Структура и функционирование пойменных микробных сообществ среднего течения реки Оби тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Никиткина Эллина Георгиевна

• Никиткина Эллина Георгиевна
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Никиткина Эллина Георгиевна

Введение

1 Обзор литературы

1.1 Особенности формирования и сезонная динамика пойменных озёр

1.2 Роль пресных озёр в углеродном цикле и трансформации органического вещества

1.3 Роль микробных сообществ в самоочищении и трансформации органического вещества в пресных озёрах

1.4 Микробная активность и биогеохимические процессы в почвах пойменных экосистем

2 Объект и методы исследований

2.1 Объект исследований

2.1.1 Физико-географические характеристики района исследований

2.1.1.1 Климатические характеристики

2.1.1.2 Гидрологические и геоморфологические характеристики

2.1.1.3 Почвенный и растительный покров

2.1.2 Описание ключевого участка

2.2 Методы биогеохимических исследований

2.3 Методы микробиологических исследований

2.3.1 Определение общего микробного числа

2.3.2 Культивирование микроорганизмов

2.3.3 Метод мультисубстратного тестирования

2.3.4 Метагеномные исследования

2.4 Методы статистического анализа

3 Структура и функционирование микробных сообществ пойменных озёр среднего течения реки Оби

3.1 Микробиологическое разнообразие воды пойменного озера среднего течения реки Оби

3.2 Взаимосвязь активности микроорганизмов со свойствами вод пойменных озёр

3.2.1 Влияние стратификации на взаимосвязь микробной активности и параметров органического вещества воды

3.2.2 Сезонные изменения микробной активности и её связей с физико-химическими характеристиками вод в озёрах поймы

3.3 Метаболическая активность микробных сообществ пойменных озёр среднего течения реки Оби

3.3.1 Оценка спектров потребления субстратов микробными сообществами пойменных водоёмов среднего течения реки Оби

3.3.2 Дискриминантный анализ спектров потребления субстратов микробными сообществами

3.3.3 Оценка взаимосвязи метаболической активности и количественных характеристик микробных сообществ пойменных озёр и реки Оби

3.3.4 Выявление скрытых закономерностей в метаболической структуре микробных сообществ на основе факторного анализа

3.3.5 Оценка потребления микробным сообществом пойменных озёр групп органических субстратов

3.3.6 Взаимосвязь метаболической активности микробного сообщества со свойствами вод

3.4 Эколого-трофическая структура и метаболическая активность почвенных микробных сообществ поймы средней Оби

3.4.1 Биологическая активность и взаимосвязи микроорганизмов разных физиологических групп в пойменных почвах

3.4.2 Сезонная и профильная динамика численности микроорганизмов разных физиологических групп

3.4.3 Взаимосвязь деятельности почвенной микробиоты с физико-химическими показателями пойменных почв

3.4.4 Метаболическая активность микробных сообществ пойменных почв среднего течения реки Оби

Заключение

Список условных обозначений и сокращений

Список использованной литературы

Приложение А Спектры потребления микробным сообществом 31 субстрата

в различных биотопах поймы

Приложение Б Коэффициенты классификационных уравнений дискриминантного

анализа спектров потребления субстратов

Приложение В Коэффициенты корреляции усреднённых значений AWCD

по группам субстратов между собой

Приложение Г Значения, распределение и корреляции функциональных микробиологических показателей почв поймы средней Оби

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Структура и функционирование пойменных микробных сообществ среднего течения реки Оби»

Введение

Пойменные экосистемы являются важным компонентом глобального углеродного цикла, играя ключевую роль в процессах образования и трансформации органического вещества, обеспечивая его накопление в пойменных почвах, а также деструкцию, физическую, химическую и биологическую фильтрацию поступающих в Мировой океан поверхностных вод.

Многие экосистемные функции (например, связывание углерода, сохранение биоразнообразия, регулирование стока) связаны с водным режимом, что обуславливает высокий интерес к пойменным экосистемам и водно-болотным угодьям в целом для изучения и прогнозирования глобально значимых биогеохимических и экологических процессов [Mitsch et al., 2001 ; Kayranli et al., 2010 ; Sha et al., 2011 ; Schlesinger, Bernhardt, 2013 ; Argiroff et al., 2017 ; Janse et al., 2019 ; Shen et al., 2021]. Понимание биогеохимических процессов в поймах необходимо для прогнозирования значимых изменений в пойменных районах, а также оптимизации восстановления и консервации поймы [Moreno-Mateos et al., 2012 ; Scott et al., 2014 ; Comin et al., 2017].

Известно, что поймы рек обладают повышенной микробиологической активностью [Добровольский, 1971 ; Никитина, Барыкова, 1982 ; Славнина, Инишева, 1987 ; Якутин и др., 2017], а пойменные почвы часто характеризуются высоким содержанием углерода из-за высокой интенсивности накопления органического материала, обеспечиваемого микроорганизмами [Хатчинсон, 1969 ; Rinklebe, Langer, 2006 ; Kallenbach et al., 2016].

Ведущим драйвером, ответственным за существование, продуктивность и взаимодействие биоты речно-пойменных систем, является паводковый импульс -ритмическое затопление и отступление воды, способствующее обмену органики и микроорганизмов между руслом и поймой (Flood Pulse Concept) [Junk et al., 1989]. Талые и сточные воды накапливаются в лентикальных резервуарах, формируя аллохтонную составляющую микрофлоры пойменных водоёмов. Именно на береговую линию малых озёр приходится большая часть глобального

интерфейса «суша-вода» [Downing et al., 2006 ; Verpoorter et al., 2014]. Эта зона содержит некоторые из самых продуктивных местообитаний на Земле [Wetzel, 1992]. Мелкие озера являются «горячими точками» выбросов парниковых газов [Davidson et al., 2015]. В экосистемах озёр микроорганизмы выступают в качестве основных движущих сил процессов круговорота углерода и трансформации органического вещества [Wetzel, 1992 ; Braga et al., 2022 ; Guo et al., 2023], а эвтрофикация играет решающую роль в регулировании выбросов CO2 и CH4 [Davidson et al., 2015 ; Sun et al., 2021, 2022]. Изучение микробных сообществ пойменных озёр помогает понять процессы, обеспечивающие трансформацию органического вещества, секвестрацию углерода и устойчивость к антропогенному воздействию, что важно для прогнозирования последствий климатических изменений и управления водными ресурсами.

Это особенно актуально для Западной Сибири, где протекает река Обь, обладающая крупнейшим в Евразии водосборным бассейном площадью около 3 млн км2. Пойма Оби представляет собой вторую по величине затапливаемую территорию в мире [Papa et al., 2007 ; Vorobyev et al., 2015]. Недавно учёными Томского государственного университета (ТГУ) было подтверждено, что выбросы СО2, важного парникового газа, с затапливаемой территории поймы в 3-10 раз выше, чем из русла реки [Vorobyev et al., 2024], поэтому определение роли микробных сообществ поймы реки Оби в этих процессах имеет большое научное и практическое значение. С 2014 года на территории поймы функционирует исследовательская станция «Кайбасово», которая также является частью карбонового полигона, созданного ТГУ и его партнёрами в 2021 году для мониторинга углерода и разработки технологий его аккумуляции.

Степень разработанности темы исследования. Начиная с 50-х годов ХХ столетия пойма реки Оби является востребованным объектом для изучения, интерес к исследованию которого только возрастает [Иоганзен, 1963 ; Иоганзен, Тюменцев, 1968 ; Хромых, 2008 ; Булатов, Игенбаева, 2010 ; Krickov et al., 2021 ; Vorobyev et al., 2024]. Пойменные водотоки и озёра являются важным звеном в биогеохимических циклах: они накапливают информацию, выступая индикаторами

изменений, и дают возможность интегрированной характеристики процессов, происходящих на сопредельных территориях. Ранее подобные исследования в основном проводились в поймах рек американского континента [Repeta et al., 2002 ; Scott et al., 2014; Kenwell et al., 2016 ; Hernández et al., 2019 ; Barros et al., 2020], российские же исследования среднеобской поймы в основном были ориентированы на изучение типологии и динамики ресурсных компонентов: растительность [Дыдина, 1961 ; Вылцан, 1980 ; Шепелева, 1986 ; Гафуров, Скулкин, 1981 ; Семериков и др., 1992 ; Лапшина, 2003 ; Таран, 2014 ; Таран и др., 2018 ; Шепелева, 2019], почва [Непряхин, 1963 ; Сметанин, 1963 ; Добровольский, 1968, 1911 ; Славнина и др., 1981 ; Добровольский и др., 1984 ; Славнина, Инишева, 1981 ; Нечаева, 1992 ; Пашнева, Евсеева, 1992 ; Шепелев, Шепелева, 1995 ; Шепелев, Воробьев, 1999 ; Аветов и др., 2008 ; Нечаева, 2008 ; Izerskaia et al., 2014 ; Середина, Носова, 2018], гидрология и гидрохимия [Савичев, 2003, 2009 ; Savichev et al., 2015, 2019 ; Zemtsov, Savichev et al., 2015; Vorobyev et al., 2015, 2019, 2024].

Масштабные микробиологические исследования почв поймы средней Оби освещены в монографиях Л. И. Инишевой с соавторами [Славнина, Инишева, 1981 ; Инишева, 1992]; более поздние исследования микробиологии почв этого региона представлены М. В. Якутиным, в том числе с соавторами [Якутин, 1994 ; Якутин и др., 2013, 2014], однако, при имеющихся данных о роли микроорганизмов в преобразованиях органического вещества [Алекин, 1953 ; Findlay et al., 1991 ; Moorhead, Sinsabaugh, 2000 ; Repeta et al., 2002 ; Stepanauskas et al., 2005 ; Sinsabaugh, Follstad Shah, 2012 ; Sun et al., 2024] даже на фоне активного изучения органического вещества в различных объектах среднеобской поймы [Benner et al., 2004 ; Amon, Meon, 2004 ; Frey et al., 2001 ; Третьякова и др., 2009 ; Vorobyev et al., 2015, 2024 ; Крицков и др., 2024], микробиологические аспекты их функционирования пока не раскрыты, а комплексных исследований микробных сообществ, объединяющих метагеномику воды, функциональные тесты и структуру растворённого органического вещества в сезонном разрезе (включая зимний период), до сих пор не проводилось. Таким образом, данное исследование поможет получить более полную научную картину в рамках комплексного изучения поймы реки Оби.

Цель работы - оценка структуры и функционирования водных и почвенных микробоценозов и определение роли микробных сообществ в трансформации органического вещества в пойме среднего течения реки Оби.

Задачи исследования:

1. Определить структуру микробных сообществ пойменных озёр и их биоразнообразие на основании анализа данных секвенирования бактериального метагенома воды.

2. Выявить сезонные и стратификационные изменения в активности микроорганизмов водоёмов поймы среднего течения реки Оби и оценить их взаимосвязь с характеристиками растворённого органического вещества в контексте пойменного режима.

3. Оценить функциональное разнообразие микроорганизмов и выявить взаимосвязи метаболических характеристик микробоценозов со структурой растворённого органического вещества в водоёмах поймы на разных стадиях пойменного режима.

4. Оценить функциональное разнообразие микроорганизмов и определить структуру микробного сообщества в аллювиальных почвах, прилегающих к пойменным озёрам средней Оби, на основе учёта бактерий различных физиологических групп и оценки их взаимосвязей с сезонными изменениями, физико-химическими показателями почв и между собой.

Научная новизна исследования. Впервые для поймы среднего течения Оби выполнено комплексное исследование, объединяющее метагеномные исследования бактериального сообщества воды, функциональные профили и количественные характеристики микробоценозов воды и почв с учётом зимнего периода, оценку связей метаболической активности с характеристиками растворённого органического вещества и газового состава вод пойменных озёр в сезонной и стратификационной динамике.

Теоретическая и практическая значимость работы. Полученные в работе результаты расширяют и дополняют современные представления о структуре и функционировании пойменных микробоценозов, их вкладе в биогеохимический

круговорот веществ и их взаимосвязи с особенностями структуры пойменных ландшафтов.

Данные о влиянии микроорганизмов на структуру растворённого органического вещества в пойменных озёрах дают эмпирические критерии (спектральные индексы и спектры потребления субстратов), по которым можно диагностировать сезонные сдвиги в метаболизме и оценивать риск выбросов С02 в затопляемых ландшафтах; результаты применимы при планировании биоремедиационных вмешательств в мелководных пойменных системах.

Данные по микробиологическому составу профилей пойменных почв и сезонной активности микроорганизмов водоёмов поймы могут быть учтены в рамках проведения комплексных экологических исследований секвестрационных и климаторегулирующих функций микробных сообществ пойменных почв, а также могут быть применены для оценки потенциала среднеобской поймы с точки зрения экологических услуг и природопользования.

Выявленные сезонные изменения в характере взаимодействия бактерий с различными компонентами окружающей среды проливают свет на роль микробных сообществ в реализации климаторегулирующих функций пойменных экосистем.

Методология и методы исследования. Исследования основаны на комплексном подходе: использовалось сочетание полевых исследований, лабораторных, микробиологических и химико-аналитических работ, лабораторных экспериментов и статистических методов.

Исследование выполнено с использованием оборудования и техники уникальной научной установки «Система экспериментальных баз, расположенных вдоль широтного градиента» Национального исследовательского Томского государственного университета при финансовой поддержке Минобрнауки России ^-2296.61321X0043, 13.УНУ21.0005, договор № 075-152021-672); ряд химико-аналитических работ выполнены сотрудниками Томского регионального центра коллективного пользования (ТРЦКП); молекулярно-генетический анализ воды -сотрудниками лаборатории эволюционной цитогенетики НИИ биологии и биофизики ТГУ (НИИ ББ ТГУ).

Положения, выносимые на защиту:

1. Микробные сообщества поймы средней Оби обладают высоким таксономическим и функциональным разнообразием и пространственной и сезонной вариабельностью метаболической активности и распределения физиологических групп, отражающей адаптацию к гидрологическому циклу поймы.

2. Количественная связь между метаболической активностью микробных сообществ и структурой растворённого органического вещества в исследуемых водоёмах поймы сезонно изменчива и выражается корреляциями SUVA254 и содержания растворённого органического вещества с утилизацией органических тест-субстратов микробным сообществом.

Достоверность результатов исследования обеспечивается большим объемом фактического материала, применением современных аналитических и инструментальных методов исследования, подбором статистических методов обработки результатов, соответствующих специфике полученных в ходе исследования данных.

Апробация результатов работы. Результаты работ представлены в виде стендовых докладов на IV Ежегодном международном семинаре Сибирской Сети по изучению изменений окружающей среды (Томск, 2019), Четвёртой

Международной научной конференции (Томск, 2021), XIII Молодежной школе-конференции с международным участием (Москва, 2022), Четвёртом Росссийском микробиологическом конгрессе (Томск, 2023), Восьмой конференции молодых ученых Почвенного института им. В. В. Докучаева «Почвоведение. Горизонты будущего. 2024» (Москва, 2024.), а также в виде устных докладов на международной конференции «Научные чтения, посвященные 60-летию кафедры генетики и клеточной биологии Томского государственного университета» (Томск, 2024), VIII Международной Верещагинской Байкальской конференции (Иркутск, 2025), VIII Международной научной конференции, посвященной 95-летию кафедры почвоведения и экологии почв Томского государственного университета «Отражение био-, гео-, антропосферных взаимодействий в почвах и почвенном покрове» (Томск, 2025).

Публикации. По материалам диссертационного опубликовано 14 работ, в том числе 3 статьи в журналах, включенных в Перечень рецензируемых научных изданий, в которых должны быть опубликованы основные научные результаты диссертаций на соискание ученой степени кандидата наук, на соискание ученой степени доктора наук (все статьи в российских научных журналах, входящих в Scopus); 2 статьи в сборниках материалов конференций, представленных в изданиях, входящих в Scopus; 9 публикаций в сборниках материалов международных и всероссийских (в том числе с международным участием) научных конференций, Российского микробиологического конгресса, международного семинара и молодежной школы-конференции с международным участием.

Личный вклад автора. Автор с 2016 года принимал участие в планировании и проведении экспериментальных исследований. При непосредственном участии автора совместно с научным руководителем были сделаны выбор и обоснование темы научного исследования, определены цели, задачи и методы исследований. При участии автора осуществлены сбор почвенных и водных образцов, разработка дизайна экспериментов. Лично автором собрана и проанализирована научная литература, осуществлена пробоподготовка, реализация экспериментов и микробиологическая оценка образцов, обработка полученных данных, в том числе статистическая, и интерпретация полученных результатов исследований, представленных в диссертационной работе, а также их апробация на научных мероприятиях.

Объём и структура диссертации. Диссертационная работа изложена на 204 страницах, состоит из введения, трёх глав, заключения, списка условных обозначений и сокращений, списка использованной литературы, включающего 405 источников, из них 251 на иностранном языке, четырёх приложений, содержит 37 таблиц, 55 рисунков.

Благодарности. Автор выражает благодарность научному руководителю профессору кафедры ботаники ТГУ, заведующему лабораторией биоразнообразия и экологии НИИ ББ ТГУ, доктору биологических наук, профессору С. Н. Кирпотину за поддержку и помощь на всех этапах выполнения работы.

Особую признательность и благодарность автор выражает старшему научному сотруднику лаборатории биоразнообразия и экологии НИИ ББ ТГУ, кандидату биологических наук Л. Г. Колесниченко за идею работы и участие в теоретико-методологической и методической проработке, участие в постановке задач исследования, за организацию полевых работ и ценные замечания. Отдельную благодарность автор выражает старшему научному сотруднику научно-исследовательской лаборатории биологии и почвоведения ТГУ, кандидату биологических наук И. В. Лущаевой за полезные рекомендации, методологическое сопровождение и консультации в области микробиологических исследований при выполнении работы.

Также автор выражает благодарности доценту кафедры почвоведения и экологии почв ТГУ кандидату биологических наук Т. В. Раудиной за помощь в проведении и интерпретации результатов анализа содержания растворённого углерода в природных средах; доценту кафедры генетики и клеточной биологии ТГУ, кандидату биологических наук А. А. Коханенко за проведение нанопорового секвенирования и помощь в освоении методик по выделению бактериальной ДНК; старшему преподавателю кафедры теоретических основ информатики Института прикладной математики и компьютерных наук ТГУ Р. С. Воробьёву за анализ данных секвенирования и разработку интерактивных таксономических диаграмм; коллективу лаборатории биоразнообразия и экологии НИИ ББ ТГУ и ЦКП «Кайбасово» (С. Н. Воробьёву, Ю. Я. Колесниченко, А. А. Бызаакай, Б. А. Михалейко, Н. А. Жабиной, А. В. Сорочинскому, В. В. Дроздову и др.) за помощь в проведении полевых работ и участие в пробоотборах.

1 Обзор литературы

1.1 Особенности формирования и сезонная динамика пойменных озёр

Пойменные озёра - важная часть естественных и квазиестественных речных долин. Хотя их происхождение обычно отождествляют с процессом срезания меандрирующего перешейка, формирование пойменного бассейна обеспечивается также и другими процессами.

Экологические преимущества пойменного затопления представлены в исследованиях речных систем умеренного пояса в Испании [Drago, 1976], Юго-восточной Азии и верховьях Миссисипи [Junk et al., 1989 ; Bayley, 1995 ; Tockner et al., 2000], а также в пойме Амазонки [Melack, Forsberg, 2001 ; Parolin et al., 2004 ; Hamilton et al., 2007 ; Melack, Coe, 2021].

В результате трансформации лимнических процессов в различных условиях формируются гидроэкосистемы с разным уровнем саморегуляции и, соответственно, устойчивости: лимносистемы, или классические озёра, металимносистемы (озёрные водохранилища), гомолимносистемы (водохранилища и пруды), миксолимносистемы (старичные озёра) и псевдолимносистемы (карьерные водоёмы) [Лопух, Якушко, 2011].

Генетически котловины пойменных озёр можно классифицировать как гидрогенные речные эрозионно-аккумулятивные и разделить на семь видов: котловины озёр-стариц, озёр-проток, озёр межгривий, соров прирусловых, приустьевых, внутрипойменных, вторичных пойменных озёр [Белецкая, 1987].

Пойменные озёра возникают в результате свободного (завершённого и незавершённого) меандрирования речных русел [Лопух, Якушко, 2011] и отличаются значительным разнообразием по величине, характеру связи с создавшими их реками, по особенностям развития в них растительной и животной жизни [Земцов, Сурунов, 1993]. Форма гидрогенных котловин зависит от типа свободного меандрирования: при незавершённом меандрировании старичные озёра имеют серповидную форму, при завершённом - полуокруглую.

При отчуждении от основного русла отдельных рукавов реки в случае пойменной многорукавности формируются, как правило, длинные вытянутые озёра -староречья. В результате размыва поймы при выходе речного потока в половодье в многоводный год формируются так называемые «вертебы», которые имеют небольшую площадь и округлую котловину [Лопух, Якушко, 2011]. Характерной особенностью рек системы Оби является наличие озёр-соров («торов», «туров», «туманов») - временных крупных мелководных водоёмов. На сорах Томского приобья происходит нерест и нагул основной промысловой рыбы - частиковых [Иоганзен, 1971]. Соры возникают в устьях некоторых притоков Оби (например, р. Ларьеган) [Земцов, Сурунов, 1993]. Вторичные пойменные озёра, по Е. В. Шанцеру [1951], образуются в констративную фазу динамики реки, преимущественно вдали от русла на плохо дренируемых участках поймы, где грунтовые воды залегают близко к поверхности [Белецкая, 1987].

Пойменные, главным образом старичные, озёра обычно имеют небольшую абсолютную и относительную глубину и большую длину ветрового разгона, и поэтому теоретически должны быть полимиктическими [Padisak, Reynolds, 2003]. В отношении эволюции старичных озёр следует отметить их временную неустойчивость, которая является аномальным явлением в эволюционном ряду лимносистем и сопряжена с сезонной изменчивостью (рисунок 1), характеризующейся сменой трофического состояния и гидрохимических характеристик [Melack et al., 2021 ; Heu et al., 2023]. В весенний период они развиваются как эвтрофные водоёмы, приобретая черты дистрофирующего водоёма к концу летне-осеннего гидрологического периода. Кратковременный зимний режим прерывается весенним обновлением и омоложением. Положение старичных озёр на пойме способствует ежегодному обновлению водных масс и формированию сезонных (временных) состояний гидроэкосистем с различным уровнем трофии. Длительность этой стадии зависит от степени (полной, частичной или постоянной) гидравлической связи с рекой, например, изолированные озёра-вертебы практически исчезают за 3-4 десятилетия, а большие и вытянутые старицы существуют более долго, что объясняется ежегодным промывным режимом

и отсутствием интенсивного процесса накопления илов. Водная мелиорация и обмеление рек способствуют более быстрому заилению и зарастанию котловин озёр. Скорость полного перерождения стариц тесно связана с периодами разной водности. Продолжительный период снижения водности способствует более быстрому дистрофированию и заилению ложа. Наступление многоводного периода способствует некоторому обновлению водоёмов, однако полное обновление наступает редко и водоёмы превращаются в болото низинного типа [Лопух, Якушко, 2011].

Глубина наиболее молодых, менее заросших озёр достигает 5-7 м. Мелководные сильно заросшие озёра подвержены зимой заморным явлениям. Абсолютный возраст пойменных озёр не превышает 10 000 лет - они образовались в голоцене [Земцов, Сурунов, 1993].

2

~ 1

Фаза наполнения, весеннего промывного режима с признаками олиготрофии

1_

1 - сезонные фазы маловодных лет; 2 - сезонные фазы многоводных лет Рисунок 1 - Схема сезонных фаз развития пойменных озёр (по [Лопух, Якушко, 2011])

Для пойменных озёр характерна постоянная или временная связь с рекой. Одни озёра заливаются рекою во время весеннего половодья, другие - только при самых высоких уровнях воды и не ежегодно [Земцов, Сурунов, 1993]. Мелкие, нестратифицированные, обычно с преобладанием макрофитов и эвтрофные озёра, заводи или пруды различного размера и с низким временем удерживания являются очень распространёнными компонентами равнинных речных систем. Эти типы водоёмов обычно связаны речной сетью 2-4 порядка, особенно в послеледниковых

равнинных районах [Strahler, 1957]. По мере того, как осадки и сток увеличивают уровень воды, затопленные территории расширяются, способствуя гидрологическим связям между пойменными озёрами и речными руслами. С отступлением воды экологические процессы в озёрах всё больше отделяются от влияния рек. Испарение, осадки и гидрологический обмен между озёрами, водосборами и реками играют ключевую роль в поддержании экологического равновесия и взаимосвязанности водных и водно-болотных экосистем [Xue et al., 2024].

С точки зрения ландшафтной экологии систему «река--озеро» можно рассматривать как продольный состав двух различных гидрологически связанных участков -- лотового и стокового, а также их переходных зон (экотонов), т. е. участков смешения озёрных и речных водных масс [Forman, Godron, 1986 ; Hillbricht-Ilkowska, 1993 ; Hillbricht-Ilkowska, Weglenska, 1996]. Таким образом, основными физическими элементами структуры речно-озёрных систем низшего порядка являются лотические (ручьи), линзовые (озёрные) компоненты и их переходные зоны. Пространственная структура этих трёх компонентов образует основной шаблон среды обитания всей системы, контролирующий транспорт и трансформацию вещества внутри системы, а также её биоразнообразие [Hillbricht-Ilkowska, 1999; Hamilton et al., 2007 ; Silva et al., 2021; Xue et al., 2024 ; Cajado et al., 2025].

Элементы и питательные вещества, переносимые рекой, откладываются и расщепляются в экосистеме озера и впоследствии экспортируются вниз по течению. Конечный результат этих процессов определяет озеро как сток или источник питательных и органических веществ в речной системе [Hillbricht-Ilkowska, 1999]. Пойменные озёра могут изменять перемещения полых вод по пойме [Richey et al., 1989]. Следовательно, озёра можно рассматривать как «нарушения» или «вставки» в непрерывный характер самой речной системы. По сравнению с речными фрагментами, расположенными выше и ниже по течению, они изменяют скорость переноса и трансформируют характер речного вещества.

1.2 Роль пресных озёр в углеродном цикле и трансформации органического

вещества

Пойменные экосистемы являются важным компонентом земной экологии, играя ключевую роль в процессах трансформации органического вещества, обеспечивая его деструкцию, физическую, химическую и биологическую фильтрацию поступающих в Мировой океан поверхностных вод, удержание углерода с формированием так называемых углеродных резервуаров, представленных накапливаемым в пойменных почвах органическим веществом. Озёра выступают в качестве основных источников и поглотителей метана и на их долю приходится от 6 до 16 % метана, вырабатываемого биологическим путем [Stocker et al., 2013]. Скорость разложения органического углерода в озёрах на один или два порядка выше, чем в почвах и океанах [Catalán et al., 2016 ; Du et al., 2023].

Растворённое органическое вещество (РОВ), как важный и активный компонент водных экосистем, играет значительную роль в регулировании геохимических циклов и циклов углерода [Xia et al., 2024]. В случае эвтрофикации водоёмов состав и свойства РОВ, а также микробное сообщество могут значительно измениться [Orland et al, 2020 ; Xenopoulos et al., 2021 ; Wen et al., 2022], что имеет особое значение в контексте поемного цикла. Также на состав и структуру РОВ влияет неоднородность среды озера [Xia et al., 2024].

Органическое вещество водных экосистем представляет собой сложную смесь разнообразных органических соединений, которые могут находиться в воде как в растворённом, так и во взвешенном состоянии. Они составляют динамическую систему, в которой под действием комплекса физико-химико-биологических факторов непрерывно происходит переход компонентов из одного состояния в другое (рисунок 2) [Вождаева и др., 2016]. В формировании РОВ водных объектов играют роль как аллохтонные органические вещества, поступающие с территории водосбора, так и автохтонные вещества, образующиеся в самом водоёме. Органическое вещество является неотъемлемым компонентом химического состава природных вод, а также выступает в роли показателя происходящих в них продукционно-деструкционных процессов.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Никиткина Эллина Георгиевна, 2025 год

Список использованной литературы

1. Аветов Н. А. Агроэкологическая характеристика почв среднего Приобья / Н. А. Аветов, Д. С. Булгаков, Е. А. Шишконакова // Плодородие. - 2008. - № 4. -С. 39-41.

2. Агроклиматические ресурсы Томской области : справочник / сост. В. Л. Кухарская, Т. И. Петкун, Э. Л. Тихонова, И. Н. Тощакова, М. И. Черникова, В. И. Садонина, Н. П. Сковородина. - Л. : Гидрометеоиздат, 1975. - 147 с.

3. Агроклиматический справочник по Томской области. - Л. : Гидрометеоиздат, 1960. - 135 с.

4. Алекин О. А. Основы гидрохимии : учебное пособие / О. А. Алекин. -Л. : Гидрометеоиздат, 1953. - 296 с.

5. Алекин О. А. Основы гидрохимии : учебное пособие / О. А. Алекин. -Л. : Гидрометеоиздат, 1970. - 443 с.

6. Аристовская Т. В. Микробиология подзолистых почв / Т. В. Аристовская. -М.; Л. : Наука, 1965. - 186 с.

7. Бабьева И. П. Биология почв : учебник / И. П. Бабьева, Г. М. Зенова. - М. : Издательство Московского государственного университета, 1989. - 336 с.

8. Баканов А. И. Использование зообентоса для мониторинга пресноводных водоемов (обзор) / А. И. Баканов // Биология внутренних вод. - 2000. - №2 1. - С. 6882.

9. Белецкая Н. П. Генетическая классификация озерных котловин ЗападноСибирской равнины / Н. П. Белецкая // Геоморфология. - 1987. - № 1. - С. 50-58.

10. Белюченко И. С. Микроорганизмы почв и их роль в функционировании аграрных ландшафтов / И. С. Белюченко // Наука, технологии и инновации в современном мире : сборник материалов III Международной конференции. Уфа, 29-30 июля 2016 г. - Уфа : Исследовательский центр информационно-правовых технологий, 2016. - С. 18-25.

11. Болотнов В. П. Использование индекса воздействия половодий для мониторинга пойменных экосистем (на примере поймы средней Оби) /

B. П. Болотнов // Известия Томского политехнического университета. - 2007. -Т. 310, № 3. - С. 26-30.

12. Булатов В. И. Обь-Иртышский бассейн как геосистема: вопросы теории и практики эколого-географического изучения / В. И. Булатов, Н. О. Игенбаева. -Ханты-Мансийск : Информационно-издательский центр Югорского государственного университета, 2010. - 83 с.

13. Верховцева Н. В. Водная микробиология : учебное пособие / Н. В. Верховцева, Е. П. Никифорова. - Ярославль : Ярославский государственный университет, 1984. - 68 с.

14. Вильямс В. Р. Основы земледелия : учебник / В. Р. Вильямс. - 4-е изд. -М. : Сельхозгиз, 1946. - 192 с.

15. Вождаева М. Ю. Влияние сезонной динамики и реагентной обработки на качество растворенного органического вещества в водоисточниках и питьевой воде г. Уфы / М. Ю. Вождаева, Е. В. Вагнер, Л. И. Кантор, А. И. Константинов, И. В. Перминова, Е. А. Кантор, Н. В. Труханова, И. А. Мельницкий // Вестник Московского университета. Серия 2. Химия. - 2016. - Т. 57, № 5. - С. 369-375.

16. Воронин А. Д. Основы физики почв : учебное пособие / А. Д. Воронин. -М. : Издательство Московского университета, 1986. - 244 с.

17. Вылцан Н. Ф. Прибрежно-водная растительность пойменных водоемов среднего течения Оби (Томская область) / Н. Ф. Вылцан // Вопросы биологии : сборник статей. - Томск : Издательство Томского университета, 1980. - С. 76-83.

18. Гафуров Ф. Г. Экотопологическая характеристика луговых сообществ поймы низовьев Оби / Ф. Г. Гафуров, И. М. Скулкин // Экология. - 1987. - № 3. -

C. 73-75.

19. Гельцер Ю. Г. Биологическая диагностика почв : учебное пособие / Ю. Г. Гельцер. - М. : Издательство Московского государственного университета, 1986. - 78 с.

20. Гиззатова Г. Л. Уреаза - ключевой фермент биодеградации мочевины / Г. Л. Гиззатова, Т. А. Шипаева // Международный научно-исследовательский журнал. - 2016. - № 3 (45), ч. 3. - С. 88-90.

21. Горленко М. В. Мультисубстратное тестирование почвенных микробных сообществ : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 03.00.07 / Горленко Михаил Владимирович. - М., 1995. - 23 с.

22. Григорьян Б. Р. Методические рекомендации по оценке почвенно-экологического состояния земель сельхозназначения на соответствие требованиям органического земледелия / Б. Р. Григорьян, Т. Г. Кольцова, Л. М. Сунгатуллина. -Казань : Отечество, 2014. - 52 с.

23. Демкин В. П. Высокопроизводительная геоинформационная система мониторинга и прогнозирования состояния природных объектов для решения научно-технических и образовательных задач / В. П. Демкин, В. В. Хромых, А. Е. Березин, С. Н. Воробьев, Д. А. Вершинин, Е. Л. Лобода, П. П. Щетинин, Т. Б. Корнеева // Открытое и дистанционное образование. - 2016. - №2 4 (64). - С. 511.

24. Добровольская Т. Г. Структура бактериальных сообществ почв / Т. Г. Добровольская. - М. : Академкнига, 2002. - 283 с.

25. Добровольский Г. В. Классификация пойменных почв лесной зоны / Г. В. Доровольский // Почвоведение. - 1958. - № 8. - С. 93-101.

26. Добровольский Г. В. Почвы речных пойм центра Русской равнины / Г. В. Добровольский. - М. : Издательство Московского государственного университета, 1968. - 296 с.

27. Добровольский Г. В. Поймы рек как ландшафты высокой плотности жизни и интенсивного почвообразовательного процесса / Г. В. Добровольский // Биологическая продуктивность и круговорот химических элементов в растительных сообществах : сборник статей. - Л. : Наука. Ленинградское отделение, 1971. - С. 226-231.

28. Добровольский Г. В. Типология почв поймы среднего течения р. Оби / Г. В. Добровольский, Т. В. Афанасьева, Г. Л. Ремезова // Природные условия Западной Сибири : сборник статей. - М. : Издательство Московского университета, 1973. - Вып. 3. - С. 107-126.

29. Добровольский Г. В. Земельные ресурсы поймы Средней Оби и их рациональное использование / Г. В. Добровольский, Т. В. Афанасьева, П. Н. Балабко, Л. Б. Востокова, Т. В. Терешина // Проблемы использования и охраны почв Сибири и Дальнего Востока : сборник статей. - Новосибирск : Наука. Сибирское отделение, 1984. - С. 161-166.

30. Добровольский Г. В. Аллювиальные почвы речных пойм и дельт и их зональные отличия / Г. В. Добровольский, П. Н. Балабко, Н. В. Стасюк, Е. П. Быкова // Аридные экосистемы. - 2011 а. - Т. 17, № 3 (48). - С. 5-13.

31. Добровольский Г. В. Роль почвы в формировании и сохранении биологического разнообразия / Г. В. Добровольский, И. Ю. Чернов, А. А. Бобров, Т. Г. Добровольская, Л. В.Лысак, В. Г. Онипченко, К. Б. Гонгальский, А. С. Зайцев, В. А. Терехова, Т. А. Соколова, В. Г. Терехин, Е. В. Шмарикова, О. В. Чернова. -М. : Товарищество научных изданий КМК, 2011 б. - 273 с.

32. Дыдина Р. А. Обь-Иртышские луга в пределах Ханты-Мансийского округа / Р. А. Дыдина // Труды / Научно-исследовательский институт сельского хозяйства Крайнего Севера. - Норильск, 1961. - Т. X : Пойменные луга Крайнего Севера. Приемы их использования и улучшения. - С. 159-250.

33. Заварзин Г. А. Введение в природоведческую микробиологию : учебник / Г. А. Заварзин, Н. Н. Колотилова. - Москва : Университет, 2001. - 256 с.

34. Зайков Б. Д. Средний сток и его распределение в году на территории СССР / Б. Д. Зайков. - Л. ; М. : Гидрометеоиздат, 1946. - 147 с. - (Труды научно-исследовательских учреждений Гидрометслужбы СССР / Государственный ордена Трудового красного знамени гидрологический институт). Серия IV. Гидрология суши. Вып. 24).

35. Зайков Б. Д. Очерки гидрологических исследований в России / Б. Д. Зайков. - Л. : Гидрометиздат, 1973. - 325 с.

36. Звягинцев Д. Г. Биологическая активность почв и шкалы для оценки некоторых ее показателей / Д. Г. Звягинцев // Почвоведение. - 1978. - № 6. - С. 48-54.

37. Звягинцев Д. Г. Почва и микроорганизмы / Д. Г. Звягинцев. -М. : Издательство Московского университета, 1987. - 256 с.

38. Звягинцев Д. Г. Биология почв : учебник / Д. Г. Звягинцев, И. П. Бабьева, Г. М. Зенова. - 3-е изд., испр. и доп. - М. : Издательство Московского университета, 2005. - 445 с. - (Классический университетский учебник).

39. Земцов А. А. Озера Томского Приобья и их ресурсы / А. А. Земцов, Н. Ф. Сурунов // География и природные ресурсы. - 1993. - № 4. - С. 106-110.

40. Зигбан К. Электронная спектроскопия : пер. с англ. / К. Зигбан, К. Нордлинг, А. Фальман, Р. Нордберг, К. Хамрин, Я. Хедман, Г. Йоханссон, Т. Бергмарк, С. Карлссон, И. Линдгрен, Б. Линдберг. - М. : Мир, 1971. - 493 с.

41. Иванов Ф. Д. Сезонная динамика численности микроорганизмов в естественных и антропогенно-преобразованных почвах г. Ростова-на-Дону / Ф. Д. Иванов, А. В. Горовцов // Генетика - фундаментальная основа инноваций в медицине и селекции : материалы VIII научно-практической конференции с международным участием. Ростов-на-Дону, 26-29 сентября 2019 г. - Ростов-на-Дону ; Таганрог : Издательство Южного федерального университета, 2019. -С. 121-123.

42. Иванова И. С. Структурно-групповой состав растворенного органического вещества в водах термокарстовых озер Большеземельской тундры / И. С. Иванова, И. С. Король, Л. С. Широкова, О. С. Покровский // Известия Томского политехнического университета. Инжиниринг георесурсов. - 2018. -Т. 329, № 7. - С. 6-16.

43. Инишева Л. И. Почвенно-экологическое обоснование комплексных мелиораций / Л. И. Инишева. - Томск : Издательство Томского университета, 1992. - 270 с.

44. Иоганзен Б. Г. Природа Томской области / Б. Г. Иоганзен. - Изд-е 3-е, перераб. и доп. - Томск. : Томское книжное издательство, 1963. - 234 с.

45. Иоганзен Б. Г. Пойма Оби: природа, освоение, мелиорация / Б. Г. Иоганзен, Н. Ф. Тюменцев. - Новосибирск : Западно-Сибирское книжное издательство, 1968. - 159 с.

46. Иоганзен Б. Г. Природа Томской области / Б. Г. Иоганзен. - 4-е изд., перераб. - Новосибирск : Западно-Сибирское книжное издательство, 1971. - 176 с.

47. Клебанович Н. В. Почвы мира в системе WRB : практикум / Н. В. Клебанович. - Минск : Белорусский государственный университет, 2015. -41 с.

48. Когут Б. М. Оценка насыщенности почвы органическим углеродом / Б. М. Когут, В. М. Семенов // Бюллетень Почвенного института имени В. В. Докучаева. - 2020. - Вып. 102. - С. 103-124.

49. Колотова О. В. Выделение и изучение липидоокисляющих микроорганизмов - обитателей Северного Каспия / О. В. Колотова, И. В. Соколова, И. В. Владимцева, Т. В. Беленькова, В. С. Шевцова // Вестник технологического университета. - 2017. - Т. 20, № 6. - С. 115-138.

50. Кононова М. М. Органическое вещество почвы, его природа, свойства и методы изучения / М. М. Кононова. - М. : Издательство Академии наук СССР, 1963. - 315 с.

51. Концевая И. И. Влияние микробного препарата ПолиФунКур на агрономически полезные группы микроорганизмов почвы в посевах кукурузы / И. И. Концевая, Н. М. Дайнеко, К. О. Зяблицкий, А. В. Минина // Бюллетень науки и практики. - 2018. - Т. 4, № 9. - С. 96-102.

52. Концевая И. И. Оценка состояния микробоценоза почвы при обработке пожнивных остатков микробным биопрепаратом Жыцень / И. И. Концевая, Н. М. Дайнеко, С. Ф. Тимофеев // Известия Гомельского государственного университета имени Ф. Скорины. - 2019. - № 3 (114). - С. 41-45.

53. Краснова Е. С. Фототрофные бактерии в стратифицируемых малых озерах среднего течения реки Ик / Е. С. Краснова, М. В. Уманская, М. Ю. Горбунов // Известия Пензенского государственного педагогического университета им. В. Г. Белинского. - 2011. - № 25. - С. 528-534.

54. Крицков И. В. Сезонная динамика взвешенного стока в некоторых реках бассейна Средней Оби / И. В. Крицков, С. В. Лойко, С. П. Кулижский, О. С. Покровский // Материалы I Белорусского географического конгресса: к 90-летию факультета географии и геоинформатики Белорусского государственного университета и 70-летию Белорусского географического общества. Минск, 08-

13 апреля 2024 г. : в 7 ч. - Минск : Белорусский государственный университет, 2024. - Ч. 4 : Почвенные и геохимические исследования. Геоинформационные технологии. - С. 155-159.

55. Круглов Ю. В. Микробное сообщество почвы: физиологическое разнообразие и методы исследования / Ю. В. Круглов // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - № 51, № 1. - С. 46-59.

56. Лапшина Е. Д. Флора болот юго-востока Западной Сибири / Е. Д. Лапшина. - Томск : Издательство Томского университета, 2003. - 296 с.

57. Леонтьева М. С. Влияние поемного режима на таксономическую структуру почвенных бактериальных комплексов / М. С. Леонтьева Т. Г. Добровольская, Т. Н. Початкова // Вестник Московского университета. Серия 17. Почвоведение. - 2005. - № 1. - С. 36-39.

58. Логинов О. Н. Хитинолитическая активность бактерий рода Pseudomonas -потенциальных объектов агробиотехнологий / О. Н. Логинов, А. И. Мелентьев, Т. Ф. Бойко, Н. Ф. Галимзянова, Е. В. Свешникова, Н. Н. Силищев, Г. Э. Актуганов // Современные перспективы в исследовании хитина и хитозана (Росхит 2006) : материалы 8-й Международной конференции. Казань, 12-17 июня 2006 г. - М. : Издательство Всероссийского научно-исследовательского института рыбного хозяйства и океанографии, 2006. - С. 293-296.

59. Лопух П. С. Общая лимнология : пособие / П. С. Лопух, О. Ф. Якушко. -Минск : Белорусский государственный университет, 2011. - 365 с.

60. Лукомская К. А. Микробиология с основами вирусологии : учебное пособие / К. А. Лукомская. - М. : Просвещение, 1987. - 192 с.

61. Львов Ю. А. К характеристике растительности поймы реки Оби / Ю. А. Львов // Труды / Томский государственный университет им. В. В. Куйбышева. Серия биологическая. - Томск, 1963. - Т. 152 : Природа поймы реки Оби и ее хозяйственное освоение. - С. 258-267.

62. Львович М. И. Реки СССР / М. И. Львович. - М. : Мысль, 1971. - 348 с.

63. Маккавеев Н. И. Русло реки и эрозия в ее бассейне / Н. И. Маккавеев. -М. : Издательство Академии наук СССР, 1955. - 347 с.

64. Матюгина Е. Б. Структурно-функциональная организация микробных сообществ водотоков и водоемов верхней части бассейна реки Хилок : дис. ... канд. биол. наук : 03.00.16, 03.00.07 / Матюгина Евгения Борисовна. - Улан-Удэ, 2002. -187 с.

65. Мехтиев С. Я. Некоторые данные по изучению различных почв Молдавии / С. Я. Мехтиев // Микробиология. - 1959. - T. 25, вып. 5. - С. 31-38.

66. Мишустин Е. Н. Микроорганизмы и плодородие почвы / Е. Н. Мишустин. - М. : Издательство Академии наук СССР, 1956. - 247 с. -(В помощь сельскому хозяйству).

67. Мишустин Е. Н. Микроорганизмы и продуктивность земледелия / Е. Н. Мишустин. - М. : Наука, 1972. - 343 с.

68. Молчаново. Архив погоды // Погода и климат : справочно-информационный портал. - [Б. м.], 2004-2023. - URL: http://www.pogodaiklimat.ru/ weather.php?id=29332 (дата обращения: 09.09.2024).

69. Мосина Л. В. Антропогенное изменение лесных экосистем в условиях мегаполиса Москва : дис. ... д-ра. биол. наук : 03.00.16 / Мосина Людмила Владимировна. - М., 2002. - 458 с.

70. Непряхин Е. М. Пойменные почвы южных и юго-восточных районов Томской области / Е. М. Непряхин // Труды / Томский государственный университет имени В. В. Куйбышева. Серия биологическая. - Томск, 1963. - Т. 152 : Природа поймы реки Оби и ее хозяйственное освоение. - С. 240-257.

71. Нечаева Е. Г. Геохимические закономерности торфообразования на Западно-Сибирской равнине / Е. Г. Нечаева // География и природные ресурсы. -1992. - № 3. - С. 21-29.

72. Нечаева Е. Г. Дифференциация почвенного покрова в долине Нижней Оби / Е. Г. Нечаева // Почвоведение. - 2008. - № 11. - 1307-1313.

73. Никитин Б. А. Методика определения содержания гумуса в почве / Б. А. Никитин // Агрохимия. - 1972. - № 3. - С. 123-125.

74. Никитина В. Г. Микрофлора и биохимическая активность пойменных почв Нижнего Иртыша / В. Г. Никитина // Долина Нижнего Иртыша. Современное

состояние природной среды : сборник статей. - Иркутск : Институт географии Сибири и Дальнего Востока, 1978. - С. 81-89.

75. Никитина З. И. Численность и биомасса микроорганизмов в почвах поймы Нижнего Иртыша / З. И. Никитина, Ю. Н. Барыкова // Почвоведение. -1982. - № 9. - С. 109-115.

76. Никитина З. И. Микробиологический мониторинг наземных экосистем / З. И. Никитина. - Новосибирск : Наука. Сибирское отделение, 1991. - 222 с.

77. Никиткин В. А. Распределение эколого-трофических групп микроорганизмов плоскобугристых торфяников Западной Сибири = Distribution of Ecological-Trophic Groups of Microorganisms of Flat-Pebble Peatlands of Western Siberia / В. А. Никиткин, Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева // Сибирь в глобальном контексте. Взаимодействия и обратные связи арктических и южных территорий Сибири в условиях быстро меняющегося климата: окружающая среда и местные сообщества : тезисы докладов IV ежегодного международного семинара Сибирской Сети по изучению изменений окружающей среды (SecNet). Томск, 01-05 октября 2019 г. - Томск : Издательский Дом Томского государственного университета, 2020. - С. 62-66. (на рус. и англ. яз.).

78. Никиткин В. А. Изменение структуры микробного сообщества вследствие таяния многолетнемерзлотного слоя плоскобугристого торфяника / В. А. Никиткин, Л. Г. Колесниченко, Э. Г. Никиткина, А. В. Пивоварова, Е. Р. Халиулина, Е. Ю. Варзарова, И. В. Лущаева // Торфяные болота Сибири: функционирование, ресурсы, восстановление : материалы Четвертой Международной научной конференции. Томск, 01-08 октября 2021 г. - Томск : Издательство Ипполитова, 2021. - С. 55-57.

79. Никиткин В. А. Стратегии распределения эколого-трофических групп микроорганизмов в торфяных криогенных почвах Западной Сибири / В. А. Никиткин, И. В. Лущаева, Н. Н. Терещенко, Э. Г. Никиткина, Л. Г. Колесниченко // Актуальные аспекты современной микробиологии : сборник тезисов XIII Молодежной школы-конференции с международным участием. Москва, 16-18 ноября 2022 г. - М. : ВАШ ФОРМАТ, 2022. - С. 189-190.

80. Никиткина Э. Г. Влияние гетеротрофных бактерий на растворенный органический углерод в растительных фильтратах / Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева, В. А. Никиткин, Т. В. Раудина, Л. Г. Колесниченко // Актуальные аспекты современной микробиологии : сборник тезисов XIII Молодежной школы-конференции с международным участием. Москва, 16-18 ноября 2022 г. -М. : ВАШ ФОРМАТ, 2022. - С. 191-192.

81. Никиткина Э. Г. Микробиота пойменного озера среднего течения реки Оби и ее роль в трансформации органического вещества / Э. Г. Никиткина, В. А. Никиткин, И. В. Лущаева, Р. С. Воробьёв, Л. Г. Колесниченко // 4-й Российский микробиологический конгресс : тезисы. Томск, 24-29 сентября 2023 г. - Томск : Издательский Дом Томского государственного университета, 2023. - С. 225.

82. Никиткина Э. Г. Метаболическая активность гетеротрофных микробных сообществ пойменных озёр среднего течения реки Оби / Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева, Л. Г. Колесниченко // Научные чтения, посвящённые 60-летию кафедры генетики и клеточной биологии Томского государственного университета : материалы международной конференции. Томск, 23-26 сентября 2024 г. - Томск : Издательство Томского государственного университета, 2024 а. - С. 31-32.

83. Никиткина Э. Г. Трофическая структура почвенных микробоценозов поймы среднего течения реки Оби / Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева, Л. Г. Колесниченко // Почвоведение. Горизонты будущего. 2024 : сборник тезисов докладов восьмой конференции молодых учёных Почвенного института им. В. В. Докучаева. Москва, 16-20 сентября 2024 г. - М. : Почвенный институт им. В.В. Докучаева, 2024 б. - С. 205-206.

84. Никиткина Э. Г. Метаболическая активность гетеротрофных микробных сообществ пойменных озёр среднего течения реки Оби / Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева, Л. Г. Колесниченко // Вестник Томского государственного университета. Биология. - 2025 а. - № 69. - С. 130-138.

85. Никиткина Э. Г. Микробиологическое разнообразие пойменного озера среднего течения реки Оби / Э. Г. Никиткина, Р. С. Воробьёв, И. В. Лущаева, А. А. Коханенко // VIII Международная Верещагинская Байкальская конференция :

тезисы докладов и стендовых сообщений. Иркутск, 08-14 сентября 2025 г. -Иркутск : Издательство Иркутского государственного университета, 2025 б. -С. 418-419.

86. Никиткина Э. Г. Сезонная динамика и функциональная активность микробных сообществ аллювиальных почв поймы средней Оби / Э. Г. Никиткина, И. В. Лущаева, Л. Г. Колесниченко // Отражение био-, гео-, антропосферных взаимодействий в почвах и почвенном покрове : сборник материалов VIII Международной научной конференции, посвященной 95-летию кафедры почвоведения и экологии почв ТГУ Томск, 16-19 сентября 2025 г. - Томск : Издательство Томского государственного университета, 2025 в. - С. 103-106.

87. Николаев А. Я. О механизме индукции синтеза аспарагиназы и глутаминазы аспарагиновой и глутаминовой кислотами у Pseudamonas fluorescens АГ / А. Я. Николаев, Н. Н. Соколов, С. Р. Мардашев // Биохимия. - 1971. - Т. 36, вып. 3. - С. 643-648.

88. Норовсурэн Ж. Закономерности географического распространения актиномицетов в почвах Монголии / Ж. Норовсурэн. - М. : Издательство РГАУ -МСХА им. К. А. Тимирязева, 2009. - 168 с.

89. Огребо Е. А. Особенности природы поймы средней Оби на участке Локосово - Мегион / Е. А. Огребо, В. С. Хромых // Вестник Томского государственного университета. Серия «Науки о Земле». - 2003. - Приложение № 3 (IV) : Проблемы геологии и географии Сибири : материалы научной конференции. Томск, 02-04 апреля 2003 г. - С. 85-87.

90. Одум Ю. Экология : пер. с англ. в 2 т. / Ю. Одум. - М. : Мир, 1986. - Т. 2. -

376 с.

91. Остроумов С. А. Растворенное органическое вещество, белки и биологическое сообщество водных экосистем: обнаружение роли экзоферментов гетеротрофных бактерий в использовании растворенных белков зелеными водорослями / С. А. Остроумов, А. П. Садчиков // Экологическая химия. - 2025. -Т. 34, № 4. - С. 201-208.

92. Паринкина О. М. К микробиологической характеристике некоторых почв Западного Таймыра / О. М. Паринкина // Биогеозенозы Таймырской тундры и их продуктивность : сборник статей. - Л. : Наука. Ленинградское отделение, 1971. - С. 108-115.

93. Пашнева Г. Е. Эколого-экономический ущерб пашне юга Томской области от развития эрозионных процессов / Г. Е. Пашнева, Н. С. Евсеева // Эколого-экономические проблемы природопользования в Сибири : сборник тезисов научной конференции. Новосибирск, 03-05 февраля 1992 г. - Новосибирск : [б. и.], 1992. -С. 46-48.

94. Петров И. Б. Обь-Иртышская пойма. Типизация и качественная оценка земель / И. Б. Петров. - Новосибирск : Наука. Сибирское отделение, 1979. - 136 с.

95. Подшивалина В. Н. Весенний зоопланктон пойменных озёр: разнообразие, структура и особенности формирования в связи с изменчивостью гидрологического режима / В. Н. Подшивалина // Экология. - 2022. - № 3. - С. 234238.

96. Практикум по микробиологии : учебное пособие / М. Н. Пименова, Н. Н. Гречушкина, Е. И. Козлова, В. Н. Максимов, Г. А. Новикова, И. Т. Нетте, Л. И. Воробьева, Ж. К. Лория, С. В. Каменева. - М. : Издательство Московского университета, 1976. - 307 с.

97. Рафаилова Э. А. Микрофлора периодически затопляемых почв на примере острова Большой Мансур / Э. А. Рафаилова, Р. И. Тухбатова, А. В. Панкова, Ф. К. Алимова // Вода: химия и экология. - 2009. - № 4. - С. 18-22.

98. Роднянская Э. Е. Типология пойменных ландшафтов на примере реки Оби / Э. Е. Роднянская // Известия Всесоюзного географического общества. -1960. - Т. 92, № 1. - С. 24-35.

99. Рожкова-Тимина И. О. Эколого-биогеохимические особенности водоемов поймы среднего течения реки Оби : дис. ... канд. биол. наук : 03.02.08 / Рожкова-Тимина Инна Олеговна. - Томск, 2019. - 192 с.

100. Савенко В. С. Химический состав взвешенных наносов рек Мира / В. С. Савенко. - М. : ГЕОС, 2006. - 174 с.

101. Савич В. И. Микробиологическая активность почв как фактор почвообразования / В. И. Савич, Л. В. Мосина, Ж. Норовсурэн, О. Д. Сидоренко, Д. С. Аникина // Международный сельскохозяйственный журнал. - 2019. -№ 1 (367). - Р. 38-42.

102. Савичев О. Г. Реки Томской области: состояние, использование и охрана / О. Г. Савичев. - Томск : Издательство Томского политехнического университета, 2003. - 201 с.

103. Савичев О. Г. Гидрохимический сток в бассейне Средней Оби и условия его формирования / О. Г. Савичев // Вопросы географии Сибири : сборник статей. -Томск : Томский государственный университет, 2009. - Вып. 27. - С. 17-22.

104. Сазанова К. В. Органические кислоты грибов и их эколого-физиологическое значение : дис. ... канд. биол. наук : 03.01.05, 03.02.12 / Сазанова Катерина Владимировна. - СПб., 2014. - 159 с.

105. Семериков Л. Ф. Природа поймы нижней Оби. Наземные экосистемы / Л. Ф. Семериков, В. С. Балахонов, М. И. Брауде, Ф. Г. Гафуров, Б. А. Миронов, Н. Н. Никонова, Н. В. Пешкова, В. В. Плотников, Ю. Ф: Рождественский, В. Ф. Сосин, И. М. Скулкин, Т. В. Фамелис, Л. И. Агафонов, Н. А. Лобанова. -Екатеринбург : УрО РАН, 1992. - Т. 1. - 214 с.

106. Семёнова И. Н. Мониторинг микробных сообществ почв, расположенных в окрестностях Сибайской обогатительной фабрики, методом мультисубстратного тестирования / И. Н. Семёнова, А. Б. Зулкарнаев, Г. Р. Ильбулова, Я. Т. Суюндуков // Фундаментальные исследования. - 2011. - № 9, ч. 1. - С. 139141.

107. Середина В. П. Экологическое состояние почв пойменных экосистем в условиях локального загрязнения нефтью (Западная Сибирь) / В. П. Середина, М. В. Носова // Почвы в биосфере : сборник материалов всероссийской научной конференции с международным участием, посвященной 50-летию Института почвоведения и агрохимии СО РАН. Новосибирск, 10-14 сентября 2018 г. - Томск : Издательство Томского государственного университета, 2018. -Ч. 1. -С. 372-376.

108. Славнина Т. П. Почвы поймы Средней Оби, их мелиоративное состояние и агрохимическая характеристика / Т. П. Славнина, Г. Е. Пашнева, М. И. Кахаткина, Р. Г. Иванова, М. Д. Абрамова, В. П. Середина, Л. А. Изерская. - Томск : Издательство Томского университета, 1981. - 227 с.

109. Славнина Т. П. Биологическая активность почв Томской области / Т. П. Славнина, Л. И. Инишева - Томск : Издательство Томского университета, 1987. - 216 с.

110. Сметанин И. С. Почвы поймы реки Оби / И. С. Сметанин // Труды / Томский государственный университет имени В. В. Куйбышева. Серия биологическая. - Томск, 1963. - Т. 152 : Природа поймы реки Оби и ее хозяйственное освоение. - С. 221-239.

111. Сорокин Н. Д. Микробиологическая трансформация углерода и азота в лесных почвах Средней Сибири / Н. Д. Сорокин, Д. Е. Александров // Вестник Красноярского государственного аграрного университета. - 2013. - №2 9. - С. 74-77.

112. Сэги Й. Методы почвенной микробиологии : пер. с венг. / Й. Сэги. -М. : Колос, 1983. - 296 с.

113. Таран Г. С. Синтаксономия лугово-болотной растительности поймы средней Оби (в пределах Александровского района Томской области). Препринт / Г. С. Таран. - Новосибирск : Diamant Co., LTD, 1995. - 76 с.

114. Таран Г. С. Осокорники поймы Оби на севере Томской области (Западная Сибирь, Россия) / Г. С. Таран // Вестник Томского государственного университета. Биология. - 2014. - № 2 (26). - С. 74-89.

115. Таран Г. С. О двух ассоциациях аллювиальной растительности реки Оби (Томская область) / Г. С. Таран, В. Н. Тюрин, А. П. Дьяченко // Фиторазнообразие Восточной Европы. - 2018. - Т. 12, № 2. - С. 153-169.

116. Таран Г. С. Кайбасовские тополевые леса (р. Обь, Томская область, подзона южной тайги) / Г. С. Таран, А. П. Дьяченко, В. Н. Тюрин // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. - 2021. - Т. 14, № 1. - С. 43-60.

117. Тараховская Е. Р. Специфика усвоения маннита у Fucus vesiculosus L. и Ascophyllum nodosum (L.) le Jolis (Phaeophyta) / Е. Р. Тараховская, Ю. И. Маслов //

Вестник Санкт-Петербургского Университета. Серия 3. Биология. - 2010. -Вып. 2. - С. 75-81.

118. Терехова В. А. Микробиологические показатели агродерново-подзолистых почв разной гумусированности при внесении тяжелых металлов и углеродсодержащих препаратов / В. А. Терехова, Е. В. Прудникова, С. А. Кулачкова, М. В. Горленко, П. В. Учано, С. В. Сушко, Н. Д. Ананьева // Почвоведение. - 2021. - № 3. - С. 372-384.

119. Титова В. И. Методы оценки функционирования микробоценоза почвы, участвующего в трансформации органического вещества : научно-методическое пособие / В. И. Титова, А. В. Козлов. - Нижний Новгород : Нижегородская государственная сельскохозяйственная академия, 2012. - 64 с.

120. Третьякова Е. И. Органическое вещество в абиотических компонентах реки Обь / Е. И. Третьякова, А. Н. Эйрих, Т. С. Папина // Мир науки, культуры, образования. - 2009. - № 2 (14). - С. 17-20.

121. Уровень воды реки Обь в Никольском // FishingSib.ru. - [S. l.], 2024. -URL: https://www.fishingsib.ru/waterinfb/gauging-station/nikolskoe/Rw9ycw59bxocepwF/ (дата обращения: 09.09.2024).

122. Усов А. И. Бурые водоросли Камчатки как источник маннита / А. И. Усов, Н. Г. Клочкова // Биоорганическая химия. - 1994. - Т. 20, № 11. -С. 1236-1241.

123. Фомина Н. В. Эколого-микробиологической мониторинг почвы лесного питомника Красноярского края / Н. В. Фомина, Г. А. Демиденко, Н. Д. Сорокин // Вестник Красноярского государственного аграрного университета. - 2006. -№ 10. - С. 146-152.

124. Хатчинсон Д. Лимнология. Географические, физические и химические характеристики озер : пер. с англ. / Д. Хатчинсон. - М. : Прогресс, 1969. - 592 с.

125. Ходжимуродова Н. Микробиологическая активность староорошаемых и новоорошаемых лугово-аллювиальных почв / Н. Ходжимуродова, Н. Б. Раупова // Бюллетень науки и практики. - 2019. - Т. 5, № 3. - С. 27-33.

126. Холодов В. А. Оптические характеристики фракций органического вещества агрегатов типичных черноземов / В. А. Холодов, В. А. Иванов, Ю. Р. Фарходов, Н. А. Сафронова, З. С. Артемьева, Н. В. Ярославцева // Бюллетень Почвенного института им. В. В. Докучаева. - 2017. - Вып. 90. - С. 56-72.

127. Хромых В. С. Природное районирование поймы Средней Оби / В. С. Хромых // Вопросы географии Сибири : сборник статей. - Томск : Издательство Томского университета, 1979. - Вып. 12. - С. 69-86.

128. Хромых В. С. Половодные циклы как ведущий фактор динамики пойменных ландшафтов / В. С. Хромых // География и регион : материалы международной научно-практической конференции : в 6. т. Пермь, 23-25 сентября 2015 г. - Пермь, 2015. - Т. 1. - С. 180-186.

129. Хромых В. С. Влияние поемности на формирование ландшафтов поймы Средней Оби / В. С. Хромых // Географический сборник : сборник статей. - Томск : [б. и.], 1973. - Т. 11. - С. 49-60.

130. Хромых В. С. Ландшафты поймы Оби (в пределах Каргасокского района) / В. С. Хромых // География в Томском университете: итоги, проблемы, перспективы : материалы юбилейной научно-практической конференции, посвященной 110-летию географии в Томском государственном университете. -Томск : [б. и.], 1999. - С. 127-129.

131. Хромых В. С. Роль почвы в динамике пойменных ландшафтов / В. С. Хромых, Е. А. Костенко, А. В. Огородников // Современные проблемы почвоведения в Сибири : материалы международной научной конференции, посвященной 70-летию образования кафедры почвоведения Томского государственного университета. Томск, 01-05 сентября 2000 г. - Томск : Издательство Томского государственного университета, 2000. - Т. 1. - С. 149-153.

132. Хромых В. С. Структура и качественная оценка ландшафтов поймы Средней Оби (в границах Томской области) : дис. ... канд. геогр. наук : 11.00.01 / Хромых Валерий Спиридонович. - Новосибирск, 1975. - 230 с.

133. Хромых В. С. Функционирование и динамика пойменных ландшафтов / В. С. Хромых. - Томск : Томский государственный университет, 2008. - 125 с.

134. Чалов Р. С. Основные направления и общие вопросы изучения пойм как объекта русловедения (в историко-научном аспекте) / Р. С. Чалов // Пойма и пойменные процессы : межвузовский сборник. - СПб. : Издательство Российского государственного гидрометеорологического университета, 2006. -С. 4-11.

135. Чернов Т. И. Оценка различных индексов разнообразия для характеристики почвенного прокариотного сообщества по данным метагеномного анализа / Т. И. Чернов, А. К. Тхакахова, О. В. Кутовая // Почвоведение. - 2015. - № 4. -С. 462-468.

136. Чупакова А. А. Содержание и распределение биогенных элементов (азот, фосфор, кремний) в термокарстовых водных объектах Большеземельской тундры / А. А. Чупакова, А. В. Чупаков, Л. С. Широкова, С. А. Забелина // Органическое вещество и биогенные элементы во внутренних водоемах и морских водах : труды VI Всероссийского симпозиума с международным участием. Барнаул, 28 августа -01 сентября 2017 г. - Барнаул : Институт водных и экологических проблем СО РАН, 2017. - С. 269-273.

137. Шанцер Е. В. Аллювий равнинных рек умеренного пояса и его значение для познания закономерностей строения и формирования аллювиальных свит / Е. В. Шанцер // Труды / Институт геологических наук АН СССР. -М. : Издательство Академии наук СССР, 1951. - Вып. 135. Геологическая серия (№ 55). - 275 с.

138. Шевченко В. П. Тяжелые металлы в донных осадках малых озер водосбора Оби в ее среднем течении / В. П. Шевченко, С. Н. Воробьёв, Д. П. Стародымова, Р. А. Алиев, А. Г. Лим, О. С. Покровский // Морские исследования и образование (MARESEDU) - 2022 : труды XI Международной научно-практической конференции. Москва, 24-28 октября 2022 г. - Тверь : ПолиПРЕСС, 2022. - Т. I (IV). - С. 315-318.

139. Шенников А. П. Луговедение / А. П. Шенников. - Л. : Издательство Ленинградского государственного университета, 1941. - 511 с.

140. Шепелев А. И. Почвы и почвенный покров поймы Средней Оби : автореф. дис. ... канд. биол. наук : 03.00.27 / Шепелев Александр Игоревич. -Новосибирск, 1990. - 16 с.

141. Шепелев А. И. Принципы эколого-хозяйственной оценки пойменных земель (почвенно-генетические аспекты) / А. И. Шепелев, Л. Ф. Шепелева // Проблемы региональной экологии. - 1995. - Вып. 5. - 152 с.

142. Шепелев А. И. Физико-географические особенности формирования местообитаний поймы Средней Оби / А. И. Шепелев // Биологические ресурсы поймы Средней Оби: динамика и прогноз. - Томск : НИИ биологии и биофизики при Томском государственном университете, 1996. - Гл. 1. - С. 9-35.

143. Шепелев А. И. К построению общей методологии исследования организации пойменного комплекса / А. И. Шепелев, В. Н. Воробьев // Экология пойм сибирских рек и Арктики : труды I Межрегионального совещания. Томск, 25-26 ноября 1999 г. - Новосибирск : Издательство Сибирского отделения РАН, 1999. - С. 6-21.

144. Шепелева Л. Ф. О влиянии половодья на продуктивность лугов поймы / Л. Ф. Шепелева // Экология. - 1986. - № 2. - С. 3-8.

145. Шепелева Л. Ф. Организация луговых сообществ поймы Средней Оби : автореф. дис. ... д-ра биол. наук : 03.00.05, 03.00.16 / Шепелева Людмила Федоровна. - Новосибирск, 1998. - 34 с.

146. Шепелева Л. Ф. Структура и динамика луговых сообществ поймы Средней Оби / Л. Ф. Шепелева. - Томск : Издательство Томского университета, 2019. - 348 с.

147. Шепелева Л. Ф. Надземная и подземная фитомассы луговых сообществ поймы Средней Оби (Кривошеинский район Томской области) / Л. Ф. Шепелева, М. С. Пудова, Е. А. Леденева, Л. Г. Колесниченко // Журнал Сибирского федерального университета. Биология. - 2023. - Т. 16, вып. 4. - С. 454-470.

148. Шепелева Л. Ф. Динамика фитомассы лугов поймы Средней Оби в течение вегетационного сезона / Л. Ф. Шепелева, Л. Г. Колесниченко, Е. Е. Чураков, М. С. Пудова, И. О. Рожкова-Тимина, С. Н. Воробьев // Вестник Томского государственного университета. Биология. - 2024. - № 68. - С. 195-218.

149. Шеховцова Н. В. Экология водных микроорганизмов: учебное пособие / Н. В. Шеховцова. - Ярославль : Ярославский государственный университет, 2008. -132 с.

150. Якутин М. В. Биомасса и активность микроорганизмов пойменных почв средней Оби / М. В. Якутин // Почвоведение. - 1994. - № 12. - С. 70-76.

151. Якутин М. В. Использование почвенно-биологических методов в мониторинге пойменных экосистем в районе Средней Оби / М. В. Якутин,

B. С. Андриевский, А. И. Шепелев // Интерэкспо Гео-Сибирь - 2013 : IX Международные научный конгресс и выставка. Международная научная конференция «Дистанционные методы зондирования Земли и фотограмметрия, мониторинг окружающей среды, геоэкология : сборник материалов. Новосибирск, 15-26 апреля 2013 г. - Новосибирск : Сибирская государственная геодезическая академия, 2013. - Т. 2. - C. 65-70.

152. Якутин М. В. Особенности изменения зоомикробиологического комплекса в процессе естественной эволюции пойменных почв средней Оби / М. В. Якутин, В. С. Андриевский, А. И. Шепелев // Вестник Сургутского государственного университета. - 2014. - Вып. 2 (4). - C. 74-79.

153. Якутин М. В. Микробиологические характеристики в экологическом мониторинге пойменных почв реки Таз (ЯНАО) / М. В. Якутин, Д. С. Дубовик,

C. Е. Худяков, А. Е. Шуклина // Интерэкспо Гео-Сибирь - 2017. XIII Международные научный конгресс и выставка. Международная научная конференция «Дистанционные методы зондирования Земли и фотограмметрия, мониторинг окружающей среды, геоэкология» : сборник материалов : в 2 т. Новосибирск, 17-21 апреля 2017 г. - Новосибирск : Сибирский государственный университет геосистем и технологий, 2017. - Т. 2. - С. 191-196.

154. Якушев А. В. Комплексный структурно-функциональный метод характеристики микробных популяций / А. В. Якушев // Почвоведение. - 2015. -Т. 48, вып. 4. - С. 429-446.

155. Alexander M. Introduction to Soil Microbiology / M. Alexander. - 2nd ed. -New York : Wiley, 1977. - 467 p.

156. Amaral V. Strong linkages between DOM optical properties and main clades of aquatic bacteria / V. Amaral, D. Graeber, D. Calliari, C. Alonso // Limnology and Oceanography. - 2016. - Vol. 61, is. 3. - P. 906-918.

157. Amaral J. H. F. Influence of plankton metabolism and mixing depth on CO2 dynamics in an Amazon floodplain lake / J. H. F. Amaral, A. V. Borges, J. M. Melack, H. Sarmento, P. M. Barbosa, D. Kasper, M. L. de Melo, D. De Fex-Wolf, J. S. da Silva, B. R. Forsberg // Science of The Total Environment. - 2018. - Vol. 630. - P. 1381-1393.

158. Amon R. M. W. The biogeochemistry of dissolved organic matter and nutrients in two large Arctic estuaries and potential implications for our understanding of the Arctic Ocean system / R. M. W. Amon, B. Meon // Marine Chemistry. - 2004. - Vol. 92, is. 1-4. - P. 311-330.

159. Archer A. D. Effect of SUVA and enhanced coagulation on removal of TOX precursors / A. D. Archer, P. C. Singer / Journal of the American Water Works Association. - 2006. - Vol. 98, is. 8. - P. 97-107.

160. Argiroff W. A. Microbial Community Functional Potential and Composition Are Shaped by Hydrologic Connectivity in Riverine Floodplain Soils / W. A. Argiroff,

D. R. Zak, C. M. Lanser, M. J. Wiley // Microbiological Ecology. - 2017. - Vol. 73, is. 3. - P. 630-644.

161. Ayo C. O. Isolation and Identification of Xylose Utilising Bacteria From Agricultural Waste / C. O. Ayo, F. O. Oreva. - Benin City : University of Benin, Department of Microbiology, 2022. - 43 p.

162. Bach E. M. Greatest soil microbial diversity found in micro-habitats /

E. M. Bach, R. J. Williams, S. K. Hargreaves, F. Yang, K. S. Hofmockel // Soil Biology and Biochemistry. - 2018. - Vol. 118. - P. 217-226.

163. Baldani J. I. The Family Oxalobacteraceae / J. I. Baldani, L. Rouws, L. M. Cruz, F. L. Olivares, M. Schmid, A. Hartmann // The Prokaryotes: Alphaproteobacteria and Betaproteobacteria / K. Komagata, T. Iino, Y Yamada [et al.]. -4th ed. - Berlin ; Heidelberg : Springer, 2014. - Chap. 35. - P. 919-974.

164. Banerjee S. Spatially tripartite interactions of denitrifiers in arctic ecosystems: activities, functional groups and soil resources: denitrifier spatial patterns in arctic soils / S. Banerjee, S. Siciliano // Environmental Microbiology. - 2012. - Vol. 14, is. 9. -P. 2601-2613.

165. Banerjee S. Legacy effects of soil moisture on microbial community structure and N2O emissions / S. Banerjee, B. Helgason, L. Wang, T. Winsley, B. C. Ferrari, S. D. Siciliano // Soil Biology and Biochemistry. - 2015. - Vol. 95. - P. 40-50.

166. Barnard R. L. Responses of soil bacterial and fungal communities to extreme desiccation and rewetting / R. L. Barnard, C. A. Osborne, M. K. Firestone // ISME Journal. - 2013. - Vol. 7, is. 11. - P. 2229-2241.

167. Barros D. J. Methane, Microbes and Models in Amazonian Floodplains: State of the Art and Perspectives / D. J. Barros, M. de Souza Bento, M. de Souza Ferreira, J. Braga do Carmo, R. H. Toppa, V. Neu, M. B. de Amancio Varesche, P. B. de Morais, A. A. Navarrete // Changing Ecosystems and Their Services / L. Hufnagel, M. Palinkas, F. Mics [et al.]. - London : IntechOpen, 2020. - Vol. 6182. - Chap. 4. - P. 73-89.

168. Basiru S. Trade-off between soil organic carbon sequestration and plant nutrient uptake in arbuscular mycorrhizal symbiosis / S. Basiru, M. Hijri // Fungal Biology Reviews. - 2024. - Vol. 49. - Article number 100381. - 7 p. -URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1749461324000265?dgcid=rss _sd_all& (access date: 11.01.2025).

169. Bauhus J. Mechanisms for carbon and nutrient release and retention in beech forest gaps. II. The role of soil microbial biomass / J. Bauhus, R. Barthel // Plant and Soil. -1995. - Vol. 168-169. - P. 585-592.

170. Bayley P. B. Understanding Large River - Floodplain Ecosystems / P. B. Bayley // BioScience. - 1995. - Vol. 45, № 3 : Ecology of Large Rivers. - P. 153158.

171. Benner R. Export of young terrigenous dissolved organic carbon from rivers to the Arctic Ocean / R. Benner, B. Benitez-Nelson, K. Kaiser, R. M. W. Amon // Geophysical Research Letters. - 2004. - Vol. 31, is. 5. - Article number L05305. - 4 p. -URL: https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1029/2003GL019251 (access date: 05.03.2024).

172. Bertini S. C. B. Soil physicochemical and biological profiles as indicators for Araucaria forest disturbance levels / S. C. B. Bertini, M. Stromberger, L. C. B. Azevedo, E. J. B. N. Cardoso // Applied Soil Ecology. - 2021. - Vol. 158, is. 45. - Article umber

103794. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0929139320307 23X?via%3Dihub (access date: 10.08.2023).

173. Bhattacharyya S. S. Soil carbon sequestration - An interplay between soil microbial community and soil organic matter dynamics / S. S. Bhattacharyya, G. H. Ros, K. Furtak, H. M. N. Iqbal, R. Parra-Saldivar // Science of the Total Environment. -2022. - Vol. 815, is. 1. - Article number 152928. - URL: https://www.sciencedirect.com/ science/article/abs/pii/S0048969722000171 (access date: 03.03.2023).

174. Biddanda B. Carbon, nitrogen, and carbohydrate fluxes during the production of particulate and dissolved organic matter by marine phytoplankton / B. Biddanda, R. Benner // Limnology and Oceanography. - 1997. - Vol. 42, is. 3. - P. 506-518.

175. Blagodatsky S. Soil physics meets soil biology: Towards better mechanistic prediction of greenhouse gas emissions from soil / S. Blagodatsky, P. Smith // Soil Biology and Biochemistry. - 2012. - Vol. 47. - P. 78-92.

176. Boano F. Hyporheic flow and transport processes: Mechanisms, models, and biogeochemical implications / F. Boano, J. W. Harvey, A. Marion, A. I. Packman, R. Revelli, L. Ridolfi, A. Worman // Reviews Geophysics - 2014. - Vol. 52, is. 4. -P. 603-679.

177. Boon E. Interactions in the microbiome: communities of organisms and communities of genes / E. Boon, C. J. Meehan, C. Whidden, D. H.-J. Wong, M. G. I. Langille, R. G. Beiko // FEMS Microbiology Reviews. - 2014. - Vol. 38, is. 1. -P. 90-118.

178. Bossio D. A. Impact of Carbon and Flooding on the Metabolic Diversity of Microbial Communities in Soils / D. A. Bossio, K. M. Scow // Applied and Environmental Microbiology. - 1995. - Vol. 61, № 11. - P. 4043-4050.

179. Boustany R. G. Denitrification in a South Louisiana wetland forest receiving treated sewage effluent / R. G. Boustany, C. R. Crozier, J. M. Rybczyk, R. R. Twilley // Wetlands Ecology and Management. - 1997. - Vol. 4, is. 4. - P. 273-283.

180. Braga L. P. P. Viruses direct carbon cycling in lake sediments under global change / L. P. P. Braga, C. Orland, E. J. S. Emilson, A. A. Fitch, H. Osterholz, T. Dittmar, N. Basiliko, N. C. S. Mykytczuk, A. J. Tanentzap // Proceedings of the National Academy

of Sciences of the United States of America. - 2022. - Vol. 119, № 41. - Article number e2202261119. - 12 p. - URL: https://www.pnas.org/doi/epdf/ 10.1073/pnas.2202261119 (access date: 09.06.2023).

181. Broadbent F. E. Some factors affecting the availability of organic nitrogen in soil - A preliminary report / F. E. Broadbent, A. G. Norman // Soil Science Society of America Proceedings. - 1947. - Vol. 11, is. C. - P. 264-267.

182. Brzezinska M. S. Chitinolytic Microorganisms and Their Possible Application in Environmental Protection / M. S. Brzezinska, U. Jankiewicz, A. Burkowska, M. Walczak // Current Microbiology. - 2014. - Vol. 68. - P. 71-81.

183. Buck U. Substrate incorporation patterns of bacterioplankton populations in stratified and mixed waters of a humic lake / U. Buck, H.-P. Grossart, R. Amann, J. Pernthaler // Environmental Microbiology. - 2009. - Vol. 11, is. 7. - P. 1854-1865.

184. Buckeridge K. M. Environmental and microbial controls on microbial necromass recycling, an important precursor for soil carbon stabilization / K. M. Buckeridge, K. E. Mason, N. P. McNamara, N. Ostle, J. Puissant, T. Goodall, R. I. Griffiths, A. W.Stott, J. Whitaker // Communications Earth and Environment. -2020. - Vol. 1, is. 1. - Article number 36. - 9 p. - URL: https://www.nature.com/ articlesM3247-020-00031-4.pdf (access date: 06.08.2022).

185. Cajado R. A. Seasonal hydrology shapes the taxonomic and functional diversity of fish associated with aquatic macrophytes in a neotropical floodplain lake / R. A. Cajado, L. S. de Oliveira, J. M. S. Correa, F. K. S. da Silva-Cajado, D. M. Zacardi // Aquatic Sciences. - 2025. - Vol. 87. - Article number 52. - 14 p. -URL: https://link.springer.com/article/10.1007/s00027-025-01179-x (access date: 06.09.2025).

186. Campbell K. M. Geochemical, mineralogical and microbiological characteristics of sediment from a naturally reduced zone in a uranium-contaminated aquifer / K. M. Campbell, R. K. Kukkadapu, N. P. Qafoku, A. D. Peacock, E. Lesher, K. H. Williams, J. R. Bargar, M. J. Wilkins, L. Figueroa, J. Ranville, J. A. Davis, P. E. Long // Applied Geochemistry. - 2012. - Vol. 27, is. 8. - P. 1499-1511.

187. Catalán N. Organic carbon decomposition rates controlled by water retention time across inland waters / N. Catalán, R. Marcé, D. N. Kothawala, L. J. Tranvik // Nature Geoscience. - 2016. - Vol. 9. - P. 501-504.

188. Chen Y The proliferation and colonization of functional bacteria on amorphous polyethylene terephthalate: Key role of ultraviolet irradiation and nonionic surfactant polysorbate 80 addition / Y Chen, J. Chen, M. Bao, L. Zhao, Y Li // Chemosphere. - 2022. - Vol. 291, pt. 2. - Article number 132940. -URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0045653521034123?via% 3Dihub (access date: 27.08.2023).

189. Chung E. J. Chitinophaga oryziterrae sp. nov., isolated from the rhizosphere soil of rice (Oryza sativa L.) / E. J. Chung, T. S. Park, C. O. Jeon, Y. R. Chung // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. - 2012. - Vol. 62, pt. 12. - P. 3030-3035.

190. Comin F. A. Floodplain capacity to depollute water in relation to the structure of biological communities / F. A. Comin, J. M. Sánchez-Pérez, C. Español, F. Carranza, S. Sauvage, I. Antiguedad, A. Zabaleta, M. Martinez-Santos, M. Gerino, J. M. Yao, J. M. Bodoque, J. Ladera, J. L. Yela, S. Teissier, L. Bernard-Jannin, X. Sun, E. Navarro, E. Pinelli, O. Chamsi, R. Neves, D. Brito, E. Ruiz, J. Uriarte, J. J. Jiménez, M. García, A. Barcos, R. Sorando // Ecological Engineering. - 2017. - Vol. 103, pt. B. - P. 301-314.

191. Cory R. M. Sunlight controls water column processing of carbon in arctic fresh waters / R. M. Cory, C. P. Ward, B. C. Crump, G. W. Kling // Science. - 2014. -Vol. 345, is. 6199. - P. 925-928.

192. Davidson T. A. Eutrophication effects on greenhouse gas fluxes from shallow-lake mesocosms override those of climate warming / T. A. Davidson, J. Audet, J.-Ch. Svenning, T. L. Lauridsen, M. S0ndergaard, F. Landkildehus, S. E. Larsen, E. Jeppesen // Global Change Biology. - 2015. - Vol. 21, is. 12. - P. 44494463.

193. Díaz-Raviña M. Seasonal changes in microbial biomass and nutrient flush in forest soils / M. Díaz-Raviña, M. J. Acea, T. Carballas // Biology and Fertility of Soils. - 1995. - Vol. 19. - P. 220-226.

194. Dixon J. L. Rapid biological oxidation of methanol in the tropical Atlantic: significance as a microbial carbon source / J. L. Dixon, R. Beale, P. D. Nightingale // Biogeoscience. - 2011. - Vol. 8, is. 9. - P. 2707-2716.

195. Doronina N. The Family Methylophilaceae / N. Doronina, E. Kaparullina, Y Trotsenko // The Prokaryotes: Alphaproteobacteria and Betaproteobacteria / K. Komagata, T. Iino, Y Yamada [et al.]. - 4th ed. - Berlin ; Heidelberg : Springer, 2014. -Chap. 32. - P. 869-880.

196. Dou S. Are humic substances soil microbial residues or unique synthesized compounds? A perspective on their distinctiveness / S. Dou, J. Shan, X. Song, R. Cao, M. Wu, C. Li, S. Guan // Pedosphere. - 2020. - Vol. 30, is. 2. - P. 159-167.

197. Downing J. The Global abundance and size distribution of lakes, ponds, and Impoundments / J. Downing, Y. T. Prairie, J. J. Cole, C. M. Duarte, L. J. Tranvik, R. G. Striegl, W. H. McDowell, P. Kortelainen, N. F. Caraco, J. M. Melack, J. J. Middelburg // Limnology and Oceanography. - 2006. - Vol. 51, is. 5. - P. 23882397.

198. Drago E. C. Origen y clasificación de ambientes leníticos en llanuras aluviales [Oxigen and classification of lentic environments in floodplains] / E. C. Drago // Revista Asociación Ciencias Naturales del Litoral. - 1976. - Vol. 7. - P. 123-137. (In Spanish).

199. Drake T. W. Mobilization of aged and biolabile soil carbon by tropical deforestation / T. W. Drake, K. Van Oost, M. Barthel, M. Bauters, A. M. Hoyt, D. C. Podgorski, J. Six, P. Boeckx, S. E. Trumbore, L. C. Ntaboba, R. G. M. Spencer // Natural Geoscience. - 2019. - Vol. 12, is. 7. - P. 541-546.

200. Du Y Human Activity Coupled With Climate Change Strengthens the Role of Lakes as an Active Pipe of Dissolved Organic Matter / Y Du, F.-Z. Chen, Y-L. Zhang, H. He, S. Wen, X. L. Huang, C. -Q. Song, K. -Y Li, J. -B. Wang, D. Keellings, Y -H. Lu // Earth's Future. - 2023. - Vol. 11, is. 9. - Article number e2022EF003412. - 18 p. -URL: https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/ epdf/10.1029/2022EF003412 (access date: 23.01.2024).

201. Edzwald J. K. Surrogate Parameters for Monitoring Organic Matter and THM Precursors / J. K. Edzwald, W. C. Becker, K. L. Wattier // Journal of American Water Works Association. - 1985. - Vol. 77, is. 4. - P. 122-132.

202. Edzwald J. K. Enhanced coagulation: US requirements and a broader view / J. K. Edzwald, J. E. Tobiason // Water Science and Technology. - 1999. - Vol. 40, is. 9. -P. 63-70.

203. Ehrlich H. L. Geomicrobiology / H. L. Ehrlich. - 4th ed, rev. and exp. -New York ; Basel: Marcel Dekker Inc., 2002. - 768 p.

204. Eiler A. Heterotrophic Bacterial Growth Efficiency and Community Structure at Different Natural Organic Carbon Concentrations / A. Eiler, S. Langenheder, S. Bertilsson, L. J. Tranvik // Applied and Environmental Microbiology. - 2003. -Vol. 69, № 7. - P. 3701-3709.

205. Eiler A. Composition of freshwater bacterial communities associated with cyanobacterial blooms in four Swedish lakes / A. Eiler, S. Bertilsson // Environmental Microbiology. - 2004. - Vol. 6, is. 12. - P. 1228-1243.

206. Eiler A. Flavobacteria Blooms in Four Eutrophic Lakes: Linking Population Dynamics of Freshwater Bacterioplankton to Resource Availability / A. Eiler, S. Bertilsson // Applied and Environmental Microbiology. - 2007. - Vol. 73, № 11. -P. 3511-3518.

207. Englert A. Feedbacks between hydrological heterogeneity and bioremediation induced biogeochemical transformations / A. Englert, S. S. Hubbard, K. H. Williams, L. Li, C. I. Steefel // Environment Science and Technology. - 2009. - Vol. 43, is. 14. -P. 5197-5204.

208. Fierer N. Embracing the unknown: disentangling the complexities of the soil microbiome / N. Fierer // Nature Reviews. Microbiology. - 2017. - Vol. 15, is. 10. -P. 579-590.

209. Findlay S. Microbial enzymatic response to catchment-scale variations in supply of dissolved organic carbon / S. Findlay, C. W. Hickey, J. M. Quinn // New Zealand Journal of Marine and Freshwater Research. - 1997. - Vol. 31, is. 5. -P. 701-706.

210. Fitch A. Feasting on terrestrial organic matter: Dining in a dark lake changes microbial decomposition / A. Fitch, C. Orland, D. Willer, E. J. S. Emilson, A. J. Tanentzap // Global Change Biology. - 2018. - Vol. 24, is. 11. - P. 5110-5122.

211. Flanagan P. W. Nutrient cycling in relation to decomposition and organic-matter quality in taiga ecosystems / P. W. Flanagan, K. Van Cleve // Canadian Journal of Forest Research. - 1983. - Vol. 13, № 5. - P. 795-817.

212. Fleckenstein J. Groundwater-surface water interactions: New methods and models to improve understanding of processes and dynamics / J. Fleckenstein, S. Krause, D. M. Hannah, F. Boano // Advances in Water Resources. - 2010. - Vol. 33, is. 11. - P. 1291-1295.

213. Fog K. The effect of added nitrogen on the rate of decomposition of organic matter / K. Fog // Biological Review. - 1988. - Vol. 63, is. 3. - P. 433-462.

214. Fontaine S. Fungi mediate long term sequestration of carbon and nitrogen in soil through their priming effect / S. Fontaine, C. Henault, A. Aamor, N. Bdioui, J. M. G. Bloor, V. Maire, B. Mary, S. Revaillot, P. A. Maron // Soil Biology and Biochemistry. - 2011. - Vol. 43, is. 1. - P. 86-96.

215. Forman R. T. T. Landscape ecology / R. T. T. Forman, M. Godron. -New York : John Wiley and Sons Ltd., 1986. - 619 p.

216. Franzetti A. Environmental features of two commercial surfactants widely used in soil remediation / A. Franzetti, P. Di Gennaro, A. Bevilacqua, M. Papacchini, G. Bestetti // Chemosphere. - 2006. - Vol. 62, is. 9. - P. 1474-1480.

217. Frey K. E. Impacts of climate warming and permafrost thaw on the riverine transport of nitrogen and phosphorus to the Kara Sea / K. E. Frey, J. W. McClelland, R. M. Holmes, L. C. Smith // Journal of Geophysical Researches: Biogeoscience. -2007. - Vol. 112, is. G4. -Article number G04S58. - 10 p. -URL: https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1029/2006JG000369 (access date: 29.08.2023).

218. Fuentes S. Assessing environmental drivers of microbial communities in estuarine soils of the Aconcagua River in Central Chile / S. Fuentes, G.-C. Ding, F. Cardenas, K. Smalla, M. Seeger // FEMS Microbiology Ecology. - 2015. - Vol. 91, is. 10. - Article number fiv110. - 12 p. - URL: https://academic.oup.com/femsec/article-pdf/91/10/fiv110/16733623/fiv110.pdf (access date: 02.12.2022).

219. Furtak K. Can Model Experiments Give Insight into the Response of the Soil Environment to Flooding? A Comparison of Microcosm and Natural Event /

K. Furtak, J. Grz^dziel, A. Gal^zka // Biology. - 2022. - Vol. 11, is. 3. - Article number 386. - 19 p. - URL: https://www.mdpi.com/2079-7737/11/3/386/pdf?version =1646118195 (access date: 04.01.2025).

220. Gabriel G. V. M. Methane emission suppression in flooded soil from Amazonia / G. V. M. Gabriel, L. C. Oliveira, D. J. Barros, M. S. Bento, V. Neu, R. H. Toppa, J. B. Carmo, A. A. Navarrete // Chemosphere. - 2020. - Vol. 250, is. 4. -Article number 126263. - 10 p. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/ pii/S0045653520304562?via%3Dihub (access date: 24.03.2021).

221. Garland J. L. Classification and Characterization of Heterotrophic Microbial Communities on the Basis of Patterns of Community-Level Sole-Carbon-Source Utilization / J. L. Garland, A. L. Mills // Applied and Environmental Microbiology. -1991. - Vol. 57, № 8. - P. 2351-2359.

222. Gelsomino A. Changes in chemical and biological soil properties as induced by anthropogenic disturbance: A case study of an agricultural soil under recurrent flooding by wastewaters / A. Gelsomino, L. Badalucco, R. Ambrosoli, C. Crecchio, E. Puglisi, S. M. Meli // Soil Biology and Biochemistry. - 2006. - Vol. 38, is. 8. -P. 2069-2080.

223. Gleeson D. Response of ammonia oxidizing archaea and bacteria to changing water filled pore space / D. Gleeson C. Muller, S. Banerjee, W. Ma, S. D. Siciliano, D. V. Murphy // Soil Biology and Bioche,mistry. - 2010. - Vol. 42, is. 10. - P. 1888-1891.

224. Gonfalves J. L. M. Modelling the influence of moisture and temperature on net nitrogen mineralization in a forested sandy soil / J. L. M. Gonfalves, J. C. Carlyle // Soil Biology and Biochemistry. - 1994. - Vol. 26, is. 11. - P. 1557-1564.

225. Goudie A. S. Floodplain / A. S. Goydie // Encyclopedia of Geomorphology / A. S. Goydie. - New York. : Routledge, 2004. - Vol. 1 : A-I. - P. 381-385.

226. Griffiths B. S. Insights into the resistance and resilience of the soil microbial community / B. S. Griffiths, L. Philippot // FEMS Microbiology Reviews. - 2013. -Vol. 37, is. 2. - P. 112-129.

227. Grover J. P. Seasonal patterns of substrate utilization by bacterioplankton: case studies in four temperate lakes of different latitudes / J. P. Grover, T. H. Chrzanowski // Aquatic Microbial Ecology. - 2000. - Vol. 23, is. 1. - P. 41-54.

228. Grz^dziel J. Community-Level Physiological Profiles of Microorganisms from Different Types of Soil That Are Characteristic to Poland - A Long-Term Microplot Experiment / J. Grz^dziel, K. Furtak, A. Gal^zka // Sustainability. - 2019. - Vol. 11, is. 1. - Article number 56. - 17 p. - URL: https://www.mdpi.com/2071-1050/11/1/56/pdf?version=1545668182 (access date: 13.03.2024).

229. Guo Y. Temperature-mediated microbial carbon utilization in China's lakes / Y Guo, S. Gu, K. Wu, A. J. Tanentzap, J. Yu, X. Liu, Q. Li, P. He, D. Qiu, Y Deng, P. Wang, Z. Wu, Q. Zhou // Global Change Biology. - 2023. - Vol. 29, is. 17. - P. 50445061.

230. Hackl E. Composition of the microbial communities in the mineral soil under different types of natural forest / E. Hackl, M. Pfeffer, C. Donat, G. Bachmann, S. Zechmeister-Boltenstern // Soil Biology and Biochemistry. - 2005. - Vol. 37, is. 4. -P. 661-671.

231. Hamilton S. K. Remote sensing of floodplain geomorphology as a surrogate for biodiversity in a tropical river system (Madre de Dios, Peru) / S. K. Hamilton, J. Kellndorfer, B. Lehner, M. Tobler // Geomorphology. - 2007. - Vol. 89, is. 1-2. -P. 23-38.

232. Hansen A. M. Optical properties of dissolved organic matter (DOM): Effects of biological and photolytic degradation / A. M. Hansen, T. E. C. Kraus, B. A. Pellerin, J. A. Fleck, B. D. Downing, B. A. Bergamaschi // Limnology and Oceanography. -2016. - Vol. 61, is. 3. - P. 1015-1032.

233. Hedin L. O. Thermodynamic constraints on nitrogen transformations and other biogeochemical processes at soil-stream interfaces / L. O. Hedin, J. C. von Fischer, N. E. Ostrom, B. P. Kennedy, M. G. Brown, G. P. Robertson // Ecology. - 1998. - Vol. 79, is. 2. - P. 684-703.

234. Heikes B. G. Atmospheric methanol budget and ocean implication / B. G. Heikes, W. Chang, M. E.Q. Pilson, E. Swift, H. B. Singh, A. Guenther, D. J. Jacob,

B. D. Field, R. Fall, D. Riemer, L. Brand // Global Biogeochemical Cycles. - 2002. -Vol. 16, № 4. - P. 80-1-8-13.

235. Hellebust J. A. Excretion of some organic compounds by marine phytoplankton / J. A. Hellebust // Limnology and Oceanography. - 1965. - Vol. 10. -P. 192-206.

236. Helms J. R. The photochemical interference in oxygen-based measurements of primary productivity : poster / J. R. Helms, A. P. Stubbins, K. Mopper // Ocean Sciences Meeting. From the Watershed to the Global Ocean : Meeting Abstracts. Orlando, March 02-07, 2008. - Orlando : [s. n.], 2008. - P. 159.

237. Henderson C. E. Purification of the pyruvate dehydrogenase multienzyme complex of Bacillus stearothermophilus and resolution of its four component polypeptides / C. E. Henderson, R. N. Perham // The Biochemical Journal. - 1980. -Vol. 189, is. 1. - P. 161-172.

238. Hernandez M. Structure, function and resilience to desiccation of methanogenic microbial communities in temporarily inundated soils of the Amazon rainforest (Cunia Reserve, Rondonia) / M. Hernandez, M. Klose, P. Claus, D. Bastviken, H. Marotta, V. Figueiredo, A. Enrich-Prast, R. Conrad // Environmental Microbiology. -2019. - Vol. 21, is. 5. - P. 1702-1717.

239. Hessen D. O. Dissolved organic carbon in a humic lake: effects on bacterial production and respiration / D. O. Hessen // Hydrobiologia. - 1992. - Vol. 229. - P. 115123.

240. Heu R. Dissolved silicon in a lake-floodplain system: Dynamics and its role in primary production / R. Heu, M. P. Wai, S. Siev, V. Chem, K. E. Eang, V. Ann, M. Ateia, C. Yoshimura // Science of the Total Environment. - 2023. - Vol. 861, is. 5. -Article number 160696. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/ abs/pii/S0048969722077993?via%3Dihub (access date: 12.07.2023).

241. Hill A. R. Subsurface denitrification in a forest riparian zone: Interactions between hydrology and supplies of nitrate and organic carbon / A. R. Hill, K. J. Devito, S. Campagnolo, K. Sanmugadas // Biogeochemistry. - 2000. - Vol. 51, is. 2. - P. 193223.

242. Hillbricht-Ilkowska A. System rzecznojeziorny jako uklad platow krajobrazowych i ich stref granicznych [A river-lake system as a composition pattern of landscape patches and their transitory zones - ecotones] / A. Hillbricht-Ilkowska, T. Weglenska // Zeszyty Naukowe Komitetu 'Czlowiek i srodowisko' Polskiej Akademii Nauk. - 1996. - Vol. 12. - P. 185-202. (In Polish).

243. Hillbricht-Ilkowska A. The dynamics and retention of phosphorus in lentic and lotic patches of two river-lake systems / A. Hillbricht-Ilkowska // Hydrobiologia. -1993. - Vol. 251. - P. 257-268.

244. Hillbricht-Ilkowska A. Shallow lakes in lowland river systems: Role in transport and transformations of nutrients and in biological diversity / A. Hillbricht-Ilkowska // Hydrobiologia. - 1999. - Vol. 408-409. - P. 349-358.

245. Hiraishi A. Numerical analysis of lipoquinone patterns in monitoring bacterial community dynamics in wastewater treatment systems / A. Hiraishi, Y. Morishima, J. -I. Takeuchi // Journal of General and Applied Microbiology. - 1991. - Vol. 37, is. 1. -P. 57-70.

246. Hu H. Response of bacterial community characteristics in the rhizosphere soil of Stellera chamaejasme L. to its expansion on the Qinghai-Tibet Plateau / H. Hu, H. Sun, J. Wu, J. Liu, H. Jin, K. Tao // Land Degradation and Development. - 2023. - Vol. 34, is. 16. - P. 5135-5151.

247. Hu H.-Y Quantitative analyses of the change in microbial diversity in a bioreactor for wastewater treatment based on respiratory quinones / H.-Y. Hu, K. Fujie, H. Nakagome, K. Urano, A. Katayama // Water Researhes. - 1999. - Vol. 33, № 15. - P. 3263-3270.

248. Hutalle-Schmelzer K. M. L. Changes in the bacterioplankton community of oligotrophic Lake Stechlin (northeastern Germany) after humic matter addition / K. M. L. Hutalle-Schmelzer, H. -P. Grossart // Aquatic Microbial Ecology. - 2009. -Vol. 55. - P. 155-167.

249. Hutalle-Schmelzer K. M. L. Enrichment and cultivation of pelagic bacteria from a humic lake using phenol and humic matter additions / K. M. L. Hutalle-Schmelzer, E. Zwirnmann, A. Krüger, H.-P. Grossart // FEMS Microbiological Ecology. - 2010. -Vol. 72, is. 1. - P. 58-73.

250. Ivanova E. A. Prokaryotic communities of technozems of the spoil heaps of Kursk magnetic anomaly / E. A. Ivanova, E. V. Pershina, D. V. Karpova, A. K. Tkhakakhova, A. D. Zhelezova, O. B. Rogova, M. V. Semenov, A. I. Stifeev, D. A. Nikitin, T. V. Kolganova, E. E. Andronov // Ecological Genetics. - 2020. - Vol. 18, № 3. - P. 331-342.

251. Izerskaia L. A. The concentration of Mn, Cu, Zn, Co, B, Sr, Cd and Pb in alluvial soils of the Ob River (forest-steppe, southern taiga and central taiga) / L. A. Izerskaia, S. N. Vorobyev, T. E. Vorobyeva, L. G. Kolesnichenko, A. V. Zakharchenko // International Journal of Environmental Studies. - 2014. - Vol. 71, is. 5 : Western Siberia in a changing climate. - P. 691-697.

252. Janse J. H. Towards a global model for wetlands ecosystem services / J. H. Janse, A. A. van Dam, E. M. A. Hes, J. J. M. de Klein, C. M. Finlayson, A. B. G. Janssen, D. van Wijk, W. M. Mooij, J. T. A. Verhoeven // Current Opinion in Environmental Sustainability. - 2019. - Vol. 36. - P. 11-19.

253. Jezberova J. Ubiquity of Polynucleobacter necessarius ssp. asymbioticus in lentic freshwater habitats of a heterogeneous 2000 km2 area / J. Jezberova, J. Jezbera, U. Brandt, E. S. Lindström, S. Langenheder, M. W. Hahn // Environmental Microbiology. -2010. - Vol. 12, is. 3. - P. 658-669.

254. Jones R. T. A comprehensive survey of soil acidobacterial diversity using pyrosequencing and clone library analyses / R. T. Jones, M. S. Robeson, C. L. Lauber, M. Hamady, R. Knight, N. Fierer // The ISME Journal. - 2009. - Vol. 3, is. 4. - P. 442453.

255. Junk W. J. The flood pulse concept in riverfloodplain systems / W. J. Junk, P. B. Bayley, R. E. Sparks // Proceedings of the International Large River Symposium (LARS). Honey Harbour, Canada, September 14-21, 1986. - Ottawa : NRC Research Press, 1989. - P. 110-127. - (Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences Special Publication 106).

256. Kallenbach C. M. Direct evidence for microbial-derived soil organic matter formation and its ecophysiological controls / C. M. Kallenbach, S. D. Frey, A. S. Grandy // Nature Communications. - 2016. - Vol. 7. - Article number 13630. -10 p. - URL: https://www.nature.com/articles/ncomms13630.pdf (access date: 06.07.2023).

257. Kalyuhznaya M. G. Methylophilaceae link methanol oxidation to denitrification in freshwater lake sediment as suggested by stable isotope probing and pure culture analysis / M. G. Kalyuhznaya, W. Martens-Habbena, T. Wang, M. Hackett, S. M. Stolyar, D. A. Stahl, M. E. Lidstrom, L. Chistoserdova // Environmental Microbiology Reports. - 2009. - Vol.1, is. 5. - P. 385-392.

258. Kapetanovic D. Microbial Communities in Changing Aquatic Environments / D. Kapetanovic, M. Katouli, D. Vukic Lusic // Microorganisms. - 2024. - Vol. 12, is. 4. -Article number 726. - 2 p. - URL: https://www.mdpi.com/2076-2607/12/4/726/pdf?version=1713337274 (access date: 06.07.2025).

259. Kayranli B. Carbon Storage and Fluxes within Freshwater Wetlands: A Critical Review / B. Kayranli, M. Scholz, A. Mustafa, Ä. Hedmark // Wetlands. -2010. - Vol. 30. - P. 111-124.

260. Kenwell A. Using geochemical indicators to distinguish high biogeochemical activity in floodplain soils and sediments / A. Kenwell, A. Navarre-Sitchler, R. Prugue, J. R. Spear, A. S. Hering, R. M. Maxwell, R. W. H. Carroll, K. H. Williams // Science of the Total Environment. - 2016. - Vol. 563-564, is. 2. - P. 386-395.

261. Keylock C. J. Simpson diversity and the Shannon-Wiener index as special cases of a generalized entropy / C. J. Keylock // Oikos. - 2005. - Vol. 109, is. 1. - P. 203207.

262. Kirchman D. L. The ecology of Cytophaga-Flavobacteria in aquatic environments / D. L. Kirchman // FEMS Microbiological Ecology. - 2002. - Vol. 39, is. 2. - P. 91-100.

263. Kirpotin S. Western Siberia wetlands as indicator and regulator of climate change on the global scale / S. Kirpotin, A. Berezin, V. Bazanov, Y Polishchuk, S. Vorobiov, N. Mironycheva-Tokoreva, N. Kosykh, I. Volkova, B. Dupre, O. Pokrovsky, A. Kouraev, E. Zakharova, L. Shirokova, N. Mognard, S. Biancamaria, J. Viers, M. Kolmakova // International Journal of Environmental Studies. - 2009. - Vol. 66, № 4. - P. 409-421.

264. Kolesnichenko Y Landscape, Soil, Lithology, Climate and Permafrost Control on Dissolved Carbon, Major and Trace Elements in the Ob River, Western

Siberia / Y Kolesnichenko, L. G. Kolesnichenko, S. N. Vorobyev, L. S. Shirokova, I. P. Semiletov, O. V. Dudarev, R. S. Vorobev, U. Shavrina, S. N. Kirpotin,

0. S. Pokrovsky // Water. - 2021. - Vol. 13, is. 22. - Article number 3189. - 21 p. -URL: https://www.mdpi.com/2073-4441/13/22/3189/pdf?version=1637394254 (access date: 01.05.2022).

265. Kolmonen E. Diversity of cyanobacteria and heterotrophic bacteria in cyanobacterial blooms in Lake Joutikas, Finland / E. Kolmonen, K. Sivonen, J. Rapala, K. Haukka // Aquatic Microbial Ecology. - 2004. - Vol. 36, is. 3. - P. 201-211.

266. Krickov I. V. Sizable carbon emission from the floodplain of Ob River /

1. V. Krickov, S. Serikova, O. S. Pokrovsky, S. N. Vorobyev, A. G. Lim, M. B. Siewert, J. Karlsson // Ecological Indicators. - 2021. - Vol. 131. - Article number 108164. -14 p. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1470160X21008293? via%3Dihub (access date: 01.05.2022).

267. Kvenvolden K. A. A review of the geochemistry of methane in natural gas hydrate / K. A. Kvenvolden // Organic Geochemistry. - 1995. - Vol. 23, № 11/12. -P. 997-1008.

268. Lapidus A. Genomes of Three Methylotrophs from a Single Niche Reveal the Genetic and Metabolic Divergence of the Methylophilaceae / A. Lapidus, A. Clum, K. LaButti, M. G. Kaluzhnaya, S. Lim, D. A. C. Beck, T. Glavina del Rio, M. Nolan, K. Mavromatis, M. Huntemann, S. Lucas, M. E. Lidstrom, N. Ivanova, L. Chistoserdova // Journal of Bacteriology. - 2011. - Vol. 193, № 15. - P. 3757-3764.

269. Lauber C. L. Pyrosequencing-Based Assessment of Soil pH as a Predictor of Soil Bacterial Community Structure at the Continental Scale / C. L. Lauber, M. Hamady, R. Knight, N. Fierer // Applied and Environmental Microbiology. - 2009. -Vol. 75, is. 15. - C. 5111-5120.

270. Lee S. Selective biodegradation of sorbitan ethoxylated surfactants by soil microorganisms / S. Lee, J. H. Kweon, H. S. Kim // International Biodeterioration and Biodegradation. - 2013. - Vol. 85. - P. 652-660.

271. Lehman R. M. Combined microbial community-level analyses for quality assurance of terrestrial sub-surface cores / R. M. Lehman, F. S. Colwell,

D. B. Ringelberg, D. C. White // Journal of Microbiological Methods. - 1995. - Vol. 22, is. 3. - P. 263-281.

272. Leiros M. Dependence of mineralization of soil organic matter on temperature and moisture / M. Leiros, C. Trasar-Cepeda, S. Seoane, F. Gil-Sotres // Soil Biology and Biochemistry. - 1999. - Vol. 31, is. 3. - P. 327-335.

273. Lemarchand C. Community composition and activity of prokaryotes associated to detrital particles in two contrasting lake ecosystems / C. Lemarchand, L. Jardillier, J.-F. Carrias, M. Richardot, D. Debroas, T. Sime-Ngando, C. Amblard // FEMS Microbiological Ecology. - 2006. - Vol. 57, is. 3. - P. 442-451.

274. Liang C. The importance of anabolism in microbial control over soil carbon storage / C. Liang, J. Schimel, J. Jastrow // Nature Microbiology. - 2017. - Vol. 2. -Article number 17105. - 6 p. - URL: https://www.nature.com/articles/nmicrobiol2017105 (access date: 22.07.2023).

275. Lovley D. R. Deep subsurface microbial processes / D. R. Lovley, F. H. Chapelle // Reviews of Geophysics. - 1995. - Vol. 33, is. 3. - P. 365-381.

276. Lozupone C. A. Global patterns in bacterial diversity. / C. A. Lozupone, R. Knight // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2007. - Vol. 104, № 27. - P. 11436-11440.

277. Luef B. Impact of hydrology on free-living and particle-associated microorganisms in a river floodplain system (Danube Austria) / B. Luef, F. Aspetsberger, T. Hein, F. Huber, P. Peduzzi // Freshwater Biology. - 2007. - Vol. 52, is. 6. - P. 10431057.

278. Madigan M. T. Brock Biology of Microorganisms / M. T. Madigan, J. M. Martinko, J. Parker. - 8th ed. - New York : Prentice Hall International Inc., 1997. -1036 p.

279. Manasypov R. M. Thermokarst lakes waters across permafrost zones of Western Siberia / R. M. Manasypov, O. S. Pokrovsky, S. N. Kirpotin, L. S. Shirokova // The Cryosphere. - 2014. - Vol. 8. - P. 1177-1193.

280. McDowell W. H. Riparian nitrogen dynamics in two geomorphologically distinct tropical rain forest watersheds: subsurface solute patterns / W. H. McDowell, W. B. Bowden, C. E. Asbury // Biogeochemistry. - 1992. - Vol. 18, № 2. - P. 53-75.

281. Melack J. M. Biogeochemistry of Amazon Floodplain Lakes and Associated Wetlands / J. M. Melack, B. R. Forsberg // The Biogeochemistry of the Amazon Basin / eds. M. E. McClain, R. Victoria, J. E. Richey. - New York : Oxford University Press, 2001. - P. 235-274.

282. Melack J. M. Amazon floodplain hydrology and implications for aquatic conservation / J. M. Melack, M. T. Coe // Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. - 2021. - Vol. 31, is. 5. - P. 1029-1040.

283. Melack J. M. Limnological perspectives on conservation of floodplain lakes in the Amazon basin / J. M. Melack, D. Kasper, J. H. F. Amaral, P. M. Barbosa, B. R. Forsberg // Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems. - 2021. -Vol. 31, is. 5. - P. 1041-1055.

284. Melero S. Conservation tillage: Short- and long-term effects on soil carbon fractions and enzymatic activities under Mediterranean conditions / S. Melero, R. López-Garrido, J. M. Murillo, F. Moreno // Soil and Tillage Research. - 2009. - Vol. 104, is. 2. -P. 292-298.

285. Mitsch W. J. Reducing Nitrogen Loading to the Gulf of Mexico from the Mississippi River Basin: Strategies to Counter a Persistent Ecological Problem / W. J. Mitsch, J. W. Day, Jr., J. W. Gilliam, P. M. Groffman, D. L. Hey, G. W. Randall, N. Wang // BioScience. - 2001. - Vol. 51, is. 5. - P. 373-388.

286. Moche M. Monthly dynamics of microbial community structure and their controlling factors in three floodplain soils / M. Moche, J. Gutknecht, E. Schulz, U. Langer, J. Rinklebe // Soil Biology and Biochemistry. - 2015. - Vol. 90. - P. 169-178.

287. Montes-Borrego M. Linking microbial functional diversity of olive rhizosphere soil to management systems in commercial orchards in southern Spain / M. Montes-Borrego, J. A. Navas-Cortés, B. B Landa // Agriculture, Ecosystems and Environment. - 2013. - Vol. 181. - P. 169-178.

288. Moorhead D. L. Simulated patterns of litter decay predict patterns of extracellular enzyme activities / D. L. Moorhead, R. L. Sinsabaugh // Applied Soil Ecology. - 2000. - Vol. 14. - P. 71-79.

289. Mopper K. Fluorescence as a Possible Tool for Studying the Nature and Water Column Distribution of DOC Components / K. Mopper, C. A. Shultz // Marine Chemistry. - 1993. - Vol. 41, is. 1-3. - P. 229-238.

290. Moran M. A. Role of photoreactions in the formation of biologically labile compounds from dissolved organic matter / M. A. Moran, R. G. Zepp // Limnology and Oceanography. - 1997. - Vol. 42, № 6. - P. 1307-1316.

291. Moreno-Mateos D. Structural and Functional Loss in Restored Wetland Ecosystems / D. Moreno-Mateos, M. E. Power, F. A. Comín, R. Yockteng // PLoSBiology. - 2012. - Vol. 10, is. 1. - Article number e1001247. - 8 p. -URL: https://journals.plos.org/plosbiology/article/file?id=10.1371/journal.pbio.1001247 &type=printable (access date: 23.04.2022).

292. Morgalev Y. N. Bacteria primarily metabolize at the active layer/permafrost border in the peat core from a permafrost region in western Siberia / Y. N. Morgalev, I. V. Lushchaeva, T. G. Morgaleva, L. G. Kolesnichenko, S. V. Loiko, I. V. Krickov, A. Lim, T. V. Raudina, I. I. Volkova, L. S. Shirokova, S. Y Morgalev, S. N. Vorobyev, S. N. Kirpotin, O. S. Pokrovsky // Polar Biology. - 2017. - Vol. 40, is. 8. - P. 1645-1659.

293. Morillas L. Improving evapotranspiration estimates in Mediterranean drylands: The role of soil evaporation / L. Morillas, R. Leuning, L. Villagarcía, M. García, P. Serrano-Ortiz, F. Domingo // Water Resourses Researches. - 2013. -Vol. 49, is. 10. - P. 6572-6586.

294. Morrice J. A. Terminal electron accepting processes in the alluvial sediments of a headwater stream. / J. A. Morrice, C. N. Dahm, H. M. Valett, P. V. Unnikrishna, M. E. Campana // Journal of the North American Benthological Society. - 2000. -Vol. 19, is. 4. - P. 593-608.

295. Mu C. Dissolved organic carbon, CO2, and CH4 concentrations and their stable isotope ratios in thermokarst lakes on the Qinghai-Tibetan Plateau / C. Mu, T. Zhang, Q. Wu, X. Peng, P. Zhang, Y. Yang, Y. Hou, X. Zhang, G. Cheng // Journal of Limnology. - 2016. - Vol. 75, is. 2. - P. 313-319.

296. Newton R. J. A Guide to the Natural History of Freshwater Lake Bacteria / R. J. Newton, S. E. Jones, A. Eiler, K. D. McMahon, S. Bertilsson // Microbiology and Molecular Biology Reviews. - 2011. - Vol. 75, № 1. - P. 14-49.

297. Nikitkin V. A. Changes in the microbial community structure triggered by permafrost peat thawing / V. A. Nikitkin, L. G. Kolesnichenko, E. G. Nikitkina, A. V. Pivovarova, E. Kostenko, I. V. Lushchaeva // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2021. - Vol. 928, is. 1 : 4th International Conference Peatlands of Siberia: Functioning, Resources, Restoration (POS 2021). Tomsk, Russian Federation, October 01-08, 2021. - Article number 012008. - 6 p. -URL: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1755-1315/928/1/012008/pdf (access date: 29.05.2025).

298. Nikitkin V. A. Relationship between the content of basic chemical elements and ecological and trophic groups of microorganisms in peat oligotrophic frozen soil / V. A. Nikitkin, I. V. Lushchaeva, E. S. Rabtsevich, E. G. Nikitkina, I. I. Volkova,

A. G. Lim, S. N. Kirpotin, L. G. Kolesnichenko // Acta Biologica Sibirica. - 2023. -Vol. 9. - P. 417-431.

299. Nikitkina E. G. Ecological-trophic structure of soil microbial communities in the middle Ob floodplain / E. G. Nikitkina, I. V. Lushchaeva, V. A. Nikitkin, S. N. Kirpotin, L. G. Kolesnichenko // Acta Biologica Sibirica. - 2024. - Vol. 10. -P. 1733-1754.

300. Nold S. C. Patterns and governing forces in aquatic microbial communities / S. C. Nold, G. Zwart // Aquatic Ecology. - 1998. - Vol. 32, is. 1. - P. 17-35.

301. Ogura K. Diagenesis of biomarkers in Biwa lake sediments over 1 million years / K. Ogura, T. Machihara, H. Takada // Organic Geochemistry. - 1990. - Vol. 16, is. 4-6. - P. 805-813.

302. Ondov B. D. Interactive metagenomic visualization in a Web browser /

B. D. Ondov, N. H. Bergman, A. M. Phillippy // BMC Bioinformatics. - 2011. -Vol. 12. - Article number 385. - 9 p. - URL: https://bmcbioinformatics.biomedcentral. com/counter/pdf/10.1186/1471-2105-12-385. pdf (access date: 22.09.2022).

303. Orland C. Think global, act local: The small-scale environment mainly influences microbial community development and function in lake sediment / C. Orland, K. M. Yakimovich, N. C. S. Mykytczuk, N. Basiliko, A. J. Tanentzap // Limnology and Oceanography. - 2020. - Vol. 65, sp. is. S1 : Linking Metagenomics to Aquatic Microbial Ecology and Biogeochemical Cycles. - P. S88-S100.

304. Padisak J. Shallow lakes: the absolute, the relative, the functional and the pragmatic / J. Padisak, C. S. Reynolds // Hydrobiologia. - 2003. - Vol. 506509. - P. 1-11.

305. Papa F. Ob' River flood inundations from satellite observations: A relationship with winter snow parameters and river runoff / F. Papa, C. Prigent, W. B. Rossow // Journal of Geophysical Research Atmospheres. - 2007. - Vol. 112, is. 18. - Article number D18103. - 11 p. - URL: https://agupubs.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/ 10.1029/2007JD008451 (access date: 10.07.2024).

306. Parolin P. Central Amazonian Floodplain Forests: Tree Adaptations in a Pulsing System / P. Parolin, O. De Simone, K. Haase, D. Waldhoff, S. Rottenberger, U. Kuhn, J. Kesselmeier, B. Kleiss, W. Schmidt, M. T. F. Piedade, W. J. Junk // The Botanical Review. - 2004. - Vol. 70, is. 3. - P. 357-380.

307. Peng M. W. An institution-based view of international business strategy: a focus on emerging economies / M. W. Peng, D. Y L. Wang, Y. Jiang // Journal of International Business Studies. - 2008. - Vol. 39, is. 5. - P. 920-936.

308. Perham R. N. Limited proteolysis and proton n.m.r. spectroscopy of the 2-oxoglutarate dehydrogenase multienzyme complex of Escherichia coli / R. N. Perham, G. C. K. Roberts // The Biochemical Journal. - 1981. - Vol. 199, is. 3. -P. 733-740.

309. Peuravuori J. Molecular size distribution and spectroscopic properties of aquatic humic substances / J. Peuravuori, K. Pihlaja // Analytica Chimica Acta. -1997. - Vol. 337, is. 2. - P. 133-149.

310. Pieper D. H. Bacterial Metabolism of Polychlorinated Biphenyls / D. H. Pieper, M. Seeger // Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. -2008. - Vol. 15, is. 2-3. - P. 121-138.

311. Pinay G. Geomorphic control of denitrification in large river floodplain soils/ G. Pinay, V. J. Black, A. M. Planty-Tabacchi, B. Gumiero, H. Décamps // Biogeochemistry. - 2000. - Vol. 50, is. 2. - P. 163-182.

312. Pinay G. Impact of atmospheric CO2 and plant life forms on soil microbial activities. / G. Pinay, P. Barbera, A. Carreras-Palou, N. Fromin, L. Sonie,

M. M. Couteaux, J. Roy, L. Philippot, R. Lensi // Soil Biology and Biochemistry. -2007. - Vol. 39, is. 1. - P. 33-42.

313. Pinhassi J. Differential Growth Response of Colony-Forming a- and y-Proteobacteria in Dilution Culture and Nutrient Addition Experiments from Lake Kinneret (Israel), the Eastern Mediterranean Sea, and the Gulf of Eilat / J. Pinhassi, T. Berman // Applied and Environmental Microbiology. - 2003. - Vol. 69, №2 1. - P. 199211.

314. Pokrovsky O. S. Impact of Permafrost Thaw and Climate Warming on Riverine Export Fluxes of Carbon, Nutrients and Metals in Western Siberia / O. S. Pokrovsky, R. M. Manasypov, S. G. Kopysov, I. V. Krickov, L. S. Shirokova, S. V. Loiko, A. G.Lim, L. G. Kolesnichenko, S. N. Vorobyev, S. N. Kirpotin // Water. -2020. - Vol. 12, is. 6. - Article number 1817. - 21 p. -URL: https://www.mdpi.com/2073-4441/12/6/1817/pdf?version=1593506089 (access date: 02.03.2021).

315. Prommer H. Fringe-Controlled Natural Attenuation of Phenoxy Acids in a Landfill Plume: Integration of Field-Scale Processes by Reactive Transport Modeling / H. Prommer, N. Tuxen, P. L. Bjerg // Environmental Science and Technology. - 2006. - Vol. 40, is. 15. - P. 4732-4738.

316. Rappe M. S. Phylogenetic comparisons of a coastal bacterioplankton community with its counterparts in open ocean and freshwater systems / M. S. Rappe, K. Vergin, S. J. Giovannoni // FEMS Microbiological Ecology. - 2000. - Vol. 33. -P. 219-232.

317. Reay M. Moisture effects on microbial protein biosynthesis from ammonium and nitrate in an unfertilised grassland / M. Reay, N. Loick, R. P. Evershed, C. Müller, L. M. Cardenas // Soil Science and Soil Biology. - 2023. - Vol. 184, is. 6. - Article number 109114. - 10 p. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/ pii/S0038071723001761 ?via%3Dihub (access date: 20.07.2023).

318. Repeta D. Chemical characterization of high molecular weight dissolved organic matter in fresh and marine waters / D. Repeta, T. M. Quan, L. I. Aluwihare, A. M. Accardi // Geochimica et Cosmochimica Acta. - 2002. - Vol. 66, is. 6. - P. 955962.

319. Rheinheimer G. Aquatic microbiology / G. Rheinheimer. - 2nd ed. -New York : Wiley, 1980. - 235 p.

320. Richey J. E. Sources and routing of the Amazon River Flood Wave / J. E. Richey, L. A. K. Mertes, T. Dunne, R. L. Victoria, B. R. Forsberg,

A. C. N. S. Tancredi, E. Oliveira // Global Biogeochemical Cycles. - 1989 - Vol. 3, № 3. - P. 191-204.

321. Rinklebe J. Microbial diversity in three floodplain soils at the Elbe River (Germany) / J. Rinklebe, U. Langer // Soil Biology and Biochemistry. - 2006. - Vol. 38, is. 8. - P. 2144-2151.

322. Rodrigo A. Modelling temperature and moisture effects on C-N transformations in soils: comparison of nine models / A. Rodrigo, S. Recous, C. Neel,

B. Mary // Ecological Modelling. - 1997. - Vol. 102, is. 2-3. - P. 325-339.

323. Rousk J. Soil Bacterial and fungal communities across a pH gradient in an arable soil / J. Rousk, E. Baath, P. C. Brookes, C. L. Lauber, C. Lozupone, J. G. Caporaso, R. Knight, N. Fierer // The ISME Journal. - 2010. - Vol. 4. - P. 13401351.

324. Rozhkova-Timina I. O. Contribution of floodplain lakes to the global carbon cycle / I. O. Rozhkova-Timina, L. G. Kolesnichenko, V. V. Mukhortov, L. F. Shepeleva, S. N. Vorobyev, S. N. Kirpotin // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2019. - Vol. 232, is. 1 : 5th International Summer School for Students and Young Scientists on Natural and Human Environment of Arctic and Alpine Areas: Relief, Soils, Permafrost, Glaciers, Biota Life Style of Native Ethnic Groups in a Rapidly Changing Climate. Tomsk, Aktru, Russian Federation, July 07-21, 2018. - Article number 012011. - 5 p. - URL: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1755-1315/232/1/012011/pdf (access date: 16.03.2021).

325. Saini R. CO2 utilizing microbes - A comprehensive review / R. Saini, R. Kapoor, R. Kumar, T. O. Siddiqi, A. Kumar // Biotechnology Advances. - 2011. -Vol. 29, is. 6. - P. 949-960.

326. Salcher M. The ecology of pelagic freshwater methylotrophs assessed by a high-resolution monitoring and isolation campaign / M. Salcher,

S. M. Neuenschwander, T. Posch, J. Pernthaler // The ISME Journal. - 2015. - Vol. 9, is. 10. - P. 2442-2453.

327. Savichev O. G. Microbiological composition of river waters in the Ob basin (West Siberia) and its associations with hydrochemical indices / O. G. Savichev, O. G. Tokarenko, E. Yu. Pasechnik, N. G. Nalivaiko, E. A. Ivanova, L. V. Nadeina // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2015. - Vol. 27, is. 1 : XIX International Scientific Symposium in honor of Academician M. A. Usov «Problems of Geology and Subsurface Development». Tomsk, Russia, April 06-10, 2015. - Article number 012035. - 7 p. - URL: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/ 1755-1315/27/1/012035/pdf (access date: 01.03.2021).

328. Savichev O. G. Hydrologic conditions for chemical composition of the Siberian river waters / O. G. Savichev, V. A. Zemtsov, E. Y Pasechnik // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2019. - Vol. 232, is. 1 : 5th International Summer School for Students and Young Scientists «Natural and Human Environment of Arctic and Alpine Areas: Relief, Soils, Permafrost, Glaciers, Biota Life Style of Native Ethnic Groups in a Rapidly Changing Climate». Tomsk ; Aktru, Russian Federation, July 07-21, 2018. - Article number 012012. - 7 p. -URL: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1755-1315/232/1/012012/pdf (access date: 01.03.2021).

329. Schilling K. Effectiveness of natural riparian buffers to reduce subsurface nutrient losses to incised streams / K. Schilling, P. Jacobson // Catena. - 2014. -Vol. 114. - P. 140-148.

330. Schimel J. P. The implications of exoenzyme activity on microbial carbon and nitrogen limitation in soil: a theoretical model / J. P. Schimel, M. N. Weintraub // Soil Biology and Biochemistry. - 2003. - Vol. 35. - P. 549-563.

331. Schlesinger W. H. Biogeochemistry: an analysis of global change / W. H. Schlesinger, E. S. Bernhardt. - 3rd ed. - New York : Academic/Elsevier, 2013. -672 p.

332. Schuldt A. Biodiversity across trophic levels drives multifunctionality in highly diverse forests / A. Schuldt, T. Assmann, M. Brezzi, F. Buscot, D. Eichenberg,

J. Gutknecht, W. Härdtle, J.-S. He, A. -M. Klein, P. Kühn, X. Liu, K. Ma, P. A. Niklaus, K. A. Pietsch, W. Purahong, M. Scherer-Lorenzen, B. Schmid, T. Scholten, M. Staab, Z. Tang, S. Trogisch, G. von Oheimb, C. Wirth, T. Wubet, C.-D. Zhu, H. Bruelheide // Nature Communications. - 2018. - Vol. 9. - Article number 2989. - 10 p. -URL: https://www.nature.com/articles/s41467-018-05421-z.pdf (access date: 16.03.2023).

333. Schühle K. Phenylphosphate Carboxylase: a New C-C Lyase Involved in Anaerobic Phenol Metabolism in Thauera aromatica / K. Schühle, G. Fuchs // Journal of Bacteriology. - 2004. - Vol. 186, is, 14. - P. 4556-4567.

334. Scott D. T. Floodplain biogeochemical processing of floodwaters in the Atchafalaya River Basin during the Mississippi River flood of 2011 / D. T. Scott, R. F. Keim, B. L. Edwards, C. N. Jones, D. E. Kroes // Journal of Geophysical Research: Biogeosciences. - 2014. - Vol. 119, is. 4. - P. 537-546.

335. Seeger M. Genetics of Biphenyl Biodegradation and Co-Metabolism of PCBs / M. Seeger, D. Pieper // Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology / H. Wilkes, J. Schwarzbauer, J. M. Schiks [et al.]. - 2010. - Chap. 26. - P. 1179-1199.

336. Sha C. Methane emissions from freshwater riverine wetlands / C. Sha, W. J. Mitsch, Ü. Mander, J. Lu, J. Batson, L. Zhang, W. He // Ecological Engineering. -2011. - Vol. 37, is. 1. - P. 16-24.

337. Sharp E. L. Seasonal variations in natural organic matter and its impact on coagulation in water treatment / E. L. Sharp, S. A. Parsons, B. Jefferson // Science of the Total Environment. - 2006. - Vol. 363, is. 1-3. - P. 183-194.

338. Shen R. Flooding variations affect soil bacterial communities at the spatial and inter-annual scales / R. Shen, Z. Lan, J. Rinklebe, M. Nie, Q. Hu, Z. Yan, Ch. Fang, B. Jina, J. Chen // Science of the Total Environment. - 2021. - Vol. 759. - Article number 143471. - 12 p. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/ S0048969720370029?via%3Dihub (access date: 02.08.2024).

339. Shintani H. Gas plasma sterilization of microorganisms and mechanisms of action (Review) / H. Shintani, A. Sakudo, P. Burke, G. McDonnell // Experimental and Therapeutic Medicine. - 2010. - Vol. 1, is. 5. - P. 731-738.

340. Shirokova L. S. Heterotrophic bacterio-plankton in thawed lakes of the northern part of Western Siberia controls the CO2 flux to the atmosphere / L. S. Shirokova, O. S. Pokrovsky, S. N. Kirpotin, B. Dupre // International Journal of Environmental Studies. - 2009. - Vol. 66, № 4. - P. 433-445.

341. Shirokova L. S. Moss and Peat Leachate Degradability by Heterotrophic Bacteria: The Fate of Organic Carbon and Trace Metals / L. S. Shirokova, R. Bredoire, J.-L. Rols, O. S. Pokrovsky // Geomicrobiology. - 2015. - Vol. 34, is. 8. - P. 641-655.

342. Silva P. B. Seasonal hydrology and fish assemblage structure in the floodplain of the lower Amazon River / P. B. Silva, C. C. Arantes, C. E. C. Freitas, M. Petrere Jr., F. R. V. Ribeiro // Ecology of Freshwater Fish. - 2021. - Vol. 30, is. 2. - P. 162-173.

343. Singh J. S. Microbial biomass acts as a source of plant nutrients in dry tropical forest and savanna / J. S. Singh, A. S. Raghubanshi, R. S. Singh, S. C. Srivastava // Nature. - 1989. - Vol. 338, № 6215. - P. 499-500.

344. Sinsabaugh R. L. Ecoenzymatic Stoichiometry and Ecological Theory / R. L. Sinsabaugh, J. J. Follstad Shah // Annual Review of Ecology Evolution and Systematics. - 2012. - Vol. 43. - P. 313-343.

345. Sokol N. W. Pathways of mineral-associated soil organic matter formation: integrating the role of plant carbon source, chemistry, and point of entry / N. W. Sokol, J. Sanderman, M. A. Bradford // Global Change Biology. - 2019. - Vol. 25. - P. 12-24.

346. Steger K. Floodplain soil and its bacterial composition are strongly affected by depth / K. Steger, A. T. Kim, L. Ganzert, H.-P. Grossart, D. R. Smart // FEMS Microbiology Ecology. - 2019. - Vol. 95, is. 3. - Article number iz014. - 11 p. -URL: https://academic.oup.com/femsec/article-pdf/95/3/fiz014/27894903/fiz014.pdf (access date: 23.03.2024).

347. Stepanauskas R. Elevated microbial tolerance to metals and antibiotics in metal-contaminated industrial environments / R. Stepanauskas, T. C. Glenn, Ch. H. Jagoe, R. C. Tuckfield, A. H. Lindell, J. V. McArthur // Environmental Science and Technology. - 2005. - Vol. 39, is. 10. - P. 3671-3678.

348. Stocker T. F. IPCC, 2013: Summary for policymakers / eds. T. F. Stocker, D. Qin, G.-K. Plattner, M. Tignor, S. K. Allen, J. Doschung, A. Nauels, Y. Xia, V. Bex, P. M. Midgley // Climate Change 2013: The Physical Science Basis. Contribution

of Working Group I to the Fifth Assessment Report of the Intergovernmental Panel on Climate Change. Cambridge : Cambridge University Press, 2013. - P. 3-29.

349. Strahler A. N. Quantitative Analysis of Watershed Geomorphology / A. N. Strahler // EOS, Transactions, American Geophysical Union. - 1957. - Vol. 38, № 6. - P. 913-920.

350. Sun H. Eutrophication decreased CO2 but increased CH4 emissions from lake: A case study of a shallow Lake Ulansuhai / H. Sun, X. Lu, R. Yu, J. Yang, X. Liu, Z. Cao, Z. Zhang, M. Li, Y. Geng // Water Research. - 2021. - Vol. 201. - Article number 117363. - 15 p. - URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/ S0043135421005613?via%3Dihub (access date: 13.03.2024).

351. Sun H. Drivers of spatial and seasonal variations of CO2 and CH4 fluxes at the sediment water interface in a shallow eutrophic lake / H. Sun, R. Yu, X. Liu, Z. Cao, X. Li, Z. Zhang, J. Wang, S. Zhuang, Z. Ge, L. Zhang, L. Sun, A. Lorke, J. Yang, C. Lu, X. Lu // Water Research. - 2022. - Vol. 222. - Article number 118916. -URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0043135422008636?via% 3Dihub (access date: 13.03.2024).

352. Sun S. Diversity of carbon cycle-linked phyllosphere microorganisms: A key driver of CO2 flux in macrophyte-dominated aquatic systems / S. Sun, Z. Jian, Q. Rao, J. Chen, M. Zhong, Y. Wang, Y. Wang, J. Chen, P. Xie, H. Su // Water Biology and Security. - 2024. - Vol. 3, is. 4. - Article number 100289. - 11 p. -URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2772735124000507 (access date: 13.03.2025).

353. Sutfin N. A. Banking carbon: a review of organic carbon storage and physical factors influencing retention in floodplains and riparian ecosystems / N. A. Sutfin, E. Wohl, K. A. Dwire // Earth Surface Processes and Landforms. - 2016. - Vol. 41. -P. 38-60.

354. Szlachta M. Wykorzystanie adsorpcji na pylistym w<?glu aktywnym do usuwania rozpuszczonych substancji organicznych z wody [Application of Adsorption on Powdered Active Carbon for the Removal of Dissolved Organic Substances

from Surface Water] / M. Szlachta, W. Adamski // Ochrona Srodowiska. - 2009. -Vol. 31, № 2. - S. 61-66. (In Polish).

355. Sweerts J.-P. R. A. Oxygen-consuming processes at the profundal and littoral sediment-water interface of a small mesoeutrophic lake (Lake Vechten, The Netherlands) / J.-P. R. A. Sweerts, M.-J. Bar-Gilissen, A. A.Cornelese, T. E. Cappenberg // Limnology and Oceanography. - 1991. - Vol. 36, is. 6. - P. 1124-1133.

356. Tanentzap A. J. Chemical and microbial diversity covary in fresh water to influence ecosystem functioning / A. J. Tanentzap, A. Fitch, C. Orland, E. J.S. Emilson, K. M. Yakimovich, H. Osterholz, T. Dittmar // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2019. - Vol. 116, № 49. - P. 24689-24695.

357. Tereshchenko N. N. Microbiological characteristics of the profile of Cryic Fibric Histosol (Turbic) soil in Western Siberia / N. N. Tereshchenko, I. V. Lushchaeva, L. G. Kolesnichenko, I. V. Kritskov, S. V. Loiko, V. A. Nikitkin, E. G. Nikitkina, A. V. Pivovarova // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. - 2019. -Vol. 232, is. 1 : 5th International Summer School for Students and Young Scientists «Natural and Human Environment of Arctic and Alpine Areas: Relief, Soils, Permafrost, Glaciers, Biota Life Style of Native Ethnic Groups in a Rapidly Changing Climate». Tomsk ; Aktru, Russian Federation, July 07-21, 2018. - Article number 012016. - 6 p. -URL: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/1755-1315/232/1/012016/pdf (access date: 29.05.2025).

358. Tessler M. Large-scale differences in microbial biodiversity discovery between 16S amplicon and shotgun sequencing / M. Tessler, J. S. Neumann, E. Afshinnekoo, M. Pineda, R. Hersch, L. F.M. Velho, B. T. Segovia, F. A. Lansac-Toha, M. Lemke, R. DeSalle, C. E. Mason, M. R. Brugler // Scientific Reports. - 2017. -Vol. 7. - Article number 6589. - 14 p. - URL: https://www.nature.com/articles/ s41598-017-06665-3.pdf (access date: 07.01.2024).

359. Thurman E. M. Organic Geochemistry of Natural Waters / E. M. Thurman. -Dordrecht : Kluwer Academic Publishers Group, 1985. - 497 p. - (Developments in Biogeochemistry. Vol. 2).

360. Tiquia S. M. Metabolic diversity of the heterotrophic microorganisms and potential link to pollution of the Rouge River / S. M. Tiquia // Environmental Pollution. - 2010. - Vol. 158, is. 5. - P. 1435-1443.

361. Tockner K. An extension of the flood pulse concept / K. Tockner, F. Malard, J. V. Ward // Hydrological Processes. - 2000. - Vol. 14. - P. 2861-2883.

362. Totsche K. U. Microaggregates in soils / K. U. Totsche, W. Amelung, M. H. Gerzabek, G. Guggenberger, E. Klumpp, C. Knief, E. Lehndorff, R. Mikutta, S. Peth, A. Prechtel, N. Ray, I. Kogel-Knabner // Journal of Plant Nutrition and Soil Science. - 2018. - Vol. 181, is. 1. - P. 104-136.

363. Unger I. M. Flooding effects on soil microbial communities / I. M. Unger, A. C. Kennedy, R.-M. Muzika // Applied Soil Ecology. - 2009. - Vol. 42, is. 1. - P. 1-8.

364. Urbaniak M. Microbial response to Nature-Based Solutions in urban soils: A comprehensive analysis using Biolog® EcoPlates™ / M. Urbaniak, E. Mierzejewska-Sinner, A. Bednarek, K. Krauze, R. Wlodarczyk-Marciniak // Science of the Total Environment. - 2024. - Vol. 928. - Article number 172360. -URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0048969724025063?via% 3Dihub (access date: 05.01.2024).

365. Vance E. D. Substrate limitations to microbial activity in taiga forest floors /

E. D. Vance, F. S. Chapin III // Soil Biology and Biochemistry. - 2001. - Vol. 33. -P. 173-188.

366. Vasileiadis S. Soil microbial diversity patterns of a lowland spring environment / S. Vasileiadis, E. Puglisi, M. Arena, F. Cappa, J. A. van Veen, P. S. Cocconcelli, M. Trevisan // FEMS Microbiology Ecology. - 2013. - Vol. 86, is. 2. -P. 172-184.

367. Vergnoux A. Effects of forest fires on water extractable organic matter and humic substances from Mediterranean soils: UV-vis and fluorescence spectroscopy approaches / A. Vergnoux, R. Di Rocco, M. Domeizel, M. Guiliano, P. Doumenq,

F. Theraulaz // Geoderma. - 2011. - Vol. 160, is. 3-4. - P. 434-443.

368. Verpoorter C. A global inventory of lakes based on high-resolution satellite imagery / C. Verpoorter, T. Kutser, D. A. Seekell, L. J. Tranvik // Geophysical Research Letters. - 2014. - Vol. 41, is. 18. - P. 6396-6402.

369. Vorholt J. A. Microbial life in the phyllosphere / J. A. Vorholt // Nature Reviews Microbiology. - 2012. - Vol. 10, is. 12. - P. 828-840.