Острый миелоидный лейкоз с перестройками гена КМТ2А у детей: прогностическое значение молекулярно-генетической характеристики и мониторинг минимальной остаточной болезни тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Лебедева Светлана Александровна

• Лебедева Светлана Александровна
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Лебедева Светлана Александровна

ВВЕДЕНИЕ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Структура и функции белка KMT2A

1.2 Перестройки гена KMT2A

1.2.1 Общие характеристики перестроек гена KMT2A

1.2.2 Нарушение регуляции транскрипции при перестройках KMT2A

1.2.3 Гены-партнеры KMT2A

1.2.3.1 Ген AFF1

1.2.3.2 Гены MLLT3 и MLLT1

1.2.3.3 Ген MLLT10

1.2.3.4 Ген ELL

1.2.3.5 Ген AFDN

1.2.3.6 Редкие гены-партнеры

1.3 Распространенность KMT2A-позитивных острых лейкозов

1.4 Иммунофенотипические особенности KMT2A--позитивных острых лейкозов37

1.5 Острый миелоидный лейкоз с перестройками гена KMT2A у детей

1.5.1 Характерные перестройки гена KMT2A при ОМЛ у детей

1.5.2 Прогностическое значение перестроек гена KMT2A при ОМЛ у детей

1.5.2.1 Прогностическое значение природы гена-партнера

1.5.2.2 Прогностическое значение локализации точки разрыва в гене KMT2A

1.5.2.3 Прогностическое значение влиянии дополнительных хромосомных аберраций

1.6 Мониторинг минимальной остаточной болезни при KMT2A--позитивных острых лейкозах

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1 Общая характеристика работы

2.2 Изучение молекулярно-генетических особенностей ОМЛ с перестройками гена КМТ2А у детей

2.2.1 Определение перестроек гена КМТ2А

2.2.2 Определение природы гена-партнера и локализации точки разрыва в ДНК гена КМТ2А

2.3 Оценка влияния структуры КМТ2А--химерного гена на показатели выживаемости у детей с ОМЛ

2.3.1 Обследование пациентов

2.3.2 Терапия пациентов с КМТ2А--позитивным ОМЛ по протоколу ОМЛ-МКО-2018

2.4 Определение минимальной остаточной болезни молекулярно-генетическими методами

2.5 Обработка данных и статистический анализ

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ

3.1 Общая характеристика пациентов

3.2 Молекулярно-генетические характеристики КМТ2А-позитивного ОМЛ у детей

3.2.1 Частота встречаемости различных генов-партнеров

3.2.2 Локализация точки разрыва в ДНК гена КМТ2А

3.2.3 Сопряженность локализации точки разрыва гена КМТ2А и природы гена-партнера

3.3 Прогностическое значение характера перестройки гена КМТ2А при ОМЛ у детей

3.3.1 Прогностическое значение природы гена-партнера

3.3.2 Прогностическое значение локализации точки разрыва гена КМТ2А

3.4 Сравнение молекулярно-генетических методов детекции МОБ у пациентов с различными вариантами перестроек гена КМТ2А

3.5 Алгоритм детекции перестроек гена КМТ2А и мониторинга минимальной остаточной болезни у пациентов с ОМЛ

Глава 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Приложение А

Приложение Б

Приложение В

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Острый миелоидный лейкоз с перестройками гена КМТ2А у детей: прогностическое значение молекулярно-генетической характеристики и мониторинг минимальной остаточной болезни»

ВВЕДЕНИЕ Актуальность темы исследования

Острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) - это гетерогенная группа гемобластозов, для которой характерна опухолевая трансформация и экспансия незрелых миелоидных клеток. На долю ОМЛ приходится 15-20% от всех острых лейкозов (ОЛ) детского возраста [138].

На сегодняшний день терапия ОМЛ остается трудной задачей не только в Российской Федерации, но и за рубежом. Развитие современных молекулярных методов в последние 10 лет позволило идентифицировать прогностическое значение ряда молекулярных характеристик, которые в настоящее время учитываются при стратификации на группы риска в дебюте заболевания, а также лежат в основе классификации ОМЛ Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) [142, 148]. Одним из наиболее частых генетических событий при ОМЛ у детей являются перестройки гена KMT2A (lysinemethyltransferase 2A, ранее MLL -mixed lineage leukemia) - частота встречаемости составляет 20-25% всех случаев ОМЛ у детей [47, 158]. Ген KMT2A кодирует фермент лизинметилтрансферазу 2А, который входит в состав крупного хроматин-модулирующего белкового комплекса, осуществляющего эпигенетический контроль экспрессии генов [134]. Белок KMT2A крайне важен для самообновления стволовых кроветворных клеток как в эмбриональном, так и в постнатальном гемопоэзе, а также играет важную роль в сегментации тела эмбриона у млекопитающих путем регулирования экспрессии генов группы Hox [24, 70, 104]. Перестройки данного гена представляют собой крайне гетерогенную группу и встречаются как при ОМЛ, так и при других вариантах ОЛ (острый лимфобластный - ОЛЛ, острый билинейный и бифенотипический лейкоз, вторичный ОЛ), причем при ОЛЛ данные перестройки чаще встречаются у детей первого года жизни [153, 158]. Пациенты с различными вариантами транслокаций с участием гена KMT2A в целом характеризуются

неблагоприятным прогнозом [47, 126, 169]. Тем не менее, в ряде исследований было показано, что прогноз может варьировать в зависимости от природы гена-партнера: от крайне неблагоприятного в случаях ОМЛ с транслокацией t(6;11)(q27;q23.3)/KMT2A::AFDN и t(10;11)(p12;q23.3)/KMT2A::MLLT10 до благоприятного в случаях ОМЛ с транслокацией t(9;11)(q21;q23.3)/KMT2A::MLLT3 и ^1;П)^21^23.3)/КМТ2А::М1ХТП [47, 118]. В других исследованиях было показано, что прогноз у пациентов с ОМЛ и ОЛЛ может зависеть от локализации точки разрыва (ТР) в гене КМТ2А. По результатам этих исследований наиболее прогностически неблагоприятными являются транслокации, при которых ТР находится в интроне 11 гена КМТ2А, вне зависимости от природы гена-партнера [4, 150]. Однако важно отметить, что указанные исследования включали в себя преимущественно пациентов с ОЛЛ (131 пациент из 176 в исследовании М. Emerenciano и соавторов [150] и 46 пациентов из 68 в исследовании Г.А. Цаура и соавторов [4]), причем в оба исследования не включались пациенты в возрасте старше 24 и 12 месяцев соответственно. Исходя из этого, очевидна необходимость всестороннего исследования прогностической значимости характера перестройки гена КМТ2А, включая локализацию ТР гена КМТ2А и природу гена-партнера.

Диагностика минимальной остаточной болезни (МОБ) также является крайне важным этапом, включенным в современные протоколы различными группами по лечению ОМЛ [44]. МОБ-статус позволяет спрогнозировать течение заболевания и выбрать оптимальную терапевтическую тактику, в том числе определяет наличие показаний к проведению трансплантации гемопоэтических стволовых клеток (ТГСК) в ранние сроки. Перестройки гена КМТ2А являются удобным маркером для мониторинга МОБ, однако с учетом гетерогенности этих перестроек в ряде случаев их детекция и определение МОБ рутинными молекулярно-генетическими методами могут быть затруднены [51, 55]. Соответственно, пациенты с КМТ2А-позитивным ОМЛ нуждаются в проведении комплексного и детального генетического обследования в дебюте заболевания и после завершения каждого из ключевых этапов терапии. По этой причине существует необходимость всестороннего исследования молекулярно-генетических особенностей КМТ2А-

позитивного ОМЛ у детей, а также сравнения различных молекулярно-генетических методов детекции МОБ у данной группы пациентов.

Степень разработанности темы исследования

В зарубежной литературе имеются противоречивые данные о влиянии природы гена-партнера, вовлеченного в транслокацию с участием гена КМТ2А, на прогноз общей и бессобытийной выживаемости у детей с ОМЛ [12, 52, 67, 69, 118, 120, 125]. Влияние локализации ТР гена КМТ2А на прогноз общей и бессобытийной выживаемости у детей с ОМЛ также недостаточно изучено и было проанализировано только в одном исследовании, включавшем в себя малое количество детей с КМТ2А--позитивным ОМЛ [150]. В Российской Федерации ранее оценка прогностического значения локализации ТР гена КМТ2А у детей с ОМЛ проводилась только на небольшой группе пациентов, причем в исследование включались исключительно пациенты первого года жизни. Прогностическое значение природы гена-партнера, вовлеченного в транслокацию с участием гена КМТ2А, в данном исследовании авторами не оценивалось [4]. Таким образом вопрос влияния характера перестройки гена КМТ2А на общую и бессобытийную выживаемость у детей с ОМЛ на сегодняшний день изучен недостаточно.

Кроме того, на сегодняшний день не существует единых рекомендаций как по методам определения перестроек гена КМТ2А и определения молекулярного МОБ-статуса, так и по клинической интерпретации полученных результатов у пациентов с КМТ2А-позитивным ОМЛ.

Цель исследования

Усовершенствование подходов к диагностике и лечению пациентов детского возраста с КМТ2А-позитивным ОМЛ с учетом структуры химерного КМТ2А-гена, включая локализацию точки разрыва и природу гена-партнера.

Задачи исследования

1. Охарактеризовать молекулярно-генетические особенности ОМЛ с перестройками гена КМТ2А у детей, включая природу гена-партнера, вовлеченного в транслокацию с участием гена КМТ2А.

2. Охарактеризовать молекулярно-генетические особенности ОМЛ с перестройками гена КМТ2А у детей, включая локализацию точки разрыва в гене КМТ2А.

3. Проанализировать значение природы гена-партнера, вовлеченного в транслокацию с участием гена КМТ2А, для показателей общей (ОВ) и бессобытийной выживаемости (БСВ) у детей с ОМЛ.

4. Проанализировать значение локализации точки разрыва гена КМТ2А для показателей ОВ и БСВ у детей с ОМЛ.

5. Оценить чувствительность различных молекулярно-генетических методов детекции МОБ у пациентов с перестройками гена КМТ2А.

6. Разработать алгоритм определения перестроек гена КМТ2А и мониторинга МОБ с использованием молекулярно-генетических методов у пациентов с ОМЛ.

Научная новизна

Впервые в Российской Федерации на большой группе были изучены молекулярно-генетические характеристики КМТ2А--позитивного ОМЛ у детей, включая частоту встречаемости и спектр перестроек гена КМТ2А. Была проведена оценка сопряженности между природой гена-партнера и локализацией точки разрыва в гене КМТ2А у детей в возрасте от 0 до 18 лет. Продемонстрировано отсутствие достоверной взаимосвязи между природой гена-партнера и локализацией точки разрыва в гене КМТ2А у данной группы пациентов. Впервые в Российской Федерации на большой группе пациентов детского возраста с КМТ2А-позитивным ОМЛ, получавших специфическую терапию согласно протоколу ОМЛ-МК0-2018, изучено влияние молекулярно-генетических характеристик, а

именно природы гена партнера и локализации точки разрыва в гене КМТ2А, на прогноз выживаемости.

Выполнено сравнение молекулярно-генетических методов мониторинга минимальной остаточной болезни у детей с КМТ2А--позитивным ОМЛ; продемонстрировано более высокое нормализованное число копий химерного транскрипта при использовании моноплексной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) в сравнении с мультиплексной ОТ-ПЦР.

Теоретическая и практическая значимость

В работе представлена подробная молекулярно-генетическая характеристика КМТ2А--позитивного ОМЛ у детей, включая частоту встречаемости и спектр генов-партнеров, а также локализацию точек разрыва в гене КМТ2А.

Доказано отсутствие значимой сопряженности между природой гена-партнера и локализацией ТР в гене КМТ2А.

Продемонстрировано, что характер перестройки гена КМТ2А (а именно природа гена-партнера и локализация ТР в гене КМТ2А) не имел достоверного значения для прогноза общей и бессобытийной выживаемости у детей с КМТ2А-позитивным ОМЛ.

Продемонстрировано, что моноплексная ОТ-ПЦР для детекции КМТ2А-химерных транскриптов характеризуется большей чувствительностью в сравнении с мультиплексной ОТ-ПЦР.

На основании результатов, полученных при проведении данной работы, разработан алгоритм определения перестроек гена КМТ2А и мониторинга МОБ с использованием молекулярно-генетических методов у детей с КМТ2А-позитивным ОМЛ.

Методология и методы исследования

Диссертационная работа выполнена на базе ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и

иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации (генеральный директор - д.м.н., профессор Грачев Н.С.).

Исследование носит ретроспективно-проспективный характер и состоит из трех основных частей. Каждая часть работы представляет собой полноценный этап исследования, под задачи которого сформированы группы пациентов. Всего в исследование включено 296 пациентов с ОМЛ с подтвержденной перестройкой гена КМТ2А в возрасте от 4 дней до 17,5 лет. Первая часть исследования посвящена изучению молекулярно-генетических особенностей ОМЛ с перестройками гена КМТ2А у детей, включая природу гена-партнера и локализацию ТР гена КМТ2А. Природа гена-партнера и локализация ТР в ДНК гена КМТ2А была определена у всей исследуемой когорты. В рамках первой части работы также проанализирована сопряженность природы гена-партнера и локализации ТР гена КМТ2А. Вторая часть исследования посвящена анализу влияния характера перестройки гена КМТ2А на показатели общей и бессобытийной выживаемости у детей с ОМЛ. По данным на январь 2025г. пациенты с перестройками гена КМТ2А составили 26,6% от всех пациентов, включенных в протокол ОМЛ-МЯ0-2018. Для второй части исследования было отобрано 116 пациентов, получавших терапию согласно протоколу ОМЛ-МЯО-2018, которым проводилась первичная диагностика в ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Минздрава Российской Федерации в период с июня 2018 г. по октябрь 2023 г.. Медиана времени наблюдения составила 2,5 года. Третья часть посвящена сравнению молекулярно-генетических методов детекции МОБ у пациентов с различными вариантами перестроек гена КМТ2А. Для третьей части исследования из общей когорты было отобрано 20 пациентов с известным характером перестройки гена КМТ2А, при этом определение экспрессии химерного транскрипта выполнено суммарно в 37 точках, из них 14 - исследование в инициальных точках, 23 - исследование в контрольных точках, предусмотренных протоколом лечения.

Необходимый комплекс лабораторных исследований выполнен в лаборатории цитогенетики и молекулярной генетики, а также клинико-

диагностической лаборатории, лаборатории иммунофенотипирования гемобластозов ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации.

Обработка результатов исследования проведена при помощи методов математической статистики. Полученные результаты систематизированы, изложены в 5 основных подглавах исследования, сформулированы выводы и практические рекомендации.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Перестройки гена KMT2A при ОМЛ у детей представляют собой значительную и крайне гетерогенную группу, что обусловлено широким спектром генов-партнеров и различной локализацией точки разрыва гена KMT2A. Диагностика перестроек гена KMT2A требует использования комплекса методов клинической лабораторной диагностики, включая стандартное цитогенетическое исследование, флуоресцентную гибридизацию in situ, различные варианты ПЦР и высокопроизводительного секвенирования.

2. Значения ОВ и БСВ у пациентов с KMT2A-позитивным ОМЛ достоверно не отличались в зависимости от природы гена-партнера. Пациенты с t(9;11)(p21;q23.3)/KMT2A::MLLT3 и пациенты с другими перестройками гена KMT2A характеризовались схожим прогнозом выживаемости.

3. Значения ОВ и БСВ у пациентов с локализацией ТР гена KMT2A в интроне 11 достоверно не отличались от значений ОВ и БСВ у пациентов с другими локализациями точки разрыва гена KMT2A.

4. Моноплексная ОТ-ПЦР является высокочувствительным методом детекции KMT2A химерных транскриптов и может быть использована для детекции МОБ у пациентов с KMT2A-позитивным ОМЛ.

Внедрение результатов в практику

Разработанный алгоритм детекции перестроек гена KMT2A используется в лаборатории цитогенетики и молекулярной генетики ФГБУ «НМИЦ ДГОИ имени Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации при диагностике пациентов с подозрением на наличие перестройки гена KMT2A. Данная лаборатория осуществляет референсную диагностику и молекулярный мониторинг пациентов с ОМЛ из 54 различных клиник Российской Федерации, что определяет выбор тактики терапии пациентов, включеннных в протокол ОМЛ-MRD-2018.

Основные положения и выводы диссертации используются в практике в клинических подразделениях ФГБУ «НМИЦ ДГОИ имени Дмитрия Рогачева» Министерства здравоохранения Российской Федерации и

онкологических/гематологических отделениях клиник Российской Федерации, включенных в протокол ОМЛ-MRD-2018.

Степень достоверности и апробация работы

Достоверность полученных результатов обусловлена значительным объемом выборки пациентов. Кроме того, достоверность полученных результатов и выводов обеспечена корректным выбором методов статистического анализа данных в соответствии с решаемыми задачами. Выводы, а также разработанные на их основании практические рекомендации логично следуют из результатов диссертационного исследования и соответствуют положениям, выносимым на защиту.

Результаты диссертационной работы доложены в ходе XVII Международной конференции «Актуальные вопросы детской онкологии, гематологии и иммунологии» (Беларусь, Минск, 2022) и представлены в виде постерного доклада в рамках конгресса Европейской ассоциации гематологов (European Hematology Association Congress) (Италия, Милан, 2025).

Материалы диссертации представлены в виде постерного доклада в рамках 5й Международной конференции Европейской школы гематологов (European School of Haematology 5th International Conference Acute Myeloid Leukemia "Molecular and Translational": Advances in Biology and Treatment) (Португалия, 2019), представлены в виде устного доклада в рамках VI Всероссийской научно-практической конференция с международным участием «Генетика опухолей кроветворной системы - от диагностики к терапии» (г.Санкт-Петербург, 2021), а также опубликованы в виде тезисов в рамках X Конгресса НОДГО «Актуальные проблемы и перспективы развития детской гематологии-онкологии в Российской Федерации» (г.Сочи, 2019) и в рамках Всероссийской научно-практической конференции с международным участием «Актуальные вопросы гематологии и трансфузиологии» (г.Санкт-Петербург, 2024).

Материалы и результаты диссертации опубликованы в 9 печатных работах, из них 4 статьи в журналах, входящих в перечень рецензируемых научных изданий, рекомендованных Высшей аттестационной комиссией при Министерстве науки и высшего образования Российской Федерации для публикации результатов диссертаций, 4 статьи в зарубежных журналах, индексируемых Scopus.

Личный вклад автора

Автором лично был проведен поиск и анализ литературных источников по теме диссертации. Совместно с научными руководителями были определены цель, задачи и методы исследования, разработана база данных для хранения и статистической обработки данных. Определен дизайн исследования, в соответствии с которым осуществлялось молекулярно-генетическое обследование пациентов, изучение данных анамнеза и результатов лабораторных исследований, оценка показателей ОВ и БСВ. Совместно с лабораторией цитогенетики и молекулярной генетики ФГБУ «Национальный медицинский исследовательский центр детской гематологии, онкологии и иммунологии им. Дмитрия Рогачева» Минздрава России проводился отбор и обработка образцов пациентов и анализ полученных молекулярно-генетических данных. Автором осуществлялась

координационная деятельность в составе кооперативной группы по лечению детей с ОМЛ в рамках протокола ОМЛ-МКО-2018. Лично автором выполнена статистическая обработка и анализ полученных результатов. Проанализированы результаты исследования, сформулированы выводы и практические рекомендации.

Структура и объем диссертации

Диссертационная работа написана на 135 страницах текста компьютерного набора и состоит из введения, обзора литературы, материалов и методов исследования, результатов исследования, заключения, выводов, практических рекомендаций, приложений и списка использованной литературы, включающего 172 источника: 161 зарубежный источник и 11 российских источников. Работа содержит 40 рисунков и 16 таблиц.

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1 Структура и функции белка KMT2A

Ген KMT2A (lysine methyltransferase 2A, ранее MLL - mixed lineage leukemia) расположен на длинном плече хромосомы 11 в регионе 11q23.3 и кодирует белок лизинметилтрансферазу 2А, принадлежащий к белковому семейству лизинметилтрансфераз 2 (KMT2). Ферменты этого семейства осуществляют моно, ди- и триметилирование лизина-4 гистона Н3, что сопряжено с активацией транскрипции генов [134]. Белок KMT2A входит в состав крупного хроматин-модулирующего белкового комплекса, осуществляющего эпигенетический контроль экспрессии генов. Впервые структура этого белка была описана в работах Tkachuk и соавторов и. Gu и соавторов [163, 165]. Он играет важную роль на ранних стадиях гемопоэза, а также в эмбриональном развитии, и активно экспрессируется в большом количестве различных тканей организма человека [101, 104, 155].

Белок KMT2A состоит из 3969 аминокислотных остатков и имеет сложную доменную структуру (Рисунок 1) [169]. N-концевая часть данного белка (KMT2A-N) содержит домен, связывающий белок Menin, выступающий адаптером между белком KMT2A и хроматин-связывающим белком LEDGF (lens epithelium-derived growth factor; фактор роста, выделяемый эпителием хрусталика). Белок LEDGF, в свою очередь, связывается с деметилированным остатком лизина-36 гистона H3. Связь KMT2A с комплексом Menin/LEDGF является критически важной для функционирования продукта как нормального, так и перестроенного аллеля KMT2A [84, 97, 161]. В исследовании Méreau и соавторов на мышиных моделях было показано, что малые белковые молекулы, идентичные различным частям LEDGF, могут нарушать взаимодействие LEDGF и KMT2A, в результате чего наблюдается снижение уровня экспрессии HoxA9, ингибирование клеточного роста и замедление развития острого лейкоза (ОЛ) in vivo [83].

KMT2A-N также содержит участок взаимодействия с малой бороздкой ДНК, SNL-1 и SNL-2 домены (speckled nuclear localization domains 1 and 2; домены локализации ядерных спеклов 1 и 2), а также два домена репрессии (RD1 и RD2), причем RD1 содержит CxxC домен [119, 165]. CxxC домен гомологичен ДНК-метилтрансферазе 1 (DNMT1), функцией которой является метилирование цитозиновых оснований ДНК [26, 57]. Все вышеперечисленные домены, как правило, входят в состав всех вариантов перестроенного белка KMT2A [171].

Средняя часть белка KMT2A содержит домен MCGBD (метил-CpG-связывающий домен) и четыре PHD домена (plant homeodomain; растительный гомеодомен). MCGBD является структурным элементом для связывания гистоновых деацетилаз [137]. PHD осуществляет распознавание метилирования остатка лизина-4 в гистоне H3 [30]. Третий PHD-палец позволяет KMT2A взаимодействовать с белком PPIE (peptidylprolyl isomerase E; пептидил-пролил изомераза Е), участвующим в отрицательной регуляции некоторых KMT2A-таргетных генов [30]. При связывании с белком PPIE PHD меняет свою структуру так, что MCGBD освобождается для взаимодействия с деацетилазами гистонов [105]. Таким образом, взаимодействие с PPIE переключает KMT2A-комплекс из состояния транскрипционного активатора в состояние транскрипционного репрессора. С-концевая часть содержит домен SET (Su(var)3-9, Enhancer-of-zeste and Trithorax), катализирующий ди- и триметилирование гистона H3 по остатку лизина-4, и домен активации транскрипции [105, 165, 171]. Перечисленные функциональные домены средней и С-концевой части KMT2A отсутствуют в большинстве KMT2A-химерных белков [171].

После трансляции неперестроенный KMT2A протеолитически расщепляется таспазой I на два фрагмента [79, 132]. N-концевой фрагмент, массой около 320 кДа, содержит все вышеперечисленные функциональные домены, кроме SET-домена и домена активации транскрипции, которые локализуются в C-концевом фрагменте KMT2A. В норме KMT2A-N и KMT2A-C взаимодействую между собой в качестве компонентов мультибелкового комплекса, регулирующего модификацию хроматина и экспрессию генов [132, 136].

BCR У" MBD AT SNL_—_J, X TAD SET

III III I IIIIII I ■■■■■ I *птгп

RD PHD PHD PHD BD PHD ^¡^ ^R^

В

MBD AT_SNL

III II 1 Фрагмент белка-партнера

RD

Рисунок 1 - Структура нормального и перестроенного белка KMT2A

A. Структура неперестроенного белка KMT2A. MBD - Menin-binding domain, домен, связывающий белок Menin; AT - АТ-крючок, ДНК-связывающий мотив; SNL -домен локализации ядерных спеклов; RD - домен репрессии; BCR - breakpoint cluster region, кластер точек разрыва; PHD - растительный гомеодомен; BD - бромодомен; CS1 и CS2 -сайты расщепления таспазы I; FYRN и FYRC - сайты взаимодействия KMT2A-N и KMT2A-C соответственно; TAD - трансактивационный домен; SET-домен, катализирующий ди- и триметилирование гистона H3 по остатку лизина-4. B. KMT2A-химерные белки образуются в результате хромосомных перестроек, приводящих к слиянию KMT2A-N и одного из генов-партнеров, что приводит к утрате PHD, TAD и SET-доменов. С. Белки, взаимодействующие с KMT2A. Белки, участвующие в отрицательной регуляции транскрипции (регулируемые PPIE), сгруппированы над изображением KMT2A; белки, участвующие в положительной регуляции транскрипции, сгруппированы под изображением KMT2A. Схема дана по A. Winters et al. [169].

Другими важными белками, составляющими ядро KMT2A-комплекса, являются белки RBBP5 (Retinoblastoma-Binding Protein 5; ретинобластома-связывающий протеин 5), ASH2L (Absent, Small, Or Homeotic)-Like) и WDR5 (WD Repeat Domain 5; домен WD повторов 5) [136]. Эти три белка взаимодействуют с большим количеством различных метилтрансфераз, содержащих SET-домен, в том числе KMT2A. Согласно результатам биохимического и структурного анализа,

гетеродимер RBBP5-ASH2L, связываясь с KMT2A, стабилизирует последний в его каталитической конформации, тогда как WDR5 выступает в роли адаптера между KMT2A и гетеродимером RBBP5-ASH2L [146].

Белок KMT2A крайне важен для самообновления стволовой кроветворной клетки как в эмбриональном, так и в постнатальном гемопоэзе, поскольку он является центральным звеном целого комплекса транскрипционных факторов и других ядерных белков [104]. Помимо этого, KMT2A участвует в регулировании экспрессии генов группы HOX, что играет крайне важную роль в сегментации тела эмбриона у млекопитающих. Было показано, что гетерозиготная делеция KMT2A приводит к нарушению сегментации у мышиного эмбриона в сочетании со снижением количества тромбоцитов и концентрации гемоглобина. В свою очередь гомозиготная делеция KMT2A приводит к резкому снижению либо полному угнетению экспрессии генов группы Hox и гибели мышиного эмбриона на стадии E10.5-E12.5, что свидетельствует о критически важной роли белка KMT2A в эмбриогенезе [24, 70].

1.2 Перестройки гена KMT2A 1.2.1 Общие характеристики перестроек гена KMT2A

Хромосомные транслокации гена KMT2A чаще всего происходят с разрывом в небольшом регионе протяженностью около 10 т.п.н. — так называемом главном кластере точек разрыва (КТР).

Данный КТР охватывает регион между интроном 7 и экзоном 14 включительно [29, 158, 169]. Чаще всего ТР локализуется в регионе между интроном 9 и интроном 10 [158]. В структуре белка это соответствует области между доменами MCGBD и PHD вблизи домена PHD. Несколько реже перестройки KMT2A происходят с разрывом в регионах между интроном 7 и экзон 8 и между интроном 11 и экзоном 13 [158]. Кроме того, существует дополнительный минорный КТР, захватывающий регион между интроном 20 и экзоном 24 (Рисунок 2). Согласно имеющимся литературным данным, перестройки гена KMT2A с

разрывом в минорном КТР значительно чаще встречаются при ОЛЛ, при этом ТР в гене KMT2A чаще локализуется в регионе между интроном 21 и интроном 23 [158]. Примечательно, что в большинстве случаев разрыв гена KMT2A в минорном КТР сопряжен с образованием химерного транскрипта KMT2A::USP2 [80, 158].

Рисунок 2 - Распределение локализаций точек разрыва в гене KMT2A.

А: Структура гена KMT2A (КМ_001412597.1). Главный КТР обозначен зеленым цветом, минорный КТР обозначен красным цветом; Б: абсолютное количество пациентов с ОМЛ с различной локализацией точек разрыва, отображается в логарифмической шкале (п = 1116); В: абсолютное количество всех проанализированных пациентов (п = 3401). Регионы наиболее частой локализации точек разрыва в каждом КТР обозначены более темными цветами (главный КТР - регион с интрона 9 до интрона 11; минорный КТР -регион с интрона 21 до интрона 23). Схема дана по С.Meyer et al. [158].

Механизмы лейкозогенной трансформации при перестройках гена KMT2A активно изучаются. Предположительно, основную роль в лейкозогенной трансформации играет прямой химерный ген, содержащий 5'-часть гена KMT2A и З'-часть гена-партнера. Так, было показано, что КМТ2А-К в составе химерных белков теряет свою способность взаимодействовать с КМТ2А-С [132]. В условиях разобщения они оба переходят в конститутивно-активное состояние. К-концевая часть белка сохраняет способность связываться с ДНК и привлекать к

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Лебедева Светлана Александровна, 2025 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Воротников, А. В. Хемотаксис: движение, напраление, управление / А. В. Воротников // Успехи биологической химии. - 2011. - Т. 51. - С. 335-400.

2. Иммунофенотипическая характеристика острого лимфобластного лейкоза у детей первого года жизни / А. М. Попов, Г. А. Цаур, Т. Ю. Вержбицкая [и др.] // Онкогематология. - 2012. - Т. 2. - С. 14-21.

3. Мониторинг минимальной остаточной болезни при остром миелоидном лейкозе с перестройками гена KMT2A: сравнение методов мультиплексной и моноплексной ОТ-ПЦР в режиме реального времени / С. А. Лебедева, А. Н. Борковская, Э. Р. Дадаханова [и др.] // Гематология. Трансфузиология. Восточная Европа. - 2023. - Т. 9. - № 1. - С. 35-45.

4. Острые лейкозы у детей первого года жизни: прогностическое значение локализации точки разрыва в ДНК гена MLL / Г. А. Цаур, К. Мейер, Т. О. Ригер [и др.] // Клиническая онкогематология. - 2016. - Т. 9. - № 1. - С. 22-29.

5. Прогностическое значение природы гена-партнера и локализации точки разрыва у детей с KMT2A-позитивным острым миелоидным лейкозом / С. А. Лебедева, И. И. Калинина, А. Н. Казакова [и др.] // Вопросы гематологии/онкологии и иммунопатологии в педиатрии. - 2025. - Т. 24. - № 1. -С. 58-65.

6. Смена линейной дифференцировки в рецидиве острого лейкоза с перестройкой гена MLL (KMT2A). Обзор литературы и описание случаев. / Е. А. Зеркаленкова, О. И. Илларионова, А. Н. Казакова [и др.] // Онкогематология. -2016. - Т. 11. - № 2. - С. 21-29.

7. Analysis of prognostic factors of acute lymphoblastic leukemia in infants: report on CCG 1953 from the Children's Oncology Group / J. M. Hilden, P. A. Dinndorf, S. O. Meerbaum [и др.] // Blood. - 2016. - Т. 108. - № 2. - С. 441-451.

8. A carboxy-terminal domain of ELL is required and sufficient for immortalization of myeloid progenitors by MLL-ELL / J. F. Dimartino, T. Miller, P. M. Ayton [et al.] // Blood. - 2000. - Vol. 96. - № 12. - P. 3887-3893.

9. A case of lineage switch from acute lymphoblastic leukemia to acute myeloid leukemia. / H. J. Chung, C. J. Park, S. Jang [et al.] // The Korean journal of laboratory medicine. - 2007. - Vol. 27. - № 2. - P. 102-105.

10. A higher-order complex containing AF4- and ENL-family proteins with P-TEFb facilitates oncogenic and physiologic MLL-dependent transcription / A. Yokoyama, M. Lin, A. Naresh [et al.] // Cancer Cell. - 2010. - Vol. 17. - № 2. - P. 198-212.

11. A role for the MLL fusion partner ENL in transcriptional elongation and chromatin modification / D. Mueller, C. Bach, D. Zeisig [et al.] // Blood. - 2007. -Vol. 110. - № 13. - P. 4445-4455.

12. Abnormalities of chromosome band 11q23 and the MLL gene in pediatric myelomonocytic and monoblastic leukemias. Identification of the t(9;11) as an indicator of long survival. / J. A. Martinez-Climent, R. 3rd. Espinosa, M. J. Thirman [et al.] // Journal of Pediatric Hematology/Oncology. - 1995. - Vol. 17. - № 4. - P. 277-283.

13. Accurate and efficient detection of gene fusions from RNA sequencing data / S. Uhrig, J. Ellermann, T. Walther [et al.] // Genome Research. - 2021. - Vol. 31. - № 3. -P. 448-460.

14. Acute leukemias harboring KMT2A/MLLT10 fusion: a 10-year experience from a single genomics laboratory / J. F. Peterson, W. R. Sukov, B. A. Pitel [et al.] // Genes, Chromosomes and Cancer. - 2019. - Vol. 58. - № 8. - P. 567-577.

15. Acute myeloid leukemia with 11q23 translocations: myelomonocytic immunophenotype by multiparameter flow cytometry / M. R. Baer, C. C. Stewart, D. Lawrence [et al.] // Leukemia. - 1998. - Vol. 12. - № 3. - P. 317-325.

16. Acute myeloid leukemia with t(10;11)(p11-12;q23.3): Results of Russian Pediatric AML registration study / E. A. Zerkalenkova, S. A. Lebedeva, A. N. Kazakova [et al.] // International Journal of Laboratory Hematology. - 2019. - Vol. 41. - № 2. - P. 287-292.

17. AF-6 controls integrin-mediated cell adhesion by regulating Rap1 activation through the specific recruitment of Rap1GTP and SPA-1 / L. Su, M. Hattori, M. Moriyama [et al.] // The Journal of Biological Chemistry. - 2003. - Vol. 278. - № 17. -P. 15232-15238.

18. AF10 regulates progressive H3K79 methylation and HOX gene expression in diverse AML subtypes / A. J. Deshpande, A. Deshpande, A. U. Sinha [et al.] // Cancer Cell. - 2014. - Vol. 26. - № 6. - P. 896-908.

19. AF4 uses the SL1 components of RNAP1 machinery to initiate MLL fusion- and AEP-dependent transcription / H. Okuda, A. Kanai, S. Ito [et al.] // Nature Communications. - 2015. - Vol. 6. - № 8869. - P. 1-12.

20. AF9 YEATS domain links histone acetylation to DOT1L-mediated H3K79 methylation / Y. Li, H. Wen, Y. Xi [et al.] // Cell. - 2012. - Vol. 159. - № 3. - P. 558571.

21. AFF1 acetylation by p300 temporally inhibits transcription during genotoxic stress response / N. Kumari, M. A. Hassan, X. Lu [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2019. - Vol. 116. - № 44. -P. 22140-22151.

22. AFF4, a component of the ELL/p-TEFb elongation complex and a shared subunit of MLL chimeras can link transcription elongation to leukemia / C. Lin, E. R. Smith, H. Takahashi [et al.] // Molecular Cell. - 2010. - Vol. 37. - № 3. - P. 429-437.

23. Aldoss, I. Extramedullary relapse of KMT2A (MLL)-rearranged acute lymphoblastic leukemia with lineage switch following blinatumomab / I. Aldoss, J. Y. Song // Blood. - 2018. - Vol. 131. - № 22. - P. 2507-2507.

24. Altered Hox expression and segmental identity in Mll-mutant mice / B. D. Yu, J. L. Hess, S. E. Horning [et al.] // Nature. - 1995. - Vol. 378. - № 6556. - P. 505-508.

25. An Mll-AF9 fusion gene made by homologous recombination causes acute leukemia in chimeric mice: a method to create Fusion Oncogenes / J. Corral, I. Lavenir, H. Impey [et al.] // Cell. - 1997. - Vol. 85. - № 6. - P. 853-861.

26. Analysis of the murine All-1 gene reveals conserved domains with human ALL-1 and identifies a motif shared with DNA methyltransferases. / Q. Ma, H. Alder, K. K. Nelson [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1993. - Vol. 90. - № 13. - P. 6350-6354.

27. Basic local alignment search tool. / S. F. Altschul, W. Gish, W. Miller [et al.] // Journal of molecular biology. - 1990. - Vol. 215. - № 3. - P. 403-410.

28. BCR and its mutants, the reciprocal t(9;22)-associated ABL/BCR fusion proteins, differentially regulate the cytoskeleton and cell motility. / X. Zheng, S. Guller, T. Beissert [et al.] // BMC cancer. - 2006. - Vol. 6. - P. 262.

29. Biased distribution of chromosomal breakpoints involving the MLL gene in infants versus children and adults with t(4;11) ALL / M. Reichel, E. Gillert, S. Angermuller [et al.] // Oncogene. - 2001. - Vol. 20. - № 23. - P. 2900-2907.

30. Binding of the MLL PHD3 finger to histone H3K4me3 is required for MLL-dependent gene transcription / P. Chang, R. . Hom, C. A. Musselman [et al.] // Journal of molecular biology. - 2010. - Vol. 400. - № 2. - P. 137-144.

31. Bitoun, E. The mixed-lineage leukemia fusion partner AF4 stimulates RNA polymerase II transcriptional elongation and mediates coordinated chromatin remodeling / E. Bitoun, P. L. Oliver, K. E. Davies // Human Molecular Genetics. -2007. - Vol. 16. - № 1. - P. 92-106.

32. Blinatumomab-induced lineage switch of B-ALL with t(4:11)(q21;q23) KMT2A/AFF1 into an aggressive AML: pre- and post-switch phenotypic, cytogenetic and molecular analysis / C. L. Haddox, A. A. Mangaonkar, D. Chen [et al.] // Blood Cancer Journal. - 2017. - Vol. 7. - № 9. - P. e607.

33. Breakpoint heterogeneity in t(10;11) translocation in AML-M4/M5 resulting in fusion of AF10 and MLL is resolved by fluorescent in situ hybridization analysis / H. B. Beverloo, M. Le Coniai, J. Wijsman [et al.] // Cancer Research. - 1995. - Vol. 55. -

№ 19. - P. 4220-4224.

34. BTK, NUTM2A, and PRPF19 Are Novel KMT2A Partner Genes in Childhood Acute Leukemia. / E. A. Zerkalenkova, S. A. Lebedeva, A. N. Borkovskaia [et al.] // Biomedicines. - 2021. - Vol. 9. - № 924. - P. 4-13.

35. Candoni, A. A 2024 update on menin inhibitors. A new class of target agents against KMT2A-rearranged and NPM1-mutated acute myeloid leukemia / A. Candoni, G. Coppola // Hematology Reports. - 2024. - Vol. 16. - № 2. - P. 244-254.

36. CBX8, a polycomb group protein, is essential for MLL-AF9-induced leukemogenesis / J. Tan, M. Jones, H. Koseki [et al.] // Cancer Cell. - 2011. - Vol. 20. - № 5. - P. 563-575.

37. Ceccacci, E. Inhibition of histone deacetylases in cancer therapy: lessons from leukaemia / E. Ceccacci, S. Minucci // British Journal of Cancer. - 2016. - Vol. 114. -№ 6. - P. 605-611.

38. Children's Oncology Group's 2013 blueprint for research: acute myeloid leukemia / A. S. Gamis, T. A. Alonzo, J. P. Perentesis [et al.] // Pediatric Blood and Cancer. - 2013. - Vol. 60. - № 6. - P. 964-971.

39. Chromosomal abnormalities in 478 children with acute myeloid leukemia: clinical characteristics and treatment outcome in a cooperative pediatric oncology group study—POG 8821 / B. S. C. Raimondi, M. N. Chang, Y. Ravindranath [et al.] // Blood.

- 1999. - Vol. 94. - № 11. - P. 3707-3717.

40. Chrun, E. S. Histone modifications: a review about the presence of this epigenetic phenomenon in carcinogenesis / E. S. Chrun, F. Modolo, F. I. Daniele // Pathology -Research and Practice. - 2017. - Vol. 211. - № 7. - P. 1329-1339.

41. Cloning of ELL, a gene that fuses to MLL in a t(11;19)(q23;p13.1) in acute myeloid leukemia. / M. J. Thirman, D. A. Levitan, H. Kobayashi [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1994. -

Vol. 91. - № 25. - P. 12110-4.

42. Cloning of several species of MLL/MEN chimeric cDNAs in myeloid leukemia with t(11;19)(q23;p13.1) translocation / K. Mitani, Y. Kanda, S. Ogawa [et al.] // Blood.

- 1995. - Vol. 85. - № 8. - P. 2017-2024.

43. Cloning of the ALL-1 fusion partner, the AF-6 gene, involved in acute myeloid leukemias with the t(6;11) chromosome translocation / R. Prasad, Y. Gu, H. Alder [et al.] // Cancer Research. - 1993. - Vol. 53. - № 23. - P. 5624-5628.

44. Comparative analysis of different approaches to measure treatment response in acute myeloid leukemia / H. Inaba, E. Coustan-Smith, X. Cao [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2012. - Vol. 30. - № 29. - P. 3625-3632.

45. Comparison of minimal residual disease measurement by multicolour flow cytometry and PCR for fusion gene transcripts in infants with acute lymphoblastic leukaemia with KMT2A gene rearrangements / A. Popov, G. Tsaur, T. Verzhbitskaya [et al.] // British Journal of Haematology. - 2023. - Vol. 201. - № 3. - P. 510-519.

46. Complete genomic structure, DNA Polymorphisms, and alternative splicing of the human AF-6 gene / S. Saito, M. Matsushima, S. Shirahama, T. Minaguchi // DNA Research. - 1998. - Vol. 5. - № 2. - P. 115-120.

47. Conneely, S. . Acute myeloid leukemia in children: emerging paradigms in genetics and new approaches to therapy / S. . Conneely, A. . Stevens // Current Oncology Reports. - 2021. - Vol. 23. - № 2. - P. 1-13.

48. Consistent deregulation of gene expression between human and murine MLL-rearrangement leukemias / Z. Li, R. T. Luo, S. Mi [et al.] // Cancer Research. - 2009. -Vol. 69. - № 3. - P. 1109-1116.

49. Cowell, I. G. DNA fragility at the KMT2A / MLL locus: insights from old and new technologies / I. G. Cowell, C. A. Austin // Open Biology. - 2023. - Vol. 13. -№ 1. - P. 1-9.

50. Cytogenetic abnormalities, WHO classification, and evolution of children and adolescents with acute myeloid leukemia / A. L. Nunes, C. A. Paes, M. Murao [et al.] // Hematology, Transfusion and Cell Therapy. - 2019. - Vol. 41. - № 3. - P. 236-243.

51. Cytogenetic and molecular genetic methods for chromosomal translocations detection with reference to the KMT2A/MLL gene / N. Lomov, E. Zerkalenkova, S. Lebedeva [et al.] // Critical Reviews in Clinical Laboratory Sciences. - 2021. - Vol. 58. - № 3. - P. 180-206.

52. Cytogenetics of Childhood Acute Myeloid Leukemia: United Kingdom Medical Research Council Treatment Trials AML 10 and 12 / C. О. Harrison, R. K. Hills, A. V Moorman [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2010. - Vol. 28. - № 16. - P. 26742681.

53. Detection of acute leukemia cells with mixed lineage leukemia (MLL) gene rearrangements by flow cytometry using monoclonal antibody 7.1 / C. Wuchter, J. Harbott, C. Schoch [et al.] // Leukemia. - 2000. - Vol. 14. - № 7. - P. 1232-1238.

54. Diagnosis and management of AML in adults: 2022 recommendations from an international expert panel on behalf of the ELN / H. Döhner, A. H. Wei, F. R. Appelbaum [et al.] // Blood. - 2022. - Vol. 140. - № 12. - P. 1345-1377.

55. Diagnostic tool for the identification of MLL rearrangements including unknown

partner genes. / C. Meyer, B. Schneider, M. Reichel [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2005. - Vol. 102. -№ 2. - P. 449-54.

56. Dimerization contributes to oncogenic activation of MLL chimeras in acute leukemias / C. W. So, M. Lin, P. M. Ayton [et al.] // Cancer Cell. - 2003. - Vol. 4. -№ 22. - P. 99-110.

57. DNA methyltransferase Dnmt1 associates with histone deacetylase activity / F. Fuks, W. A. Burgers, A. Brehm [et al.] // Nature Genetics. - 2000. - Vol. 24. - № 1. -P. 88-91.

58. DOT1L-controlled cell-fate determination and transcription elongation are independent of H3K79 methylation / K. Cao, M. Ugarenko, P. A. Ozark [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. -2020. - Vol. 117. - № 44. - P. 27365-27373.

59. DOT1L complex regulates transcriptional initiation in human erythroleukemic cells / A. Wu, J. Zhi, T. Tian [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2021. - Vol. 118. - № 27. - P. 1-10.

60. EAF1, a novel ELL-associated factor that is delocalized by expression of the MLL-ELL fusion protein / F. Simone, P. E. Polak, J. J. Kaberlein [et al.] // Blood. -2001. - Vol. 96. - № 1. - P. 201-209.

61. Elgarten, C. W. Pediatric acute myeloid leukemia: updates on biology, risk stratification, and therapy / C. W. Elgarten, R. Aplenc // Current Opinion in Pediatrics. - 2020. - Vol. 32. - № 1. - P. 57-66.

62. ELL-associated factor 2 (EAF2), a functional homolog of EAF1 with alternative ELL binding properties / F. Simone, R. T. Luo, P. E. Polak [et al.] // Blood. - 2003. -Vol. 101. - № 6. - P. 2355-2362.

63. Evaluation of candidate control genes for diagnosis and residual disease detection in leukemic patients using "real-time" quantitative reverse-transcriptase polymerase chain reaction (RQ-PCR) - a Europe against cancer program. / E. Beillard, N. Pallisgaard, V. H. J. van der Velden [et al.] // Leukemia. - 2003. - Vol. 17. - № 12. -P. 2474-2486.

64. Evidence-based RT-PCR methods for the detection of the 8 most common MLL aberrations in acute leukemias / T. Burmeister, C. Meyer, D. Gröger [et al.] // Leukemia Research. - 2015. - Vol. 39. - № 2. - P. 242-247.

65. Evolution of AF6-RAS association and its implications in mixed-lineage leukemia / M. J. Smith, E. Ottoni, N. Ishiyama [et al.] // Nature Communications. -2017. - Vol. 8. - № 1. - P. 1-13.

66. Expression profiles of acute lymphoblastic and myeloblastic leukemias with ALL-1 rearrangements. / T. Rozovskaia, O. Ravid-Amir, S. Tillib [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2003. -

Vol. 100. - № 13. - P. 7853-7858.

67. Favorable impact of the t(9;11) in childhood acute myeloid leukemia / J. E. Rubnitz, S. C. Raimondi, X. Tong [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2002. -Vol. 20. - № 9. - P. 2302-2309.

68. FISH analysis of MLL gene rearrangements: detection of the concurrent loss or gain of the 3' signal and its prognostic significance / J. H. Lim, S. Jang, C. J. Park [et al.] // International Journal of Laboratory Hematology. - 2014. - Vol. 36. - № 5. -

P. 571-579.

69. Gemtuzumab Ozogamicin improves event-free survival and reduces relapse in pediatric KMT2A-rearranged AML: results from the phase III Children's Oncology Group trial AAML0531 / J. A. Pollard, E. Guest, T. A. Alonzo [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2021. - Vol. 39. - № 28. - P. 3149-3160.

70. Growth disturbance in fetal liver hematopoiesis of Mll-mutant mice. / H. Yagi, K. Deguchi, A. Aono [et al.] // Blood. - 1998. - Vol. 92. - № 1. - P. 108-117.

71. HDAC5 and HDAC9 in medulloblastoma: novel markers for risk stratification and role in tumor cell growth / T. Milde, I. Oehme, A. Korshunov [et al.] // Clinical Cancer Research. - 2010. - Vol. 16. - № 12. - P. 3240-3252.

72. hDOT1L links histone methylation to leukemogenesis / Y. Okada, Q. Feng, Y. Lin [et al.] // Cell. - 2005. - Vol. 121. - № 5. - P. 167-178.

73. Hemenway, C. S. The polycomb protein MPc3 interacts with AF9, an MLL fusion partner in t(9;11)(p22;q23) acute leukemias / C. S. Hemenway, A. C. de Erkenez,

G. C. D. Gould // Oncogene. - 2001. - Vol. 20. - № 29. - P. 3798-3805.

74. High prognostic impact of flow cytometric minimal residual disease detection in acute myeloid leukemia: data from the HOVON/SAKK AML 42A Study / M. Terwijn, W. L. J. Van Putten, T. Pabst [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2013. - Vol. 31.

- № 31. - P. 3889-3897.

75. Histone deacetylase 9 regulates breast cancer cell proliferation and the response to histone deacetylase inhibitors / M. Lapierre, A. Linares, M. Dalvai [et al.] // Oncotarget. - 2016. - Vol. 7. - № 15. - P. 19693-19708.

76. Histone demethylation mediated by the nuclear amine oxidase homolog LSD1 / Y. Shi, F. Lan, C. Matson [et al.] // Cell. - 2004. - Vol. 119. - № 7. - P. 941-953.

77. Hoxa9 transforms primary bone marrow cells through specific collaboration with Meis1a but not Pbx1b / E. Kroon, J. Krosl, U. Thorsteinsdottir [et al.] // The EMBO Journal. - 1998. - Vol. 17. - № 13. - P. 3714-3725.

78. Hrusak, O. Antigen expression patterns reflecting genotype of acute leukemias / O. Hrusak, A. Porwit-MacDonald // Leukemia. - 2002. - Vol. 16. - № 7. - P. 12331258.

79. Hsieh, J. J. D. Taspase1: A threonine aspartase required for cleavage of MLL and proper HOX gene expression / J. J. D. Hsieh, E. H. Y. Cheng, S. J. Korsmeyer // Cell. -2003. - Vol. 115. - № 3. - P. 293-303.

80. Human MLL/KMT2A gene exhibits a second breakpoint cluster region for recurrent MLL-USP2 fusions / C. Meyer, B. A. Lopes, A. Caye-Eude [et al.] // Leukemia. - 2019. - Vol. 32. - № 9. - P. 2306-2340.

81. Identification of a chromosomal breakpoint and detection of a novel form of an MLL-AF17 fusion transcript in acute monocytic leukemia with t(11;17)(q23;q21) / K. Suzukawa, S. Shimizu, N. Nemoto [et al.] // International Journal of Hematology. -2005. - Vol. 82. - № 1. - P. 38-41.

82. Identification of CD34+ and CD34- leukemia-initiating cells in MLL-rearranged human acute lymphoblastic leukemia / Y. Aoki, T. Watanabe, Y. Saito [et al.] // Blood.

- 2015. - Vol. 125. - № 6. - P. 967-980.

83. Impairing MLL-fusion gene-mediated transformation by dissecting critical

interactions with the lens epithelium-derived growth factor (LEDGF/p75) / H. Mereau, J. D. Rijck, A. Kutz [et al.] // Leukemia. - 2013. - Vol. 27. - № 6. - P. 1245-1253.

84. Interaction of MLL amino terminal sequences with menin is required for transformation / C. Caslini, Z. Yang, M. El-Osta [et al.] // Cancer Research. - 2007. -Vol. 67. - № 15. - P. 7275-7283.

85. Jansen, M. W. Efficient and easy detection of MLL-AF4, MLL-AF9 and MLL-ENL fusion gene transcripts by multiplex real-time quantitative RT-PCR in TaqMan and LightCycler / M. W. Jansen, V. H. van der Velden, J. J. van Dongen // Leukemia. -2005. - Vol. 19. - № 11. - P. 2016-2018.

86. Jorgensen, J. L. Monitoring of minimal residual disease in acute myeloid leukemia: methods and best applications / J. L. Jorgensen, S. S. Chen // Clinical Lymphoma, Myeloma and Leukemia. - 2011. - Vol. 11. - № S1. - P. S49-53.

87. Krivtsov, A. V. MLL translocations, histone modifications and leukaemia stem-cell development / A. V. Krivtsov, S. A. Armstrong // Nature Reviews Cancer. - 2007.

- Vol. 7. - № 11. - P. 823-833.

88. Lack of expression of the chondroitin sulphate proteoglycan neuron-glial antigen 2 on candidate stem cell populations in paediatric acute myeloid leukaemia/abn(11q23) and acute lymphoblastic leukaemia/t(4;11) / J. Neudenberger, M. Hotfilder, A. Rosemann [et al.] // British Journal of Haematology. - 2006. - Vol. 133. - № 3. -

P. 337-344.

89. Leukemic transformation by the MLL-AF6 fusion oncogene requires the / A. J. Deshpande, L. Chen, M. Fazio [et al.] // Blood. - 2013. - Vol. 121. - № 13. - P. 25332542.

90. Leukemic transformation of hematopoietic progenitors by MLL-GAS7 in the absence of Hoxa7 or Hoxa9 / C. W. So, H. Karsunky, P. Wong [et al.] // Blood. - 2004.

- Vol. 103. - № 8. - P. 3192-3200.

91. Li, Q. AF4 encodes a ubiquitous protein that in both native and MLL-AF4 fusion types localizes to subnuclear compartments / Q. Li, J. L. Frestedt, J. H. Kersey // Blood.

- 2018. - Vol. 92. - № 10. - P. 3841-3847.

92. Lineage switch from B acute lymphoblastic leukemia to acute monocytic

leukemia with persistent t(4;11)(q21;q23) and cytogenetic evolution under CD19-targeted therapy / E. Balducci, V. Nivaggioni, J. Boudjarane [et al.] // Annals of Hematology. - 2017. - Vol. 96. - № 9. - P. 1579-1581.

93. Ma, C. LAF-4 encodes a lymphoid nuclear protein with transactivation potential that is homologous to AF-4, the gene fused to MLL in t(4; 11) leukemias / C. Ma, M. Staudt // Blood. - 1996. - Vol. 87. - № 2. - P. 734-745.

94. Marschalek, R. Systematic Classification of Mixed-Lineage Leukemia Fusion Partners Predicts Additional Cancer Pathways / R. Marschalek // Annals of Laboratory Medicine. - 2016. - Vol. 36. - № 2. - P. 85-100.

95. Meis1 is an essential and rate-limiting regulator of MLL leukemia stem cell potential / P. Wong, M. Iwasaki, T. C. P. Somervaille [et al.] // Genes and Development. - 2007. - Vol. 21. - № 22. - P. 2762-2774.

96. Menendez, P. Expression of NG2 antigen in MLL-rearranged acute leukemias: How complex does it get? / P. Menendez, C. Bueno // Leukemia Research. - 2011. -Vol. 35. - № 8. - P. 989-990.

97. Menin and MLL cooperatively regulate expression of cyclin-dependent kinase inhibitors. / T. A. Milne, C. M. Hughes, R. Lloyd [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2005. - Vol. 102. - № 3. -

P. 749-54.

98. Meyer, C. Leukemia Methods and Protocols / C. Meyer, R. Marschalek; ed. C. W. E. So. - Humana Totowa, NJ, 2009. - 71-83 p.

99. Microenvironment determines lineage fate in a human model of MLL-AF9 leukemia / J. Wei, M. Wunderlich, C. Fox [et al.] // Cancer Cell. - 2009. - Vol. 13. -№ 6. - P. 483-495.

100. Minimal/measurable residual disease in AML: a consensus document from the European LeukemiaNet MRD Working Party / F. Buccisano, J. Cloos, G. J. Schuurhuis [et al.] // Blood. - 2018. - Vol. 131. - № 12. - P. 1275-1291.

101. Misguided Transcriptional Elongation Causes Mixed Lineage Leukemia / D. Mueller, M. P. Garcia-Cuellar, C. Bach [et al.] // PLoS Biology. - 2009. - Vol. 7. -№ 11.

102. MLL-AF6 fusion oncogene sequesters AF6 into the nucleus to trigger RAS activation in myeloid leukemia / E. Manara, E. Baron, C. Tregnago [et al.] // Blood. -2014. - Vol. 124. - № 2. - P. 263-272.

103. MLL-AF9-induced leukemogenesis requires coexpression of the wild-type Mll allele / A. T. Thiel, P. Blessington, T. Zou [et al.] // Cancer Cell. - 2010. - Vol. 17. -№ 2. - P. 148-159.

104. Mll has a critical role in fetal and adult hematopoietic stem cell self-renewal / K. A. Mcmahon, S. Y. Hiew, S. Hadjur [et al.] // Cell Stem Cell. - 2007. - Vol. 1. - № 3. -P. 338-345.

105. MLL repression domain interacts with histone deacetylases, the polycomb group proteins HPC2 and BMI-1, and the corepressor C-terminal-binding protein / Z. Xia, M. Anderson, M. O. Diaz, N. J. Zeleznik-Le // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2003. - Vol. 100. - № 14. - P. 8342-8347.

106. MLL translocations specify a distinct gene expression profile that distinguishes a unique leukemia / S. A. Armstrong, J. E. Staunton, L. B. Silverman [et al.] // Nature Genetics. - 2002. - Vol. 30. - № 1. - P. 41-47.

107. MLLT3 regulates early human erythroid and megakaryocytic cell fate / C. Pina, G. May, S. Soneji [et al.] // Cell Stem Cell. - 2008. - Vol. 2. - № 3. - P. 264-273.

108. Molecular basis of p53 functional inactivation by the leukemic protein MLL-ELL / D. Wiederschain, H. Kawai, J. Gu [et al.] // Molecular and cellular biology. - 2003. -Vol. 23. - № 12. - P. 4230-4246.

109. Molecular coupling of histone crotonylation and active transcription by AF9 YEATS domain / Y. Li, B. R. Sabari, T. Panchenko [et al.] // Molecular Cell. - 2016. -Vol. 62. - № 2. - P. 181-193.

110. Molecular emergence of acute myeloid leukemia during treatment for acute lymphoblastic leukemia / J. G. Blanco, T. Dervieux, M. J. Edick [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2001. -Vol. 98. - № 18. - P. 10338-10343.

111. Molecular rearrangements of the MLL gene are present in most cases of infant acute myeloid leukemia and are strongly correlated with monocytic or myelomonocytic

phenotypes. / P. H. Sorensen, C. S. Chen, F. O. Smith [et al.] // J Clin Invest. - 1994. -Vol. 93. - № 1. - P. 429-437.

112. Monitoring of minimal residual leukemia in patients with MLL-AF9 positive acute myeloid leukemia by RT-PCR / G. Mitterbauer, C. Zimmer, C. Fonatsch [et al.] // Leukemia. - 1999. - Vol. 13. - P. 1519-1524.

113. Mouse Af9 is a controller of embryo patterning, like Mll, whose human homologue fuses with AF9 after chromosomal translocation in leukemia / E. C. Collins, A. Appert, L. Ariza-McNaughton [et al.] // Molecular and cellular biology. - 2002. -Vol. 22. - № 20. - P. 7313-7324.

114. Multiple Interactions Recruit MLL1 and MLL1 Fusion Proteins to the HOXA9 Locus in Leukemogenesis / T. A. Milne, J. Kim, G. G. Wang [et al.] // Molecular Cell. -2010. - Vol. 38. - № 6. - P. 853-863.

115. Multiplex reverse transcriptase - polymerase chain reaction screening in childhood acute myeloblastic leukemia / S. Strehl, M. Konig, G. Mann, O. A. Haas // Blood. - 2001. - Vol. 97. - № 3. - P. 805-808.

116. Muntean, A. G. The Pathogenesis of Mixed-Lineage Leukemia / A. G. Muntean, J. L. Hess // Annual Review of Pathology: Mechanisms of Disease. - 2012. - Vol. 7. -№ 1. - P. 283-301.

117. Mutational landscape and clinical outcome of patients with de novo acute myeloid leukemia and rearrangements involving 11q23/KMT2A / M. Bill, K. Mrozek, J. Kohlschmidt [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2020. - Vol. 117. - № 42. - P. 26340-26346.

118. Novel prognostic subgroups in childhood 11q23/MLL-rearranged acute myeloid leukemia: Results of an international retrospective study / B. V. Balgobind, S. C. Raimondi, J. Harbott [et al.] // Blood. - 2009. - Vol. 114. - № 12. - P. 2489-2496.

119. Nuclear punctate distribution of ALL-1 is conferred by distinct elements at the N terminus of the protein. / T. Yano, T. Nakamura, J. Blechman [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1997. - Vol. 94. -№ 14. - P. 7286-7291.

120. Optimized cytogenetic risk-group stratification of KMT2A -rearranged pediatric

acute myeloid leukemia / R. E. van Weelderen, C. J. Harrison, K. Klein [et al.] // Blood Advances. - 2024. - Vol. 8. - № 12. - P. 3200-3213.

121. Paediatric patients with acute leukaemia and KMT2A (MLL) rearrangement show a distinctive expression pattern of histone deacetylases / N. Vega-Garcia, R. Malatesta, C. Estella [et al.] // British Journal of Haematology. - 2018. - Vol. 182. -№ 4. - P. 542-553.

122. Peterlin, B. M. Controlling the elongation phase of transcription with P-TEFb / B. M. Peterlin, D. H. Price // Molecular Cell. - 2006. - Vol. 23. - № 3. - P. 297-305.

123. Physical interaction and functional antagonism between the RNA polymerase II elongation factor ELL and p53* / N. Shinobu, T. Maeda, T. Aso [et al.] // The Journal of Biological Chemistry. - 1999. - Vol. 274. - № 24. - P. 17003-17010.

124. Prognostic factors in infants with acute myeloid leukemia / C. P. Pui, S. C. Raimondi, D. K. Srivastava [et al.] // Leukemia. - 2000. - Vol. 14. - № 4. - P. 684-687.

125. Prognostic impact of specific chromosomal aberrations in a large group of pediatric patients with acute myeloid leukemia treated uniformly according to trial AML-BFM 98 / C. von Neuhoff, D. Reinhardt, A. Sander [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2010. - Vol. 28. - № 16. - P. 2682-2689.

126. Prognostic Implications of t(10;11) Translocations in Childhood Acute Myelogenous Leukemia: A Report From the Children ' s Cancer Group / J. N. Casillas, W. G. Woods, S. P. Hunger [et al.] // Journal of Pediatric Hematology/Oncology. -2003. - Vol. 25. - № 8. - P. 594-600.

127. Prognostic significance of additional cytogenetic aberrations in 733 de novo pediatric 11q23/MLL -rearranged AML patients: results of an international study / E. A. Coenen, S. C. Raimondi, J. Harbott [et al.] // Blood. - 2011. - Vol. 117. - № 26. -

P. 7102-7111.

128. Prognostic significance of Mixed-Lineage Leukemia (MLL) gene detected by real-time fluorescence quantitative PCR assay in acute myeloid leukemia / S. Huang, H. Yang, Y. Li [et al.] // Medical Science Monitor. - 2016. - Vol. 26. - № 2. - P. 30093017.

129. Prognostic value of minimal residual disease quantification by real-time reverse

transcriptase polymerase chain reaction in patients with core binding factor leukemias / J. Krauter, K. Gorlich, O. Ottmann [et al.] // Journal of Clinical Oncology. - 2014. -Vol. 21. - № 23. - P. 4413-4422.

130. Proposals for the classification of the acute leukaemias. French-American-British (FAB) co-operative group. / J. M. Bennett, D. Catovsky, M. T. Daniel [et al.] // British journal of haematology. - 1976. - Vol. 33. - № 4. - P. 451-458.

131. Prospective evaluation of gene mutations and minimal residual disease in patients with core binding factor acute myeloid leukemia / E. Jourdan, N. Boissel, S. Chevret [et al.] // Blood. - 2013. - Vol. 121. - № 12. - P. 2213-2223.

132. Proteolytic cleavage of MLL generates a complex of N- and C-terminal fragments that confers protein stability and subnuclear localization. / J. J.-D. Hsieh, P. Ernst, H. Erdjument-Bromage [et al.] // Molecular and cellular biology. - 2003. -Vol. 23. - № 1. - P. 186-194.

133. Quantification of NG2-positivity for the precise prediction of KMT2A gene rearrangements in childhood acute leukemia / E. Zerkalenkova, E. Mikhaylova, S. Lebedeva [et al.] // Genes Chromosomes and Cancer. - 2021. - Vol. 60. - № 2. - P. 8899.

134. Rao, R. C. Hijacked in cancer: the MLL/KMT2 family of methyltransferases / R. C. Rao, Y. Dou // Nature Publishing Group. - 2015. - Vol. 15. - № 6. - P. 334-346.

135. Rayes, A. Lineage switch in MLL-rearranged infant leukemia following CD19-directed therapy / A. Rayes, R. L. McMasters, M. M. O'Brien // Pediatric Blood and Cancer. - 2016. - № 63. - P. 1113-1115.

136. Regulation of MLL1 H3K4 methyltransferase activity by its core components / Y. Dou, T. A. Milne, A. J. Ruthenburg [et al.] // Nature Structural and Molecular Biology. - 2006. - Vol. 13. - № 8. - P. 713-719.

137. Roloff, T. C. Comparative study of methyl-CpG-binding domain proteins / T. C. Roloff, H. H. Ropers, U. A. Nuber // BMC Genomics. - 2003. - Vol. 4. - № 1. - P. 1-9.

138. Rooij, J. D. de. Pediatric AML: from biology to clinical management / J. D. de Rooij, C. M. Zwaan, M. van den Heuvel-Eibrink // Journal of Clinical Medicine. -2015. - Vol. 4. - № 1. - P. 127-149.

139. Róssler, T. An alternative splice process renders the MLL protein either into a transcriptional activator or repressor / T. Róssler, R. Marschalek // Pharmazie. - 2013. -Vol. 68. - № 7. - P. 601-607.

140. Self-association mediated by the Ras association 1 domain of AF6 activates the oncogenic potential of MLL-AF6 / M. Liedtke, P. M. Ayton, T. C. Somervaille [et al.] // Blood. - 2010. - Vol. 116. - № 1. - P. 63-71.

141. Sensitivity of FISH in detection of MLL translocations / G. Cuthbert, K. Thompson, G. Breese [et al.] // Genes Chromosomes and Cancer. - 2000. - Vol. 29. -№ 2. - P. 180-185.

142. Shimony, S. Acute myeloid leukemia: 2023 update on diagnosis, risk-stratification, and management / S. Shimony, M. Stahl, R. M. Stone // American Journal of Hematology. - 2023. - Vol. 98. - № 3. - P. 502-526.

143. Slany, R. K. The oncogenic capacity of HRX-ENL requires the transcriptional transactivation activity of ENL and the DNA binding motifs of HRX / R. K. Slany, C. Lavau, M. L. Cleary // Molecular and cellular biology. - 1998. - Vol. 18. - № 1. -

P. 122-129.

144. Standardization and quality control studies of "real-time" quantitative reverse transcriptase polymerase chain reaction of fusion gene transcripts for residual disease detection in leukemia - a Europe Against Cancer program. / J. Gabert, E. Beillard, V. H. J. van der Velden [et al.] // Leukemia. - 2003. - Vol. 17. - № 12. - P. 2318-2357.

145. Standardized RT-PCR analysis of fusion gene transcripts from chromosome aberrations in acute leukemia for detection of minimal residual disease. Report of the BIOMED-1 Concerted Action: investigation of minimal residual disease in acute leukemia. / J. J. van Dongen, E. A. Macintyre, J. A. Gabert [et al.] // Leukemia. - 1999. - Vol. 13. - № 12. - P. 1901-1928.

146. Structural basis for activity regulation of MLL family methyltransferases / Y. Li, J. Han, Y. Zhang [et al.] // Nature. - 2016. - Vol. 530. - № 7591. - P. 447-452.

147. Targeted Next-Generation Sequencing for Detecting MLL Gene Fusions in Leukemia. / S. Afrin, C. R. C. Zhang, C. Meyer [et al.] // Molecular cancer research. -2018. - Vol. 16. - № 2. - P. 279-285.

148. The 5th edition of the World Health Organization Classification of Haematolymphoid Tumours: Myeloid and Histiocytic/Dendritic Neoplasms. / J. D. Khoury, E. Solary, O. Abla [et al.] // Leukemia. - 2022. - Vol. 36. - № 7. - P. 17031719.

149. The developmental stage of the hematopoietic niche regulates lineage in MLL-rearranged leukemia / R. G. Rowe, E. Lummertz da Rocha, P. Sousa [et al.] // The Journal of Experimental Medicine. - 2019. - Vol. 216. - № 3. - P. 527-538.

150. The distribution of MLL breakpoints correlates with outcome in infant acute leukaemia / M. Emerenciano, C. Meyer, M. B. Mansur [et al.] // British Journal of Haematology. - 2013. - Vol. 161. - № 2. - P. 224-236.

151. The elongation domain of ELL is dispensable but its ELL-associated factor 1 interaction domain is essential for MLL-ELL-induced leukemogenesis / R. T. Luo, C. Lavau, C. Du [et al.] // Molecular and cellular biology. - 2001. - Vol. 21. - № 16. -P. 5678-5687.

152. The ENL moiety of the childhood leukemia-associated MLL-ENL oncoprotein recruits human Polycomb 3 / M. P. Garcia-Cuellar, O. Zilles, S. A. Schreiner [et al.] // Oncogene. - 2001. - Vol. 20. - № 4. - P. 411-419.

153. The heterogeneity of pediatric MLL -rearranged acute myeloid leukemia / B. V Balgobind, C. M. Zwaan, R. Pieters, M. M. Van Den Heuvel-eibrink // Leukemia. -2011. - Vol. 25. - № 8. - P. 1239-1248.

154. The histone demethylase KDM1A sustains the oncogenic potential of MLL-AF9 leukemia stem cells / W. J. Harris, X. Huang, J. T. Lynch [et al.] // Cancer Cell. - 2012.

- Vol. 21. - № 4. - P. 473-487.

155. The HRX proto-oncogene product is widely expressed in human tissues and localizes to nuclear structures. / L. H. Butler, R. Slany, X. Cui [et al.] // Blood. - 1997.

- Vol. 89. - № 9. - P. 3361-3370.

156. The human homologue of rat NG2, a chondroitin sulfate proteoglycan, is not expressed on the cell surface of normal hematopoietic cells but is expressed by acute myeloid leukemia blasts from poor-prognosis patients with abnormalities of chromosome band 11q / F. O. Smith, C. Rauch, D. E. Williams [et al.] // Blood. - 1996.

- Vol. 87. - № 3. - P. 1123-1133.

157. The junction-associated protein AF-6 interacts and clusters with specific Eph receptor tyrosine kinases at specialized sites of cell-cell contact in the brain / M. Buchert, S. Schneider, V. Meskenaite [et al.] // The Journal of Cell Biology. - 1999. -Vol. 144. - № 2. - P. 361-371.

158. The KMT2A recombinome of acute leukemias in 2023 / C. Meyer, P. Larghero, B. Almeida Lopes [et al.] // Leukemia. - 2023. - Vol. 37. - № 5. - P. 988-1005.

159. The MLL recombinome of acute leukemias in 2013 / C. Meyer, J. Hofmann, T. Burmeister [et al.] // Leukemia. - 2013. - Vol. 27. - № 11. - P. 2165-2176.

160. The MLL recombinome of acute leukemias in 2017 / C. Meyer, T. Burmeister, D. Gröger [et al.] // Leukemia. - 2017. - Vol. 32. - № 2. - P. 273-284.

161. The PZP Domain of AF10 Senses Unmodified H3K27 to Regulate DOT1L-Mediated Methylation of H3K79 / S. Chen, Z. Yang, A. W. Wilkinson [et al.] // Molecular Cell. - 2015. - Vol. 60. - № 2. - P. 319-327.

162. The Role of DOT1L in normal and malignant hematopoiesis / O. Arnold, K. Barbosa, A. J. Deshpande, N. Zhu // Frontiers in Cell and Developmental Biology. -2022. - Vol. 10. - P. 1-7.

163. The t(4;11) Chromosome Translocation of Human Acute Leukemias Fuses the ALL-1 Gene, related to Drosophila trithorax, to the AF-4 gene / Y. Gu, T. Nakamura, H. Alder [et al.] // Cell. - 1992. - Vol. 71. - № 4. - P. 701-708.

164. Therapy-related myeloid neoplasm in an 18-year-old boy with B-lymphoblastic leukemia / X. Qing, E. Panosyan, C. Yue [et al.] // Experimental and Molecular Pathology. - 2017. - Vol. 103. - № 3. - P. 263-266.

165. Tkachuk, D. C. Involvement of a homolog of Drosophila trithorax by 11q23 Chromosomal Translocations in Acute Leukemias / D. C. Tkachuk, S. Kohler, M. L. Cleary // Cell. - 1992. - Vol. 71. - № 4. - P. 691-700.

166. Transcription linked to recombination: a gene-internal promoter coincides with the recombination hot spot II of the human MLL gene / S. Scharf, J. Zech, A. Bursen [et al.] // Oncogene. - 2007. - Vol. 26. - № 10. - P. 1361-1371.

167. Translocation (10;11)(p12;q23) in childhood acute myeloid leukemia: incidence

and complex mechanism / I. Stasevich, R. Utskevich, A. Kustanovich [et al.] // Cancer Genetics and Cytogenetics. - 2006. - Vol. 169. - № 2. - P. 114-120.

168. Unique BHLHB3 overexpression in pediatric acute myeloid leukemia with t(6;11)(q27;q23) / E. A. Coenen, C. M. Zwaan, J. Stary [et al.] // Leukemia. - 2014. -Vol. 28. - № 7. - P. 1564-1568.

169. Winters, A. C. MLL-Rearranged Leukemias — An Update on Science and Clinical Approaches / A. C. Winters, K. M. Bernt // Frontiers in Pediatrics. - 2017. -Vol. 5. - № 4. - P. 11-13.

170. Yunis, J. J. High resolution of human chromosomes / J. J. Yunis // Science. -1976. - Vol. 191. - № 4233. - P. 1268-1270.

171. Zeleznik-Le, N. J. 11q23 translocations split the "AT-hook" cruciform DNA-binding region and the transcriptional repression domain from the activation domain of the mixed-lineage leukemia (MLL) gene. / N. J. Zeleznik-Le, A. M. Harden, J. D. Rowley // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1994. - Vol. 91. - № 22. - P. 10610-10614.

172. Zhou, J. ENL: structure, function, and roles in hematopoiesis and acute myeloid leukemia / J. Zhou, Y. Ng, W. J. Chng // Cellular and Molecular Life Sciences. - 2018. - Vol. 75. - № 21. - P. 3931-3941.

Таблица А1 - Праймеры, использовавшиеся для проведения ДИ-ПЦР

Название Последовательность

СБ1 5'-салааллллалаталлаллаааллатстсаа-3'

СБ2 5'-алллллсслсстссаатсллтлласлаалаллта-3'

СЯ1 5'-ССТАООСТАОААСАТОТОО-3'

СЯ2 5'-атссслааслстслаааталтластатттсаа-з'

Б1 5'-асласстсслсслсслаллтслааталата-з'

Б2 5'-атаастссссасссллатлтссстатллллс-з'

Б3 5'-ссслслтаттстласстлааллтстас-з'

Б4 5'-астааалаластттаатслататтаттлаа-з'

Б5 5'-лтссталлтлллтааалсстттстаттаатаа-з'

Б6 5'-стсттттссатсттллтлслатастттаслсс-з'

Б7 5'-ттаталасссттсслсллаттттатттлалаа-з'

Б8 5'-ататллтллатассалллсластлтслссста-з'

Я1 5'-алСАТТСССТТСТТСАСТСТТТТССТС-3'

Я2 5'-ассттслслтттасллслалтллтллтас-з'

Я3 5'-слтстссслслслттттстасттслсллтсс-з'

Я4 5'-слстслаталтлтатслтаалслтстттсс-з'

Я5 5'-асллласлстатлттллалсааллллалаа-з'

Я6 5'-сллллсттатааллааастслсллслалсттаа-з'

Таблица А2 - Контрольные размеры кольцевых фрагментов

Номер Буква Пара праймеров Длина продукта Локализация

БашИ кольцевой фрагмент (8332 Ьр)

1 а Я1 х Б3 6632 ёег11

2 Ь Я1 х Б5 4723 ёег11

3 с Я1 х Бб 3070 ёег11

4 а Я1 х Б7 1606 ёег11

5 е Я3 х Б8 3424 ёегТР

б f СБ1 х СЯ2 7966 контроль

БашИ-Бй1 кольцевой фрагмент 1 (2253 Ьр)

7 g Я1 х Б1 2092 ёег11

8 Ъ Я1 х Б2 1714 ёег11

9 { Я1 х Б3 554 ёег11

10 .1 СБ1 х СЯ1 1747 контроль

БашИ-Бй1 кольцевой фрагмент 2 (5976 Ьр)

11 к Я2 х Б4 | 5657 ёег11

Продолжение таблицы А2

Номер Буква Пара праймеров Длина продукта Локализация

БашИ-Бй! кольцевой фрагмент 2 (597< 6 Ьр)

12 1 Я2 х Б5 4597 ёег11

13 т Я2 х Б6 2944 ёег11

14 п Я2 х Б7 1480 ёег11

15 О Я6 х Б8 4831 ёегТР

16 Р Я5 х Б8 3372 ёегТР

17 Ч Я4 х Б8 2393 ёегТР

18 г Я3 х Б8 1068 ёегТР

19 Б СБ2 х СЯ2 5664 контроль

Месяцы

30 36 42 48 54 60 66 72

ф Смерть

Рецидив ■ ТГСК

Рисунок Б1 - Продолжительность времени до развития рецидива/проведения ТГСК/смерти у пациентов первых двух лет жизни с t{9;11)/ШT2A::MLLT3 и t(10^;11)/KMT2A::MLLT10, получавших терапию согласно протоколу ОМЛ-МЯО в рамках группы промежуточного риска, п=13+2

№ пац-та

Месяцы

о 6 12 18 24 30 36 42 48 54

1

2

3

4

5

6

7

8 9

10 11 12

13

14

15

16

17

18

19

20 21 22

23

24

60

66 72 ф Смерть

^ Рецидив

■ ТГСК

§ /

§ В а § а

Рисунок Б2 - Продолжительность времени до развития рецидива/проведения ТГСК/смерти у пациентов старше двух лет с t(9;11)/KMT2A::MLLT3 и t(10;11)/KMT2A::MLLT10, получавших терапию согласно протоколу ОМЛ-МЯО в рамках группы промежуточного риска, п=23+2

№ пац-та

Месяцы

12

18

24

30

36

42

48

54

60

16

17

18

19

20 21 22

23

24

25

26

27

28

29

30

31

32

33

34

35

36

37

38

39

40

41

42

43

44

45

46

47

66 72 ф Смерть

Рецидив

■ ТГСК

Рисунок Б3 - Продолжительность времени до развития рецидива/проведения ТГСК/смерти у пациентов первых двух лет жизни с 1:(9;11 )/КМТ2А::МЬЬТ3, получавших терапию согласно протоколу ОМЛ-МЯО в рамках группы высокого риска, 1(10;11)/КМТ2А::МЬЬТ10,1(11;19)/КМТ2А::ЕЬЬ и нетипичными перетсройками гена КМТ2А, п=4+13+6+9

№ пац-та О 6

Месяцы

12

18

24

30

36

42

48

54

60

66 72 ф Смерть ^ Рецидив ■ ТГСК

а

ГГ|

§

СП

Ь )

г § §

ь ^ е

т С

§ т

Ь тз о

51 X. 5

Рисунок Б4 - Продолжительность времени до развития рецидива/проведения ТГСК/смерти у пациентов старше двух лет с 1:(9;11 )/КМТ2А::МЬЬТ3, получавших терапию согласно протоколу ОМЛ-МЯО в рамках группы высокого риска, 1(10;11)/КМТ2А::МЬЬТ10,1(11;19)/КМТ2А::ЕЬЬ, 11(6;11)/КМТ2А::А^ОТ и нетипичными перетсройками гена КМТ2А, п=7+20+4+8+6

Рисунок В1 - Суммарное количество выполненных цитогенетических и молекулярно-генетических исследований. FISH - флуоресцентная гибридизация in situ, ДИ-ПЦР - длинная инвертированная полимеразная цепная реакция, МЯ-ПЦР - мультиплексная якорная ПЦР, ВПС - высокопроизводительное секвенирование, ОТ-ПЦР -полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией