Поиск антидотов к токсикантам с помощью математического моделирования на примере микотоксинов тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 05.13.18, кандидат технических наук Медовикова, Юлия Евгеньевна

• Медовикова, Юлия Евгеньевна
• кандидат технических наук
• 2011

Оглавление диссертации кандидат технических наук Медовикова, Юлия Евгеньевна

ВВЕДЕНИЕ.

ГЛАВА 1. ПРЕДПОСЫЛКИ К ПОИСКУ И СОЗДАНИЮ АНТИДОТОВ К

МИКОТОКСИНАМ.

Введение.

1.1. Общая характеристика и токсикология микотоксипов.

1.1.1. Афлатоксины.

1.1.2. Продукты, подверженные заражению афлатоксинами.

1.2. Структура и физико-химические свойства.

1.3. Биологическое действие.

1.4. Метаболизм афлатоксинов.

1.5. Молекулярный и клеточный механизм действия.

1.5.1. Взаимодействие с белками.

1.5.2. Влияние на обмен белков.

1.6. Влияние на структурные и функциональные свойства клеточных органелл.

1.7. Моделирование структурных компонентов клетки.

1.7.1. Моделирование белкового компонента.

1.7.2. Моделирование углеводного компонента.

1.7.3. Моделирование липидного компонента.

1.7.4. Моделирование мономеров ДНК и РНК.

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Поиск антидотов к токсикантам с помощью математического моделирования на примере микотоксинов»

2.1. Математическое описание молекулярных моделей.35

2.2. Неэмпирические методы.41

2.3. Полуэмпирические методы.44

2.4. Точность квантово-химических расчетов.49

2.5. Модели воздействия токсикантов на структурные компоненты клеток51 Заключение к главе 2.55

ГЛАВА 3. СОЗДАНИЕ МАТЕМАТИЧЕСКОЙ МОДЕЛИ, ОБЕСПЕЧИВАЮЩЕЙ ПОИСК АНТИДОТОВ ПРОТИВ АФЛАТОКСИНОВ

56

Введение.56

3.1. Сущность математической модели.57

3.2. Пример реализации математической модели.60

3.3 Программные продукты.81

Заключение к главе III.97

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШИХ ИССЛЕДОВАНИЙ.100

ПУБЛИКАЦИИ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ.101

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ.104

ПРИЛОЖЕНИЕ.117

Приложение 1.117

Приложение 2.141

2.1. Фрагмент кода посторения таблицы значений критериев Z.141

2.2. Фрагмент кода расчета критерия Z для заданных веществ.142

Приложение 3.144

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы

Проблема накопления в окружающей среде большого количества чрезвычайно токсичных химических веществ, способных влиять на живые организмы, оценка их токсического действия является одной из важнейших и требует решения.

На современном этапе развития биохимии и медицины необходим научно обоснованный поиск различных веществ, которые уменьшали бы или сводили на нет пагубное влияние ядов, токсинов на живые организмы или отдельные структурные составляющие живых организмов. Такие вещества называются антидотами. Требования, которые необходимо предъявлять к антидотам:

• абсолютная безопасность антидотов для живых организмов;

• использование в качестве антидотов уже известных веществ лекарственных препаратов или пищевых компонентов, которые уже используются на практике для иных целей);

• коммерческая целесообразность использования (возможность покупки человеком с любым достатком);

• выпуск веществ - антидотов отечественной промышленностью;

• доступность веществ - антидотов (возможность приобретения в любой аптеке вне зависимости от её географического удаления);

Актуальность и перспективность данного направления обусловлена большой трудоемкостью и длительностью многостадийного процесса создания новых лекарственных средств — антидотов. Современные достижения в области математики, квантовой химии, компьютерной техники привели к появлению инновационных программных технологий, позволяющих создавать эффективные экспертные системы рационального конструирования лекарственных средств. При этом поведение молекулы лекарственного средства (антидота) в присутствии структурного компонента клетки и микотоксина остается невыявленным. На данный момент важнейшей задачей становится моделирование на основе построенных моделей и выявление закономерностей в сопряженных системах взаимодействия токсикант - структурный компонент клетки -антидот.

Цель и задачи исследования

Целью данной работы является создание математической модели для поиска антидотов к отрицательному воздействию микогоксипов на различные структурные компоненты клетки. Это позволит качественно и количественно оценивать возможность использования в качестве антидотов предлагаемые вещества.

Для достижения поставленной цели предусмотрено решение следующих задач: Создание математической модели, позволяющей осуществлять поиск антидотов к отрицательному воздействию микотоксинов на I клеточные структурные компоненты; Разработка схемы, отражающей моделирование взаимодействия токсиканта и антидота со структурным компонентом клетки; Разработка формулы для оценки возможности использования различного рода соединений в качестве антидотов к токсинам; Создание автоматизированной программы для обработки результатов квантовых расчетов и количественной оценки возможности использования различных соединений в качестве антидотов к токсинам; Создание базы данных взаимодействия объединенной системы трех веществ: токсин - структурный компонент клетки - антидот. Методы исследований

Для создания первичной молекулярной модели использована программа МОР АС, расчеты в которой проведены полуэмпирическим РМЗ методом.

Для дальнейшей оптимизации, корректировки г-матриц и поиска энергетических параметров исходных веществ и адсорбционных комплексов использована программа РС ОАМЕБЭ, расчёты в которой проведены с применением РМЗ метода в рамках приближения Хартри-Фока, с полной оптимизацией геометрии молекул. Расчеты проводились в изолированной фазе, без учета сольватации. Визуализация и обработка результатов проводилась с помощью программы СЬешСгаЙ. Научная новизна

Создана математическая модель, обеспечивающая поиск антидотов к токсичному воздействию микотоксинов на различные структурные компоненты клетки.

Сущность математической модели состоит в том, что с помощью методов квантовой химии проводят расчет параметров взаимодействия молекул токсиканта и антидота со структурными компонентами клетки. Антидот должен присоединиться к тем же функциональным группам компонента клетки, что и токсикант. При этом энтальпия образования адсорбционных комплексов (АК) между антидотом и реакционным центром компонента клетки (ДН?) должна быть меньше, чем энтальпия образования АК1 токсиканта с этим же реакционным центром (ДН/). Замещение токсиканта у функциональной группы происходит за счет смещения химического равновесия из-за присутствия антидота в большем, количестве, чем токсиканта. Токсикант и антидот взаимодействуют между собой, при этом энергия такого взаимодействия должна быть или меньше, чем энергия взаимодействия токсиканта с клеточным компонентом, или находиться на том же уровне.

Необходимо четко определить, сколько потребуется антидота, чтобы он занял положение, которое до этого принадлежало токсиканту. В результате такого взаимодействия для смещения равновесия требуется, чтобы ДЯ2 стало меньше, чем АН\. Таким образом, разность между этими двумя величинами будет ААН. В математической модели производится расчет именно этой величины. Расчет включает в себя следующие этапы:

1. Выбор взаимодействующих молекул и поиск их оптимизированных равновесных структур;

2. Моделирование взаимодействия токсиканта и антидота со структурным компонентом клетки и расчет геометрических и энергетических характеристик полученных адсорбционных комплексов;

3. Расчет Ъ (ДА И) для каждого реакционного центра выбранного компонента клетки. Ъ — величина, учитывающая значения энергий взаимодействия между молекулами токсина и антидота с одним реакционным центром структурного компонента клетки, и число значений этих энергий;

4. Визуализация модели на основе всех проведенных расчетов. Модель представляет собой синтез молекулярного графа молекулы структурного компонента клетки с пронумерованными реакционными центрами и графика зависимости величин Ъ для каждого реакционного центра от числа этих реакционных центров в данном структурном компоненте клетки.

Разработана программа, позволяющая обработать результаты квантовых расчетов и дать количественную оценку возможности использования различных соединений в качестве антидотов к токсинам. Практическая значимость

Разработанная математическая модель поиска антидотов против токсического действия токсикантов на клеточные структурные компоненты позволяет не только рассматривать в качестве антидотов уже известные науке соединения, но и на основе полученных результатов синтезировать принципиально новые антидоты. При этом применение математического моделирования для изучения влияния молекул веществ - антидотов на молекулы токсинов и структурные компоненты клетки позволяет существенно уменьшить время поиска и избежать длительных экспериментов.

Создана программа, позволяющая обрабатывать результаты квантовых расчетов, автоматизировать расчеты энергетических характеристик и рассчитывать ряды величин Ъ для каждого реакционного центра клеточного элемента.

Результаты диссертационной работы используются в учебном процессе по дисциплинам: «Квантовая механика и квантовая химия», «Экология на стыке математики, физики и химии», «Нанохимия».

Заключение диссертации по теме «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ», Медовикова, Юлия Евгеньевна

ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ И ВЫВОДЫ

1. Разработана математическая модель, обеспечивающая поиск ан'гидотов к .токсическому действию токсикантов на различные структурные компоненты клетки, позволяющая качественно и количественно оценивать возможность использования в качестве антидотов предлагаемые вещества. Модель представляет собой синтез молекулярного графа молекулы структурного компонента клетки с пронумерованными реакционными центрами и графика зависимости величин численного критерия Z для каждого реакционного центра от числа этих реакционных центров в данном структурном компоненте клетки.

2. Предложен численный критерий оценки токсичности Ъ, учитывающий значения энергий взаимодействия между молекулами токсина и антидота с одним реакционным центром структурного компонента клетки, и число значений этих энергий; предложена эмпирическая формула для расчета этих величин с целью оценки возможности использования различного рода соединений в качестве антидотов к токсинам.

3. Разработан алгоритм, отражающий моделирование взаимодействия токсиканта и антидота со структурным компонентом клетки, проведен расчет геометрических и энергетических характеристик полученных адсорбционных комплексов.

4. Создана база данных, которая позволяет структурировать результаты квантово-химических расчетов молекул афлатоксинов, орнитина, компонентов клеточной мембраны - полипептидов, фосфолипидов, полисахаридов, а также образующихся в результате их взаимодействия адсорбционных комплексов.

5. Создана программа, позволяющая обрабатывать результаты квантовых расчетов, автоматизировать расчеты энергетических характеристик и рассчитывать ряды численных критериев Ъ для каждого реакционного центра клеточного элемента.

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШИХ ИССЛЕДОВАНИЙ

Чтобы вести направленный и результативный поиск антидотов к воздействию микотоксинов на структурные компоненты клетки, необходимо прежде всего расширять и увеличивать масштабы расчетных данных, т. е. создать базы данных предполагаемых веществ-антидотов, включающих как лекарственные средства локального действия, так и вещества природного происхождения, например, витамины или БАДы; создать расширенные базы данных структурных компонентов клеток, отражающие как можно большее число характерных функциональных групп; необходимо провести масштабные квантово-механические расчеты, направленные на выявление закономерностей во взаимодействии трех веществ для установления четкого механизма поведения антидота в клетке в присутствии микотоксина; необходимо развивать и совершенствовать математические модели в сторону укрупнения рассчитываемых структур и увеличения числа соединений в расчетных системах.

ПУБЛИКАЦИИ ПО ТЕМЕ ДИССЕРТАЦИИ

Статьи в ведущих рецензируемых научных журналах и изданиях, включенных в список ВАК РФ

1. Левкина (Медовикова), Ю. Е. Квантово-химическое моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина В] с белковым компонентом биологической мембраны [Текст] / Ю. Е. Левкина (Медовикова), Н. Н. Алыков // Вестник Московского государственного областного университета. Сер. Естественные науки. - 2006. - № 2 (24). - С. 61-63.-ISBN 5-7017-0928-0. '

2. Медовикова, Ю. Е. Моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина В! с гликозидным компонентом животной клетки [Текст] // Экологические системы и приборы. - 2007. - № 9.-С. 48-52.

3. Медовикова, Ю. Е. Квантово-химическое моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина В| со структурными компонентами нуклеиновых кислот [Текст] // Экологические системы и приборы. - 2007. - № 9. - С. 53-58.

4. Медовикова Ю. Е., Алыков Н. М. Математическое моделирование, обеспечивающее поиск антидотов против афлатоксинов // Прикаспийский журнал: управление и высокие технологии. - 2011. - №3(15). - С. 47-52 -ISSN 2074-1707

Статьи в материалах международных и всероссийских конференций

5. Левкина (Медовикова), Ю. Е. Моделирование процесса адсорбции афлатоксина В] на белковом компоненте биологической мембраны [Текст] // Фундаментальные и прикладные проблемы современной химии в исследованиях молодых ученых: материалы Международной научной конференции (10-12 сентября 2006 г.) - Астрахань, 2006. - С. 207-211. -ISBN 5-88200-897-2.

6. Медовикова, Ю. Е. Теоретические исследования с целью разработки антидотов к микотоксинам [Текст] // Экология биосистем: проблемы изучения, индикации и прогнозирования: Материалы конференции — Астрахань, 2007 - С.207-210. - ISBN 5-88200-995-2.

7. Медовикова, Ю. Е. Квантовохимическое моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина В) с пенгозами нуклеиновых кислот [Текст]// III школа-семинар: Квантовохимические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул (14 марта 2007 г.). - Иваново, 2007. - С. 138-142. -ISBN 5-7807-0609-3.

8. Медовикова, Ю. Е. Математическое моделирование процессов образования адсорбционных комплексов афлатоксина В| с углеводными компонентами мембраны клетки [Текст] // Фундаментальные и прикладные проблемы современной химии: материалы II Международной конференции (15-17 апреля 2008 г.) - Астрахань, 2008. - С. 208-215. - ISBN 978-5-99260191-6.

9. Медовикова, Ю. Е. Расчет параметров образования адсорбционных комплексов афлатоксина В] со структурными компонентами биологических мембран полуэмпирическим РМЗ методом [Текст]// Материалы IV школы-семинара молодых ученых «Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул (20-22 мая 2009 г.). - Иваново, 2009. - С. 131 -134. - ISBN 5-9616-0298-2.

10. Медовикова Ю. Е. Квантово-химическое моделирование адсорбции орнитина на афлатоксин В] и структурные компоненты клетки [Текст] // Фундаментальные и прикладные проблемы получения новых материалов: исследование, инновации и технологии: материалы V Международной научной конференции (27 - 29 апреля 2011 г.) - Астрахань, 2011. - С 58-63 -ISBN 978-5-9926-0487-0.

11. Медовикова Ю. Е. Квантово-химическое моделирование адсорбции орнитина на афлатоксин Bi и структурные компоненты клетки [Текст]// Материалы V школы-семинара молодых ученых «Квантово-химические расчеты: структура и реакционная способность органических и неорганических молекул (20-22 апреля 2011 г.). - Иваново, 2011. - С. 146150 - ISBN 978-5-7807-0897-1.

Список литературы диссертационного исследования кандидат технических наук Медовикова, Юлия Евгеньевна, 2011 год

1. Билай В.И., Пидопличко Н.М. Токсинобразующие микроскопические грибы. К.: Наукова думка. - 1970. - 287 с.

2. Sana Z. B. Elshafie, Abdullah ElMubarak, Saifeldin A. F. El-Nagerabi, Abdulkadir E. Elshafie. Aflatoxin Bi Contamination of Traditionally Processed Peanuts Butter for Human Consumption in Sudan //Mycopathologia. -2011,- 171,-p.435-439.

3. Беседа с директором ГУ НИИ питания РАМН, д-ром мед. наук, академиком Виктором Александровичем Тутельяном // Пищевая промышленность, №5, 2008.

4. Папазян Т. Микотоксины: экономический риск и контроль//Животноводство России, 2002, №7, с. 16-20.

5. Тутельян В. А., Кравченко JI. В. Микотоксины М.: Медицина, 1985. -319с.

6. Элл ер К. И., Соболев В. С. Идентификация и количественное определение трихотеценовых микотоксинов методом капиллярной газожидкостной хроматографии//Аналитическая химия. 1983. №5. - с. 903-907.

7. Оценка загрязнения пищевых продуктов микотоксинами, под ред. В.А. Гутельяна, т. 1-—3, М., 1985.

8. Daiana Garcia, Antonio J. Ramos, Vicente Sanchis, Sonia Marin. Predicting mycotoxins in foods: A review // Food Microbiology. 26. - 2009. - p.757-769.

9. Mycotoxins (Production, Isolation, Separation and Purification) // Ed. by Betina V. —Amsterdam u.a.: Elsevier. —1984. —525 p.

10. Шатерников В.А., Марокко И.Н. // Оценка загрязнения пищевых продуктов микотоксинами, Т. 2. —М.: 1985. —С. 65—83.

11. Зайченко A.M., Нагорная С.С., Кириллова JI.M. и др. //Микробиол. журн. —1992. —Т. 54, N 3. —С. 43—40.

12. Desjardins А.Е., Hohn Т.М., McCormick // Microbiological reviews. —1993. —V. 57, N 3. —P. 595—604.

13. Johanning E., Biagini R., Hull D.-L. et al. // Int. Arch. Occup. Environ. Health. —1996.—"V. 68.—P. 207—218.

14. Johanning E., Garies E.L., Hintikka E.-L. // Appl. Industr. Hygiene J. —1998. —V. 54, N 11. —P.' 305—312.

15. Jopal G.S., Briggs S.P. // Science. —1992. —V. 258. —P. 985—987.

16. Lesovoy M.P., Zaichenko A.M., Pehota E.N. // Eucarpia (sect, oil and protein crops) Symp. on Breeding of Oil and Protein Crops. 5 —8.08.1996. Zaporozhye, Ukraine. —P. 108—110.

17. Reddy R. V., Taylor M. J., Sharma R. P.// Journ. of Food Protection. —1988. —V. 51, 1.—P. 32—36.

18. Richard J.L., Cysewski S.J., Pier A.C. et al. // Amer. J. Vet. res. —1978. —V. 39,—P. 1674—1679.

19. Rubezhnyak I. G., Zaichenko О. M. // J. of Wine Research. —1996. —V. 7, N 2,—P. 111—116.

20. Watson D.H., Lindsay D.G. // J. Sei. Food Agric. —1982. —V. 33, N 1. —P. 59—67.

21. Алыкова Т. В. Контрольные задания, программа и лабораторный практикум по курсу «Биологическая химия с основами общей химии»/Учебное пособие для студентов педагогических институтов.-Астрахань: Изд-во Астраханского пед. ин-та, 1994.-128с.

22. Sonia Marin, Carmen Colom, Vicente Sanchis, Antonio J. Ramos. Modelling of growth of aflatoxigenic A. flavus isolates from red chilli powder as a function of water availability// International Journal of Food Microbiology. 128. — 2009.-p. 491-496.

23. Francesca Degola, Elettra Bemi, Francesco M. Restivo. Laboratory tests for assessing efficacy of atoxigenic Aspergillus fïavus strains as biocontrol agents // International Journal of Food Microbiology. 146. - 2011. - p. 235-243.

24. Саркисов A.X. Микотоксикозы, M., 1954.

25. Markus Storvik, Pasi Huuskonen, Taija Kyllonen , Sarka Lchtonen , Hani El-Nezami, Seppo Auriola , Markku Pasanen. Aflatoxin В1 — a potential endocrine disruptor- up-regulates CYP19A1 in JEG-3 cells //Toxicology Letters. 202. -2011.-p. 161-167.

26. Smita Tripathi, H. N. Mishra. Modeling and Optimization of Enzymatic Degradation of Aflatoxin B1(AFB1 ) in Red Chili Powder Using Response Surface Methodology //Food Bioprocess Technol. 2011. - 4. -p.770-780.

27. Мелешина A.M. Курс квантовой механики для химиков. M.: Высш. шк., 1980.-381 с. '

28. Daohong Zhanga, Peiwu Lia, Yang Yang, Qi Zhang, Wen Zhanga, Zhi Xiao, Xiaoxia Ding. A high selective immunochromatographic assay for rapid detection of aflatoxin B,// Talanta. 2011. - 12095. - p.7.

29. Белясова H. А. Биохимия и молекулярная биология. Мн.: Книжный Дом, 2004.-416с.

30. Овчинников Ю. А. Биоорганическая химия. М.: Просвещение, 1987. 815с.

31. Комов В. П., Шведова В. Н. Биохимия. М.: Дрофа, 2004. - 638с.

32. Львова Л. С., Соседов Н. И. // Прикладная биохимия. 1976. № 5. С. 741 -749с.

33. Кнорре Д.Г., Мызина С.Д. Биологическая химия. М.: Высшая школа, 2000. - 479с.

34. Исидоров В. А. Введение в химическую экотоксикологию. С.-Пб.: Химиздат, 1999.-72с.36. http://www.likar.info/ Портал о здоровье.

35. Майер И. Избранные главы квантовой химии: Доказательства теорем и вывод формул. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2006. - 384 с.

36. Соловьев М. Е., Соловьев М. М. Компьютерная химия. М.: СОЛОН-Пресс, 2005.-536с.

37. Бейдер Р. Атомы в молекулах: Квантовая теория. Пер. с англ. М.: Мир, 2001.-532с.

38. Барановский В.И. Квантовая механика и квантовая химия. М.: Академия, 2008. - 384 с.

39. Майер И. Избранные главы квантовой химии: Доказательства теорем и вывод формул. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2006. - 384 с.

40. Степанов Н.Ф. Квантовая механика и квантовая химия. М.: Мир, 2001. -519с.

41. Кларк Т. Компьютерная химия: Пер. с англ. М.: Мир, 1990. - 383 с.

42. Ладик Я. Квантовая биохимия для химиков и биологов. Пер с нем. М.: Мир, 1975. 256 с.

43. Пюльман Б., Пюльман А. Квантовая биохимия. / Б. Пюльман, А. Пюльман. Перевод с англ. М.: Мир 1965. 654 с.

44. Бурштейн К.Я. Квантово-химические расчеты в органической химии и молекулярной спектроскопии/ К.Я. Бурштейн, ГШ. Шорыгин. М.: Наука, 1989,- 104 с.

45. Дьюар М. Теория молекулярных орбиталей в органической химии. М.: Мир, 1972. 592 с.

46. Заградник Р. Основы-квантовой химии / Р. Заградник, Р. Полак. М.: Мир, 1990.-412 с.

47. Алыков Н. М. Метод молекулярных орбиталей в приближении Хюккеля. Астрахань.: Издательство АГПИ, 1989. 39с.

48. Фларри Р. Квантовая химия. Введение: Учеб. пособие / Р. Фларри. М.: Мир, 1985.-472 с.

49. Абаренков И.В., Братцев В.Ф., Тулуб A.B. Начала квантовой химии. М.: Высш. шк., 1989. 304 с.

50. Дункен X., Лыгин В.И. Квантовая химия адсорбции на поверхности твердых тел. М.: Мир, 1980. 288 с.

51. Бахвалов Н. С. Численные методы (анализ, алгебра, обыкновенные дифференциальные уравнения). М.: Наука, 1975.-631с.

52. Тарасевич Ю.Ю. Математическое и компьютерное моделирование. Вводный курс. М.: Едиториал УРСС, 2008. - 191с.

53. Ахназарова С. Л., Кафаров В. В. Методы оптимизации эксперимента в химической технологии. М.: Высшая школа, 1985. - 327с.

54. Жидомиров Г.М., Михейкин И.Д. Кластерное приближение в квантовохимических исследованиях хемосорбции и поверхностных структур // Итоги науки и техники. Строение молекул и химическая связь. Т. 9. М.: ВИНИТИ, 1984. С. 3-161.

55. Жарких Л. И. Квантово -химическое кластерное моделирование процесса взаимодействия сероводорода с компонентами поверхностибиологической мембраны. Диссертация на соискание ученой степени кандидата технических наук, 2006.

56. Золотарева Н. В. Математическая модель процессов взаимодействия диоксида серы со структурными элементами клеточной мембраны. Диссертация на соискание ученой степени кандидата технических наук, 2009.

57. Очередко Ю. А. Моделирование процессов взаимодействия диоксинов со структурными элементами клеточной мембраны. Диссертация на соискание ученой степени кандидата технических наук, 2010.

58. Очередко, Ю. А. Квантово-химическое моделирование процесса адсорбции 2,4-дихлорфенола в компоненты биологической мембраны Текст. // Экологические системы и приборы. 2007. — № 9. — С. 40-47.

59. Очередко, Ю. А. Создание противодиоксиновых средств защиты живых организмов Текст. // Экология биосистем: проблемы изучения, индикации и прогнозирования: Материалы конференции Астрахань, 2007 - С.215-217. -ISBN 5-88200-995-2

60. Жарких JI. И., Алыков Н.М., Казанцева Н. В. Квантово-химическое кластерное моделирование адсорбции фенола на поверхности алюмосиликатов//Экологические системы и приборы. — 2005. № 9. -С.27-29.

61. Жарких JT. И. Моделирование процесса взаимодействия сероводорода с белковым компонентом клеточной мембраны. // Южно-Российский вестник геологии, географии и глобальной энергии. 2006. - №7. - С. 180184.

62. Жарких Л. И. Квантово-химическое кластерное моделирование процесса адсорбции сероводорода на поверхности белковой мембраны. // Вестник МГОУ. Серия химическая. 2006. - №9. - С. 56-59.

63. Жарких Л. И., Золотарева Н. В. Создание баз данных для моделирования антидотов к токсическим веществам. //Каспийский инновационный форум: Материалы выступлений (8-10 февраля 2009 г.) Астрахань, 2009. -С. 52-53.

64. Жарких J1. И., Головацкий М. И. Создание программного обеспечения для автоматизации работ, связанных с обновлением баз данных на предприятиях. //Каспийский инновационный форум: Материалы выступлений (8-10 февраля 2009 г.) Астрахань, 2009. - С. 54.

65. Казанцева, Н. В. (Золотарева) Теоретическое обоснование сорбции диоксида серы на структурных элементах клеточных мембран Текст. // Экологические системы и приборы. 2007. - № 9. - С. 35-37.

66. Казанцева, Н. В. (Золотарева) Квантово-химическое моделирование хемосорбции диоксида серы на структурных элементах клеточных мембран Текст. / Н. В. Казанцева, Н. Н. Алыков // Изв. вузов. Химия и хим. технология. 2007. - Т. 50, № 12. - С. 132-133.

67. Апостолова Е.С. Квантово-химическое описание реакций / Е.С. Апостолова, А.И. Михайлюк, В.Г. Цирельсон. М.: РХТУ, 1999. - 61 с.

68. Голованов И.Б. Элементарное введение в квантовую биохимию / И. Б. Голованов, А.К. Пискунов, Н.М. Сергеев М.: Наука, 1969. 236 с.

69. Медовикова, Ю. Е. Квантово-химическое моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина Bi со структурными компонентами нуклеиновых кислот Текст. // Экологические системы и приборы. 2007. - № 9. - С. 53-58.

70. Медовикова, Ю. Е. Моделирование процесса образования адсорбционных комплексов афлатоксина В| с гликозидным компонентом животной клетки Текст. // Экологические системы и приборы. 2007. — № 9. — С. 48-52.

71. Медовикова, Ю. Е. Теоретические исследования с целью разработки антидотов к микотоксинам Текст. // Экология биосистем: проблемы изучения, индикации и прогнозирования: Материалы конференции -Астрахань, 2007 С.207-210. - ISBN 5-88200-995-2.

72. Аскадский A.A. Компьютерное материаловедение полимеров. * т. 1. Атомно-молекулярный уровень. / A.A. Аскадский, В.И. Кондратенко. — М.: Научный мир, 1999. 544 с.

73. Грибов В.Д. Квантовая химия / В.Д. Грибов, С.П. Муштахова. М.: Гардарики, 1999. - 387 с.

74. Джонсон К. Численные методы в химии. М.: Мир, 1983. 238 с.

75. Иванов В.В., Слета JI.A. Расчетные методы прогноза биологической активности органических соединений. Харьков: ХНУ, 2003. - 71 с.

76. Инструментальные методы анализа функциональных групп органических соединений / Под ред. С. Сиггиа. М.: Мир, 1974. - 464 с.

77. Попл Дж. Квантово-химические модели УФН, 2002. — Т. 172, № 3. -С.349-356.

78. Калашников Ю.Я. Основы молекулярной биологической информатики. -М., 2004.-66 с.

79. Кобзев Г. И. Применение неэмпирических и полуэмпирических методов в квантово-химических расчетах Оренбург: ГОУ ОГУ, 2004. -150 с.

80. Самарский А.А. Численные методы / А.А. Самарский, А.В. Гулин М.: Наука, 1989.-430 с.

81. Coulson С. A. Dictionary of values of molecular constants. / C.A. Coulson, R. Daudel. Mathematical Institute, Oxford and Centre de mechanique ondulatoire appliques. - Paris, 2nd ed., 1959.

82. Gross C. Beginning C# 2008: from novice to professional, 2nd ed. New York, 2008.-p. 489