Экологические и микробиологические аспекты эпидемиологического надзора за холерой (по материалам Сибири и Дальнего Востока) тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.02.02, кандидат медицинских наук Куликалова, Елена Станиславовна

• Куликалова, Елена Станиславовна
• кандидат медицинских наук
• 2010

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Куликалова, Елена Станиславовна

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ.

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. СОВРЕМЕННЫЕ ПРЕДСТАВЛЕНИЯ О МЕХАНИЗМАХ ВЫЖИВАНИЯ ХОЛЕРНОГО ВИБРИОНА В ВОДНОЙ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЕ (обзор литературы).

1.1 Обстановка в отношении холеры в мире, странах СНГ и

Российской Федерации.

1.2 Факторы сохранения вибрионов в водоемах.

1.3 Механизмы выживания.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.1 Материал.

2.2 Препараты.

2.3 Экспериментальные животные.

2.4 Методы исследования.

ГЛАВА 3. ЭКОЛОГИЧЕСКИЕ ПРЕДПОСЫЛКИ ДЛИТЕЛЬНОЙ ЦИРКУЛЯЦИИ ВИБРИОНА ЭЛЬТОР В ОБЪЕКТАХ

ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ.'.

3.1 Оценка эпидемиологической ситуации по холере в регионе в последнее десятилетие седьмой пандемии (1999-2008тг.).

3.2 Санитарно-гигиеническая характеристика и микробиологический мониторинг водоемов Сибири. 61 '

3.3 Микробиологический мониторинг водоемов Дальнего

Востока.

ГЛАВА 4. РАЗРАБОТКА КОМПЛЕКСНОГО МЕТОДА СИГНАЛЬНОЙ ДЕТЕКЦИИ ХОЛЕРНОГО ВИБРИОНА OI И 0139 В СИСТЕМЕ ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКОГО НАДЗОРА ЗА ХОЛЕРОЙ.

4.1 Оптимизация мультиплексной ПЦР для выявления детерминант О-антигена и регуляторного гена toxR V.cholerae.

4.2 Апробация мультиплексной ПЦР в комплексе с реакцией иммунофлуоресценции в лабораторной практике.

ГЛАВА 5. БИОЛОГИЧЕСКИЕ СВОЙСТВА VIBRIO CHOLERAE ИЗ ОБЪЕКТОВ ОКРУЖАЮЩЕЙ СРЕДЫ.

5.1 Культурально-морфологические, биохимические, серологические, фаголизабельные и другие свойства.

5.2 Чувствительность к антибиотикам.

5.3 Молекулярно-генетическая характеристика штаммов холерного вибриона.

ГЛАВА 6. СПОСОБНОСТЬ ХОЛЕРНЫХ ВИБРИОНОВ К

ОБРАЗОВАНИЮ БИОПЛЕНКИ. ш

6.1 Подбор субстрата для прикрепления холерного вибриона.

6.2 Исследование способности холерных вибрионов к образованию биопленки на питательной среде.

6.3 Определение количественного уровня способности вибрионов к образованию биопленки.

6.4 Определение способности вибрионов к образованию биопленки при инкубации в автоклавированной речной воде

6.5 Выявление формируемой холерным вибрионом биопленки с использованием метода светооптической и люминесцентной микроскопии.

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЯ.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Экологические и микробиологические аспекты эпидемиологического надзора за холерой (по материалам Сибири и Дальнего Востока)»

Актуальность проблемы

Холера - острая особо опасная бактериальная инфекция с фекально-оральным механизмом передачи возбудителя, склонная к эпидемическому и пандемическому распространению. В настоящее время при оценке эпидемиологической обстановки в любом регионе она по-прежнему сохраняет свое значение. Обусловливаемая данной инфекцией ситуация в свете новых Международных медико-санитарных правил [44] может рассматриваться как чрезвычайная, нередко имеющая международное значение.

Чрезмерная продолжительность седьмой пандемии, обусловленной холерным вибрионом эльтор 01 серогруппы, по сравнению с шестью предыдущими, объясняется как изменением биологических свойств возбудителя (возможность длительного существования в водной среде, изменение вирулентности), так и формированием вибриононосительства, по-видимому, обеспечивающего беспрепятственное прохождение носителей и больных стертыми формами через санитарно-контрольные пункты. В конце 1992 г. в Индии, а затем в Бангладеш и Таиланде зарегистрированы вспышки клинически сходного с холерой тяжелого диарейного заболевания, вызванного ранее неизвестным эпидемическим штаммом 0139 (Бенгал), продуцирующим типичный холерный энтеротоксин. С 1996 г. холерный вибрион 0139 существует наряду с вибрионом эльтор и в ряде районов Индии и Бангладеш занимает доминирующее положение [130].

Анализ эпидемиологической обстановки по холере в мире, странах СНГ и России свидетельствует о том, что прогноз по этой инфекции на ближайшие годы остается неблагоприятным, что связано с существующей реальной возможностью завоза инфекции из эндемичных стран.

В регионе Сибири и Дальнего Востока (ДВ) последние эпидосложнения по холере (обусловленные заносом инфекции из Китая в гг. Уссурийск и Южно-Сахалинск с последующим накоплением возбудителя в водоемах и развитием вспышек в гг. Владивостоке и Южно-Сахалинске) зарегистрированы в 1999 г.

После 1999 г. общая эпидемиологическая ситуация в отношении холеры обычно характеризуется ежегодным (в летне-осенний сезон) выделением холерного вибриона из поверхностных водоемов. И хотя в регионе Сибири и Дальнего Востока изолируемые штаммы являются нетоксигенными, интенсивное антропогенное воздействие на водоемы - их загрязнение недостаточно очищенными и необеззараженными сточными водами - превращает их в резервуары для размножения вибрионов с опасностью реализации водного пути передачи инфекции при попадании патогенного варианта микроба в водоем во время заноса.

В связи с тем, что обстановка в мире по холере остается неблагоприятной, представляется приоритетным изучение благоприятствующих адаптации, жизнедеятельности и накоплению холерного вибриона в водной окружающей среде экологических факторов. Все это требует постоянного эпидемиологического надзора за холерой, включая мониторинг, направленный на своевременное обнаружение возбудителя (в объектах окружающей среды и среди определенных групп риска) с соответствующей его характеристикой.

Известен ряд подходов к ускоренному выявлению холерных вибрионов, основанных на обнаружении антигенных маркеров микроорганизма в реакции флюоресцирующих антител [39, 108] для обнаружения бактерий в природных водных образцах с подсчетом жизнеспособных клеток под микроскопом [148]. Перспективно прямое выявление генетических детерминант возбудителя в полимеразной цепной реакции (ПЦР), превосходящей (на несколько порядков) иммунологические тесты по чувствительности и специфичности, что позволяет работать с исходным материалом без предварительного выделения культуры [80]. Предложены разные варианты ПЦР для скрининга специфичных фрагментов генов холерного вибриона [65,73, 123].

М. Alam et al. [172, 179] показали, что обнаружение в ПЦР гена ompW или генов rfbOl, rjb0139, ctxA является убедительным подтверждением присутствия в поверхностных водоемах эндемичных районов Бангладеш токсигенных V. cholerae 01 и 0139 серогрупп, хотя методом культивирования данные вибрионы обнаруживаются лишь в 2-3 % образцов из окружающей среды.

В связи с этим остается актуальной разработка способа сигнальной детекции холерного вибриона, направленного на одновременное выявление комплекса генетических и антигенных детерминант возбудителя 01 и 0139 серогрупп.

Заслуживает внимания тот факт, что вегетативные формы холерного вибриона в водоёмах подвержены многообразной изменчивости, степень которой адекватна условиям среды [33]. В межсезонный период в эстуарийных и морских водах Аргентины на юго-западе Атлантического океана обнаружены V. cholerae 01 в жизнеспособном, но покоящемся некультивируемом состоянии [184]. В Бангладеш между сезонными эпидемиями, вызванными токсигенными штаммами V. cholerae 01 и 0139, сочетаниями бактериологического метода, мультиплексной ПЦР и иммунофлуоресценции удалось диагностировать культивируемые и некультивируемые клетки в составе биопленки, служащей дополнительным резервуаром возбудителя в водной окружающей среде [172, 179].

В естественных водоемах формирование биопленки на биотических и абиотических поверхностях обеспечивает персистенцию холерного вибриона при неблагоприятных условиях окружающей среды в виде «условно жизнеспособных клеток», которые in vitro реанимируются, а в кишечнике человека могут реверсировать в вирулентные бактерии. Для образования-биопленки на абиотических поверхностях необходим манноза-чувствительный гемагглютинин, а в формировании её на хитиновых поверхностях ракообразных определенная роль - принадлежит токсинкорегулируемым пилям адгезии. Заражение людей происходит в результате проглатывания подобных скоплений «условно жизнеспособных» вибрионов, что способствует прониканию в организм достаточно высокой дозы возбудителя [180]. Следовательно, холерный вибрион в окружающей среде может пребывать в разных формах, обладать значительной гетерогенностью, а потому его способность к адаптации в разнородной и-изменчивой во времени среде обитания требует специального изучения.

Цель работы. Комплексная оценка эпидемиологической ситуации по холере в Сибири и на Дальнем Востоке по данным эпидемиологического, микробиологического, молекулярно-генетического, санитарногигиенического и экологического мониторинга.

Задачи исследования.

1. Дать оценку динамики развития эпидемиологической ситуации по холере в Сибирском и Дальневосточном Федеральных' округах РФ в последнее десятилетие текущей пандемии.

2. Провести анализ комплекса абиотических и биотических факторов, влияющих на выживаемость холерного вибриона в поверхностных водоемах.

3. Разработать метод мультиплексной ПЦР для одновременной детекции генов холерного вибриона wbOl, wb0139 и регуляторного гена toxR, апробировать данный метод для ускоренного выявления антигенов холерного вибриона в комплексе с м'етодом иммунофлюоресценции.

4. Охарактеризовать биоразнообразие V. cholerae на основе комплекса микробиологических и молекулярно-генетических методов в условиях эпидемиологического благополучия.

5. Изучить способность V. сЪоЫгае разных серогрупп к образованию биопленки в условиях эксперимента.

Научная новизна и теоретическая значимость работы

Установлена закономерность обнаружения атоксигенных холерных вибрионов 01 и 0139 серогрупп в мелких полузамкнутых малопроточных водоемах, а также в местах сброса ливневой канализации с неблагоустроенных участков селитебной территории.

Для изучения1 экологии холерного вибриона и микробиологического мониторинга за поверхностными водоемами предложен комплекс методов, основанный на разработанной М-ПЦР и реакции иммунофлюоресценции, позволяющий одновременно обнаружить специфические гены и антигены холерного вибриона 01 и 0139 серогрупп.

Показана эффективность и оперативность применения комплекса 1 методов - М-ПЦР и РИФ для детекции V. ско1егае 01/0139 серогрупп в сравнении с бактериологическим методом', что позволяет вести целенаправленный поиск указанного микроорганизма.

Представлена по комплексу фенотипических и молекулярно-генетиче-ских методов характеристика изолированных в регионе штаммов холерных вибрионов.

Показана более выраженная адаптационная способность токсигенного штамма холерного вибриона из поверхностного водоема во время вспышки холеры к формированию биопленки в сравнении со штаммами от больных.

Теоретическая значимость исследования состоит: в установлении существования скрытого периода накопления токсигенного возбудителя в благоприятных участках поверхностных водоемов в случае заноса, что обусловливает в ряде случаев внезапное возникновение эпидосложнений по холере и подтверждает роль мелких полузамкнутых малопроточных водоемов как возможного резервуара инфекции; в получении новых данных о способности вибрионов разных серогрупп образовывать биопленку и описании морфологических признаков её формирования.

Практическая значимость и внедрение результатов исследования

Полученные результаты исследований нашли отражение в следующих документах: методические указания МУК 4.2.2218-07 «Лабораторная диагностика холеры», утверждены руководителем Роспотребнадзора Главным государственным санитарным врачом РФ; санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.1.2521-09 «Профилактика холеры. Общие требования к эпидемиологическому надзору за холерой на территории Российской Федерации», утверждены постановлением № 43 Главного государственного санитарного врача РФ от 9 июня' 2009 г.; методические рекомендации «Детекция холерных вибрионов в исследуемом материале с применением мультиплексной ПЦР и иммунофлюоресценции» одобрены Ученым, Советом (протокол № 4 от 29.03. 2007 г.), утверждены директором института ФГУЗ' ИркутскНИПЧИ Сибири и ДВ;

Методические рекомендации.по получению и морфологической оценке структуры образуемой холерным вибрионом биопленки» одобрены Ученым Советом (протокол № 2'от 05.03.2010 г.), утверждены директором ФГУЗ ИркутскНИПЧИ Сибири и ДВ.

Микробиологический мониторинг поверхностных водоемов в отношении Vibrio cholerae на основе предложенного нами комплекса методов - мультиплексной ПЦР и реакции иммунофлюоресценции -позволяет более оперативно выявить в пробе одновременно серогруппоспецифические гены wbOl, wb0139, глобальный регуляторный ген toxR и антигены этих серогрупп, что необходимо для ведения целенаправленного поиска вибриона в этой пробе.

В Государственную коллекцию патогенных бактерий "Микроб" при ФГУЗ РосНИГГШ "Микроб" депонирован RO вариант токсигенного Vibrio cholerae эльтор - КМ 258.

Выделенные штаммы с характеристикой их биологических свойств, указанием мест и времени их выделения внесены в таблицу-шаблон в программе Microsoft Access для создания информационной базы данных V.cholerae, изолированных на территории Сибири и Дальнего Востока с глубиной ретроспективы в 8 лет (2001-2008 г.).

Сформированная коллекция штаммов позволяет изучать их фенотипические свойства и структуру генома с применением современных методов и технологий и получать новые данные для понимания механизмов эволюции эпидемического процесса при холере.

Материалы настоящей работы используются в учебном процессе на курсах специализации врачей по особо опасным инфекциям в ФГУЗ ИркутскНИПЧИ Сибири и Дальнего Востока.

Положения, выносимые на защиту:

1. Ситуация по холере в регионе определяется регистрацией заносов с накоплением в ряде случаев возбудителя в поверхностных водоемах, развитием в последующем острых вспышек инфекции (1999 г.) и длительной ежегодной циркуляцией нетоксигенного холерного вибриона в водной окружающей среде;

2. Длительному пребыванию нетоксигенного холерного вибриона в поверхностных водоемах способствует сброс в них неочищенных хозяйственно-бытовых сточных вод и наличие благоприятных биотических и абиотических факторов водной окружающей среды. Обнаружение нетоксигенного холерного вибриона эльтор главным образом в мелких малопроточных водоемах (места неорганизованного отдыха населения) и чрезвычайно редкие находки его в санитарных поясах водозаборов и в гарантированных зонах рекреации в условиях региона обусловливают выбор стационарных точек забора проб также в местах несанкционированного использования водоемов (для купания, рыболовства и летних видов спорта).

3. Разработанный вариант мультиплексной ПЦР для одновременной детекции генов V. ско1егае 01, 0139 серогрупп (-и>Ь(Э1, \vb0139) и ШЯ позволяет оперативно обнаружить ДНК холерного вибриона соответствующей серогруппы и в комплексе с реакцией иммунофлуоресценции повышает эффективность индикации холерного вибриона и своевременного установления границ контаминации поверхностного водоема.

4. Штаммы V. ско1егаеь выделенные из поверхностных водоемов в благополучный по холере период, характеризуются вариабельностью культурально-морфологических, агглютинабельных и фаголизабельных свойств, изменением в динамике чувствительности к некоторым антибактериальным препаратам, не содержат в своем геноме основных генов вирулентности, входящих в состав профагов СТХф (сЬсАВ, К81ф (га/С), острова патогенности УР1-1 (ЮрА). Изоляты холерного вибриона 01 и 0139 серогрупп различаются по наличию детерминант персистенции и генов, ответственных за формирование структуры биопленки.

5. Штаммы V. ско1егае еНог 01 обладают широким диапазоном формирования биопленки в отличие от V. с1го1егае 0139 серогруппы. Порошкообразный и коллоидный хитин, а также микрокристаллическая целлюлоза усиливает способность вибрионов к образованию биопленки. Токсигенный вибрион эльтор, выделенный из поверхностного водоема во время вспышки холеры, в сравнении с таковым от больных холерой, обладает выраженной способностью к образованию биопленки.

Апробация работы

Изложенные материалы исследований представлены на научной конференции «Противочумные учреждения России и их роль в обеспечении эпидемиологического благополучия населения» (М., 2004); 2-ом Байкальском микробиологическом Симпозиуме с международным участием «Микроорганизмы в экосистемах озер, рек, водохранилищ» (Иркутск, 2007); IX Всероссийском съезде эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (М., 2007); межрегиональной научно-практической конференции «Итоги, проблемы и перспективы государственной санитарно-эпидемиологической службы Иркутской области» (Иркутск, 2007); научно-практической конференции «Современные аспекты эпидемиологического надзора за особо опасными инфекционными заболеваниями на юге России» (Ставрополь, 2007); научной конференции с международным участием «Актуальные вопросы региональной инфекционной патологии» (Иркутск, 2007); IX Межгосударственной научно-практической конференции государств-участников СНГ «Современные технологии в реализации глобальной стратегии борьбы с инфекционными болезнями на территории государств-участников Содружества Независимых Государств» (Волгоград, 2008); 2-ом межрегиональном семинаре «Организация санитарно-эпидемиологического' мониторинга за острыми кишечными инфекциями» (Иркутск, 2008); научно-практической конференции «Современные аспекты эпидемиологического надзора и профилактики особо опасных и природно-очаговых болезней» (г. Иркутск, 2009); научно-практической конференции, посвященной 60-летию со дня образования республиканской санитарно-эпидемиологической станции (Улан-Удэ, 2009 г.); Проблемной комиссии 50.04 «Холера и патогенные для человека вибрионы» Межведомственного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории РФ (Ростов-на Дону, 2003-2010); заседании Иркутского отделения Всероссийского общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов (Иркутск, 2010 г.); 20th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, (Vienna, Austria, 2010); международной научной конференции и международной школе для молодых ученых «Проблемы экологии: Чтения памяти профессора М.М.Кожова» (Иркутск, 2010), а также на научно-практических конференциях Иркутского НИПЧИ (2007-2010 гг.).

Личный вклад автора. Сбор данных, полученных в ходе эпидемиологического надзора за холерой, отбор и исследование проб из объектов водной окружающей среды, молекулярно-генетическое исследование штаммов холерного вибриона, постановка экспериментов, анализ результатов и подготовка публикаций проведены при непосредственном участии автора.

Работа выполнена в рамках двух плановых тем: «Экологические аспекты эпиднадзора за холерой на территории Сибири и Дальнего Востока» (№ государственной регистрации 0120.0013861) и «Оценка ситуации по холере в Сибири и на Дальнем Востоке по данным экологического мониторинга и результатам молекулярно-биологического исследования циркулирующих V. cholerae» (№ государственной регистрации 0120.0511209).

Публикации по теме исследования. Материалы исследования изложены в 36 опубликованных научных работах, из них 6 в изданиях, рекомендованных ВАК Министерства образования и науки РФ для публикации материалов диссертационных работ, 1 — в зарубежной печати и в одном заключительном отчете.

Структура и объем диссертации. Диссертация изложена на 189 листах текста, состоит из введения, обзора литературы, четырех глав собственных исследований, обсуждения, выводов, списка литературы, включающего 197 ссылок, из них 106 отечественных и 91 зарубежных авторов и приложения. Работа содержит 22 таблицы и 42 рисунка.

Заключение диссертации по теме «Эпидемиология», Куликалова, Елена Станиславовна

ВЫВОДЫ

1. Последние эпидосложнения по холере в регионе (1999 г.) возникли в результате заноса инфекции из Китая, накопления возбудителя в поверхностных водоемах и реализации водного пути передачи. Отсутствие в последующее десятилетие выявленных заносных случаев заболевания одновременно с ежегодным длительным выделением холерного вибриона из объектов водной окружающей среды характеризует эпидемиологическую обстановку по холере в Сибири и на Дальнем Востоке как относительно благополучную. Вместе с тем все возрастающая интенсивность миграционных потоков (из неблагополучных по холере стран), постоянные эпидемические осложнения в близлежащих странах Южной, Юго-Восточной и Центральной Азии и установленные пути проникновения холеры в регион свидетельствуют о высоком риске заноса инфекции.

2. В местах неорганизованного отдыха населения, не являющихся узаконенными зонами рекреации, но использующихся для купания, обнаружено около 90 % штаммов нетоксигенного холерного вибриона эльтор, что дает основание при мониторинге водоемов для выбора здесь точек забора проб.

3. Закономерное обнаружение микроорганизмов рода Vibrio в поверхностных водоемах в период эпидблагополучия по холере на фоне существенных нарушений санитарно-гигиенических требований к качеству их воды является показателем - загрязнения водных объектов хозяйственно-бытовыми сточными водами. Выявление холерного вибриона происходит при определенных показателях температуры и рН на фоне обнаружения значительной численности и разнообразия сине-зеленых водорослей (iCyanophyta): Anabaena sp., Oscillatoria, видов рода Cryptomonas отдела Cryptophyta и разных форм хитинсодержащего зоопланктона, которые (в натуральном виде или в виде продуктов их метаболизма) могут быть использованы вибрионами в.качестве питательного субстрата.

4. Разработанная мультиплексная ПЦР в- комплексе с реакцией иммунофлуоресценции в, ходе проведения бактериологического анализа дает возможность: получить оперативную информацию о наличии' в пробе генов и антигенов возбудителя 01 и 0139 серогрупп,, причем; частота их обнаружения; составляет 22,6 .% и 25,8 %, что заметно превышает возможность бактериологического метода:

5: Штаммы холерного вибриона из поверхностных водоемов в условиях эпидемиологического благополучия характеризуются высокой вариабельностью ^ культурально-морфологических, агглютинабельных. и фаголизабельных свойств (количество типичных штаммов составляет всего 16.7%). Штаммы холерного вибриона чувствительны к ципрофлоксацину, гентамицину, цефотаксиму, хлорамфениколу.: У всех культур отсутствуют основные гены вирулентности; входящие в- состав профагов СТХф (ctxAB, zof), RS1 (rstC) и острова патогенности VPI-1 (tcpA). По наличию других генетических элементов: острова патогенности VPI-2 (папН), острова пандемичности VSP-1 и VSP-2 (tnp0183, deo 0175 и pro 0490, pro 0496), острова персистенции EPI (mshA, mshQ), а также участка консервативной; части хромосомы - сайта для внедрения в неё умеренных фагов СТХф и RSI (attRS) и тгиов карА, mboAl, mbaA2 и vpsR (всего 12 генов) эти штаммы вариабельны. Штаммы V. cholerae 0139 из внешней среды,не содержат гены mshA и mshQ острова персистенции ЕР1.

6. Штаммы V. cholerae eltor обладают широким, диапазоном способности формировать биопленку (со значениями оптической плотности при QD570 0,2 — 4,5). Культуры V. cholerae 0139 серогруппы проявляют , гораздо меньший размах показателей (значения'оптической .плотности при OD570 0,53 — 1,85). Выделенный из поверхностного водоема во время вспышки холеры токсигенный вибрион эльтор; в сравнении с таковым от больных холерой, обладает выраженной способностью к образованию биопленки. Признаками формирования биопленки является наличие периферической её части из прилегающих друг к другу вибрионов; их полиморфизм (палочки, кокковидные, полые, округлые неокрашенные) и появление полисахаридного матрикса, выявляемого при световой микроскопии различными методами окраски. В процессе образования биопленки показана изменчивость холерного вибриона в его основных формах — переход в стабильный шероховатый ЯО-в ар и ант (с сохранением исходного набора генов патогенности) и в некультивируемое состояние.

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Куликалова, Елена Станиславовна, 2010 год

1. Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за холерой / A.C. Марамович и др. // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 1999. — № 5. -С. 54-57

2. Алексеева, Л.П. Изучение антигенных взаимосвязей типичных и R-форм холерных вибрионов на основании моноклональных антител / Л.П. Алексеева, И.Я. Черепахина, О.С. Бурлакова // Журн. микробиол. 1998.-№4.-С. 9-12

3. Ашмарин, И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях / И.П. Ашмарин, A.A. Воробьев. Л., 1962. - 179 с.

4. Безгодов, И.В. Гигиеническая оценка качества питьевой воды по отдельным территориям Иркутской области / И.В. Безгодов, A.A. Воропаев // Тез. Докладов I съезда гиг., эпид., микроб. Ирк. Области. 2002. -С. 19-22

5. Биологическая энциклопедия. Планктонные водоросли. http.//dic.academic.ru/dic.nfs/encbiology/l 515планктонные (Дата обращения 23.04.2010 г.)

6. Болезни человека как отражение внутривидовой борьбы. / В.П. Сергиев и др. // ЖМЭИ. 2007. -№ з, С. 97-102

7. Vibrio cholerae Ol39, выделенные от людей и из поверхностных водоемов: сравнительное генотипирование / Б.Н. Мишанькин и др. // Журн. микробиол. 2000. - № 3. - С. 3-7

8. Влияние санитарно-коммунального благоустройства городов на распространение холеры на Украине / Л.Я. Могилевский и др. // Холера. Сб. материалов VIII Рос. науч.-практ. конф. по проблеме "ХОЛЕРА". -Ростов н/Д, 2003. С.85-87

9. Водопьянов, С.О. Разработка способа'выявления гена tcpA холерного вибриона биотипа эльтор и сероварианта Ol39 Бенгал с помощью по-лимеразнойч цепной реакции / С.О. Водопьянов, М.Б. Мишанькин, И.П. Олейников // Биотехнология. 1999. - № 6. - С 19-23

10. Ганин, B.C. Динамика лекарственной устойчивости холерных вибрионов, выделенных из поверхностных водоемов Сибири и Дальнего Востока в 1976-1990 г. / B.C. Ганин, А.Ф. Пинигин // Антибиотики и химиотерапия. 1992. - Т. 37, № 11. - С. 17-21

11. Генез эпидемических вспышек холеры / A.C. Марамович и др. // Материалы VIII съезда эпидемиол., микробиол. и паразитол. М.: РосИН-ЭКС. 2002. - Т. 1. - С. 74-75

12. Гигиенические требования к охране поверхностных вод: Санитарные правила и нормы СанПиН 2.1.5.980-00. — М.: Федеральный центр Госсанэпиднадзора Минздрава России, 2000. 24 с .

13. Гланц, С. Медико-биологическая статистика / С. Гланц. Пер. с англ. М.: Практика, 1999. 459 с.

14. Гуськов, Г.В. Гигиеническая оценка поверхностного стока с территории городов и промышленных площадок / Г.В. Гуськов, М.М. Сайфут-динов // Гигиена и санитария. 1989. — № 9. - С. 56-59

15. Ерошенко Г.А. Молекулярно-генетический анализ штаммов Vibrio cholerae 0139: Дис. . докт.мед.наук: 03.00.07., 03.00.15. / Г.А. Ерошенко; РосНИПЧИ «Микроб» Саратов, 2004 . - 297 с.20а. Зуева, Л.П. Эпидемиология / JI. П. Зуева, Р.Х. Яфаев : Учебник.

16. СПб : ООО «Издательство ФОЛИАНТ», 2006. 756 с. : ил.

17. Изучение распространенности основных генов вирулентности среди различных штаммов Vibrio cholerae El-Tor для определения их эпидемической значимости. / Н.И. Смирнова и др. // Молекул, генетика. -2001.-№3,-С. 23-28

18. Изучение распространенности регуляторных генов, контролирующих экспрессию генов вирулентности, среди штаммов Vibrio cholerae биовара эльтор с разным пандемическим потенциалом / Н.И. Смирнова и др. // Молекул, генетика. 2007. - № 1. - С. 15-22

19. Инструкция по контролю специфической стерильности экспериментальных препаратов, приготовленных из культур чумного и холерного микроба.: Саратов, 1982 г. - 8 с.

20. Источники централизованного хозяйственно-питьевого водоснабжения. Гигиенические, технические требования и правила выбора. ГОСТ 2761-84. Введ. 1984-27-11. - М.: Изд-во стандартов, 1984. - 12 с.

21. К использованию ПЦР для детекции маркеров патогенности штаммов Vibrio cholerae / C.B. Балахонов и др. // Генная диагностика особо опасных инфекций: Материалы. 1-й Всерос. науч.-практ. конф. Саратов, 2000. - С. 23-26

22. Коробкова Е.И. Микробиология и эпидемиология холеры / Е.И. Кор-бкова. 2-е изд., перераб. и доп. - М.: Медгиз, 1959 - 303 с.

23. Коммунальная гигиена / Под ред. В.Т. Мазаева. — 2-е изд., испр. и доп. М.: ГЭОТАР-Медиа, 2005. - 304 с.

24. Костромитина, Е.А. Молекулярно-генетические свойства штаммов холерных вибрионов Эль-Тор с различной эпидемической значимостью: Дис. . канд.мед.наук. 03.00.07., 03.00.15. / Е.А. Костромитина; Рос-НИПЧИ «Микроб» Саратов, 2004. - 161 с.

25. Кулыпань,Т.А. Генетические изменения вирулентных штаммов холерных вибрионов биовара эльтор при их обитании в водной среде / Т.А. Кульшань, A.B. Топорков, Н.И. Смирнова // Пробл. особо опасных инфекций. 2006. - Вып. 1 (91). - С. 41-44

26. Кутырев, В.В. Влияние биологических свойств возбудителя холеры на характер эпидемического процесса / В.В. Кутырев, Н.И. Смирнова, Б.Л. Черкасский // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 2006. - № 4. - С. 43-47

27. Лабораторная диагностика холеры: Методические рекомендации МУК 4.2.2218-07. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Рос-потребнадзора, 2007. - 87 с.

28. Литвин, В.Ю. Стратегия адаптивной изменчивости холерных вибрионов в природных водоемах / В.Ю. Литвин, A.C. Марамович, А.Л. Гинцбург // Вестн. РАМН. 2001. - № 11. - С. 20-24

29. Литвин, В.Ю. Интегративные процессы в современной эпидемиологии / В.Ю. Литвин, А.Л. Гинцбург // Журн. микробиол. 2002. № 4. - С. 6372

30. Ломов, Ю.М. Эволюция возбудителя холеры и прогноз по этой инфекции на ближайшее будущее / Ю.М. Ломов // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 2004. -№ 1. - С. 7-12

31. Луппа, X. Основы гистохимии / X. Луппа. Пер. с нем. М.: Мир, 1980. -343 с.

32. Малеев, Г.В. Методы флюоресцентной детекции и их применение в микробиологии / Г.В. Малеев, А.Л. Гинцбург // Молекул, генетика. -2004.-№3.-С. 30-39

33. Марамович, A.C. Научное обоснование системы эпидемиологического надзора за холерой в условиях Сибири и Дальнего Востока: Дис. . докт.мед.наук: 14.00.30 / A.C. Марамович. Иркутск, 1983.-402 с.

34. Марамович, A.C. Эндемичные очаги холеры в Азии / A.C. Марамович, М.И. Наркевич, А.Ф. Пинигин // Журн. микробиол. 1992. - № 5-6. -С. 61-66

35. Марамович, A.C. Эндемичные очаги холеры в Африке / A.C. Марамович, А.Ф? Пинигин // Журн. микробиол. 1995. - № 2, Приложение. — С. 101-108

36. Мединский, Г.М. Пути и= факторы, способствовавшие распространению холеры Эль-Тор на территории СССР. / Г.М. Мединский, Ю.М. Ломов // Холера в СССР в период VII пандемии / Под ред. В.И. Покровского. М.: Медицина, 2000. - С. 26-127

37. Международные Медико-санитарные правила. ВОЗ. Женева, 2005. -79 с.

38. Меньшикова, Е.А. Сравнительная характеристика препаратов гемолизина СТХ+ и СТХ- штаммов Vibrio cholerae эльтор и Vibrio cholerae 0139 / Е.А. Меньшикова, Л.П. Подосинникова // Журн. микробиол. -2006. № 6. — С.47-49

39. Миронова, Л.В. Молекулярно-биологические и эпидемиологические аспекты патогенности холерного вибриона (по материалам Сибири и Дальнего Востока: Дис. . канд. мед. наук. 14.00*30; 03.00.07 / Иркутск, 2004. 197 с.

40. Михайлова, А.Е. Факторы сохранения холерных вибрионов в водоемах / А.Е. Михайлова, А.Б. Хайтович // Журн.микробиол. 2000. - № 6. -С. 99-104

41. Многолетние наблюдения за циркуляцией микроорганизмов рода Vibrio в поверхностных водоемах г. Иркутска и его окрестностей /

42. B.C. Ганин и др. // Сб. материалов межрегиональной науч.-практич. конф. «Итоги, проблемы и перспективы государственной санитарно-эпидемиологической службы Иркутской области», Иркутск, 2007.1. C.177-181

43. Москвитина, Э.А. Вспышка холеры г. Вилково Одесской области в 1991 году. / Э.А. Москвитина, Ю.М. Ломов, Б.П. Голубев // Холера. Вопр. эпидемиол., микробиол. и лабораторной диагностики. Ростов н/Д. 1992. - С. 44-47

44. Москвитина, Э.А. Современные тенденции в развитии седьмой пандемии холеры / Э.А. Москвитина // Пробл. особо опасных инфекций. -2008. Вып. 1 (95). - С. 22-26

45. Мурначев Г.П. Научно-практическое обоснование системы противохолерных мероприятий в условиях Приморского края: Дис.канд. мед. наук: 14.00.30. / Иркутск, 2007. - 147 с.

46. Мурначев, Г.П. Становление торгового пути на Дальнем Востоке России и его роль в заносе и распространении холеры / Г. П. Мурначев, A.C. Марамович // Пробл. особо опасных инфекций. 2005. - Вып. 89. - С. 25-29

47. Определение холерогенных свойств вибриона на новорожденных крольчатах / A.C. Марамович и др. // Журн. микробиол. 1972. -№ 10.-С. 59-64

48. Панин, В.Ф. О мониторинге за контаминацией холерными вибрионами водных объектов Рязанской области / В.Ф. Панин, В.И. Костырко // Сб. материалов VIII Рос. науч.-практ. конф. по проблеме "ХОЛЕРА". -Ростов н/Д, 2003. С.61-63

49. Парамонов, И.В. Обнаружение и идентификация холерных вибрионов с использованием полимеразной цепной реакции / И.В. Парамонов, Е.Ю. Вахнов, A.A. Воробьев // Проблемы особо опасных инфекций. Саратов, - 1999. - Вып. 79. - С. 95-102

50. Пирс, Э. Гистохимия / Э. Пирс. Пер. с англ. М.: Изд-во иностр. литературы, 1962.-962 с.

51. Погорелов В.И. Оценка экологических факторов, влияющих на циркуляцию вибрионов эльтор в поверхностных водоемах Сибири и Дальнего Востока: Дис.канд. мед. наук. 03.00.07. / Иркутск, 1997. 171 с.

52. Покровский, В.И. Уроки VII пандемии холеры / В.И. Покровский, A.C. Марамович, В.В. Малеев // Вестн. АМН СССР. 1989. - № 9. -С. 60-67

53. Применение статистических методов в эпидемиологическом анализе / Е.Д. Савилов и др. // Новосибирск: Наука, 1993. 136 с.

54. Профилактика холеры. Общие требования к эпидемиологическому надзору за холерой на территории Российской Федерации: Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.1.2521-09. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2009. - 35 с.

55. Пузырь, А.П. Архитектоника колоний Flavobacterium sp. 56 и Flavobacterium sp.22 по данным просвечивающей электронной микроскопии / А.П. Пузырь, O.A. Могильная, Л.С. Тирранен // Микробиология. 1998. - Вып. 67 (5). - С.672-679

56. ПЦР-детекция маркеров эпидемической значимости штаммов Vibrio cholerae 0139, изолированных в Сибири / Балахонов C.B. и др. // Молекул. генетика. 2001. - № 2. — С. 24-26

57. Реброва, О.Ю. Статистический анализ медицинских данных. Применение пакета прикладных программ STATISTIKA / О.Ю. Реброва. 3-е изд. - М.: МедиаСфера, 2006. - 312 с.

58. Рокицкий, П.Ф. Биологическая статистика / П.Ф. Рокицкий. — 3-е изд., испр. Минск: Вышэйш. школа, 1973. - 320 с.

59. Роль и значение поверхностных водоемов в становлении и развитии VII пандемии холеры. / A.C. Марамович и др. // Эпидемиол. и инф. болезни. 2009. - № 2. - С. 21 -26

60. Смирнова, Н.И. Биопленка: структура, функция, ПЦР-диагностика / Н.И. Смирнова, Ю.В. Лозовский // Совр. технологии в диагн. особо опасн. Болезней: Материалы 4 межгосударств, науч.-практ. конф. госу-дарств-участн. СНГ. Саратов, 2003. - С. 175-177

61. Смирнова, Н.И. Эволюция генома возбудителя холеры / Н.И. Смирнова, В.В. Кутырев // Молекул, генетика. 2004. - № 4. - 3-13

62. Смирнова, Н.И. Сравнительный анализ молекулярно-генетических особенностей геномов и их эволюционных преобразований у возбудителей холеры, чумы и сибирской язвы / Н.И. Смирнова, В.В. Кутырев // Молекул, генетика. 2006. - № 2. - С. 9-19

63. Современные технологии в диагностике опасных инфекционных болезней / Г.Г. Онищенко и др. // Материалы 4-й Межгосударств, науч.-практ. конф. государств-участн. СНГ. Саратов, - 2003. - С. 9-11

64. Соколенко A.B. Индикация некультивируемых форм холерных вибрионов / A.B. Соколенко, Ю.М. Ломов, Л.П. Алексеева // Холера. Матер. VIII Рос. науч.-практ. конф. по проблеме "ХОЛЕРА". Ростов н/Д, 2003.- С.156-160

65. Сравнительное изучение различных методов определения токсигенно-сти Vibrio cholerae / C.B. Балахонов и др. // Молекул, генетика. -1999.-№1.-С. 9-12

66. Сравнительный анализ геномов холерных вибрионов эльтор, выделенных до начала и в разные периоды седьмой пандемии холеры / A.B. Осин и др. // Генетика. 2005. - № 1, Т. 41.- С. 53-62

67. Телесманич, Н.Р. Механизмы гемолитической активности холерных вибрионов: Автореф. дис. . докт. биол. наук. Ростов н/Д., 2006. — 38с.

68. Холера в Приморье: Эколого-эпидемиологические аспекты / Г.П. Мурначев и др.. Владивосток, 2009. - 279 с.

69. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщ. 1. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Владивостоке. / Г.Г. Они-щенко и др. // Журн. микробиол. 2000. - № 5. - С.26-31

70. Холера на Дальнем Востоке России. Сообщ. 2. Эпидемиологическая характеристика вспышки холеры эльтор в г. Южно-Сахалинске. / Г.Г. Онищенко и др. // Журн. микробиол. 2000. - № 5. - С.31-34

71. Холера эльтор в Латинской Америке / А.С. Марамович и др. // Журн. микробиол. 2001. - № 5. - С. 82-89

72. Холера, обусловленная Vibrio cholerae OI ctxAB- tcpA+ / Г.Г. Онищенко и др. // Журн. микробиол. 2007. - № 1. - С. 23-29

73. Холерные вибрионы OI и 0139 серогрупп: чувствительность к антибиотикам в период седьмой пандемии / И.Т. Андрусенко и др. // Журн. микробиол. 2008. - № 3. - С. 107-114

74. Эволюция генома Vibrio cholerae: пути формирования атипичных штаммов / Н.И. Смирнова и др. // Пробл. особо опасных инфекций. — Саратов. 2008. - Вып. 97, №3.-с. 5-11

75. Эволюция эпидемиологии холеры / A.C. Марамович и др. // Журн. микробиол. 2006. - № 6. - С. 63-71

76. Экология микроорганизмов: Учеб. для студ. вузов / Под ред А.И. Не-трусова. М.: Издательский центр «Академия», 2004. - 272 с.

77. Экспериментальное получение некультивируемых форм Vibrio cholerae eltor и характеристика их биологических свойств / Э.Е. Та-фелыитейн и др. // Журн. микробиол. 2004. - № 1. - С. 13-18

78. Эпидемиологический надзор за холерой: обоснования к оценке его эффективности / Г.Г. Онищенко и др. // Пробл. особо опасных инф. 2005. - Вып 1 (89) - С. 5-9

79. Эпидемическая и неэпидемическая формы холеры Эль-Тор: этиология, клиника, эпидемиология / В.Н. Савельев и др. // Эпидемиол. и инф. болезни. 2009. - № 5. - С. 56-59

80. Acquisition of classical СТХ prophage from Vibrio cholerae 0141 by El Tor strains aided by lytic phages and chitin-induced competence / S.M.Udden et al. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008. - Vol.105. -P. 11951-11956

81. An andirect fluorescent antibody staining procedure for detection of Vibrio cholerae serovar Ol cells in aquatic environmental samples / H.S. Xu et al. 11 J. Microbiol. Methods. 1984 - Vol. 2. - P. 221-231

82. Assotiation of Vibrio cholerae Ol with the cyanobacterium, Anabae-na sp., elucidated by polymerase chain reaction and transmission electron microscopy. / M.S. Islam et al. // Trans. R. Soc. Trop. Med. Hyg. 1999. -Vol. 93.-P. 36-40

83. Assotiation of Vibrio cholerae with plankton in coastal areas of Mexico / M.L. Lizarraga-Partida et al. // Environ. Microbiol. 2009. - Vol. 11, Is. l.-P. 201-208

84. Blokesch, M. Serogroup Conversion of Vibrio cholerae in Aquatic . Reservoirs / M. Blokesch, G. K. Schoolnik // PLoS Pathogens. 2007.

85. Vol. 3, Is. 6, e81. P. 0733-0742

86. Bomchil, N. Identification and characterization of a Vibrio cholerae gene, mbaA, involved in maintenance of biofilm architecture / N. Bomchil, P. Watnick, R.Kolter // J. Bacteriol. 2003. - Vol. 185, N 4. - P. 1384-1390

87. Borroto, R.J. Geographical patterns of cholerae in Mexico, 1991-1996 / R.J. BoiTOto, R. Martinez-Piedra // Int. J. Epidemiol. 2000. - V. 29, № 4. - P. 764-772.

88. Charakterization of VPI Pathogenecity Island and CTX(p prophage in environmental strains of Vibrio cholerae I A.K. Mukhopadhyay et al. Il J. Bacteriol. 2001. - Vol. 183, N 16. - P. 4737-4746

89. Chemotaxis between Vibrio cholerae 01 and a blue-green alga, Ana-baena sp. / M.S. Islam et al. II Epidemiol. Infect. 2006. - Vol. 134, N 3. -P. 645-648

90. Cholera among Belgian travelers in Turkey in 2005 / K. De Schrejver et al. // Travel Med. Infect. Dis. 2007. - Vol. 5, № 4. - P. 236-238

91. Cholera in Lima, Peru, correlates with prior isolation of Vibrio cholerae from the environment / A.A. Franco et al. // Am. J. Epidemiol. 1997. -Vol. 146, N 12.-P. 1067-1075

92. Comparative genomic analysis of Vibrio cholerae'. genes that correlate with cholera endemic and pandemic disease / M. Dziejman et al. Il Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2002. - Vol. 99, N3,-P. 1556-1561

93. Comparison of Vibrio cholerae pathogenicity island in sixth and seventh pandemic strains / D.K. Karaolis et al. II Infect. Immun. 2001. -Vol. 69, N3.-P. 1947-1952

94. CTX genetis elemet encodes a site-specific recombination system and ---an-intestinal colonization factor / G.D.N. Pearson et al. // J.J. Proc. Natl.

95. Acad. Sci. USA. 1993. - Vol. 90. - P. 3750-3754

96. Detection of Vibrio cholerae 01 in the aquatic environment by fluorescent monoclonal antibody and culture method / A. Huq et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1990. - Vol. 56. - P. 2370-2373

97. Development and evaluation of a multiplex PCR assay for rapid detection of toxigenic Vibrio cholerae Ol and 0139 / K. Hoshino et al. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 1998. - Vol. 20. - P. 201-207

98. Donlan, R.M. Biofilms: survival mechanisms of clinically relevant microorganisms / R.M. Donlan, J.W. Costerton // Clin. Microbiol. Rev. -2002.-Vol. 15.-P. 167-193

99. Dutta, N.K. Experimental cholera in infant rabbits: a method for che-motherapeutic investigation / N.K. Dutta, M.K. Habbu // Brit. J. Pharmacol. 1955.-Vol. 10.-P. 153-159

100. Effect of Phage on the Infectivity of Vibrio cholerae and Emergence of Genetic Variants / M.S. Zahid et al. // Infect. Immun. 2008 -Vol. 76, N 11.-P. 5266-5273

101. Environmental aspects of Vibrio cholera in transmission of cholera / R.R. Colwell et al. // Advances in research on cholera and related diarrhoeas / R.B. Sack and Y. Zinnaka (ed.). K.T.K. Scientific Publishers, Tokyo, Japan, 1999. - P. 327-343

102. Environmental signatures associated with cholera epidemics. 2009 / G.C. De Magny et al. // PNAS. 2008. - Vol. 105, N 46. - P. 17676-17681

103. Epidemiologic study of Vibrio cholerae Ol and 0139 in Thailand: at the advancing edge of the eighth pandemic / C. W. Hoge et al. // Amer. J. Epidemiol. 1996. - Vol. 143, N 3. - P. 263-268

104. Escalating association of Vibrio cholerae 0139 with cholera outbreaks in India / S. Sinha et al. // J. Clin. Microbiol. 2002 - Vol. 40, N 7. -P. 2635-2637

105. Evolutionary relationships of pathogenic clones of Vibrio cholerae by sequence analysis of four housekeeping genes / R. Byun et al. // Infect. Immun. 1999. - Vol. 67, N 3. - P. 1116-1124

106. Faruque, S.M. Epidemiology, Genetics and Ecology of Toxigenic Vibrio cholerae 11 S.M. Faruque, M.J. Albert, J.J. Mekalanos // Microbiol, and Molecular Biology Reviews. 1998. - Vol. 62, No. 4. - P. 1301-1314

107. Faruque, S.M. Pathogenicity islands and phages in Vibrio cholerae evolution / S.M. Faruque, J.J. Mekalanos // Trends Microbiol. 2003. -Vol. 11,№ ll.-P. 505-510

108. Faruque, S.M. Genomic analysis of the Mozambique strain of Vibrio cholerae reveals the origin of El Tor strains carrying classical CTX prophage / S.M. Faruque, V.C. Tarn, N. Chowdhury // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2007. - Vol. 104.-P. 5151-5156

109. Global impact of Vibrio cholerae interactions with chitin / C. Pruzzo et al. // Environ. Microbiol. 2008. - Vol. 10, N. 6. - P. 1400-1410

110. Flalpern, M. Waterfowl The Missing Link in Epidemic and Pandemic Cholera Dissemination / M. Halpern, Yi. Senderovich, I. Izhaki. // PLoS Pathog 4(10): el000173. / doi:10.1371. journal.ppat. 1000173

111. Hostacka, A. Temperature and pH affect the production of bacterial biofilm / A. Hostacka, I. Ciznar, M. Stefkovicova // Folia Microbiol (Praha). 2010. - Vol. 55, N 1. - P. 75-78138. http:// pcr-rus.narod.ru/primer.htm139. http://www.promedmail.org

112. IASR. -2002. Vol. 23. - P. 219-220;

113. IASR.-2006.-Vol. 27.-P. 1-2

114. Identification of genes involved in the switch between the smooth and rugose phenotypes of Vibrio cholerae / M.H. Rashid et al. // FEMS Microbiol. Lett. 2003. - Vol. 227. - P. 113-119

115. Incidence and molecular analysis of Vibrio cholerae associtted with cholera outbreak subsequent to the super cyclone in Orissa / G.P. Chhotray et al. 11 India Epidemiol. Infect. 2002. - Vol.128, N 2. - P. 131-138

116. Induction of the lysogenic phage encoding cholera toxin in naturally occurring strains of toxigenic Vibrio cholerae Ol and 0139 / S.M. Faruque et al. // Infect. Immun. 1998. - V. 66, № 3. - P. 3752-3757

117. Islam, M.S. Attachment of toxigenic Vibrio cholerae Ol to various freshwater plants and survival with filamentous green algae Rhizocloniumfontanum / M.S. Islam, B.S. Draser, D.J. Bradley // J. Trop. Med. Hyg. -1989.-Vol. 92.-P. 396-401

118. Isolation of Vibrio cholerae Ol from aquatic environment and foods in Pernambuco State, Brazil / W. Colaco et al. // Cad. Saude Publica. -1998. Vol 14, N 3. - P. 465-471

119. Isolation of Vibrio cholerae Ol strains similar to pre-seventh pandemic El Tor strains during an outbreak of gastrointestinal disease in an island resort in Fiji / G.B. Nair et al. // J. Med. Microbiol. 2006. - Vol. 55, N 11.-P. 1559-1562

120. Kogure, K. A tentative direct microscopic method for counting living marine bacteria / K. Kogure, U. Simidu, N. Taga // Can. J. Microbiol. -1979.-Vol. 25.-P. 415-420

121. Light and electron microscopic examinations of methane-producing biofilms from anaerobic fixed-bed reactorst / R. W. Robinson et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1984. - Vol. 48, No. 1. - P. 127-136

122. Lipp, E.K. Effects of global climate on injectious disease: the cholera model / E.K. Lipp, A. Huq, R.R. Colwell // Clin. Microbiol. Rev. 2002. -Vol.15, №4.-P. 757-770

123. Marsh, J.W. Genetik and transcriptional analyses of the Vibrio cholerae mannose-sensitive hemagglutinin type 4 pilus gene locus / J.W. Marsh, R.K. Taylor IIJ. Bacteriol. 1999. - Vol. 181, № 4. - P. 1110-1117

124. Minor pilin subunits are conserved in Vibrio cholerae type IV pili / G. Torna et. al. // FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2002. - Vol. 23. - P. 35-40.

125. Molecular analysis of Vibrio cholerae Ol, 0139, non-Ol and non-0139 strains: clonal relationships between clinical and environmental isolates / D.V. Singh et al. // Am. J. Epidemiol. 2001. - Vol. 146, N 2. -P. 910-921

126. Molecular characterisation of rough strains of Vibrio cholerae isolated from diarrhoeal cases in India and their comparison to smooth strains / K. De et al. // FEMS Microbiol. Lett. 2004. - Vol. 232, N 1.- P. 23-30

127. Molecular characterization of rough variants of Vibrio cholerae isolated from hospitalized patients with diarrhea / R.K. Mitra et al. // J. Med. Microbiol. 2001. - Vol. 502, P. 268-276

128. Molecular epidemiology of Vibrio cholerae 0139 in China: polymorphism of ribotypes and CTX elements. / M. Qu et al. // J. Clin. Microbiol. 2003. - Vol. 41. - P. 2306-2310

129. Moorthy, S. Cenetic evidence that the Vibrio cholerae monolayer is a distinct stage in biofilm development / S. Moorthy, P.J. Watnic // Mol. Microbiol. 2004. - V.52, № 2. - P.573-587

130. New insights on the emergence of cholera in Latin America during 1991: the Peruvian experience / C. Seas et al. // Am. J. Med. Flyg. 2000. -Vol. 62, N4.-P. 513-517

131. New Variants of Vibrio cholerae Ol Biotype El Tor with Attributes of the Classical Biotype from Hospitalized Patients with Acute Diarrhea in Bangladesh / G.B. Nair et al. II J. Clin. Microbiol. 2002 . - Vol. 40, No. 9.-P. 3296-3299

132. Okoh, A.I. Antibiotic susceptibility profiles of some Vibrio strains isolated from wastewater final effluents in a rural community of the Eastern Cape Province of South Africa / A.I. Okoh, E.O. Igbinosa // BMC Microbiol. 2010. - Vol.14, N 10. - P. 143

133. Optical Sectioning of Microbial Biofilms / J. R. Lawrence et al. / J. Bacterid. 1991. -Vol. 173, No. 20.-P. 6558-6567

134. O'Shea, M.L. Detection and disinfection of pathogens in storm-generated flows / M.L. O'Shea, R. Field // Can. J. Microbiol. 1992. -Vol. 38.-P. 267-276

135. Phenotypic and Genotypic Characteristics and Epidemiological Significance of ctx+ Strains of Vibrio cholerae isolated from Seafood in Malaysia

136. C. Chen et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2004. - Vol. 70, N 4. - P. 1964-1972

137. Potasman, I. Infectious outbreaks associated with bivalve shellfish consumption: a worldwide perspective / I. Potasman, A. Paz, M. Oden. // Clin. Infect. Dis. 2002. - Vol. 15, Is. 35, N 8. - P. 921-928

138. Presence of vibrios in surface water and their relation with cholera in a community / M.U. Khan et al. // Trop.Geogr. Med. 1984. - Vol. 36. -P. 335-340

139. Rabbani, G.H. Food as a vehicle of transmission of cholerae / G.H. Rabbani, W.B. Greenough // J. Diarrhoeal Dis. Res. 1999. - V.17, № 1. - P. 1-9

140. Rapid polymerase chain reaction method for detection of Vibrio cholerae in foods / W.H. Koch et al. // Appl. Environ. Microbiol. 1993. -Vol. 59, №2.-P. 556-560

141. Rawlings, T.K. Association of 2007 Vibrio cholerae Ol El Tor and 0139 Bengal with the Copepods Acartia tonsa and Eurytemora affinis / T.K. Rawlings, G.M. Ruiz // Appl. Environ. Microbiol. 2007. - Vol. 73, N 24.- P. 7926-7933

142. Regulation, replication, and integration functions of the Vibrio cholerae CTXphi are encoded by region RS2 / M.K. Waldor et al. // Mol. Microbiol. 1997. - Vol. 24, №5. -P. 917-926

143. Schneider, D.R. Purification and characterization of the mucinase of Vibrio cholera / D.R. Schneider, C.D. Parker // J. Infect. Dis. 1982. -Vol. 145.-P. 472-482

144. Scope of potential bacterial agents of diarrhea and microbial assessment of quality of river water sources in rural Venda communities in South Africa / C.L. Obi et al.. // Water Sci. Technol. 2003. - V. 47, № 3. -P. 59-64

145. Seasonal cholera caused by Vibrio cholerae serogroups Ol and 0139 in the coastal aquatic environment of Bangladesh / M. Alam et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2006. - Vol. 72, №.6 - P. 4096-4104

146. Seasonal epidemics of cholera inversely correlate with the prevalence of environmental cholera phages / S.M. Faruque et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA.-2005.-Vol. 102, N5.-P. 1702-1707

147. Self-limiting nature of seasonal cholera epidemics: Role of hostmediated amplification of phage / S.M. Faruque et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2005. - Vol. 102, N 17. - P. 6119-6124

148. Stoodley, P. Liquid flow in biofilin systems / P. Stoodley, D. DeBeer, Z. Lewandowski // Appl. Environ. Microbiol. 1994. - Vol. 60. - P. 27112716

149. The Amazonia variant of Vibrio cholerae: molecular identification and study of virulence genes / M.A.S. Baptista et al. // Mem. Inst. Oswaldo. Crus. 1998. - Vol. 93, № 5. - P. 601-607

150. The spatial epidemiology of cholerae in an endemic area of Bangladesh / M. Ali et al. // Soc. Sei. Med. 2002. - Vol. 55, N 6. - P. 1015-1024

151. Toxigenic Vibrio cholerae in the aquatic environment of Mathbaria, Bangladesh / M. Alam et al. // Appl. Environ. Microbiol. 2006. - Vol. 72, N4.-P. 2849-2855

152. Transmissibility of cholera: in vivo-formed biofilms and their relationship to infectivity and persistence in the environment / S.M. Faruque et al. // Proc. Natl. Acad. Sei. USA. 2006. - Vol. 103, N 16. - P. 6350-6355

153. Vezzulli, L. Environmental reservoirs of Vibrio cholerae and their role in cholera / L. Vezzulli et al. // Environ. Microbiol. Reports. 2010. -Vol. 2, N 1. - P. 27-33

154. Viability of the nonculturable Vibrio cholerae 01 and 0139 / S.Chaiyanan et al. // Syst. Appl. Microbiol. 2001. - V. 24, № 3. - P. 331341

155. Viability of Vibrio cholerae Ol in different types of water under experimental conditions/ J.M. Nogueira et al. Il Cad Saude Publica. 2002. -Vol. 18, N. 5.-P. 1339-1345

156. Viable but nonculturable Vibrio cholerae Ol in the aquatic environment of Argentina / N Binsztein et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2004. - Vol. 70, N 12. - P. 7481-7486

157. Vibrio cholerae hemagglutinin/protease degrades chironomid egg masses / M. Halpern et al. II Appl. Environ. Microbiol. 2003. - Vol. 69, N 7. - P. 4200-4204

158. Vibrio cholerae Ol can assume a chlorine-resistant rugose survival form that is virulent for humans / J.GJr.Morris et al. // J. Infect. Dis. -1996.-Vol. 174, N6.-P. 1364-1368

159. Vibrio cholerae Ol strains are facultative intracellular bacteria, able to survive and multiply symbiotically inside the aquatic free-living amoeba Acanthamoeba castellanii / Ii. Abd et al. // FEMS Microbiol. Ecol. 2007. -Vol. 60, N 1. - P. 33-39

160. Virulence genes in environmental strains of Vibrio cholerae / S. Cha-kraborty et al. II Appl. Environ Microbiol. 2000. - Vol. 66, N 9. -P. 4022-4028

161. Wai, S.N. How Vibrio cholerae survive during starvation / S.N. Wai, Y. Mizunoe, S.-I. Yoshida // FEMS Microbiology. 1999. - Vol. 180. - P. 123-131

162. Waldor, M.K. Lysogenic conversion by a filamentous phage encoding cholera toxin / M.K. Waldor, J.J. Mekalanos // Science. 1996. - V. 272, N5270.-P. 1910-1914

163. Watnick, P.I. Steps in the development of a Vibrio cholerae El Tor biofilm / P.I. Watnick, R. Kotler // Mol. Mikrobiol. 1999. - № 34. -P. 586-595

164. Weekly epidemiological record 2005. - Vol.80, № 31. - P. 261-268 http://www.who.int/wer

165. Weekly epidemiological record 2006. - Vol.81, № 31. - P. 297-308

166. Weekly epidemiological record 2007. - Vol.82, № 31. - P. 273-284