Нематоды подсемейства Ostertagiinae Lopez-Neyra, 1947: систематика и филогения тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.11, кандидат биологических наук Аксёнов, Антон Павлович

  • Аксёнов, Антон Павлович
  • кандидат биологических науккандидат биологических наук
  • 2013, Москва
  • Специальность ВАК РФ03.02.11
  • Количество страниц 175
Аксёнов, Антон Павлович. Нематоды подсемейства Ostertagiinae Lopez-Neyra, 1947: систематика и филогения: дис. кандидат биологических наук: 03.02.11 - Паразитология. Москва. 2013. 175 с.

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Аксёнов, Антон Павлович

Введение

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Классическая систематика нематод подсемейства Оз1е11:

§ипае ^ ^ Ьорег-Ыеуга, 1947 основанная на морфологических признаках

1.2. Экологические особенности нематод подсемейства С^е^^ппае: 21 жизненные циклы и гостальная специфичность

13 Гельминтофауна северного оленя ^ 4 Гельминтофауна козы

1.5. Использование методов молекулярной таксономии и ^ филогении в изучении трихостронгилид

1.5.1. Молекулярные данные и проблема генетических идентичных минорных и мажорных форм у трихостронгилид

1.5.2. Молекулярные данные и вопросы популяционной структуры 35 трихостронигид

1.5.3. Филогенетические отношения нематод подсемейства ^ Оз1е11:

§ппае (Ш1аЬс1Шс1а, Эггог^уЫёеа) по результатам молекулярно-филогенетического анализа

1.5.4. Разнообразие гаплотипов рибосомальной ДНК у 41 трихостронгилид (Тпс1"1051:го

§у1о1с1еа, Ш1аЬс1Шс1а)

Глава 2. Материалы и методы

2.1. Изучение таксономического состава нематод

2.2. Изучение тонкой морфологии поверхности нематод

2.3. Молекулярные методы

2.3.1. Выделение ДНК

2.3.1.1. Выделение ДНК при помощи набора фирмы «Ргогг^а»

2.3.1.2. Протеиназный метод

2.3.1.3. Выделение ДНК с использованием раствора содержащего ИаОН

2.3.1.4. Выделение ДНК по методу Холтермана

2.3.2. Проведение ПЦР

2.3.3. Визуализация результатов ПЦР

2.3.4. Очистка ДНК

2.3.5. Метод векторного клонирования

Глава 3. Полученные результаты

Таксономический состав нематод от разных хозяев

3.1.1. Видовой состав нематод сычуга и тонкого кишечника северных оленей горной тундры (Момский район) республики Саха

Якутия)

3.1.2. Видовой состав нематод сычуга и тонкого кишечника северных оленей равнинной тайги (Алданский район) республики Саха (Якутия)

3.1.3. Видовой состав нематод сычуга и тонкого кишечника северных оленей полуострова Ямал

3.1.4. Видовой состав нематод сычуга и тонкого кишечника домашних 5] коз Кировской области

3.1.5. Соотношение полов в популяциях нематод коз Кировской 52 области

3.1.6. Видовой состав нематод сычуга и тонкого кишечника домашних 53 коз Восточной Монголии

3.2. Результаты исследования морфологии остертагиин и некоторых ^ других трихостронгилоидей

3.2.1. Ostertagia ostertagi Stiles,

3.2.2. Ostertagia lyrata Sjoberg,

IT! /--»/Т7 /~i J s~> f/т iOT/*i 4 l/i4iahin I Ll /U Ail

J . VyOtCUUglCi gf МК^Г 11KZ-! I UlVlJCAUiii, i SA-У O^

3.2.4. Ostertagia arctica Mitzkewitsh,

3.2.5. Ostertagia antipini Matschulski,

3.2.6. Marshailagia mongolica Schumakovith,

3.2.7. Teladorsagia circumcincta (Stadelmann, 1894), Ransom,

3.2.8. Orloffia bisonis Chapin,

3.2.9. Orloffia kasakhstanica Dikov et Nekipelova,

3.2.10. Mazamastrongylus dagestanica (Altaev, 1953) Jansen,

3.2.11. Graphidium strigosum Railliet et Henry,

3.2.12. Haemonchus contortus (Rudolphi, 1803) Cobb,

3.2.13. Trichostrongylus probolurus (Railliet, 1896)Looss,

3.2.14. Trichostrongylus colubriformis Giles,

3.2.15. Cooperiapunctata (Linstow, 1906) Ransom,

3.2.16. Nematodirus helvetianus May, 1920 ГГ

Результаты исследования участков рибосомальной и митохондриальной ДНК нематод подсемейства Оз1е11^ппае и 114 других родственных подсемейств

3.3.1. Результаты исследования ITS участка рибосомальной ДНК у различных нематод подсемейства Ostertagiinae

3.3.2. Результаты исследования COI участка митохондриальной ДНК у \23 различных нематод подсемейства Ostertagiinae

3.3.3. Результаты исследования ITS участка рибосомальной ДНК у 129 различных гаплотипов нематоды Haemonchus contortus

Глава 4. Обсуждение результатов исследований

4. i. Таксономический состав нематод сычуга и кишечника северного 139 оленя

4.2. Таксономический состав нематод сычуга и кишечника коз

4.3. Тонкая морфология поверхности нематод нематод подсемейства 143 Ostertagiinae и некоторых других трихостронгилоидей.

4.4. Филогенетические отношения нематод подсемейства Ostertagiinae по результатам анализа ITS участка рибосомальной 148 ДНК

4.4. Филогенетические отношения нематод подсемейства ^^

Ostertagiinae по результатам анализа COI участка митохондриальной ДНК

4.6. Полиморфизм ITS участка рибосомальной ДНК нематоды

Haemonchus contortus

Выводы ^^

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Паразитология», 03.02.11 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Нематоды подсемейства Ostertagiinae Lopez-Neyra, 1947: систематика и филогения»

Актуальность темы: Нематоды подсемейства Ostertagiinae - это представители многочисленной группы паразитических стронгилидных, произошедшей от свободноживущих форм семейства Rhabditidae, существующего в настоящее время (Sudhaus, Fitch, 2001). Изучение этой группы нематод позволит внести вклад в исследования по возникновению и эволюции паразитизма. Нематоды этой группы паразитируют у различных млекопитающих, в том числе у жвачных животных. Они зарегистрированы в большинстве географических зон. При высоких показателях зараженности паразитирование остертагиин оказывает отрицательное воздействие на жизнедеятельность домашних животных, что указывает на социально-экономическую важность изучения этих паразитов (Fox, 1997). Наибольшее внимание исследователей привлекают представители родов Ostertagia Ransom, 1907; Marshallagia (Orloff, 1933), Travassos, 1937; Teladorsagia Andreeva et Satubaldin, 1954; Orloffia Drozdz, 1965 паразитирующие у домашних и диких жвачных. В США ущерб, причиняемый скотоводству этими нематодами, превышает $ 2 ООО ООО ООО в год (Zarlenga et al., 2001). Кроме этого, нематоды этого подсемейства иногда паразитируют у человека. В России и сопредельных государствах обнаруживали виды Ostertagia ostertagi Stiles, 1892 и Teladorsagia circumcincta Stadelman, 1894 (Асадов, 1960).

Относительно подробные данные по фауне нематод подсемейства Ostertagiinae имеются лишь для некоторых регионов и небольшого числа видов жвачных (крупный рогатый скот, овцы, благородные олени, лоси). Со времени опубликования этих работ (Асадов, 1960; Прядко, 1976; Говорка, 1988) численное соотношение разных видов жвачных во многих регионах изменилось, что должно было повлиять и на состав фауны паразитов (Говорка и др., 1988).

В последние годы, в связи с сокращением поголовья домашних жвачных, снизилась интенсивность обмена паразитами между домашними и дикими жвачными, что привело к изменению состава фауны паразитов. Интродуцирование новых для данных географических регионов видов жвачных сопровождается проникновением новых для этих территорий паразитов (Говорка и др., 1988).

Наряду с практической значимостью, изучение этих нематод методами молекулярной филогении, представляет собой актуальную фундаментальную задачу (Корсуненко, 2010). Так, Чилтон с соавторами (Chilton et al, 2006) провели анализ отряда Strongylida Railliet et Henry, 1913 на основе данных о строении участков 18S и 28S рибосомальной ДНК. Однако эти авторы отмечают, что остается ряд неразрешенных вопросов, в частности, касающихся подотряда Trichostrongylina, и требующих проверки с использованием данных о строении более вариабельных участков рибосомальной ДНК, таких, как ITS-1 и ITS-2. Кроме того, в настоящее время нет основанных на современных данных филогенетических деревьев, отражающих взаимоотношения в подсемействе Ostertagiinae (Chilton et al., 2006).

Ряд вопросов таксономии остертагиин на уровне родов и видов разработан недостаточно. Кроме того, известно, что для самцов некоторых родов этого подсемейства характерен диморфизм (Drozdz, 1965, 1995), однако попытки проверить это экспериментально были предприняты лишь для пяти из восемнадцати видов (Drozdz, 1965, 1995; Stevenson et al., 1996; Dallas et al., 2000 a, б; Кузнецов, 2009).

ДНК-исследования остертагиин (Zarlenga et al1998; Dallas et al., 2000; Chilton et al., 2001; Santin-Duran et al, 2002) позволили прояснить ряд общих вопросов филогении и частные вопросы систематики на родовом и видовом уровнях, в т.ч. подтвердить конспецифичность предполагаемых мажорных и минорных морфов для некоторых видов. Наряду с этим имеются виды, для которых эти вопросы так и остались неразрешёнными. Исследования рибосомальной и митохондриальной ДНК позволят разобраться в этой проблеме.

Ряд видов остертагиин (Ostertagia antïp'ml Matschulski, 1950, Mazamastrongylus dagestanica (Altaev, 1953) Jansen, 1986 и др.) широко распространены главным образом в России, данные о строении ДНК этих видов не учтены в фундаментальных исследованиях по филогении стронгилид (Chilton et al., 2006).

Для большинства видов остертагиин имеются лишь данные о строении коротких фрагментов рибосомальной ДНК (ITS-1, ITS-2) длиной порядка 240-260 п.н. (Zarlenga et al., 1998; Dallas et al., 2000; Santin-Duran et al., 2002).

Цель исследования:

Провести молекулярно-таксономическое изучение нематод подсемейства Ostertagiinae и провести анализ филогенетических взаимоотношений нематод этого подсемейства и родственных групп стронгилид.

Задачи исследований:

1. Провести морфологическое и молекулярно-таксономическое изучение остертагиин от разных хозяев.

2. Отработать методы выделения ДНК из массового материала и единичных особей, провести подбор праймеров и соответствующих программ проведения ПЦР.

3. Провести филогенетический анализ совокупности молекулярных и морфологических данных по нематодам подсемейства Ostertagiinae и родственным формам. Определить уровень внутривидовых и межвидовых нуклеотидных различий у остертагиин.

Положения, выносимые на защиту:

1. Использование в филогенетическом анализе полной последовательности рибосомальных спейсеров (ITS-1+5.8S+ITS-2) существенно повышает количество выявляемых нуклеотидных различий между видами остертагиин, и повышает уровень статистической поддержки отдельных ветвей в филогенетических деревьях.

2. Реконструкция филогении Ostertagiinae, основывающаяся на полном фрагменте рибосомальных спейсеров (ITS-1+5.8S+ITS-2) не подтверждает монофилию этого подсемейства. Его представители распадаются на две группы (Ostertagia, Marshallagia, Orloffia, Teladorsagia) и (Spiculopteragia,

Mazamastrongy[us\ Skrjabinagia, Graphidium) не показывающие тесного родства в пределах Trichostrongylidae.

3. Анализ нуклеотидных последовательностей рибосомальных спейсеров (ITS-1+5.8S+ITS-2) нематод Haemonchus contortus выявил новые, ранее не отмеченные, гаплотипы, а также гаплотипы описанные для этих нематод из различных регионов мира; позволил получить новые данные для выявления внутривидовых группировок и установления их взаимоотношений.

Научная новизна:

1. Впервые проведено исследование молекулярными методами трихостронгилид жвачных собранных в Якутии и на полуострове Ямал и получены данные по строению ITS региона рДН1< для двух видов трихостронгилид из Центральной России.

2. Получены молекулярные данные, характеризующие внутривидовой полиморфизм ITS-последовательностей трихостронгилид из России и Монголии.

3. Впервые с помощью сканирующей электронной микроскопии изучено два вида трихостронгилид.

4. В результате проведения филогенетического анализа определены взаимоотношения между родами подсемейства Osteilagiinae, выяснен уровень нуклеотидных различий между таксонами разного ранга.

Теоретическая и практическая значимость работы:

Теоретическая значимость исследования определяется важностью исследуемой группы (остертагиин и в целом стронгилид), как одной из наиболее успешных в эволюционном отношении групп паразитических нематод позвоночных. Остертагиины России и прилегающих территорий достаточно хорошо исследованы традиционными методами, однако их изученность молекулярно-генетическими методами все еще недостаточна для проведения полноценного анализа состава фауны и филогении этой группы. Использование комплекса морфологических и молекулярных признаков для реконструкции эволюционной истории трихостронгилид необходимо для построения естественной системы этих организмов, многие из которых являются возбудителями опасных заболеваний домашних и диких животных, чем определяется и практическая значимость проведенной работы.

Результаты работы могут быть использованы для видовой диагностики стронгилид, а также при разработке ветеринарных программ в различных учреждениях РАН и РАСХН соответвующего профиля (Центр паразитологии ИПЭЭ РАН, ВИГИС им. К.И.Скрябина, ветеринарные академии, институты, факультеты).

Личное участие автора в получении результатов: Диссертантом самостоятельно, без участия других лиц, получено 30 нуклеотидных последовательностей для 18 видов нематод (в основном Ostertagiinae, но также и родственных им форм семейства Trichostrongylidae). Также диссертантом самостоятельно получено 48 электроннограмм в сканирующем электронном микроскопе. Диссертантом единолично проведен анализ нуклеотидных данных, построены филогенетические деревья, проведено депонирование полученных последовательностей в международной базе данных. Также им самостоятельно проведен анализ имеющихся литературных данных (125 источников отечественной и зарубежной литературы), на основании которых составлен соответствующий обзор. Сбор материала по нематодам-остертагиинам и их первичное определение проводилось под руководством и при участии к.б.н. Д.Н. Кузнецова.

Апробация работы: Результаты исследования были представлены на научных конференциях «Теория и практика борьбы с инвазионными болезнями» (г. Москва, 2008; 2010 г.г.); на научно-практической конференции «Беккеровские чтения» (г. Волгоград, 2010г.); на международной научной конференции «Теоретические и практические проблемы паразитологии» (г. Москва, 2010г.); на межрегиональной научной конференции «Паразитологические исследования в Сибири и на Дальнем Востоке» (г. Новосибирск, 2009г.); на симпозиуме Российского общества нематодологов с международным участием «Нематоды естественных и трансформированных экосистем» (г. Петрозаводск, 2011г.); на международной научной конференции «Современные проблемы общей паразитологии» (г. Москва, 2012г.).

Публикации: По материалам диссертации опубликовано 11 научных работ, в том числе 3 статьи в изданиях, рекомендованных ВАК.

Похожие диссертационные работы по специальности «Паразитология», 03.02.11 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Паразитология», Аксёнов, Антон Павлович

Выводы

1. Применение для решения вопросов таксономии трихостронгилоидей совокупности молекулярных и морфологических признаков, в том числе полученных с помощью сканирующего электронного микроскопа, позволяет повысить достоверность реконструкции филогенетических отношений этих нематод, и приблизиться к построению естественной системы этого таксона, отражающей эволюционную историю данной группы паразитических нематод.

2. Использование полной последовательности ITS-участка рибосомальной , ДНК (ITS-1+ 5.8S+ ITS-2) дает дополнительные молекулярно-таксономические признаки (нуклеотидные различия) для дифференциации видов трихостронгилид, и повышает статистическую поддержку, а значит и надежность выделения основных эволюционных линий в пределах этого таксона.

3. Для большей части изученных родов остертагиин и других трихостронгилид наблюдается четкая граница между уровнем межродовых нуклеотидных различий и различиями между видами входящими в эти роды. В то же время, такого надежного разрыва в уровне нуклеотидной изменчивости между видами и между отдельными образцами, относящимися к одному виду, 1 (межпопуляционные различия) не выявлено. Существуют виды (например, Teladorsagia circumcincta), у которых различия по последовательностям ITS rDNA и COI mtDNA между отдельными популяциями (от разных хозяев и из разных регионов) превышают уровень межвидовых различий.

4. Для отдельных представителей подсемейства Ostertagiinae и некоторых видов семейства Trichostrongylidae свойственен значительный полиморфизм в последовательностях ITS-участка рибосомальной ДНК. У Haemonchus contortus геном одной особи может содержать до пяти гаплотипов различающихся по последовательности этого домена. Меньшее разнообразие гаплотипов было обнаружено у Marshallagia mongolica . При этом характер полиморфизма у этих нематод существенно отличается: у гемонхов он обеспечивается изменчивостью на уровне отдельных нуклеотидов (замены, делеции) тогда как у остертагий полиморфизм образуется за счет сравнительно небольшого количества довольно крупных вставок (от 90 до 500 пар нуклеотидов).

5. Филогенетический анализ взаимоотношений Trichostrongylidae и некоторых родственных форм использованных в качестве внешних групп показал, что исследованные нами роды подсемейства Ostertagiinae разделяются в полученных нами филограммах на две отдельные эволюционные линии: собственно остертагиин в составе родов Ostertagia, Marshallagia, Teladorsagia и Orloffia и представителей родов Mazamastrongylus, Spiculopteragia и Skrjabinagia, не показавших при различных методах анализа явного родства с первой группой. Таким образом, результаты анализа по данному домену могут рассматриваться как указание на полифилетический характер самого таксона Ostertagiinae (в понимании Дюре-Дессет и Шабо (1999).

6. Наложение морфологических признаков, традиционно используемых в систематике и таксономии трихостронгилид, на филогенетические деревья, построенные на основании анализа молекулярных данных, показывает, что для большей части выявленных эволюционных линий могут быть найдены синапоморфные признаки, в том числе и те, что были предложены в качестве наиболее существенных в последних ревизиях группы (Durette-Desset et al, 1999; Anderson et al, 2009). В то же время, не для всех терминальных таксонов - родов, в полученных нами филогенетических деревьях могут быть найдены надежные аутапоморфии.

7. Изучение тонкой морфологии поверхности остертагиин и родственных им форм в сканирующем электронном микроскопе позволило выявить дополнительные морфологические признаки. Особенности организации поверхности кутикулы (простая кольчатость без синлофа) оказываются в наших филограммах надежной аутапоморфией для рода Trichostrongylus. Особенности строения головного конца также могут быть поставлены в соответствие основным эволюционным линиям: так, треугольное ротовое отверстие с тремя губами у рода Trichostrongylus и наличие пузыревидных кутикулярных образований головы (cephalic vesicle) вкупе с треугольным ротовым отверстием у рода Cooperia, а также большое шестиугольное ротовое отверстие, для рода Haemonchus являются аутопоморфными признаками.

8. В целом использование для филогенетического анализа нуклеотидных последовательностей по таким изменчивым (быстро эволюционирующим последовательностям), как ITS rDNA и COI mtDNA позволяет получить достаточно данных для решения вопросов систематики Ostertagiinae и Trichostrongylidae на уровне видов и родов. Эти же данные оказываются информативными для выявления структуры вида трихостронгилид (полиморфзм, внутривидовые группировки, географичесская распространенность отдельных гаплотипов), но не позволяют определить внутренние узлы филогении группы с достаточным уровнем статистической поддержки.

9. Для определения большинства видов остертагиин достаточно применения прямого секвенирования ПБ-участка рибосомальной ДНК, что представляется достаточно дешевой и нетрудоемкой альтернативой или дополнением к морфологическому определению. В то же время, присущий некоторым видам трихостронгилид полиморфизм в нуклеотидных последовательностях вынуждает использовать более трудоемкие и дорогостоящие методы (клонирование).

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Аксёнов, Антон Павлович, 2013 год

1. Азимов Д.А. О видовой самостоятельности Ostertagia davtiani Grigorian, 1951 //Мат. науч. конф. ВОГ. М., 1964. 4.1. С. 12-14.

2. Алтаев А.Х. О видовой самостоятельности Trichostrongylus skrjabini Kalantarian, 1928 и Ostertagia davtiani Grigorian, 1951 // Тр. ГЕЛАН СССР, 1961. Т. XI. С. 5-9.

3. Андреева Н.К. О новых принципах систематики некоторых трихос-ронгилид (Ostertagiea) // Тр. II науч. конф. паразитологов УССР, 1956. С. 18-19.

4. Андреева Н.К. Ревизия Остертагией (Трихостронгелид) жвачных // Тр. ин-та вет. Казахского филиала ВАСХНИЛ, 1957. Т.8. С. 473-487.

5. Андреева Н.К. Структура спикул у трихостронгилид и их диагностическое значение // Сб. раб. по гельминтологии к 60-летию со дня рождения проф. P.C. Шульца. Алма-Ата: Казахское гос. изд-во, 1958. С. 577.

6. Асадов С.М. Гельминтофауна жвачных животных СССР и ее эколого-географический анализ. Баку: Изд. АН АзССР, 1960. 511с.

7. Багиров В.А., Кленовицкий П.М., Насибов Ш.Н. и др. Рациональное использование генетических ресурсов и гибридизация в козоводстве // Сельскохозяйственная биология. М., 2009. № 6. С. 27-33.

8. Гельминтозы жвачных животных / Под ред. проф. Е.Е. Шумаковича. М.: Колос, 1968. 392 с.

9. Говорка Я., Маклакова Л.П., Митух Я. и др. Гельминты диких копытных Восточной Европы. М.: Наука, 1988. 207с.

10. Ершов B.C. Работа пятьдесят седьмой союзной гельминтологической экспедиции в Вятской губернии. Вятка, 1929. С. 18-19.

11. Ершов B.C., Горшунова O.K., Малыгин С.А. Работа 142-й союзной гельминтологической экспедиции в Сунском районе Кировского края // Труды Кировского зоотехническо-ветеринарного института, 1935. Т. II. Вып. 1-2 (5-6).С. 159-160.

12. Закревский С.Р. Супрессивное влияние паразитов на пантовую продуктивность северных оленей: автореф. дис. канд. биол. наук: 03.00.19. Тюмень, 2007. 22 с.

13. Ивашкин В.М., Контримавичус В.Н., Назарова Н.С. Методы сбора и изучения гельминтов наземных млекопитающих. М.: Наука, 1971. 124 с.

14. Ивашкин В.М., Мухамадиев С. А. Определитель гельминтов крупного рогатого скота. М.: Наука, 1981. 259 с.

15. Ивашкин В.М., Орипов А. О., Сонин М. Д. Определитель гельминтов мелкого рогатого скота. М.: Наука, 1989. 254 с.

16. Исаков С.И. Гельминты и гельминтозы северных оленей Якутии и меры борьбы с ними. Якутск: Кн. изд-во респ. Саха (Якутия), 1992. 38 с.

17. Кеннеди К. Экологическая паразитология. М.: Мир, 1978. -230 с.

18. Клоков К.Б., Иернслеттен И.-Л. Устойчивое оленеводство // Арктический совет 2000-2002. Издание Центра саамских исследований Университета Тромсё, 2002-2003. 159 с.

19. Копырин A.B. Работы по гельминтологии // Сборник, посвящ. 30-летию науч. пед. и обществ, деятельности К.И. Скрябина и 15-летию Всесоюзн. ин-та гельминтол. М.: Изд. ВАСХНИЛ, 1937. С. 296-301.

20. Корсуненко A.B. Геномная вариабельность трематод (Trematoda) на стадии промежуточного хозяина моллюска: автореф. дис. канд. биол. наук: 03.00.19. М., 2010. 24 с.

21. Кузнецов Д.Н. К вопросу о количественном соотношении самцов и самок в популяциях трихострогелид // Мат. науч. конф. «Теория и практика борьбы с паразитарными болезнями». М., 2006а. С. 190-192.

22. Кузнецов Д.Н. Принципы и подходы к систематике нематод подсемейства Ostertagiinae Lopez-Neyra, 1947 (Nematoda: Trichostrongyloidea) // ' Тр. Всерос. ин-та гельминтологии. М., 20066. Т. 42. С. 163-173.

23. Кузнецов Д.Н. Таксономический анализ некоторых родов подсемейства Ostertagiinae (Nematoda,Trichostrongylidae)// Сб. Успехи общей паразитологии. М.: Наука, 2004. С. 164-202.

24. Кузнецов Д.Н. Методика дифференциации нематод подсемейства ' Ostertagiinae // Тр. Всерос. ин-та гельминтологии. 2006. Т. 43. С. 271-278.

25. Кузнецов Д.Н. Результаты сравнительного изучения спейсерных участков рибосомальной ДНК Teladorsagia circumcincta и Т. trifurcata (Nematoda: Ostertagiinae) // Российский паразитологический журнал. М., 2009. №. 2. С. 16-23.

26. Кузнецов Д.Н. Ультраструктура наружных покровов нематод-представителей подсемейства Ostertagiinae // Тр. Всерос. ин-та гельминтологии. 2002. Т.38. С.154-163.

27. Кузнецов Д.Н. Таксономическая ревизия рода Orlofßa (Nematoda: Ostertagiinae) по результатам исследований участков ITS-2 рибосомальной ДНК // Известия РАН: Серия Биологическая. М., 2011. № 6. С. 1-7.

28. Кузнецова Э.А. Полимеразная цепная реакция как один из методов генодиагностики // Тр. Всерос. ин-та гельминтологии. 2002. Т.38. С. 163-183.

29. Кузнецов Д.Н., Данзан Г., Батчимег М. и др. Нематоды жвачных Монголии возбудители гельминтозоонозов // Медицинская паразитология и паразитарные болезни. 2010. № 3. С. 38-39.

30. Кузнецов Д.Н., Данзан Г., Хрусталев A.B. и др. О таксономической структуре фауны нематод-паразитов сычуга и тонкого кишечника коз в Восточной Монголии // Мат. науч. конф. ВОГ. В.9. М., 2008а. С.248-250.

31. Кузнецов Д.Н., Данзан Г., Хрусталев A.B., Батчимег М., Уржинбямба Б.-О., Аксенов А.П., Есаулова Н.В. О видовом составе нематод сычуга и тонкого кишечника коз Восточной Монголии // Российский паразитологический журнал. М., 20086. №.2. С. 15-19.

32. Кузнецов Д.Н., Никулина H.A. Особенности геномной ДНК некоторых видов Ostertagiinae, выявленные с использованием ПЦР с164универсальными праймерами // Тр. Всерос. ин-та гельминтол. 2005. Т.41. С. 220-224.

33. Лайшев К.А, Самандас A.M., Марцеха Е.В., Федяев C.B. Основные гельминты пищеварительного тракта копытных животных // Вестник РАСХН. М., 2008. №5. С. 59-61.

34. Лещев М.В. Эпизоотология инвазионных болезней северных оленей в Ямало-Ненецком автономном округе: автореф. дис. канд. биол. наук: 03.00.19. Тюмень, 2008. 24 с.

35. Малыгин С.М., Исаева A.M. К вопросу эпизоотологии стронгилоидоза овец и коз // Труды Кировской областной ветеринарно-бактериологической лаборатории. Киров, 1940. Вып. И. С. 129-140.

36. Малыгин С.М., Исаева A.M., Гурженко Л.М. Распространение мюллериоза овец и коз в Кировской области // Труды Кировской областной ветеринарно-бактериологической лаборатории. Киров, 1940. Вып. II. С. 141144.

37. Мицкевич В.Ю. Гельминты северного оленя и вызываемые ими заболевания. Л.: Колос, 1967. 308 с.

38. Павлинов И.Я., Любарский Г.Ю. Биологическая систематика: эволюция идей. М.: Товарищество научных изданий КМК, 2011. 667 с.

39. Прядко Э.И. Гельминты оленей. Алма-Ата: Наука, 1976. 228 с.

40. Сафронов М.Г. Гельминты и гельминтозы животных Якутии. Якутск: Якутское кн. изд-во, 1966. С. 43-47.

41. Скрябин К.И., Орлов И.В. Трихостронгилидозы жвачных. М.-Л.: Сельхозгиз, 1934. 350 с.

42. Скрябин К.И., Шульц P.C. Гельминтозы крупного рогатого скота и его молодняка. М.: Сельхозгиз, 1937а. 723 с.

43. Скрябин К.И., Шульц P.C. Основы общей гельминтологии. М.: Сельхозгиз, 19376. 470 с.

44. Скрябин К.И., Шихобалова Н.П. и др. Стронгиляты. Определитель паразитических нематод. М.: Изд. АН СССР, 1952. Т.З. 890 с.

45. Скрябин К.И., Шихобалова Н.П., Шульц Р.С. Трихостронгилиды животных и человека. Основы нематодологии. М.: Изд. АН СССР, 1954. Т.З. 683 с.

46. Трач В.Н. Соотношение полов стронгилят, выявленных у домашних жвачных животных на территории УССР. // Проблемы паразитологии. Киев: Наукова думка, 1972. Т.2. С. 333-334.

47. Трач В.Н. Эколого-фаунистическая характеристика половозрелых стронгилят домашних жвачных Украины. Киев: Наук, думка, 1986. 213 с.

48. Швец О.М. Соотношение полов в популяциях остертагий и трихостронгил // Мат. науч. конф. «Гельминтозоонозы-меры борьбы и профилактика». М., 1994. С. 183-184.

49. Шумакович В.Е. Работы по гельминтологии. // Сборник, посвящ. 30-летию науч.-пед. и обществ, деятельности К.И. Скрябина и 15-летию Всесоюзн. ин-та гельминтол. М.: Изд. ВАСХНИЛ, 1937. С. 625-636.

50. Achi Y.L., Zinsstag Т., Yao К., Yeoa N., Dorchiesc P., Jacquietc P. Host specificity of Haemonchus spp. for domestic ruminants in the savanna in northern Ivory Coast. // Veterinary Parasitology. 2003. Vol. 116, № 2. P. 151-158.

51. Aleshin V.V., Kedrova O.S., Milyutina I.A., Vladychenskaya N.S., Petrov N.B. Secondary structure of some elements of 18S rRNA suggests that strongylid and a part of rhabditid nematodes are monophyletic // FEBSLetters. 1998. Vol. 429, № 1. P. 4-8.

52. Altschul S.F., Gish W., Miller W., Myers E.W., Lipman D.J. Basic local alignment search tool. // Journal of Molecular Biology. 1990. Vol. 215, .№ 3. P. 403410.

53. Anderson T.J.C. Ascaris infections in humans from North America: molecular evidence for cross-infection // Parasitology. 1995. Vol. 110. P. 215-219.

54. Anderson T.J.C., Blouin M.S., Beech R.N. Population biology of parasitic nematodes: applications of genetic markers // Advances in Parasitology. 1998. Vol. 41. P. 219-282.

55. Arnheim N. Concernted evolution of multigene families In: Evolution of genes and proteins. (Eds. M. Nei, R.K. Koehn) // Sunderland. MA, Sinauer Associates, 1983, P. 38-61.

56. Back E., Felder H., Muller F., Tobler H. Chromosomal arrangement of the two main rDNA size classes of Ascaris lumbricoides // Nucleic Acids Research. 1984. Vol. 12, № 3. P. 1333-1347.

57. Becklund W.W., Walker M.L. Redescription of the nematodes Ostertagia bisonis Chapin, 1925, of cattle and wild animals, and Ostertagia mossi Dikmans, 1931, of deer//The Journal of Parasitology. 1967. Vol. 53, № 6. P. 1273-1280.

58. Benson D.A., Karsch-Mizraci I., Lipman D.J. Ostell J., Wheeler D.L. Gen Bank. //Nucleic acids Research. 2008. Vol. 36. P. 25-30.

59. Blaxter M.L., De Ley P., Garey J.R., Scheldeman P, Vierstraete A, Vanfleteren J.R., Mackey L.Y., Dorris M., Frisse L.M., Vida J.T., Thomas W.K. A molecular evolutionary framework for the phylum Nematoda // Nature. 1998. Vol. 392. P. 71-75.

60. Blouin M.S., Yowell C.A., Courtneu C.H., Dame J.B. Host movement and ' genetic structure of populations of parasitic nematodes // Genetics. 1995. Vol. 141. P. 1007-1014.

61. Blouin M. S., Yowell C. A., Courtneu C. H. et al. Substitution bias, rapid saturation and the use of mtDNA for nematode systematics // Moil. Biol. Evol. 1998. V. 15, № 2. P. 1719-1727.

62. Burke W.D., Mueller F., Eickbush T.H. R4, a non-LTR transposon specific to the large subunit rRNA genes of nematodes // Nucleis Acids Researcgh. 1995. Vol. 23. P. 4628-4634.

63. Bye K. Abomasal nematodes from three Norwegian wild reindeer populations // Canadian Journal of Zoology. 1987. Vol 65, № 3. P. 677-680.

64. Constantine C. C. Molecular markers, analysis and the population genetics of parasites. The thesis for the degree of doctor of phylosophy // Univ., 2002. Western Australia: Murdoch. 140 p.

65. Chilton N.B., Huby-Chilton F., Gasser R.B., Beveridge I. The evolutionary origins of nematodes within the order Strongylida are related to predilection sites within hosts // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2006. Vol. 40. P. 118-128.

66. Chilton N.B., Newton L.A., Beveridge I., Gasser R.B. Evolutionary Relationships of Trichostrongyloid Nematodes (Strongylida) Inferred from Ribosomal DNA Sequence Data // Molecular Phylogenetics and Evolution. 2001. Vol. 19, №3. P. 367-386.

67. Dallas J.F., Irvine R.J., Halvorsen O., Albon S.D. Identifcation by polymerase chain reaction (PCR) of Marshallagia marshalli and Ostertagia gruehneri from Svalbard reindeer // International Journal for Parasitology. Vol. 30, № 7 20006. P. 863-866.

68. Daskalov P. On the reproductive relationships between Ostertagia circumcincta, Teladorsagia davtiani and O. trifurcata (Nematoda, Trichostrongylidae) // Izvestiya na Tsentralnata Khelminthologichna Laboratoriya. 1974. Vol. 17. P. 59-72.

69. Drozdz J. Studies on the helminths and helminthiases in Cervidae I. Revision of the subfamily Ostertagiinae Sarwar, 1956 and an attempt to explain the phylogenesis of its representatives // Acta Parasitología. Polonica. 1965. Vol. 13, № 44. p.445-481.

70. Drozdz J. Polymorphism in the Ostertagiinae Lopez-Neyra, 1947 and comments on the systematics of these nematodes //Systematic Parasitology. 1995. Vol. 32. P. 91-99.

71. Durette-Desset M.C., Hugot J.P., Darlu P., Darlu P., Chabaud A.G. A cladistic analysis of the Trichostrongyloidea (Nematoda) // International Journal for Parasitology. 1999. Vol. 29. P. 1065-1086.

72. Garretson P.D., Hammond E.E., Craig T.M., Holman P.J. Anthelmintic Resistant Haemonchus contortus in a giraffe {Giraffa cameiopardalis) in Florida // Journal of Zoo and Wildlife Medicine 2009. Vol. 40, № l.P. 131-139.

73. Gasser R.B. Molecular taxonomic, diagnostic and genetic studies of parasitic helminthes // International Journal for Parasitology. 2001. Vol. 31. P.860-864.

74. Gasser R.B., Newton S.E. Genomic and genetic research on bursate nematodes: significance, implications and prospects // International Journal for Parasitology. 2000. Vol. 29. P. 509-534.

75. Gasser R.B., Zhu X., Chilton N.B., Newton L.B. Nedergaard T., Guldberg P. Analysis of sequence homogenisation in rDNA arrays of Haemonchus contortus by denaturing gradient gel electrophoresis // Electrophoresis. 1998. № 19. P. 23912395.

76. Gibbons L.M. Keys to the nematode parasites of vertebrates. Departament of Pathology and Infection Deseases; London; England, 2010. 463 p.

77. Files J.G., Hirsh D. Ribosomal DNA of Caenorhabditis elegans // Journal of Molecular Biology. 1981. № 149. P. 223-240.

78. Fox M.T. Pathophysiology of infection with gastrointestinal nematodes in domestic ruminants: recent developments // Veterinary Parasitology. 1997. № 72. P. 285-308.

79. Hall M.C. Two new genera of Nematodes, with a note on a neglected nematode structure //Proceedings of the United States National Museum. 1921. Vol. 59. P. 541-546.

80. Hillis D.M., Dixon, M.T. Ribosomal DNA: molecular evolution and phylogenetic inference // The Quarterly Review of Biology. 1991. Vol. 66. P. 411428.

81. Hoberg E.P., Abrains A. Emended description and radetermination of Sarwaria caballeroni n. comb. (Nematoda: Ostertagiinae) with details of the synlophe and esophageal characters // The Journal of Parasitology. 2007. Vol. 93, № 5. P. 1140-1150.

82. Hoberg E.P., Abrams A. Hamulonema Gen. Nov. for Teladorsagia hamata and Ostertagia kenyensis in the Ostertagiine Fauna (Nematoda: Trichostrongyloidea) From African Ungulates // The Journal of Parasitology. 2008. Vol. 94, № 4. P. 866879.

83. Hoberg E.P., Abrams A., Ezenwa V.O. An Exploration of Diversity Among the Ostertagiinae (Nematoda: Trichostrongyloidea) in Ungulates from Sub

84. Saharan Africa with a Proposal for a New Genus // The Journal of Parasitology. 2008. Vol. 94, № 1. P. 230-251.

85. Hoberg E.P., Abrams A., Pilitt P.A. A New Species of Trichostrongyloid in African Buffalo (Syncerus caffer) (Artiodactyla: Bovinae) from Uganda // The Journal of Parasitology. 2010. Vol. 96, №1.P. 129-136.

86. Hoberg E.P., Khrustalev A.V. Re-evaluation of Mazamastrongylus dagestanica (Trichostrongylidae) with descriptions of the synlophe, genital cone,and other structural characters // The Journal of Parasitology. 1996. Vol.85, № 2. P. 778787.

87. Hoberg E.P., Lichtenfels J.R., Rickard L.G. Phylogeny for genera of Nemadodirinae (Nematoda: Trichostrongylina) // The Journal of Parasitology. 2005. Vol. 91, № 2. P.382-389.

88. Hoste H., Chilton N.B., Beveridge I., Gasser R.B. A comparison of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA in seven species of Trichostrongylus

89. Nematoda: Trichostrongylidae) // International Journal for Parasitology. 1998. Vol. 28. P. 1251-1260.

90. Hugall A., Stanton J., Moritz C. Evolution of the AT-rich mitochondrial DNA of the root knot nematode, Meloidogine hapla II Molecular Biology and Evolution. 1997. Vol. 14, № 1. P. 40-48.

91. Hugall A., Moritz C., Stanton J. Low, but strongly structured mitochondrial DNA diversity in root knot nematodes (Meloidogyne) // Genetics. 1994. V.136. P.903-912.

92. Itagaki T., Ohtori M., Aoki M., Ichinomiya M. Molecular phylogenetic analysis of gastrointestinal helminth from Japanese serow(Capricornis crispus) in North Tohoku region // Published Only in Database (2007).

93. Kuznetsov D.N., Kuznetsova N.A. Sequences of the second internal transcribed spacer of ribosomal DNA of tree species of Trichostrongylus (Nematoda: Trichostrongylidae ) from sheep in Russia // Helminthologia. 2007. Vol. 44, № 2. P. 43-46.

94. Lichtenfels J. R. Differences in Cuticular Ridges Among Cooperia spp. of North American Ruminants with an Illustrated Key to Species // Journal of the Helminthological Society of Washington. 1977. Vol. 44, № 2. P.l 11-119.

95. Lichtenfels J.R., Pilitt P.A., Fruetel M. Cuticular rige pattern of Ostertagia gruehneri and Ostertagia arctica (Nematoda: Trichostrongyloidea) from

96. Caribou, Rangifer tarandus // Journal of the Helminthological Society of Washington. 1991. Vol. 57, № 1. P.61-68.

97. Lichtenfels J.R., Pilitt P.A., Lancaster M.B. Cuticular Ridge Patterns of Seven Species of Ostertagiinae (Nematoda) Parasitic in Domestic Ruminants // Journal of the Helminthological Society of Washington. 1988. Vol. 55, № 1. P.77-86.

98. Lichtenfels J.R., Pilitt P.A., Le Jambre L.F. Cuticular Ridge Patterns of Haemonchus contortus and Haemonchus placei (Nematoda: Trichostrongyloidea) // Journal of the Helminthological Society of Washington. 1986. Vol. 53, № 1. P. 94101.

99. Leignel V., Cabaret J. Are Teladorsagia circumcincta (Nematoda) morphs equally able to survive under anthelmintic treatment in sheep on pastures? // Parasitology Research. 2001a. Vol. 87, № 9. P. 687-692.

100. Leignel V., Humbert J.F. Mitochondrial DNA variation in benzimedazole-resistant and susceptiple populations of the small ruminant parasite Teladorsagia circumcincta II The Journal of Heredity. 20016. Vol.92, № 6. P. 503-506.

101. Leignel V., Cabaret J., Humbert J.F. New molecular evidence that Teladorsagia circumcincta (Nematoda: Trichostrongylidea) is a species complex // The Journal of Parasitology. 2004. Vol.88, № 1. P. 135-140.

102. McCarthy C. Chromas version 1.45. 1996-1998 URL: http:// www. technelysium. com. au/chromas. html.

103. Nicholas K.B. GeneDoc. Multiple sequence aligment editor & shading utility version 2. 5. 000. 1999. URL: www. cris. com.

104. Page R. M. TREEVIEW: an application to view phylogenetic trees on personal computer//Cabios. 1996. Vol. 12. P. 357-358.

105. Prichard R., Tait A. The role of molecular biology in veterinary parasitology // Veterinary Parasitology. 2001. № 98. P. 169-294.

106. Raes J., Van de Peer Y. ForCon: a software tool for the conversion of sequence alignments // Embnet. News. 1999. Vol.6. P. 10-12.

107. Schlotterer C., Hauser M.-T., Haesler A., Tautz D. Comparative evolutionary analysis of rDNA ITS regions in Drosophila II Molecular Biology and Evolution. 1994. Vol. 11, № 3. P. 513-522.

108. Sharkhuu T. Helminths of goats in Mongolia // Veterinary Parasitology. 2001. № 101. P. 161-169.

109. Silvestre A., Humbert J.F. A Molecular Tool for Species Identification and Benzimidazole Resistance Diagnosis in Larval Communities of Small Ruminant Parasites // Experemental Parazitology. 2000. № 95. P. 271-276.

110. Stevenson L.A., Chilton N.B., Gasser R.B. Differentiation of Haemonchus placei from H. contortus (Nematoda: Trichostrongylidae) by the

111. Ribosomal DNA Second Internal Transcribed Spacer // International Journal for Parasitology. 1995. Vol. 25, № 10. P. 483-488.

112. Sudhaus W., Fitch D. Comparative studies on the phylogeny and systematics of the Rhabditidae // The Journal of Nematology. 2001. Vol. 3, № 1. P.

113. Swofford D.L. PAUP*. Phylogenetic analysis using parsimony (and other methods). Sunderland: Sinauer Associates, 1998.

114. Thompson J.D., Gibson T.J., Plewniak F., Jeanmougin F., Higgins D. G. The CLUSTAL X windows interface: Flexible strategies for multiple sequence alignment aided by quality analysis tools // Nucleic Acids Research. 1998. Vol. 25. P. 4876-4882.

115. Wahab A.R., Suhaila A.H., Ahmad S.O. Genetic characterization of Haenonchus contortus in goats (Capra hircus) and sheep {Ovis aries) in Penang, Malaysia // Journal Biosains. Vol. 18, № 2. 2007. P.45-56.

116. Zarlenga D.S., Chute M.B., Gasbarre L.C., Boyd P.C. A multiplex PCR assay for differentiating economically important gastrointestinal nematodes of cattle // Veterinary Parasitology. 2001. № 97. P. 199-209.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.