Микробные процессы круговорота углерода в донных осадках озера Байкал: структура и функционирование микробных сообществ тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.16, доктор биологических наук Земская, Тамара Ивановна

• Земская, Тамара Ивановна
• доктор биологических наук
• 2007

Оглавление диссертации доктор биологических наук Земская, Тамара Ивановна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА Материалы и методы исследования

1.1. Районы исследования, используемые пробоотборники

1.2. Методы химического анализа

1.3. Методы микробиологического анализа

1.4. Молекулярно-микробиологические методы исследования 23 микроорганизмов: ПЦР, клонирование, секвенирование, гибридизация in situ

1.5. Измерение скоростей аэробных и анаэробных процессов

ГЛАВА 2. Литературный обзор

ГЛАВА 3. Донные осадки озера Байкал - среда обитания 48 микроорганизмов

3.1. Геолого-геофизические характеристики, влияющие на 48 деятельность микробных сообществ

3.2. Органическое вещество донных отложений озера Байкал

3.3. Газовый состав и газовые гидраты

3.4. Химический состав поровых вод осадков озера Байкал

ГЛАВА 4. Численность микроорганизмов в донных осадках 96 Байкала

4.1. История исследования микрофлоры донных осадков на 96 Байкале

4.2. Количественная характеристика культивируемых и 99 некультивируемых микроорганизмов, обитающих в донных осадках

ГЛАВА 5. Аэробные процессы, осуществляемые микробными 119 сообществами в донных осадках озера Байкал

5.1. Численность и активность микроорганизмов, 119 осуществляющих аэробные процессы деструкции органического вещества

5.2. Нефтеокисляющие микроорганизмы в районах 121 естественного выхода нефти: пространственное распределение, наличие генов алкангидроксилаз

5.3. Бактериальное окисление метана 144 5.4.Численность, морфология и таксономический состав метанотрофных бактерии в Байкале

5.5. Анализ аэробного метанотрофного сообщества озера Байкал, 161 методом анализа фрагментов гена 168 рРНК и гена мембрансвязанной метанмонооксигеназы (ртоА)

ГЛАВА 6. Деятельность анаэробных микроорганизмов в донных 170 отложениях озера Байкал: процессы ацетогенеза, сульфатредукции, метаногенеза

6.1. Численность анаэробных культивируемых 170 микроорганизмов, участвующих в деструкции органического вещества в осадках озера Байкал

6.2. Микроорганизмы, осуществляющие процессы ацетогенеза и 177 сульфатредукции

6.3. Скорости процесса метаногенеза в донных отложениях озера 182 Байкал

6.4. О возможном анаэробном окислении метана в пресноводном 196 Байкале

ГЛАВА 7. Микробные сообщества осадков в районах 207 субаквальных разгрузок

7.1. Процессы и филогенетическая структура микробных 207 сообществ в районах грязевых вулканов

7.2. Микробные маты в районе гидротермального подводного 223 источника в б. Фролиха

7.3. Микробные сообщества осадков, сформированных в 263 различные временные периоды: голоцене и плейстоцене ЗАКЛЮЧЕНИЕ И ВЫВОДЫ 278 СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробные процессы круговорота углерода в донных осадках озера Байкал: структура и функционирование микробных сообществ»

t восстановленных соединений и углекислоты окружающей морской воды. Исследованиями последних лет на Байкале установлены многочисленные зоны субаквальных разгрузок (Гранин, Гранина, 2002; Клерке и др., 2003; Хлыстов, 2006), где в водную толщу озера поступают разнообразные углеводороды. Открытие гидротермального вента в б. Фролиха на Байкале показало наличие богатого сообщества представителей высших организмов - губок, хирономид, моллюсков, основой для жизнедеятельности которых является древний метан ^ (Кузнецов, 1974; Grachev et al., 1994).

Есть еще один аспект, который инициирует исследование микроорганизмов круговорота углерода, как в мире, так и на Байкале, это открытие больших скоплений газовых гидратов (Кузьмин и др., 1998; Клерке и др., 2003). На настоящее время озеро Байкал является единственным пресноводным водоемом, где обнаружены значительные запасы гидратов метана. Каким образом поддерживается его баланс, и какие микроорганизмы участвуют в образовании и деструкции метана в ультрапресном водоеме, до сих пор оставалось неизвестным.

Следует отметить, что большая часть из перечисленных явлений нова для Байкала и не имеет аналогов в других пресноводных экосистемах, поэтому исследование микроорганизмов и процессов, происходящих в таких районах, имеет теоретическое значение.

Цели и задачи работы:

Целью данной работы было комплексное исследование микроорганизмов, участвующих в круговороте углерода в донных осадках озера Байкал, различающихся геохимическими обстановками: в глубоководной зоне южной, средней и северной котловин, в районах грязевых вулканов, нефтепроявлений и подводного термального источника в б. Фролиха. Были поставлены следующие задачи.

1. Исследовать численность микроорганизмов, участвующих в деструкции органического вещества в донных осадках различных зон и районов озера Байкал.

2. Изучить с помощью радиоактивно-меченных субстратов скорости процессов деструкции органического вещества и выявить ключевые для донных осадков озера Байкал процессы.

3. Изучить микробные сообщества в районах субаквальных разгрузок: грязевые вулканы, подводный термальный источник в б. Фролиха (Северный Байкал).

4. Установить филогенетическое положение байкальских микроорганизмов из этих районов по данным анализа гена 16 Б рРНК и провести сравнение со структурами пресноводных и морских последовательностей.

5. Оценить возможность существования процесса анаэробного окисления метана в ультрапресном водоеме.

6. На основе анализа структуры гена 16 Б рРНК исследовать сообщества микроорганизмов в донных осадках, сформированных в различные временные периоды.

Научная новизна работы: Впервые для исследования микроорганизмов обитающих в осадках Байкала, применен комплексный подход, который включает одновременное изучение физико-химических, геохимических и молекулярно-микробиологических параметров в одних и тех же образцах воды и донных осадков. С использованием данного подхода охарактеризована количественная структура микроорганизмов в разных слоях осадков с учетом экологических условий и времени их формирования. Исследование распространения различных видов аэробных и анаэробных, автотрофных и гетеротрофных, психрофильных, мезофильных и термофильных бактерий показало, что их количество определяется конкретными условиями: наличием кислорода, необходимых для их жизнедеятельности биогенных элементов. Выделены доминирующие в определенных биотопах группы микроорганизмов, оценен их вклад в процессы круговорота углерода и других биогенных элементов.

Впервые проведены масштабные измерения скоростей процессов деструкции органического вещества в донных осадках озера Байкал, в том числе в районах грязевых вулканов и гидротермального вента. Установлено, что на конечных этапах деструкции органического вещества в донных осадках озера Байкала преобладает метаногенез, в большинстве осадков озера Байкал скорость этого процесса значительно превышает сульфатредукцию. При этом большая часть органического вещества используется для синтеза метана. И только в местах поступления антропогенного органического вещества и сульфатов скорость восстановления сульфатов опережает процесс метаногенеза. Поэтому увеличение численности и активности сульфатредукторов в донных осадках отдельных районов озера Байкал может служить индикатором экологического неблагополучия.

Показано, что наиболее интенсивно процессы деструкции осуществляются в местах поступления и концентрации органического вещества. К ним относятся поверхностные слои осадков, куда из фотических слоев водной толщи поступают остатки фитопланктона, и прибрежные районы, особенно приустьевые участки, куда с терригенным и речным сносами поступает значительное количество растительного опада и других органических веществ.

Впервые в районе гидротермального вента в бухте Фролиха (Северный Байкал) исследованы микробные сообщества - микробные маты, основу которых составляют бесцветные серные бактерии рода ТЫор1оса. Получены первые данные по их распространению, экофизиологии и филогенетическом положении.

Впервые с помощью комплекса радиоизотопных, микроскопических, молекулярно-биологических методов исследованы микробные сообщества в районах приповерхностного залегания газовых гидратов, оценена филогенетическая структура сообществ в разных слоях осадка. Биогеохимические данные показывают, что основой сгущения жизни в районах субаквальных разгрузок является деятельность метаногенных, метаноокисляющих и бесцветных серных бактерий, использующих энергию восстановленных газов. Установлено, что в районах поступления флюидов микроорганизмы формируют своеобразный биологический фильтр, препятствуя поступлению сероводорода, метана и других соединений из донных осадков в водную толщу.

Впервые в пресноводном озере с использованием молекулярных методов исследовано сообщество микроорганизмов, ассоциированное с газовыми гидратами. На основе сравнительного анализа фрагментов гена 16Б рРНК установлено, что в осадках преобладают некультивируемые формы бактерий, имеющие низкую степень гомологии со структурами в мировой базе данных. Выявлено, что байкальские последовательности образуют отдельные кластеры, которые могут свидетельствовать о наличии эндемичных бактерий. В районе повышенных концентраций метана с помощью электронной трансмиссионной микроскопии обнаружено большое количество морфологически разнообразных форм бактерий, спор и цист. Наличие внутри клеток внутрицитоплазматических мембран (ВЦМ) позволило идентифицировать их как метанотрофные бактерии. Эти результаты подтверждены данными сравнительного анализа функциональных генов-метанмонооксигеназ, присущих метанотрофным бактериям. Впервые исследовано разнообразие архей в донных осадках озера Байкал, установлено наличие последовательностей, относящихся к царствам Сгепагскаео1а и Еигуагскаео1а.

Основные защищаемые положения диссертации.

1. Распределение и структура сообществ микроорганизмов в донных отложениях озера Байкал определяются химической обстановкой, спектром органических субстратов и наличием субаквальных разгрузок углеводородсодержащих флюидов.

2. В процессе деструкции органического вещества микроорганизмами в донных осадках озера Байкала значительная его часть идет на образование метана. Окисление метана осуществляется аэробными метанотрофами в придонной воде и поверхностном слое осадков, анаэробное окисление возможно лишь в зонах субаквальных разгрузок минерализованных флюидов.

3. В местах субаквальных разгрузок газонасыщенных флюидов на дне Байкала формируются особые микробные сообщества, использующие энергию восстановленных газов для образования органического вещества. Изотопный состав углерода в бентосных организмах и органическом веществе осадков свидетельствует о вовлечении глубинного метана в круговорот углерода.

4. Совокупность молекулярно-биологических данных позволяет утверждать, что байкальские микроорганизмы являются эндемичными, поскольку их подавляющее большинство не имеет близких аналогов в мировой базе данных. Байкал мог быть, и по-видимому, продолжает оставаться потенциальным резервуаром микроорганизмов, способных при благоприятных условиях, завоевывать новые экологические нишы. Практическая значимость. Для микробиологических исследований донных отложений озера Байкал адаптированы и внедрены молекулярные методы. Создана автоматизированная система подсчета бактерий, которая апробирована и используется при проведении мониторинговых работ в Южном Байкале.

Проведенные исследования скоростей образования и деструкции метана необходимы для оценки его вклада в общий круговорот углерода, а также оценки потока поступления из донных осадков в водную толщу и в атмосферу. Эти результаты будут полезны для прогноза возможности катастрофических выбросов метана в водную толщу. Данные по распределению различных видов микроорганизмов, в том числе метанотрофных, могут быть использованы в качестве индикаторных показателей мест разгрузки метана и мониторинга деятельности микроорганизмов.

Создан банк данных байкальских последовательностей фрагментов гена 16Б рРНК и гена рток метанотрофных бактерий, включающий 430 последовательностей, 92 из них зарегистрированы в ЕМВЬ-банке данных. Полученные нуклеотидные последовательности могут служить основой для конструирования зондов для гибридизации, что позволит проводить количественную оценку структуры микробного сообщества донных осадков озера Байкал и оценивать качество его вод.

Личный вклад соискателя. В цикле исследований, входящих в диссертационную работу, соискателю принадлежит решающая роль в выборе направления исследований, использовании методических и экспериментальных подходов, а также в обобщении полученных материалов. Автор принимал непосредственное участие во всех экспедициях, результаты которых вошли в диссертацию. В работах, выполненных в соавторстве, вклад соискателя заключался в постановке научных задач, в непосредственном участии в получении материалов и участии на всех этапах исследований, а также в их обсуждении и подготовке публикаций. Диссертантом сформировано направление, основанное на комплексном подходе исследования микробных сообществ с использованием микробиологических, молекулярных, физико-химических методов.

Исследования были выполнены в рамках планов НИР Института

Механизмы диагенеза байкальских осадков: микробиальные и геохимические процессы» (2001-2003 гг.), «Разработка и апробация комплексной системы химического, биологического и дистанционного мониторинга экологической системы озера Байкал, прогноз состояния экосистемы на ближайшее десятилетие» (2004-2006 гг.), а также при поддержке грантов РФФИ-Байкал № 97-04-96206 и 97-04-96270, РФФИ № 97-04-485, 01-05-97256, 03-05-65289, № 05-05-65291, Интеграционных проектов СО РАН №147 «Природные и синтетические газовые гидраты», №58 «Углеводороды Байкала и роль архей и других микроорганизмов в их деградации и образовании», программ Президиума РАН: №13 «Изменения окружающей среды и климата: природные катастрофы», проект «Исследование биологических сообществ барьерных зон, обеспечивающих формирование чистых вод Байкала и ограничивающих проникновение чужеродных видов»; №18 «Происхождение и эволюция биосферы», проект «Исследование механизмов функционирования микробных сообществ барьерных зон, как основного фактора динамической устойчивости экосистемы озера Байкал».

Апробация работы. Материалы и основные положения диссертации докладывались на российских и международных конференциях: на I (1989), II (1995), III (2000) и IY (2005) верещагинских байкальских конференциях, на конференции НАТО «Байкал - природная лаборатория для исследования изменений окружающей среды и климата» (Иркутск, 1994); на семинаре Института морской микробиологии Макса Планка (Бремен, 2000), на III и IY международных симпозиумах "Ancient Lakes: Speciation, Development in Time and Space, Natural History" (SIAL III), (Иркутск, 2002), (SIAL IY) (Берлин, 2006), на всероссийской конференции «Биоразнообразие и функционирование микробных систем Центральной Азии», Улан-Удэ, 2003; на международном симпозиуме «Газовые гидраты в экосистеме Земли», 2003; международном симпозиуме «Микроорганизмы в экосистемах озер, рек и водохранилищ» (Иркутск, 2003); на 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Slovenia (Ljubljana, 2003); на XV Международной школе морской геологии (Москва,

2003); международном рабочем совещании «Происхождение и эволюция биосферы» (Новосибирск, 2005).

Публикации: Основные материалы диссертации опубликованы в 105 публикациях, в том числе 1 монография, 25 статей в рецензируемых журналах, 3 авторских свидетельства, 77 публикаций в сборниках и материалах конференций.

Благодарности. Автор выражает глубокую признательность научному консультанту д.б.н. Б.Б. Намсараеву.

Автор искренне признателен ак. М.А. Грачеву за его постоянную поддержку, дельные советы, идеи и обсуждение результатов работы на всех этапах ее выполнения. Автор благодарит сотрудников Института профессора С.И. Беликова, д.б.н. Е.В. Лихошвай за помощь на завершающем этапе выполнения работы. Огромное спасибо зав. лаб. водной микробиологии к.б.н.

B.В. Парфеновой, профессору В.В. Дрюккеру, Шубенковой О.В., Черницыной

C.М., Павловой О.Н., Косторновой Т.Я., и другим, за разностороннюю поддержку и помощь в сборе материалов. Отдельное спасибо О. М. Хлыстову, без участия, которого эта работа навряд бы была выполнена.

Автор выражает глубокую признательность сотрудникам лаб. гидрохимии и химии атмосферы Т.П. Погодаевой, Л.П. Голобоковой, лаб. палеоклиматологии С.С. Воробьевой, Е.П. Чебыкину, А.Г. Горшкову, сотрудникам лаб. водных беспозвоночных д.б.н. O.A. Тимошкину, В.И. Провиз.

Автор выражает глубокую признательность сотрудникам лаборатории микробиологии Института общей и экспериментальной биологии СО РАН О.П. Дагуровой, С. Бурухаеву и всем остальным, за поддержку и помощь в сборе материала для диссертации. Автор искренне благодарен сотруднику Институт океанологии РАН A.B. Егорову за конструктивные дискуссии и помощь в сборе и обработке материала для диссертации, а также сотрудникам Института микробиологии РАН Г.А. Дубининой и Н.М. Дульцевой за обсуждение полученных материалов. Работа выполнена в тесном сотрудничестве с зарубежными учеными, и автор выражает благодарность проф. Э Ваде, X. w

Шоджи, Я. Клерксу, М. Батисту, Бо Б. Иергенсу, Р. Амману, Е.Ф. Зайчикову и др.

Автор выражает глубокую признательность команде НИС «Верещагин» и капитанам О.Г. Калинину и A.B. Священкову за помощь в отборе материалов.

Автор благодарит всех сотрудников Лимнологического института СО РАН, чью поддержку и внимание автор чувствовал постоянно.

Структура и объем диссертации. Работа состоит из введения и 7 глав, ^ списка литературы, содержащего 406 источников, в том числе на иностранном

Заключение диссертации по теме «Экология», Земская, Тамара Ивановна

Выводы

1. Впервые сочетанием методов классической и молекулярной микробиологии исследован состав микробных сообществ верхнего слоя осадков озера Байкал в различных геохимических обстановках: в глубоководной толще южной, средней и северной котловин, в районах грязевых вулканов, нефтепроявлений и подводного термального источника. В аэробной зоне обнаружены представители альфа-, бета-, гамма-протеобактерий, Nitrospirae, Actinobacteria, Verrucomicrobia, ЦФБ, Acidobacteria, Planctomycetes, Chloroflexi, Synechococcus, Clostridium, Euryarchaeota, Crenarchaeota, в анаэробной представители альфа-, гамма-, дельта-, бета- протеобактерий, Planctomycetes, грам-положительные, Euryarchaeota, Crenarchaeota.

2. Сравнительный анализ нуклеотидных последовательностей гена 16S рРНК в осадках озера Байкал свидетельствует о более разнообразном таксономическом составе микроорганизмов современных осадков по сравнению с микроорганизмами осадков, сформированных в плейстоцене. Применение различных праймеров для анализа одного образца ДНК значительно расширил спектр идентифицированных последовательностей.

3. Значительная часть органического вещества осадков озера Байкал используется для образования метана, расход углерода на этот процесс (33 1

2288,4 мкг С дм' сут") превышает расход на сульфатредукцию (0.47-41 мкг

3 1

С дм" сут" ). Основным путем синтеза метана в поверхностных слоях пелагических осадков является автотрофный метаногенез (97-99%), в глубинных слоях этих осадков и в осадках мелководных районов -ацетоклассический (29-98%).

4. Анализ данных измерений стабильных изотопов углерода метана, органического вещества, бактериальных матов и бентосных организмов в зонах субаквальных разгрузок газонасыщенных флюидов свидетельствует о вовлечении глубинного метана в круговорот углерода. Облегченный изотопный состав в бентосных животных (- 40 - -66 %о) указывает на то, что они используют углерод метана биогенного происхождения.

5. Наиболее высокие скорости окисления метана (0,12-4,7 мл СН4 дм"3 сут*1), обеспечиваются микроорганизмами поверхностных слоев осадка в районах субаквальной разгрузки метана: в районах грязевых вулканов, подводного источника в б. Фролиха, естественных нефтепроявлений. На границе раздела «вода-донные осадки» этих районов численность метанотрофных бактерии составляет 107 кл/мл, против 10-104 кл/мл в обычных. Молекулярно-микробиологический анализ показал у байкальских последовательностей наличие генов, ответственных за синтез метанмонооксигеназ, обеспечивающих окисление метана. В донных осадках Байкала преобладают метанотрофные бактерии I типа, имеющие наибольшее сходство с представителями рода МеЖуЬЬаМег.

6. В местах субаквальных разгрузок газонасыщенных флюидов формируются особые микробные сообщества, которые в процессе жизнедеятельности используют энергию восстановленных газов, препятствуя их поступлению в водную толщу озера. В районе гидротермального вента в б. Фролиха основу сообщества составляют бесцветные серные бактерии рода ТЫор1оса, в районах грязевых вулканов наряду с эубактериями, широко представлены археи царства Еигуагскаео1а, относящиеся к порядку МеШапозагстакБ. Филогенетический анализ бесцветных серных бактерий рода ТШор1оса из подводного термального источника в б. Фролиха показал, что они кластеризуются с пресноводными видами этого рода, процент гомологии с видом Т. пса составляет 99%.

7. Профили концентраций метана в донных осадках районов грязевых вулканов свидетельствуют о его окислении в анаэробной зоне. Филогенетический анализ последовательностей архейной компоненты микробных сообществ из этих осадков показал, что они принадлежат к порядку Ме1капо$аеШ, что и группы АЫМЕ-1 и АЫМЕ-2, участвующие в анаэробном 'окислении метана в морских экосистемах. Как и для водной толщи озера Байкал, последовательности байкальских архей образуют отдельные кластеры, процент сходства с известными последовательностями в мировой базе данных составил 85 - 94%.

8. Совокупность молекулярно-биологических данных позволяет утверждать, что байкальские микроорганизмы являются эндемичными, поскольку их подавляющее большинство не имеет близких аналогов в мировой базе данных. Этот факт может быть следствием того, что Байкал является уникальным пресноводным водоемом, который существует непрерывно, по крайней мере, 8 млн. лет, и никогда не высыхал и не менял существенно свою соленость. Таким образом, Байкал мог быть, и, по-видимому, продолжает оставаться потенциальным резервуаром микроорганизмов, способных при благоприятных условиях, завоевывать новые места обитания.

§

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Микробиологические исследования, проведенные в различных районах озера Байкал, показали, что в донных отложениях широко распространены различные виды аэробных и анаэробных, автотрофных и гетеротрофных, психрофильных, мезофильных и термофильных бактерий. Количественные исследования их деятельности показывают важную роль этих групп микроорганизмов в круговороте биогенных элементов, продукции, трансформации и деструкции органического вещества. Они играют определяющую роль в установлении динамического равновесия между биогеохимическими процессами в донных отложениях и водной толще озера.

Изучение биоразнообразия микробного сообщества донных осадков озера Байкал разными методами свидетельствует о более разнообразном таксономическом составе микроорганизмов современных осадков по сравнению с осадками, сформированными в период похолодания в > плейстоцене. В районах субаквальных разгрузок выявлены аномалии состава поровых вод, определен характер их проявлений. В бухте Фролиха (Северный Байкал), районах грязевых вулканов, естественных выходов нефти обнаружены уникальные природные сообщества бактерий, использующие глубинные восстановленные вещества. Они образуют бактериальный фильтр между вулканогенными флюидами и экосистемой озера.

Для функционирования экосистемы Байкала очень важной компонентой является цикл метана. По данным Егорова A.B. (Егоров, 2003; Намсараев и др., 2006), его концентрации в придонных слоях воды и поверхностных слоях осадка гораздо выше, чем в водном теле. Анализ кривых распределения метана на границе вода-донные осадки свидетельствует о его активной деструкции в данной зоне. Это подтверждается данными исследований численности метанотрофных бактерий, она оказалась высокой на протяжении всего периода исследований (105-106 кл/мл) и сопоставима с численностью данной группы бактерий в морских экосистемах (Пименов,

2004), где отмечено наличие грязевых вулканов и холодных метановых сипов. Молекулярно-биологические исследования свидетельствуют о наличии в микробном сообществе бактерий в поверхностных горизонтах осадка (0-5 см), имеющих функциональный ген мембрансвязанной метанмонооксигеназы (ртоА). Сравнительный анализ полученных последовательностей байкальских метанотрофных бактерий показал их низкое сходство (92 %) с метанотрофами первого типа пресноводного озера Вашингтон. С помощью ультратонких срезов бактерий выявлено наличие внутрицитоплазматических мембран, характерных для метанотрофов первого и второго типа. Эти данные свидетельствуют о более широком спектре видов, чем удалось нам идентифицировать с помощью методов молекулярного анализа. Поэтому в будущем исследования в этом направлении необходимо продолжить и с применением других методов исследования.

Исследования изотопного состава углерода метана свидетельствуют о том (Калмычков и др., 2006), что в Байкале метан в основном, имеет биогенное происхождение. В его образовании участвует специализированная группа строго анаэробных автотрофных и гетеротрофных бактерий -метаногенов. Это подтверждается результатами расчета использования органического углерода в терминальных микробных процессах. Очевидно, что в донных осадках озера Байкал большая часть органического вещества

3 1 используется для синтеза метана. В дм" сут" на образование метана расходуется от 0,01 до 2288,4 мкг С, что значительно больше, чем идет на бактериальное восстановление сульфатов.

Кривые концентраций метана в донных осадках районов грязевых вулканов, поступление высоких концентраций сульфата с глубинным флюидом свидетельствуют об анаэробном окислении метана в локальных районах. Филогенетический анализ последовательностей архейной компоненты микробных сообществ из этих осадков показал, что они принадлежат к тому же порядку Ме1капо8ае1а, что и группы АЫМЕ-1 и

ANME-2), участвующими в анаэробном 'окислении метана в морских экосистемах. Как и для водной толщи озера Байкал, последовательности байкальских архей имеют низкий процент сходства с известными последовательностями (85 - 94%).

Методом анализа гена 16S рРНК показано широкое разнообразие видов бактерий, обитающих в донных осадках озера Байкал. Подавляющее большинство исследованных байкальских бактерий проявляют низкую степень гомологии с некультивируемыми бактериями, выделенными из природных образцов воды и осадков морских и пресноводных экосистем. Процент гомологии байкальских последовательностей с известными в GeneBank составил 84-95%. Наиболее высокий процент гомологии отмечен с культивируемыми представителями родов Pseudomonas, Ralstonia, Clostridium (95-99%).

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Земская, Тамара Ивановна, 2007 год

1. Абрамочкина, Ф.Н. Микробиологическое окисление метана в пресном водоеме Текст. / Ф.Н. Абрамочкина, Л.В. Безрукова, А.В. Кошелева // Микробиология. 1987. - Т. 56, № 3. - С. 464 - 471.

2. Белькова Н.Л. Таксономическое разнообразие микробного сообщества водной толщи озера Байкал: Автореф. дис. канд. биол. наук: 03.00.16, 03.00.07 / Н.Л. Белькова; Дальневосточный государственный университет МО РФ. В., 2004. - 20 с.

3. Беляев, С.С. Радиоизотопный метод определения интенсивности бактериального метанобразования Текст. / С.С. Беляев, М.В. Иванов //Микробиология. 1975. - Т. 44. - С. 166 - 168.

4. Беляев, С.С. Метанобразующие бактерии: биология, систематика,применение в биотехнологии Текст. / С.С. Беляев // Успехи микробиологии. -1988.-Вып. 22.-С. 68-79.

5. Богданов, Ю.А. Обнажения миоценовых осадков на дне озера Байкал и время сбросообразования (по наблюдениям с подводных обитаемых аппаратов 'Пайсис') Текст. / Ю.А. Богданов, Зоненшайн Л.П. // Докл. АН СССР. 1991. - Т. 320, № 4. - С. 931-933.

6. Бонч-Осмоловская, Е.А. Образование метана сообществамимикроорганизмов Текст. / Е.А. Бонч-Осмоловская // Успехи микробиологии. -М.: Наука, 1979.-Вып. 14.-С. 106- 123.

7. Вайнштейн, М.Б. Спрообразующая, сульфатредуцирующая бактерия БезШ/оЮтасиШт §иио1йеит эр. поу. Текст. / М.Б.Вайнштейн, Г.И. Гоготова // Микробиология. 1983. - Т. 52, вып. 5. - С. 789 - 793.

8. Вайнштейн, М.Б. Сульфатвосстанавливающие бактерии водоемов: экология и кластерирование Текст. / М.Б. Вайнштейн // Прикладная биохимияи микробиология.- 1996.-Т. 32, № 1.-С. 136- 143.

9. Вайнштейн, М.Б. Характеристика тионовых бактерий озер Марийской АССР Текст. / М.Б. Вайнштейн // Микробиология. 1975. - Т. 44, вып. 1.-С.98- 104.

10. Верхозина, В. А. Микробиальные процессы круговорота азота в Байкале Текст. /В.А. Верхозина //Микроорганизмы в экосистемах озер и водохранилищ. Н.: Наука, 1985. С. 33 - 42.

11. Вильяме, Д.Ф. Геохимические индикаторы продуктивности источники органического вещества в поверхностных осадках оз. Байкал Текст. / Д.Ф. Вильяме,. Лиин Чин, Е.Б. Карабанов, А.Н. Гвоздков // Геология и геофизика.- 1993.-Т. 34, № 10-11. С. 136- 148.

12. Виноградский, С.Н. Микробиология почвы. Проблемы и методы 50 лет исследований Текст. / С.Н. Виноградский; М.: Изд-во АН СССР, 1952.

13. Власова, Л.К. О стоке взвешенных наносов рек Байкала Текст. / Л.К. Власова// Донные отложения Байкала. 1970. - С. 60-63.

14. Волков, И.И. Первичная продукция водоемов Текст. / И.И. Волков; Минск: Изд-во АН БССР, 1960. - 329 с.

15. Волков И.И. Геохимия серы в осадках океана Текст. / И.И. Волков; -М.: Наука, 1984.-272 с.

16. Вотинцев, К. К. Гидрохимия озера Байкал Текст. / К. К. Вотинцев; Академ, наук СССР, Сиб. отд., вост.- сиб. филиал, труды Байк. лимн. ст. М.: Изд-во АН СССР, 1961. - Т. 20. - 302, е.; 26 см. - Библиогр.: с. 302 - 309. - 1000 экз.

17. Вотинцев, К.К. К вопросу о современном осадкообразовании в Байкале Текст. / К.К. Вотинцев // Докл. АН СССР. 1967. - Т. 174, № 2. - С. 419-422.

18. Выхристюк, Л.А. О поступлении и распределении основных химических элементов в донных отложениях Байкала Текст. / Л.А. Выхристюк // Литология и полезные ископаемые. 1977. - № 1. - С. 54 - 65.

19. Выхристюк, Л.А. Органическое вещество и его преобразование в донных отложениях Текст. / Л.А. Выхристюк // Труды ЛИН СО АН СССР. -1975. Т. 21, № 41. - Динамика Байкальской впадины. - С. 202 - 203.

20. Галимов, Э.М. Геохимия стабильных изотопов углерода Текст. / Э.М. Галимов; М.: Наука, 1968. - 226 с.

21. Галимов, Э.М. Исследования органического вещества и газов в осадочной толще Мирового океана Текст. / Э.М. Галимов, Л.А. Кодина; М.: Наука, 1982.- 126 с.

22. Гальченко, В.Ф. К вопросу об анаэробном окислении метана Текст. / В.Ф. Гальченко // Микробиология. 2004 а. - Т. 73, №5. - С. 698-707.

23. Гальченко, В.Ф. Интенсивности микробного образования и окисления метана в донных осадках и водной толще Черного моря Текст. / В.Ф. Гальченко А.Ю. Леин, М.В. Иванов // Микробиология. 2004 б. - Т. 73, №2.-С. 271-283.

24. Гальченко, В.Ф. Выделение и свойства новых штаммов облигатных метанотрофов Текст. / В.Ф. Гальченко, В.Н. Шишкина, Н.Е. Сузина, Ю.А. Троценко // Микробиология. 1977. - Т. 46. - С. 890-897.

25. Гальченко, В.Ф. Метанотрофные бактерии Текст. / В.Ф. Гальченко; -М.: ГЕОС, 2001.-500 с.

26. Гальченко, В.Ф. Таксономия и идентификация облигатных метанотрофных бактерий Текст. / В.Ф. Гальченко, Андреев Л.В., Троценко Ю.А; Пущино: НЦБН АН СССР, 1986 - 96 с.

27. Гальченко, В.Ф. 1994 Сульфатредукция, метанобразование и метанокисление в различных водоемах Оазиса Бангер Хиллс, Антарктида. Текст. / В.Ф. Гальченко // Микробиология. 1994. - Т. 63ю - С. 683 - 698.

28. Голдырев Г. С. Осадкообразование и четвертичная история котловины Байкала Текст. / Г. С. Голдырев. Новосибирск: Наука. Сиб. отд-ние, 1982. 182 е.; 20 см. -Библиогр.: с. 179-181. -300 экз.

29. Головачева, P.C. Биология аэробных термоацидофильных хемолитотрофных бактерий Текст. / P.C. Головачева // Хемосинтез: к 100-летию открытия С.Н. Виноградским. М.: Наука. - 1989. - С. 123 - 138.

30. Голубев, В. А. Очаги субаквальной гидротермальной разгрузки и тепловой баланс Северного Байкала Текст. / В. А. Голубев // Доклады РАН. -1993.- Т. 328, №3.-С. 315-318.

31. Гольдберг, Е. Л. Урановый сигнал влажности палеоклиматов в осадках озера Байкал Текст. / Е. JI. Гольдберг, Е. П. Чебыкин, С.С. Воробьева, М.А. Грачев // ДАН. 2005. - Т. 400. - С. 72-77.

32. Гольдберг, E.JI. Геохимические индикаторы изменений палеоклимата в осадках озера Байкал Текст. / E.JI. Гольдберг, М.А. Федорин, М.А. Грачев, К.В. Золотарев, О.М. Хлыстов // Геология и геофизика. 2001. -Т. 42, № 1-2.-С. 76-86.

33. Гоман, Г. А. Процессы аэробного распада клетчатки в грунтах Байкала Текст. / Г.А. Гоман // Микробиология. 1973. - Т. 42, вып. 1. - С. 148 -153.

34. Гоман, Г. А. Бактериальное восстановление сульфатов и окисление сульфидов в грунтах Байкала Текст. / Г. А. Гоман // Гидробиологический журнал, 1975.-Т. 11, №5.-С. 18-22.

35. Гоман, Г.А, Бактериальная деструкция Текст. / Г.А. Гоман // Экология Южного Байкала. 1983. - С. 78 - 83.

36. Горбенко, А. Ю. О возможности количественного учета олигокарбофильного (олиготрофного) бактериопланктона на богатой питательной среде Текст. / А.Ю. Горбенко, А. Н. Дзюбан // Микробиология. -1992. Т. 61,№3.-С. 531 -532.

37. Горленко, М. В. Экология водных микроорганизмов Текст. / М. В. Горленко, Г. А. Дубинина, С. И. Кузнецов. М.: Наука, 1977. - 289, [2] е., 99 с. ил.; 22 см. - Библиогр.: с. 264 - 285. - 1700 экз.

38. Горшков, А. Г. Углеводороды в байкальской воде на участках нефтепроявлений Текст. / А.Г. Горшков, Т.Н. Земская, A.JI. Верещагин, О.М.

39. Хлыстов // Перспективы нефтегазоносности Байкала и Западного Забайкалья: Тез. докл. 2003. - С. 68 - 69.

40. Гранин, Н.Г. Газовые гидраты и выходы газов на Байкале Текст. / Н.Г. Гранин, JI.3. Гранина // Геология и геофизика. 2002. - Т. 43. - С.629-637.

41. Гранина, JI. 3. Аномалии состава поровых вод донных осадков Байкала Текст. /Л. 3. Гранина, Е. Каллендер, И. С. Ломоносов, В. Д. Матц // Геология и геофизика. 2001. - V. 42. - Р. 362-372.

42. Гранина, Л.З. Аккумуляция биогенного кремнезема в донных отложениях Байкала Текст. / Л.З. Гранина, М.А. Грачев, Е.Б. Карабанов, В.М. Купцов, М.К. Шимараева, Д.Ф. Вильяме// Геология и геофизика. 1993. - Т. 34, № 10-11.-С. 149-159.

43. Гранина, Л.З. Газогидраты 2000: первые сведения. Текст. / Л. 3. Гранина, Ж. Клерке, Н.Г. Гранин, Т.Н. Земская, Л.П. Голобокова, О.М. Хлыстов, A.A. Жданов, Р.Ю.Гнатовский // Третья Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. 2000. - С. 68.

44. Грачев, М. А. Глубинная вода озера Байкал природный стандарт пресной воды Текст. / М. А. Грачев, В. М. Домышева, Т. В. Ходжер // Химия в интересах устойчивого развития. - 2004. - № 12. - С. 417-429.

45. Грачев, М. А. О современном состоянии экологической системы озера Байкал Текст. / Михаил Грачев. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2002. -156 [3] е., 57 с. ил.; 22 см.- Библиогр.: с.141-153.- 1000 экз. - ISBN 5-7692-04818.

46. Громов, Б. В. Экология бактерий. Текст. / Б. В. Громов, Т. В. Павленко. Л.: Изд- во Ленингр. ун-та, 1989; 22 см.- Библиогр.: с.141-153.-1000 экз. - ISBN 5-7692-0481-8.

47. Дагурова, О.П. Бактериальные процессы цикла метана в донных осадках озера Байкал Текст. / О.П. Дагурова, Б.Б. Намсараев, Л.П. Козырева, Т.П. Земская, Л.Е. Дулов // Микробиология. 2004. - Т.74, №2. - С. 248-257.

48. Дзюба, A.A. Ископаемые соленые озера и их разрушение в дельте Селенги Текст. / A.A. Дзюба, Н.В. Кулагина, Т.Ю. Богатырева, В.П. Исаев, Н.Г. Коновалова, И.С. Ломоносов //География и природ, ресурсы. 2001. - Т. 3. -С. 61-65.

49. Дзюба, А. А. Реликтовые соленые озера дельты Селенги Текст. / А. А. Дзюба, Н. В. Кулагина // Третья Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. 2000. - С. 76.

50. Дзюбан, А.Н. Численность бактерий и процессы превращения метана в донных отложениях водохранилищ Волги и Камы Текст. /А.Н. Дзюбан // Микробиология. 1998. - Т. 67., №4. - С. 573-575.

51. Дзюбан, А.Н. Интенсивность микробиологических процессов круговорота метана в разнотипных озерах Прибалтики Текст. / А. Н. Дзюбан //Микробиология. 2002. - Т. 71, №1. - С. 111-118.

52. Драбкова, В.Т. Зональное изменение интенсивности микробиологических процессов в озерах Текст. / В.Т. Драбкова. JI.: Наука. Ленингр. отд-ние, 1981. - 212, с; 22 см.- Библиогр.: с. 141-153.- 1000 экз. - ISBN 5-7692-0481-8.

53. Дроздов, В.Н. Компьютерная система учета изображений флюоресцентно-окрашенных бактерий Текст. / В.Н. Дроздов, В.Н. Сергеева, С.Ю. Максименко, Т.И. Земская //Микробиология. 2006. - Т. 75, № 6. С. 751 -755.

54. Дубинина, Г.А. Выделение и таксономическое изучение бесцветных серобактерий рода Thiodendron Текст. / Г.А. Дубинина, Н.В. Лещева, М.Ю. Грабович //Микробиология. 1993. - Т. 62, вып. 4. С. 717 - 732.

55. Дубинина, Г.А. Бесцветные серобактерии Текст. / Г.А. Дубинина // Хемосинтез: к 100-летию открытия С.Н. Виноградским. М.: Наука. - 1989. -С. 76- 1100.

56. Егоров, A.B. Биогеохимия метана в осадках Балтийского и Черного морей: кинетические модели диагенеза Текст. / A.B. Егоров //Океанология. -2000. Т. 40, № 5. - С. 690 - 696.

57. Егоров, A.B. Основные закономерности распределения метана в воде и осадках оз. Байкал Текст. / A.B. Егоров, Т.И. Земская, М.А. Грачев // Четвертая Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. -2005.-С 76-77.

58. Егоров, A.B. Исследование распределения метана в воде и осадках северо-восточной части Черного моря 1999-2002 гг. Текст. / A.B. Егоров // XVсъезд Международной школы морской геологии: Тез, докл. Москва. 2003. - Т. II С. 167-168.

59. Заварзин, Г. А. Развитие микробных сообществ в истории Земли Текст. / Г. А. Заварзин // Труды Института микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН, Вып. XII, Юбилейный сборник к 70-летию Института. -М.: Наука. 2004. - С. 149 - 172.

60. Заварзин, Г. А. Изучение микробного разнообразия в Институте микробиологии им. С.Н. Виноградского Текст. / Г. А. Заварзин // Микробиология. 2004. - Т. 73, № 5. - С. 598 - 612.

61. Заварзин, Г. А. Введение в природоведческую микробиологию: Учебное пособие Текст. / Г. А. Заварзин, Н. Н. Колотилова. М.: Книжный дом «Университет», 2001. - 256 е., ил.; 20 см. - Библиогр.: с. 254 - 255. - 3000 экз., ISBN 5-8013-0124-0.

62. Заварзин, Г. А. К понятию микрофлоры рассеяния в круговороте углерода Текст. / Г.А. Заварзин //Журнал общей биологии. 1970. - Т. 31, № 4. -С. 386-393.

63. Заварзин, Г. А. Лекции по природоведческой микробиологии Текст. / Г. А. Заварзин; Отв. ред. Н. Н. Колотилова; Ин-т микробиологии. М.: Наука, 2003. - 348 [8] е.; 21 см. - Библиогр.: с. 340 - 341.-510 экз., ISBN 5-02006454-8.

64. Заварзин, Г. А. Литотрофные микроорганизмы Текст. / Г. А. Заварзин. М.: Наука, - 1972. - 323 е.; 20 см. - Библиогр.: с. 318 - 320. - 1000 экз.

65. Заварзин, Г.А. Бактерии и состав атмосферы Текст. / Г.А. Заварзин. М.: Наука, 1984. - 199 с; 22 см.- Библиогр.: с.141-153,- 1000 экз. - ISBN 57692-0481-8.

66. Земская, Т. И. Пространственное распределение бактерий различных физиологических групп в районе подводного термального источника в бухте Фролиха, Северный Байкал Текст. / Т. И. Земская, Б. Б.

67. Намсараев, H. M. Дульцева, T. A. Ханаева, JI. П. Голобокова, JI. Е. Дулов // Микробиология. 2001. - Т. 70, № 3. - С. 429-431.

68. Нечесов, И.А. Текст. / И.А. Нечесов, О.И. Нечесова //Лимнология горных водоемов. Ереван, 1984. - С. 188 - 189.

69. Иванов, М.В. Геологическая микробиология Текст. / М.В. Иванов, Г.И. Каравайко //Микробиология. 2004. - Т. 73, № 5. - С. 581 - 597.

70. Иванов, М.В. Круговорот серы в озерах и водохранилищах Текст. / М.В. Иванов // Глобальный биохимический цикл серы и влияние на него деятельности человека. М.: Наука, 1983. - С. 305 - 309.

71. Иванов, М.В. Применение изотопов для изучения интенсивности процесса редукции сульфатов в озере Беловодь Текст. / М.В. Иванов // Микробиология. 1956. - Т. 25, вып. 3. - С. 305 - 309.

72. Исаев В. П., Преснова Р. Н. Байкальская нефть // Нефть и газ в современном мире: Геолого-экономические и социально-культурные аспекты. Иркутск.-2003. С. 44-51.

73. Исаев, В. П. Отчет о проведении науно-производственных работ в 2002 2004 гг. на тему: «Геолого-геохимическое изучение перспектив нефтегазоносности Баргузинской впадины» Текст. / В. П. Исаев, A.A. Широбон // Росгеолфонд, фонды БГЦ, 2005. - 235 с.

74. Исаев, В. П. Природные газы Байкала Текст. / В. П. Исаев, Н. Г. Коновалова, П. В. Михеев // Геология и геофизика. 2002. - Т. 43. - С. 638 -643.

75. Калл истова, А.Ю. Сульфат редукция и метаногез в меромиктических озерах Шира и Шунет Текст. / А.Ю. Каллистова, М.В. Кевбрина, Н.В. Пименов, И.И. Русанов, Д.Ю. Рогозин, Б. Верли, А.Н. Ножевникова // Микробиология. 2006. - Т. 75, № 6. - С. 828 - 835.

76. Калмычков, Г.В. Генетические типы метана озера Байкал Текст. / Г.В. Калмычков, А.В. Егоров, ак. М.И. Кузьмин, О.М. Хлыстов// Доклады Академии наук. 2006. - Т. 411. - С. 672-675.

77. Карабанов, Е.Б. Подводные ландшафты Байкала Текст. / Е.Е. Карабанов, В.Г. Сиделева, Л.А. Ижболдина // Труды ЛИН СО АН СССР. -1990.-С. 182.

78. Каширцев, В.А. Терпаны нефтей озера Байкал Текст. / В.А. Каширцев, А.Э. Конторович, В.И. Москвин, В.П. Данилова, В.Н. Меленевский //Нефтехимия. 2006. - Т. 46, №4. - С. 243-250.

79. Киселев, И.А. Пирофитовые водоросли Текст. /И.А. Киселев // М., 1954.212 с.

80. Кияшко, С.И. Соотношение стабильных изотопов углерода выявляют автотрофов, поддерживающих разнообразие животных в озере

81. Байкал Текст. / С.И. Кияшко, М.А. Козлов, П. Ришар // Вторая Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. 1995. - С. 80 - 81.

82. Князева Л. М. Вивианит в донных илах озера Байкал Текст. / Л.М. Князева // Докл. АН СССР. 1964. - Т.97, № 3.- С. 519-522

83. Князева, Л.М. Осадкообразование в осадках влажной зоны СССР. Южный Байкал Текст. / Л.М. Князева. М.: Наука, 1954. - 236 с; 22 см.-Библиогр.: с.232-236,- 300 экз.

84. Кондратьева, Е. Н. Автотрофные прокариоты Текст. / Е. Н. Кондратьева. М.: Изд-во МГУ, 1996. - 302 е.; 21 см. - Библиогр.: с. 296- 298. - 500 экз.

85. Конторович, А.Э. Геохимия нафтидов и проблема генезиса байкальской нефти Текст. / А. Э. Конторович, Д.И. Дробот, Р.Н. Преснова// Советская геология. 1989. № 2. - С. 21 - 29.

86. Конторович, А.Э. Генезис байкальской нефти Текст. / А. Э. Конторович, В.И. Москвин, В.П. Данилова, E.H. Иванова, Е.А. Костырева // Четвертая Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. -2005.-С. 101-102.

87. Косолапов, Д.Б. Определение содержания активных клеток в бактериопланктоне Рыбинского водохранилища с помощью 5-циано-2,3-дитолилтетразолия: сравнение с другими методами Текст. /Д.Б. Косолапов, А.И. Копылов // Микробиология. Т. 70, № 5. - С. 687 - 693

88. Кузнецов, С.И. Развитие идей С.Н. Виноградского в области экологической микробиологии Текст. / С. И. Кузнецов // 11-е чтение им. С.Н. Виноградского. М.: Наука. 1974. 62 с.

89. Кузнецов, С. И. Методы изучения водных микроорганизмов Текст. / С. И. Кузнецов, Г. А. Дубинина М.: Наука, 1989. - 288 с; 22 см.- Библиогр.: с.232-236.- 300 экз.

90. Кузнецов, С. И. Микробиологическая характеристика вод и грунтов Байкала Текст. / С. И. Кузнецов // Тр. Байкальск. Лимнолог, ст. АН СССР. -1957.-Т. 15.-С. 388-396.

91. Кузнецов, С. И. Микрофлора озер и ее геохимическая деятельность Текст. / С. И. Кузнецов. АН СССР. Ин-т биол. внутр. вод. Л.: Наука.

92. Ленингр. отд., 1970.-440 6. е., 202 1. с. ил.; 26 см. -Библиогр.: с. 402-4351250 экз.

93. Кузнецов, С. И. Роль микроорганизмов в круговороте веществ в озерах Текст. / С. И. Кузнецов // М.: Изд-во АН СССР. 1952. - 300с.

94. Кузнецов, С.И. Микробиологические процессы круговорота углерода и азота в озерах Текст. / С.И. Кузнецов, А.И. Саралов, Т.Н. Назина -М.: Наука, 1985.-213 с.

95. Кузнецов, Ю. А. Магматические породы и магматические формации Сибири и Дальнего Востока Текст. / Ю. А. Кузнецов // Геология и геофизика. 1977. - Т. 11. - С. 98-101.

96. Кузнецов, А.П. Новое в природе Байкала: сообщество, основанное на бактериальном хемосинтезе Текст. / А.П. Кузнецов, В.П. Стрижов, B.C. Кузин, В.А. Фиалков, B.C. Ястребов // Изв. АН. СССР. Сер. биол. 1991. - №5.- С. 766-772.

97. Кузьмин, М.И. Непрерывная летопись палеоклиматов последних 4,5 миллионов лет из озера Байкал Текст. / М.И. Кузьмин, М.А. Грачев, Д. Вильяме, Т. Каваи, Ш. Хорие, X. Оберхенсли // Геология и геофизика. 1997. -Т. 38, №5. с. 1021-1023.

98. Кузьмин, М.И. Геохимия познекайнозойских отложений дна озера Байкал Текст. / М.И. Кузьмин,В.Д. Пампура, Т.Н. Гуничева // Доклады РАН.- 1995. Т.344, № 3. - С. 381 - 384.

99. Кузьмин, М.И. Первая находка газогидратов в осадочной толще озера Байкал Текст. / М.И. Кузьмин, Г.В. Калмычков, В.Ф. Гелетий // Доклады РАН. 1998. - Т. 362, № 4. с. 541 -543.

100. Лаптева, Н. А. Видовая характеристика гетеротрофных бактерий в озере Байкал Текст. / Н. А. Лаптева // Микробиология. 1990. - Т. 59, вып. 3. -С. 499-506.

101. Леин, А.Ю. Геохимические особенности карбонатных построек, образующихся при микробном окислении метана в анаэробных условиях Текст. / А.Ю. Леин, М.В. Иванов, Пименов Н.В., М.Б. Гулин // Микробиология. 2002. - Т. 71. - С. 89 - 102.1. О W

102. Ленглер, И. Современная микробиология прокариоты Текст. / И. Ленглер, Г. Древе, Г. Шлегель М.: Мир, 2005. - 486 с; 22 см.- Библиогр.: .1000 экз. - ISBN 5-7692-0481-8.

103. Лисицын, А. П. Основные понятия биогеохимии океана Текст. / А. П. Лисицын // М.: Наука. 1983. - С. 3-31.

104. Логачев, H.A. О важнейших чертах развития рельефа Прибайкалья и Забайкалья Текст. / H.A. Логачев // Результаты научных исследований Института Земной Коры СО АН СССР в 1973 г. 1974. - С. 13 - 20.

105. Лойцянская, М.С. Синтез целлюлозы бактериями // Успехи современной биологии. 1964. - Т. 58. - С. 2 - 11.

106. Максимова, Э. А. Биодеструкция целлюлозы в донных отложениях Байкала Текст. / Э. А. Максимова, В. Н. Максимов, Г.Н. Колесницкая // Гидробиол. журн. 1981. - Т. 17, № 3. - С. 896 - 902.

107. Максимова, Э. А. Биопродуктивность микробиоценозов донных отложений Южного Байкала Текст. / Э. А. Максимова, В. Н. Максимов, Г.Н. Колесницкая // Гидробиол. журн. 1983. - Т. 19, № 6. - С. 9 - 14.

108. Максимова, Э. А. Микробиальные процессы в донных отложениях Текст. / Э. А. Максимова, Г.Н. Колесницкая // Состояние сообществ Южного Байкала. Иркутск: Изд-во Иркут. ун-та, 1982. - С. 105 - 126.

109. Максимова, Э. А. Микробиоценозы доннных отложений Байкала Текст. / Э. А. Максимова, И. А. Сергеева, В. Н. Максимов // Иркутск, 1991. -С. 160.

110. Максимова, Э.А. Сравнительная характеристика процессов, протекающих в различных участках литоральной зоны Южного Байкала Текст. / Э. А. Максимова // Продуктивность Байкала и антропогенные изменения его природы. Иркутск, 1974. - С. 230 - 244.

111. Маниатис, Т. Молекулярное клонирование Текст. / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук // Лабораторное руководство. Москва: Мир, 1984. 480, [2] е., 75 с. ил.; 22 см. - Библиогр.: с. 446-463. - 4000 экз.

112. Манская, С.М. Геохимия органического вещества Текст. / С.М. Манская, Т.В. Дроздова-М.: Наука, 1964. 125 с.

113. Мельник, Н.Г. Исследования трофической структуры экосистемы озера Байкал (методом стабильных изотопов) Текст. /Н.Г. Мельник, O.A.

114. Тимошкин, К. Иоши, Е. Вада. // Вторая Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. 1995. - С. 134 - 135.

115. Мессинева, М. А. Биогеохимические исследования глубоководных осадков Байкала Текст. / М. А. Мессинева // Тр. Байкальск. Лимнол. Ст. АН СССР. 1957. - Т.15. - С. 199-211.

116. Мизандронцев, И. Б. Об относительной интенсивности раннего диагенеза донных отложений озера Байкал Текст. / И.Б. Мизандронцев, Т.А. Младова // Круговорот вещества и энергии в озерных водоемах. Изд-во Наука. - 1975.-С. 107-115.

117. Мизандронцев, И. Б. Химический состав грунтовых растворов Байкала Текст. / И.Б. Мизандронцев // Круговорот вещества и энергии в озерных водоемах. Изд-во Наука, 1975. - С. 250-253.

118. Мизандронцев, И. Б. Осадкообразование Текст. / И. Б. Мизандронцев // Труды ЛИН СО АН СССР. 1978. - Т. 16, № 36. -Проблемы Байкала. - С. 33-46.

119. Младова, Т. А. Микроорганизмы донных отложений (авандельты р. Селенги) Текст. / Т. А. Младова // Труды Байкальск. лимн. ст. АН СССР. -1971.-Т. 12, вып. 32.-С. 90-95.

120. Младова, Т. А. Микробиологическая характеристика донных отложений Байкала Текст. / Т. А. Младова // Круговорот вещества и энергии в озерных водоемах. 1975. - С. 246-250.

121. Назина, Т.Н. Филогенетическое разнообразие аэробных сапрофитных бактерий, изолированных из нефтяных месторождений Дацина

122. Текст. / Т.Н. Назина, A.A. Григорян, Я.-Ф. Сюэ, В. Ш. Соколова, Е.В. Новикова // Микробиология. 2002. - Т. 71, № 1. - С. 103 - 110.

123. Намсараев, Б. Б. Геохимическая деятельность сульфатредуцирующих бактерий в донных осадках озера Байкал Текст. / Б. Б. Намсараев, JI. Е. Дулов, Т. И. Земская, Е. Б. Карабанов // Микробиология. -1995.-Т. 64, №3.-С. 405-410.

124. Намсараев, Б. Б. Геохимическая деятельность целлюлозоразрушающих микроорганизмов в донных отложениях водоемов Текст. / Б.Б. Намсараев // Успехи современной биологии. 1992. - Вып. 25. -С. 143- 162.

125. Наумова, Н.Б. Археи в неэкстремальных экосистемах Текст. / Н.Б. Наумова // Успехи современной биологии. 2003. - Т.123, № 1. - С. 16-23.

126. Нечаева, Н. Б. Микробиологический анализ донных отложений Байкала Текст. / Н. Б. Нечаева, А. Г. Салимовская-Родина // Тр. Байкал, лимнол. ст. АН СССР 1935. - Т. 6. - С. 5-14.

127. Нечесов, И.А. Ферментативная активность грунтов озера Байкал с Текст. / И.А. Нечесов // Лимнология Северного Байкала. Новосибирск: Наука. Сиб. отд-ние, 1983. - С. 80 - 85.

128. Определитель бактерий Берджи. В 2-х т. /Под ред. Дж. Хоулта, Н. Крига, П. Снита, Дж. Стейли, С. Уилльямса. М.: Мир, 1997. - 432 с.

129. Парфенова В.В., Илялетдинов А.Н. Видовой состав фосформобилизующих микроорганизмов, выделенных из воды и грунтов Байкала //Микроорганизмы в экосистемах озер и водохранилищ. -Новосибирск: Наука. 1985. - С. 55 - 63.

130. Парфёнова, В. В. Фосформобилизующие микроорганизмы в донных осадках Байкала Текст. / В. В. Парфёнова // Экологические проблемы водной микробиологии. Новосибирск: Наука, 1984.-С. 18-27.

131. Пименов, Н.В. Микробиологические процессы цикла углерода и серы на холодных метановых сипах северной Атлантики Текст. / Н.В. Пименов. A.C. Савичев, И.И. Русанов, А.Ю. Леин, М.В. Иванов //Микробиология. 2000. - Т. 69, № 6. - С. 831 - 843.

132. Пименов, Н.В. Микробные процессы в зонах разгрузки газосодержащих флюидов на дне океана Текст. / Н.В. Пименов // Труды Института микробиологии им. С.Н. Виноградского РАН, Вып. XII. Юбилейный сборник к 70-летию института. М: Наука, 2004. С. 337-360,

133. Пименов, H.B. Микробные процессы цикла углерода на гидротермальных полях и холодных метановых сипах: Дис. в виде научного доклада на соис. уч. ст. докт. биол. наук: 03.00.07 / Н.В. Пименов; Московский государственный университет. М., 2006. - 70 с.

134. Поповская, Г. И. Этапы изучения автотрофного пикопланктона озера Байкал Текст. / Г. И. Поповская, О. И. Белых // Гидробиологический журнал. 2003. Т.39, № 6. - С. 12-24.

135. Пушева, М.А. Литотрофные гомоацетатные бактерии Текст. / М.А. Пушева //Хемосинтез: к 100-летию открытия С.Н. Виноградским. М.: Наука. -1989.-С. 123 - 138.

136. Ришар, П. Анализ стабильных изотопов углерода и азота в планктонных и бентосных трофических цепях озера Байкал Текст. / П. Ришар, С.И. Кияшко, Т.А. Козлова // Вторая Верещагинская Байкальская конференция: Тез. докл. Иркутск. 1995. - С. 167- 168.

137. Родина, А. Г. Бактерии в продуктивности каменистой литорали оз. Байкал Текст. / А. Г. Родина // Проблемы гидробиологии внутренних вод. -1954.-С. 172-201.

138. Романенко, В. И. Текст. / В.И. Романенко //Микробиологические процессы продукции и деструкции органического вещества во внутренних водоемах. Л.: Наука. 1985. - 295 с.

139. Романенко, В.И. Текст. / В.И. Романенко, С.И. Кузнецов // Экология микроорганизмов пресных водоемов: лабораторное руководство. Л.: Наука, 1974. - 194 с.

140. Романова, А. П. Микробиологическая характеристика глубоководных грунтов южной части озера Байкал Текст. / А. П. Романова // Исследования по микрофлоре и зоопланктону Байкала. М.: Изд-во АН СССР. - 1963.-С. 1-11.

141. Романова, А. П. Сезонная динамика процессов круговорота азота в водной толще и грунтах литорали оз. Байкал Текст. / А. П. Романова // В кн.: Труды VI совещания по проблемам биологии внутренних вод. - Борок, 1959. -С. 159-167.

142. Романова, А. П. Сезонная динамика процессов круговорота в водной толще и грунтах литорали озера Байкал Текст. / А. П. Романова // Тр. 6-го совещ. по проб. биол. внутр. вод. Л.: Наука. Ленингр. отд-ние, 1974. - 194 с.

143. Руководство по химическому анализу поверхностных вод суши. Л.: Гидрометеоиздат, 1977. 542 с.

144. Русанов, И.И. Биогеохимический цикл метана на Северо-Западном шельфе Черного моря Текст. / И.И. Русанов, А.Ю. Леин, Н.В. Пименов, С.К. Юсупов, М.В. Иванов // Микробиология. 2002. - Т. 71, № 4. - С.558-566.

145. Светличный, В. А. Новая группа термофильных карбоксидобактерий Текст. / В.А. Светличный, Т.Г. Соколова, М. Герхард // Доклады АН СССР. 1990. - Т. 314. - С. 742-744.

146. Семенова, Е.А. Генетическое разнообразие пикопланктона озера Байкал: Автореф. дис. канд. биол. наук: 03.00.15 / Е.А. Семенова; Институт цитологии и генетики СО РАН. Н., 2002. - 17 с.

147. Современная микробиология. Прокариоты: в 2-х томах./Под ред. И Ленгелера, Г. Древса, Г. Шлегеля. М.: Мир, 2005. - 656 с. ISBN 5-03-003701 -1.

148. Соколова, Г. А. Физиология и геохимическая деятельность тионовых бактерий Текст. / Г.А. Соколова, Каравайко Г.И. // М.: Изд-во АН СССР.- 1964.- 333 с.

149. Сорокин, Ю.И. О бактериальном хемосинтезе в иловых отложениях Текст. /Ю.И. Сорокин // Микробиология. 1955. - Т. 24, вып. 4. - С. 393 - 399.

150. Сорокин, Ю.И. Применение изотопного метода в водной микробиологии Текст. /Ю.И. Сорокин // Успехи микробиологии. 1975. -Вып. 10.-С. 214-229.

151. Сузина, Н.Е. Цитобиохимические особенности метанотрофных бактерий Текст. / Н.Е. Сузина, В.Е. Четина, В.В. Дмитриев // Микробиология. 1984. - V. 53.-С. 257-260.

152. Талиев, С. Д. Углеводородокисляющие микроорганизмы в биоценозах некоторых районах Байкала Текст. / С.Д. Талиев, О.М. Кожова, O.A. Моложавая // Микроорганизмы в экосистемах озер и водохранилищ. Н.: Наука, 1985.-С. 64-74.

153. Троицкая, Е.С. Многолетние изменения температуры поверхности воды в Байкале. Текст. / Е.С. Троицкая, М.Н. Шимараев, В.В. Цехановский // География и природ, ресурсы. 2003. - Т. 2. - С. 47-50.

154. Флоренсов, H.A. Байкальская рифтовая зона и некоторые ее задачи ее изучения Текст. /H.A. Флоренсов // Байкальский рифт. М.: Наука, 1968. -с. 40-56.

155. Фомин Г.С. Вода. Контроль химический, бактериальный и радиационной безопасности по международным стандартам. М.: 2000. -840 с.

156. Хлыстов, О.М. Новые находки газовых гидратов в донных осадках озера Байкал Текст. / О.М. Хлыстов // Геология и геофизика. 2006. - Т. 47, № 8.-С. 979-981.(8292)

157. Чебыкин, Е. П. Изотопы ряда радиоактивного распада урана 238 -сигналы палеоклиматов верхнего плейстоцена и геохронометры в осадках озера Байкал Текст. / Е. П. Чебыкин, Д. Н. Эджингтон, Е. Л. Гольдберг, М. А.

158. Федорин, Н. С. Куликова, Т. О. Железнякова, С. С. Воробьева, О. М. Хлыстов, О. В. Левина, Г. А. Зиборова, М. А. Грачев // Геология и геофизика. 2004. - Т. 45, № 5. - С. 539-556.

159. Шлегель Г. Общая микробиология. М: Мир, 1987. 567 с.

160. Штевнева, А. И. Активность бактериальных процессов в донных отложениях южной части Байкала Текст. / А. И. Штевнева, Н. Д. Судакова // Микробиология. 1986. - Т. 55, № 5. - С. 839-845.

161. Яснитский, В. А. Отчет о работе Байкальской лимнологической станции Текст. / В. А. Яснитский, Б. Н. Бланков, В. И. Гортиков // Известия биол.-геогр. института при ИГУ. Иркутск. - 1927. - Т. 3, вып.З. - С. 47-54.

162. A manual on methods for measuring primary production in aquatic enviroments. IBP Handbook N. 12 / Ed. A. Richard. Vollenweider. - Oxford etc.: Blackwell, 1969.

163. Alperin, M.J. Inhibition experiments on anaerobic methane oxidation Text. / M.J. Alperin, W.S. Reeburgh // Applied and Environmental Microbiology. -1985.-Vol. 50.-P. 940-945.

164. Amann, R. J. Methodological aspects of fluorenscence in situ hybridization Text. / R. J. Amann // Biosci. Microflora. 2000 -V. 19, № 2. - P. 8591.

165. Amann, R. J. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation Text. / R. J. Amann, W. Ludwig, K.-H. Schleifer // Microbial Rewiev. 1995. - V. 59, № 1. - P. 3496-3500.

166. Amann, R.I. In situ identification of microorganisms by whole cell hybridization with rRNA- tageted nucleic acid probes Text. / R. J. Amann,// Molecular Microbial Ecology Manual. Netherlands: Kluwer. - 1995. - V. 3.3.6.-P. 1-15.

167. Atlas, R. M. Hydrocarbon biodégradation and oil spill bioremediation. Text. / R. M. Atlas, R. Bartha // Adv. Microb. Ecol. 1972. - Vol. 12. P. 180 - 209.

168. Auman, A.J. Molecular Characterization of Methanotrophic Isolates from Freshwater Lake Sediment Text. / A.J. Auman, S. Stolyar, A.M. Costello, M.E. Lidstrom // Appl. Environ. Microbiol. 2000. - V. 66, № 12. - P. 5259-5266.

169. Bak, F. Microbial sulfate reduction in littoral sediment of Lake Constance Text. / F. Bak, N. Pfenning // FEMS Microbiol. Ecology. 1991. Vol. 85.-P. 31-42.

170. Bano, N. Phylogenetic composistion of Artie Ocean archaeal assemblages and comparison with Antartic assemblages Text. / N. Bano, S. Ruffin, B. Ranson, J. T. Hollibaugh // Applied and Environmental Microbiology. 2004. -V. 70, №2.-P. 781-789.

171. Bastviken, D. Methane emissions from lakes: Dependence of lake characteristics, two regional assessments, and a global estimate Text. /D. Bastviken, J. Cole, M. Pace, L. Tranvik // Global Biogeochemical cycles. 2004. - V. 18, № 4. -P. 400-415.

172. Bergey's Manual of systematic Bacteriology. Editor Garrity, G. M. -Springer, 2nd edition. 2004. 2816 P.; 28 см. - экз. - ISBN 978-0387950402.

173. Boetius, A. A marine microbial consortium apparently mediating anaerobic oxidation of methane Text. / A. Boetius, K. Ravenschlag, C.J. Schubert,

174. D. Rickert, F. Widdel, A. Gieseke, R. Amann, B.B. Jorgensen, U. Witte, O. Pfannkuche // Nature. 2000. - V. 407. - P. 623 - 626.

175. Boetius, A. Hydrate Ringe: a natural laboratory for the study of microbial life fiield by methane from near-surface gas hydrates Text. / A. Boetius, E. Suess // Chem. Geol. 2004. - V. 205. - P. 291 - 310.

176. Bolin, B. The global carbon cycle Text. / B. Bolin, E. Degens, W. Kempe // SCOPE. Chichester: Wiley and Sons. 1979. 491 p.

177. Bonch-Osmolovskaya, E.A. Radioisotopic, Culture-Based, and

178. Baikal Text. / J. P. Bradburry, Y. V.Bezrukova, G. P. Chernyaeva // Paleolimnology. 1994.-V. 10.-P. 213-252.

179. Bucholz, L.A. Activity of methanotrophic bacteria in Gren-Bay sediments Text. / L.A. Bucholz, J. Valklump, M.L.P. Collins, C.A. Brantner, C.C. Remsen // FEMS Microbiol. Ecol. 1995. - V. 16. - P. 1 - 8.

180. Callender, E. Geochemical mass balances of major elements in Lake Baikal Text. / E. Callender, L. Granina // Limnology and Oceanography. 1997.1 V. 42, № l.-P. 148-155.

181. Casamayor, E.O. Identification of phototrofic sulfur bacteria through the analysis of LmwRNA band patterns Text. / E.O. Casamayor, J.I. Calderon-Paz, J. Mas, C. Pedros-Alio // Arch. Microbiol. 1998. - V. 170. - P. 269-278.

182. Cases, I. The grammar of microbiological diversity Text. /1. Cases, V. de Lorenzo // Environ. Microbiol. 2002. - 4, № 11. - P. 623-627.

183. Chapelle, F.H. Rates of microbial metabolism in deep coastal-plain aquifers Text. / F.H. Chapelle, D.R. Lovley // Applied and Environmental Microbiology. 1990.-V. 56.-P. 1856-1874.

184. Colman, S.M. AMS radiocarbon analysis from Lake Baikal, Siberia: challenges for dating sediments from a large, oligotrophic lake Text. / S.M. Colman, G.A. Jones, M. Rubin // Quaternary Geochronology (Quaternary Sci. Rev.). 1996. -V. 15.-P. 669-684.

185. Colman, S.M. Continental climate response to orbital forcing from biogenic silica record in Lake Baikal, Siberia Text. / S.M. Colman, J.A. Peck, E.B. Karabanov, S.J. Carter, J.P. Bradbury, J.W. King, D.F. Williams // Nature. 1995. -V. 378.-P. 769-771.

186. Cragg, B.A. Bacterial biomass and activity profiles within deep sediment layers Text. / B.A. Cragg, R.J. Parker, J.C. Fry, R.A. Herbert, J.W.T. Wimpenny, J.M. Getliff // Proc. ODP, Sci. Res. 1990. - V. 112. - P. 607 - 619.

187. Cragg, B.A. A novel method for the transport and long-term storage of cultures and samples in an anaerobic atmosphere Text. / B.A. Cragg, S.J. Bale, R.J Parkes // Letters in Applied Microbiol. 1992. - V. 15, № 4. - P. 125 - 128.

188. Crane, K. Hydrothermal vents in Lake Baikal Text. / K. Crane, B. Hecker, V. Golubev // Nature. 1991. - V. 350, № 6316. - P. 281.

189. D'Hondt, S. Metabolic activity of subsurface life in deep-sea sediments Text. / S. D'Hondt, S. Rutherford, A. J. Spivack // Science. 2002. - V. 295. - P. 2067-2070.

190. Davydova-Charakhchyan, I.A. Acetogenic bacteria from oil fields of Tataria and Western Siberia Text. / I.A. Davydova-Charakhchyan, A.N. Mileeva, L.L. Mityushina, S.S. Belyaev // Microbiology. 1992. - V. 61. - P. 306-315.

191. Deinema, M.H. Formation of cellulose fibrils by gram-negative bacteria and their role in bacterial flocculation Text. / M.H. Deinema, L.P. Zevenhui // Archiv fur microbiologie. 1971. - V. 78, № 1. - P. 42 - 50.

192. Dermott, R. Dense mat-forming bacterium Thioploca ingrica (Beggiatoaceae) in eastern Lake Ontario: Implications to the bentic food web Text. / R. Dermott, M. Legner // Journal of Great Lakes Research. 2002. - V. 28. - P. 688697.

193. Edgington, D.N. Sedimentation rates, residence times and radionuclide inventories in Lake Baikal from Cs 137 and Pb - 210 in sediment cores Text. / D.N. Edgington, J.V. Klump, J.A. Robbins // Nature. - 1991. - V. 350. - P. 601 -604.

194. Ekendahl, S. Carbon transformations by attached bacterial populations in granitic groundwater from deep crystalline bed-rock of the Stripa research mine Text. / S. Ekendahl, K. Pedersen // Microbiology. 1994. - V. 140. - P. 1565-73.

195. Ellis, L.B.M. The University of Minnesota Biocatalysis/Biodegradation Database: post-genomic data mining Text. /L.B.M. Ellis, B.K. Hou, W.J. Kang, L.P. Wackett //Nucleic Acid Res. 2003. - V. 31. - P. 262 - 265.

196. Falkner, K.K. The major and minor element geochemistry of Lake Baikal Text. / K.K. Falkner, C.I. Measures, S.E. Herbelin, J.M. Edmond, R.F. Weiss // Limnology and Oceanography. 1991. - V. 36, №3. - P. 413-423.

197. Fisher, C.R. Chemoautotrophic and methanotrophic symbiosis in marine invertebrates Text. / C.R. Fisher//Rev. Aquat. Sei. 1990. - V. 2. - P. 59 - 71.

198. Fodde, R. Mutation detection by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) Text. / R. Fodde, M. Losekoot // Human Mutation. 1994. - V. 3. - P. 8394.

199. Frenzel, P. Oxidation of methane in the oxic surface-layer of a deep lake sediment (Lake Constance) Text. / P. Frenzel, B. Thebrath, R. Conrad // FEMS Microbiol. Ecol. 1990. V. 73, № 2. - P. 149 - 158.

200. Fricker, C.R. From media to molecules: new approaches to the detection of microorganisms in water Text. / C.R. Fricker, // Water, Air and Soil Pollution. -2000.- 123.-P. 35-41.

201. Fukui, M. Physiology, phylogenetic relationships, and ecology of filamentous sulfate-reducing bacteria (genus Desulfonema) Text. / M. Fukui, A. Teske, B. Assmus, G. Muyzer, F.Widdel // Arch. Microbiol. 1999. - V. 172. - P. 193-203.

202. Galchenko, V.F. Biological sinks of methane Text. / V.F. Galchenko, A.Yu. Lein, M.V. Ivanov // Exchange of trace gases between terrestrial ecosystems and the atmosphere. Dahlem konferenzen. - 1989. - P. 59-71.

203. Galand, P.E. Depth related diversity of methanogen Archaea in Finnish oligotrophic fen Text. / P.E. Galand, S. Saarnio, H. Fritze, K. Yrjala // FEMS Microbiology Ecology. 2002. - V. 42, № 3. - P. 441 - 449.

204. Gallardo, V. A. Large benthic microbial communities in sulphide biota under Peru-Chile subsurface counter current Text. / V. A. Gallardo // Nature. 1977. -V. 286.-P. 331-332.

205. Giovannoni, S.J. Genetic diversity in Sargasso sea bacterioplankton Text. / S.J. Giovannoni, T.B. Britschgi, C.L. Moyer, K.G. Field // Nature. 1990. -V. 345.-P. 60-63.

206. Glockner, F.O. An In Situ Hybridization Protocol for Detection and Identification of Planctonic Bacteria Text. / F.O. Glockner//Microbiol. 1996. - V. 19.-P. 403-406.

207. Glockner, F.O. Bacterioplankton compositions of lakes and oceans: a first comparison based on fluorescence in situ hybridisation Text. / F.-O. Glockner, B. M. Fuchs, R. Amann // Applied and Environmental Microbiology. 1999. - V. 65,№8.-P. 3721-3726.

208. Gogou, A. Marine organic geochemistry of the Eastern Mediterranean: 1. Aliphatic and polyaromatic hydrocarbons in Cretan Sea surficial sediments Text. /A. Gogou, I. Bouloubassi, E.G. Stephanou // Marine chemistry. 2000. - V. 68, № 4.-265-282.

209. Gorshkov, A.G. Oil in Lake Bakal, Paradox or Regularity? Text. / A.G. Gorshkov, M.A.Grachev, T.I. Zemskaya, O.M. Khlystov, V.I. Moskvin // International Congress on Analytical Science. 2006. V. 1. - P. 375-376.

210. Grabowski, A. Microbial diversity in production waters of a low-temperature biodegraded oil reservoir Text. / A. Grabowski, O. Nercessian, F. Fayolle, D. Blanchet, C. Jeanthon //FEMS Microbiology Ecology. 2005. - V. 54, № 3. - P. 427-443.

211. Grachev, M. Extant fauna of ancient carbon. Text. / M. Grachev, V. Fialkov, T. Nakamura, T. Ohta, T. Kawai // Nature. 1995. - V. 374. - P. 123-124.

212. Granina, L. Oxygen, iron, and manganese at the sediment-water interface in Lake Baikal Text. / L. Granina, B. Mueller, B. Wehrli, P. Martin // Terra Nostra. -2000.- V. 9.-P. 87-94.

213. Gray, N.D. Phylogenetic analysis of the bacterial communities in marine sediments Text. / N.D. Gray, R.P. Herwig // Appl. Environ. Microbiol. 1996. -V.62.-P. 4049-4059.

214. Hazen, T.C. Comparison of bacteria from deep subsurface sediment and adjacent groundwater Text. / T.C. Hazen, L. Jimenez, G.L. Devictoria, C.B. Fliermans // Microbial Ecology. 1991. - V. 22, № 3. - P. 293 - 304.

215. Head I.M., Biological activity in the deep subsurface and the origin of heavy oil Text. / I.M. Head, D.M. Jones, S.R. Larter // Nature. 2003. - V. 426. - P. 344-352.

216. Head, I.M. Marine microorganisms make a meal of oil Text. / I.M. Head, D.M. Jones, F.M. Roling // Nature. 2006. - V. 4. - P. 173 - 182.

217. Head, I.M. Uncultured giant sulfur bacteria of the genus Achromatium Text. / I.M. Head, N.D. Gray, H.D. Babenzin, F.O. Glockner // FEMS Microbiol. Ecol. 2000. V. 33. - P. 171 - 180.

218. Hinrichs, K. U. Methane-consuming archaebacteria in marine sediments Text. / K. U. Hinrichs, J. M. Hayes, S. P. Sylva, P. G. Brewer, E. F. DeLong // Nature. 1999. - V. 398. - P. 802-805.

219. Hoehler, T.M. Field and laboratory studies of methane oxidation in an anoxic marine sediments: evidence for a methanogen-sulfate reducer consorcium Text. / T.M. Hoehler, M.J. Alperin, B. Albert // Global Biochem. Cycles. 1994. -V.8, №4. - P. 451-463.

220. Hoeniger, J.F. Microbial decomposition of cellulose in acidifying lakes of South Central Ontario Text. / J.F. Hoeniger, // Appl. Environ. Microbiol. 1985. - V. 50. P. 315-322.

221. Hofle, M.G. Bacterioplankton community structure and dynamics after largescale release of nonindigenous bacteria as reveald by low-molecular-weight

222. RNA analysis Text. / M.G. Höfle // Appl. Environ. Microbiol. 1992. - 58, № 10. -P. 3387-3394.

223. Höfle, M.G. Taxonomic diversity and metabolic activity of microbial communities in the water column of the central Baltic Sea Text. / M.G. Höfle // Limnol. Oceanogr. 1995. - 40, - P. 868-874.

224. Holben, W. E. DNA probe method for the detection of specific microorganisms in the soil bacterial community Text. / W. E. Holben, J. K. Jansson,r B. K. Chelm, J. M. Tiedje // Applied Environmental Microbiology. 1988. - V. 54. 1. P.703-711.

225. Huettel, M. Vertical Migration in the Sediment-Dwelling Sulfur Bacteria Thioploca spp. In Overcoming Diffusion Limitations Text. / M. Huettel, S. Forsret, S. Kloser, H. Fossing // Applied Environmental Microbiology. 1996. - P. 18631872.

226. Hutchinson, D. R. Depositional and tectonic flamework of the rift basins I of Lake Baikal from multichannel seismic data Text. / D. R. Hutchinson, A. J.

227. Golmshtok, L. P. Zonenshain, T. C. Moore, C. A. Scholz, K. D. Klitgord // Geology. 1992. -V. 20.-P. 589-592.

228. Hutchinson, D.R. Bottom simulating reflector in Lake Baikal D.R. Hutchinson, A.J. Golmshtok, C.A Scholz., T.C. Moore, M.W. Lee, M.I. Kuzmin // Eos Trans. AGU: Spring Meeting. 1991. - V. 72. - P. 307.

229. Inagaki, F. Characterization of CI-Metabolizing Prokaryotic Communities in Methane Seep Habitats at the Kuroshima Knoll, Southern Ryukyu

230. Arc, by Analyzing pmoA, mmoX, mxaF, mcrA, and 16S rRNA Genes Text. / F.1.agaki, U. Tsunogai, M. Suzuki, A. Kosaka, H. Machiyama, K. Takai, T. Nunoura, K. H. Nealson, K. Horikoshi // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - V. 70, № 12. - P. 7445-7455.

231. Ishii, K. An improved fluorescence in situ hybridization protocol for the identification of bacteria and archaea in marine sediments Text. /K. Ishii, M. Mussmann, B.J. MacGregor // Microbiol. Ecology. 2004. - V.50, № 3 - P. 203-212.

232. Ivanov, M.V. On the carbon and sulfur balanses in the Black Sea Текст. / M.V. Ivanov, A. Yu. Lein // Black Sea oceanograph / Eds. Isdar E.A., Murrey J.W. Netherlands: Kluwer Acad. Publ. 1991. - V. 351. - P. 307 - 319.

233. Jannasch, H.W. Assive natural occurrence of unusually large bacteria (Beggiatoa sp.) at a hydrothermal deep-sea vent site Text. / H.W. Jannasch, D.C. Nelson, C.O. Wirsen // Nature. 1989. - V. 342. - P. 454 - 460.

234. Jezequel, R. Natural cleanup of heavy fuel oil on rocks: an in situ experiment Text. R. Jezequel, L. Menot, F.X. Merlin, R.C. Prince // Mar. Pollut. Bull. 2003. - V., № 8. - P. 983 - 990.

235. Jorgensen, B.B. Microbial transformation of sulphur compounds in a stratified lake (Solar Lake, Sinai) Text. / B.B. Jorgensen, J.G. Kuenen, Y. Cohen // Limnol. Oceanogr. 1979. - V. 24, № 5. - P. 799 - 822.

236. Jorgensen, B.B. Thioploca spp.: filamentous sulfur bacteriawith nitrate vacuoles Text. / B.B. Jorgensen, V. Gallardo // FEMS Microbiology Ecology. -1999, V. 28.-P. 301-313.

237. Karabanov, E.B. Evidence from Lake Baikal for Siberian glaciation during oxygen-isotope substage 5d Text./ E.B. Karabanov, A.A. Prokopenko, D.F. Williams, S.M. Colman // Quaternary Ressearch. 1998. - P. 50.

238. Karabanov, E.B. Pelagic sedimentary complexes and sedimentation conditions in Lake Baikal, Siberia Text. / E.B. Karabanov, S.M. Colman, K.H. Nelson // Eos Trans. AGU: Fall Meeting / Suppl. 1993. V. 73. - P. 43.

239. Kasai, Y. Physiological and molecular characterization of a microbial community established in unsaturated, petroleum-contaminated soil Text. / Y. Kasai,

240. Y. Takahata, T. Hoaki, K. Watanabe // Environ Microbiol. 2005. - V.7. - P.806-818.

241. Kipfer, R. Bottomwater formation due to hydrothermal activity in Frolikha Bay, Lake Baikal, eastern Siberia Text. / R. Kipfer, W. Aeschbach-Hertig, M. Hofer, R. Hohmann, D. M. Imboden, H. Baur, V. Golubev, J. Klerkx //

242. Geochimica et Cosmochimica Acta. 1996. - V. 60, № 6. - P. 961-971.

243. Klug, G.M. Glucose metabolism in sedimeny of a eutrophic lake. Tracer analysis of uptake and product formation Text. / G.M. Klug, M.J Klug // Appl. Environ. Microbiol. 1982. - V. 44, № 6. - P. 1308 - 1317.

244. Kojima, H. Community structure of bacteria associated with sheaths of freshwater and brackish Thioploca species Text. / H. Kojima, Y. Koizumi, M. Fukui // Microbial Ecology. 2006. - V. 52, № 4. - P. 765-773.pw 317

245. Krumholz, L.R. Confined subsurface microbial communities in Cretaceous rock Text. / L.R. Krumholz, J.P. McKinley, F.A. Ulrich, J.M. Suflita // Nature. 1997. - V. 385. - P. 64 - 66.

246. Lane, D. J. Rapid determination of 16S ribosomal RNA sequences for phylogenetic analyses Text. / D. J. Lane, B. Pace, G. J. Olsen, D. A. Stahl, M. L. Sogin, N. R. Pace // Proceedings of the National Academy of Science USA. 1985. -V. 82. -P. 6955-9.

247. Laramee, L. Molecular analysis and development of 16S rRNA oligonucleotide probes to characterize a diclofop-methyl-degrading biofilm consortium Text. / L. Laramee, J.R. Lawrence, C.W. Greer // Can. J. Microbiol. -2000.-V. 46, №2.-P. 133-142.

248. Larkin, J. M. Filamentous sulfide-oxidizing bacteria at hydrocarbon seeps of the Gulf of Mexico Text. / J. M. Larkin, M. G. Henk // Microscopy Research and Technique. 1996. - V.33. - P. 23-31.

249. Larkin, J. M. Beggiatoa, Thiothrix, and Thioploca Text. / J. M. Larkin, W. R. Strohl // Annual Review Microbiology. 1983. - V. 37. - P. 341-367.

250. Lauterborn, R. A new genus of sulfur bacteria (Thioploca schmidlei nov. gennov.spec.) Text. / R. Lauterborn //Ber. Dt. bot. Ges. 1907. - V. 25. - P. 238242.

251. Leahy, J.G. Microbial degradation of hydrocarbons in the environment Text. / J.G. Leahy, R.R. Colwell // Microbiol. Rev. 1990. - Vol. 54. - P. 305 -315.

252. LeGall, J. The physiology of suphate-reducing bacteria Text. / J. LeGall, J.R. Postgate //Adv. Microbial. Physiol. 1973. - V. 10. - P. 82-135.

253. Leifson, E. Atlas of bacterial flagellation Text. /Leifson, E. // Acad. Press, Inc., N.Y. & London. 1960

254. Lerman, L. S. Computational simulation of DNA melting and its application to denaturing gradient gel electrophoresis Text. / L. S. Lerman, K. Silverstein //Methods Enzymology. 1987. - V. 155. - P. 482-501.

255. Lidstrom, M.E. Seasonal Study of Methane Oxidation in Lake Washington Text. / M.E. Lidstrom, L. Somers // Appl. Environ. Microbiol. 1984. -V. 47, №6.-P. 1255-1260.

256. MacDonald, I.R. Text. /G.S. Boland, J. M. Bacer // Marine Biol. -1989. V. 101.-P. 235-247.

257. Mai er, S. Description of Thioploca ingrica sp.nov. nom.rev. Text. / S. Maier // International Journal Systematic Bacteriology. 1984. - V. 34. - P. 344345.

258. Marmur, J. A procedure for the isolation of deoxyribonucleic acid from micro-organisms Text. / J. Marmur // Journal Molecular Biology. -1961. V. 3. - P. 208-218.

259. Martens C.S., Berner R.A. Interstitial water chemistry of anoxic Long Island Sound Sediments. 1. Dissolved gases. Limnol. Ocean. 1977. V. 21. №1. P. 10-25.

260. Martin, P. Oxygen concentration profiles in sediments of two ancient lakes: Lake Baikal (Siberia, Russia) and Lake Malawi (East Africa) Text. / P. Martin, L.Z. Granina, K. Martens, B. Goddeeris // Hydrobiologia. 1998. - V. 367. -P. 163-174.

261. Martin, P. Sediment oxygen distribution in ancient lakes Text. / P. Martin, B. Goddeeris, K. Martens // Verh. Internat. Verein. Limnol. 1993. - V. 25. -P. 793-794.

262. Mats, V.D. The structure and development of the Baikal rift depression. Text. / V.D. Mats // Earth-Science Riveiws. 1993. V. 34. - P. 81 - 118.

263. Matsumoto, R. Isotopically heavy oxygen-containing siderite derived from the decomposition of methane hydrate Text. / R. Matsumoto // Geology. -1989.-V. 17.-P. 707-710.

264. Matveeva, T.V. Gas hydrate accumulation in the subsurface sediments of Lake Baikal (Eastern Siberia) Text. / T.V. Matveeva, L.L. Mazurenko, V.A. Soloviev, J. Klerkx, V.V. Kaulio, E.M. Prasolov // Geo Mar Lett. 2003. - V. 23, № 3-4.-P. 289-299.

265. McHatton, S. C. High nitrate concentrations in vacuolate, autotrophic marine Beggiatoa spp. Text. / S. C. McHatton, J. P. Barry, H. W. Jannasch, D. C. Nelson I I Applied Environmental Microbiology. 1996. - V. 62. - P. 954-958.

266. Mills, I. Microbial diversity in sediments associated with surface-breaching gas hydrate mounds in the Gulf of Mexico Text. / I. Mills, C. Hodges, K. Wilson, I.R. MacDonald, P.A. Sobecky // FEMS Microbiology Ecology. 2003. - V. 46, № l.-P. 39-52.

267. Miskin, I. Bacteria in post-glacial freshwater sediments Text. / I. Miskin, G. Rhodes, K. Lawlor, J. R. Saunders, R. W. Pickup // Microbiology. -1998.-V. 144.-P. 2427-2439.

268. Moll, G. A new type of fimbriae Text. / G. Moll, R. Ahrens // Archiv fur Mikrobiologie. 1970. - V. 70, № 4. - P. 361 - 395.

269. Morita, R. Y. Is H2 the universal energy source for long-term survival? Text. / R. Y. Morita // Microb. Ecol. 2000. - V. 38. - P. 307-320.

270. Mortimer, C. H. The exchange of dissolved substances between mud and water in lake Text. / C. H. Mortimer // The Journal of Ecology. 1941. - V. 29, № 2. -P. 280-329.

271. Muller, V. Utilization of Methanol plus Hydrogen by Methanosarcina barkeri for Methanogenesis and Growth. Text. / V. Muller, M. Blaut, G. Gottschalk // Appl. Environ. Microbiol. 1986. - V. 52, № 2. - P. 269 - 274.

272. Murreil, J.C. Molecular methods for the study of methanotroph ecology Text. / J.C. Murrell, I.R. McDonald, D.G. Bourne // FEMS Microbiol. Ecol. 1998. -V. 27.-P. 103-114.

273. Nazina, T.N. Occurrence and geochemical activity of microorganisms in high-temperature, water-flooded oil fields of Kazakhstan and Western Siberia Text. /

274. T.N. Nazina, A.E. Ivanova, I.A. Borzenkov, S.S. Belyaev, M.V. Ivanov // Geomicrobiol J.- 1995.-V. 13.-P. 181-192.

275. Nedwell, D.B. The input and mineralization of organic carbon in anaerobic aquatic sediments Text. / D.B. Nedwell // Advances in Microbial Ecology. -N.Y.: Plenum Press. 1984. - V. 133. - P. 249 - 256.

276. Nihino, M.N. Text. / M.N. Nisino, T. Nakajima // Water Res. 1998. -V. 32.-P. 953 -957.

277. Ogram, A. Isolation and characterization of RNA from low-biomass deep-subsurface sediments Text. / A. Ogram, W.H. Sun, F.J. Brockman, J.K. Fredrickson // Appl. Environ. Microbiol. 1995. - V. 61, № 2. - P. 763 - 768.

278. Ogram, A. The extraction and purification of microbial DNA from sediments Text. /A. Ogram, G. S. Sayler, T. Barkay // Journal Microbiology Methods. 1987. - V. 7. - P. 57-66.

279. Orphan, V.J. Methane-consuming Archaea revealed by directly coupled isotopic and phylogenetic analysis Text. / V.J. Orphan, C.H. House, K.-U. Hinrichs, K.D. McKeegan, E.F. DeLong // Science. 2001. - V. 293. - P. 484 - 487.

280. Panganiban, A. Oxidation of methane in the absence of oxygen in the lake water samples Text. / A. Panganiban, J.T. Patt, W. Hart, R. Hanson // Appl. Environ. Microbiol. 1979. - V. 17. - P. 303 - 309.

281. Parkes, R.J. Deep bacterial biosphere in Pacific-ocean sediments Text. / R.J. Parkes, B.A. Cragg, S.J. Bale, J.M. Getliff, K. Goodman, P.A. Rochelle, J.C. Fry, A.J. Weightman, S.M. Harvey//Nature. 1994. - V. 371. - P. 410 -413.

282. Paster, E. Preservation of agricultural lands through land use planning tools and techniques Text. /E. Paster // Natural Resources Journal. 2004. - V. 44, № 1.-P.283-318.

283. Peck, J.A. A rock-magnetic record from Lake Baikal Siberia: Evidence for Late Quaternary climate change Text. / J.A. Peck, J.W. King, S.M. Colman, V.A. Kravchinsky // Earth and Planetary Science Letters. 1994. - V. 122. - P. 221 -238.

284. Peckmann, J. Carbon cycling at ancient methane-seeps Text. /J. Peckmann, V. Thiel // Chemical Geology. 2004. - V. 205, № 3-4. - P. 443 - 467.

285. Phelps, T.J. Comparison between geochemical and biological estimates of subsurface microbial activities Text. / T.J. Phelps, E.M. Murphy, S.M. Pfiffner, D.C. White // Microbial Ecology. 1994. - V. 28, № 3. - P. 335 - 349.

286. Pilskaln, C.H. The flux and composition of limnal snow in Lake Baikal, Russia Text. / C.H. Pilskaln, Y.V. Likhoshway, G.I. Popovskaya, V.I. Aspen 1992. Unpublished manuscript. 1992. - 19 p.

287. Purdy, K. J. Analysis of the sulfate-reducing bacterial and methanogenic archaeal populations in contrasting Antarctic sediments Text. / K. J. Purdy, D. B. Nedwell, T. M. Embley // Applied Environmental Microbiology. 2003. - V. 69. - P. 3181-3191.

288. Ratledge, G. Single oils have they a biotechnological future Text. / G. Ratledge // Trends in Biotechnology. - 1993. - V. 11, № 7. - P. 278 - 284.

289. Reeburgh, W. Anaerobic methane oxidation: rate depth distributions in Skan Bay sediments Text. /W. Reeburgh // Earth Planet. Sei. Lett. 1980. - V. 47. -P. 345-352.

290. Rochelle, P. A. DNA extraction for 16S rRNA gene analysis to determine genetic diversity in deep sediment communities Text. / P. A. Rochelle, J. C. Fry, R. J. Parkes, A. J. Weightman // FEMS Microbiology Letters. 1992. - V.100. - P.59-66.

291. Roose-Amsaleg C. L., Extraction and purification of microbial DNA from soil and sediment samples Text. / C. L. Roose-Amsaleg, E. Garnier-Sillam, M. Harry // Applied Soil Ecology. 2001. - V. 18. - P. 47-60.

292. Rothfuss, F. Survival and activity of bacteria in a deep, aged lake sediment (Lake Constance) Text. / F. Rothfuss, M. Bender, R. Conrad // Microbial ecology. 1997.-V. 33, №1.-P. 69-77. .

293. Sambrook, J. Molecular cloning. A laboratory manual Text. / J. Sambrook, E. F. Frisch, Maniatis T. // New York, Cold Spring Harbor: Cold Spring

294. Harbor Laboratory Press. 1989. - 350, 2. с ил. 27,5 см. - Библиогр.: с. 342-348. -экз.-ISBN 0-87969-309-6.

295. Sassen, R. Bacterial methane oxidation in sea-floor gas hydrate:significance to life in extreme environmets Text. / R Sassen, I.R. MacDonald, N.L.J. Guinasso, S. Joye, A.G. Requejo // Geology. 1998. V. 26. - P. 851 - 854.

296. Scholz, С. Results of 1992 sienmic reflection experiment in Lake Baikal Text. / C. Scholz, K.D. Klidgord, Ten Brink // EOS Transation, American Geophysics Union. 1993. - V. 74. - P. 465 - 470.

297. Shima, S. Methyl-coenzyme M reductase and the anaerobic oxidation of methane in methanotrophic Archaea Text. /S. Shima, R.K. Thauer // Currentopinion in Microbiology. 2005. - V. 8, № 3. - P. 643 - 648.

298. Schulz, H. N. Population study of the filamentous sulfur bacteria Thioploca spp. off the Bay of Concepcion, Chile Text. / Schulz H. N., В. Strotman., V.A. Gallardo, В. В. Jorgensen // Mar. Ecol. Progr. Ser. 2000. V. 200. -P. 117 -126.

299. Schulz, H. N. Big bacteria Text. / H. N. Schulz, В. В. Jorgensen // Annual Review Microbiology. -2001. V. 55. - P. 105-137.

300. Schulz, H. N. Dense populations of a giant sulfur bacterium in Namibian shelf sediments Text. / Schulz H. N., Brinkhoff T. G., Ferdelman T. G., Marine M. H., Teske A. // Science. 1999. - V. 284. - P.493-495.

301. Sekar, R. An improved protokol for quantification of freshwater Actinobacteria by fluorescence in situ hybridization. Text. / R. Sekar // Appl. Env. Microbiol. 2003. - V.69, - P. 2928-2935.

302. Shima, S Thauer RK. Methyl-coenzyme M reductase and the anaerobic oxidation of methane in methanotrophic Archaea. Curr Opin Microbiol. 2005. V. 8. P. 643-648. Review.

303. Spanggaard, B. The microflora of rainbow trout intestine: a comparison of trditional and molecular identification Text. / B. Spanggaard, I. Huber, J. Nielsen, T. Nielsen, K. F. Appel, L. Gram // Aquaculture. 2000.- V. 182. - P. 1-15.

304. Stahl, D.A. Characterization of a Yellowstone hot spring microbial community by 5S rRNA sequences Text. / D.A. Stahl, D.J. Lane, G.J. Olsen, N.R. Pace // Appl. Environ. Microbiol. 1985. - V. 49. - P. 1379-1384.

305. Staley, J.T. Prosthecomicrobium and Ancalomicrobium, new prosthecate freshwater bacteria Text. / J.T. Staley I I Journal of Bacteriology. 1968. - V. 95. -P. 1921 -1924.

306. Stein, LY. Intriguing microbial diversity associated with metal-rich particles from a freshwater reservoir Text. / G. Jones, B. Alexander, K. Elmund, C. Wright-Jones, K.H. Nealson // FEMS Microbiology Ecology . 2002. - V. 42, № 3. -P. 431 -440.

307. Strous, M. Anaerobic oxidation of methane and ammonium Text. / M. Strous, M.S.M. Jetten // Annual Review of Microbiology . 2004. - V. 58. - P. 99 -117.

308. Takai, K. Genetic diversity of archaea in deep-sea hydrothermal vent environments Text. / K. Takai, K. Horikoshi // Genetics. 1999. V. 152. - P. 1285 -1297.

309. Teske, A. Genomic markers of ancient anaerobic microbial pathways: sulfate reduction, methanogenesis, and methane oxidation Text. / A. Teske, B. Dhillon, M.L. Sogin // Biol. Bull.- 2003. V. 204. - P. 186-191.

310. Teske, A. Phylogenetic relationships of a large marine Beggiatoa / A. Teske, M.L. Sogin, L.P. Wilsen, H.W. Jannasch // Syst. Appl. Microbiol. 1999. -Vol. 22, № l.-P. 39-44.

311. Teske, A. Phylogeny of Thioploca and related filamentous sulfide-oxidizing bacteria Text. / A. Teske, N. B. Ramsing, J. Kuver, H. Fossing // Systematic Applied Microbiology. 1995. - V. 18. - P. 517-526.

312. Thomsen, T.R. Biogeochemical and molecular signatures of anaerobic methane oxidation in a marine sediment Text. / T.R. Thomsen, K. Finster, N.B. Ramsing

313. Appl. Environ. Microbiol. 2001. - V. 67, № 4. - P. 1646 - 1656.

314. Urbach, E. Unusual bacterioplankton community structure in ultra-oligotrophic Crater Lake Text. / E. Urbach, K. L. Vergin, L.Young, A. Morse, G. L. Larson, S.J. Giovannoni // Limnological Oceanography. -2001. V. 46, №3. - P. 557-572.

315. Valentine, D.L. New perspectives on anaerobic methane oxidation Text. / D.L. Valentine, W.S. Reeburgh //Environ. Microbiol. 2000. - V. 2. - P. 477 -484.

316. Valentine, D.L. Biogeochemistry and microbial ecology of methane oxidation in anoxic environments: a review Text. / D.L. Valentine // Antonie Van Leeuwenoek Int. J. of General and Molec. Microbiology. 2002. - V. 81, № 1-4. - P. 271 -282.

317. Van Hamme, J.D. Recent advances in petroleum microbiology Text. / J.D. Van Hamme, A. Singh, O.P. Ward // Microbiol. Mol. Biol. Rev. 2003. - V. 67, № 4. - P. 503 - 549.

318. Weller, R. 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes for in situ detection of members of the phylum Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides Text. /R. Weller, F.-O. Glöckner, R. Amann // System. Appl. Microbiolol. 2000. - 23. -P. 107-114.

319. Wellsbury, P. Deep marine biosphere fuelled by increasing organic matter availability during burial and heating Text. / P. Wellsbury, K. Goodman, T. Barth, B.A. Cragg, S.P. Barnes, R.J. Parkes // Nature. 1997. - V. 388. - P. 573 -576.

320. Whiticar, M.J. Carbon and Hydrogen isotope systematics of bacterial formation and oxidation of methane Text. / M.J. Whiticar // Chemical Geology. -1999.-V. 161.-P. 291-314.

321. Whittenbury, R. Enrichment, isolation and some properties of methane-utilizing bacteria Text. / R. Whittenbury, K.C. Phillips, J.F. Wilkinso // J. of General Microbiology. 1970. - V. 61. - P. 205 - 211.

322. Widdel, F. Anaerobic biodégradation of saturated and aromatic hydrocarbons Text. /F. Widdel, R. Rabus // Current opinion in biotechnology. -2001. V. 12, № 3. - P. 259 - 276.

323. Williams, D. F. Lake Baikal record of continental climate response to orbital insolation during the past 5 million years Text. / D. F. Williams // Science. -1997.-V. 278.-P. 1114-1117.

324. Williams, T. M. Filamentous sulfur bacteria of activated sludge: characterization of Thiothrix, Beggiatoa, and Eikelboom type 02IN strains Text. / T. M. Williams, R. F. Unz // Applied and Environmental Microbiology. 1985. - V. 49, №4.-P. 887-898.

325. Woese, C. R. Bacterial evolution Text. / C. R. Woese // Microbial Reviews. 1987. -V. 51, № 2. - P. 221-271.

326. Woese, C.R. Towards natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria and Eukarya Text. / C.R. Woese, O. Kandier, M.L. Wheelis // Proc. Natl Acad. Sei. USA. 1990. - V. 87. - P. 4576-4579.

327. Yakimov, M.M. Alcanivorax borkumensis gen nov., sp. nov., a new, hydrocarbon-degrading and surfactant-producing marine bacterium Text. / M.M. Yakimov // Int. J. Syst. Bacteriol. 1998. - V. 48. - P. 339 - 348.

328. Yakimov, M.M. Oleispira antarctica gen nov., sp. nov., a novel hydrocarbonoclastic marine bacterium isolated from Antarctic coastal sea water Text. / M.M. Yakimov // Int. J. Syst. Bacteriol. 2003. - V. 53. - P. 779 - 785.

329. Yakimov, M.M. Thalassolituus oleovorans gen nov., sp. nov., a novel marine bacterium that obligately utilized hydrocarbons Text. / M.M. Yakimov // Int. J. Syst. Bacteriol. 2004. - V. 54. - P. 141 - 148.

330. Yoshii, K. Stable Isotope Analyses of Pelagic Food Webs in Lake Baikal Text. / K. Yoshii, N.G. Melnik, O.A. Timoshkin, N.A. Bondarenko, P.N. Anoshko,

331. T. Yoshioka, E. Wada //Limnogy and Oceanography. 1999. - V. 44, N 3. - P. 502511.

332. Zender, A.J.B. Anaerobic methane oxidation: occurrence and ecology Text. / A.J.B. Zender, T.D. Brock // Applied and Environmental Microbiology. -1980.-V. 39.-P. 194-204.

333. Zender, A.J.B. Methane formation and methane oxidation by methanogenic bacteria Text. / A.J.B. Zender, T.D. Brock //J. Bacteriol. 1979. - V. 137.-P. 420-432.