Микробиологические аспекты диагностики коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Видманова Мария Владимировна

• Видманова Мария Владимировна
• кандидат наук
• 2026

Оглавление диссертации кандидат наук Видманова Мария Владимировна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

ГЛАВА 1. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ

ДИАГНОСТИКИ КОКЛЮША И ИХ СОВРЕМЕННЫЕ

ОСОБЕННОСТИ КАК ПЕРСПЕКТИВЫ МОДЕРНИЗАЦИИ

(ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1. Микроорганизмы рода Bordetella. Современные представления

1.2. Распространенность и современные подходы к верификации 18 случаев коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами.

1.3. Культуральный метод выявления возбудителей рода Bordetella. 22 Современные особенности выполнения.

1.4. Некультуральные методы детекции возбудителей рода Bordetella 24 и их применение для индивидуальной диагностики.

1.5. Современный алгоритм лабораторной диагностики коклюша и 26 заболеваний, обусловленных другими бордетеллами и возможные пути его оптимизации в части микробиологической диагностики.

ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ

2.1. Дизайн исследования

2.2. Штаммы микроорганизмов

2.3. Характеристика обследуемых

2.4. Микробиологические методы исследования

2.5. Времяпролётная масс-спектрометрия

2.6. Молекулярно-генетические методы исследования

2.7. Серологические методы исследования

2.8. Методы статистического анализа данных

ГЛАВА 3. ОЦЕНКА ВОЗМОЖНОСТЕЙ КУЛЬТУРАЛЬНОГО 44 МЕТОДА МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ КОКЛЮША И ЗАБОЛЕВАНИЙ, ОБУСЛОВЛЕННЫХ ДРУГИМИ БОРДЕТЕЛЛАМИ

3.1. Особенности определения видовой принадлежности Bordetella 44 spp. при использовании метода MALDI-ToF масс-спектрометрии

3.2. Видовое разнообразие сопутствующих микроорганизмов верхних 59 дыхательных путей при обследовании на коклюш.

3.3. Определение антагонистической активности

3.4. Характеристика колоний

3.5. Пути оптимизации отбора проб. Маска

ГЛАВА 4. СОВРЕМЕННЫЕ АСПЕКТЫ НЕКУЛЬТУРАЛЬНЫХ 77 МЕТОДОВ МИКРОБИОЛОГИЧЕСКОЙ ДИАГНОСТИКИ КОКЛЮША И ЗАБОЛЕВАНИЙ, ОБУСЛОВЛЕННЫХ ДРУГИМИ БОРДЕТЕЛЛАМИ

4.1. Преаналитических этап некультуральных методов 77 микробиологической диагностики коклюша и его особенности при централизованном подходе.

4.2. Особенности применения метода полимеразная цепная реакция 81 для верификации стёртых форм коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами.

4.3. Современные аспекты микробиологической диагностики 85 коклюша методом ИФА у индивидуумов.

4.4. Мониторинг гуморального противококлюшного иммунитета. 86 Современное состояние проблемы.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

СПИСОК НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ , В КОТОРЫХ 125 ИЗЛОЖЕНЫ ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ ДИССЕРАЦИИ

ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Микробиологические аспекты диагностики коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследований и степень разработанности темы

исследования

На современном этапе коклюш (МКБ-10: A37.0/A37.1/A37.8/A37.9) является актуальной инфекцией с тенденцией к росту заболеваемости на всей территории РФ [Форма государственной отчётности № 2 об инфекционной заболеваемости, 2020-2023]. В структуре детей с длительным кашлем коклюш различной степени тяжести регистрируется в 28,0-34,1% случаев, это происходит на фоне высокого охвата вакцинацией детей и других противоэпидемических мер в отношении воздушно-капельных инфекций [Бабаченко И.В., 2020, Харит С.М., 2020, Knuutila A., 2020]. Актуальность коклюша у взрослых обусловлена распространенной коморбидной патологией (бронхиальная астма, ХОБЛ, ожирение, иммунодефицитные состояния) [Черданцев А.П., 2023].

Регистрация случаев коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами, напрямую зависит от микробиологической диагностики, доступности чувствительных методов, необходимых для подтверждения атипичных и стертых форм заболевания [Попова О.Ю., Мазанкова Л.Н., 2019]. В актуальных нормативных документах для микробиологической диагностики коклюша рекомендовано применять бактериологический метод, ПЦР и ИФА [Бабаченко И.В., Нестерова Ю.В. 2021].

Возбудитель коклюша, Bordetella pertussis, был впервые выделен в 1906 году Дж. Борде и О. Жангу [Литусов Н.В., 2013]. Бактерии рода Bordetella включают 15 видов, среди которых B. pertussis, B. holmesii и B. parapertussis распространены наиболее широко [Лабинская А.С., 2022]. B. bronchiseptica, преимущественно является возбудителем респираторных заболеваний у животных, у людей - значительно реже (0,1-0,5% случаев); B. trematum и B. petrii могут обнаруживаться в раневом отделяемом. B. hinzii и B. avium обнаруживаются в крови и слюне у пациентов ВИЧ-инфекцией; а также

поражают птиц, медицинское значение остальных видов рода Bordetella малоизучено [Пруцкова Е.В., 2025].

Антигенная структура Bordetella spp. включает коклюшный токсин, филаментозный гемагглютинин, трахеальный цитотоксин, пертактин, аденилатциклазный гемолизин, а также агглютиногены, фимбрии, липополисахарид и дермонекротоксин [Пруцкова Е.В., 2025, Yu. Liu, Ja. Freeborn, B. Okeugo, 2024]. Коклюшный токсин является экзотоксином, обладает высокой иммуногенностью, увеличивает секрецию инсулина и стимулирует лимфоцитоз [Пруцкова Е.В., 2025, Locht C., Antoine R., 2021]. У детей первого года жизни, перенесших коклюш, наиболее выраженный иммунный ответ наблюдается именно к коклюшному токсину [Kapil P, Merkel TJ., 2019].

Культуральный метод микробиологической диагностики коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами, является «золотым стандартом», его грамотное исполнение позволяет подтвердить коклюш у при проведении индивидуальной лабораторной диагностики, получать изоляты циркулирующих штаммов Bordetella spp. для изучения изменчивости его фенотипических свойств и эпидемиологического мониторинга [Мерцалова Н.У., Зайцев Е.М., 2009]. Но из-за трудоёмкости метода, погрешностях в организации преаналитического этапа, нестабильности расходных материалов и незначительного процента положительных результатов в последние десятилетия бактериологическая диагностика коклюша упоминается как низкочувствительный и неэффективный метод. В публикациях с глубиной поиска 10 лет этому методу уделено небольшое внимание; недостаточно информации об особенностях преаналитического этапа, о возможностях модернизации аналитического этапа, об альтернативах определения видовой принадлежности бордетелл, в частности практически не упоминается про современный относительно доступный метод определения видовой принадлежности MALDI-ToF масс-спектрометрию, в то время как для других

бактериальных патогенов этот метод видовой идентификации описан и широко представлен в публикациях последних лет.

Некультуральные методы детекции бактерий рода Bordetella (ПЦР и ИФА) в настоящее время широко используются, для них предусмотрены сроки применения в зависимости от давности начала проявлений коклюша. Однако распространение стертых форм коклюша на фоне массовой вакцинации требует детализации известных алгоритмов, изучения преаналитических особенностей выполнения метода ПЦР, которые существенно влияют на его эффективность [Прадед М.Н., 2016, Sun C., Xiao F., Fu J., 2022].

Ретроспективная детекция Bordetella spp. у пациентов проводится методом ИФА, что включает в себя определение IgG, IgA, IgM к основным факторам патогенности: коклюшному токсину и филаментозному гемагглютинину. Этот некультуральный метод позволяет значительно повысить расшифровку случаев коклюша. Он даёт возможность индикации сероконверсии и нарастания IgG при исследовании парных сывороток в динамике, однако в существующем комплексном алгоритме микробиологической диагностики коклюша отсутствуют разъяснения об очерёдности и рациональности определения Ig [Храмцов П.В., 2016, Басов А.А., 2017]. Также на современном этапе актуальную проблему представляет собой корректность интерпретации результатов массовых исследований методом ИФА без унифицированного референтного значения IgG к коклюшному токсину [Басов А.А., 2016].

Таким образом, в совокупности микробиологические аспекты диагностики коклюша на современном этапе развития медицинской микробиологии требуют уточнения.

Цель и задачи исследования Цель - повышение эффективности диагностики коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами, путём обоснования новых подходов к микробиологическим исследованиям.

Для достижения цели были поставлены задачи:

1. Установить оптимальные рецептурные комбинации питательных сред для культивирования Bordetella spp. с последующим определением видовой принадлежности изолятов методом MALDI-ToF масс-спектрометрии.

2. Охарактеризовать видовое разнообразие сопутствующей микробиоты в бактериологических посевах на коклюш и изучить её антагонистические свойства в отношении Bordetella pertussis.

3. Уточнить характеристики роста Bordetella pertussis на плотных питательных средах, оптимальных для культивирования с последующим определением видовой принадлежности методом MALDI-ToF масс-спектрометрии.

4. Оценить эффективность неинвазивного способа взятия биоматериала для индикации Bordetella spp.

5. Определить современные особенности применения метода ПЦР для детекции Bordetella spp.

6. Детализировать алгоритм микробиологической диагностики коклюша, используя полученные новые данные.

Научная новизна работы Впервые систематизированы данные о получении чистых культур клинически значимых Bordetella spp. для дальнейшей ускоренной видовой идентификации методом MALDI-ToF масс-спектрометрии.

Дано описание видового разнообразия микроорганизмов верхних дыхательных путей человека, получаемых на питательных средах, элективных для клинически значимых Bordetella spp.

Получены данные об отсутствии антагонистической активности у сопутствующих микроорганизмов в отношении Bordetella pertussis при совместном культивировании.

Теоретическая и практическая значимость работы

Теоретическая значимость исследований заключается в получении новых данных о видовом разнообразии сопутствующей микробиоты в бактериологических посевах при исследовании на коклюш и уточнении характеристик ростовых свойств представителей рода Bordetella и особенностей их масс-спектров.

Практическая значимость исследований заключается в том, что были определены оптимальные рецептуры питательных сред для культивирования бордетелл с последующим определением видовой принадлежности ускоренным методом MALDI-ToF масс-спектрометрии. Были получены данные об отсутствии антагонистической активности условно-патогенных нейссерий в отношении Bordetella pertussis. Была разработана полезная модель для взятия кашлевого аэрозоля, расширяющая возможности микробиологической диагностики коклюша и снижающая биологические риски в отношении медицинского персонала (Патент RU 216948 U1). Была определена распространённость потенциально ложноотрицательных результатов ПЦР метода в рамках микробиологической диагностики коклюша и других заболеваний, обусловленных бордетеллами. Действующий алгоритм микробиологического подтверждения коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами. был детализирован с использованием новых полученных данных.

Методология и методы исследования -Диссертационная работа выполнена с применением клинических, лабораторных, инструментальных, аналитических и статистических методов в соответствии с поставленной целью; одобрена Биоэтическим комитетом при ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» МЗ РФ (протокол № 212 от 11 ноября 2020 года). Дизайн исследования представляет собой проспективное, открытое, сплошное, одноцентровое исследование [28].

План выполнения этапов работы составлен в соответствии с поставленной целью и задачами; подобранны объекты и определены методы

современной диагностики. Проводимая работа основана на результатах сравнительного открытого клинического исследования. В ходе исследования применены культуральные и некультуральные методы, а также клинико-статистические и методы доказательной медицины. Математическая обработка полученных результатов основана в соответствии с принципами доказательной медицины.

Микробиологические некультуральные (молекулярно-биологические и серологические исследования) проводились в период с 2016 по 2020 год на базе микробиологической лаборатории ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Самарской области». Микробиологические культуральные исследования, идентификация методом MALDI-ToF масс-спектрометрией, протеомный анализ полученных белковых спектров проводились в период с 2021 по 2023 год на базе ФГБОУ ВО СамГМУ МЗ РФ.

Дизайн для диссертационного исследования представлен следующим перечнем исследований:

Изучение современных аспектов культурального метода для детекции бордетелл (n=442):

1. Определение оптимального состава питательной среды для культивирования Bordetella spp. (n=144);

2. Изучение культуральных свойств Bordetella spp. с применением современного оборудования (n=45);

3. Изучение видового разнообразия сопутствующей микробиоты, определяемой на бордетелл-элективных питательных средах (n=116);

4. Изучение антагонистических свойств представителей сопутствующей микробиоты в отношении Bordetella spp. (n=27);

5. Апробация полезной модели маски для отбора кашлевого аэрозоля. Экспериментальные исследования. (n=110).

Изучение современных аспектов некультуральных методов для детекции бордетелл (n=3329):

1. Анализ преаналитического этапа методов ПЦР и ИФА для индикации бордетелл) (n=765);

2. Анализ ретроспективных данных по детекции бордетелл методом ПЦР (n=250);

3. Анализ ретроспективных данных по детекции бордетелл методом ИФА у пациентов (n=515);

4. Определение уровня антител к Bordetella spp. у привитых против коклюша детей (n=1729);

5. Сличительные параллельные исследования образцов сывороток привитых против коклюша детей (n=70)

Статистическая обработка данных. Формулировка выводов и практических рекомендаций.

Микробиологические методы диагностики коклюша проводится согласно нормативному документу МУК 4.2.3701-21. Для накопления культур применяются составные питательные среды. В рамках данного исследования производились посевы микроорганизмов B.pertussis, B.parapertussis, B.bronchiseptica на составные питательные среды с рецептурными вариантами. Всего было апробировано 48 рецептурных вариантов.

Времяпролётная масс-спектрометрия применялась для определения видовой принадлежности изолятов культур выделенных микроорганизмов. У всех изолятов был проведен анализ протеомных спектров, полученных при MALDI-ToF масс-спектрометрии с использованием, встроенной программ flexAnalysis 3.0 и MALDI Biotyper 3.0 Offline Classification (Braker Daltonik GmbH, Германия). Сравнительная визуализация белковых профилей была также выполнена в программе MALDI Biotyper 3.0 Offline Classification [22].

Оценка видового разнообразия сопутствующей микробиоты была проведена с использованием коэффициента постоянства микроорганизмов в биоматериале у обследуемых. Также был рассчитан коэффициент сходства

Жаккара, что позволило дать количественную характеристику взаимоотношений видов микроорганизмов в парных сочетаниях [55].

Молекулярно-генетические методы исследования. Для исследований мазков использовали набор реагентов «АмплиСенс® Bordetella multi-FL» для выявления и дифференциации ДНК возбудителей коклюша (Bordetella pertussis), паракоклюша (Bordetella parapertussis) и бронхисептикоза (Bordetella bronchiseptica) в биоматериале методом ПЦР с гибридизационно-флуоресцентной детекцией для 4 и более канальных приборов RQ, IQ, CFX, ДТ, предназначенных для анализа кривых накопления флуоресцентного сигнала по четырем каналам (FAM, JOE, ROX и Cy5).

Биоинформационные и статистические методы исследования. Статистическая обработка результатов проведена с учетом совпадения количественного значения Score в зависимости от состава питательной среды, а также количества пиков в зависимости от среды. Группировку данных была выполнена в программе Microsoft Excel® 2013. Статистический анализ был выполнен с использованием программы StatTech 3.1.8 © ООО "Статтех", Россия, 2023 (программа зарегистрирована Федеральной службой по интеллектуальной собственности, номер регистрации 2020615715, дата регистрации 29.05.2020) [22].

Положения, выносимые на защиту

1. Получение чистой культуры бордетелл с последующим определением видовой принадлежности методом MALDI-ToF масс-спектрометрии целесообразно проводить с использованием питательной среды Bordet Gengou Agar.

2. Микроорганизмы Streptococcus agalactiae, Staphylococcus lugdunensis, Arthroderma gloriae характеризуются как синергисты по отношению к Bordetella spp. При бактериологическом исследовании на наличие бордетелл в качестве сопутствующей микробиоты наиболее часто выявляются условно-патогенные Neisseria sicca, Neisseria maccacae, Neisseria subflava, у которых не

выявлены антагонистические свойства в отношении Bordetella pertussis при сокультивировании.

3. Применение полезной модели маски показало более высокую эффективность выделения Bordetella spp. по сравнению с классическим методом «кашлевых пластинок».

Степень достоверности и апробация результатов

Достоверность полученных результатов обусловлена современным уровнем экспериментальных исследований и применением фундаментальных и актуальных трудов в области микробиологии в качестве методологической и теоретической базы.

Основные положения диссертационной работы представлены в виде устных и постерных докладов на следующих научно-практических мероприятиях: Всероссийский ежегодный конгресс «Инфекционные болезни у детей: диагностика, лечение и профилактика» (Санкт-Петербург, 2017); I Поволжская Межрегиональная конференция «Инфекционные болезни. Вызовы времени» (Самара, 2017); XXII Кашкинские чтения (Санкт-Петербург, 2019); II Поволжская научно-практическая школа по клинической инфектологии и иммунологии (Самара, 2021); Межрегиональная научно-практическая конференция Школа НАСКИ "ИСМП: проблемы и решения" (Самара, 2021); VII Российский конгресс Лабораторной медицины (Москва, 2021); IV Всероссийская научно-практическая конференция молодых учёных и студентов с международным участием «Современные аспекты профилактики заболеваний» (Самара, 2021); Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Аспирантские чтения-2022»; Всероссийская научно-практическая конференция «Вопросы вакцинопрофилактики Самарского региона-2023 (Самара, 2023); Научно-практическая конференция «Многогранная инфектология» (Самара, 2023); XIV Всероссийский ежегодный конгресс «Инфекционные болезни у детей: диагностика, лечение и профилактика» (Санкт-Петербург, 2023);

Всероссийская научно-практическая конференция «Аспирантские чтения-2023» (Самара, 2023); III Российский конгресс по медицинской микробиологии и инфектологии (Москва, 2025), VI Приволжская конференция по антимикробной терапии и клинической микробиологии (Самара, 2025), Школа клинического микробиолога (Новосибирск, 2025).

Личное участие автора в получении результатов.

Автор принимал личное участие на всех этапах диссертационного исследования. Основная идея, планирование научной работы, формулировка научной гипотезы, определение методологии и общей концепции диссертационного исследования, постановка целей и задач, разработка дизайна исследования проводились совместно с научным руководителем -д.м.н., профессором, з.д.н. РФ А.В. Жестковым. Экспериментальные исследования, анализ полученных данных, их интерпретация, представление результатов работы в виде научных публикаций, докладов на конференциях и конгрессах проводились совместно с сотрудниками ФГБОУ ВО СамГМУ МЗ РФ, сотрудниками КДЛ Клиник ФГБОУ ВО СамГМУ МЗ РФ и сотрудниками микробиологической лаборатории и эпидемиологического отдела ФБУЗ «ЦГиЭ в Самарской области».

Анализ современной отечественных и зарубежных публикаций по изучаемой проблеме, статистическая обработка первичных данных, написание и оформление рукописи диссертации проведены лично диссертантом.

Публикации по теме диссертации По теме диссертации опубликовано 8 статей (из них 4 - в журналах из перечня ВАК Минобрнауки РФ) и 11 публикаций в сборниках всероссийских и международных конференций. Получен 1 патент РФ на полезную модель и 1 свидетельство РФ о регистрации базы данных.

Структура и объём диссертации

Диссертация изложена на 131 странице машинописного текста, иллюстрирована 24 таблицами и 16 рисунками, состоит из введения, обзора литературы, главы с описанием материалов и методов исследования, 2 глав с изложением результатов собственных исследований, заключения, выводов, практических рекомендаций, списка литературы, который включает 75 отечественных и 83 зарубежных источников, и 1 приложения.

ГЛАВА 1. МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ ДИАГНОСТИКИ КОКЛЮША И ИХ СОВРЕМЕННЫЕ ОСОБЕННОСТИ КАК

ПЕРСПЕКТИВЫ МОДЕРНИЗАЦИИ (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

1.1. Микроорганизмы рода Bordetella. Современные представления.

Коклюш - острое антропонозное инфекционное заболевание дыхательных путей, характеризующееся воспалением гортани, трахеи, бронхов и приступами спазматического кашля [85,110,117,136]. Медицинский термин "коклюш" появился в 1724 г. (франц. coqueluche - петушиный крик), он описывает характерные звуковые характеристики кашля и его репризы у пациентов при данной инфекции [109]. Однако задолго до появления специального термина типичная клиническая картина коклюша была известна многим народам, о чём свидетельствуют бытовые названия коклюша в разных языках, красноречиво отражающие основные симптомы коклюша, длительность заболевания и его исход [106,138].

Возбудителем коклюша является микроорганизм Bordetella pertussis [82,112,139]. В настоящее время к роду Bordetella относят 15 видов: B. pertussis, B. parapertussis, B.bronchiseptica, B.holmesii, B.avium, B.hinzii, B.ansorpii, B.petrii и B.trematum, B.bronchialis, B.flabilis, B.sputigena и др. [81,140]. Основным фактором патогенности Bordetella pertussis является коклюшный токсин, который широко используется в серологической диагностике в качестве антигена и при производстве бесклеточных противококлюшных вакцин [32,86,90,103,105]. Также к роду Bordetella отнесены три патогенных вида - B.bronchiseptica, B.parapertussis и B.holmesii, которые у человека в основном ассоциированы с респираторными инфекциями и коклюшеподобными симптомами [32,116,120,137].

Микроорганизм B. bronchiseptica вызывает у человека заболевание бронхисептикоз, похожее на коклюш в легкой или средней форме тяжести, также данный возбудитель регистрируется как оппортунистическая респираторная инфекция у пациентов при СПИД [32,97,107,152]. Ретроспективный эпидемиологический анализ случаев бронхисептикозов

позволяет рассматривать B. bronchiseptica в качестве внутрибольничного патогена [120,126].

Микроорганизм B. holmesii первоначально был выделен из периферической крови у взрослых с гипоспленизмом, но в последствии был также изолирован из респираторных образцов, полученных от здоровых людей с коклюшеподобным заболеванием [32,93,98,99]. Относительно B. holmesii высказываются предположения, что он может ошибочно быть идентифицирован как B. pertussis при применении метода ПЦР, так как оба генома содержат последовательность вставки IS481, используемую для ПЦР-анализа [32,127]. Ряд исследователей выражают сомнение, что B. holmesii может быть скрытой причиной роста респираторных коклюшеподобных инфекций [135,151].

Внутривидовая дифференциация Bordetella pertussis проводится по сочетанию ведущих агглютиногенов; на сегодня выделяют четыре серотипа B.pertussis (1.2.0; 1.0.3; 1.2.3 и 1.0.0) [32,89,104,155]. Считается, что серотипы 1.2.0 и превалирующий в настоящее время серотип 1.0.3 чаще выделяют от привитых, больных с легкими и атипичными формами коклюша, серотип 1.2.3 - от ранее непривитых, больных с тяжелыми и среднетяжелыми формами, что согласуется с результатами исследований некоторых российских авторов [111,113].

Молекулярное типирование изолятов B. pertussis, получаемых на территории нашей страны за период с начала массовой вакцинации по 2015 год, позволило выявить изменения в аллелях генов, так называемый «антигенный дрейф» [6,32,95,96,141]. При этом было зафиксировано 19 MAST2 типов, что свидетельствует о генетическом разнообразии популяции возбудителя коклюша, при этом в период 1948-1969 годы выявлена циркуляция только двух вариантов штаммов, а в период 2005-2015 число циркулирующих штаммов возросло до 17, при этом выявлено доминирование новых MAST2 типов 322 и 329, из которых тип 329 в настоящее время преобладает [14,32]. Современная популяция штаммов B. pertussis

характеризуется в основном так называемыми «невакцинными» аллелями генов, кодирующих факторы патогенности (коклюшный токсин, фимбриальные белки и пертактин) [32,83,133,153].

1.2. Распространенность и современные подходы к верификации случаев коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами.

Согласно данным государственного доклада за последние десятилетие на территории России показатель заболеваемости коклюшем характеризовался колебаниями от 0,76 на 100 тыс. населения в 2021 г. до 35,98 на 100 тыс. населения в 2023 г. [30,48].

В 2023 г. показатель заболеваемости составил 35,98 на 100 тысяч населения, что в 16,4 раз превысило уровень заболеваемости в 2022 г. и в 7,6 раз превысило среднемноголетний показатель [1,48]. За последние годы наблюдается тенденция роста случаев коклюша и заболеваний, обусловленных другими бордетеллами, что связано с накоплением неиммунной (восприимчивой) прослойки популяции и с улучшением выявления заболевших коклюшем, в том числе с легкими и средней тяжести формами заболевания. Так, в 2023 году в структуре форм клинического течения коклюша преобладали легкие формы - 40,6 %, что существенно выше, чем в год предыдущего циклического подъёма (2019 г.) - 29,5 %; доля среднетяжелых, тяжелых и типичных форм клинического течения составляла в 2023 году 48,1%, 0,4% и 2,0% соответственно [1,48,121]. Частое лабораторное подтверждение коклюша связано с широким применением некультуральных методов, которые ранее практически не применялись [87, 114].

Летальные случаи коклюша (10 случаев) зарегистрированы среди непривитых детей младше 1 года [48,125]. В 26 субъектах показатель заболеваемости превышает среднероссийский показатель. [48]. 83% заболевших коклюшем приходится на детей в возрастной группе до 14 лет, заболеваемость подростков от 15 до 17 лет составила 10,4 %, взрослых - 7%

[119,128]. На протяжении более 10 лет заболеваемость детей в возрасте до 1 года статистически значимо превышала заболеваемость детей других возрастных групп, а в 2023 году показатель заболеваемости коклюшем в этой когорте увеличился по сравнению с прошлым годом в 13,8 раз (в 2022 г. этот показатель составлял 34,5 на 100 тысяч детей данного возраста, в 2021 году -5,1) [156,157].

В Самарской области за период 2023 г. наблюдается резкий рост заболеваемости коклюшем населения, по итогам 2023 года в регионе зарегистрировано 747 случаев коклюша на 28 из 37 административных территорий области (75,7%), показатель заболеваемости на 100 тысяч населения составил 23,9; показатель заболеваемости коклюшем в Самарской области выше среднемноголетнего (5,9) на 305,08% [49]. Среднемноголетний показатель рассчитывался за исключением 2020 и 2021 гг. так как из-за пандемии COVID-19 они считаются непоказательными. Анализ многолетней динамики заболеваемости коклюшем свидетельствует о смене периодов подъема и спада заболеваемости каждый 3-4 года [48,49].

В Самарской области за последние 10 лет заболеваемость коклюшем колеблется в пределах 0,1 на 100 тыс. нас. в 2022 году до 23,9 на 100 тыс. населения в 2023 году, а с 2019 года регистрировались только легкие, среднетяжелые формы коклюша, независимо от прививочного анамнеза и возраста заболевших [2].

По данным научных публикаций, имеет место крайне неравномерное распределение заболеваемости по территории страны; одной из причин этого могут быть различные подходы к лабораторной диагностике коклюша [92,94]. В последнее десятилетие уровень подтверждения диагноза составляет не более 10-20 % [44-46]. Бактериологический метод, de jure остающийся «золотым стандартом», на практике сталкивается с проблемой нестабильности качества расходных материалов и их вариабельностью, что существенно снижает чувствительность метода [110]. Отсутствие бактериальной диагностики длительно кашляющих (более 3-7 дней) приводит

к низкому проценту высеваемости возбудителя у детей на поздних сроках обследования, а также после продолжительного лечения антибактериальными препаратами [44-46]. Бактериологическое подтверждение диагноза коклюша по отдельным регионам России составляет всего от 10 до 36% [68].

Более 90 % случаев коклюша приходится также на детское население [100]. Рост заболеваемости коклюшем в РФ и в Самарской области наблюдается на фоне высокого охвата населения прививками [48,49].

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Видманова Мария Владимировна, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Анализ лабораторной диагностики коклюшной инфекции в России в 2023 году / О. Ю. Борисова, И Ю Андриевская, Н Т Гадуа [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика - 2024 - Т 69, № 10 - С 548-555 - DOI 10.51620/0869-2084-2024-69-10-548-555 - EDN FKPOQQ.

2. Андриевская, И Ю Характеристика популяции B pertussis, циркулирующей на территории Российской Федерации в 2018 - 2024 гг.: специальность 1.5.11 «Микробиология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата биологических наук / Андриевская Ирина Юрьевна, 2025 - 143 с.

3. Бабаченко, И В Клинико-лабораторные особенности коклюша у детей разных возрастных групп / И В Бабаченко, Ю В Нестерова, Н В Скрипченко // Педиатрия Журнал им Г.Н Сперанского - 2020 - Т 99, № 6 - С 98-104 - DOI 10.24110/0031-403X-2020-99-6-98-104 - EDN FWLTVB

4. Бабаченко, И.В Коклюш у детей / И.В. Бабаченко, С.М Харит, Н.Н. Курова, Г.Я. Ценева - М.: Комментарий, 2014 - 176 с.

5. Басов, А.А Проблема коклюша в некоторых регионах мира / А А Басов, О В. Цвиркун, А Г Герасимова, А. Х Зекореева // Инфекция и иммунитет -2019 - Т 9, № 2 - С 354-362.

6. Басов, А.А Характеристика эпидемического процесса коклюшной инфекции в Архангельской области на фоне высокого охвата вакцинацией / А А Басов, Е В Байдакова, О В Цвиркун, О Н Дурягина, О Н Попова, А Б Гудков // Вятский медицинский вестник - 2020 - № 3(67) - С 4-9.

7. Борисова, А Б Молекулярно-генетическая диагностика и клинические особенности заболеваний, вызываемых представителями рода Bordetella : специальность 03.02.03 «Микробиология», 14.01.09 «Инфекционные болезни» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Борисова Анастасия Борисовна, 2021 - 166 с - EDN AYEBCI.

8. Вакцина для профилактики дифтерии, столбняка, коклюша, полиомиелита и инфекции, вызываемой Haemophilus influenzae тип b, лиофилизат для приготовления суспензии для внутримышечного введения в комплекте с суспензией для внутримышечного введения Фармакопейная статья от 11.04.2022 N ФС.3.3.0006.22

9. Вакцина коклюшно-дифтерийно-столбнячная адсорбированная (АКДС-вакцина) Фармакопейная статья от 31.10.2018 N ФС.3.3.1.0010.15;

10.Видманова, М.В Мониторинг поствакцинального иммунитета к коклюшу в Самарской области методом ИФА / М В Видманова, О Н Оверченко, Т В Вандышева, В Г Щелокова // Проблемы медицинской микологии - 2019 - Т 21, № 2 - С 51.

11.Видманова, М В Современные лабораторные методы для лабораторной диагностики коклюша в клинической практике / М В Видманова, А В Жестков // Актуальные вопросы экспериментальной микробиологии: теория, методология, практика, инноватика : Материалы Международной научно-практической конференции, посвященной 85 -летию основания кафедры микробиологии, вирусологии, иммунологии и 100-летию со дня рождения профессора Людвиги Микртычевны Закарян, Курск, 19 мая 2022 года - Курск: Курский государственный медицинский университет, 2022 - С 49-52 - EDNILIMBE.

12. Видманова, М В Централизованный подход к лабораторному подтверждению атипичного коклюша в Самарской области / М В Видманова // 100-летие Пермского медицинского журнала : Материалы конференции с международным участием, посвященной 100-летию «Пермского медицинского журнала», Пермь, 23 сентября 2023 года -Пермь: Пермский национальный исследовательский политехнический университет, 2023 - С 72-76 - EDN VEZMHR.

13.Гаврилова, О А Специфическая лабораторная диагностика коклюша у детей / О. А. Гаврилова, А А Астапов // Лабораторная диагностика Восточная Европа - 2019 - Т 8, № 3 - С 404-412 - EDN IPGVXJ.

14.Гадуа, Н.Т Выявление Bordetella holmesii среди больных, госпитализированных в стационар с подозрением на коклюш или коклюшеподобные заболевания / Н Т Гадуа, А Б Борисова, А С Пименова, О Ю Борисова, М С Петрова, О В Шамшева, С С Афанасьев, Л И Кафарская, Е В Власов, М С Афанасьев, А В Алешкин, С В Бунин, В А Алешкин // Журнал инфектологии - 2019 - Т 11, № 1, S1 - С 45-52.

15.Грудина, В В Анализ течения коклюша у детей до 14 лет города Архангельска за период 2005-2015гг / В В Грудина, О. С. Шерстобитова // Бюллетень Северного государственного медицинского университета -2018 - № 1(40) - С 215-216 - EDN YOIFMT.

16.Егорова, О А Коклюш у взрослых / О. А. Егорова // Forcipe - 2021 - Т 4, № S1 - С 356 - EDN BMVVPF.

17.Елькина, М.А Роль и место молекулярно-генетических методов в диагностике и эпидемиологическом надзоре за коклюшем и дифтерией / М А Елькина, С Б Яцышина // Молекулярная диагностика 2018 Сборник трудов конференции (Минск, 27-28 сентября 2018 г.) / под ред Акад РАН В.И Покровского - Минск: СтройМедиаПроект, 2018 - С 134-136.

18.Иммуногенность коклюшной суспензии и цельноклеточного коклюшного компонента комбинированных вакцин Общая фармакопейная статья от 31.10.2018 N ОФС.1.7.2.0005.15.

19.Инструкция по бактериологическому и серологическому исследованиям при коклюше и паракоклюше (для бактериологических лабораторий санитарно-эпидемиологических станций и больниц) Инструкция Минздрава СССР от 01.01.1984 г.

20.Инструкция по применению набора реагентов для выявления и дифференциации ДНК возбудителей коклюша (Bordetella pertussis), паракоклюша (Bordetella parapertussis) и бронхисептикоза (Bordetella bronchiseptica) в биологическом материале методом полимеразной цепной реакции (ПЦР) с гибридизационно-флуоресцентной детекцией

«АмплиСенс Bordetella multi-FL», утв. Приказом Росздравнадзора 11.04.2012 №1715-Пр/12.

21.Иозефович О.В., Харит С.М Частота коклюша в структуре заболеваний детей с кашлем более 2-х недель, ранее полностью привитых Санкт-Петербург, Россия 20-21 мая 2020 г VI конгресс ЕВРО-АЗИАТСКИЙ ЖУРНАЛ ИНФЕКТОЛОГИИ Том 12, № 2, 2020 ПРИЛОЖЕНИЕ 1 С.59.

22.Исматуллин, Д Д Оптимизация микробиологической диагностики инфекционных осложнений, вызванных нетуберкулезными микобактериями, у пациентов с муковисцидозом специальность 03.02.03 «Микробиология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Исматуллин Данир Дамирович, 2022 - 160 с - EDN FBOMII.

23.Картакаева, С С Изучение биологических свойств бактерий вида Bordetella avium / С. С. Картакаева, А В Мастиленко // Естественные и технические науки - 2023 - № 4(179) - С 43-53 - EDN SWNSMX.

24. Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям больным коклюшем Введены впервые 2013 - 73 с

25.Коклюш - одна из самых важных медико-социальных проблем современности // Практика педиатра - 2018 - № 2 - С 8-9.

26.Коклюш у детей - клинико-эпидемическая характеристика в Самарской области / Е С Гасилина, С М Китайчик, И А Горелова [и др.] // Журнал инфектологии - 2018 - Т 10, № 3 - С 54-60 - DOI 10.22625/2072-67322018-10-3-54-60 - EDN YOQYYP.

27.Колодкина, В Л Содержание ДНК Bordetella pertussis в носоглоточных мазках детей и взрослых, позитивных в ПЦР реального времени / В Л Колодкина, В С Мартынов // Медицинский журнал - 2017 - № 1 (59) - С 70-73.

28. Кондратенко, О В Комплексный подход к микробиологической диагностике бактериальных осложнений при муковисцидозе : специальность 03.02.03 «Микробиология» : диссертация на соискание

ученой степени доктора медицинских наук / Кондратенко Ольга Владимировна - Самара, 2020 - 264 с - БЭК ТОЬК2!

29.Красилова Е.В., Мацакова Д.В., Башкина О.А., Продеус А.П., Кокуев А.В., Симбирцев А.С Структура длительного кашля у детей по данным отделения аллергологии ГБУЗ АО «ОДКБ имени Н.Н Силищевой» Астрахань 20-21 мая 2020 г VI конгресс ЕВРО-АЗИАТСКИЙ Журнал Инфектологии Том 12, № 2, 2020 ПРИЛОЖЕНИЕ 1 С.71.

30.Кузнецова, А А Сравнительный анализ заболеваемости населения регионов Приволжского федерального округа коклюшем в период с 2018 по 2023 годы / А А Кузнецова, И Д Тупиев // Вестник Башкирского государственного медицинского университета - 2023 - № 6 - С 44-48 -БЭК 1Х881У.

31.Литусов Н.В Возбудители коклюша и паракоклюша Иллюстрированное учебно-методическое пособие - Екатеринбург: Изд-во УГМА, 2013 - 32 с.

32.Ломоносова, А В Эпидемиологические особенности и основные направления надзора и профилактики коклюша на современном этапе : специальность 14.02.02 «Эпидемиология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Ломоносова Алена Вячеславовна, 2021 - 201 с - БЭК ОМиХОЛ.

33. Лямин, А В Новые подходы к культивированию и идентификации кислотоустойчивых представителей порядка Actinomycetales, выделенных из клинического материала : диссертация специальность 03.02.03 «Микробиология» : диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук / Лямин Артем Викторович, 2020 - 234 с.

34.Марии П.Р., Шей И.Р Клиническая микробиология Краткое руководство: Пер с англ - М.:Мир, 2006 - 425 с., ил.

35.Мастиленко, А В Разработка системы детекции бактерий рода Bordetella / А В Мастиленко, М И Матюнина, Д В Батяйкина // Вестник науки - 2023 - Т 5, № 10(67) - С 721-730 - EDN IURNAM.

36.Международная статистическая классификация болезней и проблем, связанных со здоровьем Одиннадцатый пересмотр (МКБ -11)

37.МР 3.1.2.0072-13 Диагностика коклюша и паракоклюша Методические рекомендации от 24.05.2013 N 3.1.2.0072-13

38.МУ 3.1.2.2160-07 Эпидемиологический надзор за коклюшной инфекцией Методические указания от 12.02.2007 N 3.1.2.2160-07.

39. МУ 3.1.2943-11 Организация и проведение серологического мониторинга состояния коллективного иммунитета к инфекциям, управляемым средствами специфической профилактики (дифтерия, столбняк, коклюш, корь, краснуха, эпидемический паротит, полиомиелит, гепатит В) Методические указания от 15.07.2011 N 3.1.2943-11.

40.МУК 4.2.2317-08 Отбор, проверка и хранение производственных штаммов коклюшных, паракоклюшных и бронхисептикозных бактерий Методические указания по методам контроля от 18.01.2008 N4.2.2317-08.

41.МУК 4.2.3701-21 Лабораторная диагностика коклюша и других заболеваний, обусловленных другими бордетеллами Методические указания по методам контроля от 01.09.2021 N 4.2.3701 -21

42.Немченко, Д С Выявление общих черт пользователей для рекомендательной системы на примере коэффициента сходства Жаккара / Д С Немченко // Вестник магистратуры - 2023 - № 3-1(138) - С 14-15 -EDN IWTCBX.

43.Нестерова Ю.В., Бабаченко И.В ХАРАКТЕРИСТИКА СЕМЕЙНЫХ ОЧАГОВ КОКЛЮША 20-21 мая 2020 г VI конгресс ЕВРО-АЗИАТСКИЙ ЖУРНАЛ ИНФЕКТОЛОГИИ Том 12, № 2, 2020 ПРИЛОЖЕНИЕ 1 С.90-91.

44. О результатах проведения внешнего контроля качества исследований по бактериологической диагностике дифтерии и коклюша и серологической диагностике дифтерии в Российской Федерации в 2016 году Письмо Роспотребнадзора от 17.11.2016 N 01/15395-16-27

45. О результатах проведения внешнего контроля качества исследований по бактериологической диагностике дифтерии и коклюша и серологической диагностике дифтерии в Российской Федерации в 2018 году Письмо Роспотребнадзора от 12.11.2018 N 01/14710-2018-27.

46. О результатах проведения внешнего контроля качества исследований по диагностике коклюша и качества питательных сред в Российской Федерации Письмо Роспотребнадзора от 29.02.2016 N 01/2360-16-27

47.О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2019 году: государственный доклад - М : Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2020 - 299 с.

48.О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2023 году: Государственный доклад Москва: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека, 2024 - 364 с.

49. О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Самарской области в 2019 году: государственный доклад / Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Самарской области, ФБУЗ «Центр гигиены и эпидемиологии в Самарской области» - Самара : Управление Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека по Самарской области, 2020 - 200 с.

50. Об утверждении критериев оценки качества медицинской помощи Приказ Минздрава России от 10.05.2017 N 203н Зарегистрирован в Министерстве юстиции Российской Федерации 17.05.2017 N 46740.

51.Оценка факторов сердечно-сосудистого риска и других показателей у коморбидных пациентов с инфарктом миокарда с подъемом сегмента ST и их влияния на выживаемость / А А Гильманов, С Д Маянская, А Ф Усманова, И Р Искандаров // Практическая медицина - 2025 - Т 23, № 4 -С 65-72 - 001 10.32000/2072-1757-2025-4-65-72 - БЭК ТРОООБ.

52.Пименова, А.С Применение метода ПЦР для видовой идентификации возбудителя коклюша в Российской Федерации / А С Пименова, А Б Борисова, Н Т Гадуа, О Ю Борисова, С С Афанасьев, М С Петрова, М С Афанасьев, А Ю Миронов, В А Алешкин // Клиническая лабораторная диагностика - 2021 - Т 66, № 1 - С 52-58.

53.Пименова, А С Совершенствование молекулярно-генетических методов лабораторной диагностики дифтерии и коклюша : специальность 03.02.03 "Микробиология" : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Пименова Алена Сергеевна, 2018 - 176 с - БЭК КМШОг.

54.Платонова, Т А Система биологической безопасности персонала медицинских организаций в условиях высоких биологических рисков, связанных с новой коронавирусной инфекцией, и ее совершенствование : специальность 3.2.2 «Эпидемиология» : диссертация на соискание ученой степени доктора медицинских наук / Платонова Татьяна Александровна, 20215 - 247 с.

55. Побежимова, О О Иммунологические и микробиологические аспекты атопического дерматита у подростков специальность 3.2.7 «Иммунология» 1.5.11 «Микробиология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Побежимова Ольга Олеговна, 2025 - 180 с.

56.Прадед, М Н ПЦР в алгоритме диагностики коклюшной и паракоклюшной инфекции / М Н Прадед, С Б Яцышина, С В Малинина // Лабораторная служба - 2016 - Т 5, № 3 - С 55-56.

57.Прибылов, В С Оценка эффективности фармакотерапии комбинированными гипотензивными препаратами у больных ишемической болезнью сердца с коморбидной патологией после коронарного стентирования : специальность 3.3.6 «Фармакология, клиническая фармакология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Прибылов Владислав Сергеевич, 2025 - 131 с.

58.Пруцкова, Е В Состояние специфического иммунитета против коклюша у подростков организованных коллективов : специальность 3.1.21 «Педиатрия», 3.2.7 «Аллергология и иммунология» : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Пруцкова Екатерина Владимировна, 2025 - 112 с

59.Распространенность стертых форм коклюша и анализ фазовых состояний бактерий bordetella pertussis / А Ю Медкова, Ю С Аляпкина, Л Н Синяшина [и др.] // Детские инфекции - 2010 - Т 9, № 4 - С 19-22 - EDN NBVVXP.

60.Романенко, Т А Системный анализ современного эпидемического процесса коклюша и совершенствование эпидемического надзора : автореф дис ... д-ра мед наук / Т А Романенко - Донецк, 2012 - 29 с.

61.Романов В.А., Духанина И.В., Афанасьев А.В., Гульнева М.Ю., Семечкин Н.В Особенности микробиоты носовой полости у лиц, переболевших Covid-19 Астраханский медицинский журнал 2023;18(4):97-102 https://doi.org/10.17021/1992-6499-2023-4-97-102

62.Частная медицинская микробиология с техникой микробиологических исследований / А С Лабинская, А С Анкирская, М В Бадлеева [и др.] - 5-е издание, стереотипное - Санкт-Петербург : Издательство "Лань", 2022 -608 с - (Среднее профессиональное образование) - ISBN 978-5-50744780-0 - EDN FJENSW.

63.Самодова, О В Оценка гуморального иммунитета к некоторым вакциноконтролируемым инфекциям у медицинских работников

инфекционных стационаров / О В Самодова, Е А Кригер, Н Л Рогушина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика - 2022 - Т 21, № 4 - С 37-47 -Э01 10.31631/2073-3046-2022-21-4-37-47 - БЭК ЛиУОУи.

64. Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.2.3162-14 «Профилактика коклюша», утверждены постановлением главного государственного санитарного врача Российской Федерации от 17.03.2014 № 9 // Главная медицинская сестра - 2014 - № 12 - С 101-117.

65. Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней (с изменениями на 25 мая 2022 года) Постановление Главного государственного санитарного врача РФ от 28.01.2021 эпидемиологические правила и нормативы от 28.01.2021 N Зарегистрирован в Министерстве юстиции РФ 15.02.2021 N 62500

66.Скирда, Т.А Сравнительное исследование сывороток крови больных коклюшем в ИФА-тест системах / Т А Скирда, О Ю Борисова, М С Петрова, А С Пименова, И С Воронова, Н Т Гадуа, С Ю Комбарова, В А Алешкин, М В Базарова, С В Бунин, А Б Борисова, О В Шамшева // Инфекционные болезни в современном мире: эволюция, текущие и будущие угрозы: мат-лы X ежегодного Всероссийского конгресса по инфекционным болезням с международным участием (Москва, 26-28 февраля 2018 г.) / под ред В И Покровского - М : Медицинское маркетинговое агентство, 2018 - С 206.

67. Современный подход к диагностике коклюша: опыт Самарской области / Видманова М.В., Жестков А.В., Лямин А.В., Кондратенко О.В., Оверченко О.Н., Большакова Л.Н., Железнова Е.А // Астраханский медицинский журнал 2021 Т 16, № 4 С 6-13.

68.Состояние лабораторной диагностики коклюшной инфекции в Российской Федерации / О Ю Борисова, А С Пименова, Н Т Гадуа [и др.] // Научное обеспечение противоэпидемической защиты населения: актуальные проблемы и решения : Сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным

участием, посвященной 100-летию ФБУН ННИИЭМ им.академика И.Н Блохиной Роспотребнадзора, Нижний Новгород, 11-12 сентября 2019 года - Нижний Новгород: Ремедиум Приволжье, 2019 - С 41-43 - EDN NBVMKY.

69.Субботина, К.А Эпидемиологическое обоснование к изменению стратегии и тактики специфической профилактики коклюша в современных условиях / К А Субботина, И В Фельдблюм, Е А Кочергина, Н А Лехтина // Эпидемиология и вакцинопрофилактика - 2019 - Т 18, № 2 - С 27-33.

70.Тюкавкина С.Ю Коклюш: эпидемиология, биологические свойства Bordetella pertussis, принципы лабораторной диагностики и специфической профилактики /Тюкавкина С.Ю., Харсеева Г.Г / Эпидемиология и инфекционные болезни, Т 19, № 4, 2014

71.Чемисова О.С., Мазрухо А.Б., Харабаджахян Г.Д., Савельева И.К., Санамянц Е.М., Сагакянц М.М., Каминский Д.И., Ульрих Е.П ОЦЕНКА ДИАГНОСТИЧЕСКОЙ ЭФФЕКТИВНОСТИ НОВОЙ ПИТАТЕЛЬНОЙ СРЕДЫ ДЛЯ ВЫДЕЛЕНИЯ И ПЕРВИЧНОЙ ИДЕНТИФИКАЦИИ ПАРАГЕМОЛИТИЧЕСКИХ ВИБРИОНОВ Астраханский медицинский журнал 2021;16(2):62-70 https://doi.Org/10.17021/2021.16.2.62.70

72.Шилова, М А Эпидемический процесс коклюша через 60 лет от начала специфической профилактики / М А Шилова, И А Раевская, Г Н Чистенко // Медико-биологические, клинические и социальные вопросы здоровья и патологии человека : мат-лы III Всероссийской образовательно-научной конференции студентов и молодых ученых с международным участием в рамках XIII областного фестиваля «Молодые ученые - развитию Ивановской области» (Иваново, 10-14 апреля 2017 г.) / под ред И.К Томиловой, А.В Шишовой, Е.С Тихоновой - Иваново: Ивановская государственная медицинская академия, 2017 - С 333-334.

73.Шулятникова, О А Оценка вклада симбиотических отношений микроорганизмов ротовой полости в развитие воспалительных изменений слизистой оболочки рта при полном отсутствии зубов / О А Шулятникова, М В Яковлев, А П Годовалов // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии - 2024 - Т 101, № 4 - С 512-519 - DOI 10.36233/03729311-524 - EDNIOEEGB.

74.Эффективность метода ПЦР-РВ для этиологической диагностики атипичных форм коклюша / А Ю Медкова, Е Г Семин, Л Н Синяшина [и др.] // Детские инфекции - 2022 - Т 21, № 4(81) - С 37-42 - DOI 10.22627/2072-8107-2022-21-4-37-42 - EDN PMHFOY.

75.Якимова, Т Н Эпидемиологический надзор за дифтерией в России в период регистрации единичных случаев заболевания : специальность 14.02.02 "Эпидемиология" : диссертация на соискание ученой степени кандидата медицинских наук / Якимова Татьяна Николаевна, 2016 - 191 с - EDN INIVEQ.

76.Alghounaim M, Alsaffar Z, Alfraij A, Bin-Hasan S, Hussain E Whole-Cell and Acellular Pertussis Vaccine: Reflections on Efficacy Med Princ Pract 2022;31(4):313-321 doi: 10.1159/000525468 Epub 2022 Jun 13 PMID: 35696990; PMCID: PMC9485965.

77.Alvarez Hayes J, Oviedo JM, Valdez H, Laborde JM, Maschi F, Ayala M, Shah R, Fernandez Lahore M, Rodriguez ME A recombinant iron transport protein from Bordetella pertussis confers protection against Bordetella parapertussis Microbiol Immunol 2017 Oct;61(10):407-415 doi: 10.1111/1348-0421.12532 Epub 2017 Sep 26 PMID: 28857261.

78.Bagordo F, Grassi T, Savio M, Rota MC, Baldovin T, Vicentini C, Napolitano F, Trombetta CM, Gabutti G, Seroepidemiological Study Group Assessment of Pertussis Underreporting in Italy J Clin Med 2023 Feb 21;12(5): 1732 doi: 10.3390/jcm12051732 PMID: 36902519; PMCID: PMC10003430.

79.Barkoff AM, Knuutila A, Mertsola J, He Q Evaluation of Anti-PT Antibody Response after Pertussis Vaccination and Infection: The Importance of Both

Quantity and Quality Toxins (Basel) 2021 Jul 21;13(8):508 doi: 10.3390/toxins13080508 PMID: 34437379; PMCID: PMC8402585.

80.Belcher T, Preston A Bordetella pertussis evolution in the (functional) genomics era Pathog Dis 2015 Nov;73(8):ftv064 doi: 10.1093/femspd/ftv064 Epub 2015 Aug 21 PMID: 26297914; PMCID: PMC4626590.

81.Bouchez V, Guiso N Bordetella pertussis, B parapertussis, vaccines and cycles of whooping cough Pathog Dis 2015 0ct;73(7):ftv055 doi: 10.1093/femspd/ftv055 Epub 2015 Aug 4 PMID: 26242280.

82.Calvert A, Amirthalingam G, Andrews N, Basude S, Coleman M, Cuthbertson H, England A, Greening V, Hallis B, Johnstone E, Jones CE, Karampatsas K, Khalil A, Le Doare K, Matheson M, Peregrine E, Snape MD, Vatish M, Heath PT; OpTIMUM Study Group Optimising the timing of whooping cough immunisation in mums (OpTIMUM) through investigating pertussis vaccination in pregnancy: an open-label, equivalence, randomised controlled trial Lancet Microbe 2023 May;4(5):e300-e308 doi: 10.1016/S2666-5247(22)00332-9 Epub 2023 Apr 17 PMID: 37080224.

83.Cattelan N, Dubey P, Arnal L, Yantorno OM, Deora R Bordetella biofilms: a lifestyle leading to persistent infections Pathog Dis 2016 Feb;74(1):ftv108 doi: 10.1093/femspd/ftv108 Epub 2015 Nov 19 PMID: 26586694; PMCID: PMC4830220.

84.Chen XF, Hou X, Xiao M, Zhang L, Cheng JW, Zhou ML, Huang JJ, Zhang JJ, Xu YC, Hsueh PR Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) Analysis for the Identification of Pathogenic Microorganisms: A Review Microorganisms 2021 Jul 19;9(7):1536 doi: 10.3390/microorganisms9071536 PMID: 34361971; PMCID: PMC8304613.

85.Cherry JD Pertussis in Young Infants Throughout the World Clin Infect Dis 2016 Dec 1 ;63(suppl 4):S119-S122 doi: 10.1093/cid/ciw550 PMID: 27838663; PMCID: PMC5106622.

86.Chitkara AJ, Pujadas Ferrer M, Forsyth K, Guiso N, Heininger U, Hozbor DF, Muloiwa R, Tan TQ, Thisyakorn U, Wirsing von König CH Pertussis vaccination in mixed markets: Recommendations from the Global Pertussis Initiative Int J Infect Dis 2020 Jul;96:482-488 doi: 10.1016/j.ijid.2020.04.081 Epub 2020 May 12 PMID: 32413606.

87.Comparative genomics of Bordetella pertussis isolates from New Zealand, a country with an uncommonly high incidence of whooping cough / N Ring, A Preston, S Bagby [et al.] // Microbial Genomics - 2022 - Vol 8, No 1 - P 000756 - DOI 10.1099/mgen.0.000756 - EDN NMEDXO.

88.Curran T, Coyle PV Understanding the true burden and infection dynamics of Bordetella pertussis using molecular diagnostics J Infect 2016 Apr;72(4):504-5 doi: 10.1016/j.jinf.2016.01.006 Epub 2016 Jan 27 PMID: 26826519.

89.De Graaf H, Ibrahim M, Hill AR, Gbesemete D, Vaughan AT, Gorringe A, Preston A, Buisman AM, Faust SN, Kester KE, Berbers GAM, Diavatopoulos DA, Read RC Controlled Human Infection With Bordetella pertussis Induces Asymptomatic, Immunizing Colonization Clin Infect Dis 2020 Jul 11;71(2):403-411 doi: 10.1093/cid/ciz840 PMID: 31562530; PMCID: PMC7353841.

90.Dewan KK, Linz B, DeRocco SE, Harvill ET Acellular Pertussis Vaccine Components: Today and Tomorrow Vaccines (Basel) 2020 May 13;8(2):217 doi: 10.3390/vaccines8020217 PMID: 32414005; PMCID: PMC7349526.

91.Dou M, Sanchez J, Tavakoli H, Gonzalez JE, Sun J, Dien Bard J, Li X A low-cost microfluidic platform for rapid and instrument-free detection of whooping cough Anal Chim Acta 2019 Aug 13;1065:71-78 doi: 10.1016/j.aca.2019.03.001 Epub 2019 Mar 5 PMID: 31005153; PMCID: PMC6481316.

92.Drugs and Lactation Database (LactMed®) [Internet] Bethesda (MD): National Institute of Child Health and Human Development; 2006- Diphtheria-Tetanus-Pertussis Vaccines 2023 Sep 15 PMID: 29999632.

93.Elgarini M, Mennane Z, Sobh M, Hammoumi A Bordetella holmesii: Causative agent of pertussis Arch Pediatr 2024 Apr;31(3):172-175 doi: 10.1016/j.arcped.2023.10.012 Epub 2024 Mar 14 PMID: 38490892.

94.Erb ML, Erlanger TE, Heininger U Do fathers care about their own immunisation status? The Child-Parent-Immunisation Survey and a review of the literature Swiss Med Wkly 2020 Aug 2;150:w20289 doi: 10.4414/smw.2020.20289 PMID: 32799309.

95.Ernst K Novel Strategies to Inhibit Pertussis Toxin Toxins (Basel) 2022 Mar 3;14(3):187 doi: 10.3390/toxins14030187 PMID: 35324684; PMCID: PMC8951090.

96.Esposito S, Principi N Prevention of pertussis: An unresolved problem Hum Vaccin Immunother 2018;14(10):2452-2459 doi: 10.1080/21645515.2018.1480298 Epub 2018 Jul 24 PMID: 29856680; PMCID: PMC6284497.

97.Fernández Vecilla D, Roche Matheus MP, Iglesias Hidalgo G, Unzaga Barañano MJ, Díaz de Tuesta Del Arco JL Neumonía asociada a derrame parapneumónico en paciente inmunocompetente causado por Bordetella bronchiseptica [Pneumonia associated with parapneumonic effusion in an immunocompetent patient caused by Bordetella bronchiseptica] Rev Esp Qnimioter 2023 Oct;36(5):533-535 Spanish doi: 10.37201/req/006.2023 Epub 2023 Jun 1 PMID: 37256910; PMCID: PMC10586747.

98.Ferronato AE, Gilio AE, Vieira SE Resppiratory viral infections in infants with clinically susppected pertussis J Pediatr (Rio J) 2013 Nov-Dec;89(6):549-53 doi: 10.1016/j.jped.2013.05.004 Epub 2013 Sep 13 PMID: 24035869.

99.Fong W, Timms V, Holmes N, Sintchenko V Detection and incidence of Bordetella holmesii in respiratory specimens from patients with pertussis-like symptoms in New South Wales, Australia Pathology 2018 Apr;50(3):322-326 doi: 10.1016/j.pathol.2017.10.014 Epub 2018 Feb 15 PMID: 29455870.

100. Gestal MC, Howard LK, Dewan KK, Harvill ET Bbvac: A Live Vaccine Candidate That Provides Long-Lasting Anamnestic and Th17-Mediated

Immunity against the Three Classical Bordetella spp mSphere 2022 Feb 23;7(1):e0089221 doi: 10.1128/msphere.00892-21 Epub 2022 Feb 23 PMID: 35196124; PMCID: PMC8865921.

101. Intranasal sensitization model of alopecia areata using pertussis toxin as adjuvant / Yu Liu, Ja Freeborn, B Okeugo [et al.] // Frontiers in Immunology -2024 - Vol 15 - DOI 10.3389/fimmu.2024.1469424 - EDN YBFNII.

102. Grassi T, Bagordo F, Savio M, Rota MC, Vitale F, Arghittu A, Sticchi L, Gabutti G, On Behalf Of The Sero-Epidemiological Study Group Sero-Epidemiological Study of Bordetella pertussis Infection in the Italian General Population Vaccines (Basel) 2022 Dec 13;10(12):2130 Doi: 10.3390/vaccines10122130 PMID: 36560541; PMCID: PMC9782223.

103. Gregg KA, Merkel TJ Pertussis Toxin: A Key Component in Pertussis Vaccines? Toxins (Basel) 2019 Sep 21;11(10):557 Doi: 10.3390/toxins11100557 PMID: 31546599; PMCID: PMC6832755.

104. Guiso N, Berbers G, Fry NK, He Q, Riffelmann M, Wirsing von König CH; EU Pertstrain group What to do and what not to do in serological diagnosis of pertussis: recommendations from EU reference laboratories Eur J Clin Microbiol Infect Dis 2011 Mar;30(3):307-12 doi: 10.1007/s10096-010-1104-y Epub 2010 Nov 11 PMID: 21069406; PMCID: PMC3034915.

105. Guiso N Bordetella Adenylate Cyclase-Hemolysin Toxins Toxins (Basel) 2017 Sep 11;9(9):277 Doi: 10.3390/toxins9090277 PMID: 28892012; PMCID: PMC5618210.

106. Guiso N Bordetella pertussis: why is it still circulating? J Infect 2014 Jan;68 Suppl 1:S119-24 Doi: 10.1016/j.jinf.2013.09.022 Epub 2013 Oct 5 PMID: 24103807.

107. Gujju VR, Akram B, Shibib DR, McGhee MA, Drevets DA Bordetella bronchiseptica infections in patients with HIV/AIDS: A case report and review of the literature Medicine (Baltimore) 2021 Dec 23;100(51):e28244 doi: 10.1097/MD.0000000000028244 PMID: 34941094; PMCID: PMC8702113.

108. Hou TY, Chiang-Ni C, Teng SH Current status of MALDI-TOF mass spectrometry in clinical microbiology J Food Drug Anal 2019 Apr;27(2):404-414 Doi: 10.1016/j.jfda.2019.01.001 Epub 2019 Jan 31 PMID: 30987712; PMCID: PMC9296205.

109. Hughes MM, Englund JA, Kuypers J, Tielsch JM, Khatry SK, Shrestha L, LeClerq SC, Steinhoff M, Katz J Population-Based Pertussis Incidence and Risk Factors in Infants Less Than 6 Months in Nepal J Pediatric Infect Dis Soc 2017 Mar 1;6(1):33-39 Doi: 10.1093/jpids/piw079 PMID: 28073985; PMCID: PMC5907881.

110. Ivaska L, Barkoff AM, Mertsola J, He Q Macrolide Resistance in Bordetella pertussis: Current Situation and Future Challenges Antibiotics (Basel) 2022 Nov 7;11(11):1570 Doi: 10.3390/antibiotics11111570 PMID: 36358225; PMCID: PMC9686491.

111. Kapil P, Merkel TJ Pertussis vaccines and protective immunity Curr Opin Immunol 2019 Aug;59:72-78 Doi: 10.1016/j.coi.2019.03.006 Epub 2019 May 9 PMID: 31078081; PMCID: PMC6774807.

112. Kilgore PE, Salim AM, Zervos MJ, Schmitt HJ Pertussis: Microbiology, Disease, Treatment, and Prevention Clin Microbiol Rev 2016 Jul;29(3):449-86 Doi: 10.1128/CMR.00083-15 PMID: 27029594; PMCID: PMC4861987.

113. Knuutila A, Dalby T, Ahvenainen N, Barkoff AM, J0rgensen CS, Fuursted K, Mertsola J, He Q Antibody avidity to pertussis toxin after acellular pertussis vaccination and infection Emerg Microbes Infect 2023 Dec;12(1):e2174782 Doi: 10.1080/22221751.2023.2174782 PMID: 36715361; PMCID: PMC9936998.

114. Knuutila A, Dalby T, Barkoff AM, J0rgensen CS, Fuursted K, Mertsola J, Markey K, He Q Differences in epitope-specific antibodies to pertussis toxin after infection and acellular vaccinations Clin Transl Immunology 2020 Aug 2;9(8):e1161 Doi: 10.1002/cti2.1161 PMID: 32765879; PMCID: PMC7396262.

115. Kurova, N.A cross-sectional study of Bordetella pertussis seroprevalence and estimated duration of vaccine protection against pertussis in St Petersburg, Russia / N Kurova, E.V Timofeeva, N Guiso, D Macina // Vaccine 2018 № 36 (52) С 7936—7942.

116. Laboratory Manual for the diagnosis of whooping cough caused by Bordetella pertussis / Bordetella parapertussis: update 2014 World Health Organization -Режим доступа: https://www.who.int/publications/i/item/WHO-IVB-14.03, свободный -Заглавие с экрана - Яз Англ - Дата обращения: 21.03.2021.

117. Lauria AM, Zabbo CP Pertussis 2022 Oct 7 In: StatPearls [Internet] Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan- PMID: 30085550.

118. Lee AD, Cassiday PK, Pawloski LC, Tatti KM, Martin MD, Briere EC, Tondella ML, Martin SW; Clinical Validation Study Group Clinical evaluation andvalidation of laboratory methods for the diagnosis of Bordetella pertussis infection: Culture, polymerase chain reaction (PCR) and anti-pertussis toxin IgGserology (IgG-PT) PLoS One 2018 Apr 13;13(4):e0195979 doi: 10.1371/journal.pone.0195979 PMID: 29652945; PMCID: PMC5898745.

119. Li J, Liu L, Zhang H, Guo J, Wei X, Xue M, Ma X Severe problem of macrolides resistance to common pathogens in China Front Cell Infect Microbiol 2023 Aug 10;13:1181633 Doi: 10.3389/fcimb.2023.1181633 PMID: 37637457; PMCID: PMC10448830.

120. Liko J, Robison SG, Cieslak PR Do Pertussis Vaccines Protect Against Bordetella parapertussis? Clin Infect Dis 2017 Jun 15;64(12):1795-1797 Doi: 10.1093/cid/cix221 PMID: 28369240.

121. Lin X, Zou J, Yao K, Li L, Zhong L Analysis of antibiotic sensitivity and resistance genes of Bordetella pertussis in Chinese children Medicine (Baltimore) 2021 Jan 15;100(2):e24090 doi: 10.1097/MD.0000000000024090 PMID: 33466172.

122. Locht C, Antoine R The History of Pertussis Toxin Toxins (Basel) 2021 Sep 5;13(9):623 Doi: 10.3390/toxins13090623 PMID: 34564627; PMCID: PMC8472871.

123. Long-Term Analysis of Pertussis Vaccine Immunity to Identify Potential Markers of Vaccine-Induced Memory Associated With Whole Cell But Not Acellular Pertussis Immunization in Mice / K L Weaver, C B Blackwood, A M Horspool [et al.] // Frontiers in Immunology - 2022 - Vol 13 - P 838504 - DOI 10.3389/fimmu.2022.838504 - EDN SUMARG.

124. Luna CM Impact of vaccination on the epidemiology and prognosis of pneumonia Rev Esp Quimioter 2022 Apr;35 Suppl 1(Suppl 1):104-110 Doi: 10.37201/req/s01.22.2022 Epub 2022 Apr 22 PMID: 35488837; PMCID: PMC9106193.

125. Martin Aispuro P, Bottero D, Zurita ME, Gaillard ME, Hozbor DF Impact of maternal whole-cell or acellular pertussis primary immunization on neonatal immune response Front Immunol 2023 Jun 26;14:1192119 Doi: 10.3389/fimmu.2023.1192119 PMID: 37435078; PMCID: PMC10330814.

126. Miguelena Chamorro B, De Luca K, Swaminathan G, Longet S, Mundt E, Paul S Bordetella bronchiseptica and Bordetella pertussis: Similarities and Differences in Infection, Immuno-Modulation, and Vaccine Considerations Clin Microbiol Rev 2023 Sep 21;36(3):e0016422 Doi: 10.1128/cmr.00164-22 Epub 2023 Jun 12 PMID: 37306571; PMCID: PMC10512794.

127. Missed pertussis diagnosis during co-infection with Bordetella holmesii / M De Lorenzi-Tognon, Ya Charretier, A Iten [et al.] // European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases - 2022 - Vol 41, No 10 - P 12271235 - DOI 10.1007/s10096-022-04488-3 - EDN HEHKNH.

128. Nash ZM, Cotter PA Bordetella Filamentous Hemagglutinin, a Model for the Two-Partner Secretion Pathway Microbiol Spectr 2019 Mar;7(2):10.1128/microbiolspec.PSIB-0024-2018 Doi: 10.1128/microbiolspec.PSIB-0024-2018 PMID: 30927348; PMCID: PMC6443250.

129. Nian X, Liu H, Cai M, Duan K, Yang X Coping Strategies for Pertussis Resurgence Vaccines (Basel) 2023 Apr 24;11(5):889 Doi: 10.3390/vaccines11050889 PMID: 37242993; PMCID: PMC10220650.

130. Nieves DJ, Heininger U Bordetella pertussis Microbiol Spectr 2016 Jun;4(3) Doi: 10.1128/microbiolspec.EI10-0008-2015 PMID: 27337481 Nieves DJ, Heininger U Bordetella pertussis Microbiol Spectr 2016 Jun;4(3) Doi: 10.1128/microbiolspec.EI10-0008-2015 PMID: 27337481.

131. Niinikoski V, Barkoff AM, Mertsola J, He Q Bordetella pertussis isolates in Finland after acellular vaccination: serotype change and biofilm formation Clin Microbiol Infect 2024 May;30(5):683.e1-683.e3 doi: 10.1016/j.cmi.2024.01.021 Epub 2024 Feb 2 PMID: 38310999.

132. Nunes MC, Soofie N, Downs S, Tebeila N, Mudau A, de Gouveia L, Madhi SA Comparing the Yield of Nasopharyngeal Swabs, Nasal Asppirates, and Induced Spputum for Detection of Bordetella pertussis in Hosppitalized Infants Clin Infect Dis 2016 Dec 1;63(suppl 4):S181-S186 doi: 10.1093/cid/ciw521 PMID: 27838671; PMCID: PMC5106614.

133. Otsuka N, Koide K, Goto M, Kamachi K, Kenri T Fim3-dependent autoagglutination of Bordetella pertussis Sci Rep 2023 May 10;13(1):7629 doi: 10.1038/s41598-023-34672-0 PMID: 37165008; PMCID: PMC10172299.

134. PeterVan den Steen, BrigitteCheuvart, QuentinDeraedt, LauraValdes Verelst & DashaShamarina(2023)Immunogenicity and safety of reduced-antigen tetanus, diphtheria and acellular pertussis vaccination in adults treated for obstructive airway diseases,Human Vaccines & Immunotherapeutics,19:1 ,DOI: 10.1080/21645515.2022.2159731

135. Pittet, L.F Bordetella holmesii: still emerging and elusive 20 years on / L.F Pittet, K.M Posfay-Barbe // Microbiology Sppectrum 2016 Vol 4, № 2 eI10-0003-2015

136. Rubin K, Glazer S The pertussis hypothesis: Bordetella pertussis colonization in the pathogenesis of Alzheimer's disease Immunobiology 2017

Feb;222(2):228-240 doi: 10.1016/j.imbio.2016.09.017 Epub 2016 Sep 28 PMID: 27692981.

137. Safarchi A, Saedi S, Tay CY, Lamichhane B, Nakhost Lotfi M, Shahcheraghi F Genome Characteristic of Bordetella parapertussis Isolated from Iran Curr Microbiol 2022 Sep 10;79(10):314 Doi: 10.1007/s00284-022-03009-x PMID: 36088519; PMCID: PMC9464130.

138. Schmitt P, Borkner L, Jazayeri SD, McCarthy KN, Mills KH Nasal vaccines for pertussis Curr Opin Immunol 2023 0ct;84:102355 Doi: 10.1016/j.coi.2023.102355 Epub 2023 Jun 10 PMID: 37307651.

139. Solans L, Locht C The Role of Mucosal Immunity in Pertussis Front Immunol 2019 Jan 14;9:3068 Doi: 10.3389/fimmu.2018.03068 PMID: 30692990; PMCID: PMC6339907.

140. Souder E, Long SS Pertussis in the Era of New Strains of Bordetella pertussis Infect Dis Clin North Am 2015 Dec;29(4):699-713 Doi: 10.1016/j.idc.2015.07.005 Epub 2015 Sep 1 PMID: 26337739.

141. Stevenson A, Roberts M Use of Bordetella bronchiseptica and Bordetella pertussis as live vaccines and vectors for heterologous antigens FEMS Immunol Med Microbiol 2003 Jul 15;37(2-3):121-8 doi: 10.1016/S0928-8244(03)00068-3 PMID: 12832115.

142. Sukumar N, Sloan GP, Conover MS, Love CF, Mattoo S, Kock ND, Deora R Cross-species protection mediated by a Bordetella bronchiseptica strain lacking antigenic homologs present in acellular pertussis vaccines Infect Immun 2010 May;78(5):2008-16 doi: 10.1128/IAI.01142-09 Epub 2010 Feb 22 PMID: 20176797; PMCID: PMC2863494.

143. Sun C, Xiao F, Fu J, Huang X, Jia N, Xu Z, Wang Y, Cui X LoopMediated Isothermal Amplification Coupled With Nanoparticle-Based Lateral Biosensor for Rapid, Sensitive, and Specific Detection of Bordetella pertussis Front Bioeng Biotechnol 2022 Feb 8;9:797957 doi: 10.33 89/fbioe.2021.797957 PMID: 35211469; PMCID: PMC8861531.

144. Szwejser-Zawislak E, Wilk MM, Piszczek P, Krawczyk J, Wilczynska D, Hozbor D Evaluation of Whole-Cell and Acellular Pertussis Vaccines in the Context of Long-Term Herd Immunity Vaccines (Basel) 2022 Dec 20;11(1): 1 doi: 10.3390/vaccines11010001 PMID: 36679846; PMCID: PMC9863224.

145. Talbird SE, Graham J, Mauskopf J, Masseria C, Krishnarajah G Impact of tetanus, diphtheria, and acellular pertussis (Tdap) vaccine use in wound management on health care costs and pertussis cases J Manag Care Spec Pharm 2015 Jan;21(1):88-99, 99a-c doi: 10.18553/jmcp.2015.21.1.88 PMID: 25562776; PMCID: PMC10397626.

146. Tessier E, Litt D, Ribeiro S, Abdul Aziz N, Campbell H, Amirthalingam G, Fry NK, Andrews N Mixture modelling of Bordetella pertussis serology samples to evaluate anti-pertussis toxin immunoglobulin G titre thresholds for positivity: England 2008-2022 J Med Microbiol 2023 Dec;72(12) doi: 10.1099/jmm.0.001774 PMID: 38047762.

147. Tessier E, Newport D, Tran A, Nash SG, Mensah AA, Yun Wang T, Shantikumar S, Campbell H, Amirthalingam G, Todkill D Pertussis immunisation strategies to optimise infant pertussis control: A narrative systematic review Vaccine 2023 Sep 22;41(41):5957-5964 doi: 10.1016/j.vaccine.2023.08.073 Epub 2023 Aug 30 PMID: 37658001.

148. Uzuriaga M, Leiva J, Guillén-Grima F, Rua M, Yuste JR Clinical Impact of Rapid Bacterial Microbiological Identification with the MALDI-TOF MS Antibiotics (Basel) 2023 Nov 25;12(12):1660 doi: 10.3390/antibiotics 12121660 PMID: 38136694; PMCID: PMC10740418.

149. Valero-Rello A, Henares D, Acosta L, Jane M, Jordan I, Godoy P, Muñoz-Almagro C Validation and Implementation of a Diagnostic Algorithm for DNA Detection of Bordetella pertussis, B parapertussis, and B holmesii in a Pediatric Referral Hospital in Barcelona, Spain J Clin Microbiol 2019 Jan 2;57(1):e01231-18 doi: 10.1128/JCM.01231-18 PMID: 30404946; PMCID: PMC6322476.

150. Valero-Rello, A Validation and Implementation of a Diagnostic Algorithm for DNA Detection of B pertussis, B parapertussis, and B holmesii in a Pediatric Referral Hosppital in Barcelona, Sppain / A Valero-Rello, D Henares, L Acosta, M Jane, I Jordan, P Godoy, C Munoz-Almagro // J Clin Microbiol 2019 № 2;57(1) e01231-18.

151. Vancraeynest E, Cattoir L, Van Vaerenbergh K, De Beenhouwer H, Vankeerberghen A, Boel A Bacteremia and complicated parapneumonic effusion caused by Bordetella holmesii in an elderly patient Acta Clin Belg 2021 Aug;76(4):307-309 doi: 10.1080/17843286.2020.1724448 Epub 2020 Feb 3 PMID: 32009598.

152. Viejo G, de la Iglesia P, Otero L, Blanco MI, Gomez B, De Miguel D, Del Valle A, De la Fuente B Bordetella bronchiseptica pleural infection in a patient with AIDS Scand J Infect Dis 2002;34(8):628-9 doi: 10.1080/00365540210147697 PMID: 12238585.

153. Wanlapakorn N, Maertens K, Vongpunsawad S, Puenpa J, Tran TMP, Hens N, Van Damme P, Thiriard A, Raze D, Locht C, Poovorawan Y, Leuridan E Quantity and Quality of Antibodies After Acellular Versus Whole-cell Pertussis Vaccines in Infants Born to Mothers Who Received Tetanus, Diphtheria, and Acellular Pertussis Vaccine During Pregnancy: A Randomized Trial Clin Infect Dis 2020 Jun 24;71(1):72-80 doi: 10.1093/cid/ciz778 PMID: 31418814.

154. Weyrich LS, Feaga HA, Park J, Muse SJ, Safi CY, Rolin OY, Young SE, HarvillET Resident microbiota affect Bordetella pertussis infectious dose and hostsppecificity J Infect Dis 2014 Mar;209(6):913-21 doi: 10.1093/infdis/j it597 Epub 2013 Nov 13 PMID: 24227794; PMCID: PMC3935476.

155. Yilmaz Çolak Ç, Tefon Öztürk BE Bordetella pertussis and outer membrane vesicles Pathog Glob Health 2023 Jun;117(4):342-355 doi: 10.1080/20477724.2022.2117937 Epub 2022 Sep 1 PMID: 36047634; PMCID: PMC10177744.

156. Zhang L, Prietsch SO, Axelsson I, Halperin SA Acellular vaccines for preventing whooping cough in children Cochrane Database Syst Rev 2014 Sep 17;2014(9):CD001478 doi: 10.1002/14651858.CD001478.pub6 PMID: 25228233; PMCID: PMC9722541.

157. Zheng Y, Correa-Silva S, Palmeira P, Carneiro-Sampaio M Maternal vaccination as an additional approach to improve the protection of the nursling: Anti-infective properties of breast milk Clinics (Sao Paulo) 2022 Aug 10;77:100093 doi: 10.1016/j.clinsp.2022.100093 PMID: 35963149; PMCID: PMC9382412.

158. Alghounaim M, Alsaffar Z, Alfraij A, Bin-Hasan S, Hussain E Whole-Cell and Acellular Pertussis Vaccine: Reflections on Efficacy Med Princ Pract 2022;31(4):313-321 doi: 10.1159/000525468 Epub 2022 Jun 13 PMID: 35696990; PMCID: PMC9485965.

СПИСОК НАУЧНЫХ ПУБЛИКАЦИЙ , В КОТОРЫХ ИЗЛОЖЕНЫ ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ ДИССЕРАЦИИ

1. Современный подход к диагностике коклюша в Самарской области / М.В. Видманова, Т.В. Вандышева, В.Г. Щелокова [и др.] // Инфекционные болезни в современном мире: эпидемиология, диагностика, лечение и профилактика: Сборник трудов XII Ежегодного Всероссийского интернет-конгресса по инфекционным болезням с международным участием, Москва, 07-09 сентября 2020 г. / Под ред. В.И. Покровского. - Москва: ООО "Медицинское Маркетинговое Агентство", 2020. - С. 48.

2. Современный подход к диагностике коклюша: опыт Самарской области / Видманова М.В., Жестков А.В., Лямин А.В., Кондратенко О.В., Оверченко О.Н., Большакова Л.Н., Железнова Е.А. // Астраханский медицинский журнал. 2021. Т. 16, № 4. С. 6-13.

3. Современные лабораторные методы для лабораторной диагностики коклюша в клинической практике / Видманова М.В., Жестков // Сборник трудов международной научно-практической конференции «Актуальные вопросы экспериментальной микробиологии» Курск. 19 мая 2022. С. 49-52.

4. Видманова, М.В. Лабораторное подтверждение коклюша при стертой клинической картине методом полимеразной цепной реакции / М. В. Видманова, Л. Н. Большакова // Бактериология. - 2022. - Т. 7, № 3. - С. 23-24.

5. ПЦР диагностика коклюша при стёртой клинической картине / Видманова М.В. // Сборник трудов конгресса. XXXII Национальный конгресс по болезням органов дыхания; Под. ред. акад. А.Г. Чучалина. С. 38.

6. Видовое разнообразие сопутствующей микрофлоры при бактериологическом исследовании на коклюш / М. В. Видманова, А. В. Жестков, С. С. Неняйкин [и др.] // Материалы конгресса. РКММИ 2023: Сборник тезисов, Москва, 02-03 марта 2023 года. - Москва: ООО "Издательско-полиграфическое объединение "У Никитских ворот", 2023. - С. 28-29.

7. Патент на полезную модель № 216948 U1 Российская Федерация, МПК G01N 33/487, G01N 33/497, G01N 1/22. Маска для неинвазивного сбора кашлевого аэрозоля для микробиологической диагностики при респираторных заболеваниях: № 2022122550: заявл. 19.08.2022: опубл. 10.03.2023 / М. В. Видманова, С. В. Тонеева, А. В. Лямин, А. В. Жестков.

8. Оптимизация бактериологического метода лабораторной диагностики коклюша / Видманова М.В., Жестков А.В., Неняйкин С.С. [и др.] // Журнал инфектологии. - 2023. - Т.15. № 2. С. 160-161.

9. Видовое разнообразие сопутствующей микрофлоры при бактериологическом исследовании на коклюш / М. В. Видманова, А. В. Лямин, С. С. Неняйкин, Е. Е. Никишкова // Боткинские чтения: Сборник тезисов Всероссийского терапевтического конгресса с международным участием, 2021 апреля 2023 года. - Санкт-Петербург: Санкт-Петербургская общественная организация "Человек и его здоровье", 2023. - С. 51-52.

10. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2023622328 Российской Федерации. Противококлюшный гуморальный иммунитет у привитых детей Самарской области в 2016-2020гг: № 2023621934: заявл. 19.06.2023: опубл. 11.07.2023 / М. В. Видманова; заявитель ФГБОУ ВО «Самарский государственный медицинский университет» МЗ РФ.

11. Видманова, М.В. Централизованный подход к лабораторному подтверждению атипичного коклюша в Самарской области / М. В. Видманова // Материалы конференции с международным участием, посвященной 100-летию "Пермского медицинского журнала", Пермь, 23 сентября 2023 г. -Пермь: Пермский национальный исследовательский политехнический университет, 2023. - С. 72-76.

12. Особенности масс-спектрометрической идентификации бордетелл при подготовке культур на разных питательных средах / М.В. Видманова, А.В. Лямин, Д.Д. Исматуллин, А.В. Козлов, Е.Ю. Шеститко, А.В. Жестков, В.П. Решетникова // XVI Ежегодный всероссийский конгресс по инфекционным

болезням имени Академика В.И. Покровского: Материалы конгресса, Москва, 25-27 марта 2024 года. ООО «Медицинское Маркетинговое Агентство», 2024. - С.48.

13. Маска для взятия кашлевого аэрозоля и последующего микробиологического исследования / М.В. Видманова, А.В. Лямин, А.В. Жестков // Научно-практическая конференция «Инфекционные болезни: мультидисциплинарный взгляд», Санкт-Петербург, 16-17 апреля 2024 года, Официальное издание Межрегиональной общественной организации «Ассоциация врачей-инфекционистов Санкт-Петербурга и Ленинградской области», 2024. - С.55-57.

14. Белковые профили бордетелл при подготовке культур на разных питательных средах / М.В. Видманова, А.В. Лямин, Д.Д. Исматуллин и [др.], // Молекулярная диагностика и биобезопасность - 2024: Сборник тезисов Конгресса с международным участием, Москва, 16-17 апреля 2024 года. -Москва Moscow Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии Роспотребнадзора, 2024. - С.236-237. - EDNPRUVQT

15. Видманова, М. В. Компоненты питательных сред и их влияние на идентификацию бордетелл по протеомному профилю / М. В. Видманова // Проблемы медицинской микологии. - 2024. - Т. 26, № 2. - С. 96.

16. Маска для взятия кашлевого аэрозоля для микробиологического исследования / М.В. Видманова, А.В. Жестков, Т.П. Видманова // Второй Гомельский международный конгресс «Инфекционные болезни, микробиология и иммунология» Материалы международного конгресса. -Гомель, 2024 - 216 с.

17. Видманова, М. В. Оптимизация отбора проб для микробиологического исследования при подозрении на коклюш / М. В. Видманова // Аспирантские чтения - 2023: молодые ученые - медицине. Приоритетные направления науки в достижении технологического суверенитета : Сборник материалов Всероссийской научно-практической конференции с международным

участием, Самара, 25 октября 2023 года. - Самара: ООО "Полиграфическое объединение "Стандарт", 2024. - С. 443-445. - EDN EDCVMP.

18. Видманова М.В. Лабораторное обеспечение серомониторинга поствакцинального иммунитета против коклюша // Инфекция и иммунитет. 2024. Т. 14, № 4. C. 827-832. doi: 10.15789/2220-7619-LSF-17536.

19. М. В. Видманова, А. В. Жестков, А. В. Лямин [и др.] / Микробиологическое исследование при коклюше и влияние состава питательной среды на белковое профилирование Bordetella spp. // Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. - 2024. -Т. 26, № 4. - С. 514-521. - DOI: 10.36488/cmac.2024.4.514-521.

20. Микробиологическая диагностика коклюша. Видовое разнообразие сопутствующих микроорганизмов. / М.В. Видманова, А.В. Жестков, С.С. Неняйкин, А.В. Лямин, Е.Ю. Шеститко // Материалы III Российского конгресса по медицинской микробиологии и инфектологии с международным участием, Москва, 27-28 февраля 2025 года.

21. Видманова, М. В. Видовое разнообразие микробиоты при микробиологическом подтверждении коклюша / М. В. Видманова // Известия ГГТУ. Медицина, фармация. - 2025. - № 1. - С. 107-110. - DOI 10.51620/2687-1521-2025-1-21-107-110. - EDN UVLRVP.

ПРИЛОЖЕНИЯ

Приложение № 1

Таблица 24.

Применяемое оборудование.

№ Наименование Производитель

1. Аквадистиллятор электрический АЭ-10 МО Россия, ОАО «Тюменский завод медицинского оборудования и инструментов», 2011

2. Аппарат подготовки сред SMP160 Латвия, ООО «BioSan», 2011

3. Бокс микробиологической безопасности класс II Тип А2 «БМБ-II- Ламинар-С»-1,2 Россия, ЗАО «Ламинарные системы», 2017

4. Весы неавтоматического действия Vibra AJH-220CE Япония «Shinco Densi CO., LTD» 2022

5. Дозатор пипеточный одноканальный с переменным объемом доз «Колор» ДПОПц-1 -20-200 мкл Россия, ЗАО «Термо Электрон», 2016

6. Дозатор пипеточный одноканальный с переменным объемом доз «Колор» ДП0П-1-1000-5000 мкл Россия, ЗАО «Термо Электрон», 2016

7. Дозатор пипеточный с переменным объемом 8-канальный «Колор» ДПМП-8-5-50 мкл Россия ЗАО «Термо Фишер Сайнтифик», 2010

8. Камера цифровая Optix C 900 Австрия, West Medica, 2017

9. Кондуктометр с Эксперт-0002-2-6 п Россия, Москва, ООО «Эконикс-Эксперт», 2023

10. Манометр ФТ ДМ2010ф Россия, АО «ПО Физтех», 2022

11. Микроскоп Альтами СМ0745-Т стереоскопический Россия, «Альтами» 2023

12. Микроскоп для биологических исследований МиктроН-200МV Россия, ООО «Петролазер», 2007

13. Микроскоп медицинский LEICA ZOOM Китай, LEICAMICROSYS -TEMS, 2005

14. Мини-центрифуга/ вортекс MikroSpin FV-2400 Латвия, ООО «BioSan», 2016

15. Морозильник ультранизкотемпературный ULUF 65 Arctiko, 54 л DAL 1418 Arctiko, Дания, 2015

16. Масс-спектрометр Microflex LT (BrukerDaltonikGmbH, Германия) 2015

17. Объект микрометр ОМО № 720871 Россия, 2003

18. Прибор Densi-La-Meter Чешская республика, «ЭрбаЛахемас.р.о.», 2012

19. Программное обеспечение для иммуноферментного анализа RIDASOFTWin Германия, R-biofarm Stylab, 2015

20. Стерилизатор паровой горизонтальный ГК-100-3 Россия, ОАО «Тюменский завод медицинского оборудования и инструментов», 2012

21. Стерилизатор паровой вертикальный ВК-75-01 Россия, ОАО «Тюменский завод медицинского оборудования и инструментов», 2011

22. Стерилизатор паровой ВК-75-01 Россия, АО «ПО Физтех», 2011

23. Термогигрометр Testo 608-H1 «Testo AG», Германия, 2020

24. Термометр ТС-7АМК ОАО «Термоприбор», Россия, 2021

25. Термостат водяной BWT-U «BioSan» Латвия, ООО «BioSan», 2009

26. Термостат BinderBD 53 Германия, Binder, 2009

27. Термоциклер для амплификации нуклеиновых кислот CFX 96 (модули) С1000 Touch 2017

28. Термошейкер для иммунопланшет PST-60HL-4 «BioSan» Латвия, ООО «BioSan», 2014

29. Устройство для промывки микропланшет PW 40 Россия, ООО «БИО-РАД Лаборатории», 2011

30. Фотометр для микропланшет «BioRad» модель 680 США, «BioRad», 2006

31. Фотометр для микропланшет «Магк»исп. iMark США, «Б№аё», 2015

32. Холодильник ХФ-400-1 «Позис» Россия, ОАО «Производственное объединение «Завод имени Серго», 2014

33. Холодильник комбинированный лабораторный ХЛ- 340 « Pozis» Россия, АО «Производственное объединение «Завод имени Серго», 2023

34. Центрифуга Ева-20 Германия, НеШсИ, 2010

35. Центрифуга MICRO - 185 Германия, НеШсИ 2016

36. Шкаф сушильный ШС-80-01 СПУ Россия, ОАО «Смоленское СКТБ СПУ», 2007

37. Электрод Аквилон ЭСЛК-01.7 Россия, ООО «НПО Аквилон», 2022