Микробиота урогенитального тракта и кишечника у здоровых женщин и при инфекциях мочевых путей тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, доктор наук Гудима Ирина Александровна

• Гудима Ирина Александровна
• доктор наук
• 2019

Оглавление диссертации доктор наук Гудима Ирина Александровна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ПАРАДИГМЫ ЭТИОЛОГИЧЕСКОЙ СТРУКТУРЫ И ПАТОГЕНЕЗА ИНФЕКЦИОННО-ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ВЕРХНИХ И НИЖНИХ МОЧЕВЫХ ПУТЕЙ У ЖЕНЩИН (обзор литературы)

1.1. Эпидемиология инфекции мочевых путей

1.2.Роль микробных патогенов в развитии инфекции мочевых путей

1.3.Биологические свойства возбудителей инфекции мочевых путей у женщин

1.4. Концепции развития инфекции верхних и нижних мочевых путей

1.5. Антибиотикочувствительность каузативных уропатогенов 43 ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Дизайн клинического исследования

2.1.1. Клиническая характеристика пациенток с острой и хронической инфекцией верхних и нижних мочевых путей

2.1.2. Клинические методики обследования пациенток с инфекцией верхних и нижних мочевых путей

2.2. Бактериологическое исследование мочи и биоптатов слизистой мочевого пузыря

2.3. Бактериологическое исследование микробиоты кишечника и влагалища

2.4. Определение антибиотикочувствительности микроорганизмов

2.5. Определение адгезивной активности

2.6. Определение антилизоцимной активности

2.7. Определение Ркз-острова патогенности

2.8. Дизайн и методики экспериментального исследования

2.9. Методы статистической обработки результатов исследования

ГЛАВА 3. МИКРОБИОТА МОЧИ, ВЛАГАЛИЩА И КИШЕЧНИКА

ЗДОРОВЫХ ЖЕНЩИН

3.1. Микробиота мочи здоровых женщин

3.1.1. Микробиота мочи здоровых сексуально неактивных женщин

3.1.2. Микробиота мочи здоровых сексуально активных женщин

3.1.3. Сравнительный анализ микробиоты мочи сексуально неактивных и активных женщин

3.1.4. Микробиота мочи здоровых постменопаузальных женщин

3.1.5. Оценка дневных колебаний микробиоты мочи молодых здоровых сексуально активных женщин

3.2. Микробиота влагалища здоровых женщин

3.2.1. Микробиота влагалища сексуально активных женщин

3.2.2. Микробиота влагалища постменопаузальных женщин

3.3. Микробиота кишечника здоровых женщин

3.3.1. Микробиота кишечника сексуально активных женщин

3.3.2. Микробиота кишечника постменопаузальных женщин

3.4. Биологические свойства микроорганизмов, выделенных из мочи здоровых женщин

3.4.1. Биологические свойства микроорганизмов, верифицированных в моче сексуально неактивных женщин

3.4.2. Биологические свойства микроорганизмов, верифицированных в моче сексуально активных женщин

3.4.3. Сравнительный анализ биологических свойств микроорганизмов верифицированных в моче сексуально неактивных и активных женщин

3.5. Резюме 106 ГЛАВА 4. ОСОБЕННОСТИ МИКРОБИОТЫ МОЧИ ПРИ ОСТРОМ ОБСТРУКТИВНОМ ПИЕЛОНЕФРИТЕ КАЛЬКУЛЕЗНОГО

ГЕНЕЗА

4.1. Микробиота мочи

4.2. Биологические свойства микроорганизмов, выделенных из мочи

4.3. Резюме 116 ГЛАВА 5. ХАРАКТЕРИСТИКА МИКРОБИОТЫ МОЧИ И СЛИЗИСТОЙ МОЧЕВОГО ПУЗЫРЯ ПРИ НЕОСЛОЖНЕННОЙ РЕЦИДИВИРУЮЩЕЙ ИНФЕКЦИИ НИЖНИХ МОЧЕВЫХ ПУТЕЙ

5.1. Динамика микробного паттерна мочи за период 2010-2015 гг

5.2. Биологические свойства микроорганизмов, верифицированных в моче

5.3. Микробиота слизистой мочевого пузыря

5.4. Резюме 150 ГЛАВА 6. АНТИБИОТИКОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТЬ МИКРООРГАНИЗМОВ, ВЕРИФИЦИРОВАННЫХ В МОЧЕ ПРИ ИНФЕКЦИИ МОЧЕВЫХ ПУТЕЙ

6.1. Острый обструктивный пиелонефрит

6.2. Неосложненная рецидивирующая инфекция нижних мочевых путей

6.3. Резюме

ГЛАВА 7. ОЦЕНКА ВЗАИМОСВЯЗИ МИКРОБИОТЫ МОЧИ, ВЛАГАЛИЩА, КИШЕЧНИКА ЗДОРОВЫХ ЖЕНЩИН И ПРИ ИНФЕКЦИЯХ МОЧЕВЫХ ПУТЕЙ

7.1. Оценка взаимосвязи микробиоты мочи, влагалища, кишечника здоровых женщин и больных острым обструктивным пиелонефритом

7.2. Оценка взаимосвязи микробиоты локусов «мочевые пути - влагалище», «мочевые пути - кишечник», «влагалище - кишечник» здоровых женщин и больных острым обструктивным пиелонефритом

7.3. Оценка взаимосвязи микробиоты мочи, влагалища, кишечника здоровых женщин и больных неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей

7.4. Оценка взаимосвязи микробиоты локусов «мочевые пути - влагалище», «мочевые пути - кишечник», «влагалище - кишечник» здоровых женщин и больных неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей

7.5. Резюме

ГЛАВА 8. АНАЛИЗ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ОСТРОЙ ОБСТРУКЦИИ МОЧЕТОЧНИКА И УРОПАТО-

ГЕННОСТИ НЕКЛОСТРИДИАЛЬНЫХ АНАЭРОБНЫХ

БАКТЕРИЙ

8.1. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного E.coli

8.2. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного Peptococcus niger

8.3. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного Eubacterium spp

8.4. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного Propionibacterium acnes

8.5. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного Bacteroides fragilis

8.6. Экспериментальная модель острого обструктивного пиелонефрита, инициированного E.coli+ P.niger

8.7. Резюме 233 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 237 ВЫВОДЫ 256 ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ 258 СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 259 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиота урогенитального тракта и кишечника у здоровых женщин и при инфекциях мочевых путей»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Распространенность инфекции мочевых путей (ИМП) различной локализации высока и не имеет тенденции к снижению [203, 314, 367]. ИМП занимают вторую позицию по частоте встречаемости после ОРВИ и их чаще регистрируют у женщин репродуктивного возраста [159, 175, 390]. Актуальность изучения различных аспектов ИМП подчеркивается тем, что даже краткосрочная острая ИМП отрицательно влияет на качество жизни пациенток [165, 251]. В США по поводу ИМП к амбулаторным врачам в среднем обращаются около 7 млн. пациенток в год и 1 млн. больных приходится на отделения неотложной помощи [177, 340]. Пациентки с неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей (НРИНМП) представляют крайне сложную в плане эффективной и адекватной терапии когорту больных. Высокая частота рецидивов в течение года, неоднократные курсы антибактериальной терапии, самолечение и множество других факторов делают данную проблему зачастую трудноразрешимой. Поэтому «по ведению пациентов с рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей консенсус не найден» (цит. по «Федеральным клиническим рекомендациям», 2017) [74].

Изучение микробиома человека стало важной вехой для исследователей, в частности, занимающихся различными аспектами ИМП. «Дефиниции «микро-биота» и «микробиом» становятся частью клинической лексики» (цит. по Bru-baker L., Wolfe A.J., 2017) [132].

По нашему мнению, стагнация в изучении различных аспектов ИМП, в частности, в вопросах этиологии и патогенеза связана с несколькими глобальными обстоятельствами. Одно из них заключается в том, что и микробиологами и урологами поддерживалась и поддерживается догма о стерильности мочи, что является одной из причин не включения исследований по микробиому органов мочевой системы в фундаментальные проекты, в частности, «Human microbiome project» [227]. Развенчание этого мифа началось с отечественных работ в 2004 г.

[29, 33, 48, 248] и продолжилось зарубежными исследователями [173, 381, 435]. Данные публикации способствовали изменению общей клинической парадигмы не только о стерильности мочи, но и мочевого пузыря [106, 142, 410]. Необходимо отметить, что на сегодняшний день работ по изучаемому вопросу не много по сравнению с исследованиями по микробиоте и микробиому других биотопов [80, 131, 227, 347].

Следующее обстоятельство, которое, на наш взгляд, тормозит изучение различных аспектов ИМП, является следствием вышеописанной парадигмы - это этиологическая структура ИМП. Огромный пласт отечественных и зарубежных работ свидетельствует о том, что в этиологии ИМП доминирует моноинфекция с каноническим патогеном Е.соН [20, 41, 43, 56, 65, 135, 145, 156, 163, 203, 217, 224, 233, 358, 370, 426].

Причиной данного обстоятельства мы считаем неизменность подходов к стандартам бактериологического исследования мочи. Ряд авторов, также указывает на то, что рекомендуемые методики, несмотря на незначительные вариации в использовании питательных сред, были разработаны в свое время для обнаружения распространенных быстрорастущих аэробных уропатогенов, как правило, представителей семейства ЕП:егоЬас1ег1асеае и некоторых таксонов грампози-тивной флоры. Данные протоколы не предусматривают верификацию в моче медленно растущих и более того, анаэробных представителей микробиоты [130, 216, 241, 245, 272, 341, 369, 395, 409, 435]. В последних отечественных клинических рекомендациях «Бактериологический анализ мочи» (2014) [28] указывается на необходимость проведения бактериологического исследования мочи исключительно в аэробных условиях культивирования микроорганизмов. Таким образом, за рамками бактериологического исследования мочи остаются широкие паттерны микробиоты, в том числе, анаэробной. К настоящему времени опубликованы единичные работы, посвященные исследованию мочи на расширенном наборе питательных сред [49, 54, 55, 216, 241, 345].

Сложившаяся десятилетиями узкая направленность в изучении этиологической структуры ИМП с доминированием моноинфекции, как правило, представ-

ленной энтеробактериями, напрямую связана с рекомендациями по стартовой эмпирической антибактериальной терапии, которая нацелена на каузативные патогены, что отражено в рекомендациях European Association of Urology (EAU) последнего десятилетия. По-видимому, в ближайшее время эти рекомендации будут учитывать новые нюансы в этиологической структуре ИМП, включающей гораздо более широкий спектр патогенов [132, 345, 435].

Таким образом, современная антибактериальная терапия ИМП направлена на какой-либо один таксон микробиоты, в основном из семейства Enterobacteria-ceae. А как же быть с представителями аэробной грампозитивной флоры, роль которых в этиологии ИМП подвергается сомнению и рассматривается только в одном случае - при отсутствии в моче каких-либо представителей семейства En-terobacteriaceae, то есть, по сути, абсолютно игнорируется сама возможность бактериальной микст-инфекции. Данных о роли аэробной грампозитивной флоры, а также о значении бактериальной микст-инфекции в манифестации ИМП пока крайне мало. Поэтому в данном контексте актуально звучит фраза Kleine K.A. et Lewis A.L. соавторов монографии «Urinary tract infections» (2017): «... полимикробные инфекции, включающие в себя грампозитивные бактерии, распространены гораздо шире, чем ранее описывалось, и могут влиять на неблагоприятные исходы заболевания в мочевом тракте» [246].

Но помимо аэробных микроорганизмов, существует обширный пласт труд-нокультивируемых, в том числе анаэробных. Антибиотикочувствительность которых, если допустить их присутствие в моче и каузативность в развитии ИМП, практически не изучена. Тем более, что вопрос о роли анаэробных бактерий в развитии ИМП различного генеза даже не дискутируется в широкой печати. Есть лишь единичные работы в прошлом и настоящем, свидетельствующие о причастности некоторых таксонов анаэробов к развитию ИМП [30, 31, 32, 53, 55, 96, 108, 128, 254, 300, 366, 373, 386].

В настоящее время только начато изучение гендерных различий микробиоты и микробиома мочевых путей [33, 161, 173, 264, 281, 310, 365].

Существует и еще одна проблема в изучении различных аспектов ИМП, заключающаяся в том, что микробиота мочевых путей рассматривается изолированно от микробиоты других биотопов (влагалище, кишечник и др.). Появились исследования о дисбалансе в составе микробиоты мочевых путей женщин, связанном с бактериальным вагинозом [194, 244]. Van de Wijgert J.H. et al. (2014) в мочевом пузыре здоровых женщин верифицировали Lactobacillus, Gardnerella, Prevotella, Corynebacterium, Sneathia и другие роды, большинство из которых с одной стороны являются нормальными симбионтами влагалища, кишечника и других биотопов, а с другой стороны могут быть причастными к развитию бактериального вагиноза [418]. В настоящее время предпринимаются попытки по исследованию Lactobacillus spp. в мочевых путях, однако их верификация при стандартном бактериологическом исследовании мочи не предусмотрена [98, 131, 248, 293].

Недостаточно изучена микроэкологическая связь «мочевые пути - кишечник». В единичных работах рассматривается взаимосвязь между мочевыми путями и кишечником на основании сравнения микробиомов [244, 342]. В настоящее время некоторые авторы лишь констатируют факт, что верифицируемые в кишечнике микробные паттерны гораздо более разнообразны, чем в моче [132, 200, 341].

Таким образом, вектор изучения различных аспектов ИМП в настоящее время должен быть направлен на детализацию этиологической структуры, а также на вопросы, связанные с совершенствованием протокола бактериологического исследования мочи и изучением микробиоты мочевых путей не изолированно, а в совокупности с данными по микробиоте других биотопов (влагалище, кишечник и др.).

Цель исследования

Сформировать представление о микробиоте мочевых путей, влагалища и кишечника у здоровых женщин и при инфекциях верхних и нижних мочевых путей.

Задачи исследования

1. Исследовать микробиоту пузырной мочи здоровых женщин с использованием расширенного набора питательных сред, предполагающего определение в моче не только факультативно-анаэробных, но и труднокультивируемых не-клостридиальных анаэробных бактерий, а также изучить биологические свойства доминирующих в моче таксонов микроорганизмов.

2. Исследовать микробиоту влагалища и кишечника здоровых женщин и корреляционные связи между микроорганизмами, выделенными из этих биотопов и мочи.

3. Изучить особенности микробиоты пузырной мочи у женщин с острым об-структивным (калькулезным) пиелонефритом и биологические свойства каузативных уропатогенов.

4. Определить особенности микробиоты пузырной мочи у женщин с неослож-ненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей, в том числе биологические свойства доминирующих патогенов в отдельном урологическом центре с 2010 по 2015 годы.

5. Оценить антибиотикочувствительность доминирующих в моче таксонов факультативно-анаэробных и неклостридиальных анаэробных бактерий у больных острым обструктивным пиелонефритом и неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей, в том числе в динамике (20102015 годы).

6. Дать оценку микробиоте пузырной мочи, влагалища, кишечника у больных острым обструктивным пиелонефритом и неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей в сравнении с микробиотой здоровых женщин.

7. Выявить корреляционные связи между таксонами микробиоты, верифицированными в локусах «мочевые пути - влагалище», «мочевые пути - кишечник», «влагалище - кишечник» у больных острым обструктивным пиелонефритом и неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей.

8. Исследовать в эксперименте причастность дискутируемых микроорганизмов к развитию острого пиелонефрита в условиях острой односторонней моче-точниковой обструкции.

Методология и методы диссертационного исследования

Микробиологические исследования выполнены на базе кафедры микробиологии и вирусологии №1 ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России (зав. - д.м.н., проф. Ю.Л. Набока). Методологический базис работы состоял в комплексном микробиологическом подходе к изучению микробиоты мочи (с использованием расширенного набора питательных сред), влагалища, кишечника у пациенток с инфекцией верхних и нижних мочевых путей в сравнении со здоровыми женщинами. Клиническая часть работы в соответствии с дизайном исследования (отбор пациенток (критерии включения и исключения) с инфекцией верхних и нижних мочевых путей) проведена на базе отделения урологии, кафедры урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии ФПК и ППС ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России (зав. - д.м.н., проф. М.И. Коган) и урологического отделения МБУЗ городской больницы скорой медицинской помощи г. Ростова-на-Дону (ГБСМП) (зав. - к.м.н. П.П. Моргун). Отбор женщин контрольных групп (критерии включения и исключения) осуществлялся на базе кафедр урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии ФПК и ППС (зав. - д.м.н., проф. М.И. Коган) и акушерства и гинекологии №1 ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России (зав. - д.м.н., проф. А.Н. Рымашевский).

Проведено трехкратное бактериологическое исследование средней порции утренней мочи (n=201) на расширенном наборе питательных сред 67 здоровым женщинам и изучены биологические свойства факультативно-анаэробных (ФАБ) (гемолитическая, адгезивная, антилизоцимная активности), верифицированных в моче здоровых женщин. У части обследуемых (n=20) определены в динамике дневные параметры микробиоты мочи. У женщин контрольных групп изучена микробиота влагалища и кишечника (n=45).

В период с 2010 по 2015 гг. обследованы 60 женщин с острым обструктив-ным пиелонефритом (ООП) и 333 - с НРИНМП, проведены 393 бактериологических исследования мочи пациенток до назначения антибактериальной терапии. Во всех случаях поставлены индивидуальные антибиотикограммы. У представителей семейства Enterobacteriaceae определяли продукцию беталактамаз расширенного спектра (БЛРС). Изучены биологические свойства доминирующих таксонов ФАБ, верифицированных в моче пациенток с инфекцией верхних и нижних мочевых путей. У 59 штаммов энтеробактерий, выделенных из мочи пациенток с НРИНМП определены маркеры Pks-острова патогенности на базе ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии им. почетного академика Н.Ф. Гамалеи Минздрава России. По показаниям 28 пациенткам с НРИНМП была проведена цистоскопия с щипковой биопсией слизистой оболочки мочевого пузыря. Проведено бактериологическое исследование и полимеразная цепная реакция (ПЦР) биоптатов мочевого пузыря. ПЦР исследование осуществлено на базе ФКУЗ Ростовского-на-Дону противочумного института Роспотребнадзора. Исследованы (бактериологический метод) микробиота влагалища и кишечника у пациенток с ООП (n=60) и с НРИНМП (n=64).

Для определения роли ряда таксонов неклостридиальных анаэробных бактерий (НАБ) в развитии ООП проведено экспериментальное моделирование заболевания на кроликах (n=72). Животные были разделены на 6 групп для экспериментального моделирования ООП, вызванного: 1 группа (контрольная) -E.coli, 2 - Peptococcus niger, 3 - Eubacterium spp., 4 - Propionibacterium acnes, 5 -Bacteroides fragilis, 6 - E.coli + P.niger. Исследование проводили на базе центральной научно-исследовательской лаборатории ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России.

Проведен сравнительный статистический анализ микробиоты мочи, влагалища и кишечника у больных с ООП, НРИНМП и здоровых сексуально активных женщин, а также изучены корреляционные связи между различными таксонами микроорганизмов, верифицированных в трех биотопах. Статистический анализ результатов исследований выполняли в среде статистической обработки

и визуализации данных «R ver 3.2» («R Foundation for Statistical Computing», Вена, Австрия). Данные представлены при нормальном распределении в виде Медиана и интерквартильного размаха (Ме, 25% квартиль; 75% квартиль). Встречаемость представлена в виде частот, сравнение осуществлялось с помощью точного теста Фишера. Сравнение медианных концентраций микроорганизмов в порциях мочи, взятых в различные промежутки времени, проводили с помощью теста Фридмана (попарные апостериорные сравнения осуществляли с помощью метода Неменьи). Средние значения концентрации представлены в виде Медиана [Нижний квартиль; Верхний квартиль], сравнение осуществлялось с помощью теста Манна-Уитни. Сравнение встречаемости микроорганизмов оценивали с помощью теста Кохрана. Для обоих тестов использовали поправку на множественные сравнения по Холму. Различия признавали статистически значимыми на уровне р<0,05. Для кластеризации результатов анализов для всех временных точек были построены дендрограммы. Для анализа сходства использовали метод Варда (расстояние Брея-Кёртиса). Исследование проводилось на базе лаборатории биоинформатики, медицинской статистики и компьютерного моделирования центральной научно-исследовательской лаборатории ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России.

Степень достоверности, апробация результатов, личное участие автора

Достоверность полученных результатов достигнута за счет применения в качестве методологической и теоретической базы фундаментальных трудов в области микробиологии; соответствия результатов современному уровню методик проведения исследований.

Основные положения диссертации обсуждены на Всероссийской научно -практической конференции с международным участием «Рациональная фармакотерапия в урологии» (Москва, 2010, 2012), конгрессе Европейской ассоциации урологов (Барселона, 2010; Париж, 2012; Мадрид, 2015; Копенгаген, 2018), 3-ей Всероссийской междисциплинарной научно-практической конференции «Уроге-нитальные инфекции и репродуктивное здоровье: клинико-лабораторная диагно-

стика и терапия» (Санкт-Петербург, 2010), VI Российском конгрессе с международным участием «Мужское здоровье» (Москва, 2010), Российской научной конференции «Персистенция микроорганизмов» (Оренбург, 2012), XV конгрессе Российского общества урологов с участием Европейской Ассоциации Урологов (Санкт-Петербург, 2015), 3-ей научно-практической конференции урологов Северо-Западного федерального округа (Санкт-Петербург, 2017), XIII Российской школе оперативной урологии «Мочекаменная болезнь. Хирургические осложнения в оперативной урологии» (Ростов-на-Дону, 2017), XVII конгрессе Российского общества урологов «110 лет РОУ» (Москва, 2017), XIV Российской школе оперативной урологии «Малоинвазивная хирургия - классика и новации. Дефицит тестостерона. Инфекции мочевых путей» (Ростов-на-Дону, 2018).

Личный вклад автора состоит в непосредственном участии на всех этапах диссертационного исследования. Основная идея, планирование научной работы, включая формулировку научной гипотезы, определение методологии и общей концепции диссертационного исследования, формулировка цели и задач, разработка дизайна исследования проводились совместно с научными консультантами д.м.н., профессором Ю.Л. Набока и д.м.н., профессором М.И. Коганом. Экспериментальные исследования, статистическая обработка и анализ полученных данных, их интерпретация, подготовка публикаций проводились совместно с сотрудниками кафедр микробиологии и вирусологии №1 (зав. каф. - д.м.н., профессор Ю.Л. Набока), урологии и репродуктивного здоровья человека с курсом детской урологии-андрологии ФПК и ППС (зав. каф. - д.м.н., профессор М.И. Коган) и центральной научно-исследовательской лаборатории (рук. - к.м.н. О.С. Оксенюк) ФГБОУ ВО РостГМУ Минздрава России.

Положения, выносимые на защиту

1. Моча здоровых женщин нестерильна и содержит аэробно-анаэробные ассоциации микроорганизмов. Сексуальная активность и возраст изменяют мик-робиоту мочи.

2. В моче женщин с острым обструктивным пиелонефритом преобладают не-клостридиальные анаэробные бактерии (100,0%), энтеробактерии (53,3%), коагулазоотрицательные стафилококки (45,0%). Уропатогены с уровнем бак-териурии >105 КОЕ/мл регистрируются в 41,0% случаев. Гемолитическая, адгезивная, антилизоцимная активности бактерий определяются достоверно чаще по сравнению со здоровыми женщинами. Энтеробактерии чувствительны к карбапенемам, некоторым фторхинолонам и амоксицил-лин/клавулановой кислоте.

3. В моче женщин с неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей (2010 - 2015 годы) регистрируют аэробно-анаэробные ассоциации с доминированием неклостридиальных анаэробных бактерий (96,9%), коагулазоотрицательных стафилококков (72,4%) и энтеробактерий (67,9%). Чувствительность энтеробактерий и энтерококков к основному препарату -фосфомицину снижается с 2010 по 2015 годы с 74,3% до 54,5%.

4. У больных с инфекцией верхних и нижних мочевых путей в моче, влагалище и кишечнике изменяются частоты обнаружения и количество некоторых таксонов микробиоты относительно здоровых женщин. В большинстве случаев определены значимые корреляционные связи между микроорганизмами в биотопах «мочевые пути - влагалище, кишечник», «влагалище - кишечник», характерные только для больных острым обструктивным пиелонефритом, или - неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей, или для здоровых женщин.

5. Peptococcus niger, Eubacterium spp., Propionibacterium acnes, Bacteroides fragi-lis, а также E.coli+P.niger при экспериментальном моделировании острой односторонней мочеточниковой обструкции, вызывают острое инфекционно-воспалительное поражение в обструктивной почке различной степени тяжести.

Научная новизна

1. Впервые сформулировано представление о том, что моча, как среда мочевых путей, не является стерильной у здоровой женщины.

2. Впервые расширено понимание микробиоты мочи во взаимосвязи с микро-биотой влагалища и кишечника здоровой женщины, а также определены факторы, влияющие на спектр таксонов микробиоты мочи (возраст, сексуальность, гормональный статус).

3. Впервые сформирована парадигма об аэробно-анаэробных ассоциациях микроорганизмов в моче больных острым обструктивным пиелонефритом, ставящая под сомнение этиологическую концепцию «один микроб - одно заболевание».

4. Установлено, что каузативные патогены, выделенные из пузырной мочи при остром обструктивном пиелонефрите характеризуются факторами патоген-ности, отсутствующими у здоровых женщин.

5. Впервые показано, что острый обструктивный пиелонефрит сопровождается дисбиотическими изменениями во влагалище и кишечнике на старте заболевания еще до начала антибактериальной терапии.

6. Выявлено, что более половины случаев острого обструктивного пиелонефрита, вызванного Е.соН сопровождается уровнем бактериурии <105,° КОЕ/мл, что допускает возможность развития заболевания и при подобных уровнях бактериурии Е.соН.

7. Впервые продемонстрировано, что в микробиоте мочи женщин с неослож-ненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей доминируют неклостридиальные анаэробные бактерии и коагулазоотрицательные стафи-

3 О

лококки, а не энтеробактерии, причем с уровнями бактериурии >10 , КОЕ/мл, а дисбиотические изменения в микробиоте влагалища и кишечника и персистентный потенциал некоторых таксонов урофлоры выражены в большей степени, чем при остром обструктивном пиелонефрите. Шестилетняя динамика мониторинга микробиоты мочи при неосложненной рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей характеризуется разно-

направленными колебаниями частоты обнаружения тех или иных таксонов и их концентраций в моче, однако, в целом, различия не существенны в рамках отдельного урологического стационара.

8. Впервые установлено наличие корреляционных связей между определенными таксонами микробиоты мочи, влагалища и кишечника при остром об-структивном пиелонефрите и неосложненной рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей.

9. Впервые показано, что все штаммы каузативного уропатогена E.coli, верифицированные в пузырной моче больных острым обструктивным пиелонефритом вырабатывают беталактамазы расширенного спектра, тем не менее, по-прежнему, они обладают наибольшей чувствительностью к карбапенемам (до 90,0%) и фторхинолонам (до 75,0%). Напротив чувствительность каузативных уропатогенов при неосложненной рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей к основному антибиотику фосфомицину на протяжении 20102015 гг. снизилась с 74,3% до 54,5%.

10. Впервые экспериментально доказано, что ряд таксонов неклостридиальных анаэробных бактерий (Peptococcus niger, Eubacterium spp., Propionibacterium acnes, Bacteroides fragilis) в условиях острой мочеточниковой обструкции вызывают развитие в обструктивной почке инфекционно-воспалительного процесса, тяжесть которого и скорость развития связаны с родом и/или видом микроорганизма, что доказывает факт уропатогенности неклостридиальных анаэробных бактерий.

Теоретическая и практическая значимость работы

1. Моча здоровых женщин во всех случаях является нестерильной средой, содержащей ассоциации различных аэробов и анаэробов во множестве комбинаций. Признание факта нестерильности мочи диктует необходимость пересмотра методических подходов к стандартному бактериологическому исследованию мочи. Присутствие в моче широкого спектра факультативно-анаэробных и неклостридиальных анаэробных бактерий предполагает вклю-

чение в методику бактериологического исследования мочи питательных сред для верификации неклостридиальных анаэробных бактерий в анаэробных условиях (Патент РФ №2452773, Патент РФ №2444016). Подход к современному бактериологическому исследованию мочи необходимо строить на основе применения расширенного набора питательных сред (8-10) (Патент РФ № 2452774).

2. Микробиота мочевых путей, влагалища и кишечника как здоровых женщин, так и страдающих неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей находятся во взаимосвязи и подвержены изменениям, характерным для каждого из биотопов. При неосложненной рецидивирующей инфекции нижних мочевых путей целесообразно исследовать микробиоту влагалища и кишечника на наличие дисбиотических нарушений и при их выявлении необходимо рассматривать вопрос о коррекции микрофлоры данных биотопов.

3. Острый обструктивный пиелонефрит характеризуется уровнями бактериурии

2 0 8 0

каузативных патогенов в пределах 10 , - 10 , КОЕ/мл. В связи с чем, в конкретном клиническом случае любой уровень бактериурии целесообразно рассматривать как клинически значимый, а выявление таксонов «дискута-бельных» патогенов в любой степени бактериурии - как причинный фактор воспаления.

4. Неклостридиальные анаэробные бактерии (Peptococcus spp., Eubacterium spp., Propionibacterium spp., Bacteroides spp.) вызывают развитие острой воспалительной реакции в почке при экспериментальной обструкции мочеточника. В связи с чем, их следует рассматривать в спектре каузативных патогенов при обнаружении в моче у больных острым обструктивным пиелонефритом и учитывать при этом спектр их антибиотикочувствительности.

5. Неклостридиальные анаэробные бактерии и коагулазоотрицательные стафилококки доминируют в микробиоте мочи женщин с неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей и отличаются наравне с каузативными патогенами крайне низкими показателями чувствительности к ос-

новным антибактериальным препаратам (фосфомицину, фторхинолонам, це-фалоспаринам), причем с негативной динамикой чувствительности на протяжении шестилетнего мониторинга. 6. Неосложненная рецидивирующая инфекция нижних мочевых путей ассоциируется с более тяжелыми дисбиотическими изменениями микробиоты влагалища и кишечника в сравнении с острым обструктивным пиелонефритом. Более того, персистентный потенциал ряда таксонов микробиоты мочи при неосложненной рецидивирующей инфекцией нижних мочевых путей также более выражен, чем при остром обструктивном пиелонефрите.

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Гудима Ирина Александровна, 2019 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алмагамбетов, К.Х. Транслокация кишечной микрофлоры и ее механизмы / К.Х. Алмагамбетов, Е.М. Горская, В.М. Бондаренко // Журн. микробиол. -1991. - № 7. - С. 74-79.

2. Аляев, Ю.Г. Роль определения функционального состояния нижних мочевы-водящих путей в выборе лечебной тактики у пациентов с хроническим циститом и хроническим необструктивным пиелонефритом / Ю.Г. Аляев, П.В. Глыбочко, З.К. Гаджиева // Урология. - 2011. - № 6. - С. 4-8.

3. Аносова, Ю.А. Морфологические изменения в ткани почки при остром гнойном пиелонефрите в эксперименте на животных / Ю.А. Аносова, О.В. Золотухин, В.В. Кузьменко // Вестник новых медицинских технологий. - 2010. -Т. XVII. - № 2. - С. 16-18.

4. Аполихин, О.И. Формуляр антимикробных препаратов для урологических отделений в современных условиях / О.И. Аполихин, Т.С. Перепанова // Мат. XIII Конгресса Российского общества урологов. - 2013. - С. 237-238.

5. Бешлиев, Д.А. Диагностика и лечение острого пиелонефрита / Д.А. Бешлиев, Л.А. Ходырева // Трудный пациент. - 2009. - Т. 5. - № 12-13. - С. 5-8.

6. Бовбалан, А.В. Оптимизация эмпирической антибактериальной терапии гнойных пиелонефритов: автореферат дис. ... канд. мед. наук / А.В. Бовбалан. - Смоленск, 2004. - 20 с.

7. Бондаренко, В.М. Персистенция биологически активных компонентов микрофлоры желудочно-кишечного тракта / В.М. Бондаренко, В.Г. Лиходед // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2012. - № 4. -С. 81-87.

8. Борисов, Л.Б. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология / Л.Б. Борисов. - М.: «МИА», 2016. - 792 с.

9. Брилис, В.И. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов / В.И. Брилис, Г.А. Брилине, А.А. Ленцнер // Лаб. дело. - 1986. - № 4. - С. 210212.

10. Бухарин, О.В. Персистенция патогенных бактерий / О.В. Бухарин М.: Медицина, 1999. - 367 с.

11. Бухарин, О.В. Персистенция бактериальных патогенов как результат отношений в системе паразит-хозяин / О.В. Бухарин // Журн. микробиол. - 1997. - № 4. - С. 3-9.

12. Бухарин, О.В. Механизмы выживания бактерий / О.В. Бухарин, А.Л. Гинц-бург, Ю.М. Романова [и др.] // М.: Медицина, 2005. - 367 с.

13. Бухарина, О.В. Экология микроорганизмов человека / О.В. Бухарина, А.В. Валышев, Ф.Г. Гильмутдинова [и др.] // Екатеринбург: УрО РАН, 2006. - 477 с.

14. Бухарин, О.В. Симбиоз и его роль в инфекции / О.В. Бухарин, Е.С. Лобакова, Н.Б. Перунова [и др.] // Екатеринбург: УрО РАН, 2011. - 300 с.

15. Бухарин, О.В. Биология и экология энтерококков / О.В. Бухарин, А.В. Валы-шев // Екатеринбург, 2012. - 227 с.

16. Воробьев, А.А. Медицинская микробиология, вирусология и иммунология. А.А. Воробьев // М.: «МИА», 2004. - 690 с.

17. Воробьев, А.А. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология /

A.А.Воробьев, А.С.Быков, Е.П. Пашков // М.: Медицина, 2008. - С. 357.

18. Газаев, З.И. Роль неклостридиальных анаэробов в развитии и течении острого обструктивного пиелонефрита: (клинико-эксперим. исследование): дис. ...канд. мед. наук / З.И. Газаев. - СПб., 2012. - 160 с.

19. Гизатулина, С.С. Способ оценки состояния микрофлоры кишечника человека по количеству адгезивно-активных колоний и типу адгезии / С.С. Гизатулина, М.О. Биргер, Л.И. Кулинич [и др.] // Журн. микробиол. - 1991. - № 4а. -С. 21-23.

20. Глыбочко, П.В. Анаэробные паразитоценозы мочевыводящих путей как фактор риска развития острого пиелонефрита / П.В. Глыбочко, К.А. Хачатуров,

B.С. Липский [и др.] // Урология. - 2006. - № 2. - С. 50-54.

21. Гриценко, В.А. Характеристика энтеробактерий, выделенных от больных с урогенитальной патологией / В.А. Гриценко, Ю.А. Брудастов, М.Г. Шухман [и др.] // Журн. микробиол. - 2001. - № 4. - С. 107-11.

22. Гриценко, В.А. Роль персистентных свойств микроорганизмов в патогенезе эндогенных инфекций. / В.А. Гриценко, Ю.Б. Иванов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2009. - № 4. - С. 66-71.

23. Давыдов, М.И. Инфекции в онкологии / М.И. Давыдов, И.В. Дмитриева // М.: Практическая медицина, 2009. - 471 с.

24. Диденко, Л.В. К вопросу об инфекционном генезе камней почек (электронно-микроскопическое исследование) / Л.В. Диденко, Т.С. Перепанова, Э.Р. То-лордава [и др.] // Урология. - 2012. - № 3. - С. 4-7.

25. Довлатян, А.А. Интенсивная терапия при осложненных формах гнойного пиелонефрита беременных / А.А. Довлатян // Урология. - 2008. - № 2. - С. 10-14.

26. Зверев, В.В. Медицинская микробиология, вирусология и иммунология / В.В. Зверев, А.С. Быков // М.: «МИА», 2016. - 816 с.

27. Клинические рекомендации «Инфекции мочевыводящих путей у детей, взрослых, беременных: цистит, пиелонефрит, бессимптомная бактериурия», М.-Казань-Ростов-на-Дону, 2014. - 25 с.

28. Клинические рекомендации «Бактериологический анализ мочи» // М., 2014. -33 с.

29. Коган, М.И. Микробный спектр мочи молодых здоровых женщин / М.И. Коган, Ю.Л. Набока, И.А. Гудима [и др.] / Урология. - 2010. - № 5. - С. 7-10.

30. Коган, М.И. Роль неклостридиальных анаэробов в генезе обструктивного пиелонефрита / М.И. Коган, Х.С. Ибишев, Ю.Л. Набока [и др.] // Владикавказский медико-биологический вестник. - 2011. - Т. XIII. - № 20-21. - С. 155-159.

31. Коган, М.И. Новый взгляд на этиологическую структуру острого обструктивного пиелонефрита [электронный ресурс] / М.И. Коган, Ю.Л. Набока, И.А. Гудима [и др.] // Современные проблемы науки и образования: элек-

тронный науч. журнал. - 2012. - № 4. - Режим доступа: Шр:/А№№^8шепсе-education.ru. - 24.05.15.

32. Коган, М.И. Могут ли неклостридиально-анаэробные бактерии вызывать острый пиелонефрит? (экспериментальное исследование) / М.И. Коган, Д.Г. Пасечник, Ю.Л. Набока [и др.] // Урология. - 2012. - № 2. - С. 8-13.

33. Коган, М.И. Нестерильность мочи здорового человека - новая парадигма в медицине / М.И. Коган, Ю.Л. Набока, Х.С. Ибишев [и др.] // Урология. -2014. - № 5. - С. 48-52.

34. Козлов, Р.С. Резистентность к антимикробным препаратам как реальная угроза национальной безопасности / Р.С. Козлов // Русский медицинский журнал. - 2014. - Т. 22. - № 4. - С. 321-323.

35. Козлов, Р.С. Выбор антимикробных препаратов при неосложненных инфекциях мочевых путей: как принять соломоново решение? / Р.С. Козлов, А.В. Голуб // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. -2014. - Т. 16. - № 1. - С. 18-25.

36. Козлов, Р.С. Современные аспекты выбора антимикробных препаратов при неосложненных инфекциях мочевых путей / Р.С. Козлов, А.В. Голуб // Ста-ционарозамещающие технологии. Амбулаторная хирургия. - 2015. - № 3-4. -С. 50-57.

37. Козлов, Р.С. Чувствительность основных возбудителей бактериальных инфекций к цефтаролину в Российской Федерации / Р.С. Козлов, М.В. Сухору-кова, С.В. Сидоренко [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2015. - Т. 17. - № 3. - С. 217-226.

38. Косарева, П.В. Условно-патогенная флора кишечника как источник эндогенного инфицирования при пиелонефрите у детей грудного возраста / П.В. Косарева, В.Ф. Кузнецов, Н.И. Аверьянова // Казанский медицинский журнал. -2009. - Т. 90. - № 1. - С. 110-111.

39. Кудрявцева, Л.В. Бактериальный вагиноз: пособие для врачей / Л.В. Кудрявцева, Е.Н. Ильина, В.М. Говорун [и др.] // М., 2001. - 27 с.

40. Литвинов, В. Хронический пиелонефрит: Особенности иммунопатогенеза и принципы клинической иммуногенодиагностики / В. Литвинов, Н. Черепахи-на, А. Санаев [и др.] // Врач. - 2008. - № 1. - С. 12-17.

41. Лоран, О.Б. Современные подходы к диагностике и лечению острого необ-структивного пиелонефрита у женщин / О.Б. Лоран, Л.А. Синякова, И.В. Косова // Медицинский совет. - 2008. - №1. - С. 59-63.

42. Лоран, О.Б. Рациональная терапия рецидивирующих инфекций нижних мо-чевыводящих путей. Результаты проспективной наблюдательной программы по оценке эффективности и безопасности применения препаратов Цефорал® Солютаб® и Уро-Ваксом® у пациенток с рецидивирующими неосложнен-ными инфекциями нижних мочевых путей (FLORA) / О.Б. Лоран, М.И. Коган, Л.А. Синякова [и др.] // Урология. - 2015. - № 4. - С. 11-18.

43. Максимов, В.А. Эмпирическая антибактериальная профилактика в урологии / В.А. Максимов, С.К. Яровой, М.В. Странадко [и др.] // Экспериментальная и клиническая урология. - 2012. - № 1. - С. 13-20.

44. Меньшиков, В.В. Методики клинических лабораторных исследований / В.В. Меньшиков // М.: Лабора, 2009. - 880 с.

45. Методические указания МУК 4.2.18990-04 Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам. - М., 2004.- 91 с.

46. Методические указания МУ 4.2.2039-05. Техника сбора и транспортирования биоматериалов в микробиологические лаборатории.- М., 2006.- С.43-59.

47. Митусова, Е.В. Сравнительный анализ острого обструктивного пиелонефрита, вызванного различными родами неклостридиальных анаэробов (клинико-эксперим. исследование): дис. ...канд. мед. наук / Е.В. Митусова. - Ростов-на-Дону., 2015. - 162 с.

48. Набока, Ю.Л. Вирусо-бактериальный спектр мочи у детей из группы риска и второй группы здоровья / Ю.Л. Набока // Сибирь-Восток. Всероссийский мед. научно-производственный журн. - 2004. - № 7. - С. 13-15.

49. Набока, Ю.Л. Бактериальная и вирусная составляющая этиопатогенеза хронического пиелонефрита у детей / Ю.Л. Набока // Сибирь-Восток. Всероссийский мед. научно-производственный журн. - 2005. - № 2. - С. 12-15.

50. Набока, Ю.Л. Этиологическая структура острого пиелонефрита у детей / Ю.Л. Набока // Вестник Оренбургского государственного университета. -2005. - № 5. - С. 31-34.

51. Набока, Ю.Л. Вирусо-бактериальные ассоциации при пиелонефрите у детей: дис. ... докт. мед. наук / Ю.Л. Набока. - Ростов-на-Дону, 2006. - 216 с.

52. Набока, Ю.Л. Микробные ассоциации, выявленные при хроническом пиелонефрите у детей / Ю.Л. Набока, Л.И. Васильева, М.И. Коган [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2009. - № 5. - С. 8-12.

53. Набока, Ю.Л. Роль неклостридиальных анаэробных бактерий в развитии острого экспериментального пиелонефрита / Ю.Л. Набока, Д.Г. Пасечник, М.И. Коган [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2. - № 1-2. - С. 302.

54. Набока, Ю.Л. Микробный спектр мочи и биоптатов мочевого пузыря у женщин с хроническим рецидивирующим циститом / Ю.Л. Набока, И.А. Гудима, М.И. Коган [и др.] // Урология. - 2013. - № 4. - С. 16-18.

55. Набока, Ю.Л. Роль неклостридиальных анаэробов в развитии инфекционно-воспалительных заболеваний органов мочевой и половой систем / Ю.Л. Набока, М.И. Коган, И.А. Гудима [и др.] // Урология. - 2013. - № 6. - С. 118121.

56. Натрус, Л.В. Характеристика возбудителей инфекции и их антибиотикочув-ствительность у пациентов с урологической патологией / Л.В. Натрус, Л.Л. Поповиченко, В.С. Колесников // Материалы Международной научной конференции «Современные исследования медико-биологических наук: совершенствование диагностики, разработка средств профилактики и терапии болезней»: Киров, 2013. - С. 270-278.

57. Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам. Клинические рекомендации / Расширенное совещание межрегиональной

ассоциации микробиологии и антимикробной химиотерапии (22.05.2015). -М., 2015. - 162 с.

58. Отраслевой стандарт «Протокол ведения больных. Дисбактериоз кишечника» (ОСТ 91500.11.0004-2003). - М., 2003.

59. Палагин, И.С. Осложненные внебольничные инфекции мочевых путей у взрослых пациентов в России / И.С. Палагин, М.В. Сухорукова, Ф.В. Дехнич [и др.] // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. -2014. - Т. 16. - № 1. - С. 39-56.

60. Плеханов, В.Н. Гендерные различия острого пиелонефрита в условиях севера / В.Н. Плеханов, М.И. Васильченко, Н.Ф. Сергиенко // Урология. - 2011. - № 5. - С. 4-8.

61. Покровский, В.И. Медицинская микробиология / В.И. Покровский // М.:ГЭОТАР-МЕД, 2001. - 768 с.

62. Приказ Министерства здравоохранения СССР «Об унификации микробиологических (бактериологических) методов исследования, применяемых в клинико-диагностических лабораториях лечебно-профилактических учреждений». - 1985. - №535.

63. Рафальский, В.В. Фторхинолоны в лечении инфекций мочевыводящих путей: роль антибиотикорезистентности / В.В. Рафальский, Е.В. Довгань // Русский медицинский журнал. - 2011. - № 16. - С. 1006-1010.

64. Рыбальченко, О.В. Атлас ультраструктуры микробиоты кишечника человека / О.В. Рыбальченко, В.М. Бондаренко, В.П. Добрица // СПб.: ИИЦ ВМА, 2008. - 112 с.

65. Сидоренко, С.В. Современные подходы к лечению и профилактике инфекций мочевых путей / С.В. Сидоренко, В.П. Авдошин, Л.В. Шаплыгин // Эффективная фармакотерапия в урологии. - 2006. - № 2. - С. 58-61.

66. Синякова, Л.А. Рецидивирующие инфекции нижних мочевых путей: диагностика и лечение / Л.А. Синякова, М.Л. Штейнберг, А.М. Плесовский // Медицинский совет. - 2011. - № 7-8. - С.70-75.

67. Синякова, Л.А. Антибактериальная терапия острого цистита в эру растущей резистентности возбудителей / Л.А. Синякова // Терапевтический архи. -2014. - Т. 86. - № 4.- С. 125-129.

68. Синякова, Л.А. Антимикробная терапия неосложненных инфекций мочевых путей / Л.А. Синякова // Consilium Medicum. - 2014. - Т. 16. - № 7. - С. 29-33.

69. Синякова, Л.А. Современный взгляд на профилактику рецидивов инфекций нижних мочевых путей / Л.А. Синякова // Consilium Medicum. - 2014. - Т. 16. - № 7. - С. 47-50.

70. Синякова, Л.А. Рецидивирующие инфекции нижних мочевых путей - междисциплинарная проблема / Л.А. Синякова // Медицинский совет. - 2014. -№ 9. - С. 100-102.

71. Смагин, А.А. Влияние регионарной лимфотропной терапии на течение острого пиелонефрита у детей / А.А. Смагин, С.Н. Кучма // Современные наукоемкие технологии. - 2008. - № 2. - С. 78.

72. Тихомиров, А.Л. Бактериальный вагиноз - современные представления, комплексное лечение / А.Л. Тихомиров, Ч.Г. Олейник, С.И. Сарсания // Методические рекомендации для врачей акушеров-гинекологов. - М., 2005. - 26 с.

73. Уразбаева, Д.Ч. Антилизоцимная активность микроорганизмов, вызывающих острый и хронический пиелонефрит / Д.Ч. Уразбаева, Б.А. Рамазанова, Б.У. Шалекенов // Урология. - 2006. - № 6. - С. 63-64.

74. Федеральные клинические рекомендации «Антимикробная терапия и профилактика инфекций почек, мочевыводящих путей и мужских половых органов / под ред. Ю.Г. Аляева, О.И. Аполихина, Д.Ю. Пушкаря [и др.] // М., 2013, 2014, 2015, 2017. - 72 с.

75. Фиалкина, С.В. Выявление генетических детерминант Pks-острова патоген-ности у клинических штаммов энтеробактерий / С.В. Фиалкина, В.М. Бонда-ренко, Ю.Л. Набока [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2011. - № 5. - С. 3-7.

76. Ханно, Ф.М. Руководство по клинической урологии / Ф.М. Ханно, С.Б. Мал-кович, А.Дж. Вейн // М.: МИА, 2006. - 544 с.

77. Хельсинская декларация всемирной медицинской ассоциации. Этические принципы проведения медицинских исследований с участием человека и животных в качестве субъекта. Принята на 18 генеральной Ассамблее ВМА, Хельсинки, Финляндия, июнь 1964 г, последние изменения внесены на 64 Генеральной Ассамблее ВМА, Форталеза, Бразилия, октябрь 2013 г.

78. Шевяков, М.А. Иммунотерапия инфекционно-воспалительных заболеваний мочевыводящих путей и ее эффективность / М.А. Шевяков // Урология.-2013. - № 2. - С. 98-102.

79. Яровой, С.К. Современное состояние антибиотикорезистентности основных возбудителей пиелонефрита / С.К. Яровой, В.А. Максимов, Н.Л. Шиманов-ский [и др.] // Урология. - 2010. - № 2. - С. 22.

80. Aagaard, K. The Human Microbiome of Local Body Sites and Their Unique Biology / K. Aagaard, R.A. Luna, J. Versalovic // Principles and Practice of infectious Diseases. - 2015. - № 2. - Р. 11-18.

81. Abernethy, M.G. Urinary microbiome and cytokine levels in women with interstitial cystitis / M.G. Abernethy, A. Rosenfeld, J.R. White [et al.] // Jbstet Gynecol. -2017. - Vol. 129, № 3. - P. 500-506.

82. Adeep, M. A retrospective analysis of the etiologoc agents and antibiotic susceptibility pattern of uropathogens isolated in the Jigme Dorji Wangchuck National Referral Hospital, Thimphu, Bhutan / M. Adeep, T. Nima, W. Kezang [et al.] // BMC Res Notes. - 2016. - Vol. 9. - P. 54.

83. Adeghate, J. Does Staphylococcus saprophyticus cause acute cystitis only in young females, or is there more to the story? A one-year comprehensive study done in Budapest, Hungary / J. Adeghate, E. Juhasz, J. Pongracz [et al.] // Acta Microbiol Immunol Hung. - 2016. - Vol. 63, № 1. - P. 57-67.

84. Agrawal, R. Metabolic syndrome' in the brain: deficiency in omega-3 fatty acid exacerbates dysfunctions in insulin receptor signaling and cognition / R. Agrawal, F. Gomez-Pinilla // J Physiol. - 2012. - Vol. 590. - P. 2485-2499.

85. Akiyama, H. Adenovirus is a key pathogen in hemorrhagic cystitis associated with bone marrow transplantation / H. Akiyama, T. Kurosu, C. Sakashita [et al.] / Clin Infect Dis. - 2001. - Vol. 32. - P. 1325-1330.

86. Albenberg, L.G. Food and the gut microbiota in inflammatory bowel diseases: a critical connection / L.G. Albenberg, J.D. Lewis, G.D. Wu [et al.] // Curr Opin Gastroenterol. - 2012. - Vol. 28, № 4. - P. 314-320.

87. Aldridge, K.E. Bacteremia due to Bacteroides fragilis group: distribution of species, B-lactamase production and antimicrobial susceptibility patterns / K.E. Aldridge, D. Ashcraft, D. ÖBrien [et al.] // Antimicrob Agents Chemother. - 2003. -Vol. 47. - P. 148-153.

88. Anesi, J.A. Poor clinical outcomes associated with community-onset urinary tract infections due to extended-spectrum cephalosporin-resistant Enterobacteriaceae / J.A. Anesi, E. Lautenbach, I. Nachamkin // Infect Control Hosp. Epedemiol. -2018. - Vol. 39, № 12. - P. 1431-1435.

89. Armbruster, C.E. Initiation of swarming motility by Proteus mirabilis occurs in response to specific cues present in urine and requires excess L-glutamine / C.E. Armbruster, S.A. Hodges, H.L.T. Mobley // J Bacteriol. - 2013. - Vol. 195. - P. 1305-1319.

90. Anderson, G.G. Intracellular bacterial biofilm-like pods in urinary tract infections / G.G. Anderson, J.J. Palermo, J.D. Schilling [et al.] // Science. - 2003. - V. 301. -P. 105-107.

91. Anderson, G.G. Intracellular bacterial communities of uropathogenic Escherichia coli in urinary tract pathogenesis / G.G. Anderson / Trends Microbiol. - 2004. -Vol. 12. - P. 424-430.

92. Anderson, M.J. A new method for non-parametric multivariate analysis of virance / M.J. Anderson // Aystral. Ecol. - 2001. - Vol. 26. - P. 32-46.

93. Andrews, F. A study of streptococci pathogenic for man / F. Andrews, T. Horder // Lancet. - 1906. - Vol. 2. - P. 708-713.

94. Annual Epidemiological Report 2014 - Antimicrobial Resistance and Healthcare-associated Infections. Stockholm, Sweden: European Centre for Disease Prevention and Control, 2015.

95. Antibiotic resistance threats in the United States, 2013. Atlanta, GA: Centers for Disease Control and Prevention, U.S. Department of Health and Human Services; 2013.

96. Apostolopoulou, C. Isolation of anaerobic organisms from kidney in serious renal infections / C. Apostolopoulou, S. Konstantoulaki, P. Androulakakis [et al.] // Urology. - 1982. - Vol. 20, № 5. - P. 479-481.

97. Aragon, I.M. The urinary tract microbiome in health and disease / I.M. Aragon, B. Herrera-Imbroda, M.I. Queipo-Ortuno [et al.] / Eur Urol Focus. - 2018. - Vol. 4, № 1. - P. 128-138.

98. Aroutcheva, A. Defense factors of vaginal lactobacilli / A. Aroutcheva, D. Gariti, M. Simon [et al.] // Am J Obstet Gynecol. - 2001. - Vol. 185. - P. 375-379.

99. Arias, C.A. Enterococcus srecies, Streptococcus gallolyticus group, and Leuco-nostoc species / C.A. Arias, B.E. Murray // In: Mandell G.L., Bennett J.E., Dolin R., editors. Principles and Practice of Infectious Diseases, ed 8. Philadelphia, PA: Churchill Livingstone, Elsevier, 2015. - P. 2328-2339.

100. Ashida, H. Bacteria and host interactions in the gut epithelial barrier / H. Ashida, M. Ogawa, M. Kim [et al.] // Nat Chem Biol. - 2012. - Vol. 8. - P. 36-45.

101. Azevedo, A.S. Impact of Delftia tsuruhatensis and Achromobacter xylosoxidans on Esherichia coli dual-species biofilm treated with antibiotic agents / A.S. Azevedo, C. Almedia, B. Pereira [et al.] / Biofouling. - 2016. - Vol. 32, № 3. - P. 227-241.

102. Aziminia, N. Vaccines for the prevention of recurrent urinary tract infection: a systematic review / N. Aziminia, M. Hadjipavlou, Y. Philippou [et al.] / BJU Int. - 2018. - doi: 10.1111/bju.14606.

103. Babel, N. BK polyomavirus infection and nephropathy: the virus-immune system interplay / N. Babel, H.D. Volk, P. Reinke // Nat Rev Nephrol. - 2011. - № 7. -P. 399-406.

104. Baka, S. Prevalence of ureaplasma urealyticum and mycoplasma hominis in women with chronic urinary symptoms / S. Baka, E. Kouskouni, S. Antonopou-lou [et al.] / Urology. - 2009. - № 74. - P.62-66.

105. Balachandran, A.A. Is chronic urinary infection a cause of overactive bladder? / A.A. Balachandran, S.S. Wildman, M. Strutt [et al.] / Eur J Obstetrics Gynecol Reproduct Biol. - 2016. - Vol. 201. - P. 108-112.

106. Barasch, J. Urine: Waste product or biologically active tissue / J. Barasch, T.G. Bavendam, D.K. Hoshizaki [et al.] // Neurourol. Urodyn. - 2018. - Vol. 37, № 3.

- P. 1162-1168.

107. Bayingana, C. Antibiotic activity assessment of bacterial strains isolated from urine samples at Butare University Teaching Hospital (Buth) Laboratory / C. Bayingana // Int J Infect Dis. - 2014. - Vol. 21. - P. 83.

108. Beigelman, P.M. Clinical significance of Bacteroides / P.M. Beigelman // Arch Intern Med. - 1949. - Vol. 5. - P. 605.

109. Beguelin, C. Actinobaculum schaalii: clinical observation of 20 cases / C. Begue-lin, D. Genne, A. Varca [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2011. - Vol. 17, № 7. -P. 1027-1031.

110. Bercik, P. Chronic gastrointestinal inflammation induces anxiety-like behavior and alters central nervous system biochemistry in mice / P. Bercik, E.F. Verdu, J.A. Foster [et al.] / Gastroenterology. - 2010. - Vol. 139. - P. 2102-2112.

111. Berg, R.D. Bacterial translocation from the intestines / R.D. Berg // Expt Animals. - 1985. - Vol. 34. - P. 1-16.

112. Berg, R.D. Bacterial translocation from gastrointestinal tract / R.D. Berg // Trends Microbiol. - 1995. - Vol. 3, № 4. - P. 149-154.

113. Berger, R.E. Bacteria in the prostate tissue of men with idiopathic prostatic inflammation / R.E. Berger, J.N. Krieger, I. Rothman [et al.] // J Urol. - 1997. -Vol. 157, № 3. - P. 863-865.

114. Bergsten, G. PapG-dependent adherence breaks mucosal inertia and triggers the innate host response / G. Bergsten, M. Samuelsson, B. Wullt [et al.] / J Infect Dis.

- 2004. - Vol. 189. - P. 1734-1742.

115. Bertoni, G. Etiology and antimicrobial resistance of uncomplicated urinary tract infections / G. Bertoni, P. Pessacq, M.G. Guerrini [et al.] // Medicina. - 2017. -Vol. 77, № 4. - P. 304-308.

116. Blango, M.C. Persistence of uropathogenic Escherichia coli in the face of multiple antibiotics / M.C. Blango, M.A. Mulvey // Antimicrob Agents Chemother. -2010. - Vol. 54. - P. 1855-1863.

117. Blekhman, R. Host genetic variation impacts microbiome composition across human body sites / R. Blekhman, J.K. Goodrich, K. Huang [et al.] / Genome Biol. - 2015. - Vol. 16. - P. 191.

118. Bogyiova, E. Occurrence and genetic association of selected virulence factors in clinical Escherichia coli isolates. / E. Bogyiova, L. Siegfried, M. Kmetova [et al.] // Folia Microbiol. - 2002. - Vol. 47. - P. 73-77.

119. Bossa, L. Urinary catheter-associated microbiota change in accordance with treatment and infection status / L. Bossa, K. Kline, D. McDougald [et al.] // PLoS ONE. - 2017. - Vol. 12, №6. - e0177633.

120. Bouchillon, S.K. Antimicrobial susceptibility of inpatient urinary tract isolates of gram-negative bacilli in the United States: results from the study for monitoring antimicrobial resistance trends (SMART) program: 2009-2011 / S.K. Bouchillon, R.E. Badal, D.J. Hoban [et al.] // Clin. Ther. - 2013. - Vol. 35, № 6. - P. 872 -877.

121. Bourgogne, A. Large scale variation in Enterococcus faecalis illustrated by the genome analysis of strain OGIRF / A. Bourgogne, D.A. Garsin, X. Qin [et al.] // Genome Biol. - 2008. - Vol. 9. - P. 110

122. Bowden, M.G. Is the GehD lipase from Staphylococcus epidermidis a collagen binding adhesin? / M.G. Bowden, L. Visai, C.M. Longshaw [et al.] // J Biol Chem. - 2002. - Vol. 277. - P. 43017-43023.

123. Bowden, M.G. Evidence for the «dock, lock, and lath» ligand binding mechanism of the staphylococcal microbial surface component recognizing adhesive matrix molecules (MSCRAMM) SdrG / M.G. Bowden, A.P. Heuck, K. Ponnuraj [et al.] / J Biol Chem. - 2008. - Vol. 283. - P. 638-647.

124. Bowler, P.G. Wound microbiology and associated to wound management / P.G. Bowler, B.I. Duerden, D.G. Armstrong // Clin Microbiol Rev. - 2001. - Vol. 14. - P. 244-269.

125. Brasier, J.S. Antibiotic susceptibilities of gram-positive anaerobic cocci: results of a sentinel study in England and Wales / J.S. Brasier, V. Hall, T.E. Morris, [et al.] // J Antimicrob Chem. - 2003. - Vol. 52. - P. 224-228.

126. Bravo, J.A. Ingestion of Lactobacillus strain regulates emotional behavior and central GABA receptor expression in a mouse via the vagus nerve / J.A. Bravo, P. Forsythe, M.V. Chew [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 2011. - Vol. 108. - P. 16050-16055.

127. Brinster, S. Enterococcal leucine-rich repeat-containing protein involved in virulence and host inflammatory response / S. Brinster, B. Posteraro, H. Bierne [et al.] // Infect Immun. - 2007. - Vol. 75. - P. 4463-4471.

128. Brook, I. Urinary tract infection caused by anaerobic bacteria in children / I. Brook // Urology. - 1980. - Vol. 16, № 6. - P. 596-598.

129. Brook, I. Urinary tract and genito-urinary suppurative infections due to anaerobic bacteria / I. Brook // International Journal of Urology. - 2004. - Vol. 11, № 3. -P. 133-141.

130. Brubaker, L. Urinary bacteria in adult women with urgency urinary incontinence / L. Brubaker, C.W. Nager, H.E. Richter [et al.] // Int Urogenicol J. - 2014. - № 25. - P. 1179-1184.

131. Brubaker, L. The new world of the urinary microbiota in women / L. Brubaker, A.J. Wolfe // Am J of Obst and Gynecol. - 2015. - Vol. 213. - № 5. - P. 644649.

132. Brubaker, L. The female urinary microbiota, urinary health and common urinary disorders / L. Brubaker, A.J. Wolfe // Ann Transl Med. - 2017. - Vol. 5, № 2. -P. 34-40.

133. Brumbaugh, A.R. Blocking yersiniabactin import attenuates extraintestinal pathogenic Escherichia coli in cystitis and pyelonephritis and represents a novel tar-

get to prevent urinary tract infection / A.R. Brumbaugh, S.N. Smith, S. Subash-chandrabose [et al.] // Infect Immun. - 2015. - Vol. 83. - P. 1443-1450.

134. Butel, J.S. Molecular evidence of simian virus 40 infections in children / J.S. Bu-tel, A.S. Arrington, C. Wong [et al.] / J Infect Dis. - 1999. - Vol. 180. - P. 884887.

135. Cardwell, S.M. Epidemiology and economics of adult patients hospitalized with urinary tract infections / S.M. Cardwell, J.L. Crandon, D.P. Nicolau [et al.] // Hosp Pract. - 2016. - Vol. 44, № 1. - P. 33-40.

136. Carlet, J. Ready for a world without antibiotics? The Pensières Antibiotic Resistance Call to Action / J. Carlet, V. Jarlier, S. Harbarth [et al.] // Antimicrob Resist Infect Control. - 2012. - Vol. 1. - P. 11.

137. Carmeli, Y. Ceftazidime-avibactam or best available therapy in patients with cef-tazididime-resistant Enterobacteriaceae and Pseudomonas aeruginosa complicated urinary tract infections or complicated intra-abdominal infections (REPRISE): a randomized, pathogen-directed, phase 3 study / Y. Carmeli, J. Armstrong, P.J. Laud [et al.] // Lancet Infect Dis. - 2016. - Vol. 16. - P. 661-673.

138. Castro, J. Escherichia coli and Enterococcus faecalis are able to incorporate and enhance a pre-formed Gardnerella vaginalis biofilm / J. Castro, D. Machado, N. Cerca // Pathog Dis. - 2016. - Vol. 74, №3. - doi: 10.1093/femspd/ftw007.

139. Catenacci, M.H. Severe Sepsis and Septic Shock: Improving Outcomes in the Emergency Department / M.H. Catenacci, K. King // Emergency Medicine Clinics of North America. - 2008. - Vol. 26, № 3. - P. 603-623.

140. Cattoir, V. Actinobaculum schaalii: review of an emerging uropathogen / V. Cat-toir // J of Infection. - 2012. - №64. - P.260-267.

141. Chiu, C.-C. Etiologies of community-onset urinary tract infections requiring hospitalization and antimicrobial susceptibilities of causative microorganisms C.-C. Chiu, T.-C. Lin, R.-X. Wu [et al.] // J Microbial, Immun and Infect. - 2017. -Vol. 50, № 6. - P. 879-885.

142. Chen, Z. The urinary microbiome in patients with refractory urge incontinence and recurrent urinary tract infection / Z. Chen, M.-D. Plan, L.J. Bates [et al.] // Int

Urogynecol J. - 2018. - Vol. 20, №12. - P. 1775-1782.

143. Cheng, C.H. Comparison of extended virulence genotypes for bacteria isolated from pediatric patients with urosepsis, acute pyelonephritis, and acute lobar nephroma / C.H. Cheng, Y.K. Tsau, C.Y. Kuo [et al.] // Pediatr Infect Dis J. - 2010. -Vol. 29. - P. 736-740.

144. Chiou, Y.Y. Bacterial virulence factors are accociated with occurrence of acute pyelonephritis but not renal scarring / Y.Y. Chiou, M.J. Chen, N.T. Chiu [et al.] // J Urol. - 2010. - Vol. 184. - P. 2098-2102.

145. Colgan, R. Diagnosis and treatment of acute pyelonephritis in women / R. Col-gan, M. Williams, J.R. Johnson // Am. Fam. Physician. - 2011. - Vol. 84, № 5. -P. 519 - 526.

146. Cortade-Saidi, M. Urine cytology pitfalls due to Polyomaviruses / M. Cortade-Saidi, J. Aziza, L. Collin [et al.] // Ann Pathol. - 2010. - Vol. 30. - P. 176-181.

147. Coyne, K.S. The prevalence of lower urinary tract symptoms (LUTS) in the USA, the UK and Sweden: results from the Epidemiology of LUTS (EpiLUTS) study / K.S. Coyne, C.C. Sexton, C.L. Thompson [et al.] // BJU Int. - 2009. - № 104. -P. 352-360.

148. Crepin, S. Decreased expression of type 1 fimbriae by a pst mutant of uropatho-genic Escherichia coli reduces urinary tract infection / S. Crepin, S. Houle, M.E. Charbonneau [et al.] // Infect Immun. - 2012. - Vol. 80. - P. 2802-2815.

149. Croxen, M.A. Molecular mechanisms of Escherichia coli pathogenicity / M.A. Croxen, B.B. Finlay // Nat Rev Microbiol. - 2010. - Vol. 8, № 1. - P. 26-38.

150. Cuevas-Ramos, G. Escherichia coli induces DNA damage in vivo and triggers genomic instability in mammalian cells / G. Cuevas-Ramos, C.R. Petit, I. Marcq [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 2010. - Vol. 107, №25. - P. 11537-11542.

151. Cullen, I.M. The changing pattern of antimicrobial resistence within 42,033 Escherichia coli isolates from nosocomial, community and urology patient-specific urinary tract infections, Dublin, 1999-2009 / I.M. Cullen, R.P. Maneck-sha, E. McCullagh [et al.] // BJU Int. - 2012. - Vol. 109, № 8. - P. 1198-1206.

152. Cusumano, C.K. Virulence plasmid harbored by uropathogenic Escherichia coli

functions in acute stages of pathogenesis / C.K. Cusumano, C.S. Hung, S.L. Chen [et al.] // Infect Immun. - 2010. - Vol. 78. - P. 1457-1467.

153. Cyoia, P.S. Presence of virulence genes and pathogenicity islands in extraintestinal pathogenic Escherichia coli isolated from Brazil / P.S. Cyoia, G.R. Rodrigues, E.K. Nishio [et al.] // J Infect Dev Ctries. - 2015. - Vol. 9, №10. - P. 10681075.

154. Czaplewski, L. Alternatives to antibiotics - a pipeline portfolio review / L. Czap-lewski, R. Bax, M. Clokie [et al.] // Lancet Infect Dis. - 2016. - Vol. 16. - P. 239-251.

155. Dalhoff, A. A long journey from minimum inhibitory concentration testing to clinically predictive breakpoints: determinist and probabilistic approaches in deriving breakpoints / A. Dalhoff, P.G. Ambrose, J.W. Mouton // Infection. - 2009.

- Vol. 37. - P. 296-305.

156. Das, R. Antimicrobial susceptibility of bacteria isolated from urine samples obtained from nursing home residents / R. Das, V. Towle, P.H. Van Ness [et al.] // Infect Control Hosp Epidemiol. - 2009. - Vol. 30, № 11. - P. 1116-1119.

157. Dasgupta, N. Analysis of quinolone resistance due of mutational changes in Escherichia coli associated with urinary tract infections: a study from North East India / N. Dasgupta, D. Paul, D. Dhar (Chandra) [et al.] // Int J Infect Dis. - 2016.

- Vol. 45. - P. 86.

158. Davis, J.M. Citotoxic necrotizing factor type 1 delivered by outer membrane vesicles of uropathogenic Escherichia coli attenuates polymorphonuclear leukocyte antimicrobial activity and chemotaxis / J.M. Davis, H.M. Carvalho, S.B. Rasmus-sen, A.D. O'Brien // Infect Immun. - 2006. - Vol.74. - P. 4401-4408.

159. Davis, C. Lower urinary tract infection in women / C. Davis, A. Rantell // British J Nursing. - 2017. - Vol. 26, № 9. - P. 12-19.

160. Dobrindt, U. Uropathogens and virulence factors. / U. Dobrindt, J. Hacker In: K.G. Naber, A.J. Schaeffer, C.F. Heyns [et al.] // Urogenital Infections. Arnhem, the Netherlands: European Association of Urology. - 2010. - P. 4-22.

161. Dong, Q. The microbial communities in male first urine are highly similar to

those in paired urethral swab specimens / Q. Dong, D.E. Nelson, E. Toh [et al.] // PLoS ONE. - 2011. - Vol. 6, № 5. - P. e19709.

162. Draft global action plan on antimicrobial resistance. Report by the WHO Secretariat. Geneva, Switzerland: World Health Organization, 2015.

163. Drai, J. Management of acute pyelonephritis / J. Drai, T. Bessede, J.J. Patard // Prog. Urol. - 2012. - Vol. - 22, № 14. - P. 871-875.

164. Duenas-Garsia, O.F. Pharmacological agents to decrease new episodes of recurrent lower urinary tract infections in postmenopausal women: a systematic review / O.F. Duenas-Garsia, G. Sullivan, C.D. Hall [et al.] // Female Pelvic Med Re-constr Surg. - 2016. - Vol. 22. - P. 63-69.

165. Eriksson, I. Do urinary tract infections affect morale among very old women? / I. Eriksson, Y. Gustafson, L. Fagerström [et al.] // Healt Qual Life Outcomes. -2010. - Vol. 8. - P. 73.

166. Feldmann, F. The salmochelin siderophore receptor IroN contributes to invasion of urothelial cells by extraintestinal pathogenic Escherichia coli in vitro / F. Feldmann, L.J. Sorsa, K. Hildinger [et al.] // Infect Immun. - 2007. - Vol. 75. -P. 3183-3187.

167. Fendukly, F. Isolation of Actinobaculum schaalii and Actinobaculum urinale from a patient with chronic renal failure / F. Fendukly, B. Osterman // J Clin Mi-crobiol. - 2005. - Vol. 43, №7. - P. 3567-3569.

168. Ferretti, J.J. Complete genome sequence of an M1 strain of Streptococcus pyogenes / J.J. Ferretti, W.M. McShan, D. Ajdic [et al.] // Proc Nat Acad Sci USA. -2001. - Vol. 98, №8. - P. 4658-4663.

169. Finegold, S.M. Recently described clinically important anaerobic bacteria: medical aspects / S.M. Finegold, H. Jousimiens-Somer // Clin Infect Dis. - 1997. - 25 (Suppl 2). - P. 88-93.

170. Finucane, T.E. Urinary tract infection and the microbiome / T.E. Finucane // Am J Med. - 2017. - Vol. 130, №3. - P. 97-98.

171. Flores-Mireles, A.L. Urinary tract infection: epidemiology, mechanisms of infection and treatment options / A.L. Flores-Mireles, J.N. Walker, M. Caparon [et al.] // Nat Rev Microbiol. - 2015. - Vol. 13, №5. - P. 269-284.

172. Fischer, H. Pathogen specific, IRF3-dependent signaling and innate resistance to human kidney infection / H. Fischer, N. Lutay, B. Ragnarsdottir [et al.] / PLoS Pathog. - 2010. - Vol. 6. - P. e1001109.

173. Fouts, D.E. Integrated next-generation sequencing of 16S rDNA and metapro-teomics differentiate the healthy urine microbiome from asymptomatic bacteriuria in neuropathic bladder associated with spinal cord injury / D.E. Fouts, R. Pieper, S. Szpakowski [et al.] // J Transl Med. - 2012, № 10. - P. 174.

174. Foxman, B. Virulence characteristics of Escherichia coli causing first urinary tract infection predict risk of second infection // B. Foxman, L. Zhang, P. Tallman [et al.] / J Infect Dis. - 1995. - Vol. 172. - P. 1536-1541.

175. Foxman, B. Urinary tract infection: self-reported incidence and associated costs / B. Foxman, R. Barlow, H. D'Arcy [et al.] // Ann Epidemiol. - 2000. - № 10. - P. 509-515.

176. Foxman, B. Epidemiology of urinary tract infection: incidence, morbidity, and economic costs / B. Foxman // Am J Med. - 2002, № 113. - P. 5-13.

177. Foxman, B. The epidemiology of urinary tract infection / B. Foxman // Nat Rev Urol. - 2010. - № 7. - P. 653-660.

178. Frank, D.N. Culture-independent microbiological analysis of foley urinary catheter biofilms / D.N. Frank, S.S. Wilson, A.L. St Amand [et al.] // PLoS One. -2009. - № 4. - P.7811.

179. Fredricks, D.N. Molecular identification of bacteria associated with bacterial vaginosis / D.N. Fredricks, T.L. Fiedler, J.M Marrazzo // N Engl J Med. - 2005. -Vol. 3353. - P. 1899-1911.

180. Gajer, P. Temporal dynamics of the human vaginal microbiota / P. Gajer, R.M. Brotman, G. Bai [et al.] / Sci Transl Med. - 2012. - Vol. 4. - P. 132-152.

181. Gallagher, D.J.A. Acute infections of the urinary tract and the urethral syndrome in general practice / D.J.A. Gallagher, J.Z. Montgomerie, J.D.K. North // Br Med

J. - 1965. - Vol. 1. - P. 622-626.

182. Galloway-Pena, J. Genomic and SNP analyses demonstrate a distant separation of the hospital and community-associated blades of Enterococcus faecium / J. Galloway-Pena, J.H. Roh, M. Latorre [et al.] // PLoS One. - 2012. - Vol. 7. - P. e30187.

183. Gandee, L. The efficacy of immediate versus delayed antibiotic administration on bacterial growth and biofilm production of selected strains of uropathogenic Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa / L. Gandee, J.T. Hsieh, V. Spe-randio [et al.] // Int Braz J Urol. - 2015. - Vol. 41, №1. - P. 67-77.

184. Gao, Q. Roles of iron acquisition systems in virulence of extraintestinal pathogenic Escherichia coli: salmochelin and aerobactin contribute more to virulence than heme in a chicken infection model / Q. Gao, X. Wang, H. Xu [et al.] // BMC Microbiol. - 2012. - Vol. 12. - P. 143.

185. Garcia-Bravo, M. Urinary tract infection caused by Actinobaculum schaalii in an elderly patient / M. Garcia-Bravo, M.B. Gonzalez-Fernandez, M.A. Garsia-Castro [et al.] // Rev Esp Quimioter. - 2011. - Vol. 24, № 1. - P. 52-53.

186. Garofalo, C.K. Escherichia coli from urine of female patients with urinary tract infection is competent for intracellular bacterial community formation / C.K. Garofalo, T.M. Hooton, S.M. Martin [et al.] / Infect Immun. - 2007. - Vol. 75. - P. 52-60.

187. Gastmeier, P. Dramatic increase in vancomycin-resistant enterococci in Germany / P. Gastmeier, C. Schröder, M. Behnke [et al.] // J Antimicrob Chemother. -2014. - Vol. 69, №6. - P. 1660-1664.

188. Geetha, D. Results of repeat renal transplantation after graft loss from BK virus nephropathy / D. Geetha, S.M. Sozio, M. Ghanta [et al.] // Transplantation. -2011. - № 92. - P. 781-786.

189. Giamarellos-Bourboulis, E. Immunomodulatory clarithromycin treatment of experimental sepsis and acute pyelonephritis caused by multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa / E. Giamarellos-Bourboulis, T. Adamis, G. Laoutaris et al. // Antimicrob. Agents Chemother. - 2004. - Vol. 48, №1. - P. 93-99.

190. Gill, S.R. Insights on evolution of virulence and resistance from complete genome analysis of an early methicillin-resistant Staphylococcus aureus strain and a biofilm-producing methicillin-resistant Staphylococcus epidermidis strain / S.R. Gill, D.E. Fouts, G.L. Archer [et al.] // J Bacteriol. - 2005. - Vol. 187. - P. 24262438.

191. Gilmore, M.S. Genetic structure of the Enterococcus faecalis plasmid pADI-encoded cytolytic toxin system and its relationship to antibiotic determinants / M.S. Gilmore, R.A. Segarra, M.C. Booth [et al.] // J Bacteriol. - 1994. - Vol. 176. - P. 7335-7344.

192. Goldman, L. Approach to the Patient with Urinary Tract Infection / L. Goldman, A.I. Shaffer // Goldman's Cecil Medicine. - 2012. - P. 1791 - 1796.

193. Goodhand, J.R. Mood disorders in inflammatory bowel disease: relation to diagnosis, disease activity, perceived stress, and other factors /J.R. Goodhand, M. Wahed, J.E. Mawdsley [et al.] // Inflamm Bowel Dis. - 2012. - № 18. - P. 23012309.

194. Gottschick, C. The urinary microbiota of men and women and its changes in women during bacterial vaginosis and antibiotic treatment / C. Gottschick, Z.-L. Deng // Microbiome. - 2017. - Vol. 99, № 5. - P. 1-24.

195. Grabe, M. EAU Guidelines on Urological infection (online). / M. Grabe, R. Bar-toletti, T.E. Bjerklund-Johansen [et al.] // European Associaation of Urology Web site. http://uroweb.org/guideline/urologucal-infections/, Updated 2015.

196. Greene, S.E. Human urine decreases function and expression of type 1 pili in uropathogenic Escherichia coli / S.E. Greene, M.E. Hibbing, J. Janetka [et al.] // MBoi. - 2015. - Vol. 6, № 4. - P. e00820.

197. Greenwood, D. Medical microbiology, 18th edition / D. Greenwood, M. Barer, R. Slack [et al.] // Churchill Livingstone, 2012.

198. Grenham, S., Brain-gut-microbe communication in health and diseases / S. Gren-ham, G. Clarke, J.F. Cryan [et al.] // Front Physiol. - 2011, № 2. - P. 94.

199. Groah, S. Pyuria and asymptomatic bacteriuria is associated with novel and specific urine microbiomes / S. Groah, M. Perez-Losada, L. Caldovic [et al.] // J Urol. - 2015. - Vol. 193, №4. - P. 226.

200. Guarner, F. Gut flora in health and disease / F. Guarner, J.R. Malagelada // Lancet. - 2003. - Vol. 361. - P. 512-519.

201. Guidelines on urological infections, EUA, 2014, 88 s.

202. Gupta, K. Short-course nitrofurantoin for the treatment of acute uncomplicated cystitis in women / K. Gupta, T.M. Hooton, P.L. Roberts [et al.] // Arch Intern Med. - 2007. - Vol. 167. - P. 2207-2212.

203. Gupta, K. International clinical practice guidelines for acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women: a 2010 update by the IDSA and ESCMID Guidelines Committee / K. Gupta, T.M. Hooton, K.G. Naber [et al.] // Clin Infect Dis. - 2011. - № 52. - P. 561.

204. Hacker, J. Deletions of chromosomal regions coding for fimbriae and hemolysins occur in vitro and in vivo in various extraintestinal Escherichia coli isolates / J. Hacker, L. Bender, M. Ott [et al.] // Microb Pathog. - 1990. - Vol. 8. - P. 213225.

205. Hagberg, L. Adhesion, hemagglutination, and virulence of Escherichia coli causing urinary tract infection / L. Hagberg, U. Jodal, T.K. Korhonen [et al.] / Infect Immun. - 1981. - Vol. 31. - P. 564-570.

206. Hagberg, L. Contribution of adhesion to bacterial persistence in the mouse urinary tract / L. Hagberg, R. Hull, S. Hull [et al.] / Infect Immun. - 1983. - Vol. 40. - P. 265-272.

207. Hancock, V. Biofilm formation by asymptomatic and virulent urinary tract infections Escherichia coli strains / V. Hancock, L. Ferrieres, P. Klemm // FEMS Microbiol Lett. - 2007. - Vol. 267. - P. 30-37.

208. Hartford, O. The Fbe (SdrG) protein of Staphylococcus epidermidis HB promotes bacterial adherence to fibrinogen / O. Hartford, L. O'Brien, K. Schofield [et al.] // Microbiology. - 2001. - Vol. 147. - P. 2545-2552.

209. Hayami, H. Nationwide surveillance of bacterial pathogens from patients with

acute uncomplicated cystitis conducted by the Japanese surveillance committee during 2009 and 2010: antimicrobial susceptibility of Escherichia coli and Staphylococcus saprophyticus / H. Hayami, S. Takahashi, K. Ishikawa [et al.] // J Infect Chemother. - 2013. - Vol. 19. - P. 393-403.

210. Hawkey P.M. Multidrug-resistant gram-negative bacteria: a product of globalization / P.M. Hawkey // J Hosp Infect. - 2015. - Vol. 89. - P. 241-247.

211. Heilmann, C. Evidence for autolysin-mediated primary attachment of Staphylo-coccus epidermidis to a polystyrene surface / C. Heilmann, M. Hussain, G. Peters [et al.] // Mol Microbiol. - 1997. - Vol. 24. - P. 1013-1024.

212. Heilmann, C. Identification and characterization of a novel autolysin (Aae) with adhesive properties from Staphylococcus epidermidis / C. Heilmann, G. Thumm, G.S. Chhatwal [et al.] // Microbiology. - 2003. - Vol. 149. - P. 2769-2778.

213. Hendrickx, A.P. Expression of two distinct types of pili by a hospital-axquired Enterococcus faecium isolate / A.P. Hendrickx, M.J. Bonten, M. van Luit-Asbroek [et al.] // Microbiol. - 2008. - Vol. 154, № 10. - P. 3212-3223.

214. Hernday, A. Self-perpetuating epigenetic pili switches in bacteria / A. Hernday, M. Krabbe, B. Braaten [et al.] // Proc Nat Acad Sci USA. - 2002. - Vol. 99, № 4. - P. 16470-16476.

215. Hesstvedt, L. Septicaemia due to Actinobaculum schaalii / L. Hesstvedt, V. Has-seltvedt, E. Aandahl [et al.] // Scand J Infect Dis. - 2006. - Vol. 38, №8. - P. 735-737.

216. Hilt, E.E. Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder / E.E. Hilt, K. McKinley, M.M. Pearce [et al.] // J Clin Microbiol. - 2014. - Vol. 52, № 3. P. 871-876.

217. Hisano, M. The bacterial and antimicrobial susceptibility in female recurrent urinary tract infection: how different they are from sporadic single episodes M. Hi-sano, H. Bruschini, A.C. Nicodemo // Urology. - 2015. - Vol. 86, № 3. - P. 492497.

218. Homburg, S. Expression analysis of the colibactin gene cluster coding for a novel polypeptide in Escherichia coli / S. Homburg, E. Oswald, J. Hacker [et al.] //

FEMS Microbiol Lett. - 2007. - Vol. 275, № 2. - P. 255-262.

219. Hooton, T.M. Escherichia coli bacteriuria and contraceptive method / T.M. Hoo-ton, S. Hillier, C. Johnson [et al.] // JAMA. - 1991. - № 265. - P. 64-69.

220. Hooton, T.M. A prospective study of risk factors for symptomatic urinary tract infection in young women / T.M. Hooton, D. Scholes, J.P. Hughes [et al.] // N Engl J Med. - 1996. - № 335. - P. 468-474.

221. Hooton, T.M. Pathogenesis of urinary tract infection: an update / T.M. Hooton // J Antimicrob Chemother. - 2000. - №46. - P. 1-7.

222. Hooton, T.M. Uncomplicated urinary tract infection / T.M. Hooton // N Engl J Med. - 2012. - № 336. - P. 1028-1037.

223. Hooton, T.M. Voided midstream urine culture and acute cystitis in premenopausal women / T.M. Hooton, P.L. Roberts, M.E. Cox [et al.] // N Engl J Med. - 2013.

- Vol. 369. - P. 1883-1891.

224. Hu, K.K. Risk factors for urinary tract infection in postmenopausal women K.K. Hu, E.J. Boyko, D. Scholes [et al.] // Arch Intern Med. - 2004. - Vol. 164, № 9. -P. 989-993.

225. Huang, E.S. National patterns in the treatment of urinary tract infections in women by ambulatory care physicians / E.S. Huang, R.S. Stafford // Arch Intern Med.

- 2002. - Vol. 162. - P. 41-47.

226. Huang, G. Prospective study of polyomavirus BK replication and nephropathy in renal transplant recipients in China: a single-center analysis of incidence, reduction in immunosuppression and clinical course / G. Huang, L.Z. Chen, J. Qui [et al.] // Clin Transplant. - 2010. - № 24. - P. 599-609.

227. Human microbiome project [http://nihroadmap.nih.gov/hmp/, www/human-microbiome.org].

228. Johnson, J.R. Virulence factors in Escherichia coli urinary tract infection / J.R. Johnson // Clin Microbiol Rev. - 1991. - Vol. 4. - P. 80-128.

229. Johnson, J.R. Extended virulence genotypes of Escherichia coli strains from patients with urosepsis in relation to phylogeny and host compromise / J.R. Johnson, A.L. Stell // J Infect Dis. - 2000. - Vol. 181. - P. 261-272.

230. Johnson, J.R. Molecular epidemiology and phylogenetic distribution of the Escherichia coli pks genomic island / J.R. Johnson, B. Johnston, M.A. Kuskowski [et al.] // Clin Microbiol. - 2008. - Vol. 46, № 12. - P. 3906-3911.

231. Johnson, L. Emergence of fluoroquinolone resistence in outpatient urinary Escherichia coli isolates / L. Johnson, A. Sabel, W. Burman [et al.] // Am J Med. -2008. - Vol. 121, № 10. - P. 876 - 884.

232. Johnssen, T.E. The role of imaging in urinary tract infection / T.E. Johnssen // World J Urol. - 2004. - № 22. - P. 392.

233. Juthani-Mehta, M. Nursing home practitioner survey of diagnostic criteria for urinary tract infections / M. Juthani-Mehta, M.A. Drickamer, V. Towle [et al. ] // J Am Geriatr Soc. - 2005. - Vol. 53, № 11. - P. 1986-1990.

234. Kahan, N.R. Longer than recommended empiric antibiotic treatment of urinary tract infection in women: an avoidable waste of money / N.R. Kahan, D.P. Chini-tiz, E. Kahan // J Clin Pharm Ther. - 2004. - Vol. 29, № 1. - P. 59-63.

235. Kahlmeter, G. An international survey of the antimicrobial susceptibility of pathogens from uncomplicated urinary tract infections: the ECO. SENS Project / G. Kahlmeter // J Antimicrob Chemother. - 2003. - Vol. 51. - P. 69-76.

236. Kang, C-I. Clinical practice guidelines for the antibiotic treatment of community-acquired urinary tract infection / C-I. Kang, J. Kim, D.W. Park // Infect Chemother. - 2018. - Vol. 50, № 1. - P. 67-100.

237. Kass, E.H. Chemotherapeutic and antibiotic drugs in the management of infections of the urinary tract / E.H. Kass // Am J Med. - 1955. - Vol. 18, № 5. - P. 764-81.

238. Kass, E.H. Bacteriuria and pyelonephritis of pregnancy / E.H. Kass // Arch Intern Med. - 1960. - Vol. 44. - P. 194-198.

239. Kass, E.H. Pyelonephritis and bacteriuria: a major problem in preventive medicine / E.H. Kass // Ann Intern Med. - 1962. - Vol. 56. - P. 46-53.

240. Karstens, L. Does the urinary microbiome play a role in urgency urinary incontinence and its severity? / L. Karstens, M. Asquith, S. Davin [et al.] // Front Cell Infect Microbiol. - 2016. - № 6. - P. 78.

241. Khasriya, R. Spectrum of bacterial colonization associated with urothelial cells from patients with chronic lower urinary tract symptoms / R. Khasriya, S. Sathia-nanthamoorthy, S. Ismail [et al.] // J Clin Microbiol. - 2013. - Vol. 51. - P. 20542062.

242. Khawcharoenporn, T. High rates of quinolone resistance among urinary tract infections in the ED / T. Khawcharoenporn, S. Vasoo, E. Ward [et al.] // Am J Emerg Med. - 2012. - Vol. 30, № 1. - P. 68 - 74.

243. Kim, Y.B. Virulence factors and genotyping of enterotoxigenic Escherichia coli O128 isolates from clinical specimens / Y.B. Kim, S.Y. Kim, E.G. Lim // J Korean Soc Microbiol. - 1999. - Vol. 45. - P. 211-220.

244. Kim, J-M. Lactobacillus and urine microbiome in association with urinary tract infections and bacterial vaginosis / J-M. Kim, Y-J. Park // UTI. - 2018. - Vol. 13, № 1. - P. 7-13.

245. Kim, W-J. Uropathogenic Escherichia coli invades bladder epithelial cells by activating kinase networks in host cells / W-J. Kim, A.E. Shea, J-H. Kim [et al.] // J Biol Chem. - 2018. - Vol. 293, № 42. - P. 16518-16527

246. Kleine, K.A. Gram-positive uropathogens, polymicrobiol urinary tract infection and the emerging microbiota of the urinary tract / K.A. Kline, A.L. Lewis // Microbiol Spectr. - 2016. - Vol. 4, № 2. - doi: 10.1128/microbiolspec.

247. Kodner, C.M. Recurrent Urinary Tract Infections in Women: Diagnosis and Management / C.M. Kodner, E.K. Gupton // Am Fam Phys. - 2010. - Vol. 82, № 6. - P. 638 - 643.

248. Kogan, M.I. Human Urine Is Not Sterile - Shift of Paradigm / M.I. Kogan, Y.L. Naboka, K.S. Ibishev [et al.] // Urologia Internationalis. - 2015. - Vol. 94, № 4. -P. 445-452.

249. Koschinski, A. Why Escherichia coli alphahemolysin induced calcium oscillations in mammalian cells - the pore is on its own / A. Koschinski, H. Repp, B. Unver [et al.] / FASEB J. - 2006. - Vol. 20. - P. 973-975.

250. Köves, B. The role of the host and the pathogens in urinary tract infection / B. Köves, B. Wullt // Eur Urology Suppl. - 2016. - Vol. 15. - P. 88-94.

251. Kranz, J. Uncomplicated bacterial community-acquired urinary tract infection in adults / J. Kranz, S. Schmidt, C. Lebert [et al.] // Dtsch Arztebl Int. - 2017. - № 114. - P. 866-873.

252. Kunin, C.M. A reasstssment of the importance of «low-count» bacteriuria in yong women with acute urinary symptoms / C.M. Kunin, L.V. With, T.H. Hua // Ann Intern Med. - 1993. - Vol. 119. - P. 454-460.

253. Kunzelmann, K. Flagelling of Pseudomonas aeruginosa inhibits Na+ transport in airway epithelia / K. Kunzelmann, K. Scheidt, B. Scharf [et al.] // FASEB J. -2006. - Vol. 20, № 3. - P. 545-546.

254. Kumazawa, J. Significance of anaerobic bacteria isolated from the urinary tract. II. Experimental studies / J. Kumazawa, H. Kiyohara, S. Momose // Invest Urol. -1976. - Vol. 13, № 4. - P. 309-312.

255. Larios, O.E. First report of Actinobaculum schaalii urinary tract infection in North America / O.E. Larios, K.A. Bernard, K. Manickam [et al.] // Diagn Microbiol Infect Dis. - 2010. - Vol. 67, №3. - P. 282-285.

256. Latthe, P.M. Mycoplsma and ureaplasma colonization in women with lower urinary tract symptoms / P.M. Latthe, P. Toozs-Hobson, J. Gray // J Obstet Gynaecol. - 2008. - № 8. - Р. 519-521.

257. Lane, M.C. Expression of flagella is coincident with uropathogenic Escherichia coli ascension to the upper urinary tract / M.C. Lane, C.J. Alteri, S.N. Smith [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 2007. - Vol. 104. - P. 16669-16674.

258. Langermann, S. Prevention of mucosal Escherichia coli infection by FimH-adhesin-based systemic vaccination / S. Langermann, S. Palaszynski, M. Barnhart [et al.] // Science. - 1997. - Vol. 276. - P. 607-611.

259. Lebreton, F. Emergence of epidemic multidrug-resistant Enterococcus faecium from animal and commensal strains / F. Lebreton, W. van Schaik, A.M. McGuire [et al.] // MBio. - 2013. - Vol. 4. - P. e00534-13.

260. Leclercq, S.Y. Pathogenesis of Streptococcus urinary tract infection depends on bacterial strain and ß-hemolisin/cytolisin that mediates cytotoxicity, cytokine syn-

thesis, inflammation and virulence / S.Y. Leclercq, M.J. Sullivan, D.S. Ipe [et al.] // Sci Rep. - 2016. - Vol. 6. - P. 29000.

261. Leffler, H. Chemical identification of a glycosphingolipid receptor for Escherichia coli attaching to human urinary tract epithelial cells and agglutinating human erythrocytes / H. Leffler, C. Svanborg-Edén // FEMS Microbiol Lett. - 1980. -Vol. 8. - P. 127-134.

262. Leffler, H. Glycolipid receptors for uropathogenic Escherichia coli on human erythrocytes and uroepithelial cells / H. Leffler, C. Svanborg-Edén // Infect Immun. - 1981. - Vol. 34. - P. 920-929.

263. Lerner, A. Spread of KPC-producing carbapenem-resistant Enterobacteriaceae: the importance of super-spreaders and rectal KPC concentration / A. Lerner, A. Adler, J. Abu-Hanna [et al.] // Clin Microbiol Infect. - 2015. - Vol. 21. - P. 470.e1-470.e7.

264. Lewis, D.A. The human urinary microbiome; bacterial DNA in voided urine of asymptomatic adults / D.A. Lewis, R Brown, J. Williams [et al.] // Front Cell Infect Microbiol. - 2013. - № 3. - P. 41.

265. Li, W. Memory and learning behavior in mice is temporally associated with diet-induced alteration in gut bacteria / W. Li, S.E. Dowd, B. Scurlock [et al.] // Physiol Behav. - 2009. - № 96. - P. 557-567.

266. Lipsky, B.A. Diagnosis of bacteriuria in men: specimen collection and culture interpretation / B.A. Lipsky, R.C. Ireton, S.D. Fihn [et al.] // J Infect Dis. - 1987. -Vol. 155. - P. 847-854.

267. Liu, Q. The Enterococcus faecalis MSCRAMM ACE binds its ligand by the Collagen Hug model / Q. Liu, K. Ponnuraj, Y. Xu [et al.] // J Biol Chem. - 2007. -Vol. 282. - P. 19629-19637.

268. Lopes, Mde F. Activity and expression of a virulence factors, gelatinase, in dairy enterocicci / Mde F. Lopes, A.P. Simöes, R. Tenreiro[ et al.] // Int J Food Microbiol. - 2006. - Vol. 112, № 3. - P. 208-214.

269. Lu, P.-L. Epidemiology and antimicrobial susceptibility profiles of gram-negative bacteria causing urinary tract infection in the Asia-Pacific region: 2009-2010 re-

suits from the Study for Monitoring Antimicrobial Resistance Trends (SMART) / P.-L. Lu, Y.-C. Liu, H.-S. Toh [et al.] / Int J Antimicrobial Agents. - 2012. - Vol. 40. - P. 37-43.

270. Ma, J. mtDNA haplogroup and single nucleotidae polymorphisms structure human microbiome communities / J. Ma, C. Coarfa, X. Qin // BMC Genomics. -2014. - Vol. 15. - P. 257.

271. Mabbett, A.N. Virulence properties of asymptomatic bacteriuria Escherichia coli / A.N. Mabbett, G.C. Ulett, R.E. Watts [et al.] // Int J Microbiol. - 2009. - Vol. 299. - P. 53-63.

272. Madigan, M.T. Brock Biology of Microorganisms (13th Edition) / M.T. Madigan, J.M. Martinko, D. Stahl [et al.] // San Francisco: Pearson education, 2012.

273. Madsen, K.L. Normal breast milk limits the development of colitis in IL-10-deficient mice / K.L. Madsen, R.N. Fedorak, M.M. Tavernini [et al.] // Inflamm Bowel Dis. - 2002. - № 8. - P. 390-398.

274. Madsen, K.L. DNA from probiotic bacteria exerts anti-inflammatory actions on intestinal epithelial cells by inhibition of NF-kB / K.L. Madsen, K. Jijon, H. Yeung [et al.] // Gastroenterology. - 2002. - Vol. 122. - P. 1129.

275. Maghdid, D.M. Urine is not sterile: use of enhanced urine culture techniques to detect resident bacterial flora in the adult female bladder / D.M. Maghdid, D.J. Kok // Eur Urol. - 2014. - Vol. 66, № 5. - P. 966.

276. Magri, V. A severely symptomatic case of anaerobic chronic bacterial prostatitis successfully resolved with moxifloxacin therapy / V. Magri, A. Restelli, E. Marras [et al.] // Anaerobe. - 2010. - Vol. 16, № 3. - P. 206-209.

277. Mahjoub-Messai, F. Escherichia coli isolates causing bacteriemia via gut traslo-cation and urinary tract infection in young infants exhibit different virulence genotypes / F. Mahjoub-Messai, P. Bidet, V. Caro [et al.] // J Infect Dis. - 2011. -Vol. 203, № 12. - P. 1844-1849.

278. Mahler, M. FELASA recommendations for the health monitoring of mouse, rat, hamster, guinea pig and rabbit colonies in breeding and experimental units / M.

Mahler, M. Berard, R. Feinstein [et al.] // Laboratory Animals. - 2014. - Vol. 48, № 3. - P. 178-192.

279. Maia, T.M. Polyomavirus infected decoy cells in cytocentrifuged urine cytology specimens from renal transplant recipients / T.M. Maia, S.E. Silva, S.L. Silva [et al.] // Acta Cytol. - 2011. - Vol. 55. - P. 445-448.

280. Mambie, A. Cefoxitin: an alternative to carbapenems in urinary tract infections due to extended-spectrum beta-lactamase-producing Enterobacteriaceae / A. Mambie, F. Vuotto, D. Poitrenaud [et al.] / Med Mal Infect. - 2016. - Vol. 46, № 4. - P. 215-219.

281. Manhart, L.E. Bacterial vaginosis-associated bacteria in men: association of Lep-totrichia/Sneathia spp. With nongonococcal uretrihritis / L.E. Manhart, C.M. Khosropour, C. Liu [et al.] // Sex Transm Dis. - 2013. - Vol. 40. - P. 944-949.

282. Mandell, G.L. Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases / G.L. Mandell, J.E. Bennett, R. Dolin // Book chapter, 8th Edition, 2015. -P. 886-913.

283. Mandlik, A. Pili in gram-positive bacteria: assembly, involvement in colonization and biofilm development / A. Mandlik, A. Swierczynski, A. Das [et al.] // Trends Microbiol. - 2008. - Vol. 16, № 1. - P. 33-40.

284. Marrs, C.F. Escherichia coli mediated urinary tract infections: are there distinct uropathogenic E.coli (UPEC) pathotypes? / C.F. Marrs, L. Zhang, B. Foxman // FEMS Microbiol Lett. - 2005. - Vol. 252. - P. 183-190.

285. Marques, L.P. Epidemiological and clinical aspects of urinary tract infection in community-dwelling elderly women / L.P. Marques, J.T. Flores, O. Barros Junior Ode [et al.] // Braz J Infect Dis. - 2012. - Vol. 16, № 5. - P. 436-441.

286. Maskell, R.M. The natural history of urinary tract infection in women / R.M. Maskell // Med Hypotheses. - 2010. - Vol. 74. - P. 802-806.

287. Matsumoto, T. Nationwide survey of antibacterial activity against clinical isolates from urinary tract infections in Japan (2008) / T. Matsumoto, R. Hamasuna, K. Ishikawa [et al.] // Int J Antimicrob Agents. - 2011. - Vol. 37. - P. 210-218.

288. McGowan, J.J. Does antibiotic restriction prevent resistance? / J.J. McGowan, D. Gerding // New Horiz Baltim Md. - 1996. - Vol. 4. - P. 370-376.

289. McGregor, J.C. Sex- and age-specific trends in antibiotic resistance patterns of Escherichia coli urinary isolated from outpatients / J.C. McGregor, M.R. Elman, D.T. Bearden [et al.] // BMC Fam Pract. - 2013. - Vol. 14. - P.25.

290. Mencarelli, A. Probiotics modulate intestinal expression of nuclear receptor an provide counter-regulatory signals to inflammation-driven adipose tissue activation / A. Mencarelli, E. Distrutti, B. Renga [et al.] // PLoS ONE. - 2011. -№ 6. - P. e22978.

291. Michael, M. Short compared with standard duration of antibiotic treatment for urinary tract infection: a systematic review of randomized controlled trials / M. Michael, E.M. Hodson, J.C. Craig [et al.] // Arch Dis Child. - 2002. - Vol. 87, № 2. - P. 118-123.

292. Michalopoulos, A.S. Infection and inflammation of the genitourinary tract / A.S. Michalopoulos, I.G. Livaditis, V. Gougoutas // Int J infect Dis. - 2011. - Vol. 15.

- P. 732-739.

293. Minardi, D. Urinary tract infections in women: etiology and treatment options / D. Minardi, G. D'Anzeo, D. Cantoro [et al.] // Int Gen med. - 2011. - Vol. 4. - P. 333-343.

294. Miller-Ensminger, T. Bacteriophages of the urinary microbiome / T. Miller-Ensminger, A. Garretto, J. Brenner [et al.] // J Bacteriol. - 2018. - Vol. 200, № 7.

- P. e00738-17.

295. Mills, M. Cytotoxic necrotizing factor type 1 of uropathogenic Escherichia coli kills cultured human uroepithelial 5637 cells by an apoptotic mechanism / M. Mills, K.C. Meysick, A.D. O'Brien // Infect Immun. - 2000. - Vol. 68. - P. 58695880.

296. Mittal, S. Study of virulence factors of uropathogenic Escherichia coli and its antibiotic susceptibility pattern / S. Mittal, M. Sharma, U. Chaudhary // Indian J Pathol Microbiol. - 2014. - Vol. 57, № 1. - P. 61-64.

297. Mohanty, N.K. Incidence of anaerobic bacterial infection following transurethral instrumentation / N.K. Mohanty, B.B. Jolly // Indian J Pathol Microbiol. - 1996.

- Vol. 39, № 1. - P. 33-36.

298. Mond, N.C. Presentation, diagnosis and treatment of urinary tract infections in general practice / N.C. Mond, A. Percival, J.D. Williams [et al.] // Lancet. - 1965.

- Vol. 1. - P. 514-516.

299. Morgan, J. Maternal Sepsis / J. Morgan, S. Roberts // Obstetrics and Gynecology Clinics. - 2013. - Vol. 40, № 1. - P. 69-87.

300. Moustafa, A. Microbial metagenome of urinary tract infection / A. Moustafa, W. Li, H. Singh [et al.] // Scientific Reports. - 2018. - Vol. 8, № 1. -doi:10.1038/s41598-018-22660-8.

301. Mullis, K.B. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerasecatalyzed chain reaction / K.B. Mullis, F.A. Faloon // Methods Enzymol. - 1987. - V. 155. - P. 335-350.

302. Mulvey, M.A. Urinary tract infections: molecular pathogenesis and clinical management / M.A. Mulvey, D.J. Klumpp, A.E. Stapleton // Washington, 2017. - 550 p.

303. Murphy, E.F. Divergent metabolic outcomes arising from targeted manipulation of the gut microbiota in diet-induced obesity / E.F. Murphy, P.D. Cotter, A. Ho-gan [et al.] // Gut. - 2012. - Vol. 62. - P. 220-226.

304. Murray, P.R. Medical Microbiology 8-th edition (United States of America) / P.R. Murray, K.S. Rosental, M.A. Pfaller // Elsevier, 2016. - P. 408-417.

305. Naber, K.G. Surveillance study in Europe and Brazil on clinical aspects and antimicrobial resistance Epidemiology in Females with Cystitis (ARESC): implications for empiric therapy / K.G. Naber, G. Schito, H. Botto [et al.] // Eur Urol. -2008. - Vol. 54. - P. 1164-1175.

306. Nakano, M. Structual and sequence diversity of the pathogenicity island of uropa-thogenic Escherichia coli with encodes the USP protein / M. Nakano, S. Yama-moto, A. Terai [et al.] // FEMS Microbiol Lett. - 2001. - Vol. 205. - P. 71-76.

307. Nallapareddy, S.R. Endocarditis and biofilm-associated pili of Enterococcus fae-calis / S.R. Nallapareddy, K.V. Singh, J. Sillanpaa [et al.] // J Clin Invest. - 2006. - Vol. 116. - P. 2799-2807.

308. Nallapareddy, S.R. A functional collagen adhesin gene, acm, in clinical isolates of Enterococcus faecium correlates with the recent success of this emerging nosocomial pathogen / S.R. Nallapareddy, K.V. Singh, P.C. Okhuysen [et al.] // Infect Immun. - 2008. - Vol. 76. - P. 4110-4119.

309. Nauseef, W.M. How human neutrophils kill and degrade microbes: an integrated view / W.M. Nauseef // Immunol Rev. - 2007. - Vol. 219. - P. 88-102.

310. Nelson, D.E. Characteristic male urine microbiomes associate with asymptomatic sexually transmitted infection / D.E. Nelson, B. Van der Pol, Q. Dong [et al.] // PLoS ONE. - 2010. - Vol. 5, № 11. - P. 14116.

311. Nelson, D.E. Bacterial communities of the coronal sulcus and distal urethra of adolescent males / D.E. Nelson, Q. Dong, B. Van der Pol [et al.] // PLoS ONE. -2012. - Vol. 7. - P. 36298.

312. NHS choices: urinary tract infection in adults. UK National Health Service Web site. http: //www. nhs. uk/conditions/urinary-tract-infection-adults/pages/introduction. aspx, 2015.

313. Neupane, S. Correlation between biofilm formation and resistance toward different commonly used antibiotics along with extended spectrum beta lactamase production in uropathogenic Escherichia coli isolated from the patients suspected of urinary tract infections visiting Shree Birendra Hospital, Chhauni, Kathmandu, Nepal / S. Neupane, N.D. Pant, S. Khatiwada [et al.] / Antimicrob Resist Infect Control. - 2016. - Vol. 5. - P. 5.

314. Nickel, J.C. Urinary tract infections and resistant bacteria / J.C. Nickel // Rev Urol. - 2007. - Vol. 9. - P. 78-80.

315. Nickel, J.C. Application of state-of-the-art methods to search for microbial contributions to the etiology of urological chronic pelvic pain syndrome (CPPS) / J.C. Nickel, A. Stephens, J. Chen [et al.] // American Urological Association Education and Researh, Inc. - 2013. - Vol. 189, № 4. - P. 468-469.

316. Nicolle, L.E. Infection diseases society of America guidelines for the diagnosis and treatment of asymptomatic bacteriuria in adults / L.E. Nicolle, S. Bradley, R. Colgan [et al.] // Clin Infect Dis. - 2005. - № 40. - P. 643-654.

317. Nicolle, L.E. Uncomplicated urinary tract infection in women / L.E. Nicolle, P.A. Anderson, J. Conly [et al.] // Can Fam Physician. - 2006. - № 52. - P. 612-618.

318. Nicolle, L.E. Uncomplicated urinary tract infection in adults including uncomplicated pyelonephritis / L.E. Nicolle // Urol Clin North Am. - 2008. - № 35. - P. 112.

319. Nicolle, L.E. Update in adult urinary tract infection / L.E. Nicolle // Curr Infect Dis Rep. - 2011. - № 13. - P. 552-560.

320. Nielsen, H.L. Actinobaculum schaalii: a common cause of urinary tract infection in the elderly population, bacteriological and clinical characteristics / H.L. Nielsen, K.M. Soby, J.J. Christiensen [et al.] // Scand J Infect Dis. - 2010. - Vol. 42, № 1. - P. 43-47.

321. Nielsen, K.L. Escherichia coli from patients with E.coli urinary tract infection and healthy controls who have never had a urinary tract infection / K.L. Nielsen, P. Dynesen, P. Larsen [et al.] // J Med Microbiol. - 2014. - Vol. 63, № 4. - P. 582-589.

322. Nilsson, M. A fibrinogen-binding protein of Staphylococcus lugdunensis / M. Nilsson, J. Bjerketorp, B. Guss [et al.] / FEMS Microbiol Lett. - 2004. - Vol. 241. - P. 87-93.

323. Noiby, N. Antibiotic resistance of bacterial biofilms / N. Hoiby, T. Bjarnsholt, M. Givskov [et al.] // Int J Antimicrob Agents. - 2010. - Vol. 35. - P. 322-332.

324. Noiby, N. ESCMID guideline for the diagnosis and treatment of biofilm infections 2014 / N. Hoiby, T. Bjarnsholt, C. Moser [et al.] // Clin Microbiol Infect. -2015. - 21 (Suppl 1). - 25 s.

325. Norsworthy, A.N. From catheter to kidney stone: the uropathogenic lifestyle of Proteus mirabilis / A.N. Norsworthy, M.M. Pearson // Trends in Microbiology. -2017. - Vol. 25, №4. - P. 304-315.

326. Nougayrede, J.P. Escherichia coli induced double-strand breaks in eukaryotic

cells / J.P. Nougayrede, S. Homburg, F. Taieb [et al.] // Science. - 2006. - Vol. 313. - P. 848-851.

327. Nowicki, B. Molecular analysis and epidemiology of the Dr hemagglutinin of uropathogenic Escherichia coli / B. Nowicki, C. Svanborg-Eden, R. Hull [et al.] // Infect Immun. - 1989. - Vol. 57. - P. 446-451.

328. Nozarian, Z. Microbial and antimicrobial susceptibility of bacteria implicated in urinary tract infection in Tehran, Iran / Z. Nozarian, A. Abdollahi / Iran J Pathol.

- 2015. - Vol. 10, № 1. - P. 54-60.

329. Ohland, C.L. Effects of Lactobacillus helveticus on murine behavior are dependent on diet and genotype and correlate with alterations in the gut microbiome / C.L. Ohland, K. Lisa, H. Bell [et al.] // Psychoneuroendocrinology. - 2013. - Vol. 35, № 9. - P. 1738-1747.

330. Olin, S.J. Urinary tract infections: treatment/comparative therapeutics / S.J. Olin, J.W. Bartges // Vet Clin North A Small Anim. Pract. - 2015. - Vol. 45, № 4. - P. 721-746.

331. Oliveira, F.A. Virulence characteristics and antimicrobial susceptibility of uropathogenic Escherichia coli strains / F.A. Oliveira, K.S. Paludo, L.N. Arend [et al.] // Genet Mol Res. - 2011. - Vol. 10. - P. 4114-4125.

332. Osborne, N.G. Acute urinary-tract infection: a condition overdiagnosed in women? / N.G. Osborne // J of Gynecologic Surgery. - 2008. - Vol. 24, № 1. - P. 5154.

333. Pace, W.D. Seasonal variation in diagnoses and visits to family physicians / W.D. Pace, L.M. Dickinson, E.W. Staton // Ann Fam Med. - 2004. - № 2. - P. 411417.

334. Paduch, D.A. Viral lower urinary tract infections / D.A. Paduch // Curr Urol Rep.

- 2007. - Vol. 8, № 4. - P. 324-335.

335. Palmer, K.L. Gilmore M.S. Multidrug-resistant enterococci lack CRISPR-cas K.L. Palmer // MBio. - 2010. - Vol. 1. - P. e00227-10.

336. Palmer, K.L. Comparative genomics of enterococci: variation in Enterococcus faecalis, clade structure in E.faecium, and defining characteristics of E.gallinarum and E.casseliflavus / K.L. Palmer, P. Godfrey, A. Griggs [et al.] // MBio. - 2012. - Vol. 3. - P. e00318-11.

337. Pan, P.C. Mutation in fucose synthesis gene of Klebsiella pneumonia affects capsule composition and virulence in mice / P.C. Pan, H.W. Chen, P.K. Wu [et al.] // Exp Biol Med (Maywood). - 2011. - Vol. 236. - P. 219-226.

338. Panesso, D. First characterization of a cluster of VanA-type glycopeptides-resistant Enterococcus faecium, Colombia / D. Panesso, S. Ospina, J. Robledo [et al.] // Emerg Infect Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 961-965.

339. Paulsen, I.T. Role of mobile DNA in the evolution of vancomycin-resistant Enterococcus faecalis / I.T. Paulsen, L. Banerjei, G.S. Myers [et al.] // Scince. -2003. - Vol. 299. - P. 2071-2074.

340. Parsons, S.R. Investigation of uncomplicated recurrent urinary tract infection in women / S.R. Parsons, N.C. Cornish, B. Martin [et al.] // J Clin Urol. - 2016. -Vol. 4. - P. 234-238.

341. Pearce, M.M. The female urinary microbiome: a comparison of women with and without urgency urinary incontinence / M.M. Pearce, E.E. Hilt, A.B. Rosenfeld [et al.] // Mbio. - 2014. - Vol. 5, № 4. - P. e01283-14.

342. Pearce, M.M. The female urinary microbiota in urgency urinary incontinence / M.M. Pearce, M.J. Zilliox, A.B. Rosenfeld [et al.] // Am J Obstet Gynecol. -2015. - Vol. 213, № 3. - P. 347.e1-11.

343. Plos, K. Intestinal carriage of P fimbriated Escherichia coli and the susceptibility to urinary tract infection in young children / K. Plos, H. Connell, U. Jodal [et al.] // J Infect Dis. - 1995. - Vol. 171. - P. 625-631.

344. Poole, K. Pseudomonas aeruginosa: resistance to the max / K. Poole // Front Microbiol. - 2011. - Vol. 2. - P.65.

345. Price, T.K. The clinical urine culture: enhanced techniques improve detection of clinically relevant microorganisms / T.K. Price, T. Dune, E.E. Hilt [et al.] // J Clin Microbiol. - 2016. - № 54. - P. 1216-1222.

346. Prigent, G. Actinobaculum schaalii: A truly emerging pathogen?: Actinobaculum schaalii: un pathogène réellement émergent? / G. Prigent, C. Perillaud, M. Amara [et al.] // New Microbes New Infect. - 2016. - Vol. 11. - P. 8-16.

347. Proctor, L.M. The national institutes of health human microbiome project / L.M. Proctor // Semin Fetal Neonatal Med. - 2016. - Vol. 21, № 6. - P. 368-372.

348. Ragnarsdottir, B. TLR- and CXCR1-dependent innate immunity: insights into the genetics of urinary tract infection / B. Ragnarsdottir, H. Fischer, G. Godaly [et al.] // Eur J Clin Invest. - 2008. - Vol. 38, № 2. - P. 12-20.

349. Ravel, J. Vaginal microbiome of reproductive-age women / J. Ravel, P. Gajer, Z. Abdo [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 2011. - Vol. 108, № 1. - P. 46804687.

350. Reinhard, M. Ten cases of Actinobaculum schaalii infection: clinical relevance, bacterial identification and antibiotic susceptibility / M. Reinhard, J. Prag, M. Kemp [et al.] // J Clin Microbiol. - 2005. - Vol. 43, № 10. - P. 5305-5308.

351. Relman, D.A. New technologies, human-microbe interactions, and the search for previously unrecognized pathogens / D.A. Relman // J Infect Dis. - 2002. - Vol. 186, № 2. - P. 254-258.

352. Relman, D. A molecular perspective of microbial pathogenicity / D. Relman, S. Falkow // Mandell, Douglas, and Bennett's Principles and Practice of Infectious Diseases, ed. 7. Philadelphia: Churchill Livingstone/Elsevier, 2009.

353. Rosa, R. Antimicrobial resistance in urinary tract infections at a large urban ED: factors contributing to empiric treatment failure / R. Rosa, L.M. Abbo, K. Raney [et al.] // Am J Emerg Med. - 2017. - Vol. 35, № 3. - P. 397-401.

354. Rosen, D.A. Detection of intracellular bacterial communities in human urinary tract infection / D.A. Rosen, T.M. Hooton, W.E. Stamm [et al.] // PLoS Med. -2007. - Vol. 4, № 12. - P. 329.

355. Rosen D.A. Utilization of an intracellular bacterial community pathway in Klebsiella pneumonia urinary tract infection and the effects of fimK on type 1 pilus expression / D.A. Rosen // Infect Immun. - 2008. - Vol. 76. - P. 3337-3345.

356. Rosen, D.A. Molecular variations in Klebsiella pneumonia and Escherichia coli

FimH affect function and pathogenesis in the urinary tract / D.A. Rosen, J.S. Pinkner, J.N. Walker [et al.] // Infect Immun. - 2008. - Vol. 76. - P. 3346-3356.

357. Rossignol, L. Risk factors for resistance in urinary tract infections in women in general practice: a cross-sectional survey / L. Rossignol, S. Maugat, A. Blake [et al.] // J Infect. - 2015. - Vol. 71, № 3. - P. 302-311.

358. Rowe, T.A. Diagnosis and management of urinary tract infection in older adults / T.A. Rowe, M. Juthani-Mehta // Infect Dis Ckin N Am. - 2014. - № 28. - P. 7589.

359. Rozdzinski, E. Aggregation substance-mediated adherence of Enterococcus fae-calis to immobilized extracellular matrix proteins / E. Rozdzinski, R. Marre, M. Susa [et al.] // Microb Pathog. - 2001. - Vol. 30. - P. 211-220.

360. Rutherford, S.T. Bacterial quorum sensing: its role in virulence and possibilities for its control / S.T. Rutherford, B.L. Bassler // Cold Spring Harb Perspect Med. -2012. - Vol. 2. - P. a012427.

361. Saha, S. Understanding the patterns of antibiotic susceptibility of bacteria causing urinary tract infection in West Bengal, India / S. Saha, S. Nayak, I. Bhattacharyya [et al.] // Front Microbiol. - 2014. - Vol. 5. - P. 463.

362. Sava, I.G. Pathogenesis and immunity in enterococcal infections / I.G. Sava, E. Heikens, J. Huebner // Clin Microbiol Infect. - 2010. - Vol. 16, № 6. - P. 533540.

363. Salipante, S.J. Large-scale genomic sequencing of extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains / S.J. Salipante, D.J. Roach, J.O. Kitzman [et al.] // Genome Res. - 2015. - Vol. 25, № 1. - P. 119-128.

364. Salvador, E. Comparison of asymptomatic bacteriuria Escherichia coli isolates from healthy individuals versus those from hospital patients shows that long-term bladder colonization selects for attenuated virulence phenotypes / E. Salvador, F. Wagenlehner, C.D. Kohler [et al.] // Infect Immun. - 2012. - Vol. 80. - P. 668678.

365. Santiago-Rodriguez, T.M. The human urine virome in association with urinary tract infections / T.M. Santiago-Rodriguez, M. Ly, N. Bonilla [et al.] // Front Microbial. - 2015. - Vol. 6. - P. 14.

366. Sapico, F.L. Aerobic and anaerobic flora in bladder urine of patients with indwelling urethral catheters / F.L. Sapico, P.A. Wideman, S.M. Finegold // Urology. - 1976. - Vol. 7, № 4. - P. 382-384.

367. Schaeffer, A.J. Infection of the urinary tract / A.J. Schaeffer, M.S. Matulewicz, D.J. Klumpp // Campbell-Walsh Urology. - 2016. - Vol. 12. - P. 237-303.

368. Schields, J. Acute pyelonephritis can have serious complications / J. Schields, A.P. Maxwell // Practitioner. - 2010. - Vol. 254, № 1728. - P. 19-21.

369. Schneeweiss, J. The human urinary microbiome and how it relates to urogynecol-ogy / J. Schneeweiss, M. Koch, W. Umek // Int Urogynecol J. - 2016. - Vol. 27, № 9. - P. 1307-1312.

370. Scholes, D. Risk factors associated with acute pyelonephritis in healthy women / D. Scholes, T.M. Hooton, P.L. Roberts [et al.] // Ann Intern Med. - 2005. - Vol. 142, № 1. - P. 20-27.

371. Scholes, D. Family history and risk of recurrent cystitis and pyelonephritis in women / D. Scholes, T.R. Hawn, P.L. Roberts [et al.] // J Urol. - 2010. - № 184. - P. 564-569.