Оптимизация прогнозирования течения рака предстательной железы на основе определения профиля микроРНК, ассоциированных с метастазированием тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.01.12, кандидат наук Фомичева, Карина Алексеевна

  • Фомичева, Карина Алексеевна
  • кандидат науккандидат наук
  • 2017, Москва
  • Специальность ВАК РФ14.01.12
  • Количество страниц 137
Фомичева, Карина Алексеевна. Оптимизация прогнозирования течения рака предстательной железы на основе определения профиля микроРНК, ассоциированных с метастазированием: дис. кандидат наук: 14.01.12 - Онкология. Москва. 2017. 137 с.

Оглавление диссертации кандидат наук Фомичева, Карина Алексеевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Цель работы

Задачи исследования

Научная новизна

Теоретическая и практическая значимость результатов

Методология и методы исследования

Основные положения, выносимые на защиту

Список работ, опубликованных по теме диссертации

Структура диссертации

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Введение

1.2. Лабораторные методы диагностики отдаленных метастазов РПЖ

1.3. Роль микроРНК в диагностике отдаленных метастазов РПЖ

1.4. Роль микроРНК в качестве молекулярно-генетических маркеров

1.4.1. Внеклеточные и внутриклеточные микроРНК

1.4.2. Локализация аппарата, осуществляющего РНК-сайленсинг в клетке

1.4.3. Все ли микроРНК входят в RISC?

1.4.4. Внеклеточные микроРНК и механизмы их секреции

1.4.5. Межклеточные взаимодействия посредством микроРНК

1.5. Заключение

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Методики получения плазмы и выделения и анализа циркулирующих РНК плазмы крови

2.1.1. Получение плазмы

2.1.2 Выделение тотальной РНК из плазмы крови

2.1.3 Анализ профиля представленности микроРНК с помощью микрочипов Affymetrix ОепеСЫр 4.0

2.2. Анализ профилей представленности микроРНК в плазме крови

2.2.1. Изучение профиля микроРНК пациентов без злокачественных новообразований

2.2.2. Изучение профиля микроРНК пациентов с локализованной и метастатической формами РПЖ

2.3. Анализ вклада изучаемых микроРНК в развитие процесса метастазирования рака предстательной железы

2.3.1. Создание клеточной линии Эи-145 со стабильным нокдауном гена СБ46

2.3.2. Характеристика клеточной линии Эи-145 с инактивированным геном СЭ46

2.3.3. Создание ксенографтной модели РПЖ человека в мыши с использованием линии Эи-145 с инактивированным геном СЭ46

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Характеристика коллекции плазмы крови

3.2. Анализ экспрессии отдельных микроРНК при сравнении метастатической и локализованной формы РПЖ

3.3. Пары микроРНК, позволяющие дифференцировать локализованной и метастатической форм РПЖ

3.4. Определение генов-мишеней

3.5. Экспериментальное исследование роли выявленных микроРНК в патогенезе рака предстательной железы на ксенографтных моделях

3.6. Влияние снижения экспрессии СЭ46 в линии Эи-145 на характеристику клеточной линии, а также метастатический потенциал ксенографтов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оптимизация прогнозирования течения рака предстательной железы на основе определения профиля микроРНК, ассоциированных с метастазированием»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Рак предстательной железы (РПЖ) является вторым по частоте возникновения и пятым по показателю смертности злокачественным новообразованием у мужчин в мире [Siegel, Miller, Jemal, 2015], а в Российской Федерации смертность от РПЖ стоит на третьем месте среди всех злокачественных опухолей мужчин [Каприн А. Д. и др., 2015].

В большинстве случаев на доклинической стадии РПЖ является медленно прогрессирующим заболеванием, однако и в этих случаях встречаются наблюдения агрессивного развития РПЖ, сопровождающегося ранним формированием отдаленных метастазов. В настоящий момент остается не вполне ясным, какими конкретно молекулярно-генетическими механизмами можно объяснить данные особенности опухоли. Как следствие, клинической практике недостает надежных методов оценки степени злокачественности РПЖ и вероятности его метастазирования, а также диагностических лабораторных ресурсов для выявления групп риска наличия метастазов. Адекватное стадирование РПЖ является важным клиническим вопросом, поскольку необходимо для назначения правильного лечения.

К инструментальным методам поиска отдаленных метастазов относятся сцинтиграфия костей, рентгенография или КТ легких, УЗИ или КТ брюшной и тазовой полостей, МРТ и ПЭТ [Алексеев Б. Я. и др., 2014].

Перспективным направлением в диагностике метастатических форм РПЖ является качественная и количественная оценка циркулирующих молекул микроРНК [Schaefer et al., 2010b]. МикроРНК — это малые некодирующие РНК длиной 17-25 нуклеотидов, играющие важную роль в посттрансляционной регуляции экспрессии генов. Данные молекулы стабильны в биологических жидкостях и детектируются даже в малом количестве. Было показано, что среди пациентов с впервые идентифицированным метастатическим РПЖ около

двух третей больных имели метастатическую болезнь высокого объема, то есть наличие висцеральных метастазов и/или не менее четырех метастазов в кости, при этом объем метастатических опухолей больше, чем для первичного очага [Sweeney et al., 2015]. Это означает, что масса опухолевой ткани при развитии метастазов на порядок выше, чем при локализованной форме, что способствует возрастанию уровня опухоль-специфичных микроРНК в плазме крови. При РПЖ активно изучается роль микроРНК в качестве биомаркеров для диагностики, стадирования и оценки прогноза течения заболевания [Fabris et al., 2016]. В 2008 г. было опубликовано исследование, в котором достоверно отличались уровни циркулирующих микроРНК у пациентов с метастатической формой РПЖ по сравнению со здоровыми людьми [Mitchell et al., 2008a]. С тех пор интерес к циркулирующим микроРНК при РПЖ неуклонно растет. Есть несколько публикаций, в которых miR-141 предлагается в качестве маркера распространенного и метастатического рака [Selth et al., 2012], однако в других публикациях miR-141 представляется маркером ранней диагностики РПЖ [Hao et al., 2015]. МикроРНК miR-21 дифференциально экспрессирована при локализованных и метастатических формах, однако данный маркер дифференциальной диагностики уступает классическому ПСА [Watahiki et al., 2013]. В двух работах miR-375 предлагается использовать для дифференциальной диагностики РПЖ и нормального состояния предстательной железы [Kachakova et al., 2015; Wach et al., 2015]. Однако в других исследованиях предполагается использовать miRNA как маркер метастатического рака [Watahiki et al., 2013].

Вышеперечисленные данные наглядно демонстрируют необходимость дальнейшего поиска новых микроРНК-маркеров метастатической формы РПЖ. Для повышения достоверности, специфичности и чувствительности данной методики перспективным путем является создание панелей микроРНК.

Цель работы

Оптимизация выбора лечебной тактики у больных РПЖ на основе выявления микроРНК, ассоциированных с метастазированием.

Задачи исследования

1. Создать коллекцию плазмы пациентов с локализованным и метастатическим РПЖ.

2. Провести с помощью полногеномных микрочиповых технологий высокопроизводительный анализ микроРНК в плазме из созданной коллекции.

3. Выполнить биоинформатический анализ полученных данных и выявить микроРНК плазмы крови, ассоциированные с метастатическими формами РПЖ.

4. Проанализировать научную литературу и выявить гены-мишени микроРНК, ассоциированных с метастазированием РПЖ.

5. Исследовать биологическую роль генов-мишеней в метастазировании РПЖ с помощью ксенографтных моделей РПЖ человека у иммунодефицитных мышей.

Научная новизна

Впервые проведен анализ уровней микроРНК в плазме крови пациентов с метастатическим и локализованным РПЖ с использованием микрочипов высокой плотности Affymetrix GeneChip miRNA 4.0 Array.

Впервые подобрана панель микроРНК, характерных для пациентов с метастатическим РПЖ.

Изучена роль гена CD46, являющегося геном-мишенью выявленных микроРНК, в развитии отдаленных метастазов на ксенографтной модели РПЖ у иммунодефицитных мышей.

Теоретическая и практическая значимость результатов

Проведено сравнение состава и уровня циркулирующих микроРНК в крови пациентов с локализованным и метастатическим РПЖ.

Установлен ген-мишень (CD46) для отобранных микроРНК и исследована его вовлеченность в механизм метастазирования РПЖ.

Разработана панель микроРНК для малоинвазивной дифференциальной диагностики локализованных и метастатических форм РПЖ, которая может быть использована в практической медицине и лабораторной диагностике. Планируется внедрение на базе отдела трансляционной онкологии МНИОИ им. П.А. Герцена — филиала ФГБУ «НМИРЦ» Минздрава России.

Методология и методы исследования

Для выявления роли микроРНК в дифференциальной диагностике локализованных и метастатических форм РПЖ сформирована коллекция (банк) биологических образцов:

• 36 образцов плазмы крови пациентов с локализованными формами РПЖ;

• 37 образцов плазмы крови пациентов с отдаленными метастазами РПЖ;

• 6 образцов плазмы крови здоровых добровольцев.

Набор биологических образцов производили на базе двух филиалов ФГБУ «НМИРЦ» Минздрава России: МНИОИ им. П.А. Герцена и НИИ урологии и интервенционной радиологии им. Н.А. Лопаткина. Все пациенты подписали информированное согласие.

Для проведения микрочипового анализа из образцов плазмы объемом 200 мкл выделялась РНК с помощью miRNeasy Serum/Plasma Kit («Qiagen»). Все образцы были проанализированы методами микрочипового анализа с помощью GeneChip miRNA 4.0 («Affymetrix»). После обработки микрочиповых данных с помощью программного обеспечения Affymetrix Expression Console v.1.4.1.46 и

Affymetrix Transcriptome Analysis Console v.3.1.0.5 был выбран список дифференциально экспрессированных генов.

Для отобранных в результате микрочипового анализа микроРНК был проведен биоинформационный анализ генов-мишеней.

Для выявления роли микроРНК в механизме метастазирования создана ксенографтная модель РПЖ с использованием клеточной линии РПЖ DU 145 со сниженной трансляцией мРНК гена CD46.

В работе применяются следующие методы:

1. Теоретический анализ и обобщение данных научной литературы.

2. Выделение циркулирующих нуклеиновых кислот из образцов плазмы крови с помощью гуанидин тиоцианат-фенол-хлороформной экстракции с последующей сорбцией на кремниевой мембране.

3. Мультиплексный анализ профиля представленности микроРНК на микрочипах высокой плотности Affymetrix GeneChip miRNA 4.0 Array.

4. Полимеразная цепная реакция с детекцией продуктов амплификации в реальном времени.

5. РНК-интерференция с помощью shRNA для подавление экспрессии гена CD46 в опухолевых клетках линии РПЖ (DU145).

6. Эксперименты in vivo на ксенографтных моделях РПЖ у иммуно-дефицитных мышей.

Исследование выполнено в рамках соглашения с Минобрнауки России №14.579.21.0054 (RFMEFI57914X0054).

Основные положения, выносимые на защиту

1. Уровень семи микроРНК в плазме крови повышен при метастатической

форме в сравнении с локализованной при РПЖ.

2. Анализ уровня представленности в плазме крови микроРНК в паре hsa-

miR-149-3p и hsa-miR-7110-5p, а также hsa-miR-6724-5p и hsa-miR-7110-

5p позволяет дифференцировать локализованный и метастатический РПЖ

9

с чувствительностью 88,9% и 80,6%, специфичностью 73,5% и 75,0% соответственно.

3. Ген CD46 ассоциирован с метастатическим потенциалом РПЖ, т.к. подавление трансляции мРНК этого гена увеличивает миграционную и инвазивную активность клеток РПЖ человека линии DU-145 in vitro и in vivo в ксенографтных моделях.

Список работ, опубликованных по теме диссертации

По теме диссертации опубликовано 4 работы, все в изданиях, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки РФ и входящих в базы цитирования РИНЦ, Scopus, Web of Science:

1. Князев Е.Н., Фомичева К.А., Нюшко К.М., Каприн А.Д., Алексеев Б.Я., Шкурников М.Ю. Актуальные вопросы молекулярной диагностики рака предстательной железы // Онкоурология. 2014. № 4. С. 14-22.

2. Шкурников М.Ю., Макарова Ю.А., Князев Е.Н., Фомичева К.А., Нюшко К.М., Сарибекян Э.К., Алексеев Б.Я., Каприн А.Д. Профиль микроРНК плазмы крови здоровых людей // Бюлл. экспер. биол. 2015. Т. 160, № 11. С. 577-579.

3. Шкурников М.Ю., Князев Е.Н., Фомичева К.А., Михайленко Д.С., Нюшко К.М., Сарибекян Э.К., Саматов Т.Р., Алексеев Б.Я. Определение микроРНК плазмы крови, ассоциированных с гемолизом // Бюлл. экспер. биол. 2015. Т. 160, № 12. С. 709-711.

4. Князев Е.Н., Саматов Т.Р., Фомичева К.А., Нюшко К.М., Алексеев Б.Я., Шкурников М.Ю. МикроРНК hsa-miR-4674 в негемолизированной плазме крови ассоциирована с отдаленными метастазами при раке предстательной железы // Бюлл. экспер. биол. 2016. Т. 161, № 1. С. 128-132.

Структура диссертации

Диссертация изложена на 137 страницах компьютерной верстки, иллюстрирована 4 таблицами и 20 рисунками, состоит из введения, обзора литературы, двух глав, посвященных материалам и методам и собственным наблюдениям, заключения, выводов, практических рекомендаций и списка литературы, содержащего 252 литературных источника, включая 11 работ отечественных авторов.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Введение

РПЖ занимает пятое место в общей структуре злокачественных заболеваний в Российской Федерации, а среди мужского населения стоит на втором месте по частоте и на третьем по смертности среди всех злокачественных новообразований мужчин [Каприн, Старинский, Петрова, 2015a]. В мире РПЖ занимает второе место по частоте и пятое по смертности в структуре злокачественных новообразований у мужчин [Siegel, Miller, Jemal, 2015]. Заболеваемость РПЖ стремительно растет, так, в 2004 г. в России показатель заболеваемости составил 20,08 случаев на 100 000 человек, а к 2015 г. этот показатель достиг 40,23 случая на 100 000 человек. Среднегодовой темп прироста за этот период составил 6,68% [Каприн, Старинский, Петрова, 2015a]. Количество пациентов с диагностированным РПЖ также неуклонно растет, в 2004 г. их количество составило 38,4 на 100 000 населения, а к 2014 г. поднялось до 116,4 на 100 000. В 2014 г. зарегистрировано 36 493 случая вновь выявленного РПЖ. Из них на I-ой стадии — 10%, на II — 42,2%, на III — 29,0%, на IV — 16,0% [Каприн, Старинский, Петрова, 2015c]. Согласно данным Американской Ассоциации Онкологов пятилетняя выживаемость больных с локализованными формами РПЖ составляет более 99%, в то время как при наличии отдаленных метастазов — всего 28%. Также на фоне снижения стандартизованного показателя смертности (-12,6%) у мужчин от всех злокачественных новообразований за период с 2005 по 2015 гг. наблюдается прирост показателя смертности от злокачественных опухолей предстательной железы [Каприн, Старинский, Петрова, 2015a]. За 10 лет наблюдений смертность выросла на 31,8%. Предположительно это связано не только с высокой частотой генерализации заболевания после проведения местного лечения, но и с устаревшими подходами к лечению метастатического РПЖ,

несмотря на то, что в последние 5 лет в клиническую практику были внедрены новые эффективные препараты, существенно увеличивающие продолжительность жизни таким пациентам [Алексеев, 2015]. Точное стадирование является важным пунктом диагностики, поскольку позволяет определить характер и объем необходимого лечения. Особенно важна ранняя диагностика метастазов у пациентов с РПЖ высокого риска. Несмотря на некоторые успехи, достигнутые в лечении пациентов с распространенными формами, остается множество вопросов, например, неясны механизмы метастазирования РПЖ, устойчивости метастатических клеток к различным видам терапии и возможность точной диагностики распространённых форм РПЖ. В случае ответа на эти вопросы будет достигнут прогресс в диагностике, стадировании и прогнозировании РПЖ, а также найдены новые подходы к лечению и, возможно, профилактике метастазирования.

В настоящий момент для диагностики распространенных форм РПЖ

применяются следующие методы: определение уровня щелочной фосфатазы,

сканирование костей [НшёетшсЬ & а!., 2011], рентгенография или КТ легких,

УЗИ или КТ абдоминальной и тазовой полостей, МРТ и ПЭТ. Тазовая

лимфаденэктомия является единственным точным методом оценки состояния

регионарных лимфатических узлов у больных РПЖ, поскольку другие методы

не позволяют определить наличие метастазов размером < 5 мм [Алексеев и др.,

2014]. Наиболее часто метастазами при РПЖ поражается осевой скелет — до

85% умерших от РПЖ пациентов имели метастатическое поражение осевого

скелета. Чаще всего поражаются череп, позвонки, ребра, ключица, лопатка и

бедренная кость. Наиболее распространенным методом диагностики

метастатического поражения костей является остеосцинтиграфия, в

большинстве клинических руководств для определения стадии М

рекомендуется проведение именно этого исследования. Данный метод обладает

рядом преимуществ: позволяет исследовать все тело, имеет достаточно

высокую чувствительность, имеет относительно невысокую цену. Основным

недостатком остеосцинтиграфии является низкая специфичность [Ьат§Б1е§ег &

13

al., 2012]. По данным литературы остеосцинтиграфия имеет чувствительность от 62% до 89% [Tombal, Lecouvet, 2012], а специфичность от 48% [O'Sullivan, Carty, Cronin, 2015] до 79% [Blake et al., 2001]. Причиной ложноположительных результатов чаще всего являются дегенеративные изменения и воспалительные очаги в костной ткани. У пациентов с небольшим количеством выявленных очагов требуется подтверждение другими методами. Из-за низкой специфичности и относительно высокой стоимости процедуры, а также малой вероятности наличия метастазов при ранних стадиях РПЖ проведение остеосцинтиграфии не рекомендуется при уровне ПСА < 10 нг/мл, при сумме по шкале Глисона меньше 8 баллов и при отсутствии болевых ощущений в костях по одним рекомендациям [Andelin, Baker, 2002] и при уровне ПСА < 20 нг/мл, сумме по шкале Глисона < 8 баллов и стадии меньше Т4 по другим рекомендациям [O'Sullivan et al., 2003]. При наличии симптомов поражения скелета рекомендуется проводить остеосцинтиграфию независимо от уровня ПСА [Gomez et al., 2004]. ПЭТ-КТ обладает значительно большей чувствительностью и специфичностью, которые могут достигать 100%, но стоимость этой процедуры значительно выше стоимости классического сканирования скелета [Linton, Catto, 2012], поэтому ПЭТ-КТ не используется в качестве основного метода, а назначается в качестве уточняющего исследования. МРТ также является высокоспецифичным и чувствительным методом, однако имеет схожие с ПЭТ-КТ ограничения для применения в клинического практике в качестве метода выбора диагностики метастатического поражения костей.

В настоящий момент ведутся активные поиски новых надежных маркеров

для оценки метастатического потенциала опухоли, а также для

дифференциальной диагностики метастатической и локализованных форм

РПЖ. Одним из перспективных типов молекул, претендующих на роль таких

биомаркеров, являются микроРНК. МикроРНК играют важную роль в

регуляции экспрессии многих генов, действуя на транскрипционном и

посттранскрипционном уровнях. Они вовлечены в регуляцию многих

14

сигнальных путей и принимают участие во всех клеточных процессах. МикроРНК часто имеют измененный профиль экспрессии в ткани опухолей [Heneghan, Miller, Kerin, 2010], что может свидетельствовать об их активной роли в злокачественном процессе.

Несмотря на активное изучение данного вопроса и имеющиеся подтверждения значимости циркулирующих микроРНК в диагностике метастатических форм РПЖ, применение этих молекул в клинической медицине ограничено. Необходим дальнейший поиск одиночных микроРНК или их сочетаний, которые позволят с высокой чувствительностью и специфичностью дифференцировать локализованные и метастатические формы. Кроме того, возможно, что изучив роль найденных молекул в механизме метастазировании РПЖ, удастся достигнуть успехов в вопросах лечения и предотвращения метастазирования данного вида рака.

1.2. Лабораторные методы диагностики отдаленных метастазов РПЖ

В настоящий момент ни один лабораторный показатель, применяемый в диагностике, не позволяет достоверно отличить метастатический РПЖ от его локализованных и местно-распространенных форм. В связи с этим активно ведется поиск новых маркеров, способных решить данную клиническую задачу. Большинство исследуемых маркеров отличается у этих групп лишь незначительно. Так, например, АСКП — антиген стволовых клеток предстательной железы (PSCA — prostate stem cells antigen), мембранный гликопротеин, экспрессируется в 100% случаев метастатического поражения костей при РПЖ, однако и при локализованном РПЖ его экспрессия определяется в 94% случаев [Gu et al., 2000]. С помощью метода ИГХ было показано, что до 90% метастазов РПЖ гиперэкспрессируют урокиназу и ее рецептор, однако и 64% первичных опухолей также демонстрируют их гиперэкспрессию [Cozzi et al., 2006].

Наиболее часто используемым показателем при решении различных задач диагностики и прогнозирования РПЖ является простатический

специфический антиген (ПСА). Уровень ПСА может отражать метастатический статус опухоли. Было показано, что уровень сывороточного ПСА > 100 нг/мл указывает на наличие отдаленных метастазов РПЖ, даже при отсутствии их признаков при лучевых методах обследования пациентов [Schröder et al., 2012]. Однако при более низких показателях ПСА, которые чаще встречаются в клинической практике, нет четкой корреляции между уровнем ПСА и распространенностью процесса. Однако уровень ПСА > 50 нг/мл ассоциирован с высоким риском генерализации заболевания. Частота же выявления костных метастазов при уровне ПСА < 5 нг/мл и времени его удвоения > 6 мес составила 0% (95% доверительный интервал 0,0-14,3%), что позволяет исключить сцинтиграфию из обязательного объема обследований данной категории пациентов [Демешко, Суконко, Красный, 2012]. Сочетание повышенного уровня ПСА и наличия T3-4 стадии или значения Глисона больше 7 являются предиктором наличия костных метастазов, прогностическая ценность — 71,4% и 81% соответственно [Rana et al, 1992].

Маркеры костного метаболизма представляют интерес для прогнозирования течения и диагностики РПЖ, поскольку известно, что кости являются одним из основных органов для формирования метастазов, а костные метастазы обнаруживаются у 60% больных РПЖ [Брызгунова, Власов, Лактионов, 2007]. У мужчин молодого возраста более 80% всех метастазов наблюдаются в костях [Ganov, Varlamov, Lazarev, 2014]. Таким образом, диагностика этого типа поражения при диссеминации заболевания особенно важна. Практически единственный маркер, который широко используется в клинической практике для диагностики метастатических поражений костей -щелочная фосфатаза (ЩФ). Еще в 1938 г. было отмечено значительное повышение уровня кислой фосфатазы сыворотки крови у мужчин с метастазами РПЖ [Gutman, Gutman, 1938]. Известно, что уровень ЩФ повышается уже при ранних метастазах в костную ткань [Tamada et al., 2001; Brown, Singh, 2006]. Повышенный уровень ЩФ означает наличие

метастатического поражения костной ткани в 79% случаев [Wolff et al., 1999 ], а

16

его совместное определение с ПСА значительно увеличивает эффективность диагностики [Lorente et al., 1996]. Однако ЩФ может повышаться не только при метастазах, но и в результате остеопороза, развивающегося на фоне андрогенной депривации [Daniell, 2001]. Исследовались и другие показатели костного метаболизма. Так, Yoshida с соавт. обнаружили, что концентрация PICP (Procollagen Type I Carboxyterminal Propeptide) в сыворотке крови значительно выше у пациентов с РПЖ с костными метастазами, чем у пациентов с РПЖ без генерализации процесса. Концентрация ICTP (C-telopeptide of type I collagen) в сыворотке значительно выше у пациентов с РПЖ, чем у пациентов с доброкачественной гиперплазией ПЖ [Noguchi, Yahara, Noda, 2003], а совместное измерение в сыворотке ICTP и ЩФ позволяет определить наличие костных метастазов [Tamada et al., 2001]. Еще одним маркером костных метастазов при РПЖ может служить костный морфогенетический протеин 6 (BMP6): известно, что его экспрессия значительно возрастает у пациентов с метастатическим поражением скелета [Thomas, Hamdy, 2000]. К числу маркеров костного метаболизма относятся также остеопротегерин (OPG), рецептор активатора NFkB (RANK) и его лиганд (RANKL), которые принадлежат к белкам семейства TNF. Показано, что экспрессия RANKL/RANK/OPG коррелирует с развитием метастазов при РПЖ [Брызгунова, Власов, Лактионов, 2007; Chen et al., 2006].

Метастаз-ассоциированный протеин (MTA1) впервые упоминается в работе, посвященной изучению экспрессии генов при РМЖ, в 1994 г. [Toh, Pencil, Nicolson, 1994]. Его функция окончательно не выяснена, но исследователи предполагают, что он может участвовать в активации транскрипции. Есть исследования, в которых установлено, что экспрессия белка MTA1 возрастает при наличие метастазов рака. Как маркер распространенных форм РПЖ рассматривается с 2004 г. [Аляев и др., 2006]. Интересно, что увеличение экспрессии МТА1 соответствует снижению рисков развития рецидивов после проведения радикальной простатэктомии [Hofer et al, 2004].

Как известно, метастазирование при РПЖ наблюдается поздно и сопровождает уже местно-распространенный процесс. Однако характеристики, которые в дальнейшем будут способствовать распространению опухолевых клеток, закладываются уже на ранних этапах развития опухоли [Аляев и др., 2006]. Важной является способность злокачественной клетки к двигательной активности, осуществляющейся через каскад биологических реакций, включающих в себя полимеризацию/деполимеризацию актина. Для обеспечения однонаправленного роста фибриллярного актина (F-актина) концентрация мономера (G-актина) на его (-)-конце должна быть ниже, чем на противоположном, полимеризующемся участке, что реализуется путем связывания мономеров со специальным белком — тимозином ß-15, высокоспецифичным для аденокарциномы предстательной железы [Аляев и др., 2006] [Chakravatri et al., 2000]. Увеличение экспрессии тимозина ß-15 коррелирует с вероятностью метастазирования, и оценка ее уровня может быть использована для определения агрессивности опухоли [Hutchinson et al., 2005].

В последние годы были разработаны и внедрены в клиническую практику несколько тест-систем для определения агрессивности течения и прогнозирования РПЖ, в том числе для определения вероятности развития отдаленных метастазов в течение определенного времени наблюдения. Принцип работы данных тест-систем основывается на оценке уровня экспрессии мРНК вовлеченных в жизненно важные клеточные процессы. В настоящий момент зарегистрированы и одобрены 3 коммерческих теста: Decipher™, Oncotype DX®, Prolaris®.

Decipher™ оценивает риск развития метастазов после проведения

радикальной простатэктомии. Эта тест-система была разработана на основе

анализа 1,4 миллиона молекул, включая кодирующие и некодирующие РНК. В

итоговую версию вошли 22 мРНК, которые вовлечены в различные сигнальные

пути и участвуют в клеточной дифференцировке, пролиферации, адгезии и

подвижности, иммуномодуляции, регуляции клеточного цикла и являются

частью андрогенного сигнального пути [Erho et al., 2013]. Результат теста

18

представляет собой шкалу от 0 до 1, где 1 соответствует наибольшему риску развития метастазов РПЖ в течение 5 лет.

Опсо^ре DX наиболее известен в качестве тест-системы для определения прогноза течения РМЖ. Это система основана на количественной ОТ-ПЦР-РВ 12 онкоассоциированных генов, входящих в состав различных сигнальных путей, в том числе реакция стромы (BGN, COL1A1 и SFRP4), андрогенный сигнальный путь (AZGP1, ^^, SRD5A2 и FAM13C), пролиферация (TPX2) , поддержания нормальной структуры клетки (FLNC, GSN, GSTM2 и TPM2) и 5 референсных генов (А^1, ATP5E, аТС, GPS1 и PGK1) [Кте7еую вг al, 2013]. Результат оценивается по шкале с диапазоном от 0 до 100, в которой наибольшее значение коррелирует с наибольшей вероятностью развития неблагоприятных исходов при РПЖ у пациентов с низким или средним риском. Это позволяет выбрать правильную тактику лечения: от активного наблюдения до радикального лечения. Рекомендация КССК включает в себя проведение этого исследования для пациентов с низким и очень низким риском с ожидаемой продолжительностью жизни 10-20 лет [МоЫег & al., 2016].

Prolaris® - прогностический тест, основанный на оценки уровня экспрессии 31 гена, вовлеченного в регуляции клеточного цикла и 15 генов домашнего хозяйства. Результат представлен в виде пролиферативного индекса, выраженного в баллах [Сшюк & al., 2011]. Этот тест выполняется на биопсиях, полученных от мужчин с низким и очень низким риском, для принятия решения о необходимости назначения немедленного активного лечения или возможности наблюдения. Этот прогностический анализ оценивает вероятность развития в будущем биохимического рецидива и вероятность наступления смерти от РПЖ. NCCN рекомендует использовать этот тест для прогнозирования течения РПЖ, при постановке диагноза отнесенного к группе низкого и очень низкого риска, у пациентов с ожидаемой продолжительностью жизни не менее 10 лет [МоЫег & al., 2016].

Похожие диссертационные работы по специальности «Онкология», 14.01.12 шифр ВАК

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Фомичева, Карина Алексеевна, 2017 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Алексеев Б.Я. и др. Клинические рекомендации по диагностике и лечению рака предстательной железы // 2014.

2. Алексеев Б.Я. Химиотерапия в лечении больных метастатическим раком предстательной железы: современное состояние проблемы // Онкоурология. 2015.

3. Аляев Ю.Г. и др. Молекулярная патология рака предстательной железы: диагностическая и прогностическая значимость основных маркеров // 2006. С. 45-51.

4. Брызгунова О.Е., Власов В.В., Лактионов П.П. Современеые методы диагносткики рака предстательной железы // 2007. С. 128-139.

5. Галатенко В.В. и др. О построении медицинских тест-систем с использованием жадного алгоритма и метода опорных векторов // Бюлл. экспер. биол. 2013. Т. 156, № 11. С. 654-660.

6. Демешко П.Д., Суконко О.Г., Красный С.А. Роль остеосцинтиграфии в диагностике метастатического поражения костей скелета у пациентов с биохимическим рецидивом после радикальной простатэктомии по поводу рака предстательной железы // 2012. С. 70-76.

7. Каприн А.Д., Старинский В.. , Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2015 году (заболеваемость и смертность) // 2015а.

8. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Смертность населения по причинам смерти в 2015 году // Федеральная служба государственной статистики. 2015Ь.

9. Каприн А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Состояние

онкологической помощи населению России в 2014 году. , 2015с.

113

10. Шкурников М.Ю. и др. Определение микроРНК плазмы крови, ассоциированных с гемолизом // Бюллетень экспериментальной биологии и метдицины. 2015b. Т. 12. № 15. С. 709-711.

11. Шкурников М.Ю. и др. Профиль микроРНК плазмы крови здоровых людей // Бюллетень экспериментальной биологии и метдицины. 2015a. Т. 160. № 11. С. 577-579.

12. Akat K.M. et al. Comparative RNA-sequencing analysis of myocardial and circulating small RNAs in human heart failure and their utility as biomarkers. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014. Т. 111. № 30. С. 11151-6.

13. Alexander M. et al. Exosome-delivered microRNAs modulate the inflammatory response to endotoxin. // Nat. Commun. 2015. Т. 6. С. 7321.

14. Amado T. et al. Cross-regulation between cytokine and microRNA pathways in T cells. // Eur. J. Immunol. 2015. Т. 45. № 6. С. 158495.

15. Ameyar-Zazoua M. et al. Argonaute proteins couple chromatin silencing to alternative splicing. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2012. Т. 19. № 10. С. 998-1004.

16. Andelin E., Baker M.R. Guidance on Cancer Services Improving Outcomes in Urological Cancers // 2002.

17. Antoniou A. et al. PICK1 links Argonaute 2 to endosomes in neuronal dendrites and regulates miRNA activity. // EMBO Rep. 2014. Т. 15. № 5. С. 548-56.

18. Arroyo J.D. et al. Argonaute2 complexes carry a population of circulating microRNAs independent of vesicles in human plasma. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2011. Т. 108. № 12. С. 5003-8.

19. Azuma-Mukai A. et al. Characterization of endogenous human Argonautes and their miRNA partners in RNA silencing // Proc. Natl. Acad. Sci. 2008. Т. 105. № 23. С. 7964-7969.

20. Bandiera S. et al. Nuclear outsourcing of RNA interference components to human mitochondria. // PLoS One. 2011. T. 6. № 6. C. e20746.

21. Banzet S. et al. Changes in circulating microRNAs levels with exercise modality // J. Appl. Physiol. 2013. T. 115. № 9. C. 12371244.

22. Barbato C. et al. Dicer expression and localization in post-mitotic neurons. // Brain Res. 2007. T. 1175. C. 17-27.

23. Barman B., Bhattacharyya S.N. mRNA Targeting to Endoplasmic Reticulum Precedes Ago Protein Interaction and MicroRNA (miRNA)-mediated Translation Repression in Mammalian Cells. // J. Biol. Chem. 2015. T. 290. № 41. C. 24650-6.

24. Bartel D.P. MicroRNAs: Target Recognition and Regulatory Functions // Cell. 2009. T. 136. № 2. C. 215-233.

25. Batsche E., Ameyar-Zazoua M. The influence of Argonaute proteins on alternative RNA splicing. // Wiley Interdiscip. Rev. RNA. 2015. T. 6. № 1. C. 141-56.

26. Belter A. et al. Mature MiRNAs Form Secondary Structure, which Suggests Their Function beyond RISC // PLoS One. 2014. T. 9. № 11. C. e113848.

27. Benjamini Y., Hochberg Y. Controlling the False Discovery Rate: a Practical and Powerful Approach to Multiple Testing // J. R. Stat. Soc. 1995. T. 57. № 1. C. 289-300.

28. Bissels U. et al. Absolute quantification of microRNAs by using a universal reference. // RNA. 2009. T. 15. № 12. C. 2375-84.

29. Blake G.M.et al. Quantitative studies of bone with the use of 18F-fluoride and 99mTc-methylene diphosphonate. // Semin. Nucl. Med. 2001. T. 31. № 1. C. 28-49.

30. Borchert G.M., Lanier W., Davidson B.L. RNA polymerase III

transcribes human microRNAs // Nat. Struct. Mol. Biol. 2006. T. 13.

115

№ 12. C. 1097-1101.

31. Borralho P.M., Rodrigues C.M.P., Steer C.J. microRNAs in Mitochondria: An Unexplored Niche. // Adv. Exp. Med. Biol. 2015. T. 887. C. 31-51.

32. Brase J.C. et al. Circulating miRNAs are correlated with tumor progression in prostate cancer // Int. J. Cancer. 2011. T. 128. № 3. C. 608-616.

33. Brown M.W., Singh A.K. Alkaline Phosphatase Level Increase with Initiation of Hormone Therapy for Prostate Cancer Portends Poor Prognosis with Rapid Progression to Bone Metastases: A Case Report and Review of the Literature // Clin. Genitourin. Cancer. 2006. T. 4. № 4. C. 293-295.

34. Bryant R.J. et al. Changes in circulating microRNA levels associated with prostate cancer. // Br. J. Cancer. 2012. T. 106. № 4. C. 768-74.

35. Budd W.T. et al. Dual Action of miR-125b As a Tumor Suppressor and OncomiR-22 Promotes Prostate Cancer Tumorigenesis. // PLoS One. 2015. T. 10. № 11. C. e0142373.

36. Burger K., Gullerova M. Swiss army knives: non-canonical functions of nuclear Drosha and Dicer. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2015. T. 16. № 7. C. 417-30.

37. Burroughs A.M. et al. Deep-sequencing of human Argonaute-associated small RNAs provides insight into miRNA sorting and reveals Argonaute association with RNA fragments of diverse origin. // RNA Biol. T. 8. № 1. C. 158-77.

38. Cao D. et al. 18p-glycyrrhetinic acid suppresses gastric cancer by activation of miR-149-3p-Wnt-1 signaling. // Oncotarget. 2016. T. 7. № 44. C. 71960-71973.

39. Chakravatri A. et al. Thymosin beta-15 predicts for distant failure in patients with clinically localized prostate cancer-results from a pilot study. // Urology. 2000. T. 55. № 5. C. 635-8.

40. Chen A.K. et al. MicroRNA binding to the HIV-1 Gag protein inhibits Gag assembly and virus production. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014. T. 111. № 26. C. E2676-83.

41. Chen G. et al. Expression of RANKL/RANK/OPG in primary and metastatic human prostate cancer as markers of disease stage and functional regulation // Cancer. 2006. T. 107. № 2. C. 289-298.

42. Chendrimada T.P. et al. TRBP recruits the Dicer complex to Ago2 for microRNA processing and gene silencing. // Nature. 2005. T. 436. № 7051. C. 740-4.

43. Chevillet J.R. et al. Quantitative and stoichiometric analysis of the microRNA content of exosomes. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2014. T. 111. № 41. C. 14888-93.

44. Chim S.S.C. et al. Detection and characterization of placental microRNAs in maternal plasma. // Clin. Chem. 2008. T. 54. № 3. C. 482-90.

45. Chou C.-H. et al. miRTarBase 2016: updates to the experimentally validated miRNA-target interactions database. // Nucleic Acids Res. 2016. T. 44. № D1. C. D239-47.

46. Cikaluk D.E. et al. GERp95, a membrane-associated protein that belongs to a family of proteins involved in stem cell differentiation. // Mol. Biol. Cell. 1999. T. 10. № 10. C. 3357-72.

47. Claycomb J.M. Ancient endo-siRNA pathways reveal new tricks. // Curr. Biol. 2014. T. 24. № 15. C. R703-15.

48. Collino F. et al. Microvesicles derived from adult human bone marrow and tissue specific mesenchymal stem cells shuttle selected pattern of miRNAs. // PLoS One. 2010. T. 5. № 7. C. e11803.

49. Colombo M., Raposo G., Thery C. Biogenesis, secretion, and intercellular interactions of exosomes and other extracellular vesicles. // Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 2014. T. 30. № 1. C. 255-89.

50. Cortes C., Vapnik V. Support-Vector Networks // Mach. Learn. 1995.

117

T. 20. № 3. C. 273-297.

51. Cozzi P.J. et al. Evaluation of urokinase plasminogen activator and its receptor in different grades of human prostate cancer. // Hum. Pathol. 2006. T. 37. № 11. C. 1442-51.

52. Cuzick J. et al. Prognostic value of an RNA expression signature derived from cell cycle proliferation genes in patients with prostate cancer: a retrospective study. // Lancet. Oncol. 2011. T. 12. № 3. C. 245-55.

53. Daniell H.W. Osteoporosis due to androgen deprivation therapy in men with prostate cancer. // Urology. 2001. T. 58. № 2 Suppl 1. C. 101-7.

54. Davis E. et al. RNAi-mediated allelic trans-interaction at the imprinted Rtl1/Peg11 locus. // Curr. Biol. 2005. T. 15. № 8. C. 7439.

55. Detzer A. et al. Cell stress is related to re-localization of Argonaute 2 and to decreased RNA interference in human cells. // Nucleic Acids Res. 2011. T. 39. № 7. C. 2727-41.

56. Diederichs S., Haber D.A. Dual role for argonautes in microRNA processing and posttranscriptional regulation of microRNA expression. // Cell. 2007. T. 131. № 6. C. 1097-108.

57. Dueck A. et al. microRNAs associated with the different human Argonaute proteins // Nucleic Acids Res. 2012. T. 40. № 19. C. 9850-9862.

58. Dueck A., Meister G. Assembly and function of small RNA -Argonaute protein complexes // Biol. Chem. 2014. T. 395. № 6. C. 611-29.

59. Ender C. et al. A human snoRNA with microRNA-like functions. // Mol. Cell. 2008. T. 32. № 4. C. 519-28.

60. Erho N. et al. Discovery and validation of a prostate cancer genomic

classifier that predicts early metastasis following radical

118

prostatectomy. // PLoS One. 2013. T. 8. № 6. C. e66855.

61. Ernst M.D. Permutation Methods: A Basis for Exact Inference // Stat. Sci. 2004. T. 19. № 4. C. 676-685.

62. Eulalio A. et al. P-body formation is a consequence, not the cause, of RNA-mediated gene silencing. // Mol. Cell. Biol. 2007. T. 27. № 11. C. 3970-81.

63. Fabris L. et al. The Potential of MicroRNAs as Prostate Cancer Biomarkers // Eur. Urol. 2016. T. 70. № 2. C. 312-322.

64. Fairbanks V.F., Ziesmer S.C., O'Brien P.C. Methods for measuring plasma hemoglobin in micromolar concentration compared. // Clin. Chem. 1992. T. 38. № 1. C. 132-40.

65. Falguières T. et al. In vitro budding of intralumenal vesicles into late endosomes is regulated by Alix and Tsg101. // Mol. Biol. Cell. 2008. T. 19. № 11. C. 4942-55.

66. Flores O. et al. Differential RISC association of endogenous human microRNAs predicts their inhibitory potential. // Nucleic Acids Res. 2014. T. 42. № 7. C. 4629-39.

67. Friedländer M.R. et al. Evidence for the biogenesis of more than 1,000 novel human microRNAs // Genome Biol. 2014. T. 15. № 4. C. R57.

68. Friedman J.R. et al. Endoplasmic reticulum-endosome contact increases as endosomes traffic and mature. // Mol. Biol. Cell. 2013. T. 24. № 7. C. 1030-40.

69. Friedman R.C. et al. Most mammalian mRNAs are conserved targets of microRNAs // Genome Res. 2008. T. 19. № 1. C. 92-105.

70. Gagnon K.T. et al. RNAi factors are present and active in human cell nuclei. // Cell Rep. 2014. T. 6. № 1. C. 211-21.

71. Galatenko V. V et al. Highly informative marker sets consisting of genes with low individual degree of differential expression. // Sci. Rep. 2015. T. 5. C. 14967.

72. Ganov D.I., Varlamov S.A., Lazarev A.F. Метастазирование рака предстательной железы у мужчин молодого и среднего возраста // 2014. С. 53-55.

73. Gao M. et al. Ago2 facilitates Rad51 recruitment and DNA doublestrand break repair by homologous recombination. // Cell Res. 2014. Т. 24. № 5. С. 532-41.

74. García-López J., Mazo J. del. Expression dynamics of microRNA biogenesis during preimplantation mouse development // Biochim. Biophys. Acta - Gene Regul. Mech. 2012. Т. 1819. № 8. С. 847-854.

75. Gibbings D.J. et al. Multivesicular bodies associate with components of miRNA effector complexes and modulate miRNA activity. // Nat. Cell Biol. 2009. Т. 11. № 9. С. 1143-9.

76. Godnic I. et al. Genome-Wide and Species-Wide In Silico Screening for Intragenic MicroRNAs in Human, Mouse and Chicken // PLoS One. 2013. Т. 8. № 6. С. e65165.

77. Gomez P. et al. Radionuclide bone scintigraphy in patients with biochemical recurrence after radical prostatectomy: when is it indicated? // BJU Int. 2004. Т. 94. № 3. С. 299-302.

78. González-González E., López-Casas P.P., Mazo J. del. The expression patterns of genes involved in the RNAi pathways are tissue-dependent and differ in the germ and somatic cells of mouse testis. // Biochim. Biophys. Acta. 2008. Т. 1779. № 5. С. 306-11.

79. Gould S.J., Raposo G. As we wait: coping with an imperfect nomenclature for extracellular vesicles. // J. Extracell. vesicles. 2013. Т. 2. № 1. С. 20389.

80. Gu Z. et al. Prostate stem cell antigen (PSCA) expression increases with high gleason score, advanced stage and bone metastasis in prostate cancer. // Oncogene. 2000. Т. 19. № 10. С. 1288-96.

81. Gutman A.B., Gutman E.B. AN " ACID " PHOSPHATASE

OCCURRING IN THE SERUM OF PATIENTS WITH

120

METASTASIZING CARCINOMA OF THE PROSTATE GLAND // J. Clin. Invest. 1938. Т. 17. № 4. С. 473-478.

82. Guzman N. et al. Breast Cancer-Specific miR Signature Unique to Extracellular Vesicles Includes &quot;microRNA-like&quot; tRNA Fragments. // Mol. Cancer Res. 2015. Т. 13. № 5. С. 891-901.

83. Haldrup C. et al. Profiling of circulating microRNAs for prostate cancer biomarker discovery // Drug Deliv. Transl. Res. 2014. Т. 4. № 1. С. 19-30.

84. Hao X.-K. et al. Exosomal microRNA-141 is upregulated in the serum of prostate cancer patients // Onco. Targets. Ther. 2015. С. 139.

85. Heidenreich A. et al. Рак предстательной железы // 2011.

86. Heneghan H.M., Miller N., Kerin M.J. MiRNAs as biomarkers and therapeutic targets in cancer. // Curr. Opin. Pharmacol. 2010. Т. 10. № 5. С. 543-50.

87. Hengst U. et al. Functional and selective RNA interference in developing axons and growth cones. // J. Neurosci. 2006. Т. 26. № 21. С. 5727-32.

88. Hergenreider E. et al. Atheroprotective communication between endothelial cells and smooth muscle cells through miRNAs // Nat. Cell Biol. 2012. Т. 14. № 3. С. 249-256.

89. Hicke B.J. et al. Tenascin-C Aptamers Are Generated Using Tumor Cells and Purified Protein // J. Biol. Chem. 2001. Т. 276. № 52. С. 48644-48654.

90. Hofer M.D. et al. The role of metastasis-associated protein 1 in prostate cancer progression. // Cancer Res. 2004. Т. 64. № 3. С. 8259.

91. Hoogstrate S.W. et al. Nematode endogenous small RNA pathways // Worm. 2014. Т. 3. № 1. С. e28234.

92. Hu Q. et al. DICER- and AGO3-dependent generation of retinoic

121

acid-induced DR2 Alu RNAs regulates human stem cell proliferation. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2012. T. 19. № 11. C. 1168-75.

93. Huang L. et al. Mitochondria associate with P-bodies and modulate microRNA-mediated RNA interference. // J. Biol. Chem. 2011. T. 286. № 27. C. 24219-30.

94. Huang W. et al. High-Level Expression of microRNA-21 in Peripheral Blood Mononuclear Cells Is a Diagnostic and Prognostic Marker in Prostate Cancer // Genet. Test. Mol. Biomarkers. 2015. T. 19. № 9. C. 469-475.

95. Hutchinson L.M. et al. Use of thymosin ß15 as a urinary biomarker in human prostate cancer // Prostate. 2005. T. 64. № 2. C. 116-127.

96. Imai T. et al. Macrophage-dependent clearance of systemically administered B16BL6-derived exosomes from the blood circulation in mice // J. Extracell. Vesicles. 2015. T. 4. № 1. C. 26238.

97. Ipsaro J.J., Joshua-Tor L. From guide to target: molecular insights into eukaryotic RNA-interference machinery. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2015. T. 22. № 1. C. 20-8.

98. Iwasaki S. et al. Hsc70/Hsp90 chaperone machinery mediates ATP-dependent RISC loading of small RNA duplexes. // Mol. Cell. 2010. T. 39. № 2. C. 292-9.

99. Jain S., Parker R. The Discovery and Analysis of P Bodies // Advances in experimental medicine and biology. , 2013. C. 23-43.

100. Jakymiw A. et al. Disruption of GW bodies impairs mammalian RNA interference. // Nat. Cell Biol. 2005. T. 7. № 12. C. 1267-74.

101. Janas M.M. et al. Alternative RISC assembly: binding and repression of microRNA-mRNA duplexes by human Ago proteins. // RNA. 2012. T. 18. № 11. C. 2041-55.

102. Janas T. et al. Mechanisms of RNA loading into exosomes // FEBS Lett. 2015. T. 589. № 13. C. 1391-1398.

103. Jansen R.-P. et al. mRNA transport meets membrane traffic. // Trends

122

Genet. 2014. T. 30. № 9. C. 408-17.

104. Ji H. et al. Deep Sequencing of RNA from Three Different Extracellular Vesicle (EV) Subtypes Released from the Human LIM1863 Colon Cancer Cell Line Uncovers Distinct Mirna-Enrichment Signatures // PLoS One. 2014. T. 9. № 10. C. e110314.

105. Jiao L. et al. miR-663 induces castration-resistant prostate cancer transformation and predicts clinical recurrence. // J. Cell. Physiol. 2014. T. 229. № 7. C. 834-44.

106. Jonas S., Izaurralde E. Towards a molecular understanding of microRNA-mediated gene silencing. // Nat. Rev. Genet. 2015. T. 16. № 7. C. 421-33.

107. Josson S. et al. Stromal fibroblast-derived miR-409 promotes epithelial-to-mesenchymal transition and prostate tumorigenesis. // Oncogene. 2015. T. 34. № 21. C. 2690-9.

108. Josson S., Chung L.W.K., Gururajan M. microRNAs and Prostate Cancer. // Adv. Exp. Med. Biol. 2015. T. 889. C. 105-18.

109. Kachakova D. et al. Combinations of Serum Prostate-Specific Antigen and Plasma Expression Levels of let-7c, miR-30c, miR-141, and miR-375 as Potential Better Diagnostic Biomarkers for Prostate Cancer // DNA Cell Biol. 2015. T. 34. № 3. C. 189-200.

110. Kalantari R., Chiang C.-M., Corey D.R. Regulation of mammalian transcription and splicing by Nuclear RNAi // Nucleic Acids Res. 2016. T. 44. № 2. C. 524-537.

111. King I.N. et al. The RNA-binding protein TDP-43 selectively disrupts microRNA-1/206 incorporation into the RNA-induced silencing complex. // J. Biol. Chem. 2014. T. 289. № 20. C. 1426371.

112. Kirschner M.B. et al. Haemolysis during sample preparation alters microRNA content of plasma. // PLoS One. 2011. T. 6. № 9. C. e24145.

113. Knezevic D. et al. Analytical validation of the Oncotype DX prostate cancer assay - a clinical RT-PCR assay optimized for prostate needle biopsies. // BMC Genomics. 2013. T. 14. № 1. C. 690.

114. Knyazev E.N. et al. Plasma Levels of hsa-miR-619-5p and hsa-miR-1184 Differ in Prostatic Benign Hyperplasia and Cancer // Bull. Exp. Biol. Med. 2016. T. 161. № 1. C. 108-111.

115. Koppers-Lalic D. et al. Nontemplated nucleotide additions distinguish the small RNA composition in cells from exosomes. // Cell Rep. 2014. T. 8. № 6. C. 1649-58.

116. Kornmann B. The molecular hug between the ER and the mitochondria. // Curr. Opin. Cell Biol. 2013. T. 25. № 4. C. 443-8.

117. Kosaka N. et al. Secretory Mechanisms and Intercellular Transfer of MicroRNAs in Living Cells // J. Biol. Chem. 2010. T. 285. № 23. C. 17442-17452.

118. Kowal J. et al. Proteomic comparison defines novel markers to characterize heterogeneous populations of extracellular vesicle subtypes. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2016. T. 113. № 8. C. E968-77.

119. Kowal J., Tkach M., Théry C. Biogenesis and secretion of exosomes. // Curr. Opin. Cell Biol. 2014. T. 29. C. 116-25.

120. Kubota S. et al. Secretion of small/microRNAs including miR-638 into extracellular spaces by sphingomyelin phosphodiesterase 3. // Oncol. Rep. 2015. T. 33. № 1. C. 67-73.

121. Langsteger W. et al. Imaging of bone metastases in prostate cancer: an update. // Q. J. Nucl. Med. Mol. Imaging. 2012. T. 56. № 5. C. 447-58.

122. Laterza O.F. et al. Plasma MicroRNAs as sensitive and specific biomarkers of tissue injury. // Clin. Chem. 2009. T. 55. № 11. C. 1977-83.

123. Lee Y. et al. . The role of PACT in the RNA silencing pathway //

124

EMBO J. 2006. T. 25. № 3. C. 522-532.

124. Lee Y. et al. MicroRNA genes are transcribed by RNA polymerase II // EMBO J. 2004. T. 23. № 20. C. 4051-4060.

125. Lee Y. et al. The nuclear RNase III Drosha initiates microRNA processing // Nature. 2003. T. 425. № 6956. C. 415-419.

126. Lee Y.S. et al. Silencing by small RNAs is linked to endosomal trafficking // Nat. Cell Biol. 2009. T. 11. № 9. C. 1150-1156.

127. Leung A.K.L., Calabrese J.M., Sharp P.A. Quantitative analysis of Argonaute protein reveals microRNA-dependent localization to stress granules. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006. T. 103. № 48. C. 18125-30.

128. Leung A.K.L., Sharp P.A. Quantifying Argonaute proteins in and out of GW/P-bodies: implications in microRNA activities. // Adv. Exp. Med. Biol. 2013. T. 768. C. 165-82.

129. Li S. et al. MicroRNAs inhibit the translation of target mRNAs on the endoplasmic reticulum in Arabidopsis. // Cell. 2013. T. 153. № 3. C. 562-74.

130. Lian S.L. et al. The C-terminal half of human Ago2 binds to multiple GW-rich regions of GW182 and requires GW182 to mediate silencing. // RNA. 2009. T. 15. № 5. C. 804-13.

131. Linton K.D., Catto J.W.F. Whole-body magnetic resonance imaging and prostate cancer metastases: a new gold standard of detection, but does it help us and at what cost? // Eur. Urol. 2012. T. 62. № 1. C. 76-7.

132. Liu J. et al. Argonaute2 Is the Catalytic Engine of Mammalian RNAi // Science (80-. ). 2004. T. 305. № 5689. C. 1437-1441.

133. Liu J. et al. MicroRNA-dependent localization of targeted mRNAs to mammalian P-bodies. // Nat. Cell Biol. 2005. T. 7. № 7. C. 719-23.

134. Londin E. et al. Analysis of 13 cell types reveals evidence for the

expression of numerous novel primate- and tissue-specific

125

microRNAs. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015. T. 112. № 10. C. E1106-15.

135. Lorente J.A. et al. Clinical efficacy of bone alkaline phosphatase and prostate specific antigen in the diagnosis of bone metastasis in prostate cancer. // J. Urol. 1996. T. 155. № 4. C. 1348-51.

136. Lund E. et al. Nuclear Export of MicroRNA Precursors // Science (80-. ). 2004. T. 303. № 5654. C. 95-98.

137. Maiti M. et al. Self-complementary sequence context in mature miRNAs. // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010. T. 392. № 4. C. 572-6.

138. Makarova J.A. et al. Exercise immunology meets MiRNAs. // Exerc. Immunol. Rev. 2014. T. 20. C. 135-64.

139. Maltseva D. V et al. miRNome of inflammatory breast cancer. // BMC Res. Notes. 2014. T. 7. № 1. C. 871.

140. Maragkakis M. et al. DIANA-microT Web server upgrade supports Fly and Worm miRNA target prediction and bibliographic miRNA to disease association. // Nucleic Acids Res. 2011. T. 39. № Web Server issue. C. W145-8.

141. Marcon E. et al. miRNA and piRNA localization in the male mammalian meiotic nucleus. // Chromosome Res. 2008. T. 16. № 2. C. 243-60.

142. Maroney P.A. et al. Evidence that microRNAs are associated with translating messenger RNAs in human cells. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2006. T. 13. № 12. C. 1102-7.

143. Meister G. et al. Human Argonaute2 Mediates RNA Cleavage Targeted by miRNAs and siRNAs // Mol. Cell. 2004. T. 15. № 2. C. 185-197.

144. Melo S.A. et al. Cancer exosomes perform cell-independent microRNA biogenesis and promote tumorigenesis. // Cancer Cell. 2014. T. 26. № 5. C. 707-21.

145. Mermigka G., Verret F., Kalantidis K. RNA silencing movement in plants // J. Integr. Plant Biol. 2016. T. 58. № 4. C. 328-342.

146. Milo R. et al. BioNumbers--the database of key numbers in molecular and cell biology // Nucleic Acids Res. 2010. T. 38. № Database. C. D750-D753.

147. Mitchell P.S. et al. Circulating microRNAs as stable blood-based markers for cancer detection. // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008a. T. 105. № 30. C. 10513-10518.

148. Mitchell P.S. et al. Circulating microRNAs as stable blood-based markers for cancer detection // Proc. Natl. Acad. Sci. 2008b. T. 105. № 30. C. 10513-10518.

149. Mittelbrunn M. et al. Unidirectional transfer of microRNA-loaded exosomes from T cells to antigen-presenting cells. // Nat. Commun. 2011. T. 2. C. 282.

150. Mohler J.L. et al. Prostate Cancer, Version 1.2016. // J. Natl. Compr. Canc. Netw. 2016. T. 14. № 1. C. 19-30.

151. Mullokandov G. et al. High-throughput assessment of microRNA activity and function using microRNA sensor and decoy libraries. // Nat. Methods. 2012. T. 9. № 8. C. 840-6.

152. Muszynski J.A. et al. Supernatants from stored red blood cell (RBC) units, but not RBC-derived microvesicles, suppress monocyte function in vitro. // Transfusion. 2015. T. 55. № 8. C. 1937-45.

153. Navarro-Lérida I. et al. Rac1 Nucleocytoplasmic Shuttling Drives Nuclear Shape Changes and Tumor Invasion // Dev. Cell. 2015. T. 32. № 3. C. 318-334.

154. Neilson J.R. et al. Dynamic regulation of miRNA expression in ordered stages of cellular development. // Genes Dev. 2007. T. 21. № 5. C. 578-89.

155. Neviani P., Fabbri M. Exosomic microRNAs in the Tumor Microenvironment // Front. Med. 2015. T. 2. C. 47.

156. Nguyen H.C.N. et al. Expression differences of circulating microRNAs in metastatic castration resistant prostate cancer and low-risk, localized prostate cancer // Prostate. 2013. T. 73. № 4. C. 346354.

157. Noguchi M., Yahara J., Noda S. Serum levels of bone turnover markers parallel the results of bone scintigraphy in monitoring bone activity of prostate cancer. // Urology. 2003. T. 61. № 5. C. 993-8.

158. O'Carroll D. et al. A Slicer-independent role for Argonaute 2 in hematopoiesis and the microRNA pathway. // Genes Dev. 2007. T. 21. № 16. C. 1999-2004.

159. O'Sullivan G.J., Carty F.L., Cronin C.G. Imaging of bone metastasis: An update. // World J. Radiol. 2015. T. 7. № 8. C. 202-11.

160. O'Sullivan J.M. et al. Broadening the criteria for avoiding staging bone scans in prostate cancer: a retrospective study of patients at the Royal Marsden Hospital. // BJU Int. 2003. T. 92. № 7. C. 685-9.

161. Ohno S. h gp. Systemically Injected Exosomes Targeted to EGFR Deliver Antitumor MicroRNA to Breast Cancer Cells // Mol. Ther. 2013. T. 21. № 1. C. 185-191.

162. Ortega F.J. et al. . Inflammation triggers specific microRNA profiles in human adipocytes and macrophages and in their supernatants. // Clin. Epigenetics. 2015. T. 7. № 1. C. 49.

163. Palanichamy J.K., Rao D.S. miRNA dysregulation in cancer: towards a mechanistic understanding. // Front. Genet. 2014. T. 5. C. 54.

164. Patil P.A., Magi-Galluzzi C. MicroRNA in prostate cancer: Practical aspects. // Histol. Histopathol. 2015. T. 30. № 12. C. 1379-96.

165. Pegtel D.M. et al. Functional delivery of viral miRNAs via exosomes // Proc. Natl. Acad. Sci. 2010. T. 107. № 14. C. 6328-6333.

166. Penfornis P. et al. Extracellular vesicles as carriers of microRNA, proteins and lipids in tumor microenvironment // Int. J. Cancer. 2016. T. 138. № 1. C. 14-21.

167. Pillai R.S. h gp. Inhibition of Translational Initiation by Let-7 MicroRNA in Human Cells // Science (80-. ). 2005. T. 309. № 5740.

168. Politz J.C.R., Zhang F., Pederson T. MicroRNA-206 colocalizes with ribosome-rich regions in both the nucleolus and cytoplasm of rat myogenic cells. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006. T. 103. № 50. C. 18957-62.

169. Qi H.H. et al. Prolyl 4-hydroxylation regulates Argonaute 2 stability. // Nature. 2008. T. 455. № 7211. C. 421-4.

170. Raiborg C. et al. Repeated ER-endosome contacts promote endosome translocation and neurite outgrowth. // Nature. 2015. T. 520. № 7546. C. 234-8.

171. Rana A. et al. Identification of metastatic disease by T category, gleason score and serum PSA level in patients with carcinoma of the prostate. // Br. J. Urol. 1992. T. 69. № 3. C. 277-81.

172. Reid D.W., Nicchitta C. V. Diversity and selectivity in mRNA translation on the endoplasmic reticulum // Nat. Rev. Neurosci. 2015. T. 16. № 4. C. 221-31.

173. Reid D.W., Nicchitta C. V. Primary role for endoplasmic reticulum-bound ribosomes in cellular translation identified by ribosome profiling. // J. Biol. Chem. 2012. T. 287. № 8. C. 5518-27.

174. Reyes-Gutierrez P., Ritland Politz J.C., Pederson T. A mRNA and cognate microRNAs localize in the nucleolus. // Nucleus. 2014. T. 5. № 6. C. 636-42.

175. Ritland Politz J.C., Hogan E.M., Pederson T. MicroRNAs with a nucleolar location // RNA. 2009. T. 15. № 9. C. 1705-1715.

176. Robb G.B. et al. Specific and potent RNAi in the nucleus of human cells // Nat. Struct. Mol. Biol. 2005. T. 12. № 2. C. 133-137.

177. Rocca G. La et al. In vivo, Argonaute-bound microRNAs exist

predominantly in a reservoir of low molecular weight complexes not

associated with mRNA. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2015. T.

129

112. № 3. C. 767-72.

178. Rodriguez A. et al. Identification of Mammalian microRNA Host Genes and Transcription Units // Genome Res. 2004. T. 14. № 10a. C. 1902-1910.

179. Rossi J.J. RNAi and the P-body connection. // Nat. Cell Biol. 2005. T. 7. № 7. C. 643-4.

180. Sadovska L. et al. . Biodistribution, Uptake and Effects Caused by Cancer-derived Extracellular Vesicles // J. Circ. Biomarkers. 2015. C. 1.

181. Salmanidis M. et al. Direct transcriptional regulation by nuclear microRNAs // Int. J. Biochem. Cell Biol. 2014. T. 54. C. 304-311.

182. Saunderson S.C. et al. CD169 mediates the capture of exosomes in spleen and lymph node // Blood. 2014. T. 123. № 2. C. 208-216.

183. Schaefer A. et al. Diagnostic and prognostic implications of microRNA profiling in prostate carcinoma. // Int. J. cancer. 2010a. T. 126. № 5. C. 1166-76.

184. Schaefer A. et al. Diagnostic, prognostic and therapeutic implications of microRNAs in urologic tumors // Nat. Rev. Urol. 2010b. T. 7. № 5. C. 286-297.

185. Schraivogel D. et al. Importin-ß facilitates nuclear import of human GW proteins and balances cytoplasmic gene silencing protein levels. // Nucleic Acids Res. 2015. T. 43. № 15. C. 7447-61.

186. Schraivogel D., Meister G. Import routes and nuclear functions of Argonaute and other small RNA-silencing proteins. // Trends Biochem. Sci. 2014. T. 39. № 9. C. 420-31.

187. Schröder F.H. et al. Screening for Prostate Cancer Decreases the Risk of Developing Metastatic Disease: Findings from the European Randomized Study of Screening for Prostate Cancer (ERSPC) // Eur. Urol. 2012. T. 62. № 5. C. 745-752.

188. Selth L.A. et al. Discovery of circulating microRNAs associated with

130

human prostate cancer using a mouse model of disease // Int. J. Cancer. 2012. T. 131. № 3. C. 652-661.

189. Sen G.L., Blau H.M. Argonaute 2/RISC resides in sites of mammalian mRNA decay known as cytoplasmic bodies. // Nat. Cell Biol. 2005. T. 7. № 6. C. 633-6.

190. Sheng H. et al. . Prostaglandin E2 increases growth and motility of colorectal carcinoma cells. // J. Biol. Chem. 2001. T. 276. № 21. C. 18075-81.

191. Shiao S.L., Chu G.C.-Y., Chung L.W.K. Regulation of prostate cancer progression by the tumor microenvironment [Epub ahead of print]. // Cancer Lett. 2016.

192. Siegel R.L., Miller K.D., Jemal A. Cancer statistics, 2015. // CA. Cancer J. Clin. 2015. T. 65. № 1. C. 5-29.

193. Siomi H., Siomi M.C. On the road to reading the RNA-interference code. // Nature. 2009. T. 457. № 7228. C. 396-404.

194. Smalheiser N.R., Gomes O.L.A. Mammalian Argonaute-DNA binding? // Biol. Direct. 2014. T. 10. № 1. C. 27.

195. Smyth G.K. Linear models and empirical bayes methods for assessing differential expression in microarray experiments. // Stat. Appl. Genet. Mol. Biol. 2004. T. 3. C. Article3.

196. Squadrito M.L. et al. . Endogenous RNAs modulate microRNA sorting to exosomes and transfer to acceptor cells. // Cell Rep. 2014. T. 8. № 5. C. 1432-46.

197. Stalder L. et al. The rough endoplasmatic reticulum is a central nucleation site of siRNA-mediated RNA silencing. // EMBO J. 2013. T. 32. № 8. C. 1115-27.

198. Sweeney C.J. et al. Chemohormonal Therapy in Metastatic HormoneSensitive Prostate Cancer. // N. Engl. J. Med. 2015. T. 373. № 8. C. 737-46.

199. Tabet F. et al. HDL-transferred microRNA-223 regulates ICAM-1

131

expression in endothelial cells. // Nat. Commun. 2014. T. 5. C. 3292.

200. Taft R.J. et al. Evolution, biogenesis and function of promoter-associated RNAs. // Cell Cycle. 2009. T. 8. № 15. C. 2332-8.

201. Takahashi Y. et al. Visualization and in vivo tracking of the exosomes of murine melanoma B16-BL6 cells in mice after intravenous injection. // J. Biotechnol. 2013. T. 165. № 2. C. 77-84.

202. Tamada T. et al. Biochemical markers for the detection of bone metastasis in patients with prostate cancer: diagnostic efficacy and the effect of hormonal therapy. // J. Bone Miner. Metab. 2001. T. 19. № 1. C. 45-51.

203. Tamai K. et al. Exosome secretion of dendritic cells is regulated by Hrs, an ESCRT-0 protein // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2010. T. 399. № 3. C. 384-390.

204. Tarassov I. et al. Import of Nuclear DNA-Encoded RNAs into Mitochondria and Mitochondrial Translation // Cell Cycle. 2007. T. 6. № 20. C. 2473-2477.

205. Tay Y., Rinn J., Pandolfi P.P. The multilayered complexity of ceRNA crosstalk and competition. // Nature. 2014. T. 505. № 7483. C. 344-52.

206. Tewari M. A functional extracellular transcriptome in animals? implications for biology, disease and medicine // Genome Biol. 2015. T. 16. № 1. C. 47.

207. Thomas B.G., Hamdy F.C. Bone morphogenetic protein-6: potential mediator of osteoblastic metastases in prostate cancer // Prostate Cancer Prostatic Dis. 2000. T. 3. № 4. C. 283-285.

208. Thomsen M.K. et al. Loss of JUNB/AP-1 promotes invasive prostate cancer. // Cell Death Differ. 2015. T. 22. № 4. C. 574-82.

209. Toh Y., Pencil S.D., Nicolson G.L. A novel candidate metastasis-

associated gene, mta1, differentially expressed in highly metastatic

mammary adenocarcinoma cell lines. cDNA cloning, expression, and

132

protein analyses. // J. Biol. Chem. 1994. T. 269. № 37. C. 22958-63.

210. Tombal B., Lecouvet F. Modern Detection of Prostate Cancer's Bone Metastasis: Is the Bone Scan Era Over? // Adv. Urol. 2012. T. 2012. C. 893193.

211. Tonevitsky A.G. et al. Dynamically regulated miRNA-mRNA networks revealed by exercise. // BMC Physiol. 2013. T. 13. № 1. C. 9.

212. Tosar J.P. et al. Assessment of small RNA sorting into different extracellular fractions revealed by high-throughput sequencing of breast cell lines. // Nucleic Acids Res. 2015. T. 43. № 11. C. 560116.

213. Turchinovich A. et al. Characterization of extracellular circulating microRNA // Nucleic Acids Res. 2011. T. 39. № 16. C. 7223-7233.

214. Turchinovich A. et al. Check and mate to exosomal extracellular miRNA: new lesson from a new approach. // Front. Mol. Biosci. 2015. T. 2. C. 11.

215. Turchinovich A. et al. Circulating miRNAs: cell-cell communication function? // Front. Genet. 2013. T. 4. C. 119.

216. Turchinovich A., Weiz L., Burwinkel B. Extracellular miRNAs: the mystery of their origin and function. // Trends Biochem. Sci. 2012. T. 37. № 11. C. 460-5.

217. Turchinovich A., Weiz L., Burwinkel B. Isolation of circulating microRNA associated with RNA-binding protein. // Methods Mol. Biol. 2013. T. 1024. C. 97-107.

218. Turner M.L., Schnorfeil F.M., Brocker T. MicroRNAs Regulate Dendritic Cell Differentiation and Function // J. Immunol. 2011. T. 187. № 8. C. 3911-3917.

219. Uhlemann M. et al. Circulating microRNA-126 increases after different forms of endurance exercise in healthy adults. // Eur. J. Prev. Cardiol. 2014. T. 21. № 4. C. 484-91.

220. Valdmanis P.Net al. Expression determinants of mammalian argonaute proteins in mediating gene silencing. // Nucleic Acids Res. 2012. T. 40. № 8. C. 3704-13.

221. Vickers K.C. et al. MicroRNAs are transported in plasma and delivered to recipient cells by high-density lipoproteins // Nat. Cell Biol. 2011. T. 13. № 4. C. 423-433.

222. Vieira F.Q. et al. Deregulated expression of selected histone methylases and demethylases in prostate carcinoma. // Endocr. Relat. Cancer. 2014. T. 21. № 1. C. 51-61.

223. Villarroya-Beltri C. et al. Sumoylated hnRNPA2B1 controls the sorting of miRNAs into exosomes through binding to specific motifs. // Nat. Commun. 2013. T. 4. C. 2980.

224. Vlachos I.S. et al. DIANA-TarBase v7.0: indexing more than half a million experimentally supported miRNA:mRNA interactions. // Nucleic Acids Res. 2015. T. 43. № Database issue. C. D153-9.

225. Vlist E.J. van der et al. CD4(+) T cell activation promotes the differential release of distinct populations of nanosized vesicles. // J. Extracell. vesicles. 2012. T. 1. № 1. C. 18364.

226. Wach S. et al. The combined serum levels of miR-375 and urokinase plasminogen activator receptor are suggested as diagnostic and prognostic biomarkers in prostate cancer // Int. J. Cancer. 2015. T. 137. № 6. C. 1406-1416.

227. Wang B. et al. Distinct passenger strand and mRNA cleavage activities of human Argonaute proteins. // Nat. Struct. Mol. Biol. 2009. T. 16. № 12. C. 1259-66.

228. Wang B. et al. Recapitulation of short RNA-directed translational gene silencing in vitro. // Mol. Cell. 2006. T. 22. № 4. C. 553-60.

229. Wang D. et al. Quantitative functions of Argonaute proteins in mammalian development // Genes Dev. 2012. T. 26. № 7. C. 693704.

230. Warraich S.T. et al. TDP-43: A DNA and RNA binding protein with roles in neurodegenerative diseases // Int. J. Biochem. Cell Biol. 2010. T. 42. № 10. C. 1606-1609.

231. Watahiki A. et al. Plasma miRNAs as biomarkers to identify patients with castration-resistant metastatic prostate cancer. // Int. J. Mol. Sci. 2013. T. 14. № 4. C. 7757-70.

232. Weber J.A. et al. The microRNA spectrum in 12 body fluids. // Clin. Chem. 2010. T. 56. № 11. C. 1733-41.

233. Wei W. et al. A Role for Small RNAs in DNA Double-Strand Break Repair // Cell. 2012. T. 149. № 1. C. 101-112.

234. Wei Y. et al. Importin 8 Regulates the Transport of Mature MicroRNAs into the Cell Nucleus // J. Biol. Chem. 2014. T. 289. № 15. C. 10270-10275.

235. Wicklein D. RNAi technology to block the expression of molecules relevant to metastasis: The cell adhesion molecule CEACAM1 as an instructive example // Methods Mol. Biol. 2012. T. 878. C. 241-250.

236. Wiklander O.P.B. et al. Extracellular vesicle in vivo biodistribution is determined by cell source, route of administration and targeting // J. Extracell. Vesicles. 2015. T. 4. № 1. C. 26316.

237. Willms E.et al. et al. Cells release subpopulations of exosomes with distinct molecular and biological properties. // Sci. Rep. 2016. T. 6. C. 22519.

238. Wilson R.C. et al. Dicer-TRBP complex formation ensures accurate mammalian microRNA biogenesis. // Mol. Cell. 2015. T. 57. № 3. C. 397-407.

239. Winter J., Diederichs S. Argonaute proteins regulate microRNA stability: Increased microRNA abundance by Argonaute proteins is due to microRNA stabilization // RNA Biol. 2011. T. 8. № 6. C. 1149-1157.

240. Wolff J.M. et al. Metastatic workup of patients with prostate cancer

135

employing alkaline phosphatase and skeletal alkaline phosphatase. // Anticancer Res. T. 19. № 4A. C. 2653-5.

241. Wu P.-H., Isaji M., Carthew R.W. Functionally diverse microRNA effector complexes are regulated by extracellular signaling. // Mol. Cell. 2013. T. 52. № 1. C. 113-23.

242. Yaman Agaoglu F. et al. Investigation of miR-21, miR-141, and miR-221 in blood circulation of patients with prostate cancer. // Tumour Biol. 2011. T. 32. № 3. C. 583-8.

243. Yekta S., Shih I.-H., Bartel D.P. MicroRNA-directed cleavage of HOXB8 mRNA. // Science. 2004. T. 304. № 5670. C. 594-6.

244. Yi R. et al. Exportin-5 mediates the nuclear export of pre-microRNAs and short hairpin RNAs. // Genes Dev. 2003. T. 17. № 24. C. 3011-6.

245. Zamore P.Det al. et al. RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals. // Cell. 2000. T. 101. № 1. C. 25-33.

246. Zamudio J.R., Kelly T.J., Sharp P.A. Argonaute-bound small RNAs from promoter-proximal RNA polymerase II. // Cell. 2014. T. 156. № 5. C. 920-34.

247. Zeng Y. et al. Phosphorylation of Argonaute 2 at serine-387 facilitates its localization to processing bodies. // Biochem. J. 2008. T. 413. № 3. C. 429-36.

248. Zernecke A. et al. Delivery of microRNA-126 by apoptotic bodies induces CXCL12-dependent vascular protection. // Sci. Signal. 2009. T. 2. № 100. C. ra81.

249. Zhang H.-L. et al. An elevated serum miR-141 level in patients with bone-metastatic prostate cancer is correlated with more bone lesions // Asian J. Androl. 2013. T. 15. № 10. C. 231-235.

250. Zhang H.-L. et al. Serum miRNA-21: Elevated levels in patients with

metastatic hormone-refractory prostate cancer and potential

136

predictive factor for the efficacy of docetaxel-based chemotherapy // Prostate. 2011. T. 71. № 3. C. 326-331.

251. Zhang X. et al. MicroRNA directly enhances mitochondrial translation during muscle differentiation. // Cell. 2014. T. 158. № 3. C. 607-19.

252. Zhu J. et al. Screening key microRNAs for castration-resistant prostate cancer based on miRNA/mRNA functional synergistic network. // Oncotarget. 2015. T. 6. № 41. C. 43819-30.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.