Оценка пластичности протеома плазмы крови здорового человека в экстремальных условиях жизнедеятельности тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.08, кандидат биологических наук Трифонова, Оксана Петровна

  • Трифонова, Оксана Петровна
  • кандидат биологических науккандидат биологических наук
  • 2011, МоскваМосква
  • Специальность ВАК РФ14.03.08
  • Количество страниц 136
Трифонова, Оксана Петровна. Оценка пластичности протеома плазмы крови здорового человека в экстремальных условиях жизнедеятельности: дис. кандидат биологических наук: 14.03.08 - Авиационная, космическая и морская медицина. Москва. 2011. 136 с.

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Трифонова, Оксана Петровна

1. ВВЕДЕНИЕ

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1. Протеом крови человека

2.2. Понятие «нормы» в протеомике и космической медицине

2.3. Изучение белкового состава крови здорового человека при экстремальных условиях жизнедеятельности

2.3.1. Изменение белков крови после космических полетов

2.3.2. Изменение содержание белков в крови в ходе экспериментов по моделированию факторов космического полета

2.3.2.1. Изменение белкового состава крови в условиях «сухой» иммерсии

2.3.2.2. Изменение белкового состава крови в условиях длительной изоляции в гермообъекте

2.4. Методы исследования протеома крови человека 30 2.4.1. Применение 2-БЕ для анализа протеома крови человека

2.4.1.1. Изменения протеома плазмы (сыворотки) крови, выявленные методом 2-ЭЕ при патологических процессах

2.4.1.2. Вариабельность протеома плазмы (сыворотки) крови здоровых людей, выявленная методом 2-ТУЕ

2.5. Биоинформационные методы в протеомике и космической медицине

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1. Материалы исследования

3.2. Объект исследования 50 3.2.1. Модельные эксперименты, включая анализ внутри- и межиндивидуальной вариабельности

3.2.1.1. 7-суточная «сухая» иммерсия

3.2.1.2. 105-суточная изоляция в гермообъекте

3.2.1.3. Исследование внутрииндивидуальной вариабельности протеома плазмы крови

3.2.1.4. Исследование межиндивидуальной вариабельности протеома плазмы крови

3.3. Методы исследования

3.3.1. Получение образцов плазмы крови

3.3.2. Получение обедненной фракции плазмы крови

3.3.3. Разделение белков методом двумерного электрофореза

3.3.4. Получение и анализ изображения гелей

3.3.5. Анализ данных

3.3.5.1. Расчет коэффициента вариации

3.3.5.2. Кластерный анализ

3.3.5.3. Статистический анализ

3.3.6. Идентификация белков методом масс-спектрометрического анализа пептидных фрагментов (РМР)

3.3.6.1. Проведение гидролиза белков в геле

3.3.6.2. Проведение масс-спектрометрического анализа

3.3.6.3. Обработка масс-спектров

3.3.6.4. Идентификация белков по базе данных

3.3.6.5. Тандемный масс-спектрометрический анализ

4. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

4.1. Протеомная карта плазмы крови здорового человека

4.1.1. Получение обедненной фракции образцов плазмы крови здоровых добровольцев

4.1.2. Анализ двумерных электрофореграмм

4.1.3. Оценка воспроизводимости анализа протеома плазмы крови здоровых добровольцев методом 2-ОЕ

4.1.4. Аннотирование мастер-геля

4.2. Выявление белков с различающимся уровнем содержания, определяющих внутри- и межиндивидуальную вариабельность протеома плазмы крови здоровых людей

4.2.1. Внутрииндивидуальная вариабельность

4.2.2. Межиндивидуальная (групповая) вариабельность в норме

4.3. Изменения протеома плазмы крови, вызванные воздействием модельных экспериментов

4.3.1. Эксперимент с 7-суточной «сухой» иммерсией с 105-суточной изоляцией в гермообъекте

4.4. Сопоставление пластичности протеома плазмы крови с изменениями уровня содержания идентифицированных белков при патологии

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Авиационная, космическая и морская медицина», 14.03.08 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оценка пластичности протеома плазмы крови здорового человека в экстремальных условиях жизнедеятельности»

Актуальность работы

Протеомика - одно из наиболее динамично развивающихся направлений в области постгеномной молекулярной медицины. Практическая значимость протеомики определяется её направленностью на обнаружение белковых биомаркеров для диагностики и мониторинга лечения социально-значимых заболеваний. Протеом крови человека включает в себя* большинство, если не все, белки человеческого организма. Кровь является доступным биоматериалом, что делает ее удобным объектом диагностической протеомики.

Крупномасштабное изучение протеома плазмы крови было проведено под эгидой международной организации HUPO (Human Proteome Organization) в рамках проекта Plasma Proteome Project (НРРР) (Omenn G.S. et al., 2005). В результате выполнения 95 различных исследований было идентифицировано 7884 белка крови. За последние 10 лет в плазме крови были выявлены белки, связанные с сердечно-сосудистыми, онкологическими, аутоиммунными и нейрогенеративными заболеваниями. Несмотря на то, что на этапе исследований различных заболеваний протеомными методами в плазме и. сыворотке крови было выявлено более 200 потенциальных биомаркеров, только единицы из них обладали высокой специфичностью (Anderson N.L, Anderson N.G., 2002, Anderson N.L., 2010, Hortin G.L. et al., 2010). Так, в 2009 году Американским агентством FDA был согласован многопараметрический тест OVA1 для диагностики рака яичников, что явилось первым примером практического применения результатов протеомики (http://www.fda.gov/NevvsEvents/Nevvsroom/PressAnnouncements/ucml82057.htm).

В клинической протеомике, как и в других медицинских исследованиях, остро стоит проблема биологической вариабельности контрольного биоматериала. При обнаружении, в крови белков, потенциальных биомаркеров, необходимо знать, какой степенью изменчивости характеризуется концентрация данных белков в норме, а также границы внутри- и межиндивидуальных различий. Anderson&Anderson в 2002 году представили данные о внутри- и межиндивидуальной вариабельности ряда белков, включая протромбин, миоглобин, гаптоглобин, интерлейкин, С-реактивный белок, липопротеины и другие. Показатели вариабельности составили соответственно 23% и

45%, поэтому авторы предположили, что индивидуальные изменения уровня белков во времени должны быть вдвое ниже, чем вариабельность внутри популяции (Anderson N.L.,

Anderson N.G., 2002). Todd Н. Corzett с соавторами (2010) провели статистический анализ внутрииндивидуальной вариабельности протеома плазмы крови методом дифференциального гель электрофореза (Corzett Т.Н. et al., 2010). Результаты показали, б что межиндивидуальная вариабельность значительно превышает внутрииндивидуальную, которая, в свою очередь, сравнима с технической погрешностью метода. В данном исследовании авторы не принимали во внимание, ни состояние здоровья, ни образ жизни, ни половые различия испытуемых.

Протеом человека в отличие от генома, который является константным параметром организма и в целом не зависит от физиологических или патологических- условий, напротив, является ситуационным. Состав протеома человека крайне изменчив^ и может варьироваться в широком диапазоне в зависимости от текущих условий жизнедеятельности и состояния здоровья. Помимо значительных различий протеомного профиля у разных индивидуумов и естественных колебаний индивидуального протеома во времени, существуют вариации количественного и качественного состава белков, связанные с адаптивным ответом на изменение внешних условий. Так, показано, что на протеом крови могут оказать влияние различные факторы: питание (содержание в пище жиров и белков), курение, занятия спортом, длительный постельный, режим-(Anderson N.L., Anderson N.G., 2002) и циркадианные ритмы (Linkowski P., Spiegel К., Kerkhofs М. et al., 1998).

При выполнении космических полетов, а также при участии в модельных экспериментах, имитирующих отдельные условия космической экспедиции («сухая» иммерсия, длительная изоляция и др.), организм здорового человека реагирует на непривычное для него состояние. Происходящие в организме изменения затрагивают все системы органов, в том числе и белковый состав крови. Анализ изменений белкового состава крови является основой для изучения молекулярного ответа человека в новых условиях существования. С помощью биохимических методов (например, радиоиммуннологического анализа, иммунодиффузии, электрофореза в ацетатцеллюлозном геле) были проанализированы изменения многих белков крови: гормонов белковой природы (инсулина, соматотропина, ренина и других) (Ларина И.М. 2000; 2003; Григорьев А.И. с соавт., 1999), компонентов иммунной системы (иммуноглобулинов, факторов комплемента) (Гусева Е.В., Ташпулатов Р.Ю, 1979, 1980; Рыкова М.П. с соавт., 2001, 2004, 2006), белков системы свертывания крови (Фомин, А.Н., 1981) и «острой» фазы (Ларина О.Н., 1992; 2006), ферментов, в т.ч. протеолитических (Тигранянс соавт., 1987).

Протеомные методы для анализа изменений белкового состава жидкостей тела здорового человека во время космических полетов и наземных экспериментов начали использовать совсем недавно. В лаборатории протеомики ГНЦ РФ - ИМБП РАН для анализа изменений протеома сыворотки крови был применен метод прямого масс7 спектрометрического профилирования после предварительного фракционирования образцов сыворотки на магнитных частицах (Пахарукова H.A. с соавт., 2010, Pakharukova N.A. et al., 2011). Данная технология позволяет анализировать одновременно несколько десятков пептидов, белков и белковых фрагментов, но только в низкомолекулярном диапазоне масс (до 17000 Да). До развития протеомных методов анализ соотношения белковых фракций сыворотки крови проводили с помощью электрофореза в ацетатцеллюлозе (Frenkel M.J. & Blagrove R.J., 1978). Этим методом анализировали изменения после длительных космических полетов и в ходе модельных экспериментов (Ларина О.Н., 1992, 1997, Ларина О.Н., Беккер A.M., 2006). Электрофорез в ацетатцеллюлозе позволяет выявить изменения только в соотношениях групп белков крови (альбумины, глобулины: альфа-1-глобулины, альфа-2-глобулины, бетта-глобулины, гамма-глобулины), но не предоставляет информацию об отклонениях в содержании отдельных белков.

Изучение протеома с помощью двумерного гель-электрофореза (2-DE) долгое время оставалось единственным методом для анализа сложных белковых смесей, таких как плазма крови (O'Farrell Р.Н., 1975). С помощью 2-DE можно проводить, относительный количественный анализ и поиск дифференциально экспрессируемых белков. Преимуществом 2-DE является его объективность и независимость от исходных посылок об ожидаемых результатах эксперимента. Сравнивая 2-DE с современными высоко производительными методами анализа протеома, следует обратить внимание, что количественный анализ не требует предварительной идентификации белков.

Известно, что анализ протеома плазмы крови как методом двумерного электрофореза, та к и любым другим протеомным методом, затруднен наличием мажорных

•> с белков в очень высокой (10"J - Ю'а М) концентрации (альбумин, трансферрин, иммуноглобулины и т.д.) (Anderson N.L. and Anderson N.G., 2002). Поэтому возникает необходимость удаления мажорных белков, чтобы исследовать белки, представленные в более низких концентрациях и составляющие гак называемую обедненную фракцию плазмы крови.

Несмотря на многолетние исследования по протеомному профилированию патологических состояний, четкое определение понятия «норма» в протеомике на сегодняшний день отсутствует. Качественный и количественный состав белков может изменяться в пределах нормы реакции, очевидно, заложенной на генетическом уровне, что не приводит к развитию патологии. В настоящий момент отсутствуют представления о мере пластичности/консерватизма протеома плазмы крови здорового человека при воздействии на его организм различных факторов среды или условий жизнедеятельности.

Целью работы являлась качественная и количественная оценка вариабельности белков плазмы крови здорового человека при воздействии на организм различных факторов, в том числе моделирующих и эффекты микрогравитации. В работе были поставлены и решены следующие задачи:

1. Получить методом двумерного электрофореза и охарактеризовать протеомную карту плазмы крови здорового человека после удаления мажорных и концентрирования минорных белков.

2. Выявить достоверно различающиеся по уровню содержания в плазме крови белки, определяющие внутри- и межиндивидуальные различия (пластичность) протеома здоровых людей.

3. Выявить изменения протеома плазмы крови здорового человека, вызванные воздействием экстремальных факторов («сухая» иммерсия и длительная изоляция).

4. Сопоставить пластичность протеома плазмы крови, обусловленную экстремальными условиями жизнедеятельности, с известными данными об изменении уровня содержания белков в плазме крови при патологии.

Научная новизна

Впервые было проведено исследование по выявлению пределов вариабельности протеома плазмы крови, характерных для нормального человека, в том числе связанных с экстремальными воздействиями. С помощью метода двумерного электрофореза были оценены изменения в протеоме плазмы крови здоровых людей в ходе наземных экспериментов по моделированию отдельных факторов космического полета - 7-суточная «сухая» иммерсия и 105-суточная изоляция в гермообъекте. Впервые показано, что колебания состава протеома проявляются как признаки адаптивной пластичности протеома, в период восстановления организма после перенесенного воздействия.

Практическая значимость работы

В работе проведена оценка пластичности протеома плазмы крови, с целью выявления требований к биологическим биомаркерам, необходимые для медицинского освоения результатов протеомных исследований. Определены доверительные интервалы коэффициента вариации, в пределах которых количественные изменения белкового состава крови не связаны с молекулярным механизмом развития болезни, а отражают физиологическую норму реакции организма. Установлено, что для отдельных белков масштаб этих колебаний сопоставим с изменением уровня белков плазмы, наблюдаемым 9 при патологии. Получена важная информация с точки зрения исследования индивидуальных защитных механизмов, повышающих функциональные резервы здорового человека при воздействии неблагоприятных факторов окружающей среды, в том числе и факторов космического полета.

Положения диссертации, выносимые на защиту

1. Двумерный гель-электрофорез в сочетании с пробоподготовкой с использованием пептидных микрогранул (ProteoMiner™) для удаления мажорных и концентрирования минорных белков является информативным и воспроизводимым методом анализа протеома плазмы крови здорового человека в

4 7 диапазоне концентраций от 10 до 10" М.

2. Пребывание человека в условиях длительной изоляции в гермообъекте не вызывает выраженных изменений в протеоме плазмы крови, что сопоставимо с индивидуальными изменениями во времени, наблюдаемыми в условиях обычной жизнедеятельности.

3. Экстремальные условия жизнедеятельности, моделирующие эффекты микрогравитации («сухая» иммерсия), вызывают в период реадаптации после перенесенного воздействия существенные изменения содержания белков плазмы крови здорового человека.

4. Адаптивное изменение уровня содержания белков крови, выявленных у здоровых добровольцев в экстремальных условиях жизнедеятельности, также наблюдается у пациентов как неспецифическая реакция организма в связи с развитием заболевания.

Апробация работы

Основные положения диссертационной работы докладывались и обсуждались в ходе следующих конференций:

1) 3rd Central and Eastern European Proteomics Conference, Budapest, Hungary October 6-9, 2009;

2) Итоговая конференция по результатам выполнения мероприятий за 2009 год в рамках приоритетного направления «Живые системы» ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы», Москва, Россия, 25-27 ноября 2009г.

3) French-Russian-Belarussian Conference «Neurovascular Impairment Induced by Environmental Conditions: Molecular, Cellular and Functional Approach», Angers,

France, March 10-14, 2010;

4) IX «Конференция молодых ученых, специалистов и студентов», посвященная Дню космонавтики, Москва, Россия, 14 Апреля 2010;

5) 31st Annual International Gravitation Physiology Meeting, Trieste, Italy, June 13-18, 2010;

6) I Международная научно-практическая конференция «Постгеномные методы анализа в биологии, лабораторной и клинической медицине». Москва, 17-19 ноября 2010;

7) Итоговая конференция по результатам выполнения мероприятий за 2010 год в I рамках приоритетного направления «Живые системы» ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы», Москва, Россия, 6 декабря 2010;

8) 18th IAA Humans in Space Symposium, Houston, USA, April 11-15, 2011.

Диссертация апробирована 24 июня 2011 г. на секции «Космическая физиология и биология» учёного совета ГНЦ РФ - ИМБП РАН, протокол № 3 от 24 июня 2011 г.

Публикации

По теме диссертации опубликовано 12 печатных работ, в том числе 4 статьи в журналах из перечня Высшей аттестационной комиссии Российской Федерации.

1. Oxana Trifonova, Irina Larina, Anatoly Grigoriev, Andrey Lisitsa, Sergei Moshkovskii, Alexander Archakov. Application of 2-DE for studying the variation of blood proteome. (Special report) Expert Rev Proteomics. 2010 Jun;7(3): 431-438;

2. Трифонова О.П., Пастушкова JT.X., Саменкова Н.Ф., Пятницкий М.А., Карузина И.И., Лисица A.B., Ларина И.М. Изменение белкового состава плазмы крови в

1 эксперименте с 7-суточной "сухой" иммерсией. Авиакосмическая и экологическая медицина, 2010. Т.44. No.5, с.24-28.

3. А.Л. Чернобровкин, О.П. Трифонова, H.A. Петушкова, Е.А. Пономаренко, A.B. Лисица. Выбор допустимой погрешности определения массы пептида при идентификации белков методом пептидного картирования. Биоорганическая химия, 2011. Т.37. №1, с.132-136.

4. Е.К. Байгарин, В.В. Бессонов, О.И. Передеряев, О.П. Трифонова, С.А. Мошковский, М.А. Карпова. Вариабельность протеома плазмы крови у здоровых людей. Вопросы питания, 2011. Т.80. №2, с. 20-25.

Работа выполнена в лаборатории протеомики ГНЦ РФ — ИМБП РАН и в лаборатории микросомального окисления ИБМХ РАМН в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2012 годы», при поддержке программы ОБН РАН № 6006/3, грантов Президента РФ «Ведущие научные школы» № НШ-3402.2008.4 и РФФИ № 08-04-01533-а.

Похожие диссертационные работы по специальности «Авиационная, космическая и морская медицина», 14.03.08 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Авиационная, космическая и морская медицина», Трифонова, Оксана Петровна

6. выводы

1. Получена протеомная карта обедненной фракции плазмы крови здорового человека, содержащая 140 белковых пятен, из которых 70 белковых пятен воспроизводились более чем на 70% электрофореграмм и характеризовались коэффициентом технической вариации не превышавшим 25%.

2. Внутри- и межиндивидуальные различия в протеоме плазмы крови здоровых людей в условиях их обычной жизнедеятельности характеризуются коэффициентами вариабельности 22% и 50%, соответственно.

3. Выявлены белки, определяющие пластичную часть протеома плазмы крови. Внутрииндивидуальная вариабельность обусловлена различиями в уровне содержания аполипопротеинов A-I, Е и кластерина (аполипопротеин J), а межиндивидуальная -помимо тех же белков, также связана с различиями в уровне содержания аполипопротеина A-IV, витронектина, плазминогена, фибриногена а- и (3-цепи, факторов С1. и С4 комплемента и иммуноглобулина М.

4. Пребывание здорового человека в контролируемых условиях жизнедеятельности в гермообъекте не вызывает значительных изменений в протеоме плазмы крови.

5. В эксперименте с «сухой» иммерсией значимые изменения в протеоме плазмы крови здоровых добровольцев происходили в период реадаптации после завершения испытания. Наблюдаемые изменения были связаны с достоверным увеличением уровня содержания в крови аполипопротеинов A-I, Е и A-IV и с уменьшением уровня содержания а- и Р-цепей фибриногена, сывороточного амилоида Р и фрагментов фактора С4 комплемента.

6. Изменения уровня белков, характерные для естественного молекулярного ответа организма в процессе адаптации на изменение условий жизнедеятельности аналогичны изменениям, присущим неспецифическому компоненту патогенеза заболеваний.

5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Результаты проведенной работы с применением микрогранул ProteoMiner™ (BioRad) для удаления мажорных и концентрирования минорных белков, позволили с помощью метода двумерного электрофореза построить и охарактеризовать протеомную карту обедненной фракции плазмы крови здорового человека, содержащую 140 белковых пятен. На полученной протеомной карте хорошо детектировались белковые компоненты плазмы крови - a-, ß-, и у-цепи фибриногена, сывороточный альбумин, витронектин, протромбин и аполипопрогеины А-1, A-IV и Е, что согласуется со стандартной картиной 2-DE геля плазмы крови в базе данных SWISS-2DPAGE (http://www.expasy.ch/swiss-2dpage/viewer). Для анализа пластичности протеома плазмы крови здорового человека в экстремальных условиях жизнедеятельности было отобрано 70 белковых пятен с высоким уровнем воспроизводимости и коэффициентом технической погрешности менее 25%.

Было показано, что протеом плазмы крови здорового человека характеризуется достаточно высокой межиндивидуальной вариабельностью, в то время как внутрииндивидуальная вариабельность протеома здоровых добровольцев, изученная на протяжении 3-х недель в период обычной жизнедеятельности, лишь незначительно превышает техническую погрешность метода анализа. Коэффициент внутрииндивидуальной и групповой вариабельности протеома плазмы крови здорового человека составили 22±13% и 50±19%, соответственно, при аналитической погрешности метода 2-DE — 22%. Наибольшим коэффициентом внутрииндивидуальной вариабельности характеризовались белки семейства аполипопротеинов - аполипопротеины А-1, Е и кластерин (аполипопротеин J) (средний CV=30±17%). В свою очередь, высоким коэффициентом межиндивидуальной вариабельности помимо выше обозначенных аполипопротеинов A-I, Е и кластерина (аполипопротеин J) характеризовались белки системы липидного обмена - аполипопротеин A-IV, гемостаза - фибриноген и плазминоген, и факторы С4 и С1 системы комплемента, а также иммуноглобулин М. Максимальный показатель межиндивидуальной вариабельности характерен для аполипопротеина А-1 (CV=81%). При этом даже в случае незначительности усредненных показателей внутрииндивидуальной пластичности протеома плазмы крови в течение времени в нормальных условиях жизнедеятельности анализ межиндивидуальной вариабельности показал, что у отдельных индивидуумов эти изменения могут быть существенны и достигать 2-3 раз.

Помимо оценки нормальной вариабельности протеома плазмы крови здорового человека исследовали границы адаптивных изменений протеома плазмы крови здоровых

112 людей при экстремальных физиологических воздействиях. Для анализа использовали образцы плазмы крови здоровых добровольцев, участвующих в экспериментах, моделирующих отдельные условия космических полетов — воздействие «сухой» иммерсии и длительной изоляции в гермообъекте. Полученные данные свидетельствуют о существенных изменениях в протеоме плазмы крови здорового человека в период реадаптации организма к условиям обычной жизнедеятельности после 7-суточного воздействия «сухой» иммерсии. Выявленные изменения затрагивали белки, относящиеся к иммунной системе, системам метаболизма липидов и регуляции гемостаза. На 7-й день периода реадаптации наблюдалось достоверное увеличение уровня аполипопротеинов А-I, А-1У и Е по сравнению с фоном и 7-м днем пребывания в иммерсионной ванне. В то же время, происходило снижение уровня а-, Р-цепи фибриногена, фрагментов фактора С4 комплемента и сывороточного амилоида Р. В эксперименте со 105-суточной> изоляцией анализ образцов плазмы крови позволил выявить изменения уровня белков, участвующих в функционировании системы метаболизма и транспорта липидов - аполипопротеины А-1 и Е, системы регуляции гемостаза - а-, Р-цепи фибриногена и плазминоген, а также в формировании гуморального звена иммунного ответа организма — факторы С1, С4 комплемента и иммуноглобулин М. Выраженность изменений в протеоме плазмы крови в эксперименте с длительной изоляцией оказалась значительно меньше, чем при воздействии модельного эксперимента с «сухой» иммерсией, а наблюдаемые изменения белкового профиля носили ярко выраженный индивидуальный характер.

Заключительной частью данной работы было сравнение результатов модельных экспериментов с участием здоровых добровольцев с опубликованными данными о выявлении в крови биомаркеров методом двумерного электрофореза. Для этого проверили, наблюдали ли столь же выраженное изменение уровня белков, выявленных у здоровых добровольцев в модельных экспериментах с 7-суточной «сухой» иммерсией или 105-суточной изоляцией в гермообъекте, и соответственно отражающие нормальную (адаптационную) вариабельность протеома, при развитии каких-либо патологических процессов. Оказалось, что уровень некоторых выявленных в работе белков изменяется при таких заболеваниях, как острый дыхательный синдром, инфаркт миокарда, болезнь Альцгеймера, диабет, нефропатия, различные онкологические процессы. Следовательно, эти изменения являются по большей части не специфическими для патогенеза данных заболеваний. Наблюдаемые нами изменения уровня этих белков у здоровых добровольцев, были меньше или соизмеримы с таковыми, наблюдаемыми у пациентов с определенными патологическими состояниями. В ходе данной работы было выявлено, что наиболее существенные изменения в уровне содержания идентифицированных белков

113 плазмы крови происходят в период реадаптации организма после экстремального воздействия. Можно предположить, что молекулярные механизмы, включающиеся в период реадаптации, по составу участвующих белков в той или иной степени соответствуют тем защитным механизмам, которые включаются у человека в ответ на заболевание.

Полученные данные свидетельствуют, что изменения белкового профиля в концентрационном диапазоне до 10"7 М в большей степени имеют отношение к понятию физиологической (в том числе - адаптационной) нормы протеома плазмы крови, нежели к развитию патологического процесса. Изучение такого рода изменений может иметь практическое значение с точки зрения исследования индивидуальных защитных механизмов, повышающих функциональные резервы здорового человека при воздействии неблагоприятных факторов окружающей среды, в том числе и факторов космического полета.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Трифонова, Оксана Петровна, 2011 год

1. Алешкин В.А., Новикова Л.И., Лютов А.Г. и др. Белки острой фазы и их клиническое значение. // Клиническая медицина 1998. - №8. — С. 39.

2. Афонин Б.В. Состояние пищеварительной системы в длительных космических полетах и гипокинезии. // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. — 1999. Т.9. -№7. - С.5.

3. Афонин Б.В. Система пищеварения. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. - С. 620-628.

4. Бабко А.К., Пилипенко А.Т. Фотометрический анализ. Т.1. Общие сведения и аппаратура. // М.: Химия, 1968 388 с.

5. Баранов В.М., Демин Е.П., Степанов В.А. и др. Организационно-методические проблемы модельных экспериментов с длительной изоляцией в гермообъекте. Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001.-С. 5-20.

6. Бокарев И.Н., Попова JI.B., Кондратьев Т.Б. Венозный тромбоэмболизм: лечение и профилактика // Consilium Medicum. Хирургия. 2005. - Т. 7. - №1. - С. 44-52.

7. Булатов М.И. Калинкин И. П. Практическое руководство по фотоколориметрическим и спектрофотометрическим методам анализа // Л.: Химия, 1976,- 176 с.

8. Буравкова Л.Б., Ларина И.М., Попова И.А. Особенности метаболизма у человека при выполнении физической нагрузки после 7-суточной «сухой» иммерсии. // Физиология человека, 2003. Т.29. - №5. - С. 82-89.

9. Бутченко Л.А., Бутченко В.Л. К проблеме нормы в спортивной медицине. // Теория и практика физической культуры. — 1998. №3. - С.

10. Газенко О.Г., Григорьев А.И., Наточин Ю.В. Водно-солевой гомеостаз и невесомость. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1980. — Т. 14. - №5. - С. 3-10.

11. О.Г. Газенко, И.И. Касьян. Физиологические проблемы невесомости// М, 1990.

12. Герцик Ю.Г. Уровень сывороточных иммуноглобулинов и специфических IgE-антител при действии факторов космического полета и их моделировании. // Автореферат диссертации на соискание степени канд. биол. наук. Москва, 2004 -24 с.

13. Говорун В.М, Арчаков А.И. Протеомные технологии в современной биомедицинской науке. // Биохимия. 2002. - Т.67. - №10. - С. 1109-1123.

14. Гоуфман Е.И, Мошковский С.А, Тихонова О.В. и др. Протеомное исследование термостабильной фракции сыворотки пациентов с различными опухолями с применением двумерного электрофореза. // Биохимия. 2006. - Т.71. - №4. - С. 445-453.

15. Григорьев А.И, Ларина И.М. Содержание соматотропина и других регуляторов мышечного метаболизма в крови человека при длительных космических полетах и гипокинезии. // Физиология человека. 1999. - Т.25. - №4. - С. 89-96.

16. Григорьев А.И, Баевский P.M. Концепция здоровья и проблема нормы в космической медицине. // М.: «Слово», 2001 96 с.

17. Григорьев А.И, Баевский P.M. Концепция здоровья и космическая медицина. // М.: Слово, 2007 208 с.

18. Гусева Е.В, Ташпулатов Р.Ю. Влияние 49-суточного космического полета на показатели иммунологической реактивности и белковый состав крови экипажа «Салют-5». // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1979. - Т. 13. -№1 - С. 3-8.

19. Гусева Е.В, Ташпулатов Р.Ю. Изучение альбумин-глобулинового состава крови экипажа орбитальной станции «Салют-3». // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1979 -Т.13 - № 3 - С. 15-18.

20. Гусева Е.В, Ташпулатов Р.Ю. Влияние полетов различной продолжительности на белковый состав крови космонавтов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1980.-Т. 14. -№1.~С. 13-17.

21. Заболотская И.В, Маркин A.A. Липидный состав сыворотки крови человека в эксперименте с длительной изоляцией. Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001, 437-446.

22. Каландаров С.К., Коршунова В.А., Проскурова Г.И. Влияние искусственной среды обитания гермообъектов на некоторые показатели обмена веществ у человека. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. — 1986. Т. 20 - № 10. - С. 343-344.

23. Козлов A.A., Беркович A.JL, Качалова Н.Д. и др. Пособие для врачей-лаборантов по методам исследования плазменного гемостаза. // М.: Российская академия медицинских наук, 2006. 24 с.

24. Козловская И.Б. Фундаментальные и прикладные задачи иммерсионных исследований. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2008. - Т.42. - № 5. - С.3-7.

25. Комаров Ф.И., Коровкин Б.Ф. Биохимические показатели в клинике внутренних болезней. // М.: Медпресс, 2000. 228 с.

26. Константинова И.В., Антропова E.H., Мешков Д.О. и др. Иммунная резистентность человека в течение длительной изоляции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1997. -Т.31. -№4. - С.57-60.

27. Корнилова Л.Н., Темникова В.В., Алехина М.И. и др. Влияние продолжительной микрогравитации на вестибулярную функцию. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2006. -Т.40. - №6. - С. 12-16.

28. Корольков A.A. Диалектика и теоретическая медицина. // М.: Медицина, 1979. -235 с.

29. Лакота Н.Г., Васин Ю.А., Ларина И.М., Демин Е.П. Термодинамическое состояние системы «организм человека замкнутая среда» при 240-суточной изоляции в гермообъеме. // Физиология человека. - 2002. - №5. - С. 65-74.

30. Лакота Н.Г., И.М. Ларина. Изучение температурного гомеостаза в реальной и моделируемой невесомости. // Физиология человека. 2002. - Т.28. - №3. - С.102-112.

31. Ларина И.М., Суханов Ю.В, Лакота Н.Г. Механизмы ранних реакций водно-электролитного обмена у человека в различных наземных моделях эффектов микрогравитации. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1999. - Т.ЗЗ. -№4.-С. 17-23.

32. Ларина И.М. Гормональная регуляция. Послеполетные клинико-физиологические исследования. Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. - С.603-606.118

33. Ларина О.Н. Белковый состав плазмы крови человека и животных при космических полетах и моделировании воздействия невесомости. // Диссертация на соискание степени канд. биол. наук. Москва, 1992 - 154 с.

34. Ларина О.Н. Белковый состав плазмы крови космонавтов после длительных орбитальных полетов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. -1992.-Т.26. -№3. С. -67-69.

35. Ларина О.Н. Влияние длительной изоляции в гермообъекте на состав электрофоретических фракций и содержание некоторых индивидуальных белков плазмы. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 1997. - Т.31. - №5. - С.45-54.

36. Ларина О.Н. Воздействие факторов космического полета на продукцию белков, участвующих в адаптации' к измененным условиям среды. // Материалы конференции «Организм и окружающая среда: адаптация к экстремальным условиям». Москва, 2003. - С. 204.

37. Ларина О.Н. Белки плазмы крови при длительных космических полетах. // Материалы XIII конференции1 по космической биологии и авиакосмической медицине, Москва, 2006. 13-16 июня - С. 167.

38. Ларина О.Н., Беккер A.M. Исследование индивидуальных особенностей регуляции уровней белков крови при моделировании воздействия микрогравитации на человека. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2009. - Т.43. - №1. - С. 52-56.

39. Ларина О.Н., Беккер A.M., Умарходжаев P.M. Исследование показателей воспроизводимости метода двумерного электрофореза в ацетатцеллюлозе. // Технологии живых систем. 2006. - Т.З. - №5-6. - С. 20-23.

40. Лебедев К.А., Понякина И.Д., Авдеева B.C. Системное представление о спокойном и активном функционировании иммунной системы. // Успехи современной биологии. -1991. Т. 111.- №2. - С. 229.

41. Маркин A.A., Журавлева O.A. Биохимическое исследование крови. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. - С. 606-612.

42. Маркин A.A., Журавлева O.A., Моруков Б.В. и др. Особенности обмена веществ у космонавтов после длительных полетов на международной космической станции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. — 2005. Т.39. - №4. - С. 36-41.

43. Маркин A.A., Журавлева, O.A., Моруков Б.В. и др. Гомеостатические реакции организма человека при воздействии условий 105-суточной изоляции. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2010. - Т.44. - №4. - С. 31-35.

44. Маркин A.A., Моруков Б.В., Журавлева О. А. и др. Динамика биохимических показателей крови в эксперименте с 7-суточной «сухой» иммерсией. // Ависакосмическая и экологическая медицина. 2008. - Т.42. - №5. - С. 56-60.

45. Моруков Б.В., Ларина И.М., Григорьев А.И. Изменения обмена кальция и его регуляция у человека во время длительного космического полета. // Физиология человека. 1998. - Т.24. - № 2. - С. 102-107.

46. Моруков Б.В., Носков В.Б., Ларина И.М. и др. Водно-солевой обмен и функция почек в космических полетах и наземных модельных экспериментах. // Российский физиологический журнал им. И.М. Сеченова. 2003. -Т.89. -№3. - С. 356-367.

47. Моруков Б.В., Демин Е.П., Васильева Г.Ю. Эксперимент со 105-суточной изоляцией, моделирующий элементы межпланетной экспедиции к Марсу: задачи,объем и структура исследований. // Авиакосмическая и экологическая медицина. -2010.-Т.44.-№4.-С. 3-5.

48. Носков В.Б. Состояние водно-солевого обмена. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. -Т. 1.-С. 599-603.

49. Попов И.Г., Лацкевич A.A. Аминокислоты в крови космонавтов до и после 211-суточного полета. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1984. -Т. 18. - №2. - С. 26-33.

50. Попова И.А., Ветрова Е.Г., Дроздова Т.Е. Активность ферментов сыворотки крови после длительных космических полетов. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1984. - Т. 18. - №5. - С. 81-82.

51. Попова И.А., Ветрова Е.Г., Рустамьян Л.А. Оценка энергетического метаболизма космонавтов. // Физиолог. 1991. - Т.34 (1 Suppl). - С. 98-99.

52. Поликарпов H.A., Рыкова М.П., Антропова E.H. и др. Некоторые наблюдения за состоянием иммунитет-микрофлора у членов экипажей в условиях эксперимента SFINCSS-99 в сопоставлении с параметрами гелиогеомагнитной активности.

53. Модельный эксперимент с длительной изоляцией: проблемы и достижения. // М.: Слово, 2001.-С. 480-490.

54. Ройтберг Г.Е., Струтынский А.Е. Лабораторная и инструментальная диагностика заболеваний внутренних органов. // М.: Бином, 1999. 622 с.

55. Рыкова М.П., Антропова E.H., Мешков Д.О. Иммунологическое обследование. Послеполетные клинико-физиологические исследования Орбитальная станция «Мир». // М.: Аником, 2001. Т. 1. - С. 615-620.

56. Рыкова М.П., Герцик Ю.Г., Антропова E.H. и др. Влияние длительной изоляции на формирование аллергических реакций у человека. // Авиакосмическая и экологическая медицина. 2004. - Т. 38. - №2. - С. 24-28.

57. Смирнов К.В. Пищеварение и гипокинезия. // М.: Медицина, 1990. 224 с:

58. Уильяме Р. Биохимическая индивидуальность: Основы генетотрофной концепции. // М.: Иностранная литература, 1960. 296 с.

59. Фомин А.Н. Фибриноген крови при 7-суточной водной иммерсии и кратковременном космическом полете. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1981. - Т.15. - №5. - С. 83-85.

60. Шенкман Б.С. Структурно-метаболическая пластичность скелетных мышц млекопитающих во время гипокинезии и невесомости. // Авиакосмическая и экологическая медицина. — 2002. Т.36. - №3. - С. 3-14.

61. Шмальгаузен И.И. Проблемы адаптации человека. // Вестник АМН СССР. 1975. -№10. -С. 5-16.

62. Шульженко И.Б., Виль-Вильямс И.Ф. Возможность осуществления длительной водной иммерсии методом «сухой» иммерсии. // Космическая биология и авиакосмическая медицина. 1976. - Т. 10. - №2. - С.32-34.

63. Aebersold R., Mann М., Mass spectrometry-based proteomics. // Nature. 2003. -13;422(6928). - P. 198-207.

64. Ahmed N., Barker G., Oliva K. et al. An approach to remove albumin for the proteomic analysis of low-abundance biomarkers in human serum. // Proteomics. 2003. - 3. P. 1980-1987.

65. Ahmed N., Oliva K.T., Barker G. et al. Proteomic tracking of serum protein isoforms as screening biomarkers of ovarian cancer. // Proteomics. 2005. - 5(17). - P. 4625-4636.

66. Aldred S., Sozzi T., Mudway I. Grant M.M. et al. Alpha tocopherol supplementation elevates plasma apolipoprotein Al isoforms in normal healthy subjects. // Proteomics. — 2006. Vol.6. - №5. - P. 1695-703.

67. Anderson L., Anderson N.G. High resolution two-dimensional electrophoresis of human plasma proteins. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1977. - 74(12). - P. 5421-5425.

68. Anderson N.L., Anderson N.G. A two-dimensional gel database of human plasma proteins. // Electrophoresis. 1991. - 12(11). - P. 883-906.

69. Anderson N.L., Anderson N.G. The human plasma proteome: history, character, and diagnostic prospects. // Molecular and Cellular Proteomics. 2002. - Vol.1. - №11. - P. 845-867.

70. Anderson N.L. 2010 The clinical plasma proteome: a survey of clinical assays for proteins in plasma ans serum. // Clinical Chemistry. 2010. - №56. - P. 177-185.

71. Anqles-Cano E. Overview on fibrinolysis: plasminogen activation pathways on fibrin and cell surfaces. // Chem. Phys. Lipids. 1994. - 67 - 68. - P. 353 -362.

72. Archakov A., Ivanov Y., Lisitsa A., Zgoda V. Biospecific irreversible fishing coupled with atomic force microscopy for detection of extremely low-abundant proteins. // Proteomics. -2009. 9(5). - P. 1326-1343.

73. Banfi G., Del Fabbro M. Biological variation in tests of hemostasis. // Seminars in Thrombosis and Hemostasis. 2009. -Vol! 35. - №1. - P. 120-126.

74. Belozerova I.N., Nemirovskaya T.L., Shenkman B.S. et al. Structural and metabolic characteristics of human soleus fibers after long duration spaceflight. // Journal of Gravitational Physiology. 2002. - Vol. 9. - №1. - P 125-126.

75. Belt K.T., Carroll M.C., Perter R.R. The structural basis of the multiple forms of human complement component C4. // Cell. 1984. - 36(4). - P. 907-914.

76. Bloomston M., Zhou J.X., Rosemurgy A.S., Frankel W., Muro-Cacho C.A., Yeatman T.J. Fibrinogen gamma overexpression in pancreatic cancer identified by large-scale proteomic analysis of serum samples. // Cancer. Res. 2006. - 66(5). - P. 2592-2599.

77. Bowler R.P, Duda B, Chan E.D. et al. Proteomic analysis of pulmonary edema fluid and plasma in patients with acute lung injury. // Am. J. Physiol. Lung Cell. Mol. Physiol. 2004. - 286(6). - P. 1095-1104.

78. Bradford M.M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. // Anal Biochem. 1976. - May 7.-72.-P. 248-254.

79. Bruce C, Chouinard R.A. Jr., Tall A.R. Plasma lipid transfer proteins, high-density lipoproteins, and reverse cholesterol transport. // Annu. Rev. Nutr. 1998. - 18. - P. 297330.

80. Cañas B, López-Ferrer D, Ramos-Fernández A, Camafeita E, Calvo E. Mass spectrometry technologies for proteomics. // Brief. Funct. Genomic. Proteomic. 2006. — 4(4). - P. 295-320.

81. Castellino F.J, Ploplis V.A. Structure and function of the plasminogen/plasmin system. // Thromb. Haemost. 2005. - 93(4). - P. 647-654.

82. Chauhan A.K, Moore T.L. Presence of plasma complement regulatory proteins clusterin (Apo J) and vitronectin (S40) on circulating immune complexes (CIC). // Clinical and Experimental Immunology. 2006. - 145. - P. 398-406.

83. Chen J.-H, Chang Y.W, Yao C.-W. et al. Plasma proteome of severe acute respiratory syndrome analyzed by two-dimensional gel electrophoresis and mass-spectrometry. // PNAS. -2004. -Vol.101. -№49. P. 17039-17044.

84. Chen R, Pan S, Brentnall T.A. et al. Proteomic profiling of pancreatic cancer for biomarker discovery. // Molecular and Cellular Proteomics. 2005. - Vol.4. - №4. - P. 523-533. Epub 2005 Jan 31.

85. Chen Y, Lim B.K, Peh S.C, Abdul-Rahman P.S, Hashim O.H. Profiling of serum and tissue high abundance acute-phase proteins of patients with epithelial and germ line ovarian carcinoma. // Proteome Sci. 2008. - 18. P. 6-20.

86. Cho S.Y, Lee E.Y, Lee J.S. et al. Efficient prefractionation of low-abundance proteins in human plasma and construction of a two-dimensional map. // Proteomics. 2005. -5(13). - P. 3386-3396.

87. Colantonio D.A, Dunkinson C, Bovenkamp D.A, Van Eyk J.E. Effective removal of albumin from serum. // Proteomics. 2005. - 5. - P. 3831-3835.

88. Corzett T.H., Fodor I.K., Choi M.W. et al. Statistical analysis of the experimental variation in the proteomic characterization of human plasma by two-dimensional difference gel electrophoresis. // J. Proteome Res. 2006. - 5(10). - P. 2611-2619.

89. Corzett T.H., Fodor I.K., Choi M.W. et al. Statistical analysis of variation in the human plasma proteome. // Journal of biomedicine & biotechnology. 2010. - 258494. Epub 2010 Jan 14.

90. Dodds A.W., Law S.K. The complement component C4 of mammals. // Biochem. J. -1990. 15;265(2). - P. 495-502.

91. Domon B., Aebersold R. Mass spectrometry and protein analysis. // Science. 2006. -14;312(5771).-P. 212-217.

92. Doolittle R.F. Fibrinogen and fibrin. // Annu. Rev. Biochem. 1984. - 53. - P. 195229.

93. Echan L.A., Tang H.Y., Ali-Khan N., Lee K., Speicher D.W. Depletion of multiple high-abundance proteins improves protein profiling capacities of human serum and plasma. // Proteomics. 2005. - 5. - P. 3292-3303.

94. Feng J.T., Liu Y.K., Song H.Y. et al. Heat-shock protein 27: a potential biomarker for hepatocellular carcinoma identified by serum proteome analysis. // Proteomics. 2005. -5(17).-P. 4581-4588.

95. Frenkel M.J., Blagrove R.J. Cellulose acetate impregnated with polyacrylamide: a novel medium for electrophoresis. // Analytical Biochemistry. 1978. — Vol.84. - №2. - P. 583-8.

96. Gabay C., Kushner T. Acute-phase proteins and other systemic responses to inflammation. //N. Engl. J. Med. 1999. - 340. - P. 448-454.

97. Gazenko O.G., Shulzhenko E.B., Egorov A.D. Cardiovascular changes in prolonged space flights. // Acta physiologica Polonica. 1986. - Vol. 37. - №2. - P. 53-68.

98. Gazenko O.G., Egorov A.D., Ioseliani K.K. et al. Medical problems of manned space flights onboard orbital stations. // Acta Astronautica. 1987. - Vol. 15. - №9 - P.757-760.

99. Gigli I., von Zabern I., Porter R.R. The isolation and structure of C4, the fourth component of human complement. // Biochemistry Journal. 1977. - 165. - P. 439-446.

100. Grigoriev A.I., Egorov A.D. The effects of prolonged spaceflights on the human body. // Advances in Space Biology and Medicine. 1991. -№1.-P. 1-35.

101. Grigoriev, A.I., Egorov, A.D. General mechanisms of the effect of weightlessness on the human body. // In: Goor BS, ed. Advances in space biology and medicine. The Netherlands: JAI Press. 1992. - P. 1- 43.

102. Han X., Aslanian A., Yates J.R. 3rd. Mass spectrometry for proteomics. // Curr. Opin. Chem. Biol. -2008. 12(5). - P. 483-490.

103. Hanash S.HUPO initiatives relevant to clinical proteomics. // Mol Cell Proteomics. -2004.-3(4).-P. 298-301.

104. Harris E.K., DeMets D.L. Biological and analytic components of variation in long-term studies of serum constituents in normal subjects 5. Estimated biological variations in ionized calcium. // Clin Chem. 1971. -17(10). P. 983-987.

105. Hortin G., Sviridov D., Anderson N.L. High-abundance polypeptides of the human plasma proteome comprising the top 4 logs of polypeptide abundance. // Clinical Chemistry. 2008. - 54 (10). - P. 1608-1616.

106. Hortin G.L. et al. 2010 Introduction: Advances in protein analysis for the clinical laboratory. // Clinical Chemistry. 2010. - №56(2). - P. 149-151.

107. Huang H.L., Stasyk T., Morandell S. et al. Biomarker discovery in breast cancer serum using 2-D differential gel electrophoresis/MALDI-TOF/TOF and data validation bi routine clinical assays. // Electrophoresis. 2006. - 27(8). - P. 1641-1650.

108. Hui L., Ge-ge W., Zhiyue L., Yanan G. Association analysis of biological variations in different routinely measured biochemical parameters in healthy subjects. // LABMEDICINE. 2009. - Vol. 40. - №8. - P. 474-477.

109. Hye A., Lynham S., Thambisetty M. et al. Proteome-based plasma biomarkers for Alzheimer's disease. // Brain. 2006. - 129(11). - P. 3042-3050.

110. Jackson D., Craven R.A., Hutson R.C. et al. Proteomic profiling identifies afamin as a potential biomarker for ovarian cancer. // Clin. Cancer Res. 2007. - 13(24). - P. 73707379.

111. Jenny N.S., Arnold A.M., Kuller L.H. et al. Serum amyloid P and cardiovascular disease in older men and women: Results of cardiovascular health study. // Arterioscler Thromb Vase Biol. 2007. - №27. - P. 352-358.

112. Jiang 1., He L., Fountoulakis M. Comparison of protein precipitation methods for sample preparation prior to proteomic analysis. // Journal of Chromatography. 2004. -1023.-P. 317-320.

113. Joo W.A., Sul D., Lee D.Y., et al. Proteomic analysis of plasma proteins of workers exposed to benzene. // Mutation Research. 2004. - Vol.558. - №1-2. - P. 35-44.

114. Kahn S.N., Strony L.P. Impresicion of quantification of serum protein fractions by electrophoresis on cellulose acetate. // Clinical Chemistry. 1986. - Vol.32. - №2. - P. 356-357.

115. Kalenka A., Feldmann R.E. Jr., Otero K., Maurer M.H., Waschke K.F., Fiedler F. Changes in the serum proteome of patients with sepsis and septic shock. // Anesth. Analg. -2006. 103(6).-P. 1522-1526.

116. Kaplan A., Savary J. Evaluation of cellulose acetate electrophoresis system for serum protein fractionation. // Clinical Chemistry. 1965. - Vol.11. - №10. - P. 937-942.

117. Kap-Soon N., Do-Youn L., Hak C.J. et al. Protein biomarkers in the plasma of workers occupationally exposed to polycyclic aromatic hydrocarbons. // Proteomics. 2004. -Vol. 4.-№11.-P. 3505-3513.

118. Klie S., Martens L., Vizcaino J.A. et al. Analyzing large-scale proteomics projects with latent semantic indexing. // J. Proteome Res. 2008. - 7(1). - P. 182-191.

119. Konstantinova I.V., Rykova M.P., Lesnyak A.T. et al. Immune changes during long-duration missions //Journal ofleukocyte biology. 1993. - Vol.54. - P. 189-201.

120. Kremer A., Schneider R., Terstappen G.C. A bioinformatics perspective on proteomics: data storage, analysis, and integration. // Biosci Rep. 2005. - 25(1-2). - P. 95-106.

121. Krogh M., Fernandez C., Teilum M., Bengtsson S., James P. A probabilistic treatment of the missing spot problem in 2D gel electrophoresis experiments. // J Proteome Res. -2007.-6(8).-P. 3335-3343.

122. Kuzichkin D.S., Morukov B.V., Markin A.A. et al. Haemostasys system indices during 7-day «dry» immersion. // 30th Annual International Gravitational Physiology Meeting. -Xi'an, China, 2009. P. 48

123. Kuzichkin D.S., Morukov B.V., Markin A.A. et al. Cosmonauts haemostasis system indices after long-term and short-term space flights. // 17th IAA Humans in Space Symposium. Moscow, Russia, 2009 - P. 75.

124. Laemmli U.K. Cleavage of Structural Proteins during the Assembly of the Head of Bacteriophage T4. // Nature. 1970. - Vol.227. - P.680-685.

125. Lapolla A., Brioschi M., Banfi C. et al. On the search for glycated lipoprotein ApoA-I in the plasma of diabetic and nephropathic patients. // J. Mass. Spectrom. 2008. - 43(1). -P. 74-81.

126. Leach C.S., Altschuler S.I., Cintron-Trevino N.M. The endocrine and metabolic responses to spaceflight. // Medicine and science in sports and exercise. — 1983. Vol.15. - №5. - P. 432-440.

127. Leach C.S. Biochemical and hematologic changes after short-term space flight. // Microgravity Q. 1992. - Vol. 2. - №2. - P. 69-75.

128. Li X., Gong Y., Wang Y. et al. Comparison of alternative analytical techniques for the characterisation of the human serum proteome in HUPO Plasma Proteome Project. // Proteomics. -2005. 5(13). - P. 3423-3441.

129. Liao Q., Zhao L., Chen X., Deng Y., Ding Y. Serum proteome analysis for profiling protein markers associated with carcinogenesis and lymph node metastasis in nasopharyngeal carcinoma. // Clin. Exp. Metastasis. 2008. - 25(4). - P. 465-476.

130. Lijnen H.R., Collen D. Mechanisms of physiological fibrinolysis. I I Baillieres Clin Haematol. 1995. - 8(2). - P. 277-290.

131. Linkowski P., Spiegel K., Kerkhofs M. et al. Genetic and environmental influences on prolactin secretion during wake and during sleep. // American Journal of Physiology. -1998. Vol. 274, (5 Pt 1). - P. 909-919.

132. Ma Y., Peng L., Huang L., Liu W., Zhang P., Qin H. Searching for serum tumor markers for colorectal cancer using a 2-D DIGE approach. // Electrophoresis. 2009. -30(15).-P. 2591-2599.

133. Macho L., Kvetnansky R., Vigas M. et al. Effect of space flights on plasma hormone levels in man and in experimental animal. // Acta Astronáutica. — 1991. — Vol. 23. — P. 117-121.

134. Mahley R.W., Innerarity T.L., Rail S.C. Jr. et al. Plasma lipoproteins: apolipoprotein structure and function. // Journal of Lipid Research. 1984. - Vol. 25. - №12. - P.1277-1294.

135. Mancini G., Carbonara A.O., Heremans J.F. Immunochemical quantitation of antigens by single radial immunodiffusion. // Immunochemistry. 1965. - Vol. 2. - №3. - P. 235254.

136. Markin A., Strogonova L., Balashov O. et al. The dynamics of blood biochemical parameters in cosmonauts during long-term space flights. // Acta Astronáutica. 1998. -Vol.42 (1-8).-P. 247-253.

137. Mateos-Cáceres P.J., García-Méndez A., López Farré A. et al. Proteomic analysis of plasma from patients during an acute coronary syndrome. // J. Am. Coll. Cardiol. 2004. -44(8).-P. 1578-1583.

138. Mayer G., Heinze G., Mischak H., Hellemons M.E., Heerspink H.J., Bakker S.J., de Zeeuw D., Haiduk M., Rossing P., Oberbauer R. Omics-bioinformatics in the context of clinical data. // Methods Mol Biol. 2011. - 719. - P. 479-497.

139. Molloy M.P., Brzezinski E.E., Hang J., McDowell M.T., VanBogelen R.A. Overcoming technical variation and biological variation in quantitative proteomics. // Proteomics. -2003.-3(10).-P. 1912-1919.

140. Nedelkov D., Kiernan U.A., Niederkofler E.E., Tubbs K.A., Nelson R.W. Population proteomics: the concept, attributes, and potential for cancer biomarker research. // Mol Cell Proteomics. 2006. - 5(10). - P. 1811-1818.

141. Nelsestuen G.L., Zhang Y., Martinez M.B. et al., Plasma protein profiling: unique and stable feature of individuals. // Proteomics. 2005. - №5. - P. 4012-4024.

142. Nesvizhskii A.I., Vitek 0., Aebersold R. Analysis and validation of proteomic data generated by tandem mass spectrometry. // Nat. Methods. 2007. № 10. - P. 787-797.

143. O'Farrell P.H. High resolution two-dimensional electrophoresis of proteins. // J. Biol. Chem. 1975. - 250(10). - P. 4007-4021.

144. Pakharukova N.A., Pastushkova L.Kh., Larina I.V., Grigoriev A.I. Changes of human serum proteome profile during 7-day "dry" immersion. // Acta Astronautica. 2010. -V.68.- P. 1523-1528.

145. Palmblad M., Tiss A., Cramer R. Mass spectrometry in clinical proteomics from the present to the future. // Proteomics Clin. Appl. - 2009. - 3. - P. 6-17.

146. Penque D. Two-dimensional gel electrophoresis and mass spectrometry for biomarker discovery. // Proteomics Clin. Appl. 2009. - №3. - P. 155-172.

147. Pepys M.B., Dash A.C., Marcham R.E. et al. Comparative clinical study of protein SAP (amyloid P component) and C-reactive protein in serum. // Clin. Exp. Immunol. 1978. -№32. - P. 119-124.

148. Petrak J., Ivanek R., Toman O. et al. Déjà vu in proteomics. A hit parade of repeatedly identified differentially expressed proteins. // Proteomics. 2008. - 8(9). - P. 1744-1749.

149. Petricon E.F., Paweletz C.P. Liotta L.A. Clinical application of proteomics: Proteomic pattern diagnostics. // J. Mammary. Gland. Biol. Neoplasia. 2002. - 7. - P. 433-440.

150. Petricon E.F., Liotta L.A. The vision for a new diagnostic paradigm. // Clin. Chem. -2003.-49.-P. 1276-1278.

151. Preckel D., von Kanel R. Regulation of hemostasis by the sympathetic nervous system: Any contribution to coronary artery disease? // Heartdrug. 2004. - V.4. - №3. - P. 123130.

152. Rigretti P.G., Boschetti E., Lomas L., Citterio A. Protein equalizer technology: the quest for a democratic proteome. // Proteomics. 2006. - 6. - P. 3980-3992.

153. Rogers S. Statistical methods and models for bridging Omics data levels. // Methods Mol Biol.-2011.-719.-P. 133-151.

154. Rosenberg L.H., Franzen B., Auer G., Lehtio J., Forshed J. Multivariate meta-analysis of proteomics data from human prostate and colon tumours. // BMC Bioinformatics. -2010,- 17(11).-P. 468.

155. Rosenberg M.E., Silkensen J. Clusterin: physiologic and pathophysiologic considerations. // Int J Biochem Cell Biol. 1995. - Jul 27(7). - P. 633-645.

156. Sanchez J.C., Appel R.D., Golaz O. et al. Inside SWISS-2DPAGE database. // Electrophoresis. 1995. - 16(7).-P. 1131-1151.

157. Schaller J., Gerber S., Kampfel U., Lejon S., Trachsel C. Human blood plasma proteins: Structure and function. // John Wiley & Sons Ltd, England. 2008.

158. Schenone N., Furie B.C., Furie B. The blood coagulation cascade. // Curr. Opin. Hematol. 2004. - 11(4). - P. 272-277.

159. Scherp P., Ku G., Coleman L., Kheterpal I. Gel-based and gel-free proteomic technologies.//Methods in Molecular Biology.-2011. Vol. 702.-P. 163-189.

160. Stein T.P., Gaprindashvili T. Spaceflight and protein metabolism, with special reference to humans. // American Journal of Clinical Nutrition. 1994. - Vol. 60. - №5. - P. 806819.

161. Stein T.P., Leskiw M.J. Oxidant damage during and after spaceflight. // American journal of physiology. // Endocrinology and metabolism. 2000. - Vol. 278. - №3. - P. 375-382.

162. Stein T.P. Nutrition in the space station era. // Nutrition research reviews. 2001. - Vol. 14. -№ l.-P. 87-118.

163. Stein T.P. Space flight and oxidative stress. // Nutrition. 2002. - Vol.18. - №10. -P. 867-871.

164. Stein T.P., Schluter M.D. Plasma protein synthesis after spaceflight. // Aviation Space Environmental Medicine. 2006. - Vol. 77. - №7. - P. 745- 748.

165. Thulasiraman V., Lin S., Gheorghui L. et al. Reduction of the concentration difference of proteins in biological liquids using a library of combinatorial ligands. // Electrophoresis. 2005. - 26. - P. 3561-3571.

166. Tipton C.M., Greenleaf J.E., Jackson C.G. Neuroendocrine and immune system responses with spaceflights. // Medicine and science in sports and exercise. 1996. -Vol. 28.-№8.-P. 988-998.

167. Voss E.W.Jr. Prolonged weightlessness and humoral immunity. // Science. 1984. -Vol. 225. - № 4658. - P. 214-215.

168. Wan J., Sun W., Li X. et al. Inflammation inhibitors were remarkably up-regulated in plasma of severe acute respiratory syndrome patients at progressive phase. // Proteomics. 2006. - 6(9). - P. 2886-2894.

169. Winkler W., Zellner M., Diestinger M. et al. Biological variation of the platelet proteome in the elderly population and its implication for biomarker research. // Molecular and Cellular Proteomics. 2008. - Vol. 7. - №1. - P. 193-203.

170. Yalow R.S. Radioimmunoassay methodology: application to problems of heterogeneity of peptide hormones. // Pharmacology Review. 1973. — Vol. 25. - №2. — P. 161-178.

171. Yalow R.S. Radioimmunoassay: Practices and pitfalls. // Circulation research. 1973. -Vol. 32,(Suppl 1).-P. 116-128.

172. Yalow R.S. Heterogeneity of peptide hormones: Its relevance in clinical radioimmunoassay. // Advances in clinical chemistry 1978. - Vol. 20. - P. 1-47.

173. Yalow R.S. Radioimmunoassay // Annual review of biophysics and bioengineering. -1980.-Vol. 9.-P. 327-345.

174. Yu M., Wang X.X., Zhang F.R. et al. Proteomic analysis of the serum in patients with idiopathic pulmonary arterial hypertension. // J. Zhejiang. Univ. Sci. B. 2007. - 8(4). -P. 221-227.

175. Zhang X., Guo Y., Song Y. et al. Proteomic analysis of individual variation in normal livers of human beings using difference gel electrophoresis. // Proteomics. 2006. - Vol. 6(19).-P. 5260-5268.

176. Zolotarjova N, Martosella J, Nicol G. et al. Differences among techniques for high-abundant protein depletion. // Proteomics. 2005. - Aug. 5(13). - P. 3304-3313.1. БЛАГОДАРНОСТИ:

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.