Прогностическое значение молекулярно-генетических маркеров у пациентов с нейробластомой тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.01.12, кандидат наук Друй, Александр Евгеньевич

• Друй, Александр Евгеньевич
• кандидат наук
• 2015

Оглавление диссертации кандидат наук Друй, Александр Евгеньевич

ОГЛАВЛЕНИЕ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Клинические характеристики нейробластомы

1.2. Стратификация больных нейробластомой на группы риска

1.3. Молекулярно-генетические факторы, не включенные в схемы стратификации

1.4. Молекулярно-генетические методы, используемые для идентификации прогностических биологических маркеров

1.5. Выявление поражения КМ и оценка минимальной остаточной болезни при нейробластоме

1.6. Прогностическое значение выявления инициального поражения КМ и мониторинга минимальной остаточной болезни

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Характеристика пациентов, включенных в исследование

2.2. Исследование генетических аберраций, ассоциированных с изменением количества копий генов или хромосомных регионов

2.3. Исследование прогностической значимости генетических аберраций, ассоциированных с изменением количества копий

генов или хромосомных регионов

2.4. Исследование инициального поражения КМ и оценка МОБ на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов

2.5. Сравнение применения ПЦР-РВ и проточной цитометрии для выявления поражения КМ и оценки МОБ

2.6. Исследование поражения КМ и оценка МОБ с помощью молекулярного маркера, основанного на анализе метилирования геномной ДНК

2.7. Исследование прогностической значимости инициального поражения КМ и оценки МОБ у больных нейробластомой

2.8. Качественная и количественная оценка РНК, используемой для выявления поражения КМ и оценки МОБ

2.9. Статистическая обработка данных

ГЛАВА 3. ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕНЕТИЧЕСКИХ АБЕРРАЦИЙ, АССОЦИИРОВАННЫХ С ИЗМЕНЕНИЕМ КОЛИЧЕСТВА КОПИЙ ГЕНОВ ИЛИ ХРОМОСОМНЫХ РЕГИОНОВ

3.1. Результаты определения количества копий гена МУСТУ и аберраций короткого плеча хромосомы 2

3.2. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 1

3.3. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 3

3.4. Результаты определения аберраций хромосомы 4

3.5. Результаты определения аберраций хромосомы 7

3.6. Результаты определения аберраций короткого плеча хромосомы 9

3.7. Результаты определения аберраций хромосомы 11

3.8. Результаты определения аберраций хромосомы 12

3.9. Результаты определения аберраций хромосомы 14

3.10. Результаты определения аберраций хромосомы 17

3.11. Результаты определения генетических аберраций в парах первичная опухоль-рецидив (прогрессия)

ГЛАВА 4. ИССЛЕДОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИХ МАРКЕРОВ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ИНИЦИАЛЬНОГО ПОРАЖЕНИЯ КОСТНОГО МОЗГА И ОЦЕНКИ МИНИМАЛЬНОЙ ОСТАТОЧНОЙ

БОЛЕЗНИ

4.1. Исследование инициального поражения КМ и оценка МОБ на

основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов

4.2. Прогностическое значение выявления поражения КМ и МОБ

на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов

4.3. Выявление контаминации препаратов АГСК и МОБ на момент проведения лейкафереза на основании экспрессии опухоль-ассоциированных генов

4.4. Сравнение результатов выявления поражения КМ при помощи экспрессии опухоль-ассоциированных генов и проточной цитометрии

4.5. Исследование поражения КМ и оценка МОБ на основании выявления метилированной формы гена RASSFla и определение

его прогностической значимости

4.6. Сопоставление результатов выявления поражения КМ с помощью метилированной формы гена RASSFla с определением экспрессии опухоль-ассоциированных генов и проточной цитометрией

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АГСК Аутологичные гемопоэтические стволовые клетки

АРМС Альвеолярная рабдомиосаркома

АТФ Аденозинтрифосфорная кислота

БСВ Бессобытийная выживаемость

ВС Величина соотношения

ГН Ганглионеврома

ГНБ Ганглионейробластома

ДНК Дезоксирибонуклеиновая кислота

ДЧ Диагностическая чувствительность

ДЭТ Диагностическая эффективность теста

кДНК Комплементарная дезоксирибонуклеиновая кислота

КМ Костный мозг

МкАт Моноклональное антитело

микроРНК Малая некодирующая рибонуклеиновая кислота

МОБ Минимальная остаточная болезнь

мРНК Матричная рибонуклеиновая кислота

НБ Нейробластома

ОВ Общая выживаемость

олл Острый лимфобластный лейкоз

омл Острый миелобластный лейкоз

ОР Относительный риск

ПК Периферическая кровь

пнэо Примитивная нейроэктодермальная опухоль

ппк Площадь под кривой

ПУ Пороговый уровень

ПЦОР Прогностическая ценность отрицательного результата

ПЦПР Прогностическая ценность положительного результата

ПЦР Полимеразная цепная реакция

ПЦР-РВ Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени

РБ Ретинобластома

РНК Рибонуклеиновая кислота

Сп Специфичность

ТГСК Трансплантация гемопоэтических стволовых клеток

XMJ1 Хронический миелолейкоз

ЭРМС Эмбриональная рабдомиосаркома

BHQ Гаситель флуоресценции «черная дыра»

CD Кластер дифференцировки

COG Группа детской онкологии, США

FAM Флуоресцеин амидит

FISH Флуоресцентная in situ гибридизация

GPOH Общество детской онкологии и гематологии, Германия

Система предоперационной стратификации больных

INRG

нейробластомой на группы риска

INSS Международная система стадирования нейробластомы

КЗЭДТА Трикалиевая соль этилендиаминтетрауксусной кислоты

miR Малая некодирующая рибонуклеиновая кислота

MLPA Множественная лигазно-зависимая амплификация зондов

NB2004 Схема программного лечения нейробластомы 2004 года

R6G Родамин 6G

RIN Показатель целостности рибонуклеиновой кислоты

ROC-кривые Характеристические кривые

ROX 6-карбоксил-Х-родамин

RTQ Гаситель флуоресценции для ПЦР в реальном времени

Европейский исследовательский проект по нейробластоме

SIOPEN

Международного общества детской онкологии

VNTR Анализ вариабельного числа тандемных повторов

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Прогностическое значение молекулярно-генетических маркеров у пациентов с нейробластомой»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Нейробластома — наиболее часто встречающаяся у детей солидная опухоль экстракраниальной локализации. Клиническое течение заболевания и, соответственно, прогноз варьируют в широких пределах от относительно доброкачественных форм, склонных к спонтанной регрессии (у детей раннего возраста) или созреванию (у детей более старших возрастных групп) до агрессивных опухолей, характеризующихся быстрым локорегионарным распространением, ранним появлением отдаленных метастазов, плохим ответом на проводимую мультимодальную терапию и высокой частотой рецидивов [35,52].

Гетерогенность клинических форм нейробластомы обусловлена биологическими свойствами опухолевых клеток, включающих изменение количества копий отдельных генов или хромосомных регионов, мутации в онкогенах и генах-супрессорах опухолевого роста, а также аберрантную экспрессию ряда генов [10,19,32]. Клинические данные, в первую очередь, возраст и масса опухоли в организме (локальная стадия и наличие отдаленных метастазов), имеют определенное прогностическое значение [150,204]. Современные схемы стратификации больных нейробластомой на группы риска, основанные на совокупности клинических и молекулярно-биологических данных, позволяют проводить селективную риск-адаптированную терапию, однако они не дают полной возможности прогнозировать эффективность терапии, вероятность развития рецидива и исход заболевания [54,107]. Этим продиктована необходимость дальнейшего поиска прогностических маркеров, введение которых в современные схемы стратификации позволило бы более точно определять степень риска у пациентов с нейробластомой, проводить индивидуализированное противоопухолевое лечение, добиваясь высокой эффективности и избегая избыточной токсичности.

Диссеминация опухоли в организме значительно усугубляет течение заболевания и увеличивает риск неудачи терапии. При этом значение имеют не только визуализируемые метастатические очаги, но и пул циркулирующих опухолевых клеток в периферической крови и инфильтрация ими костного мозга (КМ). Предполагается, что совокупность клеток опухоли в КМ, не выявляемая методами стандартного цитологического исследования, может иметь важное прогностическое значение [170].

Ответ опухоли на проводимую терапию является независимым прогностическим фактором при различных онкологических и гематологических заболеваниях [147,172]. Наличие остаточных опухолевых клеток в организме -минимальной остаточной болезни (МОБ) - во время проведения химиотерапии, после индукционной химиотерапии или перед проведением трансплантации аутологичных гемопоэтических стволовых клеток (АГСК) значимо снижает показатели выживаемости больных нейробластомой [49,76,183]. Это определяет необходимость поиска высокочувствительных методов, служащих для обнаружения оккультных опухолевых клеток как в момент диагностики нейробластомы для корректного стадирования заболевания, так и в процессе лечения для оценки наличия и кинетики МОБ. Также необходим анализ прогностической значимости полученных результатов.

Степень разработанности темы исследования

На сегодняшний день в схемы стратификации больных нейробластомой на группы риска включены такие молекулярно-биологические характеристики опухоли, как амплификация гена МУСЫ, делеция короткого плеча хромосомы 1 и длинного плеча хромосомы 11, неблагоприятная роль которых была показана в большом количестве исследований [19,54,107]. В то же время патогенетическое и прогностическое значение ряда генетических аберраций (аномалии хромосом 4,7,12,14) остается невыясненным, а литературные данные о влиянии структурных аберраций хромосом 3 и 9 на выживаемость пациентов являются противоречивыми [73,142,179]. Кроме того, отсутствуют данные об изменении

спектра молекулярно-генетических аномалий в ткани опухоли при развитии рецидива заболевания по сравнению с клетками первичной опухоли.

Не подвергается сомнению факт ухудшения прогноза нейробластомы при наличии диссеминированной опухоли [52]. Однако способы выявления отдаленных метастазов и, в частности, поражения опухолевыми клетками костного мозга в последнее время претерпели существенные изменения. Внедрены современные методы визуализационной диагностики (мультиспиральная компьютерная томография, магнитно-резонансная томография, а также сцинтиграфия с использованием 131-1 метайодбензилгуанидина). Для оценки поражения КМ в рутинной практике продолжает применяться цитологический метод, чувствительность которого невелика [170]. Вместе с тем различными исследовательскими группами предлагается использовать с этой целью высокочувствительные методы молекулярной биологии и иммунофенотипирование [37,170]. Однако стандартизованный подход к использованию данных методов для определения опухолевых клеток в КМ отсутствует.

Таким образом, целью исследования является определение прогностической значимости молекулярно-генетических аберраций в клетках нейробластомы и поражения КМ, выявляемого методами молекулярной биологии.

Задачи исследования

1. Изучить возможность применения полимеразной цепной реакции (ПЦР), множественной лигазно-зависимой амплификации зондов (MLPA) и флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) для определения изменений числа копий отдельных генов и хромосомных регионов, а также проанализировать качественное соответствие результатов, полученных различными методами.

2. Установить частоту выявления и связь с клиническими характеристиками аберраций короткого плеча хромосомы 1, короткого плеча хромосомы 2 (а также гена MYCN), короткого плеча хромосомы 3, короткого плеча хромосомы 4, хромосомы 7, короткого плеча хромосомы 9, длинного плеча хромосомы 11,

длинного плеча хромосомы 12 (а также гена MDM2), длинного плеча хромосомы 14, длинного плеча хромосомы 17.

3. Определить прогностическое значение указанных аберраций во всей исследуемой группе пациентов, а также в подгруппах: больные младше 1 года, с локализованной опухолью, отсутствием амплификации гена MYCN.

4. Провести сравнение различных молекулярных маркеров поражения КМ и наличия МОБ на основе экспрессии опухоль-ассоциированных генов, а также оценить прогностическое значение их выявления при первичной диагностике и в ходе терапии.

5. Оценить возможность применения маркера поражения КМ на основе исследования геномной ДНК.

6. Провести сравнительный анализ методов ПЦР и проточной цитометрии для выявления поражения КМ и определения остаточных опухолевых клеток.

Научная новизна

Впервые установлено, что обнаружение экспрессии генов РНОХ2В и ТН является оптимальным тестом для оценки инициального поражения КМ и контроля МОБ (диагностическая эффективность теста (ДЭТ) 0,994 и 0,952, соответственно). Показано негативное прогностическое значение поражения КМ, выявленного с помощью анализа экспрессии генов РНОХ2В и ТН на момент первичной диагностики нейробластомы (снижение БСВ на 26%, OB - на 23%). Впервые выявлено снижение выживаемости пациентов (БСВ на 59%, OB - на 75%) при наличии экспрессии генов РНОХ2В и ТН в КМ перед процедурой афереза АГСК, несмотря на отсутствие экспрессии данных генов в аутотрансплантате.

Установлено неполное качественное соответствие результатов выявления поражения КМ методами ПЦР-РВ и проточной цитометрии (78,8%). Продемонстрирована эффективность применения и прогностическое значение (снижение БСВ на 39%) метилированной формы гена RASSFla в качестве маркера поражения КМ, основанного на исследовании геномной ДНК.

Получены высокие показатели качественного соответствия результатов выявления делеции короткого плеча хромосомы 1 (95%) и амплификации гена MYCN (100%) методами ПЦР, FISH и MLPA. Определено прогностическое значение генетических аберраций, клиническая значимость которых ранее оставалась неизвестной, в том числе увеличения генетического материала короткого плеча хромосомы 4, увеличения материала длинного и короткого плеч хромосомы 7 и делеции короткого плеча хромосомы 9. В группе больных с прогностически благоприятными формами нейробластомы выявлены генетические аберрации, имеющие негативное прогностическое значение: увеличение генетического материала короткого плеча хромосомы 2, увеличение материала длинного и короткого плеч хромосомы 7, делеция короткого плеча хромосомы 9 и увеличение материала длинного плеча хромосомы 17.

Впервые обнаружено, что при возникновении рецидива или прогрессии нейробластомы спектр выявляемых генетических аберраций в ткани первичной опухоли и в ткани рецидива (после прогрессии) может различаться, причем как в сторону приобретения новых аномалий, так и в сторону исчезновения имеющихся и нормализации кариотипа.

Теоретическая и практическая значимость

Показано, что методы ПЦР, FISH и MLP А могут быть использованы для выявления генетических аберраций, связанных с изменением числа копий отдельных генов или хромосомных регионов в клетках нейробластомы. При этом технология MLPA является универсальной и позволяет в условиях одной постановки определять множество аберраций в локусах, наиболее часто вовлекаемых в перестройки при нейробластоме. Выявленное негативное прогностическое значение аномалий хромосом 1, 2, 4, 7, 9, 17 позволяет использовать их для определения степени риска, в том числе, в группе с прогностически благоприятной нейробластомой, пациентам которой в ряде случаев проведение химиотерапии не показано. Обосновано комплексное использование всех трех методик для выявления прогностически-значимых

генетических аберраций, как при первичной верификации диагноза, так и при возникновении прогрессии или рецидива опухоли.

Показано, что нормализованная величина экспрессии генов РНОХ2В и ТН в КМ является наиболее информативным маркером инициального поражения КМ и наличия остаточных опухолевых клеток перед проведением аутологичной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ДЭТ 0,994 и 0,952). Установлено, что для наиболее точной оценки поражения КМ необходимо дополнительное применение маркера, основанного на геномной ДНК -метилированной формы ЯА88Р1а или проточной цитометрии.

На основе технологии капиллярного электрофореза на микроструйных чипах установлен предельный уровень деградации РНК, используемой для анализа экспрессии генов (ШЫ=4,2).

Методология и методы исследования

Диссертационное исследование проведено в соответствии с мировым опытом проведения научно-исследовательских работ, в основе которого лежат принципы медицинской этики и доказательной медицины. Методология работы включала создание дизайна исследования, установление объема выборки и критериев включения и исключения пациентов, а также подбор оптимального математического аппарата для статистической обработки результатов. При осуществлении настоящего исследования были применены клинические, морфологические, инструментальные и лабораторные методы, среди которых молекулярно-генетические и цитогенетические.

Положения, выносимые на защиту

1. Технология МЬРА позволяет достоверно выявлять многочисленные генетические аберрации у больных нейробластомой.

2. Наличие делеций короткого плеча хромосомы 1, короткого плеча хромосомы 9, а также увеличения генетического материала короткого плеча хромосомы 2, короткого плеча хромосомы 4, длинного и короткого плеч

хромосомы 7 и длинного плеча хромосомы 17 связаны с неблагоприятным прогнозом нейробластомы.

3. Экспрессия генов РНОХ2В и ТН обладает наибольшей диагностической ценностью при выявлении поражения КМ и МОБ среди транскриптов опухоль-ассоциированных генов (ДЭТ 0,994 и 0,952). Наличие экспрессии РНОХ2В и/или ТН в КМ во время инициальной диагностики ассоциировано со снижением выживаемости пациентов (БСВ на 26%, OB - на 23%). Выявление экспрессии данных генов в КМ пациентов перед аферезом АГСК связано с развитием посттрансплантационных рецидивов нейробластомы.

4. Выявление метилированной формы гена RASSFla является эффективным методом выявления поражения КМ у пациентов с нейробластомой. Обнаружение метилированной формы RASSF1 а в КМ при первичной диагностике связано с более низкими значениями бессобытийной выживаемости пациентов (БСВ 0,28±0,13).

Внедрение в практику

Определение прогностически значимых генетических аберраций в клетках нейробластомы методами ПЦР, FISH и MLPA, а также выявление поражения КМ и оценка МОБ с помощью молекулярных маркеров РНОХ2В, ТН, RASSFla и проточной цитометрии успешно внедрены в практику Лаборатории молекулярной биологии Отдела детской онкологии и гематологии Областной детской клинической больницы №1 (ОДКБ№1, г. Екатеринбург) и применяются для всех больных нейробластомой. В лаборатории исследуются образцы пациентов из детских онкологических клиник Перми, Челябинска и Новосибирска. Результаты проведенного исследования используются в учебном процессе на кафедре клинической лабораторной диагностики и бактериологии ГБОУ ВПО «Уральский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Степень достоверности и апробация работы

Для обеспечения достоверности результатов исследуемая когорта включала 122 пациента с верифицированным диагнозом нейробластома. С целью доказательной аргументации выводов данные, полученные в процессе исследования, подвергались статистической обработке с помощью программ 81а^811са 8.0 и Апа^е-к.

Основные положения диссертации были доложены на IV Съезде детских онкологов России (Москва, 2008); IV Объединенном иммунологическом форуме (Санкт-Петербург, 2008); VI Съезде Российского общества медицинских генетиков (Ростов-на-Дону, 2010); Конференциях «Достижения в исследовании нейробластомы - 2010, 2012 и 2014» (Стокгольм, 2010, Торонто, 2012, Кёльн, 2014); IV и V Митингах по трансплантации гемопоэтических стволовых клеток, посвященных памяти Р.М.Горбачевой (Санкт-Петербург, 2010, 2011); 42-46 Конгрессах Международного общества детских онкологов (Бостон, 2010, Окленд, 2011, Лондон, 2012, Гонконг, 2013, Торонто, 2014); 8 Азиатском Конгрессе Международного общества детских онкологов (Сеул, 2014); 14 и 16 Российских национальных онкологических конгрессах (Москва, 2010, 2012), Европейском мультидисциплинарном онкологическом конгрессе (Стокгольм, 2011), Конференции «Современные достижения и перспективы в клиническом и фундаментальном исследовании нейробластомы» (Екатеринбург, 2013), Конференции Американского общества клинической онкологии (Чикаго, 2013) и исследования рака (Сан-Диего 2014). По материалам исследования опубликовано 30 печатных работ, из них 6 статей в журналах, входящих в перечень изданий, рекомендованных ВАК.

Личный вклад автора в получение результатов

При выполнении диссертационной работы автор лично участвовал в создании ее дизайна, формировал исследуемую когорту больных, осуществлял обработку и молекулярно-генетическое исследование клинического материала, сбор, систематизацию и анализ полученных результатов и данных дополнительных методов исследования. Автором выполнены обзор мировой

литературы по теме диссертации, статистическая обработка результатов, формирование выводов и практических рекомендаций. Структура и объем диссертации

Диссертация изложена на 206 страницах машинописного текста. Состоит из введения, четырех глав, заключения и выводов. Библиография включает 205 источников, из них 9 отечественных и 196 иностранных. Работа иллюстрирована 41 таблицей и 49 рисунками.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1Л. Клинические характеристики нейробластомы

Нейробластома — обобщающее понятие, включающее ряд опухолей нейрогенной природы различной степени злокачественности. Все они объединены общностью гистогенеза из клеток нервного гребня эмбриональной нейроэктодермы, которые в норме дифференцируются в клетки симпатических ганглиев и хромаффинной ткани надпочечников [27,133]. В результате гиперэкспрессии генов МУСЫ, РНОХ2а, РНОХ2Ь, ЕЬАУЬ4, ТгкВ, ТгкС

клетки теряют способность реагировать на дифференцировочные сигналы, а также утрачивают активность генов-супрессоров опухолевого роста ЯЪ, р53, р73 что является молекулярной основой формирования опухолевого клона [4,5,12,34,94,98,100,108,133,163].

Морфологическая классификация опухолей симпатической нервной системы основана на соотношении между клетками нейрального типа (нейробласты, ганглиозные клетки) и шванновской стромой и включает нейробластому, ганглионейробластому и ганглионеврому [13,156].

Нейробластома является наиболее частой детской солидной опухолью экстракраниальной локализации и составляет в структуре детской онкологической патологии 8-10% [87]. Заболеваемость нейробластомой составляет 1 на 8000 новорожденных или 10,5 случаев на 1 миллион детей в возрасте до 15 лет. Максимум заболеваемости приходится на возраст от 0 до 4 лет, медиана 23 месяца [169].

Локализация нейробластомы определяется расположением элементов симпатической нервной системы в организме. Наиболее частой локализацией опухоли является надпочечник, несколько реже поражаются вегетативные ганглии забрюшинного пространства, средостения, шеи и полости малого таза [3,6]. На момент постановки диагноза около 40% пациентов имеют IV стадию

заболевания, которая характеризуется наличием диссеминированной опухоли [91]. Распространение опухоли происходит путем лимфогенного и гематогенного метастазирования в отдаленные лимфатические узлы, КМ, кости скелета, печень и кожу. Вариантом стадии IV нейробластомы является стадия 1У1ЧГ, при которой происходит метастатическое поражение только отдаленных лимфатических узлов без вовлечения других органов, что ассоциировано с более благоприятным прогнозом [128].

Среди пациентов с диссеминированными опухолями выделяется специфическая группа больных в возрасте младше 1 года с метастатическим поражением кожи, печени и КМ (до 10% опухолевых клеток) - стадия 1У8 нейробластомы. Данные пациенты имеют хороший прогноз, поскольку опухоль склонна к спонтанной регрессии без проведения специфического лечения [52].

1.2. Стратификация больных нейробластомой на группы риска

Нейробластома характеризуется разнообразием клинических и морфологических форм, которые имеют различный прогноз в отношении развития рецидивов заболевания и общей выживаемости (ОВ) пациентов. Часть опухолей склонны к спонтанной регрессии или созреванию, в результате чего они трансформируются в доброкачественную опухоль - ганглионеврому. Другие, напротив, характеризуются агрессивным поведением. При этом отмечается большая опухолевая масса, раннее появление отдаленных метастазов и часто наблюдается прогрессивное клиническое течение, несмотря на многокомпонентную противоопухолевую терапию.

Одновременно с описанием феномена клинической гетерогенности нейробластомы [66,72] стали появляться попытки идентифицировать маркеры, ассоциированные как с благоприятным, так и с неблагоприятным поведением опухоли и, следовательно, прогнозом заболевания. Первыми факторами, прогностическое значение которых было доказано, являлись возраст ребенка на

момент постановки диагноза и распространенность опухолевого процесса (стадия заболевания). Было показано, что прогноз в группе больных младше 1 года значительно лучше, чем в возрасте старше 1 года, поскольку в данной группе достоверно чаще встречались случаи спонтанной дифференцировки опухолевых клеток. При этом местное распространение процесса и появление отдаленных метастазов существенно ухудшало результаты лечения [72]. Однако практически сразу стало очевидно, что одних клинических характеристик недостаточно для корректного определения прогноза заболевания. В качестве потенциальных прогностических маркеров исследовались гистологическое строение опухоли и содержание ДНК в клетках опухоли (плоидность). Прогностическое значение данных характеристик было подтверждено на большом количестве пациентов в ретроспективных и проспективных исследованиях. Низкая дифференцировка клеток, малое количество Шванновской стромы, а также диплоидный и тетраплоидный наборы хромосом в опухолевых клетках являются неблагоприятными прогностическими факторами [45,106,116,157].

С развитием молекулярной биологии стали анализироваться генетические факторы прогноза нейробластомы. Было выявлено, что наличие амплификации гена МУСЫ в клетках опухоли ассоциировано с агрессивным течением заболевания [32,154]. В дальнейшем появились данные о влиянии различных аномалий структуры и числа хромосом на выживаемость больных нейробластомой. Были описаны как прогностически неблагоприятные хромосомные перестройки, так и аберрации, характеризующие относительно доброкачественное течение заболевания. К первым относятся делеция короткого плеча хромосомы 1 (локус 1р36), [31,53,81], делеция длинного плеча хромосомы 11 (локус 1Ц23) [88,194], несбалансированное увеличение материала длинного плеча хромосомы 17 (локус \1(\2\) [29,109], делеция короткого плеча хромосомы 3 (локус Зр22), а также делеции хромосом 4, 9 и 12. Ко вторым - полное умножение хромосомы 17, которое часто является маркером околотриплоидного кариотипа [201] и делеция короткого плеча хромосомы 9 (локусы 9р22-24) [82].

Показано, что использование клинических, морфологических и молекулярных критериев позволяет разделить пациентов на группы риска, долгосрочная выживаемость в которых значительно различается. При отсутствии неблагоприятных факторов прогноза выживаемость больных достигает 95% [139], а при сочетании нескольких (распространенная опухоль, амплификация гена MYCN, делеция короткого плеча хромосомы 1) - не превышает 40%, несмотря на мультимодальную терапию, включающую высокодозную химиотерапию с аутологичной трансплантацией костного мозга [123,162]. Все современные протоколы программного лечения нейробластомы включают стратификацию пациентов на группы риска с целью выбора оптимальной интенсивности терапии. При этом критерии, лежащие в основе стратификации, в разных схемах различаются.

В большинстве детских онкологических клиник России лечение пациентов с нейробластомой проводится в соответствии со схемой программной терапии NB2004, разработанной немецкой группой детской онкологии и гематологии (GPOH, Group for Pediatric Oncology and Hematology, Германия). Для определения группы риска в данной схеме используются следующие критерии: стадия заболевания, наличие амплификации гена MYCN, делеции короткого плеча хромосомы 1 и возраст на момент постановки диагноза (учитывается при III или IV стадии нейробластомы без амплификации MYCN) (рисунок 1). При этом количество копий гена MYCN имеет решающее значение: при наличии амплификации пациенты относятся к группе высокого риска, независимо от стадии заболевания и наличия других прогностических факторов. Наличие делеции короткого плеча хромосомы 1 имеет значение в случаях II и III стадий при отсутствии амплификации MYCN [150].

Стадия III

Стадия IV

Возраст года

Ш Группа наблюдения

■ Группа промежуточного риска

■ Группа высокого риска

Рисунок 1. Схема стратификации больных нейробластомой на группы риска, используемая в протоколе ЫВ2004.

В протоколе кооперативной группы детской онкологии (COG, Children's Oncology Group, США) в основе определения группы риска помимо стадии заболевания лежат возраст пациента на момент постановки диагноза, наличие амплификации гена MYCN, гистологическое строение опухоли (согласно классификации H.Shimada) и плоидность опухолевых клеток (имеет значение только для определения риска у пациентов IVS стадии). Единственный молекулярно-генетический фактор, используемый в данной схеме стратификации, амплификация гена MYCN не является решающим. Пациенты с I или II (младше 1 года) стадией нейробластомы, имеющие амплификацию MYCN относятся к группе низкого риска [158,204].

Европейская группа по изучению нейробластомы (SIOPEN, International Society of Pediatric Oncology European Neuroblastoma Group, Европейский Союз)

для определения риска у больных нейробластомой предлагает использовать такие параметры, как стадию заболевания (INSS), возраст и количество копий гена MYCN. При этом в случае наличия амплификации MYCN пациент сразу попадает в группу высокого риска [107]. Система стратификации больных нейробластомой на группы риска - INRG объединила различные клинические, морфологические и молекулярно-био логические характеристики. К первым относятся распространенность опухоли и возраст больного на момент постановки диагноза. Ко вторым - гистологическая категория и степень дифференцировки опухолевых клеток согласно классификации H.Shimada. К третьим - наличие амплификации гена MYCN и делеции длинного плеча хромосомы 11. Наличие аберраций длинного плеча хромосомы 11 учитывается при локорегионарном распространении опухоли с наличием факторов риска, выявляемых при использовании визуализационных методов исследования (стадия L2 по системе INRG), а также при диссеминированной опухоли с поражением кожи, печени и/или костного мозга у больных не старше 18 месяцев (стадия MS, INRG). Кроме того, при диссеминированной нейробластоме (стадия M, INRG) у детей младше 18 месяцев имеет значение плоидность опухолевых клеток [54].

Таким образом, из большого количества аберраций структуры и числа хромосом в клетках нейробластомы, выявляемых методами молекулярной биологии, три включены в различные протоколы для стратификации пациентов на группы риска: амплификация гена MYCN, делеция короткого плеча хромосомы 1 (1р) и делеция длинного плеча хромосомы 11 (llq). Патогенетическая роль данных аномалий, также как их прогностическая значимость, различна.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Друй, Александр Евгеньевич, 2015 год

ЛИТЕРАТУРА

1. Генетический паспорт - основа индивидуальной и предиктивной медицины. / Под ред. B.C. Баранова - СПб.: Издательство Н-Л, 2009. - 54 с.

2. Глик, Б. Молекулярная биотехнология. Принципы и применение. / Б. Глик, Д. Пастернак. - М.: Мир, 2002. - 589 с.

3. Клинические лекции по детской онкологии. / Под ред. Л.А. Дурнова. — М.: Медицинское информационное агентство, 2004. - 145 с.

4. Жимулев, И.Ф. Общая и молекулярная генетика. / И.Ф. Жимулев. -Новосибирск: Сибирское университетское издательство, 2007. - 400 с.

5. Иванов, В.И. Геномика - медицине. / В.И. Иванов, Л.Л. Киселев. -М.: Академкнига, 2005. - 245 с.

6. Ланцковский, Ф. Детская гематология и онкология / Ф. Ланцковский. -М.: Лори, 2005.-484 с.

7. Мисюрин, А.В. Молекулярная диагностика хронического миелолейкоза / А.В. Мисюрин, Е.В. Аксенова, А.А. Крутов и др. // Гематология и трансфузиология. - 2007. - №2. - С. 35-40.

8. ПЦР в реальном времени. / Под ред. Д.В. Ребрикова. - М.: Бином, 2009,- 114 с.

9. Фейгин, В.Л. Основы мета-анализа: теория и практика / В.Л. Фейгин // Международный журнал медицинской практики. - 1999. - № 7. - С. 7-13.

10. Abel, F. A 6-gene signature identifies four molecular subgroups of neuroblastoma / F. Abel, D. Dalevi, M. Nethander et al // Cancer Cell Int. - 2011. -Vol. 11.-P. 9-24.

11. Adida, C. Prognostic significance of survivin expression in diffuse large B-cell lymphomas / C. Adida, C. Haioun, P. Gaulard et al // Blood. - 2000. - Vol. 96.-P. 1921-1925.

12. Aloyz, R.S. p53 is essential for developmental neuron death as regulated by the TrkA and p75 neurotrophin receptors / R.S. Aloyz, S.X. Bamji, C.D. Pozniak et al // J. Cell Biol. - 1998. - Vol. 143. - P. 1691-1703.

13. Ambros, I.M. Morphologic features of neuroblastoma (Schwannian stroma-poor tumors) in clinically favorable and unfavorable groups / I.M. Ambros, J. Hata, V.V. Joshi et al // Cancer. - 2002. - Vol. 94. - P. 1574-1583.

14. Ambros, I.M. A Multilocus technique for risk evaluation of patients with neuroblastoma / I.M. Ambros, B. Brunner, G. Aigner et al // Clin Cancer Res. -2011.-Vol. 17.-P. 792-804.

15. Ambros, P.F. Intratumoural heterogeneity of lp deletions and MYCN amplification in neuroblastomas / P.F. Ambros, I.M. Ambros, R. Kerbl et al. // Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. - P. 1-4.

16. Ambros, P.F. International consensus for neuroblastoma molecular diagnostics: report from the International Neuroblastoma Risk Group (INRG) Biology Committee / P.F. Ambros, I.M. Ambros, G.M. Brodeur et al // Br. J. Cancer. -2009. - Vol. 100.-P. 1471-1482.

17. Anderson, J. Rapid and accurate determination of MYCN copy number and lp deletion in neuroblastoma by quantitative PCR / J. Anderson, S. Gibson, D. Williamson et al // Pediatr. Blood Cancer. - 2006. - Vol. 46. - P. 820-824.

18. Ando, K. Expression of TSLC1, a candidate tumor suppressor gene mapped to chromosome llq23, is downregulated in unfavorable neuroblastoma without promoter hypermethylation / K. Ando, M. Ohira, T. Ozaki et al // Int. J. Cancer. - 2008. - Vol. 123. - P. 2087-2094.

19. Attiyeh, E.F. Chromosome lp and llq deletions and outcome in neuroblastoma / E.F. Attiyeh, W.B. London, Y.P. Mosse et al // N. Engl. J. Med. -2005. - Vol. 353. - P. 2243-2253.

20. Avigad, S. Minimal residual disease in peripheral blood stem cell harvests from high-risk neuroblastoma patients / S. Avigad, G. Feinberg-Gorenshtein, D. Luria et al // J. Pediatr. Hematol. Oncol. - 2009. - Vol. 31. - P. 22-26.

21. Bagchi, A. CHD5 is a tumor suppressor at human lp36 / A. Bagchi, C. Papazoglu, Y. Wu et al // Cell. - 2007. - Vol. 128. - P. 459-475.

22. Baksh, S. The tumor suppressor RASSF1A and MAP-1 link death receptor signaling to Bax conformational change and cell death / S. Baksh, S. Tommasi, S. Fenton et al // Molec. Cell. - 2005. - Vol. 18. - P. 637-650.

23. Banelli, B. Distinct CpG methylation profiles characterize different clinical groups of neuroblastic tumors / B. Banelli, I. Gelvi, A. Di Vinci et al // Oncogene. - 2005. - Vol. 24. - P. 5619-5628.

24. Baxter, J. Positive supercoiling of mitotic DNA drives decatenation by topoisomerase II in eukaryotes / J. Baxter, N. Sen, V. Lopez Martinez et al // Science.-2011.-Vol. 331.-P. 1328-1332.

25. Berthold, F. Neuroblastoma: current drug therapy recommendations as part of the total treatment approach / F. Berthold, B. Hero // Drugs. - 2000. - Vol. 59.-P. 1261-1277.

26. Berthold, F. Long-term results and risk profiles of patients in five consecutive trials (1979-1997) with stage 4 neuroblastoma over 1 year of age / F. Berthold, B. Hero, B. Kremens et al // Cancer Lett. - 2003. - Vol. 197. - P. 11-17.

27. Bolande, R.P. The neurocristopathies: a unifying concept of disease arising in neural crest maldevelopment / R.P. Bolande // Human Pathol. - 1974. -Vol. 5.-P. 409-429.

28. Bown, N. Gain of chromosome arm 17q and adverse outcome in patients with neuroblastoma / N. Bown, S. Cotterill, M. Lastowska et al // N. Engl. J. Med. - 1999,-Vol. 340.-P. 1954-1961.

29. Bown, N. 17q gain in neuroblastoma predicts adverse clinical outcome. U.K. Cancer Cytogenetics Group and the U.K. Children's Cancer Study Group / N. Bown, M. Lastowska, S. Cotterill et al // Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. -P. 14-19.

30. Breen, C.J. Coordinate deletion of chromosome 3p and llq in neuroblastoma detected by comparative genomic hybridization / C.J. Breen, A. O'Meara, M. McDermott et al // Cancer. Genet. Cytogenet. - 2000. - Vol. 120. -P. 44-49.

31. Brodeur, G.M. Cytogenetic features of human neuroblastomas and cell lines / G.M. Brodeur, A.A. Green, F.A. Hayes et al // Cancer Res. - 1981. - Vol. 41.-P. 4678-4686.

32. Brodeur, G.M. Amplification of N-myc in untreated human neuroblastomas correlates with advanced disease stage / G.M. Brodeur, R.C. Seeger, M. Schwab et al // Science. - 1984. - Vol. 224. - P. 1121-1124.

33. Brodeur, G.M. Revisions of the international criteria for neuroblastoma diagnosis, staging, and response to treatment / G.M. Brodeur, J. Pritchard, F. Berthold et al //J. Clin. Oncol. - 1993. - Vol. 11.-P. 1466-1477.

34. Brodeur, G.M. Molecular basis for heterogeneity in human neuroblastomas / G.M. Brodeur // Eur. J. Cancer. - 1995. - Vol. 31. - P. 505-510.

35. Brodeur, G.M. Neuroblastoma. / G.M. Brodeur, T. Sawada, Y. Tsuchida. - New York: Elsevier Science, 2000. - 21 p.

36. Burchill, S.A. Neuroblastoma cell detection by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) for tyrosine hydroxylase mRNA / S.A. Burchill, F.M. Bradbury, B.M. Smith et al // Int. J. Cancer. - 1994. - Vol. 57. - P. 671-675.

37. Burchill, S.A. Minimal residual disease at the time of peripheral blood stem cell harvest in patients with advanced neuroblastoma / S.A. Burchill, S.E. Kinsey, S. Picton et al //Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. - P. 213-219.

38. Burchill, S.A. Circulating neuroblastoma cells detected by reverse transcriptase polymerase chain reaction for tyrosine hydroxylase mRNA are an independent poor prognostic indicator in stage 4 neuroblastoma in children over 1 year / S.A. Burchill, I J. Lewis, K.R. Abrams et al // J. Clin. Oncol. - 2001. - Vol. 19.-P. 1795-1801.

39. Cai, J.Y. Prognostic influence of minimal residual disease detected by flow cytometry and peripheral blood stem cell transplantation by CD34+ selection in childhood advanced neuroblastoma / J.Y. Cai, Y.J. Tang, L.M. Jiang et al // Pediatr. Blood Cancer. - 2007. - Vol. 49. - P. 952-957.

40. Cai, J.Y. Minimal residual disease is a prognostic marker for neuroblastoma with bone marrow infiltration / J.Y. Cai, C. Pan, J.Y. Tang et al // Am. J. Clin. Oncol. - 2012. - Vol. 35. - P. 275-278.

41. Caron, H Allelic loss of the short arm of chromosome 4 in neuroblastoma suggests a novel tumour suppressor gene locus / H. Caron, P. van Sluis, R. Buschman et al // Hum. Genet. - 1996. - Vol. 97. - P. 834-837.

42. Caron, H. Allelic loss of chromosome lp as a predictor of unfavorable outcome in patients with neuroblastoma / H. Caron, P. van Sluis, J. de Kraker et al // N. Engl. J. Med. - 1996. - Vol. 334. - P. 225-230.

43. Celi, F.S. A rapid and versatile method to synthesize internal standards for competitive PCR / F.S. Celi, M.E. Zenilman, A.R. Shuldiner // Nucleic Acids Research. - 1993.-Vol. 21.- 1047 P.

44. Chagnovich, D. Binding of a 40-kDa protein to the N-myc 3'-untranslated region correlates with enhanced N-myc expression in human neuroblastoma / D. Chagnovich, S.L.Cohn // J. Biol. Chem. - 1996. - Vol. 271. -P. 33580-33586.

45. Chatten, J. Prognostic value of histopathology in advanced neuroblastoma: a report from the Childrens Cancer Study Group / J. Chatten, H. Shimada, H.N. Sather et al // Hum. Pathol. - 1988. - Vol. 19. - P. 1187-1198.

46. Chen, H. Semaphorin-neuropilin interactions underlying sympathetic axon responses to class 3 semaphorins / H. Chen, Z. He, A. Bagri, M. Tessier-Lavigne // Neuron. - 1998. - Vol. 21. - P. 1283-1290.

47. Cheung, I.Y. Detection of microscopic neuroblastoma in marrow by histology, immunocytology, and reverse transcription-PCR of multiple molecular markers / I.Y. Cheung, D. Barber, N.K. Cheung // Clin. Cancer Res. - 1998. - Vol. 4.-P. 2801-2805.

48. Cheung, I.Y. Quantification of marrow disease in neuroblastoma by realtime reverse transcription-PCR / I.Y. Cheung, N.K.V. Cheung // Clin. Cancer Res. -2001.-Vol. 7.-P. 1698-1705.

49. Cheung, I.Y. Early molecular response of marrow disease to biologic therapy is highly prognostic in neuroblastoma // I.Y. Cheung, M.S. Lo Piccolo, B.H. Kushner, N.K. Cheung // J. Clin. Oncol. - 2003. - Vol. 20. - P. 3853-3858.

50. Cheung, I.Y. Quantitation of GD2 synthase mRNA by real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction: clinical utility in evaluating adjuvant therapy in neuroblastoma / I.Y. Cheung, M.S. Lo Piccolo, B.H. Kushner et al // J. Clin. Oncol. - 2003. - Vol. 6. - P. 1087-1093.

51. Cheung, N.K. Detection of neuroblastoma cells in bone marrow using GD2 specific monoclonal antibodies / N.K. Cheung, D.D. Von Hoff, S.E. Strandjord, P.F. Coccia // J. Clin. Oncol. -1986. - Vol. 3. - P. 363-369.

52. Cheung N.K.V. Neuroblastoma. / N.K.V. Cheung, S.L. Cohn. - New York: Springer, 2005. - 189 p.

53. Christiansen, H. Tumour karyotype discriminates between good and bad prognostic outcome in neuroblastoma // H. Christiansen, F. Lampert // Br. J. Cancer. - 1988. - Vol. 57. - P. 121-126.

54. Cohn, S.L. The International Neuroblastoma Risk Group (INRG) classification system: an INRG Task Force report / S.L. Cohn, A.D. Pearson, W.B. London et al // J. Clin. Oncol. - 2009. - Vol. 2. - P. 289-297.

55. Combaret, V. Determination of 17q Gain in Patients With Neuroblastoma by Analysis of Circulating DNA / V. Combaret, S. Brejon, I. Iacono et al // Pediatr. Blood Cancer. - 2011. - Vol. 56. - P. 757-761.

56. Corrias, M.V. Peripheral blood stem cell tumor cell contamination and survival of neuroblastoma patients / M.V. Corrias, R. Haupt, B. Carlini et al // Clin. Cancer Res. - 2006. - Vol. 19. - P. 5680-5685.

57. Corrias, M.V. Detection of GD2-positive cells in bone marrow samples and survival of patients with localised neuroblastoma / M.V. Corrias, S. Parodi, R. Haupt R. et al et al // Br. J. Cancer. - 2008. - Vol. 2. - P. 263-269.

58. Corvi, R. Cytogenetic evolution of MYCN and MDM2 amplification in the neuroblastoma LS tumour and its cell line / R. Corvi, L. Savelyeva, L. Amler et al // Eur. J. Cancer. - 1995.-Vol. 31.-P. 520-523.

59. Corvi, R. Non-syntenic amplification of MDM2 and MYCN in human neuroblastoma / R. Corvi, L. Savelyeva, S. Breit et al // Oncogene. - 1995. - Vol. 10.-P. 1081-1086.

60. Corvi, R. Patterns of oncogene activation in human neuroblastoma cells / R. Corvi, L. Savelyeva, M. Schwab // J. Neurooncol. - 1997. - Vol. 31. - P. 2531.

61. Cotterill, S.J. Clinical prognostic factors in 1277 patients with neuroblastoma: results of the European Neuroblastoma Study Group 'Survey' 1982-1992 / S.J. Cotterill, A.D.J. Pearson, J. Pritchard et al // Eur. J. Cancer. -2000.-Vol. 36.-P. 901-908.

62. Crossey, P.A. Molecular genetic investigations of the mechanism of tumourigenesis in von Hippel-Lindau disease: analysis of allele loss in VHL tumours / P.A. Crossey, K. Foster, F.M. Richards et al // Hum. Genet. - 1994. -Vol. 93.-P. 53-58.

63. Crossey, P.A. Identification of intragenic mutations in the von Hippel-Lindau disease tumour suppressor gene and correlation with disease phenotype / P.A. Crossey, F.M. Richards, K. Foster et al // Hum. Molec. Genet. - 1994. - Vol. 3.-P. 1303-1308.

64. Cuesta, R. miR-181a regulates cap-dependent translation of p27(kipl) mRNA in myeloid cells / R. Cuesta, A. Martinez-Sanchez, F. Gebauer // Molec. Cell. Biol. - 2009. - Vol. 29. - P. 2841-2851.

65. Dalmau, J. The expression of the Hu (paraneoplastic encephalomyelitis / sensory neuronopathy) antigen in human normal and tumor tissues / J. Dalmau, H.M. Furneaux, C. Cordon-Cardo et al // Am. J. Pathol. - 1992. - Vol. 141. - P. 881-886.

66. D'Angio, G.J. Special pattern of widespread neuroblastoma with a favourable prognosis / G.J. D'Angio, A.E. Evans, C.E. Koop // Lancet. - 1971. -Vol. 22.-P. 1046-1049.

67. DeLong, E.R. Comparing the areas under two or more correlated receiver operating characteristic curves: a nonparametric approach / E.R. DeLong, D.M. DeLong, D.L. Clarke-Pearson // Biometrics. - 1988. - Vol. 44. - P. 837-845.

68. Do, J.H. Genome-wide examination of chromosomal aberrations in neuroblastoma SH-SY5Y cells by array-based comparative genomic hybridization / J.H. Do, I.S. Kim, T.K. Park, D.K. Choi // Mol. Cells. - 2007. - Vol. 24. - P. 105-112.

69. Dykhuizen, E.C. BAF complexes facilitate decatenation of DNA by topoisomerase II-alpha / E.C. Dykhuizen, D.C. Hargreaves, E.L. Miller et al // Nature. - 2013. - Vol. 497. - P. 624-627.

70. Elkahloun, A.G. Molecular cytogenetic characterization and physical mapping of 12ql3- ql5 amplification in human cancers / A.G. Elkahloun, M. Bittner, K. Hoskins et al // Genes Chromosomes Cancer. - 1996. - Vol. 17. - P. 205-214.

71. Esser, R. Detection of neuroblastoma cells during clinical follow up: advanced flow cytometry and rt-PCR for tyrosine hydroxylase using both conventional and real-time PCR / R. Esser, W. Glienke, K. Bochennek et al // Klin. Padiatr.-2011.-Vol. 6.-P. 326-331.

72. Evans, A.E. Spontaneous regression of neuroblastoma / A.E. Evans, J. Gerson, L. Schnaufer // Natl. Cancer Inst. Monogr. - 1976. - Vol. 44. - P. 49-54.

73. Fenton, S.L. Identification of the ElA-regulated transcription factor pl20(E4F) as an interacting partner of the RASSF1A candidate tumor suppressor gene / S.L. Fenton, A. Dallol, A. Agathanggelou et al // Cancer Res. - 2004. - Vol. 64.-P. 102-107.

74. Flahaut, M. Molecular cytogenetic characterization of doxorubicin-resistant neuroblastoma cell lines: evidence that acquired multidrug resistance

results from a unique large amplification of the 7q21 region / M. Flahaut, A. Miihlethaler-Mottet, D. Martinet et al // Genes Chromosomes Cancer. - 2006. -Vol. 5.-P. 495-508.

75. Fong, C.T. Loss of heterozygosity for the short arm of chromosome 1 in human neuroblastomas: correlation with N-myc amplification / C.T. Fong, N.C. Dracopoli, P.S. White et al // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1989. - Vol. 86. - P. 3753-3757.

76. Fukuda, M. Disease outcome may be predicted by molecular detection of minimal residual disease in bone marrow in advanced neuroblastoma: a pilot study / M. Fukuda, Y. Miyajima, Y. Miyashita, K. Horibe // J. Pediatr. Hematol. Oncol. -2001.-Vol. 1.-P. 10-13.

77. Gabert, J. Standardization and quality control studies of 'real-time' quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction of fusion gene transcripts for residual disease detection in leukemia - A Europe Against Cancer Program / J. Gabert, E. Beillard, V. van der Velden et al // Leukemia. - 2003. -Vol. 17.-P. 2318-2357.

78. Gattolliat, C.H. Expression of miR-487b and miR-410 encoded by 14q32.31 locus is a prognostic marker in neuroblastoma / C.H. Gattolliat, L. Thomas, S.A. Ciafre et al//Br. J. Cancer. - 2011. - Vol. 9.-P. 1352-1361.

79. George, R.E. Investigation of co-amplification of the candidate genes ornithine decarboxylase, ribonucleotide reductase, syndecan-1 and a DEAD box gene, DDX1, with N-myc in neuroblastoma. United Kingdom Children's Cancer Study Group // R.E. George, R.M. Kenyon, A.G. McGuckin et al // Oncogene. -1996.-Vol. 12.-P. 1583-1587.

80. George, R.E. Analysis of candidate gene co-amplification with MYCN in neuroblastoma / R.E. George, R. Kenyon, A.G. McGuckin et al // Eur. J. Cancer. - 1997. - Vol. 33. - P. 2037-2042.

81. Gilbert, F. Human neuroblastomas and abnormalities of chromosomes 1 and 17 / F. Gilbert, M. Feder, G. Balaban et al // Cancer Res. - 1984. - Vol. 44. -P. 5444.5449.

82. Giordani, L. Two regions of deletion in 9p22- p24 in neuroblastoma are frequently observed in favorable tumors / L. Giordani, A. Iolascon, V. Servedio et al // Cancer Genet. Cytogenet. - 2002. - Vol. 1. - P. 42-47.

83. Gisselsson, D. Differentially amplified chromosome 12 sequences in low- and high-grade osteosarcoma / D. Gisselsson, E. Palsson, M. Hoglund // Genes Chromosomes Cancer. - 2002. - Vol. 33. - P. 133-140.

84. Gotoh, T. Prediction of MYCN amplification in neuroblastoma using serum DNA and real-time quantitative polymerase chain reaction / T. Gotoh, H.

Hosoi, T. Iehara et al // J. Clin. Oncol. - 2005. - Vol. 23. - P. 5205-5210.

\

85. Grady, E.F. Expression of N-myc and c-src during the development of fetal human brain / E.F. Grady, M. Schwab, W. Rosenau // Cancer Res. - 1987. -Vol. 47.-P. 2931-2936.

86. Grossman, D. Inhibition of melanoma tumor growth in vivo by survivin targeting / D. Grossman, P.J. Kim, J.S. Schechner, D.C. Altieri // Proc. Nat. Acad. Sci. - 2001. - Vol. 98. - P. 635-640.

87. Grovas, A. The National Cancer Data Base report on patterns of childhood cancers in the United States / A. Grovas, A. Fremgen, A. Rauck et al // Cancer. - 1997. - Vol. 12. - P. 2321-2332.

88. Guo, C. Allelic deletion at llq23 is common in MYCN single copy neuroblastomas / C. Guo, P.S. White, M.J. Weiss et al // Oncogene. - 1999. - Vol. 35.-P. 4948-4957.

89. Handgretinger, R. Tumour cell contamination of autologous stem cells grafts in high-risk neuroblastoma: the good news? / R. Handgretinger, W. Leung, K. Ihm et al // Br. J. Cancer. - 2003. - Vol. 12.-P. 1874-1877.

90. Hartmann, O. Prognostic factors in metastatic neuroblastoma in patients over 1 year of age treated with high-dose chemotherapy a stem cell transplantation:

a multivariate analysis in 218 patients treated in a single institution / O. Hartmann, D. Valteau-Couanet, G. Vassal et al // Bone Marrow Transplant. - 1999. - Vol. 23. -P. 789-795.

91. Hayat, M.A. Neuroblastoma (Pediatric Cancer: Diagnosis, Therapy, and Prognosis, Vol. 1). / M.A. Hayat. - New York: Springer, 2011. - 47 p.

92. He, Y.W. The extracellular matrix protein mindin is a pattern-recognition molecule for microbial pathogens / Y.W. He, H. Li, J. Zhang et al // Nature Immun. - 2004. - Vol. 5. - P. 88-97.

93. Hesson, L.B. The role of RASSF1A methylation in cancer / L.B. Hesson, W.N. Cooper, F. Latif// Dis. Markers. - 2007. - Vol. 23. - P. 73-87.

94. Hirsch, M.R. Control of noradrenergic differentiation and Phox2a expression by MASH1 in the central and peripheral nervous system / M.R. Hirsch, M.C. Tiveron, F. Guillemot et al // Development. - 1998. - Vol. 125. - P. 599-608.

95. Hoebeeck, J. Aberrant methylation of candidate tumor suppressor genes in neuroblastoma / J. Hoebeeck, E. Michels, F. Pattyn et al // Cancer Lett. - 2009. -Vol. 2.-P. 336-346.

96. Holland, P.M. Detection of specific polymerase chain reaction product by utilizing the 5-3' exonuclease activity of Thermus aquaticus DNA polymerase / P.M. Holland, R.D. Abramson, R. Watson, D.H. Gelfand // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. - 1991.-Vol. 88.-P. 7276-7280.

97. Holmqvist, M.H. Elimination of fast inactivation in Kv4 A-type potassium channels by an auxiliary subunit domain / M.H. Holmqvist, J. Cao, R. Hernandez-Pineda et al // Proc. Nat. Acad. Sei. - 2002. - Vol. 99. - P. 1035-1040.

98. Ichimiya, S. Downregulation of hASHl is associated with the retinoic acid-induced differentiation of human neuroblastoma cell lines / S. Ichimiya, Y. Nimura, N. Seki et al // Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. - P. 132-134.

99. Jarvik, J.G. The research framework / J.G. Jarvik // Am J Roentgenol. -2001.-Vol. 176.-P. 873-877.

100. Kaghad, M. Monoallelically expressed gene related to p53 at lp36, a region frequently deleted in neuroblastoma and other human cancers / M. Kaghad, H. Bonnet, A. Yang et al // Cell. - 1997. - Vol. 90. - P. 809-819.

101. Koh, J. Tumour-derived pi6 alleles encoding proteins defective in cell-cycle inhibition / J. Koh, G.H. Enders, B.D. Dynlacht, E. Harlow // Nature. - 1995.' -Vol. 375.-P. 506-510.

102. Komada, Y. Flow cytometric analysis of peripheral blood and bone marrow for tumor cells in patients with neuroblastoma / Y. Komada, X.L. Zhang, Y.W. Zhou et al // Cancer. - 1998. - Vol. 82. - P. 591-599.

103. Kratzke, R.A. Immunohistochemical analysis of the pl6(INK4) cyclin-dependent kinase inhibitor in malignant mesothelioma / R.A. Kratzke, G.A. Otterson, C.E. Lincoln et al // J. Nat. Cancer Inst. - 1995. - Vol. 87. - P. 18701875.

104. Krona, C. Analysis of neuroblastoma tumour progression; loss of PHOX2B on 4pl3 and 17q gain are early events in neuroblastoma tumourigenesis / C. Krona, H. Caren, R.M. Sjoberg // International Journal of Oncology. - 2008. -Vol. 32.-P. 575-583.

105. Krupp, G. Stringent RNA quality control using the Agilent 2100 bioanalyzer. / G. Krupp. -Agilent Technologies, 2005.- P. 4-5.

106. Ladenstein, R. Prognostic significance of DNA di-tetraploidy in neuroblastoma / R. Ladenstein, I.M. Ambros, U. Pötschger et al // Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. - P. 83-92.

107. Ladenstein, R. Randomized Trial of prophylactic granulocyte colony-stimulating factor during rapid COJEC induction in pediatric patients with high-risk neuroblastoma: the European HR-NBL1/SIOPEN study // R. Ladenstein, D. Valteau-Couanet, P. Brock et al // J. Clin. Oncol. - 2010. - Vol. 28. - P. 35163524.

108. Lasorella, A. Id2 is a retinoblastoma protein target and mediates signalling by Myc oncoproteins / A. Lasorella, M. Noseda, M. Beyna, A. Iavarone // Nature. - 2000. - Vol. 407. - P. 592-598.

109. Lastowska, M. Gain of chromosome arm 17q predicts unfavourable outcome in neuroblastoma patients. U.K. Children's Cancer Study Group and the U.K. Cancer Cytogenetics Group / M. Lastowska, S. Cotterill, A.D. Pearson et al // Eur. J. Cancer. - 1997. - Vol. 33. - P. 1627-1633.

110. Layfield, L.J. Assessment of NMYC amplification: a comparison of FISH, quantitative PCR monoplexing and traditional blotting methods used with formalin-fixed, paraffin-embedded neuroblastomas / L.J. Layfield, C. Willmore-Payne, H. Shimada, J.A. Holden // Anal. Quant. Cytol. Histol. - 2005. - Vol. 1. -P. 5-14.

111. Lazcoz, P. Frequent promoter hypermethylation of RASSF1A and CASP8 in neuroblastoma / P. Lazcoz, J. Muñoz, M. Nistal et al // BMC Cancer. -2006.-Vol. 6.-P. 254.

112. Levine, T.D. Hel-Nl: an autoimmune RNA-binding protein with specificity for 3' uridylate-rich untranslated regions of growth factor mRNAs / T.D. Levine, F. Gao, P.H. King et al // Mol. Cell. Biol. - 1993. - Vol. 13. - P. 3494-3504.

113. Li, F. Control of apoptosis and mitotic spindle checkpoint by surviving / F. Li, G. Ambrosini, E. Chu et al // Nature. - 1998. - Vol. 396. - P. 580-584.

114. Lightfoot, S. Quantitation comparison of total RNA using the Agilent 2100 bioanalyzer, Ribogreen analysis and UV spectrometry. / S. Lightfoot. -Agilent Technologies, 2002. - P. 2-3.

115. Longo, L. Genetic predisposition to familial neuroblastoma: identification of two novel genomic regions at 2p and 12p / L. Longo. E. Panza, F. Schena et al // Hum. Hered. - 2007. - Vol. 63. - P. 205-211.

116. Look, A.T. Clinical relevance of tumor cell ploidy and N-myc gene amplification in childhood neuroblastoma: a Pediatric Oncology Group study /

A.T. Look, F.A. Hayes, J.J. Shuster et al // J. Clin. Oncol. - 1991. - Vol. 9. - P. 581-591.

117. Lukas, J. Retinoblastoma-protein-dependent cell-cycle inhibition by the tumour suppressor pi6 / J. Lukas, D. Parry, L. Aagaard et al // Nature. - 1995. -Vol. 375.-P. 503-506.

118. Manda, R. Identification of genes (SPON2 and C20orf2) differentially expressed between cancerous and noncancerous lung cells by mRNA differential display / R. Manda, T. Kohno, Y. Matsuno et al // Genomics. - 1999. - Vol. 61. -P. 5-14.

119. Manohar, C.F. Co-amplification and concomitant high levels of expression of a DEAD box gene with MYCN in human neuroblastoma / C.F. Manohar, H.R. Salwen, G.M. Brodeur, S.L. Cohn // Genes Chromosomes Cancer. - 1995. - Vol. 14. - P. 196-203.

120. Marabelle, A. CD34+ Immunoselection of Autologus Grafts for the Treatment of High-Risk Neuroblastoma / A. Marabelle, E. Merlin, P. Halle et al // Pediatr. Blood Cancer. - 2011. - Vol. 56. - P. 134-124.

121. Maris, J.M. Significance of chromosome lp loss of heterozygosity in neuroblastoma / J.M. Maris, P.S. White, C.P. Beltinger et al // Cancer Res. - 1995. -Vol. 55.-P. 4664-4669.

122. Marshall, B. Loss of heterozygosity at chromosome 9p21 in primary neuroblastomas: evidence for two deleted regions / B. Marshall, G. Isidro, A.G. Martins, M.G. Boavida // Cancer Genet. Cytogenet. - 1997. - Vol. 2. - P. 134-139.

123. Matthay, K.K. Treatment of high-risk neuroblastoma with intensive chemotherapy, radiotherapy, autologous bone marrow transplantation, and 13-cis-retinoic acid. Children's Cancer Group / K.K. Matthay, J.G. Villablanca, R.C. Seeger et al // N. Engl. J. Med. - 1999. - Vol. 34. - P. 1165-1173.

124. McArdle, L. Oligonucleotide microarray analysis of gene expression in neuroblastoma displaying loss of chromosome llq / L. McArdle, M. McDermott, R. Purcell et al // Carcinogenesis. - 2004. - Vol. 25. - P. 1599-1609.

125. Monclair, T. The International Neuroblastoma Risk Group (INRG) Staging System: An INRG Task Force Report / T. Monclair, G.M. Brodeur, P.F. Ambros et al // J. Clin. Oncol. - 2009. - Vol. 27. - P. 298-303.

126. Mondal, N. DNA topoisomerase II-alpha is required for RNA polymerase II transcription on chromatin templates / N/. Mondal, J.D. Parvin // Nature.-2001.-Vol. 413.-P. 435-438.

127. Mora, J. Comprehensive analysis of the 9p21 region in neuroblastoma suggests a role for genes mapping to 9p21-23 in the biology of favourable stage 4 tumours / J. Mora, M. Alaminos, C. de Torres et al // Br. J. Cancer. - 2004. - Vol. 91.-P. 1112-1118.

128. Morgenstern, D.A. Metastatic neuroblastoma confined to distant lymph nodes (stage 4N) to predict outcome in patients with stage 4 disease: A study from the International Neuroblastoma (NB) Risk Group (INRG) Database / D.A. Morgenstern, W.B. London, D. Stephens // J. Clin. Oncol. - 2013. - Vol. 31 suppl. -Abstract 10015.

129. Morohashi, Y. Molecular cloning and characterization of CALP/KChIP4, a novel EF-hand protein interacting with presenilin 2 and voltage-gated potassium channel subunit Kv4 / Y. Morohashi, N. Hatano, S. Ohya et al // J. Biol. Chem. - 2002. - Vol. 277. - P. 14965-14975.

130. Moss, T.J. Clonogenicity of circulating neuroblastoma cells: implications regarding peripheral blood stem cell transplantation / T.J. Moss, M. Cairo, V.M. Santana et al // Blood. - 1994. - Vol. 83. - P. 3085-3089.

131. Mueller, O. RNA Integrity Number (RIN) - Standardization of RNA Quality Control / O. Mueller. - Agilent Technologies, 2004. - P. 1-8.

132. Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification (MLPA). General Protocol. Instructions for use // MRC -Holland. - 2012. - P. 1-14.

133. Nakagawara, A. Comprehensive genomics linking between neural development and cancer: neuroblastoma as a model / A. Nakagawara, M. Ohira // Cancer Lett. - 2004. - Vol. 204. - P. 213-224.

134. Obuchowski, N.A. ROC analysis / N.A. Obuchowski // Am. J. Roentgenol. - 2005. - Vol. 184. - P. 364-372.

135. Ohtsu, K. Clinical investigation of neuroblastoma with partial deletion in the short arm of chromosome 1 / K. Ohtsu, E. Hiyama, T. Ichikawa et al // Clin. Cancer Res. - 1997. - Vol. 7. - P. 1221-1228.

136. Ootsuka, S. Useful markers for detecting minimal residual disease in cases of neuroblastoma / S. Ootsuka, S. Asami, T. Sasaki et al // Biol. Pharm. Bull. -2008.-Vol. 31.-P. 1071-1074.

137. Parareda, A. Prognostic impact of the detection of microcirculating tumor cells by a real-time RT-PCR assay of tyrosine hydroxylase in patients with advanced neuroblastoma / A. Parareda, S. Gallego, J. Roma et al // Oncol. Rep. -2005. - Vol. 4. - P. 1021-1027.

138. Pattyn, A. Expression and interactions of the two closely related homeobox genes Phox2a and Phox2b during neurogenesis / A. Pattyn, X. Morin, H. Cremer et al // Development. - 1997. - Vol. 124. - P. 4065-4075.

139. Perez, C.A. Biologic variables in the outcome of stages I and II neuroblastoma treated with surgery as primary therapy: a children's cancer group study / C.A. Perez, K.K. Matthay, J.B. Atkinson et al // J. Clin. Oncol. - 2000. -Vol. 18.-P. 18-26.

140. Perri, P. Weak linkage at 4pl6 to predisposition for human neuroblastoma / P.Perri, L. Longo, R. Cusano et al // Oncogene. - 2002. - Vol. 54. -P. 8356-8360.

141. Pession, A. The prognostic effect of amplification of the MYCN oncogene in neuroblastoma. The preliminary results of the Italian Cooperative Group for Neuroblastoma (GCINB) / A. Pession, B. De Bernardi, P. Perri et al // Pediatr. Med. Chir. - 1994. - Vol. 16. - P. 211-218.

142. Pezzolo, A. Presence of lq gain and absence of 7p gain are new predictors of local or metastatic relapse in localized resectable neuroblastoma / A. Pezzolo, E. Rossi, S. Gimelli et al // Neuro Oncol. - 2009. - Vol. 2. - P. 192-200.

143. Pfaffl, W. RNA integrity and the effect on the real-time qRT-PCR performance / W. Pfaffl // Elsevier. - 2005. - P. 127-139.

144. Polyak, K. Cloning of p27(Kipl), a cyclin-dependent kinase inhibitor and a potential mediator of extracellular antimitogenic signals / K. Polyak, M.H. Lee, H. Erdjument-Bromage et al // Cell. - 1994. - Vol. 78. - P. 59-66.

145. Raschella, G. Expression of B-myb in neuroblastoma tumors is a poor prognostic factor independent from MYCN amplification / G. Raschella, V. Cesi, R. Amendola et al // Cancer Res. - 1999. - Vol. 59. - P. 3365-3368.

146. Reifenberger, G. Amplification at 12ql3—14 in human malignant gliomas is frequently accompanied by loss of heterozygosity at loci proximal and distal to the amplification site / G. Reifenberger. J. Reifenberger, K. Ichimura, V.P. Collins//Cancer Res. - 1995,-Vol. 55.-P. 731-734.

147. Riehm, H. Corticosteroid-dependent reduction of leukocyte count in blood as a prognostic factor in acute lymphoblastic leukemia in childhood (therapy study ALL-BFM 83) / H. Riehm, A. Reiter, M. Schrappe et al // Klin. Padiatr. -1987. Vol. 199.-P. 151-160.

148. Santo E.E. Oncogenic activation of FOXR1 by llq23 intrachromosomal deletion-fusions in neuroblastoma / E.E. Santo, M.E. Ebus, J. Koster et al // Oncogene. - 2012. - Vol. 31. - P. 1571-1581.

149. Schleiermacher, G. Segmental chromosomal alterations have prognostic impact in neuroblastoma: a report from the INRG project / G. Schleiermacher, V. Mosseri, W.B. London et al // Br. J. Cancer. - 2012. - Vol. 107.-P. 1418-1422.

150. Schmidt, M. Is there a benefit of 131 I-MIBG therapy in the treatment of children with stage 4 neuroblastoma? A retrospective evaluation of The German Neuroblastoma Trial NB97 and implications for The German Neuroblastoma Trial NB2004 / M. Schmidt, T. Simon, B. Hero et al // Nuklearmedizin. - 2006. - Vol. 45.-P. 145-151.

151. Schroeder, A. The RJN: an RNA integrity number for assigning integrity values to RNA measurements / A. Schroeder, O. Mueller, S. Stocker et al // BMC Molecular Biology. - 2006. - Vol. 7. - P. 1-14.

152. Schumacher-Kuckelkorn, R. Lacking immunocytological GD2 expression in neuroblastoma: report of 3 cases / R. Schumacher-Kuckelkorn, B. Hero, K. Ernestus, F. Berthold // Pediatr. Blood Cancer. - 2005. - Vol. 45. - P. 195-201.

153. Schwab, M. Amplified MYCN in human neuroblastoma: paradigm for the translation of molecular genetics to clinical oncology/ M. Schwab // Ann. N.Y. Acad. Sci. - 2002. - Vol. 963. - P. 63-73.

154. Seeger, R.C. Association of multiple copies of the N-myc oncogene with rapid progression of neuroblastomas/ R.C. Seeger, G.M. Brodeur, H. Sather et al // N. Engl. J. Med. - 1985. - Vol. 313. - P. 1111-1116.

155. Sharma, V.K. .Semi-automated fluorogenic PCR assays (TaqMan) forrapid detection of Escherichia coli 0157:H7 and other shiga toxigenic E. coli / V.K. Sharma, E.A. Dean-Nystrom, T.A. Casey // Mol. Cell. Probes. - 1999. - Vol. 13.-P. 291-302.

156. Shimada, H. Terminology and morphologic criteria of neuroblastic tumors: recommendations by the International Neuroblastoma Pathology Committee / H. Shimada, I.M. Ambros, L.P. Dehner et al // Cancer. - 1999. - Vol. 86.-P. 349-363.

157. Shimada, H. The International Neuroblastoma Pathology Classification (the Shimada system) / H. Shimada, I.M. Ambros, L.P. Dehner et al // Cancer. -1999,-Vol. 86.-P. 364-372.

158. Shimada, H. International neuroblastoma pathology classification for prognostic evaluation of patients with peripheral neuroblastic tumors: a report from the Children's Cancer Group / H. Shimada, S. Umehara, Y. Monobe et al // Cancer. - 2001. - Vol. 92. - P. 2451 -2461.

159. Shirvan, A. Semaphorins as mediators of neuronal apoptosis / A. Shirvan, I. Ziv, G. Fleminger et al // J. Neurochem. - 1999. - Vol. 73. - P. 961971.

160. Shivakumar, L. The RASSF1A tumor suppressor blocks cell cycle progression and inhibits cyclin D1 accumulation / L. Shivakumar, J. Minna, T. Sakamaki et al // Molec. Cell. Biol. - 2002. - Vol. 22. - P. 4309-4318.

161. Shono, K. Clinical implications of minimal disease in the bone marrow and peripheral blood in neuroblastoma / K. Shono, T. Tajiri, Y. Fujii, S. Suita // J. Pediatr. Surg. - 2000. - Vol. 35.-P. 1415-1420.

162. Simon, T. New definition of low-risk neuroblastoma using stage, age, and lp and MYCN status / T. Simon, R. Spitz, A. Faldum et al // J. Pediatr. Hematol. Oncol. - 2004. - Vol. 26. - P. 791-796.

163. Soderholm, H. Human achaete-scute homologue 1 (FtASH-1) is downregulated in differentiating neuroblastoma cells / H. Soderholm, E. Ortoft, I. Johansson et al // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 1999. - Vol. 256. - P. 557563.

164.. Song, M.S. The tumour suppressor RASSF1A regulates mitosis by inhibiting the APC-Cdc20 complex / M.S. Song, S.J. Song, N.G. Ayad et al // Nature Cell. Biol. - 2004. - Vol. 6. - P. 129-137.

165. Speliotes, E.K. The survivin-like C. elegans BIR-1 protein acts with the Aurora-like kinase AIR-2 to affect chromosomes and the spindle midzone / E.K. Speliotes, A. Uren, D. Vaux, H.R. Horvitz // Molec. Cell. - 2000. - Vol. 6. - P. 211-223.

166. Spitz, R. Deletions in chromosome arms 3p and 1 lq are new prognostic markers in localized and 4s neuroblastoma / R. Spitz, B. Hero, K. Ernestus, F. Berthold // Clin. Cancer Res. - 2003. - Vol. 9. - P. 52-58.

167. Squire, J.A. Co-amplification of MYCN and a DEAD box gene (DDX1) in primary neuroblastoma / J.A. Squire, P.S. Thorner, S. Weitzman et al // Oncogene.- 1995.-Vol. 10.-P. 1417-1422.

168. Stallings, R.L. Are gains of chromosomal regions 7q and 1 lp important abnormalities in neuroblastoma? / R.L. Stallings, J. Howard, A. Dunlop et al // Cancer Genet. Cytogenet. - 2003. - Vol. 140. - P. 133-137.

169. Stiller, C.A. International variations in the incidence of neuroblastoma / C.A. Stiller, D.M. Parkin // Int. J. Cancer. - 1992. - Vol. 52. - P. 538-543.

170. Stutterheim, J. PHOX2B is a novel and specific marker for minimal residual disease testing in neuroblastoma / J. Stutterheim, A. Gerritsen, L. Zappeij-Kannegieter et al // J. Clin. Oncol. - 2008. - Vol. 26. - P. 5443-5449.

171. Stutterheim, J. Detecting minimal residual disease in neuroblastoma: the superiority of a panel of real-time quantitative PCR markers / J. Stutterheim, A. Gerritsen, L. Zappeij-Kannegieter et al // Clin. Chem. - 2009. - Vol. 55. - P. 13161326.

172. Stutterheim, J. The prognostic value of fast molecular response of marrow disease in patients aged over 1 year with stage 4 neuroblastoma / J. Stutterheim, L. Zappeij-Kannegieter, R. Versteeg et al // Eur. J. Cancer. - 2011. -Vol. 47.-P. 1193-1202.

173. Stutterheim, J. Methylated RASSFla is the first specific DNA marker for minimal residual disease testing in neuroblastoma / J. Stutterheim, F.A. Ichou, E. denOuden, et al// Clin. Cancer Res. - 2012. - Vol. 18.-P. 808-814.

174. Su, W.T. Positional gene expression analysis identifies 12q overexpression and amplification in a subset of neuroblastomas / W.T. Su, M. Alaminos, J. Mora et al // Cancer Genet. Cytogenet. - 2004. - Vol. 154. - P. 131137.

175. Swerts, K. Standardization of the immunocytochemical detection of neuroblastoma cells in bone marrow / K. Swerts, P.F. Ambros, C. Brouzes et al // J. Histochem. Cytochem. - 2005. - Vol. 53. - P. 1433-1440.

176. Swerts, K. Potential application of ELAVL4 real-time quantitative reverse transcription-PCR for detection of disseminated neuroblastoma cells / K.

Swerts, B. De Moerloose, C. Dhooge et al // Clin. Chem. - 2006. - Vol. 52. - P. 438-445.

177. Szabo, A. HuD, a paraneoplastic encephalomyelitis antigen, contains RNA-binding domains and is homologous to Elav and Sex-lethal / A. Szabo, J. Dalmau, G. Manley et al // Cell. - 1991. - Vol. 67. - P. 325-333.

178. Takeda, K. WFS1 (Wolfram syndrome 1) gene product: predominant subcellular localization to endoplasmic reticulum in cultured cells and neuronal expression in rat brain / K. Takeda, K. Inoue, Y. Tanizawa et al // Hum. Molec. Genet. - 2001. - Vol. 10. - P. 477-484.

179. Takita, J. Deletion map of chromosome 9 and pi6 (CDKN2A) gene alterations in neuroblastoma / J. Takita, Y. Hayashi, T. Kohno et al // Cancer Res. - 1997. - Vol. 57. - P. 907-912.

180. Takita, J. The pi6 (CDKN2A) gene is involved in the growth of neuroblastoma cells and its expression is associated with prognosis of neuroblastoma patients / J. Takita, Y. Hayashi, T. Nakajima et al // Oncogene. -1998.-Vol. 17.-P. 3137-3143.

181. Tan, K.O. MAP-1, a novel proapoptotic protein containing a BH3-like motif that associates with Bax through its Bcl-2 homology domains / K.O. Tan, K.M.L. Tan, S.L. Chan et al // J. Biol. Chem. - 2001. - Vol. 276. - P. 2802-2807.

182. Tchirkov, A. Molecular monitoring of tumor cell contamination in leukapheresis products from stage IV neuroblastoma patients before and after positive CD34 selection / A. Tchirkov, J. Kanold, M. Giollant et al // Med. Pediatr. Oncol. - 1998. - Vol. 30. - P. 228-232.

183. Tchirkov, A. Significance of molecular quantification of minimal residual disease in metastatic neuroblastoma / A. Tchirkov, C. Paillard, P. Halle et al // J. Hematother. Stem Cell Res. - 2003. - Vol. 12. - P. 435-442.

184. Theissen, J. Heterogeneity of the MYCN oncogene in neuroblastoma / J. Theissen, M. Boensch, R. Spitz et al // Clin. Cancer Res. - 2009. - Vol. 15. - P. 2085-2090.

185. Thompson, P.M. Loss of heterozygosity for chromosome 14q in neuroblastoma / P.M. Thompson, B.A. Seifried, S.K. Kyemba et al // Med. Pediatr. Oncol. - 2001. - Vol. 36. - P. 28-31.

186. Thompson, P.M. CHD5, a new member of the chromodomain gene family, is preferentially expressed in the nervous system / P.M. Thompson, T. Gotoh, M. Kok et al // Oncogene. - 2003. - Vol. 22. - P. 1002-1011.

187. Thompson, R.J. PGP 9.5 - a new marker for vertebrate neurons and neuroendocrine cells / R.J. Thompson, J.F. Doran, P. Jackson et al // Brain Res. -1983. - Vol. 278. - P. 224-228.

188. Tonini, G.P. MYCN oncogene amplification in neuroblastoma is associated with worse prognosis, except in stage 4s: the Italian experience with 295 children / G.P. Tonini, L. Boni, A. Pession et al // J. Clin. Oncol. - 1997. -Vol. 15.-P. 85-93.

189. Trager, C. Quantitative analysis of tyrosine hydroxylase mRNA for sensitive detection of neuroblastoma cells in blood and bone marrow / C. Trager, P. Kogner, M. Lindskog et al // Clin. Chem. - 2003. - Vol. 49. - P. 104-112.

190. Trager, C. mRNAs of tyrosine hydroxylase and dopa decarboxylase but not of GD2 synthase are specific for neuroblastoma minimal disease and predicts outcome for children with high-risk disease when measured at diagnosis / C. Trager, A. Vernby, A. Kullman et al // Int. J. Cancer. - 2008. - Vol. 123. - P. 2849-2855.

191. Trochet, D. Germline mutations of the paired-like homeobox 2B (PHOX2B) gene in neuroblastoma / D. Trochet, F. Bourdeaut, I. Janoueix-Lerosey et al // Am. J. Hum. Genet. - 2004. - Vol. 74. - P. 761-764.

192. Tse, C. Human semaphorin 3B (SEMA3B) located at chromosome 3p21.3 suppresses tumor formation in an adenocarcinoma cell line / C. Tse, R.H. Xiang, T. Bracht, S.L. Naylor // Cancer Res. - 2002. - Vol. 62. - P. 542-546.

193. Van Roy, N. Identification of two distinct chromosome 12-derived amplification units in neuroblastoma cell line NGP / N. Van Roy, A. Forus, O. Myklebost et al // Cancer Genet. Cytogenet. - 1995. - Vol. 82. - P. 151-154.

194. Vandesompele, J. Genetic heterogeneity of neuroblastoma studied by comparative genomic hybridization / J. Vandesompele, N. Van Roy, M. Van Gele et al // Genes Chromosomes Cancer. - 1998. - Vol. 23. - P. 141-152.

195. Vandesompele, J. Unequivocal delineation of clinicogenetic subgroups and development of a new model for improved outcome prediction in neuroblastoma / J. Vandesompele, M. Baudis, K. De Preter et al // J. Clin. Oncol. -2005. - Vol. 23. - P. 2280-2299.

196. Viprey, V.F. Standardisation of operating procedures for the detection of minimal disease by QRT-PCR in children with neuroblastoma: Quality assurance on behalf of SIOPEN-R-NET / V.F. Viprey, M.V. Corrias, B. Kagedal et al // Eur. J. Cancer. - 2007. - Vol. 43. - P. 341-350.

197. Wang, Y. Expression of protein gene product 9.5 and tyrosine hydroxylase in childhood small round cell tumors / Y. Wang, P. Einhorn, T.J. Triche et al//Clin. Cancer Res. - 2000. - Vol. 6.-P. 551-558.

198. Weber, A. Coamplification of DDX1 correlates with an improved survival probability in children with MYCN-amplified human neuroblastoma / A. Weber, P. Imisch, E. Bergmann, H. Christiansen // J. Clin. Oncol. - 2004. - Vol. 22.-P. 2681-2690.

199. Wei, J.S. The MYCN oncogene is a direct target of miR-34a / J.S. Wei, Y.K. Song, S. Durinck et al // Oncogene. - 2008. - Vol. 27. - P. 5204-5213.

200. Weinstein, S. Clinical evaluation of diagnostic tests / S. Weinstein, N.A. Obuchowski, M.L. Lieber // Am. J. Roentgenol. - 2005. - Vol. 184. - P. 1419.

201. Westermann, F. Genetic parameters of neuroblastomas / F. Westermann, M. Schwab//Cancer Lett. - 2002. - Vol. 184.-P. 127-147.

202. Wurl, P. Co-expression of survivin and TERi and risk of tumour-related death in patients with soft-tissue sarcoma / P. Wurl, M. Kappler, A. Meye et al // Lancet. - 2002. - Vol. 359. - P. 943-945.

203. Xiang, R.H. Isolation of the human semaphorin III/F gene (SEMA3F) at chromosome 3p21, a region deleted in lung cancer / R.H. Xiang, C.H. Hensel, D.K. Garcia et al // Genomics. - 1996. - Vol. 32. - P. 39-48.

204. Yanik, G.A. Semiquantitative mlBG scoring as a prognostic indicator in patients with stage 4 neuroblastoma: a report from the Children's oncology group / G.A. Yanik, M.T. Parisi, B.L. Shulkin et al // J. Nucl. Med. - 2013. - Vol. 54.-P. 541-548.

205. Zweig, M.H. Receiver-operating characteristic (ROC) plots: a fundamental evaluation tool in clinical medicine / M.H. Zweig, G. Campbell // Clin. Chem. - 1993. - Vol. 31. - P. 561-577.