Индукция иммунитета против чумы аттенуированным штаммом Yersinia pseudotuberculosis тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Трунякова Александра Сергеевна

• Трунякова Александра Сергеевна
• кандидат наук
• 2026

Оглавление диссертации кандидат наук Трунякова Александра Сергеевна

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

Степень разработанности темы исследования

Цель исследования

Задачи исследования

Научная новизна исследования

Теоретическая и практическая значимость исследования

Методология и методы исследования

Материалы исследования

Микробиологические методы

Молекулярно-генетические методы

Биохимические методы

Биологические методы

Иммунологические методы

Статистический анализ

Личное участие автора в получении результатов

Основные положения диссертации, выносимые на защиту

Степень достоверности и апробация результатов исследования

ГЛАВА 1 ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Перспективы разработки вакцин против чумы и псевдотуберкулеза

1.2 Преимущества вакцин с пероральной доставкой

1.3 Лицензированные оральные вакцины и прототипы препаратов против инфекций, вызываемых бактериальными патогенами

1.3.1 Вакцины против холеры

1.3.2 Вакцины против брюшного тифа

1.3.3 Вакцины против шигеллеза

1.3.4 Вакцины против диареегенных Escherichia coli

1.3.5 Вакцины против хеликобактериоза

1.3.6 Вакцина против чумы

1.3.7 Вакцина против бруцеллеза

1.3.8 Вакцина против сибирской язвы

1.4 Факторы патогенности Yersinia pseudotuberculosis', мишени для аттенуации при создании живых и векторных вакцин

1.4.1 Белки Yops

1.4.2 Регулятор экспрессии T3SS

1.4.3 Система секреции VI-го типа (T6SS)

1.4.4 Система двойной транслокации аргинина

1.4.5 Факторы адгезии

1.4.6 Инвазины

1.4.7 ДНК-аденинметилаза

1.4.8 Шапероны

1.5 Разработка оральных вакцин против чумы и псевдотуберкулеза на основе живых аттенуированных штаммов Yersinia pseudotuberculosis

1.6 Заключение по главе

РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

ГЛАВА 2 ВЫБОР И ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММА

Yersinia pseudotuberculosis

2.1 Поиск штамма псевдотуберкулезного микроба

2.2 Определение вирулентности штаммов Yersinia pseudotuberculosis

2.3 Определение способности штамма Yersinia pseudotuberculosis 85 колонизировать организм мышей при пероральном введении

2.4 Полногеномное секвенирование, сборка генома и аннотирование

2.4.1 Филогенетическое исследование

2.4.2 Мультилокусное сиквенс-типирование и определение серотипа

2.4.3 Сравнение структур хромосомы и плазмиды штаммов Yersinia pseudotuberculosis 85 и Yersinia pseudotuberculosis IP

2.5 Заключение по главе

ГЛАВА 3 КОНСТРУИРОВАНИЕ И ХАРАКТЕРИСТИКА РЕКОМБИНАНТНЫХ ШТАММОВ Yersinia pseudotuberculosis С

ДЕЛЕЦИЯМИ ГЕНОВ, ОТВЕТСТВЕННЫХ ЗА НАРУШЕНИЕ БИОГЕНЕЗА НАРУЖНОЙ МЕМБРАНЫ

3.1 Оптимизация методов селекции штаммов Yersinia pseudotuberculosis на плотных питательных средах

3.2 Получение штаммов с мутациями в генах surA, degP, bamB и ompH

3.3 Влияние делеции генов surA, degP, bamB и ompH на рост Yersinia pseudotuberculosis

3.4 Оценка целостности и проницаемости наружной мембраны

3.5 Исследование композиции белков наружной мембраны

3.6 Устойчивость к действию нормальной человеческой сыворотки

3.7 Важность нокаута для вирулентности штаммов при заражении мышей

3.8 Заключение по главе

ГЛАВА 4 СОЗДАНИЕ РЕКОМБИНАНТНОГО ШТАММА-ПРОДУЦЕНТА КАПСУЛЬНОГО АНТИГЕНА ЧУМНОГО МИКРОБА С ТЕМПЕРАТУРОНЕЗАВИСИМЫМ СИНТЕЗОМ

4.1 Клонирование caf оперона

4.2 Серологическая активность

4.3 Выделение F1 антигена

4.4 Иммунологическая активность препаратов F1 антигена

4.5 Конструирование мутантных штаммов Yersinia pseudotuberculosis, продуцирующих F1 антиген

4.6 Оценка уровня F1 антигена в бактериальных культурах мутантных штаммов

4.7 Заключение по главе

ГЛАВА 5 ИММУНОЛОГИЧЕСКАЯ АКТИВНОСТЬ РЕКОМБИНАНТНЫХ

ШТАММОВ Yersinia pseudotuberculosis

5.1 Гуморальный иммунный ответ на пероральное введение рекомбинантных штаммов Yersinia pseudotuberculosis

5.2 Клеточный иммунный ответ на пероральное введение рекомбинантных штаммов Yersinia pseudotuberculosis

5.3 Пероральная иммунизация рекомбинантными штаммами Yersinia pseudotuberculosis предоставляет защиту при заражении чумным и псевдотуберкулезным микробом

5.3.1 Защита мышей от летального заражения Yersinia pseudotuberculosis

5.3.2 Защита мышей от летального заражения Yersiniapestis на модели бубонной и легочной чумы

5.4 Кинетика распространения в организме мышей и реактогенность экспериментальных штаммов

5.5 Определение LD50 вирулентного штамма для иммунизированных беспородных мышей при моделировании бубонной и легочной чумы

5.6 Иммунологическая активность штаммов Yersinia pseudotuberculosis 85AdegP и Yersinia pseudotuberculosis 85AdegP/pPKB-F1 при пероральной иммунизации крыс

5.7 Заключение по главе

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Индукция иммунитета против чумы аттенуированным штаммом Yersinia pseudotuberculosis»

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы исследования

Yersinia pestis - грамотрицательная бактерия из порядка Enterobacterales, чьим прародителем принято считать энтеропатогенный микроорганизм Yersinia pseudotuberculosis. Разделение этих видов по оценкам M. Achtman et al. [22] произошло примерно 1500-20000 лет назад. Y. pestis является возбудителем чумы и передается, как правило, при укусах инфицированных блох, провоцируя развитие бубонной формы заболевания. При неблагоприятном течении возможен переход в легочную форму чумы, характеризующуюся передачей от человека к человеку посредством аэрозоля. Из-за высокой летальности легочной формы, Y. pestis рассматривается как потенциальное биологическое оружие [118]. На территории Мадагаскара были идентифицированы штаммы Y. pestis, демонстрирующие природную множественную устойчивость к антибиотикам, включая те, что рекомендованы для терапии и экстренной профилактики чумы [258]. Кроме того, изоляты, полученные из Монголии в ходе исследования, еще раз подтверждают существование естественных вариантов Y. pestis со множественной лекарственной устойчивостью [125]. Одним из эффективных методов профилактики, особенно в отношении заболеваний, вызываемых резистентными штаммами, является вакцинация.

Живую вакцину против чумы, основанную на аттенуированном штамме Y. pestis EV76, продолжают применять в Российской Федерации, странах СНГ и Китае. Препарат обеспечивает защиту от бубонной и легочной форм инфекции, индуцирует клеточное звено иммунитета и выработку высоких уровней специфических антител, однако может вызывать побочные реакции различной степени тяжести [155]. Показано, что иммуногенность и остаточная вирулентность различных линий вакцинного штамма EV76, поддерживаемых в отдельных лабораториях, варьирует [155, 279], что может быть связано с высокой геномной пластичностью Y. pestis [30], обусловленной множественными инсерционными последовательностями (IS), способствующими хромосомным перестройкам. Альтернативные вакцины, представляющие собой убитые цельноклеточные

препараты, ранее производившиеся, например, в США (USP) и Австралии (CSL), требовали бустерной иммунизации, отличались повышенной реактогенностью и обеспечивали кратковременную и более слабую защиту по сравнению с EV76 [155].

На сегодняшний день разрабатывается ряд субъединичных вакцин против чумы, находящихся на различных этапах доклинических или клинических исследований. Чаще всего в их состав входят видоспецифический капсульный антиген F1 (Caf1) и/или V антиген (LcrV), общий для всех трех патогенных для людей видов рода Yersinia. Такие вакцины демонстрируют высокую защитную эффективность в модельных экспериментах на мышах и обладают хорошей переносимостью у людей [26, 110, 245, 265, 266]. Однако наличие высокопатогенных природных штаммов Y. pestis, не экспрессирующих F1 антиген [268], а также наличие вариабельности в структуре V антигена [26], существенно ограничивает их эффективность.

Живые вакцины обладают рядом значимых преимуществ по сравнению с инактивированными аналогами. Широкий спектр представленных антигенов способствует формированию комплексного иммунного ответа. При этом антигены синтезируются in vivo в процессе персистенции бактерий в организме, сохраняя нативную конформацию, что обеспечивает длительную стимуляцию иммунной системы. Вводить адъювант не требуется, поскольку собственные компоненты бактерии, такие как липополисахариды и другие патоген-ассоциированные молекулы, сами по себе стимулируют иммунитет. Кроме того, живые вакцины активируют как гуморальное, так и клеточно-опосредованное звено иммунного ответа, а также являются более рентабельными при массовом производстве [23].

Степень разработанности темы исследования

Чтобы преодолеть недостатки живых, инактивированных и субъединичных вакцин исследователи используют разные стратегии [70, 196, 214, 254], одной из которых является создание вакцинного препарата на основе аттенуированного штамма Y. pseudotuberculosis.

Псевдотуберкулез - природно-очаговый зооноз, основным резервуаром

которого, как и при чуме, служат дикие и синантропные грызуны, а также домашние и сельскохозяйственные животные [47, 91]. Y. pseudotuberculosis серотипа O:1b - эволюционный предок Y. pestis с 96-99% генетической идентичностью и более стабильным геномом ввиду меньшего количества IS-элементов [23, 57]. Оба вида бактерий содержат плазмиду pCad (pCD1, pYV), ответственную за экспрессию системы секреции III типа (T3SS) [63]. При этом, несмотря на значительное антигенное сходство, бактерия Y. pseudotuberculosis существенно менее патогенна, чем этиологический агент системной кровяной инфекции чумы - Y. pestis [116], и вызывает острое инфекционное заболевание, поражающее желудочно-кишечный тракт. Сочетание этих качеств лежит в основе неоднократных попыток сконструировать кандидатную оральную чумную вакцину на основе аттенуированного штамма возбудителя псевдотуберкулеза [45, 75, 145, 191, 204, 228, 235].

В связи с этим, перспективным направлением является поиск новых мишеней для аттенуации и создание оральной вакцины на основе аттенуированных штаммов Y. pseudotuberculosis. Такой препарат обеспечит защиту и будет обладать преимуществами перед парентеральными вакцинами, такими как возможность быстрого охвата массовых контингентов, более высокий уровень безопасности, удобство введения и упрощенная технология производства.

Цель исследования - Получение новых сведений о развитии протективного иммунитета у лабораторных животных после перорального введения живого аттенуированного штамма Y. pseudotuberculosis.

Задачи исследования:

1. Выбрать и охарактеризовать штамм Y. pseudotuberculosis для аттенуации и использования в качестве заражающего.

2. Провести аттенуацию штамма Y. pseudotuberculosis путем делеции генов, отвечающих за синтез белков-шаперонов SurA, OmpH, DegP и белка BamB олигомерного мембран-ассоциированного комплекса.

3. Создать рекомбинантные штаммы Y. pseudotuberculosis, обладающие стабильной суперпродукцией капсульного антигена чумного микроба.

4. Оценить остаточную вирулентность, реактогенность и иммунологическую активность сконструированных штаммов Y. pseudotuberculosis при пероральном введении.

Научная новизна исследования При проведении сравнительной характеристики показано, что штамм Y. pseudotuberculosis 85 превосходит по вирулентности для беспородных мышей при разных способах введения штаммы Y. pseudotuberculosis 529-3260 и H-4795, что позволяет использовать его для моделирования псевдотуберкулезной инфекции при изучении патогенеза псевдотуберкулеза, оценке эффективности терапевтических препаратов, средств экстренной и специфической профилактики.

Обнаружено наличие штаммовых отличий в чувствительности Y. pseudotuberculosis к полимиксину Б, триклозану и генцианвиолету, а также установлен диапазон оптимальных концентраций данных препаратов (2-250 мкг/мл, 5-25 мкг/мл и 10-15 мкг/мл соответственно), позволяющих эффективно отобрать рекомбинантные клоны Y. pseudotuberculosis из конъюгационной смеси с донорным штаммом кишечной палочки.

Разработаны приемы создания немаркированных делеционных мутантов Y. pseudotuberculosis методом сайт-направленного мутагенеза с использованием суицидных векторов, включающие конъюгативный перенос суицидного вектора, содержащего предварительно клонированную мутантную аллель, получение маркированного делеционного мутанта при удалении интегрированного в хромосому суицидного вектора и последующее удаление маркера антибиотикоустойчивости.

Впервые показано, что делеция гена bamB приводит к наибольшей степени нарушения целостности клеточной оболочки возбудителя псевдотуберкулеза, что сопровождается повышением антибактериальной эффективности энрофлоксацина, ванкомицина, доксициклина и азитромицина, приобретением чувствительности к дезоксихолату натрия и додецилсульфату натрия, а также утратой устойчивости к бактерицидной активности комплемента сыворотки. Утрата синтеза белка SurA Y. pseudotuberculosis сопровождается приобретением чувствительности к

додецилсульфату натрия и комплементу сыворотки крови, а отсутствие синтеза OmpH ведет к возникновению чувствительности к додецилсульфату натрия и ванкомицину.

Выявлена высокая степень аттенуации штаммов Y. pseudotuberculosis 85 с делетированными генами surA, degP, bamB для беспородных мышей, что наряду с обнаруженной 100% защитой от гибели экспериментальных животных после однократной пероральной иммунизации данными штаммами при последующем заражении псевдотуберкулезным микробом позволяет рассматривать их в качестве кандидатных при создании средств специфической профилактики псевдотуберкулеза.

Сконструирован штамм Y. pseudotuberculosis 11M/pPKB-F1 - эффективный продуцент капсульного антигена. Впервые установлено, что протективные свойства высокоочищенного препарата F1 антигена превосходят аналог, выделенный в изоэлектрической точке (патент на изобретение РФ № RU 2844170 С1 от 28.07.2025 г.).

Впервые при пероральном введении беспородным мышам штаммов Y. pseudotuberculosis 85AdegP и 85AdegP/pPKB-F1 показано отсутствие реактогенности (безвредности) и выявлена способность мутантных штаммов колонизировать внутренние органы, способствуя формированию напряженного гуморального и клеточного иммунитета. Впервые показана способность штамма Y. pseudotuberculosis 85AdegP защищать от гибели беспородных мышей при моделировании бубонной и легочной чумы после заражения вирулентным штаммом Y. pestis 231 или вирулентным непродуцирующим капсулу штаммом Y. pestis 358/12.

Впервые продемонстрировано, что пероральная иммунизация крыс штаммами Y. pseudotuberculosis 85AdegP и 85AdegP/pPKB-F 1 в дозе 109 КОЕ стимулирует формирование гуморального и клеточного иммунного ответа и защищает, в случае иммунизации штаммом 85AdegP, 100% животных от подкожного и интраназального заражения 150 LD50 и 30 LD50 вирулентного штамма Y. pestis 231 соответственно. Наличие в кандидатной вакцине F1 антигена

(85AdegP/pPKB-F1) положительно коррелировало со снижением числа выживших примерно до 90%.

Теоретическая и практическая значимость исследования

Данные, полученные в ходе диссертационной исследования, демонстрируют, что использование живых аттенуированных штаммов Y. pseudotuberculosis способствует формированию перекрестного иммунитета против двух патогенных для человека представителей рода Yersinia. Эти результаты расширяют представление о молекулярных механизмах патогенеза иерсиниозов и чумы, а также микроэволюции иерсиний.

Определение функциональной значимости генов, кодирующих белки-шапероны SurA, OmpH, DegP и белок BamB олигомерного мембран-ассоциированного белкового комплекса, формирует представление о биогенезе наружной мембраны Y. pseudotuberculosis, необходимое для поиска мишеней для антимикробных субстанций и сайт-направленного мутагенеза при создании новых препаратов для терапии и иммунопрофилактики чумы и псевдотуберкулеза.

Предложен штамм Y. pseudotuberculosis 85 - перспективный кандидат для аттенуации и использования в качестве тест-заражающего при оценке эффективности иммунитета к псевдотуберкулезу.

Для подавления роста донорных штаммов кишечной палочки при проведении оптимизации метода селекции клеток псевдотуберкулезного микроба на этапе первичной рекомбинации рекомендовано использование триклозана, полимиксина Б или генцианвиолета, а также установлена их взаимозаменяемость.

Показана принципиальная возможность создания на основе аттенуированных рекомбинатных штаммов Y. pseudotuberculosis 85AdegP и 85AdegP/pPKB-F 1 кандидатного вакцинного препарата, пероральное введение которого способно защитить от гибели мышей и крыс при моделировании бубонной и легочной чумы.

Методика использования суицидного вектора pCVD442 для сайт-направленного мутагенеза оформлена в виде методических рекомендаций «Получение нокаутных мутантов Yersinia pseudotuberculosis с использованием

суицидного вектора» (утверждены директором ФБУН ГНЦ ПМБ 29.03.2024 г., протокол № 2). Методика оценки безвредности рекомбинантных штаммов Y. pseudotuberculosis оформлена в виде методических рекомендаций «Определение степени остаточной вирулентности (безвредности) аттенуированных штаммов Yersinia pseudotuberculosis» (утверждены директором ФБУН ГНЦ ПМБ 25.06.2025 г., протокол № 5).

Экспериментально доказана возможность применения высокоочищенного препарата капсульного F1 антигена чумного микроба, полученного из сконструированного рекомбинантного низкоэндотоксичного штамма-суперпродуцента Y. pseudotuberculosis 11M/pPKB-F1, в качестве компонента кандидатной субъединичной чумной вакцины.

Депонированы в Государственную коллекцию патогенных микроорганизмов и клеточных культур «ГКПМ-Оболенск» (п. Оболенск, Московская обл.) 9 штаммов: Y. pseudotuberculosis 85 (B-16895), Y. pseudotuberculosis 85AsurA (B-16588), Y. pseudotuberculosis 85AdegP (B-16589), Y. pseudotuberculosis 85AbamB (B-16590), Y. pseudotuberculosis 85AompH::cat (B-16591), Y. pseudotuberculosis 11M/pPKB-F1 (B-9142), Y. pseudotuberculosis 85AsurA/pPKB-F1 (B-16585), Y. pseudotuberculosis 85AdegP/pPKB-F1 (B-16586), Y. pseudotuberculosis 85 AbamB/pPKB-F1 (B-16587).

Нуклеотидные последовательности хромосомы и плазмиды кальцийзависимости pCad (pCD, pYV) штамма Y. pseudotuberculosis 85 (SCPM-O-B-16895) депонированы в международную базу данных NCBI под номерами CP180261 и CP180262 соответственно.

Полная аннотированная последовательность генома высоковирулентного штамма Y. pseudotuberculosis 85 используется в Федеральном казенном учреждении здравоохранения «Ростовский-на-Дону ордена Трудового Красного Знамени научно-исследовательский противочумный институт» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в качестве референтной при сравнительном анализе штаммов возбудителя псевдотуберкулеза, выделенных на территории России, с помощью различных

методов генетической дифференциации, определения качества и полноты геномных сборок исследуемых штаммов, выявления геномных различий, влияющих на культуральные, биохимические и патогенетические свойства (акт внедрения от 15.07.2025 г.).

Результаты, полученные в ходе диссертационного исследования, внедрены в учебные и методические материалы программы дополнительного профессионального образования «Микробиология». Основы биологической безопасности и практика работ с микроорганизмами I-IV групп патогенности» Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (акт внедрения от 29.07.2025 г.).

Методология и методы исследования Методология исследования соответствовала поставленным задачам. Предметом исследования являлись три белка шаперона SurA, OmpH, DegP и белок BamB олигомерного мембран-ассоциированного белкового комплекса Y. pseudotuberculosis, а также роль белков в обеспечении целостности и проницаемости наружной мембраны, вирулентности штаммов Y. pseudotuberculosis и протективности созданных мутантов при разных способах заражения.

Материалы исследования Штаммы микроорганизмов, плазмиды, праймеры. В работе использовали 17 штаммов бактерий: E. coli (n = 1), Y. pestis subsp. pestis (n = 4) и Y. pseudotuberculosis (n = 12) (Таблица 1). Использованные в работе плазмиды и нуклеотидные последовательности праймеров представлены в таблицах 2 и 3.

Таблица 1 - Характеристика штаммов, использованных в работе

Источник

п/н Номер штамма (особое название) Характеристика получения и (или) ссылка на литературу

Y. pseudotuberculosis

1 85 O:1b, pCad+, вирулентный ГКПМ-Оболенск

2 11M O:1b, pCad", авирулентный ГКПМ-Оболенск

3 11M/pPKB-F1 O:1b серотип, производный 11M, продуцент НИ*

капсульного антигена (F1) Y. pestis

4 85 AsurA pCad+ surA~ НИ*

Продолжение таблицы 1

Источник

п/н Номер штамма (особое название) Характеристика получения и (или) ссылка на литературу

5 85AswrA/pPKB-F1 рСаё+ surA~ продуцент капсульного антигена (Т1) Y. pestis НИ*

6 85 AdegP рСаё+ degP- НИ*

7 85 AdegP/pPKB -F1 рСаё+ degP продуцент капсульного антигена (Т1) Y. pestis НИ*

8 85 AbamB рСаё+ bamB~ НИ*

9 85 AbamB/pPKB -F1 рСаё+ bamB~ продуцент капсульного антигена (Т1) Y. pestis НИ*

10 85 AompH::cat рСаё+ ompH~ НИ*

11 Н-4795 0:1Ь, рСаё+ ГКПМ-Оболенск

12 О:1Ь, рСаё+рУМ82+ ГКПМ-Оболенск

Y. pestis

13 231 Штамм дикого типа; универсально вирулентный, Р§ш+, рБга, рСаё, рРБ1 ГКПМ-Оболенск

14 358/12 Ега"Тох"Ьсг+Р81+Р1а+Р§ш+, вирулентный рСаё, рРБ1 (БиЬвр. pestis ЬУ. шеё1еуа11в) ГКПМ-Оболенск

15 EV НИИЭГ рБга, рСаё, рРБ1 Apgm, вакцинный; линия EV, поддерживаемая в России для производства живой чумной вакцины ГКПМ-Оболенск

16 1146 Рб^, бесплазмидный, авирулентный ГКПМ-Оболенск

E. coli

17 S17-1 Xpir thi pro hsdR hsdM+ recA RP4 2-Tc::Mu- ГКПМ-Оболенск

Km::Tn7(TpR SmR PmS)

Примечание: *НИ - настоящие исследование

Таблица 2 - Список использованных в работе плазмид

Источник

Плазмида Описание Цель использования получения и (или) ссылка на литературу

pKD46 bla Pbad gam bet exopSC101 oriTS плазмида, экспрессирующая X Red рекомбиназу, ApR [69]

pKD3 bla FRT cat FRT PS1 PS2 oriR6K RedGam мутагенез, ApROmR [69]

pKD4 bla FRT kan FRT PS1 PS2 oriR6K RedGam мутагенез, ApRKmR [69]

pCP20 bla cat cI857 IPfp pSC101 oriTS Вектор, экспрессирующий Flp-рекомбиназу [59]

pCVD442 ori R6K mob RP4 bla sacB суицидный вектор, ApR [181]

Продолжение таблицы 2

Плазмида Описание Цель использования Источник получения и (или) ссылка на литературу

рСУБ442 AsurA::kan ori Я6К mob ЯР4 ЬШ sacB Лрк Кшк суицидный вектор, несущий фрагмент AsжA::kan НИ

рСУБ442 AdegP::kan ori Я6К mob ЯР4 ЬШ sacB Лрк Кшк суицидный вектор, несущий фрагмент AdegP::kan НИ

рСУБ442 AbamB::kan ori Я6К mob ЯР4 ЬШ sacB Лрк Кшк суицидный вектор, несущий фрагмент AbamB::kan НИ

рСУБ442 AompH::cat ori Я6К mob ЯР4 ЬШ sacB Лрк Сшк суицидный вектор, несущий фрагмент AompH::cat НИ

рРКБ-Б1 Кшк плазмида, экспрессирующая антиген НИ

Таблица 3 - Нуклеотидные последовательности использованных праймеров

Праймер Нуклеотидная последовательность (5' ^3')

Общие тест-праймеры6

к1 сооттаслттсалттсстатттат

к2 алсалсталлстсааталаллтоа

с1 ттлтлсасллаасалсллаа

с2 алтсттссатслслаатлаа

У8сБР1и8 лслсслтлталатллсттстстаалтттлса

У8сБМ1пи8 лттстсалатаааллсттстатлаалта

1пу1007 ссслтлсасталтстлсс

1пу839 тлсстаслстссслсллс

CafP1us латтссаттлтсасслттас

CafMinus ааттлалтлсааттлсааттлс

р§ш-ш-Б таасслататслттлтлс

р§ш-ш-Я татттслсстлссатлас

ШООсЯ слсталсстсласалтас

Р§ш-Ю сллалтааллттсатсла

Локус-специфичные тест-праймеры

8игЛ1Б лталлаллстаалаллсасттлттстсаалттаатслтттатассл лтлссасатататлаастааластасттс

БигЛ1Я ттлттатааттатаслттлстлсслтсллаллтттттлслтлласла сласлсаслтаааллттласслтаатсс

8игЛ2Б ллсссслллсталллалстсл

БигЛ2Я лллтасссттаатаалстстл

Бе§Р1Б лталллллллсллстттлатлттллатаслттааслтталаслтта атттсасслататлаастааластасттс

Бе§Р1Я ттлстаслтсллтлллтлалаталлатлтслсслсатталлтлттс ллсассллтлтаааллттласслтаатсс

Продолжение таблицы 3

Праймер Нуклеотидная последовательность (5' ^3')

DegP2F GTCATCAGTGGGCTGCTTGA

DegP2R ATTGGGCACAGGCTGTCAGG

BamB1F ATGCAATTGCGTAAAACACTCTTAGTAGGACTGGTATCTGTTGCCC TATTGAGTGGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC

BamB1R TTAACGGGTGAACGCGTATACCGTACCGCTTCTTGCCTGAATCAAC AGCTTATCGATGGGAATTAGCCATGGTCC

BamB2F GTGCGGGTAATGTTAGTGCT

BamB2R GTTGAGCAATCCCCTGATCT

OmpH1F TTATTTAACCTGTTTCAATACGTCAGCAGTAATGTCTTTAGAAGAAT CAGCGTATGTGTAGGCTGGAGCTGCTTC

OmpH1R GTGAAAAAGTGGTTGTGTGCCGCAAGTCTAGGTTTAGCATTGGCTG CTTCAGCCAATGGGAATTAGCCATGGTCC

OmpH2F TCAACACGGTCGCCAATATG

OmpH2R TGACTAACTCTACCGATGCGGT

Питательные среды. Для выращивания микроорганизмов использовали агар или бульон Хоттингера (ФБУН ГНЦ ПМБ), pH 7,2 и LB, pH 7,2.

Лабораторные животные. В экспериментах использовали белых беспородных мышей (20 ± 2) г и белых крыс Wistar (190 ± 10) г (филиал «Андреевка» ФГБУН НЦБМТ ФМБА России) в соответствии с ГОСТ 33216-2014 «Руководство по содержанию и уходу за лабораторными животными». Протокол экспериментов с животными одобрен комитетом по биоэтике ФБУН ГНЦ ПМБ (ВП - 2021/3 от 02.11.2021 г.).

Микробиологические методы Для предотвращения утраты штаммом Y. pseudotuberculosis плазмиды pCad в среду культивирования добавляли хлорид кальция до концентрации 2,5 мМ. Отбор клеток, содержащих рекомбинантные плазмиды вели на средах с добавлением соответствующих антибиотиков (ампициллин - 100 мкг/мл, канамицин -40 мкг/мл, хлорамфеникол - 20 мкг/мл). Оценку скорости роста, определение чувствительности к антибиотикам, солям желчных кислот и додецилсульфату натрия экспериментальных штаммов проводили, как описано ранее [7].

Молекулярно-генетические методы Рестрикцию и лигирование проводили, как описано ранее [147]. Передачу рекомбинантных плазмид в штаммы E. coli и Y. pseudotuberculosis осуществляли методом конъюгации [157], электропорации [10] и криотрансформации [14].

Нокаутный мутагенез выполняли с помощью суицидного вектора pCVD442 [85]. Для второго этапа рекомбинации (удаление интегрированной плазмиды) проводили селекцию в присутствии 10% сахарозы [122]. Удаление кассеты устойчивости к антибиотику в инактивированных генах проводили с помощью вектора pCP20 [59]. Корректность проведения всех этапов мутагенеза подтверждали с помощью ПЦР с общими или локус-специфичными тест-праймерами (Таблица 4) и секвенирования.

Полногеномное секвенирование осуществляли на платформах MGISEQ-2000 (короткие единичные прочтения) и Nanopore MinlON (длинные единичные прочтения). Филогенетические исследования проводили с использованием программы Snippy v. 4.6.0. Сиквенс тип определяли на сервере MLST 2.0 (Multi-Locus Sequence Typing).

Биохимические методы

Выделение белков внешней мембраны проводили по модифицированному методу [54, 55, 86, 186]. Выделение капсульного антигена осуществляли методом изоэлектрической преципитации (pH 4,1) или ступенчатым осаждением сульфатом аммония с дальнейшей аффинной хроматографией [1]. Электрофоретический анализ белковых препаратов проводили по стандартной методике [18].

Биологические методы

Остаточную вирулентность штаммов Y. pseudotuberculosis определяли по величине LD50. Динамику распространения и оценку реактогенности проводили путем перорального введения беспородным мышам суспензии двухсуточных агаровых культур исследуемого и контрольного штаммов Y. pseudotuberculosis. Обсемененность органов (мезентериальные лимфатические узлы, Пейеровы бляшки, селезенка, печень, фекалии) изучали после вскрытия павших животных или эвтаназии на 4, 8, 12, 16 и 20 сут. Оценку реактогенности проводили для животных из опыта по изучению распространяемости, которых, согласно плану, умерщвляли на 12-20 сут после введения культур. Регистрируемые показатели: внешний вид, отклонения в поведенческих реакциях, изменение массы тела, симптомы инфекционного заболевания и гибель животных.

Иммунизацию мышей и крыс проводили перорально суспензиями экспериментальных штаммов. Животных лишали пищи и воды за 4 ч до иммунизации.

Напряженность иммунитета (индекс иммунитета - ИИ), т.е. способность сконструированного рекомбинантного штамма Y. pseudotuberculosis защищать животных от гибели после заражения массивными дозами вирулентного штамма чумного микроба рассчитывали по формуле (1):

ИИ = LD50имм/LD50инт, (1)

где LDsohmm - средняя летальная доза для иммунизированных животных; LD50hht - средняя летальная доза для интактных (не иммунизированных) животных.

Иммунологические методы Реакцию непрямой гемагглютинации (РНГА) проводили с диагностикумом чумным эритроцитарным иммуноглобулиновым. Определение чувствительности к бактерицидному действию комплемента проводили путем сравнительной оценки жизнеспособности культур после инкубации в нормальной человеческой сыворотке и сыворотке с инактивированным путем нагревания комплементом по методу M.G. Barnes et al. [37].

Титры антител к рекомбинантным белкам и лизатам клеток Y. pestis и/или Y. pseudotuberculosis в сыворотках иммунных мышей или крыс оценивали методом иммуноферментного анализа (ИФА) [266].

Уровень цитокинов IFN-y (BD Pharmingen™, США), TNF-a, IL-6 и IL-8 (Fine Biotech, Китай) в клеточном супернатанте спленоцитов in vitro определяли методом непрямого твердофазного ИФА согласно инструкциям производителей. Оценку пролиферативной активности лимфоцитов мышей и крыс проводили методом МТТ [159].

Статистический анализ

Статистический анализ проводили, используя Graph Pad Prism 6 (GraphPad Software, La Jolla, CA). Вычисление величин LD50, а также доверительных интервалов (для вероятности 95%) проводили по методу Karber в модификации И.П. Ашмарина и А.А. Воробьева [2].

Личное участие автора в получении результатов

Личное участие автора заключалось в анализе литературных данных, планировании экспериментов, выполнении молекулярно-биологических, микробиологических, биотехнологических и иммунобиологических исследований, анализе полученных результатов, в подготовке материалов для публикаций, в представлении устных и стендовых докладов на конференциях. Отдельные разделы работы выполнены в лаборатории биологических испытаний под руководством канд. биол. наук Комбаровой Т.И., в отделе коллекционных культур под руководством канд. биол. наук Кисличкиной А.А., в лаборатории молекулярной биологии под руководством канд. биол. наук Карцевой А.С. и канд. биол. наук Иващенко Т.А.

Основные положения диссертации, выносимые на защиту

1. Делеция любого из генов surA, degP и bamB приводит к полной, а ompH к частичной аттенуации вирулентного штамма Y. pseudotuberculosis 85 при подкожном, внутрибрюшинном и внутрижелудочном заражении на мышиной модели.

2. Сконструированная на основе репликона плазмиды пестициногенности pPst (pPCP1) Y. pestis рекомбинантная плазмида pPKB-F1, в которой ген, кодирующий синтез активатора плазминогена Pla, инактивировали путем вставки гена устойчивости к канамицину, с клонированным по сайтам EcoRI caf опероном плазмиды pFra (pMT1), обеспечивает стабильный температуронезависимый синтез капсульного антигена чумного микроба в штаммах Y. pseudotuberculosis.

3. Аттенуированный рекомбинантный штамм Y. pseudotuberculosis при пероральном введении обеспечивает формирование протективного иммунного ответа против псевдотуберкулеза и чумы.

Степень достоверности и апробация результатов исследования

Достоверность результатов определяется использованием современных методов, документально регистрирующих изучаемые явления и объекты, достаточным по объему фактическим материалом и наличием соответствующих контролей, а также проведением статистической обработки данных.

Работа выполнена в Федеральном бюджетном учреждении науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека в рамках отраслевой научно-исследовательской программы Роспотребнадзора на 2021-2025 гг.: «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации. Создание новых технологий, средств и методов контроля и профилактики инфекционных и паразитарных болезней» (номер регистрации ЕГИСМ 121022500007-6) и в рамках работы Центра геномных технологий мирового уровня по биобезопасности на базе Федерального бюджетного учреждения науки «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (Соглашение №2 075-152019-1671 от 31.10.2019 г. и 075-15-2025-525 от 30.05.2025 г. с Министерством науки и высшего образования Российской Федерации).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Трунякова Александра Сергеевна, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анисимов, А.П. Молекулярно-генетические механизмы образования и функциональная значимость капсулы Yersinia pestis: дис. ... д-ра мед. наук: 03.00.07 / Анисимов Андрей Павлович. - Саратов, 1999. - 326 с.

2. Ашмарин, И.П. Статистические методы в микробиологических исследованиях / И.П. Ашмарин, А.А. Воробьев. - Л.: Медгиз, 1962. - 180 c.

3. Бахтеева, И.В. Вирулентность для мышей pH 6+ и pH 6- штаммов Yersinia pestis / И.В. Бахтеева, С.В. Дентовская, Е.А. Панферцев, Т.Э. Светоч, Т.Б. Кравченко, М.Е. Платонов, Г.М. Титарева, Т.И. Комбарова, С.А. Иванов, А.П. Анисимов // Проблемы особо опасных инфекций. - 2008. - № 1. - С. 34-36.

4. Бугоркова, С.А. Научно-методическое обеспечение мероприятий по проведению иммунологического мониторинга вакцинированных против чумы лиц, проживающих на территориях природных очагов инфекции / С.А. Бугоркова, Т.Н. Щуковская, Н.И. Микшис, С.А. Щербакова, О.М. Кудрявцева, Е.В. Куклев, В.И. Дубровина, А.К. Носков, К.М. Корытов, С.В. Балахонов, Д.Н. Санджиев, С.В. Конушева, С.П. Савченко, Г.Б. Мацакова, Л.В. Щучинов, Е.П. Михайлов, Б.Л. Агапов, К.Б. Яшкулов, Т.Б. Каляева, В.В. Кутырев // Проблемы особо опасных инфекций. - 2018. - № 2. - С. 6-13.

5. Бывалов, А.А. Адгезины Yersinia pseudotuberculosis / А.А. Бывалов, И.В. Конышев // Инфекция и иммунитет. - 2019. - Т. 9, № 3-4. - С. 437-448.

6. Воробьев, А.А. Массовые способы иммунизации / А.А. Воробьев, В.А. Лебединский. - М.: Медицина, 1977. - 255 c.

7. Дентовская, С.В. Избирательная протективность AnlpD-мутантов Yersinia pestis / С.В. Дентовская, С.А. Иванов, П.Х. Копылов, Р.З. Шайхутдинова, М.Е. Платонов, Т.И. Комбарова, Т.В. Гапельченкова, С.В. Балахонов, А.П. Анисимов // Acta Naturae (русскоязычная версия). - 2015. - Т. 7, № 1 (24). - С. 108-115.

8. Дентовская, С.В. Молекулярно-генетические механизмы образования и функциональная значимость липополисахарида Yersinia pestis: дис. ... д-ра мед. наук: 03.02.03 и 03.01.04 / Дентовская Светлана Владимировна. - М., 2012. - 311 с.

9. Дентовская, С.В. Структурное разнообразие и эндотоксическая

активность липополисахарида Yersinia pestis / С.В. Дентовская, И.В. Бахтеева, Г.М. Титарева, Р.З. Шайхутдинова, А.Н. Кондакова, О.В. Быстрова, Б. Линднер, Ю.А. Книрель, А.П. Анисимов // Биохимия. - 2008. - Т. 73, № 2. - С. 237-246.

10. Еремин, P.A. Изучение электростимулируемой трансформации ДНК гетерогенных и собственных плазмид в клетки чумного микроба / P.A. Еремин, И.Г. Дроздов, И.Н. Ежов // Генетика, микробиология и совершенствование методов лабораторной диагностики особо опасных инфекций. - 1991. - № 5. - P. 55-62.

11. Кадникова, Л.А. Капсульный антиген чумного микроба / Л.А. Кадникова, П.Х. Копылов, С.В. Дентовская, А.П. Анисимов // Инфекция и иммунитет. - 2015. - Т. 5, № 3. - С. 201-218.

12. Клюева, С.Н. Влияние олигодезоксинуклеотида CpG ODN 2006 на продукцию цитокинов клетками крови людей, вакцинированных против чумы / С.Н. Клюева, Т.П. Шмелькова, Т.Н. Щуковская // Медицинская иммунология. -2014. - Т. 16, № 6. - С. 531-538.

13. Книрель, Ю.А. Липополисахарид чумного микроба Yersinia pestis: структура, генетика, биологические свойства / Ю.А. Книрель, А.П. Анисимов // Acta Naturae (русскоязычная версия). - 2012. - Т. 4, № 3. - С. 49-61.

14. Кокушкин, А.М. Трансформирующая активность плазмид чумного микроба: дис. ... канд. мед. наук: 03.00.07 / Кокушкин Александр Михайлович. -Саратов, 1983. - 183 с.

15. Медуницын, Н.В. Вакцинология: монография / Н.В. Медуницын, А.В. Катлинский, Л.О. Ворслов. - М.: Практическая медицина, 2022. - 473 с.

16. Микшис, Н.И. Современное состояние проблемы разработки вакцин для специфической профилактики чумы / Н.И. Микшис, В.В Кутырев // Проблемы особо опасных инфекций. - 2019. - № 1. - С. 50-63.

17. Онищенко, Г.Г. Специфическая профилактика холеры в современных условиях / Г.Г. Онищенко, В.В. Кутырев, Т.Н. Щуковская, Н.И. Смирнова, А.К. Никифоров, С.А. Еремин, В.П. Топорков // Проблемы особо опасных инфекций. -2011. - № 1 (107). - С. 5-12.

18. Остерман, Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот / Л.А.

Остерман. - М.: Наука, 1981. - 288 с.

19. Сутягин, В.В. Белки вакцинного штамма чумного микроба (Yersinia pestis EV НИИЭГ) с потенциальными свойствами аллергенов / В.В. Сутягин, Г.Г. Ковалева // Проблемы особо опасных инфекций. - 2019. - № 4. - С. 97-101.

20. Титарева, Г.М. Штаммовые отличия Yersinia pestis по чувствительности к бактерицидному действию полимиксина В / Г.М. Титарева, Н.К. Фурсова, С.В. Балахонов, Р.З. Шайхутдинова, А.П. Анисимов // Успехи современного естествознания. - 2003. - Т. 10. - С. 100.

21. Шаров, Д.А. Усовершенствование технологии концентрирования микробных клеток в производстве вакцины чумной живой, таблетки для рассасывания / Д.А. Шаров, А.А. Лещенко, С.В. Багин, С.В. Логвинов, Д.А. Мохов, А.В. Ежов, А.Г. Лазыкин, В.В. Крупин, И.В. Косенков // Проблемы особо опасных инфекций. - 2020. - № 4. - С. 139-145.

22. Achtman, M. Microevolution and history of the plague bacillus, Yersinia pestis / M. Achtman, G. Morelli, P. Zhu, T. Wirth, I. Diehl, B. Kusecek, A.J. Vogler, D.M. Wagner, C.J. Allender, W.R. Easterday, V. Chenal-Francisque, P. Worsham, N.R. Thomson, J. Parkhill, L.E. Lindler, E. Carniel, P. Keim // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2004. - Vol. 101, № 51. - P. 17837-17842.

23. Achtman, M. Yersinia pestis, the cause of plague, is a recently emerged clone of Yersinia pseudotuberculosis / M. Achtman, K. Zurth, G. Morelli, G. Torrea, A. Guiyoule, E. Carniel // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 1999. - Vol. 96, № 24. - P. 14043-14048.

24. Aepfelbacher, M. Modulation of Rho GTPases and the actin cytoskeleton by Yersinia outer proteins (Yops) / M. Aepfelbacher, J. Heesemann // International journal of medical microbiology. - 2001. - Vol. 291, № 4. - P. 269-276.

25. Amedei, A. Role of immune response in Yersinia pestis infection / A. Amedei, E. Niccolai, L. Marino, M.M. D'Elios // The Journal of Infection in Developing Countries. - 2011. - Vol. 5, № 09. - Р. 628-639.

26. Anderson Jr, G.W. Protection of mice from fatal bubonic and pneumonic plague by passive immunization with monoclonal antibodies against the F1 protein of

Yersinia pestis / G.W. Anderson Jr, P.L. Worsham, C.R. Bolt, G.P. Andrews, S.L. Welkos, A.M. Friedlander, J.P. Burans // The American journal of tropical medicine and hygiene. - 1997. - Vol. 56, № 4. - P. 471-473.

27. Andersson, J.A. Identification of new virulence factors and vaccine candidates for Yersinia pestis / J.A. Andersson, J. Sha, T.E. Erova, E.C. Fitts, D. Ponnusamy, E.V. Kozlova, M.L. Kirtley, A.K. Chopra // Frontiers in cellular and infection microbiology. -2017. - Vol. 7. - P. 448.

28. Anisimov, A.P. Design of a Yersinia pestis strain with increased protection / A.P. Anisimov, A.K. Nikiforov, S.A. Eremin, I.G. Drozdov // Biulleten'eksperimental'noi biologii i meditsiny. - 1995. - Vol. 120, № 11. - P. 532-534.

29. Anisimov, A.P. Factors of Yersinia pestis providing circulation and persistence of plague pathogen in ecosystems of natural foci. / A.P. Anisimov // Molecular Genetics Microbiology and Virology. - 2002. - № 3. - P. 3-23.

30. Anisimov, A.P. Intraspecific diversity of Yersinia pestis. / A.P. Anisimov, L.E. Lindler, G.B. Pier // Clinical microbiology reviews. - 2004. - Vol. 17, № 2. - P. 434-464.

31. Anisimov, A.P. Live Plague Vaccine Development: Past, Present, and Future / A.P. Anisimov, A.S. Vagaiskaya, A.S. Trunyakova, S.V. Dentovskaya // Vaccines. -2025. - Vol. 13, № 1. - P. 66.

32. Anwari, K. A modular BAM complex in the outer membrane of the a-proteobacterium Caulobacter crescentus / K. Anwari, S. Poggio, A. Perry, X. Gatsos, S.H. Ramarathinam, N.A. Williamson, N. Noinaj, S. Buchanan, K. Gabriel, A.W. Purcell, C. Jacobs-Wagner, T. Lithgow // PloS one. - 2010. - Vol. 5, № 1. - P. e8619.

33. Arshadi, N. Immunogenicity of inactivated Escherichia coli O157: H7 with Stx2B microparticle in mice / N. Arshadi, S.L. Mousavi Gargari, J. Amani, S. Nazarian // Iranian Journal of Basic Medical Sciences. - 2022. - Vol. 25, № 9. - P. 1069.

34. Baker, E.E. Studies on immunization against plague: I. The isolation and characterization of the soluble antigen of Pasteurella pestis / E.E. Baker, H. Sommer, L.E. Foster, E. Meyer, K.F. Meyer // The Journal of Immunology. - 1952. - Vol. 68, № 2. -P. 131-145.

35. Balada-Llasat, J.M. Oral inoculation with Type III secretion mutants of

Yersinia pseudotuberculosis provides protection from oral, intraperitoneal, or intranasal challenge with virulent Yersinia / J.M. Balada-Llasat, B. Panilaitis, D. Kaplan, J. Mecsas // Vaccine. - 2007. - Vol. 25, № 8. - P. 1526-1533.

36. Balchin, D. In vivo aspects of protein folding and quality control / D. Balchin, M. Hayer-Hartl, F.U. Hartl // Science. - 2016. - Vol. 353, № 6294. - P. aac4354.

37. Barnes, M.G. BrkA Protein of Bordetella pertussis inhibits the classical pathway of complement after C1 deposition / M.G. Barnes, A.A. Weiss // Infection and immunity. - 2001. - Vol. 69. - P. 3067-3072.

38. Bartra, S.S. Resistance of Yersinia pestis to complement-dependent killing is mediated by the Ail outer membrane protein / S.S. Bartra, K.L. Styer, D.M. O'Bryant, M.L. Nilles, B.J. Hinnebusch, A. Aballay, G.V. Plano // Infection and immunity. - 2008. - Vol. 76, № 2. - P. 612-622.

39. Behrens, S. The SurA periplasmic PPIase lacking its parvulin domains functions in vivo and has chaperone activity / S. Behrens, R. Maier, H. de Cock, F.X. Schmid, C.A. Gross // The EMBO journal. - 2001. - Vol. 20. - P. 285-294.

40. Behrens-Kneip, S. The role of SurA factor in outer membrane protein transport and virulence / S. Behrens-Kneip // International Journal of Medical Microbiology. -2010. - Vol. 300, № 7. - P. 421-428.

41. Ben-Efraim, S. New antigenic component of Pasteurella pestis formed under specified conditions of pH and temperature / S. Ben-Efraim, M. Aronson, L. Bichowsky-Slomnicki // Journal of bacteriology. - 1961. - Vol. 81, № 5. - P. 704-714.

42. Bertherat, E. Plague around the world in 2019 / La peste dans le monde en 2019 // Weekly epidemiological record. - 2019. - Vol. 94, № 25. - P. 289-293.

43. Biedzka-Sarek, M. Functional mapping of YadA-and Ail-mediated binding of human factor H to Yersinia enterocolitica serotype O: 3 / M. Biedzka-Sarek, S. Salmenlinna, M. Gruber, A.N. Lupas, S. Meri, M. Skurnik // Infection and immunity. -2008. - Vol. 76, № 11. - P. 5016-5027.

44. Bliska, J.B. Role of the Yersinia pseudotuberculosis virulence plasmid in pathogen-phagocyte interactions in mesenteric lymph nodes / J.B. Bliska, I.E Brodsky., J. Mecsas // EcoSal Plus. - 2021. - Vol. 9, № 2. - P. eESP-0014-2021.

45. Blisnick, T. Oral vaccination against bubonic plague using a live avirulent Yersinia pseudotuberculosis strain / T. Blisnick, P. Ave, M. Huerre, E. Carniel, C.E. Demeure // Infection and immunity. - 2008. - Vol. 76, № 8. - P. 3808-3816.

46. Bobrov, A.G. Insights into Yersinia pestis biofilm development: topology and co-interaction of Hms inner membrane proteins involved in exopolysaccharide production / A.G. Bobrov, O. Kirillina, S. Forman, D. Mack, R.D. Perry // Environmental microbiology. - 2008. - Vol. 10, № 6. - P. 1419-1432.

47. Brubaker, R.R. Factors promoting acute and chronic diseases caused by Yersinia / R.R. Brubaker // Clinical Microbiology Reviews. - 1991. - Vol. 4. - P. 309324.

48. Brubaker, R.R. Interleukin-10 and inhibition of innate immunity to Yersiniae: roles of Yops and LcrV (V antigen) / R.R. Brubaker // Infection and immunity. - 2003. -Vol. 71, № 7. - P. 3673-3681.

49. Burrows, T.W. An antigen determining virulence in Pasteurella pestis / T.W. Burrows // Nature. - 1956. - Vol. 177, № 4505. - P. 426-427.

50. Byvalov, A.A. Effectiveness of revaccinating hamadryas baboons with NISS live dried plague vaccine and fraction I of the plague microbe / A.A. Byvalov, V.N. Pautov, Yu.V. Chicherin, V.A. Lebedinskii, V.I. Evtigneev // Zhurnal Mikrobiologii, Epidemiologii i Immunobiologii. - 1984. - № 4. - P. 74-76.

51. Caballero, M.L. Delayed hypersensitivity reactions caused by drug excipients: a literature review / M.L. Caballero, S. Quirce // Journal of Investigational Allergology and Clinical Immunology. - 2020. - Vol. 30, № 6. - P. 400-408.

52. Callinan, R.B. Enterocolitis in cattle associated with Yersinia pseudotuberculosis infection / R.B. Callinan, R.W. Cook, J.G. Boulton, G.C. Fraser, D.B. Unger // Australian veterinary journal. - 1988. - Vol. 65, № 1. - P. 8-11.

53. Cantwell, A.M. YopH inhibits early pro-inflammatory cytokine responses during plague pneumonia / A.M. Cantwell, S.S. Bubeck, P.H. Dube // BMC immunology. - 2010. - Vol. 11. - P. 1-11.

54. Carlone, G.M. Comparison of Outer Membrane Protein and Biochemical Profiles of Haemophilus aegyptius and Haemophilus influenzae Biotype III / G.M.

Carlone, F. Sottnek, B. Plikaytis // Journal of clinical microbiology. - 1985. - Vol. 22, № 5. - P. 708-713.

55. Carlone, G.M. Rapid Microprocedure for Isolating Detergent-Insoluble Outer Membrane Proteins from Haemophilus Species / G.M. Carlone, M.L. Thomas, H.S. Rumschlag, F. Sottnek // Journal of clinical microbiology. - 1986. - Vol. 24, № 3. -P. 330-332.

56. Cassese, G. Plasma cell survival is mediated by synergistic effects of cytokines and adhesion-dependent signals / G. Cassese, S. Arce, A.E. Hauser, K. Lehnert, B. Moewes, M. Mostarac, G. Muehlinghaus, M. Szyska, A. Radbruch, R.A. Manz // The Journal of Immunology. - 2003. - Vol. 171, № 4. - P. 1684-1690.

57. Chain, P.S.G. Insights into the evolution of Yersinia pestis through whole-genome comparison with Yersinia pseudotuberculosis / P.S.G. Chain, E. Carniel, F.W. Larimer, J. Lamerdin, P.O. Stoutland, W.M. Regala, A.M. Georgescu, L.M. Vergez, M.L. Land, V.L. Motin, R.R. Brubaker, J. Fowler, J. Hinnebusch, M. Marceau, C. Medigue, M. Simonet, V. Chenal-Francisque, B. Souza, D. Dacheux, J.M. Elliott, A. Derbise, L.J. Hauser, E. Garcia // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2004. - Vol. 101, № 38. - P. 13826-13831.

58. Charlson, E.S. Differential effects of yfgL mutation on Escherichia coli outer membrane proteins and lipopolysaccharide / E.S. Charlson, J.N. Werner, R. Misra // Journal of bacteriology. - 2006. - Vol. 188, № 20. - P. 7186-7194.

59. Cherepanov, P.P. Disruption in Escherichia coli: TcR and KmR cassettes with the option of Flp-catalyzed excision of the antibiotic-resistance determinant / P.P. Cherepanov, W. Wackernagel // Gene. - 1995 - Vol. 158. - P. 9-14.

60. Cho, H. Over-activation of a nonessential bacterial protease DegP as an antibiotic strategy / H. Cho, Y. Choi, K. Min, J.B. Son, H. Park, H.H. Lee, S. Kim // Communications Biology. - 2020. - Vol. 3, № 1. - P. 547.

61. Chomarat, P. IL-6 switches the differentiation of monocytes from dendritic cells to macrophages / P. Chomarat, J. Banchereau, J. Davoust, A.K. Palucka // Nature immunology. - 2000. - Vol. 1, № 6. - P. 510-514.

62. Cohen, D. Prospective study of the association between serum antibodies to

lipopolysaccharide O antigen and the attack rate of shigellosis / D. Cohen, M.S. Green, C. Block, R. Slepon, I. Ofek // Journal of clinical microbiology. - 1991. - Vol. 29, № 2.

- P. 386-389.

63. Cornelis, G.R. Yersinia type III secretion send in the effectors / G.R. Cornelis // The Journal of cell biology. - 2002. - Vol. 158, № 3. - P. 401-408.

64. Cornelius, C.A. Yersinia pestis IS 1541 transposition provides for escape from plague immunity / C.A. Cornelius, L.E. Quenee, D. Elli, N.A. Ciletti, O. Schneewind // Infection and immunity. - 2009. - Vol. 77, № 5. - P. 1807-1816.

65. Costa, T.R.D. Type III secretion translocon assemblies that attenuate Yersinia virulence / T.R.D. Costa, A.A.A. Amer, S.I. Farag, H. Wolf-Watz, M. Fällman, A. Fahlgren, T. Edgren, M.S. Francis // Cellular microbiology. - 2013. - Vol. 15, № 7. - P. 1088-1110.

66. Creighton, R.L. Microneedle-mediated vaccine delivery to the oral mucosa / R. L. Creighton, K.A. Woodrow // Advanced healthcare materials. - 2019. - Vol. 8, № 4. -P. 1801180.

67. Cruz, L.J. Targeting nanoparticles to dendritic cells for immunotherapy / L.J. Cruz, P.J. Tacken, F. Rueda, J.C. Domingo, F. Albericio, C.G. Figdor // Methods in enzymology. - 2012. - Vol. 509. - P. 143-163.

68. Daniel, C. Protection against Yersinia pseudotuberculosis infection conferred by a Lactococcus lactis mucosal delivery vector secreting LcrV / C. Daniel, F. Sebbane, S. Poiret, D. Goudercourt, J. Dewulf, C. Mullet, M. Simonet, B. Pot // Vaccine. - 2009.

- Vol. 27, № 8. - P. 1141-1144.

69. Datsenko, K.A. One-step inactivation of chromosomal genes in Escherichia coli K-12 using PCR products / K.A. Datsenko, B.L. Wanner // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2000. - Vol. 97, № 12. - P. 6640-6645.

70. Demeure, C.E. Humoral and cellular immune correlates of protection against bubonic plague by a live Yersinia pseudotuberculosis vaccine / C.E. Demeure, A. Derbise, C. Guillas, C. Gerke, S. Cauchemez, E. Carniel, J. Pizarro-Cerda // Vaccine. - 2019. -Vol. 37, № 1. - P. 123-129.

71. Demeure, C.E. Oral vaccination against plague using Yersinia

pseudotuberculosis / C.E. Demeure, A. Derbise, E. Carniel // Chemico-Biological Interactions. - 2017. - Vol. 267. - P. 89-95.

72. Dentovskaya, S.V. Molecular bases of vaccine-prevention of plague / S.V. Dentovskaya, P.Kh. Kopylov, S.A. Ivanov, S.A. Ageev, A.P. Anisimov // Molecular Genetics, Microbiology and Virology. - 2013. - Vol. 28. - P. 87-98.

73. DePaolo, R.W. Toll-like receptor 6 drives differentiation of tolerogenic dendritic cells and contributes to LcrV-mediated plague pathogenesis / R.W. Depaolo, F. Tang, I. Kim, M. Han, N. Levin, N. Ciletti, A. Lin, D. Anderson, O. Schneewind, B. Jabri // Cell host & microbe. - 2008. - Vol. 4, № 4. - P. 350-361.

74. Derbise, A. An encapsulated Yersinia pseudotuberculosis is a highly efficient vaccine against pneumonic plague / A. Derbise, A. Cerda Marin, P. Ave, T. Blisnick, M. Huerre, E. Carniel, C.E. Demeure // PLoS neglected tropical diseases. - 2012. - Vol. 6, № 2. - P. e1528.

75. Derbise, A. Complete protection against pneumonic and bubonic plague after a single oral vaccination / A. Derbise, Y. Hanada, M. Khalife, E. Carniel, C.E. Demeure // PLoS neglected tropical diseases. - 2015. - Vol. 9, № 10. - P. e0004162.

76. Dewoody, R. YopK regulates the Yersinia pestis type III secretion system from within host cells / R. Dewoody, P.M. Merritt, A.S. Houppert, M.M. Marketon // Molecular microbiology. - 2011. - Vol. 79, № 6. - P. 1445-1461.

77. Driessen, A.J.M. Protein translocation across the bacterial cytoplasmic membrane / A.J.M. Driessen, N. Nouwen // Annual Review of Biochemistry. - 2008. -Vol. 77. - P. 643-667.

78. Duan, R. Homology analysis of pathogenic Yersinia species Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis, and Yersinia pestis based on multilocus sequence typing / R. Duan, J. Liang, G. Shi, Z. Cui, R. Hai, P. Wang, Y. Xiao, K. Li, H. Qiu, W. Gu, X. Du, H. Jing, X. Wang // Journal of clinical microbiology. - 2014. - Vol. 52, № 1. - P. 20-29.

79. Dworkin, M. The Prokaryotes: Vol. 6: Proteobacteria: Gamma Subclass / M. Dworkin, S. Falkow, E. Rosenberg, K.-H. Schleifer, E. Stackebrandt. - N.Y.: Springer Science & Business Media, 2006. - 1193 p.

80. El Tahir, Y. YadA, the multifaceted Yersinia adhesin / Y. El Tahir, M. Skurnik // International Journal of Medical Microbiology. - 2001. - Vol. 291, № 3. - P. 209-218.

81. Ensign, L.M. Oral drug delivery with polymeric nanoparticles: the gastrointestinal mucus barriers / L.M. Ensign, R. Cone, J. Hanes // Advanced drug delivery reviews. - 2012. - Vol. 64, № 6. - P. 557-570.

82. Falagas, M.E. Resistance to polymyxins: mechanisms, frequency and treatment options / M.E. Falagas, P.I. Rafailidis, D.K. Matthaiou // Drug resistance updates. - 2010.

- Vol. 13, № 4-5. - P. 132-138.

83. Feodorova, V.A. Plague vaccines: current developments and future perspectives / V.A. Feodorova, V.L. Motin // Emerging microbes & infections. - 2012. -Vol. 1, № 1. - P. 1-5.

84. Fernando, M.R. The pro-inflammatory cytokine, interleukin-6, enhances the polarization of alternatively activated macrophages / M.R. Fernando, J.L. Reyes, J. Iannuzzi, G. Leung, D.M. McKay // PloS one. - 2014. - Vol. 9, № 4. - P. e94188.

85. Figaj, D. SurA-like and Skp-like Proteins as Important Virulence Determinants of the Gram Negative Bacterial Pathogens / D. Figaj, P. Ambroziak, I. Rzepka, J. Skorko-Glonek // International Journal of Molecular Sciences. - 2022. - Vol. 24, № 1. - P. 295.

86. Filip, C. Solubilization of the cytoplasmic membrane of Escherichia coli by the ionic detergent sodium-lauryl sarcosinate. / C. Filip, G. Fletcher, J.L. Wulff, G.F. Earhart // Journal of Bacteriology. - 1973. - Vol. 115, № 3. - P. 717-722.

87. Freedman, D.O. Re-born in the USA: Another cholera vaccine for travellers / D.O. Freedman // Travel Medicine and Infectious Disease. - 2016. - Vol. 14, № 4. - P. 295-296.

88. Fukushima, H. Growth of Yersinia pseudotuberculosis and Yersinia enterocolitica biotype 3B serotype O3 inhibited on cefsulodin-Irgasan-novobiocin agar / H. Fukushima, M. Gomyoda // Journal of clinical microbiology. - 1986. - Vol. 24, № 1.

- P. 116-120.

89. Fukushima, H. Intestinal carriage of Yersinia pseudotuberculosis by wild birds and mammals in Japan / H. Fukushima, M. Gomyoda // Applied and environmental microbiology. - 1991. - Vol. 57, № 4. - P. 1152-1155.

90. Galán, J.E. Protein delivery into eukaryotic cells by type III secretion machines / J.E. Galán, H. Wolf-Watz // Nature. - 2006. - Vol. 444, № 7119. - P. 567-573.

91. Galindo, C.L. Pathogenesis of Y. enterocolitica and Y. pseudotuberculosis in human yersiniosis / C.L. Galindo, J.A. Rosenzweig, M.L. Kirtley, A.K. Chopra // Journal of pathogens. - 2011. - Vol. 2011. - P. 182051.

92. Garinot, M. PEGylated PLGA-based nanoparticles targeting M cells for oral vaccination / M. Garinot, V. Fiévez, V. Pourcelle, F. Stoffelbach, A. des Rieux, L. Plapied, I. Theate, H. Freichels, C. Jérôme, J. Marchand-Brynaert, Y.J. Schneider, V. Préat // Journal of controlled release. - 2007. - Vol. 120, № 3. - P. 195-204.

93. Ge, X. DegP primarily functions as a protease for the biogenesis of P-barrel outer membrane proteins in the Gram-negative bacterium Escherichia coli / X. Ge, R. Wang, J. Ma, Y. Liu, A.N. Ezemaduka, P.R. Chen, X. Fu, Z. Chang // The FEBS journal. - 2014. - Vol. 281, № 4. - P. 1226-1240.

94. Germanier, R. Isolation and characterization of Gal E mutant Ty 21a of Salmonella typhi: a candidate strain for a live, oral typhoid vaccine / R. Germanier, E. Füer // Journal of infectious diseases. - 1975. - Vol. 131, № 5. - P. 553-558.

95. Gessmann, D. Outer membrane P-barrel protein folding is physically controlled by periplasmic lipid head groups and BamA / D. Gessmann, Y.H. Chung, E.J. Danoff, A.M. Plummer, C.W. Sandlin, N.R. Zaccai, K.G. Fleming // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2014. - Vol. 111, № 16. - P. 5878-5883.

96. Girard, G. Immunity in plague. Acquisitions supplied by 30 years of work on the «Pasteurella pestis Ev» (Girard and Robic) strain / G. Girard // Biologie Medicale. -1963. - Vol. 52. - P. 631-731.

97. Goure, J. Protective anti-V antibodies inhibit Pseudomonas and Yersinia translocon assembly within host membranes / J. Goure, P. Broz, O. Attree, G.R. Cornelis, I. Attree // The Journal of infectious diseases. - 2005. - Vol. 192, № 2. - P. 218-225.

98. Grasset, E. Control of plague by means of live avirulent plague vaccine in Southern Africa (1941-44) / E. Grasset // Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene. - 1946. - Vol. 40, № 3. - P. 275-294.

99. Grasset, E. Live plague vaccine as a prophylactic against plague / E. Grasset //

South African Medical Journal. - 1941. - Vol. 15, № 19. - P. 373-375.

100. Guo, L. Oral immunization with a multivalent epitope-based vaccine, based on NAP, urease, HSP60, and HpaA, provides therapeutic effect on H. pylori infection in Mongolian gerbils / L. Guo, H. Yang, F. Tang, R. Yin, H. Liu, X. Gong, J. Wei, Y. Zhang, G. Xu, K. Liu // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. - 2017. - Vol. 7. - P. 349.

101. Gurleva, G.G. Antibiotic sensitivity of Yersinia enterocolitica and Yersinia pseudotuberculosis isolated from patients with the jaundice form of acute hepatitis / G.G. Gurleva, Ia.N. Korganov, L.N. Makarovskaia, V.S. Zosimenko, V.F. Popov // Antibiotiki. - 1982. - Vol. 27, № 1. - P. 37-41.

102. Haffkine, W.M. Concerning Inoculation against Plague and Pneumonia / W.M. Haffkine // The Indian Medical Gazette. - 1915. - Vol. 50, № 4. - P. 121.

103. Hagan, C.L. Bam lipoproteins assemble BamA in vitro / C.L. Hagan, D.B. Westwood, D. Kahne // Biochemistry. - 2013. - Vol. 52, № 35. - P. 6108-6113.

104. Hagan, C.L. Reconstitution of outer membrane protein assembly from purified components / C.L. Hagan, S. Kim, D. Kahne // Science. - 2010. - Vol. 328, № 5980. - P. 890-892.

105. Han, Y.W. Reevaluation of the virulence phenotype of the inv yadA double mutants of Yersinia pseudotuberculosis / Y.W. Han, V.L. Miller // Infection and immunity. - 1997. - Vol. 65, № 1. - P. 327-330.

106. Hartl, F.U. Molecular chaperones in protein folding and proteostasis / F.U. Hartl, A. Bracher, M. Hayer-Hartl // Nature. - 2011. - Vol. 475, № 7356. - P. 324-332.

107. Hartley, L. The efficacy, safety, and immunogenicity of plague vaccines: A systematic literature review / L. Hartley, S. Harold, E. Hawe // Current Research in Immunology. - 2023. - Vol. 4. - P. 100072.

108. Harutyunyan, S. Characterization of ShigETEC, a novel live attenuated combined vaccine against Shigellae and ETEC / S. Harutyunyan, I. Neuhauser, A. Mayer, M. Aichinger, V. Szijarto, G. Nagy, E. Nagy, P. Girardi, F.J. Malinoski, T. Henics // Vaccines. - 2020. - Vol. 8, № 4. - P. 689.

109. Hase, K. Uptake through glycoprotein 2 of FimH+ bacteria by M cells

initiates mucosal immune response / K. Hase, K. Kawano, T. Nochi, G.S. Pontes, S. Fukuda, M. Ebisawa, K. Kadokura, T. Tobe, Y. Fujimura, S. Kawano, A. Yabashi, S. Waguri, G. Nakato, S. Kimura, T. Murakami, M. Iimura, K. Hamura, S. Fukuoka, A.W. Lowe, K. Itoh, H. Kiyono, H. Ohno // Nature. - 2009. - Vol. 462, № 7270. - P. 226-230.

110. Heath, D.G. Protection against experimental bubonic and pneumonic plague by a recombinant capsular F1-V antigen fusion protein vaccine / D. G. Heath, G.W. Anderson Jr, J.M. Mauro, S.L. Welkos, G.P. Andrews, J. Adamovicz, A.M. Friedlander // Vaccine. - 1998. - Vol. 16, № 11-12. - P. 1131-1137.

111. Heithoff, D.M. An essential role for DNA adenine methylation in bacterial virulence / D.M. Heithoff, R.L. Sinsheimer, D.A. Low, M.J. Mahan // Science. - 1999. -Vol. 284, № 5416. - P. 967-970.

112. Herzog, C. Successful comeback of the single-dose live oral cholera vaccine CVD 103-HgR / C. Herzog // Travel medicine and infectious disease. - 2016. -Vol. 14, № 4. - P. 373-377.

113. Heuck, A. Augmenting ß-augmentation: structural basis of how BamB binds BamA and may support folding of outer membrane proteins / A. Heuck, A. Schleiffer, T. Clausen // Journal of molecular biology. - 2011. - Vol. 406, № 5. - P. 659666.

114. Holmgren, J. An oral B subunit: whole cell vaccine against cholera / J. Holmgren, A.M. Svennerholm, M. Jertborn, J. Clemens, D.A. Sack, R. Salenstedt, H. Wigzell // Vaccine. - 1992. - Vol. 10, № 13. - P. 911-914.

115. Holmgren, J. Mucosal immunity and vaccines / J. Holmgren, C. Czerkinsky // Nature medicine. - 2005. - Vol. 11, Suppl. 4. - P. S45-S53.

116. Howard, I.S. Context-dependent partitioning of motor learning in bimanual movements / I.S. Howard, J.N. Ingram, D.M. Wolpert // Journal of neurophysiology. - 2010. - Vol. 104, № 4. - P. 2082-2091.

117. Huang, X.Z. The pH 6 antigen is an antiphagocytic factor produced by Yersinia pestis independent of Yersinia outer proteins and capsule antigen / X.Z. Huang, L.E. Lindler // Infection and immunity. - 2004. - Vol. 72, № 12. - P. 7212-7219.

118. Inglesby, T.V. Plague as a biological weapon: medical and public health

management / T.V. Inglesby, D.T. Dennis, D.A. Henderson, J.G. Bartlett, M.S. Ascher, E. Eitzen, A.D. Fine, A.M. Friedlander, J. Hauer, J.F. Koerner, M. Layton, J. McDade, M.T. Osterholm, T. O'Toole, G. Parker, T.M. Perl, P.K. Russell, M. Schoch-Spana, K. Tonat // Jama. - 2000. - Vol. 283, № 17. - P. 2281-2290.

119. Inoue, M. Community outbreak of Yersinia pseudotuberculosis / M. Inoue, H. Nakashima, O. Ueba, T. Ishida, H. Date, S. Kobashi, K. Takagi, T. Nishu, M. Tsubokura // Microbiology and immunology. - 1984. - Vol. 28, № 8. - P. 883-891.

120. Jalava, K. Multiple outbreaks of Yersinia pseudotuberculosis infections in Finland / K. Jalava, S. Hallanvuo, U. Nakari, P. Ruutu, E. Kela, T. Heinäsmäki, A. Siitonen, J.P. Nuorti // Journal of clinical microbiology. - 2004. - Vol. 42, № 6. - P. 2789-2791.

121. Jepson, M.A. M cell targeting by lectins: a strategy for mucosal vaccination and drug delivery / M.A. Jepson, M.A. Clark, B.H. Hirst // Advanced drug delivery reviews. - 2004. - Vol. 56, № 4. - P. 511-525.

122. Jiang, J. Activation of DegP chaperone-protease via formation of large cage-like oligomers upon binding to substrate proteins / J. Jiang, X. Zhang, Y. Chen, Y. Wu, Z.H. Zhou, Z. Chang, S.F. Sui // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2008. - Vol. 105, № 33. - P. 11939-11944.

123. Julio, S.M. DNA adenine methylase is essential for viability and plays a role in the pathogenesis of Yersinia pseudotuberculosis and Vibrio cholerae / S.M. Julio, D.M. Heithoff, D. Provenzano, K.E. Klose, R.L. Sinsheimer, D.A. Low, M.J. Mahan // Infection and immunity. - 2001. - Vol. 69, № 12. - P. 7610-7615.

124. Justice, S.S. Maturation of intracellular Escherichia coli communities requires SurA / S.S. Justice, S.R. Lauer, S.J. Hultgren, D.A. Hunstad // Infection and immunity. - 2006. - Vol. 74, № 8. - P. 4793-4800.

125. Kiefer, D. Phenotypical characterization of Mongolian Yersinia pestis strains / D. Kiefer, G. Dalantai, T. Damdindorj, J.M. Riehm, H. Tomaso, L. Zöller, O. Dashdavaa, K. Pfister, H.C. Scholz // Vector Borne Zoonotic Diseases. - 2012. - Vol. 12, № 3. - P. 183-188.

126. Kim, S. Cage assembly of DegP protease is not required for substrate-

dependent regulation of proteolytic activity or high-temperature cell survival / S. Kim, R.T. Sauer // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2012. - Vol. 109, № 19. - P. 7263-7268.

127. Kim, S. Covalent linkage of distinct substrate degrons controls assembly and disassembly of DegP proteolytic cages / S. Kim, R.A. Grant, R.T. Sauer // Cell. -2011. - Vol. 145, № 1. - P. 67-78.

128. Klein, K. Deprivation of the periplasmic chaperone SurA reduces virulence and restores antibiotic susceptibility of multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa / K. Klein, M.S. Sonnabend, L. Frank, K. Leibiger, M. Franz-Wachtel, B. Macek, T. Trunk, J.C. Leo, I.B. Autenrieth, M. Schütz, E. Bohn // Frontiers in microbiology. - 2019. - Vol. 10. - P. 100.

129. Kolodziejek, A.M. Yersiniapestis Ail: multiple roles of a single protein / A.M. Kolodziejek, C.J. Hovde, S.A. Minnich // Frontiers in cellular and infection microbiology. - 2012. - Vol. 2. - P. 103.

130. Korobkova, E.I. Live antiplague vaccine / E.I. Korobkova. - M.: Medgiz, 1956. - 206 p.

131. Kotloff, K.L. Deletion in the Shigella enterotoxin genes further attenuates Shigella flexneri 2a bearing guanine auxotrophy in a phase 1 trial of CVD 1204 and CVD 1208 / K.L. Kotloff, M.F. Pasetti, E.M. Barry, J.P. Nataro, S.S. Wasserman, M.B. Sztein, W.D. Picking, M.M. Levine // The Journal of infectious diseases. - 2004. - Vol. 190, № 10. - P. 1745-1754.

132. Krojer, T. Structural basis for the regulated protease and chaperone function of DegP / T. Krojer, J. Sawa, E. Schäfer, H.R. Saibil, M. Ehrmann, T. Clausen // Nature. - 2008. - Vol. 453, № 7197. - P. 885-890.

133. LaRock, C.N. The Yersinia virulence effector YopM binds caspase-1 to arrest inflammasome assembly and processing / C.N. LaRock, B.T. Cookson // Cell host & microbe. - 2012. - Vol. 12, № 6. - P. 799-805.

134. Lavander, M. Twin arginine translocation in Yersinia / M. Lavander, S.K. Ericsson, J.E. Bröms, A. Forsberg // The Genus Yersinia: From Genomics to Function. -2007. - Vol. 603. - P. 258-267.

135. Lavelle, E.C. Delivery systems and adjuvants for oral vaccines / E.C. Lavelle, D.T. O'Hagan // Expert opinion on drug delivery. - 2006. - Vol. 3, № 6. - P. 747-762.

136. Lei, C. Yersinia pestis antibiotic resistance: a systematic review / C. Lei, S. Kumar // Osong Public Health and Research Perspectives. - 2022. - Vol. 13, № 1. -P. 24.

137. Lemaitre, N. Yersinia pestis YopJ suppresses tumor necrosis factor alpha induction and contributes to apoptosis of immune cells in the lymph node but is not required for virulence in a rat model of bubonic plague / N. Lemaitre, F. Sebbane, D. Long, B.J. Hinnebusch // Infection and immunity. - 2006. - Vol. 74, № 9. - P. 51265131.

138. Levine, M.M. Clinical trials of Shigella vaccines: two steps forward and one step back on a long, hard road / M.M. Levine, K.L. Kotloff, E.M. Barry, M.F. Pasetti, M.B. Sztein // Nature Reviews Microbiology. - 2007. - Vol. 5, № 7. - P. 540-553.

139. Levine, M.M. Duration of efficacy of Ty21a, attenuated Salmonella typhi live oral vaccine / M.M. Levine, C. Ferreccio, P. Abrego, O.S. Martin, E. Ortiz, S. Cryz // Vaccine. - 1999. - Vol. 17. - P. S22-S27.

140. Levy, Y. T cells play an essential role in anti-F1 mediated rapid protection against bubonic plague / Y. Levy, Y. Flashner, A. Tidhar, A. Zauberman, M. Aftalion, S. Lazar, D. Gur, A. Shafferman, E. Mamroud // Vaccine. - 2011. - Vol. 29, № 40. - P. 6866-6873.

141. Li, Y. A sopB deletion mutation enhances the immunogenicity and protective efficacy of a heterologous antigen delivered by live attenuated Salmonella enterica vaccines / Y. Li, S. Wang, W. Xin, G. Scarpellini, Z. Shi, B. Gunn, K.L. Roland, R. 3rd.Curtiss // Infection and immunity. - 2008. - Vol. 76, № 11. - P. 5238-5246.

142. Lin, J.S. IL-17 contributes to cell-mediated defense against pulmonary Yersinia pestis infection / J.S. Lin, L.W. Kummer, F.M. Szaba, S.T. Smiley // The Journal of Immunology. - 2011. - Vol. 186, № 3. - P. 1675-1684.

143. Lipinska, B. Identification, characterization, and mapping of the Escherichia coli htrA gene, whose product is essential for bacterial growth only at

elevated temperatures / B. Lipinska, O. Fayet, L. Baird, C. Georgopoulos // Journal of bacteriology. - 1989. - Vol. 171, № 3. - P. 1574-1584.

144. Lycke, N. Mucosal adjuvants and long-term memory development with special focus on CTA1-DD and other ADP-ribosylating toxins / N. Lycke, M. Bemark // Mucosal immunology. - 2010. - Vol. 3, № 6. - P. 556-566.

145. Majumder, S. Protection induced by oral vaccination with a recombinant Yersinia pseudotuberculosis delivering Yersinia pestis LcrV and F1 antigens in mice and rats against pneumonic plague / S. Majumder, R.M. Olson, A. Singh, X. Wang, P. Li, H. Kittana, P.E. Anderson, D.M. Anderson, W. Sun // Infection and Immunity. - 2022. -Vol. 90, № 8. - P. e00165-22.

146. Malinverni, J.C. YfiO stabilizes the YaeT complex and is essential for outer membrane protein assembly in Escherichia coli / J.C. Malinverni, J. Werner, S. Kim, J.G. Sklar, D. Kahne, R. Misra, T.J. Silhavy // Molecular microbiology. - 2006. -Vol. 61, № 1. - P. 151-164.

147. Maniatis, T. Molecular cloning: a laboratory manual / T. Maniatis, E.F Fritsch, J. Sambrook. - N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1982. -480 p.

148. Marasini, N. Oral delivery of nanoparticle-based vaccines / N. Marasini, M. Skwarczynski, I. Toth // Expert Review of Vaccines. - 2014. - Vol. 13, № 11. - P. 1361-1376.

149. Martin, C.A. Differential regulation of lnterleukin-6, macrophage inflammatory protein-1, and JE/MCP-1 cytokine expression in macrophage cell lines / C.A. Martin, M.E. Dorf // Cellular immunology. - 1991. - Vol. 135, № 1. - P. 245-258.

150. Mas, G. The periplasmic chaperones Skp and SurA / G. Mas, J. Thoma, S. Hiller // Bacterial cell walls and membranes. - 2019. - Vol. 92. - P. 169-186.

151. Mattel, P. Membrane targeting and pore formation by the type III secretion system translocon / P. Mattel, E. Faudry, V. Job, T. Izoré, I. Attree, A. Dessen // The FEBS journal. - 2011. - Vol. 278, № 3. - P. 414-426.

152. McCoy, M.W. The C-terminal tail of Yersinia pseudotuberculosis YopM is critical for interacting with RSK1 and for virulence / M.W. McCoy, M.L. Marré, C.F. Lesser, J. Mecsas // Infection and immunity. - 2010. - Vol. 78, № 6. - P. 2584-2598.

153. McKenzie, R. Safety and immunogenicity of an oral, inactivated, whole-cell vaccine for Shigella sonnei: preclinical studies and a Phase I trial / R. McKenzie, R.I. Walker, G.S. Nabors, L.L. Van De Verg, C. Carpenter, G. Gomes, E. Forbes, J.H. Tian, H.H. Yang, J.L. Pace, W.J. Jackson, A.L. Bourgeois // Vaccine. - 2006. - Vol. 24, № 18.

- P. 3735-3745.

154. Meyer, K.F. Effectiveness of live or killed plague vaccines in man / K.F. Meyer // Bulletin of the World Health Organization. - 1970. - Vol. 42, № 5. - P. 653.

155. Meyer, K.F. Plague immunization. VI. Vaccination with the fraction I antigen of Yersinia pestis / K.F. Meyer, J.A. Hightower, F.R McCrumb // Journal of Infectious Diseases. - 1974. - Vol. 129. - P. S41-S45.

156. Miller, J.H. Experiments in Molecular Genetics / J.H. Miller. - N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1972. -280 p.

157. Mohamadzadeh, M. Targeted expression of anthrax protective antigen by Lactobacillus gasseri as an anthrax vaccine / M. Mohamadzadeh, E. Durmaz, M. Zadeh, K.C. Pakanati, M. Gramarossa, V. Cohran, T.R. Klaenhammer // Future Microbiology. -2010. - Vol. 5, № 8. - P. 1289-1296.

158. Montminy, S.W. Virulence factors of Yersinia pestis are overcome by a strong lipopolysaccharide response / S.W. Montminy, N. Khan, S. McGrath, M.J. Walkowicz, F. Sharp, J.E. Conlon, K. Fukase, S. Kusumoto, C. Sweet, K. Miyake, S. Akira, R.J. Cotter, J.D. Goguen, E. Lien // Nature immunology. - 2006. - Vol. 7, № 10.

- P. 1066-1073.

159. Mosmann, T. Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival: application to proliferation and cytotoxicity assays / T. Mosmann // Journal of Immunological Methods. - 1983. - Vol. 65, № 1-2. - P. 55-63.

160. Mowat, A.M. Regional specialization within the intestinal immune system / A.M. Mowat, W.W. Agace // Nature Reviews Immunology. - 2014. - Vol. 14, № 10. -P. 667-685.

161. Mühlenkamp, M. Yersinia adhesin A (YadA) - beauty & beast / M. Mühlenkamp, P. Oberhettinger, J.C. Leo, D. Linke, M.S. Schütz // International Journal of Medical Microbiology. - 2015. - Vol. 305, № 2. - P. 252-258.

162. Mukherjee, S. Yersinia YopJ acetylates and inhibits kinase activation by blocking phosphorylation / S. Mukherjee, G. Keitany, Y. Li, Y. Wang, H.L. Ball, E.J. Goldsmith, K. Orth // Science. - 2006. - Vol. 312, № 5777. - P. 1211-1214.

163. Nakajima, R. Association between virulence of Yersinia pestis and suppression of gamma interferon and tumor necrosis factor alpha / R. Nakajima, R.R. Brubaker // Infection and Immunity. - 1993. - Vol. 61, № 1. - P. 23-31.

164. Nakajima, R. Suppression of cytokines in mice by protein AV antigen fusion peptide and restoration of synthesis by active immunization / R. Nakajima, V.L. Motin, R.R. Brubaker // Infection and immunity. - 1995. - Vol. 63, № 8. - P. 3021-3029.

165. Nikaido, H. Molecular basis of bacterial outer membrane permeability revisited / H. Nikaido // Microbiology and molecular biology reviews. - 2003. - Vol. 67, № 4. - P. 593-656.

166. Noinaj, N. The P-barrel assembly machinery in motion / N. Noinaj, J.C. Gumbart, S.K. Buchanan // Nature Reviews Microbiology. - 2017. - Vol. 15, № 4. - P. 197-204.

167. Obi, I.R. Demarcating SurA activities required for outer membrane targeting of Yersinia pseudotuberculosis adhesins / I.R. Obi, M.S. Francis // Infection and Immunity. - 2013. - Vol. 81, № 7. - P. 2296-2308.

168. Oelschlaeger, T.A. Adhesins as invasins / T.A. Oelschlaeger // International journal of medical microbiology. - 2001. - Vol. 291, № 1. - P. 7-14.

169. Ogra, P.L. Vaccination strategies for mucosal immune responses / P.L. Ogra, H. Faden, R.C. Welliver // Clinical microbiology reviews. - 2001. - Vol. 14, № 2. - p. 430-445.

170. Orning, P. Pathogen blockade of TAK1 triggers caspase-8-dependent cleavage of gasdermin D and cell death / P. Orning, D. Weng, K. Starheim, D. Ratner, Z. Best, B. Lee, A. Brooks, S. Xia, H. Wu, M.A. Kelliher, S.B. Berger, P.J. Gough, J. Bertin, M.M. Proulx, J.D. Goguen, N. Kayagaki, K.A. Fitzgerald, E. Lien // Science. - 2018. -Vol. 362, № 6418. - P. 1064-1069.

171. Otten, L. Immunization against plague with live vaccine. / L. Otten // Indian Journal of Medical Research. - 1936. - Vol. 24, № 1. - P. 73-101.

172. Paczosa, M.K. Yersinia pseudotuberculosis uses Ail and YadA to circumvent neutrophils by directing Yop translocation during lung infection / M.K. Paczosa, M.L. Fisher, F.J. Maldonado-Arocho, J. Mecsas // Cellular microbiology. -2014. - Vol. 16, № 2. - P. 247-268.

173. Pakharukova, N. Structural basis for Myf and Psa fimbriae-mediated tropism of pathogenic strains of Yersinia for host tissues / N. Pakharukova, S. Roy, M. Tuittila, M.M. Rahman, S. Paavilainen, A.K. Ingars, M. Skaldin, U. Lamminmäki, T. Härd, S. Teneberg, A.V. Zavialov // Molecular Microbiology. - 2016. - Vol. 102, № 4. - P. 593-610.

174. Palace, S.G. Gain-of-function analysis reveals important virulence roles for the Yersinia pestis type III secretion system effectors YopJ, YopT, and YpkA / S.G. Palace, M.K. Proulx, R.L. Szabady, J.D. Goguen // Infection and Immunity. - 2018. -Vol. 86, № 9. - P. 10-1128.

175. Pallen, M.J. Genomic analysis of secretion systems / M.J. Pallen, R.R. Chaudhuri, I.R. Henderson // Current opinion in microbiology. - 2003. - Vol. 6, № 5. -P. 519-527.

176. Paramasivam, N. Is the C-terminal insertional signal in Gram-negative bacterial outer membrane proteins species-specific or not? / N. Paramasivam, M. Habeck, D. Linke // BMC genomics. - 2012. - Vol. 13. - P. 1-16.

177. Parent, M.A. Cell-mediated protection against pulmonary Yersinia pestis infection / M.A. Parent, K.N. Berggren, L.W. Kummer, L.B. Wilhelm, F.M. Szaba, I.K. Mullarky, S.T. Smiley // Infection and immunity. - 2005. - Vol. 73, № 11. - P. 73047310.

178. Parent, M.A. Gamma interferon, tumor necrosis factor alpha, and nitric oxide synthase 2, key elements of cellular immunity, perform critical protective functions during humoral defense against lethal pulmonary Yersinia pestis infection / M.A. Parent, L.B. Wilhelm, L.W. Kummer, F.M. Szaba, I.K. Mullarky, S.T. Smiley // Infection and Immunity. - 2006. - Vol. 74, № 6. - P. 3381-3386.

179. Pastoret, P.P. Epidemiology and control of fox rabies in Europe / P.P. Pastoret, B. Brochier // Vaccine. - 1999. - Vol. 17, № 13-14. - P. 1750-1754.

180. Pha, K. Yersinia type III effectors perturb host innate immune responses / K. Pha, L. Navarro // World journal of biological chemistry. - 2016. - Vol. 7, № 1. - P. 1.

181. Philippe, N. Improvement of pCVD442, a suicide plasmid for gene allele exchange in bacteria / N. Philippe, J.P. Alcaraz, E. Coursange, J. Geiselmann, D. Schneider // Plasmid. - 2004. - Vol. 51, № 3. - P. 246-255.

182. Pierson, D.E. Mutations affecting lipopolysaccharide enhance ail-mediated entry of Yersinia enterocolitica into mammalian cells / D.E. Pierson // Journal of bacteriology. - 1994. - Vol. 176, № 13. - P. 4043-4051.

183. Pietrzak, B. Secretory IgA in intestinal mucosal secretions as an adaptive barrier against microbial cells / B. Pietrzak, K. Tomela, A. Olejnik-Schmidt, A. Mackiewicz, M. Schmidt // International journal of molecular sciences. - 2020. - Vol. 21, № 23. - P. 9254.

184. Pisano, F. In vivo-induced InvA-like autotransporters Ifp and InvC of Yersinia pseudotuberculosis promote interactions with intestinal epithelial cells and contribute to virulence / F. Pisano, A. Kochut, F. Uliczka, R. Geyer, T. Stolz, T. Thiermann, M. Rohde, P. Dersch // Infection and immunity. - 2012. - Vol. 80, № 3. - P. 1050-1064.

185. Ponnusamy, D. High-throughput, signature-tagged mutagenic approach to identify novel virulence factors of Yersinia pestis CO92 in a mouse model of infection / D. Ponnusamy, E.C. Fitts, J. Sha, T.E. Erova, E.V. Kozlova, M.L. Kirtley, B.L. Tiner, J.A. Andersson, A.K. Chopra // Infection and immunity. - 2015. - Vol. 83, № 5. - P. 2065-2081.

186. Portnoy, D.A. Characterization of common virulence plasmids in Yersinia species and their role in the expression of outer membrane proteins. / D.A. Portnoy, H. Wolf-Watz, I. Bolin, A.B. Beeder, S. Falkow. // Infection and immunity. - 1984. - Vol. 43, № 1. - P. 108-114.

187. Purdy, G.E. IcsA surface presentation in Shigella flexneri requires the periplasmic chaperones DegP, Skp, and SurA / G.E. Purdy, C.R. Fisher, S.M. Payne // Journal of bacteriology. - 2007. - Vol. 189, № 15. - P. 5566-5573.

188. Qiu, Y. Comparison of immunological responses of plague vaccines F1+ rV270 and EV76 in Chinese-origin rhesus macaque, Macaca mulatta / Y. Qiu, Y. Liu, Z. Qi, W. Wang, Z. Kou, Q. Zhang, G. Liu, T. Liu, Y. Yang, X. Yang, Y. Xin, C. Li, B. Cui,

5. Huang, H. Liu, L. Zeng, Z. Wang, R. Yang, H. Wang, X. Wang // Scandinavian journal of immunology. - 2010. - Vol. 72, № 5. - P. 425-433.

189. Quenee, L.E. Plague vaccines and the molecular basis of immunity against Yersinia pestis / L.E. Quenee, O. Schneewind // Human vaccines. - 2009. - Vol. 5, №12. - P. 817-823.

190. Quenee, L.E. Yersinia pestis cafl variants and the limits of plague vaccine protection / L.E. Quenee, C.A. Cornelius, N.A. Ciletti, D. Elli, O. Schneewind // Infection and immunity. - 2008. - Vol. 76, № 5. - P. 2025-2036.

191. Quintard, B. Efficacy of an oral live vaccine for veterinary use against pseudotuberculosis / B. Quintard, T. Petit, N. Ruvoen, E. Carniel, C.E. Demeure // Comparative Immunology, Microbiology and Infectious Diseases. - 2010. - Vol. 33, №

6. - P. e59-e65.

192. Raqib, R. Local entrapment of interferon gamma in the recovery from Shigella dysenteriae type 1 infection / R. Raqib, A. Ljungdahl, A.A. Lindberg, U. Andersson, J. Andersson // Gut. - 1996. - Vol. 38, № 3. - P. 328-336.

193. Rascovan, N. Emergence and spread of basal lineages of Yersinia pestis during the Neolithic decline / N. Rascovan, K.G. Sjögren, K. Kristiansen, R. Nielsen, E. Willerslev, C. Desnues, S. Rasmussen // Cell. - 2019. - Vol. 176, № 1. - P. 295-305.

194. Riet-Correa, F. Yersinia pseudotuberculosis infection of buffaloes (Bubalus bubalis) / F. Riet-Correa, C. Gil-Turnes, J.C. Reyes, A.L. Schild, M.C. Mendez // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. - 1990. - Vol. 2, № 1. - P. 78-79.

195. Roggenkamp, A. Passive immunity to infection with Yersinia spp. mediated by anti-recombinant V antigen is dependent on polymorphism of V antigen / A. Roggenkamp, A.M. Geiger, L. Leitritz, A. Kessler, J. Heesemann // Infection and immunity. - 1997. - Vol. 65, № 2. - P. 446-451.

196. Rosenzweig, J.A. Plague vaccines: new developments in an ongoing search / J.A. Rosenzweig, E.K. Hendrix, A.K. Chopra // Applied Microbiology and

Biotechnology. - 2021. - Vol. 105. - P. 4931-4941.

197. Rosqvist, R. Increased virulence of Yersinia pseudotuberculosis by two independent mutations / R. Rosqvist, M. Skurnik, H. Wolf-Watz // Nature. - 1988. - Vol. 334, № 6182. - P. 522-525.

198. Roth-Walter, F. Targeting antigens to murine and human M-cells with Aleuria aurantia lectin-functionalized microparticles / F. Roth-Walter, B. Bohle, I. Schöll, E. Untersmayr, O. Scheiner, G. Boltz-Nitulescu, F. Gabor, D.J. Brayden, E. Jensen-Jarolim // Immunology letters. - 2005. - Vol. 100, № 2. - P. 182-188.

199. Rouviere, P.E. SurA, a periplasmic protein with peptidyl-prolyl isomerase activity, participates in the assembly of outer membrane porins / P.E. Rouviere, C.A. Gross // Genes & development. - 1996. - Vol. 10, № 24. - P. 3170-3182.

200. Ruan, X. Multiepitope fusion antigen induces broadly protective antibodies that prevent adherence of Escherichia coli strains expressing colonization factor antigen I (CFA/I), CFA/II, and CFA/IV / X. Ruan, D.E. Knudsen, K.M. Wollenberg, D.A. Sack, W. Zhang // Clinical and Vaccine Immunology. - 2014. - Vol. 21, № 2. - P. 243-249.

201. Ruiz, N. Advances in understanding bacterial outer-membrane biogenesis / N. Ruiz, D. Kahne, T.J. Silhavy // Nature Reviews Microbiology. - 2006. - Vol. 4, № 1. - P. 57-66.

202. Sagi, S. Heterologous expression of Intimin and IpaB fusion protein in Lactococcus lactis and its mucosal delivery elicit protection against pathogenicity of Escherichia coli O157 and Shigella flexneri in a murine model / S. Sagi, B. Konduru, M. Parida // International Immunopharmacology. - 2020. - Vol. 85. - P. 106617.

203. Sagiyev, Z. Human response to live plague vaccine EV, Almaty region, Kazakhstan, 2014-2015 / Z. Sagiyev, A. Berdibekov, T. Bolger, A. Merekenova, S. Ashirova, Z. Nurgozhin, Z. Dalibayev // PloS one. - 2019. - Vol. 14, № 6. - P. e0218366.

204. Sanapala, S. Multiple antigens of Yersinia pestis delivered by live recombinant attenuated Salmonella vaccine strains elicit protective immunity against plague / S. Sanapala, H. Rahav, H. Patel, W. Sun, R. Curtiss III // Vaccine. - 2016. - Vol. 34, № 21. - P. 2410-2416.

205. Sanford, S.E. Outbreaks of yersiniosis caused by Yersinia pseudotuberculosis in farmed cervids / S.E. Sanford // Journal of Veterinary Diagnostic Investigation. - 1995. - Vol. 7, № 1. - P. 78-81.

206. Schoberle, T.J. Uncovering an important role for YopJ in the inhibition of caspase-1 in activated macrophages and promoting Yersinia pseudotuberculosis virulence / T.J. Schoberle, L.K. Chung, J.B. McPhee, B. Bogin, J.B. Bliska // Infection and immunity. - 2016. - Vol. 84, № 4. - P. 1062-1072.

207. Schotte, P. Targeting Rac1 by the Yersinia effector protein YopE inhibits caspase-1-mediated maturation and release of interleukin-1ß / P. Schotte, G. Denecker, A. Van Den Broeke, P. Vandenabeele, G.R. Cornelis, R. Beyaert // Journal of Biological Chemistry. - 2004. - Vol. 279, № 24. - P. 25134-25142.

208. Seabaugh, J.A. Pathogenicity and virulence of Yersinia / J.A. Seabaugh, D.M. Anderson // Virulence. - 2024. - Vol. 15, № 1. - P. 2316439.

209. Sebbane, F. Kinetics of disease progression and host response in a rat model of bubonic plague / F. Sebbane, D. Gardner, D. Long, B.B. Gowen, B.J. Hinnebusch // The American journal of pathology. - 2005. - Vol. 166, № 5. - P. 14271439.

210. Seo, H. Preclinical characterization of immunogenicity and efficacy against diarrhea from MecVax, a multivalent enterotoxigenic E. coli vaccine candidate / H. Seo, C. Garcia, X. Ruan, Q. Duan, D.A. Sack, W. Zhang // Infection and immunity. -2021. - Vol. 89, № 7. - P. e0010621.

211. Shaikh, H. Current and future cholera vaccines / H. Shaikh, J. Lynch, J. Kim, J.L. Excler // Vaccine. - 2020. - Vol. 38. - P. A118-A126.

212. Shao, F. Biochemical characterization of the Yersinia YopT protease: cleavage site and recognition elements in Rho GTPases / F. Shao, P.O. Vacratsis, Z. Bao, K.E. Bowers, C.A. Fierke, J.E. Dixon // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2003. - Vol. 100, № 3. - P. 904-909.

213. Simonet, M. Protection against Yersinia infection induced by non-virulence-plasmid-encoded antigens / M. Simonet, P. Berche, D. Mazigh, M. Veron // Journal of medical microbiology. - 1985. - Vol. 20, № 2. - P. 225-231.

214. Singh, A.K. A recombinant attenuated Yersinia pseudotuberculosis vaccine delivering a Y. pestis YopENt138-LcrV fusion elicits broad protection against plague and yersiniosis in mice / A.K. Singh, R. 3rd Curtiss, W. Sun // Infection and Immunity. - 2019. - Vol. 87, № 10. - P. 10-1128.

215. Sklar, J.G. Defining the roles of the periplasmic chaperones SurA, Skp, and DegP in Escherichia coli / J.G. Sklar, T. Wu, D. Kahne, T.J. Silhavy // Genes & development. - 2007. - Vol. 21, № 19. - P. 2473-2484.

216. Sklar, J.G. Lipoprotein SmpA is a component of the YaeT complex that assembles outer membrane proteins in Escherichia coli / J.G. Sklar, T. Wu, L.S. Gronenberg, J.C. Malinverni, D. Kahne, T.J. Silhavy // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2007. - Vol. 104, № 15. - P. 6400-6405.

217. Skorko-Glonek, J. HtrA protease family as therapeutic targets / J. Skorko-Glonek, D. Zurawa-Janicka, T. Koper, M. Jarzab, D. Figaj, P. Glaza, B. Lipinska // Current pharmaceutical design. - 2013. - Vol. 19, № 6. - P. 977-1009.

218. Skorko-Glonek, J. The extracellular bacterial HtrA proteins as potential therapeutic targets and vaccine candidates / J. Skorko-Glonek, D. Figaj, U. Zarzecka, T. Przepiora, J. Renke, B. Lipinska // Current Medicinal Chemistry. - 2017. - Vol. 24, № 20. - P. 2174-2204.

219. Slee, K.J. Epidemiology of Yersinia pseudotuberculosis and Y. enterocolitica infections in sheep in Australia / K.J. Slee, N.W Skilbeck // Journal of Clinical Microbiology. - 1992. - Vol. 30, № 3. - P. 712-715.

220. Smiley, S.T. Current challenges in the development of vaccines for pneumonic plague / S.T. Smiley // Expert review of vaccines. - 2008. - Vol. 7, № 2. - P. 209-221.

221. Smiley, S.T. Immune defense against pneumonic plague / S.T. Smiley // Immunological reviews. - 2008. - Vol. 225, № 1. - P. 256-271.

222. Somov, G.P. New facts about Pseudotuberculosis in the USSR / G.P. Somov, I.L. Martinevsky // Contributions to Microbiology and Immunology. - 1973. -Vol. 2. - P. 214-216.

223. Spinner, J.L. Role of the Yersinia YopJ protein in suppressing interleukin-

8 secretion by human polymorphonuclear leukocytes / J.L. Spinner, A.M. Hasenkrug, J.G. Shannon, S.D. Kobayashi, B.J. Hinnebusch // Microbes and Infection. - 2016. - Vol. 18, № 1. - P. 21-29.

224. Strauch, K.L. Characterization of degP, a gene required for proteolysis in the cell envelope and essential for growth of Escherichia coli at high temperature / K.L. Strauch, K. Johnson, J. Beckwith // Journal of Bacteriology. - 1989. - Vol. 171, № 5. -P. 2689-2696.

225. Sulskis, D. Structural basis of DegP protease temperature-dependent activation / D. Sulskis, J. Thoma, B.M. Burmann // Science Advances. - 2021. - Vol. 7, № 50. - P. eabj1816.

226. Sun, W. Developing live vaccines against plague / W. Sun, K.L. Roland, R. Curtiss III // The Journal of Infection in Developing Countries. - 2011. - Vol. 5, № 09. - P. 614-627.

227. Sun, W. LcrV delivered via type III secretion system of live attenuated Yersinia pseudotuberculosis enhances immunogenicity against pneumonic plague / W. Sun, S. Sanapala, J.C. Henderson, S. Sam, J. Olinzock, M.S. Trent, R. Curtiss 3rd // Infection and immunity. - 2014. - Vol. 82, № 10. - P. 4390-4404.

228. Sun, W. Oral administration of a recombinant attenuated Yersinia pseudotuberculosis strain elicits protective immunity against plague / W. Sun, S. Sanapala, H. Rahav, R. Curtiss // Vaccine. - 2015. - Vol. 33, № 48. - P. 6727-6735.

229. Sun, W. Plague vaccine: recent progress and prospects / W. Sun, A.K. Singh // Vaccines. - 2019. - Vol. 4, № 1. - P. 11.

230. Sun, W. Plague vaccines: status and future / W. Sun // Yersinia pestis: Retrospective and Perspective / R. Yang, A.P. Anisimov. - Dordrecht: Springer, 2016. -Chap. 12. - P. 313-360.

231. Sun, W. Rational considerations about development of live attenuated Yersinia pestis vaccines / W. Sun, R. Curtiss // Current pharmaceutical biotechnology. -2013. - Vol. 14, № 10. - P. 878-886.

232. Sydenham, M. Salmonella enterica serovar Typhimurium surA mutants are attenuated and effective live oral vaccines / M. Sydenham, G. Douce, F. Bowe, S.

Ahmed, S. Chatfield, G. Dougan // Infection and immunity. - 2000. - Vol. 68, № 3. - P. 1109-1115.

233. Tamayo, R. Identification and genetic characterization of PmrA-regulated genes and genes involved in polymyxin B resistance in Salmonella enterica serovar Typhimurium / R. Tamayo, S.S. Ryan, A.J. McCoy, J.S. Gunn // Infection and immunity. - 2002. - Vol. 70, № 12. - P. 6770-6778.

234. Tan, S.Y. YersiniaBase: a genomic resource and analysis platform for comparative analysis of Yersinia / S.Y. Tan, A. Dutta, N.S. Jakubovics, M.Y. Ang, C.C. Siow, N.V. Mutha, H. Heydari, W.Y. Wee, G.J. Wong, S.W. Choo // BMC bioinformatics. - 2015. - Vol. 16. - P. 1-13.

235. Taylor, V.L. Oral immunization with a dam mutant of Yersinia pseudotuberculosis protects against plague / V.L. Taylor, R.W. Titball, P.C.F. Oyston // Microbiology. - 2005. - Vol. 151, № 6. - P. 1919-1926.

236. Tellez Jr, R. Substitutions in the BamA ß-barrel domain overcome the conditional lethal phenotype of a AbamBAbamE strain of Escherichia coli / R. Tellez Jr, R. Misra // Journal of bacteriology. - 2012. - Vol. 194, № 2. - P. 317-324.

237. Thorslund, S.E. Role of YopK in Yersinia pseudotuberculosis resistance against polymorphonuclear leukocyte defense / S.E. Thorslund, D. Ermert, A. Fahlgren, S.F. Erttmann, K. Nilsson, A. Hosseinzadeh, C.F. Urban, M. Fällman // Infection and immunity. - 2013. - Vol. 81, № 1. - P. 11-22.

238. Tormo, A. surA, an Escherichia coli gene essential for survival in stationary phase / A. Tormo, M. Almiron, R. Kolter // Journal of bacteriology. - 1990. -Vol. 172, № 8. - P. 4339-4347.

239. Trosky, J.E. Yersinia outer proteins: Yops / J.E. Trosky, A.D.B. Liverman, K. Orth // Cellular microbiology. - 2008. - Vol. 10, № 3. - P. 557-565.

240. Tsang, T.M. Ail proteins of Yersinia pestis and Y. pseudotuberculosis have different cell binding and invasion activities / T.M. Tsang, J.S. Wiese, S. Felek, M. Kronshage, E.S. Krukonis // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, № 12. - P. e83621.

241. Turner, A.K. Generation and characterization of a live attenuated enterotoxigenic Escherichia coli combination vaccine expressing six colonization factors

and heat-labile toxin subunit B / A.K. Turner, J.C. Stephens, J.C. Beavis, J. Greenwood, C. Gewert, R. Randall, D. Freeman, M.J. Darsley // Clinical and Vaccine Immunology. -2011. - Vol. 18, № 12. - P. 2128-2135.

242. Tyrer, P. Microbial pattern recognition receptors mediate M-cell uptake of a gram-negative bacterium / P. Tyrer, A.R. Foxwell, A.W. Cripps, M.A. Apicella, J.M. Kyd // Infection and immunity. - 2006. - Vol. 74, № 1. - P. 625-631.

243. Ureta, A.R. Kinetic analysis of the assembly of the outer membrane protein LamB in Escherichia coli mutants each lacking a secretion or targeting factor in a different cellular compartment / A.R. Ureta, R.G. Endres, N.S. Wingreen, T.J. Silhavy // Journal of bacteriology. - 2007. - Vol. 189, № 2. - P. 446-454.

244. Verma, S.K. Plague vaccine development: current research and future trends / S.K. Verma, U. Tuteja // Frontiers in immunology. - 2016. - Vol. 7. - P. 602.

245. Vertommen, D. Characterization of the role of the Escherichia coli periplasmic chaperone SurA using differential proteomics / D. Vertommen, N. Ruiz, P. Leverrier, T.J. Silhavy, J.F. Collet // Proteomics. - 2009. - Vol. 9, № 9. - P. 2432-2443.

246. Viboud, G.I. Comparison of YopE and YopT activities in counteracting host signalling responses to Yersinia pseudotuberculosis infection / G.I. Viboud, E. Mejia, J.B. Bliska // Cellular microbiology. - 2006. - Vol. 8, № 9. - P. 1504-1515.

247. Viboud, G.I. Yersinia outer proteins: role in modulation of host cell signaling responses and pathogenesis / G.I. Viboud, J.B. Bliska // Annual Review of Microbiology. - 2005. - Vol. 59, № 1. - P. 69-89.

248. Vincent, P. Sudden onset of pseudotuberculosis in humans, France, 200405 / P. Vincent, A. Leclercq, L. Martin, Yersinia Surveillance Network, J.M. Duez, M. Simonet, E. Carniel // Emerging infectious diseases. - 2008. - Vol. 14, № 7. - P. 11191122.

249. Volokhina, E.B. The ß-barrel outer membrane protein assembly complex of Neisseria meningitidis / E.B. Volokhina, F. Beckers, J. Tommassen, M.P. Bos // Journal of bacteriology. - 2009. - Vol. 191, № 22. - P. 7074-7085.

250. Vuong, P. Analysis of YfgL and YaeT interactions through bioinformatics, mutagenesis, and biochemistry / P. Vuong, D. Bennion, J. Mantei, D.

Frost, R. Misra // Journal of bacteriology. - 2008. - Vol. 190, № 5. - P. 1507-1517.

251. Walker, R.I. An assessment of enterotoxigenic Escherichia coli and Shigella vaccine candidates for infants and children / R.I. Walker // Vaccine. - 2015. -Vol. 33, № 8. - P. 954-965.

252. Wang, T. Type VI secretion system transports Zn2+ to combat multiple stresses and host immunity / T. Wang, M. Si, Y. Song, W. Zhu, F. Gao, Y. Wang, L. Zhang, W. Zhang, G. Wei, Z.Q. Luo, X. Shen // PLoS pathogens. - 2015. - Vol. 11, № 7. - P. e1005020.

253. Wang, X. Live-attenuated Yersinia pestis vaccines / X. Wang, X. Zhang,

D. Zhou, R. Yang // Expert review of vaccines. - 2013. - Vol. 12, № 6. - P. 677-686.

254. Wang, X. Remodeling Yersinia pseudotuberculosis to generate a highly immunogenic outer membrane vesicle vaccine against pneumonic plague / X. Wang, P. Li, A.K. Singh, X. Zhang, Z. Guan, R. Curtiss 3rd, W. Sun // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2022. - Vol. 119, № 11. - P. e2109667119.

255. Wang, X. Serum cytokine responses in primary pneumonic plague patients / X. Wang, Z. Wang, Z. Guo, B. Wei, F. Tian, S. Yu, H. Wang, H. Wang, R. Yang // Clinical and Vaccine Immunology. - 2011. - Vol. 18, № 1. - P. 184-186.

256. Webb, C.T. Evolution of the ß-barrel assembly machinery / C.T. Webb,

E. Heinz, T. Lithgow // Trends in microbiology. - 2012. - Vol. 20, № 12. - P. 612-620.

257. Weirich, J. Identifying components required for OMP biogenesis as novel targets for antiinfective drugs / J. Weirich, C. Bräutigam, M. Mühlenkamp, M. FranzWachtel, B. Macek, I. Meuskens, M. Skurnik, K. Leskinen, E. Bohn, I. Autenrieth, M. Schütz // Virulence. - 2017. - Vol. 8, № 7. - P. 1170-1188.

258. Welch, T.J. Multiple antimicrobial resistance in plague: an emerging public health risk / T.J. Welch, W.F. Fricke, P.F. McDermott, D.G. White, M.L. Rosso, D.A. Rasko, J. Ravel // PloS one. - 2007. - Vol. 2, № 3. - P. e309.

259. Welsh, R.D. Epizootic of Yersinia pseudotuberculosis in a wildlife park / R.D. Welsh, R.W. Ely, R.J. Holland // Journal of the American Veterinary Medical Association. - 1992. - Vol. 201, № 1. - P. 142-144.

260. Wiley, D.J. The Ser/Thr kinase activity of the Yersinia protein kinase A

(YpkA) is necessary for full virulence in the mouse, mollifying phagocytes, and disrupting the eukaryotic cytoskeleton / D.J. Wiley, R. Nordfeldth, J. Rosenzweig, C.J. DaFonseca, R. Gustin, H. Wolf-Watz, K. Schesser // Microbial pathogenesis. - 2006. -Vol. 40, № 5. - P. 234-243.

261. Williams, C. Approaches to control of Yersinia pseudotuberculosis in European zoos / C. Williams // European Association of Zoo-and Wildlife Veterinarians 5th scientific meeting: abstract book (Ebeltoft, 19-23 of May 2004). - Ebeltoft: Annegret Fröhner und Jörg Swoboda, 2004. - P. 19-25.

262. Williams, J.E. Chronic infections in laboratory rodents from inoculation of nonencapsulated plague bacilli (Yersinia pestis) / J.E. Williams, D.C. Cavanaugh // Experientia. - 1983. - Vol. 39, № 4. - P. 408-409.

263. Williams, J.E. Measuring the efficacy of vaccination in affording protection against plague / J.E. Williams, D.C. Cavanaugh // Bulletin of the World Health Organization. - 1979. - Vol. 57, № 2. - P. 309-13.

264. Williams, J.E. Potential for rat plague from nonencapsulated variants of the plague bacillus (Yersinia pestis) / J.E. Williams, D.C. Cavanaugh // Experientia. -1984. - Vol. 40, № 7. - P. 739-740.

265. Williamson, E.D. A new improved sub-unit vaccine for plague: the basis of protection / E.D. Williamson, S.M. Eley, K.F. Griffin, M. Green, P. Russell, S.E. Leary, R.W. Titball // FEMS Immunology & Medical Microbiology. - 1995. - Vol. 12, № 3-4. - P. 223-230.

266. Williamson, E.D. An IgG1 titre to the F1 and V antigens correlates with protection against plague in the mouse model / E.D. Williamson, P.M. Vesey, K.J. Gillhespy, S.M. Eley, M. Green, R.W. Titball // Clinical & Experimental Immunology. -1999. - Vol. 116, № 1. - P. 107-114.

267. Williamson, E.D. Human immune response to a plague vaccine comprising recombinant F1 and V antigens / E.D. Williamson, H.C. Flick-Smith, C. Lebutt, C.A. Rowland, S.M. Jones, E.L. Waters, M. Irving // Infection and immunity. -2005. - Vol. 73, № 6. - P. 3598-3608.

268. Winter, C.C. An unusual strain of Pasteurella pestis isolated from a fatal

human case of plague / C.C. Winter, W.B. Cherry, M.D. Moody // Bulletin of the World Health Organization. - 1960. - Vol. 23, № 2-3. - P. 408.

269. Wood, R.A. Allergic reactions to vaccines / R.A. Wood // Pediatric Allergy and Immunology. - 2013. - Vol. 24, № 6. - P. 521-526.

270. Wu, T. Identification of a multicomponent complex required for outer membrane biogenesis in Escherichia coli / T. Wu, J. Malinverni, N. Ruiz, S. Kim, T.J. Silhavy, D. Kahne // Cell. - 2005. - Vol. 121, № 2. - P. 235-245.

271. Yang, X. Oral vaccination with Salmonella simultaneously expressing Yersinia pestis F1 and V antigens protects against bubonic and pneumonic plague / X. Yang, B.J. Hinnebusch, T. Trunkle, C.M. Bosio, Z. Suo, M. Tighe, A. Harmsen, T. Becker, K. Crist, N. Walters, R. Avci, D.W. Pascual // The Journal of Immunology. -2007. - Vol. 178, № 2. - P. 1059-1067.

272. Yang, X. Type VI secretion systems present new insights on pathogenic Yersinia / X. Yang, J. Pan, Y. Wang, X. Shen // Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. - 2018. - Vol. 8. - P. 260.

273. Yang, Y. The psa locus is responsible for thermoinducible binding of Yersinia pseudotuberculosis to cultured cells / Y. Yang, J.J. Merriam, J.P. Mueller, R.R. Isberg // Infection and immunity. - 1996. - Vol. 64, № 7. - P. 2483-2489.

274. Yun, Y. Nanoparticles for oral delivery: targeted nanoparticles with peptidic ligands for oral protein delivery / Y. Yun, Y.W. Cho, K. Park // Advanced drug delivery reviews. - 2013. - Vol. 65, № 6. - P. 822-832.

275. Zeng, M. Efficacy, safety, and immunogenicity of an oral recombinant Helicobacter pylori vaccine in children in China: a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial / M. Zeng, X.H. Mao, J.X. Li, W.D. Tong, B. Wang, Y.J. Zhang, G. Guo, Z.J. Zhao, L. Li, D.L. Wu, D.S. Lu, Z.M. Tan, H.Y. Liang, C. Wu, D.H. Li, P. Luo, H. Zeng, W.J. Zhang, J.Y. Zhang, B.T. Guo, F.C. Zhu, Q.M. Zou // The Lancet. -2015. - Vol. 386, № 10002. - P. 1457-1464.

276. Zhang, L. Helicobacter pylori in the Oral Cavity: current evidence and potential survival strategies / L. Zhang, X. Chen, B. Ren, X. Zhou, L. Cheng // International journal of molecular sciences. - 2022. - Vol. 23, № 21. - P. 13646.

277. Zhang, S. Ag85A, As an S2 Vaccine Carrier, Reduces the Toxicity of the S2 Vaccine and Enhances the Protective Ability of Mice against Brucella / S. Zhang, L. Chao, L. She, H. Sui, H. Niu, Z. Chen, X. Li, J. Zhai // Journal of Immunology Research. - 2022. - Vol. 2022. - P. 4686541.

278. Zhang, Y. Role of Toll-like receptor signaling in the apoptotic response of macrophages to Yersinia infection / Y. Zhang, J.B. Bliska // Infection and immunity. -2003. - Vol. 71, № 3. - P. 1513-1519.

279. Zhou, D. Defining the genome content of live plague vaccines by use of whole-genome DNA microarray / D. Zhou, Y. Han, E. Dai, Y. Song, D. Pei, J. Zhai, R. Yang // Vaccine. - 2004. - Vol. 22, № 25-26. - P. 3367-3374.

280. Zietz, B.P. The history of the plague and the research on the causative agent Yersinia pestis / B.P. Zietz, H. Dunkelberg // International journal of hygiene and environmental health. - 2004. - Vol. 207, № 2. - P. 165-178.

СПИСОК НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ

1. Трунякова, А.С. Штамм Yersinia pseudotuberculosis - основа родоспецифичного иммунитета / А.С. Трунякова, Т.В. Гапельченкова, М.Е. Платонов, Р.З. Шайхутдинова, С.В. Дентовская // Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы: материалы XIII Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням имени академика В.И. Покровского (Москва, 24-26 мая 2021 года). - Москва: Медицинское маркетинговое агентство, 2021. - С. 218.

2. Трунякова, А.С. Зависимость протективной активности капсульного антигена Yersinia pestis от степени очистки / А.С. Трунякова, М.Е. Платонов, П.Х. Копылов, Е.А. Красильникова, Т.И. Комбарова, С.В. Дентовская // Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены: материалы XIII Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора (Екатеринбург, 15-17 сентября 2021 года). -Екатеринбург: ФБУН ЕМНЦ ПОЗРПП Роспотребнадзора, 2021. - С. 315-317.

3. Трунякова, А.С. Оценка иммуногенной и протективной активности штамма Yersinia pseudotuberculosis 85pCad+ с делецией гена surA / А.С. Трунякова, Е.А. Красильникова, Т.В. Гапельченкова, Т.Э. Светоч, С.В. Дентовская // VIII Национальный конгресс бактериологов: сборник трудов (Москва, 28-29 сентября 2023 года). - Москва: Издательство «Династия», 2023. - С. 135.

4. Трунякова, А.С. Оценка иммуногенной и протективной активности штамма Y. pseudotuberculosis 85pCad+ с делецией гена bamB / А.С. Трунякова, Е.А. Красильникова, Т.В. Гапельченкова, С.В. Дентовская // Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы: материалы XVI Ежегодного Всероссийского Конгресса по инфекционным болезням имени академика В.И. Покровского (Москва, 25-27 марта 2024 года). - Москва: Медицинское маркетинговое агентство, 2024. - С. 202.

5. Светоч, Т.Э. Оральные вакцины для профилактики бактериальных инфекций: стратегии и перспективы разработок / Т.Э. Светоч, А.С.

Трунякова, С.В. Дентовская // Проблемы особо опасных инфекций. - 2024. -Вып. 2. - С. 51-61.

6. Трунякова, А.С. Рекомбинантный низкоэндотоксичный штамм Yersinia pseudotuberculosis - суперпродуцент капсульного Fl-антигена чумного микроба / А.С. Трунякова, М.Е. Платонов, С.А. Иванов, П.Х. Копылов, С.В. Дентовская, А.П. Анисимов // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2024. - Т. 42, № 2. - С. 10-15.

7. Дентовская, С.В. SurA необходим для биогенеза наружной мембраны и может быть использован в качестве молекулярной мишени для терапии чумы / С.В. Дентовская, М.Е. Платонов, Р.З. Шайхутдинова, Т.Э. Светоч, С.А. Иванов, Т.В. Гапельченкова, Е.А. Красильникова, А.С. Трунякова, Т.И. Комбарова, А.С. Вагайская, Н.А. Липатникова, Е.М. Мазурина, Л.В. Коломбет, А.П. Анисимов // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2024. - Т. 42, № 2. - С. 3-9.

8. Трунякова, А.С. Оптимизация метода селекции при конструировании мутантных штаммов Yersinia pseudotuberculosis / А.С. Трунякова, Р.З. Шайхутдинова, С.В. Дентовская // Бактериология. - 2024. - Т. 9, № 4. - С. 64-66.

9. Трунякова, А.С. Влияние делеции генов surA, degP, bamB и ompH на способность штамма Yersinia pseudotuberculosis 85 pCad+ колонизировать внутренние органы мышей / А.С. Трунякова, А.С. Вагайская, С.В. Дентовская // IX Национальный конгресс бактериологов: сборник трудов (Москва, 17-19 сентября 2024 года). - Москва: Издательство «Династия», 2024. - С. 130.

10. Трунякова, А.С. Влияние делеции генов surA, degP, bamB и ompH на целостность внешней мембраны псевдотуберкулезного микроба / А.С. Трунякова, Т.В. Гапельченкова, Р.З. Шайхутдинова, Е.М. Мазурина, Е.А. Красильникова, С.В. Дентовская // IX Национальный конгресс бактериологов: сборник трудов (Москва, 17-19 сентября 2024 года). - Москва: Издательство «Династия», 2024. - С. 131.

11. Трунякова, А.С. Иммунологическая активность мутантных штаммов Yersinia pseudotuberculosis при оральном введении / А.С. Трунякова //

Современные проблемы эпидемиологии, микробиологии и гигиены: материалы XVI Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора (Екатеринбург, 4-6 сентября 2024 года). -Екатеринбург: ФБУН ЕМНЦ ПОЗРПП Роспотребнадзора, 2024. - С. 282-284.

12. Anisimov, A.P. Live Plague Vaccine Development: Past, Present, and Future / A.P. Anisimov, A.S. Vagaiskaya, A.S. Trunyakova, S.V. Dentovskaya // Vaccines. - 2025. - Vol. 13, № 1. - P. 66.

13. Трунякова, А. С. Влияние делеции гена протеазы degP на иммунологическую активность штамма Yersinia pseudotuberculosis / А.С. Трунякова, Т.В. Гапельченкова, Т.И. Комбарова, С.В. Дентовская // Проблемы медицинской микологии. - 2025. - Т. 27, № 2. - С. 267.

14. Трунякова, А.С. Нарушение биогенеза наружной мембраны ведет к аттенуации Yersinia pseudotuberculosis / А.С. Трунякова, Р.З. Шайхутдинова, Т.В. Гапельченкова, А.С. Вагайская, Н.А. Липатникова, Е.А. Красильникова, Е.М. Мазурина, Т.И. Комбарова, С.В. Дентовская, А.П. Анисимов // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2025. - Т. 43, № 2. -С. 29-34.

15. Трунякова, А.С. Факторы патогенности Yersinia pseudotuberculosis: мишени для аттенуации при создании живых и векторных вакцин / А.С. Трунякова, А.С. Вагайская, С.В. Дентовская // Бактериология. - 2025. - Т. 10, № 2. - С. 103-107.

16. Trunyakova, A.S. Construction of plague vaccines based on Yersinia pseudotuberculosis / A.S. Trunyakova, A.S. Vagaiskaya, A.S. Kartseva, T.A. Ivaschenko, S.V. Dentovskaya, A.P. Anisimov // Yersinia: XV International symposium: abstract book (Ulaanbaatar, 16-17 of September 2025). - Ulaanbaatar: National Center for Zoonotic Diseases (NCZD), 2025. - P. 25.

17. Патент 2844170 С1 Российская Федерация, МПК C12N 15/63 (2006.01) C12N 15/31 (2006.01). Штамм-продуцент рекомбинантного капсульного антигена чумного микроба и способ его получения / Трунякова А.С., Платонов М.Е., Иванов С.А., Копылов П.Х., Мазурина Е.М., Дентовская С.В., Анисимов

А.П.; заявитель и патентообладатель: ФБУН ГНЦ ПМБ Роспотребнадзора (Яи). - № 2024121279; заявл. 26.07.2024; опубл. 28.07.2025, Бюл. № 22. - 16 с.