Аллельные варианты и экспрессия генов-кандидатов содержания абдоминального жира у кур тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.02.07, кандидат наук Ларкина, Татьяна Александровна
- Специальность ВАК РФ03.02.07
- Количество страниц 103
Оглавление диссертации кандидат наук Ларкина, Татьяна Александровна
2. ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ.........................................................................10
2.1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.....................................................................10
2.1.1. Липидный обмен птиц..................................................................10
2.1.2. Картирование QTL, влияющих на жирность бройлеров............................13
2.1.3. Характеристика генов-кандидатов: FABP1, FABP2, FABP3, HMGA1, PPARG, МС4Я, PPARGС1А, РОМС и РТРЫ................................................16
2.1.3.1. Ген FABP1.................................................................................16
2.1.3.2. Ген FABP2.................................................................................20
2.1.3.3. Ген FABP3...................................................................................22
2.1.3.4. Ген HMGA1..............................................................................24
2.1.3.5. Ген PPARG..............................................................................27
2.1.3.6. Ген MC4R................................................................................32
2.1.3.7. Ген PPARGС1А...............................................................................34
2.1.3.8. Ген РОМС..................................................................................35
2.1.3.9. Ген РТРШ.................................................................................36
2.1.4. Автоматическое секвенирование ДНК..................................................37
2.2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ........................................47
2.2.1. Материалы..................................................................................48
2.2.2. Методы исследований...................................................................49
2.3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ................................52
2.3.1. Определение уровня экспрессии девяти генов-кандидатов.........................53
2.3.2. Секвенирование гена PPARG и подбор праймеров для генотипирования генов PPARG и FABP2....................................................................................56
2.3.3. Генотипирование бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» по трем полиморфным сайтам гена PPARG.........................................................58
3. ЗАКЛЮЧЕНИЕ....................................................................................71
3.1. ВЫВОДЫ....................................................................................73
3.2. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ...................................................74
3.3. ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ........................74
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ..............................75
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ..............................................................................76
ПРИЛОЖЕНИЯ...................................................................................95
Приложение 1 - Результаты генотипирования бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» (п=52), низкая масса абдоминального жира (г) и низкое содержание
абдоминального жира (%).........................................................................95
Приложение 2 - Результаты генотипирования бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» (п=68), средняя масса абдоминального жира (г) и среднее содержание
абдоминального жира (%).....................................................................98
Приложение 3 - Результаты генотипирования бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» (п=30), высокая масса абдоминального жира (г) и высокое содержание абдоминального жира (%).....................................................................102
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Генетика», 03.02.07 шифр ВАК
Молекулярно-генетические маркеры физических качеств человека2010 год, доктор медицинских наук Ахметов, Ильдус Ильясович
Ассоциация полиморфизмов генов-регуляторов с физической деятельностью, адаптацией сердечно-сосудистой системы к физическим нагрузкам и типом мышечных волокон человека2007 год, кандидат медицинских наук Ахметов, Ильдус Ильясович
Сравнительный анализ органоспецифичных профилей генной экспрессии у свиней2012 год, кандидат биологических наук Хлопова, Наталия Сергеевна
Биологические особенности и продуктивные качества кур отдельных кроссов1998 год, кандидат сельскохозяйственных наук Эфендиев, Нурдин Казимагомедович
Эффективность использования премиксов и БВМД на основе сапропелей в кормлении цыплят-бройлеров разных кроссов1998 год, кандидат биологических наук Евтишенков, Владимир Дмитриевич
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Аллельные варианты и экспрессия генов-кандидатов содержания абдоминального жира у кур»
Актуальность темы исследования. Более половины производимого на сегодняшний день мяса птицы составляют бройлерные кроссы домашней курицы. Селекция бройлеров по признаку высокой скорости роста параллельно привела к увеличению жирности тушки, что значительно снижает эффективность кормления, не несет коммерческой целесообразности, и снижает потребительскую ценность. Примерно 15-20% массы тушки у современных бройлерных пород приходится на жир. Основным местом отложения жира у животных является жировая ткань (подкожная, внутримышечная, абдоминальная). Остальной жир присутствует в крови и других тканях и является физиологически необходимым. Различные жировые депо взаимосвязаны между собой и изменения в одном сопровождаются и изменениями в других. Однако, абдоминальный жир более изменчив, чем общий жир или внутримышечная жировая ткань (Архипов А.В., 2012). Таким образом, возможны значительные изменения в абдоминальном жире без серьезных изменений межмышечных и внутримышечных жировых депо. Для борьбы с излишней жирностью тушки птиц требуется пристальное изучение факторов, участвующих в депонировании жира и разработка методик, ослабляющих этот процесс.
ДНК-маркеры локусов количественных признаков, ассоциированные с хозяйственно-полезными признаками, позволяют оценить генетический потенциал животного (Костюнина О.В., 2016).
Поиск полиморфизмов в генах, участвующих в липидном обмене, важная задача на сегодняшний день для многих ученых передовых стран. Найдены точечные мутации в гене A-FABP, которые являются маркерами для отбора линий бройлеров с высоким содержанием внутримышечного жира (Wang Y. et al., 2016). К тому же, недавно выяснили, что совместная работа гамма-рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPARG) с метилированным
энхансер-связывающим белком альфа (СЕВРА), повышает скорость адипогенеза и играет решающую роль в дифференциации адипоцитов ^ао Y. et а1., 2015).
Спектр ДНК-маркеров, связанных с воспроизводительными, мясными и откормочными качествами постоянно расширяется. Таким образом, поиск мутаций, обуславливающих экономически значимые признаки, устойчивость к заболеваниям и наличие генетических дефектов, а также разработка тест-систем диагностики таких мутаций для использования в селекционно-племенном процессе представляет интерес, как для исследователей, так и для практических специалистов (Костюнина О.В., 2016).
Степень разработанности темы исследования. Исследование механизмов отложения абдоминального жира во всем мире важны как для повышения продуктивности сельскохозяйственных птиц и животных, так и для профилактики и лечения ожирения у человека. Изучение этого процесса, предполагает проведение исследований как на белковом, транскрипционном так и геномном уровнях. Поэтому, имеется необходимость в поиске молекулярных маркеров для селекции родительских линий бройлеров на снижение содержания абдоминального жира, что позволит увеличить пищевую ценность тушки и уменьшить расходы на кормление.
С целью обнаружения новых генов-кандидатов, связанных с отложением брюшного жира, Морейра с соавторами секвенировал QTL, локализованный на 3 хромосоме между микросателлитными маркерами LEI0161 и ADL0371 (33,595,706-42,632,651 п.н.). В общей сложности было найдено 136054 полиморфизмов с 15496 вставками в этом регионе. Из этих вариантов, 386 с 15 вставкам оказались расположены в кодирующих областях генов, связанных с липидным метаболизмом. А именно шесть генов: LOC771163, EGLN1, GNPAT, FAM120B, ТНВ^32 и GGP, показали положительную связь с отложением абдоминального жира (Могека G.C. et а1., 2015). Исследователем Ли с соавторами, удалось вскрыть связь роста жировой ткани в брюшной полости с полиморфизмами в локусах количественных признаков. Они обнаружили 22
локуса количественных признаков и 97 генов (в том числе 9 некодирующих), а прорывом стало обнаружение Gga_rs14303341 и Gga_rs14988623. Эти
результаты дают представление об огромном генетическом влиянии мутаций на продуктивные характеристики кур мясного направления F. et а1., 2013).
Цель и задачи исследований. Целью данной работы является изучение экспрессии генов-кандидатов, участвующих в метаболизме липидов в организме, выявление полиморфных сайтов в этих генах и изучение их связи с содержанием абдоминального жира у кур мясного направления.
В соответствии с поставленной целью решались следующие задачи:
1. Создать банк матричной РНК из образцов различных органов и тканей домашней курицы с высоким и низким содержанием абдоминального жира.
2. Выполнить теоретическое моделирование условий эксперимента по анализу экспрессии генов FABP1, FABP2, FABP3, HMGA1, PPARG, MC4R, PPARGC1A, POMC, РТРЫ1 на основе ПЦР в режиме реального времени.
3. Определить профиль экспрессии генов-кандидатов в разных тканях с помощью количественной полимеразной цепной реакции.
4. Провести секвенирование регуляторной и кодирующей областей гена PPARG и выявить мутации в их пределах.
5. Проанализировать распространение мутаций в генах PPARG и FABP2 в группах кур с разным содержанием абдоминального жира.
6. Изучить влияние генотипов по генам PPARG и FABP2 на хозяйственно-полезные признаки кур мясного направления.
Научная новизна работы. Впервые создан банк мРНК и разработана тест-система, позволяющая определять уровень экспрессии генов FABP1, FABP2, FABP3, HMGA1, PPARG, MC4R, PPARGC1A, POMC, РТРШ в разных тканях бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15». Методом секвенирования выявлено три сайта мононуклеотидного полиморфизма ^ЫР) гена PPARG в пределах регуляторной последовательности. С помощью аллелеспецифической полимеразной цепной реакции выявлена связь ряда (4855561А>С,
4856011Т>С, 4857001Т^) с содержанием абдоминального жира у кур. Установлены статистически значимые различия в группах кур с высоким, средним и низким содержанием абдоминального жира с учетом их генотипов по исследуемым ДНК-маркерам.
Теоретическая и практическая значимость работы. Выявлены мононуклеотидные полиморфные сайты в пределах регуляторной
последовательности генов PPARG и FABP2. Обнаружена связь SNP's (4855561А>С, 4856011Т>С, 4857001Т>G) гена PPARG с содержанием абдоминального жира у кур. Полученные результаты могут быть использованы для разработки системы молекулярных маркеров, которые смогут выступать в качестве инструментов для селекции кур мясного направления на птицеводческих предприятиях. Выявленные закономерности и предложения представляют материал для лекций, методических пособий, информативных стендов в учебных заведениях сельскохозяйственного, биологического и ветеринарного профиля.
Методология и методы исследования. При проведении исследований методологической основой стали работы зарубежных и отечественных ученых в области изучения структуры и функции генов, а также методология геномной оценки и геномной селекции. Для поставленной цели и задач были использованы современные методы молекулярной генетики с биологическими и статистическими основами анализа.
Основные положения, выносимые на защиту:
1. Оценка экспрессии девяти генов-кандидатов для количественных признаков в различных органах и тканях кур мясного направления (бройлеров) кросса «Иза Хаббард Ф-15».
2. Последовательность кодирующей и регуляторной области гена PPARG, определенная на основе секвенирования.
3. Мононуклеотидные полиморфные сайты - SNP's в пределах экспрессирующейся и регуляторной последовательности генов PPARG и FABP2.
5. Статистически значимые ассоциации генотипов гена PPARG с содержанием абдоминального жира в разных группах кур.
Степень достоверности и апробация результатов. Результаты исследований обработаны с помощью современных информационных статистических программ Excel 2003 (Microsoft Corp., Сиэтл, США), а также программы для статистического анализа данных AtteStat12.0.5. (http://www.twirpx.com/file/166961) и Instat+v3.37 (http://www.obnovisoft1.ru/instat).
Материалы работы были представлены на международной научной конференции «Экологическое равновесие и устойчивое развитие территории» (Россия, Санкт-Петербург-Пушкин, 2010); научно-практической конференции «Генетика и селекция в животноводстве: вчера, сегодня, завтра» (Россия, Санкт-Петербург, 2010); на международной научно-практической конференции «Современные биотехнологии для науки и практики» (Россия, Санкт-Петербург, 2015) и на VI международной научной конференции «Актуальные проблемы биологии в животноводстве» (Россия, Боровск, 2015). Проект «Поиск молекулярных маркеров по признаку масса абдоминального жира у кур» (Санкт-Петербург, 2015) прошел в финал конкурса «Молодые, дерзкие, перспективные». Результаты исследований заслушаны на семинарах отдела молекулярной генетики и биотехнологии ФБГНУ ВНИИГРЖ.
Личное участие. Автор оценил и проанализировал современные научные достижения, определил цели и задачи своего исследования. С помощью современных методов собрал материал и выполнил лабораторные исследования на современном оборудовании. Обработал полученные результаты, обобщил и публично представил труды своих научных исследований в виде печатных работ в самостоятельном виде и в соавторстве.
Публикации. По теме диссертационной работы опубликовано 8 статей: 3 -опубликованы в научных журналах, рекомендованных ВАК Минобрнауки РФ: «Генетика», «Научный журнал КубГАУ», «Известия Оренбургского государственного аграрного университета»; 1- в международном журнале «Journal of Applied Genetics» (Scopus), 4 - в материалах научно-практических конференций.
Структура и объем работы. Диссертация изложена на 103 страницах машинописного текста, содержит 11 таблиц, 27 рисунков и состоит из следующих разделов: введение; основная часть, включая обзор литературы, материалы и методы исследований, результаты собственных исследований и обсуждение; заключение, включая выводы, практические предложения и перспективы дальнейшей разработки темы; список литературы, который включает 159 цитируемых источников, из них 150 - на иностранных языках; 3 приложения.
Похожие диссертационные работы по специальности «Генетика», 03.02.07 шифр ВАК
Изменения некоторых физиологических показателей и продуктивности мясных кур под влиянием липотропных факторов2001 год, кандидат биологических наук Сидоренко, Анна Ивановна
Селекция исходных линий мясных кур при создании аутосексного кросса "Смена 7"2008 год, кандидат сельскохозяйственных наук Емануйлова, Жанна Владимировна
Взаимосвязь генотипов по генам RYR1 и ESR с естественной резистентностью и продуктивностью свиней2013 год, кандидат сельскохозяйственных наук Смирнов, Николай Николаевич
Изучение полиморфизма ДНК-маркеров и их влияния на показатели мясной и откормочной продуктивности свиней различных пород и кроссов2009 год, кандидат биологических наук Левитченков, Александр Николаевич
Особенности выращивания цыплят-бройлеров кросса "Хаббард" в условиях крупногруппового клеточного способа содержания2012 год, кандидат сельскохозяйственных наук Разаев, Сергей Викторович
Заключение диссертации по теме «Генетика», Ларкина, Татьяна Александровна
3.1. ВЫВОДЫ
1. Создан банк мРНК из образцов различных органов и тканей домашней курицы с высоким и низким содержанием абдоминального жира.
2. Выполнено теоретическое моделирование условий эксперимента по анализу экспрессии генов FABP1, FABP2, FABP3, HMGA1, PPARG, MC4R, PPARGC1A, РОМС, РТРЫ1 на основе ПЦР в режиме реального времени.
3. Обнаружены достоверные различия экспрессии гена HMGA1 в печени с высоким и низким содержанием жира у бройлеров. Отношение средних значений уровней экспрессии в двух группах составляет 2,90 (Р < 0,01). Уровень экспрессии этого гена коррелирует с содержанием абдоминального жира (г=0,70, Р < 0,01) и массой абдоминального жира (г=0,70, Р < 0,01).
4. Уровень экспрессии гена PPARG в печени достоверно различается в группах с различным содержанием и массой абдоминального жира. Отношение средних значений уровней экспрессии составляет 3,34 (Р < 0,01). Уровень экспрессии этого гена коррелирует с содержанием абдоминального жира (г=0,55, Р < 0,01) и массой абдоминального жира (г=0,57, Р < 0,01).
5. Путем секвенирования в пределах последовательности гена PPARG выявлено три сайта мононуклеотидного полиморфизма (4855561А>С, 4857001Т^, 4856011Т>С) в регуляторной области.
6. По результатам исследований 150 бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15» по гену PPARG частота встречаемости аллеля А (4855561А>С), аллеля С (4856011Т>С) и аллеля Т (4857001Т^) составила 57%, 47% и 57%, соответственно.
7. Установлено статистически значимое влияние генотипов АА (4855561А>С), СС (4856011Т>С), ТТ (4857001Т^) по гену PPARG на содержание абдоминального жира в экспериментальных группах кур.
3.2. ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ
1. Результаты диссертационной работы рекомендуется использовать при создании систем молекулярных маркеров для генной селекции отечественных кроссов бройлеров, с целью уменьшения содержания абдоминального жира в тушке.
2. Материалы данной работы рекомендуется использовать в учебном процессе в высших учебных заведениях сельскохозяйственного, биологического и ветеринарного профилей.
3.3. ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
Перспектива данного научного исследования заключается в увеличении выборки бройлеров кросса «Иза Хаббард Ф-15». Будут включены и другие мясные кроссы птицы. А также продолжится поиск полиморфизмов в генах, участвующих в липидном обмене, и их аддитивный механизм работы.
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Ларкина, Татьяна Александровна, 2017 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Арсиенко, Р.Ю. Полиморфизм гена белка, связывающего жирные кислоты (H-FABP), и его влияние на хозяйственно-полезные признаки свиней / Р.Ю. Арсиенко // Автореф. дисс. на соиск. уч. ст. кандид. биол. наук. Московская обл.: Всероссийский государственный научно-исследовательский институт животноводства РАСХН. - 2003. - С. 97.
2. Архипов, А.В. Источник незаменимых жирных кислот в организме / А.В. Архипов // Птицеводство. - 2012. - № 11. - С. 38-39.
3. Бойко, А.В. Ген FABP2 - белок, связывающий жирные кислоты в кишечнике [Электронный ресурс] / А.В. Бойко // Моя генетика. - 2014. - N 1. -Режим доступа: http: //mygenetics.ru.
4. Костюнина, О.В. Характеристика аллелофонда и анализ ассоциаций ДНК-маркеров с хозяйственно-полезными признаками свиней / О.В. Костюнина // Диссертация доктора биологических наук 03.02.07 - Дубровицы - 2016. - С. 372.
5. Ларкина, Т.А. Аллельные варианты и экспрессия генов-кандидатов массы абдоминального жира у кур / Т.А. Ларкина // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета (Научный журнал КубГАУ). - 2015. - № 06(110) - IDA [article ID]: 1101506086 Режим доступа: http://ej.kubagro.ru/2015/06/pdf/86.pdf, 1,125 у.п.л.
6. Мазин, А.В. Методы молекулярной генетики и генной инженерии / А.В. Мазин, К.Д. Кузнеделов, А.С. Краев // Ин-т цитологии и генетики. - 1990. - С. 13-14.
7. Тарасова, Г.А. Создание новейшего лекарства от атеросклероза и диабета омрачено патентованием человеческого гена [Электронный ресурс] / Г.А. Тарасова // Наука для жизни. - 2012. - N 4. - Режим доступа: http: //science-for-life.ru.
8. Федоров, А.Н. Таксономический анализ повторяющихся элементов ДНК / А.Н. Федоров, В.В. Гречко, С.Я. Слободянюк, Л.В. Федорова, Г.И. Тимохина // Мол. биол. - 1992. - Т. 26. Вып. 2. - С. 464-469.
9. Чемерис, А.В. Секвенирование ДНК / А.В. Чемерис, Э.Д. Ахунов, В.А. Вахитов // М. Наука. - 1999. - С. 429.
10. Ashar, H.R. Genomic characterization of human HMGIC, a member of the accessory transcription factor family found at translocation breakpoints in lipomas / H.R. Ashar, L. Cherath, K.M. Przybysz, K. Chada // Genomics. - 1996. - V. 31. - P. 207 - 214.
11. Anand, A. In vivo modulation of HMGI Creduces obesity / A. Anand, K. Chada // Nat. Genet. - 2000 - V. 24. - P. 377 - 380.
12. Ansorge, W. Automated DNA sequencing: Ultrasensitive detection of fluorescent bands during electrophoresis / W. Ansorge, B. Sproat, J. Stegemann, C. Schwager, M. Zenke // I Nucl. Acids Res. - 1987. - V. 15. - P. 4593 - 4602.
13. Amills, M. Identification of three single nucleotide polymorphisms in the chicken insulin-like growth factor 1 and 2 genes and their associations with growth and feeding traits / M. Amills, N. Jimenez, D. Villalba, M. Tor, E. Molina, D. Cubilo, C. Marcos, A. Francesch, A. Sanchez, J. Estany // Poult. Sci. - 2003. - V. 82. - P.1485-1493.
14. Atshaves, B. Liver Fatty Acid Binding Protein and Obesity. / B. Atshaves, G. Martin, H. Hostetler, A. Mcintosh, A. Kier, F. Schroeder // J Nutr Biochem. - 2010. -V. 21. - P. 1015-1032.
15. Beale, S. Capillary electrophoresis / S. Beale // I I Anal. Chem. -1998. -V. 70. -P. 279-300.
16. Beccavin, C. Insulin-like growth factors and body growth in chicken divergently selected for high and low growth rate / C. Beccavin, B. Chevalier, L.A. Cogburn, J. Simon, M.J. Duclos. // J. Endocrinol. - 2001. - V.168. - P.297-306.
17. Best, N. Separation of fragments up to 570 bases in length by use of 6% T non-cross-linked polyacrylamide for DNA sequencing in capillary electrophoresis / N. Best, E. Arriaga , D. Chen, N. Dovichi // Anal. Chem. - 1994. - V. 66. - P. 4063-4067.
18. Bionaz, M. ACSL1, AGPAT6, FABP3, LPIN1, and SLC27A6 are the most abundant isoforms in bovine mammary tissue and their expression is affected by stage of lactation. / M. Bionaz, J.J. Loor // J Nutr. - 2008. - V. 138. - P. 1019-1024.
19. Bock, J. Fluorescence-based cycle sequencing with primers selected from a nonamer library / J. Bock, J. Slightom // Biotechniques. - 1995. - V. 19. - P. 60-64.
20. Botstein, D. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms / D. Botstein, R.L. White, M. Scolnick, R.W. Davis // Am. J. Hum. Genet. - 1980. - V. 32. - P. 314-331.
21. Brunetti, A. Human diabetes associated with defects in nuclear regulatory proteins for the insulin receptor gene / A. Brunetti, L. Brunetti, D. Foti, D. Accili, I.D. Goldfine // J. Clin. Invest. - 1996. - V. 97. - P. 258-262.
22. Brunetti, A. Transcriptional regulation of human insulin receptor gene by the high-mobility group protein HMGI(Y) / A. Brunetti, G. Manfioletti, E. Chiefari, I.D. Goldfine, D. Foti // FASEB J. - 2001. - V. 15. - P. 492-500.
23. Bruun, C. Evaluation of the porcine melanocortin 4 receptor (MC4R) gene as a positional candidate for a fatness QTL in a cross between Landrace and Hampshire / C. Bruun, C. Jorgensen, V. Nielsen // Animal Genetics.- 2006. -V. 37.- P. 359-362.
24. Cahaner, A. Weight and fat content of adipose and nonadipose tissues in broilers selected for or against abdominal adiposetissue / A. Cahaner, Z. Nitsan, I. Nir // Poult. Sci. - 1986. -V. 65. - P. 215-222.
25. Calton, M. Association of functionally significant Melanocortin-4 but not Melanocortin-3 receptor mutations with severe adult obesity in a large North American case-control study / M. Calton, B. Ersoy, S. Zhang, J. Kane, M. Malloy, C. Pullinger, Y. Bromberg, L. Pennacchio, R. Dent, R. McPherson, N. Ahituv, C. Vaisse // Hum Mol Genet. - 2009. - V. 18. - P. 1140-1147.
26. Chambers, J. Quantitative genetics and selection. Genetics of growt and meat production in chickensn / J. Chambers // Poultry Breeding and Genetics, R.D. Crawford, ed., Amsterdam, The Netherlands. - 1990. - P. 599-643.
27. Chen, H.H. Severe obesity is associated with novel single nucleotide polymorphism of the ESR1 and PPARGamma locus in han Chinese / H.H. Chen, W.J. Lee, C.S. Fann, C. Bouchard, W.H. Pan // Am J Clin Nutr. - 2009. - V. 90. - P. 255262.
28. Chiappini, F. Ventromedial hypothalamus-specific Ptpnl deletion exacerbates diet-induced obesity in female mice / F. Chiappini, K. Catalano, J. Lee, D. Peroni, J. Lynch, A. Dhaneshwar, K. Wellenstein, A. Sontheimer, B. Neel, B. Kahn // J Clin Invest. -2014. - V. 124(9). - P. 3781-3792.
29. Costet, P. Peroxisome proliferator-activated receptor a-isoform deficiency leads to progressive dyslipidemia with sexually dimorphic obesity and steatosis / P. Costet, C. Legendres, J. More, A. Edgar, P. Galtier, T. Pineau // J. Biol. Chem. - 1998. - V. 273. -P. 29577-29585.
30. Dodd, G. Leptin and insulin act on POMC neurons to promote the browning of white fat / G. Dodd, S. Decherf, K. Loh, S. Simonds, F. Wiede, E. Balland, T. Merry, H. Munzberg, Z. Zhang, B. Kahn, B. Neel, K. Bence, Z. Andrews, M. Cowley, T. Tiganis // Cell.- 2015. - V. 160(1-2). - P. 88-104.
31. Douaire, M. Identifying genes involved in the variability of genetic fatness in the growing chicken / M. Douaire, N. Le Fur, C. Khadir-Mounier, P. Langlois, F. Flamant, J. Mallard // Poult. Sci. - 1992. - V.11. - P. 1911-1920.
32. Drossman, H. High-speed separations of DNA sequencing reactions by capillary electrophoresis / H. Drossman, J. Luckey, A. Kostichka, J. D'Cunha, L. Smith // Anal. Chem. - 1990. - V. 62. - P. 900-903.
33. Dubern, B. Mutational analysis of the pro-opiomelanocortin gene in French obese children led to the identification of a novel deleterious heterozygous mutation located in the alpha-melanocyte stimulating hormone domain / B. Dubern, C. Lubrano-Berthelier, M. Mencarelli // Pediatric Research. - 2008. - V. 63. - P. 211-216.
34. Esposito, F. Interaction between HMGA1 and retinoblastoma protein is required for adipocyte differentiation / F. Esposito, G.M. Pierantoni, S. Battista, R.M. Melillo,
35. Falvo, J.V. Reversal of intrinsic DNA bends in the IFN beta gene enhancer by transcription factors and the architectural protein HMG I(Y) / J.V. Falvo, D. Thanos, T. Maniatis // Cell. - 1995. - V. 83. - P. 1101-1111.
36. Fangge, Li. Epistatic Effects on Abdominal Fat Content in Chickens: Results from a Genome-Wide SNP-SNP Interaction Analysis / L. Fangge, H. Guo, H. Zhang., S. Wang., Z. Wang., H. Li // PLoS One. - 2013. - V. 8 - P.12.
37. Foti, D. A nucleoprotein complex containing Sp1, C/EBP beta, and HMGI-Y controls human insulin receptor gene transcription / D. Foti, R. Iuliano, E. Chiefari, A. Brunetti // Mol Cell Biol. - 2003. - V. 23. - P. 2720-2732.
38. Foti, D. Lack of the architectural factor HMGA1 causes insulin resistance and diabetes in humans and mice / D. Foti, E. Chiefari, M. Fedele, R. Iuliano, L. Brunetti, F. Paonessa, G. Manfioletti, F. Barbetti, A. Brunetti, C.M. Croce // Nat Med. - 2005. -V. 11. - P. 765-773.
39. Fu, R.Q. Expression profiles of key transcription factors involved in lipid metabolism in Beijing-You chickens / R.Q. Fu, R.R. Liu, G.P. Zhao, M.Q. Zheng, J.L. Chen, J. Wen // Gene. - 2014. - V. 537. - P. 120-125.
40. Gao, Y. CpG site DNA methylation of the CCAAT/enhancer-binding protein, alpha promoter in chicken lines divergently selected for fatness / Y. Gao, Y. Sun, K. Duan, H. Shi, S. Wang, H. Li, N. Wang // Anim Genet. - 2015. - V. 46 (4). - P. 410417.
41. Gardan, D. Adipocyte- and heart-type fatty acid binding proteins are both expressed in subcutaneous and intramuscular porcine (Sus scrofa) adipocytes / D. Gardan , I. Louveau , F. Gondret // Comparative Biochemistry and Physiology. Part B. Biochemistry and Molecular Biology. - 2007. - V.148. - P. 14-19.
42. Gerbens, F. Characterization, chromosomal localization, and genetic variation of theporcine heart fatty acid-binding protein gen / F. Gerbens, G. Rettenberger, J. Lenstra, J. Veerkamp, M. Te Pas // Mamm. Genome. - 1997. - V.8. - P. 328-332.
43. Gerbens, F. Effect of genetic variants of the heart fatty acid-binding protein gene on intramuscular fat and performance traits in pigs / F. Gerbens, A.J. van Erp, F.L. Harders, F.J. Verbürg, T.H. Meuwissen, J.H. Veerkamp, M.F. te Pas // J Anim Sci. -1999. - V.77. - P. 846-852.
44. Goodwin, G. A new group of chromatin-associated proteins with a high content of acidic and basic amino acids / G. Goodwin, C. Sanders, E. Johns // Eur. J. Biochem. - 1973. - V. 38. - P. 14-19.
45. Grechko, V.V. Restriction endonuclease analysis of highly repetitive DNA as a phylogenetic tool / V.V. Grechko, L.V. Fedorova, S.Y. Slobodyanyuk, D.M. Ryabinin, M.N. Melnikova, A A. Bannikova, A.A. Lomov, V.A. Sheremet'eva, V.A. Gorshkov, G.A. Sevostyanova, S.K. Semenova, A.P. Ryskov, B.M. Mednikov, I.S. Darevsky // J. Mol. Evol. - 1997. - V. 45. № 3. - P. 332-336.
46. Griffin, H. Understanding genetic variation in fatness in chickens / H. Griffin // Annual Report 95/96Roslin Institute, Edinburgh, UK. - 1996. - P. 35-38.
47. Grosschedl, R. HMG domain proteins: architectural elements in the assembly of nucleoprotein structures / R. Grosschedl, K. Giese, J. Pagel // Trends Genet. -1994. - V. 10. - P. 94-100.
48. Hagemann, T. ABI analysis: Manipulation of sequence data from the ABI sequencer / T. Hagemann, S. Kwan // Meth. Mol. Biol. - 1997. - V. 70. - P. 39-54.
49. Heiner, C Sequencing miltimegabase- template DNA with BigDye terminator chemistry / C. Heiner, K. Hunkapilleer, S. Chen, J. Glass, E. Chen // Genome Res. -1998. - V. 8. - P. 557-561.
50. Hermier, D. Lipoprotein metabolism and fattening in poultry / D. Hermier // J.Nutr.-1997. - V.127. - P. 805-808.
51. Hindle, A.K. Dysregulation of gene expression within the peroxisome proliferator activated receptor pathway in morbidly obese patients / A.K. Hindle, J. Koury, T. Mc. Caffrey, S.W. Fu, F. Brody // Surgical Endoscopy. - 2009. - V. 23. - P. 1292-1297.
52. Huang, W. A method to determine the filter matrix in four-dye fluorescence-based DNA sequencing / W. Huang, Z. Yin, D. Fuhrmann, D. States, J. Thomas // I I Electrophoresis. - 1997. - V. 18. - P. 23-25.
53. Huang, W. Filter matrix estimation in automated DNA sequencing / W. Huang, D. Fuhrmann, D. Politte, J. Thomas, D. States // IEEE Trans. Biomed. Eng. - 1998. - V. 45. - P. 422-428.
54. Hu, G. Epistatic effect between ACACA and FABP2 gene on abdominal fat traits in broilers / G. Hu, S. Wang, J. Tian, L. Chu, H. Li // Genet Genomics. - 2010. -V. 37. - P. 505-512.
55. Huth, J.R. The solution structure of an HMG-I(Y)-DNA complex defines a new architectural minor groove binding motif / J.R. Huth, C.A. Bewley, M.S. Nissen, J.N. Evans, R. Reeves, A.M. Gronenborn, G.M. Clore // Nature Struct. Biol. - 1997. -V. 4. -P. 657-665.
56. Nagpal, S. Retinoid-dependent recruitment of a histone H1 displacement activity by retinoic acid receptor / S. Nagpal, C. Ghosn, D. DiSepio, Y. Molina, M. Sutter, E. Klein, R. Chandraratna // J. Biol. Chem. - 1999. - V. 274. - P. 22563-22568.
57. Nir, I. Strategies of selection for leanness in meat production / I. Nir, Z. Nitsan, S. Keren-Zvi // Leanness in Domestic Birds: genetic, metabolic and hormonal aspects, B. Leclercq, and C.C. Whitehead, eds., Essex, UK. - 1988. - P. 3-23.
58. Jennen, D. A comparative map of chicken chromosome 24 and human chromosome 11 / D. Jennen, R. Crooijmans, B. Kamps, R. Afar, A. Veenendaal, J. Poel, M. Groenen // Anim. Genet. - 2002. - V.33. - P. 205-210.
59. Jennen, D. Comparative map between chicken chromosome 15 and human chromosomal region 12q24 and 22q11-q12 / D. Jennen, R. Crooijmans, B. Kamps, R. Afar, J. Poel, M. Groenen // Mamm. Genome. - 2003. - V.14. - P. 629-639.
60. Jennen, D. Detectionand localization of quantitative trait loci affecting fatness in broilers / D. Jennen, A.Vereijken, H. Bovenhuis, R. Crooijmans, A. Veenendaal, J. Van der Poel, M. Groenen // Poultry Science. - 2004. - V.83. - P. 295-301.
61. Johnson, K.R. Alternative processing of mRNAs encoding mammalian chromosomal high-mobility-group proteins HMG-I and HMG-Y / K.R. Johnson, D.A. Lehn, R. Reeves // Mol. Cell. Biol. - 1989. - V.9 - P. 2114-2123.
62. Johnson, K. Expression of mRNAs encoding mammalian chromosomal proteins HMG-I and HMG-Y during cellular proliferation / K.R. Johnson, J.E. Disney, C.R. Wyatt, R. Reeves // Cell Res. - 1990. - V.187. - P. 69-76.
63. Jose, C. Association Testing of the Protein Tyrosine Phosphatase 1B Gene (PTPN1) With Type 2 Diabetes in 7,883 People / C. Jose, M. Christina, P. Noël // Diabetes. - 2005. - V. 54(6). - P. 1884 -1891.
64. Kaiser, R. Specific - primer-directed DNA sequencing using automated fluorescence detection / R. Kaiser, S. MacKellar, R. Vinayak, J. Sanders, R. Saavedra, L. Hood // Nucl. Acids Res. - 1989. -V. 17. - P. 6087 - 6102.
65. Kamakaka, R.T. Chromatin structure of transcriptionally competent and repressed genes / R.T. Kamakaka, J.O. Thomas // EMBO J. - 1990. - V. 9. - P. 39974006.
66. Karger, A. Multiwavelength fluorescence detection for DNA sequencing using capillary electrophoresis / A. Karger, J. Harris, R. Gesteland // Ibid. - 1991. - V. 19. -P. 4955-4962.
67. Kim Y. Separation of DNA sequencing fragments up to 1000 bases using po- ly (ethyleneoxide)-filled capillary electrophoresis / Y. Kim, E. Yeung // J. Chromatogr. A. - 1997. - V. 781. - P. 315-325.
68. Kim, K.S. Association of melanocortin 4 receptor (MC4R) and high mobility group AT-Hook 1 (HMGA1) polymorphisms with pig growth and fat deposition traits / K.S. Kim, J.J. Lee, H.Y. Shin, B.H. Choi, C.K. Lee, J.J. Kim, B.W. Cho, T.H. Kim // Anim Genet. - 2006. - V. 37. - P. 419-421.
69. Kipfer-Coudreau, S. Single nucleotide polymorphisms of protein tyrosine phosphatase 1B gene are associated with obesity in morbidly obese French subjects / S. Kipfer-Coudreau, D. Eberle, M. Sahbatou // Diabetologia. - 2004. - V. 47. - P. 12781284.
70. Krakowski, K. Rapid purification of fluorescent dye- labeled products in a 96-well format for high-throughput automated DNA sequencing / K. Krakowski, J. Bunville, J. Seto, D. Baskin, D. Seto // Nucl. Acids Res. - 1995. - V. 23. - P. 49304931.
71. Lagarrigue, S. Hepatic lipogenesisgene expression in two experimental egg-laying lines divergently selectedon residual food consumption / S. Lagarrigue, S. Daval, A. Bordas, M. Douaire // Genet. Sel. Evol. - 2000. -V. 32. - P. 205-216.
72. Lara-Castro, C. Association of the intestinal fatty acid-binding protein Ala54Thr polymorphism and abdominal adipose tissue in African-american and Caucasian women / C. Lara-Castro, G.R. Hunter, J.C. Lovejoy, B.A. Gower, J.R. Fernández // J Clin Endocrinol Metab. - 2005. -V. 90 - P. 1196-1201.
73. Laurent, V. Heart-type Fatty Acid-binding Protein Is Essential for Efficient Brown Adipose Tissue Fatty Acid Oxidation and Cold Tolerance. / V. Laurent, R. Chin,
S. Young, K. Reue // J Biol Chem. - 2011. - V.7. - P. 380-390.
74. Laybourn, P.J. Role of nucleosomal cores and histone H1 in regulation of transcription by RNA polymerase II / P.J. Laybourn, J.T. Kadonaga // Science. - 1991.
- V.254. - P. 238-245.
75. Le Bihan-Duval, E. Genetic analysis of a selection experiment on increased body weight and breast muscle weight as well as on limited abdominal fat weight / E. Le Bihan-Duval, S. Mignon-Grasteau, N. Millet, C. Beaumont // Br.Poult. Sci. - 1998.
- V.39. - P. 346-353.
76. Le Bihan-Duval, E. Broiler meat quality: effect of selection for increased carcass quality and estimates of genetic parameters / E. Le Bihan-Duval, N. Millet, H. Remignon // Poult.Sci. - 1999. - V.78 - P. 822-826.
77. Le Bihan-Duval, E. Estimation of the genetic parameters of meat characteristics and of their genetic correlations with growth and body composition in an experimental broiler line / E. Le Bihan-Duval, C. Berri, E. Baeza, N. Millet, C. Beaumont // Poult.Sci. - 2001. - V.80 - P. 839-843.
78. Lee, L. DNA sequencing with dye-labeled terminators and T7 DNA polymerase: Effect of dyes and dNTPs on incorporation of dye-terminators and probability analysis of termination fragments / L. Lee, C. Cornell, S. Woo, R. Cheng, B. Mc Ardle, C. Fuller, N. Halloran, R. Wilson // Nucl. Acids Res. - 1992. - V. 20. - P. 2471-2483.
79. Leenstra, F. Effect of age, sex, genotype and environment on fat deposition in broiler chickens - a review / F. Leenstra // World's Poultry Science Journal. - 1986. -V.42. - P. 12-25.
80. Li, B. Heart fatty acid binding protein is upregulated during porcine adipocyte development / B. Li , H. Zerby, K. Lee // Journal of Animal Science. - 2007. - V.85. -P. 1651-1659.
81. Li, C.L. Distributions of polymorphism of ADD1, MC4R, H-FABP gene, associated with IMF and BF in 3 populations in pig / C.L. Li, Y.C. Pan, H. Meng, Z.L. Wang, X.G. Huang // Yi Chuan. - 2006. - V. 28. - P. 159-164.
82. Li, F. Epistatic effects on abdominal fat content in chickens: results from a genome-wide SNP-SNP interaction analysis / F. Li, G. Hu, H. Zhang, S. Wang, Z. Wang, H. Li // PLoS One. - 2013. -V.5 - P. 8-12.
83. Li, L. Retroviral cDNA integration: stimulation by HMG I family proteins / L. Li, K. Yoder, M.S. Hansen, J. Olvera, M.D. Miller, F.D. Bushman // J. Virol. - 2000. -V. 74. - P. 10965-10974.
84. Li, WJ. Gene expression of heart - and adipocyte - fatty acid-binding protein and correlation with intramuscular fat in Chinese chichens / W.J. Li, H.B. Li, J.L. Chen, G.P. Zhao, M.Q. Zheng, J. Wen // Anim Biotechnol. - 2008. - V. 19 - P. 189193.
85. Lim, D. Gene Expression Patterns Associated with Peroxisome Proliferator-activated Receptor (PPAR) Signaling in the Longissimus dorsi of Hanwoo (Korean Cattle) / D. Lim, H.H. Chai, S.H. Lee, Y.M. Cho, J.W. Choi, N.K. Kim // Asian-Australas J Anim Sci. - 2015. - V. 28(8). - P. 1075-1083.
86. Lopez, I. DNA microarray analysis of genes differentially expressed in diet-induced (cafeteria) obese rats / I. Lopez, A. Marti, F. Milagro // Obesity Research.-2003. - V.11. - P. 188-194.
87. Luckey, J. High speed DNA sequencing by capillary electrophoresis / J. Luckey, H. Drossman, A. Kostichka, D. Mead, J. D'Cunha, T. Norris, L. Smith // Nucl Acids Res. - 1990. - V. 18. - P. 4417- 4421.
88. de Luis, D.A. Influence of Ala54Thr polymorphism of fatty acid-binding protein 2 on obesity and cardiovascular risk factors / D.A. de Luis, M.G. Sagrado, R. Aller, O. Izaola, R. Conde // Horm Metab Res. - 2007. - V. 39. - P. 830- 834.
89. Madabhushi, R. Separation of 4-color DNA sequencing extension products in noncovalent- ly coated capillaries using low viscosity polymer solutions / R. Madabhushi // Electrophoresis. - 1998. - V. 19. - P. 224-230.
90. Maher, J.F. Multivalent DNA-binding properties of the HMG-1 proteins / J.F. Maher, D. Nathans // Proc. Natl Acad. Sci. USA. - 1996. - V. 93. - P.6716-6720.
91. Meidtner, K. Association of the melanocortin 4 receptor with feed intake and daily gain in F2 Mangalitsa x Pietrain pigs / K. Meidtner, A.K. Wermter, A. Hinney // Animal Genetics. - 2006. - V.37. - P. 245-247.
92. Meng, H. Studies of single nucleotide polymorphism of PPAR gene and its association with fattiness trait in chicken / H. Meng, G.H. Wang, Q.G. Wang, J.G. Zhao, Z.L. Gu, Y.X. Wang, H. Li // Yi Chuan Xue Bao. - 2002. - V.29. - P. 119-123.
93. Moreira, G.C. Variant discovery in a QTL region on chromosome 3 associated with fatness in chickens / G.C. Moreira, T.F. Godoy, C. Boschiero, A. Gheyas, G. Gasparin, S.C. Andrade, M. Paduan, H. Montenegro, D.W. Burt, M.C. Ledur, L.L. Coutinho // Anim Genet. - 2015. - V. 46 (2). - P. 141-147.
94. Moore, G. Grasses, line up and form a circle / G. Moore, K.M. Devos, Z. Wang, M.D. Gale // Curr. Biol. - 1995. - V. 5. - P. 737-739.
95. Moose, S.P. Molecular plant breeding as the foundation for 21st century crop improvement / S.P. Moose, R.H. Mumm // Plant Physiol. - 2008. - V. 147. - P. 969-977.
96. Mullis, K. The unusual origin of the polymerase chain reaction / K. Mullis // Sci Am. - 1990. - V.262. - P. 56-61.
97. Mullis, K. Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction / K. Mullis, F. Faloona // Methods Enzymol. - 1987. - V.155. - P. 335-350.
98. Munshi, N. Acetylation of HMG I(Y) by CBP turns off IFN beta expression by disrupting the enhanceosome / N. Munshi, M. Merika, J. Yie, K. Senger, G. Chen, D. Thanos // Mol. Cell. - 1987. - V.2 - P. 457-467.
99. Newberry, E. Protection against Western diet-induced obesity and hepatic steatosis in liver fatty acid-binding protein knockout mice / E. Newberry, Y. Xie, S. Kennedy // Hepatology. - 2006. - V. 44. - P. 1191-1205.
100. Okauchi, Y. PGC-1alpha Gly482Ser polymorphism is associated with the plasma adiponectin level in type 2 diabetic men / Y. Okauchi, H. Iwahashi, K. Okita // Endocrine Journal. - 2008. - V. 55. - P. 991-997.
101. Parker, L. Peak height variations in automated sequencing of PCR products using Taq dye-terminator chemistry / L. Parker, Q. Deng, H. Zakeri, C. Carlson, D. Nickerson, P. Kwok // Biotechniques. - 1995. - V. 19. - P. 116-121.
102. Parker, L. Ampli Taq DNA polymerase, FS dye-terminator sequencing: analysis of peak height patterns / L. Parker, H. Zakeri, Q. Deng, S. Spurgeon, P. Kwok, D. Nickerson // Ibid. - 1996. - V. 21. - P. 694-699.
103. Pérusse, L. A genome-wide scan for abdominal fat assessed by computed tomography in the Québec family study / L. Pérusse, T. Rice, Y.C. Chagnon, J.P. Després, S. Lemieux, S. Roy, M. Lacaille, M.A. Ho-Kim, M. Chagnon, M.A. Province, D.C. Rao, C. Bouchard // Diabetes. - 2001. - V.50. - P. 614-621.
104. Pierantoni, G. A truncated HMGA1 gene induces proliferation of the 3T3-L1 pre-adipocytic cells: a model of human lipomas / G.M. Pierantoni, S. Battista, F. Pentimalli, M. Fedele, R. Visone, A. Federico, M. Santoro, G. Viglietto, A. Fusco // Carcinogenesis. - 2003. - V. 24. - P. 1861-1869.
105. Powledge, T. The polymerase chain reaction / T. Powledge // Adv Physiol Educ. - 2004. - V. 28. - P. 44-50.
106. Prober, J. A system for rapid DNA sequencing with fluorescent chain terminating dideoxynucleotides / J. Prober, G. Trainor, R. Dam, F. Hobbs, C. Robertson, R. Zagursky, A. Cocuzza, M. Jensen, K. Baumeister // Science. - 1987. - V. 238. - P. 336-341.
107. Prober, J. Method systems and reagents for DNA sequencing / J. Prober, R. Dam, C. Robertson, F. Hobbs, G. Trainor // Pat 5306618 (US). - 1994.
108. Qin, Y. Cloning of the Huhuai goat PPARG gene and the preparation of transgenic sheep / Y. Qin, H. Chen, Y. Zhang, C. Zhu, B. Gao, Y. Yin, W. Li, Q. Shi, M. Zheng, Q. Xu, J. Song, B. Li // Biochem Genet. - 2013. - V. 51(7-8). - P. 543-553.
109. Qiu, X. The single nucleotide polymorphisms of chicken melanocortin-4 receptor (MC4R) gene and their association analysis with carcass traits / X. Qiu, N. Li, X. Deng, X. Zhao, Q. Meng, X. Wang // China Life Sci. - 2006. - V. 49(6). - P. 560-566.
110. Queiroz, E.M. IGF2, LEPR, POMC, PPARG, and PPARGC1 gene variants are associated with obesity-related risk phenotypes in Brazilian children and adolescents / E.M. Queiroz , A.P. Candido, I.M. Castro, A.Q. Bastos, G.L. Machado-Coelho, R.N. Freitas // Braz J Med Biol Res. - 2015. - http://dx.doi.org/10.1590/1414-431X20154155 [Epub ahead of print].
111. Quesada, M. Replaceable polymers in DNA sequencing by capillary electrophoresis. / M. Quesada // Curr. Opin. Biotechnol. - 1997. - V. 8. - P. 82-93.
112. Ramiah, SK. Dietary conjugated linoleic acid supplementation leads to downregulation of PPARG transcription in broiler chickens and reduction of adipocyte cellularity / S.K. Ramiah, G.Y. Meng, W.T. Sheau, Y. Swee Keong, M. Ebrahimi // PPAR Res. - 2014. - doi: 10.1155/2014/137652.
113. Reeves, R. Molecular biology of HMGA proteins: hubs of nuclear function. / R. Reeves // Gene. - 2001. - V. 277. - P. 63-81.
114. Reeves, R. HMGI/Y proteins: flexible regulators of transcription and chromatin structure. / R. Reeves, L. Beckerbauer // Biochim. Biophys Acta. - 2001. - V. 1519. -P. 13-29.
115. Rebhan, M. Gene Cards: encyclopedia for genes, proteins and diseases / M. Rebhan, M. Chalifa-Caspi, J. Prilusky, D. Lancet // Weizmann Institute of Science, Bioinformatics Unit and Genome Center, Rehovot, Israel. http://bioinformatics.ru -1997.
116. Roberts, R.J. REBASE - enzymes and genes for DNA restriction and modification. / R.J. Roberts, T. Vincze, J. Posfai, D. Macelis // Nucleic Acids. - 2007. -Res 35 (Database issue): D269-70. D0I:10.1093/nar/gkl891. PMID 17202163.
117. Rosenblum, B. New dye-labeled terminators for improved DNA sequencing patterns / B. Rosenblum, L. Lee, S. Spurgeon, S. Khan, S. Menchen, C. Heiner, S. Chen // Nucl. Acids Res. - 1997. - V. 25. - P. 4500-4504.
118. Rosenthal, A. New protocols for DNA sequencing with dye terminators / A. Rosenthal, D. Charnock-Jones // DNA Sequenc. - 1992. - V. 3. - P. 61-64.
119. Ruiz-Martinez, M. DNA sequencing by capillary electrophoresis with replaceable linear polyacrylamide and laser-induced fluorescence detection / M. Ruiz-Martinez, J. Berka, A. Belenkii, F. Foret, A. Miller, B. Karger // Anal. Chem. - 1993. -V. 65. - P. 2851-2858.
120. Saiki, R. Enzymatic amplification of b-globin genomic sequences and restriction site analysis for diagnosis of side cell anemia / R. Saiki, S. Scharf, F. Faloona, K. Mullis, G. Horn, H. Erlich, N. Arnheim // Science. - 1985. - V. 230 - P. 1350-1354.
121. Sato, K. Expression of the chicken peroxisome proliferator-activated receptor-gamma gene is influenced by aging, nutrition, and agonist administration / K. Sato, K. Fukao, Y. Seki, Y. Akiba // Poult Sci. - 2004. - V. 83. - P. 1342-1347.
122. Schmid, M. First report on chicken genes and chromosomes / M. Schmid, I. Nanda, M. Guttenbach, C. Steinlein, H. Hoehn, M. Schartl, T. Haaf, S. Weigend, R. Fries, J-M. Buerstedde, K. Wimmers, D.W. Burt, J. Smith, S. A'Hara, A. Law, D.K. Griffin, N. Bumstead, J. Kaufman, P.A. Thomson, T. Burke, M.A.M. Groenen, R.P.M.A. Crooijmans, A. Vignal, V. Fillon, M. Morisson, F. Pitel, M. Tixier-Boichard, K. Ladjali-Mohammedi, J. Hillel, A. Mäki-Tanila, H.H. Cheng, M.E. Delany, J. Burnside, S. Mizuno // Cytogenet. Cell Genet. - 2000. - V. 90 - P. 169-218.
123. Smith, L. The synthesis of oligonucleotides containing an aliphatic group at the 5' terminus: Synthesis of fluorescent DNA primers for use in DNA sequence analysis / L. Smith, S. Fung, M. Hunkapiller, T. Humkapiller, L. Hood // Nucl. Acids Res. - 1985. - V. 13. - P. 2399-2412.
124. Smith, L. Fluorescence detection in automated DNA sequence analysis / L. Smith, J. Sanders, R. Kaiser, P. Hughes, C. Dodd, C. Connel, C. Heiner, S. Kent, L. Hood // Nature. -1986. - V. 321. - P. 674-679.
125. Stachowiak, M. SNPs in the porcine PPARGC1a gene: interbreed differences and their phenotypic effects / M. Stachowiak, M. Szydlowski, J. Cieslak // Cellular and Molecular Biology Letters. - 2007. -V. 12. - P. 231-239.
126. Sun, G. Association and linkage between an insulin-like growth factor-1 gene polymorphism and fat free mass in HERTAGE family study / G. Sun, J. Gagnon, Y. Chagnon, L. Perusse, J. Despres, A. Leon, J. Wilmore, J. Skinner, I. Borecki, D. Rao, C. Bouchard // Int. J. Obes. Relat. Metab. Disord. - 1999. - V. 23. - P. 929-935.
127. Switonski, M. Family of melanocortin receptor (MCR) genes in mammals— mutations, polymorphisms and phenotypic effects / M. Switonski, M. Mankowska, S. Salamon // J Appl Genet. - 2013. - V. 54(4). - P. 461-472.
128. Swerdlow, H. Capillary gel electrophoresis for rapid, high resolution DNA sequencing / H. Swerdlow, R. Gesteland // Nucl. Acids Res. - 1990. - V. 18. - P.
1415-1419.
129. Swerdlow, H. Three DNA sequencing methods using capillary gel electrophoresis and laser-induced fluorescence / H. Swerdlow, J. Zhang, D. Chen, H. Harke, R. Grey, S. Wu, N. Dovichi // Anal. Chem. - 1991. - V. 63. - P. 235-284.
130. Swerdlow, H. Stability of capillary gels for automated sequencing of DNA / H. Swerdlow, K. Dew-Jageer, K. Brady, R. Grey, N. Dovichi, R. Gesteland // Electrophoresis. - 1992. - V. 13. - P. 475483.
131. Tai, E. Association between the PPARA L126V polymorphism and plasma lipid levels: the Framingham Offspring Study. Arterioscler. Thromb / E. Tai, S. Demissie, L.
Cupples, D. Corella, P.W. Wilson, E.J. Schaefer, J.M. Ordovas // Vasc. Biol. - 2002 -V. 22. - P. 805-810.
132. Takada, I. Structural features and transcriptional activity of chicken PPARs (a, ß, y) / I. Takada, M. Kobayashi // Published online 2013. - doi: 10.1155/2013/186312.
133. Tallini, G. HMGI(Y) and HMGI-C dysregulation: a common occurrence in human tumors / G. Tallini, P. Dal Cin // Adv. Anat. Pathol. - 1999 - V.6. - P. 237-246.
134. Tan, K. Functional characterization and structural modeling of obesity associated mutations in the melanocortin 4 receptor / K. Tan, I.D. Pogozheva, G.S. Yeo // Endocrinology. - 2009. -V. 150. - P.114-125.
135. Tautz, D. Hypervariability of simple sequences as a general source for polymorphic DNA markers / D. Tautz // Nucl. Acids Res. - 1989. - V. 17. - P. 64636471.
136. Tavridou, A. Thr54 allele of fatty-acid binding protein 2 gene is associated with obesity but not type 2 diabetes mellitus in a Caucasian population / A. Tavridou, K.I. Arvanitidis, A. Tiptiri-Kourpeti, I. Petridis, G. Ragia, S. Kyroglou, D. Christakidis, V.G. Manolopoulos // Diabetes Res Clin Pract. - 2009. - V. 84 - P.132-
137.
137. Thanos, D. Virus induction of human IFN beta gene expression requires the assembly of an enhanceosome. / D. Thanos, T. Maniatis // Cell. - 1995. - V. 84 -P.132-137.
138. Wang, H. Profiling of chicken adipose tissue gene expression by genome array / H. Wang, Q. Wang, X. Zhang, S. Wang, Y. Wang, X. Wang, L. Hui // BMC Genomics. - 2007. - V. 8. - P.193-207.
139. Wang, D. Identification of differentially expressed proteins in adipose tissue of divergently selected broilers / D. Wang, N. Wang, N. Li // Poultry Science. - 2009. - V. 88. - P. 2285-2292.
140. Wang, Y. Correlation of the A-FABP Gene Polymorphism and mRNA Expression with Intramuscular Fat Content in Three-Yellow Chicken and Hetian-
Black Chicken / Y. Wang, H. Chen, D. Han, Y. Chen, G. Muhatai, T. Kurban, J. Xing, J. He // Anim Biotechnol. - 2016. - V. 10. - P. 1-7.
141. Wang, Y. Peroxisome proliferator-activated receptor-gamma gene: a key regulator of adipocyte differentiation in chickens / Y. Wang, Y. Mu, N. Ding, Q. Wang, S. Wang, N. Wang // Poultry Science. - 2008. - V. 87. - P. 226-232.
142. Weintraub, H. Assembly and propagation of repressed and depressed chromosomal states / H. Weintraub // Cell. - 1985. - V. 42. - P. 705-711.
143. Weikard, R. The bovine PPARGC1A gene: molecular characterization and association of an SNP with variation of milk fat synthesis / R. Weikard, C. Kühn, T. Goldammer, G. Freyer, M. Schwerin // Physiol Genomics. - 2005. - V. 21(1). - P. 113.
144. Wendl, M. Automated sequence preprocessing in a large- scale sequencing environment / M. Wendl, S. Dear, D. Hodgson, L. Hillier // Genome Res. - 1998. - V. 8. - P. 975-984.
145. Williams, P. Influence of birth weight on gene regulators of lipid metabolism and utilization in subcutaneous adipose tissue and skeletal muscle of neonatal pigs / P. Williams, N. Marten, V. Wilson, C. Litten-Brown, A.M. Corson, L. Clarke, M.E. Symonds, A. Mostyn // Reproduction. - 2009. - V. 138. - P. 609-617.
146. Wu, C. Polyacrylamide solutions for DNA sequencing by capillary electrophoresis: mesh sizes, separation and dispersion / C. Wu, M. Quesada, D. Scchneider, R. Farinato, F. Studier, B. Chu // Electrophoresis. - 1996. - V. 17. - P. 1103-1109.
147. Wu, G. A potential molecular marker for selection against abdominal fatness in chickens / G. Wu, X. Deng, J. Li, N. Li, N. Yang // Poult Sci. - 2006. - V. 85(11). - P. 1896-1899.
148. Yamakawa-Kobayashi, K. A Val227Ala polymorphism in the peroxisome proliferator activated receptor alpha (PPARalpha) gene is associated with variations in serum lipid levels / K. Yamakawa-Kobayashi, H. Ishiguro, T. Arinami, R. Miyazaki, H. Hamaguchi // J. Med. Genet. - 2002. - V. 39. - P. 189-191.
149. Yie, J. Intra- and intermolecular cooperative binding of high-mobility-group protein I(Y) to the beta-interferon promoter / J. Yie, S. Liang, M. Merika, D. Thanos // Mol. Cell. Biol. - 1997. - V. 17. - P. 3649-3662.
150. Yie, J. The role of HMG I(Y) in the assembly and function of the IFN-beta enhanceosome / J. Yie, M. Merika, N. Munshi, G. Chen, D. Thanos // EMBO J. - 1999.
- V. 18 - P. 3074-3089.
151. Yin, Z. Automatic matrix determination in four dye fluorescence-based DNA sequencing / Z. Yin, J. Severin, M. Giddings, W. Huang, M. Westphall, L. Smith // Ibid. - 1996. - V. 17. - P.1143-1150.
152. You, X.Y. Study on SNP of the H-FABP gene and its association with slaughter performance in chicken / X.Y. You, Y.P. Liu, Q. Zhu, Z.Q. Yang // Yi Chuan. - 2007. -V. 29. - P. 230-234.
153. Yu, X. Folate supplementation modifies CCAAT/enhancer-binding protein a methylation to mediate differentiation of preadipocytes in chickens / X. Yu, R. Liu, G. Zhao, M. Zheng, J. Chen, J. Wen // Poult Sci. - 2014. - doi: 10.3382/ps.2014-04027.
154. Zagursky, R. DNA sequencing separations in capillary gels on a modified commercial DNA sequencing instrument / R. Zagursky, R. McCormick // Biotechniques. -1990. - V. 9. - P. 74-79.
155. Zakeri, H. Peak height pattern in dichloro- rhodamine and energy transfer dye terminator sequencing. / H. Zakeri, G. Amparo, S. Chen, S. Spurgeon, P. Kwok // Ibid.
- 1998. - V. 25. - P. 406-414.
156. Zhang, J. Use of non-cross-linked polyacrylamide for four-color DNA sequencing by capillary electrophoresis separation of fragments up to 640 bases in length in two hours / J. Zhang, Y. Fang, J. Hou, J. Ren, R. Jiang, P. Roos, N. Dovichi // Anal. Chem. - 1995. - V. 67. - P. 4589-4593.
157. Zhao, K. SAR-dependent mobilization of histone H1 by HMG-I/Y in vitro: HMG-I/Y is enriched in H1-depleted chromatin / K. Zhao, E. Kas, E. Gonzalez, U.K. Laemmli // EMBO J. - 1993. - V. 12. - P. 3237-3247.
158. Zhou, X. Mutation responsible for the mouse pygmy phenotype in the developmentally regulated factor HMGI-C / X. Zhou, K.F. Benson, H.R. Ashar, K. Chada // Nature. - 1995. - V. 376. - P. 771-774.
159. Zuo, B. Melanocortin-4 receptor (MC4R) polymorphisms are associated with growth and meat quality traits in sheep / B. Zuo, G. Liu, Y. Peng, H. Qian, J. Liu, X. Jiang, A. Mara // Mol Biol Rep. - 2014. - V. 41 (10). - P. 6967-6974.
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.