Биологические характеристики представителей нормобиоты и патогенной микрофлоры, выделенных от сельскохозяйственных животных тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Прасолова Ольга Владимировна

• Прасолова Ольга Владимировна
• доктор наук
• 2025

Оглавление диссертации доктор наук Прасолова Ольга Владимировна

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

2.1 Коллекционная деятельность в разных странах и ее нормативно-правовое регулирование

2.2 Разработка мер специфической профилактики бруцеллеза_и систематика возбудителя

2.2.1 Анализ штаммов Brucella, используемых для специфической

профилактики бруцеллеза крупного и мелкого рогатого скота

на территории РФ

2.4 Биологические свойства и систематика возбудителей бактериальных болезней птиц (A. paragallinarum и O. rhinotracheale)

2.4.1 Принципы разработки тест-систем на основе ПЦР-РВ

2.5 Оценка эпизоотической обстановки по сальмонеллезам в РФ и методы субтипирования сальмонелл

2.6 Генетические маркеры резистентности к критически важным противомикробным препаратам

2.7 Микробиом и метагеномика

2.7.1 Биоинформатическая обработка данных таргетного секвенирования

2.7.2 Прогнозирование функциональных профилей для выяснения метаболических возможностей микробных сообществ

3. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

3.1 МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

3.1.1 Материалы

3.1.2 Методы

3.2 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.2.1 Молекулярно-генетические особенности штаммов B. abortus, используемых с целью производства средств специфической профилактики бруцеллеза крупного и мелкого рогатого скота

3.2.1.1 Биоинформатический анализ геномных данных штаммов B. abortus

3.2.1.2 Филогенетический анализ вакцинных штаммов B. abortus

3.2.1.3 Анализ мутаций в генах вирулентности штаммов B. abortus

3.2.2 Биоинформатический анализ изолятов O. rhinotracheale

и A. paragaШnarum

3.2.2.1 Разработка и валидация методик идентификации ДНК_ O. rhinotracheale и A. pamgaШшrum

3.2.3 Биологические свойства и генетические характеристики коллекционных и полевых штаммов сальмонелл

3.2.3.1 Результаты исследования серологических свойств штаммов

3.2.3.2 Результаты полногеномного секвенирования производственных штаммов сальмонелл с высокой иммуногенностью

3.2.5.3 Результаты полногеномного секвенирования полевых штаммов сальмонелл

3.2.5 Разработка и валидация способа обнаружения генов устойчивости к аминогликозидам из группы aadA у бактерий животного происхождения методом ПЦР-РВ

3.2.6 Разработка и валидация системы олигонуклеотидов и оптимизация условий амплификации фрагментов генов группы tet у бактерий

3.2.7 Олигонуклеотидные праймеры и зонд для выявления фрагмента

гена 233 рРНК бактерий семейства Ейегососсасеае

3.2.8 Идентификация генов резистентности в рамках ветеринарного мониторинга

3.2.8.1 Результаты анализа наличия генов резистентности у представителей различных семейств бактерий с использованием таргетного секвенирования

3.2.9 Чувствительность к АМП Е. faecalis и Е. faecium

3.2.10 Мониторинг внутривидового разнообразия нормальной микрофлоры толстого отдела кишечника птицы

3.2.10.1 Исследование генетического разнообразия кишечной нормобиоты птицы

3.2.11 Исследование сукцессии в бактериальном сообществе желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственной птицы

под воздействием антимикробного препарата энрофлоксацина

3.2.11.1 Влияние антибиотика на популяционный уровень микроорганизмов

3.2.11.3 Анализ прогнозируемой представленности метаболических путей метагеномного сообщества слепых отростков толстого отдела кишечника

цыплят

3.2.12 Формирование фонда государственной коллекции представителей нормальной микрофлоры и образцов нормальных микробиоценозов сельскохозяйственных животных

3.2.12.1 Штамм бактерий C. jejuni

3.2.12.2 Штамм бактерий E. coli

4. ОБСУЖДЕНИЕ

5. ЗАКЛЮЧЕНИЕ

6. РЕКОМЕНДАЦИИ И ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

7.ПРЕДЛОЖЕНИЯ ДЛЯ ПРАКТИКИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Биологические характеристики представителей нормобиоты и патогенной микрофлоры, выделенных от сельскохозяйственных животных»

1. ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Распространение инфекционных болезней сельскохозяйственных животных является основной биологической угрозой с учетом большого количества ввозимого в РФ и перемещаемого поголовья и продукции живоотноводства внутри страны за последние годы. Депонирование уже изученных штаммов, на основе которых осуществляется производство средств специфической профилактики, необходимо для предотвращения биологических угроз и защиты населения и окружающей среды от воздействия опасных биологических факторов [5]. Федеральный закон от 30 декабря 2020 г. № 492 «О биологической безопасности в Российской Федерации» также устанавливает перечень основных биологических опасностей, к которым относятся изменение свойств и форм патогенов, проектирование и создание патогенов с помощью технологий синтетической биологии, нарушение нормальной микробиоты сельскохозяйственных животных, приводящее к распространению связанных с этим патологических состояний, а также распространение резистентности, и регламентирует обязательное депонирование всех штаммов микроорганизмов, используемых при производстве лекарственных средств для ветеринарного применения в коллекциях патогенных микроорганизмов. Совершенствование контроля свойств производственных штаммов микроорганизмов является залогом производства высокоиммуногенных и безвредных иммунобиологических лекарственных средств, а также высокочувствительных и специфичных диагностикумов, что в конечном счете обеспечивает эпизоотическое благополучие страны [37].

Изучение антигенного и генетического соответствия свойств выделенных

культур микроорганизмов с применением новейших современных методик и

сравнение их свойств с производственными вакцинными и диагностическими

штаммами, а также проведение выборочных мониторинговых диагностических

исследований актуальных бактериальных болезней животных, разработка и

5

стандартизация методов исследований являются задачей Федерального государственного бюджетного учреждения «Всеросийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов» (ФГБУ «ВГНКИ»), который является центром Всемирной организации здоровья животных (ВОЗЖ, WOAH — World Organisation for Animal Health) по диагностике и борьбе с бактериальными болезнями животных для стран Восточной Европы, Центральной Азии и Закавказья. В рамках своих компетенций, в научной сфере, Учреждение осуществляет формирование фондов государственных коллекций как патогенных микроорганизмов, потенциально пригодных для изготовления диагностических и лекарственных средств для животных, так и представителей нормальной микрофлоры сельскохозяйственных животных. Формирование фондов осуществляется с помощью процедуры депонирования. Депонирование штаммов с типичными и атипичными свойствами, расширение перечня изучаемых биологических характеристик являются необходимым аспектом осуществления эпизоотического мониторинга. Подробный анализ свойств штамма возможно осуществить с помощью современных молекулярно-генетических методов исследования, которые должны подбираться индивидуально для каждого штамма, с учетом характера его дальнейшего использования в составе специфических средств профилактики. Подбор метода и стандартизация подобных исследований является сложной задачей, требующей комплексного подхода. Систематизация данных и подробный анализ выделенных изолятов в отдельных регионах создают перспективы для ретроспективного анализа и выявления эпизоотически значимых микроорганизмов с целью оценки изменчивости их свойств, патогенности и изучения их устойчивости к дезинфекционным и бактерицидным средствам. Отдельного внимания заслуживает упоминание возможности валидации актуальных диагностических

тест-систем, оно невозможно без наличия охарактеризованного, «референтного» штамма микроорганизма [22; 28; 32;108; 196; 174].

Степень разработанности. В последние годы развитие генетических

технологий предоставило возможность осуществить революцию в производстве

вакцин. Возможность генетически модифицировать микроорганизмы, чтобы

доставить иммуногенный материал (антигены/эпитопы) в иммунную систему

животного для провоцирования иммунного ответа, создала предпосылки для

производства эффективных вакцин с целью профилактики хорошо изученных и

возникающих болезней [42; 147]. Количество исследований по разработке вакцин

от инфекционных болезней во всем мире увеличилось, одновременно изменилась

их структура — только 23 % разработок представляют собой традиционные

инактивированные или аттенуированные вакцины. А основная часть разработок

основана на различных манипуляциях со штаммами [222]. Идентификация

штаммов путем определения нуклеотидной последовательности вариабельных

участков геномов и сравнение их с известными последовательностями

предоставляет возможность использовать такой подход с целью контроля

качества вакцин в части идентификации вариантов патогенов, которые могут

быть не обнаружены с использованием других исследований [245]. Изучение

биологических свойств и каталогизация генотипов штаммов микроорганизмов,

используемых в ветеринарии с практической целью, стало неотъемлемой частью

деятельности международных репозиториев, тогда как в РФ подобные работы

единичны [19; 24; 43]. Анализ резистентности бактерий к антимикробным

средствам является необходимой частью таких исследований [Забровская А.В.,

2019, 2024; Сухинин А.А., 2022]. Высокопроизводительное секвенирование

позволяет быстро получить полную информацию о бактериальном сообществе и

является мощным инструментом, который привел к новому важному пониманию

биологической и экологической роли нормальной микробиоты желудочно-

кишечного тракта [27; 92]. В последние годы исследованию роли кишечной

7

микробиоты в развитии болезней у различных видов животных посвящены работы отечественных ученых [20; 34]. Детальное изучение молекулярно-генетических характеристик штаммов позволяет более точно проводить эпизоотологическое изучение случаев вспышек инфекционных болезней животных. Наблюдения Shang et al. (2018) и Wegl et al. (2021), Temmerman R. et al. (2022), посвященные влиянию критически важного фторхинолона энрофлоксацина и его отмены на микробиоту слепой кишки цыплят-бройлеров, важны для анализа микробиома и связанной с ним динамики резистома. Анализ метаболических путей позволяет расширить представление о глубоких биохимических процессах [Шабунин С.В., 2024].

Целью данной работы являлось изучение биологических свойств микроорганизмов для оценки их патогенного потенциала, перспективы возможности использования для производства вакцин, а также влияния применения антимикробных препаратов на бактериальные сообщества.

Для достижения поставленной цели необходимо было решить следующие задачи:

1. Изучить молекулярно-генетические особенности вакцинных и диагностических штаммов Brucella abortus 82, 75/79-AB, 104 M, KB 17/100, R-1096, KB 13/100.

2. Изучить биологические свойства изолятов Ornithobacterium rhinotracheale и Avibacterium paragallinarum, выделенных от больных птиц. Осуществить разработку и валидацию диагностических тест-систем для идентификации данных видов на основе ПЦР-РВ.

3. Провести исследования биологических свойств коллекционных и полевых штаммов Salmonella с целью выбора перспективных штаммов для изготовления диагностических препаратов и вакцин.

4. Осуществить разработку и валидацию методик для идентификации генетических детерминант устойчивости к аминогликозидам (aadA) и тетрациклинам (tetA, tetM, tetO) у бактерий семейства Enterococcaceae на основе ПЦР-РВ, перевести их в формат тест-систем.

5. Провести мониторинг выявления генетических детерминант устойчивости бактерий к антимикробным средствам в сравнительном аспекте методиками ПЦР-РВ и с помощью таргетного секвенирования, с анализом представленности семейств бактерий. Оценить резистентность изолятов Enterococcus faecalis и Enterococcus faecium.

6. Провести исследование сукцессии в бактериальном сообществе желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственной птицы под воздействием антимикробного препарата.

Научная новизна. Впервые осуществлен комплексный биоинформатический анализ геномов 6 вакцинных и диагностических штаммов B. abortus, полногеномные последовательности которых размещены в международной открытой базе «Национальный центр биотехнологической информации» (National Center for Biotechnology Information — NCBI), BioProject ID: PRJNA932701. Разработаны методики на основе ПЦР-РВ для идентификации генетического материала O. rhinotracheale и A. paragallinarum, обладающие высокой аналитической чувствительностью и специфичностью (BioProject ID: PRJNA1054055). Впервые осуществлено исследование биологических свойств диких штаммов сальмонелл, выделенных в 2010-2021 гг. в различных регионах Российской Федерации. Выделенные изоляты подвергнуты процедуре депонирования во «Всероссийскую государственную коллекцию штаммов микроорганизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве» Salmonella

enterica (ser. Infantis) ВКШМ-Б-850М (патент от 16.08.2021 № 2753412 C1),

9

Salmonella Infantis ВКШМ-Б-896М (патент от 24.10.2022 № 2782213 C1). Они

были использованы при разработке методик на основе ПЦР-РВ для

идентификации генетических детерминант, характеризующих устойчивость

бактерий к тетрациклинам — tetA, tetO, tetM (патент 12.04.2023 № 2794156 C1),

аминогликозидам — aadA (патент 01.04.2024 № 2816522 C1) и системы

праймеров и зонда для детекции бактерий семейства Enterococcaceae (патент от

08.08.2024 № 2824466 C1). С помощью разработанных методик проведена

идентификация детерминант резистентности в биологическом материале,

полученном от разных видов животных и на объектах их содержания,

осуществлен мониторинг распространения детерминант резистентности,

полученные данные систематизированы и переведены в формат базы данных

(свидетельство о государственной регистрации от 05.06.2024 №2024622488).

Выделен и охарактеризован штамм бактерий Campylobacter jejuni ВКШМ-Б-

897М (патент от 22.05.2023№ 2796348 C1), который рекомендован для

использования в качестве референтного в микробиологических исследованиях,

связанных с определением чувствительности микроорганизмов к

антибактериальным препаратам, в качестве аналога Campylobacter jejuni subsp.

jejuni (Jones et al.) Veron and Chatelain ATCC BAA-373. Выделен и

охарактеризован штамм бактерий Escherichia coli ВКШМ-Б-891М (патент от

05.06.2023 № 2797383 C1) для определения бактерицидного эффекта

антимикробных препаратов, применяемых в ветеринарии. Получены справки о

депонировании выделенных штаммов микроорганизмов с присвоением

коллекционного каталожного номера из государственной коллекции: Salmonella

Bredeney ВКШМ-Б-89Ш/ Escherichia coli ВКШМ-Б-894М/ Escherichia coli

ВКШМ-Б-893М; Escherichia coli ВКШМ-Б-892М и консорциума Enterococcus

spp. ВКШМ-Б-843М (первый представитель консорциума в Государственной

коллекции нормофлоры сельскохозяйственных животных). Качественные и

количественные исследования таксономического состава микробиома толстого

10

кишечника молодняка птицы яичного направления в период роста, при использовании и отмене антибиотика с помощью метагеномного секвенирования, систематизированы, переведены в формат баз данных и рекомендованы для использования с целью формирования перечня фонда государственной коллекции нормальной микрофлоры сельскохозяйственных животных (свидетельство о государственной регистрации базы данных от 08.05.2024 № 2024621987 и 29.05.2024 № 2024622355).

Практическая значимость и реализация результатов работы. Выводы,

полученные при проведении исследований, легли в основу разработки

Положения о «Всероссийской государственной коллекции штаммов

микроорганизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве» и «Правил

депонирования и выдачи штаммов микроорганизмов Всероссийской

государственной коллекции штаммов микроорганизмов, используемых в

ветеринарии и животноводстве, федерального государственного Центра качества

и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов», утверждены

директором Учреждения в 2020 году. Отдельные части работы легли в основу

проекта Федерального закона от 30.12.2020 № 492-ФЗ «О биобезопасности»,

постановления Правительства Российской Федерации от 30.09.2021 № 1668 «Об

утверждении Порядка создания, пополнения, ведения и использования

коллекций патогенных микроорганизмов и вирусов», а также постановления

Правительства Российской Федерации от 16.04.2022 № 676 «Об утверждении

Правил формирования, сохранения и развития государственной коллекции

представителей нормальной микрофлоры человека, сельскохозяйственных

животных и растений, а также криогенных банков образцов природных

нормальных микробиоценозов (биоматериалов)» (в части касающейся).

Результаты проведенного исследования являются основой для

совершенствования лабораторной диагностики бруцеллеза животных и позволят

снизить риски, связанные с распространением этой инфекции на территории

11

Российской Федерации, а также улучшить контроль за качеством и безопасностью противобруцеллезных иммунобиологических препаратов. Разработаны эффективные и чувствительные диагностические тесты для быстрого и точного обнаружения ДНК A. paragaШnarum и O. rhinotracheale, с использованием ПЦР-РВ. Их применение улучшит дифференциальную диагностику респираторных болезней у кур и индеек и сократит время, необходимое для получения результатов, по сравнению с микробиологическими техниками культивирования. Охарактеризованные полирезистентные штаммы сальмонелл использованы в качестве положительных контролей для создания методик с целью идентификации генетических детерминант резистентности. Разработанные методики используются с целью анализа выявления маркеров резистентности. На основе проведенных исследований разработаны, валидированы, утверждены и внедрены в практику в виде готовых тест-систем наборы реагентов для идентификации генетических детерминант устойчивости к аминогликозидам и тетрациклинам.

Сформированный фонд государственной коллекции представителей нормальной микрофлоры сельскохозяйственных животных служит основой для разработки средств профилактики и лечения болезней, связанных с нарушениями количественного и видового состава нормальной микробиоты.

Материалы диссертационной работы используются при реализации программ дополнительного профессионального образования в ФГБУ «ВГНКИ».

Методология и методы исследований. Теоретические исследования,

проведенные в работе, основываются на современных представлениях о

возбудителях инфекционных болезней и представителях нормальной

микробиоты, их биологических особенностях, способах детекции в различных

видах материала, их идентификации и стандартизации исследований.

Методологический подход включал анализ накопленных литературных данных,

систематизацию и обобщение полученных результатов исследования. Объектом

12

исследования являлось изучение биологических характеристик микроорганизмов, предметом — изоляты и штаммы микроорганизмов. В экспериментальной части работы использованы молекулярно-генетические (выделение нуклеиновых кислот, ПЦР с различными форматами детекции продуктов амплификации, секвенирование по методу Сэнгера, полногеномное, таргетное) микробиологические и биоинформатические методы анализа со статистической обработкой полученных данных. Основные положения, выносимые на защиту

1. Полногеномные последовательности вакцинных и диагностических штаммов B. abortus 82, 75/79-AB, 104 M, KB 17/100, R-1096, KB 13/100, с выявленными молекулярно-генетическими особенностями, являются основой для контроля качества лекарственных средств и расшифровки вспышек бруцеллеза крупного и мелкого рогатого скота.

2. Диагностические тесты на основе ПЦР-РВ для идентификации O. rhinotracheale и A. paragallinarum обладают высокой эффективностью, диагностической чувствительностью и специфичностью.

3. Тест-системы на основе ПЦР-РВ для идентификации генетических детерминант устойчивости к аминогликозидам (группа aadA) и тетрациклинам (tetA, tetO, tetM) обладают высокой эффективностью и чувствительностью.

4. Исследование сукцессии в бактериальном сообществе желудочно-кишечного тракта сельскохозяйственной птицы под воздействием антимикробного препарата выявило самостоятельное восстановление таксономического разнообразия на 11 день отмены препарата.

Степень достоверности и апробация работы. Для решения поставленных

задач использованы современные средства и методы проведения исследований.

Достоверность представленных результатов подтверждается большим объемом

экспериментального материала, репрезентативной выборкой анализируемых

13

данных и их статистической обработкой. Выводы, сформулированные в работе, подтверждены анализом современной научной литературы, экспериментальными данными, обработкой полученных результатов с помощью методов вариационной статистики и метрологической экспертизой разработанных методик.

Основные результаты исследований, представляющие собой основу

диссертационной работы, доложены, обсуждены и одобрены на: заседаниях

Ученого совета ФГБУ «Всероссийский государственный Центр качества и

стандартизации лекарственных средств для животных и кормов» (2019, 2020,

2021, 2022, 2023, 2024); научно-технического совета Россельхознадзора (Москва,

2019, 2020, 2021, 2022, 2023, 2024), 31st International congress of Antimicrobial

Chemotherapy and 4th Gulf Congress of Clinical Microbiology & Infectious Diseases,

(Dubai, 2019), международной научной конференции «Знания молодых для

развития ветеринарной медицины и АПК страны», (Санкт-Петербург, 2021),

международной научно-практической конференции Молекулярная диагностика

(Москва, 2021), XIII Всероссийском Конгрессе по инфекционным болезням

имени академика В.И. Покровского (Санкт-Петербург, 2021), национальной

научно-практической конференции «Актуальные вопросы биологии,

биотехнологии, ветеринарии, зоотехнии, товароведения и переработки сырья

животного и растительного происхождения» (Москва, 2021), международной

научно-практической конференции «Фундаментальные и прикладные аспекты

микробиологии в науке и образовании» (Рязань, 2022), международной научно -

практической конференции «Экономически и социально значимые инфекции

сельскохозяйственных животных: меры профилактики и борьбы» (Москва,

2022), международной научно-практической конференции молодых ученых

«Научные основы производства и обеспечения качества биологических

препаратов» (Лосино-Петровский, 2022), IV International Scientific Conference

«Microbiota of humans and animals» (St. Petersburg, 2022), всероссийской научной

14

конференции «Генетические ресурсы микроорганизмов как основа создания средств диагностики и профилактики болезней животных, обеспечение безопасности продовольствия и охрана объектов культурного наследия» (Санкт-Петербург, 2022), II международной молодежной конференции «Генетические и радиационные технологии в сельском хозяйстве» (Обнинск, 2023), II Международной научно-практической конференции «Социально значимые инфекции сельскохозяйственных животных: меры профилактики и борьбы» (Ереван, 2023), II Всероссийской научной конференции «Биологические ресурсы и цифровизация» (Москва, 2023), международном конгрессе МАКМАХ по антимикробной химиотерапии и клинической микробиологии (Москва, 2019, 2022-2024), Выездном заседании бюро отделения сельскохозяйственных наук РАН (Дубровицы, 2024).

Публикации. По материалам исследований опубликовано 39 научных работ, 7 из которых опубликованы в изданиях, входящих в базы данных Scopus/Web of Science (4 — Q1), 7 статей — в журналах, включенных ВАК в перечень рецензируемых научных журналов для опубликования основных научных результатов диссертации (К1, 2), получены 10 патентов Российской Федерации.

Личный вклад соискателя. Диссертация выполнена автором

самостоятельно. Изучение биологических свойств коллекционных и

эпизоотических штаммов сальмонелл проводили совместно с сотрудником

научно-технологической лаборатории ФГБУ «ВГНКИ» к.б.н. Ленёвым С.В.

Изучение антимикробной резистентности E. faecalis и E. faecium проводили

совместно с с.н.с отдела санитарной и клинической микробиологии ФГБУ

«ВГНКИ» к.в.н. Карабановым С.Ю. Выделение и изучение штаммов бактерий E.

coli проводили совместно в.н.с научно-технологической лаборатории ФГБУ

«ВГНКИ» д.в.н. Пирожковым М.К. Валидационные испытания молекулярно-

генетических методик в параллелях осуществляли с н.с. отдела молекулярной

15

биологии ФГБУ «ВГНКИ» Тимофеевой И.А., Кирсановой Н.А. и Путинцевой (Сухоедовой) А.В., Осиповой Ю.А. Анализ мутаций в генах вирулентности штаммов B. abortus проведен при участии к.б.н. Богомазовой А.Н. и к.б.н. Гордеевой В.Д. Формирование фонда коллекции нормофлоры сельсохозяйственных животных осуществлено с сотрудниками ФГБУ «ВГНКИ» Русановым И.А., к.в.н. Чупахиной Н.А., Маленковой Л.А. Участие всех коллег отражено в совместных публикациях. Всем коллегам, оказавшим техническую, консультативную и методическую помощь при выполнении работы и подготовке совместных публикаций, автор выражает глубокую признательность.

Объем и структура диссертации. Материалы диссертационной работы изложены на 286 страницах компьютерного текста и содержат введение, обзор литературы, материалы и методы исследований, результаты собственных исследований и их обсуждение, заключение, рекомендации по использованию полученных результатов, список сокращений и условных обозначений, список литературы, приложения. Диссертация иллюстрирована 71 таблицей и 52 рисунками. Список литературы содержит 252 источника, в том числе 52 отечественных и 200 иностранных.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

По данному разделу опубликованы статьи в следующих изданиях: Формирование в России коллекции представителей нормальной микрофлоры сельскохозяйственных животных, нормативно-правовые аспекты / О.В. Прасолова, Л.К. Киш, Н.И. Малик, В.А. Грицюк, А.Е. Бабушкина // Ветеринария. — 2023. — № 10. — С. 62-68. — DOI 10.30896/00424846.2023.26.10.62-67. Депонирование патогенных штаммов микроорганизмов как основа биобезопасности, Прасолова О.В., Нормативно-правовое регулирование в ветеринарии. — 2024. — № 3. — С. 39-43. — DOI 10.52419/issn2782-6252.2024.3.39.

2.1. Коллекционная деятельность в разных странах и ее нормативно-

правовое регулирование Формирование коллекций микроорганизмов — важнейший этап в развитии микробиологии. Первая «живая» коллекция культур была создана в Праге Франтишеком Кралом в 1890 г. на медицинском факультете Института гигиены. Она содержала несколько сотен культур и препаратов, фиксированных на предметных стеклах. Впоследствии большая часть была вывезена в США и включена в Американскую коллекцию типовых культур (ATCC). Наиболее старыми из ныне существующих коллекций микроорганизмов являются созданная в 1894 г. коллекция грибов при Левенском католическом университете (MUCL) и основанное в 1906 г. Центральное бюро микологических коллекций (CBS). На заседании Международного общества ботаников в 1903 г. признали целесообразным формирование специализированных фондов изученных и описанных культур. Вскоре их начали формировать в разных странах (Англия, Франция, Чехия, Австрия, США и Япония) [25].

В 1920 г. в Великобритании основали Национальную коллекцию типовых культур (NCTQ, в состав которой вошли более 5000 бактериальных штаммов

[179]. В 1947 г. NCTC ограничилась перечнем бактерий, представляющих только медицинский и ветеринарный интерес. В октябре 2021 г. сформировано Агентство по безопасности здравоохранения Великобритании (ИКНЗА), объединившее четыре уникальные коллекции тщательно сохраненных, аутентифицированных клеточных линий (ЕСАСС), вирусов (КОРУ), грибов (КСРБ) и бактерий (КСТС).

Созданная в США пятью годами позже Американская коллекция типовых культур (АТСС) в настоящее время считается крупнейшим в мире биоресурсным центром по хранению и изучению микроорганизмов. Коллекция располагает 18000 бактериальных штаммов, принадлежащих к 750 родам. В АТСС хранится более 3600 типовых штаммов, закладывающих основу для изучения систематики бактерий [71]. Будучи при формировании национальными, вскоре эти коллекции превратились в международные, исследователи и лаборатории из разных стран мира высылают туда свои культуры на хранение. Во Всемирной федерации коллекций культур (WFCC) к 2023 году зарегистрировано уже 768 коллекций из 76 стран, из них 6 — российские [234].

В России формировать коллекции микроорганизмов начали в 1930-е годы, к 1950-1960-м годам их было 36, а в 2020 году — 97. Наибольшее значение имеют государственные организации, которые не просто хранят биоматериал, а являются современными биоресурсными центрами, обеспечивающими хранение, комплексное изучение (с помощью современных методов) и пополнение за счет процедуры национального и/или международного депонирования.

Первое депонирование штамма микроорганизма произошло в 1949 г. в

связи с регистрацией изобретения микробиологического характера. В

Сельскохозяйственной коллекции культур для исследовательских целей

депонировали штамм Streptomycces aureofaaciens А-377 — продуцент

антибиотика хлортетрациклина. В настоящее время патентные законодательства

большинства стран мира предусматривают перед регистрацией изобретений,

18

связанных с микроорганизмами, депонирование последних в уполномоченной коллекции, считая это передачей обществу микробиологического изобретения. Для получения патента международного образца необходимо депонировать штаммы только в коллекциях, зарегистрированных в 'БСС, то есть имеющих статус международного органа. В Российской Федерации таких биоресурсных центров шесть [234] (табл. 1).

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Прасолова Ольга Владимировна, 2025 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1 Ашмарин, И.А. Статистические методы в микробиологии / И.А. Ашмарин, А.А. Воробьев. - Ленинград: Медицина, 1962. - 180 с

2 Биоинформатическая обработка данных метагеномного секвенирования / Е. Я. Скоповец, Р. М. Смолякова // Сахаровские чтения 2020 года: экологические проблемы XXI века = Sakharov readings 2020: environmental problems of the XXI century: материалы 20-й международной научной конференции, 21-22 мая 2020 г., г. Минск, Республика Беларусь : в 2 ч. / Междунар. гос. экол. ин-т им. А. Д. Сахарова Бел. гос. ун-та; редкол.: А. Н. Батян [и др.]; под ред. д-ра ф.-м. н., проф. С. А. Маскевича, к. т. н., доцента М. Г. Герменчук. - Минск : ИВЦ Минфина, 2020. - Ч. 2. - С. 259261.

3 Бруцеллёз в Российской Федерации в 2018 году. Информационный бюллетень. - Ставрополь, 2019. - 38 с. - URL: http://www.snipchi.ru/updoc/2019/Bruzelez%20 -2018.pdf (дата обращения 28.06.2019)

4 Бруцеллёз. Современное состояние проблемы / под ред. Г.Г. Онищенко, А.Н. Куличенко. - Ставрополь: ООО «Губерния», 2019. - 336 с.

5 Букова, Н. К. Сап: ретроспектива и перспективы создания вакцины / Н. К. Букова, О. Д. Скляров, О. В. Бабичева // Ветеринария. - 2020. - №2 10. - С. 3-8. - DOI 10.30896/0042-4846.2020.23.10.03-08.

6 Валидация разработанной методики индикации возбудителя вирусной диареи крупного рогатого скота/ Сухинин А.А., Макавчик С.А., Яцентюк С.П. и др. // Ветеринария. — 2019. — № 8. — С. 62-64.

7 Выявление генетических детерминант резистентности к тетрациклинам и фторхинолонам в рамках ветеринарного мониторинга / О. В. Прасолова, И. В. Солтынская, О. В. Иванова, А. В. Путинцева // Знания молодых для развития ветеринарной медицины и АПК страны : Материалы X юбилейной международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых ученых, посвященной году науки и технологий, Санкт-Петербург, 23-24 ноября 2021 года. - Санкт-Петербург: Санкт-Петербургский государственный университет ветеринарной медицины, 2021. - С. 293-294.

8 Гарант: [сайт]. - 2025. - URL : https://base.garant.ru/12151067/ (дата обращения: 21.12.2023)

9 Гарант: [сайт]. - 2025. - URL : https://base.garant.ru/402878209/ (дата обращения: 17.08.2022)

10 Гарант: [сайт]. - 2025. - URL : https://base.garant.ru/403192758/ (дата обращения: 27.07.2023)

11 Гарант: [сайт]. - 2025. - URL : https://base.garant.ru/404498428/#friends (дата обращения: 16.08.2022)

12 Гарант: [сайт]. - 2025. - URL: https://base.garant.ru/403192758/ (дата обращения: 20.07.2023)

13 Генетическое типирование Salmonella enterica с помощью ПЦР / В. В. Слизень, Ж. Ф. Циркунова, Е. И. Гудкова, О. Ч. Глаз // Медицинский журнал. - 2014. - № 3(49). - С. 93-97.

14 Грачева, И. В. Современное состояние процедуры депонирования микроорганизмов в коллекционных центрах / И. В. Грачева, О. П.

Плотников, А. В. Осин // Проблемы особо опасных инфекций. - 2010. - .№ 1(103). - С. 11-17. - doi:org/10.21055/0370-1069-2010-1(103)-11-17

15 Гуляева, А. Ю. Фармако-токсикологические свойства и терапевтическая эффективность лекарственного препарата для интрацистернального введения на основе энрофлоксацина и кетопрофена: специальность 06.02.03 "Ветеринарная фармакология с токсикологией" : диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук / Гуляева Анастасия Юрьевна. - Москва, 2014. - 173 с.

16 Егорова С. А., Современные методы субтипирования сальмонелл при расследовании вспышек сальмонеллеза / С. А. Егорова, К.В. Кулешов, Л.А. Кафтырева // Иммунопатология, аллергология, инфектология. -2019. - № 3. - С. 36-42.

17 Законы, кодексы и нормативно-правовые акты РФ: [сайт]. - 2025. - URL : https://https://legalacts.ru/search/?term (дата обращения: 12.01.2023)

18 Идентификация генов резистентности в рамках ветеринарного мониторинга / О.В. Прасолова, Е.В. Крылова, И.В. Солтынская и др. // Международный вестник ветеринарии. - 2023. - № 2. - С. 77-85. - doi: 10.52419/issn2072-2419.2023.2.77.

19 Изучение ультраструктуры клетки при разных видах хранения референтных штаммов Cl. Botulinum / Э. Н. Мустафина, А. К. Галиуллин, Е. В. Панкова, А. М. Плотникова // Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана. -2024. - Т. 258, № 2. - С. 146-149. - doi: 10.31588/2413 4201 1883 2 258 146.

20 Ильина, Л. А. Микробиом сельскохозяйственных животных, его связь со здоровьем и продуктивностью: специальность 03.01.06 "Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)": диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук / Ильина Лариса Александровна, 2022. - 365 с.

21 Информационный бюллетень Референс центра по мониторингу за сальмонеллезами, №35, Москва, 2023г.-с.56

22 Использование полногеномного секвенирования производственных штаммов Brucella spp. для выявления генетических маркеров с целью штаммовой дифференциации / О. В. Прасолова, М. А. Гергель, И. В. Солтынская [и др.] // Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы : Сборник трудов XIII Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням имени академика В.И. Покровского; IV Всероссийской научно-практической конференции; VI Всероссийского симпозиума, Москва, 24-26 мая 2021 года. - Москва: Общество с ограниченной ответственностью "Медицинское Маркетинговое Агентство", 2021. - С. 134-135.

23 Касьян, Ж. А. Разработка методических подходов и диагностических препаратов для определения видов и биоваров бруцелл на основе молекулярно-генетических технологий: специальность 03.02.03 "Микробиология" : автореферат диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Касьян Жанетта Андреевна. -Саратов, 2017. - 22 с.

24 Каталогизация генотипов штаммов из коллекции патогенных и вакцинных штаммов микроорганизмов-возбудителей инфекционных

болезней животных / А. Д. Забережный, М. И. Искандаров, А. М. Гулюкин [и др.] // Иппология и ветеринария. - 2019. - № 3(33). - С. 105-111.

25 Красильникова С.В. Международные и национальные коллекции культур микроорганизмов и их значение для развития биотехнологии. Природные соединения и здоровье человека: Сборник научных статей Всероссийской научно-практической конференции. Иркутский государственный медицинский университет, 2021.-С. 181- 183.

26 Кузнецов, Ю. Е. Паразитозы пушных зверей в хозяйствах СевероЗападного региона Российской Федерации (меры борьбы и профилактика): специальность 03.02.11 "Паразитология": диссертация на соискание ученой степени доктора ветеринарных наук / Кузнецов Юрий Евгеньевич. - Санкт-Петербург, 2020. - 496 с.

27 Лаптев, Г. Ю. Генетические методы изучения разнообразия и функций микробиомов для улучшения здоровья и повышения продуктивности / Г. Ю. Лаптев, Е. А. Йылдырым, Л. А. Ильина // Экономически и социально значимые инфекции сельскохозяйственных животных: меры профилактики и борьбы: Материалы Международной научно-практической конференции, Москва, 15 декабря 2022 года. - Москва: Сельскохозяйственные технологии, 2022. - С. 128-135.

28 Макавчик, С. А. Ветеринарный мониторинг антибиотикорезистентности как инструмент инфекционной безопасности / С. А. Макавчик // Нормативно-правовое регулирование в ветеринарии. - 2023. - № 3. - С. 42-46. -ёо1: 10.52419/1ввп2782-6252.2023.3.42.

29 Молекулярные детерминанты резистентности Salmonella enterica к антибиотикам / А. С. Павлова, Ю. А. Бочарова, К. В. Кулешов [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2021. - Т. 98, № 6. - С. 721-730. - doi: 10.36233/0372-9311-140.

30 Орнитобактериоз в промышленном птицеводстве Республики Мордовия / Боряева Ю., Родина Е., Родин В. [и др.] // Международный научный журнал. - 2023. - № 11 С. 137. - DOI: https://doi.org/10.23670/IRJ.2023.137.94.

31 Патент № 2782213 C1 Российская Федерация, МПК C12N 1/20. Штамм бактерий Salmonella infantis, используемый в качестве положительного контроля для молекулярно-генетических, а также микробиологических исследований, связанных с определением чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: заявл. 29.12.2021: опубл. 24.10.2022 / Л. К. Киш, О. Е. Иванова, И. В. Солтынская [и др.]; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение "Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов".

32 Патент № 2797383 C1 Российская Федерация, МПК C12N 1/20, C12N 15/00, C12R 1/19. Полирезистентный штамм бактерий Escherichia coli для определения бактерицидного действия антибактериальных препаратов в ветеринарии: № 2022127817 : заявл. 26.10.2022: опубл. 05.06.2023 / О. В. Прасолова, М. К. Пирожков, О. Е. Иванова [и др.] ; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение "Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов".

33 Патент № 2816522 С1 Российская Федерация, МПК C12Q 1/68, СВД 1/686, C12Q 1/6876. Способ обнаружения генов устойчивости к аминогликозидам из группы aadA у бактерий животного происхождения методом ПЦР с детекцией в режиме реального времени: № 2023118181: заявл. 11.07.2023: опубл. 01.04.2024 / О. В. Прасолова, А. Н. Богомазова, А. В. Путинцева [и др.]; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение "Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов".

34 Плешакова, В. И. Фенотипические и молекулярно-генетические методы определения антибиотикорезистентности микроорганизмов в ветеринарии / В. И. Плешакова, Н. А. Лещева, И. Н. Кошкин // Вестник КрасГАУ. - 2023. - № 8(197). - С. 106-115. - ёо1: 10.36718/1819-40362023-8-106-115.

35 Прасолова О.В., Анализ исследований и разработок вакцин в мире / О. В. Прасолова, Д.Г. Исакова, Г.Ю. Косовский // Ветеринария. - 2024. - № 4. С.35-38.

36 Прасолова, О. В. Депонирование патогенных штаммов микроорганизмов как основа биобезопасности / О. В. Прасолова // Нормативно-правовое регулирование в ветеринарии. - 2024. - № 3. - С. 39-43. -ёо1: 10.5241 9/1Б8П2782-6252.2024.3.39.

37 Результаты сравнительной оценки иммунобиологических свойств вакцинных штаммов бруцелл / О. Д. Скляров, А. И. Климанов, О. В. Бабичева [и др.] // Ветеринария. - 2021. - № 9. - С. 28-34. - ёо1: 10.30896/0042-4846.2021.24.8.27-33.

38 Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2024622355 Российская Федерация. «Профили метаболических путей молодняка птицы яичного направления в период роста, при использовании и отмене антибиотика» : №2 2024621909 : заявл. 14.05.2024: опубл. 29.05.2024 / О. В. Прасолова; заявитель Федеральное государственное бюджетное учреждение «Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных и кормов».

39 Свойства экспериментальных образцов вакцины против инфекционного ринита кур / М. С. Фирсова, А. В. Потехин, В. А. Евграфова [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2021. - Т. 56, № 2. - С. 315-325. - ёо1: 10.15389/а§гоЬю1о§у.2021.2.315гш.

40 Сидоренко, С.В. Молекулярные механизмы устойчивости грамотрицательных бактерий семейства ЕПеюЬаСепасеае к цефалоспориновым антибиотикам / С.В. Сидоренко, В.И. Тишков // Успехи биологической химии. - 2004. - Т.44. - С. 263-306.

41 Современные молекулярно-генетические технологии для формирования перечня представителей нормальной микрофлоры птицы / Прасолова О.В., Малик Н.И., Солтынская И.В. и др.// Международный вестник ветеринарии. - 2022. - № 4. - С. 203-210. - ёо1: 10.52419/1ввп2072-2419.2022.4.203.

42 Современные подходы к разработке и изготовлению вакцин для животных / П. А. Красочко, П. П. Красочко, А. И. Зинченко [и др.] // Продовольственная безопасность в агропромышленном комплексе : материалы IV Международной научно-практической конференции,

Тирасполь, 23 ноября 2023 года. - Тирасполь: Приднестровский государственный университет им. Т. Г. Шевченко, 2024. - С. 165-169.

43 Сравнительная оценка антигенной активности и иммуногенности вакцинных штаммов Chlamydia psittaci на лабораторных животных / В. В. Евстифеев, Ф. М. Хусаинов, С. И. Яковлев [и др.] // Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана. - 2024. - Т. 258, № 2. - С. 71-76. - doi: 10.31588/2413_4201_1883_2_258_71.

44 Стандарт по биобанкированию ISO 20387. Анализ требований и опыт внедрения / Борисова А.Л., Покровская М.С., Мешков А.Н., [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. 2020. 65(9). С. 587 - 592.

45 Шурахова Ю. Н. Биологические особенности популяции Ornithobacterium rhinotracheale и перспективы ее обнаружения в объектах птицеводства // Ветеринарная патология. 2008. № 1. С. 95-99.

46 Шурахова, Ю.Н., Кононенко, A. Б; Виткова, О.Н. Ornithobacterium rhinotracheale: Распространение и диагностика. Междунар. вет. конгр. по птицеводству. М., 2007. - С. 181 -183.

47 Электронный фонд правовых и нормативно технических документов: [сайт]. - 2025. - URL : https://docs.cntd.ru/document/573249393 (дата обращения: 20.12.2023)

48 Электронный фонд правовых и нормативно-технических документов: [сайт]. - 2025. - URL : https://docs.cntd.ru/document/573660140 (дата обращения: 04.07.2022)

49 Эпидемиологическое расследование вспышек сальмонеллезов c использованием молекулярно-генетических методов типирования / В. В. Слизень, Ж. Ф. Циркунова, Д. А. Довнар [и др.] // 90 лет в авангарде микробиологической науки Беларуси : Сборник трудов Республиканской научно-практической конференции с международным участием, посвященной 125-летию со дня рождения Б.Я. Эльберта, Минск, 18 декабря 2015 года / Под редакцией Л.П. Титова. - Минск: Белорусский государственный медицинский университет, 2015. - С. 129-133.

50 Юсупов, М.М. Структура и функция эукариот. Результаты рентгено-структурного анализа: специальность 03.01.03 - молекулярная биология, 02.00.10 - биоорганическая химия: диссертация на соискание ученой степени доктора химических наук / Юсупов Марат Миратович. - Москва, 2021. - 152 с.

51 Яровой Л.В. Бруцеллез овечье-козьего типа у человека / Л.В. Яровой -Ставрополь, 1959. - 31 с

52 Яцентюк, С.П. Биобезопасность спермопродукции быков-производителей: современное состояние и совершенствование методов контроляспециальность 4.2.2-санитария, гигиена, экология, ветеринарно-санитарная экспертиза и биобезопасность ; 4.2.3-инфекционные болезни и иммунология животных: диссертация на соискание ученой степени доктора биологических наук / Яцентюк Светлана Петровна. - Москва, 2024. - 311 с.

53 16S rRNA sequencing analysis of the gut microbiota in broiler chickens prophylactically administered with antimicrobial agents / M.Cuccato, S. Rubiola, D. Giannuzzi [et al.] //Antibiotics. - 2021. - Т. 10. - №. 2. - P. 146. -doi.org/10.3390/antibiotics10020146 (дата обращения:10.04.2024)

54 18S rRNA is a reliable normalisation gene for real time PCR based on influenza virus infected cells /S.V. Kuchipudi, M. Tellabati, R.K. Nelli [et al.] //Virology journal. - 2012. - Т. 9. - P. 1-7.

55 A highly sensitive and specific probe-based real-time PCR for the detection of Avibacterium paragallinarum in clinical samples from poultry /S.V. Kuchipudi, M. Yon,M. Surendran Nair [et al.] // Frontiers in Veterinary Science. - 2021.

- Т. 8. - P. 609126. - doi: 10.3389/fvets.2021.609126 (дата обращения: 12.10.2023)

56 A multiplex PCR method for simultaneous detection of infectious laryngotracheitis virus and Ornithobacterium rhinotracheale / V. G. Nguyen, T. B. P. Cao, V. T. Le [et al.] // Veterinary Sciences. - 2023. - Т. 10. - №. 4. - P. 272.

57 A review of bioinformatics tools for bio-prospecting from metagenomic sequence data / D. D. Roumpeka, R. J. Wallace, I. Fotheringham [et al.] // Frontiers in genetics. - 2017. - Т. 8. - P. 23.

58 Abdelwhab, E. M. Development of real-time polymerase chain reaction assay for detection of Ornithobacterium rhinotracheale in poultry / E.M. Abdelwhab, D. Lüschow, H.M. Hafez //Avian Diseases. - 2013. - Т. 57. - №. 3. - P. 663666.

59 ABRicate: [сайт]. - URL: https://github.com/tseemann/abricate (дата обращения 20.11.2022).

60 Adem, A. Characteristics and intracellular life of Brucella organism: a review / A. Adem, A. Duguma //J. Microb. Biochem. Technol. - 2020. - Т. 12. - №. 3.

- P. 431.

61 Adherence of Ornithobacterium rhinotracheale to chicken embryo lung cells as a pathogenic mechanism / M.A. De la Rosa-Ramos, K.Munoz-Solis, M. Palma-Zepeda [et al.] //Avian Pathology. - 2018. - T. 47. - №. 2. - P. 172178.

62 Aminov, R. I. Horizontal gene exchange in environmental microbiota / R.I Aminov //Frontiers in microbiology. - 2011. - T. 2. - P. 158.

63 AMRcloud: a new paradigm in monitoring of antibiotic resistance / A.Y. Kuzmenkov, G.V. Alina,V. T. Ivan [et al.] // Clinical microbiology and antimicrobial chemotherapy. - 2019. - T. 21. - №. 2. - P. 119-124.

64 AMRmap: an interactive web platform for analysis of antimicrobial resistance surveillance data in Russia /A.Y. Kuzmenkov, I.V. Trushin, A.G. Vinogradova [et al.] // Frontiers in Microbiology. - 2021. - T. 12. - P. 620002.

65 An update on avian infectious coryza: It's re-emerging trends on epidemiology, etiologic characterization, diagnostics, therapeutic and prophylactic advancements / S.Deshmukh, H.S. Banga, S. Sodhi, R.S. Brar //J. Dairy Vet. Anim. Res. - 2015. - T. 2. - P.86-92.

66 Antimicrobial resistance in Enterococcus spp. of animal origin / C. Torres, C. A. Alonso, L. Ruiz-Ripa [et al.] // Antimicrobial resistance in bacteria from livestock and companion animals. - 2018. - P. 185-227.

67 Antimicrobial resistance of commensal Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from food-producing animals in Russia / D. A. Makarov, O. E. Ivanova, A. V. Pomazkova [et. al] // Veterinary World. - 2022. - Vol. 15, No. 3. - P. 611-621. - doi: 10.14202/vetworld.2022.611-621.

68 ARG-ANNOT, a new bioinformatic tool to discover antibiotic resistance genes in bacterial genomes / S.K. Gupta, B.R. Padmanabhan, S.M. Diene [et al.] // Antimicrobial agents and chemotherapy. - 2014. - Т. 58. - №. 1. - P. 212-220.

69 Assays for identification and differentiation of Brucella species: a review /B. Kurmanov, D. Zincke, W. Su e[t al.] //Microorganisms. - 2022. - Т. 10. - №. 8. - P. 1584.

70 Astrup, L. B. Microbiological diagnoses on clinical mastitis—comparison between diagnoses made in veterinary clinics versus in laboratory applying MALDI-TOF MS / L.B. Astrup, K. Pedersen, M. Farre // Antibiotics. - 2022. - Т. 11. - №. 2. - P. 271.

71 ATCC: [сайт]. - 2024. - URL : https://www.atcc.org/ (дата обращения 12.03.2023)

72 Bacterial communities of the upper respiratory tract of turkeys / O. Kursa, G. Tomczyk, A. Sawicka-Durkalec [et al.] //Scientific reports. - 2021. - Т. 11. -№. 1. - P. 2544. - doi: 10.1038/s41598-021-81984-0 (дата обращения: 20.10.2023)

73 Banani, M. Characterization of Ornithobacterium rhinotracheale isolates from commercial chickens. /M. Banani, S.A. Pourbakhsh, P. Khaki // Arch. Razi Inst. 2001.- Vol. 52.P. 27-36.

74 Bang, B. The etiology of contagious abortion / Bang B. // Zeitschrift für Tiermedizin- 1897. - Т. 1. - P. 103-105.

75 Biopharm: [сайт]. - 2023. - URL : https://food.r-biopharm.com/products/surefast-salmonella-species-enteritidis-typhimurium-4plex (дата обращения 19.02.2023)

76 Blackall, P. J. Proposal of a new serovar and altered nomenclature for Haemophilus paragallinarum in the Kume hemagglutinin scheme /P.J. Blackall, L.E. Eaves, D.G. Rogers // Journal of Clinical Microbiology. - 1990. - Т. 28. - №. 6. - P. 1185-1187.

77 Bovine brucellosis-a comprehensive review / S.K. Khurana, A. Sehrawat, R. Tiwari [et al.] //Veterinary Quarterly. - 2021. - Т. 41. - №. 1. - P. 61-88.

78 Brucella abortus genes identified following constitutive growth and macrophage infection / L. Eskra, A. Canavessi, M. Carey, G. Splitter // Infection and immunity. - 2001. - Т. 69. - №. 12. - P. 7736-7742.

79 Brucella ceti sp. nov. and Brucella pinnipedialis sp. nov. for Brucella strains with cetaceans and seals as their preferred hosts /G. Foster, B.S. Osterman, J. Godfroid [et al.] //International journal of systematic and evolutionary microbiology. - 2007. - Т. 57. - №. 11. - P. 2688-2693. - doi: 10.1099/ijs.0.65269-0 (дата обращения:08.02.2023)

80 Brucella lipopolysaccharide acts as a virulence factor / N. Lapaque, I. Moriyon, E. Moreno, J. P. Gorvel //Current opinion in microbiology. - 2005. - Т. 8. - №. 1. - P. 60-66. - doi: 10.1016/j.mib.2004.12.003

81 Brucella melitensis MucR, an orthologue of Sinorhizobium meliloti MucR, is involved in resistance to oxidative, detergent, and saline stresses and cell envelope modifications /A. Mirabella ,M. Terwagne, M. S. Zygmunt [et al.] // Journal of bacteriology. - 2013. - Т. 195. - №. 3. - P. 453-465.

82 Brucella microti sp. nov., isolated from the common vole Microtus arvalis / H. C. Scholz, Z. Hubalek, I. Sedlacek [et al.] // International journal of systematic and evolutionary microbiology. - 2008. - Т. 58. - №. 2. - P. 375-382.

83 Brucella pathogenesis, genes identified from random large-scale screens /R.M. Delrue, P. Lestrate, A. Tibor [et al.] // FEMS microbiology letters. - 2004. - Т. 231. - №. 1. -P. 1-12. - doi: 10.1016/S0378-1097(03)00963-7 (дата обращения 24.01.2023)

84 Brucella vulpis sp. nov., isolated from mandibular lymph nodes of red foxes (Vulpes vulpes) / H. C. Scholz, S. Revilla-Fernandez, S. A. Dahouk [et al.] // International journal of systematic and evolutionary microbiology. - 2016. - Т. 66. - №. 5. - P. 2090-2098.

85 Brucella ß 1, 2 cyclic glucan is an activator of human and mouse dendritic cells / A. Martirosyan, C. Perez-Gutierrez, R. Banchereau [et al.] // PLoS pathogens. - 2012. - Т. 8. - №. 11. - P. e1002983. - doi: 10.1371/journal.ppat.1002983

86 Buffie C. G., Microbiota-mediated colonization resistance against intestinal pathogens /C.G. Buffie, E.G.Pamer // Nature Reviews Immunology. - 2013. -Т. 13. - №. 11. - P. 790-801.

87 CARD: [сайт]. - 2023. - URL.: https://www.card.mcmaster.ca (дата обращения:18.05.2022)

88 Characterization of betaine aldehyde dehydrogenase (BetB) as an essential virulence factor of Brucella abortus / J.J. Lee, J.H. Kim, D.G. Kim [et al.] // Veterinary microbiology. - 2014. - Т. 168. - №. 1. - P. 131-140. doi: -10.1016/j.vetmic.2013.10.007

89 Characterization of Salmonella Typhimurium isolates from domestically acquired infections in Finland by phage typing, antimicrobial susceptibility testing, PFGE and MLVA /T. Lienemann, A. Kyyhkynen, J. Halkilahti [et al.] //Bmc Microbiology. - 2015. - Т. 15. - №. 1. - P. 1-11.

90 Check&Trace: [сайт]. - 2024. - https://www.checkandtrace.com/technology (дата обращения 18.04.2023)

91 Chicken gut microbiota responses to dietary Bacillus subtilis probiotic in the presence and absence of eimeria infection / F. U. Memon,Y. Yang ,G. Zhang [et al.] // Microorganisms. - 2022. - Т. 10. - №. 8. - P. 1548.

92 Chicken gut microbiota: importance and detection technology / Y. Shang, S. Kumar, B. Oakley, W. K. Kim // Frontiers in veterinary science. - 2018. - Т. 5.

- P. 254. - doi: 10.3389/fvets.2018.00254

93 Chin, R.P. Ornithobacterium rhinotracheale infection. / R.P. Chin, P.C.M/ van Empel, H.M. Hafez //In Diseases of Poultry / Swayne, D.E. - 13th. ed. - NJ, 2013.- pp. 807-858

94 Comparative evaluation of qnrA, qnrB, and qnrS genes in Enterobacteriaceae ciprofloxacin-resistant cases, in swine units and a hospital from Western Romania /A.O. Doma, R. Popescu, M. Mituletu [et al.] //Antibiotics. - 2020. -Т. 9. - №. 10. - P. 698. - doi: 10.3390/antibiotics9100698 (дата обращения: 16.11.2021)

95 Comparative genomic analysis of Brucella abortus vaccine strain 104M reveals a set of candidate genes associated with its virulence attenuation / D. Yu, Y. Hui, X. Zai [et al.] // Virulence. - 2015. - Т. 6. - №. 8. - P. 745-754. - doi: 10.1080/21505594.2015.1038015

96 Comparison of xMAP Salmonella Serotyping Assay With Traditional Serotyping and Discordance Resolution by Whole Genome Sequencing / Y. Luo, C. Huang, J. Ye [et al.] // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology.

- 2020. - Т. 10. - P. 452.

97 Complete genome sequence of Brucella abortus A13334, a new strain isolated from the fetal gastric fluid of dairy cattle / H. Kim, W. Jeong, H.Y. Jeoung [et al.] //Journal of Bacteriology. - 2012. -Vol.194(19). -P.5444. - doi: 10.1128/JB.01124-12.

98 Completion of the genome sequence of Brucella abortus and comparison to the highly similar genomes of Brucella melitensis and Brucella suis /S.M. Halling, B.D. Peterson-Burch, B.J. Bricker [et al.] // Journal of Bacteriology. - 2005. -Т. 187. - №. 8. - P. 2715-2726. - doi: 10.1128/JB.187.8.2715-2726.2005 (дата обращения :30.01.2023)

99 Corner, L. A. Persistence of Brucella abortus strain 19 infection in adult cattle vaccinated with reduced doses / Corner L. A., Alton G. G. // Research in veterinary science. - 1981. - Т. 31. - №. 3. - P. 342-344.

100 Crawford, E. W. The stringent response in Myxococcus xanthus is regulated by SocE and the CsgA C-signaling protein / E.W. Crawford, L.J. Shimkets // Genes & development. - 2000. - Т. 14. - №. 4. -PC. 483-492.

101 CRISPR provides acquired resistance against viruses in prokaryotes / R. Barrangou, C. Fremaux, H. Deveau [et al.] //Science. - 2007. - Т. 315. - №. 5819. - P. 1709-1712.

102 CRISPR typing and subtyping for improved laboratory surveillance of Salmonella infections / L.Fabre, J. Zhang, G. Guigon [et al.] //PloS one. - 2012. - Т. 7. - №. 5. - P. e36995.

103 Deciphering chicken gut microbial dynamics based on high-throughput 16S rRNA metagenomics analyses /M.A. Mohd Shaufi , C.C. Sieo, C.W. Chong [et al.] // Gut pathogens. - 2015. - Т. 7. - P. 1-12.

104 Del Giudice, M. G. A lysozyme-like protein in Brucella abortus is involved in the early stages of intracellular replication / M.G. Del Giudice, J.E. Ugalde, C. Czibener // Infection and immunity. - 2013. - Т. 81. - №. 3. - P. 956-964.

105 DePaola, A. Oligonucleotide probe determination of tetracycline-resistant bacteria isolated from catfish ponds /A. DePaola, W.E. Hill, F.M. Harrell // Molecular and cellular probes. - 1993. - Т. 7. - №. 5. - P. 345-348.

106 Design of a high-throughput real-time PCR system for detection of bovine respiratory and enteric pathogens / N.B. Goecke, B.H. Nielsen, M.B. Petersen, L.E. Larsen // Frontiers in veterinary science. - 2021. - Т. 8. - P. 677993. -doi: 10.3389/fvets.2021.677993 (дата обращения:16.06.2022)

107 Development and application of DNA probes and PCR tests for Haemophilus paragallinarum /X. Chen, J.K. Miflin, P. Zhang [et al.] //Avian diseases. - 1996. - P. 398-407.

108 Development and validation of a new TaqMan real-time PCR for the detection of Ornithobacterium rhinotracheale / A. Hashish, A. Sinha, Y. Sato [et al.] // Microorganisms. - 2022. - Т. 10. - №. 2. - P. 341. -doi:10.3390/microorganisms10020341 (дата обращения: 17.10.2023)

109 Development of a custom 16S rRNA gene library for the identification and molecular subtyping of Salmonella enterica / R.S. Hellberg, C.J. Haney, Y. Shen [et al.] // Journal of microbiological methods. - 2012. - Т. 91. - №. 3. -P. 448-458.

110 Development of a molecular platform for GMO detection in food and feed on the basis of "combinatory qPCR" technology / S. Broeders, N.Papazova, M. Van den Bulcke [et. al] // Polymerase chain reaction. - 2012. - Т. 1. - P. 363404.

111 Development of a multiplex real-time PCR assay using two thermocycling platforms for detection of major bacterial pathogens associated with bovine respiratory disease complex from clinical samples / J. D. Loy, L. Leger, A.M. Workman [et al.] // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. - 2018. - Т. 30. - №. 6. - P. 837-847. - doi: 10.1177/1040638718800170

112 Development of a rapid detection method for real-time fluorescent quantitative PCR of Salmonella spp. and Salmonella Enteritidis in ready-to-eat fruits and vegetables / J. Wan, L. Zheng, L. Konget al. // Lwt. - 2021. - Т. 149. - P. 111837.

113 Diasorin: [сайт]. - URL: https://www.luminexcorp.com/salmonella-serotyping-assay/#overview (дата обращения 20.09.2022).

114 Dietary supplementation with Piper sarmentosum extract on gut health of chickens infected with Eimeria tenella /F. U. Memon, Y. Yang, A. M. Soliman [et al.] // Tropical Animal Health and Production. - 2021. - Т. 53. - P. 1-10.

115 Dietary vitamin K is remodeled by gut microbiota and influences community composition /J.L. Ellis, J.P. Karl, A.M. Oliverio [et al.] // Gut Microbes. - 2021. - Т. 13. - №. 1. - P. 1887721.

116 Differences in caecal microbiota composition and Salmonella carriage between experimentally infected inbred lines of chickens / A.Cazals, J. Estelle, N. Bruneau [et al.] // Genetics Selection Evolution. - 2022. - Т. 54. - №2. 1. - P. 7.

117 Digital PCR as an effective tool for GMO quantification in complex matrices / A.B.Kosir, T. Demsar, D. Stebih [et al.] //Food Chemistry. - 2019. - Т. 294. -P. 73-78.

118 Diseases of poultry / Editorial Board for the American Association of Avian Pathologists ;editor-in-chief, Y.M. Saif, associate editors, A.M. Fadly ... [et al.].—12th ed.- Ames, Blackwell Publishing Professional - 2009. - 1409p.

119 DNA polymorphism in strains of the genus Brucella / A. Allardet-Servent, G. Bourg, M. Ramuz, [et al.] // J. of bacteriology. - 1988. - Vol. 170 (10). - P. 4603-7.

120 Dowling, P.M. Aminoglycosides // Antimicrobial Therapy in Veterinary Medicine / In: Giguere S, Prescott JF, Baggot JF et al., eds. Ames, USA: Blackwell Publishing, 2006.- P. 207-229.

121 Ecological modelling approaches for predicting emergent properties in microbial communities / N. I. van den Berg, D. Machado, S. Santos [et al.] //Nature ecology & evolution. - 2022. - T. 6. - №. 7. - P. 855-865.

122 Effect of experimental Ornithobacterium rhinotracheale infection along with live infectious bronchitis vaccination in broiler chickens /H.F. Ellakany, A.R. Elbestawy, H.S. Abd-Elhamid [et al.] //Poultry science. - 2019. - T. 98. - №. 1. - P. 105-111.

123 Effectiveness of tests to detect the presence of SARS-CoV-2 virus, and antibodies to SARS-CoV-2, to inform COVID-19 diagnosis: a rapid systematic review / D. Jarrom, L. Elston, J. Washington [et al.] // BMJ evidence-based medicine. - 2022. - T. 27. - №. 1. - P. 33-45.

124 Effects of antibiotics on gut microbiota / K. Lange, M. Buerger, A. Stallmach, T. Bruns // Digestive Diseases. - 2016. - T. 34. - №. 3. - P. 260-268. - doi: 10.1159/000443360

125 Enterococci, from harmless bacteria to a pathogen / S. Ramos, V. Silva, M. D. L. E. Dapkevicius [et al.] / /Microorganisms. - 2020. - T. 8. - №. 8. - P. 1118.

126 EUCAST: [сайт]. - 2025. - URL : https://www.eucast.org/clinical_breakpoints (дата обращения: 22.09.2021)

127 EUCAST: [сайт]. - 2025. - URL : https://mic.eucast.org/ (дата обращения: 22.09.2021)

128 Evaluation of recombinant 28 kDa outer membrane protein of Brucella abortus for the clinical diagnosis of bovine brucellosis in Korea /J.J. Lim, D.H. Kim, J.J. Lee [et al.] // Journal of Veterinary Medical Science. - 2012. - Т. 74. - №2. 6. - P. 687-691. - doi: 10.1292/jvms.11-0512

129 Evaluation of the immunogenicity and safety of Brucella melitensis B115 vaccination in pregnant sheep / M. Perez-Sancho, R. Adone, T. García-Seco, M. Tarantino, A. Diez-Guerrier, R. Drumo et al. // Vaccine. - 2014. - Vol. 32. - P. 1877-1881.

130 Feil E. Small change: keeping pace with microevolution / E. Feil // Nature Reviews Microbiology. - 2004. - Vol. 2 (6). - P. 483-495.

131 Gardner S. N., kSNP3. 0: SNP detection and phylogenetic analysis of genomes without genome alignment or reference genome / S.N. Gardner, T. Slezak, B.G. Hall // Bioinformatics. - 2015. - Т. 31. - №. 17. - P. 2877-2878

132 Genetic diversity of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from chickens and turkeys in the United States / M. Nisar, S. Thieme, H. M. Hafez [et al.] //Avian diseases. - 2020. - Т. 64. - №. 3. - P. 324-329.

133 Genetic stability of Brucella abortus isolates from an outbreak by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis (MLVA16) / E.M. Dorneles, J.A. Santana, T.M. Alves [et al.] // BMC Microbiol. - 2014. - Vol. 14. - P. 186. -doi: 10.1186/1471-2180-14-186. (дата обращения: 26.01.2023)

134 Genome sequence of Brucella abortus vaccine strain S19 compared to virulent strains yields candidate virulence genes / O.R.Crasta, O. Folkerts, Z. Fei [et al.] // PLoS One. - 2008. - Т. 3. - №. 5. - P. e2193.

135 GooglePatents: [поисковый ресурс]. - URL: https://patents.google.com/patent/RU2149184C1/ru?oq=RU+2149184+C1 (дата обращения 20.11.2022).

136 Grissa, I. The CRISPRdb database and tools to display CRISPRs and to generate dictionaries of spacers and repeats /I. Grissa, G. Vergnaud, C. Pourcel //BMC bioinformatics. - 2007. - Т. 8. - P. 1-10.

137 Hollenbeck, B. L. Intrinsic and acquired resistance mechanisms in enterococcus / B.L. Hollenbeck, L.B. Rice // Virulence. - 2012. - Т. 3. - №. 5. - P. 421-569.

138 Identification and analysis of integrons and cassette arrays in bacterial genomes / J.Cury, T.Jove, M. Touchon [et al.] //Nucleic acids research. - 2016. - Т. 44.

- №. 10. - P. 4539-4550.

139 Identification of acquired antimicrobial resistance genes / E. Zankari, H. Hasman, S. Cosentino [et al.] // Journal of antimicrobial chemotherapy. - 2012.

- Т. 67. - №. 11. - P. 2640-2644.

140 Identification of an IS 711 element interrupting the wboA gene of Brucella abortus vaccine strain RB51 and a PCR assay to distinguish strain RB51 from other Brucella species and strains / R. Vemulapalli, J. R. McQuiston, G. G. Schurig [et al.] // Clinical diagnostic laboratory immunology. - 1999. - Т. 6. -№. 5. - P. 760-764.

141 Identification of genes that are associated with DNA repeats in prokaryotes / R. Jansen, J.D.V. Embden, W. Gaastra, L. M. Schouls // Molecular microbiology.

- 2002. - Т. 43. - №. 6. - P. 1565-1575.

142 Immunomodulatory and ameliorative effects of probiotic in combination with diclazuril on broilers under coccidia infection / F. U. Memon, I. H. Leghari, N. Rajput [et al.] // Journal of Applied Microbiology. - 2022. - Т. 132. - №. 4. -P. 3181-3188.

143 Impact of enrofloxacin on the human intestinal microbiota revealed by comparative molecular analysis /B.S. Kim, J.N. Kim, S.H. Yoon [et al.] //Anaerobe. - 2012. - Т. 18. - №. 3. - P. 310-320.

144 In silico analysis to develop PCR assays for identification of bacterial pathogens in animals: what can we improve? / A. Bogomazova, E. Krylova, I. Soltynskaya [et al.] // Frontiers in Veterinary Science. - 2023. - Vol. 10. - P. 1235837. -doi 10.3389/fvets.2023.1235837.

145 Intraspecies biodiversity of the genetically homologous species Brucella microti / Al S. Dahouk, E. Hofer, H. Tomaso [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 2012. - Vol. 78. - P. 1534-1543.

146 Janda, J. M. 16S rRNA gene sequencing for bacterial identification in the diagnostic laboratory: pluses, perils, and pitfalls / J.M. Janda, S.L. Abbott // Journal of clinical microbiology. - 2007. - Т. 45. - №. 9. - P. 2761-2764.

147 Jose, J. Comparison of regulatory framework of clinical trial with genetically modified organism-containing vaccines in the Europe, Australia, and Switzerland / J. Jose, S. Pai / /Clinical and Experimental Vaccine Research. -2021. - Т. 10. - №. 2. - P. 93.

148 JRC: [сайт]. - URL https://gmo-crl.jrc.ec.europa.eu/summaries/MON89788_val_report.pdf (дата обращения: 10.07.2019)

149 Kumar A., Studies on absolute requirement of NAD and reduced oxygen tension for growth of field isolates of Avibacterium paragallinarum of poultry origin /A. Kumar, M. Rawat, R. Verma // Indian Journal of Poultry Science. -2012. - Т. 47. - №. 1. - P. 90-92.

150 Kursa O., Occurrence of in Polish turkey flocks /O. Kursa, G. Tomczyk, A. Sawicka-Durkalec //Journal of Veterinary Research. - 2022. - Т. 66. - №. 1. -P. 77-84. - doi: 10.2478/jvetres-2022-0014 (дата обращения:25.10.2023)

151 Letunic, I. Interactive Tree Of Life (iTOL) v5: an online tool for phylogenetic tree display and annotation /I. Letunic, P. Bork //Nucleic acids research. - 2021.

- Т. 49. - №. W1. - P. W293-W296.

152 Levels of Firmicutes, Actinobacteria Phyla and Lactobacillaceae Family on the Skin Surface of Broiler Chickens (Ross 308) Depending on the Nutritional Supplement and the Housing Conditions /M. Michalak ,K. Wojnarowski ,S. Skowera [et al.] // Agriculture. - 2021. - P. 3-13

153 Long, C. X. Intestinal microbiota disturbance affects the occurrence of African swine fever / C.X. Long, J.Q. Wu, Z.J. Tan // Animal Biotechnology. - 2023. -Т. 34. - №. 4. - P. 1040-1049. - doi: 10.1080/10495398.2021.2010089

154 Loss of the capsule increases the adherence activity but decreases the virulence of Avibacterium paragallinarum / T. Y. Tu, M. K. Hsieh, D. H. Tan [et al.] // Avian Diseases. - 2015. - Т. 59. - №. 1. - С. 87-93.

155 Love, M. I. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 /M.I. Love, W. Huber, S.Anders //Genome biology. - 2014.

- Т. 15. - P. 1-21. - doi.org/10.1186/s13059-014-0550-8

156 Madden, T. The BLAST sequence analysis tool //The NCBI handbook. - 2013.

- Т. 2. - №. 5. - С. 425-436.

157 Mancilla, M. Smooth to rough dissociation in Brucella: the missing link to virulence / M. Mancilla // Frontiers in cellular and infection microbiology. -2016. - Т. 5. - P. 98. - doi: 10.3389/fcimb.2015.00098

158 Manoj, J. A Review on the Role of Poultry in Food Borne Salmonellosis and Its Public Health Importance / J. Manoj, M. K. Singh // Research Aspects in Agriculture and Veterinary Science - 2021. Vol. 1, P.26-33. doi.org/10.9734/bpi/raavs/v1/2683F

159 Marti, J. M. Not just BLAST nt: WGS database joins the party /J.M. Marti, C.P. Garay // BioRxiv. - 2019. - P. 653592. - doi: 10.1101/653592

160 Martin, R. Regional economic resilience, hysteresis and recessionary shocks / R. Martin // Journal of economic geography. - 2012. - Т. 12. - №2. 1. - С. 1-32. - doi: 10.1093/jeg/lbr019

161 Martirosyan, A. An evolutionary strategy for a stealthy intracellular Brucella pathogen /A. Martirosyan, E. Moreno, J.P. Gorvel // Immunological reviews. -2011. - Т. 240. - №. 1. -PC. 211-234. - doi: 10.1111/j.1600-065X.2010.00982.x

162 Metabolomics: towards understanding host-microbe interactions / J. Han, L.C.M.Antunes, B.B. Finlay,C.H. Borchers // Future microbiology. - 2010. -Т. 5. - №. 2. - P. 153-161. - doi:10.2217/fmb.09.132. (дата обращения: 07.09.2023)

163 Metagenome analysis using the Kraken software suite /J. Lu, N. Rincon, D.E. Wood [et al.] //Nature protocols. - 2022. - Т. 17. - №. 12. - P. 2815-2839.

164 Metagenomic analysis reveals the microbiome and resistome in migratory birds / J.Cao, Y. Hu, F. Liu et al. // Microbiome. - 2020. - Т. 8. - P. 1-18.

165 Method for culturing Candidatus Ornithobacterium hominis /H.C. Smith-Vaughan, A. Chang, K.A. Lawrence [et al.] //Journal of Microbiological Methods. - 2019.- T. 159.-P.157-160. - doi: 10.1016/j.mimet.2019.03.006

166 Methods for the detection and identification of pathogenic bacteria: past, present, and future / L. Varadi, J. L. Luo, D. E. Hibbs [et al.] // Chemical Society Reviews. - 2017. - T. 46. - №. 16. -P. 4818-4832.

167 Microbial diversity and community variation in the intestines of layer chickens / S. S. Xiao, J. D. Mi, L. Mei [et al.] // Animals. - 2021. - T. 11. - №. 3. - P. 840.

168 Microbiological Effectivity Evaluation of New Poultry Farming Organic Waste Recycling / E. Gorliczay, I. Boczonadi, N. É. Kiss [et al.] // Agriculture- 2021.

- T. 11. - №. 7.- P.41-61 doi.org/10.3390/ agriculture11070683

169 Miller, W. R. Mechanisms of antibiotic resistance in enterococci / W. R. Mille, J. M. Munita , C. A. Arias // Expert review of anti-infective therapy. - 2014. -T. 12. - №. 10. - P. 1221-1236.

170 Mohamed, E. S. Current status of multidrug resistance of Ornithobacterium rhinotracheale from avian host / E. S. Mohamed, A. M. Hamouda, M. I. E. Enbaawy // International Journal of Veterinary Science . - 2022. - T.11. - P. 539-543. - doi.org/10.47278/journal.ijvs/2021.127

171 Moya, A. Functional redundancy-induced stability of gut microbiota subjected to disturbance / A. Moya, M. Ferrer // Trends in microbiology. - 2016. - T. 24.

- №. 5. -P. 402-413.

172 Multilocus sequence typing of total-genome-sequenced bacteria / M.V. Larsen, S. Cosentino, S. Rasmussen [et al.] //Journal of clinical microbiology. - 2012.

- T. 50. - №. 4. - P. 1355-1361.

173 Mushegian, A. R. A minimal gene set for cellular life derived by comparison of complete bacterial genomes / A. R. Mushegian, E. V. Koonin // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1996. - Т. 93. - №. 19. - С. 10268-10273.

174 Muzzi, A. The pan-genome: towards a knowledge-based discovery of novel targets for vaccines and antibacterials / A. Muzzi, V. Masignani, R. Rappuoli // Drug discovery today. - 2007. - Vol. 12 (11). - P. 429-439.

175 Naive Bayesian classifier for rapid assignment of rRNA sequences into the new bacterial taxonomy / Q. Wang, G. M. Garrity, J. M. Tiedje, J. R. Cole //Applied and environmental microbiology. - 2007. - Т. 73. - №. 16. - P. 5261-5267.

176 National antimicrobial resistance monitoring system: two decades of advancing public health through integrated surveillance of antimicrobial resistance / B.E. Karp, H.Tate, J.R. Plumbee et al. // Foodborne pathogens and disease. - 2017. - Т. 14. - №. 10. - P. 545-557.

177 NCBI: [сайт]. - URL : https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pathogens (дата обращения 18.04.2023)

178 NCBI: [сайт]. - URL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK190427/ (дата обращения:05.08.2019)

179 NCTC: [сайт]. - URL https://www.ukbrcn.org/who-we-are/national-collection-of-type-cultures-nctc/ (дата обращения 18.03.2023)

180 Numee, S. Detection and typing of Ornithobacterium rhinotracheale from German poultry flocks / S. Numee, R. Hauck, H. M. Hafez // Avian Diseases. -2012. - Т. 56. - №. 4. -P. 654-658.

181 Nurmi, E. New aspects of Salmonella infection in broiler production / E. Nurmi, M. Rantala // Nature. - 1973. - Т. 241. - №. 5386. - P. 210-211.

182 Oligo Analysis Tool: [сайт]- URL: https://eurofinsgenomics.eu/en/ecom/tools/oligo-analysis.aspx (дата обращения 01.12.2021)

183 Optimization of culturomics strategy in human fecal samples /Y. Chang, F. Hou, Z. Pan [et al.] //Frontiers in microbiology. - 2019. - Т. 10. - P. 2891.

184 Ornithobacterium rhinotracheale: An update review about an emerging poultry pathogen / E.V. Barbosa, C.V. Cardoso, R.d.C.F. Silva [et al.] // Veterinary sciences. - 2019. - Т. 7. - №. 1. - P. 3.

185 Palmer, K. L. Horizontal gene transfer and the genomics of enterococcal antibiotic resistance / K. L. Palmer, V. N. Kos, M. S. Gilmore // Current opinion in microbiology. - 2010. - Т. 13. - №. 5. - P. 632-639.

186 Pathogenic and non-pathogenic factors; especially infectious bursal disease viruses; affect chicken digestive system microbiota and methods of its evaluation and recovery: a review /M. I. Mosa, H. M. Salem , M. A. Bastamy, M. M.Amer [et al.] // Egyptian Journal of Veterinary Sciences. - 2023. - Т. 54. - №. 4. - P. 733-760.

187 PCR Primer Stats [сайт]. - URL:

http: //www.bioinformatics. org/sms2/pcr_primer_stats. html (дата обращения 01.12.2021)

188 Phenotypic and genotypic characterization of Brucella strains isolated from autochthonous livestock reveals the dominance of B. abortus biovar 3a in Nigeria / W. J. Bertu, M. J. Ducrotoy, P. M. Muñoz [et al.] //Veterinary Microbiology. - 2015. - Т. 180. - №. 1-2. - P. 103-108.

189 Phylogenetic relationship of Ornithobacterium rhinotracheale isolated from poultry and diverse avian hosts based on 16S rRNA and rpoB gene analyses / I. M.B. Veiga, D. Luschow, S. Gutzer [et al.] //BMC microbiology. - 2019. - Т. 19. - P. 1-7.

190 Pourabedin, M. Prebiotics and gut microbiota in chickens / M. Pourabedin, X. Zhao // FEMS microbiology letters. - 2015. - Т. 362. - №. 15. - P. fnv122. -doi: 10.1093/femsle/fnv122

191 ppGpp conjures bacterial virulence /Z.D. Dalebroux, S.L. Svensson, E.C. Gaynor, M.S Swanson // Microbiology and Molecular Biology Reviews. -2010. - Т. 74. - №. 2. - P. 171-199. - doi: 10.1128/MMBR.00046-09

192 Primer-BLAST: a tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction / J. Ye, G. Coulouris, I. Cutcutache [et al.] // BMC bioinformatics. -2012. - Т. 13. - P. 1-11.

193 PrimerQuest™ Tool: [сайт]. - 2024. - URL: https://eu.idtdna.com/Primerquest/Home/Index (дата обращения 20.09.2022).

194 QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data / J. G. Caporaso, J. Kuczynski, J. Stombaugh [et al.] // Nature methods. - 2010. - Т. 7. - №. 5. - P. 335-336.

195 Rapid and sensitive detection of Avibacterium paragallinarum in the presence of other bacteria using a 5' Taq nuclease assay: a new tool for diagnosing infectious coryza / B. G. Corney, I.S. Diallo,L. Wright [et al.] // Avian Pathology. - 2008. - Т. 37. - №. 6. - P. 599-604.

196 Rapid whole-genome sequencing for detection and characterization of microorganisms directly from clinical samples / H. Hasman, D. Saputra, T. Sicheritz-Ponten [et al.] //Journal of clinical microbiology. - 2014. - T. 52. -№. 1. - P. 139-146.

197 RASTtk: a modular and extensible implementation of the RAST algorithm for building custom annotation pipelines and annotating batches of genomes / T. Brettin J.J. Davis, T. Disz [et al.] // Scientific reports. - 2015. - T. 5. -P. 8365.

198 Reference sequence (RefSeq) database at NCBI: current status, taxonomic expansion, and functional annotation / N. A. O'Leary, M. W. Wright, J. R. Brister [et al.] // Nucleic acids research. - 2016. - T. 44. - №. D1. - P. D733-D745.

199 Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 / E. Bolyen, J.R. Rideout, M.R. Dillon [et. al.] //Nature biotechnology. - 2019. - T. 37. - №. 8. - P. 852-857.

200 Research Note: Serological investigation of Ornithobacterium rhinotracheale infection in China / J. Xue, C. Lv, P. He et al. // Poultry science. - 2020. - T. 99. - №. 10. - P. 4814-4817.

201 Salmonellosis: An Overview of Epidemiology, Pathogenesis, and Innovative Approaches to Mitigate the Antimicrobial Resistant Infections /B. Lamichhane, A.M. Mawad, M. Saleh [et al.] // Antibiotics. - 2024. - T. 13. - №. 1. - P. 76. - doi: 10.3390/antibiotics 13010076

202 Sangari, F. J. The genes for erythritol catabolism are organized as an inducible operon in Brucella abortus / F. J. Sangari, J. Agüero, J. M. Garcia-Lobo // Microbiology. - 2000. - T. 146. - №. 2. -P. 487-495.

203 Selection of Avibacterium paragallinarum Page serovar B strains for an infectious coryza vaccine / H. Sun, S. Xie, X. Li [et al.] // Veterinary immunology and immunopathology. - 2018. - T. 199. - P. 77-80.

204 Seleem, M. N. Brucellosis: a re-emerging zoonosis / M. N. Seleem, S. M. Boyle, N. Sriranganathan //Veterinary microbiology. - 2010. - T. 140. - №. 3-4. - P. 392-398.

205 Shumilov, K. V. Designing vaccines against cattle brucellosis / K. V. Shumilov, O. Sklyarov, A. Klimanov //Vaccine. - 2010. - T. 28. - P. F31-F34. - doi: 10.1016/j.vaccine.2010.03.049

206 Sievers, F. Clustal omega / F. Sievers, D. G. Higgins // Current protocols in bioinformatics. - 2014. - T. 48. - №. 1. - P. 3-13. -doi:/10.1002/0471250953.bi0313s48

207 Stringent response regulation of biofilm formation in Vibrio cholerae / H. He, J.N. Cooper, A. Mishra, D.M. Raskin // Journal of bacteriology. - 2012. - T. 194. - №. 11. - P. 2962-2972. - doi: 10.1128/JB.00014-12

208 Subtyping of Canadian isolates of Salmonella enteritidis using multiple locus variable number tandem repeat analysis (MLVA) alone and in combination with pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and phage typing / K. Ziebell, L. Chui, R. King [et al.] // Journal of microbiological methods. - 2017. - T. 139. - P. 2936.

209 Sugar metabolism by Brucellae / R. C. Essenberg, R. Seshadri, K. Nelson, I. Paulsen // Veterinary microbiology. - 2002. - T. 90. - №. 1-4. - P. 249-261.

210 Suggested guidelines for validation of real-time PCR assays in veterinary diagnostic laboratories / K. Toohey-Kurth, M. M. Reising, R. L. Tallmadge [et

al.] // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. - 2020. - T. 32. - №. 6. -C. 802-814. - doi: 10.1177/104063872096082

211 Taxonomy of the genus Brucella / J. M. Verger, F.Grimont, P. A. D. Grimont, M. Grayon // Annales de l'Institut Pasteur-Microbiologiey. - 1987, - Vol. 138.

- № 2, P. 235-238. - 1987. - doi:10.1016/0769-2609(87)90199-2

212 The Brucella abortus phosphoglycerate kinase mutant is highly attenuated and induces protection superior to that of vaccine strain 19 in immunocompromised and immunocompetent mice / C. G. Trant, T. L. Lacerda, N. B. Carvalho [et al.] // Infection and immunity. - 2010. - T. 78. - №. 5. - P. 2283-2291.

213 The Brucella abortus vaccine strain B19 carries a deletion in the erythritol catabolic genes / F. J. Sangari, J. M. García-Lobo, J. Agüero // FEMS Microbiology Letters. - 1994. - T. 121. - №. 3. - P. 337-342. - doi: 10.1111/j.1574-6968.1994.tb07123.x

214 The Brucella suis genome reveals fundamental similarities between animal and plant pathogens and symbionts / I. T. Paulsen, R. Seshadri, K. E. Nelson [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2002. - T. 99. - №. 20.

- P. 13148-13153.

215 The BtaF trimeric autotransporter of Brucella suis is involved in attachment to various surfaces, resistance to serum and virulence / V. Ruiz-Ranwez, D. M. Posadas, S. M. Estein [et al.] // PLoS One. - 2013. - T. 8. - №. 11. - P. e79770.

216 The first isolation and detection of Ornithobacterium rhinotracheale from swollen head syndrome-infected broiler flocks in Iraq. /B.A. Al-Hasan, A.O. Alhatami, H.M. Abdulwahab et. al. // Veterinary world. - 2021. - T. 14. - №. 9. - P. 2346.

217 The genome sequence of the facultative intracellular pathogen Brucella melitensis / V. G. DelVecchio, V. Kapatral, R. J. Redkar [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2002. - Т. 99. - №. 1. - P. 443-448.

218 The genome sequence of the facultative intracellular pathogen Brucella melitensis /V.G. DelVecchio, V.Kapatral, R.J. Redkar [et al.] //Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2002. - Т. 99. - №. 1. - P. 443-448. - doi: 10.1073/pnas.22157539 (дата обращения:28.12.2022)

219 The microbial community of the respiratory tract of commercial chickens and turkeys / O. Kursa, G. Tomczyk, K. Adamska [et al.] //Microorganisms. - 2022. - Т. 10. - №. 5. - P. 987.

220 The microbiome of the chicken gastrointestinal tract / C. J. Yeoman, N. Chia, P. Jeraldo et al. // Animal health research reviews. - 2012. - Т. 13. - №. 1. - P. 89-99. - doi: 10.1017/S1466252312000138

221 The poultry-associated microbiome: network analysis and farm-to-fork characterizations / B. B. Oakley, C. A. Morales, J. Line [et al.] //PloS one. -2013. - Т. 8. - №. 2. - P. e57190.

222 The R&D landscape for infectious disease vaccines / J. Yue, Y. Liu, M. Zhao et al. // infection. - 2023. - Т. 37. - №. 3. - P. 40. - doi:10.1038/d41573-023-00119-4

223 The role of the intestinal microbiota in the health and disease of dogs and its importance in the agricultural sector / M. D. L. S. Mazamba, D. M. Cushicondor-Collaguazo, S. G. Parra-Guayasamin, R. D.Coello-Peralta // Centrosur Agraria. - 2023. - Т. 1. - №. 18.- P.99-109

224 Touchon, M. The small, slow and specialized CRISPR and anti-CRISPR of Escherichia and Salmonella / M. Touchon, E. P. C. Rocha // PloS one. - 2010.

- T. 5. - №. 6. - P. e11126.

225 Turse, J. E. Lipopolysaccharide-deficient Brucella variants arise spontaneously during infection / J. E. Turse, J. Pei, T. A. Ficht // Frontiers in microbiology. -2011. - T. 2. - P. 54.

226 Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit / K. Okonechnikov, O. Golosova, M. Fursov, Ugene Team // Bioinformatics. - 2012. - T. 28. - №. 8.

- P. 1166-1167.

227 Unlocking the gut-heart axis: exploring the role of gut microbiota in cardiovascular health and disease / S. Shariff, A. K. S. Huey, N. P. Soni [et al.] //Annals of Medicine and Surgery. - 2024. - T. 86. - №. 5. - P. 2752-2758.

228 Vaccination of one-day-old broiler chicks against infectious coryza / M.D. Conde, Y.D. Huberman, A.M. Espinoza [et. al.] // Avian Diseases. - 2011. - T. 55. - №. 1. - P. 119-122.

229 Validation of a real-time PCR assay for high-throughput detection of Avibacterium paragallinarum in chicken respiratory sites / K. A. Clothier, S. Stoute, A. Torain, B. Crossley // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation.

- 2019. - T. 31. - №. 5. - P. 714-718.

230 VFDB 2019: a comparative pathogenomic platform with an interactive web interface /B. Liu, D. Zheng, Q. Jin [et al.] // Nucleic acids research. - 2019. -T. 47. - №. D1. - P. D687-D692.

231 Virulence factors, intracellular survivability and mechanism of evasion from host immune response by Brucella: an overview / A. Gopalakrishnan,U. Dimri, M. Saminathan [et al.] // J Anim Plant Sci. - 2016. - T. 12. - P. 26.

232 Wattiau, P. Methodologies for Salmonella enterica subsp. enterica subtyping: gold standards and alternatives / P. Wattiau, C. Boland, S. Bertrand //Applied and environmental microbiology. - 2011. - Т. 77. - №. 22. - P. 7877-7885.

233 Wei, S. Bacterial census of poultry intestinal microbiome / S. Wei, M. Morrison, Z. Yu // Poultry science. - 2013. - Т. 92. - №. 3. - P. 671-683.

234 WFCC: [сайт]. - 2023. - URL : https://wfcc.info/membership/memberlist (дата обращения 15.07.2024)

235 WHO: [сайт]. - 2020. - URL: https://iris.who.int/handle/10665/40202 (дата обращения: 22.12.2023)

236 WIPO: [сайт]. - 2023. - URL :

https : //www.wipo .int/wipolex/ru/treaties/textdetails/19806 (дата обращения 08.04.2022)

237 WIPO: [сайт]. - 2024. - URL : http://www.wipo.int/treaties/en/ShowResults.jsp?lang=en&treaty_id=7 (дата обращения 08.04.2022)

238 WIPO: [сайт]. - 2024. - URL :

https://www.wipo .int/treaties/ru/registration/budapest/ (дата обращения 28.06.2024)

239 WOAH: [сайт]. - 2017. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/255747/9789241512411-eng.pdf (дата обращения 15.02.2023)

240 WOAH: [сайт]. - 2021. - URL: https://www.woah.org/app/uploads/2021/06/a-oie-list-antimicrobials-june2021.pdf. (дата обращения 06.03.2024)

241 WOAH: [сайт]. - 2024. - URL: https://www.woah.org/en/produit/technical-standards-for-manufacturing-and-quality-control-of-veterinary-vaccines/ (дата обращения 01.07.2024)

242 WOAH: [сайт]. - 2024. - URL: https://www.woah.org/app/uploads/2021/06/amended-91gs-tech-03-amr-working-group-report-en.pdf (дата обращения 10.09.2024)

243 WOAH: [сайт]. - URL : https://rr-europe.woah.org/app/uploads/2020/08/oie-terrestrial-code-1_2019_en.pdf (дата обращения:20.08.2022)

244 WOAH: [сайт]. - URL : https://www.woah.org/app/uploads/2021/05/a-fifth-annual-report-amr.pdf (дата обращения: 20.07.2022)

245 WOAH: [сайт]. - URL: https://www.woah.org/en/produit/technical-standards-for-manufacturing-and-quality-control-of-veterinary-vaccines/ (дата обращения: 08.06.2022)

246 WOAH: [сайт]. - URL:

https: //www.woah. org/fileadmin/Home/eng/Health_standards/aahm/current/G UIDELINE_3.6.3_NAD_ASSAYS.pdf (дата обращения:17.08.2022)

247 WOAH: [сайт]. - URL:

https: //www.woah. org/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/3.03.06_AV IAN_TB.pdf (дата обращения:13.08.2022)

248 WOAH: [сайт]. - URL:

https://www.woah. org/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/3.03.09_F0 WL_CHOLERA.pdf (дата обращения: 14.08.2022)

249 WOAH: [сайт]. - URL:

https: //www.woah. org/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/3.03.01 _AV IAN_CHLAMYD.pdf (дата обращения: 15.08.2022)

250 WOAH: [сайт]. - URL:

https://www.woah. org/fileadmin/Home/fr/Health_standards/tahm/3.03.05_AV IAN_MYCO.pdf (дата обращения: 12.08.2022)

251 Wu, J. (p) ppGpp and drug resistance / J. Wu, Q. Long, J. Xie // Journal of cellular physiology. - 2010. - Т. 224. - №. 2. - P. 300-304.

252 Yeast mannan rich fraction positively influences microbiome uniformity, productivity associated taxa, and lay performance / R.J. Leigh, A. Corrigan, R.A. Murphy [et al.] // Animal Microbiome. - 2024. - Т. 6. - №. 1. - P. 9. -doi: 10.1186/s42523-024-00295-7

ПРИЛОЖЕНИЯ

РОССЕЛЬХОЗНАДЗОР

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВСЕРОССИЙС КИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ (ФГБУ «В1 НКИ»)

«04» сснтнбри 2023 г. .У» 843М

г. Москва

СПРАВКА О ДЕПОНИРОВАНИИ

«Всероссийская государственная коллекция штаммов микроорганизмов, используемых в ветерипарии и животноводстве» ФГБУ «ВГНКИ» приняла на хранение но форме «патентное депонирование» штамм:

Название штамм»: Enterococcus spp. Н-М 16 (VGNKI-00221)

Авторы: Малик Е.В.. Самохвалова U.C., Гергель МЛ., Прасолова О.В.

Таксономии, описание штамма: семейство Enterococcaceae, род Enterococcus, вид Enterococcus spp. Выделен из образцов, полученных на животноводческом предприятии, Нарьян-Мар. Источник получения: Теленок Rangifcr tarandus, фекалии из прямой кишки.

Дата депонирования: 21.12.2019 г. Депозитор: ФГБУ «ВГНКИ»

Назначение ш гамма: референтный, в том числе диагностический

Регистрационный номер: ВКИТМ-Б-843М

Место хранения культура л ыюго штамма: ФГБУ «ВГНКИ»

Заместитель директора

/

/ /

РОССЕЛЬХОЗНАДЗОР

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВСЕРОССИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ (ФГБУ «ВГНКИ»)

«_j» и юла 2021г. .V,

«Всероссийская государственная коллекция штаммов микроорганизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве» ФГБУ «ВГНКИ» приняла на хранение по форме «гарантийное хранением штамм:

Нашание штамма: Escherichia coli (VGNKJ-005I I)

Авторы: O.B. 1 [расолова, M.K. Пирожков, H.A. Кирсанова, М.Л. Гергель Таксономия, описание штамма: семейство Enterobacteriaceae, род Escherichia, вид Escherichia coli. Источник получения: крупный рогатый скот, фекалии.

Дата депонирования: 09.06.2021г.

Депозитор: ФГБУ «ВГНКИ»

Назначение штамма: референтный, в том числе диагностический

Регистрационный номер: ВКШМ-Б-893М

Место хранении ку.тьтура.тмюго штамма: ФГБУ «ВГНКИ»

г. Москва

СПРАВКА О ДЕПОНИРОВАНИИ

Men- Миксмко А.А

Тел $ (499) W | -01 -51 вн.637

РОССЕЛЬХОЗНАДЗОР

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВСЕРОССИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ (ФГБУ «ВГНКИ»)

« » июля 2021 г. № -'' 'ty/

«Всероссийская государственная коллекция штаммов микроор1анизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве» ФГБУ «ВГНКИ» приняла на хранение но форме «гарантникое хранение» пггамм:

Название штамма: Escherichia coli (VGNK1-00513)

Авторы: С.Ю. Карабанов. О.В. Прасолова, Д.А. Макаров, А.В. Иутинцева Таксономия, описание штамма: семейство Enterobacteriaceae, род Escherichia. вид Escherichia coli Источник получения: крупный рогатый скот, смыв из влагалища.

Дата депонирования: 09.06.2021г.

Депозитор: ФГБУ «ВГНКИ»

Назначение штамма: референтный, в том числе диагностический

Регистрационный номер: ВКШМ-Б-894М

Место хранения культура.ibiiui о штамма: ФГБУ «ВГНКИ»

г, Мискви

CI ! РАВКА О ДЕПОН ИРОВАН И И

UK

■ '.V5r

M.A. Гергель

Иеп. Иваненко А. А. Te.i8(4W)<WI-0l-JI »н 637

РОССЕЛЬХОЗНАДЮР

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВСЕРОССИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ (ФГБУ «ВГНКИ»)

«___» июля 2021 г. Si- " "'

«Всероссийская государственная коллекция штаммов микроорганизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве» ФГБУ «ВГНКИ» приняла на хранение по форме «г арантийное хранение» штамм:

Название штамма: Salmonella Bredeney (VGNK.I-02105)

Авторы: O.B. Прасолова, O.E. Иванова. Л.К. Киш, C.B. Ленев, В.А. Грицюк, H.A. Кирсанова

Таксономия, описание штамма: семейство Enterobacteriaceae, род Salmonella, вид Salmonella Bredene. Источник получения: курица, пншевая продукция (бедро).

Дата депонирования: 09.06.2021г. Депозитор: ФГБУ «ВГНКИ»

Назначение штамма: референтный, в том числе диагностический

Регистрационный номер: ВКШМ-Б-895М

Место хранении культу рал ыюго штамма: ФГБУ «ВГНКИ»

г. Моск'ьа

СПРАВКА О ДЕПОНИРОВАНИИ

пч1 DuaiicMMi /v«, <г

Тел,S ЧЩШАМ вн. 637

M.А, Гергель

МИНИСТЕРСТВО СЕЛЬСКОГО ХОЗЯЙСТВА РОС СИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ

РОССЕЛЬХОЗНАДЗОР

ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИИ «ВСЕРОСС ИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ» (ФГБУ «ВГНКИ»)

Утверждав» Заместитель директора, руководитель Непитательного центра

Методика выявления генов устойчивости к тетрациклина»! из группы tel у бактерий методом ПЦР с детекцией в режиме «реального времени»

Москва 2021

СПИСОК ИСПОЛНИТЕЛЕЙ Завслуюшнй отделом молекулярной биологии

Вслуший научный сотрудник отдела молекулярной биологии

И.В. Солтынская

А.Н. Богоматова

Ведущий научный сотрудник отдела молекулярной биологии

Ведущий научный сотрудник отдела молекулярной биологии

Старший научный сотрудник отдела генодиагностики инфекционных болезней животных

11аучный сотрудник отдела молеку лярной биологии

Научный сотрудник отдела молекулярной биологии

Младший научный сотрудник отдела молекулярной биологии

Лаборант-исследователь отдела молекулярной биологаи

Ведущий специалист отдела генодиагностики инфекционных болезней животных

£

Г

Ю.А. Оснпова

Е.О. Курнченкова Р Ф. Хаерова

Федеральное i ос>дарс1 венное бю гжешое > чрежденнс «Всероссийский гос> дарс1»сн-ный Петр качеста и ciaiiiupiiitaiiini лекаре! ценных среден» .Lia животных н кормов»(ФП»У «BI НКИ») 123022, i. Москва. Звенигородское шоссе. 5

Аттестат аккредитации POCC.RI .0001.310354

УТВЕРЖДАЮ Начальник отдела обеспечения единства измерений

^ J7 A.M.Зайцев « PC » /¿_202/_г.

ЭКСПЕРТНОЕ ЗАКЛЮЧЕНИЕ № МЭ I 0077 по результатам метрологической экспертизы

Методика выявления генов устойчивости к тетрациклинам из группы tet у бактерий методом III(Р с детекцией в режиме реального времени

Номер н кавчеиомиж 1 с\чи'*сск1>11 до«»ие1пм01и

Разработанная_ФГБУ «ВГНК11»

I Цимсиоыи не оргамиоиии

Проведена на основании заявки .У« Ml 1/0077 от 15.12.2021 г.

На метрологическую экспертизу представлены документы: проект методики на 21л.:

В результате метрологической установлено:

Представленная техническая документация соответствует/не соответствует ГОСТ 8.010-2013 «ГСИ. Методики выполнения измерений. Основные положения», ГОСТ 8.417-2002 «ГСИ. Единицы величин»; РМГ 29-2013 «ГСИ. Метрология. Основные термины и определения»; ПМГ 92-2009 «Метрологическая экспертиза проектов межгосударственных и национальных стандартов»; ГОСТ 1.5-2001 «Межгосударственная система стандартизации. Стандарты межгосударственные, правила и рекомендации по межгосударственной стандартизации. Общие требования к построению, изложению, оформлению. содержанию и обозначению»; ГОСТ Р ИСО 5725-1- 2002 «Точность (правильность и прецизионность) методов и результатов измерений. Часть I. Основные термины и определения».

Министерство сс какого хомПства Российской Федерации Федеральная служба по ветеринарному и фитосантарному иадтор) ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВС1 РОССИЙСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ ЦЕНТР КАЧЕСТВА И СТАНДАРТИЗАЦИИ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ ДЛЯ ЖИВОТНЫХ И КОРМОВ»

(ФГБУ » ВЕНКИ»)

ОТЧЕ! ПО ВАЛИДАЦИИ

методики выявления генов I р\ ииы ааЛА, обеснечнваюшнх устойчивость к амнноглнкошдам,у бактерии семейства ЕтегоЬасП'гшсеае, методом ПЦР с детекцией в режиме «реального

времени»

Москва 2022

Ф02(16.02.0|)

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств дли живоIных н кормов»(ФГБУ «НЕНКИ») 123022, г. Москва, Звенигородское шоссе, 5

Методика выявления генов группы аа<1А, обеспечивающих устойчивость к аминогликози-дам. у бактерий семейства ЕтегоЬааепасеае методом Г1ЦР с детекцией в режиме «реального времени»

НоМСр II Ш11МС1к11Ш1Н1.' 1С\11Н'1С1К1<П !К\ Ш1ИН

Разработаны: федеральным государственным бюджетным учреждением -(Всероссийский государственный Центр качества и стандартизации лекарственных средств для животных

и кормов».

Ндичснованыс орпшишиш

Проведена на основании: заявки № МО 1/0085 от 19.12.2022

Иа метрологическую экспертизу представлены документы;

- проект методических рекомендаций

- техническое задание