Распространенность и молекулярно-генетическая характеристика ротавирусов свиней в Российской Федерации тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Красников Никита Юрьевич

• Красников Никита Юрьевич
• кандидат наук
• 2026

Оглавление диссертации кандидат наук Красников Никита Юрьевич

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. История открытия

1.2. Классификация ротавирусов

1.3. Структурная биология ротавируса

1.3.1. Строение вириона

1.3.2. Строение генома

1.4. Цикл репродукции ротавируса

1.5. Патогенез и клинические признаки ротавирусной инфекции свиней

1.6. Иммунитет

1.7. Диагностика ротавирусной инфекции

1.8. Профилактика ротавирусной инфекции

1.9. Молекулярно-генетические особенности и эволюция ротавирусов

1.10. Глобальное распространение ротавирусов в стадах домашних свиней

1.10.1. Европа

1.10.2. Азия

1.10.3. Африка

1.10.4. Северная Америка

1.10.5. Южная Америка

1.10.6. Австралия

1.11. Заключение по обзору литературы

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Материалы

2.2. Молекулярно-биологические методы исследования

2.2.1. Выделение РНК

2.2.2. Постановка полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией

2.2.3. Амплификация фрагментов для проведения G/P-генотипирования

2.2.4. Электрофорез в агарозном геле и очистка продуктов амплификации

2.2.5. Определение нуклеотидных последовательностей

2.2.5.1. Секвенирование методом Сэнгера

2.2.5.2. Нанопоровое секвенирование

2.3. Биоинформатические и статистические методы исследования

2.3.1. Анализ нуклеотидных последовательностей, полученных методом Сэнгера

2.3.2. Анализ нуклеотидных последовательностей, полученных методом нанопорового секвенирования

2.3.3. Филогенетический анализ

2.3.4. Рекомбинационный анализ

2.3.5. Статистический анализ

ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Оценка распространенности ротавирусов видов A, B и C в свиноводческих хозяйствах РФ

3.2. Анализ вариабельности G- и P-генотипов изолятов ротавирусов у домашних свиней

3.3. Полногеномная характеристика изолятов ротавирусов видов A, B, ^ циркулирующих среди свиней в свиноводческих хозяйствах России

3.3.1. Филогенетический и сравнительный анализ полных геномов изолятов ротавируса А

3.3.2. Филогенетический анализ изолятаротавируса B

3.3.3. Филогенетический анализ изолята ротавируса С

3.4. Первое обнаружение ротавируса Н у домашних свиней в России

3.4.1. Филогенетический анализ

3.4.2. Рекомбинация в гене белка NSP3

81

ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

БЛАГОДАРНОСТИ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования

В России свиноводство является одной из самых развитых отраслей животноводства. В период с 2015 по 2020 гг. производство свинины в стране в убойном весе выросло на 39%, что составило 1.2 млн. тонн, и по некоторым прогнозам к 2025 году должно достигнуть 6 млн. тонн в живом весе [2]. Инфекционные болезни свиней наносят существенный экономический урон отрасли, значительно снижая производственные показатели и повышая себестоимость продукции и расходы на профилактику и лечение. Вопросы, связанные с формированием благополучия поголовья, являются основополагающими для развития свиноводства и требуют поисков правильных подходов к пути их решения.

Желудочно-кишечные болезни свиней — одна из основных проблем, с которой сталкиваются на промышленных свинокомплексах. По некоторым сведениям, данная группа болезней составляет от 50 до 80% от всех патологий, при этом летальность животных может достигать 25% [178]. Диарея - это главный клинический признак, который сопровождает желудочно-кишечные болезни у свиней. Чаще всего она возникает на двух критических этапах жизни животного: в подсосный период и в первые недели после отъема, — и зачастую является результатом инфекций, вызванных кишечными патогенами, к числу которых относятся бактерии, вирусы и паразиты [17]. Ротавирусы являются одной из основных причин острого гастроэнтерита у различных видов млекопитающих, включая человека и свиней, и считаются зоонозными патогенами [167]. Возбудитель передается фекально-оральным путем и быстро распространяется по организму, вызывая обширные повреждения слизистой оболочки кишечника, что приводит к диарее, обезвоживанию и летальному исходу, особенно у молодых животных.

Ротавирусы относятся к порядку Reovirales, семейству Sedoreoviridae, роду Rotavirus. На текущий момент различают 9 видов ротавирусов, именуемых от A до J, исключая ротавирус E. Причиной гастроэнтеритов, диареи и ассоциированных с ними клинических признаков у свиней являются 3 вида ротавируса (A, B и С) [167]. Ротавирус А - наиболее изученный этиологический агент кишечных заболеваний у

свиней, поражает особей различных возрастов, в основном в период от 3 до 5 недель жизни. Инфекции, связанные с наличием ротавируса B, обычно характерны для свиней в возрасте более 3 недель, в период доращивания и откорма, однако за последнее время возросло число случаев, где он являлся причиной неонатальной диареи. Ротавирус C чаще отмечается у поросят-сосунов (<7 дней), однако его циркуляция отмечена и у более возрастных групп животных. Для свиней также характерно инфицирование ротавирусом К За последнее десятилетие этот вид ротавируса обнаруживали в разных странах мира как в клинически здоровых стадах, так и у больных животных с диареей, но его роль в развитии кишечной патологии еще не установлена.

Геном ротавируса представлен двухцепочечной молекулой РНК, разделенной на 11 сегментов, кодирующих структурные (VP1-VP4, VP6, VP7) и неструктурные (NSP1-NSP5/6) белки. На основании изменчивости нуклеотидных последовательностей 4-го и 9-го сегментов генома ротавирусов, кодирующих протеаза-чувствительный белок (VP4) и гликопротеин (VP7), разработана бинарная система генотипирования, согласно которой различают Р-генотипы для гена белка VP4 и G-генотипы для гена белка VP7. В современной классификации ротавирусов принято учитывать все сегменты генома, где формула Gx-P[x]-Ix-Rx-Cx-Mx-Ax-Nx-Tx-Ex-Hx отражает генотипы генов белков VP7-VP4-VP6-VP1-VP2-VP3-NSP1-NSP2-NSP3-NSP4-NSP5/6 [88]. Для ротавирусов характерны два генетических процесса, которые определяют скорость его эволюции, реассортация и рекомбинация [53, 92]. Оба эти механизма повышают генетическое разнообразие, делая ротавирусы высоко изменчивыми патогенами.

Для грамотного проведения профилактических мероприятий, направленных на сдерживание распространения ротавирусной инфекции у домашних свиней, необходимо иметь представление о видовом составе вирусов и их молекулярно-генетической характеристике.

Степень разработанности темы

В настоящее время исследования, направленные на изучение распространенности и молекулярно-генетической структуры ротавирусов у домашних свиней, проводятся во многих странах мира. Работы, посвященные

данной теме, в разные годы наиболее активно выполнялись в странах Европы (Бельгия, Соединенное Королевство, Италия, Испания, Хорватия и др.), США и Японии [17, 35, 82, 84, 154, 164]. За последние годы возросло количество исследований в странах, неблагополучных по ротавирусной инфекции, среди которых страны Африки (Замбия, Мозамбик, Гана и др.) и Юго-Восточной Азии (Вьетнам, Таиланд) [16, 48, 106, 119, 147, 175].

На сегодняшний день имеется значительное число работ, посвященных циркуляции и генетической характеристике ротавирусов в популяции людей в России. Такие исследования в разные годы осуществляли коллективы из Москвы, Нижнего Новгорода и регионов Сибири [103, 134, 176, 177]. Однако вопросы, касающиеся ротавирусов у домашних свиней в нашей стране, изучены недостаточно. Исследованием РВА свиней занимались в 1980-е годы в ФГБНУ ФНЦ ВИЭВ, в частности Г. Г. Рухадзе с соавторами изолировали в культуре клеток локальный штамм РВА, определили его культуральные и иммунобиологические свойства, изучили молекулярный дрейф в процессе аттенуации [130, 131, 135]. В свою очередь, информация о генотипах циркулирующих изолятов отсутствует, в общедоступных базах генетических данных представлено малое число последовательностей геномов ротавирусов. На момент начала выполнения диссертационной работы информация, касающаяся текущей эпизоотологической ситуации по ротавирусам свиней в России, носила фрагментарный характер. Так РВА был детектирован при проверке образцов в ходе работы по созданию мультиплексной ПЦР тест-системы. Образцы были получены от поросят с признаками гастроэнтерита из 17 хозяйств 9 регионов России в период c 2005 по 2007 гг. Геном вируса был обнаружен в 64 образцах (36,5%), а сочетанная инфекция РВА с вирусом ЭДС была детектирована в 7 образцах (4%) [133]. В 2018 г. был детально охарактеризован штамм ротавируса В (штамм Вигуай5), детектированный у домашних свиней при вспышке заболевания кишечной этиологии на промышленном свинокомплексе в республике Бурятия. Геном вируса был депонирован в международную базу NCBI GenBank [5].

Поскольку клинические признаки ротавирусных инфекций, вызываемых разными видами, не обладают специфичностью, нужно точно понимать этиологию

инфекционного процесса, чтобы эффективно воздействовать на нее, в связи с чем возникает необходимость исследовать циркулирующие штаммы разных видов ротавирусов. Также важно отслеживать появление новых вариантов возбудителей, чтобы иметь актуальные данные об их эволюции и профилактировать новые эпизоотические вспышки. Для получения данной информации необходимы масштабные мониторинговые исследования с применением современных молекулярно-генетических и биоинформатических методов анализа.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Распространенность и молекулярно-генетическая характеристика ротавирусов свиней в Российской Федерации»

Цель работы

Изучение распространенности и молекулярно-генетических характеристик ротавирусов, циркулирующих в стадах свиней в условиях крупных промышленных свинокомплексов в России.

Задачи работы

1. Определить видовой состав ротавирусов, циркулирующих в ряде промышленных свиноводческих хозяйств России.

2. Оценить общие закономерности распространения различных видов ротавирусов у разных возрастных групп домашних свиней с клиническими признаками диареи.

3. Получить нуклеотидные последовательности генов белков VP7 и УР4 циркулирующих изолятов ротавирусов. Провести генотипирование, выявить наиболее распространенные комбинации.

4. Получить полные нуклеотидные последовательности всех сегментов генома нескольких изолятов циркулирующих ротавирусов.

5. Провести филогенетический анализ полных последовательностей сегментов генома изолятов ротавирусов, определить генотипы для всех сегментов, оценить вероятность событий рекомбинации и реассортации.

Научная новизна

Получены современные данные о распространении ротавирусов, проанализирована текущая эпизоотическая ситуация по 3 видам (Л, Б и О) у домашних свиней. Впервые в России проведено G/P-генотипирование детектированных изолятов ротавирусов Л и С, определены циркулирующие генотипы и доминирующие комбинации. Определены нуклеотидные

последовательности 7 полных геномов циркулирующих изолятов ротавирусов, изучена их геномная структура, оценены события реассортации, определена филогенетическая связь с референтными полевыми и вакцинными штаммами, представленными в международных базах данных. Впервые показана циркуляция ротавируса H в стадах домашних свиней в Российской Федерации, получен геном изолята вируса, описана его генетическая характеристика, выявлен вариант межвидовой рекомбинации с ротавирусом С

Теоретическая и практическая значимость работы

По результатам исследования получены 142 нуклеотидные последовательности, включая 5 полных нуклеотидных последовательностей сегментов геномов изолятов ротавируса А, 1 полного генома ротавирусов B и С, 1 неполного генома ротавируса H (10 сегментов), 19 частичных нуклеотидных последовательностей гена гликопротеина и 20 частичных нуклеотидных последовательностей гена протеаза-чувствительного белка изолятов ротавируса А, 5 частичных нуклеотидных последовательностей гена гликопротеина и 7 частичных последовательностей гена протеаза-чувствительного белка изолятов ротавируса С. Все нуклеотидные последовательности были депонированы в базу NCBI GenBank под специализированными номерами, которые отражены в тексте диссертационной работы.

При использовании полученных данных появится возможность сформировать более полную картину распространения видов ротавирусов в стадах домашних свиней в России, детализировать молекулярно-генетический состав автохтонных изолятов, а также проследить их эволюцию. Применение полученных данных также поможет в разработке мер профилактики на свинокомплексах, направленных на контроль циркуляции конкретного вида патогена в стадах. Дополнительно станет возможным проводить сравнительный анализ российских изолятов со штаммами и изолятами из других стран, полученных не только от домашних свиней, но и других видов животных, включая человека, что открывает перспективы оценки зоонозного потенциала и добавляет значимости исследованию в сфере профилактики здоровья животных и человека в рамках концепции ВОЗ «Единый мир-единое здоровье».

Материалы кандидатской диссертации задействованы в учебном процессе кафедры эпизоотологии и организации ветеринарного дела ФГБОУ ВО «Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии - МВА имени К.И. Скрябина» при проведении занятий лекционного и семинарского типов для студентов очной, очно-заочной, заочной форм обучения. Полученные результаты легли в основу методических рекомендаций по выявлению и генотипированию ротавирусов А и С свиней с помощью полимеразной цепной реакции и секвенирования генов белков УР4 и УР7.

Методология и методы исследования

В исследовании были использованы молекулярно-биологические (выделение нуклеиновых кислот, полимеразная цепная реакция, секвенирование), биоинформатические (сборка генома, метагеномный анализ, методы филогенетического анализа) и статистические методы. Исследования выполнены на базе лаборатории биохимии и молекулярной биологии ФГБУ ФНЦ ВИЭВ РАН в 2021-2025 гг.

Личный вклад автора

Автором проведен анализ литературы, изучена степень разработанности проблемы с определением цели, задач исследования, разработки и выполнения исследования. Результаты, представленные в данной работе, получены лично автором или при его непосредственном участии. Лично или с участием автора подготовлены основные публикации по результатам исследования. Подробный вклад работы соавторов отражен в соответствующих разделах опубликованных работ.

Положения, выносимые на защиту

1. Ротавирусы видов А, В, С широко распространены в стадах домашних свиней в России среди разных возрастных групп, при этом наибольший процент обнаружения вирусов отмечается в группах животных после отъема.

2. Состав генотипов российских автохтонных изолятов РВА характеризуется вариативностью G и Р генотипов и консервативностью генотипов в геномном остове, в то время как российские изоляты РВВ и РВС демонстрируют более неоднородный генотипический состав во всех генах.

3. Ротавирус H циркулирует в стадах домашних свиней в России. Межвидовая рекомбинация для видов C и H по всей видимости является характерным явлением для этих видов.

Степень достоверности и апробация результатов

Основные материалы диссертации были представлены на девятом Европейском конгрессе, посвященном биологии ротавирусов (9th European Rotavirus Biology Meeting 2024) в г. Валенсия, Испания (02-04 октября 2024 г.), а также на 2 международных конференциях «Ветеринария в АПК» в 2023 и 2025 гг. в г. Новосибирск, Россия.

Соответствие диссертации паспорту научной специальности

Положения диссертации соответствуют пунктам 2, 3, 4, 7, 9, 16 паспорта специальности 4.2.3 - «Инфекционные болезни и иммунология животных».

Положения диссертации соответствуют пунктам 4, 8, 9 паспорта специальности 1.5.10 - «Вирусология».

Публикации

Основные результаты исследования отражены в печати. По теме диссертации опубликовано 3 научные работы: 1 статья - в журнале, рекомендованном ВАК, 2 статьи в рецензируемых научных изданиях, индексируемых в библиографических базах - Scopus, Web of Science,PubMed.

Объем и структура диссертации

Диссертация изложена на 138 страницах машинописного текста, включает 12 таблиц и 16 рисунков. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, результатов и обсуждения, заключения, выводов, рекомендаций, перспектив дальнейшей разработки темы, списка сокращений и условных обозначений, списка литературы. Список литературы включает 179 источников, из них 13 отечественных авторов.

ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. История открытия

С середины 60-х годов 20 века ротавирусы были выявлены у широкого спектра видов млекопитающих, среди которых мыши, телята и обезьяны [3, 78]. В 1969 году "бычий" ротавирус А стал первым ротавирусом, выделенным в культуре клеток и подтвержденным в качестве причины диареи у телят [93]. Позднее, в 1973 г. Бишопом с соавторами была доказана этиологическая роль ротавирусов в развитии острых гастроэнтеритов у детей в возрасте до 5 лет [14]. Впоследствии название "ротавирус" было предложено Флеветтом с соавторами в 1974 году, и спустя 4 года оно было официально принято Международным комитетом по таксономии вирусов (ICTV) [37]. В переводе с латинского языка "rota" означает "колесо", что соответствует форме вируса, которая была установлена методом просвечивающей электронной микроскопии. Вскоре после этого, в 1975 году, ротавирусы были также обнаружены в фекалиях домашних свиней [129].

1.2. Классификация ротавирусов

Согласно данным текущей классификации, предложенной ICTV, ротавирусы относятся к следующим таксонам в соответствии с их таксономическими категориями: реалм Riboviria, царство Orthornavirae, тип Duplornaviricota, порядок Reovirales, семейство Sedoreoviridae, род Rotavirus [89].

В настоящее время на основании изменчивости нуклеотидной последовательности 6-го сегмента, кодирующего ген капсидного белка (VP6), принято выделять 9 видов ротавирусов: A, B, C, D, F, G, H, I и J. Ранее также выделяли ротавирус E, но он был исключен из классификации, поскольку был обнаружен единожды у свиней в 1986 году в Великобритании с применением серологических методов и не был изучен генетически.

В 2023 году была предложена новая система наименования видов, согласно которой старые наименования таксонов было решено заменить новыми в

соответствии с бинарной номенклатурой, утвержденной для обозначения вирусных видов. Таким образом новое наименование таксона вида ротавируса стало состоять из двух названий: родового и видового (Таблица 1).

Таблица 1 - Старые и новые обозначения наименований таксонов видов ротавирусов согласно классификации Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) [179].

Старое наименование таксона Новое наименование таксона

Rotavirus A Rotavirus alphagastroenteritidis

Rotavirus B Rotavirus betagastroenteritidis

Rotavirus C Rotavirus tritogastroenteritidis

Rotavirus D Rotavirus deltagastroenteritidis

Rotavirus F Rotavirus phigastroenteritidis

Rotavirus G Rotavirus gammagastroenteritidis

Rotavirus H Rotavirus aspergastroenteritidis

Rotavirus I Rotavirus iotagastroenteritidis

Rotavirus J Rotavirus jotagastroenteritidis

Ротавирусы поражают широкий спектр видов животных, но инфицирование в подавляющем большинстве случаев характерно для детей и молодых животных. Виды ротавирусов A, B, C и H инфицируют свиней, причем штаммы ротавируса A (РВA) ответственны за большинство диарейных вспышек [167]. Также РВА поражает другие виды млекопитающих (например, человека, крупный рогатый скот, лошадей, крыс, летучих мышей), у которых он вызывает гастроэнтериты и диарею, и птиц (например, кур, индеек и голубей), вызывая кишечные инфекции и синдром задержки роста и развития. На текущий момент РВА является самым изученным видом, что связано с его широким распространением во многих странах мира,

обширным спектром восприимчивых видов и негативным влиянием на организм хозяина.

Штаммы РВБ вызывают спорадические эпидемические вспышки гастроэнтерита у людей, но свиньи являются их основным резервуаром. РВБ часто связывают с причиной как неонатальной диареи, так и кишечных инфекций у свиней старше 3 недель [5]. Кроме этого вирус также находили у крупного и мелкого рогатого скота, крыс и лошадей [23, 49, 137, 143].

Штаммы РВС также широко распространены среди животных, в основном у домашних свиней. Впервые РВС был обнаружен у свиней с диарейным синдромом в 1980 году и впоследствии выявлялся в случаях кишечных заболеваний у коров, хорьков, собак и при эндемичных вспышках гастроэнтерита у людей [87, 91, 132, 159]. Среди свиней вирус часто является причиной вспышек диарей у поросят-сосунов и отъемышей, но также циркулирует в более возрастных группах, оказывая патогенное воздействие на организм [9, 24, 128]. Резкое увеличение числа полных геномов изолятов РВС за последние несколько лет продемонстрировало высокую генетическую изменчивость этого вида [168].

Ротавирус Н (РВН) был первоначально выявлен у людей с симптомами гастроэнтерита в Китае в 1997 году и назван «новый ротавирус диареи взрослых» (ЛОКУ-Ы) [173]. Позднее генетически схожий вирус был обнаружен в Бангладеш в 2002 году (штамм В219) [4]. В дальнейшем циркуляция РВН была показана у домашних свиней разных возрастных групп в США, Бразилии, Японии, ЮАР, Вьетнаме, Испании и Италии [35, 83, 99, 110, 120, 125, 152]. Недавнее крупномасштабное исследование, проведенное в Китае, также выявило высокую распространенность этого вируса в местных стадах домашних свиней [138]. Кроме этого вирус обнаруживали у летучих мышей в Западно-Центральной Африке и Южной Корее [62, 174]. Ряд исследований продемонстрировал присутствие данного вируса в метагеномах летучих мышей [46, 72].

Ротавирусы видов D, F, G широко распространены в популяции домашней птицы в разных странах мирах, например среди кур и индеек. [30, 122]. Ротавирус I был впервые обнаружен в результате мониторинговых исследований у собак в Венгрии и впоследствии также детектировался у кошек с клиническими признаками диареи и у морских львов [75, 95, 121]. Ротавирус J был выявлен у летучих мышей в Сербии методом метагеномного анализа [13]. В недавних исследованиях два потенциально новых вида ротавируса K и L были найдены у креветок [59, 60].

Для наименования ротавирусного штамма или изолята принято использовать единую номенклатуру, которая была предложена рабочей группой по классификации ротавирусов (RCWG). В этой системе номенклатуры каждый штамм/изолят сокращенно обозначается следующим образом: вид ротавируса/вид происхождения (хозяин)/страна идентификации/название штамма или изолята/год идентификации^- и Р-генотипы [88].

1.3. Структурная биология ротавируса 1.3.1. Строение вириона

Ротавирусы представляют собой безоболочечные вирусы с икосаэдрическим типом симметрии, около 80 нм в диаметре. Вирион ротавируса состоит из 3 белковых слоев и называется также трехслойной частицей. От периферии к центру слои вириона расположены в следующем порядке: поверхностный слой представлен двумя белками — гликопротеином (VP7) и протеаза-чувствительным белком (VP4); средний слой включает основной капсидный белок (VP6); внутренний слой, называемый ядром или сердцевиной, объединяет три структурно-функциональных белка вириона — РНК-зависимую РНК-полимеразу (VP1), основной белок ядра или коровый белок (VP2) и метилтрансферазу (VP3) [31].

Внутренний слой вириона состоит из 120 молекул белка УР2, организованных в виде 60 димеров, и имеет толщину около 3,5 нм. Этот слой окружает геном ротавируса и содержит до 12 копий каждого из двух минорных белков:

РНК-зависимой РНК-полимеразы, которая прикреплена к внутренней поверхности белка УР2, и метилтрансферазы. Точное местоположение метилтрансферазы не определено, но предполагается, что она существует в комплексе с белком УР1. Промежуточный слой капсида состоит из 780 копий белка УР6, организованных в виде 260 тримерных морфологических единиц, расположенных на осях икосаэдрической решетки, образуя внешнюю поверхность двухслойной частицы. Два белка (УР4 и УР7) формируют наружный слой вириона, около 75 нм в диаметре, и необходимы для проникновения вируса в клетку. Белок УР7 образует поверхность внешней оболочки, которая организована в виде 260 тримеров, стабилизированных ионами Са2+. Из слоя белка УР7 выступают 60 тримерных шипов, представленных белком УР4. В свою очередь, белок УР4 протеолитически расщепляется на белки УР5 и УР8, формируя шип, который используется для прикрепления к клетке и инфицирования [31].

1.3.2. Строение генома

Ротавирусы относятся к третьему классу согласно классификации Балтимора [12]. Геном ротавируса представлен двухцепочечной линейной молекулой РНК, разделенной на 11 сегментов, которые кодируют 6 структурных (УР1-4, УР6, УР7) и от 5 до 6 неструктурных белков (Ы8Р1-5/6). Каждый из сегментов является отдельным геном, кодирующим один белок, за исключением 11 сегмента у РВА, который кодирует 2 неструктурных белка (ЫБР5 и ЫБР6) (Таблица 2).

Таблица 2 - Основные характеристики сегментов генома и кодируемых ими белков на примере ротавируса А [31].

Сегмент генома Размер (п. н.) Белок Нахождение в вирионе Функция

1 3302 УР1 Сердцевина РНК-зависимая РНК-полимераза. Репликация вирусного генома

Продолжение Таблицы 2

2 2690 VP2 Сердцевина Основной коровый белок, структура вирусного ядра

3 2591 VP3 Сердцевина Гуанилил-трансфераза, кэпирование, метилирование вирусного генома

4 2362 VP4 Наружный капсидный слой Протеаза-чувствительный белок. Прикрепление к клетке, вирулентность

5 1611 NSP1 Неструктурный Антагонист интерферона

6 1356 VP6 Толща капсида (средний слой) Структурный белок, видоспецифичный антиген

7 1104 NSP3 Неструктурный Усиливает трансляцию вирусных РНК, выключает синтез клеточных белков

8 1059 NSP2 Неструктурный НТФаза, участвует в упаковке РНК

9 1062 VP7 Наружный капсидный слой Гликопротеин Адсорбция и проникновение

10 751 NSP4 Неструктурный Вирусный энтеротоксин

11 667 NSP5 NSP6 Неструктурные Фосфопротеин Фосфопротеин

Сегменты генома ротавируса полностью спарены по основаниям и характеризуются наличием 5'-концевой кэп-структуры (m7GpppG(m)GC) и отсутствуем на 3'-конце сигнала полиаденилирования. Все сегменты имеют короткие консервативные 5'- и З'-концы. Внутри этих терминальных областей на каждом

конце сегмента имеется вторая консервативная область (около 30-40 п.н.), длина которой зависит от конкретного сегмента. 5'-нетранслируемые области различаются по длине, но обычно они составляют менее 50 п.н., и за ними следует, по меньшей мере, одна непрерывная открытая рамка считывания (ОРС). Некоторые сегменты генома РВА содержат дополнительные внутрикадровые (сегменты 7, 9 и 10) или внекадровые (сегмент 11) ОРС. Однако только в случае 9 и 11 сегментов альтернативные стартовые кодоны используются для инициации синтеза более чем одного первичного продукта трансляции. У других видов ротавирусов также наблюдаются дополнительные ОРС. Так, например, 5 сегмент РВВ содержит, по крайней мере, две потенциальные ОРС, а ген белка NSP3 у РВС, по-видимому, является матрицей для двух белков, образующихся путем рибосомального «проскока».

Для РВА длина сегментов генома варьирует в диапазоне от 3302 до 667 п.н., что в общей сложности составляет 18555 п.н. При разрешении с помощью гель-электрофореза сегменты штаммов РВА обычно демонстрируют следующее распределение 4:2:3:2 (за исключением изолятов от птиц). У некоторых изолятов отклонение от данной схемы миграции указывает на событие конкатемеризации, при котором до 1800 дополнительных пар оснований упаковываются в жизнеспособные вирионы из-за частичной дупликации сегмента генома. Штаммы РВB, РВC и РВH обычно демонстрируют следующие распределения сегментов 4:2:2:3, 4:3:2:2 и 4:2:1:1:1:1:1, соответственно [31, 179].

1.4. Цикл репродукции ротавируса

Ротавирусы обладают тропизмом к энтероцитам тонкого отдела кишечника многих видов животных.

Цикл репликации ротавируса включает следующие этапы: 1. присоединение вируса к клетке, опосредованное поверхностными белками VP4 и VP7;

2. проникновение в клетку и депротеинизация;

3. синтез одноцепочечной РНК (мРНК) с участием структурных белков УР1, УР3 и УР2;

4. образование вироплазмы, опосредованное упаковкой РНК, репликация РНК и образование двуслойной вирусной частицы;

5. созревание трехслойных вирусных частиц;

6. высвобождение из клетки.

Ротавирус реплицируется в цитоплазме энтероцитов, проникая в клетки хозяина посредством рецептор-опосредованного эндоцитоза. Низкий уровень ионов Са2+ внутри эндосомы способствует удалению поверхностного слоя капсида, что приводит к высвобождению двухслойной частицы в цитоплазму. Вирусная мРНК транскрибируется для формирования структурных белков капсида. Геном реплицируется и упаковывается в новые двухслойные частицы в вироплазмах. Связывание двуслойной частицы с белком №Р4 приводит к ее почкованию в эндоплазматический ретикулум, где к ней добавляются белки УР4 и УР7, образуя трехслойную частицу. Созревшие вирионы высвобождаются из клеток посредством лизиса [31].

1.5. Патогенез и клинические признаки ротавирусной инфекции свиней

Ротавирусы размножаются исключительно в цитоплазме зрелых энтероцитов, покрывающих кончики ворсинок тонкого отдела кишечника. Эти клетки содержат энтерокиназу, фермент, необходимый для активации трипсина, который способствует сегрегации капсидного белка УР4 на субъединицы УР5 и УР8. Эти субъединицы связываются с пермиссивными клетками, взаимодействуя с сиаловой кислотой на их поверхности, что позволяет вирусной частице проникать в клетку.

Основной механизм развития диарейного синдрома при ротавирусной инфекции — это низкая абсорбция питательных веществ и снижение ферментативной активности в просвете кишечника из-за разрушения зрелых

энтероцитов. В результате инфицирования клетки разрушаются, ворсинки становятся короткими или сморщиваются, вследствие чего питательные вещества не полностью усваиваются [27, 67]. Непереваренная пища увеличивает осмотическое давление в просвете кишечника, приводя к задержке воды, что способствует развитию диареи. Кроме того непереваренная пища проходит в толстый отдел кишечника, задерживаясь там, что дополнительно вызывает размножение бактерий, усугубляя инфекционный процесс. Стоит отметить, что степень атрофии при ротавирусной инфекции менее тяжелая, чем при других вирусных кишечных инфекциях свиней, таких как ЭДС или ТГС [1, 178].

Сопутствующий механизм, обостряющий протекание ротавирусной инфекции — это активация энтеральной нервной системы (ЭНС). Запуск ЭНС может быть результатом местного воспаления в кишечнике или прямого эффекта, опосредованного действием энтеротоксина №Р4. Энтеротоксин высвобождается из инфицированных энтероцитов и вызывает увеличение внутриклеточной концентрации ионов Ca2+ в энтерохромаффинных клетках, функционирующих в роли сенсоров в просвете кишечника. При повышении внутриклеточной концентрации ионов Ca2+ происходит высвобождение гранул с серотонином, что вызывает стимуляцию 5-ИГ3 рецепторов на внутренних и внешних афферентных нервных волокнах. Активация внешних афферентных окончаний блуждающего нерва может приводить к рвоте, поскольку эти нервные окончания связаны с рвотным центром в продолговатом мозге. В свою очередь, внутренняя активация запускает высвобождение вазоактивного интестинального пептида, что приводит к гиперсекреции электролитов и воды [45].

Ротавирусы являются важной причиной диареи у поросят-сосунов и отъемышей, но они могут циркулировать как у животных с клиническими проявлениями инфекции, так и в субклинических случаях [142]. Инкубационный период инфекции в среднем составляет 17-48 часов у поросят-гнотобиотов и 1-4 дня у обычных поросят. Клинические признаки инфекции включают профузную

водянистую диарею, вялость, рвоту и анорексию, сопровождающуюся быстрой потерей веса. Фекалии у больных животных водянистые или тестообразные, желтого или желто-зеленого, иногда белого цвета. Обычно заболевает менее 20 % животных, а летальность составляет около 15 % [1]. При вскрытии в фекалиях и кишечнике нередко обнаруживают непереваренное молоко. Поражения, связанные с ротавирусными инфекциями у поросят, ограничиваются тонким отделом кишечника, в частности тощей и подвздошной кишками. Микроскопически наблюдают степень укорочения ворсинок и гипертрофию крипт Либеркюна. Тяжесть проявления клинической формы может зависеть от штамма ротавируса, возраста и иммунного статуса конкретного животного, общего состояния здоровья поголовья и присутствия вторичных бактериальных или вирусных агентов [178].

1.6. Иммунитет

Врожденный и адаптивный виды иммунитета играют ключевую роль в сдерживании ротавирусной инфекции у инфицированных животных. Т-лимфоциты, опосредующие клеточный иммунитет, вместе с В-лимфоцитами, опосредующими гуморальный иммунитет, обеспечивают адаптивный иммунный ответ, который работает в тесной связи с врожденной иммунной системой.

Ведущую роль в системе врожденного иммунного ответа играют паттернраспознающие рецепторы, которые улавливают вирусные компоненты (РНК, вирусные белки) или продукты репликации и транскрипции вируса. Данный вид рецепторов представлен То11-подобными рецепторами (ТЬЯ), Коё-подобными рецепторами (МЬЯ) и КЮ-1-подобными рецепторами (КЬЯ), которые распознают патогенассоциированные молекулярные паттерны (РАМР) и запускают сложный каскад реакций в клетке, приводящий к выработке интерферона, который оказывает противовирусную активность [6]. Так, например, ротавирусная инфекция стимулирует работу рецепторов ТЬЯ3, ТЬЯ5 и ТЬЯ7 [67, 124, 170]. В одном из

исследований также было показано, что рецепторы ЯШ-1 и MDA-5 участвуют в индукции Ш^Р при ротавирусной инфекции [19].

Несмотря на то что врожденный иммунный ответ играет важную протективную роль, адаптивные иммунные ответы обеспечивают эффективный клиренс и защиту от повторного заражения. При инфицировании антитела вырабатываются против белков VP7, VP4, VP6, NSP3 и NSP4 [20, 104, 166]. Однако природа иммунных ответов на эти белки различается, и только белки VP7 и VP4 стимулируют индукцию вируснейтрализующих антител.

Для защиты потомства от кишечных патогенов в молозиво и молоко секретируются нейтрализующие антитела. В-клетки, локализуясь в молочной железе, дифференцируются в плазматические клетки и вырабатывают антитела класса ^А. Затем эти антитела поступают в молоко как секреторные ^А путем прохождения через эпителий молочной железы.

1.7. Диагностика ротавирусной инфекции

Диагноз на ротавирусную инфекцию свиней ставят на основании эпизоотологических данных, клинических признаков, патоморфологических изменений и лабораторных исследований [1]. Клинические признаки и поражения, связанные с ротавирусными инфекциями у свиней, не являются специфичными, следовательно для подтверждения роли данного патогена необходимо проведение лабораторной диагностики. Для лабораторной диагностики необходимо предоставлять клинические образцы, собранные в ранние сроки (не позднее 24 ч. после начала диареи), так как в этот период они содержат большее количество вирусных частиц [1]. Для обнаружения генома или антигенов вируса отбирают образцы фекалий, участки тканей тонкого отдела кишечника и ректальные смывы.

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Красников Никита Юрьевич, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Орлянкин, Б.Г. Ротавирусы свиней / Б. Г. Орлянкин, А. Г. Южаков, Н. Ю. Красников, Т. И. Алипер // Ветеринария. - 2023. - № 7. - С. 3-10.

2. Плаксин, И. Е. Тенденции и перспективы развития свиноводства в России / И. Е. Плаксин, С. И. Плаксин, А. В. Трифанов // АгроЭкоИнженерия. - 2022. - № 1(110). -С. 155-168.

3. Adams, W. R. Epizootic diarrhea of infant mice: indentification of the etiologic agent / W. R. Adams, L. M. Kraft // Science (New York, N.Y.). - 1963. - Vol. 141, No. 3578. - P. 359-360.

4. Alam, M. M. Genetic analysis of an ADRV-N-like novel rotavirus strain B219 detected in a sporadic case of adult diarrhea in Bangladesh / M. M. Alam, N. Kobayashi, M. Ishino [et al.] // Archives of Virology. - 2007. - Vol. 152, No. 1. - P. 199-208.

5. Alekseev, K. P. Genome characterization of a pathogenic porcine rotavirus B strain identified in Buryat republic, Russia in 2015 / K. P. Alekseev, A. N. Mukhin, T. V. Grebennikova [et al.] // Pathogens. - 2018. - Vol. 7, No. 2. - P. 46.

6. Amarante-Mendes, G. P. [Pattern recognition receptors and the host cell death molecular machinery / G. P. Amarante-Mendes, S. Adjemian, L. M. Branco [et al.] // Frontiers in Immunology. - 2018. - Vol. 9. - P. 02379.

7. Amimo, J. O. Detection and genetic characterization of porcine group A rotaviruses in asymptomatic pigs in smallholder farms in East Africa: predominance of P[8] genotype resembling human strains / J. O. Amimo, J. O. Junga, W. O. Ogara, [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2015. - Vol. 175, No. 2-4. - P. 195-210.

8. Amimo, J. O. Detection and Genetic Diversity of Porcine Group A Rotaviruses in Historic (2004) and Recent (2011 and 2012) Swine Fecal Samples in Ohio: Predominance

of the G9P[13] Genotype in Nursing Piglets / J. O. Amimo, A. N. Vlasova, L. J. Saif // Journal of Clinical Microbiology. - 2013. - P. 1142-1151.

9. Amimo, J. O. Prevalence and genetic heterogeneity of porcine group C rotaviruses in nursing and weaned piglets in Ohio, USA and identification of a potential new VP4 genotype / J. O. Amimo, A. N. Vlasova, L. J. Saif // Veterinary Microbiology. - 2013. -Vol. 164, No. 1-2. - P. 27-38.

10. Anderson, A. V. Evaluating natural planned exposure protocols on rotavirus shedding patterns in gilts and the impact on their suckling pigs / A. Anderson, F. Shepherd, F. Dominguez [et al.] // Journal of Swine Health and Production. - 2023. - Vol. 31, No. 1. -P. 10-19.

11. Babji, S. Approach to molecular characterization of partially and completely untyped samples in an Indian rotavirus surveillance program / S. Babji, R. Arumugam, A. Sarvanabhavan [et al.] // Vaccine. - 2014. - № Suppl 1 (32 Suppl 1). - P. A84-88.

12. Baltimore, D. Expression of animal virus genomes / D. Baltimore // Bacteriological Reviews. - 1971. - Vol. 35, No. 3. - P. 235-241.

13. Banyai, K. Candidate new rotavirus species in Schreiber's bats, Serbia / K. Banyai, G. Kemenesi, I. Budinski [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2017. - Vol. 48. - P. 19-26.

14. Bishop, R. F. Virus particles in epithelial cells of duodenal mucosa from children with acute non-bacterial gastroenteritis / R. F. Bishop, G. P. Davidson, I. H. Holmes [et al.] // Lancet (London, England). - 1973. - Vol. 2, No. 7841. - P. 1281-1283.

15. Blackhall, J. Genetic stability of a porcine rotavirus RNA segment during repeated plaque isolation / J. Blackhall, A. Fuentes, G. Magnusson // Virology. - 1996. - Vol. 1, No. 225. - P. 181-190.

16. Boene, S. S. Prevalence and genome characterization of porcine rotavirus A in southern Mozambique / S. S. Boene, E. D. Joao, A. Strydom [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2021. - Vol. 87. - P. 104637.

17. Brnic, D. Rotavirus A in Domestic Pigs and Wild Boars: High Genetic Diversity and Interspecies Transmission / D. Brnic, D. Colic, V. Kunic [et al.] // Viruses. - 2022. - Vol. 14, No. 9. - P. 2028.

18. Brnic, D. The impact and complete genome characterisation of viruses involved in outbreaks of gastroenteritis in a farrow-to-finish holding / D. Brnic, D. Vlahovic, A. Gudan Kurilj [et al.] // Scientific Reports. - 2023. - Vol. 13, No. 1. - P. 18780.

19. Broquet, A. H. RIG-I/MDA5/MAVS are required to signal a protective IFN response in rotavirus-infected intestinal epithelium / A. H. Broquet, Y. Hirata, C. S. McAllister [et al.] // Journal of Immunology (Baltimore, Md.: 1950). - 2011. - Vol. 186, No. 3. - P. 1618-1626.

20. Caddy, S. L. Intracellular neutralisation of rotavirus by VP6-specific IgG / S. L. Caddy, M. Vaysburd, M. Wing [et al.] // PLoS Pathogens. - 2020. - Vol. 16, No. 8. - P. e1008732.

21. Canon, Jones H. High genetic diversity of species A rotaviruses detected in swine farms in Chile / H. Canon Jones, H. Cortes, A. Gaggero [et al.] // The Journal of General Virology. - 2017. - Vol. 98, No. 4. - P. 539-547.

22. Chandler-Bostock, R. Genetic diversity of porcine group A rotavirus strains in the UK / R. Chandler-Bostock, L. R. Hancox, S. Nawaz [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. - Vol. 173, No. 1-2. - P. 27-37.

23. Chen, F. Complete genome characterization of a rotavirus B (RVB) strain identified in Alpine goat kids with enteritis reveals inter-species transmission with RVB bovine strains / F. Chen, T. P. Knutson, M. Ciarlet [et al.] // The Journal of General Virology. - 2018. -Vol. 99, No. 4. - P. 457-463.

24. Chepngeno, J. Rotavirus C: prevalence in suckling piglets and development of viruslike particles to assess the influence of maternal immunity on the disease development / Ju. Chepngeno, A. Diaz, F. C. Paim [et al.] // Veterinary Research. - 2019. - Vol. 50, No. 1. -P. 1-12.

25. Collins, P. J. Detection and characterization of group C rotaviruses in asymptomatic piglets in Ireland / P. J. Collins, V. Martella, H. O'Shea // Journal of Clinical Microbiology. - 2008. - Vol. 46. No. 9. - P. 2973-2979.

26. Cortey, M. High levels of unreported intraspecific diversity among RNA viruses in faeces of neonatal piglets with diarrhoea / M. Cortey, A. Vidal, G. Martin-Valls [et al.] // BMC Veterinary Research. - 2019. - Vol. 15, No. 1. - P. 441.

27. Crawford, S. E. Rotavirus infection / S. E. Crawford, S. Ramani, J. E. Tate [et al.] // Nature Reviews. Disease Primers. - 2017. (3). - P. 17083.

28. Danecek, P. Twelve years of SAMtools and BCFtools / P. Danecek, Ja. K. Bonfield, J. Liddle [et al.] // GigaScience. - 2021. - Vol. 10, No. 2.

29. De Coster, W. NanoPack: visualizing and processing long-read sequencing data / W. De Coster, S. D'Hert, D.T. Schultz // Bioinformatics. - 2018. - Vol. 34, No. 15, - P. 26662669.

30. Deol, P. Avian Group D Rotaviruses: Structure, Epidemiology, Diagnosis, and Perspectives on Future Research Challenges / P. Deol, J. J. Kattoor, S. Sircar [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2017. - Vol. 6, No. 4. - P. 53.

31. Desselberger, U. Rotaviruses / U. Desselberger // Virus Research. - 2014. - Vol. 190. -P. 75-96.

32. Esona, M. D. Multiplexed one-step RT-PCR VP7 and VP4 genotyping assays for rotaviruses using updated primers / M. D. Esona, R. Gautam, K. I. Tam [et al.] // Journal of Virological Methods. - 2015. - Vol. 223. - P. 96-104.

33. Euring, B. Extended analyses of rotavirus C (RVC) G-types and P-types reveal new cut-off value for the G-types and reclassification of strains / B. Euring, M. Harzer, T. W. Vahlenkamp // Journal of Virology. - Vol. 99, No. 5. - C. e00049-25.

34. Faizuloev, E. New approach of genetic characterization of group A rotaviruses by the nanopore sequencing method / E. Faizuloev, R. Mintaev, O. Petrusha [et al.] // Journal of Virological Methods. - 2021. - Vol. 292. - P. 114114.

35. Ferrari, E. Assessing the Epidemiology of Rotavirus A, B, C and H in Diarrheic Pigs of Different Ages in Northern Italy / E. Ferrari, C. Salogni, V. Martella [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2022. - Vol. 11, No. 4. - P. 467.

36. Ferrari, E. Identification of Putative Novel Rotavirus H VP7, VP4, VP6 and NSP4 Genotypes in Pigs / E. Ferrari, G. Vignola, C. Bertasio [et al.] // Viruses. - 2024. - Vol. 16, No. 1. - P. 68.

37. Flewett, T. H. Relation between viruses from acute gastroenteritis of children and newborn calves / T. H. Flewett // Lancet (London, England). - 1974. - Vol. 2, No. 7872. -P. 61-63.

38. Fu, Z. F. Transfer of maternal antibody against group A rotavirus from sows to piglets and serological responses following natural infection / Z. F. Fu, D. J., Hampson, C. R. Wilks // Research in Veterinary Science. - 1990. - Vol. 48, No. 3. - P. 365-373.

39. Fukusho, A. Isolation of cytopathic porcine rotavirus in cell roller culture in the presence of trypsin / A. Fukusho, Y. Shimizu, Y. Ito // Archives of Virology. - 1981. -Vol. 69, No. 1. - P. 49-60.

40. Gachanja, E. Prevalence of Group A Rotavirus in Piglets in a Peri-Urban Setting of Arusha, Tanzania / E. Gachanja, J. Buza, P. Petrucka // Journal of Biosciences and Medicines. - 2016. - Vol. 04, No. 01. - P. 37-44.

41. Genz, B. Detection and genetic diversity of porcine rotavirus A, B and C in eastern Australian piggeries / B. Genz, J. Gerszon, Y. Pollock [et al.] // Australian Veterinary Journal. - 2023. - Vol. 101, No. 4. - P. 153-163.

42. Goecke, N. B. Occurrence and diversity of porcine rotavirus groups A, B, C and H in Danish pigs / N. B. Goecke, M. V. Agerlin, K. Skadborg [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2025. - P. 110615.

43. Gratia, M. Rotavirus NSP3 Is a Translational Surrogate of the Poly(A) Binding Protein-Poly(A) Complex / M. Gratia, E. Sarot, P. Vende [et al.] // Journal of Virology. -2015. - Vol. 89, No. 17. - P. 8773-8782.

44. Grubaugh, N. D. An amplicon-based sequencing framework for accurately measuring intrahost virus diversity using PrimalSeq and iVar / N. D. Grubaugh, K. Gangavarapu, J. Quick [et al.] // Genome Biology. - 2019. - Vol. 20, No. 1. - P. 1-19.

45. Hagbom, M. Rotavirus stimulates release of serotonin (5-HT) from human enterochromaffin cells and activates brain structures involved in nausea and vomiting / M. Hagbom, C. Istrate, D. Engblom [et al.] // PLoS pathogens. - 2011. - Vol. 7, No. 7. - P. e1002115.

46. Hardmeier, I Metagenomic analysis of fecal and tissue samples from 18 endemic bat species in Switzerland revealed a diverse virus composition including potentially zoonotic

viruses / I. Hardmeier, N. Aeberhard, C. Fraefel [et al.] // PLoS ONE. - 2021. - Vol. 16, No. 6. - P. e0252534

47. Harima, H. A first report of rotavirus B from Zambian pigs leading to the discovery of a novel VP4 genotype P[9] / H. Harima, Y. Qiu, M. Sasaki [et al.] // Virology Journal. -2024. - Vol. 21, No. 1. - P. 263.

48. Harima, H. First identification and whole genome characterization of rotavirus C in pigs in Zambia / H. Harima, Y. Qiu, M. Sasaki [et al.] // Virology. - 2025. - Vol. 603. - P. 110385.

49. Hayashi-Miyamoto, M. Diversity in VP3, NSP3, and NSP4 of rotavirus B detected from Japanese cattle / M. Hayashi-Miyamoto, T. Murakami, F. Minami-Fukuda [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2017. - Vol. 49. - P. 97-103.

50. He, J. Development of a Quadruplex RT-qPCR for the Detection of Porcine Astrovirus, Porcine Sapovirus, Porcine Norovirus, and Porcine Rotavirus A / Ju. He, K. Shi, Yu. Shi [et al.] // Pathogens. - 2024. - Vol. 13, No. 12. - P. 1052.

51. Hodgins, D. C. Effects of maternal antibodies on protection and development of antibody responses to human rotavirus in gnotobiotic pigs / D. C. Hodgins, S. Y. Kang, L. deArriba [et al.] // Journal of Virology. - 1999. - Vol. 73, No. 1. - P. 186-197.

52. Homwong, N. Three-Level Mixed-Effects Logistic Regression Analysis Reveals Complex Epidemiology of Swine Rotaviruses in Diagnostic Samples from North America / N. Homwong, A. Diaz, S. Rossow [et al.] // PLOS ONE. - 2016. - Vol. 11, No. 5. - P. e0154734.

53. Hoxie, I. Intragenic recombination influences rotavirus diversity and evolution / I. Hoxie, J. J. Dennehy // Virus Evolution. - 2020. - Vol. 6, No. 1. - P. vez059.

54. Huang, J. Comparative sequence analysis of VP7 genes from five Australian porcine rotaviruses / J. Huang, H. S. Nagesha, M. L. Dyall-Smith, I. H. Holmes // Archives of Virology. - 1989. - Vol. 109, No. 3. - P. 173-183.

55. Huang, J. A. Comparative sequence analysis of VP4s from five Australian porcine rotaviruses: implication of an apparent new P type / J. A. Huang, H. S. Nagesha, I. H. Holmes // Virology. - 1993. - Vol. 196, No. 1. - P. 319-327.

56. Hull, J. J. A. Metagenomic sequencing generates the whole genomes of porcine rotavirus A, C, and H from the United States / J. J. A. Hull, M. Qi, A. M. Montmayeur [et al.] // PloS One. - 2020. - Vol. 15, No. 12. - P. e0244498.

57. Jampanil, N. Prevalence and genetic diversity of porcine rotavirus A from diarrheic piglets in Northern Thailand / N. Jampanil, P. Khamrin, K Kumthip, et al. // BMC veterinary research. - 2025. - Vol. 21, No. 1. - P. 308.

58. Jang, G. Successful Eradication of Porcine Epidemic Diarrhea in an Enzootically Infected Farm: A Two-Year Follow-Up Study / G. Jang, J. Park, Ch. Lee // Pathogens. -2021. - Vol. 10, No. 7. - P. 830.

59. Johne, R. Whole Genome Sequence Analysis of a Prototype Strain of the Novel Putative Rotavirus Species L / R. Johne, K. Schilling-Loeffler, S. H. Tausch, R. G. Ulrich // Viruses. - 2022. - Vol. 14, No. 3.

60. Johne, R. Genome analysis of the novel putative rotavirus species K / R. Johne, S. H. Tausch, R. G. Ulrich, K. Schilling-Loeffler // Virus Research. - 2023. - Vol. 334. - P. 199171.

61. Khamrin, P. Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain / P. Khamrin, N. Maneekarn, S. Peerakome [et al.] // Virology. - 2007. - Vol. 361, No. 2. - P. 243-252.

62. Kim, H. K. Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome-Like, Middle East Respiratory Syndrome-Like Bat Coronaviruses and Group H Rotavirus in Faeces of Korean Bats / H. K. Kim, S. W. Yoon, D. J. Kim [et al.] // Transboundary and Emerging Diseases. - 2016. - Vol. 63, No. 4. - P. 365-372.

63. Koren, S. Canu: scalable and accurate long-read assembly via adaptive k-mer weighting and repeat separation / S. Koren, B. P. Walenz, K. Berlin [et al.] // Genome Research. - 2017. - Vol. 27, No. 5. - P. 722-736.

64. Krasnikov, N. Complete genome characterization by nanopore sequencing of rotaviruses A, B, and C circulating on large-scale pig farms in Russia / N. Krasnikov, A. Gulyukin, T. Aliper, A. Yuzhakov // Virology Journal. - 2024. - Vol. 21, No. 1.

65. Krasnikov, N. Interspecies recombination in NSP3 gene in the first porcine rotavirus H in Russia identified using nanopore-based metagenomic sequencing / N. Krasnikov, A. Yuzhakov // Frontiers in Veterinary Science. - 2023. - Vol. 10.

66. Kuga, K. Genetic diversity and classification of the outer capsid glycoprotein VP7 of porcine group B rotaviruses / K. Kuga, A. Miyazaki, T. Suzuki [et al.] // Archives of Virology. - 2009. - Vol. 154, No. 11. - P. 1785-1795.

67. Kumar, D. Rotavirus Infection in Swine: Genotypic Diversity, Immune Responses, and Role of Gut Microbiome in Rotavirus Immunity / D. Kumar, F. K. Shepherd, N. L. Springer [et al.] // Pathogens. - 2022. - Vol. 11, No. 10. - P. 1078.

68. Kumar, D. Role of Pre-Farrow Natural Planned Exposure of Gilts in Shaping the Passive Antibody Response to Rotavirus A in Piglets / D. Kumar, A. V. Anderson Reever, J. S. Pittman [et al.] // Vaccines. - 2023. - Vol. 11, No. 12. - P. 1866.

69. Kumar, S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets / S. Kumar, G. Stecher, K. Tamura // Molecular Biology and Evolution. - 2016. -Vol. 33, No. 7. - P. 1870-1874.

70. Lachapelle, V. Genetic diversity of group A rotavirus in swine in Canada / V. Lachapelle, J. Brassard, P. Fravalo [et al.] // Archives of Virology. - 2014. - Vol. 159, No. 7. - P. 1771-1779.

71. Lahon, A. Molecular characterization of group B rotavirus circulating in pigs from India: identification of a strain bearing a novel VP7 genotype, G21 / A. Lahon, V. C. Ingle, H. S. Birade [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. - Vol. 174, No. 3-4. - P. 342352.

72. Lazov, C. M. Full-genome sequences of alphacoronaviruses and astroviruses from myotis and pipistrelle bats in Denmark / C. M. Lazov, G. J. Belsham, A. B0tner, T. B. Rasmussen // Viruses. - 2021. - Vol. 13, No. 6.

73. Lecce, J. G., King M. W. Role of rotavirus (reo-like) in weanling diarrhea of pigs / J. G. Lecce, M. W. King // Journal of Clinical Microbiology. - 1978. - Vol. 8, No. 4. - P. 454-458.

74. Li, H. Minimap2: pairwise alignment for nucleotide sequences / H. Li, // Bioinformatics. - 2018. - Vol. 34, No. 18. - P. 3094-3100.

75. Li, L. The fecal viral flora of California sea lions / L. Li, T. Shan, E. Delwart [et al.] // Journal of Virology. - 2011. - Vol. 85, No. 19. - P. 9909-9917.

76. Li, Q. Outbreak of piglet diarrhea associated with a new reassortant porcine rotavirus B / Q. Li, Z. Wang, J. Jiang [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2024. - Vol. 288. - P. 109947.

77. Lorenzetti, E. Genetic heterogeneity of wild-type G4P[6] porcine rotavirus strains detected in a diarrhea outbreak in a regularly vaccinated pig herd / E. Lorenzetti, T. N. da Silva Medeiros, A. F. Alfieri // Veterinary Microbiology. - 2011. - Vol. 154, No. 1-2. - P. 191-196.

78. Malherbe, H. The cytopathic effects of vervet monkey viruses / H. Malherbe, R. Harwin // South African Medical Journal = Suid-Afrikaanse Tydskrif Vir Geneeskunde. -1963. - Vol. 37. - P. 407-411.

79. Martella, V. Identification of group A porcine rotavirus strains bearing a novel VP4 (P) Genotype in Italian swine herds / V. Martella, M. Ciarlet, K. Banyai [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2007. - Vol. 45, No. 2. - P. 577-580.

80. Martel-Paradis, O. Full-length genome analysis of G2, G9 and G11 porcine group A rotaviruses / O. Martel-Paradis, M. A. Laurin, V. Martella [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2013. - Vol. 162, No. 1. - P. 94-102.

81. Marthaler, D. Detection of substantial porcine group B rotavirus genetic diversity in the United States, resulting in a modified classification proposal for G genotypes / D. Marthaler, K. Rossow, M. Gramer [et al.] // Virology. - 2012. - Vol. 433, No. 1. - P. 8596.

82. Marthaler, D. Identification, phylogenetic analysis and classification of porcine group C rotavirus VP7 sequences from the United States and Canada / D. Marthaler, K. Rossow, M. Culhane [et al.] // Virology. - 2013. - Vol. 446, No. 1-2. - P. 189-198.

83. Marthaler, D. Widespread rotavirus H in commercially raised pigs, United States / D. Marthaler, K. Rossow, M. Culhane [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 20, No. 7. - P. 1195-1198.

84. Marthaler, D. VP6 genetic diversity, reassortment, intragenic recombination and classification of rotavirus B in American and Japanese pigs / D. Marthaler, T. Suzuki, K. Rossow [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. - Vol. 172, No. 3-4. - P. 359-366.

85. Marthaler, D. Rapid detection and high occurrence of porcine rotavirus A, B, and C by RT-qPCR in diagnostic samples / D. Marthaler, N. Homwong, K. Rossow, [et al.] // Journal of Virological Methods. - 2014. - Vol. 209. - P. 30-34.

86. Martin, D. P. RDP4: Detection and analysis of recombination patterns in virus genomes / D. P. Martin, B. Murrell, M. Golden [et al.] // Virus Evolution. - 2015. - Vol. 1, No. 1. - P. vev003.

87. Marton, S. Canine rotavirus C strain detected in Hungary shows marked genotype diversity / S. Marton, E. Mihalov-Kovacs, R. Doro [et al.] // The Journal of General Virology. - 2015. - Vol. 96, No. 10. - P. 3059-3071.

88. Matthijnssens, J. Full genome-based classification of rotaviruses reveals a common origin between human Wa-Like and porcine rotavirus strains and human DS-1-like and bovine rotavirus strains / J. Matthijnssens, M. Ciarlet, E. Heiman [et al.] // Journal of Virology. - 2008. - Vol. 82, No. 7. - P. 3204-3219.

89. Matthijnssens, J. ICTV Virus Taxonomy Profile: Sedoreoviridae 2022 / J. Matthijnssens, H. Attoui, K. Banyai [et al.] // Journal of General Virology. - 2022. - Vol. 103, No. 10.

90. Matthijnssens, J. Genotype constellation and evolution of group A rotaviruses infecting humans / J. Matthijnssens, M. Van Ranst // Current Opinion in Virology. - 2012. - Vol. 2, No. 4. - P. 426-433.

91. Mawatari, T. Detection of a bovine group C rotavirus from adult cows with diarrhea and reduced milk production / T. Mawatari, A. Taneichi, T. Kawagoe [et al.] // The Journal of Veterinary Medical Science. - 2004. - Vol. 66, No. 7. - P. 887-890.

92. McDonald, S. M. Reassortment in segmented RNA viruses: Mechanisms and outcomes / S. M. Mcdonald, M. I. Nelson, P. E. Turner, J. T. Patton // Nature Reviews Microbiology. - 2016. - Vol. 14, No. 7. - P. 448-460.

93. Mebus, C. A. Further studies on neonatal calf diarrhea virus / C. A. Mebus, N. R. Underdahl, M. B. Rhodes [et al.] // Proceedings, Annual Meeting of the United States Animal Health Association. - 1969. - Vol. 73. - P. 97-99.

94. Midgley, S. E. Diversity and zoonotic potential of rotaviruses in swine and cattle across Europe / S. E. Midgley, K. Banyai, J. Buesa [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2012. -Vol. 156, No. 3. - P. 238-245.

95. Mihalov-Kovacs, E. Candidate new rotavirus species in sheltered dogs, Hungary / E. Mihalov-Kovacs, Â. Gellért, S. Marton [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2015. -Vol. 21, No. 4. - P. 660-663.

96. Miyabe, F. M. Porcine rotavirus B as primary causative agent of diarrhea outbreaks in newborn piglets / F. M. Miyabe, A. M. Dall Agnol, R. A. Leme [et al.] // Scientific Reports. - 2020. - Vol. 10, No. 1. - P. 22002.

97. Miyazaki, A. Analysis of the excretion dynamics and genotypic characteristics of rotavirus A during the lives of pigs raised on farms for meat production / A. Miyazaki, K. Kuga, T. Suzuki [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 2012. - Vol. 50, No. 6. - P. 2009-2017.

98. Miyazaki, A. Annual changes in predominant genotypes of rotavirus A detected in the feces of pigs in various developmental stages raised on a conventional farm / A. Miyazaki, K. Kuga, T. Suzuki [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2013. - Vol. 163, No. 1. - P. 162-166.

99. Molinari, B. L. D. Species H rotavirus detected in piglets with diarrhea, Brazil, 2012 / B. L. Molinari, E. Lorenzetti, R. A. Otonel [et al.] // Emerging Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 20, No. 6. - P. 1019-1022.

100. Molinari, B. L. D. Unusual outbreak of post-weaning porcine diarrhea caused by single and mixed infections of rotavirus groups A, B, C, and H / B. L. Molinari, F. Possatti, E. Lorenzetti [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2016. - Vol. 193. - P. 125-132.

101. Monini, M. Full-length genomic analysis of porcine rotavirus strains isolated from pigs with diarrhea in Northern Italy / M. Monini, G. Zaccaria, G. Ianiro [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 25. - P. 4-13.

102. Monteagudo, L. V. Occurrence of Rotavirus A Genotypes and Other Enteric Pathogens in Diarrheic Suckling Piglets from Spanish Swine Farms / L. V. Monteagudo, A. A. Benito, S. Lázaro-Gaspar [et al.] // Animals. - 2022. - Vol. 12, No. 3. - P. 251.

103. Morozova, O. V. Increasing detection of rotavirus G2P[4] strains in Nizhny Novgorod, Russia, between 2016 and 2019 / O. V. Morozova, T. A. Sashina, N. V. Epifanova [et al.] // Archives of Virology. - 2021. - Vol. 166, No. 1. - P. 115-124.

104. Nair, N. VP4- and VP7-specific antibodies mediate heterotypic immunity to rotavirus in humans / N. Nair, N. Feng, L. K. Blum [et al.] // Science Translational Medicine. -2017. - Vol. 9, No. 395. - P. eaam5434.

105. Naseer, O. Genotypic and epitope characteristics of group A porcine rotavirus strains circulating in Canada / O. Naseer, M. C. Jarvis, M. Ciarlet [et al.] // Virology. - 2017. -Vol. 507. - P. 53-63.

106. Ndebe, J. Prevalence and Genomic Characterization of Rotavirus A from Domestic Pigs in Zambia: Evidence for Possible Porcine-Human Interspecies Transmission / J.

Ndebe, H. Harima, H. M. Chambaro [et al.] // Pathogens. - 2023. - Vol. 12, No. 10. - P. 1199.

107. Neira, V. Identification and characterization of porcine Rotavirus A in Chilean swine population / V. Neira, C. Melgarejo, C. Urzua-Encina [et al.] // Frontiers in Veterinary Science. - 2023. - Vol. 10.

108. Nguyen Thi, T. H. Antibody Evaluation and Mutations of Antigenic Epitopes in the Spike Protein of the Porcine Epidemic Diarrhea Virus from Pig Farms with Repeated Intentional Exposure (Feedback) / T. H. Nguyen Thi, Ch. Ch. Chen, W. B. Chung [et al.] // Viruses. - 2022. - Vol. 14, No. 3. - P. 551.

109. Niira, K. Whole genome sequences of Japanese porcine species C rotaviruses reveal a high diversity of genotypes of individual genes and will contribute to a comprehensive, generally accepted classification system / K. Niira, M. Ito, T. Masuda [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2016. - Vol. 44. - P. 106-113.

110. Nyaga, M. M. Complete genome analyses of the first porcine rotavirus group H identified from a South African pig does not provide evidence for recent interspecies transmission events / M. M. Nyaga, I. Peenze, C. A. Potgieter, [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2016. - Vol. 38. - P. 1-7.

111. Oki, H. Genomic diversity and intragenic recombination of species C rotaviruses / H. Oki, M. Hayashi-Miyamot, M. Kawai [et al.] // Journal of General Virology. - 2022. -Vol. 103, No. 2. - P. 001703.

112. Ondov, B. D. Interactive metagenomic visualization in a Web browser / B. D. Ondov, N. H. Bergman, A. M. Phillippy // BMC Bioinformatics. - 2011. - Vol. 12, No. 1. - P. 110.

113. Otto, P. H. Detection of rotavirus species A, B and C in domestic mammalian animals with diarrhoea and genotyping of bovine species A rotavirus strains / P. H. Otto, S. Rosenhain, M. C. Elschner [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2015. - Vol. 179, No. 3. -P. 168-176.

114. Papp, H. Review of group A rotavirus strains reported in swine and cattle / H. Papp, B. Laszlo, F. Jakab, et al. // Veterinary Microbiology. - 2013. - Vol. 165, No. 3. - P. 190199.

115. Park, G.-N. Genetic Diversity of Porcine Group A Rotavirus Strains from Pigs in South Korea / G. N. Park, Da. In. Kim, S. Choe [et al.] // Viruses. - 2022. - Vol. 14, No. 11. - P. 2522.

116. Parra, G. I. Phylogenetic analysis of porcine rotavirus in Argentina: Increasing diversity of G4 strains and evidence of interspecies transmission / G. I. Parra, G. Vidales, J. A. Gomez [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2008. - Vol. 126, No. 1-3. - P. 243-250.

117. Patton, J. T. Coupling of rotavirus genome replication and capsid assembly / J. T. Patton, R. Vasquez-Del Carpio, M. A. Tortorici [et al.] // Advances in Virus Research. -2007. - Vol. 69. - P. 167-201.

118. Peng, R. [The epidemiological characteristics of group C rotavirus in Lulong area and the analysis of diversity of VP6 gene] / R. Peng, D. D. Li, K. Cai [et al.] // Zhonghua Shi Yan He Lin Chuang Bing Du Xue Za Zhi = Zhonghua Shiyan He Linchuang Bingduxue Zazhi = Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology. - 2013. - Vol. 27, No. 3. - P. 164-166.

119. Pham, H. A. The prevalence and genetic diversity of group A rotaviruses on pig farms in the Mekong Delta region of Vietnam / H. A. Pham, J. J. Carrique-Mas, V. C. Nguyen [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. - Vol. 170, No. 3-4. - P. 258-265.

120. Phan, M. V. T. Unbiased whole-genome deep sequencing of human and porcine stool samples reveals circulation of multiple groups of rotaviruses and a putative zoonotic infection / M. V. T. Phan, P. H. Anh, N. V. Cuong [et al.] // Virus Evolution. - 2016. -Vol. 2, No. 2. - P. vew027.

121. Phan, T. G. Rotavirus I in feces of a cat with diarrhea / T. G. Phan, Ch. M. Leutenegger, R. Chan, E. Delwart // Virus Genes. - 2017. - Vol. 53, No. 3. - P. 487-490.

122. Pinheiro, M. S. Molecular Characterization of Avian Rotaviruses F and G Detected in Brazilian Poultry Flocks / M. S. Pinheiro, Ju. B. L. Dias, M. P. Petrucci [et al.] // Viruses. -2023. - Vol. 15, No. 5. - P. 1089.

123. Possatti, F. Genetic heterogeneity of the VP6 gene and predominance of G6P[5] genotypes of Brazilian porcine rotavirus C field strains / F. Possatti, E. Lorenzetti, A. F. Alfieri, A. A. Alfieri // Archives of Virology. - 2016. - Vol. 161, No. 4. - P. 1061-1067.

124. Pott, J. Age-dependent TLR3 expression of the intestinal epithelium contributes to rotavirus susceptibility / J. Pott, S. Stockinger, N. Torow [et al.] // PLoS pathogens. -2012. - Vol. 8, No. 5. - P. e1002670.

125. Puente, H. First identification and characterization of rotavirus H in swine in Spain / H. Puente, M. Cortey, P. J. G. Nova [et al.] // Transboundary and Emerging Diseases. -2021. - Vol. 68, No. 6. - P. 3055-3069.

126. Ren, X. Milk lactose protects against porcine group A rotavirus infection / X. Ren, W. Saleem, R. Haes [et al.] // Frontiers in Microbiology. - 2022. - Vol. 13.

127. Robinson, J. T. Integrative genomics viewer / J. T. Robinson, H. Thorvaldsdottir, W. Winckler [et al.] // Nature Biotechnology. - 2011. - Vol. 29, No. 1. - P. 24-26.

128. Roczo-Farkas, S. Rotavirus group C infections in neonatal and grower pigs in Australia / S. Roczo-Farkas, R. H. Dunlop, C. M. Donato [et al.] // Veterinary Record. -2021. - Vol. 188, No. 12.

129. Rodger, S. M. Letter: Demonstration of reovirus-like particles in intestinal contents of piglets with diarrhoea / S. M. Rodger, J. A. Craven, I. Williams // Australian Veterinary Journal. - 1975. - Vol. 51, No. 11. - P. 536.

130. Rukhadze, G. G. [Isolation and cultivation of a swine rotavirus] / G. G. Rukhadze, V. A. Sergeev, B. G. Orliankin // Voprosy Virusologii. - 1987. - Vol. 32, No. 1. - P. 74-80.

131. Rukhadze, G. G. [Immunobiologic properties of swine rotavirus] / G. G. Rukhadze // Voprosy Virusologii. - 1988. - Vol 33, No. 6. - P. 717-722.

132. Saif, L. J. Rotavirus-like, calicivirus-like, and 23-nm virus-like particles associated with diarrhea in young pigs / L. J. Saif, E. H. Bohl, K. W. Theil [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. - 1980. - Vol. 12, No. 1. - P. 105-111.

133. Salem, A. N. B. Multiplex nested RT-PCR for the detection of porcine enteric viruses / A. N. B. Salem, A. Chupin Sergei, P. Bjadovskaya Olga [et al.] // Journal of Virological Methods. - 2010. - Vol. 165, No. 2. - P. 283-293.

134. Sashina, T. A. Genotype constellations of the rotavirus A strains circulating in Nizhny Novgorod, Russia, 2017-2018 / T. A. Sashina, O. V. Morozova, N. V. Epifanova, N. A. Novikova // Infection, Genetics and Evolution. - 2020. - Vol. 85. - P. 104578.

135. Sergeev, V. A. [Molecular drift of rotavirus during attenuation] / V. A. Sergeev, A.G. Bukrinskaia, G. G. Rukhadze [et al.] // Voprosy Virusologii. - 1987. - Vol. 32, No. 3. - P. 347-352.

136. Shepherd, F. K. Longitudinal Surveillance of Porcine Rotavirus B Strains from the United States and Canada and In Silico Identification of Antigenically Important Sites / F.

K. Shepherd, M. P. Murtaugh, F. Chen [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2017. -Vol. 6, No 4. - P. 64.

137. Shepherd, F. K. Whole Genome Classification and Phylogenetic Analyses of Rotavirus B strains from the United States / F. K. Shepherd, D. M. Herrera-Ibata, E. Porter [et al.] // Pathogens (Basel, Switzerland). - 2018. - Vol. 7, No. 2. - P. 44.

138. Shi, K. Development of a Quadruplex RT-qPCR for the Detection of Porcine Rotaviruses and the Phylogenetic Analysis of Porcine RVH in China / K. Shi, H. Zhou, Sh. Feng [et al.] // Pathogens. - 2023. - Vol. 12, No. 9. - P. 1091.

139. Silva, F. D. F. Whole-genomic analysis of 12 porcine group A rotaviruses isolated from symptomatic piglets in Brazil during the years of 2012-2013 / F. D. F. Silva, L. R. L. Espinoza, P. O. Tonietti [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. - 2015. - Vol. 32. - P. 239-254.

140. Silva, M. F. M. da. Phylogenetic analysis of VP1, VP2, and VP3 gene segments of genotype G5 group A rotavirus strains circulating in Brazil between 1986 and 2005 / M. F. M. da Silva, L. F. Tort, M. M. Gómez [et al.] // Virus Research. - 2011. - Vol. 160, No. 12. - P. 381-388.

141. Smitalova, R. Detection of nongroup A rotaviruses in faecal samples of pigs in the Czech Republic / R. Smitalova, L. Rodak, B. Smid // Veterinární medicina. - 2009. - Vol. 54, No 1. - P. 12-18.

142. Smol'ak, D. Analysis of RNA virome in rectal swabs of healthy and diarrheic pigs of different age / D. Smol'ak, S. Salamúnová, A. Jacková [et al.] // Comparative Immunology, Microbiology & Infectious Diseases. - 2022. - Vol. 90-91. - P. 101892.

143. Sreenivasan, C. C. Epidemiological investigation of equine rotavirus B outbreaks in horses in central Kentucky / Ch. C. Sreenivasan, A. Naveed, T. Uprety [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2024. - Vol. 298. - P. 110278.

144. Steyer, A. Molecular characterization of a new porcine rotavirus P genotype found in an asymptomatic pig in Slovenia / A. Steyer, M. Poljsak-Prijatelj, D. Barlic-Maganja [et al.] // Virology. - 2007. - Vol. 359, No. 2. - P. 275-282.

145. Stipp, D. T. VP6 gene diversity in 11 Brazilian strains of porcine group C rotavirus / D. T. Stipp, A. F. Alfieri, E. Lorenzetti [et al.] // Virus Genes. - 2015. - Vol. 50, No. 1. -P. 142-146.

146. Strydom, A. Phylogenetic Analyses of Rotavirus A, B and C Detected on a Porcine Farm in South Africa / A. Strydom, N. Segone, R. Coertze [et al.] // Viruses. - 2024. -Vol. 16, No. 6. - P. 934.

147. Stubbs, S. C. B. Full genomic characterization of a porcine rotavirus strain detected in an asymptomatic piglet in Accra, Ghana / S. C. B. Stubbs, O. Quaye, M. E. Acquah [et al.] // BMC Veterinary Research. - 2020. - Vol. 16, No. 1. - P. 1-18.

148. Suzuki, T. Phylogenetic analysis of nonstructural protein 5 (NSP5) gene sequences in porcine rotavirus B strains / T. Suzuki, J. Soma, A. Miyazaki [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2012. - Vol. 12, No. 8. - P. 1661-1668.

149. Suzuki, T. Phylogenetic characterization of VP6 gene (inner capsid) of porcine rotavirus C collected in Japan / T. Suzuki, A. Hasebe, A. Miyazaki [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2014. - Vol. 26. - P. 223-227.

150. Suzuki, T. Analysis of genetic divergence among strains of porcine rotavirus C, with focus on VP4 and VP7 genotypes in Japan / T. Suzuki, A. Hasebe, A. Miyazaki [et al.] // Virus Research. - 2015. - Vol. 197. - P. 26-34.

151. Suzuki, T., Hasebe A. A provisional complete genome-based genotyping system for rotavirus species C from terrestrial mammals / T. Suzuki, A. Hasebe // Journal of General Virology. - 2017. - Vol. 98, No. 11. - P. 2647-2662.

152. Suzuki, T. Full genome-based genotyping system for rotavirus H and detection of potential gene recombination in nonstructural protein 3 between porcine rotavirus H and rotavirus C / T. Suzuki, D. Inoue // The Journal of General Virology. - 2018. - Vol. 99, No. 12. - P. 1582-1589.

153. Teodoroff, T. A. Predominance of porcine rotavirus G9 in Japanese piglets with diarrhea: close relationship of their VP7 genes with those of recent human G9 strains / T. A. Teodoroff, H. Tsunemitsu, K. Okamoto [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. -2005. - Vol. 43, No. 3. - P. 1377-1384.

154. Theuns, S. Porcine group A rotaviruses with heterogeneous VP7 and VP4 genotype combinations can be found together with enteric bacteria on Belgian swine farms / S. Theuns, L. M. Desmarets, E. Heylen [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2014. - Vol. 172, No. 1-2. - P. 23-34.

155. Theuns, S. Complete genome characterization of recent and ancient Belgian pig group A rotaviruses and assessment of their evolutionary relationship with human rotaviruses / S. Theuns, E. Heylen, M. Zeller [et al.] // Journal of Virology. - 2015. - Vol. 89, No. 2. - P. 1043-1057.

156. Theuns, S. Presence and characterization of pig group A and C rotaviruses in feces of Belgian diarrheic suckling piglets / S. Theuns, P. Vyt, L. M. B. Desmarets [et al.] // Virus Research. - 2016. - Vol. 213. - P. 172-183.

157. Theuns, S. Characterization of a genetically heterogeneous porcine rotavirus C, and other viruses present in the fecal virome of a non-diarrheic Belgian piglet / S. Theuns, N. Conceiçâo-Neto, M. Zeller [et al.] // Infection, Genetics and Evolution: Journal of Molecular Epidemiology and Evolutionary Genetics in Infectious Diseases. - 2016. - Vol. 43. - P. 135-145.

158. Theuns, S. Nanopore sequencing as a revolutionary diagnostic tool for porcine viral enteric disease complexes identifies porcine kobuvirus as an important enteric virus / S. Theuns, Q. Bernaert, M. Vandenhole [et al.] // Scientific Reports. - 2018. - Vol. 8, No. 1.

- P. 9830.

159. Torres-Medina, A. Isolation of an atypical rotavirus causing diarrhea in neonatal ferrets / A. Torres-Medina // Laboratory Animal Science. - 1987. - Vol. 37, No. 2. - P. 167-171.

160. Troväo, N. S. Evolution of rotavirus C in humans and several domestic animal species / N. S. Troväo, M. I. Nelson, F. K. Shepherd [et al.] // Zoonoses and Public Health. - 2019.

- Vol. 66, No. 5. - P. 546-557.

161. Tuanthap, S. Porcine rotavirus C in pigs with gastroenteritis on Thai swine farms, 2011-2016 / S. Tuanthap, C. Phupolphan, S. Luengyosluechakul [et al.] // PeerJ. - 2018. -Vol. 6. - P. e4724.

162. Tzipori, S. Escherichia coli and rotavirus infections in four-week-old gnotobiotic piglets fed milk or dry food / S. Tzipori, D. Chandler, T. Makin [et al.] // Australian Veterinary Journal. - 1980. - Vol. 56, No. 6. - P. 279-284.

163. Vereecke, N. Viral and Bacterial Profiles in Endemic Influenza A Virus Infected Swine Herds Using Nanopore Metagenomic Sequencing on Tracheobronchial Swabs / N. Vereecke, S. Zwickl, S. Gumbert [et al.] // Microbiology Spectrum. - 2023. - Vol. 11, No. 2.

164. Vidal, A. Full-genome characterization by deep sequencing of rotavirus A isolates from outbreaks of neonatal diarrhoea in pigs in Spain / A. Vidal, H. Clilverd, M. Cortey, [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2018. - Vol. 227. - P. 12-19.

165. Vidal, A. Prevalence of enteric pathogens in diarrheic and non-diarrheic samples from pig farms with neonatal diarrhea in the North East of Spain / A. Vidal, G. E. Martin-Valls, M. Tello [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2019. - Vol. 237. - P. 108419.

166. Vizzi, E. Evaluation of serum antibody responses against the rotavirus nonstructural protein NSP4 in children after rhesus rotavirus tetravalent vaccination or natural infection / E. Vizzi, E. Calviño, R. González [et al.] // Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology. - 2005. - Vol. 12, No. 10. - P. 1157-1163.

167. Vlasova, A. N. Porcine Rotaviruses: Epidemiology, Immune Responses and Control Strategies / A. N. Vlasova, J. O. Amimo, L. J. Saif // Viruses. - 2017. - Vol. 9, No. 3. - P. 48.

168. Wang, Y. Whole-genome classification of rotavirus C and genetic diversity of porcine strains in the USA / Y. Wang, E. P. Porter, N. Lu [et al.] // Journal of General Virology. -2021. - Vol. 102, No. 5.

169. Welter, M. W. Evaluation of killed and modified live porcine rotavirus vaccines in cesarean derived colostrum deprived pigs / M. W. Welter, C. J. Welter // Veterinary Microbiology. - 1990. - Vol. 22, No. 2-3. - P. 179-186.

170. Wen, K. Toll-like receptor and innate cytokine responses induced by lactobacilli colonization and human rotavirus infection in gnotobiotic pigs / K. Wen, M. S. Azevedo, A. Gonzalez [et al.] // Veterinary Immunology and Immunopathology. - 2009. - Vol. 127, No. 3-4. - P. 304-315.

171. Wenske, O. Epidemiological analysis of porcine rotavirus A genotypes in Germany / O. Wenske, A. Rückner, D. Piehler [et al.] // Veterinary Microbiology. - 2018. - Vol. 214. - P. 93-98.

172. Yamagami, T. Analysis of the effect of feedback feeding on the farm-level occurrence of porcine epidemic diarrhea in Kagoshima and Miyazaki Prefectures, Japan / T. Yamagami, T. Miyama, H. Toyomaki [et al.] // Journal of Veterinary Medical Science. -2021. - Vol. 83, No. 11. - P. 1772-1781.

173. Yang, H. [A novel rotavirus causing large scale of adult diarrhea in Shi Jiazhuang] / H. Yang, S. Chen, S. Ji // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi = Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi. - 1998. - Vol. 19, No. 6. - P. 336-338.

174. Yinda, C. K. Cameroonian fruit bats harbor divergent viruses, including rotavirus H, bastroviruses, and picobirnaviruses using an alternative genetic code / C. K. Yinda, S. M. Ghogomu, N. Concei?äo-Neto [et al.] // Virus Evolution. - 2018. - Vol. 4, No. 1. - P. vey008.

175. Yodmeeklin, A. Great genetic diversity of rotaviruses detected in piglets with diarrhea in Thailand / A. Yodmeeklin, P. Khamrin, W. Chuchaona [et al.] // Archives of Virology. -2016. - Vol. 161, No. 10. - P. 2843-2849.

176. Yuzhakov, A. Prevalence and genetic diversity of group a rotavirus genotypes in moscow (2019-2020) / A. Yuzhakov, K. Yuzhakova, N. Kulikova [et al.] // Pathogens. -2021. - Vol. 10, No. 6. - P. 674.

177. Zhirakovskaia, E. First genetic characterization of rotavirus C in Russia / E. Zhirakovskaia, A. Tikunov, N. Tikunova [et al.] // Infection, Genetics and Evolution. -2016. - Vol. 39. - P. 1-8.

178. Zimmerman Jeffrey J. Diseases of Swine. / J. J. Zimmerman, L. A. Karriker, A. Ramirez, K. J. Schwartz, G. W. Stevenson [et al.]., 11-е изд., New York, NY: John Wiley & Sons, - 2019.

179. Genus: Rotavirus | ICTV. - Режим доступа: https://ictv.global/report/chapter/sedoreoviridae/rotavirus (дата обращения: 24.02.2025). - [Электронный ресурс].

ПРИЛОЖЕНИЕ

Дополнительная таблица 1 - Показатели обнаружения видов ротавирусов у

домашних свиней на свинокомплексах в разных регионах России.

Регионы Хозяйства Комбинации

РВА РВВ РВС РВА +РВС РВА +РВВ РВВ +РВС РВА+РВВ +РВС

Тверская область Т01 5/8 0 0 0 0 0 0

Т02 4/10 0 0 2/10 0 0 0

ТОЗ 2/12 0 0 0 0 0 0

Московская область М01 3/20 3/20 9/20 1/20 0 0 0

Воронежская область У01 1/10 0 0 0 0 0 0

У02 7/20 0 6/20 3/20 0 0 0

УОЗ 9/20 1/20 0 0 0 0 0

Белгородская область В01 8/50 7/50 5/50 3/50 9/50 0 1/50

Свердловская область 801.1 5/40 0 1/40 0 6/40 0 0

801.2 16/40 0 0 2/40 0 0 0

Тюменская область ТУ1 28/30 1/30 0 0 0 0 0

Томская область ТМ1 6/40 2/40 1/40 3/40 1/40 0 3/40

ТМ2 3/40 16/40 0 1/40 2/40 2/40 1/40

ТМЗ 1/40 3/40 5/40 1/40 0 2/40 2/40

ТМ4 1/40 4/40 1/40 0 5/40 0 1/40

Красноярский край КК1 0 4/40 2/40 0 0 0 0

КК2 3/40 0 0 0 0 0 0

КК4 5/40 3/40 1/40 0 0 0 0

Продолжение Дополнительной таблицы 1

Новосибирская область N01.1 3/40 0 0 0 0 0 0

N01.2 0 0 7/40 0 0 2/40 0

Республика Бурятия ЯБ1 22/40 0 1/40 15/40 0 0 2/40

ЯБ2 26/39 0 1/39 8/39 1/39 0 3/39

Кемеровская область КМ1 4/40 1/40 1/40 0 3/40 1/40 2/40

КМ2 4/40 1/40 0 0 1/40 3/40 3/40

Всего 774 166 (21,4%) 46 (5,9%) 41 (5,3%) 39 (5,0%) 28 (3,6%) 10 (1,3%) 18 (2,3%)

Дополнительная таблица 2 - Распределение комбинаций О/Р-генотипов изолятов РВА, выявленных у домашних свиней в ходе мониторингового и полногеномного исследований.

Генотип О2 О3 О4 О5 О9 О11 ОХ

Р[6] - 1 3 - 1 1 1

Р[7] - 1 - - - - -

Р[13] - 3 1 2 1 1 2

Р[23] - 2 5 - 2 1 1

Р[27] 1 - - - - - -

Р[Х] - 1 - - 2 - -

Дополнительная таблица 3 - Статистический анализ распространения ротавирусов (РВ) при моно- и смешанных (смеш.) инфекциях между возрастными группами: поросята-сосуны (С), до отъема (Д), после отъема (П) и откорм (О).

Вид ротавируса С УБ. Д С УБ. П С УБ. О Д УБ. П Д УБ. О П УБ. О

РВ (общий) р=0,0258* р<0,0001**** р=0,2643 р<0,0001**** р=0,2479 р<0,0001****

РВА общий р=0,8975 р<0,0001**** р=0,0319* р<0,0001**** р=0,0625 р<0,0001****

РВА моно р=0,6671 р=0,0166* р=0,0003*** р=0,0084** р=0,0001*** р=0,3271

РВА смеш. - р<0,0001**** р=0,0123 - - р<0,0001****

РВБ общий р=0,4124 р<0,0001**** р=0,0008*** р<0.0001**** р=0,0001*** р<0,0001****

РВБ моно р=0,4124 р=0,9020 р=0,0023** р=0,3643 р=0,0003*** р=0,0119*

РВБ смеш. - - - - - р<0,0001****

РВС общий - р<0,0001**** р=0,7307 - - р<0,0001****

РВС моно - р=0,9655 р=0,0464* - - р=0,0699

РВС смеш. - р<0,0001**** р=0,0074** - - р<0,0001****

"-" - вычисление не выполнялось, если один из показателей был равен 0.

Дополнительная таблица 4 - Представленность видов бактерий и вирусов, определенная методом метагеномного секвенирования в положительных образцах на разные виды ротавирусов.

Sample ID Buryatia-22-7

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus A 99% Bacteroides sp. 60%

Caudoviricetes 1% Fusobacterium sp. 8%

Escherichia sp. 3%

Sample ID Buryatia-22-8

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus A 98% Bacteroides sp. 25%

Caudoviricetes 2% Campilobacter sp. 21%

Clostridium sp. 10%

Escherichia sp. 5%

Sample ID MR-22

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus A 82% Bacteriodes sp. 13%

Caudoviricetes 5% Escherichia sp. 7%

Porcine kobuvirus 4% Streptococcus sp. 7%

Enterovirus G 0.4% Rothia sp. 5%

Cutibacterium sp. 1%

Sample ID KRSN5-2

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus A 93% Escherichia sp. 13%

Rotavirus B 0.8% Prevotella sp. 8%

Caudoviricetes 0.7% Clostridium sp. 3%

Picobirnavirus sp. 0.5% Klebsiella sp. 2%

Porcine astrovirus 2 0.2%

Posavirus sp. 0.1%

Enterovirus G 0.07%

Porcine astrovirus 4 0.02%

Sample ID MSC9

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus С 99% Fusobacterium sp. 27%

Caudoviricetes 1% Clostridium sp. 12%

Escherichia sp. 5%

Sample ID Moscow-13

Viruses Procentage Bacteria Procentage

Rotavirus A 49% Prevotella sp. 17%

Caudoviricetes 24% Dialister sp 2%

Enterovirus G 12% Treponema sp. 2%

Picobirnavirus sp. 3% Chlamydia suis 2%

Porcine astrovirus 4 0.6%

Porcine astrovirus 2 0.4%

Дополнительный рисунок 1 - Филогенетические дендрограммы с указанием генотипов, построенные на основании последовательностей генов белков УР1, УР2, УР3, УР6, ШР1, NSP2, NSP3, NSP4, NSP5 изолятов РВА. Генотипы указаны справа от скобок. Изоляты, полученные в ходе исследования, выделены синим цветом.

Дополнительный рисунок 2 - Филогенетические дендрограммы с указанием генотипов, построенные на основании последовательностей генов белков УР1, УР2, УР3, УР6, NSP1, ШР2, NSP3, NSP4, NSP5 изолятов РВБ. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят, полученный в ходе исследования, выделен синим цветом.

Дополнительный рисунок 3 - Филогенетические дендрограммы с указанием генотипов, построенные на основании последовательностей генов белков УР1, УР2, УР3, УР6, К8Р1, ШР2, ШР3, ШР4, ШР5 изолятов РВС. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят, полученный в ходе исследования, выделен синим цветом.

VP1

ITL

H_p

100 I I_

I-F

Porcine RVH VNM/12089 (KX362513 Vietnam 2012) Porcine RVH VNM/12087 [KX362524 Vietnam 2012) Porcine RVH VNM/14250 (KX362537 Vietnam 2012) Porcine RVH VNM/14176 [KX362548 Vietnam 2012) 1001_ Porcine RVH VNM/142S4 (KX362558 Vietnam 2012) -Porcine RVH MRC-DPRU1575 (KT962027 South Africa 2007)

-• Porcine RVH KLM-2022 (OQ603403 Russia 2022)

-Porcine RVH SP-VC36 (MT644968 Spain 2017)

-Porcine RVH SP-VC29 (MT644967 Spain 2017)

-Porcine RVH SP-VC19 (MT644966 Spain 2017)

-Porcine RVH SP-VC18 (MT64496S Spain 2017) -Porcine RVH MN.9.65 (KU254S92 USA 2008) -Porcine RVH NGS-18 (LC416269 Japan 2013)

-Porcine RVH OK.5.68 (MH230116 USA 2008)

-Porcine RVH NGS-9 (LC416249 Japan 2013)

-Porcine rotavirus SKA-1 (AB576629 Japan 1999)

Дополнительный рисунок 4 - Филогенетическая дендрограмма с указанием генотипов, построенная на основании последовательностей гена белка УР1 изолятов РВН. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят РВН, обнаруженный в ходе исследования, обозначен черным кругом.

Дополнительный рисунок 5 - Филогенетическая дендрограмма с указанием генотипов, построенная на основании последовательностей гена белка УР2 изолятов

РВН. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят РВН, обнаруженный в ходе исследования, обозначен черным кругом.

Дополнительный рисунок 6. Филогенетическая дендрограмма с указанием генотипов, построенная на основании последовательностей гена белка К8Р2 изолятов РВН. Изолят РВН, обнаруженный в ходе исследования, обозначен черным кругом.

NSP4

98

47

19

51

60

r- Porcine RVH BR64 (KM359499 Brazil 2012] 691 Porcine RVH BR61 (KM359497 Brazil 2012) 100 I Porcine RVH BR59 (KM359494 Brazil 2012)

Porcine RVH BR60 (KM359495 Brazil 2012) E3 Porcine RVH BR62 [km359498 Brazil 2012) Porcine RVH BR63 (KM359496 Brazil 2012) ■Porcine RVH MRC-DPRU1575(KT962036 South Africa 2007)_ -• Porcine RVH KLM-22 (OR589277 Russia 2022) ] E3

CPorcine RVH VNM/14250 (KX362546 Vietnam 2012) Porcine RVH VNM/12087 (KX362535 Vietnam 2012) _

E5

100

■Porcine RVH SP-VC29 (MT644963 Spain 2017) JE3

100 1-Porcine RVH VNM/14176 (KX362556 Vietnam 2012)

L Porcine RVH VNM/14254 (KX362567 Vietnam 2012) ■Porcine RVH VNM/12089 (KX362522 Vietnam 2012) ! oo I Porcine RVH NGS-18 [LC416267 Japan 2013) I Porcine RVH NGS-17 (LC416258 Japan 2013) -Porcine RVH NGS-9 (LC416247 Japan 2015)

69

64

99

65

66

LrPo

lool-

-Porcine RVH NGS-8 (LC348511 Japan 2015) Porcine RVH NGS-5 (LC348508 Japan 2014) Porcine RVH NGS-3 [LC348507 Japan 2014)

100

72

37

С

Porcine RVH NGS-7 (LC348510 Japan 2014) 100 I—Porcine RVH NGS-6 (LC348509 Japan 2014) Porcine RVH SP-VC18 (MT644961 Spain 2017)

E6

Porcine RVH SP-VC19 (MT644962 Spain 2017) Porcine RVH MN.9.65 (KU254585 USA 2008)

E4

99

Porcine RVH SP-VC36 (MT644964 Spain 2017) -Porcine RVH NGS-14 (LC348512.1 Japan 2014)

■Porcine RVH OK.5.68 (MH230125.1 USA 2008) -Porcine rotavirus SKA-1 (AB576628.1 Japan 1999) _

El

0.1

Дополнительный рисунок 7 - Филогенетическая дендрограмма с указанием генотипов, построенная на основании последовательностей гена белка К8Р4 изолятов РВН. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят РВН, обнаруженный в ходе исследования, обозначен черным кругом.

Дополнительный рисунок 8 - Филогенетическая дендрограмма с указанием генотипов, построенная на основании последовательностей гена белка №Р5 изолятов РВН. Генотипы указаны справа от скобок. Изолят РВН, обнаруженный в ходе исследования, обозначен черным кругом.

Приложение. Справка об использовании в учебном процессе материалов научных

исследований.

На №

МИНИСТЕРСТВО СЕЛЬСКОГО ХОЗЯЙСТВА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ федеральное государственное

БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ

ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ «МОСКОВСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННАЯ АКАДЕМИЯ

ВЕТЕРИНАРНОЙ МЕДИЦИНЫ И БИОТЕХНОЛОГИИ - МВА ИМЕНИ К.И.СКРЯБИНА» ОГРН 1037739216790 109472, г. Москва, ул.Академика Скрябина, д.23. тел. [phone], факс: [phone]

СПРАВКА

об использовании в учебном процессе материалов научных исследований Красникова Никиты Юрьевича на тему: «Распространенность

и молекулярно-генетическая характеристика ротавирусов свиней в РоссийскойФедерации»

Материалы кандидатской диссертации Красникова Никиты Юрьевича широко используются в учебном процессе кафедры эпизоотологии и организации ветеринарного делаФГБОУ ВО «Московская государственная академия ветеринарной медицины и биотехнологии -МВА имени К.И. Скрябина».

Материалы используются при проведении занятий лекционного обСучМенияРСКОГО ™П0В ДЛЯ СТуДеНТ°В °ЧН0Й' очно-заочной, заочной форм

Результаты научных исследований Красникова Н.Ю. использованы при написании методических рекомендаций для практикующих ветеринарных врачей. Рекомендуем также использоват написании учебников, учебных пособий и методических указаний по курсам эпизоотологии илабораторной диагностике болезней животных.

ь материалы при < указаний по инфекционных

Материалы рассмотрены на заседании кафедры эпизоотологии и организации ветеринарного дела (протокол от 10 июня 2025 года № 13).

Проректор по науке и инновацией™ ФГБОУ ВО «Московская государственна академия ветеринарной медицины и биотехнологии - МВА i имени К.И. Скрябина», * доктор ветеринарных наук!, профессор

А.А. Дельцов

Приложение. Методические рекомендации по выявлению и генотипированию ротавирусов А и С свиней с помощью полимеразной цепной реакции и

секвенирования генов белков УР4 и УР7.

Москва 2025