Получение рекомбинантных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis и перспективы их использования для серодиагностики туберкулеза тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Дятлова, Варвара Ивановна

  • Дятлова, Варвара Ивановна
  • кандидат науккандидат наук
  • 2015, Москва
  • Специальность ВАК РФ03.02.03
  • Количество страниц 209
Дятлова, Варвара Ивановна. Получение рекомбинантных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis и перспективы их использования для серодиагностики туберкулеза: дис. кандидат наук: 03.02.03 - Микробиология. Москва. 2015. 209 с.

Оглавление диссертации кандидат наук Дятлова, Варвара Ивановна

ОГЛАВЛЕНИЕ

Введение

Актуальность темы исследования

Степень разработанности темы исследования

Цели и задачи

Научная новизна

Теоретическая и практическая значимость работы

Методология и методы исследования

Объекты исследования

Методы исследования

Личное участие автора в получении результатов

Положения, выносимые на защиту

Степень достоверности и апробация результатов

Публикации

Объем и структура диссертации

Основная часть

Глава 1. Обзор литературы

1.1. Эпидемиологическая ситуация по туберкулезу в Российской Федерации

1. 2. Современные методы диагностики туберкулеза

1.2.1. Современные методы иммунодиагностики туберкулеза

1.2. 1. 1. Туберкулинодиагностика

1.2. 1.2. Методы детекции высвобождения гамма-интерферона

1.2. 1.3. Иммуносеродиагностика

1.3. Особенности гуморального иммунного ответа при туберкулезе

1. 4. Антигены Mycobacterium tuberculosis, имеющие потенциал для

серодиагностики туберкулеза

1.4.1. Критерии отбора антигенов М. tuberculosis для целей

серодиагностики туберкулеза

1. 4. 2. Способы получения антигенных препаратов М. tuberculosis

для целей серодиагностики туберкулеза

1. 4. 3. Белковые антигены М. tuberculosis, обладающие потенциалом

для использования в серодиагностике туберкулеза

1. 4. 3. 1. «RD1 белки» М. tuberculosis

1. 4. 3. 2. Другие потенциальные белковые антигены М. tuberculosis

для целей серодиагностики туберкулеза

1. 4. 4. Липидные и углеводные антигены М. tuberculosis

1. 4. 4. 1. Липоарабиноманнан (ЛАМ)

1. 4. 5. Конъюгаты белков М. tuberculosis с углеводными фрагментами ЛАМ

1. 4. 6. Мультиантигеиные композиции, используемые

в серодиагностике туберкулеза

Глава 2. Собственные исследования

2. 1. Получение антигенов М tuberculosis разными методами

2. 1. 1. Получение рекомбинаитных белков М tuberculosis

в экспрессиопной системе E.coli

2. 1.2. Результаты химической конъюгации рекомбинаитных белков с

гексаарабинофуранозидом ЛАМ

2. 1.3. Получение рекомбинаитных белков М. tuberculosis

в экспрессиопной системе Р. pastoris

2. 2. Результаты иммуноферментного анализа (ИФА)

2. 2. 1. Результаты ИФА с белками М. tuberculosis,

экспрессированными в системе E.coli

2. 2. 2. Результаты ИФА с конъюгатами белков М. tuberculosis, полученных в системе Е. coli, с синтетическим

гексаарабинофуранозидом ЛАМ

2. 2. 3. Результаты ИФА с белками М. tuberculosis,

экспрессированными в системе P. pastoris

2. 3. Сравнение диагностического потенциала рекомбинантных

и синтетических антигенов М. tuberculosis

2. 3. 1. Сравнение показателей эффективности применения в ИФА белков М. tuberculosis, полученных в Е. coli, и их конъюгатов

с гексаарабинофуранозидом ЛАМ

2. 3. 2. Сравнение результатов применения в ИФА аналогичных

рекомбинантных белков М. tuberculosis, иолучеиных в разных

экспрессионных системах

2. 3. 3. Сравнение результатов применения в ИФА трех вариантов

одного белка М. tuberculosis, полученного разными методами

2. 4. Определение расчетных показателей эффективности

мультиантигенных композиций, включающих антигены

М. tuberculosis, использованные в работе

Заключение

Выводы

Практические рекомендации

Перспективные направления дальнейшей разработки темы

Приложения

Приложение 1. Нуклеотидные последовательности праймеров,

использованных в работе

Приложение 2. Основные характеристики белков M tuberculosis,

использованных в работе

Приложение 3. Гель - электрофореграмма образцов ДНК

Приложение 4. Гель - электрофореграммы белков М. tuberculosis,

использованных в работе

Приложение 5. Результаты иммуноблог анализа

Принятые обозначения и сокращения

Список литературы

Список иллюстративного материала

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Получение рекомбинантных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis и перспективы их использования для серодиагностики туберкулеза»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Одной из приоритетных задач отечественного здравоохранения является улучшение эпидемиологической ситуации по туберкулезу. По данным Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), Российская Федерация (РФ) входит в список 22 стран с высоким бременем туберкулеза, па которые приходится около 80% случаев данного заболевания в мире. Согласно ее оценке, до 20% новых случаев туберкулеза в России остаются недиагностированными в течение года [335]. При этом каждый невыявленный больной с активной формой туберкулеза ежегодно может заразить до 15 человек, а риск возникновения заболевания у тубинфицированных лиц составляет от 15 до 50% уже в течение первых двух лет после контакта с больным.

Своевременное применение эффективных методов диагностики туберкулеза может способствовать снижению темпов распространения данного заболевания [29, 31, 223].Традиционные методы диагностики туберкулеза обладают рядом недостатков: длительность культурального цикла Mycobacterium tuberculosis, недостаточная чувствительность анализа мазков, неспецифичность радиологического анализа и туберкулиновых проб, трудности диагностики внелегочного туберкулеза и другие [223].

Методы диагностики туберкулеза, основанные на детекции реакций иммунитета, могут стать привлекательной альтернативой традиционным методам, так как позволяют в ранние сроки выявлять заболевание вне зависимости от локализации очага и распространенности инфекции [31, 108].

Одним из перспективных методов иммунодиагностики туберкулеза является серодиагностика. Она в отличие, например, от туберкулинодиагностики обладает способностью дифференцировать активный туберкулез от латентной инфекции или предшествующей вакцинации бациллой Кальметта-Гсрспа (БЦЖ).

К ее преимуществам можно также отнести простоту, воспроизводимость, малую инвазивность методик, скорость исполнения анализов.

Серодиагностические тест-системы, выполненные в формате иммунохроматографических (ИХ) тестов, за счет невысокой цены и возможности их применения без специализированных лабораторий и медицинского персонала, могут быть востребованы для скрининга населения на туберкулез в странах с низким уровнем медицины [15, 108].

При разработке серодиагностических тест-систем по выявлению туберкулеза необходим аргументированный выбор антигенных препаратов. Эффективность данных тестов также в значительной степени зависит от качества антигенов, входящих в их состав, что обусловлено, прежде всего, способом их производства. Например, применение дрожжевой системы экспрессии Pichia pastoris, в отличие от традиционно используемой бактериальной системы Escherichia coli, позволяет получать рекомбииаитные белки М. tuberculosis в гликозилированной форме, что сближает их по структуре с нативпыми антигенами и обеспечивает эффективное взаимодействие данных антигенов со специфическими антителами в иммунологических анализах [ 185, 273].

Важной задачей при конструировании новых антигенов для серотестов является оптимизация композиции эгштопов для компенсации индивидуальной и региональной гетерогенности гуморального ответа больных туберкулезом [349|. Перспективными подходами для объединения нужных эпигонов из различных антигенов являются получение химерных белков, кодируемых слитными генами, а также химическая конъюгация белков с углеводными молекулами, например, с гексаарабинофуранозидом (Ага/6) - основным эпигоном липоарабиноманнана (ЛАМ) [108, 126, 136].

Таким образом, наиболее актуальной задачей развития серодиагностики туберкулеза является создание новых антигенов, которые смогут обеспечить чувствительность и специфичность серотестов, требуемые для возможности их применения в качестве первичного дополнительного метода обследования населения на туберкулез.

Степень разработанности темы исследования

Впервые серодиагностика туберкулеза была применена в конце 19 века С. Арлоингом, но показала низкую эффективность [46].

Интерес к разработке серологических тестов на туберкулез возобновился после внедрения в научную практику иммуноферментного анализа (ИФА) [55, 223]. Однако использование в ИФА грубых антигенных препаратов из культуры М tuberculosis приводило к возникновению перекрестных реакций с сыворотками здоровых людей, и, следовательно, низкой специфичности анализов [170, 318].

Современные серотссты включают преимущественно хорошо очищенные нативные или рекомбинантные белковые, а также гликолигшдные антигены М. tuberculosis [48, 236, 303].

В настоящее время на рынке представлено более 70 серодиагностических тестов на туберкулез, но, в связи с недостаточными показателями их чувствительности и специфичности, ни один из тестов не рекомендован ВОЗ для применения без учета результатов традиционных методов диагностики туберкулеза [44, 292, 334, 335].

Цели и задачи

Цель исследования - получение рекомбинантных и сиитетических антигенов Mycobacterium tuberculosis и оценка их потенциала для применения в серодиагностике туберкулеза.

Задачи исследования:

1. Сформулировать критерии выбора антигенов Mycobacterium tuberculosis, пригодных для серодиагностики туберкулеза.

2. Применить системы экспрессии Escherichia coli, Pichia pastor is, а также методы химического синтеза и конъюгации для получения антигенов Mycobacterium tuberculosis.

3. Сформировать панели сывороток здоровых доноров и пациентов с диагнозом туберкулез из одного региона Российской Федерации.

4. Провести сравнительный анализ чувствительности и специфичности взаимодействия полученных антигенов Mycobacterium tuberculosis с сыворотками здоровых доноров и туберкулезных больных с помощью иммуноферментного анализа.

5. Установить перспективные комбинации рекомбинантных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis для серодиагностики туберкулеза с учетом данных об индивидуальной вариабельности антительпого ответа при туберкулезной инфекции.

Научная новизна

Впервые показана возможность получения ряда антигенов Mycobacterium tuberculosis, а именно Rv0040c, Rvl837c, Rvl860, Rv2873, Rvl636 - Rv2185c и Rv2875, в экспрессиониой системе Pichia pastoris с целью дальнейшего использования их в качестве основного компонента серодиагностического теста на туберкулез.

Установлено, что серодиагностический потенциал белков, экспрессированных в дрожжевой системе Pichia pastoris, выше, чем у аналогичных белков, экспрессированных в системе Escherichia coli, что свидетельствует о том, что применение системы Pichia pastoris для получения антигенов Mycobacterium tuberculosis может повысить эффективность серодиагностики туберкулеза.

Получены новые данные о конъюгатах рекомбинантных белков с углеводными молекулами, а именно показано, что химическое копъюгированис ряда белков Mycobacterium tuberculosis, экспрессированных в системе Escherichia coli, с синтетическим гексаарабинофуранозидом липоарабиномапнапа приводит к повышению чувствительности ИФА с сыворотками больных туберкулезом.

Результаты тестирования 24 антигенов Mycobacterium tuberculosis с сыворотками, полученными из Саратовской области, позволили выявить наиболее перспективные антигены для применеиия в серодиагностике туберкулеза на территории данного региона.

Определены перспективные комбинации рекомбинаитпых и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis для эффективного выявления туберкулеза с помощью серодиагностики в конкретном регионе (Саратовской области).

Теоретическая и практическая значимость работы

Разработана научно обоснованная концепция получения рекомбииаптных антигенов Mycobacterium tuberculosis, пригодных для использования в серодиагностике туберкулеза.

Определена значимость различных способов гликозилирования (микробиологического и химического) белковых антигенов Mycobacterium tuberculosis для их иммунореактивпости в серологических тестах, что расширяет представления о роли углеводных молекул в иммунном ответе при туберкулезе.

Показана возможность использования дрожжевой системы экспрессии Pichia pastoris для получения рекомбинаитпых белков Mycobacterium tuberculosis, пригодных для серодиагностики туберкулеза. Установлено, что антигены, экспрессированные в Pichia pastoris, имеют более высокую иммунорсакгивность с сыворотками больных туберкулезом, чем антигены, экспрессированные в системе Escherichia coli.

Применяемые в работе лабораторные методы для получения ряда ашшенов Mycobacterium tuberculosis в дрожжевой системе экспрессии Pichia pastoris могут быть легко масштабированы, что создает основу для массового производс!ва недорогих и эффективных туберкулезных серотестов.

Установлено, что химическое конъюгирование рекомбинаитпых белков Mycobacterium tuberculosis с синтетическим гексаарабинофурапозидом липоарабиноманнана является перспективным методом повышения эффективности серодиагностики туберкулеза.

Полученные данные о серодиагностическом потенциале различных рекомбинантных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis могут учитываться при разработке новых серотестов на туберкулез.

Подобрана мультиантигепная композиция из рскомбинаитных и синтетических антигенов Mycobacterium tuberculosis, обладающая высокой прогностической эффективностью, для выявления больных туберкулезом в Саратовской области.

Результаты работы были использованы при разработке иммунохроматографических тестов для серодиагностики микобактериозов, в частности, туберкулеза и лепры (акт внедрения от 1.12.2014 г.).

Методология и методы исследования

Работа выполнена в отделе иммупобиохимии патогенных микроорганизмов Федерального бюджетного учреждения науки «Государственного научного центра прикладной микробиологии и биотехнологии» (ФБУН ГНЦ Г1МБ).

Методология исследования была определена соответственно поставленной цели. Предметом исследования стали проблемы, связанные с получением антигенов М. tuberculosis разными способами и оценкой их потенциала для целей использования в серодиагностике туберкулеза.

Объекты исследования

Основными объектами исследования являлись сыворотки крови больных туберкулезом и здоровых БЦЖ-вакцинированпых доноров из Саратовской области.

Панель сывороток контрольной группы составляли образцы сывороток от 30 здоровых БЦЖ-вакцинированных доноров из Саратовской области. Все доноры из контрольной группы были пациентами неврологического отделения Медицинского учреждения здравоохранения «1-ой городской клинической больницы им. Ю. Я. Гордеева» города Саратова, не состоящими на учете в туберкулезном диспансере и не имеющими клинических признаков туберкулеза.

В панель сывороток исследуемой группы входили образцы от 100 больных туберкулезом легких с подтвержденным диагнозом, полученные из Государственного учреждения здравоохранения «Областного клинического противотуберкулезного диспансера» Саратовской области.

68% доноров больных туберкулезом были мужчины. Средний возраст больных составил 39 (от 18 до 80) лет. 90% допоров исследуемой группы были вновь выявленными больными, остальные - имели рецидив хронического туберкулеза.

Распределение доноров по диагностированным формам туберкулеза было следующее (рисунок 1): 76% - инфильтративная, 11% - диссеминировапная, 5% -фиброзно-кавернозпая, 5% - очаговая формы туберкулеза, 2% - туберкулема, 1% -цирротический туберкулез.

У 30 больных был выявлен туберкулез легких в фазе распада. 54% из всех больных были бактериовыделителями.

Для 27% больных диагноз был подтвержден бактериоскопией мазка мокроты с окраской по Цшпо-Нильсену, для 44% - посевом мокроты на плотные питательные среды.

У 27% доноров исследуемой группы было выявлено посительство штаммов М. tuberculosis с множественной лекарственной устойчивостью (МЛУ).

Ни один донор не имел вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) -положительного статуса. От всех доноров получено информированное согласие на использование образцов крови в исследовании.

Сыворотки были собраны в течение двух недель, разделены на аликвоты, хранились при температуре минус 80°С и использовались в течение одного года. Изменений в их активности при повторных контрольных анализах не наблюдалось.

В качестве материалов исследования в работе также были использованы хромосома М. tuberculosis штамма H37Rv (ФБУН ГНЦ ПМБ); плазмиды pET32b(+), pPIC9 (Invitrogen, США), pPMClfopL-ag85B-esat-6 (ФБУН ГНЦ ПМБ); штаммы Е. coli BL21-CodonPlus(DE3)-RP (Novagen, Inc., США), E. coli TOPIO'F, E. coli DH5a, P. pastoris KM71 и GS115 (Invitrogen, CLLIA).

■ Инфильтративный туберкулез легких

■ Цирротический туберкулез легких

□ Диссеминированный туберкулез

легких

□ Очаговый туберкулез легких

легких

Ш Фиброзно-кавернозный туберкулез

9 Туберкулема

Рисунок 1 - Распределение доноров исследуемой группы по диагностированным формам туберкулеза

Методы исследования

В работе использовали методы молекулярной биологии (полимеразная цепная реакция (ПНР), электрофорез ДНК, молекулярное клонирование, методы выделения ДНК), микробиологии (культивирование Е. coli, P. pastoris), биохимии (аффинная хроматография, определение концентрации белка, высаливание, диализ, электрофорез белков в полиакриламидном геле (ПААГ)), иммунохимии (иммуноблот, ИФА), химии (химический синтез и конъюгация), статистики (параметрические и непараметрические методы анализа данных, анализ кривых операционной характеристики (ROC (receiver-operating characteristic) анализ)).

Полимеразная цепная реакция. Реакционная смесь для ПЦР (25мкл) включала ЮмМ Трис-HCl (рН=8,3), 1,5мМ MgCl2, 50мМ KCL, 0,2мМ дезоксинулеотидтрифосфат (дНТФ), 400 нМ олигонуклеотидов, 5% диметилсульфоксид, 1ед. Taq ДНК - полимеразы (Fermentas, Литва). Хромосомную ДНК М tuberculosis штамма H37Rv добавляли из расчета 10 нг на 25 мкл реакционной смеси.

Параметры ПЦР реакций: начальная денатурация 95°С-Змии, 30 циклов: денатурация 95°С - 30е, отжиг 50 - 64°С (в зависимости от нуклеотидного состава праймеров) - 30с, элонгация 72°С - от 30с до Змии (в зависимости от длины амплифицируемого фрагмента ДНК), завершающая элонгация 72°С - Юмин.

Гены белков Rv0222, Rvl860, Rv2875, Rv3425, Rv3872, Rv3875 амплифицировали с хромосомы M. tuberculosis штамма H37Rv методом ГЩР со специфическими праймерами (Синтол, Москва) (приложение 1).

Размеры амплифицированных генов и их расположение в хромосоме М. tuberculosis штамма H37Rv указаны в приложении 2.

Для амплификации гена rv1837с первоначально с хромосомы М. tuberculosis штамма H37Rv методом ПЦР с помощью праймеров For2,6kb и Rev2,6kb амплифицировали участок ДНК (2600 пар оснований (п. о.)), содержащий нуклеотидную последовательность гена rv1837с. Очищенный продукт ПЦР, 2600 п. о., использовали в качестве матрицы для амплификации геиа rv1837с со специфическими праймерами.

Кодирующая последовательность rvl886c-rv3875 амплифицировали с pPMClfopL-ag85B-esat-6 (любезно предоставлена В.М.Павловым (ФБУН ГНЦ ПМБ)) методом ПЦР.

Гены rv0040c, rv!636, rv2185c, rvl860, rv28 73, rv2875 амплифицировали с хромосомы M. tuberculosis штамма H37Rv методом ПЦР со специфическими праймерами (приложение 1).

Ген rvl837c амплифицировали с плазмиды pET32bRvl837c. Гены rv0040c, rvl860, rv2875 амплифицировали без сигнальных последовательностей. Длины сигнальных последовательностей в генах рассчитывали программой SignalP 3.0 Server [272], они составили для rv0040c - 96 п. о., rvl860 -117 п. о., rv2875 -90 п. о. «Гистидиновые таги», состоящие из 6 нуклеотидных последовательностей гистидина, вносили в гены с их 5' концов праймерами.

Анализ соответствия длин полученных фрагментов размерам амплифицируемых генов проводили посредством электрофореза (приложение 3).

Электрофорез ДНК. Электрофорез ДНК проводили в 1-2% агарозном геле в однократном трис-ацетатном буфере (ТАЕ (40 мМ Трис HCl, рН=8,0; 1 мМ этилендиаминтетраукеусной кислоты (ЭДТА); 20 мМ ледяная уксусная кислота)). Детектировали результаты визуализизацией гелей, окрашенных бромистым этидием, в ультрафиолетовом излучении.

Методы выделения ДНК. Выделение плазмидной ДНК производили набором AxyPrep plasmid miniprep kit, геномной ДНК - AxyPrep Multisource Genomic DNA Miniprep Kit, а очистку ДНК из растворов и гелей - AxyPrep DNA Gel Extraction Kit (Axygen Bioscience, США).

Молекулярное клонирование и трансформация клеток Е. coli. Полученные ампликоны генов {rv0222, rvl860, rv2875, rv3425, rv38 72, rv3875, rv1837c, rvl886c-rv3875), гидролизованиые сначала ферментом Ndel в течение 3 часов при 37°С в однократном буфере О (Fermentas, Литва), а затем ферментами Xhol (для Rvl860), либо PlindIII (для остальных генов) в однократном буфере R (Fermentas, Литва) в течение 3 часов при 37°С, вставили по сайтам рестрикции Ndel и Xhol, либо Ndel и HindIII в плазмиду рЕТ32Ь(+), гидролизоваиную соответствующими ферментами, в открытую рамку считывания с кодирующей последовательностью шести гистидинов.

Лигирование гидролизованных вектора и генов проводили в соотношении линеаризованных концов вектор: вставка - 1:5, в Юмкл реакционной смеси, содержащей 5 ед. Т4ДНК лигазы (Fermentas, Литва), в течение 1 часа при 22°С. Полученными лигазными смесями трансформировали химически компетентные клетки Е. coli штамма ТОРЮ методом «теплового шока» в течение 45с при 42°С. Трансформапты растили на среде Луриа-Бертани (LB) с 100 мкг/мл ампициллина при 37°С. Соответствие нуклеотидных последовательностей вставок в рекомбинантных плазмидах соответствующим генам белков подтверждали секвенированием данных плазмид с Т7 праймерами (приложение 1) на приборе MEGA Base750 (Amersham, Швеция). Выделенными рекомбинаптными плазмидами трансформировали химически компетентные клетки Е. coli штамма BL21-CodonPlus(DE3)-RP методом «теплового шока» в течение 45с при 42°С.

Молекулярное клонирование и трансформация клеток P. pastoris.

Вектор рР1С9 и гены rv0040c, rvl636, rv1837с, rv!860, rv2873, rv2875 гидролизовалн ферментами рестрикции EcoRJ и Noll в однократном буфере О (Fermentas, Литва) в течение 16 часов при 37°С, затем проводили лигированис гидролизованных вектора и генов в соотношении линеаризованных концов вектор: вставка - 1:5, в 10 мкл реакционной смеси, содержащей 5 ед. Т4 ДНК-лигазы (Fermentas, Литва), в течение 1 часа при 22°С. Плазмиду pPIC9Rvl636 и ген rv2185c рестрицировали ферментами Avril и Noll в буфере Tango (Fermentas, Литва) при 37°С в течение 16 часов, затем проводили лигировапие линеаризованных гшазмиды pPIC9Rvl636 и гена rv2185c. Полученными лигазными смесями трансформировали химически компетентные клетки Е. coli штамма DH5a методом «теплового шока» 45с при 42°С.

Схема рекомбииаитной гшазмиды рР1С9 с встроенным геном белка представлена на рисунке 2.

Трансформанты растили на среде LB с 100 мкг/мл ампициллина при 37°С. Выделенные из них плазмиды анализировали на наличие соответствующих вставок рестрикциоипым картированием по сайтам EcoRI и Notl, методом П1{Р с праймерами АОХ1 5' и АОХ1 3', а также секвенированием плазмид с АОХ1 3' и АОХ1 5' праймерами па приборе MEGA Base750 (Amersham, Швеция).

Рекомбинантные плазмиды pPIC9Rv0040c, pPIC9Rvl837c, pPIC9Rvl860, pPIC9Rv2873, pPIC9Rvl636-Rv2185c линеаризовали ферментом Sacl, а плазмиду pPIC9Rv2875 - ферментом Sali (так как сайт рестрикции Sacl присутствовал в гене Rv2875).

Клетки штаммов Р. pastoris GS 115 (для плазмид pPIC9Rvl636-Rv2185c и pPIC9Rvl837c) и КМ71 (для остальных плазмид) трансформировали линеаризованными плазмидами методом электропорации на приборе MicroPulser (Bio-Rad Laboratories, Inc.,США) в 0,2 см кювете в растворе 1 M сорбитола при 4°С (напряжение - 2 кВ, длительность воздействия - 5 мс).

На рисунке 3 представлена схема вставки гена белка в ЛОХ1 и his4 локусы хромосомы P. pastoris.

SacI

5Y,

AÜK1

i

AOX1

\ 6-cat ii3i белка стоп ^Nofl

снракгор EooRI V

НБ4 - 3'AOXl

Рисунок 2 - Конструкция рекомбинантной плазмиды рР1С9. Примечания: Paoxi ~ промотор гена АОХ1; 6*cat - нуклеотидная последовательность, соответствующая 6 гистидинам; ATG - точка начала транскрипции; SacI, Sali, EcoRI, NotI - сайты рестрикции; HIS4 - ген гистидинол дегидрогеназы в рР1С9, his4 - мутантный ген гистидинол дегидрогеназы в хромосоме P. pastoris\ стоп -стоп-кодон.

У

а)-5'АОХ1

L ДГ

сгопз' ч 57pagm =1—/

о-фектор

6-cat

гея белка

Углы

Экспрессионная кассета (ЭК)

3'AOXl

IIIS4 I fis+

k

5'Р

AQX1

/

а-фжтор 6-cat ген белка СПЯ! 1

ЭК

113'AOXl ^Ж^ з7

!]C#

His

Рисунок 3 - Схема вставки гена белка в АОХ1 (а) и Ыб4 (б) локусы хромосомы Р. раБ^пБ. Примечания: Рдох1 - промотор гена АОХ1; 6»са1 -нуклеотидная последовательность, соответствующая 6 гистидинам; Н184 - ген гистидинол дегидрогеназы в рР1С9, Ыб4 - мутантный ген гистидинол дегидрогеназы в хромосоме Р. раБЮпБ', стоп - стоп-кодон; стрелки на рисунке (а) обозначают возможные позиции вставки гена.

Селекцию трансформантов проводили на чашках с агаром с минимальной средой с декстрозой (minimal dextrose (MD)) (1,34% дрожжевой азотной основы (yeast nitrogen base (YNB)) (Invitrogen, США), 0,04% биотин (Sigma-Aldridge,

Германия), 2% глюкоза, 1,5% агар (Рапгеас, Испания)) - по росту без гистидипа, затем на чашках с агаром с минимальной средой с метанолом (minimal methanol (MM)) (1,34% YNB, 0,04% биотин, 1% метанол, 1,5% агар) - по росту с метанолом. Подтверждали наличие генов в хромосомах трансформированных штаммов методом ПЦР с ЛОХ1 5' и АОХ1 3' праймерами (приложение 1).

Экспрессия рекомбинангных белков М. tuberculosis в системе Е. coli. Экспрессию белков проводили в штамме Е. coli BL21-CodonPlus(DE3)-RP под индукцией 1мМ изопропил-Р-О-галактогшранозид (ИПТГ) и селективным давлением антибиотиков в среде LB (1% триптон, 0,5% дрожжевой экстракт, 1% хлорид натрия). Трансформированные штаммы-продуценты рекомбинаптпых белков М. tuberculosis выращивали в 5 мл среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина, 34 мкг/мл хлорамфеникола, ночь при 30°С, 250 об/мии до насыщения OD600=4. Затем 1 мл полученной ночной культуры вносили в 500 мл среды LB с ампициллином (100 мкг/мл), хлорамфепиколом (34 мкг/мл), растили до достижения поздней логарифмической фазы около 2 часов при 37°С, затем добавляли ИПТГ до 1 мМ, феиилметилсульфонил флуорид (ФМСФ) до 1 мМ и инкубировали при 37°С, 250 об/мии, в течение 4 часов.

Экспрессия рекомбинаптпых белков в системе P. pastoris. Для оценки экспрессирующей способности отобранных клонов, было проведено культивирование в «малом объеме». Отобранные клоны растили 48 часов при 30°С, 250 об/мин в буферизированной среде с глицерином (buffered glyccrol-complex medium (BMGY)) (1% дрожжевой экстракт, 2% пептон, 100 мМ калий-фосфатный буфер, рН=6,0, 1,34% YNB, 0,04% биотин, 1% глицерин), затем клетки переносили в буферизированную среду с метанолом (buffered methanol-complex medium (BMMY)) (состав аналогичен BMGY, no глицерин заменен па 1% метанол) до OD600=1- В качестве ингибитора протеаз вносили в среду казаминовые кислоты (Bccton Dickinson, США) до 1%. Культуру инкубировали 100 часов при 30°С, 250 об/мин, отбирая пробы культуры (клетки и супериатант) и добавляя метанол до концентрации 1% в среде каждые 24 часа. Образцы клеток из 0,5 мл среды лизировали с помощью литиказы (Sigma-Aldrich, Германия)

(0,1 мг/мл) в лизирующем буфере (1 М сорбитол, 10 мМ Трис-HCl, рН=7,5, 10 мМ дитиотреитол (ДТТ), 10 мМ ЭДТА), а образцы супериатанта из 0,5 мл среды концентрировали высаливанием белков сульфатом аммония до насыщения 70%, затем осадок растворяли в Юмкл однократного буфера для образцов (50 мМ Трис-HCl, 10% глицерин, 1% додецилсульфат натрия (ДСН), 0,0025% бромфеноловый синий, 100 мМ ß-меркаптоэтанол). Образцы анализировали в ДСН-электрофорезе в 10-12% ПАЛГ и в иммуноблоте. Препаративное культивирование (объем среды 400 мл) проводили в соответствии с методикой для культивирования в «малом объеме».

Электрофорез белков. Электрофорез белков проводили по методу Лэммли в 10-12% разделяющем полиакриламидном геле [171]. Образцы белков вносили в гель в однократном буфере для образцов (50 мМ Трис-HCl, рН=6,8, 10% глицерин, 2% ДСН, 0,02% бромфеноловый синий, 1% ß-меркаптоэтапол). Визуализировали полосы белков в геле после окраски их PageBlue ProteinStain (Fermentas, Литва).

Очистка белков из культуры Е. coli. Очистку белков из культуры Е. coli проводили методом металлхелатной хроматографии в денатурирующих условиях с 8 М мочевиной. Культуру собирали после 4 часов индукции, центрифугировали 2800g 15 мин, клетки ресуспендировали в буфере нанесения (50 мМ Трис-HCl, рН=8,0, 500 мМ NaCl, 8М мочевина, 10 мМ имидазол), вносили ФМСФ до 1 мМ, обрабатывали ДНКазой I (10000 ед./мл), лизоцимом (20 мг/мл) и озвучивали па дезинтеграторе UDM-10 («Techpan», Польша) при 44 кГц, 1,8 кВт, 10 раз по 30 с, при 0°С. Лизат клеток центрифугировали 37000 g 15мин.

Наличие белка в лизате культуры клеток Е. coli BL21-CodonPlus(DE3)-RP подтверждали ДСН - электрофорезом в 10-12% ПАЛГ, а присутствие полигистидинового тага - в иммуноблоте [16]. Супернатапт после центрифугирования лизата клеток наносили на колонку (Amersham, Швеция) с 5 мл иминодиуксусиой сефарозы (Iminodiacetic acid Sepharose, Sigma-Aldridge, Германия), предварительно насыщенной ионами никеля и уравновешенной буфером нанесения. Колонку промывали 10 объемами буфера нанесения, 3

объемами буфера с 60 мМ имидазола (50 мМ Трис-HCl, рН=8,0, 500 мМ NaCl, 8 М мочевина, 60 мМ имидазол), затем элюировали белки элюирующим буфером (50 мМ Трис-HCl, рН=8,0, 250 мМ имидазол, 8 М мочевина, 500мМ NaCl). Фракции анализировали электрофорезом в 10% ПААГ (приложение 4 рисунки А, Б, El).

Очистка белков из культуры P. pastoris. Очистку белков из культуры Р. pastoris проводили методом металлхелатной хроматографии в нативпых условиях. На пятые сутки индукции культуру Р. pastoris центрифугировали 3000g 15мин, отбирали сунерпатапт. Высаливали белки из супернатанта сульфатом аммония (Рапгеас, Испания) до насыщения раствора 70%, центрифугировали полученный раствор 33000g ЗОмин, осадок растворяли в буфере иапесения (50 мМ Трис-HCl, 500 мМ KCl, 10 мМ имидазол, рН=8,0) в объеме, соответствующем 2/3 первоначально отобранного количества супернатанта культуры.

Раствор наносили па колонку с иминодиуксусной сефарозой (Iminodiacetic acid Sepharose, Sigma-Aldridge, Германия), предварительно насыщенную ионами никеля и уравновешенную буфером нанесения. Промывали колонку 3 объемами колонки (15 мл) буфера нанесения и 10 мл буфера с 30 мМ имидазола (50 мМ Трис-HCl, рН=8,0, 500 мМ KCl, 30 мМ имидазол). Элюировали белки элюирующим буфером (50 мМ Трис-HCl, 500 мМ KCl, 300 мМ имидазол, рН=8,0). Полученные фракции анализировали ДСП-электрофорезом в 10% ПААГ (приложение 4 рисунки В, Г, Е2).

Диализ белков. Белки диализовали против фосфатного буфера (137 мМ NaCl, 2,7 мМ KCl, 8 мМ Na2HP04, 1,4 мМ КН2Р04, рН=7,4) с добавлением ФМСФ до 1мМ в течение 16 часов при 22°С.

Определение концентрации белков. Концентрации белков определяли ДСН-электрофорезом в 10% ПААГ или по мех оду Лоури [16]. Копцсшрации очищенных белков высчитывали с помощью коэффициентов молярной экстинкции (абсорбции) согласно закону Бира [222]. Измерения проводились на спектрофотометре СФ-56 (ОКБ Спектр, Россия) па 280 им против диализного буфера.

Похожие диссертационные работы по специальности «Микробиология», 03.02.03 шифр ВАК

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Дятлова, Варвара Ивановна, 2015 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Абронина, П. И. Синтез гексасахаридных фрагментов арабинанов клеточной стенки Mycobacterium tuberculosis в виде гликозидов с фунционализовапным агликоном и неогликоконъюгатов на их основе / 11. И. Абронина, Л. О. Кононов, Н. М. Подвальный, В. И. Торгов, А. И. Зинин, В. В. Качала, Т. М. Мельникова // Тезисы доклада на Всероссийской конференции но органической химии, посвященной 75-летию со дня основания ИОХ РАН. -М., 2009. - С. 80.

2. Арчакова, Л. И. Совершенствование терапии на основе изучения иммуногенетических факторов в формировании туберкулеза легких: автореферат диссертации доктора медицинских наук: 14.00.26 // Арчакова Людмила Ивановна. - СПб., 2009,- С. 1-38.

3. Балпанова, Г. Т. Генетические маркеры инфекционных заболеваний / Г. Т. Балпанова, А. А. Шортанбаев, Д. Ж. Талгатбекова // Вестник КазНМУ. -2013,-№5.-С. 1 -5.

4. Статистический бюллетень Федеральной службы государственной статистики (Росстат) «Численность и миграция населения Российской Федерации в 2012 году» - выпуск 2013 г. [Электронный ресурс]. // Росстат. -М., 2013. - Режим доступа: http://www.gks.ru/bgd/regl/bl3_107/Main.hUTi

5. Справка Федерального научно-методический центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2013 г». [Электронный ресурс] // ФБУН ЦНИИЭ Роспотребнадзора. - М., 2013. - Режим доступа: http://www.aidsvolgograd.ru/index_htm_files/hivrussia.pdf

6. Возякова, Т. Р. Метод ускоренной диагностики туберкулеза / Т. Р. Возякова, О. Е. Стебловская, В. Н. Максимова // Здравоохранение Чувашии: ежеквартальный научно-практический журнал. - 2010. - № 2. - С. 21 - 26.

7. Гланц, С. Медико-биологическая статистика. Пер. с апгл. / С. Гланц. - М.: Практика, 1999. - 460 с.

8. Гончарова, И. А. Геномные основы предрасположенности к инфекционным заболеваниям / И. А. Гончарова, М. Б. Фрейдин, А. А. Рудко, О. В. Напалкова, О. В. Колоколова, Э. А. Ондар, JI. Е. Дунаева, Е. В. Белобородова, В. П. Пузырев // Вавиловский журнал генетики и селекции. - 2006. - Т. 10 -№3,- С. 540 - 552.

9. Дементьева, JI. А. Особенности развития ситуации по ВИЧ-инфекции в Российской Федерации / Л. А. Дементьева // Справочник заведующего клинико-диагностической лабораторией. - 2011.- № 9.- С. 9 - 15.

10. Жердев, А. В. Сравнительная характеристика рекомбинантных белков Mycobacterium tuberculosis в серодиагностике туберкулеза / А. В. Жердев, А. А. Мартьянов, В. Г. Авдиенко, С. С. Бабаян, В. Я. Гергерг, А. С. Калюкина, Д. К. Лауринавичуте, Н. В. Позднякова, А. Н. Федоров, Е. С. Северин, Е. А. Панферцев, С. Ф. Бикетов, Н. А. Бызова, Б. Б. Дзантиев // Физиология и патология иммунной системы. - 2006. - Т. 9. - С. 3 - 8.

11. Капков, Л. П. Значение показателей резервуара бациллярных больных туберкулезом органов дыхания в оценке эпидемической ситуации по туберкулезу / Л.П. Капков // Проблемы туберкулеза и болезней легких. -2007. -№ 1.. с. 17-22.

12. Кононец, А. С. Лекарственно-устойчивый туберкулез легких в исправительных учреждениях уголовно-исполнительной системы / А. С. Кононец // Проблемы туберкулеза и болезней легких. - 2008.-№12. - С. 60-63.

13. Кравченко, Т. Б. Клонирование и экспрессия прогективных антигенов Mycobacterium tuberculosis Ag85 и ESAT-6 в клетках Francisella tularensis 15/10 / Т. Б. Кравченко, М. Е. Платонов, Г. М. Вахрамеева, В. А. Баннов, Т. Ю. Кудрявцева, А. Н. Мокриевич, В. М. Павлов // Биохимия. - 2007. - Т. 72. -№7.-С. 905 - 914.

14. Мейснер, А. Ф. Туберкулинодиагпостика у детей. Скрытая (латентная) туберкулезная инфекция? / А. Ф. Мейснер, Е. С. Овсянкииа, Л. Б. Стахеева // Проблемы туберкулеза и болезней легких. — 2008. — № 6. — С. 29-32.

15. Морозова, Т. И. Иммуноферментный и иммунохроматографический анализы в дифференциальной диагностике туберкулеза и онкологических заболеваний органов дыхания / Т. И. Морозова, Т. Ю. Салина, И. И. Завалева // Проблемы туберкулеза и болезней легких.- 2003. - №4 - С. 20-21.

16. Остерман, Л. А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот: электрофорез и ультрацентрифугирование / Л. А. Остерман. - М.: Наука, 1981.-288 с.

17. Подвальный, Н. М. Циклизация 1,2-(метил)ортобензоата Р-Б-арабинофуранозы с помощью бромида магния / II. М. Подвальный, А. И. Зинин, П. И. Абронина, В. И. Торгов, Л. О. Кононов // Известия академии наук. Серия химическая.- 2009. - С. 472 -473.

18. Приказ Минздрава РФ № 109 от 21.03.2003 «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации». Приложение 4. Инструкция по применению туберкулиновых проб [Электронный ресурс]. // Ресурсный центр по изучению политики в сфере туберкулеза. - Режим доступа: http://tbpolicy.ru/documcnts/ index.php?id=l 7&page=40.

19. Система инфекционного контроля в противотуберкулезных учреждениях: руководство / под ред. Л. С. Федоровой. - Тверь: ООО «Издательство «Триада». - 2013. - 192 с.

20. Ситуация по туберкулезу в Приволжском Федеральном округе в 2012 году. Отчет Федерального центра мониторинга противодействия распространению туберкулеза в РФ [Электронный ресурс]. // ФГБУ «ЦНИИОИЗ» Минздрава РФ - Режим доступа:

http://mednet.ru/images/stories/files/CMT/2012tvs5_privolzhskiy_cfo.pdf

21. Ситуация по туберкулезу и работе противотуберкулезной службы Российской Федерации в 2013 году. Отчет Федерального центра мониторинга противодействия распространению туберкулеза в РФ [Электронный ресурс]. // ФГБУ «ЦНИИОИЗ» Минздрава РФ. - Режим доступа: http://www.mednet.ru/images/stories/files/CMT/Tb_rf_2013_2.pdf

22. Стогова, Н. А. Особенности иммунитета и иммунологической реактивности у больных туберкулезным плевритом пожилого и старческого возраста / Н. А. Стогова, II. С. Тюхтин, А. В. Лушникова // Проблемы туберкулеза и болезней легких. - 2008. - № 4,- С. 21 - 24.

23. Туберкулез в Российской Федерации 2011 г. Аналитический обзор статистических показателей, используемых в Российской Федерации и в мире.-М., 2013.-280 с.

24. Туберкулез: руководство для врачей / под ред. А. Г. Хоменко. -М.Медицина, 1996. - 496 с.

25. Федеральные клинические рекомендации по диагностике и лечению латентной туберкулезной инфекции у детей: под ред. В. А. Аксеновой [Электронный ресурс]. // Информационный ресурс Российского общества фтизиатров - Режим доступа: http://roftb.ru/netcat_files/userriles/lti.pdf.

26. Филлипов, А. В. Диаскинтест - новый метод выявления туберкулеза / А. В. Филлипов, Л. В. Слогоцкая, Я. А. Кочетков // Туберкулез и болезни легких. -2011.-№6.-С. 17-22.

27. Фрейдин, М. Б. Сравнительный анализ структуры наследственной компоненты подверженности туберкулезу у тувинцев и русских / М. Б. Фрейдин, А. А. Рудко, О. В. Колоколова, Э. А. Ондар, А. К. Стрелис, В. IT. Пузырев // Молекулярная биология. - 2006. - Т. 40. - №2. - С. 252 - 262.

28. Хаитов, Р. М. Иммунология: учебник / Р. М. Хаитов, Г. Л. Игнатьева, И. Г. Сидорович. - М.: Медицина, 2000. - 432 с.

29. Хоменко, А. Г. Современные тенденции в распространении туберкулеза в России / А. Г. Хоменко // Русский медицинский журнал. - 1998. - Т. 77. - № 17.-С. 1121-1125.

30. Abebe, F. The protective role of antibody responses during Mycobacterium tuberculosis infection / F. Abebe, G. Bjune // Clinical and experimental immunology. - 2009. - V. 157,- N. 2. - P. 235-243.

31. Abebe, F. Progress in serodiagnosis of Mycobacterium tuberculosis infection / F. Abebe, C. Holm-Hansen, H. G. Wiker, G. Bjune // Scandinavian journal of immunology - 2007. - V. 66. - N. 2-3. - P. 176-191.

32. Abronina, P. I. Formation of orthoester-linked D-arabinofuranose oligosaccharides and their isomerization into the corresponding glycosides / P. I. Abronina, S. L. Sedinkin, N. M. Podvalnyy, K. G. Fedina, A. I. Zinin, V. I. Torgov, L. O. Kononov //Tetrahedron Lett. - 2011,-V. 52. - P. 1794-1796.

33. Achkar, J. M. Antibody responses to mycobacterial antigens in children with tuberculosis: challenges and potential diagnostic value / J. M. Achkar, A. Ziegenbalg // Clinical and Vaccine Immunology. - 2012. - V. 19. - N. 12. -P. 1898-1906.

34. Achkar, J. M. Mycobacterium tuberculosis malate synthase - and MPT51 -based serodiagnostic assay as an adjunct to rapid identification of pulmonary tuberculosis / J. M. Achkar, Y. Dong, R. S. Holzman, J. Belisle, I. S. Kourbeti, T. Sherpa, R. Condos, W. N. Rom, S. Laal // Clinical and Vaccine Immunology. - 2006. - V. 113. - P. 1291-1293.

35. Afonso-Barroso, A. Lipoarabinomannan mannose caps do not affect mycobacterial virulence or the induction of protective immunity in experimental animal models of infection and have minimal impact on in vitro inflammatory responses / A. Afonso-Barroso, S. O. Clark, A. Williams, G. T. Rosa, C. Nóbrega, S. Silva-Gomes, S. Vale-Costa, R. Ummels, N. Stoker, F. Movahedzadeh, P. van der Ley, A. Sloots, M. Cot, B. J. Appelmelk, G. Puzo, J. Nigou, J. Geurtsen, R. Appelberg // Cellular Microbiology. - 2013. - V. 15. - N. 4. - P. 660-674.

36. Ahmad, A. Diagnosis of tuberculosis by using ELISA to detect 38 kda mycobacterial antigen in the patients / A. Ahmad, S. Afghan, C. Raykundalia, D. Catty // Journal of Islamic academy of sciences. -1995. - V. 8. - N. 4. - P. 155-160.

37. Akhter, Y. The PE/PPE multigene family codes for virulence factors and is a possible source of mycobacterial antigenic variation: perhaps more? / Y. Akhter, M. T. Ehebauer, S. Mukhopadhyay, S. E. Flasnain // Biochimie. - 2012,- V. 94. -N. 1. -P. 110-116.

38. Almeida, C. M. C. Humoral immune responses of tuberculosis patients in Brazil indicate recognition of Mycobacterium tuberculosis MPT-51 and GlcB / C. M. C. Almeida, A. C. Vasconcelos, A. Kipnis, A. L. Andrade, A. P. Junqueira-Kipnis // Clinical and vaccine immunology.- 2008,- V. 15. - N. 3. - P. 579-581.

39. Al-Orainey, I. O. Diagnosis of latent tuberculosis: Can we do better? / I. O. Al-Orainey // Ann. Thorac Med. - 2009. - V. 4. - N. 1. - P. 5-9.

40. Amicosante, M. Evaluation of a novel tuberculosis complex-specific 34 kDa protein in the serological diagnosis of tuberculosis / M. Amicosante, S. Barnini, V. Corsini, G. Paone, C. A. Read Jr, P. L. Tartoni, M. Singh, C. Albera, A. Bisetti, S. Senesi, M. Campa, C. Saltini // Eur. Respir. J. - 1995. -V. 8.-N.12.-P. 2008-2014.

41. Amicosante, M. Sensitivity and specificity of a multi-antigen ELISA test for the serological diagnosis of tuberculosis / M. Amicosante, M. I loude, G. Guaraldi, C. Saltini // Int. J. Tuberc. Lung Dis. - 1999. - V. 3. - N. 8. - P. 736-740.

42. Andersen, A. B. Structure and mapping of antigenic domains of protein antigen b, a 3 8,000-molecular-weight protein of Mycobacterium tuberculosis / A. B. Andersen, E. B. Hansen // Infection and immunity. - 1989. - V. 57. - N. 8.-P. 2481-2488.

43. Andersen, P. Specific immune-based diagnosis of tuberculosis. Review / P. Andersen, M. E. Munk, J. M. Pollock, T. M. Doherty // Lancet. - 2000. - V. 356. -P.1099-1104.

44. Anderson, B. L. Assessment of three commercially available serologic assays for detection of antibodies to Mycobacterium tuberculosis and identification of active tuberculosis / B. L. Anderson, R. J. Welch, C. M. Litwin // Clinical and vaccine immunology. - 2008. - V. 15. - N. 11. - P. 1644-1649.

45. Araujo, L. S. Assessment of the IgA immunoassay diagnostic potential of the Mycobacterium tuberculosis MT10.3-MPT64 fusion protein in tuberculous pleural fluid / L. S. Araujo, R. M. Moraes, A. Trajman, M. H. Fe'res Saad // Clinical and vaccine immunology. - 2010. - V. 17. - N. 12. - P. 1963-1969.

46. Arloing, S. Agglutination de bacille de la tuberculose vraie / S. Arloing // Comptes Rendues de l'Academie de Sciences.- 1898. - V. 126. - P. 1398-1400.

47. Bahk, Y. Y. Antigens secreted from Mycobacterium tuberculosis: identification by proteomics approach and test for diagnostic marker / Y. Y. Bahk, S. A. Kim, J. S. Kim, H. J. Euh,G. H. Bai, S. N. Cho, Y. S. Kim // Proteomics.- 2004. - V. 4. -N. 11. - P. 3299-3307.

48. Banerjee, S. Serodiagnosis of tuberculosis using two ELISA systems / S. Banerjee, S. Gupta, N. Shende, S. Kumar, B. C. Harinath // Indian journal of clinical biochemistry. -2003.- V. 18. - N. 2. - P. 48-53.

49. Barnes, P. F. Tuberculosis in patients with human immunodeficiency virus infection / P. F. Barnes, A. B. Block, P. T. Davidson, D. E. J. Snider // New Engl. J. Med. -1991. - V. 324. - P. 1644-1650.

50. Bassey, E. O. T-cell response to mycobacterial proteins: a comparative study of tuberculous and control immunoblots of Mycobacterium tuberculosis and M bovis BCG / E.O. Bassey, P. F. Life, D. Catty, J. S. Gaston, D. S. Kumararatne // Tuber. Lung. Dis. -1996. - V. 77. - P. 146-153.

51. Beck, S. T. Humoral response to low molecular weight antigens of Mycobacterium tuberculosis by tuberculosis patients and contacts / S. T. Beck, O. M. Leite, R. S. Arruda, A. W. Ferreira // Braz. J. Med. Biol. Res. -. 2005. - V. 38. - N. 4,- P. 587-596.

52. Benabdesselem, C. Enhanced patient serum immunoreactivity to recombinant Mycobacterium tuberculosis CFP32 produced in the yeast Pichia pastoris compared to Escherichia coli and its potential for serodiagnosis of tuberculosis / C. Benabdesselem, D. M. Fathallah, R. C. Huard, H. Zhu, M.A. Jarboui, K. Dellagi, J. L. Ho, R. M. Barbouche // Journal of clinical microbiology. - 2006. - V. 44. -P.3086-3093.

53. Benz, I. Never say never again: protein glycosylation in pathogenic bacteria / I. Benz, M. A. Schmidt // Mol. Microbiol. - 2002. - V. 45. - P 267-276.

54. Bezerra, J. M. A Study of IgA antibody response to different Mycobacterium tuberculosis antigens in the diagnosis and monitoring of pulmonary tuberculosis / J. M. Bezerra, S. T. Beck, K. A. Kanunfre, O. M. Leite, A. W. Ferreira // The Brazilian journal of infectious diseases. - 2009. - V. 13. - N. 1. - P. 53-58.

55. Bhatia, A. S. Immunodiagnosis of tuberculosis: an update / A. S. Bhatia, S. Kumar, B. C. Harinath // Indian journal of clinical biochemistry.-2003.- V. 18. - N. 2. - P. 1-5.

56. Boehme, C. Detection of mycobacterial lipoarabinomannan with an antigen-capture ELISA in unprocessed urine of Tanzanian patients with suspected tuberculosis / C. Boehme, E. Molokova, F. Minja, S. Geis, T. Loscher, L. Maboko, V. Koulchin, M. Hoelscher // Trans. R. Soc. Trop. Med. Flyg. - 2005. - V.99. - N. 12. - P. 893-900.

57. Boesen, IT. Human T-cell responses to secreted antigen fractions of Mycobacterium tuberculosis / IT. Boesen, B. N. Jensen, T. Wilcke, P. Andersen // Infect. Immun. -1995. - V. 63,- P. 1491-1497.

58. Bondos, S. E. Detection and prevention of protein aggregation before, during, and after purification / S. E. Bondos, A. Bicknell // Analytical Biochemistry. - 2003. -V. 316.-P. 223-231.

59. Bothamley, G. H. Sérodiagnostic value of the 19 kilodalton antigen of Mycobacterium tuberulosis in Indian patients / G. FI. Bothamley, II. V. Batra, V. Ramesh, A. Chandramuki, J. Ivanyi // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. -1992. -V. 11,-P. 6-10.

60. Brierley, R. Production of insulin-like growth factor-1 in methylotrophic yeast cells / R. A. Brierley, G. R. Davis, G. C. Holtz // United States Patent 5324639.-1994.

61. Briken, V. Mycobacterial lipoarabinomannan and related lipoglycans: from biogenesis to modulation of the immune response / V. Briken, S. A. Porcelli, G. S. Besra, L. Kremer // Molecular microbiology.-2004.- V. 53. - N. 2. - P. 391-403.

62. Brostoff, J. Immune complexes in the spectrum of tuberculosis / J. Brostoff, L. Lenzini, P. Rottoli, L. Rottoli // Tubercle. -1981. -V. 62. - N. 3. - P. 169-173.

63. Brusasca, P. N. Immunological characterization of antigens encoded by the RDI region of the Mycobacterium tuberculosis genome / P. N. Brusasca, R. Colangeli, K. P. Lyashchenko, X. Zhao, M. Vogelstein, J. S. Spencer, D. N. Mcmurray, M. L. Gennaro // Scand. J. Immunol. - 2001,- V. 54. - P. 448-452.

64. Cerezales, M. S. Diagnosis of tuberculosis infection using interferon-y-based assays / M. S. Cerezales, J. B. Domnguez // Enferm. Infec. Microbiol. Clin. -2011.-V.29.-Supl 1:26-33.

65. Certification for medium binding F-bottom plate of Greiner bio-one, Germany / [Электронный ресурс] - Режим доступа:

http://www.greinerbioone.com/UserFiles/File/QM_QS/ISO%209001 -E.pdf.

66. Chambers, M. A. Antibody bound to the surface antigen MPB83 of Mycobacterium bovis enhances survival against high dose and low dose challenge / M. A. Chambers, D. Gavier-Wid, R. G. Hewinson // FEMS Immunology and medical microbiology. -2004. - V. 41. - P. 93-100.

67. Chan, E. D. Immunologic diagnosis of tuberculosis: a review / E. D. Chan, L. Fleifets, M. D. Iseman // Tubercle and Lung Disease. - 2000. - V.80. - N. 3. -P. 131-140.

68. Charlet, D. Reduced expression of antigenic proteins MPB70 and MPB83 in Mycobacterium bovis BCG strains due to a start codon mutation in sigK / D. Charlet, S. Mostowy, D. Alexander, L. Sit, H. G. Wiker, M. A. Behr // Molecular microbiology. - 2005. - V. 56. - N. 5. - P. 1302-1313.

69. Chatterjee, D. Structural features of the arabinan component of the lipoarabinomannan of Mycobacterium tuberculosis / D. Chatterjee, С. M. Bozic, M. McNeilS, P. J. Brennan // The journal of biological chemistry. - 1991. - V. 266. -N. 15. - P. 9652-9660.

70. Clare, J. Expression of tetanus toxin fragment С / J. Clare, K. Sreekrishna, M. Romanos//Methods in molecular biology.- 1998.-V. 103. - P. 193-208.

71. Colangeli, R. Humoral immune responses to multiple antigens of Mycobacterium tuberculosis in tuberculosis patients co-infected with the human immunodeficiency virus / R. Colangeli, A. Antinori, A. Cingolani, L. Ortona, K. Lyashchenko, G. Fadda, M. L. Gennaro // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 1999,- V. 3. - N. 12. - P.l 127-1131.

72. Cole, R. A. Clinical evaluation of a rapid immunochromatographic assay based on the 38 kDa antigen of Mycobacterium tuberculosis on patients with pulmonary

tuberculosis in China / R. A. Cole, H. M. Lu, Y. Z. Shi, J. Wang, T. De-Hua, A. T. Shou // Tubercle Lung Dis. -1996,- V. 77. - P. 363-368.

73. Corbett, E. L. The growing burden of tuberculosis global trends and interactions with the HIV / E. L. Corbett, C. J. Watt, N. Walker, B. G. Williams, M. C. Raviglione, C. Dye // Epidemic. Arch. Intern. Med. - 2003. - V. 163. - N. 9. - P. 1009-1021.

74. Costello, A. M. Does antibody to mycobacteria] antigens, including lipoarabinomannan, limit dissemination in childhood tuberculosis? / A. M. Costello, A. Kumar, V. Narayan, M. S. Akbar, S. Ahmed, C. Abou-Zeid, G. A. Rook, J. Stanford, C. Moreno // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. - 1992. - V. 86. -N.6. - P. 686-692.

75. Côté, J. P. Glycosylation of the Escherichia coli TibA self-associating autotransporter influences the conformation and the functionality of the protein / J. P. Côté, M. È. Charbonneau, M. Mourez // PLoS One. - 2013. - V. 8. - N. 11.-e80739.

76. Cunha, A. E. Methanol induction optimization for scFv antibody fragment production in Pichia pastoris / A. E. Cunha, J. J. Clemente, R. Gomes, F. Pinto, M. Thomaz, S. Miranda, R. Pinto, D. Moosmayer, P. Donner, M.J. Carrondo // Biotechnol bioeng. - 2004,- V. 86. - P. 458-467.

77. D'Agostino, R. B. Tests for Normal Distribution. Goodness-Of-Fit Techniques / edited by R. B. D'Agostino, M. A. Stepenes // Statistics: a scries of textbooks and monographs. - New York: M. Decker, Inc., 1986. - P. 367-420.

78. Daley, C. L. The typically 'atypical' radiographic presentation of tuberculosis in advanced HIV disease / C. L. Daley // Tuber. Lung. Dis. - 1995,- V.76. - P. 475-476.

79. Daley, P. Blinded evaluation of commercial urinary lipoarabinomannan for active tuberculosis: a pilot study / P. Daley, J. S. Michael, P. Hmar, A. Latha, P. Chordia, D. Mathai, K. R. John, M. Pai // The international journal of tuberculosis and lung disease. - 2009. - V.13. - N.8. - P. 989-995.

80. Daly, R. Expression of heterologous proteins in Pichia pastoris: a useful experimental tool in protein engineering and production / R. Daly, M. T. W. Ilearn // Journal of molecular recognition. -2005.- V. 18. - P. 119-138.

81. Daugelat, S. The RD1 proteins of Mycobacterium tuberculosis: expression in Mycobacterium smegmatis and biochemical characterization / S. Daugelat, J. Kowall, J. Mattow, D. Bumann, R. Winter, R. Hurwitz, S. II. Kaufmann // Microbes Infect. - 2003. - V.5. - N.12. -P. 1082-1095.

82. Delacourt, C. Value of ELISA using antigen 60 for the diagnosis of tuberculosis in children / C. Delacourt, J. Gobin, J. L. Gaillard, J. de Blic, M. Veron, P. Scheinmann//Chest. - 1993,-V. 104. - P. 393-398.

83. Demangel, C. Cell envelope protein PPE68 contributes to Mycobacterium tuberculosis RD1 immunogenicity independently of a 10-kilodalton culture filtrate protein and ESAT-6 / C. Demangel, P. Brodin, P. J. Cockle, R. Brosch, L. Majlessi, C. Leclerc, S. T. Cole // Infection and immunity. - 2004. - V. 72. - N. 4. -P. 2170-2176.

84. Demissie, A. Recognition of stage-specific mycobacterial antigens differentiates between acute and latent infections with Mycobacterium tuberculosis / A. Demissie, E. M. Leyten, M. Abebe, A. Aseffa, G. Abate, H. Fletcher, P. Owiafe, P. C. Hill, R. Brookes,. G. Rook, A. Zumla, S. M. Arend, Klein M., T. II. Ottenhoff, P. Andersen, T. M. Doherty, VACSEL Study Group // Clin. Vaccine Immunol. -2006,-V. 13,-P. 179-186.

85. Desikan, P. Sputum smear microscopy in tuberculosis: Is it still relevant? / P. Desikan // Indian. J. Med. Res. - 2013,- V.137. - N.3. - P. 442-444.

86. Dijkman, R. Human Coronavirus NL63 and 229E seroconversion in children / R. Dijkman, M. F. Jebbink, N. Bahia El Idrissi, K. Pyre, M. A. Müller, T.W. Kuijpers, H. L. Zaaijer, L. van der Floek // J. Clin. Microbiol. -2008,- V.46. - N.7.- P. 2368.

87. Dinnes, J. A systematic review of rapid diagnostic tests for the detection of tuberculosis infection / J. Dinnes, J. Deeks, FI. Kunst, A. Gibson, E. Cummins, N. Waugh, F. Drobniewski, A. Lalvani // Health Technol. Assess.-2007,- V.U. - N.3.-P. 40.

88. Dobos, K. M. Evidence for glycosylation sites on the 45-kilodalton glycoprotein of Mycobacterium tuberculosis / K. M. Dobos, K. Swiderek, K.-H. Khoo, P. J. Brennan, J. T. Belisle //Infection and immunity. -1995. -V. 63. - N. 8 - P. 28462853.

89. Duman, J. G. O-Mannosylation of Pichia pastoris cellular and recombinant proteins / J. G. Duman, R. G. Miele, H. Liang, D. K. Grella, K. L. Sim, F. J. Castellino, R. K. Bretthauer // Biotechnol. Appl. Biochem. -1998,- V. 28.-P. 39-45.

90. Endo, T. Dystroglycan glycosylation and its role in a-dystroglycanopathies / T. Endo // Acta Myologica. - 2007. - V. 26. - P. 165-170.

91. Espitia, C. Identification, isolation and partial characterization of Mycobacterium tuberculosis glycoprotein antigens / C. Espitia, R. Mancilla // Clin. Exp. Immunol. -1989,-V.77.-P. 378-383.

92. Espitia, C. Antigenic and structural similarities between Mycobacterium tuberculosis 50- to 55-Kilodalton and Mycobacterium bovis BCG 45- to 47-kilodalton antigens / C. Espitia, R. Espinosa, R. Saavedra, R. Mancilla, F. Romain, A. Laqueyrerie, C. Moreno // Infection and immunity. - 1995. -V. 63. - N. 2. - P. 580-584.

93. Fawcett, T. An introduction to ROC analysis / Fawcett T. // Pattern recognition letters.- 2006. - V. 27. - P. 861-874.

94. Felber, A. Weakly positive tests and chronologic variation of the QuantiFERON assay: A retrospective appraisal of usefulness / A. Felber, W. Graninger. // Tuberculosis. - 2013. -V. 93. - N. 6. - P. 647-653.

95. Feng, X. Enhanced sérodiagnostic utility of novel Mycobacterium tuberculosis polyproteins / X. Feng, B. Xiu, K. Chen, X. Yang, IT. Zhang, J. Yue, Y. Tan, IT. Li, R. A. Nicholson, A. W. Tam, P. Zhao, L. Zhang, J. Liu, X. Song, G. Wang, II. Zhang // J. Infect. - 2013. - V. 66. - N. 4,- P. 366-375.

96. Ferrara, G. Use in routine clinical practice of two commercial blood tests for diagnosis of infection with Mycobacterium tuberculosis: a prospective study / G. Ferrara, M. Losi, R. D'Amico, P. Roversi, R. Piro, M. Meacci, B. Meccugni, I. M.

Dori, A. Andreani, B. M. Bergamini, C. Mussini, F. Rumpianesi, L. M. Fabbri, L. Richcldi // Lancet. - 2006. - V. 367. - N. 9519. - P. 1328-1334.

97. Fifis, T. Cellular and humoral immune responses of cattle to purified Mycobacterium bovis antigens / T. Fifis, L. A. Corner, J. S. Rothel, P. R. Wood // Scand. J. Immunol. -1994.- V. 39,- P. 267-274.

98. Fisch, C. The antitoxic and bactericidal properties of the serum of horses treated with Koch's new tuberculin / C. Fisch // JAMA. -1897,- V. 29. - P. 882-889.

99. Fortune, S. M. Mutually dependent secretion of proteins required for mycobacterial virulence / S. M. Fortune, A. Jaeger, D. A. Sarracino, M. R. Chase, C. M. Sassetti, B. R. Bloom, E. J. Rubin // Proc. Natl. Acad. Sci. USA.- 2005. - V. 102. -N. 30. - P. 10676-10681.

100. Frank, S. A. Immunology and evolution of infectious disease / S. A. Frank. -Princeton, N.J: Princeton University Press, 2002. - V.39-40. - 359 p.

101. Fritz, J. M. Examining diagnostic tests: an evidence-based perspective / J. M. Fritz, R. S. Wainner//Phys. ther.- 2001. - V.81. -P.1546-1564.

102. Fujita, Y. Diverse humoral immune responses and changes in IgG antibody levels against mycobacterial lipid antigens in active tuberculosis / Y. Fujita, T. Doi, K. Sato, I. Yano // Microbiology. -2005. - V. 151. - P. 2065-2074.

103. Gamboa-Suasnavart, R. A. The O-mannosylation and production of recombinant APA (45/47 KDa) protein from Mycobacterium tuberculosis in Streptomyces lividans is affected by culture conditions in shake flasks / R. A. Gamboa-Suasnavart, N. A. Valdez-Cruz, L. E. Cordova-Davalos, J. Martinez-Sotelo, L. Servin-Gonzalez, C. Espitia, M. A. Trujillo-Roldan // Microbial cell factories. -2011. - V.10. -P. 110.

104. Garbe, T. Expression of the Mycobacterium tuberculosis 19-Kilodalton antigen in Mycobacterium smegmatis: immunological analysis and evidence of glycosylation / T. Garbe, D. Harris, M. Vordermeier, R. Lathigra, J. Ivanyi, D. Young // Infection and immunity. -1993.- V. 61. - N. 1. - P. 260-267.

105. Gardner, I. A. Receiver-operating characteristic curves and likelihood ratios: improvements over traditional methods for the evaluation and application of

veterinary clinical pathology tests / Gardner I. A., M. Greiner // Veterinary clinical pathology. - 2006,- V.35. - P. 8-17.

106. Gaseitsiwe, S. Pattern recognition in pulmonary tuberculosis defined by high content peptide microarray chip analysis representing 61 proteins from M. tuberculosis / S. Gaseitsiwe, D. Valentini, S. Mahdavifar, I. Magalhaes, D. F. Ploft, J. Zerweck, M. Schutkowski, J. Andersson, M. Reilly, M. J. Maeurer // PLoS ONE. - 2008. - V. 3. - N. 12,- e3840.

107. Gatner, E. M. Circulating immunoglobulin levels in patients with pulmonary tuberculosis with special reference to IgE / E. M. Gatner, V. Msibi, J. Dauth // Tubercle. - 1982. - V. 63. - N. 2. - P. 113-117.

108. Gennaro, M. L. Immunologic diagnosis of tuberculosis / M. L. Gennaro // Clinical infectious diseases. - 2000. - V.30. - S. 243-246.

109. Gevorkian, G. Peptide mimotopes of Mycobacterium tuberculosis carbohydrate immunodeterminants / G. Gevorkian, E. Segura, G. Acero, J. P. Palma, C. Espitia, K. Manoutcharian, L. L' Opez-Mar'in // Biochem. J. -2005. -V. 387. - P. 411-417.

110. Gey van Pittius, N. C. Letter to the editor. ESAT-6 and CFP-10: what is the diagnosis? / N. C. Gey van Pittius, R. M. Warren, P. D. van Helden // Infection and immunity. - 2002. - V. 70. - N. 11. - P. 6509-6511.

111. Gibbs, J. Effective blocking procedures ELISA technical bulletin / J. Gibbs // Corning incorporated life sciences. - 2001.- N. 3. - P. 1-6.

112. Glatman-Freedman, A. The role of antibody-mediated immunity in defense against Mycobacterium tuberculosis: advances toward a novel vaccine strategy / A. Glatman-Freedman // Tuberculosis. - 2006. - V. 86. - N. 3-4. - P. 191-197.

113. Glatman-Freedman, A. Serum therapy for tuberculosis revisited: reappraisal of the role of antibody-mediated immunity against Mycobacterium tuberculosis / A. Glatman-Freedman, A. Casadevall // Clinical Microbiology Reviews. - 1998. - V. 11. -N. 3. -P.514-532.

114. Glatman-Freedman, A. Clearance and organ distribution of Mycobacterium tuberculosis lipoarabinomannan (LAM) in the presence and absence of LAM-

binding immunoglobulin / A. Glatman-Freedman, A. J. Mednick, N. Lendvai, A. Casadevall // M. Infect. Immun. - 2000. - V. 68. - P. 335-341.

115. Goletti, D. Effect of Mycobacterium tuberculosis on HIV replication. Role of immune activation / D. Goletti, D. Weissman, R. W. Jackson, N. M. Graham, D. Vlahov, R. S. Klein, S. S. Munsiff, L. Ortona, R. Cauda, A. S. Fauci // J. Immunol. - 1996. -V. 157. - P. 1271-1278.

116. Gomara, M. J. Synthetic peptides for the immunodiagnosis of human diseases / M. J. Gomara, I. Haro // Current medicinal chemistry. - 2007. - V.14. - P.531-546.

117. Gomez, M. P. Analysis of LAM and 38kDa antibody levels for diagnosis of tb in a case-control study in West Africa / M. P. Gomez, S. Donkor, I. M. Adetifa, M. O. C. Ota, J. S. Sutherland // ISRN immunology. -V. 2012. -Article ID 237823,- P. 16.

118. Gopal, G. Strategies for the production of recombinant protein in Escherichia coli / G. Gopal, A. Kumar // Protein J. -2013,- V. 32. - P. 419-425.

119. Greenaway, C. Humoral response to Mycobacterium tuberculosis antigens in patients with tuberculosis in the Gambia / C. Greenaway, C. Lienhardt, R. Adegbola, P. Brusasca, K. McAdam, D. Menzies // The International journal of tuberculosis and lung disease. - 2005. - V. 9. - N. 10. - P. 1112-1119.

120. Guarna, M. M. On-line monitoring and control of methanol concentration in shake-flask cultures of Pichia pastoris / M. M. Guarna, G. J. Lesnicki, B. M. Tam, J. Robinson, C. Z. Radziminski, D. Ilasenwinkle, A. Boraston, E. Jervis, R. T. MacGillivray, R. F. Turner, D. G. Kilburn // Biotechnol Bioeng. -1997,- V.56. - P. 279-286.

121. Guirado, E. Passive serum therapy with polyclonal antibodies against Mycobacterium tuberculosis protects against post-chemotherapy relapse of tuberculosis infection in SCID mice / E. Guirado, I. Amat, O. Gil, J. Diaz, V. Arcos, N. Caceres, V. Ausina, P. J. Cardona // Microbes Infect. - 2006. - V.8. - P. 1252-1259.

122. Guo, S. The CFP10/ESAT6 complex of Mycobacterium tuberculosis may function as a regulator of macrophage cell death at different stages of tuberculosis infection

/ S. Guo, R. Xue, Y. Li, L. Ren, J. J. Xu // Med. hypotheses. - 2012. -V. 78. - N. 3. -P. 389-392.

123. Gupta, S. Serological diagnosis of childhood tuberculosis by estimation of mycobacterial antigen 60-specific immunoglobulins in the serum / S. Gupta, R. Bhatia, K. K. Datta // Tuber. Lung. Dis. - 1997,- V. 78. - P. 21-27.

124. Gustavsson, M. Stable linker peptides for a cellulose-binding domain-lipase fusion protein expressed in Pichia pastor is / M. Gustavsson, J. Lehtio, S. Denman, T. T. Teeri, K. Hult, M. Martinelle // Protein Eng. - 2001. - V. 14. - P. 711-715.

125. Hamasur, B. Synthesis and immunologic characterization of Mycobacterium tuberculosis lipoarabinomannan specific oligosaccharide-protein conjugates / B. Hamasur, G. Källenius, S. B. Svenson//Vaccine. - 1999. - V. 17. - P.2853-2861.

126. Hamasur, B. Mycobacterium tuberculosis arabinomannan-protein conjugates protect against tuberculosis / B. Hamasur, M. Haile, A. Pawlowski, U. Schröder, A. Williams, G. Hatch, G. Hall, G. Källenius, S. B. Svenson // Vaccine. -2003,-V.21 - P. 4081-4093.

127. Harboe, M. Generation of antibodies to the signal peptide of the MPT83 lipoprotein of Mycobacterium tuberculosis / M. Harboe, A. O. Whelan, G. Ulvund, J. McNair, J. M. Pollock, R. G. ITewinson, Wiker H.G.. // Scand. J. Immunol. -2002.-V.55. -N. 1. -P.82-87.

128. Harboe, M. Secreted proteins of Mycobacterium leprae / M. Harboe, IT. G. Wiker //Scand. J. Immunol. - 1998,- V.48. -P. 577-584.

129. Harboe, M. Protein G based enzyme linked immunosorbent assay for anti-MPB70 antibodies in bovine tuberculosis / M. Harboe, LI. G. Wiker, J. R. Duncan, M. M. Garcia, T. W. Dukes, C. Turcotte, S. Nagai // J. Clin. Microbiol. - 1990,- V.28. -P. 913-921.

130. Havlir, D. V. Human immune response to Mycobacterium tuberculosis antigens / D. V. Havlir, R. S. Wallis, H. Boom, T. M. Daniel, K. Chervenak, J. J. Ellner // Infect. Immun.- 1991,- V. 59. -P. 665-670.

131. He, H. Rapid serodiagnosis of human mycobacteriosis by ELISA using cord factor (trehalose-6,69-dimycolate) purified from Mycobacterium tuberculosis as antigen /

H. He, S. Oka, Y. K. Han, Y. Yamamura, E. Kusunose, M. Kusunose, I. Yano // FEMS Microbiol. Immunol. - 1991.- V.3. - P. 201-204.

132. Fie, X.Y. Assessment of five antigens from Mycobacterium tuberculosis for serodiagnosis of tuberculosis / X. Y. Fie, J. Li, J. Hao, FI. B. Chen, Y. Z. Zhao, X. Y. Huang, K. He, L. Xiao, L. P. Ye, Y. M. Qu, L. H. Ge // Clinical and vaccine immunology. - 2011. -V. 18. - N. 4. - P. 565-570.

133. Hendrickson, R. C. Mass spectrometric identification of Mtb81, a novel serological marker for tuberculosis / R. C. Hendrickson, J. F. Douglass, L. D. Reynolds, P. D. McNeill, D. Carter, R. L. Floughton // J. Clin. Microbiol.- 2000. -V. 38. -N. 6. - P. 2354-2361.

134. Hewinson, R. G. Molecular characterization of MPT83: a seroreactive antigen of Mycobacterium tuberculosis with homology to MPT70 / R. G. Hewinson, S. L. Michell, W. P. Russell, R. A. Mcadam, W. R. Jacobs Jr. // Scandinavian journal of immunology. - 1996. - V. 43. - P. 490-499.

135. Hoff, S. Evaluation of Mycobacterium tuberculosis—specific antibody responses in populations with different levels of exposure from Tanzania, Ethiopia, Brazil, and Denmark / S. T. Hoff, M. Abebe, P. Ravn, N. Range, W. Malenganisho, D. S. Rodriques, E. G. Kallas, C. Soborg, T. M. Doherty, P. Andersen, K. Weldingh // Clinical infectious diseases. - 2007 .- V. 45. - P. 575-582.

136. Houghton, R. L. Use of multiepitope polyproteins in serodiagnosis of active tuberculosis / R. L. Houghton, M. J. Lodes, D. C. Dillon // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2002. - V. 9. - N. 4. - P. 883-891.

137. Hu, S. Dynamic observation on duration of TB antibody positive in patients in patients formally as pulmonary tuberculosis / S. Flu, J. Ding, X. Zeng // Chinese journal of public health. - 2008. - V.24. - P. 667-668.

138. Imaz, M. S. Evaluation of the diagnostic value of measuring IgG, IgM and IgA antibodies to the recombinant 16-kDa antigen of Mycobacterium tuberculosis in childhood tuberculosis / M. S. Imaz, M. A. Domini, E. Zerbini, M. D. Sequeira, M. J. Spoletti, A. A. Etchart, H. J. Pagano, E. Bonifasich, N. Diaz, J. D. Claus, M. Singh // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2001. - V. 5. - P. 1036-1043.

139. Imaz, M. S. Serodiagnosis of tuberculosis: specific detection of free and complex-dissociated antibodies anti-mycobacterium tuberculosis recombinant antigens / M. S. Imaz, M. F. Schmelling, S. Kaempfer, R. Spallek, M. Singh // The Brazilian journal of infectious diseases. - 2008. - V. 12. - N. 3. - P. 234-244.

140. Imaz, M. S. Antibody response to culture filtrate antigens of Mycobacterium tuberculosis during and after treatment of tuberculosis patients / M. S. Imaz, E. Zerbini // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2000. - V. 4. - N. 6,- P. 562-569.

141. Ireton, G. C. Identification of Mycobacterium tuberculosis antigens of high sérodiagnostic value / G. C. Ireton, R. Greenwald, IT. Liang, J. Esfandiari, K. P. Lyashchenko, S. G. Reed // Clinical and vaccine immunology. - 2010. - V. 17. - N. 10. - P. 1539-1547.

142. Johnston, J. A. Multiplex immunoassay for serological diagnosis of Mycobacterium bovis infection in cattle / J. A. Johnston, W. C. Davis, S. A. Olwill, J. Clarke // Clinical and vaccine immunology. - 2008. - V. 15. - N. 12. - P. 18341838.

143. Joller, N. Antibody - Fc receptor interactions in protection against intracellular pathogens / N. Joller, S. S. Weber, A. Oxenius // European journal of immunology. - 2011. -V. 41. - N. 4. - P. 889-897.

144. Joung, S. M. BCG vaccine in Korea / S. M. Joung, S. Ryoo // Clin. Exp. Vaccine. Res. - 2013. - V. 2. - N. 2. - P. 83-91.

145. Julian, E. Comparison of antibody responses to a potential combination of specific glycolipids and proteins for test sensitivity improvement in tuberculosis serodiagnosis / E. Julian, L. Matas, J. Alcaide, M. Luquin // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2004. - V. 11. - N. 1. - P. 70-76.

146. Julian, E. Serodiagnosis of tuberculosis: comparison of immunoglobulin A (IgA) response to sulfolipid I with IgG and IgM responses to 2,3-diacyltrehalose, 2,3,6-triacyltrehalose, and cord factor antigens / E. Julian, L. Matas, A. Perez, J. Alcaide, M. A. Lanéelle, M. Luquin // J. Clin. Microbiol. - 2002. - V. 40. - P. 3782-3788.

147. Kaisermann, M.C. IgA antibody responses to Mycobacterium tuberculosis recombinant MPT-64 and MPT-10.3 (Rv3019c) antigens in pleural fluid of

patients with tuberculous pleurisy / M. C. Kaisermann, I. G. Sardella, A. Trajman, L. Coelho, S. Kämpfer, M. Singh, M. II. Saad // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2005. -V.9. - N. 4. - P.461-466.

148. Kallenius, G. Mycobacterial glycoconjugates as vaccine candidates against tuberculosis / G. Kallenius, A. Pawlowski, B. Hamasur, S. B. Svenson // Trends in microbiology. - V. 16. - N. 10. - P. 456-462.

149. Kalra, M. Utility of a combination of RD1 and RD2 antigens as a diagnostic marker for tuberculosis / M. Kalra, G. K. Khuller, A. Grover, D. Behera, A. Wanchu, I. Verma // Diagnostic microbiology and infectious disease. - 2010. - V. 66.-N. 2.-P. 153-161.

150. Kao, F. F. The secreted lipoprotein, MPT83, of Mycobacterium tuberculosis is recognized during human tuberculosis and stimulates protective immunity in mice / F. F. Kao, S. Mahmuda, R. Pinto, J. A. Triccas, N. P. West, W. J. Britton // PLoS ONE. - 2012,- V. 7. - N. 5. - e34991.

151. Kashyap, R. S. Diagnosis of tuberculosis infection based on synthetic peptides from Mycobacterium tuberculosis antigen 85 complex / R. S. Kashyap, S. D. Shekhawat, A. R. Nayak, II. J. Purohit, G. M. Taori, II. F. Daginawala // Clin. Neurol. Neurosurg. - 2013. - V. 115. - N. 6,- P. 678-683.

152. Kaur, D. Characterization of the epitope of antilipoarabinomannan antibodies as the terminal hexaarabinofuranosyl motif of mycobacterial arabinans / D. Kaur, T. L. Lowary, V. D. Vissa, D. C. Crick, P. J. Brennan // Microbiology. -2002,- V.148. - P. 3049-3057.

153.Kaushik, A. Diagnostic potential of 16 kDa (FIspX, a-crystalline) antigen for serodiagnosis of tuberculosis / A. Kaushik, U. B. Singh, C. Porwal, S. J. Venugopal, A. Mohan, A. Krishnan, V. Goyal, J. N. Banavaliker // Indian. J. Med. Res.-2012.-V.135. - P. 771-777.

154. Kay, B. K. The importance of being proline: the interaction of proline-rich motifs in signaling proteins with their cognate domains / B. K. Kay, M. P. Williamson, M. Sudol // The FASEB journal. - 2000. - V. 14. - P. 231-241.

155. Keller, P. M. Tuberculosis vaccine strain Mycobacterium bovis BCG Russia is a natural recA mutant / P. M. Keller, E. C. Bottger, P. Sander // Microbiology. -2008. - V.8. -P.120.

156. Khalilzadeh, S. Serodiagnosis of tuberculosis in children using A60 antigen / S. Khalilzadeh, M. Yazdanpanah, M. Hosseini, N. Baghaie, A. Akbar Velayati, M. Reza Masjedi // Tanaffos. - 2002. - V. 1. - N. 2,- P. 15-19.

157. Khan, I. H. Profiling antibodies to Mycobacterium tuberculosis by multiplex microbead suspension arrays for serodiagnosis of tuberculosis / I. H. Khan, R. Ravindran, J. Yee, M. Ziman, D. M. Lewinsohn, M. L. Gennaro, J. L. Flynn, C. W. Goulding, K. DeRiemer, N. W. Lerche, P. A. Luciw // Clin. Vaccine Immunol. -2008. - V.15.- P.433-438.

158. Khomenko, A. G. Tuberculosis in patients with various IILA phenotypes / A. G. Khomenko, V. I. Litvinov, V. P. Chukanova, L. E. Pospelov // Tubercle. -1990.-V.71. - P. 187-192.

159. Kidd, P. Thl/Th2 balance: the hypothesis, its limitations, and implications for health and disease / P. Kidd // Altern med rev.- 2003. - V.8. - N.3. - P. 223-246.

160. Kinhikar, A. G. Potential role for ESAT6 in dissemination of M tuberculosis via human lung epithelial cells / A. G. Kinhikar, I. Verma, D. Chandra, K. K. Singh, K. Weldingh, P. Andersen, T. FIsu, W. R. Jacobs, S. Laal // Mol. Microbiol. -2010. -V. 75. -N. l.-P. 92-106.

161. Koo, H. C. Use of rMPB70 protein and ESAT-6 peptide as antigens for comparison of the enzyme-linked immunosorbent, immunochromatographic, and latex bead agglutination assays for serodiagnosis of bovine tuberculosis / IT. C. Koo, Y. FI. Park, J. Ahn, W. R. Waters, M. V. Palmer, M. J. Plamilton, G. Barrington, A. A. Mosaad, K. T.Park, W. K. Jung, I. Y. Hwang, S. N. Cho, S. J. Shin, W. C. Davis // Journal of clinical microbiology.- 2005,- V. 43. - N. 9.- P. 4498-4506.

162. Kothadia, S. N. Evaluation of direct microscopy as a screening test in the diagnosis of pulmonary tuberculosis / S. N. Kothadia, S. Deshmukh, A. M. Saoji // Indian J Pathol Microbiol. - 1990,- V. 33. - P. 68-73.

163. Kulshrestha, A. Expression and purifcation of recombinant antigens of Mycobacterium tuberculosis for application in serodiagnosis / A. Kulshrestha, A. Gupta, N. Verma, S. K. Sharma, A. K. Tyagi, V. K. Chaudhary // Protein expression and purification. - 2005. - N. 44. - P. 75-85.

164. Kumar, G. Whole cell & culture filtrate proteins from prevalent genotypes of Mycobacterium tuberculosis provoke better antibody & T cell response than laboratory strain H37Rv / G. Kumar, H. Shankar, M. Chahar, P. Sharma, V. S. Yadav, D. S. Chauhan, V. M. Katoch, B. Josh // Indian. J. Med. Res. - 2012. - V. 135. - P. 745-755.

165. Kumar, G. Sérodiagnostic efficacy of Mycobacterium tuberculosis 30/32-kDa mycolyl transferase complex, ESAT-6, and CFP-10 in patients with active tuberculosis / G. Kumar, P. K. Dagur, B. Joshi // Arch of immunology and experimental therapy. - 2010. -V. 58. - N. 1. - P. 57-65.

166. Kunnath-Velayudhan, S. Dynamic antibody responses to the Mycobacterium tuberculosis proteome / S. Kunnath-Velayudhan, H. Saiamon, H. Y. Wang, A. L. Davidow, D. M. Molina, V. T. Huynh, D. M. Cirillo, G. Michel, E. A. Talbot, M. D. Perkins, P. L. Felgner, X. Liang, M. L. Gennaro // PNAS.- 2010. - V. 107. - N. 33.-P. 14703-14708.

167. Kunter, E. The value of pleural fluid anti-A60 IgM in BCG vaccinated tuberculous pleurisy patients / E. Kunter, K. Cerrahoglu, A. Ilvan, T. Isitmangil, O. Türken, O. Okutan, Z. Kartaloglu, S. Cavuslu // Clin. Microbiol. Infect.- 2003,- V. 9.- N. 3. -P. 212-220.

168. Kurian, S. M. Immune response to Mycobacterium tuberculosis culture filtrate antigen in cured spinal tuberculosis patients and their spouses / S. M. Kurian, P. Selvaraj, A. M. Reetha, N. Charles, A. A. Mathan, P. R. Naryanan // Ind. J. Tub. -2001,- V.48. - N. 3. - P. 3-7.

169. Laal, S. Surrogate marker of preclinical tuberculosis in human immunodeficiency virus infection: antibodies to an 88-kDa secreted antigen of Mycobacterium tuberculosis / S. Laal, K. M. Samanich, M. G. Sonnenberg, J. T. Belisle, J.

O'Leary, M. S. Simberkoff, S. Zolla-Pazner // J. Infcct. Dis. - 1997. - V.176. - P. 133-143.

170. Laal, S. Human humoral responses to antigens of Mycobacterium tuberculosis: immunodominance of high-molecular-mass antigens / S. Laal, K. M. Samanich, M. G. Sonnenberg, S. Zolla-Pazner, J. M. Phadtare, J. T. Belisle // Clinical and diagnostic laboratory immunology. - 1997. -V. 4. - N. 1. - P. 49-56.

171. Laemmli, U. K. Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4 / U. K. Laemmli // Nature.- 1970. - V.227. - P. 680-685.

172. Lalvani, A. Rapid detection of Mycobacterium tuberculosis infection by enumeration of antigen-specific T cells / A. Lalvani, A. A. Pathan, LI. McShane, R. J. Wilkinson, M. Latif, C. P. Conlon, G. Pasvol, A.V. Hill // Am. J. Respir. Crit. Crit. Care Med. - 2001,- V. 163. - P. 824-828.

173. Landowski, C. P. Combinatorial use of antibodies to secreted mycobacterial proteins in a host immune system-independent test for tuberculosis / C. P. Landowski, IT. P. Godfrey, S. I. Bentley-ITibbert, X. Liu, Z. Huang, R. Sepulveda, K. ITuygen, M. L. Gennaro, F. FI. Moy, S. A. Lesley, M. Flaak-Frendscho // Journal of clinical microbiology.- 2001. - V. 39. - N. 7. - P. 2418-2424.

174. Lang, M. Do CD 1-restricted T cells contribute to antibody-mediated immunity against Mycobacterium tuberculosis? / M. Lang, A. Glatman-Freedman // Infect. Immun. - 2006. - V. 74. - N. 2 - P. 803-809.

175. Langermansa, J. A. M. Protection of macaques against Mycobacterium tuberculosis infection by a subunit vaccine based on a fusion protein of antigen 85B and ESAT-6 / J. A. M. Langermansa, T. M. Doherty, R. A. W. Vervenne, T. van der Laan, K. Lyashchenko, R. Greenwald, E. M. Agger, C. Aagaard, IT. Weiler, D. van Soolingen, W. Dalemans, A. W. Thomas, P. Andersen // Vaccine. -2005.-V. 3 - P. 2740-2750.

176. Lara, M. Expression, secretion, and glycosylation of the 45- and 47-kDa glycoprotein of Mycobacterium tuberculosis in Streptomyces lividans / M. Lara, L. Servi'n-GonzaTez, M. Singh, C. Moreno, I.Cohen, M. Nimtz, C. Espitia // Applied and environmental microbiology. - 2004. - V. 70. - N. 2. - P. 679-685.

177. Laszlo, A. Evaluation of synthetic pseudo cord-factor-like glycolipids for the serodiagnosis of tuberculosis / A. Laszlo, H. Ii. Baer, M. B. Goren, V. Handzel, L. Barrera, I. N. de Kantor // Res. Microbiol.- 1992. - V. 143. - N. 2. - P. 217-223.

178. Lawn, S. D. Evaluation of a commercial immunodiagnostic kit incorporating lipoarabinomannan in the serodiagnosis of pulmonary tuberculosis in Ghana / S. D. Lawn, E. H. Frimpong, E. Nyarko // Trop. Med. Int. Health. - 1997. -V. 2. - P. 978-981.

179. Lee, J. S. Diagnosis of pulmonary tuberculosis using MTB12 and 38-kDa antigens /J. S. Lee, E. K. Jo, C. PI. Song//Respirology. - 2008. - V.13. - P. 432-437.

180. Lenka, M. Changes in avidity and level of immunoglobulin G antibodies to Mycobacterium tuberculosis in sera of patients undergoing treatment for pulmonary tuberculosis / M. Lenka, P. Arias-Bouda, S. Kuijper, A. Van Der Werf, L. N. Nguyen, FI. M. Jansen, A. FI. J. Kolk // Clinical and vaccine immunology. -2003. - V. 10. - N. 4. - P. 702-709.

181. Lew, J. M. TubercuList - 10 years after / J. M. Lew, A. Kapopoulou, L. M. Jones, S. T. Cole // Tuberculosis (Edinb). - 2011. - V. 91. - N. 1. - P. 1 -7.

182. Li, Z. Low-temperature increases the yield of biologically active herring antifreeze protein in Pichia pastoris / Z. Li, F. Xiong, Q. Lin, M. d'Anjou, A. J. Daugulis, D. S.C. Yang, C. L. Hew. // Protein expression and purification. - 2001. - V. 21. - N. 3. - P. 438-445.

183. Lienhardt, C. Active tuberculosis in Africa is associated with reduced Thl and increased Th2 activity in vivo / C. Lienhardt, A. Azzurri, A. Amedei, K. Fielding, J. Sillah, O. Y. Sow, B. Bah, M. Benagiano, A. Diallo, R. Manetti, K. Manneh, P. Gustafson, S. Bennett, M. M. D'Elios, K. McAdam, G. Del Prete // Eur. J. Immunol. - 2002. - V. 32,- P. 1605-1613.

184. Lim, J. H. Purification and immunoreactivity of three components from the 30/ 32-kilodalton antigen 85 complex in Mycobacterium tuberculosis / J. FI. Lim , J. K. Park , E. K. Jo // Infect. Immun.- 1999. - V. 67. - P. 6187-6190.

185. Liu, C.-F. Bacterial protein-O-mannosylating enzyme is crucial for virulence of Mycobacterium tuberculosis / C.-F. Liu, L. Tonini, W. Malaga, M. Beau, A. Stella,

D. Bouyssié, M. C. Jackson, J. Nigou, G. Puzo, C. Guilhot, O. Burlet-Schiltz, M. Riviérea // PNAS. - 2013. - V. 110. - N. 16. - P. 6560-6565.

186. Liu, S. A novel fusion protein-based indirect enzyme-linked immunosorbent assay for the detection of bovine tuberculosis / S. Liu, S. Guo, C. Wang, M. Shao, X. Zhang, Y. Guo, Q. Gong // Tuberculosis. - 2007. - V. 87. - P. 212-217.

187. Lodes, M. J. Serological expression cloning and immunological evaluation of Mtb48, a novel Mycobacterium tuberculosis antigen / M. J. Lodes, D. C. Dillon, R. Mohamoth, C. H. Day, D. R. Benson, L. D. Reynolds, P. D. McNeill, D. P. Sampaio, Y. A. W. Skeiky, R. Badaro, D. IT. Persing, S. G. Reed, R. L. Houghton //Journal of clinical microbiology. - 2001,- V. 39. - N. 7. - P. 2485-2493.

188. Lopez, Y. Induction of a protective response with an IgA monoclonal antibody against Mycobacterium tuberculosis 16 kDa protein in a modell of progresive pulmonary infection / Y. López, D. Yero, G. Falero-Diaz, N. Olivares, M. E. Sarmiento, S. Sifontes, R. L. Solis, J. A. Barrios, D. Aguilar, R. ITernández-Pando, A. Acosta // Int. J. Med. Microbiol.- 2009. - V.15. - P. 1229-1237.

189. Louise, R. Antigen discovery and tuberculosis vaccine development in the post-genomic era / R. Louise, V.Skjot, E. M. Agger, P. Andersen // Scand. J. Infect. Dis. - 2001. - V.33. - N.9. - P. 643-647.

190. Luh, K. T. Tuberculosis antigen A60 serodiagnosis in tuberculous infection: application in extrapulmonary and smear-negative pulmonary tuberculosis / K. T. Luh, C. J. Yu, P. C. Yang, L. N. Lee // Respirology. - 1996. - V. 1. - P. 145-151.

191. Lyashchenko, K. Heterogeneous antibody responses in tuberculosis / K. Lyashchenko, R. Colangeli, M. IToude, H. Jahdali, D. Menzies, M. L. Gennaro // Infection and immunity. - 1998. - V. 66. - N. 8. - P. 3936-3940.

192. Lyashchenko, K. P. Diversity of antigen recognition by serum antibodies in experimental bovine tuberculosis / K. P. Lyashchenko, J. M. Pollock, R. Colangeli, M. L. Gennaro // Infection and immunity. - 1998. - V. 66. - N. 11. - P. 5344-5449.

193. Macauley-Patrick, S. Heterologous protein production using the Pichia pastor is expression system / S. Macauley-Patrick, M. L. Fazenda, B. McNeil, L. M. Flarvey // Yeast. - 2005. - V. 22. - P. 249-270.

194. Macedo, G. C. Human T cell and antibody-mediated responses to the Mycobacterium tuberculosis recombinant 85A, 85B, and ESAT-6 antigens / G. C. Macedo, A. Bozzi, H. R. Weinreich, A. Bafica, H. C. Teixeira, S. C. Oliveira // Clinical and developmental immunology. - V. 2011. - Article ID 351573. - P. 1-10.

195. Maekura, R. Clinical evaluation of rapid serodiagnosis of pulmonary tuberculosis by ELISA with cord factor (trehalosc-6,6'-dimycolate) as antigen purified from Mycobacterium tuberculosis / R. Maekura, M. Nakagawa, Y. Nakamura, T. Hiraga, Y. Yamamura, M. Ito, E. Ueda, S. Yano, H. He, S. Oka, K. Kashima, I. Yano // American review of respiratory disease. - 1993. - V. 148. - N. 4. - P. 9971001.

196. Maekura, R. Clinical evaluation of anti-tuberculous glycolipid immunoglobulin G antibody assay for rapid serodiagnosis of pulmonary tuberculosis / R. Maekura, Y. Okuda, M. Nakagawa, T. Hiraga, S. Yokota, M. Ito, I. Yano, H. Kohno, M. Wada, C. Abe, T. Toyoda, T. Kishimoto, T. Ogura// Journal of clinical microbiology. -2001. - V. 39. - N. 10. - P. 3603-3608.

197. Maglione, P. J. How B cells shape the immune response against Mycobacterium tuberculosis / P. J. Maglione, J. Chan // Eur. J. Immunol. - 2009. - V. 39. - P.676-686.

198. Manca. C. MTC28, a novel 28-kilodalton proline-rich sccreted antigen specific for the Mycobacterium tuberculosis complex / C. Manca, K. Lyashchenko, R. Colangeli, M. L. Gennaro // Infection immunology. - 1997. - V. 65. - N. 12. - P. 4951-4957.

199. Manivannan, S. Role of complement activation andantibody in the interaction between Mycobacterium tuberculosis and human macrophages / S. Manivannan, V. N. Rao, V. D. Ramanathan // Indian. J. Exp. Biol. - 2012. - V. 50. - N. 8. - P. 542-550.

200. Mattow, J. Comparative proteome analysis of culture supernatant proteins from virulent Mycobacterium tuberculosis H37Rv and attenuated M bovis BCG Copenhagen / J. Mattow, U. E. Schaible, F. Schmidt, K. Hagens, F. Siejak, G.

Brestrich, G. Haeselbarth, E. C. Miller, P. R. Jungblut, S. H. Kaufmann // Electrophoresis. - 2003. - V. 24. - P. 3405-3420.

201. Mayson, B. E. Effects of methanol concentration on expression levels of recombinant protein in fed-batch cultures of Pichia methanolica / B. E. Mayson, D. G. Kilburn, B. L. Zamost, C. K. Raymond, G. J. Lesnicki // Biotechnology and bioengineering. -2003. - V. 81. - P. 291-298.

202. Meher, A. K. Mycobacterium tuberculosis IT37Rv ESAT-6-CFP-10 complex formation confers thermodynamic and biochemical stability / A. K. Meher, N. C. Bal, K. V. R. Chary, A. Arora // FEBS journal. - 2006. - V. 273. - P. 1445-1462.

203. Meier, T. Sensitivity of a new commercial enzyme-linked immunospot assay (T SPOT-TB) for diagnosis of tuberculosis in clinical practice / T. Meier, IT. P. Eulenbruch, P. Wrighton-Smith, G. Enders, T. Regnath // European journal of clinical microbiology and infectious diseases. - 2005. - V. 24. - N.8. - P. 529-536.

204. Menzies, D. Interpretation of repeated tuberculin tests. Boosting, conversion, and reversion / D. Menzies // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 1999. - V. 159. - P. 1521.

205. Mezzasoma, L. Antigen microarrays for serodiagnosis of infectious diseases / L. Mezzasoma, T. Bacarese-Hamilton, M. Di Cristina, R. Rossi, F. Bistoni, A. Crisanti//Clinical chemistry. - 2002. - V. 48. - N. l.-P. 121-130.

206. Min, F. Serum antibody responses to 10 Mycobacterium tuberculosis proteins, purified protein derivative, and old tuberculin in natural and experimental tuberculosis in rhesus monkeys / F. Min, Y. Zhang, R. ITuang, W. Li, Y. Wu, J. Pan, W. Zhao, X. Liu // Clinical and vaccine immunology. - 2011. - V. 18. - N. 12. -P. 2154-2160.

207. Minning, S. Optimization of the high-level production of Rhizopus oryzae lipase in Pichia pastoris / S. Minning, A. Serrano, P. Ferrer, C. Sola, R. D. Schmid, F. Valero //J. Biotechnol. - 2001. -V. 86. - P. 59-70.

208. Misaki, A. Structural and immunochemical studies on D-arabino-D-mannans and D-mannans of Mycobacterium tuberculosis and other mycobacterium species / A.

Misaki, I. Azuma, Y.Yamamura // J. Biochem. - 1977. - V. 82. - N.6.- P. 17591770.

209. Mosmann, T. R. Two types of murine helper T cell clone. I. Definition according to profiles of lymphokine activities and secreted proteins / T. R. Mosmann, II. Cherwinski, M. W. Bond, M. A. Giedlin, R. L. Coffman // J. Immunol. - 1986. -V. 136. -N. 7.-P. 2348-2357.

210. Mukherjee, P. The RDl-encoded antigen Rv3872 of Mycobacterium tuberculosis as a potential candidate for serodiagnosis of tuberculosis / P. Mukherjee, M. Dutta, P. Datta, A. Dasgupta, R. Pradhan, M. Pradhan, M. Kundu, J. Basu, P. Chakrabarti // Clin. Microbiol. Infect. - 2007. - V. 13. - P. 146-152.

211. Mukherjee, S. Potential serological use of a recombinant protein that is a replica of a Mycobacterium tuberculosis protein found in the urine of infected mice / S. Mukherjee, N. Daifalla, Y. Zhang, J. Douglass, L. Brooks, T. Vedvick, R. Houghton, S. G. Reed, A. Campos-Neto // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2004. -V. 11 - P. 280-286.

212. Mukhopadhyay, S. The PE and PPE proteins of Mycobacterium tuberculosis / S. Mukhopadhyay, K. N. Balaji//Tuberculosis. - 2011. - V. 91. - P. 441-447.

213. Mustafa, A. S. Recombinant and synthetic peptides to identify Mycobacterium tuberculosis antigens and epitopes of diagnostic and vaccine rclevance / A. S. Mustafa // Tuberculosis. - 2005. - V. 85. - P. 367-376.

214. Mustafa, A. S. Comparison of antigen-specific T-cell responses of tuberculosis patients using complex or single antigens of Mycobacterium tuberculosis / A. S. Mustafa, PI. A. Amoudy, H. G. Wiker, A. T. Abal, P. Ravn, F. Oftung, P. Andersen // Scand. J. Immunol. - 1998. - V. 48. - P. 535-543.

215. Nakata, K. Mycobacterium tuberculosis enhances human immunodeficiency virus-1 replication in the lung / K. Nakata, W. N. Rom, Y. Flonda, R. Condos, S. Kanegasaki, Y. Cao // Am. J. Respir. Crit. Care Med. - 1997. - V. 155. - P. 9961003.

216. Narayana, Y. Differential B-cell responses are induced by Mycobacterium tuberculosis PE antigens Rv 1169c, Rv0978c, and Rvl818c / Y. Narayana, B.

Joshi, V. M. Katoch, K. C. Mishra, K. N. Balaji // Clinical and vaccine immunology. - 2007. - V. 14. - N. 10.-P. 1334-1341.

217. Nayak, S. Mantoux test and its interpretation / S. Nayak, B. Acharjya // Indian dermatol. online J. - 2012,- V. 3. - N. 1. - P. 2-6.

218. Neu, N. Diagnosis of pediatric tuberculosis in the modern era/N. Neu, L. Saiman, P. San Gabriel, S. Whittier, C. Knirsch, C. Ruzal-Shapiro, P. Della-Latta // Pediatr. Infect. Dis. J. - 1999. - V. 18. - P. 122-126.

219. Nguyen, T. K. A. The mycobacterial glycolipid glucose monomycolate induces a memory T cell response comparable to a model protein antigen and no B cell response upon experimental vaccination of cattle / T. K. A. Nguyen, A. Koets P., W. J. Santema, W. vanEden, V. P. M. G. Rutten, I. V. Rhijn // Vaccine. -2009. -V. 27. -N. 35. - P. 4818-4825.

220. Okkels, L. CFP10 discriminates between nonacetylated and acetylated ESAT-6 of Mycobacterium tuberculosis by differential interaction / L. Okkels, E. C. Müller, M. Schmid, I. Rosenkrands, S. H. E. Kaufmann, P. Andersen, P. R. Jungblut // Proteomics. - 2004. - V. 4. - P. 2954-2960.

221. Okkels, L. M. PPE protein (Rv3873) from DNA segment RD1 of Mycobacterium tuberculosis: strong recognition of both specific T-cell epitopes and epitopes conserved within the PPE family / L. M. Okkels, I. Brock, F. Follmann, E. M. Agger, S. M. Arend, T. FI. M. Ottenhoff, F. Oftung, I. Rosenkrands, P. Andersen // Infect. Immun. - 2003. - V. 71. - P. 6116-6123.

222. Pace, C. N. How to measure and predict the molar absorption coefficient of a protein / C. N. Pace, F. Vajdos, L. Fee, G. Grimsley, T. Gray // Prorein Science. -1995. -V. 4. - P. 2411-2423.

223. Palomino, J. C. / Palomino J. C., Leao S. C., Ritacco V. (Editors) // Tuberculosis 2007. From basic science to patient care. TuberculosisTextbook.com. - First Edition, 2007. - P. 53-230.

224. Pan, W. Fusion of two malaria vaccine candidate antigens enhances product yield, immunogenicity, and antibody-mediated inhibition of parasite growth in vitro / W.

Pan, D. Huang, Q. Zhang, L. Qu, D. Zhang, X. Zhang, X. Xue, F. Qian // J. Immunol. - 2004. - V. 172. - P. 6167-6174.

225. Pandhal, J. Systematic metabolic engineering for improvement of glycosylation efficiency in Escherichia coli / J. Pandhal, P. Desai, C. Walpole, L. Doroudi, D. Malyshev, P. C. Wright // Biochemical and biophysical research communications. -2012.-V. 419.-P. 472-476.

226. Pandhal, J. Inverse metabolic engineering to improve Escherichia coli as an N-glycosylation host / J. Pandhal, L. B. A. Woodruff, S. Jaffe, P. Desai, S. Y. Ow, J. Noirel, R. T. Gill, P. C. Wright // Biotechnol. Bioeng. - 2013. - V. 110. - P. 24822493.

227. Papiha, S. S. HLA and circulating immunoglobulin levels in Indian patients with pulmonary tuberculosis / S. S. Papiha, J. Wentzel, F. Behjati, S. S. Agarwal // Tubercle. - 1985. - V. 66. - P. 25-33.

228. Paquin, P. Further report of cases treated with anti-tubercle serum / P. Paquin // JAMA. - 1897. - V. 29. - P. 98-99.

229. Pethe, K. The heparin-binding hemagglutinin of M. tuberculosis is required for extrapulmonary dissemination / K. Pethe, S. Alonso, F. Biet, G. Delogu, M. J. Brennan, C. Locht, F. D. Menozzi //Nature. - 2001,- V. 412. - P. 190-194.

230. Phuah, J. Y. Activated B cells in the granulomas of nonhuman primates infected with Mycobacterium tuberculosis / J. Y. Phuah, J. T. Mattila, P. L. Lin, J. L. Flynn // Am. J. Pathol. - 2012. - V. 181. - P. 508-514.

231. Pichia expression kit: a manual of methods for the expression of recombinant proteins in Pichia pastorisll Invitrogen. Catalog no. K1710-01. - P. 1-68.

232. Planatscher, H. Systematic reference sample generation for multiplexed serological assays / FI. Planatscher, S. Rimmele, G. Michel, O. Po"tz, T. Joos, N. Schneiderhan-Marra // Scientific reports. - 2013. - V. 3. - N. 3259. - P. 1-5.

233. Piatt, L. HIV in the European region: using evidence to strengthen policy and programs / L. Piatt, E. Jolley, V. Hope, A. Latypov, F. Hickson, L. Reynolds, T. Rhodes // Human development sector dept. Policy brief. - Washington D. C.: World Bank, 2013.

234. Porsa, E. Comparison of a new ESAT-6/CFP-10 peptide-based gamma interferon assay and a tuberculin skin test for tuberculosis screening in a moderate-risk population / E. Porsa, L. Cheng, M. M. Seale, G. L. Delclos, X. Ma, R. Reich, J. M. Musser, E. A. Graviss // Clinical and vaccine immunology. - 2006. - V. 13. -N. 1. - P. 53-58.

235. Pospelov, L. E. Genetic HLA markers associated with pulmonary tuberculosis in the Barum-Khemchiksky District, Republic of Tyva / L. E. Pospelov, A. G. Matrakshin, A. F. Malenko, I. G. Udina; V. I. Gergert; A. L. Pospelov; M. M. Kyzyl-ool; A. A. Zhachin // Problems of tuberculosis and pulmonary diseases. -

2007. - V. 6. - P. 62-64.

236. Pottumarthy, S. A comparison of seven tests for serological diagnosis of tuberculosis / S. Pottumarthy, V. C. Wells, A. J. Morris // Journal of clinical microbiology. - 2000. - V. 38. - N. 6. - P. 2227-2231.

237. Prasad, G. B. K. S. Immunoprophylactic mechanisms of glycolipid antigens in tuberculosis / G. B. K. S. Prasad, P. S. Bisen, N. J. Zacharia, R. Dubey, R. P. Tiwari // Advances in biomedical research. - 2010. - V. 1. - P. 407-416.

238. Rabahi, M. F. Humoral response to FIspX and GlcB to previous and recent infection by Mycobacterium tuberculosis / M. F. Rabahi, A. P. Junqueira-Kipnis, M. C. Dos Reis, W. Oelemann, M. B. Conde // BMC Infect Dis. - 2007. - V. 7. - P. 148.

239. Radhakrishnan, V. V. Diagnostic significance of circulating immune complexes in patients with pulmonary tuberculosis / V. V. Radhakrishnan, A. Mathai, P. Sundaram // J. Med. Microbiol. - 1992. - V. 36. - P. 128-131.

240. Raja, A. Immunology of tuberculosis. Review article / A. Raja // Indian J. Med. Res. - 2004. - V. 120. - P. 213-232.

241. Raja, A. Improved diagnosis of pulmonary tuberculosis by detection of antibodies against multiple Mycobacterium tuberculosis antigens / A. Raja, U. D. Ranganathan, R. Bethunaickan // Diagnostic microbiology and infectious disease. -

2008. -V. 60. - P. 361-368.

242. Raja, A. Characterization of mycobacterial antigens and antibodies in circulating immune complexes from primary tuberculosis / A. Raja, P. R. Narayanan, R. Mathew, R. Prabhakar // Lab. Clin. Med. - 1995. - V. 5. - P. 581-587.

243. Raju, R. Diagnostic role of the antibody response to the 38 kDa, 16 kDa proteins and lipoarabinomannan of Mycobacterium tuberculosis / R. Raju, S. Suneetha, K. Sagili, M. C. Vani, V. Saraswathi, A. V. Satyanarayana, L. M. Suneetha // Indian journal of clinical biochemistry. - 2005. - V. 20. - N. l.-P. 123-128.

244. Raqib, R. Detection of antibodies secreted from circulating Mycobacterium tuberculosis-specific plasma cells in the diagnosis of pediatric tuberculosis / R. Raqib, D. Mondal, M. A. Karim, F. Chowdhury, S. Ahmed, S. Luby, A. Cravioto, J. Andersson, D. Sack // Clinical and vaccine immunology. - 2009. - V. 16. - N. 4. -P. 521-527.

245. Raqib, R. Rapid diagnosis of active tuberculosis by detecting antibodies from lymphocyte secretions / R. Raqib, J. Rahman, A. K. M. Kamaluddin, S. M. M. Kamal, F. A. Banu, S. Ahmed, Z. Rahim, P. K. Bardhan, J. Andersson, D. A. Sack // The journal of infectious diseases. - 2003. - V. 188. - P. 364-70.

246. Ratanasuwan, W. Evaluation of the MycoDot test for the diagnosis of tuberculosis in HIV seropositive and seronegative patients / W. Ratanasuwa, J. K. Kreiss, C. M. Nolan, B. A. Schaeffler, S. Suwanagool, S. Tunsupasawasdikul, C. Chuchottaworn, W. Dejsomritrutai, PI. M. Foy // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 1997.-V. l.-P. 259-264.

247. Ravn, P. Prospective evaluation of a whole-blood test using Mycobacterium tuberculosis-specific antigens ESAT-6 and CFP-10 for diagnosis of active tuberculosis / P. Ravn, M. E. Munk, A. B. Andersen, B. Lundgren, J. D. Lundgren, L. N. Nielsen, A. Kok-Jensen, P. Andersen, K. Weldingh // Clin. Diagn. Lab. Immunol. - 2005. - V. 12. - N. 4. - P. 491-496.

248. Rekha, R. S. Validation of the ALS assay in adult patients with culture confirmed pulmonary tuberculosis / R. S. Rekha, S. M. M. Kamal, P. Andersen, Z. Rahim, I. Iloq, G. Ara, J. Andersson, D. Sack, R. Raqib // PLoS ONE. - 2011. - V. 6. - N. 1. -el6425.

249. Romanos, M. A. Foreign gene expression in yeast: a review / M. A. Romanos, C. A. Scorer, I. J. Clare // Yeast. - 1992. - V. 8. - P. 423-488.

250. Rosenkrandsa, I. Identification of Rv0222 from RD4 as a novel sérodiagnostic target for tuberculosis /1. Rosenkrandsa, C. Aagaard, K. Weldingh, I. Brock, M. IT. Dziegiel, M. Singh, S. Hoffa, P. Ravne, P. Andersen // Tuberculosis. - 2008. - V. 88. - P. 335-343.

251. Roupie, V. Immunogenicity of eight dormancy (DosR) regulon encoded proteins of Mycobacterium tuberculosis in DNA vaccinated and TB infected mice / V. Roupie, M. Romano, L. Zhang, H. Korf, M. Young, L. Kees, L. M. C. Franken, T. IT. M. Ottenhoff, M. R. Klein, K. Huygen // Infection and immunity. - 2007. - V. 75. -N. 2. - P. 941-949.

252. Rudnev, S. G. On the relative risk concept and TB morbidity in Russia: linking population genetics and epidemiological studies / S. G. Rudnev, R. P. Selitskaya, M. N. Boldyreva // Russ. J. Numer. Anal. Math. Modelling. - 2009. - V. 24. - N. 4. - P. 377-384.

253. Sachan, A. S. Diagnostic significance of antigen A - 60 by ELISA test in pulmonary tuberculosis / A. S. Sachan, R. K. Gupta, D. Gupta, K. D.Gautam // Ind. J. Tub. - 1994. - V. 4. - P. 239-244.

254. Sack, D. A. Use of antibodies from lymphocyte secretion to diagnose active infection / D. A.Sack, R. Raquib // United States Patent. Patent No: US7638271 B2. Patent date: Dec. 29, 2009.

255. Sada, E. Detection of lipoarabinomannan as a diagnostic test for tuberculosis / E. Sada, D. Aguilar, M. Torres, T. Herrera // Journal of clinical microbiology. - 1992. -V. 30. -N. 9. - P. 2415-2418.

256. Salamin, K. Secretion of an endogenous subtilisin by Pichia pastoris strains GS115 and KM71 / K. Salamin, D. Sriranganadane, B. Le'chenne, O. Jousson, M. Monod // Applied and environmental microbiology. - 2010. - V. 76. - N. 13. - P. 4269-4276.

257. Samanich, K. Homogeneity of antibody responses in tuberculosis patients infection and immunity / K. Samanich, J. T. Belisle, S. Laal // Infection and immunity. - 2001. - V. 69. - P. 4600-4609.

258. Samanich, K. M. Delineation of human antibody responses to culture filtrate antigens of Mycobacterium tuberculosis / K. M. Samanich, J. T. Belisle, M. G. Sonnenberg, M. A. Keen, S. Zolla-Pazner, S. Laal // The journal of infectious diseases. - 1998. - V. 178. - P. 1534-1538.

259. Samanich, K. M. Serodiagnostic potential of culture filtrate antigens of Mycobacterium tuberculosis / K. M. Samanich, M. A. Keen, V. D. Vissa, J. D. Harder, J. S. Spencer, J. T. Belisle, S. Zolla-Pazner, S. Laal // Clin. Diagn.Lab. Immunol.- 2000. - V. 7. - N. 4. - P. 662-668.

260. Samten, B. Mycobacterium tuberculosis ESX-1 system-secreted protein ESAT-6 but not CFP10 inhibits human T-cell immune responses / B. Samten, X. Wang, P. F. Barnes // Tuberculosis. - 2009. - V. 89. - Suppl 1 :S74-6.

261. Sánchez-Rodríguez, C. An IgG antibody response to the antigen 85 complex is associated with good outcome in Mexican Totonaca Indians with pulmonary tuberculosis / C. Sánchez-Rodríguez, C. Estrada-Chávez, J. Garcia-Vigil, F. Laredo-Sánchez, J. Ilalabe-Cherem, A. Pereira-Suárcz, R. Mancilla // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2002. - V. 6. - N. 8. -P. 726-712.

262. Saxena, U. Antigenic epitopes on Mycobacterium tuberculosis recognized by antibodies in tuberculosis and mouse antisera / U. Saxena, R. K. Saxena // FEMS Microbiol. Immunol. - 1991. - V. 76. - P. 7-12.

263. Selma, W. B. Rapid detection of immunoglobulin G against Mycobacterium tuberculosis antigens by two commercial ELISA kits / W. B. Selma, FI. Harizi, M. Marzouk, I. Ben Kahla, F. Ben Lazreg, A. Ferjeni, I. Harrabi, A. Abdelghani, M. Ben Said, J. Boukadida // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2010. - V. 14. - N. 7. - P. 841-846.

264. Selvaraj, P. Role of human leucocyte antigen (FILA) and non-FILA genes in susceptibility or resistance to pulmonary tuberculosis leading article / P. Selvaraj // Ind. J. Tub. - 2000. - V. 47. - P. 133.

265. Selvaraj, P. HLA-DR phcnotypes and IgG, IgA and IgM antibody responses to Mycobacterium tuberculosis culture filtrate and 30 kDa antigens in pulmonary tuberculosis / P. Selvaraj, A. Raja, S. M. Kurian, K. R. Uma Devi, P. R. Narayanan // Current science. - 2004. - V. 87. - N. 6. - P. 771-775.

266. Selvaraj, P. Influence of IILA-DR2 phenotype on humoral immunity and lymphocyte response to Mycobacterium tuberculosis culture filtrate antigens in pulmonary tuberculosis. / P. Selvaraj, H. Uma, A. M. Reetha, T. Xavier, R. Prabhakar, P. R. Narayanan // Indian journal of medical research. - 1998. - V. 107. -P. 208-217.

267. Senol, G. Humoral immune response against 38-kDa and 16-kDa mycobacterial antigens in tuberculosis / G. Senol, O. F. Erer, Y. A. Yalcin, M. Coskun, A. T. Gu"ndu"z, C. Bicmen., M. Ertas, S. A. O'zkan // Eur. Respir. J. -2007. - V. 29. -P. 143-148.

268. Sester, M. Interferon-gamma release assays for the diagnosis of active tuberculosis: a systematic review and meta-analysis / M. Sester, G. Sotgiu, C. Lange, C. Giehl, E.Girardi, G. B. Migliori, A. Bossink, K. Dheda, R. Diel, J. Dominguez, M. Lipman, J. Nemeth, P. Ravn, S. Winkler, Fi. Fluitric, A. Sandgren, D. Manissero // Eur. Respir. J. - 2011. - V. 37. - P. 100-111.

269. Shen, G. Peptide-based antibody detection for tuberculosis diagnosis / G. Shen, D. Behera, M. Bhalla, A. Nadas, S. Laal // Clinical and vaccine immunology. - 2009. -V. 16. -N. 1. - P. 49-54.

270. Shin, A. R. Improved sensitivity of diagnosis of tuberculosis in patients in Korea via a cocktail enzyme-linked immunosorbent assay containing the abundantly expressed antigens of the K strain of Mycobacterium tuberculosis / A. R. Shin, S. J. Shin, K. S. Lee, S.-II. Eom, S.-S. Lee, B.-S. Lee, J.-S. Lee, S. N. Cho, PI.-J. Kim //Clinical and vaccine immunology. - 2008. - V. 15. - N. 12. - P. 1788-1795.

271. Shiratori, B. Understanding tuberculosis - global experiences and innovative approaches to the diagnosis. Chapter 17. Immunological diagnosis of active and latent tuberculosis. Edited by Dr. P.-J. Cardona / B. Shiratori, FI. Saitoh, U. R. Siddiqi, J. Zhao, FI. Chagan-Yasutan, M. Usuzawa, C. Nakajima, Y. Suzuki, T.

Hattori // Published online. Available at www.intechopen.com - 2012. -P. 353378.

272. SignalP 3.0 server //available at www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-3.0.

273. Yan, L. Heterologous expression of Mycobacterium tuberculosis Ag85B in Pichia pastoris / L. Yan, P. Jian-Hong, M. Li-Xin, J. Wep, Q. Xue-Ju, L. Jun-Yan // Wuhan university journal of natural science. - 2005. - V. 10. - P. 602-606.

274. Silva, V. M. Factors associated with humoral response to ESAT-6, 38 kDa and 14 kDa in patients with a spectrum of tuberculosis / V. M. Silva, G. Kanaujia, M. L. Gennaro, D. Menzies // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2003. - V. 7. - N. 5. - P. 478484.

275. Simonney, N. B-cell immune responses in HIV positive and HIV negative patients with tuberculosis evaluated with an ELISA using a glycolipid antigen / N. Simonney, P. Chavanet, C. Perronne // Tuberculosis. - 2007. - V. 87. - P. 109-122.

276. Simonney, N. Analysis of circulating immune complexes (CICs) in childhood tuberculosis: levels of specific antibodies to glycolipid antigens and relationship with serum antibodies / N. Simonney, A. Bourrillon, P. II. Lagrange // Int. J. Tuberc. Lung. Dis. - 2000. -V. 4. - P. 152-160.

277. Simundic, A. M. Measures of diagnostic accuracy: basic definitions / A. M. Simundic // The journal of the international federation of clinical chemistry and laboratory medicine. - 2008. - V. 19. - N. 4. - P. 1-9.

278. Singh, K. K. Antigens of Mycobacterium tuberculosis recognized by antibodies during incipient, subclinical tuberculosis / K. K. Singh, Y. Dong, J. T. Belisle, J. Harder, V. K. Arora, S. Laal // Clinical and diagnostic laboratory immunology. -2005. - V. 12. - N. 2. - P. 354-358.

279. Singh, K. K. Combined use of serum and urinary antibody for diagnosis of tuberculosis / K. K. Singh, Y. Dong, L. Hinds, M. A. Keen, J. T. Belisle, S. Zolla-Pazner, J. M. Achkar, A. J. Nadas, V. K. Arora, S. Laal // J. Infect. Dis. - 2003. -V. 188. -N. 3. - P. 371-377.

280. Sinha, J. Causes of proteolytic degradation of secreted recombinant proteins produced in methylotrophic yeast Pichia pastoris: case study with recombinant

ovine interferon-T / J. Sinha, B. A. Plantz, M. Inan, M. M. Meagher // Biotechnology and bioengineering. -2005. - V. 89. - N. 1. - P. 102-112.

281. Sinha, J. Improved production of recombinant ovine interferon-y by Mut+ strain of Pichia pastoris using an optimized methanol feed profile / J. Sinha, B. A. Plantz, W. Zhang, M. Gouthro, V. Schlegel, C. P. Liu, M. M. Meagher // Biotechnol. Prog. - 2003. -V. 19. - P. 794-802.

282. Skeiky, Y. A. Non-clinical efficacy and safety of IIyVac4:IC31 vaccine administered in a BCG prime-boost regimen / Y. A. Skeiky, J. Dietrich, T. M. Lasco, K. Stagliano, V. Dheenadhayalan, M. A. Goetz, L. Cantarero, R. J. Basaraba, P. Bang, I Kromann, J. B. McMclain, J. C. Sadoff, P. Andersen // Vaccine. - 2010. - V. 28. - P. 1084-1093.

283. Smith, G. T. O-linked glycosylation sites profiling in Mycobacterium tuberculosis culture filtrate proteins / G. T. Smith, M. J. Sweredoski, S. Hess // J. Proteomics. -2014.-V. 97.-P. 296-306.

284. Smith, K. C. Detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical specimens from children using a polymerase chain reaction / K. C. Smith, J. R. Starke, K. Eisenach, L. T. Ong, M. Denby // Pediatrics. - 1996. - V. 97. - P. 155-160.

285. Somi, G. R. Evaluation of the MycoDot test in patients with suspected tuberculosis in a field setting in Tanzania / G. R. Somi, R. J. O'Brien, G. S. Mfinanga, Y. A. Ipuge // Internetional journal of tuberculosis and lung diseases. -1999.-V. 3. - P. 231-238.

286. Souza, G. A. Using a label-free proteomics method to identify differentially abundant proteins in closely related hypo- and hypervirulent clinical Mycobacterium tuberculosis Beijing isolates / G. A. Souza, S. Fortuin, D. Aguilar, R. H. Pando, C. R. E. McEvoy, P. D. van Flelden, C. J. Koehler, B. Thiede, R. M. Warren, H. G. Wiker//Mol. Cell Proteomics. - 2010. - V. 9. - P. 2414-2423.

287. Souza, G. A. Bacterial proteins with cleaved or uncleaved signal peptides of the general secretory pathway / G. A. Souza, N. A. Leversen, H. Malcn, IT. G. Wiker // Journal of proteomics. - 2011. - V. 75. - N. 2. - P. 502-510.

288. Souza, I. IF. Screening of recombinant proteins as antigens in indirect ELISA for diagnosis of bovine tuberculosis / I. IF. Souza, E. S. Melo, C. A. Ramos, T. A. Farias, A. L. Osorio, K. S. Jorge, C. E. Vidal, A. S. Silva, M. R. Silva, A. O. Pellegrin, F. R. Araujo // SpringerPlus. - 2012. - V. 1. - N. 77. - P. 1-6.

289. Sreekrishna, K. Strategies for optimal synthesis and secretion of heterologous proteins in the methylotrophic yeast Pichia pastoris / K. Sreekrishna, R. G. Brankamp, K. E. Kropp, D. T. Blankenship, J. T. Tsay, P. L. Smith, J. D. Wierschke, A. Subramaniam, L. A. Birkenberger // Gene. - 1997. - V. 190. - N. 1. -P. 55-62.

290. Sriram, U. HLA-DR2 subtypes & immune responses in pulmonary tuberculosis / U. Sriram, P. Selvaraj, S. M. Kurian, A. M. Reetha, P. R. Narayanan // Indian. J. Med. Res.-2001,-V. 113.-P. 117-124.

291. Srivastava, S. K. A. 16 kDa heat shock protein from heat-inactivated Mycobacterium tuberculosis is a homodimer - suitability for diagnostic applications with specific llama VFIH monoclonals / S. K. Srivastava, V. J. B. Ruigrok, N. J. Thompson, A. K. Trilling, A. J. R. Fleck, C. van Rijn, J. Beekwilder, M. Jongsma // PLOS ONE. - 2013. - V. 8. - N. 5. - e64040.

292. Steingart, K. R. Serological tests for the diagnosis of active tuberculosis: relevance for India. Review article / K. R. Steingart, A. Ramsay, D. W. Dowdy, M. Pai // Indian. J. Med. Res. - 2012. - V. 135. - P. 695-702.

293. Stratton, J. High cell-density fermentation. In Higgins DR & Gregg JM (eds) Pichia Protocols / J. Stratton, V. Chiruvolu, M. Meagher // Humana Press, Totowa (New Jersey). - 1998. - P. 107-120.

294. Succi, M. The challenge of diagnosing tuberculosis in children / M. Succi // Rev. Paul. Pediatr. - 2014. - V. 32. - N. 1. - P. 2-3.

295. Sutcliffe, I. C. Lipoproteins of Mycobacterium tuberculosis: an abundant and functionally diverse class of cell envelope components / I. C. Sutcliffe, D. J. Harrington // FEMS Microbiology Reviews. - 2004. - V. 28. - P. 645-659.

296. Syed Ahamed Kabeer, B. Role of interferon gamma release assay in active tb diagnosis among HIV infected individuals / B. Syed Ahamed Kabeer, R.

Sikhamani, S. Swaminathan, V. Perumal, P. Paramasivam, A. Raja // PLOS ONE -2009. - V. 4.-N. 5.-e5718.

297. Takahashi, K. Effects of site-directed mutagenesis in the cysteine residues and the N-glycosylation motif in recombinant Der f 1 on secretion and protease activity / K. Takahashi, T. Takai, T. Yasuhara, T. Yokota, Y. Okumura // Int. Arch. Allergy Immunol. - 2001. - V. 124. - N. 4. - P. 454-460.

298. Teixeira, IT. C. Immunological diagnosis of tuberculosis: problems and strategies for success / H. C. Teixeira, C. Abramo, M. E. Munk // J. Bras. Pneumol. - 2007. -V. 33. -N. 3. - P. 323-334.

299. Tessema, T. A. Circulating antibodies to lipoarabinomannan in relation to sputum microscopy, clinical features and urinary anti-lipoarabinomannan detection in pulmonary tuberculosis / T. A. Tessema, G. Bjune, B. Hamasur, S. Svenson, IT. Syre, B. Bjorvatn // Scand. J. Infect. Dis. - 2002. - V. 34. - N. 2. - P. 97-103.

300. Tessema, T. A. Diagnostic evaluation of urinary lipoarabinomannan at an Ethiopian tuberculosis centre / T. A. Tessema, B. Hamasur, G. Bjune, S. Svenson, B. Bjorvatn // Scand. J. Infect. Dis. - 2001. - V. 33. - N. 4. - P. 279-284.

301. The ELISA Guidebook / Edited by J. R. Crowther // Springer. - 2000. - 436 p.

302. The new profile of drug-resistant tuberculosis in Russia: a global and local perspective: summary of a joint workshop. Drug-resistant tuberculosis in the Russian Federation // Institute of medicine of the national academies and Russian academy of medical science. - Washington D. C.: National academies press, 2011. -P. 29-37.

303. Tiwari, R. P. Glycolipids of Mycobacterium tuberculosis strain IT37Rv are potential serological markers for diagnosis of active tuberculosis / R. P. Tiwari, D. Tiwari, S. K. Garg, R. Chandra, P. S. Bisen // Clinical and diagnostic laboratory immunology. - 2005. - V. 12. - N. 3. - P. 465-473.

304. Tong, M. A multiplexed and miniaturized serological tuberculosis assay identifies antigens that discriminate maximally between TB and non-TB sera / M. Tong, C. E. Jacobi, F. M. van de Rijke, S. Kuijper, S. van de Werken, T. L. Lowary, C. H. ITokke, B. J. Appelmelk, N. J. D. Nagelkerke, IT. J. Tanke, R. P. M. van Gijlswijk,

J. Veuskens, A. H. J. Kolk, A. K. Raap // Journal of immunological methods. -2005. - V. 301. - N. 1-2. - P. 154-163.

305. Trajman, A. Interferon-gamma release assays versus tuberculin skin testing for the diagnosis of latent tuberculosis infection: an overview of the evidence / A. Trajman, R. E. Steffen, D. Menzies // Pulmonary medicine. - 2013. - Article ID 601737. -P. 1-11.

306. Ulrichs, T. Human tuberculous granulomas induce peripheral lymphoid folliclelike structures to orchestrate local host defense in the lung / T. Ulrichs, G. A. Kosmiadi, V. Trusov, S. Jorg, L. Pradl, M. Titukhina, V. Mishenko, N. Gushina, S. H. Kaufmann // J. Pathol. - 2004. - V. 204. - P. 217-228.

307. Ulstrup, J. C. Relationship of secretion pattern and MPB70 homology with osteoblast-specific factor 2 to osteitis following Mycobacterium bovis BCG vaccination / J. C. Ulstrup, S. Jeansson, H. G. Wiker, M. Harboe // Infection and immunity. - 1995. - V. 63. - N. 2. - P. 672-675.

308. Uma Devi, K.R. Antibody response to Mycobacterium tuberculosis 30 and 16 kDa antigens in pulmonary tuberculosis with human immunodeficiency virus coinfection / K. R. Uma Devi, B. Ramalingam, A. Raja // Diagnostic microbiology and infectious disease. - 2003,- V. 46. - P. 205-209.

309. Uma Devi, K. R. Specific and early detection of IgG, IgA and IgM antibodies to Mycobacterium tuberculosis 38kDa antigen in pulmonary tuberculosis / K. R. Uma Devi, B. Ramalingam, P. J. Brennan, P. R. Narayanan, A. Raja // Tuberculosis (Edinb). - 2001. - V. 81. - P. 249-253.

310. Uma, H. Antibody and lymphocyte responses to Mycobacterium tuberculosis culture filtrate antigens in active and quiescent (cured) pulmonary tuberculosis / H. Uma, P. Selvaraj, A. M. Rectha, T. Xavier, R. Prabhakar, P. R. Narayanan // Ind. J. Tub. - 1999. -V. 46. - P. 21.

311. Valderrama-Rincon, J. D. An engineered eukaryotic protein glycosylation pathway in Escherichia coli / J. D. Valderrama-Rincon, A. C. Fisher, J. H. Merritt, Y. Y. Fan, C. A. Reading, K. Chhiba, C. Heiss, P. Azadi, M. Aebi, M. P. DeLisa // Nat. Chem. Biol. - 2012. - V. 8. - N. 5. - P. 434-436.

312. Vallie're, S. Enhancement of innate and cell-mediated immunity by antimycobacterial antibodies / S. de Vallie're, G. Abate, A. Blazevic, R. M. Heuertz, D. F. Ho ft // Infection and immunity. - 2005. - V. 73. - N. 10. - P. 67116720.

313. Vasala, A. A new wireless system for decentralised measurement of physiological parameters from shake flasks / A. Vasala, J. Panula, M. Bollok, L. Illmann, C. Halsig, P. Neubauer // Microbial, cell factories. - 2006. - V. 5. - P. 8.

314. Verma, R. K. Antibodies to mycobacterial antigens for diagnosis of tuberculosis / R. K. Verma, A. Jain // FEMS. Immunology and medical microbiology. - 2007. -V. 51.-P. 453-461.

315. Veyrier, F. Evolution of the mycobacterial SigK regulon / F. Veyrier, B. Saf'd-Salim, M. A. Behr // Journal of bacteriology - 2008. - V. 190. - N. 6. - P. 1891— 1899.

316. Vincent, M. S. Understanding the function of CD 1-restricted T cells / M. S. Vincent, J. E. Gumperz, M. B. Brenner // Nature immunology. - 2003. - V. 4. - N. 6.-P. 517-523.

317. Wacker, M. N-linked glycosylation in Campylobacter jejuni and its functional transfer into E. coli / M. Wacker, D. Linton, P. G. Ilitchen, M. Nita-Lazar, S. M. Flaslam, S. J. North, M. Panico, FI. R. Morris, A. Dell, B. W. Wren, M. Aebi // Science. - 2002. - V. 298. - N. 5599. - P. 1790-1793.

318. Wadhwa, A. Opportunities for improved serodiagnosis of human tuberculosis, bovine tuberculosis, and paratuberculosis / A. Wadhwa, G. J. flickling, S. Eda // Veterinary medicine international. - 2012. - V. 2012. - P. 1-13.

319. Wanchu, A. Advances in serology for diagnosing TB in the FIIV Infected / A. Wanchu // Indian. J. Chest. Dis. Allied. Sci. - 2005. - V. 47. - P. 31-37.

320. Wang, X. Serological diagnosis of tuberculosis using proteins expressed from the region of difference 1 (RD1) and RD2 of Mycobacterium tuberculosis as antigens / X. Wang, X. Li, FI. Niu // African journal of microbiology research. - 2012. - V. 6. -N. 38. - P. 6698-6703.

321. Wang, Z. Global identification of prokaryotic glycoproteins based on an Escherichia coli proteome microarray / Z. Wang, R. Deng, H.-W.Jiang, S. Guo, II. Le, X. Zhao, C. Chen, J. Zhang, S. Tao // PLOS ONE. - 2012. - V. 7. - N. 11.-e49080.

322. Waters, W. R. Early antibody responses to experimental Mycobacterium bovis infection of cattle / W. R. Waters, M. V. Palmer, T. C. Thacker, J. P. Bannantine, H. M. Vordermeier, R. G. Hewinson, R. Greenwald, J. Esfandiari, J. McNair, J. M. Pollock, P. Andersen, K. P. Lyashchenko // Clin. Vaccine. Immunol. - 2006. - V. 13. - P. 648-654.

323. Way, S. S. The Mycobacterium tuberculosis ESAT-6 homologue in Listeria monocytogenes is dispensable for growth in vitro and in vivo / S. S. Way, C. B. Wilson//Infection and immunity. - 2005. - V. 73. - N. 9. - P. 6151-6153.

324. Wedemayer, G. J. Structural insights into the evolution of an antibody combining site / G. J. Wedemayer, P. A. Patten, L. H. Wang, P. G. Schultz, R. C. Stevens // Science. - 1997. - V. 276. - P. 1665-1669.

325. Weldingh, K. Assessing the sérodiagnostic potential of 35 Mycobacterium tuberculosis proteins and identification of four novel serological antigens / K. Weldingh, I. Rosenkrands, L. M. Okkels, T. M. Doherty, P. Andersen // Journal of clinical microbiology. - 2005. - V. 43. - N. 1. - P. 57-65.

326. Whelan, C. Immunoassay for serological diagnosis of Mycobacterium bovis infection in cattle / C. Whelan, E. Shuralev, G. O'Keeffe, P. Flyland, PI. F. Kwok, P. Snoddy, A. O'Brien, M. Connolly, P. Quinn, M. Groll, T. Watterson, S. Call, K. Kenny, A. Duignan, M. J. Hamilton, B. M. Buddle, J. A. Johnston, W. C. Davis, S. A. Olwill, J. Clarke // Clinical and vaccine immunology. - 2008. - V. 15. - N. 12. -P. 1834-1838.

327. Wiker, H. G. MPB70 and MPB83 - major antigens of Mycobacterium bovis / FI. G. Wiker // Scandinavian journal of immunology. - 2009. - V. 69. - P. 492-499.

328. Wiker, H. G. The antigen 85 complex: a major secretion product of Mycobacterium tuberculosis / H. G. Wiker, M. Harboe // Microbiological reviews. - 1992. - V. 56. - N. 4. - P. 648-661.

329. Wiker, H. G. Immunochemical characterization of the MPB70/80 and MPB83 proteins of Mycobacterium bovis / H. G. Wiker, K. P. Lyashcenko, A. M. Aksoy, K. A. Lightbody, J. M. Pollock, S. V. Komissarenko, S. O. Bobrovnik, I. N. Kolesnikova, L. O. Mykhalsky, M. L. Gennaro, M. Harboe // Infect. Immun. -1998. - V. 66. - N. 4.- P. 1445-1452.

330. Wilcke, J. T. R. Diagnostic strategy for pulmonary tuberculosis in a low-incidence country: results of chest X-ray and sputum cultured for Mycobacterium tuberculosis / J. T. R. Wilcke, A. Kok-Jensen // Respiratory medicine. - 1997. -V. 91. -N. 5.-P. 281-285.

331. Wilkinson, R. J. Evaluation of the recombinant 38-kilodalton antigen of Mycobacterium tuberculosis as a potential immunodiagnostic reagent / R. J. Wilkinson, K. Haslov, R. Rappuoli, F. Giovannoni, P. R. Narayanan, C. R. Desai, H. M. Vordermeier, J. Paulsen, G. Pasvol, J. Ivanyi, M., Singh // J. Clin. Microbiol. - 1997. - V. 35. - P. 553-557.

332. Williamson, M. P. The structure and function of proline-rich regions in proteins / M. P. Williamson // Biochem J. - 1994. - V. 297. - P. 249-260.

333. Wood, R. Lipoarabinomannan in urine during tuberculosis treatment: association with host and pathogen factors and mycobacteriuria / Wood R., K. Racow , L. G. Bekker, K. Middelkoop, M. Vogt, B. N. Kreiswirth, S. D. Lawn // BMC Infectious diseases. - 2012. -V. 12:47.

334. World Health Organization 2011. Commercial sérodiagnostic tests for diagnosis of tuberculosis: policy statement. WHO/HTM/TB/2011.5. - Geneva, 2011.

335. World Health Organization. Global tuberculosis report 2013. WHO/HTM/TB/2013.11,- Geneva, 2013.

336. Wu, Q. A study on the methods for early serological diagnosis of leprosy and their potential use / Q. Wu, X. Li, Y. Yin, FI. Shu, W. Wei, Q. Liu, G. Ye // Int. J. Lepr. other mycobact. Dis. - 1999. - V. 67. - N. 3. - P. 302-305.

337. Wu, X. Comparison of antibody responses to seventeen antigens from Mycobacterium tuberculosis / X. Wu, Y. Yang, J. Zhang, B. Li, Y. Liang, C. Zhang, M. Dong. // Clinica Chimica Acta. - 2010. - V. 411. - P. 1520-1528.

338. Wu, X. Humoral immune responses against the Mycobacterium tuberculosis 38-kilodalton, MTB48, and CFP-10/ESAT-6 antigens in tuberculosis / X. Wu, Y. Yang, J. Zhang, B. Li, Y. Liang, C. Zhang, M. Dong, H. Cheng, J. He // Clinical and vaccine immunology. - 2010.- V. 17. - N. 3. - P. 372-375.

339. Xiao, G. Operon information improves gene expression estimation for cDNA microarrays / G. Xiao, B. Martinez-Vaz, W. Pan, A. B. Khodursky // BMC Genomics. -2006,- V.7:87. - P. 1-11.

340. Xu, J. N. Serodiagnosis efficacy and immunogenicity of the fusion protein of Mycobacterium tuberculosis composed of the 10-kilodalton culture filtrate protein, ESAT-6, and the extracellular domain fragment of PPE68 / J. N. Xu, C. Jian-Ping, C.Da-Li // Clinical and vaccine immunology. - 2012. - V. 19. - N. 4. - P. 536-544.

341. Youden, W. J. An index for rating diagnostic tests / W. J. Youden // Cancer. -1950. -V. 3. - P. 32-35.

342. Zeng, S. R. Expression and identification of a small recombinant beefy meaty peptide secreted by the methylotrophic yeast Pichia pastor is / S. R. Zeng, Y. P. Wang, Y. Q. Yang, J. Zhang // African journal of microbiology research. - 2010. -V. 4. -N. 24. - P. 2754-2762.

343. Zhang, G. Screening and assessing 11 Mycobacterium tuberculosis proteins as potential serodiagnostical markers for discriminating tb patients from BCG vaccines / G. Zhang, L. Zhang, S. Hu // Genomics proteomics bioinformatics. -2009. -V. 7. -N. 3. - P. 107-115.

344. Zhang, H. PPE protein (Rv3425) from DNA segment RD11 of Mycobacterium tuberculosis: a potential B-cell antigen used for serological diagnosis to distinguish vaccinated controls from tuberculosis patients / H. Zhang, J. Wang, J. M. Zhang, Y. Yang, Y. Chen, PI. Wang // Clin. Microbiol. Infect. - 2007. - V. 13. - P. 139145.

345. Zhang, L. Sérodiagnostic value of 23 Mycobacterium tuberculosis proteins and a novel protein combination / L. Zhang, Y. Sun, G. Zhang, G. Li, B. Li, X. Cheng // African journal of microbiology research. - 2011. - V. 5. - N. 26. - P. 4569-4576.

346. Zhang, M. M. Identification of RD5-encoded Mycobacterium tuberculosis proteins as B-cell antigens used for serodiagnosis of tuberculosis / M. M. Zhang, J. W. Zhao, Z. Q. Sun, J. Liu, X. K. Guo, W. D. Liu, S. L. Zhang // Clinical and developmental immunology.- 2012. - V. 6. - N. 38. - P. 6698 - 6703.

347. Zhang, Q. Influence of deleting 9 amino acid residues at N-terminus on immunogenicity of a Plasmodium falciparum chimeric protein / Q. Zhang, W. Pan, L. Qu, X. Xue // Acta Biochim biophys sinica. - 2003. - V. 35. - P. 345-349.

348. Zhang Q. Changing the N-terminal sequence protects recombinant Plasmodium falciparum circumsporozoite protein from degradation in Pichia pastoris / Q. Zhang, F. Ding, X. Xue, X. Xu, W. Pan // Applied microbiology and biotechnology. - 2008. - V. 78. - N. l.-P. 139-145.

349. Zhang, S. L. Development and evaluation of a novel multiple-antigen ELISA for serodiagnosis of tuberculosis / S. L. Zhang, J. W. Zhao, Z. Q. Sun, E. Z. Yang, J. FI. Yan, Q. Zhao, G. L. Zhang, FI. M. Zhang, Y. M. Qi, FI. FI. Wang, Q. W. Sun // Tuberculosis. - 2009. - V. 89. - P. 278-284.

350. Zhou, A. T. Detection of pulmonary and extrapulmonary tuberculosis patients with the 38-kilodalton antigen from Mycobacterium tuberculosis in a rapid membrane-based assay / A. T. Zhou, W.-L. Ma, P.-Y. Zhang, R. A. Cole // Clinical and diagnostic laboratory immunology. -1996. - V. 3. - N. 3. - P. 337-341.

351.Zweig, M. IT. Receiver-operating characteristic (ROC) plots: a fundamental evaluation tool in clinical medicine / M. IT. Zweig, G. Campbell // Clinical chemistry. -1993. - V. 39. - P. 561-577.

СПИСОК ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА

Рисунки

Рисунок 1. Распределение доноров исследуемой группы по диагностированным формам туберкулеза. - С. 13.

Рисунок 2. Конструкция рекомбинантной плазмиды рР1С9 - С. 17.

Рисунок 3. Схема вставки гена белка в АОХ1 (а) и his4 (б) локусы хромосомы Р. pastoris - С. 17.

Рисунок 4. - Строение гликоконъюгата белка с гексаарабинофуранозидом ЛАМ-С. 21

Рисунок 5. График распределения коммерческих тест-систем по их диагностической эффективности при легочном туберкулезе - С.43

Рисунок 6. Генеалогия вакцинных штаммов БЦЖ - С. 59.

Рисунок 7 (7А, 7Б). Точечная диаграмма результатов ИФА с антигенами М. tuberculosis, полученными в экспрессионной системе E.coli, и их конъюгатами с гексаарабинофуранозидом ЛАМ - С. 107.

Рисунок 8 (8А, 8Б, 8В). ROC - кривые для анализов с белками М. tuberculosis, полученными в системе E.coli, и их конъюгатами с гексаарабинофуранозидом ЛАМ - С. 109.

Рисунок 9. Точечная диаграмма результатов ИФА с антигенами М. tuberculosis, полученными в разных экспрессиоиных системах - С. 112.

Рисунок 10 (10А, 10Б). ROC - кривые для анализов с белками М tuberculosis, полученными в разных экспрессиоиных системах - С. 113.

Рисунок 11. Диаграмма значений диагностической достоверности ИФА с антигенами М. tuberculosis, рассчитанных разными методами статистического анализа - С. 114.

Рисунок 12. Лепестковая диаграмма сравнения данных ИФА с рекомбинантными белками М. tuberculosis, полученными в системе Е. coli, и их конъюгатами - С. 116

Рисунок 13. Лепестковая диаграмма сравнения данных ИФА с белками М. tuberculosis, полученными в разных экспрессиоиных системах - С. 118

Рисунок 14. Гетерогенность распознавания антигенов М. tuberculosis сыворотками больных туберкулезом - С. 121.

Таблицы

Таблица 1. Концентрации антигенов, использованные при постановке ИФА - С. 24.

Таблица 2. Преимущества и недостатки различных методов диагностики туберкулеза - С. 35.

Таблица 3. Характеристики коммерческих тест-систем для серодиагностики туберкулеза легких - С. 42

Таблица 4. Видовая специфичность антигенов М. tuberculosis - С. 58.

Таблица 5. Перспективные серо диагностические маркеры туберкулеза при различных формах и стадиях заболевания - С. 60.

Таблица 6. Серодиагностическая эффективность антигенов М tuberculosis в разных странах - С. 62.

Таблица 7. Видовая специфичность некоторых «RD белков» М tuberculosis - С. 67.

Таблица 8. Эффективность серодиагностики туберкулеза при использовании различных вариантов мультиантигенных композиций - С. 89.

Таблица 9. Результаты статистического анализа данных ИФА - С. 100-101.

Таблица 10. Статистические показатели, рассчитанные на основании двух вариантов «отсекающих» значений - С. 103.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.