Разнообразие криптофитовых водорослей водоёмов европейской части России тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Мартыненко Никита Александрович

• Мартыненко Никита Александрович
• кандидат наук
• 2025

Оглавление диссертации кандидат наук Мартыненко Никита Александрович

Введение

Глава 1. Общая характеристика, систематика и разнообразие криптофитовых водорослей (обзор литературы)

1.1. Строение, происхождение, размножение и экология криптомонад

1.1.1 Общее строение клетки криптофитовых водорослей

1.1.2. Эволюционные связи криптомонад

1.1.3. Размножение и жизненный цикл криптофитовых водорослей

1.1.4. Экология, распространение и значение криптофитовых водорослей

1.2. История изучения и подходы к систематике криптофитовых водорослей

1.2.2. Развитие классификационных схем криптомонад

1.2.3. Признаки, используемые в систематике криптофитовых водорослей

1.2.4. Проблема морфологического диморфизма и степень разработанности родовых концепций криптофитовых водорослей

1.2.5. Проблема классификации криптофитовых водорослей

1.2.6. Скрытое разнообразие криптомонад и его изучение с помощью метода метабаркодинга

1.3. Исследования криптомонад пресных вод России

Глава 2. Материал и методы исследований

2.1. Отбор проб и краткая характеристика исследованных водоёмов

2.2. Выделение клеток в культуру и изучение их морфологии

2.3. Выделение тотальной ДНК из культур клеток, амплификация и секвенирование генетических регионов

2.4. Биоинформатический анализ полученных нуклеотидных данных

2.4.1. Обработка последовательностей и их выравнивание

2.4.2. Выбор модели нуклеотидных замен и филогенетический анализ

2.4.3. Построение моделей вторичных структур рРНК

2.5. Выделение ДНК из природных проб, подготовка библиотек,

высокопроизводительное секвенирование и обработка результатов метабаркодинга

Глава 3. Молекулярная филогения рода Cryptomonas

Глава 4. Разнообразие рода Cryptomonas в России, выявленное при изучении культур

Глава 5. Изучение разнообразия криптофитовых водорослей России с помощью метода метабаркодинга

5.1. Поиск подходящего генетического маркера для идентификации видов криптофитовых водорослей с помощью метода метабаркодинга

5.2. Разнообразие криптофитовых водорослей России, выявленное с помощью метабаркодинговых данных

Глава 6. Ревизия флоры криптомонад пресных вод России

Выводы

Список сокращений и условных обозначений

Список литературы

Приложение

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Разнообразие криптофитовых водорослей водоёмов европейской части России»

Введение

Актуальность исследования. Изучение водорослей имеет высокую значимость для оценки биоразнообразия и мониторинга состояния пресноводных экосистем. Оно способствует прогнозированию и разработке рекомендаций, направленных на сохранение биологического и ландшафтного разнообразия, а также на обеспечение нормального функционирования природных комплексов (Fan et al., 2020). В настоящее время в связи с активным развитием и внедрением современных методов идентификации водорослей, включая молекулярно-генетические походы, происходит пересмотр систематики и таксономии различных групп водорослей. Такие исследования позволяют уточнить существующие представления о разнообразии и эволюции водорослей и их месте в биологических системах.

Криптофитовые водоросли (Cryptophyceae) - обособленная эволюционная линия сравнительно небольших организмов, обитающих практически повсеместно, в пресноводных, солоноватоводных и морских экосистемах. Это преимущественно одноклеточные организмы 5-70 мкм в длину, с двумя жгутиками неравной длины и дорсовентральным строением клетки, имеющей борозду и глотку. Характерными признаками этой группы водорослей являются эжектосомы в области глотки и в покровах клетки, трехкомпонентный перипласт, хлоропласт, окружённый четырьмя мембранами и содержащий в перипластидном пространстве рудиментарное ядро красной водоросли (эндосимбионта) - нуклеоморф (Hoef-Emden, Archibald, 2017).

Известно около 20 родов и более 100 видов криптомонад, однако реальное разнообразие группы недооценено и гораздо выше этих значений (Lane, Archibald, 2008; Hoef-Emden, Archibald, 2017). В частности, в последнее время описано два новых рода криптомонад (Laza-Martinez, 2012; Daugbjerg et al., 2018). Подавляющее большинство криптофитовых водорослей - подвижные планктонные организмы, что определяет особенности выделения клеток в культуру. Небольшие размеры у большинства видов, подвижность, плохая сохранность клеток в пробах и трудности содержания культур, а именно требовательность к составу сред в зависимости от

условий обитания, необходимость частых пересевов и неустойчивость в культуре, определяют сравнительно небольшое число видов и штаммов даже в самых крупных коллекциях культур водорослей. Живые культуры данной группы водорослей доступны только из ограниченного числа регионов и местообитаний. Наиболее крупные коллекции пресноводных криптомонад получены при изучении водоемов Германии (Hoef-Emden, Melkonian, 2003; Hoef-Emden, 2007) и Южной Кореи (Choi et al., 2013). В систематике криптомонад для разграничения видов традиционно использовали морфологические признаки, основанные на изучении клеток сначала методами световой, а потом и электронной микроскопии. Ревизия рода Cryptomonas Ehrenberg, проведенная в начале 2000-х годов (Hoef-Emden, Melkonian, 2003; Hoef-Emden, 2007) на основе изучения культур водорослей с применением молекулярно-генетических методов и параллельным исследованием морфологии клеток (световая и электронная микроскопия), выявила диморфизм у видов рода. Диморфизм криптомонад, а также то, что эти организмы имеют простую и не всегда постоянную форму клетки с небольшим количеством признаков, привели к конфликту традиционной системы, построенной только на морфологических характеристиках, с молекулярно-генетическими данными, которые выявили большое разнообразие группы (Hoef-Emden, Archibald, 2017).

При метабаркодинговых исследованиях водоемов Европы (Boenigk et al., 2018), оз. Байкал (Annenkova et al., 2020) и Северной Америки (Hornberger et al., 2023) было выявлено много клад некультивируемых организмов среди криптомонад и большое разнообразие на видовом уровне внутри рода Cryptomonas. Таким образом, можно констатировать, что разнообразие криптомонад пресных вод изучено слабо, и молекулярно-генетический подход становится единственным надежным методом выявления разнообразия и идентификации этой группы водорослей (Hoef-Emden, 2007).

Несмотря на распространённость и частоту встречаемости криптомонад в природных пробах, в России практически отсутствуют специализированные исследования этой сложной для изучения группы (Митрофанова, 2010; 2015). Подавляющее большинство работ, где были идентифицированы криптофитовые

водоросли, посвящены фитопланктону и, к сожалению, в них не представлены ни фотографии, ни размерные данные, ни другие характеристики, по которым можно было проверить ту или иную находку. При исследовании фитопланктона часто используются фиксаторы, что приводит к деформации стенок или полному разрушению клеток криптомонад. Это ведет к неверной идентификации и недоучету данной группы водорослей в большинстве исследований.

Цель и задачи исследования. Цель данного исследования - оценка разнообразия криптофитовых водорослей водоёмов европейской части России с помощью современных молекулярно-генетических методов и проведение ревизии флоры данной группы.

Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

1. Изучить разнообразие пресноводных криптофитовых водорослей европейской части России на основе оригинальной коллекции культур.

2. Выявить филогенетические связи внутри рода Cryptomonas и рассмотреть скрытое разнообразие в группе, используя анализ молекулярно-генетических данных, полученных при изучении оригинальной и мировых коллекций культур.

3. Оценить релевантность различных генетических маркеров для изучения разнообразия криптомонад в природных пробах методом метабаркодинга на основе созданной референсной базы данных.

4. Выявить разнообразие криптофитовых водорослей и особенности их распространения с помощью метода метабаркодинга природных проб из различных водоёмов России.

5. Выявить степень сходства флоры криптомонад европейской части России и стран Европы с помощью метода метабаркодинга.

6. Провести ревизию криптофитовых водорослей России на основе литературных и оригинальных данных.

Предмет защиты. Разнообразие, биогеография и систематика криптофитовых водорослей.

Научная новизна. Впервые было проведено исследование пресноводной флоры криптомонад России современными молекулярно-генетическими методами: с помощью мультигенной филогении, моделирования вторичных структур рРНК и поиска компенсаторных замен, а также метабаркодинга. На основе материала из России были описаны 9 новых для науки видов, типифицировано ещё 3 и подтверждены молекулярно-генетическими методами находки 10 видов рода Cryptomonas. Для всех обнаруженных видов впервые приведены уточнённые морфологические описания на русском языке, найдены молекулярные подписи в домене О LSU и ITS2 ядерной рДНК, а также представлены нуклеотидные последовательности SSU, рДНК и psbA хпДНК у всех идентифицированных видов.

Изучены филогенетические отношения внутри рода Cryptomonas на основании наиболее представительной на сегодняшний день выборки, включающей нуклеотидные последовательности 105 штаммов, относящихся к 59 видовым кладам рода Cryptomonas, по четырём генетическим фрагментам SSU, LSU, ITS2 ядерной рДНК и psbA хпДНК. Подтверждено и описано скрытое молекулярно-генетическое разнообразие внутри считающихся распространёнными видов рода Cryptomonas.

Сформирована коллекция культур, включающая практически все описанные с помощью молекулярно-генетических подходов виды из Европы, а также 12 новых видовых клад, обнаруженных в России. На основе этих данных была сформирована референсная база данных по маркеру У9 SSU+ITS1 ядерной рДНК с целью дальнейшего использования в метабаркодинговых исследованиях. Впервые для России были исследованы водоёмы Нижегородской области, республик Коми, Карелии и Марий Эл методом метабаркодинга и проведено изучение разнообразия криптофитовых водорослей данным методом. Было проведено сравнение оценок разнообразия криптомонад пресных вод, полученных с помощью метода метабаркодинга и молекулярно-генетического анализа штаммов, и указаны отличия результатов двух разных подходов. Согласно вновь полученным данным, расширены представления о значительно недооценённом разнообразии других

родов криптофитовых водорослей в пресных водах. Впервые был проведён анализ географического распространения видов рода Cryptomonas на основе метабаркодинговых данных России и Европы.

Теоретическая значимость. Результаты исследования имеют высокую значимость в области систематики и филогении водорослей. Работа вносит большой вклад в ревизию таксономической структуры рода Cryptomonas, а также закладывает фундамент понимания роли криптомонад в структуре водных экосистем. В ходе данной работы обсуждаются методологические основы и подходы метабаркодинговых исследований для изучения не только криптомонад, но и других групп водорослей.

Практическое значение работы. Полученные результаты могут использоваться для составления атласов и определителей криптофитовых водорослей. Молекулярные подписи, лежащие в основе точного определения видов, а также созданная нами референсная база данных могут быть пригодны не только для видовой идентификации видов, но и изучения их географического распространения и использования в биомониторинге. Полученные в ходе работ штаммы криптофитовых водорослей могут быть использованы в биотехнологических исследования с целью получения ценных соединений.

Положения, выносимые на защиту:

1. Разнообразие криптофитовых водорослей в водоёмах России недооценено. В результате молекулярно-генетических исследований были описаны новые для науки и флоры России виды рода Cryptomonas и выявлены новые филогенетические линии видового и родового уровня в других группах криптомонад.

2. Внутри большого числа видовых клад рода Cryptomonas, идентифицированных на основе изучения их морфологии, имеется скрытое разнообразие, которое можно выявить только с помощью молекулярно-генетических методов.

3. Виды, считавшиеся космополитными, имеют ограниченное распространение. Флора криптофитовых водорослей европейской части России во

многом схожа с флорой Европы, но при этом обладает своеобразием, выраженным в обнаруженных только в России видах криптомонад.

Структура и объем работы. Диссертационная работа включает введение, 6 глав, выводы, список сокращений и условных обозначений, список литературы и приложение; изложена на 402 страницах. Список литературы содержит 467 источников, из них 422 на иностранных языках.

Личный вклад соискателя. Представленная работа, включая её планирование, получение результатов, написание и редактирование текста диссертации, выполнена непосредственно соискателем Мартыненко Никитой Александровичем. Им проведён сбор полевого материала, изоляция клеток криптомонад с целью получения культур этой группы водорослей, инвентаризация и пересев имеющихся штаммов, цикл молекулярно-генетических работ и их биоинформационная обработка. В коллективе с соавторами был подготовлен и опубликован ряд публикаций по теме диссертации.

Апробация работы. Результаты работы были представлены на 5 всероссийских конференциях с международным участием: на XI Всероссийском конгрессе молодых ученых-биологов с международным участием «Симбиоз-Россия 2019» (Пермь, 2019), V Всероссийской научной конференции с международным участием «Водоросли: проблемы таксономии, экологии и использование в мониторинге» (Нижний Новгород, 2021), Всероссийской конференции «Коллекции как основа изучения генетических ресурсов растений и грибов» (Санкт-Петербург, 2022), XIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием для молодых ученых по проблемам водных и наземных экосистем, посвященная 60-летию со дня преобразования Севастопольской биологической станции в ИнБЮМ» (Севастополь, 2023) и на VII Всероссийской научной конференции с международным участием «Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии» (Владивосток, 2024).

Публикации. По теме работы опубликовано 14 публикаций, среди них 9 статей в журналах, входящих в «Белый список» и индексируемых в базах данных

Web of Science и Scopus; 4 тезиса докладов на российских конференциях с международным участием и 1 статья РИНЦ.

1. Martynenko, N.A. Cryptomonas cattiensis sp. nov. (Cryptophyta: Cryptophyceae), a new species described from Vietnam / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, D.A. Kapustin, E.E. Guseva, M.S. Kulikovskiy // Phytotaxa. - 2020a. - Vol. 454. -P. 127-136. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.454.2.4

2. Martynenko, N. A. A new species of Cryptomonas (Cryptophyceae) from the Western Urals (Russia) / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, P.V. Kulizin, E.E. Guseva, K. McCartney, M.S. Kulikovskiy // European Journal of Taxonomy. - 2020b. - Vol. 649. - P. 1-12. https://doi.org/10.5852/ejt.2020.649

3. Gusev, E. Taxonomic studies of Cryptomonas lundii clade (Cryptophyta: Cryptophyceae) with description of a new species from Vietnam / E. Gusev, Y. Podunay, N. Martynenko, N. Shkurina, M. Kulikovskiy // Fottea. - 2020. - Vol. 20, №. 2. -P. 137-143. http://doi.org/10.5507/fot.2020.004

4. Gusev, E. Cryptomonas indica sp. nov. (Cryptophyceae: Cryptomonadales), a new species described from the Western Ghats, India / E. Gusev, B. Karthick, N. Martynenko, N. Shkurina, M. Kulikovskiy // Phytotaxa. - 2021. - Vol. 518, №4. -P. 261-270. https://doi.org/10.11646/phytotaxa.518.4.3

5. Martynenko, N. Description of a New Species of the Genus Cryptomonas (Cryptophyceae: Cryptomonadales), Isolated from Soils in a Tropical Forest / N. Martynenko, E. Kezlya, E. Gusev // Diversity. - 2022a. - Vol. 14, №. 11. - e1001. https://doi.org/10.3390/d14111001

6. Martynenko, N. A. Revealing hidden diversity in the Cryptomonas erosa clade (Cryptophyceae), with the description of two new species from acidic habitats / N. A. Martynenko, E. S. Gusev, I. N. Sterlyagova, M. S. Kulikovskiy // Phycologia. -2022b. - Vol. 61, №. 2. - P. 184-194. https://doi.org/10.1080/00318884.2022.2025727

7. Gusev, E. Molecular diversity of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae) in Russia / E. Gusev, N. Martynenko, P. Kulizin, M. Kulikovskiy // European Journal of Phycology. - 2022. - Vol. 57, №. 4. - P. 526-550. https://doi.org/10.1080/09670262.2022.2031304

8. Kulizin, P. V. New Species of the Genus Cryptomonas (Cryptophyceae) in the Flora of Russia / P. V. Kulizin, N. A. Martynenko, E.S. Gusev, D. A. Kapustin, E. L Vodeneeva., M. S. Kulikovskiy // Inland Water Biology. - 2022. - Vol. 15, №. 3. - P. 227-237. https://doi.org/10.1134/S1995082922030087

9. Martynenko, N. A. Two New Species of the Genus Cryptomonas (Cryptophyta: Cryptophyceae) from Cat Tien National Park (Vietnam) / N.A. Martynenko, E. S. Gusev, P. T. Huan // Inland Water Biology. - 2024. - Vol. 17, № 6. - P. 965-976. https://doi.org/10.31857/S0320965224060033

Публикации в других изданиях:

10. Гусев, Е.С. Разнообразие криптофитовых водорослей тропического региона / Е. С. Гусев, Н. А. Мартыненко, П. В. Кулизин, Ю. А. Подунай // Вопросы современной альгологии. - 2021. - № 2(26). - С. 139-143.

11. Мартыненко, Н. А. Первые итоги изучения криптофитовых водорослей Пермского края молекулярно-генетическими методами / Н. А. Мартыненко, С. В. Боронникова, Е. С. Гусев // Симбиоз-Россия 2019: Материалы XI Всероссийского конгресса молодых ученых-биологов с международным участием, Пермь, 13-15 мая 2019 года. - Пермь: Пермский государственный национальный исследовательский университет, 2019. - С. 132133.

12. Гусев, Е.С. Изучение культур как основа для выявления скрытого разнообразия микроводорослей / Е. С. Гусев, Н. А. Мартыненко, П. В. Кулизин, Ю. А. Подунай // Коллекции как основа изучения генетических ресурсов растений и грибов: Тезисы докладов всероссийской конференции (в рамках Первого научного форума «Генетические ресурсы России», 21-24 июня 2022 г.), Санкт-Петербург, 23-24 июня 2022 года. - Санкт-Петербург: Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, 2022. - С. 11.

13. Мартыненко, Н.А. Разнообразие рода Cryptomonas водоёмов различных природных зон / Н. А. Мартыненко, Е. С. Гусев, П. В. Кулизин, Ю. А. Подунай // Понт Эвксинский - 2023: Материалы XIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием для молодых ученых по

проблемам водных и наземных экосистем, посвященной 60-летию со дня преобразования Севастопольской биологической станции в ИнБЮМ, Севастополь, 09-14 октября 2023 года. - Севастополь: ФИЦ "Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского РАН", 2023. - С. 34-35.

14. Мартыненко, Н.А. Разнообразие, биогеография и экология пресноводных криптомонад / Н. А. Мартыненко, Е. С. Гусев, Ю. А. Подунай, П. В. Кулизин // Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии. Материалы VII Всероссийской научной конференции с международным участием (г. Владивосток, Россия, 16-20 сентября 2024 г.). - Владивосток: 2024. - С. 81-82.

Благодарности. Автор искренне благодарит научного руководителя к.б.н., с.н.с. лаборатории почвенной зоологии и общей энтомологии Института проблем экологии и эволюции им. А.Н. Северцова РАН Гусева Е.С. за обучение, поддержку и всестороннюю помощь на всех этапах исследования. Автор выражает глубокую благодарность всем соавторам опубликованных работ, а в особенности к.б.н. Кулизину П.В. (ННГУ им. Н.И. Лобачевского), к.б.н. Подунай Ю.А. (КНС-ПЗ РАН - филиал ФИЦ ИнБЮМ), Гусевой Е.Е., Шкуриной Н.А. (ИБВВ РАН) и к.б.н. Стерляговой И.Н. (ИБ ФИЦ Коми НЦ УрО РАН) за выполнение отдельных работ по сбору материала, изоляции клеток в культуру и поддержании коллекции культур. Автор признателен также Воякиной Е.Ю. (НИЦЭБ РАН - СПб ФИЦ РАН) за сбор проб из водоёмов Валаамского архипелага для метабаркодинга и профессору Колледжа Вирджинского университета в Уайзе (The University of Virginia's College at Wise) PhD, A.B. Cahoon за предоставление первичных результатов своего исследования. Часть работы выполнена при финансовой поддержке гранта РФФИ 18-04-01280.

Глава 1. Общая характеристика, систематика и разнообразие криптофитовых водорослей (обзор литературы)

1.1. Строение, происхождение, размножение и экология криптомонад 1.1.1 Общее строение клетки криптофитовых водорослей

Размеры клеток криптофитовых водорослей варьируются от менее 5 мкм (виды рода Hemiselmis Parke) до 70 мкм (Cryptomonas maxima Playfair). Апикальным полюсом клетки (апексом) называют полюс клетки, из которого выходят жгутики. Противоположный полюс называется антапикальным полюсом или антапексом (Hoef-Emden, Melkonian, 2003). Клетки криптомонад имеют асимметричную форму, вершина ее (апекс) часто смещена к левой стороне, а два неравных жгутика прикрепляются субапикально или латерально перед углублением, ведущим к комплексу борозды-глотки. Клетки уплощены, вентральной стороной считается та, из которой выходят жгутики, а дорсальной -противоположная сторона. Форма клеток может быть овальной, сжатой, луновидной, хвостатой, остроконечной, удлиненной, сигмовидной или иным образом искривленной. На поперечном сечении они имеют округлую или эллиптическую форму. Клетки уплощены, вентральной стороной клетки считается та, из которой выходят жгутики, а дорсальной - противоположная сторона. Когда клетку криптомонады видно с вентральной стороны, правая и левая стороны находятся справа и слева клетки, соответственно.

Строение вестибулярной зоны. Все клетки криптомонад имеют переднее, обращенное наружу углубление, называемое вестибулюм (vestibulum) или вестибулярной зоной, которое определяет вентральную сторону клетки. Два субапикальных жгутика отходят от правого края (дорсального края у Goniomonas Stein) вестибулярной зоны, и возникающая в результате асимметрия вызывает характерное вращательное движение вокруг длинной оси во время плавания. У пресноводных криптомонад имеется сократительная вакуоль, которая расположена ближе к апикальному полюсу клетки и обычно выходит на дорсальной части

вестибулюма (Kugrens et al., 1986). У некоторых представителей рода Cryptomonas (кампиломорфы) небольшой плоский придаток, известный как вестибулярный язычок (лигула), отходит от дорсального края вестибулюма, где он закрывает место выхода сократительной вакуоли (Hill, 1991a; Kugrens, Lee, 1991; Kugrens et al., 1986).

Борозда, глотка, или их комплекс являются одним из основных диагностических признаков для разграничения родов. Борозда - это вентральное углубление переменной длины, начинающееся в вестибулярной области клетки, продолжающееся назад и заканчивающееся в передней половине, центре или задней половине клетки в зависимости от вида (Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Klaveness, 1985; Kugrens et al., 1986; Munawar, Bistricki, 1979). Трубчатая инвагинация, называемая глоткой, может идти назад, вглубь клетки, начинаясь от вестибулюма или от заднего конца борозды (Munawar, Bistricki, 1979; Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Kugrens et al., 1986). У криптомонад описано несколько типов борозд (Munawar, Bistricki, 1979; Klaveness, 1985; Kugrens et al., 1986). К ним относятся простые борозды, которые остаются постоянно открытыми, и сложные борозды, которые открываются и закрываются. Такие вариации послужили фундаментальными признаками в систематике криптомонад (Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Hill, 1991a,b; Clay et al., 1999). Фактически, имеется не менее пяти вариаций в комплексе борозда-глотка (Kugrens et al., 1986), включая только глотку, только простую борозду, простую борозду и глотку или сложную структуру борозды с глоткой или без неё. Общая схема строения клетки криптомонад изображена на рисунке 1.1.

Рисунок 1.1. Общая схема строения клетки криптофитовой водоросли, вид с вентральной стороны (по Clay, 2015, с изменениями).

Два типа бороздчатых пластин, лестничные и фибриллярные, могут быть связаны с каждым типом борозд, тем самым обеспечивая дополнительный источник вариабельности. Лестничная бороздчатая пластина принимает форму лестницы, стороны которой соединены боковыми кристаллическими «ступенями». Фибриллярные пластины борозды состоят из микрофибрилл, ориентированных параллельно друг другу и образующих тонкую пластину, идущую вдоль одной стороны борозды (Hoef-Emden, Archibald, 2017).

Строение оболочки. Клеточная оболочка криптомонад представлена перипластом. Он состоит из плазматической мембраны, внутреннего и внешнего компонентов (Hibberd et al., 1971; Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Kugrens et al.,

1987; Kugrens, Lee, 1991; Wetherbee et al., 1986; 1987; Hill, 1991a,b; Clay, Kugrens, 1999a,b,c). Внутренний компонент перипласта (inner periplast component, IPC) представлен белковыми пластинками различной формы и размера (Hibberd et al., 1971; Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Kugrens, Lee, 1987; Hill, 1991a,b) или одиночным белковым чехлом, прерванным порами, где могут располагаться мелкие эжектосомы (Grim, Staehelin, 1984; Kugrens, Lee, 1987; Hill, 1991a). Пластинки IPC прикреплены к клеточной мембране с помощью внутримембранных частиц (Brett, Wetherbee, 1986; Hill, Wetherbee, 1986; 1988; 1989; Kugrens, Lee, 1987; 1991; Wetherbee et al., 1986; 1987; Clay et al., 1999), тогда как в белковых чехлах они отсутствуют. Расположение доменов внутримембранных частиц соответствует форме пластинок (Brett, Wetherbee, 1986; Kugrens, Lee, 1987; 1991; Wetherbee et al., 1987; Clay et al., 1999). Вариации формы этих пластинок могут быть различными, они могут быть шестиугольными, квадратными, овальными/круглыми, прямоугольными или неправильными. Эти признаки считались систематически значимыми и использовались для идентификации на родовом уровне. Однако, с развитием классификационных концепций криптофитовых водорослей, было показано, что наличие на внутреннем компоненте перипласта пластинок или сплошного чехла не является систематически значимым признаком и используется лишь для определения морфы, стадии жизненного цикла того или иного вида (Hill, Wetherbee, 1986; Hoef-Emden, Melkonian, 2003; Altenburger et al., 2020; van den Hoff et al., 2020). Поверхностный компонент перипласта (external periplast component, EPC) представлен пластинками, семиугольными чешуйками, слизью или их комбинацией.

Некоторые авторы утверждали, что форма пластинок на IPC может претерпевать конформационные изменения в зависимости от пробоподготовки к сканирующей электронной микроскопии (СЭМ; Gantt, 1971; Faust, 1974; Oakley, Santore, 1982). Пластинки легко поддаются изменению их геометрической формы в результате химического и физического давления между соседними пластинами (Clay, 2015). Например, в перипластах, где пластинки примерно одинакового размера, и каждая окружена шестью другими, давление, которое прижимает

пластины друг к другу, преобразует круглые/овальные пластинки в шестиугольные (Kugrens et al., 1987). В некоторых исследованиях предпринимались попытки использовать световую микроскопию для изучения структуры перипласта (Коршиков, 1924; Novarino, 1993). Различия в строении IPC, считавшиеся значимыми для систематики, показаны на рисунке 1.2.

Рисунок 1.2. СЭМ-фотографии клеток криптомонад, где слева обозначен IPC в виде пластинок у Pyrenomonas ovalis Kugrens, Clay & Lee, а справа IPC в виде сплошного чехла у Storeatula rhinosa Kugrens, Clay & Lee. Борозда и глотка обозначены стрелками (по Clay, 2015 с изменениями).

Жгутиковый аппарат. За исключением Goniomonas, у которых жгутики прикрепляются на дорсальной стороне вестибулярной зоны, у других криптомонад они крепятся субапикально к вестибулюму. Оба жгутика примерно одинаковой длины, несущие двудольные трубчатые волоски (мастигонемы) (Kugrens et al., 1987; Clay et al., 1999). По-видимому, существуют не менее пяти вариантов расположения волосков на жгутиках, которые можно увидеть только с помощью

электронной микроскопии (Kugrens et al., 1987). Наиболее распространённым вариантом является такой, при котором более длинный дорсальный жгутик имеет два ряда трубчатых волосков, а более короткий вентральный жгутик несет один ряд волосков. Трубчатые волоски дорсального жгутика имеют удлинение, называемое терминальной нитью, тогда как у вентрального жгутика эти структуры имеют две неравные терминальные нити. Жгутиковые волоски криптомонад не имеют сужающегося основания, как, например, у мастигонем страменопил (Hoef-Emden, Archibald, 2017). Кроме того, жгутики могут иметь небольшие семиугольные чешуйки (Pennick, 1981; Lee, Kugrens, 1986). Вместо трубчатых волосков у Goniomonas имеются односторонний ряд изогнутых шипов на одном из жгутиков и тонкие нетрубчатые волоски на обоих жгутиках (Kugrens et al., 1987; Kugrens, Lee, 1991).

Переходная зона жгутикового аппарата уникальна у всех криптомонад и состоит из дуплетной системы перегородок (Grain et al., 1988; Kugrens, Lee, 1991). Нет никаких свидетельств существования переходной спирали, подобной той, что была обнаружена у других классов водорослей, содержащих хлорофилл c (Hibberd, 1979). Наиболее заметными структурами, связанными со жгутиком, являются ризостиль и сложный корешок. Ризостиль - неотъемлемый компонент жгутикового аппарата криптомонад, состоящий частично из полосы микротрубочек, берущей начало вблизи базальных тел и затем распространяющейся назад в клетку. Тип ризостиля, по-видимому, коррелирует с одной из стадий жизненного цикла, о которых более подробно речь пойдёт в следующей подглаве. Один тип ризостиля обнаружен у кампиломорфных (дипломорфных) форм рода Cryptomonas Ehrenberg emend. Hoef-Emden & Melkonian (Roberts et al., 1981; Kugrens, Lee, 1991) и Proteomonas Hill & Wetherbee (Hill, Wetherbee, 1986), родов Hanusia Deane (Gillott, Gibbs, 1983; Gillot, 1990; Deane et al., 1998), Teleaulax Hill (Hill, 1991a), Storeatula Hill (Hill, 1991a), Geminigera Hill (Hill, 1991a). Такой тип ризостиля проходит близко к ядру и заканчивается вблизи заднего конца клетки. Из каждой микротрубочки отходит крыловидное расширение (киль), и длина каждого киля может варьироваться в зависимости от соответствующей микротрубочки (Gillott,

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Мартыненко Никита Александрович, 2025 год

Список литературы

1. Баженова, О.П. Фитопланктон Омского Прииртышья / О.П. Баженова, Н.Н. Барсукова, И.Ю. Игошкина [и др.]. - Омск: Омский государственный аграрный университет им. П.А. Столыпина, 2019. - 320 с.

2. Баринова, С.С. Биоразнообразие водорослей-индикаторов окружающей среды / С.С. Баринова, Л.А. Медведева, О.В. Анисимова. - Тель-Авив: Pilies Studio, 2006. - 498 с.

3. Беляева, П.Г. Видовой состав и структура фитопланктона Камского водохранилища / П.Г. Беляева // Вестник Пермского университета. Серия: Биология. - 2013. - № 3. - С. 4-11.

4. Бессудова, А.Ю. Гидрохимия и альгофлора термокарстовых озер арктической части бассейна нижнего Енисея / А.Ю. Бессудова, Л.М. Сороковикова, Ю.С. Букин [и др.] // Синергия Наук. - 2017. - № 16. - С. 1175-1199.

5. Бондаренко, Н.А. Cryptophyta водоемов и водотоков Восточной Сибири (Россия) / Н.А. Бондаренко, Л.А. Щур // Альгология. - 2008. - Т. 18, № 4. - С. 408422.

6. Буркова, Т.Н. Таксономическая характеристика фитопланктона высокоминерализованной реки Большая Сморогда (Приэльтонье) / Т.Н. Буркова // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2016. - Т. 25, № 1. - С. 131-138.

7. Буркова, Т.Н. Таксономический состав планктонных водорослей реки Чапаевка / Т.Н. Буркова // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2010. - Т. 19, № 2. - С. 26-43.

8. Воденеева, Е.Л. Доминирующие комплексы фитопланктона в устьевых участках притоков Чебоксарского водохранилища в летний сезон 2019 года / Е.Л. Воденеева, П.В. Кулизин, Е.М. Шарагина, А.Г. Охапкин // Проблемы экологии Волжского бассейна: Труды 5-й всероссийской научной конференции, Нижний Новгород, 24-25 ноября 2020 года. Выпуск 3. - Нижний Новгород: Волжский государственный университет водного транспорта, 2020. - С. 2-6.

9. Воденеева, Е.Л. Состав альгофлоры и оценка количественного развития водорослей в разнотипных водоемах национального парка "Смольный" (Республика Мордовия) / Е.Л. Воденеева, П.В. Кулизин // Труды национального парка "Смольный". - 2021. - № 5. - С. 16-27.

10. Голлербах, М.М. Почвенные водоросли / М.М. Голлербах, Э.А. Штина. -Ленинград: Наука, 1969. - 228 с.

11. Горохова, О.Г. Таксономический состав альгофлоры планктона водоемов охраняемых территорий Самарской области / О.Г. Горохова // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2010. - Т. 19, № 4. - С. 51-71.

12. Горохова, О.Г. Состав и структура сообществ фитопланктона реки Самары (бассейн Саратовского водохранилища) / О.Г. Горохова // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. - 2020. - Т. 162, № 3. -С. 413-429.

13. Горохова, О.Г. К изучению альгофлоры планктона реки Большой Черемшан / О.Г. Горохова // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2016. - Т. 25, № 2. - С. 153-160.

14. Гусев, Е.С. Разнообразие криптофитовых водорослей тропического региона / Е.С. Гусев, Н.А. Мартыненко, П.В. Кулизин, Ю.А. Подунай // Вопросы современной альгологии. - 2021. - № 2(26). - С. 139-143.

15. Гусева, К.А. Новые и редкие планктонные организмы Москва-реки, найденные в районе постройки плотины Рублевской насосной станции / К.А. Гусева // Бюллетень Московского общества испытателей природы, Отдел биологический. - 1936. - Т. 45, № 3. - С. 220-224.

16. Джаяни, Е.А. Межгодовые изменения фитопланктона Ириклинского водохранилища / Е.А. Джаяни // Биология внутренних вод. - 2020. - № 5. - С. 450457.

17. Дмитриева, О.А. Структура и динамика планктонных сообществ в Правдинском водохранилище (Калининградская область, Россия) в 2017-2020 гг / О.А. Дмитриева, А.С. Семенова // Труды АтлантНИРО. - 2021. - Т. 5, № 1(11). -С. 37-59.

18. Жариков, В.В. Протисты и бактерии озер Самарской области /

B.В. Жариков, М.Ю. Горбунов, С.В. Быкова [и др.]. - Тольятти: Кассандра, 2009. -240 с.

19. Киселев, И.А. Определитель пресноводных водорослей СССР. Вып. 6. Пирофитовые водоросли / И.А.Киселёв. - М.: Сов. наука, 1954. - 212 с.

20. Корнева, Л.Г. Состав и сезонная сукцессия фитопланктона Таганрогского залива Азовского моря и нижнего течения р. Дон в условиях изменяющегося климата / Л.Г.Корнева, Г.Ю. Глущенко // Биология внутренних вод. - 2020. - Т. 1. - С. 18-26.

21. Корнева, Л.Г. Фитопланктон водохранилищ бассейна Волги / Л.Г.Корнева; под ред. А.И. Копылова. - Кострома: Костромской печатный дом, 2015. - 284 с.

22. Коршиков, А.А. Протистологические заметки / А.А. Коршиков // Русский архив протистологии. - 1924. - Т. 3. - С. 57-74.

23. Кривина, Е.С. Таксономический состав фитопланктона оз. Прудовиков (г. Тольятти, Самарская область) / Е.С. Кривина // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2016. - Т. 25, № 4. - С. 175-188.

24. Кулизин, П.В. Новые для флоры России виды рода Cryptomonas (Cryptophyceae) / П.В. Кулизин, Н.А. Мартыненко, Е.С. Гусев, Д.А. Капустин, Е.Л. Воденеева, М.С. Куликовский // Биология внутренних вод. - 2022. - № 3. -

C. 222-232.

25. Литвиненко, Л.И. Особенности развития фитопланктона в зимовальных прудах с геотермальным водоснабжением / Л.И. Литвиненко, А.И. Литвиненко // Вестник рыбохозяйственной науки. - 2019. - Т. 6, № 3(23). - С. 24-37.

26. Мартыненко, Н.А. Разнообразие рода Cryptomonas водоёмов различных природных зон / Н.А. Мартыненко, Е.С. Гусев, П.В. Кулизин, Ю.А. Подунай // Понт Эвксинский - 2023: Материалы XIII Всероссийской научно-практической конференции с международным участием для молодых ученых по проблемам водных и наземных экосистем, посвященной 60-летию со дня преобразования Севастопольской биологической станции в ИнБЮМ, Севастополь, 09-14 октября

2023 года. - Севастополь: ФИЦ "Институт биологии южных морей им. А.О. Ковалевского РАН", 2023. - С. 34-35.

27. Мартыненко, Н.А. Разнообразие, биогеография и экология пресноводных криптомонад / Н.А. Мартыненко, Е.С. Гусев, Ю.А. Подунай, П.В. Кулизин // Водоросли: проблемы таксономии и экологии, использование в мониторинге и биотехнологии. Материалы VII Всероссийской научной конференции с международным участием (г. Владивосток, Россия, 16-20 сентября 2024 г.). -Владивосток: 2024. - С. 81-82.

28. Магаенко, О.М. Матерiали до вивчення водоростей УРСР. I. Водорост Клюквеного болота / О.М. Магаенко // Учеш записки Харювського державного университету iм. О. М. Горького. - 1938. - Т. 3. - С. 29-78.

29. Магаенко, О.М. Визначник прюноводних водоростей Украшьс^ РСР. Пiрофитовi водорост - Pyrrophyta / О.М. Матенко, Р.М. Литвиненко. - Кшв, 1977. - T. 3. - Ч. 2. - 384 с.

30. Медведева, Л.А. Каталог пресноводных водорослей юга Дальнего Востока России / Л.А. Медведева, Т. В. Никулина - Владивосток: Дальнаука. - 2014. - 271 с.

31. Митрофанова, Е.Ю. Литоральный фитопланктон глубокого олиготрофного Телецкого озера в 2021 году / Е.Ю. Митрофанова, Р.И. Воробьев // Полевые исследования в Алтайском биосферном заповеднике. - 2022. - № 4. - С. 53-58.

32. Митрофанова, Е.Ю. Chroomonas acuta Uterm. (Cryptophyta) в Телецком озере (Алтай, Россия) / Е.Ю. Митрофанова // Turczaninowia. - 2015. - Т. 18, № 2. -С. 96-104.

33. Митрофанова, Е.Ю. Криптофитовые в фитопланктоне глубокого олиготрофного Телецкого озера (горный Алтай, Россия) / Е.Ю. Митрофанова // Проблемы ботаники Южной Сибири и Монголии. - 2010. - № 9. - С. 168-171.

34. Науменко, Ю.В. Криптофитовые водоросли в водотоках и водоемах западной Сибири / Ю.В. Науменко // Растительный мир Азиатской России: Вестник Центрального сибирского ботанического сада СО РАН. - 2014. - №2 1(13). - С. 3-8.

35. Павлова, О.А.Таксономический состав фитопланктона городских водоемов Санкт-Петербурга / О.А. Павлова, И.С. Трифонова // Новости систематики низших растений. - 2005. - Т. 38. - С. 62-74.

36. Рогозин, Д.Ю. Микробное сообщество хемоклинамеромиктического озера Шунет (Хакасия, Россия) в период летней стратификации / Д.Ю. Рогозин, М.Ю. Трусова, Е.Б. Хромечек, А.Г. Дегерменджи // Микробиология. - 2010. - Т. 79, № 2. - С. 277-285.

37. Сахарова, Е.Г. Фитопланктон озера Плещеево в 2014-2016 гг / Е.Г. Сахарова // Труды Института биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН. - 2019. -№ 86(89). - С. 23-33.

38. Семенова, Л.А. Многолетние исследования фитопланктона в устье реки Оби / Л.А. Семенова // Человек и Север: Антропология, археология, экология: материалы Всероссийской научной конференции, Тюмень, 02-06 апреля 2018 года / Федеральный исследовательский центр Тюменский научный центр СО РАН. Выпуск 4. - Тюмень: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Федеральный исследовательский центр Тюменский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук, 2018. - С. 565-570.

39. Семенова, Л.А. Альгофлора некоторых водных объектов Северного Ямала / Л.А. Семенова // Экосистемные услуги и менеджмент природных ресурсов: материалы международной научно-практической конференции, Тюмень, 28-30 ноября 2019 года. - Тюмень: Издательство "ВекторБук", 2020. - С. 90-94.

40. Сиделев, С.И. Видовой состав фитопланктона озера Неро (Ярославская область) / С.И. Сиделев, О.В. Бабаназарова // Новости систематики низших растений. - 2011. - Т. 45. - С. 59-84.

41. Скворцов Б.В. Новый род МеуепеПа (Cryptomonadales) из Китая // Новости систематики низших растений. - 1968. - Т. 5. - 65-66.

42. Тарасова, Н.Г. Состав альгофлоры планктона озера Голубое (Самарская область) / Н.Г. Тарасова // Самарская Лука: проблемы региональной и глобальной экологии. - 2010. - Т. 19, № 2. - С. 157-161.

43. Трифонова, И.С. Сезонная динамика фито- и зоопланктона эвтрофирующегося озера в разные по водности и температурным условиям годы / И.С. Трифонова, А.Л. Афанасьева, Н.В. Родионова // Региональная экология. -2018. - № 3(53). - С. 29-38.

44. Троицкая, О.В. О новой криптомонаде / О.В. Троицкая // Ботанические материалы Института Споровых Растений Главного Ботанического Сада РСФСР. -1922. - Т. 1, № 8. - С. 113-114.

45. Халиуллина, Л.Ю. Фитопланктон мелководий в верховьях Куйбышевского водохранилища / Л.Ю. Халиуллина, В.А. Яковлев. - Казань: Академия наук Республики Татарстан, 2015. - 171 с.

46. Чекрыжева, Т. А. Таксономическая и экологическая характеристика фитопланктона Онежского озера / Т.А. Чекрыжева // Труды Карельского научного центра Российской академии наук. - 2012. - № 1. - С. 56-69.

47. Шибаев, С. В. Характеристика фонового состояния биоты реки Неман в зоне возможного воздействия Балтийской АЭС (Калининградская область) / С.В. Шибаев, А.В. Соколов, М.Н. Шибаева [и др.] // Известия КГТУ. - 2016. - № 42.

- С. 59-86.

48. Abidizadegan, M. Promising biomolecules with high antioxidant capacity derived from cryptophyte algae grown under different light conditions / M. Abidizadegan, J. Blomster, D. Fewer, E. Peltomaa // Biology. - 2022. - Vol. 11, № 8. - P. 1112.

49. Abidizadegan, M. The potential of cryptophyte algae in biomedical and pharmaceutical applications / M. Abidizadegan, E. Peltomaa, J. Blomster // Frontiers in Pharmacology. - 2021. - Vol. 11. - P. 618836.

50. Adir, N. Elucidation of the molecular structures of components of the phycobilisome: reconstructing a giant / N. Adir // Photosynthesis Research. - 2005. -Vol. 85. - P. 15-32.

51. Adl, S.M. Revisions to the classification, nomenclature, and diversity of eukaryotes / S.M. Adl, D. Bass, C.E. Lane [et al.] // Journal of Eukaryotic Microbiology.

- 2019. - Vol. 66, № 1. - P. 4-119.

52. Adl, S.M. The revised classification of eukaryotes / S.M. Adl, A.G. Simpson, C.E. Lane [et al.] // Journal of eukaryotic microbiology. - 2012. - Vol. 59, №2 5. - P. 429514.

53. Adolf, J.E. Can cryptophyte abundance trigger toxic Karlodinium veneficum blooms in eutrophic estuaries? / J.E. Adolf, T. Bachvaroff, A.R. Place // Harmful Algae. - 2008. - Vol. 8, № 1. - P. 119-128.

54. Aguilar, M. Next-generation sequencing assessment of eukaryotic diversity in oil sands tailings ponds sediments and surface water / M. Aguilar, E. Richardson, B. Tan, G. Walker, P.F.D. Bass, C. Nesb0, J. Foght, J.B. Dacks // Journal of Eukaryotic Microbiology. - 2016. - Vol. 63, № 6. - P. 732-743.

55. Alcocer, J. Isabela Crater-Lake: a Mexican insular saline lake / J. Alcocer, A. Lugo, M. del Rosario Sánchez, E. Escobar // Hydrobiologia. - 1998. - Vol. 381. -P. 1-7.

56. Altenburger, A. Dimorphism in cryptophytes - The case of Teleaulax amphioxeia / Plagioselmis prolonga and its ecological implications / A. Altenburger, H.E. Blossom, L. Garcia-Cuetos, H.H. Jakobsen, J. Carstensen, N. Lundholm, P.J. Hansen, 0. Moestrup, L. Haraguchi // Science advances. - 2020. - Vol. 6, № 37. - P. eabb1611.

57. Andersen, R.A. Algal Culturing Techniques. / R.A. Andersen. - New York: Elsevier Academic Press, 2005. - 578 p.

58. Andreoli, C. Some observations on Chryptophycea responsible for a winter red bloom / C. Andreoli, C. Tolomio, N. Rascio, L. Talarico // Giornale Botanico Italiano. -1986. - Vol. 120. - P. 70-71.

59. Annenkova, N. V. Tracing the origin of planktonic protists in an ancient lake / N.V. Annenkova, C.R. Giner, R. Logares // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8, № 4. -P. 543.

60. Antia, N.J. Marine cryptomonad starch from autolysis of glycerol-grown Chroomonas salina / N.J. Antia, J.Y. Cheng, R.A. Foyle, E. Percival // Journal of Phycology. - 1979. - Vol. 15, № 1. - P. 57-62.

61. Antia, N.J. The heterotrophic growth of a marine photosynthetic cryptomonad (Chroomonas salina) / N.J. Antia, J.Y. Cheng, F.J.R. Taylor // Proceedings of the

international seaweed symposium held in Santiago De Compostela, September 9-13, 1968. - Madrid: Subsecretaria De La Marina Mercante, 1969. - P. 17-29.

62. Appeltans, W. The magnitude of global marine species diversity / W. Appeltans, S.T. Ahyong, G. Anderson, M.V. Angel [et al.] // Current biology. - 2012. - Vol. 22, № 23. - P. 2189-2202.

63. Apt, K.E. Evolution of the phycobiliproteins / K.E. Apt, J.L. Collier, A.R. Grossman // Journal of Molecular Biology. - 1995. - Vol. 248, № 1. - P. 79-96.

64. Archibald, J.M. Nucleomorph genomes: structure, function, origin and evolution / J.M. Archibald // Bioessays. - 2007. - Vol. 29, № 4. - P. 392-402.

65. Arvola, L. Migration behaviour of three cryptophytes in relation to environmental gradients: an experimental approach / L. Arvola, A. Ojala, F. Barbosa, S.I. Heaney // British Phycological Journal. - 1991. - Vol. 26, № 4. - P. 361-373.

66. Arvola, L. Effects of allochthonous dissolved organic matter and inorganic nutrients on the growth of bacteria and algae from a highly humic lake / L. Arvola, T. Tulonen // Environment International. - 1998. - Vol. 24, № 5-6. - P. 509-520.

67. Auinger, B.M. Improved methodology for identification of protists and microalgae from plankton samples preserved in Lugol's iodine solution: combining microscopic analysis with single-cell PCR / B.M. Auinger, K. Pfandl, J. Boenigk // Applied and environmental microbiology. - 2008. - Vol. 74, № 8. - P. 2505-2510.

68. Bailey, J.C. Phaeothamniophyceae classis nova: a new lineage of chromophytes based upon photosynthetic pigments, rbcL sequence analysis and ultrastructure / J.C. Bailey, R.R. Bidigare, S.J. Christensen, R.A. Andersen // Protist. - 1998. - Vol. 149, № 3. - P. 245-263.

69. Ballen-Segura, M. Experimental evidence of the quantitative relationship between the prokaryote ingestion rate and the food vacuole content in mixotrophic phytoflagellates / M. Ballen-Segura, J. Catalan, M. Felip // Environmental microbiology reports. - 2018. - Vol. 10, № 6. - P. 704-710.

70. Banerji, A. Spatial and temporal dynamics of a freshwater eukaryotic plankton community revealed via 18S rRNA gene metabarcoding / A. Banerji, M. Bagley, M. Elk,

E. Pilgrim, J. Martinson, J. Santo Domingo // Hydrobiologia. - 2018. - Vol. 818. - P. 7186.

71. Baurain, D. Phylogenomic evidence for separate acquisition of plastids in cryptophytes, haptophytes, and stramenopiles / D. Baurain, H. Brinkmann, J. Petersen, N. Rodriguez-Ezpeleta, A. Stechmann, V. Demoulin, A.J. Roger, G. Burger, B.F. Lang, H. Philippe // Molecular biology and evolution. - 2010. - Vol. 27, № 7. - P. 1698-1709.

72. Belykh, O.I. Characterization of photoautotrophic microbial communities in the coastal water of Lake Baikal / O.I. Belykh, I.V. Tikhonova, A.Y. Krasnopeev, A.D. Galachyants, E.V. Sukhanova, M.Y. Suslova, A.S. Gorshkova, G. Gevorgyan, S.A. Potapov // Limnology and Freshwater Biology. - 2020. - № 3(4). - P. 966-968.

73. Bérard-Therriault, L. Guide d'identifi cation du phytoplanctonmarin de l'estuaire et du golfe du Saint-Laurent incluantégalementcertainsprotozoairs / L. Bérard-Therriault, M. Poulin, L. Bossé. - Publication spéciale canadienne des sciences halieutiques et aquatiques 128, 1999. - 387 pp.

74. Bicudo, C.E.M. Bjornbergiella, a new genus of Cryptophyceae from Hawaiian soil / C.E.M. Bicudo // Phycologia. - 1966. - Vol. 5, № 4. - P. 217-221.

75. Bicudo, C.E.M. Validation of the generic name Protocryptomonas (Cryptophyceae: Cryptomonadaceae) / C.E.M. Bicudo // Taxon. - 1989. - Vol. 38, № 1. - P. 82-83.

76. Bird, D.F. Algal phagotrophy: regulating factors and importance relative to photosynthesis in dinobryon (chrysophyceae) / D.F. Bird, J. Kalff // Limnology and Oceanography. - 1987. - Vol. 32, № 2. - P. 277-284.

77. Boenigk, J. Geographic distance and mountain ranges structure freshwater protist communities on a European scale / J. Boenigk, S. Wodniok, C. Bock, D. Beisser, C. Hempel, L. Grossmann, A. Lange, M. Jensen // Metabarcoding and Metagenomics. -2018. - Vol. 2. - P. e21519.

78. Bolyen, E. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 / E. Bolyen, J.R. Rideout, M.R. Dillon [et al.] // Nature biotechnology. - 2019. - Vol. 37, № 8. - P. 852-857.

79. Boraas, M.E. Phagotrophic Phototrophs: The Ecological Significance of Mixotrophy / M.E. Boraas, K.W. Estep, P.W. Johnson, J. Sieburth // The Journal of protozoology. - 1988. - Vol. 35, № 2. - P. 249-252.

80. Bourelly, P. Les Algues D'eau Douce. Tome III: Les Agues Bleues et Rouges. Les Eugleniens, Peridiniens et Cryptomonadines / P. Bourelly. - Paris: Editions N. Boubee & Cie, 1970. - 512 pp.

81. Brett, S.J. A comparative study of periplast structure in Cryptomonas cryophila and C. ovata (Cryptophyceae) / S.J. Brett, R. Wetherbee // Protoplasma. - 1986. -Vol. 131. - P. 23-31.

82. Broughton, M.J. Distinctive organization of genes for light-harvesting proteins in the cryptophyte alga Rhodomonas / M.J. Broughton, C.J. Howe, R.G. Hiller // Gene. -2006. - Vol. 369. - P. 72-79.

83. Brown, M.R. Nutritional properties of microalgae for mariculture / M.R. Brown, S.W. Jeffrey, J.K. Vokman, G.A. Dunstan // Aquaculture. - 1997. - Vol. 151, № 1-4. -P. 315-331.

84. Burki, F. The evolutionary history of haptophytes and cryptophytes: phylogenomic evidence for separate origins / F. Burki, N. Okamoto, J.F. Pombert, P.J. Keeling // Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences. - 2012. -Vol. 279, № 1736. - P. 2246-2254.

85. Burki. F. Phylogenomics reveals a new 'megagroup' including most photosynthetic eukaryotes / F. Burki, K. Shalchian-Tabrizi, J. Pawlowski // Biology letters. - 2008. - Vol. 4, № 4. - P. 366-369.

86. Butcher, R.W. Contributions to our knowledge of the smaller marine algae / R.W. Butcher // Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom. -1952. - Vol. 31, № 1. - P. 175-191.

87. Butcher, R.W. An introductory account of the smaller algae of British coastal waters. Part IV: Cryptophyceae (Fishery investigations. Series IV, 54 pp. + 20 plates) / R.W. Butcher. - London: Ministry of Agriculture, Fisheries and Food, 1967. - 54 p.

88. Byun, Y. PseudoViewer: web application and web service for visualizing RNA pseudoknots and secondary structures / Y. Byun, K. Han // Nucleic acids research. - 2006.

- Vol. 34, № suppl_2. - P. 416-422.

89. Cahoon, A. A meta-barcoding census of freshwater planktonic protists in Appalachia-Natural Tunnel State Park, Virginia, USA / A.B. Cahoon, A.G. Huffman, M.M. Krager, R.M. Crowell // Metabarcoding and Metagenomics. - 2018. - Vol. 2. -P. e26939.

90. Caisova, L. A consensus secondary structure of ITS2 in the Chlorophyta identified by phylogenetic reconstruction / L. Caisova, B. Marin, M. Melkonian // Protist. - 2013.

- Vol. 164, № 4. - P. 482-496.

91. Caljon, A. Brackish-water phytoplankton of the Flemish lowland / A. Caljon // Developments in Hydrobiology. Vol. 18 (edited by K. Martens). - Springer Dordrecht, 1983. - P. 1-272.

92. Callahan, B.J. DADA2: High-resolution sample inference from Illumina amplicon data / B.J. Callahan, P.J. McMurdie, M. J. Rosen, A.W. Han, A.J.A. Johnson, S.P. Holmes // Nature methods. - 2016. - Vol. 13, № 7. - P. 581-583.

93. Canter, H.M. Studies on British chytrids: XXVII. Rhizophydium fugax sp. nov., a parasite of planktonic cryptomonads with additional notes and records of Planktonic fungi / H.M. Canter, J.W.G. Lund // Transactions of the British Mycological Society. - 1968.

- Vol. 51, № 5. - P. 699-705.

94. Caraus, I. Algae of Romania. A distributional checklist of actual algae. Version 2.4. / I. Caraus. - Bacau: Studiisi Cercetari Biologie, 2017. - P. 1-1002.

95. Cavalier-Smith, T.M. Sponge phylogeny, animal monophyly, and the origin of the nervous system: 18S rRNA evidence / T.M. Cavalier-Smith, M.T.E. Allsopp, E.E. Chao, N. Boury-Esnault, J. Vacelet // Canadian Journal of Zoology. - 1996. -Vol. 74, № 11. - P. 2031-2045.

96. Cavalier-Smith, T. Principles of protein and lipid targeting in secondary symbiogenesis: Euglenoid, dinoflagellate, and sporozoan plastid origins and the eukaryote family tree / T. Cavalier-Smith // Journal of Eukaryotic Microbiology. - 1999.

- Vol. 46, № 4. - P. 347-366.

97. Cavalier-Smith, T. The kingdom Chromista: Origin and systematics / T. Cavalier-Smith // Progress in phycological research. Vol. 4. (edited by F.E. Round & D.J. Chapman). - Bristol: Biopress, 1986. - P. 309-347.

98. Chang, F.H. Winter phytoplankton and microzooplankton populations off the coast of Westland, New Zealand, 1979 / F.H. Chang // New Zealand journal of marine and freshwater research. - 1983. - Vol. 17, № 3. - P. 279-304.

99. Chodat, R. Matériaux pour l'histoire des Algues de la Suisse / R. Chodat // Bulletin de la Société Botanique de Genève. - 1922. - Vol. 13. - P. 66.

100. Choi, B. Taxonomy and phylogeny of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae, Cryptophyta) from Korea / B. Choi, M. Son, J.I. Kim, W. Shin // Algae. - 2013. - Vol. 28, № 4. - P. 307-330.

101. Christensen, T. Two new families and some new names and combinations in the algae / T. Christensen // Blumea: Biodiversity, Evolution and Biogeography of Plants. -1967. - Vol. 15, № 1. - P. 91-94.

102. Christensen, T. Bind II. Systematisk botanik. Nr. 2. Alger / T. Christensen // Botanik. (edited by T.W. Böcher, M. Lange, T. S0rensen). - K0benhavn: Munksgaard, 1962. - 178 p.

103. Christensen, T. Annotations to a textbook of phycology / T. Christensen // Botanisk Tidsskrift. - 1978. - Vol. 73(2). - P. 65-70.

104. Clay, B. L. Cryptomonads / B.L. Clay // Freshwater algae of north America (edited by J.D. Wehr, R.G. Sheath, J.P. Kociolek). - Academic Press, 2015. - P. 809850.

105. Clay, B.L. Systematics of the enigmatic kathablepharids, including EM characterization of the type species, Kathablepharisphoenikoston, and new observations on K. remigera comb. nov / B.L. Clay, P. Kugrens // Protist. - 1999a. - Vol. 150, № 1. -P. 43-59.

106. Clay, B.L. Characterization of Hemiselmis amylosa sp. nov. and phylogenetic placement of the blue-green cryptomonads H. amylosa and Falcomonas daucoides / B.L. Clay, P. Kugrens // Protist. - 1999b. - Vol. 150, № 3. - P. 297-310.

107. Clay, B.L. Description and ultrastructure of Kathablepharis tenuis sp. nov. and K. obesa sp. nov. - two new freshwater kathablepharids (Kathablepharididae) from Colorado and Wyoming / B.L. Clay, P. Kugrens // European Journal of Protistology. -1999c. - Vol. 35, № 4. - P. 435-447.

108. Clay, B.L. A revised classification of Cryptophyta / B.L. Clay, P. Kugrens, R.E. Lee // Botanical Journal of the Linnean Society. - 1999. - Vol. 131, № 2. - P. 131151.

109. Cobelas, M.Á. Catálogo de las algas continentalesespañolas. II. Craspedophyceae, Cryptophyceae, Chrysophyceae, Dinophyceae, Euglenophyceae, Haptophyceae, Phaeophyceae, Rhodophyceae, Xanthophyceae / M. Á. Cobelas // Acta Botánica Malacitana. - 1984. - Vol. 9. - P. 27-40.

110. Coleman, A.W. Is there a molecular key to the level of "biological species" in eukaryotes? A DNA guide / A.W. Coleman // Molecular phylogenetics and evolution. -2009. - Vol. 50, № 1. - P. 197-203.

111. Coleman, A.W. The significance of a coincidence between evolutionary landmarks found in mating affinity and a DNA sequence / A.W. Coleman // Protist. -2000. - Vol. 151, № 1. - P. 1-9.

112. Collini, E. Coherently wired light-harvesting in photosynthetic marine algae at ambient temperature / E. Collini, C. Wong, K.E. Wilk, P.M. Curmi, P. Brumer, G.D. Scholes // Nature. - 2010. - Vol. 463, № 7281. - P. 644-647.

113. Conrad, W. Notes protistologiques. XII.-Sur quatre Cryptomonadines rouges / W. Conrad // Bulletin du Musée royal d'Histoire naturelle de Belgique. - 1939. - Vol. 15. - P. 1-5.

114. Cruaud, P. Annual protist community dynamics in a freshwater ecosystem undergoing contrasted climatic conditions: The Saint-Charles River (Canada) / P. Cruaud, A. Vigneron, M.S. Fradette, C.C. Dorea, A.I. Culley, M.J. Rodriguez, S.J. Charette // Frontiers in Microbiology. - 2019. - Vol. 10. - P. 2359.

115. Cuhel, R.L. Night synthesis of protein by algae / R.L. Cuhel, P.B. Ortner, D.R.S. Lean // Limnology and Oceanography. - 1984. - Vol. 29, № 4. - P. 731-744.

116. Cui, Z. Metabarcoding analysis of harmful algal bloom species in the Changjiang Estuary, China / Z. Cui, Q. Xu, K. Gibson, S. Liu, N. Chen // Science of the Total Environment. - 2021. - Vol. 782. - P. 146823.

117. Cunningham, B.R. Light capture and pigment diversity in marine and freshwater cryptophytes / B.R. Cunningham, M.J. Greenwold, E.M. Lachenmyer, K.M. Heidenreich, A.C. Davis, J. Dudycha, T.L. Richardson // Journal of Phycology. - 2019. - Vol. 55, №2 3.

- P. 552-564.

118. Curtis, B.A. Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs / B.A. Curtis, G. Tanifuji, F. Burki, A. Gruber [et al.] // Nature. - 2012. -Vol. 492, № 7427. - P. 59-65.

119. Darriba, D. jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing / D. Darriba, G.L. Taboada, R. Doallo, D. Posada // Nature methods. - 2012. - Vol. 9, №№ 8.

- P. 772-772.

120. Daugbjerg, N. Baffinella frigidus gen. et sp. nov. (Baffinellaceae fam. nov., Cryptophyceae) from Baffin Bay: Morphology, pigment profile, phylogeny, and growth rate response to three abiotic factors / N. Daugbjerg, A. Norlin, C. Lovejoy // Journal of phycology. - 2018. - Vol. 54, № 5. - P. 665-680.

121. De Meester, L. The Monopolization Hypothesis and the dispersal-gene flow paradox in aquatic organisms / L. De Meester, A. Gómez, B. Okamura, K. Schwenk // Acta oecologica. - 2002. - Vol. 23, № 3. - P. 121-135.

122. Deane, J.A. Hanusia phi gen. et sp. nov. (Cryptophyceae): characterization of 'Cryptomonas sp. O' / J.A. Deane, D.R.A. Hill, S.J. Brett, G.I. McFadden // European Journal of phycology. - 1998. - Vol. 33, № 2. - P. 149-154.

123. Deane, J.A. Cryptomonad evolution: nuclear 18S rDNA phylogeny versus cell morphology and pigmentation / J.A. Deane, I.M. Strachan, G.W. Saunders, D.R.A. Hill, G.I. McFadden // Journal of Phycology. - 2002. - Vol. 38, № 6. - P. 1236-1244.

124. Debroas, D. Overview of freshwater microbial eukaryotes diversity: a first analysis of publicly available metabarcoding data / D. Debroas, I. Domaizon, J.-F. Humbert, L. Jardillier, C. Lepere, A. Oudart, N. Tai'b // FEMS Microbiology Ecology.

- 2017. - Vol. 93, № 4. - P. fix023.

125. Debroas, D. Evidence for an active rare biosphere within freshwater protists community / D. Debroas, M. Hugoni, I. Domaizon // Molecular Ecology. - 2015. -Vol. 24, № 6. - P. 1236-1247.

126. Donaher, N. The complete plastid genome sequence of the secondarily nonphotosynthetic alga Cryptomonas paramecium: reduction, compaction, and accelerated evolutionary rate / N. Donaher, G. Tanifuji, N.T. Onodera, S.A. Malfatti, P.S. Chain, Y. Hara, J.M. Archibald // Genome Biology and Evolution. - 2009. - Vol. 1. - p. 439-448.

127. Douglas, S.E. Cryptomonad algae are evolutionary chimaeras of two phylogenetically distinct unicellular eukaryotes / S.E. Douglas, C.A. Murphy, D.F. Spencer, M.W. Gray // Nature. - 1991. - Vol. 350, № 6314. - P. 148-151.

128. Douglas, S.E. The plastid genome of the cryptophyte alga, Guillardia theta: complete sequence and conserved synteny groups confirm its common ancestry with red algae / S.E. Douglas, S.L. Penny // Journal of Molecular Evolution. - 1999. - Vol. 48. -P. 236-244.

129. Doust, A.B. The photophysics of cryptophyte light-harvesting / A.B. Doust, K.E. Wilk, P.M. Curmi, G.D. Scholes // Journal of Photochemistry and Photobiology A: Chemistry. - 2006. - Vol. 184, № 1-2. - P. 1-17.

130. Dwarte, D. Freeze-fracture thylakoid ultrastructure of representative members of 'chlorophyll c' algae / D. Dwarte, M. Vesk // Micron. - 1982. - Vol. 13, № 3. - P. 325326.

131. Dwarte, D. A freeze-fracture study of cryptomonad thylakoids / D. Dwarte, M. Vesk // Protoplasma. - 1983. - Vol. 117. - P. 130-141.

132. Edmondson, W.T. Reproductive rate of planktonic rotifers as related to food and temperature in nature / W.T. Edmondson // Ecological Monographs. - 1965. - Vol. 35, № 1. - P. 61-111.

133. Ehrenberg, C.G. Animalia Evertebrataexclusis Insectis. Series Prima cum Tabularum Decade Prima / C.G. Ehrenberg // Symbolae Physicaeseu Icones et Descriptiones Animalium Evertebratorumsepositis Insectis (edited by F. Hemprich, C.G. Ehrenberg). - Berlin: Berolini ex Officina Academica, 1831. - P. 1-126.

134. Ehrenberg, C.G. Über die Entwicklung und Lebensdauer der Infusionsthiere: nebst ferneren Beiträgen zu einer Vergleichung ihrer organischen Systeme / C.G. Ehrenberg. - Berlin: Abhandl. Akad. Wissens, 1832. - P. 1-154.

135. Ehrenberg, C.G. Der Organismus der Infusionsthierchen als volkommene Organismen. Ein Blick in das tiefere organische Leben der Natur / C.G. Ehrenberg. -Leipzig: Leopold Voss, 1838. - 548 pp.

136. Ettl, H. Die Zweiteiligkeit der Chromatophorenbei Cryptomonaden / Bilobed Chromatophores in Cryptomonads / H. Ettl // Plant Systematics and Evolution. - 1980. -Vol. 135, № 3/4. - P. 227-234.

137. Ettl, H. Untersuchungen an flagellaten / H. Ettl // Österreichische Botanische Zeitschrift. - 1965. - Vol. 112, № 5. - P. 701-745.

138. Ettl, H. Uber einenintra zellularen Parasiten be Cryptomonas (Cryptophyceae) / H. Ettl, 0. Moestrup // Plant Systematics and Evolution. - 1980. - Vol. 135, № 3/4. -P. 211-226.

139. Fan, L. Alga! biorefinery to value-added products by using combined processes based on thermochemical conversion: a review / L. Fan, H. Zhang, J. Li, Y. Wang, L. Leng, J. Li, Y. Wang, L. Leng, J. Li, Y. Yao, Q. Lu, W. Yuan, W. Zhou // Algal Research. - 2020. - Vol. 47. - P. 101819.

140. Faust, M.A. Structure of the Periplast of Cryptomonas ovata var. palustris / M.A. Faust // Journal of Phycology. - 1974. - Vol. 10, № 1. - P. 121-124.

141. Faust, M.A. Effect of Light Intensity and Glycerol on the Growth, Pigment Composition, and Ultrastructure of Chroomonas sp. / M.A. Faust, E. Gantt // Journal of Phycology. - 1973. - Vol. 9, № 4. - P. 489-495.

142. Ferguson, A.J.D. Structure and dynamics of zooplankton communities maintained in closed systems, with special reference to the algal food supply / A.J.D. Ferguson, J.M. Thompson, C.S. Reynolds // Journal of Plankton Research. - 1982. - Vol. 4, № 3. -P. 523-543.

143. Fields, S.D. Ingestion and retention of Chroomonas spp. (Cryptophyceae) by Gymnodinium acidotum (Dinophyceae) / S.D. Fields, R.G. Rhodes // Journal of Phycology. - 1991. - Vol. 27, № 4. - P. 525-529.

144. Finlay, B.J. Freshwater protozoa: biodiversity and ecological function / B.J. Finlay, G.F. Esteban // Biodiversity & Conservation. - 1998. - Vol. 7. - P. 11631186.

145. Fritsch, F.E. The structure and reproduction of the algae. Vol. 1. / F.E. Fritsch. -Cambridge: University Press, 1948. - 791 pp.

146. Gantt, E. Micromorphology of the Periplast of Chroomonas sp. (Cryptophyceae) / E. Gantt // Journal of Phycology. - 1971. - Vol. 7, № 3. - P. 177-184.

147. Gantt, E. Chloroplast structure of the Cryptophyceae: evidence for phycobiliproteins within intrathylakoidal spaces / E. Gantt, M.R. Edwards, L. Provasoli // The Journal of cell biology. - 1971. - Vol. 48, № 2. - P. 280-290.

148. Gantt, E. Phycobiliproteins of Cryptophyceae. / E. Gantt // Biochemistry and Physiology of Protozoa, Vol. 1. (edited by M. Levandowsky, S.H. Hunter). - New York and London: Academic Press, 1979. - P. 121-138.

149. Gantt, E.R. Photosynthetic cryptophytes / E.R. Gantt // Phytoflagellates, Developments in Marine Biology, Vol. 2. (edited by E.R. Cox). - North Holland Amsterdam: Elsevier, 1980. - P. 381-405.

150. Garibotti, I.A. Phytoplankton spatial distribution patterns along the western Antarctic Peninsula (Southern Ocean) / I.A. Garibotti, M. Vernet, M.E. Ferrario, R.C. Smith, R.M. Ross, L.B Quetin. // Marine Ecology Progress Series. - 2003. -Vol. 261. - P. 21-39.

151. Gasol, J.M. Physiological ecology of a metalimnetic Cryptomonas population: relationships to light, sulfide and nutrients / J.M. Gasol, J. Garcia-Cantizano, R. Massana, R. Guerrero, C. Pedros-Alio // Journal of Plankton Research. - 1993. - Vol. 15, № 3. -P. 255-275.

152. Gasol, J.M. Diel changes in the microstratification of the metalimnetic community in Lake Ciso / J.M. Gasol, J. Garcia-Cantizano, R. Massana, F. Peters, R. Guerrero, C. Pedros-Alio // Hydrobiologia. - 1991. - Vol. 211. - P. 227-240.

153. Gasol, J.M. Spatial and temporal dynamics of a metalimnetic Cryptomonas peak / J.M. Gasol, R. Guerrero, C. Pedros-Alio // Journal of Plankton Research. - 1992. -Vol. 14, № 11. - P. 1565-1579.

154. Gasol, J.M. On the origin of deep algal maxima: The case of Lake Ciso / J.M. Gasol, C. Pedros-Alio // Internationale Vereinigung fur theoretische und angewandte Limnologie: Verhandlungen. - 1991. - Vol. 24, № 2. - P. 1024-1028.

155. George, E.E. A single cryptomonad cell harbors a complex community of organelles, bacteria, a phage, and selfish elements / E.E. George, D. Barcyte, G. Lax, S. Livingston, D. Tashyreva, F. Husnik, J. Lukes, M. Elias, P.J. Keeling // Current Biology. - 2023. - Vol. 33, № 10. - P. 1982-1996.

156. Gervais, F. Ecology of cryptophytes coexisting near a freshwater chemocline / F. Gervais // Freshwater Biology. - 1998. - Vol. 39, № 1. - P. 61-78.

157. Gervais, F. Light-dependent growth, dark survival, and glucose uptake by cryptophytes isolated from a freshwater chemocline / F. Gervais // Journal of Phycology. - 1997. - Vol. 33, № 1. - P. 18-25.

158. Gillespie, J.J. Characteristics of the nuclear (18S, 5.8S, 28S and 5S) and mitochondrial (12S and 16S) rRNA genes of Apis mellifera (Insecta: Hymenoptera): structure, organization, and retrotransposable elements / J.J. Gillespie, J.S. Johnston, J.J. Cannone, R.R. Gutell // Insect molecular biology. - 2006. - Vol. 15, № 5. - P. 657686.

159. Gillot, M. Phylum Cryptophyta (Cryptomonads) / M. Gillot // Handbook of Protoctista (edited by L. Margulis, J.O. Corliss, M. Melkonian, D.J. Chapman). - Boston: Jones & Bartlett Publishers, 1990. - P. 139-151.

160. Gillott, M.A. Comparison of the flagellar rootlets and periplast in two marine cryptomonads / M.A. Gillott, S.P. Gibbs // Canadian Journal of Botany. - 1983. - Vol. 61, № 7. - P. 1964-1978.

161. Gillott, M.A. The cryptomonad nucleomorph: its ultrastructure and evolutionary significance / M.A. Gillott, S.P. Gibbs // Journal of Phycology. - 1980. - Vol. 16, № 4. -P. 558-568.

162. Glazer, A.N. A common evolutionary origin for the biliproteins of cyanobacteria, rhodophyta and cryptophyta / A.N. Glazer, G.S. Apell // FEMS Microbiology Letters. -1977. - Vol. 1, № 2. - P. 113-116.

163. Glazer, A.N. Cryptomonad biliproteins - an evolutionary perspective / A.N. Glazer, G.J. Wedemayer // Photosynthesis Research. - 1995. - Vol. 46. - P. 93105.

164. Govorunova, E.G. Natural light-gated anion channels: A family of microbial rhodopsins for advanced optogenetics / E.G. Govorunova, O.A. Sineshchekov, R. Janz, X. Li, J.L. Spudich // Science. - 2015. - Vol. 349, № 6248. - P. 647-650.

165. Grain, J. Ultrastructures and evolutionary modalities of flagellar and ciliary systems in protists / J. Grain, J.P. Mignot, P. de Puytorac // Biology of the Cell. - 1988. - Vol. 63, № 2. - P. 219-237.

166. Grattepanche, J.D. Diversity of diversity: conceptual and methodological differences in biodiversity estimates of eukaryotic microbes as compared to bacteria / J.D. Grattepanche, L.F. Santoferrara, G.B. McManus, L.A. Katz // Trends in microbiology. - 2014. - Vol. 22, № 8. - P. 432-437.

167. Greenwold, M.J. A three-genome ultraconserved element phylogeny of cryptophytes / M.J. Greenwold, K. Merritt, T.L. Richardson, J.L. Dudycha // Protist. -2023. - Vol. 174, № 6. - P. 125994.

168. Grim, J.N. The Ejectisomes of the Flagellate Chilomonas paramecium: Visualization by Freeze-Fracture and Isolation Techniques / J.N. Grim, L.A. Staehelin // The Journal of protozoology. - 1984. - Vol. 31, № 2. - P. 259-267.

169. Guillard, R.R.L. Culture of phytoplankton for feeding marine invertebrates / R.R.L. Guillard // Culture of marine invertebrate animals (edited by W.L. Smith, M.H. Chanley). - New York: Plenum Press, 1975. - P. 29-60.

170. Guillou, L. The Protist Ribosomal Reference database (PR2): a catalog of unicellular eukaryote small sub-unit rRNA sequences with curated taxonomy / L. Guillou, D. Bachar, S. Audic, D. Bass [et al.] // Nucleic acids research. - 2012. -Vol. 41, № D1. - P. 597-604.

171. Guiry, M.D. AlgaeBase [World-wide electronic publication] / M.D. Guiry, G.M. Guiry. - National University of Ireland, Galway, 2021. - http: //www.al gaebase. org. (date: 25.02.2025).

172. Gusev, E. Cryptomonas indica sp. nov. (Cryptophyceae: Cryptomonadales), a new species described from the Western Ghats, India / E. Gusev, B. Karthick, N. Martynenko, N. Shkurina, M. Kulikovskiy // Phytotaxa. - 2021. - Vol. 518, № 4. -P. 261-270.

173. Gusev, E. Molecular diversity of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae) in Russia / E. Gusev, N. Martynenko, P. Kulizin, M. Kulikovskiy // European Journal of Phycology. - 2022. - Vol. 57, № 4. - P. 526-550.

174. Gusev, E. Taxonomic studies of Cryptomonas lundii clade (Cryptophyta: Cryptophyceae) with description of a new species from Vietnam / E. Gusev, Y. Podunay, N. Martynenko, N. Shkurina, M. Kulikovskiy // Fottea. - 2020. - Vol. 20, № 2. - P. 137143.

175. Hagemann, M. Heterosides - compatible solutes occurring in prokaryotic and eukaryotic phototrophs / M. Hagemann, N. Pade // Plant Biology. - 2015. - Vol. 17, №2 5. - P. 927-934.

176. Hamilton, M. Spatiotemporal variations in Antarctic protistan communities highlight phytoplankton diversity and seasonal dominance by a novel cryptophyte lineage / M. Hamilton, M. Mascioni, E. Hehenberger, C. Bachy, C. Yung, M. Vernet, A.Z. Worden // MBio. - 2021. - Vol. 12, № 6. - P. e02973-21.

177. Hammer, A. Light and temperature acclimation of Rhodomonas salina (Cryptophyceae): photosynthetic performance / A. Hammer, R. Schumann, H. Schubert // Aquatic Microbial Ecology. - 2002. - Vol. 29, № 3. - P. 287-296.

178. Hansgirg, A. Anhangzumeiner Abhandlung "Ueber den Polymorphismus der Algen" / A. Hansgirg // Botanisches Centralblatt. - 1885. - Vol. 23. - P. 229-233.

179. Hanzek, N. Comparative identification of phytoplankton taxonomic and functional group approach in karst lakes using classical microscopy and eDNA metabarcoding for ecological status assessment / N. Hanzek, M.G. Udovic, K. Kajan, G. Borics, G. Varbiro, T. Stoeck, S. Orlic, I. Stankovic // Hydrobiologia. - 2024. -Vol. 851, № 4. - P. 1015-1034.

180. Harrop, S.J. Single-residue insertion switches the quaternary structure and exciton states of cryptophyte light-harvesting proteins / S.J. Harrop, K.E. Wilk, R. Dinshaw,

E. Collini, T. Mirkovic, C.Y. Teng, D G. Oblinsky, B.R. Green, K. Hoef-Emden, R.G. Hiller, G.D. Scholes, P.M.G. Curmi // Proceedings of the National Academy of Sciences. - 2014. - Vol. 111, № 26. - P. E2666-E2675.

181. Heywood, P. Ultrastructure of Chilomonas paramecium and the phylogeny of the cryptoprotists / P. Heywood // BioSystems. - 1988. - Vol. 21, № 3-4. - P. 293-298.

182. Hibberd, D.J. Observations on the ultrastructure of the cryptomonad endosymbiont of the red-water ciliate Mesodinium rubrum / D.J. Hibberd // Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom. - 1977. - Vol. 57, № 1. - P. 4561.

183. Hibberd, D.J. The structure and phylogenetic significance of the flagellar transition region in the chlorophyll c-containing algae / D.J. Hibberd // BioSystems. -1979. - Vol. 11, № 4. - P. 243-261.

184. Hibberd, D.J. Observations on the ultrastructure of the flagella and periplast in the Cryptophyceae / D.J. Hibberd, A.D. Greenwood, H.B. Griffiths // British Phycological Journal. - 1971. - Vol. 6, № 1. - P. 61-72.

185. Hill, D.R.A. A revised circumscription of Cryptomonas (Cryptophyceae) based on examination of Australian strains / D.R.A. Hill // Phycologia. - 1991a. - Vol. 30, № 2. - P. 170-188.

186. Hill, D.R.A. Chroomonas and other blue-green cryptomonads / D.R.A. Hill // Journal of Phycology. - 1991b. - Vol. 27, № 1. - P. 133-145.

187. Hill, D.R.A. The biliproteins of the Cryptophyceae / D.R.A. Hill, K.S. Rowan // Phycologia. - 1989. - Vol. 28, № 4. - P. 455-463.

188. Hill, D.R.A. A reappraisal of the genus Rhodomonas (Cryptophyceae) / D.R.A. Hill, R. Wetherbee // Phycologia. - 1989. - Vol. 28, № 2. - P. 143-158.

189. Hill, D.R.A. Guillardia theta gen. et sp. nov. (Cryptophyceae) / D.R.A. Hill, R. Wetherbee // Canadian Journal of Botany. - 1990. - Vol. 68, № 9. - P. 1873-1876.

190. Hill, D.R.A. Proteomonas sulcata gen. et sp. nov. (Cryptophyceae), a cryptomonad with two morphologically distinct and alternating forms / D.R.A. Hill, R. Wetherbee // Phycologia. - 1986. - Vol. 25, № 4. - P. 521-543.

191. Hill, D.R.A. The structure and taxonomy of Rhinomonas pauca gen. et sp. nov. (Cryptophyceae) / D.R.A. Hill, R. Wetherbee // Phycologia. - 1988. - Vol. 27, № 3. -P. 355-365.

192. Hirakawa, Y. Polyploidy of endosymbiotically derived genomes in complex algae / Y. Hirakawa, K.I. Ishida // Genome biology and evolution. - 2014. - Vol. 6, № 4. -P. 974-980.

193. Hoang, D.T. UFBoot2: improving the ultrafast bootstrap approximation / D.T. Hoang, O. Chernomor, A. Von Haeseler, B.Q. Minh, L.S. Vinh // Molecular biology and evolution. - 2018. - Vol. 35, № 2. - P. 518-522.

194. Hoef-Emden, K. Molecular phylogeny of phycocyanin-containing cryptophytes: evolution of biliproteins and geographical distribution / K. Hoef-Emden // Journal of Phycology. - 2008. - Vol. 44. - № 4. - P. 985-993.

195. Hoef-Emden, K. Multiple independent losses of photosynthesis and differing evolutionary rates in the genus Cryptomonas (Cryptophyceae): combined phylogenetic analyses of DNA sequences of the nuclear and the nucleomorph ribosomal operons / K. Hoef-Emden // Journal of molecular evolution. - 2005. - Vol. 60. - P. 183-195.

196. Hoef-Emden, K. Osmotolerance in the Cryptophyceae: Jacks-of-all-trades in the Chroomonas Clade / K. Hoef-Emden // Protist. - 2014. - Vol. 165, № 2. - P. 123-143.

197. Hoef-Emden, K. Pitfalls of establishing DNA barcoding systems in protists: the Cryptophyceae as a test case / K. Hoef-Emden // Plos One. - 2012. - Vol. 7, № 8. -P. e43652.

198. Hoef-Emden, K. Revision of the genus Chroomonas Hansgirg: The benefits of DNA-containing specimens / K. Hoef-Emden // Protist. - 2018. - Vol. 169, № 5. -P. 662-681.

199. Hoef-Emden, K. Revision of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae) II: incongruences between the classical morphospecies concept and molecular phylogeny in smaller pyrenoid-less cells / K. Hoef-Emden // Phycologia. - 2007. - Vol. 46, № 4. -P. 402-428.

200. Hoef-Emden, K. Cryptophyta (Cryptomonads) / K. Hoef-Emden, J.M. Archibald // Handbook of the Protists. - 2017. - Vol. 724. - P. 851-891.

201. Hoef-Emden, K. Nuclear and nucleomorph SSU rDNA phylogeny in the Cryptophyta and the evolution of cryptophyte diversity / K. Hoef-Emden, B. Marin, M. Melkonian // Journal of molecular evolution. - 2002. - Vol. 55. - P. 161-179.

202. Hoef-Emden, K. Revision of the genus Cryptomonas (Cryptophyceae): a combination of molecular phylogeny and morphology provides insights into a long-hidden dimorphism / K. Hoef-Emden, M. Melkonian // Protist. - 2003. - Vol. 154, № 34. - P. 371-409.

203. Hoef-Emden, K. Lineage-specific variations of congruent evolution among DNA sequences from three genomes, and relaxed selective constraints on rbc L in Cryptomonas (Cryptophyceae) / K. Hoef-Emden, H.D. Tran, M. Melkonian. // BMC Evolutionary Biology. - 2005. - Vol. 5. - P. 1-11.

204. Hollande, A. Classe des Chloromonadines (Chloromonadina Klebs, 1892). Classe des Eugleniens (Euglenoidina Butschli, 1884). Classe des Cryptomonadines (Cryptomonadina Ehrenberg, 1832). Classe des Chrysomonadines (Chrysomonadina Stein, 1878). Ordre des Choanoflagellesou Craspedomonadines (Choanoflagellata S. Kent, 1880, Craspedomonadaceae Senn, 1900). Ordre des Bodonides (Bodonidea ord. nov.) / A. Hollande // Traite de zoologie. Tome I. Fasc. 1. (edited by P.P. Grasse). - Paris: Masson, 1952. - P. 227-308.

205. Hornberger, L.O. Cryptomonaspyrenoidifera organellar genomes and estimation of its ITS2 sequence diversity using lineage directed barcode primers / L.O. Hornberger, I.J. Maggard, R.A. Matthews, A.B. Cahoon // Phycologia. - 2023. - Vol. 62, № 3. -P. 280-291.

206. Huber-Pestalozzi, G. Das Phytoplankton des Siisswassers. Systematik und Biologie. 3. Teil. Cryptophyceen. Chloromonadinen. Peridineen / G. Huber-Pestalozzi // Die Binnengewasser. Band 16, 3. Teil. (edited by A. Thienemann). - Stuttgart: Schweizerbart, 1950. - P. 1-78.

207. Ignatenko, M. E. Algal and cyanobacterial diversity in saline rivers of the Elton Lake Basin (Russia) studied via light microscopy and next-generation sequencing / M.E. Ignatenko, E.A. Selivanova, Y.A. Khlopko, T.N. Yatsenko-Stepanova // Biosystems Diversity. - 2021. - Vol. 29, № 1. - P. 59-66.

208. Isaksson, A. Phagotrophic phytoflagellates in lakes - a literature review / A. Isaksson // Archiv für Hydrobiologie Spec. Issues: Advances in Limnology. - 1998. -Vol. 51. - P. 63-90.

209. Javornicky, P. Cryptomonas ovata Ehrenberg (Cryptophyceae) and some related species / P. Javornicky // Archiv für Hydrobiologie. Supplementband, Algological studies. - 2003. - Vol. 149. - P. 43-65.

210. Javornicky, P. Light microscopical observations of the sigmoid species of the genus Cryptomonas Ehrenberg (Cryptophyceae) and their eventual pyrenoids / P. Javornicky // Acta MuseiSilesiae. Scientiae Naturales. - 2014. - Vol. 63, № 1. - P. 124.

211. Javornicky P. N0 ekoliknovych a maloznamych bi i c ikovcyu z kmene Pyrrhophyta / P. Javornicky // Acta Universitatis Carolinae. Biologica. - 1957. - Vol. 3, № 3. - P. 251-268.

212. Javornicky, P. Some interesting algal flagellates / P. Javornicky // Folia geobotanica et phytotaxonomica. - 1967. - Vol. 2. - P. 43-67.

213. Javornicky, P. The occurrence of microscopic algae with blue-green chloroplasts or with endocyanelles (Glaucophyta) in the fresh waters of the Czech Republic, with a new report of Cryptella cyanophora Pascher / P. Javornicky // Fottea. - 2016. - Vol. 16, № 1. - P. 22-33.

214. Javornicky, P. Cryptomonas frigoris spec. nova (Cryptophyceae), the new cyst-forming flagellate from the snow of the High Tatras / P. Javornicky, F. Hindak // Biologia (Bratislava). - 1970. - Vol. 25, № 4. - P. 241-250.

215. Javornicky, P. Freshwater Rhodomonads (Cryptophyceae) / P. Javornicky // Archiv für Hydrobiologie. Supplementband, Algological studies. - 2001. - Vol. 138. -P. 93-116.

216. Jenkins, J. A genomic clone encoding a cryptophyte phycoerythrin a-subunit: Evidence for three a-subunits and an N-terminal membrane transit sequence / J. Jenkins, R.G. Hiller, J. Speirs, J. Godovac-Zimmermann // FEBS letters. - 1990. - Vol. 273, № 12. - P. 191-194.

217. Jeong, M. Multigene phylogeny reveals a cryptic diversity in the genus Dinobryon (Chrysophyceae) with integrative description of five new species / M. Jeong, Y. Wang, J.I. Kim, W. Shin // Frontiers in Plant Science. - 2023. - Vol. 14. - P. 1150814.

218. Jiang, J.G. Development of a new biotic index to assess freshwater pollution / J.G. Jiang // Environmental pollution. - 2006. - Vol. 139, № 2. - P. 306-317.

219. Jiang, J.G. Use of the aquatic protozoa to formulate a community biotic index for an urban water system / J.G. Jiang, Y.F. Shen // Science of the total environment. - 2005.

- Vol. 346, № 1-3. - P. 99-111.

220. Jones, H. A classification of mixotrophic protists based on their behaviour / H. Jones // Freshwater Biology. - 1997. - Vol. 37, № 1. - P. 35-43.

221. Karsten, G. Rhodomonas baltica n. g. et sp. / G. Karsten // Wissenschaftliche Meeresuntersuchungen: Abteilung Kiel. - 1898. - Vol. 3. - P. 15-16.

222. Katoh, K. Parallelization of the MAFFT multiple sequence alignment program / K. Katoh, H. Toh // Bioinformatics. - 2010. - Vol. 26, № 15. - P. 1899-1900.

223. Kauss, H. Sensing of volume changes by Poterioochromonas involves a Ca2+-regulated system which controls activation of isofloridoside-phosphate synthase / H. Kauss // Plant Physiology. - 1981. - Vol. 68, № 2. - P. 420-424.

224. Keeling, P.J. The secondary endosymbiont of the cryptomonad Guillardia theta contains alpha-, beta-, and gamma-tubulin genes / P.J. Keeling, J.A. Deane, C. HinkSchauer, S.E. Douglas, U.-G. Maier, G.I. McFadden // Molecular biology and evolution.

- 1999. - Vol. 16, № 9. - P. 1308-1313.

225. Khanaychenko, A.N. Rhodomonas storeatuloformis sp. nov. (Cryptophyceae, Pyrenomonadaceae), a new cryptomonad from the Black Sea: morphology versus molecular phylogeny / A.N. Khanaychenko, O.A. Rylkova, L.O. Aganesova, O.V. Popova, V.V. Aleoshin, M. Saburova // Fottea. - 2022. - Vol. 22, № 1. - P. 122136.

226. Khomich, M. Planktonic protistan communities in lakes along a large-scale environmental gradient / M. Khomich, H. Kauserud, R. Logares, S. Rasconi, T. Andersen // FEMS Microbiology Ecology. - 2017. - Vol. 93, № 4. - P. fiw231.

227. Kies, L. Typification of the Glaucocystophyta / L. Kies, B.P. Kremer // Taxon. -1986. - Vol. 35. - P. 128-133.

228. Kim, J.H. Two freshwater cryptomonads new to Korea: Cryptomonas marssonii and C. pyrenoidifera / J.H. Kim, S.M. Boo, W.G. Shin // Algae. - 2007. - Vol. 22, № 3. - P. 147-152.

229. Kimura, B. Possible phagotrophic feeding of bacteria in a freshwater red tide Chrysophyceae Uroglena americana / B. Kimura, Y. Ishida // Bulletin of the Japanese Society of Scientific Fisheries. - 1986. - Vol. 52, № 4. - P. 697-701.

230. Klaveness, D. Biology and ecology of the Cryptophyceae: status and challenges / D. Klaveness // Biological Oceanography. - 1989. - Vol. 6, № 3-4. - P. 257-270.

231. Klaveness, D. Classical and modern criteria for determining species of Cryptophyceae / D. Klaveness // Bulletin of Plankton Society of Japan (Japan). - 1985. -Vol. 32, № 2. - P. 111-128.

232. Klaveness, D. Morphology, distribution and significance of the manganese-accumulating microorganism Metallogenium in lakes / D. Klaveness // Hydrobiologia. -1977. - Vol. 56. - P. 25-33.

233. Klaveness, D. Rhodomonas lacustris (Pascher & Ruttner) Javornicky (Cryptomonadida): ultrastructure of the vegetative cell / D. Klaveness // The Journal of Protozoology. - 1981. - Vol. 28, № 1. - P. 83-90.

234. Klaveness, D. Studies on the morphology, food selection and growth of two planktonic freshwater strains of Coleps sp. / D. Klaveness // Protistologica. - 1984. -Vol. 20, № 3. - P. 335-349.

235. Klaveness, D. The Cryptomonas - Caulobacter consortium: facultative ectocommensalism with possible taxonomic consequences? / D. Klaveness // Nordic Journal of Botany. - 1982. - Vol. 2, № 2. - P. 183-188.

236. Klaveness, D. Ecology of the Cryptomonadida: a first review / D. Klaveness // Growth and Reproductive Strategies of Freshwater Phytoplankton (edited by C.D. Sandgren). - New York: Cambridge University Press, 1988. - P. 105-133.

237. Knapp, C.W. Physical and chemical conditions surrounding the diurnal vertical migration of Cryptomonas spp. (Cryptophyceae) in a seasonally stratified midwestern

reservior (USA) / C.W. Knapp, F. de Noyelles, D.W. Graham, S. Bergin // Journal of Phycology. - 2003. - Vol. 39, № 5. - P. 855-861.

238. Knuckey, R.M. Development of an optimal microalgal diet for the culture of the calanoid copepod Acartia sinjiensis: effect of algal species and feed concentration on copepod development / R.M. Knuckey, G.L. Semmens, R.J. Mayer, M.A. Rimmer // Aquaculture. - 2005. - Vol. 249, № 1-4. - P. 339-351.

239. Kondo, K. Red tides in the brackish lake Nakanoumi, 1: The frequency and causative species of red tides / K. Kondo, Y. Seike, Y. Date // Bulletin of Plankton Society of Japan (Japan). - 1990. - Vol. 36, № 2. - P. 103-110.

240. Kristiansen, J. A new species of Chroomonas (Cryptophyceae) living inside the submarine ikaite columns in the Ikkafjord, Southwest Greenland, with remarks on its ultrastructure and ecology / J. Kristiansen, A. Kristiansen // Nordic Journal of Botany. -1999. - Vol. 19, № 6. - P. 747-758.

241. Kugrens, P. Ultrastructure and systematics of two new freshwater red cryptomonads, Storeatula rhinosa, sp. nov. and Pyrenomonas ovalis, sp. nov / P. Kugrens, B.L. Clay, R.E. Lee // Journal of phycology. - 1999. - Vol. 35, № 5. -P. 1079-1089.

242. Kugrens, P. An ultrastructural survey of cryptomonad periplasts using quick-freezing freeze fracture techniques / P. Kugrens, R.E. Lee // Journal of phycology. - 1987. - Vol. 23. - P. 365-376.

243. Kugrens, P. Ultrastructural Evidence for bacterial incorporation and myxotrophy in the photosynthetic cryptomonad Chroomonas pochmanni Huber-Pestalozzi (Chyptomonadida) / P. Kugrens, R.E. Lee // The Journal of protozoology. - 1990. -Vol. 37, № 4. - P. 263-267.

244. Kugrens, P. Ultrastructure of fertilization in a cryptomonad / P. Kugrens, R.E. Lee // Journal of phycology. - 1988. - Vol. 24, № 3. - P. 385-393.

245. Kugrens, P. Cell form and surface patterns in Chroomonas and Cryptomonas cells (Cryptophyta) as revealed by scanning electron microscopy / P. Kugrens, R.E. Lee, R.A. Andersen // Journal of Phycology. - 1986. - Vol. 22, № 4. - P. 512-522.

246. Kugrens, P. Ultrastructural variations in cryptomonad flagella / P. Kugrens, R.E. Lee, R.A. Andersen // Journal of phycology. - 1987. - Vol. 23, № 4. - P. 511-518.

247. Kugrens, P. Ultrastructure, biogenesis, and functions of extrusive organelles in selected non-ciliate protists / P. Kugrens, R.E. Lee, J.O. Corliss // Protoplasma. - 1994. -Vol. 181. - P. 164-190.

248. Kugrens, P. Organization of cryptomonads / P. Kugrens, R.E. Lee // The biology of free-living heterotrophic flagellates (edited by D. J. Patterson, J. Larsen). - Oxford: Clarendon, 1991. - P. 2195-2233.

249. Kulizin, P. Alien Algae Species Invasions in Humic Rivers within Weakly Human Impact Basin / P. Kulizin, E. Vodeneeva, N. Martynenko, E. Sharagina, A. Okhapkin // Life. - 2024. - Vol. 14, № 1. - P. 61.

250. Kumar, S. MEGA X: molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms / S. Kumar, G. Stecher, M. Li, C. Knyaz, K. Tamura // Molecular biology and evolution. - 2018. - Vol. 35, № 6. - P. 1547-1549.

251. Lackey, J.B. Some fresh water protozoa with blue chromatophores / J.B. Lackey // The Biological Bulletin. - 1936. - Vol. 71, № 3. - P. 492-497.

252. Lane, C.E. New marine members of the genus Hemiselmis (Cryptomonadales, Cryptophyceae) / C.E. Lane, J.M. Archibald // Journal of Phycology. - 2008. - Vol. 44, № 2. - P. 439-450.

253. Lane, C.E. Insight into the diversity and evolution of the cryptomonad nucleomorph genome / C.E. Lane, H. Khan, M. MacKinnon, A. Fong, S. Theophilou, J.M. Archibald // Molecular biology and evolution. - 2006. - Vol. 23, № 5. - P. 856-865.

254. Larsen, J. Some flagellates (Protista) from tropical marine sediments / J. Larsen, D.J. Patterson // Journal of Natural History. - 1990. - Vol. 24, № 4. - P. 801-937.

255. Larsen, J. Endocytobiotic consortia with dinoflagellate hosts / J. Larsen // Algae and Symbioses: Plants, Animals, Fungi, Viruses, Interactions Explored (W. Reisser). -Bristol: Biopress, Ltd., 1992. - P. 427-442.

256. Laza-Martínez, A. Urgorri complanatus gen. et sp. nov. (Cryptophyceae), a red-tide-forming species in brackish waters / A. Laza-Martínez // Journal of phycology. -2012. - Vol. 48, № 2. - P. 423-435.

257. Laza-Martínez, A. Morphological and molecular characterization of Teleaulax gracilis sp. nov. and T. minuta sp. nov. (Cryptophyceae) / A. Laza-Martínez, J. Arluzea, I. Miguel, E. Orive // Phycologia. - 2012. - Vol. 51, № 6. - P. 649-661.

258. Lee, R.E. Ancient atmospheric CO2 and the timing of evolution of secondary endosymbioses / R.E. Lee, P. Kugrens // Phycologia. - 2000. - Vol. 39, № 2. - P. 167172.

259. Lee, R.E. Hypothesis: the ecological advantage of chloroplast ER - the ability to outcompete at low dissolved CO2 concentrations / R.E. Lee, P. Kugrens // Protist. - 1998.

- Vol. 149, № 4. - P. 341-345.

260. Lee, R.E. Katablepharis ovalis, a colorless flagellate with interesting cytological characteristics / R.E. Lee, P. Kugrens // Journal of phycology. - 1991. - Vol. 27, № 4. -P. 505-513.

261. Lee, R.E. The occurrence and structure of flagellar scales in some freshwater Cryptophytes / R.E. Lee, P. Kugrens // Journal of phycology. - 1986. - Vol. 22, № 4. -P. 549-552.

262. Lee, R.E. Feeding apparatus of the colorless flagellate Katablepharis (Cryptophyceae) / R.E. Lee, P. Kugrens, A. P. Mylnikov // Journal of phycology. - 1991.

- Vol. 27, № 6. - P. 725-733.

263. Lefèvre, E. Unveiling fungal zooflagellates as members of freshwater picoeukaryotes: evidence from a molecular diversity study in a deep meromictic lake / E. Lefèvre, C. Bardot, C. Noël, J.F. Carrias, E. Viscogliosi, C. Amblard, T. Sime-Ngando // Environmental Microbiology. - 2007. - Vol. 9, № 1. - P. 61-71.

264. Lefranc, M. Genetic diversity of small eukaryotes in lakes differing by their trophic status / M. Lefranc, A. Thénot, C. Lepere, D. Debroas // Applied and environmental microbiology. - 2005. - Vol. 71, № 10. - P. 5935-5942.

265. Lemmermann, E. Peridinales / E. Lemmermann // Wissenschaftliche ergebnisse der Deutschen Zentral-Afrika-Expedition, 1907-1908: unter Führung Adolf Friedrichs, herzogszu Mecklenburg. Band II. Botanik. (edited by J. Mildbraed). - Leipzig: Klinkhardt & Biermann, 1910. - P. 497-712.

266. Lepere, C. Community composition of lacustrine small eukaryotes in hyper-eutrophic conditions in relation to top-down and bottom-up factors / C. Lepere, I. Domaizon, D. Debroas // FEMS microbiology ecology. - 2007. - Vol. 61, № 3. -P. 483-495.

267. Lepere, C. Geographic distance and ecosystem size determine the distribution of smallest protists in lacustrine ecosystems / C. Lepere, I. Domaizon, N. Taib, J.-F. Mangot, G. Bronner, D. Boucher, D. Debroas // FEMS Microbiology Ecology. - 2013. - Vol. 85, № 1. - P. 85-94.

268. Lepisto, L. Occurrence of Cryptophyceae and katablepharids in boreal lakes / L. Lepisto, A.L. Holopainen // Phytoplankton and Equilibrium Concept: The Ecology of Steady-State Assemblages: Proceedings of the 13th Workshop of the International Association of Phytoplankton Taxonomy and Ecology (IAP), held in Castelbuono (Italy), 1-8 September 2002. - Netherlands: Springer, 2003. - P. 307-314.

269. Lewitus, A.J. Physiological responses of phytoflagellates to dissolved organic substrate additions. 1. Dominant role of heterotrophic nutrition in Poterioochromonas malhamensis (Chrysophyceae) / A.J. Lewitus, D.A. Caron // Plant and cell physiology. -1991. - Vol. 32, № 5. - P. 671-680.

270. Lewitus, A.J. Kleptoplastidy in the toxic dinoflagellate Pfiesteria piscicida (Dinophyceae) / A.J. Lewitus, H.B. Glasgow, J.A.M. Burkholder // Journal of Phycology. - 1999. - Vol. 35, № 2. - P. 303-312.

271. Li, A. Ingestion of fluorescently labeled and phycoerythrin-containing prey by mixotrophic dinoflagellates / A. Li, D.K. Stoecker, D.W. Coats, E.J. Adam // Aquatic Microbial Ecology. - 1996. - Vol. 10, № 2. - P. 139-147.

272. Lichtle, C. Effects of nitrogen deficiency and light of high intensity on Cryptomonas rufescens (Cryptophyceae) I. Cell and photosynthetic apparatus transformations and encystment / C. Lichtle // Protoplasma. - 1979. - Vol. 101, № 4. -P. 283-299.

273. Lichtle, C. Effects of nitrogen deficiency and light of high intensity on Cryptomonas rufescens (Cryptophyceae) II. Excystment / C. Lichtle // Protoplasma. -1980. - Vol. 102, № 1. - P. 11-19.

274. Lin, Y. Spatial and temporal variations in phytoplankton community in Dianchi lake using eDNA metabarcoding / Y. Lin, J. Xu, L. Shen, X. Zhou, L. He, Z. Zhao, S. Xu // Water. - 2023. - Vol. 16, № 1. - P. 32.

275. Liu, S. Metabarcoding analysis of harmful algal species in Jiaozhou Bay / S. Liu, K. Gibson, Z. Cui, Y. Chen, X. Sun, N. Chen // Harmful Algae. - 2020. - Vol. 92. -P. 101772.

276. Lopez-Garcia, P. Unexpected diversity of small eukaryotes in deep-sea Antarctic plankton / P. Lopez-Garcia, F. Rodriguez-Valera, C. Pedros-Alio, D. Moreira // Nature. - 2001. - Vol. 409, № 6820. - P. 603-607.

277. Loret, P. Phytoplankton composition and selective feeding of the pearl oyster Pinctada margaritifera in the Takapoto lagoon (Tuamotu Archipelago, French Polynesia): in situ study using optical microscopy and HPLC pigment analysis / P. Loret, A. Pastoureaud, C. Bacher, B. Delsalle // Marine Ecology Progress Series. - 2000. -Vol. 199. - P. 55-67.

278. Lucas, I.A.N. Observations on the fine structure of the Cryptophyceae. I. The genus Cryptomonas / I.A.N. Lucas // Journal of Phycology. - 1970. - Vol. 6, № 1. -P. 30-38.

279. Ludwig, M. DNA is present in the nucleomorph of cryptomonads: further evidence that the chloroplast evolved from a eukaryotic endosymbiont / M. Ludwig, S.P. Gibbs // Protoplasma. - 1985. - Vol. 127. - P. 9-20.

280. Ludwig, M. Localization of phycoerythrin at the lumenal surface of the thylakoid membrane in Rhodomonas lens / M. Ludwig, S.P. Gibbs // The Journal of cell biology. -1989. - Vol. 108, № 3. - P. 875-884.

281. Lund, J.W.G. Contributions to our knowledge of British algae-VIII / J.W.G. Lund // Journal of Botany. - 1942. - Vol. 80. - P. 57-73.

282. Luo, W. Molecular and microscopic diversity of planktonic eukaryotes in the oligotrophic Lake Stechlin (Germany) / W. Luo, C. Bock, H.R. Li, J. Padisak, L. Krienitz // Hydrobiologia. - 2011. - Vol. 661. - P. 133-143.

283. Lv, J. eDNA metabarcoding revealed the seasonal and spatial variation of phytoplankton functional groups in the Chai river and their relationship with

environmental factors / J. Lv, Y. Lin, Z. Zhao, X. Zhou // Journal of Freshwater Ecology.

- 2023. - Vol. 38, № 1. - P. 2176374.

284. MacColl, R. Phycobilisomes and biliproteins / R. MacColl // Photochemistry and Photobiology. - 1982. - Vol. 35, № 6. - P. 899-904.

285. Magalhaes, K. Hemiselmis aquamarina sp. nov. (Cryptomonadales, Cryptophyceae), a cryptophyte with a novel phycobiliprotein type (Cr-PC 564) / K. Magalhaes, A.L. Santos, D. Vaulot, M.C. Oliveira // Protist. - 2021. - Vol. 172, № 4.

- P. 125832.

286. Mai, J.C. The internal transcribed spacer 2 exhibits a common secondary structure in green algae and flowering plants / J.C. Mai, A.W. Coleman // Journal of Molecular Evolution. - 1997. - Vol. 44. - P. 258-271.

287. Majaneva, M. Rhinomonas nottbecki n. sp. (Cryptomonadales) and Molecular Phylogeny of the Family Pyrenomonadaceae / M. Majaneva, I. Remonen, J.M. Rintala, I. Belevich, A. Kremp, O. Setala, E. Jokitalo, J. Blomster // Journal of Eukaryotic Microbiology. - 2014. - Vol. 61, № 5. - P. 480-492.

288. Mangot, J.F. Short-term dynamics of diversity patterns: evidence of continual reassembly within lacustrine small eukaryotes / J.F. Mangot, I. Domaizon, N. Taib, N. Marouni, E. Duffaud, G. Bronner, D. Debroas // Environmental Microbiology. - 2013.

- Vol. 15, № 6. - P. 1745-1758.

289. Marazzi, L. Assemblage Patterns of Microalgae along the Upstream to Downstream Gradient of the Okavango Delta: Abundance, Taxonomic Diversity, and Functional Diversity / L. Marazzi, A.W. Mackay, R. Mazebedi, V.J. Jones // Water. -2023. - Vol. 15, № 15. - P. 2692.

290. Marin, B. Phylogenetic relationships among the Cryptophyta: analyses of nuclear-encoded SSU rRNA sequences support the monophyly of extant plastid-containing lineages / B. Marin, M. Klingberg, M. Melkonian // Protist. - 1998. - Vol. 149, № 3. -P. 265-276.

291. Marin, B. Molecular phylogeny and classification of the Mamiellophyceae class. nov. (Chlorophyta) based on sequence comparisons of the nuclear-and plastid-encoded

rRNA operons / B. Marin, M. Melkonian // Protist. - 2010. - Vol. 161, № 2. - P. 304336.

292. Martens, N. Metabarcoding reveals potentially mixotrophic flagellates and picophytoplankton as key groups of phytoplankton in the Elbe estuary / N. Martens, V. Russnak, J. Woodhouse, H.P. Grossart, C.E. Schaum // Environmental Research. -2024. - Vol. 252. - P. 119126.

293. Martynenko, N.A. Two New Species of the Genus Cryptomonas (Cryptophyta: Cryptophyceae) from Cat Tien National Park (Vietnam) / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, P.T. Huan // Inland Water Biology. - 2024. - Vol. 17, № 6. - P. 965-976.

294. Martynenko, N.A. Cryptomonas cattiensis sp. nov. (Cryptophyceae: Cryptomonadales), a new species described from Vietnam / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, D.A. Kapustin, E.E. Guseva, M.S. Kulikovskiy // Phytotaxa. - 2020a. -Vol. 454, № 2. - P. 127-136.

295. Martynenko, N.A. A new species of Cryptomonas (Cryptophyceae) from the Western Urals (Russia) / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, P.V. Kulizin, E.E. Guseva, K. McCartney, M.S. Kulikovskiy // European Journal of Taxonomy. - 2020b. - Vol. 649. - P. 1-12.

296. Martynenko, N. Description of a New Species of the Genus Cryptomonas (Cryptophyceae: Cryptomonadales), Isolated from Soils in a Tropical Forest / N. Martynenko, E. Kezlya, E. Gusev // Diversity. - 2022a. - Vol. 14, № 11. - e1001.

297. Martynenko, N.A. Revealing hidden diversity in the Cryptomonas erosa clade (Cryptophyceae), with the description of two new species from acidic habitats / N.A. Martynenko, E.S. Gusev, I.N. Sterlyagova, M.S. Kulikovskiy // Phycologia. -2022b. - Vol. 61, № 2. - P. 184-194.

298. Massana, R. Impact of Daphnia pulex on a metalimnetic microbial community / R. Massana, J.M. Gasol, K. Jurgens, C. Pedros-Alio // Journal of Plankton Research. -1994. - Vol. 16, № 10. - P. 1379-1399.

299. Massart, J. Recherches sur les organismesinferieurs. VIII. - Sur la motilite des Flagellates / J. Massart // Bulletin de la Classe des sciences de l'Academie Royale de Belgique. - 1920. - Vol. 5, № 6 (4-5). - P. 116-141.

300. McFadden, G.I. Goniomonas: rRNA sequences indicate that this phagotrophic flagellate is a close relative of the host component of cryptomonads / G.I. McFadden, P.R. Gilson, D.R.A. Hill // European Journal of Phycology. - 1994. - Vol. 29, № 1. -P. 29-32.

301. McFadden, G.I. Use of Hepes buffer for microalgal culture media and fixation for electron microscopy / G.I. McFadden, M. Melkonian // Phycologia. - 1986. - Vol. 25, № 4. - P. 551-557.

302. McFadden, G.I. Bonsai genomics: sequencing the smallest eukaryotic genomes / G.I. McFadden, P.R. Gilson, S.E. Douglas, T. Cavalier-Smith, C.J.B. Hofmann, U.-G. Maier // Trends in Genetics. - 1997. -Vol. 13, № 2. - P. 46-49.

303. McKerracher, L. Cell and nucleomorph division in the alga Cryptomonas / L. McKerracher, S.P. Gibbs // Canadian Journal of Botany. - 1982. - Vol. 60, № 11. -P. 2440-2452.

304. Medinger, R. Diversity in a hidden world: potential and limitation of next-generation sequencing for surveys of molecular diversity of eukaryotic microorganisms / R. Medinger, V. Nolte, R.V. Pandey, S. Jost, B. Ottenwalder, C. Schlotterer, J. Boenigk // Molecular ecology. - 2010. - Vol. 19. - P. 32-40.

305. Menezes, M. How diverse are planktonic cryptomonads in Brazil? Advantages and difficulties of a taxonomic-biogeographical approach / M. Menezes, G. Novarino // Hydrobiologia. - 2003. - Vol. 502. - P. 297-306.

306. Meyer, S.R. The taxonomic implications of the ultrastructure and cell division of a plastidcontaining Chroomonas sp. (Cryptophyceae) from Rocky Bay, Natal, South Africa / S.R. Meyer // South African Journal of Botany. - 1987. - Vol. 53, № 2. - P. 129139.

307. Meyer, S.R. Mitosis and cytokinesis in Chroomonas africana Meyer & Pienaar (Cryptophyceae) / S.R. Meyer, R.N. Pienaar // South African Journal of Botany. - 1984a.

- Vol. 3, № 5. - P. 320-330.

308. Meyer, S.R. The microanatomy of Chroomonas africana sp. nov. (Cryptophyceae) / S.R. Meyer, R.N. Pienaar // South African Journal of Botany. - 1984b.

- Vol. 3, № 5. - P. 306-319.

309. Mignot, J.P. Étude ultrastructurale de (Cyathomonas truncata) From. (Flagellé cryptomonadine) / J.P. Mignot // Journal de Microscopie. - 1965. - Vol. 4, №2. - P. 239252.

310. Miyazaki, T. Diel changes of uptake of inorganic carbon and nitrogen by phytoplankton, and the relationship between inorganic carbon and nitrogen uptake in Lake Nakanuma, Japan / T. Miyazaki, S. Hideki, H. Uotani // Journal of plankton research. - 1987. - Vol. 9, № 3. - P. 513-524.

311. Molinari-Novo, E.A. Nomenclatural notes on algae. I. Replacement names for various algal taxa / E.A. Molinari-Novoa, L.F. Mayta, C.E. Sánchez Ocharan, M.D. Guiry // Notulae Algarum. - 2021. - Vol. 177. - P. 1-9.

312. Monchy, S. Exploring and quantifying fungal diversity in freshwater lake ecosystems using rDNA cloning/sequencing and SSU tag pyrosequencing / S. Monchy, G. Sanciu, M. Jobard, S. Rasconi, M. Gerphagnon, M. Chabé, A. Cian, D. Meloni, N. Niquil, U. Christaki, E. Viscogliosi, T. Sime-Ngando // Environmental microbiology.

- 2011. - Vol. 13, № 6. - P. 1433-1453.

313. Moon-van der Staay, S.Y. Oceanic 18S rDNA sequences from picoplankton reveal unsuspected eukaryotic diversity / S.Y. Moon-van der Staay, R. De Wachter, D. Vaulot // Nature. - 2001. - Vol. 409, № 6820. - P. 607-610.

314. Moreira, D. The molecular ecology of microbial eukaryotes unveils a hidden world / D. Moreira, P. López-García // Trends in Microbiology. - 2002. - Vol. 10, № 1.

- P. 31-38.

315. Morrall, S. A comparison of the periodic substructure of the trichocysts of the Cryptophyceae and Prasinophyceae / S. Morrall, A.D. Greenwood // BioSystems. - 1980.

- Vol. 12, № 1-2. - P. 71-83.

316. Morrall, S. Ultrastructure of nucleomorph division in species of Cryptophyceae and its evolutionary implications / S. Morrall, A.D. Greenwood // Journal of Cell Science.

- 1982. - Vol. 54, № 1. - P. 311-328.

317. Müller, T. Distinguishing species / T. Müller, N. Philippi, T. Dandekar, J. Schultz, M. Wolf // RNA. - 2007. - Vol. 13, № 9. - P. 1469-1472.

318. Munawar, M. Scanning electron microscopy of some nanoplankton cryptomonads / M. Munawar, T. Bistricki // Scanning Electron Microscopy. - 1979. - Vol. 3. - P. 247252.

319. Nakayama, T. The phylogenetic relationship between the Chlamydomonadales and Chlorococcales inferred from 18S rDNA sequence data / T. Nakayama, S. Watanabe, K. Mitsui, H. Uchida, I. Inouye // Phycological research. - 1996. - Vol. 44, № 1. - P. 4755.

320. Nam, S.W. Ultrastructure of the flagellar apparatus in cryptomorphic Cryptomonas curvata (Cryptophyceae) with an emphasis on taxonomic and phylogenetic implications / S.W. Nam, W. Shin // Algae. - 2016. - Vol. 31, № 2. - P. 117-128.

321. Nauwerck, A. Das Phytoplankton des Latnjajaure 1954-1965 / A. Nauwerck // Schweizerische Zeitschrift für Hydrologie. - 1968. - Vol. 30. - P. 188-216.

322. Nishino, H. Identification of species and genotypic compositions of Cryptomonas (Cryptophyceae) populations in the eutrophic Lake Hira, Japan, using single-cell PCR / H. Nishino, Y. Hodoki, S.D. Thottathil, K. Ohbayashi, Y. Takao, S.I. Nakano // Aquatic Ecology. - 2015. - Vol. 49. - P. 263-272.

323. Norton, J.R. Soil algae from north central Florida / J.R. Norton, J.S. Davis // Florida Scientist. - 1975. - Vol. 38, №2. - P. 77-81.

324. Novarino, G. A companion to the identification of cryptomonad flagellates (Cryptophyceae= Cryptomonadea) / G. Novarino / Phytoplankton and Equilibrium Concept: The Ecology of Steady-State Assemblages: Proceedings of the 13th Workshop of the International Association of Phytoplankton Taxonomy and Ecology (IAP) held in Castelbuono (Italy), 1-8 September 2002. - Netherlands: Springer, 2003. - P. 225-270.

325. Novarino, G. Nanoplankton protists from the western Mediterranean Sea. II. Cryptomonads (Cryptophyceae=Cryptomonadea) / G. Novarino // Scientia Marina. -2005. - Vol. 69, № 1. - P. 47-74.

326. Novarino, G. Observations on Rhinomonas reticulata comb. nov. and R. reticulata var. eleniana var. nov. (Cryptophyceae), with comments on the genera Pyrenomonas and Rhodomonas / G. Novarino // Nordic journal of botany. - 1991a. -Vol. 11, № 2. - P. 243-252.

327. Novarino, G. Observations on some new and interesting Cryptophyceae // G. Novarino // Nordic journal of botany. - 1991b. - Vol. 11, № 5. - P. 599-611.

328. Novarino, G. Possible detection of the periplast areas and the nucleomorph of cryptomonads by light microscopy: some early observations by Künstler, Skuja and Hollande / G. Novarino // Quekett Journal of Microscopy - 1993. - Vol. 37. - P. 45-51.

329. Novarino, G. A comparison of some morphological characters in Chroomonas ligulata sp. nov. and C. placoidea sp. nov. (Cryptophyceae) / G. Novarino, I.A.N. Lucas // Nordic journal of botany. - 1993a. - Vol. 13, № 5. - P. 583-591.

330. Novarino, G. Some proposals for a new classification system of the Cryptophyceae / G. Novarino, I.A.N. Lucas // Botanical journal of the Linnean Society.

- 1993b. - Vol. 111, № 1. - P. 3-21.

331. Novarino, G. Observations on the genus Plagioselmis (Cryptophyceae) / G. Novarino, I.A.N. Lucas, S. Morrall // Cryptogamie. Algologie. - 1994. - Vol. 15, №2 2.

- P. 87-107.

332. Novarino, G. Pelagic flagellate populations in the southern North Sea, 1988-89. I. Qualitative observations / G.Novarino, D. K. Mills, F. Hannah // Journal of plankton research. - 1997. - Vol. 19, № 8. - P. 1081-1109.

333. Novarino, G. Typification and ultrastructural characterization of long-described flagellate taxa based on original type material / G. Novarino, E. Oliva // The Flagellates Symposium, University of Birmingham. - 1998. - P. 7-11.

334. Oakley, B.R. Mitotic spindle formation in Cryptomonas and Chroomonas (Cryptophyceae) / B.R. Oakley // Protoplasma. - 1978. - Vol. 95. - P. 333-346.

335. Oakley, B.R. Mitosis and cell division in Cryptomonas (Cryptophyceae) / B.R. Oakley, T. Bisalputra // Canadian Journal of Botany. - 1977. - Vol. 55, № 22. -P. 2789-2800.

336. Oakley, B.R. The ultrastructure of mitosis in Chroomonas salina (Cryptophyceae) / B.R. Oakley, J.D. Dodge // Protoplasma. - 1976. - Vol. 88. - P. 241-254.

337. Oakley, B.R. Cryptophyceae: introduction and bibliography / B.R. Oakley, U.J. Santore // Selected Papers of Phycology (edited by J.R. Rosowski, B.C. Parker). -Lawrence: Allen Press, 1982. - P. 682-686.

338. Obertegger, U. Do inferences about freshwater phytoplankton communities change when based on microscopy or high-throughput sequencing data? / U. Obertegger, M. Pindo, G. Flaim // Freshwater Biology. - 2021. - Vol. 66, № 4. - P. 640-655.

339. Okamoto, N. Molecular phylogeny and description of the novel katablepharid Roombia truncata gen. et sp. nov., and establishment of the Hacrobia taxon. nov. / N. Okamoto, C. Chantangsi, A. Horak, B.S. Leander, P.J. Keeling // PloS one. - 2009. -Vol. 4, № 9. - P. e7080.

340. Okamoto, N. The katablepharids are a distant sister group of the Cryptophyta: a proposal for Katablepharidophyta divisio nova / Kathablepharida phylum novum based on SSU rDNA and beta-tubulin phylogeny / N. Okamoto, I. Inouye // Protist. - 2005. -Vol. 156, № 2. - P. 163-179.

341. Oltmanns, F. Morphologic und Biologie der Algen. 2. Aufl. 2. Band / F. Oltmanns. - Jena: Gustav Fischer, 1922. - 439 p.

342. Parke, M. Studies on marine flagellates / M. Parke // Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom. - 1949. - Vol. 28, № 1. - P. 255-288.

343. Pascher, A. Die Süßwasser flora Deutschlands, Österreichs und der Schweiz. Heft 2: Flagellatae II. Chrysomonadinae, Eugleninae, Chloromonadinae und gefärbte Flagellatenunsicherer Stellung / A. Pascher. - Jena: Gustav Fischer, 1913. - P. 96-114.

344. Pascher, A. Systematische Übersichtüber die mit Flagellaten in Zusammenhangstehenden Algenreihen und Versucheiner Einreihungdieser Algenstämme in die Stämme des Pflanzenreiches / A. Pascher // Beiheftezum Botanischen Centralblatt. - 1931. - Vol. 48. - P. 317-322.

345. Pascher, A. Über Flagellaten und Algen / A. Pascher // Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft. - 1914. - Vol. 32. - P. 136-160.

346. Pascher, A. Über die Beziehungen der Cryptomonadenzu den Algen / A. Pascher // Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft. - 1911. - Vol. 29. - P. 193-203.

347. Patron, N.J. Multiple gene phylogenies support the monophyly of cryptomonad and haptophyte host lineages / N.J. Patron, Y. Inagaki, P.J. Keeling // Current Biology. -2007. - Vol. 17, № 10. - P. 887-891.

348. Patterson, D.J. The behaviour of contractile vacuole complexes of cryptophycean flagellates / D.J. Patterson, K. Hausmann // British Phycological Journal. - 1981. -Vol. 16, № 4. - P. 429-439.

349. Pedros-Alio, C. On the ecology of a Cryptomonas phaseolus population forming a metalimnetic bloom in Lake Ciso, Spain: Annual distribution and loss factors / C. Pedros-Alio, J.M. Gasol, R. Guerrero // Limnology and Oceanography. - 1987. -Vol. 32, № 2. - P. 285-298.

350. Pedros-Alio, C. Predation by ciliates on a metalimnetic Cryptomonas population: feeding rates, impact and effects of vertical migration / C. Pedros-Alio, R. Massana, M. Latasa, J. Garci-Cantizano, J.M. Gasol // Journal of Plankton Research. - 1995. -Vol. 17, № 11. - P. 2131-2154.

351. Peltomaa, E. Marine cryptophytes are great sources of EPA and DHA / E. Peltomaa, M.D. Johnson, S.J. Taipale // Marine drugs. - 2017. - Vol. 16, № 1. - P. 3.

352. Pennick, N. Flagellar scales in Hemiselmis brunnescens Butcher and H. virescens Droop (Cryptophyceae) / N. Pennick // Archiv für Protistenkunde. - 1981. - Vol. 124, № 3. - P. 267-270.

353. Perasso, L. Pole reversal and the development of cell asymmetry during division in cryptomonad flagellates / L. Perasso, S.J. Brett, R. Wetherbee // Protoplasma. - 1993. - Vol. 174. - P. 19-24.

354. Perasso, L. Transformation and development of the flagellar apparatus of Cryptomonas ovata (Cryptophyceae) during cell division / L. Perasso, D.R.A. Hill, R. Wetherbee // Protoplasma. - 1992. - Vol. 170. - P. 53-67.

355. Pfiester, L.A. A freshwater "red tide" in Texas / L.A. Pfiester, J.R. Holt // The Southwestern Naturalist. - Vol. 23, №1. - P. 103-110.

356. Phlips, E.J. Seasonal dynamics of phytoplankton in two Amazon flood plain lakes of varying hydrologic connectivity to the main river channel / E.J. Phlips, K.E. Havens, M.R.M. Lopes // Fundamental and applied limnology. - 2008. - Vol. 172, № 2. - P. 99109.

358. Pinseel, E. A new dawn for protist biogeography / E. Pinseel, K. Sabbe, E. Verleyen, W. Vyverman // Global Ecology and Biogeography. - 2024. - Vol. 33, № 12. - P. e13925.

359. Playfair, G.I. Australian freshwater flagellates / G.I. Playfair // Proceedings of the Linnean Society of New South Wales. - 1921. - Vol. 46. - P. 99-146.

360. Pollingher, U. The structure and dynamics of the phytoplankton assemblages in Lake Kinneret, Israel / U. Pollingher // Journal of Plankton Research. - 1981. - Vol. 3, № 1. - P. 93-105.

361. Porter, K.G. Phagotrophic phytoflagellates in microbial food webs / K.G. Porter // Hydrobiologia. - 1988. - Vol. 159. - P. 89-97.

362. Porter, K.G. Protozoa in planktonic food webs / K.G. Porter, E.B. Sherr, B.E. Sherr, M. Pace, R.W. Sanders // The Journal of protozoology. - 1985. - Vol. 32, № 3. - P. 409-415.

363. Poulin, M. Catalogue des alguesd'eaudouce du Québec, Canada / M. Poulin, P.B. Hamilton, M. Proulx // Canadian Field Naturalist. - 1995. - Vol. 109, № 1. - P. 27110.

364. Pratt, J.R. Functional groups in the Protozoa: roles in differing ecosystems 1, 2: protozoan functional groups / J.R. Pratt, J. Cairns // The Journal of protozoology. - 1985. - Vol. 32, № 3. - P. 415-423.

365. Pringsheim, E.G. Some aspects of taxonomy in the Cryptophyceae / E.G. Pringsheim // The New Phytologist. - 1944. - Vol. 43, № 2. - P. 143-150.

366. Pringsheim, E.G. Zur kenntnis der Cryptomonaden des Süsswassers / E.G. Pringsheim // Nova Hedwigia. - 1968. - Vol. 16, № 1-2. - P. 367-401.

367. Probert, I. Brandtodinium gen. nov. and B. nutricula comb. nov. (Dinophyceae), a dinoflagellate commonly found in symbiosis with polycystine radiolarians / I. Probert, R. Siano, C. Poirier, J. Decelle, T. Biard, A. Tuji, N. Suzuki, F. Not // Journal of Phycology. - 2014. - Vol. 50, № 2. - P. 388-399.