Значение быстрого определения множественной лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis методом биочипов в клинике туберкулеза легких тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.00.26, кандидат медицинских наук Кузьмин, Алексей Владимирович

  • Кузьмин, Алексей Владимирович
  • кандидат медицинских науккандидат медицинских наук
  • 2006, Москва
  • Специальность ВАК РФ14.00.26
  • Количество страниц 144
Кузьмин, Алексей Владимирович. Значение быстрого определения множественной лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis методом биочипов в клинике туберкулеза легких: дис. кандидат медицинских наук: 14.00.26 - Фтизиатрия. Москва. 2006. 144 с.

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Кузьмин, Алексей Владимирович

Список сокращений Ви«,1(ннс

ГЛАВА L Обзор литературы

1. Лекарствен паи устойчивость Mycobacterium tuberculosa

II История формирования и классификация лекарственной 10 уел ойчнвоети . Wi г п h ij l и Tt и т tuberculosis

1-2 Молекулирио- генетические механизмы развития множественной 15 лекарственной устойчивости Xfycobacterium tuberculosis 1.3 Методы определения чувствительности Mycttbacterium 18 tuberculosis к противотуберкулезным препаратам

2, Химиотерапия туберкулеза

2.1 Ос ионные принципы химиотерапии туберкулам

22 Лечение туберкул сю с ыиожйстменной ЛЯЯфОПемшИ 33 устойчивостью

ГЛАВА И. Методика работы и характеристика клинзгческих 37 наблюдений

ГЛАВА III Сравнительная опенка определения лекорстпетюй 56 чувствительности Mycobacterium tuberculosis к нзонназнду И рифами ицину методом абсолютных концентраций и на биочипах «ТБ-Бночип»

ГЛАВА IV. Особенности клинических проявлений туберкулезного 66 процесса и спектр мутаций и генах устойчивости Муса barter г ит tubcrcuktobK рифами канну и НЭОНИНКДУ у разных категорий больных туберкулеюм легких

ГЛАВА V Эффективность химиотерапии больных деетруктияным 83 туберкулезом легких, назначенной по результатам определений чувствительности Mycobacterium tuberculosis к HSOHMMUy и рнфампицину на биочзшах «ТБ Биочил»

Id ключ сине

Выводы

Нряктическне рекомендации

Рекомендованный список диссертаций по специальности «Фтизиатрия», 14.00.26 шифр ВАК

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Значение быстрого определения множественной лекарственной устойчивости Mycobacterium tuberculosis методом биочипов в клинике туберкулеза легких»

При подтверждении диагноза туберкулеза легких "золотым стандартом" считается выделение культуры MET щ мокроты Однако бактериологические методы выявления МЕТ требуют длительного периода иременн {до 3-х месят») к хлиинщнт-фпанкр получает сведения о лекарственной чувствительности возбудителя туберкулеза практически к моменту завершения интенсивной фазы лечения. Таким образом. больным туберкулезом лёгких с самого начата Кит начнется эмпирическое лечение бе» достоверной информации о наличии лекарственной устойчивости МБТ. В «или с этим кирастает актуальность проблемы внедрения и практику ноны* ускоренных методов лабораторной диагностики МЛУ МБТ

В Институте модекуляриой биологии им, В А. Энгельгардта РАН (ИМБ) был разработан биологический мнкрочкп (биочип), позволяющий определять деэокскрнбонуклеииовую кислоту (ДНК) МБТ и идентифицировать мутации, ответственные за чувствительность возбудителя туберкулеза к Н и R та максимально короткое время (24 часа) [Грялунов Д.А., Михайлович В.М., Лш СЛ., 2003], Тест-система «ТБ-Биочип* прошш регкетршию в Министерстве ^драиоокранения и Социального развития (Регистрационное удостоверение № ФС 0326200^/0&&9-04) однако ло настоящего времени клиническая значимость диагностики МЛУ МБТ на биотипах «ТБ-Бночип» не установлена

Цель исследования.

Оценки. эффективность химиотерапии больных туберкуледа* легких, основанной на раннем определен ни чувствительности Mycobacterium ivbercuhsis к рнфшкинюш)' и юоишяиу «столом биочнпо»

9 Изучить частоту совпадений результате» бактериологического (абсолютных концентраций) к молекулярно-генетнческого (на биочипах "ТБ-Биочнн" J методой определения чувствительности Mycobacterium tuberculosis к июииазилу н рифампнинну

2- Определить спектр мутаций н kaiG mhA, ahpC.rpvB reitax Mycobacterium tuberculosis, ответственных за устойчивость к иэонивзиду и рнфампиинну. у больных туберкулезом легких.

3. Изучить особенности клинических проявлений и частоту выявления мутаинй в генах Mycobacterium tuberculosis у впервые выявленных н ранее леченных больны* туберкулезом лёгких.

4. Оценить эффективность лечения больных туберкулезом легких в ависимости от сроню коррекции химиотерапии по результата* определения лекарственной чувствительности Mycobacterium tubcrculoiu с помощью «ет<истемы *ТБ-Бноцнпн.

5. Оценить эффективность химиотерапии комбинацией из 5-тн протиьотуберкулг-шых препаратов реэераного ряда »№ начальном этапе лечения у больных туберкулезом легких, выделяющих мультнрсзнетентные \hvobaetcrium tuberculosis поданным тест-системы «ТЬ-биочин»,

Новиша исследования.

Впервые щучена эффективность химиотерапии деструктивного туберкулёза лёгких, основанной на определении чувствительности МВТ к итониазиду и рнфамлниину бночиповьш методом «ТБ-Бночил»

Установлено, что эффективность лечения больных, выделяющих резистентные к нзониазнду и/илн рнфампнцнну мнкобактернн туберкулеза, зависит от методики химиотерапии и течение начальной фазы согласно данным лекарственной чувствительности МБ Г по методу бночнпов.

Оперные проведено сравнение спектра мутаций в генах каЮ. тЬЛ. ahpC, rpoB Mycobacterium tuberculosis, выделенных от больных туберкулезом легких разни* категорий: впервые выманенных, не получавших противотуберкулйтные препараты и ранее леченых.

Показано, что наиболее часто мутации в katG, tniiA. afspC, rpoB генах Mycobacterium tubercuhsis определяются у больных туберкулезом яйгкнх, 1юлучавших ранее противотуберкулезную терапию.

Впервые показана высокая частота совладений результатов биочилоаого метода н истода Абсолютных концентраций по установленюо устойчивости Mycobacterium tuberculosis к нзонивзнду и рифампилину

ОЕатандуаач.лечиццц.'дь!

Применение тест-системы «ТБ-Бночил» позволяет сократит!, до 24 часов определение чувствительности Mycobacterium tuberculosa к основным протяюуФеркулвзныы препаратам первого ряда - нэонкюиду н рнфамлннииу,

Ройная коррекция схем химиотерапии НО результатам определенна чувствительности Mycobacterium tuberculous на биочипах да£т возможность в более короткие сроки добиться абациллнровання мокроты, ускорить репаративнме процессы в легочной ткани.

Надавать амазаиа^ м ашш

1. Тест-система «ТБ-Биочип* позволяет на этапе обследования в мокроте детектировать генетический маркёр ISSIIO и мутации к генах rpoB. katG. tnhA, ahpC Mycobacterium tubtrctrlosis, определяющих устойчивость к нзониазиду н рифампицину.

2. Результаты определения устойчивости Mycobacterium tuberculosis к изоиначнду и рифампицину на биочнпак «ТБ-Биочип» а высокой степени совпадают с резу льтатами метола абсолютных концентраций

3. Ранняя коррекция химиотерапии при быстром установлении чувствитслыюсти Mycobacterium tuberculosis к иэонивзилу и рифампицину на бмочнпах «ТБ-Биочнп» повышает эффективность лечения туберкулёза лёгких

-4. Ииволюиня специфических изменений в легких н конверсия мокроты у больных с МЛУ туберкулёзом шушет быстрее при назначении комбинации из 5-ти препаратов резервного ряда в начальной фазе химиотерапии. основанной на результатах установления устойчивости к нзонназиду и рифампицину на биочнпах «ТБ-Бночип», по сравнению с поздней коррекцией по результатам бактериологического метода абсолютных концентраций.

Внедрение результатов исследования в практик!.

Результаты исследования внедрены в лечебно - диагностический процесс ГУ ЦНИИТ РАМН, 1"У ПТД №2 г. Москвы. Материалы диссертации используются в лекциях и на практических шатиях с аспирантами и ординаторами, проходящими обучение в ГУ 1 [НИИТ РАМН, при проведении сертификационных курсов и курсов повышения квалификации и Учебном центре ГУ ЦНИИТ РАМН, а также внедрены п учебный провесе кафедры фтизиатрии Санкт-Петербургской медицинской академии последипломного образования.

Апробация работы.

Материмы диссертации доложены иа XIV u XV Национальных конгрессах по болезням органов дыхания в 2004г., 2005г„ на 14 конгрессе Европейского респираторного общества (2004). Научно-практической конференции молодых ученых, посвященной Всемирному дню борьбы с туберкулезом (2005), Научно-практической конференции молодых учёных «Актуальные вопросы клинической и экспериментальной медицины» (2006).

Работа апробирована на соамсстном заседании отделов фтизиатрии, микробиологии и детско-подроеткояото отдела ГУ ЦНИИ туберкулой PAMFI4 мы 2006 годи,

ШЙдмдяшь

Материалы диссертации изложены в 12 публикациях

Об^сч и структура диссердации

Диссертация изложена на 144 страницах машинописного текста, состоит из введения* 5 глав с изложением материалов и результатов проведенных исследований. включения, выходов, практических рекомендаций и списка цитируемой литературы. В диссертации представлено 32 таблицы it 24 рисунка. Список литературы вюиочает 162 источника отечественных и зарубежных автороя

Похожие диссертационные работы по специальности «Фтизиатрия», 14.00.26 шифр ВАК

Заключение диссертации по теме «Фтизиатрия», Кузьмин, Алексей Владимирович

123 ВЫВОДЫ

1 Совпадение результатов молекулярио-генетнчесхого (на бночилах ТБ-БночяГ) и бактериологического (абсолютных концентраций) методов составило 93,1% при выявлении М tvbcvubtft , устойчивых одновременно к изонназнду н рнфампицину, н 8В.9% - при выявлении № tuberculosis , устойчивых только к изонназнду.

2 Анализ мокроты больных деструктивным туберкулёзом лёгких на бночнпах выявил широкий спектр мутаций в генах М. tuberculosis . связанных с устойчивостью к изонназнду н рнфампицину, и продемонстрировал преобладание мутаций л 315 колош гена katG (Ser—Thr(l), AGC->ACC) в 65.3% и 531 кодонс гена г/дай (Ser-«Leu, TCG->TTG)- в 79,1% случаев,

3 Клиническая картина туберкулёза лёгких у ранее леченых больных по сравнению с впервые выявленными характеризовалась преобладанием двусторонних процессов (60,4%), наличием сформированных фиброзных каверн (31,3%). обильным бяктериовылелением (83,3%),

4 Молекулярно-генетнчсскнй анализ М, tuberculosis, выделенных от больных разных категорий, выявил мутации в генах katG, intiA, ahpC, гроИ в 49,1% -в группе впервые выявленных пациентов и в 89,6% случаев в группе ранее леченых, В группе впервые выявленных больных преобладали М tuberculous с мутациями в генах katG u inhA с доминированием мутации AGC->ACC в 315 кодонс гена kii/G, у ранее леченых пациентов А/ tuberculosis несли сочстанныс мутации одновременно в нескольких генах гроВ. katG, inhA, ahpC с преобладанием мутации TCG->TTG в 531 кодонс гена гроВ

5 Ранняя коррекция химиотерапии по результатам установления лекарственной чувствительности к изониазиду и рифампишму на бночнпах способствовала абацнлнроваиию мокроты у 64,1% больных после 2-х месяцев, у 72,0% - после 4-х н у 90,1% - после 6 месяцев лечения. При более поздней коррекции ил основании результатов метода абсолютных концентраций бактериоцыделеиие прекращалось значительно медленнее: у 41,6% больных после 2-х , у 524% - после 4-х и у 59,4% - после 6 месяцев терапии,

6 При режимах химиотерапии, назначенных по результатам выявления ЛУ М. Иtbercitlotis с использованием бночнпов, отмечается более быстрая регрессия специфических изменений о легких рассасывание инфильтрации н уменьшение деструкиий у 48,6% ■ через 2 чесани, у 673% - через 4 месяца и у 92.5% - через 6 месяцев При стандартной терапии инволюция специфических изменений в легких отмечена у 31,7%, 40,6% и 64,4% а соответствующие сроки.

7 Использование комбинации из 5-тн противотуберкулезных препаратов резервного ряда в начальной фазе химиотерапии повышает е£ зффектилиосп, у больных с МЛУ штаммами М («(етк/ий . выявленными по методу бночнпов. При пом исчезновение \t tuberculosis из мокроты определялось у 61,1% -через 2 и у 83,3% через 6 месяцев, частичное рассасывание воспалительных изменений наблюдалось у 463% и 85,2% больных в зги же сроки При стандартной химиотерапии на начальной фазе с последующей коррекцией по методу абсолютных концешрацнй абаинллнрованне мокроты у больных с МЛУ туберкулезом отмечено у 133% и 30,8%, а инволюция специфических изменений в лёгких -у 133% и 63,5% в соответствующие сроки.

UP А КТНЧ ЕСКИ F. PF.KOM КНДЛЦИИ

1 Определение мнкобоктерий туберкулfrjного комплекса н выявление мутаций в гага.х rpofi, katG, inhA. ahpC на биочипах «ТБ-Биочип» может быть рекомендовано в качестве информативного теста для детекции устойчивости А/. tuberculosis к рифампицину ы надииазиду как у впервые выявленных больных, нс получавших противотуберкулезные препараты, тох и у ранее леченых пацнигтол, при отсутствии лонных о лекарственной устойчивости возбудителя туберкул Си

2 При получении дойных биочннового анализа о мутациях в генах, ответственных та устойчивость А/ tuberculosis к изониаэнду, необходимо исключить препарат из схемы и заменить его двумя другими противотуберкулезными препаратами

3.Выявление мутаций в генах, ответственных за устойчивость .V/ tuberculosis к изоииазнду и рнфампипииу, является основанием для назначения химиотерапии комбинацией резервных противотуберкулёзных препаратов

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

Проблема лекарственной устойчивости возбудителя туберкулёза человека приобрела в последнее «ремл глобальное значение. Запоздалая диагностика ЛУ МБТ к нэо ни азиду может привести к ускоренному развитию устойчивости к другим ранее действенным лекарственным препаратам, прежде всего к микобактернцндноыу рифампицину. В последнее время большое значение придается выявлению штаммов МБТ с МЛУ Заражение человека такими штаммами приводит к быстрому прегрессированию специфического процесса н, нередко, к детальному исходу Бактериологические методы выявления Л У МБТ требуют длительного периода времени (до трёх месяцев) и клиницист • фтизиатр получает сведении о ЛУ МБТ практически к моменту завершения интенсивной фазы лечения. Технология биочнпов ддя выявления устойчивости MET к рнфамлниину и изонназнду 1го1воляет определять ДНК МБТ и идентифицировать мутации в генах, ответственные та устойчивость возбудителя туберкулёза к Н и R , за 24 часа. Для того, чтобы оисинтъ эффективность химиотерапии больных туберкулезом лёгких, основанной на раннем определении чувствительности А/ tuberculosis к рифампиннну и изонназнду методом биочнпов бито обследовано -ОН ВИЧ- отрицательных пациентов с деструктивным туберкулезом органов дыхания, находившихся на лечении в ГУ ЦНИИТ РАМН с 2003 «о 2005 гг. Среди обследованных больных мужчин было 55,8%, женщин - 44,2%. Наибольшей по численности оказалась возрастная группа от 21 до 40 лет - 523%. У 47,6% пациентов диагноз туберкулеза лег*нх был установлен впервые в жизни в период до 1 месяца до поступления в клинику ГУ ЦНИИТ РАМН- 21,2% были с рецидивом туберкулезного процесса. 25,4% - с прогрессировал нем туберкулёзного процесса на фо«№ предшествующего лечения препаратами первого ряда в течение 3-6 месяцев. НнфнльтратнаныЙ туберкуле1! легких при поступлении в стационар был выявлен у 71,2% больных. лисееминированиый - 2,9 %. кавернозный - 3,9%. фнброэио-кввериозиый - 14.3%, казеошая пневмония - 7,7% обследованных пациентов. У 60,5% больных процесс заболевания ограничивался поражением 1 -2 долей лёгких, у 33,7% протяженность процесса соответствовала 3-5 долям легких. Двусторонний процесс отмечался у 40,4%, односторонний - у 59,6% больных- Микобактерин туберкулеза были обнаружены методом посева при поступлении в клинику у всех 208 naiuteirroB. Исследование культур М. tuberculosis нз чувствительность к противотуберкулезным препаратам первого ряда проводили метолом абсолютных концентраций по методике, описанной в Приказе МЗ РФ № 109 от 21 марта 2003 года. В 107 случаях определение устойчивости к рифампицкну и «гэонназиду А/ tuheixuUxiis проводили на бночипох «ТБ-Биочнп».

Для оценки эффективности лечения больных туберкулезом легких в зависимости от сроков коррекции химиотерапии по данным бактериологического и молскулярио-гснегичеекого методов определения лекарственной чувствительности М. tvbercutosto 208 пациентов были разделены на две группы: 107 пациентов составили 1-ую н 101- It-ую. Группы были сопоставимы по полу, дорасту, формам туберкулезного процесса. Веем пациентам прн поступлении в стационар и далее ежемесячно проводили исследование мазка мокроты методом люминесцентной микроскопии и посев мокроты на плотную питательную среду Левснигтсйна-Йенссна. Выделенные на средах М tuberculosis исследовались на чувствительность к стрептомицину, изонилзилу, рнфампнцнну, згамбутолу, пнразднамнлу методом абсолютных концентраций. 107 пациентам 1-ой группы прн поступлении в стационар исследовали мокроту и выделенную из нее культу ру М tuberculosis на бночилш «ТБ-Бночнп» По результатам определения мутаций в генах, ответственных за чувствительность возбудителя туберкулёза к рифам Пнин ну н изонназнду, назначались схемы химиотерапии, При отсутствии мутаций в ieHax гроВ, katG, inhA, ahftC MET пациентам назначали 4 препарат [криш ч ряда -изониоэид, рифампицнн, пирознномнд, этамбутол (стрептомицин). Прк выявлении мутаций в генах МБТ, ответственных за устойчивость к изониазиду (katG. inhA, ahpC). и отсутствии мутаций в геле гроВ. ответственные за устойчивость к рифампицину, больным назначалась следующая комбинация препаратов, рнфампнцнн. этамбутол. пират ним лл. фторхннолон, амнкации (каиамицин). При выявлении мутаций одновременно в гроВ и и одном или нескольких rwiax katG. inhA. aftpC, лечение назначалось по IV режиму: протнонамнд, пиразниамил. омикацин или капреомицин, ПАСК, циклосерин, офлоксашн или левофлоксацнн Коррекция лечения проводилась после получения результатов чувствительности МБТ но методу абсолютных концентраций Пациентам II-И группы лечение назначалось по стандартным схемам 4-5 препаратами первого ряда с последующей коррекцией через три меся цл по результатам метода абсолютных концентраций

Сравнение результатов установления устойчивости к рифампицину и нзоннлэнду по методу абсолютных концентраций и на биочипах показало, что процент совпадения составил; для МЛУ МБТ 93,1%, для устойчивых к Н - 88.9%, для чувствительных к Н и R- 94,3%. Полное совпадение результатов наблюдалось при определении моноустойчнвости к рифампицину ни одним методом не было получено данных об устойчивости к этому препарату при отсутствии устойчивости к другим ПТП. Подобные результаты были получены ранее Скотникмюй О Н- с соавт, которая показало, что результаты определения устойчивости М. tuberculosa к рифампицину и Изоииазнду но бночипах из диагностического материала совпадали с результатами традиционного бактериологического метода абсолютных концентраций на среде Лсвснштсйна -Йексена в 88,8% случаев, а при выявлении чувстшгтельных к изоииазнду и рифампицину М. ruhercnioxi*-№ 100%, Результаты исследовании клинических изолятов

At. tuberculosis ид устойчивость к рнфампнцнну н иэониаянду обоими методами соаплпали на 97,3%, а при выявлении чувствительных ■ на 97,6%. (Скотннкова О.И., Галкина КЮ, Носова ЕЮ-. 2005).

Дня определения показаний к использованию бночнпов сравнивались клинические проявления туберкулеза и спектр мутаций в «на* МОТ у двух категорий больных: 59 впервые выявленных больных, не получавших противотуберкулезные препараты до поступления в стационар, и 4В ранее леченных нацистов препаратами первого ряда в течение тр5х месяцев и более, Мутации в генах rpoB. katG, inhA. ahpC МБТ выявляли на б но чип ах и при отсутствии мутаций относили к чувствительным к R и Н, при наличии мутаций - к устойчивым к R или Н. Молскудярно-гснстичсскнй анализ М tuberculosa показал, что чувствительных к И и R в группе впервые выявленных больных было 50,9%, в группе ранее леченых - 10,4%, то есть по числу М4делителей МБТ, чувствительных к итониазиду и рнфачпнинну, категория впервые выявленных больных достоверно отличалась от категории ранее леченных (р<0.01), По выделению МБТ с МЛУ достоверно большее число пациентов было in категории ранее леченных ■ 83,3%, Среди пациентов из категории впервые выявленных выделяющие МБТ с МЛУ составили 23,7% (р<0,01). При определении устойчивости МБТ к нзоннатиду разница между категориями оставалась, однако пациентов, выделяющих МБТ, устойчивые к изониазнду. было л группе впервые выявленных больных больше, чем в груп не ранее леченных (25,4% н 6,3% , соответственно, р-0,018). Такая разница может быть объяснена тем. в группе ранее леченных значительно преобладали выделители МЛУ штаммов МБТ

Акал № спектра мутаций в генах rpott. katG. I'thA. ahpC на биочипах МБТ, выделенных от больных разных категорий, выявил 21 вариант мутаций МБТ в зтнх генах (табл. 32)- Наиболее распространённым был вариант мутаций №1 (rpoB 53ITCG-TTG;jfcaxG 3I5AOC-ACC), который встречался у впервые выявленных в 20,3%, а у ранее леченных в 47,6%.

Необходимо отметать, что этот вариант мутаций встречался у ранее леченных больных в достоверно большем числе случаев, чем у впервые выявленных, Били выявлены и другие варианты мутаций {№ 2-5), которые встречались с одинаковой частотой у МБ'Г от больных обеих групп Кроме того, были детектированы варианты мутаций, которые обнаруживались только у больных ранее леченных (№ 6-17) и только у впервые выявленных больных (№ 18-21). Сопоставление вариантов мупший показало, что у ранее леченных больных были более сложные мутации, затрагивающие одновременно несколько генов, ответственных за устойчивость х изоиназиду в сочетания с мутациями в репных колонах гена гроВ, Мутации, выявленные в МБТ от кнервые выявленных больных. затрагивали только по одному гену, ответственному за устойчивость к изоиназиду.

Эти данные являются фундаментальной основой, объясняющей трудность лечения у больных, ранее подвергавшихся терапии и больных с рецидивами. Так как МБТ. имеющие сложные мутации а нескольких генах являются более защищенными от воздействие противотуберкулёзных препаратов

В работах некоторых отечественных исследователей, изучавших мутации в генах устойчивых к ПТП микобактернй. также было показано большое разнообразие вариантов мутаций. Всеми группами было показано преобладание МБТ с мутациями а 3(5 кодоне гена katG (Геиерозов Э В . Акопян Т А-, Говорун В М„ 2000. Шемякин И,Г., СтепаншнНа В.Н., Иванов НЮ.,2003, Скотникова ОЛ., Галкина К.Ю., Носова EJO,, 2005), Однако распространение штаммов с мутациями а гене гроВ зависело от региона обследования. Так Шемякин ИХ. с соавт. при анализе устойчивых к рнфампнцииу штаммов М tuberculosis, выделенных от больных в Приволжском и Центральном округах показал, что устойчивость к рнфзмпнцнну в 87.4% случаев детерминирована мутациями в 516, 526. 531 колонах гена, причем наиболее часто встречалась мутация в 516 кодоне гроВ (74,5%), Скотникова О.И, с соавт. продемонстрировали преобладание МБТ с мутациями в 531 кодоне гена гроВ (от 47,8% в Саратове до 933% в Алматы). В отличие от ранее проведенных исследований и нашей работе проанализированы особенности спектра мутаций у впервые выявленных н

Варианты мутаций в генах katG. inhA. ahpC rpoB M fuberculoru, определенные на биочинах «ТБ-Бкочига у впервые выявленных и ранее леченных больных туберкулезом

Мутаини в генах katG. inhA. ahpC. гроВ Ранее леченные n-48 Впервые выявленные n-59 P абс % абс % мутации lie выявлены 5 10.414,4 30 SO,9±6.5 0,0

1 гроВ 531 TCG-TTG kxaC 31SAGC-ACC 23 47,617,2 12 20,315,2 0.005

2 rpoB 516 GAC-GTC luuG 315 AGC-ACC; m/iA I5C-T 2 4,212,9 i 1,711,7 0,849

3 t-poB 531TCG-TTG katG 315 AGC-ACC inhA I5C-T 2 4,2±2,9 i 1,711,7 0,849

4 katG 315AGC-ACC inhA 15C-T 1 2,112,1 2 3.412,4 0.855

5 katG 315AGC-ACC I 2.1 ±2.1 8 13,514.4 0,078

6 rpoB 511CTG-CCG. rpoBS 16GAC-GGC katG 3£5AGC-ACC 2 4,2*2,9

7 rpoB 526TCG-TTG katG 315AGC-ACC 2 4,212,9

8 rpoB 531TCG-TGG katG 315AGC-CGC inhA 15C-T I

9 rpoB 531TCG-TTG mhA iSC-T I 2,l±2.l *

10 гровшгсо-тга katG 315AGC-ACC inhA 15C-T 1 2,1 ±2.1

11 rpoB 531 TCG-TTG katG 315AGC-ACC ahpC 9G-A 1 2,l±2,l

12 rpoB 53tTCG TTG katG 315AGC-ACA 1 2. [±2,1

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Кузьмин, Алексей Владимирович, 2006 год

1. Валнев РЛ1., Филатова М,С Лекарственная устойчивость мнкобактерий туберкулеза при «первые выявленном туберкулезе легких //Сб. тезисов 14-ого Национального конгресса по болезням органов дыхания. М., 2004.-С.386.

2. Васильева И.А. Эффективность химиотерапии больных лекарственно-устойчивым туберкулезом легких: Дне. докт. мед. наук. Москва 2002, - 263с,

3. Визсль А. А. Клиннко-фуикционадьиые особенности ннфнльтратнвного туберкулеза легких //Врачебное дело,- 1986.- N8.-С. 57-59.

4. Дорожхово ИР., Медведева ИМ. Проблема лекарственной устойчивости возбудителя туберкулеза ив современном этапе !( Туберкулез и экология.- 1997.- N2. С. 25-28.

5. Иртуганова О.А-, Смирнова Н.С., Мороз А.М., Литвинов В-И. Ускоренная культуральная диагностика туберкулеза с использованием систем ВАСТЕС MG1T и MR'"Bad //Методрекомендации МНПЦБТ. М-, 2001. - СЛ6

6. Карачунскнй М.А. Туберкулез в наши дни, //Русский мед. журнал,-2001.- T.9.-M2I.-C.9S 1-933,

7. Мамолат А.С., Клебанова М.А. Лечение туберкулеза легких Н «Вкш школа». Киев.- 1973,- С.32-72.

8. Мишин В.Ю-. Борисов С-Е-, Соколова Г Б и др. Разработка современных протоколов диагностики и лечения туберкулеза органов дыхания '/Consilium mediewn- 2001.- Т-3. - С-148 -154.

9. Мишин В.Ю., Чуканов В.И., Васильева И А Эффективность лечения туберкулеза легких вызванного мнкобактериями с множественной лекарственной устойчивостью // Пробл. туб. 2002. - № 12. - С. 18-23.

10. Наумов В.Н. Шайхаев А Я „ Токае» К В. Хирургическая тактика » условиях современного течения туберкулеза легких И Русский мед. журнал.-l 998.-Т.6.-№ 17.-C.2S-2S

11. Олинен B.C., Василенко Т.Н., Левченко В.И., Артюкова Т,Г,П Шалайко Т.А. Эффективность лечения больных туберкулезом на стационарном этапе Н Туберкулез сегодня: материалы VII российского съезда фтизиатров Москва, 2003.-С.246,

12. Партнеры во имя здоровья. Руководство по лечению туберкулеза с множественной лека решенной устойчивостью // «Партнеры во имя здоровья».-2003.- 173с.

13. Патрушев JUL Экспрессия генов // М.- Наука. 2000. - 527с.

14. Полукгом ФГ Особенности течения и эффективность лечения лекарственно-устойчивого туберкулеза легких у подростков: Дне— канд. мед наук. Москва, 2004. — С,98

15. Приказ МЗ РФ Jfe 109 от 21 марта 2003 года. «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации:» // Проба, туб. 2004.- ж.- С-40-65.

16. Приказ МЗ РФ № 109 от 21 марта 2003 года. «О совершенствовании противотуберкулезных мероприятий в Российской Федерации» // Пробл. туб. 2004.- №4.- С.31 -61.

17. Пун га ВВ., Капков Л.П, Туберкулез в России ЧЖури Проблемы туберкулеза. 19W.-J6 1.-С, 14-16.

18. Рабухин А Е, Химиотерапия больных туберкулезом. М,: Медицина,-I970.-C.9-18

19. Рудой Н. М. Лекарственная устойчивость мнкобактернй туберкулеза (значение в клинике н эпидемнолмчи туберкулеза}. -М,- 1969.-С. 255

20. Фармер П.Е., Канонси А.С и др Палирсзнстнггный туберкулез: угроза человечеству. Гарвардская медицинская школа /Институт «Открытое общество». М . 1999,- С-52

21. Фнрсова В.А., Полузктова Ф.Г., Кузьмин А.В. Черноусова Л.Н., Значение мнкрочнповой технологии в выявлении лекарственной устойчивости М.tuberculosis у больных туберкул в» м подростков // Материалы VII Российского съезда фтизиатров,- Москва, 2003, -С. Мб

22. Хейфец Л-Б. Микробиологические аспекты выявления больных туберкулезом с лекарственной устойчивостью ЛПробл. туб. 2004. -Nf5. - С.3-5

23. Хоменко А.Г. Туберкулез органов дыхания.- М.: Медицина. 1988.-С-355

24. Хоменко А.Г. Современные проблемы туберкулеза легких /.'Вестник РАМП 1995. -С.З-6.

25. Хоменко AT,. Мишин В.Ю. Диагностика и лечение остропрогресснруюпшх форм туберкулеза //Пробл. туб. 1996,- №5.1. G21-23.

26. Хоменко А.Г Современная химиотерапия туберкулеза U Клин, фармакол и терапия -1998, -№.7. С. 16-20.

27. Хоменко А, Г. Мишин В, Ю-. Чуканов В. И, Выявление, диагностика н химиотерапия туберкулеза органов дыхания в современных эпидемиологических условиях //Методическое пособие для врачей.1. М.,2000

28. Чуканов ВН. Проблема излечения больных туберкулезом органов дыхания, И Русский реферативный журнал,- 2001- Т, 9., №21. С. 9S4-959.

29. Чуканов В.И., Каминская Г.О., Лнвчане Э. Частота и характер побочных реакций при лечении больных туберкулевдм легких противотуберкулезными препаратами резервного рало. // Пробл. туб. и бол. легк -2004 ,- №10. С,6-10.

30. Шилова M B. Туберкулез в России в 2004 голу. М.; Фолиум, 2005.» С.69

31. Шмалнй К, В,. Нахнмсон Г. Л. // Врач. дело. 1962. - № I .-С. 98.

32. Albert Н-, Hoydenrych А., Mole ft., ТтЫПр A., Blumberg L, Evaluation of FASTPIaifueTQ-RIF14, a rapid, manual test foe the delermination of rifampicin resistance from Afivobacierium tuberculosis cultures. II J. Tuberc, bmj, ffis,-200l.-v.5 ,-p,906-911

33. Avendano M., Golduein R Mutadrug-rc^iflant mberculosis long term follow-up of 40 non-HIV-infecled patients // Canadian respiratory journal.2000.-V3.-P. 383-389

34. Bastian I. Cotebundcrs R. Treatment and prevention of multidrug-resistanttubciculosis //Drugs 1999. V.58.-P. 633-661

35. Blower SM, Gerdberding J.L Understanding. predicting and controlling the emergence of drug-resistant tuberculosis a theoretical framework // J. Mol. Mcd-I998.-№76.-P.624-636

36. Bomeman J, Chrobnk M. Delia Vedova G. Figueroa Л. Jiang T, Probe selection algorithms with applications in the analysis of microbial communities //Biobforaioiics.- 200l.-v.L-p. 39-48.

37. Broob G.F., Buiel J.S., Morse 5A- Jawctr, Melnick. and Adclbertfs medical microbiology// Applelon and Lange -Stamford.-22nd e<L-200I.

38. Brunei lo F . Fontana R. Reliability of the MBTOacT system for testing susceptibility of Mycobacterium tuberculosis complex isolates to antituberculosis drags tt}. Clin. Microbiol. 2000. - v.38. - p.872-S73.

39. Canetti G. ct el. Advances in techniques of testing mycobacterial drug sensitivity, and the use of sensitivity test in tuberculosis control programmes, // Bull. Wld HlthOrg.-l969.-v, 41.-p. 21-43

40. Cavusoylu C-, Bjlgic A. Determination of rifampin resistance in Mycoboctenvm tuberculosis isolates by the RNA/RNA mismatch method //Bull Mikrobiyol.- 2003,- v.-J7.p, 13,Turkish,

41. CDC Epidemiologic notes and reports nosocomial transmission of muttidrug-resistajit tuberculosis to health-care workers and HIV-infected patients in an urhan hospital Florida Z/MMWR. Morb. Mortal- WkJy. Rep. -1990. - № 39. -P.718-722.

42. Cole S.T, Mycobacterium tuberculosis drag-resistance mechanisms //Trends- Microbiol, -1994- № 2. ■ P. 41 Mt4.

43. Crofton J. Chemotherapy of pulmonary tuberculosis // Brit- Med- J -1959,-P.16KM6I4

44. Crofton J. etal. Clinical tuberculosis //Hacniillan.-1992-- P.199-208,

45. Dittfr Infantes M , Ruiz-Serrano M . Martinez-Sanchez L, et al, Evaluation of the MB'Вас Г Mycobacteium detection system for susceptibility testing of M.tuberculosis //J. Clin. Microbiol. 2000. - v.38. - P. 1988-1989.

46. Microbiol1998.-№47 -P 189-196.

47. Drobnicwski F, Balabanova Y . Ruddy M. ei al. Rifampin- and multidrug-resistant tuberculosis in Russian civilians and prison inmates: dominance of the Beijing strain family //Emerg. Infeci- Dis. ■ 2002. №8. -P.1320-1326.

48. Farmer P.E-, Kim Y, Community based approaches to the control of multidrug resistant tuberculosis: introducing ТХУГЗ-рЬн- //Br Med, J,1998.-Vol.317--P.671 -674

49. Farmer P. E-, Konowis Л. S,. Borisov S. E, Goldfarb A. Healing T. and M McKcc. Rccmdcsccnt tuberculosis in the Russian Federation Program in Infectious Disease and Social Change. Harvard Medical School, Boston-1999.-p. 41-83

50. Fischer 8„ FeHinz R Therapie und prognose dct Tubercutose // Vcrsichcrungsmedian. 1995. - v.47. - N 6. - P.212-216.

51. Fischer E) Epidemiology of mycobacterial resistance (especially Mycobacterium ttibcrculMti/ //Chemother, -1999. № 45 - p. 109-120.

52. Fox W, lillard GA. Mitchison DA. Studies on the treatment of tuberculosis undertaken by the British Medical Research Council Tuberculosis Units, 1946-1986. with relevant subsequent publications // J Tuberc Lung Dis.1999.-v^.-P,231-S279

53. Fricdcn T.K , Sherman L F , Maw K.Lct al. A multi-institutional outbreak of highly drag-resistant tuberculosis Epidemiology and clinical out comes //JAMA. -1996. -Jfc 276, P 1229-35.

54. Eriedman L.N. Tuberculosis Current Concepts and Treatment H CRC Prtss -Kew York.- 2001,- P 475-4%

55. Gali N, Domingue* J-, Me Nerncy R. el al. Rapid detection of drug resistance in M. tuberculosis clinical isolates using; micobaciertophage D29. Preliminary' s«udy // Int. J. Tubercle Lung Dis. 1999. - vJ. - P. 129.

56. Gillespie S.H. F.volution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosaclinical and molecular perspective //Antimicrobial. Agents. Chemother -2002,-v. 46. P. 267-274.

57. Grompe M. The rapid detection of unknown mulations in nucleic acids //Nature Genet. 1993. - v,5. -Р.Ш-П6,

58. Hawkins I., Wallace JL, Brown B, Antibacterial susceptibility tests, mycobacteria И In.: Manual of clinical microbiology', (ed. ABaJows et al-> Washington, -1991.-p 1138-1152,

59. Heitcts L., Lindcr Т., Sanchez Т., Spencer D., Brennan J, Two liguid mediu-m systems, Mycobacterium Growth Indicator Tube and MB Redox Tube, for M tuberculosa isolation from чрагшп specimens // J.Clin microbiol. 2000. -v.38.-p.l227-l230,

60. Inderljed CB Antimicrobial susceptibility testing; present practices and future trends //Eur. J. Clin. Microbiol. Infect Dis. 1994 №I3.-P. 9S0-993.

61. International Union Against Tuberculosis. An international investigation of the efficacy of chemotherapy in previously untreated patients with pulmonary tuberculosis, I964;34.t-I9l

62. Iseman M„ Madsen D, Drug-resistant tuberculosis // Clin, Chest Med -1989,-Vo). 10.-P. 341-353.

63. Iseman M D. Evolution of drag-resistant tuberculosis: a mle of two species II Proc.NalJ. Acad- Sci.(USA), 1994,. v. 91. - P. 2428-2429.

64. Iseman M,. Madsen L. Ackcrson L Impact of surgery on the management of MDR-TB// American Journal Respir. CriL Care Med-1996-P.IJ 1

65. Kalantri S,. Pai M„ Pascopella U Ri'cy L. Rcingold A. Bacleriophage-based tests for the detection of Mycobacterium tuberculosis in clinical specimens: a systematic review and meta-analysis I/ BMC Inf. Dis--2005-v.5.-P. 59

66. Khijirmm M-, Slayden R., У a qi ZhU- Inhibition of a M.tubereuJosis P-ketoacil ACP synthase by isoniazid U Science, 1998. - v.280, - p. 16071610

67. Kochi A. Varcld/is В., Sty bio K. Multidrug-resistant tuberculosis and its control U Res Microbiol.- 1993.-v.-144-р, 104-110.

68. Larsen L, A„ Christiansen M, Vuust J., Andersen P.S- High throughputmutation screening by automated capillary' electrophoresis //Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. 2000, Vol, 3, No. 5.-P.397

69. Madaras Т А Tuberculosis in the Eiuropean Region D Copenhagen.-2000

70. McNcrney R. ТВ: the return of the phage. A review of fifty years of mycobacteriophage research H J- Tuberc. Lung Di».-1999.- v.3.-P, 179-84,

71. Medical Research Council, Streptomycin treatment of pulmonary tuberculosis //BMJ-1948. Jfr 2. - P. 769^782

72. Mirzabekov A. & Kolchinsky A. MAGIChip: Properties and applications in genomic studies //Genomic Technologies Present and Future. Functional Genomics Series,-2002,- V, L-Ch. 6,- P.-163-196,

73. Musser J. Antimicrobial agents resistance in mycobacteria: molecular genetic insights// Clin. Microb. Rev. -1995. v.8. - P, 496-514.

74. Nachega J,В., Chaisson R E, Tuberculosis drag resistance: a global threat // Clin. Infect Dts. -2003. Jfe36. - P S24-S30.

75. Cheng S., Van B. Ma Y. Detection of rpoB gene mutation in Mycobacterium tubercuJwu by PCR "cold" SSCP //ZKonghua Tie He He Hu Xi Za Zhi.-1996.-v, 19,-P.333-337

76. Pagan -Ramos E., Song L, Me Falone M. et ol. Oxidative stress response and characterisation of the o*yR-ahpC and furA-katG loci in M. tuberculosis ttJ. of Bacteriology. 1998. - v,180. - P.4S56-4S64.

77. Pfaller M A- Application of new technology to the detection, identification,and antimicrobial susceptibility testing of Mycobacteria //Am. J,Chn. Pathol. -1994, ■ №01. P. 329-337,

78. Pyle M. Relative numbers of resistant tubercle bacilli in sputa of patients before and during treatment wilh streptomycin i'/Ptoc. Staff. Meet. Mayo. Clin- -1947 №Z - P 465-473,

79. Ramaswamy S.Musser J. M. Molecular genetic basis of antimicrobial agent resistance in Mycobacterium tuberculosis: 1998 update //J. Tubercl. Lung Dis.-1998.-Vol 79.-P. 3-29

80. Rattan A.Kalia A., Ahmad N J/ Multidrug' resistant Mycobacterium tuberculosis: molecular perspectivcs/Emerg Infect Dis.*l998.-№4,-P.I95

81. Raviglione M.C. The ТВ epidemic from 1992 to 2002 /^Tuberculosis. -2003,-X®S3.-P.4-14.

82. Rinder H., Thomschke A. Rusch-Gerdcs S. tt al. Significance of nhpC promoter imitations for the prediction of isoniazid resistance in M, tuberculosis H Eur. J, din microb. infect, dis. -1998. ~ v. 17. P,508-511

83. Rohner P., Ntnci В., Metal C. ct al. Evaluation of the MB/BacT system and companion to the BACTEC 460 system and solid media for isolation of mycobacteria from clinical specimens //J. Clin. Microb. 1997. - v.35. -P.3127-3131.

84. Rusch-Gerdcs S., Domeht C, Nardi G, ct al. Multicenlcr evaluation of the Mycobacteria Growth Indicator Tube for testing susceptibility of M.tuberculosis to first-line drugs//J. Clin, Microb. 1999. - vJ7. - p.45-48

85. Satyers A A, Bacterial pathogenesis // A molecular approach Washington; ASM Press D.C.-2002.- P. 138

86. S hinder I) , Cauthen G„ Farer L. ct al. Drug-resistant tuberculosis П Amer. Rev. resp. Dis. 1991. - Vol.141 - P 732-732,

87. Resistance in Mycobacterium tuberculosis by Double Gradient-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis // Amimicrob Agents Chemother.- I999.-v.43.-P. 2550-2554.

88. Snider D. F The global threat of drug-resistant tuberculosis №. Engl. J. Med. -1998. №338. - P. 1689-1690.

89. Smith I. Mycobacterium tuberculosis Pathogenesis and Molecular Determinants of Virulence // Clin. Microbiol, Rev, 2003. - V, 16. -P. 463-496.

90. Starke J. R. Drag-resistance in tuberculosis: mechanisms and prevention //Pediatric. Pulmondogy. -1997, v.16, - P. 154-156.

91. Sumitomo S, Treatment of multi drug resistant tuberculosis //J. Nippon-Rinsho -1998,-V.56.-P.3171 -3175

92. Sung S„ Kang C.H. Kim Y.T., Han S.K. Shim Y.-S., Kim J.H. Surgery increased Ihc chance of cure in multi-drug resistant pulmonary tuberculosis // Eur. Joum- of Cardjo-ihoracie Surgery,- I999,-V,l6.-Rl87-193

93. Voreldzis BP, Grossct T-, de Kantor I. el al. Drug resistant tuberculosis: laboratory issues, World Health recommendations // Tuberc, Lung. Dis. -1994, -v,75(1).-P. 1-7.

94. Verbist L . Gyselen A. Antituberculosis activity of rifampin in vitro and in vivo and the concentrations attained in human blood // Am. Rev. Respir, Dis-1968 v.9g .p. 923-932.

95. Viljoncn M.K., Vyshnevskiy B.L, Otten T F et al,Survey of drug-resistant tuberculosis in northwestern Russia from 1984 through 1994 //Tar. J. Clin.Microbiol. Infect Dis. -1998. №17, - P, 177-183.

96. WHO/lUATLD. Anti-tuberculosis drug resistance in the world- the WHOIUATLD global project on anti-tuberculosis drug resistance surveillance 1994-1997// WHO.- Geneva,- 1997.

97. WHO. Report on ТВ epidemic. Global ТВ programme // WHO, Geneva.-1997.

98. WHO. Geneva/I U ATLD Paris. Guidelines for survej I lancc of drugresistance fa tuberculosis //Int. J. Tuberc. Lung, Dis 1998.-№22.-P. 7289.

99. WIKMUATLD Anti-tuberculosis drug resistance in the world: the WHO-1UATLD Global Project on Anti-Tuberculosis Drug Resistance Surveillance Report 3. Geneva, World Health Organization, 2005

100. WHO. Global tuberculosis control: surveillance, planning, financing // WHO report 2006,- Gcneva-2006

101. Verokhin V. V., Punga V.V., Rybka L.N. Tuberculosis in Russia and the problem of multiple drug resistance //Annals, New- York Academy, of Scicncc. 2001. - №953. - P. 133-137.

102. Vershov G., Barsky V„ Belgovskiy A , Kirillov E„ Kreindlin E, Ivonov I., Parinov S., Guschtn D., Drobyshcv A., Dubiky S., Mirzabckov A, H Proc. Notl. Acad. Sei. USA. 1996. V. 93. P. 4913-4918

103. Yew W W .Chan C.K., Chan C.H. at al Outcomes of patients with mullidrug-resistant pulmonary tuberculosis treated with ofloxacin/Wortoxacin-cantaining regimens //ChesL-2000.-№l 17.-P.744-751

104. Zhang Y, Heym В., Allen B. ct al. The catalase-peroxidase gene and1. U-1isoniaad resistance of Mycobacterium tuberculosis //Nature. -1992- -v.358. P.-591-593.

Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.