. - T. 15. - C. 1455759.

116. Kline K. A. et al. Immune activation and suppression by group B streptococcus in a murine model of urinary tract infection //Infection and immunity. - 2011. - T. 79. - №. 9. - C. 3588-3595.

117. Kmet V. et al. Aggregation-promoting factor in pig intestinal Lactobacillus strains //Letters in applied microbiology. - 1995. - T. 21. - №. 6. - C. 351-353.

118. Kolenbrander P. E. Intergeneric coaggregation among human oral bacteria and ecology of dental plaque //Annual Reviews in Microbiology. - 1988. - T. 42. - №. 1. - C. 627-656.

119. Kostakioti M., Hadjifrangiskou M., Hultgren S. J. Bacterial biofilms: development, dispersal, and therapeutic strategies in the dawn of the postantibiotic era //Cold Spring Harbor perspectives in medicine. - 2013. - T. 3. - №. 4. - C. a010306.

120. Kot B. et al. Virulence factors, biofilm-forming ability, and antimicrobial resistance of urinary Escherichia coli strains isolated from hospitalized patients //Turkish journal of medical sciences. - 2016. - T. 46. - №. 6. - C. 1908-1914.

121. Kuchiiwa T. et al. Cellular expression of monocarboxylate transporters in the female reproductive organ of mice: implications for the genital lactate shuttle //Histochemistry and cell biology. - 2011. - T. 135. - C. 351-360.

122. Kumar L. [et al.] Molecular mechanisms and applications of N-acyl homoserine lactone-mediated quorum sensing in bacteria //Molecules. - 2022. - T. 27. - №. 21. - C. 7584.

123. Kuo W. T. [et al.] Tight junction proteins occludin and ZO-1 as regulators of epithelial proliferation and survival //Annals of the New York Academy of Sciences. - 2022. - T. 1514. -№. 1. - C. 21-33..

124. Lamont R. F. et al. The vaginal microbiome: new information about genital tract flora using molecular based techniques //BJOG: An International Journal of Obstetrics & Gynaecology. - 2011. - T. 118. - №. 5. - C. 533-549.

125. Larsen B., Monif G. R. G. Understanding the bacterial flora of the female genital tract //Clinical Infectious Diseases. - 2001. - T. 32. - №. 4. - C. e69-e77.

126. Lewis, D.A. The human urinary microbiome; bacterial DNA in voided urine of asymptomatic adults / D.A. Lewis, R Brown, J. Williams [et al.] // Front Cell Infect Microbiol. - 2013. - № 3. - P. 41.

127. Linares R. [et al.] Bacterial Translocation as Inflammatory Driver in Crohn's //The Role of Microbiota in the Onset and Development of Intestine and Liver Diseases and Cancer: Molecular and Cell Mechanisms. - 2022.]

128. Lopes dos Santos Santiago G. et al. Longitudinal qPCR study of the dynamics of L. crispatus, L. iners, A. vaginae,(sialidase positive) G. vaginalis, and P. bivia in the vagina. - 2012.

129. Lopes dos Santos Santiago G. et al. Longitudinal study of the dynamics of vaginal microflora during two consecutive menstrual cycles //PloS one. - 2011. - T. 6. - №. 11. - C. e28180.

130. Lu L. [et al.] Contemporary strategies and approaches for characterizing composition and enhancing biofilm penetration targeting bacterial extracellular polymeric substances //Journal of Pharmaceutical Analysis. - 2024. - T. 14. - №. 4. - C. 100906.

131. Macklaim J. M. et al. Comparative meta-RNA-seq of the vaginal microbiota and differential expression by Lactobacillus iners in health and dysbiosis //Microbiome. - 2013. - T. 1. - C. 1-11.

132. Madigan, M.T. Brock Biology of Microorganisms (13th Edition) / M.T. Madigan, J.M. Martinko, D. Stahl [et al.] // San Francisco: Pearson education, 2012.

133. Maggi L. et al. Technological and biological evaluation of tablets containing different strains of lactobacilli for vaginal administration //European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics. - 2000. - T. 50. - №. 3. - C. 389-395.

134. Magruder M. et al. Gut commensal microbiota and decreased risk for Enterobacteriaceae bacteriuria and urinary tract infection //Gut microbes. - 2020. - T. 12. - №. 1. - C. 1805281.

135. Maki D. G., Tambyah P. A. Engineering out the risk for infection with urinary catheters //Emerging infectious diseases. - 2001. - T. 7. - №. 2. - C. 342.

136. Malik S. et al. Draft genome sequence of Lactobacillus plantarum CMPG5300, a human vaginal isolate //Genome Announcements. - 2014. - T. 2. - №. 6. - C. 10.1128/genomea. 0114914.

137. Malik S. et al. The highly autoaggregative and adhesive phenotype of the vaginal Lactobacillus plantarum strain CMPG5300 is sortase dependent //Applied and Environmental Microbiology. - 2013. - T. 79. - №. 15. - C. 4576-4585.

138. Maslennikov R. et al. Gut microbiota and bacterial translocation in the pathogenesis of liver fibrosis //International journal of molecular sciences. - 2023. - T. 24. - №. 22. - C. 16502.

139. Masters E. A. et al. Evolving concepts in bone infection: redefining "biofilm","acute vs. chronic osteomyelitis","the immune proteome" and "local antibiotic therapy" //Bone research. -2019. - T. 7. - №. 1. - C. 20.

140. Melzer M., Welch C. Outcomes in UK patients with hospital-acquired bacteraemia and the risk of catheter-associated urinary tract infections //Postgraduate medical journal. - 2013. -T. 89. - №. 1052. - C. 329-334.

141. Miller, M. B., Quorum sensing in bacteria / M. B. Miller, B. L. Bassler // Ann. Rev. Microbiol. - 2001. - Vol. 55. - P. 165-199.

142. Monaco A. et al. The epithelial cell leak pathway //International journal of molecular sciences. - 2021. - T. 22. - №. 14. - C. 7677.

143. Moonwiriyakit A. et al. Tight junctions: from molecules to gastrointestinal diseases //Tissue Barriers. - 2023. - T. 11. - №. 2. - C. 2077620.

144. Morampudi V. [et al.] Tricellular tight junction protein tricellulin is targeted by the enteropathogenic Escherichia coli effector EspG1, leading to epithelial barrier disruption //Infection and immunity. - 2017. - T. 85. - №. 1. - C. 10.1128/iai. 00700-16.

145. Muhammad M. H. [et al.] Beyond risk: bacterial biofilms and their regulating approaches //Frontiers in microbiology. - 2020. - T. 11. - C. 928.

146. Nagamatsu K. et al. Dysregulation of Escherichia coli a-hemolysin expression alters the course of acute and persistent urinary tract infection //Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2015. - T. 112. - №. 8. - C. E871-E880.

147. Nielubowicz G. R., Mobley H. L. T. Host-pathogen interactions in urinary tract infection //Nature Reviews Urology. - 2010. - T. 7. - №. 8. - C. 430-441.

148. Norsworthy, A.N. From catheter to kidney stone: the uropathogenic lifestyle of Proteus mirabilis / A.N. Norsworthy, M M. Pearson // Trends in Microbiology. -2017. - Vol. 25, №4. -P. 304-315.

149. O'Hanlon D. E., Moench T. R., Cone R. A. Vaginal pH and microbicidal lactic acid when lactobacilli dominate the microbiota //PloS one. - 2013. - T. 8. - №. 11. - C. e80074.

150. O'brien V. P. et al. Drug and vaccine development for the treatment and prevention of urinary tract infections //Urinary Tract Infections: Molecular Pathogenesis and Clinical Management. - 2017. - C. 589-646.

151. Oelschlaeger T. A., Dobrindt U., Hacker J. Pathogenicity islands of uropathogenic E. coli and the evolution of virulence //International journal of antimicrobial agents. - 2002. - T. 19. -№. 6. - C. 517-521.

152. Oelschlaeger T. A., Dobrindt U., Hacker J. Virulence factors of uropathogens //Current Opinion in Urology. - 2002. - T. 12. - №. 1. - C. 33-38.

153. O'Hanlon D. E. et al. Cervicovaginal fluid and semen block the microbicidal activity of hydrogen peroxide produced by vaginal lactobacilli //BMC infectious diseases. - 2010. - T. 10. - C. 1-8.

154. O'Hara A. M., Shanahan F. The gut flora as a forgotten organ //EMBO reports. - 2006. -T. 7. - №. 7. - C. 688-693.

155. Ojala T. et al. Comparative genomics of Lactobacillus crispatus suggests novel mechanisms for the competitive exclusion of Gardnerella vaginalis //BMC genomics. - 2014. -T. 15. - C.1-21.

156. Olmsted S. S. et al. Diffusion of macromolecules and virus-like particles in human cervical mucus //Biophysical journal. - 2001. - T. 81. - №. 4. - C. 1930-1937.

157. Olmsted S. S. et al. Glycosidase and proteinase activity of anaerobic gram-negative bacteria isolated from women with bacterial vaginosis //Sexually transmitted diseases. - 2003. -T. 30. - №. 3. - C. 257-261.

158. Ong M. L. D. M. et al. Differential regulation of claudin-2 and claudin-15 expression in children and adults with malabsorptive disease //Laboratory investigation. - 2020. - T. 100. -№. 3. - C. 483-490.

159. Otani T. et al. Claudins and JAM-A coordinately regulate tight junction formation and epithelial polarity //Journal of Cell Biology. - 2019. - T. 218. - №. 10. - C. 3372-3396.

160. Otani T., Furuse M. Tight junction structure and function revisited //Trends in cell biology. - 2020. - T. 30. - №. 10. - C. 805-817.

161. O'Toole G. A. To build a biofilm //Journal of bacteriology. - 2003. - T. 185. - №. 9. - C. 2687-2689.

162. Oztürk F. Y., Darcan C., Karipta§ E. The determination, monitoring, molecular mechanisms and formation of biofilm in E. coli //Brazilian Journal of Microbiology. - 2023. -T. 54. - №. 1. - C. 259-277.

163. Pamer E. G. Immune responses to commensal and environmental microbes //Nature immunology. - 2007. - T. 8. - №. 11. - C. 1173-1178.

164. Paradis T. [et al.] Tight junctions as a key for pathogens invasion in intestinal epithelial cells //International journal of molecular sciences. - 2021. - T. 22. - №. 5. - C. 2506.

165. Peng L. [et al.] Butyrate enhances the intestinal barrier by facilitating tight junction assembly via activation of AMP-activated protein kinase in Caco-2 cell monolayers //The Journal of nutrition. - 2009. - T. 139. - №. 9. - C. 1619-1625.

166. Pérez-Reytor D. [et al.] Accessory toxins of Vibrio pathogens and their role in epithelial disruption during infection //Frontiers in Microbiology. - 2018. - T. 9. - C. 2248.

167. Petrova M. I. [et al.] Lactobacillus iners: friend or foe? //Trends in microbiology. - 2017. - T. 25. - №. 3. - C. 182-191.

168. Petrova M. I. [et al.] Lactobacillus species as biomarkers and agents that can promote various aspects of vaginal health //Frontiers in physiology. - 2015. - T. 6. - C. 81.

169. Pongkorpsakol P. [et al.] An agonist of a zinc-sensing receptor GPR39 enhances tight junction assembly in intestinal epithelial cells via an AMPK-dependent mechanism //European Journal of Pharmacology. - 2019. - T. 842. - C. 306-313.

170. Potruch A., Schwartz A., Ilan Y. The role of bacterial translocation in sepsis: a new target for therapy //Therapeutic Advances in Gastroenterology. - 2022. - T. 15. - C.

171. Radera S., Srivastava S., Agarwal J. Virulence genotyping and multidrug resistance pattern of Escherichia coli isolated from community-acquired and hospital-acquired urinary tract infections //Cureus. - 2022. - T. 14. - №. 9. - C. e29404.

172. Ramirez-Velez I., Belardi B. Storming the gate: New approaches for targeting the dynamic tight junction for improved drug delivery //Advanced drug delivery reviews. - 2023. -T. 199. - C. 114905.

173. Rather M. A., Gupta K., Mandal M. Microbial biofilm: formation, architecture, antibiotic resistance, and control strategies //Brazilian Journal of Microbiology. - 2021. - C. 1-18.

174. Ravel J. et al. Vaginal microbiome of reproductive-age women //Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2011. - T. 108. - №. supplement_1. - C. 4680-4687.

175. Reichhardt C., Parsek M. R. Confocal laser scanning microscopy for analysis of Pseudomonas aeruginosa biofilm architecture and matrix localization //Frontiers in microbiology. - 2019. - T. 10. - C. 677.

176. Resta-Lenert S., Barrett K. E. Live probiotics protect intestinal epithelial cells from the effects of infection with enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) //Gut. - 2003. - T. 52. - №. 7. -C. 988-997.

177. Roberton A. M. et al. A novel bacterial mucinase, glycosulfatase, is associated with bacterial vaginosis //Journal of clinical microbiology. - 2005. - T. 43. - №. 11. - C. 5504-5508.

178. Rogosa, M. and Sharpe, M.E. (1960) Species differentiation of human vaginal lactobacilli. // Journal of General Microbiology 20, 382-386..

179. Ronald A. The etiology of urinary tract infection: traditional and emerging pathogens //The American journal of medicine. - 2002. - T. 113. - №. 1. - C. 14-19.

180. Roos S., Lindgren S., Jonsson H. Autoaggregation of Lactobacillus reuteri is mediated by a putative DEAD-box helicase //Molecular Microbiology. - 1999. - T. 32. - №. 2. - C. 427-436.

181. Rosen D.A. Utilization of an intracellular bacterial community pathway in Klebsiella pneumonia urinary tract infection and the effects of fimK on type 1 pilus expression / D.A. Rosen // Infect Immun. - 2008. - Vol. 76. - P. 3337-3345.

182. Rosenthal R. et al. Claudin-15 forms a water channel through the tight junction with distinct function compared to claudin-2 //Acta Physiologica. - 2020. - T. 228. - №. 1. - C. e13334.

183. Rouaud F. et al. Scaffolding proteins of vertebrate apical junctions: structure, functions and biophysics //Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Biomembranes. - 2020. - T. 1862. - №. 10. - C. 183399.

184. Ruhal R., Kataria R. Biofilm patterns in gram-positive and gram-negative bacteria //Microbiological Research. - 2021. - T. 251. - C. 126829.

185. Ruiz F. O. et al. Synergistic effect between two bacteriocin-like inhibitory substances produced by lactobacilli strains with inhibitory activity for Streptococcus agalactiae //Current microbiology. - 2012. - T. 64. - C. 349-356.

186. Samrot A. V. et al. Mechanisms and impact of biofilms and targeting of biofilms using bioactive compounds—A review //Medicina. - 2021. - T. 57. - №. 8. - C. 839.

187. Santos C. M. A. et al. Selection of Lactobacillus strains as potential probiotics for vaginitis treatment //Microbiology. - 2016. - T. 162. - №. 7. - C. 1195-1207.

188. Scillato M. [et al.] Antimicrobial properties of Lactobacillus cell-free supernatants against multidrug-resistant urogenital pathogens //Microbiologyopen. - 2021. - T. 10. - №. 2. - C. e1173.

189. Selem E. [et al.] Antibacterial and antibiofilm effects of silver nanoparticles against the uropathogen Escherichia coli U12 //Saudi Journal of Biological Sciences. - 2022. - T. 29. - №. 11. - C. 103457.

190. Shah C. [et al.] Virulence factors of uropathogenic Escherichia coli (UPEC) and correlation with antimicrobial resistance //BMC microbiology. - 2019. - T. 19. - C. 1-6.

191. Sharma D., Misba L., Khan A. U. Antibiotics versus biofilm: an emerging battleground in microbial communities //Antimicrobial Resistance & Infection Control. - 2019. - T. 8. - C. 1-10.

192. Skinner C. [et al.] Intestinal permeability and bacterial translocation in patients with liver disease, focusing on alcoholic aetiology: methods of assessment and therapeutic intervention //Therapeutic advances in gastroenterology. - 2020. - T. 13. - C. 175.

193. Sobel J. D. Management of vaginosis: prevention and treatment //Drug Investigation. -1994. - T. 8. - C. 26-34.

194. Stamm W. E., Norrby S. R. Urinary tract infections: disease panorama and challenges //The Journal of infectious diseases. - 2001. - T. 183. - №. Supplement_1. - C. S1-S4.

195. Stensballe J. [et al.] Infection risk with nitrofurazone-impregnated urinary catheters in trauma patients: a randomized trial //Annals of Internal Medicine. - 2007. - T. 147. - №. 5. - C. 285-293.

196. Stringer A. M. [et al.] Updated perspectives on the contribution of the microbiome to the pathogenesis of mucositis using the MASCC/ISOO framework //Supportive Care in Cancer. -2024. - T. 32. - №. 8. - C. 558.

197. Su Y, Zhang B, Su L. CD4 detected from Lactobacillus helps understand the interaction between Lactobacillus and HIV. //Microbiol Res. - 2013. - T.168. - №5. - P. 273.

198. Szabados F. Staphylococcus saprophyticus ATTC 15305 is internalized into human urinary bladder carcinoma cell line 5637 / F. Szabados // FFEMS Microbiol Lett. - 2008. - Vol. 285. - P. 163-169.

199. Tambyah PA, Maki DG. Catheter-associated urinary tract infection is rarely symptomatic: A prospective study of 1,497 catheterized patients. //Arch Intern Med. - 2000. -Vol. 160. - №5. - P. 678-682.

200. Tenke P. et al. European and Asian guidelines on management and prevention of catheter-associated urinary tract infections //International journal of antimicrobial agents. - 2008. - T. 31.

- C. 68-78.

201. Terciolo C., Dapoigny M., Andre F. Beneficial effects of Saccharomyces boulardii CNCM I-745 on clinical disorders associated with intestinal barrier disruption //Clinical and experimental gastroenterology. - 2019. - C. 67-82.

202. Thanert R. et al. Comparative genomics of antibiotic-resistant uropathogens implicates three routes for recurrence of urinary tract infections //MBio. - 2019. - T. 10. - №. 4. - C. 10.1128/mbio. 01977-19.

203. Thomas S. Doderlein's bacillus: Lactobacillus acidophilus //The Journal of Infectious Diseases. - 1928. - C. 218-227.

204. Tremblay Y. D. N. et al. Method to grow Actinobacillus pleuropneumoniae biofilm on a biotic surface //BMC Veterinary Research. - 2013. - T. 9. - C. 1-8.

205. Tsai P. Y. et al. IL-22 upregulates epithelial claudin-2 to drive diarrhea and enteric pathogen clearance //Cell host & microbe. - 2017. - T. 21. - №. 6. - C. 671-681. e4.

206. Twardowska A. et al. Preventing bacterial translocation in patients with leaky gut syndrome: Nutrition and pharmacological treatment options //International journal of molecular sciences. - 2022. - T. 23. - №. 6. - C. 3204.

207. Van Hul M. et al. What defines a healthy gut microbiome? //Gut. - 2024. - T. 73. - №. 11. - C. 1893-1908.

208. Vandana, Das S. Structural and mechanical characterization of biofilm-associated bacterial polymer in the emulsification of petroleum hydrocarbon //3 Biotech. - 2021. - T. 11. -№. 5. - C. 239.

209. Verstraelen H. Cutting edge: the vaginal microflora and bacterial vaginosis //Verhandelingen-Koninklijke Academie voor Geneeskunde van Belgie. - 2008. - T. 70. - №. 3. - C. 147-174.

210. Vijaya, G. Is there bacterial infection in the bladder wall of patients with refractory overactive bladder? / G. Vijaya, F. Puccini, S. Dutta // Int Urogynecol J. - 2013. - Vol. 24, № 1.

- P. 78-79.

211. Wang B., Shen J. NF-kB inducing kinase regulates intestinal immunity and homeostasis //Frontiers in Immunology. - 2022. - T. 13. - C. 895636.

212. Wang Y. [et al.] Regulatory mechanisms of the LuxS/AI-2 system and bacterial resistance //Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2019. - T. 63. - №. 10. - C. 10.1128/aac. 01186-19.

213. Waren, J.W. A prospective microbiologic study of bacteriuria in patients with chronic indwelling urethral catheters / J.W. Waren, J.M. Tenney, J.M. Hoopes [et al.] // J Infect Dis. -1982. - № 146. - P. 719,

214. Warren J. W. Catheter-associated urinary tract infections //International journal of antimicrobial agents. - 2001. - T. 17. - №. 4. - C. 299-303.

215. Weiland-Brauer N. Friends or foes—microbial interactions in nature //Biology. - 2021.

- T. 10. - №. 6. - C. 496.

216. Whelan S., Lucey B., Finn K. Uropathogenic Escherichia coli (UPEC)-associated urinary tract infections: the molecular basis for challenges to effective treatment //Microorganisms. -2023. - T. 11. - №. 9. - C. 2169.

217. Williams, P. Quorum sensing, communication and crosskingdom signalling in the bacterial world / P. Williams // Microbiology. - 2007. - №153. - P. 3923-3938.

218. Witkin S. S. et al. Influence of vaginal bacteria and D-and L-lactic acid isomers on vaginal extracellular matrix metalloproteinase inducer: implications for protection against upper genital tract infections //MBio. - 2013. - T. 4. - №. 4. - C. 10.1128/mbio. 00460-13.

219. Wolfe, A.J.Evidence of uncultivated bacteria in the adult female bladder / A.J. Wolfe, E. Toh, N. Shibata [et al.] // J Clin Microbiol. - 2012. - Vol. 50, № 4. - P. 1376-1383.

220. Yang T. et al. The gut microbiota and the brain-gut-kidney axis in hypertension and chronic kidney disease //Nature Reviews Nephrology. - 2018. - T. 14. - №. 7. - C. 442-456.

221. Yoon B. H. et al. An elevated amniotic fluid matrix metalloproteinase-8 level at the time of mid-trimester genetic amniocentesis is a risk factor for spontaneous preterm delivery //American journal of obstetrics and gynecology. - 2001. - T. 185. - №. 5. - C. 1162-1167.

222. Younes J. A. et al. Adhesion forces and coaggregation between vaginal staphylococci and lactobacilli //PloS one. - 2012. - T. 7. - №. 5. - C. e36917.

223. Zhao A., Sun J., Liu Y. Understanding bacterial biofilms: From definition to treatment strategies //Frontiers in cellular and infection microbiology. - 2023. - T. 13. - C. 1137947.

224. Zuo L., Kuo W. T., Turner J. R. Tight junctions as targets and effectors of mucosal immune homeostasis //Cellular and molecular gastroenterology and hepatology. - 2020. - T. 10.

- №. 2. - C. 327-340.