Анализ результатов микробиологического мониторинга холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации с 1989 г. по 2016 г. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат наук Левченко Дарья Александровна

• Левченко Дарья Александровна
• кандидат наук
• 2018

Оглавление диссертации кандидат наук Левченко Дарья Александровна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Тенденция и особенности эпидемиологической ситуации по холере на современном этапе развития седьмой пандемии в мире и на территории Российской Федерации

1.2 Результаты микробиологических мониторинговых исследований объектов окружающей среды на наличие холерных вибрионов О1, О139 серогрупп, как основа разработки ГИС

1.3 Современное информационно-аналитическое обеспечение мониторинга инфекционных заболеваний, в том числе особо опасных инфекций, на территории Российской Федерации

1.4 ГИС-технология как инструмент информационного анализа в рамках проведения мониторинговых исследований за холерой на территории Российской Федерации

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Бактериальные штаммы холерных вибрионов

2.2 Питательные среды для выделения и культивирования холерных вибрионов

2.3 Контроль качества питательных сред, используемых для проведения идентификации изучаемых штаммов холерных вибрионов

2.4 Методы идентификации выделенных культур холерных вибрионов с комплексным определением эпидзначимости. Фаготипирование изучаемых штаммов холерных вибрионов

2.5 Методы ПЦР-генотипирования штаммов холерных вибрионов

2.6 Метод УКШ-генотипирования штаммов холерных вибрионов

2.7 Статистическая обработка результатов

ГЛАВА 3. РЕТРОСПЕКТИВНЫЙ ИНФОРМАЦИОННЫЙ АНАЛИЗ РЕЗУЛЬТАТОВ МОНИТОРИНГА ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ О1, О139 В ОБЪЕКТАХ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА ТЕРРИТОИЯХ ФЕДЕРАЛЬНЫХ ОКРУГОВ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ И ИХ СУБЪЕКТОВ С 1989г. ПО 2016г

3.1 Федеральные округа Российской Федерации и их субъекты, на территории которых регистрировалось выделение из объектов окружающей среды холерных вибрионов различной эпидзначимсти

3.2 Анализ динамики выделения штаммов холерных вибрионов О1, О139 из объектов окружающей среды на территориях субъектов Российской Федерации с 1989г. по 2016г

3.3 Анализ результатов мониторинга холерных вибрионов в пространственном, временном и микробиологическом аспектах с привязкой к конкретным объектам окружающей среды

на территории России

ГЛАВА 4 СРАВНИТЕЛЬНАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ФЕНО- И ГЕНО-ТИПИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ШТАММОВ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ О1, 0139, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА РАЗЛИЧНЫХ ТЕРРИТОРИЯХ РОССИИ С 1989г. ПО 2016г

4.1 Фенотипическая характеристика штаммов холерных вибрионов, изолированных из поверхностных водоёмов и стоков

на территории Российской Федерации

4.2 Молекулярно-биологическая характеристика штаммов холерных вибрионов, изолированных из поверхностных водоёмов и стоков на территории Российской Федерации

ГЛАВА 5. РАЗРАБОТКА ПОПОЛНЯЕМОЙ ГЕОИНФОРМАЦИ-

3

ОННОЙ СИСТЕМЫ «ХОЛЕРА 1989-2014» И АЛГОРИТМА РАБОТЫ

С НЕЙ

5.1 Создание и характеристика базы данных ГИС «Холера 1989-2014»

5.1.1 Установка компьютерной программы; работа с базой данных и редактирование информации

5.1.2 Поиск идентичных и схожих штаммов

ГЛАВА 6 ПЦР-ГЕНОТИПИРОВАНИЕ НЕТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ О1 ЭЛЬ ТОР, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА ТЕРРИТОРИИ РОССИИ

6.1 Установление ПЦР-генотипа нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из поверхностных водоёмов и стоков на разных территориях Российской Федерации

6.2 Алгоритм расчета минимального числа генов-мишеней для детекции при ПЦР-генотипировании и определение генотипов репрезентативной выборки нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 Эль Тор

6.3 Анализ ПЦР-генотипов репрезентативной выборки неток-сигенных штаммов холерных вибрионов, изолированных из поверхностных водоёмов и стоков на территории Российской Федерации

ГЛАВА 7 ПРИКЛАДНОЕ ИСПОЛЬЗОВАНИЕ СПОСОБА ГЕНОТИ-ПИРОВАНИЯ НЕТОКСИГЕННЫХ ШТАММОВ V. CHOLERAE O1 EL TOR ПО МИНИМАЛЬНОМУ НАБОРУ ГЕНОВ-МИШЕНЕЙ, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ НА РАЗЛИЧНЫХ АДМИНИСТРАТИВНЫХ ТЕРРИТОРИЯХ

7.1 Сравнительная ПЦР генотипическая характеристика нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor ctxA-tcpA+ по минимальному набору детерминант факторов патогенности

4

7.2 Анализ данных генотипирования по 14 генам-мишеням факторов патогенности/персистенции V. cholerae О1 El Tor, изолированных из водных экосистем на территории Краснодарского края

7.3 Анализ соотношения между обнаружением в ООС токси-генных и нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor на территории Российской Федерации с 2001г. по 2016г

7.4 Определение соотношения между обнаружением в ООС штаммов V. cholerae O1 El Tor и бактериофагов холерных вибрионов на территории Ростовской области с 2008г. по 2010г

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ, ИСПОЛЬЗУЕМЫХ В РАБОТЕ

БД

вольт/см

ГИС

ДНК

ДРТ

ДФО

КС

МЖК с ЦПВ

мкг/мл.

МПА

МПБ

ОКИ

ООИ

ООС

ПВ

ПФО

ПЦР

Р.

С-ЗФО

С-КФО

СФО

УФО

ФО

ЦФО

ЩА

ЮФО

MALDI-TOF UPGMA

VNTR VPI

- база данных

- вольт/сантиметр

- геоинформационная система

- дезоксирибонуклеиновая кислота

- рабочий титр

- Дальневосточный Федеральный округ

- «коэффициент совместимости»

- музей живых культур с центром патогенных вибрионов

- микрограмм/ миллилитр

- мясо-пептонный агар

- мясо-пептонный бульон

- острые кишечные инфекции

- особо опасные инфекции

- объекты окружающей среды

- пептонная вода

- Приволжский Федеральный округ

- полимеразная цепная реакция

- река

- Северо-Западный Федеральный округ

- Северо-Кавказский Федеральный округ

- Сибирский Федеральный округ

- Уральский Федеральный округ

- федеральный округ

- Центральный Федеральный округ

- щелочной агар

- Южный Федеральный округ

- матрично-активированная лазерная десорбция/ионизация

- Unweighted Pair-Group Method using Arithmetic averages (попарное невзве-шенное кластирование с арифметическим усреднением)

- метод переменного числа тандемных повторов

- Vibrio Pathogenicity Island (остров патогенности холерного вибриона)

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Анализ результатов микробиологического мониторинга холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации с 1989 г. по 2016 г.»

ВВЕДЕНИЕ

Современный этап развития седьмой пандемии холеры в мире характеризуется широким распространением, проникновением в новые регионы, регистрацией эпидемий, вспышек и спорадических заболеваний, связанных с заносами этой инфекции [Сагымбек У.А. с соавт., 2012; Bubshait S.A. et al., 2000; Ahmad S. et al, 2011; Ali A. et al., 2011]. В этой связи определенное значение приобретают и эволюционные изменения генома Vibrio cholerae El Tor [Горяев А.А. с соавт., 2011; Шаш-кова А.В. с соавт., 2012; Агафонов Д.А. с соавт., 2013; Кульшань Т.А. с соавт., 2015]. За последние десять лет эпидемиологическую ситуацию по этой инфекции в России определяли имевшие место эпизодические заносы без распространения (2010г., 2012г., 2014г.), а также не связанные с ними единичные случаи обнаружения в объектах окружающей среды (ООС) токсигенных, наряду с ежегодным выделением десятков нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1, без эпидосложнений по холере. Анализ данных литературы указывает на значительный диапазон экологической толерантности водной популяции холерных вибрионов. У холерных вибрионов Эль Тор выработались приспособительные механизмы, способствующие разным срокам существования популяции в различных климато-географических условиях [Ерошенко Г.А. с соавт., 2008; Monakhova E.V., 2010, 2012; Смирнова Н.И. с соавт., 2011; Москвитина Э.А. с соавт., 2015; Онищенко Г.Г. с соавт., 2015, 2016; Титова С.В. с соавт., 2015, 2016; Кульшань Т.А. с соавт., 2015; Ali M. et al., 2012;]. Стоит отметить, что на отдельных территории России (Краснодарский край р. Агура 2015г.) нетоксигенные штаммы холерных вибрионов выделялись на протяжении более одного месяца в количестве, превышающем 100 штаммов. В то же время доказано, что водные экосистемы являются резервуаром генов патогенности холерных вибрионов [Куликалова Е.С. с соавт., 2015, Титова С.В. с соавт., 2016, Monakhova E.V., 2010].

Особое внимание привлекают случаи обнаружения в ООС штаммов холерных вибрионов О1, не содержащих ген холерного токсина, но имеющие кластер VPI (tcpA и toxT), что может иметь значение в этиологии вспышек и спорадических случаев диарейных заболеваний. При этом особое значение имеет наличие ряда генети-

7

ческих детерминант дополнительных токсинов, количество и уровни экспрессии которых могут различаться от штамма к штамму [Монахова Е.В., 2012; Осина Н.А. с соавт., 2013; Куликалова Е.С. с соавт., 2015; Кульшань Т.А. с соавт., 2015; Ali M. et al., 2012]. Данные штаммы с большей вероятностью могут колонизировать кишечник, и, как следствие, способны вызывать спорадические случаи заболевания у людей и вспышки острых кишечных инфекций (ОКИ) [Гриднева Л.Г. с соавт., 2014; Кульшань Т.А. с соавт., 2015; Kumar P. et al., 2011].

В целях повышения эффективности мониторинговых исследований на холеру разработка и внедрение информационно-аналитических и компьютерных технологий проводилась и ранее. Результаты мониторинга холерных вибрионов Эль Тор в различных экологических нишах ООС на территории бывшего СССР в период 19701988гг., послужили основой создания «Справочника-кадастра», в котором приведены данные по длительности и сезонности выделения штаммов этих микроорганизмов [Мединский Г.М. с соавт., 1991]. По результатам микробиологического мониторинга на территории Российской Федерации по параметрам фенотипа и токсигенно-сти в 2010г. была создана база данных (БД) геоинформационная система (ГИС) «Распространение холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации в 2005-2008 годах», выделенных из поверхностных водоемов и стоков [Голубев Б.П. с соавт., 2010].

Разработаны и успешно используются многие проблемно-ориентированные БД и ГИС, такие как «Холера Эль Тор. Эпидемиологический анализ заболеваемости в СНГ»; «Штаммы Vibrio cholerae»; «Холерные вибрионы не О1/не О139 серогрупп, циркулирующие в Ростовской области»; интегративная «онлайн» ГИС «Холера штаммы VNTR», доступная на веб-сайте Ростовского противочумного института для широкого круга исследователей; «Vibrio cholerae eltor. Сибирь и Дальний Восток», «Географическая информационная система Vibrio cholerae О1 и О139, г. Иркутск» и др. Созданные ГИС-разноплановые: или отражают информацию по проблеме холеры на глобальном и территориальном уровне, либо учитывают региональные особенности выделения штаммов Vibrio cholerae различного происхождения и эпидзначимости, либо основываются на разнообразных методических подхо-

дах, характеризующих изолированные штаммы (УКТЯ-типирование, ПЦР-типирование и т.д.) [Москвитина Э.А. с соавт., 2003, 2013; Ежова М.И. с соавт., 2012; Водопьянов С.О. с соавт., 2013; Миронова Л.В. с соавт., 2012; 2015; Архангельская И.В. с соавт., 2015].

При оценке результатов мониторинга холеры в ООС, сравнивая разные популяции нетоксигенных штаммов холерных вибрионов (в аспекте их происхождения, сходства и различия) применяют различные молекулярно-биологические методы с разной дискриминирующей силой [Кульшань Т.А. с соавт., 2015; Смирнова Н.И. с соавт., 2015; Титова С.В. с соавт., 2015, 2016].

Вместе с тем, на сегодняшний день не существует единого подхода позволяющей комплексно охарактеризовать и систематизировать данные изучения различных по происхождению и токсигенности штаммов V. с^1егае О1, О139, выделенных из ООС в процессе многолетних мониторинговых исследований на территории России; фенотипическим признакам и генотипическим свойствам с учетом углубленного молекулярно-биологического исследования доступным и экономичным методом ПЦР, что имеет важное значение в изучении способности к переживанию и оперативном определении происхождения (занос или переживание), в плане повышения эффективности мониторинговых исследований.

Не установлено минимальное количество генетических детерминант, определение которых дает достоверное представление о происхождении (сходстве/различии) штаммов и позволяет проводить их генотипирование с привязкой к временному и пространственному формату, что в свою очередь расширяет наши представления о способности к переживанию популяции нетоксигенных штаммов V. с^1егае, изолированных из ООС на территориях субъектов Российской Федерации.

Цель работы: изучение фенотипического и генотипического разнообразия штаммов холерных вибрионов О1, О139 различной эпидзначимости, выделенных с 1989г. по 2016г. из объектов окружающей среды различных регионов бывшего СССР, федеральных округов и субъектов России.

Задачи исследования:

1. Ретроспективный сравнительный анализ динамики выделения штаммов холерных вибрионов О1, О139 различной эпидзначимости из водных объектов окружающей среды на административных территориях бывшего СССР, федеральных округов и субъектов Российской Федерации с 1989г. по 2016г. с учетом особенностей их фенотипической характеристики в пространственном и временном (по годам) форматах.

2. Изучение фено- и генотипических свойств нетоксигенных штаммов V. cholerae, изолированных из объектов окружающей среды, в расширенном диапазоне детерминант факторов патогенности.

3. Создание пополняемой базы данных ГИС «Холера 1989-2014» с учетом молекулярно-биологических свойств штаммов и алгоритма работы с ней как с инструментом информационного анализа результатов мониторинга холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории России. Интеграция базы данных ГИС в геоинформационный портал ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора.

4. Разработка способа генотипической идентификации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы с помощью ПЦР и определение минимально необходимого количества генетических детерминант, детекция которых позволит с высокой степенью дискриминации определять генотипы данных штаммов.

5. Генотипирование нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor по минимальному набору генетических детерминант с последующим информационно-сравнительным анализом холерных вибрионов различной эпидзначимости и серологической принадлежности, выделенных за 27 летний период на территории бывшего СССР и Российской Федерации.

Научная новизна работы

Впервые разработан способ идентификации нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor методом ПЦР-генотипирования на основе детекции минимального количества генов-мишеней, что позволяет достоверно классифицировать и систе-

матизировать вышеуказанные культуры при проведении микробиологического мониторинга за холерой. Способ подтвержден заявкой на изобретение «Способ идентификации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 серогруппы с помощью ПЦР для выделения генетических детерминант» (заявка на изобретение №2017127665, приоритет от 01.08.2017г.).

Впервые по результатам ПЦР-анализа, проведенного по набору минимального количества генетических детерминант (14), показана геторогенность (разнообразие) нетоксигенных штаммов V. cholerae, а также определены генотипы нетоксигенных культур холерных вибрионов, которые обнаруживаются в водных ООС на территории ФО и субъектов Российской Федерации на протяжении нескольких лет.

Способ идентификации нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 Эль Тор методом ПЦР-генотипирования позволяет устанавливать принадлежность того или иного изолированного штамма к определенному генотипу, как в референс -центре по мониторингу холеры, так и изученных в других научно -исследовательских учреждениях Роспотребнадзора (по представлению результатов ПЦР-генотипирования по разработанной методике в ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора).

Впервые создана пополняемая БД ГИС «Холера 1989-2014», которая содержит данные, позволяющие систематизировать результаты микробиологических и моле-кулярно-биологических исследований штаммов холерных вибрионов, выделенных из ООС при осуществлении мониторинга на территории России. Обеспечивает сравнительный подход к анализу изолированных штаммов различной токсигенно-сти, а именно: по фенотипу и генотипу, что способствует повышению эффективности мониторинговых исследований за холерой на территории Российской Федерации в текущем временном периоде и на перспективу.

Теоретическая и практическая значимость

Охарактеризованы штаммы V. cholerae О1, О139, поступившие в референс-центр по мониторингу холеры на территории Российской Федерации, на основе чего разработана пополняемая БД ГИС «Холера 1989-2014» (свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621055, 2014г.), позволяющая наглядно

11

оценить реальную ситуацию по контаминации ООС штаммами V. скв1вгав О1, О139 в динамике по ФО, субъектам и конкретным водным объектам.

Проведен сравнительный анализ фено- и генотипических свойств штаммов V. скв1вгав О1, О139 с учетом количественной динамики и повторяемости выделения (по годам) культур на территории России за 27-летний период во временном и пространственном форматах.

Разработаны методические рекомендации «ПЦР-генотипирование нетокси-генных штаммов холерных вибрионов», которые одобрены Ученым советом ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора и утверждены директором (протокол № 2 от 05.04.2017г.). Методические рекомендации были внедрены в работу сотрудников лаборатории диагностики особо опасных инфекций ФКУЗ Ростовского-на-Дону противочумного института Роспотребнадзора (акт внедрения от 02.05.2017г.) и лаборатории холеры ФКУЗ Иркутского научно-исследовательского противочумного института Роспотребнадзора (акт внедрения от 27.04.2017г.).

БД ГИС «Холера 1989-2014» в 2015г. интегрирована в геоинформационный портал ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора (http://gis.antiplague.ru/s_cholera-genes.php), доступный всем сотрудникам Роспотребнадзора (по логину и паролю). БД ГИС была использована в научно-исследовательской работе специалистов лаборатории диагностики особо опасных инфекций в ФКУЗ Ростовском-на-Дону противочумном институте Роспотребнадзо-ра (акт внедрения от 02.05.2017г.).

Полученные сведения диссертационного исследования используются при чтении лекции по микробиологии и лабораторной диагностике холеры на курсах дополнительного послевузовского образования при ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора.

Основные положения, выносимые на защиту:

1. Ретроспективный информационный анализ динамики выделения и биологических свойств 1158 штаммов V. скв1вгав О1, О139 различной токсигенности, изолированных из объектов окружающей среды на территориях бывшего СССР, фе-

12

деральных округов и субъектов Российской Федерации за 27-летний период показал значимость микробиологической составляющей мониторинговых исследований.

2. Результаты изучения фено- и генотипических свойств V. cholerae О1, О139, выделеных из водных объектов, свидетельствуют о целесообразности совершенствования методов генотипирования нетоксигенных штаммов.

3. С помощью разработанного нами методического подхода сформирован минимальный набор из 14 генов-мишеней, который оказался достаточным для дифференциации нетоксигенных штаммов V. cholerae О1. Предложенный метод обладает высокой дискриминирующей силой и может быть использован для ПЦР-генотипирования штаммов, выделяемых в процессе мониторинга.

4. Применение разработанной пополняемой базы данных ГИС «Холера 1989-2014» позволяет проводить сравнительный анализ фено- и генотипических свойств групп штаммов холерных вибрионов, изолированных из объектов окружающей среды на различных административных территориях в разные временные периоды.

Личный вклад автора в исследования

Работа выполнена в лаборатории микробиологии холеры ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора в рамках трех государственных тем: «Изучение циркуляции холерных вибрионов в водоёмах и стоках г. Ростова-на-Дону с комплексной оценкой эпидемической опасности выделенных культур» (№ гос. регистрации 1020.0 800412); «Создание ГИС «Распространение холерных вибрионов О1, О139 в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации с 1989 по 2014 гг.» (№ гос. регистрации 01201002618); «Характеристика биологических свойств и генетической организации холерных вибрионов, выделяемых из объектов окружающей среды на территории Ростовской области» (№ гос. регистрации 01201352135).

Личный вклад автора состоит в анализе литературных данных и информационного материала при планировании, определении цели работы, поиске наиболее эффективных путей реализации поставленных задач, в выполнении бактериологических, серологических, молекулярно-биологических исследований, в анализе, систе-

матизации и статистической обработке полученных научных результатов, оформлении патента и методических рекомендаций; написании диссертации и автореферата. УКТЯ-генотипирование, а также работу по созданию БД ГИС выполняли совместно с руководителем группы вирусологии к.м.н. А.С. Водопьяновым.

Степень достоверности и апробация работы.

Степень достоверности полученных результатов базировалась на современной информационно-аналитической методологии комплексного подхода к учету достоверности полученных результатов мониторинга холерных вибрионов в ООС за 27-летний период на территории России в формате пространственной и временной динамики с применением ГИС-технологий, а также характеристике биологических свойств штаммов, включая эффективность методов молекулярно-генетического ти-пирования нетоксигенных штаммов, основанную на использовании статистических методов интерпретации данных. Все исследования выполнены на оборудовании прошедшем метрологическую поверку.

Материалы диссертации представлены на научных конференциях: проблемная комиссия «Холера и патогенные для человека вибрионы» в рамках Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации (г. Ростов-на-Дону, 2013-2016гг.); VII Всероссийская научно-практическая конференция молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии и гигиены» (г. Санкт-Петербург, 2015г.); межрегиональная научно-практическая конференция «Актуальные проблемы диагностики инфекционных заболеваний (микробиология, биотехнология, эпидемиология, паразитология)» (г. Ростов-на-Дону, 2015г.); Всероссийское совещание специалистов Роспотребнадзора (г. Ростов-на-Дону, 2016г.); научно-практическая конференция «Диагностика и профилактика инфекционных болезней на современном этапе» (г. Новосибирск, 2016г.); межрегиональная научно-практическая конференция с международным участием «Актуальные вопросы диагностики и профилактики инфекционных и паразитарных заболеваний на юге России» (г. Ростов-на-Дону, 2016г.); международный форум специалистов с заседанием профильной комиссии по специальности «Инфекционные болезни» «Актуальные вопросы инфекционной

патологии Министерства здравоохранения РФ» (г. Краснодар, 2016г., 2017г.); региональная научная конференция «Актуальные вопросы эпидемиологии, микробиологии и диагностики инфекционных и паразитарных заболеваний в Ростовской области» (г. Ростов-на-Дону, 2017г.).

Публикации. Материалы исследований отражены в 45 опубликованных работах, из них 8 в периодических изданиях из «Перечня ведущих рецензируемых научных журналов, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки России», а также 37 тезисов.

План диссертационной работы утвержден на заседании Ученого совета ФКУЗ Ростовского-на-Дону противочумного института Роспотребнадзора (протокол № 14 от 26.12.16г.).

Структура диссертации. Диссертация построена по традиционному плану, изложена на 157 страницах, состоит из введения, одной главы обзора литературы, материалов и методов, пяти глав собственных исследований, заключения и выводов. Работа иллюстрирована 30 таблицами и 22 рисунками. Библиография содержит ссылки на 211 публикации, из которых 156 отечественных и 55 зарубежных.

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Тенденция и особенности эпидемиологической ситуации по холере на современном этапе развития седьмой пандемии в мире и на территории Российской Федерации

Холера продолжает оставаться одной из социально-значимых особо опасных инфекционных болезней, единичные случаи заболеваний и вспышки которой в проекте Международных медико-санитарных правил рассматриваются как чрезвычайная ситуация с возможностью распространения в международных масштабах [Москвитина Э.А. с соавт., 2012-2015; Онищенко Г.Г. с соавт., 2016]. По данным результатов исследований Г.Г. Онищенко с соавт. (2015), Э.А. Москвитиной с соавт. (2015), установлено интенсивное и широкомасштабное распространение инфекции в странах Африки, Азии, Америки, а также в регионе Карибского бассейна, что позволило оценить ситуацию по холере в мире как неблагополучную.

Обращают на себя внимание публикации, в которых сообщается о случаях возникновения вспышек холеры на территории Российской Федерации (г. Ставрополь - 1990 г., Республика Дагестан - 1994г., Южно-Сахалинск и Владивосток -1999г., Республика Татарстан г. Казань - 2001г., Ростовская область - 2005г.), которые были обусловлены заносом инфекции [Богданов И.К. с соавт., 1992; Ефременко В.И. с соавт., 1992; Онищенко Г.Г. с соавт., 1995; Голубинский Е.П. с соавт., 2002; Кюрегян А.А. с соавт., 2002; Мишанькин Б.Н. с соавт., 2002; Фазылов В.Х. с соавт., 2003; Мазрухо А.Б. с соавт., 2012]. Подчеркивается тенденция возникновения спорадических заболеваний и редких вспышек холеры на территории нашей страны в течение седьмой пандемии обусловленная заносами инфекции [Онищенко Г.Г. с соавт., 2007]. В этой связи определенное значение приобретают и эволюционные изменения генома Vibrio cholerae El Tor [Смирнова Н.И. с соавт., 2005, 2007, 2008, 2011; Ерошенко Г.А. с соавт., 2008; Савельева В.Н., с соавт., 2012; Агафонов Д.А. с соавт, 2013; Ali M. et al., 2012; Ceccarelli D. et al., 2011; Thompson C.C. et al., 2011; Zhou H. et al, 2014].

Предпосылками для возникновения вспышек водного происхождения были и остаются эколого-гигиенические условия поверхностных водоемов, благоприятные для размножения возбудителя холеры в концентрациях, достаточных для инфицирования населения, использующего водные объекты для водоснабжения, организованного и неорганизованного рекреационного водопользования [Куликалова Е.С. с со-авт., 2007; Информационное письмо Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2011].

Особенностью эпидемиологической ситуации по холере в Российской Федерации на современном этапе являются заносы этой инфекции с эндемичных территорий без распространения. Так, за последние 10 лет имели место заносы токсиген-ных штаммов возбудителя холеры в Россию (Москва - 2010г., 2012г. и 2014г.), встречались единичные изоляты и нетоксигенные штаммы из клинического материала [Онищенко Г.Г. с соавт., 2015, 2016; Писанов Р.В. с соавт., 2015]. Кроме того, были отмечены единичные случаи обнаружения в водных ООС токсигенных (при отсутствии эпидосложнений по холере) и ежегодное выделение десятков нетокси-генных штаммов V. cholerae О1 El Tor, в том числе не содержащих ген холерного токсина, но имеющие кластер VPI (tcpA и toxT), что в совокупности определяло неустойчивую эпидемиологическую обстановку по холере в России [Ломов Ю.М. с соавт., 2012; Монахова Е.В., 2012; Москвитина Э.А. с соавт., 2014, 2015].

Другие особенности эпидситуации в России связаны с результатами изучения выделяемых нетоксигенных штаммов холерных вибрионов различного происхождения на молекулярно-биологическом уровне. По данным литературы обнаружение в ООС нетоксигенных штаммов холерных вибрионов О1 Эль Тор, в том числе не содержащих ген холерного токсина, но имеющих ген tcpA, имеет определенное значение в этиологии диарейных заболеваний [Агафонова Е.Ю. с соавт., 2016; Кульшань Т.А., 2015; Faruque S.M. et al, 1998, 2002; Reguera G. et al, 2005; Nair G.B. et al, 2006; Lizárraga-Partida M.L. et al., 2009; Monakhova E.V., 2010; Thompson C.C. et al., 2011]. В литературе имеются сообщения о спорадических случаях и вспышках диарейных заболеваний, причиной которых являлись нетоксигенные штаммы V. cholerae О1 El Tor ctxA-tcpA+, продуцирующие дополнительные факторы патогенности.

17

По-видимому, это связано с тем, что токсин-корегулируемые пили (TCP) являются ключевым фактором адгезии Vibrio cholerae, поэтому данные штаммы с большей вероятностью могут колонизировать кишечник и, как следствие, способны вызывать заболевания ОКИ (острых кишечных инфекций) у людей [Монахова Е.В., 2012, 2013; Осина Н.А. с соавт., 2013; Титова С.В. с соавт., 2016]. Примером тому могут служить факты регистрации вспышки и единичных случаев диарейных заболеваний в Каменском районе Ростовской области в 2005г. и в Республике Калмыкия (2011г.) [Кругликов В.Д. с соавт., 2006; Ерошенко Г.А. с соавт., 2008; Бембеева Е.С. с соавт., 2013]. В этой связи, значение штаммов холерных вибрионов с генетической характеристикой ctxA-tcpA+ трактуется неоднозначно. С одной стороны, их изначально позиционировали как «потенциально эпидемически опасные» [Кругликов В.Д. с соавт., 2006; Онищенко Г.Г. с соавт., 2007; Кульшань Т.А. с соавт., 2015]. С другой стороны, существует мнение, что все нетоксигенные штаммы, изолированные из водной среды на не эндемичной территории России, имеющие различные, связанные с патогенностью гены, следует расценивать как штаммы, не имеющие особенностей, обусловливающих их эпидемический потенциал [Монахова Е.В., 2012, 2013]. Мы тоже придерживаемся этого мнения, заключающегося в том, что несмотря на наличие токсин-корегулируемых пилей (TCP), являющихся рецептором для фага СТХф, несущего ключевой ген фактора патогенности и пандемичности - ген холерного токсина (ctxA), ввиду кратковременности циркуляции в ООС токсиген-ных штаммов V. cholerae О1 El Tor на территории России, вероятность образования геновариантов с повышенным эпидемическим потенциалом характеризуется как крайне низкая и не актуальная, но высокая для эндемичных по холере стран.

Вместе с тем, следует учитывать, что геном холерного вибриона высокопластичен, что выражается в генетической неоднородности популяций, обнаруживаемых на различных территориях. Способность к обмену генетической информацией, не затрагивающая ключевые гены патогенности и пандемичности, позволяет считать природные популяции этих микроорганизмов резервуарами генов, которые в условиях умеренного климата представляют собой скорее динамичные, чем постоянные сообщества с горизонтальной передачей определенных аллелей генов и формирова-

нием новых генотипов, в том числе с повышенным персистентным потенциалом и вирулентностью, связанной со способностью вызывать ОКИ [Гриднева Л.Г. с соавт., 2014; Куликалова Е.С. с соавт., 2015; Титова С.В. с соавт., 2016; Soumen C. et al 2000; Monakhova E.V., 2010].

Следовательно, при выделении нетоксигенных штаммов V. cholerae О1 El Tor возникает необходимость разработки дополнительного подхода к их систематизации (классификации), связанного с установлением их генотипов, то есть, выявления сходств/различий со штаммами, как вновь выделенными, так и обнаруженными ранее, а также установление их происхождения (занос/переживание) и предположительное определение возможной степени вероятности этиологической роли в возникновении диарейных заболеваний, что имеет прикладной характер в плане эпидрасследований по фактам обнаружения данных штаммов в соответствии с пунктом 5.2 СП 3.1.1.2521-09 «Профилактика холеры. Общие требования к эпидемиологическому надзору на территории Российской Федерации».

Е.П. Голубинским с соавт. (2002) было установлено, что на территории Сибири и Дальнего Востока холера проявилась в виде спорадических и групповых заболеваний, отдельных заносных случаев и исключительно редко обнаружением транзитор-ных носителей на фоне длительной циркуляции вибрионов Эль Тор в ООС. Выявлены единичные случаи выделения нетоксигенных штаммов холерных вибрионов от людей (больные, вибрионосители) на территориях Сахалинской области (1999г.), Краснодарского края (1999г.), Астраханской области (2000г.) и Республики Калмыкия (2002г., 2011г.), одновременно с этим из ООС были изолированы культуры холерных вибрионов, имевшие такой же генотип и фенотип [Кюрегян А.А. с соавт., 2000, 2001; Безсмертный В.Е. с соавт., 2003; Иванова С.М. с соавт., 2012].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Левченко Дарья Александровна, 2018 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Агафонова, Е.Ю. Дифференциация нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор ctxAB-tcpA+ с различной эпидемиологической значимостью методом мультиплексной ПЦР / Е.Ю. Агафонова, Т.А. Кульшань // Современные проблемы эпидемиологии и гигиены. Матер. VIII Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора. - 2016. - С.14-16.

2. Агафонов, Д.А. Структурные изменения генома возбудителя холеры в процессе эволюции / Д.А. Агафонов, А.В. Шашкова, С.П. Заднова,

A.В. Черкасов, Н.И. Смирнова // Инфекция и иммунитет. - 2013. - Т. 3, № 2. - С.108.

3. Антюганов, С.Н. Совершенствование эпидемиологического надзора за сибирской язвой с использованием ГИС-технологий на административных территориях Северо-Кавказского федерального округа: Автореф. Дисс....канд. мед. наук по специальности: 14.02.02 / Антюганов Степан Николаевич. - Ставрополь, 2014. - с. 23.

4. Антюганов, С.Н. Сибирская язва в Ставропольском крае / С.Н. Антюганов, Н.П. Буравцева, А.Г. Рязанова, Е.И. Ерошенко, О.И. Цыганкова,

B.М. Мезенцев, Л.Ю. Аксенова, С.В. Лысогора, Г.А. Джаилиди // Медицин-сий вестник Северного Кавказа. - 2012. - Т. 28, № 4. - С.67-70.

5. Архангельская И.В., Водопьянов А.С., Непомнящая Н.Б., Монахова Е.В., Кругликов В.Д., Зубкова Д.А., Ежова М.И. Свидетельство № 2015620331. Холерные вибрионы не О1/не О139 серогрупп, циркулирующие в Ростовской области. - 2015.

6. Ашмарин, И.П. Быстрые методы статистической обработки и планирования экспериментов / И.П. Ашмарин, Н.Н. Васильев, В.А. Амбросов // Л.: Ленинград. ун-т. 1975. - 78 с.

7. Байтанаева, А.О. Экологические особенности заболеваемости Конго-Крымской геморрагической лихорадкой и применение ГИС-технологий для ее изучения в Южном Казахстане / А.О. Байтанаева, Б.Б. Ат-

128

мабар, К.Р. Рахимов, М.В. Кулемин, М. Тажеков, Д. Садуллаева // Наука и мир. - 2014. - №8(12). - С.157-162.

8. Балахонов, С.В. MALDI-TOF масс-спектрометрическое определение видовой принадлежности патогенов в совершенствовании эпидемиологического надзора за опасными инфекционными болезнями / С.В. Балахонов, Л.В. Миронова, М.В. Афанасьев, Е.С. Куликалова, А.С. Остяк // Бактериология. - 2016. - Т. 1, № 1.- С. 88-95.

9. Балахонов, С.В. Актуальные вопросы совершенствования мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов в системе эпидемиологического надзора за холерой в Сибири и на Дальнем Востоке / С.В. Балахонов, Л.В. Миронова, Ж.Ю. Хунхеева, Л.Я. Урбанович, Е.А. Басов, Э.Г. Голь-дапель, Е.С. Куликалова, А.С. Пономарева, С.К. Миткеева, В.С. Ганин, Г.И. Кобанова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2015. - № 28. - С.37-45.

10. Балахонов, С.В. Эпидемиологический надзор за холерой в Сибири и на Дальнем Востоке: результаты и направления совершенствования / С.В. Балахонов, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, Л.Я. Урбанович, Ж.Ю. Хунхеева, Е.А. Басов, М.В. Афанасьев, Э.Г. Гольдапель, В.С. Ганин // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2014. - № 27. - С.28-35.

11. Балахонов, С.В. Ретроспективный анализ результатов микробиологического мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов Приамурья и обоснование мероприятий по профилактике холеры в послепаводковый период / С.В. Балахонов, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, Ж.Ю. Хунхеева, Л.Г. Гриднева, Ю.С. Мусатов, Т.В. Громова, Н.М. Пуховская, Л.И. Иванов, Т.А. Зайцева, Т.Н. Каравянская, А.В. Попова, Г.Н. Петрова, И.В. Чишагорова, О.П. Курганова, А.А. Перепелица, Е.Н. Бурдинская // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2014. - № 24 (24). - С. 116-124.

12. Балахонов, С.В. Эпидемиологический надзор за холерой в Сибири и на Дальнем Востоке на текущем этапе VII пандемии / С.В. Балахонов,

129

Л.Я. Урбанович, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, В.С. Ганин, М.В. Афанасьев, Е.А. Басов, Ж.Ю. Хунхеева, Э.Г. Гольдапель, В.С. Вишняков // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2012. - № 25. - С.55-63.

13. Балахонов, С.В. Эколого-микробиологические аспекты эпиднад-зора за холерой / С.В. Балахонов, Л.Я. Урбанович, Е.С. Куликалова // По материалам Сибири и Дальнего Востока. Saarbrücken, 2013.

14. Балахонов, С.В. Экологические и молекулярно-биологические аспекты в системе эпидемиологического надзора за холерой в Сибири и на Дальнем Востоке / С.В. Балахонов, Л.Я. Урбанович, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, А.С. Кожевникова, В.С. Ганин // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2010. - № 23. - С.24-28.

15. Баранихина, Е.Ю. Разработка способа дифференциации нетокси-генных штаммов Vibrio cholerae О1биовара Эль Тор с различной эпидемической значимостью методом мультиплексной ПЦР / Е.Ю. Баранихина, Т.А. Кульшань, Н.И. Смирнова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2016. - № 29. - С.199-202.

16. Безсмертный, В.Е. Характеристика культур холерных вибрионов О1 и О139, изолированных от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2002 году / В.Е. Безсмертный, С.М. Иванова, Б.Л. Мазрухо, Л.М. Смоликова, Л.С. Подосинникова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2003. - № 16. - С.13-17.

17. Безсмертный, В.Е. Информация о биологических свойствах холерных вибрионов О1 серогруппы, изолированных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2007 году / В.Е. Безсмертный, С.М. Иванова, Г.В. Титов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2008. - № 21. - С.52-58.

18. Безсмертный, В.Е. Информация о биологических свойствах холерных вибрионов О1 серогруппы, изолированных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2008 году / В.Е. Безсмертный, С.М. Иванова, Г.В. Титов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2009. - № 22. - С.55-58.

19. Безсмертный, В.Е. Характеристика культур холерных вибрионов О1 и О139 серогрупп, изолированных от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2006 году / В.Е. Безсмертный, Л.С. Подосинникова, С.М. Иванова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2007. - № 20. - С.49-53.

20. Безсмертный, В.Е. Холерные вибрионы, изолированные от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2005 году / В.Е. Безсмертный, Л.С. Подосинникова, С.М. Иванова, Г.В. Титов, В.Д. Кругликов, Е.В. Монахова, Л.М. Смоликова, И.С. Шестиалтынова, Е.П. Евдеева, Т.А. Кудрякова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2006. - № 19. - С.33-37.

21. Бембеева, Е.С. Результаты и эффективность мониторинга объектов окружающей среды на наличие холерного вибриона в Республике Калмыкия / Бембеева Е.С., Каляева Т.Б., Манджиева К.Л., Мухараева Д.Б., Об-роткин В.В., Оброткина Н.Ф., Савченко С.П. // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. совещ. спец-ов Роспотребнадзора. - Ростов-на-Дону, 2013. - № 26. - С.105-107.

22. Богданов, И.К. Прошлое и настоящее холеры в Ставропольском крае / И.К. Богданов, Г.М. Грижебовский, В.П. Исаев, Г.П. Юндина // Холера. Матер. Российской научной конференции. - Ростов-на-Дону, 1992. - С.29-31.

23. Буравцева, Н.П. Использование ГИС-технологий при разработке кадастра стационарного неблагополучных по сибирской язве пунктов в Краснодарском крае / Н.П. Буравцева, В.М. Мезенцев, А.Г. Рязанова, О.В. Плужникова, Е.И. Еременко, О.В. Малецкая, А.Н. Куличенко // Журн. мик-робиол., эпидемиол., иммунобиол. - 2014. - № 2. - С.59-64.

131

24. Васильева, О.В. Совершенствование эпидемиологического надзора на территории I типа по эпидемиологическим проявлениям холеры на примере Ставропольского края / О.В. Васильева, В.Н. Савельев, В.М. Ду-бянский, С.И. Москвитина, А.Н. Куличенко // ЗНиСО. - 2013. - № 10 (247). -С.29-31.

25. Васильева, О.В. Создание информационной системы «Холера на Кавказе» / О.В. Васильева, С.И. Москвитина, В.Н. Савельев, Б.В. Бабенышев // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С.126.

26. Васильева, О.В. Информационно-поисковая база данных «Холера на Кавказе» / О.В. Васильева, А.Н. Куличенко, В.Н. Савельев, Б.В. Бабенышев, С.И. Москвитина // Актуальные проблемы болезней, общих для человека и животных: матер. Всерос. науч.-практ. конф. с международным участием. - Ставрополь, 2012. - С. 152.

27. Водопьянов, А.С. Генетическое разнообразие Francisella tularensis: VNTR - анализ: Дис.... канд. мед. наук: 03.00.07 / Водопьянов Алексей Сергеевич. - Ростов-на-Дону, 2009. - 197 с.

28. Водопьянов, А.С. ГИС «Холера-интернет» - использование современных интернет-технологий в эпидемиологической практике / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, Б.Н. Мишанькин, И.П. Олейников // ЗНиСО. -2016. - № 12. - С.36-39.

29. Водопьянов, А.С. Алгоритм компьютерного VNTR-типирования на основе неполных сиквенсов ДНК-штаммов Vibrio cholerae, выделенных на Гаити в 2010 г. // ЗНиСО. - 2016. - № 3. - С.28-30.

30. Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Сучков И.Ю., Мишанькин Б.Н. Свидетельство № 2007620389. Холера. Штаммы VNTR. - 2007.

31. Водопьянов, А.С. Вариабельные тандемные повторы, выявленные при компьютерном анализе генома Vibrio cholerae / А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов, М.Б. Мишанькин, И.Ю. Сучков, Б.Н. Мишанькин // Биотехнология. - 2001. - № 6. - С.85-88.

32. Водопьянов, С.О. Генетическое разнообразие гена tcpA у представителей рода Vibrio / С.О. Водопьянов, А.С. Водопьянов, И.Ю. Сучков // Соврем. технологии в диагност. особ. опасн. бол-ней: Матер. IV Межгосуд. науч.-практ. конф. госуд-в. участн. СНГ. - Саратов, 2003. - С.38-42.

33. Водопьянов, А.С. Использование ГИС-технологий на основе пространственного анализа для разработки методики риск-ориентированной оценки потенциальной опасности территорий по сибирской язве в Ростовской области / А.С. Водопьянов, С.Ю. Водяницкая, Ф.В. Логвин, В.В. Бата-шев, С.О. Водопьянов, И.П. Олейников, Л.В. Судьина // Медицинский вестник Юга России. - 2016. - № 3. - С.46-50.

34. Водопьянов А.С., Павлович Н.В., Водопьянов С.О., Мишанькин Б.Н. Свидетельство № 2006620302. Геоинформационная система «Туляремия». - 2006.

35. Водопьянов, С.О. Ретроспективный анализ культур Vibrio cholerae nonO1/non O139, выделенных от людей на территории Республики Узбекистан с 1987 по 1990гг., с помощью ГИС «Холера-Штаммы-VNTR» / С.О. Водопьянов, М.В. Полеева, Н.Р. Телесманич, А.С. Водопьянов, В.В. Агафонова // Медицинский вестник Юга России. - 2013. - №2 (12). - С.44-48.

36. Водопьянов, С.О. Разработка способа выявления гена tcpA холерного вибриона биотипа эльтор и сероварианта О139 Бенгал с помощью по-лимеразной цепной реакции / С.О. Водопьянов, Б.Н. Мишанькин, И.П. Олейников // Биотехнология. - 1999. - № 6. - С.19-23.

37. Водопьянов, С.О. Конструирование специфических праймеров для выявления гена toxR холерного вибриона / С.О. Водопьянов, И.В. Парамонов, И.Ю. Сучков // Биотехнология. - 2001. - № 5. - С.70-74.

38. Водяницкая С.Ю., Водопьянов А.С., Киреев Ю.Г., Водопьянов С.О. Свидетельство № 2015620562. Сибирская язва. Ростовская область. -2015.

39. Водяницкая, С.Ю. О совершенствовании эпидемиологического надзора за сибирской язвой в Ростовской области на основе новых компью-

терных технологий / С.Ю. Водяницкая, А.С. Водопьянов, Ю.Г. Киреев, С.О. Водопьянов, Л.В. Судьина, Ф.В. Логвин // Медицинский вестник Юга России. - 2016. - № 2. - С.42-46.

40. Водяницкая, С.Ю. ГИС-технологии в совершенствовании эпидемиологического надзора за сибирской язвой в Ростовской области / С.Ю. Водяницкая, Л.В. Судьина, Ф.В. Логвин, А.С. Водопьянов, Ю.Г. Киреев, В.В. Баташев // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2016. - Т. 21, № 3. -С.152-156.

41. Гаевская Н.Е., Македонова Л.Д. Использование бактериофагов в лабораторной диагностике холеры / Н.Е. Гаевская, Л.Д. Македонова // Клин. лаб. диагностика. - 2016. -№12, Т.61. - С.849-852.

42. Голубев, Б.П. ГИС «Распространение холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации в 2005-2008 гг.» / Б.П. Голубев, В.Д. Кругликов, Е.П. Авдеева, И.С. Шестиалтынова, С.В. Часовских, Е.В. Монахова, Л.М. Смоликова, Н.Н. Ускова, О.С. Чемисова, Т.А. Кудрякова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2010. - № 23. - С.35-40.

43. Голубев Б.П., Кругликов В.Д., Кудрякова Т.А., Часовских С.В., Монахова Е.В. Свидетельство № 2010620040 Распространение холерных вибрионов в объектах окружающей среды на территории Российской Федерации в 2005-2008 годах. - 2010.

44. Голубинский, Е.П. Закономерности циркуляции Vibrio cholerae на территории Сибири и Дальнего Востока и комплексная оценка их биологических свойств / Е.П. Голубинский, А.С. Марамович, Л.Я. Урбанович, В.И. Погорелов, Л.В. Миронова, С.В. Балахонов, В.С. Ганин // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2002. - №15. - С.21-24.

45. Горяев, А.А. Измененные варианты возбудителя холеры, выделенные на территории Российской Федерации / А.А. Горяев, С.П. Заднова,

А.В. Шубина, Я.М. Краснов, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инф. -2011. - № 1 (107). - С. 49-52.

46. Гриднева, Л.Г. Проведение профилактических и противоэпидемических мероприятий при выделении Vibrio cholerae El Tor О1серогруппы с генотипом ctxAB-tcpA+ на территории Хабаровского края в 2013 году / Л.Г. Гриднева, Ю.С. Мусатов, Т.В. Громова, Н.М. Пуховская, Н.Б. Белозерова, А.Г. Ковальский, Л.И. Иванов, Т.А. Зайцева, Т.Н. Каравянская, А.В. Попова, Г.Н. Петрова, И.В. Чишагорова, Е.Н. Присяжнюк // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2014. - № 24 (24). - С. 110-113.

47. Гриднева, Л.Г. Результаты мониторинга и биологические свойства холерных вибрионов, изолированных из объектов окружающей среды на территории Хабаровского края / Л.Г. Гриднева, Ю.С. Мусатов, Т.В. Громова,

H.М. Пуховская, Н.Б. Белозерова, О.М. Уткина, Л.И. Иванов, А.Г. Ковальский, Л.В. Миронова, Е.С. Куликалова, Ж.Ю. Хунхеева, С.В. Балахонов // Пробл. особо опасных инф. - 2014. - № 1. - С.121-124.

48. Дубянский, В.М. Концепция использования ГИС-технологий и дистанционного зондирования в эпиднадзоре за чумой / В.М. Дубянский // Врач и инфекционные технологии. - 2012. - № 2. - С.42-46.

49. Дубянский, В.М. Совершенствование эпидемиологического надзора за инфекционными болезнями с использованием геоинформационных систем / В.М. Дубянский, А.Н. Куличенко, О.В. Семенко, О.В. Малец-кая, В.М. Мезенцев // Журн. микробиол., эпидемиол., иммунол. - 2014. - №

I. - С.85-91.

50. Дугаржапова, З.Ф. Эпидемиологический надзор за сибирской язвой на территории строительства крупных промышленных объектов с использованием ГИС-технологий / З.Ф. Дугаржапова, А.В. Родзиковский, М.В. Чеснокова // Дальневосточный журнал инфекционной патологии. - 2010. - № 17. - С.216-219.

51. Ежова, М.И. Мониторинг водных объектов на наличие холерных вибрионов / М.И. Ежова, И.В. Архангельская, Л.В. Григоренко, И.С. Шести-

135

алтынова, А.Б. Мазрухо, Д.И. Каминский // Здравоохранение Российской Федерации. - 2011. - № 5. - С.40а.

52. Ежова, М.И. Результаты мониторинга наличия холерных вибрионов в поверхностных водоемах и стоках г. Ростова-на-Дону в 2010г. / М.И. Ежова, В.Д. Кругликов, Ю.М. Ломов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2011. - № 24. - С.58-61.

53. Ежова, М.И., Кругликов В.Д., Водопьянов А.С., Водопьянов С.О., Монахова Е.В. Свидетельство № 2012620979. Штаммы Vibrio cholerae. -2012.

54. Ерошенко, Г.А. Vibrio cholerae O139: генетика и молекулярные механизмы образования возбудителя холеры не О1 серогруппы / Г.А. Еро-шенко // Пробл. особо опасных инф. - 2006. - № 2 (92). - С.15-18.

55. Ерошенко, Г.А. Распространение генов системы секреции III типа у холерных вибрионов различных серогрупп / Г.А. Ерошенко, В.В. Кутырев,

A.В. Фадеева // Журн. микробиол., эпидемиол., иммунол. - 2008. - № 4. -С.23-27.

56. Ефременко, В.И. Вспышка холеры в Ставрополе в 1990 году /

B.И. Ефременко, В.Н. Беляев, В.Н. Никифоров, И.Н. Гнутов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 1992. - С.40-43.

57. Заднова, С.П. Сравнительный анализ выживаемости типичных штаммов и штаммов геновариантов Vibrio cholerae биовара Эль Тор in vitro и in vivo / С.П. Заднова, Т.А. Кульшань, Н.Б. Челдышова, А.А. Крицкий, Н.А. Плеханов, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инф. - 2015. - № 4. - С.65-69.

58. Заднова, С.П. Молекулярно-генетический анализ измененных вариантов Vibrio cholerae биовара Эль Тор, завезенных в Российскую Федерацию, и способ их обнаружения / С.П. Заднова, А.В. Шашкова, Н.И. Смирно-

ва, В.В. Кутырев // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2011. - № 24. - С.93-96.

59. Заднова, С.П. Фенотипический и генетический анализ измененных вариантов Vibrio cholerae биовара Эль Тор / С.П. Заднова, А.В. Шашко-ва, Я.М. Краснов, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инф. - 2012. - № 1 (111). - С.57-61.

60. Иванова, С.М. Информация о биологических свойствах холерных вибрионов О1 серогруппы, изолированных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2012 году / С.М. Иванова, Г.В. Титов, В.Е. Безсмертный, Б.Л. Мазрухо, Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, В.Д. Кругликов, Э.А. Москвитина, И.С. Шестиалтынова, И.В. Архангельская, Т.А. Кудрякова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2013. - № 26. - С.21-25.

61. Иванова, С.М. Информация о биологических свойствах холерных вибрионов О1серогруппы, изолированных из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2011 году / С.М. Иванова, Г.В. Титов,

B.Е. Безсмертный, Б.Л. Мазрухо, Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, В.Д. Круг-ликов, Э.А. Москвитина, И.В. Архангельская, И.С. Шестиалтынова, Л.В. Григоренко, М.И. Ежова, Т.А. Кудрякова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2012. - № 25. -

C.75-79.

62. Кирьякова, Л.С. Использование географических информационных технологий в эпидемиологической диагностике особо опасных инфекций / Л.С. Кирьякова, А.Б. Хайтович, И.С. Коваленко, А.И. Дулицкий // Пробл. особо опасных инф. - 2004. - №87. - С.24-28.

63. Контроль диагностических питательных сред по биологическим показателям для возбудителей чумы, холеры, сибирской язвы, туляремии, бруцеллеза, легионеллеза: Методические указания 3.3.2.2124-06. - М., 2006. -24 с.

64. Кругликов, В.Д. Генотипическая и фенотипическая характеристика штаммов холерных вибрионов, выделенных от людей и из объектов окружающей среды во время эпидосложнения по холере в Каменском районе Ростовской области в 2005 году / В.Д. Кругликов, Б.Л. Мазрухо, Е.П. Авдеева, Е.В. Монахова, И.С. Шестиалтынова, Н.К. Михась, В.В. Сухарь, Т.А. Кудрякова, Г.В. Качкина, А.Б. Мазрухо, Э.Г. Цедова, Д.И. Каминский // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2006. - № 19. - С.37-39.

65. Кругликов, В.Д. Изучение циркуляции холерных вибрионов в водоемах и стоках г. Ростова-на-Дону в период с 2008 по 2011гг. / В.Д. Кругликов, Н.Р. Телесманич, Ю.М. Ломов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2012. - № 25. - С.50-54.

66. Кузнецов, А.А. Перспективы ГИС - паспортизации природных очагов чумы Российской Федерации / А.А. Кузнецов, А.М. Поршаков, А.Н. Матросов // Пробл. особо опасных инф. - 2012. - № 111. - С.48-53.

67. Куликалова, Е.С. Обнаружение холерного вибриона в поверхностных водоёмах в связи с их загрязнением сточными водами / Е.С. Кулика-лова, А.С. Марамович, Л.Я. Урбанович // Матер. IX съезда Всеросс. науч.-практ. общ-ваэпидем., микробиол. и паразитол. - Москва, 2007. - Т. 3. - С. 55.

68. Куликалова, Е.С. Биопленка холерного вибриона: получение, характеристика и роль в резервации возбудителя в водной окружающей среде / Е.С. Куликалова, Л.Я. Урбанович, С.Г. Саппо, Л.В. Миронова, Е.Ю. Марков,

B.В. Мальник, В.М. Корзун, С.К. Миткеева, С.В. Балахонов // Журн. мико-биол., эпидемиол., иммунол. - 2015. - № 1. - С.3-11.

69. Куликалова, Е.С. К вопросу о положении холеры в систематике инфекционных болезней / Е.С. Куликалова, Л.Я. Урбанович, Л.В. Миронова,

C.В. Балахонов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2015. - № 28. - С.56-60.

70. Кульшань, Т.А. Анализ молекулярно-генетических особенностей штаммов Vibrio cholerae классического и Эль Тор биоваров: Автореф. Дисс. ... канд. мед. наук: 03.02.03 / Кульшань Татьяна Алексеевна. - Саратов, 2013. - 12 с.

71. Кульшань, Т.А. Генетическое разнообразие клинических штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор, выделенных на территории Российской Федерации / Т.А. Кульшань // Современные технологии обеспечения биологической безопасности III научно-практическая школа-конференция молодых ученых и специалистов: материалы конференции. Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, ФБУН Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии. - Оболенск, 2011. - С.104-106.

72. Кульшань, Т.А. Особенности геномов штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор с разной эпидемической значимостью / Т.А. Кульшань, Д.А. Агафонов, Е.Ю. Баранихина, Я.М. Краснов, Н.И. Смирнова // Современные проблемы эпидемиологии и гигиены. Матер. VII Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребна-дзора. - 2015. - С.150-151.

73. Кульшань, Т.А. Потенциально эпидемически опасные штаммы холерного вибриона: механизм возникновения и структура генома / Т.А. Кульшань, Е.Ю. Баранихина, Д.А. Агафонов, Я.М. Краснов, Н.И. Смирнова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2015. - С.113-116.

74. Кульшань, Т.А. Оценка функциональных особенностей и стрес-соустойчивости изогенных токсигенных и нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор / Т.А. Кульшань, С.П. Заднова, Н.Б. Челдышова, Н.И. Смирнова // Журн. микобиол., эпидемиол., иммунол. - 2015. - № 3. -С.11-17.

75. Кульшань, Т.А. Генетические изменения вирулентных штаммов холерных вибрионов биовара Эль Тор при их обитании в водной среде / Т.А.

Кульшань, А.В. Топорков, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инф. -2006. - № 1 (91). - С.41-44.

76. Кульшань, Т.А. Сравнительный анализ участков генома, связанных с вирулентностью, у природных штаммов Vibrio cholerae классического и Эль Тор-биоваров / Т.А. Кульшань, Н.Б. Челдышова, Н.П. Гусева, Н.И. Смирнова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - № 2. - С.26-33.

77. Кутырев, В.В. Противочумная система Российской Федерации в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия / В.В. Кутырев // Здравоохранение РФ. - 2013. - № 2. - C 24-28.

78. Кюрегян, А.А. Характеристика культур холерных вибрионов О1 и О139, изолированных от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2001 году / А.А. Кюрегян, С.М. Иванова, Б.Л. Мазрухо, Л.М. Смоликова, Т.А. Кудрякова, Г.В. Титов, И.С. Шестиалтынова, С.О. Водопьянов, Л.С. Подосинникова, В.В. Лобанов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2002. -№ 15. - С.34-39.

79. Кюрегян, А.А. Характеристика культур холерных вибрионов О1, изолированных от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 2000 году / А.А. Кюрегян, С.М. Иванова, Б.Л. Мазрухо, Л.М. Смоликова, Т.А. Кудрякова, Г.В. Титов, И.С. Шестиалтынова, Е.В. Монахова, Л.С. Подосинникова, В.В. Лобанов // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2001. -№ 14. - С.26-30.

80. Кюрегян, А.А. Характеристика культур холерных вибрионов О1, выделенных от людей и из объектов окружающей среды на территории Российской Федерации в 1999 году / А.А. Кюрегян, С.М. Иванова, Г.В. Титов, Л.С. Подосинникова, Б.Л Мазрухо., Т.А. Кудрякова, Е.В. Монахова, Л.М. Смоликова, И.С. Шестиалтынова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2000. - № 13. - С.23-27.

140

81. Лабораторная диагностика холеры: Методические указания 4.2.2218-07. - М., 2007. - 87 с.

82. Ломов, Ю.М. Свойства штаммов холерных вибрионов, выделенных в Азии и их связь со штаммами, циркулирующими на других континентах в период седьмой пандемии холеры / Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, И.Т. Андрусенко, Э.А. Москвитина, О.А. Арешина // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2012. - № 1. - С.39-45.

83. Ломов, Ю.М. Мониторинг вибриофлоры водных объектов окружающей среды в системе эпиднадзора за холерой / Ю.М. Ломов, Н.Р. Телесманич, В.Д. Кругликов, Е.П. Авдеева, М.И. Ежова, И.С. Шестиалтынова, О.А. Шалу, Н.Б. Непомнящая, И.В. Архангельская // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. - № 5. - С.24-28.

84. Лухнова, Л.Ю. Использование ГИС технологий для составления базы данных очагов сибирской язвы в Казахстане / Л.Ю. Лухнова, А.М. Ай-кимбаев, В.П. Садовская, С.К. Позылов, Т.В. Мека-Мечеченко, Л.Е. Некрасова, А.Б. Сармантаева // Дезинфекция. Антисептика. - 2011. - № 6. - С.42-49.

85. Мазрухо, А.Б. Мероприятия по предотвращению заноса холеры на территорию Ростовской области и другие субъекты Российской Федерации в связи с осложнением эпидемиологической обстановки на Украине в 2011 году / А.Б. Мазрухо, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, В.И. Промет-ной, И.Я. Черепахина, С.Ю. Водяницкая // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2012. - № 25. - С.31-39.

86. Мазрухо, А.Б. Деятельность Ростовского-на-Дону научно-исследовательского противочумного института в 2011 году как ведущего по проблеме «Холера и патогенные для человека вибрионы» / А.Б. Мазрухо, Н.Р. Телесманич, Ю.М. Ломов, В.В. Кучин, Е.И. Марковская, И.А. Молдаван, В.Д. Кругликов, Э.А. Москвитина, С.Ю. Водяницкая, В.И. Прометной, О.С. Чемисова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2012. - № 25. - С.9-16.

87. Мазрухо, Б.Л. Микробиологические аспекты мониторинга за наличием холерных вибрионов в объектах окружающей среды г. Ростова-на-Дону / Б.Л. Мазрухо, В.Д. Кругликов, Е.В. Монахова, Н.К. Михась, И.С. Ше-стиалтынова, Е.П. Авдеева, Е.В. Ишина, А.Б. Мазрухо, В.В. Лобанов, Т.А. Кудрякова, Д.И. Каминский, Э.Г. Цедова, Н.Б. Непомнящая // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2005. - № 18. - С.22-25.

88. Мединский, Г.М. / Справочник-кадастр распространения вибрионов Эль-Тор в поверхностных водоемах и сточных водах на территории СССР во время 7-й пандемии холеры // Мединский Г.М., Наркевич М.И., Ломов Ю.М., Пинигн А.Ф., Голубев Б.П., Алексеенко В.В., Левчишина Г.И., Кюрегян А.А. - Ростов-на-Дону, 1991. - 172 с.

89. Мельникова, О.В. Применение ГИС - технологий для анализа заболеваемости трансмиссивными клещевыми инфекциями (на примере города Иркутска) / О.В. Мельникова, С.И. Лесных, Е.И. Андаев // ЗНиСО. - 2014. -№ 12. - С.43-45.

90. Методические указания 1.3.2569-09 «Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности».

91. Методические указания по применению прямого фаготипирова-ния возбудителя холеры Эль Тор.- Сост.: Дрожевкина М.С., Арутюнов Ю.И. 1983. - 10с.

92. Миронова Л.В. Свидетельство № 2012620754. Vibrio cholerae eltor. Сибирь и Дальний Восток. - 2012.

93. Миронова Л.В. Свидетельство № 2015620466. Географическая информационная система Vibrio cholerae О1 и О139, г. Иркутск. - 2015.

94. Мишанькин, Б.Н. Мультилокусное VNTR-типирование культур вибрионов, выделенных в Казани во время вспышки холеры летом 2001 года / Б.Н. Мишанькин, А.С. Водопьянов, Ю.М. Ломов // Журн. микробиол., эпи-демиол., иммунол. - 2003. - № 6. - С.11.

95. Мишанькин, Б.Н. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов вибрионов, выделенных в г. Казани во время вспышки холеры летом 2001 года / Б.Н. Мишанькин, С.О. Водопьянов, А.С. Водопьянов, И.В. Рыжко, Л.В. Романова, Е.К. Гончаров, И.Ю. Сучков, И.Я. Черепахина, О.В. Дуванова, М.В. Шишияну, Р.И. Цураева, А.Г. Шутько, Н.А. Дудина, И.А. Молдаван // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. Российской научной конференции. - Ростов-на-Дону, 2002. - № 15. - С.39-41.

96. Монахова, Е.В. Клонирование гена цитотонического фактора Cef (CHO-cell elongating factor) Vibrio cholerae в Escherichia coli и его экспрессия под контролем PBAD-промотора / Е.В. Монахова, Ю.М.Ломов, Р.В. Писанов // Биотехнология. - 2006. - № 5. - С.12-18.

97. Монахова, Е.В. Стратегия вирулентности холерных вибрионов и пути ее реализации / Е.В. Монахова // Пробл. особо опасных инф. - 2013. - № 4. - С.60-68.

98. Монахова, Е.В. Факторы патогенности нехолерогенных штаммов холерных вибрионов: Автореф. Дисс. ... докт. биол. наук по специальности: 03.00.07 / Монахова Елена Владимировна. - Ростов-на-Дону, 2012. - 46 с.

99. Монахова, Е.В. Структура и изменчивость неполного СТХ-элемента холерных вибрионов / Е.В. Монахова, Ю.М. Ломов, Н.К. Михась // Пробл. особо опасных инф. - 2007. - № 1 (93). - С.58-61.

100. Монахова, Е.В. Токсины холерных вибрионов / Е.В. Монахова, Р.В. Писанов // Молекулярная генетика. - 2005. - № 1. - С.7-18.

101. Морозова, Л.Ф. Применение географических информационных систем в Здравоохранении / Л.Ф. Морозова // Медициская паразитология и паразитарные болезни. - 2014. - № 37. - С.46-50.

102. Москвитина, Э.А. Эпидемиологическая обстановка по холере в мире в 2013 г. Прогноз на 2014 г. / Э.А. Москвитина, О.Л. Адаменко, И.В. Дворцова, В.Д. Кругликов, С.М. Иванова, Д.А. Козина // Пробл. особо опасных инф. - 2014. - № 2. - С.19-26.

103. Москвитина, Э.А. Холера: эпидемиологическая обстановка в мире в 2005-2014 г. Прогноз на 2015 г. / Э.А. Москвитина, О.Л. Адаменко, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, С.М. Иванова, Г.Б. Анисимова // Пробл. особо опасных инф. - 2015. - № 1. - С.18-25.

104. Москвитина Э.А., Анисимова Г.Б., Беспалов И.А. Свидетельство № 2003620048. Холера Эль Тор. Эпидемиологический анализ заболеваемости в СНГ. - 2003.

105. Москвитина, Э.А. Эпидемиология холеры, эпиднадзор и экология холерных вибрионов / Э.А. Москвитина, Ю.М. Ломов, А.И. Беспалов, А.В. Горобец, В.И. Прометной, Л.С. Подосинникова, Б.Л. Мазрухо, А.А Кюрегян, С.А. Иванова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2002. - № 15. - С.11-14.

106. Москвитина, Э.А. Заносы холеры в Россию (1998-2007) / Э.А. Москвитина, Ю.М. Ломов, В.И. Прометной // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2008. - № 21. -С.16-18.

107. Москвитина, Э.А. Эпидемиологические особенности холеры на современном этапе седьмой пандемии / Э.А. Москвитина, А.Б. Мазрухо, О.А. Арешина, О.Л. Адаменко, А.А. Назаретян, Г.Б. Анисимова // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2014. - Т. 19, № 4. - С.44-49.

108. Москвитина, Э.А. Холера в начале XXI века. Прогноз на глобальном уровне / Э.А. Москвитина, А.Б. Мазрухо, О.Л. Адаменко, В.Д. Круг-ликов // Пробл. особо опасных инф. - 2012. - № 1 (111). - С. 11-16.

109. Москвитина, Э.А. Характеристика эпидемиологической обстановки по холере в мире (2003-2012 гг.) и прогноз на 2013 г. / Э.А. Москвитина, А.Б. Мазрухо, О.Л. Адаменко, О.А. Арешина, А.А. Назаретян, В.Д. Круг-ликов, С.М. Иванова, Д.А. Козина // Пробл. особо опасных инф. - 2013. - № 1. - С.11-17.

110. Ниязбеков, Н.Ш. Регрессивный анализ и ГИС-методы при оценке эпизоотической активности природных очагов чумы Казахстана / Н.Ш. Ния-

144

збеков, З.Ж. Абделиев, З.А. Сагиев, А.М. Матжанова, А. Абдразакова, Б. Ай-сауытов, М. Балибаев, С. Токсанбаева, Б.К. Аймаханов, К.У. Акмамбетова // Бюллетень Вост.-Сиб. науч. центра Сиб-го отд-я РАМН. - 2014. - № 2 (96). -С.77-82.

111. Об итогах надзора за холерой в эпидсезон 2011 года // Информационное письмо Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Роспотребнадзора) от 15.12.2011г.

112. Онищенко, Г.Г. Холера в Дагестане: прошлое и настоящее / Г.Г. Онищенко, Е.Н. Беляева, Э.А. Москвитина, В.И. Резайкин, Ю.М. Ломов, Г.М. Мединский // Ростов-на-Дону, 1995. - с. 120.

113. Онищенко, Г.Г. О мерах по совершенствованию эпидемиологического надзора в части индикации возбудителей инфекционных заболеваний / Онищенко Г.Г., Ежлова Е.Б., Демина Ю.В., Мельникова А.А. // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2013. - № 2. - С. 413.

114. Онищенко, Г.Г. Холера, обусловленная Vibrio cholerae O1 ctxAB-tcpA+ / Г.Г. Онищенко, Ю.М. Ломов, Э.А. Москвитина, Л.С. Подосинникова, С.Ю. Водяницкая, В.И. Прометной, Е.В. Монахова, C.O. Водопьянов, Н.Р. Телесманич, Н.А. Дудина // Журн. микробиол., эпидемиол., иммунолог. -2007. - № 1. - С.23-29.

115. Онищенко, Г.Г. Эпидемиологический надзор за холерой в России в период седьмой пандемии / Г.Г. Онищенко, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругли-ков, С.В. Титова, О.Л. Адаменко, А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов // Вестник РАМН. - 2015. - Т. 70, № 2. - С.249-256.

116. Онищенко, Г.Г. Эпидемиологический надзор за холерой в России в период седьмой пандемии: от общей тактики до дифференцированного объема мероприятий с учетом районирования страны по типам эпидемических проявлений холеры (сообщение I) / Г.Г. Онищенко, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов // ЗНиСО. - 2015. - № 9 (270). - С.43-47.

117. Онищенко, Г.Г. Совершенствование эпидемиологического надзора за холерой в России в период седьмой пандемии (сообщение II) / Г.Г. Онищенко, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов // ЗНиСО. - 2015. - №10 (271). - С.47-51.

118. Онищенко, Г.Г. Современные аспекты эпидемиологического надзора за холерой в России в период седьмой пандемии и основные направления его дальнейшего совершенствования (сообщение III) / Г.Г. Онищенко, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, О.Л. Адаменко // ЗНиСО. -2015. - № 11 (272). - С.35-37.

119. Онищенко, Г.Г. Эпидемиологический надзор за холерой в России в период седьмой пандемии / Г.Г. Онищенко, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, С.В. Титова, О.Л. Адаменко, А.С. Водопьянов, С.О. Водопьянов // Вестник РАМН. - 2015. - № 2. - С.207-214.

120. Онищенко, Г.Г. Актуальные проблемы эпидемиологического надзора, лабораторной диагностики и профилактики холеры в Российской Федерации / Г.Г. Онищенко, А.Ю. Попова, В.В. Кутырев, Н.И. Смирнова, С.А. Щербакова, Э.А. Москвитина, С.В. Титова // Журн. миробиол., эпиде-миол., иммунол. - 2016. - № 1. - С.89-101.

121. Осина, Н.А. Результаты мониторинга холерных вибрионов в водных экосистемах на территории Республики Калмыкия / Н.А. Осина, Т.Б. Каляева, Т.В. Бугоркова, И.А. Касьян, Н.Ф. Оброткина // ЗНиСО. - 2013. - № 2 (239). - С.28-30.

122. Осин, А.В. Фенотипический и генетический анализ вирулентных и авирулентных штаммов Vibrio cholerae O139: Автореф. Дисс. ... канд. биол. наук по специальности: 03.00.07, 03.00.15 / Осин Александр Владимирович. -Саратов, 2002. - 22 с.

123. Писанов, Р.В. Особенности структуры генома токсигенного штамма Vibrio cholerae El Tor Инаба, выделенного в 2014 г. из открытого водоема в Ростове-на-Дону / Р.В. Писанов, М.И. Ежова, Е.В. Монахова, А.В. Черкасов, Я.М. Краснов, А.С. Водопьянов, Т.А. Кульшань, Л.Ф. Ливанова,

С.А. Портенко, А.С. Абдрашитова, В.Д. Кругликов, С.В. Титова // Пробл. особо опасных инф. - 2015. - №2. - С.63-67.

124. Поршаков, А.М. ГИС-картографирование и паспортизация природных очагов чумы Российской Федерации / А.М. Поршаков, А.А. Кузнецов // Инфекция и иммунитет. - 2012. - №1-2. - С.183.

125. Поршаков, А.М. Совершенствование эпизоотологического мониторинга природных очагов чумы в режиме ГИС-паспортизации / А.М. Поршаков, А.А. Кузнецов, А.Н. Матросов, В.А. Сафронов, А.С. Раздорский, Т.В. Князева // Мат. XII Межгос. науч.-пр. конф. - Москва, 2014. - С.163-165.

126. Порядок организации и проведения лабораторной диагностики холеры для лабораторий территориального, регионального и федерального уровней: Методические указания 4.2.2870-11. - М., 2011. - 83 с.

127. Приказ № 88 от 17 марта 2008 г. «О мерах по совершенствованию мониторинга за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней». -М. - 40 с.

128. Савельева, В.Н. Эволюция возбудителя и клинико-эпидемиологические особенности современной холеры Эль-Тор / В.Н. Савельев, И.В. Савельева, Б.В. Бабенышев, А.Н. Куличенко // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2012. - №5. - С.31-35.

129. Савельев, С.И. Внедрение Геоинформационных технологий в систему эпидемиологического надзора за холерой / С.И. Савельев, И.А. Щукин, И.А. Ходякова // Современные технологии в совершенствовании мер предупреждения действий на черезвычайные ситуации. - 2012. - С.203-205.

130. Савилов, Е.Д. Эпидемиологический анализ: Методы статистической обработки материала / Е.Д. Савилов, В.А. Астафьев, С.Н. Жданова, Е.А. Заруднев // Новосибирск: Наука-Центр. - 2011. - 156 с.

131. Сагымбек, У.А. Эпидемическая и неэпидемическая холера на территории Республики Казахстан / У.А. Сагымбек, Р.С. Мусагалиева, А.К. Касенова, Р.А. Сеитова //Окружающая среда и здоровье населения. Алматы. - 2012. - № 2. - С.28-32.

132. Санитарные правила СП 3.1.1.2521-09 «Лабораторная диагностика опасных инфекционных болезней» под редакцией Г.Г.Онищенко, В.В. Ку-тырева (2013).

133. Смирнова, Н.И. Генетическая характеристика клинических штаммов Vibrio cholerae, завезенных на территорию Российской Федерации в современный период / Н.И. Смирнова, А.А. Горяев, С.П. Заднова // Микробиология. - 2010. - № 3. - С.3-10.

134. Смирнова, Н.И. Вариабельность генома измененных вариантов Vibrio cholerae биовара Эль Тор, изолированных на территории России в современный период / Н.И. Смирнова, С.П. Заднова, А.В. Шашкова, В.В. Ку-тырев // Мол. генет., микробиол. и вирусол. - 2011. - № 3. - С.11-18.

135. Смирнова, Н.И. Вариабельность генома штаммов Vibrio cholerae биовара Эль-Тор / Н.И. Смирнова, Е.А. Костромитина, А.В. Осин, В.В. Ку-тырев // Вестник РАМН. - 2005. - № 7. - С.19-26.

136. Смирнова, Н.И. MLVA-типирование клинических штаммов Vibrio cholerae, изолированных в разные периоды текущей пандемии холеры / Н.И. Смирнова, Т.А. Кульшань, Я.М. Краснов // Мол. генет., микробиол. и вирусол. - 2015. - Т. 33, № 1. - С.15-22.

137. Смирнова, Н.И. Структурные и функциональные изменения генома возбудителя холеры в водной среде / Н.И. Смирнова, Т.А. Кульшань, Н.Б. Челдышова, А.В. Осин // Эпидемиология и инфекционные болезни. -2007. - №5. - С.22-28.

138. Смирнова, Н.И. Эволюция генома Vibrio cholerae: пути формирования атипичных штаммов / Н.И. Смирнова, Н.Б. Челдышова, А.А. Горяев, Ю.В. Лозовский, В.В. Кутырев // Пробл. особо опасных инф. - 2008. - № 97. - С. 5-11.

139. Соловьев, М.Ю. Взаимодействие Управления Роспотребнадзора по Ростовской области с ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора по эпидемиологическому надзору за холерой в 2015 году / М.Ю. Соловьев, Е.В. Ковалев, С.С. Слись, С.А. Ненадская, А.В. Кон-

148

ченко, Н.В. Леоненко, С.В. Титова, Э.А. Москвитина, В.Д. Кругликов, А.В. Самородова, Н.Л. Пичурина // Холера и патогенные для человека вибрионы. Матер. Российской научной конференции. - Ростов-на-Дону, 2016. - № 29. -С.34-37.

140. Телесманич, Н.Р. Применение МАСС-спектрометрического метода MALDI-TOF для межвидовой дифференциации близкородственных вибрионов / Н.Р.Телесманич, С.О. Чайка, С.Ю. Водяницкая, О.С. Чемисова, И.А. Чайка // Клин. лаб. диагностика. - 2014. - Т.59, №8. - С.27-38.

141. Титова, С.В. Анализ динамики выделения и биологических свойств штаммов V. сИо!егав О1 Е1Тог, изолированных из водных объектов на территории Ростовской области в 2003-2014 гг. / С.В. Титова, В.Д. Круг-ликов, М.И. Ежова // ЗНиСО. - 2015. - № 2. - С.39-41.

142. Титова С.В. Деятельность ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора как референс-центра по мониторингу холеры в Российской Федерации / С.В. Титова, В.Д. Кругликов, Э.А. Москвитина, И.В. Архангельская, М.И. Ежова, Д.А. Зубкова, А.Б. Мазрухо, Н.Л. Пичурина // Холера и патогенные для человека вибрионы. Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2015. - № 28. - С.22-26.

143. Титова, С.В. Деятельность Ростовского-на-Дону противочумного института как референс-центра по мониторингу холеры на территории России / С.В. Титова, В.Д. Кругликов, Э.А. Москвитина, Д.А. Левченко, И.В. Архангельская, М.И. Ежова, А.Б. Мазрухо, А.В. Самородова, Н.Л. Пичурина, М.Ю. Соловьёв, Е.В. Ковалёв, С.А. Ненадская, Н.В. Леоненко, С.С. Слись, А.В. Конченко, Ю.В. Рыжков // Холера и патогенные для человека вибрионы. Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2016. - № 29. - С.25-29.

144. Титова, С.В. Влияние условий культивирования на сроки перси-стенции и некоторые свойства холерных вибрионов / С.В. Титова, Е.А. Меньшикова, Е.М. Курбатова, Л.К. Лысова, И.В. Архангельская, О.В. Дува-нова, А.В. Миронова, А.В. Самородова, Э.А. Москвитина // Пробл. особо опасных инф. - 2016. - № 3. - С.76-80.

149

145. Титова, С.В. Природные популяции холерных вибрионов как резервуар генов факторов патогенности / С.В. Титова, Е.В. Монахова, И.В. Архангельская, Р.В. Писанов, Н.Б. Непомнящая // ЗНиСО. - 2016. - № 5. - С.45-47.

146. Титова, С.В. Холера: оценка эпидемиологичской обстановки в мире и России в 2006-2015 гг. прогноз на 2016 год / С.В. Титова, Э.А. Моск-витина, В.Д. Кругликов, А.В. Самородова, Е.Г. Тюленева, Е.В. Монахова, Р.В. Писанов, А.С. Водопьянов, И.В. Архангельская, С.М. Иванова, Т.В. Ковалева, С.О. Водопьянов // Пробл. особо опасных инф. - 2016. - № 1. - С.20-27.

147. Титова, С.В. О потенциальной опасности нетоксигенных штаммов холерных вибрионов, содержащих гены токсин-корегулируемых пилей адгезии / С.В. Титова, Е.В. Монахова // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. - 2016. - № 5. - С.65-72.

148. Титова, С.В. Роль биопленок холерных вибрионов в сохранении возбудителя в окружающей среде / С.В. Титова, Н.А. Селянская Л.М., Вер-кина, Е.А. Меньшикова, Е.М. Курбатова, Л.А. Егиазарян, Л.К. Лысова, И.В. Архангельская // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2016. - № 29. - С.65-67.

149. Указ президента России В.В. Путина от 13 мая 2000г. № 849 «О полномочном представителе Президента Российской Федерации в федеральном округе».

150. Указ президента Д.А. Медведева от 19 января 2010 года № 82 «О внесении изменений в перечень федеральных округов, утвержденный Указом Президента Российской Федерации от 13 мая 2000 г. № 849».

151. Указ Президента РФ В.В. Путина от 21 марта 2014 г. № 168 «Об образовании Крымского федерального округа».

152. Фазылов, В.Х. Клинико-эпидемиологическая характеристика вспышки холеры в Казани / В.Х. Фазылов, Д. Баширова, Л.М. Малышева,

B.Б. Зиатдинов, Д.Ф. Нестерова, А.А. Малова, Г.А. Таирова // Казанский медицинский журнал. - 2003. - Т. 84, № 2. - С.150-151.

153. Челдышова, Н.Б. Генетическое разнообразие природных штаммов возбудителя холеры, выделенных на территории России и зарубежных стран / Н.Б. Челдышова, Т.А. Кульшань, С.П. Заднова, Н.И. Смирнова // Инфекция и иммунитет. - 2013. - Т. 3, № 2. - С.185.

154. Чемисова О.С. Изучение поверхностных полисахаридных антигенов штаммов Vibrio cholerae О139 различного происхождения с использованием моноклональных антител: Дисс. ... канд. биол. наук по специальности: 03.00.07 / Чемисова Ольга Сергеевна. - Ростов-на-Дону, 2007. - 149 с.

155. Четина, Е.В. О возможном механизме эндемичности современной холеры (роль некультивируемых форм Vibrio cholerae O1 / Е.В. Четина, Г.М. Грижебовский, А.Ф. Брюханов // Мол. генетика, микробиол. и вирусол. -1993. - № 6. - С.18-22.

156. Шашкова, А.В. Молекулярно-генетический анализ и изучение генетического родства измененных вариантов холерного вибриона биовара Эль Тор, выделенных в Российской Федерации / А.В. Шашкова, Т.А. Кульшань,

C.П. Заднова, Н.И. Смирнова // Инфекция и иммунитет. - 2012. - Т. 2, № 1-2. - С.344-345.

157. Щелканова, Е.Ю. Изучение возможности генетического обмена между штаммами Vibrio cholerae O139, выделенных из различных источников / Е.Ю. Щелканова, А.В. Осин, Г.А. Ерошенко, Н.И. Смирнова // Холера и патогенные для человека вибрионы: Матер. пробл. комиссии. - Ростов-на-Дону, 2002. - № 15. - С.75-76.

158. Monakhova, E.V. Phenotypic and molecular characteristics of epidemic and non-epidemic Vibrio cholerae strains isolated in Russia and certain countries of Commonwealth of Independent States (CIS) // Epidemiological and Molecular Aspects on Cholera. - Springer Science+Business Media. - 2010. -Ch.4. - P.51-78.

159. Ahmed, S. The 2008 cholera epidemic in Zimbabwe: experience of the ICDDR,B team in the field / S. Ahmed, P.K. Bardhan, A. Iqbal, R.N. Ma-zumder, A.I. Khan, M.S. Islam, A.K. Siddique, A. Cravioto //J. Health Popul. Nutr.

- 2011. - Vol.29, N5. - P.541-546.

160. Ali, A. Jr. Recent clonal origin of cholera in Haiti / A. Ali, Y. Chen, J.A. Johnson, E. Redden, Y. Mayette, M.H. Rashid, O.C. Stine, J.G. Morris // Emerg. Infect. Dis. - 2011. - Vol.17, N4. - P.699-701.

161. Ali, M. The global burden of cholera. Bulletin / M. Ali, A. L. Lopez, Y.A. Ybu // WHO. - 2012. - N90. - P.209-218.

162. Boyd, E.F. Molecular analysis of a putative CTX9 precursor and evidence for independent acquisition of distinct CTX^s by toxigenic Vibrio cholerae / E.F. Boyd, A.J. Heilpern, M.K. Waldor // J.Bacteriol. - 2000. - Vol.182, N19. -P.5530-5538.

163. Bubshait, S.A. Seasonal, non-toxigenic Vibrio cholerae O1 Ogawa infections in the Eastern Region of Saudi Arabia / S.A. Bubshait, K. Al-Turki, M.H. Quadri, R.E. Fontaine, D. Cameron // Int. J. Infect. Dis. - 2000. - N4(4). - P.198-202.

164. Ceccarelli, D. Origin of Vibrio cholerae in Haiti / D. Ceccarelli, M. Spagnoletti, P. Cappuccinelli, V. Burrus, M.M. Colombo // Lancet Infect. Dis. -2011. - Vol.11, N4. - P.262.

165. Ceccarelli, D. New Vibrio cholerae atypical El Tor variant emerged during the 2006 epidemic outbreak in Angola / D. Ceccarelli, M. Spagnoletti, D. Bacciu, P. Cappuccinelli, M.M. Colombo // BMC Microbiol. - 2011. - P.11:130.

166. Chow, K.H. Detection of RTX toxin in Vibrio cholerae by PCR / K.H. Chow, N.K. Ng, K.Y. Yuen, W.C. Yam // J.Clin.Microbiol. - 2001. - Vol.39, N7.

- P.2594-2597.

167. Dzeijman, M. Genomic characterization of non-O1, non-O139 Vibrio cholerae reveals genes for a type III secretion system / M. Dzeijman, D. Serruto, V.C. Tam // Proc.Natl.Acad.Sci. - 2005. - Vol.102, N9. - P.3465-3470.

168. Faruque, S.M. Epidemiology, genetics, and ecology of toxigenic Vibrio cholerae / S.M. Faruque, M.J. Albert, J.J. Mekalanos // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 1998. - N62(4). - P.1301-14.

169. Faruque, S.M. RS1 element of Vibrio cholerae can propagate horizontally as a filamentous phage exploiting the morphogenesis genes of CTXD / S.M. Faruque, Asadulghani, M. Kamruzzaman // Infect.Immun. - 2002. - Vol.70, N1. -P.163-170.

170. Faruque, S.M. Induction of the lysigenic phage encoding cholera toxin in naturally occurring toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139 / S.M. Faruque, Asadulghani, A.R.M.A. Alim // Infect.Immun. - 1998. - Vol.66, N8. - P.3752-3757

171. Faruque, S.M. Analysis of clinical and environmental strains of nontoxigenic Vibrio cholerae for susceptibility to CTX9: molecular basis for origination of new strains with epidemic potential / S.M. Faruque, Asadulghani, M.N. Saha, A.R. Alim, M.J. Albert, K.M. Islam, J.J. Mekalanos // Infect. Immun. -1998. - N66. - P.5819-5825.

172. Faruque, S.M., Molecular ecology of toxigenic Vibrio cholerae / S.M. Faruque, G.B. Nair // Microbiol. Immunol. - 2002. - Vol.46 - P.59-66.

173. Fullner Satchell, K.J. MARTX, multifunctional autoprocessing re-peats-in-toxin toxins / K.J. Fullner Satchell // Infect. Immun. - 2007. - Vol.75, N11. - P.5079-5084.

174. Hayashi, S. Soft-agar-coated filter method for early detection of viable and thermostable direct hemolysin (TDH)- or TDH-related hemolysin-producing Vibrio parahaemolyticus in seafood / S. Hayashi, M. Okura, R. Osawa // App. Environ. Microbiol. - 2006. - Vol.72, N7. - P.4576-4582.

175. Heilpern, A.J. CTX$ infection of Vibrio cholerae requires tolQRA gene products / A.J. Heilpern, M.K. Waldor // J. Bacteriol. - 2000. - Vol.182, N6. - P.1739-1747.

176. Hoshino, K. Development and evaluation of a multiplex PCR assay for rapid detection of toxigenic Vibrio cholerae O1 and O139 / K. Hoshino, S.

153

Yamasaki, A.K.Mukhopadhyay, S. Chakraborty, A.Basu, S.K. Bhattacharya, G.B. Nair, T. Shimada, Y.Takeda // FEMS Immunol. Med. Microbiol. - 1998. - Vol.20. - P.201-207.

177. Hunter, P.R. Numerical index of the discriminatory ability of typing systems: an application of Simpson's index of diversity / P.R. Hunter, M.A. Gaston // J. Clin. Microbiol. - 1988. - Vol.26, №11. - P.2465-2466.

178. Jermyn W.S. Characterization of a novel Vibriopathogenicity island (VPI-2) encoding neuraminidase (nanH) among toxigenic Vibrio cholerae isolates / W.S. Jermyn, E.F. Boyd // Microbiology. - 2002. - Vol.148. - P.3681-3693.

179. Karaolis, D.K.R. A Vibrio cholerae pathogenicity island associated with epidemic and endemic strains / D.K.R. Karaolis, J.A. Johnson, C.C. Bailey // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1998. - Vol.95. - P.3134-3139.

180. Keasler, S.P. Detecting and biotypingVibrio cholera O1 with multiplex polymerase chain reaction / S.P. Keasler, R.H. Hall // Lancet. - 1993. -Vol.341. - P.1661.

181. Kumar, P. A large cholera outbreak due to a new cholera toxin variant of the Vibrio cholerae O1 El Tor biotype in Orissa, Eastern India / P. Kumar, M. Jain, A.K. Goel // J. Med. Microbiol. - 2009. - Vol.58. - P.234-238.

182. Kumar, P. Characterization of novel alleles of toxin co-regulated pilus A gene (tcpA) from environmental isolates of Vibrio cholerae / P. Kumar, A. Thu-laseedharan, G. Chowdhury, T. Ramamurthy, S. Thomas //Curr. Microbiol. -2011. - Vol.62, N3. - P.758-763.

183. Labrie, S.J. Bacteriophage resistance mechanisms / S.J. Labrie, J. Samson, S. Moineau // Nat Rev Microbiol.- 2010. - Vol.8, N5. - P.317-27.

184. Li, X.J. Design and implementation of Geographical Information System on prevention and control of cholera / X.J. Li, L.Q. Fang, D.C. Wang, L.X. Wang, Y.P. Li, Y.L. Li, H. Yang, B. Kan, W.C. Cao // Zhonghua Liu Xing Bin XueZaZhi. - 2012. - Vol.33, N4. - P.431-434.

185. Lin, W. Identification of a Vibrio cholerae RTX toxin gene cluster that is tightly linked to the cholera toxin prophage / W. Lin, K.J. Fullner, R. Clayton // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1999. - Vol.96, N2. - P.1071-1076.

186. Lizarraga-Partida, M.L. Molecular analyses of Vibrio cholerae O1 clinical strains, including new nontoxigenic variants isolated in Mexico during the cholera epidemic years between 1991 and 2000 / M.L. Lizarraga-Partida, M.-L. Quilici // J. Clin. Microbiol. - 2009. - N47(5). - P.1364-1371.

187. McCardell, B.A. Purification and characterization of a CHO cell-elongating toxin produced by Aeromonashydrophila / B.A. McCardell, J.M. Madden, M.H. Kothary, V. Sathyamoorthy // Microb.Pathogen. - 1995. - Vol.19, N1. -P.1-9.

188. McCardell, B.A. Cloning, expression and characterization of the CHO cell elongating factor (Cef) from Vibrio cholerae O1 / B.A. McCardell, V. Sathyamoorthy, J. Michalski // Microb.Pathogen. - 2002. - Vol.32, N4. - P.165-172.

189. Nair, G.B. Isolation of Vibrio cholerae O1 strains similar to pre-seventh pandemic El Tor strains during an outbreak of gastrointestinal disease in an island resort in Fiji / G.B. Nair, A. Safa, N.A. Bhuiyan, S. Nusrin, D. Murphy, C. Nicol, M. Valcanis, S. Iddings, I. Kubuabola, H. Vally // J. Med. Microbiol. -2006. - N55(11). - P.1559-1562.

190. Nusrin, S. Diverse CTX phages among toxigenic Vibrio cholerae 01 and O139 strains isolated between 1994 and 2002 in an area where cholera is endemic in Bangladesh / S. Nusrin, G.Y. Khan, N.A. Bruiyan // J. Clin. Microbiol. -2004. - Vol.42, N12. - P.5854-5856.

191. O'Brien, A.D. Environmental and human isolates of Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus produce a Shigelladysenteriae 1 (Shiga)-like toxin / A.D. O'Brien, M.E. Chen, R.K. Holmes // Lancet. - 1984. - N1(8368). - P.77-78.

192. Pukatzki, S. Identification of a conserved bacterial protein secretion system in Vibrio cholerae using the Dictyostelium host model system / S. Pukatzki, A.T. Ma, D. Sturtevant // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2006. - Vol.103, N5. -P.1528-1533.

193. Pukatzki, S. Type VI secretion system translocates a phage tail spikelike protein into target cells where it cross-links actin / S. Pukatzki, A.T. Ma, A.T. Revel // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2007. - Vol.104, N39. - P.15508-15513.

194. Reguera G., Kolter R. // J. Bacteriol. - 2005. - N187(10). - P.3551-

3555.

195. Rivera, I.N.G. Genotypes associated with virulence in environmental isolates of Vibrio cholerae / I.N.G. Rivera, J. Chun, A. Huq // Appl. Environ. Microbiol. - 2001. - Vol.67, N6. - P.2421-2429.

196. Sears, C.L. Enteric bacterial toxins: mechanisms of action and linkage to intestinal secretion / C.L. Sears, J.D. Kaper // Microbiol.Revs. - 1996. - Vol.60.

- N1. - P.167-215.

197. Sheahan, K.-L. Identification of a domain within the multifunctional Vibrio cholerae RTX toxin that covalently cross-links actin / K.-L. Sheahan, C.L. Cordero, K.J. FullnerSatchell // Proc.Natl.Acad.Sci. USA. - 2004. - Vol.101. -N26. - P.9798-9803.

198. Soumen, C. Virulence Genes in Enviromental Strains of Vibrio cholerae / C. Soumen, K.M. Asish, K.B. Rupak // Appl. And Environ. Microbiol. -2000. - V.66, №9. - P.4022-4028.

199. Struelens, M.J. Consensus guidelines for appropriate use and evaluation of microbial epidemiological typing system 11 / M.J. Struelens, A. Bauernfeind, A. Van Belkum // Clin. Microbiol. Infect. - 1996. - Vol.2, №1. - P.2-11.

200. Thompson, C.C. Genome sequence of the human pathogen Vibrio cholerae Amazonia / C.C. Thompson, M.A. Marin, G.M. Dias, B.E. Dutilh, R.A. Edwards, T. Iida, F.L. Thompson, A.C. Vicente // J. Bacteriol. - 2011. - N193(20).

- P.5877-5878.

201. Tock, M.R. The biology of restriction and anti- restriction / M.R. Tock, D.T. Dryden // Curr Opin Microbiol. - 2005. - Vol.8, N4. - P.466-72.

202. Thompson, C.C. Vibrio cholerae O1 lineages driving cholera outbreaks during seventh cholera pandemic in Ghana / C.C. Thompson, F.S. Freitas,

M.A. Marin, E.L. Fonseca, I.N. Okeke, A.C. Vicente // Infect. Genet. Evol. - 2011. - N11(8). - P.1951-1956.

203. Vicente, A.C.P. Detection of Vibrio cholerae and V.mimicus heat stable toxin gene sequence by PCR / A.C.P. Vicente, A.M. Coelho, C.A. Salles // J.Med.Microbiol. - 1997. - Vol.46. - P.398-402.

204. Waldor, M.K. Lysogenic conversion by a filamentous phage encoding cholera toxin / M.K. Waldor, J.J. Mekalanos // Science. - 1996. - Vol.272. -N5269. - P.1910-1914.

205. Waldor, M.K. Regulation, replication and integration functions of the Vibrio cholerae CTX are encoded by region RS2 / M.K. Waldor, E.J. Rubin, D.N. Gregory et al. // Mol.Microbiol. - 1997. - Vol.24. - P.917-926.

206. Watnick, P.I. A role for the mannose-sensitive hemagglutinin in biofilm formatom by Vibrio cholera O1 El Tor / P.I. Watnick, K.J. Fullner, R.A. Kolter // J. Bacteriol. - 1999. - Vol.181. - P.3606-3609.

207. Wu, Z. Distinct effects of Vibrio cholerae hemagglutinin/protease on the structure and localization of the tight junction-associated proteins occludin and ZO-1 / Z. Wu, A. Nybon, K.E. Magnusson // Cell Microbiol. - 2000. - Vol.2. -P.11-17.

208. Yildiz, F.H. Vibrio cholerae O1 El Tor: Identification of a gene cluster required for the rugose colony type, exopolysaccharide production, chlorine resistance, and biofilm formation / F.H. Yildiz, G.K. Schoolnik // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1999. - Vol.96. - P.4028-4033.

209. Zhou, H. Population structural analysis of O1 El Tor Vibrio cholerae isolated in China among the seventh cholera pandemic on the basis of multilocus sequence typing and virulence gene profiles / H. Zhou, X. Zhao, R. Wu, Z. Cui, B. Diao, J. Li, D. Wang, B. Kan, W. Liang // Infect. Genet. Evol. - 2014. - N22. -P.72-80.

210. http: //rospotrebnadzor.ru/about/info/news/news_detail s. php?ELEME NT_ID=7531

211. http://rospotrebnadzor.ru/deyatelnost/nauka/?ELEMENT_ID=8060