Характеристика оральной микробиоты при воспалительных заболеваниях пародонта: диагностическое, прогностическое и терапевтическое значение тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Гимранова Ирина Анатольевна

• Гимранова Ирина Анатольевна
• доктор наук
• 2026

Оглавление диссертации доктор наук Гимранова Ирина Анатольевна

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ АСПЕКТЫ ПРОБЛЕМЫ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ПАРОДОНТА (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1. Эпидемиологическая и социально-экономическая значимость различных форм воспалительных заболеваний парододонта

1.2. Роль оральной микробиоты в этиологии и патогенезе воспалительных заболеваний пародонта

1.3. Характеристика факторов патогенности основных пародонтопатогенных микроорганизмов

1.4. Особенности лабораторной диагностики воспалительных заболеваний пародонта

1.5. Современные подходы к терапии воспалительных заболеваний пародонта

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Дизайн и объекты диссертационного исследования

2.2. Методы клинического обследования пациентов

2.3. Бактериологический метод исследования

2.4. Молекулярно-генетические методы исследования

2.5. Иммунологические методы исследования

2.6. Выделение штаммов Lactobacillus spp. из исследуемого материала и их биологическая характеристика

2.7. Методы статистической обработки полученных данных и биоинформатический анализ

ГЛАВА 3. ХАРАКТЕРИСТИКА МИКРОБИОТЫ СОДЕРЖИМОГО ДЕСНЕВЫХ БОРОЗД И ПАРОДОНТАЛЬНЫХ КАРМАНОВ У ПАЦИЕНТОВ С ВОСПАЛИТЕЛЬНЫМИ ЗАБОЛЕВАНИЯМИ ПАРОДОНТА

3.1. Анализ результатов бактериологического исследования образцов

3.2. Результаты анализа метагеномных данных образцов в группах обследуемых лиц: уровни филума типов, рода и вида бактерий

3.3. Оценка взаимосвязи состава орального микробиома и формы воспалительного заболевания пародонта

ГЛАВА 4. РАЗРАБОТКА СПОСОБОВ ДИАГНОСТИКИ И ПРОГНОЗИРОВАНИЯ ХАРАКТЕРА ТЕЧЕНИЯ ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ЗАБОЛЕВАНИЙ ПАРОДОНТА

4.1. Прогнозирование тяжести воспалительного заболевания пародонта по составу микробиоты содержимого десневой

борозды или пародонтального кармана, выделенной бактериологическим методом

4.2. Результаты иммунологического исследования лиц в анализируемых группах

4.3. Клинико-иммунологические показатели и маркеры микробиома как предикторы воспалительных заболеваний пародонта

4.4. Определение факторов патогенности S. gordonii и F. alocis как маркеров прогрессирующего течения пародонтита

4.5. Алгоритм лабораторной диагностики пародонтита на основе микробиологических, клинико-иммунологических и молекулярно-генетических критериев

ГЛАВА 5. ИЗУЧЕНИЕ БИОЛОГИЧЕСКИХ СВОЙСТВ LACTOBACILLUS SPP., ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ СОДЕРЖИМОГО ДЕСНЕВЫЗ БОРОЗД И ПАРОДОНТАЛЬНЫХ КАРМАНОВ ДЛЯ ВЫБОРА ШТАММОВ - КАНДИДАТОВ В ПРОБИОТИКИ

5.1. Видовая структура оральных штаммов Lactobacillus spp

5.2. Адгезивная способность штаммов Lactobacillus spp. к буккальному эпителию

5.3. Антагонистические свойства штаммов Lactobacillus spp

5.4. Способность штаммов Lactobacillus spp. к биопленкообразованию

5.5. Изучение антибиотикоустойчивости штаммов

Lactobacillus spp

5.6. Биосовместимость штаммов Lactobacillus spp

5.7. Практическая значимость исследуемых штаммов Lactobacillus spp

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Характеристика оральной микробиоты при воспалительных заболеваниях пародонта: диагностическое, прогностическое и терапевтическое значение»

Актуальность исследования

Заболевания пародонта представляют собой актуальную проблему общественного здравоохранения, затрагивающую около 20-50% людей во всем мире, число которых, по прогнозам, будет увеличиваться [43, 188]. Нарушение баланса в составе микроорганизмов биопленок и иммунной реакцией человека, вследствие особенных пищевых привычек и неправильной гигиеной полости рта, приводит к различным, воспалительным, заболеваниям полости рта, таким как кариес, гингивит, пародонтит, а также рак [349].

Гингивит проявляется признаками воспаления, покраснением и отеком десен [45, 152]. Накопление зубного налета и сдвиг иммунно-воспалительных реакций организма человека могут спровоцировать начало развития гингивита, что в свою очередь может привести к нарушению микробного равновесия, то есть к дисбиозу [152]. Гингивит может проявляться кровоточивостью десен и часто имеет едва заметные клинические признаки, в результате чего большинство пациентов не знают о заболевании или не могут его распознать. В отличие от пародонтита при гингивите возможно полное выздоровление десен, так как сам процесс на этой стадии обратим. Однако дальнейшие изменения состава микробиома с сохраняющимся воспалением десен могут привести к пародонтиту. Своевременное лечение и контроль гингивита с определением этиологически значимых микроорганизмов могут предотвратить прогрессирующее течение процесса.

Одним из наиболее серьезных воспалительных заболеваний пародонта является пародонтит, характеризующийся хроническим течением, склонностью к генерализации и прогрессированию патологического процесса, который приводит к разрушению структурных компонентов опорного аппарата зубов, их подвижности и, в конечном счете, потере. Следует отметить, что в этиологии и патогенезе пародонтита ключевая роль принадлежит микроорганизмам, прежде

всего - бактериям [144], и их взаимодействию с гуморальными и клеточными эффекторами иммунитета макроорганизма, о чем свидетельствуют результаты многочисленных исследований, посвященных указанной проблеме [318]. Было доказано взаимодействие защитных механизмов хозяина с биопленкой, содержащей микроорганизмы, обусловливающее длительное воспаление. Эти патофизиологические изменения сохраняются до тех пор, пока не купируется воспаление посредством терапевтических вмешательств, например, под действием антибиотиков, лазерной терапии и т.п., с последующей регенерацией тканей [12]. Формирование биопленки начинается с прикрепления бактерий-первичных колонизаторов, таких как Actinomyces spp. и Streptococcus spp., над десной, что обеспечивает основу для прикрепления других бактерий, в частности Corynebacterium spp., на которых могут закрепляться микроорганизмы других видов. Увеличение массы и формирование сложной структуры зубной биоплёнки создаёт в её центре бескислородную среду, которая идеально подходит для роста капнофильных видов, таких как Capnocytophaga spp. и Fusobacterium spp, которые способствуют появлению предполагаемых патогенов пародонта, к которым относятся Porphyromonas gingivalis, Filifactor alocis, Tanerella forsitia, Treponema denticola и др. В условиях возникшего дисбиоза в ротовой полости некоторые потенциальные патогенные бактерии, например Streptococcus gordonii, Streptococcus viridans, могут проявлять свой патогенный потенциал, способствуя усилению воспалительной реакции в тканях пародонта [329]. Примечательно, что инфекционный процесс при пародонтите вызывает воспалительную реакцию иммунной системы не только местного, но и системного характера в виде обострения других хронических заболеваний [42].

Общепризнанными этиологически значимыми пародонтопатогенами при развитии пародонтита являются микроорганизмы видов Porphyromonas gingivalis, Aggregatibacter actinomycetecomitans, Fusobacterium nucleatum и Tannerella forsythia, а также Treponema denticola, Prevotella intermedia, Campylobacter rectus, Peptostreptococcus micros и рода Spirochetes [15]. Наиболее значимую роль

отводят Porphyromonas gingivalis, который способен нарушать баланс микробных сообществ и вызывать инфекционный процесс [294]. Кроме того, Porphyromonas ^т^таНя взаимодействует с другими микроорганизмами, которые колонизируют пародонтальный карман на ранних стадиях заболевания, что способствует прогрессированию пародонтита и необратимым изменениям опорно-удерживающих тканей зуба и альвеолярной кости, в итоге, потере зуба [294]. Недавние исследования указывают на присутствие в поддесневом пространстве новых видов бактерий, которые могут играть определенную роль в развитие пародонтита, в частности, FШfactor а1оcis. F. а\о^ обладает уникальными свойствами вирулентности, связанными с наличием у них таких факторов/особенностей, как внеклеточные везикулы, липотейхоевая кислота, устойчивость к окислительному стрессу и протеазная активность, которые вместе запускают провоспалительный цитокиновый ответ тканей пародонта [54, 78, 91]. Считается, что F. а\о^ является синергистом Р. gingivalis, а сочетанное присутствие этих возбудителей взаимно повышает их инвазивные свойства и значительно усиливает процессы формирования биоплёнки в целом [41, 55]. Сегодня измененные микробные сообщества ротовой полости рассматриваются как потенциально патогенные ассоциации микроорганизмов, способные вызвать развитие заболеваний пародонта.

Идеальный метод диагностики пародонтита должен позволять, во-первых, проводить скрининг микробиоты, во-вторых, прогнозировать течение заболевания, в-третьих, контролировать эффективность проводимой терапии. Наряду с традиционно используемыми бактериологическими методами этиологической диагностики воспалительных заболеваний пародонта, начинают активно внедряться молекулярно-генетические методы, такие как секвенирование 16S рРНК и метагеномный анализ, которые позволяют выявлять весь спектр микроорганизмов, присутствующих в биопленках полости рта, включая некультивируемые виды. Также появилась возможность идентифицировать гены, ответственные за устойчивость к антибиотикам у пародонтопатогенов и

определять генетические маркеры патогенности бактерий для более глубокого понимания механизмов, лежащих в основе развития пародонтита, и разработки новых методов лечения и профилактики. Учитывая сложность терапии пародонтита и высокий риск хронического рецидивирующего течения заболевания, в настоящее время расширяются исследования по поиску новых эффективных лекарственных препаратов, в том числе пробиотических, нацеленных на снижение агрессивного потенциала микробных биопленок в полости рта.

Таким образом, высокая распространенность воспалительных заболеваний пародонта, недостаточная эффективность и длительные сроки их терапии, склонность данной патологии к хроническому и рецидивирующему течению с вовлечением в патогенетический круг многочисленных иммунных механизмов обусловливают актуальность проблемы оптимизации диагностики заболеваний пародонта, в частности пародонтита. Всестороннее понимание экологии оральной микробиоты и выявление особенностей динамической взаимосвязи между развитием заболеваний пародонта и поддесневым микробным сообществом являются многообещающей основой для разработки новых критериев в диагностике и прогнозировании пародонтита, совершенствования и повышения эффективности профилактики и лечения данной патологии.

Степень разработанности темы исследования

В настоящее время отмечается увеличение количества исследований, посвященных связи между составом оральной микробиоты и развитием воспалительных заболеваний пародонта. Однако уточнение роли отдельных видов микроорганизмов и особенностей их взаимодействий остается актуальным. Для понимания молекулярных механизмов повреждения пародонта и разработки эффективной таргетной терапии пародонтита особую ценность представляют данные по идентификации этиологически значимых видов микроорганизмов, участвующих в формировании дисбиотических сдвигов орального микробиома

при прогрессировании гингивита и пародонтита. Такая информация может быть получена в рамках проведения метагеномных исследований, при которых можно не только всесторонне охарактеризовать пародонтальные микробные консорциумы, но и обнаружить в них новые виды микроорганизмов, ассоциированные с развитием и прогрессированием гингивита и пародонтита, в том числе в сравнении составом микробиома здоровых лиц, идентифицируя в них доминирующие виды бактерий и их факторов патогенности. При этом необходимы большое количество исследований, изучающих влияние генетических, иммунных и других факторов человека на состав и функции микробиоты полости рта и развитие заболеваний пародонта. Перспективным является разработка лекарственных препаратов и терапевтических стратегий, нацеленных на специфические патогены или пути их патогенности. В этом случае необходимы исследования возможности использования не только лекарственных, но и пробиотических препаратов для восстановления баланса оральной микробиоты и предотвращения развития пародонтита. Необходимо выявить эффективные штаммы и определить оптимальные режимы применения в качестве персонализированной терапии. Таким образом, дальнейшие научные исследования в данной области актуальны и должны сосредоточиться на интеграции данных о микробиоте с данными о факторах хозяина, чтобы создать более полную картину патогенеза воспалительных заболеваний пародонта и разработать эффективные методы диагностики, прогнозирования и лечения.

Цель исследования

Охарактеризовать особенности оральной микробиоты у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта и оптимизировать подходы к диагностике, терапии и профилактике.

Задачи исследования

1. Провести сравнительный анализ таксономических составов микробных

ассоциаций в содержимом пародонтальных карманов у пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом легкой и средней степенями тяжести и десневой борозде пациентов с гингивитом и здоровых лиц, выявленных бактериологическим методом и секвенированием 16S рРНК.

2. Определить частоту обнаружения приоритетных пародонтопатогенов и других вероятных возбудителей при гингивите и хроническом генерализованном пародонтите легкой и средней степенями тяжести.

3. Проанализировать взаимосвязи видового состава оральной микробиоты в десневой борозде и пародонтальном кармане с формой и степенью тяжести патологии у лиц с воспалительными заболеваниями пародонта.

4. Определить в образцах от пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта генетические детерминанты патогенности бактерий Streptococcus gordonii и Filifactor alocis как потенциальных пародонтопатогенов.

5. Оценить состояние цитокинового профиля и показателей иммунного ответа у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта и провести анализ взаимосвязей иммунологических парметров с количественно-качественными характеристиками оральной микробиоты при данной патологии.

6. На основе микробиологических, клинико-иммунологических и молекулярно-генетических критериев разработать алгоритм лабораторной диагностики пародонтита.

7. Охарактеризовать в опытах in vitro комплекс биологических свойств и пробиотический потенциал штаммов Lactobacillus spp., выделенных из содержимого десневой борозды здоровых лиц/пациентов с гингивитом и пародонтальных карманов пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом, для отбора потенциальных кандидатов, перспективных при создании оральных пробиотиков лечебно-профилактической направленности.

Научная новизна

На основе результатов бактериологического исследования и

корреляционного анализа установлена взаимосвязь между формой заболевания пародонта и определенным составом микробиоты содержимого десневой борозды и пародонтального кармана.

Проведенный сравнительный анализ геномного состава оральной микробиоты у здоровых лиц и пациентов с гингивитом и хроническим генерализованным пародонтитом легкой и средней степенями тяжести показал статистически значимые различия на уровне типов, родов и видов бактерий, что отражает сложность и динамичность микробных сообществ при различных состояниях пародонта. У пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта идентифицированы «специфические» консорциумы микроорганизмов, характерные как для начальных этапов воспаления пародонта (гингивит), так и для прогрессирующего течения воспалительного процесса (пародонтит), что позволяет рассматривать их в качестве микробиологических маркеров и диффернциально-диагностических критериев данной патологии. В частности, установлено, что при гингивите в микробиоте десневой борозды часто (82%) выявляются ассоциации микроорганизмов таких видов, как Streptococcus anginosus, Gemella haemolysans, Haemophilus haemolyticus, Aggregatibacter segnis, Aggregatibacter segnis, Campylobacter gracilis, тогда как при хроническом генерализованном пародонтите в формировании микробиоты пародонтальных карманов принимают участие не только известные пародонтопатогены (Porphyromonas gingivalis, Treponema denticola, Tannerella forsythia Prevotella intermedia, Fusobacterium nucleatum), но и не тривиальные потенциально пародонтопатогенные бактерии (Streptococcus gordonii, Gemella morbillorum, Phocaeicola аbscessus, Veillonella dispar, Capnocytophaga sputigena, Filifactor alocis, Desulfobulbus spp.).

Впервые на основе комплексного подхода с использованием иммунологического и метагеномного анализов выявлены иммуно-микробиологические параллели, характеризующие состояние здоровья пародонта и его отклонения на ранних и прогрессирующих стадиях пародонтита, и установлено, что сочетанное

присутствие в оральном микробиоме у пациентов Fusobacterium nucleatum, Porphyromonas gingivalis, Filifactor alocis и Veillonella dispar способствует угнетению клеточного и гуморального звеньев иммунитета и является биомаркером прогрессирующего течения пародонтита.

Впервые молекулярно-генетическим методом с использованием подобранных олигонуклеотидных праймеров к генам, кодирующим факторы патогенности hsa (кодирующего антиген Hs) и GspB (кодирующего поверхностный белок B) у Streptococcus gordonii, ftxA (кодирующего белок RTX) у Filifactor alocis, определена частота их встречаемости в клинических образцах пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта и обоснована их индикаторная роль в оценке риска развития, тяжести течения заболевания и эффективности проводимой терапии.

Обоснованы дополнительные микробиологические, клинико-иммунологические и молекулярно-генетические критерии воспалительных заболеваний пародонта, на основе которых разработан алгоритм лабораторной диагностики данной патологии.

У выделенных из содержимого десневой борозды здоровых лиц/пациентов с гингивитом и пародонтальных карманов пациентов с хроническим генерализованным пародонтитом штаммов Lactobacillus spp. охарактеризован комплекс биологических свойств (адгезивная способность, антагонистическая активность, способность к биопленкообразованию, антибиотикорезистентность, биосовместимость), что позволило оценить их пробиотический потенциал и отобрать изоляты лактобацилл в качестве потенциальных кандидатов для создания оральных пробиотиков лечебно-профилактической направленности.

Теоретическая и практическая значимость работы

Полученные в ходе выполнения работы микробиологические, клинико-лабораторные и экспериментальные данные расширяют представления о роли оральной микробиоты, в целом, отдельных ее представителей и формирующихся

бактериальных ассоциаций в этиологии воспалительных заболеваний пародонта и их влиянии на течение данной патологии. Они явились теоретическими предпосылками для разработки подходов к повышению эффективности диагностики, прогнозирования, лечения и профилактики воспалительных заболеваний пародонта.

В процессе исследований разработаны питательная среда для выделения чистых культур такого признанного продонтопатогена, как Porphyromonas gingivalis (Приложение А, Патент на изобретение № 2802078) и новый способ для определения особенностей формирования биопленки штаммов Lactobacillus casei, Lactobacillus fermentum, выделенных из пародонтальных карманов, на инертных поверхностях (Приложение В - Патент РФ на изобретение № 2819447 и Приложение Б - Патент РФ на изобретение № 2817419).

На основе выявленных бактериологическим методом особенностей составов микробиоты содержимого десневой борозды и пародонтального кармана и их взаимосвязи с характером течения воспалительных заболеваний пародонта разработан способ прогнозирования тяжести данной патологии (Приложение Г, решение о выдаче патента РФ на изобретение заявка № 2025101538 от 27.01.2025).

Для оценки тяжести и прогнозирования дальнейшего развития воспалительных заболеваний пародонта подобраны праймеры и на их основе разработаны тест-системы ПЦР-идентификации генов патогенности hsa (кодирующего антиген Hs) и GspB (кодирующего поверхностный белок B) Streptococcus gordonii, а также ftxA (кодирующего белок RTX) Filifactor alocis (Заявки на выдачу патентов РФ на изобретение: от 09.04.2025 № 2025108766 (Приложение Ж), от 17.04.2025 № 2025109709 (Приложение Е), от 23.04.2025 № 2025110387 (Приложение Д)).

На основе выявленных микробиологических, клинико-иммунологических и молекулярно-генетические критериев, оптимизирован алгоритм лабораторной диагностики воспалительных заболеваний пародонта, внедрение которого в

практику будет способствовать стандартизации и повышению эффективности лечения и профилактики данной патологии.

На основе результатов оценки пробиотического потенциала отобраны клинические изоляты Lactobacillus spp., которые могут служить потенциальными кандидатами для создания оральных пробиотиков лечебно-профилактической направленности как эффективного средства профилактики и лечения пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта.

Методология и методы исследования

Методология диссертационного исследования построена на анализе современной литературы по диагностике и лечению гингивита и хронического генерализованного пародонтита, а также на оценке актуальности темы. Исследование проводилось последовательно по разработанному плану, включающему выбор объектов и современных методов исследования, соответствующих поставленным целям и задачам. Объектом исследования были 287 пациентов из них: с диагнозами К 05.1 Хронический гингивит (65 человек) и К 05.3 Хронический генерализованный пародонтит легкой (80 пациентов) и средней (87 пациентов) степенями тяжести, а также 55 здоровых лиц составили контрольную группу. В процессе диссертационного исследования применяли общеклинические и специальные методы исследования, включающие бактериологические, микробиологические, молекулярно-генетические, иммунологические, статистические и биоинформатические методы. Результаты исследований интерпретировали, опираясь на логику и имеющиеся литературные источники; выводы формулировали с применением научно обоснованной методологии доказательной медицины.

Положения, выносимые на защиту

1. Особенности состава микробиоты десневой борозды и пародонтального кармана отражают характер течения воспалительных заболеваний пародонта

(гингивит, пародонтит), указывают на важную этиологическую роль микроорганизмов в их развитии и могут служить диагностическим/прогностическим биомаркером тяжести данной патологии.

2. Консорциумы микроорганизмов, выявляемые метагеномным исследованием, могут рассматриваться в качестве дифференциально-диагностических критериев определения тяжести воспалительного процесса при патологии пародонта и микробиологическим маркером её прогрессирования.

3. Сочетанное присутствие в оральном микробиоме у пациентов с пародонтитом Fusobacterium nucleatum, Tannerella forsythia, Filifactor alocis и Veillonella dispar сопровождается угнетением клеточного и гуморального звеньев иммунитета и является биомаркером прогрессирующего течения данной патологии.

4. Идентификация методом ПЦР в содержимом зубной борозды и пародонтальных карманом у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта генов факторов патогенности hsa (кодирующего антиген Hs) и GspB (кодирующего поверхностный белок B) Streptococcus gordonii и FtxA (кодирующего белок RTX) Filifactor alocis является дополнительным диагностическим критерием для оценки тяжести и прогрессирующего течения пародонтита и определения эффективности его терапии.

5. Комплекс выявленных микробиологических, клинико-иммунологических и молекулярно-генетических биомаркеров воспалительных заболеваний пародонта использован для оптимизации и повышения алгоритма лабораторной диагностики данной патологии.

6. Характеристика комплекса биологических свойств (адгезивная способность, антагонистическая активность, способность к биопленкообразованию, антибиотикорезистентность, биосовместимость) у штаммов Lactobacillus spp. позволяет оценить их пробиотический потенциал и отобрать из них потенциальных кандидатов для создания оральных пробиотиков лечебно-профилактической направленности.

Степень достоверности и апробация результатов

Использование современных методик микробиологического исследования, значительный объем полученных данных и их статистическая обработка с помощью современного программного обеспечения позволили получить достоверные результаты исследования.

Основные результаты исследования доложены и обсуждены на научно-практических мероприятиях регионального, всероссийского и международного уровнях: Научно-практическая конференция с международным участием «Наука, образование и практика: 20 лет вместе», приуроченная к празднованию 20-летия кафедры лабораторной диагностики ИДПО ФГБОУ ВО БГМУ Минздрава России, (Уфа, 20.10.2023 г.); II Международный форум геномных и биомедицинских технологий (Сургут, 30.11.2023 г.); Международная научная конференция «Scientific research of the SCO countries: synergy and integration» (Пекин (КНР), 23.12.2023 г.); II Российский конгресс с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (Москва 29.02.2024 г.); Научно-практическая конференция стоматологов с международным участием «Актуальные вопросы стоматологической помощи» в рамках 4-й специализированной выставки ДЕНТАЛ-ЭКСПО (Уфа, 20.11.2024 г.); Ежегодная междисциплинарная научно-практическая конференция с международным участием «Клиника, генетика, лаборатория» (Уфа, 30.05.2024 г.); Х Белорусский международный стоматологический конгресс (Минск (Беларусь), 15.11.2024 г.); III Российский конгресс с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (Москва, 28.02.2025 г.); Международная научно-практическая конференция, посвященная 70-летию профессора Абдумомунова Абдыкалила Оморбаевича на тему: «Актуальные вопросы пародонтологии и мукологии» (Бишкек (Кыргызстан), 23.05.2025 г.); Ежегодная междисциплинарная научно-практическая конференция с международным участием «Клиника, генетика, лаборатория» (Уфа, 29.05.2025 г.).

Диссертационная работа апробирована на совместном расширенном заседании кафедр фундаменатальной и прикладной микробиологии, микробиологии и вирусологии, инфекционных болезней, лабораторной медицины, эпидемиологии федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Башкирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации (ФГБОУ ВО БГМУ Минздрава России) (Протокол №38 от 25.06.2025 г.). Приняты положительная оценка и заключение по научно-исследовательской работе диссертационного исследования.

Соответствие диссертации паспорту научной специальности

Научные положения диссертации соответствуют паспорту научной специальности 1.5.11. Микробиология (медицинские науки) — систематика и филогения микроорганизмов; биологическое разнообразие микроорганизмов, включая разнообразие типов энергетического обмена и источников углерода; физиология и метаболизм микроорганизмов, в том числе физиология и физико-химические параметры роста микроорганизмов; продукция биологически активных веществ микроорганизмами; ферменты микроорганизмов; геномный и метагеномный анализ микроорганизмов и их сообществ; патогенные микроорганизмы, факторы вирулентности и патогенности; симбиотические микробные сообщества, в том числе микробиота человека и животных; структурированные сообщества микроорганизмов, в том числе биопленки; межмикробные взаимодействия, включая синтрофные ассоциации и чувство кворума, согласно пунктам 1, 3, 5, 6, 7, 11, 12, 13, 15, 16 соответственно.

Внедрение результатов исследования

Результаты исследования внедрены в практическую работу врачей стоматологов стоматологических поликлиник № 6 и «Примадент» г. Уфы, а также используются в образовательном процессе обучающихся на базе кафедрах

фундаментальной и прикладной микробиологии и терапевтической стоматологии ФГБОУ ВО БГМУ Минздрава России.

Личный вклад автора в исследование

Автор участвовала в разработке дизайна диссертационного исследовании и его планировании, в определении цели и задач исследования. Автором самостоятельно проведен анализ современной отечественной и зарубежной литературы по изучаемой проблеме. Для реализации практической части исследования освоены методики взятия микробиологического материала от пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта. Автором лично проведены микробиологические и иммунологические исследования клинического материала, а также молекулярно-генетические исследования, включая подбор праймеров к генам факторов патогенности, экстракция ДНК из образцов, постановка ПЦР с электрофоретической детекцией на базе кафедры фундаменатльной и прикладной микробиологии ФГБОУ ВО БГМУ. Минздрава России (г. Уфа). Секвенирование 16 рРНК и биоинформатический анализ полученных данных проведены в лаборатории Сербалаб (г. Санкт-Петербург). Автор принимал непосредственное участие в статистической обработке, интерпретации полученных данных и написании диссертации, лично участвовал в апробации и внедрении результатов исследования в практику, а также в подготовке всех публикаций и заявок на патенты на изобретения по теме диссертационной работе совместно с д.м.н., профессором В.А. Гриценко, главным научным сотрудником Института клеточного и внутриклеточного симбиоза УрО РАН и с сотрудниками ФГБОУ ВО БГМУ Минздрава России: д.м.н., доцентом Г.М. Акмаловой - деканом стоматологического факультета, профессором кафедры детской стоматологии и ортодонтии. На основании проведенных исследований автор лично провела анализ результатов, их обобщение, формулировку выводов и практических рекомендаций.

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Гимранова Ирина Анатольевна, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Адгезия лактобактерий к клеткам вагинального и буккального эпителия / А. Г. Бойцов, С. В. Рищук, Ю. Ю. Ильясов, Т. А. Гречанинова // Вестник Санкт-Петербургской медицинской академии им. И.И. Мечникова. -2004. - Т. 4, № 5. - С. 191-3.

2. Бактериальный состав пародонтальных карманов у больных с хронической сердечной недостаточностью / С. Г. Амбарцумян, Л. Г. Андриасян, Р. А. Шарабчян [и др.] // Вестник стоматологии и челюстно-лицевой хирургии. -2020. - Т. 17, № 2. - С. 17-22.

3. Банержи, А. Медицинская статистика понятным языком: вводный курс / А. Банержи. - М.: Практическая медицина, 2007. - 287 с.

4. Батаев, Х. М. Корреляционная зависимость генерализованного пародонтита и ишемической болезни сердца / Х. М. Батаев, Р. Р. Ярасханова, А. Х. Батаев // Вестник Медицинского института. - 2022. - Т. 2, № 22. - С. 5-9.

5. Бертова, О. И. Роль Порфиромонада десневая в патогенезе пародонтита и его связи с системными заболеваниями / О. И. Бертова, Д. А. Минаева, С. Н. Писарева // Тенденции развития науки и образования. - 2024. - № 110-11. - С. 43-48.

6. Большедворская, Н. Е. Этиопатогенетические особенности воспалительных заболеваний пародонта / Н. Е. Большедворская, Е. М. Казанкова // Безопасность здоровья человека. - 2017. - № 3. - С. 26-35.

7. Влияние сверхэкспрессии гена rosR на образование биоплёнок бактериями КМгоЫит leguminosarum / З. Р. Вершинина, О. В. Чубукова, Ю. М. Никоноров [и др.] // Микробиология. - 2021. - Т. 90, № 2. - С. 191-203.

8. Волков, А. Н. Апробация тест системы для одновременного пцр анализа пяти пародонтопатогенных микроорганизмов в биологическом образце / А. Н. Волков // Медицина в Кузбассе. - 2014. - Т. 13, № 4. - С. 14-18.

9. Воспалительные изменения в тканях пародонта как показатель выраженности системных метаболических нарушений / Д. Ю. Крючков, И. Г. Романенко, А. А. Джерелей, С. М. Горобец // Крымский терапевтический журнал.

- 2020. - № 2. - С. 57-62.

10. Габараев, Д. Э. Взаимосвязь пародонтита и хронической почечной недостаточности / Д. Э. Габараев, В. Г. Касоев // Научный Лидер. -2023. - № 4 (102). - С. 29-30.

11. Гимранова, И. А. Особенности микробиома пародонтальных карманов у пациентов с пародонтитом различной степени тяжести / И. А. Гимранова // Клиническая лабораторная диагностика. - 2025. - Т. 70, № 6. - С. 424-433.

12. Гимранова, И. А. Сравнительная характеристика видового состава микробиома ротовой полости у пациентов с гингивитом и пародонтитом / И.А. Гимранова, В. А. Гриценко, Г. М. Акмалова // Клиническая стоматология. - 2024.

- Т. 27, № 4. - С. 76-81.

13. Гланц, С. Медико-биологическая статистика / С. М. Гланц. - М.: Практика, 1998. -459 с.

14. Гржибовский, А. М. Анализ номинальных данных / А. М. Гржибовский // Экология человека. - 2008. - № 8. - С. 58-68.

15. Джавадова, Л. М. Современные представления об этиологии и патогенезе воспалительных заболеваний пародонта (обзор литературы) / Л. М. Джавадова // Достижения науки и образования. - 2022. - № 4 (84). - С. 51-57.

16. Диагностика течения воспалительных заболеваний тканей пародонта в период беременности / А. Д. Козлов, С. В. Микляев, А. В. Сущенко [и др.] // Актуальные проблемы медицины. - 2022. - Т. 45, № 4. - С. 351-364.

17. Диагностическая ценность микробиомных биомаркеров пародонтального микробиома у пациентов с сочетанием хронического пародонтита и сахарного диабета 2 типа / И. П. Бальмасова, В. Н. Царев, К. Г. Унаньян [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2021. - Т. 66, № 11. -С. 678-683.

18. Динамика показателей цитокинового профиля при экспериментальном пародонтите / А. Н. Захватов, Д. А. Хайдар, Т. В. Тарасова [и др.] // Вестник Биомедицина и социология. - 2022. - Т. 7, № 3. - С. 43-47.

19. Дранник, Г. Н. Клиническая иммунология и аллергология / Г. Н. Дранник. - Киев: Полиграф плюс, 2010. - 604 с.

20. Журбенко, В. А. Встречаемость различных форм заболеваний пародонта у беременных / В. А. Журбенко, А. А. Маринкина // Современная наука: актуальные проблемы теории и практики. Серия: Естественные и технические науки. - 2022. - № 12-2. - С. 233-235.

21. Заболотный, Т. Д. Состояние местного и системного иммунитета у больных с разным течением генерализованного пародонтита / Т. Д. Заболотный, Ю. Л. Бандривский, В. Т. Дырык // Стоматология. - 2016. - Т. 95, № 6. - С. 23-5.

22. Зайдуллин, И. И. Основные факторы риска развития воспалительных заболеваний пародонта (обзор литературы) / И. И. Зайдуллин // Тенденции развития науки и образования. - 2024. - № 116-14. - С. 79-83.

23. Значение вирусно-бактериального консорциума в возникновении и развитии хронического пародонтита / В. Н. Царев, Е. А. Ягодина, Т. В. Царева, Е. Н. Николаева // Пародонтология. - 2020. - Т. 25, № 2. - С. 84-89.

24. Иванов, В. А. Связь ревматоидного артрита с пародонтологическими заболеваниями / В. А. Иванов, А. П. Полякова // Интегративные тенденции в медицине и образовании. - 2023. - Т. 3. - С. 129-133.

25. Изучение биологических свойств Lactobacillus spp., выделенных у пациентов с заболеваниями пародонта / И. А. Гимранова, Л. Р. Хакимова, Г. Р. Газизуллина [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2024. - Т. 69, № 7. - С. 341-348.

26. Изучение биологических свойств новых штаммов рода Lactobacillus / И. В. Соловьева, А. Г. Точилина, Н. А. Новикова [и др.] // Вестник Нижегородского университета им. Н.И. Лобачевского. - 2010. - № 2-2. - С. 462468.

27. Изучение биологических свойств штаммов рода Lactobacillus / А. Г. Точилина, И. В. Белова, И. В. Соловьева [и др.] // Современные проблемы науки и образования. - 2015. - № 5. - С. 631.

28. Изучение влияния пародонтопротекторов на состояние пародонта в норме и при хроническом пародонтите / О. А. Зорина, В. А. Венедиктова, В. В. Прокопьев, М. А. Амхадова // Стоматология для всех. - 2016. - № 3. - С. 34-39.

29. Иммунологические параллели у пациентов с гингивитом и хроническим генерализованным пародонтитом / И. А. Гимранова, Г. М. Акмалова, Е. М. Гареев [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2025. - Т. 70, № 7. - С. 477-483.

30. Исследование пародонтопатогенной микрофлоры методом полимеразной цепной реакции у детей с врожденной расщелиной неба и дефектом после уранопластики / С. В. Чуйкин, А. Р. Мавзютов, О. С. Чуйкин [и др.] // Стоматология детского возраста и профилактика. - 2022. - Т. 22, № 1. - С. 19-28.

31. Керимханов, К. А. Протетический пародонтит: возможность профилактики / К. А. Керимханов, А. К. Иорданишвили // Пародонтология. -2023. - Т. 28, № 1. - С. 83-88.

32. Клинико-микробиологическое обоснование комплексного лечения больных пародонтитом со средней и тяжелой степенью тяжести с учетом молекулярно-генетической характеристики микробиоты полости рта / А. И. Булгакова, А. Р. Мавзютов, Э. Р. Тамарова [и др.] // Пародонтология. - 2017. - Т. 22, № 1. - С. 70-74.

33. Клинико-патогенетические особенности суставного синдрома при ревматоидном артрите с коморбидным пародонтитом / О. В. Синяченко, М. В. Ермолаева, Д. О. Гавилей [и др.] // Травма. - 2020. - Т. 21, № 6. - С. 10-15.

34. Клиническое значение представителей рода Streptococcus при развитии пародонтита / И. В. Бажутова, Д. Д. Исматуллин, А. В. Лямин [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2022. - Т. 12, № 1. - С. 51-58.

35. Копытов, А. А. О факторах этиологии и патогенеза хронического пародонтита / А. А. Копытов, В. К. Леонтьев // Институт стоматологии. - 2024. -№ 3 (104). - С. 77-79.

36. Копытов, А. А. Об этиологии хронического пародонтита / А. А. Копытов, В. К. Леонтьев // Институт стоматологии. - 2020. - № 4 (89). - С. 66-69.

37. Кочубейков, Б. К. Биостатистика / Б. К. Кочубейков. - Казань: КГМУ, 2014. - 135 с.

38. Культивирование Porphyromonas gingivalis, выделенных у пациентов с хроническим пародонтитом в лабораторных условиях / И. А. Гимранова, Л. Р. Хакимова, Г. М. Акмалова [и др]. // Клиническая лабораторная диагностика. -2024. - Т. 69, № 6. - С. 272-277.

39. Липатова, Т. Е. Стабильная ишемическая болезнь сердца и хронический пародонтит: клинико-микробиологические параллели / Т. Е. Липатова, А. В. Еремин, А. В. Лепилин // Саратовский научно-медицинский журнал. - 2021. - Т. 17, № 3. - С. 527-531.

40. Микробиоценоз ротовой полости в норме, при воспалительных заболеваниях пародонта. Методы лечения и профилактики / А. Ю. Юрищева, А. А. Лазарева, Е. А. Петрачкова, А. Ю. Крупенькина // Молодой ученый. - 2024. -№ 52 (551). - С. 181-184.

41. Микроэкология пародонта. Взаимосвязь локальных и системных эффектов / И. П. Балмасова, В. Н. Царёв, О. О. Янушевич [и др.]. - М.: Практическая медицина, 2021. - 264 с.

42. Молекулярная диагностика пародонтита и метагеномный анализ микробиоты пародонта у пациентов с сахарным диабетом II типа / В. Н. Царёв, С. Д. Арутюнов, И. П. Балмасова [и др.] // Бактериология. - 2018. - Т. 3, № 2. - С. 30-37.

43. Молекулярно-генетическая характеристика микробиоты пародонтальных карманов у пациентов с хроническим генерализованным

пародонтитом, перенесших СОУГО-19 / О. С. Гилева, Г. М. Акмалова, Ф. З. Мирсаева [и др.] // Проблемы стоматологии. - 2023. - Т. 19, № 1. - С. 30-34.

44. Молекулярные методы диагностики гингивита и пародонтита у ВИЧ-инфицированных пациентов / В. Н. Царёв, Е. Н. Николаева, Е. В. Ягодина [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2016. - Т. 61, № 1. - С. 54-9.

45. Неинвазивные методы лечения гингивита и пародонтита легкой степени тяжести / Н. Н. Гаража, Е. Е. Ильина, С. Н. Гаража [и др.] // Российский стоматологический журнал. - 2020. - Т. 24, № 1. - С. 61-64.

46. Особенности иммунного статуса у больных с разными клиническими формами красного плоского лишая слизистой оболочки рта / С. В. Чуйкин, Г. М. Акмалова, И. А. Мирсаяпова [и др.] // Инфекция и иммунитет. - 2019. - Т. 9, № 1. -С. 128-134.

47. Особенности микробиома ротовой полости при различных соматических заболеваниях. / Г. Е. Леонов, Ю. Р. Вараева, Е. Н. Ливанцова, А. В. Стародубова // Вопросы питания. - 2023. - Т. 92, № 4. - С. 6-19.

48. Особенности оказания стоматологической помощи пациентам с сахарным диабетом (обзор литературы) / О. Л. Мишутина, В. Р. Шашмурина, Г. В. Волченкова [и др.] // Смоленский медицинский альманах. - 2024. - № 1. - С. 1619.

49. Особенности стоматологического статуса у больных сахарным диабетом / Р. М. Арамисова, М. Т. Тхазаплижева, С. Ю. Карданова [и др.] // Современная наука: актуальные проблемы теории и практики. Серия: Естественные и технические науки. - 2020. - № 1. - С. 151-156.

50. Оценка показателей системного воспаления у больных генерализованным пародонтитом, имеющих высокий риск развития сахарного диабета / Д. Ю. Крючков, И. Г. Романенко, А. А. Джерелей, С. М. Горобец // Крымский терапевтический журнал. - 2021. - № 4. - С. 49-54.

51. Пародонтит - модификатор сердечно-сосудистых заболеваний / Т. Л. Рединова, Т. В. Савельева, А. А. Янгирова [и др.] // Врач. - 2025. - Т. 36, № 4. - С. 44-49.

52. Пародонтит при ревматоидном артрите / О. Синяченко, И. Гейко, М. Ермолаева [и др.] // АпдаЛ ^ЙаНа. - 2020. - № 14-1. - С. 19-22.

53. Пародонтит: причины, условия возникновения и профилактика / В. Ф. Черныш, А. М. Ковалевский, М. А. Бокарев, С. А. Лопатин // Морская медицина.

- 2023. - Т. 9, № 3. - С. 13-23.

54. Первый опыт применения отечественного диагностического набора генетических праймеров для выявления нового пародонтопатогена FШfactor alocis и его ассоциации с Porphyromonas gingivalis / О. О. Янушевич, В. Н. Царев, И. П. Балмасова [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. - 2022. - Т. 67, № 12.

- С. 744-748.

55. Первый отечественный опыт выявления ассоциации анаэробных бактерий FШfactor alocis и Porphyromonas gingivalis молекулярно-биологическими методами при заболеваниях пародонта и коморбидной патологии (сравнительное исследование) / О. О. Янушевич, В. Н. Царев, Е. Н. Николаева [и др.] // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2022. - Т. 77, № 6. - С. 437-446.

56. Показатели микробиологического исследования при генерализованном хроническом пародонтите / Ч. К. Жолдошев, К. Б. Куттубаева, Р. С. Алымбаев [и др.] // Бюллетень науки и практики. - 2021. - Т. 7, № 10. - С. 231-235.

57. Порочные круги в патогенезе хронического генерализованного пародонтита / А. Н. Иванов, А. А. Савкина, Е. В. Ленгерт [и др.] // Пародонтология. - 2022. - Т. 27, № 4. - С. 309-317.

58. Пробиотики - новая панацея заболеваний пародонта?! Обзор литературы / Д. Т. Таймазова, М. З. Чониашвили, В. М. Аванисян [и др.] // Медицинский алфавит. - 2023. - № 20. - С. 30-34.

59. Роль оральной микробиоты в этиологии, патогенезе пародонтита и в системной патологии / И. А. Гимранова, В. А. Гриценко, И. М. Рабинович [и др.] // Клиническая стоматология. - 2025. - Т. 28, № 1. - С. 179-185.

60. Руководство по обеспечению решения медико-биологических задач с применением программы Statistica 10 / В. М. Боев, Е. Л. Борщук, А. К. Екимов, Д. Н. Бегун. - Оренбург: ОАО «ИПК «Южный Урал», 2014. - 208 с.

61. Самедова, С. И. Показатели качества жизни у пациентов с кариесом и заболеваниями пародонта различной степени интенсивности и тяжести / С. И. Самедова // Клиническая стоматология. - 2020. - № 1 (93). - С. 94-98.

62. Сахарный диабет и хронический пародонтит: двунаправленная связь / С. Т. Тулеутаева, Ж. Ж. Аширбекова, О. А. Понамарева, С. А. Гранько // Вестник Карагандинского университета. Серия: Биология. Медицина. География. - 2021. -Т. 104, № 4. - С. 117-121.

63. Слажнева, Е. С. Пародонтопатогены: новый взгляд. Систематический обзор. Часть 1 / Е. С. Слажнева, Е. А. Тихомирова, В. Г. Атрушкевич // Стоматология детского возраста и профилактика. - 2020. - Т. 20, № 1 (73). - С. 70-76.

64. Совершенствование методов комплексного лечения воспалительных заболеваний пародонта / С. А. Блашкова, Е. В. Крикун, Ю. В. Фазылова, Ю. В. Блашкова // Вестник последипломного образования в сфере здравоохранения. - 2024. - № 2. - С. 5-10.

65. Современные методы диагностики заболеваний пародонта: возможности и перспективы (обзор литературы) / И. А. Гимранова, Л. Р. Хакимова, Г. М. Акмалова, Г. Р. Газизуллина // Клиническая лабораторная диагностика. - 2023. -Т. 68, № 9. - С. 570-577.

66. Современный взгляд на комплексное лечение пациентов с хроническим локализованным пародонтитом средней степени тяжести (обзор литературы) / И. И. Синев, А. М. Нестеров, М. И. Садыков, М. Б. Хайкин // Аспирантский вестник Поволжья. - 2020. - № 1-2. - С. 108-121.

67. Состояние микрофлоры полости рта у пациентов с хроническими воспалительными заболеваниями пародонта / Л. П. Герасимова, Р. Р. Хайбуллина, Л. И. Кузнецова [и др.] // Аспирантский вестник Поволжья. - 2017. - № 5-6. - С. 87-92.

68. Спектр микрофлоры пародонтального кармана у пациентов с хроническим пародонтитом средней степени тяжести / В. Р. Шашмурина, Л. И. Девликанова, И. А. Эйдельштейн [и др.] // Медико-фармацевтический журнал «Пульс». - 2024. -Т. 26, № 1. - С. 42-51.

69. Степаненкова, М. Н. Анализ антибиотикотерапии при лечении генерализованного пародонтита / М. Н. Степаненкова, К. В. Славкина, Н. В. Бучнева // Современная наука: актуальные проблемы теории и практики. Серия: Естественные и технические науки. - 2021. - № 10. - С. 193-196.

70. Степанова, А. И. Совершенствование диагностики пародонта и ортопедического лечения / А. И. Степанова, А. А. Богданова, М. В. Алымова // Интегративные тенденции в медицине и образовании. - 2024. - Т. 1. - С. 188-190.

71. Структура воспалительных заболеваний пародонта и динамика пародонтального статуса беременных на протяжении гестационного периода / В. М. Гринин, И. М. Макеева, Н. С. Гостева [и др.] // Стоматология. - 2020. - Т. 99, № 1. - С. 12-17.

72. Султаншина, А. Р. Стоматологический статус пациентов с сахарным диабетом 2 типа / А. Р. Султаншина, М. Ф. Кабирова, Т. В. Баширова // Медико-фармацевтический журнал «Пульс». - 2021. - Т. 23, № 5. - С. 22-28.

73. Трухан, Д. И. Коморбидность ревматоидного артрита и заболеваний пародонта / Д. И. Трухан, А. Ф. Сулимов, Л. Ю. Трухан // Медицинский совет. -2024. - Т. 18, № 5. - С. 288-297.

74. Трухан, Д. И. Сахарный диабет и заболевания пародонта: вместе или параллельно? / Д. И. Трухан, А. Ф. Сулимов, Л. Ю. Трухан // Фарматека. - 2024. -Т. 31, № 8. - С. 16-22.

75. Тюрин, С. М. Состояние тканей пародонта у пациентов с ревматоидным артритом и Результаты ПЦР исследования микрофлоры пародонтальных карманов / С. М. Тюрин, О. Л. Мишутина, Т. Г. Морозова // Системный анализ и управление в биомедицинских системах. - 2024. - Т. 23, № 3. - С. 14-19.

76. Уровни отдельных цитокинов в сыворотке крови и ротовой жидкости у женщин в постменопаузе, имеющих хронический генерализованный пародонтит и остеопороз / Э. А. Майлян, И. В. Чайковская, А. А. Соболева [и др.] // Актуальные проблемы медицины. - 2021. - Т. 44, № 1. - С. 79-91.

77. Успенская, О. А. Цитокиновый профиль при лечении хронического генерализованного пародонтита / О. А. Успенская, Е. В. Кондюрова, И. И. Фадеева // Проблемы стоматологии. - 2020. - Т. 16, № 4. - С. 64-70.

78. Filifactor alocis и его роль в этиологии хронического пародонтита / И. П. Балмасова, В. Н. Царев, С. Д. Арутюнов, Э. А. Бабаев // Стоматология. - 2020. - Т. 99, № 3. - С. 78-82.

79. Холлендер, М. Непараметрические методы статистики / М. Холлендер, Д. Вульф. - М.: Финансы и статистика, 1983. - 518 с.

80. Хронический генерализованный пародонтит и ишемическая болезнь сердца: морфофункциональные взаимосвязи / А. В. Еремин, А. В. Лепилин, Т. Е. Липатова, И. М. Кветной // Российский стоматологический журнал. - 2020. -Т. 24, № 4. - С. 219-224.

81. Хронический пародонтит и ревматоидный артрит: взаимосвязь этиопатогенеза / Э. О. Исаков, А. А. Калбаев, К. Д. Шаяхметова [и др.] // Евразийский журнал здравоохранения. - 2025. - № 1. - С. 204-211.

82. Царев, В. Н. Пародонтопатогенные бактерии - основной фактор возникновения и развития пародонтита / В. Н. Царев, Е. Н. Николаева, Е. В. Ипполитов // Журнал микробиологии. - 2017. - № 5. - С. 101-112.

83. Цитокиновый профиль крови крыс при экспериментальном пародонтите и действии иммуномодуляторов / Е. В. Мокренко, А. Я. Вязьмин, П.

Д. Шабанов [и др.] // Современные проблемы науки и образования. - 2020. - № 6.

- С. 179.

84. Частота выявления основных пародонтопатогенных бактерий у детей в Российской Федерации / Е. С. Куракин, А. В. Михайленко, В. А. Вохидова [и др.] // Тенденции развития науки и образования. - 2024. - № 109-10. - С. 85-89.

85. Яшнова, Н. Б. Микробный состав пародонтального кармана при хроническом генерализованном пародонтите / Н. Б. Яшнова, Ю. И. Пинелис, А. А. Дутова // Актуальные проблемы медицины. - 2024. - Т. 47, № 1. - С. 89-98.

86. A case control study to assess frequency, risk factors and genetic diversity of entamoeba gingivalis / E. Tahmasebi, M. Ghanimatdan, S. Hajisadeghi [et al.] // Oral Dis. - 2025. - May 26. doi: 10.1111/odi. 15391.

87. A cross-species interaction with a symbiotic commensal enables cell-density-dependent growth and in vivo virulence of an oral pathogen / A. Hoare, H. Wang, A. Meethil [et al.] // ISME J. - 2021. - Vol. 15. - P. 1490-1504.

88. A new biomarker of fecal bacteria for non-invasive diagnosis of colorectal cancer / Y. Yao, H. Ni, X. Wang [et al.] // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2021. - Vol. 11. - p. 744049.

89. A propeptide-independent protease from Tannerella sp.6_1_58FAA_CT1 displays trypsin-like specificity / Q. Song, X. Zhang, N. Li [et al.] // J. Basic Microbiol.

- 2017. - Vol. 57, № 1. - P. 50-6.

90. Adhesive protein-mediated cross-talk between Candida albicans and Porphyromonas gingivalis in dual species biofilm protects the anaerobic bacterium in unfavorable oxic environment / D. Bartnicka, J. Karkowska-Kuleta, M. Zawrotniak [et al.] // Sci. Rep. - 2019. - № 9. - P. 4376.

91. Aggregatibacter actinomycetemcomitans and Filifactor alocis / H. Ozuna, I. Snider, G. N. Belibasakis [et al.] // Front. Oral Health. - 2022. - Vol. 3. - P. 981343.

92. American Dental Association - ADA. D9995 and D9996 ADA guide: version 1. Chicago: American Dental Association, 2017 [cited 2018 Dec 20]. Available from:

https://ww.ada.org/~/mediaADA/Publications/Files/D9995andD9996_ADAGuideto UnderstandingandDocumentingTeledentistryEvents_v1_2017Jul 17.pdf?la=en

93. An endodontic-periodontal lesion with primary periodontal disease: a case report on its bacterial profile / R. Fujii, T. Muramatsu, Y. Yamaguchi [et al.] // Bull. Tokyo Dent. Coll. - 2014. - Vol. 55. - P. 33-7.

94. Anti-bacterial efficacy of zirconium oxide nanoparticles on streptococcus mutans and enterococcus faecalis: an in vitro study / A. P. Guruswamy Pandian, A. K. Ramachandran, P. Kodaganallur Pitchumani [et al.] // Cureus. - 2024. - Vol. 16, № 12. - P. e75421.

95. Antibiotic resistance in probiotic bacteria / M. Gueimonde, B. Sánchez, C. G de Los Reyes-Gavilán, A. Margolles // Front. Microbiol. - 2013. - Vol. 4. - P. 202.

96. Antibiotic susceptibility and resistance genes in oral clinical isolates of Prevotella intermedia, Prevotella nigrescens, and Prevotella melaninogenica / Y. Castillo, N. A. Delgadillo, Y. Neuta [et al.] // Antibiotics (Basel). - 2022. - Vol. 11, № 7. - P. 888.

97. Antimicrobial drug use in the first decade of life influences saliva microbiota diversity and composition / S. C. Raju, H. Viljakainen, R. A. Figueiredo [et al.] // Microbiome. - 2020. - Vol. 8, № 1. - P. 121.

98. Ardila, C. M. Antibiotic resistance in patients with peri-implantitis: a systematic scoping review / C. M. Ardila, A. M. Vivares-Builes // Int. J. Environ. Res. Public Health. - 2022. - Vol. 19, № 23. - P. 15609.

99. Ardila, C. M. Antibiotic resistance of subgingival species in chronic periodontitis patients / C. M. Ardila, M. I. Granada, I. C. Guzmán // J. Periodont. Res. -2010. - Vol. 45, № 4. - P. 557-563.

100. Aryl hydrocarbon receptor activation by Lactobacillus reuteri tryptophan metabolism alleviates Escherichia coli-induced mastitis in mice / C. Zhao, X. Hu, L. Bao [et al.] // PLoS Pathog. - 2021. - Vol. 17, № 7. - P. e1009774.

101. Assessment of IL-6, IL-8 and TNF-a levels in the gingival tissue of patients with periodontitis / M. K. Noh, M. Jung, S. H. Kim [et al.] // Exp. Ther. Med. - 2013. -Vol. 6. - P. 847-51.

102. Association between periodontitis and peripheral markers of innate immunity activation and inflammation / J. Dopico, J. Botelho, A. Ouro [et al.] // J. Periodontol. - 2023. - Vol. 94, № 1. - P. 11-19.

103. Association of Filifactor alocis and its RTX toxin gene ftxA with periodontal attachment loss, and in synergy with Aggregatibacter actinomycetemcomitans / Z. Razooqi, N. Khzam, M. L'Hostis [et al.] // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2024. - Vol. 14. - P. 1501028.

104. Association of oral microbiome with periodontal disease progression: a longitudinal study / R. Javaid, M. Rasheed, M. Imran [et al.] // Pakistan J. Health Sci. -2024. - Vol. 5, № 8. - P. 138-143.

105. Bacillus megaterium delayed onset lamellar keratitis after LASIK / J. C. Ramos-Esteban, J. J. Servat, S. Tauber [et al.] // J. Refract. Surg. - 2006. - Vol. 22. - P. 309-312.

106. Bacterial adhesion of TESPSA and citric acid on different titanium surfaces substrate roughness: an in vitro study with a multispecies oral biofílm model / J. Vilarrasa, G. Àlvarez, A. Soler-Ollé [et al.] // Materials (Basel). - 2023. - Vol. 16, № 13. - P. 4592.

107. Bacterial biofilm and associated infections / M. Jamal, W. Ahmad, S. Andleeb [et al.] // J. Chin. Med. Assoc. - 2018. - Vol. 81, № 1. - P. 7-11.

108. Bacterial diversity of symptomatic primary endodontic infection by clonal analysis / L. M. Nóbrega, F. Montagner, A. C. Ribeiro [et al.] // Braz. Oral Res. - 2016. - Vol. 30, № 1. - P. e103.

109. Bacteriology and antimicrobial susceptibility of gram-positive cocci isolated from pus specimens of orofacial odontogenic infections / T. Kuriyama, T. Karasawa, K. Nakagawa [et al.] // Oral Microbiol. Immunol. - 2002. - Vol. 17, № 2. -P. 132-5.

110. Bartold, P. M. An appraisal of the role of specific bacteria in the initial pathogenesis of periodontitis / P. M. Bartold, T. E. Van Dyke // J. Clin. Periodontol. -2019. - Vol. 46. - P. 6-11.

111. Bensing, B. A. The Streptococcus gordonii Surface Proteins GspB and Hsa mediate binding to sialylated carbohydrate epitopes on the platelet membrane Glycoprotein Iba / B. A. Bensing, J. A. López, P. M. Sullam // Infect. Immun. - 2004. -Vol. 72. - P. 6528-6537.

112. Biogeography of a human oral microbiome at the micron scale / J. L. Mark Welch, B. J. Rossetti, C. W. Rieken [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. - 2016. - Vol. 113, № 6. - P. E791.

113. Blood-brain barrier disruption by lipopolysaccharide and sepsis-associated encephalopathy / X. Peng, Z. Luo, S. He [et al.] // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2021. - Vol. 11. - P. 768108.

114. Brain abscess caused by Bacillus megaterium in an adult patient / F. P. Guo, H. W. Fan, Z. Y. Liu [et al.] // Chine Med. J. - 2015. - Vol. 128. - P. 1552-1554.

115. Can abutment with novel superlattice CrN/NbN coatings influence peri-implant tissue health and implant survival rate compared to machined abutment? 6-month results from a multi-center split-mouth randomized control trial / F. Pera, M. Menini, M. Alovisi [et al.] // Materials. - 2023. - Vol. 16. - P. 246.

116. Candida species in periodontitis: A new villain or a new target? / Y. Hu, B. Ren, L. Cheng [et al.] // J. Dent. - 2024. - Vol. 148. - P. 105138.

117. Catheter-related bacteraemia and infective endocarditis caused by Kocuria species / C. C. Lai, J. Y. Wang, S. H. Lin [et al.] // Clin. Microbiol. Infect. - 2011. -Vol. 17. - P. 190-2.

118. Catheter-related bacteremia caused by Kocuria salsicia: the first case / K. M. Sohn, J. Y. Baek, S. H. Kim [et al.] // J. Infect. Chemother. - 2015. - Vol. 21. - P. 305.

119. Catheter-related bacteremia due to Kocuria kristinae in a patient with ovarian cancer / G. Basaglia, E. Carretto, D. Barbarini [et al.] // J. Clin. Microbiol. -2002. - Vol. 40. - P. 311-3.

120. Catheter-related bacteremia due to Kocuria rosea in a patient undergoing peripheral blood stem cell transplantation / F. Altuntas, O. Yildiz, B. Eser [et al.] // BMC Infect. Dis. - 2004. - № 4. - P. 62.

121. Caveolin-1 serves as a negative effector in senescent human gingival fibroblasts during Fusobacterium nucleatum infection / S. H. Ahn, S. H. Cho, J. E. Song [et al.] // Mol. Oral Microbiol. - 2017. - Vol. 32. - P. 236-249.

122. Cellular components mediating coadherence of candida albicans and fusobacterium nucleatum / T. Wu, L. Cen, C. Kaplan [et al.] // J. Dent. Res. - 2015. -Vol. 94. - P. 1432-1438.

123. Characteristics of the salivary microbiota in periodontal diseases and potential roles of individual bacterial species to predict the severity of periodontal disease / S. Ji, J. K. Kook, S. N. Park [et al.] // Microbiol. Spectr. - 2023. - Vol. 11, № 3. - P. e0432722.

124. Characterization and immunostimulatory activity of extracellular vesicles from Filifactor alocis / H. Y. Kim, Y. Lim, S. J. An, B. K. Choi // Mol. Oral Microbiol. - 2020. - Vol. 35, № 1. - P. 1-9.

125. Characterization and morphological methods for oral biofilm visualization: where are we nowadays / D. Gerardi, S. Bernardi, A. Bruni [et al.] // AIMS Microbiology. - 2024. - Vol. 10. - P. 391-414.

126. Characterization of clustered bacteriocin-type signal domain protein genes in Treponema denticola / T. Nukaga, E. Kokubu, K. Okamoto-Shibayama [et al.] // Front. Dent. Med. - 2025. - Vol. 6. - P. 1543535.

127. Chen, S. Multi-omics insights reveal the remodeling of gut mycobiome with P. gingivalis / S. Chen, C. Niu, W. Lv // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2022. - № 12. - P. 937725.

128. Chen, T. SMDI: an index for measuring subgingival microbial dysbiosis / T. Chen, P. D. Marsh, N. N. Al-Hebshi // J. Dent. Res. - 2022. - Vol. 101, № 3. - P. 331-8.

129. Chopra, A. Editorial: Porphyromonas gingivalis: molecular mechanisms of invasion, immune evasion, and dysbiosis / A. Chopra, Y. Shiheido-Watanabe, J. Eberhard // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2023. - Vol. 13. - P. 1289103.

130. Chopra, A. Editorial: Porphyromonas gingivalis: molecular mechanisms of invasion, immune evasion, and dysbiosis / A. Chopra, Y. Shiheido-Watanabe, J. Eberhard // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2023. - Vol. 13. - P.1.

131. Chopra, A. Porphyromonas gingivalis adopts intricate and unique molecular mechanisms to survive and persist within the host: a critical update / A. Chopra, S. G. Bhat, K. Sivaraman // J. Oral Microbiol. - 2020. - Vol. 12. - P. 1801090.

132. Cigarette smoking and the oral microbiome in a large study of American adults / J. Wu, B. A. Peters, C. Dominianni [et al.] // ISME J. - 2016. - Vol. 10, № 10. -P. 2435-46.

133. Clinical and microbiological effects of probiotic lozenges in the treatment of chronic periodontitis: a 1-year follow-up study / M. Tekce, G. Ince, H. Gursoy [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 2015. - Vol. 42, № 4. - P. 363-72.

134. Clinical and microbiological evaluation of the efficacy of autoprobiotics in the combination treatment of chronic generalized periodontitis / I. Koroleva, E. S. Mikhaylova, E. S. Zhukovskaia [et al.] // Rev. Latinoam. Hipertens. - 2021. - Vol. 16, № 1. doi: http://doi.org/10.5281/zenodo.5102968

135. Clinical characteristics of patients with micrococcus luteus bloodstream infection in a Chinese tertiary-care hospital / M. Zhu, Q. Zhu, Z. Yang, Z. Liang // Pol. J. Microbiol. - 2021. - Vol. 70, № 3. - P. 321-326.

136. Clinical effects of probiotics on the treatment of gingivitis and periodontitis: a systematic review and meta-analysis / C. Benavides-Reyes, I. Cabello, A. Magan-Fernandez [et al.] // BMC Oral Health. - 2025. - Vol. 25, № 1. - P. 490.

137. Clustering of subgingival microbiota reveals microbial disease ecotypes associated with clinical stages of periodontitis in a cross-sectional study / S. Boutin, D. Hagenfeld, H. Zimmermann [et al.] // Front. Microbiol. - 2017. - № 8. - P. 340.

138. Community development between. porphyromonas gingivalis and candida albicans mediated by InlJ and Als3 / M. N. Sztukowska, L. C. Dutton, C. Delaney [et al.] // MBio. - 2018. - Vol. 9. - P. e00202-18.

139. Comparison of the oral microbiome of patients with generalized aggressive periodontitis and periodontitis-free subjects / S. Schulz, M. Porsch, I. Grosse [et al.] // Arch. Oral Biol. - 2019. - Vol. 99. - P. 169-176.

140. Composition analysis and feature selection of the oral microbiota associated with periodontal disease / W. P. Chen, S. H. Chang, C. Y. Tang [et al.] // Biomed. Res. Int. - 2018. - Vol. 2018. - P. 3130607.

141. Composition of subgingival microbiota associated with periodontitis and diagnosis of malignancy-a cross-sectional study / A. Narayanan, B. Söder, J. Meurman [et al.] // Front. Microbiol. - 2023. - Vol. 14. - P. 1172340.

142. Corynebacterium amycolatum: An unexpected pathogen in the ear / M. Sengupta, P. Naina, V. Balaji, S. Anandan // J. Clin. Diagn. Res. - 2015. - Vol. 9, № 12. - P. DD01-3.

143. Cui, Z. Microbial dysbiosis in periodontitis and peri-implantitis: pathogenesis, immune responses, and therapeutic / Z. Cui, P. Wang, W. Gao // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2025. - Vol. 15. - P. 1517154.

144. Current concepts in the pathogenesis of periodontitis: from symbiosis to dysbiosis / A. A. Abdulkareem, F. B. Al-Taweel, A. J. B. Al-Sharqi [et al.] // J. Oral Microbiol. - 2023. - Vol. 15, № 1. - P. 2197779.

145. Curtis, M. A. The role of the microbiota in periodontal disease / M. A. Curtis, P. I. Diaz, T. E. Van Dyke // Periodontology. - 2020. - Vol. 83. - P. 14-25.

146. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data / B. J. Callahan, P. J. McMurdie, M. J. Rosen [et al.] // Nat. Methods. - 2016. - Vol. 13, № 7. - P. 581-3.

147. Dahlen, G. Importance of virulence factors for the persistence of oral bacteria in the inflamed gingival crevice and in the pathogenesis of periodontal disease / G. Dahlen, A. Basic, J. Bylund // J. Clin. Med. - 2019. - Vol. 8. - P. 1339.

148. Darveau, R. P. Periodontitis: a polymicrobial disruption of host homeostasis / R. P. Darveau // Nat. Rev. Microbiol. - 2010. - Vol. 8. - P. 481-490.

149. Deep sequencing of the oral microbiome reveals signature of periodontal disease / B. Liu, L. L. Faller, N. Klitgord [et al.] // PloS One. - 2012. - Vol. 7, № 6. - P. e37919.

150. Defining the normal bacterial flora of the oral cavity / J. A. Aas, B. J. Paster, L. N. Stokes [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2005. - Vol. 43, № 11. - P. 57215732.

151. Dental caries and periodontal diseases in the ageing population: call to action to protect and enhance oral health and well-being as an essential component of healthy ageing—consensus report of group 4 of the joint EFP/ORCA workshop on the boundaries between caries and periodontal diseases / M.S. Tonetti, P. Bottenberg, G. Conrads [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 2017. - Vol. 44, Suppl. S18. - P. S135-S144.

152. Dental plaque-induced gingival conditions / S. Murakami, B. L Mealey, A. Mariotti, I. L C Chapple // J. Clin. Periodontol. - 2018. - Vol. 45, Suppl. 20. - P. S17-S27.

153. Deo, P. N. Oral microbiome: unveiling the fundamentals / P. N. Deo, R. Deshmukh // J. Oral Maxillofac. Pathol. - 2019. - Vol. 23, № 1. - P. 122-8.

154. Detection of periodontal pathogens in the patients with aortic aneurysm / F. Ding, Y. Lyu, X. Han [et al.] // Chine Med. J. - 2014. - Vol. 127. - P. 4114-8.

155. Dietary simple sugars alter microbial ecology in the gut and promote colitis in mice / S. Khan, S. Waliullah, V. Godfrey [et al.] // Sci. Transl. Med. - 2020. - Vol. 12. - P. 567.

156. Differences in the subgingival microbiome according to stage of periodontitis: A comparison of two geographic regions / G. I. Lafaurie, Y. Neuta, R. Ríos [et al.] // PLoS One. - 2022. - Vol. 17, № 8. - P. e0273523.

157. Differential involvement of the canonical and noncanonical inflammasomes in the immune response against infection by the periodontal bacteria Porphyromonas gingivalis and Fusobacterium nucleatum / K. Q. de Andrade, C. L. C. Almeida-da-Silva, D. M. Ojcius, R. Coutinho-Silva // Curr. Res. Microb. Sci. - 2021.

- № 2. - P. 100023.

158. Direct MALDI-TOF profiling of gingival crevicular fluid sediments for periodontitis diagnosis / J. Yi, Y. Shen, Y. Yang [et al.] // Talanta. - 2021. - Vol. 225. -P. 121956.

159. Distinct and complex bacterial profiles in human periodontitis and health revealed by 16S pyrosequencing / A. L. Griffen, C. J. Beall, J. H. Campbell [et al.] // ISME J. - 2012. - Vol. 6. - P. 1176-85.

160. Diversity of treponema denticola and other oral treponeme lineages in subjects with periodontitis and gingivitis / H. Zeng, Y. Chan, W. Gao [et al.] // Microbiol. Spectr. - 2021. - Vol. 9, № 2. - P. e0070121.

161. Du, Q. Research progress of correlation between periodontal pathogens and systemic diseases / Q. Du, X. Ma // Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao. - 2020. - Vol. 40, № 5. - P. 759-764.

162. Duncan, K. O. Primary cutaneous infection with Bacillus megaterium mimicking cutaneous anthrax / K. O. Duncan, T. L. Smith // J. Am. Acad. Dermatol. -2011. - Vol. 65. - P. e60-e61.

163. Dynamic changes in the subgingival microbiome and their potential for diagnosis and prognosis of periodontitis / B. Shi, M. Chang, J. Martin [et al.] // MBio. -2015. - Vol. 6. - P. e01926-14.

164. Dysbiosis and alterations in predicted functions of the subgingival microbiome in chronic periodontitis / M. E. Kirst, E. C. Li, B. Alfant [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 2015. - Vol. 81. - P. 783-793.

165. Dysbiosis in chronic periodontitis: key microbial players and interactions with the human host / Z-L. Deng, S. P. Szafranski, M. Jarek [et al.] // Sci. Rep. - 2017.

- Vol. 7, № 1. - P. 1-13.

166. Economic burden of periodontitis in the United States and Europe-An updated estimation / J. Botelho, V. Machado, Y. Leira [et al.] // J. Periodontol. - 2022. -Vol. 93. - P. 373-379.

167. Effect of smoking on periodontitis: A systematic review and meta-regression / F. R. M. Leite, G. G. Nascimento, F. Scheutz, R. López // Am. J. Prevent. Med. - 2018. - Vol. 54, № 6. - P. 831-841.

168. Effect of the intratumoral microbiota on spatial and cellular heterogeneity in cancer / J. L. Galeano Nino, H. Wu, K. D. LaCourse, [et al.] // Nature. - 2022. - Vol. 611. - P. 810-817.

169. Entamoeba gingivalis causes oral inflammation and tissue destruction / X. Bao, R. Wiehe, H. Dommisch, A. S. Schaefer // J. Dent. Res. - 2020. - Vol. 99. - P. 561-567.

170. Entamoeba gingivalis exerts severe pathogenic effects on the oral mucosa / X. Bao, J. Weiner 3rd, O. Meckes [et al.] // J. Dent. Res. - 2021. - Vol. 100. - P. 771776.

171. Evolutionary and pan-genome analysis of three important black-pigmented periodontal pathogens / P. Q. Meng, Q. Zhang, Y. Ding [et al.] // Chine J. Dent. Res. -2023. - Vol. 26, № 2. - P. 93-104.

172. Faisal, R. H. Increased bacterial load of Filifactor alocis in deep periodontal pockets discriminate between periodontitis stage 3 and 4 / R. H. Faisal, A. O. Ali // Front. Oral Health. - 2025. - № 6. - P. 1543030.

173. Fatahi-Bafghi, M. Characterization of the Rothia spp. and their role in human clinical infections / M. Fatahi-Bafghi // Infect. Genet. Evol. - 2021. - Vol. 93. -P. 104877.

174. Fernandez, L. V. Mastitis por Corynebacterium pyruviciproducens y Corynebacterium amycolatum en mujeres inmunocompetentes no lactantes / L. V. Fernandez, A. S. Fortuny, E. F. Rodriguez // Rev. Argent. Microbiol. - 2021. - Vol. 53, № 1. - P. 39-42.

175. Filifactor alocis modulates human neutrophil antimicrobial functional responses / J. S. Edmisson, S. Tian, C. L. Armstrong [et al.] // Cell Microbiol. - 2018. -Vol. 20, № 6. - P. e12829.

176. Filifactor alocis: recent insights and advances / E. Aja, M. Mangar, H. M. Fletcher, A. Mishra // J. Dent. Res. - 2021. - Vol. 100, № 8. - P. 790-797.

177. Fine, D. H. Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa) under the radar: myths and misunderstandings of aa and its role in aggressive periodontitis / D. H. Fine, A. G. Patil, S. K. Velusamy // Front. Immunol. - 2019. - Vol. 10. - P. 728.

178. Formation, development, and cross-species interactions in biofilms / A. Luo, F. Wang, D. Sun [et al.] // Front. Microbiol. - 2022. - Vol. 12. - P. 757327.

179. Fusobacterium nucleatum facilitates apoptosis, ROS generation, and inflammatory cytokine production by activating AKT/MAPK and NF-kappaB signaling pathways in human gingival fibroblasts / W. Kang, Z. Jia, D. Tang [et al.] // Oxidative Med. Cell. Longev. - 2019. - Vol. 2019. - P. 1681972.

180. Fusobacterium nucleatum Interaction with Pseudomonas aeruginosa induces biofilm-associated antibiotic tolerance via fusobacterium adhesin A / Q. Li, L. Tan, H. Wang, Y. Kou [et al.] // ACS Infect. Dis. - 2020. - Vol. 6. - P. 1686-1696.

181. Fusobacterium nucleatum outer membrane proteins Fap2 and RadD induce cell death in human lymphocytes / C. W. Kaplan, X. Ma, A. Paranjpe [et al.] // Infect. Immun. - 2010. - Vol. 78. - P. 4773-4778.

182. Fusobacterium species and subspecies differentially affect the composition and architecture of supra- and subgingival biofilms models / T. Thurnheer, L. Karygianni, M. Flury, G. N. Belibasakis // Front. Microbiol. - 2019. - Vol. 10. - P. 1716.

183. Gemella haemolysans inhibits the growth of the periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis / T. Miyoshi, S. Oge, S. Nakata [et al.] // Sci. Rep. - 2021. -Vol. 11, № 1. - P. 11742.

184. Genetic and molecular determinants of polymicrobial interactions in Fusobacterium nucleatum / C. Wu, Y. W. Chen, M. Scheible [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. - 2021. - Vol. 118. - P. e2006482118.

185. Genetic manipulation of Patescibacteria provides mechanistic insights into microbial dark matter and the epibiotic lifestyle / Y. Wang, L. A. Gallagher, P. A. Andrade [et al.] // Cell. - 2023. - Vol. 186, № 22. - P. 4803-4817.e13.

186. Genomic and phenotypic comparison of Prevotella intermedia strains possessing different virulence in vivo / K. Kwack, E. Jang, S. Yang [et al.] // Virulence.

- 2022. - Vol. 13. - P. 1133-1145.

187. Gingival crevicular fluid (GCF): a diagnostic tool for the detection of periodontal health and diseases / T. Fatima, Z. Khurshid, A. Rehman [et al.] // Molecules. - 2021. - Vol. 26. - P. 1208.

188. Global prevelence of periodontal disease and lack of its surveillance / M. Nazir, Al-Ansari, R. Al-Khalifa [et al.] // Sci. World J. Vol. - 2020. - Issue 1. - Art. ID 2146160.

189. Gu, Y. Toll-Like receptor signaling and immune regulatory lymphocytes in periodontal disease / Y. Gu, X. Han // Int. J. Mol. Sci. - 2020. - Vol. 21, № 9. - P. 3329.

190. Guo, J. Bacillus megaterium infection presenting as pulmonary alveolar proteinosis, a case report / J. Guo, J. Chen, X. Sun // BMC Infect. Dis. - 2024. - Vol. 24, № 1. - P. 868.

191. Hadza Prevotella require diet-derived microbiota-accessible carbohydrates to persist in mice / R. H. Gellman, M. R. Olm, N. Terrapon [et al.] // Cell Rep. - 2023.

- Vol. 42. - P. 401.

192. Hajishengallis, G. Dysbiosis and inflammation in periodontitis: synergism and implications for treatment / G. Hajishengallis // J. Oral Microbiol. - 2017. - Vol. 9, № 1. - P. 1325198.

193. Hajishengallis, G. Immunomicrobial pathogenesis of periodontitis: keystones, pathobionts, and host response / G. Hajishengallis // Trends Immunol. -

2014. - Vol. 35, № 1. - P. 3-11.

194. Hajishengallis, G. Polymicrobial communities in periodontal disease: Their quasi-organismal nature and dialogue with the host / G. Hajishengallis, R. J. Lamont // Periodontology 2000. - 2021. - Vol. 86, № 1. - P. 210-230.

195. Histopathological and immunohistochemical study of periodontal changes in chronic smokers / G. V. Popa, A. Costache, O. Badea [et al.] // Roman. J. Morphol. Embryol. - 2021. - Vol. 62. - P. 209-217.

196. Horizontal and vertical transfer of oral microbial dysbiosis and periodontal disease / M. Payne, A. Hashim, A. Alsam [et al.] // J. Dent. Res. - 2019. - Vol. 98, № 13. - P. 1503-10.

197. How do intestinal probiotics restore the intestinal barrier? / H.-Z. Gou, Y.-L. Zhang, L.-F. Ren [et al.] // Front. Microbiol. - 2022. - Vol. 13. - P. 929346.

198. Impact of Fusobacterium nucleatum in the gastrointestinal tract on natural killer cells / Y. J. Kim, B. K. Kim, S. J. Park, J. H. Kim // World J. Gastroenterol. -2021. - Vol. 27. - P. 4879-4889.

199. Impact of periodontal therapy on the subgingival microbiota of severe periodontitis: comparison between good responders and individuals with refractory periodontitis using the human oral microbe identification microarray / A. P. Colombo, S. Bennet, S. L. Cotton [et al.] // J. Periodontol. - 2012. - Vol. 83. - P. 1279-1287.

200. Implications of Porphyromonas gingivalis peptidyl arginine deiminase and gingipain R in human health and diseases / Y. C. Chow, H. C. Yam, B. Gunasekaran [et al.] // Front. Cell. Infect. Microbiol. - 2022. - Vol. 12. - P. 987683.

201. Infection route of parvimonas micra: a case report and systematic review / K. Shimizu, Y. Horinishi, C. Sano, R. Ohta // Healthcare (Basel). - 2022. - Vol. 10, № 9. - P. 1727.

202. Inflammatory and immune pathways in the pathogenesis of periodontal disease / A. Cekici, A. Kantarci, H. Hasturk, T. E. Van Dyke // Periodontology 2000. -2014. - Vol. 64, № 1. - P. 57-80.

203. Influence of inflammation in the process of t lymphocyte differentiation: proliferative, metabolic, and oxidative changes / M. A. Moro-García, J. C. Mayo, R. M. Sainz, R. Alonso-Arias // Front. Immunol. - 2018. - Vol. 9. - P. 339.

204. Innate and adaptive immunity of periodontal disease. From etiology to alveolar bone loss / J. S. Becerra-Ruiz, C. Guerrero-Velázquez, F. Martínez-Esquivias [et al.] // Oral Dis. - 2022. - Vol. 28, № 6. - P. 1441-1447.

205. Insertional inactivation and gene complementation of prevotella intermedia type ix secretion system reveals its indispensable roles in black pigmentation, hemagglutination, protease activity of interpain a, and biofilm formation / M. Naito, M. Shoji, K. Sato, K. Nakayama // J. Bacteriol. - 2022. - Vol. 204, № 8. - P. e0020322.

206. Insights into the evolution of host association through the isolation and characterization of a novel human periodontal pathobiont, Desulfobulbus oralis / K. L. Cross, P. Chirania, W. Xiong [et al.] // mBio. - 2018. - Vol. 9, № 2. - P. e02061-17.

207. Interaction of lifestyle, behavior or systemic diseases with dental caries and periodontal diseases: Consensus report of group 2 of the joint EFP/ORCA workshop on the boundaries between caries and periodontal diseases / I. L. C. Chapple, P. Bouchard, M. G. Cagetti [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 2017. - Vol. 44. - P. 39-51.

208. Interleukin gene variability and periodontal bacteria in patients with generalized aggressive form of periodontitis / P. Borilova Linhartova, Z. Danek, T. Deissova [et al.] // Int. J. Mol. Sci. - 2020. - Vol. 21, № 13. - P. 4728.

209. Is bleeding on probing a reliable clinical indicator of peri-implant diseases? / H. Dukka, M. H. A. Saleh, A. Ravida [et al.] // J. Periodontol. - 2021. - Vol. 92. - P. 1669-1674.

210. Isola, G. Antibiotics and antimicrobials for treatment of the oral microbiota: myths and facts in research and clinical practice / G. Isola // Antibiotics (Basel, Switzerland). - 2020. - Vol. 9, № 2. - P. 95.

211. Isolation, and storage of Aggregatibacter actinomicetemcomitans from the subgingival plaque of patients with periodontitis / T. Thao, L. Ngan, N. Van, P. Thuy // Sci. Technol. Developm. J. - 2021. - Vol. 2, № 2. - P. 185-193.

212. Janakiram, C. A Public health approach for prevention of periodontal diseas / C. Janakiram, B. A. Dye // Periodontology 2000. - 2020. - Vol. 84. - P. 202214.

213. Jasma, P. Porphyromonas gingivalis and its impact on periodontal health and systemic diseases. A concise review / P. Jasma, P. Sánchez // Int. J. Med. Surg. Sci.

- 2019. - Vol. 6, № 1. - P. 31-34.

214. Jennings, M. P. How bacteria utilize sialic acid during interactions with the host: snip, snatch, dispatch, match and attach / M. P. Jennings, C. J. Day, J. M. Atack // Microbiology. - 2022. - Vol. 168, № 3. - P. 001157.

215. Keragala, C. B. Plasminogen: an enigmatic zymogen / C. B. Keragala, R. L. Medcalf // Blood. - 2021. - Vol. 137. - P. 2881-2889.

216. Kim, H. Instruction of microbiome taxonomic profiling based on 16S rRNA sequencing / H. Kim, S. Kim, S. Jung // J. Microbiol. - 2020. - Vol. 58, № 3. -P. 193-205.

217. Kinane, D. F. Authors' reply: Predictive diagnostic tests in periodontal diseases / D. F. Kinane, P. G. Stathopoulou, P. N. Papapanou // Nat. Rev. Dis. Primers.

- 2017. - Vol. 3, № 1. - P. 1-14.

218. Kocuria kristinae infection associated with acute cholecystitis / E. S. Ma, C. L. Wong, K. T. Lai [et al.] // BMC Infect. Dis. - 2005. - Vol. 5. - P. 60.

219. Kocuria rhizophila prosthetic hip joint infection / T. McAleese, A. Ahmed, M. Berney [et al.] // J. Surg. Case Rep. - 2023. - 2023. - № 8. - P. rjad484.

220. Kocuria varians infection associated with brain abscess: a case report / C. Y. Tsai, S. H. Su, Y. H. Cheng [et al.] // BMC Infect. Dis. - 2010. - Vol. 10. - P. 102.

221. Lamont, R. J. The oral microbiota: dynamic communities and host interactions. / R. J. Lamont, H. Koo, G. Hajishengallis // Nat. Rev. Microbiol. - 2018. -Vol. 16. - P. 745-759.

222. Lee, M. K. Descending necrotizing mediastinitis caused by Kocuria rosea: a case report / M. K. Lee, S. H. Choi, D. W. Ryu // BMC Infect. Dis. - 2013. - Vol. 13.

- P. 475.

223. Levels of candidate periodontal pathogens in subgingival biofilm / R. R. Oliveira, D. Fermiano, M. Feres [et al.] // J. Dent. Res. - 2016. - Vol. 95, № 6. - P. 711-8.

224. Link between oral health, periodontal disease, smoking, and systemic diseases in Romanian patients / C. Schwarz, A. I. Hajdu, R. Dumitrescu [et al.] // Healthcare. - 2023. - Vol. 11, № 16. - P. 2354.

225. Longitudinal microbiome changes in supragingival biofilm transcriptomes induced by orthodontics / E. Babikow, N. Ghaltakhchyan, T. Livingston [et al.] // JDR Clin. Trans. Res. - 2023. doi: 10.1177/23800844231199393.

226. Lunar Silva, I. Molecular strategies underlying porphyromonas gingivalis virulence / I. Lunar Silva, E. Cascales // J. Mol. Biol. - 2021. - Vol. 433, № 7. - P. 166836.

227. Matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) for subgingival bacteriome identification in a group of treated periodontitis patients: a case series / I. Lupse, M. Flonta, A. Ciurea [et al.] // Rev. Romana Med. Lab. - 2022. - Vol. 30. - P. 227-234.

228. Mechanism of alveolar bone destruction in periodontitis—periodontal bacteria and inflammation / M. Usui, S. Onizuka, T. Sato [et al.] // Jpn. Dent. Sci. Rev. - 2021. - Vol. 57. - P. 201-208.

229. Mechanisms of Porphyromonas gingivalis to translocate over the oral mucosa and other tissue barriers / C. A. de Jongha, T. J. de Vries, F. J. Bikker [et al.] // J. Oral Microbiol. - 2023. - Vol. 15. - P. 2205291.

230. Metagenomic and metatranscriptomic analysis of saliva reveals disease-associated microbiota in patients with periodontitis and dental caries / D. Belstrem, F. Constancias, Y. Liu [et al.] // NPJ Biofilms Microbiomes. - 2017. - Vol. 3. - P. 23.

231. Metagenomic changes of gut microbiota following treatment of helicobacter pylori infection with a simplified low-dose quadruple therapy with bismuth or lactobacillus reuteri / M. P. Dore, R. Sau, C. Niolu [et al.] // Nutrients. - 2022. - Vol. 14, № 14. - P. 2789.

232. Metagenomics analysis reveals features unique to Indian distal gut microbiota / K. Kaur, I. Khatri, A. Akhtar [et al.] // PLoS One. - 2020. - Vol. 15, № 4. - P. e0231197.

233. Metatranscriptomic analysis of an in vitro biofilm model reveals strain-specific interactions among multiple bacterial species / Y. Zhang, W. Shi, Y. Song, J. Wang // J. Oral Microbiol. - 2019. - Vol. 11. - P. 1599670.

234. Microbial complexes in subgingival plaque / S. S. Socransky, A. D. Haffajee, M. A. Cugini [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 1998. - Vol. 25. - P. 134-44.

235. Microbial diversity in the early in vivo -formed dental biofilm / D. Heller, E. J. Helmerhorst, A.C. Gower [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 2016. - Vol. 82. -P. 1881-1888.

236. Microbial dynamics with CRC progression: a study of the mucosal microbiota at multiple sites in cancers, adenomatous polyps, and healthy controls / T. Senthakumaran, A. E. F. Moen, T. M. Tannaes [et al.] // Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. - 2023. - Vol. 42. - P. 305-322.

237. Microbial dynamics: Understanding the triad of periodontal pathogens / B. Chellathurai, D. Chandrasekar, U. Subbiah [et al.] // IP Int. J. Periodontol. Implantol. -2024. - Vol. 9, № 2. - P. 72-76.

238. Microbiome profiles in periodontitis in relation to host and disease characteristics / B. Y. Hong, M. V. Furtado Araujo, L. D. Strausbaugh [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10. - P. e0127077.

239. Microbiota DNA isolation, 16S rRNA amplicon sequencing, and bioinformatic analysis for bacterial microbiome profiling of rodent fecal samples / C. J. Love, C. Gubert, S. Kodikara [et al.] // STAR Protoc. - 2022. - Vol. 3, № 4. - P. 101772.

240. Microbiota of peri-implant healthy tissues, peri-implant mucositis, and peri-implantitis: a comprehensive review / F. Di Spirito, F. Giordano, M. P. Di Palo [et al.] // Microorganisms. - 2024. - Vol. 12, № 6. - P. 1137.

241. Microbiota transplantation as an adjunct to standard periodontal treatment in periodontal disease: a systematic review / C. E. Lindo, J. Sebastian, K. N. Kuntjoro [et al.] // Medicina (Kaunas). - 2024. - Vol. 60, № 4. - P. 672.

242. Mikelsaar, M. Lactobacillus fermentum ME-3 - an antimicrobial and antioxidative probiotic / M. Mikelsaar, M. Zilmer // Microb. Ecol. Health Dis. - 2009. -Vol. 21, № 1. - P. 1-27.

243. Miralda, I. Neutrophil interaction with emerging oral pathogens: a novel view of the disease paradigm / I. Miralda, A. Vashishta, S. Uriarte // Adv. Exp. Med. Biol. - 2019. - № 1197. - P. 165-178.

244. Mitogen-activated protein kinases and phosphatidylinositol 3-kinase are involved in Prevotella intermedia-induced proinflammatory cytokines expression in human periodontal ligament cells / S. M. Guan, M. Zhang, J. J. He, J. Z. Wu // Biochem. Biophys. Res. Commun. - 2009. - Vol. 386, № 3. - P. 471-476.

245. Molecular diagnostics of periodontitis / I. Korona-Glowniak, R. Siwiec, M. Berger [et al.] // Postepy Hig. Med. Dosw. (Online). - 2017. - Vol. 71. - P. 47-56.

246. Molecular identification of Capnocytophaga species from the oral cavity of patients with chronic periodontitis and healthy individuals / U. B Idate, K. Bhat, V. Kotrashetti [et al.] // J. Oral. Maxillofac. Pathol. - 2020. - Vol. 24. - P. 397.

247. Mombelli, A. Microbial colonization of the periodontal pocket and its significance for periodontal therapy / A. Mombelli // Periodontology 2000. - 2018. -Vol. 76, № 1. - P. 85-96.

248. Moon, J. H. Subgingivalmicrobiome in smokers and non-smokers in Korean chronic periodontitis patients / J. H. Moon, J. H. Lee, J. Y. Lee // Mol. Oral Microbiol. - 2015. - Vol. 30. - P. 227-41.

249. Multiple hepatic and brain abscesses caused by parvimonas micra: a case report and literature review / N. Cesta, L. Foroghi Biland, B. Neri [et al.] // Anaerobe. -2021. - Vol. 69. - P. 102366.

250. Nadaf, R. Unravelling the intricacies of Porphyromonas gingivalis: virulence factors, lifecycle dynamics and phytochemical interventions for periodontal

disease management / R. Nadaf, V. M. Kumbar, S. Ghagane // Acta Pathol. Microbiol. Immunol. Scand. - 2024. - Vol. 132, № 9. - P. 611-624.

251. Naive Bayesian classifier for rapid assignment of rRNA sequences into the new bacterial taxonomy / W. Qiong, G. M. Garrity, J. M. Tiedje, J. R. Cole // Appl. Environ. Microbiol. - 2007. - Vol. 73. - P. 5261-7.

252. Naruishi, K. Biological effects of interleukin-6 on gingival fibroblasts: cytokine regulation in periodontitis / K. Naruishi, T. Nagata // J. Cell. Physiol. - 2018. -Vol. 233. - P. 6393-6400.

253. Native valve endocarditis caused by Kocuria rosea complicated by peripheral mycotic aneurysm in an elderly host / P. Gunaseelan, G. Suresh, V. Raghavan, S. Varadarajan // J. Postgrad. Med. - 2017. - Bd. 63. - S. 135.

254. New bacterial species associated with chronic periodontitis / P. S. Kumar, A. L. Griffen, J. A. Barton [et al.] // J. Dent. Res. - 2003. - Vol. 82. - P. 338-344.

255. Nitrate and a nitrate-reducing Rothia aeria strain as potential prebiotic or synbiotic treatments for periodontitis / D. Mazurel, M. Carda-Dieguez, T. Langenburg [et al.] // NPJ Biofilms Microbiomes. - 2023. - Vol. 9. - P. 40.

256. Novel pathogens in periodontal microbiology / K. V. Hiranmayi, K. Sirisha, R. M. Ramoji, P. Sudhakar // J. Pharm. Bioallied Sci. - 2017. - Vol. 9. - P. 155-63.

257. Oka, H. Co-infection of oral candida albicans and porphyromonas gingivalis is associated with active periodontitis in middle-aged and older Japanese people / H. Oka, K. Shigeishi, K. Ohta // Medicina (Kaunas). - 2022. - Vol. 58, № 6. -P. 723.

258. Olsen, I. Is Porphyromonas gingivalis involved in Parkinson's disease? / I. Olsen, D. B. Kell, E. Pretorius // Eur. J. Clin. Microbiol. - 2020. - Vol. 39. - P. 2013-8.

259. Oral bacteriophages and their potential as adjunctive treatments for periodontitis: a narrative review / M. Kabwe, J. Tucci, I. Darby, S. Dashper // J. Oral Microbiol. - 2025. - Vol. 17, № 1. - P. 2469890.

260. Oral community interactions of Filifactor alocis in vitro / Q. Wang, C. J. Wright, H. Dingming [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8. - P. e76271.

261. Oral diagnostic methods for the detection of periodontal disease / L. L. Ramenzoni, M. P. Lehner, M. E. Kaufmann [et al.] // Diagnostics (Basel, Switzerland). - 2021. - Vol. 11, № 3. - P. 571.

262. Oral dysbiosis induced by Porphyromonas gingivalis is strain-dependent in mice / E. Boyer, P. Leroyer, L. Malherbe [et al.] // J. Oral Microbiol. - 2020. - Vol. 12, № 1. - P. 1832837.

263. Oral Lactobacillus zeae exacerbates the pathological manifestation of periodontitis in a mouse model / Y.-W. Chen, Y.-W. Hou, C.-W. Wang [et al.] // J. Mol. Oral Microbiol. - 2024. - Vol. 39, № 5. - P. 344-353.

264. Oral microbial communities in 5-year-old children with versus without dental caries / Z. Yang, T. Cai, Y. Li [et al.] // BMC Oral Health. - 2023. - Vol. 23, № 1. - P. 400.

265. Oral microbiome and health / N. Sharma, S. Bhatia, A. S. Sodhi, N. Batra // AIMS Microbiol. - 2018. - Vol. 4, № 1. - P. 42-66.

266. Oral microbiota in human systematic diseases / X. Peng, L. Cheng, Y. You [et al.] // Int. J. Oral Sci. - 2022. - Vol. 14, № 1. - P. 14.

267. Oral microflora and pregnancy: a systematic review and meta-analysis / H. Jang, A. Patoine, T. T. Wu [et al.] // Sci. Rep. - 2021. - Vol. 11. - P. 16870.

268. P. gingivalis alters lung microbiota and aggravates disease severity of COPD rats by up-regulating Hsp90a/MLKL / N. Feng, X. Han, D. Peng [et al.] // Oral Microbiol. - 2024. - Vol. 16, №1. - P. 2334588.

269. Pan-genomic analysis of Corynebacterium amycolatum gives insights into molecular mechanisms underpinning the transition to a pathogenic phenotype / H. N. R. Jesus, D. J. P. G. Rocha, R. T. J. Ramos [et al.] // Front. Microbiol. - 2022. - Vol. 13. -P. 1011578.

270. Park, S. N. Development of quantitative real-time PCR primers for detecting 42 oral bacterial species / S. N. Park, Y. K. Lim, J. K. Kook // Arch. Microbiol. - 2013. - Vol. 195, № 7. - P. 473-82.

271. Parvimonas micra stimulates expression of gingipains from Porphyromonas gingivalis in multi-species communities / J. Neilands, J. R. Davies, F. J. Bikker, G. Svensater // Anaerobe. - 2019. - Vol. 55. - P. 54-60.

272. Pathogenetic characterization of a Micrococcus luteus strain isolated from an infant / X. Shi, S. Qiu, L. Ji [et al.] // Front. Pediatr. - 2023. - Vol. 11. - P. 1303040.

273. PD-L1 up-regulation in prostate cancer cells by porphyromonas gingivalis / S. Groeger, F. Wu, F. Wagenlehner [et al.] // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2022. -Vol. 12. - P. 935806.

274. Periodontal infectogenomics: a systematic review update of associations between host genetic variants and subgingival microbial detection / N. Zoheir, Y. Kurushima, G.-H. Lin, L. Nibali // Clin. Oral Invest. - 2022. - Vol. 26, № 3. - P. 220921.

275. Periodontal pathogens of the interdental microbiota in a 3-month pregnant population with an intact periodontium / F. Carrouel, A. Kanoute, V. E. Lvovschi, D. Bourgeois // Front. Microbiol. - 2023. - Vol. 14. - P. 1275180.

276. Periodontitis exacerbates and promotes the progression of chronic kidney disease through oral flora, cytokines, and oxidative stress / L. Li, Y. L. Zhang, X. Y. Liu [et al.] // Front. Microbiol. - 2021. - Vol. 12. - P. 656372.

277. Periodontitis: consensus report of workgroup 2 of the 2017WorldWorkshop on the classification of periodontal and peri-Implant diseases and conditions / P. N. Papapanou, M. Sanz, N. Buduneli [et al.] // J. Periodontol. - 2018. - Vol. 89. - P. 173182.

278. Periodontopathogens porphyromonas gingivalis and fusobacterium nucleatum and their roles in the progression of respiratory diseases / T. Shi, J. Wang, J. Dong [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2023. - Vol. 12, № 9. - P. 1110.

279. Phylogenetic analysis of Filifactor alocis strains isolated from several oral infections identified a novel RTX toxin, ftxA / J. Oscarsson, R. Claesson, K. Bao [et al.] // Toxins. - 2020. - Vol. 12. - P. 687.

280. Plaque-induced gingivitis: Case definition and diagnostic considerations / L. Trombelli, R. Farina, C. O. Silva, D. N. Tatakis // J. Periodontol. - 2018. - Vol. 89. Suppl. 1. - P. S46-S73.

281. Pleuritis with pleural effusion due to a Bacillus megaterium infection / E. Crisafulli, I. Aredano, I. Valzano [et al.] // Respirol. Case Rep. - 2019. - Vol. 7, № 1. -P. e00381.

282. Porphyromonas gingivalis exacerbates ulcerative colitis via Porphyromonas gingivalis peptidylarginine deiminase / X. Zhao, J. Liu, C. Zhang [et al.] // Int. J. Oral Sci. - 2021. - Vol. 13, № 1. - P. 31.

283. Porphyromonas gingivalis GroEL accelerates abdominal aortic aneurysm formation by matrix metalloproteinase-2 SUMOylation in vascular smooth muscle cells: A novel finding for the activation of MMP-2 / Y.-W. Lin, F.-Y. Lin, Z.-H. Lai [et al.] // Mol. Oral Microbiol. - 2024. doi: 10.1111/omi.12487.

284. Porphyromonas gingivalis in the development of periodontitis: impact on dysbiosis and inflammation / A. Gasmi Benahmed, P. Kumar Mujawdiya, S. Noor, A. Gasmi // Arch. Razi Inst. - 2022. - Vol. 77, № 5. - P. 1539-1551.

285. Porphyromonas gingivalis induces chronic kidney disease through Crosstalk between the NF-kB/NLRP3 Pathway and Ferroptosis in GMCs / X. Li, C. Yao, D.-M. Lan [et al.] // Curr. Med. Sci. - 2024. - Vol. 44, № 5. - P. 932-946.

286. Porphyromonas gingivalis interaction with Candida albicans allows for aerobic escape, virulence and adherence / C. A. de Jongh, F. J. Bikker, T. J. de Vries [et al.] // Biofilm. - 2024. - № 7. - P. 100172.

287. Porphyromonas gingivalis Lipopolysaccharide affects oral epithelial connections via pyroptosis / Y. Li, B. Li, Y. Liu [et al.] // J. Dent. Sci. - 2021. - Vol. 16. - P. 1255-1263.

288. Porphyromonas gingivalis manipulates complement and TLR signaling to uncouple bacterial clearance from inflammation and promote dysbiosis / T. Maekawa, J. L. Krauss, T. Abe [et al.] // Cell Host Microbe. - 2014. - Vol. 15, № 6. - P. 768-778.

289. Porphyromonas gingivalis outer membrane vesicles inhibit the invasion of Fusobacterium nucleatum into oral epithelial cells by downregulating FadA and FomA / Z. Zhang, S. Liu, S. Zhang [et al.] // J. Periodontol. - 2021. - Vol. 93. - P. 515-525.

290. Porphyromonas gingivalis promotes oral squamous cell carcinoma progression by modulating autophagy / K. Yuan K, S. Xu, G. Liu [et al.] // Oral Dis. -2024. - Vol. 31, № 2. - P. 492-502.

291. Porphyromonas gingivalis regulates atherosclerosis through an immune pathway / Q. Ruan, P. Guan, W. Qi [et al.] // Front. Immunol. - 2023. - Vol. 14. - P. 1103592.

292. Porphyromonas gingivalis secretion leads to dysplasia of normal esophageal epithelial cells via the Sonic hedgehog pathway / X. Jia, J. Liu, Y. He, X. Huang // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2022. - Vol. 12. - P. 982636.

293. Porphyromonas gingivalis: A key role in Parkinson's disease with cognitive impairment? / D. Li, T. Ren, H. Li [et al.] // Front. Neurol. - 2022. - Vol. 13. - P. 945523.

294. Porphyromonasgingivalis in the development of periodontitis: impact on dysbiosis and inflammation / A. Gasmi Benahmed, P. Kumar Mujawdiya, S. Noor, A. Gasmi // Arch. Razi Inst. - 2022. - Vol. 77, № 5. - P. 1539-1551.

295. Potential relationship between clinical symptoms and the root canal microbiomes of root filled teeth based on the next-generation sequencing / Y. Hou, L. Wang, L. Zhang [et al.] // Int. Endod. J. - 2022. - Vol. 55, № 1. - P. 18-29.

296. Prevalence of Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Porphyromonas gingivalis and Tannerella forsythia in Japanese patients with generalized chronic and aggressive periodontitis / S. Tomita, A. Komiya-Ito, K. Imamura [et al.] // Microb. Pathog. - 2013. - Vol. 61-62. - P. 11-5.

297. Prevalence of periodontitis in dentate people between 2011 and 2020: A systematic review and meta-analysis of epidemiological studies / D. Trindade, R. Carvalho, V. Machado [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 2023. - Vol. 50, № 5. - P. 604626.

298. Prevalence of six periodontal pathogens in subgingival samples of Italian patients with chronic periodontitis / M. R. Gatto, M. Montevecchi, M. Paolucci [et al.] // New Microbiol. - 2014. - Vol. 37. - P. 517-24.

299. Prevotella intermedia upregulates MMP-1 and MMP-8 expression in human periodontal ligament cells / S. M. Guan, L. Shu, S. M. Fu [et al.] // FEMS Microbiol. Lett. - 2009. - Vol. 299, № 2. - P. 214-222.

300. Prevotella species as oral residents and infectious agents with potential impact on systemic conditions / E. Kononen, D. Fteita, U. K. Gursoy, M. Gursoy // J. Oral Microbiol. - 2022. - Vol. 14, № 1. - P. 2079814.

301. Prevotella: An insight into its characteristics and associated virulence factors / G. Sharma, N. Garg, S. Hasan, S. Shirodkar // Microb. Pathog. - 2022. - Vol. 169. - P. 105673.

302. Probiotic bacterial application in pediatric critical illness as coadjuvants of therapy / C. Zanza, T. Romenskaya, Y. Longhitano [et al.] // Medicina (Kaunas). -2021. - Vol. 57, № 8. - P. 781.

303. Probiotics for periodontal health-Current molecular findings / T. Nguyen, H. Brody, A. Radaic, Y. Kapila // Periodontology 2000. - 2021. - Vol. 87, № 1. - P. 254-67.

304. Probiotics in the non-surgical treatment of periodontitis: a systematic review and network meta-analysis / C. D. Mendonfa, A. D. S. P. D. Mata, L. F. R. Azevedo [et al.] // BMC Oral Health. - 2024. - Vol. 24, № 1. - P. 1224.

305. Progression of attachment loss is strongly associated with presence of the JP2 genotype of Aggregatibacter actinomycetemcomitans: A prospective cohort study of a young adolescent population / C. Hoglund Aberg, F. Kwamin, R. Claesson [et al.] // J. Clin. Periodontal. - 2014. - Vol. 41. - P. 232-241.

306. Putative periodontal pathogens, filifactor alocis and peptoanaerobacter stomatis, induce differential cytokine and chemokine production by human neutrophils / A. Vashishta, E. Jimenez-Flores, C. K. Klaes [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2019. - Vol. 8, № 2. - P. 59.

307. Rams, T. E. Comparative in vitro resistance of human periodontal bacterial pathogens to tinidazole and four other antibiotics / T. E. Rams, J. D. Sautter, A. J. van Winkelhoff // Antibiotics (Basel). - 2020. - Vol. 9, № 2. - P. 68.

308. Real-Time PCR method as diagnostic tool for detection of periodontal pathogens in patients with periodontitis / S. Kuret, N. Kalajzic, M. Ruzdjak [et al.] // Int. J. Mol. Sci. - 2024. - Vol. 25, № 10. - P. 5097.

309. Relatively low invasive capacity of Porphyromonas gingivalis strains into human gingival fibroblasts in vitro / J. Y. Jang, K. J. Baek, Y. Choi, S. Ji // Arch. Oral Biol. - 2017. - Vol. 83. - P. 265-271.

310. Reyes, L. Porphyromonas gingivalis / L. Reyes // Trends Microbiol. -2021. - Vol. 29. - P. 376-377.

311. Rocas, I. N. Frequency and levels of candidate endodontic pathogens in acute apical abscesses as compared to asymptomatic apical periodontitis / I. N. Rocas, J. F. Siqueira // PLoS One. - 2018. - Vol. 13. - P. e0190469.

312. Role of microbial biofilms in the maintenance of oral health and in the development of dental caries and periodontal diseases. Consensus report of group 1 of the joint EFP/ORCA workshop on the boundaries between caries and periodontal disease / M. Sanz, D. Beighton, M. A. Curtis [et al.] // J. Clin. Periodontol. - 2017. -Vol. 44, Suppl. 18. - P. S5-11.

313. Roles of Porphyromonas gingivalis and its virulence factors in periodontitis / W. Xu, W. Zhou, H. Wang, S. Liang // Adv. Protein Chem. Struct. Biol. - 2020. - Vol. 120. - P. 45-84.

314. Schaffer, Ch. The intriguing strategies of Tannerella forsythia's host interaction? / Ch. Schaffer, O. Andrukhov // Front. Oral Health. - 2024. - Vol. 5. - P. 1434217.

315. Sedghi, L. M. Periodontal disease: the good, the bad, and the unknown / L. M. Sedghi, M. Bacino, Y. L. Kapila // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2021. - Vol. 11. -P. 766944.

316. Serine-rich repeat adhesin gordonii surface protein b is important for streptococcus gordonii / A. Kim, K. B. Ahn, H. Y. Kim [et al.] // Biofilm Formation Basic Res. - 2016. - Vol. 42. - P. 1767-1772.

317. Shahoumi, L. A. Virulence factors of the periodontal pathogens: tools to evade the host immune response and promote carcinogenesis / L. A. Shahoumi, M. H. A. Saleh, M. M. Meghil // Microorganisms. - 2023. - Vol. 11, № 1. - P. 115.

318. Sharifovich, A. D. The role of the immune system and oral fluid and blood antimicrobial peptides in patients with chronic generalized periodontitis / A. D. Sharifovich, R. J. Alimjanovich // Am. J. Interdisc. Innov. Res. - 2023. - Vol. 5, № 05. - P. 64-71.

319. Shut-down of type IX protein secretion alters the host immune response to Tannerella forsythia and Porphyromonas gingivalis / M. L. Braun, M. B. Tomek, C. Grünwald-Gruber [et al.] // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2022. - № 12. - P. 835509.

320. Sidstedt, M. PCR Inhibition in QPCR, DPCR and MPS—Mechanisms and Solutions / M. Sidstedt, P. Rädström, J. Hedman // Anal. Bioanal. Chem. - 2020. - № 412. - P. 2009-23.

321. Signature of microbial dysbiosis in periodontitis / V. Meuric, S. Le GallDavid, E. Boyer [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 2017. - Vol. 83, № 14. - P. e00462-17.

322. Singhrao, S. K. Are Porphyromonas gingivalis outer membrane vesicles microbullets for sporadic Alzheimer's disease manifestation? / S. K. Singhrao, I. J. Olsen // Alzheimers Dis. Rep. - 2018. - № 2. - P. 219-228.

323. Siqueira, J. F. Present status and future directions: microbiology of endodontic infections / J. F. Siqueira, I. N. Rocas // Int. Endodont. J. - 2022. - Vol. 55, № 3. - P. 512-530.

324. Sivamaruthi, B. S. A review of the role of probiotic supplementation in dental caries / B. S. Sivamaruthi, P. Kesika, C. Chaiyasut // Probiotics Antimicrob. Proteins. - 2020. - Vol. 12, № 4. - P. 1300-1309.

325. Smoking induced salivary microbiome dysbiosis and is correlated with lipid biomarkers / L. I. Mohammed, R. Razali, Z. Z. Zakaria [et al.] // BMC Oral Health. - 2024. - Vol. 24, № 1. - P. 608.

326. Specific oral microbial differences in proteobacteria and bacteroidetes are associated with distinct sites when moving from healthy mucosa to oral dysplasia-a microbiome and gene profiling study and focused review / A. Radaic, E. R. Shamir, K. Jones [et al.] // Microorganisms. - 2023. - Vol. 11, № 9. - P. 2250.

327. Stokowa-Soltys, K. Fusobacterium nucleatum - Friend or foe? / K. Stokowa-Soltys, K. Wojtkowiak, K. Jagiello // J. Inorg. Biochem. - 2021. - Vol. 224. -P. 111586.

328. Streptococcus gordonii Hsa environmentally constrains competitive binding by Streptococcus sanguinis to saliva-coated hydroxyapatite / A. H. Nobbs, Y. Zhang, A. Khammanivong, M. C. Herzberg // J. Bacteriol. - 2007. - Vol. 189. - P. 3106-3114.

329. Streptococcus gordonii: pathogenesis and host response to its cell wall components / O. J. Park, Y. Kwon, C. Park [et al.] // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8. - P. 1852.

330. Subgingival plaque sampling after combined mechanical and antibiotic nonsurgical periodontal therapy / T. Ramich, B. Schacher, S. Scharf [et al.] // Clin. Oral Investig. - 2015. - Vol. 19. - P. 27-34.

331. Synergistic biofilm formation by Parvimonas micra and Fusobacterium nucleatum / A. Horiuchi, E. Kokubu, T. Warita, K. Ishihara // Anaerobe. - 2020. - Vol. 62. - P. 102100.

332. Systematic review and meta-analysis of double-blind, placebo-controlled, randomized clinical trials using probiotics in chronic periodontitis / S. Ikram, N. Hassan, M. A. Raffat [et al.] // J. Invest. Clin. Dent. - 2018. - Vol. 9. - P. e12338.

333. Tamai, R. Candida infections: the role of saliva in oral health-a narrative review / R. Tamai, Y. Kiyoura // Microorganisms. - 2025. - Vol. 13, № 4. - P. 717.

334. Tannerella forsythia strains differentially induce interferon gamma-induced protein 10 (IP-10) expression in macrophages due to lipopolysaccharide heterogeneity / S. Chinthamani, R. P. Settem, K. Honma [et al.] // Pathog. Dis. - 2022. - Vol. 80, № 1. - P. ftac008.

335. Tetracycline and multidrug resistance in the oral microbiota: differences between healthy subjects and patients with periodontitis in Spain / A. Arredondo, V. Blanc, C. Mor [et al.] // J. Oral Microbiol. - 2020. - № 13. - P. - 1847431.

336. The battle of probiotics and their derivatives against biofilms / A. Barzegari, K. Kheyrolahzadeh, S. M. H. Khatibi [et al.] // Infect. Drug. Resistance. -2020. - Vol. 13. - P. 659-672.

337. The biofilm community: rebels with a cause / A. W. Aruni, Y. Dou, A. Mishra, H. M. Fletcher // Curr. Oral Health Rep. - 2015. - № 2. - P. 48-56.

338. The forming of bacteria biofilm from streptococcus mutans and aggregatibacter actinomycetemcomitans as a marker for early detection in dental caries and periodontitis / I. Kriswandini, I. T. Diyatri, P. Nuraini [et al.] // Infect. Dis. Rep. -2020. - Vol. 12, № 11. - P. 26-28.

339. The Fusobacterium nucleatum outer membrane protein RadD is an arginine-inhibitable adhesin required for inter-species adherence and the structured architecture of multispecies biofilm / C. W. Kaplan, R. Lux, S. K. Haake, W. Shi // Mol. Microbiol. - 2009. - Vol. 71. - P. 35-47.

340. The Global burden of periodontal disease: a narrative review on unveiling socioeconomic and health challenges / N. T. Hashim, R. Babiker, V. Padmanabhan [et al.] // Int. J. Environ. Res. Public Health. - 2025. - Vol. 22. - P. 624.

341. The human oral microbiome / F. E. Dewhirst, T. Chen, J. Izard [et al.] // J. Bacteriol. - 2010. - Vol. 192, № 19. - P. 5002-17.

342. The impact of Filifactor alocis on the severity of periodontitis among diabetic and non-diabetic patients: a narrative review / S. C. Manenzhe, S. Koutras, N. B. Zwane, [et al.] // Front. Dent. Med. - 2024. - Vol. 5. - P. 1408839.

343. The impact of smoking on periodontitis patients' GCF/serum cytokine profile both before and after periodontal therapy: a meta-analysis / C. P. Hao, N. J. Cao, Y. H. Zhu, W. Wang // BMC Oral Health. - 2023. - Vol. 23, № 1. - P. 60.

344. The impacts of oral and gut microbiota on alveolar bone loss in periodontitis / N. Han, X. Li, J. Du [et al.] // J. Periodont. Res. - 2023. - Vol. 58, № 6. -P. 1139-1147.

345. The loop-mediated isothermal amplification technique in periodontal diagnostics: a systematic review / M. Lenkowski, K. Nijakowski, M. Kaczmarek, A. Surdacka // J. Clin. Med. - 2021. - Vol. 10. - P. 1189.

346. The microbiome in periodontitis and diabetes / D. N. A. d Silva, M. Casarin, S. Monajemzadeh [et al.] // Front. Oral Health. - 2022. - № 3. - P. 859209.

347. The oral bacterial microbiome of interdental surfaces in adolescents according to carious risk / C. Inquimbert, D. Bourgeois, M. Bravo [et al.] // Microorganisms. - 2019. - Vol. 9. - P. 319.

348. The oral microbiome: role of key organisms and complex networks in oral health and disease / L. Sedghi, V. DiMassa, A. Harrington [et al.] // Periodontology 2000. - 2021. - Vol. 87. - P. 107-31.

349. The role of oral microbiome in respiratory health and diseases / J. L. Pathak, Y. Yan, Q. Zhang [et al.] // Respir. Med. - 2021. - Vol. 185. - P. 106475.

350. The role of virulence factors of Porphyromonas gingivalis and Tannerella forsythia in the pathogenesis of periodontal diseases: literature review / O. V. Evdokimova, E. P. Kotelevets, A. I. Novak, V. V. Biryukov // Klin. Stomatol. - 2025. -Vol. 28. - P. 171-178.

351. The SILVA ribosomal RNA gene database project: improved data processing and web-based tools / C. Quast, E. Pruesse, P. Yilmaz [et al.] // Nucleic. Acids Res. - 2013. - Vol. 41, № D1. - P. D590-D596.

352. The subgingival microbiome in health and periodontitis and its relationship with community biomass and inflammation / L. Abusleme, A. K. Dupuy, N. Dutzan [et al.] // ISME J. - 2013. - Vol. 7. - P. 1016-25.

353. The Th17/Treg cell balance: crosstalk among the immune system, bone and microbes in periodontitis / J. Deng, C. Lu, Q. Zhao [et al.] // J. Periodont. Res. - 2022. -Vol. 57, № 2. - P. 246-255.

354. The value of antimicrobial peptides in the age of resistance / M. Magana, M. Pushpanathan, A. L. Santos [et al.] // Lancet Infect. Dis. - 2020. - Vol. 20. - P. e216-e230.

355. Tonetti, M. S. Staging and grading of periodontitis: Framework and proposal of a new classification and case definition / M. S. Tonetti, H. Greenwell, K. S. Kornman // J. Periodontol. - 2018. - Vol. 89, Suppl. 1. - P. S159-S172.

356. Towards the nano-control of periodontal inflammation / A. Brun, N. Moignot, M.L. Colombier, E. Dursun // Oral Dis. - 2020. - Vol. 26, № 2. - P. 245-248.

357. Tuganbaev, T. The effects of oral microbiota on health / T. Tuganbaev, K. Yoshida, K. Honda // Science. - 2022. - № 376. - P. 934-936.

358. Two cases of peritonitis caused by Kocuria marina in patients undergoing continuous ambulatory peritoneal dialysis / J. Y. Lee, S. H. Kim, H. S. Jeong [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2009. - Vol. 47. - P. 3376-8.

359. Unraveling the sequence of cytosolic reactions in the export of GspB adhesin from Streptococcus gordonii / Y. Chen, B. A. Bensing, R. Seepersaud [et al.] // J. Biol. Chem. - 2018. - Vol. 293. - P. 5360-5373.

360. Van Dyke, T. E. The nexus between periodontal inflammation and dysbiosis / T. E. Van Dyke, P. M. Bartold, E. C. Reynolds // Front. Immunol. - 2020. -Vol. 11. - P. 511.

361. Vasiee, A. Evaluation of probiotic potential of autochthonous lactobacilli strains isolated from Zabuli yellow kashk, an Iranian dairy product / A. Vasiee, F. Falah, S. A. Mortazavi // J. Appl. Microbiol. - 2022. - Vol. 133, № 5. - P. 3201-3214.

362. Veillonellae: beyond bridging species in oral biofilm ecology / P. Zhou, D. Manoil, G. N. Belibasakis, G. A. Kotsakis // Front. Oral Health. - 2021. - Vol. 2. - P. 774115.

363. What is the heritability of periodontitis? A systematic review / L. Nibali, J. Bayliss-Chapman, S. A. Almofareh [et al.] // J. Dent. Res. - 2019. - Vol. 98, № 6. - P. 632-641.

364. Wilbert, S. A. Spatial ecology of the human tongue dorsum microbiome / S. A. Wilbert, J. L. Mark Welch, G. G. Borisy // Cell Rep. - 2020. - Vol. 30. - P. 40034015.

365. Wolf, N. K. Roles of natural killer cells in immunity to cancer, and applications to immunotherapy / N. K. Wolf, D. U. Kissiov, D. H. Raulet // Nat. Rev. Immunol. - 2022. - Vol. 23. - P. 90-105.

366. Zhang, S. M. The commensal anaerobe Veillonella dispar reprograms its lactate metabolism and short-chain fatty acid production during the stationary phase / S. M. Zhang, S. L. Huang // Microbiol. Spectr. - 2023. - Vol. 11. - P. e0355822.

367. Zhang, Y. Probiotic species in the management of periodontal diseases: an overview / Y. Zhang, Y. Ding, Q. Guo // Front. Cell Infect. Microbiol. - 2022. - Vol. 12. - P. 806463.

368. Zhao, Y. Gut microbial dysbiosis and inflammation: Impact on periodontal health / Y. Zhao, Y. Liu, L. Jia // J. Periodont. Res. - 2025. - Vol. 60, № 1. - P. 30-43.

Приложение А (справочное) Патент на изобретение №2802078 Питательная среда для выделения чистой культуры Ротркутошопаз ^т^аНя

Приложение Б (справочное) Патент на изобретение №2819447 Способ формирования биопленки Lactobacillus casei, выделенных из пародонтальных карманов, на инертных поверхностях

Приложение В (справочное) Патент на изобретение №2817419 Способ формирования биопленки Lactobacillus fermentum, выделенных из пародонтальных карманов, на инертных поверхностях

Приложение Г (справочное)

Положительное решение о выдаче патента на изобретение заявка № 2025101538/10 (003639) Способ прогнозирования тяжести воспалительных заболеваний пародонта

по составу микробиоты

Приложение Д (справочное) Патентная справка заявка № 2025110387 от 23.04.2025 Способ детекции гена FtxA, кодирующего белок ЯТХ Е1^ас1ог а!осгз, выделенного у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта

Приложение Е (справочное) Патентная справка заявка № 2025109709 от 17.04.2025 Способ детекции гена GspB, кодирующего поверхностный белок B Streptococcus gordonii, выделенного у пациентов с воспалительными

заболеваниями пародонта

Приложение Ж (справочное) Патентная справка заявка № 2025108766 от 09.04.2025 Способ детекции гена hsa, кодирующего антиген Hs Streptococcus gordonii, выделенного у пациентов с воспалительными заболеваниями пародонта