Усовершенствование методов выделения, идентификации и индикации бактерий Pseudomonas putida тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.03, кандидат биологических наук Викторов, Денис Александрович

• Викторов, Денис Александрович
• кандидат биологических наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Викторов, Денис Александрович

Список условных сокращений.

ВВЕДЕНИЕ.

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

1.1. Развитие классификации бактерий рода Pseudomonas.

1.2. Характеристика семейства Pseudomonadaceae.

1.2.1. Род Pseudomonas.

1.2.2. Характеристика отдельных видов и групп бактерий рода Pseudomonas.

1.2.3. Морфологические, культуральные и физиолого-биохимические признаки псевдомонад.

1.3. Биологические свойства бактерии Pseudomonas putida.

1.3.1. Клеточная структура и метаболизм Pseudomonas putida.

1.3.2. Значение бактерии Pseudomonas putida и её применение в биотехнологии.

1.4. Псевдомонозы карповых рыб.

1.5. Микробиологические методы идентификации бактерий рода Pseudomonas.

1.5.1. Ход микробиологического исследования.

1.5.2. Питательные среды, применяемые для'выделения и идентификации псевдомонад.

1.6. Фагодиагностика бактерий.

1.6.1. Биологические свойства и особенности бактериофагов Pseudomonas putida.

1.6.2. Взаимодействие бактериофагов с клетками хозяина.

1.6.3. Реакция нарастания титра фага (РНФ).

2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ.

2.1. Объект, материалы и методы.

212. Результаты собственных исследований и их обсуждение.

2.2.1. Тинкториальные свойства клеток Pseudomonas putida.

2.2.2. Рост референс-штаммов Pseudomonas putida на стандартных: средах.

2.2.3. Основные биохимические свойства референс-штаммов Pseudomonas putida.

2.2.4. Антибиотикочувствительность референс-штаммов Pseudomonas putida.

2.2.5. Исследование отношения референс-штаммов Pseudomonas putida к температуре культивирования.

2.2.6. Конструирование среды накопления Psp-А-УГСХА.

2.2.7. Конструирование плотной селективной среды Psp-S-УГСХА.

2.2.8. Подбор тестов бактериологической дифференциации.

2.2.8.1. Разработка теста на способность Pseudomonas putida к росту в присутствии солей двухвалентного бария.

2.2.8.2.ViecTa на способность Pseudomonas putida к разжижению желатина.

2.2.9. Разработка бактериологической схемы выделения и идентификации Pseudomonas putida.

2.2.10. Основные биохимические свойства выделенных штаммов Pseudomonas putida.

2.2.11. Выделение бактериофагов Pseudomonas putida.

2.2.12. Характеристика выделенных фагов Pseudomonas putida.

2.2.13. Разработка технологических параметров изготовления и контроля индикаторных бактериофагов Pseudomonas putida.

2.2.14. Разработка оптимальных условий постановки реакции нарастания титра фага.

2.2.15. Использование РНФ для индикации бактерий Pseudomonas putida в объектах внешней среды.

2.2.15.1. Исследование с помощью РНФ прудовой воды, контаминированной бактериями Pseudomonas putida.

2.2.15.2. Исследование с помощью РНФ патологического материала рыб, контаминированного бактериями Pseudomonas putida.

2.2.15.3. Исследование с помощью РНФ овощей, контаминированных бактериями Pseudomonas putida.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Усовершенствование методов выделения, идентификации и индикации бактерий Pseudomonas putida»

Актуальность темы

Pseudomonas putida — часто встречающаяся бактерия, выделяемая как из внешней среды (вода, почва, растения), так и из патологического материала (Красильников, 1974; Смирнов, 1990; Identification^:Unusual., 1996). ^

В отечественной и зарубежной литературе имеются многочисленные сообщения, в которых освещаются отдельные биологические свойства P. putida (Сиволодскиий, 1990; Волкова, 2006; Blazevic, Koepke, Matsen, 1973; Harwood, Fosnaugh, Dispensa, 1989; Boopathi, Rao, 1999; Ribera, Monteoliva-Sanchez, Ramos-Cormenzana, 2001; Ward, de Roo, O'Connor, 2005; Th^Pseudomonas С/" putida,., 2007).

Данный микроорганизм является возбудителем псевдомоноза у прудовых рыб, сопровождающегося массовой гибелью рыбы (^Септический псевдомо- V ноз., 1971; Мусселиус, 1983; Грищенко, 1984; Вялова, Шкурина, 1995; Юн-чис, 2005; Altinok, Kayis, Capkin, 2006). В единичных случаях бактерии P. putida способны вызывать заболевания у теплокровных животных и человека: абсцессы, бактериемии, раневые инфекции, инфекции мочевыводящих путей, кольпит, приводящий к самопроизвольным выкидышам, абортам (Литвин, 1997; Blazevic, Koepke, Matsen, 1973; Pseudomonas putida newly., 1987; t^" Pseudomonas putida Septicemia., 2005). V

Имеются сведения, что P. putida вызывает порчу пищевых продуктов (Clive de W. Blackburn, 2008). Кроме того, ряд штаммов данной бактерии проявляет фитопатогенные свойства (Пастушенко, Симонович, 1979; Burkholder, 1950). Другие штаммы, напротив, входят в состав биопрепаратов для стимуляции роста растений (Воронин, Кочетков, 2000; Lopez, Henkels, 1999).

Бактерии Р. putida широко известны и имеют важное научно-практическое значение благодаря своей способности окислять необычайно большое число различных органических соединений, являются объектом биотехнологических исследований при конструировании препаратов-деструкторов, в том числе со множественной деструктивной активностью (Волкова, 2006; Muller, 1992). Разработаны методы использования Р. putida для очистки воды и почвы от нефти и нефтепродуктов (Клюянова, 2006; Kowalski, 2002).

Вышеперечисленное обуславливает научный и практический интерес к бактериям Р. putida. В значительной степени это связано с недостаточно разработанными методами индикации и идентификации данного микроорганизма при выделении из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов (Сиволодский, 1988; Васильев, Золотухин, Никишина, 1998).

С середины прошлого столетия бактериофаги широко используются для диагностики различных бактериальных инфекций (Гольдфарб, 1961). Вместе с тем, использование реакции нарастания титра фага, как быстрого и точного метода индикации бактерий, для Р. putida ранее не изучалось.

Цель исследования

Усовершенствование методов выделения, идентификации и индикации бактерий Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов.

Задачи исследования

1. Разработать среду накопления и селективную среду для выделения 'штаммов Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов, подобрать бактериологические тесты для идентификации этих бактерий.

2. Разработать схему бактериологической идентификации и дифференциации Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов на основе разработанных сред и подобранных тестов.

3. Изучить основные биологические свойства штаммов Р. putida, выделенных из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов.

4. Выделить бактериофаги бактерий Р. putida и изучить их основные биологические свойства: морфологию негативных колоний, литическую активность, установить спектр литической активности, специфичность действия, температурную устойчивость и устойчивость к хлороформу.

5. По критериям литической активности, спектру лизируемых культур и специфичности, отобрать наиболее оптимальный бактериофаг для конструирования биопрепарата.

6. На основе отобранного бактериофага создать биопрепарат для индикации и идентификации Р. ри^а и разработать технологию его изготовления.

7. Оптимизировать схему индикации бактерий Р. риНс1а в объектах внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов с помощью биопрепарата бактериофага РэрЮ-УГСХА методом реакции нарастания титра фага.

Научная новизна

Впервые для выделения, идентификации и оценки распространения бактерий Р. риМа была предложена и использована бактериологическая схема, основанная на применении оригинальных специфических сред: среды накопления Рэр-А-УГСХА с сукцинатом натрия и минеральными солями, селективной среды Рэр-З-УГСХА с глюкозой, бромтимоловым синим и фурадонином, а так же подобранной системы тестов, позволяющая за 96 часов провести дифференциацию бактерий Р. риМа от сопутствующей микрофлоры. Применение данной схемы позволило выделить и изучить 33 штамма Р. риШа из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов, что внесло существенный вклад в понимание биологических особенностей этих псевдомонад.

Выделены и изучены по заданным биологическим свойствам бактериофаги Р. риййа. Впервые для целей идентификации бактерий указанного вида разработан биопрепарат на основе отобранного наиболее оптимального для данных целей бактериофага РзрЮ-УГСХА.

Впервые разработана и апробирована на объектах внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов схема реакции нарастания титра фага для индикации бактерий Р. риМа с использованием биопрепарата бактериофага РБрЮ-УГСХА, позволяющая проводить индикацию бактерий Р. риИйа за 24 часа. Разработаны биотехнологические параметры изготовления биопрепарата бактериофага PsplO-УГСХА для индикации и идентификации бактерий Р. putida.

Практическая значимость

Предложена схема по выделению, бактериологической идентификации и дифференциации, позволяющая выделять и идентифицировать штаммы Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов. Сконструированная среда накопления Psp-А-УГСХА, селективная среда Psp-S-УГСХА и подобранная система биохимических тестов позволяют выделять и типировать бактерии Р. putida до вида за 96 часов. Сконструирован биопрепарат на основе бактериофага PsplO-УГСХА и разработана схема индикации бактерий Р. putida методом реакции нарастания титра фага (РНФ) в течение 24 часов.

Результаты усовершенствования бактериологической схемы выделения и идентификации Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов, изучения биологических свойств бактериофага PsplO-УГСХА, а также возможность использования биопрепарата бактериофага PsplO-УГСХА в схеме реакции нарастания титра фага, подтверждены актами комиссионных испытаний в Ульяновской ГСХА от 11 апреля 2011 г.

По материалам диссертационной работы предложены и утверждены ректором УГСХА (29 апреля 2011 г.) «Методические рекомендации по ускоренной индикации бактерий Pseudomonas putida методом реакции нарастания титра фага в объектах санитарного надзора», «Методические рекомендации по изготовлению и контролю бактериофага PsplO-УГСХА», а также «Методические рекомендации по выделению и идентификации бактерий вида Pseudomonas putida в объектах санитарного надзора». Методические рекомендации предназначены для сотрудников медико-биологических научных учреждений и специалистов бактериологических лабораторий.

Материалы диссертационной работы используются в учебном процессе при чтении лекций, для практических занятий студентов, работы аспирантов на кафедре микробиологии, вирусологии, эпизоотологии и ветеринарно-санитариой экспертизы Ульяновской государственной сельскохозяйственной академии.

Основные положения выносимые на защиту

1. Разработанная среда накопления Рзр-А-УГСХА обеспечивает преимущественный рост и размножение бактерий Р. ргиШа. Сконструированная плотная селективная среда: Рзр-8-УГСХА является специфичной по отношению к бактериям Р. рМгс1а и угнетает рост возможных ассоциантов. 2'. Разработанная схема бактериологической дифференциации, включающая; сконструированные среды: среду накопления Рзр-А-УГСХА и плотную, селективную среду Рзр-8-УГСХЛ, а также систему бактериологических тестов, позволяет идентифицировать Р. риМс!а за 96 часов.

3. Из 14 выделенных и изученных по биологическим свойствам штаммов бактериофагов бактерий Р. ры(Ша отобран один бактериофаг РярЮ-УГСХА, который может быть использован для целей идентификации и индикации Р:рий<1а в объектах внешней среды, пищевом сырье и пищевых продуктах.

4. Разработан биопрепарат на основе бактериофага Рэр 10-УГСХА для индикации бактерий Р. рМгс1а и биотехнологические[ параметры по его изготовлению; ' V- ' ' " '' Л ■ -'' '

5. Усовершенствованная схема индикации Р- ри^а методом РНФ с применением биопрепарата бактериофага РврЮ-УГСХА позволяет типировать Р. ргШфа за 24 часа. :•■.':.'

Апробация работы :

• ; Материалы диссертационной работы были представлены на: Международной научно-практической конференции Ульяновской ГСХА (Ульяновск, 2008, 2009, 2011), Конференции молодых ученых «Актуальные проблемы инфекционной патологии ветеринарной медицины» (Покров, 2009), Ш-й Международной научно-практической конференции молодых учёных «Молодёжь и наука XXI века» (Ульяновск 2010), Всероссийском симпозиуме с. международным участием «Биологически активные вещества микроорганизмов: прошлое, настоящее, будущее» (Москва, 2011), Международной научно-практической конференции «Задачи ветеринарной науки в реализации доктрины продовольственной безопасности Российской Федерации» (Покров, 2011).

Работа выполнена на кафедре микробиологии, вирусологии, эпизоотологии и ветеринарно-санитарной экспертизы ФГБОУ ВПО «Ульяновская государственная сельскохозяйственная академия».

Публикации

По теме диссертации опубликовано 9 работ, из них 1 статья в журнале, рекомендованном ВАК РФ.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, двух глав: обзора литературы, собственных исследований, состоящих из объекта, материалов и методов, результатов исследования и их обсуждения, заключения, выводов, практических предложений, списка использованных литературных источников, приложений. Материалы диссертации изложены на 155 страницах, включают 42 таблицы и 21 рисунок. Список использованных литературных источников включает 239 наименований, в том числе 127 зарубежных.

Заключение диссертации по теме «Микробиология», Викторов, Денис Александрович

124 Выводы

1. Сконструированы среды - накопительная среда Psp-А-УГСХА с сукцинатом натрия и минеральными солями и селективная среда Psp-S-УГСХА с глюкозой, бромтимоловым синим и фурадонином, обладающие высокой специфичностью и позволяющие выделять штаммы P. putida.

2. Усовершенствована бактериологическая схема выделения и идентификации P. putida, основанная на сконструированных средах и подобранных тестах, включающих тесты на оксидазу, каталазу, желатиназу, чувствительность к хлориду бария, подвижность, утилизацию ацетамида, окисление глюкозы в аэробных условиях, окраску по Граму, реакцию «стекающая капля» с бактериофагом PsplO-УГСХА, способность к росту при 4 °С и при 41 °С. С использованием разработанной схемы из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов выделено и идентифицировано 33 «полевых» штамма P. putida.

3. Выделены и изучены по биологическим свойствам 14 культур бактериофау гов бактерий P. putida, литическая активность которых варьировала от 10 до Ю"10 по методу Аппельмана и от 6x107 до 4x1010 по методу Грациа, а спектр литической активности составил от 71,4 до 85,7%. Выделенные бактериофаги строго специфичны по отношению к P. putida и не лизируют бактерии других видов и родов; проявляют устойчивость к хлороформу в течение 40 минут и инактивируются при температуре 66 °С в течение 30 минут.

4. Отобран бактериофаг PsplO-УГСХА, имеющий оптимальные для конструирования биопрепарата свойства: спектр литической активности 85,7%; титр Ю"10 по методу Аппельмана и 4x1010 по методу Грациа.

5. Разработаны параметры постановки реакции нарастания титра фага с использованием биопрепарата на основе бактериофага PsplO-УГСХА для ускоренной индикации бактерий P. putida, позволяющие обнаружить в исследуемом материале указанные бактерии в концентрации от 103 м.к. в 1 г (1 мл) в течение 24 часов.

6. Установлены оптимальные технологические показатели для изготовления специфического биопрепарата бактериофага PsplO-УГСХА: соотношение количества фаголизата к количеству взвести бактериальных клеток индикаторного штамма Р. putida — 1:2, оптимальное время инкубирования при температуре 28 °С - 8 часов, обработка фаголизата хлороформом в соотношении 1:10 в течение 20 минут, хранение биопрепарата в условиях холодильника при температуре 4-6 °С в герметичных флаконах до 1 года без снижения активности.

Заключение

Бактерии P. putida вызывают заболевания у животных, что приводит к снижению экономического эффекта в животноводстве. В частности, псевдомо-нозы рыб наносят значительный ущерб рыбоводческим хозяйствам (Септический псевдомоноз., 1971; Мусселиус, 1983; Грищенко, 1984; Вялова, Шкури-на, 1995; Юнчис, 2005; Altinok, Kayis, Capkin, 2006). Имеются данные о способности P. putida вызывать заболевания у теплокровных животных, такие как абсцессы, бактериемии, раневые инфекции, инфекции мочевыводящих путей, кольпит, приводящий к самопроизвольным выкидышам, абортам (Литвин, 1997; Blazevic, Koepke, Matsen, 1973; Pseudomonas putida newly., 1987; Pseudomonas putida Septicemia., 2005). Ряд штаммов данной бактерии проявляет фитопатогенные свойства (Пастушенко, Симонович, 1979; Burkholder, 1950). Р. putida вызывает порчу пищевых продуктов (Clive de W. Blackburn, 2008).

Бактерии P. putida широко используются при конструировании препаратов-деструкторов, в том числе со множественной деструктивной активностью (Волкова, 2006; Muller, 1992). Существуют методы использования Р. putida для очистки воды и почвы от нефти и нефтепродуктов (Клюянова, 2006; Kowalski, 2002).

Нерациональное применение антибиотиков в рыбоводческих хозяйствах при борьбе с псевдомонозами способствуют появлению штаммов Р. putida, обладающих резистентностью к широкому спектру антибиотиков (Trevors, 1991).

Таким образом, проблема идентификации P. putida во внешней среде, пищевом сырье и пищевых продуктах остаётся актуальной (Сиволодский, 1988; Васильев, Золотухин, Никишина, 1998).

При разработке накопительной среды Psp-А-УГСХА и селективной среды Psp-S-УГСХА, нами исследовалась возможность применения сукцината натрия как источника углеродного питания для P. putida, особенность данного вида бактерий окислять глюкозу в аэробных условиях и резистентность к антимикробному препарату фурадонину. Использование среды накопления Psp-A

УГСХА и селективной среды Psp-А-УГСХА даёт возможность визуализировать бактериальные колоний на плотной селективной среде, а так же повышает эффективность выделения и идентификации Р. putida.

Нами подобрана система тестов бактериологической идентификации Р. putida, учитывающая основные биохимические свойства данного вида бактерий, включая наличие у Р. putida оксидазы и каталазы, подвижность бактериальных клеток, ингибирование роста Р. putida солями бария и отсутствие фермента желатиназы.

Используя сконструированные среды и подобранные тесты, мы разработали схему с высокими показателями чувствительности и специфичности и позволяющую проводить выделение и идентификацию Р. putida до вида за 96 часов. Специфичность сконструированной схемы выделения и идентификации Р. putida из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов проверена на 16 штаммах бактерий других видов и родов. С использованием разработанной нами схемы, из объектов внешней среды, пищевого сырья и пищевых продуктов было выделено 33 штамма Р. putida.

Важное значение приобретает ускоренная индикация Р. putida для быстрого и точного обнаружения данных бактерий в объектах внешней среды, пищевом сырье и пищевых продуктах. Вместе с тем, применение современных генетических и иммунологических методов для решения этих задач зачастую претерпевает трудности связанные с высокой стоимостью, либо сложностью выполнения исследований.

С середины прошлого столетия бактериофаги широко используются для диагностики различных бактериальных инфекций (Гольдфарб, 1961). О возможности применения бактериофагов с целью идентификации бактерий Р. putida сообщают некоторые исследователи (Выделение и анализ., 1981, 1989; Lee, Boezi, 1966; Chakrabarty, Niblack, Guansalus, 1967).

Для достижения поставленной цели из объектов внешней среды было выделено 14 культур бактериофагов бактерий Р. putida и изучены их основные биологические свойства: морфология негативных колоний, литическая активность, установлен спектр литической активности, специфичность действия, температурная устойчивость и устойчивость к хлороформу.

У выделенных бактериофагов наблюдалось пять типов негативных колоний:

1. Диаметр 1-2 мм, полностью прозрачны, без зоны вторичного лизиса,

2. Диаметр 0,5-1 мм с мутным центром, без зоны вторичного лизиса,

3. Диаметр 4-5 мм с наличием прозрачного центра и мутной зоной вторичного лизиса на периферии,

4. Диаметр 3-4 мм, полностью прозрачны, без зоны вторичного лизиса,

5. Диаметр 1-2 мм, с прозрачным центром и мутной периферией.

Литическая активность выделенных бактериофагов Р. риШа варьировала от 10"7 до 10"'° по методу Аппельмана и от 6x107 до 4x10ю по методу Грациа.

Далее отобрали бактериофаги РБр1-УГСХА, Рзр4Ь-УГСХА, Рэр 10-' УГСХА и рБр 17-У1 'СХА, обладающие наиболее высокой литической активностью и изучили спектр литической активности и специфичность действия. Пр°-веденные эксперименты показали, что все четыре отобранных фага являлись высокоспецифичными по отношению к штаммам Р. ршШа. Спектр литической : активности составил у бактериофага РБр4Ь-УГСХА - 71,4%, Рзр1-УГСХА и РврП-УГСХА - 80%, спектр литической активности бактериофага РБр 10" УГСХА - 85,7%. В настоящее время в России препараты бактериофагов выггус~ каются на производственных объединениях концерна «Микроген». Спектр литической активности коммерческих бактериофагов составляет 48,4%.

Таким образом в целях конструирования биопрепарата для индикации и идентификации Р. риШа, по критериям литической активности, спектру руемых культур и специфичности был отобран бактериофаг РБрЮ-УГСЗ^СА» имеющий оптимальные свойства.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Викторов, Денис Александрович, 2011 год

1. Абдусаматов М.А. Сравнительное изучение реакции нарастания титра фага и бактериологического метода при диагностике брюшного тифа у больных и реконвалесцентов / М.А Абдусаматов // ЖМЭИ. 1960. - №1. -С. 23-27.

2. Аврех В.В. О применении бактериофагов в диагностике сальмонеллезов /

3. B.В. Аврех // ЖЭМИ. 1954. - №7. - С. 93-96.

4. Аврех В.В. О понятии "Серологический тип бактериофагов" / В.В. Аврех // В кн.: XIII Всесоюзный съезд гигиенистов, эпидемиологов, микробиологов и инфекционистов. Ленинград, 1959. - Т.2. - С. 537-540.

5. Адельсон Л.И. Современное состояние проблемы теории бактериофага и его практическое применение / Л.И. Адельсон, В.Д Гуторова, Г.Г. Ключа-рева // Тезисы докладов юбилейной научной сессии Ленинградского сан.-гиг. мед. ун-та. Ленинград, 1958. — С.34.

6. Азизбекян P.P. Изменение наследственности бактерий путем фаговой конверсии / P.P. Азизбекян // В кн. Микробиология. Генетика микроорганизмов. Итоги науки и техники ВИНИТИ АН СССР. М., 1974. - Т.З.1. C. 191-233.

7. Арский В.Г. Применение реакции нарастания титра фага для диагностики хронической дизентерии / В.Г. Арский, 3.3. Ахметов, А.В. Ясенский // Здравоохранение Таджикистана. — 1961. — №2. — С. 5-11.

8. Архангельский И.И. Фаготипирование патогенных стафилококков, выделенных из молока коров / Б.А. Степанов, И.И. Архангельский // Ветеринария. 1966. -№3. - С. 27.

9. Асланов Б.И. Пути рационального использования синегнойных бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике / Б.И. Асланов, Р.Х. Яфаев, Л.П. Зуева // Микробиология. 2003. - №5. - С. 72-76.

10. Афонин Э.А. Разработка бактериологического метода выделения и идентификации Pseudomonas aeruginosa / Э.А. Афонин // Автореф. дис. . канд. биол. наук. Ульяновск, 1999 - 18 с.

11. Байрак В.А. Тесты патогенности и фаготипы стафилококков, выделенных при мастите коров / В.А. Байрак // Автореф. дис. . канд. биол. наук. -М., 1970.-19 с.

12. Воронин A.M. Биологические препараты на основе псевдомонад / A.M. Воронин, В.В. Кочетков // Arpo XXI. 2000. - №3. - С. 3-5.

13. Бульканова Е.А. Выделение и изучение основных биологических свойств бактериофагов Klebsiella, конструирование на их основе биопрепарата и разработка параметров их применения // Автореферат, дис. . канд. биол. наук. Саратов. - 2006. - 20 с.

14. Быкова З.И. Некоторые свойства чумных фагов / З.И. Быкова // Тр. Армянской противочумной станции. М., 1964. - №3. - С. 171-175.

15. Васильев Д.А. Учебно-методическое пособие по методам общей бактериологии / Д.А. Васильев, С.Н. Золотухин, Н.М. Никишина Ульяновск, 1998.-151 с.

16. Висконти Р. Генетика бактериофага / Р. Висконти // В кн.: Онтогенез вирусов. М., 1956. - 141 с.

17. Волкова К.В. Деструкция диметилфталата Pseudomonas putida МК55 / K.B. Волкова II Биотехнология состояние и перспективы развития: материалы 1-го Междунар. конгресса. 14-18 октября 2002. - Москва, 2002. — С. 281-282.

18. Волкова К.В. Разрушение ДМФ в воде штаммом Pseudomonas putida МК55 / К.В. Волкова II Ломоносов: сб. тезисов XIII Межд. науч. конф. студентов, аспирантов и молодых ученых, Москва, МГУ им. М.В, Ломоносова. 12-15 апреля 2006. М., 2006. - Т. IV. - С.29.

19. Воронцова A.A. Применение метода реакции нарастания титра фага при эпидемиологическом и санитарном обследовании / A.A. Воронцова // Кишечные инфекции: Тез.докл. на межинстит.конф. М., 1961. — С. 127128.

20. Выделение и анализ фагоустойчивых мутантов Pseudomonas putida с помощью новых бактериофагов / В.Н. Крылов и др. // Генетика. 1981.1. Т.17, №2. С.239-245.

21. Выделение и общая характеристика группы умеренных фагов Pseudomonas aeruginosa / А.С. Яненко и др. // Микробиология. 1979. -Т.48, №1. - С.109-113.

22. Вялова Г.П. Псевдомоноз молоди лососевых на Малкинском рыбо- водном заводе Камчатки / Г.П. Вялова, З.К. Шкурина // Проблемы товар, выращивания лососевых рыб России: Сб. докл. Всерос. совещ. 1-4 августа 1995 - Мурманск: Изд-во ПИНРО, 1995. - С. 79-84.

23. Вялова Г.П. Методы борьбы и профилактики псевдомоноза молоди горбуши / Г.П. Вялова, А.В. Полтева, З.К. Шкурина // Информ. листок СахЦНТИ. 1995. - № 38-95. - С. 4.

24. Габрилович И.М. Общая характеристика бактериофагов / И.М. Габрилович // Основы бактериофагии. Минск. - 1973. - С. 5-24.

25. Ганюшкин В.Я. Бактериофаги сальмонелл и их применение в ветеринарии / В.Я. Ганюшкин Ульяновск. — 1988. - С.45.

26. Ганюшкин В.Я. Бактериофаги Salmonella choleraesuis, сравнительная характеристика и практическое применение / В.Я. Ганюшкин // Автореф. дис. . докт. вет. наук. — М., 1984. — С. 13-34.

27. Ганюшкин В.Я. Реакция нарастания титра фага при диагностике паратифа поросят / В.Я. Ганюшкин // Ветеринария. 1967. - №3. - С. 69-71.

28. Гольдфарб Д.М. Бактериофагия / Д.М. Гольдфарб // М.: Медгиз. 1961. -225 с.

29. Гольдфарб Д.М. Опыт применения реакции нарастания титра фага для диагностики дизентерии / Д.М. Гольдфарб, В.Н. Кузнецова // ЖМЭИ. -1957.-№8.-С. 90-94.

30. Гольдфарб Д.М. Индикация брюшнотифозной палочки в воде с помощью реакции нарастания титра фага / Д.М. Гольдфарб, З.С. Островская // ЖМЭИ. 1957. - №5. - С. 17.

31. Гордина Р.В. Фаготипирование паратифозных В бактерий и действие на них бактериофагов / Р.В. Гордина // Автореф. дис. . докт. вет. наук. -М., 1954.-С. 24-27.

32. Грищенко Л.И. Патоморфология и вопросы патогенеза при септическом псевдомонозе рыб / Л.И. Грищенко // Восьмое Всесоюзн. совещание по паразитам и болезням рыб. Тезисы докл. М., 1984. - С. 26-27.

33. Грищенко Л.И. Болезни рыб и основы рыбоводства. Учебник. / Л.И. Грищенко, М.Ш. Акбаев, Г.В. Васильков М.: Колос, 1999. - С. 10-69; 139-263; 420-448.

34. Давиденко Т.А. Фаготипирование S.typhimurium, выделенных в Киеве в 1966-1970 / Т.А. Давиденко, А.М. Зарицкий // В кн.: Кишечные инфекции. -Киев.-1972.-С. 41.

35. Домарадский И.В. Методика быстрого обнаружения чумного микроба при помощи бактериофага / И.В. Домарадский, О.Н. Мосолова, Л.К. Денисенко // Иркутск. — 1957. — С. 44-51.

36. Ершов Ф.И. Индикация дизентерийных бактерий с помощью РНФ / Ф.И. Ершов // В кн.: Изменчивость микроорганизмов и иммунитет. — М. — 1959.-С. 188.

37. Жиленков Е.Л. Изучение начальных стадий взаимодействия умеренного фага phi04 с клеткой Pseudomonas aeruginosa / Е.Л. Жиленков // Микробиология. 1997. - Т.66, №4. - С. 532-538.

38. Золотухин С.Н. Создание и разработка схем применения диагностическихбиопрепаратов на основе выделенных и изученных бактериофагов робактерий / С.Н. Золотухин // Автореф. дис. . д-ра биол. наук. -новск, 2007.-39 с.

39. Изучение морфологии частиц и структуры геномов бактериос~^ Ъагов

40. Pseudomonas putida с, целью их классификации / В.Н. Крылов м >

41. Генетика. 1989. — Т.25, №9. — С. 1559-1570. -v,;'' ■

42. Илюхин В.И. Псевдрмонадные инфекции в патологии человека / ЗЗ.И. Илюхин^/УЖМЭШ;-;1985.-№2.-G. 110-114. V \'vV'

43. Инструкция о мероприятиях по профилактике и ликвидации псевдоту^""—грно-за рыб / Министерство сельского хозяйства и продовольствия Росси^^Ег^^ской Федерации от 18 сентября 1998г.

44. Капырина H.A. Идентификация возбудителя листериоза.с помощью»- ■ бактериофага / И.А. Бакулов, H.A. Капырина // Симпозиум > "Профилакт: е: тка и меры борьбы с лептоспирозом и листериозом с/х животных". — Hog<- >чер-касск. 1972. - С. 76-78. ' ■:■•';■

45. Катмакова Н.П. Селекция псевдотуберкулезных бактериофагов дл5эц.;- создания диагностического препарата // H.H. Катмакова, С.Н. Золоту-—-—

46. Катмакова Н.П: Разработка и применение диагностического би<р>~—парата «YP 09 УГСХА» на основе бактериофагов Yersinia ps*^-——cZ^-do-tuberculosis / Н.П. Катмакова// Автореф. дис. . канд. биол. наук. —яновск, 2010 -24 с.

47. Килессо В.А. Идентификация сальмонеллёзных культур с помощью О-бактериофага / В.А. Килессо // Тез. докл. конф. Таллин, научн.- иссл. инта эпидемиол., микробиол. и гигиены. Таллин. - 1960. - С. 5.

48. Клив де В. Блекберн. Микробиологическая порча пищевых продуктов: пер. с англ. / ред. Клива де В. Блекберн. СПб.: Профессия, 2008. - 784 с.

49. Ковалева E.H. Создание биопрепарата на основе выделенных и изученных бактериофагов Enteroccocus Faecalis // Автореф. дис. . канд. биол. наук. 2009. - 20 с.

50. Козелько O.A. Применение метода РНФ для контроля качества дезинфекции в очагах кишечных инфекций / O.A. Козелько // ЖМЭИ. — 1961. — №2. С. 36-40.

51. Кольпикова Т.И. Фаготипирование листерий / Т.И. Кольпикова // Ветеринария. 1990. - №6. - С. 31-32.

52. Коритняк Б.М. Выделение и изучение основных биологических свойств бактериофагов Yersinia enterocolitica и их применение в диагностике //

53. Автореф. дис. . канд. биол. наук. Саратов, 2005. - 20 с.

54. Красильников H.A. Определитель бактерий и актиномицетов / H.A. Кра-сильников М.: Д.: Изд-во АН СССР, 1949. - 830 с.

55. Красильников H.A. Жизнь растений. Том 1. Введение Бактерии и актино-мицеты / Под ред. члена-корреспондента АН СССР, профессора H.A. Красильников, профессора A.A. Уранов М.: Просвещение, 1974. - С. 209-218.

56. Красильников А.П. Микробиологический словарь справочник / А.П. Красильников, Т.Р. Романовская // Минск: Асар. - 1999. - 310 с.

57. Кременчук Г.А. Применение реакции нарастания титра фага для исследования объектов внешней среды / Г.А. Кременчук, М.А. Гицевич, К.П. Бо-яршинова И ЖМЭИ. 1961.-№7.-С. 124.

58. Кульба A.M. Биологические свойства и нуклеотидный состав ДНК бактериофагов Pseudomonas / A.M. Кульба, A.C. Горелышев // Микробиология. — 1981. — Т.50. — С. 536-542

59. Лешкович Н.Л. О диапазоне и специфичности действия чумных фагов 1701, 1710иих мутантов / Н.Л. Лешкович, В.П. Ермилова //В кн.: Проблемы особо опасных инфекций. М. - 1974. - С. 38-41.

60. Лихачев Н.В. Метод диагностики паратифа свиней при помощи бактериофага / Н.В. Лихачев // Ветеринария. 1948. - №7. - С. 32.

61. Мац Л.И. Вопросы санитарной бактериологии и вирусологии / Л.И. Мац — М.: Медицина. 1965. - С. 44-59.

62. Методические рекомендации по выделению и диагностике псевдомоноза сельскохозяйственных животных / ГУБ МСХ СССР от 15 декабря 1982г.

63. Методические указания по лабораторной диагностике псевдомонозов рыб / Министерство сельского хозяйства и продовольствия Российской Федерации от 22 сентября 1998г.

64. Методические указания по санитарно-бактереологической оценке рыбо-хозяйственных водоемов от 27.09.99г. №13-4-2/1742.

65. Методы получения, концентрации и очистки бактериофагов, поражающих фитопатогенные бактерии рода Pseudomonas / Ж.И. Оемчук и др. // Пробл.общ.и молекул, биол. Киев ,1988. - №7. - С. 97-100.

66. Микробиологическая диагностика бактериальных болезней животных / Д.И. Скородумов и др.. М.: ИзографЪ, 2005. - 656 с.

67. Микробиологические методы идентификации микробов рода Pseudomonas. Приказ № 535 от 22.04.85г. "Об унификации микробиологических методов иследования, применяемых в КДЛ лечебно-профилактических учреждениях".

68. Молофеева Н.И. Выделение и изучение основных биологических свойств бактериофагов Escherichia coli 0157 и их применение в диагностике // Автореф. дис. . канд. биол. наук. — Саратов, 2004. — 20 с.

69. Мусселиус В.А. Лабораторный практикум по болезням рыб / Под ред. В.А. Мусселиус. — М.: Лёгк. и пищ. пром-сть, 1983 — 296 с.

70. Никитюк Н.М. Фаготипирование Styphimurium, выделенных на различных территориях СССР / Н.М. Никитюк // ЖМЭИ. 1970. - №1. - С. 53.

71. Определитель нетривиальных патогенных грамотрицательных бактерий (аэробных и факультативно анаэробных). Пер. с англ. / Р. Вейант и др. -М.: Мир, 1999. С. 506-553.

72. Островская H.H. Ускоренный метод диагностики брюшного тифа Vi-фага

73. H.H. Островская, Б.Н. Папкова // ЖМЭИ. 1951. - №2. - С. 37-40.

74. Островская H.H. К использованию метода нарастания титра фага для выявления бруцелл во внешней среде / H.H. Островская, Д.М. Гольдфарб // ЖМЭИ.-1961.-№5.-С. 145.

75. Павлова И.П. Изучение морфологии и биологических свойств фагов Bacillus anthracis и Bacillus cereus / И.П. Павлова // ЖМЭИ. 1971. - №7. -С. 147.

76. Пастушенко А.Т. Серологические группы фитопатогенных бактерий рода Pseudomonas / А.Т. Пастушенко, И.Д. Симонович // Микроб, журн. -1979.-Т.41.-С. 222-228

77. Покровский В.И. Медицинская микробиология / В.И. Покровский, O.K. Поздеев // М.: Гоэтар Медицина. 2002. - С. 343-348.

78. Покровский В.И. Медицинская микробиология / В.И. Покровский, O.K. Поздеев // М.: Гоэтар Медицина. 1998. - С. 183-192.

79. Пожарникова E.H. Выделение и изучение биологических свойств бактериофагов рода Enterobacter, конструирование на их основе биопрепарата и разработка параметров практического применения: Автореф. дис. . канд. биол. наук. — Саратов, 2006. С. 4-19.

80. Поляк М.С. Питательные среды для медицинской и санитарной микробиологии / М.С. Поляк СПб.: ЭЛБИ-СПб. - 2008. - С. 179-180.

81. Понявин Б .Я. Изучение реакции нарастания титра фага в условиях практической лаборатории / Б.Я. Понявин // ЖМЭИ. 1960. - № 6. - С. 135.

82. Применение РНФ для индикации дизентерийных бактерий флекснера в организме зараженных кроликов / А.Ю. Иллютович и др. // Бюлл. эксп. биол. и мед. 1958. — №6. — С. 78.

83. Пульчеровская Л.П. Выделение и изучение основных биологических свойств бактериофагов Citrobacter и их применение в диагностике: Автореф. дис. . канд. биол. наук. Саратов, 2004. 21с.

84. Ревенко И.П. К диагностике рожи свиней / И.П. Ревенко // Ветеринария. -1970. -№ 6. -С. 13.

85. Ревенко И.П. Бактериофаги и их использование в ветеринарной практшивсе-- Киев: Урожай. 1978. - С. 41-88.

86. Рубашкина Б.К. Применение метода нарастания титра фага для иссле^хо-вания объектов внешней среды / Б.К. Рубашкина, С.Ф. Казакова^ // ЖМЭИ. 1959. - №6. - С. 110-112.

87. Самойленко В.И. Современное состояние изученности фагов фитопагзсго-генных бактерий / В.И. Самойленко // Бактериальные болезни растениМг — М.: Колос, 1981. С. 27-42.

88. Септический псевдомоноз карпов и толстолобиков / К.А. Лобунцов JQec др. //Ветеринария. 1971. - С. 58-59.

89. Сиволодскиий Е.П. Питательная среда Pseudomonas APS для выделениям ^ идентификации Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas putida / Е.П. Сив <cz>— лодскиий // ЖМЭИ. 1990. - С. 60-65.

90. Сиволодский Е.П. Тест идентификации бактерий рода Pseudomonas / Е.ЖПХ-Сиволодский // Лаб. дело. 1988. - №11. - С. 64-66.

91. Смирнов В.В. Бактерии рода Pseudomonas / B.B. Смирнов, Е.А. Кипрщ^з^-нова // Киев: Наук. Думка. 1990. - С. 65-69.

92. Стент Г. Молекулярная биология вирусов бактерий / Г. Стент — М.: Мищ=г>=у 1965.-452 с.

93. Стронговская Н.В. Сравнительное изучение РНФ для выявления нос^зп—тельства дизентерийных бактерий: Автореф. дис. . канд. мед. наук. --

94. Симферополь. — 1964. — С. 6-20.

95. Сидоров М.А. Определитель зоопатогенных микроорганизмов, справо^зм-— ник / М.А. Сидоров, Д.И. Скородумов, В.Ф. Федотов. М.: Медицина-. 1995-С. 162.

96. Таксономическое изучение Pseudomonas fragi / Е.А. Киприанова и др. // Микобиология. 1988. - Т.57, №1. - С. 119-125.

97. Тимаков В.Д. Экспериментальное обоснование нового принципа обнару-— жения дизентерийных и брюшнотифозных бактерий с помощью фага В.Д. Тимаков, Д.М. Гольдфарб // ЖМЭИ. 1956. - №10. - С. 3-7.

98. Тимаков В.Д. Об условиях взаимодействия фага и бактериальной клетки / В.Д. Тимаков, Д.М. Гольдфарб // Вестник АМН СССР. 1958. - №2. - С. 37.

99. Тимаков В.Д. Реакция нарастания титра фага (РНФ) / В.Д. Тимаков, Д.М. Гольдфарб М., 1962. - С. 65-71.

100. Тихоненко А.С. Ультраструктура вирусов бактерий / А.С. Тихоненко — М.: Наука, 1968. С. 89-168.

101. Усвоение додецилсульфата натрия бактериями рода Pseudomonas / Е.А. Киприанова и др. // Микробиол. Журн. 1978. - Т. 40, №4. - С. 503-505.

102. Фаги Pseudomonas aeruginosa / А.Г. Шестаков и др. // Современное развитие АПК: региональный опыт, проблемы, перспективы: Материалы Всероссийской научно-практической конференции. 26-28 апреля 2005. — Ульяновск, 2005. 4.5. - С. 227-229.

103. Феоктистова Н.А. Выделение и изучение основных биологических свойств бактериофагов Proteus, конструирование на их основе биопрепарата и разработка параметров практического применения // Автореф. дис. . канд. биол. наук. — Саратов. — 2006. — 22 с.

104. Хейс У. Генетика бактерий и бактериофагов / У. Хейс М.: «Мир», 1965. -С. 288-294.

105. Цветков К.И. Применение специфического фактериофага для диагностики паратифозного аборта кобыл / К.И. Цветков // Ветеринария. — 1941. — №6.-С. 4-6.

106. Шестаков А.Г. Усовершенствование методов выделения, идентификации и индикации бактерий Pseudomonas aeruginosa / А.Г. Шестаков // Автореф. дис. . канд. биол. наук. Саратов, 2010 - 22 с.

107. Щеглова М.К. Некоторые свойства листериозного бактериофага / 1VI.K. Щеглова // ЖМЭИ. 1962. - №1. - С. 99-102.

108. Эпидемиологические аспекты экологии бактерий / В.Ю. Литвин и др.- ~~ М.: Фармарус-Принт, 1997. С. 255-256.

109. Юнчис О.Н. Инфекционные болезни морских аквариумных рыб / О-Н. Юнчис // Проблемы аквакультуры: Межвед. сб. науч. и науч.-метод. тр. Московский зоопарк. 2005. - С. 115-126.

110. Aalam S. High efficiency styrene biodégradation in a biphasic organic/water continuous reactor / S. Aalam, A. Pauss, J. Lebeault //Applied Microbiology Biotechnology. 1993. - N39. - P. 696-699.

111. Adams M. H. Bacteriophages / M.H. Adams Interscience Publishers, Inc., New York, 1959. - 473 p.

112. Altinok I. Pseudomonas putida infection in rainbow trout /1. Altinok, S. Kayis, E. Capkin // Aquaculture. 2006. - V.261. - P. 850-855.

113. Baigent H.L. Bacteriophages of Pseudomonas syringae / H.L. Baigent, J.E. De Va y, M.P. Starr // Z. J. Sei. 1963. - N6. - P. 75-100.

114. Bartell P.F. Distinct slime polysaccharide depolymerases of bacteriophage-infected Pseudomonas aeruginosa: evidence of close assotiation with the structured bacteriophage particle / P.F. Bartell, Т.Е. Orr // J. Virol. 1969. - V.4(5> -P. 580-584.

115. Benzene, Toluene and Xylene Biodegradation by Pseudomonas putida CClS/tI 852 / M.H. Otenio et al. // Brazilian Journal of Microbiology. V.36. -258-261.

116. Bergey's manual of determinative bacteriology / D. Bergey et al. Baltimore : Williams and Wilkins Co., 1923. - 442 p.

117. Blazevic D.J. Incidence and identification of Pseudomonas fluorescens arx<ä Pseudomonas putida in the clinical laboratory / D.J. Blazevic, M.H. Koepki^, J.M. Matsen // Appl. Microbiol. 1973. - P. 107-110.

118. Bonde G. Bacterial Indicator of Water Pollution / G. Bonde // Teknisk Forlag. Copenhagen. 1963. - P. 164.

119. Boopathi E. A sideophore from Pseudomonas putida type Al: structural and biological characterization / E. Boopathi, K.S. Rao // 1999. V.1435. - P. 3040.

120. Boyd J. S. K. Bacteriophage and heredity / J. S. K. Boyd // Nature. 1954. -V.173.-P. 50-51.

121. Bredley D.E. The structure of some Staphylococcus and Pseudomonas phages / D.E. Bredley // J. Ultrastruct. Res. 1963. -N8. - P. 552- 558.

122. Bradley D.E. The fine structure of bacteriophages / D.E. Bradley, D. Kay // J. Gen. Microbiol. 1960. - V.23. - P. 553-563.

123. Bradley D.E. The structure and infective process of a Pseudomonas aeruginosa bacteriophage containing ribonucleic acid / D.E. Bradley // J. Gen. microbiol. -1966.-V.45.-P. 83-96.

124. Bradley D.E. The adsorption of the Pseudomonas aeruginosa bacteriphage pf to its hast / D.E. Bradley // J. Microbiol. 1973. - N5. - P. 623-631.

125. Bradley D.E. Adsorption of bacteriophages specific for Pseudomonas aeruginosa R factors and R1 1822 / D.E. Bradley // Bio-chem. Biophys. Ries. Comm. 1974. -N57. - P. 893-900.

126. Breed K. Bergey's manual of determinative bacteriology / K. Breed, E. Murray, N. Smith Baltimore, 1957. - 1094 p.

127. Buchanan T. Pathogenic aspects of outer membrane components of Grammnegative bacteria / T. Buchanan, W. Pearce // Bacterial outer membranes, biogenesis and function. New York: Wiley and Sons. - 1979. - P. 475-514.

128. Burkholder W. Sour skin, a bacterial rot of onion bulbs / W. Burkholder // Phytopathology. 1950.-Nl.-P. 115-117.

129. Burnet F.M. Induced lysogenicity and mutation of bacteriophage within lysog-enic bacteria / F.M. Burnet, D. Lush. // Australian J. Exptl. Biol. Med. Sei. -1936.-V.14.-P. 27-38.

130. Castillo F.J. Localization and functional role of the Pseudomonas bacteriophage 2 depolimerase / F.J. Castillo, P.F. Bartell // J. Virol. 1976. - V.18(2). -P. 701-708.

131. Chakrabarty A.M. Phage initiated polysaccaride depolimerase in Pseudomonas putida / A.M. Chakrabarty, J.F. Niblack, I.C. Guansalus // Virology. 1967. -V.32.-P. 532-534.

132. Darreil J.H. Pyocine-typing of hospital strains of Pseudomonas pyocyanea / J.H. Darreil, A.H. Wahba. // J. Clin. Pathol. 1964. - V. 17. - P. 236-242.

133. Davison P.F. The physical properties of T7 bacteriophage / P.F. Davison, D. Freifelder // J. Mol. Biol. 1962. - P. 635-642.

134. Decomposition of poly-ß-hydroxybutyrate by Pseudomonads / F.P. Delafield et al. // J. Bacteriol. 1965. - N5. - P. 1455.

135. De Vos P. Intrageneric and intergeneric similarities of ribosomal RNA cistrons of the Genus Pseudomonas and the implications for taxonomy / P. De Vos // Antonie van Leeuwenhoek J. Microbiol, and Serol. 1980. - V.46, N1. - P. 96.

136. Dooren de Jong L.E. Bijdrage tot de Kennis van het mineralisatieproces / L.E. Dooren de Jong Rotterdam: Nijgt, van Ditmar, 1926.

137. Doudoroff M. Genus Pseudomonas Migula 1894 / M. Doudoroff, N.J. Palleroni // Bergey's Manual of Determinative Bacteriology 8th ed. - Baltimore : Williams and Wilkins Co, 1974. - P. 217-243.

138. Ednie L.M. Comparative activities of clinafloxacin against gram-positive and -negative bacteria / L.M. Ednie, M.R. Jacobs, P.C. Appelbaum // Antimicrob Agents Chemother. 1998. - V.42. - P. 269-273.

139. Espinosa-Urgel M. Genetic Analysis of Functions Involved in Adhesion of Pseudomonas putida to Seeds / M. Espinosa-Urgel, A. Salido, J. Ramos // Journal of Bacteriology. 2000. - V.182. - P. 2363-2369.

140. European perspective on nosocomial urinary tract infections. I. Report on the microbiology, work-load, etiology and antimicrobial susceptibility / E. Bouza et al. // Clin Microbiol Infect. 2001. - V.7. - P. 523-531.

141. Euzeby J.P. List of Prokaiyotic Names with Standing in Nomenclature Genus Pseudomonas. - http://www.bacterio.cict.fr/index.html

142. Evaluation of microbial surfactants for recovery of hydrophobic pollutants from soil / M.I. Van Dyke et al. // Journal of Industrial Microbiology. 1993. -Nil.-P. 163-170.

143. Festl H. DNA hybridization probe for the Pseudomonas fluorescens group/ H. Festl, W. Ludwig, K.H. Schleifer // Appl. And Environ. Microbiol. 1986. -V.52, N5. — P. 1190-1194.

144. Finegold, Bailey and Scott's Diagnostic Microbiology / Finegold // 7th ed., The C. V. Mosby Co., St. Louis. 1986.

145. Freeman V. J. Studies on the virulence of bacteriophage infected strains of Corynebacterium diphtheriae / V. J. Freeman // J. Bacteriol. 1951. — V.61. — P. 675-688.

146. Frei W. Uber Cytochrom and das Atmungssystem der Bakterien / W. Frei, L. Riedmuller, F. Almasy // Biochem. Z. 1934. - V.274. - P. 253-267.

147. Fuerst J.A. Surfase appendages similar to fimbriae (pili) von Pseudomonas cpecies / J.A. Fuerst, A. Hayward // J. Gen. Microbiology. 1969. - V.58, N2. -P. 227-237.

148. Gaby W.L. Differential diagnosis of Pseudomonas-iike microorganisms in the clinical laboratory / W.L. Gaby, E. Free // J. Bact. 1958. - V.76, N4. - P. 442-444.

149. Galarneault T. Pseudomonas vesiculare (Busing et al.) comp. nov. / T. Galarneault, E. Leifson // Int. Bull. Bact. Nomencl. Taxon. 1964. - V14, N1. -P. 165.

150. Genomotyping of Pseudomonas putida strains using P. putida KT2440-based high-density DNA microarrays: implications for transcriptomics studies / H. Ballerstedt et al. // Applied Microbiology and Biotechnology. 2007. - V.75. -P. 1133-1142.

151. Greta B. Elaboraría Si Evaluaría Metodelor Rapide Pentru Diagnosticul Laborator Al Infectiilor Tractusulii Urinar / G. Balan // Teza de doctor on medicina. Chisunai. - 2008.

152. Gilardi G.L. Nonfermentative gram-negative bacteria encouatered in clinical specimens / G.L. Gilardi // J. Microbiol. Serol. 1974. - V.39. - P. 229-242.

153. Hancock R. Antibiotic uptake in Gram-negative bacteria // R. Hancock, A. Bell / Eur. J. Clin Microbiol Infect. Dis. 1988. - V.7. - P. 713-720.

154. Härtig C. Formation of trans Fatty Acids Is Not Involved in Growth-Linked Membrane Adaptation of Pseudomonas putida II C. Härtig, N. Loffhagen, H. Harms / Applied and Enbironmental Microbiology. 2005. - V.71. - P. 19151922.

155. Harwood C.S. Flagellation of Pseudomonas putida and analysis of its motile behavior / C.S. Harwood, K. Fosnaugh, M. Dispensa // Journal of Bacteriology. 1989. - V.171. -P. 4063-4066.

156. Hayward A.C. Characteristics oí Pseudomonas solanacearum / A.C. Hayward I I J. Appl. Bacterid. 1964. - V.27. - P. 265.

157. Hegeman G.D. Synthesis of the enzymes of the mandelate pathway by Pseudomonas putida. I. Synthesis of enzymes by the wild type / G.D. Hegeman // J. Bacteriol. 1966. - V.91. - P. 1140-1154.

158. Holloway B. W. Genom organization in Pseudomonas / B.W. Holloway, A.F. Morgan // Ann. Rev. Microbiol. 1986. - V.40. - P. 79-105.

159. Holloway B. W. Lysogenic conversion in Pseudomonas aeruginosa / B.W. Holloway, G.N Cooper. // J. Bacteriol. 1962. - Y.84. - P. 321-324.

160. Hugh R. The taxonomic significance of fermentative versus oxidative metabolism of carbohydrates by various Gram-negative bacteria / R. Hugh, E. Leifson // J. Bact. 1953. - V.66, N1. - P. 24-26.

161. Hugh R. Ryschenkow, E. Pseudomonas maltophilia, an alcaligenes-like species / R. Hugh // J. Gen. Microbiol. 1961. - V.26, N1. - P. 123-132.

162. Human- and animal-pathogenic members of the genus Pseudomonas / T. Bergen et al. I I The Prokaryotes A Handbook on Habitats, Isolation and Identification of Bacteria. Springer-Verlag. - Berlin, 1981.

163. Identification of Unusual Pathogenic Gram-Negativ Aerobic and Facultatively Anaerobic bacteria / R.S. Weyant et al. // 2nd ed. The Williams & Wilkins Co., Baltimore, Md. 1996.

164. Iglewski B.H. Pseudomonas. In: Baron's Medical Microbiology (S. Barron et al, eds.) / B.H. Iglewski // 4th ed., Univ of Texas Medical Branch. 1996.

165. Iizuka H. An attempt at grouping of the genus Pseudomonas / H. Iizuka, K. Komagata I I J. Gen. and Appl. Microbiol. 1963. - V.9, N1. - P. 73-82.

166. Ikari P. Pseudomonas alcaligenes monias (1928) a polar monotrichos dextrose non-oxidizer / P. Ikari, R. Hugh // Bacteriol. Proc. 1962. - P. 70.

167. Incidence, spectrum and antibiotic sensitivity pattern of bacterial infections among patients with acute pancreatitis / P.K. Garg et al. // J. Gastroenterol Hepatol. -2001. -V. 16. P. 55-59.

168. Jessen O. Pseudomonas aerugenosa and other green fluorescent pseudomonads / O. Jessen. Munksgaad, Copenhagen, 1965 - P. 240-244.

169. Keeven J. A new selective medium for isolation / J. Keeven, B. De Cicco // Abstr. Annu. Meet. Amer. Soc. Microbiol. 87tm Annu. Meet. AtlantaWashington, D.C. - 1987. - P. 382.

170. Kellin E.A. Isolation and properties ofa bacteriophage lytic for a wide rang of Pseudomonas / E.A. Kellin, R.A. Wrren // Canad. J. liacrobiol. 1971. - V.17, N5.-P. 677-682.

171. Klinge K. Differential tehniques and methods of isolation of Pseudomonas / K. Klinge I I Journal of Applied Microbiology. 1960. - V.23, N3. - P. 442-462.

172. Kluyver A.J. Pseudomonas aureofaciens nov. spec, and its pigments / A.J. Kluyver // J. Bacreriol. 1956. - V.72, N3. - P. 406-411.

173. Kowalski H. U.S. German Research Consortium Sequences Genome of Versatile Soil Microbe / H. Kowalski // J.Craig Venter Archive. - 2002.

174. Krylov V. Myoviridae bacteriophages of Pseudomonas aeruginosa: a long and complex evolutionary pathway / V. Krylov // Res Microbiol. 2003. - V.154. -P. 69-75.

175. Lee L. F. Characterization of bacteriophage gh-1 for Pseudomonas putida / L.F. Lee, J.A. Boezi // J. Bacteriol. 1966. - V.92. - P. 1821-1827.

176. Loele W. Uber die Verwendbarkeit von Oxydationswirkungen mit Para-phenylendiamin in der Bakteriologie / W. Loele // Zbl. Bakt. (Abt. 1 Orig.). -1929.-V.111.-P. 325.

177. Lopez J.E. Utilization of Heterologous Siderophores Enhances Levels of Iron Available to Pseudomonas putida in the Rhizosphere / J.E. Lopez, M.D. Henkels // Applied and Environmental Microbiology. 1999. - V.65. — P. 5357-5363.

178. Lysenko O. Pseudomonas — an attempt at a general classification / O. Lysenko // J. Gen. Microbiol. 1961. - V.25, N3. - P. 379-408.

179. MacFaddin J.F. Media for Isolation Cultivation -Identification-Maintenance of Medical Bacteria / J.F. MacFaddin // Williams and Wilkins, Baltimore. -1985.-V.l.-P. 25-28.

180. Marcus A. Versatile soil-dwelling microbe is mapped / A. Marcus // Genome News Network. 2003.

181. Marcus P. Induction and purification of a- and ß-hydroxysteroid dehydrogenases / P. Marcus, P. Talalay // J. Biol. Chem. 1956. - V.218, N2. - P. 661-674.

182. Migula W. Shizomycetes / W. Migula // Engler and Prante. Naturlichen pflanzenfamilien. 1895. - P. 29.

183. Migula W. System der Bacterien / W. Migula Jena : G. Fisher. - 1900. - V.2. -876 p.

184. Miller C.D. Cloning and mutational analysis of the gene for the stationary-phase inducible catalase (catC) from Pseudomonas putida / C.D. Miller, Y.C. Kim, A.J. Anderson // Journal of Bacteriology. 1997. - V.179. - P. 52415245.

185. Moustafa F.A. A Comparison of some phytopathogenic and nonphytopatho-genic Pseudomonas / F.A. Moustafa, Whittenbury // Phytopatol. Z. 1970. -V.67, Nl.-P. 63.

186. Muller R. Bacterial Degradation of Xenobiotics. / R. Muller // Microbial Control of Pollution. 1992. - V.48. - P. 52.

187. New selective media for enumeration and recovery of Pseudomonads from various habitats / W. Gould et al. // Appl. and Envirion.Microbiol. 1985. -V.45, Nl.-P. 28-32.

188. Nikaido H. Penetration of lipophilic agents with multiple protonation sites into bacteria cells; tetracyclines and fluoroquinolones as examples / H. Nikaido, D.G. Thanassi // Antimicrob Agents Chemother. 1993. - V.37. - P. 13931399.

189. Olive P. B. D. Principles and applications of methods for DNA-based typing of microbial organisms / P. B. D. Olive // J. Clin Microbiol. 1999. - V.37. - P. 1661-1669.

190. O'Toole Isolation and Characterization of a Generalized Transducing Phage for Pseudomonas aeruginosa Strains PAOl and PA14 / M. Jonathan et al. // Journal of Bacteriology. 2004. - V.186, N10. - P. 3270-3273.

191. Palleroni N. Phenotypic characterization and deoxyribonucleia acid homologies of Pseudomonas solanacearum / N. Palleroni, M. Doudoroff Ibid. — 1971.-V.107, N3.-690 p.

192. Palleroni N.J. Nucleic acid homologies in the genus Pseudomonas / N.J. Palleroni, M. Doudoroff// Int. J. Syst. Bacterid. 1973. - V.23, N4. - P. 333339.

193. Palleroni N.J. Genus Pseudomonas Migula 1894 / N.J. Palleroni // Bergey'smanual of systematic bacteriology Ed. R. Noel, Krieg J. G. Holf.-Baltimore:1.ndon: Williams Wilkins. 1984. - V.l. -P. 141-198.

194. Palleroni N.J. The Pseudomonas group / N.J. Palleroni // Bushey: Meadowfield press Ltd.-1978.-P. 80.

195. Pesci E.C. The chain of command in Pseudomonas quorum sensing / E.C. Pe-sci, B.H. Inglewski // Trends Microbiol. 1997. - V.24. - P. 132-134.

196. Phylogenese definition of the major eubacterial taxa / C.R. Woese et al. // Syst. Appl. Microbiol. 1985. - V.6, N1. -P. 143-151.

197. Pickett M.J. Manual of Clinical Microbiology / M.J. Pickett, D.G. Hollis, E. Bottone // 5th ed., ed. in chief A.Ballows. Washington: Am Soc Mirobiol. -1991.-P. 410-28.

198. Postic B. Observations on bacteriophage typing of Pseudomonas aeruginosa / B. Postic, M. Finland // J. Clin. Invest. 1961. - V.40, N20. - P. 64-75.

199. Prevot A.R. Traite de sistematique bacterienne / A.R. Prevot Paris : Dunod, 1961.-V.2.-P. 41-191.

200. Pseudomonas and Burkholderia / M.O. Husson et al. //Clinical precis of bacteriology, Paris. 2000. - P. 1259-1285.

201. Pseudomonas aureofaciens Kluyver and phenazine-a-carboxylic acid, ist characteristic pigment / W.C. Haynes et al. // J. Bacteriol. 1956. - V.72, N3. -P. 412-417.

202. Pseudomonas bacteriophage phiKZ contains an inner body in its capsid / V.N. Krylov et al. // Can. J. Microbiol. 1984. - V.30. - P. 758-762.

203. Pseudomonas putida newly recognized pathogen in patients with cancer / E. Anaissie et al. // Am. J. Med. 1987. - P. 1191-1194.

204. Pseudomonas putida Septicemia in a Special Care Nursery Due to Contaminated Flush Solutions Prepared in a Hospital Pharmacy / J. Perz et al. //Journal of Clinical Microbiology. -2005. -V.43. -P. 5316-5318.

205. Reanney D. Genetic Interactions Among Communities / D. Reanney, P. Gowland, J. Slater // Microbes in Their Natural Environments. 1983. - V.34. -P. 408.

206. Rhodes M.E. The characterization of Pseudomonas fluorescens / M.E. Rhodes // J. Gen. Microbiol. 1959. - V.21, N1. - P. 221-263.

207. Rhodes M.E. The characterization of Pseudomonas fluorescens with the acid of an electronic computer / M.E. Rhodes // Ibid. 1961. - V.25, N2. - P. 331.

208. Ribera R. Production of polyhidroxyalkanoates by Pseudomonas putida KT2442 harboring pSK2665 in wastewater from olive oil mills (alpechin) / R. Ribera, M. Monteoliva-Sanchez, A. Ramos-Cormenzana // Electronic Journal of Biotechnology. V.4. - 2001.

209. Romano J. Pseudomonas-Saccharomyces Interactions: Influence of Fungal Metabolism on Bacterial Physiology and Survival / J. Romano, R. Kolter // Journal of Bacteriology. 2005. - V.187. - P. 940-948.

210. Roncero C. Pseudomonas aeruginosa Transposable Bacteriophages D3112 and B3 Require Pili and Surface Growth for Adsorption / C. Roncero, A. Darzins, J. Malcolm // J. of Bact. 1990. - P. 1899-1904.

211. Ruiz-Manzano A. Levels and Activity of the Pseudomonas putida Global Regulatory Protein Crc Vary According to Growth Conditions / A. Ruiz-Manzano, L. Yuste, F. Rojo // Journal of Bacteriology. 2005. - V.187. - P. 3678-3686.

212. Ryan K.J. Sherris Medical Microbiology / K.J. Ryan, C.G. Ray // 4th ed., McGraw. 2004. - P. 236.

213. Sands D.C. Taxonomy of phytopathogenio Pseudomonads / D.C. Sands, M.N. Schroth, D.C. Hildebrand // J. Bacteriol. 1970. - V. 101, N1. - P. 9.

214. Sellers W. Medium for differentiating the gram-negative, nonfermenting bacilli of medical interest / W. Sellers // J. Bact. 1964. - V.8. - P. 46-48.

215. Sjoberg L. Phage typing of Pseudomonas aeruginosa / L. Sjoberg, A.A. Lindberg. // Acta Pathol. Microbiol. Scand. 1968. - V.74. - P.61-68.

216. Slayter H.S. The structure of Pseudomonas aeruginosa phages B3, E79, and F116. / H.S. Slayter, B.W. Holloway, C.E. Hall // J. Ultrastruct. Res. 1964. — V.ll.-P. 274-281.

217. Stanier R. Y. The aerobic pseudomonads: a taxonomic study / R.Y. Starrier, N.J. Palleroni, M. Doudoroff. // J. Gen. Microbiol. 1966. - V.43. - P. 159271.

218. Stock J.B. Protein phosphorylation and regulation of adaptive response in bacteria / J.B. Stock, A.J. Ninfa, A.M. Stock // Microbiol Rev. 1989. - V.53. -P. 450-490.

219. Taxonomy of aerobic pseudomonads: P. diminuta and P. veziculare / R. Bailard et al. // J. Gen. Microbiol. 1968. - V.53, N2. - P. 349-361.

220. Taxonomy of the aerobic pseudomonads: the properties of the Pseudomonas stitzeri group / N.J. Palleroni et al. // J. Gen. Microbiol. 1970. - V.60, N2. -P. 215-231.

221. The Effect of Nutrient Limitation of Styrene Metabolism in Pseudomonas putida CA-3. / K. O'Connor et al. // Applied and Environmental Microbiology. 1996. - V.62. - P. 3594-3599.

222. The family and genera of the bacteria. Preliminary report of the society of American bacteriologists on characterization and classification of bacterial types / C.E. Winslow et al. // J. Bacteriol. 1917. - V.2, N5. - P. 505-566.

223. The genome of bacteriophage phiKMV, a T7-like virus infecting Pseudomonas aeruginosa / R. Lavigne et al. // Virology. 2003. - V.20, N312(1). - P. 4959.

224. The genome of bacteriophage phiKZ of Pseudomonas aeruginosa / V.V. Me-syanzhinov et al. // J. Mol. Biol. 2002. - V.15, N317(1). - P. 1-19.

225. The Pseudomonas putida Lon protease is involved in N-acyl homoserine lactone quorum sensing regulation / I. Bertani et al. // BMC Microbiology. -2007. — V.7. — P. 71.

226. Trevors J.T. Development of a Microbial Profile on Selected Groups of Microorganisms to assist in evaluations under the Canadian Environmental Protection Act for the Genus: Pseudomonas / J.T. Trevors // Environment Canada contract report. —1991.

227. TSCA Experimental Release Application Approved for Pseudomonas putida Strains. United States Environmental Protection Agency. 2007.

228. Uetake H. Conversion of somatic antigens in Salmonella by phage infection leading to lysis or lysogeny / H. Uetake // Virology. 1958. - V.5. - P. 68-91.

229. Vandenbergh P.A. Plasmid Involvement in Acyclic Isoprenoid Metabolism by Pseudomonas putida / P.A. Vandenbergh, A.M. Wright // Applied and Environmental Microbiology. 1983. - V.45. - P. 1953-1955.

230. Variable enzymological pattering in tyrosine biosynthesis as a means of determining natural relatedness among the Pseudomonadaceae / G. Byng R. et al. // J. Bacteriol. 1980. - V.144, N1. - P. 247-257.

231. Van Niel C. A note on 'Pseudomonas stutzeri / C. Van Niel, M.B. Allen // J. Bacteriol. 1952. - V.64, N 3. - P. 413-421.

232. Vicente M. Glucolysis in Pseudomonas putida\ Physiological Role of Alternative Routes from the Analysis of Defective Mutants / M. Vicente, J.L. Canovas // Journal of Bacteriology. 1973. - V.l 16. - P. 908-914.

233. Ward P.G. Accumulation of Polyhydroxyalkanoate from Styrene and Phylacetic Acid by Pseudomonas putida CA-3 / P.G. Ward, G. de Roo, K.E. O'Connor // Applied Environmental Microbiology. 2005. - V.71. - P. 20462052.

234. Weber D.J. Nosocomial infections in the ICU: the growing importance of antibiotic-resistant pathogens / D.J. Weber, R. Raasch, W.A. Rutala // Chest. -1999.-V.l 15.-P. 34-41.

235. Welsh J. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers / J. Welsh, M. McClelland // Nucleic Acids Res. — 1990. — V. 18, N72. — P. 13-18.

236. Whitman P.A. Characterisation of two psychrophylic Pseudomonas bacteriophages isolated from ground beef / P.A. Whitman, R.T. Marshall // Appl.Microbiol. 1971. - V.22, N3. -P. 463-468