Оценка влияния рибонуклеазы bacillus pumilus (биназы) на функциональную активность макрофагов и нормофлоры кишечника тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Макеева Анна Владимировна

• Макеева Анна Владимировна
• кандидат наук
• 2019

Оглавление диссертации кандидат наук Макеева Анна Владимировна

ВВЕДЕНИЕ

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Терапевтический потенциал РНКаз

1.1.1 РНКазы высших эукариот

1.1.2 Рибонуклеазы микроорганизмов

1.1.2.1. Секретируемые низкомолекулярные РНКазы бактерий

1.1.2.2. Бактериальные рибозимы

1.1.2.3. РНКазы микромицетов

1.1.3 Защитные функции РНКаз

1.2 Механизмы противоопухолевого действия РНКаз

1.2.1 Взаимодействие с поверхностными компонентами клеток

1.2.2 Взаимодействие цитотоксических РНКаз с внутриклеточными компонентами

1.2.3. Модификация и олигомеризация РНКаз

1.3 Возможности сочетанной терапии с использованием РНКаз

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

2 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Ферменты

2.2 Используемые культуры

2.2.1 Бактериальная культура

2.2.2 Клеточные культуры

2.2.3 Перитонеальные макрофаги

2.3 Цитофлуориметрический анализ жизнеспособности E. coli К12

2.4 ЭПР-характеристика парамагнитных центров в образцах клеток E. coli К12

2.5 Определение содержания металлов в образцах клеток E. coli К12

2.6 Оценка жизнеспособности и пролиферации макрофагов

2.7 Цитофлуориметрический анализ жизнеспособности клеток аденокарциномы легкого А549

2.8 Выделение, гидролиз и капиллярный электрофорез РНК

2.9 Анализ содержания цитокинов

2.10 Вестерн-блоттинг

2.11 Статистическая обработка результатов

3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

3.1 Влияние рибонуклеазы B. pumilus биназы на кишечную микрофлору

3.1.1 Цитофлуориметрический анализ жизнеспособности клеток E. coli К12

3.1.2 ЭПР-спектроскопия клеток E.coli К12 в присутствии рибонуклеазы B. pumilus

3.1.3 Элементный анализ клеток E.coli К12

3.1.4 Генерация прокариотическими клетками активных форм кислорода

3.2 Биологические эффекты биназы в отношении иммунной системы

3.2.1 Цитотоксичность биназы и РНК по отношению к макрофагам

3.2.2 Профиль гидролиза РНК, индуцируемый биназой и РНКазой А

3.2.3 Изменение спектра цитокинов, синтезируемых макрофагами под действием биназы

3.2.4 Активация канонического NF-кВ-сигнального пути в макрофагах

3.2.5 Влияние биназы на компоненты неканонического NF-kB пути

3.3 Терапевтический потенциал биназы как компонента сочетанной терапии

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Оценка влияния рибонуклеазы bacillus pumilus (биназы) на функциональную активность макрофагов и нормофлоры кишечника»

Актуальность проблемы и степень ее разработанности.

Рибонуклеазы (РНКазы) представляют собой ферменты класса гидролаз, катализирующие гидролиз фосфодиэфирных связей между нуклеозидами в РНК, деполимеризуя субстрат до кислоторастворимых моно- и олигонуклеозидов. Ранее РНКазам приписывалась роль неспецифических деградирующих ферментов, однако теперь становится ясно, что они играют центральную роль в регуляции множества аспектов клеточного метаболизма РНК, включая распад мРНК, превращение предшественников РНК в их зрелые формы и функционирование систем РН^интерференции [Deutscher, Li, 2001]. Терапевтические свойства РНКаз различного происхождения привлекают пристальное внимание со стороны ученых и медиков [Castro et al., 2016; Jordaan et al., 2018; Lee et al., 2008].

Среди данного класса ферментов наиболее перспективными являются бактериальные РНКазы вследствие их резистентности к действию ингибитора РНКаз, присутствующего в клетках и тканях млекопитающих. Биназа - гуанил-специфичная РНКаза Bacillus pumilis (ранее - Bacillus intermedius, откуда происходит и тривиальное название фермента), образующая димер как в растворе, так и в естественных условиях биосинтеза и секреции [Dudkina et al., 2014], обладает антипролиферативной и апоптоз-индуцирующей активностью по отношению к широкому спектру опухолевых клеточных линий и вирусам. Охарактеризованы цитотоксическое действие биназы в отношении клеток лейкемии линии Касуми-1 [Mitkevich et al.,

2013], рака яичников человека линий SKOV3 и OVCAR5 [Garipov et al.,

2014], миелоидной лейкемии человека линии К562 [Ilinskaya et al., 2007], аденокарциномы легких линий А549 [Cabrera Fuentes et al., 2012] и MLE-12 [Cabrera-Fuentes et al., 2013], трансгенных фибробластов NIH3T3 [Ilinskaya et al., 2001] и трансгенных предшественников миелоидных клеток [Mitkevich et al., 2011] и активность против РНК-содержащего вируса бешенства и

пандемического гриппа А [Ilinskaya, Shah Mahmud, 2014; Грибенча с соав., 2004]

Избирательная цитотоксичность РНКаз по отношению к клеткам, экспрессирующим определенные онкогены, может быть использована для разработки препаратов РНКаз в качестве средств целенаправленной терапии. Биназа проявляет избирательную цитотоксичность к клеткам, экспрессирующим онкогены ras [Ilinskaya et al., 2001], kit [Mitkevich et al., 2010a], AML1-ETO [Mitkevich et al., 2011], TNF [Mitkevich et al., 2013]. Помимо бактериальных РНКаз, широкой известностью пользуется онконаза - противоопухолевая РНКаза, выделенная из ооцитов леопардовой лягушки Rana pipiens, угнетающая экспрессию генов клетками злокачественной мезотелиомы легкого. Онконаза оказывает ингибирующее действие на гены, ответственные за апоптоз, регулирующие иммунный ответ и участвующие в транскрипции [Altomare et al., 2010]. Онконаза была использована в качестве средства мототерапии против мезотелиомы легких, однако ожидаемые результаты в ходе данного исследования получены не были. В связи с этим были инициированы клинические испытания онконазы как одного из компонентов сочетанной терапии совместно с противоопухолевым антибиотиком доксорубицином, которые были доведены до III фазы [Porta et al., 2008]. Таким образом, сочетание РНКаз с классическими средствами терапии раковых заболеваний представляется перспективным, однако взаимодействие бактериальных РНКаз со стандартными терапевтиками до сих пор не изучалось.

Потенциал биназы как средства химиотерапии злокачественных новообразований ставит вопрос о ее биологических эффектах в отношении микрофлоры желудочно-кишечного тракта. Такие высокоорганизованные организмы, как человек и другие млекопитающие существуют в тесных симбиотических взаимоотношениях с собственной кишечной микрофлорой, формируемой разнообразными метаболически активными консорциумами видов [Wilson, Nicholson, 2009]. Недавние исследования показали, что низкие

концентрации биназы могут оказывать стимулирующее действие на микроорганизмы, тогда как высокие концентрации фермента, лежащие в диапазоне 1 мг/мл, подавляют развитие бактерий [Kolpakov et al., 2012]. Биназа проявляет апоптоз-индуцирующую активность в отношении малигнизированных клеток в концентрации от 0,10 до 0,75 мг/мл [Mitkevich et al., 2010; Ilinskaya et al., 2007]. Ингибирующего действия на бактерии при таких концентрациях обнаружено не было. Хотя приведенные концентрации практически не действуют на рост бактерий, но в определенный момент могут приводить к изменениям различных жизненных параметров клеток. Стоит отметить, что среди клеточных компонентов, способных откликаться на самые незначительные изменения окружающей среды, важную роль играют ферментные комплексы электрон-транспортных цепей, расположенные в цитоплазматической мембране бактерий [Beinert, Kiley, 1999]. ЭПР-спектроскопия позволяет с достаточной степенью эффективности охарактеризовать состояние подобных комплексов. С помощью данного метода осуществляется анализ качественных и количественных изменений парамагнитных центров, входящих в состав электрон-транспортных цепей, локализованных в цитоплазматической мембране прокариот и во внутренних мембранных структурах эукариотических клеток [Swartz et al., 2004].

Кишечная микрофлора не только влияет на биодоступность и абсорбцию веществ, поступающих с пищей, но и принимает непосредственное участие в регуляции функционирования иммунной системы [Belkaid et al., 2014]. Иммунные реакции, возникающие в организме в ответ на действие лекарственных средств, способны внести значительный вклад в конечный результат терапии, поэтому иммуногенный эффект ферментов, внедряемых в практическую медицину, должен быть минимальным. Ранее было показано, что биназа не стимулирует экспрессию антигена CD69 и синтез интерферона-у CD4+ и CD8+ Т-клетками. Неспособность биназы активировать CD4+ и CD8+ Т-клетки позволяет сделать вывод, что фермент не имеет свойств суперантигена и не индуцирует поликлональный иммунный ответ Т-клеток

[Ilinskaya et al., 2007]. Однако до сих пор остается неясным, оказывает ли биназа существенное влияние на макрофаги, которые представляют собой первую линию иммунной защиты. Макрофаги играют центральную роль при запуске про- либо противовоспалительной реакции иммунной системы и составляют значительную часть инфильтрата клеток, мигрирующих в сайт возникновения опухоли [Van Der Bij, 2005].

В соответствии с вышеизложенным сформулирована цель и определены задачи настоящего исследования.

Цель и задачи исследований.

Целью настоящей работы стал анализ влияния биназы - рибонуклеазы Bacillus pumilus, обладающей противоопухолевой активностью, на функциональную активность макрофагов и нормофлоры кишечника на примере Escherichia coli.

В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи:

1. Охарактеризовать элементный состав клеток и качественный состав парамагнитных центров E. coli К12 в присутствии биназы и РНКазы А при разных температурных режимах в отсутствие токсического действия РНКаз.

2. Определить уровень генерации активных форм кислорода клетками E. coli К12 при воздействии на них РНКаз.

3. Оценить экспрессию белков NF-kB сигнального пути (фосфо-NF-kB p65, NF-kB p65, NF-kB p100/p52) и белка-адаптера Toll-подобных рецепторов MyD88 в макрофагах мыши и человека под действием внеклеточных РНКаз и продуктов их гидролиза.

4. Проанализировать количественные изменения спектра цитокинов, синтезируемых макрофагам под действием внеклеточных РНКаз.

5. Выявить терапевтический потенциал низких концентраций биназы в сочетании с противоопухолевым антибиотиком блеомицином по отношению к клеткам аденокарциномы легких человека.

Научная новизна. В ходе исследования был получен ряд новых данных, имеющих большое значение для развития фундаментальных и прикладных аспектов современной биологической науки. С помощью метода ЭПР-спектроскопии впервые были зафиксированы изменения парамагнитных центров комменсального штамма желудочно-кишечного тракта E. coli K12 после обработки биназой в нетоксичных концентрациях. Зарегистрирован повышенный уровень интенсивности ЭПР-сигналов от железосодержащих белков и усиление сигнала сверхтонкой структуры двухвалентного марганца. С помощью спинового зонда зафиксировано двукратное повышение уровня активных форм кислорода в клетках, которое является следствием окислительного стресса, вызванного воздействием биназы. В настоящем исследовании было зарегистрировано увеличение содержания ряда таких переходных металлов, как марганец, железо, медь и цинк.

В работе впервые выявлено повышение уровня экспрессии компонента канонического NF-kB пути - фосфорилированной по серину-536 субъединицы р65 - в макрофагах человека и мыши при стимуляции биназой. Кроме того, нами была обнаружена способность биназы активировать периферические макрофаги мыши и усиливать синтез данным типом клеток цитокинов IL-6, IL-10, МСР-1, TNF-a. При этом биназа не оказывала влияния на продукцию макрофагами противовоспалительного цитокина IL-10. Полученные в ходе исследования данные о профиле цитокинов и активации NF-kB сигнального пути свидетельствуют о способности биназы индуцировать макрофаги с провоспалительным фенотипом.

Впервые было охарактеризовано апоптозиндуцирующее и антипролиферативное действие антинеопластического агента блеомицина в сочетании с биназой. Показано, что одновременное использование биназы и блеомицина в максимальных концентрациях является неэффективным. С другой стороны, сочетание неапоптогенных концентраций биназы и блеомицина привело к повышенной по сравнению с индивидуальным действием исследуемых веществ доли апоптотических клеток в популяции.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Согласно данным Всемирной организации здравоохранения раковые заболевания являются второй ведущей причиной смертности во всем мире и в 2018 году привели к 9,6 миллиона смертей. В глобальном масштабе одна из шести смертей приходится на рак. В связи с этим поиск новых средств противоопухолевой терапии, а также новых способов элиминации раковых клеток в организме является одной из фундаментальных задач современной медицины и биологии. Настоящая работа важна тем, что в ней проведена комплексная оценка влияния перспективного цитотоксического в отношении малигнизированных клеток фермента биназы на механизмы клеточного ответа про- и эукариот. Расширение спектра модельных объектов, по отношению к которым охарактеризовано действие биназы, позволяет дать более точную оценку их селективности. В работе охарактеризованы качественные и количественные изменения в парамагнитных центрах клеток индикаторного штамма микрофлоры человека E.coli Ю2 и обоснована безопасность практического применения биназы, в том числе и как средства терапии рака различных отделов кишечника.

В работе впервые продемонстрирована перспективность применения низких концентраций биназы и противоопухолевого антибиотика блеомицина в качестве компонентов сочетанной терапии. Сочетанная терапия имеет ряд преимуществ относительно монотерапии. Помимо отсутствия приобретенной устойчивости малигнизированных клеток к действию единственного компонента монотерапии, при сочетанной терапии возможно взаимовыгодное усиление действия двух различных терапевтиков.

Полученные нами результаты, свидетельствующие об отсутствии изменений жизнеспособности макрофагов после обработки биназой, а также данные о профиле синтезируемых цитокинов и активации канонического кВ сигнального пути в данном типе клеток подтверждают предположение о способности биназы индуцировать провоспалительный ответ со стороны иммунной системы, связанный с активацией М1макрофагов, обладающих

противоопухолевыми свойствами, что может внести положительный вклад в результат терапии.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Биназа в концентрациях, не обладающих токсическим и ростостимулирующим действием по отношению к клеткам прокариот, приводит к изменениям элементного состава клеток, функционального состояния и структуры ферментных комплексов электрон-транспортных цепей кишечных бактерий.

2. Биназа не оказывает влияния на жизнеспособность и пролиферацию макрофагов, но ведет к их активации по каноническому NF-kB сигнальному пути.

3. Биназа индуцирует провоспалительный и противоопухолевый иммунный ответ, повышая синтез провоспалительных и подавляя продукцию противовоспалительных цитокинов макрофагами.

4. Сочетанное действие биназы и противоопухолевого антибиотика блеомицина представляет собой перспективный терапевтический подход в лечении аднокарциномы легких ввиду взаимного усиления апоптоз-индуцирующего действия терапевтиков в низких в концентрациях.

Апробация работы. Материалы диссертационной работы представлены на международных и региональных конференциях: всероссийская заочная научно-практическая конференция с международным участием «Микробиология в современной медицине» (Казань, 2013, 2014); I Международная школа-конференции студентов, аспирантов и молодых ученых «Биомедицина, материалы и технологии XXI века» (Казань, 2015); 19-ая Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых -«Биология Наука XXI века» (Пущино, 2015); Annual Scientific Meeting of the European Society for Clinical Investigation «Precision medicine for healthy ageing» (Barcelona, 2018), итоговых научных конференциях Казанского (Приволжского) федерального университета (Казань, 2014 - 2016).

Место выполнения работы и личный вклад соискателя.

Диссертационная работа выполнена на кафедре микробиологии Института фундаментальной медицины и биологии Казанского (Приволжского) федерального университета. Основные направления исследования, его цель и задачи сформулированы совместно с научным руководителем. Анализ данных литературы по теме диссертационной работы, лабораторные исследования и интерпретация полученных результатов проводились автором лично. Анализ элементного состава клеток проводился на Институте физики КФУ совместно с А.В. Волошиным. Определение жизнеспособности макрофагов и анализ спектра экспрессируемых белков проведены автором лично в Институте биохимии Гиссенского университета им. Юстуса Либиха (Гиссен, Германия).

Связь работы с научными программами. Исследования выполнены в рамках Российской Правительственной Программы повышения конкурентоспособности Казанского федерального университета среди ведущих мировых научно-исследовательских центров и поддержаны проектами № 12-04-31022а Российского фонда фундаментальных исследований и № 14-14-00522 Российского научного фонда.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 9 научных работ, среди них 4 статьи в рецензируемых научных журналах, рекомендованных ВАК Российской Федерации и включенных в глобальный индекс цитирования Scopus, одна из которых индексируется в базе данных Web of Science, и 5 тезисов на международных и российских конференциях.

Структура и объем диссертации. Диссертационная работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов, их обсуждения, заключения и списка цитируемой литературы. Работа изложена на 109 страницах машинописного текста, включает 1 таблицу, 18 рисунков. Библиография включает 188 наименование.

1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Терапевтический потенциал РНКаз

Согласно данным Всемирной организации здравоохранения раковые заболевания являются ведущей причиной смертности во всем мире и в 2018 году привели к 9,6 миллионам смертей. В глобальном масштабе одна из шести смертей приходится на рак, при этом приблизительно 70% смертей от рака приходится на страны с низким и средним уровнем дохода [URL: http://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/cancer].

Классические противоопухолевые препараты нарушают поток биохимической информации от нуклеиновых кислот к белкам, останавливая таким образом неконтролируемую пролиферацию раковых клеток и вызывая их гибель по пути апоптоза. Большинство используемых в настоящее время противоопухолевых препаратов являются генотоксическими, поскольку их основной мишенью является ДНК. Фармацевтическая промышленность занимается поиском новых, не имеющих генотоксических эффектов методов лечения злокачественных новообразований [Gurova et al., 2009]. Непосредственно к такому типу химиотерапевтиков можно отнести рибонуклеазы (РНКазы), которые представляют собой небольшие основные белки - ферменты класса гидролаз, катализирующие гидролиз фосфодиэфирных связей между нуклеозидами в РНК [Deutscher, Li, 2001]. Ряд РНКаз обладает значительной противоопухолевой активностью, связанной со способностью данного класса ферментов разрушать РНК, что является мощным способом контроля экспрессии генов в отсутствие повреждающего действия в отношении ДНК. В последние годы использование РНКаз в качестве немутагенных противораковых препаратов привлекает всё большее внимание исследователей [Castro et al., 2016; Jordaan et al., 2018; Lee et al., 2008; Ardelt et al., 2009].

РНКазы катализируют деградацию РНК на более мелкие компоненты с очень коротким сроком жизни в окружающей среде. Ранее РНКазам

приписывалась роль неспецифических деградирующих ферментов, однако теперь становится ясно, что они играют центральную роль в регуляции множества аспектов клеточного метаболизма РНК, включая распад мРНК, превращение предшественников РНК в их зрелые формы и функционирование систем РНК-интерференции [Deutscher, Li, 2001].

РНКазы являются гетерогенной группой ферментов, которые делятся на экзорибонуклеазы и эндорибонуклеазы в зависимости от механизма деградации РНК [Zuo, Deutscher, 2001]. Экзорибонуклеазы деградируют молекулу РНК начиная с 3'- либо 5'-конца, тогда как эндорибонуклеазы осуществляют распознавание и расщепление определенных последовательностей нуклеотидов одноцепочечной РНК на 3'-фосфорилированные мононуклеотиды и олигонуклеотиды.

Экзорибонуклеазы и эндорибонуклеазы дополнительно содержат несколько подклассов. Некоторые члены этого семейства белков проявляют ангиогенную, нейротоксическую и иммуносупрессивную активности [Schein, 1997]. РНКазы также способны ингибировать вирусные инфекции и играют роль в обеспечении защитных функций организма [Shah Mahmud et al., 2013; Yang et al., 2004; Mikhailova et al., 2010]. Среди общего многообразия данного класса ферментов наиболее хорошо охарактеризованными являются представители РНКаз высших эукариот и микробные РНКазы.

1.1.1 РНКазы высших эукариот

Наиболее известным представителем эукариотических РНКаз является онконаза - РНКаза, присутствующая как в ранних эмбрионах, так и в неоплодотворенных ооцитах леопардовой лягушки R. pipiens [Ardelt et al., 2008]. Это наименьший по размеру фермент (104 аминокислоты, молекулярная масса 11,8 кДа) в надсемействе РНКазы А. Онконаза имеет ряд преимуществ, в том числе: (1) исключительную стабильность с приблизительным термическим переходом около 90°C, что облегчает потенциальное терапевтическое применение и коммерциализацию фермента;

(2) низкую каталитическую активность и способность уклоняться от ингибитора РНКаз, локализованного в цитозоле; (3) онконазу возможно ввести пациентам повторно без какого-либо неблагоприятного иммунного ответа и с обратимой почечной токсичностью [Ardelt et al., 2008]. Эти побудило исследователей провести клинические испытания онконазы.

Однако в ходе III фазы клинических исследований онконазы в качестве средства против мезотелиомы легкого было показано, что новый препарат на основе пеметрекседа и производных платины оказался более эффективным и был одобрен в качестве терапевтического агента первой линии для пациентов с мезотелиомой. Учитывая неудовлетворительные результаты, полученные при использовании онконазы в качестве терапии первой линии, а также отсутствие стандарта лечения мезотелиомы, вполне возможно, что онконаза может служить в качестве терапии второй линии, проводимой в тех случаях, когда болезнь продолжает прогрессировать, несмотря на предшествующее первичное лечение [Porta et al., 2008]. Успех в изучении онконазы обуславливает возможное применение в клинике других РНКаз.

Помимо онконазы, из эмбрионов, ооцитов и печени амфибий были получены другие РНКазы, включая амфиназу из R. pipiens [Singh et al., 2007], лектин из R. japonica [Kamiya et al., 1990], RC-РНКазу из R. catesbeiana [Leu et al., 2003]. Амфиназа проявляла цитотоксическую активность по отношению к клеткам карциномы A-253, лектин R. japonica избирательно агглютинировал трансформированные клетки, а RC-РНКаза оказалась цитотоксичной для клеток раковой опухоли шейки матки HeLa; при этом цитотоксичность RC-РНКаза не коррелировала со специфической каталитической активностью фермента [Singh et al., 2007; Kamiya et al., 1990].

РНКазы с терапевтическим потенциалом были обнаружены у других животных и человека. РНКаза А и бычья семенная РНКаза (BS-РНКаза) представляют собой наиболее хорошо охарактеризованные РНКазы млекопитающих. РНКаза А существует в нескольких формах - мономерной,

димерной, тримерной и тетрамерной. Олигомеры РНКазы А проявляют высокую противоопухолевую активность по отношению к миелоидным клеткам ML-2 (клетки миелоидного лейкоза человека) и миелоидным клеткам HL-60 и in vivo ингибируют рост клеток пигментной меланомы человека (линия UB900518). Стоит отметить, что после подкожной инъекции олигомерные формы не вызывали эмбриотоксичности у голых мышей [Matousek et al., 2003]. BS-РНКаза оказалась цитотоксичной для раковых клеток, включая клетки карциномы щитовидной железы, миелоидные клетки ML-2 и две клеточных линии нейробластомы (NB-1 и NB-2) [Antignani et al., 2001; Marinov et al, 2000].

Некоторые РНКазы человека также проявляют терапевтические свойства. РНКаза 18К (белок весом 18 кДа), выделенная из мочи человека, оказывала значительное апоптоз-индуцирующее дозо-зависимое действие в отношении Y-1 клеток саркомы Капоши in vitro и in vivo у иммунодефицитных мышей [Griffiths et al., 1997]. Еще одна РНКаза человека - клеточная РНКаза L - ингибировала пролиферацию клеток лейкоза человека H9 и подавляла развитие рака предстательной железы [Liang et al., 2006; Roy et al., 2001]. Еще одна РНКаза человека, конъюгированная с антителом к рецептору 2 эпидермального фактора роста человека (HER2), ингибировала развитие карциномы. Полученный конъюгант анти-HER2-иммуноРНКаза сохранял каталитическую активность фермента дикого типа и специфически созывался с рецептором HER2, экспрессия которого значительно повышена в клетках карциномы [De Lorenzo et al., 2004].

РНКазы растений также относятся к агентам, которые могут использоваться как потенциальные противоопухолевые препараты. Гетеродимерная РНКаза корней женьшеня Panax notoginseng, состоящая из двух субъединиц весом 27 и 29 кДа, соответственно, продемонстрировала значительную антипролиферативную активность по отношению к клеткам лейкоза L1210, еще раз подтвердив ценность данного растения для медицины [Lam, Ng, 2001]. Помимо РНКазы женьшеня, в литературе встречаются

данные о противоопухолевом действии РНКаз злаковых: in vivo эксперименты по введению выделенной из листьев пшеницы РНКазы мышам-носителям меланомы человека привели к заметному уменьшению размера опухоли [Skvor et al., 2006].

1.1.2 Рибонуклеазы микроорганизмов

Бактериальные и грибные РНКазы представляют собой большую и разнообразную группу белков, отличных от ферментов высших эукариот и имеющих свои особенности каталитического и биологического действия. Из огромного разнообразия РНКаз в настоящей работе рассматриваются те их них, для которых установлен потенциал применения в качестве терапевтических агентов. Несмотря на то, что первая статья, продемонстрировавшая противоопухолевую активность микробной РНКазы Serratia marcescens, приобрела известность около шести десятилетий назад [Belyaeva et al., 1964], представление о механизмах действия микробных РНКаз до сих пор остается не полным.

1.1.2.1. Секретируемые низкомолекулярные РНКазы бактерий

Среди множества микробных РНКаз наиболее перспективными оказались РНКазы семейства T1/N1 (EC 3.1.27.3), первый представитель которых был выделен из гриба Aspergillus oryzae [Yoshida, 2001]. РНКаза Т1 разрезает клеточную молекулы одноцепочечной РНК после остатков гуанина, то есть, между З'-гуанильными остатками и 5'-ОН-остатками соседних нуклеотидов с образованием соответствующих промежуточных 2',3'-циклических фосфатов. Сходный механизм каталитического действия позволил отнести к этому семейству секретируемые РНКазы ряда бацилл и актинобактерий, в частности, стрептомицетов.

Биназа - одна из наиболее хорошо охарактеризованных РНКаз этого семейства. Это низкомолекулярный белок (109 аминокислот, 12,2 кДа), изолированный из B. pumilus (прежнее название - B. intermedius, штамм переопределен современными методами молекулярной биологии, GenBank

Accession No. HQ650161.1). Биназа представляет собой асимметричную молекулу, состоящую из двух субъединиц, формирующих гомодимер. Структурная особенность димера такова, что только одна из его субъединиц способна связываться с нуклеотидом и образовывать З'-ГМФ-комплекс с гуаниновым основанием, локализованным в сайте распознавания [Polyakov et al., 2002]. Биназа расщепляет фосфодиэфирную связь между З'-гуанильным остатком и 5'-ОН-остатком соседнего нуклеотида с образованием соответствующего промежуточного соединения, циклического 2',3-гуанозинмонофосфата (цГМФ) на первой стадии каталитической реакции. 2',3'-цГМФ может существовать в реакционной смеси в течение часа. Добавление двухвалентного непереходного металла Mg2+ повышает уровень 2',3'-цГМФ, что может быть связано со стабилизацией третичной структуры РНК этим металлом. Было показано, что экзогенный 2',3'-цГМФ не вызывает апоптоз клеток A549, чувствительных к биназе. Однако, принимая во внимание способность биназы проникать в клетки, можно сделать вывод, что 2',3'-цГМФ вносит вклад в апоптогенную активность биназы только в случае его внутриклеточного формирования [Sokurenko et al., 2017]. Чрезвычайно важным фактом является то, что действие данной РНКазы избирательно. Так, биназа селективно индуцирует апоптоз клеток миелогенной эритролейкемии К562, карциномы легких А549 человека, о чем свидетельствовало появление в них олигонуклеосомных фрагментов ДНК - маркеров апоптического процесса, однако никаких антипролиферативных и проапоптических эффектов по отношению к нормальным лимфоцитам биназа не проявляет [Zelenikhin et al, 2005]. Клетки рака яичников SKOV3 и OVCAR5 подвержены цитотоксическому действию фермента, а нормальные эпителиальные клетки HOSE1 и HOSE2 - нет [Garipov et al., 2014].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Макеева Анна Владимировна, 2019 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

1. Ажипа, Я. И. Медико-биологические аспекты применения метода электронного парамагнитного резонанса [Текст] / Я. И. Ажипа; Акад. наук СССР. Отделение физиологии. - Москва: Наука, 1983. - С. 528.

2. Грибенча, С.В. Противовирусная активность РНКазы Bacillus intermedius в экспериментах на мышах линии СВА, предварительно зараженных уличным вирусом бешенства [Текст] / С. В. Грибенча, Л. А. Поцелуева, И. Ф. Баринский, С. М. Деев, Т. Г. Баландин, И.Б. Лещинская [Текст] // Вопросы вирусологии. - 2004. - Т.49. - C. 38-41.

3. Иванов, С. И. Определение химических элементов в биологических средах методами атомноэмиссионной спектрометрии с индуктивно связанной плазмой и массспектрометрией [Методические указания МУК 4.1.148303] / С. И. Иванов, Л. Г. Подунова, В. Б. Скачков, В. А. Тутельян, А. В. Скальный, В. А. Демидов, М. Г. Скальная, Е. П. Серебрянский, А. Р. Грабеклис, В. В. Кузнецов // М.: ФЦГСЭН МЗ РФ, 2003.

- 56 с.

4. Коваленко, О. А. Количественное изучение спектров ЭПР замороженных препаратов тканей животных [Текст] / О. А. Коваленко, Т. В. Анфалова, В. С. Соколов, В. М. Чибрикин // Биофизика. - 1971. - Т.16. - №4.

- С. 663-666.

5. Колпаков, А. И. Внеклеточные факторы регуляции развития микроорганизмов [Текст] / А. И. Колпаков, Ф. Г. Куприянова-Ашина // LAP LAMBERT Academic Publishing, 2012. - С. 36-38.

6. Abraham, A. T. RNA Cleavage and Inhibition of Protein Synthesis by Bleomycin [Текст] / A. T. Abraham, J. Lin, L. Newton, S. Rybak, S. M. Hecht // Chem. Biol. - 2003. - V.10. - P. 45-52.

7. Alekseeva, I. I. Comparative study of the antiviral activity of pancreatic and microbial RNAse [Текст] / I. I. Alekseeva, B. M. Kurinenko, G. I.

Kleiner, A. Skuia, G. A. Penzikova// Antibiotiki. - 1981. -V.26. - N.7. - P. 527532.

8. Altomare, D. A. Onconase responsive genes in human mesothelioma cells: implications for an RNA damaging therapeutic agent [Текст] / D. A. Altomare, S. M Rybak, J. Pei, J. .V Maizel, M. Cheung, J. R. Testa and Kuslima Shogen // BMC Cancer. - 2010. - V.10. - N.34. - P. 1-12.

9. Antignani, A. Antitumor action of seminal ribonuclease, its dimeric structure, and its resistance to the cytosolic ribonuclease inhibitor [Текст] / A. Antignani, M. Naddeo, M. V. Cubellis, A. Russo, G. D'Alessio // Biochemistry. -2001. - V. 40. - P. 3492-3496.

10. Ardelt, B. Cytotoxic ribonucleases and RNA interference (RNAi) [Текст] / B. Ardelt, W. Ardelt, Z. Darzynkiewicz // Cell Cycle. - 2003. - V.2. -N.1. - P. 22-24.

11. Ardelt, B. Onconase, an anti- tumor ribonuclease suppresses intracellular oxidative stress [Текст] / B. Ardelt, G. Juan, P. Burfeind, T. Salomon, J. M. Wu, T. C. Hsieh, X. Li, R. Sperry, P. Pozarowski, K. Shogen, W. Ardelt, Z. Darzynkiewicz // Int. J. Oncol. - 2007. - V.31. - P. 663-669.

12. Ardelt, W. Ribonucleases as potential modalities in anticancer therapy [Текст] / W. Ardelt, B. Ardelt, Z. Darzynkiewicz // Eur J Pharmacol. -2009. - V. 625. - P. 181-189.

13. Ardelt, W. Onconase and amphinase, the antitumor ribonucleases from Rana pipiens oocytes [Текст] / W. Ardelt, K Shogen, Z. Darzynkiewicz // Curr. Pharm. Biotechnol. - 2008. - V. 9. - P. 215-225.

14. Avendano, C. Medicinal Chemistry of Anticancer Drugs [Текст] / C. Avendano, J. C. Menendez // Elsevier Science, 2008. - 400 p.

15. Balandin, T. G. Antitumor activity and toxicity of anti-HER2 immunoRNase scFv 4D5-dibarnase in mice bearing human breast cancer xenografts [Текст] / T. G. Balandin, E. Edelweiss, N. V. Andronova, E. M. Treshalina, A. M. Sapozhnikov, S. M. Deyev // Invest New Drugs. - 2011. - V.29. - P. 22-32.

16. Balkwill, F. Cancer and the chemokine network [Текст] / F. Balkwill // Nature reviews Cancer. - 2004. - V.4. - N.7. - P. 540-550.

17. Bastos, J. C. Antiviral activity of Bacillus sp. isolated from the marine sponge Petromica citrina against bovine viral diarrhea virus, a surrogate model of the hepatitis C virus [Текст] / J. C. Bastos, L. K. Kohn, F. Fantinatti-Garboggini, M. A. Padilla, E. F. Flores, B. P. da Silva, C. B. de Menezes, C. W. Arns // Viruses. - 2013. - V.5. - P. 1219-1230.

18. Bedoya, V. I. Ribonucleases in HIV type 1 inhibition: Effect of recombinant RNases on infection of primary T cells and immune activation-induced RNase gene and protein expression [Текст] / V. I. Bedoya, A. Boasso, A. W. Hardy, S. Rybak, G. M. Shearer, M. T. Rugeles // AIDS Res. Hum. Retrovir. -2006. - V.22. - P. 897-907.

19. Beinert, H. Fe-S proteins in sensing and regulatory functions [Текст] / H. Beinert, P. J. Kiley // Curr. Opin. Chem. Biol. - 1999. - V.3. - N. 2. - P. 152157.

20. Belkaid, Y. Role of the microbiota in immunity and inflammation [Текст] / Y. Belkaid, T. W. Hand // Cell. - 2014. - V.157. - N.1. - P. 121-141.

21. Belyaeva, M. I. Effect of bacterial deoxyribonuclease on Ehrlich's ascites carcinoma cells in vitro [Текст] / M. I. Belyaeva, M. F. Kyune, A. M. Nuzhina // Fed Proc Transl Suppl. - 1964. - V.23. - P. 345-348.

22. Benito, A. The structural determinants that lead to the formation of particular oligomeric structures in the pancreatic-type ribonuclease family [Текст] / A. Benito, D. V. Laurents, M. Ribo, M. Vilanova // Current Protein and Peptide Science. - 2008. - V.9. - P. 370-393.

23. Benov, L. How superoxide radical damages the cell [Текст] / L. Benov // Protoplasma. - 2001. - V.217. - N.1-3. - P. 33-36.

24. Bereswill, S. Pro-inflammatory potential of Escherichia coli strains k12 and Nissle 1917 in a murine model of acute ileitis [Текст] / S. Bereswill, A. Fischer, I. R. Dunay, A. A. Kühl, U. B. Göbel, O. Liesenfeld and M. M. Heimesaat

// European Journal of Microbiology and Immunology. - 2013. - V. 3. - N. 2. - P. 126-134.

25. Biswas, P. Interleukin-6 induces monocyte chemotactic protein-1 in peripheral blood mononuclear cells and in the U937 cell line [Текст] / P. Biswas, F. Delfanti, S. Bernasconi, M. Mengozzi, M. Cota, N. Polentarutti, A. Mantovani, A. Lazzarin, S. Sozzani, G. Poli // Blood. - 1998. - V.91. - P. 258-265.

26. Biswas, S. K. NF-kappaB as a central regulator of macrophage function in tumors [Текст] / S. K. Biswas, C. E. Lewis // Journal of Leukocyte Biology. - 2010. - V.88. - N.5. - P. 877-884.

27. Blencowe, D. K. Zn(II) metabolism in prokaryotes [Текст] / D. K. Blencowe, A. P. Morby // FEMS Microbiology Review. - 2003. - V.27. - P. 291311.

28. Boix, E. Structural determinants of the eosinophil cationic protein antimicrobial activity [Текст] / E. Boix, V. A. Salazar, M. Torrent, D. Pulido, M. V. Nogues, M. Moussaoui // Biol. Chem. - 2012. - V.393. - 801-815.

29. Bracale, A. Essential stations in the intracellular pathway of cytotoxic bovine seminal ribonuclease [Текст] / A. Bracale, D. Spalletti-Cernia, M. Mastronicola, F. Castaldi, R. Mannucci, L. Nitsch, G. D'Alessio // Biochemical Journal. - 2002. - V. 362. - Pt. 3. - P. 553-560.

30. Bradford, M. M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding [Текст] / M. M. Bradford // Analytical Biochemistry. - 1976. - V.72. - N.5. - P. 248-254.

31. Burger, R. M. Cleavage of Nucleic Acids by Bleomycin [Текст] / R. M. Burger // Chem. Rev. - 1998. - V.98. - N.3. - P. 1153-1170.

32. Burnysheva, K. M. Ribonuclease binase induces death in T-cell acute lymphoblastic leukemia cells by apoptosis [Текст] / K. M. Burnysheva, I. Y. Petrushanko, P. V. Spirin, V. S. Prassolov, A. A. Makarov, V. A. Mitkevich // Molecular Biology (Moscow). - 2016. - V.50. - N.2. - P. 347-352.

33. Cabrera Fuentes, H. A. Binase penetration into alveolar epithelial cells does not induce cell death [Текст] / H. A. Cabrera Fuentes, N. V. Kalacheva, R. T. Mukhametshina, P. V. Zelenichin, A. I. Kolpakov, G. Barreto, K.T. Preissner, O. N. Ilinskaya // Biochemistry (Moscow) Supplement Series B: Biomedical Chemistry. - 2012. - V. 6. - N. 4. - P. 317-321.

34. Cabrera-Fuentes, H. A. Internalization of Bacillus intermedius ribonuclease (BINASE) induces human alveolar adenocarcinoma cell death [Текст] / H. A. Cabrera-Fuentes, M. Aslam, M. Saffarzadeh, A. Kolpakov, P. Zelenikhin, K. T. Preissner, O. N. Ilinskaya // Toxicon. - 2013. - V.69. - N.7. - P. 219-226.

35. Cabrera-Fuentes, H. A. Regulation of monocyte/macrophage polarisation by extracellular RNA [Текст] / H. A. Cabrera-Fuentes, M. L. Lopez, S. McCurdy, S. Fischer, S. Meiler, Y. Baumer, S. P. Galuska, K. T. Preissner, W. A. Boisvert // Thrombosis and Haemostasis. - 2015. - V.113. - N.3. - P. 473-481.

36. Cadenas, E. Mitochondrial free radical generation, oxidative stress, and aging [Текст] / E. Cadenas, K. J. Davies // Free Radic Biol Med. - 2000. -V.29. - 3-4. - P. 222-230.

37. Cammack, R. Electron magnetic resonance of iron-sulfur proteins in electron-transfer chains: Resolving complexity [Текст] / R. Cammack, F. MacMillan // Metals in Biology: Biological Magnetic Resonance / Ed. Hanson G., L. Berliner. Springer New York, 2010. - V.29. - P. 11-44.

38. Carroll, R.B. RNA is covalently linked to SV40 large T antigen [Текст] / R. B. Carroll, A. Samad, A. Mann, J. Harper, C. W. Anderson // Oncogene. - 1988. - V.2. - P. 437-444.

39. Castro, J. Approaches to endow ribonucleases with antitumor activity: Lessons learned from the native cytotoxic ribonucleases [Текст] / J. Castro, M. Ribo, A. Benito, M. Vilanova // Anti-cancer Drugs - Nature, Synthesis and Cell. - London: IntechOpen, 2016. - P. 135-168.

40. Chao, T. Y. Mechanism of ribonuclease A endocytosis: Analogies to cell-penetrating peptides [Текст] / T. Y. Chao, R. T. Raines // Biochemistry. -2011. - V.50. - P. 8374-8382.

41. Cobaleda, I. C. In vivo inhibition by a site-specific catalytic RNA subunit of RNase P designed against the BCR-ABL oncogenic products: a novel approach for cancer treatment [Текст] / I. C. Cobaleda, I. S. Garcia // Blood. -2000. - V.95. - P. 731-737.

42. Connelly, L. NF-kappaB activation within macrophages leads to an anti-tumor phenotype in a mammary tumor lung metastasis model [Текст] / L. Connelly, W. Barham, H. M. Onishko, L. Chen, T. P. Sherrill, T. Zabuawala, M. C. Ostrowsk, T. S. Blackwell, F.E. Yull // Breast cancer research. - 2011. -V.13. - N.4. - P. R83.

43. De Leeuw, M. The 1.8 A crystal structure of ACTIBIND suggests a mode of action for T2 ribonucleases as antitumorigenic agents [Текст] / M. De Leeuw, A. Gonzalez, A. Lanir, L. Roiz, I. P. Smirnoff, B. Schwartz, O. Shoseyov, O. Almog // J. Med. Chem. - 2012. - V.55. -P. 1013-1020.

44. De Lorenzo, C. A fully human antitumor immunoRNase selective for ErbB-2-positive carcinomas [Текст] / C. De Lorenzo, A. Arciello, R. Cozzolino, D. B. Palmer, P. Laccetti, R. Piccoli, G. D'Alessio // Cancer Res. - 2004. - V. 64.

- P. 4870-4874.

45. De Zamaroczy, M. Hijacking cellular functions for processing and delivery of colicins E3 and D into the cytoplasm [Текст] / M De Zamaroczy, L. Mora // Biochem. Soc. Trans. - 2012. - V.40. - P. 1486-1491.

46. Deshmane, S. L. Monocyte chemoattractant protein-1 (MCP-1): an overview [Текст] / S. L. Deshmane, S. Kremlev, S. Amini, Sawaya B. E. // J. Interferon. CytokineRes. - 2009. - V.29. - P. 313-326.

47. Dethlefsen, C. The role of intratumoral and systemic IL-6 in breast cancer [Текст] / C. Dethlefsen, G. Hojfeldt, P. Hojman // Breast Cancer Res. Treat.

- 2013. - V.138. - P. 657-664.

48. Deutscher, M. P. Exoribonucleases and their multiple roles in RNA metabolism [Текст] / M. P. Deutscher, Z. Li // Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. - 2001. - V.66. - P.67-105.

49. Dudkina, E. New insight into secreted ribonuclease structure: binase is a natural dimer [Текст] / E. Dudkina, A. Kayumov, V. Ulyanova, O. Ilinskaya // PLoS One. - 2014. - V. 9. - N.12. - e115818.

50. Edelweiss, E. Barnase as a new therapeutic agent triggering apoptosis in human cancer cells [Текст] / E. Edelweiss, T. G. Balandin, J. L. Ivanova, G. V. Lutsenko, O. G. Leonova, V. I. Popenko, A. M. Sapozhnikov, S. M. Deyev // PLoS ONE. - 2008. - V.3. - e2434.

51. Fan, T. C. A heparan sulfate-facilitated and raft-dependent macropinocytosis of eosinophil cat- ionic protein [Текст] / T. C. Fan, H. T. Chang, I. W. Chen, H. Y. Wang, M. D. Chang // Traffic. - 2007. - V.8. - P. 1778-1795.

52. Fischer, S. Extracellular RNA mediates endothelial-cell permeability via vascular endothelial growth factor [Текст] / S. Fischer, T. Gerriets, C. Wessels; Walberer, M.; Kostin, S.; Stolz, E.; Zheleva, K.; Hocke, A.; Hippenstiel, S.; Preissner, K.T.. Blood 2007, 110, 2457-2465. [CrossRef] [PubMed]

53. Gansler, J. Influence of proinflammatory stimuli on the expression of vascular ribonuclease 1 in endothelial cells [Текст] / J. Gansler, K. T. Preissner, S. Fischer // FASEB J. - 2014. - V.28. - P. 752-760.

54. Garcia, I. S. Tumorigenic activity of the BCR-ABL oncogenes is mediated by BCL2 [Текст] /I. S. Garcia, G. Grutz, Garcia, I. S. Grutz G. Proc Natl Acad Sci USA 1995; 92: 5287-91.

55. Garipov, A. R. Bacillus intermedius ribonuclease (BINASE) induces apoptosis in human ovarian cancer cells [Текст] / A. R. Garipov, A. A. Nesmelov, H. A. Cabrera-Fuentes, O. N. Ilinskaya // Toxicon. - 2014. - V. 92. - P. 54-59.

56. Garvie, C. W. Mechanistic insights into RNase L through use of an MDMX-derived multifunctional protein domain [Текст] / C. W. Garvie, K. Vasanthavada, Q. Xiang // Biochim. Biophys. Acta. - 2013. - V.1834. - N.8. - P. 1562-1571.

57. Goparaju, C. M. Onconase mediated NFKp downregulation in malignant pleural mesothelioma [Текст] / C. M. Goparaju, J. D. Blasberg, S. Volinia, J. Palatini, S. Ivanov, J. S. Donington, C. Croce, M. Carbone, H. Yang, H. I. Pass // Oncogene. - 2011. - V.30. - P. 2767-2777.

58. Gotte, G. Structural and functional relationships of natural and artificial dimeric bovine ribonucleases: new scaffolds for potential antitumor drugs [Текст] / G. Gotte, D. V. Laurents, A. Merlino, D. Picone, R. Spadaccini // FEBS Letters. - 2013. - V.587. - N.22. - P. 3601-3608.

59. Griffiths, S. J. Ribonuclease inhibits Kaposi's sarcoma [Текст] / S.J. Griffiths, D. J. Adams, S. J. Talbot // Nature. - 1997. - V. 390. - P. 568.

60. Gurova, K. New hopes from old drugs: revisiting DNA-binding small molecules as anticancer agents [Текст] / K. Gurova // Future Oncology. - 2009. -V.5. - P. 1685-1704.

61. Haigis, M. C. Secretory ribonucleases are internalized by a dynamin-independent endocytic pathway [Текст] / M. C. Haigis, R. T. Raines // J. Cell Sci. - 2003. - V.116. - P. 313-324.

62. Hamilton, J. A. Colony-stimulating factors in inflammation and autoimmunity [Текст] / J. A. Hamilton // Nature Reviews Immunology. - 2008. -V. 8. - N. 7. - P. 533-544.

63. He, Y. Cell type specificity of signaling: View from membrane receptors distribution and their downstream transduction networks [Текст] / Y. He, Z. Yu, Ge D., Wang-Sattler R., Thiesen H.J., Xie L., Li Y 2012.. Protein Cell. 3, 701-713.

64. Hoffmann, A. Circuitry of nuclear factor kappaB signaling [Текст] / A. Hoffmann, D. Baltimore // Immunol Rev. - 2006. - V. 210. - P. 171-186.

65. Hooper, L. V. A new class of microbicidal proteins involved in innate immunity [Текст] / L. V. Hooper, T. S. Stappenbeck, C. V. Hong, J. I. Gordon // Angiogenins: Nat. Immunol. - 2003. - V.4. - P. 269-273.

66. Ilinskaya, O. Bacillus intermedius ribonuclease as inhibitor of cell proliferation and membrane current [Текст] / O. Ilinskaya, K. Decker,

A. Koschinski, F. Dreyer, H. Repp // Toxicology. - 2001. - V.156. - N. 2-3. -P. 101-107.

67. Ilinskaya, O. N. Binase induces apoptosis of transformed myeloid cells and does not induce T-cell immune response [Текст] / O. N. Ilinskaya, P. V. Zelenikhin, I. Y. Petrushanko, V. A. Mitkevich, V. S. Prasolov, A. A. Makarov // BBRC. - 2007. - V.361. - N. 4. - P. 1000-1005.

68. Ilinskaya, O. N. Changing the net charge from negative to positive makes ribonuclease Sa cytotoxic [Текст] / O. N. Ilinskaya, F. Dreyer, V. A. Mitkevich, K. L. Shaw, C. N. Pace, A. A. Makarov // Protein Sci. - 2002. - V.11. - N.10. - P. 2522-2525.

69. Ilinskaya, O. N. Cytotoxicity of RNases is increased by cationization and counteracted by KCa channels [Текст] / O. N. Ilinskaya, A. Koschinski, V. Mitkevich, H. Repp, F. Dreyer, C. N. Pace, A. A. Makarov // Biochem Biophys Res Commun. - 2004. - V. 314. - N.2. - P. 550-554.

70. Ilinskaya, O. N. Direct inhibition of oncogenic KRAS by Bacillus pumilus ribonuclease (binase) [Текст] / O. N. Ilinskaya, I. Singh, E. Dudkina, V. Ulyanova, A. Kayumov, G. Barreto // Biochimica et Biophysica Acta. - 2016. - V. 1863. - N. 7, Pt A. - P. 1559-1567.

71. Ilinskaya, O. N. Ribonucleases as antiviral agents [Текст] / O. N. Ilinskaya, R. S. Shah Mahmud // Molecular Biology. - 2014. - V. 48. - N. 5. -P. 615-623.

72. Ilinskaya, O. N. RNase-induced apoptosis: fate of calcium-activated potassium channels [Текст] / O. N. Ilinskaya, A. Koschinski, H. Repp, V. A. Mitkevich, F. Dreyer, J. M. Scholtz, C. N. Pace, A. A. Makarov // Biochimie. -2008. - V. 90. - N. 5. - P. 717-725.

73. Inaoka, T. SodA and manganese are essential for resistance to oxidative stress in growing and sporulating cells of Bacillus subtilis [Текст] / T. Inaoka, Y. Matsumura, T. Tsuchido // J Bacteriol. - 1999. - V.181. - N.6. - P. 1939-1943.

74. Irie, M. Ribonuclease T2 [Текст] / M. Irie, K. Ohgi // Meth Enzymol. - 2001. -V.341. - P. 42-55.

75. Ivanov, P. Angiogenin-induced tRNA fragments inhibit translation initiation [Текст] / P. Ivanov, M. M. Emara, J. Villen, S. P. Gygi, P. Anderson // Mol. Cell. - 2011. - V.43. - P. 613-623.

76. Jakubovics, N. S. Out of the iron age: new insights into the critical role of manganese homeostasis in bacteria [Текст] / N. S. Jakubovics, H. F. Jenkinson // Microbiology. - 2001. - V.147. - P. 1709-1718.

77. Janssens, S. A universal role for MyD88 in TLR/IL-1R-mediated signaling [Текст] / S. Janssens, R. Beyaert // Trends in Biochemical Sciences. -2002. - V. 27. - N.9. - P. 474-482.

78. Jordaan, S. Updates in the Development of ImmunoRNases for the Selective Killing of Tumor Cells [Текст] / S. Jordaan, O. A. Akinrinmade, T. Nachreiner, C. Cremer, K. Naran, S. Chetty, S. Barth // Biomedicines. - 2018. -V. 6. - N. 28. - P. 1-13.

79. Kamiya, Y. Amino acid sequence of a lectin from Japanese frog (Rana japonica) eggs [Текст] / Y. Kamiya, F. Oyama, R. Oyama, F. Sakakibara, K. Nitta, H. Kawauchi, Y. Takayanagi, K. Titani // J. Biochem. - 1990. - V. 108. - P. 139143.

80. Kao, R. Fungal ribotoxins: a family of naturally engineered targeted toxins? [Текст] / R. Kao, J. Davies // Biochem Cell Biol. - 1995. - V.73. - N.11-12. - P. 1151-1159.

81. Keyer, K. Superoxide accelerates DNA damage by elevating free-iron levels [Текст] / K. Keyer, J. Imlay // Biochemistry. - 1996. - V.93. - N.24. - P. 13635-13640.

82. Kozlov, A.V. Epr analysis reveals three tissues responding to endotoxin by increased formation of reactive oxygen and nitrogen species [Текст] / A. V. Kozlov, L. Szalay, F. Umar, B. Fink, K. Kropik, H. Nohl, H. Redl, S. Bahrami // Free Rad. Biol. Med. - 2003. - V.34. - N.12. - P. 1555-1562.

83. Kulka, M. Human mast cells synthesize and release angiogenin, a member of the ribonuclease A (RNase A) superfamily [Текст] / M. Kulka, N. Fukuishi, D. D. Metcalfe // J. Leukoc. Biol. - 2009. - V.86. - P. 1217-1226.

84. Kurland, C. G. Origin and evolution of the mitochondrial proteome [Текст] / C. G. Kurland, S. G. Andersson // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2000. -V.64. - N.4. - P. 786-820.

85. Kvarnhammar, A. M. Pattern recognition receptors in human eosinophils [Текст] / A. M. Kvarnhammar, L. O. Cardell // Immunology. - 2012. -V.136. - N.1. - P. 11-20.

86. Lam, S. K. Isolation of a novel thermolabile heterodimeric ribonuclease with antifungal and antiproliferative activities from roots of the sanchi ginseng Panax notoginseng [Текст] S. K. Lam, T. B. Ng // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 2001. - V.285. - P. 419-423.

87. Lanciano, P. Molecular mechanisms of superoxide production by complex III: A bacterial versus human mitochondrial comparative case study [Текст] / P. Lanciano, B. Khalfaoui-Hassani, N. Selamoglu, A. Ghelli, M. Rugolo, F. Daldal // Biochim. Biophys. Acta. - 2013. - V.1827. - N.11-12. - P. 1332-1339.

88. Leatham, M. P. Precolonized Human Commensal Escherichia coli Strains Serve as a Barrier to E. coli O157:H7 Growth in the Streptomycin-Treated Mouse Intestine [Текст] / M. P. Leatham, S. Banerjee, S. M. Autieri, R. Mercado-Lubo, T. Conway, P. S. Cohen // Infection and immunity. - 2009. - V. 77. - N. 7.

- P. 2876-2886.

89. Lee, J. E. Structural basis for catalysis by Onconase [Текст] / J. E. Lee, E. Bae, C. A. Bingman, G. N. Phillips Jr., R. T. Raines // J. Mol. Biol. - 2008.

- V. 375. - N. 1. - P. 165-177.

90. Lee, V.Y. Bleomycin induces alveolar epithelial cell death through JNK-dependent activation of the mitochondrial death pathway [Текст] / V. Y. Lee, C. Schroedl, J. K. Brunelle, L. J. Buccellato, O. I. Akinci, H. Kaneto, C. Snyder, J. Eisenbart, G. R. Budinger, N. S. Chandel // Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. -2005. - V.289. - P. L521-L528.

91. Lee, Y. H. Rana Catesbeiana ribonuclease inhibits Japanese encephalitis virus (JEV) replication and enhances apoptosis of JEV-infected BHK-21 cells [Текст] / Y. H Lee, C. W. Wei, J. J. Wang, C. T. Chiou // Antivir Res. -2011. - V. 89. - P. 193-198.

92. Leland, P. A. Ribonuclease A variants with potent cytotoxic activity [Текст] / P. A. Leland, L. W. Schultz, B. M. Kim, R. T. Raines // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1998. - V.95. - P. 10407-10412.

93. Leu, J. Residues involved in the catalysis, base specificity, and cytotoxicity of ribonuclease from Rana catesbeiana based upon mutagenesis and X-ray crystallography [Текст] / J. Leu, S. S. Chern, S. C. Wang, Y. Y. Hsiao, I. Amiraslanov, Y. C. Liaw, Y. D. Liao // J. Biol. Chem. - 2003. - V. 278. -P. 7300-7309.

94. Liang, S. RNase L: Its Biological Roles and Regulation [Текст] / S. Liang, D. Quirk, A. Zhou // IUBMB Life. - 2006. - V. 58. - N.9. - P. 508-514.

95. Lin, Y. M. Outer membrane protein I of Pseudomonas aeruginosa is a target of cationic antimicrobial peptide/protein [Текст] / Y. M. Lin, S. J. Wu, T. W. Chang, C. F. Wang, C. S. Suen, M. J. Hwang, M. D. Chang, Y. T. Chen, Y. D. Liao // J. Biol. Chem. - 2010. - V.285. - P. 8985-8994.

96. Lobikin, M. Resting potential, oncogene-induced tumorigenesis, and metastasis: The bioelectric basis of cancer in vivo [Текст] / M. Lobikin, B. Chernet, D. Lobo, M. Levin // Phys. Biol. - 2012. - V.9. - N.065002. - P. 1-22.

97. Ma, W. Safety profile of combined therapy inhibiting EFGR and VEGF pathways in patients with advanced non-small-cell lung cancer: a metaanalysis of fifteen phase II/III randomized trials [Текст] / W. Ma, M. Xu, Y. Liu, H. Liu, J. Huang, Y. Zhu, L. Ji, X. Qi // Int J Cancer. - 2015. -V.137. - N.2. -P.409-419.

98. Majchrzak, A. In vitro cytotoxicity of ranpirnase (onconase) in combination with components of R-CHOP regimen against diffuse large B cell lymphoma (DLBCL) cell line [Текст] / A. Majchrzak, M. Witkowska, A. Medra,

M. Zwolinska, J. Bogusz, B. Cebula-Obrzut, Z. Darzynkiewicz, T. Robak, P. Smolewski // Postepy Hig. Med. Dosw. - 2013. - V. 67. - P. 1166-1172.

99. Makarov, A. A. Cytotoxic ribonucleases: molecular weapons and their targets [Текст] / A. A. Makarov, O. N. Ilinskaya // FEBS Lett. - 2003. - V. 540. - P. 15-20.

100. Marinov, I. Bovine seminal ribonuclease induces in vitro concentration dependent apoptosis in stimulated human lymphocytes and cells from human tumor cell lines [Текст] / I. Marinov, J. Soucek // Neoplasma. - 2000. - V. 47. - P. 294-298.

101. Matousek, J. Antitumor activity and other biological actions of oligomers of ribonuclease A [Текст] / J. Matousek, G. Gotte, P. Pouckova, J. Soucek, T. Slavik, F. Vottariello, M. Libonati // J. Biol. Chem - 2003. - V. 278. -P. 23817-23822.

102. Matsumoto, K. Pharmacotherapy for recurrent ovarian cancer: current status and future perspectives [Текст] / K. Matsumoto, T. Onda, N. Yaegashi // Japanese Journal of Clinical Oncology. - 2015. - V.45. - N.5. - P. 408-410.

103. Mayo, M. W. The transcription factor NF-kappaB: control of oncogenesis and cancer therapy resistance [Текст] / M. W. Mayo, A. S. Baldwin // Biochimica et Biophysica Acta. - 2000. - V.1470 - N.2. - P. M55-M62.

104. Mieczkowski, J. Down-regulation of IKKbeta expression in glioma-infiltrating microglia/macrophages is associated with defective inflammatory/immune gene responses in glioblastoma [Текст] / J. Mieczkowski, M. Kocyk, P. Nauman, K. Gabrusiewicz, M. Sielska, P. Przanowski, M. Maleszewska, W. D. Rajan, D. Pszczolkowska, T. Tykocki, W. Grajkowska, K. Kotulska, M. Roszkowski, B. Kostkiewicz, B. Kaminska // Oncotarget. - 2015. -V.6. - P. 33077-33090.

105. Mikhailova, N. A. Experimental study of antiviral activity of spore-forming bacteria Bacillus pumilus [Текст] / N. A. Mikhailova, F. G. Nagieva, O.

M. Grin'ko, V. V. Zverev // Zh. Mikrobiol. Epidemiol. Immuniobiol. - 2010. -V.2. - P. 69-74.

106. Mironova, N. L. Ribonuclease binase inhibits primary tumor growth and metastases via apoptosis induction in tumor cells [Текст] / N. L. Mironova, I. Y. Petrushanko, O. A. Patutina, A. V. Sen'kova, O. V. Simonenko, V. A. Mitkevich, O. V. Markov, M. A. Zenkova, A. A. Makarov // Cell Cycle. - 2013. -V.12. - N.13. - P. 2120-2131.

107. Mitkevich, V .A. Binase cleaves cellular noncoding RNAs and affects coding mRNAs [Текст] / V. A. Mitkevich, N. A. Tchurikov, P. V. Zelenikhin, I. Y. Petrushanko, A. A. Makarov, O. N. Ilinskaya // FEBS J. - 2010. - V.277. - P. 186-196.

108. Mitkevich, V.A. Cellular targets of antitumor ribonucleases [Текст] / V. A. Mitkevich, A. A. Makarov, O. N. Ilinskaya // Mol. Biologiya. - 2014. - V. 48. - P. 214-219.

109. Mitkevich, V. A. Expression of FLT3-ITD oncogene confers mice progenitor B-cells BAF3 sensitivity to the ribonuclease binase cytotoxic action [Текст] // V. A. Mitkevich, N. N. Orlova, I. Iu. Petrushanko, O. V. Simonenko, P. V. Spirin, M. M. Prokofeva, A. S. Gornostaeva, C. Stocking, A. A. Makarov, V. S. Prasolov // Mol Biol (Mosk). - 2013. - V.47. - 2. - P. 282-285.

110. Mitkevich, V. A. Oncogenic c-kit transcript is a target for binase [Текст] / V. A Mitkevich, I. Y. Petrushanko, O. V. Kretova, P. V. Zelenikhin, V. S. Prassolov, N. A. Tchurikov, O. N. Ilinskaya, A. A. Makarov // Cell Cycle. -2010a. - V. 9. - N.13. - P. 2674-2678.

111. Mitkevich, V. A. Ribonuclease binase apoptotic signature in leukemic Kasumi-1 cells [Текст] / V. A. Mitkevich, O. V. Kretova, I. Y. Petrushanko, K. M. Burnysheva, D. V. Sosin, O. V. Simonenko, O. N. Ilinskaya, N. A. Tchurikov, A. A. Makarov // Biochimie. - 2013. - V.95. - N.6. - P. 1344-1349.

112. Mitkevich, V. A. Sensitivity of acute myeloid leukemia Kasumi-1 cells to binase toxic action depends on the expression of KIT and AML1-ETO oncogenes [Текст] / V. A. Mitkevich, I. Y. Petrushanko, P. V. Spirin, T. V.

Fedorova, O. V. Kretova, N. A. Tchurikov, V. S. Prassolov, O. N. Ilinskaya, A. A. Makarov // Cell Cycle. - 2010. - V. 10. - N. 23. - P. 4090-4097.

113. Mohammed, I. Signalling pathways involved in ribonuclease-7 expression [Текст] / I. Mohammed, A. Yeung, A. Abedin, A. Hopkinson, H. S. Dua // Cell. Mol. Life Sci. - 2010. - V.68. - P. 1941-1952.

114. Mooren, O. L. Roles for actin assembly in endocytosis [Текст] / O. L. Mooren, B. J. Galletta, J. A. Cooper // Annu. Rev. Biochem. - 2012. - V.81. -P. 661-686.

115. Morita, T. Distribution of two urinary ribonuclease-like enzymes in human organs and body fluids [Текст] / T. Morita, Y. Niwata, K. Ohgi, M. Ogawa, M. Irie // J. Biochem. - 1986. - V.99. - P. 17-25.

116. Mungunsukh, O. Bleomycin induces the extrinsic apoptotic pathway in pulmonary endothelial cells [Текст] / O. Mungunsukh, A. J. Griffin, Y. H. Lee, R. M. Day // Am J Physiol Lung Cell Mol Physiol. - 2010. - V.298. - N.5. - P. L696-703.

117. Navarro, S. The cytotoxicity of eosinophil cat- ionic protein/ribonuclease 3 on eukaryotic cell lines takes place through its aggregation on the cell membrane [Текст] / S. Navarro, J. Aleu, M. Jimenez, E. Boix, C. M. Cuchillo, M. V. Nogues // Cell Mol. Life Sci. - 2008. - P.65 324-337.

118. Noy, R. Tumor-associated macrophages: from mechanisms to therapy [Текст] / R. Noy, J. W. Pollard // Immunity. - 2014. - V.41. - N.1. - P. 49-61.

119. Oeckinghaus, A. The NF-kB Family of Transcription Factors and Its Regulation [Текст] / A. Oeckinghaus, S. Ghosh // Cold Spring Harb Perspect Biol. - 2009. - V.1. - N.4: a000034.

120. Olmo, N. Cytotoxic mechanism of the ribotoxin-sarcin induction of cell death via apoptosis [Текст] / N. Olmo, J. Turnay, G. G. Buitrago, I. Lopez de Silanes, J. G. Gavilanes, M. A. Lizarbe // Eur J Biochem. - 2001. - V.268. - P. 2113-2123.

121. Orth, J. D. Dynamin at the actin- membrane interface [Текст] / J. D. Orth, M. A. McNiven // Curr. Opin. Cell Biol. - 2003. - V.15. - N.1. - P. 31-39.

122. Park, C. Dimer formation by a "monomeric" protein [Текст] / C. Park, R. T. Raines // Protein Sci. - 2000. - V.9. - N.10. - P. 2026-2033.

123. Peigneur, S. Crotamine pharmacol-ogy revisited: Novel insights based on the inhibition of KV channels [Текст] / S. Peigneur, D. J. Orts, A. R. Prieto da Silva, N. Oguiura, M. Boni-Mitake, E. B. de Oliveira, A .J. Zaharenko, J. C. de Freitas, J. Tytgat // Mol. Pharmacol. - 2012. - V.82. - N.1. - P. 90-96.

124. Perez-Canadillas, J. M. The highly refined solution structure of the cytotoxic ribonuclease alpha-sarcin reveals the structural requirements for substrate recognition and ribonucleolytic activity [Текст] / J. M. Perez-Canadillas, J. Santoro, R. Campos-Olivas, J. Lacadena, A. Martinez del Pozo, J. G. Gavilanes, M. Rico, M. Bruix // J. Mol. Biol. - 2000. - V.299. - N.4. - P. 1061-1073.

125. Plate J. M. Effect of gemcitabine on immune cells insubjects with adenocarcinoma of the pancreas [Текст] / J. M. Plate, A. E. Plate, S. Shott, S. Shott, S. Bograd, J. E. Harris // Cancer Immunol. Immunother. - 2005. - V.54. -N.9. - P. 915-925.

126. Polyakov, K. M. The structure of substrate-free microbial ribonuclease binase and of its complexes with 3'GMP and sulfate ions [Текст] / K. M. Polyakov, A. A. Lebedev, A. L. Okorokov, K. I. Panov, A. A. Schulga, A. G. Pavlovsky, M. Y. Karpeisky, G. G. Dodson // Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. - 2002. - V.58. - Pt 5. - P. 744-750.

127. Porta, C. Ranpirnase and its potential for the treatment of unresectable malignant mesothelioma [Текст] / C. Porta, C. Paglino, L. Mutt // Biologics. - 2008. - V. 2. - N.4. - P. 601-609.

128. Pulido, D. Towards the rational design of antimicrobial proteins single point mutations can switch on bactericidal and agglutinating activities on the RNase A superfamily lineage [Текст] / D. Pulido, M. Moussaoui, M. V. Nogues, M. Torrent, E. Boix, // FEBS J. - 2013. - V.280. - P. 5841-5852.

129. Qiao, M. Onconase downregulates micro RNA expression through targeting microRNA precursors [Текст] / M. Qiao, L. D. Zu, X. H. He, R. L. Shen, Q. C. Wang, M. F. Liu // Cell Res. - 2012. - V.22. - N.7. - P. 1199-1202.

130. Ramos-Nino, M. E. Human mesothelioma cells exhibit tumor cell-specific differences in phosphatidylinositol 3-kinase/AKT activity that predict the efficacy of onconase [Текст] / M.E. Ramos-Nino, G. Vianale, T. Sabo-Attwood, L. Mutti, C. Porta, N. Heintz, B. T. Mossman // 2005.. Mol. Can-cer Ther. 4, 835842.

131. Ran, S. Increased expo-sure of anionic phospholipids on the surface of tumor blood vessels [Текст] / S. Ran, A. Downes, P. E. Thorpe // Cancer Res. -2002. - V.62. - P. 6132-6140.

132. Rensing, C. The copper metallome in prokaryotic cells [Текст] / C. Rensing, S. F. McDevitt // Met Ions Life Sci. - 2013. - V.12. - P. 417-450.

133. Richmond, A. The role of NF-kB in modulating antitumor immunity [Текст] / A. Richmond, J. Yang // Oncoimmunology. - 2016. - V.5. - N.1. -P. e1005522.

134. Riedl, S. In search of a novel target - phosphatidylserine exposed by non-apoptotic tumor cells and metastases of malignancies with poor treatment efficacy [Текст] / S. Riedl, B. Rinner, M. Asslaber, H. Schaider, S. Walzer, A. Novak, K. Lohner, D. Zweyticka // Biochim Biophys Acta. - 2011. - V.1808. -N.11. - P. 2638-2645.

135. Rivera, L. B. Location, location, location: macrophage positioning within tumors determines pro- or antitumor activity [Текст] / L. B. Rivera, G. Bergers // Cancer Cell. - 2013. - V.24. - N.6. - P. 687-689.

136. Rodriguez, M. Intracellular pathway of onconase that enables its delivery to the cytosol [Текст] / M. Rodriguez, G. Torrent, M. Bosch, F. Rayne, J. F. Dubremetz, M. Ribo, A. Benito, M. Vilanova, B. Beaumelle // J. Cell Sci. -2007. - V.120. - Pt.8. - P. 1405-1411.

137. Roiz, L. Actibind, an actin-binding fungal T2-RNase with antiangiogenic and anticarcinogenic characteristics [Текст] / L. Roiz, P. Smirnoff, M. Bar-Eli, B. Schwartz, O. Shoseyov // Cancer. - 2006. - 106. - N.10. - P. 22952308.

138. Rosenberg, H. F. Eosinophils: Changing perspectives in health and disease [Текст] / H. F. Rosenberg, K. D. Dyer, P. S. Foster // Nat. Rev. Immunol. -2013. - V.13. - N.1.- P. 9-22.

139. Roy, F. Le. The 2-5A/RNase L/RNase L inhibitor (RLI) [correction of (RNI)] pathway regulates mitochondrial mRNAs stability in interferon alpha-treated H9 cells [Текст] / F. Le Roy, C. Bisbal, M. Silhol, C. Martinand, B. Lebleu, T. Salehzada // J. Biol. Chem. - 2001. - V.276. - N.51. - P. 48473-48482.

140. Rutkoski, T. J. Evasion of ribonuclease inhibitor as a determinant of ribonuclease cytotoxicity [Текст] / T. J. Rutkoski, R. T. Raines // Curr. Pharm. Biotechnol. - 2008. - V. 9. - N.3. - P. 185-189.

141. Schein, C. H. From housekeeper to microsurgeon: the diagnostic and therapeutic potential of ribonucleases [Текст] / C. H. Schein // Nat. Biotechnol. -1997. - V.15. - N.1. - P. 529-536.

142. Schirrmann, T. Targeted therapeutic RNases (ImmunoRNases) [Текст] / T. Schirrmann, J. Krauss, M. A. Arndt, S. M. Rybak, S. Dübel // Expert Opin Biol Ther. - 2009. - V.9. - N.1. - P. 79-95.

143. Scott, M. J. Interleukin-10 suppresses natural killer cell but not natural killer T cell activation during bacterial infection [Текст] / M. J. Scott, J. J. Hoth, M. Turina // Cytokine. - 2006. - V.33. - N.2. - P. 79-86.

144. Seggewiss, R. Imatinib inhibits T-cell receptor-mediated T-cell proliferation and activation in a dosedependent manner [Текст] / R. Seggewiss, K. Lore, E. Greiner, M. K. Magnusson, D. A. Price, D. C. Douek, C. E. Dunbar, A. Wiestner // Blood. - 2005. - V.105. - N.6. - P. 2473-2479.

145. Shah Mahmud, R. Antiviral activity of Binase against the pandemic influenza a (H1N1) virus [Текст] / R. Shah Mahmud, O. N. Ilinskaya // Acta Nat. - 2013. - V.5. - P. 44-51.

146. Shah Mahmud, R. Bacterial ribonuclease binase exerts an intra-cellular anti-viral mode of action targeting viral RNAs in influenza a virus-infected MDCK-II cells [Текст] / R. Shah Mahmud, A. Mostafa, C. Müller, P. Kanrai, V.

Ulyanova, Y. Sokurenko, J. Dzieciolowski, I. Kuznetsova, O. Ilinskaya, S. Pleschka // Virology Journal. - 2018. - V.15. - N.5. - P. 1-12.

147. Sheng, J. Three decades of research on angiogenin: A review and perspective [Текст] / J. Sheng, Z. Xu // Acta Biochim. Biophys. Sin. - 2016. -V.48. - N.5. - P. 399-410.

148. Shi, L. Limits of propidium iodide as a cell viability indicator for environmental bacteria [Текст] / L. Shi, S. Gunther, T. Hubschmann, L. Y. Wick, H. Harms, S. Muller // Cytometry. - 2007. - V.71. - N.8. - P. 592-598.

149. Sica, A. Altered macrophage differentiation and immune dysfunction in tumor development [Текст] / A. Sica, V. Bronte // The Journal of Clinical Investigation. - 2007. - V.117. - N.5. - P. 1155-1166.

150. Simsekyilmaz, S. Role of extracellular RNA in atherosclerotic plaque formation in mice [Текст] / S. Simsekyilmaz, H. A. Cabrera-Fuentes, S. Meiler Kostin S, Baumer Y, Liehn EA, C. Weber, W. A. Boisvert, K. T. Preissner, A. Zernecke // Circulation. - 2014. - V.129. - N.5. - P. 598-606.

151. Singh, U. P. Enzymatic and structural characterisation of amphinase, a novel cytotoxic ribonuclease from Rana pipiens oocytes [Текст] / U. P. Singh, W. Ardelt, S. K. Saxena, D. E. Holloway, E. Vidunas, H. S. Lee, A. Saxena, K. Shogen, K. R. Acharya // J. Mol. Biol. - 2007. - V.371. - N.1. - P. 93-111.

152. Skvor, J. Effect of wheat leaf ribonuclease on tumor cells and tissues [Текст] / J. Skvor, P. Lipovova, P. Pouckova, J. Soucek, T. Slavik, J. Matousek // Anticancer Drugs. - 2006. - V.17. - N.7. - P. 815-823.

153. Smolewski, P. Cytotoxic activity of the amphibian ribonucleases onconase and r-amphinase on tumor cells from B cell lymphoproliferative disorders [Текст] / P. Smolewski, M. Witkowska, M. Zwolinska, B. Cebula-Obrzut, A. Majchrzak, A. Jeske, Z. Darzynkiewicz, W. Ardelt, B. Ardelt, T. Robak // Int J Oncol. - 2014. - V.45. - N.1. - P. 419-425

154. Sokurenko, Y. Mg2+ enhances the formation of 2',3'-cGMP, an intermediate of RNA cleavage by binase [Текст] / Y. Sokurenko, A. Kolpakov, O. Ilinskaya // BioNanoScience. - 2017. - V.7. - N.1. - P. 167-169.

155. Sorrentino, S. Degradation of double-stranded RNA by human pancreatic ribonuclease: Crucial role of noncatalytic basic amino acid residues [Текст] / S. Sorrentino, M. Naddeo, A. Russo, G. D'Alessio // Biochemistry. -2003. - V.42. - N.34. - P. 10182-10190.

156. Srinivasan, C. Yeast lacking superoxide dismutase(s) show elevated levels of "free iron" as measured by whole cell electron paramagnetic resonance [Текст] / C. Srinivasan, A. Liba, J. A. Imlay, J. S. Valentine, E. B. Gralla // The journal of biological chemistry. - 2000. - V.275. - N.38. - P. 29187-29192.

157. Strong, L. E. First-in-human phase I clinical trial of QBI-139, a human ribonuclease variant, in solid tumors [Текст] / L. E. Strong, J. A. Kink, M. Baigen, M. N. Shahan, R. T. Raines // ASCO Annual Meeting, editor. J. Clin. Oncol. - Chicago, Illinois, 2012. - P. suppl; abstr TPS3113.

158. Suhasini, A. N. Transfer RNA Cleavages by Onconase Reveal Unusual Cleavage Sites [Текст] / A. N. Suhasini, R. Sirdeshmukh // J. Biol. Chem. - 2006. - V.281. - N.18. - P. 12201-12209.

159. Sun, S. C. New insights into NF-kappaB regulation and function [Текст] / S. C. Sun, S.C. Ley // Trends in immunology. - 2008. - V.29. - N.10. -P. 469-478.

160. Sun, S. C. Non-canonical NF-kappaB signaling pathway [Текст] / S. C. Sun // Cell Research. - 2011. - V.21. - N.1. - P. 71-85.

161. Swartz, H. M. Clinical applications of EPR: Overview and perspectives [Текст] / H. M. Swartz, N. Khan, J. Buckey, R. Comi, L. Gould, O. Grinberg, A. Hartford, H. Hopf, H. Hou, E. Hug, A. Iwasaki, P. Lesniewski, I. Salikhov, T. Walczak // NMR Biomed. - 2004. - V.17. - N.5. - P. 335-351.

162. Szachowicz-Petelska, B. Phospholipid composition and electric charge in healthy and cancerous parts of human kidneys [Текст] / B. Szachowicz-Petelska, I. Dobrzynska, M. Skrodzka, B. Darewicz, Z. A. Figaszewski, J. Kudelski // J. Membr. Biol. - 2013. - V.246. - N.5. - P. 421-425.

163. Tanaka, F. Intratumoral injection of dendritic cells after treatment of anticancer drugs induces tumorspecific antitumor effect in vivo [Текст] / F.

Tanaka, H. Yamaguchi, M. Ohta, K. Mashino, H. Sonoda, N. Sadanaga, H. Inoue, M. Mori // Int. J.Cancer. - 2002. -V.101. - N.3. - P. 265-269.

164. Tang, C. H. Synergism of Rana catesbeiana ribonuclease and IFN-gamma triggers distinct death machineries in different human cancer cells [Текст] / C. H. Tang, C. C. Hu, C. W. Wei, J. J. Wang // FEBS Lett. - 2005. - V.579. -N.1. - P. 265-270.

165. Tao, Z. An Efficient Mammalian Transfer RNA Target for Bleomycin [Текст] / Z. Tao, K. Konishi, G. Keith, S.M. Hecht // J. Am. Chem. Soc. - 2006. -V.128. - N.46. - P. 14806-14807.

166. Trevino, S. R. Amino acid contribution to protein solubility: Asp, Glu, and Ser contribute more favorably than the other hydrophilic amino acids in RNase Sa [Текст] / S. R. Trevino, J. M. Scholtz, C. N. Pace // J Mol Biol. - 2007. - 366. - N.2. - P.449-460.

167. Ulyanova, V. Barnase and binase: twins with distinct fates [Текст] / V. Ulyanova, V. Vershinina, O. Ilinskaya // FEBS Journal. - 2011. - V.278. -N.19. - P. 3633-3643.

168. Van der Bij, G. J. The role of macrophages in tumor development [Текст] / G. J. van der Bij, S. J. Oosterling, S. Meijer, R. H. Beelen, M. van Egmond // Cellular Oncology. - 2005. - V.27. - N.4. - P. 203-213.

169. Van Horssen, R. TNF-alpha in cancer treatment: molecular insights, antitumor effects, and clinical utility [Текст] / R. van Horssen, T.L. Ten Hagen, A.M. Eggermont // Oncologist. - 2006. - V. 11. - P. 397-408.

170. Weinblatt, M. E. Methotrexate in rheumatoid arthritis: a quarter century of development [Текст] / M. E. Weinblatt // Trans. Am. Clin. Climatol. Assoc. - 2013. - V.124. - P. 16-25.

171. Weiner, H. L. Treatment of multiple sclerosis with cyclophosphamide: critical review of clinical and immunologic effects [Текст] / H. L. Weiner, J. A. Cohen // Mult. Scler. - 2002. - V.8. - N.2. - P.142-154.

172. World Health Organization [Электронный ресурс] - Режим доступа: http://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/cancer (Дата обращения 03.07.2018)

173. Wu, J. Natural killer cells and cancer [Текст] / J. Wu, L. L. Lanier // Adv. Cancer Res. - 2003. - V.90. - P. 127-156.

174. Wu, Y. A study of the intracellular routing of cytotoxic ribonucleases [Текст] / Y. Wu, S. K. Saxena, W. Ardelt, M. Gadina, S. M. Mikulski, C. De Lorenzo, G. D'Alessio, R. J. Youle // J. Biol. Chem. - 1995. - V.270. - N.29. - P. 17476-17481.

175. Wynn, T. A. Macrophage biology in development, homeostasis and disease [Текст] / T. A. Wynn, A. Chawla, J. W. Pollard // Nature. - 2013. - V.496. - N.7446. - P. 445-455.

176. Xia, C. Treatment of resistant metastatic melanoma using sequential epigenetic therapy (decitabine and panobinostat) combined with chemotherapy (temozolomide) [Текст] / C. Xia, R. Leon-Ferre, D. Laux, J. Deutsch, B. J. Smith, M. Frees, M Milhem // Cancer Chemother Pharmacol. - 2014. - V.74. - N.4. - P. 691-697.

177. Yang, D. Human ribonuclease A superfamily members, eosinophil-derived neurotoxin and pancreatic ribonuclease, induce dendritic cell maturation and activation [Текст] / D. Yang, Q. Chen, H. F. Rosenberg, S. M. Rybak, D. L. Newton, Z. Y. Wang, Q. Fu, V. T. Tchernev, M. Wang, B. Schweitzer, S. F. Kingsmore, D. D. Patel, J. J. Oppenheim, O. M. Howard // J. Immunol. - 2004. -V.173. - N.10. - P. 6134-6142.

178. Yoshida, H. The ribonuclease T1 family [Текст] / H. Yoshida // Methods Enzymol. - 2001. - V.341. - P. 28-41.

179. Yuki, S. Noncytotoxic ribonuclease, RNase T1, induces tumor cell death via hemagglutinating virus of Japan envelope vector [Текст] / S. Yuki, Y. Kondo, F. Kato, M. Kato, V. Matsuo // Eur J Biochem. - 2004. - V.271. - N.17. -P. 3567-3572.

180. Zagozdzon, R. Effective chemoimmunotherapy of L1210 leukemia invivousing interleukin-12 combined with doxorubicin but not with cyclophosphamide, paclitaxel or cisplatin [Текст] / R. Zagozdzon, J. Golab, T. Stoklosa, A. Giermasz, D. Nowicka, W. Feleszko, W. Lasek, M. Jakobisiak // Int. J. Cancer. - 1998. - V.77. - N.5. - P. 720-727.

181. Zanardi, E. Better Together: Targeted Combination Therapies in Breast Cancer [Текст] / E. Zanardi, G. Bregni, F. de Braud, S. Di Cosimo // Semin Oncol. - 2015. - V.42. - N.6. - P. 887-895.

182. Zasloff, M. Antimicrobial RNases of human skin [Текст] / M. Zasloff // J. Investig. Dermatol. - 2009. - V.129. - N.9. - P. 2091-2093.

183. Zelenikhin, P.V. Induction of apoptosis of tumor cells by binase [Текст] / P. V. Zelenikhin, A. I. Kolpakov, G. V. Cherepnev, O. N. Il'inskaia // Molekuliarnaia biologiia. - 2005. - V.39. - N.3. - P. 457-463.

184. Zeligs, K. P. Molecular Pathways: The Balance between Cancer and the Immune System Challenges the Therapeutic Specificity of Targeting Nuclear Factor-кВ Signaling for Cancer Treatment [Текст] / K. P. Zeligs, M. K. Neuman, C. M. Annunziata // Clin Cancer Res. - 2016. - V.22. - N.17. - P. 4302-4308.

185. Zernecke, A. Extracellular ribonucleic acids (RNA) enter the stage in cardiovascular disease [Текст] / A. Zernecke, K. T. Preissner // Circ. Res. - 2016.

- V.118. - N.3. - P. 469-479.

186. Zhang, D. X. Mitochondrial reactive oxygen species-mediated signaling in endothelial cells [Текст] / D. X. Zhang, D. D. Gutterman // Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol. - 2007. - V.292. - N.5. - P. 2023-2031.

187. Zhou, W. W. Purification and some properties of an extracellular ribonuclease with antiviral activity against tobacco mosaic virus from Bacillus cereus [Текст] / W. W. Zhou, T. G. Niu // Biotechnol. Lett. - 2009. - V.31. - N.1.

- P. 101-105.

188. Zuo, Y. Exoribonuclease superfamilies: structural analysis and phylogenetic distribution [Текст] / Y. Zuo; M. P. Deutscher // Nucleic Acids Res.

- 2001. - V.29. - N.5. - P. 1017-1026.