Эпидемиологическая и клиническая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии в Российской Федерации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, доктор наук Подколзин Александр Тихонович

• Подколзин Александр Тихонович
• доктор наук
• 2016

Оглавление диссертации доктор наук Подколзин Александр Тихонович

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1 Обзор литературы

1.1 Вирусные агенты, ассоциированные с острыми диарейными заболеваниями человека, имеющие наибольшее эпидемиологическое значение

1.2. Методики лабораторной диагностики и существующие подходы к комплексной этиологической диагностике ОКИ вирусной природы

1.3 Методические подходы к изучению генетической гетерогенности возбудителей острых кишечных инфекций вирусной этиологии

Глава 2. Материалы и методы

2.1. Обследуемые контингенты

2.2. Групповая заболеваемость ОКИ

2.3. Регистрация клинической и эпидемиологической информации о случаях заболевания

2.4. Методы статистической обработки

2.5. Методы лабораторных исследований, использованные в работе

Глава 3. Оценка эпидемиологической ситуации по ОКИ вирусной этиологии в Российской Федерации по по данным их расширенной этиологической верификации

3.1. Пилотное изучение этиологической структуры ОКИ

3.2 Разработка методик этиологического мониторинга, адаптированных для использования в системе эпидемиологического надзора Российской Федерации и оценка оценка эффективности их практического применения

3.3 Итоги внедрения наборов реагентов для этиологической диагностики ОКИ в практику здравоохранени и сравнительная оценка эффективности различных методов лабораторной диагностики ОКИ в практике учреждений Роспотребнадзора

Глава 4. Особенности эпидемического процесса ОКИ вирусной этиологии

4.1. Сезонность и территориальные особенности этиологической структуры ОКИ в Российской Федерации

4.2. Особенности сезонных подъемов заболеваемости ротавирусной инфекцией на территории РФ

4.3. Возрастная структура острых диарейных заболеваний по данным госпитализации в РФ

115

Глава 5. Сравнение клинической симптоматики у пациентов с ОКИ различной этиологии

5.1. Особенности синдромальной диагностики острых диарейных заболеваний различной этиологии

5.2. Особенности температурной реакции пациентов с острыми диарейными заболеваниями различной этиологии

5.3. Особенности гастроинтестинальной симптоматики у пациентов с острыми диарейными заболеваниями различной этиологии

5.4. Клиническая картина заболеваний, вызываемых редко выявляемыми возбудителями ОКИ

5.5. Определение этиологической структуры летальных исходов у детей младшего возраста на фоне острых инфекционных заболеваний с синдромом диареи

Глава 6. Эпидемиологическая и клиническая интерпретация результатов этиологического мониторинга

6.1. Подходы к интерпретации результатов этиологического мониторинга

6.2. Сочетанное выявление патогенов

Глава 7. Субвидовая характеристика изолятов вирусных возбудителей ОКИ, циркулирующих на территории РФ

Заключение:

Выводы:

Практические рекомендации:

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

АД артериальное давление

ВКО внутренний контрольный образец

ГУС гемолитико-уремический синдром

ДНК дезоксирибонуклеиновая кислота

ЖКТ желудочно-кишечный тракт

ИБС ишемическая болезнь сердца

ИФА иммуноферментный анализ

ИХ иммунохроматографический анализ

КИНЭ кишечные инфекции неустановленной этиологии

ЛПУ лечебно-профилактическое учреждение

МАНК методы амплификации нуклеиновых кислот

МНТЦ международный научно-технический центр

НВИ норовирусная инфекция

НК нуклеиновые кислоты

НПИ накопительный процент инфицирования

ОГ острый гастрит

ОГЭ острый гастроэнтерит

ОГЭК острый гастроэнтероколит

ОКИ острые кишечные инфекции

ОКО отрицательный контрольный образец

ООС объекты окружающей среды

ОПН острая почечная недостаточность

ОРЗ острые респираторные заболевания

ОЭ острый энтерит

ОЭК острый энтероколит

п.н.о. пары нуклеотидных оснований

ПААГ полиакриламидный гель

ПКО положительный контрольный образец

ПЦР полимеразная цепная реакция

РВИ ротавирусная инфекция

РНГА реакция непрямой гемагглютинации

РНК рибонуклеиновая кислота

ЧСС частота сердечных сокращений

BAIs Biotin-avidin immunoassays

CDC Центр контроля и профилактики заболеваний (CDC, США)

Ct Пороговый цикл

EIEC энтероинвазивные E coli

ELISA иммуноферментный анализ (enzymelinked

immunosorbent assay) HAstV астровирусы человека

HBoV бокавирусы человека

HEV энтеровирусы человека

HPeV парэховирусы человека

ICTV Интернациональный комитет по таксономии вирусов

International Committee on Taxonomy of Viruses

NLV норфолк-подобные вирусы (устаревшее название норовирусов)

Noronet международная сеть надзора за норовирусами

NSP обозначение неструктурных белков вирионов

ORF открытая рамка считывания

RCWG Rotavirus Classification Working Group

RdRp РНК-зависимая РНК полимераза

RIA радиоимунный тест

RIVM Национальный институт общественного

здравоохранения и контроля окружающей среды (Нидерланды) (Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu)

RVA ротавирусы группы А

RVB ротавирусы группы В

RVC ротавирусы группы С

SD стандартное отклонение

SLV саппоро-подобные вирусы

SRSV small round structured viruses

VP обозначение структурных белков вирионов

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Эпидемиологическая и клиническая характеристика острых кишечных инфекций вирусной этиологии в Российской Федерации»

ВВЕДЕНИЕ

Несмотря на позитивные тенденции по снижению показателей заболеваемости целым рядом инфекционных заболеваний, которые наблюдаются в Российской Федерации в последние годы, отмечается возрастание количества регистрируемых случаев диарейных инфекций вирусной этиологии. Данный рост связан не только с естественными изменениями истинных показателей заболеваемости, но и с внедрением в практику здравоохранения адекватных методов этиологической диагностики данных заболеваний. Оптимизация схем диагностики данной группы заболеваний в связи с вышеизложенным становится высокоактуальной.

Представление об этиологии острых кишечных инфекций (ОКИ) у врачей клинической практики часто складывается на основе ознакомления с традиционной отечественной литературой, в которой до настоящего времени иногда доминируют необъективные представления о ведущей роли нескольких, хорошо изученных патогенов. Подобные представления тесно связаны с использованием традиционно доступных для широкого практического применения в рутинной клинико-лабораторной практике диагностических тестов. К сожалению, в настоящее время их спектр не позволяет эффективно решать вопросы этиологической диагностики острых кишечных инфекций. Данный факт подтверждается тем, что в РФ до 6567% заболеваний этой группы, согласно официальной статистике, составляют ОКИ неуточненной этиологии.

Общеизвестно, что вирусные агенты занимают существенное место в этиологической структуре острых кишечных инфекций у лиц различного возраста. Особенно велика их роль в формировании спорадической заболеваемости ОКИ детей и вспышечной заболеваемости в различных возрастных группах. Возбудители этих заболеваний относятся к нескольким семействам: Reoviridae, объединяющим ротавирусы человека групп A, B и C; Caliciviridae, включающее роды норо- и саповирусов (старое название норфолк-подобные и саппоро-подобные вирусы); Astroviridae, к которому относят несколько серогрупп

астровирусов человека; Adenoviridae включающее ассоциированную с острыми кишечными инфекциями группу F(40 и 41 типы); Picobirnavirus ; Picornaviridae с родом Kobuvirus к которому относят Aichi virus и род Enterovirus; Coronaviridae с родами Torovirus и Coronavirus и сем Parvoviridae (human Bocavirus.). Наибольшее клинико-эпидемиологическое значение при этом вследствие своей распространенности имеют ротавирусы гр А (сем Reoviridae), норовирусы 2 генотипа (сем Caliciviridae), астровирусы и аденовирусы гр F. Другие возбудители выявляются, по данным литературы, либо достаточно редко, либо имеют низкую доказательную ассоциацию с клинической симптоматикой заболеваний [26, 47, 72, 190, 216, 272, 331].

Существенную долю синдромальных диагнозов в данной группе заболеваний составляют гастроэнтериты, что в частности, находит отражение в широком применении термина «вирусные гастроэнтериты» в зарубежной литературе. Однако синдромальная диагностика не позволяет корректно верифицировать вирусную этиологию заболеваний в силу полиморфизма синдромальных форм заболеваний, ассоциированных с вирусными агентами.

В настоящее время в Российской Федерации отсутствуют исследования, в которых проводится комплексный сравнительный анализ клинической симптоматики диарейных заболеваний различной этиологии у пациентов разного возраста.

В Российской Федерации в последнее десятилетие произошло существенное

изменение спектра регистрируемых кишечных инфекций. При этом отмечается

снижение либо стабилизация показателей заболеваемости кишечными инфекциями

диагностируемыми методами классической бактериологии и возрастание

показателей заболеваемости инфекциями, требующими применения

альтернативных диагностических подходов. Так, показатель заболеваемости

бактериальной дизентерией в период 2002 - 2012гг снизился в 5,5 раза (с 55,72 до

10,14 на 100 тыс населения), брюшным тифом в 6,5 раза (с 0,13 до 0,02 на 100 тыс

населения). Показатели заболеваемости сальмонеллезом в аналогичный период

времени существенно не изменились (34,27 в 2002 и 36,56 в 2012г). При этом в 5.5

7

раз возрос показатель заболеваемости ротавирусной инфекцией (с 14,36 до 78,83 на 100 тыс населения). Такой «интегральный» показатель как «Другие острые кишечные инфекции, вызванные установленными бактериальными, вирусными возбудителями, а также пищевые токсикоинфекции установленной этиологии» также вырос в 1.8 раза (с 84,64 до 154,8 на 100 тыс населения). Наряду с этим происходит актуализация учетных форм заболеваемости. С 2008 года в форму №2 федерального статистического наблюдения «Сведения об инфекционных и паразитарных заболеваниях», введена регистрация норовирусной инфекции и проведено разделение учета кишечных инфекций установленной бактериальной и вирусной этиологии. За четыре года учета заболеваемости норовирусной инфекцией количество зарегистрированных случаев данного заболевания выросло в 5.5. раза (с 1284 в 2009 г до 6993 в 2012г). Данные изменения в совокупности отражают эффективность внедрения в практику здравоохранения современных методов диагностики заболеваний, актуальность которых ранее недооценивалась, в частности кишечных инфекций вирусной этиологии.

Однако, несмотря на позитивный характер данной тенденции, нельзя не отметить наличие существенных различий в активности этиологической диагностики вирусных гастроэнтеритов в различных субъектах Российской Федерации. Наиболее неблагополучным по внедрению методов диагностики данной группы заболеваний является Северо-Кавказский федеральный округ, в субъектах Федерации которого их регистрация либо не проводится (Чеченская Республика, Республика Ингушетия), либо характеризуется необъективно низкими (менее 10 на 100 тыс населения) показателями заболеваемости (Республика Дагестан, Республика Северная Осетия, Кабардино-Балкарская Республика). Такие же низкие показатели заболеваемости отмечаются в Волгоградской и Калужской областях.

Основной удельный вес в структуре вирусных гастроэнтеритов по данным

официальной статистики, занимает ротавирусная инфекция, на долю которой в

2009 г приходилось 95,9% а в 2012 г - 89,5% суммы кишечных инфекций вирусной

этиологии. Регистрируемые показатели заболеваемости норовирусной инфекцией

8

при этом в сопоставлении с данными выборочных исследований и официальной статистики других государств непропорционально малы (2009г - 0,9; 2012 - 4,89 на 100 тыс населения) [137,323].

Одними из основных причин данной необъективности учета является отсутствие адаптированных для широкого применения в практике здравоохранения наборов реагентов для диагностики данных заболеваний, недостаточная разработка нормативной базы для рутинного применения методов их диагностики и недостаточный охват методами этиологической диагностики взрослых пациентов и пациентов с амбулаторной заболеваемостью.

В Российской Федерации производятся только наборы реагентов для детекции ротавирусов группы А и аденовирусов, без определения их групповой принадлежности, что снижает диагностическую специфичность исследования. Наборы реагентов, производимые за рубежом, предназначенные для выявления норовирусов, обладают низкой диагностической чувствительностью [113]. В настоящее время не вызывает сомнений огромное эпидемиологическое значение генетической характеристики возбудителей вирусных агентов, ассоциированных с острыми диарейными заболеваниями. Смена доминирующих генотипов ассоциируется с изменением объективных показателей заболеваемости [341], и позволяет прогнозировать потенциальную эффективность применения средств специфической профилактики данных заболеваний [87]. Данные, представленные в научной литературе по особенностям циркуляции вирусных возбудителей ОКИ в Российской Федерации, отрывочны и не позволяют получить комплексного представления о проблеме. В связи с вышеизлженным, в РФ сформировалась потребность в оптимизации эпидемиологического надзора за данной группой заболеваний.

Цель работы: Выявление эпидемиологических и клинических особенностей острых кишечных инфекций вирусной этиологии на основе разработки и внедрения в практику здравоохранения комплексной схемы их этиологической

диагностики и субвидовой характеристики возбудителей.

9

Задачи исследования. Исходя из намеченной цели исследования были поставлены

следующие задачи:

1. Провести расширенное пилотное изучение этиологической структуры спорадической (по данным госпитализации) и групповой заболеваемости ОКИ.

2. Определить спектр потенциальных патогенов для скрининговой этиологической диагностики ОКИ при спорадической и групповой заболеваемости в различных возрастных группах населения на основе оценки их распространенности и доказательной ассоциации с клиническими проявлениями острых инфекционных диарей.

3. Разработать адаптированные к практическому применению методики детекции и субвидовой характеристики возбудителей ОКИ вирусной этиологии и провести оценку эффективности их практического применения при групповой и спорадической заболеваемости кишечными инфекциями.

4. Установить особенности эпидемических проявлений ОКИ вирусной этиологии на территории РФ.

5. Определить распространенность субвидовых групп (геногрупп, генотипов, субтипов) основных вирусных патогенов на территории РФ.

6. Провести сравнительную характеристику клинических проявлений ОКИ различной этиологии. Провести анализ факторов, ассоциированных с развитием летальных исходов у детей на фоне заболеваний, протекающих с диарейным синдромом.

7. Разработать предложения по оптимизации этиологического мониторинга ОКИ вирусной этиологии как части системы эпидемиологического надзора.

Научная новизна.

Впервые, на примере ОКИ, сформулирована концепция оптимизации мониторинга этиологической структуры синдромально сходных групп инфекционных заболеваний, которая включает в себя следующие конструктивные принципы:

1. Обязательность комплексного характера этиологической диагностики, синдромально сходных групп заболеваний, обеспечивающего более точное определение позитивного предсказательного значения исследований с учетом случаев сочетанного выявления возбудителей.

2. Формирование перечня диагностических исследований с использованием следующих критериев:

- достоверности ассоциации положительных результатов исследований с клиническими проявлениями заболевания

- минимальной достаточности перечня проводимых исследований, определяемых распространенностью возбудителей в обследуемой группе и трудозатратностью исследований.

3. Пересмотр данного перечня при:

- статистически значимом снижении его эффективности (повышении доли КИНЭ).

- появлении данных об изменении клинической значимости отдельных патогенов (изменение свойств циркулирующих или появление новых патогенов).

- модернизации (повышении эффективности, снижении себестоимости и трудозатратности) лабораторной диагностики.

На основе предложенной концепции разработан и применен на практике

набор реагентов для комплексной этиологической диагностики ОКИ.

Впервые проведен комплексный анализ территориального, возрастного и

временного распределения заболеваемости кишечными инфекциями вирусной

этиологии на территории Российской Федерации и разработата методологическая

база для дальнейшего мониторинга данных показателей.

Впервые проведен объективный анализ территориальных особенностей

сезонных изменений заболеваемости ротавирусной инфекцией в РФ за пятилетний

11

период, выявлены территории с атипичной для основной части страны сезонностью (группы территорий инициации сезонных подъемов заболеваемости -Кировская, Костромская, Нижегородская области; Кемеровская область и Республика Хакасия; Хабаровский край и территории с летне-осенним подъемом заболеваемости - ЮФО и СКФО).

Впервые представлена генетическая характеристика вирусных возбудителей ОКИ на территории различных федеральных округов РФ. Определены превалирующие в период выполнения работы субтипы ротавирусов группы А ^4Р]8 - 42,5%, G1[P]8 - 19,7%, G3[P]8 - 15,2%), норовирусов ^П.4 - 30.9%, GП.1 -22,1%, GП.6 - 19,1%), астровирусов человека (Ы (33.2%), 1Ь (19.9%), ^ (15.6%)). Впервые представлена сравнительная характеристика клинического течения острых кишечных инфекций вирусной и бактериальной этиологии у пациентов разного возраста, подтверждающая незаменимость лабораторных методов их этиологической диагностики.

Практическая значимость.

Разработанная схема комплексной этиологической диагностики ОКИ успешно внедрена в практическую работу учреждений здравоохранения (объемы проводимых исследований в 2011-2012-2013гг: 69 - 105 - 142 тысяч исследований).

Внедрение комплексной этиологической диагностики ОКИ в практическую работу учреждений Роспотребнадзора позволило добиться повышения эффективности выявления возбудителей ОКИ вирусной природы в очагах групповой заболеваемости в период 2011-2013гг: в сравнении с использованием ИФА на антигены вирусных агентов на 2,5% для заболевших, 4,7% для лиц, подвергшихся риску заражения, и 28,2% для объектов окружающей среды, в

сравнении с применением иммунохроматографических наборов реагентов - на 5,9% для заболевших и на 39,7% для лиц, подвергшихся риску заражения.

Возрастание колическтва регистрируемых случаев норовирусной инфекции в период с 2009 по 2013 гг в 8,2 раза, при превалирующем применении для ее диагностики разработанных наборов реагентов (в период 2011-2013гг в 87,1% очагов групповой заболеваемости) свидетельствуют о высокой эффективности их практического применения.

Данные, полученные при сравнительной характеристике клинического течения острых кишечных инфекций вирусной и бактериальной этиологии у пациентов разного возраста, свидетельствуют об ограниченных возможностях их дифференцировки на основании клинической симптоматики и подтверждают незаменимость лабораторного этиологического мониторинга.

Данные об активности циркуляции ротавирусов гр А и территориальных особенностях сезонной заболеваемости РВИ в РФ позволяют провести более объективный выбор территорий для определения факторов, влияющих на активацию эпидемического процесса при РВИ.

Данные о генетической вариабельности возбудителей кишечных инфекций вирусной этиологии на территории различных федеральных округов РФ положены в основу динамического мониторинга за их популяциями, осуществляемого Референс-центром по мониторингу возбудителей ОКИ.

Внедрения

Получены регистрационные удостоверения на наборы реагентов, для комплексной этиологической диагностики ОКИ, предназначенные для выявления ротавирусов человека группы А, норовирусов II геногруппы, астровирусов человека, аденовирусов человека группы F (40, 41 типы), а также комплекса наиболее распространенных бактериальных патогенов (микроорганизмов рода Salmonella, Shigella, энтероинвазивных E coli (EIEC), термофильных видов рода Campylobacter):

«АмплиСенс® ОКИ скрин-FL» № ФСР 2008/02265 «АмплиСенс® Rotavirus/Norovims/Astrovirus-FL» № ФСР 2008/02268

«АмплиСенс® Shigella/Salmonella/Campylobacter-FL» № ФСР 2008/03087

С участием автора разработаны и внедрены в практику учреждений здравоохранения следующие нормативные документы:

- МУК 4.2.2746-10. «Методы контроля. Биологические и микробиологические факторы. Порядок применения молекулярно-генетических методов при обследовании очагов острых кишечных инфекций с групповой заболеваемостью»

- МУ 3.1.1.2957-11. «Эпидемиологический надзор, лабораторная диагностика и профилактика ротавирусной инфекции»

- МУ 3.1.1.2969-11 «Эпидемиологический надзор, лабораторная диагностика и профилактика норовирусной инфекции».

- СП 3.1.1.3108-13 «Профилактика острых кишечных инфекций»

Персональный вклад автора

Планирование исследования, включающее анализ данных литературы, формирование критериев отбора пациентов в обследуемые группы, обоснование и выбор эпидемиологических, клинических и лабораторных методов исследования, методов статистической обработки результатов.

Разработка наборов реагентов для комплексной этиологической диагностики ОКИ, включая разработку его дизайна, определение перечня детектируемых возбудителей, методик выявления их маркеров, проведение лабораторного этапа разработки, подготовка документации и проведение его государственной регистрации. Разработка методик субвидовой характеристики ротавирусов, норовирусов, астровирусов человека.

Организация сбора, транспортировки образцов клинического материала, лабораторного иследования части образцов. Организация сбора клинической и эпидемиологической информации. Разработка и ведение базы данных (Access).

Проведение анализа и интерпретации данных клинических, эпидемиологических и лабораторных исследований. Сбор и анализ данных по оценке сравнительной эффективности внедрения разработки в практику учрежденй здравоохранения. Написание методических документов.

Глава 1 Обзор литературы

1.1 Вирусные агенты, ассоциированные с острыми диарейными заболеваниями человека, имеющие наибольшее эпидемиологическое значение.

1.1.1 Таксономия, номенклатура и классификация вирусных агентов, ассоциированные с острыми диарейными заболеваниями человека

Семейство Reoviridae. История открытия.

Первое описание ротавирусов было сделано австралийским профессором Ruth F. Bishop, которая в 1973 году при проведении электронной микроскопии фекальных экстрактов у детей при вспышке «небактериального гастроэнтерита» в 11 из 14 образцов обнаружила морфологически сходные вирионы, отсутствовавшие у 9 детей из группы сравнения. Аналогичные вирусные частицы выявлялись у 81% детей со спорадическими гастроэнтеритами в Мельбурне [99]. Таксономическое положение.

В настоящее время, интернациональным комитетом по таксономии вирусов (International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV)), в соответствии с изданием 2012г таксономии вирусов [28], род Rotavirus, относят к подсемейству Sedoreovirinae семейства Reoviridae. Данный род включает 5 видов ротавирусов (А-Е).

Структура вириона и его генетическая характеристика.

Вирион ротавируса, размером около 76 нм, имеет сферическую форму с икосаэдральной симметрией, лишен липопротеиновой оболочки и обладает двойным капсидом.

Наружная оболочка капсида образована двумя белками - VP7 (гликопротеин) (м.м. 37,198 кДа) и VP4 (м.м. 86,78 кДа), в процессе протеолиза образующего VP5 и VP8 протеины.

Внутренняя оболочка капсида образована белком VP6 (м.м. 44,8 кДа) Коровская область вириона имеет гексагональную форму, образована белками VP1 (РНК-зависимая РНК-полимераза), VP2 и VP3.

Структурная организация ротавириона показана на рис. 1.1.

VP8 VPS VP7

VP6 VP2

Рисунок 1.1 Структурная организация вириона ротавирусов (по материалам http://viralzone.expasy.org)

VP4 и VP7 - белки наружного капсида, VP6 - белок внутреннего капсида, VP1/VP3 - гетеродимер транскрипционных ферментов, VP2 - белок оболочки сердцевины.

Вирион ротавируса имеет также шесть неструктурных белков (NSP1-NSP6). Белки NSP1, NSP2, NSP3, NSP5 и NSP6 связаны с РНК вириона и участвуют в репликации, белок NSP4 является трансмембранным гликопротеином и участвует в сборке вирионов [139, 322].

Для вирусов семейства Reoviridae характерно наличие сегментированного генома, содержащего от 9 до 12 сегментов двуцепочечной РНК. Геном вирусов рода Rotavirus представлен двуцепочечной РНК, состоящей из 11 сегментов с суммарным размером около 18 тыс п.н., кодирующие 12 белков. Геном типового штамма ротавирусов обезьян SiRV-A/SA11 представлен 11 сегментами размером от 667 до 3302 п.н. общим размером 18 550 п.н. (Рис 1.2 ) [122].

Данное строение генома обеспечивает возможность эффективной внутригрупповой (внутри групп А, В, С) реассортации.

Рисунок 1.2. Строение генома рода Rotavirus

(по материалам http://viralzone.expasy.org)

При проведении электрофореза в полиакриламидном геле наблюдается характерное распределение сегментов генома ротавирусов. Принята нумерация сегментов в соответствии с уменьшением их молекулярной массы/размера (от 3300 до 670 п.н.). Каждым геномным сегментом кодируется один белок, за исключением 11 сегмента, кодирующего два белка. Соответствие кодируемых белков сегментам генома ротавируса представлено на рис. 1.3.

Антигенные свойства внутреннего капсида ротавирусов VP6 определяют их групповую (А-G) и субгрупповую принадлежность. Ротавирусы групп А, В и С способны вызывать заболевания у человека [234, 309]. Ротавирусы группы А.

Номенклатура ротавирусов

Антигенное разнообразие ротавирусов определяется VP7 и VP4 белками их

капсида (включая VP8 и VP5 фрагменты VP4), которые образуют антигенные

эпитопы, индуцирующие продукцию нейтрализующих антител [349].

Первоначальное обозначение антигенных детерминант ротавирусов гр А

было связано с выделением их серотипов, нейтрализующихся референтными

сыворотками к VP7 белку (G - Glycoprotein) и к VP4 белку (P - Protease-

чувствительный белок) [89]. Позже была разработана бинарная система

классификации ротавирусов гр А на основе генетического анализа VP4 и VP7 генов

18

[201, 277]. В настоящее время выделяют 27 G генотипов (G1-G27) и 35 Р (Р[1] -Р[35]) генотипов ротавирусов.

Геномные Кодируемые

сегменты белки

Рисунок 1.3 Соответствие кодируемых белков сегментам генома ротавируса [270].

Несмотря на относительно независимое перераспределение генов кодирующих VP4 и VP7 белки, выделяют несколько антигенных типов ротавирусов, имеющих максимальное распространение в популяции человека (G1P[8], G2P[4], G3P[8], G4P[8], or G9P[8]).

Гостальная специфичность наиболее распространенных G[P] типов ротавирусов представлена на таб. 1.1 [317].

В основу прикладной эпидемиологической классификации ротавирусов группы А положено антигенное разнообразие изолятов, обусловленное гликопротеином (VP7) и протеазо-чувствительным белком (VP4). При этом наибольшее распространение в человеческой популяции имеют изоляты с сочетанием P[8] с G1, G3 или G4 типами и P[4] с G2 типом.

Таблица 1.1.

Гостальная специфичность и реассортанты ротавирусов гр А.

(по ве^еЬ ЛЯ е1 а1. 2005 [317])

О тип Р серотип [генотип]

1А[8] 1Б[4] 2А[6] 2С[6] 3[9] 4[10] 5А[3] 6[1] 8[11] 11[14] 12[19]

1 Wa АИ64 М37 АИ19 К8

2 1076

3 Р 107Е1Б МсШ3 Аи-1 НСЯ3 157С

4 НоеЫ БТ-3

5 Бг1054

6 РА151 РА169

8 MW333 MW023 69М НАЫ166

9 WI61 Ш1205 116Е Ме323

10 1321 Ме35

12 Ш585

□- малораспространенные о глобально распространенные

□- регионально распространенные и распространенные у новорожденных

Меньшее распространение имеют типы О9Р[8] и О9Р[6]. Данные антигенные типы ротавирусов, принято относить к глобально распространенным. На их долю приходилось более 90% изолятов в первых работах, выполненных в различных странах [243, 296, 299].

Наряду с ними выделалась группа антигенных типов ротавирусов, имеющих существенное распространение в отдельных регионах (регионально распространенные) О5Р[8], О8Р[4], О1-4,8Р[6], и некоторые другие. Достоверных данных, подтверждающих ассоциацию тяжести течения заболевания с различными генотипами ротавирусов, недостаточно. Имеются наблюдения о более высокой восприимчивости лиц старшего возраста к ротавирусам О2Р[4] генотипа [264].

Это находит практическое подтверждение регистрацией вспышек, вызванных данным возбудителем в гериатрических учреждениях [336].

При комплексном анализе вариабельности других сегментов генома выделяют

несколько геногрупп ротавирусов группы А [158].

При этом ротавирусы, наиболее широко циркулирующие в человеческой

популяции, относятся к 1 и 2 геногруппе [165].

20

В таблице 1.2 представлена генетическая структура штаммов ротавирусов, циркулирующий в популяции человека и животных [270].

Филогенетический анализ указывает на эволюционную близость ротавирусов 1 геногруппы к ротавирусам свиней, а 2 геногруппы - к бычьим ротавирусам [158]. В 2011 г Рабочей группой по классификации ротавирусов (Rotavirus Classification Working Group (RCWG)) были разработаны унифицированные рекомендации по номенклатуре ротавирусов. Уникальное наименование изолята включает указание группы (вида), источника выделения, страны выделения, уникальной аббревиатуры изолята , года и источника изоляции а также антигенного ([P]G) типа. При обозначении диких типов ротавирусов должна указываться их группа (вид) - RVA, RVB, RVC, RVD, RVE, RVF или RVG. При невозможности определения принадлежности к группе или выявлении потенциально новой группы она обозначается как Х.

Источник выделения изолята включает наименование организма (human, pig, cow и т.д.) и тип штамма (wt - дикий тип (прямая изоляция из организма), tc -штамм, изолированный на клеточных линиях и -lab - обозначает штамм, созданный в лаборатории). Страна изоляции обозначается трехбуквенной аббревиатурой. При полногеномной характеристике изолятов используется однобуквенное обозначение сегментов генома с указанием генотипа сегмента в следующей последовательности: VP7 - G(1-27); VP4 - [P](1-35); VP6 - I(1-16); VP1-R(1-9); VP2-C(1-9); VP3-M1-8); NSP1-A(1-16); NSP2-N(1-1-9); NSP3 - T(1-12); NSP4-E(1-14); NSP5-H1-11). [340].

Таблица 1.2

Полногеномная генетическая структура отдельных штаммов ротавирусов человека и животных, а также вакцинных штаммов (по Patton JT 2012 [270])

Genotype (# possible)

VP7 (27) VP4 (35) VP6 (16) VP1 (9) VP2 (9) VP3 (8) NSP1 (16) NSP2 (9) NSP3 (12) NSP4 (14) NSP5 (11)

Common Global Strains Wa human Gl P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

DS-I human G2 P[4] I2 R2 C2 M2 A2 N2 T2 E2 H2

P human G3 P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

ST3 human G4 P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

WI61 human G9 P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

Vaccine Strains Rotarix RIX441 human Gl P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

RotaTeq WI79-9 H u x Bo reassort Gl P[5] I2 R2 C2 M1 A3 N2 T6 E2 H3

RotaTeq SC2-9 G2 P[5] I2 R2 C2 M1 A3 N2 T6 E2 H3

RotaTeq W178-8 G3 P[5] I2 R2 C2 M2 A3 N2 T6 Б2 H3

RotaTeq BrB-9 G4 P[5] I2 R2 C2 M2 A3 N2 T6 E2 H3

RotaTeq WI79-4 G6 P[8] I2 R2 C2 M2 A3 N2 T6 E2 H3

Uncommo n Strains Au-I human G3 P[9] I3 R3 C3 M3 A3 N3 T3 E3 H3

MWI human G8 P[4] I2 R2 C2 M2 A2 N2 T2 E2 H2

GR 10924/99 human G9 P[6] I2 R2 C2 M2 A2 N2 T2 Б2 H2

6717/2002 /ARN human G10 P[8] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

Dhaka 1203 human G12 P[6] I1 R1 C1 M1 A1 N1 T1 E1 H1

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Подколзин Александр Тихонович, 2016 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ:

1 Адаптированная к практическому применению методика (Р^ генотипирования ротавирусов группы А / А.Т. Подколзин, Е.Б. Фенске, Н.Ю. Абрамычева, Г.А. Шипулин // Генодиагностика инфекционных болезней - 2007 (Молекулярная диагностика - 2007), Москва. Сб. трудов VI Всерос. науч.-практ. конф. - 2007. - Т. 3, с. 284-286.

2 Внутрибольничные инфекции: Проблемы и пути решения / В.И. Покровский, Н.А. Семина //Эпидемиология и инфекционные болезни -2000 - №5. -С. 12-14.

3 Генетическое разнообразие изолятов ротавирусов гр А, выявленных в Западной Сибири в 2007 - 2011гг./ Е.В. Жираковская, Р.Х. Аксанова, М.Г. Горбунов // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология - 2012 - №4, С. 33-41.

4 Диагностика ротавирусной инфекции методом полимеразной цепной реакции / А.А. Мухина, Г.А. Шипулин, А.Г. Боковой, Е.Э. Евреинова, О.Ю. Шипулина// Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2002. -К 2, с. 43-47.

5 Дроздов С.Г. , Покровский В.И. , Шекоян Л.А. , Машилов В.П. Ротавирусный гастроэнтерит - монография, 1982.

6 Дроздов, С.Г. Ротавирусный гастроэнтерит. Лабораторные методы диагностики и исследования / С.Г. Дроздов, Л.А. Шекоян, М.Б. Королев // Вопросы вирусологии. - 1981. - N 6, с. 644-649.

7 Изучение этиологии острых кишечных инфекций у детей, госпитализированных в инфекционные отделения стационаров Москвы / Подколзин АТ, Мухина А,А, Шипулин ГА [и др..]// Инфекционные болезни. -2004.- Т. 2, N 4,- с.85-91.

8 Концепция профилактики внутрибольничных инфекций / В.И. Покровский, А.А.Монисов, М.Г.Шандала [ и др.]// Эпидемиология и инфекционные болезни - 2000 - №5. -С. 4-9.

9 Новикова, Н.А. Анализ электрофоретипов ротавирусов человека, выделенных в г. Горьком / Н.А. Новикова, А.С. Анцупова // Вопросы вирусологии. - 1987. - N 2, с. 238-241.

10 Норовирусы как этиологический фактор острых кишечных инфекций у детей раннего возраста в Новосибирске / Эпидемиология и инфекционные болезни - 2010 - №1, С. 40-44.

11 Ошибки при проведении патогенетической терапии острых кишечных инфекций / Л.Е.Бродов, В.В.Малеев, Н.Д.Ющук [и др.] // Терапевтический архив - 1990 - №11, С. 31-35.

12 Патогенетическая терапия больных пищевыми токсикоинфекциями с осложненным течением / Л.Е.Бродов, В.В.Малеев, Н.Д.Ющук [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии - 1995 -№2, С. 96-100.

13 Первый опыт изучения калицивирусной инфекции у детей в Москве / А.А. Мухина, Г.А. Шипулин, А.Г. Боковой, С.Б. Яцышина // Вопросы вирусологии. - 2002. - N 6, с. 33.

14 Пути оптимизации эпидемиологического надзора за инфекционными болезнями в стране / В.И.Покровский // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии - 1986 - №11, С. 3-7.

15 Разработка методик детекции возбудителей острых кишечных инфекций на основе мультиплексной ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией продуктов амплификации /Подколзин АТ, Абрамычева НЮ, Фенске ЕБ [и др..]// Генодиагностика инфекционных болезней: Материалы Рос. науч.-практ. конф. (Новосиб. обл.). - 2005. - с. 216-221.

16 Результаты применения ПЦР для установления этиологии вспышечной заболеваемости ОКИ у детей / Подколзин АТ, Мухина А,А, Шипулин ГА [и др..]// 5-я Всероссийская научно-практическая конференция "Генодиагностика инфекционных болезней (Москва). - 2004. - Т. 2, с. 111-113.

17 Ротавирус человека в культуре клеток: выделение и пассирование / С.Г. Дроздов, Л.А. Шекоян, М.Б. Королев, А.Г. Анджапаридзе// Вопросы вирусологии. -1979. - N 4, с. 389-392.

18 Ротавирусный гастроэнтерит / В.И. Покровский, С.Г. Дроздов, В.П. Машилов, Л.А. Шекоян, Л.Е. Бродов, Н.Д. Ющук, Л.Ф. Колобова// Терапевтический архив. - 1982. - N 2, с. 8-12.

19 Ротавирусы у детей раннего возраста в Новосибирске в 2005 - 2007 гг: выявление и генотипирование / Е.В.Жираковская, В.В. Малеев,

B.В.Клемешева [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии - 2008 - №4, С. 12-16.

20 Сергевнин, В.И. Эпидемиологический надзор за ротавирусной инфекцией / Сергевнин В.И., Сармометов Е.В., Вольдшмидт Н.Б// Эпидемиология и вакцинопрофилактика. - 2008. - 1 С. 28-31.

21 Трудности дифференциальной диагностики между рядом инфекционных заболеваний и пищевыми токсикоинфекциями / Л.Е.Бродов, Н.Д.Ющукб Г.Н.Кареткина [и др.] //Клиническая медицина - 1989 - № 7, С. 131-135.

22 Эпидемиологические исследования, клиническая эпидемиология и доказательная медицина / Н.И. Брико, В.И. Покровский // Медицинский альманах - 2008 - №5. -С. 15-19.

23 Эпидемиологические исследования, клиническая эпидемиология и доказательная медицина / Н.И. Брико, В.И. Покровский // Сеченовский вестник - 2010 - №2. -С. 106-111.

24 Эпидемиология и профилактика внутрибольничных инфекций в Российской Федерации / Покровский В.И., Семина Н.А., Ковалева Е.П., Акимкин В.Г. // Стерилизация и госпитальные инфекции - 2006 - №1. -

C. 8-11.

25 Deaths from norovirus among the elderly, England and Wales / Harris JP, Edmunds WJ, Pebody R [et al.]// Emerg Infect Dis -2008 - Vol. 14 -P. 15461552.

26 Reuter, G. Kobuviruses - a comprehensive review/ Reuter G, Boros A, Pankovics P// Rev Med Virol. - 2011 - Vol. 21 N1 -P.32-41.

27 The epidemiology of enteric caliciviruses from humans: a reassessment using new diagnostics / Glass RI, Noel J, Ando T [et al.]// J Infect Dis - 2000 - Vol.181(Suppl. 2)-P.254-61.

28 2012 Release EC 44 [Электронный ресурс]: Leuven, July 2012; Режим доступа: http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp.

29 A 5-year study of the prevalence and genetic diversity of human caliciviruses associated with sporadic cases of acute gastroenteritis in young children admitted to hospital in Melbourne, Australia (1998-2002) / Kirkwood, C.D., Clark, R., Bogdanovic-Sakran, N., Bishop, R.F. // J. Med. Virol. - 2005 -Vol.77? N1, -P.96-101.

30 A combined enzyme immunoassay for rotavirus and adenovirus (EIARA) / Pereira, H.G., Azeredo, R.S., Leite, J.P.G. [et al.]// J. Virol. Methods - 1985

- N10 -P. 1-28.

31 A correlated histochemical and electron microscopic study of the intranuclear crystalline aggregates of adenovirus (RI-APC virus) in HeLa cells. / Bloch DP, Morgan C, Godman GC, Howe C, Rose Hm. J // Biophys Biochem Cytol. - 1957 - Vol.25;3 N1. -P.1-8.

32 A dot-blot hybridization procedure for the detection of astrovirus in stool samples / Willcocks MM, Carter MJ, Silcock JG, Madeley CR. / Epidemiol Infect. - 1991 - Vol.107(2), N10. -P.405-410.

33 A norovirus protease structure provides insights into active and substrate binding site integrity / Nakamura K, Someya Y, Kumasaka T [et al.]// J. Virol. - 2005 - Vol.79 -P.13685-13693.

34 A nosocomial sapovirus-associated outbreak of gastroenteritis in adults / Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, [et al.]// Scand J Infect Dis. - 2005

- Vol. 37 N3, -P. 200 - 204.

35 A novel picornavirus associated with gastroenteritis / Li L, Victoria J, Kapoor A, Blinkova O, Wang C [et al.]// J. Virol. - 2009 - Vol.83, -P.12002-12006.

36 A novel RT-multiplex PCR for detection of Aichi virus, human parechovirus, enteroviruses, and human bocavirus among infants and children with acute gastroenteritis / Pham NT, Trinh QD, Chan-It W, [et al.]// J Virol Methods.

- 2010 - Vol.169(1) -P.193-197.

37 A novel RT-multiplex PCR for enteroviruses, hepatitis A and E viruses and influenza A virus among infants and children with diarrhea in Vietnam / Phan TG, Nguyen TA, Yan H [et al.]// Arch Virol. - 2005 - Vol.150, N6 -P.1175-1185.

38 A prospective study of persistent diarrhea among children in an urban Brazilian slum/ Schorling JB, Wanke CA, Schorling SK [et al.]// American Journal of Epidemiology - 1990 - Vol.132- P.144-156.

39 A reovirus-like agent (rotavirus) in gastroenteritis of children. Virus detection and serological studies / Orstavik I, Figenschau KJ, Haug KW, Ulstrup JC. // Scand J Infect Dis. - 1976 - Vol.8, N1 -P.1-5.

40 A simple and rapid single-step multiplex RT-PCR to detect Norovirus, Astrovirus and Adenovirus in clinical stool samples / Rohayem J, Berger S, Juretzek T [et al.]// J Virol Methods. - 2004 - Vol. 118(1) -P.49-59.

41 A single-tube multiplex PCR for rapid detection in feces of 10 viruses causing diarrhea / Khamrin P, Okame M, Thongprachum A [et al.]// J Virol Methods. - 2011 - Vol.173(2) -P.90-93.

42 Acute diarrhea associated with rotavirus among children in Belize, Brazil/ Linhares AC, Moncao HC, Gabbay YB [et al.]// Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene -1983- Vol.77- P. 384-390.

43 Adams, M.J. Ratification vote on taxonomic proposals to the International Committee on Taxonomy of Viruses/ MJ Adams, A.M.Q. King E.B. Carstens// - Archives of virology, - 2013 - P. 2023-2030.

44 Adenoviruses associated with acute gastroenteritis in hospitalized and community children up to 5 years old in Rio de Janeiro and Salvador, Brazil / Filho EP, da Costa Faria NR, Fialho M, [et al.]// J Med Microbiol - 2007 -Vol. 56 -P. 313-9.

45 Aetiological role of human parechovirus type 3 in neonatal sepsis identified by direct typing assay on cerebrospinal fluid / Harvala H, Robertson I, McWilliam Leitch C[et al.]// J Infect Dis - 2009 - Vol.199 -P.1753-1760.

46 Ahmed, S.M. A systematic review and meta-analysis of the global seasonality of norovirus/ Ahmed SM, Lopman BA, Levy K.// PLoS One. -2013 - Vol. 8(10) :e75922. doi: 10.1371/journal.pone.0075922. eCollection 2013.

47 Aichi virus shedding in high concentrations in patients with acute diarrhea/ Drexler JF, Baumgarte S, de Souza Luna LK [et al.]// Emerg Infect Dis. -2011- Aug;17(8) -P.1544-8.

48 An outbreak of gastroenteritis associated with calicivirus in an infant home / Chiba S, Sakuma Y, Kogasaka R [et al.]// J Med Virol - 1979 - Vol. 4(4) -P. 249-254.

49 Analysis of genetic diversity and molecular evolution of human group B rotaviruses based on whole genome segments/ Yamamoto, D., Ghosh, S., Ganesh, B. [et al.]// J Gen Virol - 2010 - Vol.91, - P.1772-1781.

50 Antigenic characterization of small, round-structured viruses by immune electron microscopy / Okada S., Sekine S., Ando T. [et al.]// J. Clin. Microbiol. - 1990. - Vol. 28. - P. 1244 - 1248.

51 Application of a reverse transcription-PCR for identification and differentiation of Aichi virus, a new member of the Picornavirus family associated with gastroenteritis in humans / Yamashita, T., Sugiyama, M., Tsuzuki, H. [et al.]// J. Clin. Microbiol. - 2000 - Vol.38, -P. 2955-2961.

52 Astrovirus and adenovirus associated with diarrhea in children in day care settings / Lew JF , Moe CL , Monroe SS [et al.]// J Infect Dis -1991 - Vol. 164.-P. 673 - 678.

53 Astrovirus infection among hospitalized children with acute diarrhea in seven regions of China, 1998-2005 / Fang ZY, Sun YP, Ye XH [et al.]// Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi - 2006 - Vol.27 -P. 673-676.

54 Astrovirus infection in association with acute, persistent and nosocomial diarrhea in Bangladesh / Unicomb LE, Banu NN, Azim T, Islam A [et al.]// Pediatr Infect Dis J - 1998 - Vol. 17 -P.611-614.

55 Babiuk, L A. Solid-phase radioimmunoassay for detecting bovine (neonatal calf diarrhea) rotavirus antibody/ Babiuk, L A., S. D. Acres, B. T. Rouse. // J. Clin. Microbiol. - 1977 -N6-P.10-15.

56 Beuret, C. Simultaneous detection of enteric viruses by multiplex real-time RT-PCR / Beuret C. // J Virol Methods. - 2004 - - Vol. 115, N1-P.1-8.

57 Blacklow Detection of Norwalk Virus in Stools by Enzyme lmmunoassay / John E. Herrmann, Nancy A. Nowak, Neil R.// Journal of Medical Virology

- 1985 - Vol.17 -P.127-133.

58 Blakeney, S.J. Processing of Norwalk virus nonstructural proteins by a 3C-like cysteine proteinase/Blakeney SJ, Cahill A, Reilly P.A// Virology. -2003

- Vol. 308- P. 216-224.

59 Blaser MJ, Smith PD, Ravdin JI, Greenberg HB, Guerrant RL [et al.]/ Group A rotaviruses /Infections of the gastrointestinal tract. New York: Raven Press; - 1995 - P. 967-981.

60 Bridger, J.C. Neonatal calf diarrhoea: identification of a reovirus-like (rotavirus) agent in faeces by immunofluorescence and immune electron microscopy/ Bridger J.C., Woode G.N.// Br Vet J - 1975 - Vol.131 -P. 528535.

61 Brown, M. Diagnosis of fastidious enteric adenoviruses 40 and 41 in stool specimens / Brown M, Petric M, Middleton PJ.// J Clin Microbiol. - 1984 -Vol.20(3)-P. 334-8.

62 Büchen-Osmond, C. /Norovirus. In: ICTVdB — The Universal Virus Database, version 4. ICTVdB Management (2006). Columbia University, New York, USA [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http: //www.ncbi. nlm.nih.gov/ICTVdb/ICTVdB/ .

63 Bull, R.A. Norovirus recombination/ Bull RA, Tanaka MM, White PA// J Gen Virol. - 2007 - Vol. 88- P.3347-3359.

64 Burroughs, J.N. Presence of a covalently linked protein on calicivirus RNA/ Burroughs J.N., Brown F. // J. Gen. Virol. - 1978. - Vol. 4. - P. 443 - 446.

65 Campe, H. Role of Human Bocavirus infections in outbreaks of gastroenteritis Role of Human Bocavirus infections in outbreaks of gastroenteritis / Campe H, Hartberger C, Sing A. // J Clin Virol. - 2008 -Vol.43(3)-P.340-2.

66 Candidate adenoviruses 40 and 41: fastidious adenoviruses from human infant stool / de Jong JC, Wigand R, Kidd AH, [et al.]// J Med Virol. - 1983

- N11(3) -P.215-231.

67 Cardioviruses are genetically diverse and cause common enteric infections in South Asian children / Blinkova, O., Kapoor, A., Victoria, J., Jones, M., [et al.]// J. Virol. - 2009 - Vol.83 -P. 4631-4641.

68 Characterization and manipulation of the human adenovirus 4 genome / Jacobs SC, Davison AJ, Carr S [et al.]// J Gen Virol. - 2004 - Vol.85, N 11, -P. 3361-3366.

69 Characterization of a rhesus monkey calicivirus representing a new genus of Caliciviridae/ Farkas T., Sestak K., Chao W. [et al.]// J. Virol. - 2008. -Vol. 82, N. 11. - P. 5408 - 5416.

70 Chernesky, M. A. Detection of viral antigens, particles, and early antibodies in diagnosis / Chernesky, M. A., J. B. Mahony.// Yale J. Biol. Med. - 1984

- Vol.57-P.757-776.

71 Child Health Epidemiology Reference Group of WHO and UNICEF (2010) Global, regional, and national causes of child mortality in 2008: a systematic analysis / Black RE, Cousens S, Johnson HL [et al.] // Lancet - 2010 -Vol.375. -P.1969-1987.

72 Chow, B.D. The human bocaviruses: a review and discussion of their role in infection/ Chow BD, Esper FP// Clin Lab Med. - 2009. - Vol. 29, N4 -P.695-713.

73 Circulation of 3 lineages of a novel Saffold cardiovirus in humans / Drexler, J.F., Luna, L.K., Stocker [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2008 - Vol.14, -P. 1398-1405.

74 Cleavage map and proteolytic processing of the murine norovirus nonstructural polyprotein in infected cells / Sosnovtsev SV, Belliot G, Chang KO [et al.]// J. Virol. - 2006 - Vol.80-P.7816 -7831.

75 Clinical manifestation of norovirus gastroenteritis in health care settings / Lopman BA, Reacher MH, Vipond IB [et al.]// Clin Infect Dis. - 2004 -Vol.39(3) -P.318-24.

76 Clinical presentation and molecular characterization of group B rotaviruses in diarrhoea patients in Bangladesh / Saiada, F., Rahman, H. N., Moni, S. [et al.]// J Med Microbiol - 2011 - Vol. 60- P. 529-536.

77 Clinical utility of nested multiplex RT-PCR for group F adenovirus, rotavirus and norwalk-like viruses in acute viral gastroenteritis in children and adults / O'Neill HJ, McCaughey C, Coyle PV, Wyatt DE, Mitchell F. // J Clin Virol. - 2002 - Vol.25(3) -P.335-343.

78 Cloning of a human parvovirus by molecular screening of respiratory tract samples / Allander T, Tammi MT, Eriksson M, [et al.]// Proc Natl Acad Sci USA - 2005 - Vol.102 -P. 12891-6.

79 Comparative epidemiology of rotavirus, subgenus F (types 40 and 41) adenovirus and astrovirus gastroenteritis in children / Bates PR , Bailey AS , Wood DJ [et al.]// J Med Virol - 1993 - Vol.39 -P. 224 - 228.

80 Comparison between specific and multiplex reverse transcription-polymerase chain reaction for detection of hepatitis A virus, poliovirus and rotavirus in experimentally seeded oysters / Coelho C, Vinatea CE, Heinert AP, [et al.]// Mem Inst Oswaldo Cruz. - 2003 - Vol.98(4) -P.465-468.

81 Comparison of direct electron microscopy,immune electron microscopy, and rotavirus enzyme-linked immunosorbentassay for detection of gastroenteritis viruses in children / Brandt, C. D., H. W. Kim, W. J. Rodriguez, L [et al.]// J. Clin. Microbiol. - 1981 - N13 -P.976-981.

82 Comparison of ELISA, SPACE, and electron microscopy for the routine diagnosis of rotavirus infection / Wall RA, Mellars BJ, Luton P, Boulding S. //J Clin Pathol. - 1982 - Vol.35, N1 -P.104-106.

211

83 Comparison of six methods for detecting human rotavirus in stools / Morinet, F., F. Ferchal, R. Colimon, Y. Perol.// Eur. J. Clin. Microbiol. - 1984 - N3 -P.136-140.

84 Comparison of specific and random priming in the reverse transcriptase polymerase chain reaction for genotyping group A rotaviruses / Iturriza-Gomara M, Green J, Brown DW, Desselberger U, Gray JJ. // J Virol Methods. - 1999 - Vol.78(1-2) -P.93-103.

85 Comparison of the polymerase region of small round structured virus strains previously classified in three antigenic types by solid-phase immune electron microscopy / Ando T, Mulders MN, Lewis DC [et al.] // Arch Virol. - 1994 - Vol.135(1-2) -P.217-226.

86 Correlation of patient immune responses with genetically characterized small round-structured viruses involved in outbreaks of nonbacterial acute gastroenteritis in the United States, 1990 to 1995 / Noel JS, Ando T, Leite JP [et al.] // J Med Virol. - 1997 - Vol.53(4) -P.372-383.

87 Cortese, M.M. CDC. Prevention of rotavirus gastroenteritis among infants and children: Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP) / Cortese MM, Parashar UD// MMWR -2009 - Vol. 58 (No. RR-2.).

88 Cosavirus infection in persons with and without gastroenteritis, Brazil / Stocker, A., Souza, B.F., Ribeiro, T.C. [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2012 -N.18 -P. 656-659.

89 Coulson, B. VP4 and VP7 typing using monoclonal antibodies / Coulson B// Arch Virol Suppl. - 1996 - N12- P.113-118.

90 Counter-immunoelectroosmophoresis for the detection of infantile gastroenteritis virus (orbi-group) antigen and antibody / Middleton PJ, Petrie M, Hewitt CM [et al.]// J Clin Pathol - 1979 - Vol.29 -P.191-197.

91 Crystal structures of active and inactive conformations of a caliciviral RNA-dependent RNA polymerase / Ng KK, Cherney MM, Vazquez AL [et al.]// J. Biol. Chem. -2002- Vol. 277-P. 1381-1387.

212

92 Cultivation and serological characterization of a human Theiler'slike cardiovirus associated with diarrheal disease / Chiu, C.Y., Greninger, A.L., Chen, E.C., Haggerty, T.D., [et al.]// J. Virol. - 2010 - Vol.84 -P. 4407-4414.

93 Current status and future priorities for rotavirus vaccine development, evaluation and implementation in developing countries/ Bresee JS, Glass RI, Ivanoff B, Gentsch JR.// Vaccine - 1999 - Vol.17- P. 2207-22.

94 Detection and characterization of group C rotavirus in Buenos Aires, Argentina, 1997-2003./ Castello AA, Arguelles MH, Rota RP [et al.]// J Med Virol. - 2009 - Vol.81, N6 - P.1109-16.

95 Detection and characterization of sapoviruses in outbreaks of gastroenteritis in southwest Germany / Ike, A. C., K. Hartelt, R. M. Oehme, S. O. Brockmann // J. Clin. Virol. - 2008 - Vol.43, -P.37-41.

96 Detection and differentiation of porcine epidemic diarrhoea virus and transmissible gastroenteritis virus in clinical samples by multiplex RT-PCR /Kim O, Choi C, Kim B, Chae C.// Vet Rec. - 2000 - Vol.146(22) -P.637-640.

97 Detection and genotyping of human group A rotaviruses by oligonucleotide microarray hybridization / Chizhikov V, Wagner M, Ivshina A, Hoshino Y, Kapikian AZ, Chumakov K. / J Clin Microbiol. - 2002 - Vol.40, N7. -P.2398-2407.

98 Detection and molecular characterization of cosavirus in adults with diarrhea, Thailand / Khamrin, P., Chaimongkol, N., Malasao, R. [et al.]// Virus Genes - 2012 - Vol.44, -P.244-246.

99 Detection of a new virus by electron microscopy of faecal extracts from children with acute gastroenteritis/ Bishop RF, Davidson GP, Holmes IH, Ruck BJ.// Lancet. - 1974 - Feb 2;1(7849) -P.149-51.

100 Detection of enteric adenoviruses by dot-blot hybridization using a molecularly cloned viral DNA probe / Takiff HE, Seidlin M, Krause P [et al.]// J Med Virol. - 1985 - Vol16(2) -P.107-118.

101 Detection of group B rotavirus in an adult with acute gastroenteritis in Yangon, Myanmar/ Aung, T. S., Kobayashi, N., Nagashima, S. [et al.]// J Med Virol - 2009 - Vol.81, - P.1968-1974.

102 Detection of human bocavirus in Japanese children with lower respiratory tract infections / Ma X, Endo R, Ishiguro N [et al.]// J Clin Microbiol - 2006

- Vol.44 -P. 1132-1134.

103 Detection of human rotavirus by reversed passive hemagglutination (RPHA) using antibody against a cultivable human rotavirus as compared with electron microscopy (EM) and enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) / Nakagomi, O., A. Nakagomi, T. Suto [et al.]// Microbiol. Immunol. - 1982

- Vol.26 -P.747-751.

104 Detection of newly described astrovirus MLB1 in stool samples from children / Finkbeiner SR, Le BM, Holtz LR [et al.]// Emerg Infect Dis. -2009 - Vol. 15, N3. -P.441-4.

105 Detection of norovirus, sapovirus, and human astrovirus in fecal specimens using a multiplex reverse transcription-PCR with fluorescent dye-labeled primers / Shigemoto N, Fukuda S, Tanizawa Y [et al.]// Microbiol Immunol.

- 2011 - Vol.55, N5. -P.369-372.

106 Detection of Norwalk virus antibodies and antigen with a biotin-avidin immunoassay / Gary GW Jr, Kaplan JE, Stine SE, Anderson LJ// J Clin Microbiol. - 1985 - Vol. 22 N8. -P. 274-8.

107 Detection of Norwalk virus in stool by polymerase chain reaction / Jiang X, Wang J, Graham DY, Estes MK.// J Clin Microbiol. - 1992 - Vol.30, N10 -P.2529-2534.

108 Development of a serological assay based on a synthetic peptide selected from the VP0 capsid protein for detection of human parechoviruses / Abed Y, Wolf D, Dagan R, Boivin G. // J Clin Microbiol - 2007 - Vol.45 -P.2037-2039.

109 Development of RT-multiplex PCR assay for detection of adenovirus and group A and C rotaviruses in diarrheal fecal specimens from children in China / Yan H, Nguyen TA, Phan TG [et al.]// Kansenshogaku Zasshi. -2004 - Vol.78, N8. -P.699-709.

110 Diagnosis of strovirus gastroenteritis by antigen detection with monoclonal antibodies / Herrmann JE, Nowak NA, Perron-Henry DM [et al.]// J Infect Dis. - 1990 - Vol.161, N2 -P.226-229.

111 Diagnosis of rotavirus using viral RNA electrophoresis / Espejo R, Romero P, Calder6n E, GonzAlez N// Bol Med Hosp Infant Mex - 1978 - Vol.35 -P.323-331.

112 Diagnosis of viral gastroenteritis by simultaneous detection of Adenovirus group F, Astrovirus, Rotavirus group A, Norovirus genogroups I and II, and Sapovirus in two internally controlled multiplex real-time PCR assays /Maarseveen NM, Wessels E, Brouwer CS [et al.]// J Clin Virol. - 2010 -Vol.49(3) -P.205-10.

113 Diagnostic accuracy and analytical sensitivity of IDEIA Norovirus assay for routine screening of human norovirus /Costantini V, Grenz L, Fritzinger A [et al.]// J Clin Microbiol. - 2010 - Vol.48, N8. -P.2770-2778.

114 Discovery of a novel human picornavirus in a stool sample from a pediatric patient presenting with fever of unknown origin / Jones MS, Lukashov VV, Ganac RD, Schnurr DP. // J Clin Microbiol. - 2007 - Vol.45, N7 -P.2144-2150.

115 Diversity and zoonotic potential of rotaviruses in swine and cattle across Europe / Midgley SE, Banyai K, Buesa J, [et al.] // Vet Microbiol. - 2012 -Vol.156(3-4) -P.238-245.

116 Doern, GV Detection of rotavirus with a new polyclonal antibody enzyme immunoassay (Rotazyme II) and a commercial latex agglutination test (Rotalex): comparison with a monoclonal antibody enzyme immunoassay/ Doern GV, Herrmann JE, Henderson P// J Clin Microbiol. - 1986 - N2 -P.226-9.

117 Effect of concomitant HIV infection on presentation and outcome of rotavirus gastroenteritis in Malawian children/ Cunliffe NA, Gondwe JS, Kirkwood CD [et al.]// Lancet - 2001 - Vol.358- P.550-555.

118 Ehrnst, A. Echovirus type 23 observed as a nosocomial infection in infants/ Ehrnst A, Eriksson M. // Scand J Infect Dis - 1996 - Vol.28-P.205-6.

119 Electron microscopy of HeLa cells infected with agents of the adenovirus (APC-RI-ARD) group / Lagermalm G, Kjellen L, Thorsson K, Svedmyr A.// Arch Gesamte Virusforsch. - 1957 -N7(3) -P.221-241.

120 Ellens, D.J. Detection of infantile gastroenteritis virus (rotavirus) by ELISA / Ellens DJ, de Leeuw PW // Lancet - 1977 - N1- P. 1363-1364.

121 Emergence of adult diarrhoea rotavirus in Calcutta, India/ Krishnan, T., Sen, A., Choudhury, J. S. [et al.]// Lancet - 1999 - Vol. 353- P. 380-381.

122 Emerging themes in rotavirus cell entry, genome organization, transcription and replication/ Jayaram H., Estes M.K., Prasad V. // Virus Research. -2004. - Vol. 101. - P. 67-81.

123 Engvall, E. Enzyme-hnked immunosorbent assay (ELISA). Quantitative assay of immunoglobulin G / Engvall, E., P. Perlmann.// Immunochemistry - 1971 -N 8-P.871-874.

124 Enriquez CE / Adenoviruses . In: Bitton G (ed.) Encyclopedia of environmental microbiology , Vol. 1 . John Wiley & Sons, Inc. , New York, NY , -2002. -P. 92 - 100 .

125 Enteric adenovirus infection and childhood diarrhea: An epidemiologic study in three clinical settings / Kotloff KL, Losonsky GA, Morris JG Jr[et al.]// Pediatrics - 1989 - Vol. 84 -P. 219-25.

126 Enterovirus surveillance—United States, 1970-2005 / Khetsuriani N, Lamonte-Fowlkes A, Oberst S, Pallansch MA. // MMWR Surveill Summ -2006 - N55 -P.1-20.

127 Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) for detection of human reovirus-like agent of infantile gastroenteritis / Yolken RH, Kim HW, Clem T [et al.]// Lancet - 1977 - N2 -P.263-267.

128 Enzyme-linked immunosorbent assays for Snow Mountain and Norwalk agents of viral gastroenteritis / Madore HP, Treanor JJ, Pray KA, Dolin R. // J Clin Microbiol. - 1986 - Vol.24(3) N9. -P.456-459.

129 Epidemiological and genetic characteristics of norovirus outbreaks in long-term care facilities, 2003-2006 / Rosenthal NA, Lee LE, Vermeulen BA [et al.]// Epidemiol Infect. -2011- Vol.139 N2 -P.286-94.

130 Epidemiological profile and clinical associations of human bocavirus and other human parvoviruses / Manning A, Russell V, Eastick K [et al.]// J Infect Dis - 2006 - Vol.194 -P.1283-1290.

131 Epidemiology and genotype analysis of emerging sapovirus-associated infections across Europe /Svraka S1, Vennema H, Veer B[et al.]// J Clin Microbiol. - 2010 - Vol.48 N6. -P.2191-8.

132 Epidemiology and Genotype Analysis of Sapovirus Associated with Gastroenteritis Outbreaks in Alberta, Canada: 2004-2007 / Pang XL, E. Lee BL, Tyrrell GJ [et al.]// The Journal of Infectious Diseases - 2009 -Vol. 199, -P.547-51.

133 Epidemiology of enteric adenoviruses 40 and 41 in acute gastroenteritis in infants and young children in the Tokyo area / Shinozaki T , Araki K , Fujita Y [et al.]// Scand J Infect Dis - 1991 - Vol.23 -P. 543 - 547.

134 Epidemiology of Group C Rotavirus Gastroenteritis in Matsuyama/ Ishimaru Y, Nakano S, Nakano H, [et al.]// Japan Acta Paediatr Jpn - 1991- ; 33- P. 50-56 .

135 Epidemiology of human Sapporo-like caliciviruses in the South West of England: molecular characterisation of a genetically distinct isolate / Robinson, S., I. N. Clarke, I. B. Vipond [et al.]// J. Med. Virol. - 2002- Vol. 67 -P.282-288.

136 Epidemiology of Norwalk gastroenteritis and the role of Norwalk virus in outbreaks of acute nonbacterial gastroenteritis / Kaplan JE, Gary GW, Baron RC [et al.]// Annals of Internal Medicine - 1982 - Vol.96 -P.756-761.

137 Epidemiology of norovirus gastroenteritis in Germany 2001-2009: eight seasons of routine surveillance/ Bernard H., Höhne M., Niendorf S. [et al.]// Epidemiol. Infect. - 2013 - Mar 21-P.1-12.

138 Epochal evolution of GGII.4 norovirus capsid proteins from 1995 to 2006 / Siebenga JJ, Vennema H, Renckens B [et al.]// J Virol - 2007 - Vol.81, -P.9932-9941.

139 Estes M. K. Rotaviruses and their replication. In Fields B.N. Knipe D.N., Howley P.M., Griffin D.E. [et al.]// Virology, Philadelphia, 2001. - P. 17471785.

140 Etiological study on sporadic viral gastroenteritis among adult in Beijing / Chen M.F., Gao Y., Cong X. [et al.]// Zhonghua Yi Xue Za Zhi. - 2008. -Vol. 88, No. 4. - P. 265 - 267.

141 Ettayebi, K. Norwalk virus nonstructural protein p48 forms a complex with the SNARE regulator VAP-A and prevents cell surface expression of vesicular stomatitis virus G protein/ Ettayebi K, Hardy ME// J. Virol. - 2003 -Vol. 77- P.11790- 11797.

142 Evaluation of a multiplex real time reverse transcription PCR assay for the detection and quantitation of the most common human rotavirus genotypes / Kottaridi C, Spathis AT, Ntova CK, Papaevangelou V, Karakitsos P.// J Virol Methods. - 2012 - Vol.180(1-2) -P.49-53.

143 Evaluation of a newly developed immunochromatographic method for detection of norovirus / Okame M, Yan H, Akihara S, Okitsu S [et al.]// Kansenshogaku Zasshi. - 2003 - Vol.77, N8. -P.637-963.

144 Evaluation of a rapid immunochromatography strip test for detection of astrovirus in stool specimens / Khamrin P, Dey SK, Chan-it W [et al.]// J Trop Pediatr. - 2010 - Vol.56(2) N4. -P.129-131.

145 Evaluation of rapid diagnostic methods for pediatric viral diarrhea using samples collected in Nepal and Japan / Kurokawa M, Ono K, Ishiyama S, Rai SK. // Nepal Med Coll J. - 2004 - N.6(2) -P.78-82.

146 Evaluation of the diagnostic reagents which detect rotavirus and adenovirus with the immunochromatographical method / Kojima T, Arai M, Sadamoto S, Ikeda M, Araki K. // Rinsho Biseibutshu Jinsoku Shindan Kenkyukai Shi.

- 2000 - Vol.11, N2. -P.93-8.

147 Evidence for airborne transmission of Norwalk-like virus (NLV) in a hotel restaurant / Marks P.J., Vipond I.B., Careisle D. [et al.]// Epidemiol. Infect.

- 2000. - Vol. 124. - P. 481 - 487.

148 Examination of uncommon clinical isolates of human adenoviruses by restriction endonuclease analysis / Hammond GW, Mauthe G, Joshua J, Hannan CK. // J Clin Microbiol. - 1985 - Vol.21, N4 -P.611-616.

149 Existence of multiple outbreaks of viral gastroenteritis among infants in a day care center in Japan / Akihara S, Phan TG, Nguyen TA [et al.] // Arch Virol. - 2005 - Vol. 150, N10. -P.2061-2075.

150 Extended excretion of rotavirus after severe diarrhoea in young children / Richardson S, Grimwood K, Gorrell R [et al.] // Lancet. - 1998 - Vol.351, -P.1844-1848.

151 Finkbeiner, S.R. Complete genome sequence of a highly divergent astrovirus isolated from a child with acute diarrhea/ Finkbeiner SR, Kirkwood CD, Wang D. // Virol J. -2008 - Vol. 14-P.5:117.

152 First detection of group C rotavirus in children with acute gastroenteritis in South Korea/ Moon S, Humphrey CD, Kim JS [et al.]// Clin Microbiol Infect. - 2011- Vol.17, N2 - P.244-7.

153 Foodborne illness acquired in the United States—major pathogens / Scallan E, Hoekstra RM, Angulo FJ [et al.]// Emerg Infect Dis - 2011 - Vol.17 -P. 715.

154 Food-related illness and death in the United States. Reply to Hedberg / Mead, P. S., L. Slutsker, P. M. Griffin, R. V. Tauxe.// Emerg. Infect. Dis. - 1999-N5 -P.841-842.

155 Foy HM / Adenoviruses . In: Evans AS , Kaslow RA (eds.) Viral infections of humans: epidemiology and control , 4 th Ed. Plenum Publishing Corporation , New York, NY , - 1997. -P. 119 - 138.

156 Fredericks, D.N. "Sequence-based identification of microbial pathogens: a reconsideration of Koch's postulates"/ Fredericks DN, Relman DA // Clin Microbiol Rev - 1996- N9 (1)-P. 18-33.

157 Frequent detection of human rhinoviruses, paramyxoviruses, coronaviruses,and bocavirus during acute respiratory tract infections / Arden KE, McErlean P, Nissen MD [et al.]// J Med Virol - 2006 - Vol.78 -P. 12321240.

158 Full genome-based classification of rotaviruses reveals a common origin between human Wa-Like and porcine rotavirus strains and human DS-1-like and bovine rotavirus strains / Matthijnssens J, Ciarlet M, Heiman E [et al.]// J Virol. - 2008 - Vol. 82(7) - P. 3204-3219.

159 Gastroenteritis viruses: an overview / Glass RI, Bresee J, Jiang B [et al.]// Novartis Found Symp. - 2001 - Vol.238 -P.5-25.

160 Genetic analysis of group B human rotaviruses detected in Bangladesh in 2000 and 2001/ Ahmed, M. U., Kobayashi, N., Wakuda, M. [et al.]// J Med Virol - 2004 - Vol. 72, - P. 149-155.

161 Genetic diversity among sapoviruses / Farkas T, Zhong WM, Jing Y [et al.]// Arch Virol - 2004 - Vol. 149 -P.1309-1323.

162 Genetic diversity and recombination of porcine sapoviruses / Wang QH, Han MG, Funk JA, Bowman G [et al.]// J Clin Microbiol. - 2005 - Vol. 43, N1, -P. 5963 - 5972.

163 Genetic diversity of norovirus and sapovirus in hospitalized infants with sporadic cases of acute gastroenteritis in Chiang Mai, Thailand / Hansman GS, Katayama K, Maneekarn N [et al.]// J Clin Microbiol -2004 Vol. 42 -P.1305-1307.

164 Genetic diversity of the genus Cosavirus in the family Picornaviridae: a new species, recombination, and 26 new genotypes / Kapusinszky, B., Phan, T.G., Kapoor, A., Delwart, E.// PLoS One - 2012 - N7, e36685.

165 Genomic characterization of human rotavirus G10 strains from the African Rotavirus Network: relationship to animal rotaviruses/ Esona MD, Banyai K, Foytich K [et al.]// Infect Genet Evol. - 2011 - Vol.11(1) - P. 237-241.

166 Ghose, L. Comparison of an Enzyme-Linked Immunosorbent Assay for Quantitation of Rotavirus Antibodies with Complement Fixation in an Epidemiological Survey/ Ghose L, Schnagl R, Holmes I // JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY. -1978 - N.9 -P. 268-276.

167 Glass, R.I. Norovirus gastroenteritis/ Glass RI, Parashar UD, Estes MK. // N Engl J Med - 2009 - Vol. 361- P.1776-85.

168 Global review of rotavirus morbidity and mortality data by age and region. Sanderson C, Clark A, Taylor D [et al.]// Report to WHO/IVB, 2011 [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http: //www. who. int/immunization/sage/meetings/2012/april/Sanderson_et_ al_SAGE_April_rotavirus.pdf .

169 Gonin, P. Genetic diversity and molecular epidemiology of Norwalk-like viruses / Gonin P, Couillard M, d'Halewyn MA.// J Infect Dis. - 2000 -Vol.182, N3-P.691-7.

170 Grauballe, P. C. Comparison of indirect double antibody and double antibody sandwich ELISA techniques with latex agglutination test for the diagnosis of human rotavirus infection / Grauballe, P. C., Z. Jarzabek. // Acta Virol. -1984 - Vol. 28-P. 59-63.

171 Green Kim Y Caliciviridae: The Noroviruses. Knipe David M, Howley Peter M. Fields Virology 5th Edition 2007 950 - 979.

172 Greenberg, H.B. Detection of Norwalk agent antibody and antigen by solidphase radioimmunoassay and immune adherence hemagglutination assay / Greenberg HB, Kapikian AZ.// J Am Vet Med Assoc. - 1978 - Vol.173, -P. 620-3.

173 Grist, N.R. Enteroviruses in human disease / Grist NR, Bell EJ, Assaad F// Prog Med Virol - 1978 - Vol.24 -P. 114-57.

174 Grohman, G.S. Viral diarrhoea in children in Australia/ Grohman G.S. Tzipori S. // Infectious diarrhoea in the young. - 1985. - P. 25 - 28.

175 Group B rotavirus infection in patients with acute gastroenteritis from India: 1994-1995 and 2004-2010/ Lahon, A., Maniya, N. H., Tambe, G. U. [et al.]// Epidemiol Infect. - 2012 - Vol.141, N5 - P.969-75.

176 Guerrero, M.L. A prospective study of astrovirus diarrhea of infancy in Mexico City/ Guerrero ML, Noel JS, Mitchell DK // Pediatr Infect Dis J -1998 - Vol.17-P.723-7.

177 Healthcare-associated viral gastroenteritis among children in a large pediatric hospital, United Kingdom / Cunliffe NA, Booth JA, Elliot C [et al.]// Emerg Infect Dis - 2010 - Vol.16 -P. 55-62.

178 Hedberg, C.W. Outbreaks of food-borne and waterborne viral gastroenteritis/ Hedberg CW, Osterholm MT.// Clin Microbiol Rev. - 1993 - N6(3)- P.199-210.

179 Herrmann, J.E. Antigen detection with monoclonal antibodies for the diagnosis of adenovirus gastroenteritis/ Herrmann JE, Perron-Henry DM, Blacklow NR.// J Infect Dis. - 1987 - Vol.155(6)-P. 1167-71.

180 High prevalence of human parechovirus genotypes in the Amsterdam region and the identification of specific HPeV variants by direct genotyping of stool samples / Benschop K, Thomas X, Serpenti C[et al.]// J Clin Microbiol -2008 - Vol.46 -P.3965-3970.

181 Hilleman, M. R. Recovery of new agent from patient with acute respiratory illness/ Hilleman M. R. Werner J. H. // Proc. Soc. exp. Biol.-1954 - ,N.Y. iS,-P.183.

182 Himeda, T. Saffold virus, a novel human Cardiovirus with unknown pathogenicity/ Himeda T., Ohara Y.,//. J. Virol. - 2012 - Vol. 86-P. 12921296.

183 Hospital-based surveillance of rotavirus and other viral agents of diarrhea in children and adults in Russia, 2005-2007 / Podkolzin AT, Fenske EB, Abramycheva NY, [et al.]// J Infect Dis. - 2009 - N1;200 Suppl 1 -P.228-233.

184 Human bocavirus and acute wheezing in children / Allander T, Jartti T, Gupta S [et al.]// Clin Infect Dis - 2007 - Vol.44 -P.904-910.

185 Human Bocavirus in Children Hospitalized for Acute Gastroenteritis: A Case-Control Study / Wei-xia Cheng, Yu Jin,,a Zhao-jun Duan, Zi-qian Xu [et al.]// Clin Infect Dis. - 2008 - Vol.47(2) -P.161-167.

186 Human bocavirus infection in young children in the United States: molecular epidemiological profile and clinical characteristics of a newly emerging respiratory virus / Kesebir D, Vazquez M, Weibel C [et al.]// J Infect Dis -2006 - Vol.194 -P. 1276-1282.

187 Human bocavirus, a respiratory and enteric virus / Vicente D, Cilla G, Montes M [et al.]// Emerg Infect Dis - 2007 - Vol.13 -P.636-637.

188 Human bocavirus: a novel parvovirus epidemiologically associated with pneumonia requiring hospitalization in Thailand /Fry AM, Lu X, Chittaganpitch M [et al.]// J Infect Dis - 2007 - Vol.195 -P.1038-1045.

189 Human bocavirus: prevalence and clinical spectrum at a children's hospital / Arnold JC, Singh KK, Spector SA, Sawyer MH.// Clin Infect Dis - 2006 -Vol.43 -P.283-288.

190 Human bocavirus-the first 5 years / Jartti T, Hedman K, Jartti L [et al.] // Rev Med Virol. - 2012 - Jan;22(1) -P.46-64.

191 Human cosavirus infections in children in China / Dai, X.Q., Hua, X.G., Shan, T.L. [et al.]// J. Clin. Virol. - 2010 - Vol.48, -P.228-229.

192 Human enteric Caliciviridae: a new prevalent small round-structured virus group defined by RNA-dependent RNA polymerase and capsid diversity / Green SM, Dingle KE, Lambden PR [et al.]// J Gen Virol - 1994 - Vol.75 -P.1883-1888.

193 Human parechovirus infections in Dutch children and the association between serotype and disease severity / BenschopKS, Schinkel J, Minnaar RP[et al.]// Clin Infect Dis - 2006 - Vol.42 -P.204-210.

194 Human sapovirus classification based on complete capsid nucleotide sequences / Oka T, Mori K, Iritani N [et al.]// Arch Virol -2012 - Vol.157, -P-349-352.

195 Human stool contains a previously unrecognized diversity of novel astroviruses./ Finkbeiner SR, Holtz LR, Jiang Y [et al.]// Virol J. - 2009 -Vol.8;6 -P.161.

196 Hutson, A.M. Norovirus disease: changing epidemiology and host susceptibility factors/ Hutson A.M., Atmar R.L., Estes M.K. // Trends in Microbiology. - 2004. - Vol. 12, N 6. - P. 279 - 286.

197 ICTV dB INDEX of Viruses [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http: //ictvdb.bio-mirror.cn/Ictv/fs_astro .htm.

198 Identification of a novel astrovirus (astrovirus VA1) associated with an outbreak of acute gastroenteritis / Finkbeiner SR, Li Y, Ruone S [et al.]// J. Virol. - 2009 - Vol. 83 (20) -P. 10836-9.

199 Identification of a novel picornavirus related to cosaviruses in a child with acute diarrhea / Holtz, L.R., Finkbeiner, S.R., Kirkwood, C.D., Wang, D., // Virol. J. - 2008 - N.5, -P.159.

200 Identification of cardioviruses related to Theiler's murine encephalomyelitis virus in human infections / Chiu, C.Y., Greninger, A.L., Kanada, K., [et al.]// Proc. Natl. Acad. Sci. USA - 2008 - Vol105. N9. -P 14124-14129.

201 Identification of group A rotavirus gene 4 types by polymerase chain reaction/ Gentsch JR, Glass RI, Woods P [et al.]// J Clin Microbiol. - 1992 - Vol.30(6) - P. 1365-1373.

202 Identification of human astrovirus infections among children with acute gastroenteritis in the Southern Part of Vietnam during 2005-2006 / Nguyen TA, Hoang L, Pham le D [et al.]// J Med Virol - 2008 - Vol. 80 -P. 298-305.

203 Immature and mature human astrovirus: structure, conformational changes, and similarities to hepatitis E virus /Dryden KA, Tihova M, Nowotny N [et al.]// J Mol Biol. - 2012 - Vol. 422(5) -P.650-658.

204 Immunofluorescent cell assay of neonatal calf diarrhoea virus / Barnett BB, Spendlove RS, Peterson MW [et al.]// Can J Comp Med - 1975 - Vol.39 -P.462-465.

205 Importance of enteric adenoviruses 40 and 41 in acute gastroenteritis in infants and young children / Uhnoo I, Wadell G, Svensson L, Johansson ME.// J Clin Microbiol. - 1984 - Vol.20(3) -P.365-372.

206 In vitro proteolytic processing of the MD145 norovirus ORF1 nonstructural polyprotein yields stable precursors and products similar to those detected in calicivirus-infected cells / Belliot G, Sosnovtsev SV, Mitra T [et al.]// J. Virol. - 2003 - Vol. 77. -P. 10957-10974.

207 Incubation periods of viral gastroenteritis: a systematic review / Lee RM, Lessler J, Lee RA [et al.]// BMC Infect Dis. - 2013 - Vol.25;13 -P.446.

208 Investigation of an outbreak of adult diarrhea rotavirus in China/ Fang, Z.Y., Ye, Q., Ho, M.S. [et al.]// J Infect Dis - 1989 - Vol. 160- P. 948-953.

209 Isolation of a cytopathogenic agent from human adenoids undergoing spontaneous degeneration in tissue culture / Rowe, W. P., Huebner, R. J., Gilmore, L. K. [et al.]// Proc. Soc. exp. Biol. -1953 - Vol. 84, P-570.

210 Jutta, K. Preiksaitis Epidemiology and Genotype Analysis of Sapovirus Associated with Gastroenteritis Outbreaks in Alberta, Canada: 2004-2007/ Jutta K. // The Journal of Infectious Diseases - 2009 - Vol.199-P.547-51.

211 Kapikian AZ, Cline WL, Greenberg HB [et al.]// (1981a) Antigenic characterization of human and animal rotaviruses by immune adherence hemagglutination assay (lAHA): evidence for distinctness oflAHA and neutralization antigens. Infect Immun 33:415-425.

212 Kapikian, A. Z. Overview of viral gastroenteritis/ Kapikian AZ// Arch. Virol. - 1996 - Suppl. N12- P. 7-19.

213 Klassevirus infection in children, South Korea / Han, T.H., Kim, C.H., Chung, J.Y. [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2010 - N16, -P.1623-1625.

214 Klingenberg, V. K. Evaluation of a one-step test for rapid, in practice detection of rotavirus in farm animals / Klingenberg V. K, Esfandiari J.// Vet Rec. - 1996 - Vol. 138, N16, -P.393-5.

215 Koopmans, M. Progress in understanding norovirus epidemiology/ Koopmans M.// Curr Opin Infect Dis. - 2008 - Vol. 21- P.544-52.

216 Koopmans, M. Toroviruses of animals and humans: a review/ Koopmans M, Horzinek MC.// Adv Virus Res. - 1994 - Vol. 43-P.233-73.

217 Kumazaki, M. Epidemiological and genetic analysis of human group C rotaviruses isolated from outbreaks of acute gastroenteritis in Yokohama, Japan, between 2006 and 2012/ Kumazaki M, Usuku S.// Arch Virol. - 2014 - Vol. 159(4) - P.761-71.

218 Kurtz, J. Astrovirus gastroenteritis age distribution of antibody / Kurtz J, Lee T. // Med Microbiol Immunol. - 1978 - Vol.17, -P. 227-230.

219 Latex agglutination test for adenovirus diagnosis in diarrheal disease / Grandien M, Pettersson CA, Svensson L, Uhnoo I.//J Med Virol. -1987 -Vol23(4) -P.311-316.

220 Lee, TW Human astrovirus serotypes/ Lee TW, Kurtz JB.// J Hyg (Lond). -1982 - N 89(3)-P.539-40.

221 Lessons from a large norovirus outbreak: impact of viral load, patient age and ward design on duration of symptoms and shedding and likelihood of transmission / Partridge DG, Evans CM, Raza M [et al.] // J Hosp Infect. -2012 - Vol.81(1) -P.25-30.

222 Liu, B. Polyprotein processing in Southampton virus: identification of 3C-like protease cleavage sites by in vitro mutagenesis / Liu B, Clarke IN, Lambden PR// J. Virol. 1996.-Vol. 70- P.2605-2610.

223 Longitudinal observation of parechovirus in stool samples from Norwegian infants / Tapia G, Cinek O, Witso E [et al.]// J Med Virol - 2008 - Vol.80 -P.1835-1842.

224 Longitudinal studies of infectious disease and physical growth of children in rural Bangladesh 2. Incidence of diarrhea and association with known pathogens/ Black RE, Brown KH, Becker S [et al.]// American Journal of Epidemiology - 1982 - Vol. 115- P. 315-324.

225 Longitudinal study of infectious intestinal disease in the UK (IID2 study): incidence in the community and presenting to general practice/ Tam CC, Rodrigues LC, Viviani L. [et al.] //. Gut - 2012 - Vol.61 -P. 69-77.

226 Madeley, C.R. 28 nm particles in faeces in infantile gastroenteritis / Madeley CR, Cosgrove BP // Lancet - 1975 - N2, -P. 451-452.

227 Madeley, C.R. Caliciviruses in man/ Madeley C.R., Cosgrove B.P. // Lancet. - 1976. - Vol. 1. - P. 199 - 200.

228 Major, M.E. 3' terminal nucleotide sequence of human astrovirus type 1 and routine detection of astrovirus nucleic acid and antigens / Major ME, Eglin RP, Easton AJ. // J Virol Methods. - 1992 - Vol.39, N(1-2)-P. 217-25.

229 Mechanisms of GII.4 norovirus persistence in human populations/ Lindesmith LC, Donaldson EF, Lobue AD [et al.]// PLoS Med 2008 ;5:e31.

230 Mena, K.D. Waterborne Adenovirus/ K.D. Mena, C.P. Gerba // Rev Environ Contam Toxicol. - 2009 - Vol. 198-P.133-67.

231 Mendez E, Arias CF. Astroviruses. Fields Virology Philadelphia: Lippincott Williams & Wilkins Knipe DM, Howley PM , 5 2007, 1:981-1000.

232 Metagenomic analysis of human diarrhea: viral detection and discovery / Finkbeiner SR, Allred AF, Tarr PI [et al.]// PLoS Pathog. - 2008 -Vol.29;4(2):e1000011.

233 Microarrays for genotyping human group a rotavirus by multiplex capture and type-specific primer extension / Lovmar L, Fock C, Espinoza F, Bucardo F, Syvänen AC, Bondeson K. // J Clin Microbiol. - 2003 - Vol.41, N11. -P.5153-5158.

234 Molecular characterization of a novel adult diarrhoea rotavirus strain J19 isolated in China and its significance for the evolution and origin of group B rotaviruses/ Jiang S, Ji S, Tang Q [et al.]// J Gen Virol - 2008 - 89 - P. 2622-2629.

235 Molecular characterization of group C rotaviruses detected in children in Italy./ Medici MC, Abelli LA, Martinelli M [et al.]// J Clin Virol. - 2009 -Vol. 44, N1 - P.62-5.

236 Molecular epidemiology and genetic diversity of human astrovirus in South Korea from 2002 to 2007 / Jeong AY, Jeong HS, Jo MY [et al.]// Clin Microbiol Infect - 2011 - Vol. 17 -P.404-408.

237 Molecular epidemiology of astrovirus infection in Barcelona, Spain / Guix S, Caballero S, Villena C [et al.]// J Clin Microbiol - 2002 - 40 -P.133-139.

238 Molecular epidemiology of astroviruses in Japan from 1995 to 1998 by reverse ranscription-polymerase chain reaction with serotype-specific primers (1 to 8) / Sakamoto T, Negishi H, Wang QH, [et al.]// J Med Virol -2000 - Vol.61 -P.326-331.

239 Molecular epidemiology of childhood astrovirus infection in child care centers / Mitchell, D.K., Matson, D.O., Jiang, X., [et al.]// J. Infect. Dis. -1999- Vol.180 , N2, -P. 514-517.

240 Molecular epidemiology of human enteric caliciviruses in the Netherlands / Koopmans M., Vinje J., de Wit M. [et al.]// J. Infect. Dis. - 2000. - Vol. 181. - P. 262 - 269.

240 Morens, D.M. Human Enterovirus Infections/Morens D.M., Pallansch M.A.,// ASM Press. - 1995 -P 3-23.

242 Moser, L.A., Schultz-Cherry, S., 2005. Pathogenesis of astrovirus infection. Viral Immunol. 18 (1), 4-10.

243 Mphalele, M.J. Relative frequency of human rotavirus VP4 (P) genotypes recovered over a ten-year period from South African children with diarrhea/ Mphalele MJ, Steele AD// Journal of Medical Virology. -1995- Vol. 47- P. 1-5.

244 Muchinik, G.R. Rotavirus in Buenos Aires, Argentina / Muchinik GR, Grinstein S // Intervirology - 1980 - Vol.13 -P.253-256.

245 Multiple novel astrovirus species in human stool / Kapoor A, Li L, Victoria J, Oderinde B [et al.]// J Gen Virol. - 2009 - Vol.90 (Pt 12) -P. 2965-2972.

246 Multistate Outbreak of Norwalk-like Virus associated with a common caterer / Anderson AD, Garrett VD, Sobel J, [et al.] // J Epidemiol - 2001 - Vol.154, -P.1013-1019.

247 Musher, D.M. Contagious acute gastrointestinal infections / Musher DM, Musher BL.// N Engl J Med. - 2004 - Vol.351(23)-P.2417-27.

248 Natural history of human calicivirus infection: a prospective cohort study / Rockx B, De Wit M, Vennema H [et al.]// Clin Infect Dis. - 2002 - Vol. 35, N3 -P. 246 - 253.

249 New developments in viral gastroenteritis. In: Holme T, Holmgren J, Merson MH, Mollby R (eds) Acute enteric infections in children. New prospects for treatment and prevention / Kapikian AZ, Greenberg HB, Kalica AR [et al.]// (1981) . ElsevierINorth-Holland Biomedical, Amsterdam, pp 9-57.

250 New Saffold cardiovirus in children, China / Xu, Z.Q., Cheng, W.X., Qi, H.M. [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2009 - N.15 -P. 993-994.

251 Noronet report April 2014 [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http://www.rivm.nl/dsresource?objectid=rivmp:248062&type=org&disposit ion=inline&ns_nc=1.

252 Norovirus classification and proposed strain nomenclature / Zheng DP, Ando T, Fankhauser RL [et al.]// Virology - 2006 - Vol. 346 -P. 312-323.

253 Norovirus illness is a global problem: emergence and spread of norovirus GII.4 variants, 2001-2007/ Siebenga JJ, Vennema H, Zheng DP [et al.]// J Infect Dis - 2009 - Vol.200 -P.802-812.

254 Norovirus regulation of the innate immune response and apoptosis occurs via the product of the alternative open reading frame 4/ McFadden N, Bailey D, Carrara G [et al.]// PLoS Pathog. - 2011- Dec;7(12): e1002413.

255 Noroviruses: a comprehensive review / Patel MM, Hall AJ, Vinje J, Parashar UD.// J Clin Virol - 2009 - Vol.44 -P.1-8.

256 Norwalk gastrointestinal illness: an outbreak associated with swimming in a recreational lake and secondary person-to-person transmission / Baron R.C., Murphy F.D., Greenberg M.B. [et al.]// Am. J. Epidemiol. - 1982. - Vol. 115. - P. 163 - 172.

257 Norwalk virus gastroenteritis aboard a cruise ship: An outbreak on five consecutive cruises. Gunn RA, Terranova WA, Greenberg HB [et al.]// American Journal of Epidemiology - 1980 - Vol.112 -P. 820-827.

258 Norwalk virus infection of volunteers: new insights based on improved assays / Graham DY, Jiang X, Tanaka T [et al.]// J Infect Dis. -1994 -Vol.170(1) P.34-43.

259 Novel human parechovirus from Brazil / Drexler JF, Grywna K, Stocker A[et al.]// Emerg Infect Dis - 2009 - Vol.15 -P.310-313.

260 Orbivirus acute gastroenteritis of infancy / Middleton PJ, Szymanski MT, Abbott GD [et al.]// Lancet - 1974 - N1 -P.1241-1244.

261 Outbreak of gastroenteritis due to sapovirus / Hansman, G. S., H. Saito, C. Shibata [et al.]// J. Clin. Microbiol. -2007- Vol. 45, -P.1347-1349.

230

262 Outbreak of sapovirus infection among infants and children with acute gastroenteritis in Osaka City, Japan during 2004-2005 / Phan, T. G., Q. D. Trinh, F. Yagyu, K [et al.]// J. Med. Virol. - 2006 - Vol.78, -P.839-846.

263 Outbreak of viral gastroenteritis due to a contaminated well / Beller M, Ellis A, Lee SH, [et al.] // International consequences. JAMA - 1997 - Vol278 -P.563-568.

264 Outbreaks of adult gastroenteritis traced to a single genotype of rotavirus/ Griffin DD, Fletcher M, Levy ME [et al.]// J Infect Dis. - 2002- Vol. 185-P. 1502-1505.

265 Oyster-associated gastroenteritis in Australia: The detection of Norwalk virus and its antibody by immune electron microscopy and radioimmunoassay / Grohmann GS, Greenberg HB, Welch BM, Murphy AM // Journal of Medical Virology - 1980- N6 -P. 11-19.

266 Page, N.A. Antigenic and genetic characterization of serotype G2 human rotavirus strains from the African continent / Page NA, Steele AD. / J Clin Microbiol. - 2004 - Vol.42, N2-P.595-600.

267 Palombo, E.A. Annual incidence, serotype distribution, and genetic diversity of human astrovirus isolates from hospitalized children in Melbourne, Australia/ Palombo EA, Bishop RF. //J Clin Microbiol -1996 - Vol. 34-P.1750-3.

268 Pang, X.L. Human astrovirus-associated gastroenteritis in children under 2 years of age followed prospectively during a rotavirus vaccine trial/ Pang XL, Vesikari T. //Acta Paediatr - 1999 - Vol.88 -P.532-6.

269 Parashar, U,D. Public health. Progress toward rotavirus vaccines/ Parashar UD, Glass RI.// Science - 2006 - Vol. 312(5775) - P. 851-2.

270 Patton, J.T. Rotavirus diversity and evolution in the post-vaccine world/ Patton J.T.// Discov Med. - 2012 - Vol. 13(68) - P. 85-97.

271 Pfister, T. Polypeptide p41 of a Norwalk-like virus is a nucleic acid-independent nucleoside triphosphatase/ Pfister T, Wimmer E// J. Virol.-2001.- Vol. 75- P.1611- 1619.

272 Picobirnavirus infections: viral persistence and zoonotic potential/ Ganesh B, Bányai K, Martella V[et al.]// Rev Med Virol. - 2012 - Jul;22(4) -P.245-56.

273 Picornaviridae / Melnick J.L., Agol V.I., Bachrach H.L. [et al.]// Intervirology. - 1974. - Vol. 4. - P. 303 - 316.

274 Picornaviridae: second report / Cooper P.D., Agol V.I., Bachrach H.L. [et al.]// Intervirology. - 1978. - Vol. 10. - P. 165 -180.

275 Picornavirus and enterovirus diversity with associated human diseases / Tapparel C, Siegrist F, Petty TJ, Kaiser // L. Infect Genet Evol. - 2013 -Vol.14, N3. -P. 282-293.

276 Picornavirus salivirus/klassevirus in children with diarrhea, China / Shan, T., Wang, C., Cui, L. [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2010 - N16, -P.1303-1305.

277 Polymerase chain reaction amplification and typing of rotavirus nucleic acid from stool specimens / Gouvea V, Glass RI, Woods P [et al.] // J Clin Microbiol. - 1990 - Vol.28, N2. -P.276-282.

278 Polymerase chain reaction for detection of adenoviruses in stool samples / Allard A, Girones R, Juto P, Wadell G.// J Clin Microbiol. - 1990 - Vol.28, N12. -P.2659-2667.

279 Preparation and characterization of monoclonal antibodies to enteric adenovirus types 40 and 41 / Herrmann JE, Perron-Henry DM, Stobbs-Walro D, Blacklow NR. // Arch Virol. - 1987 - Vol.94(3-4) -P.259-265.

280 Presence of two distinct types of rotavirus in infants and young children hospitalized with acute gastroenteritis in Mexico City, 1977 / Espejo RT, Calderón E, González N, Salomon A, Martuscelli A, Romero P. // J Infect Dis. - 1979 - Vol.139, N4. -P.474-477.

281 Prevalence and genetic diversity of Aichi virus strains in stool samples from community and hospitalized patients / Ambert-Balay, K., Lorrot, M., Bon, F. [et al.]// J. Clin. Microbiol. - 2008 - Vol. 46, -P. 1252-1258.

282 Prevalence and genetic diversity of human astroviruses in Mexican children with symptomatic and asymptomatic infections / Mendez-Toss, M., Griffin, D.D., Calva, J. [et al.]// J. Clin. Microbiol. - 2004 - Vol.42 N1, -P. 151- 157.

283 Prevalence of antibody to the Norwalk agent by a newly developed immune adherence heinagglutination assay / Kapikian AZ, Greenberg HB, Cline WL [et al.]// Journal of Medicdl Virology - 1978 - N.2(4) -P.281-294.

284 Prevalence of astrovirus infection among Chilean children with acute gastroenteritis / Gaggero A, O'Ryan M, Noel JS[et al.]// J Clin Microbiol -1998 - Vol.36 -P.3691-3693.

285 Prevalence of group A rotavirus, human calicivirus, astrovirus, and adenovirus type 40 and 41 infections among children with acute gastroenteritis in Dijon, France / Bon F, Fascia P, Dauvergne M [et al.]// J Clin Microbiol - 1999 - Vol.37 -P.3055-3058.

286 Prevalence of group C rotavirus among children in Rhode Island, United States/ Esona MD, Humphrey CD, Dennehy PH, Jiang B// J Clin Virol.-2008 - - Vol.42(2) - P.221-4.

287 Prevalence of human parechovirus in the Netherlands in 2000 to 2007 / Sanden S, Bruin E, Vennema H[et al.]// J Clin Microbiol - 2008 - Vol.46 -P.2884-2889.

288 Prevalence, types, and RNA concentrations of human parechoviruses, including a sixth parechovirus type, in stool samples from patients with acute enteritis / Baumgarte S, Souza Luna LK, Grywna K, [et al.]// J Clin Microbiol - 2008 - Vol.46 -P.242-248.

289 Prevalent enteric adenovirus variant not detected by commercial monoclonal antibody enzyme immunoassay / Scott-Taylor T, Ahluwalia G, Klisko B, Hammond GW. //J Clin Microbiol. - 1990 - Vol.28, N12. -P.2797-2801.

290 Proposal for a unified norovirus nomenclature and genotyping/ Kroneman A, Vega E, Vennema H [et al.]// Arch Virol. - 2013 - Vol.158 N.10 -P.2059-2068.

291 Rapid detection of human viruses in faeces by a simple and routine immune electron microscopy technique / Berthiaume, L., R. Alain, B. cLaughlin [et al.]// J. Gen. Virol. - 1981 - Vol.55 -P.223-227.

292 Rapid detection of rotavirus in stool by latex agglutination: comparison with radioimmunoassay and electron microscopy and clinical evaluation of the test / Haikala, O. J., J. O. Kokkonen, M. K. Leinonen [et al.]// J. Med. Virol.

- 1983 - N11 -P.91-97.

293 Rapid diagnosis of adenoviral conjunctivitis on conjunctival swabs by 10-minute immunochromatography / Uchio E, Aoki K, Saitoh W, Itoh N, Ohno S. // Ophthalmology. - 1997 - Vol.104 N8. -P.1294-1299.

294 Real-time PCR for diagnosis of human bocavirus infections and phylogenetic analysis / Neske F, Blessing K, Tollmann F [et al.]// J Clin Microbiol - 2007

- Vol.45 -P.2116-2122.

295 Real-time RT-PCR assays to differentiate wild-type group A rotavirus strains from Rotarix® and RotaTeq® vaccine strains in stool samples /Gautam R, Esona MD, Mijatovic-Rustempasic S, Ian Tam K, Gentsch JR, Bowen MD // Hum Vaccin Immunother. - 2014 - Vol.10, N3. -P.767-77.

296 Relative frequency of VP4 gene alleles among human rotaviruses recovered over a 10 year period (1982-1991) from Japanese children with diarrhea/ Gunasena S, Nakagomi O, Isegawa Y [et al.]// Journal of Clinical Microbiology - 1993 - Vol.31- P. 2195-2197.

297 Reoviruslike agent in stools: association with infantile diarrhea and development of serologic tests / Kapikian AZ, Kim HW, Wyatt RG [et al.]// Science - 1974 - Vol.185 -P.1049-1053.

298 Reuter, G. Kobuviruses - a comprehensive review/ Reuter G., Boros A., Pankovics P.// Rev. Med. Virol. - 2011 - Vol. 21 -P. 32-41.

299 Review of G and P typing results from a global collection of strains: implications for vaccine development/ Gentsch JR, Woods PA, Ramachandran M [et al.]// Journal of Infectious Diseases - 1996 - Vol. 174(Suppl 1) - P. 30-S36.

300 Rischel, A. Epidemic nausea? (Norwegian)/ Rischel, A. // Ugeskrift for Laeger, - 1935 - Vol. 97, - P.1285-1288.

301 Risk of diarrhea during the first year of life associated with initial and subsequent colonization by specific enteropathogens/ Cravioto A, Reyes RE, Trujillo F [et al.]// American Journal of Epidemiology - 1990 - Vol.131-P.886-904.

302 Rodger, S.M. Detection of a rotavirus-like agent associated with diarrhea in an infant/ Rodger, S.M., Bishop, R.F., Holmes, I.H.// J. Clin. Microbiol. -1982 - Vol. 16, - P.724-726.

303 Role of Norwalk virus in outbreaks of nonbacterial gastroenteritis / Greenberg HB, Valdesuso J, Yolken RH [et al.]// Journal of Infectious Diseases - 1979 - Vol.139 -P.564-568.

304 Rotavirus Group A Surveillance and Genotype Distribution in Russian Federation in Seasons 2012-2013 / O A. Veselova, A T. Podkolzin, D N. Petukhov [et al.] // International Journal of Clinical Medicine - 2014 - N5 -P. 407-413.

305 Rotavirus in Asia: The Value of Surveillance for Informing Decisions about the Introduction of Nev Vaccines/ Bresee J.S. E. Hummelman, E.A.S. Nelson, R.I Glass.// JID - 2005 - Vol 192 Supplement 1 - P. 1-5.

306 Rotavirus infection in children with acute diarrhea as detected by latex agglutination, ELISA and polyacrylamide gel electrophoresis / Altindis M, Yavru S, Simsek A, Ozkul A, Ceri A, Koc H. // Indian Pediatr. - 2004 -Vol.41, N6. -P.590-594.

307 Rotavirus surveillance in europe, 2005-2008: web-enabled reporting and real-time analysis of genotyping and epidemiological data / Iturriza-Gomara M, Dallman T, Banyai K, [et al.]// J Infect Dis. - 2009 - N1;200 Suppl 1 -P.215-21.

308 Rotavirus viral RNA electrophoresis in hospitalized infants with diarrhea in Santiago, Chile / Avendano LF, Calderon A, Macaya J [et al.]// Pediatr Res - 1982 - Vol.16 -P.329-330.

309 Rotaviruses. In Fields Virology / Kapikian, A. Z., Hoshino, Y. , Chanock, R. M.// -2001- 4th edn, - P. 1787-1833. Edited by D. M. Knipe & P. M. Howley. Philadelphia, PA: Lippincott Williams & Wilkins. 2008.

310 Ruuska, T. Rotavirus disease in Finnish children: use of numerical scores for clinical severity of diarrhoeal episodes/ Ruuska T, Vesikari T.// Scand J Infect Dis. - 1990 - Vol. 22, N3 - P.259-67.

311 Saffold cardiovirus in children with acute gastroenteritis, Beijing, China / Ren, L., Gonzalez, R., Xiao Y. [et al.]// Emerg. Infect. Dis. - 2009 - N.15 -P.1509-1511.

312 San Miguel sea lion virus isolation, preliminary characterization and relationship to vesicular exanthema of swine virus/ Smith AW, Akers TG, Madin SH, Vedros NA.// Nature. - 1973 - Vol.13;244(5411) - P. 108-10.

313 Schnagl, R.D. Characteristics of the genome of human infantile enteritis virus (Rotavirus) / Schnagl RD, Holmes IH.// J Virol. -1976 - Vol.19, N1-P.267-70.

314 Sensor, a population-based cohort study on gastroenteritis in the Netherlands: incidence and etiology / Wit MA, Koopmans MP, Kortbeek LM [et al.]// Am J Epidemiol - 2001 - Vol. 154 -P. 666-674.

315 Sequence and genomic organization of Norwalk virus / Jiang, X., M. Wang, K. Wang, M. K. Estes. // Virology - 1993 - Vol.195 -P.51-61.

316 Sequence diversity of small, round-structured viruses in the Norwalk virus group / Wang J, Jiang X, Madore HP [et al.]// J Virol - 1994 - Vol. 68 -P.5982-5990.

317 Serotype diversity and reassortment between human and animal rotavirus strains: implications for rotavirus vaccine programs/ Gentsch JR, Laird AR, Bielfelt B [et al.]// J Infect Dis. - 2005 - Vol.192 Suppl 1- P. 146-59.

318 Serotypic characterization of rotaviruses derived from asymptomatic human neonatal infections/ Hoshino Y, Wyatt RG, Flores J [et al.]// Journal of Clinical Microbiology - 1985 - Vol.21- P.425-430.

319 Shenk T / Adenoviridae: the viruses and their replication . In: Knipe DM , Howley PM , Griffin DE , Lamb RA , Martin MA , Roizman B , Straus SE (eds.) Fields Virology , 4 th Ed. Lippincott Williams & Wilkins , Philadelphia, PA , 2001. - P. 2265 - 2300 .

320 Sibling transmission of vaccine-derived rotavirus (RotaTeq) associated with rotavirus gastroenteritis / Payne DC, Edwards KM, Bowen MD [et al.]// Pediatrics. - 2010 - Vol.125, N2. -P.438-441.

321 Siitari, H. Dual-label time-resolved fluoroimmunoassay for the simultaneous detection of adenovirus and rotavirus in faeces / Siitari H. // J Virol Methods. - 1990 - Vol.28, N 2-P.179-87.

322 Silencing the morphogenesis of rotavirus/ Lopes T., Camacho M., Zayas R. [et al.] // J. Virol. - 2005. - Vol. 79. - P. 184-192.

323 Surveillance for foodborne disease outbreaks - United States, 1998-2008/Gould LH, Walsh KA, Vieira AR [et al.]// MMWR Surveill Summ. -2013 - Jun 28;62 Suppl 2-P.1-34.

324 Symptomatic Infection and Detection of Vaccine and Vaccine- Reassortant Rotavirus Strains in 5 Children: A Case Series / Boom JA, Sahni LC, Payne DC, [et al.] // J Infect Dis. - 2012 - Vol.206(8) -P.1275-1279.

325 Systematic literature review of role of noroviruses in sporadic gastroenteritis / Patel MM, Widdowson MA, Glass RI [et al.]// Emerg Infect Dis - 2008 -Vol.14 -P.1224-1231.

326 Testfor reovirus-like agent / Spence L, Fauvel M, Bouchard S [et al.]// Lancet

- 1975 - N2 -P.322.

327 The association of newly identified respiratory viruses with lower respiratory tract infections in Korean children 2000-2005 / Choi EH, Lee HJ, Kim SJ [et al.]//Clin Infect Dis - 2006 - Vol.43 -P.585-592.

328 The changing epidemiology of astrovirus-associated gastroenteritis: a review / Glass, R.I., Noel, J., Mitchell, D [et al.]// Arch. Virol. - 1996 - Suppl. N12, -P.287-300.

329 The complete genome of klassevirus - a novel picornavirus in pediatric stool / Greninger, A.L., Runckel, C., Chiu, C.Y., Haggerty, T. [et al.]// Virol. J. -2009 - N6, -P.82.

330 The detection of enteropathogens in acute diarrhea in a family cohort population in rural Egypt/ Zaki AM, DuPont HL, E Alamy MA [et al.]// American Journal of Tropical Medicine and Hygiene - 1986 - Vol.35-P.1013-1022.

331 The role of torovirus in nosocomial viral gastroenteritis at a large tertiary pediatric centre/ Gubbay J, Al-Rezqi A, Hawkes M [et al.]// Can J Infect Dis Med Microbiol. - 2012 - Summer-P.23(2):78-81.

332 Torres-Median, A. Isolation of an atypical rotavirus causing diarrhea in neonatal ferrets/ Torres-Median, A.// - 1987- Lab. Anim. Sci. Vol. 37- P.167.

333 Transmission of Norwalk virus during football game/ Becker K.M., Moe C.L., Southwick K.L. [et al.]// N. Engl. J. Med. - 2000. - Vol. 343. - P. 1223 - 1227.

334 Tufvesson, B. Occurrence of reo-like calf viruses in young children with acute gastroenteritis / Tufvesson B, Johnsson T // Acta Path Microbiol Scand

- 1976 - Vol. 84-P.22-28.

335 Two epidemiologic patterns of norovirus outbreaks: surveillance in England and wales, 1992-2000 / Lopman BA, Adak GK, Reacher MH, Brown DW // Emerg Infect Dis - 2003 - N9 -P. 71-77.

336 Two rotavirus outbreaks caused by genotype G2P[4] at large retirement communities: cohort studies/ Cardemil CV, Cortese MM, Medina-Marino A [et al.]// Ann Intern Med. - 2012 - Vol.157(9) - P. 621-31.

337 Typing database for noroviruses / Duizer E, Kroneman A, Siebenga J, [et al.] // Euro Surveill. - 2008 - Vol. 13 N5. -P.19.

338 Typing of human astroviruses from clinical isolates by enzyme immunoassay and nucleotide sequencing / Noel JS, Lee TW, Kurtz JB [et al.] // J Clin Microbiol - 1995 - Vol.33 -P.797-801.

339 Uhnoo, I. Clinical features of acute gastroenteritis associated with rotavirus, enteric adenoviruses, and bacteria/ Uhnoo I, Olding-Stenkvist E, Kreuger A. // Arch Dis Child -1986 - Vol. 61 -P. 732-8.

340 Uniformity of rotavirus strain nomenclature proposed by the Rotavirus Classification Working Group (RCWG)/ Matthijnssens J, Ciarlet M, McDonald SM [et al.]// Arch Virol. - 2011 - Aug;156(8) - P. 1397-413.

341 Updated norovirus outbreak management and disease prevention guidelines/ Aron J, Vinje J, Lopman B [et al.]// MMWR Recomm Rep. - 2011 - Mar 4;60(RR-3) -P.1-18.

342 Vaccine-derived NSP2 segment in rotaviruses from vaccinated children with gastroenteritis in Nicaragua / Bucardo F, Rippinger CM, Svensson L, Patton JT.// Infect Genet Evol. - 2012 - N6. -P.1282-1294.

343 Vesikari, T. Rotavirus vaccines against diarrhoeal disease/ Vesikari T// Lancet. - 1997 - Vol. 350(9090) - P. 1538-41.

344 Vinje, J. Development and application of a capsid VP1 (region D) based reverse transcription PCR assay for genotyping of genogroup I and II noroviruses / Vinje J, Hamidjaja RA, Sobsey MD.// J Virol Methods. - 2004 - Vol.116, N2-P. 109-117.

345 Viral agents of gastroenteritis. Public health importance and outbreak management / LeBaron C.W., Furutan N.P., Lew J.F. [et al.]// MMWR Recomm. Rep. -1990- N39 (RR-5), -P. 1-24.

346 Viral diarrhea in children in Beijing, China / Qiao H, Nilsson M, Abreu ER [et al.]// J Med Virol - 1999 - Vol. 57 -P.390-396.

347 Virus diversity in a winter epidemic of acute diarrhea in France / Chikhi-Brachet R, Bon F, Toubiana L [et al.]// J Clin Microbiol - 2002 - Vol.40 -P.4266-4272.

348 Visualization by immune electron microscopy of a 27-nm particle associated with acute infectious nonbacterial gastroenteritis /Kapikian, A. Z., R. G. Wyatt, R. Dolin [et al.] //J. Virol. - 1972- - Vol.10. -P1075-1081.

349 VP6 sequence-based cutoff values as a criterion for rotavirus species demarcation/ Matthijnssens J, Otto PH, Ciarlet M [et al.]// Arch Virol. -2012 - Vol.157(6) - P.1177-82.

350 Wadell, G. Molecular epidemiology of human adenoviruses/ Wadell G. // Curr Top Microbiol Immunol - 1994 - Vol.110 -P. 191 - 220.

351 Watanabe, H. Filter paper solid-phase radioimmunoassay for human rotavirus surface immunoglobins / Watanabe, H., I. H. Holmes. // J. Clin. Microbiol. - 1977 - N6-P.319-324.

352 Waterborne outbreak of rotavirus diarrhoea in adults in China caused by a novel rotavirus/ Hung, T., Chen, G. M., Wang, C. G. [et al.]// Lancet - 1984 - N1, - P. 1139-1142.

353 WHO. Generic protocols for hospital-based surveillance to estimate the burden of rotavirus gastroenteritis in children and a community-based survey on utilization of health care services for gastroenteritis in children WH0/V&B/02.15 [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http://www.episouth.org/outputs/wp5/s_t_module/articles/Generic_protocol _for_surveillance_WH0.pdf.

354 WHO. Manual of Rotavirus Detection and Characterization Methods

WHO/IVB/O8.17 [Электронный ресурс] . - Режим доступа: http://www. who. int/immunization/documents/WHO_IVB_08.17/en/.

355 Wigand, R. Properties of ECHO types 22, 23 and 24 viruses/Wigand R, Sabin AB.//Arch Gesamte Virusforsch - 1961 N11-P.224-47.

356 Wilson, S.A. The development and evaluation of radioimmune assays for the detection of immune globulins M and G against astrovirus/ Wilson SA, Cubitt WD.// J Virol Methods. - 1988 - N2, -P.151-9.

357 Xu, L. The application of polymerase chain reaction to the detection of rotaviruses in faeces / Xu L, Harbour D, McCrae MA// J Virol Methods. -1990 - Vol.27, N1-P.29-37.

358 Yolken, R. ELISA for rotavirus/ Yolken R, Wyatt RG, Kapikian AZ.// Lancet. -1977 -- Vol.15;2(8042)-P.819.

359 Zahorsky, J. Hyperemesis hiemis or the winter vomiting disease/ Zahorsky J. // Arch. Pediatr. - 1929. - Vol. 46. - P. 391 - 395.

360 Zissis, G Routine diagnosis of human rotaviruses in stools/ Zissis G, Lambert JP, De Kegel D // J Clin Pathol - 1978- Vol.31-P.175-178.

361 Zissis, G. Enzyme-linked immunosorbent assays adapted for serotyping of human rotavirus strains / Zissis G., Lambert J.P. // J Clin Microbiol - 1980 -N 11 -P.1-5.

362 Zoysa, I. Interventions for the control of diarrhoeal disease among young children: rotavirus and cholera immunization / Zoysa I, Feachem RG// Bulletin of the World Health Organization. - 1985 - Vol. 63- P. 569-583.