Новые полициклические бис-лактамные скаффолды для дизайна биологически активных веществ тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 02.00.03, кандидат наук Усманова Лилия Маратовна

  • Усманова Лилия Маратовна
  • кандидат науккандидат наук
  • 2021, ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный технологический институт (технический университет)»
  • Специальность ВАК РФ02.00.03
  • Количество страниц 135
Усманова Лилия Маратовна. Новые полициклические бис-лактамные скаффолды для дизайна биологически активных веществ: дис. кандидат наук: 02.00.03 - Органическая химия. ФГБОУ ВО «Санкт-Петербургский государственный технологический институт (технический университет)». 2021. 135 с.

Оглавление диссертации кандидат наук Усманова Лилия Маратовна

Введение

Глава 1 Литературный обзор

1.1 Постконденсационные модификации продуктов реакции Кастаньоли-Кушмана

1.1.1 Постмодификации продуктов РКК с участием иминной компоненты

1.1.2 Постмодификации продуктов РКК посредством преобразования циклических ангидридов

1.1.3 Постмодификации продуктов РКК с участием ГФА

1.2 Методы синтеза тетрагидро-1#-пиразино[1,2-а]пиразинонов

1.3 Концепция пептидомиметиков

1.4 Миметики ß-поворота пептида

1.5 Биологически активные пептидомиметики на основе бициклических

пиперазинонов

Глава 2 Обсуждение результатов

2.1 Выбор объектов исследования и направлений постконденсационных модификаций продуктов РКК

2.2 Синтез исходных соединений

2.2.1 Получение ^-защищенных циклических ангидридов иминодиуксусной кислоты

2.2.2 Получение транс-5-оксопиперазин-2-карбоновых кислот по РКК

2.3 Синтез цис-тетрагидро- 1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-трионов

2.4 Синтез транс-тетрагидро-1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-триона

2.5 Синтез транс-тетрагидропиразино[1,2-а][1,4]диазепин-3,6,10-трионов и транс-тетрагидропиразино[1,2-а][1,4]диазоцин-3,6,11 -триона

2.6 Синтез транс-бензо[/]пиперазино[1,2-Ь][1,2,5]тиадиазепин-3,12(2Я,4Я)-дион 6,6-диоксидов

2.7 Изучение реакции внутримолекулярного арилирования амидов из продуктов РКК в синтезе бис-лактамов. Спонтанное образование трициклических лактонов

2.8 Рациональный дизайн потенциальных лигандов хемокиновых рецепторов

2.9 Синтез потенциального лиганда рецептора CXCR4

Глава 3 Экспериментальная часть

3.1 Синтез исходных соединений

3.1.1 Получение ^-защищенных циклических ангидридов иминодиуксусной кислоты

3.1.2 Получение транс-5-оксопиперазин-2-карбоновых кислот по РКК

3.2 Получение замещенных транс-5-оксопиперазин-2-карбоксамидов

3.3 Получение метил транс-5-оксопиперазин-2-карбоксилатов

3.4 Синтез цис-тетрагидро- 1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-трионов

3.5 Синтез транс-тетрагидро-1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-триона

3.6 Синтез транс-тетрагидропиразино[1,2-а][1,4]диазепин-3,6,10-трионов и транс-тетрагидропиразино[1,2-а][1,4]диазоцин-3,6,11 -триона

3.7 Синтез транс-бензо[/]пиперазино[1,2-Ь][1,2,5]тиадиазепин-3,12(2#,4#)-дион 6,6-диоксидов

3.8 Синтез цис-пиридо[3',2':5,6]пирано[3,4-Ь]пиперазин-2,5(Ш)-дионов

3.9 Синтез метил транс-5-оксо-3-(2-хлорпиридин-3-ил)пиперазин-2-карбоксилатов

3.10 Синтез потенциального лиганда рецептора CXCR4

Заключение

Список сокращений и обозначений

Список литературы

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Органическая химия», 02.00.03 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Новые полициклические бис-лактамные скаффолды для дизайна биологически активных веществ»

Введение

Актуальность темы. Создание новых биологически активных соединений с ожидаемыми свойствами для разработки лекарственных препаратов является практически значимой задачей органической химии и ее актуальным направлением. Удобным инструментом в решении этой задачи в процессе конструирования «подобных лекарству» (druglike) соединений выступают многокомпонентные реакции (МКР), продукты которых часто обладают благоприятным фармакологическим профилем. Из доступных исходных веществ МКР позволяют разрабатывать с высокой производительностью библиотеки органических соединений для биологического скрининга. Кроме того, МКР открывают доступ к большому разнообразию новых гетероциклических структур с уникальным расположением атомов и периферийных заместителей, которые часто трудно получить с помощью альтернативных стратегий синтеза. Усложнение структуры продуктов МКР посредством так называемых постконденсационных модификаций позволяет расширить хемотипное разнообразие конечных соединений и синтезировать ранее неизвестные гетероциклические системы.

Реакция Кастаньоли-Кушмана (РКК, циклоконденсация циклических ангидридов дикарбоновых кислот с иминами) занимает уверенное место в ряду МКР по своей способности конструировать биологически значимые соединения - полизамещенные у-и 8-лактамы. Однако долгое время синтетический потенциал РКК ограничивался главным образом получением различных производных таких лактамов.

Недавно реализованное успешное вовлечение новых циклических ангидридов (гетероаналогов глутарового ангидрида) в РКК позволило расширить методологию данной реакции. Так, путем введения в РКК ^-защищенных ангидридов иминодиуксусной кислоты всего за одну стадию были получены полизамещенные функционализированные пиперазин-2-оны (5-оксипиперазин-2-карбоновые кислоты).

Аннелирование второго лактамного цикла путем постконденсационных модификаций пиперазинонового кольца привело к целому ряду новых насыщенных азагетероциклических каркасов - бициклические пиперазиноны «бис-лактамного» характера - пиперазино[1,2-а]пиперазин-1,4,7-трионы, пиперазино[1,2-а][1,4]диазепин-

3,6,10-трионы и пиперазино[1,2-а][1,4]диазоцин-3,6,11-трионы. А также

трициклические производные пиперазинонов «сультам-лактамного» характера -бензо[/]пиперазино[1,2-6][1,2,5]тиадиазепин-3,12(2#,4#)-дион 6,6-диоксиды и «лактон-лактамного» характера - пиридо[3',2':5,6]пирано[3,4-6]пиперазин- 2,5(Ш)-дионы.

Подобные структуры благодаря насыщенной «матрице» и конформационной жесткости бициклического каркаса обладают высоким потенциалом для биомедицинского приложения, в частности могут воспроизводить структуру ^-поворота полипептидной цепи, а также, в силу тех же свойств, являются удобными скаффолдами для дизайна и конструирования пептидомиметиков в целом.

Исследование и реализация стратегий «пост-РКК» модификаций в разработке новых синтетических подходов к пептидомиметическим соединениям - пиперазино[1,2-а]пиперазинонам являлись предметом настоящего диссертационного исследования.

Работа была выполнена в Лаборатории химической фармакологии Института химии Санкт-Петербургского государственного университета (2016-2019 гг.) при финансовой поддержке РНФ (гранты 14-50-00069 и 19-75-30008).

Степень разработанности темы. В литературе представлено небольшое число работ применительно к синтезу производных пиперазино[1,2-а]пиперазинонов. Основная сложность состоит в разработке подходов к синтезу пиперазинового цикла необходимым образом функционализированного для дальнейшего наращивания бициклического каркаса. Кроме того, получение такого рода структур часто сопряжено с необходимостью контроля относительной или абсолютной конфигурации создаваемых стереоцентров, процессами рацемизации и разделения смеси диастереомеров. Подходы к синтезу других гетероциклических структур, полученных в рамках данной работы, в литературе отсутствуют.

Цель диссертационной работы заключалась в разработке новых подходов к синтезу пептидомиметических бис-лактамных скаффолдов на основе бициклических и трициклических пиперазинонов путем реализации постконденсационных модификаций продуктов реакции Кастаньоли-Кушмана - производных 5-оксопиперазин-2-

карбоновых кислот, а также исследование принципиальной возможности применения синтезированных каркасов в дизайне биологически активных веществ.

Для достижение данной цели были сформулированы следующие задачи:

• Поиск оптимальных условий протекания последовательных реакций ацилирования и циклизации с участием ^,^-1,4-бинуклеофилов (производных 5-оксопиперазин-2-карбоксамидов) и алифатических диэлектрофилов, приводящих к бициклическим лактамам (пиперазино[1,2-а]пиперазинонам).

• Изучение реакционной способности метил 5-оксопиперазин-2-карбоксилатов как субстратов, содержащих фрагмент а-аминокислоты, в реакциях пептидного сочетания с природными аминокислотами.

• Проверка возможности использования защитной группы на атоме азота пиперазинонов (2-нитрофенилсульфонильной) в «пост-РКК» преобразованиях: восстановления нитрогруппы/амидирования.

• Изучение возможности протекания реакции внутримолекулярного амидирования 5-оксопиперазин-2-карбоксамидов, содержащих в иминной части молекулы активный атом галогена в орто-положении ароматического кольца (2-хлорпиридиновый фрагмент).

• Дизайн и синтез потенциальных лигандов пептидергических рецепторов на основе нового бис-пиперазинового скаффолда.

Научная новизна диссертационной работы

■ Разработаны два новых диастереоселективных подхода к синтезу цис- и транс-2,8,9-тризамещенных тетрагидро-1#-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-трионов с новым типом замещения.

■ Предложены синтетические подходы к ранее неизвестным аннелированным 7- и 8-членным производным пиперазин-2-онов путем использования природных аминокислот в реакции с «пост-РКК» субстратами (метил 5-оксопиперазин-2-карбоксилатами).

■ Получен ряд соединений с новым вариантом применения фармакологически релевантного скаффолда 1,2,5-бензотиадиазепин-4-он-1,1-диоксида, аннелированного с циклом пиперазин-2-она - транс-бензо[/]пиперазино[1,2-Ь][1,2,5]тиадиазепин-3,12(2Н,4Н)-дион 6,6-диоксиды.

■ Предложен синтез ранее неописанных трициклических лактонов - цис-пиридо[3',2':5,6]пирано[3,4-Ь]пиперазин-2,5(1Я)-дионов в одну стадию по РКК.

■ При помощи инструментов компьютерного моделирования осуществлен дизайн и синтез потенциальных лигандов хемокиновых рецепторов CXCR4 на основе каркаса пиперазино[1,2-а]пиперазинона.

Теоретическая и практическая значимость работы заключается в расширении границ применимости «пост-РКК» модификаций в синтезе ранее неизвестных гетероциклических систем, удовлетворяющих критериям подобия лекарству (drug-likeness). На основе выработанных подходов показана возможность эффективно конструировать новые фармакологически релевантные скаффолды для последующего дизайна миметиков биологически активных пептидов. Опираясь на литературные данные проведен рациональный дизайн лигандов хемокиновых рецепторов с использованием инструментов компьютерного моделирования (докинга) на основе каркаса пиперазино[1,2-а]пиперазинона. Один из лигандов успешно синтезирован и готов к биологическим испытаниям.

Методы и методология исследования. В ходе работы над диссертационным исследованием использовались следующие современные физико-химические методы анализа для установления строения полученных соединений: масс-спектроскопия

1 13 1 1 13 1 13

высокого разрешения (HRMS-ESI); 1D (1H, CfH}) и 2D (1H,13C-HSQC и 1H,13C-HMBC) ЯМР-спектроскопия и методы рентгеноструктурного анализа (РСА) монокристаллов. Кроме того, для сравнения термодинамической устойчивости стереоизомеров проводились квантово-химические расчеты их энергий в наиболее стабильной конформации (расчёты проведены д.х.н., проф. Новиковым М. С.). Докинг кандидатных пептидомиметических лигандов в кристаллическую структуру хемокиновых рецепторов CXCR4 был проведен к.х.н., м.н.с. Гуреевым М. А. (СПбГТИ (ТУ)).

Степень достоверности результатов и апробация работы. Достоверность результатов обеспечена воспроизводимостью экспериментальных данных и использованием совокупности физико-химических методов анализа для установления строения полученных соединений. Материалы работы опубликованы в трех научных статьях в международных журналах, реферируемых в системах цитирования РИНЦ, Web of Science и Scopus, и представлены на трех докладах (устных и стендовых) на международных и всероссийских (с международным участием) конференциях.

Положения, выносимые на защиту:

- Разработка новых методов синтеза диастереомерно чистых 2,8,9-тризамещенных цис-тетрагидро-1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-трионов на основе реакций N-ацилирования и внутримолекулярного нуклеофильного замещения атома хлора (Sn2) в 5-оксопиперазин-2-карбоксамидах.

- Методы синтеза ранее неописанных пиперазино[1,2-а][1,4]диазепин-3,6,10-трионов и пиперазино[1,2-а][1,4]диазоцин-3,6,11-трионов транс-конфигурации, а также транс-тетрагидро-1Н-пиразино[1,2-а]пиразин-1,4,7-триона на основе реакции взаимодействия метил 5-оксопиперазин-2-карбоксилатов с аминокислотами - N-метилглицином, ß- и у-аминомасляной кислотами.

- Методы синтеза ранее неописанных трициклических производных пиперазинонов на основе РКК и «пост-РКК» трансформаций: цис-пиридо[3',2':5,6]пирано[3,4-Ь]пиперазин-2,5(Ш)-дионов и транс-бензо[/]пиперазино[1,2-Ь][1,2,5]тиадиазепин-3,12(2Я,4#)-дион 6,6-диоксидов.

- Возможность использования нового бис-пиперазинового скаффолда в дизайне потенциальных лигандов пептидергических рецепторов.

Содержание работы. Диссертация состоит из введения, литературного обзора, обсуждения результатов, выводов и списка цитируемой литературы, включающего 118 наименований. С целью введения в тематику исследования и обоснования его содержания в обзоре литературы представлены данные о известных «пост-РКК» модификациях для доступа к ранее неизвестным структурам. В соответствии с целью работы вторая часть литературного обзора посвящена рассмотрению основных методов

синтеза пептидомиметических бициклических пиперазинонов. Также включены главы, в ознакомительной форме излагающие концепцию пептидомиметиков и миметиков (3-поворота пептида, а также анализ известных биологически активных пептидомиметиков на основе бициклических пиперазинонов. Работа изложена на 135 страницах.

Глава 1 Литературный обзор

1.1 Постконденсационные модификации продуктов реакции Кастаньоли-

Кушмана

Реакция формального циклоприсоединения между иминами и циклическими ангидридами была открыта Н. Кастаньоли и М. Кушманом и впоследствии использована для синтеза природных соединений и их аналогов [1-8,21,25,30].

Введение в РКК новых циклических ангидридов дикарбоновых кислот, а также модификация структуры исходных иминов позволяет получать за одну стадию (включая тандемные процессы) разнообразные сложные полициклические каркасы, часто труднодоступные альтернативными способами синтеза. В обзорах [9-10] приведены наиболее последние результаты. Кроме того, в научной группе М. Красавина были проведены многочисленные исследования в этом направлении [11-17].

В данной части литературного обзора будут рассмотрены ключевые известные примеры из литературы преобразования продуктов РКК посредством так называемых постконденсационных модификаций, основанные на линейных синтетических последовательностях реакций.

1.1.1 Постмодификации продуктов РКК с участием иминной компоненты

Пример использования продуктов РКК был показан Т. Бергом и коллегами в синтезе замещенных 2-азабициклов [118-20]. Так, путем введения 1,3-азадиенов 2 в реакцию формального [4+2]-циклоприсоединения (РКК) с гексациклическими ангидридами вида 1а-с были получены с высокой диастереоселективностью вицинально функционализированные N-гетероциклы 3-5, несущие в а-положении алкенильный фрагмент (Схема 1.1).

1а, х = О 1Ь, X = Б 1с, X = сн2

1) Толуол, 90 °С

2) К2С03| ДМФА

Ме1, к. т.

X чС02Ме О^М^^Аг

3, х = о

4, X = Б

5, X = СН2

^ = А1к, Аг К" = Н, Ме

Схема 1.1

Из литературы известно, что гомофталевый ангидрид (ГФА) реагирует с ароматическими иминами, образуя азагетероциклические циклоаддукты 6. Тогда как его реакция с а, в-ненасыщенными иминами вида 7 приводит к карбоциклическим аддуктам - енаминонам 8 (Схема 1.2). На основании этого авторы предположили, что пониженная а-СН-кислотность циклических ангидридов 1а-с в реакциях с 1,3-азадиенами могла бы обеспечить баланс между их реакционной способностью и селективностью в сторону образования лактамов, подобных 6.

о о ^о

,\С02Н

Схема 1.2

Хемоселективная трансформация боковой сложноэфирной группы в субстратах 3 и 5 литийорганическими соединениями приводила к четвертичным алкильным/бензиловым спиртам 9 (алкенолам) (Схема 1.3). Последние выступали ключевыми синтетическими предшественниками для всех последующих разработанных вариантов «пост-РКК» модификаций в синтезе новых бициклических структур.

(3.0 экв.)

ТГФ, -78 °С

К' К" 3 или 5 К,К = Н или Ме

Так, палладий-катализируемая внутримолекулярная этерификация (окислительное алкоксилирование) алкенолов из субстратов 3 или 5 в присутствии основания приводила к лактамам 10 [18] (Схема 1.4).

31М пи!

X чС02Ме

N

3 или 5

(3.0 экв.)

Р|1 ТГФ, -78 °С

2) Рс1(ОАс)2 (5 мол%) и2С03 (1.5 экв.) РЫ(ОАс)2(1.5 экв.) С6Р61 100 °С

Ме Ме

О. X.

СГ N у РИ ^ Ме

Юа, 79%

Аг Аг

о^.Х

СГ N ^Г РИ Ме

ЮЬ, 83% Аг = 3-МеОР11

N

К"

10

РЬ

Схема 1.4

Было показано, что спирты 9 под действием каталитических количеств кислоты Льюиса (FeClз) подвергаются внутримолекулярной дегидратации/циклизации [19], результате чего были получены бициклические соединения 11 (Схема 1.5).

у

^п Т он

К"

РеС13*6Н20 (5 мол%)

МеС1Ч, 80 °С

грш

X И"

Г" ТУ*

о 11

№ = А1к, Аг К" = Н, Ме

РГ = А1к, Аг, а11у1, а1купу1 п = 0,1 X = СН2, О

Схема 1.5

Авторами был предложен возможный механизм показанной выше реакции: протонирование и дегидратация 9 приводит к карбокатиону 12, внутримолекулярное электрофильное присоединение которого по алкенильному фрагменту дает циклический карбокатион 13. Депротонирование 13 приводит к целевому соединению 11 наряду с возможными побочными процессами образования 14 и 15 (Схема 1.6).

х

Аг

К"

ТМ-кат.

кислота Льюиса

12

^ К"

изомеризация

депротонирование

изомеризация

11

Схема 1.6

Также на примере замещенных спиртов 9 дополнительно был разработан подход, основанный на С-Н функционализации (внутримолекулярной енольной этерификации) в синтезе лактамов 10 (Схема 1.4). При этом применялись более дешевые в сравнении с палладием катализаторы на основе меди [20]. Лактамы 10, содержащие боковые геминальные алкенильные заместители, по реакции метатезиса приводили к получению спиротрициклических дигидропиранов 16 (Схема 1.7).

С|'рСу3РЬ О кат. Граббса 2-покол. (2 мол%)

РИ

гп СН2С12, 40 °С, 6 ч

Схема 1.7

1.1.2 Постмодификации продуктов РКК посредством преобразования

циклических ангидридов

Исследования группы М. Кушмана были сосредоточены главным образом на изучении реакции янтарного и гомофталевого (ГФА) ангидридов с иминами [3,5]. Использование других субстратов, в частности замещенных производных янтарного ангидрида, было изучено мало. Однако было сделано наблюдение, что фенилянтарный ангидрид является реакционноспособным субстратом для РКК [2].

«Пробел» в этой области был восполнен экспериментами, предпринятыми в группе Д. Шоу, где был изучен синтетический потенциал новых ангидридов в РКК, главным образом производных янтарного ангидрида. В результате были разработаны эффективные подходы к синтезу структурно разнообразных библиотек малых молекул [21-26]. Высокий уровень скелетного разнообразия продуктов был достигнут за счет дизайна «пост-РКК» преобразований.

Так, путем тщательно продуманного размещения ключевых функциональных групп как в альдегидной (стратегия А), так и в ангидридной частях (стратегия B) участников РКК были реализованы новые трехстадийные подходы к синтезу разнообразных трициклических и спироциклических каркасов вида 20 и 21, схожих с биоактивными малыми молекулами [27] (Схема 1.8). В данном подходе расположение периферийных заместителей определяло структуру конечных продуктов.

о

По стратегии А кислоту 22 переводили в амид 22', который далее претерпевал циклизацию в трициклический тетрагидрохинолон 23. Использование орто-арилбромидов вместо орто-арилиодидов в данном случае не приводило к циклизации (Схема 1.9 и стратегия А, Схема 1.8).

& = 2-МеО-С6Н4СН2СН2 Схема 1.9

Однако стратегию В реализовать аналогичным образом (то есть через внутримолекулярное амидирование арилйодидов) не удалось. Вместо этого прибегли к реакции прямого нуклеофильного ароматического замещения. С этой целью был синтезирован специальным образом замещённый янтарный ангидрид 24, который после РКК давал аддукт 25 в виде смеси диастереомеров. Амидирование свободной карбоксильной группы в последнем приводило к амиду 26 с выходом 80% на две стадии. Последний претерпевал реакцию внутримолекулярного ароматического замещения в присутствии карбоната калия и давал с высоким выходом спироциклический аддукт 27 [28] (Схема 1.10).

МеО

Схема 1.10

В той же исследовательской группе было показано, что 3-арилтиозамещенные янтарные ангидриды могут образовывать у-лактамы 28 с высокой

диастереоселективностью [29]. Этот процесс также может быть реализован в «one-pot» формате по четырехкомпонентной реакции между альдегидами, аминами, тиолами и малеиновым ангидридом (Схема 1.11). На схеме представлены некоторые примеры полученных продуктов.

Rl

HS +

NH= rAh

Толуол кипячение

r1n

+ iL

ö' \ 3 R2 H SR3

R2 TT"

K2CO3/CH3I R^S

COOMe

28

"COOMe S(p-tol)

94% (>95:5)

Схема 1.11

"COOMe S(p-tol)

80% (>95:5)

'COOMe

68% (71:29)

"COOMe

92% (>95:5)

В рамках данной работы была изучена способность тиоэфирной группы в лактамах 28 служить предшественниками реакционноспособных интермедиатов - катионов, анионов и радикалов для образования новых С-С связей в синтезе разнообразных каркасов.

Наличие двухвалентной серы (склонной к окислению в условиях живого организма) в продуктах РКК может рассматриваться как недостаток с точки зрения разработки лекарственного средства. Однако авторы продемонстрировали возможность удаления тиоэфирной группы как напрямую (с получением 29, Схема 1.12), так и после окисления тиоэфира 30 до сульфоксида 31, что приводит после элиминирования сульфиновой кислоты к ненасыщенным лактамам - пирролинонам 32, существующим в виде смеси таутомеров (Схема 1.13).

-/••""СООМе 28а

I

А1ВМ (ТМв^Н

СОО^Ви

СООМе

29, 89%

Схема 1.12

У" "'СООМе

СООЕ1

[О]

.....СООМе . ривОН

80(р-и>1)

СООМе

30

СООЕ1

33%

СООЕ1

Схема 1.13

Обработка сульфоксида 33 реактивом Гриньяра (изопропилмагнийхлоридом) приводила к генерации промежуточного карбаниона, который подвергался внутримолекулярной реакции присоединения по Михаэлю с образованием с высокой диастереоселективностью трициклического каркаса индено[1,2-6]пиррол-2-она 34 (Схема 1.14).

Схема 1.14

Продукты РКК, полученные из арилтиозамещенных янтарных ангидридов, были использованы в пятистадийном синтезе трициклического каркаса мартинелловой кислоты из мартинеллина [21]. Оба соединения являются алкалоидами, выделенными из тропического растения МаШпеНа iquitosensis.

Лактам 36 с выходом 61% получали по РКК из ангидрида 35. Обработка соединения 36 никелем Ренея приводила к восстановительному удалению арилтиогруппы и восстановлению нитрогруппы до соответствующего анилина. Последний претерпевал частичную лактамизацию с образованием трициклического лактама 37 (^wc-конфигурация была доказана методом РСА монокристаллов). Для достижения полной конверсии в реакцию добавляли DBU. В результате с выходом 41% был получен продукт 37. Формирование полного каркаса природной мартенелловой кислоты (а также мартенеллина) - соединение 38 - происходило в три стадии с выходом 73% (Схема 1.15). Примечательно, что авторы наблюдали образование единственного диастереомера конечного трициклического лактама 38, относительную конфигурацию которого подтверждали с помощью спектроскопии NOESY.

Схема 1.15

Сообщалось также о применении РКК и «пост-РКК» к шестистадийному синтезу пирролизидинового алкалоида (±)-изоретронеканола [25]. Это стало возможно благодаря использованию в РКК высокореакционноспособного сульфонилзамещенного янтарного ангидрида 40.

Реакция ангидрида 40 с имином 39 (полученного из коричного альдегида и аллиламина) приводила с высокой диастереоселективностью к замещенному у-лактаму

41. Аннелирование второго кольца происходило по реакции метатезиса боковых алкенильных заместителей с получением пирролизидинового бициклического каркаса

42. Удаление фенилсульфольнильной группы, содержащейся в соединении 42, под

о

действием ББи давало продукт 44, который превращали в (±)-изоретронеканол в две стадии с низким выходом. Альтернативный подход заключался в гидрогенолизе соединения 42 с образованием лактама 43. Двойную связь в последнем восстанавливали с образованием соединения 45, который был превращен в (±)-изоретронеканол в одну стадию. Второй путь получения (±)-изоретронеканола оказался менее удобным, однако целевое соединение в данном случае было получено с гораздо более высоким выходом без использования автоклава, что необходимо для восстановления пиррола 44 в соединение 45 (Схема 1.16).

1) О ТГФ

2) ТМЗСН1Ч2 78%

-он

(±)-изоретронеканол

РИ

О

■^уЛ

гГ^^'ЭОгРЬ ^ С02Ме 41

кат. Граббса 2-покол. (3 мол%)

86%

1) Н2, Рс1/С 99%

ЭОгРЬ

42 С02Ме

43 С02Ме

2) ОВи 84%

Н2, Рс1/С 99%, >95:5 с1г

ови

41%

45 Н С02Ме

Схема 1.16

На основе ^-сульфонилимина 46 и замещенного янтарного ангидрида 47 был разработан пример РКК [30]. Данный подход был успешно применен к синтезу полизамещенного каркаса сложного природного соединения - (±)-бисавентантрамида Б-6. Последний относится к классу защитных метаболитов растений (фитоалексинов), обладает хорошей биодоступностью для млекопитающих, а также антиоксидантными, противовоспалительными и противоопухолевыми свойствами. На Схеме 1.17 показана ретросинтетическая схема, иллюстрирующая данный подход.

двойное N-арилирование по Бухвальду

>

О

ОМе

Схема 1.17

Исходный у-лактам по РКК был синтезирован с высокой диастереоселективностью из имина 46 с 2-триметилсилилсульфонильной (SES) защитной группой и ангидрида 47. Для этого ангидрид 47 переводили в соответствующий енолят под действием сильного основания (диизопропиламида лития) при пониженной температуре. В этой форме он эффективно вступал во взаимодействие с имином 46 по реакции Манниха с последующим внутримолекулярным ^-ацилированием, что и приводило к у-лактаму, а после удаления силильной защитной группы - к NH-лактаму 48. Введение двух идентичных арильных заместителей по амидному и лактамному атомам азота для получения соединения 50 проводили двойным медькатализируемым N-арилированием с использованием арилйодида 49. Последующее удаление двух изопропильных заместителей и гидролиз двух сложноэфирных групп приводило к образованию к (±)-бисавентантрамида B-6 с суммарным выходом 72% на две стадии (Схема 1.18).

о

4 экв. 6 20 мол% Cul 40 мол% DMEDA

К3РО4, диоксан 50 °С, 72 ч 72%

2) LiOH, ТГФ/Н20 к. т., 17ч 72% (2 стадии)

1) BCI3, CH2CI2 0 °С -> к. т., 3 ч

МеО

НО.

ОН

(±)-Бисавенантрамид Б-6

II'V- ОМе

Схема 1.18

1.1.3 Постмодификации продуктов РКК с участием ГФА

Потенциал РКК с участием ГФА и «пост-РКК» преобразований был продемонстрирован в работах М. Кушмана [31-34].

Некоторые разработанные этой группой трансформации приведены на Схеме 1.19. В частности, по РКК с участием 6,7-диметоксизамещенного гомофталевого ангидрида 51 была получена диастереоселективная смесь продуктов. Выделенный из этой смеси с выходом 60% основной диастереомер транс-52 подвергали этерификации, дегидрированию посредством элиминирования фенилселеноксида и щелочному гидролизу, что приводило к образованию смеси тетрациклического продукта 53а и нециклизованной аминокислоты. Последняя в чистом виде не выделялась. Аналогичным обзором были синтезированы дибезно[с,^][1,6]нафтиридины вида 53, содержащие другие боковые заместители. Полученные соединения проявили мощную ингибиторную активность в отношении топоизомеразы I человека, что говорит о перспективности использования данного класса соединений в качестве противоопухолевых препаратов (Схема 1.19).

о

транс-52,60%

О

цис-52,35%

кон

Н20/этиленгликоль (1:1)

уыпаиоима А л

0 °С —> К. Т., 6 Ч 62%

Н

Кроме того, группой Кушмана была показана возможность применения РКК в синтезе каркасов природных алкалоидов [8, 35-37].

Другие синтетические стратегии, включающие постмодификации продуктов РКК можно также найти в работах [38-42].

В литературе встречаются такие конденсированные структуры, которые обозначаются термином «бициклические пиперазиноны» - в общем виде так обозначаются гетероциклические соединения, аннелированные пиперазиновым циклом, как правило, следующим образом:

В виду большого числа структур, обозначаемых таким образом (X = CH2, O, S, NH), в данной работе будут рассмотрены их азааналоги и известные методы синтеза пиперазино[1,2-а]пиперазинонов («6/6» системы, они же далее бис-лактамы). Аннелированные «6/7» и «6/8» пиперазиноны в литературе не представлены. В работах [43-46] были получены бензоаннелированные производные «6/7» систем -пиперазинобензодиазепины и проведены их биологические испытания в качестве непептидных антагонистов рецептора вазопрессина.

Впервые получение соединения вида 55 упоминается в немецкой статье Archiv der Pharmazie от 1962 г [47]. Продукт конденсации 1,3-бисзамещенного пропан-2-она и 2,4-динитрофенилгидразина вида 54 подвергали расщеплению по связи N-N гидразона (восстановлению C=N связи с отщеплением триаминобензола) на никеле Ренея с последующей циклизацией с образованием бис-лактама 55 (4,6-диоксо-пиперазино[1,2-а]пиперазина) с выходом 26%. (Схема 1.20).

Похожие диссертационные работы по специальности «Органическая химия», 02.00.03 шифр ВАК

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Усманова Лилия Маратовна, 2021 год

Список литературы

1. Castagnoli, N. The condensation of succinic anhydride with N-benzylidene-N- methylamine. Stereoselective synthesis of trans- and cis-1-methyl-4-carboxy-5-phenyl- 2-pyrrolidinone / N. Jr. Castagnoli // J. Org. Chem. - 1969. - 34. - P. 3187-3189.

2. Cushman, M. Condensation of succinic anhydrides with Schiff bases. Scope and mechanism / M. Cushman, N. Jr. Castagnoli // J. Org. Chem. - 1971. - 36. - P. 3404-3406.

3. Cushman, M. The condensation of imines with homophthalic anhydrides. A convergent synthesis of cis- and trans-13-methyltetrahydroprotoberberines / M. Cushman, J. Gentry, F. W. Dekow // J. Org. Chem. - 1977. - 42. - P. 1111-11116.

4. Cushman, M. Novel approach to the synthesis of nitrogen analogs of the tetrahydrocannabinols / M. Cushman, N. Jr. Castagnoli // J. Org. Chem. - 1973. - 38. - P. 440448.

5. Cushman, M. Synthesis of pharmacologically active nitrogen analogs of the tetrahydrocannabinols / M. Cushman, N. Jr. Castagnoli // J. Org. Chem. - 1974. - 39. - P. 1546-1550.

6. Cushman, M. A study and mechanistic interpretation of the electronic and steric effects that determine the stereochemical outcome of the reaction of Schiff bases with homophthalic anhydride and 3-phenylsuccinic anhydride / M. Cushman, E. J. Madaj // J. Org. Chem. - 1987.

- 52. - P. 907-915.

7. Haimova, M. A. A highly stereoselective synthesis of 3,4-dihydro-1(2H)-isoquinolinones and 8-oxoberbines from homophthalic anhydrides and azomethines / M. A. Haimova, N. M. Mollov, S. C. Ivanova, A. I. Dimitrova, V. I. Ognyanov // Tetrahedron - 1977. - 33. - P. 331336.

8. Cushman, M. Total Synthesis of (±)-14-Epicorynoline, (±)-Corynoline, and (±)-6-Oxocorynoline / M. Cushman, A. Abbaspour, Y. P. Gupta // J. Am. Chem. Soc. - 1983. - 105.

- Р. 2873- 2879

9. Krasavin, M. Current diversity of cyclic anhydrides for the Castagnoli-Cushman- type formal cycloaddition reactions: prospects and challenges / M. Krasavin, D. Dar'in // Tetrahedron Lett. - 2016. -57. - P. 1635-1640.

10. Gonza lez-Lo pez, M. Cyclic anhydrides in formal cycloadditions and multicomponent reactions / M. Gonza lez-Lo 'pez, J. T. Shaw // Chem. Rev. - 2009. -109. - P. 164-189.

11. Dar'in, D. New Heterocyclic Product Space for the Castagnoli-Cushman Three-Component Reaction / D. Dar'in, O. Bakulina, M. Chizhova, M. Krasavin // Org. Lett. - 2015.

- 17. - P. 3930-3933.

12. Chizhova, M. New Dicarboxylic Acid Anhydride for Ambient-Temperature Castagnoli-Cushman Reactions / M. Chizhova, O. Bakulina, D. Dar'in, M. Krasavin // Chemistry Selection

- 2016. - 1. - P. 5487-5492.

13. Bakulina, O. o-Phenylenediacetic Acid Anhydride in the Castagnoli-Cushman Reaction: Extending the Product Space to e-Lactams / O. Bakulina, D. Dar'In, M. Krasavin // Synlett. -2017. 28. - P. 1165-1169.

14. Lepikhina, A. Skeletal Diversity in Combinatorial Fashion: A New Format for the Castagnoli-Cushman Reaction / A. Lepikhina, D. Dar'In, O. Bakulina, E. Chupakhin, M. Krasavin // ACS Comb. Sci. - 2017. - 19. - P. 702-707.

15. Bakulina, O. A General Way to Construct Arene-Fused Seven-Membered Nitrogen Heterocycles / O. Bakulina, M. Chizhova, D. Dar'in, M. Krasavin // European J. Org. Chem.

- 2018. - P. 362-371.

16. Moreau, E. The First Example of Azole-Fused Cyclic Anhydride Reacting in the Castagnoli-Cushman Way / E. Moreau, D. Dar'In, M. Krasavin // Synlett. - 2018. - 29. - P. 890-893.

17. Chupakhin, E. The Castagnoli-Cushman reaction in a three-component format / E. Chupakhin, D. Dar'in, M. Krasavin // Tetrahedron Lett. - 2018. - 59. - P. 2595-2599.

18. Braunstein, H. Modular access to vicinally functionalized allylic (thio)morpholinonates and piperidinonates by substrate-controlled annulation of 1,3-azadienes with hexacyclic anhydrides

/ H Braunstein, S. Langevin, M. Khim, J. Adamson, K. Hovenkotter, L. Kotlarz, B. Mansker, T. K. Beng // Org. Biomol. Chem. - 2016. - 14. - P. 8864-8872.

19. Hovenkotter, K. Expedient and modular access to 2-azabicyclic architectures by iron-catalyzed dehydrative coupling of alcohol-bearing allylic lactams / K. Hovenkotter, H. Braunstein, S. Langevin, T. K. Beng // Org. Biomol. Chem. - 2017. - 15. - P. 1217-1221.

20. Beng, T. K. Copper-catalyzed regioselective dehydrogenative alkoxylation of morpholinonyl alkenols: application to the synthesis of spirotricyclic dihydropyrans and of trans-fused bicyclic morpholines / T. K. Beng, M. Bauder, M. J. Rodriguez, A. Moreno // New J. Chem. - 2018. - 42. - P. 16451-16455.

21. Ng, P. Y. Cycloaddition Reactions of Imines with 3-Thiosuccinic Anhydrides: Synthesis of the Tricyclic Core of Martinellic Acid / P. Y. Ng, C. E. Masse, J. T. Shaw // Org. Lett. -2006. - 8. - P. 3999-4002.

22. Wei, J. Diastereoselective Synthesis of y-Lactams by a One-Pot, Four-Component Reaction / J. Wie, J. T. Shaw // Org. Lett. - 2007. - 9. - P. 4077-4080.

23. Tang, Y. One-Step Synthesis of Complex Nitrogen Heterocycles from Imines and Alkyl-Substituted Maleic Anhydrides / Y. Tang, J. C. Fettinger, J. T. Shaw // Org. Lett. - 2009. - 11. - P. 3802-3805.

24. Tan, D. Q. Stereoselective Synthesis of y-Lactams from Imines and Cyanosuccinic Anhydrides / D. Q. Tan, A. Younai, O. Pattawong, J. C. Fettinger, P. H. - Y. Cheong, J. T. Shaw // Org. Lett. - 2013. - 15. - P. 5126-5129.

25. Sorto, N. A. Diastereoselective Synthesis of y- and 8-Lactams from Imines and Sulfone-Substituted Anhydrides / N. A. Sorto, M. J. Di Maso, M. A. Munoz, R. J. Dougherty, J. C. Fettinger, J. T. Shaw // J. Org. Chem. - 2014. - 79. - P. 2601-2610.

26. Di Maso, M. J. Diastereoselective Synthesis of and Mechanistic Understanding for the Formation of 2-Piperidinones from Imines and Cyano-Substituted Anhydrides / M. J. Di Maso, K. M. Snyder, F. De Souza Fernandes, O. Pattawong, D. Q. Tan, J. C. Fettinger, P. H. Y. Cheong, J. T. Shaw // Chem. - A Eur. J. - 2016. - 22. - P. 4794-4801.

27. Masse, C. Divergent Structural Complexity from a Linear Reaction Sequence: Synthesis of Fused and Spirobicyclic y-Lactams from Common Synthetic Precursors / C. E. Masse, P. Y. Ng, Y. Fukase, M. Sa'nchez-Rosello ' , Jr. T. Shaw // J. Comb. Chem. - 2006. - 8. - P. 293296.

28. Tan, D. Synthesis of a y-Lactam Library via Formal Cycloaddition of Imines and Substituted Succinic Anhydrides / D. Q. Tan, A. L. Atherton, A. J. Smith, C. Soldi, K. A. Hurley, J. C. Fettinger, Jr. T. Shaw // ACS Comb. Sci. - 2012. - 14. - P. 218-223.

29. Biggs-Houck, J. Carbon-Carbon Bond-Forming Reactions of a-Thioaryl Carbonyl Compounds for the Synthesis of Complex Heterocyclic Molecules / J. E. Biggs-Houck, R. L. Davis, J. Wei, B. Q. Mercado, M. M. Olmstead, D. J. Tantillo, Jr.T. Shaw // J. Org. Chem. -2012. - 77. - P. 160-172.

30. Di Maso, M. Synthesis of (±)-Bisavenanthramide B-6 by an Anionic Anhydride Mannich Reaction / M. J. Di Maso, G. M. Nepomuceno, M. A. St. Peter, H. H. Gitre, K.S. Martin, Jr. T. Shaw // Org. Lett. - 2016. - 88. - P. 1740-1743.

31. Kiselev, E. Design, Synthesis, and Evaluation of Dibenzo[c,h][1,6]naphthyridines as Topoisomerase I Inhibitors and Potential Anticancer Agents / E. Kiselev, T. S. Dexheimer, Y. Pommier, M. Cushman // J. Med. Chem. - 2010. - 53. - P. 8716-8726.

32. Kiselev, E. Dibenzo[c,h][1,5]naphthyridinediones as Topoisomerase I Inhibitors: Design, Synthesis, and Biological Evaluation/ E. Kiselev, N. Empey, K. Agama, Y. Pommier, M. Cushman // J. Org. Chem. - 2012. - 77. - P. 5167-5172.

33. Lv, P. Design, Synthesis, and Biological Evaluation of O-2-Modified Indenoisoquinolines as Dual Topoisomerase I-Tyrosyl-DNA Phosphodiesterase I Inhibitors / P. Lv, K. Agama, C. Marchand, Y. Pommier, M. Cushman // J. Med. Chem. - 2014. - 57. - P. 4324-4324.

34. Lv, P. Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Potential Prodrugs Related to the Experimental Anticancer Agent Indotecan (LMP400) / P.Lv, M. S. A. Elsayed, K. Agama, C. Marchand, Y. Pommier, M. Cushman // J. Med. Chem. - 2016. - 59. - P. 4890-4899.

35. Cushman, M. Utilization of the 1-ferrocenyl-2-methylpropyl substituent as a chiral auxiliary in the asymmetric syntheses of the benzophenanthridine alkaloids (+)- and (-)-corynoline / M. Cushman, J. K. Chen // J. Org. Chem. - 1987. - 52. - P. 1517-1521.

36. Cushman, M. Total synthesis of nitidine chloride / Cushman, J. K. Chen // J. Org. Chem. -1978. - 43. - P. 286-288.

37. Cushman, M. Total synthesis of (±)-chelidonine / M. Cushman, T. Choong, J. T. Valko, M. P. Koleck // J. Org. Chem. - 1980. - 45. - P. 5067-5073.

38. Floyd, D. Hit-to-Lead Studies for the Antimalarial Tetrahydroisoquinolone Carboxanilides / D. M. Floyd, P. Stein, Z. Wang, J. Liu, S.Castro, J. A. Clark, M. Connelly, F. Zhu, G. Holbrook, A. Matheny, M. S. Sigal, J. Min, R. Dhinakaran, S. Krishnan, S. Bashyum, S. Knapp, R. K. Guy // J. Med. Chem. - 2016. - 59. - P. 7950-7962.

39. Wang, Z. Stereochemical Aspects of T3P Amidations / Z. Wang, R.D. Barrows, T. J. Emge, S. Knapp // Org. Process Res. Dev. - 2017. - 21. - P. 399-407.

40. Burdzhiev, N. Synthesis and transformations of polysubstituted diastereomeric 5-oxomorpholin-2-carboxylic acids / N. Burdzhiev, E. Stanoeva, B. Shivachev, R. Nikolova // C. R. Chimie - 2014. - 17. - P. 420-430.

41. Sarnpitak, P. Convenient access to novel functionalized pyrazino[1,2-6] isoquinolin-6-one and diazepino[1,2-6]isoquinolin-7-one scaffolds via the Cushman multicomponent reaction followed by post-condensation / P. Sarnpitak, M. Krasavin // Tetrahedron Lett. - 2014. - 55.

- P. 2299-2303.

42. Burdzhiev, N. Reaction between glutaric anhydride and N-benzylidenebenzylamine, and further transformations to new substituted piperidin-2-ones / N. Burdzhiev, E. Stanoeva // Tetrahedron - 2006. - 62. - P. 8318-8326.

43. Matthews, J. Synthesis, resolution, and absolute configuration of novel tricyclic benzodiazepines / J. Matthews, A. Dyatkin, M. Evangelisto, D. Gauthier, L. Hecker, W. Hoekstra, F. Liu, B. Poulter, K. Sorgi, B. Maryanoff // Tetrahedron: Asymmetry - 2004. - 15.

- P. 1259-1267.

44. Matthews, J. Pyrazinobenzodiazepinesas Potent Nonpeptide Vasopressin Receptor Antagonists / J. Matthews, D. Hlasta, P. Andrade-Gordon, K. Demarest, E. Ericson, J. Gunnet, W. Hageman, R. Look, J. Moore, B. Maryanoff // Lett. in Drug Design & Discovery - 2005. -2. - P. 219-223.

45. Mieczkowski, A. A traceless solid-supported synthesis of novel pyrazinediazepinedione derivatives / A. Mieczkowski, J. Jurczak // Tetrahedron - 2010. - 66. - P. 2514-2519.

46. Mieczkowski, A. Novel (S)-1,3,4,12a-tetrahydropyrazino[2,1-c][1,4]benzodiazepine-6,12(2H,11H)-dione derivatives: Selective inhibition of MV-4-11 biphenotypic B myelomonocytic leukemia cells' growth is accompanied by reactive oxygen species overproduction and apoptosis / A. Mieczkowski, M. Psurski, M. Bagin ski, B. Bieszczad, M. Mroczkowska, M. Wilczek, J. Czajkowska, D. Trzybin ski, K. Woz niak, J. Wietrzyk // Bioorg. & Med. Chem. Lett. - 2018. - 28. - P. 618-625.

47. Rink, M. Synthese des 2,8-Dimethylpiperazino[1,2-a]piperazins und des 1-Methcarbaethoxy-2-oxo-4-acetyl-6-(2',4'-dinitro)phenylhydrazon-hexahydro-l,4-diazepins / M. Rink, K. Feiden // Arch. Pharm. (Weinheim) - 1962. - 295. - P. 121-126.

48. Beim. H. New Synthesis of Octahydro-2-methyl-2H-pyrazino[1,2-a]pyrazine / H. Beim, A. Day // J. Heterocycl. Chem. - 1977. - 14. - P. 307-308.

49. Witiak, D. Synthesis and Antimetastatic Properties of Stereoisomeric Tricyclic Bis(dioxopiperazine) Analogues in a B16 Melanoma Model / D. Witiak, B. Trivedi // J. Med. Chem. - 1981. - 24. - P. 1329-1332.

50. Gubert, S. A Convenient Synthesis of Parent and 2-Substituted Octahydro-2H-pyrazino[1,2-a]pyrazines / S. Gubert, C. Braojos, A. Sacrista'n, J. Ortiz // Synthesis - 1991. -4. - P. 318-320.

51. Belov, V. An Easy Access to Bicyclic Peptides with an Octahydro[2H]pyrazino[1,2-a]pyrazine Skeleton /V. Belov, C. Funke, T. Labahn, M. Es-Sayed, A. de Meijere // Eur. J. Org. Chem. - 1999. - 50. - P. 1345-1356.

52. Limbach, M. High yielding selective access to spirocyclopropanated 5-oxopiperazine-2-carboxylates and 1,4-diazepane-2,5-diones from methyl 2-chloro-2-cyclopropylideneacetate / M. Limbach, V. Korotkov, M. Es-Sayed, A. de Meijere // Org. Biomol. Chem. - 2008. - 6. -P. 3816-3822.

53. Eguchi, M. Solid-Phase Synthesis and Structural Analysis of Bicyclic ß-Turn Mimetics Incorporating Functionality at the i to i + 3 Positions / M. Eguchi, M. Lee, H. Nakanishi, M. Stasiak, S. Lovell, M. Kahn // J. Am. Chem. Soc. - 1999. - 121. - P. 12204-12205.

54. Kim, H. Design and Synthesis of Novel Conformational^ Restricted Peptide Secondary Structure Mimetics / H. Kim, H. Nakanishi, M. Lee, M. Kahn // Org. Lett. - 2000. - 2. - P. 301-302.

55. Golebiowski, A. Solid-Supported Synthesis of a Peptide ß-Turn Mimetic / A. Golebiowski, S. Klopfenstein, X. Shao, J. Chen, A. Colson, A. Grieb, A. Russell // Org. Lett. - 2000. - 17. - P. 2615-2617.

56. Golebiowski, A. Solid supported high-throughput organic synthesis of peptide b-turn mimetics via Petasis reaction/diketopiperazine formation / A. Golebiowski, S. Klopfenstein, J. Chen, X. Shao // Tetrahedron Lett. - 2000. - 41. - P. 4841-4844.

57. Golebiowski, A. Solid-Supported Synthesis of Putative Peptide ß-Turn Mimetics via Ugi Reaction for Diketopiperazine Formation / A. Golebiowski, J. Jozwik, S. Klopfenstein, A. Colson, A. Grieb, A. Russell, V. Rastogi, C. Diven, D. Portlock, J. Chen // J. Comb. Chem. -2002. - 4. - P. 584-590.

58. Lukina, T. Intramolecular [2+3]-addition of an azide to a C=C double bond as a novel approach to piperazines / T. Lukina, S. Sviridov, S. Shorshnev, G. Alexandrov, A. Stepanova // Tetrahedron Lett. - 2005. - 46. - P. 1205-1207.

59. Lukina, T. Novel approach to the synthesis of perhydropyrazino[1,2-a]pyrazine derivatives from amino alcohols / T. Lukina, S. Sviridov, S. Shorshnev, G. Aleksandrov, A. Stepanov // Tetrahedron Lett. - 2006. - 47. - P. 51-54.

60. Ivanov, A. Targeting protein-protein interactions as an anticancer strategy / A. Ivanov, F. Khuri, H. Fu // Trends Pharmacol. Sci. - 2013. - 34. - P. 393-400.

61. Jones, S. Principles of protein-protein interactions / S. Jones, J. Thornton // Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. - 1996. - 93. - P. 13-20.

62. Jin, L. Targeting Protein-Protein Interaction by Small Molecules / L. Jin, W. Wang, G. Fang // Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. - 2014. - 54. - P. 435-456.

63. Arkin, M. Small-Molecule Inhibitors of Protein-Protein Interactions: Progressing toward the Reality/ M. Arkin, Y. Tang, J. Wells // Chem. Biol. - 2014. - 21. - P. 1102-1124.

64. Arkin, M. Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: progressing towards the dream / M. Arkin, J. Wells // Nat. Rev. Drug Discovery - 2004. - 3. - P. 301-317.

65. Perez de Vega, M. Modulation of Protein-Protein Interactions by Stabilizing/Mimicking Protein Secondary Structure Elements / M. Perez de Vega, M. Martin-Martinez, R. Gonzalez-Muniz // Curr. Top. Med. Chem. - 2007. - 7. - P. 33-62.

66. Bogan, A. Anatomy of Hot Spots in Protein Interfaces / A. Bogan, K. Thorn // J. Mol. Biol. - 1998. - 280. - P. 1-9.

67. Guo, W. Hot spot-based design of small-molecule inhibitors for protein-protein interactions / W. Guo, J. Wisniewski, H. Ji // Bioorg. & Med. Chem. Lett. - 2014. - 24. - P. 2546-2554.

68. Ibarra, A. Predicting and Experimentally Validating Hot-Spot Residues at Protein-Protein Interfaces / A. Ibarra, G. Bartlett, Z. Hegedüs, S. Dutt, F. Hobor, K. Horner, K. Hetherington, K. Spence, A. Nelson, T. Edwards, D. Woolfson, R. Sessions, A. Wilson // ACS Chem. Biol. -2019. - 14. - P. 2252-2263.

69. White, C. Contemporary strategies for peptide macrocyclization / C. White, A. Yudin //

Nature Chemistry - 2011. - 3. - P. 509-524.

70. Chapter 15: Cyclic Peptides as Privileged Structures, in: Privileged Scaffolds in Medicinal Chemistry: Design, Synthesis, Evaluation / P. Cherkupally, R. Ramesh, E. Jad, T. Govender, H. Kruger, B. De La Torre, F. Albericio; Edited by Stefan Bräse. - RSC: Cambridge, 2015. -398 P.

71. Peptidomimetics in Organic and Medicinal Chemistry: The Art of Transforming Peptides in Drugs / A. Guarna, A. Trabocchi. - John Wiley & Sons Ltd: United Kingdom, 2014. - 312 P.

72. Ahn, J. Peptidomimetics and Peptide Backbone Modifications / J. Ahn, N. Boyle, M. MacDonald, K. Janda // Mini Rev Med Chem. - 2002. - 5. - P. 463-473.

73. Methods of Organic Chemistry: Synthesis of Peptides and Peptidomimetics / M. Goodman, A. Felix. - G. Thieme: Stuttgart, New York, 2003. - Volume E 22a. - 395 P.

74. Grauer, A. Peptidomimetics - A Versatile Route to Biologically Active Compounds / A. Grauer, B. König // Eur. J. Org. Chem. - 2009. - 30. - P. 5099-5011.

75. Vagner, J. Peptidomimetics, a synthetic tool of drug discovery / J. Vagner, H. Qu, V. Hruby

// Curr Opin Chem Biol. - 2008. - 12. - P. 292-296.

76. Tran, T. Defining scaffold geometries for interacting with proteins: geometrical classification of secondary structure linking regions / T. Tran, C. Kulis, S. Long, D. Bryant, P. Adams, M. Smythe // J. Comput. Aided Mol. Des. - 2010. -24. - P. 917-934.

77. Marcelino, A. Roles of ß-Turns in Protein Folding: From Peptide Models to Protein Engineering / A. Marcelino, L. Gierasch // Biopolymers - 2008. - 89. - P. 380-391.

78. Kee, S. Design of ß-turn Based Therapeutic Agents / S. Kee, K. Jois // Curr. Pharm. Des. -2003. - 9. - P. 1209-1224.

79. Whitby, L. Design, Synthesis, and Validation of a ß-Turn Mimetic Library Targeting Protein-Protein and Peptide-Receptor Interactions / L. Whitby, Y. Ando, V. Setola, P. Vogt, B. Roth, D. Boger // J. Am. Chem. Soc. - 2011. - 133. - P. 10184-10194.

80. Borthwick, A. 2,5-Diketopiperazines: Synthesis, Reactions, Medicinal Chemistry, and Bioactive Natural Products / A. Borthwick // Chem. Rev. - 2012. - 112. - P. 3641-3716.

81. Van, C. Structural Prerequisites for Receptor Binding of Helicokinin I, a Diuretic Insect Neuropeptide from Helicoverpa zea / C. Van, T. Zdobinsky, G. Seebohm, D. Nennstiel, O. Zerbe, J. Scherkenbeck // Eur. J. Org. Chem. - 2014. - 13. - P. 2714-2725.

82. Van, C. Macrocyclic analogues of the diuretic insect neuropeptide helicokinin I show strong receptor-binding / C. Van, D. Nennstiel, J. Scherkenbeck // Bioorg. Med. Chem. - 2015. - 23. - P. 3278-3286.

83. Malancona, S. Identification of MK-5710 ((8aS)-8a-methyl-1,3-dioxo-2-[(1S,2R)-2-phenylcyclopropyl] -N-(1 -phenyl- 1H-pyrazol-5-yl)hexahydroimid azo[1,5 -a]pyrazine-7( 1H)-carboxamide), a potent smoothened antagonist for use in Hedgehog pathway dependent malignancies, Part 1 / S. Malancona, S. Altamura, G. Filocamo, O. Kinzel, J. Hernando, M. Rowley, R. Scarpelli, C. Steinkühler, P. Jones // Bioorg. Med. Chem. - 2011. - 21. - P. 44224438.

84. Kozlowski, M. Formation of the 7-Oxa-1,4,10-triazatricyclo[8.2.25,12]tetradecane-2,14-dione Ring System: Misrouted Synthesis of a Peptidomimetic / M. Kozlowski, P. Bartlett // J. Org. Chem. - 1996. - 61. - P. 7681-7696.

85. Welmaker, G. Synthesis and 5-Hydroxytryptamine (5-HT) Activity of 2,3,4,4a-Tetrahydro-1H-pyrazino[1,2-a]quinoxalin-5-(6H)ones and 2,3,4,4a,5,6-Hexahydro- 1H-pyrazino[1,2-a]quinoxalines / G. Welmaker, J. Nelson, J. Sabalski, A. Sabb, J. Potoski, D. Graziano, M. Kagan, J. Coupet, J. Dunlop, H. Mazandarani, S. Rosenzweig-Lipson, S. Sukoff, Y. Zhang // Bioorg. & Med. Chem. Lett. - 2000. - 10. - P. 1991-1994.

86. Taylor, R. Combining Molecular Scaffolds from FDA Approved Drugs: Application to Drug Discovery / R. Taylor, M. MacCoss, A. Lawson // J. Med. Chem. - 2017. - 60. - P. 16381647.

87. Vitaku, E. Analysis of the Structural Diversity, Substitution Patterns, and Frequency of Nitrogen Heterocycles among U.S. FDA Approved Pharmaceuticals / E. Vitaku, D. Smith, J. Njardarson // J. Med. Chem. - 2014. - 57. - P. 10257-10272.

88. Vo, C.-V. Synthesis of Saturated N-Heterocycles / C.-V. Vo, J. Bode // J. Org. Chem. -2014. - 79. - P. 2809-2815.

89. Gettys, K. Recent Advances in Piperazine Synthesis / K. Gettys, Zh. Ye, M. Dai // Synthesis - 2017. - 49. - P. 2589-2604.

90. Tsuji, Y. Ruthenium Complex Catalyzed N-Heterocyclization. Syntheses of N-Substituted Piperidines, Morpholines, and Piperazines from Amines and 1,5-Diols / Y. Tsuji, K.-T. Huh, Y. Ohsugi, Y. Watanabe // J. Org. Chem. - 1985. - 50. - P. 1365-1370.

91. Rulev, A. Reaction of a-bromoenones with 1,2-diamines. Cascade assembly of 3-CF3-piperazine-2-ones via rearrangement / A. Rulev, M. Muzalevskiy, E. Kondrashov, I. Ushakov, A. Romanov, V. Khrustalev, V. Nenajdenko // Organic Letters - 2013. - Vol. 15, No 11. - P. 2726-2729.

92. Dandapani, D. Current strategies for diversity-oriented synthesis / S. Dandapani, L. Marcaurelle // Curr Opin Chem Biol. - 2010. - 14. - P. 362-370.

93. Yi, S. A Brief Overview of Two Major Strategies in Diversity-Oriented Synthesis: Build/Couple/Pair and Ring-Distortion / S. Yi, B. Varun, Y. Choi, S. Park // Front Chem. -2018. - 6. - P. 507-515.

95. Han, S.-Y. Recent development of peptide coupling reagents in organic synthesis / S.-Y. Han, Y.-A. Kim // Tetrahedron - 2004. - 60. - P. 2447-2467.

96. Yu, Z. Design, Synthesis and Biological Evaluation of Sulfamide and Triazole Benzodiazepines as Novel p53-MDM2 Inhibitors / Z. Yu, Ch. Zhuang, Y. Wu, Z. Guo, J. Li, G. Dong, J. Yao, Ch. Sheng, Zh. Miao, W. Zhang // Int. J. Mol. Sci. - 2014. - 15. - P. 1574115753.

97. Fanto, N. Design, Synthesis, and In Vitro Activity of Peptidomimetic Inhibitors of Myeloid Differentiation Factor 88 / N. Fanto, G. Gallo, A. Ciacci, M. Semproni, D. Vignola, M. Quaglia, V. Bombardi, D. Mastroianni, M. Zibella, G. Basile, M. Sassano, V. Ruggiero, R. De Santis, P. Carminati // J. Med. Chem. - 2008. - 51. - P. 1189-1202.

98. Di Santo, R. Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Molecular Modeling Studies of TIBO-Like Cyclic Sulfones as Non-Nucleoside HIV-1 Reverse Transcriptase Inhibitors / R. Di Santo, R. Costi, M. Artico, R. Ragno, A. Lavecchia, E. Novellino, E. Gavuzzo, F. La Torre, R. Cirilli, R. Cancio, G. Maga // Chem. Med. Chem. - 2006. - 1. - P. 82-95.

100. Shen, Q. Highly Reactive, General, and Long-Lived Catalysts for Coupling Heteroaryl and Aryl Chlorides with Primary Nitrogen Nucleophiles / Q. Shen, S. Shekhar, J. Stambuli, J. Hartwig // Angew. Chem. Int. Ed. - 2005. - 44. - P. 1371-1375.

101. Nicolas, L. Copper-catalysed amidation of 2-chloro-pyridines / L. Nicolas, P. Angibaud, I. Stansfield, L. Meerpoel, S. Reymond, J. Cossy // RSC Adv. - 2013. - 3. - P. 18787-18790.

102. Dar'in, D. The rare cis-configures trisubstitututed lactam products obtained by the Castagnoli-Cushman reaction in N,N-dimethylformamide / D. Dar'in, O. Bakulina, S. Nikolskaya, I. Gluzdikov, M. Krasavin // RSC Advances - 2016. - 6. - P. 49411-49415.

103. Arndt, V. Zur Darstellung von Diazomethan / V. Arndt, J. Amende // Angew. Chem. -1930. - 43. - P. 444-447.

104. Debnath, B. Small Molecule Inhibitors of CXCR4 / B. Debnath, Sh. Xu, F. Grande, A. Garofalo, N. Neamati // Theranostics - 2013. - 3. - P. 47-75.

105. Väben0, J. Progress toward rationally designed small-molecule peptide and peptidomimetic CXCR4 antagonists / J. Väben0, B. Haug, M. Rosenkilde // Future Med. Chem. - 2015. - 7. - P. 1261-1283.

106. Baumann, M. Influence of chain length on the activity of tripeptidomimetic antagonists for CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) / M. Baumann, M. Hussain, N. Henne, D. Garrote, S. Karlsh0j, T. Fossen, M. Rosenkilde, J. Väben0, B. Haug // Bioorg. Med. Chem. - 2017. -25. - P. 646-657.

107. Baumann, M. Synthesis of a novel tripeptidomimetic scaffold and biological evaluation for CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) antagonism / M. Baumann, L. Nome, Z. Zachariassen, S. Karlsh0j, T. Fossen, M. Rosenkilde, J. Väben0, B. Haug // Tetrahedron -2017. - 73. - P. 3866-3877.

108. Zachariassen, Z. Design, synthesis, and biological evaluation of scaffold-based tripeptidomimetic antagonists for CXC chemokine receptor 4 (CXCR4) / Z. Zachariassen, S. Thiele, E. Berg, P. Rasmussen, T. Fossen, M. Rosenkilde, J. Väben0, B. Haug // Bioorg. Med. Chem. - 2014. - 22. - P. 4759-4769.

109. Organicum. Practical Handbook of Organic Chemistry / H. Becker, W. Berger, G. Domschke - Addison-Wesley Pub. Co: U.S.A., 1973. - 768 P.

110. Adams, A. Benzyl Cyanide / R. Adams, A. Thal // Org. Synth. - 1941. - 1. - P. 107.

111. Vilches-Herrera, M. Selective catalytic transfer hydrogenation of nitriles to primary amines using Pd/C / M. Vilches-Herrera, S. Werkmeister, K. Junge, A. Börner, M. Beller // Catal. Sci. Technol. - 2014. - 4. - P. 629-632.

112. Bagal, D. Catalytic Reduction of Nitriles / D. Bagal, B. Bhanage // Science of Synthesis: Catalytic Reduction in Organic Synthesis 2 - 2018. - P. 375-401.

113. Heinzman, S. Mechanism of sodium borohydride-cobaltous chloride reductions / S. Heinzman, B. Ganem // J. Am. Chem. Soc. - 1982. - 104. - P. 6801-6802.

114. Osby, J. Studies on the Mechanism of Transition-Metal-Assisted Sodium Borohydride and Lithium Aluminum Hydride Reductions / J. Osby, S. Heinzman, B. Ganem // J.Am. Chem. Soc. - 1986. - 108. - P. 67-72.

115. Feichtinger, K. Triurethane-Protected Guanidines and Triflyldiurethane-Protected Guanidines: New Reagents for Guanidinylation Reactions / K. Feichtinger, H. Sings, T. Baker, K. Matthews, M. Goodman // J. Org. Chem. - 1998. - 63. - P. 8432-8439.

116. Palatinus, L. Superflip - a computer program for the solution of crystal structures by charge flipping in arbitrary dimensions / L. Palatinus, G. Chapuis // J. Appl. Cryst. - 2007. -40. - P. 786-790.

117. Sheldrick, G. M. Crystal structure refinement with SHELXL / G. M. Sheldrick // Acta Crystallographica Section C. - 2015. - 71. - P. 3-8.

118. Программный пакет для расчетов и обработки данных РСА: http://www.olexsys.org/Software.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.