Аллозимные спектры глюкозо-6-фосфат изомеразы у полидорид (Polychaeta: spionidae) и возможные механизмы их формирования тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 03.00.15, кандидат биологических наук Панькова, Виктория Владимировна

• Панькова, Виктория Владимировна
• кандидат биологических наук
• 2006

Оглавление диссертации кандидат биологических наук Панькова, Виктория Владимировна

1. ВВЕДЕНИЕ.

2. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.

2.1. Общепринятая концепция изоферментов.

2.1.1. Аллельные изоферменты.

2.1.2. Изоферменты, определяемые разными генами.

2.1.3. Гибридные изоферменты.

Ь 2.1.4. Вторичные изоферменты.

2.2. Новые механизмы генерирования множественности белковых изо-форм.

2.2.1. Альтернативный сплайсинг.

2.2.2. Использование альтернативных сайтов инициации транскрипции и полиаденилирования.

2.2.3. Редактирование мРНК.

2.2.4. Альтернативная инициация трансляции.

2.3. Альтернативный сплайсинг ферментных генов.

3. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

4. РЕЗУЛЬТАТЫ.

4.1. Изоферментные спектры ГФИ полидорид.

4.1.1. Polydora brevipalpa.

4.1.2. Polydora calcarea.

4.1.3. Polydora manchenkoi.

4.1.4. Polydora limicola.

4.1.5. Polydora glycymerica.

4.1.6. Polydora cornuta.

4.1.7. Dipolydora commensalis.

4.1.8. Dipolydora bidentata.

4.1.9. Dipolydora carunculata. ъ 4.1.10 Dipolydora cardalia.

4.2. Доля идентичных аллозимных спектров ГФИ-1 и ГФИ-2.

ОБСУЖДЕНИЕ.

5.1. Трудности интерпретации изоферментных спектров ГФИ полидорид с позиций общепринятой концепции изоферментов.

5.1.1. Характер аллозимной изменчивости изоферментов ГФИи ГФИ-2.

5.1.2. Сопряженность экспрессии изофермента ГФИ-2 с полом и тканепецифичность экспрессии изоферментов ГФИ-1 и ГФИ-2.

5.1.3. Большое электрофоретическое различие изоферментов ГФИ-1 и ГФИ-2.

5.1.4. Формирование межлокусных гибридов ГФИ-1/ГФИ-2.

5.2. Альтернативный сплайсинг - механизм, способный генерировать изоферментные спектры ГФИ, наблюдаемые у полидорид.

5.2.1. Согласованность аллозимной изменчивости альтернативных изоферментов.

5.2.2. Большое электрофоретическое различие альтернативных изоферментов.

5.2.3. Тканеспецифичность экспрессии альтернативных изоферментов и возможная роль альтернативного сплайсинга в детерминации пола полидорид.

5.2.4. Гибридизация альтернативных изоферментов.

5.3. Возможное ретропозонное происхождение изофермента ГФИ-2.

ВЫВОДЫ.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Аллозимные спектры глюкозо-6-фосфат изомеразы у полидорид (Polychaeta: spionidae) и возможные механизмы их формирования»

Изоферменты - множественные молекулярные формы одного и того же фермента, экспрессируемые в одном организме и обладающие сходной функцией. Сочетая гелевый электрофорез ферментсодержащих препаратов с последующим окрашиванием электрофоретических гелей на специфическую ферментативную активность можно выявлять изоферменты в виде окрашенных зон. Благодаря тому, что изоферменты проявляются кодоминантно, т.е. один аллель не маскирует другой, и о генотипе особи мы можем судить по выявляемому изо-ферментному спектру, они являются удобными маркерами генов, и давно используются в различных областях биологии и медицины. Наиболее широкое применение они нашли в популяционной генетике для исследования генетической изменчивости природных популяций и видов.

Генетическая концепция изоферментов, используемая как основа для генетической интерпретации результатов ферментного электрофореза, была сформулирована еще в 70-е годы, и на протяжении более трех десятилетий существует в неизменной виде (Harris and Hopkinson, 1976; Корочкин и др., 1977). Эта концепция выделяет три основные причины электрофоретически выявляемой множественности ферментов. Во-первых, это генные дупликации, ведущие к возникновению независимых генных локусов, определяющих разные изоформы одного фермента, которые и рекомендовано называть изоферментами. Во-вторых, это генные мутации, приводящие к возникновению множественных вариантов одного генного локуса, определяющих аллельные варианты одного фермента, получивших название «аллозимов». В-третьих, это поспрансляционные модификации ферментных молекул, которые приводят к возникновению вторичных изоферментов, имеющих негенетическую, модификационную природу.

Ясная генетическая интерпретация изоферментных спектров является ключевым моментом в использовании изоферментов как маркеров генов, однако она всегда имела определенные проблемы. Значительная часть этих проблем относится к разряду методических и выражается в недостаточно четком разделении зон ферментной активности на специфически окрашенных электрофоретических гелях - зимограммах. Однако другая часть включает проблемы, связанные с несовершенством концепции и недостаточностью наших знаний о природе изофер-ментов и механизмах их формирования. В литературе описано много необычных изоферментных спектров, не имеющих обоснованной и убедительной генетической интерпретации. К числу таких случаев относится недавно описанный необычный электрофоретический спектр димерного фермента глюкозо-6-фосфат изомеразы (ГФИ) у полихеты Polydora brevipalpa (Manchenko, 2001а). Было выявлено два изофермента ГФИ: ГФИ-1 и ГФИ-2. Анодный изофермент ГФИ-1 вы* являлся у всех особей, а катодный ГФИ-2 - только у самцов. Необычность спектра состояла в том, что изоферменты проявляли согласованную аллозимную изменчивость (имели идентичные аллозимные спектры) и формировали гибриды. Способность образовывать гибриды in vivo присуща только изоферментам, определяемым дуплицированными генными локусами, а способность проявлять согласованную аллозимную изменчивость - только вторичным изоферментам, образующимся из первичных молекул в результате постгрансляционных модификаций (Корочкин и др., 1977; Moss, 1982; Филиппович и Коничев, 1987). Таким образом, общепринятая концепция изоферментов не могла дать удовлетворительной генетической интерпретации согласованной аллозимной изменчивости гибридизующихся изоферментов. Для объяснения необычных изоферментных спектров ГФИ Polydora brevipalpa Манченко (Manchenko, 2001а) предложил меf ханизм альтернативного сплайсинга (АС). Известно, что АС пре-мРНК транс-криптов, считываемых с одного структурного гена, может давать несколько структурно отличающихся белковых изоформ (Andreadis et al., 1987). Для обозначения изоферментов, генерируемых АС, был предложен новый термин «альтернативные изоферменты» (Manchenko, 2001а). Согласованная аллозимная изменчивость изоферментов и их способность формировать гибриды были расценены как веские аргументы в пользу участия АС в генерировании изоферментов ГФИ P. brevipalpa (Manchenko, 2001а). Однако предварительные данные свидетельствовали о том, что у близких видов полидорид P. ciliata sp.l и P. limicola * изоферменты ГФИ проявляют несогласованную аллозимную изменчивость, характерную для изоферментов, определяемых двумя разными генами (Manchenko and Radashevsky, 1993,1998).

Цель настоящей работы заключалась в выяснении молекулярных механизмов формирования изоферментных спектров ГФИ у полидорид (Polychaeta: Spi-onidae).

Для достижения поставленной цели были определены следующие задачи:

1) Исследовать изоферментные спектры ГФИ у десяти видов полидорид (Polychaeta: Spionidae).

2) Исследовать сопряженность экспрессии изофермента ГФИ-2 с полом у десяти видов полидорид.

3) Исследовать тканеспецифичность экспрессии изоферментов ГФИ-1 и ГФИ-2.

Научная новизна работы. Проведено электрофоретическое исследование изоферментных спектров глюкозо-6-фосфат изомеразы (ГФИ) у десяти видов полидорид родов Polydora и Dipolydora (Polychaeta: Spionidae), ранее не исследованных в этом отношении. Установлено, что у всех исследованных видов полидорид экспрессируется два изофермента (ГФИ-1 и ГФИ-2), один из которых (ГФИ-2) экспрессируется почти исключительно у самцов. Проведено исследование тканеспецифичности экспрессии изоферментов ГФИ. Показано, что изофер-мент ГФИ-1 экспрессируется преимущественно в соматических тканях у особей обоих полов и в незначительных количествах в диплоидных сперматогенных клетках самцов. Изофермент ГФИ-2 экспрессируется в диплоидных сперматогенных клетках самцов и в следовых количествах у самок. Установлен факт гибридизации изоферментов ГФИ-1 и ГФИ-2 у всех исследованных видов. Показано, что у каждого из исследованных видов полидорид среди особей, экспрессирую-щих оба изофермента, преобладают те, которые имеют идентичные аллозимные спектры ГФИ-1 и ГФИ-2. Впервые сделана оценка доли таких особей у 10 исследованных видов.

Впервые получены данные, свидетельствующие в пользу гипотезы о том, что альтернативный сплайсинг способен генерировать изофермента, которые на электрофоретических гелях могут быть неотличимы от классических изоферментов, определяемых разными генными локусами.

Теоретическая и практическая ценность работы. Полученные данные, говорящие о том, что изоферменты ГФИ полидорид генерируются АС, послужат важной предпосылкой для формулирования положений новой концепции изо-ферментов, учитывающей важную роль АС в их генерировании. Это составит основу для ясной генетической интерпретации электрофоретических данных и подтвердит для изоферментов статус надежных генных маркеров.

Апробация работы. Основные положения работы докладывались на IV Региональной конференции по актуальным проблемам морской биологии и экологии (Владивосток, 2001), Международной конференции: «Evolution, Genetics, Ecology and Biodiversity» (MAPEEG) (Владивосток, МБС «Восток», 2001), VII Дальневосточной молодежной школе - конференции по актуальным проблемам химии и биологии (Владивосток, МЭС ТИБОХ, 2003) и ежегодных научных конференциях Института биологии моря (Владивосток, 2004,2006).

Структура и объем работы. Работа состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов, результатов и обсуждения, выводов и списка цитируемой литературы, содержащего 209 ссылок. Диссертация изложена на 108 страницах, содержит 4 таблицы и 43 рисунка.

Заключение диссертации по теме «Генетика», Панькова, Виктория Владимировна

ВЫВОДЫ

1. У всех десяти исследованных видов полидорид (Polydora brevipalpa, P. cal-carea, P. cornuta, P. glycymerica, P. limicola, P. manchenkoi, Dipolydora biden-tata, D. cardalia, D. carunculata, D. commensalis (Polychaeta: Spionidae)) у самцов выявлено два изофермента ГФИ - ГФИ-1 и ГФИ-2, у самок-только один ГФИ-1.

2. Изофермент ГФИ-1 у всех исследованных видов экспрессируется в соматических тканях, а ГФИ-2 - в сперме.

3. У всех исследованных видов полидорид выявлены гибридные зоны между изоферментами ГФИ-1 и ГФИ-2, что свидетельствует о том, что изофермент ГФИ-2 не может иметь посттрансляционное происхождение. Об этом же свидетельствует и большое электрофоретическое различие между изоферментами ГФИ-1 и ГФИ-2.

4. Согласованная полиаллельная аллозимная изменчивость изоферментов ГФИ-1 и ГФИ-2 у большинства особей у всех исследованных видов полидорид свидетельствуют против того, что эти изоферменты определяются разными генными локусами.

5. Своеобразие спектров ГФИ полидорид - согласованная аллозимная изменчивость двух гибридизующихся изоферментов у большинства исследованных особей наряду с наличием редких особей с несогласованной аллозимной изменчивостью и разная тканеспецифичность экспрессии этих изоферментов - может быть объяснено участием альтернативного сплайсинга в экспрессии одного гена ГФИ.

Список литературы диссертационного исследования кандидат биологических наук Панькова, Виктория Владимировна, 2006 год

1. Корочкин Л.И., Серов O.JL, Пудовкин А.И., Аронштам А.А., Боркин Л.Я.,

2. Малецкий С.И., Полякова Е.В., Манченко Г.П. Генетика изоферментов. М. Наука. 1977.278 с.

3. Basnakian A.G., Singh A.B., Shah S.V. Identification and expression of deoxyribo-nuclease (DNase) I alternative transcripts in the rat // Gene. 2002. V. 289. P. 87-96.

4. Major transcript of the frameshifted coxll gene from tripanosome mitochondria contains four nucleotides that are not encoded in the DNA // Cell. 1986. V. 46. P. 819-826.

5. Caceres J.F., Kornblihtt A.R. Alternative splicing: multiple control mechanisms and involvement in human disease // Trends Genet. 2002. V. 18. P. 186 193.

6. Chaloupka J.A., Bullock S.A., Iourgenko V., Levin L.R., Buck J. Autoinhibitoryregulation of soluble adenylyl cyclase // Molecular Reproduction and Development. 2006. V. 73. P. 361 -368.

7. Chessler S.D., Lernmark A. Alternative splicing of GAD67 results in the synthesis of a third form of glutamic-acid decarboxylase in human islets and other non-neural tissues // J. Biol. Chem. 2000. V. 275. P. 5188 5192.

8. Cooper A.J.L. The role of glutamine transaminase К (GTK) in sulfur and a-keto acid metabolism in the brain, and in the possible bioactivation of neurotoxicants // Neurochemistry Internationa. 2004. V. 44. P. 557 577.

9. Cramer P., Pesce C.G., Baralle F.E., Kornbliht A.R. Functional association betweenpromoter structure and transcript alternative splicing // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1997. V. 94. P. 11456 11460.

10. Crombie Т., Swaffield J.C., Brown A.J. Protein folding within the cell is influenced by controlled rates of polypeptide elongation // J. Mol. Biol. 1992. V. 228. P. 7 12.

11. Dayton J.S., Lindsten Т., Thompson C.B., Mitchell B.S. Effects of human Tlymphocyte activation on inosine monophosphate dehydrogenase expression // J. Immunol. 1994. V. 152. P. 984 991.

12. Delaloy C., Lu J., Houot A.M., Disse-Nicodeme S., Gasc J.M., Corvol P., Heunemaitre X. Multiple promoters in WNK1 gene: one controls expression of a kidney specific kinase-defective isoform // Mol. Cell. Biol. 2003. V. 23. P. 9208 9221.

13. De Luis 0., del Mazo J. Gene expression of mouse Ml and M2 pyruvate kinaseisoenzymes correlates with differential polyA. tract extension of their mRNAs during the development of spermatogenesis // Biochim. Biophys. Acta. 1998. V. 1396. P. 294-305.

14. De Maria A., Arruti C. Bovine DNase 1: gene organization, mRNA expression, andchanges in the topological distribution of the protein during apoptosis in lens epithelial cells // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003. V. 312. P. 634 641.

15. DeglTnnocenti D., Marzocchini R., Malentacchi F., Ramazzotti M., Raugei G.,

16. Ramponi G. ACYP1 gene possesses two alternative splicing forms that induce apoptosis // IUBMB Life. 2004. V. 56. P. 29 33.

17. Dikic I., Schlessinger J. Identification of a new Pyk2 isoform implicated in chemokine and antigen receptor signaling // J. Biol. Chem. 1998. V. 273. P. 14301 14308.

18. Doyen N., Dandon M.F., Bentolila L.A., Nguyen Q.T., Rougeon F. Differential splicing in mouse thymus generates 2 forms of terminal deoxynucleotidyl transferase // Nucleic Acids Res. 1993. V. 21. P. 1187-1191.

19. V. 272. P. 32715-32718. Fedorova L., Fedorov A. Introns in gene evolution // Genetica. 2003. V. 118. P. 123-131.

20. Gott J.M., Emeson R.B. Functions and mechanisms of RNA editing // Annu. Rev.

21. Genet. 2000. V. 34. P. 499 531. Graveley B.R. Alternative splicing: increasing diversity in the proteomic world //

22. Harris H., Hopkinson D.A. Handbook of Enzyme Electrophoresis in Human Genetics.

23. Hellen C.U., Sarnow P. Internal ribosome entry sites in eukaryotic mRNA molecules //

24. Hirono A., Beutler E. Molecular cloning and nucleotide sequences of cDNA for human glucose-6-phosphate dehydrogenase varriant A(-) // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1988. V. 85. P. 3951 -3954.

25. Houdebine L.M., Attal J. Internal ribosome entry sites (IRESs): reality and use // Transgenic Research. 1999. V. 8. P. 157 177.

26. Jen C.-H., Michalopoulos I., Westhead D.R., Meyer P. Natural antisense transcriptswith coding capacity in Arabidopsis may have a regulatory role that is not linked to double-stranded RNA degradation // Genome Biology. 2005. V. 6. P. 51.

27. Jin P., Fu G.K., Wilson A.D., Yang J., Chien D., Hawkins P.R., Au-Young J., Stuve

28. L. PCR isolation and cloning of novel splice variant mRNAs from known drug target genes // Genomics. 2004. V. 83. P. 566 571.

29. Johnson J.M., Castle J., Garrett-Engele P., Kan Z., Loerch P.M., Armour C.D.,

30. Santos R., Schadt E.E., Stoughton R., Shoemaker D.D. Genome-wide survey of human alternative pre-mRNA splicing with exon junction microarrays // Science. 2003. V. 302. P. 2141-2144.

31. Kessler R., Eschrich K. Splice isoforms of ubiquitous 6-phosphofructo-2kinase/fructose-2,6-bisphosphatase // Molecular Brain Research. 2001. V. 87. P. 190- 195.

32. Kim J.E., Kim K.H., Lee S.W., Seol W., Shiba K., Kim S. An elongation factorassociating domain is inserted into human cysteinyl-tRNA synthetase by alternative splicing // Nucleic Acids Res. 2000. V. 28. P. 2866 2872.

33. Kim H., Klein R., Majewski J., Ott J. Estimating rates of alternative splicing in mammals and invertebrates // Nature Genetics. 2004. V. 36. P. 915 916.

34. Kimura S., Kotani Т., McBride O.W., Umeki K., Hirai K., Nakayama Т., Ohtaki S.

35. Human thyroid peroxidase: complete cDNA and protein sequence, chromosome mapping, and identification of two alternately spliced mRNAs // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1987. V. 84. P. 5555 5559.

36. Kinnaird J.H., Revell D.F., Connerton I.F., Hasleham I. Fincham J.R.S. Alternativemodes of messenger-RNA processing in a 3' splice site mutant of Neurospora crassa И Curr. Genet. 1992. V. 22. P. 37 40.

37. Kitagawa H.T. Molecular cloning, sequencing and alternative splicing of the acidphosphatase (Acph) gene from Drosophila virilis IIDNA Sequence. 2003. V. 14. P. 135 -139.

38. Kobayashi Y., Dokiya Y., Sugita M. Dual targeting of phage-type RNA polymerase to both mitochondria and plastids is due to alternative translation initiation in single transcripts // Biochim. Biophys. Res. Commun. 2001. V. 289. P. 1106 1113.

39. Kochiwa H., Itaya M., Tomita M., Kanai A. Stage-specific expression of Caenorhabdi-tis elegans ribonuclease HI enzymes with different substrate specificities and bivalent cation requirements // FEBS Journal. 2006. V. 273. P. 420 429.

40. Kohtz J.D., Jamison S.F., Will C.L., Zuo P., Luhrmann R., Garcia-Blanco M.A.,

41. Manley J.L. Protein-protein interactions and 5'-splice-site recognition in mammalian mRNA precursors // Nature. 1994. V. 368. P. 119 124.

42. Kolb V.A. Cotranslational protein folding // Mol. Boil. 2001. V. 35(4). P. 584 590.

43. Kondrashov F.A., Koonin E.V. Origin of alternative splicing by tandem exon duplication // Hum. Mol. Genet. 2001. V. 10. P. 2661 2669.

44. Konno R Rat D-amino-acid oxidase cDNA: rat D-amino-acid oxidase as anintermediate form between mouse and other mammalian D-amino-acid oxidases //Biochim. Biophys. Acta. 1998. V. 1395. P. 165 -170.

45. Koslowski M., Tureci O., Bell C., Krause P., Lehr H-A., Brunner J., Seitz G., Nestle F.O., Huber C., Sahin U. Multiple splice variants of lactate dehydrogenase С selectively expressed in human cancer // Cancer Research. 2002. V. 62. P. 6750 -6755.

46. Kountikov E., Wilson M., Miller N., Clem W., Bengten E. Organization and expression of thirteen alternatively spliced exons in catfish CD45 homologs // Developmental and Comparative Immunology. 2004. V. 28. P. 1023 1035.

47. Kozak M. The scanning model for translation: an update // J. Cell. Biol. 1989. V. 108. P. 229-241.

48. Kravchenko E., Chumakov P.M. Alternative transcripts of POLRMT gene coding for nuclear RNA polymerase IV // Mol. Biol. 2005. V. 39. P. 58 61.

49. Kriventseva E.V., Koch I., Apweiler R, Vingron M., Bork P., Gelfand M.S.,

50. Malek О., Knoop V. 7><my-splicing group II introns in plant mitochondria: the complete set of ш-arranged homologs in ferns, fern allies, and a hornwort // RNA. 1998. V. 4. P. 1599-1609.

51. Polydora brevipalpa (Polychaeta: Spionidae) // Biochem. Genet. 2001b. V. 39. P. 285-288.

52. Manchenko G.P. Handbook of detection of enzyme on electroforetic gels // CRC Press. 2003.514 р.

53. Manchenko G.P. and Pankova V.V. Sex-linkage of a gene responsible for the expression of alternative GPI isozyme in Polydora brevipalpa (Polychaeta: Spionidae) // Gene Families and Isozymes Bulletin. 2001. V. 34. P. 55.

54. Maniatis Т., Tasic B. Alternative pre-mRNA splicing and proteome expansion in metazoans // Nature. 2002. V. 418. P. 236 243.

55. Manley J.L., Tacke R. SR proteins and splicing control // Genes Dev. 1996. V. 10. P. 1569-1579.

56. Mao G.F., Kunapuli S.P., Rao A.K. Evidence for two alternatively spliced forms ofphospholipase C-f5 2 in haematopoietic cells // Brit. J. Haematol. 2000. V. 110. P. 402-408.

57. Mar S.S., Mori H., Lee J.H., Fukuda K., Saburi W., Fukuhara A., Okuyama M.,

58. Chiba S., Kimura A. Purification, characterization, and sequence analysis of two a-amylase isoforms from azuki bean, Vigna angularis, showing different affinity towards P-cyclodextrin sepharose // Biosci. Biotechnol. Biochem. 2003. V. 67. P. 1080-1093.

59. Marie J., Simon M.-P., Dreyfus J.-C., Kahn A. One gene, but two messenger RNAs encode liver L and red cell L' pyruvate kinase subunits // Nature. 1981. V. 292. P. 70 72.

60. Marrs K.A., Walbot V. Expression and RNA splicing of the maize glutathione Stransferase Bronze 2 gene is regulated by cadmium and other stresses // Plant Physiol. 1997. V. 113. P. 93 102.

61. Meng J-P., Zang F-P., Huhtaniemi I., Pakarinen P. Characterization and developmental expression of a testis-specific adenosine deaminase mRNA in the mouse // J. An-drol. 1997. V. 18. P. 88-95.

62. Miller P.W., Schmidt R.R. Precursor messenger-RNA alternative splicing yieldsmultiple chloroplastic, NADP-specific glutamate dehydrogenase isoenzymes // Plant Physiol. 1993. V. 102. P. 70 79.

63. Miller S.W., Hayward D.C., Bunch T.A., Miller D.J., Ball E.E., Bardwell V.J.,

64. Zarkower D., Brower D.L. A DM domain protein from a coral, Acropora mille-pora, homologous to proteins important for sex determination // Evolution and development. 2003. V. 5. P. 251 258.

65. Miranda-Vizuete A., Spyrou G. Genomic organization and identification of a nowelalternative splicing variant of mouse mitochondrial thioredoxin reductase (TrxR2) gene // Mol. Cell. 2002. V. 13. P. 488 492.

66. Miro X., Casacuberta J.M., Gutierrez-Lopez M.D., de Ladnazuri M.O., Puigdomenech P. Phosphodiesterases 4D and 7 A splice variants in the responce of HUVEC cells to TNF-a // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000. V. 274. P. 415 421.

67. Mironov A., Fickett J., Gelfand M. Frequent alternative splicing of human genes // Genome Res. 1999. V. 9. P. 1288 1293.

68. Miwa M., Hanai S., Poltronieri P., Uchida M., Uchida K. Functional analysis ofpoly (ADP-ribose) polymerase in Drosophila melanogaster II Mol. Cell. Biochem. 1999. V. 193. P. 103-107.

69. Montoya G.E., Vernot J.P., Patarroyo M.E. Comparative analysis of CD45 proteins in primate context: owl monkeys versus humans // Tissue Antigens. 2004. V. 64. P. 165- 172.

70. Morgan B.A., Johnson W.A., Hirsh J. Regulated splicing produces different forms of dopa decarboxylase in the central nervous system and hypoderm of Drosophila melanogaster // EMBO J. 1986. V. 5. P. 3335 3342.

71. Moss D.W. Isoenzymes, Chapman and Hall Ltd. London. 1982.204 pp.

72. Mukai F., Ishiguro K., Sano Y., Fujita S.C. Alternative splicing isoform of tau protein kinase/glycogen synthase kinase 3(5 //J. Neurochem. 2002. V. 81. P. 1073 -1083.

73. Murphy R.W., Sites J.W.,Jr., Buth D.G., Haufler C.H. Proteins: isozyme electrophoresis. In: Molecular Systematics (D.M. Hillis, C. Moritz, B.K. Mable, eds.). Sinauer. Sunderland. 1996. P. 51 120.

74. Murray K.D., Isackson P.J., Jones E.G. iV-methyl-D-aspartate receptor dependenttranscriptional regulation of two calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II isoforms in rodent cerebral cortex // Neuroscience. 2003. V. 122. P. 407 -420.

75. Niesel D.W. Bewley G.C., Miller S.G., Armstrong F.B. Purification and structuralanalisis of the soluble sn- glycerol-3-phosphate dehydrogenase isozymes in Dro-sophila melanogaster II J. Biol. Chem. 1980. V. 255. P. 4073 4080.

76. Noguchi Т., Inoue H., Tanaka T. The Ml and M2-type isozymes of rat pyruvate kinase are produced from the same gene by alternative RNA splicing //J. Biol. Chem. 1986. V. 261. P. 13807-13812.

77. Noh S.A., Kwak M.S., Lee H.S., Huh G.H., Liu J.R., Shin J.S., Bae J.M. Genomicorganizations of two small subunit ADP-glucose pyrophosphorylase genes from sweet potato // Gene. 2004. V. 339. P. 173 180.

78. Ohno S., Kawasaki H., Imajoh S., Suzuki K., Inagaki M. Yokokura H., Sakoh Т.,

79. Hidaka H. Tissue-specific expression of three distinct types of rabbit protein kinase С // Nature. 1987. V. 325. P. 161 166.

80. Ono Y., Kurokawa Т., Fujii Т., Kawahara K., Igarashi K., Kikkawa U., Ogita K.,

81. Nishizuka Y. Two types of complementary DNAs of rat brain protein kinase С // FEBS Letters. 1986. V. 206. P. 347 352.

82. Ortiz D.F., Strommer J.N. The Mul maize transposable element induces tissue-specificaberrant splicing and polyadenylation in two Adhl mutants // Mol. Cell. Biol. 1990. V. 10. P. 2090-2095.

83. Pan S.S., Han Y.S., Farabaugh P., Xia H. Implication of alternative splicing for expression of a variant NAD(P)H:quinone oxidoreductase-1 with a single nucleotide polymorphism at 465C>T // Pharmacogenetics. 2002. V. 12. P. 479 488.

84. Pankova V.V., Pudovkin A.I., Manchenko G.P. Allozymic variation determined byalternatively spliced exon of the Gpi gene in Polydora brevipalpa (Polychaeta: Spionidae) // GFI Bulletin. 2004. V. 37. P. 30.

85. Papadopoulou D., Louis C. The glutamate dehydrogenase gene of Drosophilamelanogaster: molecular analysis and expression // J. Neurogenet. 2000. V. 14. P. 125-145.

86. Peters J., Nash H.R., Eicher E.M., Bulfield G. Polymorphism of kidney pyruvate kinase in the mouse is determined by a gene, Pk-3, on chromosome 9 // Biochem. Genet. 1981. V. 19. P. 757-769.

87. Poly W.J. Nongenetic variation, genetic-environmental interactions and altered geneexpression. III. Posttranslational modifications // Сотр. Biochem. Physiol. 1997. V. 118. P. 551 -572.

88. Pourter L.D., Ibrahim H., Taylor L., Curthoys N.P. Complexity and species variation of the kidney-type glutaminase gene // Physiological Genomics. 2002. V. 9. P.157 -166.

89. Pozzoli U., Sironi M. Silencers regulate both constitutive and alternative splicing events in Mammals // Cellular and Molecular Life Sciences. 2005. V. 62. P. 1579 -1604.

90. Quest A.F.G., Eppenberger H.M., Wallimann T. Two different B-type creatine kinase subunits dimerize in a tissue-specific manner // FEBS Letters. 1990. V. 262. P. 299-304.

91. Radashevsky V.I., Pankova V.V. The morphology of two sibling sympatric Polydora species (Annelida: Spionidae) from the Sea of Japan // The Journal of Marine Biological Association of United Kindom» (JMBA). 2006. V. 86. P. 245-252.

92. Ranson H., Collins F., Hemingway J. The role of alternative splicing in generatingheterogeneity within the Anopheles gambiae class I glutathione ^-transferase family // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1998. V. 95. P. 14284 14289.

93. Raymond C.S., Shamu C.E., Shen M.M., Seifert K.J., Hirsch В., Hodgkin J.,

94. Zarkower D. Evidence for evolutionary conservation of sex-determining genes // Nature. 1998. V. 391. P. 691 -695.

95. Richardson B.J., Baverstock P.R., Adams M. Allozyme electrophoresis: A handbook for animal systematics and population studies. Academic Press. Sydney. 1986. 410 pp.

96. Rider M.H., Vandamme J., Lebeau E., Vertommen D., Vidal H., Rousseau G.G.,

97. Vandekerckhove J., Hue L. The two forms of bovine heart 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase result from alternative splicing // Biochem. J.1992. V. 285. P. 405-411.

98. Ross V.L., Board P.G. Molecular-cloning and heterologous expression of an alternatively spliced human Mu class glutathione-S-transferase transcript // Biochem. J.1993. V. 294. P. 373-380.

99. Rueter S.M., Emeson RB. Adenosine-to-Inosine conversion in mRNA. In: (Grosjean H., Benne R., eds.) Modification and Editing of RNA. Washington, DC; ASM Press. 1998. P. 343-361.

100. Rueter S.M., Dawson T.R., Emeson R.B. Regulation of alternative splicing by RNA editing //Nature. 1999. V. 399. P. 75 80.

101. Sabina R.L., Ogasawara N., Holmes E.W. Expression of three stage-specific transcripts of AMP deaminase during myogenesis // Mol. Cell. Biol. 1989. V. 9. P. 2244 -2246.

102. Salmon A., Erb C., Meshorer E., Ginzberg D., Adani Y., Rabinovitz I., Amitai G.,

103. Soreq H. Muscarinic modulations of neuronal anticholinesterase responses // Chemico-Biological Interactions. 2005. V. 157. P. 105 113.

104. Sanford J.R., Bruzik J.P. Developmental regulation of SR protein phosphorylation and activity // Genes Dev. 1999. V. 13. P. 1513 1518.

105. Schmucker D., Clemens J.C, Shu H., Worby C.A, Xiao J., Muda M., Dixon J.E,

106. Zipursky S.L. Drosophila DSCAM is an axon guidance receptor exhibiting extraordinary molecular diversity // Cell. 2000. V. 101. P. 671 684.

107. Schutt C., Nothiger R. Structure, function and evolution of sex-determining systems in Dipterian insects // Development. 2000. V. 127. P. 667 677.

108. Setoyama C., Tamaoki H., Nishina Y., Shiga K.O., Miura R. Functional expression of two forms of rat acyl-CoA oxidase and their substrate specificities // Biochem. Bioph. Res. Commun. 1995. V. 217. P. 482-487.

109. Sharov A.A., Dudekula D.B., Ко M.S.H. Genome-wide assembly and analysis of alternative transcripts in mouse // Genome Research. 2005. V. 15. P. 748 754.

110. Shaw C.R. Electrophoretic variation in enzymes // Science. 1965. V. 149. P. 936 943.1. J^"

111. Shaw-Lee R., Lissemore J.L., Sullivan D.T., Tolan D.R. Alternative splicing of fructose -1,6-bisphosphate aldolase transcripts in Drosophila melanogaster predicts 3 isozymes // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 3959 3967.

112. Shi H., Xiong L., Stevenson В., Lu Т., Zhu J-K. The Arabidopsis salt overly sensitive 4 mutants uncover a critical role for vitamin B6 in plant salt tolerance // Plant Cell. 2002. V. 14. P. 575-588.

113. Shin D., Park C. iV-terminal extension of canine glutamine synthetase created bysplicing alters its enzymatic properties // J. Biol. Chem. 2004. V. 279. P. 1184 -1190.

114. Shiokawa D., Matsushita Т., Kobayashi Т., Matsumoto Y., Tanuma S.I. Characterization of the human DNAS1L2 gene and the molecular mechanism for its transcrip-f tional activation induced by inflammatory cytokines // Genomics. 2004. V. 84. P.95. 105.

115. Siaterli M.Z., Vassilacopoulou D., Fragoulis E.G. Cloning and expression of human placental L-Dopa decarboxylase // Neurochemical Research. 2003. V. 28. P. 797 803.

116. Sikorav J.-L., Duval N., Anselmer A., Bon S., Krejci E., Legay C., Osterlund M.,

117. Reimund В., Massoulie L. Complex alternative splicing of acetylcholinesterase transcripts in Torpedo electric organ; primary structure of the precursor of the glycolipid-anchored dimeric form // EMBO J. 1988. V. 7. P. 2983 2993.

118. Singh R. RNA-protein interactions that regulate pre-mRNA splicing // Gene Expression. 2002. V. 10. P. 79 92.

119. Siqueira S.F., Dias S.M.G., Hardouin P., Pereira F.R.S., Lejeune В., de Souza A.P.

120. Transcription of succinate dehydrogenase subunit 4 (sdh4) gene in potato: detection of extensive RNA editing and co-transcription with cytochrome oxidase sub-unit III (сохЗ) gene // Curr. Genet. 2002. V. 41. P. 282 289.

121. Slavov D., Gardiner K. Phylogenetic comparison of the pre-mRNA adenosinedeaminase ADAR2 genes and transcripts: conservation and diversity in editing site sequence and alternative splicing patterns // Gene. 2002. V. 299. P. 83-94.

122. Soldati Т., Schafer B.W., Perriard J.C. Alternative ribosomal initiation gives rise tochicken brain-type creatine kinase isoproteins with heterogeneous amino termini // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 4498 4506.

123. Stamm S., Zhu J., Nakai K., Stoilov P., Stoss O., Zhang M.Q. An altemative-exon database and its statistical analysis // DNA Cell Biol. 2000. V. 19. P. 739 756.

124. Stamm S., Ben-Ari S., Rafalska I., Tang Y.S., Zhang Z.Y., Toiber D., Thanaraj

125. T.A., Soreq H. Function of alternative splicing // Gene. 2005. V. 344. P. 1 20.

126. Stromberg P., Hoog J.O. Human class V alcohol dehydrogenase (ADH5): a complex transcription unit generates C-terminal multiplicity // Biochem. Biophys. Res. Commun. 2000. V. 278. P. 544 549.

127. Stuart K., Panigrahi A.K. RNA editing: complexity and complications // Mol. Microbiol. 2002. V. 45. P. 591 -596.

128. Su D., Gladyshev V.N. Alternative splicing involving the thioredoxin reductase module in mammals: a glutaredoxin-containing thioredoxin reductase 1 // Biochemistry. 2004. V. 43. P. 12177-12188.

129. Tailor P., Gilman J., Williams S., Mustelin T. A novel isoform of the low molecular weight phosphotyrosine phosphatase, LMPTP-C, arising from alternative mRNA splicing // Eur. J. Biochem. 1999. V. 262. P. 277 282.

130. Takahara K., Hayashi N., Fujitasagawa K., Morishita Т., Hashimoto Y., Noda A.

131. Alternative splicing of bovine terminal deoxynucleotidyl transferase С DNA // Biosci. Biotech. Bioch. 1994. V. 58. P. 786 786.

132. Takenaka M., Noguchi Т., Sadahiro S., Hirai H., Yamada K., Matsuda Т., Imai E.,

133. Tanaka T. Isolation and characterization of the human pyruvate kinase M gene // Eur. J. Biochem. 1991. V. 198. P. 101 106.

134. Cancer. 2001. V. 32. P. 222 235. Uy R., Wold F. Posttranslational covalent modification of protein // Science. 1977. V. 198. P. 890-896.

135. Venter J.C., Adams M.D., Myers E.W. et al. (274-coauthors). The sequence of the human genome // Science. 2001. V. 291. P. 1304 -1351. Visvikis A., Pawlak A., Accaoui M.J., Ichino K., Leh H., Guellaen G., Wellman M.

136. Structure of the 5' sequences of the human y-glutamyltransferase gene // Eur. J. Biochem. 2001. V. 268. P. 317-325. Wahle E., Riiegsegger U. З'-End processing of pre-mRNA in eukaryotes // FEMS

137. Weiss С., Zeng Y., Huang J.M., Sobocka M.B., Rushbrook J.I. Bovine NAD(+)dependent isocitrate dehydrogenase: alternative splicing and tissue-dependent expression of subunit 1 //Biochemistry. 2000. V. 39. P. 1807- 1816.

138. Wiens M., Koziol C., Batel R., Muller W.E.G. Prolidase in the marine sponge Suberites domuncula: Enzyme activity, molecular cloning, and phylogenetic relationship // Mar. Biotechnol. 1999. V. 1. P. 191 199.

139. Wilanowski T.M., Hayward D.C., Gibson J.B. Nucleotide sequence and expression of the 5«-glycerol-3-phosphate dehydrogenase gene in Locusta migratoria II Bio-chimica and Biophysica Acta. 1998. V. 1443. P. 414 418.

140. Wirz Т., Soldati Т., Hissle J.P., Perriard J.C. A unique chiken В crestine kinase gene gives rise to 2 В - creatine kinase isoproteins with distinct N - termini by alternative splicing // J. Biol. Chem. 1990. V. 265. P. 1656 -1666.

141. Wright D.A., Shaw C.R. Genetics and ontogeny of a-glycerophosphate dehydrogenase isozymes in Drosophila melanogaster И Biochem. Genet. 1969. V. 3. P. 343 -353.

142. Wright R.M., Vaitaitis G.M., Wilson C.M., Repine T.B., Terada L.S., Repine J.E.cDNA cloning, characterization, and tissue-specific expression of human xanthine dehydrogenase/xanthine oxidase // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1993. V. 90. P. 10690-10694.

143. Yamaguchi S., Nakanishi S. Regional expression and regulation of alternative forms of mRNAs derived from two distinct transcription initiation sites of the rat mGluR5 gene // J. Neurochem. 1998. V. 71. P. 60 68.

144. Yang X.L., Liu F.M., Skene R.J., McRee D.E., Schimmel P. Crystal structure of an

145. EMAP-II-like cytokine released from a human tRNA synthetase // Helvetica Chimica Acta. 2003. V. 86. P. 1246 1257.

146. Ye D.J., Lee C.H., Queener S.F. Differential splicing of Pneumocystis carinii f. sp.carinii inosine 5'-monophosphate dehydrogenase pre-mRNA // Gene. 2001. V. 263. P. 151 158.

147. Yoshimura K., Yabuta Y., Ishikawa Т., Shigeoka S. Identification of a cis element for tissue-specific alternative splicing of chloroplast ascorbate peroxidase pre-mRNA in higher plants // J. Biol. Chem. 2002. V. 277. P. 40623 40632.

148. Zheng Y., Zhou Z.M., Min X., Li J.M., Sha J.H. Identification and characterization of the BGR-like gene with a potential role in human testicular develop-ment/spermatogenesis // Asian Journal of Andrology. 2005. V. 7. P. 21 32.

149. Zhou Z., Licklider L.J., Gygi S.P., Reed R. Comprehensive proteomic analysis of the human spliceosome // Nature. 2002. V. 419. P. 182 185.

150. Zhu F., Zhang M. DNA polymerase zeta: new insight into eukaryotic mutagenesis and mammalian embryonic development // World Journal of Gastroenterology. 2003. V. 9. P. 1165- 1169.

151. Zwicky R., Muntener K., Csucs G., Goldring M.B., Baici A. Exploring the role of5' alternative splicing and of the 3'-untranslated region of cathepsin В mRNA // Biol. Chem. 2003. V. 384. P. 1007 1018.