Регуляция Mcl-1 для повышения чувствительности опухолевых клеток к апоптозу тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.08, кандидат наук Сеничкин, Вячеслав Витальевич

  • Сеничкин, Вячеслав Витальевич
  • кандидат науккандидат наук
  • 2018, Москва
  • Специальность ВАК РФ03.01.08
  • Количество страниц 158
Сеничкин, Вячеслав Витальевич. Регуляция Mcl-1 для повышения чувствительности опухолевых клеток к апоптозу: дис. кандидат наук: 03.01.08 - Биоинженерия. Москва. 2018. 158 с.

Оглавление диссертации кандидат наук Сеничкин, Вячеслав Витальевич

Оглавление

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Концепция программируемой клеточной гибели

1.2. Апоптоз

1.2.1. Инициаторная фаза

1.2.2. Эффекторная фаза

1.2.3. Деградационная фаза

1.3. Аутофагия

1.3.1. Механизмы аутофагии

1.3.2. Контроль запуска аутофагии

1.4. Семейство Вс1-2

1.4.1. Структура и классификация белков Вс1-2 семейства

1.4.2. Контроль ПВММ белками семейства Вс1-2

1.4.3. Физиологическая значимость белков семейства Вс1-2

1.4.4. Белки Вс1-2 семейства как мишени противоопухолевой терапии

1.5. Мс1-1

1.5.1. Структура и изоформы Мс1-1

1.5.2. Роль изоформ Мс1-1 в апоптозе

1.5.3. Неапоптотические функции Мс1-1

1.5.3.1. Мс1-1 и аутофагия

1.5.3.2. Мс1-1 и митохондриальный гомеостаз

1.5.3.3. Функции белка Мс1-1 в ядре

1.5.4. Регуляция Мс1-1 на молекулярном уровне

2

1.5.4.1. Регуляция транскрипции гена MCL1

1.5.4.2. Посттранскрипционный контроль Mcl-1

1.5.4.3. Контроль синтеза белка Mcl-1 на уровне трансляции

1.5.4.4. Посттрансляционный контроль Mcl-1: фосфорилирование

1.5.4.5. Посттрансляционный контроль Mcl-1: убиквитинирование и деградация

1.5.4.6. Дисрегуляция Mcl-1 в опухолевых клетках

1.6. Ограничение питательных веществ при комбинированной терапии опухолей

1.6.1. Депривация сыворотки как in vitro модель ОПВ

1.6.2. Непрямое воздействие на Mcl-1 как подход к комбинированной терапии опухолей

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Материалы

2.1.1. Рабочие растворы

2.1.2. Клеточные культуры

2.1.3. Реактивы

2.1.4. Антитела

2.1.5. Плазмиды и РНК

2.1.6. Коммерческие наборы, реагенты и оборудование

2.2. Методы

2.2.1. Культивирование клеток

2.2.2. Экспериментальные процедуры

2.2.3. Трансфекция клеток

2.2.4. Вестерн-блот анализ

2.2.5. Проточная цитофлуориметрия

2.2.6. Измерение субстратной активности каспаз

2.2.7. Гель-фильтрация

2.2.8. ПЦР в реальном времени

2.2.9. Обработка данных

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1. Непрямое воздействие на Mcl-1 как подход к повышению чувствительности опухолевых клеток к химиотерапевтическим препаратам

3.1.1. Анализ влияния депривации сыворотки на деградацию Mcl-1 и уровень апоптотической гибели при действии ДНК-повреждающего агента цисплатина

3.1.2. Анализ вклада инициаторных каспаз в усиление цисплатин-индуцированной гибели при депривации сыворотки

3.1.3. Анализ роли Mcl-1 в усилении цисплатин-индуцированного апоптоза в условиях депривации сыворотки

3.1.4. Изучение механизмов ускоренной деградации Mcl-1 при комбинаторном действии депривации сыворотки и цисплатина

3.1.5. Оценка роли аутофагии в деградации Mcl-1

3.2. Использование ВН3-миметиков к Mcl-1 как подход к увеличению чувствительности опухолевых клеток к химиотерапевтическим препаратам

105

3.2.1. Оценка эффективности ВН3-миметиков А1210477 и Б63845 в качестве индивидуальных веществ и в комбинации с цисплатином

3.2.2. Изучение механизмов различной проапоптотической активности ВН3-миметиков A1210477 и S63845

3.2.3. Оценка влияния цисплатина на преодоление резистентности клеток к

действию БИ3-миметика 863845

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ГЛАВА 5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

AIF (apoptosis inducing factor) - фактор, индуцирующий апоптоз AMPK (AMP-activated protein kinase) - АМФ-зависимая протеинкиназа

ATM Ataxia telangiectasia mutated) - серин/треониновая протеинкиназа, маркер заболевания атаксии телеангиэктазии

Bcl-2 (B-cell leukemia/lymphoma-2) - антиапоптотический белок, маркер B-клеточной лейкемии/лимфомы-2

BH-домен (Bcl-2 homology domain) - Bcl-2 подобный домен

CAD (caspase-activated DNase) - ДНКаза, активируемая каспазами

Class III PI3K- фосфатидилинозитол-3-киназа класса III

DISC (death-inducing signaling complex) - сигнальный комплекс, индуцирующий клеточную смерть

EGF (epidermal growth factor) - эпидермальный фактор роста

eIF2 (Eukaryotic Initiation Factor 2) - фактор-2 инициации трансляции эукариот

eIF4F (Eukaryotic initiation factor 4F) - фактор^ инициации трансляции эукариот

ERK (extracellular signal regulated kinases) - киназы, регулируемые внеклеточными сигналами

FADD (Fas-associated protein with Death Domain) - Fas-ассоциированный белок, содержащий домен смерти

FDA (Food and Drug Administration) - управление США по санитарному

надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов

6

FITC - флуоресцеин изотиоцианат

GAPDH (Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase) - глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназа

GM-CSF (granulocyte-macrophage colony-stimulating factor) - Гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор

GSK-3 (glycogen synthase kinase 3) - киназа-3 гликогенсинтазы

HGF (hepatocyte growth factor) - фактор роста гепатоцитов

HIF-1 (Hypoxia-inducible factor-1) - фактор-1, индуцируемый гипоксией

IAP (Inhibitors of apoptosis proteins) - семейство белков, ингибирующих апоптотические протеазы

ICAD (inhibitor of caspase-activated DNase) - ингибитор ДНКазы, активируемой каспазами

IFN-a - интерферон-альфа

IL - интерлейкин

JAK (Janus kinase) - Janus-киназа

JNK1 (c-Jun N-terminal kinase-1) - c-Jun N-концевая киназа-1

MAPK (mitogen-activated protein kinases) - митоген-активируемые протеинкиназы

Mcl-1 (Myeloid cell leukemia-1) - антиапоптотический белок, маркер лейкемии миелоидных клеток-1

mTORC1 (mammalian TOR complex1; TOR - target of rapamycin) - комплекс 1 TOR млекопитающих; TOR - мишень действия рапамицина

Mule (Mcl-1 ubiquitin ligase E3) - E3 убиквитинлигаза Mcl-1

NF-kB (nuclear factor kappa B) - ядерный фактор «каппа-би»

PARP (PolyADP-Ribose Polymerase) - полиАДФ-Рибоза полимераза

PCNA (Proliferating cell nuclear antigen) - ядерный антиген пролиферирующих клеток

PEST-последовательности - последовательности, богатые пролином [P], глутаминовой кислотой [E], серином [S] и треонином [T]

PI3K - фосфатидилинозитол-3-киназа

PKC (Protein kinase C) - протеинкиназа C

PP2A - фосфатаза 2A

SCF (stem cell factor) - фактор стволовых клеток

SD (serum deprivation) - удаление сыворотки из культуральной среды

SMAC/Diablo (second mitochondria-derived activator of caspases/direct IAP binding protein with low pI) - второй митохондриальный активатор каспаз/прямой IAP-связывающий белок с низким pI

SRF (serum response factor) - фактор, чувствительный к компонентам сыворотки

STAT (signal transducer and activator of transcription) - белки-трансдукторы сигнала и активаторы транскрипции

TIM/TOM комплекс (translocase of the inner/outer membrane complex) -комплекс транслоказ внутренней/внешней митохондриальной мембран

TPA (12-O-Tetradecanoylphorbol-13-acetate) - 12-0-тетрадеканоилфорбол-13-ацетат, форболовый эфир

TRAIL (TNF-related apoptosis-inducing ligand; TNF - tumor necrosis factor); цитокин семейства ФНО, индуцирующий апоптоз (ФНО - фактор некроза опухолей)

TSC2 (Tuberous Sclerosis Complex 2) - комплекс-2 туберозного склероза

VEGF (Vascular endothelial growth factor) - фактор роста эндотелия сосудов

VLCAD (Very long chain acyl-CoA dehydrogenase) - Ацил-КоА-дегидрогеназа жирных кислот с очень длинной цепью

xIAP (X-linked inhibitor of apoptosis protein) - ассоциированный с X-хромосомой ингибитор апоптотических белков

YFP (yellow fluorescent protein) - желтый флуоресцентный белок

АФК - активные формы кислорода

ВММ - внешняя митоходриальная мембрана

днРНК - длинные некодирующие РНК

ДС - «домен смерти» (DD, Death Domain)

ДЭС - «домен эффектора смерти» (DED, Death Effector Domain), миРНК - малая интерферирующая РНК ОПВ - ограничение питательных веществ ПААГ - полиакриламидный гель

ПВММ - пермеабилизация внешней митохондриальной мембраны

ПКГ - программируемая клеточная гибель ТМ-домен - трансмембранный домен ФИ3Ф - фосфатидилинозитол-3-фосфат ЭПР - эндоплазматический ретикулум

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Биоинженерия», 03.01.08 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Регуляция Mcl-1 для повышения чувствительности опухолевых клеток к апоптозу»

ВВЕДЕНИЕ

АКТУАЛЬНОСТЬ ТЕМЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

Одной из главных задач современной медицины, безусловно, является борьба с опухолевыми заболеваниями. Так, в 2012 году было зафиксировано 14,1 млн случаев впервые выявленных онкологий [1]. Смертность от таких болезней в 2015 году составила 8,8 млн человек [2]. На сегодняшний день опухолевые заболевания занимают второе место среди связанных с болезнями причин смертности в мире.

Опухоль - патологическое образование, возникающее вследствие мутаций в генетическом материале клеток и их бесконтрольного деления. В основе биологии опухолевых клеток лежат принципы селекции в пользу наиболее приспособленных клонов. В результате такие клоны приобретают ряд адаптационных преимуществ, в том числе устойчивость к программируемой клеточной гибели (ПКГ) [3]. Одним из наиболее изученных типов ПКГ на сегодняшний день является апоптоз, который представляет собой, среди прочего, важный онкосупрессорный механизм. Индукция апоптоза с помощью различных биоинженерных и биохимических подходов является перспективной стратегией элиминирования опухолевых клеток.

Процесс апоптоза контролируется рядом генов и их продуктов, среди которых особое место занимают члены семейства Вс1-2, представленного как проапоптотическими, так и антиапоптотическими белками. Одним из механизмов устойчивости опухолевых клеток к апоптозу является повышенная экспрессия антиапоптотических белков данного семейства, в частности, Вс1-2, Вс1-хЬ и Мс1-1. Как следствие, эти белки представляют собой привлекательные мишени для противоопухолевой терапии.

Более 10 лет назад был описан первый эффективный ингибитор Bcl-2 и Bcl-xL [4]. Однако попытки исследователей разработать высокоактивный и высокоселективный ингибитор Mcl-1 долгое время были тщетны. Лишь в последние годы поиски увенчались успехом. В частности, был описан специфический ингибитор Mcl-1, S63845, а химическое производное данного соединения с улучшенными фармакологическими свойствами в настоящее время проходит клинические испытания. Стоит отметить, что Мс1-1 характеризуется очень коротким временем полужизни (примерно 40 минут), а экспрессия гена данного белка тонко регулируется на транскрипционном, трансляционном и посттрансляционном уровнях. Как итог, помимо прямого ингибирования, одним из способов нейтрализации антиапоптотической активности Мс1-1 является негативная регуляции уровня этого белка в опухолевых клетках.

Учитывая роль Мс1-1 в резистентности опухолевых клеток к апоптотическим стимулам, понимание молекулярных механизмов ингибирования или снижения уровня Mcl-1 является одной из приоритетных задач экспериментальной онкологии. В рамках данной работы с помощью методов биоинженерии, таких как использование малых интерферирующих РНК и оверэкспрессия целевого гена, а также действия малых молекул, были исследованы способы как прямого, так и непрямого влияния на белок Mcl-1 в опухолевых клетках.

ЦЕЛЬ РАБОТЫ

Целью данной работы является изучение механизмов усиления гибели опухолевых клеток при прямом или опосредованном воздействии на антиапоптотический белок Mcl-1.

ЗАДАЧИ РАБОТЫ

1. Оценить снижение уровня антиапоптотического белка Мс1-1 в опухолевых клетках при комбинированном действии ДНК-повреждающего агента цисплатина и депривации сыворотки.

2. Оценить эффективность усиления клеточной гибели в рамках используемой модели, а также роль белка Мс1-1 в наблюдаемом феномене.

3. Исследовать механизмы, лежащие в основе ускоренной деградации белка Мс1-1 при комбинированном действии цисплатина и депривации сыворотки в опухолевых клетках.

4. Изучить вклад аутофагии в изменения уровня Мс1-1 при индукции клеточной гибели цисплатином в стандартной и бессывороточной средах.

5. Оценить эффективность усиления клеточной гибели различными специфическими антагонистами Мс1-1 класса ВН3-миметиков при воздействии ДНК-повреждающего агента цисплатина.

НАУЧНАЯ НОВИЗНА РАБОТЫ

В результате проведенных исследований был описан принципиально новый способ регуляции уровня антиапоптотического белка Мс1-1 в опухолевых клетках. В частности, продемонстрировано снижение уровня мРНК Мс1-1 при культивировании клеток в бессывороточной среде. Показана эффективность комбинирования ДНК-повреждающего агента цисплатина с непрямым воздействием на белок Мс1-1. В процессе работы обнаружено не описанное ранее стабилизирующее действие ингибиторов аутофагии на уровень белка Мс1-1. Также была оценена эффективность действия инновационных антагонистов Мс1-1 на индукцию клеточной гибели как в качестве одиночных агентов, так и в комбинации с цисплатином. Показано, что для увеличения эффективности антагонистов Мс1-1 необходимо разрушение ими высокоаффинных комплексов Мс1-1/Вак.

Наконец, продемонстрирована эффективность комбинирования цисплатина и антагониста Mcl-1 S63845 для преодоления устойчивости опухолевых клеток к агенту S63845.

ПРАКТИЧЕСКАЯ ЗНАЧИМОСТЬ ИССЛЕДОВАНИЯ

Полученные в рамках работы результаты расширяют понимание способов регуляции антиапоптотического белка Mcl-1, являющегося перспективной мишенью противоопухолевой терапии. Помимо этого, данные настоящего исследования помогут оценить перспективы и риски использования прямых антагонистов Mcl-1 в клинической практике для лечения злокачественных заболеваний.

Данные, полученные в ходе выполнения настоящего исследования, были включены в педагогические программы на факультете фундаментальной медицины МГУ им. М.В. Ломоносова, войдя в курсы лекций «Токсикология» и «Программируемая гибель клеток в медицине», а также в практический курс "Молекулярное программирование клеток человека" для слушателей образовательного центра "Сириус" (Сочи, июль 2017 г.).

АПРОБАЦИЯ РАБОТЫ

Материалы настоящей работы были представлены на 24-ой, 25-ой и 26ой ежегодных конференциях Европейской организации по исследованию клеточной гибели (ECDO, European Cell Death Organization), прошедших, соответственно, в Барселоне (Испания, 27-30 сентября 2016 г.), Лёвене (Бельгия, 27-29 сентября 2017 г.) и Санкт-Петербурге (Россия, 10-12 октября 2018 г.), на международной конференции "XII чтения памяти академика Ю. А. Овчинникова" VIII Российский симпозиум "Белки и пептиды" в Москве (Россия, 18-22 сентября 2017 г.), а также на III Национальном конгрессе по регенеративной медицине в Москве (15-18 ноября 2017 г.). Результаты данной работы были представлены в виде статьи в высокорейтинговом

международном журнале. Полученные в настоящем исследовании выводы были обсуждены в двух обзорных статьях, опубликованных в российском и международном журналах. Апробация работы была проведена на совместном заседании кафедры биохимии и молекулярной медицины, НИЛ генных и клеточных технологий, НИЛ постгеномных технологий в медицине, НИЛ исследования механизмов апоптоза 5 июля 2018 г., протокол №1/7, а также на заседании научно-исследовательского института физико-химической биологии имени А.Н. Белозерского МГУ им. М.В.Ломоносова 4 октября 2018 г., протокол №406.

ПОЛОЖЕНИЯ, ВЫНОСИМЫЕ НА ЗАЩИТУ

1. Депривация сыворотки ведет к усилению гибели опухолевых клеток, индуцируемой ДНК-повреждающим агентом цисплатином.

2. Усиление клеточной гибели при комбинаторном воздействии цисплатина и депривации сыворотки происходит за счет снижения уровня антиапоптотического белка Мс1-1.

3. В основе снижения уровня Мс1-1 при комбинаторном воздействии депривации сыворотки и ДНК-повреждающего агента цисплатина лежит деградация белка Мс1-1 в условиях ингибирования его синтеза.

4. Ингибирование аутофагии ведет к стабилизации белка Мс1-1 в опухолевых клеточных линиях.

5. Селективный антагонист Мс1-1 S63845, в сравнении с антагонистом А1210477, проявляет большую проапоптотическую активность за счет разрушения комплексов Мс1-1/Вак.

6. Комбинаторное действие S63845 и цисплатина ведет к эффективной индукции апоптоза в клетках НеЬа, характеризующихся повышенной устойчивостью к S63845 в качестве индивидуального противоопухолевого агента.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Концепция программируемой клеточной гибели

Разрозненные исследования, посвященные проблеме гибели клеток, периодически появлялись в печати с середины XIX века. Однако детальное изучение данной тематики началось лишь с середины прошлого столетия. Так, Альфред Глюксманн в 1951 г. впервые описал гибель клеток в процессе онтогенеза [5]. Принципиально важным событием стало появление гипотезы, согласно которой в результате активации специальной молекулярно-биологической программы могут погибать жизнеспособные клетки, выполнившие свои функции в организме [6]. В 1972 г. для описания особой формы гибели клеток, имеющей важное биологическое значение, был предложен термин «апоптоз» [7].

С тех пор накоплено множество экспериментальных данных как об апоптозе, так и о других типах ПКГ. На сегодняшний день, согласно рекомендациям Номенклатурного Комитета по изучению гибели клеток, описано более 10 типов ПКГ, включая апоптоз, аутофагию, некроптоз, пироптоз, ферроптоз и другие [8].

Все типы ПКГ играют важную роль в нормальном развитии и функционировании организма. Так, процессы ПКГ необходимы для формирования тканей и органов в ходе эмбриогенеза [9], пироптоз отвечает за защиту организма от патогенов [10], а в основе позитивной и негативной селекции ^лимфоцитов лежит запуск апоптотической гибели [11]. Одной из ключевых функций ПКГ является противоопухолевая защита организма, заключающаяся в элиминировании клеток с поврежденным генетическим материалом. В настоящее время перспективной стратегией противоопухолевой терапии является запуск в опухолевых клетках механизмов ПКГ, например, ферроптоза [12], аутофагии [13], некроптоза [14], а индукция апоптоза в быстро делящихся клетках является основным

механизмом действия различных терапевтических препаратов, включая ДНК-повреждающие агенты [15].

1.2. Апоптоз

Наиболее изученным процессом ПКГ на сегодняшний день, бесспорно, является апоптоз - эволюционно-консервативный физиологический процесс, в ходе которого наблюдается уменьшение размера клетки с последующей ее фрагментацией. Образующиеся фрагменты, так называемые апоптотические тельца, в дальнейшем поглощаются и утилизируются макрофагами либо другими соседними клетками [7,16]. Распознаванию апоптотических телец способствует экспонирование на их поверхности фосфатидилсерина, который в норме находится на внутренней поверхности клеточной мембраны [17]. Таким образом, отличительной характеристикой апоптоза по сравнению с некротической гибелью является полное поглощение фрагментов гибнущих клеток и, как следствие, отсутствие воспалительного ответа. В то же время в некоторых случаях апоптоз сопровождается иммуногенным ответом, например, при действии антрациклинов [18].

Одними из основных ферментов, обеспечивающих запуск и протекание процесса апоптоза в клетке, являются цистеиновые протеазы, каспазы, расщепляющие субстраты по остатку аспартата. Традиционно каспазы разделяют на две функциональные группы: каспазы, вовлеченные в регуляцию иммунного ответа (каспазы-1, -4, -5, -11), и каспазы, принимающие участие в реализации процесса апоптоза. Последние подразделяют на инициаторные (-2, -8, -9, -10) и эффекторные (-3, -6, -7) каспазы. Каспаза-14 стоит особняком, принимая участие в регуляции созревания кератиноцитов [19]. Инициаторные и эффекторные каспазы принимают участие в соответствующих стадиях апоптоза. Помимо инициаторной и эффекторной выделяют также деградационную стадию апоптоза.

1.2.1. Инициаторная фаза

В настоящее время наиболее детально описаны два пути запуска апоптоза: рецептор-зависимый (внешний) и митохондриальный (внутренний) [20], (Рис. 1).

В ответ на повреждения ДНК, нарушения работы митохондрий, чрезмерную продукцию активных форм кислорода (АФК) и другие стрессовые стимулы наблюдается запуск внутреннего пути апоптоза. Важными регуляторами данного пути являются белки семейства Bcl-2, насчитывающего более 25 представителей. Основной функцией данных белков является регуляция апоптотического ответа клеток. При этом семейство Bcl-2 представлено как проапоптотическими (например, Bim, Bak и Noxa), так и антиапоптотическими (например, Bcl-2, Bcl-xL и Mcl-1) членами [21]. Антиапоптотические члены семейства Bcl-2 препятствуют действию проапоптотических, которые, в свою очередь, в том или ином виде отвечают за пермеабилизацию внешней митохондриальной мембраны (ПВММ) [22]. Данный процесс ведет к выходу в цитоплазму белков межмембранного пространства митохондрий, способствующих протеканию процесса апоптоза: цитохрома C, SMAC/Diablo (second mitochondria-derived activator of caspases/direct IAP binding protein with low pI), эндонуклеазы G, флавопротеина AIF (apoptosis inducing factor). Цитохром С - важный компонент дыхательной цепи. В цитоплазме цитохром C является одним из компонентов высокомолекулярного комплекса активации инициаторной каспазы-9 - апоптосомы. Как следствие, каспаза-9 активирует каспазы-3 и -7, что способствует вхождению клетки в эффекторную фазу апоптоза [23-25].

Рис. 1. Общая схема апоптоза (модифицировано из [26])

Рецептор-зависимый путь инициации апоптоза индуцируется при взаимодействии «рецепторов смерти», находящихся на поверхности цитоплазматической мембраны, с соответствующими лигандами (Рис. 1). В качестве примера такого взаимодействия можно привести связывание рецептора Fas с лигандом FasL [27]. Как следствие, в цитоплазматической части рецептора происходит конформационный переход, обеспечивающий

19

возможность связывания адаптерного белка. Так, с рецептором Fas взаимодействует FADD - Fas-Associated protein with Death Domain. Связывание рецептора с адаптером осуществляется за счет гомотипического взаимодействия между «доменами смерти» (ДС, Death Domain). Наконец, с образующимся мультимолекулярным комплексом связываются инициаторные каспазы-8 и -10, что приводит к их активации (Рис. 1). Данное взаимодействие осуществляется за счет гомотипического связывания «доменов эффектора смерти» (ДЭС, Death Effector Domain), присутствующих как в адаптерных молекулах, так и в инициаторных каспазах-8 и -10 [27]. Описанный белковый комплекс получил название DISC (death-inducing signaling complex) [28]. Основными субстратами каспазы-8 являются каспаза-3 и белок Bid, являющийся проапоптотическим членом семейства Bcl-2 (Рис. 1). Процессинг каспазы-3 напрямую ведет к ее активации, тогда как ограниченный протеолиз Bid приводит к образованию укороченной формы tBid, принимающей участие в ПВММ [29].

Разные клетки отличаются по механизму активации эффекторных каспаз в ответ на стимуляцию рецепторов смерти. В клетках I типа (например, лимфоцитах) активация эффекторной каспазы-3 происходит независимо от расщепления белка Bid каспазой-8 (Рис. 1). Это связано, в частности, с высоким уровнем образования комплекса DISC и, соотвественно, активной каспазы-8, которая непосредственно приводит к активации эффекторной каспазы-3. В клетках II типа (например, гепатоцитах) образуется значительно меньшее количество комплекса DISC и активной каспазы-8 и, таким образом, для дальнейшего протекания апоптоза необходим каспаза-8-опосредованный протеолиз Bid и последующая ПВММ [30]. Важной отличительной особенностью клеток II типа также является повышенный уровень в них белка xIAP (X-chromosome linked inhibitor of apoptosis protein -ассоциированный с X-хромосомой ингибитор апоптотических белков). Данный белок является негативным регулятором каспаз, в частности каспаз-

3, -7, -9. Низкий уровень активной каспазы-8 в клетках II типа не может активировать достаточное количество каспазы-3, если уровень белка xIAP в клетке достаточно высок. Однако при индукции расщепления Bid и последующей ПВММ высвобождающийся в цитоплазму белок SMAC/Diablo инактивирует xIAP и, следовательно, ведет к активации каспаз и эффективному запуску апоптоза в клетках II типа [31].

Помимо описанных путей запуска апоптоза существуют и другие механизмы. Так, цитотоксические Т-лимфоциты, помимо стимуляции Fas-рецептора зараженной клетки, способны убивать ее, вводя внутрь через специфические каналы, образуемые белком перфорином, смесь сериновых протеаз - гранзимов (Рис. 1). Гранзим B активирует каспазу-3, вследствие чего запускается каспазный каскад [32]. Инициация апоптоза также возможна при высвобождении лизосомальных протеаз - катепсинов. Они расщепляют регуляторные белки и активируют проапоптотические факторы, что приводит к вхождению клетки в эффекторную фазу апоптоза [33].

1.2.2. Эффекторная фаза

В результате появления в клетке активных инициаторных каспаз происходит запуск эффекторов апоптоза - каспаз-3 и -7 (Рис. 1). Основная функция эффекторных каспаз заключается в прямом и опосредованном разрушении клеточных структур, что приводит к протеолизу белков ядерной ламины, цитоскелета и белков, регулирующих клеточную адгезию [34]. Также расщепляются белки, препятствующие апоптозу (Рис. 1). Например, протеолизу подвергается белок ICAD (inhibitor of caspase-activated DNase), препятствующий активации белка CAD (caspase-activated DNase). Последний, в свою очередь, отвечает за фрагментацию ДНК в ядре [35].

Существуют и каспаза-независимые эффекторы апоптоза, такие как флавопротеин AIF (Рис. 1). AIF высвобождается из межмембранного пространства митохондрий вместе с другими проапоптотическими белками

(Рис. 1). Далее АШ транслоцируется в ядро и принимает участие в регуляции конденсации хроматина и активации эндонуклеаз, участвующих в фрагментации ДНК [36].

1.2.3. Деградационная фаза

В результате развития апоптоза, независимо от стимула, запустившего процесс, наблюдается фрагментация клетки на отдельные апоптотические тельца. В процессе деградации происходят реорганизация молекул адгезии, деполимеризация микротрубочек, разрушение ядерной ламины. Актиновые микрофиламенты формируют кортикальные пучки, и клетка приобретает округлую форму. Сокращения кортикальных пучков приводят к образованию пузырей на поверхности клетки [37]. Как следствие, формируются апоптотические тельца, которые впоследствии узнаются и поглощаются макрофагами либо другими клетками [17], (при написании раздела использованы материалы статьи автора диссертации [38]).

1.3. Аутофагия

Аутофагия - высококонсервативный процесс катаболизма различных клеточных компонентов в аутолизосомах - представляет собой не только один из типов ПКГ, но также и важный адаптационный механизм. Так, в процессе аутофагии происходит утилизация поврежденных органелл и белков. Важную роль аутофагия играет в адаптации к условиям ограничения питательных веществ (ОПВ) за счет обеспечения клеток энергетическими субстратами [39]. Как следствие, умеренный уровень аутофагии сопровождается повышением устойчивости клеток к различным стрессовым воздействиям. В то же время преобладание деградационных процессов в ходе аутофагии может приводить к гибели клеток.

В зависимости от механизмов доставки компонентов клеток к

лизосомам различают несколько типов аутофагии, такие как шаперон-

зависимую аутофагию, микроаутофагию и макроаутофагию. Последняя

22

является наиболее изученным типом аутофагии на сегодняшний день. Далее термин «аутофагия» будет использоваться для обозначения макроаутофагии.

1.3.1. Механизмы аутофагии

Ключевыми регуляторами аутофагии являются белки семейства ATG, кодируемые соответствующими генами (autophagy related genes - гены, связанные с аутофагией). При индукции аутофагии данные белки принимают участие в формировании фагофоров - двумембранных структур, которые изолируют цитоплазматические компоненты, подлежащие аутофагии. У млекопитающих образование фагофоров происходит в местах контакта митохондрий и ЭПР [40]. Постепенный рост фагофоров ведет к образованию сферических структур - аутофагосом. Большинство белков семейства ATG диссоциирует от аутофагосом, после чего последние сливаются с лизосомами. Доставка содержимого в лизосомы с помощью аутофагосом является отличительной особенностью макроаутофагии [41].

Белки семейства ATG формируют в процессе образования, роста и созревания фагофора различные функциональные комплексы (Рис. 2). Комплекс Ulkl включает одноименный белок, а также белки FIP200, Atg13, и Atg101 и принимает участие в фосфорилировании различных белков-мишеней на поверхности созревающего фагофора, что необходимо для его роста [42]. Регуляция взаимодействия между Ulkl и Atg13 является одним из механизмов контроля запуска аутофагии, например, в условиях ОПВ.

Транслокация к фагофору ряда белков, принимающих участие в его созревании, происходит за счет их взаимодействия с фосфатидилинозитол-3-фосфатом (ФИ3Ф) в мембране [43]. За образование ФИ3Ф отвечает белковый комплекс фосфатидилинозитол-3-киназа класса III (Class III PI3K), в состав которого входят Vps15, Vps34, Beclin-1 и Atg14L (Barkor) [44-46].

Важную роль в росте и созревании фагофора играют два белковых комплекса, принцип действия которых близок к убиквитин-конъюгирующим системам (Рис. 2). В состав первого из них входят Atg5, Atg7, Atg10 и Atg12. В результате действия данного комплекса происходит конъюгация Atg12 и Atg5 [47]. Далее гетеродимер Atg5-Atg12 взаимодействует с белком Atg16L. Образующийся комплекс Atg5-Atg12-Atg16L имеет ключевое значение во второй системе, подобной убиквитин-конъюгирующей [48,49]. В частности, данный комплекс осуществляет конъюгацию белка LC3 (Atg8) с фосфатидилэтаноламином мембраны формирующегося фагофора. Преобразование нелипидированной формы LC3 (LC3I) в липидированную (LC3II) ведет к накоплению данного белка в мембране фагофора, что способствует созреванию последнего. По соотношению липидированной и нелипидированной форм LC3 можно судить об интенсивности протекания процессов аутофагии в клетке [50].

Итогом аутофагии является слияние аутофагосом с лизосомами. Данный процесс обеспечивается белками группы SNARE: STX17 и SNAP29 на поверхности аутофагосом и VAMP8 на поверхности лизосом [51,52]. В результате образуются аутофаголизосомы, где поглощенные компоненты деградируют под действием протеаз [41], (Рис. 2).

Рис. 2. Общая схема аутофагии (модифицировано из [53])

1.3.2. Контроль запуска аутофагии

Фосфорилирование участников начальных этапов аутофагии, Ulkl и Atg13, является одним из основных механизмов контроля инициации данного процесса. В частности, фосфорилирование белка Atg13 посредством mTORC1 (mammalian TOR complex1 - комплекс 1 TOR млекопитающих; TOR, target of rapamycin - мишень действия рапамицина) предотвращает взаимодействие между Atg13 и Ulkl [54]. Также mTORCl препятствует аутофагии за счет фосфорилирования Ulkl, в то время как фосфорилирование Ulkl белком AMPK (AMP-activated protein kinase - АМФ-зависимой киназой) ведет к запуску аутофагии [55].

AMPK является сенсором энергетического состояния клетки. В частности, активация AMPK наблюдается в ответ на повышение уровня АМФ. Помимо Ulkl, субстратами данной киназы являются TSC2 и raptor,

фосфорилирование которых ведет к ингибированию mTORC1 [56]. шТОКС1 активируется в ответ на стимуляцию различных пролиферативных каскадов, в том числе на стимуляцию клеток факторами роста (например, EGF, IGF-1) [57]. В целом активация mTORC1 препятствует аутофагии, стимулирует синтез белков и деление клеток, в то время как активация АМРК ведет к противоположным эффектам (при написании раздела использованы материалы статьи автора диссертации [38]).

1.4. Семейство Вс1-2

В 1978 году у пациентов с фолликулярной лимфомой была описана хромосомная аберрация - транслокация 1:(14;18) ^32; д21) [58]. Предполагаемый онкоген, расположенный в локусе 18q21, в 1984 году получил название БСЬ2 - В-се11 1еикеш1а/1ушрЬоша-2 (В-клеточная лейкемия/лимфома-2) [59]. В 1987 было показано, что белковый продукт данного гена способствует выживанию клеток, но не ускоренной пролиферации [60], что было подтверждено в дальнейших исследованиях [61,62]. В 1993 году были клонированы гены МСЬ1 [63], А1 [64], БСЬХ [65] и БАХ [66], обладающие существенной степенью гомологии с БСЬ2. В исходной работе, описывающей БСЬХ, было показано два белковых продукта данного гена, Вс1-хЬ и Вс1-хБ, обладающие, соответственно, анти- и проапоптотической активностью [65]. Для белка Вах было показано взаимодействие с Вс1-2, а оверэкспрессия Вах вызывала апоптоз [66]. Эти данные указывали на существование целого семейства Вс1-2-подобных белков, которое было названо в честь первого описанного представителя. Стало очевидно, что одной из основных функций белков семейства Вс1-2 является контроль клеточной гибели. Более того, имеющиеся данные указывали на то, что некоторые члены данного семейства препятствуют клеточной гибели, в то время как другие, напротив, способствуют ей. Наконец, можно было предположить, что в основе анти- или

проапоптотической активности белков семейства Bcl-2 лежат взаимодействия друг с другом.

1.4.1. Структура и классификация белков Bcl-2 семейства

Как сказано выше, на сегодняшний день известно более 30 белков семейства Bcl-2 и ассоциированных с ним членов. Все представители данного семейства содержат один или несколько так называемых BH-доменов (Bcl-2 homology domains - Bcl-2 подобный домен). В зависимости от числа BH-доменов в структуре, представители семейства Bcl-2 могут быть разделены на две группы: белки, включающие только Bffi-домен (BH3-only белки), и мультидоменные белки. В то время как группа BH3-only белков включает лишь проапоптотических представителей (Bid, Bim, Bad, Puma, Noxa и др.), в группу мультидоменных белков входят как про- (Bak, Bax), так и антиапоптотические (Bcl-2, Bcl-xL, Bcl-w, Mcl-1, A1) члены. Также необходимо отметить, что механизм альтернативного сплайсинга обеспечивает появление мРНК, кодирующих белки с противоположными функциями. Например, как упоминалось ранее, длинная изоформа белка Bcl-x, Bcl-xL, обладает антиапоптотическими функциями, в то время как короткая изоформа данного белка, Bcl-xS, является проапоптотическим белком [67].

Похожие диссертационные работы по специальности «Биоинженерия», 03.01.08 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Биоинженерия», Сеничкин, Вячеслав Витальевич

ГЛАВА 5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В рамках данной работы изучены способы как прямой (при помощи специфических BH3-миметиков и РНК интерференции), так и непрямой (ограничение питательных веществ и ростовых факторов) регуляции Mcl-1. Было показано, что при культивировании клеток в бессывороточной среде наблюдается подавление синтеза Mcl-1 на транскрипционном уровне, что ведет к ускорению его деградации и последующему усилению процесса апоптоза. При этом данный эффект зависит от базального уровня Mcl-1 в клетках. Эти данные создают предпосылки для разработки новых подходов к непрямому воздействию на Mcl-1 в комбинированной терапии опухолевых заболеваний. Также была оценена эффективность двух BH3-миметиков к Mcl-1. Полученные результаты свидетельствуют о различной эффективности антагонистов Mcl-1 при наличии их взаимодействия с мишенью. Так, BH3-миметик S63845 ведет к эффективной нейтрализации Mcl-1, проявляя эффект, сопоставимый с нокдауном ЫСЬ1. В то же время другой BH3-миметик, A1210477, проявляет меньшую проапоптотическую активность в сравнении с методом РНК интерференции, а повышение доз данного вещества ограничено его взаимодействиями с другими белками семейства Bcl-2. В рамках данной работы было показано, что ограниченная эффективность А1210477 является следствием неполного разрушения комплексов Mcl-1 с проапоптотическим белком семейства Bcl-2 - Bak. Наконец, показана эффективность использования цисплатина в комбинации с BH3-миметиками, в том числе и для преодоления устойчивости к данным препаратам. Теоретически подобная комбинация может быть рассмотрена для потенциального использования в клинической практике. Учитывая значимость Mcl-1 в регуляции процесса ПКГ, полученные в настоящей работе результаты могут внести свой вклад в развитие подходов противоопухолевой терапии.

ВЫВОДЫ

1. Результатом комбинаторного действия депривации сыворотки и цисплатина является ускорение деградации Mcl-1.

2. Снижение уровня Mcl-1 при действии цисплатина в бессывороточной среде является основным механизмом повышения чувствительности опухолевых клеток к цисплатин-индуцированному апоптозу.

3. Депривация сыворотки ведет к снижению уровня мРНК Mcl-1 независимо от действия цисплатина.

4. Ингибирование аутофагии ведет к стабилизации Mcl-1 в клетках HeLa в условиях комбинаторного действия цисплатина и SD.

5. Для повышения проапоптотической активности ВЮ-миметиков необходимо разрушение высокоаффинных комплексов с белком Bak.

6. Комбинация цисплатина и S63845 ведет к преодолению устойчивости опухолевых клеток к ВН3-миметику S63845.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Сеничкин, Вячеслав Витальевич, 2018 год

СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Ferlay J. et al. Cancer incidence and mortality worldwide: Sources, methods and major patterns in GLOBOCAN 2012 // Int. J. Cancer. 2015. Vol. 136, № 5. P. E359-E386.

2. WHO | Cancer // WHO. World Health Organization, 2018.

3. Hanahan D., Weinberg R.A. Hallmarks of Cancer: The Next Generation // Cell. 2011. Vol. 144, № 5. P. 646-674.

4. Oltersdorf T. et al. An inhibitor of Bcl-2 family proteins induces regression of solid tumours // Nature. 2005. Vol. 435, № 7042. P. 677-681.

5. GLUCKSMANN A. Cell deaths in normal vertebrate ontogeny. // Biol. Rev. Camb. Philos. Soc. 1951. Vol. 26, № 1. P. 59-86.

6. Lockshin R.A., Williams C.M. Programmed cell death—II. Endocrine potentiation of the breakdown of the intersegmental muscles of silkmoths // J. Insect Physiol. 1964. Vol. 10, № 4. P. 643-649.

7. Kerr J.F., Wyllie A.H., Currie A.R. Apoptosis: a basic biological phenomenon with wide-ranging implications in tissue kinetics. // Br. J. Cancer. 1972. Vol. 26, № 4. P. 239-257.

8. Galluzzi L. et al. Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018 // Cell Death Differ. 2018. Vol. 25, № 3. P. 486-541.

9. Fuchs Y., Steller H. Programmed cell death in animal development and disease. // Cell. NIH Public Access, 2011. Vol. 147, № 4. P. 742-758.

10. Berghe T. Vanden et al. Regulated necrosis: the expanding network of non-apoptotic cell death pathways // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2014. Vol. 15, № 2. P. 135-147.

11. Surh C.D., Sprent J. T-cell apoptosis detected in situ during positive and negative selection in the thymus // Nature. 1994. Vol. 372, № 6501. P. 100103.

12. Lachaier E. et al. Sorafenib induces ferroptosis in human cancer cell lines originating from different solid tumors. // Anticancer Res. 2014. Vol. 34, № 11. P. 6417-6422.

13. Sui X. et al. Autophagy and chemotherapy resistance: a promising therapeutic target for cancer treatment // Cell Death Dis. 2013. Vol. 4, № 10. P. e838-e838.

14. Su Z. et al. Cancer therapy in the necroptosis era. // Cell Death Differ. Nature Publishing Group, 2016. Vol. 23, № 5. P. 748-756.

15. Makin G., Hickman J.A. Apoptosis and cancer chemotherapy. // Cell Tissue Res. 2000. Vol. 301, № 1. P. 143-152.

16. Taylor R.C., Cullen S.P., Martin S.J. Apoptosis: controlled demolition at the cellular level // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2008. Vol. 9, № 3. P. 231-241.

17. Fadok V.A. et al. The role of phosphatidylserine in recognition of apoptotic cells by phagocytes. // Cell Death Differ. 1998. Vol. 5, № 7. P. 551-562.

18. Obeid M. et al. Calreticulin exposure dictates the immunogenicity of cancer cell death. // Nat. Med. 2007. Vol. 13, № 1. P. 54-61.

19. Denecker G. et al. Caspase-14 reveals its secrets. // J. Cell Biol. The Rockefeller University Press, 2008. Vol. 180, № 3. P. 451-458.

20. Elmore S. Apoptosis: a review of programmed cell death. // Toxicol. Pathol. NIH Public Access, 2007. Vol. 35, № 4. P. 495-516.

21. Youle R.J., Strasser A. The BCL-2 protein family: opposing activities that mediate cell death // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. Nature Publishing Group,

2008. Vol. 9, № 1. P. 47-59.

22. Czabotar P.E. et al. Control of apoptosis by the BCL-2 protein family: implications for physiology and therapy // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2013. Vol. 15, № 1. P. 49-63.

23. Zou H. et al. Apaf-1, a human protein homologous to C. elegans CED-4, participates in cytochrome c-dependent activation of caspase-3. // Cell. 1997. Vol. 90, № 3. P. 405-413.

24. Li P. et al. Cytochrome c and dATP-dependent formation of Apaf-1/caspase-9 complex initiates an apoptotic protease cascade. // Cell. 1997. Vol. 91, № 4. p. 479-489.

25. Twiddy D. et al. Caspase-7 Is Directly Activated by the 700-kDa Apoptosome Complex and Is Released as a Stable XIAP-Caspase-7 200-kDa Complex // J. Biol. Chem. 2006. Vol. 281, № 7. P. 3876-3888.

26. Maiuri M.C. et al. Self-eating and self-killing: crosstalk between autophagy and apoptosis. // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2007. Vol. 8, № 9. P. 741-752.

27. Lavrik I.N., Krammer P.H. Regulation of CD95/Fas signaling at the DISC. // Cell Death Differ. 2012. Vol. 19, № 1. P. 36-41.

28. Kischkel F.C. et al. Cytotoxicity-dependent APO-1 (Fas/CD95)-associated proteins form a death-inducing signaling complex (DISC) with the receptor. // EMBO J. 1995. Vol. 14, № 22. P. 5579-5588.

29. Li H. et al. Cleavage of BID by caspase 8 mediates the mitochondrial damage in the Fas pathway of apoptosis. // Cell. 1998. Vol. 94, № 4. P. 491501.

30. Ozören N., El-Deiry W.S. Defining characteristics of Types I and II apoptotic cells in response to TRAIL. // Neoplasia. Vol. 4, № 6. P. 551-557.

31. Jost P.J. et al. XIAP discriminates between type I and type II FAS-induced apoptosis. // Nature. 2009. Vol. 460, № 7258. P. 1035-1039.

32. Goping I.S. et al. Granzyme B-induced apoptosis requires both direct caspase activation and relief of caspase inhibition. // Immunity. 2003. Vol. 18, № 3. P. 355-365.

33. Guicciardi M.E. et al. Cathepsin B contributes to TNF-a-mediated hepatocyte apoptosis by promoting mitochondrial release of cytochrome c // J. Clin. Invest. 2000. Vol. 106, № 9. P. 1127-1137.

34. Degterev A., Boyce M., Yuan J. A decade of caspases. // Oncogene. 2003. Vol. 22, № 53. P. 8543-8567.

35. Wolf B.B. et al. Caspase-3 is the primary activator of apoptotic DNA fragmentation via DNA fragmentation factor-45/inhibitor of caspase-activated DNase inactivation. // J. Biol. Chem. 1999. Vol. 274, № 43. P. 30651-30656.

36. Susin S.A. et al. Molecular characterization of mitochondrial apoptosis-inducing factor // Nature. 1999. Vol. 397, № 6718. P. 441-446.

37. Saraste A., Pulkki K. Morphologic and biochemical hallmarks of apoptosis. // Cardiovasc. Res. 2000. Vol. 45, № 3. P. 528-537.

38. Сеничкин В.В. et al. Ограничение питательных веществ как подход к комбинированной терапии опухолей // Молекулярная биология. 2016. Vol. 50, № 3. P. 416-434.

39. Mizushima N. Autophagy: process and function. // Genes Dev. 2007. Vol. 21, № 22. P. 2861-2873.

40. Hamasaki M. et al. Autophagosomes form at ER-mitochondria contact sites // Nature. 2013. Vol. 495, № 7441. P. 389-393.

41. Glick D., Barth S., Macleod K.F. Autophagy: cellular and molecular mechanisms. // J. Pathol. NIH Public Access, 2010. Vol. 221, № 1. P. 3-12.

42. Abounit K., Scarabelli T.M., McCauley R.B. Autophagy in mammalian cells. // World J. Biol. Chem. 2012. Vol. 3, № 1. P. 1-6.

43. Burman C., Ktistakis N.T. Regulation of autophagy by phosphatidylinositol 3-phosphate. // FEBS Lett. Elsevier, 2010. Vol. 584, № 7. P. 1302-1312.

44. Kihara A. et al. Two distinct Vps34 phosphatidylinositol 3-kinase complexes function in autophagy and carboxypeptidase Y sorting in Saccharomyces cerevisiae. // J. Cell Biol. 2001. Vol. 152, № 3. P. 519-530.

45. Kihara A. et al. Beclin-phosphatidylinositol 3-kinase complex functions at the trans-Golgi network. // EMBO Rep. 2001. Vol. 2, № 4. P. 330-335.

46. Sun Q. et al. Identification of Barkor as a mammalian autophagy-specific factor for Beclin 1 and class III phosphatidylinositol 3-kinase. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008. Vol. 105, № 49. P. 19211-19216.

47. Mizushima N. et al. A protein conjugation system essential for autophagy. // Nature. 1998. Vol. 395, № 6700. P. 395-398.

48. Hanada T. et al. The Atg12-Atg5 conjugate has a novel E3-like activity for protein lipidation in autophagy. // J. Biol. Chem. 2007. Vol. 282, № 52. P. 37298-37302.

49. Ichimura Y. et al. A ubiquitin-like system mediates protein lipidation. // Nature. 2000. Vol. 408, № 6811. P. 488-492.

50. Tanida I., Ueno T., Kominami E. LC3 and Autophagy. // Methods Mol. Biol. 2008. Vol. 445. P. 77-88.

51. Itakura E., Kishi-Itakura C., Mizushima N. The Hairpin-type Tail-Anchored SNARE Syntaxin 17 Targets to Autophagosomes for Fusion with

Endosomes/Lysosomes // Cell. 2012. Vol. 151, № 6. P. 1256-1269.

52. Dickens L.S. et al. The "complexities" of life and death: death receptor signalling platforms. // Exp. Cell Res. 2012. Vol. 318, № 11. P. 1269-1277.

53. Dikic I., Elazar Z. Mechanism and medical implications of mammalian autophagy // Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2018. Vol. 19, № 6. P. 349-364.

54. Kamada Y. et al. Tor-mediated induction of autophagy via an Apgl protein kinase complex. // J. Cell Biol. 2000. Vol. 150, № 6. P. 1507-1513.

55. Kim J. et al. AMPK and mTOR regulate autophagy through direct phosphorylation of Ulk1. // Nat. Cell Biol. Nature Publishing Group, a division of Macmillan Publishers Limited. All Rights Reserved., 2011. Vol. 13, № 2. P. 132-141.

56. Shaw R.J. LKB1 and AMP-activated protein kinase control of mTOR signalling and growth. // Acta Physiol. (Oxf). 2009. Vol. 196, № 1. P. 65-80.

57. Saxton R.A., Sabatini D.M. mTOR Signaling in Growth, Metabolism, and Disease // Cell. 2017. Vol. 168, № 6. P. 960-976.

58. Fukuhara S., Rowley J.D. Chromosome 14 translocations in non-Burkitt lymphomas. // Int. J. cancer. 1978. Vol. 22, № 1. P. 14-21.

59. Pegoraro L. et al. A 14;18 and an 8;14 chromosome translocation in a cell line derived from an acute B-cell leukemia. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1984. Vol. 81, № 22. P. 7166-7170.

60. Vaux D.L., Cory S., Adams J.M. Bcl-2 gene promotes haemopoietic cell survival and cooperates with c-myc to immortalize pre-B cells // Nature. 1988. Vol. 335, № 6189. P. 440-442.

61. McDonnell T.J. et al. bcl-2-immunoglobulin transgenic mice demonstrate extended B cell survival and follicular lymphoproliferation. // Cell. 1989.

Vol. 57, № 1. P. 79-88.

62. Hockenbery D. et al. Bcl-2 is an inner mitochondrial membrane protein that blocks programmed cell death // Nature. 1990. Vol. 348, № 6299. P. 334336.

63. Kozopas K.M. et al. MCL1, a gene expressed in programmed myeloid cell differentiation, has sequence similarity to BCL2. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1993. Vol. 90, № 8. P. 3516-3520.

64. Lin E.Y. et al. Characterization of A1, a novel hemopoietic-specific early-response gene with sequence similarity to bcl-2. // J. Immunol. 1993. Vol. 151, № 4. P. 1979-1988.

65. Boise L.H. et al. bcl-x, a bcl-2-related gene that functions as a dominant regulator of apoptotic cell death. // Cell. 1993. Vol. 74, № 4. P. 597-608.

66. Oltvai Z.N., Milliman C.L., Korsmeyer S.J. Bcl-2 heterodimerizes in vivo with a conserved homolog, Bax, that accelerates programmed cell death. // Cell. 1993. Vol. 74, № 4. P. 609-619.

67. Chang B.S. et al. The BH3 domain of Bcl-x(S) is required for inhibition of the antiapoptotic function of Bcl-x(L). // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 1999. Vol. 19, № 10. P. 6673-6681.

68. Petros A.M., Olejniczak E.T., Fesik S.W. Structural biology of the Bcl-2 family of proteins // Biochim. Biophys. Acta - Mol. Cell Res. Elsevier, 2004. Vol. 1644, № 2-3. P. 83-94.

69. Dewson G. et al. To Trigger Apoptosis, Bak Exposes Its BH3 Domain and Homodimerizes via BH3:Groove Interactions // Mol. Cell. 2008. Vol. 30, № 3. P. 369-380.

70. Hinds M.G. et al. Bim, Bad and Bmf: intrinsically unstructured BH3-only

proteins that undergo a localized conformational change upon binding to

132

prosurvival Bcl-2 targets // Cell Death Differ. 2007. Vol. 14, № 1. P. 128136.

71. Chou J.J. et al. Solution structure of BID, an intracellular amplifier of apoptotic signaling. // Cell. 1999. Vol. 96, № 5. P. 615-624.

72. McDonnell J.M. et al. Solution structure of the proapoptotic molecule BID: a structural basis for apoptotic agonists and antagonists. // Cell. 1999. Vol. 96, № 5. P. 625-634.

73. Wolter K.G. et al. Movement of Bax from the cytosol to mitochondria during apoptosis. // J. Cell Biol. 1997. Vol. 139, № 5. P. 1281-1292.

74. Griffiths G.J. et al. Cell damage-induced conformational changes of the proapoptotic protein Bak in vivo precede the onset of apoptosis. // J. Cell Biol. The Rockefeller University Press, 1999. Vol. 144, № 5. P. 903-914.

75. Wei M.C. et al. tBID, a membrane-targeted death ligand, oligomerizes BAK to release cytochrome c. // Genes Dev. 2000. Vol. 14, № 16. P. 2060-2071.

76. Mandal T. et al. Assembly of Bak homodimers into higher order homooligomers in the mitochondrial apoptotic pore. // Sci. Rep. Nature Publishing Group, 2016. Vol. 6. P. 30763.

77. Willis S.N. et al. Proapoptotic Bak is sequestered by Mcl-1 and Bcl-xL, but not Bcl-2, until displaced by BH3-only proteins // Genes Dev. 2005. Vol. 19, № 11. P. 1294-1305.

78. Dai H. et al. Contribution of Bcl-2 phosphorylation to Bak binding and drug resistance. // Cancer Res. NIH Public Access, 2013. Vol. 73, № 23. P. 69987008.

79. Kuwana T. et al. BH3 Domains of BH3-Only Proteins Differentially Regulate Bax-Mediated Mitochondrial Membrane Permeabilization Both Directly and Indirectly // Mol. Cell. 2005. Vol. 17, № 4. P. 525-535.

133

80. Chen L. et al. Differential Targeting of Prosurvival Bcl-2 Proteins by Their BH3-Only Ligands Allows Complementary Apoptotic Function // Mol. Cell. 2005. Vol. 17, № 3. P. 393-403.

81. Dai H. et al. Evaluation of the BH3-only Protein Puma as a Direct Bak Activator // J. Biol. Chem. 2014. Vol. 289, № 1. P. 89-99.

82. Chen H.-C. et al. An interconnected hierarchical model of cell death regulation by the BCL-2 family. // Nat. Cell Biol. NIH Public Access, 2015. Vol. 17, № 10. P. 1270-1281.

83. Oda E. et al. Noxa, a BH3-only member of the Bcl-2 family and candidate mediator of p53-induced apoptosis. // Science. 2000. Vol. 288, № 5468. P. 1053-1058.

84. Nakano K., Vousden K.H. PUMA, a novel proapoptotic gene, is induced by p53. // Mol. Cell. 2001. Vol. 7, № 3. P. 683-694.

85. Yu J. et al. PUMA induces the rapid apoptosis of colorectal cancer cells. // Mol. Cell. 2001. Vol. 7, № 3. P. 673-682.

86. Puthalakath H. et al. ER Stress Triggers Apoptosis by Activating BH3-Only Protein Bim // Cell. 2007. Vol. 129, № 7. P. 1337-1349.

87. Puthalakath H. et al. The proapoptotic activity of the Bcl-2 family member Bim is regulated by interaction with the dynein motor complex. // Mol. Cell. 1999. Vol. 3, № 3. P. 287-296.

88. Bouillet P. et al. Proapoptotic Bcl-2 relative Bim required for certain apoptotic responses, leukocyte homeostasis, and to preclude autoimmunity. // Science. 1999. Vol. 286, № 5445. P. 1735-1738.

89. Bouillet P. et al. BH3-only Bcl-2 family member Bim is required for apoptosis of autoreactive thymocytes // Nature. 2002. Vol. 415, № 6874. P. 922-926.

Enders A. et al. Loss of the Pro-Apoptotic BH3-only Bcl-2 Family Member Bim Inhibits BCR Stimulation-induced Apoptosis and Deletion of Autoreactive B Cells // J. Exp. Med. 2003. Vol. 198, № 7. P. 1119-1126.

91. Villunger A. et al. p53- and Drug-Induced Apoptotic Responses Mediated by BH3-Only Proteins Puma and Noxa // Science (80-. ). 2003. Vol. 302, № 5647. P. 1036-1038.

92. Erlacher M. et al. Puma cooperates with Bim, the rate-limiting BH3-only protein in cell death during lymphocyte development, in apoptosis induction. // J. Exp. Med. The Rockefeller University Press, 2006. Vol. 203, № 13. P. 2939-2951.

93. Knudson C.M. et al. Bax-deficient mice with lymphoid hyperplasia and male germ cell death. // Science. 1995. Vol. 270, № 5233. P. 96-99.

94. Lindsten T. et al. The combined functions of proapoptotic Bcl-2 family members bak and bax are essential for normal development of multiple tissues. // Mol. Cell. NIH Public Access, 2000. Vol. 6, № 6. P. 1389-1399.

95. Veis D.J. et al. Bcl-2-deficient mice demonstrate fulminant lymphoid apoptosis, polycystic kidneys, and hypopigmented hair. // Cell. 1993. Vol. 75, № 2. P. 229-240.

96. Motoyama N. et al. Massive cell death of immature hematopoietic cells and neurons in Bcl-x-deficient mice. // Science. 1995. Vol. 267, № 5203. P. 1506-1510.

97. Rucker E.B. et al. Bcl-x and Bax Regulate Mouse Primordial Germ Cell Survival and Apoptosis during Embryogenesis // Mol. Endocrinol. 2000. Vol. 14, № 7. P. 1038-1052.

98. Mason K.D. et al. Programmed Anuclear Cell Death Delimits Platelet Life Span // Cell. 2007. Vol. 128, № 6. P. 1173-1186.

99. Takehara T. et al. Hepatocyte-specific disruption of Bcl-xL leads to continuous hepatocyte apoptosis and liver fibrotic responses. // Gastroenterology. 2004. Vol. 127, № 4. P. 1189-1197.

100. Rinkenberger J.L. et al. Mcl-1 deficiency results in peri-implantation embryonic lethality. // Genes Dev. 2000. Vol. 14, № 1. P. 23-27.

101. Opferman J.T. et al. Development and maintenance of B and T lymphocytes requires antiapoptotic MCL-1 // Nature. 2003. Vol. 426, № 6967. P. 671676.

102. Vikstrom I. et al. Mcl-1 Is Essential for Germinal Center Formation and B Cell Memory // Science (80-. ). 2010. Vol. 330, № 6007. P. 1095-1099.

103. Opferman J.T. et al. Obligate Role of Anti-Apoptotic MCL-1 in the Survival of Hematopoietic Stem Cells // Science (80-. ). 2005. Vol. 307, № 5712. P. 1101-1104.

104. Vick B. et al. Knockout of myeloid cell leukemia-1 induces liver damage and increases apoptosis susceptibility of murine hepatocytes. // Hepatology. NIH Public Access, 2009. Vol. 49, № 2. P. 627-636.

105. Arbour N. et al. Mcl-1 is a key regulator of apoptosis during CNS development and after DNA damage. // J. Neurosci. NIH Public Access, 2008. Vol. 28, № 24. P. 6068-6078.

106. Thomas R.L. et al. Loss of MCL-1 leads to impaired autophagy and rapid development of heart failure // Genes Dev. 2013. Vol. 27, № 12. P. 13651377.

107. Wang X. et al. Deletion of MCL-1 causes lethal cardiac failure and mitochondrial dysfunction // Genes Dev. 2013. Vol. 27, № 12. P. 1351-1364.

108. McDonnell T.J., Korsmeyer S.J. Progression from lymphoid hyperplasia to

high-grade malignant lymphoma in mice transgenic for the t(14;18) // Nature.

136

1991. Vol. 349, № 6306. P. 254-256.

109. Strasser A. et al. Novel primitive lymphoid tumours induced in transgenic mice by cooperation between myc and bcl-2 // Nature. 1990. Vol. 348, № 6299. P. 331-333.

110. Egle A. et al. Bim is a suppressor of Myc-induced mouse B cell leukemia // Proc. Natl. Acad. Sci. 2004. Vol. 101, № 16. P. 6164-6169.

111. Michalak E.M. et al. Puma and to a lesser extent Noxa are suppressors of Myc-induced lymphomagenesis // Cell Death Differ. 2009. Vol. 16, № 5. P. 684-696.

112. Eischen C.M. et al. Bax Loss Impairs Myc-Induced Apoptosis and Circumvents the Selection of p53 Mutations during Myc-Mediated Lymphomagenesis // Mol. Cell. Biol. 2001. Vol. 21, № 22. P. 7653-7662.

113. Lessene G., Czabotar P.E., Colman P.M. BCL-2 family antagonists for cancer therapy // Nat. Rev. Drug Discov. Nature Publishing Group, 2008. Vol. 7, № 12. P. 989-1000.

114. Zantl N. et al. Frequent loss of expression of the pro-apoptotic protein Bim in renal cell carcinoma: evidence for contribution to apoptosis resistance // Oncogene. 2007. Vol. 26, № 49. P. 7038-7048.

115. Garrison S.P. et al. Selection against PUMA Gene Expression in Myc-Driven B-Cell Lymphomagenesis // Mol. Cell. Biol. 2008. Vol. 28, № 17. P. 53915402.

116. Tagawa H. et al. Genome-wide array-based CGH for mantle cell lymphoma: identification of homozygous deletions of the proapoptotic gene BIM // Oncogene. 2005. Vol. 24, № 8. P. 1348-1358.

117. Tse C. et al. ABT-263: A Potent and Orally Bioavailable Bcl-2 Family

Inhibitor // Cancer Res. 2008. Vol. 68, № 9. P. 3421-3428.

137

118. Cory S. et al. Targeting BCL-2-like Proteins to Kill Cancer Cells // Trends in Cancer. 2016. Vol. 2, № 8. P. 443-460.

119. Wilson W.H. et al. Navitoclax, a targeted high-affinity inhibitor of BCL-2, in lymphoid malignancies: a phase 1 dose-escalation study of safety, pharmacokinetics, pharmacodynamics, and antitumour activity // Lancet Oncol. 2010. Vol. 11, № 12. P. 1149-1159.

120. Souers A.J. et al. ABT-199, a potent and selective BCL-2 inhibitor, achieves antitumor activity while sparing platelets // Nat. Med. 2013. Vol. 19, № 2. P. 202-208.

121. Fda, Cder. HIGHLIGHTS OF PRESCRIBING INFORMATION.

122. Konopleva M. et al. Mechanisms of apoptosis sensitivity and resistance to the BH3 mimetic ABT-737 in acute myeloid leukemia // Cancer Cell. 2006. Vol. 10, № 5. P. 375-388.

123. Niu X. et al. Binding of Released Bim to Mcl-1 is a Mechanism of Intrinsic Resistance to ABT-199 which can be Overcome by Combination with Daunorubicin or Cytarabine in AML Cells. // Clin. Cancer Res. NIH Public Access, 2016. Vol. 22, № 17. P. 4440-4451.

124. Lee E.F. et al. Conformational changes in Bcl-2 pro-survival proteins determine their capacity to bind ligands. // J. Biol. Chem. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2009. Vol. 284, № 44. P. 3050830517.

125. Leverson J.D. et al. Potent and selective small-molecule MCL-1 inhibitors demonstrate on-target cancer cell killing activity as single agents and in combination with ABT-263 (navitoclax) // Cell Death Dis. Nature Publishing Group, 2015. Vol. 6, № 1. P. e1590.

126. Kotschy A. et al. The MCL1 inhibitor S63845 is tolerable and effective in

diverse cancer models // Nature. 2016. Vol. 538, № 7626. P. 477-482.

127. Merino D. et al. Synergistic action of the MCL-1 inhibitor S63845 with current therapies in preclinical models of triple-negative and HER2-amplified breast cancer // Sci. Transl. Med. 2017. Vol. 9, № 401. P. eaam7049.

128. Vikström I.B. et al. MCL-1 is required throughout B-cell development and its loss sensitizes specific B-cell subsets to inhibition of BCL-2 or BCL-XL // Cell Death Dis. 2016. Vol. 7, № 8. P. e2345-e2345.

129. Reinhart R. et al. BH3 mimetics efficiently induce apoptosis in mouse basophils and mast cells // Cell Death Differ. 2018. Vol. 25, № 1. P. 204216.

130. Murphy M.P., Caraher E. Mcl-1 is vital for neutrophil survival // Immunol. Res. 2015. Vol. 62, № 2. P. 225-233.

131. Meyerovich K. et al. MCL-1 Is a Key Antiapoptotic Protein in Human and Rodent Pancreatic ß-Cells // Diabetes. 2017. Vol. 66, № 9. P. 2446-2458.

132. Uhlen M. et al. Tissue-based map of the human proteome // Science (80-. ). 2015. Vol. 347, № 6220. P. 1260419-1260419.

133. Fernandez-Marrero Y. et al. Survival control of malignant lymphocytes by anti-apoptotic MCL-1 // Leukemia. 2016. Vol. 30, № 11. P. 2152-2159.

134. Sieghart W. et al. Mcl-1 overexpression in hepatocellular carcinoma: A potential target for antisense therapy // J. Hepatol. 2006. Vol. 44, № 1. P. 151-157.

135. Lin J. et al. Mcl-1 inhibitor suppresses tumor growth of esophageal squamous cell carcinoma in a mouse model. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2017. Vol. 8, № 70. P. 114457-114462.

136. Campbell K.J. et al. MCL-1 is a prognostic indicator and drug target in breast

cancer // Cell Death Dis. 2018. Vol. 9, № 2. P. 19.

137. Uhlen M. et al. A pathology atlas of the human cancer transcriptome // Science (80-. ). 2017. Vol. 357, № 6352. P. eaan2507.

138. Perciavalle R.M. et al. Anti-apoptotic MCL-1 localizes to the mitochondrial matrix and couples mitochondrial fusion to respiration. // Nat. Cell Biol. NIH Public Access, 2012. Vol. 14, № 6. P. 575-583.

139. Rogers S., Wells R., Rechsteiner M. Amino acid sequences common to rapidly degraded proteins: the PEST hypothesis. // Science. 1986. Vol. 234, № 4774. P. 364-368.

140. Chao J.R. et al. mcl-1 is an immediate-early gene activated by the granulocyte-macrophage colony-stimulating factor (GM-CSF) signaling pathway and is one component of the GM-CSF viability response. // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 1998. Vol. 18, № 8. P. 4883-4898.

141. Liu H. et al. Stabilization and enhancement of the antiapoptotic activity of mcl-1 by TCTP. // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 2005. Vol. 25, № 8. P. 3117-3126.

142. Fujise K. et al. Regulation of Apoptosis and Cell Cycle Progression by MCL1 // J. Biol. Chem. 2000. Vol. 275, № 50. P. 39458-39465.

143. Jamil S. et al. An essential role for MCL-1 in ATR-mediated CHK1 phosphorylation. // Mol. Biol. Cell. American Society for Cell Biology, 2008. Vol. 19, № 8. P. 3212-3220.

144. Nijhuis A. et al. MCL-1 is modulated in Crohn's disease fibrosis by miR-29b via IL-6 and IL-8 // Cell Tissue Res. 2017. Vol. 368, № 2. P. 325-335.

145. Bingle C.D. et al. Exon Skipping in Mcl-1 Results in a Bcl-2 Homology

Domain 3 Only Gene Product That Promotes Cell Death // J. Biol. Chem.

140

2000. Vol. 275, № 29. P. 22136-22146.

146. Bae J. et al. MCL-1S, a Splicing Variant of the Antiapoptotic BCL-2 Family Member MCL-1, Encodes a Proapoptotic Protein Possessing Only the BH3 Domain // J. Biol. Chem. 2000. Vol. 275, № 33. P. 25255-25261.

147. Morciano G. et al. Mcl-1 involvement in mitochondrial dynamics is associated with apoptotic cell death. // Mol. Biol. Cell. American Society for Cell Biology, 2016. Vol. 27, № 1. P. 20-34.

148. Kim J.-H. et al. MCL-1ES, a novel variant of MCL-1, associates with MCL-1L and induces mitochondrial cell death // FEBS Lett. 2009. Vol. 583, № 17. P. 2758-2764.

149. Kim J.-H., Bae J. MCL-1ES Induces MCL-1L-Dependent BAX- and BAK-Independent Mitochondrial Apoptosis // PLoS One / ed. Takehara T. 2013. Vol. 8, № 11. P. e79626.

150. Stewart M.L. et al. The MCL-1 BH3 helix is an exclusive MCL-1 inhibitor and apoptosis sensitizer // Nat. Chem. Biol. 2010. Vol. 6, № 8. P. 595-601.

151. Soleymanlou N. et al. Hypoxic switch in mitochondrial myeloid cell leukemia factor-1/Mtd apoptotic rheostat contributes to human trophoblast cell death in preeclampsia. // Am. J. Pathol. American Society for Investigative Pathology, 2007. Vol. 171, № 2. P. 496-506.

152. Sariyer R. et al. Alcohol-Mediated Missplicing of Mcl-1 Pre-mRNA is Involved in Neurotoxicity // Alcohol. Clin. Exp. Res. 2017. Vol. 41, № 10. P. 1715-1724.

153. Gao Y., Koide K. Chemical perturbation of Mcl-1 pre-mRNA splicing to induce apoptosis in cancer cells. // ACS Chem. Biol. NIH Public Access, 2013. Vol. 8, № 5. P. 895-900.

154. Laetsch T.W. et al. Multiple components of the spliceosome regulate Mcl1

141

activity in neuroblastoma. // Cell Death Dis. Nature Publishing Group, 2014. Vol. 5, № 2. P. e1072.

155. Gao Y. et al. Regulation of HPV16 E6 and MCL1 by SF3B1 inhibitor in head and neck cancer cells. // Sci. Rep. Nature Publishing Group, 2014. Vol. 4. P. 6098.

156. Shieh J.-J. et al. Modification of Alternative Splicing of Mcl-1 Pre-mRNA Using Antisense Morpholino Oligonucleotides Induces Apoptosis in Basal Cell Carcinoma Cells // J. Invest. Dermatol. 2009. Vol. 129, № 10. P. 24972506.

157. Kale J., Osterlund E.J., Andrews D.W. BCL-2 family proteins: changing partners in the dance towards death // Cell Death Differ. 2018. Vol. 25, № 1. P. 65-80.

158. Certo M. et al. Mitochondria primed by death signals determine cellular addiction to antiapoptotic BCL-2 family members // Cancer Cell. 2006. Vol. 9, № 5. P. 351-365.

159. Ku B. et al. Evidence that inhibition of BAX activation by BCL-2 involves its tight and preferential interaction with the BH3 domain of BAX. // Cell Res. Nature Publishing Group, 2011. Vol. 21, № 4. P. 627-641.

160. Smith A.J. et al. Noxa/Bcl-2 protein interactions contribute to bortezomib resistance in human lymphoid cells. // J. Biol. Chem. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Vol. 286, № 20. P. 1768217692.

161. Gomez-Bougie P. et al. Noxa controls Mule-dependent Mcl-1 ubiquitination through the regulation of the Mcl-1/USP9X interaction // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2011. Vol. 413, № 3. P. 460-464.

162. Nakajima W. et al. DNA damaging agent-induced apoptosis is regulated by

MCL-1 phosphorylation and degradation mediated by the Noxa/MCL-1/CDK2 complex. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2016. Vol. 7, № 24. P. 36353-36365.

163. Zhai D. et al. Differential regulation of Bax and Bak by anti-apoptotic Bcl-2 family proteins Bcl-B and Mcl-1. // J. Biol. Chem. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2008. Vol. 283, № 15. P. 9580-9586.

164. Gillissen B. et al. Mcl-1 determines the Bax dependency of Nbk/Bik-induced apoptosis. // J. Cell Biol. The Rockefeller University Press, 2007. Vol. 179, № 4. P. 701-715.

165. Gomez-Bougie P. et al. Repression of Mcl-1 and disruption of the Mcl-1/Bak interaction in myeloma cells couple ER stress to mitochondrial apoptosis // Cancer Lett. 2016. Vol. 383, № 2. P. 204-211.

166. Leu J.I.-J. et al. Mitochondrial p53 activates Bak and causes disruption of a Bak-Mcl1 complex // Nat. Cell Biol. 2004. Vol. 6, № 5. P. 443-450.

167. Zhang X. et al. TRAF6 Restricts p53 Mitochondrial Translocation, Apoptosis, and Tumor Suppression. // Mol. Cell. NIH Public Access, 2016. Vol. 64, № 4. P. 803-814.

168. Wang C., Youle R.J. Predominant requirement of Bax for apoptosis in HCT116 cells is determined by Mcl-1's inhibitory effect on Bak. // Oncogene. NIH Public Access, 2012. Vol. 31, № 26. P. 3177-3189.

169. Thomas M.P. et al. Apoptosis Triggers Specific, Rapid, and Global mRNA Decay with 3' Uridylated Intermediates Degraded by DIS3L2. // Cell Rep. NIH Public Access, 2015. Vol. 11, № 7. P. 1079-1089.

170. Clohessy J.G., Zhuang J., Brady H.J.M. Characterisation of Mcl-1 cleavage during apoptosis of haematopoietic cells // Br. J. Haematol. 2004. Vol. 125, № 5. P. 655-665.

171. Han J. et al. Disruption of Mcl-1-Bim Complex in Granzyme B-mediated Mitochondrial Apoptosis // J. Biol. Chem. 2005. Vol. 280, № 16. P. 1638316392.

172. Weng C. et al. Specific Cleavage of Mcl-1 by Caspase-3 in Tumor Necrosis Factor-related Apoptosis-inducing Ligand (TRAIL)-induced Apoptosis in Jurkat Leukemia T Cells // J. Biol. Chem. 2005. Vol. 280, № 11. P. 1049110500.

173. Fan F. et al. Targeting Mcl-1 for multiple myeloma (MM) therapy: Drug-induced generation of Mcl-1 fragment Mcl-1128-350 triggers MM cell death via c-Jun upregulation // Cancer Lett. 2014. Vol. 343, № 2. P. 286-294.

174. Herrant M. et al. Cleavage of Mcl-1 by caspases impaired its ability to counteract Bim-induced apoptosis // Oncogene. 2004. Vol. 23, № 47. P. 7863-7873.

175. Marquez R.T., Xu L. Bcl-2:Beclin 1 complex: multiple, mechanisms regulating autophagy/apoptosis toggle switch. // Am. J. Cancer Res. 2012. Vol. 2, № 2. P. 214-221.

176. Green D.R., Levine B. To be or not to be? How selective autophagy and cell death govern cell fate. // Cell. NIH Public Access, 2014. Vol. 157, № 1. P. 65-75.

177. Maiuri M.C. et al. Functional and physical interaction between Bcl-X(L) and a BH3-like domain in Beclin-1. // EMBO J. European Molecular Biology Organization, 2007. Vol. 26, № 10. P. 2527-2539.

178. Erlich S. et al. Differential interactions between Beclin 1 and Bcl-2 family members. // Autophagy. Vol. 3, № 6. P. 561-568.

179. Elgendy M. et al. Oncogenic Ras-induced expression of Noxa and Beclin-1 promotes autophagic cell death and limits clonogenic survival. // Mol. Cell.

2011. Vol. 42, № 1. P. 23-35.

180. Elgendy M. et al. Beclin 1 restrains tumorigenesis through Mcl-1 destabilization in an autophagy-independent reciprocal manner // Nat. Commun. 2014. Vol. 5. P. 5637.

181. Germain M. et al. MCL-1 is a stress sensor that regulates autophagy in a developmentally regulated manner. // EMBO J. European Molecular Biology Organization, 2011. Vol. 30, № 2. P. 395-407.

182. Escudero S. et al. Dynamic Regulation of Long-Chain Fatty Acid Oxidation by a Noncanonical Interaction between the MCL-1 BH3 Helix and VLCAD // Mol. Cell. 2018. Vol. 69, № 5. P. 729-743.e7.

183. Rasmussen M.L. et al. A Non-apoptotic Function of MCL-1 in Promoting Pluripotency and Modulating Mitochondrial Dynamics in Stem Cells // Stem Cell Reports. 2018. Vol. 10, № 3. P. 684-692.

184. Hollville E. et al. Bcl-2 Family Proteins Participate in Mitochondrial Quality Control by Regulating Parkin/PINK1-Dependent Mitophagy // Mol. Cell. 2014. Vol. 55, № 3. P. 451-466.

185. Wang B. et al. Role of Ku70 in deubiquitination of Mcl-1 and suppression of apoptosis. // Cell Death Differ. Nature Publishing Group, 2014. Vol. 21, № 7. P. 1160-1169.

186. Pawlikowska P. et al. ATM-dependent expression of IEX-1 controls nuclear accumulation of Mcl-1 and the DNA damage response // Cell Death Differ. 2010. Vol. 17, № 11. P. 1739-1750.

187. Mattoo A.R. et al. MCL-1 Depletion Impairs DNA Double-Strand Break Repair and Reinitiation of Stalled DNA Replication Forks // Mol. Cell. Biol. 2017. Vol. 37, № 3. P. e00535-16.

188. Yoon S. et al. IEX-1-induced cell death requires BIM and is modulated by

145

MCL-1 // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2009. Vol. 382, № 2. P. 400404.

189. Yang T. et al. MCL-1, a member of the BCL-2 family, is induced rapidly in response to signals for cell differentiation or death, but not to signals for cell proliferation // J. Cell. Physiol. 1996. Vol. 166, № 3. P. 523-536.

190. Townsend K.J. et al. Regulation of MCL1 through a serum response factor/Elk-1-mediated mechanism links expression of a viability-promoting member of the BCL2 family to the induction of hematopoietic cell differentiation. // J. Biol. Chem. 1999. Vol. 274, № 3. P. 1801-1813.

191. Akgul C. et al. Functional analysis of the human MCL-1 gene // Cell. Mol. Life Sci. 2000. Vol. 57, № 4. P. 684-691.

192. Sheng Z. et al. A genome-wide RNA interference screen reveals an essential CREB3L2-ATF5-MCL1 survival pathway in malignant glioma with therapeutic implications. // Nat. Med. NIH Public Access, 2010. Vol. 16, № 6. P. 671-677.

193. Townsend K.J. et al. Expression of the antiapoptotic MCL1 gene product is regulated by a mitogen activated protein kinase-mediated pathway triggered through microtubule disruption and protein kinase C // Oncogene. 1998. Vol. 17, № 10. P. 1223-1234.

194. Chandra A. et al. Epidermal growth factor receptor (EGFR) signaling promotes proliferation and survival in osteoprogenitors by increasing early growth response 2 (EGR2) expression. // J. Biol. Chem. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2013. Vol. 288, № 28. P. 2048820498.

195. Leu C.-M., Chang C., Hu C. Epidermal growth factor (EGF) suppresses staurosporine-induced apoptosis by inducing mcl-1 via the mitogen-activated

protein kinase pathway // Oncogene. 2000. Vol. 19, № 13. P. 1665-1675.

196. Booy E.P., Henson E.S., Gibson S.B. Epidermal growth factor regulates Mcl-1 expression through the MAPK-Elk-1 signalling pathway contributing to cell survival in breast cancer. // Oncogene. Nature Publishing Group, 2011. Vol. 30, № 20. P. 2367-2378.

197. Huang H.M., Huang C.J., Yen J.J. Mcl-1 is a common target of stem cell factor and interleukin-5 for apoptosis prevention activity via MEK/MAPK and PI-3K/Akt pathways. // Blood. 2000. Vol. 96, № 5. P. 1764-1771.

198. Wang J.M. et al. The antiapoptotic gene mcl-1 is up-regulated by the phosphatidylinositol 3-kinase/Akt signaling pathway through a transcription factor complex containing CREB. // Mol. Cell. Biol. 1999. Vol. 19, № 9. P. 6195-6206.

199. Schulze-Bergkamen H. et al. Hepatocyte growth factor induces Mcl-1 in primary human hepatocytes and inhibits CD95-mediated apoptosis via Akt // Hepatology. 2004. Vol. 39, № 3. P. 645-654.

200. Jiang C.C. et al. Up-regulation of Mcl-1 Is Critical for Survival of Human Melanoma Cells upon Endoplasmic Reticulum Stress // Cancer Res. 2008. Vol. 68, № 16. P. 6708-6717.

201. Dong L. et al. Ets-1 mediates upregulation of Mcl-1 downstream of XBP-1 in human melanoma cells upon ER stress // Oncogene. Nature Publishing Group, 2011. Vol. 30, № 34. P. 3716.

202. Puthier D., Bataille R., Amiot M. IL-6 up-regulates mcl-1 in human myeloma cells through JAK / STAT rather than ras / MAP kinase pathway. // Eur. J. Immunol. 1999. Vol. 29, № 12. P. 3945-3950.

203. Jourdan M. et al. Regulation of Bcl-2-family proteins in myeloma cells by three myeloma survival factors: interleukin-6, interferon-alpha and insulin-

like growth factor 1. // Cell Death Differ. Inserm, 2000. Vol. 7, № 12. P. 1244-1252.

204. Lee Y.K. et al. VEGF receptors on chronic lymphocytic leukemia (CLL) B cells interact with STAT 1 and 3: implication for apoptosis resistance // Leukemia. 2005. Vol. 19, № 4. P. 513-523.

205. Ricci M.S. et al. Reduction of TRAIL-Induced Mcl-1 and cIAP2 by c-Myc or Sorafenib Sensitizes Resistant Human Cancer Cells to TRAIL-Induced Death // Cancer Cell. 2007. Vol. 12, № 1. P. 66-80.

206. Piret J.-P. et al. Hypoxia-inducible Factor-1-dependent Overexpression of Myeloid Cell Factor-1 Protects Hypoxic Cells against tert-Butyl Hydroperoxide-induced Apoptosis // J. Biol. Chem. 2005. Vol. 280, № 10. P. 9336-9344.

207. Croxton R. et al. Direct repression of the Mcl-1 promoter by E2F1 // Oncogene. 2002. Vol. 21, № 9. P. 1359-1369.

208. Moore M.J. et al. An alternative splicing network links cell-cycle control to apoptosis. // Cell. NIH Public Access, 2010. Vol. 142, № 4. P. 625-636.

209. Lin J.-C. et al. Elevated SRPK1 lessens apoptosis in breast cancer cells through RBM4-regulated splicing events. // RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2014. Vol. 20, № 10. P. 1621-1631.

210. Kçdzierska H. et al. Decreased Expression of SRSF2 Splicing Factor Inhibits Apoptotic Pathways in Renal Cancer. // Int. J. Mol. Sci. Multidisciplinary Digital Publishing Institute (MDPI), 2016. Vol. 17, № 10.

211. Moulding D.A. et al. BCL-2 family expression in human neutrophils during delayed and accelerated apoptosis. // J. Leukoc. Biol. 2001. Vol. 70, № 5. P. 783-792.

212. Ebner F. et al. The RNA-binding protein tristetraprolin schedules apoptosis

148

of pathogen-engaged neutrophils during bacterial infection. // J. Clin. Invest. American Society for Clinical Investigation, 2017. Vol. 127, № 6. P. 20512065.

213. Cui J., Placzek W.J. PTBP1 modulation of MCL1 expression regulates cellular apoptosis induced by antitubulin chemotherapeutics. // Cell Death Differ. Nature Publishing Group, 2016. Vol. 23, № 10. P. 1681-1690.

214. Filipowicz W., Bhattacharyya S.N., Sonenberg N. Mechanisms of post-transcriptional regulation by microRNAs: are the answers in sight? // Nat. Rev. Genet. 2008. Vol. 9, № 2. P. 102-114.

215. Mott J.L. et al. mir-29 regulates Mcl-1 protein expression and apoptosis. // Oncogene. NIH Public Access, 2007. Vol. 26, № 42. P. 6133-6140.

216. Gong J. et al. MicroRNA-125b promotes apoptosis by regulating the expression of Mcl-1, Bcl-w and IL-6R // Oncogene. 2013. Vol. 32, № 25. P. 3071-3079.

217. Xu J., Liao X., Wong C. Downregulations of B-cell lymphoma 2 and myeloid cell leukemia sequence 1 by microRNA 153 induce apoptosis in a glioblastoma cell line DBTRG-05MG // Int. J. Cancer. 2009. Vol. 126, № 4. P. NA-NA.

218. Braconi C. et al. Hepatitis C virus proteins modulate microRNA expression and chemosensitivity in malignant hepatocytes. // Clin. Cancer Res. NIH Public Access, 2010. Vol. 16, № 3. P. 957-966.

219. Chen L. et al. The role of microRNA expression pattern in human intrahepatic cholangiocarcinoma // J. Hepatol. 2009. Vol. 50, № 2. P. 358369.

220. Cui J., Placzek W.J. Post-Transcriptional Regulation of Anti-Apoptotic BCL2 Family Members // Int. J. Mol. Sci. Multidisciplinary Digital

Publishing Institute (MDPI), 2018. Vol. 19, № 1.

221. Wang K.C., Chang H.Y. Molecular mechanisms of long noncoding RNAs. // Mol. Cell. NIH Public Access, 2011. Vol. 43, № 6. P. 904-914.

222. Wang S.-H. et al. The lncRNA MALAT1 functions as a competing endogenous RNA to regulate MCL-1 expression by sponging miR-363-3p in gallbladder cancer. // J. Cell. Mol. Med. Wiley-Blackwell, 2016. Vol. 20, № 12. P. 2299-2308.

223. Wang H. et al. MALAT1/miR-101 -3p/MCL 1 axis mediates cisplatin resistance in lung cancer. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2018. Vol. 9, № 7. P. 7501-7512.

224. Stamato M.A. et al. Inhibition of EZH2 triggers the tumor suppressive miR-29b network in multiple myeloma. // Oncotarget. Impact Journals, LLC,

2017. Vol. 8, № 63. P. 106527-106537.

225. Huang Y. et al. LINC00152 down-regulated miR-193a-3p to enhance MCL1 expression and promote gastric cancer cells proliferation // Biosci. Rep.

2018. P. BSR20171607.

226. Wu Q. et al. Long noncoding RNA PVT1 inhibits renal cancer cell apoptosis by up-regulating Mcl-1. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2017. Vol. 8, № 60. P. 101865-101875.

227. Subramaniam D. et al. Translation inhibition during cell cycle arrest and apoptosis: Mcl-1 is a novel target for RNA binding protein CUGBP2 // Am. J. Physiol. Liver Physiol. 2008. Vol. 294, № 4. P. G1025-G1032.

228. Fritsch R.M. et al. Translational repression of MCL-1 couples stress-induced eIF2a phosphorylation to mitochondrial apoptosis initiation // J. Biol. Chem. 2007. Vol. 282, № 31. P. 22551-22562.

229. De Benedetti A., Graff J.R. eIF-4E expression and its role in malignancies

150

and metastases // Oncogene. 2004. Vol. 23, № 18. P. 3189-3199.

230. Mills J.R. et al. mTORCl promotes survival through translational control of Mcl-1 // Proc. Natl. Acad. Sci. National Academy of Sciences, 2008. Vol. 105, № 31. P. 10853-10858.

231. Pradelli L.A. et al. Glycolysis inhibition sensitizes tumor cells to death receptors-induced apoptosis by AMP kinase activation leading to Mcl-1 block in translation // Oncogene. 2010. Vol. 29, № 11. P. 1641-1652.

232. Kobayashi S. et al. Serine 64 Phosphorylation Enhances the Antiapoptotic Function of Mcl-1 // J. Biol. Chem. 2007. Vol. 282, № 25. P. 18407-18417.

233. Chu R. et al. Mitotic arrest-induced phosphorylation of Mcl-1 revisited using two-dimensional gel electrophoresis and phosphoproteomics: nine phosphorylation sites identified. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2016. Vol. 7, № 48. P. 78958-78970.

234. Ding Q. et al. Down-regulation of myeloid cell leukemia-1 through inhibiting Erk/Pin 1 pathway by sorafenib facilitates chemosensitization in breast cancer. // Cancer Res. NIH Public Access, 2008. Vol. 68, № 15. P. 61096117.

235. Inoshita S. et al. Phosphorylation and Inactivation of Myeloid Cell Leukemia 1 by JNK in Response to Oxidative Stress // J. Biol. Chem. 2002. Vol. 277, № 46. P. 43730-43734.

236. Ding Q. et al. Degradation of Mcl-1 by beta-TrCP mediates glycogen synthase kinase 3-induced tumor suppression and chemosensitization. // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 2007. Vol. 27, № 11. P. 4006-4017.

237. Maurer U. et al. Glycogen Synthase Kinase-3 Regulates Mitochondrial Outer Membrane Permeabilization and Apoptosis by Destabilization of MCL-1 //

Mol. Cell. 2006. Vol. 21, № 6. P. 749-760.

238. Mojsa B., Lassot I., Desagher S. Mcl-1 Ubiquitination: Unique Regulation of an Essential Survival Protein // Cells. 2014. Vol. 3, № 2. P. 418-437.

239. Domina A.M. et al. MCL1 is phosphorylated in the PEST region and stabilized upon ERK activation in viable cells and at additional sites with cytotoxic okadaic acid or taxol // Oncogene. 2004. Vol. 23, № 31. P. 53015315.

240. Inuzuka H. et al. SCF(FBW7) regulates cellular apoptosis by targeting MCL1 for ubiquitylation and destruction. // Nature. NIH Public Access, 2011. Vol. 471, № 7336. P. 104-109.

241. Wertz I.E. et al. Sensitivity to antitubulin chemotherapeutics is regulated by MCL1 and FBW7 // Nature. 2011. Vol. 471, № 7336. P. 110-114.

242. Harley M.E. et al. Phosphorylation of Mcl-1 by CDK1-cyclin B1 initiates its Cdc20-dependent destruction during mitotic arrest. // EMBO J. European Molecular Biology Organization, 2010. Vol. 29, № 14. P. 2407-2420.

243. Nijhawan D. et al. Elimination of Mcl-1 is required for the initiation of apoptosis following ultraviolet irradiation. // Genes Dev. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2003. Vol. 17, № 12. P. 1475-1486.

244. Chau V. et al. A multiubiquitin chain is confined to specific lysine in a targeted short-lived protein. // Science. 1989. Vol. 243, № 4898. P. 15761583.

245. Stewart D.P. et al. Ubiquitin-Independent Degradation of Antiapoptotic MCL-1 // Mol. Cell. Biol. 2010. Vol. 30, № 12. P. 3099-3110.

246. Zhong Q. et al. Mule/ARF-BP1, a BH3-Only E3 Ubiquitin Ligase, Catalyzes the Polyubiquitination of Mcl-1 and Regulates Apoptosis // Cell. 2005. Vol. 121, № 7. P. 1085-1095.

247. Warr M.R. et al. BH3-ligand regulates access of MCL-1 to its E3 ligase // FEBS Lett. 2005. Vol. 579, № 25. P. 5603-5608.

248. Park S.H. et al. Metformin enhances TRAIL-induced apoptosis by Mcl-1 degradation via Mule in colorectal cancer cells. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2016. Vol. 7, № 37. P. 59503-59518.

249. Hao Z. et al. The E3 ubiquitin ligase Mule acts through the ATM-p53 axis to maintain B lymphocyte homeostasis. // J. Exp. Med. The Rockefeller University Press, 2012. Vol. 209, № 1. P. 173-186.

250. Zhang C. et al. PINK1 triggers autocatalytic activation of Parkin to specify cell fate decisions. // Curr. Biol. NIH Public Access, 2014. Vol. 24, № 16. P. 1854-1865.

251. Carroll R.G., Hollville E., Martin S.J. Parkin Sensitizes toward Apoptosis Induced by Mitochondrial Depolarization through Promoting Degradation of Mcl-1 // Cell Rep. 2014. Vol. 9, № 4. P. 1538-1553.

252. Ren H. et al. The E3 ubiquitin ligases P-TrCP and FBXW7 cooperatively mediates GSK3-dependent Mcl-1 degradation induced by the Akt inhibitor API-1, resulting in apoptosis. // Mol. Cancer. BioMed Central, 2013. Vol. 12. P. 146.

253. Magiera M.M. et al. Trim17-mediated ubiquitination and degradation of Mcl-1 initiate apoptosis in neurons. // Cell Death Differ. Nature Publishing Group, 2013. Vol. 20, № 2. P. 281-292.

254. Feng C., Yang F., Wang J. FBXO4 inhibits lung cancer cell survival by targeting Mcl-1 for degradation // Cancer Gene Ther. 2017. Vol. 24, № 8. P. 342-347.

255. Subramanian A. et al. Inhibition of MARCH5 ubiquitin ligase abrogates MCL1-dependent resistance to BH3 mimetics via NOXA. // Oncotarget.

Impact Journals, LLC, 2016. Vol. 7, № 13. P. 15986-16002.

256. Schwickart M. et al. Deubiquitinase USP9X stabilizes MCL1 and promotes tumour cell survival // Nature. 2010. Vol. 463, № 7277. P. 103-107.

257. Zhang S. et al. Deubiquitinase USP13 dictates MCL1 stability and sensitivity to BH3 mimetic inhibitors. // Nat. Commun. Nature Publishing Group, 2018. Vol. 9, № 1. P. 215.

258. Yan J. et al. Usp9x- and Noxa-mediated Mcl-1 downregulation contributes to pemetrexed-induced apoptosis in human non-small-cell lung cancer cells. // Cell Death Dis. Nature Publishing Group, 2014. Vol. 5, № 7. P. e1316.

259. Amsel A.D. et al. Regulation of the proapoptotic factor Bax by Ku70-dependent deubiquitylation. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. National Academy of Sciences, 2008. Vol. 105, № 13. P. 5117-5122.

260. Peterson L.F. et al. Targeting deubiquitinase activity with a novel small-molecule inhibitor as therapy for B-cell malignancies // Blood. 2015. Vol. 125, № 23. P. 3588-3597.

261. Beroukhim R. et al. The landscape of somatic copy-number alteration across human cancers. // Nature. NIH Public Access, 2010. Vol. 463, № 7283. P. 899-905.

262. Forbes S.A. et al. COSMIC: somatic cancer genetics at high-resolution. // Nucleic Acids Res. Oxford University Press, 2017. Vol. 45, № D1. P. D777-D783.

263. Mazumder S. et al. Mcl-1 Phosphorylation defines ABT-737 resistance that can be overcome by increased NOXA expression in leukemic B cells. // Cancer Res. NIH Public Access, 2012. Vol. 72, № 12. P. 3069-3079.

264. Koo J. et al. mTOR Complex 2 Stabilizes Mcl-1 Protein by Suppressing Its

Glycogen Synthase Kinase 3-Dependent and SCF-FBXW7-Mediated

154

Degradation. // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 2015. Vol. 35, № 13. P. 2344-2355.

265. Gasca J. et al. Loss of FBXW7 and accumulation of MCL1 and PLK1 promote paclitaxel resistance in breast cancer. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2016. Vol. 7, № 33. P. 52751-52765.

266. Tong J. et al. FBW7 mutations mediate resistance of colorectal cancer to targeted therapies by blocking Mcl-1 degradation. // Oncogene. NIH Public Access, 2017. Vol. 36, № 6. P. 787-796.

267. Ishii N. et al. Reduced FBXW7 expression in pancreatic cancer correlates with poor prognosis and chemotherapeutic resistance via accumulation of MCL1. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2017. Vol. 8, № 68. P. 112636112646.

268. He L. et al. Mcl-1 and FBW7 control a dominant survival pathway underlying HDAC and Bcl-2 inhibitor synergy in squamous cell carcinoma. // Cancer Discov. NIH Public Access, 2013. Vol. 3, № 3. P. 324-337.

269. Senichkin V. V. et al. Nutrient restriction in combinatory therapy of tumors // Mol. Biol. Pleiades Publishing, 2016. Vol. 50, № 3. P. 362-378.

270. Kopeina G.S., Senichkin V. V., Zhivotovsky B. Caloric restriction - A promising anti-cancer approach: From molecular mechanisms to clinical trials // Biochim. Biophys. Acta - Rev. Cancer. 2017. Vol. 1867, № 1. P. 2941.

271. Raffaghello L. et al. Starvation-dependent differential stress resistance protects normal but not cancer cells against high-dose chemotherapy. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2008. Vol. 105, № 24. P. 8215-8220.

272. Shi Y. et al. Starvation-induced activation of ATM/Chk2/p53 signaling sensitizes cancer cells to cisplatin // BMC Cancer. 2012. Vol. 12, № 1. P.

273. Bianchi G. et al. Fasting induces anti-Warburg effect that increases respiration but reduces ATP-synthesis to promote apoptosis in colon cancer models. // Oncotarget. 2015. Vol. 6, № 14. P. 11806-11819.

274. Krause D.S., Van Etten R.A. Tyrosine kinases as targets for cancer therapy. // N. Engl. J. Med. 2005. Vol. 353, № 2. P. 172-187.

275. Caffa I. et al. Fasting potentiates the anticancer activity of tyrosine kinase inhibitors by strengthening MAPK signaling inhibition. // Oncotarget. 2015. Vol. 6, № 14. P. 11820-11832.

276. Engelman R.W. et al. Mammary and submandibular gland epidermal growth factor expression is reduced by calorie restriction. // Cancer Res. 1995. Vol. 55, № 6. P. 1289-1295.

277. Fontana L. et al. Long-term effects of calorie or protein restriction on serum IGF-1 and IGFBP-3 concentration in humans. // Aging Cell. NIH Public Access, 2008. Vol. 7, № 5. P. 681-687.

278. De Lorenzo M.S. et al. Caloric restriction reduces growth of mammary tumors and metastases. // Carcinogenesis. 2011. Vol. 32, № 9. P. 1381-1387.

279. Lee C. et al. Reduced levels of IGF-I mediate differential protection of normal and cancer cells in response to fasting and improve chemotherapeutic index. // Cancer Res. 2010. Vol. 70, № 4. P. 1564-1572.

280. Olivier M., Hollstein M., Hainaut P. TP53 mutations in human cancers: origins, consequences, and clinical use. // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2010. Vol. 2, № 1. P. a001008.

281. Bogenberger J. et al. Combined venetoclax and alvocidib in acute myeloid leukemia. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2017. Vol. 8, № 63. P. 107206-107222.

282. Bible K.C. et al. Phase 1 Trial of Flavopiridol Combined with Cisplatin or Carboplatin in Patients with Advanced Malignancies with the Assessment of Pharmacokinetic and Pharmacodynamic End Points // Clin. Cancer Res. 2005. Vol. 11, № 16. P. 5935-5941.

283. Karp J.E. et al. Phase 1 and pharmacokinetic study of bolus-infusion flavopiridol followed by cytosine arabinoside and mitoxantrone for acute leukemias. // Blood. American Society of Hematology, 2011. Vol. 117, № 12. P. 3302-3310.

284. Meynet O. et al. Caloric restriction modulates Mcl-1 expression and sensitizes lymphomas to BH3 mimetic in mice. // Blood. 2013. Vol. 122, № 14. P. 2402-2411.

285. Bhat M. et al. Metformin requires 4E-BPs to induce apoptosis and repress translation of Mcl-1 in hepatocellular carcinoma cells. // Oncotarget. Impact Journals, LLC, 2017. Vol. 8, № 31. P. 50542-50556.

286. Manier S. et al. Inhibiting the oncogenic translation program is an effective therapeutic strategy in multiple myeloma // Sci. Transl. Med. 2017. Vol. 9, № 389. P. eaal2668.

287. Vermes I. et al. A novel assay for apoptosis. Flow cytometric detection of phosphatidylserine expression on early apoptotic cells using fluorescein labelled Annexin V. // J. Immunol. Methods. 1995. Vol. 184, № 1. P. 39-51.

288. Kopeina G.S. et al. Identification of new complex for caspase-2 activation after DNA damage // Russ. J. Bioorganic Chem. Pleiades Publishing, 2016. Vol. 42, № 1. P. 74-82.

289. Dhillon A.S. et al. MAP kinase signalling pathways in cancer // Oncogene. 2007. Vol. 26, № 22. P. 3279-3290.

290. Steiger-Barraissoul S., Rami A. Serum deprivation induced autophagy and

predominantly an AIF-dependent apoptosis in hippocampal HT22 neurons // Apoptosis. 2009. Vol. 14, № 11. P. 1274-1288.

291. Zhao Y. et al. Cytosolic FoxOl is essential for the induction of autophagy and tumour suppressor activity // Nat. Cell Biol. 2010. Vol. 12, № 7. P. 665675.

292. Abulwerdi F. et al. A novel small-molecule inhibitor of mcl-1 blocks pancreatic cancer growth in vitro and in vivo. // Mol. Cancer Ther. NIH Public Access, 2014. Vol. 13, № 3. P. 565-575.

293. Chou C.-H. et al. IL-6 Regulates Mcl-1L Expression through the JAK/PI3K/Akt/CREB Signaling Pathway in Hepatocytes: Implication of an Anti-Apoptotic Role during Liver Regeneration // PLoS One / ed. Das A. Public Library of Science, 2013. Vol. 8, № 6. P. e66268.

294. Bhaskar P.T. et al. mTORC1 hyperactivity inhibits serum deprivation-induced apoptosis via increased hexokinase II and GLUT1 expression, sustained Mcl-1 expression, and glycogen synthase kinase 3beta inhibition. // Mol. Cell. Biol. American Society for Microbiology (ASM), 2009. Vol. 29, № 18. P. 5136-5147.

295. Warr M.R. et al. Mitochondrion-dependent N-terminal processing o*f outer membrane Mcl-1 protein removes an essential Mule/Lasu1 protein-binding site. // J. Biol. Chem. American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2011. Vol. 286, № 28. P. 25098-25107.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.