Полигостальность условно-патогенных энтеробактерий на модели их взаимодействия с растениями тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, доктор биологических наук Маркова, Юлия Александровна

• Маркова, Юлия Александровна
• доктор биологических наук
• 2013

Оглавление диссертации доктор биологических наук Маркова, Юлия Александровна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Эндофиты

1.2. Выделение патогенных для человека бактерий из эндосферы и 19 филлосферы растительных тканей

1.3. Проникновение патогенных и условно-патогенных бактерий в 23 растение

1.4. Ответ растений при взаимодействии с патогенными и 27 непатогенными микроорганизмами

1.4.1. Ответ растений при взаимодействии с фитопатогенами

1.4.2. Ответ растений при взаимодействии с непатогенными 42 эндофитами

1.4.3. Ответ растений при взаимодействии с бактериями, 47 патогенными для человека

1.5. Универсальные факторы патогенности бактерий

1.6. Случаи заболеваний, вызванные растениями, 58 контаминированными патогенными и условно-патогенными микроорганизмами

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

ГЛАВА 3 АДАПТАЦИЯ УСЛОВНО-ПАТОГЕННЫХ И

ПАТОГЕННЫХ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ К УСЛОВИЯМ ВНЕШНЕЙ СРЕДЫ

ГЛАВА 4. БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ,

ОБУСЛОВЛИВАЮЩИЕ ИХ СПОСОБНОСТЬ ВЫЖИВАТЬ В ОРГАНИЗМЕ РАСТЕНИЙ

4.1. Влияние условий культивирования на образование биопленок 99 условно-патогенными и патогенными энтеробактериями

4.2. Определение антагонизма менаду патогенными и условно- 110 патогенными для человека энтеробактериями и эндофитом

Bacillus subtilis 26D и фитопатогеном Pectobacterium carotovorum В-1247

4.3. Экзоферменты энтеробактерий, необходимые для выживания в растительных тканях

4.4. Синтез индолилуксусной кислоты условно-патогенными и патогенными энтеробактериями

ГЛАВА 5. ВЛИЯНИЕ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ РАЗНЫХ ВИДОВ НА ш РОСТ И РАЗВИТИЕ РАСТЕНИЙ

5.1. Влияние Escherichia coli (штамм XL-1 Blue) на всхожесть и ^^ развитие проростков разных видов сельскохозяйственных растений

5.2. Сравнение влияния разных видов энтеробактерий на всхожесть и развитие редиса сорта Жара

5.3. Влияние энтеробактерий на растения картофеля in vitro ^д

5.4. Выживаемость суспензионных культур табака при jg^ кокультивировании с Escherichia coli

5.5. Фитотоксичность супернатанта среды культивирования ^^ энтеробактерий разных видов

ГЛАВА 6. ИЗУЧЕНИЕ СКОРОСТИ РАСПРОСТРАНЕНИЯ И НАКОПЛЕНИЯ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ В РАСТЕНИИ

6.1. Колонизация растений in vitro условно-патогенными ^^ энтеробактериями

6.2. Сохранение заражения условно-патогенными бактериями в растениях при их пассировании

6.3. Сохранение энтеробактериями генов, отвечающих за ^^ вирулентность при пассировании их через растение

ГЛАВА 7. ОТВЕТНЫЕ РЕАКЦИИ РАСТЕНИЯ ПРИ

ВЗАИМОДЕЙСТВИИ С ЭНТЕРОБАКТЕРИЯМИ, ПАТОГЕННЫМИ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА

7.1. Определение активных форм кислорода в суспензионной 167 культуре клеток при заражении патогенной для человека

Escherichia coli (штамм XLl-Blue) и фитопатогенной Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus (вирулентный штамм CsR14)

7.2. Определение АФК в корнях растений картофеля {Solanum 171 tuberosum) и редиса (Rhaphanus sativus L.) в ответ на внесение Escherichia coli (XLl-Blue)

7.3. Динамика внеклеточных АФК из корней редиса (Rhaphanus 173 sativus L.) сорта Жара при обработке E.coli XLl-Blue и

Pectobacterium carotovorum В-1247

7.4. Динамика пероксидазной активности в растении редиса 177 (Rhaphanus sativus L.) сорта Жара при инокуляции E.coli (XLl-

Blue)

7.5. Активность пероксидазы в тканях растений картофеля in vitro 181 при инокулировании патогенной для человека Escherichia coli

(штамм XLl-Blue) и фитопатогенной С. michiganensis ssp.

sepedonicus (вирулентный штамм CsR14)

7.6. Развитие СЧ реакции растениями табака (Nicotiana tabacum) in

vitro при инокуляции энтеробактериями разных видов

ГЛАВА 8. ВЫДЕЛЕНИЕ ПАТОГЕННЫХ ДЛЯ ЧЕЛОВЕКА ш БАКТЕРИЙ ИЗ РИЗО-, ФИЛЛО- И ЭНДОСФЕРЫ РАСТИТЕЛЬНЫХ ТКАНЕЙ

ГЛАВА 9. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Полигостальность условно-патогенных энтеробактерий на модели их взаимодействия с растениями»

ВВЕДЕНИЕ

Условно-патогенные энтеробактерии в настоящее время приобретают все большее медицинское значение. Такие представители семейства Enterobacteriaceae как Escherichia coli, Serracia marcescens, Enterobacter, Citrobacter, Proteus вызывают до 50% поражений мочевыводящих путей, 35% госпитальных пневмоний, 57% бактериемий, 4% менингитов (Поздеев O.K., Федоров Р.В., 2007).

В связи с высокой экологической пластичностью и широким распространением этой группы микроорганизмов, большое значение имеет выявление их связей с другими живыми организмами, что в конечном итоге будет способствовать определению новых резервуаров их обитания. Это является необходимым этапом в разработке мероприятий по прерыванию путей передачи от источника инфекции до восприимчивого организма.

В настоящее время появились исследования по проблеме так называемых cross-kingdom инфекций. Этиологические агенты этих инфекций способны поражать различные группы хозяев, вплоть до относящихся к разным царствам жизни (растения и животные), так называемое явление полигостальности (Литвин В. Ю. и др., 1997). Самые изученные представители: Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia, Enterococcus faecalis, Salmonella enterica, E. coli, причем с каждым годом в эту группу попадает все больше видов бактерий и грибов. Появляются данные, свидетельствующие о медицинской значимости фитопатогенов - Agrobacterium tumefaciens, Erwinia sp. и др. Полным ходом идет сравнительное изучение факторов патогенности фитопатогенов и патогенов животных, а также сравнительный анализ иммунного ответа растений и животных. Исследованиями последних лет выявлено значительное сходство в патологическом процессе у тех и других групп живых организмов, что позволило предположить, что основные этапы взаимодействия высших организмов с бактериями развились на ранних стадиях эволюции до разделения на царства жизни.

Установлено, что некоторые виды условно-патогенных бактерий Klebsiella pneumoniae (lniguez A. L. et al., 2004), Enterobacter cloacae, Enterobacter aerogenes (Zinniel D. K. et al., 2002), S. marcescens (Gyaneshwar P. et al., 2001), разные виды Pseudomonas (Rahme L. G. et al., 1997) обитают в растительных тканях как эндофиты. Исследованиями последних лет доказано присутствие в растительных тканях и бактерий, патогенных для человека - Listeria monocytogenes (Gorski L. et al., 2003), Campylobacter jejuni (Brandl M. T. et al., 2004), S. enterica (Franz E. et al., 2007), E. coli (Bernstein N. et al., 2007; Wachtel M. R. et al., 2002). Здесь следует отметить, что локализация в глубине растительных тканей - межклетниках, проводящей системе и др. делает эти микроорганизмы недоступными для действия большинства дезинфектантов.

Все это определяет актуальность проблемы изучения сосуществования бактерий семейства Enterobacteriaceae с растениями, как в теоретическом, общебиологическом аспекте для изучения механизмов полигостальности и транспатогенеза, так и в прикладном медицинском для установления резервуара обитания этих микроорганизмов.

Цель работы обосновать механизмы полигостальности условно-патогенных энтеробактерий на основе изучения биологических свойств этих микроорганизмов и особенностей их взаимодействия с растениями.

ЗАДАЧИ:

1. Определить влияние условий культивирования (среда, температура) на кинетику роста патогенных и условно-патогенных энтеробактерий (Sh. sonnei, Sh. ßexneri, E. cloacae, E. aerogenes, C. freundii, K. pneumoniae, P. mirabilis).

2. Выявить продукцию биологически активных соединений у исследуемых видов энтеробактерий, способствующих их выживанию в тканях и органах растений.

3. Оценить влияние условий культивирования на формирование биопленок исследуемыми видами патогенных и условно-патогенных энтеробактерий.

4. Провести сравнительный анализ воздействия условно-патогенных и патогенных энтеробактерий на рост и развитие растений.

5. Определить скорость контаминации растительных тканей энтеробактериями.

6. Изучить развитие ответных реакций растения на заражение энтеробактериями.

7. Оценить контаминацию энтеробактериями растительных объектов (дикорастущие и культурные растения, в том числе, приобретенные в розничной продаже).

НАУЧНАЯ НОВИЗНА

Впервые показано, что недостаток пищевых субстратов в среде культивирования способствует большей устойчивости патогенных и условно-патогенных энтеробактерий к условиям низких температур. Впервые у энтеробактерий, выделенных от больных людей, выявлены ферменты и биологически активные соединения, способствующие их персистенции в организме растения. Установлена зависимость формирования биопленки от условий культивирования.

Выявлено специфическое взаимодействие между условно-патогенными энтеробактериями и растениями, о чем свидетельствует их различное влияние на рост и развитие растений, зависимое от температуры. Впервые в модельной системе «растение картофеля in vitro - Е. coli», показано, что полная колонизация растительных тканей энтеробактериями происходит на вторые-третьи сутки после инокуляции, при этом растение-хозяин распознает присутствие энтеробактерий в ризо- и эндосфере и отвечает активацией иммунного ответа уже в первые минуты после заражения.

ПРАКТИЧЕСКАЯ И ТЕОРЕТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ

Разработан метод определения контаминации внутренних тканей овощей и фруктов патогенными и условно-патогенными микроорганизмами, что позволяет оценить потенциальную опасность этих продуктов питания для здоровья человека.

Показано, что заражение растений условно-патогенными бактериями, как правило, не вызывает внешних симптомов повреждения растительного организма. Следовательно, контаминированные продукты питания растительного происхождения могут использоваться в качестве источников питания и способствовать последующему инфицированию человека.

Выявлено, что УПЭ, возбудители ОКИ человека, при попадании во внешнюю среду могут использовать растительные ткани как резервуар обитания, способствующий их сохранению вне организма человека.

ВНЕДРЕНИЯ

Материалы исследований использованы для подготовки методических рекомендаций для студентов ИГУ «Микробиологический мониторинг окружающей среды», утверждена научно-методическим советом ИГУ (2000 г.), врачей «Определение ферментативной активности условно-патогенных бактерий», утверждена Методическим советом ГБОУ ДПО ИГМАПО (2013 г.). Полученные результаты используются при проведении лекционных занятий на кафедре микробиологии ИГМУ, кафедре эпидемиологии и микробиологии ИГМАПО, кафедре микробиологии биолого-почвенного факультета ИГУ.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Недостаток питательных элементов способствует развитию устойчивости условно-патогенных и патогенных энтеробактерий человека к широкому диапазону температур (от 4 до 37 °С), что, в конечном итоге, обусловливает их выживаемость во внешней среде.

2. Условно-патогенные энтеробактерии, выделенные от больных ОКИ, обладают набором специфических экзоферментов и биологически активных соединений, способствующих, при попадании во внешнюю среду, созданию активных взаимоотношений с растительным организмом.

3. В ответ на колонизацию энтеробактериями, условно-патогенными для человека, растение-хозяин отвечает активацией паттерн-индуцированного иммунитета (РТ1) уже в первые минуты после инфицирования. Отсутствие специфических факторов патогенности, аналогичных таковым для фитопатогенов, приводит к тому, что контаминированное растение, как правило, не проявляет симптомов поражения и не способно быстро элиминировать из тканей эти микроорганизмы.

4. Условно-патогенные энтеробактерии при попадании во внешнюю среду персистируют в растительных тканях, что позволяет считать растения одним из резервуаров, способствующих сохранению этих микроорганизмов во внешней среде.

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Результаты исследований были представлены: на Всероссийской научной конференции, "Стрессовые белки растений", Иркутск, 2004; Межрегиональной научно-практической конференции «Биология микроорганизмов и их научно-практическое использование», Иркутск, 2004; Региональной научно-практической конференции «Пищевые технологии, качество и безопасность продуктов питания», Иркутск, 2006; семинаре врачей-эпидемиологов «Эпидемиология кишечных инфекций», Иркутск, 2006; Научно-практической конференции, посвященной 50-летию Иркутского НИИСХ «Роль сельскохозяйственной науки в развитии АПК Приангарья», Иркутск, 2007; Всероссийской научной конференции «Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды», Иркутск, СИФИБР, 2007; Всероссийской молодежной научно-практической конференции «Пищевые технологии, качество и безопасность

продуктов питания», Иркутск, ИрГТУ, 2007; Международной научно-практической конференции «Актуальные проблемы Права, Экономики и Управления», СИПЭУ, Иркутск, 2008; 2-м межрегиональном семинаре «Организация санитарно-эпидемиологического мониторинга за острыми кишечными инфекциями», Иркутск, 2008; II Всероссийской научно-практической конференции «Развитие физико-химической биологии и биотехнологии на современном этапе», Иркутск, 2008; Всероссийской научной конференции «Устойчивость растений к неблагоприятным факторам внешней среды», Иркутск, 2009; V Всероссийской конференции молодых ученых «Стратегия взаимодействия микроорганизмов и растений с окружающей средой», Саратов, 2010; Международной научной конференции «Проблемы экологии: чтения памяти М. М. Кожова», Иркутск, 2010; VII Съезде Общества физиологов растений России «Физиология растений - фундаментальная основа экологии и инновационных биотехнологий», Нижний Новгород, 2011; II Международной научно-практической конференции «Особенности формирования здорового образа жизни: факторы и условия», Улан-Удэ, 2012; научной конференции с международным участием «Фундаментальные и прикладные аспекты инфекционной патологии», посвященной 100-летнему юбилею ИЭМ ФГБУ «НЦ ПЗСРЧ» СО РАМН, Иркутск, 2012.

ЛИЧНЫЙ ВКЛАД АВТОРА

Автору принадлежит ведущая роль в выборе направления исследования, подборе методов исследования и анализе полученных результатов. Все результаты, представленные в работе, получены при личном участии автора.

ПУБЛИКАЦИИ

По теме диссертации опубликовано 52 работы, из них 16 в журналах, рекомендованных ВАК для публикации материалов докторских диссертаций и 2 -монографии.

СТРУКТУРА И ОБЪЕМ РАБОТЫ

Диссертационная работа изложена на 291 странице машинописного текста, состоит из введения, обзора литературы, методической части, результатов исследования и их обсуждения, заключения, выводов и списка цитируемой литературы. Работа включает 21 таблицу и 74 рисунка. Список литературы состоит из 377 источников, в том числе 304 зарубежных.

13

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Маркова, Юлия Александровна

ВЫВОДЫ

1. Условия, лимитированные по пищевым субстратам способствуют лучшей адаптации энтеробактерий к неблагоприятным температурам, что обусловливает выживание этой группы микроорганизмов во внешней среде.

2. Процесс образования биопленок разными видами условно-патогенных и патогенных энтеробактерий в голодной среде, зависит от температурных условий в большей степени, чем в полной среде.

3. Условно-патогенные энтеробактерии, возбудители острых кишечных инфекций человека, синтезируют экзоферменты (целлюлазы, пектиназы, амилазы, Мп-пероксидазы и др.) и биологически активные вещества (индолилуксусная кислота), способствующие их персистенции в организме растений.

4. Условно-патогенные и патогенные энтеробактерии оказывают разнонаправленное влияние на рост и развитие растений, свидетельствуя о видоспецифических реакциях, возникающих в результате этого взаимодействия. В отличие от патологического действия фитопатогена, реакция растений на контакт с условно-патогенными и патогенными энтеробактериями зависит от температурных условий.

5. Контакт корневой системы с условно-патогенными энтеробактериями приводит к проникновению микроорганизмов в растительные ткани и полной колонизации растения в течение двух-трех суток.

6. Растения реагируют на присутствие энтеробактерий, патогенных для человека уже в первые минуты взаимодействия, что вызывает стремительное увеличение уровня АФК - «окислительный взрыв».

7. Условно-патогенные энтеробактерии, этиологические агенты ОКИ человека, при попадании во внешнюю среду обладают набором биологических свойств, позволяющих проникать и персистировать в организме растений, что свидетельствует о полигостальности этой группы микроорганизмов. Контаминированные растения при употреблении в пищу в необработанном виде, являются фактором риска, способствуя возникновению острых кишечных инфекций человека.

АГЛ

АФК

АЦК

ИСУ

ИУК

КАА

КОЕ

КС

ЛПС

МАМР

МП А

НАДО

ОКИ

СПУ

СЧ

ТА

УПМ

УПЭ эпс

ВАК1 В1К1 сья

СМ8 БСБ ЕзрР

Список литературы диссертационного исследования доктор биологических наук Маркова, Юлия Александровна, 2013 год

СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анганова Е. В. Анализ заболеваемости острыми кишечными инфекциями населения Иркутской области / Е. В. Анганова, А. В. Духанина, Е. Л. Кичигина // Сибирский медицинский журнал. - 2011. - № 6. - С. 230 - 232.

2. Анганова Е. В. Биологические свойства условно-патогенных бактерий водных экосистем / Е. В. Анганова // Гигиена и санитария. - 2010. - № 5. -С. 67-68.

3. Баснакьян И. А. Общие стрессорные белки у бактерий / И. А. Баснакьян // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2002. - № 5. - С. 92-97.

4. Беляков В. Д. Саморегуляция паразитарных систем и механизм развития эпидемического процесса / В. Д. Беляков // Вестн. АМН СССР. - 1983. - №

5.-С. 57-65.

5. Бондаренко В. М. Роль условно-патогенных бактерий при хронических воспалительных процессах различной локализации / Бондаренко В. М. -Тверь: Триада, 2011. - 88 с.

6. Бояркин А. Н. Быстрый метод определения активности пероксидазы / А. Н. Бояркин // Биохимия. - 1951. - Т.16, вып. 4. - С. 352 - 355.

7. Брико Н. И. Глобализация и эпидемический процесс / Н. И. Брико, В. И. Покровский // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. - № 4. - С. 4-10.

8. Бутенко Р. Г. Культура изолированных тканей и физиология морфогенеза растений / Р. Г. Бутенко. - М.: Наука, 1964. - 212 с.

9. Бухарин О. В. Ассоциативный симбиоз / О. В. Бухарин, Е. С. Лобакова, Н. В. Немцева и др. - Екатеринбург: УрО РАН, 2007. - 264 с.

10. Бухарин О. В. Патогенные бактерии в природных экосистемах / О. В. Бухарин, В. Ю. Литвин. - Екатеринбург, 1997. - 277 с.

11. Варвашевич Т. Н. Механизмы низкотемпературной регуляции метаболизма у бактерий. / Т. Н. Варвашевич, Л. С. Никифорова, А. Ф. Траценко, Т. Ф. Богомазова // Психрофильность патогенных микроорганизмов. - Новосибирск, 1986. - С. 7 - 14.

12. Возняковская Ю. М. Микрофлора растений и урожай / Ю. М. Возняковская. - Л.: Колос, 1969. - 238 с.

13. Волкогон В. В. Ассоциативные азотфиксирующие микроорганизмы / В. В. Волкогон // Микробиологический журнал. - 2000. - Т. 62, № 2. - С. 51 -68.

14. Гинцбург А. Л. «Quorum sensing» или социальное поведение бактерий / А. Л. Гинцбург, Т. С. Ильина, Ю. М. Романова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2003. - №5. - С. 86 - 93.

15. Гланц С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. - Пер. с англ. — М, Практика, 1998. — 459 с.

16. Горшкова Т. А. Растительная клетка как динамическая система / Т. А. Горшкова. - М.: Наука, 2007. - 429 с.

17. Денисов К.А. Механизмы передачи возбудителей и естественнонаучная классификация инфекционных болезней / К. А. Денисов, А. Д.

Усенко, Л. И. Слюсарь и др. // Вестник гигиены и эпидемиологии. - 2000. - Т. 4, № 2. - С. 219 - 223.

18. Дмитриев А. П. Сигнальные молекулы растений / А. П. Дмитриев // Физиология растений. - 2003. - Т.50, № 3. - С. 465 - 474.

19. Дьяков Ю.Т. На пути к общей теории иммунитета / Ю. Т. Дьяков // Журнал общей биологии. - 2005. - Т. 66, № 6. - С. 451 - 458.

20. Ермилова Е. В. Молекулярные аспекты адаптации прокариот / Е. В. Ермилова. - СПб.: Изд-во С.-Петерб. ун-та, 2007. - 299 с.

21. Желдакова Р. А. Фитопатогенные микроорганизмы: Учеб. - метод, комплекс для студентов биол. фак. спец .в - 31 01 01 «Биология» / Р. А. Желдакова, В. Е. Мямин. - Мн.: БГУ, 2006. - 116 с.

22. Зиновьева С. В. Роль изопреноидных соединений в адаптации растений к биогенному стрессу, вызванному паразитическоми нематодами (обзор) / С. В. Зиновьева, Ж. В. Удалова, Васильева И. В. и др. // Прикладная биохимия и микробиология. - 2001. - Т. 37, № 5. - С. 533 - 541.

23. Кацы Е. И. Молекулярная генетика ассоциативного взаимодействия бактерий и растений: состояние и перспективы исследований / Е. И. Кацы. -М.: Наука, 2007. - 86 с.

24. Кокряков В. Н. Очерки о врожденном иммунитете / В. Н. Кокряков. -СПб.: Наука, 2006.-261 с

25. Колупаев Ю. Е. Ферментативные источники активных форм кислорода в растительных клетках: регуляция активности и участие в стрессовых реакциях / Ю. Е. Колупаев, Ю. В. Карпец, Т. О. Ястреб // Вестник Харьковского аграрного университета, сер. биология. - 2012. - вып. 1 (25). -С. 6-22.

26. Коровякова Е. Р. Применение ударных доз бифидумбактерина для лечения больных острыми кишечными инфекциями / Е. Р. Коровякова // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - № 6. -С. 58-61.

27. Кочемасова 3. Н. Санитарная микробиология и вирусология / 3. Н. Кочемасова, С. А. Ефремова, А. М. Рыбакова. - М.: Медицина, 1987. - 352 с.

28. Кравченко JI. В. Роль триптофана в корневых экзометаболитах для фитостимулирующей активности ризобактерий / JI. В. Кравченко, Т. С. Азарова, Н. М. Макарова, И. А. Тихонович // Микробиология. - 2004. - том 73, № 2. - С. 195 - 198.

29. Краснощеков Г. П. Экологическая концепция паразитизма / Г. П. Краснощекое // Журнал общей биологии. - 1995. - Т. 59, № 1. - С. 18-32.

30. Купряшина М. А. Активность Mn-пероксидазы Azospirillum brasilense в зависимости от фенольных соединений в среде культивирования / М. А. Купряшина, Н. Ю. Селиванов, В. Е. Никитина // Тезисы конференции «Актуальные аспекты современной микробиологии». - М.: Изд-во МАКС Пресс, 2010.-С. 36- 38.

31. Лебедев К. А. Иммунология образраспознающих рецепторов (интегральная иммунология) / К. А. Лебедев, И. Д. Понякина - М.: Книжный дом "Либроком", 2009. -256 с.

32. Литвин В. Ю. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий / В. Ю. Литвин, А. Л. Гинцбург, В. И. Пушкарёва и др. - изд-во «ФармарусПринт», 1998.-256 с.

33. Ломов Ю. М. Выявление липазы у Vibrio cholerae OI серогруппы в реакции объемной агломерации / Ю. М. Ломов, В. В. Агафонова, Н. Р.

Телесманич и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2007. - № 1. - С.74-77.

34. Мавзютов А. Р. «Острова» патогенности условно-патогенных энтеробактерий / А. Р. Мавзютов, С. В. Фиалкина, В. М. Бондаренко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2002. - № 6. -С. 5 - 9.

35. Максимов И. В. Про-/антиоксидантная система и устойчивость растений к патогенам / И. В. Максимов, Е. А. Черепанова // Успехи совр. биологии. - 2006. - Т. 126, № 3. - С. 250-261.

36. Медведев С. С. Кальциевая сигнальная система растений / С. С. Медведев // Физиология растений. - 2005. - Т. 52, № 1. - С. 1 - 24.

37. Мелентьев А. И. Аэробные и спорообразующие бактерии Bacillus Cohn в агроэкосистемах / А. И. Мелентьев. - Ин-т биологии УфимНЦ РАН. - М.: Наука, 2007. - 147 с.

38. Методы определения фитогормонов и фенолов в семенах / Под ред. М. Г. Николаевой. - Л.: Наука, 1979. - 78 с.

39. Мосолов В. В. Участие протеолитических ферментов и их ингибиторов в защите растений / В. В. Мосолов, Л. И. Григорьева, Т. А. Валуева // Журнал прикладной биохимии и микробиологии. - 2001.-Т.37, № 2. - С. 131 - 140.

40. Недачин А. Е. Проблемы эпидемической безопасности питьевого водопользования населения России / А. Е. Недачин, Т. 3. Артемова, Р. А. Дмитриева и др. // Гигиена и Санитария. - 2005. - № 6. - Р. 14-19.

41. Николаев Ю. А. Биопленка - «город микробов» или аналог многоклеточного организма? / Ю. А. Николаев, В. К. Плакунов // Микробиология. - 2007. - Т. 76, № 2. - С. 149 - 163.

42. Одум Ю. Экология Т. 1. / Ю. Одум. -М.:Мир, 1986.-328 с.

43. Олюнина JI. И. Участие индолил-3-уксусной кислоты в реакции про- и эукариот на тепловой шок / Л. И. Олюнина, А. Г. Орлова, Ю. А. Мацкова, В. П. Французова // Сигнальные системы клеток растений: Роль в адаптации и иммунтитете. Тезисы докладов. Казань, 27 - 30 июня 2006. - С. 90-92.

44. Омеличкина Ю. В. Ответные реакции растений и культуры клеток табака на заражение Clavibacter michiganensis ssp. sepedonicus / Ю. В. Омеличкина, Т. Н. Шафикова, А. Л. Алексеенко и др. // В мире научных открытий. - 2010. - № 1 (07), часть 4. - С. 87 - 92.

45. Поздеев О. К. Энтеробактерии: руководство для врачей / О. К. Поздеев, Р. В. Федоров. - М.: ГЭОТАР-Медиа, 2007. - 720 с.

46. Покровский В. И. Инфекционные болезни и эпидемиология / В. И. Покровский, С. Г. Пак, Н. И. Брико и др. - М. «ГЭОТАР-Медиа», 2007. -816 с.

47. Полесская О. Г. Растительная клетка и активные формы кислорода / О. Г. Полесская. - М.: КДУ, 2007. - 140 с.

48. Практикум по микробиологии: учеб. пособие для студ. ВУЗов / под ред. А. И. Нетрусова. - М.: Издательский центр «Академия», 2005. - 602 с.

49. Проворов Н. А. Коэволюция партнеров и целостность симбиотических систем / Н. А. Проворов, Н. И. Воробьев // Журнал общей биологии. - 2012. - № 1.-С. 21-36.

50. Проворов Н. А. Макро- и микроэволюция бактерий в системах симбиоз / Н. А. Проворов, Н. И. Воробьев, Е. Е. Андронов // Генетика. - 2008. - Т. 44, № 1.-С. 12-28.

51. Прозоров А. А. Системы «токсин-антитоксин» у бактерий: инструмент апоптоза или модуляторы метаболизма? / А. А. Прозоров, В. Н. Даниленко // Микробиология. - 2010. - Т. 79, № 2. - С. 147 - 159.

52. Рабинович M.JI. Структура и механизм действия целлюлолитических ферментов / М. JI. Рабинович, М. С. Мельник, М. С. Болобова // Биохимия. 2002. - Т. 67, № 8. - С. 1026-1050.

53. Ройтман В. А. Паразитизм как форма симбиотических отношений / В. А. Ройтман, С. А. Беэр. - М.: Товарищество научных изданий КМК, 2008. -310 с.

54. Рокицкий П. Ф. Биологическая статистика / П. Ф. Рокицкий. - Минск, «Вышэйш. Школа», 1973. - 320 с.

55. Романова JI. И. Метаболическая реакция сеянцев лиственницы сибирской на затопление корней / JI. И. Романова // Лесоведение. - 2004. -№ 1. - С. 31-37.

56. Романова Ю. М. Способность к формированию биопленок в искусственных системах у различных штаммов Salmonella Typhimurium / Ю. М. Романова, Н. В. Алексеева, Т. А. Смирнова и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2006. - №4. - С. 38 -42.

57. Савилов Е. Д. Условно-патогенные микроорганизмы в водных экосистемах Восточной Сибири и их роль в оценке качества вод / Е. Д. Савилов, Л. М. Мамонтова, Е. В. Анганова, В. А. Астафьев // Бюллетень СО РАМН. - 2008. - № 1.-Р. 47-51.

58. Савилов Е. Д. Эволюция эпидемического процесса в современных условиях / Е. Д. Савилов // Вестник Российской Академии Медицинских Наук. - 2011. - № 3. - С. 14-48.

59. Савилов Е. Д. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала / Е. Д. Савилов, В. А. Астафьев, С. Н. Жданова, Е. А. Заруднев. - Новосибирск: Наука-Центр, 2011.-156 с.

60. Сергиев В. П. Инфекционные болезни на рубеже веков: осознание биологической угрозы. / В. П. Сергиев, Н. Н. Филатов. - М.: Наука, 2006. -572 с.

61. Синицын А. П. Методы изучения и свойства целлюлолитических ферментов / А. П. Синицын, А. П. Гусаков, В. М. Черноглазов / Итоги науки и техники. М. Сер. биотехн. - 1990. - Т. 25. - 150 с

62. Сомов Г. П. Современные представления о сапронозах и сапрозоонозах / Г. П. Сомов // Ветеринарная патология. - 2004. - № 3. - С. 31-35.

63. Тарчевский И.А. Сигнальные системы клеток растений / И. А. Тарчевский. - М.: Наука, 2002. - 294 с.

64. Тец В. В. Пангеном / В. В. Тец // Цитология. - 2003. - Т. 45, № 5. - С. 526-531.

65. Усвяцов Б. Я. Взаимодействие бактерий и эритроцитов / Б. Я. Усвяцов, Е. А. Ханина, О. В. Бухарин // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2005. - № 4. - С.89-95.

66. Цавкелова Е. А. Микроорганизмы - продуценты стимуляторов роста растений и их практическое применение (обзор) / Е. А. Цавкелова, С. Ю. Климова, Т. А. Чердынцева и др. // Прикладная биохимия и микробиология. - 2006. - Т. 42, № 2. - С. 133 - 143.

67. Черкасский Б. Л. Инфекционные и паразитарные болезни человека / Б. Л. Черкасский. - М, 1994. - 477 с.

68. Чумаков М.И. Новый ассоциативный диазотроф Agrobacterium radiobacter из гистосферы пшеницы / М. И. Чумаков, В. В. Горбань, JI. Е. Ковлер и др. // Микробиология. - 1992. - Т. 61, № 1. - С. 92 -102.

69. Шагинян И. А. Формирование биопленок клиническими штаммами бактерий комплекса Burkholderia cepacia в зависимости от их фенотипических и генотипических характеристик / И. А. Шагинян, Г. А. Данилина, М. Ю. Чернуха и др. // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2007. - №1. - С. 3 - 9.

70. Шевченко Ю. JI. Микроорганизмы и человек, некоторые особенности их взаимососуществования на современном этапе / Ю. JI. Шевченко, Г. Г. Онищенко // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. -2001.-№2.-С. 94- 104.

71. Шурыгина И. А. Псевдотуберкулез / И. А. Шурыгина, М. В. Чеснокова, В. Т. Климов. - Новосибирск: Наука, 2003. - 320 с.

72. Яковлев С. В. Краткий справочник по антимикробной химиотерапии / С. В. Яковлев, В. П. Яковлев. - М.: Центр по биотехнологии, медицине и фармации, 2002. - 127 с.

73. Abbott D. W. Structural Biology of Pectin Degradation by Enterobacteriaceae / D. W. Abbott, A. B. Boraston // Microbiology And Molecular Biology Reviews. - 2008. - V. 72, № 2. - P. 301-316.

74. Abd H. Pseudomonas aeruginosa Utilises Its Type III Secretion System to Kill the Free-Living Amoeba Acanthamoeba castellanii / H. Abd, B. Wretlind, A. Saeed et al. // Journal of Eukaryotic Microbiology. - 2008. - V. 55, № 3. - P. 235-243.

75. Achouak W. Phenotypic Variation of Pseudomonas brassicacearum as a Plant Root-Colonization Strategy / W. Achouak, S. Conrod, V. Cohen, T. Heulin // MPMI. - 2004. - V.17, № 8. -P. 872-879.

76. Ahmad F. Screening of free-living rhizospheric bacteria for their multiple plant growth promoting activities / F. Ahmad, I. Ahmad, M.S. Khan // Microbiological Research. - 2008. - V. 163. - P. 173—181.

77. Alvarez M. E. Epigenetic control of plant immunity / M. E. Alvarez, F. Nota, D. A. Cambiagno // Mol. Plant Pathol. - 2010. - № 11. - P. 563-576.

78. An C. Salicylic Acid and its Function in Plant Immunity / C. An, Z. Mou // Journal of Integrative Plant Biology. - 2011. - V. 53, № 6. - P. 412-428.

79. Andreote F. D. Effect of bacterial inoculation, plant genotype and developmental stage on root-associated and endophytic bacterial communities in potato {Solanum tuberosum) / F. D. Andreote, U. N. da Rocha, W. L. Araujo et al. // Antonie van Leeuwenhoek. - 2010. - V. 97. - P. 389 - 399.

80. Arpigny J. L. Bacterial lipolytic enzymes: classification and properties / J. L. Arpigny, K.-E. Jaeger // Biochem. J. - 1999. - V. 343. - P. 177-183.

81. Arthurson V. Persistence and spread of Salmonella enterica serovar Weltevreden in soil and on spinach plants / V. Arthurson, A. Sessitsch, L. Jäderlund // FEMS Microbiology Letters. - 2011. - V. 314, № 1. - P. 67-74.

82. Alsam S. Escherichia coli interactions with Acanthamoeba: a symbiosis with environmental and clinical implications / S. Alsam, S. R. Jeong, J. Sissons et al. // J. Med. Microbiol. - 2006. - V. 55 № 6. - P. 689 - 694.

83. Andreote F. D. Endophytic population of Pantoea agglomerans in citrus plants and development of a cloning vector for endophytes / F. D. Andreote, P. B. Rossetto, L. C. Souza et al. // J. Basic Microbiol. - 2008. - V 48. - P. 338-346.

84. Arthurson V. Persistence and spread of Salmonella enterica serovar Weltevreden in soil and on spinach plants / V. Arthurson, A. Sessitsch, L. Jaderlund // FEMS Microbiology Letters. - 2011. - V. 314, № 1. - P. 67-74.

85. Aruscavage D. Interactions affecting the proliferation and control of human pathogens on edible plants / D. Aruscavage, K. Lee, S. Miller, J. T. LeJeune // Journal of Food Science. - 2006. - V 71. - P. 89-99.

86. Asplund K. The growth of salmonellae in tomatoes / K. Asplund, E. Nurmi // Int. J. Food Microbiol. - 1991. - V. 13. - P. 177-182.

87. Assmus B. In Situ Localization of Azospirillum brasilense in the Rhizosphere of Wheat with Fluorescently Labeled, rRNA-Targeted Oligonucleotide Probes and Scanning Confocal Laser Microscopy / B. Assmus, P. Hutzler, G. Kirchhof et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1995. - V. 61, № 3. -P. 1013 - 1019.

88. Austin M. J. Regulatory Role ofSGTl in Early R Gene-Mediated Plant Defenses / M. J. Austin, P. Muskett, K. Kahn et al. // Science. - 2002. - V. 295, №5562.-P. 2077-2080.

89. Ausubel F. M. Are innate immune signaling pathways in plants and animals conserved? / F. M. Ausubel // Nat. Immunol. - 2005. - V.6. - P. 973979.

90. Azevedo C. The RAR1 interactor SGTl,an essential component of R gene-triggered disease resistance / C. Azevedo, A. Sadanandom, K. Kitagawa et al. // Science. - 2002. - V. 295. - P. 2073-2076.

91. Baarlen P. Molecular mechanisms of pathogenity: how do pathogenic microorganisms develop cross-kingdom host jumps? / P. Baarlen, A. Belkum, R. Summerbell et al. // FEMS Microbiology Reviews. - 2007. - V. 31, № 3. - P. 239-277.

92. Babic I. Changes in microbial populations on fresh cut spinach / I. Babic, S. Roy, A. E.Watada, W. P. Wergin // Int. J. Food Microbiol. - 1996. -V.31.-P. 107-119.

93. Bacteria Associated with Foodborne Diseases Scientific Status Summary. Institute Of Food Technologists AUGUST. - 2004.

94. Bais H. P. Biocontrol of Bacillus subtilis against infection of Arabidopsis roots by Pseudomonas syringae is facilitated by biofilm formation and surfactin production / H. P. Bais, R. Fall, J. M. Vivanco // Plant Physiol. - 2004. - V 134, № 1. - P. 307-319.

95. Bandara W. M. Interactions Among Endophytic Bacteria And Fungi: Effects And Potentials / W. M. Bandara, G. Seneviratne, S. A. Kulasooriya // J. Biosci. -2006. - V. 31, № 5. - P. 645 - 650.

96. Barak J.D. Differences in attachment of Salmonella enterica serovars and Escherichia coli 0157:H7 to alfalfa sprouts / J. D. Barak, L. C. Whitehand, A. O. Charkowski // Applied and environmental microbiology. - 2002. - V. 68, № 10. -P. 758-763.

97. Barak J. D. Salmonella enterica virulence genes are required for bacterial attachment to plant tissue / J. D. Barak, L. Gorski, P. Naraghi-Arani, A. O. Charkowski // Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - V. 71. - P. 5685-5691.

98. Barak J. D. The Role of Cellulose and O-Antigen Capsule in the Colonization of Plants by Salmonella enteric / J. D. Barak, C. E. Jahn, D. L. Gibson, A. O. Charkowski // MPMI. - 2007. - V. 20, № 9. - P. 1083 - 1091.

99. Bavaro M. F. E. coli 0157.H7 and Other Toxigenic Strains: The Curse of Global Food Distribution / M. F. Bavaro // Curr Gastroenterol Rep. - 2012. - V. 14, №4.-P. 317 - 323.

100. Beattie G. A. E. Bacterial colonization of leaves: a spectrum of strategies / G. A. Beattie, S. E. Lindow // Phytopathology. - 1999. - V. 89. - P. 353-359.

101. Beckers G. J. M. Mitogen-activated protein kinases 3 and 6 are required for full priming of stress responses in Arabidopsis thaliana / G. J. M. Beckers, M. Jaskiewicza, Y. Liu et al. // Plant Cell. - 2009. - V. 21. - P. 944-953.

102. Beneden C. A. Multinational outbreak of Salmonella enterica serotype Newport infections due to contaminated alfalfa sprouts / C. A. Beneden, W. E. Keene, R. A. Strang // Journal of the American Medical Association. - 1999. -V.281, № 2. - P.158-162.

103. Bent A. F. Elisitors, Effectors and R Genes: The New Paradigm and a Lifetime Supply of Questions / A. F. Bent, D. Mackey // Annu. Rev. Phytopathol. - 2007. - V. 45.-P. 399-436.

104. Berendsen R. L. The rhizosphere microbiome and plant health / R. L. Berendsen, C. M. J. Pieterse, P. A. H. M. Bakker // Trends in Plant Science. -2012. - V. 17, № 8. - P. 478 - 486.

105. Berg G. The rhizosphere as a reservoir for opportunistic human pathogenic bacteria / G. Berg, L. Eberl, A. Hartmann // Environ Microbiol. -2005. - V.7, № 11. -P.1673-1685.

106. Berger C. N. Salmonella enterica strains belonging to O serogroup 1,3,19 induce chlorosis and wilting of Arabidopsis thaliana leaves / C. N. Berger, D. J. Brown, R. K. Shaw // Environmental Microbiology. - 2011. - V. 13, № 5. -P. 1299-1308.

107. Berk S. G. Packaging of Live Legionella pneumophila into Pellets Expelled by Tetrahymena spp. Does Not Require Bacterial Replication and Depends on a Dot/Icm-Mediated Survival Mechanism / S. G. Berk, G. Faulkner,

E. Garduño et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2008. - V. 74, № 7. - P. 2187-2199.

108. Bernstein N. Evidence for internalization of Escherichia coli into the aerial parts of maize via the root system / N. Bernstein, S. Sela, R. Pinto, M. Ioffe // J. Food Prot. - 2007. - V. 70. - P. 471-475.

109. Bhat K. A. Studies on the Effect of Temperature on the Development of Soft Rot of Cabbage (Brassica oleracea var. Capitata) Caused by Erwinia carotovora sub Sp. Carotovora / K. A.Bhat, S. D. Masoodi, N. A. Bhat et al. // Journal of Phytology. - 2010. - V 2, № 2. - P. 64 - 67.

110. Bianco C. Indole-3-acetic acid regulates the central metabolic pathways in Escherichia coli / C. Bianco, E. Imperlini, R. Calogero et al. // Microbiology. -2006.-V 152, №8.-P. 2421-2431.

111. Bieri S. RAR1 positively controls steady-state levels of barley MLA resistance proteins and enables sufficient MLA6 accumulation for effective resistance / S. Bieri, S. Mauch, Q. H. Shen et al. // The Plant Cell. - 2004. -V.16.-P. 3480-3495.

112.Bindschedler L.V. Early signaling events in the apoplastic oxidative burst in

___ -1-0

suspension cultured French bean cells involve cAMP and Ca / L. V. Bindschedler, F. Minibaeva, S. L. Gardner // New Phytologist. - 2001. - V. 151. -P.185-194.

113. Boceara M. Flavohaemoglobin HmpX from Erwinia chrysanthemi confers nitrosative stress tolerance and affects the plant hypersensitive reaction by intercepting nitric oxide produced by the host / M. Boceara, C. E. Mills, J. Zeier et al. // The Plant Journal. - 2005. - V.43. - P. 226-237.

114. Boiler T. Renaissance of Elicitors: Perception of Microbe-Associated Molecular Patterns and Danger Signals by Pattern-Recognition Receptors / T.

Boiler, G. A. Felix // Annual Review of Plant Biology. - 2009. - V. 60. - P. 379-406.

115. Bordiec S. Comparative analysis of defence responses induced by the endophytic plant growth-promoting rhizobacterium Burkholderia phytofirmans strain PsJN and the non-host bacterium Pseudomonas syringae pv. pisi in grapevine cell suspension / S. Bordiec, S. Paquis, H. Lacroix et al. // Journal of Experimental Botany. - 2011. - V. 62, № 2. - P. 595-603.

116. Brandl M. T. Fitness of Salmonella enterica serovar Thompson in the cilantro phyllosphere / M. T. Brandl, R. E. Mandrell // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V.68, № 7. - P.3614-3621.

117. Brandl M. T. Comparison of Survival of Campylobacter jejuni in the Phyllosphere with That in the Rhizosphere of Spinach and Radish Plants / M. T. Brandl, A. F. Haxo, A. H. Bates, R. E. Mandrell // Appl. Environ. Microbiol. -2004. - V.70, №2. - P. 1182-1189.

118. Brandl M. T. Fitness of human enteric pathogens on plants and implications for food safety / M. T. Brandl // Annual Rev. Phytopathol. - 2006. -V.16, №3 - P.67-92.

119. Buchholz U. German Outbreak of Escherichia coli 0104:H4 Associated with Sprouts / U. Buchholz, H. Bernard, D. Werber et al. // N. Engl. J. Med. -2011. - V. 365, № 10. - P. 1763 - 1770.

120. Burnett S. L. Attachment of Escherichia coli 0157:H7 to the surfaces and internal structures of apples as detected by confocal scanning laser microscopy / S. L. Burnett, J. Chen, L. R. Beuchat // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - V.66, №11.-P. 679-687.

121. Buttner D. Who comes first? How plant pathogenic bacteria orchestrate type III secretion / D. Buttner, U. Bonas // Curr. Opin. Microbiol. -2006.-V. 9.-P. 193-200.

122. Buxton J. Outbreak of Salmonella serotype Muenchen infection in the United States and Canada associated with unpasteurized orange juice—the British Columbia experience / J. Buxton, M. Fyfe, A. King et al. // Can. Commun. Dis. Rep. - 1999. - V.25, №19. -P.161-164.

123. Castro-Rosas J. Presence of faecal coliforms, Escherichia coli and diarrheagenic E. coli pathotypes in ready-to / J. Castro-Rosas, J. F. Cerna-Cortés, E. Méndez-Reyes et al. // Int J Food Microbiol. - 2012. - V. 156, № 2. - P. 176180.

124. Cankar K. Bacterial endophytes from seeds of Norway spruce (Picea abies L. Karst) / K. Cankar, H. Kraigher, M. Ravnikar, M. Rupnik // FEMS Microbiol Lett. - 2005. - V. 244. - P. 341-345.

125. Celloto V.R. Biosynthesis of Indole-3-Acetic Acid by New Klebsiella oxytoca Free and Immobilized Cells on Inorganic Matrices / V.R. Celloto, A. J. B. Oliveira, J. E. Goncalves // The Scientific World Journal. - 2012. - Article IB 495970.- 7 pages

126.Chalupowicz L. Sequential expression of bacterial virulence and plant defense genes during infection of tomato with Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis / L. Chalupowicz, M. Cohen-Kandli, O. Dror et al. // Phytopathology. - 2010. - V.100. -P.252-261.

127.Chelius, M.K. Immunolocalization of dinitrogenase reductase produced by Klebsiella pneumoniae in association with Zea mays L. / M. K. Chelius, E. W. Triplett // Appl. Environ. Microbiol. - 2000. - V. 66. - P.783-787.

128. Cleary P. A foodborne outbreak of Salmonella Bareilly in the United Kingdom, 2010 / P. Cleary, L. Browning, J. Coia et al. // Eur. Surveill. -2010.-V. 15, №48. -P. 8-11.

129. Cody S. H. An outbreak of Escherichia coli 0157:H7 infection from unpasteurized commercial apple juice / S. H. Cody, M. K. Glynn, J. A. Farrar et al. // Ann. Intern. Med. - 1999. - V.130, № 3. - P.202-209.

130. Cook K.A. Outbreak of Salmonella serotype Hartford infections associated with unpasteurized orange juice / K. A. Cook, T. E. Dobbs, W. G. Hlady et al. // JAMA. - 1998. - V.280, № 17. - P. 1504-1509.

131. Cooley M. B. Colonization of Arabidopsis thaliana with Salmonella enterica and enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 and competition by Enterobacter asburiae / M. B. Cooley, W. G. Miller, R. E. Mandrell // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - V.69, № 8. - P.4915-4926.

132. Compant S. Endophytes of Grapevine Flowers, Berries, and Seeds: Identification of Cultivable Bacteria, Comparison with Other Plant Parts, and Visualization of Niches of Colonization / S. Compant, B. Mitter, J. G. Colli-Mull et al. // Microb Ecol. - 2011. - V. 62. - P. 188-197.

133. Conn V. M. Effect of Microbial Inoculants on the Indigenous Actinobacterial Endophyte Population in the Roots of Wheat as Determined by Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism / V. M. Conn, C. M. Franco // Applied And Environmental Microbiology. - 2004. - V. 70, № 11.- P. 6407-6413.

134. Conn V. M. Endophytic Actinobacteria Induce Defense Pathways in Arabidopsis thaliana / V. M. Conn, A. R. Walker, C. M. Franco // MPMI. -2008. - V. 21, № 2. - P. 208-218.

135. Corby R. Outbreaks of Salmonella infections associated with eating Roma tomatoes - United States and Canada / R. Corby, V. Lanni, B. County et al. // Morb. Mortal. Wkly. Rep. - 2005. - V. 54, № 13. - p. 325 - 328.

136. Da Cunha L. Innate immunity in plants: a continuum of layered defenses / L. Da Cunha, A. J. McFall, D. Mackey // Microbes Infect. - 2006. -V. 8.-P. 1372- 1381.

137. Dangl J. L. Plant pathogens and integrated defense responses to infection / J. L. Dangl, J. D. G Jones // Nature. - 2001. - V. 411. - P. 826-833.

138. Danhorn T. Phosphorus limitation enhances biofilm formation of the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens through the PhoR-PhoB regulatory system / T. Danhorn, M. Hentzer, M. Givskov et al. // J. Bacteriol. - 2004. - V 186.-P. 4492-4501.

139. Danhorn T. Biofilm Formation by Plant-Associated Bacteria / T. Danhorn, C. Fuqua // Annual Review of Microbiology. - V 61. - P 401-422.

140. Davidson C. J. Individuality in Bacteria / C. J. Davidson, M. G. Surette // Annual Review of Genetics. - 2008. - V. 42. - P. 253-268.

141. Daudi A. The Apoplastic Oxidative Burst Peroxidase in Arabidopsis Is a Major Component of Pattern-Triggered Immunity / A. Daudi, Z. Cheng, J. A. O'Brien et al. // Plant Cell. - 2012. - V. 24, № 1. - P. 275-287.

142. Delaquis P. Behavior of Escherichia coli 0157.H7 in Leafy Vegetables / P. Delaquis, S. Bach, L.-D. Dinu // Journal of Food Protection. - 2007. - V. 70, №8.-P. 1966-1974.

143. de Oliveira P. L. Purification and Partial characterization of manganese peroxidase from Bacillus pumilus and Paenibacillus sp. / P. L. de Oliveira, M. C. Duarte, A. N. Ponezil, L. R. Durrant // Braz. J. Microbiol. - 2009. - V.40, №4. -P. 818-826.

144. De Vleesschauwer D. Differential effectiveness of Serratia plymuthica IC1270-induced systemic resistance against hemibiotrophic and necrotrophic leaf pathogens in rice / D. De Vleesschauwer, L. Chernin, M. Hofite // BMC Plant Biology. - 2009. - V.9. - P. 9.

145. Dimkpa C. O. Production of Indole-3-Acetic Acid via the Indole-3-Acetamide Pathway in the Plant-Beneficial Bacterium Pseudomonas chlororaphis 06 Is Inhibited by ZnO Nanoparticles but Enhanced by CuO Nanoparticles / C. O. Dimkpa, J. Zeng, J. E. McLean et al. // Applied and Environmental Microbiology. - 2012. - V. 78, № 5. - p. 1404-1410.

146. Do H. M. Expression of Peroxidase-like Genes, H202 Production, and Peroxidase Activity During the Hypersensitive Response to Xanthomonas campestris pv. Vesicatoria in Capsicum annuum / H. M. Do, J. K. Hong, H. W. Jung et al. //MPMI. - 2003. - V. 16, № 3. - P. 196-205.

147. Dodds P. N. Plant immunity: towards an integrated view of plant-pathogen interactions / P. N. Dodds, J. P. Rathjen // Nature Reviews. Genetics. -2010.-V.il.-P. 539-548.

148. Dong Y. M. Kinetics and Strain Specificity of Rhizosphere and Endophytic Colonization by Enteric Bacteria on Seedlings of Medicago sativa and Medicago truncatula / Y. M. Dong, L. Iniguez, B. Ahmer et al. // Appl. and Environ. Microbiol. - 2003. - V. 69, № 3. - P. 1783-1790.

149. Dong Y. M. Quantitative assessments of the host range and strain specificity of endophytic colonization by Klebsiella pneumoniae / Y. M. Dong, A. L. Iniguez, E. W. Triplett // Plant Soil. - 2003. - V.25, № 7. - P.49-59.

150. Dong Y. M. Quorum sensing and quorum-quenching enzymes / Y. M. Dong, L. H. Zhang // J. Microbiol. - 2005. - V. 43. - P. 101-109.

151. Doornbos R. F. Impact of root exudates and plant defense signaling on bacterial communities in the rhizosphere. A review / R. F. Doornbos, L. C. van Loon, P. A. Bakker // Agronomy for Sustainable Development January. - 2012. - V 32, № l.-P. 227-243.

152. Doyle M. P. Opportunities for mitigating pathogen contamination during on-farm food production. / M. P. Doyle, M. C. Erickson // Int. J. Food Microbiol. -2012. - V. 152, №3. - P. 54-74.

153. Durrant W. E. Systemic Acquired Resistance / W. E. Durrant, X. Dong // Annual Review of Phytopathology. - 2004. - V. 42. - P. 185-209.

154. Eblen B. S. Potential for internalization, growth, and survival of Salmonella and Escherichia coli 0157:H7 in oranges / B. S. Eblen, M. O. Walderhaug, S. Edelson-Mammel et al.. // J. Food Prot. - 2004. - V.67. - P. 1578-1584.

155. Eberl L. Biofilms on plant surfaces / L. Eberl, S. B. von Bodman, C. Fuqua. - The Biofilm Mode of Life: Mechanisms and Adaptations. - 2007. - P. 215-234.

156. Eichenlaub R. The Clavibacter michiganensis Subspecies: Molecular Investigation of Gram-Positive Bacterial Plant Pathogens / R. Eichenlaub, K. H. Gartemann // Annual Review of Phytopathology. - 2011. - V. 49. - P. 445 - 464.

157. Emberland K. E. Outbreak of Salmonella Weltevreden infections in Norway, Denmark and Finland associated with alfalfa sprouts, July-October 2007 / K. E. Emberland, S. Ethelberg, M. Kuusi et al. // Euro Surveill. - 2007. -V 12.-P. 3321.

158. Engelberg-Kulka H. Bacterial Programmed Cell Death and Multicellular Behavior in Bacteria / H. Engelberg-Kulka, S. Amitai, I. Kolodkin-Gal, R. Hazan //PLoS Genet. - 2006. - V 2, № 10. - el35. doi:10.1371/journal.pgen.0020135.

159. Erickson M.C. Food as a vehicle for transmission of Shiga toxin-producing Escherichia coli / M. C. Erickson, M. P. Doyle // J. Food Prot. -2007. - V 70. - P. 2426-2449.

160. Erickson M. C. Internalization of fresh produce by foodborne pathogens / M. C. Erickson // Annu. Rev. Food Sei. Technol. - 2012. - V.3. - P.283-310.

161. Fatica M. K. Salmonella and produce: Survival in the plant environment and implications in food safety / M. K. Fatica, K. R. Schneider // Virulence. -2011.-V 2, №6.-P. 573-579.

162. Faulkner G. Passage through Tetrahymena tropicalis Triggers a Rapid Morphological Differentiation in Legionella pneumophila / G. Faulkner, S. G. Berk, E. Garduño et al. II J. Bacteriol. - 2008. - V 190, № 23. - P. 7728-7738.

163. Figueira V. Comparison of ubiquitous antibiotic-resistant Enterobacteriaceae populations isolated from wastewaters, surface waters and drinking waters / V. Figueira, E. A. Serra, I. Vaz-Moreira et al. // Journal of Water and Health. - 2012. - V. 10, № 1. - P. 1-10.

164. Flor H. H. Inheritance of pathogenicity in Melampsora lini /H. H. Flor //Phytopathology - 1942. - V.32. - P. 653-669.

165. Francis G. A. Factors affecting quality and safety of fresh-cut produce / G. A. Francis, A. Gallone, G. J. Nychas et al. // Crit. Rev. Food Sei. Nutr. - 2012. - V 52, № 7.-P. 595 -610.

166. Franke I. H. Molecular detection of Gluconacetobacter sacchari associated with the pink sugarcane mealybug Saccharicoccus sacchari (Cockerell) and the sugarcane leaf sheath microenvironment by FISH and PCR / I. H. Franke, M. Fegan, C. Hayward et al.// FEMS Microbiol Ecol. - 2000. - V. 31.-P. 61-71.

167. Franz E. Quantification of contamination of lettuce by GFP-expressing Escherichia coli 0157:H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium / E. Franz, A. A. Visser, A. D. Van Diepeningen et al. // Food Microbiol. - 2007. - V.24. - P. 106-112.

168. Franz E. Manure-amended soil characteristics affecting the survival of E. coli 0157:H7 in 36 Dutch soils / E. Franz, A. V. Semenov, A. J. Termorshuizen et al. // Environmental Microbiology. - 2008. - V 10, № 2. - P. 313-327.

169. Galan J. E. Protein delivery into eukaryotic cells by type III secretion machines / J. E. Galan, H. Wolf-Watz // Nature. - 2006. - V.444. - P. 567-573.

170. Glazebrook J. Contrasting mechanisms Of Defense Against Biotrophic And Necrotrophic Pathogens / J. Glazebrook // Annu. Rev. Phytopathol. - 2005. -V. 43.-P. 205-207.

171. Glick B. R. Promotion of plant growth by ACC deaminase-producing soil bacteria / B. R. Glick, Z. Cheng, J. Czarny, J. Duan // European Journal of Plant Pathology. - 2007. - V 119, № 3. - P. 329-339.

172. Golberg D. Salmonella Typhimurium internalization is variable in leafy vegetables and fresh herbs / D. Golberg, Y. Kroupitskia, E. Belausovb et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2011. - V 145, № 1. - P. 250-257.

173. Gonzalez J. E. Messing with bacterial quorum sensing / J. E. Gonzalez, N. D. Keshavan // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2006. - V 70. - P. 859-875.

174. Gorski L. Attachment of Listeria monocytogenes to Radish Tissue Is Dependent upon Temperature and Flagellar Motility / L. Gorski, J. D. Palumbo, R. E. Mandrell // Appl Environ Microbiol. - 2003. - V. 69, № 1. - P. 258-266.

175. Gourabathini P. Interactions between Food-Borne Pathogens and Protozoa Isolated from Lettuce and Spinach / P. Gourabathini, M. T. Brandl, K.

S. Redding et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2008. - V. 74 № 8. - P. 2518-2525.

176. Grant S. R. Subterfuge and manipulation: type III effector proteins of phytopathogenic bacteria / S. R. Grant, E. J. Fisher, J. H. Chang et al. // Annu. Rev. Microbiol. - 2006. - V.60. - P. 425-449.

177. Guo X. Survival of Salmonellae on and in tomato plants from the time of inoculation at flower in gand early stages of fruit development through fruit ripening / X. Guo, J. Chen, R. E. Brackett et al. // Appl. Environ. Microbiol. -2001. - V.67. - P.4760-4764.

178. Gyaneshwar P. Endophytic Colonization of Rice by a Diazotrophic Strain of Serratia Marcescens / P. Gyaneshwar, E. K. James, N. Mathan et al. // Journal of Bacteriology. - 2001. - V.3, № 8. - P.2634-2645.

179. Hallmann J. Bacterial endophytes in agricultural crops / J. Hallmann, A. Quadt-Hallmann, W. F. Mahaffee et al. // Can. J. Microbiol. - 1997. - V.43. -P.895-914.

180. He F. Shigellosis Outbreak Associated with Contaminated Well Water in a Rural Elementary School: Sichuan Province, China, June 7-16, 2009. / F. He, K. Han, L. Liu et al. // PLoS ONE. - 2012. - V. 7, № 10. - e47239. doi: 10.137 l/journal.pone.0047239

181. Hirneisen K. A. Human enteric pathogen internalization by root uptake into food crops / K. A. Hirneisen, M. Sharma, K. E. Kniel // Foodborne Pathog Dis. - 2012. - V. 9, № 5. - P. 396-405.

182. Hirano S. S. Bacteria in the Leaf Ecosystem with Emphasis on Pseudomonas syringae—a Pathogen, Ice Nucleus, and Epiphyte / S. S. Hirano, C. D. Upper // Microbiology And Molecular Biology Reviews. - 2000. - V. 64, № 3. -P. 624-653.

183. Hoa Long H. Native Bacterial Endophytes Promote Host Growth in a Species-Specific Manner; Phytohormone Manipulations Do Not Result in Common Growth Responses / H. Hoa Long, D. D. Schmidt, I. T. Baldwin // PLoS ONE. -2008. -V. 3, № 7. - e2702. doi:10.1371/journal.pone.0002702.

184. Hoelzer K. Produce consumption in the United States: an analysis of consumption frequencies, serving sizes, processing forms, and high-consuming population subgroups for microbial risk assessments. / K. Hoelzer, R. Pouillot, K. Egan, S. Dennis // J. Food Prot. - 2012. - V.75, № 2. - P. 328-340.

185. Hubälek Z. Microbial zoonoses and sapronoses / Z. Hubälek, I. Rudolf -Springer, Dordrecht-Heidelberg-London-New York, 2011. —457 p.

186. Huckelhoven R. Cell Wall-Associated Mechanisms of Disease Resistance and Susceptibility / R. Huckelhoven // Annu. Rev. Phytopathol. -2007.-V.45.-P. 101-127.

187. Hundt M. J. Interaction of Pasteurella multocida with Free-Living Amoebae / M. J. Hundt, C. G. Ruffolo // Appl. Environ. Microbiol. - 2005. - V. 71, №9.-P. 5458-5464.

188. Iniguez A. L. Nitrogen Fixation in Wheat Provided by Klebsiella pneumoniae 342 / A. L. Iniguez, Y. Dong, E. W. Triplett // MPMI. - 2004. - V 17, № 10. - P. 1078-1085.

189. Iniguez A. L. Regulation of Enteric Endophytic Bacterial Colonization by Plant Defenses / A. L. Iniguez, Y. Dong, H. D. Carter et al. // MPMI. - 2005. - V 18, №2.-P. 169-178.

190. Ingham S. C. Escherichia coli Contamination of Vegetables Grown in Soils Fertilized with Noncoposted Bovinr Manure: Garden-Scale Studies / S. C. Ingham, J. A. Losinski, M. P. Andrews et al. // Appl. and Environ. Microbiol. -2004. - V.70, №11.- P.6420 - 6427.

191. Islam M. Fate of Salmonella enterica serovar Typhimurium on carrots and radishes grown in fields treated with contaminated manure composts or irrigation water / M. Islam, J. Morgan, M. P. Doyle et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - V.70. - P. 2497 - 2502.

192. Itoh Y. Enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 present in radish spouts / Y. Itoh, Y. Sugita-Konishi, F. Kasuga et al. // Appl. Environ. Microbiol.

- 1998.-V.64.-P.1532 - 1535.

193. Iturriaga M. H. Colonization of Tomatoes by Salmonella Montevideo Is Affected by Relative Humidity and Storage Temperature / M. H. Iturriaga, M. L. Tamplin, E. F. Escartin // Journal of Food Protection. - 2007. - V. 70, № 1. - P. 30-34.

194. Jablasone J. Interactions of Escherichia coli 0157:H7, Salmonella Typhimurium, and Listeria monocytogenes in a gnotobiotic system / J. Jablasone, K. Warriner, M. Griffiths // Int. J. Food Microbiol. - 2005. - V.99. - P. 7-18.

195. Jacobs S. Broad-Spectrum Suppression of Innate Immunity Is Required for Colonization of Arabidopsis Roots by the Fungus Piriformospora indica / S. Jacobs, B. Zechmann, A. Molitor et al // Plant Physiology. - 2011. - V. 156, № 2.

- P. 726-740.

196. Janes M. E. Transmission electron microscopy study of enterohemorrhagic Escherichia coli 0157:H7 in apple tissue / M. E. Janes, K. S. Kim, M. G. Johnson // J. Food Prot. - 2005. - V.68. - P. 216-224.

197. Janeway C. A. Approaching the asymptote? Evolution and revolution in immunology / C. A. Janeway // Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology. - 1989. - V.54. -P. 1-13.

198. Jaskiewicz M. Chromatin modification acts as a memory for systemic acquired resistance in the plant stress response / M. Jaskiewicz, U. Conrath, C. Peterhansel // EMBO Rep. - 2011. - V. 12. - P. 50-55.

199. Jennings D. B. Roles for mannitol and mannitol dehydrogenase in active oxygen-mediated plant defense / D. B. Jennings, M. Ehrenshaft, D. M. Pharr, J. D. Williamson//Proc Natl Acad Sci U S A.- 1998.-V 95.-P. 15129-15133.

200. Jha A. K. Enterococcus faecalis mammalian virulence-related factors exhibit potent pathogenicity in the Arabidopsis thaliana plant model / A. K. Jha, H. P. Bais, J. M. Vivanco // Infect. Immun. - 2005. - V.73. - P. 464-475.

201. Johnston-Monje D. Conservation and Diversity of Seed Associated Endophytes in Zea across Boundaries of Evolution, Ethnography and Ecology / D. Johnston-Monje, M. N. Raizada // PLoS ONE. - 2011. - V. 6, № 6. - e20396. doi:10.1371/journal.pone.0020396.

202. Johri B. N. Endophytes to the rescue of plants / B. N. Johri // Curr. Sci. - 2006. - № 90.-P. 1315-1316.

203. Jonas K. Roles of curli, cellulose and BapA in Salmonella biofllm morphology studied by atomic force microscopy / K. Jonas, H. Tomenius, A. Kader et al. // BMC Microbiol. - 2007. - V. 24, № 7. - P. 70.

204. Jones J. D. G. The plant immune system / J. D. G. Jones, J. L. Dangl // Nature. - 2006. -V.444. - P. 323-329.

205. Kang Y. L. Guard-cell apoplastic sucrose concentration—a link between leaf photosynthesis and stomatal aperture size in the apoplastic phloem loader Vicia faba / Y. L. Kang, W. H. Outlaw, P. C. Andersen, G. B. Fiore // Plant Cell Environ. - 2007. - V. 30. - P. 551-558.

206. Khare E. Effect of Indole-3- Acetic Acid (IAA) Produced by Pseudomonas aeruginosa in Suppression of Charcoal Rot Disease of Chickpea / E. Khare, N. K. Arora // Curr Microbiol. - 2010. - V. 61. - P. 64-68.

207. Kim Y. C. The Multifactorial Basis for Plant Health Promotion by Plant-Associated Bacteria / Y. C. Kim, J. Leveau, B. B. McSpadden // Appl. Environ. Microbiol. - 2011. - V. 77, № 5. - P. 1548-1555.

208. Kingsley R. A. Host adaptation and the emergence of infectious disease: The Salmonella paradigm. / R. A. Kingsley, A. J. Baumler // Mol. Microbiol. -2000.-V 36.-P. 1006-1014.

209. Kirk M. D. An outbreak due to peanuts in their shell caused by Salmonella enterica serotypes Stanley and Newport - sharing molecular information to solve international outbreaks / M. D. Kirk, C. L. Little, M. Lem et al. // Epidemiol Infect. - 2004. - V.132, №4. - P.571-577.

210. Kirzinger M.W.B. Insights into Cross-Kingdom Plant Pathogenic Bacteria / M.W.B. Kirzinger, G. Nadarasah, J. Stavrinides // Genes. - 2011. - № 2. - P. 980-997.

211. Klerks M. M. Differential interaction of Salmonella enterica serovars with lettuce cultivars and plant-microbe factors influencing the colonization efficiency / M. M. Klerks, E. Franz, M. van Gent-Pelzer et al. // ISME - 2007. -№ l.-P. 620-631

212. Kloepper J. W. Induced Systemic Resistance and Promotion of Plant Growth by Bacillus spp. / J. W. Kloepper, C.-M. Ryu, S. Zhang // Phytopathology. - 2004. - V 94, № 11. - P. 12 - 59.

213. Korzeniewska E. Culture-Dependent and Culture-Independent Methods in Evaluation of Emission of Enterobacteriaceae from Sewage to the Air and

Surface Water / E. Korzeniewska, M. Harnisz // Water, Air, & Soil Pollution. - 2012. - V. 223, № 7. - P. 4039-4046.

214. Koutsoudis M. D. Quorum-sensing regulation governs bacterial adhesion, biofilm development, and host colonization in Pantoea stewartii subspecies stewartii / M. D. Koutsoudis, D. Tsaltas, T. D. Minogue, S. B. von Bodman // Proc Natl Acad Sci USA.- 2006. - V 103, № 15. - P. 5983-5988.

215. Krechel A. Potato-associated bacteria and their antagonistic potential towards plant-pathogenic fungi and the plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita (Kofoid & White) Chitwood / A. Krechel, A. Faupel, J. Hallmann et al. // Can J Microbiol. - 2002. - V 48. - P. 772-786.

216. Krtinic G. Salmonellae in food stuffs of plant origin and their implications on human health / G. Krtinic, P. Duric, S. Ilic // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. - 2010. - V. 29, № 11. - P. 13211325.

217. Kroupitski Y. Internalization of Salmonella in leaves is induced by light and involves chemotaxis and penetration through open stomata / Y. Kroupitski, D. Goiberg, E. Belausov et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. -V75.-P. 6076-6086.

218. Kutter S. Colonization of barley (Hordeum vulgare) with Salmonella enterica and Listeria spp. / S. Kutter, A. Hartmann, M. Schmid // FEMS Microbiology. - 2006. - V 56, № 2. - P. 262-271.

219. Lacava P. T. Evaluation of endophytic colonization of Citrus sinensis and Catharanthus roseus seedlings by endophytic bacteria / P. T. Lacava, W. L. Araujo, J. L. Azevedo // J. Microbiol. - 2007. - V.45. - P. 11-14.

220. Lapidot A. Transfer of Salmonella enterica Serovar Typhimurium from Contaminated Irrigation Water to Parsley Is Dependent on Curli and Cellulose,

the Biofilm Matrix Components / A. Lapidot, S. Yaron // Journal of Food Protection. - 2009. - V 72, № 3. - P. 618-623.

221. Lemoine R. Sucrose transporters in plants: update on function and structure: a review / R. Lemoine // Biochim. Biophys. Acta. -. 2000. - V 1465. -P. 246 - 262.

222. Li J. ACC Deaminase Minus Mutant of Enterobacter cloacae UW4No Longer Promotes Root Elongation / J. Li, D. H. Ovakim, T. C. Charles et al. // Current Microbiology. - 2000. - V. 41, № 2. - P. 101-105.

223. Lindow S. E. Microbiology of the phyllosphere / S. E. Lindow, M. T. Brandl // Appl. Environ. Microbiol. - 2003. - V 69. - P. 1875-1883.

224. Liu X. Characterisation of two quorum sensing systems in the endophytic Serratia plymuthica strain G3: differential control of motility and biofilm formation according to life-style / X. Liu, J. Jia, R. Popat et al. // BMC Microbiology. - 2011. - V 11. - doi: 10.1186/1471 -2180-11 -26.

225. Liu S. Role of sdhA and pfkA and catabolism of reduced carbon during colonization of cucumber roots by Enterobacter cloacae / S. Liu, X. Hu, S. M. Lohrke et al. // Microbiology. - 2007. - V 153. - P. 3196-3209.

226. Long H. H. Native Bacterial Endophytes Promote Host Growth in a Species-Specific Manner; Phytohormone Manipulations Do Not Result in Common Growth Responses / H. H. Long, D. D. Schmidt, I. T. Baldwin // PLoS ONE. - 2008. - V. 3, № 7.

227. Lugtenberg B. J. Molecular determinants of rhizosphere colonization by Pseudomonas / B. J. Lugtenberg, L. C. Dekkers, G. V. Bloemberg // Annu. Rev. Phytopathol. - 2002. - V 39. - P. 461 - 490.

228. Lugtenberg B. Plant-growth-promoting rhizobacteria / B. Lugtenberg, F. Kamilova // Annu. Rev. Microbiol. - 2009. - V 63. - P. 541- 556.

229. Ma W. Innate Immunity Signaling: Cytosolic Ca2+ Elevation Is Linked to Downstream Nitric Oxide Generation through the Action of Calmodulin or a Calmodulin-Like Protein / W. Ma, A. Smigel, Y-C. Tsai et al. // Plant Physiology. - 2008. - V 148. - P. 818-828.

230. Mahajan-Miklos S. Molecular Mechanisms of Bacterial Virulence Elucidated Using a Pseudomonas aeruginosa - Caenorhabditis elegans Pathogenesis Model / S. Mahajan-Miklos, M.-W. Tan, L. G. Rahme, F. M. Ausubel // Cell. - 1999. - V 96, № 1. - P. 47-56.

231. Mackey D. RIN4 interacts with Pseudomonas syringae type III effector molecules and is required for RPM1-mediated resistance in Arabidopsis / D. Mackey, B. F. Holt, A. Wiig, J. L. Dangl // Cell. - 2002. - 108. - P. 743-754.

232. Magliozzo R. S. The Role of Mn (Il)-Peroxidase Activity of Mycobacterial Catalase-Peroxidase in Activation of the Antibiotic Isoniazid / R. S. Magliozzo, J. A. Marcinkeviciene // The Journal of Biological Chemistry. -1997. - V 272. - P. 8867-8870.

233. Magnuson R. D. Hypothetical functions of toxin-antitoxin systems / R. D. Magnuson // J Bacteriol. - 2007. - V 189, № 17. - P. 6089-6092.

234. Maldonado A. M. A putative lipid transfer protein involved in systemic resistance signalling in Arabidopsis / A. M.Maldonado, P. Doerner, R. A. Dixon et al. // Nature. -2002. - V 419. - P. 399-403.

235. Malpica J. M. Association and Host Selectivity in Multi-Host Pathogens / J. M. Malpica, S. Sacrista, A. Fraile, F. Garcia-Arenal // PLoS ONE. - 2006. -№ l.-P. 1 -8.

236. Mavrodi D. V. Structural and functional analysis of the type III secretion system from Pseudomonas fluorescens Q8rl-96 / D. V. Mavrodi, A. Joe, O. V. Mavrodi et al. // J. Bacteriol. - 2011. - V 193. - P. 177-189.

237. Mazurier S. Distribution and diversity of type III secretion systemlike genes in saprophytic and phytopathogenic fluorescent pseudomonads / S. Mazurier, M. Lemunier, S. Siblot et al. // FEMS Microbiol. Ecol. - 2004. - V 49. -P. 455 -467.

238. McHale L. Plant NBS-LRR proteins: adaptable guards / L. McHale, X. Tan, P. Koehl, R W. Michelmore // Genome Biol. - 2006. - № 7. - P. 212.

239. Meier R. Calcium-gated Lid and a Large-Roll Sandwich Are Revealed by the Crystal Structure of Extracellular Lipase from Serratia marcescens / R. Meier, T. Drepper, V. Svensson et al. // Journal Of Biological Chemistry. - 2007. -V. 282, №43. -P. 31477-31483.

240. Melech-Bonfil S. Tomato MAPKKKe is a positive regulator of cell-death signaling networks associated with plant immunity / S. Melech-Bonfil, G. Sessa//The Plant Journal.-2010.-№ 64.- P. 379-391.

241. Melotto M. Plant Stomata Function in Innate Immunity against Bacterial Invasion / M. Melotto, W. Underwood, J. Koczan et al. // Cell. - 2006.

- V 126.-P. 969-980.

242. Melotto M. Role of Stomata in Plant Innate Immunity and Foliar Bacterial Diseases / M. Melotto, W. Underwood, S. Y. He // Annu Rev Phytopathol. -2008. - V 46. - P. 101-122.

243. Mendes R. Diversity of cultivated endophytic bacteria from sugarcane: Genetic and biochemical characterization of Burkholderia cepacia complex isolates / R. Mendes, A. A. Pizzirani-Kleiner, W. L. Araujo, J. M. Raaijmakers // Appl Environ Microbiol. - 2007. - V 73. - P. 7259-7267.

244. Mendes R. Deciphering the Rhizosphere Microbiome for Disease-Suppressive Bacteria / R. Mendes, M. Kruijt, I. de Bruijn et al. // Science. - 2011.

- V. 332, № 27. - P. 1097-1100.

245. Mercier J. Role of leaf surface sugars in colonization of plants by bacterial epiphytes / J. Mercier, S. E. Lindow // Appl. Environ. Microbiol. -2000. -V.66. - P.369-374.

246. Meyers B. C. Genome-wide analysis of NBS-LRR-encoding genes in Arabidopsis / B. C. Meyers, A. Kozik, A. Griego et al. // Plant Cell. - 2003. - 15. - P. 809-34

247. Miche L. Upregulation of Jasmonate-Inducible Defense Proteins and Differential Colonization of Roots of Oryza sativa Cultivars with the Endophyte Azoarcus sp. / L. Miche, F. Battistoni, S. Gemmer et al. // MPMI. - 2006. - V 19, №5.-P. 502-511.

248. Millet Y. A. Innate immune responses activated in Arabidopsis roots by microbe-associated molecular patterns / Y. A. Millet, C. H. Danna, N. K. Clay et al. // Plant Cell. - 2010. - V 22. - P. 973-990.

249. Mittler R. Reactive oxygen gene network of plants / R. Mittler, S. Vanderauwera, M. Gollerya, F. Van Breusegem // Trends in Plant Science. -2004. - V. 9, № 10. - P. 490-498.

250. Mobley H. L. Virulence determinants of uropathogenic Escherichia coli and Proteus mirabilis / H. L. Mobley, M. D. Island, G. Massad // Kidney Int. Suppl. - 1994. - V 47. - P. 129-136.

251. Mohle-Boetani J. C. Investigation Team. Escherichia coli Ol57 and Salmonella infections associated with sprouts in California, 1996-1998. / J. C. Mohle-Boetani, J. A. Farrar, S. B. Werner et al. // Ann Intern Med. - 2001. - V 135, №4.-P. 239-247.

252. Molin S. Gene transfer occurs with enhanced efficiency in biofilms and induces enhanced stabilisation of the biofilm structure / S. Molin, T. Tolker-Nielsen // Current Opinion in Biotechnology. - 2003. - V 14, № 3. - P. 255-261.

253. Monds R. D. Expression of the Pho regulon negatively regulates biofilm formation by Pseudomonas aureofaciens PA147-2 / R. D. Monds, M. W. Silby, H. K. Mahanty // Mol. Microbiol. - 2001. - V 42. - P. 415-426.

254. Monier J.-M. Frequency, Size, and Localization of Bacterial Aggregates on Bean Leaf Surfaces / J.-M. Monier, S. E. Lindow // Appl. Environ. Microbiol. January. - 2004. - V 70, № 1. - P. 346-355.

255. Monier J. M. Aggregates of resident bacteria facilitate survival of immigrant bacteria on leaf surfaces / J. -M. Monier, S. E. Lindow // Microb. Ecol. - 2005. - № 49. - P. 343-352.

256. Mukhtar M. S. Independently Evolved Virulence Effectors Converge onto Hubs in a Plant Immune System Network / M. S. Mukhtar et al. // Science. -2011.-V. 333.-P. 596-601.

257. Naimi T. S. Concurrent outbreaks of Shigella sonnei and enterotoxigenic Escherichia coli infections associated with parsley: implications for surveillance and control of foodborne illness / T. S. Naimi, J. H. Wicklund, S. J. Olsen et al. // J. Food Prot. - 2003. - V. 66, № 4. - P. 535 - 541.

258. Newman K. L. Virulence of Plant Pathogenic Bacteria Attenuated by Degradation of Fatty Acid Cell-to-Cell Signaling Factors / K. L. Newman, S. Chatterjee, K. A. Ho, S. E. Lindow // MPMI. - 2008. - V. 21, № 3. - P. 326334.

259. Nakajima H., Juone M., Mori T. (1992) Detection and identification of Yersinia pseudotubaerculosis and pathogenic Yersinia enterocolitica by an improved polimerase chain reaction method / H. Nakajima, M. Juone, T. Mori // J. Clin. Microbiol. Vol. 30. 2484 - 2486.

260. Nakamura T. Biotransformation of pentachlorophenol by Chinese chive and a recombinant derivative of its rhizosphere-competent microorganism,

Pseudomonas gladioli M-2196 / T. Nakamura, T. Motoyama, Y. Suzuki, I. Yamaguchi // Soil Biology and Biochemistry. - 2004. - V 36, № 5. - P. 787-795.

261. Natvig E. E. Salmonella enterica Serovar Typhimurium and Escherichia coli Contamination of Root and Leaf Vegetables Grown in Soils with Incorporated Bovine Manure / E. E. Natvig, S. C. Ingham, B. H. Ingham et al. // Appl Environ Microbiol. - 2002. - V 68, № 6. - P. 2737-2744.

262. Neto J. R. Comparative Rflp-Its Analysis Between Enterobacter Cloacae Strains Isolated From Plants And Clinical Origin / J. R. Neto, T. Yano, L.O.S. Beriam et al. // Arq. Inst. Biol. - 2003. - V70, № 3. - P. 367-372.

263. Noel J. T. Specific Responses of Salmonella enterica to Tomato Varieties and Fruit Ripeness Identified by In Vivo Expression Technology / J. T. Noel, N. Arrach, A. Alagely et al. // PloS one. - 2010. - V 5, № 8. - el2406. doi: 10.1371/journal.pone.0012406.

264. O'Brien J. A. Peroxidase-Dependent Apoplastic Oxidative Burst in Cultured Arabidopsis Cells Functions in MAMP-Elicited Defence / J. A. O'Brien, A. Daudi, P. Finch et al. // Plant Physiology Preview. - 2012. - V. 158. -P. 2013-2027.

265. Ogbo F. Some Characteristics of a Plant Growth Promoting Enterobacter sp. Isolated from the Roots of Maize / F. Ogbo, J. Okonkwo // Advances in Microbiology. - 2012. - V 2. - P. 368-374.

266. Okinaka Y. Microarray profiling of Erwinia chrysanthemi 3937 genes that are regulated during plant infection / Y. Okinaka, C.-H. Yang, N. T. Perna, N. T. Keen // Mol. Plant Microbe Interact. - 2002. - V 15. - P. 619 - 629.

267. de Oliveira M. A. Microbiological quality of ready-to-eat minimally processed vegetables consumed in Brazil / M. A. de Oliveira, V. M. de Souzab,

A. M. M. Bergaminia, E. C. P. De Martinis // Food Control. - 2011. - V 22, №8.-P. 1400-1403.

268. Omari S. The Study Of Bacterial Contamination Of Drinking Water Sources: A Case Study Of Mpraeso, Ghana / S. Omari, D. Yeboah-Manu // The Internet Journal of Microbiology. - 2012. - V. 10, № 1

269. Ona O. Growth and indole-3-acetic acid biosynthesis of Azospirillum brasilense Sp245 is environmentally controlled / O. Ona, J. Van Impe, E. Prinsen, J. Vanderleyden // FEMS Microbiol Lett. - 2005. - V. 246. - P. 125132.

270. Ongeng D. Transfer and internalisation of Escherichia coli 0157.H7 and Salmonella enterica serovar Typhimurium in cabbage cultivated on contaminated manure-amended soil under tropical field conditions in Sub-Saharan Africa / D. Ongeng, G. A. Vasquezc, C. Muyanjad et al. // International Journal of Food Microbiology. - 2011. - V 145, № 1. - P. 301-310.

271. Park S.-W. Methyl salicylate is a critical mobile signal for plant systemic acquired resistance / S.-W. Park, E. Kaimoyo, D. Kumar et al. // Science. - 2007. -V 318. - P. 113-116.

272. Parke J. L. Diversity of the Burkholderia Cepacia complex and implications for risk assessment of biological control strains / J. L. Parke, D. Gurian-Sherman // Annual Review of Phytopathology. - 2001. - V 39. - P. 225258.

273. Passardi F. Prokaryotic origins of the non-animal peroxidase superfamily and organelle-mediated transmission to eukaryotes / F. Passardia, N. Bakalovica, F. K. Teixeirab et al. // Genomics. - 2007. - V 89, № 5. - P. 567579.

274. Patel J. Differences in attachment of Salmonella enterica serovars to cabbage and lettuce leaves / J. Patel, M. Sharma // International Journal of Food Microbiology. - 2010. - V 139, № 1. - P. 41-47.

275. Patel J. Effect of curli expression and hydrophobicity of Escherichia coli 0157:H7 on attachment to fresh produce surfaces / J. Patel, M. Sharma, S. Ravishakar // Journal of Applied Microbiology. - 2011. - V 110, № 3. - P. 737745.

276. Plotnikova J. M. Pathogenesis of the human opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa PAH in Arabidopsis / J. M. Plotnikova, L. G. Rahme, F. M. Ausubel // Plant Physiol. - 2000. - V. 124, № 4. - P. 1766 - 1774.

277. Pieterse C. M. J. Networking by small-molecule hormones in plant immunity / C. M. J. Pieterse, A. Leon-Reyes, S. Van der Ent et al. // Nat. Chem. Biol. -2009. -№ 5.-P. 308-316.

278. Pineda A. Helping plants to deal with insects: The role of beneficial soilborne microbes / Pineda A, Zheng S.-J, Van Loon J. J. A. et al. // Trends Plant Sci. -2010. - V 15.-P. 507-514.

279. Portnoy D. A. Role of plasmid in the pathogenicity of Yersinia species / D. A. Portnoy // Curr. Topics Microbiol. Immunol. - 1985. - V 118. - P. 29-51.

280. Preston G. M. Type III secretion in plant growth-promoting Pseudomonas fluorescens SBW25 / G. M. Preston, N. Bertrand, P. B. Rainey // Mol. Microbiol. - 2001. -V 41. - P. 999 - 1014.

281. Prithiviraj B. Staphylococcus aureus pathogenicity on Arabidopsis thaliana is mediated either by a direct effect of salicylic acid on the pathogen or by SA-dependent, NPR1-independent host responses / B. Prithiviraj, H. P. Bais, A. K. Jha, J. M. Vivanco // Plant J. - 2005. - V. 42. - P. 417 - 432.

282. Proctor M. E. Multistate outbreak of Salmonella serovar Muenchen infections associated with alfalfa sprouts grown from seeds pretreated with calcium hypochlorite / M. E. Proctor, M. Hamacher, M. L. Tortorello et al. // J. Clin Microbiol. - 2001. - V.39. №10. - P. 3461 - 3465.

283. Qing-Chunj H. Physiological characters of the resistant mutant of Xanthomonas citri to amicarthiazol / H. Qing-Chunj, Z. Ming-Guoj, Zh.Y. Ye // Acta Phytopathologica Sinica. - 2003. - V. 33, No. 1.

284. Quilliam R. S. Lettuce cultivar mediates both phyllosphere and rhizosphere activity of Escherichia coli 0157:H7 / R. S. Quilliam, A. P. Williams, D. L. Jones // PLoS One. - 2012. - V 7, № 3. - e33842. doi: 10.1371/journal.pone.0033842.

285. Rahman M. Z. Recovery and Characterization of Environmental Variants of Shigella flexneri from Surface Water in Bangladesh / M. Z. Rahman, N. Azmuda, M. J. Hossain et al. // Current Microbiology. - 2011. - V. 63, № 4. - P. 372-376.

286. Rahme L. G. Common virulence factors for bacterial pathogenicity in plants and animals / L. G. Rahme, E. J. Stevens, S. F. Wolfort et al. // Science. -1995. - V 268. - P. 1899-1902.

287. Rahme L.G. Use of model plant hosts to identify Pseudomonas aeruginosa virulence factors / L. G. Rahme, M. W. Tan, L. Le et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1997. - V.94, №24. - P. 13245-13250.

288. Rahme L.G. Plants and animals share functionally common bacterial virulence factors / L. G. Rahme, F. M. Ausubel, H. Cao et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 2000. - V. 97, № 16. - P.8815-8821.

289. Rainey P. B. Adaptation of Pseudomonas fluorescens to the plant rhizosphere / P. B. Rainey // Environ. Microbiol. - 1999. - № 1. - P. 243-257.

290. Reinhold-Hurek B. Living inside plants: bacterial endophytes / B. Reinhold-Hurek, T. Hurek // Current Opinion in Plant Biology. - 2011. - V. 14, №4.-P. 435-443.

291. Reinhold-Hurek B. Life in grasses: diazotrophic endophytes / B. Reinhold-Hurek, T. Hurek // Trends in Microbiology. - 1998. - V. 6, № 4. - P. 139-144.

292. Rezzonico F. Comparison of ATPase-encoding type III secretion system hrcN genes in biocontrol fluorescent Pseudomonads and in phytopathogenic proteobacteria / F. Rezzonico, G. Defago, Y. Moenne-Loccoz // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - V 70. - P. 5119-5131.

293. Rivas-San Vicente M. Salicylic acid beyond defence: its role in plant growth and development / M. Rivas-San Vicente, J. Plasencia // J. Exp. Bot. -2011. - V. 62, № 10. - P. 3321-3338.

294. Roberts D. P. Mutation of a degS Homologue in Enterobacter cloacae Decreases Colonization and Biological Control of Damping-Off on Cucumber / D. P. Roberts, S. M. Lohrke, L. McKenna et al. // Phytopathology. - 2011. - V. 101, №2.-P. 271-280.

295. Rosenblueth M. Bacterial Endophytes and Their Interactions with Hosts / M. Rosenblueth, E. Martinez-Romero // MPMI. - 2006. - V 19, № 8. - P. 827837.

296. Ross A. F. Localized acquired resistance to plant virus infection in hypersensitive hosts / A. F. Ross // Virology. - 1961. - V. 14, № 3. - P. 329-339.

297. Saeed A. Acanthamoeba castellanii an environmental host for Shigella dysenteriae and Shigella sonnei / A. Saeed, H. Abd, B. Edvinsson, G. Sandstrom // Archives of Microbiology. - 2009. - V. 191, № 1. - p. 83-88.

298. Saeed A. Temperature Depended Role of Shigella flexneri Invasion Plasmid on the Interaction with Acanthamoeba castellanii / A. Saeed, D. Johansson, G. Sandström, H. Abd // International Journal of Microbiology. -2012. - V 8. - Article ID 917031, 8 pages doi: 10.1155/2012/917031.

299. Saldaña Z. Surface structures involved in plant stomata and leaf colonization by Shiga-toxigenic Escherichia coli 0157:H7 / Z. Saldaña, E. Sánchez, J. Xicohtencatl-Cortes et al. II Frontiers in Microbiology. - 2011. - V 2. -P. 1 -9.

300. Salto A. Microbial Community Analysis of the Phytosphere Using Culture-Independent Methodologies / A. Salto, S. Ikeda, H. Ezura et al. // Microbes Inviron. - 2007. - V.22, №2. - P.93-105.

301. Sant'Ana A.S. Growth potential of Salmonella spp. and Listeria monocytogenes in nine types of ready-to-eat vegetables stored at variable temperature conditions during shelf-life / A. S. Sant'Ana, M. S. Barbosa, M. T. Destro et al. // Int. J. Food Microbiol. - 2012. - V. 157, № 1. - P. 52 - 58.

302. Santos J. M. The gene bolA regulates dacA (PBP5), dacC (PBP6) and ampC (AmpC), promoting normal morphology in Escherichia coli / J. M. Santos, M. Lobo, A. P. Matos et al. II Mol Microbiol. - 2002. - V. 45, № 6. - P. 1729- 1740.

303. Scavia G. Similarity of Shiga Toxin-producing Escherichia coli 0104:H4 Strains from Italy and Germany / G. Scavia, S. Morabito, R. Tozzoli et al.//Emerg. Infect. Dis. - 2011. - V. 17, №10.-P. 1957-1958.

304. Schikora A. The Dark Side of the Salad: Salmonella typhimurium Overcomes the Innate Immune Response of Arabidopsis thaliana and Shows an Endopathogenic Lifestyle / A. Schikora, A. Carreri, E. Charpentier, H. Hirt // PLoS ONE. - 2008. - V. 3, № 5. - e2279. doi:10.1371/journal.pone.0002279.

305. Schikora A. Conservation of Salmonella Infection Mechanisms in Plants and Animals / A. Schikora, I. Virlogeux-Payant, E. Bueso et al. // PLoS ONE. - 2011. - V 6, № 9. - e24112. doi:l0.1371/journal.pone.0024112.

306. Schütz A. Crystal structure of thiamindiphosphate-dependent indolepyruvate decarboxylase from Enterobacter cloacae, an enzyme involved in the biosynthesis of the plant hormone indole-3-acetic acid / A. Schütz, T. Sandalova, S. Ricagno et al. // European Journal of Biochemistry. - 2003. - V 270, № 10.-P. 2312-2321.

307. Shipp G. M. The Establishment of Enterobacteriaceae and Salmonella London in a New Dairy Farm Environment / G. M. Shipp, J. S. Dickson // Foodborne Pathogens and Disease. - 2011. - V. 8, № 3. - P. 411 - 420.

308. Shirron N. Active Suppression of Early Immune Response in Tobacco by the Human Pathogen Salmonella Typhimurium / N. Shirron, S. Yaron // PLoS ONE. - 2011. - V 6, № 4. - el8855. doi:10.1371/journal.pone.0018855.

309. Seghers D. Impact of agricultural practices on the Zea mays L. endophytic community / D. Seghers, L. Wittebolle, E. M. Top et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2004. - V. 70. - P. 1475 - 1482.

310. Sessitsch A. B. Cultivation-independent population analysis of bacterial endophytes in three potato varieties based on eubacterial and Actinomycetes-specific PCR of 16S rRNA genes / A. Sessitsch, B. Reiter, U. Pfeifer, E. Wilhelm // FEMS Microbiol. - 2001. - V. 1305. - P. 1-10.

311. Shao F. Cleavage of Arabidopsis PBS1 by a bacterial type III effector / F. Shao, C. Golstein, J. Ade et al. // Science. - 2003. - 301. - P. 1230-1233.

312. Shi X. Microbial population profiles of the microflora associated with pre- and postharvest tomatoes contaminated with Salmonella typhimurium or

Salmonella Montevideo / X. Shi, Z. Wu, A. Namvar et al. // Journal of Applied Microbiology. - 2009. - V. 107, № 1. - P. 329-338.

313. Siddiqui I. A. Rhizobacteria mediated Induction of Systemic Resistance (ISR) in Tomato against Meloidogyne javanica / I. A. Siddiqui, S. S. Shaukat // Journal of Phytopathology. - 2002. - V 150, № 8-9. - P. 469-473.

314. Singh B. R. Pathogenic effects of Salmonella enterica subspecies enterica serovar Typhimurium on sprouting and growth of maize / B. R. Singh, R. Agarwal, M. Chandra // Indian Journal of Experimental Biology. - 2004. - V 42, № 11.-P. 1100-1106.

315. Sirrenberg A. Piriformospora indica affects plant growth by auxin production / A. Sirrenberg, C. Goebel, S. Grond et al. // Physiol. Plant. - 2007. -V 131.-P. 581-589.

316. Solomon E. B. Transmission of Escherichia coli 0157:H7 from contaminated manure and irrigation water to lettuce plant tissue and its subsequent internalization / E. B. Solomon, S. Yaron, K. R. Matthews // Appl. Environ. Microbiol. - 2002. - V. 68. - P. 397 - 400.

317. S0rensen S. J. Studying plasmid horizontal transfer in situ: a critical review / S. J. S0rensen, M. Bailey, L. H. Hansen, N. Kroer // Nature Reviews Microbiology. - 2005. - № 3. - P. 700-710.

318. Spaepen S. Indole-3-acetic acid in microbial h microorganism-plant signaling / S. Spaepen, J. Vanderleyden, R. Remans // FEMS Microbiology Reviews. - 2007. - V. 31, № 4. - P. 425 - 448

319. Spoel S. H. How do plants achieve immunity? Defence without specialized immune cells / S. H. Spoel, X. Dong // Nature Reviews Immunology. -2012. - V. 12.-P. 89- 100.

320. Stavrinides J. Origin and Evolution of Phytopathogenic Bacteria / In Plant Pathogenic Bacteria: Genomics and Molecular Biology. - Jackson R.W, Ed.; Caister Academic Press: Norfolk, UK, 2009. - 330 c.

321. Steinert M. Mycobacterium avium Bacilli Grow Saprozoically in Coculture with Acanthamoeba polyphaga and Survive within Cyst Walls / M. Steinert, K. Birkness, E. White et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 1998. - V. 64, №6.-P. 2256-2261.

322. Sturz A. V. Endophytic bacterial communities in the periderm of potato tubers and their potential to improve resistance to soil-borne plant pathogens / A. V. Sturz, B. R. Christie, B. G. Matheson et al. // Plant Pathol. - 1999. - V. 48. -P. 360-369.

323. Taban M. B. Do leafy green vegetables and their ready-to-eat [RTE] salads carry a risk of foodborne pathogens? / M. B. Taban, A. K. Halkman // Anaerobe. - 2011. - V. 17, № 6. - P. 286 - 287.

324. Taechowisan T. Secondary metabolites from endophytic Streptomyces aureofaciens CMUAcl30 and their antifungal activity / T. Taechowisan, L. U. Chunhua, Y. Shen, S. Lumyong 11 Microbiology. - 2005. - V. 151. - P. 1691 -1695.

325. Taghavi S. Genome survey and characterization of endophytic bacteria exhibiting a beneficial effect on growth and development of poplar trees / S. Taghavi, C. Garafola, S. Monchy et al. // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. - V. 75.-P. 748-757.

326. Taghavi S. Genome Sequence of the Plant Growth Promoting Endophytic Bacterium Enterobacter sp. 638 / S. Taghavi, D. van der Lelie, A. Hoffman et al. // PLoS Genetics. - 2010. - V 6, № 5. - el000943. doi: 10.1371/journal.pgen. 1000943.

327. Takahashi A. HSP90 interacts with RAR1 and SGT1 and is essential for RPS2- mediated disease resistance in Arabidopsis / A. Takahashi, C. Casais, K. Ichimura, K. Shirasu // PNAS. - 2003. - V. 100. - P. 1177711782.

328. Takeuchi K. Quantitative determination of the role of lettuce leaf structures in protecting Escherichia coli 0157:H7 from chlorine disinfection / K. Takeuchi, J. F. Frank // J. Food Prot. - 2001. - V. 64, № 2. - P. 147-151.

329. Thaller M. C. Characterization and sequence of PhoC, the principal phosphate-irrepressible acid phosphatase of Morganella morganii / M. C. Thaller, F. Berlutti, S. Schippa et al. // Microbiology. - 1994. - V. 140. - P. 1341-1350.

330. Tanaka A. Reactive oxygen species play a role in regulating a fungus-perennial ryegrass mutualistic interaction / A. Tanaka, M. J. Christensen, D. Takemoto et al. // Plant Cell. - 2006. - V 18. - P. 1052 - 1066.

331. Taormina P. J. Survival of Listeria monocytogenes in commercial food-processing equipment cleaning solutions and subsequent sensitivity to sanitizers and heat / P. J. Taormina, L. R. Beuchat // Journal of Applied Microbiology. -2002. -V. 92, № 1.-P. 71-80.

332. Thomma B. P. The complexity of disease signaling in Arabidopsis / B. P. Thomma, I. A. Penninckx, W. F. Broekaert, B. P. A. Cammue // Curr Opin Immunol.-2001.-V. 13.-P. 63-68.

333. Thomma B. P. Plant defensins / B. P. Thomma, B. P. Cammue, K. Thevissen // Planta. - 2002. - 216. - P. 193-202

334. Todd E. C. Epidemiology of foodborne diseases: a worldwide review / E. C. Todd // World Health Stat Quarterly. - 1997. - V. 50, № 1-2. - P. 30 - 50.

335. Ton J. Identification of a locus in Arabidopsis controlling both the expression of rhizobacteriamediated induced systemic resistance (ISR) and basal

resistance against Pseudomonas syringae pv. tomato / J. Ton, C. M. J. Pieterse, L. C. Van Loon // Mol. Plant-Microbe Interact. - 1999. - № 12. - P. 911-918.

336. Ton J. The Arabidopsis ISR1 locus is required for rhizobacteria-mediated induced systemic resistance against different pathogens / J. Ton, J. A. Van Pelt, L. C. Van Loon, C. M. J. Pieterse // Plant Biol. - 2002. - № 4. - P. 224 -227.

337. Troxler J. Conjugative Transfer of Chromosomal Genes between Fluorescent Pseudomonads in the Rhizosphere of Wheat / J. Troxler, P. Azelvandre, M. Zala et al. // Appl Environ Microbiol. - 1997. - V. 63, № 1. - P. 213-219.

338. Trujillo M. Ubiquitination in plant immunity / M. Trujillo, K. Shirasu // Current Opinion in Plant Biology. - 2010. - V. 13. - P. 402-408.

339. Tsolis R. M. Comparative genome analysis of the y-proteobacteria: Relationships between plant and animal pathogens and host specificity / R. M. Tsolis // PNAS. - 2002. - V. 99, № 20. - P. 12503-12505.

340. Tsuda K. Comparing signaling mechanisms engaged in pattern-triggered and effector-triggered immunity / K. Tsuda, F. Katagiri // Current Opinion in Plant Biology. - 2010. - V 13. - P. 459-465.

341. Tyler H. L. Plants as a Habitat for Beneficial and/or Human Pathogenic Bacterium / H. L. Tyler, E. W. Triplett // Annu. Rev. Phytopathol. - 2008. - V. 46.-P. 53-73.

342. Underwood W. Role of plant stomata in bacterial invasion / W. Underwood, M. Melotto, S. Y. He // Cell Microbiol. - 2007. - № 7. - P. 16211629.

343. van Baarlen P. Disease induction by human microbial pathogens in plant model systems: potential, problems and prospects / P. van Baarlen, A. van Belkum, B. P. Thomma // Drug Discovery Today. - 2007. - № 12.-P. 167-173.

344. van der Biezen E. A. The NB-ARC domain: a novel signalling motif shared by plant resistance gene products and regulators of cell death in animals / E. A. van der Biezen, J. D. G. Jones // Curr Biol. - 1998. - № 8. - P. 226-227.

345. Van den Broek D. The role of phenotypic variation in rhizosphere Pseudomonas bacteria / D. Van den Broek, G. V. Bloemberg, B. Lugtenberg // Environ. Microbiol. - 2005. - V 7. - P. 1686-1697.

346. Van der Ent S. Jasmonate signaling in plant interactions with resistance-inducing beneficial microbes / S. Van der Enta, S. C. M. Van Weesa, C. M. J. Pietersea // Phytochemistry. - 2009. - V. 70, № 13. - P. 1581-1588.

347. Van der Riet F. Diseases of plants transmissible between plants and man (Phytonoses) exist - follow-up paper / F. Van der Riet // Medical Hypotheses. -2000.-V. 54, №2.-P. 310-311.

348. Van der Woude M. W. Phase and antigenic variation in bacteria / M. W. Van der Woude, A. J. Baumler // Clin. Microbiol. Rev. - 2004. - V. 17. - P. 581611.

349. Van Elsas J. D. Microbial diversity determines the invasion of soil by a bacterial pathogen / J. D. Van Elsasa, M. Chiurazzia, C. A. Mallona et al. // PNAS. - 2012. - V. 109, № 4. - P.l 159-1164.

350. Van Loon L. C. Systemic resistance induced by rhizosphere bacteria / L. C. Van Loon, P. A. Bakker, C. M. J. Pieterse // Annu. Rev. Phytopathol. - 1998. -V 36. - P.453-483.

351. Van Loon L. C. Early responses of tobacco suspension cells to rhizobacterial elicitors of induced systemic resistance / L. C. Van Loon, P. A. Bakker, H. M. Van der Heijdt et al. // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2008. - V 21.-P. 1609-1621.

352. Van Hulten M. Costs and benefits of priming for defense in Arabidopsis / M. Van Hulten, M. Pelser, L.C. van Loon et al. // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2006. - V. 103. - P. 5602-5607.

353. van Ooijen G. Structure and Function of Resistance Proteins in Solanaceous Plants / G. van Ooijen, H. A. van den Burg, B. J. C. Cornelissen, F. L.W. Takken // Annu. Rev. Phytopathol. - 2007. - V 45. - P. 43-72.

354. Van Wees S. С. M. Plant immune responses triggered by beneficial microbes / S. С. M. Van Wees, S. Van der Ent, С. M. J. Pieterse // Curr. Opin. Plant Biol. - 2008. - № 11. - P. 443-448.

355. Venisse J.-S. Evidence for участие of an oxidative stress in the initiation infection of Pear by Erwinia amylovora / J.-S. Venisse, G. Gullner, M.-N. Brissel // Plant Physiology. - 2001. - V. 125. - P. 2164 - 2172.

356. Verhage A. Plant immunity: It's the hormones talking, but what do they say? / A. Verhage, S. С. M. van Wees, С. M. J. Pieterse // Plant Physiol. - 2010. -V. 154.-P. 536-540.

357. Verhagen B. W. M. The transcriptome of rhizobacteriainduced systemic resistance in Arabidopsis / B. W. M. Verhagen, J. Glazebrook, T. Zhu et al. // Mol. Plant-Microbe Interact. - 2004. - V. 17. - P. 895-908.

358. Vierstra R. D. The ubiquitin/26S proteasome pathway, the complex last chapter in the life of many plant proteins / R. D. Vierstra // Trends in Plant Science. - 2003. - № 8. - P. 135-142.

359. Vinatzer B. A. The type III effector repertoire of Pseudomonas syringae pv. syringae B728a and its role in survival and disease on host and nonhost plants / B. A.Vinatzer, G. M. Teitzel, M. W. Lee et al. // Mol. Microbiol.

- 2006. - V. 62. - P. 26-44.

360. Vlot A. C. Salicylic acid, a multifaceted hormone to combat disease / A. C. Vlot, D. M. A. Dempsey // Annual review of of Phytopathology. - 2009. - V. 47.-P. 177-206.

361. Walker T. S. Pseudomonas aeruginosa-plant root interactions. Pathogenicity, biofilm formation, and root exudation / T. S.Walker, H. P. Bais, E. Deziel et al. // Plant Physiol. - 2004. - V. 134. - P. 320-331.

362. Wachtel M. R. Association of Escherichia coli 0157:H7 with preharvest leaf lettuce upon exposure to contaminated irrigation water / M. R. Wachtel, L. C. Whitehand, R. E. Mandrell // J. Food Prot. - 2002. - V. 65. - P. 18-25.

363. Warriner K. Internalization of bioluminescent Escherichia coli and Salmonella Montevideo in growing bean sprouts / K. Warriner, S. Spaniolas, M. Dickinson et al. // J. Appl. Microbiol. - 2003. - V 95. - P. 719-727.

364. Watanabe Y. Factory outbreak of Escherichia coli 0157:H7 infection in Japan / Y. Watanabe, K. Ozasa, J. H. Mermin et al. // Emerg. Infect. Dis. - 1999.

- V.5, № 3. - P.424-428.

365. Wells S. J. Fecal shedding of Salmonella spp. by dairy cows on farm and at cull cow markets / S. J. Wells, P. J. Fedorka-Cray, D. A. Dargatz et al. // J. Food Prot.-2001.-V. 64, № 1.-P.3-11.

366. Werner S. Outbreak of Salmonella Stanley in Sweden associated with alfalfa sprouts, July-August 2007/ S. Werner, K. Boman, I. Einemo et al. // Euro. Surveill. -2007. - № 12.-P. 3291.

367. Whitham S. The product of the tobacco mosaic virus resistance gene N: similarity to toll and the interleukin-1 receptor / S. Whitham, S. P. Dinesh-Kumar, D. Choi et al. // Cell. - 1994. - V 78. - P. 1101-1115.

368. Whipps J. M. Microbial interactions and biocontrol in the rhizosphere / J. M. Whipps // Journal of Experimental Botany. - 2001. - V. 52. - P. 487-511.

369. Wisniewski-Dye F. Phase and antigenic variation mediated by genome modifications / F. Wisniewski-Dye, L. Vial // Anton. Leeuw. Int. J. G. - 2008. -V. 94.-P. 493-515.

370. Yang D. Multiple roles of antimicrobial defensins, cathelicidins, and eosinophil-derived neurotoxin in host defense / D. Yang, A. Biragyn, D. M. Hoover, J. Lubkowski, J. J. Oppenheim // Annu. Rev. Immunol. - 2004. - V. 22. -P. 181-215.

371. Yoo J. S. Molecular cloning and characterization of CMCase gene (celC) from Salmonella typhimurium UR. / J. S. Yoo, Y. J. Jung, S. Y. Chung et al. // J. Microbiol. - 2004. - V. 42, № 3. - P. 205-210.

372. Zamioudis C. Modulation of Host Immunity by Beneficial Microbes / C. Zamioudis, C. M. J. Pieterse // MPMI. - 2012. - V. 25, № 2. - P. 139-150.

373. Zhang H. The role of G-proteins in plant immunity / H. Zhang, Z. Gao, X. Zheng, Z. Zhang // Plant Signaling & Behavior. - 2012. - V.7, № 10. - P. 1284-1288.

374. Zhang W. The plant innate immunity response in stomatal guard cells invokes G-protein-dependent ion channel regulation / W. Zhang, S. Y. He, S. M. Assmann // Plant J. - 2008. - V. 56, № 6. - P. 984-996.

375. Zeier J. Genetic elucidation of nitric oxide signaling in incompatible plant-pathogen interactions / J. Zeier, M. Delledonne, T. Mishina et al. // Plant Physiology. - 2004. - V. 136. - P. 2875-2886.

© i)

376. Ziennel D. K. Isolation and Characterization of Endophytic Colonizing Bacteria from Agronomic Crops and Prairie Plants / D. K. Zinniel, P. Lambrecht, N. B. Harris et al. // Applied And Environmental Microbiology. -2002. - V. 68, № 5. - P. 2198-2208.

377. Zhuang R.Y. Fate of Salmonella montevideo on and in raw tomatoes as affected by temperature and treatment with chlorine / R. Y. Zhuang, L. R. Beuchat, F. J. Angulo // Appl. Environ. Microbiol. - 1995. - V. 61, № 6. -P.2127-2131.