Выделение и изучение сульфатредуцирующих бактерий из экосистем, подверженных влиянию металлургических предприятий тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.16, кандидат биологических наук Франк, Юлия Александровна

• Франк, Юлия Александровна
• кандидат биологических наук
• 2006

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Франк, Юлия Александровна

ВВЕДЕНИЕ

1. СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ И ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ

ДЛЯ ОЧИСТКИ ВОД ОТ ТЯЖЕЛЫХ МЕТАЛЛОВ

1.1. Общая характеристика сульфатредуцирующих бактерий

1.1.1 .Особенности физиологии сульфатредуцирующих бактерий

1.1.2. Филогения сульфатредуцирующих бактерий

1.1.3. Экология и распространение сульфатредуцирующих бактерий

1.2. Влияние ионов металлов на сульфатредуцирующие бактерии

1.2.1. Токсичность металлов для бактериальных клеток

1.2.2. Устойчивость СРБ к ионам двухвалентной меди и ее генетические детерминанты

1.2.3. Устойчивость СРБ к ионам других тяжелых металлов

1.2.4. Жизнедеятельность СРБ в загрязненных экосистемах

1.3. Возможности применения сульфатредуцирующих бактерий в биотехнологиях очистки вод

1.3.1. Механизмы обезвреживания тяжелых металлов сульфатредуцирующими и другими бактериями

1.3.2. Использование СРБ для обезвреживания кислых шахтных дренажных вод

1.3.3. Осаждение тяжелых металлов в промышленных стоках сульфатредуцирующими бактериями

2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Объекты исследования

2.1.1. Чистые культуры СРБ

2.1.2. Осадки, использованные для выделения чистых культур

2.2. Культивирование сульфатредуцирующих бактерий и ростовые эксперименты

2.2.1. Приготовление среды Видцеля и добавок

2.2.2. Приготовление растворов металлов

2.2.3. Подготовка посуды для посева

2.2.4. Посев сульфатредуцирующих бактерий

2.2.5. Измерение рН среды

2.2.6. Определение круга используемых доноров и акцепторов электрона для сульфатредукции

2.2.7. Определение численности СРБ

2.2.8. Определение кинетических параметров роста чистых культур СРБ

2.3. Аналитические методы

2.3.1. Определение сероводорода по Пахмайеру

2.3.2. Определение белка по методу Лоури

2.3.3. Определение ацетата методом газовой хроматографии

2.4. Молекулярные методы

2.4.1. Выделение хромосомной ДНК бактерий

2.4.2. Электрофорез в агарозном геле

2.4.3. Полимеразная цепная реакция

2.4.4. Градиентный денатурирующий гель-электрофорез (DGGE)

2.4.5. Флуоресцентная гибридизация in situ (FISH)

2.5. Микроскопирование и микрофотосъемка

2.6. Программное обеспечение и статистическая обработка

3. СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ В ЭКОСИСТЕМАХ, ПОДВЕРЖЕННЫХ ВЛИЯНИЮ МЕТАЛЛУРГИЧЕСКИХ ПРЕДПРИЯТИЙ

3.1. Численность и филогенетическое положение культивируемых СРБ в осадках влажных местообитаний Норильской промышленной зоны

3.2. Численность и разнообразие культивируемых СРБ в осадках влажных местообитаний промышленной зоны на Кольском полуострове

3.3. Выделение чистых культур СРБ из осадков влажных местообитаний Норильской промышленной зоны, их фенотипическая и филогенетическая характеристика

3.4. Выделение чистых культур СРБ из осадков влажных местообитаний промышленной зоны на Кольском полуострове, их фенотипическая и филогенетическая характеристика

3.5. Фенотипическая и филогенетическая характеристика чистых культур СРБ, выделенных из сточных вод Челябинского металлургического комбината

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Выделение и изучение сульфатредуцирующих бактерий из экосистем, подверженных влиянию металлургических предприятий»

Актуальность проблемы. Загрязнение вод тяжелыми металлами - одна из наиболее серьезных проблем окружающей среды России (Государственный доклад «О состоянии окружающей природной среды Российской Федерации», 1998). Интенсивные шахтные разработки в северных регионах и гигантские плавильные производства на Урале, в Норильске и на Кольском полуострове долгое время осуществлялись без учета их воздействия на окружающую среду, что вызвало мощные загрязнения металлами прилегающих экосистем. В местах действующих и заброшенных шахт образуются кислые дренажные воды. Они содержат большое количество тяжелых металлов и сульфатов, а также имеют низкий рН, являющийся результатом окисления сульфидов металлов. В настоящее время широко распространены химические методы обезвреживания кислых шахтных вод. Стоимость подобных процессов велика при не очень высокой эффективности удаления сульфата и металлов (Boonstra et al., 1999). Биологическая очистка стоков, содержащих металлы, имеет несколько существенных преимуществ по сравнению с химическими методами, таких как сравнительно низкая стоимость, высокая эффективность удаления металлов и возможность повторного использования извлеченных металлов.

Сульфатредуцирующие бактерии (СРБ) привлекают внимание исследователей как потенциальные агенты очистки различных сред, загрязненных тяжелыми металлами и сульфатами. В ходе своей жизнедеятельности они восстанавливают сульфаты (White et al., 2000). Продукт сульфатредукции - сероводород - реагирует с ионами тяжелых металлов с образованием нерастворимых сульфидов металлов. Благоприятным фактором является редукция растворимых металлов до менее токсичных или менее растворимых форм. Сульфатредукторы не только эффективно осаждают ионы металлов путем продукции сероводорода, но и естественным путем повышают щелочность среды, переводя серную кислоту в сульфид (Johnson, 2000).

Токсичность ионов металлов для микроорганизмов - одно из главных ограничений применения ремедиационных биотехнологий (Johnson, 2000). Сульфатредуцирующие бактерии проявляют повышенную устойчивость к тяжелым металлам (Karnachuk et al., 2003; Karnachuk et al., 2005), однако, кинетика роста чистых культур сульфатредукторов и ингибирования их роста ионами металлов, в частности ионами меди (II), остается малоизученной. В условиях бореального климата существует перспектива выделения и использования СРБ, устойчивых к низким температурам (Banks et al., 1997). В настоящее время применение микроорганизмов для очистки окружающей среды в период с осени до весны ограничено из-за низких температур. Одним из путей преодоления данного ограничения может быть использование для биоремедиации психротолерантных микроорганизмов.

Актуальной задачей при изучении чистых культур и сообществ микроорганизмов - агентов природоохранных технологий - является также поиск эффективных и экономически выгодных субстратов для роста. Наличие органических веществ - доноров углерода и электронов для сульфатредукции - одно из важнейших условий обеспечения жизнедеятельности для большинства СРБ. Показана возможность стимуляции активности сульфатредукторов в биореакторных системах путем внесения определенных органических веществ (Kaksonen et al., 2004). Нерастворимые фосфаты представляют собой более дешевые ростовые субстраты по сравнению с растворимыми. Способность к утилизации природных нерастворимых фосфатов - важный механизм, обеспечивающий конкурентноспособность СРБ при биоремедиации загрязненных водных экосистем, лимитированных по содержанию фосфора.

В последние годы возрос интерес к изучению возможностей стимулирования активности аборигенной микрофлоры в загрязненных местообитаниях. Целью подобных исследований является поиск новых путей развития биоремедиационных технологий. В связи с этим, данные о численности и разнообразии СРБ в низкотемпературных осадках, загрязненных стоками металлургических производств, представляют особую ценность.

Цель и задачи исследования. Целью диссертационного исследования являлось выделение и изучение СРБ, перспективных для использования в технологиях очистки вод от металлов, а также определение их численности и разнообразия в загрязненных экосистемах. Для достижения цели были поставлены следующие задачи:

1. Определить численность СРБ в осадках влажных местообитаний, загрязненных стоками металлургических предприятий в Норильске и на Кольском полуострове;

2. Исследовать разнообразие и состав сообщества культивируемых СРБ в загрязненных влажных осадках промышленных зон в Норильске и на Кольском полуострове;

3. Выделить чистые культуры СРБ из осадков, загрязненных стоками металлургических предприятий в Норильской промышленной зоне и на Кольском полуострове, изучить их фенотипические и филогенетические характеристики;

4. Изучить филогенетические характеристики чистых культур, выделенных ранее из сточных вод Челябинского металлургического комбината, и определить оптимальные органические субстраты - доноры углерода и электронов для их роста;

5. Установить влияние температуры на рост чистых культур СРБ, выделенных из осадков влажных местообитаний Норильской промышленной зоны, и на образование ими сероводорода;

6. Изучить влияние ионов меди и других металлов на рост чистых культур СРБ и их разнообразие;

7. Исследовать возможность использования чистыми культурами СРБ нерастворимых природных фосфатов в качестве субстратов для роста.

Научная новизна работы. В ходе исследований впервые изучено биоразнообразие СРБ в низкотемпературных экосистемах, загрязненных стоками металлургических предприятий. Пять новых штаммов СРБ выделены в чистые культуры. Один из них предположительно принадлежит к новому, ранее неописанному виду рода Desulfomicrobium. Два изолята являются новыми представителями малоизученных сульфатредуцирующих клостридий. Впервые изучена кинетика роста СРБ с использованием сахарозы и крахмала. Показана возможность роста чистых культур СРБ с использованием нерастворимых источников фосфора. Выявлена стимуляция роста СРБ небольшими концентрациями ионов меди (II).

Практическая значимость. Данные о численности и биоразнообразии СРБ в осадках влажных местообитаний, загрязненных стоками металлургических комбинатов в Норильской промышленной зоне и на Кольском полуострове могут быть использованы при разработке технологий стимуляции аборигенного сообщества микроорганизмов, способных к осаждению металлов в загрязненных экосистемах.

Чистые культуры СРБ, выделенные и охарактеризованные в ходе настоящей работы, обладают свойствами, важными с точки зрения использования в биотехнологиях осаждения металлов, а именно: устойчивостью к металлам, психротолерантностью, ацидотолерантностью, способностью к использованию дешевых органических веществ (этанола, Сахаров) и нерастворимых источников фосфора в качестве ростовых субстратов. Штаммы могут быть рекомендованы для тестирования в in situ и ex situ технологиях очистки вод от металлов. На основе результатов изучения физиологических свойств культур возможно определение технологических коридоров оптимума для их использования в экобиотехнологиях. В настоящее время чистые культуры, выделенные в ходе данной работы, проходят испытание в низкотемпературном биореакторе в Институте инженерии окружающей среды и биотехнологии Технологического университета Тампере (Финляндия) в рамках проекта «Biotechnology for metal bearing material in Europe».

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены на международных научных конференциях «Экология и рациональное природопользование на рубеже веков. Итоги и перспективы» (Томск, 2000), «Экология Южной Сибири - 2000 год» (Абакан, 2000), «Эколого-экономические проблемы природопользования» (Томск, 2004), конференциях молодых ученых «Экология Южной Сибири и сопредельных территорий» (Абакан, 2004), «Наука и образование» (Томск, 2005); школе - конференции «III Сибирская школа молодого ученого» (Томск, 2003); XL, XLI, XLIII международных конференциях «Студент и научно-технический прогресс» (Новосибирск, 2002, 2003, 2005); международной конференции по Арктической Микробиологии «International Conference on Arctic Microbiology» (Рованиеми, 2004), на международной конференции по энвайронментальной, индустриальной и прикладной биотехнологии «BioMicroWorld2005» (Бадахос, 2005), на Российско-французском форуме «Актуальные проблемы экологии и природопользования Сибири в глобальном контексте» (Томск, 2006) и на 11 Международном Симпозиуме по Экологической микробиологии «ISME-И» (Вена, 2006). По материалам диссертации опубликовано 16 печатных работ.

Благодарности. Автор выражает благодарность научному руководителю к.б.н., с.н.с. О.В. Карначук и сотрудникам кафедры физиологии растений и биотехнологии Томского государственного университета за неоценимую помощь при проведении исследований и написании диссертации. Также -признательность к.т.н., профессору Г.Л. Генцлеру и д.б.н., профессору Е.В. Евдокимову за помощь в обсуждении диссертации и коллегам, оказавшим содействие при выполнении исследований (в особенности Д.А. Ивасенко).

Автор также выражает благодарность за помощь при проведении исследований в Институте инженерии окружающей среды и Биотехнологии при Технологическом университете г. Тампере (Финляндия) старшему исследователю Анне Каксонен (Anna Kaksonen), исследователям Пайви Киннунен (Paivi Kinnunen), Пертту Коксинену (Perttu Koksinen), а также доценту Уве Мюнстеру (Uwe Munster) и директору института, профессору Яаакко Пухакке (Jaakko Puhakka).

Работа частично выполнена при финансовой поддержке фонда ИНТАС (гранты «Acidophilic and psychrophilic sulfate-reducing bacteria in boreal, acid mine drenage-impacted environments» (INTAS - 2001 - 0731) и «Microbial processes of carbon and sulfur cycling at the oxic-anoxic interface in meromictic lakes» (INTAS - 2001 - 2333)). Молекулярно-генетические исследования структуры сообществ и состава накопительных культур сульфатредуцирующих бактерий осуществлялись при поддержке фонда Правительства Финляндии CIMO и объединенного исследовательского проекта Европейской комиссии «Biotechnology for metal bearing material in Europe» (BioMinE 500329). Изучение некоторых аспектов устойчивости сульфатредуцирующих бактерий к меди финансировалось Федеральным агентством по образованию России (Грант А04-2.12-725).

СУЛЬФАТРЕДУЦИРУЮЩИЕ БАКТЕРИИ И ИХ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ В БИОТЕХНОЛОГИЯХ ОЧИСТКИ ОТ

ТЯЖЕЛЫХ МЕТАЛЛОВ

Заключение диссертации по теме «Экология», Франк, Юлия Александровна

ВЫВОДЫ

1. Численность СРБ в осадках Норильской промышленной зоны и Кольского полуострова достигает 1.5х107 и 2.5х105 клеток на миллилитр влажного осадка, соответственно. Факторы, влияющие на активность сульфатредукторов, различаются в зависимости от сайта и могут включать наличие доноров электрона, температуру и кислотность среды.

2. Преобладающими группами культивируемых СРБ в осадках Норильской промышленной зоны являются Desulfobulbus spp. и Desulfosarcina-Desulfococcus. В осадках Кольского полуострова обнаружены преимущественно Desulfarculus-Desulfomonile, Desulfobulbus spp., Desulfomicrobium spp. и Desulfovibrio spp.

3. Из низкотемпературных осадков, загрязненных стоками металлургических комбинатов в Норильске и на Кольском полуострове, выделены в чистые культуры спорообразующие ацидотолерантные СРБ Desulfosporosinus spp. ОТ2, RLAc и Clostridium spp. KA, RL и неспорообразующий Desulfomicrobium sp. BL.

4. Desulfovibrio spp.Al, A2, A4, выделенные из сточных вод Челябинского металлургического комбината, утилизируют различные органические субстраты с неполным окислением. Наиболее предпочтительными субстратами для их роста служат лактат и этанол. Обнаружена способность к росту на среде с сахарами.

5. Desulfomicrobium sp. BL и Desulfosporosinus sp. OT2, выделенные из осадков Норильской промышленной зоны, проявляют психротолерантные свойства. Desulfomicrobium sp.BL способен к активному росту и продукции сероводорода при низких положительных температурах. Определена температурная кинетика. Оптимум для роста Desulfomicrobium sp. BL +23 °С - +25 °С.

6. Сульфатредуцирующие бактерии, выделенные из загрязненных местообитаний, устойчивы к меди (II) и другим тяжелым металлам. Обнаружен эффект стимуляции роста Desulfovbirio sp. А2 ионами меди (II) в небольших концентрациях. Ki составила 57 мг меди (II) на литр. Отмечено возрастание разнообразия СРБ в накопительных культурах с увеличением концентрации меди (II) в среде, что, вероятно, связано с повышенной устойчивостью бактерий этой группы по сравнению с другими группами микроорганизмов. Представители Desulfovibrio наиболее устойчивы к ионам меди (II) среди сульфатредукторов.

7. Сульфатредуцирующие бактерии способны к активному росту при внесении природного фосфорита как единственного источника фосфора. Свойством расти в присутствии нерастворимых фосфатов обладают сульфатредукторы, выделенные как из промышленных экосистем, так и из экологически чистых местообитаний.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Рациональное использование бактериальных процессов в очистных сооружениях и эффективное манипулирование аборигенными бактериальными сообществами для стимуляции in situ активности требуют знаний о физиологии и филогении, а также о биоразнообразии и структуре бактериальных сообществ в загрязненных местообитаниях. Методы, основанные на культивировании, дают недостаточную информацию о структуре и динамике микробных сообществ in situ. Достижения в области молекулярной экологии, основанные на анализе последовательностей генов 16S рРНК и функциональных генов, такие как клонирование, флуоресцентная гибридизация in situ (FISH), денатурирующий градиентный гель-электрофорез (DGGE), представляют собой новые подходы, способствующие изучению микробных сообществ (Amann et al., 1995; Roest, 2005). Однако, выделение и изучение культивируемых микроорганизмов необходимо для лучшего понимания их физиологии и роли в биогеохимических реакциях (Connon, Giovanni, 2002). Кроме того, некоторые авторы считают, что использование в биотехнологиях специально подобранных смешанных культур сульфатредуцирующих бактерий на основе чистых культур является предпочтительным (Vainshtein et al., 2003).

В ходе настоящей работы было выделено 5 новых штаммов СРБ из низкотемпературных осадков влажных местообитаний, загрязненных стоками металлургических предприятий Зполярного филиала ОАО «ГМК «Норильский никель» на Таймыре и АО «Комбинат «Североникель» на Кольском полуострове. Подобные местообитания представляют собой естественные резервуары СРБ, устойчивых к металлам, низким температурам и повышенной кислотности. Так, спорообразующие Desulfosporosinus spp. ОТ2, MS и Clostridium spp. КА, RL обладают ацидотолерантными свойствами. Неспорообразующий Desulfomicrobium sp.

BL способен к активному росту и продукции сероводорода при низких положительных температурах. Desulfosporosinus sp. ОТ2 также проявляет психротолерантные свойства.

В работе установлена возможность роста чистых культур с использованием различных органических веществ - доноров углерода и электронов. Результаты исследований показали, что СРБ способны использовать широкий круг субстратов, однако оптимальным для биотехнологических целей является этанол - дешевый и эффективный субстрат, который активно используется СРБ и дает значительный выход биомассы и сероводорода. Многие из изученных изолятов способны использовать сахара, которые по экономичности превосходят этанол. Наиболее часто на сахарах, а именно, на фруктозе, глюкозе и сахарозе, растут представители рода Desulfovibrio. Они же проявляют наибольшую устойчивость к меди.

Токсичность ионов металлов для СРБ - одно из главных ограничений применения ремедиационных технологий (Johnson, 2000). В связи с этим, актуальным является выделение чистых культур микроорганизмов, устойчивых к ионам металлов в повышенной концентрации. Обнаружено, что чистые культуры СРБ, выделенные из низкотемпературных осадков влажных местообитаний промышленных зон в Норильске и на Кольском полуострове, и чистые культуры из сточных вод Челябинского металлургического комбината, проявляют устойчивость к меди (И) и другим металлам. Показано также, что при увеличении концентрации меди в среде увеличивается содержание СРБ по сравнению с другими группами микроорганизмов. При изучении кинетики роста Desulfovibrio sp. А2 обнаружен эффект стимуляции роста и продукции сероводорода в присутствии меди (II) в небольших концентрациях.

Таким образом, чистые культуры сульфатредуцирующих бактерий, выделенные из осадков влажных местообитаний Норильской промышленной зоны и промышленной зоны на Кольском полуострове, а также из сточных вод Челябинского металлургического комбината, обладают устойчивостью к ионам металлов; спорообразующие формы толерантны к повышенной кислотности среды. Изученные СРБ способны к росту с различными органическими субстратами, включая этанол и сахара, а также с использованием нерастворимых источников фосфора, в частности, природного фосфорита.

Данные, полученные в ходе настоящей работы, важны для пополнения знаний о распространении и активности сульфатредуцирующих бактерий в загрязненных экосистемах. Чистые культуры, выделенные из низкотемпературных осадков, загрязненных стоками металлургических комбинатов, перспективны для использования в биотехнологиях очистки вод от металлов. В настоящее время культуры, выделенные и изученные в данной работе, в составе консорциумов проходят испытание в биореакторной установке в Технологическом университете Тампере (Финляндия) в рамках проекта Европейской комиссии «Biotechnology for metal bearing material in Europe» (BioMinE 500329). Предварительные результаты, полученные исследователями Технологического университета Тампере, свидетельствуют о возможности успешного применения штаммов для очистки водоемов от сульфатов и металлов в составе специально подобранных консорциумов, в том числе в условиях умеренного и бореального климата.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Франк, Юлия Александровна, 2006 год

1. Александров В.Я. Клетки, макромолекулы и температура. Л.: изд-во «Наука», Ленингр. Отд., 1975. - 330 с.

2. Вайнштейн М.Б., Гоготова Г.И., Хиппе X. Сульфатредуцирующая бактерия из вечной мерзлоты // Микробиология. 1995. - Том 64. - С. 514-518.

3. Варфоломеев С.Д., Гуревич К.Г. Биокинетика: Практический курс. -М.:ФАИР-ПРЕСС, 1999. 720 с.

4. Государственный доклад «О состоянии окружающей природной реды Российской Федерации в 1997 году» // Госкомитет РФ по охране окружающей среды. М., Центр международных проектов, 1998. - 608 с.

5. Громов Б.В., Павленко Г.В. Экология бактерий. Л.: Изд-во ЛГУ, 1989.-248 с.

6. Заварзин Г.А., Колотилова Н.Н. Введение в природоведческую микробиологию. М.: Книжный дом «Университет», 2001. - 256 с.

7. Иванов А.Ю., Фомченков В.М., Хасанова Л.А. Влияние ионов тяжелых металлов на электрофизические свойства клеток A.nidulans и E.coli II Микробиология. 1992. - Том 61, № 3. - С.455 - 463.

8. Иванов А.Ю., Фомченков В.М., Хасанова Л.А., Гаврюшкин А.В. Токсическое действие гидроксилированных ионов тяжелых металлов на цитоплазматическую мембрану бактериальных клеток // Микробиология. -1997. Том 66, №5. - С.588 - 594.

9. Иванов М.В. Круговорот серы в озерах и водохранилищах // Глобальный биохимический цикл серы и влияние на него деятельности человека. М.:Наука, 1983. - С. 256-280.

10. Иерусалимский Н.Д. Основы физиологии микробов. М.: Изд-во АН СССР, 1963.-242 с.

11. Карначук О.В. Влияние шестивалентного хрома на образование сероводорода сульфатредуцирующими бактериями // Микробиология. 1995. -Том 64,№3.-С. 262-265.

12. Карначук О.В. Мобилизация фосфата из нерастворимых соединений под действием сульфатредуцирующих бактерий // Микробиология. 1995. - Том 64, №4. - С. 559 - 563.

13. Карначук О.В., Пименов Н.В., Юсупов С.К., Франк Ю.А., Пухакка Я. А., Иванов М.В. Распределение, разнообразие и активность сульфатредуцирующих бактерий в водной толще озера Гек-Гель, Азербайджан // Микробиология. 2006. - Том 75, №1. - С. 1-9.

14. Кондратьева Е.Н., Гоготов И.Н. Молекулярный водород в метаболизме микроорганизмов. М.: Наука, 1981. - 344 с.

15. Курочкина С.Ю. Устойчивость сульфатредуцирующих бактерий к ионам двухвалентной меди: Диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук. 03.00.16/ Науч.ред. О.В. Карначук. Томск: Б.и., 2002.- 107 с.

16. Логинова Л.Г. Анаэробные термофильные бактерии. М.: «Наука», 1982.- 100 с.

17. Лях С.П. Адаптация микроорганизмов к низким температурам. М.: «Наука», 1976. - 160 с.

18. Мур Дж.В., Рамамурти С. Тяжелые металлы в природных водах. -М.: Мир, 1987.-286 с.

19. Оксенгендлер Г. И. Яды и противоядия. Л., 1982. - С. 94 - 114.

20. Розанова Е.П., Назина Т.Н. и Галушко А.С. Выделение нового рода сульфатредуцирующих бактерий и описание нового вида этого рода Desulfomicrobium apsheronum gen. nov., sp. nov // Микробиология. 1988. -Том 57.-С. 634-641.

21. Савельева Л.С., Эпов А.Н. Очистка сточных вод на биоплато // Экология и промышленность России. 2000. - Т.8. - С.26-28.

22. Фелленберг Г. Загрязнение природной среды. Введение в экологическую химию.: Перевод с нем. М.: Мир, 1997. - 232 с.

23. Akagi J.M. Respiratory sulfate reduction // Sulfate-reducing bacteria, ed. By L.L. Barton. Plenum Press, New York, 1995. - P.89-111.

24. Akagi J.M., Jackson G. Degradation of glucose by proliferating cells of Desulfotomaculum nigrificans II Appl. Microbiol. 1967. - V.15. - P.1427-1430.

25. Amann R.I., Binder B.J., Olson R.J., Chisholm S.W., Devreux R. and Stahl D.A. Combination of 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes with flow cytometry for analyzing mixed microbial populations // Appl. Environ. Microbiol. 1990.- V.56.-P. 1919-1925.

26. Amann R.I., Ludwig W. and Schleifer K.-H. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation // Microbiological Reviews. 1995. - V.59. - P. 143-169.

27. Arundhati P., Paul A.K. Aerobic chromate reduction by chromium-resistant bacteria isolated from serpentine soil // Microbiological Research. 2004. -V.159.-P. 347-354.

28. Badziong W., Thauer R.K. Growth yields and growth rates of Desulfovibrio vulgaris (Marburg) growing on hydrogen plus sulfate and hydrogen plus thiosulfate as the sole energy sources // Archives of microbiology. 1978. -V.117.-P.209-214.

29. Banks D., Younger P.L., Arnesen R., Iversen E.R., Banks Sh.B. Mine-water chemistry: the good, the bad and the ugly // Environmental Ecology 1997. - V.32,№3.-P.157-174.

30. Barghoorn E.S. & Nichols R.L. Sulfate-reducing bacteria and pyretic sediments in Antarctica // Science. 1961. - V. 134. - P. 190.

31. Barton L.L., Tomei F.A. Characteristics and activities of sulfate-reducing bacteria // Sulfate-reducing bacteria (L.L.Barton,eds.). New York: Plenum Press, 1995.-P.1-32.

32. Bassett R.I., Melchior D.C. // Chemical modeling of aqueous systems. Bassett R.I., Melchior D.C. (Eds.). Am. Chem. Soc., Washington D.C., 1990. - P.l

33. BeijerinckW. M. Ueber Spirillum desulfuricans als Ursache von Sulfatreduction // Zentralbl. Bakteriol. 2. Abt., 1895. V.l. - P. 1-9, P. 49-59, P. 104-114.

34. Benner S.G., Blowes D.W., Ptacek C.J., Mayer K.U. Rates of sulfate reduction and metal sulfade precipitation in a permeable reactive barrier // Appl. Geochem. -2002. V.17. - P. 301-320.

35. Blais J.M., Duff K.E., Laing Т.Е., Smol J.P. Regional contamination in lakes from the Norilsk region in Siberia, Russia // Wat. Air Soil Pollut. 1999. -V.l 10. -P.389-404.

36. Bochker H.T., de Graaf W., Koster M., Meyer-Reil L., Cappenberg Т.Е. Bacterial populations and processes involved in acetate and propionate consumption in anoxic brackish sediment// FEMS Microbiol. Ecol. 2001. - V. 35. - P.97-103.

37. Brierley C.L., Brierley J.A., Davidson M.S. Applied microbial processes for metals recovery and removal from wastewater // Metal Ions and Bacteria (Eds. T.J. Beveridge, R.J. Doyle). John Wiley&Sons, New York, 1989. - P. 359 - 381.

38. Brierley C.L., Kelly D.P., Seal K.J and Best D.J. Material and biotechnology // Biotechnology principles and applications (Eds. I.J. Higgins, D.J. Best, J.Jones). Blackwell Scientiphic Publications, Oxford, 1985. - P. 163.

39. Bridge T.A.M., White C. and Gadd G.M. Extracellular metal-binding activity of the sulphate-reducing bacterium Desulfococcus multivorans // Microbiology. 1999. - V.145.-P. 2987-2995.

40. Brown N.L., Barrett S.R., Camakaris J., Lee B.T. and Rouch D.A. Molecular genetics and transport analyses of the copper-resistant determinant (pco) from Escherichia coli plasmid pRJ1004 // Mol. Microbiol. 1995. - V.17. -P.1153-1166.

41. Brown N.L., Rouch D.A. and Lee B.T. Copper resistance determinants in bacteria//Plasmid. 1992. - V.27. - P. 41-51.

42. Burggraf S., Jannasch H.W., Nicolaus, В., Stetter, K.O. Archaeoglobus profundus sp. nov., represents a new species within the sulfate-reducing archaebacteria // Syst. Appl. Microbiol. 1990. - V.13. - P. 24-28.

43. Campbell L.L. and Postgate J.R. Classification of the spore-forming sulfate-reducing bacteria // Bacteriol.Rev. 1965 - V.29. - P.359-363.

44. Castro H., Williams N.H., Ogram A. Phylogeny of sulfate-reducing bacteria // Appl. Env. Microbiol. 1999. - №10. - P. 189-196.

45. Cervantes C., Campos-Garcia J., Devars S., Gutierrez Corona F., Lora-Tavera H., Torres-Gusman J.C., Moreno-Sanchez R. Interactions of chromium with microorganisms and plants // FEMS Microbiol. Rev. - 2001. - №25. - P. 335-347.

46. Cha J.- S., Cooksey D.A. Copper resistance in Pseudomonas syringae mediated by periplasmic and membrane proteins // Proc. Acad. Sci., USA, 1991. -№88.-P. 8915 -8919.

47. Challenger F. Biological methylation.// Adv. Enzymol. 1951. - №12. -P. 429.

48. Chen L., Liu M.-Y. and Gall J.L. Characterization of electron transfer proteins // Barton L.L. (Ed.) Sulfate-reducing bacteria. Plenum Press, New York, 1995.-P. 113-149.

49. Connon S.A., Giovanni S.J. High-throughput methods for culturing microorganisms in veru-low-nutritient media yield diverse new marine isolates // Appl. Env. Microbiol. 2002. - V.68. - P. 3878-3885.

50. Cooksey D. Copper uptake and resistance in bacteria // Molecular Microbiology. 1993. - V.7, №1. - P. 1-5.

51. Cooksey D. Molecular mechanisms of copper resistance and accumulation in bacteria // FEMS Microbiol. Rev. 1994. - V. 14. - P. 381-386.

52. Cowling S.J., Gardner M.J. and Hunt D.T.E. Removal of heavy metals from sewage by sulphide precipitation: thermodynamic calculations and test on a pilot-scale anaerobic reactor//Environ. Technol. 1992. - V.13. -P. 281-291.

53. Crathorne B. and Dobbs A.J. Chemical pollution of the aquatic environment by priority pollutants and its control // Pollution: Causes, Effects and

54. Control (Harrison R.M., Ed.). The Royal Society of Chemistry, Cambridge, 1990. -P. 1-18.

55. Cypionka H. Oxygen respiration by Desulfovibrio spicies // Annu. Rev. Microbiol. 2000. - V.54. - P. 827-848.

56. Dalsgaard Т., Bak F. Nitrate reduction in a sulfate-reducing bacterium, Desulfovibrio desulfuricans, isolated from rice paddy soil sulfide inhibition, kinetics, and regulation // Appl. Environ. Microbiol. 1994. - V.60. - P. 291-297.

57. Daly K., Sharp R.J. and McCarthy A. Development of oligonucleotid probes and PCR primers for detecting phylogenetic subgroups of sulfate-reducing bacteria // Microbiology. 2000. - №146. - P. 1693-1705.

58. Daurnas S., Cord-Ruwisch R., Garcia J.L. Desulfotomaculum geothermicum sp.nov., a thermophilic, fatty acid-degrading, sulfate-reducing bacterium isolated with H2 from geothermal ground water // Antonie van Leeuwenhoek. 1988. - V.54. - P. 165-178.

59. Devereux R., He S.H., DoyleC.L., Orkland S., Stahl D.A., LeGall J. , Whitman W.B. Diversity and origin of Desulfovibrio species: phylogenetic definition of a family // J. Bacterid. 1990. - Vol. 172. - P. 3609-3619.

60. Devereux R., Kane M.D., Winfrey J. and Stahl D.A. Genus- and group-specific hybridization probes for determinative and environmental studies of sulfate-reducing bacteria// Syst. Appl. Microbiol. 1992. - V.15.-P. 601-609.

61. Detmers J., Strauss H., Schulte U., Bergmann A., Knittel K. and Kuever J. FISH shows that Desulfotomaculum spp. are the dominating sulfate-reducing bacteria in a pristine aquifer // Microbiol. Ecol. 2004. - V.47. - P. 236 - 242.

62. Diaz M.A., Monhemius A.J. and Narayanan A. Consecutive hydroxide-sulfide presipitation treatment of acid mine drainage // Proceedings of the 4thinternational conference on acid rock drainage. Vancouver, British Columbia, 1997.-Vol.3.-P. 1179-1194.

63. Desulfovibrio spp. // Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH. Режим доступа: http://www.dsmz.de/species/gn301582.htm (свободный).

64. Dvorak D.H., Hedin R.S., Edenborn H.M. and Mclntyre P.E. Treatment of metal-contaminated water using bacterial sulfate-reduction: results from pilot-scale reactors // Biotechnol. Bioeng. 1991. - V.40. - P. 609-616.

65. Eccles H. Biotreatment of metals: site dependent.// OESD Documents "Wider application and diffusion of bioremediation technologies".- Amsterdam, 1995. P. 296-302.

66. Eger P. Wetland treatment for trace metal removal from mine drainage: The importance of aerobic and anaerobic processes // Water Sci Tech. 1994ю -V.29.-P. 249-256.

67. Ehrlich H.L. Geomicrobiology. Dekker, New York, 1884. - 386 p.

68. Fortin D. and Beveridge T.J. Microbial sulfate reduction within sulfidic mine tailings: formation of diagenetic Fe sulfides // Geomicrobiol. J. 1997. -V.14.-P. 1-21.

69. Fortin D., Davis В., Southham G. and Beveridge T.J. Biogeochemical phenomena induced by bacteria within sulfidic mine tailings // J. Ind. Microbiol. -1995. V.14. -P.178-185.

70. Fortin D., Southam G. and Beveridge T.J. Nickel sulfide, iron-nickel sulfide and iron sulfide precipitation by a newly isolated Desulfotomaculum species and its relation to nickel resistance // FEMS Microbiol. Ecol. 1994. -V.14.-P. 121-132.

71. Freedman J.H. and Peisach J. Resistance of cultured hepatoma cells to copper toxicity. Purification and characterization of hepatoma metallothionein // Biochem. Biophys. Res. Commun. 1989. - №992. - P.145-154.

72. Franzmann P.D., Robertson W.J., Zappia L.R. and Davis G.B. The role of microbial populations in the containment of aromatic hydrocarbons in the subsurface // Biodegradation. 2002. - V.13. - P. 65 - 78.

73. Fude L., Harris В., Urrutia M.M. and Beveridge T.J. Reduction of Cr (VI) by a consortium of sulfate-reducing bacteria (SRB III) // Appl. Env. Microbiol. 1994. - V. 60, № 5. -P.l525 - 1531.

74. Gadd G.M. Metals and microorganisms: a problem of definition // FEMS Microbiol. Lett. 1992. - Vol.100. - P. 197-204.

75. Gadd G.M. Fungal production of citric and oxalic acid: importance in metal speciation, physiology and biogeochemical processes // Adv. Microb. Physiol. 1999. - V.41.-P. 47-92.

76. Gadd G. M. Bioremedial potential of microbial mechanisms of metal mobilization and immobilization // Current Opinion in Biotechnology. 2000. -V.ll.-P. 271-279.

77. Gale N.L., Wixson B.L. Control of heavy metals in lead industry effluents by algae and other aquatic vegetation // Conf. Management and Control of Heavy Metals in the Environment, London. CEP Consultants Ltd., Edinburgh, U.K., 1979.-P. 580-583.

78. Garrity G.M., Bell J.A. and Lillburn T.G. Taxonomic outline of the Procaryotes, Bergey's manual of systematic bacteriology, 2nd edition. Release 4.0, October 2003. - Springer-Verlag, New York, USA, 2003. - P.395.

79. Garrity G.M., Bell J.A. and Lillburn T.G. Bergey's taxonomic outline, 2nd edition. Release 5.0, May 2004. - Режим доступа: http://141.150.157.80/bergeysoutline/outline/index.htm (свободный) - P.401.

80. Gazea В., Adam К. And Kontopoulos A. A review of passive systems for the treatment of acid-mine drainage // Miner. Eng. 1996. - №9. - P. 23 - 42.

81. Genschow E., Hegemann W. and Maschke C. Biological sulfate removal from tannery wastewater in a two-stage anaerobic treatment // Water Research. -1996.-V.30.-P. 2072-2078.

82. Guerinot M.L. Microbial iron transport // Annu. Rev. Microbiol. 1994. -V.48.-P. 743-772.

83. Hammack R.W., Edenborn H.M. The removal of nickel from mine waters using bacterial sulfatereduction // Appl. Microbiol. Biotechnol. 1992. -V.37.-P. 674-678.

84. Hansen T.A. Metabolism of sulfate-reducing prokaryotes //Antonie van Leeuwenhoek. 1994. - V.66. - P. 165-185.

85. Hansen T.A. Carbon metabolism of sulfate-reducing bacteria // The Sulfate-reducing bacteria: contemporary perspectives (Eds. J.M. Odom, R. Singleton Jr.). Springer-Verlag, New York, 1995. - P. 21-40.

86. Hard B.C., Friedrich S. and Babel W. Microorganisms and acid mine drainage from uraniun mines // Ecological effect of microorganism action: Materials of international conference (October 1-4). Vilnus, 1997. - P. 11-18.

87. Hawkins W.B., Rodgers J.H. Jr., Gillespie W.B. Jr., Dunn A.W., Dorn P.B., Cano M.L. Design and construction of wetlands for aqueous transfers and transformations of selected metals //Ecotoxicol. Environ. Safety. -1997. V. 36. - P. 238-248.

88. Hebraud M. and Potier P. Cold shock respons and low temperature adaptation in psychrotrophic bacteria//J. Mol. Microbiol. Biotechnol. -1999. №1. - P. 211-219.

89. Hedin R.Sand, Narin R.W. Contaminant removal capabilities of wetlands constructed to treat coal mine drainage // Proceedings of the International

90. Symposium of Constructed Wetlands for Water Quality Improvement (Moshiri, G.A., Ed.). Lewis Publishers, Chelsea, MI, 1991. - P. 187-195.

91. Hess E. Cultural characteristics of marine bacteria in relation to low temperatures and freezing // Contrib. Canad. Biol., Fisheries ser. -1934. №8. - P. 461474.

92. Hiligsmann S., Jacques P., Thonart P. Isolation of highly performant sulfate reducers from sulfate-rich environments // Biodegradation. 1998. - V.9. - P. 285-292.

93. Hippe H., Vainshtein M., Gogotova G.I., and Stackebrandt E. Reclassification of Desulfobacterium macestii as Desulfomicrobium macestii comb.nov // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2003. - V.53. - P. 1127 - 1130.

94. Hristova К., Май M., Zheng D., Aminov R., Mackie R., Gaskins H., Raskin L. Desulfotomaculum genus and sub-genus-specific 16S rRNA hybridization probes for environmental studies.// Environ. Microbiol. 2000. - №2. - P. 143-160.

95. Hughes V.M. and Datta N. Conjugative plasmids in bacteria of the 'pre-antibiotic' era // Nature. 1983. - №302 - P.725-726.

96. Isaksen M.F., Jergensen B.B. Adaptetion of Psychrophilic and psychrotrophic Sulfare-reducing bacteria to permanently cold marine environments // Appl. Env. Microbiol. 1996. - V. 62, №2. - P. 408 - 414.

97. Isaksen M.F., Teske A. Desulforhopalus vacuolates gen. nov., sp. Nov., a new moderately psychrophilic sulfate-reducing bacterium with gasvacuoles isolated from a temperate estuary // Arch. Microbiol. 1996. - V.166. -P. 160-168.

98. Jaenicke R. Protein structure and function at low temperature // Philos. Trans. R. Soc./ Ser. B. Biol. Sci. London, 1990. - №326. - 535 - 553.

99. Johnson D.B. Biological removal of sulfurous compounds from inorganic wastewaters // Environmental technologies to treat sulfur pollution. Principles and engineering (Ed. By P.N.L.Lens and L.Hulshoff). IWA Publishing, London, 2000. - P. 175-205.

100. Johnson D.B., Ghauri M.A., McGinnes M. Biogeochemical cycling of iron and sulfur in leaching environments // FEMS Microbiol. Rev. -1993. V.l 1. - P.63 -70.

101. Jong T. and Parry D.L. Adsorption of Pb (И), Си (II), Cd (II), Zn (II), Ni (II), Fe (II) and As (V) on bacterially produced metal sulfides // Journal of Colloid and Interface Science. 2004. - №274. - P. 61-71.

102. Jorgensen B.B. Mineralization of organic matter in the sea bed the role of sulfate-reduction // Nature. - 1982. - № 296. - P.643 - 645.

103. Karnachuk O.V., Kurochkina S.Y., Tuovinen O.H. Growth of sulfate-reducing bacteria with solid-phase electron acceptors // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2002. - V.58. - P. 482-486.

104. Karnachuk O.V., Kurochkina S.Y., Nicomrat D., Frank Y.A., Ivasenko D.A., Phyllipenko E.A., Tuovinen O.H. Copper resistance in Desulfovibrio strain R2II Antonie Van Leuwenhoek. Holland, 2003. - №83. - P. 99-106.

105. Karnachuk O.V., Pimenov N.V., Yusupov S.K., Frank Y.A., Kaksonen A.H., Puhakka J.A., Linstrom E.B. and Tuovinen O.H. Sulfate reducing potential in sediments in the Norilsk mining area, Northern Siberia // Geomicrobiology. -2005.-V.22.-P. 1-15.

106. Karner M.V., DeLong E.F., Karl D.M. Archaeal dominance in the mesopelagic zone of the Pacific ocean // Nature. 2001. - №409. - P. 507-510.

107. Knoblauch C, Jorgensen BB, Harder J. Community size and metabolic rates of psychrophilic sulfate-reducing bacteria in Arctic marine sediments // Appl. Environ. Microbiol. 1999. - V.65. - P. 4230-4233.

108. Knoblauch C., Sahm K., Jorgensen B.B. Psychrophilic sulfate-reducing bacteria isolated from permanently cold Arctic marine sediments: description of Desulfofrigus oceanense gen.nov., sp.nov., Desulfofrigus fragile sp.nov.,

109. Desulfofaba gelida gen.nov., sp.nov. and Desulfotalea arctica sp.nov И J. Syst. Bacterid. 1999. - V.49. - P. 1631 - 1643.

110. Kleikemper J., Pelz 0., Schroth M.H. and Zeyer J. Sulfate-reducing bacterial community response to carbon source amendments in contaminated aquifer microcosms // FEMS Microbiol. Ecol. 2002. - V.42, №1. - P. 109-118.

111. Klemps R., Cypionka H., Widdel F. and Pfennig N. Growth with hydrogen, and further physiological characteristics of Desulfotomaculum species // Arch. Microbiol. 1985. - V.143. - P. 203-208.

112. Koch A.L. Most probable numbers // Methods for General and Molecular Bacteriology (Gerchard P., Murray R.G.E., Wood W.A. and Krieg N.R., Eds.), American Society for Microbiology. Washington DC, 1994. - P. 257 - 260.

113. Kuo W.-Ch., Shu T.-Y. Biological pretreatment of wastewater containing sulfate using anaerobic immobilized cells // J. Hazardous Materials. -2004.-№ 113.-P.147-155.

114. Lens P.N.L., Omil F., Lema J.M. and Hulshoff Pol L.W. Biological treatment of organic sulphate-rich wastewaters // Lens P.N.L. and Hulshoff Pol

115. W. (eds.) Environmental technologies to treat sulphur pollution. Principles and engineering. IWA Publishing, London, 2000. - P. 153 - 173.

116. Lens P., Vallero M., Esposito G. and Zandvoort M. Perspectives of sulfate-reducing bioreactors in environmental biotechnology // Reviews in Environmental Science and Biotechnology. 2002. - № 1. - P. 311 - 325.

117. Lide D.R. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 76th edn. Boca Raton, FL: CRC Press, 1995.

118. List of Bacteria // Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH. Режим доступа: http://www.dsmz.de/species /bacteria.htm#D (свободный).

119. Lovely D.R. Dissimilatory metal reduction // Annu.Rev.Microbiol., 1993, V.47.- P.263-290.

120. Lovely D.R. Bioremediation of organic and metal contaminants with dissimilatory metal reduction // J. Ind. Microbiol. 1995. - V.14. - P. 85-93.

121. Lovely D.R, Coates J.D., Woodward J.C. and Phillips E.J.P. Benzene oxidation coupled to sulfate reduction// Appl. Environ. Microbiol. -1995. V.61. -P. 953-958.

122. Lovely D.R. and Coates J.D. Bioremediation of metal contamination // Curr. Opin. Biotechnol. 1997. - V.8. - P. 285-289.

123. Lovely D.R., Dwyer D.F. and Klug M.J. Kinetic analysis of competition between sulfate-reducers and methanogenes for hydrogen insediments.// Appl. Env. Microbiol. 1982. - V.43. - P. 1373-1379.

124. Lovely D.R., Phillips E.J.P., Gorby Y.A. Microbial reduction of uranium // Nature. 1991. - № 350. - P. 413-416.

125. Lovely D.R., Phillips E.J.P. Reduction of chromate by Desulfovibrio vulgaris and its c3 cytochrome // Appl. Env. Microbiol. -1994. V.60. -P.726 - 728.

126. Lovley D.R., Widman P.K., Woodward J.C., Phillips E.J. Reduction of uranium by cytochrome c3 of Desulfovibrio vulgaris И Appl. Environ. Microbiol. 1998. - V. 64. - P. 2301-2303.

127. Luptakova A., Kusnierova M. Bioremediation of acid mine drainage contaminated by SRB // Hydrometallurgy. 2005. - V.77. - P. 97-102.

128. Magnani D. and Solioz H. Copper chaperone cycling and degradation the regulation of the cop operon of Enterococcus hirae // BioMetals. 2005. -V.18, № 4. - P. 407-412.

129. Michel С., Brugna M., Aubert C., Bernadac A., Bruschi M. Enzymatic reduction of chromate: comparative studies using SRB. Key role of polycheme cytochromes с and hydrogenases // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001. - V.55. - P.95 -100.

130. Michel C., Giudici-Orticoni M.-T., Baymann F. and Bruschi M. Bioremediation of chromate by sulfate-reducing bacteria, cytochromes c3 and hydrogenases // Water, Air and Soil Pollution: Focus 3.- 2000. P.161-169.

131. Miller C.L., Landa E.R., Updegraff D.M. Ecological aspects of microorganisms inhabiting uranium mill tailings // Microb. Ecol. 1987. - V.14. -P. 141-155.

132. Min H., Zinder S.H. Isolation and characterization of a termophilic sulfate-reducing bacterium Desulfotomaculum thermoacetooxidans sp. nov.// Arch. Microbiol. 1990. - V. 153. - P. 399-404.

133. Muyzer G. DGGE/TGGE a method for identifying genes from natural ecosystems // Current Opinion in Microbiology. 1999. - V.2, № 3. - P. 317-322.

134. Nagpal S., Chuichulcherm S., Livingston A., Peeva L. Ethanol utilization by sulfate-reducing bacteria: an experimental and modeling study // Biotechnology and Bioengineering. 2000. - V.70. - P. 533 - 543.

135. Nedwell D.B. Effect of low temperature on microbial growth: lowered affinity for substrates limits growth at low temperature // FEMS Microbiol.Ecol. -1999.-V.30.-P. 101-111.

136. Newman D.K., Kennedy E.K., Coates J.D., Ahmann D., Ellis D.J., Lovley D.R. and Moral F.M.M. Dissimilatoiy arsenate and sulfate reduction in Desulfotomaculum auripigmentum sp. nov// Arch. Microbiol. -1997. V.168. -P. 380-388.

137. Nielsen J.T., Liesack W., Finster K. Desulfovibrio zosterae sp.nov., a new sulfate reducer isolated from surface-sterilized roots of the seagrass Zostera marina // IJSB. 1999. - V.49. - P.859-865.

138. Nies D.H. Microbial heavy-metal resistance // Appl.Microbiol.Biotechnol. 1999. - V.51. - P. 730 - 750.

139. Odom J.M. Industrial and environmental activities of the sulfate-reducing bacteria // The Sulfate-reducing bacteria: contemporary perspectives (Eds. J.M. Odom, R. Singleton Jr.). Springer-Verlag, New Yoik, 1995.-P. 189-210.

140. Okabe S., Itoh Т., Satoh H. and Watanabe Y. Analyses of spatial distribution of sulfate-reducing bacteria and their activity in aerobic wastewater biofilms // Appl. Env. Microbiol. 1999. - V.65. - P. 5107 - 5116.

141. Ollivier В., Cord-Ruwisch R., HatdiikianE.C.,GarciaJL. Characterization of Desulfovibriofructosovorans sp^v //Arch. Microbiol. -1988. V.149. -P. 447450.

142. Orphan V., Taylor L., Hafenbradi D., Delong E. Culture-dependent and culture-independent characterization of microbial assemblages associated with high-temperature petroleum reservoirs // Appl Environ Microbiol. 2000. - V.66. - P. 700-711.

143. Pachmayr F. Vorkommen und Schwefelverbindungen in Mineralwasser. PhD thesis. University Munchen, FRG, 1960. - P. 171.

144. Pacyna JM. The origin of Arctic air pollutants: lessons learned and future Research // Sci. Total. Environ. 1995. - V.160/161. - P.39-53.

145. Parkin G.F., Owen W.F. Fundamentals of anaerobic digestion of wastewater sludges // JWPCF. 1986. - V.l 12. - P. 867-920.

146. Pedersen K., Arlongen J., Ekendahl S. And Hallbeck L. 16SRNA gene diversity of attached and unattached bacteria in boreholes along the access tunnel to the Aspo hard rock laboratory, Sweden // FEMS Microbiol. Ecol. 1996. -V.19, № 4. - P. 249-262.

147. Peters R.W., Ku Y., and Bhattacharyya D. Evaluation of recent treatment techniques for removal of heavy metals from industrial wastewaters // AIChE Symp.Ser. 1985. - № 81. - P. 165-203.

148. Petrilli F.L., Flora S.D. Toxicity and mutagenicity of hexavalentchromium in Salmonella typhimurium // Appl. Env. Microbiol -1977 V.33. - P.805-809.

149. Phelps C.D., Kerkhof L.J. and Young L.Y. Molecular characterization of a sulfate-reducing consortium which mineralizes benzene // FEMS Microbiol. Ecol. 1998. - V.27. - P. 269-279.

150. Phelps C.D., Young L.Y. Anaerobic biodegradation of BTEX and gasoline in various aquatic sediments // Biodegradation. -1999. V. 10. - P. 15 - 25.

151. Pikuta E., Lysenko A., Suzina N., Osipov G., Kuznetsov В., Tourova Т., Akimenko V. and Laurinavichius K. Desulfotomaculum alkalifllum sp.nov., a new alkaliphilic, moderately thermophilic, sulfate-reducing bacterium // IJSEM. -2000.-V.50.-P. 25-33.

152. Plugge C.M., Balk M. and Stams A.J. Desulfotomaculum thermobenzoicum subsp. thermosyntrophicum subsp. nov., a thermophilic, syntrophic, propionate-oxidizing, spore-forming bacterium // IJSEM. 2002. - V.52. - P. 391 - 399.

153. Postgate J. R. The sulphate reducing bacteria, 2nd. ed.- Cambridge: Cambridge University Press, 1984. P. 1208.

154. Poulson S.R., Colberg P.J.S. and Drever J.I. Toxicity of heavy metals (Ni, Zn) to Desulfovibrio desulfuricans II Geomicrobiology J. -1997. V.14. - P. 41-49.

155. Purdy K.J., Embley T.M. and Nedwell D.B. The distribution and activity of sulfate reducing bacteria in estuarine and coastal marine sediments // Antonie van Leeuwenhoek. 2002. - V.81. - P. 181-187.

156. Purdy K.J., Nedwell D.B., Embley T.M., Takii S. Use of 16S rRNA-targeted oligonucleotide probes to investigate the distribution of sulphate-reducing bacteria in estuarine sediments // FEMS Microbiol. Ecol. -2001. V.36. - P. 165-168.

157. Rabus R., Bruchert V., Amann J., Konneke M. Physyological response to temperature changes of the marine sulfate-reducing bacterium Desulfobacterium autotrophicum II FEMS Microbiology Ecology. 2002. - V.42. - P. 409 - 417.

158. Rae T.D., Schmidt P.J., Pufahl R.A., Culotta V.C. and O'Halloran T.V. Undetectable intracellular free copper: requirement of a copper chaperone for superoxide dismutase // Science. 1999. - № 284. - P.805-808.

159. Ravenschlag К., Sahm К., Knoblauch Ch., Jorgensen B.B. and Amann R. Community structure, cellular rRNA content, and activity of sulfate-reducing bacteria in marine arctic sediments // App Env Microbiol. 2000. - V.66, № 8. - P. 3592-3602.

160. Ravenschlag K., Sahm K., Pernthaler J., Amann R. High bacterial diversity in permanently cold marine sediments // Appl Environ Microbiol. 2000. -V.65.-P. 3982-3989.

161. Redburn A.C., Patel B.K. Desulfovibrio longreachii sp.nov., a sulfate-reducing bacterium isolated from the Great Artesian Basin of Australis // FEMS Microbiol.Lett. 1994. - V.l 15, № 1. - P. 33-41.

162. Reinchenbecher W., Schink B. Desulfovibrio inopinatus sp.nov., a new sulfate-reducing bacterium thet degrades hydroxyhydroquinone (1,2,4-trihydroxybenzene) // Arch. Microbiol. 1997. - V.168. - P. 338-344.

163. Rensing C., Ghosh M. and Rosen B.P. Families of soft-metal-ion-transporting ATP-ases // J.Bacteriol. 1999. - V.l81. - P. 5891-5897.

164. Rensing C., Grass G. Escherichia coli mechanisms of copper homeostasis in a changing environment // FEMS Microbiol. Reviews. 2003. -V.27.-P. 197-213.

165. Richards J.W., Krumholz G.D., Chval M.S. and Tisa L.S. Heavy metal resistance of Frankia Strains // Appl. Env. Microbiol. 2002. - V.68, № 2 - P. 923-927.

166. Risatti J.B., Capman W.C., and Stahl D.A. Community structure of a microbial mat: The phylogenetic dimension // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1994. - № 91. - P.10173.

167. Robertson W. J., Bowman J. P., Franzmann P. D. and Мее B. J. Desulfosporosinus meridiei sp. nov., a spore-forming sulfate-reducing bacterium isolated from gasolene-contaminated ground water // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. -2001.-V.51.-P. 133-140.

168. Roest K., Heilig H.G.H.J., Smidt H., de Vos W.M., Stams J.M., Akkermans A.D.L. Community analysis of a full-scale anaerobic bioreactor treating paper millwastewater I I Syst. Appl. Microbiol. 2005. - V.28. - P. 175 - 185.

169. Rouch D.A. and Brown N.L. Copper inducible transcriptional regulation at two promoters in the Escherichia coli copper resistance determinant pco // Microbiology. 1997. - V.143. - P. 1191-1202.

170. Rouch D., Camakaris J., Lee B.T. and Luke P.K. Inducible plasmid-mediated copper resistance in Escherichia coli II J. Gen. Microbiol. 1985. -V.131.-P. 939-943.

171. Rowley D.A. and Halliwell B. Superoxide-dependent and ascorbate-dependent formation of hydroxy 1 radicals in the presence of copper salts: a physiological significant reaction? // Arch. Biochem. Biophys. 1983. - № 225. -P.279-284.

172. Rowley M., Warkentin D.D. and Sicotta V. Site demonstration of the bisulphide process at the former Britannia mine // Proceedings of the 4th international conference on acid rock drainage, Vancouver, British Columbia. -1997.-P.1531 -1548.

173. Sadler W. R., Trudinger P.A. The inhidition of microorganisms by heavy metals // Min. Dep. 1967. - №2. - P. 158 - 168.

174. Sahm K., MacGregor B.J., Jorgensen B.B. and Stahl D.A. Sulfate reduction and vertical distribution of sulfate-reducing bacteria quantified by rRNA slot-blot hybridization in a coastal marine sediment // Environ. Microbiol. 1999. № l.-P. 65-74.

175. Sagemann J., Skowronek F., Dahmke A. and Schulz H.D. Pore-Water response on seasonal environmental changes in intertidal sediments of the Weser Estuary, Germany // Environ.Geol. 1996. - V.27. - P.362 - 369.

176. Sani R.K., Geesey G.G. and Peyton B.M. Assessment of lead toxicity to Desulfovibrio G20: Influence of components of lactate С medium // Adv. Env. Res. -2001.-V. 5.-P. 269-276.

177. Sani R.K., Peyton B.M., Brown L.T. Copper-induced inhibition of growth of Desulfovibrio desulfuricans G20: Assessment of its toxicity and correlation with those of zinc and lead // Appl. Environ. Microbiol. 2001. - V. 67. - P. 4765-4772.

178. Sani R.K., Peyton B.M., Amonette J.E., and Geesey G.G. Reduction of uranium (VI) under sulfate-reducing conditions in the presence of Fe(III)-(hydr)oxides // Geochimica et Cosmochimica Acta. 2004. - V.68, № 12. - P. 2639-2648.

179. Sass A., Riitters H., Cypionka H., Sass H. Desulfobulbus mediterraneus sp. Nov., a sulfate-reducing bacterium growing on mono- and disaccharides // Arch. Microbiol. 2002. - V.177. - P. 468-474.

180. Sass H., Overmann J., Riitters H., Babenzien H.-D., Cypionka H. Desulfosporomusa polytropa gen. nov., sp. nov., a novel sulfate-reducing bacterium from sediments of an oligotrophic lake // Arch. Microbiol. 2004. -V.182.-P. 204-211.

181. Schippers A., Hallman R., Wentzien S. and Sand W. Microbial diversity in uranium mine waste heaps // Appl Environ Microbiol. 1995. - V.61. -P. 2930-2935.

182. Seghezzo L., Zeeman G., van Lier J.B., Hamelers H.V.M., Lettinga G. A review: the anaerobic treatment of sewage in UASB and EGSB reactors // Bioresour.Technol. 1998. - V.65. -P.175 - 190.

183. Sharak Genthner B.R., Mundfrom G. and Devereux R. Characterization of Desulfomicrobium, escambium sp.nov. and proposal to assign Desulfovibrio desulfuricans Norway4 to the genus Desulfomicrobium // Arch.Microbiol. 1994. - V.161. -P.215-219.

184. Shen Y., Buick R. and Canfield D.E. Isotopic evidence for microbial sulfate reduction in the early Archaean era // Nature. 2001. - № 410. - P. 77-81.

185. Shirazi F. Development of biological permeable barriers for removal of chlorophenols (2,4,6 trichlorophenol) in contaminated groundwaters, PhD Dissertation. - Oklahoma State Univ., Stillwater, OK, 1997. - P. 114.

186. Silver M., Torma A.E. Oxidation of metal sulfides dy Thiobacillus ferrooxidans grow in different substrates // Can. J. Microdiol. 1974. - V.20. - P. 141-147.

187. Silver S. and Phung L.T. Bacterial heavy-metal resistance : new surprises // Annu. Rev. Microbiol. 1996. - V.50. - P. 753-789.

188. Singleton R.Jr. The sulfate-reducing bacteria: an overwiew // The Sulfate-reducing bacteria: contemporary perspectives (Eds. J.M. Odom, R. Singleton Jr.). Springer-Verlag, New York, 1995. - P. 1 - 20.

189. Solioz M., Stoyanov J.M. Copper homeostasis in Enterococcus hirae // FEMS Microbiol.Rev. 2003. -V.133, № 6. - P. 817-823.

190. Speece R.E. Anaerobic biotechnology for industrial wastewaters. -Archae Press, USA, 1996. P. 394.

191. Stackebrandt E., Stahl D.A. and Devereux R. Taxonomic relationships// Barton L.L. (Ed.) Sulfate-reducing bacteria, Plenum Press, New York. 1995. P. 49 - 87.

192. Stackebrandt E., Schumann P., Schiiler E., and Hippe H. Reclassification of Desulfotomaculum auripigmentum as Desulfosporosinus auripigmenti conig., comb, nov // bit J. SysL Evol. Microbiol. -2003. V.53. -P. 1439 -1443.

193. Stahl D.A., Fishbain S., Klein M., Baker B.J. and Vagner M. Origins and diversification of sulfate-respiring microorganisms // Antonie van Leeuwenhoek. 2002. - V.81. - P. 189-195.

194. Staley J.T., Irgens R.L., Herwig R.P. Gas vacuolated bacteria from the sea ice of Antarctica//Appl. Environ. Microbiol. 1989. - V.55.-P. 1033-1036.

195. Stetter K.O. Archaeglobus fulgidus gen. nov., sp. nov.: a new taxon of extremely thermophilic archaebacteria // System. Appl. Microbiol. 1988. - V.10. -P. 172-173.

196. Stucki G., Hanselmann K.W. and Hiirzeler R.A. Biological sulfuric acid transformation: Reactor design and process optimization // Biotechnology and Bioengineering. 1993. - V.41. -P.303 -315.

197. Taylor M.R.G. and McLean R.A.N. Overview of clean-up ethods for contaminated sites // JIWEM. 1992. - V.6. - P. 408-417.

198. Tebo B.M., Obraztsova A.Y. Sulfate-reducing bacterium grows with Cr (VI), U (IV), Mn (IV) and Fe (III) as electron acceptors // FEMS Microbiology Letters. 1998. - 162. - P. 193 - 198.

199. Tetaz T.J., Luke R.K.J. Plasmid-controlled resistance to copper in Ecsherichia coli II J. Bacteriol. 1983. - 170. - P. 1263 - 1268.

200. Thayer J.S., Brinckman F.E. The biological methylation of metals and metalloids // Adv. Organometallic Chem. 1984. - № 20. - P. 313.

201. Trajanovska S., Britz M.L., and Bhave M. Detection of heavy metal ion resistance genes in Gram-positive and Gram-negative bacteria isolated from a lead-contaminated site // Biodegradation. 1997. - V.8. - P. 113-124.

202. Trinkerl M., Breunig A., Schauder R., Konig H. Desulfovibrio termitidis sp.nov., a carbohydrate-degrading sulfate-reducing bacterium from the hindgut of a termite // System. Appl. Microbiol. 1990. - V. 13. - P.372-377.

203. Tsukamoto Т.К., Killion H.A., Miller G.C. Column experiments for microbiological treatment of acid mine drainage: low-temperature, low-pH and matrix investigations // Water Research. 2004. - V.38. - P. 1405-1418.

204. Tucker M.D., Barton L.L., Thomson B.M. Reduction of Cr, Mo, Se and U Desulfovibrio desulfuricans immobilized in polyacrylamide gels // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 1998. - V.20. - P. 13-19.

205. Tuttle J.M., Dugan P.R. and Randies C. Microbial dissimilatory sulfur cycle in acid mine water // J. Bacteriol. 1969. - V.97. - P. 594 - 602

206. Upadhyay J., Stokes J.L. Anaerobic growth of psychrophilic bacteria // J. Bacteriol. 1962. - V.83. - P. 983-1015.

207. Urukawa H., Kita-Tsukamoto K., Ohwada K. Microbial diversity in marine sediments from Sagami Bay and Tokyo Bay, Japan, as determined by 16S rRNA gene analysis // Microbiology. 1999. - V.145. - P. 3305-3315.

208. Utgikar V.P., Harmon S.M., Chaudhary N., Tabak H.H., Givond R., Haines J.R. Inhibition of sulfate-reducing bacteria by metal sulfide formation in bioremediation of acid mine drainage // Env. Toxicol. 2002. - V.l 7. - P. 40-48.

209. Vainshtein M., Kuschk P., Mattusch J., Vatsourina A., Wiessner A. Model experiments on the microbial removal of chromium from contaminated groundwater // Water Research. 2003. - V.37. - P. 1401-1405.

210. Wagner M., Roger A.J., Flax J.L., Brusseau G.A., and Stahl D.A. Phylogeny of dissimilatory sulfite reductases supports an early origin of sulfate respiration //J. Bacteriol. 1998. - V.180. - P. 2975-2982.

211. Wallner G., Amann R. and Beisker W. Optimizing fluorescent in situ hybridization with rRNA-targeted oligonucleotide probes for flow cytometric identification of microorganism // Cytometry. 1993. - V.14. - P. 136-143.

212. Werkman C.H. and Weaver H.J. Studies in the bacteriology of sulphur stinker spoilage of canned sweet corn // Jowa State Coll. J. Sci. -1927. V.2. - P. 57-67.

213. White C. and Gadd G.M. Accumulation and effects of cadmium on sulfate-reducing bacterial biofilms // Microbiology. 1998. - V.144. - P. 14071415.

214. White C., Gadd G.M. Copper accumulation by sulfate-reducing bacterial biofilms // FEMS Microbiology Letters. 2000. - V. 183. - P. 313-318.

215. White C., Sayer J.A., Gadd G.M. Microbial solubilization and immobilization of toxic metals: key biogeochemical processes for treatment of contamination // FEMS Microbiol. Ecol. 2000. - V.33. - P. 197-208.

216. Widdel F. Microbiology and ecology of sulfate-reducing bacteria // Biology of Anaerobic Microorganisms.- Carl Hanser Verlag, Munich. -1988,. V3. -P. 469 -585.

217. Widdel F., Bak F. Gram-negative mesophilic sulfate-reducing bacteria // The Procaryotes, 2nd edn., vol.4 (A. Balows, H.G.Truper, M. Dworkin, W. Harder, and K.-H. Schleifer, Eds). Berling: Springer-Verlag, 1992.- P. 33523378.

218. Widdel F., Hansen T.A. The dissimilatory sulfate- and sulfur-reducing bacteria // Balows A., Truper H.G., Dworkin M., Harder W. and Schleifer K.-H. (Eds.) The Prokaiyotes., 2nd edition. Springer-Verlag, New York, USA, 1992. -Vol.1.-P.584-624.

219. Widdel F., Pfennig N. Studies on dissimilatory sulfate-reducing bacteria that decompose fatty acidsll. Incomplite oxidation of propionate by Desulfobulbus propionicus gen. nov., sp. nov // Arch. Microbiol. 1982. - V.131. -P. 360-365.

220. Wiegel J. Temperature spans for growth: hypotesis and discussion // FEMS Microbiol. Rev. 1990. - V.75. - P. 155-170.

221. Wielinga В., Lucy J.K., Moore J.N., Seastone O.F. and Gannon J.E. Microbiological and geochemical characterization of fluvially deposited sulfidic mine tailings // Appl. Env. Microbiol. 1999. - V.65. - P. 1548-1555.

222. Williams J.R., Morgan A.G., Rouch D.A., Brown N.L. and Lee B.T.O. Copper-resistant enteric bacteria from United Kingdom and Australian piggeries // Appl. Env. Microbiol. 1993. - V.59. - P. 2531-2537.

223. Zellner G., Messner P., Kneifel H., Winter J. Desulfovibrio simplex sp.nov., a new sulfate-reducing bacterium from a sour whey digester // Arch. Microbiol. 1989. - V.l52. - P. 329-334.