Разработка противовирусной композиции малых интерферирующих РНК для ингибирования репродукции вируса гриппа A тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.02, кандидат наук Бродская, Александра Валерьевна

  • Бродская, Александра Валерьевна
  • кандидат науккандидат наук
  • 2018, Санкт-Петербург
  • Специальность ВАК РФ03.02.02
  • Количество страниц 115
Бродская, Александра Валерьевна. Разработка противовирусной композиции малых интерферирующих РНК для ингибирования репродукции вируса гриппа A: дис. кандидат наук: 03.02.02 - Вирусология. Санкт-Петербург. 2018. 115 с.

Оглавление диссертации кандидат наук Бродская, Александра Валерьевна

Оглавление

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Вирусы гриппа

1.1.1. Строение и жизненный цикл вируса гриппа А

1.1.2. Антигенная изменчивость вирусов гриппа

1.1.3. Распространение, профилактика и терапевтические подходы для лечения ВГА

1.2. РНК-интерференция

1.2.1. Возможность применения РНК-интерференции в качестве противовирусной терапии

1.2.1.1. Вирус-ингибирующая активность синтетических малых РНК

1.2.1.2. Применение миРНК для подавления вируса гриппа А

1.2.1.3. Подбор и дизайн противогриппозных терапевтических миРНК

1.3. Доставка миРНК в клетку

1.3.1. Доставка миРНК в клетку вирусными системами

1.3.2. Невирусная доставка миРНК в клетку

1.3.2.1. Липосомальная доставка миРНК

1.3.2.2. Полиплексная доставка миРНК

1.3.2.2.1.Полиэтиленимин

1.3.2.2.2.Хитозан

1.3.2.3. Доставка миРНК с помощью микро -/наноконтейнеров

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Дизайн миРНК, направленных на выключение экспрессии генов PA и NP вируса гриппа

3.2. Скрининг противовирусной активности анти-PA и анти-NP миРНК, доставляемых в клетки с помощью липофектамина, in vitro

3.3. Выбор носителей противовирусных миРНК на основе полиэтиленимина, производных хитозана и гибридных микрокапсул

3.4. Сравнение эффективности внутриклеточной доставки миРНК в комплексе с производными хитозана, ПЭИ и SiO2-МК

3.5. Сравнение противовирусной активности миРНК в комплексе с производными хитозана, ПЭИ и SiO2-MR

3.6. Оценка противовирусного действия композиции миРНК, инкапсулированных

в SiO2-MR

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Вирусология», 03.02.02 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разработка противовирусной композиции малых интерферирующих РНК для ингибирования репродукции вируса гриппа A»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность проблемы

Грипп — это острая респираторная инфекция, вызываемая одноименными вирусами семейства Ortomyxoviridae. Грипп представляет серьезную проблему для общественного здравоохранения, вызывая ежегодные сезонные эпидемии и периодические пандемии с высокой летальностью. Грипп приводит к развитию множества осложнений, основным из которых является вторичная бактериальная пневмония, способная вызывать смертельные исходы в группах риска. По данным ВОЗ ежегодно фиксируются десятки миллионов случаев заболевания гриппом, в том числе до полумиллиона смертельных исходов.

Вследствие сегментированности генома вирус гриппа имеет потенциал к реассортации генов, приводящей к кардинальному изменению биологических свойств вируса (вирулентность и инфекционность). Вирусы гриппа также обладают способностью к очень высокой мутационной изменчивости, и, как следствие, к быстрому приобретению устойчивости к лекарственным препаратам [1]. В настоящее время противовирусные средства для лечения гриппа представляют собой крайне ограниченную группу препаратов, при этом для части из них известна лекарственная резистентность [2-4]. За последние десятилетия в связи с угрозой возникновения новых штаммов вируса гриппа типа А (ВГА), нехарактерных для человеческой популяции, как в случае «птичьего» в 2006 и «свинного» гриппа в 2009 годах [5,6], возросла потребность в разработке принципиально новых этиотропных препаратов, способных обойти проблему резистентности вируса, или же противовирусных препаратов широкого спектра действия, обладающих повышенной эффективностью и доступностью в применении. Одним из перспективных направлений создания противовирусных препаратов является использование ингибиторов вирусной репродукции на основе малых интерферирующих РНК (миРНК) [7].

Впервые синтетические миРНК были применены в качестве терапевтических агентов против респираторно-синтициального вируса в 2001 году [8]. С тех пор были исследованы различные подходы по использованию

РНК-интерференции для терапии респираторных вирусных инфекций [9-11]. Основным препятствием практического применения миРНК по сей день является проблема эффективной и нетоксичной доставки этих молекул в клетки и длительной защиты их функционально активного состояния. В случае вируса гриппа человека наиболее целесообразной видится система доставки миРНК, подходящая для интраназального введения. Этот путь доставки минимизирует системную потерю миРНК, так как они доставляются непосредственно к месту репликации вируса гриппа - эпителиальным клеткам дыхательных путей. Для этой цели часто используются поликатионные полимеры, способные за счет положительного заряда связывать миРНК и обеспечивать защиту от нуклеаз и хорошую растворимость. В настоящее время существует ряд препаратов на основе молекул миРНК, находящихся на стадии доклинических исследований [12]. Тем не менее, несмотря на полученные положительные результаты, проблема оптимальной доставки миРНК для терапии гриппа все еще не решена, и разрешенный к применению фармацевтический препарат на основе миРНК в настоящее время отсутствует.

Таким образом, разработка новых современных подходов к терапии гриппа на основе использования механизма РНК-интерференции и сопутствующее ей решение задачи высокоэффективной и безопасной доставки препарата миРНК в инфицированные клетки являются чрезвычайно актуальными задачами современной молекулярной и клинической вирусологии.

Степень разработанности темы исследования

Разработка новых противовирусных препаратов, в частности, направленных на лечение и профилактику гриппа, является общемировой актуальной задачей. На сегодняшний день уровень развития биотехнологий позволяет синтезировать множество соединений, обладающих биологической/фармакологической активностью с высокой специфичностью к вирусным мишеням. Разработка таких препаратов проводится с применением методов высокоточного молекулярного докинга с дальнейшим скринингом - оптимизацией для селективного взаимодействия с определенной мишенью. Однако, практический выход такого

подхода, к сожалению, невелик. Более того, высокая адресность действия лекарственных средств может приводить к быстрому появлению резистентных вирусных штаммов.

В связи с этим требуются новые подходы к созданию противовирусных препаратов, позволяющие как проводить их быстрый дизайн, так и избавиться от моноспецифичности в отношении мишени. Перспективным направлением ингибирования вирусной репродукции на уровне экспрессии генов считается использование миРНК. После успешного применения терапевтических миРНК для подавления гриппозной инфекции в исследованиях на клеточных культурах и лабораторных мышах в 2009 году [13,14], многие научные коллективы тестировали различные миРНК, направленные на подавление экспрессии всех консервативных генов ВГА: NP, PA, PB1, PB2, M, NS [15-19]. Убедительно продемонстрировано, что одна миРНК может обеспечить защиту от ВГА разных подтипов [20]. Относительно недавно компанией siRNAomics был разработан новый препарат STP702 многоцелевого действия, объединяющий в себе коктейль миРНК, направленных на различные консервативные области генома ВГА. Было показано, что STP702 эффективен в отношении штаммов ВГА подтипов H5N1 и H1N1 [21]. Вместе с тем, вопрос о стабильном защитном действии миРНК остается не решенным. Открытым также является вопрос максимально эффективной и биологически безопасной доставки миРНК в инфицированные клетки. Существует ряд обзоров, посвящённых методам невирусной доставки миРНК [22,23], однако четкого понимания, какая система может быть признана оптимальной для использования на уровне организма, до сих пор нет.

Перспективные результаты по доставке миРНК были получены при их инкапсулировании в гибридные микро- и наноконтейнеры, представляющие собой полиэлектролитные капсулы с поверхностью, модифицированной неорганическими соединениями [24,25]. Технология капсулирования показала себя как эффективная мультифункциональная платформа для доставки различных биомолекул, позволяющая включать в себя несколько биомакромолекул с высоким их содержанием и контролируемым соотношением, а также большой

степенью защиты от биодеградации [26]. Благодаря возможности модификации микрокапсул за счет химического состава наружного слоя, скорость их деградации и распределение содержимого могут легко варьироваться. Это позволяет осуществлять направленный транспорт к клеткам-мишеням с оптимальной терапевтической концентрацией. Применение этой технологии для доставки терапевтических миРНК для подавления репродукции ВГА было впервые осуществлено в рамках выполнения данного исследования в 2017 г на базе ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России научным коллективом при участии автора [25].

Цель исследования

Разработать комбинацию малых интерферирующих РНК (миРНК) в комплексе с эффективной системой доставки для ингибирования экспрессии генов вируса гриппа типа А человека in vitro.

В соответствии с целью были поставлены следующие задачи:

Задачи исследования

1. Провести подбор миРНК, направленных на консервативные области геномных сегментов PA и NP ВГА человека.

2. Выбрать наиболее перспективные миРНК по результатам in vitro скрининга их противовирусной активности при внутриклеточной доставке с использованием липофектамина.

3. Выбрать наиболее эффективный носитель для миРНК по результатам сравнения эффективности внутриклеточной доставки и противовирусной активности миРНК в комплексе с полиэтиленимином, производными хитозана, липофектамином и гибридными микрокапсулами.

4. Оценить противовирусный потенциал композиции выбранных миРНК и носителя в отношении ВГА in vitro.

5. Провести исследование противовирусного действия разработанной композиции in vitro в отношении ВГА разных подтипов.

Научная новизна работы

В процессе выполнения исследования впервые подобраны миРНК, направленные на «выключение» экспрессии генов ВГА, кодирующих белки NP, PA, PA-N155, PA-N182 и PA-X, и обладающие противовирусной активностью in vitro.

Впервые проведено сравнительное исследование эффективности внутриклеточной доставки и противовирусного в отношении ВГА действия препаратов миРНК с различными невирусными носителями: полиплексами, липосомами и микрокапсулами.

Впервые продемонстрировано эффективное применение упакованных в гибридные микрокапсулы миРНК для эффективного подавления репродукции ВГА in vitro.

Разработана не имеющая прямых аналогов противовирусная композиция для подавления экспрессии генов PA, NP и NS ВГА, представляющая собой комбинацию из трех направленных на эти гены миРНК, инкапсулированных в гибридные полиэлектролитные микрокапсулы с поверхностью, модифицированной частицами SiO2.

Теоретическая и практическая значимость работы

Выполненная работа представляет собой фундаментальное научное исследование, посвященное проблеме внутриклеточной доставки противовирусных миРНК в клетки, обладающее, помимо теоретической значимости, прикладным потенциалом.

Продемонстрирована возможность успешного применения инкапсулированных терапевтических миРНК, направленных на подавление экспрессии нескольких генов ВГА, в опытах in vitro в отношении штаммов ВГА различных подтипов.

Полученные результаты исследования противовирусного потенциала миРНК будут в дальнейшем использоваться для разработки фармакологической формы препарата на основе миРНК, предназначенного для профилактики и/или лечения вирусной инфекции, вызванной ВГА человека.

Предложенные подходы по эффективной внутриклеточной доставке миРНК с помощью гибридных микрокапсул, поверхность которых может быть при необходимости модифицирована с целью достижения большей биосовместимости, биодеградируемости, эффективности и таргетности доставки, будут также использованы при разработке новых фармацевтических препаратов различного действия.

Методология и методы исследования.

В работе применялись стандартные вирусологические, биохимические, молекулярно-биологические и иммунологические методы. Кроме того, были применены оригинальные подходы при компьютерном анализе последовательностей и подборе миРНК. Более подробно способы проведения экспериментов отражены в разделе «Материалы и методы».

Основные положения, выносимые на защиту

1. Синтетические миРНК РА-1630, NP-717, NP-1004 и NP-1341, направленные на консервативные области мРНК РА и NP, обладают противовирусным действием в отношении ВГА in vitro.

2. Гибридные ЗЮ2-микрокапсулы обладают низкой цитотоксичностью и высокой инкапсулирующей способностью в отношении миРНК, обеспечивают длительную защиту миРНК от РНКаз, а также эффективную и быструю трансфекцию миРНК внутрь клетки и их полное высвобождение в цитозоль через 24 часа инкубации.

3. Препарат инкапсулированных в гибридные ЗЮ2-микрокапсулы миРНК, направленных на подавление экспрессии генов NP, PA и NS ВГА, обладает высокоспецифичным противовирусным действием в отношении ВГА подтипов H1N1, ШШрат09, H5N2, H7N9. Эффективность ингибирования вирусной репродукции в случае профилактического введения препарата из комбинации трех миРНК выше, чем эффективность каждого препарата по отдельности.

Личный вклад автора состоит в самостоятельном планировании и выполнении всех основных лабораторных исследований, анализе и статистической обработке полученных результатов. Автором лично проведен подбор миРНК, направленных на подавление экспрессии генов PA и NP ВГА, и первичный скрининг их противовирусного действия in vitro в комплексе с липофектамином. Также автором проведены все работы по подбору параметров и характеристике комплексов миРНК с поликатионными носителями, сравнительное исследование эффективности доставки, опыты in vitro по определению противовирусной активности препаратов миРНК.

Вклад соавторов. При выполнении данного исследования методическая помощь была оказана сотрудниками ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России: Даниленко Д.М., Штро А.А. - при культивировании используемых в работе штаммов вируса гриппа, Сахенберг Е.И. - при культивировании используемых в работе клеточных культур А549 и MDCK, Горшковым А.Н. - при проведении экспериментов с использованием электронной микроскопии, Шурыгиной А-П. С. - при проведении экспериментов по проточнй цитофлуориметрии. Химический синтезе микрокапсул, их характеристика и помощь в проведении конфокальной микроскопии для оценки внутриклеточной доставки миРНК, были осуществлены сотрудниками рабочей группы RASA-центра СПбПУ Петра Великого Тиминым А.С. и Муслимовым А.Р. под руководстврм проф. Сухорукова Г.Б.

Степень достоверности и апробация материалов диссертации

Достоверность результатов исследований, проведённых автором, подтверждена статистическим анализом данных, полученных в ходе независимых экспериментов. Материалы диссертационной работы доложены на 42-м Международном конгрессе FEBS (Иерусалим, Израиль 2017); на Международной научной конференции «Trends in Influenza Research 2017» (Санкт-Петербург, 2017); на XVIII Зимней молодежной школ11-конференции по биофизике и молекулярной биологии ПИЯФ (Ленинградская область, п. Рощино, 2017), на X Всероссийском Конгрессе с международным участием молодых ученых-биологов "Симбиоз 2017" (Казань, 2017), на Конференции с международным участием

XLVI «Неделя науки СПбПУ», (Санкт-Петербург, 2017), а также в виде доклада на научно-практическом курсе Европейской Организации Молекулярной Биологии EMBO «Small non-coding RNA in infection» (Вюрцбург, Германия, 2014).

Публикации

По теме диссертации опубликовано 17 печатных работ, в том числе 7 статей, из них 4 в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК, и 10 тезисов докладов.

Объем и структура диссертации

Диссертация изложена на 115 страницах машинописного текста, включая 7 таблиц и 35 рисунков. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания использованных материалов и методов, шести глав собственных исследований и обсуждения полученных результатов, выводов и списка цитируемой литературы. Список литературы содержит 130 источников на русском и английском языках. Диссертация изложена в соответствии с общими требованиями к оформлению кандидатских и докторских диссертаций, утверждёнными в ГОСТ Р 7.0.11-2011.

Работа поддержана грантом РНФ 15-15-13734 «Клеточные микроРНК -новые молекулярные мишени для терапии тяжелых вирусных инфекций», грантом для студентов, аспирантов, молодых учёных, молодых кандидатов наук ВУЗов и академических институтов, расположенных на территории Санкт-Петербурга в 2015 году. Также работа проводилась в рамках темы Государственного задания, выполняемого в ФГБУ «НИИ гриппа» Минздрава России.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Вирусы гриппа

Вирусы гриппа относятся к семейству Orthomyxoviridae и подразделяются на 4 типа: А, В, С и Б. Вирусы гриппа различных типов отличаются друг от друга по количеству сегментов генома, кругу возможных хозяев, а также антигенным различиям внутренних белков (ЫР и М), не дающими перекрестных межтиповых серологических реакций. Несмотря на то, что вирусы гриппа типов В и С достаточно широко циркулируют в человеческой популяции, только вирусы гриппа типа А (ВГА), которые обнаружены также у других видов позвоночных таких как птицы, свиньи, лошади, тюлени, киты, а также собаки и кошки, способны вызывать пандемии, представляющие серьезную опасность для человечества. Для ВГА характерно различие в антигенных свойствах двух поверхностных белков: гемагглютинина (НА) и нейраминидазы (ЫА). Вследствие наличия множества антигенных вариантов этих белков в 1980 г. для ВГА была введена новая классификация, основанная на обозначении антигенного подтипа НА и ЫА. В настоящее время известно 16 подтипов НА и 9 подтипов ЫА ВГА. Различие аминокислотных последовательностей участков НА, отвечающих за антигенность, составляет более 30% между различными подтипами ВГА [27].

У вирусов гриппа типов В и С антигенные варианты существуют, но они не столь занчительны, как для ВГА. По этой причине они не нуждаются в дополнительной классификации, за исключением того, что для вирусов гриппа типа В выделяют две линии: Викторианскую и Ямагатскую.

1.1.1. Строение и жизненный цикл вируса гриппа А

ВГА является оболочечным вирусом, зрелый вирион имеет сферическую или овальную форму и диаметр 80-120 нм. ВГА имеет сегментированный геном, состоящий из 8 сегментов РНК с отрицательной полярностью. В вирионе геномная РНК ассоциирована с вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой (RdRp) и многочисленными молекулами нуклеопротеина (ЫР) и формирует рибонуклеопротеиновые комплексы (РНП). Главными структурными белками

ВГА являются НА, КА, белки матрикса М1 и М2, КР и три субъединицы ЯёЯр — РВ1, РВ2 и РА. В составе вирионов ВГА, по-видимому, присутствует также небольшое количество белка ядерного экспорта N82 (КЕР), ассоциированного с М1 [28]. Кроме того, по данным протеомного исследования вирионы ВГА включают в себя в невысоких концентрациях группу белков клеток-хозяев, в том числе белки цитоскелета, аннексины, гликолитические ферменты, тетраспанины [29]. Функциональная значимость присутствия перечисленных клеточных белков в вирионах ВГА остаётся невыясненной. Недавно было показано, что неструктурный белок N81 также входит в состав вириона ВГА [30].

Схема организации вириона ВГА и локализация его главных структурных белков представлена на рисунке 1.1.

Рисунок 1.1 - Строение вируса гриппа типа А [31]. Свойства и функции белков ВГА кратко суммированы в таблице 1.1.

Таблица 1.1 - Сегменты генома ВГА и функциональная роль продуктов их экспрессии в жизненном цикле вируса [32,33]

Сегмент Название белка Функции белка

I РВ2 Основной полимеразный белок 2 (несплайсированная мРНК) Субъединица вирусной полимеразы; инициирует транскрипцию вирусной мРНК, распознает 5'-кэп структуры хозяйской пре-мРНК. Было обнаружено, что РВ2 влияет на вирулентность и диапазон хозяев ВГА. Взаимодействует с РА.

РВ1 Основной полимеразный белок 1 (несплайсированная мРНК) Каталитическая субъединица вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразы, отвечающей удлинение цепи РНК; участвует в транскрипции. Взаимодействует с РВ2 и РА.

II РВ1-Б2 (несплайсированная мРНК, вторая рамка считывания) Усеченная форма РВ1, взаимодействует с РВ1 и влияет на активность полимеразного комплекса. Показано что является фактором вирулентности; индуцирует апоптоз зараженных клеток, ассоциированный с митохондриями

РВ1-Ы40 (несплайсированная мРНК, третья рамка считывания) Ы-терминально усеченная форма РВ1; поддерживаетбаланс между РВ1 и РВ1-Б2

III РА (несплайсированная мРНК, вторая рамка считывания) Субъединица вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразы, обладающая эндонуклеазной а также протеазной активностью. Были высказаны предположения, что белок вовлечен в сборку функциональных комплексов вирусной РНК полимеразы из неактивных интермедиатов.

РА-Х (несплайсированная мРНК, рибосомальный сдвиг рамки) Неструктурный белок вируса; участвует в модуляции клеточного ответа на инфекционный процесс, предположительно является фактором вирулентности ВГА[32]

Сегмент Название белка Функции белка

РА-Ш55 Минорные неструктурные белки; предположительно

(несплайсированная ассоциированы с вирулентностью и отвечают за

мРНК, вторая рамка регуляцию взаимодействий между вирусом и клеткой

III считывания)

РА-Ш82 (несплайсированная мРНК, третья рамка считывания)

НА Поверхностный гликопротеин, гомотример. Отвечает за

(несплайсированная связывание с рецепторами (сиаловая кислота) на

IV мРНК) мембране клеток-мишеней, прикрепление и проникновение вируса в клетку на начальных стадиях инфекции.

КР Основной компонент вирусного капсида.

Нуклеокапсидный Взаимодействует с сегментами вирусной РНК, образуя

V белок частицы вирусного РНП; осуществляет контроль

(несплайсированная ядерно-цитоплазматического транспорта РНК.

мРНК)

КА Интегральный мембранный гликопротеин. Отщепляет

Нейраминидаза остатки сиаловых кислот с поверхности гликопротеинов

VI (несплайсированная у вирусных частиц и клеток хозяина, способствуя

мРНК) выходу новых вирусных частиц из инфицированных клеток и освобождая вирусы от рецепторов клеточных мембран.

М1 Основной компонент вирусной мембраны; самый

Белок матрикса 1 многочисленный белок, лежащий в основе вирусной

(несплайсированная оболочки. Обеспечивает процессы самосборки

мРНК) вирусных частиц и их почкование, оказывает влияние на морфологию вирионов. Взаимодействует с белками КР, РВ1, РВ2, РА, М2.

М2 Интегральный мембранный белок. Образует ионный

Белок матрикса 2 канал — протонную помпу. Закачивает протоны (Н)

VII (ал ьтернативн ый внутрь вирусных частиц, тем самым снижая рН в

сплайсинг мРНК) вирионах, пока они находятся в эндосомах. Низкий рН облегчает диссоциацию М1 от РНП и способствует высвобождению РНП в цитоплазму.

М42 Укороченная форма матриксного белка. Функции не

(альтернативный выяснены до конца, однако показано, что при

сплайсинг мРНК, отсутствии в вирионе белка М2 М42 может

вторая рамка функционально его заменить

считывания)

Сегмент Название белка Функции белка

VIII ЫБ1 Неструктурный белок1 (несплайсированная мРНК) Неструктурный многофункциональный белок, который участвует в различных процессах взаимодействия между вирусом и клеткой; контролирует сплайсинг и полиаденилировние мРНК; является антагонистом интерферона и КЮ-1; содержит классический иммуносупрессивный домен.

ЫБ2 Неструктурный белок2 (ЫЕР) (альтернативный сплайсинг мРНК) Неструктурный белок (но небольшое количество присутствует в составе вириона в ассоциации с М1) Контролирует ядерно-цитоплазматический транспорт вирусного РНП комплекса.

ЫБ3 (ал ьтернативн ый сплайсинг мРНК) Минорный белок. Роль NS3 потенциально связана с адаптацией вируса к новому видовому хозяину

Жизненный цикл вируса гриппа состоит из следующих этапов: о прикрепление вируса к рецепторам на поверхности клетки; о проникновение вируса в клетку в процессе рецептор-опосредованного эндоцитоза

о репликация и транскрипция вирусных РНП внутри клеточного ядра; о сборка и выход вирусных частиц из клетки.

Первой стадией инфицирования вирусами гриппа клеток хозяина является распознавание рецептор-связывающим сайтом НА рецепторов Ы-ацетилнейраминовой (сиаловой) кислоты, которые присутствуют преимущественно на поверхности клеток верхних дыхательных путей. После связывания с рецепторами на клеточной поверхности вирус попадает внутрь клетки в процессе эндоцитоза. Низкий уровень рН в поздней эндосоме открывает М2-ионный канал, в результате чего внутри вириона понижается рН, происходит конформационное изменение НА, что в конечном итоге приводит к слиянию вирусной и эндосомальной мембран и высвобождению вирусных РНП в цитоплазму. Далее РНП транслоцируются в ядро, где происходит транскрипция и

репликация под действием ЯёЯр, являющейся гетеротримером из субъединиц РА, РВ1 и РВ2 [27].

В жизненном цикле ВГА участвуют три типа РНК: геномная (-)-РНК (вРНК), комплементарная ей (+)-РНК (кРНК) и матричная РНК (мРНК). РВ1 является каталитической субъединицей ЯёЯр, которая содержит четыре консервативных мотива (мотивы I, II, III и IV) и четыре инвариантных аминокислотных остатка (по одному в каждом мотиве), сохраняющихся среди всех вирусных РНК-зависимых РНК- и ДНК-полимераз. Она катализирует последовательное присоединение нуклеотидов к растущей цепи РНК. Таким образом, РВ1 отвечает за репликацию и транскрипцию [34]. РВ1 не способна самостоятельно инициировать синтез мРНК и модифицировать ее 5'-конец с помощью кэпирования и присоединения метильной группы. РВ1 использует в качестве затравки для транскрипции кэпированный 5'-конец клеточных мРНК, образованных РНК-полимеразой II. ПолиА-хвост вирусных мРНК образуется за счёт «пробуксовки» RdRp на полиУ-последовательности вРНК. Для экспорта вирусных мРНК из ядра используется ряд клеточных белков, в частности, ТЯЕХ и КХБ1/ТАР [35,36]

На более поздних стадиях ВГА инфекции RdRp переключается с транскрипционной на репликативную активность. У всех вирусов с (-)РНК геномом репликация осуществляется вирус-специфическими белками. Белки, ответственные за транскрипцию, участвуют и в репликации генома ВГА. Первичным продуктом репликативного синтеза вРНК являются комплементарные копии всех сегментов геномной вРНК. Эти РНК отличаются от мРНК структурой концевых последовательностей. В отличие от мРНК они не содержат кэпированных и метилированных затравочных последовательностей, и оба их конца строго комплементарны концам РНК-матриц; этим они отличаются от укороченных и полиаденилированных транскриптов [37]. Эти антигеномные сегменты РНК служат в свою очередь матрицами для синтеза точных копий геномных вРНК сегментов.

Синтезированные на рибосомах белки РА, РВ1, РВ2 и ЫР проникают в ядро и образуют РНП комплекс с вновь образованными копиями вРНК. Экспорт РНП из ядра происходит вследствие формирования ЫБ2-М1-РНП-комплекса, который может взаимодействовать с высококонсервативным ядерным рецептором клетки хозяина.

Главным фактором в формировании и отпочковании нового вириона является белок М1, содержащий структурную информацию, необходимую для сборки вириона и его взаимодействия с клеточной мембраной [38].

Похожие диссертационные работы по специальности «Вирусология», 03.02.02 шифр ВАК

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Бродская, Александра Валерьевна, 2018 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. ВОЗ | Грипп [электронный ресурс] // режим доступа: http://www.who.int/mediace1. ВОЗ | Грипп // WHO. -2017.ntre/factsheets/fs211/ru/ (01.02.2018).

2. Деева Э.Г., Мельникова Т.И., Сологуб Т.В. К.О.И. Химиопрепараты для лечения гриппа - современное состояние // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2013. - № 5. - с. 26-32.

3. Киселев О.И., Цыбалова Л.М. П.В И. Покровского. И. Грипп: эпидемиология, диагностика, лечение, профилактика. / — М.: МИА, 2012., 2012.-496 с.

4. De Clercq E. Antiviral agents active against influenza A viruses // Nat. Rev. Drug Discov. - 2006. - V. 5, № 12. P. 1015-1025.

5. Andradottir S. et al. Reactive strategies for containing developing outbreaks of pandemic influenza // BMC Public Health. - 2011. - V. 11, № Suppl 1. - P. S1.

6. Киселев О.И. Пандемии начала XXI века. Грипп птиц и пандемия "свинного гриппа" H1N1 2009 года. - 2016.

7. van Mierlo J.T., van Cleef K.W.R., van Rij R.P. Small Silencing RNAs: Piecing Together a Viral Genome // Cell Host Microbe. - 2010. - V. 7, № 2. - P. 87-89.

8. Bitko V., Barik S. An endoplasmic reticulum-specific stress-activated caspase (caspase-12) is implicated in the apoptosis of A549 epithelial cells by respiratory syncytial virus. // J. Cell. Biochem. 2001. - V. 80, № 3. - P. 441-454.

9. Ballarin-Gonzalez B., Thomsen T.B., Howard K.A. Clinical translation of RNAi-based treatments for respiratory diseases // Drug Deliv. Transl. Res. - 2013. - V. 3, № 1. - P. 84-99.

10. Горшков А.Н., Петрова А.В. В.А.В. РНК интерференция и патогенез вируса гриппа // Цитология. - 2017. - V. 59, № 8. - P. 513-533.

11. Tan F.L., Yin J.Q. RNAi, a new therapeutic strategy against viral infection // Cell Res. 2004. - V. 14, № 6. - P. 460-466.

12. Ozcan G. et al. Preclinical and clinical development of siRNA-based therapeutics

// Adv Drug Deliv Rev. - 2015. № 87. - P. 108-119.

13. Ge Q. et al. RNA interference of influenza virus production by directly targeting mRNA for degradation and indirectly inhibiting all viral RNA transcription. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003. - V. 100, № 5. - P. 2718-2723.

14. Ge Q. et al. Inhibition of influenza virus production in virus-infected mice by RNA interference // Proc. Natl. Acad. Sci. 2004. - V. 101, № 23. - P. 8676-8681.

15. Hui E.K.W. et al. Inhibition of influenza virus matrix (M1) protein expression and virus replication by U6 promoter-driven and lentivirus-mediated delivery of siRNA // J. Gen. Virol. 2004. - V. 85, № 7. - P. 1877-1884.

16. McCown M., Diamond M.S., Pekosz A. The utility of siRNA transcripts produced by RNA polymerase I in down regulating viral gene expression and replication of negative- and positive-strand RNA viruses // Virology. 2003. - V. 313, № 2. - P. 514-524.

17. Jiao H. et al. Effective inhibition of mRNA accumulation and protein expression of H5N1 avian influenza virus NS1 gene in vitro by small interfering RNAs // Folia Microbiol. (Praha). - 2013. - V. 58, № 4. - P. 335-342.

18. Svancarova P., Svetlikova D., Betakova T. Synergic and antagonistic effect of small hairpin RNAs targeting the NS gene of the influenza A virus in cells and mice // Virus Res. Elsevier B.V., 2015. - V. 195. - P. 100-111.

19. Sui H.Y. et al. Small interfering RNA targeting M2 gene induces effective and long term inhibition of influenza A virus replication // PLoS One. 2009. - V. 4, № 5. - P. 1-7.

20. Thakur N., Qureshi A., Kumar M. VIRsiRNAdb: a curated database of experimentally validated viral siRNA/shRNA // Nucleic Acids Res. - 2012. - V. 40, № D1. - P. D230-D236.

21. Sirnaomics [Электронный Ресурс] // режим доступа: http://old. sirnaomics.com/products .html (03.12.2018).

22. Kaczmarek J.C., Kowalski P.S., Anderson D.G. Advances in the delivery of RNA therapeutics: From concept to clinical reality // Genome Med. Genome Medicine, 2017. - V. 9, № 1. - P. 1-16.

23. Thomas M. et al. Full deacylation of polyethylenimine dramatically boosts its gene delivery efficiency and specificity to mouse lung // Proc. Natl. Acad. Sci. 2005. - V. 102, № 16. - P. 5679-5684.

24. Ganas C. et al. Biodegradable capsules as non-viral vectors for in vitro delivery of PEI/siRNA polyplexes for efficient gene silencing. // J. Control. Release. - 2014.

- V. 196. - P. 132-138.

25. Timin A.S. et al. Hybrid inorganic-organic capsules for efficient intracellular delivery of novel siRNAs against influenza A (H1N1) virus infection // Sci. Rep. -2017. - V. 7, № 1. - P. 102.

26. Timin A.S., Gould D.J., Sukhorukov G.B. Multi-layer microcapsules: fresh insights and new applications // Expert Opin. Drug Deliv. - 2017. - V. 14, № 5. -P. 583-587.

27. Fields B.N., Knipe D.M. (David M., Howley P.M. Fields virology. Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins, 2007. 86 - P.

28. Kawaoka Y. nfluenza Virology: Current Topics / ed. Kawaoka Y. Caister Academic Press,Wymondham., 2006.

29. Shaw M.L. et al. Cellular Proteins in Influenza Virus Particles // PLoS Pathog. / ed. Früh K. 2008. - V. 4, № 6. P. e1000085.

30. Hutchinson E.C. et al. Conserved and host-specific features of influenza virion architecture // Nat. Commun. - 2014. - V. 5. - P. 4816.

31. Nelson M. I. H.E.C. The evolution of epidemic influenza // Nat. Rev. Genet. 2007.

- V. 8. - P. 196-205.

32. Vasin A. V. et al. Molecular mechanisms enhancing the proteome of influenza A viruses: An overview of recently discovered proteins // Virus Res. Elsevier B.V., 2014. - V. 185. - P. 53-63.

33. Чучалина А.Г., Сологуб Т.В. Грипп у взрослых : методические рекомендации по диагностике , лечению , специфической и неспецифической профилактике под редакцией : 2014.

34. Kobayashi M., Toyoda T. I.A. Influenza virus PB1 protein is the minimal and essential subunit of RNA polymerase // Arch. Virol. 1996. - V. 141. - P. 525-539.

35. Liu Y. et al. Structure-function studies of the influenza virus RNA polymerase PA subunit. // Sci. China. Ser. C, Life Sci. 2009. - V. 52, № 5. - P. 450-458.

36. Pflug A. et al. Structural insights into RNA synthesis by the influenza virus transcription-replication machine. // Virus Res. - 2017. - V. 234. - P. 103-117.

37. Ortin J., Martin-Benito J. The RNA synthesis machinery of negative-stranded RNA viruses // Virology. - 2015. - V. 479-480. - P. 532-544.

38. Das K. et al. Structures of influenza A proteins and insights into antiviral drug targets. // Nat. Struct. Mol. Biol. - 2010. - V. 17, № 5. - P. 530-538.

39. Gaidet N. et al. Avian Influenza Viruses in Water Birds, Africa1 // Emerg. Infect. Dis. 2007. - V. 13, № 4. - P. 626-629.

40. Reid A.H., Taubenberger J.K., Fanning T.G. Evidence of an absence: the genetic origins of the 1918 pandemic influenza virus // Nat. Rev. Microbiol. 2004. - V. 2, № 11. - P. 909-914.

41. Грипп: факты и статистика [Electronic resource].

42. А.Н. Слепушкин Л.Н.В. Профилактика гриппа и ОРВИ // Русский медицинский журнал. 2001. № 16. - P. 717.

43. Кареткина Г.Н. Применение индукторов интерферонов для лечения и профилактики гриппа и других острых респираторных вирусных инфекций // Лечащий врач. 2009. № 10. - P. 23-31.

44. Naesens L., Stevaert A., Vanderlinden E. Antiviral therapies on the horizon for influenza. // Curr. Opin. Pharmacol. - 2016. - V. 30. - P. 106-115.

45. Sangawa H. et al. Mechanism of Action of T-705 Ribosyl Triphosphate against Influenza Virus RNA Polymerase // Antimicrob. Agents Chemother. - 2013. - V. 57, № 11. - P. 5202-5208.

46. Takashita E. et al. Antiviral susceptibility of influenza viruses isolated from patients pre- and post-administration of favipiravir. // Antiviral Res. - 2016. - V. 132. - P. 170-177.

47. Trist I.M.L. et al. 4,6-Diphenylpyridines as Promising Novel Anti-Influenza Agents Targeting the PA-PB1 Protein-Protein Interaction: Structure-Activity Relationships Exploration with the Aid of Molecular Modeling. // J. Med. Chem.

- 2016. - V. 59, № 6. - P. 2688-2703.

48. Yuan S. et al. Identification of a small-molecule inhibitor of influenza virus via disrupting the subunits interaction of the viral polymerase. // Antiviral Res. -2016. - V. 125. - P. 34-42.

49. Fire, A., Xu, S., Montgomery, M.K., Kostas, S.A., Driver, S.E., and Mello C.C. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans // Nature. 1998. - V. 391. - P. 806-811.

50. Ketting R.F. The Many Faces of RNAi // Dev. Cell. - 2011. - V. 20, № 2. - P. 148-161.

51. Ender C., Meister G. Argonaute proteins at a glance. // J. Cell Sci. - 2010. - V. 123, № Pt 11. - P. 1819-1823.

52. Mittal V. Improving the efficiency of RNA interference in mammals. // Nat. Rev. Genet. 2004. - V. 5, № 5. - P. 355-365.

53. Elbashir S.M., Harborth J., Weber K. T.T. Analysis of gene function in somatic mammalian cells using small interfering RNAs // Methods. 2002. - V. 26, № 199213.

54. Kurreck J. RNA Interference: From Basic Research to Therapeutic Applications // Angew. Chemie Int. Ed. - 2009. - V. 48, № 8. - P. 1378-1398.

55. DeVincenzo J.P. The promise, pitfalls and progress of RNA-interference-based antiviral therapy for respiratory viruses // Antivir. Ther. - 2012. - V. 17, № 1 Pt B. - P. 213-225.

56. Khanna M. et al. Gene silencing: a therapeutic approach to combat influenza virus infections // Futur. Microbiol. - 2015. - V. 10. - P. 131-140.

57. Barik S. SiRNA for influenza therapy // Viruses. - 2010. - V. 2, № 7. - P. 14481457.

58. Youngren-Ortiz S.R. et al. Aerosol Delivery of siRNA to the Lungs. Part 1: Rationale for Gene Delivery Systems // Kona powder Sci. Technol. Japan. NIH Public Access, 2016. - V. 33. - P. 63.

59. Ge Q., Eisen H.N., Chen J. Use of siRNAs to prevent and treat influenza virus infection // Virus Res. - 2004. - V. 102, № 1. - P. 37-42.

60. Tompkins S.M. et al. Protection against lethal influenza virus challenge by RNA interference in vivo. - 2004.

61. Zhou H. et al. Effective small interfering RNAs targeting matrix and nucleocapsid protein gene inhibit influenza A virus replication in cells and mice // Antiviral Res. - 2007. - V. 76, № 2. - P. 186-193.

62. Zhou K. et al. RNA interference of avian influenza virus H5N1 by inhibiting viral mRNA with siRNA expression plasmids // J. Biotechnol. - 2008. - V. 135, № 2. -P. 140-144.

63. Wu Y. et al. Inhibition of highly pathogenic avian H5N1 influenza virus replication by RNA oligonucleotides targeting NS1 gene // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 2008. - V. 365, № 2. - P. 369-374.

64. Abrahamyan A., Nagy E., Golovan S.P. Human H1 promoter expressed short hairpin RNAs (shRNAs) suppress avian influenza virus replication in chicken CH-SAH and canine MDCK cells // Antiviral Res. - 2009. - V. 84, № 2. - P. 159167.

65. Suzuki H. et al. Inhibition of influenza virus by baculovirus-mediated shRNA. // Nucleic Acids Symp. Ser. (Oxf). - 2009. - V. 53, № 53. - P. 287-288.

66. Zhang W. et al. Inhibition of highly pathogenic avian influenza virus H5N1 replication by the small interfering RNA targeting polymerase A gene // Biochem. Biophys. Res. Commun. Elsevier Inc., 2009. - V. 390, № 3. - P. 421-426.

67. Li W. et al. Inhibition of influenza A virus replication by RNA interference targeted against the PB1 subunit of the RNA polymerase gene // Arch. Virol. -2011. - V. 156, № 11. - P. 1979-1987.

68. Rajput R. et al. Small interfering RNA targeting the nonstructural gene 1 transcript inhibits influenza A virus replication in experimental mice. // Nucleic Acid Ther. - 2012. - V. 22, № 6. - P. 414-422.

69. Khantasup K. et al. Targeted small interfering RNA-immunoliposomes as a promising therapeutic agent against highly pathogenic avian influenza A (H5N1) virus infection // Antimicrob. Agents Chemother. - 2014. - V. 58, № 5. - P. 2816-2824.

70. Hinton T.M., Challagulla A., Stewart C.R., Guerrero-Sanchez C., Grusche F.A., Shi S., Bean A.G., Monaghan P., Gunatillake P.A., Thang S.H. T.M.L. Inhibition of influenza virus in vivo by siRNA delivered using ABA triblock copolymer synthesizedby reversible addition-fragmentation chain-transfer polymerization // Nanomedicine. - 2014. № 9. - P. 1141-1154.

71. Stoppani E., Bassi I., Dotti S., Lizier M., Ferrari M. L.F. Expression of a single siRNA against a conserved region of NP gene strongly inhibits in vitro replication of different Influenza A virus strains of avian and swine origin. // Antiviral Res. -2015. № 120. - P. 16-22.

72. Behera P., Nagarajan S., Murugkar H.V., Kalaiyarasu S., Prakash A., Gothalwal R., Dubey S.C., Kulkarni D.D. T.C. siRNAs targeting PB2 and NP genes potentially inhibit replication of highly pathogenic H5N1 avian Influenza virus // J. Biosci. - 2015. № 40. - P. 233-240.

73. Liang W., Chow M.Y., Lau P.N., Zhou Q.T., Kwok P.C., Leung G.P., Mason A.J., Chan H.K., Poon L.L. L.J.K. Inhalable dry powder formulations of siRNA and pH-responsive peptides with antiviral activity against H1N1 influenza virus // Mol. Pharm. - 2015. № 12. - P. 910-921.

74. Xu F., Liu G., Liu Q. Z.Y. RNA interference of influenza A virus replication by microRNA-adapted lentiviral shRNA // J. Gen. Virol. - 2015. № 96. - P. 29712981.

75. McMillen C.M. et al. Inhibition of influenza A virus matrix and nonstructural gene expression using RNA interference // Virology. Elsevier, 2016. - V. 497. -P. 171-184.

76. Linke L.M. et al. Inhibiting avian influenza virus shedding using a novel RNAi antiviral vector technology: proof of concept in an avian cell model // AMB Express. Springer Berlin Heidelberg, 2016. - V. 6, № 1. - P. 1-10.

77. Wang S. et al. Targeted disruption of influenza A virus hemagglutinin in genetically modified mice reduces viral replication and improves disease outcome // Sci. Rep. Nature Publishing Group, 2016. - V. 6, № March. - P. 1-12.

78. Youngren-Ortiz S.R. et al. Aerosol Delivery of siRNA to the Lungs. Part 2:

Nanocarrier-based Delivery Systems // Kona powder Sci. Technol. Japan. NIH Public Access, 2017. - V. 34. - P. 44.

79. Ruigrok M.J., Frijlink H.W. H.W.L. - 2016. P. administration of small interfering R.T. route to go? J.C.R. 235: 14-23. Pulmonary administration of small interfering RNA: The route to go // J. Control. Release. - 2016. № 235. - P. 14-23.

80. Roberts T.C., Ezzat K., El Andaloussi S. W.M.S. Synthetic siRNA delivery: progress and prospects // Methods Mol. Biol. - 2016. № 1364. - P. 291-310.

81. ElHefnawi M. et al. The design of optimal therapeutic small interfering RNA molecules targeting diverse strains of influenza a virus // Bioinformatics. - 2011. - V. 27, № 24. - P. 3364-3370.

82. Liu Y. et al. Optimised design of siRNA based on multi-featured comparison and analysis of H1N1 virus // Int. J. Data Min. Bioinform. - 2013. - V. 7, № 4. - P. 345.

83. Raza A. et al. Selection of predicted siRNA as potential antiviral therapeutic agent against influenza virus. // Bioinformation. - 2011. - V. 6, № 9. - P. 340-343.

84. Wang X., Wang X., Varma R.K., Beauchamp L., Magdaleno S. S.T.J. Selection of hyperfunctional siRNAs with improved potency and specificity // Nucleic Acids Res. - 2009. - V. 37. - P. e152.

85. Fakhr E., Zare F. T.-T.L. Precise and efficient siRNA design: a key point in competent gene silencing. Cancer Gene Ther. 23: 73-82. // Cancer Gene Ther. -2016. № 23. - P. 73-82.

86. Birmingham A. et al. A protocol for designing siRNAs with high functionality and specificity // Nat. Protoc. - 2007. - V. 2, № 9. - P. 2068-2078.

87. A.J. H. The use of RNAi-based screens to identify host proteins involved in viral replicatione // Futur. Microbiol. - 2010. - V. 5, № 2. - P. 303-311.

88. Chou Y.-C. et al. Variations in genome-wide RNAi screens: lessons from influenza research // J. Clin. Bioinforma. - 2015. - V. 5, № 1. - P. 2.

89. Portela A., Digard P. The influenza virus nucleoprotein: a multifunctional RNA-binding protein pivotal to virus replication. // J. Gen. Virol. - 2002. - V. 83, № Pt 4. - P. 723-734.

90. Decroly E et al. Conventional and unconventional mechanisms for capping viral mRNA. Nat Rev Microbiol // Nat. Rev. Microbiol. - 2011.

91. J.Wang, Z.Lu, M.G. Wientjes J.L.-S.A. Delivery of siRNA therapeutics: barriers and carriers // Am. Assoc. Pharm. Sci. - 2010. - V. 12, № 4. - P. 492-503.

92. Никитенко Н.А. П.В.С. Невирусные методы доставки и терапевтическое применение малых интерферирующих РНК // Acta Naturae. - 2013. - V. 5, № 3 (18). - P. 37-56.

93. M. Jafari, M. Soltani, S. Naahidi, D. Karunaratne P.C. Nonviral approach for targeted nucleic acid delivery // Curr. Med. Chem. - 2012. - V. 19, № 2. - P. 197208.

94. Northfelt D.W. et al. Efficacy of pegylated-liposomal doxorubicin in the treatment of AIDS-related Kaposi's sarcoma after fa ilure of standard chemotherapy. // J. Clin. Oncol. 1997. - V. 15, № 2. - P. 653-659.

95. How Cationic Lipid Mediated Transfection Works [Electronic resource]. URL: https://www.thermofisher.com/ru/ru/home/references/gibco-cell-culture-basics/transfection-basics/gene-delivery-technologies/cationic-lipid-mediated-delivery/how-cationic-lipid-mediated-transfection-works.html (accessed: 12.02.2018).

96. Lipofectamine® 2000 [Electronic resource]. URL: https://www.thermofisher.com/ru/ru/home/brands/product-brand/lipofectamine/lipofectamine-2000.html (accessed: 12.02.2018).

97. Lipofectamine® RNAiMAX Reagent [Electronic resource]. URL: https://www.thermofisher.com/ru/ru/home/brands/product-brand/lipofectamine/lipofectamine-rnaimx.html (accessed: 12.02.2018).

98. Nguyen J., Szoka F.C. Nucleic acid delivery: the missing pieces of the puzzle? // Acc. Chem. Res. - 2012. - V. 45, № 7. - P. 1153-1162.

99. Jere D. et al. Degradable polyethylenimines as DNA and small interfering RNA carriers. // Expert Opin. Drug Deliv. - 2009. - V. 6, № 8. - P. 827-834.

100. Nimesh S. et al. Polyethylenimine nanoparticles as efficient transfecting agents for mammalian cells // J. Control. Release. - 2006. - V. 110, № 2. - P. 457-468.

101. MUMPER, Russell J., ROLLAND A. CHITOSAN RELATED COMPOSITIONS FOR DELIVERY OF NUCLEIC ACIDS INTO A CELL. 1997.

102. Katas H., Alpar H.O. Development and characterisation of chitosan nanoparticles for siRNA delivery. // J. Control. Release. - 2006. - V. 115, № 2. - P. 216-225.

103. Ji A.M. et al. Functional gene silencing mediated by chitosan/siRNA nanocomplexes. // Nanotechnology. - 2009. - V. 20, № 40. - P. 405103.

104. Ali A., Ahmed S. A review on chitosan and its nanocomposites in drug delivery // Int. J. Biol. Macromol. - 2018. - V. 109. - P. 273-286.

105. Singh B. et al. Chitosan-based particulate systems for the delivery of mucosal vaccines against infectious diseases // Int. J. Biol. Macromol. - 2017.

106. Crivianu-Gaita V T.M. Immobilization of Fab' fragments onto substrate surfaces: A survey of methods and applications // biosens biolectronica. - 2015. № 70. - P. 167-180.

107. Gao H., Wen D., Sukhorukov G.B. Composite silica nanoparticle/polyelectrolyte microcapsules with reduced permeability and enhanced ultrasound sensitivity // J. Mater. Chem. B. The Royal Society of Chemistry, 2015. - V. 3, № 9. - P. 18881897.

108. Antipina M.N., Sukhorukov G.B. Remote control over guidance and release properties of composite polyelectrolyte based capsules // Adv. Drug Deliv. Rev. -2011. - V. 63, № 9. - P. 716-729.

109. Shao J. et al. Biointerfacing polymeric microcapsules for in vivo near-infrared light-triggered drug release // Nanoscale. The Royal Society of Chemistry, 2015. -V. 7, № 45. - P. 19092-19098.

110. Kolesnikova T.A. et al. Nanocomposite Microcontainers with High Ultrasound Sensitivity // Adv. Funct. Mater. WILEY-VCH Verlag, 2010. - V. 20, № 7. - P. 1189-1195.

111. Sukhorukov G.B. et al. Multifunctionalized Polymer Microcapsules: Novel Tools for Biological and Pharmacological Applications // Small. - 2007. - V. 3, № 6. -P. 944-955.

112. Kolesnikova T.A., Skirtach A.G., Mohwald H. Red blood cells and polyelectrolyte

multilayer capsules: natural carriers versus polymer-based drug delivery vehicles // Expert Opin. Drug Deliv. - 2013. - V. 10, № 1. - P. 47-58.

113. Timin A.S. et al. Intracellular redox induced drug release in cancerous and mesenchymal stem cells. // Colloids Surf. B. Biointerfaces. - 2016. - V. 147. - P. 450-458.

114. Luo G.-F. et al. Encapsulation of an Adamantane-Doxorubicin Prodrug in pH-Responsive Polysaccharide Capsules for Controlled Release // ACS Appl. Mater. Interfaces. American Chemical Society, 2012. - V. 4, № 10. - P. 5317-5324.

115. Timin A.S. et al. Triple-responsive inorganic-organic hybrid microcapsules as a biocompatible smart platform for the delivery of small molecules // J. Mater. Chem. B. The Royal Society of Chemistry, 2016. - V. 4, № 45. - P. 7270-7282.

116. Ott A. et al. Light-Addressable and Degradable Silica Capsules for Delivery of Molecular Cargo to the Cytosol of Cells // Chem. Mater. American Chemical Society, 2015. - V. 27, № 6. - P. 1929-1942.

117. Faizuloev E. et al. Water-soluble N-[(2-hydroxy-3-trimethylammonium)propyl]chitosan chloride as a nucleic acids vector for cell transfection // Carbohydr. Polym. - 2012. - V. 89, № 4. - P. 1088-1094.

118. Петрова-Бродская А.В., Бондаренко А.Б., Тимин А.С., Плотникова М.А., Афанасьев М.В, Семенова А.А., Лебедев К.И., Горшков А.Н., Горшкова М.Ю., Егоров В.В., Клотченко С.А. В.А.В. Сравнение эффективностей ингибирования вируса гриппа А in vitro комплексами малых интерферирующих РНК с производными хитозана, полиэтиленимином и гибридными микрокапсулами на основе полиаргинина с неорганическими компонентами // вопросы вирусологии. - 2017. - V. 62, № 6. - P. 259-265.

119. Reed L.J. M.H. A simple method of estimating fifty per cent endpoints // Am. J. Epidemiol. 1938. - V. 27, № 3. - P. 493-497.

120. Who. Manual for the laboratory diagnosis and virological surveillance of influenza // World Heal. Organ. - 2011. - - P. 153.

121. CDC. CDC Protocol of realtime RT-PCR for influenza A (H1N1) // World Heal. Organ. - 2009. - V. 1, № April. - P. 7.

122. Mittelholzer C.M. Influenza virus - Protection and Adaptation // Program. - 2006. 1-61 - P.

123. Genbank [Electronic resource]. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/Database.

124. MAFFT [Electronic resource]. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/FLU/Database.

125. van Baalen C.A. et al. Detection of Nonhemagglutinating Influenza A(H3) Viruses by Enzyme-Linked Immunosorbent Assay in Quantitative Influenza Virus Culture // J. Clin. Microbiol. - 2014. - V. 52, № 5. - P. 1672-1677.

126. Muslimov A.R. et al. Mesenchymal Stem Cells Engineering: Microcapsules-Assisted Gene Transfection and Magnetic Cell Separation // ACS Biomater. Sci. Eng. American Chemical Society, 2017. - V. 3, № 10. - P. 2314-2324.

127. Doench J.G., Petersen C.P., Sharp P.A. siRNAs can function as miRNAs. // Genes Dev. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2003. - V. 17, № 4. - P. 438-442.

128. Leuschner P.J.F. et al. Cleavage of the siRNA passenger strand during RISC assembly in human cells. // EMBO Rep. European Molecular Biology Organization, 2006. - V. 7, № 3. - P. 314-320.

129. Filipowicz W., Sonenberg N. The long unfinished march towards understanding microRNA-mediated repression. // RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2015. - V. 21, № 4. - P. 519-524.

130. Morozova N. et al. Kinetic signatures of microRNA modes of action. // RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012. - V. 18, № 9. - P. 1635-1655.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.