Молекулярно-эпидемиологический мониторинг гриппа в Азиатской части России: 2005-2012 гг. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.03, доктор биологических наук Ильичёва, Татьяна Николаевна

• Ильичёва, Татьяна Николаевна
• доктор биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации доктор биологических наук Ильичёва, Татьяна Николаевна

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ.

ОБЩАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ.

АКТУАЛЬНОСТЬ РАБОТЫ.

ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ.

I. ОБЗОР ДАННЫХ ЛИТЕРАТУРЫ.

ВВЕДЕНИЕ.

1.1. СТРОЕНИЕ ВИРУСА ГРИППА.

1.1.1. Строение вириона.

1.1.2. Геном и белки вируса гриппа.

1.1.3. Репликативный цикл вируса гриппа.

1.2. ЭВОЛЮЦИЯ АНТИГЕННЫХ СВОЙСТВ ВИРУСА ГРИППА.

1.2.1. Структура гемагглютинина и нейраминидазы.

1.2.2. Антигенный дрейф.

1.2.3. Антигенный шифт (сдвиг).

1.3. ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ГРИППА.

1.3.1. Первые исторически зафиксированные эпидемии и пандемии гриппа.

1.3.2. Пандемии гриппа в XX веке.

1.3.2.1. Пандемия гриппа А(НINI) в 1918- 1920-х гг. («испанка»).

1.3.2.2. Пандемия «азиатского гриппа» A(H2N2) в 1957 - 1959 гг.

1.3.2.3. Пандемия «гонконгского гриппа» A(H3N2) (1968 - 1970 гг.).

1.3.2.4. Пандемия Русского гриппа A(H1N1) (1977- 1978 гг.).

1.3.2.5. Эпидемия гриппа A(HINI) в 1946- 1947 гг.

1.3.3. Пандемия гриппа А(НINI) в XXI веке.

1.3.4. Заболевания человека, вызванные вирусами гриппа свиней.

1.3.5. Заболевания человека, вызванные вирусами гриппа птиц.

1.3.6. Эпидемиология гриппа В.

1.3.7. Эпидемиология сезонного гриппа.

1.4. ПАТОГЕНЕЗ.

1.4.1. Патогенез при инфицировании вирусом гриппа человека.

1.4.2. Особенности патогенеза при заражении человека вирусами гриппа птиц подтипа A(H5N1).

1.4.3. Патогенез при заражении человека вирусами гриппа птиц H7N7, H7N3, H7N2, H9N

1.4.4. роль вирусных белков в адаптации к хозяину и патогенезе.

1.4.4.1. Белки полимеразного комплекса.

1.4.4.2. Гемагглютинин.

1.4.4.3. Неструктурный белок NS1.

1.4.4.4. Роль других белков вируса гриппа в патогенезе.

1.5. ИММУНИТЕТ ПРИ ГРИППЕ.

1.5.1. неспецифический иммунитет.

1.5.1.1. Рецепторы распознавания патоген-ассоциированных молекулярных структур в респираторном тракте.

1.5.1.1.1. Толл-подобные рецепторы (toll-like receptors - TLR).

1.5.1.1.2. НОД-подобные рецепторы (nucleotide oligomerization domain-like receptors - NLR)

1.5.1.1.3. RIG-I-подобные рецепторы (retinoic acic induced gene I-like receptors - RLR).

1.5.1.1.4. Цитокины.

1.5.1.2. Связь между врожденным и адаптивным иммунными ответами.

1.5.2. Адаптивный иммунный ответ на вирус гриппа А.

1.5.2.1. Гуморальный ответ.

1.5.2.2. Цитотоксический Т-клеточный ответ.

1.5.3. Влияние популяционного иммунитета на смену серотипов вируса гриппа.

1.6. ПОЯВЛЕНИЕ ПАНДЕМИЧЕСКИХ ВИРУСОВ ГРИППА А.

1.6.1. Дискуссия о появлении шифтовых вариантов вируса гриппа.

1.6.2. Современные представления о возникновении пандемических вирусов гриппа

1.6.2.1. Появление «испанки» 1918 г.

1.6.2.2. Появление азиатского (1957 г.) и гонконгского (1968 г.) гриппа.

1.6.2.3. Появление пандемического вируса A(HlNl)pdm2009.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярно-эпидемиологический мониторинг гриппа в Азиатской части России: 2005-2012 гг.»

Грипп в его зоонозной, сезонной эпидемической и пандемической формах остается серьезной угрозой здоровью населения. Сезонный грипп является высокоинфекционным острым вирусным заболеванием, которое преимущественно поражает дыхательные пути. Он может вызывать заболевание разной степени тяжести, от легкой и даже бессимптомной формы до тяжелой с летальным исходом. Младенцы, лица престарелого возраста, а также люди с хроническими заболеваниями - наиболее уязвимые группы населения, так называемые группы риска. Сезонные эпидемии гриппа могут поражать до 15 % населения и ежегодно уносить 250 ООО - 500 ООО человеческих жизней (Программа исследований ВОЗ., 2009).

Непрерывная циркуляция вирусов гриппа в природе, главным образом среди водоплавающих птиц, и способность к реассортации способствуют появлению новых вариантов вируса с пандемическим потенциалом. Если вирус приобретает способность эффективно передаваться от человека к человеку, он может вызвать вспышку заболевания. Слабый популяционный иммунитет не в состоянии защитить население от нового вируса, и он быстро распространяется по странам и континентам. В отличие от сезонного пандемический грипп поражает преимущественно молодых людей и лиц среднего возраста. Опыт пандемий XX века показал, что они существенно отразились на здоровье людей и повлекли значительные экономические потери.

В 1947 году Всемирной организацией здравоохранения была создана «Глобальная система надзора за гриппом» (с мая 2011 года она называется Global Influenza Surveillance and Response System - GISRS), главной задачей которой является получение текущей, репрезентативной картины изменений вируса гриппа на глобальном уровне. Программа была организована, как сеть лабораторий, нацеленных на изучение циркуляции и особенностей генетического строения штаммов вируса гриппа, выделенных из клинических образ

10 цов и секционного материала Национальными центрами по гриппу (\УНС)/С08/2005.29).

Сегодня Глобальная программа ВОЗ по надзору за гриппом включает 138 Национальных центров по гриппу из 108 стран, шесть сотрудничающих с ВОЗ референс-центров, расположенных в Лондоне (Англия), Атланте (США), Мельбурне (Австралия), Токио (Япония), Пекине (Китай), Мемфисе (США), 4 Головные контрольные лаборатории (в Австралии, Японии, Великобритании, США), 12 референс лабораторий по диагностике А/Н5.

Современная концепция надзора за гриппом в России сложилась благодаря совместным усилиям Руководителя Роспотребнадзора, акад. РАМН, проф. Г.Г. Онищенко, академика РАМН, проф. Д.К. Львова и академика РАМН, проф. О.И. Киселева. Система базируется на деятельности двух Национальных центров по гриппу, существующих на базе НИИ вирусологии им. Д. И. Ивановского и НИИ гриппа, и 59 базовых вирусологических лабораторий Роспотребнадзора. Система охватывает практически всю территорию РФ.

После 2005 г., когда высокопатогенный вирус гриппа птиц А(Н5Ш) вызвал несколько эпизоотий на территории России, на базе ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» был организован референс-центр по надзору за высокопатогенным вирусом гриппа и референс-лаборатория ВОЗ по диагностике А/Н5. Помимо работ, связанных с эпизоотиями, вызванными высокопатогенным гриппом, в перечень задач этой лаборатории всходит выявление случаев инфицирования людей вирусами гриппа птиц и появления в человеческой популяции вирусов гриппа с пандемическим потенциалом.

В появлении новых вариантов вируса гриппа велико значение Азиатских регионов РФ. Так, юг Западной Сибири (долины рек Оби и Иртыша, Обь-Иртышское междуречье) богат реками и озерами, находится на путях миграции многих видов птиц и является гнездовым ареалом большого числа видов, экологически связанных с водоемами. Лесостепь Западной Сибири представляет собой одновременно огромный «инкубатор», где выводятся в

11 период гнездования миллионы птенцов, и обширный «вокзал», в котором останавливается во время пролетов еще большее количество птиц, гнездящихся в тайге и тундре (Шестопалов, 2010). Территориальные связи западносибирских птиц, которые устанавливаются в процессе сезонных миграций, весьма обширны, поскольку здесь сходятся миграционные потоки птиц, зимующих в различных регионах мира - Европе, Африке, на Ближнем Востоке и в Средней Азии, Индостане и Юго-Восточной Азии. Поскольку Юго-Западная Сибирь - это регион с развитой инфраструктурой, относительно высокой для Сибири плотностью населения, то здесь высока вероятность появления реассортантных штаммов между вирусами гриппа человека и животных и возникновения локальных вспышек заболевания людей, вызванных необычными вариантами вируса гриппа.

Физико-географическое положение Восточной Сибири и экологические особенности орнитофауны этого региона также создают благоприятные условия для реассортации геномов различных штаммов вируса гриппа А. Это, в свою очередь, способствует увеличению гетерогенности вирусной популяции и обеспечивает формирование большого разнообразия штаммов, появления и распространения новых, ранее не описанных вариантов вируса гриппа (Львов, 2004).

Дальневосточный регион имеет особое значение в экологии и эпидемиологии гриппа. По его территории пролегает Восточноазиатско-австралийский пролетный путь, который включает территории Австралии, Индонезии, Китая, Японии, США, России и некоторых других стран. Таким образом, птицы, мигрирующие этим путем, могут осуществлять перенос патогенных штаммов, эндемичных для Индонезии и Китая, где постоянно регистрируются вспышки, вызванные вирусом подтипа А(Н5М1).

Дальневосточный регион имеет самую протяженную в РФ границу с Китаем, страной, где наиболее часто появляются эпидемические штаммы вируса гриппа. В российских приграничных регионах (республика Алтай, Приморский и Хабаровский края, Читинская и Амурская области, Еврейская автономная область) проживает 6,3 млн. чел.

В связи с вышесказанным представляется очевидным, что для своевременного выявления новых вариантов вируса гриппа человека, ретроспективного эпидемиологического анализа и оценки степени защищенности населения от эпидемически значимых типов/субтипов вируса, в дополнине к ординарному эпидемиологическому надзору необходимо проводить комплексное исследование, включающее выявление циркулирующих штаммов вирусов, анализ их молекулярно-биологических и антигенных свойств, филогенетических связей, поиск маркеров высокопатогенных вирусов в сыворотках крови людей из групп риска, анализ динамики популяционного иммунитета.

ЦЕЛЬ И ЗАДАЧИ ИССЛЕДОВАНИЯ

Цель - охарактеризовать пандемию гриппа 2009-2010 гг., предпанде-мический и постпандемический периоды в Азиатской части России, используя комплексную методологию молекулярно-эпидемиологического мониторинга.

Для выполнения поставленной цели необходимо решить следующие задачи.

1) Организовать сбор сывороток крови людей, проживающих на территориях, неблагополучных по гриппу птиц А(Н5Ш).

2) Разработать методику и провести тестирование сывороток людей на наличие антител к вирусу гриппа А(Н5Ш).

3) Организовать всесезонный сбор образцов сывороток крови в условиях случайной независимой выборки по категориям: мужчины, женщины, возраст 0-18 лет, 19 - 45, 46 - 60 лет и старше 60 лет. На каждого человека собрать основную анамнестическую информацию с обязательными данными о вакцинации

4) Провести анализ сывороток на наличие специфических антител к се-ротипам вируса гриппа А (НШ1, НШ1 рёш09; НЗЫ2, Н51Ч1) и вирусу гриппа В двух генетических линий - Виктория и Ямагата. Сыворотки крови, положительные в РТГА к вирусам гриппа птиц А(Н5Ш), исследовать методом микронейтрализации.

5) Организовать сбор клинических образцов от пациентов с диагнозом «ОРВИ» и патологического материала от людей, скончавшихся от пневмонии, и исследовать их на возможное присутствие различных типов и сероти-пов вируса гриппа с применением ПЦР-анализа и серологических методов типирования и субтипирования вирусов.

6) Провести секвенирование всех генов у изолированных нетипичных и пандемических штаммов вируса гриппа, у типичных штаммов определить нуклеотидные последовательности генов поверхностных белков - гемагглю-тинина и нейраминидазы, построить филогенетические деревья генов НА и ЫА.

7) Провести анализ аминокислотных замен в белках выделенных штаммов по отношению к соответствующим белкам вакцинных штаммов

8) Определить лекарственную чувствительность штаммов вируса гриппа к используемым в России противогриппозным препаратам.

9) Проанализировать особенности эпидемических сезонов по гриппу в Сибири в сравнении с другими регионами мира.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА

Обоснована комплексная методология молекулярноэпидемиологического мониторинга гриппа, позволяющая выявлять варианты вируса с пандемическим и эпидемическим потенциалом, проводить ретроспективный анализ эпидемических вспышек заболевания, оценивать популя-ционный иммунитет населения в отношении значимых типов/субтипов вируса гриппа.

Впервые получены данные о наличии специфических антител к поверхностному антигену вируса гриппа птиц серотипа А(Н5Ш) в сыворотках крови людей на территории России.

Предложен подход к выявлению специфических антител к вирусу гриппа птиц в сыворотках людей, в котором, наряду с референс антигеном, используются штаммы вируса гриппа, выделенные от птиц данного региона; при постановке РТГА используются нативные эритроциты лошади, макаки-резус или формалинизированные эритроциты лошади, макаки-резус и гуся.

Показано, что эпидемия гриппа в 2009 г. в Азиатской части России была вызвана пандемическим вирусом гриппа А(НШ1)рс1т09. В предпандеми-ческий период эпидемию вызывали вирусы гриппа А(НШ1), А(НЗМ2) и вирусы гриппа В (линия Виктория), в первый постпандемический сезон преобладал вирус гриппа А(НШ1)рс1т09, ко-циркулировали вирусы А(НЗК2) и гриппа В (линия Виктория), во второй постпандемический сезон преобладали вирусы гриппа А(НЗШ) и В (линия Ямагата). Филогенетический анализ нук-леотидных последовательностей показал генетическое разнообразие штаммов вируса гриппа, циркулировавших в Сибири в 2009-2012 гг.

С помощью молекулярно-генетического анализа была определена лекарственная чувствительность выделенных в 2009 г. штаммов пандемического вируса гриппа А(НШ1)рс1т09 к используемым в России противогриппозным препаратам (все штаммы были чувствительны к антинейраминидазным препаратам озельтамивир, занамивир, препарату арбидол и устойчивы к ремантадину).

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ РАБОТЫ

Полученные в ходе работы данные были использованы при подготовке лекционных и практических занятий по курсу Миробиология в Новосибирском государственном университете и на курсах повышения квалификации врачей-вирусологов Центров гигиены и эпидемиологии субъектов РФ, проводимых на базе ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор».

15

Результаты, полученные при выполнении настоящей работы, были использованы для подготовки следующих учебных и учебно-методических пособий.

1. Ильичева Т.Н., Нетесов C.B., ГуреевВ.Н. Вирусы гриппа. Микробиология. Практикум. - Новосибирск: НГУ, 2012. - 164 с.

2. Азаев М.Ш., Кисленко В.Н., Дадаева A.A., Ильичева Т.Н., Сергеев А.Н. Теоретическая и практическая иммунология. Учебное пособие. - Новосибирск, 2013. - 325 с.

3. Азаев М. Ш., Нетесов С. В., Бакулина JI. Ф., Генина Е. С., Сороченко С. А., Дадаева А. А., Ильичева T. H., Сергеев А. Н. Практическое пособие по работе с клеточными культурами. - Арзамас: ОАО «Арзамасская типография», 2011. - 108 с.

4. Покровский А.Г., Федюк Н.В., Ильичева Т.Н. Микробиология и вирусология. Культивирование культур клеток. Методические указания. -НГУ, 1999. - 35 с.

5. Покровский А.Г., Федюк Н.В., Ильичева Т.Н. Микробиология и вирусология. Культивирование риккетсий и вируса гриппа. Методические указания. - Новосибирск: НГУ, 2001. - 28 с.

Данные о лабораторно подтвержденных случаях гриппа еженедельно предавались во всемирную сеть надзора за гриппом FluNet.

61 нуклеотидная последовательность генов разных типов/субтипов вируса гриппа депонированы в международную базу GeneBank

Создана и принята на патентное депонирование в Коллекцию микроорганизмов ФБУН ГНЦ ВБ «Вектор» коллекция из 43 штаммов вируса гриппа различных типов/субтипов, выделенных в Сибирских регионах в 2008 - 2012 гг.

Получены два патента РФ.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Дана характеристика пандемии гриппа 2009-2010 гг., предпандемическо-му и постпандемическому периодам в Азиатской части России.

2. Обоснована комплексная методология молекулярно-эпидемиологического мониторинга гриппа, позволившая выявить маркеры вируса с пандемическим потенциалом в сыворотках крови у жителей Западной Сибири, провести ретроспективный анализ эпидемических сезонов гриппа, оценить популяционный иммунитет населения в отношении значимых типов/субтипов вируса.

3. В последний предпандемический по гриппу сезон 2008 - 2009 гг. в Западной Сибири заболевание вызывали штаммы вируса гриппа А(НШ1), А(НЗК2) и вируса гриппа В, по молекулярно-биологическим характеристикам подобные вакцинным штаммам.

4. В 2009 г. грипп вызывали штаммы пандемического вируса А(НШ1)рёт09, по молекулярно-биологическим и антигенным характеристикам подобные референс-штамму А/СаН1шша/04/2009. От пандемического гриппа наиболее пострадало население Дальнего Востока, в меньшей степени - население Восточной и Западной Сибири, болели в основном люди в возрасте до 30 лет.

5. В эпидемические сезоны по гриппу в 2010 - 2011 гг. и 2011 - 2012 гг. заболевание вызывали штаммы вируса гриппа А(НШ1)рёт09, А(НЗШ), и вирусы гриппа В двух генетических линий - Виктория и Ямагата.

6. С марта 2009 г. по май 2012 г. состояние популяционного иммунитета к гриппу в Западной Сибири существенно изменилось, что было связано с появлением пандемического вируса А(Н 1N1 )рёт09.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Основные результаты диссертационной работы доложены на Всероссийской конференции «Проблемы инфекционной патологии в регионах Сибири, Дальнего Востока и Крайнего Севера» (Новосибирск, 1998), Второй Международной конференции «Современная вакцинология», посвященной 100-летию Пермского НПО «Биомед» (Пермь, 1998), 8-й и 10-й Международных конференциях по молекулярной эпидемиологии и эволюционной генетике инфекционных болезней (Бангкок, Таиланд, 2006, Амстердам, Нидерланды, 2010), Международной конференции «Опции по контролю гриппа» (Торонто, Канада, 2007), 3-ей Международной конференции «Фундаментальная наука медицине» (Новосибирск, 2007), Международной конференции «Грипп птиц 2008: интеграция для познания и контроля» (Бангкок, Таиланд,

2008), Международной конференции «Биотехнология в Казахстане: проблемы и перспективы инновационного развития» (Алматы, Казахстан, 2008), 10-ом Международном симпозиуме по респираторным вирусным инфекциям (Сингапур, 2008), Международной конференции «Грипп птиц 2008: грипп птиц и здоровье человека» (Оксфорд, Великобритания, 2008), Международной научно-практической конференции «Проблемы совершенствования межгосударственного взаимодействия в подготовке к пандемии гриппа» (Новосибирск, 2008), 7-м Международном симпозиуме по гриппу птиц «Грипп у домашних и диких птиц» (Афины, Джорджия, США, 2009), Всероссийской научной конференции «Медицинская геномика и протеомика» (Новосибирск,

2009), Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Дни иммунологии в Сибири» (Абакан, 2011), 4-ой Международной конференции по гриппу «Зоонозный грипп и здоровье человека» (Оксфорд, Великобритания, 2011), Международной конференции «Патогенез гриппа: взаимодействие вируса и хозяина» (Гонконг, Китай, 2011), Научной конференции с международным участием «Фундаментальные и прикладные аспекты инфекционной патологии» (Иркутск, 2012).

Публикации результатов исследований

По материалам диссертации опубликовано 45 печатных работ, в том числе 21 статья (из них 16 в научных журналах, рекомендованных ВАК и 4 статьи в высокорейтинговых международных журналах), 2 патента РФ, 5 учебных и учебно-методических пособия и 15 тезисов научных конференций.

Работа выполнена в 1999 - 2012 гг. в Федеральном бюджетном учреждении науки «Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор» в рамках Распоряжения Правительства Российской Федерации № 820-Р от 5 июня 2006 г. о выделении средств на осуществление мер, направленных на борьбу с гриппом, включая грипп птиц, и при поддержке ФЦП «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на 2009 - 2013 годы (Госконтракт № 14.740.11.0247 от 17.09.2010 г. и Соглашение № 14.В37.21.1927 от 04.10.2012).

Личный вклад автора в исследования, вошедшие в диссертацию, был определяющим. Постановка задач, планирование экспериментов, анализ результатов, представленных в диссертационной работе, написание основополагающих научных трудов осуществлялись автором лично. Автором лично или под ее руководством проведено выделение, типирование и субтипирова-ние изолятов вируса гриппа, исследованы их антигенные свойства (при участии А.Г. Дурыманова, О.Г. Курской), проведены молекулярно-биологические исследования (при участии к.б.н. И.М. Суслопарова, И.А. Соболева, М.В. Сивай), исследована чувствительность вирусов к хи-миопрепаратам, получены иммунные сыворотки животных (совместно с к.б.н. A.B. Зайковской и к.б.н. A.A. Романовской). Сыворотки крови людей, собранные в 2005-2007 гг., были исследованы автором лично в СЦ ВОЗ по гриппу, CDC, Атланта, США, в лаборатории д-ра [А. Климова| и лаборатории д-ра J. Katz. В организации сбора образцов от людей и животных принимали участие к.б.н. К.А. Шаршов, к.б.н. А.Ю. Алексеев, С.И. Золотых, B.C. Беспалов, Л.М. Горбатовская. Синтез новых противовирусных препаратов проводился сотрудниками ИОХ СО РАН, ИБХ им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН., ИОС УрО РАН. Анализ противовирусной активности препаратов автор проводила лично или совместно с к.б.н. O.A. Плясуновой, Т.Р. Проняевой, к.б.н. [Е.Ф. Белановым| под руковод

19 ством д.м.н., проф. А.Г. Покровского. В обсуждении концепции работы участвовали научные консультанты: чл.-корр. РАН, д.б.н., проф. C.B. Нетесов и д.б.н., проф. A.M. Шестопалов. Все материалы, использованные в диссертационной работе, проанализированы и обобщены автором лично. Вклад в работу соавторов отражен в публикациях по теме диссертации. Всем коллегам автор выражает глубокую искреннюю благодарность за совместную работу.

Структура и объем диссертации. Диссертация изложена на 271 страницах машинописного текста, включает введение, обзор литературы, материалы и методы, результаты собственных исследований, обсуждение результатов исследований, выводы, список литературы, содержащий 454 работы отечественных и зарубежных авторов, приложения. Диссертация иллюстрирована 26 таблицами и 23 рисунками.

Заключение диссертации по теме «Молекулярная биология», Ильичёва, Татьяна Николаевна

выводы

1. Дана характеристика пандемии гриппа 2009-2010 гг., предпандемического и постпандемического периодов в Азиатской части России при использовании комплексной методологии молекулярно-эпидемиологического мониторинга гриппа.

2. Впервые получены данные о наличии специфических антител к вирусу гриппа птиц серотипа А(Н5М1) в сыворотках крови людей на территории России. Все положительные сыворотки получены от пациентов, в анамнезе которых не было заболевания высокопатогенным вирусом гриппа или контакта с погибшей домашней птицей.

3. Предложен подход для обнаружения специфических антител к вирусу гриппа птиц в сыворотках людей, использующий, наряду с референс-антигеном, штаммы вируса гриппа, выделенные от птиц данного региона, при постановке РТГА использующий нативные эритроциты лошади, ма-каки-резус или формалинизированные эритроциты лошади, макаки-резус или гуся.

4. В предпандемический сезон (2008-2009 гг.) на юге Западной Сибири грипп был обусловлен циркуляцией штаммов вируса гриппа А(НЗШ), подобных А/Вп5Ьапе/10/2007(НЗК2), штаммов вируса А(НШ1), подобных А/Вп8Ьапе/59/2007(НШ1) (генетические клады 2В и 2С), и вирусом гриппа В (генетическая линия Виктория). Все штаммы вируса гриппа были чувствительны к действию арбидола (за единственным исключением -штамм А/КоК8Оуо/31/2009(ГОН2) и в подавляющем большинстве резистентны к ремантадину.

5. В Азиатской части России эпидемия гриппа 2009-2010 гг. началась на Дальнем Востоке, затем распространилась на всю территорию Сибири. Заболевание вызывал пандемический вирус гриппа А(НШ1)рс1т09. Исследование популяционного иммунитета в условиях репрезентативной выборки показало, что к марту 2010 г., относительно фонового показателя

6,2 ± 4,1) %, прирост в популяции серопозитивных к вирусу гриппа A(HlNl)pdm09 людей составил (5,0 ± 4,3) %, (6,6 ± 4,5) % и (23,3 ± 5,2) % в Западной, Восточной Сибири и на Дальнем Востоке, соответственно.

6. Исследование сывороток крови людей, переболевших острой респираторной вирусной инфекцией в ноябре-декабре 2009 г. в Амурской области, показало, что к февралю-марту 2010 г. эпидемически значимые титры антител к вирусу гриппа A(HlNl)pdm09 имели 48,9 % лиц в возрасте до 30 лет и 20,1 % лиц старше 30 лет.

7. Штаммы пандемического вируса гриппа A(HlNl)pdm09, выделенные в 2009 г. на территории Азиатской части России, по нуклеотидным и аминокислотным последовательностям на 99 % и выше идентичны референс-штамму A/California/04/2009. Единичные замены в антигенных сайтах не изменили антигенные характеристики штаммов. Молекулярно-генетический анализ выявил, что все штаммы были чувствительны к ан-тинейраминидазным препаратам (озельтамивир, занамивир), препарату арбидол и устойчивы к ремантадину.

8. В 2010-2011 гг. в Западной Сибири заболевание вызывали штаммы вируса гриппа A(HlNl)pdm09, по молекулярно-биологическим и антигенным характеристикам близкие вакцинному штамму A/California/7/2009 (HlNl)pdm09, штаммы вируса гриппа A(H3N2) - варианты вакцинного штамма A/Perth/16/2009 (клада Perth/16), и вирусы гриппа В, генетическая линия Виктория, подобные B/Brisbane/60/2008.

9. В эпидемическом сезоне по гриппу 2011-2012 гг. из клинического материала выделялись преимущественно штаммы вируса A(H3N2) (генетическая клада Victoria/208) и штаммы вируса гриппа В двух генетических линий (Виктория и Ямагата).

Ю.Исследование популяционного иммунитета в условиях репрезентативной выборки показало, что среди населения Западной Сибири процент серопозитивных лиц к вирусу гриппа A(HlNl)pdm09 увеличился с 6,2 ± 4,1 в марте 2009 г. до 13,6 ± 2,4 в марте 2011 г. и 21,5 ± 2,9 в мае 2012 г.; к вирусу сезонного гриппа А(НШ1) снизился с 38,6 ± 3,5 в 2009 г. до 9,4 ± 2,2 в 2012 г.; к вирусу гриппа А(НЗК2) снизился с 43,1 ± 3,5 в марте 2009 г. до 11,7 ± 2,2 в 2011 г. и затем вырос до 19,4 ± 2,8 в мае 2012 г.; к вирусу гриппа В (линия Виктория) снизился с 26,0 ± 4,0 в марте 2009 г. до 13,0 ± 2,3 в 2011г. и вырос до 18,6 ± 2,7 в мае 2012.; к вирусу гриппа В (линия Ямагата) вырос с 8,9 ± 2,1 в марте 2011 г. до 19,6 ± 2,8 в мае 2012 г.

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Ильичёва, Татьяна Николаевна, 2013 год

1. Актуальные аспекты противодействия пандемиям гриппа (курс лекций), 2009 / Под ред. д.м.н., профессора И.Г. Дроздова. Новосибирск: Информ-экспресс.

2. Вогралик Г.Ф., 1935. Учение об эпидемических заболеваниях. Томск.

3. Гамалея Н.Ф., 1942. Грипп и борьба с ним. Москва - Ленинград: Изд-во АН СССР. - 72 с.

4. Гезер Г., 1867. История повальных болезней. СПб (цит. по Гамалея, 1942).

5. Гендон Ю.З., 2008. Пандемии гриппа: факты и предложения // Педиа-тическая фармакология. Т. 5(4). - С. 14 - 19.

6. Голубев Д.Б., Кузнецов O.K., 2009. Ожидаемая пандемия гриппа// Эпидемиология и вакцинопрофилактика. -№3.-С.5-11.

7. Гореликов В.Н. и др., 2012. Лабораторная диагностика гриппа в период пандемии 2009 2010 гг. в Приморском крае // Инфекция и иммунитет. - Т. 2(1 -2).-С. 393.

8. Грипп: эпидемиология, диагностика, лечение, профилактика, 2012/ Под ред. акад. РАМН проф. О.И. Киселева, д-ра мед. наук. Л.М. Цыба-ловой, акад. РАМН проф. В.И. Покровского // М.: ООО Изд-во «Медицинское информационное агентство». 496 с.

9. Запольских A.M. и др., 2012. Эпидемиологическая характеристика гриппа и ОРВИ в эпидемических сезонах 2008- 2009, 2009- 2010 и2010 2011 гг. // Инфекция и иммунитет. - Т. 2(1 - 2). - С. 396.

10. Иванова В.Т. и др., 2009. Характеристика циркулировавших в России в сезоне 2007- 2008 гг. эпидемических штаммов вирусов гриппа А и В // Вопросы вирусологии. Т. 54(5). - С. 28 - 33.

11. Карпова Л.С. и др., 2010. Анализ эпидемии гриппа A(H1N1)/ Калифорния/07/2009 в России в сезон 2009- 2010 годов// Эпидемиология и вакцинопрофилактика. Т. 3(52). - С. 23 - 30.

12. Карпова Л.С. и др., 2011. Сравнение эпидемий гриппа в России 2009 и2011 годов, вызванных пандемическим вирусом гриппаА(НШ1)// Эпидемиология и вакцинопрофилактика. № 5. - С. 6 - 15.

13. Киселев О.И., 2011. Геном пандемического вируса гриппа A/HlNlv-2009. М.: Изд-во «Димитрейд График Групп». - 164 с.

14. Коновалова Н.И. и др., 2010. Этиологическая характеристика эпидемий гриппа 2006 2009 гг. в Российской Федерации (по данным НИИ Гриппа СЗО РАМН) // Вопросы вирусологии. - Т. 55(4). - С. 9 - 16.

15. Кузнецов O.K. и др., 2010. Популяционный иммунитет к сезонному гриппу как основной фактор, ограничивающий глобальную эпидемию 2009- 2010 годов A(H1N1)// Эпидемиология и вакцинопрофилакти-ка. № 4. - С. 9 - 17.

16. Кузнецов O.K., Степанова JI.A., 2009. Продолжительность защиты от гриппа после инфицирования и вакцинации // Эпидемиология и вакци-нопрофилактика. Т. 4(47). - С. 29 - 38.

17. Кутсар К., 2010. Пандемический грипп (H1N1) 2009 в Европе// Эпи-Норт. Т. 11(3). - С. 73 - 74.

18. Литвинова О.М. и др., 2011. Этиология современного гриппа// Эпидемиология и вакцинопрофилактика, №1, с. 5 9.

19. Львов Д.К. и др., 2004. Экология и эволюция вирусов гриппа в России (1979 2002 гг.) // Вопросы вирусологии. - №3. - С. 17 - 24.

20. Маринич И.Г. и др., 2009. Ситуация по гриппу в мире и России во втором полугодии 2007 первом полугодии 2008 года // Эпидемиология и вакцинопрофилактика - Т. (44). - С. 8 - 14.

21. Маркушин С.Г., 2012. Особенности врожденного иммунитета при вирусных инфекциях // Эпидемиология и вакцинопрофилактика. № 1. -С. 72-81.

22. Многоцелевые серологические обследования и банки эталонных сывороток ВОЗ. Серия техн. докл. ВОЗ, 1972, № 454.

23. Онищенко Г.Г. и др., 2006. Выявление в Западной Сибири высокопатогенных H5N1-вирусов гриппа, генетически родственных вирусам, циркулирующим в Юго-восточной Азии в 2003 2005 гг. // Доклады Академии наук. - Т. 406(2). - С. 278 - 280.

24. Полякова Т.Г. и др., 1970. Изучение вирусемии при гриппе А2 (Гонконг) // Вопросы вирусологии. Т. 15, № 6. - С. 724 - 728.

25. Программа исследований ВОЗ по гриппу с позиции общественного здравоохранения, 2009. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/influenza/resources/research/2010ll15globalinflue nzaresearchagendaversion01ru.pdf (Дата обращения: 19.10.2012).

26. Протасов Н.А., 1891. Исторический очерк эпидемий гриппа в России // Военно-медицинский журнал. Т. CLXXII(3). - С. 534- 531 (цит. по Гамалея, 1942).

27. Роспотребнадзор, 2009. Пресс-релизы. Ситуация по заболеваниям, вызванных высокопатогенным вирусом гриппа А/Калифорния/04/2009 по состоянию на 23.05.2009.

28. Смординцев А.А. и др., 1981. Классификация и номенклатура вирусов гриппа // Вопросы вирусологии. №4. - С. 499 - 504.

29. Смородинцев А.А., 1984. Грипп и его профилактика: руководство для врачей / А.А. Смородинцев. Л.: Медицина. Ленингр. отд-ние. - 384 с.

30. Федулова А.Г. и др., 2012. Особенности циркуляции вируса гриппа A(HlNl)pdm09 на территории республики Саха (Якутия) в сезонный период острых респираторных инфекций в 2009 г. // Инфекция и иммунитет. Т. 2(1 - 2). - С. 406.

31. Шестопалов A.M., 2010. Экологический полиморфизм и территориальная значимость различных вирусных патогенов. Автореферат дисс., Новосибирск.

32. Яцышина С.Б. и др., 2010. Пандемический грипп A/H1N1(SW2009) в России: эпидемиология, диагностика, клиническая картина и лечение // Терапевтический архив. -№ 11. С. 10-14.

33. Aderem A., Ulevitch R.J., 2000. Toll-like receptors in the induction of the innate immune response // Nature. V. 406. - P. 782 - 787.

34. Air G.M., 1981. Sequence relationships among the hemagglutinin genes of 12 subtypes of influenza A virus// Proc Natl Acad Sci USA. V. 78. -P. 7639-7643.

35. Akira S., et al., 2001. Toll-like receptors: critical proteins linking innate and acquired immunity // Nat. Immunol. V. 2. - P. 675 - 680.

36. Akira S., Sato S., 2003. Toll-like receptors and their signaling mechanisms // Scand. J. Infect. Dis. V. 35. - P. 555 - 562.

37. Akira S., Takeda K., 2004. Toll-like receptor signaling // Nat. Rev. Immunol.-V. 4.-P. 499-511.

38. Alexander D.J., Brown I.H., 2009. History of highly pathogenic avian influenza // Rev Sci Tech. V. 28(1). - P. 19 - 38.

39. Alonso-Caplen F.V., Krug R.M., 1991. Regulation of the extent of splicing of influenza virus NS1 mRNA: role of the rates of splicing and of the nucle-ocytoplasmic transport of NS1 mRNA// Mol. Cell. Biol.- V. 11.-P. 1092- 1098.

40. Andrejeva J., et al., 2004. The V proteins of paramyxoviruses bind the IFN-inducible RNA helicase, mda-5, and inhibit its activation of the IFN-J3 promoter // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. V. 101. - P. 17264 - 17269.

41. Antal-Szalmas P., et al., 1997. Quantitation of surface CD14 on human monocytes and neutrophils // J. Leukoc. Biol. V. 61. - P. 721 - 728.

42. Anton A., et al., 2010. D225G mutation in the hemagglutinin protein found in 3 severe cases of 2009 pandemic influenza A(H1N1) in Spain// Diagn. Microbiol. Infect. Dis. V. 67(2). - P. 207 - 208.

43. Apisarnthanarak A., et al., 2005. Seroprevalence of Anti-H5 Antibody among Thai Health Care Workers after Exposure to Avian Influenza (H5N1) in a Tertiary Care Center // CID. V. 40. - el6-el8.

44. Assaad F., et al., 1973. Use of excess mortality from respiratory diseases in the study of influenza // Bull World Health Organ. V. 49. - P. 219 - 233.

45. Bancroft C.T., Parslow T.G., 2002. Evidence for segment-nonspecific packaging of the influenza a virus genome // J. Virol. V. 76. - P. 7133 - 7139.

46. Bao Y., et al., 2008. The Influenza Virus Resource at the National Center for Biotechnology Information // J. Virol. V. 82(2). - P. 596 - 601.

47. Barchet W., et al., 2005. Dendritic cells respond to influenza virus through TLR7- and PKR- independent pathways // Eur. J. Immunol. V. 35. -P. 236 - 242.

48. Barton G.M., Medzhitov R., 2003. Toll-like receptor signaling pathways// Science. V. 300. - P. 1524 - 1525.

49. Basu S., Fenton M.J., 2004. Toll-like receptors: function and roles in lung disease // Am. J. Physiol. Lung Cell Mol. Physiol. V. 286. - P. L887 -L892.

50. Beal A.L., Cerra F.B., 1994. Multiple organ failure syndrome in the 1990s: systemic inflammatory response and organ dysfunction // J. Am. Med. Assoc.-V. 271.-P. 226-233.

51. Bean W.J., et al., 1992. Evolution of the H3 influenza virus hemagglutinin from human and nonhuman hosts // J Virol. V. 66. - P. 1129 - 1138.

52. Beigel J.H., et al., 2005. Avian influenza A (H5N1) infection in humans // N Engl J Med. V. 353. - P. 1374 - 1385.

53. Bender B.S., et al., 1992. Transgenic mice lacking class I major histocompatibility complex-restricted T cells have delayed viral clearance and increased mortality after influenza virus challenge // J Exp Med. V. 175. -P. 1143- 1145.

54. Beutler B., 2002. TLR4 as the mammalian endotoxin sensor// Curr. Top. Microbiol. Immunol. V. 270. - P. 109 - 120.

55. Beutler B., 2004. Innate immunity: an overview // Mol. Immunol. V. 40. -P. 845 - 859.

56. Beutler B., Hoffmann J., 2004. Innate immunity// Curr. Opin. Immunol. -V. 16.-P. 1-3.

57. Bhat N., et al., 2005. Influenza-associated deaths among children in the United States, 2003 2004 // N Engl J Med. - V. 353. - P. 2559 - 2567.

58. Blach-Olszewska Z., 2005. Innate immunity: cells, receptors and signaling pathway // Arch. Immunol. Ther. Exp. V. 53. - P. 245 - 253.

59. Bodewes R., et al., 2011. Prevalence of antibodies against seasonal influenza A and B viruses in children in Netherlands // Clin. Vaccine Immunol. -V. 18.-P. 469-476.

60. Boettcher E., et al., 2006. Proteolytic activation of influenza viruses by serine proteases TMPRSS2 and HAT from human airway epithelium // J Virol. V. 80. - P. 9896 - 9898.

61. Boettcher-Friebertshauser E., et al., 2010. Cleavage of influenza virus hemagglutinin by airway proteases TMPRSS2 and HAT differs in subcellular localization and susceptibility to protease inhibitors // J Virol. V. 84. - P. 5605-5614.

62. Boni M.F., 2008. Vaccination and antigenic drift in influenza // Vaccine. -V. 26 (suppl. 3). P. C8 - 14.

63. Brass A.L., et al., 2009. The IFITM proteins mediate cellular resistance to influenza A H1N1 virus, West Nile virus, and dengue virus// Cell.-V. 139.-P. 1243- 1254.

64. Bridges C.B., et al., 2002. Risk of influenza A (H5N1) infection among poultry workers, Hong Kong, 1997 1998 // J Infection Diseases. -V. 185.-P. 1005- 1010.

65. Brockwell-Staats C., et al., 2009. Diversity of influenza viruses in swine and the emergence of a novel human pandemic influenza A (H1N1) // Influenza Other Respi Viruses. V. 3(5). - P. 207 - 213.

66. Brown J.D., et al., 2007. Persistence of H5 and H7 avian influenza viruses in water // Avian Dis. V. 51. - P. 285 - 289.

67. Bruder D., et al., 2006. Cellular immunity and lung injury in respiratory virus infection // Viral Immunol. V. 19. - P. 147 - 155.

68. Burmeister W.P., et al., 1992. The 2.2 A resolution crystal structure of influenza В neuraminidase and its complex with sialic acid // EMBO J. -V. 11. P. 49-56.

69. Butt K.M., et al., 2005. Human infection with an avian H9N2 influenza A virus in Hong Kong in 2003 //J Clin Microbiol 2005. V. 43. - P. 57605767.

70. Campbell C.H., et al., 1970. Fowl plague virus from man// J Infect Dis. -V. 122.-P. 513-516.

71. Carrat F., Flahault A, 2007. Influenza vaccine: the challenge of antigenic drift. Vaccine. V. 25. - P. 6852 - 6862.

72. Carrat F., Valleron A.J., 1995. Influenza mortality among the elderly in France, 1980- 90: how many deaths may have been avoided through vaccination? // J Epidemiol Community Health. V. 49. - P. 419 - 425.

73. CDC, 2009a. Swine influenza A (H1N1) infection in two children-southern California, March-April 2009 // Morb Mortal Wkly Rep. V. 58. - P. 400 -402.

74. CDC, 2009b. Outbreak of swine-origin influenza A (H1N1) virus infection -Mexico, March-April 2009 // Morb Mortal Wkly Rep. V. 58, № 17. - P. 467 - 470.

75. CDC, 2011. Swine-origin influenza A (H3N2) virus infection in two children-Indiana and Pennsylvania, July-August 2011// Morb Mortal Wkly Rep. V. 60.-P. 1213-1215.

76. CDC, 2012a. Influenza A (H3N2) variant virus outbreaks. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.cdc.gov/flu/swineflu/h3n2v-outbreak. (Дата обращения: 19.10.2012).

77. CDC, 2012b. Antibodies cross-reactive to influenza A (H3N2) variant virus and impact of 2010- 11 seasonal influenza vaccine on cross-reactive antibodies United States // Morb Mortal Wkly Rep. - V. 61. - P. 237 - 241.

78. Chen Z., et al., 2000. Cross-protection against a lethal influenza virus infection by DNA vaccine to neuraminidase// Vaccine. V. 18.- P. 32143222.

79. Childs R.A., et al., 2009. Receptor-binding specificity of pandemic influenza A (H1N1) 2009 virus determined by carbohydrate microarray // Nat Bio-technol. V. 27. - P. 797 - 9.RRN1152.

80. Choi K., Thacker S.B., 1981. An evaluation of influenza mortality surveillance, 1962 1979. I. Time series forecasts of expected pneumonia and influenza deaths // Am J Epidemiol. - V. 113. - P. 215 - 226.

81. Chowell G., et al., 2006. Transmission dynamics of the great influenza pandemic of 1918 in Geneva, Switzerland: assessing the effects of hypothetical interventions // J Theor Biol. V. 241. - P. 193 - 204.

82. Chowell G., et al., 2007a. Seasonal influenza in the United States, France, and Australia: transmission and prospects for control // Epidemiol Infect. -V. 2.-P. 1 13.

83. Chowell G., et al., 2007b. Comparative estimation of the reproduction number for pandemic influenza from daily case notification data // J R Soc Interface. V. 4.-P. 155- 166.

84. Claas E.C.J., et al., 1998. Human influenza A H5N1 virus related to a highly pathogenic avian influenza virus // Lancet. V. 351. - P. 472 - 477.

85. Clementi N., et al., A human monoclonal antibody with neutralizing activity against highly divergent influenza subtypes. PLoS One. 2011;6(12):e28001.

86. Colman P.M., et al., 1983. Structure of the catalytic and antigenic sites in influenza virus neuraminidase // Nature. V. 303. P. 41 - 44.

87. Coraux C., et al., 2005. Réparation et régénération de l'épithélium respiratoire // Méd. Sei. V. 21 № 12. - P. 1063 - 1069.

88. Couch R.B., Kasel J.A., 1983. Immunity to influenza in man// Annu Rev Microbiol. V. 37. - P. 529 - 549.

89. Cox N.J., Bender C.A., 1995. The molecular epidemiology of influenza viruses // Sem. Virol. V. 6. - P. 359 - 370.

90. Craighead J.E., 2000. Pathology and pathogenesis of human viral disease. San Diego // Academic Press; Influenza viruses; p. 35 46.

91. Cros J.F., Palese P., 2003. Trafficking of viral genomic RNA into and out of the nucleus: influenza, Thogoto and Borna disease viruses // Virus Res. -V. 95.-P. 3- 12.

92. Dapat I.C., et al., 2012. Japanese Influenza Collaborative Study Group. Genetic characterization of human influenza viruses in the pandemic (2009 -2010) and post-pandemic (2010 2011) periods in Japan // PLoS One. - V. 7(6). - e36455.

93. DeLay PD, et al., 1967. Comparative study of fowl plague virus and a virus isolated from man // Public Health Rep. V. 82. - P. 615 - 620.

94. Dempsey P.W., et al., 2003. The art of war: Innate and adaptive immune responses // Cell. Mol. Life Sei. V. 60. - P. 2604 - 2621.

95. Deng T., et al., 2005. In vitro assembly of PB2 with a PB1-PA dimer supports a new model of assembly of influenza A virus polymerase subunits into a functional trimeric complex // J. Virol., V. 79. - P. 8669 - 8674.

96. Desselberger U., Palese P., 1978. Molecular weights of RNA segments of influenza A and B viruses // Virology. V. 88. - P. 394- 399.

97. Deutschman C.S., 1998. The systemic inflammatory response syndrome and the multiple organ dysfunction syndrome // In: Fishman AP, editor. Fish-man's pulmonary diseases and disorders. 3rd ed. New York: McGraw-Hill; p. 2567 2574.

98. Diamond G., et al., 2000. The innate immune response of the respiratory epithelium // Immunol. Rev. V. 173. - P. 27 - 38.

99. Diebold S.S., et al., 2004. Innate antiviral responses by means of TLR7-mediated recognition of single-stranded RNA// Science.- V. 303.-P. 1529- 1531.

100. Diefenbach A., Raulet D.H., 2003. Innate immune recognition by stimulatory immunoreceptors // Curr. Opin. Immunol. V. 15. - P. 37 - 44.

101. Dorinsky P.M., Gadek J.E., 1990. Multiple organ failure // Clin ChestMed. -V. 11.-P. 581 -591.

102. Ducatez M.F., et al., 2011. Multiple reassortment between pandemic (H1N1) 2009 and endemic influenza viruses in pigs, United States // Emerg Infect Dis.-V. 17.-P. 1624- 1629.

103. Eccles R., 2005. Understanding the symptoms of the common cold and influenza // Lancet Infect Dis. V. 5. - P. 718 - 725.

104. Ellis T.M., et al., 2004. Investigation of outbreaks of highly pathogenic H5N1 avian influenza in waterfowl and wild birds in Hong Kong in late 2002 // Avian Pathol. V. 33. - P. 492 - 505.

105. Engblom E., et al., 1983. Fatal influenza Amyocarditis with isolation of virus from themyocardium // ActaMed Scand. V. 213. - P. 75 - 78.

106. Falcon A.M., et al., 2004. Defective RNA replication and late gene expression in temperature-sensitive influenza viruses expressing deleted forms of the NS1 protein // J. Virol. V. 78. - P. 3880 - 3888.

107. Fan S., et al., 2009. Two amino acid residues in the matrix protein Ml contribute to the virulence difference of H5N1 avian influenza viruses in mice // Virology. V. 384, № 1. - P. 28 - 32.

108. Fan X., et al., 2012. Emergence and dissemination of a swine H3N2 reassortant with 2009 pandemic H1N1 genes in pigs in China// J. Virol.-V. 86, № 4. P. 2375 - 2378.

109. Fang R., et al., 1981. Complete structure of A/duck/Ukraine/63 influenza hemagglutinin gene: animal virus as progenitor of human H3 Hong Kong 1968 influenza hemagglutinin // Cell. V. 25. - P. 315 - 323.

110. Fechter P., Brownlee G.G., 2005. Recognition of mRNA cap structures by viral and cellular proteins // J. Gen.Virol. V. 86. - P. 1239 - 1249.

111. Fenton M.J., Golenbock D.T., 1998. LPS-binding proteins and receptors // J. Leukoc. Biol. V. 64. - P. 25 - 32.

112. Fereidouni S.R., et al., 2009. Differentiation of two distinct clasters among currently circulating influenza A(HlNl)v viruses, March-September 2009 // Euro Surveill. V. 14(46). - pii: 19409.

113. Ferguson N.M., et al., 2003. Ecological and immunological determinants of influenza evolution // Nature. V. 422. - P. 428 - 433.

114. Ferguson N.M., et al., 2005. Strategies for containing an emerging influenza pandemic in Southeast Asia // Nature. V. 437. - P. 209 - 214.

115. Ferguson N.M., et al., 2006. Strategies for mitigating an influenza pandemic // Nature. V. 442. - P. 448 - 452.

116. Fernandez-Sesma A., et al., 2006. Influenza virus evades innate and adaptive immunity via the NS1 protein // J Virol. 2006. V. 80. - P. 6295 - 6304.

117. Fleming D.M., 2000. The contribution of influenza to combined acute respiratory infections, hospital admissions, and deaths in winter // Commun Dis Public Health. V. 3. - P. 32 - 38.

118. Flu View weekly report by Influenza de vision, 2009. CDC. Электронный ресурс. Режим доступа:http://www.cdc.gov/flu/weekly/weeklyarchives2008-2009/weeklyl9.htm. (Дата обращения: 19.10.2012).

119. Fodor Е., et al., 2002. A single amino acid mutation in the PA subunit of the influenza virus RNA polymerase inhibits endonucleolytic cleavage of capped RNAs // J. Virol. V. 76. - P. 8989 - 9001.

120. Fouchier R.A., et al., 2005. Characterization ofa novel influenza A virus hemagglutinin subtype (HI6) obtained from black-headed gulls // J Virol. -V. 79.-P. 2814-2822.

121. Fouchier R.A.M., et al., 2004. Avian influenza A virus (H7N7) associated with human conjunctivitis and a fatal case of acute respiratory distress syndrome // Proc Natl Acad Sci USA. V. 101. - P. 1356 - 1361.

122. Franchi L., et al., 2009. The inflammasome: a caspase-1 -activation platform that regulates immune responses and disease pathogenesis // Nat. Immunol.-V. 10.-P. 241 -247.

123. Francis T. Jr., 1960. On the doctrine of original antigenic sin // Proc Am Philos Soc. V. 104(6). - P. 572 - 578.

124. Gabriel G., et al., 2005. The viral polymerase mediates adaptation of an avian influenza virus to a mammalian host // Proc Natl Acad Sci USA. V. 102.-P. 18590- 18595.

125. Gabriel G., et al., 2007. Differential polymerase activity in avian and mammalian cells determines host range of influenza virus // J Virol. V. 81. - P. 9601 - 9604.

126. Gabriel G., et al., 2008. Interaction of polymerase subunit PB2 and NP with importin alpha 1 is a determinant of host range of influenza A virus // PLoS Pathog.-V. 4.-P. ell.

127. Galiano M., et al., 2011. Evolutionary Pathways of the Pandemic Influenza A (H1N1) 2009 in the UK // PLoS ONE. V. 6(8). - e23779.

128. Gamblin S.J., Skehel J.J., 2010. Influenza Hemagglutinin and Neuraminidase Membrane Glycoproteins // Journal of Biological Chemistry. 2010-V. 285, № 37. - P. 28403 - 28409.

129. Gammelin M., et al., 1990. Phylogenetic analysis of nucleoproteins suggests that human influenza A viruses emerged from a 19th-century avian ancestor // Mol Biol Evol. V. 7. - P. 194 - 200.

130. Garten R.J., et al., 2009. Antigenic and genetic characteristics of swine-origin 2009 A(H1N1) influenza viruses circulating in humans. Science. -V. 325.-P. 197-201.

131. Garten W., Klenk H.D., 2008. Cleavage activation of the influenza virus hemagglutinin and its role in pathogenesis // In: Klenk HD, Matrosovich MN, Stech J, eds; Avian Influenza. Monographs in Virology. V. 27. - P. 156- 167.

132. Gerhard W., 2001. The role of the antibody response in influenza virus infection // Curr Top Microbiol Immunol. V. 260. - P. 171 - 190.

133. Gewirtz A.T., et al., 2001. Madara Cutting edge: bacterial flagellin activates basolaterally expressed TLR5 to induce epithelial proinflammatory gene expression // J. Immunol. V. 167. - P. 1882 - 1885.

134. Ghedin E., et al., 2005. Large-scale sequencing of human influenza reveals the dynamic nature of viral genome evolution // Nature. V. 437(7062). -P. 1162- 1166.

135. Ghendon Y., 1994. Introduction to pandemic influenza through history // European Journal of Epidemiology. V. 10. - P. 451 - 453.

136. Girardin S.E., et al., 2003. Sensing microbes by diverse hosts// EMBO Rep. V. 4, № 10. - P. 932 - 936.

137. Glezen W.P., 1996. Emerging infections: pandemic influenza// Epidemiol. Rev. V. 18.-P. 64-76.

138. Gorman O.T., et al., 1990. Evolution of influenza A virus PB2 genes: implications for evolution of the ribonucleoprotein complex and origin of human influenza A virus // J Virol. V. 64. - P. 4893 - 4902.

139. Gorman O.T., et al., 1991. Evolution of influenza A virus nucleoprotein genes: implications for the origins of H1N1 human and classical swine viruses // J Virol. V. 65. - P. 3704 - 3714.

140. Gorman O.T., et al., 1992. Evolutionary processes in influenza viruses: divergence, rapid evolution, and stasis // Current Topics in Microbiology and Immunology. V. 176. - P. 75 - 97.

141. Gregory V., et al., 2002. Emergence of influenza A H1N2 reassortant viruses in the human population during 2001 // Virology. V. 300. - P. 1-7.

142. Greiner M., et al., 2007. Expert opinion based modelling of the risk of human infections iwth H5N1 through the consumption of poultry meat in Germany // Berl Munch Tierarztl Wochenschr Heft. V. 3/4. - P. 98 - 107.

143. Guan Y., et al., 2002. H5N1 influenza viruses isolated from geese in Southeastern China: evidence for genetic reassortment and interspecies transmission to ducks // Virology. V. 292(1). - P. 16 - 23.

144. Guenther I., et al., 1993. A HI hemagglutinin of a human influenza A virus with a carbohydrate-modulated receptor binding site and an unusual cleavage site // Virus Res. V. 27. - P. 147 - 160.

145. Guo Y., et al., 1992. Human influenza A (H1N2) viruses isolated from China // J. Gen. Virol. V. 73. - P. 383 - 387.

146. Ha Y., et al., 2001. X-ray structures of H5 avian and H9 swine influenza virus hemagglutinins bound to avian and human receptor analogs // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. V. 98. - P. 11181 - 11186.

147. Hajjar A.M., et al., 2002. Human Toll-like receptor 4 recognizes host-specific LPS modifications // Nat. Immun. V. 3. - P. 354 - 359.

148. Hale B.G., et al., 2008. The multifunctional NS1 protein of influenza A viruses // J Gen Virol. V. 89. - P. 2359 - 2376.

149. Hale B.G., et al., 2010. Inefficient control of host gene expression by the 2009 pandemic H1N1 influenza A virus NS1 protein // Virology. V. 84. -P. 6909 - 6922.

150. Haller O., et al., 2008. Influenza A virus virulence and innate immunity: Recent insights from new mouse models // In: Klenk HD, Matrosovich MN, Stech J, eds; Avian Influenza. Monographs in Virology. V. 27. - P. 195 -209.

151. Hampson A., 2002. Influenza virus antigens and «antigenic drift» // In: Potter C.W. (Ed.), Influenza. Elsevier, Amsterdam, The Netherlands. P. 49 -85.

152. Hannoun C., et al., 2004. Immunogenicity and protective efficacy of influenza vaccination // Virus Res. V. 103. - P. 133 - 138.

153. Hatada E., et al., 1990. Analysis of influenza A virus temperature-sensitive mutants with mutations in RNA segment 8// J. Gen. Virol. V. 71.-P. 1283 - 1292.

154. Hatta M., et al., 2001. Molecular basis for high virulence of Hong Kong H5N1 influenza A viruses // Science. V. 293. - P. 1840 - 1842.

155. Hay A.J., et al., 2001. The evolution of human influenza viruses// Phil. Trans.The Royal Society Lond. B. V. 356. - P. 1861 - 1870.

156. Hay den F., Croisier A., 2005. Transmission of avian influenza viruses to and between humans // J Infect Dis 2005. V. 192. - P. 1311 - 1314.

157. Hayden F.G., et al., 1998. Local and systemic cytokine responses during experimental human influenza A virus infection: Relation to symptom formation and host defense // J Clin Invest. V. 101. - P. 643 - 649.

158. Haye K., et al., 2009. The NS1 protein of a human influenza virus inhibits type I interferon production and the induction of antiviral responses in primary human dendritic and respiratory epithelial cells // J Virol. V. 83. -P. 6849 - 6862.

159. Heltzer M.L., et al., 2009. Immune dysregulation in severe influenza// J Leukoc Biol. 2009. V. 85. - P. 1036 - 1043.

160. Henklein P., et al., 2005. Influenza A virus protein PB1-F2: synthesis and characterization of the biologically active full length protein and related peptides // J. Pept. Sci. V. 11. - P. 481 - 490.

161. Hensley S.E., et al., 2009. Hemagglutinin receptor binding avidity drives influenza A virus antigenic drift // Science. 2009. V. 326. - P. 734 - 736.

162. Hensley S.E., Yewdell J.W., 2009. Quesera, sera: evolution of the swine H1N1 influenza A virus // ExpertRev. Antiinfect. Ther. V. 7(7). - P. 763 -768.

163. Herfst S., et al., 2010. Introduction of virulence markers in PB2 of pandemic swine-origin influenza virus does not result in enhanced virulence or transmission // J Virol. V. 84. - P. 3752 - 3755.

164. Herold S., et al., 2006. Alveolar epithelial cells direct monocyte transepithe-lial migration upon influenza virus infection: impact of chemokines and adhesion molecules // J Immunol. V. 177. - P. 1817 - 1824.

165. Hers J.F.P., et al., 1958. Bacteriology and histopathology of the respiratory tract and lungs in fatal Asian influenza // Lancet. V. 2. - P. 1141 - 1143.

166. Hidaka F., et al., 2006. A missense mutation of the Tolllike receptor 3 gene in a patient with influenza-associated encephalopathy // Clin Immunol. V. 2006.-P. 188- 194.

167. Hofshagen M., et al., 2009. Pandemic influenza A(HlNl)v: human to pig transmission in Norway? // Euro Surveill. V. 14.

168. Holgate S.T., et al., 2000. Bronchial epithelium as a key regulator of airway allergen sensitization and remodeling in asthma // Am. J. Respir. Crit. Care Med. V. 162.-P. SI 13 - SI 17.

169. Holmes E.C., et al., 2005. Whole-genome analysis of human influenza A virus reveals multiple persistent lineages and reassortment among recent H3N2 viruses // PLoS Biol. V. 3. - e300.

170. Hornung V., et al., 2006. 5'-Triphosphate RNA is the ligand for RIG-I// Science. V. 314. - P. 994 - 997.

171. Howard W.A., et al., 2011. Reassortant Pandemic (H1N1) 2009 virus in pigs, United Kingdom // Emerg Infect Dis. V. 17. - P. 1049 - 1052.

172. Howden K.J., et al., 2009. An investigation into human pandemic influenza virus (H1N1) 2009 on an Alberta swine farm// Can Vet J.- V. 50,-P. 1153-1161.

173. Hulse-Post D.J., et al., 2007. Molecular changes in the polymerase genes (PA and PB1) associated with high pathogenicity of H5N1 influenza virus in mallard ducks // J Virol. V. 81, № 16. - P. 8515 - 8524.

174. Ichinohe T., et al., 2009. Inflammasome recognition of influenza virus is essential for adaptive immune responses // J Exp Med. V. 206. - P. 79 - 87.

175. Imaz M.S., et al., 2006. Influenza associated excess mortality in Argentina: 1992 2002 // Rev Chilena Infectol. - V. 23. - P. 297 - 306.

176. Ito R., et al., 2003. Roles of anti-hemagglutinin IgA and IgG antibodies in different sites of the respiratory tract of vaccinated mice in preventing lethal influenza pneumonia // Vaccine. V. 21. - P. 2362 - 2371.

177. Jain S., et al., 2009. Hospitalized patients with 2009 H1N1 influenza in the United States // N Engl J Med 2009. V. 361. - P. 1935 - 1944.

178. Janeway C.A.Jr., 1989. Approaching the asymptote? Evolution and revolution in immunology // Cold Spring. Harb. Symp. Quant. Biol. V. 54. - P. 1-13.

179. Janeway C.A.Jr., Medzhitov R., 2002. Innate immune recognition// Annu. Rev. Immunol. V. 20. - P. 197 - 216.

180. Joffre O., et al., 2009. Inflammatory signals in dendritic cell activation and the induction of adaptive immunity // Immun. Rev. V. 227. - P. 234 - 247.

181. Jones I.M., et al., 1986. Nuclear location of all three influenza polymerase proteins and a nuclear signal in polymerase PB2 // EMBO J. V. 5. -P. 2371 -2376.

182. Jorba N., et al., 2008. Analysis of the interaction of influenza virus polymerase complex with human cell factors // Proteomics. V. 8. - P. 2077 - 2088.

183. Kandun I., et al., 2009. Chicken Faeces Garden Fertilizer: Possible Source of Human Avian Influenza H5N1 Infection // Zoonoses Public Health. V. 57. - P. 285 - 290.

184. Karageorgopoulos D.E., et al., 2011. Age distribution of cases of 2009 (H1N1) pandemic influenza in comparison with seasonal influenza // PLoS One. V. 6.-P. e21690.

185. Karlas A., et al., 2010. Genome-wide RNAi screen identifies human host factors crucial for influenza virus replication // Nature. V. 463. - P. 818 -822.

186. Katz J.M., et al., 1999. Antibody response in individuals infected with avian influenza A (H5N1) viruses and detection of anti-H5 antibody among household and social contacts // J Infection Diseases. V. 180. - P. 1763 -1770.

187. Kaverin N., 2010 Postreassortment amino acid substitutions in influenza A viruses // Future Microbiol. V. 5(5). - P. 705 - 715.

188. Kaverin N.V., et al., 2007. Epitope mapping of the hemagglutinin molecule of a highly pathogenic H5N1 influenza virus by using monoclonal antibodies//J Virol. V. 81(23).-P. 12911 - 12917.

189. Kawada J., et al., 2003. Systemic cytokine responses in patients with influenza-associated encephalopathy // J Infect Dis. V. 188. - P. 690 - 698.

190. Kawaguchi A., et al., 2005. vement of influenza virus PA subunit in assembly of functional RNA polymerase complexes // J. Virol. V. 79. - P. 732 -744.

191. Kawai T., Akira S., 2007. Antiviral signaling through pattern recognition receptors // J Biochem. 2007. V. 141. - P. 137 - 145.

192. Kawaoka Y, Webster R.G. 1989. Interplay between carbohydrate in the stalk and the length of the connecting peptide determines the cleavability of influenza virus hemagglutinin // J Virol. V. 63. - P. 3296 - 3300.

193. Kawaoka Y., et al., 1989. Avian-to-human transmission of the PB1 gene of influenza A viruses in the 1957 and 1968 pandemics // J Virol. V. 63. -P. 4603 - 4608.

194. Kawaoka Y., et al., 1990. Molecular characterization of a new hemagglutinin, subtype H14, of influenza A virus // Virology. V. 179. - P. 759 - 767.

195. Kedzierska K., et al., 2006. Early establishment of diverse T cell receptor profiles for influenza-specific CD8(+)CD62L(hi) memory T cells // Proc Natl Acad Sci U S A. V. 103. - P. 9184 - 9189.

196. Khakpour M., et al., 1969. Proved viraemia in Asian influenza (Hong Kong variant) during incubation period // Br Med J. V. 4. - P. 208 - 209.

197. Khatchikian D., et al., 1989. Increased viral pathogenicity after insertion of a 28S ribosomal RNA sequence into the haemagglutinin gene of an influenza virus // Nature. V. 340. - P. 156 - 157.

198. Kilbourne E.D., 1977. Influenza pandemics in perspective // J. Am. Med. Assoc. V. 237. - P. 1225 - 1228.

199. Kilbourne E.D., 2006. Influenza pandemics of the 20th century // Emerg Infect Dis. V. 12. - P. 9 - 14.

200. Kilbourne E.D., et al., 2002. The total influenza vaccine failure of 1947 revisited: Major intrasubtypic antigenic change can explain failure of vaccine in a post-World War II epidemic // Proc Natl Acad Sci USA. V. 99. - P. 10748 - 10752.

201. Kilbourne E.D., et al., 2004. Protection of mice with recombinant influenza virus neuraminidase // J. Infect. Dis. V. 189. - P. 459 - 461.

202. Kim T.K., Maniatis T., 1997. The mechanism of transcriptional synergy of an in vitro assembled interferon beta enhanceosome// Mol Cell. V. 1. -P. 119-129.

203. Kitikoon P., et al., 2011. Brief report: Molecular characterization of a novel reassorted pandemic H1N1 2009 in Thai pigs// Virus Genes. V. 43.-P. 1-5.

204. Klenk H.D., Garten W., 1994. Host cell proteases controlling virus pathogenicity // Trends Microbiol. V. 2. - P. 39 - 43.

205. Klenk H.D.et al., 2011. Molecular mechanisms of interspecies transmission and pathogenicity of influenza viruses: Lessons from the 2009 pandemic // Bioessays. V. 33 Issue: 3. - P. 180 - 188.

206. Koenig R., et al., 2010. Human host factors required for influenza virus replication // Nature. V. 463. - P. 813 - 817.

207. Koopmans M., et al., 2004. Transmission of H7N7 avian influenza A virus to human beings during a large outbreak in commercial poultry farms in the Netherlands // Lancet. V. 363(9409). - P. 587 - 593.

208. Korteweg C., Gu J., 2008. Pathology, molecular biology, and pathogenesis of avian influenza A (H5N1) infection in humans // Am J Pathol. V. 172. -P. 1155-70.

209. Kozak W., et al., 1995. Thermal and behavioral effects of lipopolysaccharide and influenza in interleukin-1 beta-deficient mice// Am J Physiol.-V. 269. P. R969 - 977.

210. Kurtz J., et al., 1996. Avian influenza virus isolated from a woman with conjunctivitis // Lancet. V. 348. - P. 901 - 902.

211. Kwan-Gett T.S., et al., 2009. Spring 2009 H1N1 influenza outbreak in King country Washington// Disaster Med Pub Health Preparedness.- V. 3.-P. S109- 116.

212. Laberge S., El Bassam S., 2004. Cytokines, structural cells of the lungs and airway inflammation // Paediatr. Respir. Rev. V. 5, Suppl A. - P. - S41 -S45.

213. Lakadamyali M., et al., 2004. Endocytosis of influenza viruses // Microbes Infect. V. 6. - P. 929 - 936.

214. Le Goffic R., et al., 2006. Detrimental contribution of the Toll-like receptor (TLR)3 to influenza A virus-induced acute pneumonia // PLoS Pathog. V. 2.-P. e53.

215. Le Goffic R„ et al., 2007. Cutting Edge: Influenza A virus activates TLR3-dependent inflammatory and RIG-I-dependent antiviral responses in human lung epithelial cells // J Immunol. V. 178. - P. 3368 - 3372.

216. Lee Y.-M., et al., 2009. Virological investigation of four outbreaks of influenza B reassortants in the northern region of Taiwan from October 2006 to February 2007. 2009 // BMC Research Notes. V. 2. - P. 86.

217. Lehmann N.I., Gust I.D., 1971. Viraemia in influenza: a report of two cases // Med J Aust. V. 2. - P. 1166 - 1169.

218. Leneva L.A., et al., 2009. Characteristics of arbidol-resistant mutants of influenza virus: implications for the mechanism of anti-influenza action of arbidol // Antiviral Research. V. 8(2). - P. 132 - 140.

219. Li S.Q., et al., 1990. Generation of seal influenza virus variants pathogenic for chickens, because of hemagglutinin cleavage site changes // J Virol. V. 64.-P. 3297-3303.

220. Li X.S., et al., 1992. Origin and evolutionary characteristics of antigenic réassortant influenza A (H1N2) viruses isolated from man in China// J. Gen. Virol. V. 73. - P. 1329 - 1337.

221. Li Z., et al., 2005. Molecular basis of replication of duck H5N1 influenza viruses in a mammalian mouse model// J Virol. V. 79.- P. 1205812064.

222. Likos A.M., et al., 2007. Influenza viremia and the potential for blood-borne transmission // Transfusion. V. 47. - P. 1080 - 1088.

223. Lin Y.P., et al., 2000. Avian-to-human transmission of H9N2 subtype influenza A viruses: Relationship between H9N2 and H5N1 human isolates// Proc Natl Acad Sci USA. V. 97. - P. 9654 - 9658.

224. Lindstrom S.E., et al., 1998. Phylogenetic analysis of the entire genome of influenza A (H3N2) viruses from Japan: evidence for genetic reassortment of the six internal genes // J. Virol. V. 72. - P. 8021 - 8031.

225. Liu B., et al., 2004. Interleukin-18 improves the early defence system against influenza virus infection by augmenting natural killer cell-mediated cytotoxicity // J Gen Virol. 2004. V. 85. - P. 423 - 428.

226. Liu J., et al., 2005. Highly pathogenic H5N1 influenza virus infection in migratory birds // Science. V. 309. - P. 1206.

227. Louria D.B., et al., 1959. Studies on influenza in the pandemic of 1957 -1958. II. Pulmonary complications of influenza // J Clin Invest. V. 38(1 Pt 1 -2).-P. 213-265.

228. Ludwig S., et al., 1995. European swine virus as a possible source for the next pandemic? // Virology. V. 212. - P. 555 - 561.

229. Lund J.M., et al., 2004. Recognition of singlestranded RNA viruses by Tolllike receptor 7 // Proc Natl Acad Sci U S A. V. 101. - P. 5598 - 5603.

230. Maines T.R., et al., 2009. Transmission and pathogenesis of swine-origin 2009 A (H1N1) influenza viruses in ferrets and mice // Science. V. 325. -p. 484-487.

231. Malik Peiris S., et al., 2009. Emergence of a novel swine-origin influenza A virus (S-OIV) H1N1 virus in humans // J Journal of Clinical Virology. V. 45.-P. 169- 173.

232. Manuguerra J.C., et al., 2000. Evidence for evolutionary stasis and genetic drift by genetic analysis of two equine influenza H3 viruses isolated in France // Veterinary Microbiology. V. 74. - P. 59 - 70.

233. Marchenko V.Y., et al., 2012. Ecology of Influenza Virus in Wild Bird Populations in Central Asia // Avian Diseases V. 56(1). - P. 234 - 237.

234. Martinez O., et al., 2009. Neutralizing anti-influenza virus monoclonal antibodies: therapeutics and tools for discovery // Int Rev Immunol. V. 28. -P. 69 - 92.

235. Mastrosovich M., et al., 1999. The surface glycoproteins of H5 influenza viruses isolated from humans, chickens, and wild aquatic birds have distinguishable properties // J. Virol. V. 73. - P. 1146 - 1155.

236. Masurel N., Marine W.M., 1973. Recycling of Asian and Hong Kong Influenza A virus hemagglutinins in man // Am J Epidemiol. V. 97. - P. 44 -49.

237. McCauley J.W., Mahy B.W., 1983. Structure and function of the influenza virus genome // J. Biochem. V. 211. - P. 281 - 294.

238. McCown M.F., Pekosz A., 2005. The influenza A virus M2 cytoplasmic tail is required for infectious virus production and efficient genome packaging // J. Virol. V. 79. - P. 3595 - 3605.

239. McCown M.F., Pekosz A., 2006. Distinct domains of the influenza a virus M2 protein cytoplasmic tail mediate binding to the Ml protein and facilitate infectious virus production // J. Virol. V. 80. - P. 8178 - 8189.

240. McCullers J.A., et al., 1999. Reassortment and insertion-deletion are strategies for the evolution of influenza В viruses in nature // J. Virol. V. 73. -P. 7343-7348.

241. McGill J., et al., 2009. Innate immune control and regulation of influenza virus infections // J Leukoc Biol. 86. P. 803 - 812.

242. McGovern P.C., et al., 2002. Successful explantation of a ventricular assist device following fulminant influenza type A-associated myocarditis // J Heart Lung Transplant. V. 21. - P. 290 - 293.

243. McHardy A.C., Adams В., 2009. The role of genomics in tracking the evolution of influenza A virus // PLoS Pathogens. V. 5. - P. el000566.

244. Medzhitov R., 2001. Toll-like receptors and innate immunity// Nat. Rev. Immunol. V. 1. - P. 135 - 145.

245. Medzhitov R., Biron C.A., 2003. Innate immunity // Curr. Opin. Immunol. -V. 15.-P. 2-4.

246. Medzhitov R., et al., 1997. A human homologue of the Drosophila Toll protein signals activation of adaptive immunity // Nature. V. 388. - P. 394 -397.

247. Medzhitov R., Janeway C. Jr., 2000. Innate Immunity // N. Engl. J. Med. -V. 343, № 5. p.-338-344.

248. Medzhitov R., Janeway C.A.Jr., 1997a. Innate immunity: impact on the adaptive immune response // Curr. Opin. Immunol. V. 9. - P. 4 - 9.

249. Medzhitov R., Janeway C.A.Jr., 1997b. Innate immunity: the virtues of a nonclonal system of recognition // Cell. V. 91. - P. 295 - 298.

250. Mehle A., Doudna J.A., 2009. Adaptive strategies of the influenza virus polymerase for replication in humans // Proc Natl Acad Sci USA. V. 106. - P. 21312-21316.

251. Melen K., et al., 2003. Importin alpha nuclear localization signal binding sites for STAT1, STAT2, and influenza A virus nucleoprotein// J. Biol. Chem. V. 278. - P. 28193 - 28200.

252. Mikulasova A., et al., 2000. Transcription and replication of the influenza a virus genome // Acta Virol. V. 44. - P. 273 - 282.

253. Miller R.R., et al., 2010. Occurrence of haemagglutinin mutation D222G in pandemic influenza A(H1N1) infected patients in the West of Scotland United Kingdom, 2009 10 // Euro Surveill. - V. 15(16).

254. Mills C.E., et al., 2004. Transmissibility of 1918 pandemic influenza// Nature. V. 432. - P. 904 - 906.

255. Monto A.S., 1994. Studies of the community and family: acute respiratory illness and infection // Epidemiol Rev. V. 16. - P. 351 - 373.

256. Monto A.S., 2002. Epidemiology of viral respiratory infections // Am J Med V. 112(Suppl 6A). - P. 4S - 12S.

257. Monto A.S., Cavallaro J.J., 1971. The Tecumseh study of respiratory illness. II. Patterns of occurrence of infection with respiratory pathogens, 1965 -1969 // Am J Epidemiol. V. 94. - P. 280 - 289.

258. Moreno A., et al., 2010. First Pandemic H1N1 Outbreak from a Pig Farm in Italy // Open Virol J. V. 4. - P. 52 - 56.

259. Moreno A., et al., 2011. Novel H1N2 swine influenza reassortant strain in pigs derived from the pandemic H1N1/2009 virus// Vet Microbiol. V. 149.-P. 472-477.

260. Mori I., et al., 1997. Use of the polymerase chain reaction for demonstration of influenza virus dissemination in children // Clin Infect Dis. V. 24. -P. 736-737.

261. Morsy J., et al., 1994. Activation of an influenza virus A/turkey/Oregon/71 HA insertion variant by the subtilisin-like endoprotease furin // Virology. -V. 202.-P. 988-991.

262. Mullooly J.P., Barker W.H., 1982. Impact of type A influenza on children: a retrospective study // Am. J. Public Health. V. 72. - P. 1008 - 1016.

263. Murphy B.R., Webster R.G., 1996. Orthomyxoviruses // In: Fields Virology (Ed. Fields K., Howley P.M.) Lippincott-Raven, Philadelphia. 1353 1445.

264. Naffakh N., et al., 2008. Host restriction of avian influenza viruses at the level of the ribonucleoproteins // Annu Rev Microbiol. V. 62. - P. 403 -424.

265. Naficy K., 1963. Human influenza infection with proved viremia. Report of a case // N Engl J Med. V. 269. - P. 964 - 966.

266. Nagarajan K., et al., 2010. Influenza A H1N1 virus in Indian pigs & its genetic relatedness with pandemic human influenza A 2009 H1N1 // Indian J Med Res. V. 132. - P. 160 - 167.

267. Nakagawa Y., et al., 1995. The RNA polymerase PB2 subunit is not required for replication of the influenza virus genome but is involved in capped mRNA synthesis // J. Virol. V. 69. - P. 728 - 733.

268. Nakagawa Y., et al., 1996. The PB1 subunit alone can catalyze cRNA synthesis, and the PA subunit in addition to the PB1 subunit is required for viral RNA synthesis in replication of the influenza virus genome // J. Virol. -V. 70.-P. 6390-6394.

269. Nakajima K., et al., 1978. Recent human influenza A (H1N1) viruses are closely related genetically to strains isolated in 1950 // Nature. V. 274. - P. 334-339.

270. Nayak B., et al., 2010. Contributions of the Avian Influenza Virus HA, NA and M2 Surface Proteins to the Induction of Neutralizing Antibodies and Protective Immunity // J Virol. V. 84(5). - P. 2408 - 2420.

271. Nelson M.I., et al., 2006. Stochastic processes are key determinants of short-term evolution in influenza a virus // PLoS Pathog. V. 2. - el25.

272. Nerome R., et al., 1998. Evolutionary characteristics of influenza B virus since its first isolation in 1940: dynamic circulation of deletion and insertion mechanism // Arch. Virol. V. 143. - P. 1569 - 1583.

273. Neumann G., et al., 2009. Emergence and pandemic potential of swine-origin H1N1 influenza virus // Nature. V. 459. - P. 931 - 939.

274. Neumann G., Kawaoka Y., 2006. Host range restriction and pathogenicity in the context of influenza pandemic // Emerg Infect Dis. -V. 12.-P. 881 — 886.

275. Ngo L.T., et al., 2011. Isolation of novel triple-reassortant swine H3N2 influenza viruses possessing the hemagglutinin and neuraminidase genes of a seasonal influenza virus in Vietnam in 2010 // Influenza Other Respi Viruses.

276. Nicholls J.M., et al., 2007. Tropism of avian influenza A (H5N1) in the upper and lower respiratory tract // Nat Med. V. 13. - P. 147 - 149.

277. Nishikawa F., Sugiyama T., 1983. Direct isolation of H1N2 recombinant virus from a throat swab of a patient simultaneously infected with H1N1 and H3N2 influenza A viruses // J. Clin. Microbiol. V. 18. - P. 425 - 427.

278. Noble G.R., 1982. Epidemiological and clinical aspects of influenza. In: Beare AS, ed; Basic and // Applied Influenza Research. P. 11 - 50.

279. Nobusawa E., et al., 1991. Comparison of complete amino acid sequences and receptorbinding properties among 13 serotypes of hemagglutinins of influenza A viruses // Virology. V. 182. - P. 475 - 485.

280. Noda T., et al., 2006. Architecture of ribonucleoprotein complexes in influenza A virus particles // Nature. V. 439. - P. 490 - 492.

281. O'Neill L.A., 2002. Toll-like receptor signal transduction and the tailoring of innate immunity: a role for Mai?// Trends Immunol. V. 23.- P. 296300.

282. O'Neill R.E., et al., 1995. Nuclear import of influenza virus RNA can be mediated by viral nucleoprotein and transport factors required for protein import // J.Biol.Chem. V. 270. - P. 22701 - 22704.

283. O'Neill R.E., et al., 1998. The influenza virus NEP (NS2 protein) mediates the nuclear export of viral ribonucleoproteins // EMBO J. V. 17. - P. 288 -296.

284. Oseasohn R., et al., 1959. Clinicopathologic study of thirty-three fatal cases of Asian influenza // N Engl J Med. V. 260. - P. 509 - 518.

285. Palese P., Wang T.T., 2011. Why do influenza virus subtypes die out? A hypothesis // mBio. V. 2(5). - P. e00150 - 11.

286. Parvin J.D., et al., 1986. Measurement of the mutation rates of animal viruses: influenza A virus and poliovirus type 1 // J Virol. V. 59. - P. 377 -383.

287. Pasick J., et al., 2005. Intersegmental recombination between the haemag-glutinin and matrix genes was responsible for the emergence of a highly pathogenic H7N3 avian influenza virus in British Columbia // J Gen Virol. -V. 86.-P. 727-731.

288. Pasma T., Joseph T., 2010. Pandemic (H1N1) 2009 infection in swine herds, Manitoba, Canada // Emerg Infect Dis. V. 16. - P. 706 - 708.

289. Pauli E.K., et al., 2008. Influenza A virus inhibits type I IFN signaling via NF-kappaB-dependent induction of SOCS-3 expression // PLoS Pathog. -V. 4. P. el000196.

290. Pearce M.B., et al., 2012. Pathogenesis and transmission of swine origin A(H3N2)v influenza viruses in ferrets // Proc Natl Acad Sci USA. -V. 109. P. 3944 - 3949.

291. Peiris J. S. M., et al., 2004. Re-emergence of fatal human influenza A subtype H5N1 disease // Lancet. V. 363. - P. 617 - 619.

292. Peiris J.S., et al., 2001. Cocirculation of avian H9N2 and contemporary «human» H3N2 influenza A viruses in pigs in southeastern China: potential for genetic reassortment? // J Virol. V. 75. - P. 9679 - 9686.

293. Peiris M., et al., 1999. Human infection with influenza H9N2 // Lancet. -V. 354.-P. 916-917.

294. Pereda A., et al., 2010. Pandemic (H1N1) 2009 outbreak on pig farm, Argentina // Emerg Infect Dis. V. 16. - P. 304 - 307.

295. Pinto L.H., et al., 1992. Influenza-virus M2 protein has ion channel activity // Cell. V. 69, Issue: 3. - P. 517 - 528.

296. Plakokefalos E.T., et al., 2001. Molecular and phylogenetic analysis of hae-magglutinin and neuraminidase sequences from recent human influenza type A (H3N2) viral isolates in Southern Greece // Arch. Virol. V. 146. - P. 1899- 1918.

297. Plotch S.J., et al., 1981. A unique cap(m7GpppXm)-dependent influenza virion endonuclease cleaves capped RNAs to generate the primers that initiate viral RNA transcription // Cell. V. 23. - P. 847 - 858.

298. Presland R.B., Jurevic R.J., 2002. Making sense of the epithelial barrier: what molecular biology and genetics tell us about the functions of oral mucosal and epidermal tissues // J. Dent. Educ. V. 66. - P. 564 - 574.

299. Puzelli S., et al., 2010. Transmission of hemagglutinin D222G mutant strain of pandemic (HIN 1)2009 virus // Emerg InfectDis. V. 16(5). - P. 863 -865.

300. Pyle G.F., 1986. The Diffusion of Influenza: Patterns and Paradigms. New Jersey: Rowan & Littlefield.

301. Qureshi S.T., Medzhitov R., 2003. Toll-like receptors and their role in experimental models of microbial infection // Genes. Immun. V. 4. - P. 87 -94.

302. Racaniello V., 2009. http://www.virology.ws/2009/05/04 influenza virus. Columbia University Medical Center.

303. Randall R.E., Goodbourn S., 2008. Interferons and viruses: an interplay between induction, signalling, antiviral responses and virus countermeasures // J Gen Virol. V. 89. - P. 1 - 47.

304. Reed L.J., Muench H., 1938. A simple method of estimating fifty per cent end points // Am J Hyg. V. 27. - P.493 - 497.

305. Reichert T., et al., 2010. Does Glycosylation as a modifier of Original Antigenic Sin explain the case age distribution and unusual toxicity in pandemic novel H1N1 influenza? // BMC Infectious Diseases. V. 10. - P. 1 - 9.

306. Reid A.H., Taubenberger J.K., 2003. The origin of the 1918 pandemic influenza virus: a continuing enigma // Journal of General Virology. V. 84. - P. 2285 - 2292.

307. Renegar K.B., et al., 2004. Role of IgA versus IgG in the control of influenza viral infection in the murine respiratory tract// J Immunol. V. 173. — P. 1978- 1986.

308. Richardson J.C., Akkina R.K., 1991. NS2 protein of influenza virus is found in purified virus and phosphorylated in infected cells // Arch. Virol. V. 116.-P. 69-80.

309. Rimmelzwaan G.F., et al., 2009. Influenza virus CTL epitopes, remarkably conserved and remarkably variable // Vaccine. V. 27. - P. 6363 - 6365.

310. Rizzo C., 2007. Trends for influenza-related deaths during pandemic and epidemic seasons, Italy, 1969 2001 // Emerg Infect Dis. - V. 13. - P. 694 -699.

311. Roberts G.T., Roberts J.T., 1976. Postsplenectomy sepsis due to influenzal viremia and pneumococcemia // Can Med Assoc J. V. 115. - P. 435 - 437.

312. Rocchi G., et al., 1974. Epidemiological evaluation of influenza in Italy // Bull World Health Organ. V. 50. - P. 401 - 406.

313. Rogers G.N., Paulson J.C., 1983. Receptor determinants of human and animal influenza virus isolates: Differences in receptor specificity of the H3 hemagglutinin based on species of origin// Virology. V. 127. - P. 361 -373.

314. Rohm C., et al., 1996. Characterization of a novel influenza hemagglutinin, HI5: criteria for determination of influenza A subtypes// Virology.-V. 217. P. 508-516.

315. Rothberg M.B., Haessler S.D., 2010. Complications of seasonal and pandemic influenza // Crit Care Med. V. 38. - P. e91 - 97.

316. Rudneva I., et al., 2012. Escape mutants of pandemic influenza A/H1N1 2009 virus: variations in antigenic specificity and receptor affinity of the hemagglutinin // Virus Res. V. 166(1 - 2). - P. 61 - 67.

317. Saitou N., Nei M., 1987. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees // Mol Biol Evol. V. 4(4). - P. 406 - 425.

318. Sandbulte M.R., et al., 2007. Cross-reactive neuraminidase antibodies afford partial protection against H5N1 in mice and are present in unexposed humans // PLoS Med. V. 4. - P. e59.

319. Schanzer D.L., et al., 2007. Influenza-attributable deaths, Canada 19901999 // Epidemiol Infect. V. 135. - P. 1109 - 1116.

320. Schmitz N., et al., 2005. Interleukin-1 is responsible for acute lung immuno-pathology but increases survival of respiratory influenza virus infection // J Virol. V. 79. - P. 6441 - 6448.

321. Scholtissek C., et al., 1978. Genetic relatedness between the new 1977 epidemic strains (H1N1) of influenza and human influenza strains isolated between 1947 and 1957 (H1N1) // Virology. V. 89. - P. 613 - 617.

322. Scholtissek C., et al., 1978. On the origin of the human influenza virus subtype H2N2 and H3N2 // Virology. V. 87. - P. 13 - 20.

323. Schultz U., et al., 1991. Evolution of pig influenza viruses// Virology.-V. 183.-P. 61-73.

324. Serfling R., 1963. Methods for current statistical analysis of excess pneumonia-influenza deaths // Public Health Rep. V. 78. - P. 494 - 506.

325. Sha Q., et al., 2004. Activation of Airway Epithelial Cells by Toll-Like Receptor Agonists // Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. V. 31. - P. 358 - 364.

326. Shapiro G.I., et al., 1987. Influenza virus gene expression: control mechanisms at early and late times of infection and nuclear-cytoplasmic transport of virus-specific RNAs // J. Virol. V. 61. - P. 764 - 773.

327. Sharshov K., et al., 2009. Avian influenza (H5N1) outbreak among wild birds, Russia // Emerg Infect Dis. V. 16(2). - P. 349 - 351.

328. Shaw M.W., et al., 2002. Reappearance and global spread of variants of influenza B/Victoria/2/87 lineage viruses in the 2000 2001 and 2001 - 2002 seasons // Virology. - V. 303. - P. 1 - 8.

329. Shen J., et al., 2009. Evolutionary trends of A(H1N1) influenza virus hemagglutinin since 1918 // PLoS One. V. 4. - P. e7789.

330. Shi L., et al., 1995. Influenza A Virus RNA Polymerase Subunit PB2 Is the Endonuclease Which Cleaves Host Cell mRNA and Functions Only as the Trimeric Enzyme // Virology. V. 208. - P. 38 - 47.

331. Shinya K., et al., 2006. Influenza virus receptors in the human airway // Nature. V. 440. - P. 435 - 436.

332. Shortridge K.F., et al., 1977. Persistence of Hong Kong influenza virus variants in pigs // Science. V. 196. - P. 1454 - 1455.

333. Shortridge K.F., et al., 1998. Characterization of avian H5N1 influenza viruses from poultry in Hong Kong // Virology. V. 252. - P. 331 - 342.

334. Simonsen L., et al., 2005. Impact of influenza vaccination on seasonal mortality in the US elderly population // Arch Intern Med. V. 165. - P. 265 -272.

335. Sivay M.V., et al., 2012. Surveillance of influenza A virus in wild birds in the Asian portion of Russia in 2008 // Avian Dis. V. 56(3). - P. 456 - 463.

336. Sivay M.V., et al., 2013. Influenza A (H15N4) Virus Isolation in Western Siberia, Russia // J Virol. V. 87(6). - P. 3578 - 3582.

337. Skehel J.J., Wiley D.C., 2000. Receptor binding and membrane fusion in virus entry: the influenza hemagglutinin // Annu Rev Biochem. V. 69. -P. 531 -569.

338. Skowronski D.M., et al., 2013. H3N2v and Other Influenza Epidemic Risk Based on Age-Specific Estimates of Sero-Protection and Contact Network Interactions // PLOS ONE. V. 8(1). - e54015.

339. Smith G.J., et al., 2009a. Dating the emergence of pandemic influenza viruses // Proc Natl Acad Sci U S A. V. 06. - P. 11709 - 11712.

340. Smith G.J., et al., 2009b. Origins and evolutionary genomics of the 2009 swine-origin H1N1 influenza A epidemic// Nature. V. 459. - P. 11221125.

341. Smith G.L., et al., 1987. Synthesis and cellular location of the ten influenza polypeptides individually expressed by recombinant vaccinia viruses // Virology. V. 160. - P. 336 - 345.

342. Song M.S., et al., 2010. Evidence of human-to-swine transmission of the pandemic (H1N1) 2009 influenza virus in South Korea // J Clin Microbiol. -V. 48.-P. 3204-3211.

343. Spicer C.C., 1979. The mathematical modelling of influenza epidemics // Br Med Bull. V. 35. - P. 23 - 28.

344. Spicer C.C., Lawrence C.J., 1984. Epidemic influenza in Greater London // J Hyg (Lond). V. 93. - P. 105 - 112.

345. Sreta D., et al., 2010. Pandemic (H1N1) 2009 virus on commercial swine farm, Thailand // Emerg Infect Dis 16. P. 1587 - 1590.

346. Stambas J., et al., 2008. Killer T cells in influenza // Pharmacol Ther. V. 120.-P. 186- 196.

347. Stanley E.D., Jackson G.G., 1966 // Viremia in Asian influenza. Trans Assoc Am Physicians. V. 79. - P. 376 - 387.

348. Starick E., et al., 2011. Reassorted pandemic (H1N1) 2009 influenza A virus discovered from pigs in Germany // J Gen Virol. V. 92. - P. 1184 - 1188.

349. Steinhauer D.A., 1999. Role of hemagglutinin cleavage for the pathogenicity of influenza virus // Virology. V. 258. - P. 1 - 20.

350. Stieneke-Groeber A., et al., 1992. Influenza virus hemagglutinin with multibasic cleavage site is activated by furin, a subtilisin-like endoprotease // EMBO J.-V. 11.-P. 2407-2414.

351. Stroup D.F., et al., 1988. Application of multiple time series analysis to the estimation of pneumonia and influenza mortality by age 1962 1983 // Stat Med.-V. 7.-P. 1045- 1059.

352. Sturm-Ramirez K.M., et al., 2004. Reemerging H5N1 influenza viruses in Hong Kong in 2002 are highly pathogenic to ducks // J Virol. V. 78(9). -P. 4892-4901.

353. Suarez D.L., et al., 2004. Recombination resulting in virulence shift in avian influenza outbreak, Chile // Emerg Infect Dis. V. 10. - P. 693 - 699.

354. Subbarao E.K., et al., 1993. A single amino acid in the PB2 gene of influenza A virus is a determinant of host range // J Virol. V. 67. - P. 1761 -1764.

355. Subbarao K., et al., 1998. Characterization of an avian influenza A (H5N1) virus isolated from a child with a fatal respiratory illness // Science. -V. 279.-P. 393-396.

356. Sun S., et al., 2011. glycosylation site alteration in the evolution of influenza A (H1N1) viruses // PLoS ONE. V. 6, № 7. - e22844.

357. Takeda K., et al., 2003. Toll-like receptors // Annu. Rev. Immunol. -V. 21.-P. 335-376.

358. Tarendeau F., et al., 2007. Structure and nuclear import function of the C-terminal domain of influenza virus polymerase PB2 subunit. Nat Struct Mol Biol. V. 14.-P. 229-233.

359. Tateno I., et al., 1966. Diverse immunocytologic findings of nasal smears in influenza // N Engl J Med. V. 274. - P. 237 - 242.

360. Taubenberger J.K., et al., 2005. Characterization of the 1918 influenza virus polymerase genes // Nature. V. 437. - P. 889 - 893.377.378.379.380.381.382.383.384,385386387388389390391392393

361. Taubenberger J.K., et al., 2006. Molecular virology: was the 1918 pandemic caused by a bird flu? (Reply) // Nature. V. 440. - P. E9 - 10.

362. Taubenberger J.K., Morens D.M., 2006. 1918 influenza: the mother of all pandemics // Emerg Infect Dis. V. 12. - P. 15 - 22.

363. Taubenberger J.K., Morens D.M., 2008. The pathology of influenza virus infections // Annu Rev Pathol 2008. V. 3. - P. 499 - 522.

364. Taylor H.R., Turner A.J., 1977. A case report of fowl plague keratoconjunctivitis // Br J Ophthalmol 1977. V. 61. - P. 86 - 88.

365. Thompson W.R., 1947. Use of moving averages and interpolation to estimate median-effective dose; fundamental formulas, estimation of error, and relation to other methods // Bacteriol Rev. V. 11(2). - P. 115 - 145.

366. Thompson W.W., et al., 2003. Mortality associated with influenza and respiratory syncytial virus in the United States // JAMA. V. 289. - P. 179 -186.

367. Thompson W.W., et al., 2004. Influenza-associated hospitalizations in the United States // JAMA. V. 292. - P. 1333 - 1340.

368. Tong S., et al., 2012. A distinct lineage of influenza A virus from bats // Proc Natl Acad Sci U S A. V. 109, № 11. - P. 4269 - 4274.

369. Treanor J., 2004. Influenza vaccine outmaneuvering antigenic shift and drift // New England Journal of Medicine. - V. 350. - P. 218 - 220.

370. Tsai H.-P., et al., 2006. Increasing Appearance of Reassortant Influenza B Virus in Taiwan from 2002 to 2005 // Journal of Clinical Microbiology. -V. 44, No. 8.-P. 2705-2713.

371. Tumpey T.M., et al., 2005. Characterization of the reconstructed 1918 Spanish influenza pandemic virus // Science. V. 310. - P. 77 - 80.

372. Tweed S.A., et al., 2004. Human illness from avian influenza H7N3, British Columbia // Emerg Infect Dis. V. 10. - P. 2196 - 2199.

373. Varghese J.N., et al., 1983. Structure of the influenza virus glycoprotein antigen neuraminidase at 2.9 A resolution // Nature. V. 303. P. 35 - 40.246

374. Varich N.L., et al., 2011. Antibody-binding epitope differences in the nucle-oprotein of avian and mammalian influenza A viruses // Viral Immunol. -V. 24(2).-P. 101 107.

375. Vasselon T., Detmers P.A., 2002. Toll Receptors: a Central Element in Innate Immune Responses // Infect. Immun. V. 70, № 3. - P. 1033- 1041.

376. Verel D., et al., 1976. Observations on the A2 England influenza epidemic: a clinicopathological study // Am Heart J. V. 92. - P. 290 - 296.

377. Vestbo J., 2002. Epidemiological studies in mucus hypersecretion // Novar-tis Found Symp. V. 248. - P. 277 - 282.

378. Viboud C., et al., 2004. Influenza epidemics in the United States, France, and Australia, 1972 1997 // Emerg Infect Dis. - V. 10. - P. 32 - 39.

379. Viboud C., et al., 2005. Multinational impact of the 1968 Hong Kong influenza pandemic: evidence for a smoldering pandemic // J Infect Dis. V. 192.-P. 233-248.

380. Viboud C., et al., 2006a. 1951 influenza epidemic, England and Wales, Canada, and the United States // Emerg Infect Dis. V. 12. - P. 661 - 668.

381. Viboud C., et al., 2006b. Transmissibility and mortality impact of epidemic and pandemic influenza, with emphasis on the unusually deadly 1951 epidemic // Vaccine. V. 24. - P. 6701 - 6707.

382. Vigerust D.J., Shepherd V.L., 2007. Virus glycosylation: role in virulence and immune interactions // Trends Microbiol. V. 15.-P.211-218.

383. Vijaykrishna D., et al., 2010. Reassortment of pandemic H1N1/2009 influenza A virus in swine // Science. V. 328. - P. 1529.

384. Viriyakosol S., et al., 2000. Structure-function analysis of CD14 as a soluble receptor for lipopolysaccharide // J. Biol. Chem. V. 275. - P. 3144 - 3149.

385. Virus taxonomy : classification and nomenclature of viruses : ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, 2012 / Ed. King A. et al; International Committee on Taxonomy of Viruses. London : Academic Press. 1327 p.

386. Visintin A., et al., 2001. Regulation of Toll-like receptors in human monocytes and dendritic cells // J. Immunol. V. 166. - P. 249 - 255.

387. Visintin A., et al., 2003. Golenbock Lysines 128 and 132 enable LPS binding to MD-2, leading to Toll-like receptor 4 aggregation and signal transduction // J. Biol. Chem. V. 278. - P. 48313 - 48320.

388. Vong S., et al., 2009. Risk Factors Associated with Subclinical Human Infection with Avian Influenza A (H5N1) Virus- Cambodia, 2006 // Journal of Infectious Diseases. V. 199. - P. 1744 - 1752.

389. Waalen К., et al., 2012. Agedependent prevalence of antibodies cross-reactive to the influenza A(H3N2) variant virus in sera collected in Norway in 2011 // Euro Surveill. V. 17(19). - pii: 20170.

390. Wan H., et al., 2008. Replication and transmission of H9N2 influenza viruses in ferrets: Evaluation of pandemic potential // PLoS One. V. 3, № 8. -P. e2923.

391. Wan H., Perez D.R., 2007. Amino acid 226 in the hemagglutinin of H9N2 influenza viruses etermines cell tropism and replication in human airway epithelial cells // J Virol. V. 81, № 10. - P. 5181 - 5191.

392. Ware L.B., Matthay M.A., 2000. The acute respiratory distress syndrome // N Engl J Med. V. 342. - P. 1334 - 1349.

393. Webster R.G., et al. (eds.), 2011. The Origin and Evolution of H1N1 Pandemic Influenza Viruses Influenza Vaccines for the Future, 2nd edition, Springer Basel AG Part 1, P. 77 93.

394. Webster R.G., et al., 1981. Characterization of an influenza A virus from seals // Virology. V. 113. - P. 712 - 724.

395. Webster R.G., et al., 1992. Evolution and Ecology of Influenza A Viruses // Microbiological Reviews. V. 56, No.l. - P. 152 - 179.

396. Weingartl H.M., et al., 2010. Genetic and pathobiologic characterization of pandemic H1N1 2009 influenza viruses from a naturally infected swine herd // J Virol. V. 84. - P. 2245 - 2256.

397. Werling D., Jungi T.W., 2003. Toll-like receptors linking innate and adaptive immune response // Vet. Immunol. Immunopathol. V. 91. - P. 1-12.

398. Wessler I., Kirkpatrick C.J., 1999. Airway epithelium: More than just a barrier // Trends Pharmacol. Sci. V. 20. - P. 52 - 53.

399. Whitsett J.A., 2002. Series Introduction: Intrinsic and innate defenses in the lung: intersection of pathways regulating lung morphogenesis, host defense, and repair // J. Clin. Invest. V. 109, № 5. - P. 565 - 569.

400. WHO, 2009. World now at the start of 2009 influenza pandemic. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/mediacentre/news/statements/2009/hlnlpandemicpha se620090611/en/index.html (Дата обращения: 19.10.2012).

401. WHO, 2010а. Recommendations for Influenza Vaccines. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/csr/disease/influenza/vaccinerecommendations/en/index .html (Дата обращения: 19.10.2012).

402. WHO, 2010b. Preliminary review of D222G aminoacid substitution in the haemagglutinin of pandemic influenza A (H1N1) 2009 viruses. Wkly Epidemiol Rec. V. 85, № 4. - P. 21 - 22.

403. WHO, 2010c. H1N1 in post-pandemic period. Электронный ресурс. -Режим доступа: http ://www. who.int/mediacentre/news/statements/2010/h 1 n 1 vpc2010081 0/en/index.html (Дата обращения: 19.10.2012).

404. WHO, 2010d. What is apandemic? 24 February 2010. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/csr/disease/swineflu/frequentlyaskedquestions/pande mic/en/index.html (Дата обращения: 19.10.2012).

405. WHO, 2010е. Pandemic (H1N1) 2009. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/csr/don/20100115/en/ (Дата обращения: 19.10.2012).

406. WHO, 2011. Outbreak news// Weekly epidemiological record.- V. 86(22). P. 221 - 232.

407. WHO, 2012b. Influenza update. Электронный ресурс. Режим доступа: http://www.who.int/influenza/surveillancemonitoring/updates/latestupdate GIPsurveillance/en/ (Дата обращения: 19.10.2012).

408. Wijkstrom-Frei С., et al., 2003. Lactoperoxidase and Human Airway Host Defense // Am. J. Respir. Cell Mol. Biol. V. 29, № 2. - P. 206 - 212.

409. Wiley D.C., Skehel J.J., 1987. The structure and function of the hemagglutinin membrane glycoprotein of influenza virus // Annu Rev Biochem. -V. 56.-P. 365-394.

410. Wilson I.A., Cox N.J., 1990. Structural basis of immune recognition of influenza virus hemagglutinin // Annu Rev Immunol. V. 8. - P. 737 - 771.

411. Wise H.M., et al., 2009. A complicated message: Identification of a novel PB1-related protein translated from influenza A virus segment 2 mRNA // J. Virol. V. 83, № 16. - P. 8021 - 8031.

412. Wolf Y.I., et al., 2006. Long intervals of stasis punctuated by bursts of positive selection in the seasonal evolution of influenza A virus // Biology Direct.-V. l.-P. 34.

413. Wrammert J., et al., 2011. Broadly cross-reactive antibodies dominate the human В cell response against 2009 pandemic H1N1 influenza virus infection // J. Exp. Med. V. 208. - P. 181 - 193.

414. Wright P.F., et al., 2007. Orthomyxoviruses// In: Knipe, DM.; Howley, PM., editors. Fields virology. V. 5th ed. Philadelphia: Wolters Kluwer Health/Lippincott, Williams and Wilkins; p. 1691 - 1740.

415. Xie Y., et al., 2011. The Medicinal Potential of Influenza Virus Surface Proteins: Hemagglutinin and Neuraminidase // Current Medicinal Chemistry. -V. 18.-P. 1050- 1066.

416. Xu J., et al., 2012. Evolutionary history and phylodynamics of influenza A and B neuraminidase (NA) genes inferred from large-scale sequence analyses // PLoS One. 2012. - V. 7(7). - e38665.

417. Xu R., et al., 2010. Structural basis of preexisting immunity to the 2009 H1N1 pandemic influenza virus // Science. V. 328. - P. 357 - 360.

418. Xu X., et al., 1993. Genetic reassortment of human influenza virus in nature // In: Hannoun C., Kendal A.P., Klenk H.D., Rudenko L.G. (Eds.), Options for the Control of Influenza. V. II. Elsevier, Amsterdam, The Netherlands. - P. 203 - 207.

419. Xu X., et al., 2002. Intercontinental circulation of human influenza A(H1N2) reassortant viruses during the 2001 2002 influenza season// J. Infect. Dis.-V. 186.-P. 490-493.

420. Yamamoto M., et al., 2004. TIR domain-containing adaptors define the specificity of TLR signaling // Mol. Immunol. V. 40. - P. 861 - 868.

421. Yang H., et al., 2010. Structure and Receptor binding properties of a pandemic H1N1 virus hemagglutinin // PLoS Curr Mar 22. P. RRN1152.

422. Yasuda J., et al., 1993. Molecular assembly of influenza virus: association of the NS2 protein with virion matrix // Virology. V. 196. - P. 249 - 255.

423. Yewdell J.W., Bennink J.R., 1999. Immunodominance in major histocompatibility complex class I-restricted T lymphocyte responses // Annu Rev Immunol. V. 17. - P. 51 - 88.

424. Yoneyama M., et al., 2004. The RNA helicase RIG-I has an essential function in double-stranded RNA-induced innate antiviral responses // Nat. Immunol.-V. 5.-P. 730-737.

425. Yoneyama M., Fujita T., 2009. RNA recognition and signal transduction by RIG-I-like receptors // Immunol Rev. V. 227. - P. 54 - 65.

426. Young J.F., Palese P., 1979. Evolution of human influenza A viruses in nature: recombination contributes to genetic variation of H1N1 strains // Proc. Natl. Acad. Sci. V. 76. - P. 6547 - 6551.

427. Young L.J., et al., 2007. Dendritic cell preactivation impairs MHC class II presentation of vaccines and endogenous viral antigens // Proc Natl Acad Sci U S A. V. 104. - P. 17753 - 17758.

428. Yu F.-S.X., Hazlett L.D., 2006. Toll-like Receptors and the Eye // IOVS. -V.47.-P. 1255- 1263.

429. Zebedee S.L., Lamb R.A., 1988. Influenza a virus m2-protein monoclonal-antibody restriction of virus growth and detection of m2 in virions // Journal of Virology. - V. 62 Issue: 8. - P. 2762 - 2772.

430. Zhang D., et al., 2004. A toll-like receptor that prevents infection by uro-pathogenic bacteria // Science. V. 303. - P. 1522 - 1526.

431. Zhang J., et al., 2000. The cytoplasmic tails of the influenza virus spike glycoproteins are required for normal genome packaging // Virology. -V. 269. P. 325 - 334.

432. Zhou N.N., et al., 1999. Genetic reassortment of avian, swine, and human influenza A viruses in American pigs // J Virol. V. 73. - P. 8851 - 8856.

433. Zhu H., et al., 2011. Novel reassortment of Eurasian avian-like and pandemic/2009 influenza viruses in swine: infectious potential for humans // J Virol. V. 85. - P. 10432 - 10439.