Биокаталитический способ синтеза новых модифицированных нуклеозидов: возможности, особенности, ограничения тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Константинова Ирина Дмитриевна

  • Константинова Ирина Дмитриевна
  • доктор наукдоктор наук
  • 2025, ФГАОУ ВО «Северный (Арктический) федеральный университет имени М.В. Ломоносова»
  • Специальность ВАК РФ00.00.00
  • Количество страниц 376
Константинова Ирина Дмитриевна. Биокаталитический способ синтеза новых модифицированных нуклеозидов: возможности, особенности, ограничения: дис. доктор наук: 00.00.00 - Другие cпециальности. ФГАОУ ВО «Северный (Арктический) федеральный университет имени М.В. Ломоносова». 2025. 376 с.

Оглавление диссертации доктор наук Константинова Ирина Дмитриевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

Стр.

Введение

1 Обзор литературы

1.1 Пуриннуклеозидфосфорилаза - ключевой фермент в синтезе нуклеозидов

1.1.1 Третичная и четвертичная структура РКР

1.1.2 Структура активного центра РКР и механизм фосфоролиза

1.1.3 Природные субстраты пуриннуклеозидфосфорилаз

1.1.4 Неприродные субстраты пуриннуклеозидфосфорилазы

1.1.4.1 Неприродные субстраты с модификациями в гетероциклическом 40 основании

1.1.4.2 Неприродные субстраты с модификациями в углеводном остатке

1.1.4.3 Неприродные субстраты с модификациями и в 53 гетероциклическом основании, и в углеводном остатке

1.2 Использование биокатализа в промышленном получении 58 модифицированных нуклеозидов

1.3 Получение штамм-продуцентов КР

2 Обсуждение результатов

2.1 Оптимизация биосинтеза фармацевтически значимых 67 модифицированных нуклеозидов

2.1.1 Синтез кладрибина

2.1.2 Разработка способа получения флударабина

2.1.3 Оптимизация синтеза неларабина

2.2 Особенности химико-ферментативного синтеза нуклеозидов, 81 модифицированных по пуриновому основанию

2.2.1 Синтез нуклеозидов 2-хлор-С6-замещенного пурина

2.2.1.1 Синтез рибозидов 2-хлор-С6-замещенного пурина

2.2.1.2 Изучение явления удвоения спектров ЯМР индивидуальных 86 нуклеозидов 2-хлор-С6-замещенного пурина

2.2.1.3 Синтез 2'-дезоксирибозидов 2-хлор-С6-замещенного пурина 102 серии Сl-Соdе-dА

2.2.1.4 Синтез арабинозидов серии Сl-Соdе-АА

2.2.2 Синтез нуклеозидов 2-Н- и 2-амино-С6-замещенных пуринов

2.2.3 Синтез нуклеозидов бензоксазин-пурина

2.3 Биосинтез фторированных нуклеозидов бензимидазолов

2.3.1 Особенности биосинтеза нуклеозидов бензимидазолов

2.3.2 Синтез нуклеозидов 2-амино-1,3-бензоксазола

2.4 Нуклеозиды флексимерных оснований, особенности биосинтеза

2.4.1 Синтез нуклеозидов 3-(4-аминопиридил-5-ил)пиррола

2.4.2 Особенности синтеза флексимерных нуклеозидов 8-аза-7- 138 деазаинозина

2.4.3 Синтез флексимерных нуклеозидов пиразола-аминопиридина и 142 пиразола-аминопиримидина

2.4.4 Неожиданные продукты неспецифического гликозилирования 144 4-(4-аминoпиpидин-3-ил)-/#-пиpазoла

2.4.4.1 Изучение рН-зависимости процесса гликозилирования в синтезе 147 нуклеозидов аминопиридина-пиразола

2.4.4.2 Квантoвo-xимический aнaлиз основания 4-аминопиридина- 149 пиразола и его нуклеозидов ab initio

2.4.4.3 Корреляция структуры пиридиниевого рибозида

2.4.4.4 Моделирование взаимодействия флексимеров с активным 155 сайтом PNP E. coli

2.5 Биокатализ в синтезе нуклеозидов 1,2,4-триазола

2.5.1 Синтез аналогов рибавирина, замещенных по амидной группе

2.5.2 Синтез изостерических бициклических аналогов рибавирина

2.5.3 Синтез 5-алкоксиметильных аналогов рибавирина

2.5.3.1 Особенности синтеза 5-алкоксиметильных аналогов рибавирина

2.5.3.1.1 Региоизомерные продукты гликозилирования 5- 180 бензилоксиметил-1,2,4-триазол-3-карбоксамида

2.5.3.1.2 Кинетические эксперименты по определению параметров 181 процесса синтеза нуклеозидов 5-алкоксиметил-1,2,4-триазол-3-карбоксамидов

2.5.3.1.3 Загадочный продукт в реакции трансгликозилирования

2.5.4 Синтез тионовых аналогов рибавирина

2.6 Биокатализ в синтезе нуклеозидов 8-аза-7-дезазапурина или 198 пиразоло[3,4^]пиримидина

2.6.1 Синтез 4,6-дизамещенных аналогов пиразоло[3,4- 205 d]пиримидина

2.6.2 Синтез рибозидов аллопуринола и 6-хлор-аллопуринола

2.6.3 Синтез нуклеозидов 4-замещенного 6-хлорпиразоло[3,4- 210 d]пиримидина

2

2

2

2

2

Синтез 8-аза-7-дезаза аналога кладрибина - дезоксирибозида 210 4-амино-6-хлорпиразоло[3,4^]пиримидина

Синтез арабинозида 4-амино-6-хлорпиразоло[3,4-

d]пиримидина

Синтез нуклеозидов амида 6-хлор-4-(Ка-Ь-

валинил)пиразоло[3,4^]пиримидина

Синтез 4-тионовых производных 6-хлорпиразоло[3,4-

d]пиримидина

Результаты тестирования биологической активности

синтезированных нуклеозидов

Цитотоксическая активность нуклеозидов

2.7.2 Агонистическая активность нуклеозидов в отношении А1- 224 аденозиновых рецепторов

2.7.3 Антивирусная активность нуклеозидов

2.7.3.1 Антивирусная активность нуклеозидов в отношении вируса 232 гриппа А

2.7.3.2 Антивирусная активность нуклеозидов в отношении вируса 233 герпеса простого 1 типа

2.7.3.2.1 Антивирусная активность нуклеозидов С6-замещенного 2- 234 хлорпурина в отношении HSV-1

2.7.3.2.2 Антивирусная активность нуклеозидов замещенных 235 бензимидазолов в отношении HSV-1

2.7.3.2.3 Антивирусная активность аналогов рибавирина в отношении 238 HSV-1

2.7.3.2.4 Антивирусная активность нуклеозидов пурина, замещенного 240 по С6 остатком бензоксазина, в отношении VHS-1

2.7.4 Результаты первичного скрининга биологической активности

флексимерных нуклеозидов

3

3

3

3

3

3

3

Экспериментальная часть

Материалы и методы

Методики синтеза нуклеозидов

Рибозиды С6-замещенных производных 2-хлорпурина серия 249 Cl-Code-A

Ферментативный синтез 2'-дезоксирибозидов С6-замещенных 263 производных 2-хлорпурина серия Cl-Code-dA

Синтез арабинозидов серии Cl-Code-АА

Ферментативный синтез нуклеозидов пурина и 2-амино-пурина 277 с остатками аминокислот в С6 положении

Ферментативный синтез нуклеозидов 2-аминопурина с 2,3- 280 дигидро-7,8-дифтор-бензоксазиновыми заместителями в С6

3

положении

3.2.6 Синтез нуклеозидов замещенных бензимидазолов

3.2.7 Ферментативный синтез флексимерных нуклеозидов

3.2.8 Ферментативный синтез нуклеозидов 1,2,4-триазола

3.2.9 Ферментативный синтез нуклеозидов пиразоло[3,4- 323 d]пиримидина

4 Заключение

Список сокращений

Список использованных источников

Приложения

Приложение №1 Алгоритм оптимизации реакций

трансгликозилирования в синтезе новых нуклеозидов

Приложение №2 Особенности реакций гликозилирования в

синтезе новых нуклеозидов бензимидазолов (к разделу 2.3)

Приложение №3 Описание способа получения 1-(Р-0-

арабинофуранозил)бензимидазола (к разделу 2.3.1)

Приложение №4 Условия синтеза флексимерных нуклеозидов (к 374 разделу 2.4.3)

Приложение №5 Дополнительные материалы по проведению

докинга флексимеров в активном центре РКР (к разделу 2.4.4.4)

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биокаталитический способ синтеза новых модифицированных нуклеозидов: возможности, особенности, ограничения»

ВВЕДЕНИЕ

Селективная противоопухолевая [Robak 2013, Galmarini 2002] и антивирусная [Gupta 2004, Burrows 2015, Seley-Radtke 201S, Yates 2019, Eyer 2023] активности модифицированных нуклеозидов делают их важнейшим классом соединений в медицинской практике. Известны единичные случаи проявления иммуносупрессорной активности [Robak 200б]. В последние годы ведутся разработки препаратов, обладающих антибактериальной и противогрибковой активностями [Vodnala 2013, Wiegman 201б, Khandazhinskaya 201S]. Для терапии заболеваний сердечно-сосудистой системы, онкологических и офтальмологических патологий (глаукомы) осуществляется поиск эффективных агонистов и антагонистов аденозиновых рецепторов различных подтипов [Saini 2022, Effendi 2020, Hou 2012, Jacobson 201S]. Основные модификации структуры затрагивают либо углеводную часть молекулы, либо гетероциклическое основание. Часто сочетание таких модификаций приводит к появлению у соединения уникальной биологической активности. К сожалению, многие препараты данного класса, используемые в клинической практике, обладают высокой системной токсичностью для организма человека. К некоторым препаратам этого типа при терапии вирусных и опухолевых поражений человека развивается резистентность [Galmarini 2001, Likar 2010], что стимулирует разработку принципиально новых структур или синтез аналогов уже известных в клинике нуклеозидов для исследования биологической активности. Идеально найти такие структуры, чтобы можно было нивелировать высокую системную токсичность модифицированных нуклеозидов, минимизировать спектр побочных эффектов и, желательно, избежать образования резистентных штаммов вирусов и видов опухолей к препаратам.

На сегодняшний день в медицинской практике применяются десятки препаратов на основе модифицированных нуклеозидов. Среди них необходимо особо отметить антиметаболиты на основе пуриновых нуклеозидов [Видаль. Справочник лекарственных средств, URL: http://www.vidal.ru/]:

• кладрибин - терапия волосатоклеточного лейкоза, хронического В-клеточного лимфолейкоза, неходжкинских лимфом, макроглобулинемии Вальденстрема ;

• мавенклад (табл. форма кладрибина) -терапия тяжелых форм рассеянного склероза;

• клофарабин - терапия острого лимфобластного лейкоза (дети старше 1 года) с рецидивом или отсутствием реакции на химиотерапию двух предшествующих схем, а также при отсутствии других способов достижения стойкой ремиссии;

• неларабин, флударабин - терапия онкогематологических заболеваний.

Несмотря на долгий срок использования в практической медицине в составе комплексной антивирусной терапии и индивидуально применяют [Видаль. Справочник лекарственных средств, URL: http://www.vidal.ru/]:

• рибавирин - терапия гепатита С (в составе комплексной терапии), респираторно-синцитиальной вирусной инфекции, геморрагической лихорадки с почечным синдромом;

• азидотимидин - компонент антиретровирусной терапии ВИЧ-инфекции;

• видарабин, ацикловир, валцикловир - лечение герпеса.

Для профилактики и лечения цитомегаловирусных инфекций у пациентов после трансплантации органов в клиниках США и Европы применяется препарат Марибавир (L-нуклеозид бензимидазола) [Winston 2008, Avery 2010, Харитонова 2018].

Механизмы транспорта, накопления внутри клеток, инкорпорации в растущую цепь ДНК и РНК, характер метаболизма модифицированных нуклеозидов схожи для разных структур нуклеозидов [Boswell-Casteel 2017, Lane 2015]. В последние годы появляются сообщения о невозможности описать метаболические пути и катаболические превращения многих новых модифицированных нуклеозидов с точки зрения устоявшихся представлений о нуклеозидном внутриклеточном обмене [Zhu 2019, Ali 2023]. Возможно, что модифицированные нуклеозиды, взаимодействуя с клеточными рецепторами или белковыми молекулами, способны вызывать неспецифический иммунный ответ организма наряду с непосредственным антиметаболическим действием.

Практически любые модифицированные нуклеозиды могут быть синтезированы с использованием арсенала классических методов многостадийного химического синтеза [Robins 1981, Liu 2008, Qiu 2010, Temburnikar 2018, Thames 2020]. Недостатки такого подхода очевидны: высокая стоимость реагентов, необходимость в защите функциональных групп, невозможность проведения цепочки синтетических стадий без промежуточного выделения полупродуктов. К сожалению, продукты химического гликозилирования зачастую представляют собой смесь а и ß изомеров, технологии разделения которых довольно сложны. Многих из перечисленных проблем можно избежать, заменяя стадию химического гликозилирования оснований на ферментативное трансгликозилирование [McClean 2011, Huffman 2019, Benkovics 2022]. Для таких биокаталитических процессов можно использовать бактериальные ферменты нуклеинового обмена. Наилучшим образом зарекомендовали себя в качестве биокатализаторов реакции трансгликозилирования нуклеозидфосфорилазы бактерий, обладающие широкой субстратной специфичностью.

Цель исследований - выявление возможностей, особенностей и ограничений биокаталитического способа синтеза новых модифицированных нуклеозидов для реализации

синтетических процессов получения производных, модифицированных по гетероциклическому основанию и углеводному фрагменту. В фокусе исследования - возможности генно-инженерных нуклеозидфосфорилаз в реакциях трансгликозилирования, а именно пуриннуклеозидфосфорилазы (РКР, ЕС 2.4.2.1.).

К объектам исследований можно отнести новые модифицированные нуклеозиды пурина, бензимидазола, флексимерных оснований, 1,2,4-триазола и пиразоло[3,4-ё]пиримидина как с природными углеводными остатками (рибозой, 2-дезоксирибозой, арабинозой), так и с синтетической 2-дезокси-2-фторарабинозой. Предметом исследования являются парамерты проведения реакции трансгликозилирования для осуществления эффективного синтеза новых нуклеозидов и изучения их биологической активности.

Синтетические задачи решались в отношении получения нуклеозидов пяти типов (Рисунок 1.1), для обеспечения первичного тестирования их цитотоксичности, антивирусной и агонистической активности в отношении аденозиновых рецепторов. Все разработанные способы синтеза модифицированных нуклеозидов хорошо масштабируются и ориентированы на использование не только в лабораторной практике, но и для синтеза партий препаратов для доклинических/клинических исследований в масштабах опытных производств.

Рисунок 1 .1 - Сайты модификации структуры нуклеозидов пурина, бензимидазола, проксимальных флексимерных оснований, 1,2,4-триазола, пиразоло[3,4^]пиримидина.

Для достижения поставленной цели предполагалось решить конкретные исследовательские задачи в рамках проведения экспериментальных работ:

• разработать химико-ферментативный вариант синтеза и получить серию С6-замещенных нуклеозидов 2H-, 2-амино- и 2-хлорпурина;

• разработать биокаталитический вариант синтеза фторированных по бензольному кольцу нуклеозидов 1,3-бензимидазола;

• изучить возможности и особенности синтеза гибких флексимерных нуклеозидов пиррол/пиразол-аминопиридина/пиримидина с помощью реакции трансгликозилирования;

• разработать биокаталитический вариант синтеза нуклеозидов 1,2,4-триазола, замещенных по С3 и С5 положениям основания или триазол-оксадиазолов;

• разработать химико-ферментативный вариант синтеза и получить серию нуклеозидов С4,С6-замещенных пиразоло[3,4^]пиримидинов;

• определить критические факторы, определяющие возможности использования нуклеозидфосфорилаз в синтезе новых модифицированных нуклеозидов;

• провести скрининг цитотоксичности синтезированных нуклеозидов, антивирусной активности; изучить агонистическую активность серии нуклеозидов С6-замещенного 2-хлорпурина.

Актуальность результатов диссертации. Модифицированные нуклеозиды необходимы для создания новых антиметаболитов, антибактериальных, антивирусных препаратов для доклинического изучения. Рибозиды 2-хлор-С6-замещенного пурина могут найти применение в качестве агонистов или антагонистов аденозиновых рецепторов (AR) как средства профилактики и лечения сердечно-сосудистых заболеваний и глаукомы. Высокая системная токсичность классических фармацевтических препаратов наряду с растущей резистентностью к ним со стороны вирусов и бактерий стимулируют проведение работ по получению новых модифицированных нуклеозидов для выявления среди них эффективных препаратов для клинического изучения. При изучении особенностей биосинтеза нуклеозидов выяснены синтетические возможности генно-инженерных ферментов, определены структурные особенности субстратов пуриннуклеозидфосфорилазы E. coli, позволяющие проводить биокаталитические синтезы новых нуклеозидов. Фактически, гетероциклические основания пяти типов с различными заместителями в структуре использовались в качестве своеобразных зондов, позволяющих очертить каталитические возможности PNP. На основании полученных данных можно определить направления для рационального мутагенеза активных центров фермента с целью расширения субстратной специфичности PNP, улучшения сродства субстрата к активному центру фермента, что позволит создавать и использовать биокатализаторы с улучшенными на порядок кинетическими характеристиками.

Научная новизна исследования заключается в разработке химико-ферментативных подходов и получении пяти серий новых соединений - производных С6 и С2,С6-замещенных пуриновых нуклеозидов; замещенных по С2, С4-С6 положениям нуклеозидов бензимидазола; флексимерных нуклеозидов пиррол/пиразол-аминопиридина/пиримидина; нуклеозидов пиразоло[3,4^]пиримидина; нуклеозидов замещенных по С3- или С3,С5-дизамещенных 1,2,4-триазолов, или 1,2,4-триазол-3-оксадиазолов.

Разработан и запатентован вариант проведения реакции трансгликозилирования в синтезе арабинонуклеозидов, использующий параллельный фосфоролизу процесс арсенолиза, обеспечивающий преобладание реакции арабинозилирования над рибозилированием.

Выдвинута и доказана гипотеза формирования водородной связи N-С-Н-Ш -пурина для 2-хлор-К6-замещенных пуриновых нуклеозидов. Образование шестичленного дополнительного цикла в структуре пурина приводит к торможению свободного вращения заместителя, присоединенного в его С6 положение. Методом двумерной гетероядерной спектроскопии ЯМР подтверждено наличие предсказанной водородной связи, и объяснена аномалия в спектрах ЯМР - присутствие двух форм одного нуклеозида. Экспериментально подтвержденная нами гипотеза объяснила наличие второй заторможенной формы нуклеозида именно возникновением внутримолекулярной водородной связи, а не существованием амино-имино-таутомерных форм для 2-хлор-К6-замещенных пуринов (гипотезы, предложенной ранее).

В синтезе нуклеозидов (7) 1,3-бензимидазола, (2) аналогов С5-замещенных 1,2,4-триазол-3-карбоксамидов и (3) флексимерных оснований пиразол-аминопиридина обнаружены региоизомеры основных продуктов реакций трансгликозилирования. Впервые обнаружено присутствие продуктов вторичного гликозилирования и образования бисгликозидов в синтезе флексимерных пиразол-аминопиридиновых нуклеозидов. С помощью термодинамических расчетов и компьютерного моделирования нами предложен механизм, объясняющий возможность реализации этого процесса в активном центре фермента.

Определены критические факторы в структуре различных субстратов РКР, дающие возможность предсказать субстратные свойства фермента, и возможность его использования в биосинтезе новых нуклеозидов.

Теоретическая и практическая значимость работы: Доказана возможность использования модифицированных гетероциклических оснований в качестве своеобразных зондов активного центра РКР при исследовании субстратной специфичности фермента. Определены особенности и ограничения биокаталитического способа синтеза модифицированных нуклеозидов, позволившие обозначить критические факторы в структуре

различных субстратов РКР. В оптимизированных условиях синтезированы пять серий новых соединений - производных С6-замещенных пуринов, С6-замещенных 2-аминопуринов и С6-замещенных 2-хлорпуринов, нуклеозидов 5,6-дизамещенного, 2,5,6- и 4,5,6-тризамещенного бензимидазола, флексимерных нуклеозидов пиррола/пиразола-аминопиридина/пиримидина, нуклеозидов С4,С6-замещенных пиразоло[3,4-d]пиримидинов и нуклеозидов 1,2,4-триазола (замещенных по С3 и С5 положениям основания или триазол-оксадиазолов). Показано, что региселективность характеризует реакцию трансгликозилирования только в отношении пуриновых нуклеозидов. Для всех остых лигандов региоспецифичность довольно условна: для каждого типа модифицировыанного основания мы обнаружили протекание неспецифичных реакций, в результате которых были получены новые модифицированные нуклеозиды, синтез которых классическими химическими методами нереализуем. Разработаны новые варианты технологий биосинтеза субстанций фармпрепаратов кладрибина, флударабина, неларабина. Использование арсенолиза параллельно фосфоролизу введено в практике биосинтеза пуриновых арабинозидов впервые, что позволяет эффективно смещать равновесие биокаталитической реакции в сторону образования целевых соединений. Все разработанные синтетические подходы можно использовать для синтеза модифицированных нуклеозидов высокой степени чистоты, легко масштабируются не только в лабораторных условиях, но и в условиях опытного производства.

После получения первичных данных взаимосвязи структура - биологическая активность модифицирован тип заместителя, присоединенного к экзоциклической К6 амино-группе нуклеозида, что привело к усилению обнаруженной агонистической активности рибозидов 2-хлорпурина.

При изучении структуры синтезированных соединений С6-замещенного 2-хлорпурина было зафиксировано явление возникновения заторможенной формы нуклеозида. Проведенный комплекс исследований структуры полученных нуклеозидов при помощи ЯМР спектроскопии очевидно доказал наличие нестандартной внутримолекулярной К6-С-Н>-К7-пурина водородной связи. Выдвинутая нами теория логично объясняет явление торможения вращения заместителя в С6 положении пурина относительно пуринового основания и опровергает теорию амино-иминной таутомерии С6-замещенных пуринов, предложенную зарубежными коллегами. Так, впервые было показано, что методами двумерной гетероядерной спектроскопии ЯМР можно получать исчерпывающую информацию о структуре новых соединений и фиксировать возникновение внутримолекулярных водородных связей.

Методология и методы исследования. Использованы классические и современные методы биоорганической химии и биотехнологии. Развитие информационных технологий позволило использовать для решения поставленных задач методы компьютерного

моделирования процессов, происходящих в активных центрах биокатализаторов. Так, в нашем случае, визуализация процессов биокатализа позволяет определять факторы, мешающие протеканию реакций трансгликозилирования в активных центрах нуклеозидфосфорилаз. Используя данную информацию, можно осуществлять рациональный дизайн новых мутантных форм катализатора для распространения реакции трансгликозилирования на большее количество различных субстратов, в том числе и нетипичных для этого процесса. При изучении структуры новых модифицированных нуклеозидов использовались современные методы ЯМР-спектроскопии и масс-спектрометрии, которые позволили, в частности, выяснить причину аномалии, возникающей в определенных условиях при съемке ЯМР спектров С2,С6-замещенных пуриновых нуклеозидов.

Положения, выносимые на защиту:

1. Оптимизированы до уровня опытно-промышленных технологии биосинтеза субстанций фармацевтически значимых модифицированных нуклеозидов кладрибина, флударабина, видарабина и неларабина.

2. Разработаны методы синтеза коньюгатов 2H-, 2-амино- и 2-хлорпурина с остатками амидов хиральных аминокислот (44 соединения) и остатками аминоспиртов (6 соединений). Скрининг биологической активности рибозидов показал наличие агонистической по отношению к рецепторам A1AR активности. Выявлена и объяснена аномалия возникновения удвоения сигналов 1Н ЯМР спектров для индивидуальных соединений из-за образования нестандартной внутримолекулярной водородной связи. Показано, что 9-бета-D-арабинофуранозид 2-хлорпурина с остатком амида L-серина в С6 положении оказывает цитотоксическое действие на клетки Т-лимфобластного лейкоза человека линии U937 in vitro.

3. Произведено гликозилирование пуриновых оснований с объемными 7,8-дифторбензоксазиновыми заместителями, присоединенными непосредственно к С6-атому пурина или отдаленными от него посредством аминогексаноильного спейсера. Синтезировано одиннадцать нуклеозидов с остатками рибозы, 2-дезоксирибозы и арабинозы. Два представителя из серии нуклеозидов обладают селективной активностью в отношении вируса простого герпеса 1 типа (HSV-1).

4. Получены нуклеозиды бензимидазола трех типов: замещенных (а) по С5 и С6-положениям бензимидазола, (б) тризамещенных по С2,С5-С6 и (в) по С4-С6 положениям основания (32 соединения). Показано отсутствие региоспецифичности реакции трансгликозилирования для бензимидазолов, имеющих несимметричное расположение заместителей в С4, С5 и С6 положениях основания. Изучение антивирусной активности синтезированных соединений в отношение вируса простого герпеса человека 1 типа (HSV-1, штамм L2) in vitro выявило

селективную антивирусную активность с ХТИ=32 у рибозида 2-амино-5,6-дифторбензимидазола, причем устойчивых вариантов вируса к нему не формируется.

5. Разработан эффективный способ синтеза флексимерных нуклеозидов пиррола/пиразол-аминопиридина/пиримидина (12 соединений). Впервые найдены и охарактеризованы побочные продукты гликозилирования флексимерного основания пиразол-4-аминопиридина по 4-амино-пиридиновому фрагменту и продукты бис-гликозилирования по N1 атому 4-амино-пиридина и по N1 атому пиразольного кольца одновременно. Предложен механизм (in silico), объясняющий возможность реализации этого процесса в активном центре фермента.

6. Получены нуклеозиды 1,2,4-триазола: (а) производные 1,2,4-триазол-3-карбоксамида, имеющие заместители по амидной группе, в С3 и/или С5 положениях основания (10 соединений), (б) серия 1,2,4-триазол-3-оксадиазолов (6 соединений), (в) серия 5-алкоксиметильных производных (7 соединений), и (г) - имеющие в структуре основания гидрофобные тиоалкильные заместители (9 соединений). Обнаружен единственный исключительный случай образования кроме целевого Ш-дезоксирибозида 5-бензилоксиметил-1,2,4-триазол-3-карбоксамида региоизомерных N2- и N4- нуклеозидов.

7. Впервые обнаружен Ш,№-бис-2'-дезоксирибозид гипоксантина - продукт неспецифической реакции вторичного дезоксирибозилирования природного нуклеозида 2'-дезоксиинозина по N1 атому гипоксантина в активном центре PNP.

8. Синтезированы нуклеозиды замещенного пиразоло[3,4^]пиримидина (аллопуринола) (7 соединений), показана высокая региоспецифичность процесса трансгликозилирования.

9. Определены критические факторы (тип и допустимые размеры заместителей) структуры субстратов PNP E. coli, которые можно использовать в биосинтезе новых нуклеозидов.

Степень достоверности результатов. В работе использовали современные методы биоорганической химии, биотехнологии и фармакологии. Работа проведена с использованием реактивов ведущих российских и международных производителей и оборудования, соответствующего международным стандартам. Структура полученных соединений доказана современными физико-химическими методами анализа - и N-ЯМР спектроскопией,

масс-спектрометрией высокого разрешения, УФ спектроскопией. Использованные препараты нуклеозидфосфорилаз получены с помощью штамм-продуцентов, депонированных во Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов. Докинг лигандов в активном центре PNP проводился с использованием кристаллографических данных структуры PNP E. coli, депонированных на сайте Protein Data Bank (https://www.rcsb.org/). Культуры клеток

происходили из банков данных центров, в которых проводилось биологическое тестирование. Результаты биологических экспериментов статистически достоверны.

Весь комплекс синтетических работ выполнялся в Лаборатории биотехнологии ИБХ РАН, а после формирования на ее основе Отдела биотехнологии ИБХ РАН, в Лаборатории биосинтеза низкомолекулярных физиологически активных соединений. Первичный скрининг биологичекской активности синтезированнх нуклеозидов проводили в Волгоградском государственном медицинском университете, Институте вирусологии им. Д.И. Ивановского РАМН (сейчас ФГБУ «НИЦЭМ им.Н.Ф.Гамалеи» Минздрава России), Институте диагностики и терапии опухолей Национального медицинского исследовательского центра онкологии им. Н.Н. Блохина.

Компоненты биокаталитического синтеза нуклеозидов были получены в Институте органического синтеза им. И.Я. Постовского УрО РАН, Московском институте тонкой химической технологии им. М.В.Ломоносова (совр. МИРЭА-ИТХТ), Институте молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта, Институте химии растительных веществ им. С.Ю.Юнусова АнУз (Ташкент, Республика Узбекистан) и Институте биоорганической химии Национальной академии наук Беларуси (Минск, Республика Беларусь).

Публикации.

Все результаты, представленные в диссертационной работе, опубликованы в рецензируемых журналах, входящих в международные базы данных. По материалам диссертации опубликовано 30 статей в ведущих российских и зарубежных рецензируемых журналах (из них 1 обзор):

1. Константинова И.Д., Леонтьева Н.А., Галегов Г.А., Рыжова О.И., Чувиковский Д.В., Антонов К.В., Есипов Р.С., Таран С.А., Веревкина К.Н., Феофанов С.А., Мирошников А.И. Биотехнологический способ получения рибавирина. Действие рибавирина и некоторых его комбинаций на репродукцию вируса осповакцины (Vaccinia Virus) II Биоорганическая химия, 2004, № 30, с. 613-620.

2. Чудинов М.В., Константинова И.Д., Рыжова О.И., Есипов Р.С., Юркевич А.М., Швец В.И., Мирошников А.И. Новый эффективный способ синтеза производных 1,2,4-триазол-3-карбоксамида и рибавирина IIХФЖ, 2005, т. 39, № 4, с.43-46.

3. Константинова И.Д., Фатеев И.В., Музыка И.С., Галкина И.В., Бутенко А.М., Галегов Г.А., Белов А.В., Ларичев В.Ф., Дерябин П.Г., Швец В.И., Львов Д.К., Мирошников А.И. Биотехнологический способ получения и исследование противовирусной активности рибавирина и его 5-метил замещенных аналогов IIБиотехнология, 2008, №4, с. 69-79

4. I.D. Konstantinova, K.V. Antonov, I.V. Fateev, A.I. Miroshnikov, V.A. Stepchenko, A.V. Baranovsky, I.A. Mikhailopulo. A ^emo-enzymatic synthesis of ß-D-arabinofuranosyl purine nucleosides II Synthesis, 2011, v. 10, p.1555-1560.

5. Константинова И.Д., Чудинов М.В., Фатеев И.В., Матвеев А.В., Журило Н.И., Швец В.И., Мирошников А.И. Нуклеозиды 1,2,4-триазола: возможности и ограничения химико-ферментативного способа получения IIБиоорганическая химия, 2013, т. 39, № 1, с. 61-80.

6. Konstantinova I.D.; Selezneva O.M.; Fateev I.V.; Balashova T.A.; Kotovskaya S.K.; Baskakova Z.M.; Charushin V.N.; Baranovsky A.V.; Miroshnikov A.I.; Balzarini J.; Mikhailopulo I.A. Chemo-enzymatic syntheses and biological evaluation of 5,6-disubstituted benzimidazole ribo- and 2'-deoxyribo-nucleosides // Synthesis, 2013, 45 (2), p. 272-276.

7. Константинова И.Д., Фатеев И.В., Галегов Г.А., Дерябин П.Г., Ботиков А.Г., Музыка И.С., Львов Д.К., Мирошников А.И. Арсенолиз в биотехнологическом способе получения рибавирина. Ингибирование репродукции вируса гриппа А in vitro и in vivo с помощью комбинации рибавирина и озельтамивира // Биоорганическая химия, 2013, т. 39, № 5, с. 594-603.

8. Fateev I.V., Antonov K.V., Konstantinova I.D., Muravyova T.I., Seela F., Esipov R.S., Miroshnikov A.I., Mikhailopulo I.A. The chemoenzymatic synthesis of clofarabine and related 2'-deoxyfluoroarabinosyl nucleosides: the electronic and stereochemical factors determining substrate recognition by E. coli nucleoside phosphorylases // Beilstein J. Org. Chem., 2014, v. 10, p. 1657-1669.

9. Fateev I.V., Kharitonova M.I., Antonov K.V., Konstantinova I.D., Stepanenko V.N., Esipov R.S., Seela F., Temburnikar K.W., Seley-Radtke K.L., Stepchenko V.A., Sokolov Y.A., Miroshnikov A.I., Mikhailopulo I.A. Recognition of the challenging heterocyclic bases by E. coli purine nucleoside phosphorylase vs its Ser90Ala mutant // Chem. Eur. J., 2015, v. 21 (38), p. 13401-13419.

10. Kharitonova M.I., Fateev I.V., Kaushin A.L., Konstantinova I.D., Kotovskaya S.K., Leont'eva V.L., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. Chemo-enzymatic syntheses and antiviral evaluation of 5-substituted 4,6-difluorobenzimidazoles ribo- and 2'-deoxyribo-nucleosides // Synthesis, 2016, 48(03), p. 394-406.

11. Eletskaya B.Z., Konstantinova I.D., Paramonov A.S., Esipov R.S., Gruzdev D.A., Vigorov A.Yu., Levit G.L., Miroshnikov A.I., Krasnov V.P. and Charushin V.N. Chemoenzymatic arabinosylation of 2-aminopurines bearing the chiral fragment of 7,8-difluoro-3-methyl-3,4-dihydro-2H-[1,4]benzoxazines // Mendeleev Commun., 2016, 26, p. 6-8.

12. Chudinov M.V., Prutkov A.N., Matveev A.V., Grebenkina L.E., Konstantinova I.D., Berezovskaya Y.V. An alternative route to the arylvinyltriazole nucleosides // Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016. V. 26, р. 3223-3225.

13. Chudinov M.V., Matveev A.V., Prutkov A.N., Konstantinova I.D., Fateev I.V., Prasolov V.S., Smirnova O.A., Galegov G.A., Deryabin P.G. Novel 5-alkyl(aryl)-substituted ribavirine analogues: synthesis and antiviral evaluation //Mendeleev Communications, 2016, v. 26 (3), pp. 214-216.

14. Константинова И.Д. Фатеев И.В., Мирошников А.И. Арсенолиз в ферментативном способе получения модифицированных пуриновых ß-D-арабинонуклеозидов. // Биоорганическая химия, 2016, т. 42, № 4, с. 411-420.

15. Kharitonova M.I., Fateev I.V., Antonov K.V., Berzina M.Ya., Kaushin A.L., Konstantinova I.D., Kotovskaya S.K., Andronova V.L., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. Chemo-enzymatic synthesis of modified 2'-deoxy-2'-fluoro ß-D-arabinofuranosyl benzimidazoles and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // Synthesis, 2017, v. 49, p. 1043-1052.

16. Kharitonova M.I., Denisova A.O., Аndronova V.L., Kayushin A.L., Konstantinova I.D., Kotovskaya S.K., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. New modified 2-aminobenzimidazole nucleosides: synthesis and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // BMCL, 2017, v. 27, p. 2484-2487.

17. Zhurilo N.I., Chudinov M.V., Matveev A.V., Smirnova O.S., Konstantinova I.D., Miroshnikov A.I., Prutkov A.N., Grebenkina L.E., Pulkova N.V., Shvets V.I. Isosteric ribavirin analogues: synthesis and antiviral activity// BMCL, 2018, v. 28(1), p. 11-14.

18. Харитонова М.И., Константинова И.Д., Мирошников А.И. Нуклеозиды бензимидазола: антивирусная и противоопухолевая активность, способы синтеза // Успехи химии, 2018, v. 87 (11), p. 1111-1138.

Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Константинова Ирина Дмитриевна, 2025 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

Диссертации

Берзина М.Я. Новые аналоги аденозина: химико-ферментативный подход к получению: дис. на соиск. уч. ст. канд. хим. наук: 1.4.9 / Берзина Мария Яновна. - М., 2023. - 193 с.

Елецкая Б.З. Биосинтез модифицированных нуклеозидов с нетипичными гетероциклическими основаниями: дис. на соиск. уч. ст. канд. хим. наук: 1.4.9 / Елецкая Барбара Златковна. - М., 2023. - 119 с.

Фатеев И.В. Разработка химико-ферментативного способа получения модифицированных нуклеозидов: дис. на соиск. уч. ст. канд. хим. наук: 03.00.23 / Фатеев Илья Владимирович. - М., 2008. - 107 с.

Харитонова М.И. Нуклеозиды бензимидазола: синтез и изучение свойств: дис. на соиск. уч. ст. канд. хим. наук: 03.01.06 / Харитонова Мария Игоревна. - М., 2017. - 161 с.

Публикации в открытой печати

Андронова В.Л., Галегов Г.А., Ясько М.В., и др. Сравнительное изучение лекарственной устойчивости вируса простого герпеса к ациклогуанозину и Н-фосфонату ациклогуанозина // Вопр. вирусол., 2010, т. 55(1), с. 31-34.

Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.Н. и др. Препаративный метод синтеза 2-фтораденозина // Биоорг. химия, 2009, 35 (2), с. 210-214. [Berzin V.B., Dorofeeva E.V., Leonov V.N., et al. Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2009, v. 35(2), p. 193-196. doi:10.1134/s1068162009020071.]

Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.Н. и др. Способ получения 2,6-дихлор-9-(2',3',5'-три-О-ацетил-Р-D-рибофуранозил)пурина. Патент РФ № 2324699 от 05.02.2008 г.

Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.Н. и др. Способ получения 2-хлораденозина. Патент РФ № 2324698 от 05.02.2008 г.

Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.Н. и др. Способ получения 2-амино-6-азидо-9-(2',3',5'-три-О-ацетил-Р^-рибофуранозил)пурина. Патент РФ № 2326124 от 05.02.2008 г.

Берзин В.Б., Дорофеева Е.В., Леонов В.Н. и др. Способ получения 2',3',5'-три-О-ацетил-2-фтораденозина. Патент РФ № 2325395 от 05.02.2008 г.

Бокуть С.Б., В.Н. Барай. А.И. Зинченко. Использование бариевых солей пентозо-1-фосфорных кислот в ферментативном синтезе риботимидина и бромвинилдезоксиуридина // Прикл. Биохим. Микробиол, 1995, т. 31, вып. 3, с. 308-310.

Бригадирова А., Агацарская Я., Салихов Д. и др. Метод изучения аденозиновой А1 рецепторной активности химических соединений in vitro // Вестник Волгоградского государственного медицинского университета, 2019, № 2 (70), с. 55-57.

Вейко В.П., Чеботаев Д.В., Овчарова И.В. и др. Белковая инженерия уридинфосфорилазы из Escherichia coli K-12. 1. Клонирование и экспрессия в E. coli генов уридинфосфорилаз из Klebsiella aerogenes и Salmonella typhimurium //Биоорган. химия, 1998, 24(5), с. 381-387.

Видаль, С. (2022). Лекарственные препараты в России. Издательство Видаль Рус. https://www.vidal.ru/

Есипов Р.С., Гуревич А.И., Мирошников А.И., Чувиковский Д. В. Способ получения рекомбинантной уридин-фосфорилазы, рекомбинантная плазмидная ДНК pERURPHO1 и штамм Escherichia coli BL21(DE3)/pERURPHO1 для его осуществления. Патент РФ № 2177998 от 10.01.2002 г.

Есипов Р.С., Гуревич А.И., Мирошников А.И., Чувиковский Д. В. Способ получения рекомбинантной пуриннуклеозид-фосфорилазы, рекомбинантная плазмидная ДНК pERPUPHOI и штамм Escherichia coli BL21(DE3)/pERPUPHOI для его осуществления. Патент РФ № 2179188 от 10.02.2002 г.

Есипов Р.С., Гуревич А.И., Мирошников А.И., Чувиковский Д. В. Способ получения рекомбинантной тимидин-фосфорилазы, рекомбинантная плазмидная ДНК pERTPHOl и штамм Escherichia coli BL21(DE3)/pERTPHO1 - продуцент тимидин-фосфорилазы. Патент РФ № 2188234 от 27.08.2002 г.

Есипов Р.С., Абрамчик Ю.А., Фатеев И.В., и др. Каскад термофильных ферментов как инструмент создания модифицированных нуклеотидов // Acta Naturae, 2016, v. 8 (30), p. 160-168. [Esipov R.S., Abramchik Yu.A., Fateev I.V., Konstantinova I.D., Kostromina M.A., Muravyova T.I., Artemova K.G., Miroshnikov A.I. A cascade of thermophilic enzymes as an approach to the synthesis of modified nucleotides // Acta Naturae (англоязычная версия). 2016, v. 8(31), c. 82-90.

Зинченко А.И., Барай В.Н., Ерошевская Л.А., и др. 2'-,3'- и 5'-С-Метилпроизводные уридина в реакции микробиологического трансгликозилирования // Докл. АН СССР, 1987, т. 297(3), с. 731-734.

Константинова И.Д., Леонтьева Н.А., Галегов Г.А. и др. Биотехнологический способ получения рибавирина. Действие рибавирина и некоторых его комбинаций на репродукцию вируса осповакцины

(Vaccinia Virus) // Биоорганическая химия, 2004, т. 30, с. 613-620.

Константинова И.Д., Фатеев И.В., Музыка И.С. и др. Биотехнологический способ получения 5-метилзамещенных аналогов рибавирина и исследование их противовирусной активности // Биотехнология, 2008, т. 4, с. 69-79. https://www.elibrary.ru/download/elibrary_14650095_48094766.pdf

Константинова И.Д., Антонов К.В., Берзин В.Б. и др. Способ получения 9-(Р^-арабинофуранозил)-2-фтораденина. Патент РФ № 2368662 от 27.09.2009 г.

Константинова И.Д., Фатеев И.В., Мирошников А.И. Способ получения 1-beta-^-рибофуранозил-1,2,4-триазол-3-карбоксамида. Патент РФ № 2480218 от 27.04.2013 г. МПК A61K 31/7042. Заявка № 2011149400/10; приоритет от 06.12.2011; Бюл. № 12 - 8 с.

Константинова И.Д., Фатеев И.В., Мирошников А.И. Способ получения пуриновых нуклеозидов ряда P-D-арабинофуранозы. Патент РФ № 2624023 от 30.06.2017 г., приоритет от 06.11.2015 г. Заявка на патент РФ № 2015147715 от 06.11.2015 г.

Константинова И.Д., Чудинов М.В., Фатеев И.В., Матвеев А.В., Журило Н.И., Швец В.И., Мирошников А.И. Нуклеозиды 1,2,4-триазола: возможности и ограничения химико-ферментативного способа получения // Биоорганическая химия, 2013, т. 39, № 1, с. 61-80.

Константинова И.Д., Фатеев И.В., Галегов Г.А. и др. Арсенолиз в биотехнологическом способе получения рибавирина. Ингибирование репродукции вируса гриппа А in vitro и in vivo с помощью комбинации рибавирина и озельтамивира //Биоорган. химия, 2013, т. 39, с. 594-603. [I. D. Konstantinova, I. V. Fateev, G. A. Galegov, P. G. Deryabin, A. G. Botikov, I. S. Muzyka, D. K. L'vov, and A. I. Miroshnikov. The arsenolysis reaction in the biotechnological synthesis of ribavirin. The in vitro and in vivo inhibition of influenza A virus replication with a combination of ribavirin and ozeltamivir // Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2013, v. 39(5), p. 530-538.] https://www.elibrary.ru/download/elibrary_18446907_52546975.pdf

Константинова И.Д. Фатеев И.В., Мирошников А.И. Арсенолиз в ферментативном способе получения модифицированных пуриновых P-D-арабинонуклеозидов // Биоорган. химия, 2016, т. 42(4), с. 411-420. [Konstantinova I.D., Fateev I.V., Miroshnikov A.I. The arsenolysis reaction in the biotechnological method of synthesis of modified purine P-D-arabinonucleosides // Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2016, v. 42 (4), p. 372-380. DOI: 10.1134/S1068162016040105

Ликарь Ю.Н., Мороз М.А., Румянцев А.Г. Механизмы развития резистентности к химиопрепаратам-аналогам нуклеозидов // Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии, 2010, т. 9(2), с. 32-40.

Михайлопуло И.А., Мирошников А.И. Современные тенденции в биотехнологии нуклеозидов // Acta Naturae, 2010, т. 2(2), с. 38-61.

Саватеев К.В., Русинов В.Л., Котовская С.К. и др. Нитроазолопиримидины: влияние на аденозиновый рецептор А1 и внутриглазное давление у крыс //Биоорганическая химия, 2022, т. 48(4), с. 479-485.

Харитонова М.И., Константинова И.Д., Мирошников А.И. Нуклеозиды бензимидазола: антивирусная и противоопухолевая активность, способы синтеза // Успехи химии, 2018, V. 87 (11), p. 1111-1138.

Чудинов М.В., Константинова И.Д., Рыжова О.И. и др. Новый эффективный способ синтеза производных 1,2,4-триазол-3-карбоксамида и рибавирина // ХФЖ, 2005, т. 39 (4), с. 43-46. http://www.chem.folium.ru/index.php/chem/article/viewFile/2016/1601

Яковлев Д.С., Серёгина М.С., Науменко Л.В. и др. Лиганды аденозиновых рецепторов: переоценка клинического потенциала, перспективы поиска и фармакологического изучения // Экспериментальная и клиническая фармакология, 2023, т. 86(118), 164.

Яскович, Г. А., Яковлева, Е. П. Микробиологический синтез виразола иммобилизованными клетками // Прикладная биохимия и микробиология, 1999, т. 35(27), с. 146.

Abdalla E., Hassan A., Reham A., et al. Synthesis and evaluation of the substrate activity of C-6 substituted purine ribosides with E. coli purine nucleoside phosphorylase: Palladium mediated cross-coupling of organozinc halides with 6-chloropurine nucleosides // Eur. J. Med. Chem., 2012, v. 47, p. 167-174.

Aberg A.M., Ronquist G., Haney M., et al. Effects of some modulators on purine nucleoside phosphorylase activity in myocardial tissue // Scand. J. Clin. Lab. Invest., 2010, v. 70, p. 8-14.

Afshar S., Sawaya M.R., Morrison S.L. Structure of a mutant human purine nucleoside phosphorylase with the prodrug, 2-fluoro-2-deoxyadenosine and the cytotoxic drug, 2-fluoroadenine // Protein Sci., 2009, v. 18, p. 1107-1114.

Agarwal R.P., Parks R.E. Purine nucleoside phosphorylase from human erythrocytes. IV. Crystallization and some properties // J. Biol. Chem. 1969, v. 244, p. 644-647.

Aggarwal S.K., Gogu S.R., Rangan S.R.S., et al. Synthesis and biological evaluation of prodrugs of zidovudine // J. Med. Chem., 1990, v. 33, p. 1505-1510.

Alkorta I., Elguero J., Denisov G. S. A review with comprehensive data on experimental indirect scalar NMR spin-spin coupling constants across hydrogen bonds //Magn. Reson. Chem., 2008, v. 46(7), p. 599-624.

Ali E.S., Ben-Sahra I. Regulation of nucleotide metabolism in cancers and immune disorders // Trends in Cell Biology, 2023, v. 33(11), p. 950-966.

Almendros M., Berenguer J., Sinisterra J. Thermus thermophilus nucleoside phosphorylases active in the synthesis of nucleoside analogues // Appl. Environ. Microbiol., 2012, v. 78, p. 3128-3135. DOI: 10.1128/AEM.07605-11

Antosiewicz J., Wielgus-Kutrowska B., Dlugosz M., et al. Kinetics of binding of multisubstrate analogue inhibitor (2-amino-9-[2-(phosphonomethoxy)ethyl]-6-sulfanylpurine) with trimeric purine nucleoside phosphorylase // Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids, 2007, v. 26, p. 969-974.

Ashamu G.A., Sethi J.K., Galione A., et al. Roles for adenosine ribose hydroxyl groups in cyclic adenosine 5'-diphosphateribose-mediated Ca2+-release // Biochemistry, 1997, v. 36, p. 9509-9517.

Avery R.K., Marty F.M., Strasfeld L., et al. Oral maribavir for treatment of refractory or resistant cytomegalovirus infections in transplant recipients // Transplant Infectious Disease, 2010, v. 12, p. 489-496.

de Avila A.I., Gallego I., Soria M.E., et al. Lethal mutagenesis of hepatitis C virus induced by Favipiravir // PLOS one, 2016, p. 1-19.

Backus L.I., Belperio P.S., Shahoumian T.A., et al. Comparative effectiveness of ledipasvir/sofosbuvir±ribavirin vs. ombitasvir/paritaprevir/ritonavir+dasabuvir±ribavirin in 6961 genotype 1 patients treated in routine medical practice // Alimentary pharmacology & therapeutics, 2016, v. 44(4), p. 400410.

Bagarolo M.L., Porcelli M., Martino E., et al. Multiple disulfide bridges modulate conformational stability and flexibility in hyperthermophilic archaeal purine nucleoside phosphorylase // Biochim. Biophys. Acta, 2015, v. 1854(10), p. 1458-1465. DOI: 10.1016/j.bbapap.2015.06.010.

Bakkestuen A.K., Gundersen L.-L., Petersen D., et al. Synthesis and antimycobacterial activity of agelasine E and analogs // Organic & Biomolecular Chemistry, 2005, v. 3(6), p. 1025-1033.

Barai V.N., Zinchenko A.I., Eroshevskaya L.A., et al. Chemo-Enzymatic Synthesis of 3-Deoxy-ß-d-ribofuranosyl Purines // Helv. Chim. Acta, 2002a, v. 85(7), p. 1893-1900.

Barai V.N., Zinchenko A.I., Eroshevskaya L.A., et al. A universal biocatalyst for the preparation of base-and sugar-modified nucleosides via an enzymatic transglycosylation // Helv. Chim. Acta, 2002b, v. 85(7), p. 19011908.

Barai V.N., Zinchenko A.I., Eroshevskaya L.A., et al. Chemo-enzymatic synthesis of 3-deoxy-ß-d-ribofuranosyl purines and study of their biological properties // Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, 2003, v. 22(5-8), p. 751-753.

Baranowski D., Framski G., Wyszko E., et al. Studies on structure of kinetin riboside and its analogues by variable-temperature NMR // J. Mol. Struct., 2019, v. 1195, p. 110-118. DOI: 10.1016/j.molstruc.2019.05.112

Barchi J.J.Jr, Karki R.G., Nicklaus M.C., et al. Comprehensive structural studies of 2', 3'-difluorinated nucleosides: comparison of theory, solution, and solid state // J. Am. Chem. Soc., 2008, v. 130(28), p. 90489057.

Barsacchi D., Cappiello M., Tozzi M.G., et al. Purine nucleoside phosphorylase from bovine lens: purification and properties // Biochim. Biophys. Acta, 1992, v. 1160, p. 163-170.

Bauman J.G., Wirsching R.C. Process for the preparation of fludarabine or fludarabine phosphate from guanosine. United States Patent 5,602,246. Current U.S. Class: 536/55.3; February 11, 1997.

Beaucourt, S., Vignuzzi, M. Ribavirin: a drug active against many viruses with multiple effects on virus replication and propagation. Molecular basis of ribavirin resistance // Current opinion in virology, 2014, v. 8, p. 10-15.

Belenky P., Christensen K. C., Gazzaniga F., et al. Nicotinamide riboside and nicotinic acid riboside salvage in fungi and mammals: Quantitative basis for Urh1 and purine nucleoside phosphorylase function in NAD+ metabolism // J. Biol. Chem, 2009, v. 284, p. 158-164.

Benhamou Y., Afdhal N.H., Nelson D.R., et al. A phase III study of the safety and efficacy of viramidine versus ribavirin in treatment-naive patients with chronic hepatitis C: ViSER1 results // Hepatology, 2009, v. 50(3), p. 717-726.

Benitez-Mateos A. I., Paradisi F. Sustainable flow-synthesis of (bulky) nucleoside drugs by a novel and highly stable nucleoside phosphorylase immobilized on reusable supports // ChemSusChem, 2022, v. 15(1), e202102030. D0I:10.1002/cssc.202102030

Benkovics T., Peng F., Phillips E. M., et al. Diverse catalytic reactions for the stereoselective synthesis of cyclic dinucleotide MK-1454 // J. Am. Chem. Soc, 2022, v. 144(13), p. 5855-5863. DOI: 10.1021/jacs.1c12106.

Bennett E.M., Li C., Allan P.W., et al. Structural basis for substrate specificity of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase // J. Biol. Chem, 2003, v. 278, p. 47110-47118.

Bertosa B., Mikleusevic G., Wielgus-Kutrowska B., et al. Homooligomerization is needed for stability: a molecular modelling and solution study of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase // FEBS J., 2014, v. 281, p.1860-1871.

Berzina M.Ya., Eletskaya B.Z., Kayushin A.L., et al. Synthesis of 2-chloropurine ribosides with chiral amino acid amides at C6 and their evaluation as A1 adenosine receptor agonists // Bioorg. Chem., 2022, v. 126, 105878. DOI: 10.1016/j.bioorg.2022.105878

Betbeder D., Hutchinson D.W. The enzymatic synthesis of imidazole deoxynucleosides: 1-ß-D-2'-deoxyribofuranosyl-5-aminoimidazole-4-carboxamide and 1-ß-D-2'-deoxyribofuranosyl-benzimidazole //

Nucleosides & Nucleotides, 1990, v. 9(4), p. 569-577.

Bezirdzhian K.O., Kocharian S.M., Akopian Z.I. Isolation of the hexameric form of purine nucleoside phosphorylase from E. coli. Comparative study of trimeric and hexameric forms of the enzyme // Biokhimiia (Moscow, Russia), 1986, v. 51(7), p. 1085-1092.

Biron K.K., Davis M.G., Stanat S.C., et al. Antiviral activity and mechanism of action of 1263W94, a benzimidazole riboside inhibitor of human cytomegalovirus // In Program and Abstracts of the 36th

Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy. American Society for Microbiology, Washington, DC. 1996. Abstract. H85, p. 178.

Biron K.K., Harvey R.J., Chamberlain S.C., et al. Potent and selective inhibition of human cytomegalovirus replication by 1263W94, a benzimidazole L-riboside with a unique mode of action // Antimicrob. Agents Chemother., 2002, v. 46, p. 2365-2372.

Blank W.A., Elder K.J., Gati W.P. Synthesis of 2-chloro-2'-deoxyadenosine by washed cells of E. coli // Biotechnol. Lett., 1992, v. 14, 669-672. D0I:10.1007/BF01021640

Borowicz K.K., Luszczki J., Czuczwar S.J. 2-Chloroadenosine, a preferential agonist of adenosine A1 receptors, enhances the anticonvulsant activity of carbamazepine and clonazepam in mice // European neuropsychopharmacology, 2002, v. 12(2), p. 173-179. DOI: 10.1016/s0924-977x(02)00009-3.

Boswell-Casteel R.C., Hays F.A. Equilibrative nucleoside transporters // Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, 2017, v. 36(1), p. 7-30.

Breer K., Girstun A., Wielgus-Kutrowska B., et al. Overexpression, purification and characterization of functional calf purine nucleoside phosphorylase (PNP) // Protein Expr. Purif., 2008, v. 61, p. 122-130.

Bromley J.R., Warnes B.J., Newell C.A., et al. A purine nucleoside phosphorylase in Solanum tuberosum L. (potato) with specificity for cytokinins contributes to the duration of tuber endodormancy // Biochem. J., 2014, v. 458, p. 225-237.

Bruno G., Saracino A., Fabrizio C., et al. Safety and effectiveness of a 12-week course of sofosbuvir and simeprevir±ribavirin in HCV-infected patients with or without HIV infection: a multicentre observational study

// International journal of antimicrobial agents, 2017, 49(3), p. 296-301.

Burrows F.S., Carlos L.M., Benzimra M., et al. Oral ribavirin for respiratory syncytial virus infection after lung transplantation: Efficacy and cost-efficiency // J. Heart Lung Transplant, 2015, v. 34. p. 958-962.

Bucknall R.A. The Effects of substituted benzimidazoles on the growth of viruses and the nucleic acid metabolism of host cells // J. Gen. Virol., 1967, v. 1, p. 89-99.

Buxton R.S., Hammer-Jespersen K., Valentin-Hansen P. A second purine nucleoside phosphorylase in Escherichia coli K-12: I. Xanthosine phosphorylase regulatory mutants isolated as secondary-site revertants of a deoD mutant //Molecular and General Genetics MGG, 1980, v. 179, p. 331-340.

Bzowska A., Kulikowska E., Darzynkiewicz E., et al. Purine nucleoside phosphorylase. Structure-activity relationships for substrate and inhibitor properties of N-1-, N-7-, and C-8-substituted analogues; differentiation of mammalian and bacterial enzymes with N-1-methylinosine and guanosine // J. Biol. Chem., 1988, v. 263, p. 9212-9217.

Bzowska A., Kulikowska E., Shugar D. Properties of purine nucleoside phosphorylase (PNP) of mammalian and bacterial origin // Z. Naturforsch C, 1990a, v. 45c, p. 59-70.

Bzowska A., Kulikowska E., Shugar D. Comparison of acid- and enzyme-catalyzed cleavage of the glycosidic bond of N(7)-substituted guanosines // Nucleosides Nucleotides, 1990b, v. 9, p. 439-440.

Bzowska A., Kulikowska E., Shugar D. Formycins A and B and some analogues: selective inhibitors of bacterial (Escherichia coli) purine nucleoside phosphorylase // Biochim. Biophys. Acta, 1992, v. 1120, p. 239247.

Bzowska A, Kulikowska E., Shugar D. Linear free energy relationship for N(7)-substituted guanosines as substrates of calf spleen purine nucleoside phosphorylase. Possible role of N(7)-protonation as an intermediary in phosphorolysis // Z. Naturforsch, 1993, v. 48c, p. 803-811.

Bzowska A., Kazimierczuk Z. 2-Chloro-2'-deoxyadenosine (cladribine) and its analogues are good substrates and potent selective inhibitors of Escherichia coli purine-nucleoside phosphorylase // Eur. J. Biochem., 1995, v. 233(3), p. 886-890.

Bzowska A., Luic M., Schröder W., et al. Calf spleen purine nucleoside phosphorylase: purification, sequence and crystal structure of its complex with an N(7)-acyclogua-nosine inhibitor // FEBS Lett, 1995a, v. 367, p. 214-218.

Bzowska A., Kulikowska E., Poopeiko N.E., et al. Kinetics of phosphorolysis of 3-(beta-D-ribofuranosyl)adenine and 3-(beta-D-ribofuranosyl)hypoxanthine, non-conventional substrates of purine-nucleoside phosphorylase // Eur. J. Biochem., 1996, v. 239, p.229-234.

Bzowska A., Tebbe J., Wielgus-Kutrowska B., et al. Crystallization and preliminary X-ray studies of purine nucleoside phosphorylase from Cellulomonas sp. //Acta Crystallogr D, 1998, v. 54, p.1061-1063.

Bzowska A., Kulikowska E., Shugar D. Purine nucleoside phosphorylases: properties, functions, and clinical aspects // Pharmacol. Ther., 2000, v. 88, p. 349-425.

Cacciapuoti G., Porcelli M., Bertoldo C., et al. Purification and characterization of extremely thermophilic and thermostable 5'-methylthioadenosine phosphorylase from the archaeon Sulfolobus solfataricus: purine nucleoside phosphorylase activity and evidence for intersubunit disulfide bonds // J Biol Chem, 1994, v. 269, p. 24762 - 24769.

Cacciapuoti G., Fusco S., Caiazzo N., et al. Heterologous expression of 50-methylthioadenosine phosphorylase from the archaeon Sulfolobus solfataricus: characterization of the recombinant protein and involvement of disulfide bonds in thermophilicity and thermostability // Protein Expr Purif, 1999, v. 16, p. 125-135.

Cai L., Sun Y., Song Y., et al. Viral polymerase inhibitors T-705 and T-1105 are potential inhibitors of Zika virus replication // Archives of Virology, 2017, v. 162(9), p. 2847-2853.

Calleri E., Ubiali D., Serra I., et al. Immobilized purine nucleoside phosphorylase from Aeromonas hydrophila as an on-line enzyme reactor for biocatalytic applications // J. Chromatogr. B, 2014, v. 968, p. 79-86. https: // doi.org/10.1016/j.jchromb.2013.12.031.

Calleri E., Cattaneo G., Rabuffetti M., et al. Flow-synthesis of nucleosides catalyzed by an immobilized purine nucleoside phosphorylase from Aeromonas hydrophila: integrated systems of reaction control and product purification // Adv. Synth. Catal., 2015, v. 357, p. 2520-2528.

Canduri F., Fadel V., Basso L.A., et al. New catalytic mechanism for human purine nucleoside phosphorylase // Biochem. Biophys. Res. Commun., 2005a, v. 327, p. 646-649.

Canduri F., Silva R.G., Marangoni dos Santos D., et al. Structure of human PNP complexed with ligands // Acta Crystallogr. Sect. D, 2005b, D61, p.856-862.

Carson D.A., Wasson D.B., Kaye J., et al. Deoxycytidine kinase-mediated toxicity of deoxyadenosine analogs toward malignant human lymphoblasts in vitro and toward murine L1210 leukemia in vivo // Proceedings of the National Academy of Sciences, 1980, v. 77(11), p. 6865-6869.

Casati S., Manzocchi A., Ottria R., et al. :H, 13C and 15N NMR assignments for N6-isopentenyladenosine/inosine analogues // Magnetic Resonance in Chemistry, 2010, v. 48(9), p. 745-748. doi: 10.1002/mrc.2641.

Casati S., Manzocchi A., Ottria R., et al. :H, 13C and 15N NMR spectral assignments of adenosine derivatives with different amino substituents at C6-position // Magnetic Resonance in Chemistry, 2011, v. 49(5), p. 279283. doi: 10.1002/mrc.2736

Cercignani G. Substrate specificities of adenosine deaminase and adenosine phosphorylase from Bacillus cereus // Ital. J. Biochem., 1982, v. 31, p. 243-252.

Chaudhary K., Ting L.M., Kim K., et al. Toxoplasma gondii purine nucleoside phosphorylase biochemical characterization, inhibitor profiles, and comparison with the Plasmodium falciparum ortholog // J. Biol. Chem., 2006, v. 281, p. 25652-25658.

Cheng J., Farutin V., Wu Z., et al. Purine nucleoside phosphorylase-catalyzed, phosphate-independent hydrolysis of 2-amino-6-mercapto-7-methylpurine ribonucleoside // Bioorg. Chem., 1999, v. 27, p. 307-325.

Chhikara B.S., Parang K. Development of cytarabine prodrugs and delivery systems for leukemia treatment // Expert Opin. Drug Deliv, 2010, v. 7(12), p. 1399-1414.

Chini E.N., Chini C.C.S., Netto J.M.E., et al. The pharmacology of CD38/NADase: an emerging target in cancer and diseases of aging // Trends Pharmacol. Sci., 2018, v. 39, p. 424-436.

Choi H.S. Partial purification and characterization of purine nucleoside phosphorylase in Saccharomyces cerevisiae // Korean J Microbiol, 1991, v. 29, p. 172-178.

Choi H.S. Kinetic analysis of purine nucleoside phosphorylase in Saccharomyces cerevisiae // Korean J Microbiol, 1993, v. 31, p. 148-156.

Choi H.S. Purification and characterization of purine nucleoside phosphorylase in Micrococcus luteus // Korean J Microbiol, 1996, v. 34, p. 82-89.

Choi H.S. Catalytic mechanism and inhibition studies of purine nucleoside phosphorylase (PNP) in

Micrococcus luteus // Korean J Microbiol, 1997, v. 35, p. 15-20.

Choi H.S. Purification and partial characterization of purine nucleoside phosphorylase from Serratia marcescens // Biosci. Biotechnol. Biochem., 1998, v. 62, p. 667-671.

Chudinov M.V., Matveev A. V., Prutkov A.N., et al. Novel 5-alkyl(aryl)-substituted ribavirine analogues: Synthesis and antiviral evaluation //Mendeleev Communications, 2016, v. 26(3), pp. 214-216.

Cirule D., Ozols K., Platnieks O., et al. Synthesis of purine nucleoside-amino acid conjugates and their photophysical properties // Tetrahedron, 2016, v. 72(29), p. 4177-4185. D01:10.1016/j.tet.2016.05.043

De Clercq E. Looking back in 2009 at the dawning of antiviral therapy now 50 years ago an historical perspective // Adv. Virus Res., 2009, v.73, p. 1-53.

Chudinov M.V., Prutkov A.N., Matveev A.V., Grebenkina L.E., Konstantinova I.D., Berezovskaya Y.V. An alternative route to the arylvinyltriazole nucleosides // Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016. V. 26, p. 3223-3225.

Chudinov M.V., Matveev A.V., Prutkov A.N., Konstantinova I.D., Fateev I.V., Prasolov V.S., Smirnova O.A., Galegov G.A., Deryabin P.G. Novel 5-alkyl(aryl)-substituted ribavirine analogues: synthesis and antiviral evaluation //Mendeleev Communications, 2016, v. 26 (3), pp. 214-216.

Clinch K., Evans G.B., Froehlich R.F., et al. Third-generation immucillins: syntheses and bioactivities of acyclic immucillin inhibitors of human purine nucleoside phosphorylase // J. Med. Chem., 2009, v. 52, p. 11261143.

Cobb S.L., Deng H., Hamilton J.T., et al. Identification of 5-fluoro-5-deoxy-D-ribose-1-phosphate as an intermediate in fluorometabolite biosynthesis in Streptomyces cattleya // Chem. Commun. (Camb.), 2004, v. 5, p. 592-593.

Cosgrove S.C., Miller G.J. Advances in biocatalytic and chemoenzymatic synthesis of nucleoside analogues // Expert. Opin. Drug Discov, 2022, v. 17, p. 355-364. DOI: 10.1080/17460441.2022.2039620.

Crotty S., Cameron C., Andino R. Ribavirin's antiviral mechanism of action: lethal mutagenesis? // J. Mol. Med., 2002, v. 80, p. 86-95.

Cruz G., Saiz L.P., Bilal M., et al. Magnetic multi-enzymatic system for cladribine manufacturing // Int. J. Mol. Sci., 2022, v. 23, 13634. D0I:10.3390/ijms232113634

Cui H., Ruda G.F., Carrero-Lerida J., et al. Exploring new inhibitors of Plasmodium falciparum purine nucleoside phosphorylase // Eur. J. Med. Chem., 2010, v. 45, p. 5140-5149.

Cunningham K.G., Manson W., Spring F.S., et al. Cordycepin, a metabolic product isolated from cultures of Cordyceps militaris (Linn) // Nature, 1950, v.166, p. 949. DOI: 10.1038/166949a0

Daddona P.E., Wiesmann W.P., Milhouse W., et al. Expression of human malaria parasite purine nucleoside phosphorylase in host enzyme-deficient erythrocyte culture. Enzyme characterization and identification of novel inhibitors // J. Biol. Chem., 1986, v. 261, p. 11667-11673.

Dandanell G., Szczepanowski R.H., Kierdaszuk B., et al. Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase II, the product of the xapA gene // J. Mol. Biol., 2005, v. 348, p. 113-125.

DeClercq E., Descamps J., Verheist G., et al. Comparative efficacy of antiherpes drugs against different strains of herpes simplex virus // J. Infect. Dis, 1980, v. 141(5), p. 563-574.

De Clercq, E., Field, H.J. Antiviral prodrugs - the development of successful prodrug strategies for antiviral chemotherapy. // British journal of pharmacology, 2006, v. 147, v. 1-11.

De Franceschi L., Fattovich G., Turrini F., et al. Hemolytic anemia induced by ribavirin therapy in patients with chronic hepatitis C virus infection: role of membrane oxidative damage // Hepatology, 2000, v. 31(4), p. 9971004.

Del Arco J., Fernández-Lucas J. Purine and pyrimidine salvage pathway in thermophiles: a valuable source of biocatalysts for the industrial production of nucleic acid derivatives // Applied microbiology and biotechnology, 2018, v. 102, p. 7805-7820.

Denisova A.O., Tokunova Y.A., Fateev I.V., et al. The Chemoenzymatic Synthesis of 2-Chloro- and 2-Fluorocordycepins // Synthesis, 2017, v. 49, p. 4853-4860. DOI: 10.1055/s-0036-159

Devivar R.V., Kawashima E., Revankar G.R., et al. Benzimidazole ribonucleosides: design, synthesis, and antiviral activity of certain 2-(alkylthio)-and 2-(benzylthio)-5,6-dichloro-1-(beta-D-ribofuranosyl) benzimidazoles // J. Med. Chem., 1994, v. 37(18), p. 2942-2949.

Dickinson M.J., Holly F.W., Walton E., et al. 3'-Deoxynucleosides. V. 3'-Deoxy-2-fluoroadenosine // J. Med. Chem., 1967, v. 10(6), p. 1165-1166.

Dingley A.J., Grzesiek S. Direct observation of hydrogen bonds in nucleic acid base pairs by internucleotide 2 J NN couplings // J. Am. Chem. Soc., 1998, v. 120 (33), p. 8293-8297. doi: 10.1021/ja981513x.

Dodin G., Dreyfus M., Dubois J.-E. Restricted rotation in 6-methylaminopurine and analogues. Intramolecular hydrogen bonding // J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1979, v. 4, p. 438-442.

Doskocil J., Holy, A. Specificity of purine nucleoside phosphorylase from Escherichia coli // Collect. Czech. Chem. Commun. 1977, v. 42(1), p. 370-383.

Drach J.C., Townsend L.B., Boyd F.L. Jr. US2002/0094963 A1 Benzimidazole derivatives. 18 Jul. 2002

Dracínsky M., Pohl R. NMR studies of purines // Annu. Rep. NMR Spectrosc., Academic Press, 2014, v. 82, p. 59-113.

Drenichev M.S., Oslovsky V.E., Sun L., et al. Modification of the length and structure of the linker of N6-benzyladenosine modulates its selective antiviral activity against enterovirus 71 // Eur. J. Med. Chem., 2016, v. 111, p. 84-94.

Drenichev M.S., Alexeev C.S., Kurochkin N.N., et al. Use of nucleoside phosphorylases for the preparation of purine and pyrimidine 2'-deoxynucleosides // Adv. Synth. Catal., 2018, v. 360(2), p. 305-312.

Ducati R.G., Santos D.S., Basso L.A. Substrate specificity and kinetic mechanism of purine nucleoside phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis // Arch. Biochem. Biophys., 2009, v. 486, p. 155-164.

Effendi W.I., Nagano T., Kobayashi K., et al. Focusing on adenosine receptors as a potential targeted therapy in human diseases // Cells, 2020, v. 9(3), 785.

Ekiel I., Darzynkiewicz E., Shugar D. Conformational parameters of the carbohydrate moieties of a-arabinonucleosides // Carbohydr. Res., 1981, v. 92, p. 21-36.

Eletskaya B.Z., Konstantinova I.D., Paramonov A.S., Esipov R.S., Gruzdev D.A., Vigorov A.Yu., Levit G.L., Miroshnikov A.I., Krasnov V.P. and Charushin V.N. Chemoenzymatic arabinosylation of 2-aminopurines bearing the chiral fragment of 7,8-difluoro-3-methyl-3,4-dihydro-2H-[1,4]benzoxazines // Mendeleev Commun., 2016, 26, p. 6-8.

Eletskaya B.Z., Gruzdev D.A., Krasnov V.P., Levit G.L., Kostromina M.A., Paramonov A.S., Kayushin A.L., Muzyka I.S., Esipov R.S., Andronova V.L., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. and Konstantinova I.D. Enzymatic synthesis of novel purine nucleosides bearing a chiral benzoxazine fragment // Chemical Biology & Drug Design (Chem Biol Drug Des), 2019, v. 93, p.605-616.

Eletskaya B.Z., Berzina M.Ya., Fateev I.V. et al. Enzymatic synthesis of 2-chloropurine arabinonucleosides with chiral amino acid amides at the C6 position and an evaluation of antiproliferative activity in vitro // Int. J. Mol. Sci., 2023, 24(7), 6223. DOI: 10.3390/ijms24076223

Eletskaya B.Z., Mironov A.F., Fateev I.V., Berzina M.Ya., Antonov K.V., Smirnova O.S., Zatsepina A.B., Arnautova A.O., Abramchik Yu.A., Paramonov A.S., Kayushin A.L., Khandazhinskaya A.L., Matyugina E.S., Kochetkov S.N., Miroshnikov A.I., Mikhailopulo I.A., Esipov R.S. and Konstantinova I.D. Enzymatic transglycosylation features in synthesis of 8-aza-7-deazapurine fleximer nucleosides by recombinant E. coli PNP: synthesis and structure determination of minor products // Biomolecules, 2024, v. 14(7), 798

Emmerson B. T. The management of gout // New England Journal of Medicine, 1996, v. 334(7), p. 445-451.

Engel J.D. Von Hippel P.H. Effects of methylation on the stability of nucleic acid conformations. Monomer level // Biochemistry, 1974, v. 13(20), p. 4143-4158. DOI: 10.1021/bi00717a013.

Engelbrecht H.L., Sadoff H.L. Properties of PNPs from spores and vegetative cells of Bacillus cereus and their modification by orthophosphate // J. Biol. Chem., 1969, v. 244, p. 6228-6232.

Englund J.A., Piedra P.A., Ahn Y.M., et al. High-dose, short-duration ribavirin aerosol therapy compared with standard ribavirin therapy in children with suspected respiratory syncytial virus infection // The Journal of pediatrics, 1994, v. 125(4), p. 635-641.

Eriksson B., Helgstrand E., Johansson N.G. Inhibition of influenza virus ribonucleic acid polymerase by ribavirin triphosphate // Antimicrob. Agents Chemother., 1977, v. 11, p. 946-951.

Erion M.D., Takabayashi K., Smith H.B., et al. Purine nucleoside phosphorylase. 1. Structure-function studies // Biochemistry, 1997a, v. 36, p. 11725-11734.

Erion M.D., Stoeckler J.D., Guida W.C., et al. Purine nucleoside phosphorylase. 2. Catalytic mechanism // Biochemistry, 1997b, v. 36, p. 11735-11748.

Esipov R.S., Gurevich A.I., Chuvikovsky D.V., et al. Overexpression of Escherichia coli genes encoding nucleoside phosphorylases in the pET/Bl21(DE3) system yields active recombinant enzymes // Protein Expr. Purif, 2002, v. 24 (1), p. 56-60.

Eyer L., Seley-Radtke K., Ruzek D. New directions in the experimental therapy of tick-borne encephalitis //

Antiviral Research, 2023, v. 210, 105504.

Eustaquio A.S., McGlinchey R.P., Liu Y., et al. Biosynthesis of the salinosporamide A polyketide synthase substrate chloroethylmalonyl-coenzyme A from S-adenosyl-L-methionine // Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009, v. 106, p. 12295-12300.

Fateev I.V., Antonov K.V., Konstantinova I.D., et al. The chemoenzymatic synthesis of clofarabine and related 2-deoxyfluoroarabinosyl nucleosides: the electronic and stereochemical factors determining substrate recognition by E. coli nucleoside phosphorylases // Beilstein J. Org. Chem., 2014, v. 10, p. 1657-1669. D0I:10.3762/bjoc.10.173

Fateev I.V., Kharitonova M.I., Antonov K.V., et al. Recognition of artificial nucleobases by E. coli purine nucleoside phosphorylase versus its Ser90Ala mutant in the synthesis of base-modified nucleosides // Chemistry, 2015, v. 21, p. 13401-13419. DOI: 10.1002/chem.201501334.

Fateev I.V., Sinitsina E.V., Bikanasova A.U., et al. Thermophilic phosphoribosyltransferases Thermus thermophilus HB27 in nucleotide synthesis // Beilstein J. Org. Chem., 2018, v. 14, p. 3098-3105. DOI: 10.3762/bjoc.14.289.

Fateev I., Kostromina M., Abramchik Yu., et al. Multi-enzymatic cascades in the synthesis of modified nucleosides: comparison of the thermophilic and mesophilic pathways // Biomolecules, Special Issue «Biotechnological and biomedical applications of enzymes involved in the synthesis of nucleosides and nucleotides», 2021, v. 11(4), 586. DOI: 10.3390/biom11040586.

Fateev I.V., Sasmakov S.A., Abdurakhmanov J.M., et al. Synthesis of substituted 1, 2, 4-triazole-3-thione nucleosides using E. coli purine nucleoside phosphorylase // Biomolecules, 2024, 14(7), 745. https://doi.org/10.3390/biom14070745

Fateev I.V., Sasmakov S.A., Ziyaev A.A., et al. Enzymatic synthesis and molecular docking studies of substituted 5-phenyl-1,2,4-triazole-3-thione deoxyribosides //Rus. J. Bioorg. Chem, 2025, v. 51(4), p. 17801788. DOI 10.1134/S1068162025602125

Fathi R., Nawoschik K.J., Zavoda M., et al. Enzymatic synthesis of 2', 5'-dideoxv purine nucleosides and related compounds // Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids, 1997, v. 16(10-11), p. 1907-1920.

Fedorov A., Shi W., Kicska G., et al. Transition state structure of purine nucleoside phosphorylase and principles of atomic motion in enzymatic catalysis // Biochemistry, 2001, v. 40(4), p. 853-860.

Foster G.R. Past, present and future hepatitis C treatments // Semin Liver Dis, 2004, v. 24(2), p. 97-104.

Friedkin M., Kalckar H.M. Desoxyribose-1-phosphate: I. The phosphorolysis and resynthesis of purine desoxyribose nucleoside // J. Biol. Chem., 1950a, v. 184(2), p. 437-448.

Friedkin M. Deoxyriboside-1-phosphate: II. The isolation of the crystalline deoxyribose-1-phosphate // J. Biol. Chem, 1950b, v. 184, p. 449-459.

Friedkin M. Enzymatic synthesis of deoxyxanthosine by the action of xanthosine phosphorylase in mammalian tissues // J. Am. Chem. Soc., 1952, v. 74, p. 112-115.

Friedkin M., Kalckar H. Nucleoside phosphorylases // Enzymes, 1961, v. 5, p. 237-256.

Fujiil T., Saito T., Itaya T., et al. Syntheses of 9-alkyl-2-deuterio-N6-methoxyadenines and 2-deuterio-N6, 9-dimethyladenine: tautomerism in 9-substituted N6-alkoxyadenines // Chem. Pharm. Bull., 1987, v. 35(11), p. 4482-4493.

Fujishima T., Yamamoto Y. Process for producing ribavirin. United States Patent 4,614,719. Current U.S. Class: 435/85; September 30, 1986.

Furihata T., Kishida S., Sugiura H., et al. Functional analysis of purine nucleoside phosphorylase as a key enzyme in ribavirin metabolism // DrugMetab. Pharmacokinet., 2014, v. 29, p. 211-214.

Furman R.R., Hoelzer D. Purine nucleoside phosphorylase inhibition as a novel therapeutic approach for B-cell lymphoid malignancies // Semin. Oncol., 2007, v. 34, p. S29-S34.

Furuta Y., Takahashi K., Maekawa M., et al. T-1106, a novel pyrazine nucleoside, hepatitis C virus polymerase inhibitor // In Abstr 44th Intersci Conf Antimicrob Agents Chemother, 2004, pp. 199-200.

Furuta Y., Takahashi K., Shiraki K., et al. T-705 (favipiravir) and related compounds: novel broad-spectrum inhibitors of RNA viral infections // Antiviral Research, 2009, v. 82, p. 95-102.

Furuta Y., Komeno T., Nakamura T. Favipiravir (T-705), a broad spectrum inhibitor of viral RNA polymerase // The Japan Academy, 2017, v. 93, № 7, p. 449-463.

Galmarini C.M., Mackey J.R., Dumontet C. Nucleoside analogues: mechanisms of drug resistance and reversal strategies // Leukemia, 2001, v. 15, p. 875-890.

Galmarini C.M., Mackey J.R., Dumontet C. Nucleoside analogues and nucleobases in cancer treatment // Lancet Oncol., 2002, v. 3(7), p. 415-424.

Gao H., Mitra A.K. Regioselective synthesis of various prodrugs of ganciclovir // Tetrahedron Lett., 2000, v. 41, p. 1131-1136.

Gardner, R., Kornberg, A. Biochemical studies of bacterial sporulation and germination // J. Biol. Chem., 1967, v. 242, p. 2383-2388.

Gerster J.F. Robins R.K. Purine nucleosides. XIII. The synthesis of 2-fluoro-and 2-chloroinosine and certain derived purine nucleosides // J. Org. Chem., 1966, v. 31(10), p. 3258-3262. DOI: 10.1021/jo01348a037

Ghanem M., Li L., Wing C., et al. Altered thermodynamics from remote mutations altering human toward bovine purine nucleoside phosphorylase // Biochemistry, 2008, v. 47, p. 2559-2564.

Gherardi A., Peyrol S., Sarciron M.E. Toxoplasma gondii: localization of purine nucleoside phosphorylase activity in vitro and in vivo by electron microscopy //Med. Mol. Morphol., 2005, v. 38, p. 251-255.

Ghoda L.Y., Savarese T.M., Northup C.H., et al. Substrate specificities of 5'-deoxy-5'-methylthioadenosine phosphorylase from Trypanosoma brucei brucei and mammalian cells //Mol. Biochem. Parasitol., 1988, v. 27, p. 109-118.

Gilpin R.W., Sadoff H.L. Physical and catalytic properties of the purine nucleoside phosphorylase from cells and spores of Bacillus cereus T // J. Biol. Chem., 1971, v. 246, p. 1475-1480.

Gish R.G. Treating HCV with bavirin analogues and ribavirin-like molecules // J. Antimicrob. Chemother., 2006, v. 57(1), p. 8-13.

Giuliani P., Zuccarini M., Buccella S., et al. Development of a new HPLC method using fluorescence detection without derivatization for determining purine nucleoside phosphorylase activity in human plasma // J. Chromatogr. B, 2016, v. 1009-1010, p. 114-121.

Glantz M.D., Lewis A.S. Purine nucleoside phosphorylase from rabbit liver //Methods Enzymol., 1978, v. 51, p. 524-530.

Goswami B.B., Borek E., Sharma O.K., et al. The broad spectrum antiviral agent ribavirin inhibits capping of mRNA// Biochem. Biophys. Res. Commun., 1979, v. 89(3), p. 830-836.

Grebenkina L.E., Matveev A.V., Chudinov M.V. Parallel synthesis of derivatives of 1H-1,2,4-triazole-3-carboxylic acids with heterocyclic substituents at position 5 // Chem. Heterocycl. Compd., 2020, v. 56, p. 11731179.

Gruzdev D.A., Telegina A.A., Ol'shevskaya V.A., et al. New nido-carborane-containing conjugates of purine: Synthesis and antiviral activity // Russian Chemical Bulletin, 2022, v. 71(11), p. 2375-2382.

Gupta R., Wald A., Krantz E., et al. Valacyclovir and acyclovir for suppression of shedding of herpes simplex virus in the genital tract // J. Infect. Dis., 2004, v. 190(8), p. 1374-1381.

Guse A.H., Cakir-Kiefer C., Fukuoka M., et al. Novel hydrolysis-resistant analogues of cyclic ADP-ribose: Modification of the "northern" ribose and calcium release activity // Biochemistry, 2002, v. 41, p. 6744-6751.

Gus'kova A.A., Skoblov M.Yu., Korovina A.N., et al. Antiherpetic properties of acyclovir 5'-hydrogenphosphonate and the mutation analysis of herpes virus resistant strains //Chem. Biol. Drug Des, 2009, v. 74, p. 382-389.

Halpern G. M. Cordyceps: china's healing mushroom // N. Y.: Avery Pub. Gr., 1999, p.116.

Halpern-Cohen V., Blumberg E.A. New perspectives on antimicrobial agents: maribavir // Antimicrob. Agents Chemother., 2022, v. 66(9), e02405-21.

Hamamoto T., Noguchi T., Midorikawa Y. Purification and characterization of purine nucleoside phosphorylase and pyrimidine nucleoside phosphorylase from Bacillus stearothermophilus TH 6-2 // Biosci. Biotechnol. Biochem., 1996, v. 60, p. 1179-1180.

Hamamoto T., Okuyama K., Noguchi T., et al. Cloning and expression of purine nucleoside phosphorylase I gene from Bacillus stearothermophilus TH 6-2 // Biosci. Biotechnol. Biochem., 1997, v. 61, p. 272-275.

Hammer-Jespersen K., Buxton R. S., Hansen T.D. A second purine nucleoside phosphorylase in Escherichia coli K-12: II. Properties of xanthosine phosphorylase and its induction by xanthosine //Mol. Gen. Genet., 1980, v. 179, 341-348.

Hassan A.E., Abou-Elkhair R.A., Riordan J.M., et al. Synthesis and evaluation of the substrate activity of C-6 substituted purine ribosides with E. coli purine nucleoside phosphorylase: palladium mediated cross-coupling of organozinc halides with 6-chloropurine nucleosides // Eur. J. Med. Chem., 2012, v. 47, p. 167-174.

Hassan A.E., Abou-Elkhair R.A., Parker W.B., et al. 6-Methylpurine derived sugar modified nucleosides: synthesis and evaluation of their substrate activity with purine nucleoside phosphorylases // Bioorg. Chem., 2016, v. 65, p. 9-16.

Hayat F., Migaud M.E. Nicotinamide riboside-amino acid conjugates that are stable to purine nucleoside phosphorylase // Org. Biomol. Chem., 2020, v. 18, p. 2877-2885.

He J., Mikhailopulo I., Seela F. 3-Bromopyrazolo [3,4-d] pyrimidine 2'-deoxy-2'-fluoro-P-d-arabinonucleosides: modified DNA constituents with an unusually rigid sugar N-conformation // J. Org. Chem., 2003, v. 68(14), p. 5519-5524.

Hennen W.J., Wong C-H. A new method for the enzymatic synthesis of nucleosides using purine nucleoside phosphorylase // J. Org. Chem., 1989, v. 54, p. 4692-4695.

Herbal K., Kitteringham J., Voyle M., et al. Synthesis of the enantiomer of nelarabine // Tetrahedron Lett., 2005, v. 46, p. 2961-2964.

Hershfield M.S., Chaffee, S., Koro-Johnson, L., et al. Use of site-directed mutagenesis to enhance the epitope-shielding effect of covalent modification of proteins with polyethylene glycol // PNAS, 1991, v. 88(16), p. 7185-7189.

Hodge C.N., Dickson J.K., Popa-Burke I.G., et al. Certain triazole-based compounds, compositions, and uses thereof. International Patent WO2005/097758A1, 20 October 2005.

Hoff-J0rgensen E., Friedkin M., Kalckar H.M. Desoxyribose-1-phshate: III. Comparison of microbiological and spectrophotometric estimation of enzymatically produced purine desoxyribose nucleoside // J. Biol. Chem., 1950, v. 184(2), p. 461-464.

Hood M.A., Finley R.S. Fludarabine: a review // Annals of Pharmacotherapy, 1991, v. 25(5), p. 518-524.

Hori N., Watanabe M., Yamazaki Y., et al. Purification and characterization of thermostable purine nucleoside phosphorylase of Bacillus stearothermophilus JTS 859 // Agric. Biol. Chem., 1989a, v. 53, p. 2205-2210.

Hori N., Watanabe M., Yamazaki Y., et al. Purification and characterization of thermostable purine nucleoside phosphorylase of Bacillus stearothermophilus JTS 859 // Agric. Biol. Chem., 1989b, v. 53, p. 2205-2210 and p. 3219-3224.

Hori N., Watanabe M., Sunagawa K., et al. Production of 5-methyluridine by immobilized thermostable purine nucleoside phosphorylase and pyrimidine nucleoside phosphorylase from Bacillus stearothermophilus JTS 859 // J. Biotechnol., 1991, v. 17(2), p. 121-131. DOI: 10.1016/0168-1656(91)90003-E.

Hou X., Majik M.S., Kim K., et al. Structure-activity relationships of truncated C2- or C8-substituted adenosine derivatives as dual acting A 2 A and A 3 adenosine receptor ligands // J. Med. Chem., 2012, v. 55, p. 342-356.

Huang X.S., Liu X., Constantine K.L., et al. Observation of O-H.. .N scalar coupling across a hydrogen bond in nocathiacin I //Magn. Reson. Chem., 2007, v. 45(6), p. 447-450.

Huffman M.A., Fryszkowska A., Alvizo O., et al. Design of an in vitro biocatalytic cascade for the manufacture of islatravir // Science, 2019, v. 366(6470), p. 1255-1259. DOI: 10.1126/science.aay8484.

Huggins J.W., Hsiang C.M., Cosgriff T.M., et al. Prospective, double-blind, concurrent, placebo-controlled clinical trial of intravenous ribavirin therapy of hemorrhagic fever with renal syndrome // Journal of Infect. Dis., 1991, 164(6), 1119-1127.

Hutchinson D.W. New approaches to the synthesis of antiviral nucleosides // ^ends Biotechnol., 1990, v. 8, p. 348-353.

Isaksen G.V., Hopmann K.H., Aqvist J., et al. Computer simulations reveal substrate specificity // Biochemistry, 2016, v. 55, p.2153-2162.

Isaksen G.V., Aqvist J., Brandsdal B.O. Thermodynamics of the purine nucleoside phosphorylase reaction revealed by computer simulations // Biochemistry, 2017, v. 56, p. 306-312.

Iwanow M., Magnowska L., Yokomatsu T., et al. Interactions of potent multisubstrate analogue inhibitors with purine nucleoside phosphorylase from calf spleen-kinetic and spectrofluorimetric studies // Nucleosides Nucleotides and Nucleic Acids, 2003, v. 22, p. 1567-1570.

Jackson E.K., Gillespie D.G., Cheng D., et al. Characterization of the N6-etheno-bridge method to assess extracellular metabolism of adenine nucleotides detection of a possible role for purine nucleoside phosphorylase in adenosine metabolism // Purinergic Signal., 2020, v. 16, p. 187-221.

Jacobson K.A., Merighi S., Varani K., et al. A3 adenosine receptors as modulators of inflammation: from medicinal chemistry to therapy //Med. Res. Rev., 2018, 38(4), 1031-1072.

Jäger V. D., Lamm R., Küsters K., et al. Catalytically-active inclusion bodies for biotechnology-general concepts, optimization, and application // Appl. Microbiol. Biotechnol., 2020, v. 104(17), p. 7313-7329. DOI: 10.1007/s00253-020-10760-3

Jansma A., Zhang Q., Li B., et al. Verification of a designed intramolecular hydrogen bond in a drug scaffold by nuclear magnetic resonance spectroscopy // J. Med. Chem., 2007, v. 50. № 24, p. 5875-5877. DOI: 10.1021/jm700983a.

Jensen K.F., Nygaard P. Purine nucleoside phosphorylase from Escherichia coli and Salmonella typhimurium. Purification and some properties // Eur. J. Biochem., 1975, v. 51, p. 253-265.

Jensen K.J. Two purine nucleoside phosphorylases in Bacillus subtilis. Purification and some properties of the adenosine-specific phosphorylase // Biochim. Biophys. Acta, 1978, v. 525, p. 346-356.

Jenuth J.P., Snyder F.F. Nucleotide sequence of murine purine nucleoside phosphorylase cDNA // Nucleic Acids Res., 1991, v. 19, 1708.

Jiménez-Méndez R., Castañeda-Hernández G. Characteristics of hepatitis C treatment with pegylated interferons and ribavirin // Annals of Hepatology, 2010, v. 9, S61-S64.

Johnson S. G. and S. Peters. Advances in pharmacologic stress agents: focus on regadenoson // Journal of nuclear medicine technology, 2010, v. 38, № 3, p. 163-171.

Jones W. Concerning nucleases // J. Biol. Chem., 1911a, v. 9(2): 129-138.

Jones W. On the physiological agents which are concerned in the nuclein fermentation, with special reference to four independent desamidases // J. Biol. Chem., 1911b, v. 9(2), p 160-180.

Kalckar H. M. Differential spectrophotometry of purine compounds by means of specific enzymes: I. Determination of hydroxypurines // J. Biol. Chem., 1947a, v. 167, p. 429-443.

Kalckar H. M. The enzymatic synthesis of purine ribosides // J. Biol. Chem., 1947b, v. 167, p. 477-486.

Kamath V.P., Juarez-Brambila J.J., Morris P.E. Synthesis of labeled BCX-4208, a potent inhibitor of purine nucleoside phosphorylase // Drug Test. Anal., 2009, v. 1, p. 125-127.

Kamath V.P., Xue J., Juarez-Brambila J.J., et al. Synthesis of analogs of forodesine HCl, a human purine nucleoside phosphorylase inhibitor-Part I // Bioorg. Med. Chem. Lett., 2009, v. 19, p. 2624-2626.

Kamel M.Y., Fahmy A.S., Ghazy A.H., et al. Purification and characterization of purine nucleoside phosphorylase from developing embryos of Hyalomma dromedarii // Biochem. Cell Biol., 1991, v. 69, p. 223231.

Kamel S., Yehia H., Neubauer P., et al. Enzymatic synthesis of nucleoside analogues by nucleoside phosphorylases // Ed. Jesús Fernández Lucas, María-José Camarasa Rius. John Wiley & Sons, 25 окт. 2018 г. -Всего страниц: 352, Book «Enzymatic and chemical synthesis of nucleic acid derivatives», 2019, 1.

Kamel S., Thiele I., Neubauer P., et al. Thermophilic nucleoside phosphorylases their properties, characteristics and applications // Biochim. Biophys. Acta, 2020, v. 1868(2), 140304. DOI: 10.1016/j.bbapap.2019.140304.

Kamel S., Walczak C., Kaspar F., et al. Thermostable adenosine 5'-monophosphate phosphorylase from Thermococcus kodakarensis forms catalytically active inclusion bodies // Sci. Rep., 2021, v. 11, 16880. DOI: 10.1038/s41598-021-96073-5

Kaspar F., Neubauer P., Kurreck A. The peculiar case of the hyperthermostable pyrimidine nucleoside phosphorylase from Thermus thermophilus // ChemBioChem., 2020a, v. 22(8), p. 1385-1390. DOI: 10.1002/cbic.202000679.

Kaspar F., Giessmann R.T., Neubauer P., et al. Thermodynamic reaction control of nucleoside phosphorolysis //Adv. Synth. Catal., 2020b, v. 362, 867-876. DOI: 10.1002/adsc.201901230.

Kaspar F., Schallmey A. Strategic enzymatic transformations in modern natural product synthesis // ChemRxiv, 2022, preprint. DOI: 10.26434/chemrxiv-2022-nvjkx.

Kaspar F., Seeger M., Westarp S., et al. Diversification of 4'-methylated nucleosides by nucleoside phosphorylases // ACS Catal., 2021, v. 11(17), p. 10830-10835. DOI: 10.1021/acscatal.1c02589.

Kayushin A.L., Tokunova J.A.,. Fateev I.V, et al. Radical dehalogenation and purine nucleoside phosphorylase E. coli: how does an admixture of 2',3'-anhydroinosine hinder 2-fluoro-cordycepin synthesis. // Biomolecules, Special Issue «Biotechnological and Biomedical Applications of Enzymes Involved in the Synthesis of Nucleosides and Nucleotides», 2021, 11(4), 539. DOI: 10.3390/biom11040539.

Kearney K.R., Thornton J.J., Navarro V.J. Taribavirin for the treatment of chronic hepatitis C // Expert Opin. Pharmacother., 2008, v. 9(18), p. 3243-3249.

Kelley J.A., Driscoll J.S., McCormack J.J., et al. Furanose-pyranose isomerization of reduced pyrimidine and cyclic urea ribosides // J. Med. Chem., 1986, v. 29, p. 2351-2358.

Khandazhinskaya A.L., Alexandrova L.A., Matyugina E.S., et al. Novel 5'-norcarbocyclic pyrimidine derivatives as antibacterial agents //Molecules, 2018, v. 23(12), p. 3069.

Khandazhinskaya A., Eletskaya B., Fateev I., et al. Novel fleximer pyrazole-containing adenosine analogues: chemical, enzymatic and highly-efficient biotechnological synthesis // Org. Biomol. Chem., 2021, 19 (34), 7379, DOI: 10.1039/D1OB01069G

Khandazhinskaya A., Fateev I., Eletskaya B., et al. Design and synthesis of new modified flexible purine bases as potential inhibitors of Human PNP //Molecules, 2023a, v. 28(3), 928. DOI: 10.3390/molecules28030928

Khandazhinskaya A., Eletskaya B., Mironov A., et al. New flexible analogues of 8-aza-7-deazapurine nucleosides as potential antibacterial agents // Int. J. Mol. Sci. 2023b, 24, 15421. DOI: 10.3390/ijms242015421

Kharitonova M.I., Fateev I.V., Antonov K.V., Berzina M.Ya., Kaushin A.L., Konstantinova I.D., Kotovskaya S.K., Andronova V.L., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. Chemo-enzymatic synthesis of modified 2'-deoxy-2'-fluoro ß-D-arabinofuranosyl benzimidazoles and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // Synthesis, 2017, v. 49, p. 1043-1052.

Kharitonova M.I., Denisova A.O., Andronova V.L., Kayushin A.L., Konstantinova I.D., Kotovskaya S.K., Galegov G.A., Charushin V.N., Miroshnikov A.I. New modified 2-aminobenzimidazole nucleosides: synthesis and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // BMCL, 2017, v. 27, p. 2484-2487.

Eletskaya B.Z., Mironov A.F., Fateev I.V., et al. Enzymatic transglycosylation features in synthesis of 8-aza-7-deazapurine fleximer nucleosides by recombinant E. coli PNP: synthesis and structure determination of minor products // Biomolecules, 2024, 14(7), 798. DOI: 10.3390/biom14070798

Kharitonova M.I., Fateev I.V., Kayshin A.L., et al. Chemo-enzymatic syntheses and antiviral evaluation of 5-substituted 4,6-difluorobenzimidazoles ribo- and 2'-deoxyribo-nucleosides // Synthesis, 2016, v. 48(03), p. 394-406. DOI: 10.1055/s-0035-1560911.

Kharitonova M.I., Denisova A.O., Andronova V.L., et al. New modified 2-aminobenzimidazole nucleosides: Synthesis and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // Bioorg. Med. Chem. Let., 2017a, 27 (11), p. 2484-2487.

Kharitonova M. I., Fateev I. V., Antonov K.V., et al. Chemo-enzymatic synthesis of modified 2'-deoxy-2'-fluoro ß-D-arabinofuranosyl benzimidazoles and evaluation of their activity against herpes simplex virus type 1 // Synthesis, 2017b, v. 49, p. 1043-1052. DOI 10.1055/s-0036-1588625.

Kierdaszuk B., Modrak-Wojcik A., Wierzchowski J., et al. Formycin A and its N-methyl analogues, specific inhibitors of E. coli purine nucleoside phosphorylase (PNP): induced tautomeric shifts on binding to enzyme, and enzyme^ ligand fluorescence resonance energy transfer // Biochim. Biophys. Acta, 2000, v. 1476, p.109-128.

Kim B.K., Cha S., Parks R.E. Jr. Purine nucleoside phosphorylase from human erythrocytes. II. Kinetic analysis and substrate-binding studies // J. Biol. Chem., 1968, v. 243(8), p. 1771-1776.

Kim H., Jacobson E.L., Jacobson M.K. Synthesis and degradation of cyclic ADP-ribose by NAD glycohydrolases // Science, 1993, v. 261, p. 1330-1333

Kline P.C., Schramm V.L. Purine nucleoside phosphorylase. Catalytic mechanism and transition-state analysis of the arsenolysis reaction // Biochemistry, 1993, v. 32, p. 13212-13219.

Kline P.C., Schramm V.L. Pre-steady-state transition-state analysis of the hydrolytic reaction catalyzed by purine nucleoside phosphorylase // Biochemistry, 1995, v 34, p. 1153-1162.

Koeller G., Luic M., Shugar D., et al. Crystal structure of calf spleen purine nucleoside phosphorylase in a complex with hypoxanthine at 2.15 A resolution // J. Mol. Biol., 1997, v. 265, p. 202-216.

Koellner G., Luic M., Shugar D., et al. Crystal structure of the ternary complex of E. coli purine nucleoside phosphorylase with formycin B, a structural analogue of the substrate inosine, and phosphate (Sulphate) at 2.1 Ä resolution // J. Mol. Biol., 1998, v. 280(1), p. 153-166.

Koellner G., Bzowska A., Wielgus-Kutrowska B., et al. Open and closed conformation of the E. coli purine nucleoside phosphorylase active center and implications for the catalytic mechanism // J. Mol. Biol., 2002, v. 315, p. 351-371.

Komatsu H., Awano H., Fukazawa N., et al. Process for selectively producing 1-phosphorylated sugar derivative anomer and process for producing nucleoside. EP 1178051 A2, 13.02.2001. Int. Cl.7: C07F 9/655.

Komatsu H., Araki T. Efficient chemo-enzymatic syntheses of pharmaceutically useful unnatural 2'-deoxynucleosides // Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, 2005, v. 24, № 5-7, p. 1127-1130.

Kondhare D., Leonard P., Seela F. Isoguanine (2-hydroxyadenine) and 2-aminoadenine nucleosides with an 8-aza-7-deazapurineskeleton: Synthesis, functionalization with fluorescent and clickable side chains, and impact of 7-substituents on physicalproperties // J. Org. Chem., 2021, v. 86, p. 14461-14475.

Konrad A., Piskur J., Liberies D. A. The evolution of catalytic residues and enzyme mechanism within the bacterial nucleoside phosphorylase superfamily I // Gene, 2012, v. 510(2), p. 154-161.

Konstantinova I.D., Antonov K.V., Fateev I.V., et al. A Chemo-enzymatic synthesis of ß-D-arabinofuranosyl purine nucleosides // Synthesis, 2011. v.10, p. 1555-1560.

Konstantinova I.D., Selezneva O.M., Fateev I.V., et al. Chemo-enzymatic syntheses and biological evaluation of 5,6-disubstituted benzimidazole ribo- and 2'-deoxyribo-nucleosides // Synthesis, 2013, v. 45(2), p. 272-276. DOI: 10.1055/s-0032-1317782.

Konstantinova I.D., Kayushin A.L., Arnautova A.O., et al. A convenient approach to the biosynthesis of C2,C6-disubstituted purine nucleosides using E. coli purine nucleoside phosphorylase and arsenolysis // Applied Biocatalysis: The Chemist's Enzyme Toolbox. P. 211-214/ John Whittall (Editor), Peter W. Sutton (Editor), ISBN: 978-1-119-48703-6 August 2020, 560 pages, Publisher Wiley-VCH. https: // www.wiley.com/en-gb/Applied+Biocatalysis%3A+The+Chemist%27s+Enzyme+Toolbox-p-9781119487036

Koszalka G.W., Vanhooke J., Short S.A., et al. Purification and properties of inosine-guanosine phosphorylase from Escherichia coli K-12 // J. Bacteriol., 1988, v. 170, p. 3493-3498.

Krasnov V.P., Vigorov A.Y., Musiyak V.V., et al. Synthesis and antimycobacterial activity of N-(2-aminopurin-6-yl) and N-(purin-6-yl) amino acids and dipeptides // Bioorg. Med. Chem. Lett., 2016, v. 26(11), p. 2645-2648. DOI: 10.1016/j.bmcl.2016.04.017

Krasnov V.P., Musiyak V.V., Vozdvizhenskaya O.A., et al. N-[©-(purin-6-yl) aminoalkanoyl] derivatives of chiral heterocyclic amines as promising anti-herpesvirus agents // Eur. J. Org. Chem., 2019, v. 2019(30), p. 4811-4821.

Krauss U., Jäger V. D., Diener M., et al. Catalytically-active inclusion bodies - carrier-free protein immobilizates for application in biotechnology and biomedicine // J. Biotechnol., 2017, v. 258, p. 136-147. DOI: 10.1016/j.jbiotec.2017.04.033.

Krenitsky T.A. Purine nucleoside phosphorylase: kinetics, mechanism, and specificity // Mol. Pharmacol., 1967, v. 6, p. 526-536.

Krenitsky T.A., Koszalka G.W., Tuttle J.V. Purine nucleoside synthesis, an efficient method employing nucleoside phosphorylases // Biochemistry, 1981a, v. 20(12), p. 3615-3621.

Krenitsky T.A., Koszalka G.W., Tuttle J.V., et al. An enzymic synthesis of purine D-arabinonucleosides // Carbohydr. Res., 1981b, v. 97, p. 139-146.

Krenitsky T.A., Rideout J.L., Koszalka G.W., et al. Pyrazolo [3,4-d]pyrimidine ribonucleosides as anticoccidials. 1. Synthesis and activity of some nucleosides of purines and 4-(alkylthio) pyrazolo [3, 4-d]pyrimidines // J. Med. Chem., 1982, v. 25(1), p. 32-35.

Krenitsky T.A., Rideout J.L., Chao E.Y., et al. Imidazo [4, 5-c] pyridines (3-deazapurines) and their nucleosides as immunosuppressive and antiinflammatory agents // J. Med. Chem., 1986, v. 29(1), p. 138-143.

Krosky P. M., Borysko K. Z., Nassiri M. R., et al. Phosphorylation of beta-D-ribosylbenzimidazoles is not required for activity against human cytomegalovirus // Antimicrob. Agents Chemother., 2002, v. 2, p. 478-486.

Kulikowska E., Bzowska A., Wierzchowski J., et al. Properties of two unusual, and fluorescent, substrates of purine-nucleoside phosphorylase: 7-methylguanosine and 7-methylinosine // Biochim. Biophys. Acta, 1986, v. 874, p. 355-363.

Kulikowska E., Kierdaszuk B., Shugar D. Xanthine, xanthosine and its nucleotides: solution structures of neutral and ionic forms, and relevance to substrate properties in various enzyme systems and metabolic pathways // Acta Biochim. Pol., 2004, v. 51(2), p. 493-531.

Kulikovskiy A.I., Esipov R.S., Miroshnikov A.I. et al. An enzymatic synthesis of nucleosides of N 2-acetyl-O 6-[2-(4-nitrophenyl) ethyl] guanine // Collect. Czech. Chem. Commun., 2015, v.12, p. 397-399.

Lane A.N., Fan T.W.M. Regulation of mammalian nucleotide metabolism and biosynthesis // Nucleic Acids Res., 2015, v. 43(4), p. 2466-2485.

Lee J., Filosa S., Bonvin J., et al. Expression, purification, and characterization of recombinant purine nucleoside phosphorylase from Escherichia coli // Protein Expr. Purif., 2001,v. 22, p.180-188.

Leer J.C., Hammer-Jespersen K., Schwartz M. Uridine phosphorylase from Escherichia coli. Physical and chemical characterization // Eur. J. Biochem., 1977, v. 75(1), p. 217-224.

Levene P.A., Medigrecenau F. On nucleases // J. Biol. Chem., 1911a, v. 9 (1), p. 65-83.

Levene P.A., Medigrecenau F. On nucleases // J. Biol. Chem., 1911b, v. 9 (5), p. 389-402.

Levene P.A., Yamagawa M., Weber I. On nucleosidases. I. General properties // J. Biol. Chem, 1924a, v. 60 (3), p. 693-706.

Levene P.A., Weber, I. On nucleosidases. II. Purification of the enzyme // J. Biol. Chem., 1924b, v. 60 (3), p. 707-715.

Levene P.A., Weber I. On nucleosidases. III. The degree of specificity of nucleosidase and the distribution of it in various organs and in various species // J. Biol. Chem., 1924c, v. 60(3), p. 717-720.

Lewis A.S., Glantz M.D. Bovine brain purine-nucleoside phosphorylase purification, characterization, and catalytic mechanism // Biochemistry, 1976, v. 15, p. 4451-4457.

Lewis A.S., Lowy B.A. Human erythrocyte purine nucleoside phosphorylase: molecular weight and physical properties. A Theorell-Chance catalytic mechanism // J. Biol. Chem., 1979, v. 254, p. 9927-9932.

Lewkowicz E. S., Iribarren A. M. Nucleoside phosphorylases // Curr. Org. Chem., 2006, v. 10(11), p. 11971215.

Li L., Luo M., Ghanem M., et al. Second-sphere amino acids contribute to transition-state structure in bovine purine nucleoside phosphorylase // Biochemistry, 2008, v. 47, p. 2577-2583.

Li X., Jiang X., Li H., Ren D. Purine nucleoside phosphorylase from Pseudoalteromonas sp. Bsi590: molecular cloning, gene expression and characterization of the recombinant protein // Extremophiles, 2008, v. 12, p. 325333.

Likar Yu.N., Moroz M.A., et al. Mechanisms of resistance to nucleoside analogues // Haematology, Oncology and Immunopathology Scientificant and Practical Journal, 2010, v. 9(10), p. 32-40.

Ling F., Inuoe Y., Kimura A. Induction, purification and utilization of purine nucleoside phosphorylase and uridine phosphorylase from Klebsiella sp. // Process Biochem., 1994, v. 29, p. 355 - 361.

Liu P., Sharon A., Chu C.K. Fluorinated nucleosides: synthesis and biological implication // J. Fluor. Chem., 2008, v. 129, p. 743-766.

Liu G., Cheng T., Chu J., et al. Efficient synthesis of purine nucleoside analogs by a new trimeric purine nucleoside phosphorylase from Aneurinibacillus migulanus AM007 // Molecules, 2019, v. 25, p. 100. DOI: 10.3390/molecules25010100.

Lopez-Cruz R.I., Perez-Milicua M.B., Crocker D.E., et al. Purine nucleoside phosphorylase and xanthine oxidase activities in erythrocytes and plasma from marine, semiaquatic and terrestrial mammals // Comp. Biochem. Physiol. A, 2014, v. 171, p. 31-35.

Loustaud-Ratti V., Debette-Gratien M., Jacques J., et al. Ribavirin: Past, present and future // World journal of hepatology, 2016, v. 8(2), 123.

Lucas J. F., Rius M. J. C. (Eds.). Enzymatic and chemical synthesis of nucleic acid derivatives. John Wiley & Sons. (2019).

Luic M., Koellner G., Yokomatsu T., et al. Calf spleen purine-nucleoside phosphorylase: crystal structure of the binary complex with a potent multisubstrate analogue inhibitor // Acta Crystallogr. Sect. D, 2004, v. 60, p. 1417-1424.

Luna G., Dolzhenko A.V., Mancera R.L. Inhibitors of xanthine oxidase: scaffold diversity and structure-based drug design // ChemMedChem, 2019, v. 14(7), p. 714-743.

Luo W., Liu Y., Zhu X., et al. Cloning and characterization of purine nucleoside phosphorylase in Escherichia coli and subsequent ribavirin biosynthesis using immobilized recombinant cells // Enzyme Microb. Technol., 2011, v. 48, p. 438-444.

Maag D, Castro C, Hong Z et al. Hepatitis C virus RNA-dependent RNA polymerase (NS5B) as a mediator of the antiviral activity of ribavirin // J. Biol. Chem., 2001, v. 276, p. 46094-8.

Machida Y., Nakanishi T. Properties of purine nucleoside phosphorylase from Enterobacter cloacae // Agric. Biol. Chem., 1981, v. 45, p. 1801-1807.

Mahmoudian M. Development of bioprocesses for the generation of anti-inflammatory, antiviral and anti-leukaemic agents // Focus Biotechnology, 2001, v. 1, p. 249-265.

Mahor D., Priyanka A., Prasad G.S., et al. Functional and structural characterization of purine nucleoside phosphorylase from Kluyveromyces lactis and its potential applications in reducing purine content in food // PLoS ONE, 2016, v. 11, e0164279.

Mahy B.W., Cox N.J., Armstrong S.J. et al. Multiplication of influenza virus in the presence of cordycepin, an inhibitor of cellular RNA synthesis // Nature: New biology, 1973, v. 243, p. 172-174.

Manson L.A., Lampen J.O. The metabolism of deoxyribose nucleosides in Escherichia coli // J. Biol. Chem., 1951, v. 193(2), p. 539-547.

Mao C., Cook W.J., Zhou M., et al. The crystal structure of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase: a comparison with the human enzyme reveals a conserved topology // Structure, 1997, v. 5(10), p. 1373-1383.

Mao C., Cook W.J., Zhou M., et al. Calf spleen purine nucleoside phosphorylase complexed with substrates and substrate analogues // Biochemistry, 1998, v. 36, p. 7135-7146.

Marcellin P., Gish R. G., Gitlin N., et al. Safety and efficacy of viramidine versus ribavirin in ViSER2: randomized, double-blind study in therapy-naive hepatitis C patients // Journal of hepatology, 2010, v. 52(1), p. 32-38.

Marcelin J. R., Wilson J. W., Razonable R. R. et al. Oral ribavirin therapy for respiratory syncytial virus infections in moderately to severely immunocompromised patients // Transplant Infectious Disease, 2014, v. 16 (2), p. 242-250.

Martin D., Reese C. Restricted rotation in methylated derivatives of adenosine and cytidine // Chem. Commun. (London), 1967, v. 24, p. 1275-1276.

Mason J.M., Murkin A.S., Li L., et al. A beta-fluoroamine inhibitor of purine nucleoside phosphorylase // J. Med. Chem., 2008, v. 51, p.5880-5884.

Matyugina E.S., Kochetkov S.N., Khandazhinskaya A.L. Synthesis and biological activity of aza and deaza analogues of purine nucleosides // Russ. Chem. Rev., 2021, 90 (11) 1454 -1491.

Maurins J.A., Paegle R.A., Zidermane A.A., et al. Synthesis of 1-(6-Mercaptopurinyl-9)-and 1-(6-Methylmercaptopurinyl-9)-ß-D-glucofuranuronosides // Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, 2005, v. 24, p. 147-155.

May R.A., Hoffee P. Purine nucleoside phosphorylases purified from rat liver and Novikoff hepatoma cell // Arch. Biochem. Biophys., 1979, v. 193, p. 398-406.

Maynes J.T., Yam W.S., Jenuth J.P., et al. Design of an adenosine phosphorylase by active-site modification of murine purine nucleoside phosphorylase: enzyme kinetics and molecular dynamics simulation of Asn-243 and Lys-244 substitutions of purine nucleoside phosphorylase // Biochem. J., 1999, v. 344, p. 585-592.

McClean K., Preston C., Spence D., et al. Biocatalytic synthesis of valaciclovir using commercial enzymes // Tetrahedron Lett., 2011, v. 52(2), p. 215-218.

McCormick J.B., King I.J., Webb P.A., et al. Lassa fever. Effective therapy with ribavirin // Engl. J. Med., 1986, v. 314, p. 20-26.

McElwain M.C., Williams M.V., Pollack J.D. Acholeplasma laidlawii B-PG9 adenine-specific purine nucleoside phosphorylase that accepts ribose-1-phosphate, deoxyribose-1-phosphate, and xylose-1-phosphate // J. Bacteriol, 1988, v. 170, p. 564-567.

Mcintosh J. A., Benkovics T., Silverman S. M., et al. Engineered ribosyl-1-kinase enables concise synthesis of molnupiravir, an antiviral for COVID-19 // ACS Cent. Sci., 2021, v. 7(12), p. 1980-1985. DOI: 10.1021/acscentsci.1c00608.

Mehellou Y., Balzarini J., McGuigan C. The Design, Synthesis and Antiviral Evaluation of a Series of 5-trimethylsilyl-l-ß-d-(arabinofuranosyl) uracil phosphoramidate ProTides // Antiviral Chem. Chemoter. 2010. V. 20. P.153-160.

Meissner A. and S0rensen O.W. New Techniques for the measurement of C N and C' HNJ coupling constants across hydrogen bonds in proteins // J. Magn. Reson., 2000, v. 143(2), p. 387-390. DOI: 10.1006/jmre.1999.1998.

Mikleusevic, G., Stefanie, Z., Narczyk, M., et al. Validation of the catalytic mechanism of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase by structural and kinetic studies // Biochimie, 2011, v. 93(9), p. 1610-1622.

Mikami Y., Matsumoto S., Yoshinaka S., et al. Method of preparing purine nucleoside compound. European Patent № 0896065B1. 29.07.1998. Int. Cl.7 C12P 19/40.

Mikhailopulo I.A., Poopeiko N.E., Prikota T.I., et al. Synthesis and antiviral and cytostatic properties of 3'-deoxy-3'-fluoro-and 2'-azido-3'-fluoro-2', 3'-dideoxy-D-ribofuranosides of natural heterocyclic bases // J. Med. Chem., 1991, v. 34(7), p. 2195-2202.

Mikhailopulo I.A., Zinchenko A.I., Bokut S.B., et al. 1-Deaza and 3-deazapurines in the reaction of microbiological transglycosylation // Biotechnol. Lett., 1992, v. 14(10), p. 885-890.

Mikhailopulo I.A., Zinchenko A.I., Kazimierczuk Z., et al. Synthesis of 2-chloro-2'-deoxyadenosine by microbiological transglycosylation // Nucleosides & Nucleotides, 1993, v. 2(3&4), p. 417-422.

Mikhailopulo I., Kazimierczuk Z., Zinchenko A., et al. Benzimidazoles in the reaction of enzymatic transglycosylation // Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids, 1995, v. 14(3), p. 477-480. DOI: 10.1080/152577795080124

Mikhailopulo I. A., Pricota T. I., Sivets G. G., et al. 2'-Chloro-2',3'-dideoxy-3'-fluoro-d-ribonucleosides: synthesis, stereospecificity, some chemical transformations, and conformational analysis // J. Org. Chem., 2003, v. 68(15), p. 5897-5908.

Mikhailopulo I. A. Biotechnology of nucleic acid constituents-state of the art and perspectives // Curr. Org. Chem., 2007, v. 11(4), p. 317-335.

Mikhailopulo I. A., Miroshnikov A. I. Biologically important nucleosides: modern trends in biotechnology and application //Mendeleev Commun., 2011, v. 21(2), p. 57-68.

Mikhailopulo I.A., Miroshnikov A.I. New trends in nucleoside biotechnology // Acta Naturae, 2010, v. 2(2(5)), p. 36-58.

Mikhailopulo I.A., Miroshnikov A.I. Some recent findings in the biotechnology of biologically important nucleosides // Biotechnologia Acta, 2013, v. 6(4), p. 063-077.

Mikleusevic G., Stefanic Z., Narczyk M., et al. Validation of the catalytic mechanism of Escherichia coli purine nucleoside phosphorylase by structural and kinetic studies // Biochimie, 2011, v. 93, p. 1610-1622.

Miller F.P., Kane J.M. Processo para a preparacao de derivados de 3-aril-5-alquiltio-4H-1,2,4-triazo. Portuguese Patent PT86623B, 26 January 1988, 29 January 1993

Miller R.L., Sabourin C.L.K., Krenitsky T.A. Trypanosoma cruzi adenine nucleoside phosphorylase // Biochem. Pharmacol., 1987, v. 36, p. 553-560

Milman G., Anton D.L., Weber J.L. Chinese hamster purine-nucleoside phosphorylase: purification, structural, and catalytic properties // Biochemistry, 1976, v. 15, p.4967-4973.

Mitsiki E., Papageorgiou A.C., Iyer S., et al. Structures of native human thymidine phosphorylase and in complex with 5-iodouracil // Biochem. Biophys. Res. Commun., 2009, v. 386(4), p. 666-670. DOI: 10.1016/j .bbrc.2009.06.104.

Modi J.A., Patel K. Design, synthesis of some 2,6,9-trisubstituted purinyl thioureido derivatives and evaluation of antimicrobial activity //Med. Chem. Res., 2012, v. 21(8), p. 1660-1664.

Montgomery J.A. Procedure for the preparation of 9-beta-D-arabinofuranosyl-2-fluoroadenine. United States Patent 4,210,745. Current U.S. Class: 536/27.11, July 1, 1980.

Montgomery J. Temple C. Synthesis of Potential Anticancer Agents. IX. 9-Ethyl-6-substituted-purine // Contributios from the kettering-meyer laboratory, southern research institute. 1957. p. 5238-5242.

Montgomery J.A., Thomas J.H. New approach to the synthesis of nucleosides of 8-azapurines (3-glycosyl-v-triazolo[4,5-d]pyrimidines) // J. Org. Chem., 1971, v. 36, p. 1962-1967.

Montgomery J.A. Purine nucleoside phosphorylase: a target for drug design //Med. Res. Rev., 1993, v. 13, p. 209-228.

de Moraes M.C., Cardoso C.L., Cass Q.B. Immobilized purine nucleoside phosphorylase from Schistosoma mansoni for specific inhibition studies // Anal. Bioanal. Chem., 2013, v. 405, p. 4871-4878.

Morozov Y.V., Savin F., Chekhov V., et al. Photochemistry of N6-methoxyadenosine and of N4-hydroxycytidine and its methyl derivatives I: spectroscopic and quantum chemical investigation of ionic and tautomeric forms: syn-anti isomerization // J. Photochem., 1982, v. 20(3), p. 229-252.

Moyer T.P., Fischer A.G. Purification and characterization of a purine-nucleoside phosphorylase from bovine thyroid // Arch. Biochem. Biophys., 1976, v. 174, p. 622-629.

Muller R. Encyclopedia of nuclear magnetic resonance, advances in NMR // Spectroscopy, 1996, v. 9.

Munagala N., Wang C.C. The purine nucleoside phosphorylase from Trichomonas vaginalis is a homologue of the bacterial enzyme // Biochemistry, 2002, v. 41, p. 10382-10389.

Murkin A.S., Birck M.R., Rinaldo-Matthis A., et al. Neighboring group participation in the transition state of human purine nucleoside phosphorylase // Biochemistry, 2007, v. 46, p.5038-5049.

Murray K.F., Balistreri W.F., Bansal S. Safety and efficacy of ledipasvir-sofosbuvir with or without ribavirin for chronic hepatitis C in children ages 6-11// Hepatology, 2018, v. 68(6), p. 2158-2166.

Musiyak V.V., Gruzdev D.A., Kravchenko M.A., et al. Synthesis and antimycobacterial activity of purine conjugates with (S)-lysine and (S)-ornithine // Mendeleev Commun., 2019, v. 29(1), p. 11-13. DOI: 10.1016/j.mencom.2019.01.002.

Musiyak V.V., Nizova I.A., Chulakov E.N.et al. Stereochemical aspects in the synthesis of novel N-(purin-6-yl) dipeptides as potential antimycobacterial agents // Amino Acids, 2021, v. 53(3), p. 407-415.

Nannemann, D., Kaufmann, K., Meiler, J., et al. Design and directed evolution of a dideoxy purine nucleoside phosphorylase // Protein Eng. Des. Sel., 2010, v. 23, p. 607-616.

Narczyk M., Bertosa B., Papa L., et al. Helicobacterpylori purine nucleoside phosphorylase shows new distribution patterns of open and closed active site conformations and unusual biochemical features // FEBS J., 2018, v. 285, p.1305-1325.

Niiya K., Olsson R.A., Thompson R.D., et al. 2-(N'-alkylidenehydrazino) adenosines: potent and selective coronary vasodilators // J. Med. Chem., 1992, v. 35(24), p. 4557-4561. DOI: 10.1021/jm00102a007.

Niu H.-Y., Bai S.-X., Wu S., et al. Synthesis of chiral N-(purin-6-yl) amino acid derivatives by using natural amino acids as starting materials // Asian J. Org. Chem., 2012, v. 1. (3), p. 238-244. DOI: 10.1002/ajoc.201200081.

Nixon A.E., Hunter J.L., Bonifacio G., et al. Purine nucleoside phosphorylase: its use in a spectroscopic assay for inorganic phosphate and for removing inorganic phosphate with the aid of phosphodeoxyribomutase // Anal. Biochem., 1998, v. 265, p. 299-307.

Novotna R., Travnicek Z., Popa I. X-ray crystallographic and NMR study of the tautomerism in kinetin, kinetin riboside and their derivatives: A comparison between the solid state and solution // J. Mol. Struct., 2010, v. 963(2-3), p. 202-210.

Nunez S., Wing C., Antoniou D., et al. Insight into catalytically relevant correlated motions in human purine nucleoside phosphorylase // J. Phys. Chem. A, 2006, v. 110, p. 463-472.

Okamura T, Kurogi Y, Hashimoto K, et al. Structure-activity relationships of adenosine A3 receptor ligand: New potential therapy for the treatment of glaucoma // Bioorg. Med. Chem. Lett., 2004, v. 14, p. 3775-3779.

Ölfücü G., Baumer B., Küsters K., et al. Catalytically active inclusion bodies - benchmarking and application in flow chemistry // ACS Synth. Biol., 2022, v. 11(5), p. 1881-1896. DOI: 10.1021/acssynbio.2c00035.

Oslovsky V.E., Drenichev M.S., Alexeev C.S., et al. Synthesis of cytokinins via enzymatic arsenolysis of purine nucleosides // Current Protocols in Nucleic Acid Chemistry, 2018, v. 75(1), e61. DOI: 10.1002/cpnc.61.

Osman A.M., Del Corso A., Mohamed A.S., et al. Liver purine nucleoside phosphorylase in Camelus dromedarius: purification and properties // Comp. Biochem. Physiol. B viol, 1990, v. 97, p 177-182.

Panda A., Satpati S., Dixit A., et al. Novel homologated-apio adenosine derivatives as A3 adenosine receptor agonists: design, synthesis and molecular docking studies // RSC Advances, 2016, v. 6(14), p. 11233-11239. DOI: 10.1039/C5RA26416B.

Parker W.B., Allan P.W., Ealick S.E., et al. Design and evaluation of 5-modified nucleoside analogs as prodrugs for an E. coli purine nucleoside phosphorylase mutant // Nucleosides Nucleotides & Nucleic Acids, 2005, v. 24, p. 387-392.

Parks, R.E., Agarwal, R.P. Purine nucleoside phosphorylase. The Enzymes, 3rd Ed. (Boyer, P. D., ed.) 1972, v.7, p. 483-514.

Pathak A.K., Pathak V., Seitz L.E., et al. 6-Oxo and 6-thio purine analogs as antimycobacterial agents // Bioorg. Med. Chem., 2013, v. 21(7), p. 1685-1695. DOI: 10.1016/j.bmc.2013.01.054.

Patterson J.L., Fernandez-Larsson R. Molecular mechanisms of action of ribavirin // Reviews of infectious diseases, 1990, v. 12(6), p. 1139-1146.

Pegg A.E., Swann P.F. Metabolism of O6-alkyldeoxyguanosines and their effect on removal of O6-methylguanine from rat liver DNA // Biochim. Biophys. Acta-Nucleic Acids and Protein Synthesis, 1979, v. 565(2), p. 241-252.

Pereira H.M., Rezende M.M., Castilho M.S., et al. Adenosine binding to low-molecular-weight purine nucleoside phosphorylase: the structural basis for recognition based on its complex with the enzyme from Schistosoma mansoni // Acta Crystallogr. Sect. D, 2010, v. 66, p. 73-79.

Perkins J.J., Shurtleff V.W., Johnson A.M., et al. Synthesis of C6-substituted purine nucleoside analogues via late-stage photoredox/nickel dual catalytic cross-coupling // ACS Med. Chem. Lett., 2021, v. 12(4), p. 662-666. DOI: 10.1021/acsmedchemlett.0c00673.

Pfeiffer J.K., Kirkegaard K. Ribavirin resistance in hepatitis C virus replicon-containing cell lines conferred by changes in the cell line or mutations in the replicon RNA // J. Virol., 2005, v. 79(4), p. 2346-2355.

Plochocka D., Rabczenko A., D. B. Davies. Intramolecular hydrogen bonding and molecular conformations of nucleosides: N (6)-dimethyl-2',3'-isopropylidene adenosine // Biochim. Biophys. Acta-Nucleic Acids and Protein Synthesis, 1977, v. 476(1), p. 1-15.

Poordad F., Schiff E.R., Vierling J.M., et al. Daclatasvir, sofosbuvir, and ribavirin combination for HCV patients with advanced cirrhosis or posttransplant recurrence: phase 3 ALLY-1 study // J. Hepatol., 2015, v. 62(Suppl 2), S261.

Pothier P., Dru A., Beaud G. The inhibition of Vaccinia virus replication by 5,6-dichloro-1-ß-D-ribofuranosylbenzimidazole (DRB): an effect at the assembly stage // J. Gen. Virol., 1981, v. 55, p. 87-94.

Prichard M.N., Frederick S.L., Daily S., et al. Benzimidazole analogs inhibit human herpesvirus 6 // Antimicrob. Agents Chemother., 2011, v. 55(5), p. 2442-2445.

Prokopowicz M., Ciesla J., Kierdaszuk B. A synergistic effect of phosphate, pH and Phe159 substitution on the formycin A association to the E. coli purine nucleoside phosphorylase // Biochimie, 2018, v. 148, p. 80-86.

Pugmire M.J., Ealick S.E. Structural analyses reveal two distinct families of nucleoside phosphorylases // Biochem. J., 2002, v. 361(1), p. 1-25. DOI: 10.1042/0264-6021:3610001.

Qiu X.-L. Recent advances in the synthesis of fluorinated nucleosides // Tetrahedron, 2010, v. 66, p. 789-843.

Rabuffetti M., Bavaro T., Semproli R., et al. Synthesis of ribavirin, tecadenoson, and cladribine by enzymatic transglycosylation // Catalysts, 2019, v. 9(4), 355.

Ramasamy K., Kini G.D., Robins R.K., et al. Nucleoside peptides. 8. Synthesis of certain. Peptide derivatives of ribavirin and tiazopurin // Nucleosides & Nucleotides, 1987, v. 6(5), p. 901-991.

Rehm F.B.H., Chen S., Rehm B.H.A. Bioengineering toward direct production of iImmobilized enzymes: a paradigm shift in biocatalyst design // Bioengineered, 2018, v. 9(1), p. 6-11. DOI: 10.1080/21655979.2017.1325040.

Reiter S., Simmonds H.A., Webster D.R., et al. On the metabolism of allopurinol: Formation of allopurinol-1-riboside in purine nucleoside phosphorylase deficiency // Biochem. Pharmacol., 1983, v. 32(14), p. 2167-2174, DOI: 10.1016/0006-2952(83)90222-8.

Reitz A.B., Graden D.W., Jordan A.D. Jr., et al. Conformational study of N-substituted adenines by dynamic proton NMR: relatively high barrier to rotation about C6-N6 in N3, N6-disubstituted adenines // J. Org. Chem., 1990, v. 55(22), p. 5761-5766. DOI: 10.1021/jo00309a021.

Rejman D., Panova N., Klener P., et al. N-phosphonocarbonylpyrrolidine derivatives of guanine: a new class of bi-substrate inhibitors of human purine nucleoside phosphorylase // J. Med. Chem., 2012, v. 55, p. 1612-1621.

Revankar G.R., Townsend L.B. The synthesis of 2-chloro-1-(ß-D-ribofuranosyl) benzimidazole and certain related derivatives // J. Heterocycl. Chem., 1968, v. 5(4), p. 477-483.

Rich M.A., Meyers P., Weinbaum G., et al. Inhibition of human tumor cells by cordycepin // Biochim. Biophys. Acta, 1965, v. 95, p. 194-204.

Rideout J.L., Krenitsky T.A., Koszalka G.W., et al. Pyrazolo [3,4-d] pyrimidine ribonucleosides as anticoccidials. 2. Synthesis and activity of some nucleosides of 4-(alkylamino)-1H-pyrazolo[3,4-d] pyrimidines // J. Med. Chem., 1982, v. 25(9), p. 1040-1044.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.