Формирование продуктивности и стрессоустойчивости бобовых растений в ассоциации с эндофитными бактериями тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.01.05, доктор наук Гарипова Светлана Равилевна

• Гарипова Светлана Равилевна
• доктор наук
• 2020

Оглавление диссертации доктор наук Гарипова Светлана Равилевна

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Концепция фитобиома растения и экологические ниши эндофитных бактерий

1.2. Биоразнообразие эндофитных бактерий бобовых растений

1.3. Пути проникновения эндофитных бактерий в растительный организм и распространение их в эндосфере растений

1.4. Рост и развитие растений под влиянием фитогормон-подобных соединений эндофитных бактерий

1.5. Деструкция органических загрязнителей и других ксенобиотиков эндофитными бактериями

1.6. Влияние инокуляции растений эндофитными бактериями на продуктивность и устойчивость сельскохозяйственных растений

2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Объекты исследования

2.1.1. Виды и сорта растений

2.1.2. Бактериальные культуры

2.1.3. Генетические конструкции и рефернтные штаммы

2.1.4. Грибные фитопатогены

2.2. Материалы для исследований

2.2.1. Питательные среды для культиирования бактерий

2.2.2. Среда для выращивания растений

2.3. Условия и методы проведения исследований

2.3.1. Выделение эндофитных бактерий

2.3.2. Видовая идентификация бактерий

2.3.3. Трансформация и визуализация генетически модифицированных штаммов

2.3.4. Проверка безопасности штаммов

2.3.5. Инокуляция растений

2.3.6. Определение антагонистической активности бактерий

2.3.7. Изучение колонизации корня с помощью конфокальной микроскопии

2.3.8. Оценка фитогормон-подобной активности бактерий

2.3.9. Содержание гормонов и антиоксидантов в растениях

2.3.10. Методы полевых исследований

2.3.11. Статистическая обработка данных

3 РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Исследование природных ассоциаций эндофитных

бактерий в клубеньках и корнях бобовых растений

3.1.1. Экспериментальные предпосылки, вызвавшие интерес к изучению эндофитного микробиома клубеньков бобовых растений

3.1.2. Скрининг эндофитных бактерий, способных проявлять антагонизм к фитопатогенам и стимулировать рост растений гороха и фасоли

3.1.3. Таксономическая идентификация отдельных штаммов эндофитных бактерий и оценка их безопасности

3.1.4. Межмикробные взаимоотношения эндофитных бактерий, выделенных из природных ассоциаций клубеньков гороха

и фасоли

3.2. Пути колонизации растений гороха эндофитными бактериями

3.3. Продуктивность и устойчивость бобовых растений, инокулированных эндофитными бактериями в полевых условиях

3.3.1. Анализ адаптивных свойств разных сортов гороха и

фасоли

3.3.2. Анализ продуктивности растений гороха в полевых условиях при обработке семян эндофитными бактериями

3.3.3. Продуктивность и устойчивость к болезням растений фасоли при инокуляции изолятами и штаммами эндофитными бактерий

3.4. Взаимодействие растений гороха с эндофитными бактериями, выделенными из других видов растений

3.4.1. Анализ связи дозы вносимых эндофитов на семена бобовых растений с разным уровнем продукции фитогормонов бактериями

3.4.2. Рост и фитогормональный статус проростков гороха, инокулированных бактериями с разным уровнем продукции ИУК

3.4.3. Анализ вклада эндофитных бактерий с разным уровнем продукции цитокининов на рост и фитогормональный

статус проростков гороха

3.4.4. Гормональный статус, характеристики роста проростков

при инокуляции гороха комбинациями эндофитных бацилл и ризобий

3.4.5. Анализ морфометрических показателей инокулированных эндофитными бактериями растений гороха в полевых опытах

3.5. Повышение стрессоустойчивости бобовых растений при инокуляции эндофитными бактериями

3.5.1. Оценка способности коллекционных штаммов к росту на среде, содержащей гербицид 2,4-Д в качестве единственного источника углерода

3.5.2. Рост инокулированных эндофитными бактериями растений гороха и некоторые их биохимические параметры в условиях засоления

3.5.3. Связь биохимических показателей инокулированных растений фасоли в модельных опытах с продуктивностью

в полевых условиях

3.6. Разработка методологических и биотехнологических подходов к оптимизации растительно-микробных взаимоотношений для повышения их адаптивного потенциала

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Формирование продуктивности и стрессоустойчивости бобовых растений в ассоциации с эндофитными бактериями»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Повышение адаптивного потенциала сельскохозяйственных растений имеет непосредственное отношение к таким глобальным проблемам, как необходимость обеспечения продовольственной безопасности и охраны окружающей среды. Важным фактором адаптивных возможностей растений является комплекс их взаимосвязей с микроорганизмами. Например, благодаря симбиотической азотфиксации бобовые культуры способны обеспечивать свои потребности в азотном питания. Спектр симбиотических связей растений достаточно широк и включает не только общеизвестных представителей бобово-ризобиального и диазотрофного ассоциативного симбиоза, но и обширную группу эндофитных бактерий, бессимптомно обитающих во внутренних тканях всех видов растений и составляющих вместе с эктофитами целостный микробиом растения (Leach et al., 2017).

Экологическая роль эндофитного сообщества, тесно связанного с растением-хозяином, в настоящее время недостаточно изучена. Однако сейчас находится все больше подтверждений тому, что «спрятанный внутри растений мир» имеет непосредственное отношение к таким процессам в жизни растений, как регуляция роста и развития, фитоиммунитет и приспособление к меняющимся условиям существования (Hardoim et al., 2015; Wani et al., 2015).

Как показывают современные исследования, ассоциированные с растениями микроорганизмы представляют собой совокупный генетический ресурс, с которым они образуют единую информационную и функциональную сеть, особенно востребованную при воздействии неблагоприятных биотических и абиотических факторов (Berendsen et al., 2012). Этот подход был сформулирован как «принцип дополнительности геномов» (Тихонович и др., 2015), позволяющий существенно расширить адаптивные возможности растений в преодолении стрессов.

Бобовые растения интересны тем, что в их физиологическое состояние вносят вклад как ризобиальные, так и эндофитные нерезобиальные микроорганизмы. В связи с этим представляет интерес роль эндофитных бактерий в поддержании адаптивных возможностей бобовых растений (Martinez-Hidalgo, Hirsch, 2017).

Цель работы - экспериментальное и теоретическое обоснование формирования продуктивности и устойчивости бобовых культур в ассоциации с эндофитными бактериями.

Задачи:

1. Исследовать микробиом клубеньков и корней бобовых растений с целью выделения эндофитных бактерий, оказывающих позитивное влияние на рост, устойчивость и семенную продуктивность хозяина.

2. Изучить особенности взаимоотношений между бактериями, выделенными из естественных ассоциаций, населяющих клубеньки гороха и фасоли, а также биологическую активность таких микроорганизмов по отношению к наиболее распространенным возбудителям грибных болезней бобовых культур.

3. Выявить возможные пути колонизации тканей бобовых культур на примере растений гороха и одного из штаммов эндофитных бактерий.

4. Провести анализ симбиотической активности, устойчивости к болезням и продуктивности различных сортов гороха и фасоли в условиях Южного Урала и выявить особенности отзывчивости их на инокуляцию эндофитными бактериями.

5. Оценить возможность использования искусственных ассоциаций ризобиальных бактерий и эндофитов, выделенных из другого вида растения, для повышения продуктивности и устойчивости к болезням бобовых культур.

6. Выявить особенности ответа бобовых культур на плотность популяции клеток эндофитов в начальные фазы развития растений и определить механизмы их проявления с участием фитогормонов.

7. Оценить вклад эндофитных бактерий в формирование устойчивости бобовых растений к распространенным в агроценозах экотоксикантам на примере гербицида 2,4-Д.

8. Провести анализ изменений морфометрических и биохимических параметров бобовых растений под влиянием инокуляции эндофитными бактериями при формировании устойчивости к осмотическому и токсическому стрессу (на примере влияния ионов хлорида натрия).

9. Определить возможные биохимические маркеры для скрининга позитивного действия эндофитов бобовых растений на устойчивость культур к стрессовым условиям среды.

10. Разработать теоретические подходы к созданию биопрепаратов на основе эндофитных бактерий бобовых растений для повышения их урожайности и устойчивости.

Научная новизна. В работе использованы оригинальные подходы для выделения и скрининга ростстимулирующих, антагонистичных к фитопатогенам, но нейтральных к ризобиям эндофитных бактерий из клубеньков бобовых растений, применен комплексный анализ системы «эндофитные бактерии - бобовое растение», включающий как лабораторные, так и полевые условия. Впервые показано, что эндофитный микробиом клубеньков бобовых является источником потенциально полезных бактерий, регулирующих рост, развитие и устойчивость растений к фитопатогенам и стрессам. Новым является факт о присутствии в клубеньках бобовых растений наряду с ризобиями других видов бактерий, которые находятся с ризобиями как в антагонистических, так и нейтральных отношениях; последние могут устойчиво сосуществовать в ассоциациях с представителями Rhizobium sp. C использованием штамма Serratia sp. впервые исследованы пути колонизации эндофитами ризосферы бобового растения и показано, что местом проникновения бактерий во внутренние ткани могут быть примордии боковых корней. Новизной обладают сведения об устойчивости к засухе и к биотическому стрессу разных генотипов гороха

и фасоли в условиях Южного Урала. Впервые выявлено, что дефицит влаги (ГТК < 1) в почвах Южного Урала лимитирует образование клубеньков на корнях фасоли. С использованием культуры фасоли получена уникальная информация о том, что формирование высокой семенной продуктивности растений, инокулированных эндофитами, происходит благодаря улучшению разных для каждого генотипа свойств: морфометрических показателей роста и развития растений (сорт Уфимская), устойчивости к болезням (сорт Золотистая), скороспелости (сорт Эльза). Предложена оригинальная гипотеза, объясняющая наблюдаемый доза-зависимый эффект клеток эндофитных бактерий на рост бобового растения различным уровнем продукции ауксинов эндофитами. На примере синтетического аналога ауксина - 2,4-Д впервые показано, что устойчивость бобовых растений к гербицидам может формироваться благодаря способности эндофитных бактерий разрушать токсикант. На основе показателей сравнительного содержания в тканях бобовых растений пролина, малонового диальдегида (МДА), аскорбиновой кислоты показано, что в условиях засоления обработанные эндофитными бактериями растения испытывают меньший осмотический стресс, чем неинокулированные растения.

Практическая значимость. Полученные результаты расширяют представление о составе и свойствах симбиотических ассоциаций эндофитных бактерий и бобовых растений, что повышает эффективность поиска новых штаммов эндофитов в качестве основы биопрепаратов для растениеводства. Разработанные критерии поиска эндофитных штаммов и подбора их композиций для повышения продуктивности и стрессоустойчивости растений повышают эффективность селекции растительно-микробных консорциумов. Охарактеризованы и идентифицированы новые штаммы эндофитных бактерий, выделенные из клубеньков бобовых растений: Rhizobium leguminosarum Ч16, Serratia sp. Ent16, Pseudomonas sp. Ps16, Rhizobium leguminosarum SG13, Bacillus subtilis SG12 и др., повышающие семенную продуктивность растений гороха и

фасоли. Новые штаммы Bacillus subtilis SG12 и Rhizobium leguminosarum SG13, депонированные в коллекции ВКПМ, могут являться основой препаратов для применения в системах как органического, так и интенсивного земледелия. Установлено, что для оценки характера симбиотических взаимоотношений может использоваться показатель содержания пролина, повышенный уровень в корнях инокулированных растений которого коррелирует со снижением продуктивности растений в полевых условиях. Предложен новый подход в стратегии разработки микробных препаратов на основе эндофитных бактерий, включающий индивидуальный подбор их функционального состава и доз с учетом лимитирующих для каждого вида и сорта растений свойств в конкретных условиях среды.

Защищаемые положения.

1. Микробиом клубеньков бобовых растений является перспективным источником выделения неризобиальных эндофитных бактерий с хозяйственно-ценными свойствами.

2. Перспективным направлением создания многокомпонентных микробиологических препаратов для повышения урожайности бобовых культур является использование природного консорциума из определенных видов и штаммов эндофитов, населяющих клубеньки и сохраняющих свой состав в течение длительного хранения.

3. При взаимодействии с различными по экологической пластичности сортами бобовых растений вклад эндофитных бактерий выражается в дополнении свойств растения-хозяина, которые лимитируются условиями среды и потенциалом генотипа растения.

4. Эндофитные бактерии, заселяющие корни бобовых растений, способны проникать через примордии боковых корней, что указывает на возможность сосуществования эндофитных и ризобиальных штаммов в разных экологических нишах.

5. Эндофитные бактерии клубеньков гороха способны утилизировать 2,4-Д и таким образом повышать устойчивость растений к действию гербицида.

6. Стратегия поиска эффективных штаммов бактерий для повышения урожайности и устойчивости бобовых культур должна включать прецизионный подбор генотипов растительно-микробных партнеров с определенными свойствами для преодоления растением-хозяином конкретных лимитирующих факторов окружающей среды.

Практические рекомендации.

Эндофитные штаммы бактерий, продуцирующие ИУК в большом количестве, следует применять для обработки семян бобовых культур в небольших прецизионных дозах для исключения эффекта ингибирования роста растений ауксином.

Штаммы Bacillus subtilis SG12 (ВКПМ), Bacillus subtilis 11ВМ, Bacillus subtilis 161РН (ИБГ УФИЦ РАН), 10-4 (ВКПМ), Rhizobium leguminosarum SG13 (ВКПМ) рекомендуются для разработки биопрепаратов для повышения продуктивности и устойчивости бобовых растений.

Апробация работы. Материалы диссертации были представлены и доложены на следующих научных форумах: шестом (Сыктывкар, 2007), седьмом (Нижний Новгород, 2011) и девятом (Казань, 2019) съездах Общества физиологов растений России; Всероссийской конференции с международным участием «Фундаментальные и прикладные аспекты исследования симбиотических систем» (Саратов, 2007); IV Всероссийской научной конференции ВМГОПИ (Орехово-Зуево, 2007); II Всероссийской научной конференции «Современные проблемы иммунитета растений к вредным организмам» (С-Пб, 2008); Всероссийской научной конференции с международным участием «Инновационные направления современной физиологии растений» (Москва, 2013); Годичном собрании ОФР «Сигнальные системы растений: от рецептора до ответной реакции организма» (С-Пб, 2016); Первом Российском микробиологическом

конгрессе (Пущино, 2017); на международных научных конференциях: «Микроорганизмы и биосфера» (Москва, 2007); The 5-th Congress of European microbiologists (Leipzig, 2013); «Физиология растений - теоретическая основа инновационных агро- и фитобиотехнологий» (Калининград, 2014), «Биотехнология как инструмент сохранения биоразнообразия растительного мира» (Ялта, 2016); «International Plant nutrition, growth & environment interaction III» (Vienna, Austria, 2017); «Microbe-assisted crop production-opportunities, challenges & needs (MiCROPe)» (Vienna, Austria, 2017); «Растения и микроорганизмы: Биотехнология будущего» (PLAMIC) (Уфа, 2018); «Роль физиологии и биохимии в интродукции и селекции сельскохозяйственных растений» (Москва, 2019); «Agrobiodiversity for improve the nutrition, health and quality of human and bees life»: 4th International Scientific Conference (Nitra, Slovakia, 2019).

Публикации. По теме диссертации опубликовано 32 работы, из которых 20 статей опубликованы в журналах журналах, рекомендованных ВАК при Минобрнауки России.

Конкурсная поддержка работы. Исследования частично выполнялись в лаборатории биотехнологии Учебно-научного центра БашГАУ (2007-2010) и лаборатории растительно-микробных взаимоотношений НИИСХ УФИЦ РАН (2017-2019) за счет средств Федерального бюджета в рамках заказа Минсельхоза России по теме: «Разработка полифункциональных биофунгицидов для растениеводства» (№ Госрегистрации 01200853490). Отдельные исследования были выполнены в рамках грантов Фонда содействия развития предприятий в научно-технической сфере «Старт-07» и «Старт-10», Федеральной целевой программы «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2007-2013 гг.» по теме «Разработка комплекса высокоэффективных микробиологических препаратов для полного цикла органического земледелия» (шифр заявки 2013-1.2-14-512-0039).

Благодарности. Выражаю глубокую благодарность научному консультанту д-ру биол. наук, профессору Хайруллину Р.М, за всестороннюю помощь в организации исследований и научную поддержку. Искреннюю признательность выражаю моим аспирантам к.б.н., Н.В. Иванчиной, к.б.н. Д.В. Гарифуллиной, соискателю ученой степени кандидатата наук О.В. Марковой. Искренне благодарю моих коллег по научно-исследовательской работе в БНИИСХ УФИЦ РАН - к.с.-х.н., доцента Л.И. Пусенкову, к.б.н., с.н.с. О.В. Ласточкину, к.б.н. Благодарю за сотрудничество к.б.н., доцента Н.А. Уразбахтину, к.б.н., доцента Р.Ш. Иргалину (БашГАУ), а также д.б.н., проф. Т.В. Маркушеву, к.б.н., с.н.с. Т.Р. Ясакова и к.б.н., с.н.с. Л.Ю. Кузьмину (ИБ УФИЦ РАН). Выражаю также благодарность моим коллегам по кафедре экологии и безопасности жизнедеятельности биологического факультета БашГУ за поддержку исследований, а также студентам и магистрантам, принимавшим участие в экспериментальных работах.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Концепция фитобиома и экологические ниши эндофитных

бактерий

В природе любой организм является экологической нишей для других более мелких организмов. Взаимодействие макроорганизма с населяющими его ткани и клетки микроорганизмами может быть более или менее тесным, внешне бессимптомным или сопровождаться образованием специализированных структур, балансировать от мутуализма до паразитизма. Все варианты отношений, при которых разнородные организмы на значительное время (сопоставимое с продолжительностью жизни партнеров) объединяются в общую биологическую единицу, как бы в один организм, утрачивая свою индивидуальность, были названы де Бари симбиозом (Бе Багу, 1879, цит. по: Явление симбиоза, 2009). Симбиоз - это фундаментальное явление, определяющее облик живой природы (Проворов, 2001). Симбиоз характеризуют следующие процессы: объединение метаболических систем партнеров, приводящее к резкой интенсификации базовых биохимических функций, взаимная сигнальная регуляция метаболических взаимодействий, глубокая функциональная интеграция, а иногда и структурные модификации симбиотических генов партнеров (Тихонович и др., 2005).

Экологический смысл симбиотических отношений состоит в том, что партнеры приобретают новые источники питания, самостоятельное использование которых невозможно ввиду отсутствия соответствующих ферментных систем у свободноживущих организмов (Проворов, Долгих, 2006). Вступление в симбиотические отношения дает партнерам преимущество и в защите от агрессивных факторов среды: микросимбионт получает доступ к новым ресурсам внутри другого организма, а макросимбионт благодаря микробным метаболитам приобретает

возможности улучшенного питания и резистентность к неблагоприятным факторам среды.

В эволюционном аспекте при объединении симбионтов возрастает объем взаимно используемой наследственной информации. Результатом симбиогенеза является формирование надвидовых систем изменчивости и наследственности, способных значительно влиять на скорость и направление эволюционных процессов (Тихонович, Проворов, 2012; Савинов, 2012). Исследования генетических, эволюционных и экологических аспектов формирования надорганизменных систем привели к формированию новой области знания - симбиогенетики (Проворов, Тихонович, 2019), согласующейся с концепцией хологенома - совокупности наследственных факторов эукариотического хозяина и населяющих его микросимбионтов (Bordenstein, Theis, 2015; Vandenkoornhuyse et al., 2015).

Вкладом в развитие симбиогенетики растений является представление о фитобиоме как комплексе факторов биотического и абиотического окружения, влияющего на здоровье и продуктивность растительного организма (Leach et al., 2017). Фитомикробиом - это интерактивный межорганизменный геном взаимосвязанных c ним микроорганизмов, преимущественно непатогенных, которые повышают самодостаточность растительного организма, обеспечивая его элементами питания, защищая от стрессов (Berendsen et al., 2012; Turner et al., 2013; Hale et al., 2014). Для выделения в фитобиоме комплекса организмов, потенциально являющихся причиной болезней, целесообразно применение термина патобиом. При этом следует учитывать, что баланс между патогенностью и комменсализмом, а также между мутуализмом и паразитизмом очень подвижен и зависит от сочетания неблагоприятных факторов, относящихся к тетраде «абиотическая среда - патоген - растение-хозяин - биотическое окружение» (Brader et al., 2017; Гоголев и др., 2017).

Фитомикробиом включает как эпифитные, обитающие на поверхности раститения, так и эндофитные микроорганизмы, которые проникают внутрь

растительных тканей. Одним из первых, кто сообщил о существовании бактерий, обитающих внутри здоровых тканях растений, был пионер микробной ризосферной экологии и почвенной бактериологии, автор термина «ризосфера» - Лоренц Гильтнер, который в 1904 году в докладе Немецкого общества агробиологов отметил: «отдельные бактерии образуют не только обширное покрытие на поверхности корня, но они даже входят в внешние клеточные слои корней и создают бактериоризу, которую можно сравнить с микоризой» (Hartmann et al., 2008). Несмотря на то, что подобные наблюдения появлялись в первой половине ХХ века (Perotti, 1926; Henning, Villforth, 1940; Trevet, Hollis, 1946), долгое время господствовало представление о случайном характере присутствия непатогенных эндофитов в здоровом организме растения. Особняком в системе эндофитных отношений стояли классические симбионты Rhizobia и Frankia, формирующие клубеньки на корнях бобовых и актиноризных растений.

Прорыв в этой области возник в середине 70-х гг. XX века, когда у широкого круга ризосферных бактерий были выявлены свойства подавления фитопатогенов и стимулирования рост растений (Bashan, Holguin, 1998). Эти бактерии были названы PGPR (plant growth promoting rhizobacteria) (Kloepper et al., 1978; Suslow et al., 1979). Позже, когда выяснилось, что полезные для растений бактерии встречаются не только в ризосфере, но и в филлосфере, а затем и в эндосфере растения, они были названы PGPB (Plant growth promoting bacteria), независимо от их топологической ниши.

Эндофитные бактерии встречаются разных частях растительного организма: как в корнях, так и в надземной части растений, включая цветки и семена (Mundt, Hinkle, 1976; McInroy, Kloepper, 1995). Эндофиты найдены в любых растениях (Lodewyckx, 2002; Goryluk et al., 2009; Щербаков и др., 2013) и географических точках планеты (Kan et al. 2007; Широких и др., 2008; Li et al., 2010; Roesch et al., 2008; Smith et al., 2008; West et al., 2010; Кузнецова и др., 2015). Как и ризосферные PGPB, эндофитные бактерии способны: обеспечивать защиту растения от болезней (Aravind et al., 2009;

Chen et al., 1995; Sturz, Matherson, 1996; Cho et al., 2003; Long et al., 2003; Hung et al., 2007; Chandrashekhara et al., 2007; Rijavec et al., 2007; Senthilkumar et al., 2009; Goryluk et al., 2009; Haggag et al., 2010), обладать антагонистической активностью против нематод (Sturz, Kimpinski, 2004; Vetrivelkalai et al., 2010); фиксировать азот (Kirchhorf et al., 1997; Stolzfus et al., 1997; Reinhold-Hurek, Hurek, 1998; Kuklinski-Sorbal et al., 2004; Mattos et al., 2008; Sessitsch et al., 2012; Бровко и др., 2014), синтезировать и катаболизировать регуляторы роста растений (Forchetti et al., 2007; 2010; Jha, Kumar, 2009; Shi et al., 2009; Palaniappan et al., 2010; Ambrose et al., 2013). Некоторые авторы используют аббревиатуру PGPE (Plant Gtowth Promoting Endophytes) - (Wang et al., 2009; Chen et al, 2010) как аналог к PGPB, желая подчеркнуть эндофитный характер изучаемого сообщества микроорганизмов.

Охарактеризуем экологические ниши эндофитных бактерий в фитобиоме. Согласно классическим представлениям, в понятие «экологическая ниша» входит пространство, в котором обитает вид, его роль в системе биотических связей и условия среды, обеспечивающие существование и распространение вида (Миркин, Наумова, 2005). Хотя эндофитные бактерии - многовидовая группа микроорганизмов, можно описать их экологические ниши с обозначенных позиций. Местообитание эндофитных бактерий включает всю эндосферу растения, любые органы и ткани. Экологическая роль в системе биотических связей может охватывать различные варианты взаимоотношений от мутуализма до паразитизма (Hardoim et al., 2015). Эндофитные бактерии могут латентно существовать внутри растения, а при стрессе или нарушении экологического равновесия могут активизироваться факторы патогенности, и в зависимости от обстоятельств растение либо болеет, либо уничтожает своего «врага» (Schulz, Boyle, 2006). Но, учитывая целый спектр полезных свойств, многие авторы не относят к эндофитным болезнетворных бактерий (Hallmann, Berg, 2006).

Существует классификация симбиотических отношений и по степени тесноты связи с хозяином и уровню генетической интеграции с ним: факультативный, экологически облигатный и генетически облигатный симбиоз (Тихонович, Проворов, 2003). В первом случае взаимодействие с хозяином является ассоциативным, в котором используются те же гены, что и при адаптации во внешней среде. По нашему мнению, к факультативным эндофитам относятся «транзиторные» бактерии, случайно попавшие в растительные ткани при поранениях или с фитофагами или патогенами. Второй тип симбиоза - экологически облигатный - предполагает, что взаимодействие с хозяином происходит с участием генов, которые не задействованы у микроорганизма в свободно живущем состоянии. Ярким примером экологически облигатных отношений являются клубенькообразующие бактерии. Но и эндофитные бактерии, не образующие специализированных структур, но имеющие особые сигналы распознавания растением, тоже можно отнести к такому симбиозу. По анализу транскриптома эндофитных бактерий было выявлено, что эти бактерии активны внутри растения и избирательно экспрессируют определенные гены соответственно потребностям растения (Sheibani-Tezerji et al., 2015). При генетически облигатном симбиозе организм теряет гены, необходимые для его развития и размножения в свободноживущем состоянии. Поскольку в настоящее время методами метагеномики в растительных тканях найдено множество некультивируемых на микробиологических средах форм бактерий, их можно отнести к генетически облигатным симбионтам растений.

На сегодня список эндофитных бактерий насчитывает не менее 219 видов, относящихся к 71 роду (Hallmann, Berg, 2006). По высшим таксонам эндофиты распределены следующим образом: Proteobacteria - 54% (Alfa-proteobacteria - 18%, Beta-proteobacteria - 10%, Gamma-proteobacteria - 26 %), Actinomycetes 20%, Firmicutes - 16%, Bacteroidetes - 6 %, Archae - 4 % (Hardoim et al., 2015). Очевидно, что повышением доступности новейших

молекулярно-генетических методов, список эндофитных бактерий будет постоянно расширяться и наши знания о биоразнообразии эндофитов постоянно пополняются. В обобщенном виде экологические ниши эндофитных бактерий представлены в таблице 1.1.

Таблица 1.1

Экологические ниши эндофитных бактерий

Аспект рассмотрения Варианты

География и распространение Космополиты, встречены во всех географических районах и местообитаниях, во всех изученных видах растений

Топология Эндоризосфера, эндофиллосфера, эндоспермосфера

Таксономическое биоразнообразие Рго1еоЬас1епа - 54% (Л1Га-рго1еоЬае1ег1а - 18%, Ье1а-рго1еоЬае1ег1а - 10%, Gamma-proteobacteria -26 %), Actinomycetes 20%, Бптю^ев - 16%, Bacteroidetes - 6 %, ЛгсИае - 4 %

Трофические взаимоотношения с растением Мутуализм, комменсализм, паразитизм, сапротрофитизм. Истинные (конкурентные) эндофиты относятся к первым двум вариантам

Отношения по тесноте связи с макропартнером Факультативные, экологически облигатные, генетически облигатные

Функциональная роль PGPE Биоконтроль, азотфиксация, регуляция роста, индукция фитоиммунитета, повышение стрессоустойчивости и др.

Интерес к биоразнообразию и функциям эндофитных бактерий, а также перспективам их практического использования постоянно растет, о чем свидетельствует множество обзоров литературы (Berg et al., 2008; Hardoim et al., 2008; 2015; Guo et al., 2008; Ryan et al., 2008; Jha et al., 2013; Gopal, Gupta, 2016; Santoyo et al., 2016; Compant et al., 2016; Pandey et al., 2017; CWa et al.,

2018; Васильева и др., 2019). Особенный интерес представляют взаимоотношения эндофитных бактерий с бобовыми растениями, которые благодаря симбиотической азотфиксации вносят значительный вклад в поддержание баланса азота в агроценозах. Как теперь известно, клубенькообразующими симбионтами различных бобовых растений могут являться значительно большее, чем было известно ранее, представителей разных таксонов, в то же время населять клубеньки могут не только клубенькообразующие бактерии, а разные типичные для ризосферы эндофитные бактерии (Dudeja et al., 2012; Dudeja, Nidhi, 2013; Ibañez et al., 2017). Наши представления об эндофитном сообществе корней и клубеньков в последнее десятилетие претерпели существенные изменения. Соответственно, требуются и новые подходы для эффективного управления продукционным процессом растений, учитывающие экологические принципы и молекулярные механизмы взаимодействия растений с ассоциированным с ними микробным сообществом (Paredes, Lebeis, 2016).

В отечественной симбиологии активно развиваются исследования по изучению генетических, эволюционных и физиологических аспектов взаимодействия эндомикоризных грибов и бобово-ризобиального симбиоза (Проворов и др., 2016; Иванова, Цыганов, 2014; Shtark et al., 2016), физиологических механизмов взаимодействия эндофитной и патогенетической систем (Максимов и др., 2011; 2014; 2015). Изучаются возможности использования эндофитных бактерий для производства биопрепаратов, направленных на повышение продуктивности и устойчивости растений (Хайруллин и др., 2007; 2009; 2010; Чеботарь и др., 2011; 2015). Вместе с тем исследования эндофитного сообщества бактерий бобовых растений и интерференция его взаимодействия с бобово-ризобиальной системой остаются малоизученными направлениями симбиологии.

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Гарипова Светлана Равилевна, 2020 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Акимова Г.П., Соколова М.Г. Содержание цитокининов на начальных этапах бобово-ризобиального симбиоза и влияние гипотермии // Физиология растений. 2012. Т. 63. № 5. С. 694-700.

2. Актуганов Г.Э., Галимзянова Н.Ф., Мелентьев А.И., Кузьмина Л.Ю. внеклеточные гидролазы штамма Bacillus sp. 739 и их участие в лизисе клеточных стенок микромицетов // Микробиология. 2007. Т. 76. № 4. С. 471-479.

3. Архипова Т.Н., Веселов С.Ю., Мелентьев А.И., Мартыненко Е.В., Кудоярова Г.Р. Сравнение действия штаммов бактерий, различающихся по способности синтезировать цитокинины, на рост и содержание цитокининов в растениях пшеницы // Физиология растений. 2006. Т. 53. № 4. С. 567-574.

4. Баймиев Ан.Х., Иванова Е.С., Гуменко Р.С., Чубукова О.В., Баймиев Ал.Х. Анализ симбиотических генов клубеньковых бактерий бобовых растений Южного Урала // Генетика. 2015. Т. 51. № 12. С. 1359-1367.

5. Басырова Л.Х., Васинская А.Н., Коробова А.В., Зайнутдинова Э.М., Кудоярова Г. Р. Экологическая роль этилена в регуляции роста и развития корней // Башкирский химический журнал. 2019. Т. 26. № 1. С. 91-95.

6. Белимов А.А., Сафронова В.И. АЦК деаминаза и растительно-микробные взаимодействия // Сельскохозяйственная биология. 2011. №3. С. 23-28.

7. Белимов А.А., Дечинская С.В., Сафронова В.И. Реакция гороха на инокуляцию ризосферными АЦК-утилизирующими бактериями в присутствии эндомикоризного гриба Glomus intraradices // Сельскохозяйственная биология. 2012. № 3. С. 90-97.

8. Благова Д.К., Сарварова Е.Р., Хайруллин Р.М. Выделение и характеристика бактериальных эндофитов моркови (Daucus carota L. var. sativus) // Вестник Оренбургского государственного университета. 2014. Т. 174. № 13. С. 10-12.

9. Бровко И.С., Титова Л.В., Иутинская Г.О., Сухачева М.В., Кравченко И.К. Идентификация и азотфиксирующая активность эндофитных неризобиальных бактерий из клубеньков сои // Наук. Зап. Терноп. Нац. Пед. Ун-ту. Сер. Бюл. 2014. Т. 60. № 3. С. 52-55.

10. Васильева Е.Н., Ахтемова Г.А., Жуков В.А., Тихонович И.А. Эндофитные микроорганизмы в фундаментальных исследованиях и сельском хозяйстве // Экологическая генетика. 2019. Т. 17. № 1. С. 19-32.

11. Васинская А.Н., Коробова А.В. Влияние этилена на рост побегов и корней, соотношение их биомассы и содержание цитокининов в растениях арабидопсиса // Агрохимия. 2012. № 5. С.

12. Веселов Д.С., Кудоярова Г.Р., Кудякова Н.В., Кузнецов В.В. Роль цитокининов в стресс-устойчивости растений // Физиология растений. 2017. Т. 64. № 1. С. 19-32.

13. Веселов С.Ю., Иванова Т.Н., Симонян М.В., Меленьтев А.И. Исследование цитокининов, продуцируемых ризосферными микроорганизмами // Прикладная биохимия и микробиология. 1998. Т. 34. № 2. С. 175-179.

14. Веселова С.В., Бурханова Г.Ф., Нужная Т.В., Максимов И.В. Роль этилена и цитокининов в развитии защитных реакций в растениях Triticum aestivum L., инфицировнных Septoria nodurum // Физиология растений. 2016. Т. 63. № 5. С. 649-660.

15. Вишнякова М.А. Генофонд зернобобовых культур и адаптивная селекция как факторы биологизации и экологизации растениеводства // Сельскохозяйственная биология. 2008. Т. 3. С. 3-23.

16. Гамбург К.З. Определение активности оксидазы индолилуксусной кислоты и ее ингибитора // Методы определения регуляторов роста и гербицидов / Под ред. Ракитина Ю.В. М.: Наука, 1966. С. 57-66.

17. Гарипова С.Р. Поиск мутуалистических микробных ассоциаций клубеньковых бактерий гороха // Фундаментальные и прикладные аспекты исследования симбиотических систем: Материалы

Всероссийской конференции с международным участием, 25-27 сентября 2007 г. - Саратов, 2007а. - С. 70.

18. Гарипова С.Р. О возможной роли сптниковой микрофлоры в ассоциациях клубеньковых бактерий // Микроорганизмы и биосфера: Материалы Мжедународной научной конференции. М.: ИНМИ им. С.Н. Виноградского РАН, 19-20 ноября 2007 г. - М.: МАКС Пресс, 2007б. С. 26-27.

19. Гарипова С.Р. Экологическая роль эндофитных бактерий в симбиозе с бобовыми растениями и их применение в растениеводстве // Успехи современной биологии. 2012. Т. 132. № 5. С. 493-505.

20. Гарипова С.Р. Перспективы использования эндофитных бактерий в биоремедиации почв агроэкосистем от пестицидов и других токсикантов // Успехи современной биологии. 2014. №1. С. 35-47.

21. Гарипова С.Р., Федорова А.А. Влияние инокуляции гороха утилизирующими 2,4-Д эндофитными бактериями на рост растений // Агрохимия. 2014. Т. 134. № 1. С. 62-70.

22. Гарипова С.Р., Гарифуллина Д.В., Маркова О.В., Иванчина Н.В., Хайруллин Р.М. Изучение бактериальных ассоциаций эндофитов клубеньков, способствующих увеличению продуктивности растений // Агрохимия. 2010. № 11. С. 50-58.

23. Гарипова С.Р., Гарифуллина С.Р., Баймиев Ан.Х., Хайруллин Р.М. Межмикробные взаимоотношения бактерий Serratia sp. Ent16 -симбионта клубенька гороха и колонизация ими эндоризосферы хозяина // Прикладная биохимия и микробиология. 2017. № 3. С. 299-307.

24. Гарипова С.Р., Иргалина Р.Ш., Крымова А.И. Оценка листовых болезней и продуктивность разных сортов фасоли в условиях Предуралья // Вестник Башкирского аграрного университета. 2016. № 4 (40). С. 13-17.

25. Гарипова С.Р., Маркова О.В., Вахитова Р.К. Гарифуллина Д.В., Каримов И.К., Давлетов Ф.А. Сравнение морфометрических показателей симбиоза, продуктивности и устойчивости к корневым гнилям и плодожорке у

усатых и листочковых сортов гороха в условиях Предуралья // Вестник Башкирского университета. 2015. Т. 20. № 2. С. 460-465.

26. Гарипова С.Р., Мелентьев А.И., Кузьмина Л.Ю., Гильванова Е.А. Инокуляция гороха клубеньковыми бактериями в сочетании с бактериальным препаратом Бациспецин // Энергоресурсосбережение в Республике Башкортостан. Материалы второй научно-практической республиканской конференции. 1999. С. 272-278.

27. Глянько А.К., Ищенко А. А Иммунитет бобового растения, инфицированного клубеньковыми бактериями Rhizobium spp. F. (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2017. Т. 53. № 2. С. 136-145.

28. Глянько А.К. Сигнальные системы ризобий (Rhizobiaceae) и бобовых растений (Fabaceae) при формировании бобово-ризобиального симбиоза (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2015. Т. 51. № 5. С. 453- 464.

29. Гоголев Ю.В., Горшков В.Ю., Петрова О.Е., Гоголева Н.Е., Даминова А.Г., Сальников В.В., Губаев Р.Ф., Миронычева А.А., Тарасова Н.Б. Растительно-микробный диалог при построении патосистем // Экспериментальная биология растений: фундаментальные и прикладные аспекты: Матер. Конф. 18-24 сентября 2017 г. - Судак: АНО «Центр содействия научной, образовательной и просветительской деятельности «Соцветие», 2017. С. 11.

30. Гордеева, Е.И., Крюкова А.В., Курбатова З.И. Иммунитет растений [Электронный ресурс]: учебное пособие / Е.И. Гордеева, Великие Луки, 2011. 127 с.

31. Давлетов Ф.А. Результаты селекции гороха в Башкортостане // Вестник АН РБ. 2009. Т. 14. № 1. С. 32-37.

32. Давлетов Ф.А., Гайнуллина К.П., Ашиев А.Р., Новикова Л.Ю. Изучение генетического разнообразия коллекционного материала гороха посевного (Pisum sativum L.) в условиях Республики Башкортостан // Зерновое хозяйство России. 2014. № 4. С. 44-52.

33. Дьяков Ю.Т. Фитоиммунитет: учебник. - М., ИНФРА-М, 2017. - 178 с.

34. Егорова Д.О., Плотникова Е.Г. Грамположительные бактерии -деструкторы хлорированных бифенилов, перспективных для использования при биоремедиации загрязненных почв // Биотехнология. 2009. № 3. С. 72-79.

35. Егоршина А.А., Хайруллин Р.М., Сахабутдинова А.Р., Лукьянцев М.А. Участие фитогормонов в формировании взаимоотношений проростков пшеницы с эндофитным штаммом Bacillus subtilis 11 ВМ // Физиология растений. 2012. Т. 59. № 1. С. 148-154.

36. Иванова Е.С., Баймиев Ан.Х., Ибрагимов Р.И., Баймиев Ал.Х. Симбиотические гены клубеньковых бактерий и влияние их горизонтального переноса на видовой состав микросимбионтов бобовых растений // Вестник Башкирского университета. 2011. Т. 16. № 4. С. 12101213.

37. Иванова К.А., Цыганов В.Е. Защитные реакции в бобово-ризобиальном симбиозе: индукция и супрессия (обзор) // Сельскохозяйственная биология. 2014. Т. 49. № 3. С. 3-12.

38. Калакуцкий Л.В. Коллекции микроорганизмов: взгляд в будущее // 1-й Российский Микробиологический конгресс: Сб. Тезисов / Под ред. Д.б.н., Решетиловой Т.А. М.: ООО «ИД «Вода: химия и экология, 2017. С. 19.

39. Калинкина Л.Г. Накопление пролина в клетках морской и пресноводной хлореллы в зависимости от концентрации NaCl в среде и интенсивности роста водорослей // Физиология растений. 1985. Т.32. С.42-52.

40. Кашаева (Гарипова) С.Р. Использование морфолого-культуральных различий штаммов клубеньковых бактерий гороха для оценки на конкурентоспособность // Биологические науки. 1992. № 11-12. С. 82-86.

41. Кашаева (Гарипова) С.Р. Селекция высокоэффективных штаммов клубеньковых бактерий для инокуляции в условиях Южного Урала. Дис. ... канд. биол. наук. СПб, 1994. 144 с.

42. Кашаева (Гарипова) С.Р., Мелентьев А.И., Кузьмина Л.Ю. Влияние инокуляции гороха клубеньковыми и ризосферными бактериями на азотфиксирующую активность и устойчивость к корневым гнилям // Защита растений в условиях реформирования агропромышленного комплекса: экономика, эффективность, экологичность: Тез. докл. Всеросс. Съезда по защите растений, С.-Пб., декабрь, 1995. - С.-Пб., 1995. - С. 320-321.

43. Колупаев Ю.Е., Вайнер А.А., Ястреб Т.О. Пролин: физиологические функции и регуляция содержания в растениях в стрессовых условиях // Вюник Харкивського нащонального университету. Сер1я Бюлопя. 2014. Т. 32. № 2. С. 6-22.

44. Колупаев Ю.Е. Антиоксиданты растительной клетки, их роль в АФК-сигналлинге и устойчивости растений // Успехи современной биологии.

2016. Т. 136. № 2. С. 181-198.

45. Коробов В.В., Маркушева Т.В., Кусова И.В., Журенко Е.Ю., Галкин Е.Г., Жарикова Н.В., Гафиятова Л.Р. Штамм бактерий Serracia marcescens В-6493 - деструктор фенола и 2,4-дихлорфенола // Биотехнология. 2006. № 2. С. 63-65.

46. Кошкин Е.И. Использовние признаков корневых систем полевых культур в селекции на урожайность и устойчиость к стрессорам // Агрохимия.

2017. № 7. С. 86-98.

47. Кравченко Л.В., Шапошников А.И., Макарова Н.М., Азарова Т.С., Львова К.А., Костюк И.И, Ляпунова О.А., Тихонович И.А. Состав корневых экзометаболитов мягкой пшеницы и томата, влияющих на растительно-микробные взаимодействия в ризосфере // Физиология растений. 2011. Т. 58. № 5. С. 781-786.

48. Кравченко Л.В., Азарова Т.С., Макарова Н.В., Тихонович И.А. Роль триптофана в корневых экзометаболитах для фитостимулирующей активности ризобактерий // Микробиология. 2004. Т. 73. № 2. С. 195-198.

49. Кравченко Л.В., Макарова Н.В., Азарова Т.С., Проворов Н.А., Тихонович И.А. Выделение и фенотипическая характеристика ростстимулирующих ризобактерий (PGPR), сочетающих высокую активность колонизации корней и ингибирования фитопатогенных грибов // Микробиология. 2002. Т. 71. № 4. С. 521-525.

50. Кудоярова Г.Р., Архипова Т.Н., Кузьмина Л.Ю., Веселов С.Ю. Влияние рост стимулирующих и гормон продуцирующих бактерий на уровень оксидативного стресса у растений пшеницы при засолении // Молекулярные аспекты редокс-метаболизма растений. Роль активных форм кислорода в жизни растений: Матер. II Межд. Симп. и межд. науч. школы. -Уфа: Изд-во «ООО Первая типография», 2017. С. 137-140.

51. Кудоярова Г.Р., Веселов С.Ю., Каравайко Н.Н., Гюли-Заде В.З., Чередова Е.П., Мустафина А.Р., Мошков И.Е., Кулаева О.Н. Иммуноферментная тест-система для определения цитокининов // Физиология растений, 1990. Т. 37. № 1. С. 193-199.

52. Кудоярова Г.Р., Высокая Л.Б., Архипова Т.Н., Кузьмина Л.Ю., Галимзянова Н.Ф., Сидорова Л.В., Габбасова И.М., Мелентьев А.И. Влияние ауксинпродуцирующих и фосфатмобилизующих бактерий на подвижность почвенного фосфора, скорость роста растений пшеницы и усвоение ими фосфора // Агрохимия. 2016. № 5. С. 28-34.

53. Кудоярова Г.Р., Курдиш И.К., Мелентьев А.И. Образование фитогормонов почвенными и ризосферными бактериями как фактор стимуляции роста растений // Изв. Уфимского научного центра РАН. 2011. № 3-4. С. 5-16.

54. Кузнецова И.Г., Сазанова А.Л., Сафровнова В.И., Пинаев А.Г., Верхозина А.В., Тихомирова Н.Ю., Оследкин Ю.С., Белимов А.А. Генетическое разнообразие микросимбионтов байкальских видов чины (Lathyrus), горошка (Vicia), остролодочника (Oxytropis) и астрагала (Astragalus) // Сельскохозяйственная биология. 2015. Т. 50. № 3. С. 345-352.

55. Кузьмина Л.Ю., Архипова Т.Н. Колонизация ризосферы пшеницы штаммами Bcillus subtilis с различным уровнем продукции цитокининов // Вестник Башкирского университета. 2014. Т. 19. № 3. С. 848-852.

56. Кулаева О.Н. Определение кининовой активности веществ с помощью биотестов // Методы определения регуляторов роста и гербицидов / Под ред. Ракитина Ю.В. - М.: Наука, 1966. - С. 120-135.

57. Кулаева О.Н., Кузнецов В.В. Новейшие достижения и перспективы изучпния механизма действия фитогормонов и их участия в сигнальных системах целого растения // Вестник РФФИ. 2004. № 2 (36). С. 12-36.

58. Курамшина З.М., Смирнова Ю.В., Хайруллин Р.М. Влияние бактерий Bacillus subtilis на рост пшеницы при загрязнении почвы никелем // Изв. Уфимского научного центра. 2015. Т. 4-1. С. 92-94.

59. Курамшина З.М., Смирнова Ю.В., Хайруллин Р.М. Повышение толерантности Triticum aestivum к кадмий-стрессу с помощью эндофитных штаммов Bacillus subtilis // Физиологияи растений. 2016. Т. 63. № 5. С. 679-687.

60. Ласточкина О.В., Юлдашев Р.А., Пусенкова Л.И. Влияние бактерий Bacillus subtilis 26Д на засухоустойчивость растений яровой мягкой пшеницы сортов лесостепного западносибирского и степного волжского экотипов на начальных этапах онтогенеза // Изв. Уфимского научного центра РАН. 2017.№ 3-1. С. 99-102.

61. Ласточкина О.В., Пусенкова Л.И., Юлдашев Р.А., Ильясова Е.Ю., Aliniaeifard S. Физиолого-биохимические ответы растений сахарной свеклы (Beta vulgaris L.), зараженных грибом Alternaria altrnata, на применение микробных препаратов на основе Bacillus subtilis // Сельскохозяйственная биология. 2018. Т. 53. № 5. С. 958-968.

62. Максимов И.В., Абизгильдина Р.Р., Пусенкова Л.И. Стимулирующие рост растений микроорганизмы как альтернатива химическим средствам защиты от патогенов (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2011. Т. 47. № 4. С. 373-385.

63. Максимов И.В., Абизгильдина Р.Р., Сорокань А.В., Бурханова Г.Ф. Регуляция пероксидазной активности под влиянием сигнальных молекул и Bacillus subtilis 26Д в инфицированных Phytophthora infestans растениях картофеля // Прикл. биохимия и микробиол. 2014. Т. 50. № 2. С. 197-202.

64. Максимов И.В., Веселова С.В., Нужная Т.А., Сарварова Е.Р., Хайруллин Р. М. Стимулирующие рост растений бактерии в регуляции устойчивости растений к стрессовым факторам // Физиология растений. 2015. Т. 62. № 6. С. 763-775.

65. Максимов И.В., Максимова Т.И., Сарварова Е.Р., Благова Д.К. Эндофитные бактерии как агенты для биопестицидов нового поколения (обзор) // Прикл. биохимия и микробиология. 2018. Т. 54. № 2. С. 36-50.

66. Маркушева Т.В., Журенко Е.Ю., Кусова И.В. Бактерии - деструкторы фенола и его хлорированных производных . Уфа: Гилем, 2002. 108 с.

67. Мелентьев А.И., Логинов О.Н., Бойко Т.Ф., Актуганов Г.Э. Уникальный природный штамм Paenibacillus enimensis IB-739 // Молекулярно-генетические и биотехнологические основы получения и применения синтетических и природных биологически активных веществ (Нарочанские чтения - 11). Минск - Ставрополь, 2017. С. 58-63.

68. Минина Т.С., Захарова Р.Ш., Уразбахтина Н.А., Хайруллин Р.М. Новые эндофитные штаммы Bacillus subtilis как основа биофунгцидов // Вестник Казанского аграрного университета. 2009. Т. 96. № 2. С. 133-137.

69. Миркин Б.М., Наумова Л.Г. Основы общей экологии. М.: Университетская книга, 2005. 240 с.

70. Мирошникова М.П. Современный генофонд и направления селекции зерновой фасоли // Земледелие. 2015. № 4. С. 43-45.

71. Морозов Ю.М., Мелентьев А.И., Кузьмина Л.Ю. Ультраструктура клеток пшеницы при развитии бактерий Bacillus sp. - активного начала бактериального инокулянта Бациспецин БМ // Физиология растений. 1994. Т. 41. № 1. С. 36-43.

72. Недорезков В.Д. Биологическое обоснование применения эндофитных бактерий в защите пшеницы от болезней на Южном Урале. Автореф. дис. д-ра с.-х. наук. ВИЗР С-Пб, 2003. - 41 с.

73. Определитель бактерий Берджи / Под ред. Дж. Хоулта и др. М.: Мир, 1997. 800 с.

74. Панкратова Е.М., Трофимова Л.В., Зяблых Р.Ю., Устюжанин И.А. // Микробиология. 2008. Т. 77. № 2. С. 266-272.

75. Петрова М.В., Буравцева Т.В., Колотилова А.С. Новые образцы фасоли как исходный материал для селекции. Сб. науч. тр. по прикл. ботанике, генетике и селекции зерновых бобовых культур. Л., 1990. Т. 135. С. 107112.

76. Практикум по биохимии растений / Плешков Б.П. М.: Колос, 1976. С.236 - 238.

77. Практикум по микробиологии / Нетрусов А.И., Егорова М.А., Захарчук Л.М. Практикум по микробиологии. М.: Академия. 2005.

78. Проворов Н.А. Генетико-эволюционные основы учения о симбиозе // Журнал общей биологии. 2001. Т. 62. № 6. С. 472-495.

79. Проворов Н.А., Долгих Е.А. Метаболическая интеграция организмов в системах симбиоза // Журнал общей биологии. 2006. Т. 67. С. 403-422.

80. Проворов Н.А., Штарк О.Н., Долгих Е.А. Эволюция азотфиксирующих симбиозов, основанная на миграции бактерий из микоризных грибов и почвы в ткани растений // Журнал общей биологии. 2016. V. 77. № 5. С. 329-345.

81. Пусенкова Л.И., Ильясова Е.Ю.,Ласточкина О.В., Максимов И.В., Леонова С. А. Изменение видового состава микрофлоры ризосферы и филлосферы сахарной свеклы под влиянием биопрепаратов на основе эндофитных бактерий и их метаболитов // Почвоведение. 2016. № 10. С. 1205-1213.

82. Розов С.М., Загорская А.А, Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Ауксин: биосинтез, метаболизм, транспорт // Успехи современной биологии. 2013. Т. 133. № 1. С. 50-62.

83. Романов Г.А. Как цитокинины действют на клетку // Физиология растений. 2009. Т. 56. № 2. С.295-319.

84. Рудиковская Е.Г., Акимова Г.П., Рудиковский А.В., Катышева Н.Б., Дударева Л.В. Содержание салициловой и жасмоновой кислот в корнях гороха (Pisum sativum L.) на начальном этапе симбиотического или патогенного взаимодействия с бактериями семейства Rhizobiaceae // Прикл. биохимия и микробиология. 2017. Т. 53. № 2. С. 219-224.

85. Савинов А.Б. Аутоценоз и демоценоз как симбиотические системы и биологические категории // Журн. общ. биол. 2012. Т. 73. № 4. С. 284301.

86. Садыков Б.Ф., Кашаева (Гарипова) С.Р. Использование морфолого-культуральных свойств колоний штаммов Rhizobium leguminosarum для оценки их конкурентоспособности // Микробиология. 1992. Т. 61. № 5. С. 924-928.

87. Сазанова А.Л., Кузнецова И.Г., Сафронова В.И., Белимов А.А., Попова Ж.П., Тихомирова Н.Ю., Оследкин Ю.С. Изучение генетического разнообразия микросимбионтов копеечника щетинистого Hedysarum gmelinii subsp. setigerum, произрастающего в Прибайкалье // Сельскохозяйственная биология. 2017. Т. 52. № 5. С. 1004-1011.

88. Скворцова И.Н. Идентификация почвенных бактерий рода Bacillus. M.: Изд-во МГУ, 1984. - 26 с.

89. Смирнов В.В., Киприанова Е.А. Бактерии рода Pseudomonas. Киев, Наукова думка 1990. - 264 с.

90. Смирнов В.В., Киприанова Е.А., Гарагуля А.Д. и др. Антимикробные и энтомопатогенные свойства штаммов Pseudomonas aureofaciens // Прикл. биохимия и микробиология. 1999. Т. 35. № 4. С. 413-416.

91. Стаканов Ф.С. Фасоль. Кишинев, 1986.

92. Сытников Д.М., Коць С.Я., Даценко В.К. Эффективность биопрепаратов клубеньковых бактерий сои, модифицированых гомологичным лектином // Прикладная биохимии и микробиолология. 2007. Т. 43. № 3. С. 304-310.

93. Тихонович И. А. Генетика системного контроля клубенькообразования // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2013. Т. 17. № 3. С. 985-1002.

94. Тихонович И.А., Андронов Е.Е., Борисов А.Ю., Долгих Е.А., Жернаков А.И. Жуков В.А., Проворов Н.А., Румянцева М.Л., Симаров Б.В. Принцип дополнительности геномов в расширении адаптационного потенциала растений // Генетика. 2015. Т. 51. № 9. С. 973-990.

95. Тихонович И. А., Проворов Н.А. Симбиогенетика микробно-растительных взаимодействий // Экологич. генетика. 2003. Т. 1. №0. С. 36-46.

96. Тихонович И.А., Проворов Н.А. Принципы селекции растений на взаимодействие с симбиотическими микроорганизмами // Информационный вестник ВОГиС. 2005. Т. 9. № 3. С. 295-305.

97. Тихонович И. А., Проворов Н.А. Развитие подходов симбиогенетики для изучения изменчивости и наследственности надвидовых систем // Генетика. 2012. Т. 48. № 4. С. 437-450.

98. Трефилова Л.В. Использование цианобактерий в агробиотехнологии. Автореф. дис. канд. биол. наук. Саратов. 2008. 26 с.

99. Тычинская И.Л., Кузьмичева Ю.В., Ботуз Н.И., Петрова С.Н., Белимов А.А Эколого-стабилизирующая роль АЦК-утилизирующих ризобактерий в агроценозах сои // Вестник аграрной науки. 2017. Т. 67. № 4. С. 3-9.

100. Хазиев Ф.Х., Багаутдинов Ф.Я., Сахабудтдинова А.З. Экотоксиканты в почвах Башкортостана. - Уфа: Гилем, 2000. 62 с.

101. Хайруллин Р.М., Лукьянцев М.А., Уразбахтина Н.А. Некоторые причины низкой эффективности использования высокоантагонистичных эндофитных штаммов Bacillus subtilis в качестве основы биофунгицидов // Вестник КазГАУ. 2010. Т. 5. № 3 (17). С. 146-149.

102. Хайруллин Р.М., Минина Т.С., Захарова Р.Ш., Уразбахтина Н.А. Новые штаммы Bacillus subtilis как основа биофунгицидов // Вестник КазГАУ. 2009. Т. 4. № 2 (12). С. 118-123.

103. Хайруллин Р.М., Недорезков В.Д., Мубинов И.Г., Захарова Р.Ш. Повышение устойчивости пшеницы к абиотическим стрессам эндофитным штаммом Bacillus subtilis // Вест.ОГУ. 2007. № 2. С. 129-134.

104. Цавкелова Е.А., Климова С.Ю., Чердынцева Т.А., Нетрусов А.И. Гормоны и гормоноподобные соединения микроорганизмов (обзор) // Прикладная биохимия и микробиология. 2006. Т. 42. № 3. С. 262-268.

105. Чан М.К., Егоров М.А. Исследование ростостимулирующей активности штамма рода Bacillus, выделенного из клубеньков Vigna cylindrical // Биотехнология. 2011. № 2 (35). С. 106-109.

106. Чеботарь В.К., Мальфанова Н.В., Щербаков А.В., Ахтемова Г.А., Борисов А.Ю., Люгтенберг Б., Тихонович И.А. Эндофитные бактерии в микробных препаратах, улучшающие развитие растений (обзор) // Прикл. биохимия и миробиология. 2015. Т. 51. № 3. С. 283-289.

107. Чеботарь В.К., Петров В.Б., Шапошников А.И., Кравченко Л.В. Биохимические критерии оценки агрономически значимых свойств бацилл, используемых при создании микробиологических препаратов // Сельскохозяйственная биология. 2011. № 3. С. 119-122.

108. Четина О.А., Еремченко О.З., Боталова Е.И., Середа А.М. Изменение в содержании пролина в растениях при воздействии NaCl-засоления и щелочности корневой среды // Современные проблемы науки и образования. 2016. № 6. С. 582.

109. Шапошников А.И., Макарова Н.М., Азарова Т.С. Влияние ризосферных штаммов Pseudomonas на количество L-триптофана в корневых экссудатах пшеницы и томата // Основные проблемы сельскохозяйственных наук. Сб. науч. трудов по итогам международной научно-практической конференции. 2016. № 3. Волгоград, 2016. С. 20-26.

110. Шафикова Т.Н., Омеличкина Ю.В. Молекулярно-генетические аспекты иммунитета растений к фитопатогенным бактериям и грибам // Физиология растений. 2015. Т. 62. № 5. С. 611-627.

111. Широких А.А., Широких И.Г., Огородникова С.Ю., Мерзаева О.В. Выделение и оценка биорегуляторных свойств эндофитных бактерий // Теоретическая и прикладная экология. 2008. № 3. С. 73-80.

112. Щербаков А.В., Брагина А.В., Кузьмина Е.Ю., Берг К., Мунтян А.Н., Макарова Н.М., Мальфанова Н.В., Кардинале М., Берг Г., Чеботарь В.К., Тихонович И.А. Эндофитные бактерии сфагновых мхов как перспективные объекты сельскохозяйственной микробиологии // Микробиология. 2013. Т. 82. № 3. С. 312-322.

113. Явление симбиоза: Доклад, сделанный на заседании общества немецких натуралистов и врачей г. Касселя профессором ботаники университета г. Страсбурга Антоном де Бари / Пер. с нем. Л.П. Куприяновой под ред. Н.А. Проворова. Страсбург 1879; Санкт-Петербург, 2009. - 24 с.

114. Abd-Alla M.H. Phosphodiesterase and phosphodiesterase in Rhizobium and Bradyrhizobium strains and their roles in the degradation of organophosphorus pesticides // Lett. Appl. Microbiol. 1994. V. 19. № 4. P. 240-243.

115. Abd_Allah E.F., Alqarawi A. A., Hashem A., Radhakrishnan R., Al-Huqail A.A. A., Al-Otibi F. O. N. A., Malik J.A., Alharbi R. I., Egamberdieva D. Endophytic bacterium Bacillus subtilis (BERA 71) improves salt tolerance in chickpea plants by regulating the plant defense mechanisms // J. Plant Interact. 2018. V. 13. № 1. P. 37-44.

116. Akinsanya M.A., Goh J.T., Lim S.P., Ting A.S.Y. Diversity, antimicrobial and antioxidant activities of culturable bacterial endophyte communities in Aloe vera // FEMS Microbiol. Let. V. 362. № 23. fnv184.

117. Ali B., Sabri A.N., Ljung K., Hasnain Sh. Quantification of indole-3-acetic acid from plant associated Bacillus spp. and their phytostimulatory effect on Vigna radiata (L.) // World J. Microbiol. Biotech. 2009a. V. 25. P. 519-526.

118. Ali B., Sabri A.N., Ljung K., Hasnain S. Auxin production by plant associated bacteria: impact on endogenious IAA content and growth of Triticum aestivum L. // Lett. Appl. Microbiol. 2009b. V. 48. № 5. P. 542-547.

119. Ambrose C., Varghese C., Subhash J.B. Endophytic bacteria as a source of novel antibiotics: An overview // Pharmacogn. Rev. 2013. V.7. №13. P. 11-16.

120. Aravind R., Kumar A.R., Eapen C.J., Ramana K.V. Endophytic bacterial flora in root and stem tissues of black pepper (Piper nigrum L.) genotype: isolation, identification and evaluation against Phytophthora capsici // Lett. Appl. Microbiol. 2009. V. 48. № 1. P. 58-64.

121. Arfaoui A., Sifi B., Boudabous A., El Hadrami I., Cherif M. Identification of Rhizobium isolates possessing antagonistic activity against Fusarium oxysporum f.sp. ciceris, the causal agent of Fusarium wilt of chickpea // J. Plant Pathol. 2006. V. 88. № 1. P. 67-75.

122. Arkhipova T.N., Veselov S.U., Melentiev A.I., Martynenko E.V., Kudoyarova G.R. Ability of bacterium Bacillus subtilis to produce cytokinins and to influence the growth and endogenious hormone content of lettice plants // Plant Soil. 2005. V. 272. P. 201-209.

123. Arkhipova T.N., Prinsen E., Veselov S.U., Melentiev A.I., Martynenko E.V., Kudoyarova G.R. Cytokinin producing bacteria enhance plant growth in drying soil // Plant Soil. 2007. V. 292. P. 305-315.

124. Asaf S., Khan N.A., Vaqas M., Shahzad R., Kim A-Y., Kang S.M., Lee I.J. Bacterial endophytes from arid land plants regulate endogenous hormone content and promote growth in crop plants: an example of Sphingomonas sp. and Serratia marcescens // J. Plant Interact. 2017. V. 12. № 1. P. 31-38.

125. Ashraf M. Foolad M.R. Roles of glycine betaine and proline in improving plant abiotic stress resistance // Envir. Exp. Bot. 2007. V. 59. № 2. P. 206-216.

126. Baca B.E., Elmerich C. Microbial production of plant hormones // Associative and endophytic nitrogen-fixing bacteria and cyanobacterial associations / C. Elmerich and W. Newton (eds.). Springer, 2007. P. 113-143.

127. Bacon C.W., Hinton D.M. Bacterial endophytes: the endophytic niche, its occupancts, and its utility. In: Gnanamanickam, S.S., editor. Plant associated bacteria. Dordrecht, The Netherlands: Springer, 2006. P. 155-194.

128. Bai Y., Aoust F., Smith D., Driscoll B. Isolation of plant-growth-promoting Bacillus strains from soybean root nodules // Can. J. Microbiology, 2002a. V. 48. P. 230-238.

129. Bai Y., Souleimanov A., Smith D.L. An inducible activator produced by a Serratia proteamaculans strain and its soybean growth-promoting activity under greenhouse conditions // J. Exp. Bot. 2002b. V. 53. № 373. P. 14951502.

130. Bai Y., Zhou X., Smith D.L. Enhanced soybean plant growth due to coinoculation of Bacillus strains with Bradyrhizobium japonicum // Crop Sci. Society of America. 2003. V. 43. P. 1774-1781.

131. Barac T., Taghavi S., Borremans B., Provoost A., Oeyen L., Colpaert J.V., Vangronsveld J.; van der Lelie D. Engineered endophytic bacteria improve phytoremediation of water-soluble, volatible, organic pollutants // Nature Biotechnol. 2004. V. 22. P. 583-588.

132. Barzanti R., Ozino F., Bazzicalupo M., Gabbrielli R., Galardi F., Gonnelli C., Mengoni A. Isolation and characterization of endophytic bacteria from the nickel hyperaccumulator plant Alyssum bertolonii // Microbiol. Ecol. 2007. V. 53. № 2. P. 306-316.

133. Bashan Y., Holguin G. Proposal for the division of Plant Growth-Promoting Rhizobacteria into two classifications: biocontrol-PGPB (Plant Growth-Promoting Bacteria) and PGPB // Soil Biology and Biochemistry. 1998. V. 30. P. 1225-1228.

134. Bates L.S., Waldern. R.P., Teare D. Rapid determination of free proline for water-stress studies // Plant and Soil. 1973. V. 39. P. 205-207.

135. Bauer W.D., Mathesius U. Plant responses to bacterial quorum sensing signals // Curr. Opin. Plant Biol. 2004. V. 7. № 4. P. 429-433.

136. Beijerinck M. W., van Delden A. On a colourless bacterium, whose carbon food comes from the atmosphere. K. Nederlandse Akad. Wetenschappen Proc. Ser. B Phys. Sci. 1902. V. 5. P. 398.

137. Belimov A.A., Dodd I.C., Hontzeas N., Theobald J.C. Safronova V.I., Davies W.J. Rhizosphere bacteria containing 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase increase yield of plants grown in drying soil via both local and systemic hormone signaling // New Phytologist. 2009. V. 181. P. 413-423.

138. Belimov A.A., Dodd A.C., Safronova V.I., Dumova V.A., Shaposhnikov A.I., Ladatko A.G., Davies W.J. Abscisic acid metabolizing rhizobacteria decrease ABA concentrations in planta and alter plant growth // Plant Physiol. Biochem. 2014. V. 74. P. 84-91.

139. Belimov A.A., Dodd I.C., Safronova V.I., Hontzeas N., Davies W.J. Pseudomonas brassicacearum strain Am3 containing 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase can show both pathogenic and growth-promoting properties in its interaction with tomato // J. Experimental Bot. 2007. V. 58. № 6. P. 1485-1495.

140. Benjelloun I., Alamy I.T., Douria A., Udupa S.M. Phenotypic and genotypic diversity among symbiotic and non-symbiotic bacteria present in Chickpea nodules in Morocco // Front Microbiol. 2019. V. 10. Article 1885.

141. Bensmihen S. Hormonal control of lateral root and nodule development in Lugumes // Plants. 2015. V. 4. № 3. P. 523-547.

142. Berendsen R.L., Pieterse C.M., Bakker P.A. The rhizosphere microbiome and plant health // Trends Plant Sci. 2012. V. 17. № 8. P. 478-486.

143. Berg G., Halmann J. Control of plant pathogenic fungi with bacterial endophytes // Soil Biology. 2006. V. 9. Microbial Root Endophytes. B. Schuls, T. Boyle, T.N. Sieber (Eds). Springer-Verlag Berlin Heidelberg. P. 53-70.

144. Berg G., Muller H., Zachow C., Opelt K., Scherwinski K., Tilcher R., Ulrich A., Hallmann J., Grosh R., Sessitsch A. Endophytes: Srtuctural and functional

diversity and biotechnological application in control of plant pathogens // Экологическая генетика. 2008. Т. 6. № 2. С. 17-25.

145. Bhore S.J., Ravichantar N., Loh C.Y. Screening of endophytic bacteria isolated from leaves of Sambung Nyawa [Gynura procumbens (Lour.) Merr.] for cytokinin-like compounds // Bioinformation. 2010. V. 5. № 5. P. 191-197.

146. Bhutani N., Maheshwari R., Suneja P. Isolation and characterization of plant growth promoting endophytic bacteria isolated from Vigna radiata // Indian J. Agric. Res. 2018. V. 52. № 6. P. 596-603.

147. Bianco C., Imperlini E., Calogero R., Senatore B., Amoresano A, Carpentieri A., Pucci P., Defez R. Indole-3-acetic acid improves Escherichia colfs defences to stress // Archives of Microbiology. 2006.V. 185. P. 373382.

148. Birnboim H.C., Doty J. A rapid alkaline extraction procedure for screening recombinant plasmid DNA // Nucl. Acids Res. 1979. V. 7. P. 1513-1523.

149. Blaha D., Prigent-Combaret C., Mirza M.S., Moenne-Loccoz Y. Phylogeny of the 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid deaminase-encoding gene acdS in phytobeneficial and pathogenic Proteobacteria and relation with strain biogeography // FEMS Microbiology Ecology. 2006. V. 56. P. 455-470.

150. Bordenstein S.R., Theis K.R. Host biology in light of the mcrobiome: Ten principles of holobionts and hologenomes. PLoS Biol. 2015. V. 13. № 8. e1002226.

151. Bottini R., Cassan F., Piccoli P. Gibberellin production by bacteria and its involvement in plant growth promotion and yield increase // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2004. V. 65. P. 497-503.

152. Brader G., Compant S., Vescio K., Mitter B., Trognitz F., Ma L.J., Sessitsch A. Ecology and genomic insights into plant-pathogenic and plant-nonpathogenic endophytes // Ann. Rev. Phytopathol. 2017. V. 55. P. 61-83.

153. Brandl M.T., Lindow S.E. Environmental signals modulate the expression of an indole-3-acetic acid biosynthetic gene in Erwinia herbicola // Mol. Plant-Microbe Interactions. 1997. V. 10. P. 499-505.

154. Brigido C., Menendez E., Paco A., Glick B.R., Belo A., Oliveiro S., Carvalho M. Mediterranean native leguminous plants: a reservoir of endophytic bacteria with potential to enhance chickpea growth under stress conditions // Microorganisms. 2019. V. 7. P. 392.

155. Burken J.G. Uptake and metabolism of organic compounds: green-liver model. In: Phytoremediation: Transformation and control of contaminants. Edited by McCutcheon S.C., Schnoor J.L. 2003. V. 59. P. 59-84.

156. Burch G., Sarathchandra U. Activities and survival of endophytic bacteria in white clover (Trifolium repens L.) // Can. J. Microbiol. 2006. V. 52. № 9. P.

848-856.

157. Camerini S., Senatore B., Imperlini E., Biavco C., Maschetti G., Rotino G.L., Campion B., Defez R. Intriduction of novel pathway for IAA biosynthesis to rhizobia alters vetch root nodule development // Arch Mirobiol. 2008. V. 190. № 1. P. 67-77.

158. Cassan F., Bottini R., Schneider G., Piccoli P. Azospirillum brasilense and Azospirillum lipoferum hydrolyze conjugates of GA20 and metabolize the resultant aglycones to GA1 in seedlings of rice dwarf mutants // Plant Physiology. 2001. V. 125. P. 2053-2058.

159. Chalupowicz L, Barash I, Panijel M, Sessa G, Manulis- Sasson S. Regulatory interactions between quorum-sensing, auxin, cytokinin, and the Hrp regulon in relation to gall formation and epiphytic fitness of Pantoea agglomerans pv gypsophilae // Mol Plant-Microbe Interact. 2009. V. 22. P.

849-856.

160. Chandrashekara, Niranjanraj C.S, Deepak S.A., Amruthesh N.K., Shetty P.N. and Shetty S.H., Endophytic bacteria from different plant origin enhance growth and induce downy mildew resistance in pearl millet // Asian J. Plant Pathol. 2007. V. 1. P. 1-11.

161. Chen C., Bauske E.M., Mussan G., Rodriguez-Kabana R., Kloepper J.W. Biological control of Fusarium wilt on cotton by use of endophytic bacteria // Biol. Control. 1995. V. 5. P. 83-91.

162. Chen C., Xin K., Cheng J., Shen X., Wang Y., Zhang L. Pantoea alhagi, a novel endophytic bacterium with ability to improve growth and drought tolerance in wheat // Scientific report. 2017. V. 7. Article number 41564.

163. Chen L., Luo S., Xiao X., Guo H., Chen J., Wan Y., Li B., Xu T., Xi Q., Rao C., Liu C., Zeng G. Application of plant growth-promoting endophytes (PGPE) isolated from Solanum nigrum L. for phytoextraction of Cd-polluted soils // Applied Soil Ecology. 2010. V. 46. P. 383-389.

164. Chen W.M., Laevens S., Lee T.M., Coenye T., de Vos P., Mergeay M., Vandamme P. Ralstonia taiwanensis sp. nov., isolated from root nodules of Mimosa species and sputum of a cystic fibrosis patient // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2001. V. 51. № 5. P. 1729-1735.

165. Chen W.M., Tang Y.T., Mori K., Wu X.L. Distribution of culturable endophytic bacteria in aquatic plants and their potential for bioremediation in polluted waters // Aquat. Biol. 2012. V. 15. P. 99-110.

166. Cho C.J., Lim W.J., Hong S. Y. Park S.R. Endophytic colonization of balloon flower by antifungal strain Bacillus sp. CY22 // Biol. Biotechnol. Biochem. 2003. V. 67. № 10. P. 2132-2138.

167. Clúa J., Zanetti M.E., Blanco F.A. Compatibility between Legumes and Rhizobia for the establishment of a successful nitrogen-fixing symbiosis // Genes. 2018. V. 9. P. 125; doi: 10.3390 / genes9030125.

168. Cohen A.C., Travaglia C.N., Bottini R., Piccoli P. Participation of abscisic acid and gibberellins produced be endophytic Azospirillum in the alleviation of drought effects in maize // Botany. 2009. V. 87. № 5. P. 455-462.

169. Compant S., Reiter B., Sessitch A., Nowak J., Clement C., Barka E.A. Endophytic colonization of Vitis vinifera L. by plant growth-promoting bacterium Burkholderia sp. strain PsJN // Appl. Environ. Microbiol. 2005. V. 71. № 4. P. 1685-1693.

170. Compant S., Mitter B., Saikkonen K., Campisano A., Mercado-Blanco J. Editorial special issue: soil, plants and endophytes // Plant Soil. 2016. V. 405. № 1-2. P. 1-11.

171. Costa L.E.O., Queiroz M.V., Borges A.Ch., Moraes C.A., Araujo E.F. Isolation and characterization of endophytic bacteria isolated from the leaves of the common bean (Phaseolus vulgaris) // Brazillian J. Microbiol. 2012. V. 43. № 4. P. 1562-1575.

172. Cunningham S.D., Berti W.B. Remediation of contaminated soils with green plants: an overview // In Vitro Cellular Developmental Biol. 1993. V. 29. № 4. P. 207-212.

173. Damaj M., Ahmad D. Biodegradation of polychlorinated biphenyls by Rhizobia: A novel finding // Biochemical and biophysical research communications. 1996. V. 218. P. 908-915.

174. Davidson J. Risk migration of genetically modified bacteria and plants designed for bioremediation // J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2005. V. 32. № 11-12. P. 630-650.

175. de Bary A. Die Erscheinung der Symbiose. Strassburg: Verlag Von Karl J. Trübner, 1879. 30 S.

176. Deivanai S., Bindusara A.S., Prabhakaran G., Bhore S.J. Culturable bacterial endophytes isolated from Mangrove tree (Rhizophora apiculata Blume) enhance seedling growth in Rice // J. Nat. Sci. Bio. Med. 2014. V. 5. № 2. P. 437-444.

177. Dejonghe W., Goris J. El Fantroussi S., Höfte M., De Vos P., Verstraete W., Top E.M. Effects of dissemination of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) degradation and on bacterial community structure in two different soil horisons // Appl. Environ. Microbiol. 2000. V. 66. № 8. P. 3297-3304.

178. De Meyer S., De Beuf K., Vekeman B., Willems A. A large diversity of non-rhizobial endophytes found in legume root nodules in Flanders (Belgium) // Soil Biol. Biochem. 2015. V. 83. P. 1 - 11.

179. Deng Z.S., Zhao L.F., Kong Z.Y., Yang W.Q., Lindström K., Wang E.T., Ge Hong W. Diversity of endophytic bacteria within nodules of the Sphaerophysa salsula in different regions of Loess Plateau in China // FEMS Microbiol. Ecol. 2011. V. 76. № 3. P. 463-475.

180. Desaint S., Arrault S., Siblot S., Foumler J.C. Genetic transfer of the mcd gene in soil // J. Appl. Microbiol. 2003. V. 95. № 1. P. 95-108.

181. Devers M., Henry S., Hartmann A., Martin-Laurent F. Horizontal gene transfer of atrazine-degrading genes (atz) from Agrobacterium tumefaciens St96-4 pADP1::Tn5 to bacteria of maize-cultivated soil // Pest Manage Sci. 2005. V. 61. № 9. P. 870-880.

182. Dias A.C.F., Costa F., Andreote F., Lacava P., Teixeria M.A., Assump5ao L.C., Araujo W.L., Azevedo J.L., Melo I.S. Isolation of micropropagated endophytic bacteria and assessment of their potential for plant growth promotion // World J. Microbiol. Biotechnol. 2009. V. 25. № 2. P. 189-195.

183. Donati A.J., Lee H.I., Leveau J.H., Chang W.S. Effects of indole-3-acetic acid on the transcriptional activities and stress tolerance of Bradyrhizobium japonicum// PLoS One. 2013. V. 8. e76559.

184. Dong Y., Iniquez L., Ahmer B.M.M., Triplett E. W. Kinetics and strain specificity of rhizosphere and endophytic colonization by enteric bacteria on seedlings of Medicago sativa and Medicago truncatula // Appl. Environ. Microbiol. 2003a. V. 69. № 3. P. 1783-1790.

185. Dong Y., Inigues A.L., Triplett E.W. Quantitative assessments of the host range and strain specificity of endophytic colonization by Klebsiella pneumoniae 342. // Plant Soil. 2003b. V. 257. № 1. P. 49-59.

186. Doty S.L. Enhancing phytoremediation through the use of transgenics and endophytes // New Phytologist. 2008. V. 179. № 2. P. 318-333.

187. Droin P., Sellami M., Prevost D., Fortin J., Antoun H. Tolerance to agricultural pesticides of strains belonging to four genera of Rhizobiaceae // J. Environ. Sci. Health. Part B. 2010. V. 45. P. 780-788.

188. Dudeja S.S., Giri R., Saini R., Suneja-Madan P., Kothe E. Interaction of endophytic microbes with legumes // J. Basic Microbiol. 2012. V. 52. № 3. P. 248-260.

189. Dudeja S.S., Nidhi Molecular diversity of Rhizobial and nonrhizobial bacteria from nodules of cool season Legumes. In: Salar R., Gahlawat S.,

Siwach P., Duhan J. (eds) Biotechnology: Prospects and Applications. Springer, New Delhi, 2013. P. 113-125.

190. Egamberdieva D., Wirth S.J., Alqarawi A.A., Abd_Allah E.F., Hashem A. Phytohormones and beneficial microbes: essential components for plants to balance stress and fitness // Front. Microbiol. 2017. V. 8. P. 3104.

191. Elsayed F.A., Abdulaziz A.A., Abeer H., Ramalingam R., Asma A.A., Fatma O.N.A., Jahangir A.M., Raedah I.A., Egamberdieva D. Endophytic bacterium Bacillus subtilis (BERA 71) improves salt tolerance in chickpea plants by regulating the plant defense mechanisms // J. Plant Interact. 2018. V. 13. № 1. P. 37-44.

192. Elvira-Recuenco M., van Vuurde J.W.L. Natural incidence of endophytic bacteria in pea cultivars under field conditions // Can. J. Microbiol. 2000. V. 46. P. 1036-1041.

193. Etesami H., Alikhani H.A., Hosseimi H.M. Indole-3-acetic acid (IAA) production trait, a useful screening to select endophytic and rhizosphere competent bacteria for rice growth promoting agents // MethodsX. 2015. V. 2. P. 72-78.

194. Fabro G., Kovács I., Pavet V., Szabodos L., Alvarez M.E. Proline accumulation and AtP5CS2 gene activation are induced by plant-pathogen incompatible interactions in Arabidopsis // MPMI. 2004. V. 17. № 4. P. 343350.

195. Farooq M., Gogoi N., Barthakur S., Paul S., Bharadwaj N., Migdadi H.M., Alghamdi S.S., Siddique K.H.M. Effects toletance mechanisms and management of salt stress in grain leguemes // Plant Physiol. Biochem. 2017. V. 118. P. 199- 217.

196. Ferchichi N., Toukabri W., Boularess M., Smaoui A., Mhatmdi R., Trabelsi D. Isolation, identification and plant growth promotion ability of endophyticbacteria associated with lupine root nodule grown in Tunisian soil // Arch. Microbio. 2019. DOI: 10.1007/s00203-019-01702-3

197. Forchetti G., Masciarelli O., Alemanos S., Alvares D., Abdala G. Endophytic bacteria in sunflower (Helianthus annuus L.): isolation, characterization, and production of jasmonates and abscisic acid in culture medium // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2007. V. 76. № 5. P. 1145 - 1152.

198. Forchetti G., Masciarelli O., Izaguirre M.J., Alemano S., Alvarez D., Abdala G. Endophytic bacteria improve seedling growth of sunflower under water stress, produce salicylic acid, and inhibit growth of pathogenic fungi // Curr. Microbiol. 2010. V. 61. № 6. P. 485-493.

199. Frugier F., Kosuta S., Murray J.D., Crespi M., Szczyglovski K. Cytokinin: secret agent of symbiosis // Trends Plant Sci. 2008. V. 13. P. 115-120.

200. Gagné S, Richard C, Rousseau H, Antoun H. Xylem-residing bacteria in alfalfa roots // Canadian Journal of Microbiology. 1987. V. 33. № 11. P. 996 -1000.

201. Gagné-Bourque F., Bertrand A., Claessens A., Aliferis K. A., Jabaji S. Alleviation of drought stress and metabolic changes in Timothy (Phleum pratense L.) colonized with Bacillus subtilis B26 // Front. Plant Sci. 2016. V. 7. P. 584.

202. Gaimster H., Summers D. Regulation of indole signalling during the transition of E. coli from exponential to stationary phase // Plos One. 2015. V. 10. № 9. e0136691. doi:10.1371/journal.pone.0136691.

203. Gamalero E., Glick B.R. Mechanisms used by plant growth-promoting bacteria. In: D.K. Maheshwari (ed.), Bacteria in Agrobiology: Plant nutrient management. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2011. P. 17-46.

204. Gamas P., Brauld M., Jardinaud M.F., Frugier F. Cytokinins in symbiotic nodulation: When, Where, What For? // Trends Plant Sci. 2017. V. 22. № 9. P. 792-802.

205. Gang S., Saraf M., Waite C.J., Buck M., Schumacher J. Mutualism between Klebsiella SGM 81 and Dianthus caryophyllus in modulating root plasticity and rhizospheric bacterial density // Plant Soi. 2018. V. 421. № 1. P. 273-288.

206. Germaine K.J., Liu X., Cabellos G.G., Hogan J.P., Ryan D., Dowling D.N. Bacterial endophyte-enchanced phytoremediation of the organochlorine herbicide 2,4-dichlorophenoxyacetic acid // FEMS Microbiol Ecol. 2006. V. 57. № 2. P. 302-310.

207. Germaine K.J., Keogh E., Garcia-Cabellos, Borremans B., Lelie D., Barac T., Oeyen L., Vangronsveld J., Moore F.P., Moore E.P., Campbell C.D., Ryan D., Dowling D.N. Colonisation of poplar trees by gfp expressing bacterial endophytes // FEMS Microbiology Ecology. 2004. V. 48. № 1. P. 109-118.

208. Germaine K.J., Keogh E., Ryan D., Dowling D.N. Bacterial endophyte-mediated naphthalene phytoprotection and phytoremediation // FEMS Microbiol. 2009. V. 296. № 2. P. 226-234.

209. Glick B.R. Plant growth-promoting bacteria: Mechanisms and applications // Scientifica. 2012. Article ID: 963401. http://dx.doi.org/10.6064/2012/963401

210. Glick B.R., Todorovic B., Czarny J., Cheng Z., Duan J. Promotion of plant growth by bacterial ACC deaminase // Crit. Rev. Plant Sci. 2007. V. 26. P. 227-242.

211. Glyan'ko A.K. Phytohormones and morphogenesis of root nodules and lateral roots of a Legume plant // J. Stress Biol. Biochem. 2018. V. 14. № 3. P. 12-26.

212. Gopal M., Gupta A. Microbiome selection could spur next-generation plant breeding strategies // Front Microbiol. 2016. V. 7. P. 1971. doi: 10.3389/fmicb.2016.01971.

213. Goryluk A., Rekosz-Burlaga H., Blaszczyk M. Isolation and characterisation of bacterial endophytes of Chelidonium majus L. // Polish J. Microbiol. 2009. V. 58. № 4. P. 355-361.

214. Govindarajan M., Kwon S.W., Weon H.Y. Isolation, molecular characterization and growth-promoting activities of endophytic sugarcane diazotroph Klebsiella sp. GR9 // World J. Microbiol. Biotechnol. 2007. V. 23. P. 997-1006.

215. Guo B., Wang Y., Sun X., Tang K. Bioactive natural products from endophytes: a review // Appl. Biochem. Microbiol. 2008. V.44. №2. P.136-42.

216. Guo H., Luo S., Chen L., Xiao X., Xi Q., Zeng G., Liu C. Wan Y., Chen G., He Y. Bioremediation of heavy metals by growing hyperaccumulator endophytic bacterium Bacillus sp. L14 // Bioresour. Technol. 2010. V. 101. № 22. P. 8500-8605.

217. Haggag W.M. Role of endophytic microorganisms in biocontrol of plant diseases // Life Sci J. 2010. V. 7. № 2. P. 57-62.

218. Hale I.L., Broders K., Iriarte G. A Vavilovian approach to discovering crop-associated microbes with potential to enhance plant immunity // Front Plant Sci. 2014. V. 5. P. 492.

219. Hallmann J. Plant interaction with endophytic bacteria // Jeger M.J., Spence N.J. (ed.). Biotic interactions in plant-pathogen associations. CABI Publishing, Wallingford, United Kingdom, 2001. P. 87-119.

220. Hallmann J., Berg G. Spectrum and population dynamics of bacterial root endophytes. In: Schulz et al. (Eds.) Microbial root endophytes. 2006. Berlin, Heidelberg, New York: Springer Verlag. P. 15-32.

221. Hallmann J., Quadt-Hallmann A., Mahaffee W.F., Kloepper W. Bacterial endophytes in agricultural crops // Can. J. Microbiol. 1997. V. 43. P. 895-914.

222. Han J.I., Choi H.K., Lee S.W., Orwin P.M., Kim J., Laroe S.L., Kim T.G., O'Neil J., Leadbetter J.R., Lee S.Y., Hur C.G., Spain J.C., Ovchinnikova G., Goodwin L., Han C. Complete genome sequence of the metabolically versatile plant growth-promoting endophyte Variovorax paradoxus S110 // J. Bacteriol. 2011. V. 193. № 5. P. 1183-1190.

223. Hardoim P.R., van Overbeek L.S., van Elsas J.D. Properties of bacterial endophytes and their proposed role in plant growth // Trends in Microbiol. 2008. V. 16. № 10. P. 463-471.

224. Hardoim P.R., van Overbeek L.S., Berg G., Pirttilä A.M., Compant S., Campisano A., Döring M., Sessitsch A. The hidden world within plants:

Ecological and evolutionary considerations for defining functioning of microbial endophytes // Microb.. Mol. Biol. Rev. 2015. V.79. №3. P.293-320.

225. Hartmann A., Rothballer M., Schmid M. Lorenz Hiltner, a pioneer in rhizosphere microbial ecology and soil bacteriology research // Plant Soil. 2008. V. 312. P. 7-14.

226. Hartmann A., Rothballer M., Hense B.A., Schröder P. Bacterial quorum sensing compounds are important modulators of microbe-plant interactions // Front. Plant. Sci. 2014. V. 8. № 5. P. 131.

227. He R.L., Wang G.P., Liu X-H., Zhang Ch.L. Lin F.Ch. Antagonistic bioactivity of an endophytic bacterium isolated from Epimedium brevicornu Maxim // Afr. J. Biotechnol. 2009. V. 8. № 2. P. 191-195.

228. Heath R.L., Packer L., Photoperoxidation in isolated chloroplasts. Kinetics and stoichiometry of fatty acid peroxidation // Archives Biochem. Biophysic. 1968. V. 125. P. 189-198.

229. Hemissi I., Mabrouk Y., Abdi N. Bouraoui M., Saidi M., Sifi B. Effects of some Rhizobium strains on chickpea growth and biological control of Rhizoctonia solani // African J. Microbiol. Res. 2011. V.24. №5. P. 4080-4090.

230. Henning K., Villforth F. Experimentelle untersuhungen zur frage der bakteriensymbiose in höheren pflanzen und ihrer beeinflußung durch leitelemente // Biochem. Z. 1940. V. 305. P. 299-309.

231. Hernández-Hernández L., Coutiño-Megchun J.T., Rincón-Molina C.I., Ruíz-Valdiviezo V.M., Culebro-Ricaldi J.M., Cruz-Rodríguez R.I., Palomeque-Dominguez H.H., Rincón-Rosales R. Endophytic bacteria from root nodules of Ormosia macrocalyx with potential as plant growth promoters and antifungal activity // J. Environ. Biol. 2018. V. 39. P. 997-1005.

232. Hidayati U., Chaniago I.A., Siswanto A.M., Santosa D.A. Potency of Plant Growth Promoting Endophytic Bacteria from Rubber Plants (Hevea brasiliensi Mull. Arg.) // Journal of Agronomy. 2014. V. 13. P. 147-152.

233. Ho Y.N., Mathew D.C., Hsiao S.C., Chein M.F., Chiang H.M., Huang C.C. Selection and application of endophytic bacterium Achromobacter

xylosoxidans strain F3B for improving phytoremediation of phenolic pollutants // J. Hazard Mater. 2012. V. 219-220. P. 43-49.

234. Holguin G., Glick B.R. Expression of the ACK deaminase gene from Enterobacter cloacae UW4 in Azospirillum brasilense // Microb. Ecol. 2001. V. 41. P. 281 - 288.

235. Honma M., Shimomura T. Metabolism of 1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid // Agric. Biol. Chem. 1978. V. 42. P. 1825-1831.

236. Hontzeas N., Rhichardson A.O., Belimov A.A., Safronova V.I., Abu-Omar M.M., Glick B.R. Evidence for horizontal transfer of 1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase genes // Appl. Envir. Microbiol. 2005. V. 71. № 11. P. 7556-7558.

237. Hossain M. S., Martensson A. Potential use of Rhizobium spp. to improve fitness of non-nitrogen-fixing plants // Acta Agr. Scand. B Soil Plant Sci. 2008. V. 58. P. 352-358.

238. Htwe A.Z., Yamakawa T. Low-density co-inoculation with Bradyrhizobium japonicum SAY3-7 and Streptomyces griseoflavus P4 promotes plant growth and nitrogen fixation in soybean cultivars // Amer. J. Plant Sci. 2016. V. 7. P. 1652-1661.

239. Hung P.Q., Annapurna K. Isolation and characterization of endophytic bacteria in soybean (Glycine sp.) // Omonrice. 2004. V. 12. P. 92-101.

240. Hung P.Q., Kumar S.M., Govindsamy V., Annapurna K. Isolation and characterization of endophytic bacteria from wild and cultivated soybean varieties // Biol. Fertil. Soils. 2007. V. 44. P. 155-162.

241. Hussain A., Hasnain S. Cytokinin production by some bacteria: its impact on cell division in cucumber cotyledons // African J. Microbiol. Research. 2009. V. 3. № 11. P. 704-712.

242. Ibanez F., Tonelli M. L., Munoz V., Figutiedo M.S., Fabra, A. Bacterial endophytes of plants: diversity, invasion mechanisms and effects on the host // Endophytes: Biology and biotechnology, sustainable development and

biodiversity. Springer International Publishing AG, 2017. D.K. Maheshwari (ed.). P. 25-40.

243. Idris R., Trifonova R., Puschenreiter M., Wenzel W.W., Sesitsch A. Bacterial community associated with flowering plants of the Ni hyperaccumulator Thlaspi goesingense // Appl. Environ. Microbiology. 2004. V. 70. № 5. P. 2667-2677.

244. Idris E.E., Iglesias D.J., Talon M., Borris R. Tryptophan-dependent production of indole-3-acid (IAA) affect level of plant growth promotion by Bacillus amyloliquefaciens FZB42 // Molecular Plant-Microbe Interactions. 2007. V. 20. № 6. P. 619-626.

245. Igeohon N.O., Babalola O.O. Rhizosphere microbiome modulators: contributions of nitrogen fixing bacteria towards sustainable agriculture // Int. J. Environ. Res. Public Helth. 2018. V. 15. № 4. P. 574.

246. Ikeda S., Esther L.E., Rallos E., Okubo T., Eda S., Inaba S., Mitsui H., Minamisava K. Microbial community analysis of field-grown soybeans with different nodulation phenotypes // Appl. Environ. Microbiol. 2008. V. 74. № 18. P. 5704-5709.

247. Jha P.N., Gupta G., Jha P., Mehrora R. Association of rhizospheric/endophytic bacteria with plants: a potential gateway to sustainable agriculture // Greener J. Agr. Sci. 2013. V. 3. № 2. P. 73-84.

248. Jha P., Kumar A. Characterization of novel plant growth promoting endophytic bacterium Achromobacter xylosoxidans from wheat plant // Microb. Ecol. 2009. V. 58. № 1. P. 179-188.

249. Jiang F., Chen L., Belimov A.A., Shaposhnikov A.I., Gong F., Meng X., Hartung W., Jeschke D.W., Davies W.J., Dodd I.C. Multiple impacts of the plant growth-promoting rhizobacterium Variovorax paradoxus 5C-2 on nutrient and ABA relations of Pisum sativum // J. Exp. Bot. 2012. V. 63. P. 6421-6430.

250. Joo G.J., Kang S.M., Hamayun M., Kim S.K., Na C.I., Shin D.H., Lee I.J. Burkholderia sp. KCTC 11096BP as newlyisolated gibberellin producing bacteria // J. Microbiol. 2009. V. 47. P. 167-171.

251. Joshi R., Singla-Pareek S.L., Rareek A. Engineering abiotic stress response in plants for biomass production // J. Biol. Chemistry. 2018. V. 293. P. 50355043.

252. Kan Feng Ling, Chen Zhong Yi, Wang En Tao, Tian, Chang Fu; Sui, Xin Hua; Chen, Wen Xin. Characterization of symbiotic and endophytic bacteria isolated from root nodules of herbaceous legumes grown in Qinghai-Tibet plateau and in other zones of China // Arch. Microbiol. 2007. V. 188. № 2. P. 103-115.

253. Kang J.W., Khan Z., Doty S.L. Biodegradation of trichloroethylene by an endophyte of Hybride poplar // Appl. Environ. Microbiol. 2012. V. 78. № 9. P. 3504-3507.

254. Kang S.M., Joo G.J., Hamayun N., Na C.I., Shin D.N., Kim H.Y., Hog J.K., Lee I.J. Gibberellin production and phasphate solubilization by newly isolated strain of Acinetobacter calcoaceticus and its effect on plant growth // Biotechnol. Lett. 2009. V. 31. P. 277-281.

255. Kaur G., Sharma P., Sirari A. In vitro antagonism of soil and chickpea nodule isolates against Fusarium oxysporum f. sp. ciceris in chickpea // African Journal of Microbiology Research. 2015. V. 9. № 6. P. 360-364.

256. Kawahigashi H. Transgenic plants for phytoremediation of herbicides // Curr. Opinion in Biotechnol. 2009. V. 20. № 2. P. 225-230.

257. Kazan K., Lyons R. Intervention of phytohormone pathways by pathogen effectors // Plant Cell. 2014. V. 26. P. 2285-2309.

258. Khalifa A.Y., Alsyeeh A.M., Almalki M.A., Saleh F.A. Characterization of the plant growth promoting bacterium, Enterobacter cloacae MSR1, isolated from roots of non-nodulating Medicago sativa // Saudi J. Biol. Sci. 2016. V. 23. № 1. P. 79-86.

259. Khan A., Xue S., Zhao X.Q., Javed M.T., Khan K.S., Bano A., Shen R.F., Massod S. Bacillus pumilus enhances tolerance in rice (Oryza sativa L.) to combined stresses of NaCl and high boron due to limited uptake of Na+ // Environmental and Experimental Botany. 2016. V. 124. P. 120-129.

260. Kieber J.J., Schaller D.E. Cytokinins // Arabidopsis book. 2014. V. 12. e0168.

261. Kirchhorf G., Reis V.M., Baldani J.I., Eckert B., Döbereiner J., Hartmann A. Occurrence, physiological and molecular analysis of endophytic diazotrophic bacteria in gramineous energy plants // Plant Soil. 1997. V. 194. P. 45-55.

262. Kitagawa G., Takami S., Miyuauchi K., Masai E., Kamagata Y., Tiedje J.M., Fukuda M. Novel 2,4-Dichlorophenoxyacetic Acid Degradation Genes from Oligotrophic Bradyrhizobium sp. strain HW13 Isolated from a Pristine Environment // J. Bacteriol. 2002. V. 184. № 2. P. 509-518.

263. Kloepper J.W., Schroth M.N. Plant growth-promoting rhizobacteria on radishes // In Proceedings of the 4th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. Gilbert-Clarey, Tours, France. 1978. P. 879-882.

264. Kobayashi D.Y., Palumbo J.D. Bacterial endophytes and their effect on plants and uses in agriculture. In: Bacon C.W. and White J.F. (Eds.) Microbial endophytes. 2000. New York: Marcel Dekker Inc. Р. 199-233.

265. Korir H., Mungai N.W., Thuita M., Hamba Y., Masso C. Co-inoculation effect of Rhizobia and Plant Growth Promoting Rhizobacteria on Common Bean growth in a low phosphorus soil // Front Plamt Sci. 2017. V. 8. P. 141.

266. Kudoyarova G.R., Vysotskaya L.B., Arkhipova T.N., Kuzmina L.Yu., Sidorova L.V., Gabbasova I.M., Melentiev A.I., Veselov S.Yu. Effect of auxin producing and phosphate solubilizing bacteria on mobility of soil phosphorus, growth rate, and P acquisition by wheat plants // Acta Physiol. Plant. 2017. V. 39. P. 253.

267. Kuklinski-Sorbal J., Araujo W.L., Mendes R., Geraldi I.O., Pizzirani-Kleiner A.A., Azevedo J.L. Isolation and characterisation of soybean-

associated bacteria and their potential for plant growth promotion // Envir. Microbiol. 2004. V. 6. № 12. P. 1244-1251.

268. Kuklinsky-Sobral J., Welington A., Mendes R., Pizzirani-Kleiner A., Azevedo J. Isolation and characterization of endophytic bacteria from soybean (Glycine max) grown in soil treated with glyphosate herbicide // Plant Soil. 2005. V. 273. № 1-2. P. 91-99.

269. Kunkel B.N., Harper C.P. The roles of auxin during interactions between bacterial plant pathogens and their hosts // J. Exp. Bot. 2018. V. 69. № 2. P. 245-254.

270. Ku?uk £., Kivan5 M. Preliminary characterization of Rhizobium strains isolated from chickpea nodules // Afric.J. Biotech. 2008. V.7. №6. P. 772-775.

271. Lally R.D., Galbally P., Moreira A., Spink J., Ryan D., Germaine K.J., Dowling D.N. Application of endophytic Pseudomonas fluorescens and a bacterial consortium to Brassica napus can increase plant height and biomass under greenhouse and field conditions // Front. Plant Sci. 2017. V.8. Art. 2193.

272. Lastochkina O.V., Pusenkova L.I., Yuldashev R.A., Babaev M.S., Garipova S.R., Blagova D.K., Khayrullin R.M., Aliniaeifard S. Effects of Bacillus subtilis on some physiological and biochemical parameters of Triticum aestivum L. (wheat) under salinity // Plant physiology and biochemistry. 2017. V. 121. P. 80-88.

273. Leach J.E., Triplett L.R., Argueso S.T., Trivedi P. Communication in the phytobiome // Cell. 2017. V. 169. № 4. P. 587-596.

274. Lee S., Sergeeva L.I., Vreugdenhil D. Natural variation of hormone levels in Arabidopsis roots and correlations with complex root architecture // J. Integr. Plant Biol. 2018. V. 60. № 4. P. 202-309.

275. Lei X., Wang E.T., Chen W.F., Sui X.H., Chen W.X. Diverse bacteria isolated from root nodules of wild Vicia species grown in temperate region of China // Arch Microbiol. 2008. V. 190. № 6. P. 657-671.

276. Lenart-Boron A., Zaj^c T., Boron P., Klimek-Kopyra A. NodC-based evaluation of the occurrence of bacteria in nodules of Pisum sativum isolated

on YEM agar // Die Bodenkultur: Journal of Land Management, Food and Environment. 2019. V. 70. № 1. P. 59-67.

277. Li J., Ovakim D.H., Charles T.S., Glick B.R. An ACK deaminase minus mutant of Enterobacyer cloacae UW4 no longer promotes root elongation // Curr. Microbiol. 2000. V. 41. P. 101-105.

278. Li Y.H., Zhu J.N., Zhai Zh. H., Zhang Q. Endophytic bacterial diversity in roots of Phragmites australis in constructed Beijing Cuihu Wetland (China) // FEMS Microbiology Letters. 2010. V. 309. № 1. P. 84-93.

279. Lievens L., Pollier J., Goossens A., Beyaert R., Staal J. Abscisic Acid as Pathogen Effector and Immune Regulator // Front Plant Sci. 2017. V. 8. P. 587.

280. Lin J.J. Electrotransformation of Agrobacterium. In: Methods in Molecular Biology. Ed. Nickoloff J.A. Totowa: Humana Press, 1995. P. 171-178.

281. Lin T., Zhao L., Guan Q., Gong M. Potential of endophytic bacteria isolated from Sophora alopecuroides nodule in biological control against Verticillium wilt disease // Australian J. Crop Sci. 2013. V. 7. № 1. P. 139-146.

282. Linacre N.A., Whiting S.N., Baker A.J.M., Angle S., Ades P.K. Transgenic and phytoremediation: the need for an integrated risk assessment, management, and communication strategy // Int. J. Phytoremediation. 2003. V. 5. P. 181185.

283. Liu X., Jia J., Atkinson S., Cámara M., Gao K., Li H., Cao J. Biocontrol potential of an endophytic Serratia sp. G3 and its mode of action // World J. Microbiol. Biotechnol. 2010. V. 26. № 8. P. 1465-1471.

284. Liu Y., Chen L., Wu G., Feng H., Zhang G., Shen Q. Zhang R. Identification of root-secreted compounds involved in the communication between Cucumber, the beneficial Bacillus amyloliquefaciens, and the soil-borne pathogen Fusarium oxysporum // Molucular Plant Microbe Interaction. 2017. V. 30. № 1. P. 53-62.

285. Lodewyckx C., Taghavi S., Mergeay M., Vangonsveld J., Clijsters H., van der Lelie D. The effect of recombinant heavy metal resistant endophytic

bacteria in heavy metal uptake by their host plant // Int. J. Phytoremediation. 2001. V. 3. P. 173-187.

286. Lodewyckx C., Vangronsveld J., Porteous F., Moore E.R.B., Taghavi S., Mezgeay M., van der Lelie D. Endophytic bacteria and their potential applications // Crit. Rev. Plant Sci. 2002. V. 21. № 6. P. 583-606.

287. Long H.H., Feruya N., Kurose D., Takeshita M., Takanami Y. Isolation of endophytic bacteria from Solanum sp. and their antibacterial activity against plant pathogenic bacteria // J. Fac. Agr., Kyushu Univ. 2003. V. 48. № 1-2. P. 21-28.

288. Long H.H., Schmidt D.D., Baldwin T. Native bacterial endophytes promote host growth in a species-specific manner; phytohormone manipulations do not result in common growth responses // Plos One. 2008. V. 3. № 7. P. e2702.

289. Lopez-Lopez A., Rogel M.A., Ormenno-Orrillo E., Martinez-Romero J., Martinez-Romero E. Phaseolus vulgaris seed-borne endophytic community with novel bacterial species such as Rhizobium endophyticum sp. nov. // Systematic and Appl. Microbiol. 2010. V. 33. P. 322-327.

290. Lu J., Yang F., Wang S., Ma H., Liang J., Chen Y. Co-existence of Rhizobia and diverse non-rhizobial bacteria in the rhizosphere and nodules of Dalbergia odorifera seedlings inoculated with Bradyrhizobium elkanii, Rhizobium multihospitium-like and Burkholderia pyrrocinia-like strains // Front. Microbiol. 2017. V. 8. P. 2255. doi: 10.3389/fmicb.2017.02255.

291. Lucangeli C., Bottini R. Effect of Azospirillum spp. On endogenious gibberellin content and growth maize (Zea mays L.) treated with uniconasole // Symbiosis. 1997. V. 23. P. 63-71.

292. Ma W., Guinel F.C., Glick B.R. The Rhizobium legumonosarum bv. viceae ACC deaminase protein promotes the nodulation of pea plants // Appl. Envir. Microbiol. 2003. V. 69. P. 4396-4402.

293. Ma Y., Prasad M.N.V., Rajkumar M., Freitas H. Plant growth promoting rhizobacteria and endophytes accelerate phytoremediation of metalliferous soils // Biotechnol. Advances. 2011. V. 29. № 2. P. 248-258.

294. Macmillan J. Occurrence of gibberellins in vascullar plants, fungi and bacteria // J. Plant Growth Regul. 2002. V. 20. P. 387-442.

295. Maheswari T.U., Anbukkarasi K., Hemalatha T., Chendrayan K. Studies on phytohormone producing ability of indigenous endophytic bacteria isolated from tropical legume crops // Int. J. Curr. Microbiol. App. Sci. 2013. V. 2. № 6. P. 127-136.

296. Malik D.K., Sindhu S.S. Production of indole acetic acid by Pseudomonas sp.: effect of coinoculation with Mesorhizobium sp. Cicer on nodulation and plant growth of chickpea (Cicer arietinum) // Physiol. Mol. Biol. Plants. 2011. V. 17. № 1. P. 25-32.

297. Manninger E., Antal M. Rhizobium and other bacteria in the root nodules of leguminous plants. I. Sterilization of the surface of root nodules of Soja max // Zentralbl Bakteriol Parasitenkd Infektionskr Hygeine. 1970. V.124. P.684-687.

298. Marek-Kozaczuk M., Kopsinska J., Lotocka B., Goliniwski W., Skorupska

A. Infection of clover by plant growth promoting Pseudomonas fluorescens strain 267 and Rhizobium leguminosarum bv. trifolii studied by mTn5-gusA // Antonie van Leeuwenhoek. 2000. V. 78. № 1. P. 1-11.

299. Martinez-Hidalgo P., Hirsch A.M. The nodule Microbiome: N2-fixing Rhizobia do not live alone // Phytobiomes. 2017. P. 1-13.

300. Martinez-Romero E. Coevolution in Rhizobium-legume symbiosis? // DNA and Cell Biology. 2009. V. 28. № 8. P. 361-370.

301. Mathesius U., Schlaman H.R.M., Spaink H.P., Sautter C., Rolfe B.G., Djordjevic M.A. Auxin transport inhibition precedes root nodule formation in white clover roots and is regulated by flavonoids and derivatives of chitin oligosaccharides // Plant J. 1998. V. 14. P. 23-34.

302. Mathesius U., Mulders S., Gao M., Teplitski M., Caetano-Anolles G., Rolfe

B.G., Bauer W.D. Extensive and specific responses of a eukaryote to bacterial quorum-sensing signals // Proc Natl Acad Sci USA. 2003. V. 100. P. 14441449.

303. Mattos P.A., Padua V.L., Romeiro A., Hallack L.F., Nevec B.S., Ulisses T.M., Barroc C.F., Todeschini A.R., Previato J.O., Mendoni5a-Previato L. Endophytic colonization of rice (Oryza sativa L.) by the diazotrophic bacterium Burkholderia kururiensis and its ability to enhance plant growth // An Acad Bras Cienc. 2008. V. 8. № 3. P. 477 - 493.

304. Maurel C., Verdoucq L., Luu DT., Santoni V. Plant aquaporins: membrane channels with multiple integrated functions // Annual Review of Plant Biology 2008. V. 59. P. 595-624.

305. Mbengue, M., Navaud, O., Peyraud, R., Barascud, M., Badet, T., Vincent, R., et al. Emerging trends in molecular interactions between plants and the broad host range fungal pathogens Botrytis cinerea and Sclerotinia sclerotiorum // Front. Plant Sci. 2016. V. 7. P. 422.

306. McGuinness M., Ivory C., Gilmartin N., Dowling D.N. Investigation of substrate specificity of wildtype and mutant BphKLB400 (a glutathion S-transferase) from Burkholderia LB400 // Int. Biodet. Biodegrad. 2006. V. 58. P. 203-208.

307. McGuinness M.C., Mazurkiewicz V., Brennan E., Dowling D.N. Dechlorination of pesticides by a specific bacterial glutathione S-transferase, BphKLB400: Potential for bioremediation // Eng. Life Sci. 2007. V. 7. № 6. P. 611-615.

308. McGuinness M., Dowling D. Plant-associated bacterial degradation of toxic organic compounds in soil // Int. J. Envir. Res. Public Health. 2009. № 6. P. 2226- 2247.

309. McInroy J.A., Kloepper J.W. Survey of indigenous bacterial endophytes from cotton and sweet corn // Plant Soil. 1995. V. 173. № 2. P. 337-342.

310. Mench M., Schwitzguebel J.-P., Schroeder P., Bert V., Gawronsky S., Gupta S. Assessment of successful experiments and limitations of phytotechnologies: contaminant uptake, detoxification and sequestration, and consequences for food safety // Envir. Sci Pollution Res. 2009. V. 16. № 7. P. 876-900.

311. Mendes R., Pizzirani-Kleiner A.A., Araujo W.L., Raaijmaker J.M. Diversity of cultivated endophytic bacteria from sugarcane: genetic and biochemical characterization of Burkholderia cepatica complex isolates // Appl. Ennvir. Microbiol. 2007. P. 7259-7267.

312. Mercado-Blanco J., Prieto P. Bacterial endophytes and root hairs // Plant Soil. 2012. V. 361. P. 301-306.

313. Mercado-Blanco J., Lugtenberg B.J.J. Biotechnological application of bacterial endophytes // Current Biotechnology. 2014. V. 3. P. 60-75.

314. Mhamdi R., Mrabet M., Lagurre G., Tivari R., Aouani M.E. Colonization of Phaseolus vulgaris nodules by Agrobacterium-like strains // Can. J. Microbiol.

2005. V. 51. № 2. P. 105-111.

315. Microbial root endophytes // Soil Biology. 2006. № 9. B. Schulz, C. Boyle, Sieber T.N. (Eds.) Springer-Verlag Berlin Heidelberg.

316. Mishra P.K., Mishra S., Selvakumar G., Bisht J.K., Kundu S., Gupta H.S. Coinoculation of Bacillus thuringeinsis-KR1 with Rhizobium leguminosarum enhances plant growth and nodulation of pea (Pisum sativum L.) and lentil (Lens culinaris L.) // World J. Microb. Biotech. 2009. V.25. №5. P. 753-761.

317. Mitter B., Pfaffenbichler N., Flavell R., Compant S., Antoniellli L., Petric A., Berninger T., Naveed M., Sheibani-Tezerji R., von Maltzahn G., Sessitch A. A new approach to modify plant microbiomes and traits by introducing beneficial bacteria at flowering into progeny seeds // Front Microbiol. 2017. V. 8. Article 11.

318. Moore F.P., Barac T., Borremans B., Oeyen L., Vangrosveld J., van der Lelie D., Campbell C.D., Moore E.R. Endophytic bacterial diversity in poplar trees growing on a BTEX-contaminated site: the characterization of isolates with potential to enhance phytoremediation // Systematic and Appl. Microbiol.

2006. V. 29. № 7. P. 539-556.

319. Moulin L., Munive A., Dreyfus B., Boivin-Masson C. Nodulation of legumes by members of the ß-subclass of Proteobacteria // Nature. 2001. V. 411. № 6840. P. 948-950.

320. Mrozik A., Piotrowska-Seget Z. Bioaugmentation as a strategy for cleaning up of soils contaminated with aromatic compounds // Microbiol. Res. 2010. V. 165. № 5. P. 363-375.

321. Mrabet M., Mnasri B., Romdhane S.B., Laguerre G., Aouani M.E., Mhamdi R. Agrobacterium strains isolated from root nodules of common bean specifically reduce nodulation by Rhizobium gallicum // FEMS Microbiol. Ecol. 2006. V. 56, № 2. P. 304-309.

322. Mundt J.O., Hinkle N.F. Bacteria within ovules and seeds // Appl. Environ. Microbiol. 1976. V. 32. № 5. P. 694-698.

323. Murray J.D. Invasion by invitation: rhizobial infection in legumes // Mol. Plant Microbe Interact. 2011. V. 24. № 6. P. 631-639.

324. Muresu R., Polone E., Sulas L. Baldan B., Tondello A., Delogu G., Cappuccinelli P., Alberghini S., Benhizia Y., Benhizia H., Benguedouar A., Mori B., Calamassi R., Dazzo F., Squartini A. Coexistence of predominantly nonculturable rhizobia with diverse, endophytic bacterial taxa within nodules of wild legumes // FEMS Microbiol. Ecol. 2008. V. 63. № 3. P. 383-400.

325. Murugesan S., Manoharan C., Vijayakumar R., Panneerselvam A. Isolation and characterization of Agrobacterium rhizogenes from the root nodules of some leguminous plants// Int. J. Microbiol. Res. 2010. V. 1. № 3. P. 92-96.

326. Naseem M., Kaltdorf M., Dandekar T. The nexus between growth and defence signalling: auxin and cytokinin modulate plant immune response pathways // J. Exp. Bot. 2015. V. 66. № 16. P. 4885-4896.

327. Navarro L., Dunoyer P., Jay F., Arnold B., Dharmasiri N., Estelle M., Voinnet O., Jonathan D. G. J. A plant miRNA contributes to antibacterial resistance by repressing auxin signaling // Science. 2006. V. 312. № 5772. P. 436-439.

328. Naveed M. Qureshi M.A., Zahir Z., Hussain M.B., Sessitsch A., Bitter B. L-Tryptophan dependent biosynthesis of indole-3-acetic acid (IAA) improves plant growth and colonization of maize by Burkholderia phytofirmans PsJN // Annals Microbiol. 2014. V. 65. № 3.

329. Ngom A, Nakagawa Y, Sawada H, Tsukahara J, Wakabayashi S, Uchiumi T, Nuntagij A, Kotepong S, Suzuki A, Higashi S, Abe M. A novel symbiotic nitrogen-fixing member of the Ochrobactrum clade isolated from root nodules of Acacia mangium // J. Gen. Appl. Microbiol. 2004. V. 50. V. 50. № 1. P. 17-27.

330. Newman L.A., Reynolds Ch.M. Bacteria and phytoremediation: new uses for endophytic bacteria in plants // Trends in Biotechnol. 2005. V. 23. № 1. P. 6-8.

331. Okubo T., Ikeda S., Kaneko T., Eda S., Mitsui H., Sato S., Tabata S., Minamisawa K. Nodulation-dependent communities of culturable bacterial endophytes from stems of field-grown soybeans // Microbes Environ. 2009. V. 24. P. 253-258.

332. Olanrewaju O., Babalola O.O. Mechanisms of actions of plant growth promoting bacteria // World J. Microbiol. Biotechnol. 2017. V. 33. P. 197.

333. Ona O., Van Impe J., Prinsen E., Vanderleyden J. Growth and indole-3-acetic acid biosynthesis of Azospirillum brasilense Sp245 is environmentally controlled // FEMS Microbiol. Lett. 2005. V. 246. P. 125-132.

334. Ortiz-Castro R., Valencia-Cantero E., Lopez-Bucio J. Plant growth promotion by Bacillus megaterium involves cytokinin signaling // Plant Signal Behav. 2008. V. 3. P. 263-265.

335. Ortiz-Castro R., Ziaz-Perez C., Martinez-Trujillo M., del Rio R.E., Campos-Garcia J., Lopez-Bucio J. Transkingdom signaling based on bacterial cyclodipeptides with auxin activity in plants // Proc Natl Acad Sci USA. 2011. V. 108. № 17. P. 7253-7258.

336. Palaniappan P., Chauhan P.S., Saravanan V.S., Anandham R., Sa T. Isolation and characterization of plant growth promoting endophytic bacterial isolates from root nodule of Lespedeza sp. // Biology and Fertility of Soils. 2010. V. 46. P. 807-816.

337. Pandey P.K., Singh M.C., Singh S., Singh A.K., Kumar M., Pathak M., Shakywar R.C., Pandey A.K. Inside the Plants: Endophytic Bacteria and their Functional Attributes for Plant Growth Promotion // International Journal of Current Microbiology and Applied Sciences. 2017. V. 6. № 2. P. 11-21.

338. Paredes S.H., Lebeis S.L. Giving back to the community: microbial mechanisms of plant-soil interactions // Funktional Ecology. 2016. V. 30. P. 1043-1052.

339. Patten C.L., Glick B.R. Bacterial biosynthesis of indole-3-acetic acid (review) // Can. J. Microbiol. 1996. V. 42. № 3. P. 207-220.

340. Patten C.L., Glick B.R. Role of Pseudomonasputida indoleacetic acid in development of the host plant root system // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V. 68. P. 3795-3801.

341. Perez-Jamollo J.E., Mendes R., Raaijmakers J.M. Impact of plant domestication on rhizosphere microbiome assembly and functions // Plant. Mol. Biol. 2016. Vol. 90. P. 635-644.

342. Perotti R. On the limits of biological incuiry in soil science // Proc. Int. Soc. Scu. 1926. V. 2. P. 146-161.

343. Persello-Cartieaux F., Nussaume L., Robaglia C. Tales from the underground: molecular plant-rhizobacteria interactions // Plant Cell Environ. 2003. V. 26. P. 189-199.

344. Phillipson M.N., Blair I.D. Bacteria in clover root tissue // Can. J. Microbiol. 1957. V. 3. P. 125-129.

345. Pongsilp N., Boonkerd N. Research techniques for estimating of phenotipic and genotipic diversity of root- and stem-nodule bacteria // Suranaree J. Sci. Technol. 2007. V. 14. № 3. P. 297-308.

346. Prieto P., Schiliro E., Maldonado-González M.M., Valderrama R., Barroso-Albarracin J.B., Mercado-Blanco J. Root hairs play a key role in the endophytic colonization of Olive roots by Pseudomonas spp. with biocontrol activity // Microb. Ecol. 2011. V. 62. № 2. P. 435-445.

347. Rajendran G., Sing F., Desai A.J., Archana G. Enhanced growth and nodulation of pigeon pea by co-inoculation of Bacillus strains with Rhizobium spp. // Bioresourse Technology. 2008. V. 99. № 11. P. 4544-4550.

348. Rajendran G., Patel M.H., Joshi S. Isolation and characterization of nodule-associated Exiguobacterium sp. from the root nodules of Fenugreek

(Trigonella foenum-graecum) and their possible role in plant growth promotion // Int. J. Microbiol. 2012. Article ID 693982.

349. Rajkumar M., Freitas H. Endophytic bacteria and their potential to enhance heavy metal phytoextraction // Chemosphere. 2009. V. 77. № 2. P. 153-160.

350. Reinhold-Hurek B., Hurek T. Intractions of gramineous plants with Azoarcus spp. and other diazotrophs: Identification, localization, and perspectives to study their functuion // Crit. Rev. Plant Sci. 1998. V. 17. P. 29-54.

351. Rijavec T., Lapanja A., Dermastia M., Rupnik M. Isolation of bacterial endophytes from geminated maize kernels // Can. J. Microbiol. 2007. V. 53. № 6. P. 802-808.

352. Rivas R. Velázquez E., Willems A, Vizcaino N., Subba-Rao N.S., Mateos P.F., Gillis M., Dazzo E., Martínez-Molina E. A. New Species of Devosia that forms a unique nitrogen-fixing root-nodule symbiosis with the aquatic Legume Neptunia natans (L.f.) Druce // Appl. Environ. Microbiol. 2002. V. 68. № 11. P.5217-5222.

353. Rivas R., Garcia-Fraile P., Velazquez E. Taxonomy of bacteria nodulated Legumes // Micribiology Insights. 2009. V. 2. P. 51-69.

354. Roesch L.F.W., Camargo A.O., Bento F. M., Triplett R.W. Biodiversity of diazotrophic bacteria within the soil, root and stem of field-grown maize // Plant Soil. 2008. V. 302. № 1-2. P. 91-104.

355. Rosenbluth M., Martines-Romero E. Bacterial endophytes and their interactions with hosts // MPMI. 2006. V. 19. № 8. P. 827-837.

356. Ryan R.P., Germaine K., Franks A., Ryan D.J., Dowling D.N. Bacterial endophytes: recent developments and applications // FEMS Micr. Let. 2008. V.278. №1. P.1-9.

357. Rybakova D., Schmuck M., Wetzlinger U., Varo-Suarez A., Murgu O., Muller H., Berg G. Kill or cure? The interaction between endophytic Paenibacillus and Serratia strains and the host plant is shaped by plant growth conditions // Plant Soil. 2016. V. 405. P. № 1-2. P. 65-79.

358. Ryu C.M., Hu C.H., Locy R.D., Kloepper J.W. Study of mechanisms for plant growth promotion elicited by rhizobacteria in Arabidopsis thaliana // Plant Soil. 2005. V. 268. P.285-292.

359. Saini R., Kumar V., Dudeja S.S., Pathak D.V. Beneficial effects of inoculation of endophytic bacterial isolates from roots and nodules in chickpea // Int. J. Cur. Microbiol. Appl. Sci. 2015. V. 4. № 10. P. 207-221.

360. Salomon, M. V., Bottini, R., de Souza Filho, G. A., Cohen, A. C., Moreno,

D., Gil, M., et al. Bacteria isolated from roots and rhizosphere of Vitis vinifera retard water losses, induce abscisic acid accumulation and synthesis of defense-related terpenes in in vitro cultured grapevine // Physiol. Plant. 2014. V. 151. P. 359-374.

361. Sánchez-Cruz R., Vázguez I.T., Batista-Garcia R.A., Méndez-Santiago

E.W., Sánchez-Carbente M.R., Leija A., Lira-Ruan V., Hernández G., Wong-Willarreal A., Folch-Mallol J. Isolation and characterization of endophytes from nodules of Mimosa pudica with biotechnological potential // Micr. Res. 2019. V. 218. P. 76-86.

362. Sanford G.B. The occurrence of bacteria in normal potato plants and legumes // Scientific Agriculture. 1948. V. 28. P. 21-25.

363. Santoyo G., Moreno-Hagelsieb G., Orozco-Mosquedo M., Bernard R. Plant growth-promoting bacterial endophytes // Microbiological Research. 2016. V. 183. P. 92-99.

364. Satola B., Wübbeler J.H., Steinbüchel A. Metabolic characteristics of the species Variovorax paradoxus // Appl. Microbiol. Biotechnol. 2013. V. 97. № 2. P. 541-560.

365. Schulz B., Boyle C. What are endophytes? // Microbial root endophytes. 2006. Eds: B.J.E. Schulz, C.J.C. Boyle, Th.N. Sieber. Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2006. P. 1-13.

366. Selvakumar G., Kundu S., Gapta Anand D., Shouche Y.S., Gapta H.S. Isolation and characterization of nonrhizobial plant growth promotion bacteria

from nodules of kudzu (Peraria thunbergiana) and their effect on wheat seedling growth // Curr. Microbiol. 2008. V. 56. P. 134-139.

367. Senthilkumar M., Swarnalakshmi K., Govindasamy V., Lee Y.K., Annapurna K. Biocontrol potential of soybean bacterial endophytes against charcoal rot fungus, Rhizoctonia bataticola // Curr. Microbiol. 2009. V. 58. № 4. P. 288-293.

368. Sessitsch A., Howieson J.G., Perret X., Antoun H., Martinez-Romero E. Advances in Rhizobium research // Crit. Rev. Plant Sci. 2002. T. 21. C. 323-378.

369. Sessitsch A., Coenye T., Sturz A.V., Vandamme P., Ait Barka E., Salles J.F., Van Elsas J.D., Faure D., Reiter B., Glick B.R., Wang-Pruski G., Nowak J. Burkholderia phytofirmans sp. nov., a novel plant associated bacterium with plant beneficial properties // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005. V. 55. P. 1187-1192.

370. Sessitsch A., Reiter B., Berg G. Endophytic bacterial community of field-grown potato plants and their plant-growth-promoting and antagonistic abilities // Can J. Microbiol. 2004. V. 50. № 4. P. 239-249.

371. Sessitsch A., Hardoim P., Döring J., Weilharter A., Krause ., Woyke T., Mitter B., Hauberg-Lotte L., Friedrich F., Rahalkar M., Hurek T., Sarkar A., Bodrossy L., van Overbeek L., Brar D., van Elsas J.D., Reinhold-Hurek B. Functional characteristics of an endophyte community colonizing rice roots as revealed by metagenomic analysis // Mol. Plant Microbe Interact. 2012. V. 25. № 1. P. 28-36.

372. Sgroy V., Cassan F., Masciarelli O., Del Papa M.F., Lagares A., Luna V. Isolation and characterization of endophytic plant growth promotiong (PGPB) or stress homeostasis-regulating (PSHP) bacteria associated to halophyte Prosopis strombulifera // Appl. Microb. Cell Physiol. 2009. V. 85. № 2. P. 371-381.

373. Shahid A.P., Zahoor A.B., Kuldeep Isolation and characterization of indole-3-acetic acid producing bacterial root endophytes associated with brown sarson (Brassica rapa L.) // Int. J.Adv. in Sci. Eng.Technol. 2017. V. 5. № 3. P. 69-74.

374. Shahzad R., Khan A.l., Bilal S., Wagas M., Kang S.M., Lee I.J. Inoculation of abscisic acid-producing endophytic bacteria enhances salinity stress tolerance in Oryza sativa // Environ. Exp. Bot. V. 136. P. 68-77.

375. Shakirova F.M., Sahabutdinova A.R., Bezrukova M.V., Fatkhutdinova R.A., Fatkhutdinova D.R. Changes in the hormonal status of wheat seedlings induced by salicylic acid and salinity // Plant Sci. 2003. V. 164. № 3. P. 317-322.

376. Shakirova F.M., Avalbaev A.M., Bezrukova M.V., Kudoyarova G.R. Role of endogenous hormonal system in the realization of antistress action of plant growth regulators on plants // Plant stress. 2010. V. 4. № 1. P. 32-38.

377. Shaw L.J., Burns R.C. Enhanced mineralization of [U-14C] 2,4-dichlorphenoxyacetic acid in the soil from the rhizosphere of Trifolium pratense // Appl. Environ. Microbiol. 2004. V. 79. № 8. P. 4766-4774.