Многопараметрическая высокочувствительная иммунодиагностика с использованием флюоресцентных полупроводниковых нанокристаллов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.09, кандидат наук Суханова, Алена Владимировна

• Суханова, Алена Владимировна
• кандидат наук
• 2017

Оглавление диссертации кандидат наук Суханова, Алена Владимировна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Научная новизна исследования

Теоретическая и практическая значимость работы

Методология и методы исследования

Положения, выносимые на защиту

Степень достоверности и апробация результатов исследования

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Полупроводниковые нанокристаллы - уникальные инструменты для многопараметрической и высокоточной флуоресцентной детекции в иммунодиагностике

1.1.1 Физико-химические свойства нанокристаллов

1.1.2 Преимущества полупроводниковых нанокристаллов по сравнению с органическими флуорофорами

1.1.3 Усовершенствование качества и чувствительности детекции с помощью двухфотонного режима возбуждения

1.2 Стабильные водорастворимые и биосовместимые нанокристаллы

1.2.1 Требования к свойствам нанокристаллов для их использования в иммунодиагностике

1.2.2 Методы получения водорастворимых и биосовместимых нанокристаллов

1.3 Конъюгаты НК с распознающими молекулами для использования в

иммунодиагностике

1.3.1 Получение флуоресцентной диагностической пробы на основе нанокристалла и функциональных распознающих молекул

1.3.1.1 Нековалентное связывание антитела и нанокристалла

1.3.1.2 Методы карбодиимидной химии

1.3.1.3 Использование модифицированных антител

1.3.1.4 Использование молекулярных адаптаров

1.3.1.5 Способы увеличения авидности иммунодиагностического нанозонда

1.4 Использование конъюгатов нанокристаллов для флуоресцентной детекции

1.4.1 Подходы к использованию конъюгатов нанокристаллов для детекции специфических структур клетки

1.4.2 Иммунофенотипирование СЭ8+-Т-лимфоцитов с помощью конъюгатов нанокристаллов в многопараметрическом режиме

1.4.3 Использование нанокристаллов в качестве доноров ферстеровского резонансного переноса энергии для высокоточной флуоресцентной детекции

1.5 Многопараметрическая иммунодетекция онкомаркеров

1.5.1 Диагностический потенциал многопараметрического анализа сложного профиля онкомаркеров

1.5.2 Детекция единичных циркулирующих раковых клеток с помощью нанкристаллов: использование двухфотонной проточной цитометрии

1.6 Использование флуоресцентных микросфер в многопараметрической иммунодетекции

1.7 Анализ флуоресцентных кодов микросфер, кодированных нанокристаллами,

с помощью проточной цитометрии

2 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2.1 Перечень оборудования и материалов

2.2 Физико-химические и спектроскопические методы

2.3 Биохимические методы

2.4 Методы полимерной химии

2.5 Методы молекулярной и клеточной биологии

2.6 Методы химического конъюгирования

2.7 Иммунологические методы детекции

2.8 Статистические методы

2 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ

2.1 Получение водорастворимых и биосовместимых нанокристаллов

2.2 Сравнительный анализ флуоресцентных свойств нанокристаллов и органических флуорофоров

2.3 Получение функциональных иммунодиагностических зондов на основе конъюгатов НК и фрагментов полноразмерных антител

2.4 Получение функциональных иммунодиагностических зондов на основе конъюгатов нанокристаллов и однодоменных антител

2.5 Тестирование препаратов конъюгатов нанокристаллов и однодоменных антител

2.5.1 Использование нанозондов для иммунодетекции в проточной цитометрии128

2.5.2 Использование нанозондов для детекции в флуоресцентной микроскопии и иммуногистохимии

2.5.3 Чувствительная и специфическая иммунодетекция онкомаркера HER2 в биологических пробах с помощью разработанного нанозонда

2.5.4 Валидация функциональных иммунодиагностических зондов на основе конъюгатов нанкристаллов и однодоменных антител

2.5.5 Использование конъюгата однодоменных антител и нанокристаллов для

иммунодиагностики с помощью FRET

2.6. Разработка процедуры кодирования полимерных микросфер флуоресцентными нанокристаллами для многопараметрической иммунодетекции

2.6.1 Получение микросфер кодированных нанокристаллами с помощью расплавления внешнего слоя микросфер

2.6.2 Получение кодированных микросфер с помощью метода миниэмульсионной полимеризации

2.6.3 Получение кодированных микросфер с помощью включения НК в

дополнительную полимерную оболочку

2.7 Тестирование возможности использования флуоресцентных микросфер для

дифференциальной диагностики аутоиммунных заболеваний

2.8. Тестирование флуоресцентных микросфер, кодированных нанокристаллами,

для многопараметрической иммунодетекции онкомаркеров

2.8.1 Иммунодетекция сывороточных онкомаркеров с помощью микросфер, кодированных нанокристаллами методом проточной цитометрии

2.8.2 Предклиническое тестирование диагностической системы на базе микросфер, кодированных нанокристаллами в сравнении с коммерческой

системой xMap® Lummex

ЗАКЛЮЧЕНИЕ И ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

БЛАГОДАРНОСТИ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Многопараметрическая высокочувствительная иммунодиагностика с использованием флюоресцентных полупроводниковых нанокристаллов»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования и степень ее разработанности

Актуальной задачей современной медицины является разработка методов быстрой и точной лабораторной иммунодиагностики широкого спектра заболеваний человека с целью ранней и точной постановки диагноза, мониторинга лечения, а также в эпидемиологических исследованиях и при адресном скрининге заболеваний.

Наиболее доступным в клинической практике методом выявления специфических биомаркеров является иммуноферментный анализ (ИФА), который приобрел популярность за счет сравнительно высокой чувствительности, специфичности и воспроизводимости детекции. Несмотря на то, что в настоящее время ведутся исследования, направленные на усовершенствование данного метода (снижение предела обнаружения, автоматизация анализа), ИФА обладает ограничениями, такими как длительное время анализа и отсутствие возможности одновременной детектции нескольких специфических биомаркеров в одном клиническом образце, что делает его дорогостоящим и затратным по времени в случае необходимости определения целого профиля биомаркеров. В связи с этим, все большую популярность приобретают альтернативные методы, позволяющие проводить многопараметрический анализ - одновременную количественную детекцию нескольких аналитов в одном биологическом образце. Многопараметрический анализ обладает неоспоримыми преимуществами для иммунодиагностики, так как процесс анализа происходит быстрее, затрачивается меньше реагентов и биоматериала, а также требует меньше трудовых ресурсов для осуществления анализа.

Флуоресцентные органические молекулы могут использоваться для специфической детекции в диагностических приложениях на базе твердофазных иммуноаналитических систем [7, 34] а также суспензионных, жидкофазных,

спектрально кодированных ЭО-микрочипов [64, 65, 135]. Кроме того, иммунофлуоресцентные методы детекции широко применяются для визуализации специфической экспрессии определенных клеточных маркеров с помощью проточной цитометрии [23] и тканевых маркеров в биоптатах с помощью иммуногистохимии [222].

Последние исследования и разработки в области нанотехнологий демонстрируют, что использование флуоресцентных нанокристаллов (НК) в многопараметрических суспензионных системах для дифференциальной иммунодиагностики [81, 88], а также для высокоточной молекулярной визуализации [123, 234] является перспективной научной и клинической альтернативой используемых в настоящий момент диагностических подходов.

Флуоресцентные полупроводниковые НК, или квантовые точки (КТ), обладают рядом уникальных физико-химических свойств, придающих им важные преимущества по сравнению с органическими флуоресцентными молекулами. Полупроводниковые флуоресцентные НК во много раз более фотостабильны и более чем на порядок ярче лучших органических флуорофоров. Кроме того, флуоресценция НК с различными спектральными свойствами может быть возбуждена светом одной длины волны, при этом физический размер НК определяет положение максимума спектра испускания флуоресценции [179].

Несмотря на то, что НК обладают исключительными спектральными свойствами, после синтеза в органической среде поверхность НК покрыта гидрофобными лигандами. Такие НК нерастворимы в воде и непригодны для прямого использования в биомедицинских приложениях. Вследствие этого, после синтеза поверхность НК должна быть дополнительно покрыта лигандами, обеспечивающими коллоидную стабильность и биосовместимость. Таким образом, для использования с диагностическими целями in vitro НК должны быть минимального размера, иметь стабильную защитную оболочку, а также дополнительный слой биосовместимых молекул на поверхности, обеспечивающий стабильность в биологических жидкостях и растворах. Кроме того, поверхность водорастворимых НК должна содержать определенные

функциональные группы для дальнейшего образования диагностических нековалентных комплексов или, что предпочтительнее, для ковалентного связывания НК с распознающими биомолекулами для получения диагностических нанозондов минимально возможного размера, обладающих высокой чувствительностью и отсутствием неспецифического связывания при детекции [47]. Альтернативно, на поверхности нанозондов должны быть экспонированы функциональные группы, облегчающие включение НК в полимерную матрицу при кодировании микросфер для конструирования многопараметрических диагностических суспензионных систем [199].

Химическое присоединение антиген-распознающих молекул, в частности антител (АТ), к НК превращает их в нанозонды, специфичные к конкретным типам сывороточных, клеточных или тканевых маркеров и обеспечивающие специфическую молекулярную визуализацию. Одним из перспективных кандидатов для конъюгации с КТ могут служить однодоменные антитела (одАТ). На сегодняшний день одАТ являются наименьшими природными белковыми фрагментами с размерами порядка 12-15 кДа, обладающими свойствами АТ [71, 204]. Крайне малый размер и высокая аффинность связывания одАТ с антигеном (АГ) может способствовать высокой чувствительности нанозондов на их основе при использовании в дифференциальной иммунодетекции в проточной цитометрии, а также специфическому распознаванию АГ при большой глубине проникновения диагностических нанозондов в ткани в процессе проведения иммуногистохимического анализа.

Одним из перспективных направлений для иммунодетекции специфических сывороточных маркеров является разработка суспензионных систем, спектрально кодированных при помощи флуоресцентных КТ. Впервые КТ были предложены для спектрального кодирования микрочастиц в 2001 году [88]. Несмотря на активные исследования, ведущиеся в данном направлении, разработка и усовершенствование диагностических суспензионных систем нового поколения на основе микросфер, кодированных КТ, для многопараметрической

количественной детекции маркеров различных заболеваний человека является актуальной задачей для иммунодетекции клинически значимых биомаркеров.

Таким образом, разработка принципов одновременной детекции различных сывороточных маркеров в минимальном объеме биологического образца с использованием уникальных свойств флуоресцентных НК, а также создание нанозондов для иммунодетекции с помощью специфически функционализированных популяций флуоресцентных наночастиц, избирательно и с высокой степенью чувствительности распознающих различные молекулярные детерминанты в клетках и тканях, представляет значительный интерес для клинической иммунодиагностики.

Цель исследования

Целью настоящей работы являлась разработка подходов к универсальной многопараметрической количественной иммунодетекции различных биологических маркеров в клинических образцах с использованием флуоресцентных НК, а также микросфер, оптически кодированных НК различных цветов и связанных со специфическими распознающими молекулами (с АГ или АТ).

Задачи исследования

1. Получение водорастворимых, коллоидно-стабильных в широком диапазоне экспериментальных условий концентрация соли, температура и т.д.) препаратов флуоресцентных НК с гидродинамическим диаметром в растворе не более 15 нм.

2. Приготовление препаратов функционально активных фрагментов полноразмерных АТ и одАТ, содержащих экспонированные химические группы, доступных для их высокоориентированной конъюгации с водорастворимыми НК.

3. Получение высокоактивных конъюгатов флуоресцентных НК и анализ их функциональных свойств с помощью стандартных биохимических и иммунологических методов.

4. Валидация возможности использования полученных конъюгатов для дифференциальной иммунодетекции в проточной цитометрии и для анализа экспрессии специфических биомаркеров в иммуногистохимии с использованием клинических образцов.

5. Синтез серии препаратов микросфер размером от 3 до 10 мкм, оптически кодированных НК различных цветов, анализ стабильности полученных препаратов и разработка условий конъюгирования флуоресцентных микросфер с распознающими молекулами (АГ или АТ).

6. Проведение предклинического тестирования полученной суспензионной системы на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК и несущих на своей поверхности аутоантигены (аутоАГ), для анализа сыворточного профиля аутоантител (аутоАТ) при диагностике системной склеродермии в формате «лаборатория-на-частице».

7. Проведение предклинического тестирования разработанных суспензионных систем на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК и несущих на своей поверхности АТ к специфическим онкомаркерам, для многопараметрической диагностики рака предстательной железы, рака молочной железы, рака яичников и рака лёгкого.

8. Сравнительный анализ разработанных суспензионных систем на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК и несущих на своей поверхности АТ к специфическим онкомаркерам и суспензионной системы детекции xMAP® фирмы Luminex на примере многопараметрической детекции маркеров рака лёгкого в клинических образцах бронхоальвеолярного смыва

Научная новизна исследования

Впервые разработаны эффективные подходы к использованию специфически модифицированных и функционализированных неорганических флуоресцентных НК для дифференциальной многопараметрической иммунодетекции сывороточных, клеточных и тканевых АГ.

Впервые получено новое поколение сверхминиатюрных нанозондов на основе наименьших из возможных (13 кДа) высокоаффинных рекомбинантных АТ (одАТ или "нанотел"), химически конъюгированных с компактными флуоресцентными КТ и расположенных на поверхности КТ с высокой степенью упорядоченности. Высокая степень упорядоченности обеспечивается сайт-специфической ориентированной конъюгацией КТ с одАТ через дополнительный остаток цистеина, введенный в C-концевую область аминокислотной последовательности рекомбинантных одАТ. Полученные нанозонды, распознающие раково-эмбриональный АГ (CEA), тирозиновую протеинкиназу семейства рецептора эпидермального фактора роста (EGFR/ErbB или HER2, или HER2-neu) и рецептор эпидермального фактора роста (EGFR/ErbB-1 или HER1), содержат несколько молекул одАТ, одинаковым образом ориентированных на поверхности КТ. Показано, что нанозонды имеют гидродинамический диаметр менее 12 нм и проявляют высокую функциональную активность в дифференциальной иммунодетекции в проточной цитометрии.

Повышенная способность к диффузии делает одАТ, используемые для получения этих сверхминиатюрных нанозондов, перспективной альтернативой классическим АТ в иммуногистохимическом анализе плотных тканей, непроницаемых для IgG. Установлено, что разработанные ориентированные конъюгаты одАТ-КТ окрашивают тканевые АГ с большей специфичностью и чувствительностью, чем классические АТ в иммуногистохимическом исследовании биоптатов.

Впервые созданы эффективные суспензионные иммунодиагностические системы на базе функционализированных микросфер, кодированных

флуоресцентными НК с различными оптическими свойствами, для дифференцированного определения специфических маркеров различных заболеваний в клинических образцах сыворотки крови человека: циркулирующих аутоАТ, ассоциированных с развитием аутоиммунных заболеваний (на примере детекции профиля аутоАТ, характерному для системной склеродермии), а также онкомаркеров, определяемых при раке предстательной железы, раке молочной железы, раке яичников или раке лёгкого.

С помощью репрезентативных выборок клинических образцов сыворотки крови и бронхиальвеолярного смыва пациентов и здоровых доноров проведено исследование возможностей полученных диагностических суспензионных систем для многопараметрического одновременного количественного анализа профиля сывороточных маркеров в проточной цитометрии в сравнении с традиционными иммунодиагностическими системами (ИФА), а также со суспензионной системой детекции на базе органических флуорофоров.

Впервые показано, что с помощью разработанной диагностической системы на базе флуоресцентных НК можно количественно определять заданный набор специфических маркеров в одном образце с высокой чувствительностью и специфичностью. Кроме того, использование флуоресцентных НК не только увеличивает количество возможных функциональных кодов иммунодиагностической суспензионной системы, но и упрощает регистрацию и анализ данных вследствие минимальных требований к конфигурации клинического оборудования, уменьшая, таким образом, затраты на проведение иммунодиагностических исследований.

Теоретическая и практическая значимость работы

Полученные данные позволили предложить эффективный экспериментальный подход к получению специфических иммунологических нанозондов с улучшенными функциональными характеристиками и чувствительностью. Применение полученных научных знаний можно теоретически расширить с

целью получения функционально активных ориентированных конъюгатов распознающих биомолекул любого типа с различными полупроводниковыми, металлическими и магнитными НК для создания новых многопараметрических систем иммунодетекции.

Изучение свойств полученных флуоресцентных и стабильных в биологических жидкостях НК in vitro позволило идентифицировать функциональные группы на поверхности НК, определяющие коллоидную стабильность в различных условиях, а также минимальное неспецифическое связывание с клетками и тканями, что позволило сформулировать специфические требования к свойствам поверхности НК для использования в иммунодиагностике в целом.

Работы по получению микросфер, кодированных НК выявили закономерности в стабильности флуоресцентного сигнала НК в составе полимерной микросферы в зависимости от метода кодирования и полимерного состава микросфер. Полученные данные имеют самостоятельную теоретическую ценность для дальнейшего исследования влияния полимерного окружения на интенсивность флуоресценции НК в составе диагностической системы.

Теоретическая значимость проекта подтверждается публикацией результатов работы в высокорейтинговых международных научных журналах со средним импакт-фактором публикаций по теме диссертации: 3,2; при Хирш-факторе соискателя, по базе данных Скопус: 24.

С практической точки зрения, разработанные нанозонды могут быть применены для иммунофенотипирования, детекции специфических маркеров в проточной цитометрии, а также для детекции раковых клеток в иммуногистохимических исследованиях биоптатов для высокоточной ранней дифференциальной иммунодиагностики различных заболеваний человека. Нанозонды одАТ-КТ с высокой степенью упорядоченности молекул одАТ, полученные в настоящем исследовании, могут найти множество приложений в высокоэффективной комплексной диагностике и в разработке платформ для детектирования на основе Ферстеровского резонансного переноса энергии (FRET).

Полученные диагностические суспензионные системы на основе микросфер, кодированных КТ, могут быть рекомендованы для использования в многопараметрической диагностике заболеваний, требующих многопрофильного одновременного анализа специфических сывороточных маркеров.

Таким образом, внедрение диагностических систем нового поколения с использованием флуоресцентных НК в клиническую практику позволит решить задачи своевременной ранней иммунодиагностики и массового адресного скрининга в группах повышенного риска определенных заболеваний.

Практическая значимость работы подтверждается наличием трех патентов и трех патентных заявок, а также разработкой, в процессе подготовки диссертации, научно-исследовательской документации на создание высокочувствительных диагностических систем на основе конъюгатов НК и распознающих молекул (государственный контракт ФЦП «Исследования и разработки» №. RFMEFI58415X0012).

Методология и методы исследования

Методология исследования была спланирована в соответствии с современными принципами научного познания и поставленной целью. Планирование и проведение исследований, направленных на реализацию поставленных задач, осуществлялось на основе комплекса современных общенаучных и специфических методов и подходов: иммунологических, биохимических, статистических, спектроскопических, физико-химических, а также методов полимерной химии, молекулярной и клеточной биологии, химического конъюгирования, в том числе направленного ориентированного конъюгирования.

Автором были разработаны и использовались методы биоадаптации синтетических флуоресцентных НК; редукции и очистки полноразмерных АТ и рекомбинантных одАТ; синтез высокоориентированных конъюгатов полноразмерных АТ, их фрагментов, а также рекомбинантных одАТ с НК; создание популяций полимерных микросфер, кодированных НК различных

цветов и несущих на своей поверхности распознающие молекулы для иммунодиагностики; предклиническую валидацию созданных систем и их характеристику; анализ результатов клинического тестирования с целью сравнения с существующими диагностическими стандартами. При выполнении работы использовали отечественные и международные научные базы данных и информационные ресурсы, такие как PubMed и е-НЬгагу, материалы российских и зарубежных научных журналов, российских и международных научных конференций. Анализ полученных результатов проводили с использованием общепринятых статистических методов анализа.

Все представленные в диссертационной работе научные результаты получены автором лично или под ее руководством коллективом группы наномедицины лаборатории нано-биоинженерии НИЯУ МИФИ, о чем имеется информация в соответствующих главах диссертационной работы.

Положения, выносимые на защиту

1. Применение флуоресцентных НК в иммунодиагностике позволяет увеличить чувствительность анализа, по сравнению с органическими флуорофорами.

2. Использование конъюгатов АТ-НК и суспензионных чипов на основе полимерных микросфер различного диаметра, оптически кодированных НК различных цветов, позволяет обеспечить одновременную многопараметрическую количественную иммунодетекцию биомаркеров, а также не требует специального сложного оборудования.

3. Сформулированы подходы к конструированию и обобщены результаты применения в иммунодиагностике высокочувствительных иммунодиагностических зондов на основе конъюгатов флуоресцентных НК и специфических АТ. Продемонстрировано, что ориентированное расположение аффинных молекул в составе конъюгата и двухфотонный режим возбуждения НК увеличивают чувствительность иммунодетекции.

4. Разработаны подходы к созданию и проанализированы результаты применения в иммунодиагностике суспензионной системы на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК и несущих на своей поверхности аутоАГ, для анализа сыворточного профиля аутоАТ при диагностике системной склеродермии.

5. Разработаны подходы к созданию и проанализированы результаты применения в иммунодиагностике суспензионных систем на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК и несущих на своей поверхности АТ к специфическим онкомаркерам, для многопараметрической диагностики рака предстательной железы, рака молочной железы, рака яичников и рака лёгкого.

6. Созданные иммунодиагностические суспензионные системы позволяют количественно определять профиль сывороточных маркеров в формате многопараметрического тестирования в отличии от традиционных иммунодиагностических системам (ИФА), предназначенных для индивидуальной детекции отдельных маркеров в объеме биологического образца.

7. Созданные иммунодиагностические суспензионные системы на основе микросфер, кодированных флуоресцентными НК, позволяют количественно определять профиль сывороточных маркеров в формате многопараметрического тестирования с использованием стандартного оборудования с одним источником возбуждения флуоресценции в отличии от суспензионной системы детекции xMAP® фирмы Luminex.

Степень достоверности и апробация результатов исследования

Для решения поставленных задач были изучены статистически достоверные выборки клинических проб пациентов и здоровых доноров с использованием современных иммунологических, биохимических и оптических методов исследования, при постоянном использовании отрицательных и положительных контрольных экспериментов. Все эксперименты имели не менее, чем трёхкратную

воспроизводимость. Анализ полученных результатов проводили с использованием современных статистических методов и с учетом самых последних, из известных, научных данных. Выносимые на защиту положения, выводы и рекомендации по использованию научных результатов в практике подтверждены фактическим материалом и отражают основные достижения соискателя по теме исследования. Вышеуказанное позволяет считать полученные результаты достоверными, а сделанные выводы обоснованными и вытекающими из результатов проведенных исследований.

Результаты работы были представлены на международных конференциях и конгрессах: II Международная научная конференция "Наука будущего" (Казань, 2016), International Conference "Nanomeeting 2015" (Minsk, Belarus, 2015), I Международная научная конференция "Наука будущего" (Санкт-Петербург, 2014), SPIE Photonics West International Conference (San Francisco, California, USA, 2014), SPIE Photonics Europe, Biophotonics: "Photonic Solutions for Better Health Care" (Brussels, Belgium, 2014), Global Congress on Nanosystems in Engineering and Medicine: "Nano-Bio-Info Convergence" (Incheon, Republic of Korea, 2012), Advances in Functional Materials Conference (Stony Brook University, USA, 2015), 7th International Conference on Biomedical Applications of Nanotechnology (Berlin, Germany, 2010), 6th, 5th, 3rd, 2nd Conferences "Nanobiotechnology and Cellular Biology" (Москва, 2009, 2008, 2006, 2005), European Community Workshop "Towards Zero-Power ICT (2zeroP)" research challenges: Deepening Understanding of this new FET research area (Brussels, Belgium, 2009), SPIE's Photonics West Symposium (San Jose, California, 2008), Intenational Conference on Interactions in Hybrid Nanosystems (Frauenwörth, Chiemsee, Allemagne, 2008), International Conference TMS Annual Nano-Meeting & Exhibition (Orlando, Florida, USA, 2007), International Conference "NaNaX 2, Nanoscience with Nanocrystals" (Grenoble, France, 2006), 8th International Conference of Polymers for Advanced Technologies (Budapest, Hungary, 2005), "Quantum Dots-2004" Conference (Banff, Alberta, Canada 2004), Conference "Nanoscience with nanocrystals" (Munich, Germany, 2003),

XXIIème Forum de Cancérologie (Paris, France, 2002), International Conference on Molecular Medicine, (Пущино, 2001).

Апробация диссертационной работы состоялась 16 ноября 2016 года на научном заседании межкафедральной лаборатории нанобиоинженерии НИЯУ МИФИ.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 57 научных работ в отечественных и зарубежных изданиях, в том числе 53 статей в журналах, рекомендуемых ВАК при Министерстве образования и науки Российской Федерации и цитируемых в международных базах "Скопус" и "Сеть науки", а также 34 тезиса конференций. Подготовлено 6 патентов.

Связь работы с научными программами

Работа выполнена при поддержке Федеральной целевой программы по научным исследованиям и разработкам Министерства образования и науки Российской Федерации (Соглашение о предоставлении субсидии от 30.01.2015 г. № 14.584.21.0012, контракт №. RFMEFI58415X0012).

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Полупроводниковые нанокристаллы - уникальные инструменты для многопараметрической и высокоточной флуоресцентной детекции в

иммунодиагностике

Основополагающим условием эффективного лечения различных нозологических форм заболеваний человека является возможность ранней, высокоточной и неинвазивной дифференциальной диагностики. В настоящее время в клинической практике широко применяются методы иммунодиагностики с использованием различных органических флуорофоров. Тем не менее, такие оптические свойства органических флуоресцентных соединений как узкие спектры возбуждения, широкие несимметричные спектры испускания флуоресценции, достаточно невысокая фотостабильность ограничивают их применение для многопараметрического анализа биологических образцов, а также для диагностических приложений, где используется небольшое количество клинического материала и требуется высокая точность детекции. Таким образом, важными задачами трансляционной медицины, в частности, в контексте развития высокоточных и многопараметрических подходов к диагностике в клинической иммунологии, является использование принципиально новых флуоресцентных агентов, обладающих определенными преимуществами по сравнению с уже применяемыми в клинической практике органическими флуорофорами.

1.1.1 Физико-химические свойства нанокристаллов

Достижения последних десятилетий прошлого века в области развития нанотехнологий привели к созданию нового класса флуоресцентных высокогомогенных полупроводниковых кристаллов размером 2-6 нм. Уникальные оптические свойства таких кристаллов определяются их химическим составом и размером, сравнимым с размером биомолекул, например с физическим размером

молекул глобулярных белков (Рисунок 1) [149]. Полупроводниковые НК, или "квантовые точки" (КТ), состоят из атомов элементов II-VI или III-V групп периодической таблицы Менделеева [4, 89, 185]. НК принципиальным образом отличаются от объемных полупроводниковых материалов по своим электронным свойствам. За счет квантово-размерного эффекта зонная структура КТ отличается от зонной структуры объемного полупроводника, при этом ширина запрещенной зоны КТ зависит от ее размера и подчиняется уравнению Брюса (1) [32],

Eg(QD) = Ebulk + vm, . те.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Суханова, Алена Владимировна, 2017 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Abdellah M. [h gp.]. Ultra Long-Lived Radiative Trap States in CdSe Quantum Dots // The Journal of Physical Chemistry C. 2014. № 37 (118). C. 21682-21686.

2. Ai X. [h gp.]. Generation and characterization of antibodies specific for caspase-cleaved neo-epitopes: A novel approach // Cell Death and Disease. 2011. № 9 (2).

3. Aldana J., Wang Y.A., Peng X. Photochemical instability of CdSe nanocrystals coated by hydrophilic thiols // Journal of the American Chemical Society. 2001. № 36 (123).

4. Alivisatos A.P. Semiconductor Clusters, Nanocrystals, and Quantum Dots // Science. 1996. № 5251 (271). C. 933-937.

5. Alivisatos A.P., Gu W., Larabell C. Quantum dots as cellular probes / A.P. Alivisatos, W. Gu, C. Larabell, 2005.

6. Allemani C. [h gp.]. Global surveillance of cancer survival 1995-2009: analysis of individual data for 25,676,887 patients from 279 population-based registries in 67 countries (CONCORD-2). // Lancet (London, England). 2015. № 9972 (385). C. 9771010.

7. Altara R. [h gp.]. Improving membrane based multiplex immunoassays for semiquantitative detection of multiple cytokines in a single sample. // BMC biotechnology. 2014. № 1 (14). C. 63.

8. Amit A. [h gp.]. Three-dimensional structure of an antigen-antibody complex at 2.8 A resolution // Science. 1986. № 4765 (233). C. 747-753.

9. Anderson K.S. [h gp.]. Autoantibody signature for the serologic detection of ovarian cancer. // Journal of proteome research. 2015. № 1 (14). C. 578-86.

10. Antonietti M. Polyreactions in miniemulsions // Progress in Polymer Science. 2002. № 4 (27). C. 689-757.

11. Asua J.M. Miniemulsion polymerization // Progress in Polymer Science. 2002. № 7 (27). C. 1283-1346.

12. Azuma K. [h gp.]. Mutated p53 gene encodes a nonmutated epitope recognized by HLA-B*4601-restricted and tumor cell-reactive CTLs at tumor site // Cancer Research. 2003. № 4 (63).

13. Bagalkot V. [h gp.]. Quantum dot-aptamer conjugates for synchronous cancer imaging, therapy, and sensing of drug delivery based on Bi-fluorescence resonance energy transfer // Nano Letters. 2007. № 10 (7).

14. Bailey V.J. [h gp.]. MS-qFRET: A quantum dot-based method for analysis of DNA methylation // Genome Research. 2009. № 8 (19).

15. Bakalova R. [h gp.]. Chemical nature and structure of organic coating of quantum dots is crucial for their application in imaging diagnostics. // International journal of nanomedicine. 2011. (6). C. 1719-1732.

16. Baranov A.V. [h gp.]. Effect of ZnS shell thickness on the phonon spectra in CdSe quantum dots // Physical Review B - Condensed Matter and Materials Physics. 2003. № 16 (68).

17. Barat B. [h gp.]. Cys-diabody quantum dot conjugates (ImmunoQdots) for cancer marker detection // Bioconjugate Chemistry. 2009. № 8 (20).

18. Bart J. [h gp.]. Room-temperature intermediate layer bonding for microfluidic devices. // Lab on a chip. 2009. № 24 (9). C. 3481-8.

19. Bartczak D., Kanaras A.G. Preparation of peptide-functionalized gold nanoparticles using one pot EDC/Sulfo-NHS coupling // Langmuir. 2011. № 16 (27).

20. Bartczak D., Kanaras A.G. Preparation of peptide-functionalized gold nanoparticles using one pot EDC/sulfo-NHS coupling. // Langmuir: the ACS journal of surfaces and colloids. 2011. № 16 (27). C. 10119-23.

21. Bellisario R., Colinas R.J., Pass K.A. Simultaneous measurement of thyroxine and

thyrotropin from newborn dried blood-spot specimens using a multiplexed fluorescent microsphere immunoassay // Clinical Chemistry. 2000. № 9 (46).

22. Bhuckory S. [h gp.]. Direct conjugation of antibodies to the ZnS shell of quantum dots for FRET immunoassays with low picomolar detection limits. // Chemical communications (Cambridge, England). 2016.

23. Biancotto A., McCoy J.P. Studying the human immunome: the complexity of comprehensive leukocyte immunophenotyping. // Current topics in microbiology and immunology. 2014. (377). C. 23-60.

24. Boldt K. [h gp.]. Synthesis of Highly Luminescent and Photo-Stable, Graded Shell CdSe/Cd x Zn 1- x S Nanoparticles by In Situ Alloying // Chemistry of Materials. 2013. № 23 (25). C. 4731-4738.

25. Boulesbaa A. [h gp.]. Ultrafast charge separation at CdS quantum dot/rhodamine B molecule interface. // Journal of the American Chemical Society. 2007. № 49 (129). C. 15132-3.

26. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. // Analytical biochemistry. 1976. (72). C. 248-54.

27. Brena R.M., Huang T.H.-M., Plass C. Quantitative assessment of DNA methylation: Potential applications for disease diagnosis, classification, and prognosis in clinical settings // Journal of Molecular Medicine. 2006. № 5 (84).

28. Brody T. Multistep denaturation and hierarchy of disulfide bond cleavage of a monoclonal antibody // Analytical Biochemistry. 1997. № 2 (247).

29. Bronstein I.B. [h gp.]. Expression, purification and DNA-cleavage activity of recombinant 68-kDa human topoisomerase I-target for antitumor drugs. // Anticancer research. № 1A (19). C. 317-27.

30. Bruchez Jr. M. [h gp.]. Semiconductor nanocrystals as fluorescent biological labels // Science. 1998. № 5385 (281).

31. Bruner B.F. [h gp.]. Comparison of autoantibody specificities between traditional and bead-based assays in a large, diverse collection of patients with systemic lupus erythematosus and family members. // Arthritis and rheumatism. 2012. № 11 (64). C. 3677-86.

32. Brus L. Electronic wave functions in semiconductor clusters: experiment and theory // The Journal of Physical Chemistry. 1986. № 12 (90). C. 2555-2560.

33. Bryan T.M., Cech T.R. Telomerase and the maintenance of chromosome ends // Current Opinion in Cell Biology. 1999. № 3 (11).

34. Butvilovskaya V.I. [h gp.]. Multiplex determination of serological signatures in the sera of colorectal cancer patients using hydrogel biochips. // Cancer medicine. 2016. № 7 (5). C. 1361-72.

35. Cao J. [h gp.]. DJ-1 as a human oncogene and potential therapeutic target. // Biochemical pharmacology. 2015. № 3 (93). C. 241-50.

36. Carson R.T., Vignali D.A. Simultaneous quantitation of 15 cytokines using a multiplexed flow cytometric assay. // Journal of immunological methods. 1999. № 1-2 (227). C. 41-52.

37. Catalona W.J. [h gp.]. Use of the percentage of free prostate-specific antigen to enhance differentiation of prostate cancer from benign prostatic disease: A prospective multicenter clinical trial // Journal of the American Medical Association. 1998. № 19 (279).

38. Chan W.C.W. [h gp.]. Patients, Here Comes More Nanotechnology // ACS Nano. 2016. № 9 (10).

39. Chan W.C.W., Nie S. Quantum dot bioconjugates for ultrasensitive nonisotopic detection // Science. 1998. № 5385 (281).

40. Chang Y.-H. [h gp.]. Comparative secretome analyses using a hollow fiber culture system with label-free quantitative proteomics indicates the influence of PARK7 on cell proliferation and migration/invasion in lung adenocarcinoma. // Journal of proteome

research. 2012. № 11 (11). C. 5167-85.

41. Chapman C. [h gp.]. Autoantibodies in breast cancer: Their use as an aid to early diagnosis // Annals of Oncology. 2007. № 5 (18).

42. Chattopadhyay P.K. [h gp.]. Quantum dot semiconductor nanocrystals for immunophenotyping by polychromatic flow cytometry // Nature Medicine. 2006. № 8 (12).

43. Chen F., Gerion D. Fluorescent CdSe/ZnS nanocrystal-peptide conjugates for long-term, nontoxic imaging and nuclear targeting in living cells // Nano Letters. 2004. № 10

(4).

44. Cheng W. [h gp.]. Cascade signal amplification strategy for subattomolar protein detection by rolling circle amplification and quantum dots tagging // Analytical Chemistry. 2010. № 8 (82).

45. Chiplunkar S.V. The immune system and cancer // Current Science. 2001. № 5 (81).

46. Chu V.H. [h gp.]. Synthesis and optical properties of water soluble CdSe/CdS quantum dots for biological applications // Advances in Natural Sciences: Nanoscience and Nanotechnology. 2012. № 2 (3). C. 25017.

47. Colombo M. [h gp.]. Protein oriented ligation on nanoparticles exploiting O6-alkylguanine-DNA transferase (SNAP) genetically encoded fusion. // Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany). 2012. № 10 (8). C. 1492-7.

48. Cristofanilli M. [h gp.]. Circulating tumor cells, disease progression, and survival in metastatic breast cancer // New England Journal of Medicine. 2004. № 8 (351).

49. Crouch D.J. [h gp.]. A one-step synthesis of cadmium selenide quantum dots from a novel single source precursor. // Chemical communications (Cambridge, England). 2003. № 12. C. 1454-5.

50. Dabbousi B.O. [h gp.]. (CdSe)ZnS Core-Shell Quantum Dots: Synthesis and Characterization of a Size Series of Highly Luminescent Nanocrystallites // The Journal

of Physical Chemistry B. 1997. № 46 (101). C. 9463-9475.

51. Dag I., Lifshitz E. Dynamics of Recombination Processes in Pbl 2 Nanocrystals Embedded in Porous Silica Films // The Journal of Physical Chemistry. 1996. № 21 (100). C. 8962-8972.

52. Dahan M. [h gp.]. Diffusion Dynamics of Glycine Receptors Revealed by SingleQuantum Dot Tracking // Science. 2003. № 5644 (302).

53. Delehanty J.B. [h gp.]. Self-assembled quantum dot-peptide bioconjugates for selective intracellular delivery. // Bioconjugate chemistry. № 4 (17). C. 920-7.

54. DeLisa M.P. [h gp.]. Evanescent wave long-period fiber bragg grating as an immobilized antibody biosensor. // Analytical chemistry. 2000. № 13 (72). C. 2895900.

55. Deng G. [h gp.]. High sensitive immunoassay for multiplex mycotoxin detection with photonic crystal microsphere suspension array // Analytical Chemistry. 2013. № 5 (85).

56. Derfus A.M., Chan W.C.W., Bhatia S.N. Intracellular delivery of quantum dots for live cell labeling and organelle tracking // Advanced Materials. 2004. № 12 (16).

57. Desmyter A. [h gp.]. Antigen specificity and high affinity binding provided by one single loop of a camel single-domain antibody. // The Journal of biological chemistry. 2001. № 28 (276). C. 26285-90.

58. Deyev S.M. [h gp.]. Design of multivalent complexes using the barnase*barstar module. // Nature biotechnology. 2003. № 12 (21). C. 1486-92.

59. Dif A. [h gp.]. Small and stable peptidic PEGylated quantum dots to target polyhistidine-tagged proteins with controlled stoichiometry. // Journal of the American Chemical Society. 2009. № 41 (131). C. 14738-46.

60. Dillon M. [h gp.]. Efficient production of bispecific IgG of different isotypes and species of origin in single mammalian cells. // mAbs. 2016.

61. Ding T.X. [h gp.]. Efficiency of hole transfer from photoexcited quantum dots to covalently linked molecular species. // Journal of the American Chemical Society. 2015. № 5 (137). C. 2021-9.

62. Dubertret B. [h gp.]. In vivo imaging of quantum dots encapsulated in phospholipid micelles // Science. 2002. № 5599 (298).

63. Dumoulin M. [h gp.]. Single-domain antibody fragments with high conformational stability // Protein Science. 2002. № 3 (11).

64. Dunbar S.A. Applications of Luminex xMAP technology for rapid, high-throughput multiplexed nucleic acid detection. // Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry. 2006. № 1-2 (363). C. 71-82.

65. Dunbar S.A., Jacobson J.W. Quantitative, multiplexed detection of Salmonella and other pathogens by Luminex xMAP suspension array. // Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2007. (394). C. 1-19.

66. Dunn G.P., Old L.J., Schreiber R.D. The immunobiology of cancer immunosurveillance and immunoediting // Immunity. 2004. № 2 (21).

67. East D.A., Todd M., Bruce I.J. Quantum dot-antibody conjugates via carbodiimide-mediated coupling for cellular imaging / D.A. East, M. Todd, I.J. Bruce, 2014.

68. Eastman P.S. [h gp.]. Qdot nanobarcodes for multiplexed gene expression analysis // Nano Letters. 2006. № 5 (6).

69. Edelmann L. [h gp.]. Cystic fibrosis carrier screening: Validation of a novel method using BeadChip technology // Genetics in Medicine. 2004. № 5 (6).

70. Elgundi Z. [h gp.]. The state-of-play and future of antibody therapeutics. // Advanced drug delivery reviews. 2016.

71. Even-Desrumeaux K. [h gp.]. Single-domain antibodies: A versatile and rich source of binders for breast cancer diagnostic approaches // Molecular BioSystems. 2012. № 9 (8).

72. Fan H. [h gp.]. Surfactant-assisted synthesis of water-soluble and biocompatible semiconductor quantum dot micelles. // Nano letters. 2005. № 4 (5). C. 645-8.

73. Ferguson J.A., Steemers F.J., Walt D.R. High-density fiber-optic DNA random microsphere array // Analytical Chemistry. 2000. № 22 (72).

74. Ferlay J. [h gp.]. Cancer incidence and mortality patterns in Europe: estimates for 40 countries in 2012. // European journal of cancer (Oxford, England: 1990). 2013. № 6 (49). C. 1374-403.

75. Fitzmorris B.C. [h gp.]. Optical properties and exciton dynamics of alloyed core/shell/shell Cd(1-x)Zn(x)Se/ZnSe/ZnS quantum dots. // ACS applied materials & interfaces. 2013. № 8 (5). C. 2893-900.

76. Freeman R., Willner I. Optical molecular sensing with semiconductor quantum dots (QDs). // Chemical Society reviews. 2012. № 10 (41). C. 4067-85.

77. Gao X., Nie S. Quantum Dot-Encoded Mesoporous Beads with High Brightness and Uniformity: Rapid Readout Using Flow Cytometry // Analytical Chemistry. 2004. № 8 (76).

78. Garber E.A.E., Venkateswaran K. V, O'Brien T.W. Simultaneous multiplex detection and confirmation of the proteinaceous toxins abrin, ricin, botulinum toxins, and Staphylococcus enterotoxins a, B, and C in food. // Journal of agricultural and food chemistry. 2010. № 11 (58). C. 6600-7.

79. Gaster R.S. [h gp.]. Matrix-insensitive protein assays push the limits of biosensors in medicine // Nature Medicine. 2009. № 11 (15).

80. Geidel C. [h gp.]. A general synthetic approach for obtaining cationic and anionic inorganic nanoparticles via encapsulation in amphiphilic copolymers. // Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany). 2011. № 20 (7). C. 2929-34.

81. Generalova A.N. [h gp.]. Submicron polymer particles containing fluorescent semiconductor nanocrystals CdSe/ZnS for bioassays. // Nanomedicine (London, England). 2011. № 2 (6). C. 195-209.

82. Goldman E.R. [h gp.]. A hybrid quantum dot - Antibody fragment fluorescence resonance energy transfer-based TNT sensor // Journal of the American Chemical Society. 2005. № 18 (127).

83. Gubala V. [h gp.]. A comparison of mono and multivalent linkers and their effect on the colloidal stability of nanoparticle and immunoassays performance // Talanta. 2010. № 4-5 (81). C. 1833-1839.

84. Guo W. [h gp.]. Conjugation Chemistry and Bioapplications of Semiconductor Box Nanocrystals Prepared via Dendrimer Bridging // Chemistry of Materials. 2003. № 16 (15). C. 3125-3133.

85. Hamers-Casterman C. [h gp.]. Naturally occurring antibodies devoid of light chains // Nature. 1993. № 6428 (363).

86. Hamm A. [h gp.]. Frequent expression loss of Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain (ITIH) genes in multiple human solid tumors: a systematic expression analysis. // BMC cancer. 2008. № 1 (8). C. 25.

87. Hammarstrom S. The carcinoembryonic antigen (CEA) family: Structures, suggested functions and expression in normal and malignant tissues // Seminars in Cancer Biology. 1999. № 2 (9).

88. Han M. [h gp.]. Quantum-dot-tagged microbeads for multiplexed optical coding of biomolecules // Nature Biotechnology. 2001. № 7 (19).

89. Henglein A. Small-particle research: physicochemical properties of extremely small colloidal metal and semiconductor particles // Chemical Reviews. 1989. № 8 (89). C. 1861-1873.

90. Hines M.A., Guyot-Sionnest P. Synthesis and Characterization of Strongly Luminescing ZnS-Capped CdSe Nanocrystals // The Journal of Physical Chemistry. 1996. № 2 (100). C. 468-471.

91. Ho J.A.A. [h gp.]. Ultrasensitive electrochemical detection of biotin using electrically addressable site-oriented antibody immobilization approach via

aminophenyl boronic acid // Biosensors and Bioelectronics. 2010. № 3 (26).

92. Holliger P., Hudson P.J. Engineered antibody fragments and the rise of single domains // Nature Biotechnology. 2005. № 9 (23).

93. Holmquist L., Vesterberg O. Direct on air sampling filter quantification of cat allergen. // Journal of biochemical and biophysical methods. 2002. № 1 (51). C. 17-25.

94. Hu X., Gao X. Silica-polymer dual layer-encapsulated quantum dots with remarkable stability. // ACS nano. 2010. № 10 (4). C. 6080-6.

95. Hu X., Zrazhevskiy P., Gao X. Encapsulation of single quantum dots with mesoporous silica. // Annals of biomedical engineering. 2009. № 10 (37). C. 1960-6.

96. Hueber W. [h gp.]. Autoantibody profiling for the study and treatment of autoimmune disease. // Arthritis research. 2002. № 5 (4). C. 290-5.

97. Hurley J.D. [h gp.]. A simple, bead-based approach for multi-SNP molecular haplotyping. // Nucleic acids research. 2004. № 22 (32).

98. Hwu P., Freedman R.S. The immunotherapy of patients with ovarian cancer // Journal of Immunotherapy. 2002. № 3 (25).

99. Issac A., Jin S., Lian T. Intermittent electron transfer activity from single CdSe/ZnS quantum dots. // Journal of the American Chemical Society. 2008. № 34 (130). C. 11280-1.

100. Ivanova Y.L. [h gp.]. Immunocytochemical visualization of P185HER2 receptor using antibodies fused with dibarnase and conjugate of barstar with colloidal gold // Molecular Biology. 2013. № 5 (47).

101. Jasieniak J. [h gp.]. Re-examination of the size-dependent absorption properties of CdSe quantum dots // Journal of Physical Chemistry C. 2009. № 45 (113).

102. Jasieniak J. [h gp.]. Re-examination of the Size-Dependent Absorption Properties of CdSe Quantum Dots // The Journal of Physical Chemistry C. 2009. № 45 (113). C. 19468-19474.

103. Jia J. [h gp.]. Development of a multiplex autoantibody test for detection of lung cancer. // PloS one. 2014. № 4 (9). C. e95444.

104. Jokerst J.V. [h gp.]. Nano-bio-chips for high performance multiplexed protein detection: Determinations of cancer biomarkers in serum and saliva using quantum dot bioconjugate labels // Biosensors and Bioelectronics. 2009. № 12 (24).

105. Kahn N. [h gp.]. Early detection of lung cancer by molecular markers in endobronchial epithelial-lining fluid. // Journal of thoracic oncology: official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer. 2012. № 6 (7). C. 1001-8.

106. Kawabe Y. [h gp.]. Improved recombinant antibody production by CHO cells using a production enhancer DNA element with repeated transgene integration at a predetermined chromosomal site. // Journal of bioscience and bioengineering. 2016.

107. Kellar K.L., Douglass J.P. Multiplexed microsphere-based flow cytometric immunoassays for human cytokines // Journal of Immunological Methods. 2003. № 1-2 (279).

108. Kellar K.L., Iannone M.A. Multiplexed microsphere-based flow cytometric assays // Experimental Hematology. 2002. № 11 (30).

109. Kepp O. [h gp.]. Consensus guidelines for the detection of immunogenic cell death. // Oncoimmunology. 2014. № 9 (3). C. e955691.

110. Kierny M.R., Cunningham T.D., Kay B.K. Detection of biomarkers using recombinant antibodies coupled to nanostructured platforms. // Nano reviews. 2012. (3).

111. Kim J.-H. [h gp.]. Up-regulation of peroxiredoxin 1 in lung cancer and its implication as a prognostic and therapeutic target. // Clinical cancer research: an official journal of the American Association for Cancer Research. 2008. № 8 (14). C. 2326-33.

112. Kim N.W. [h gp.]. Specific association of human telomerase activity with immortal cells and cancer // Science. 1994. № 5193 (266).

113. Kim S., Bawendi M.G. Oligomeric ligands for luminescent and stable nanocrystal quantum dots. // Journal of the American Chemical Society. 2003. № 48 (125). C. 14652-3.

114. Klarreich E. Biologists join the dots. // Nature. 2001. № 6855 (413). C. 450-2.

115. Koh I. [h gp.]. Nanoparticle-target interactions parallel antibody-protein interactions // Analytical Chemistry. 2009. № 9 (81).

116. Kokkinos C. [h gp.]. Disposable integrated bismuth citrate-modified screen-printed immunosensor for ultrasensitive quantum dot-based electrochemical assay of C-reactive protein in human serum // Analytica Chimica Acta. 2015. (886).

117. Kong X.-L. [h gp.]. One-step preparation of antibody and oligonucleotide duallabeled gold nanoparticle bio-probes and their properties // Biotechnology Letters. 2008. № 12 (30).

118. Konig K. Multiphoton microscopy in life sciences // Journal of Microscopy. 2000. № 2 (200).

119. Lacombe J., Mangé A., Solassol J. Use of autoantibodies to detect the onset of breast cancer. // Journal of immunology research. 2014. (2014). C. 574981.

120. Lao U.L., Mulchandani A., Chen W. Simple conjugation and purification of quantum dot-antibody complexes using a thermally responsive elastin-protein L scaffold as immunofluoresecent agents. // Journal of the American Chemical Society. 2006. № 46 (128). C. 14756-7.

121. Larson D.R. [h gp.]. Water-soluble quantum dots for multiphoton fluorescence imaging in vivo // Science. 2003. № 5624 (300).

122. Lee J. [h gp.]. Fast, Ratiometric FRET from Quantum Dot Conjugated Stabilized Single Chain Variable Fragments for Quantitative Botulinum Neurotoxin Sensing. // Nano letters. 2015. № 10 (15). C. 7161-7.

123. Lee-Montiel F.T., Li P., Imoukhuede P.I. Quantum dot multiplexing for the

profiling of cellular receptors. // Nanoscale. 2015. № 44 (7). C. 18504-14.

124. Levy M., Cater S.F., Ellington A.D. Quantum-dot aptamer beacons for the detection of proteins // ChemBioChem. 2005. № 12 (6).

125. Lidke D.S. [h gp.]. Reaching out for signals: Filopodia sense EGF and respond by directed retrograde transport of activated receptors // Journal of Cell Biology. 2005. № 4 (170).

126. Lim Y.T. [h gp.]. Simultaneous intracellular delivery of targeting antibodies and functional nanoparticles with engineered protein G system // Biomaterials. 2009. № 6 (30).

127. Lin C.-A.J. [h gp.]. Design of an amphiphilic polymer for nanoparticle coating and functionalization // Small. 2008. № 3 (4).

128. Liu M. [h gp.]. Vitellogenin mediates phagocytosis through interaction with FcyR // Molecular Immunology. 2011. № 1-2 (49).

129. Liu W. [h gp.]. Compact biocompatible quantum dots functionalized for cellular imaging // Journal of the American Chemical Society. 2008. № 4 (130).

130. Liu X. [h gp.]. Monofunctional gold nanoparticles prepared via a noncovalent-interaction-based solid-phase modification approach. // Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany). 2006. № 10 (2). C. 1126-9.

131. Luccardini C. [h gp.]. Size, charge, and interactions with giant lipid vesicles of quantum dots coated with an amphiphilic macromolecule. // Langmuir: the ACS journal of surfaces and colloids. 2006. № 5 (22). C. 2304-10.

132. Lukacs Z. [h gp.]. Simultaneous determination of HIV antibodies, hepatitis C antibodies, and hepatitis B antigens in dried blood spots - A feasibility study using a multi-analyte immunoassay // Clinical Chemistry and Laboratory Medicine. 2005. № 2 (43).

133. Luo L.-Y. [h gp.]. Identification of heat shock protein 90 and other proteins as

tumour antigens by serological screening of an ovarian carcinoma expression library // British Journal of Cancer. 2002. № 3 (87).

134. Luo Y. Selectivity assessment of kinase inhibitors: Strategies and challenges // Current Opinion in Molecular Therapeutics. 2005. № 3 (7).

135. Lynch H.E. [h gp.]. Development and implementation of a proficiency testing program for Luminex bead-based cytokine assays. // Journal of immunological methods. 2014. (409). C. 62-71.

136. Ma Y. [h gp.]. Surface-enhanced raman spectroscopy on liquid interfacial nanoparticle arrays for multiplex detecting drugs in urine // Analytical Chemistry. 2016. № 16 (88).

137. Maccalli C. [h gp.]. Immunological markers and clinical outcome of advanced melanoma patients receiving ipilimumab plus fotemustine in the NIBIT-M1 study. // Oncoimmunology. 2016. № 2 (5). C. e1071007.

138. Mahmoud W. [h gp.]. Advanced procedures for labeling of antibodies with quantum dots // Analytical Biochemistry. 2011. № 2 (416).

139. Makaraviciute A. [h gp.]. Considerations in producing preferentially reduced half-antibody fragments. // Journal of immunological methods. 2016. (429). C. 50-6.

140. Mastai Y., Hodes G. Size Quantization in Electrodeposited CdTe Nanocrystalline Films // The Journal of Physical Chemistry B. 1997. № 14 (101). C. 2685-2690.

141. Mattheakis L.C. [h gp.]. Optical coding of mammalian cells using semiconductor quantum dots // Analytical Biochemistry. 2004. № 2 (327).

142. McBride M.T. [h gp.]. Multiplexed liquid arrays for simultaneous detection of simulants of biological warfare agents // Analytical Chemistry. 2003. № 8 (75).

143. Medintz I.L. [h gp.]. Self-assembled nanoscale biosensors based on quantum dot FRET donors // Nature Materials. 2003. № 9 (2).

144. Medintz I.L. [h gp.]. Quantum dot bioconjugates for imaging, labelling and

sensing. // Nature materials. 2005. (4). C. 435-446.

145. Medintz I.L. [h gp.]. A reagentless biosensing assembly based on quantum dot-donor forster resonance energy transfer // Advanced Materials. 2005. № 20 (17).

146. Medintz I.L. [h gp.]. Quantum dot bioconjugates for imaging, labelling and sensing // Nature Materials. 2005. № 6 (4).

147. Medintz I.L. [h gp.]. A reactive peptidic linker for self-assembling hybrid quantum dot-DNA bioconjugates. // Nano letters. 2007. № 6 (7). C. 1741-8.

148. Miao Y. [h gp.]. Photodegradation of Mercaptopropionic Acid- and Thioglycollic Acid-Capped CdTe Quantum Dots in Buffer Solutions. // Journal of nanoscience and nanotechnology. 2015. № 6 (15). C. 4462-9.

149. Michalet X. [h gp.]. Quantum dots for live cells, in vivo imaging, and diagnostics // Science. 2005. № 5709 (307).

150. Micic O.I. [h gp.]. Size-Dependent Spectroscopy of InP Quantum Dots // The Journal of Physical Chemistry B. 1997. № 25 (101). C. 4904-4912.

151. Ming K. [h gp.]. Integrated quantum dot barcode smartphone optical device for wireless multiplexed diagnosis of infected patients // ACS Nano. 2015. № 3 (9).

152. Mitchell P. Turning the spotlight on cellular imaging. // Nature biotechnology. 2001. № 11 (19). C. 1013-7.

153. Morgan E. [h gp.]. Cytometric bead array: A multiplexed assay platform with applications in various areas of biology // Clinical Immunology. 2004. № 3 (110).

154. Moyzis R.K. [h gp.]. A highly conserved repetitive DNA sequence, (TTAGGG)(n), present at the telomeres of human chromosomes // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1988. № 18 (85).

155. Murray C.B., Norris D.J., Bawendi M.G. Synthesis and characterization of nearly monodisperse CdE (E = sulfur, selenium, tellurium) semiconductor nanocrystallites // Journal of the American Chemical Society. 1993. № 19 (115). C. 8706-8715.

156. Muyldermans S., Lauwereys M. Unique single-domain antigen binding fragments derived from naturally occurring camel heavy-chain antibodies. // Journal of molecular recognition: JMR. № 2 (12). C. 131-40.

157. Nikiforov T.T., Beechem J.M. Development of homogeneous binding assays based on fluorescence resonance energy transfer between quantum dots and Alexa Fluor fluorophores. // Analytical biochemistry. 2006. № 1 (357). C. 68-76.

158. Nirmal M., Brus L. Luminescence Photophysics in Semiconductor Nanocrystals // Accounts of Chemical Research. 1999. № 5 (32). C. 407-414.

159. Old L.J., Chen Y.-T. New paths in human cancer serology // Journal of Experimental Medicine. 1998. № 8 (187).

160. Ostendorff H.P. [h gp.]. Multiplexed VeraCode bead-based serological immunoassay for colorectal cancer. // Journal of immunological methods. 2013. (400401). C. 58-69.

161. Oumeraci T. [h gp.]. Bronchoalveolar lavage fluid of lung cancer patients: mapping the uncharted waters using proteomics technology. // Lung cancer (Amsterdam, Netherlands). 2011. № 1 (72). C. 136-8.

162. Papagiannaros A. [h gp.]. Quantum dots encapsulated in phospholipid micelles for imaging and quantification of tumors in the near-infrared region. // Nanomedicine: nanotechnology, biology, and medicine. 2009. № 2 (5). C. 216-24.

163. Parmiani G. [h gp.]. Cancer immunotherapy with peptide-based vaccines: What have we achieved? Where are we going? // Journal of the National Cancer Institute.

2002. № 11 (94).

164. Pathak S., Davidson M.C., Silva G.A. Characterization of the functional binding properties of antibody conjugated quantum dots // Nano Letters. 2007. № 7 (7).

165. Patolsky F. [h gp.]. Lighting-Up the Dynamics of Telomerization and DNA Replication by CdSe-ZnS Quantum Dots // Journal of the American Chemical Society.

2003. № 46 (125).

166. Pavao M., Traish A.M. Estrogen receptor antibodies: specificity and utility in detection, localization and analyses of estrogen receptor a and p // Steroids. 2001. № 1 (66). C. 1-16.

167. Peng X. [h gp.]. Epitaxial Growth of Highly Luminescent CdSe/CdS Core/Shell Nanocrystals with Photostability and Electronic Accessibility // Journal of the American Chemical Society. 1997. № 30 (119). C. 7019-7029.

168. Peng X. [h gp.]. Shape control of CdSe nanocrystals // Nature. 2000. № 6773 (404). C. 59-61.

169. Peng X., Wickham J., Alivisatos A.P. Kinetics of II-VI and III-V Colloidal Semiconductor Nanocrystal Growth: "Focusing" of Size Distributions // Journal of the American Chemical Society. 1998. № 21 (120). C. 5343-5344.

170. Peoples G.E. [h gp.]. T-cell recognition of ovarian cancer // Surgery. 1993. № 2

(114).

171. Perez-Arnaiz C. [h gp.]. New insights into the mechanism of the DNA/doxorubicin interaction. // The journal of physical chemistry. B. 2014. № 5 (118). C. 1288-95.

172. Pinaud F. [h gp.]. Bioactivation and Cell Targeting of Semiconductor CdSe/ZnS Nanocrystals with Phytochelatin-Related Peptides // Journal of the American Chemical Society. 2004. № 19 (126).

173. Popii V., Baumann G. Laboratory measurement of growth hormone. // Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry. 2004. № 1-2 (350). C. 1-16.

174. Prieto J.A. [h gp.]. Size and strain effects in the E[sub 1]-like optical transitions of InAs/InP self-assembled quantum dot structures // Applied Physics Letters. 1999. № 1 (74). C. 99.

175. Puertas S. [h gp.]. Designing novel nano-immunoassays: Antibody orientation versus sensitivity // Journal of Physics D: Applied Physics. 2010. № 47 (43).

176. Qian J., Gao X. Triblock copolymer-encapsulated nanoparticles with outstanding

colloidal stability for siRNA delivery. // ACS applied materials & interfaces. 2013. № 8 (5). C. 2845-52.

177. Rayavarapu R.G. [h gp.]. Synthesis and bioconjugation of gold nanoparticles as potential molecular probes for light-based imaging techniques // International Journal of Biomedical Imaging. 2007. (2007).

178. Redinbo M.R., Champoux J.J., Hol W.G. Novel insights into catalytic mechanism from a crystal structure of human topoisomerase I in complex with DNA. // Biochemistry. 2000. № 23 (39). C. 6832-40.

179. Resch-Genger U. [h gp.]. Quantum dots versus organic dyes as fluorescent labels // Nature Methods. 2008. № 9 (5).

180. Robinson C. [h gp.]. Serologic responses in patients with malignant mesothelioma. Evidence for both public and private specificities // American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 2000. № 5 (22).

181. Robinson W.H. [h gp.]. Autoantigen microarrays for multiplex characterization of autoantibody responses // Nature Medicine. 2002. № 3 (8).

182. Rogalla S., Contag C.H. Early Cancer Detection at the Epithelial Surface. // Cancer journal (Sudbury, Mass.). № 3 (21). C. 179-87.

183. Ruan G. [h gp.]. Imaging and tracking of Tat peptide-conjugated quantum dots in living cells: New insights into nanoparticle uptake, intracellular transport, and vesicle shedding // Journal of the American Chemical Society. 2007. № 47 (129).

184. Schendel D.J. [h gp.]. Tumor-specific lysis of human renal cell carcinomas by tumor-infiltrating lymphocytes: I. HLA-A2-restricted recognition of autologous and allogeneic tumor lines // Journal of Immunology. 1993. № 8 (151).

185. Schmid G. Large clusters and colloids. Metals in the embryonic state // Chemical Reviews. 1992. № 8 (92). C. 1709-1727.

186. Schmidtke C. [h gp.]. Amphiphilic, cross-linkable diblock copolymers for

multifunctionalized nanoparticles as biological probes. // Nanoscale. 2013. № 16 (5). C. 7433-44.

187. Shay J.W., Bacchetti S. A survey of telomerase activity in human cancer // European Journal of Cancer Part A. 1997. № 5 (33).

188. Shero J.H. [h gp.]. High titers of autoantibodies to topoisomerase I (Scl-70) in sera from scleroderma patients. // Science (New York, N.Y.). 1986. № 4739 (231). C. 73740.

189. Shi D. [h gp.]. Fluorescent polystyrene-Fe3O4 composite nanospheres for in vivo imaging and hyperthermia // Advanced Materials. 2009. № 21 (21).

190. Shi L., Rosenzweig N., Rosenzweig Z. Luminescent quantum dots fluorescence resonance energy transfer-based probes for enzymatic activity and enzyme inhibitors // Analytical Chemistry. 2007. № 1 (79).

191. Silva A.C.A. [h gp.]. Biological analysis and imaging applications of CdSe/CdSxSe1-x/CdS core-shell magic-sized quantum dot. // Nanomedicine: nanotechnology, biology, and medicine. 2016. № 5 (12). C. 1421-30.

192. Singh A.K. [h gp.]. Gold nanorod based selective identification of Escherichia coli bacteria using two-photon rayleigh scattering spectroscopy // ACS Nano. 2009. № 7 (3).

193. Slev P.R., La'ulu S.L., Roberts W.L. Intermethod differences in results for total PSA, free PSA, and percentage of free PSA // American Journal of Clinical Pathology. 2008. № 6 (129).

194. Slovin S.F. [h gp.]. Cellular immune response to human sarcomas: Cytotoxic T cell clones reactive with autologous sarcomas. I. Development, phenotype, and specificity // Journal of Immunology. 1986. № 9 (137).

195. Soo Choi H. [h gp.]. Renal clearance of quantum dots // Nature Biotechnology. 2007. № 10 (25).

196. Stuchinskaya T. [h gp.]. Targeted photodynamic therapy of breast cancer cells

using antibody-phthalocyanine-gold nanoparticle conjugates // Photochemical and Photobiological Sciences. 2011. № 5 (10).

197. Sukhanova A. [h gp.]. Biocompatible fluorescent nanocrystals for immunolabeling of membrane proteins and cells // Analytical Biochemistry. 2004. № 1 (324). C. 60-67.

198. Sukhanova A. [h gp.]. Oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots: Toward a new generation of ultrasmall diagnostic nanoprobes // Nanomedicine: Nanotechnology, Biology, and Medicine. 2012. № 4 (8). C. 516-525.

199. Susha A.S. [h gp.]. Formation of luminescent spherical core-shell particles by the consecutive adsorption of polyelectrolyte and CdTe(S) nanocrystals on latex colloids // Colloids and Surfaces A: Physicochemical and Engineering Aspects. 2000. № 1 (163).

200. Sutherland A.J. Quantum dots as luminescent probes in biological systems // Current Opinion in Solid State and Materials Science. 2002. № 4 (6).

201. Talapin D. V. [h gp.]. Highly Luminescent Monodisperse CdSe and CdSe/ZnS Nanocrystals Synthesized in a Hexadecylamine-Trioctylphosphine Oxide-Trioctylphospine Mixture // Nano Letters. 2001. № 4 (1). C. 207-211.

202. Talha S.M. [h gp.]. Array-in-well platform-based multiplex assay for the simultaneous detection of anti-HIV- and treponemal-antibodies, and Hepatitis B surface antigen // Journal of Immunological Methods. 2016. (429).

203. Tarnok A. [h gp.]. Cytometric bead array to measure six cytokines in twenty-five microliters of serum // Clinical Chemistry. 2003. № 6 (49).

204. Tillib S. V [«Camel nanoantibody» is an efficient tool for research, diagnostics and therapy]. // Molekuliarnaia biologiia. № 1 (45). C. 77-85.

205. Tkaczyk E.R. [h gp.]. In vivo monitoring of multiple circulating cell populations using two-photon flow cytometry // Optics Communications. 2008. № 4 (281).

206. Torcello-Gomez A. [h gp.]. Adsorption of antibody onto Pluronic F68-covered nanoparticles: Link with surface properties // Soft Matter. 2011. № 18 (7).

207. Torrance L. [h gp.]. Oriented immobilisation of engineered single-chain antibodies to develop biosensors for virus detection // Journal of Virological Methods. 2006. № 12 (134).

208. Uribarri M. [h gp.]. A new biomarker panel in bronchoalveolar lavage for an improved lung cancer diagnosis. // Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer. 2014. № 10 (9). C. 150412.

209. Vignali D.A.A. Multiplexed particle-based flow cytometric assays // Journal of Immunological Methods. 2000. № 1-2 (243).

210. Virgo P.F., Gibbs G.J. Flow cytometry in clinical pathology. // Annals of clinical biochemistry. 2012. № Pt 1 (49). C. 17-28.

211. Voura E.B. [h gp.]. Tracking metastatic tumor cell extravasation with quantum dot nanocrystals and fluorescence emission-scanning microscopy // Nature Medicine. 2004. № 9 (10).

212. Walker J.M., Ditor S.E.E. Quantum Dots: Applications in Biology // Methods in molecular biology. 2014. (1199). C. 67-83.

213. Wang Y. [h gp.]. Evaluation of a method for the simultaneous detection of multiple tumor markers using a multiplex suspension bead array // Clinical Biochemistry. 2012. № 16-17 (45).

214. Wargnier R. [h gp.]. Energy transfer in aqueous solutions of oppositely charged CdSe/ZnS core/shell quantum dots and in quantum dot - Nanogold assemblies // Nano Letters. 2004. № 3 (4).

215. Weiss S. Fluorescence spectroscopy of single biomolecules // Science. 1999. № 5408 (283).

216. Wels W. [h gp.]. Recombinant immunotoxins and retargeted killer cells: Employing engineered antibody fragments for tumor-specific targeting of cytotoxic effectors // Cancer Immunology, Immunotherapy. 2004. № 3 (53).

217. Whitehead G.S. [h gp.]. Allergen-induced airway disease is mouse strain dependent // American Journal of Physiology - Lung Cellular and Molecular Physiology. 2003. № 1 29-1 (285).

218. Williams A.F., Galfre G., Milstein C. Analysis of cell surfaces by xenogeneic myeloma-hybrid antibodies: differentiation antigens of rat lymphocytes. // Cell. 1977. № 3 (12). C. 663-73.

219. Wolfel T. [h gp.]. Lysis of human pancreatic adenocarcinoma cells by autologous hla-class I-restricted cytolytic T-lymphocyte (CTL) clones // International Journal of Cancer. 1993. № 4 (54).

220. Wu X. [h gp.]. Immunofluorescent labeling of cancer marker Her2 and other cellular targets with semiconductor quantum dots // Nature Biotechnology. 2003. № 1 (21).

221. Xie C., Wang G. Development of simultaneous detection of total prostate-specific antigen (tPSA) and free PSA with rapid bead-based immunoassay // Journal of Clinical Laboratory Analysis. 2011. № 1 (25).

222. Xiong L. [h gp.]. Indocyanine green fluorescence-guided sentinel node biopsy: a meta-analysis on detection rate and diagnostic performance. // European journal of surgical oncology: the journal of the European Society of Surgical Oncology and the British Association of Surgical Oncology. 2014. № 7 (40). C. 843-9.

223. Xu H. [h gp.]. Multiplexed SNP genotyping using the Qbead system: a quantum dot-encoded microsphere-based assay. // Nucleic acids research. 2003. № 8 (31).

224. Yamanishi C.D., Chiu J.H.-C., Takayama S. Systems for multiplexing homogeneous immunoassays // Bioanalysis. 2015. № 12 (7).

225. Yamaoka K. [h gp.]. Structural and functional characterization of a novel tumor-derived rat galectin-1 having transforming growth factor (TGF) activity: The relationship between intramolecular disulfide bridges and TGF activity // Journal of Biochemistry. 1996. № 5 (119).

226. Yan X. [h gp.]. Multiplexed flow cytometric immunoassay for influenza virus detection and differentiation // Analytical Chemistry. 2005. № 23 (77).

227. Yang H., Holloway P.H., Santra S. Water-soluble silica-overcoated CdS:Mn/ZnS semiconductor quantum dots. // The Journal of chemical physics. 2004. № 15 (121). C. 7421-6.

228. Yang L. [h gp.]. Single chain epidermal growth factor receptor antibody conjugated nanoparticles for in vivo tumor targeting and imaging // Small. 2009. № 2 (5).

229. Yasumura S. [h gp.]. Human cytotoxic T-cell lines with restricted specificity for squamous cell carcinoma of the head and neck. // Cancer research. 1993. № 6 (53). C. 1461-8.

230. Yildiz I., Tomasulo M., Raymo F.M. A mechanism to signal receptor-substrate interactions with luminescent quantum dots // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2006. № 31 (103).

231. Yin W. [h gp.]. Preparation of monoclonal antibody for Melamine and development of an indirect competitive ELISA for Melamine detection in raw milk, milk powder, and animal feeds // Journal of Agricultural and Food Chemistry. 2010. № 14 (58).

232. Yoo J.H. [h gp.]. The detection of p53 gene via fluorescence quenching of quantum dot in microfluidic chip // Journal of Nanoscience and Nanotechnology. 2012. № 5 (12).

233. Yu W.W. [h gp.]. Experimental determination of the extinction coefficient of CdTe, CdSe, and CdS nanocrystals // Chemistry of Materials. 2003. № 14 (15).

234. Zdobnova T.A. [h gp.]. Self-assembling complexes of quantum dots and scFv antibodies for cancer cell targeting and imaging. // PloS one. 2012. № 10 (7). C. e48248.

235. Zeng H.-Z. [h gp.]. Proteomic analysis identified DJ-1 as a cisplatin resistant

marker in non-small cell lung cancer. // International journal of molecular sciences. 2011. № 6 (12). C. 3489-99.

236. Zhang J. [и др.]. Direct observation of chemokine receptors 5 on T-lymphocyte cell surfaces using fluorescent metal nanoprobes 2: Approximation of CCR5 populations // Biochemical and Biophysical Research Communications. 2011. № 1 (407).

237. Zhao C. [и др.]. Small GSH-Capped CuInS2 Quantum Dots: MPA-Assisted Aqueous Phase Transfer and Bioimaging Applications. // ACS applied materials & interfaces. 2015. № 32 (7). C. 17623-9.

238. Zhao C. [и др.]. Small GSH-Capped CuInS2 Quantum Dots: MPA-Assisted Aqueous Phase Transfer and Bioimaging Applications. // ACS applied materials & interfaces. 2015. № 32 (7). C. 17623-9.

239. Zhao X., Pan F., Lu J.R. Interfacial assembly of proteins and peptides: Recent examples studied by neutron reflection // Journal of the Royal Society Interface. 2009. № SUPPL. 5 (6).

240. Zhou D. [и др.]. Simple Synthesis of Highly Luminescent Water-Soluble CdTe Quantum Dots with Controllable Surface Functionality // Chemistry of Materials. 2011. № 21 (23). C. 4857-4862.

241. Деев С.М. [и др.]. Современные технологии создания неприродных антител для клинического применения // Acta Naturae. 2009. №1. С. 32-50.

242. Екимов А.И. [и др.]. Квантовый размерный эффект в трехмерных микрокристаллах полупроводников // Письма в ЖЭТФ. 1981. № 34. С. 363-366.

243. Ивукина Е.А. [и др.]. Биоконъюгаты флуоресцентных наноалмазов на основе модуля барназа:барстар // Доклады Академии Наук. №. 440(6). С. 834-836.

244. Каприн А.Д. [и др.]. Состояние онкологической помощи населению России в 2015 году / под редакцией А.Д. Каприна, Г.В. Петровой, 2016.

СПИСОК ПУБЛИКАЦИЙ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Статьи в научных изданиях

1 Sukhanova, A. Highly stable fluorescent nanocrystals as a novel class of labels for immunohistochemical analysis of paraffin-embedded tissue sections. / A. Sukhanova, L. Venteo, J. Devy, M. Artemyev, V. Oleinikov, M. Pluot, I. Nabiev // Lab. Invest.-2002.- V. 82.- P. 1259-1262.

2 Wargnier, R., Energy transfer in aqueous solutions of oppositely charged nanoassemblies of CdSe/ZnS core/shell quantum dots and in quantum dot-nanogold systems. / R. Wargnier, A. Baranov, V. Maslov, V. Stsiapura, A. Sukhanova, M. Pluot, I. Nabiev // Nano Lett.- 2004.- V. 4. - P. 451-457.

3 Sukhanova, A. Biocompatible fluorescent nanocrystals for immunolabeling of membrane proteins and cells. / A. Sukhanova, J. Devy, L. Venteo, H. Kaplan, M. Artemyev, V. Oleinikov, D. Klinov, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Anal. Biochem. - 2004. - V. 324. - P. 60-67.

4 Stsiapura, V. Functionalized nanocrystal-tagged fluorescent polymer beads : synthesis, physicochemical characterization and immunolabeling application. // V. Stsiapura, A. Sukhanova, M. Artemyev, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Anal. Biochem. - 2004. - V. 334. - P. 257-265.

5 Sukhanova, A. Nano-biocapteurs pour la recherche et les diagnostics des maladies inflammatoires et du cancer. / A. Sukhanova, L. Venteo, J.H.M. Cohen, M. Pluot, I. Nabiev // Ann. Acad. Pharm. Franç. -2005. - V. 63. - P. 1-11.

6 Joumaa, N. Synthesis of quantum dots-tagged submicronic polystyrene particles by miniemulsion polymerization. / N. Joumaa, M. Lansalot, A. Théretz, A. Elaissari, A. Sukhanova, M. Artemyev, I. Nabiev, J.H.M. Cohen // Langmuir. - 2006. - V. 22(4). -P. 1810-1816.

7 Sukhanova, A. Nanocrystal-encoded fluorescent microbeads for proteomics: Antibody profiling and diagnostics of autoimmune diseases. / A. Sukhanova, A.S.

Susha, A. Bek, S. Mayilo, A.L. Rogach, J. Feldmann, V. Oleinikov, B. Reveil, B. Donvito, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, // Nano Lett. - 2007. - V. 7. - P. 2322-2327.

8 Nabiev, I. Nonfunctionalized nanocrystals can exploit a cell's active transport machinery delivering them to specific nuclear and cytoplasmic compartments. / I. Nabiev, S. Mitchell, A. Davies, Y. Williams, D. Kelleher, R. Moore, Y.K. Gun'ko, S. Byrne, Y.P. Rakovich, J.F. Donegan, A. Sukhanova, J. Conroy, D. Cottell, N. Gaponik, A. Rogach, Y. Volkov // Nano Lett. - 2007. - V. 7. - P. 3452-3461.

9 Олейников, В.А., Флуоресцентные полупроводниковые нанокристаллы в биологии и медицине. / В.А. Олейников, А.В. Суханова, И.Р. Набиев // Российские нанотехнологии. - 2007. - Т. 2. - С. 160-173.

10 Sukhanova, A. Fluorescent nanocrystal quantum dots as medical diagnostic tools. / Sukhanova, A., Nabiev, I. // Exp. Opin. Med. Diagnost. - 2008 - V. 2 - P. 429-447.

11 Sukhanova, A. Liquid-phase chips based on the fluorescent nanocrystal-encoded microbeads for cancer diagnostics. / A. Sukhanova, I. Nabiev // Crit. Rev. Oncol. Haematol. - 2008. - V. 68. - P. 39-59.

12 Nabiev, I. Fluorescent colloidal particles as a detection tools in biotechnology systems. / I. Nabiev, A. Sukhanova, M. Artemyev, V.A. Oleinikov // Colloidal Nanoparticles in Biothechnology / Ed. A. Elaissari. - Wiley & Sons Inc., 2008. - P. 133-168.

13 Williams, Y.E. Probing cell type-specific intracellular nanoscale barriers using size-tuned quantum dots. / Y.E. Williams, A. Sukhanova, A.M. Davies, V.A. Oleinikov, I. Nabiev, D. Kelleher, Y. Volkov. // Small. - 2009. - V. 5. - P. 2581-2588.

14 Rousserie, G. Semiconductor quantum dots for multiplexed bio-detection and cancer diagnosis on solid-state microarrays / G. Rousserie, A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, F. Fleury, P. Chames, D. Baty, V.A. Oleinikov, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Crit. Rev. Oncol. Hematol. - 2010. V. 74. - P. 1-15.

15 Mahmoud, W. Emerging applications of fluorescent nanocrystals quantum dots for micrometastases detection / W. Mahmoud, A. Sukhanova, V.A. Oleinikov, Yu. Rakovich, J.F. Donegan, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proteomics. 2010. - V. 10. P. 700-716.

16 Mahmoud, W. Advanced procedures for labelling of antibodies with fluorescent quantum dots. / W. Mahmoud, G. Rousserie, B. Reveil, T. Tabary, J.M. Millot, M. Artemyev, V.A. Oleinikov, J.H. Cohen, I. Nabiev, A. Sukhanova // Anal. Biochem. -2011. - V. 416(2). - P. 180-185.

17 Sukhanova, A. From physiological to pathological protein structures: Implication of the amyloid secondary structure instabilities. / A. Sukhanova, S. Poly, A. Shemetov, I. Bronstein, I. Nabiev // Biopolymers. - 2012. - V. 97. - P. 577-588.

18 Shemetov, A. Nano-bio interactions of proteins and peptides with nanocrystals. / A. Shemetov, I. Nabiev, A. Sukhanova // ACS NANO. - 2012. V. 6(6). - P 4585-4602.

19 Prudnikau, A. Chemical substitution of Cd ions by Hg in CdSe nanorods and nanodots: spectroscopic and sructural examination. / A. Prudnikau, M. Artemyev, M. Molinari, M. Troyon, A. Sukhanova, I. Nabiev, A.V. Baranov, S.A. Cherevkov, A.V. Fedorov // Mat. Sci. Engin. B. -2012. - V. 177. - P. 744-749.

20 Sukhanova, A. Oriented conjugates single-domain antibodies and quantum dots: Toward new generation of ultra-small diagnostic nanoprobes. / A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, A. Kisserli, T. Tabary, B. Reveil, J.M. Millot, P. Chames, D. Baty, M. Artemyev, S. Poly, V. Oleinikov, M. Pluot, J. Cohen, I. Nabiev // Nanomed-Nanotechnol. - 2012. - V. 8. - P. 516-525.

21 Sukhanova, A. Engineering of ultra-small diagnostic nanoprobes through oriented conjugation of single-domain antibodies and quantum dots. / A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, P. Chames, D. Baty, M. Artemyev, V. Oleinikov, I. Nabiev // Nature Protocols/Protocols Exchange. - 2012. - DOI: 10.1038/protex.2012.042.

22 Hardzei, M. Comparative efficiency of energy transfer from CdSe-ZnS quantum dots or nanorods to organic dye molecules. / M. Hardzei, M. Artemyev, M. Molinari, A. Sukhanova, V.A. Oleinikov, M. Troyon, I. Nabiev // ChemPhysChem. - 2012. - V. 13. - P. 330-335.

23 Hafian, H. Bi-photon imaging and diagnostics with the ultra-small diagnostic probes engineered from semiconductor nanocrystals and single-domain antibodies. / H. Hafian, A. Sukhanova, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, J.M.

Millot // In: Nanosystems in Engineering and Medicine, Proceedings of SPIE. / Ed. S.H. Choi, J.-H. Choy, U. Lee, V.K. Varadan. - 2012.- V. 8548. - 85480R.

24 Sukhanova, A. Quantum dots induce charge-specific amyloid-like fibrillation of insulin at physiological conditions. / Sukhanova, A., Poly, S., Shemetov, A., Nabiev, I. // In: Nanosystems in Engineering and Medicine, Proceedings of SPIE. / Ed. S.H. Choi, J.-H. Choy, U. Lee, V.K. Varadan. - 2012.- V. 8548. - 85485F.

25 Generalova, A. Biosensing with thermosensitive fluorescent quantum dot-containing polymer particles. / A. Generalova, V. Oleinikov, A. Sukhanova, M. Artemyev, V. Zubov, I. Nabiev // In: Biosensing and Nanomedicine V, Proceedings of SPIE / Ed. H. Mohseni, M.H. Agahi, and M. Razeghi. - 2012. - V. 8460. - 84600Y.

26 Artemyev, M. Low-field magnetic circular dichroism in silver and gold colloidal nanoparticles of different size, shape, and aggregation. / M. Artemyev, A. Sukhanova, R. Krutokhvostov, D. Melnikau, V. Oleinikov, I. Nabiev // In: Plasmonics: Metallic Nanostructures and Their Optical Properties X, Proceedings of SPIE. / Ed. M.I. Stockman. - 2012. - V. 8457. - 845729.

27 Sukhanova, A. (2012) Oriented conjugates of monoclonal and single-domain antibodies with quantum dots for flow cytometry and immunohistochemistry diagnostic applications. / A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, J. Millot, P. Chames, D. Baty, M. Artemyev, V. Oleinikov, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // In: Colloidal Nanocrystals for Biomedical Applications VII, Proceedings of SPIE. / Ed. W.J. Parak, K. Yamamoto, M. Osinski. - 2012. -V. 8232. - 82320T.

28 Mochalov, K. Combined scanning probe nanotomography and optical microspectroscopy: a correlative technique for 3D characterization of nanomaterials. / K. Mochalov, A. Efimov, A. Bobrovsky, I. Agapov, A. Chistyakov, V. Oleinikov, A. Sukhanova, I. Nabiev // ACS NANO. - 2013. - V. 7(10). - P. 8953-8962.

29 Oleinikov, V.A. Nanoprobes on the basis of fluorescent semiconductor nanocrystals for bioassays and biosensing. / V.A. Oleinikov, A. Sukhanova, A.N. Generalova, S.V. Sizova, K.E. Mochalov, A.A. Chistyakov, M.V. Artemyev, I. Nabiev // FEBS J. - 2013. - V. 280(1).- P. 275.

30 Generalova, A.N. Quantum dot-containing polymer particles with thermosensitive fluorescence. / A.N. Generalova, V.A. Oleinikov, A. Sukhanova, M.V. Artemyev, I. Nabiev // Biosens. Bioelectron. - 2013. V. 39. - P. 187-193.

31 Akinfieva, O. New directions in quantum dots-based flow cytometry detection of cancer serum markers and tumor cells. / O. Akinfieva, I. Nabiev, A Sukhanova // Crit. Rev. Oncol. Haematol. - 2013. - V. 86. - P. 1-14.

32 Бражник, К.И. Новые направления в исследовании и ранней диагностике рака с применением детекционных систем на основе флуоресцентных нанокристаллов. / К.И. Бражник, М.А. Барышникова, З.И. Соколова, А.В. Суханова // Российский биотерапевтический журнал. - 2013. - Т. 12. - С. 11-24.

33 Румянцев, К.А. Взаимодействие белков и пептидов с наночастицами. Структурные и функциональные аспекты. / К.А. Румянцев, А.А. Шеметов, И.Р. Набиев, А.В. Суханова // Российские Нанотехнологии. - 2013. - Т. 8. - С. 18-34.

34 Le Cigne, A. Biological applications of cadmium telluride semiconductor quantum dot. / A. Le Cigne, A. Sukhanova, I. Nabiev // Cadmium telluride quantum dots. / Ed. J.F. Donegan, Yu. Rakovich. - PanStanford Publish, 2013.

35 Montenegro, J.-M. Controlled antibody/(bio-) conjugation of inorganic nanoparticles for targeted delivery. / J.-M. Montenegro, V. Grazu, A. Sukhanova, S. Agarwal, J.M. de la Fuente, I. Nabiev, A. Greiner, W.J. Parak // Adv. Drug Delivery Review. -2013. - V. 65(5). - P. 677-688.

36 Rakovich, T.Y. Highly sensitive single domain antibody-quantum dot conjugates for detection of low expression levels of HER2 biomarker in lung and breast cancer cells. / T.Y. Rakovich, O.K. Mahfoud, B.M. Mohamed, A. Prina-Mello, K. Crosbie-Staunton, T. Van Den Broeck, L. De Kimpe, A. Sukhanova, D. Baty, A. Rakovich, S.A. Maier, F. Alves, F. Nauwelaers, I. Nabiev, P. Chames, Y. Volkov // ACS NANO. - 2014.- V. 8(6). - P. 5682-5695.

37 Hafian, H. Multiphoton imaging of tumor biomarkers with conjugates of singledomain antibodies and quantum dots. / H. Hafian, A. Sukhanova, M. Turini, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, J.M. Millot // Nanomed-Nanotechnol. - 2014. - V. 10(8). - P. 1701-1709.

38 Grinevich, R. Detection of carcinoembryonic antigen on colon cancer cells using single-domain antibodies and quantum dots. / R. Grinevich, G. Rousserie, K. Brazhnik, R. Even-Desrumeaux, B. Reveil, T. Tabary, P. Chames, D. Baty, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, A. Sukhanova // Acta Naturae. - 2014. -special issue "Science of the Future". - P. 76.

39 Brazhnik, K. Oriented conjugation of single-domain antibodies and quantum dots./ K. Brazhnik, I. Nabiev, A. Sukhanova // Methods in Molecular Biology. - 2014. - V. 1199. - P. 129-140.

40 Brazhnik, K. Advanced procedure for oriented conjugation of full-size antibodies with quantum dots. / K. Brazhnik, I. Nabiev, A. Sukhanova // Methods in Molecular Biology. - 2014. - V. 1199. - P. 55-66.

41 Brazhnik, K. Development and potential applications of microarrays based on fluorescent nanocrystal-encoded beads for multiplexed cancer diagnostics. / K. Brazhnik, R. Grinevich, A.E. Efimov, I. Nabiev, A. Sukhanova // In: Biophotonics: Photonic Solutions for Better Health Care IV, Proc. of SPIE / Ed. J. Popp, V.V. Tuchin, D.L. Matthews, F.S. Pavone. - 2014. - V. 9129, C.1-9.

42 Билан, Р.С. Ориентированные конъюгаты однодоменных антител и флуоресцентных нанокристаллов: новое поколение диагностических нанометок для высокопроизводительной детекции онкомаркеров. / Р.С. Билан, К.И. Бражник, П. Шамс, Д. Бати, И.Р. Набиев, А.В. Суханова // Российский биотерапевтический журнал. - 2014. - V. 4. - P. 11-16.

43 Бражник, К.И. Разработка суспензионных микрочипов на основе микросфер, кодированных флуоресцентными нанокристаллами, и принципы их использования для многопараметрической диагностики онкологических заболеваний. / К.И. Бражник, З.А. Соколова, М.А. Барышникова, Р.С. Билан, И.Р. Набиев, А.В. Суханова // Российский биотерапевтический журнал. - 2014. - V. 4. - P. 3-10.

44 Brazhnik, K. Multiplexed analysis of serum breast and ovarian cancer markers by means of suspension bead-quantum dot microarrays. / K. Brazhnik, Z. Sokolova, M.

Baryshnikova, R. Bilan, I. Nabiev, A. Sukhanova // Physics Procedia. - 2015. - V. 73. - P. 235-240.

45 Bilan R. Oriented conjugates of single-domain antibodies and fluorescent quantum dots for highly sensitive detection of tumor-associated biomarkers in cells and tissues. / R. Bilan, K. Brazhnik, P. Chames, D. Baty, I. Nabiev, A. Sukhanova // Physics Procedia. - 2015. - V. 73. P. 228-234.

46 Nabiev, I. What happens when nanotechnology meets biology: breakthrough applications are accompanied with unexpected hazards. / I. Nabiev, A. Sukhanova // Physics, Chemistry and Applications of Nanostructures. - 2015.- O-25. P. 447-450.

47 Sukhanova, A. Single-photon and two-photon tumor imaging and diagnosis using oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots. / A. Sukhanova, I. Nabiev, H. Hafian, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, R. Bilan, K. Brazhnik, M. Baryshnikova, Z. Sokolova, P. Chames D. Baty // Physics, Chemistry and Applications of Nanostructures. - 2015. - O-31. P. 495-498.

48 Brazhnik, K. Quantum dot-based lab-on-a-bead system for multiplexed detection of free and total prostate-specific antigens in clinical human serum samples./ K. Brazhnik, Z. Sokolova, M. Baryshnikova, R. Bilan, A. Efimov, I. Nabiev, A. Sukhanova // Nanomed-Nanotechnol. - 2015. - V. 11(5). - 1065-1075.

49 Bilan, R. Quantum dot surface chemistry and functionalization for cell targeting and imaging. / R. Bilan, F. Fleury, I. Nabiev, A. Sukhanova // Bioconjugate Chem. -2015. - V. 26(4). - P. 609-624.

50 Rousserie, G. Detection of carcinoembryonic antigen using single-domain or full-size antibodies stained with the quantum dot conjugates. / G. Rousserie, R. Grinevich, K. Brazhnik, K. Even-Desrumeaux, B. Reveil, T. Tabary, P. Chames, D. Baty, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, A. Sukhanova // Anal. Biochem. - 2015. - V. 478. - P. 26-32.

51 Sukhanova, A. Diagnostic nanoprobes based on the conjugates of quantum dots and single-domain antibodies for cancer biomarkers detection in immunohistochemistry and flow cytometry. / A. Sukhanova, J.M. Millot, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, K. Even-Desrumeaux, P. Chames, D. Baty // 2015.- DOI: 10.1109/SIBIRCON.2015.7361863.

52 Sukhanova, A. Multiphoton imaging of tumor biomarkers in situ using highly oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots. / A. Sukhanova, H. Hafian, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, I. Nabiev, A. Sukhanova, M. Turini, P. Chames, D. Baty // 2015. - DOI: 10.1109/SIBIRCON.2015.7361864.

53 Бражник К.И. Аналитические характеристики суспензионной системы на основе микросфер, кодированных флуоресцентными нанокристаллами для одновременной количественной детекции свободного и общего ПСА в сыворотке крови человека. / К.И. Бражник, З.А. Соколова, М.А. Барышникова, Р.С. Билан, И.Р. Набиев, А.В. Суханова // Российский биотерапевтический журнал. - 2015. - Т. 4. - С. 31-38.

54 Sukhanova, A. Nanosized fluorescent diagnostic probes consisting of single-domain antibodies conjugated with quantum dots. / A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, J.M. Millot, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev, // Materials Today: Proceedings. - 2016. - V. 3. - P. 518-522.

55 Sukhanova, A. Multiphoton imaging of tumor biomarkers in situ using singledomain antibodies conjugated with quantum dots in a set orientation. / A. Sukhanova, H. Hafian, M. Turini, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, I. Nabiev // Materials Today: Proceedings. - 2016. - V. 3. P. 523-526.

56 Bourguet, E. Design, synthesis, and use of MMP-2 inhibitor-conjugated quantum dots in functional biochemical assays. / E. Bourguet, K. Brazhnik, A. Sukhanova, G. Moroy, S. Brassart-Pasco, A.P. Martin, I. Villena, G. Bellon, J. Sapi, I. Nabiev // Bioconjugate Chem. - 2016. - V. 27. - P. 1067-1081.

57 Bilan, R. Quantum dot-based nanotools for bioimaging, diagnostics, and drug delivery. / R. Bilan, I. Nabiev, A. Sukhanova // ChemBioChem. - 2016. - V. 17(22). - P. 2103-2114.

Патенты

1 I. Nabiev, A. Sukhanova, A. Baranov, O. Charapov, M. Artemyev, J.C. Jardillier. / Ultrasensitive non-isotopic water-soluble nanocrystals. // заявка N° WO02073155 от

09/03/2001. - Евроазиатский патент - 2006. - Европейский патент - 2009: EP1366347A1, WO02073155A1.

2 I. Nabiev, A. Sukhanova, A.O. Govorov / A hybrid nanostructure composed of a natural photosystem and semiconductor nanoparticles. // заявка N° PCT/US09/62443 от 28.10.2009. - патент WO2010051325 A1 - 2010.

3 А.В. Суханова, И.Р. Набиев / Способ создания наноразмерной диагностической метки на основе конъюгатов наночастиц и однодоменных антител. // Патент РФ № 2560699. - Зарегистрирован в Государственном реестре изобретений РФ 22.07.2015.

4 А.В. Суханова, И.Р. Набиев, Р.С. Билан / Способ создания наборов микросфер, оптически кодированных флуоресцентными нанокристаллами и несущих на своей поверхности распознающие биологические молекулы. // Заявка на патент.

- Рег. № РИД: 616012810107. -Дата регистрации РИД: 28/01/2016.

5 Д.С. Довженко, Р.С. Билан, П.С. Самохвалов, K.B. Вохминцев, А.В. Суханова, И.Р. Набиев / Способ создания регенерируемого биосенсора на основе комплекса фотонного кристалла с аффинными молекулами. // Заявка на патент.

- Рег. № РИД: 616012810106. - Дата регистрации РИД: 28/01/2016.

6 И.Р. Набиев, А.В. Суханова, В.В. Терехин / Способ создания наборов магнитных флуоресцентных микросфер. // Заявка на патент. - Рег. № РИД: 2016125966. - Дата регистрации: 29.06.2016.

Материалы Конференций

1 Oleinikov, V. Water-soluble semiconductor nanocrystal probes for fluorescence analysis of biological objects. / V. Oleinikov, A. Sukhanova, M. Artemyev, A. Baranov, O. Sharapov, J.C. Jardillier, I. Nabiev // Proceedings of International Conference on Molecular Medicine. - Puchino, Russia. - 2001. - P. 57-58.

2 Sukhanova, A. Nouveaux systèmes d'immunomarquage ultrasensibles par des nanocristaux fluorescents rendus solubles et biocompatibles : perspectives en cancérologie. / A. Sukhanova, J. Devy, L. Venteo, R. Wargnier, M. Artemyev, V.

Oleinikov, J.H.M. Cohen, M. Pluot, I. Nabiev // Bulletin du Cancer, XXIIème Forum de Cancérologie. - Paris, France. - 2002. - V. 89. - P. 476.

3 Sukhanova, A. Biocompatible fluorescent semiconductor nanocrystals: immunochemical and immunohistochemical labeling of membrane proteins and cells and FRET applications. / A. Sukhanova, R. Wargnier, V. Stsiapura, M. Pluot, I. Nabiev, // Proceedings of SFB486 Conference "Nanoscience with nanocrystals", Munich, Germany. - 2003. - P.14.

4 Artemyev, M. Immunolabeling of membrane proteins and cells by highly fluorescent cadmium selenide nanocrystals. / M. Artemyev, V. Oleinikov, D. Klinov, I. Bronstein, W. Offen, A. Sukhanova, J. Devy, H. Kaplan, M. Pluot, I. Nabiev, // Proceedings of Conference in Physics, Chemistry and Application of Nanostructures. / Ed. V.E. Borisenko, S.V. Gaponenko, V.S. Gurin. - World Scientific, NJ-London-Singapore-Hong Kong. - 2003. - P. 331-336.

5 Venteo, L. Immuhistochimie des topoisomérases I et IIa, de la protéine ICB90 et de Ki67 dans des tumeurs vésicales; intérêt potentiel dans le traitement. / L. Venteo, C. Bronner, L. Schneider, A. Sukhanova, I. Bronstein, I. Nabiev, M. Pluot // Proceedings. - Annales de Pathologie. - 2003.- V. 1. - P. 139.

6 Sukhanova, A. Biocompatible fluorescent nanocrystals and nanocrystals-embedded latexes for immunolabeling of membrane proteins and cells. / A. Sukhanova, V. Stsiapura, M. Artemyev, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proceedings of « Quantum Dots-2004 » Conference. - 2004. - Banff, Alberta, Canada.

7 Sukhanova, A. Energy transfer in aqueous solutions of oppositely charged CdSe/ZnS core/shell quantum dots and in quantum dot-nanogold assemblies : Biosensors "molecular beacons". / A. Sukhanova, V. Stsiapura, R. Wargnier, A. Baranov, M. Artemyev, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proceedings of « Quantum Dots-2004 » Conference. - 2004. - Banff, Alberta, Canada.

8 Sukhanova, A. Bio-functionalization and self-organization of CdSe/ZnS core/shell photoluminescent semiconductor nanocrystals. / A. Sukhanova, L. Venteo, M. Artemyev, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proceedings of International Conference of Nanobiotechnology and Cellular Biology. - Moscou, Russia. - 2005.

9 Sukhanova, A. Biocompatible semiconductor nanocrystals: from synthesis to immunolabelling. / A. Sukhanova, L. Venteo, M. Artemyev, M. Pluot, J.H.M. Cohen,

1. Nabiev // Proceedings of International Conference of Nanobiotechnology and Cellular Biology. - Moscou, Russia. - 2005.

10 Joumaa, N. Synthesis of quantum dots-tagged polystyrene particles by miniemulsion polymerization. / Joumaa, N., Lansalot, M., Theretz, A., Elaissari, A., Sukhanova, A., Artemyev, M., Nabiev, I., Cohen, J.H.M. // Proceedings of 8th International Conference of Polymers for Advanced Technologies. - Budapest, Hungary. - 2005.

11 Sukhanova, A. Controlled self-assembly of nanocrystals in polycrystalline fluorescent dendrites with energy-transfer properties. / A. Sukhanova, A.V. Baranov, J.H.M. Cohen, M. Pluot, I. Nabiev // Proceedings of International Conference NaNaX

2, Nanoscience with Nanocrystals. - Grenoble/Autrans, France. - 2006.

12 Sukhanova, A. Intracellular delivery of semiconductor quantum dots: principles and

r c\

applications / A. Sukhanova, I. Nabiev // Proceedings of 3 International Conference "Nanobiotechnology and Cellular Biology". - Moscow, Russia. - 2007.

13 Sukhanova, A. Lab-in a-drop: Self-organsisation of semiconductor nanocrystals within the polycrystalline structures with desired optical properties / A. Sukhanova, I. Nabiev // Proceedings of International Conference TMS Annual Nano-Meeting & Exhibition. - Orlando, Florida, US. - 2007.

14 Nabiev, I. FRET with fluorescent nanocrystals for auto-antibodies profiling in clinical diagnostics of cancer and autoimmune diseases. / I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of Intenational Conference on "Interactions in Hybrid Nanosystems". -Frauenworth, Chiemsee, Germany. - 2008.

15 Sukhanova, A. FRET effect in the nanocrystals assemblies. Conference Colloidal Quantum Dots for Biomedical Applications. / Sukhanova, A. and Nabiev, I. // Proceedings of SPIE's Photonics West Symposium. - San Jose, California, USA. -2008.

16 Nabiev, I. NanoOptics with Nanocrystals. / Proceedings of 5th International Conference "Nanobiotechnology and Cellular Biology" / I. Nabiev, A. Sukhanova // Moscow, Russia. - 2008.

17 Nabiev, I. Nano-bio hybrid materials with desired energy harvesting and transfer properties. / I. Nabiev, A. Sukhanova, B. Reveil, T. Tabary, B. Donvito, M. Pluot, J.H.M. Cohen, // Proceedings of European Community Workshop "Towards Zero-Power ICT (2zeroP) research challenges: Deepening Understanding of this new FET research area". - Brussels, Belgium. - 2009.

18 Sukhanova, A. Nanodiagnostics of Autoimmune Diseases. / A. Sukhanova, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proceedings of 6th Conference "Nanobiotechnology and Cellular Biology". - Moscow, Russia. - 2009.

19 Nabiev, I. Highly specific quantum dots conjugates for cancer diagnostics. / I. Nabiev, M. Pluot, J.H.M. Cohen, A. Sukhanova // Proceedings of 6th Conference "Nanobiotechnology and Cellular Biology". - Moscow, Russia. - 2009.

20 Rousserie, G. Advanced labeling of monoclonal and single-domain antibodies with quantum dots: toward new generation of ultra-small specific nanoprobes. / G. Rousserie, W. Mahmoud, K. Even-Desrumeaux, A. Kisserli, S. Poly, B. Reveil, T. Tabary, P. Chames, D. Baty, V. Oleinikov, J.M. Millot, M. Pluot, J. Cohen, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of 7th International Conference on Biomedical Applications of Nanotechnology. - Logenhaus, Berlin, Germany. - 2007.

21 Nabiev, I. Bi-photon imaging and diagnostics with the ultra-small diagnostic probes engineered from semiconductor nanocrystals and single-domain antibodies. / I. Nabiev, H. Hafian, A. Sukhanova, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, // Proceedings of Global Congress on Nanosystems in Engineering and Medicine: Nano-Bio-Info Convergence. - Incheon, Republic of Korea. - 2012.

22 Sukhanova, A. Quantum dots induce charge-specific amyloid-like fibrillation of insulin at physiological conditions. / A. Sukhanova, S. Poly, A. Shemetov, I. Nabiev // Proceedings of Global Congress on Nanosystems in Engineering and Medicine: Nano-Bio-Info Convergence. - Incheon, Republic of Korea. - 2012.

23 Grinevich, R. Detection of carcinoembryonic antigen on colon cancer cells using single-domain antibodies and quantum dots. / R. Grinevich, G. Rousserie, K. Brazhnik, R. Even-Desrumeaux, B. Reveil, T. Tabary, P. Chames, D. Baty, J.H.M.

Cohen, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of 1st International Conference "Science of the Future". - St. Petersburg, Russia. - 2014.

24 Brazhnik, K. Development and potential applications of microarrays based on fluorescent nanocrystal-encoded beads for multiplexed cancer diagnostics. / K. Brazhnik, R. Grinevich, A.E. Efimov, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceeding of SPIE Photonics Europe Conference "Biophotonics: Photonic Solutions for Better Health Care". - Brussels, Belgium. - 2014. - 9129/86.

25 Sukhanova, A. Large nonlinear and linear optical responses in a hybrid nano-biomaterial engineered from bacteriorhodopsin and semiconductor quantum dots. / A. Sukhanova, Yu.P. Rakovich, V.A. Oleinikov, I. Nabiev // Proceeding of SPIE Photonics West International Conference. - San Francisco, California, USA. - 2014. -8955/37.

26 Nabiev, I. What happens when nanotechnology meets biology: breakthrough applications are accompanied with unexpected hazards. / I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of International Conference "Nanomeeting 2015". - Minsk, Belarus. -2015. - O-25.

27 Sukhanova, A. Single-photon and two-photon tumor imaging and diagnosis using oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots. / A. Sukhanova, I. Nabiev, H. Hafian, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, R. Bilan, K. Brazhnik, M. Baryshnikova, Z. Sokolova, P. Chames, D. Baty, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of International Conference "Nanomeeting 2015". - Minsk, Belarus. -2015. - O-31.

28 Sukhanova, A. Ultra-small diagnostic nanoprobes based on the oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots. / A. Sukhanova, K. Even-Desrumeaux, J.M. Millot, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, I. Nabiev // Proceedings of Advances in Functional Materials Conference 2015. - Stony Brook University, USA. - 2015.

29 Sukhanova, A. Highly oriented conjugates of single-domain antibodies and quantum dots for multiphoton imaging of tumor biomarkers in situ. / A. Sukhanova, H. Hafian, M. Turini, P. Chames, D. Baty, M. Pluot, J.H.M. Cohen, J.M. Millot, I. Nabiev //

Proceedings of Advances in Functional Materials Conference 2015. - Stony Brook University, USA. - 2015.

30 Lafont, F. Quantum dot-based microarray for analysis of modifications of cellular phosphoproteome in response to DNA damage. / F. Lafont, H. Benhelli-Mokrani, C. Charlier, P. Weigel, A. Sukhanova, I. Nabiev, F. Fleury // Proceedings of Advances in Functional Materials Conference 2015. - Stony Brook University, USA. - 2015.

31 Brazhnik, K. Cancer marker profiling by means of microbead-quantum dot microarrays. / K. Brazhnik, R. Bilan, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of Advances in Functional Materials Conference 2015. - Stony Brook University, USA. - 2015.

32 Glukhov S. Quantification and visualization of HER2 protein using nanocrystals conjugated with single domain antibodies. / S. Glukhov, M. Berestovoy, P. Chames, D. Baty, F. Ramos Gomes, F. Alves, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of 2nd International Conference "Science of the Future". - Kazan', Russia. - 2016.

33 Bozrova, S.V. Semiconductor quantum dot toxicity in a mouse in vivo model. / S.V. Bozrova, M.A. Baryshnikova, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of 2nd International Conference "Science of the Future". - Kazan', Russia. - 2016.

34 Berestovoy, M.A. Use of semiconductor nanocrystals to encode microbeads for multiplexed analysis of biological samples. / M.A. Berestovoy, R.S. Bilan, V.A. Krivenkov, I. Nabiev, A. Sukhanova // Proceedings of 2nd International Conference "Science of the Future". - Kazan', Russia. - 2016.