Морфологическая и молекулярно-биологическая характеристика воспалительных заболеваний кишечника у детей на материале эндоскопических биопсий. тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.02, кандидат наук Андреев, Андрей Иванович

• Андреев, Андрей Иванович
• кандидат наук
• 2014

Оглавление диссертации кандидат наук Андреев, Андрей Иванович

Оглавление

Введение с

Глава 1. Обзор литературы с

Глава 2. Материалы и методы с

Глава 3. Результаты собственных исследований с

Глава 4. Обсуждение полученных результатов с

Заключение с

Выводы с

Практические рекомендации с

Список литературы с

Приложение с

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМЫХ СОКРАЩЕНИЙ

БК - болезнь Крона

ВЗК - воспалительные заболевания кишечника ЖКТ - желудочно-кишечный тракт ИГХ - иммуногистохимия ЯК - язвенный колит

FISH - флюоресцентная in situ гибридизация

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Морфологическая и молекулярно-биологическая характеристика воспалительных заболеваний кишечника у детей на материале эндоскопических биопсий.»

Введение

Актуальность. В последние десятилетия во всем мире регистрируется повышение частоты воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК) и отмечается рост заболеваемости язвенным колитом (ЯК) и болезнью Крона (БК) у детей. По решению экспертного совета Международной организации гастроэнтерологов 2010 год был объявлен годом воспалительных заболеваний кишечника. Такой уровень заинтересованности международных экспертов обусловлен тем, что по тяжести течения, частоте осложнений и летальности ВЗК в подавляющем большинстве стран занимают одно из ведущих мест в структуре болезней желудочно-кишечного тракта (ЖКТ), представляя собой одну из наиболее серьезных и нерешенных проблем в современной гастроэнтерологии [23]. По данным итальянского регистра ВЗК частота встречаемости ЯК и БК с 1993 по 2003 годы возросла с 0.89 до 1.39 на 100 тысяч населения младше 18 лет. Причем дети младше 6 лет составили в регистре 20% от всех зарегистрированных случаев. Подобная тенденция отмечается во многих западноевропейских странах, а также в США и Канаде. В США распространенность ЯК у детей в возрасте 10-19 лет составляет 2 на 100 000 населения. Распространенность в Великобритании и Швеции возросла вдвое, достигнув 1.66 на 100 000. Россия в этом отношении не является исключением [33].

ВЗК, которые традиционно включают ЯК и БК, а также неопределенный

колит, на сегодняшний день не имеют точно установленной этиологии, несмотря

па большое количество работ, в которых подробно разбираются возможные

патогенетические механизмы и предлагаются различные этиологические

факторы [12]. Подобная ситуация крайне затрудняет постановку диагноза, в

особенности у детей. Диагноз ВЗК комплексный и обязательно включает данные

клинического, рентгенологического, эндоскопического, иммунологического и

молекулярно-генетического методов исследования. Морфологическая

диагностика является неотъемлемым и обязательным компонентом в этом

списке диагностических мероприятий. Материалом для морфологического

исследования являются колонобиоптаты, получаемые при проведении

4

эндоскопических исследований. Классические морфологические критерии для постановки диагноза ЯК и БК хорошо известны и были получены при изучении операционного материала. Колоиоскопия с прицельной биопсией на сегодняшний день являются основным методом диагностики ВЗК у детей. Только после морфологического подтверждения возможно назначение терапии, включающей современные высокотехнологичные протокольные схемы лечения. Постановка морфологического диагноза колит и проведение разграничения среди различных групп колитов не всегда возможны, а дифференциальная диагностика между кишечными инфекциями, ЯК и БК только по результатам изучения биоптатов является задачей крайне сложной. Трудности возникают при отсутствии в биоптагах классической морфологической картины, а также при дефиците клипико-лабораторпых данных. Такие ситуации могут приводить к неверной трактовке обнаруженных морфологических изменений и к ошибочному морфологическому заключению.

Морфологическая диагностика ВЗК у детей имеет свои особенности и требует крайне взвешенного подхода в оценке обнаруженных морфологических изменений. Во многих случаях для постановки окончательного диагноза приходится прибегать к повторным взятиям биопсий. У детей по сравнению с взрослыми чаще используется диагноз неопределенного колита, а также смена первоначально установленного диагноза ЯК на БК и наоборот [141] [174].

В ЖКТ человека обитает более 450 видов микроорганизмов, общая биомасса которых у взрослого человека составляет 3-4 кг [166]. Микробном рассматривают как дополнительный многоклеточный «орган» человека, состоящий из различных линий клеток, которые взаимодействуют как между собой, так и с организмом хозяина [113]. Считается, что ВЗК развиваются в результате неадекватного иммунного ответа, направленного против собственной бактериальной микрофлоры кишки, который приводит к воспалительному повреждению собственных тканей кишечника. Многие экспериментальные и клинические данные свидетельствует о вовлечении бактерий в патогенез ВЗК, однако, несмотря на интенсивные поиски, ни механизмы, благодаря которым

бактерии приводят к развитию ВЗК, ни специфические изменения в составе микрофлоры не были четко определены.

Кишечная микрофлора является многокомпонентной или полимикробной, поэтому выделение и использование в научных исследованиях одной или нескольких культур бактерий не может достоверно отражать ситуацию, которая имеет место в кишечнике.

Оценить состояние микрофлоры кишечника во всем её многообразии и пространственном расположении возможно при использовании метода флюоресцентной in situ гибридизации (FISH), использующей в качестве мишени рибосомальпые РНК. Каждая бактерия содержит 103"5 рибосом, причем определенные участки рибосомальных РНК являются строго специфичными для каждого вида бактерий. Помимо этих участков бактерии содержат участки общие для групп, классов, типов и даже сообществ бактерий. Синтезированные участки комплиментарной РНК с добавленной к ним флюоресцентной меткой являются высокочувствительными олигонуклетидными пробами, используемыми для гибридизации. Все известные на сегодняшний день олигонуклеотидпые пробы имеют свою аббревиатуру и их характеристики подробно представлены в интернет базе данных probeBase ("http://vv\vvv.microbial-ecolouv.net/probebase/credits.asp). Результаты гибридизации можно оценить в иммунофлюоресцентпом микроскопе без дополнительного усиления сигнала, так как каждая бактерия содержит большое количество РНК [36].

Толстую кишку можно сравнить с биореактором, в котором, благодаря большому количеству бактерий, происходит окончательное расщепление непереваренных остатков пищи. Для макроорганизма бактерии являются необходимыми для синтеза отдельных витаминов и короткоцепочечиых жирных кислот, которые являются продуктом метаболизма бактерий. К таким преобладающим и всегда присутствующим в толстой кишке бактериям относятся Eubacterium rectale, Faecalibacterium prausnilzii и Bacteroides. Данные бактерии составляют в общей сложности до 70% всей микрофлоры кишечника [164]. Другие бактерии присутствуют в небольших количествах и не всегда могут быть обнаружены. В то же время предположительное число групп

бактерий, обнаруживаемых у здорового человека, теоретически может достигать 3000 типов [164]

Концентрация бактерий в толстой кишке достигает концентрации 10п/мл и составляет до 90% от всей массы фекалий. Для того чтобы избежать иммунного ответа и негативного воздействия бактерий па организм, поверхность слизистой оболочки покрыта слоем слизи с определенными физико-химическими характеристиками. Этот слой слизи имеет постоянную для каждого отдела толщину, не содержит бактерий и препятствует контакту бактерий с поверхностью эпителиальных клеток.

Одной из теорий, объясняющих возникновение и развитие ВЗК, является теория потери иммунологической толерантности, проявляющейся в повышенном гуморальном и клеточном иммунном ответе на бактерии кишечной микрофлоры. В развитии иммунного ответа важная роль принадлежит регуляторным Т-клеткам. Было показано, что эффекторные клетки в кишечнике пролиферируют в ответ на изменения в составе бактериальной флоры, а регуляторные Т-клетки подавляют пролиферацию и секрецию цитокинов С04+ Т-клетками. Специфическим маркером регуляторных Т-клеток является недавно описанный транскрипционный фактор БохРЗ. Экспрессия РохРЗ коррелирует с супрессорной активностью вне зависимости от экспрессиии С025 и является определяющей для клеток с регуляторным Т-клеточным фенотипом. Нарушенный баланс между эффекторными и регуляторными Т-клетками играет ключевую роль в нарушении иммунологического гомеостаза и является ответственным за развитие воспалительных изменений в слизистой оболочке у больных с ВЗК.

Цель исследования. Охарактеризовать морфологические и молекулярно-биологические проявления воспалительных заболеваний кишечника с целыо оптимизации диагностики этих заболеваний у детей. Задачи:

1. Провести сравнительный анализ патогистологических критериев воспалительных заболеваний кишечника у детей на материале эндоскопических биопсий.

2. Выбрать наиболее достоверные патогистологические критерии воспалительных заболеваний кишечника у детей на материале эндоскопических биопсий.

3. Оценить результаты иммуногистохимического исследования популяции регулягорных Т-лимфоцитов (FoxP3+) и популяции тучных клеток (CD117+) в собственной пластинке слизистой оболочки толстой кишки при ее воспалительных заболеваниях у детей.

4. Провести изучение на биопсийном материале состава и пространственного расположения микрофлоры при воспалительных заболеваниях кишечника у де тей методом флюоресцентной in situ гибридизации (FISH).

5. Разработать алгоритм комплексной морфологической, иммуногистохимической и молекулярно-биологической диагностики воспалительных заболеваний кишечника у детей на материале эндоскопических биопсий.

Структура и объем диссертации

Диссертация представлена в традиционном виде, состоит из 4 глав, которые включают обзор литературы, характеристику материала и методов исследования, результаты собственных исследований, обсуждение полученных результатов, а также введениея выводов и практических рекомендаций. Список литературы представлен 187 источниками (33 - отечественными и 154 — зарубежными). Диссертация изложена на 140 страницах, иллюстрирована 8 таблицами, 28 рисунками.

Глава I

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ В группу воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК) объединены два заболевания - болезнь Крона (БК) и язвенный колит (ЯК). Для этих заболеваний характерны различная распространенность патологического процесса в ЖКТ, разная глубина поражения слизистой оболочки кишки, определенные морфологические признаки, а также различное течение и прогноз. Несмотря на это некоторые сходные особенности, такие как общность патогенетических механизмов развития этих заболеваний, и вследствие этого единые подходы к лечению, а также сходные клинические проявления позволяют объединять эти два заболевания в одну группу [2] [132].

Эпидемиология ЯК и БК очень схожи. При обоих заболеваниях наиболее низкая распространенность наблюдается в африканских и азиатских странах. Частота ЯК в России составляет 20 на 100 ООО населения (из них около 10% -дети), а БК 3,5 на 100 000 (20-25% дети) [5].

Выдвигались гипотезы о роли многих этиологических факторов в развитии ВЗК (в том числе табачного дыма, газированных напптков, зубных паст, оральных контрацептивов, кори и Mucobacterium paratuberculosis), однако ни одна из них не получила широкого признания [2].

В настоящее время активно исследуется генетическая основа для каждого мультифакториального заболевания, проводится идентификация в ней центральных генов и генов-модификаторов, анализ ассоциации их полиморфизмов с той или иной клинической характеристикой [177]. Уже подтверждены и скопированы 7 генов, а еще 8 предполагаются. Наиболее хорошо изучены ген HETD2/CARD15 на 16-й хромосоме (локус 1 ВЗК) и ген OICTN на 5-й хромосоме (локус 5 ВЗК), ассоциированные с БК; их продукты и белки вовлекаются в бактериальное распознавание и апоптоз, и, соответственно, в транспорт органических катионов. Исследование мутаций HETD2/CARD15 показывает, что дефектное расположение мурамилдипептида, общего компонента бактериальной стенки, ведет к активации NF-кВ. На клиническом уровне мутации HETD2/CARD15 ассоциированы со стриктурным поражением

9

тонкой кишки и увеличением потребности в хирургическом лечении. Связь ВЗК с НВТЭ2 или 01СШ не была обнаружена во всех популяционных исследованиях и отсутствует у пациентов из Азии, подтверждая факт вовлечения множества генов и то, что различные и специфичные гены могут отвечать за развитие ВЗК у населения разных этнических групп в разных частях света[28]. Перспективно и исследование генетического полиморфизма, определяющего особенности экспрессии регуляторных цитокинов при ВЗК. Представляется, что при ВЗК по какой-то причине утрачивается толерантность слизистой оболочки кишечника к множеству бактериальных и пищевых антигенов и развивается неконтролируемый воспалительный процесс. Известно, что иммунная система кишечника находится в тесном взаимодействии с антигенами бактерий, располагающихся в слое пристеночной слизи, а также пищевых антигенов. Избыточный ответ на антигены, реализуется через тол л-подобные рецепторы (ТЬЯ), внутриклеточные НЕТ02-рецепторы или через обработку антигена посредством аутофагии. Стимуляция рецепторов дендритных клеток приводит в дальнейшем к рекрутированию наивных Т-лимфоцитов с последующей их дифферепцировкой в различные подтипы Т-хелперов (ТЫ, ТЬ2, а также ТЫ7). ЯК, как представляется сегодня, ассоциирован с преимущественно ТЬ2-опосредованным иммунным ответом, тогда как БК - это преимущественно ТЫ-ТЫ7-иммунный ответ [110] [131].

При ЯК неспецифическое иммунное воспаление, как правило, не покидает пределов слизистой оболочки, распространяется непрерывно по толстой кишке на разном протяжении (от прямой кишки в проксимальном направлении), лишь иногда с ретроградным вовлечением дистального отдела подвздошной кишки. При БК воспаление трапемуральное, гранулематозное, с сегментарным поражением любого отдела ЖКТ.

«Золотого стандарта» диагностики ВЗК не существует, в каждом случае необходим тщательный анализ клинических симптомов во взаимосвязи с эндоскопическими, гистологическими, радиологическими и/или биохимическими данными. Разные лабораторные тесты, включая исследования крови, кала, проведение эндоскопии с биопсией, различных визуальных методов,

помогают подтвердить диагноз и исключить другие причины заболевания [12] [13] [29].

Клинические проявления ВЗК можно разделить на кишечные (абдоминальная боль/дискомфорт, диарея, реже запоры, примесь слизи/крови в стуле, тенезмы), внекишечные и общие. Среди кишечных проявлений абдоминальная боль наиболее типична для БК, а диарея и наличие примеси крови в стуле - для ЯК. Внекишечные проявления ВЗК многообразны и включают афтозный стоматит, узловатую эритему, гангренозную пиодермию, артралгии/артриты, первичный склерозирующий холангит, первичный билиарный цирроз печени, сакроилет (последние три проявления ассоциированы с гаплотипом НЬАВ27 и не связаны с активностью воспаления), а также состояния, связанные с развитием синдрома мальабсорбции/мальдигсстии при ВЗК (анемия, уролитиаз, желчпо-каменная болезнь, остеопороз и др.). Общие проявления (повышение температуры тела, потеря массы тела, снижение работоспособности), не являясь специфичными для ВЗК, тем не менее помогают в установлении степени активности заболевания [2] [29].

Среди лабораторных тестов обязательно проведение как общеклинического, так и биохимического анализа крови, исследование кала и его микробиологический анализ для исключения бактериального, вирусного пли паразитарного характера диареи. В последние годы предлагается дополнить лабораторное исследование иммунологическим анализом крови для выявления перинуклеарных антинейтрофильиых цитоплазматических антител (р-АЫСА) и анти-ЗассЬаготусеБ сегеу1з1ае антител (АБСА). Положительный р-АТМСА антиген и отрицательные АБСА предполагают наличие ЯК, в то время как отрицательный р-АЫСА антиген и положительные АБСА предполагают наличие БК [61].

Одним из ключевых звеньев диагностического процесса является проведение эндоскопии, которая позволяет уточнить протяженность и характер макроскопических проявлений воспалительного процесса, а в ряде случаев помогает и в выявлении осложнений заболевания. В дальнейшем для

динамического контроля возможности развития неоплазии скрининговая колоноскопия показана через 8 лет после установления диагноза ЯК или БК [69] Илеоколоноскопия должна сопровождаться биопсией из всех отделов кишки, в том числе и неизмененных. Биопсийное исследование позволяет помочь в исключении других, специфических причин воспалительного процесса, а также в проведении дифференциального диагноза между ЯК и БК [39].

Таблица. Гистологические признаки ВЗК (отношение шансов наличия признака по отношению к ЯК и БК) [42] Гистологический признак БК ЯК

С морфологических позиций ЯК - это хроническое заболевание неизвестной этиологии с преимущественным поражением слизистой оболочки толстой кишки. Основными отличиями БК от ЯК являются: локализация и глубина поражения кишки. БК может поражать все отделы ЖКТ и захватывать всю толщину стенки кишки. Поэтому диагноз БК базируется не только на результатах гистологического исследования биоптатов, но и на сопоставлении макро- и микроскопических данных. Макроскопическое изучение удаленной кишки позволяет провести дифференциальную диагностику между БК и ЯК почти в 90% случаев. На практике, однако,

Крипты

Фокальная нерегулярность 1,7

Диффузная нерегулярность Уменьшение числа крипт/атрофия Крипт-абсцессы Полиморфизм эпителия крипт Хроническое воспаление Фокальное или неравномерное 3,3 Диффузное

Базальные плазматические клетки Эпителиоидные гранулемы 12,4

3,4 2,9 1,8 3,7

1,8 2,3 0,1

постановка точного диагноза необходима до проведения хирургического лечения. Она часто основывается на данных рентгенологического и эндоскопического методов исследования в сочетании с результатами гистологического исследования биоптатов [9] [29].

Определение точной локализации и макроскопическое описание поражений является необходимым для больных с БК с диагностической целыо, а также для выделения различных клипико-морфологических форм БК, которые определяют дальнейшее течение болезни. В соответствии с Венской классификацией БК, разработанной международной рабочей группой на Всемирном конгрессе гастроэнтерологов в 1998 году [146], было предложено выделять воспалительный вариант БК, вариант с образованием стриктур (диагностируемый по наличием участков резкого сужения просвета) и вариант с пенетрацией (с наличием внутрибрюшных или перианальных фистул, воспалительных инфильтратов и/или абсцессов). На практике фистулы часто связаны со стриктурами и, соответственно, клиническое разделение ограничивается выделением двух форм БК - перфоративной и неперфоративной [158]. Микроскопические признаки ВЗК.

Гистологический диагноз БК основывается: 1) на обнаружении типичных эпителиоидпых гранулем и при обязательном наличии хотя бы одного из морфологических признаков, характерных для ВЗК, или 2) на обнаружении трех морфологических признаков ВЗК и при отсутствии гранулем, но при обязательном исключении инфекционной природы поражения И 70]. Несмотря на то, что степень схожести морфологических изменений при ЯК и БК достаточно высока, наличие афтозных язв, щелевидных язв, поражение всех слоев стенки кишки, иаличие фистул, лимфангиоэктазий, стриктур и изменений со стороны нервной ткани кишки помогают постановке диагноза БК. К сожалению, большинство из перечисленных выше диагностических признаков не могут быть выявлены при изучении материала эндоскопических биопсий [4] [13] [31].

По данным гистологического исследования биоптатов, сложно во всех случаях доказательно верифицировать ВЗК, так как структурные изменения слизистой оболочки определяются не только наличием ВЗК, но и временем проведения исследования (активность процесса), а также лекарственной терапией (не только в связи с ВЗК). Более того, повреждение структуры крипт может встретиться при любом хроническом воспалении в слизистой оболочке кишки, в том числе при ишемическом, радиационном колите/энтерите, в случае длительного приема ИПВП/ацети л салициловой кислоты в низких дозах, а также при хронических/подострых инфекциях, в том числе Clostridium difficile, амебиазе. Все это требует сопоставления данных гистологического исследования биоптатов с данными клиники, течением заболевания, продолжительностью и типом лечения [100].

Комплексная оценка клинических проявлений заболевания и результатов лабораторно-инструментальпых методов исследования позволяет выяснить нозологию, оценить характер течения, текущую активность и степень тяжести заболевания, протяженность воспалительного процесса и наличие осложнений.

В среднем на установление диагноза ВЗК уходит около 5 лет. Одним из важных этапов дифференциальной диагностики является исключение кишечных инфекций. Кишечные инфекции могут вызывать сходные клинические симптомы (диарея, боли в животе, кровь в стуле), впекишечные проявления (реактивный артрит, узловатая эритема), а также в ряде случаев сходные эндоскопические и гистологические изменения (отек и воспаление слизистой, крипт-абсцессы, эрозии) [1] [31].

Большие сложности возникают при дифференцировании БК и ЯК. Известно, что при БК поражается любой отдел пищеварительного тракта, при ЯК только толстая кишка. Для ЯК характерно поражение прямой кишки. Перианальные поражения, свищи, стриктуры характерны для БК. Рецидив после удаления пораженного сегмента толстой кишки при ЯК встречается крайне редко, тогда как при БК процесс прогрессирует, часто наблюдается рецидив заболевания. Однако основными критериями диагностики являются гистологические изменения. При БК воспалительный процесс начинается в

подслизистом слое и распространяется на все слои кишечной стенки, (в отличие от ЯК, при котором воспалительные изменения ограничиваются только слизистой оболочкой). Специфическим гистологическим признаком при БК является формирование эпителиоидных гранулем, состоящих из эгштелиоидпых и гигантских многоядерных клеток. Однако гранулемы встречаются только в 4060% случаев. Для ВЗК характерна лимфоплазмоцитарная инфильтрация. Присоединяющееся изъязвление эпителия сопровождается инфильтрацией иейтрофилами. Неравномерная плотность инфильтрата собственной пластинки слизистой оболочки также является характерной для БК. При БК язвы чаще бывают глубокие и узкие, могут проникать до субсерозного слоя и окружающей клетчатки, с формированием свищей и спаек с соседними органами [9] [10].

Классификация колитов [17] включает следующие критерии:

I. По характеру развития выделяют острый колит и хронический колит.

Течение хронического колита:

• монотонное, непрерывное

• иптермиттирующее, перемежающееся

• рецидивирующее

При рецидивирующем и интермиттирующем течении хронического воспалительного процесса выделяют две фазы:

• фаза ремиссии, которая в зависимости от клинических, эндоскопических и лабораторных показателей может делиться на а) полную и б) неполною, частичную;

• фаза обострения.

II. По степени тяжести клинических проявлений колита выделяют:

1. Легкая форма

2. Средней тяжести

3. Тяжелая форма.

У пациентов с острыми колитами инфекционного, токсического и аллергического гепеза тяжесть клинической картины определяется, в основном, характером и протяженностью воспалительных изменений толстой кишки, в то время как у больных с ВЗК подобная зависимость может отсутствовать [2].

III. По преимущественной локализации колит может быть:

1. Тотальный.

Воспалительный процесс поражает все отделы толстой кишки, макроскопические изменения на всем протяжении могут носить а) однородный или б) неоднородный характер.

2. Сегментарный.

Толстая кишка поражается в пределах одного анатомического отдела (проктит, сигмоидит, тифлит и т.д.)

3. Полнсегментрапый.

В патологический процесс вовлекаются несколько анатомических отделов толстой кишки (проктосигмоидит, левосторонний колит, правосторонний колит) В этом случае макроскопические изменения могут носить а) непрерывный и б) прерывистый характер.

4. Локальный.

Поражаются участки толстой кишки в пределах одного из ее анатомических отделов (локальный сигмоидит, локальный проктит и т.д.).

IV. По характеру макроскопических изменений выделяют: Катаральный колит, при котором слизистая оболочка отечна,

гиперемирована, сосудистый рисунок смазан или полностью отсутствует, па поверхности слизистой оболочки обильное слизистое отделяемое, что придает ей повышенный блеск. На этом фоне могут отмечаться множественные, мелкие субэпнтелиальиые геморрагии и точечные (диаметром до 0.2 см) эрозии. Обычно, диффузное катаральное воспаление сопровождает большинство инфекционных бактериальных колитов, а также наблюдается при ВЗК.

Эрозивный колит, как правило, развивается на фоне выраженного катарального воспаления слизистой оболочки толстой кишки. В зависимости от характера заболевания поверхностные дефекты могут быть одиночными или множественными, иметь правильную или неправильную форму, в некоторых случаях они сливаются, образуя обширные эрозированные поверхности.

Язвенный колит, так же, как и эрозивный, характеризуется двумя типами воспалительных изменений: диффузное катаральное воспаление (различной

степени выраженности) сопровождает очаговый некротический процесс. Глубокие дефекты слизистой оболочки, одиночные или множественные, могут иметь различную форму, размеры, характер краев и дна. Следует отметить, что в ряде случаев при поверхностных дефектах слизистой оболочки толстой кишки окончательное заключение о характере поражения можно дать только после результатов гистологического исследования, т.к. визуально эрозии и неглубокие язвы трудно различимы [4] [17].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Андреев, Андрей Иванович, 2014 год

Список использованной литературы.

1. Автандилов Г. Г., Ларченко Н. Т., Стенина М. А. и др. Морфологическая и иммунологическая характеристика различных форм неспецифического язвенного колита // Архив патологии. 1984. - № 10. - С. 18-25.

2. Адлер Г. Болезнь Крона и язвенный колит. Пер. с нем. А.А.Шептулина. М.: ГЭОТАР-МЕД, 2001

3. Алиева Э.И. Язвенный колит у детей. Глава в книге: Неспецифические воспалительные заболевания кишечника. Под ред. Воробьева Г.И., Халифа И.Л. - М.: Миклош, 2008. - С. 341-377.

4. Аруин Л.И., Капуллер Л.Л., Исаков В.А. Морфологическая диагностика болезней желудка и кишечника. - М.: Триада-Х, 1998. - 496с.

5. Белоусова Е.А. Язвенный колит и болезнь Крона. Тверь: ООО «Издательство «Триада», 2002. - 128 с.

6. Бробат A.M. Связи морфологических особенностей слизистой оболочки прямой кишки с течением ревматоидного артрита. Автореф. дис. ... канд. мед. наук. М., 2011.

7. Воробьев Г.И., Михайлова Т.Л, Костенко Н.В. Хирургическое лечение гормонорезистентной формы неспецифического язвенного колита // Хирургия. 2004. - №5. - С. 39-45.

8. Галактионов В.Г. Иммунология. М.: «РИЦ МДК», 2000. - 488 с.

9. Головенко О.В., Михайлова Т.Л., Капуллер Л.Л. и др. Недифференцированный колит, клиническая картина, дифференциальный диагноз, течение и прогноз. Рос. журн. гастроэнтерол. гепатол. колопроктол. 2003; 3: 56-61.

10. Головенко О.В. Недифференцируемый неспецифический колит (клинические, эндоскопические и морфологические особенности) Автореф. дисс. на соиск. степени докт. мед наук., Москва, 2006.

П.Ипатова М.Г., Шумилов П.В., Мухина Ю.Г. и др. Дисрегуляция иммунного ответа на индигенную микрофлору у детей и подростков с

воспалительными заболеваниями кишечника. // Педиатрия. - 2012. - Т.89, № 2. - С. 45-49.

12.Капуллер Л.Л. Патологоанатомические изменения толстой кишки при неспецифических воспалительных заболеваниях кишечника. Глава в книге: Неспецифические воспалительные заболевания кишечника. Под ред. Воробьева Г.И., Халифа И.Л. - М.: Миклош, 2008. - С. 71-105.

И.Капуллер Л.Л., Румянцев В.Г. Роль сосудистых расстройств в патогенезе язвенного колита и его осложнений. // Архив патологии. - 2010. - Т.72, №2.-С. 54-61.

И.Капуллер Л.Л., Копович Е.А. Неспецифическое гранулематозное воспаление при болезни Крона. // Архив патологии. - 2012. - Т.74, №5. -С. 57-60.

15. Козлова И.В. Воспалительные заболевания толстой кишки: патогенез, диагностика, прогнозирование течения и исходов: Автореф. дис. д-ра мед. наук: 14.00.05 /Сарат. мед. ин-т. Саратов, 1999. - 45 с.

16. Кветной И.М., Южаков В.В. Апудоциты и тучные клетки желудочно-кишечного тракта: иммуногистохимическая и ультраструктурпая идентификация // Архив патологии. 1987. - № 7. - С. 77-80.

17. Левитан М.Х., Федоров В.Д., Капуллер Л.Л. Неспецифические колиты. М.: Медицина, 1980.-280 с.

18.Мазанкова Л.Н., Водилова О.В. Болезнь Крона у детей. Глава в книге: Неспецифические воспалительные заболевания кишечника. Под ред. Воробьева Г.И., Халифа И.Л. - М.: Миклош, 2008. - С. 378-399.

19. Макарова О.В., Михайлова Л.П. Иммуиоморфология гранулематозного воспаления при Тх1 и Тх2-типе иммунного ответа. // Архив патологии. -2008. - Т70, №6. - С. 48-53.

20. Неспецифические воспалительные заболевания кишечника./ под ред. Воробьева Г.И., Халифа И.Л. - М.: Миклош, 2008. - 400с.

21. Новикова А.В., Щербаков И.Т., Ольшанский Я.О. и др. Особенности воспаления слизистой оболочки толстой кишки при неспецифическом

язвенном колите и болезни Крона.// Архив патологии. - 1982. - Том. 64. -№9.-С. 33-38.

22. Парфенов А.И. Энтерология. — М.: Триада-Х, 2001. 800 с.

23.Практические рекомендации Всемирной Гастроэнтерологической Организации. Воспалительная болезнь кишечника: глобальные перспективы. Июнь 2009.

24. Передерий В.Г., Ткач С.М., Бычкова Н.Г. Иммунопатологические нарушения при хронических неспецифических воспалительных заболеваниях кишечника // Клиническая медицина. 1989. - Т. 67, № 5. - С. 22-28.

25. Ройт А., Бростофф Дж., Мейл Д. Иммунология: Пер. с англ. М.: Мир, 2000. - 592 с.

26.Самсонова Н. Г., Звенигородская JI. А., Парфенов А. И., Хомерики С. Г. Клинико-морфологические критерии микроскопического ишемического колита у больных с хронической ишемической болезнью органов пищеварения.// Экспер. и клин, гастроэнтерология. — 2010. - №12. - С. 6467.

27. Сапип М.Р. Иммунные структуры пищеварительной системы. — М.: Медицина. - 1987. 224 с.

28 Ткачев A.B., Мкртчян JI.C., Никитина К.Е., Волынская Е.И. Воспалительные заболевания кишечника: на перекрестке проблем. // Практическая медицина. -2012. — № 3(58). - С. 17-22.

29.Федулова Э.Н., Потехин П.П., Шумилова О.В. и др. Использование морфологических критериев для определения тактики ведения ребенка с язвенным колитом. // РЖГГК. - 2012. - Т.22. - №4. - С.84-89. Халиф И.Л., Лоранская И.Д. Воспалительные заболевания кишечника (неспецифический язвенный колит и болезнь Крона): клиника, диагностика, лечение. - М.: Миклош, 2004. 88 с.

30.Цимбалова Е.Г. Клинико-лабораторные проявления и критерии активности воспалительных заболеваний кишечника у детей. Автореф. дис. ... канд. мед. наук. М., 2005.

31.Щербаков И.Т. Патофизиология слизистой оболочки желудочно-кишечного тракта при острых бактериальных, вирусной кишечных инфекциях и хронических колитах (экспериментальное и клиническое исследование). Автореф. дисс. на соиск. степени докт. мед наук., Москва, 1995.

32. Щиголева Н.Г., Румянцев В.Г., Бельмер С.В. и др. Неспецифический колит у детей и подростков. Рос. пед. журн. 2002; 2: 16-8.

33.Шумилов П.В. Патогенетические факторы развития и течения болезни Крона и песпецифического язвенного колита у детей. Автореф. дисс. на соиск. степени докт. мед наук., Москва, 1995

34.Abreu МТ, Fukata М, Arditi М. TLR signaling in the gut in health and disease. J Immunol 2005;174:4453-4460.

35. Allez M., Mayer L. Regulatory T cell: peace keepers in the gut // Inflamm Bowel Dis. 2004. - Vol.10, №5. - P. 666-676.

36.Атапп, R. I., W. Ludwig, and K.-PI. Schleifer. 1995. Phylogenetic identification and in situ detection of individual microbial cells without cultivation. Microbiol. Rev. 59:143-169.

37.Antonioli D.A. Colitis in infants and children. In: Dahms B.B., Qualman S.J., eds. Gastrointestinal Diseases. Perspectives in Pediatric Pathology, vol. 20. -Basel: Karger. - 1997. - P. 77-110.

38.Backhed F, Ding PI, Wang T, et al. The gut microbiota as an environmental factor that regulates fat storage. Proc Natl Acad Sci U S A 2004; 101:1571815723

39.Backhed F, Ley RE, Sonnenburg JL, et al. Host-bacterial mutualism in the human intestine. Science 2005;307:1915-1920.

40.Bairead E, Harmon DL, Curtis AM, et al. Association of NOD2 with Crohn's disease in a homogenous Irish population. Eur J Hum Genet 2003;11:237-244.

41. Barczyk M., Debek W., Chyczewsky L. Mast cell in the gastrointeatinal tract // Rocz Akad Med Bialymst. 1995. - Vol. 40, № 1. - p. 36-57.

42.Bentley E., Jenkins D., Campbell F., Warren B.F. Flow could pathologists improve the initial diagnosis of colitis? Evidence from an international workshop. // J. Clin. Pathol. - 2002. - Vol. 55. - P. 955-60.

43.Berg RD. Bacterial translocation from the gastrointestinal tract. Adv Exp Med Biol 1999;473:11-30.

44.Berg RD. The indigenous gastrointestinal microfl ora. Trends Microbiol 1996;4:430-435.

45.Bibiloni R, Fedorak RN, Tannock GW, et al. VSL#3 Probiotic-mixture induces remission in patients with active ulcerative colitis. Am J Gastroenterol 2005;100:1539-1546.

46. Bischoff S.C. et al. Quantitative assessment of intestinal eosinophils and mast cell in inflammatory bowel disease // ITistopatology. — 1996. Vol. 28, № 1. -P. 1-13.

47. Bischoff S.C., Lorentz A., Schwengberg S. et al. Mast cells are an important cellular source of tumour necrosis factor a in human intestinal tissue // Gut. 1999.- Vol.44.-P. 643-652.

48.Blumberg RS, Saubermann LJ, Strober W. Animal models of mucosal inflammation and their relation to human inflammatory bowel disease. Curr Opin Immunol 1999;11:648-656.

49.Bocci V. The neglected organ: bacterial flora has a crucial immunostimulatory role. PerspectBiol Med 1992;35:251-260.

50.Bringer MA, Glasser AL, Tung CH, et al. The Crohn's diseaseassociated adherent-invasive Escherichia coli strain LF82 replicates in mature phagolysosomes within J774 macrophages. Cell Microbiol 2006;8:471-484.

51.Cario E. Bacterial interactions with cells of the intestinal mucosa: toll-like receptors and NOD2. Gut 2005;54:1182-1193.

52.Cario E, Gerken G, Podolsky DK. Toll-like receptor 2 enhances ZO-1-associated intestinal epithelial barrier integrity via protein kinase C. Gastroenterology 2004; 127:224-23 8.

53.Cario E, Podolsky DK. Differential alteration in intestinal epithelial cell expression of toll-like receptor 3 (TLR3) and TLR4 in inflammatory bowel disease. Infect Immun 2000;68:7010-7017.

54.Cario E, Podolsky DK. Intestinal epithelial TOLLerance versus inTOLLerance of commensals. Mol Immunol 2005;42:887-893.

55.Cario E, Rosenberg IM, Brandwein SL, et al. Lipopolysaccharide activates distinct signaling pathways in intestinal epithelial cell lines expressing Toll-like receptors. J Immunol 2000;164:966-972.

56.Cobrin GM, Abreu MT. Defects in mucosal immunity leading to Crohn's disease. Immunol Rev 2005;206:277-295.

57.Cong Y, Brandwein SL, McCabe RP, et al. CD4+ T cells reactive to enteric bacterial antigens in spontaneously colitic C3H/IIe-JBir mice: increased T helper cell type 1 response and ability to transfer disease. J Exp Med 1998;187:855-864.

58.Conly JM, Stein K, Worobetz L, et al. The contribution of vitamin K2 (menaquinones) produced by the intestinal microfl ora to human nutritional requirements for vitamin K. Am J Gastroenterol 1994;89:915-923.

59.Coombes JL, Robinson NJ, Maloy KJ, et al. Regulatory T cells and intestinal homeostasis. Immunol Rev 2005;204:184-194.

60.Darfeuille-Michaud A, Boudeau J, Bulois P, et al. High prevalence of adherent-invasive Escherichia coli associated with ileal mucosa in Crohn's disease. Gastroenterology 2004; 127:412-421.

61.Dubinsky MC. Serologic and laboratory markers in prediction of the disease course in inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol 2010; 16 (21): 2604-8.

62.Dubuquoy L, Jansson EA, Deeb S, et al. Impaired expression of peroxisome proliferator-activated receptor gamma in ulcerative colitis. Gastroenterology 2003;124:1265-1276.

63.Duchmann R, Kaiser I, Hermann E, et al. Tolerance exists towards resident intestinal fl ora but is broken in active infl amatory bowel disease (IBD). Clin Exp Immunol 1995;102:448-455.

64.Duchmann R, May E, Heike M, et al. T cell specificity and cross reactivity towards enterobacteria, bacteroides, bifi dobacterium, and antigens from resident intestinal flora in humans. Gut 1999;44:812-818.

65.Eckburg PB, Bik EM, Bernstein CN, et al. Diversity of the human intestinal microbial flora. Science 2005;308:1635-1638.

66.Ectors N.L., Dixon M.F., Geboes K.J., et al. Granulomatous gastritis: a morphological and diagnostic approach. // Plistopathology. - 1993. - Vol. 23. -P. 55-61.

67.Escher J., Ten Kate F., Lichtenbelt K., et al. Value of rectosigmoidoscopy with biopsies for diagnosis of inflammatory bowel disease in children. // Inflamm. Bowel Dis. - 2002. - Vol. 8. - P. 16-22.

68.Falk PG, Plooper LV, Midtvedt T, et al. Creating and maintaining the gastrointestinal ecosystem: what we know and need to know from gnotobiology. Microbiol Mol Biol Rev 1998;62:1157-1170.

69.Fefferman DS, Farrell RJ. Endoscopy in inflammatory bowel disease: indications, surveillance, and use in clinical practice. Clin Gastroenterol Plepatol 2005; 3: 11-24.

70.Franchimont D, Vermeire S, El Plousni PI, et al. Deficient hostbacteria interactions in inflammatory bowel disease? the tolllike receptor (TLR)-4 Asp299gly polymorphism is associated with Crohn's disease and ulcerative colitis. Gut 2004;53:987-992.

71.Fukata M, Michelsen KS, Eri R, et al. Toll-like receptor-4 is required for intestinal response to epithelial injury and limiting bacterial translocation in a murine model of acute colitis. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 2005;288:G1055-G1065.

72.Geboes K., Ectors N., D'PIaens G., Rutgeerts P. Is ileoscopy with biopsy worthwhile in patients presenting with symptoms of IBD. // Am. J. Gastroenterol. - 1998. - Vol. 93. - P. 201-206.

73.Geboes K., Riddell R., Ost A., et al. A reproducible grading scale for histological assessment of inflammation in ulcerative colitis. // Gut. - 2000. -Vol. 47.-P. 404-409.

74.Geboes K., Dalle I. Influence of treatment on morphologic features of mucosal inflammation. // Gut. - 2002. - Vol. 50. - S. 37^12.

75.Geboes K., Colombel J.F., Greenstein A., et al. Indeterminate colitis : A review of the concept - What's in a name? // Inflamm. Bowel Dis. - 2008. - Vol. 14. -P. 860-7.

76.Geboes K., Van Eyken P. My approach to indeterminate colitis : the role of the pathologist. // J. Clin. Pathol. - 2009. - Vol. 62. - P. 201-5.

77.Gionchetti P, Rizzello F, Venturi A, et al. Oral bacteriotherapy as maintenance treatment in patients with chronic pouchitis: a double-blind, placebo-controlled trial. Gastroenterology 2000; 119:305-309.

78.Glickman J.N., Bousvaros A., Farraye F.A., et al. Pediatric patients with untreated ulcerative colitis may present initially with unusual morphologic findings. // Am. J. Surg. Pathol. - 2004. - Vol. 28. - P. 190-197.

79.Gordon JI, I-Iooper LV, McNevin MS, et al. Epithelial cell growth and diff erentiation. III. Promoting diversity in the intestine: conversations between the microfl ora, epithelium, and diffuse GALT. Am J Physiol 1997;273:G565-G570.

80. Griffiths AM. Specificities of inflammatory bowel disease in childhood. Best Prac Res Clin Gastroenterol 2004; 18 (3): 509-23.

81.Gronlund MM, Lehtonen OP, Eerola E, et al. Fecal microflora in healthy infants born by diff erent methods of delivery: permanent changes in intestinal fl ora after cesarean delivery. J Pediatr Gastroenterol Nutr 1999;28:19-25.

82.Groux I-I, O'Garra A, Bigler M, et al. A CD4+ T-cell subset inhibits antigen-specific T-cell responses and prevents colitis. Nature 1997;389:737-742.

83.Hart AL, Kamm MA, Knight SC, et al. Quantitative and functional characteristics of intestinal-homing memory T cells: analysis of Crohn's disease patients and healthy controls. Clin Exp Immunol 2004;135:137-145.

84.Hart AL, Lammers K, Brigidi P, et al. Modulation of human dendritic cell phenotype and function by probiotic bacteria. Gut 2004;53:1602-1609.

85.1-Iill MJ. Intestinal fl ora and endogenous vitamin synthesis. Eur J Cancer Prev 1997;6(Suppl 1):S43-S45.

86.1-Iisamatsu T, Suzuki M, Reinecker HC, et al. CARD15/NOD2 functions as an antibacterial factor in human intestinal epithelial cells. Gastroenterology 2003;124:993-1000.

87.Hope ME, Hold GL, Kain R, et al. Sporadic colorectal cancer: role of the commensal microbiota. FEMS Microbiol Lett 2005; 244:1-7.

88.Hooper LV, Gordon JI. Commensal host-bacterial relationships in the gut. Science 2001;292:1115-1118.

89.Hooper LV, Wong MH, Thelin A, et al. Molecular analysis of commensal host-microbial relationships in the intestine. Science 2001;291:881-884.

90.Hopkins MJ, Shaip R, Macfarlane GT. Age and disease related changes in intestinal bacterial populations assessed by cell culture, 16S rRNA abundance, and community cellular fatty acid profi les. Gut 2001;48:198-205.

91.IBD Working Group of the European Society for Paediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition. Inflammatory bowel disease in children and adolescents: recommendations for diagnosis - the Porto criteria. // J. Ped. Gastroenterol. Nutr. - 2005. - Vol. 41. - P. 1-7.

92.Inohara N, Chamaillard M, McDonald C, et al. NOD-LRR proteins: role in host-microbial interactions and infl ammatory disease. Annu Rev Biochem 2005;74:355-383

93.Inoue N, Tamura K, Kinouchi Y, et al. Lack of common NOD2 variants in Japanese patients with Crohn's disease. Gastroenterology 2002;123:86-91.

94.Kahn E., Markowitz J., Daum F. The appendix in inflammatory bowel disease in children. // Mod. Pathol. - 1992. - Vol. 5. - P. 380-383.

95.Kelly D, Campbell JI, King TP, et al. Commensal anaerobic gut bacteria attenuate inflammation by regulating nuclear-cytoplasmic shuttling of PPAR-gamma and RelA. Nat Immunol 2004;5:104-112.

96.Kleer C.G., Appelman IT.D. Ulcerative colitis : patterns of involvement in colorectal biopsies and changes with time. // Am. J. Surg. Pathol. - 1998. - Vol. 22.-P. 983-9.

97.Kobayashi KS, Chamaillard M, Ogura Y, et al. Nod2-dependent regulation of innate and adaptive immunity in the intestinal tract. Science 2005;307:731-734.

98.Kosiewicz MM, Nast CC, Krishnan A, et al. Thl-type responses mediate spontaneous ileitis in a novel murine model of Crohn's disease. J Clin Invest 2001;107:695-702.

99.Lammers KM, Vergopoulos A, Babel N, et al. Probiotic therapy in the prevention of pouchitis onset: decreased interleukin-lbeta, interleukin-8, and interferon-gamma gene expression. Infl amm Bowel Dis 2005; 11:447-454.

100. Le Berre N, ITeresbach D, Kerbaol M et al. Histological discrimination of idiopathic inflammatory bowel disease from other types of colitis. J Clin Pathol 1995; 48: 749-53.

101. Levine D.S., Plaggitt R.C. Colon. In: Sternberg S.S., ed. Histology for Pathologists, 2nd ed. Philadelphia: Lippincott-Raven. 1997. - P. 519-537.

102. Li J, Moran T, Swanson E, et al. Regulation of IL-8 and IL-lbeta expression in Crohn's disease associated NOD2/CARD15 mutations. Hum Mol Genet 2004;13:1715-1725.

103. Lodes MJ, Cong Y, Elson CO, et al. Bacterial flagellin is a dominant antigen in Crohn disease. J Clin Invest 2004; 113:1296-1306.

104. Macdonald TT, Monteleone G. Immunity, inflammation, and allergy in the gut. Science 2005;307:1920-1925.

105. Macpherson A, Khoo UY, Forgacs I, et al. Mucosal antibodies in inflammatory bowel disease are directed against intestinal bacteria. Gut 1996;38:365-375.

106. Macpherson AJ, Uhr T. Induction of protective IgA by intestinal dendritic cells carrying commensal bacteria. Science 2004; 303:1662-1665.

107. Madsen K, Cornish A, Soper P, et al. Probiotic bacteria enhance murine and human intestinal epithelial barrier function. Gastroenterology 2001;121:580-591.

108. Madsen KL, Doyle JS, Jewell LD, et al. Lactobacillus species prevents colitis in interleukin 10 gene-deficient mice. Gastroenterology 1999; 116:1107— 1114.

109. Maeda S, Hsu LC, Liu LI, et al. Nod2 mutation in Crohn's disease potentiates NF-kappaB activity and IL-1 beta processing. Science 2005;307:734-738.

110. Mahadeva U., Martin J.P., Patel N.K., Price A.B. Granulomatous ulcerative colitis: a re-appraisal of the mucosal granuloma in the distinction of Crohn's disease from ulcerative colitis. // Histopathology. - 2002. - Vol. 41. - P. 50-55.

111. Mahida YR, Rolfe VE. Host-bacterial interactions in inflammatory bowel disease. Clin Sei (Lond) 2004;107:331-341.

112. Markowitz J., Kahn E., Grancher K., et al. Atypical rectosigmoid histology in children with newly diagnosed ulcerative colitis. // Am. J. Gastroenterol. - 1993. - Vol. 88. - P. 2034-7.

113. Martin F.P., Claus S.P., Tsang T.M.,et al. Systemic multicompartmental effects of the gut microbiome on mouse metabolic phenotypes. //Mol Syst Biol. 2008;4:219.

114. Martin HM, Campbell BJ, Hart CA, et al. Enhanced Escherichia coli adherence and invasion in Crohn's disease and colon cancer. Gastroenterology 2004;127:80-93.

115. Mazmanian SK, Liu CH, Tzianabos AO, et al. An immunomodulatory molecule of symbiotic bacteria directs maturation of the host immune system. Cell 2005;122:107-118.

116. Moore WE, Moore LH. Intestinal fl oras of populations that have a high risk of colon cancer. Appl Environ Microbiol 1995;61:3202-3207.

117. Mountzouris KC, McCartney AL, Gibson GR. Intestinal microflora of human infants and current trends for its nutritional modulation. Br J Nutr 2002;87:405-420.

118. Naser SA, Ghobrial G, Romero C, et al. Culture of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis from the blood of patients with Crohn's disease. Lancet 2004;364:1039-1044.

119. Neish AS, Gewirtz AT, Zeng H, et al. Prokaryotic regulation of epithelial responses by inhibition of IkappaB-alpha ubiquitination. Science 2000;289:1560-1563.

120. Netea MG, Kullberg BJ, de Jong DJ, et al. NOD2 mediates antiinflammatory signals induced by TLR2 ligands: implications for Crohn's disease. Eur J Immunol 2004;34:2052-2059.

121. Oberhuber G., Puspok A., Oesterreicher C., et al. Focally enhanced gastritis : a frequent type of gastritis in patients with Crohn's disease. // Gastroenterology. - 1997. - Vol. 112. - P. 698-706.

122. Odze R., Antonioli D., Peppercorn M., Goldman PI. Effect of topical 5-amino-salicylic acid (5-ASA) therapy on rectal mucosal biopsy morphology in chronic ulcerative colitis. // Am. J. Surg. Pathol. - 1993. - Vol. 17. - P. 869-75.

123. Ogura Y, Bönen DK, Inohara N, et al. A frameshift mutation in NOD2 associated with susceptibility to Crohn's disease. Nature 2001 ;411:603-606.

124. O'PIara AM, O'Regan P, Fanning A, et al. Functional modulation of human intestinal epithelial cell responses by Bifi dobacterium infantis and Lactobacillus salivarius. Immunology 2006; 118:202-215.

125. Olsen I, Wilcer PIG, Johnson E, et al. Elevated antibody responses in patients with Crohn's disease against a 14-kDa secreted protein purified from Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis. Scand J Immunol 2001 ;53:198— 203.

126. Onderdonk AB, Franklin ML, Cisneros RL. Production of experimental ulcerative colitis in gnotobiotic guinea pigs with simplified microflora. Infect Immun 1981;32:225-231.

127. Pauleau AL, Murray PJ. Role of nod2 in the response of macrophages to toll-like receptor agonists. Mol Cell Biol 2003;23:7531-7539.

128. Parente F., Cucino C., Bollani S., et al. Focal gastric inflammatory infiltrates in inflammatory bowel diseases. Prevalence, immunohistochemical characteristics and diagnostic role. // Am. J. Gastroenterol. - 2000. - Vol. 95. -P. 705-711.

129. Pasare C, Medzhitov R. Toll pathway-dependent blockade of CD4+CD25+ T cell-mediated suppression by dendritic cells. Science 2003;299:1033-1036.

130. Petrof EO, Kojima K, Ropeleski MJ, et al. Probiotics inhibit nuclear factor-kappaB and induce heat shock proteins in colonic epithelial cells through proteasome inhibition. Gastroenterology 2004;127:1474-1487.

131. Pierik M., De Hertogh G., Vermeire S., et al. Epithelioid granulomas, pattern recognition receptors, and phenotypes of Crohn's disease. // Gut. - 2005. -Vol. 54.-P. 223-7.

132. Podolsky, D. K.. Inflammatory bowel disease. // N. Engl. J. Med.- 2002. -347; 417-429.

133. Polymeros D, Bogdanos DP, Day R, et al. Does cross-reactivity between mycobacterium avium paratuberculosis and human intestinal antigens characterize Crohn's disease? Gastroenterology 2006;131:85-96.

134. Raithel M., Schneider PI. T., Hahn E. G. Effect of substance P on histamine secretion from gut mucosa in inflammatory bowel disease // Scan J Gastroenterol. 1999. - Vol. 34, № 5. - P. 496-503.

135. Raithel M. et al. Release of mast cell tryptase from human colorectal mucosa in inflammatory bowel disease // Scan J Gastroenterol. 2001. - Vol. 36, № 2.-P. 174-179.

136. Rakoff-Nahoum S, Paglino J, Eslami-Varzaneh F, et al. Recognition of commensal microflora by toll-like receptors is required for intestinal homeostasis. Cell 2004; 118:229-241.

137. Ramaswamy K., Jacobson K., Jevon G., et al. Esophageal Crohn disease in children: a clinical spectrum. // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. - 2003. - Vol. 36.-P. 454-58.

138. Rescigno M, Urbano M, Valzasina B, et al. Dendritic cells express tight junction proteins and penetrate gut epithelial monolayers to sample bacteria. Nat Immunol 2001;2:361-367.

139. Rimoldi M, Chieppa M, Salucci V, et al. Intestinal immune homeostasis is regulated by the crosstalk between epithelial cells and dendritic cells. Nat Immunol 2005;6:507-514.

140. Roberfroid MB, Bornet F, Bouley C, et al. Colonic microflora: nutrition and health: summary and conclusions of an International Life Sciences Institute (ILSI) [Europe] workshop held in Barcelona, Spain. Nutr Rev 1995;53:127— 130.

141. Robert M.E., Tang L., Flao L.M., Reyes-Mugica M. Patterns of inflammation in mucosal biopsies of ulcerative colitis: perceived differences in pediatric populations are limited to children younger than 10 years. // Am. J. Surg. Pathol.-2004.-Vol. 28.-P. 183-189.

142. Rook GA, Brunet LR. Microbes, immunoregulation, and the gut. Gut 2005;54:317-320.

143. Rutgeerts P, ITiele M, Geboes K, et al. Controlled trial of metronidazole treatment for prevention of Crohn's recurrence after ileal resection. Gastroenterology 1995; 108:1617—1621.

144. Ryan P, Bennett MW, Aarons S, et al. PCR detection of Mycobacterium paratuberculosis in Crohn's disease granulomas isolated by laser capture microdissection. Gut 2002;51:665-670.

145. Ryan P, Kelly RG, Lee G, et al. Bacterial DNA within granulomas of patients with Crohn's disease: detection by laser capture microdissection and PCR. Am J Gastroenterol 2004;99:1539-1543.

146. Sachar D.B., Andrews PI., Farmer R.G., et al. Proposed classification of patient subgroups in Crohn's disease. Working team report. // Gastroenterol. Int. - 1998.-Vol.3.-P. 141-154.

147. Schultsz C, Van Den Berg FM, Ten Kate FW, et al. The intestinal mucus layer from patients with infl ammatory bowel disease harbors high numbers of bacteria compared with controls. Gastroenterology 1999; 117:1089-1097.

148. Shanahan F. Nutrient tasting and signaling mechanisms in the gut V: mechanisms of immunologic sensation of intestinal contents. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 2000;278:G1-91-G196.

149. Shanahan F. Physiological basis for novel drug therapies used to treat the inflammatory bowel diseases I. Pathophysiological basis and prospects for probiotic therapy in inflammatory bowel disease. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 2005;288:G4-17-G421.

150. Shanahan F. Probiotics in inflammatory bowel disease: therapeutic rationale and role. Adv Drug Deliv Rev 2004;56:809-818.

151. Shanahan F. The host-microbe interface within the gut. Best Pract Res Clin Gastroenterol 2002;16:915-931.

152. Shanahan F, O'Mahony J. The mycobacteria story in Crohn's disease. Am J Gastroenterol 2005;100:1537-1538.

153. Sheil B, McCarthy J, O'Mahony L, et al. Is the mucosal route of administration essential for probiotic function? Subcutaneous administration is associated with attenuation of murine colitis and arthritis. Gut 2004;53:694-700.

154. Sheila E. Crowe, Mary PI. Perdue. Gastrointestinal food hypersensitivity: Basic Mechanisms of Pathophysiology// Gastroenterology. 1992. -Vol. 103.-P. 1075-1095.

155. Sitaraman SV, Klapproth JM, Moore DA 3rd, et al. Elevated flagellin-specific immunoglobulins in Crohn's disease. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol 2005;288:G403-G406.

156. Sivak M.V. Endoscopy databases and endoscopic research.// Gastrointest Endosc. 2000 Feb;51(2):243-4

157. Stadnyk AW. Intestinal epithelial cells as a source of inflammatory cytokines and chemokines. Can J Gastroenterol 2002;16:241-246.

158. Stange E.F., Travis S.P.L., Vermeire S., et al. European evidence-based consensus on the diagnosis and management of Crohn's disease : definitions and diagnosis. // Gut. - 2006. - Vol. 55. - Suppl. I. - P. il-il5.

159. Stoyanova 1.1., Gulubova M.V. Mast cells and inflammatory mediators in chronic ulcerative colitis // Acta Plistohem. 2002. - Vol. 104, №2. - P. 185-192.

160. Strober W, Fuss IJ, Blumberg RS. The immunology of mucosal models of inflammation. Annu Rev Immunol 2002;20:495-549.

161. Sturm A. et al. Divergent cell cycle kinetics underline the distinct functional capacity of mucosal T cells in Crohn's disease and ulcerative colitis // Gut. -2004.—Vol. 53.-P. 1624-1631.

162. Suenaga K, Yokoyama Y, Nishimori I, et al. Serum antibodies to Mycobacterium paratuberculosis in patients with Crohn's disease. Dig Dis Sci 1999;44:1202-1207.

163. Suzuki K, Meek B, Doi Y, et al. Aberrant expansion of segmented fi lamentous bacteria in IgA-defi cient gut. Proc Natl Acad Sci USA 2004;101:1981-1986.

164. Swidsinski A, Doerffel Y, Loening-Baucke V, et al. Acute appendicitis is characterized by local invasion with Fusobacterium nucleatum/necrophorum. // Gut. 2009 Nov 18. [Epub ahead of print].

165. Swidsinski, A., A. Ladhoff, A. Pernthaler, et al. Mucosal flora in inflammatory bowel disease. // Gastroenterology. - 2002. - 122:44-54.

166. Swidsinski A, Weber J, Loening-Baucke V, et al. Spatial organization and composition of the mucosal flora in patients with inflammatory bowel disease. J Clin Microbiol. 2005 Jul;43(7):3380-9.

167. Takahashi A, Wada A, Ogushi K, et al. Production of beta-defensin-2 by human colonic epithelial cells induced by Salmonella enteritidis flagella filament structural protein. FEBS Lett 2001;508:484-488.

168. Tan W.C., Allan R.N. Diffuse jejunoileitis of Crohn's disease. Gut 1993

169. Tanaka M., Riddell R., Saito PI., et al. Morphologic criteria applicable to biopsy specimens for effective distinction of inflammatory bowel disease from other forms of colitis and of Crohn's disease from ulcerative colitis. // Scand. J. Gastroenterol. - 1999. - Vol. 34. - P. 55-67.

170. Tanaka M., Saito IT., Fukuda S., et al. Simple mucosal biopsy criteria differentiating among Crohn's disease, ulcerative colitis and other forms of colitis : measurement of validity. // Scand. J. Gastroenterol. - 2000. - Vol. 35. -P. 281-6.

171. Targan SR, Karp LC. Defects in mucosal immunity leading to ulcerative colitis. Immunol Rev 2005;206:296-305.

172. Thomas GA, Swift GL, Green JT, et al. Controlled trial of antituberculous chemotherapy in Crohn's disease: a fi ve year follow up study. Gut 1998;42:497-500.

173. Torok HP, Glas J, Tonenchi L, et al. Crohn's disease is associated with a toll-like receptor-9 polymorphism. Gastroenterology 2004;127:365-366.

174. Tsang P., Rotterdam PI. Biopsy diagnosis of colitis. // Am. J. Surg. Pathol. - 1999. - Vol. 23. - P. 423-430.

175. Tysk C, Lindberg E, Jarnerot G, et al. Ulcerative colitis and Crohn's disease in an unselected population of monozygotic and dizygotic twins: a study of heritability and the influence of smoking. Gut 1988;29:990-996.

176. Umesaki Y, Okada Y, Matsumoto S, et al. Segmented fi lamentous bacteria are indigenous intestinal bacteria that activate intraepithelial lymphocytes and induce MHC class II molecules and fucosyl asialo GM1 glycolipids on the small intestinal epithelial cells in the ex-germ-free mouse. Microbiol Immunol 1995;39:555-562.

177. Vermeire S, Van Assche G, Rutgeerts P. Role of genetics in prediction of disease course and response to therapy. World J Gastroenterol 2010; 16 (21): 2609-15.

178. Washington K., Greenson J.K., Montgomery E. et al. Ilistopathology of ulcerative colitis in initial rectal biopsy in children. // Am. J. Surg. Pathol. -2002. - Vol. 26. - P. 1441-1449.

179. Watanabe T, Kitani A, Murray PJ, et al. NOD2 is a negative regulator of Toll-like receptor 2-mediated T helper type 1 responses. Nat Immunol 2004;5:800-808.

180. Wehkamp J, Harder J, Weichenthal M, et al. NOD2 (CARD 15) mutations in Crohn's disease are associated with diminished mucosal alpha-defensin expression. Gut 2004;53:1658-1664.

181. Whitman WB, Coleman DC, Wiebe WJ. Prokaryotes: the unseen majority. Proc Natl Acad Sci U S A 1998;95:6578-6583.

182. Welton M. L. Human colonic microvascular endothelial cells is a model of inflammatory bowel disease // The American journal of surgery. 1997. - Vol. 174.-P. 247-250.

183. Xin W., Greenson J.K. The clinical significance of focally enhanced gastritis.//Am. J. Surg. Pathol. - 2004. - Vol. 28.-P. 1347-51.

184. Xu J, Gordon JI. Inaugural article: honor thy symbionts. Proc Natl Acad Sci U S A 2003;100:10452-10459.

185. Yantiss R.K., Farraye F.A., O'brien M.J., et al. Prognostic significance or superficial Assuring ulceration in patients with severe "indeterminate" colitis. // Am. J. Surg. Pathol. - 2006. - Vol. 30. - P. 165-70.

186. Yao K., Yao T., Iwashita A., et al. Microaggregate of immunostained macrophages in noninflamed gastroduodenal mucosa: a new useful histological marker for differentiating Crohn's colitis from ulcerative colitis. // Am. J. Gastroenterol. - 2000. - Vol. 95. - P. 1967-73.

187. Zoetendal EG, Akkermans ADL, Akkermans-van Vilet WM, et al. The host genotype affects the bacterial community in the human gastrointestinl tract. Microb Ecol Health Dis 2001;13:129-134.

Рис. 1. Язвенный колит. Биоптат слизистой оболочки прямой кишки. Окраска Г+Э. Ув.

х200.

Рис. 2. Болезнь Крона. Биоптат слизистой оболочки поперечно-ободочной кишки. Окраска Г+Э. Ув. х200.

Рис. 3. Болезнь Крона. Биоптат слизистой оболочки сигмовидной кишки. Окраска Г+Э. Ув. х400.

Рис. 4. Недифференцированный колит. Биоптат слизистой оболочки нисходящей ободочной кишки. Окраска Г+Э. Ув. х200.

Рис. 5. Минимальные неспецифические изменения. Крупный лимфоидный фолликул. Окраска Г+Э. Ув. х200.

Рис. 6. Минимальные неспецифические изменения. Биоптат слизистой оболочки прямой кишки полнокровными сосудами и очагами острых кровоизлияний. Окраска Г+Э. Ув. х200.

Рис. 7. Язвенный колит. Высокая пролиферативная активность эпителия и клеток инфильтрата. ИГХ исследование с Кл-67. Х200.

Рис. 8. Язвенный колит. Повышение пролиферативной активности эпителия крипт и клеток инфильтрата. ИГХ исследование с Кл-67. XI00.

. • Д г* «

. V« 1 ' * Ш V А

Рис. 9. Болезнь Крона. Повышение содержания Т-лимфоцитов в эпителии и собственной пластинке. ИГХ исследование с СБЗ. Х200.

Рис. 10. Болезнь Крона. Повышение содержания макрофагов-гистиоцитов в собственной пластинке. ИГХ исследование с С068. Х200.

Рис. 11. Недифференцируемый колит. Позитивная реакция эпителия крипт с маркером сегменто-ядерных лейкоцитов. ИГХ исследование с СП 15. Х200.

Рис. 12. Недифференцируемый колит. Повышение пролиферативной активности эпителия крипт. ИГХ исследование с Кл-67. Х200.

Рис. 13. Недифференцируемый колит. Немногочисленные макрофаги-гистиоциты в инфильтрате. ИГХ исследование с СЭ68. Х200.

Рис. 14. Минимальные неспецифические зменения. В-лимфоциты располагаются в верхних отделах собственной пластинки. ИГХ исследование с С079а. Х200.

Рис. 15. Язвенный колит. Назальный пламоцитоз. ИГХ исследование с С079а. Х200.

Рис. 16. Недифференцируемый колит. Немногочисленные тучные клетки в инфильтрате. ИГХ исследование с СЭ117. Х200.

Рис. 17. Минимальные неспецифические изменения. Скопление муцинофагов в собственной пластинке слизистой. Окраска Г+Э. Х400

Рис. 18. Минимальные неспецифические изменения. Скопление муцинофагов в собственной пластинке слизистой. Окраска РА8+АВ (рП2.5). Х400

Рис. 19. Язвенный колит. Повышение содержания тучных клеток в инфильтрате. ИГХ исследование с СБ117. Х600.

Рис. 20. Недифференцирумый колит. Немногочисленные тучные клетки в инфильтрате. ИГХ исследование с СВ117. Х600.

** ф 4 # < «» #

г

* >

» I I** £/

* * уь * I

А*' *

¿"Су

Р

* -т

ж.

$ ' */"*"> * * Ь

V

< I

л*

г» г

А * *

¿а

Г ~ т

#1

& I

1 *

«>• н •

V ** - *

т- « *

•л«*1 У/

Рис. 21. Язвенный колит. Высокое содержание Т-регуляторных лимфоцитов в инфильтрате. ИГХ исследование с РохРЗ. Х600.

Рис. 22. Недифференцируемый колит. Немногочисленные Т-регуляторные лимфоциты в инфильтрате. ИГХ исследование с ГохРЗ. Х600.

Рис. 23. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с БК. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Проба Eub (зеленое свечение). Х400. Определяется нарушение слизистого барьера и диффузная адгезия бактерий.

Рис. 24. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с некласссифицируемым колитом. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Проба Eub (зеленое свечение). Х400. Определяется нарушение слизистого барьера, очаговая адгезия и наличие внутриклеточных бактерий.

Рис. 25. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с НЯК. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Проба ВасЗОЗ (красное свечение). Докраска ядер DAPI (голубое свечение) Х400. Определяется нарушение слизистого барьера и адгезия в виде непрерывного слоя. Скопление лейкоцитов на поверхности.

V "

fife' *

Рис. 26. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с неклассифицируемым колитом. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Пробы ВасЗОЗ и Fprau . Х400. Определяется нарушение слизистого барьера и очаговая адгезия.

Рис. 27. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с другими вариантами колитов. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Проба Вас 303 (красное свечение) и Bif (желтое свечение). Х400. Определяется нарушение слизистого барьера и очаговая адгезия.

«

щ

1 » 'ft' #

щ

it

V ' 5

1.

1 fe

J V- • Я . ' *

Рис. 28. Микрофотография среза колонобиоптата ребенка с другими вариантами колитов. Гибридизация РНК in situ. Метод FISH. Проба Rbro (красное свечение) и Eub (зеленое свечение). Х400. Определяется нарушение слизистого барьера и очаговая адгезия.