Оценка диагностичеcкого потенциала циркулирующих микроРНК при первичных опухолях головного мозга тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Пушкин Антон Андреевич

• Пушкин Антон Андреевич
• кандидат наук
• 2022

Оглавление диссертации кандидат наук Пушкин Антон Андреевич

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ДИАГНОСТИКЕ И КЛАССИФИКАЦИИ ГЛИАЛЬНЫХ ОПУХОЛЕЙ ГОЛОВНОГО МОЗГА (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1 Классификация глиом

1.2 Инструментальная диагностика

1.3 Лабораторная диагностика

1.4 Жидкостная биопсия при опухолевых заболеваниях

1.5 Циркулирующие нуклеиновые кислоты при глиальных опухолях мозга

1.6 Экспорт микроРНК в систему кровообращения

1.7 МикроРНК - потенциальный классификационный маркер

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Поиск оптимальных маркеров HGG

2.1.1 Сбор и анализ данных секвенирования нового поколения циркулирующих микроРНК пациентов с HGG

2.1.2 Предварительная обработка данных и анализ дифференциальной экспрессии

2.1.3 Поиск сигнатур микроРНК для классификации исследуемых групп

2.1.4 Построение сети генов-мишеней микроРНК и белок-белковых взаимодействий

2.2 Поиск оптимальных маркеров LGG

2.3 Сбор и хранение образцов

2.4 Выделение фракции микроРНК из образцов ткани и плазмы

2.5 Скрининг относительной экспрессии микроРНК в исследуемых образцах

2.6 Статистическая обработка данных

ГЛАВА 3. КОМПЛЕКСНЫЙ АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ МИКРОРНК В ПЛАЗМЕ КРОВИ БОЛЬНЫХ С ГЛИАЛЬНЫМИ ОПУХОЛЯМИ ГОЛОВНОГО МОЗГА

3.1 Анализ данных проекта Gene Expression Omnibus (GEO)

3.1.1 Результаты анализа экспрессии циркулирующих микроРНК с помощью DESeq

3.1.2 Анализ дифференциально экспрессируемых микроРНК с использованием

алгоритмов машинного обучения

3.1.3 Анализ генов-мишеней значимых микроРНК

3.2 Исследование экспрессии микроРНК в плазме крови методом ПЦР в реальном времени

3.2.1 Оценка относительной экспрессии микроРНК в плазме крови пациентов основной, контрольной и группы сравнения

3.2.2 Экспрессия микроРНК в плазме крови пациентов основной группы в

зависимости от степени злокачественности

ГЛАВА 4. СПОСОБ МАЛОИНВАЗИНОЙ ДИАГНОСТИКИ ГЛИАЛЬНЫХ ОПУХОЛЕЙ ГОЛОВНОГО МОЗГА НА ОСНОВЕ ЦИРКУЛИРУЮЩИХ МИКРОРНК

4.1 Дифференциальная диагностика пациентов основной группы, группы сравнения и контрольной группы

4.2 Дифференциальная диагностика субтипов основной группы

ГЛАВА 5. АНАЛИЗ ЭКСПРЕССИИ ДИАГНОСТИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫХ

МИКРОРНК В ТКАНЯХ ГЛИАЛЬНЫХ ОПУХОЛЕЙ ГОЛОВНОГО МОЗГА

5.1 Показатели относительной экспрессии диагностически значимых

микроРНК в образцах опухолей ОП-1У в сравнении с условно-здоровой тканью

5.2 Зависимость относительной экспрессии микроРНК в плазме от

относительной экспрессии в ткани опухоли

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оценка диагностичеcкого потенциала циркулирующих микроРНК при первичных опухолях головного мозга»

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы научного исследования

Глиомы - наиболее распространенные инвазивные первичные опухоли мозга у взрослых, которые характеризуются высокими уровнями смертности и рецидивирования после хирургического удаления, частота встречаемости в мире составляет 5 человек на 100000 населения (Мацко Д. Е. и др., 2021; Рыжова М. В. и др., 2021). К этим новообразованиям относятся астроцитарные, олигодендроглиальные, эпендимарные, нейрональные, смешанные нейронально -глиальные, эмбриональные и более редкие, например, опухоли сосудистых сплетений, опухоли пинеальной области (Росторгуев Э.Е., 2021).

Глиомы поражают головной и спинной мозг и возникают в результате онкотрансформации глиальных клеток. Приблизительно 70% всех глиом относятся к злокачественным; 5-летний рубеж выживаемости преодолевают лишь 20 пациентов с данным заболеванием. Эти значения формируются за счет фактора гетерогенности опухолевой ткани и ее высокого инфильтративного потенциала.

Ранняя диагностика внутримозговых опухолей имеет решающее значение в исходах лечения. На сегодняшний день уже определены группы риска развития опухолей головного мозга у детей, но среди пациентов старше 18-ти лет заболевание является спорадическим, без коррелятивно подтвержденных факторов риска. Пока опухолевая инфильтрация глиомы низкой или высокой степени злокачественности не достигнет функционально значимых участков головного мозга или не блокирует пути ликворооттока, пациент не будет иметь клинически значимых проявлений, а диагностика заболевания будет проводиться слишком поздно (Росторгуев Э.Е., 2008).

Методы нейровизуализации (МРТ, РКТ, ПЭТ-КТ), широкодоступные в амбулаторной практике на сегодня, недостаточно полно решают задачу выявления опухолей ЦНС на ранней стадии развития заболевания.

В 2008 году Skog и соавторы описали, что экзосомы, высвобождаемые из глиальных опухолевых клеток, несут множество белков и ангиогенных

факторов, которые могут исследоваться в плазме пациентов (Skog J. et al. 2008). В дальнейшем, показано, что здоровые клетки, как и опухолевые также секретируют экзосомы для обеспечения информационного обмена между собой (Dai X. et al. 2019).

В 2015 году Lai N. S. с соавторами отметили, что дифференциальная экспрессия экзосомальных микроРНК является потенциальным биомаркером для диагностики и прогноза глиом, а по данным Li H. Y. и Zhao H., циркулирующие микроРНК могут стать альтернативой традиционной верификации опухолей ЦНС (Lai N. S., 2015; Li H. Y. et al., 2016; Zhao H. et al., 2017). В результате исследований доказано, что микроРНК в плазме или сыворотке крови чрезвычайно стабильны и доступны к скринингу, что делает эти молекулы потенциально диагностически значимыми в клинической практике. Ряд исследований показал возможность использования циркулирующих микроРНК в качестве неинвазивных биомаркеров у пациентов с глиальными опухолями ЦНС (Росторгуев Э.Е., 2021; Becker A. P. et al., 2021, Chen T. et al., 2021; Yuan F. et al., 2021).

Таким образом, создание доступной малоинвазинвой скрининговой панели для выявления возможного текущего бластоматозного процесса ЦНС у взрослого населения актуализирует изучение неинвазивных биомаркеров с высокими уровнями чувствительности и специфичности, которые возможно улучшат раннюю диагностику, выявят новые мишени таргетной терапии у пациентов с глиальными опухолями различной степени злокачественности.

Степень разработанности темы

Ряд публикаций, показавших изменение уровня экспрессии микроРНК в биологических жидкостях при онкологических заболеваниях, в том числе при опухолях головного мозга, не демонстрируют единого подхода к формированию диагностических панелей. Каждое новое исследование является уникальным, как и предлагаемые авторами наборы микроРНК для панелей малоинвазивной диагностики глиальных опухолей головного мозга различной степени злокачественности.

Цель научного исследования

Разработка и оценка панели для дифференциальной диагностики опухолей глиального ряда на основе циркулирующих в плазме крови микроРНК.

Задачи научного исследования:

1. Провести биоинформатический анализ доступных данных секвенирования нового поколения микроРНК в плазме крови пациентов с глиальными опухолями в сравнении с условно-здоровыми донорами.

2. Оценить уровень экспрессии набора микроРНК в образцах плазмы пациентов с глиомами различной степени злокачественности, оболочечными опухолями и условно-здоровых доноров.

3. Оценить профиль экспрессии диагностически значимых микроРНК в образцах тканей глиом.

4. Разработать панели циркулирующих микроРНК для малоинвазивной дифференциальной диагностики глиальных опухолей головного мозга методом полимеразной цепной реакции.

Научная новизна исследования

В рамках работы впервые показана перспективность оценки и использования циркулирующих микроРНК для диффернциальной диагностики глиальных опухолей астроцитарного ряда различной степени злокачественности. Предложен подход к анализу данных профилирования микроРНК с использованием комбинации биоинформатических подходов и методов машинного обучения. Комбинация перечисленных подходов была впервые предложена в данной работе.

Теоретическая и практическая значимость исследования

Выявлен уникальный набор значимых и дифференциально-экспрессируемых микроРНК в образцах плазмы пациентов с глиальными опухолями различной степени злокачественности. Результаты исследования могут быть применены для клинических испытаний тест-системы на базе

микроРНК-панели, что может повысить эффективность ранней диагностики данного заболевания.

Методология и методы исследования

Диссертационная работа построена на последовательном применении методов научного познания. Работа выполнена в дизайне открытого сравнительного исследования с использованием молекулярно-биологических, статистических и биоинформационных методов, в том числе с использованием контролируемого машинного обучения.

Положения, выносимые на защиту

• Для малоинвазивной диагностики глиальных опухолей астроцитарного ряда и их разграничения от оболочечных опухолей головного мозга целесообразно использовать показатели относительной экспрессии микроРНК-21-5р, микроРНК-342-3р и микроРНК-3180-3р в плазме крови.

• Для малоинвазивной дифференцировки по степени злокачественности глиальных опухолей астроцитарного ряда целесообразно использовать показатели относительной экспрессии в плазме крови микроРНК-21-5р, микроРНК-1е1-7е-5р, микроРНК-190-5р.

Степень достоверности и апробация результатов

Диссертационная работа выполнена на современном научном уровне. Достоверность научных положений и выводов диссертационной работы подтверждается результатами анализа клинического и экспериментального материала, методами диагностики, данными статистической обработки полученных результатов. В работе использовались современные клинические и лабораторные методы исследования.

Проведена статистическая обработка данных с определением достоверности полученных результатов, на основе чего сделаны обоснованные выводы и предложены практические рекомендации.

Основные положения научной работы были представлены на следующих конференциях: The 2022 ASCO Annual Meeting, 2022; конференция «Современная нейрохирургия в Южном Федеральном округе», 2021; 3-я научно-практическая онлайн-конференция Российского Общества Медицинских Генетиков, 2021; конференция «Молекулярная диагностика 2021», 2021.

Апробация диссертации состоялась 16.06.2022 года на заседании Ученого совета при ФГБУ «НМИЦ онкологии» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 5 печатных работ, из них 2 в журналах, рецензируемых Scopus/Web of Science и 2 в рецензируемом научном журнале, рекомендованном Высшей аттестационной комиссией Министерства науки и высшего образования Российской Федерации для публикаций основных результатов диссертаций на соискание ученой степени кандидата биологических наук.

Структура и объем диссертации

Диссертационная работа состоит из введения, 5 глав, заключения, выводов и списка литературы. Материал изложен на 141 странице и содержит 29 рисунков, 14 таблиц и список литературы, включающий 234 источников, в том числе 1 8 отечественных.

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПОДХОДЫ К ДИАГНОСТИКЕ И КЛАССИФИКАЦИИ ГЛИАЛЬНЫХ ОПУХОЛЕЙ ГОЛОВНОГО МОЗГА

(ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

Глиомы являются наиболее частыми опухолями центральной нервной системы. Подавляющее большинство случаев развития глиом являются спорадическими, но некоторые семейные случаи связаны с наследственными синдромами, включая нейрофиброматоз I типа, туберозный склероз, синдром Тюрко, синдром Ли-Фраумени и синдром Линча (Росторгуев Э.Е., 2008; Low J. T. et al., 2022;).

В 2018 году в США диагностировано около 84170 новых случаев первичных злокачественных и незлокачественных опухолей головного мозга и спинного мозга. Среди этих случаев 25 130 были первичных злокачественных и 59 040 незлокачественных опухолей ЦНС. Уровень заболеваемости первичными глиальными злокачественными опухолями головного мозга и других отделов ЦНС во всем мире в 2018 году составил 3,5 на 100 000 человек (Low J. T. et al., 2022).

Показатели заболеваемости в разбивке по полу составляют 3,9 на 100 000 среди мужчин и 3,1 на 100 000 среди женщин. Это, ориентировочно, 162 534 мужчин и 134 317 женщин, которым в 2018 году была диагностирована первичная злокачественная опухоль головного мозга среди мирового населения и в общей сложности 296 851 человек (Bray F. et al., 2018).

Согласно опубликованным данным, 10-летнюю выживаемость достигают примерно 43% больных c глиомой низкой степени злокачественности (low grade glioma, LGG). При прогрессии до глиомы высокой степени злокачественности (high grade glioma, HGG), общая выживаемость пациентов сокращается до 15 месяцев (Smoll N. R. et al., 2012; Oike T. et al., 2013).

В общей совокупности, первичные глиальные опухоли астроцитарного ряда GII-GIV и оболочечные опухоли составляют около 60 процентов от всех первичных опухолей головного мозга (Росторгуев Э.Е., 2021).

1.1 Классификация глиом

Традиционно Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ, WHO) классифицировала глиомы на четыре степени (Grade, G). LGG, глиомы низкой степени злокачественности - пилоидная астроцитома - GI, диффузная астроцитома - GII; и HGG, глиомы высокой степени злокачественности -анапластическая астроцитома - GIII и глиобластома - GIV (Louis D. N. et al., 2007).

Ранее степень анаплазии глиом определялась на гистологических характеристиках, включая клеточную атипию, митотическую активность, неоангиогенез и некроз опухоли. Некоторые признаки атипии затруднительно распознать и трактовать. Патоморфолог вносил некоторый субъективный взгляд в оценку данных признаков (Кит О.И. и др., 2015; Hsieh K. L. C. et al., 2017).

Для уменьшения субъективизма в нейроонкологии, классификация глиом была значительно изменена в версии ВОЗ «Классификация опухолей ЦНС» 2016 года (The 2016 World Health Organization Classification of Tumors of the Central Nervous System, CNS WHO 2016). В обновленной CNS WHO 2016. в дополнении к традиционным гистологическим исследованиям для диагностики опухолей ЦНС было введено использование молекулярных параметров. Это привело к серьезной реструктуризации классификации многих опухолей, особенно глиального происхождения.

Использование интегрированных фенотипических и генотипических параметров для классификации опухолей ЦНС повысило объективность диагностики и потребовало более широкую доступность молекулярного тестирования. По мере увеличения понимания молекулярных изменений в опухолях ЦНС и их прогностического значения, увеличивается роль молекулярных маркеров в диагностике и классификации опухолей ЦНС. (Кит О.И. и др., 2017).

Современная классификация WHO CNS пятого издания включает в себя многочисленные молекулярные-генетические изменения с клиническим и прогностическим значением. WHO CNS 5 основывается на многочисленных разработках Консорциума по информированию о молекулярных и практических подходах к таксономии опухолей ЦНС (Ellison D.W. et al., 2019). В классификацию WHO CNS 5 внесены существенные изменения и увеличена роль молекулярной диагностики, но при этом сохраняются устоявшиеся подходы к характеристике опухолей на основе гистологических и иммуногистохимических исследований (Louis D. N. et al., 2021; Weller M. et al., 2021).

На данный момент WHO CNS 5 классифицирует глиомы, глионейрональные и нейрональные опухоли на 6 разных семейств:

1. диффузные глиомы взрослого типа (большинство первичных опухолей головного мозга в нейроонкологической практике взрослых, например, глиобластома IDH-дикого типа);

2. диффузные глиомы низкой степени злокачественности детского типа (ожидается хороший прогноз);

3. диффузные глиомы высокой степени злокачественности детского типа (ожидается агрессивное поведение);

4. ограниченные астроцитарные глиомы («ограниченные» в связи с их более плотным характером роста, в отличие от изначально «диффузных» опухолей в группах 1, 2 и 3);

5. глионейрональные и нейрональные опухоли (разнообразная группа опухолей, отличающихся дифференцировкой нейронов);

6. эпендимомы (теперь классифицируются по локализации, а также по гистологическим и молекулярным признакам).

Опухоли сосудистого сплетения с их выраженными эпителиальными характеристиками отделены от категории глиом, глионейрональных опухолей и нейрональных опухолей (Wen P. Y. et al., 2021).

В таблице 1.1 перечислены ключевые гены и белки, которые анализируются в соответствии с WHO CNS 5 на предмет диагностических изменений, важных для комплексной классификации глиальных опухолей ЦНС. Таблица 1.1 - Ключевые диагностические гены, хромосомные перестройки и/или их комбинации в глиальных опухолях

Тип глиальной опухоли Гены / молекулярные профили

Астроцитома, ГОН-мутантная ЮШ, ЮШ, ATRX, TP53, CDKN2A/B

Олигодендроглиома, ГОН-мутантная с 1р/19д-коделецией IDH1, ЮШ, 1p/19q, промотор гена TERTr, С1С, ЕПВР1, NOTCH1

Глиобластома, ГОН-^Г ЮН-ЖГ, промотор гена TERT, екг 7/10, EGFR

Диффузная астроцитома, МУБ- или МУБЬ1 -мутантные ЫУВ, ЫУВЫ

Ангиоцентрическая глиома ЫУВ

Диффузная глиома низкой степени злокачественности, мутации МАРК-пути FGFR1, BRAF

Диффузная глиома средней линии, Н3 К27-мутантная Н3(К27), ТР53, АСУШ, PDGFRA, EGFR, ЕШР

Хорошим примером значения молекулярной диагностики является тот факт, что существует часть диффузных астроцитарных глиом IDH-WT, по гистологическим критериям относящаяся к субтипу ОП-ОШ, но опухоль имеет агрессивное клиническое течение с низкими показателями выживаемости, как у пациентов с ГБ IDH-WT О1У В результате исследований было выяснено, что эти опухоли имеют общие молекулярно-генетические параметры и были

сформированы в группу диффузных астроцитарных глиом IDH-WT GIV по следующим молекулярно-генетическим аберрациям:

1. Увеличение копий хромосомы 7 вместе с полной потерей хромосомы 10 (+7/-10);

2. амплификация EGFR;

3. мутация промотора TERT.

Исследования, в которых оценивалась частота +7/-10, амплификация EGFR и мутации промотора TERT, продемонстрировали более высокий процент этих изменений в глиобластомах по сравнению с GII-III (Collins V. P. et al., 2014).

1.2 Инструментальная диагностика

У пациентов с первичными опухолями головного мозга клиническая картина многообразна и связана с развитием как очаговой, так и общемозговой симптоматики. Момент проявления симптомов зависит от интенсивности распространения и месторасположения очага, что зачастую обеспечивает позднее выявление заболевания.

Степень и вид неврологических нарушений зависит только от расположения опухоли в тех или иных структурах ЦНС и их функциональной значимости. На сегодняшний день, опухоли ЦНС часто обнаруживаются при проведении МРТ или РКТ исследований в связи с другими диагностическими задачами (Zhang H. Y. et al., 2020; Росторгуев Э.Е., 2021).

Комплексное обследование пациентов с МРТ позитивными кольцевидными образованиями при введении контрастного вещества направлено на дифференциальную диагностику первичного поражения головного мозга от метастатического (Балязин-Парфенов И. В. и др., 2015; Кит О.И. и др., 2017; Неродо Г. А. и др., 2017).

Обычно, предоперационное амбулаторное обследование больного включает МРТ-исследование головного мозга с учетом требований к стереотаксической нейрохирургии с захватом крайних точек головы и необходимым отступом от них (Росторгуев Э.Е., 2021). При необходимости

выполняется РКТ, РКТ ангиография, РКТ перфузия или ПЭТ КТ с 11С метионином (Кит О. И. и др., 2017). Также проводится стандартное МРТ-сканирование с получением T2-FLAIR, Т1 (BRAVO) и Т2 -взвешенных MP-изображений в аксиальной плоскости, сагиттальных и корональных Т2-ВИ (Росторгуев Э. Е. и др., 2017). В течение 72 часов после операции всем больным выполняют МРТ с контрастным веществом для оценки масштабов удаления опухоли (Nabors L. B. et al., 2020).

Таким образом, предположение о наличии у больного глиальной опухоли строится на стандартных МРТ-признаках с контрастным веществом.

Для дополнительной характеристики сосудистой сети и метаболизма выполняются мультимодальные МРТ-исследования (диффузионно-взвешенная визуализация, диффузионно-тензорная визуализация, МР-перфузия и МР-спектроскопия). Эти методы демонстрируют параметры, позволяющие дифференцировать опухолевые и неопухолевые процессы и изменения после лечения (Кит О. И. и др., 2021).

При магнитно-резонансной томографии часто трудно дифференцировать прогрессирование опухоли от феномена псевдопрогрессии или радионекроза (Neagu M. R. et al., 2015). Предпринимались попытки проведения дифференциальной диагностики с использованием ПЭТ-КТ и МР-спектроскопии, но была показана невысокая специфичность и чувствительность этих методов обследования (Tsougos I. et al., 2012).

Феномен псевдопрогрессии наблюдается у 10-30% пациентов с глиобластомой в течение первых 12 недель лечения, особенно в случаях с метилированием промотора гена MGMT (Müller Bark J. et al., 2020). Это вызвано местной воспалительной реакцией на лечение, что нейровизуализационно проявляется в увеличении контрастности (Zhang J. et al., 2015). Радионекроз, в свою очередь, является следствием прямого воздействия энергии фотонов на ткань головного мозга и его сосудистую систему, что меняет параметры гематоэнцефалического барьера (ГЭБ), вследствие чего происходит имитация прогрессирования опухоли при МРТ-нейровизуализации с контрастным

усилением (Ellingson B. M. et al., 2017). Таким образом, проблема ошибочной расшифровки нейровизаулизационных паттернов опухоли зачастую приводят к дополнительным и ненужным терапевтическим или даже хирургическим воздействиям или, наоборот, к ошибочному прекращению терапии у пациента.

Ежедневно во всем мире накапливается огромное количество DICOM-данных РКТ, МРТ, ПЭТ-КТ нейровизуализации глиом. Визуализация опухоли, определение степени ее злокачественности с использованием различных последовательностей визуализации изображений безусловно зависит и от мнения эксперта. Таким образом, затруднения в расшифровке нейровизуализационных паттернов опухолевого поражения и в оценки эффекта мультимодальной терапии, свидетельствуют о высокой актуальности альтернативных дополнительных методик диагностики у нейроонкологической группы больных. Если методы неинвазивной жидкой биопсии окажутся воспроизводимыми и информативными для диагностики опухолей головного мозга, определения ответа на лечение, у клиницистов появится новый мощный инструмент ведения пациентов, который может быть более объективным, чем современные методы нейровизуализациии.

1.3 Лабораторная диагностика

Диагностика опухолей ЦНС претерпела революционные изменения, начиная от световой микроскопии, гистохимического окрашивания, электронной микроскопии, иммуногистохимии до методов молекулярного профилирования. Каждый из методов увеличивал качество и объективность в оценках текущего бластоматозного процесса и находил определенную нишу в ряду многих методов, но не вытеснял их окончательно (Becker A. P. et al., 2021).

За последние десятилетия секвенирование ДНК и РНК, флуоресцентная гибридизация ДНК in situ, профилирование экспрессии РНК внесли вклад в эволюцию диагностики и классификации опухолей, о чем свидетельствуют изменения в изданиях WHO CNS IV от 2016 г. и WHO CNS V от 2021 г. (Louis D.N., 2021).

В настоящее время нет конкретных рекомендаций по поводу использования тех или иных методов молекулярно-генетического тестирования, за исключением случаев, когда определенный метод однозначно требуется для верификации типа или подтипа опухоли.

Все вышеупомянутые в подглаве 1.1 маркеры идентифицируются иммуногистохимическими исследованиями, флуоресцентной гибридизацией in situ (fluorescence in situ hybridization, FISH), полимеразной цепной реакцией (ПЦР), микроматричным анализом или секвенированием нового поколения (next generation sequencing, NGS), которые часто доступны (за исключением микроматричного анализа или секвенирования нового поколения) в клинической практике; однако для этих методов всегда требуются образцы опухоли, и их нельзя использовать для мониторинга реакции на лечение в реальном времени, для выявления рецидива опухоли. Молекулярно-генетические признаки могут быть выявлены рядом лабораторных приемов, ниже описаны наиболее значимые маркеры и методы их диагностики.

Мутации в IDH1 и IDH2 проявляются заменой аргинина в кодонах R132 и R172 соответственно. Эффективным и надежным тестом является иммуногистохимическое исследование IDH1-R132H. Но кроме IDH1-R132H встречаются мутации R132C, R132S, R132G и R132L. Мутации IDH2 составляют примерно 3 всех мутаций IDH и чаще встречаются в олигодендроглиомах, чем в астроцитомах. Тестирование мутаций, отличных от IDH1-R132H, выполняется с использованием пиросеквенирования, секвенирования по Сэнгеру, ПЦР или NGS. Профилирование метилирования ДНК так же является подходом, способным идентифицировать IDH-мутантные подтипы (Killela P. J. et al., 2014).

В присутствии мутаций генов IDH1/2 следует оценивать мутационные статусы ATRX и TP53. Коделеция 1p/19q оценивается в IDHl/2-мутантных диффузных глиомах, без изменений ATRX или TP53 (Van den Bent M. J. et. al., 2018).

Инактивация гена ATRX обеспечивает негативную регуляцию механизма сокращения длины теломер. Потеря экспрессии ядерного белка ATRX

оценивается с использованием иммуногистохимического анализа, однако, методика технически сложна и для точной оценки требует присутствия положительных и отрицательных стандартных контролей. Существует сильная обратная корреляция между потерей экспрессии ATRX и наличием коделеции 1p/19q, и наиболее надежным способом оценки мутаций в гене ATRX выступает секвенирование нового поколения (Bienkowski M. et al., 2018).

Мутации гена TP53 встречаются в 94% /DH-мутантных диффузных глиомах и приводят к активации и стабильной экспрессии белка p53. Это обеспечивает конкурентное преимущество ИГХ исследований для скрининга данной аберрации (Suzuki H. et al., 2015).

Для постановки диагноза «олигодендроглиома» необходимо выявление коделеции 1p/19q в присутствии мутации /DH1/2. Наличие коделеции 1p/19q всегда положительно коррелирует с наличием мутаций либо в /DH1, либо в /DH2 (Clark K. et al., 2013). К оптимальным подходам оценки коделеции относятся цитогенетические методы или NGS. Для снижения стоимости исследования используются подходы на основе FISH или ПЦР. Профилирование метилирования ДНК может идентифицировать метилом, характерный для олигодендроглиом, и имеет дополнительное преимущество, заключающееся в анализе копийности генов, что может напрямую демонстрировать статус коделеции 1p/19q (Capper D. et al., 2018).

Многочисленные исследования показали, что делеция CDKN2A/B является неблагоприятным прогностическим фактором при астроцитомах с мутацией /DH1/2. Поскольку гомозиготная делеция CDKN2A/B может наблюдаться и при других типах первичных опухолей головного мозга, включая глиобластому /DH-WT, плеоморфную ксантоастроцитому и анапластическую астроцитому, этот маркер исследуется конкретно среди /DH-мутантных астроцитом (Purkait S. et al., 2013). Оценивается методами FISH, микроматричным анализом или методом мультиплексной амплификации лигированных зондов.

Метилирование промотора гена MGMT является важным прогностическим маркером, особенно для глиобластом (Brito C. et al., 2019). На результаты оценки

метилирования влияет выбор тестируемых CpG-островков и промоторных областей, а также используемая аналитическая платформа. Методы для оценки статуса метилирования промотора MGMT включают качественную или количественную метил-специфичную ПЦР, пиросеквенирование, метод мультиплексной амплификации лигированных зондов, полногеномный анализ метилирования и ИГХ (РшШеп V. е1 а1., 2017). Определение оптимального показателя для дифференцировки метилированного и неметилированного промотора остается проблемой для любого из отмеченных методов. Для ЮН-мутантных диффузных глиом нет необходимости проводить тестирование метилирования промотора MGMT в силу подтвержденной прямой корреляции этих двух маркеров (Тигсап Б. е1 а1., 2012).

Исследование наличия мутации промотора гена TERT отмечается как дополнительный диагностический маркер для олигодендроглиом или глиобластом. Как и в случае с АТЯХ, мутации промотора гена TERT обеспечивают негативную регуляцию механизма сокращения длины теломер. Точечные мутации встречаются в 2 горячих точках, расположенных на 124 и 146 парах оснований выше сайта начала трансляции, и обозначаются как С228Т и С250Т. Тестирование на наличие мутаций промотора выполняется с помощью секвенирования по Сенгеру, пиросеквенирования, ПЦР или таргетного NGS (Бгйо С. е1 а1., 2019).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Пушкин Антон Андреевич, 2022 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анализ данных высокопроизводительного секвенирования базы Gene Expression Omnibus для идентификации микрорибонуклеиновых кислот в плазме крови пациентов с глиобластомой / А. А. Пушкин, Д. Ю. Гвалдин, Н. Н. Тимошкина [и др.]. - Текст: непосредственный // Research'n Practical Medicine Journal. - 2022. - Т. 9, № 1. - С. 54-64.

2. Анализ данных высокопроизводительного секвенирования и микрочипов для идентификации ключевых сигнатур микрорибонуклеиновых кислот в глиобластоме / А. А. Пушкин, Н. Н. Тимошкина, Д. Ю. Гвалдин [и др.]. - Текст: непосредственный // Research'n Practical Medicine Journal. - 2021. - Т. 8, № 3. -С. 21-33.

3. Внутрикостное метастазирование К27-мутантной глиомы / М. В. Рыжова, С. А. Галстян, Д. В. Старовойтов [и др.]. - Текст: непосредственный // Архив патологии. - 2021. - Т. 83, № 3. - С. 40-44.

4. Внутриопухолевая морфологическая и молекулярно-генетическая гетерогенность в астроцитомах разной степени злокачественности в материале от первой операции / Д. Е. Мацко, М. В. Мацко, А. О. Бакшеева [и др.]. - Текст: непосредственный // Сибирский онкологический журнал. - 2021. - Т. 20, № 6. -С. 55-68.

5. К вопросу о метастазировании злокачественных опухолей женских половых органов в головной мозг / Г. А. Неродо, Л. Ю. Владимирова, Е. А. Калабанова [и др.]. - Текст: непосредственный // Злокачественные опухоли. -2017, № Спецвыпуск 1. - С. 161-161.

6. Метастаз рака легкого в намет мозжечка, симулирующий менингиому / И. В. Балязин-Парфенов, Э. Е. Росторгуев, С. С. Тодоров [и др.]. - Текст: непосредственный // Кубанский научный медицинский вестник. - 2015. - № 3. - С. 143-146.

7. Молекулярно-генетические маркеры глиом / О. И. Кит, Д. И. Водолажский [и др.]. - Текст: непосредственный // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология - 2017. - Т. 35, № 4. - С. 132-140.

8. Новообразования головного мозга: регуляция ангиогенеза / Э. Е. Росторгуев, Е. М. Франциянц, Ю. А. Погорелова [и др.]. - Текст: непосредственный // Злокачественные опухоли. - 2017, № Спецвыпуск 1. - С. 198-199.

9. Оценка диагностической значимости циркулирующих микроРНК в плазме крови пациентов с глиомами высокой степени злокачественности / И. А Аллилуев, А. А. Пушкин, Н. С. Кузнецова [и др.]. - Текст: электронный // Современные проблемы науки и образования. - 2020. - № 6. - С. 135-135. -URL: https://science-education.ru/ru/article/view?id=30309 (дата обращения 19.01.2021).

10. Патент №2628816 Российская Федерация, МПК G01N 33/52 (2006.01). Способ дифференциальной диагностики доброкачественных, первичных и вторичных злокачественных опухолей головного мозга: № 2016137098: заявлено 15.09.2016: опубликовано 22.08.2017 / Кит О.И., Франциянц Е.М., Росторгуев Э.Е., Козлова Л.С.; заявитель и патентообладатель Ростовский научно-исследовательский онкологический институт. - 11 с. - Текст: непосредственный.

11. Патент №2742413 Российская Федерация, МПК G01N 33/48 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01). Способ диагностики глиальных опухолей головного мозга высокой степени злокачественности: №2020121030: заявлено 17.06.2020: опубликовано 05.02.2021 / Кит О.И., Росторгуев Э.Е., Тимошкина Н.Н., Пушкин А.А., Аллилуев И.А., Кузнецова Н.С., Нальгиев А.М.; заявитель и патентообладатель федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный медицинский исследовательский центр онкологии Министерства здравоохранения Российской Федерации. - 10 с. - Текст: непосредственный.

12. Пушкин, А. А. Клиническая значимость паттернов экспрессии генов в глиобластомах / А. А. Пушкин, О. И. Кит // Материалы конференции «Актуальные вопросы фундаментальной и клинической медицины». - Томск, 2018. - С. 301-302. - Текст: непосредственный.

13. Росторгуев, Э. Е. Группы риска и ранняя диагностика опухолей головного мозга у детей: специальность 14.00.14 «Онкология»: автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / : Росторгуев Эдуард Евгеньевич; ФГБУ «РНИОИ» Минздрава России - Ростов-на-Дону, 2008. - 24 с.: ил. - Текст: непосредственный.

14. Росторгуев, Э. Е. Новые подходы к диагностике и экспериментальной терапии глиальных опухолей высокой степени злокачественности: специальность 14.01.12 «Онкология»: автореферат диссертации на соискание ученой степени доктора медицнских наук / Росторгуев Эдуард Евгеньевич; ФГБУ «НМИЦ онкологии» Минздрава России - Ростов-на-Дону, 2021. - 44 с.: ил. - Текст: непосредственный.

15. Система регуляции плазминогена в различных опухолях головного мозга / О. И Кит, Е. М. Франциянц, Л. С. Козлова [и др.]. - Текст: непосредственный // Вопросы нейрохирургии им. НН Бурденко. - 2017. - Т. 81, № 2. - С. 22-27.

16. Франциянц, Е. М. Некоторые аспекты ангиогенеза опухолей головного мозга / Е. М. Франциянц, Э. Е. Росторгуев, Е. А. Шейко. - Текст: непосредственный // Анналы клинической и экспериментальной неврологии. -2021. - Т. 15, № 2. - С. 50-58.

17. Цитологическая, морфологическая и иммуногистохимическая диагностика опухолей центральной нервной системы: монография / О. И. Кит, И. В. Балязин-Парфенов, Е. В. Балязина [и др.]. - Текст: непосредственный. -Новочеркасск: Лик, 2015. - 156 с.: ил.

18. Шамова, Т. В. Получение первичных клеточных линий глиальных опухолей / Т. В. Шамова, А. О. Ситковская, Э. Е. Росторгуев [и др.]. - Текст: непосредственный // Пермский медицинский журнал. - 2020. - Т. 37, № 5. - С. 79-89.

19. A collective route to head and neck cancer metastasis / A. Kulasinghe, H. Schmidt, C. Perry [et al.] // Scientific reports. - 2018. - Vol. 8, № 1. - P. 1-8.

20. A genome-wide association study for irinotecan-related severe toxicities in patients with advanced non-small-cell lung cancer / J. Y. Han, E. S. Shin, Y. S. Lee [et al.] // The pharmacogenomics journal. - 2013. - Vol. 13, № 5. - P. 417-422.

21. A microRNA signature from serum exosomes of patients with glioma as complementary diagnostic biomarker / A. Santangelo, P. Imbrucè, B. Gardenghi [et al.] // Journal of neuro-oncology. - 2018. - Vol. 136, № 1. - P. 51-62.

22. A restricted signature of miRNAs distinguishes APL blasts from normal promyelocytes / S. Careccia, S. Mainardi, A. Pelosi [et al.] // Oncogene. - 2009. -Vol. 28, № 45. - P. 4034-4040.

23. A specific miRNA signature in the peripheral blood of glioblastoma patients / P. Roth, J. Wischhusen, C. Happold [et al.] // Journal of neurochemistry. -2011. - Vol. 118, № 3. - P. 449-457.

24. A. The vacuolar H+ ATPase is a novel therapeutic target for glioblastoma / A. Di Cristofori, S. Ferrero, I. Bertolini [et al.] // Oncotarget. - 2015. - Vol. 6, № 19. - P. 17514.

25. Advanced magnetic resonance imaging of the physical processes in human glioblastoma / J. Kalpathy-Cramer, E. R. Gerstner, K. E. Emblem [et al.] // Cancer research. - 2014. - Vol. 74, № 17. - P. 4622-4637.

26. AHIF promotes glioblastoma progression and radioresistance via exosomes / X. Dai, K. Liao, Z. Zhuang [et al.]// International Journal of Oncology. - 2019. -Vol. 54, № 1. - P. 261-270.

27. Alix-Panabières, C. Challenges in circulating tumour cell research / C. Alix-Panabières, K. Pantel // Nature Reviews Cancer. - 2014. - Vol. 14, № 9. - P. 623-631.

28. Almutairi, M. Factors controlling permeability of the blood-brain barrier / M. Almutairi, C. Gong, Y. G. Xu [et al.] // Cellular and molecular life sciences. -2016. - Vol. 73, № 1. - P. 57-77.

29. Altman, N. S. An introduction to kernel and nearest-neighbor nonparametric regression / N. S. Altman // The American Statistician. - 1992. - Vol. 46, № 3. - P 175-185.

30. Alu methylation serves as a biomarker for non-invasive diagnosis of glioma / J. Chen, W. Huan, H. Zuo [et al.] // Oncotarget. - 2016. - Vol. 7, № 18. - P. 26099.

31. Analysis of Circulating miRNA Profile in Plasma Samples of Glioblastoma Patients / D. Geczi, B. Nagy, M. Szilagyi [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2021. - Vol. 22, № 10. - P. 5058.

32. Analysis of glioblastoma patients' plasma revealed the presence of microRNAs with a prognostic impact on survival and those of viral origin / A. Herman, K. Gruden, A. Blejec, V. Podpecan [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10, № 5. - P. e0125791.

33. Analysis of miR-9-5p, miR-124-3p, miR-21-5p, miR-138-5p, and miR-1-3p in Glioblastoma Cell Lines and Extracellular Vesicles / A. Zottel, N. Samec, A. Kump [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2020. - Vol. 21, № 22.

- P. 8491.

34. Anti-miR delivery strategies to bypass the blood-brain barrier in glioblastoma therapy / D. G. Kim, K. H. Kim, Y. J. Seo [et al.] // Oncotarget. - 2016.

- Vol. 7, № 20. - P. 29400.

35. Application of a highly sensitive detection system for epidermal growth factor receptor mutations in plasma DNA / T. Nakamura, N. Sueoka-Aragane, K. Iwanaga [et al.] // Journal of Thoracic Oncology. - 2012. - Vol. 7, № 9. - P. 13691381.

36. Assessment of the diagnostic utility of serum microRNA classification in patients with diffuse glioma / M. Ohno, J. Matsuzaki, J. Kawauchi [et al.] // JAMA network open. - 2019. - Vol. 2, № 12. -P. e1916953-e1916953.

37. ATP6L promotes metastasis of colorectal cancer by inducing epithelialmesenchymal transition / J. Wang, D. Chen, W. Song [et al.], // Cancer science. -2020. - Vol. 111, № 2. - P. 477-488.

38. Balcells, I. Specific and sensitive quantitative RT-PCR of miRNAs with DNA primers / I. Balcells, S. Cirera, P. K. Busk // BMC biotechnology. - 2011. -Vol. 11, № 1. - P. 1-11.

39. Bartzokis, G. Human brain myelination and amyloid beta deposition in Alzheimer's disease / G. Bartzokis, P. H. Lu, J. Mintz // Alzheimer's & dementia. -2007. - Vol. 3, № 2. - P. 122-125.

40. Bayraktar, R. The interaction between two worlds: microRNAs and Tolllike receptors / R. Bayraktar, M. T. S. Bertilaccio, G. A. Calin // Frontiers in immunology. - 2019. - Vol. 10. - P. 1053.

41. Becker, A. P. Tumor heterogeneity in glioblastomas: from light microscopy to molecular pathology / A. P. Becker, B. E. Sells, S. J. Haque, A. Chakravarti // Cancers. - 2021. - Vol. 13, № 4. - P. 761.

42. Berindan-Neagoe, I. MicroRNAome genome: a treasure for cancer diagnosis and therapy / I. Berindan-Neagoe, P. D. C. Monroig, B. Pasculli, G. A. Calin // CA: a cancer journal for clinicians. - 2014. - Vol. 64, № 5. - P. 311-336.

43. Bevacizumab and temozolomide in patients with first recurrence of WHO grade II and III glioma, without 1p/19q co-deletion (TAVAREC): a randomised controlled phase 2 EORTC trial / M. J. Van den Bent, M. Klein, M. Smits [et al.] // The Lancet Oncology. - 2018. - Vol. 19, № 9. - P. 1170-1179.

44. Beygi, S. Epidemiology of pediatric primary malignant central nervous system tumors in Iran: a 10 year report of National Cancer Registry / S. Beygi, S. Saadat, S. B. Jazayeri, V. Rahimi-Movaghar // Cancer epidemiology. - 2013. - Vol 37, № 4. - P. 396-401.

45. Blockade of the SNARE protein syntaxin 1 inhibits glioblastoma tumor growth / F. Ulloa, A. Gonzalez-Junca, D. Meffre [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10, № 3. - P. e0119707.

46. Blood-based tumor mutational burden as a predictor of clinical benefit in non-small-cell lung cancer patients treated with atezolizumab / D. R. Gandara, S. M. Paul [et al.] // Nature medicine. - 2018. - Vol. 24, № 9. - P. 1441-1448.

47. BRAF V600E, TERT promoter mutations and CDKN2A/B homozygous deletions are frequent in epithelioid glioblastomas: a histological and molecular analysis focusing on intratumoral heterogeneity / N. Nakajima, S. Nobusawa, S. Nakata [et al.] // Brain Pathology. - 2018. - Vol. 28, № 5. - P. 663-673.

48. Breiman, L. Random forests / L. Breiman // Machine learning. - 2001. -Vol. 45, № 1. - P. 5-32.

49. CDKN2A deletion in pediatric versus adult glioblastomas and predictive value of p16 immunohistochemistry / S. Purkait, P. Jha, M. C. Sharma // Neuropathology. - 2013. - Vol. 33, № 4. - P. 405-412.

50. Cell-free plasma microRNAs that identify patients with glioblastoma / M. A. Bustos, N. Rahimzadeh, S. Ryu [et al.] // Laboratory Investigation [electronic resourse]. - 2022. - URL: https://www.nature.com/articles/s41374-021 -00720-4 (date of the application: 20.01.2022).

51. Central nervous system cancers, version 3.2020, NCCN clinical practice guidelines in oncology / L. B. Nabors, J. Portnow, M. Ahluwalia [et al.] // Journal of the National Comprehensive Cancer Network. - 2020. - Vol. 18, № 11. - P. 15371570

52. Chen, P. Plasma microRNA-720 may predict prognosis and diagnosis in glioma patients / P. Chen, G. Zhang, Q. Zhou, Z. Li // Bioscience Reports. - 2020. -Vol. 40, № 7. - P. BSR20201449.

53. Chen, Z. Immune microenvironment in glioblastoma subtypes / Z. Chen, D. Hambardzumyan // Frontiers in immunology. - 2018. - Vol. 9. - P. 1004.

54. Choppavarapu, L. Circulating microRNAs as potential biomarkers in glioma: A mini-review / L. Choppavarapu, S. M. Kandi // Endocrine, Metabolic & Immune Disorders-Drug Targets (Formerly Current Drug Targets-Immune, Endocrine & Metabolic Disorders). - 2021. - Vol. 21, № 2. - P. 195-202.

55. cIMPACT-NOW update 4: diffuse gliomas characterized by MYB, MYBL1, or FGFR1 alterations or BRAFV600E mutation / D. W. Ellison, C. Hawkins, D. T. Jones [et al.] // Acta neuropathologica. - 2019. - Vol. 137, № 4. - P. 683-687.

56. Circulating biomarkers in patients with glioblastoma / J. Müller Bark, A. Kulasinghe, B. Chua [et al.] // British journal of cancer. - 2020. - Vol. 122, № 3. - P. 295-305.

57. Circulating miR- 26a and miR- 21 as biomarkers for glioblastoma multiform / M. ParvizHamidi, G. Haddad, S. Ostadrahimi [et al.] // Biotechnology and applied biochemistry. - 2019. - Vol. 66, № 2. - P. 261-265.

58. Clark, K. How molecular testing can help (and hurt) in the workup of gliomas / K. Clark, Z. Voronovich, C. Horbinski // American journal of clinical pathology. - 2013. - Vol. 139, № 3. - P. 275-288.

59. Clinical insights gained by refining the 2016 WHO classification of diffuse gliomas with: EGFR amplification, TERT mutations, PTEN deletion and MGMT methylation / C. Brito, A. Azevedo, S. Esteves [et al.] // BMC cancer. - 2019. - Vol. 19, № 1. - P. 1-14.

60. Clinical validation of the CE-IVD marked Therascreen MGMT kit in a cohort of glioblastoma patients / V. Quillien, A. Lavenu, F. Ducray [et al.] // Cancer Biomarkers. - 2017. - Vol. 20, № 4. - P. 435-441.

61. Combination of MiR-378 and MiR-210 serum levels enables sensitive detection of renal cell carcinoma / M. Fedorko, M. Stanik, R. Iliev [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2015. - Vol. 16, № 10. - P. 2338223389.

62. Comparison of alterations in miRNA expression in matched tissue and blood samples during spinal cord glioma progression / T. An, T. Fan, X. Q. Zhang [et al.] // Scientific Reports. - 2019. - Vol. 9, № 1. - P. 1-13.

63. Courtney, N. A. Synaptotagmin 1 clamps synaptic vesicle fusion in mammalian neurons independent of complexin / N. A. Courtney, H. Bao, J. S. Briguglio, E. R. Chapman // Nature communications. - 2019. - Vol. 10, № 1. - P. 114.

64. Dai, M. Clinical value of miRNA- 122 in the diagnosis and prognosis of various types of cancer / M. Dai, L. Li, X. Qin // Oncology Letters. - 2019. - Vol. 17, № 4. - P. 3919-3929.

65. Dalkara, T. Cerebral microvascular pericytes and neurogliovascular signaling in health and disease / T. Dalkara, L. Alarcon-Martinez // Brain research. -2015. - Vol. 1623. - C. 3-17.

66. Deep sequencing of circulating exosomal microRNA allows non-invasive glioblastoma diagnosis / S. Ebrahimkhani, F. Vafaee, S. Hallal [et al.] // NPJ precision oncology. - 2018. - Vol. 2, № 1. - P. 1-9.

67. Detection of circulating tumor DNA in early-and late-stage human malignancies / C. Bettegowda, M. Sausen, R. J. Leary [et al.] // Science translational medicine. - 2014. - Vol. 6, № 224. - P. 224ra24-224ra24.

68. Diagnostic and grading accuracy of 18 F-FDOPA PET and PET/CT in patients with gliomas: a systematic review and meta-analysis / J. Xiao, Y. Jin, J. Nie [et al.] // BMC cancer. - 2019. - Vol. 19, № 1. - P. 1-11.

69. Differentiation of glioblastoma multiforme from metastatic brain tumor using proton magnetic resonance spectroscopy, diffusion and perfusion metrics at 3 T / I. Tsougos, P. Svolos, E. Kousi // Cancer imaging. - 2012. - Vol. 12, № 3. - P. 423.

70. DNA sequences within glioma-derived extracellular vesicles can cross the intact blood-brain barrier and be detected in peripheral blood of patients / N. García-Romero, J. Carrión-Navarro, S. Esteban-Rubio [et al.] // Oncotarget. - 2017. - Vol. 8, № 1. - P. 1416.

71. Downregulation of miR-342 is associated with tamoxifen resistant breast tumors / D. M. Cittelly, P. M. Das, N. S. Spoelstra [et al.] // Molecular cancer. -2010. - Vol. 9, № 1. - P. 1-12.

72. Dynamics of circulating hypoxia-mediated miRNAs and tumor response in patients with high-grade glioma treated with bevacizumab / T. Siegal, H. Charbit, I. Paldor [et al.] // Journal of neurosurgery. - 2016. - Vol. 125, № 4. - P. 1008-1015.

73. EANO guidelines on the diagnosis and treatment of diffuse gliomas of adulthood / M. Weller, M. Van den Bent, M. Preusser [et al.] // Nature reviews Clinical oncology. - 2021. - Vol. 18, № 3. - P. 170-186.

74. Ena/VASP proteins: regulators of the actin cytoskeleton and cell migration / M. Krause, E. W. Dent, J. E. Bear [et al.] // Annual review of cell and developmental biology. - 2003. - Vol. 19, № 1. - P. 541-564.

75. Epigenetic silencing of the intronic microRNA miRNA-342 and its host gene EVL in colorectal cancer / W. M. Grady, R. K. Parkin, P. S. Mitchell [et al.] // Oncogene. - 2008. - Vol. 27, № 27. - P. 3880-3888.

76. Exciting new advances in neuro- oncology: the avenue to a cure for malignant glioma / E. G. Van Meir, C. G. Hadjipanayis, A. D. Norden [et al.] // CA: a cancer journal for clinicians. - 2010. - Vol. 60, № 3. - P. 166-193.

77. Exosomal miR-3180-3p inhibits proliferation and metastasis of non-small cell lung cancer by downregulating FOXP4 / T. Chen, Y. Liu, J. Chen [et al.] // Thoracic Cancer. - 2021. - Vol. 12, № 3. - P. 372-381.

78. Exosome and exosomal microRNA: trafficking, sorting, and function / J. Zhang, S. Li, L. Li [et al.] // Genomics, proteomics & bioinformatics. - 2015. - Vol. 13, № 1. - P. 17-24.

79. Extracellular microvesicles as new industrial therapeutic frontiers / V. Agrahari, V. Agrahari, P. A. Burnouf [et al.] // Trends in Biotechnology. - 2019. -Vol. 37, № 7. - P. 707-729.

80. Fan, C. Identification of dysregulated microRNAs associated with diagnosis and prognosis in triple-negative breast cancer: An in silico study / C. Fan, N. Liu // Oncology Reports. - 2019. - Vol. 41, № 6. - P. 3313-3324.

81. Fan, Y. Profilin-1 phosphorylation directs angiocrine expression and glioblastoma progression through HIF-1a accumulation / Y. Fan, A. A. Potdar, Y. Gong [et al.] // Nature cell biology. - 2014. - Vol. 16, № 5. - P. 445-456.

82. Garzon, R. Targeting microRNAs in cancer: rationale, strategies and challenges / R. Garzon, G. Marcucci, C. M.Croce // Nature reviews Drug discovery. -2010. - Vol. 9, № 10. - P. 775-789.

83. Gene expression meta-analysis in diffuse low-grade glioma and the corresponding histological subtypes / S. Wang, F. Jin, W. Fan Hu [et al.] // Scientific reports. - 2017. - Vol. 7, № 1. - P. 1-13.

84. Glioblastoma microvesicles transport RNA and proteins that promote tumour growth and provide diagnostic biomarkers / J. Skog, T. Wurdinger, S. Van Rijn [et al.] // Nature cell biology. - 2008. - Vol. 10, № 12. - P. 1470-1476.

85. Glioblastoma multiforme imaging: the role of nuclear medicine / A. G. Alexiou, S. Tsiouris, S. Voulgaris [et al.] // Current Radiopharmaceuticals. - 2012. -Vol. 5, № 4. -P. 308-313.

86. Glioma groups based on 1p/19q, IDH, and TERT promoter mutations in tumors / J. E. Eckel-Passow, D. H. Lachance, A. M. Molinaro [et al.] // New England Journal of Medicine. - 2015. - Vol. 372, № 26. - P. 2499-2508.

87. Glioma stem cell-derived exosomal miR-944 reduces glioma growth and angiogenesis by inhibiting AKT/ERK signaling / J. Jiang, J. Lu, X. Wang [et al.] // Aging (Albany NY). - 2021. - Vol. 13, № 15. - P. 19243.

88. Gliomas and the vascular fragility of the blood brain barrier / L. G. Dubois, L. Campanati, C. Righy [et al.] // Frontiers in cellular neuroscience. - 2014. - Vol. 8.

- P. 418.

89. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries / F. Bray, J. Ferlay, I. Soerjomataram [et al.] // CA: a cancer journal for clinicians. - 2018. - Vol. 68, № 6.

- P. 394-424.

90. gprofiler2--an R package for gene list functional enrichment analysis and namespace conversion toolset g: Profiler / L. Kolberg, U. Raudvere, I. J. Kuzmin [et al.] // F1000Research. - 2020. - Vol. 9 (ELIXIR). - P.709.

91. Gruenberg, J. Mechanisms of pathogen entry through the endosomal compartments / J. Gruenberg, F. G. Van der Goot // Nature reviews Molecular cell biology. - 2006. - Vol. 7, № 7. - P. 495-504.

92. Histone H3 wild-type DIPG/DMG overexpressing EZHIP extend the spectrum diffuse midline gliomas with PRC2 inhibition beyond H3-K27M mutation / D. Castel, T. Kergrohen, A. Tauziede-Espariat [et al.] // Acta Neuropathologica. -2020. - Vol. 139, № 6. - P. 1109-1113.

93. Hsieh, K. L. C. Computer-aided grading of gliomas based on local and global MRI features / K. L. C. Hsieh, C. M. Lo, C. J. Hsiao // Computer methods and programs in biomedicine. - 2017. - Vol. 139. - P. 31-38

94. Hui, X. miR-454-3p suppresses cell migration and invasion by targeting CPEB1 in human glioblastoma / X. Hui, S. Zhang, Y. Wang // Molecular Medicine Reports. - 2018. - Vol. 18, № 4. - PC. 3965-3972.

95. Hypoxic glioma-derived exosomes promote M2-like macrophage polarization by enhancing autophagy induction / J. Xu, J. Zhang, Z. Zhang [et al.] // Cell death & disease. - 2021. - Vol. 12, № 4. - P. 1-16.

96. Identification of 9 serum microRNAs as potential noninvasive biomarkers of human astrocytoma / F. Zhi, N. Shao, R. Wang [et al.] // Neuro-oncology. - 2015. - Vol. 17, № 3. - P. 383-391.

97. Identification of differentially expressed microRNAs and the potential of microRNA-455-3p as a novel prognostic biomarker in glioma / W. Wang, S. Mu, Q. Zhao [et al.] // Oncology letters. - 2019. - Vol. 18, № 6. - P. 6150-6156.

98. Identification of microRNAs associated with glioma diagnosis and prognosis / X. Ye, W. Wei, Z. Zhang [et al.] // Oncotarget. - 2017. - Vol. 8, № 16. -P. 26394.

99. Identification of microRNAs in the cerebrospinal fluid as biomarker for the diagnosis of glioma / A. Baraniskin, J. Kuhnhenn, U. Schlegel [et al.] // Neuro-oncology. - 2012. - Vol. 14, № 1. - P. 29-33.

100. Identification of miR-25-3p as a tumor biomarker: Regulation of cellular functions via TOB1 in breast cancer / T. Zhao, W. Meng, Y. Chin [et al.] // Molecular medicine reports. - 2021. - Vol. 23, № 6. - P. 1-10.

101. Identification of novel diagnostic and prognostic miRNA signatures in endometrial cancer / M. Jayaraman, R. Radhakrishnan, C. A. Mathews [et al.] // Genes & cancer. - 2017. - Vol. 8, № 5-6. - P. 566.

102. Identification of plasma microRNA-22 as a marker for the diagnosis, prognosis, and chemosensitivity prediction of osteosarcoma / Z. B. Diao, T. X. Sun, Y. Zong [et al.] // Journal of International Medical Research. - 2020. - Vol. 48, № 12. - P. 0300060520967818.

103. Identification of serum miR-30a-5p as a diagnostic and prognostic biomarker in colorectal cancer / Y. Sun, B. Yang, M. Lin [et al.] // Cancer Biomarkers. - 2019. - Vol. 24, № 3. - P. 299-305.

104. Identifying the signatures and rules of circulating extracellular microRNA for distinguishing cancer subtypes / F. Yuan, Z. Li, L. Chen [et al.] // Frontiers in Genetics. - 2021. - Vol. 12. - P. 271

105. IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype / S. Turcan, D. Rohle, A. Goenka [et al.] // Nature. - 2012. - Vol. 483, № 7390. - P. 479-483

106. Immunohistochemical detection of EGFRvIII in high malignancy grade astrocytomas and evaluation of prognostic significance / K. D. Aldape, K. Ballman, A. Furth [et al.] // Journal of Neuropathology & Experimental Neurology. - 2004. -Vol. 63, № 7. - P. 700-707.

107. Integrative analysis of mRNA and miRNA sequencing data for gliomas of various grades / D. Y. Gvaldin, A. A. Pushkin, N. N. Timoshkina [et al.] // Egyptian Journal of Medical Human Genetics. - 2020. - Vol. 21, № 1. - P. 1-17.

108. Intelligence in Williams Syndrome is related to STX1A, which encodes a component of the presynaptic SNARE complex / M. C. Gao, U. Bellugi, L. Dai [et al.] // PloS one. - 2010. - Vol. 5, № 4. - P. e10292.

109. Intraindividual comparison of histopathological diagnosis obtained by stereotactic serial biopsy to open surgical resection specimen in patients with intracranial tumours / T. Reithmeier, W. O. Lopez, S. Doostkam // Clinical Neurology and Neurosurgery. - 2013. - Vol. 115, № 10. - P. 1955-1960.

110. Intratumoral homogeneity of MGMT promoter hypermethylation as demonstrated in serial stereotactic specimens from anaplastic astrocytomas and glioblastomas / E. M. Grasbon-Frodl, F. W. Kreth, M. Ruiter [et al.] // International journal of cancer. - 2007. - Vol. 121, № 11. - P. 2458-2464.

111. Is the blood-brain barrier really disrupted in all glioblastomas? A critical assessment of existing clinical data / J. N. Sarkaria, L. S. Hu, I. F. Parney [et al.] // Neuro-oncology. - 2018. - Vol. 20, № 2. - P. 184-191.

112. Jenike, A. E. miR-21: a non- specific biomarker of all maladies / A. E. Jenike, M. K. Halushka // Biomarker Research. - 2021. - Vol. 9, № 1. - P. 1-7.

113. Jin, L. Serum miR-3180-3p and miR-124-3p may Function as Noninvasive Biomarkers of Cisplatin Resistance in Gastric Cancer / L. Jin, Z. Zhang // Clinical Laboratory. - 2020. - Vol. 66, № 12. - URL: https://www.clin-lab-publications .com/article/3 612.

114. Jones J. Circulating biomarkers for glioma: a review / J. Jones, H. Nguyen, K. Drummond, A. Morokoff //Neurosurgery. - 2021. - Vol. 88, № 3. - P. E221-E230.

115. Kang, T. Biogenesis of extracellular vesicles / T. Kang I. Atukorala // Subcell Biochem. - 2021. - Vol. 97. - P. 19-43

116. Killock, D. CSF DNA provides a snapshot of the glioma genome / D. Killock // Nature Reviews Clinical Oncology. - 2019. - Vol. 16, № 3. - P. 143-143.

117. Kim, V. N. Biogenesis of small RNAs in animals / V. N. Kim, J. Han, M. C. Siomi // Nature reviews Molecular cell biology. - 2009. - Vol. 10, № 2. - P. 126139.

118. Kohama, I. An insight into the roles of micrornas and exosomes in sarcoma / I. Kohama, N. Kosaka, H. Chikuda, T. Ochiya // Cancers. - 2019. - Vol. 11, № 3. - P. 428.

119. Kuhn, M. A Short Introduction to the caret Package / M. Kuhn // R Found Stat Comput. - 2015. - Vol. 1. - P. 1-10.

120. Lee, H. Biogenesis and regulation of the let-7 miRNAs and their functional implications / H. Lee, S. Han, C. S. Kwon, D. Lee // Protein & cell. -2016. - Vol. 7, № 2. - P. 100-113.

121. Li, H. Y. Circulating microRNA-137 is a potential biomarker for human glioblastoma / H. Y. Li, Y. M. Li, Y. Li [et al.] // Eur Rev Med Pharmacol Sci. -2016. - Vol. 20, № 17. - P. 3599-3604.

122. Li, Y. Effect of let-7c on the PI3K/Akt/FoxO signaling pathway in hepatocellular carcinoma / Y. Li, P. Li // Oncology letters. - 2021. - Vol. 21, № 2. -P. 1-1.

123. Liquid biopsy for brain tumors / G. M. Shankar, L. Balaj, S. L. Stott [et al.] // Expert review of molecular diagnostics. - 2017. - Vol. 17, № 10. - P. 943-947.

124. Liquid biopsy in diagnosis and prognosis of high-grade gliomas; state-of-the-art and literature review / L. Bonosi, G. Ferini, G. R. Giammalva [et al.] // Life. -2022. - Vol. 12, № 3. - P. 407.

125. Long non-coding RNA FGD5-AS1 regulates cancer cell proliferation and chemoresistance in gastric cancer through miR-153-3p/CITED2 axis / Y. Gao, M. Xie, Y. Guo [et al.] // Frontiers in genetics. - 2020. - Vol. 11. - P. 715.

126. Love, M. I. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 / M. I. Love, W. Huber, S. Anders // Genome biology. - 2014. - Vol. 15, № 12. - P. 1-21.

127. Luo, Z. Pleiotropic functions of miR107 in cancer networks / Z. Luo, Y. Zheng, W. Zhang // OncoTargets and therapy. - 2018. - Vol. 11. - P. 4113.

128. Madshus, I. H. Internalization and intracellular sorting of the EGF receptor: a model for understanding the mechanisms of receptor trafficking / I. H. Madshus, E. Stang // Journal of cell science. - 2009. - Vol. 122, № 19. - P. 34333439.

129. Magnetic resonance image features identify glioblastoma phenotypic subtypes with distinct molecular pathway activities / H. Itakura, A. S. Achrol, L. A. Mitchell [et al.] // Science translational medicine. - 2015. - Vol. 7, № 303. - P. 303ra138-303ra138.

130. Mathupala, S. P. MicroRNA and brain tumors: a cause and a cure? / S. P. Mathupala, S. Mittal, M. Guthikonda, A. E. Sloan // DNA and cell biology. - 2007. -Vol. 26, № 5. - P. 301-310.

131. Mathupala, S. P. RNAi based approaches to the treatment of malignant glioma / S. P. Mathupala, M. Guthikonda, A. E. Sloan // Technology in cancer research & treatment. - 2016. - Vol. 5, № 3. - P. 261-269.

132. Melland, H. Disorders of synaptic vesicle fusion machinery / H. Melland, E. M. Carr, S. L. Gordon // Journal of Neurochemistry. - 2021. - Vol. 157, № 2. - P. 130-164.

133. Meta-analysis of the prognostic value of circulating tumor cells in breast cancer / L. Zhang, S. Riethdorf, G. Wu [et al.] // Clinical cancer research. - 2012. -Vol. 18, № 20. - P. 5701-5710.

134. Meta-analysis of transcriptome reveals let-7b as an unfavorable prognostic biomarker and predicts molecular and clinical subclasses in high-grade serous ovarian carcinoma / Z. Tang, G. S. Ow, J. P. Thiery [et al.] // International journal of cancer. - 2014. - Vol. 134, № 2. - P. 306-318.

135. Methodological considerations for measuring biofluid-based microRNA biomarkers / B. N. Chorley, E. Atabakhsh, G. Doran [et al.] // Critical Reviews in Toxicology. - 2021. - Vol.51, №3. - P.264-282.

136. MicroRNA 21 promotes glioma invasion by targeting matrix metalloproteinase regulators / G. Gabriely, T. Wurdinger, S. Kesari [et al.] // Molecular and cellular biology. - 2008. - Vol. 28, № 17. - P. 5369-5380.

137. MicroRNA based theranostics for brain cancer: basic principles / G. E. D.Petrescu, A. A. Sabo, L. I. Torsin [et al.] // Journal of experimental & clinical cancer research. - 2019. - Vol. 38, № 1. - P. 1-21.

138. MicroRNA expression signatures determine prognosis and survival in glioblastoma multiforme—a systematic overview / M. Henriksen, K. B. Johnsen, H. H. Andersen [et al.] // Molecular neurobiology. - 2014. - Vol. 50, № 3. - P. 896-913.

139. MicroRNA let-7c inhibits migration and invasion of human non-small cell lung cancer by targeting ITGB3 and MAP4K3 / B. Zhao, H. Han, J. Chen [et al.] // Cancer letters. - 2014. - Vol. 342, № 1. - P. 43-51.

140. MicroRNA Levels in Cervical Cancer Samples and Relationship with Lesion Grade and HPV Infection / C. R. Hoelzle, S. Arnoult, C. R. Borem [et al.] // MicroRNA. - 2021. - Vol. 10, № 2. - P. 139-145.

141. MicroRNA-125b-2 confers human glioblastoma stem cells resistance to temozolomide through the mitochondrial pathway of apoptosis / L. Shi, S. Zhang, K. Feng [et al.] // International journal of oncology. - 2012. - Vol. 40, № 1. - P. 119129.

142. MicroRNA-29a activates a multi-component growth and invasion program in glioblastoma / Y. Zhao, W. Huang, T. M. Kim [et al.] // Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. - 2019. - Vol. 38, № 1. - P. 1-13.

143. MicroRNA-342-3p inhibits the proliferation, migration, and invasion of osteosarcoma cells by targeting astrocyte-elevated gene-1 (AEG-1) / S. Zhang, L. Liu, Z. Lv [et al.] // Oncology research. - 2017. - Vol. 25, № 9. - P. 1505.

144. MicroRNAs bind to Toll-like receptors to induce prometastatic inflammatory response / M. Fabbri, A. Paone, F. Calore [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2012. - Vol. 109, № 31. - P. E2110-E2116.

145. MicroRNAs in cerebrospinal fluid identify glioblastoma and metastatic brain cancers and reflect disease activity / N. M. Teplyuk, B. Mollenhauer, G. Gabriely [et al.] // Neuro-oncology. - 2012. - Vol. 14, № 6. - P. 689-700.

146. miR-133b acts as a tumor suppressor and negatively regulates FGFR1 in gastric cancer / D. Wen, S. Li, F. Ji [et al.] // Tumor Biology. - 2013. - Vol. 34, № 2. - P. 793-803.

147. MiR-138 exerts anti-glioma efficacy by targeting immune checkpoints / J. Wei, E. K. Nduom, L. Y. Kong [et al.] // Neuro-oncology. - 2016. - Vol. 18, № 5. -P. 639-648.

148. miR-148b-3p, miR-190b, and miR-429 regulate cell progression and act as potential biomarkers for breast cancer / W. Dai, J. He, A. Zheng [et al.] // Journal of breast cancer. - 2019. - Vol. 22, № 2. - P. 219-236.

149. miR-181d: a predictive glioblastoma biomarker that downregulates MGMT expression / W. Zhang, J. Zhang, K. Hoadley [et al.] // Neuro-oncology. -2012. - Vol. 14, № 6. - P. 712-719.

150. miR-182 integrates apoptosis, growth, and differentiation programs in glioblastoma / F. M. Kouri, L. A. Hurley, W. L. Daniel [et al.] // Genes & development. - 2015. - Vol. 29, № 7. - P. 732-745.

151. MiR-182-5p and its target HOXA9 in non-small cell lung cancer: a clinical and in-silico exploration with the combination of RT-qPCR, miRNA-seq and

miRNA-chip / L. Gao, S. B. Yan, J. Yang [et al.] // BMC medical genomics. - 2020.

- Vol. 13, № 1. - P. 1-20.

152. MiR-190b, the highest up-regulated miRNA in ERa-positive compared to ERa-negative breast tumors, a new biomarker in breast cancers? / G. Cizeron-Clairac, F. Lallemand, S. Vacher [et al.] // BMC cancer. - 2015. - Vol. 15, № 1. - P. 1-14.

153. MiR-21 protected human glioblastoma U87MG cells from chemotherapeutic drug temozolomide induced apoptosis by decreasing Bax/Bcl-2 ratio and caspase-3 activity / L. Shi, J. Chen, J. Yang // Brain research. - 2010. - Vol. 1352. - P. 255-264.

154. Mir-21-Sox2 axis delineates glioblastoma subtypes with prognostic impact / P. Sathyan, P. O. Zinn, A. L. Marisetty [et al.] // Journal of Neuroscience. -2015. - Vol. 35, № 45. - P. 15097-15112.

155. MiR-223/PAX6 axis regulates glioblastoma stem cell proliferation and the chemo resistance to TMZ via regulating PI3K/Akt pathway / B. S. Huang, Q. Z. Luo, Y. Han [et al.] // Journal of Cellular Biochemistry. - 2017. - Vol. 118, № 10. - P. 3452-3461.

156. miR-342-3p suppresses proliferation, migration and invasion by targeting FOXM1 in human cervical cancer / X. R. Li, H. J. Chu, T. Lv [et al.] // FEBS letters.

- 2014. - Vol. 588, № 17. - P. 3298-3307.

157. miR-370-3p is a therapeutic tool in anti-glioblastoma therapy but is not an intratumoral or cell-free circulating biomarker / A. Nadaradjane, J. Briand, G. Bougras-Cartron [et al.] // Molecular Therapy-Nucleic Acids. - 2018. - Vol. 13. - P. 642-650.

158. MiR-433-3p suppresses cell growth and enhances chemosensitivity by targeting CREB in human glioma / S. Sun, X. Wang, X. Xu [et al.] // Oncotarget. -2017. - Vol. 8, № 3. - P. 5057.

159. miR-454-3p is an exosomal biomarker and functions as a tumor suppressor in glioma / N. Shao, L. Xue, R. Wang [et al.] // Molecular Cancer Therapeutics. - 2019. - Vol. 18, № 2. - P. 459-469.

160. miRNA-21 may serve as a promising noninvasive marker of glioma with a high diagnostic performance: a pooled analysis of 997 patients / X. Zhao, Z. Xiao,

B. Li [et al.] // Therapeutic Advances in Medical Oncology. - 2021. - Vol. 13. - P. 1758835920987650.

161. MiRTargetLink- -miRNAs, genes and interaction networks / M. Hamberg,

C. Backes, T. Fehlmann [et al.] // International journal of molecular sciences. - 2016. - Vol. 17, № 4. - P. 564.

162. Molecular diagnostic testing of diffuse gliomas in the real-life setting: A practical approach / M. Bienkowski, A. Wohrer, P. Moser [et al.] // Clinical neuropathology. - 2018. - Vol. 37, № 4. - P. 166.

163. Molecular stereotactic biopsy technique improves diagnostic accuracy and enables personalized treatment strategies in glioma patients / S. Eigenbrod, R. Trabold, D. Brucker [et al.] // Acta neurochirurgica. - 2014. - Vol. 156, № 8. - P. 1427-1440.

164. Mutational landscape and clonal architecture in grade II and III gliomas / H. Suzuki, K. Aoki, K. Chiba [et al.] // Nature genetics. - 2015. - Vol. 47, № 5. - P. 458-468.

165. Mutations in IDH1, IDH2, and in the TERT promoter define clinically distinct subgroups of adult malignant gliomas / P. J. Killela, C. J. Pirozzi, P. Healy [et al.] // Oncotarget. - 2014. - Vol. 5, № 6. - P. 1515

166. Nanoribbon-based electronic detection of a glioma-associated circular miRNA / Y. D. Ivanov, K. A. Malsagova, V. P. Popov [et al.] // Biosensors. - 2021. -Vol. 11, № 7. - P. 237.

167. Neagu, M. R. How treatment monitoring is influencing treatment decisions in glioblastomas / M. R. Neagu, R. Y. Huang, D. A. Reardon, P. Y. Wen // Current treatment options in neurology. - 2015. - Vol. 17, № 4. - P. 1-15.

168. Neuroendoscopic intraoperative ultrasound-guided technique for biopsy of paraventricular tumors / A. Di Somma, J. Luis, N. Gimenez [et al.] // World Neurosurgery. - 2019. - Vol. 122. - P. 441-450.

169. Optimal subset of signature miRNAs consisting of 7 miRNAs that can serve as a novel diagnostic and prognostic predictor for the progression of cervical cancer / C. Shi, Y. Yang, L. Zhang [et al.] //Oncology reports. - 2019. - Vol. 41, № 6. - P. 3167-3178.

170. Palak, P. G. Decision tree-based improved software fault prediction: a computational intelligence approach / P. G. Palak // Computational Intelligence in Software Modeling. - 2022. - Vol. 13. - P. 163.

171. Peng, W. Rates of convergence for random forests via generalized U-statistics / W. Peng, T. Coleman, L. Mentch // Electronic Journal of Statistics. - 2022.

- Vol. 16, № 1. - P. 232-292.

172. Phenotypic characterization of circulating lung cancer cells for clinically actionable targets / A. Kulasinghe, J. Kapeleris, C. Cooper [et al.] // Cancers. - 2019.

- Vol. 11, № 3. - P. 380.

173. Pilot study of whole blood MicroRNAs as potential tools for diffuse low-grade gliomas detection / C. Goze, C. Reynes, L. Forestier [et al.] // Cellular and molecular neurobiology. - 2018. - Vol. 38, № 3. - P. 715-725

174. Plasma miR-122 as a potential diagnostic and prognostic indicator in human glioma / Y. Tang, S. Zhao, J. Wang [et al.] // Neurological Sciences. - 2017. -Vol. 38, № 6. - P. 1087-1092.

175. Plasma miR-454-3p as a potential prognostic indicator in human glioma / N. Shao, L. Wang, L. Xue [et al.] //Neurological sciences. - 2015. - Vol. 36, № 2. -P. 309-313.

176. Plasma specific miRNAs as predictive biomarkers for diagnosis and prognosis of glioma. / Q. Wang, P. Li, A. Li [et al.] // Journal of Experimental & Clinical Cancer Research. - 2012. - Vol. 31, № 1. - P. 1-10.

177. Potential diagnostic and prognostic value of plasma circulating microRNA-182 in human glioma / Y. Xiao, L. Zhang, Z. Song [et al.] // Medical science monitor: international medical journal of experimental and clinical research.

- 2016. - Vol. 22. - C. 855.

178. Practical implementation of DNA methylation and copy-number-based CNS tumor diagnostics: the Heidelberg experience / D. Capper, D. Stichel, F. Sahm [et al.] // Acta neuropathologica. - 2018. - Vol. 136, № 2. - P. 181-210.

179. Precise let-7 expression levels balance organ regeneration against tumor suppression / L. Wu, L. H. Nguyen, K. Zhou [et al.] // Elife. - 2015. - Vol. 4. - P. e09431.

180. Preoperative relative cerebral blood volume analysis in gliomas predicts survival and mitigates risk of biopsy sampling error / B. J. McCullough, V. Ader, B. Aguedan [et al.] // Journal of neuro-oncology. - 2018. - Vol. 136, № 1. - P. 181-188.

181. Primary brain and other central nervous system tumors in the United States (2014-2018): A summary of the CBTRUS statistical report for clinicians / J. T. Low, Q. T. Ostrom, G. Cioffi [et al.] // Neuro-Oncology Practice. - 2022. - Vol.9, №3. - P.165-182.

182. pROC: an open-source package for R and S+ to analyze and compare ROC curves / X. Robin, N. Turck, A. Hainard [et al.] // BMC bioinformatics. - 2011. - Vol. 12, № 1. - P. 1-8.

183. Profiling circulating microRNAs in the serum of pregnant and nonpregnant pigs reveals a plethora of reproductive status-dependent microRNAs / M. M. Kaczmarek, Z. P. Reliszko, J. Szuszkiewicz [et al.] // Animal. - 2021. - Vol. 15, № 4. - P. 100182.

184. Prognostic stratification of metastatic prostate cancer patients treated with abiraterone and enzalutamide through an integrated analysis of circulating free microRNAs and clinical parameters / E. Sharova, M. Maruzzo, P. Del Bianco [et al.] // Frontiers in oncology. - 2021. - Vol. 11. - C. 686.

185. Pseudoprogression, radionecrosis, inflammation or true tumor progression? Challenges associated with glioblastoma response assessment in an evolving therapeutic landscape / B. M. Ellingson, C. Chung, W. B. Pope [et al.] // Journal of neuro-oncology. - 2017. - Vol. 134, № 3. - P. 495-504.

186. Quirico, L. The power of microRNAs as diagnostic and prognostic biomarkers in liquid biopsies / L. Quirico, F. Orso // Cancer Drug Resistance. - 2020.

- Vol. 3, № 2. - P. 117.

187. Radiotherapy plus concomitant adjuvant temozolomide for glioblastoma: Japanese mono-institutional results / T. Oike, Y. Suzuki, K. I. Sugawara [et al.] // PloS one. - 2013. - Vol. 8, № 11. - P. e78943.

188. Rani, V. Biogenesis and Mechanisms of miRNA- Mediated Gene Regulation / V. Rani, R. S. Sengar // Biotechnology and Bioengineering. - 2022. -Vol. 119, № 3. - P. 685-692.

189. Rasmussen, A. H. The DLGAP family: neuronal expression, function and role in brain disorders / A. H. Rasmussen, H. B. Rasmussen, A. Silahtaroglu // Molecular brain. - 2017. - Vol. 10, № 1. - P. 1-13.

190. Reexpression of Let-7g microRNA inhibits the proliferation and migration via K-Ras/HMGA2/snail axis in hepatocellular carcinoma / K. J. Chen, Y. Hou, K. Wang [et al.] // BioMed research international. - 2014. - Vol. 2014. - P. 742417.

191. Relative survival of patients with supratentorial low-grade gliomas / N. R. Smoll, O. P. Gautschi, B. Schatlo [et al.] // Neuro-oncology. - 2012. - Vol. 14, № 8.

- P. 1062-1069.

192. Review on the Role of miR-1246 in the Pathoetiology of Different Cancers / S. Ghafouri-Fard, T. Khoshbakht, B. M. Hussen [et al.] // Frontiers in Molecular Biosciences. - 2021. - Vol. 8. - P. 771835

193. Serum Exosomal microRNA-21, 222 and 124-3p as Noninvasive Predictive Biomarkers in Newly Diagnosed High-Grade Gliomas: A Prospective Study / D. Olioso, M. Caccese, A. Santangelo [et al.] // Cancers. - 2021. - Vol. 13, № 12. - P. 3006.

194. Serum exosomal miR-301a as a potential diagnostic and prognostic biomarker for human glioma / F. Lan, Q. Qing, Q. Pan [et al.] // Cellular Oncology. -2018. - Vol. 41, № 1. - P. 25-33.

195. Serum microRNA is a biomarker for post-operative monitoring in glioma / A. Morokoff, J. Jones, H. Nguyen [et al.] // Journal of Neuro-Oncology. - 2020. -Vol. 149, № 3. - P. 391-400.

196. Serum microRNA profiling in patients with glioblastoma: a survival analysis / H. Zhao, J. Shen, T. R. Hodges [et al.] // Molecular cancer. - 2017. - Vol. 16, № 1. - P. 1-7.

197. Serum microRNA-210 as a potential noninvasive biomarker for the diagnosis and prognosis of glioma / N. S. Lai, D. G. Wu, X. G. Fang [et al.] // British journal of cancer. - 2015. - Vol. 112, № 7. - P. 1241-1246.

198. Serum miR-100 is a potential biomarker for detection and outcome prediction of glioblastoma patients / H. Zhang, J. Wang, Z. Wang [et al.] // Cancer Biomarkers. - 2019. - Vol. 24, № 1. - P. 43-49.

199. Silencing of vacuolar ATPase c subunit ATP6V0C inhibits the invasion of prostate cancer cells through a LASS2/TMSG1-independent manner / P. Zou, Y. Yang, X. Xu [et al.] // Oncology reports. - 2018. - Vol. 39, № 1. - P. 298-306.

200. Siravegna, G. Integrating liquid biopsies into the management of cancer / G. Siravegna, S. Marsoni, S. Siena, A. Bardelli // Nature reviews Clinical oncology. -2017. - Vol. 14, № 9. - P. 531-548.

201. Small RNAs in Seminal Plasma as Novel Biomarkers for Germ Cell Tumors / N. M0rup, R. Stakaitis, I. Golubickaite [et al.] // Cancers. - 2021. - Vol. 13, № 10. - P. 2346.

202. Specific genetic predictors of chemotherapeutic response and survival in patients with anaplastic oligodendrogliomas / J. G. Cairncross, K. Ueki, M. C. Zlatescu [et al.] // JNCI: Journal of the National Cancer Institute. - 1998. - Vol. 90, № 19. - P. 1473-1479.

203. Stability of circulating exosomal miRNAs in healthy subjects / D. Sanz-Rubio, I. Martin-Burriel, A.Gil [et al.] // Scientific reports. - 2018. - Vol. 8, № 1. -P. 1-10.

204. Stem cell division is regulated by the microRNA pathway / S. D. Hatfield, H. R. Shcherbata, K. A. Fischer [et al.] // Nature. - 2005. - Vol. 435, № 7044. - P. 974-978.

205. Stool-based miR-92a and miR-144* as noninvasive biomarkers for colorectal cancer screening / H. H. Choi, Y. S. Cho, J. H. Choi [et al.] // Oncology. -2019. - Vol. 97, № 3. - P. 173-179.

206. Survival and low-grade glioma: the emergence of genetic information / E. B. Claus, K. M. Walsh, J. K. Wiencke [et al.]// Neurosurgical focus. - 2015. - Vol. 38, № 1. - P. E6.

207. Tashiro, E. Involvement of miR-3180-3p and miR-4632-5p in palmitic acid-induced insulin resistance / E. Tashiro, Y. Nagasawa, S. Itoh, M. Imoto // Molecular and Cellular Endocrinology. - 2021. - Vol. 534. - P. 111371.

208. TDP-43 Modulation by Tau-Tubulin Kinase 1 Inhibitors: A New Avenue for Future Amyotrophic Lateral Sclerosis Therapy / V. Nozal, L. Martínez-González, M. Gomez-Almeria [et al.] // Journal of medicinal chemistry. - 2022. - Vol. 65, № 2. - P. 1585-1607.

209. The 2007 WHO classification of tumours of the central nervous system / D. N. Louis, H. Ohgaki, O. D. Wiestler [et al.] // Acta neuropathologica. - 2007. -Vol. 114, № 2. - P. 97-109.

210. The 2016 World Health Organization classification of tumors of the central nervous system: a summary / D. N. Louis, A. Perry, G. Reifenberger // Acta neuropathologica. - 2016. - Vol. 131, № 6. - P. 803-820.

211. The 2021 WHO classification of tumors of the central nervous system: a summary / D. N. Louis, A. Perry, P. Wesseling [et al.] // Neuro-oncology. - 2021. -Vol. 23, № 8. - P. 1231-1251.

212. The analysis of miRNA expression profiling datasets reveals inverse microRNA patterns in glioblastoma and Alzheimer's disease / S Candido, G. Lupo, M. Pennisi [et al.] // Oncology Reports. - 2019. - Vol. 42, № 3. - P. 911-922.

213. The disturbed blood-brain barrier in human glioblastoma / H. Wolburg, S. Noell, P. Fallier-Becker [et al.] // Molecular aspects of medicine. - 2012. - Vol. 33, № 5-6. - P. 579-589.

214. The microRNAs miR-373 and miR-520c promote tumour invasion and metastasis / Q. Huang, K. Gumireddy, M. Schrier [et al.] // Nature cell biology. -2008. - Vol. 10, № 2. - P. 202-210.

215. The MiRNA journey from theory to practice as a CNS biomarker / N. Stoicea, A. Du, D. C. Lakis [et al.] // Frontiers in genetics. - 2016. - Vol. 7. - P. 11.

216. The multiMiR R package and database: integration of microRNA-target interactions along with their disease and drug associations / Y. Ru, K. J. Kechris, B. Tabakoff [et al.] // Nucleic acids research. - 2014. - Vol. 42, № 17. - P. e133-e133.

217. The role of exosomal MicroRNAs in central nervous system diseases / Y. Yu, K. Hou, T. Ji [et al.] // Molecular and Cellular Biochemistry. - 2021. - P. 1-14.

218. The surgical resection of brainstem glioma: Outcomes and prognostic factors / H. Faulkner, O. Arnaout, R. Hoshide [et al.] // World neurosurgery. - 2021.

- Vol. 146. - P. e639-e650.

219. Therneau, T. M. The rpart package / T. M. Therneau, B. Atkinson, M. B. Ripley // R Foundation for Statistical Computing: Oxford, UK. - 2010.

220. Time to focus on circulating nucleic acids for diagnosis and monitoring of gliomas: A systematic review of their role as biomarkers / A. B. Díaz Méndez, E. Tremante, G. Regazzo [et al.] // Neuropathology and Applied Neurobiology. - 2021.

- Vol. 47, № 4. - P. 471-487.

221. Tracking tumour evolution in glioma through liquid biopsies of cerebrospinal fluid / A. M. Miller, R. H. Shah, E. I. Pentsova [et al.] // Nature. -2019. - Vol. 565, № 7741. - P. 654-658.

222. Vacuolar ATPase 'a2'isoform exhibits distinct cell surface accumulation and modulates matrix metalloproteinase activity in ovarian cancer / A. Kulshrestha, G. K. Katara, S. Ibrahim // Oncotarget. - 2015. - Vol. 6, № 6. - P. 3797.

223. Vickers, K. C. HDL-small RNA Export, Transport, and Functional Delivery in Atherosclerosis / K. C. Vickers, D. L Michell // Current Atherosclerosis Reports. - 2021. - Vol. 23, № 7. - P. 1-10.

224. Wang, J. Applications of DNA-based liquid biopsy for central nervous system neoplasms / J. Wang, C. Bettegowda // The Journal of Molecular Diagnostics.

- 2017. - Vol. 19, № 1. - P. 24-34

225. Wen, P. Y. The 2021 WHO classification of tumors of the central nervous system: clinical implications / P. Y. Wen, R. J. Packer // Neuro-oncology. - 2021. -Vol. 23, № 8. - P. 1215-1217.

226. Westphal, M. Circulating biomarkers for gliomas / M. Westphal, K. Lamszus // Nature Reviews Neurology. - 2015. - Vol. 11, № 10. - P. 556-566.

227. Wong, R. Implementation of global miRNA biomarker discovery in human plasma : gnc. - Queen's University Belfast, 2021.

228. Xu, C. Using Bioinformatics To Mine The Hub Immune-Related Genes in Low-Grade Gliomas Based On TCGA and CGGA Databases / C. Xu, S. Li, X. Li, L. Gao // Research Square - 2021. - PREPRINT (Version 1) available at Research Square: https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-637341/v1.

229. Xu, W. A three-miRNA signature as a potential biomarker for the diagnosis of glioma / W. Xu, W. B. Liang, Y. X. Dai // Int J Clin Exp Pathol. - 2017.

- Vol. 10, № 3. - P. 2814-2823.

230. Zhang, H. Y. Circular RNA TTBK2 regulates cell proliferation, invasion and ferroptosis via miR-761/ITGB8 axis in glioma / H. Y. Zhang, B. W. Zhang, Z. B. Zhang, Q. J. Deng, // Eur Rev Med Pharmacol Sci. - 2020. - Vol. 24, № 5. - P. 2585-2600.

231. Zhang, Y. In vivo knockdown of gene expression in brain cancer with intravenous RNAi in adult rats / Y. Zhang, R. J. Boado, W. M. Pardridge // The Journal of Gene Medicine: A cross- disciplinary journal for research on the science of gene transfer and its clinical applications. - 2003. - Vol. 5, № 12. - P. 1039-1045.

232. Zhao, C. Hypoxic glioblastoma release exosomal VEGF-A induce the permeability of blood-brain barrier / C. Zhao, H. Wang, C. Xiong, Y. Liu, //

Biochemical and biophysical research communications. - 2018. - Vol. 502, № 3. - P. 324-331.

233. Zhao, L. miR-342-3p affects hepatocellular carcinoma cell proliferation via regulating NF-kB pathway / L. Zhao, Y. Zhang // Biochemical and biophysical research communications. - 2015. - Vol. 457, № 3. - P. 370-377.

234. Zhong, F. Serum miR-29b as a novel biomarker for glioblastoma diagnosis and prognosis / F. Zhong, T. Huang, J. Leng // International journal of clinical and experimental pathology. - 2019. - Vol. 12, № 11. - P. 4106.