Генетическое разнообразие овец и коз, разводимых в России, в контексте мирового генофонда пород тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, доктор наук Денискова Татьяна Евгеньевна

• Денискова Татьяна Евгеньевна
• доктор наук
• 2026

Оглавление диссертации доктор наук Денискова Татьяна Евгеньевна

ОГЛАВЛЕНИЕ

ВВЕДЕНИЕ

1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Породное разнообразие овец, разводимых в России

1.2. Породное разнообразие коз, разводимых в России

1.3. Применение STR-маркеров в популяционно- 53 генетических исследованиях овец и коз

1.4. Внедрение ДНК-чипов и эра геномики мелкого 58 рогатого скота

1.5. ДНК-чипы и разнообразие овец и коз

1.6. Поиск отпечатков селекции в геноме овец и коз

1.7. Скрепи овец: патогенез и генодиагностика

1.7.1. Характеристика и формы скрепи

1.7.2. История трансмиссивных губчатых энцефалопатий и 81 откр тие прионов как нового класса инфекционн х агентов

1.7.3. Методы диагностики скрепи

1.7.4. Основы генетической устойчивости овец к скрепи. 86 Анализ полиморфизма в гене прионового белка овец

2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДИКА ИССЛЕДОВАНИЙ

2.1. Объекты исследований 92 2.1.1. Овцы (Ovis aries) 92 2.1.2 Козы (Capra hircus)

2.2. Методика исследований

2.2.1. Выделение и оценка качества препаратов ДНК

2.2.2. Проведение генотипирования микросателлитов

2.2.3. Генотипирование с использованием ДНК-чипов

2.2.4. Проведение анализа молекулярно-генетических данных

2.2.5. Оценка генетической устойчивости овец к скрепи

3. РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ

ОБСУЖДЕНИЕ

3.1. Генетическое разнообразие пород овец, разводимых на 113 территории России, на основе анализа STR-маркеров

3.1.1. Характеристика аллелофонда и параметров 113 генетического разнообразия

3.1.2. Характеристика генетических связей исследованных 117 пород овец на основании анализа генотипов по микросателлитам

3.1.3. Сравнительное исследование генетического 121 разнообразия региональных популяций овец романовской пород по микросателлитн м маркерам Заключение по разделу

3.2. Генетическое разнообразие пород овец, разводимых на 129 территории России, на основе анализа SNP-маркеров

3.2.1. Характеристика аллелофонда и параметров 129 генетического разнообразия по SNP-маркерам

3.2.2. Динамика эффективной численности популяций

3.2.3. Генетические связи пород овец, разводимых в России, 138 оцененные на основании SNP-генотипов

3.2.4. Характеристика паттернов гомозиготности в геноме 147 исследованных пород овец

Заключение по разделу

3.3. Генетическое разнообразие и филогенетические связи 160 российских пород овец в аспекте мирового генофонда

пород на основе анализа полногеномных SNP-генотипов

3.3.1. Генетические связи российских пород овец с

зарубежными локальными и трансграничными

породами

3.3.2 Реконструкция филогенетических связей российских

пород овец с породами, распространенными в регионах прохождения Великого Шелкового пути

3.3.3. Характеристика генетических связей российских

локальных пород овец с породами Персидского нагорья Заключение по разделу

3.4. Поиск следов селекции в геномах овец, разводимых в

России, на основе SNP-генотипов

3.4.1. Распространение островков гомозиготности в геноме

исследуемых пород овец

3.4.2 Выявление QTL, перекрывающихся с

идентифицированными островками ROH овец

3.4.3. Поиск локусов, находящихся под давлением селекции, 201 при разделении групп овец по типу ерсти

3.4.3.1 Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с

признаками роста и потребления корма

3.4.3.2. Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с

признаками шерстной продуктивности

3.4.3.3 Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с

признаком цвета шерсти

3.4.3.4. Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с 219 признаками молочной продуктивности

3.4.3.5. Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с 221 репродуктивными качествами

3.4.3.6. Идентификация и аннотация генов, ассоциированных с 225 признаками адаптации к экологическим и климатическим условиям

3.4.4. Идентификация известных QTL в геномных регионах,

находящихся под давлением селекции у овец Заключение по разделу

3.5. Анализ генетической устойчивости к скрепи у пород

овец, разводимых в России 3.5.1. Частота встречаемости аллелей и генотипов

информативных кодонов гена прионового протеина у пород овец, разводимых в России

3.5.2. Классы генетической устойчивости к классической 243 форме скрепи

3.5.3. стойчивость к атипичной форме скрепи 247 Заключение по разделу

3.6. Использование STR и SNP-маркеров для проведения

сравнительных исследований домашних и диких представителей рода Ovis

3.6.1. Сравнительное исследование информативности STR и

SNP маркеров для межвидовой дифференциации представителей рода Ovis 3.6.2. Изучение динамики аллелофонда в поколениях

межвидовых гибридов домашних и диких представителей рода vis

Заключение по разделу

3.7. Генетические исследования популяций коз,

разводимых в России, с использованием полногеномного набора SNP-маркеров

генотипирования

3.7.1. Характеристика генетического разнообразия 263 исследуемых популяций коз

3.7.2. Динамика эффективного размера популяций 264 исследуемых пород коз

3.7.3. Характеристика паттернов гомозиготности в геноме 267 исследуемых популяций коз

3.7.4. Распространение островков гомозиготности в геноме 270 исследуемых групп коз

3.7.5. Генетические взаимосвязи и структура популяций 276 исследуемых групп коз

Заключение по разделу

3.8. Оценка генетического разнообразия популяций 284 оренбургской породы коз

3.8.1. Генетическое разнообразие и характеристика паттернов 285 гомозиготности

3.8.2. Генетическая дифференциация популяций 289 оренбургской породы

Заключение по разделу

3.9. Генетическое разнообразие и филогенетические связи 296 популяций коз, разводимых в России, в аспекте мирового генофонда пород на основе анализа полногеномных SNP-генотипов

3.9.1. Филогенетические связи популяций коз, разводимых в 296 России, в аспекте мирового генофонда пород

3.9.2. Идентификация участков генома, находящихся под 299 давлением отбора, в оренбургской и карачаевской породах коз при сравнении с иностранными породами Заключение по разделу 3.9 306 ЗАКЛЮЧЕНИЕ 309 РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ПРАКТИЧЕСКОМУ 312 ИСПОЛЬЗОВАНИЮ НАУЧНЫХ ВЫВОДОВ. ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ 312 ТЕМЫ ИССЛЕДОВАНИЙ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЕ А

ПРИЛОЖЕНИЕ Б

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Генетическое разнообразие овец и коз, разводимых в России, в контексте мирового генофонда пород»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность исследований. Одомашнивание овец (Ovis aries) и коз (Capra hircus) произошло около 10 000 лет назад в регионе «Плодородного полумесяца» [Zeder M.A., Hesse B., 2000; Zeder M.A., 2008; Daly K.G. et al., 2018; Colli L. et al., 2018; Daly K.G. et al., 2025]. Длительные процессы расселения и дифференциации в совокупности привели к тому, что современный генофонд овец и коз включает большое разнообразие местных и трансграничных пород, хорошо приспособленных к специфическим условиям для производства определенного типа продукции [Yang J. et al., 2016; Bertolini F. et al., 2018; Ciani E. et al., 2020].

С момента одомашнивания овцы и козы стали источником продуктов питания (молока, мяса), теплой одежды и обуви, защищающих от холода, а так е сопрово дали кочевников и торговые караван . вечья ерсть способствовала продвижению промышленных революций и переходу общественного производства на новый этап развития [Пресмаков В. В., Широких Д. М., 2014]. Овцы и козы характеризуются высокой биологической пластичностью и могут использовать низкопродуктивные пастбища, в том числе в регионах с горным рельефом или неблагоприятными природно-климатическими условиями, тем самым реализуя важную социально-экономическую роль для местного населения [Ерохин А.И., Карасев Е.А., Ерохин С.А.,2019].

Приоритетное направление в развитии отечественного овцеводства и козоводства - это создание новых, а также сохранение и совершенствование существующих пород и селекционных форм, сочетающих высокие показатели мясной и шерстной продуктивности с хорошими адаптационными качествами [Селионова М. И., 2019; Новопашина С.И. и др., 2019; Абонеев В.В., Абонеева Е.В., 2022; Гончаренко Г.М. и др., 2023]. В последние годы были созданы и продолжается выведение новых селекционных форм овец [Селионова М. И.,

2019; Хамируев Т.Н. и др., 2024] и коз [Сермягин А.А. и др., 2024], что, безусловно, важно для расширения спектра генетических ресурсов. Тем не менее, учитывая значительную территорию России с наличием разнообразия климатических зон и типов рельефа, локальные породы овец и коз могут стать донорами ценных аллелей для создания новых селекционных достижений [Zinovieva N.A. et al., 2020].

В России создано большое разнообразие генетических ресурсов овец и коз. На конец 2024 года разводили 52 породы овец, из них 17 - тонкорунных, 17 - полутонкорунных, 2 - полугрубошерстных и 16 - грубошерстных пород, и 11 пород коз, в том числе: 5 - молочных, 4 - пуховых, 1 - шерстную и 1 -грубошерстную [Ежегодник ВНИИПлем, 2024]. Тем не менее, породный состав генетических ресурсов мелкого рогатого скота заметно менялся вследствие глобальных мировых тенденций, снижения рентабельности и спроса на производимую продукцию. В связи с историческими, социокультурными и природно-климатическими факторами шерстные и пуховые породы козы долгое время составляли основу отечественного козоводства [Чикалев А.И., Юлдашбаев Ю.А., Римиханов Н.И., 2009; Петров Н.И., 2014]. Однако в последние десятилетия на первый план выходит доминирование зааненской породы коз, отличающейся высокой молочной продуктивностью [Новопашина С.И. и др., 2019; Селионова М. И., 2019]. Следуя глобальным тенденциям в отношении снижения востребованности шерсти, все еще продолжается перестройка отрасли овцеводства для наращивания производства баранины [Селионова М. И., 2019; Новопашина С.И. и др., 2019]. В овцеводстве не наблюдается преобладание одной или нескольких пород, в том числе иностранных. Тем не менее численность многих локальных пород неуклонно сокращается, что может привести к обеднению генетических ресурсов.

окальные породы сельскохозяйственных ивотных име т ва ное экономическое и экологическое значение для устойчивого развития животноводства как в развитых, так и в развивающихся странах [FAO DAD-

IS; Столповский Ю.А., 2010; Зиновьева Н.А. и др., 2019; Zinovieva N.A. et al., 2020; Zinovieva N.A. et al., 2025]. Кроме того, локальные породы создают основу для будущих исследований генетического разнообразия, процессов одомашнивания и для идентификаци редких аллелей, сегрегирующих в местных породах [Zinovieva N.A. et al., 2020; Pogorevc N. et al., 2021; Zinovieva N.A. et al., 2025]. Тем не менее, многие локальные породы находятся в уязвимом или критическом состоянии из-за несоответствий требованиям интенсивного производства и разводятся лишь в небольших стадах [Manunza A. et al., 2023]. Эта общемировая тенденция наблюдается и в России, где на конец 2024 г. генофондные хозяйства имелись только для шести пород овец (1 тонкорунная, 1 полутонкорунная, 4 грубошерстные) и для зааненской породы коз [Ежегодник ВНИИПлем, 2024]. Так, например, генофодных хозяйств не существует для двух интереснейших всемирно известных отечественных пород - романовской породы овец и оренбургской породы коз, а также для других хорошо районированных пород. Поэтому актуально проведение мониторинга генетического разнообразия и поиска аутентичных геномных компонентов для их последующего сохранения у локальных пород с целью их консервации в форме ex situ. Геномные технологии в сочетании с вспомогательными репродуктивными технологиями открывают новые перспективы для отбора доноров, несущих аутентичные геномные компоненты, для сохранения генетического материала, способному к воспроизводству. Повышается востребованность коллекций генетических ресурсов сельскохозяйственных животных как объектов научной инфраструктуры, необходимых для сохранения, изучения и эффективного использования биоразнообразия [Зиновьева Н.А., 2024; Zinovieva N.A. et al., 2025]. Кроме того, коллекции генетического материала, сохраняемого в биобанках, не только дают ценную информацию о текущем состоянии генофондов различных пород, но и охватывают большее разнообразие, чем некоторые популяции in situ, благодаря периодическому повторному отбору проб, геномной характеристике и хранению [Paiva S.R., McManusb C.M.,

Blackburnc H, 2016; Yue X., Dechow C., Liu W., 2015; Boitard, S.; et al., 2021].

Генетический потенциал локальных пород овец и коз в России не раскрыт полностью [Новопашина С.И и др., 2020; Гончаренко Г.М. и др., 2023]. В связи с этим, один из путей повышения уровня селекционно-племенной работы - это поиск и использование генетических маркеров, связанных с продуктивностью и жизнеспособностью [Новопашина С.И и др., 2020; Гончаренко Г.М. и др., 2023], в том числе путем выявления полиморфизмов, лежащих в основе экономически значимых признаков и находящихся в геномных регионах, которые испытывали давление селекции.

Разработка в сокопроизводительных секвенаторов привела к расшифровке последовательностей полных геномов овец и коз [Jiang Y. et al. 2014; Dong Y. et al. 2013]. Это, в свою очередь, способствовало созданию ДНК-чипов, позволяющих проводить массовое параллельное генотипирование десятков и тысяч однонуклеотидных полиморфизмов (single nucleotide polymorphism, SNP). Для овец были разработаны ДНК-чипы со средней (0vineSNP50K BeadChip, ~50 тыс. SNP) и высокой (Ovine Infinium® HD SNP BeadChip, ~600 тыс. SNP [Kijas J.W. et al., 2014; Anderson R. et al., 2014] плотность покрытия генома, а для коз - биочип со средней плотность покрытия генома (Goat SNP50 BeadChip, ~50 тыс. SNP) [Tosser-Klopp G. et al., 2014]. Сгенерированные полногеномные данные SNP-генотипирования были объединены в базы данных Международного консорциума по геномике овец (International Sheep Genomics Consortium, ISGC) в рамках проекта Ovine HapMap, содержащую более 2819 генотипов овец из 74 пород [Kijas J.W. et al., 2012] и AdaptMap, включающую генотипы коз из 148 популяций [Stella A. et al., 2018]. Эти массивы данных стали важным инструментом для понимания генетического разнообразия и взаимосвязей локальных и трансграничных пород овец и коз [Ciani E. et al., 2014; Beynon S.E. et al., 2015; Manunza A. et al., 2016; Bertolini F. et al., 2018; Colli L. et al., 2018; Da Silva A. et al., 2025]. Продемонстрировано, как генерация SNP-генотипов локальных пород способствовала реконструкции путей расселения мериносовых овец в Европе

[Ciani E. et al., 2020]. Показана возможность выявления следов интрогрессии диких видов в геномы домашних сородичей [Barbato М. et al. 2017; Mary N. et al. 2022].

С использованием полногеномного SNP-генотипирования стала возмо ной идентификация геномных регионов, испытыва их давление селекции и содержащих гены-кандидаты, связанные с формированием экономически-значимых признаков [Kijas J.W. et al., 2012]. Так, например, у овец выявлены следы селекции в геномных регионах, содержащие так называемые «горячие точки отбора» - гены ABCG2, LCORL/NCAPG, MSTN и гены, влияющие на цвет шерсти (ASIP, MC1R, MITF и TYRP1) [Rochus C.M. et al., 2018]. В геномах коз идентифицированы гены-кандидаты, связанные с качеством шерсти и пуха (CUX1 и PLOD3), мясной продуктивностью (MAPD1, NRAS и TSHB) и с циркадными циклами (SOX14, NOCT, RAI1 и TH) [Bertolini F. et al., 2018]. За последние десять лет были проведены исследования, направленные на анализ генетической архитектуры локальных пород мелкого рогатого скота с целью идентификации вариантов, участвующих в процессе адаптации к условиям окружающей среды, что приобрело особый приоритет в связи с непредсказуемым изменением климата [Manunza A. et al., 2023]. Выявлены многочисленные позиционные и функциональные кандидаты, вовлеченные в формирование адаптаций к различным природно-климатически условиям [Kim E.S. et al., 2016; Mastrangelo S. et al., 2018; Bertolini F. et al., 2018; Mastrangelo S. et al., 2019; Abied A. et al., 2020; Serranito B. et al., 2021; Yao Z. et al. 2023].

Поддержание генетической изменчивости сельскохозяйственных животных значимо для разработки программ по их консервации и формулирования стратегий по их устойчивому разведени в условиях меняющегося климата [Lenstra J.A. et al., 2012; Zinovieva N.A. et al., 2020]. Оценка генетического разнообразия в популяциях сельскохозяйственных ивотных имеет особое значение для предотвра ения неуклонного роста инбридинга, приводящего к негативным последствиям и инбредной

депрессии, а также ставящего под угрозу исчезновения уязвимые малочисленные группы [Al-Mamun H.A. et al., 2015]. Несмотря на развитие ДНК-технологий, микросателлиты по-прежнему активно применятся для проведения генетической экспертизы племенной продукции и в криминалистике [Ogden R., Dawnay N., McEwing R., 2010; Linacre A., 2021]. Микросателлитный анализ также актуален для оценки аллелофонда аборигенных пород и популяций сельскохозяйственных животных [Зиновьева Н.А. и др., 2019; Юлдашбаев Ю.А. и др., 2020; Столповский Ю.А. и др., 2021; Бекетов С.В. и др., 2022; Траисов Б.Б. и др., 2023; Криворучко А.Ю. и др., 2024], разнообразие которых весьма велико как в экономически развитых, так и развивающихся странах [Laoun A. et al., 2020; BaN.V. et al., 2020; Banayo J.B. et al., 2023].

С внедрением ДНК-чипов наряду с классическими методами оценки генетического разнообразия активно используются альтернативные методы [Al-Mamun H.A. et al., 2015], которые ранее не могли быть реализованы в полной мере из-за отсуствия необходимых генетических данных, например, расчет эффективного числа популяции (Ne, effective population size) [Sved J.A., 1971; Hill W.G., 1981; Barbato M. et al., 2015] или идентификация протяженных сегментов гомозиготности (ROH, runs of homozygosity) и вычисление коэффициента геномного инбридинга (Froh) [Sölkner J. et al., 2010; Curik I., Ferenccakovicc M., Sölkner J., 2014].

ДНК-диагностика становится все более эффективным инструментом в предотвра ении распространения летальн х инфекций

сельскохозяйственных животных [Зиновьева Н.А. и др., 2017]. Скрепи овец -это фатальная инфекция из класса трансмиссивн х губчат х энцефалопатий (transmissible spongiform encephalopathies, TSE), вызываемая накоплением белков с аномальной структурой - патогенным прионовым белком (PrPSc) [Prusiner S., 1991; Hunter N. et al., 1997; Chong A. et al. 2021]. Мировая практика показала, что идентификация резистентных генотипов - это единственный способ профилактики возникновения вспышек скрепи в популяциях овец

[Hagenaars T.J. et al., 2010; Martemucci G. et al., 2015; Zabavnik J. et al., 2018; Rashaydeh F.S. et al. 2023; Eiríksson J.H., í>órarinsdóttir Gautason E., 2024].

Степень разработанности темы. Локальные породы овец и коз с каждым годом привлекают к себе все больший научный интерес отечественных и иностранных исследователей, так как они носители уникального генетического материала, обеспечивающего приспособленность к определенным условиям разведения и содержания [Tapio М. et al., 2005; Ferrando A. et al., 2014; Beynon S.E. et al., 2015].

Почти три десятилетия микросателлиты были доминирующими маркерами для исследования ядерного генома локальных пород сельскохозяйственных животных [Olschewsky A., Hinrichs D., 2021]. На основе применения микросателлитов у овец были решены различные задачи: оценено генетическое разнообразие и изучены филогенетические связи [Dalvit C. et al., 2008; Kusza S. et al., 2010; Ferrando A. et al., 2014; Xia Q. et al 2021]; разработаны мультиплексные панели для подтвер дения происхо дения [Yilmaz O., 2016] и породной принадлежности особей [Baumung R. et al., 2006; Mishra A.K. et al., 2023]; исследована структура популяции и обнаружен дрейф генов [Tapio I. et al., 2011; Neubauer V., et al., 2015; Karsli B.A. et al., 2020; Loukovitis D. et al., 2023]; установлена степень инбридинга в определенных группах и стадах [Pariset L. et al., 2003; Ben Sassi-Zaidy Y. et al. 2022]. Анализ полиморфизма микросателлитов также широко применяется для изучения генетических взаимосвязей некоторых пород овец, разводимых в России [Гладырь Е.А. и др. 2004; Tapio M. et al., 2007, Tapio M. et al., 2010; Гладырь Е.А. и др., 2012; Марзанов Н.С. и др., 2012; Гладырь Е.А. и др., 2013; Озеров М.Ю. и др., 2013; Широкова Н.В. и др., 2017; Озеров М.Ю. и др., 2019; Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А., 2022; Бекетов С.В. и др., 2022; Криворучко А.Ю. и др., 2024; Матюков В.С., Жариков Я.А., Канева Л.А., 2024]. Тем не менее, ранее проведенные генетические исследования овец, разводимых в России, по микросателлитным маркерам затрагивали отдельные группы пород, объединенные продуктивным типом или регионом разведения.

На основе анализа SNP-генотипов 74 трансграничных и локальных пород овец Kijas J. W. et al. (2012) изучили их демографическую историю и провели оценку их популяционной структуры. В аспекте рассмотрения исторических и экологических особенностей проведены многочисленные работы по оценке взаимосвязей с мировым генофондом и проанализировано генетическое разнообразие пород овец из Швейцарии [Burren A. et al., 2014], материковой Италии [Ciani E. et al., 2014; Mastrangelo S. et al., 2017], Сицилии [Mastrangelo S. et al., 2014], Бельгии [Meyermans R. et al., 2018], Франции [Rochus C.M. et al., 2018], Испании [Manunza A. et al., 2016], Греции [Michailidou S. et al. 2018], Уэльса [Beynon S.E. et al., 2015], Венгрии [Ramírez-Díaz J. et al., 2025], Индии [Eydivandi S. et al., 2021], Непала [Gorkhali N.A. et al., 2016], Китая [Zhao Y.X. et al. 2017; Cao Y.H. et al., 2021], Казахстана [Pozharskiy A. et al., 2020; Zhumadillayev N. et al., 2022], Ирана [Manzari Z. et al., 2019; Moosanezhad Khabisi M. et al., 2021; Mohamadipoor Saadatabadi L. et al., 2021], Африки [Ahbara A. et al., 2019; Dzomba E.F. et al., 2020; Missohou A. et al., 2022; Baazaoui I. et al., 2024; Da Silva A. et al., 2025] и Новой Зеландии [Brito L.F. et al. 2017]. Установлено генетическое влияние испанского мериноса на формирование тонкорунных пород [Ciani E. et al., 2020; Ceccobelli S. et al., 2023]. Выявлены следы адаптивной интрогрессии европейского муфлона в геномах домашних овец [Barbato M. et al., 2017]. С использованием ДНК-чипов были проведены исследования французской и американской популяций романовской породы [Rochus C.M. et al., 2018; Rochus C.M., Jonas E., Johansson A.M., 2020; Stegemiller M. R. et al., 2025; Ramírez-Díaz J. et al., 2025] и казахских популяций эдильбаевской породы [Pozharskiy A. et al., 2020; Zhumadillayev N. et al., 2022]. В аспекте разнообразия коз были установлены генетические связи между локальными и мировыми популяциями из различных стран [Stella A. et al., 2018], в том числе из Испании [Manunza A. et al., 2016], материковой Италии [Nicoloso L. et al. 2015; Cortellari M. et al. 2021], Сицилии [Tolone M. et al., 2022],Северо-Западной Европы [Manunza A. et al., 2023], Греции [Michailidou S. et al., 2019], Южной Африки [Visser C. et al.,

2016], Северной Африки [Ouchene-Khelifi N.A. et al., 2018], Пакистана [Muner R.D. et al., 2021], Монголии [Mukhina V. et al., 2022; Baldan S. et al., 2024]. Тем не менее, генетические взаимосвязи пород овец и коз, разводимых в России, с мировым генофондом с использованием полногеномного SNP-генотипирования не были изучены.

На основе применения ДНК-чипов у овец и коз с помощью различных статистических подходов были идентифицированы геномные регион , находящиеся под давлением селекции. Эти регионы содержали гены-кандидаты, ассоциированные с пигментацией шерстного покрова [García-Gámez E. et al., 2011; Kijas J.W. et al. 2012; Fariello M.I. et al., 2014; Rochus C.M. et al., 2018; Talenti A. et al., 2018], ростом, развитием и мясной продуктивностью [Kim E.S. et al., 2016; La Y. et al., 2019; Abied A. et al., 2020; Liu Z. et al., 2022; Li C. et al., 2023; Ramos Z. et al., 2023], молочной продуктивностью [Wei C.H. et al., 2015; Rochus C.M. et al., 2018; Ruiz-Larrañaga O. et al., 2018; Signer-Hasler H. et al., 2019; Ramljak J. et al., 2024], репродуктивными качествами [Kijas J.W. et al. 2012;, Sallam A.M. et al. 2023; Zhong T. et al., 2024], качеством шерсти [Demars J. et al., 2019], устойчивостью к паразитам [McRae K.M. et al., 2014; Estrada-Reyes Z.M. et al., 2019; Ahbara A.M. et al., 2021; Cunha S.M.F. et al., 2024], липидным метаболизмом [Li Y. et al., 2024], а также с формированием рогов или комолостью [Kijas J.W. et al. 2012; Liu Z.H. et al. 2016; Yao Z. et al. 2023]. Однако в отношении отечественных локальных пород мелкого рогатого скота такая информация отсутствует.

Несмотря на то, что анализ генотипов в информативных кодонах гена прионового протеина у некоторых пород овец, включая романовскую, были проведены Гладырь Е.А. и др. (2005) и Гладырь Е.А. и др. (2012). Тем не менее, в этих работах не была проведена оценка резистентности к атипичной форме скрепи.

Цель работы - дать характеристику разнообразия и вариабельности генома овец и коз, разводимых в России, в аспекте мирового генофонда.

Для достижения цели диссертационной работы были поставлены и решены следующие задачи:

1. Дать характеристику аллелофонда и генетического разнообразия двадцати пяти пород овец, разводимых в России, на основе анализа микросателлитов.

2. Оценить генетическое разнообразие, дифференциацию и структуру популяций двадцати пяти пород овец, разводимых в России, на основе полногеномных SNP-генотипов.

3. Изучить генетические взаимосвязи пород овец, разводимых в России, с мировым генофондом овец, представленным трансграничными и локальными породами других стран, и провести реконструкцию филогенетических связей с породами, распространенн ми в регионах прохождения Великого Шелкового пути.

4. Провести структурную и функциональную аннотацию генов, расположенных в наиболее часто встречающихся сегментах гомозиготности в геноме, у пород овец, разводимых в России.

5. Идентифицировать участки генома, находящиеся под давлением селекции, в популяциях овец, разводим х в России, на основе анализа высокоплотных SNP-генотипов. Выполнить структурную и функциональную аннотацию генов, расположенных в идентифицированных геномных регионах.

6. Выявить локусы количественных признаков в регионах, находящихся под давлением селекции, в популяциях овец, разводимых в России.

7. Провести сравнительные исследования домашних и диких Ovis с использованием STR и SNP-маркеров.

8. Выполнить анализ генетической устойчивости пород овец, разводимых в России, к классической и атипичной формам скрепи.

9. Изучить генетическое разнообразие, генетические взаимосвязи и структуру пород коз, разводимых в России, на основе полногеномных БКР-генотипов.

10. Дать характеристику паттернов распределения протяженных сегментов гомозиготности и выполнить аннотацию генов, расположенных в наиболее часто встречающихся сегментах гомозиготности, в геноме коз, разводимых в России.

11. Провести оценку генетического разнообразия и геномной архитектуры популяций коз оренбургской породы.

12. Изучить генетические связи популяций коз, разводимых в России, с мировым генофондом коз.

Научная новизна.

Впервые оценены генетическое разнообразие, генетические взаимосвязи и генетическая дифференциация двадцати пяти пород овец, разводимых в России, на основе микросателлитов. зучена генетическая структура популяций романовской породы из пяти регионов Российской Федерации. На основе анализа данных полногеномного SNP-генотипирования дана характеристика генофонда, рассчитан эффективный размер популяции, изучены паттерны распространения сегментов гомозиготности и оценен уровень геномного инбридинга двадцати пяти пород овец, разводим х в России. Установлены генетические взаимосвязи и оценена популяционная структура двадцати пяти пород овец, разводимых в России, на основе анализа данных полногеномного ^ИР-генотипирования. Изучены генетические взаимосвязи двадцати пяти пород овец, разводимых в России, с мировым генофондом, представленным 58 трансграничными и локальными породами, на основе анализа полногеномных SNP-генотипов. Дана оценка вклада российских пород в мировое генетическое разнообразие домашних овец на основании данных полногеномного ^ИР-генотипирования. Изучены филогенетические взаимосвязи пород овец, разводимых в России, с локальными породами, разводимыми на территории Республики Киргизии и

Персидского Нагорья. Идентифицированы островки гомозиготности в геномах пород овец, разводимых в России, и аннотированы ген , расположенные внутри них. Выявлены следы селекции в геномах девяти пород овец на основе генерации и анализа высокоплотных SNP-генотипов (600К), выполнена структурная и функциональная аннотация генов-кандидатов, локализованных внутри идентифицированных геномных регионов. Выполнен поиск локусов количественных признаков в геномных регионах, находящихся под давлением селекции. Проведено сравнение информативности STR - и SNP-маркеров для межвидовой дифференциации диких и домашних О vis и для выявления межвидовых гибридов. Проведен анализ генетической устойчивости овец двадцати пяти пород к классической и атипичной формам скрепи. На основе анализа данных полногеномного SNP-генотипирования дана характеристика генофонда, рассчитан эффективный размер популяции, изучены паттерны распространения сегментов гомозиготности и оценен уровень геномного инбридинга пород коз, разводимых в России. Установлены генетические взаимосвязи и оценена популяционная структура коз, разводимых в России на основе анализа данных полногеномного SNP-генотипирования. Идентифицированы островки гомозиготности в геномах коз, разводимых в России, и аннотированы гены, расположенные внутри них. Проведен сравнительный анализ генетической структуры современных популяций коз оренбургской породы в сравнении с архивными образцами. Изучены генетические взаимосвязи пород коз, разводимых в России, с трансграничными и локальными популяциями, из разных стран на основе анализа полногеномных SNP-генотипов.

Теоретическая и практическая значимость работы.

Дана характеристика аллелофонда двадцати пяти пород овец, разводимых в России, на основе анализа микросателлитов. Дана характеристика аллелофонда и генетического разнообразия семи групп овец романовской породы, разводимых в пяти различных регионах России. Выявлены общие геномные компоненты у грубошерстных жирнохвостых

пород, разводимых в России, и пород, разводимых на территории Китая, Персидского Нагорья и Республики Киргизии, которые могли возникнуть в результате обмена генетическим материалом в рамках Великого Шелкового пути. Это вносит вклад в понимание паттерна генетического разнообразия и распространения пород овец в Евразии. Идентифицированы гены-кандидаты и локусы, находящиеся под давлением селекции у пород овец, разводимых в России, с использованием различных подходов. Эти гены, связанные с экономически-значимыми признаками, могут быть использованы в качестве потенциальных мишеней для маркер-ориентированной селекции. Выявлены QTL в геномных регионах, находящихся под давлением селекции у пород овец, разводимых в России. Установлено, что у большинства исследуемых пород овец доминировал -аллель, связанн й с восприимчивость к скрепи, что, вероятно, указывает на необходимость проведения мониторинга племенных животных. Показана эффективность STR- и SNP-маркеров для идентификации диких и домашних Ovis, что может быть использовано в рамках зоологической экспертизы. В островках гомозиготности у пород коз и овец, разводимых в России, идентифицированы гены-кандидаты, связанные с важнейшими биологическими процессами. В островках гомозиготности на двенадцатой, восемнадцатой и двадцать пятой хромосомах у коз горноалтайской, алтайской белой пуховой, дагестанской пуховой и советской шерстной пород были локализованы гены, связанные с шерстной и пуховой продуктивностью, регулирующие липидный метаболизм, репродуктивные функции, рост и развитие, эмбриогенез, иммунитет и реакцию на гипоксию. В сравнительном аспекте с архивными образцами на основе полногеномных SNP-генотипов выявлено, что современные популяции оренбургской породы коз сохранили аутентичные геномные компоненты, что дает возможности для отбора доноров для консервации генетического материала и для сохранения этой уникальной породы для будущих поколений. Проведенная оценка генетического разнообразия пород коз, разводимых в России, в аспекте мирового генофонда способствуют лучшему пониманию генетических связей

коз, ведущих свое происхождение из Западной Азии и Евразии.

Методология и методы исследований.

Методология исследования основывалась на комплексном применении современных методов молекулярной биологии для оценки генетического разнообразия и идентификации генов-кандидатов, связанных с экономически значимыми признаками у исследуемых пород овец и коз.

Применяемые методики включали выделение и оценку качества растворов ДНК; проведение фрагментного анализа; полногеномное SNP-генотипирование на основе применения ДНК-чипов; анализ молекулярно-генетических данных (расчет показателей генетического разнообразия, характеристика аллелофонда, изучение генетической дифференциации между исследуем ми породами, анализ генетической структур , в числение эффективного размера популяции, поиск протяженных сегментов гомозиготности и расчет коэффициента геномного инбридинга); исследование геномных регионов, исп тыва их давление селекции; идентификаци генов-кандидатов, связанных с экономически значимыми и адаптационными признаками; структурная и функциональная аннотация; изучение генной онтологии; оценку генетической устойчивости овец к скрепи.

Список литературы диссертационного исследования доктор наук Денискова Татьяна Евгеньевна, 2026 год

СПИСОК ИСПОЛЬЗУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫ

1. Абдельманова, А. С. Генетическое разнообразие современного и исторического бурого и палевопестрого скота / А. С. Абдельманова, О. И. Боронецкая, М. С. Форнара [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2023.

- Т. 37, № 9. - С. 39-47. - DOI: 10.53859/02352451_2023_37_9_39.

2. Абдельманова, А. С. Характеристика генетического разнообразия современной и архивной популяций крупного рогатого скота черно-пестрой породы с использованием микросателлитных маркеров / А. С. Абдельманова, В. В. Волкова, А. В. Доцев, Н. А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК.-2020.-Т. 34, №2.-С. 34-38. ^01: 10.24411/0235-2451-2020-10207.

3. Абонеев, В. В. Некоторые пути сохранения и совершенствования племенн х ресурсов в отечественном овцеводстве / . . бонеев, Е. . Абонеева // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2022. - № 3. - С. 3-6. - D0I: 10.26897/2074-0840-2022-3-3-6.

4. йбазов, . . втохтонная карачаевская порода коз: генотипы и некоторые экстерьерные и интерьерные показатели / М. М. Айбазов, М. И. Селионова, М. С. Сеитов, Ш. М. Биктеев // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2022. - № 5(97). - С. 300-306. -D0I: 10.37670/2073-0713-2022-97-5-300-305.

5. льков, Г. В. уховое козоводство в лтайском горном регионе / Г. В. Альков // Сельскохозяйственный журнал. - 2007. - № 3-3. - С. 94-98.

6. Багиров, В. А. Влияние криоконсервации на биологические параметры семени у гибридов романовской породы и архара / В. А. Багиров, Б. С. Иолчиев, Н. А. Волкова, Н. А. Зиновьева // Сельскохозяйственная биология. - 2017. - Т. 52, № 2. - С. 268-273. - D0I: 10.15389^гоЫо^у.2017.2.268гш.

7. Батыров, В. В. Адаптация калмыцкого овцеводства к административным и природно-климатическим факторам в XIX веке / В. В. Батыров // Вестник Калмыцкого университета. - 2022. - № 3 (55). - С. 22-27.

- D0I: 10.53315/1995-0713-2022-55-3-22-27.

8. Бекетов, С. В. Генетическое разнообразие и филогения пуховых коз Центральной и Средней Азии / С. В. Бекетов, А. К. Пискунов, В. Н. Воронкова [и др.] // Генетика. - 2021. - Т. 57, № 7. - С. 810-819. - DOI: 10.31857/S0016675821070031.

9. Бекетов, С. В. Популяционно-генетическая характеристика тувинских короткожирнохвостых овец / С. В. Бекетов, Е. А. Коноров, А. К. Пискунов [и др.] // Генетика. - 2022. - Т. 58, № 3. - С. 332-342. - DOI: 10.31857/S0016675822030031.

10. Белобородова, И. Н. Власть и общество на европейском севере России: проблема взаимодействия в области модернизации народной агрикультуры (конец XIX начала XX века) / И. Н. Белобородова // Via in tempore. История. Политология. - 2014. - № 1 (172). - С. 120-127.

11. Билтуев, С. И. Современное состояние полугрубошерстного и грубошерстного овцеводства в Республике Бурятия / С. И. Билтуев, Б.В. Жамьянов, AM. Попов // Значение и перспективы развития овцеводства в аграрной экономике Сибири и Дальнего Востока: материалы международной научно-практической конференции, посвящённой 60-летию Забайкальской породы овец. - Чита: Экспресс-издательство, 2016. - С. 52-57.

12. Боголюбова, Н. В. Биологические параметры пищеварительных и обменных процессов у межвидовых гибридов домашней овцы (Ovis aries) и архара (Ovis ammon polii) / Н. В. Боголюбова, В. Н. Романов, В. А. Девяткин [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - Т. 51, № 4. - С. 500-508. -DOI: 10.15389/agrobiology.2016.4.500rus.

13. Васильченко, А. А. История техники вязания (к вопросу о возникновении а урного пуховязания на ном рале) / . . Васильченко // Вестник Оренбургского государственного университета. - 2015. - № 5 (180). -С. 4-10.

14. Васильченко, А. А. Трансформация природного мотива как метод формообразования орнамента пухового платка Оренбуржья / А. А. Васильченко // Вестник РГГУ. Серия «Философия. Социология.

Искусствоведение». - 2023. - № 3. - С. 119-134. - D0I: 10.28995/2073-64012023-3-119-134.

15. Владимиров, Л. Н. Об опыте гибридизации домашней овцы со снежным бараном в Якутии / Л. Н. Владимиров, Г. Н. Мачахтыров, В. А. Мачахтырова, А. Г. Пудов // Наука и техника в Якутии. - 2014. - № 1 (26). -С. 86-88.

16. Воронкова, В. Н. Оценка генетического разнообразия и структуры автохтонных пород лошадей России и Монголии с использованием ядерных и митохондриальных ДНК-маркеров / В. Н. Воронкова, Э. А. Николаева, А. К. Пискунов [и др.] // Генетика. - 2022. - Т. 58, № 8. - С. 902-919. - D0I: 10.31857^0016675822080100.

17. Гаджиев, З. К. Грубошерстные овцы Дагестана / З. К. Гаджиев, Г. Т. Бобрышова // Сельскохозяйственный журнал. - 2017. - № 10. - С.3-10.

18. Гаджиев, З. К. Грубошерстные овцы Дагестана: монография / З. К. Гаджиев; Ставроп. НИИ животноводства и кормопроизводства РАСХН; Минсельхоз РФ. - Махачкала, 2010. - 205 с.

19. Гладырь, Е. А. Характеристика романовской породы овец по гену прионового протеина / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, А. В. Гусева [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2012. - № 8. - С. 52-55.

20. Гладырь, Е. А. Генотипирование российских пород овец по микросателлитным маркерам и РгР (гену прионового белка) / Е. А. Гладырь,

H. А. Зиновьева, Л. К. Эрнст, Г. Брем // Ветеринарная патология. - 2005. - №

I.-С. 26-32.

21. Гладырь, Е. А. Использование микросателлитов для характеристики аллелофонда популяций крупного рогатого скота Таджикистана / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, В. А. Багиров [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2012. - № 8. - С. 58-62.

22. Гладырь, Е. А. Методические рекомендации по генодиагностике устойчивости овец различных пород к скрепи / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, Л. К. Эрнст, Г. Брем. - Москва, 2006. - 26 с.

23. Гладырь, Е. А. Оценка степени дифференциации эдильбаевской и калмыцкой пород овец по микросателлитам / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, Н. В. Чимидова [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2013. - № 3. -С. 68-70.

24. Гладырь, Е. А. Характеристика аллелофонда овец юга России / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, С. С. Бурылова [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2012. - № 11. - С. 34-37.

25. Гладырь, Е. А. Характеристика генофонда и выявление генеалогических связей между породами овец России с использованием ДНК-микросателлитов / Е. А. Гладырь, Н. А. Зиновьева, Г. Брем // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. - 2004. - № 2. - С. 26-29.

26. Гончаренко, Г. М. Генетические маркеры в селекции овец / Г. М. Гончаренко, Т. Н. Хамируев, С. М. Дашинимаев [и др.] // Вестник НГАУ (Новосибирский государственный аграрный университет). - 2023. - № 4 (69). -С. 147-161.-DOI: 10.31677/2072-6724-2023-69-4-147-161.

27. Давыдова, С. А. Кустарная промышленность России. Женские промыслы: Очерки С. А. Давыдовой, Е. Н. Половцевой, К. И. Беренса и Е. О. Свидерской / С. А. Давыдова. - Типо-литография «Якорь»; СПб., Россия, 1913.

- Производство пуховых платков в Оренбургском крае. - С. 246-247.

28. анилов, . Б. зучение продуктивности, химического состава и пищевой ценности мяса овец породы «Буубэй» / М. Б. Данилов, А. А. Мерзляков, С. Н. Павлова [и др.] // Журнал «Все о мясе». - 2018. - № 3. - С. 52-54. -DOI: 10.21323/2071-2499-2018-3-52-54.

29. Двалишвили, В. Г. Романовская порода овец, методы повышения мясной продуктивности / В. Г. Двалишвили //Сельскохозяйственный журнал.

- 2017. - № 10.-С. 88-96

30. Денискова, Т. Е. Генетическая характеристика региональных популяций ненецкой породы северного оленя (Rangifer tarandus) / Т. Е. Денискова, В. Р. Харзинова, А. В. Доцев [и др.] // Сельскохозяйственная

биология. - 2018. - Т. 53, № 6. - С. 1152-1161. - D0I: 10Л5389^гоЫо^у.2018.6.1152гш.

31. Денискова, Т.Е. Динамика аллелофонда ливенской породы свиней / Т. Е. Денискова, А. С. Абдельманова, В. Р. Харзинова, Н. А. Зиновьева // Свиноводство. - 2024. - № 5. - С. 21-25. - D0I: 10.37925/0039-713Х-2024-5-21-25.

32. енискова, Т. Е. дентификация генов-кандидатов, связанных с ростом и развитием овец из кроссбредной популяции, с использованием полногеномного поиска ассоциаций / Т. Е. Денискова, О. А. Кошкина, С. Н. Петров, А. А. Сермягин, Н. А. Зиновьева // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. - 2024. - Т. 25, № 2. - С. 236-250. - D0I: 10.30766/20729081.2024.25.2.236-250.

33. Долаев, А. Воспроизводительная функция аборигенных карачаевских коз / А. Долаев // Сельскохозяйственный журнал. - 2009. - Т. 1, № 1-1.-С. 19-20.

34. Долгих, О. С. Особенности развития отечественного овцеводства и козоводства / О. С. Долгих, Т. Н. Вахнина, А. А. Москалев // Вестник Курской государственной сельскохозяйственной академии. - 2012. - № 8. - С. 64-67.

35. унин, . . Справочник пород и типов сельскохозяйственных животных, разводимых в Российской Федерации / Под ред. И. М. Дунина, А. Г. Данкверта. -М.: ВНИИПЛЕМ, 2013.

36. Егоров, . В. Современное состояние овцеводства в Российской Федерации / М. В. Егоров // Значение и перспективы развития овцеводства в агарной экономике Сибири и Дальнего Востока: материалы Междунар. науч.-практ. конф., посвящённой 60-летию Забайкальской породы овец. - Чита : Экспресс-издательство, 2016. - С. 13-22.

37. Е егодник по племенной работе в овцеводстве и козоводстве в хозяйствах Российской Федерации (2023) / Г. Ф. Сафина, О. Н. Луконина, Г. И. Шичкин, В. В. Чернов, Л. Н. Григорян, Г. Н. Хмелевская, С. А. Хататаев,

А. В. Равичева, Н.Г. Степанова (ред.). - Лесные Поляны, Россия: ВНИИПЛЕМ, 2024.

38. Ежегодник по племенной работе в овцеводстве и козоводстве в хозяйствах Российской Федерации (2024 год) / изд-во ФГБНУ ВНИИплем. -Москва, 2025.-311 с.

39. Ельчина, А. П. Пуховязальный промысел полиэтнического региона. рактика сохранения оренбургского пухового платка в художественном музее / А. П. Ельчина // В мире науки и искусства: вопросы филологии, искусствоведения и культурологии. -2017. -№ 3 (70). -С. 31-35.

40. Ерохин, . . Состояние, динамика и тенденции в развитии овцеводства в мире и в России / А. И. Ерохин, Е. А. Карасев, С. А. Ерохин // Овцы, козы, шерстяное дело. -2019. - № 3. - С. 3-6.

41. Заваденко, Н. Н. Прионные заболевания человека: современные аспекты / Н. Н. Заваденко, Г. Ш. Хондкарян, Р. Ц. Бембеева [и др.] // Журн. невропатол. и психиатр. - 2018. - Т. 118, № 6. - С. 88-95. - DOI: 10.17116/|пеуго20181186188.

42. Завалишин, И. А. Синдром Герстманна-Шреусслера: новые возможности диагностики / И. А. Завалишин, Л. С. Адарчева, В. М. Ройхель [и др.] // Журн. невропатол. и психиатр. - 1995. - № 1. - С. 8-63.

43. Загиров, Н. Г. Научное обеспечение - залог эффективного и конкурентоспособного животноводства Дагестана / Н. Г. Загиров // Сельскохозяйственный журнал. - 2014. - Т. 3, № 7. - С. 3-11.

44. Зиновьева, Н. Гаплотипы фертильности голштинского скота / Н. Зиновьева, Н. Стрекозов, Г. Ескин [и др.] // Животноводство России. - 2017. -№ S2. - С. 17-20.

45. Зиновьева, Н. А. Выделение ДНК из биоматериалов сельскохозяйственных животных: методическое руководство / Н. А. Зиновьева, Е. А. Гладырь, В. Р. Харзинова. - Подольск, 2023.

46. Зиновьева, Н. А. Генетическая экспертиза сельскохозяйственных животных: применение тест-систем на основе микросателлитов / Н. А. Зиновьева, Е. А. Гладырь // Достижения науки и техники АПК. - 2011. - № 9.

47. Зиновьева, Н. А. Генетические ресурсы животных: развитие исследований аллелофонда российских пород крупного рогатого скота -мини-обзор / Н. А. Зиновьева, А. А. Сермягин, А. В. Доцев [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2019. - Т. 54, № 4. - С. 631-641. - D0I: 10Л5389^гоЫо^у.2019.4.631гш.

48. Зиновьева, Н. А. Коллекции генетических ресурсов сельскохозяйственных ивотных и их значение для развития науки и практического животноводства / Н. А. Зиновьева // Международный Конгресс «УШ Съезд Вавиловского общества генетиков и селекционеров, посвященный 300-летию российской науки и высшей школы»: сборник тезисов. - Санкт-Петербург, 2024. - С. 58.

49. Зиновьева, . . етодические рекомендации по использовани метода полимеразной цепной реакции в животноводстве / Н. А. Зиновьева, А.Н. Попов, Л.К. Эрнст и др. - М.: Щербинская тип., 1998. - 47 с.

50. Зиновьева, . . екоторые аспекты использования микросателлитов в свиноводстве / Н. А. Зиновьева, Е. И. Сизарева, Е. А. Гладырь [и др.] //Достижения науки и техники АПК. - 2009. - № 8.

51. Зуев, В. А. Медленные инфекции человека и животных / В. А. Зуев // Вопросы вирусологии. - 2014. - Т. 59, № 5. - С. 5-12.

52. Зуев, В. А. Прионные болезни человека и животных: руководство для врачей/В. А. Зуев, И. А. Завалишин, В. М. Ройхель. -М.: Медицина, 1999.

53. Зуев, В. А. Современное состояние проблемы прионных болезней и причины их опасности для человека и животных / В. А. Зуев, С. Л. Кальнов, Н. Ю. Куликова, Т. В. Гребенникова // Вопросы вирусологии. - 2020. - Т. 65, № 2. - С. 71-76. ^01: https://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-2-71-76.

54. Иванникова, А. В. Характеристика аллелофонда овец южной мясной породы с использованием микросателлитных маркеров / А. В.

Иванникова, А. Д. Соловьева, Т. Е. Денискова // Генетика и разведение животных. - 2023. - № 4. - С. 80-85. - DOI: 10.31043/2410-2733-2023-4-80-85.

55. Иванов, М. Ф. Волошские овцы / М. Ф. Иванов; Всесоюзное акционерное общество "Шерсть", Бюро по овцеводству. - М.: Центральное управление печати ВСНХ СССР, 1925. - 92 с.

56. Колосов, Ю. А. Некоторые исторические и современные аспекты мериносового овцеводства России / Ю. А. Колосов, А. И. Клименко, В. В. Абонеев // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2014. - № 2. - С. 2-4.

57. Колосов, Ю. А. Сальская порода овец - история развития и совершенствования / Ю. А. Колосов, И. В. Засемчук, Н. В. Широкова, Н. Ф. Бакоев // Сельскохозяйственный журнал. - 2014. - № 3 (7). - С. 84-87.

58. Косилов, В. И. Продуктивные качества овец разных пород на Южном Урале: монография / В. И. Косилов, П. Н. Шкилев, Е. А. Никонова. -Оренбург: Оренбургский ГАУ, 2014. - 452 с. - ISBN 978-5-88838-887-7. -Текст: электронный // Лань: электронно-библиотечная система. - URL: https://elanbook.com/book/134505 (дата обращения: 13.05.2025). - Режим доступа: для авторизованных пользователей.

59. Кошкина, О. А. Исследование генетической резистентности к скрепи у баранов южной мясной породы / О. А. Кошкина, Т. Е. Денискова, А. В. Иванникова, Н. А. Зиновьева // Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса: Наука и высшее профессиональное образование. -2024. -№ 3 (75). - С. 257-266. -DOI: 10.32786/2071-9485-202403-30.

60. Криворучко, А. Ю. Использование микросателлитных локусов для генетической идентификации овец шерстного направления продуктивности в Ставропольском крае / А. Ю. Криворучко, А. В. Скокова, Л. Н. Скорых [и др.] //Животноводство и кормопроизводство. - 2024. - № 2. - С. 71-84. -DOI: 10.33284/2658-3135-107-2-71.

61. Криворучко, А. Ю. Поиск генов-кандидатов, ассоциированных с высотой в крестце у овец породы российский мясной меринос / . . Криворучко, А. А. Каниболоцкая, А. В. Скокова [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2024. - Т. 38, № 1. - С. 46-51. - D0I: 10.53859/0235-2451_2024_38_1_46.

62. Кызыл-оол, И. Т. Овцеводство Тувинской АССР: историко-зоотехнический очерк / . Т. Кызыл-оол. - Кызыл: Тувкнигоиздат, 1975. - 263 с.

63. Лебель, Л. Д. Козоводство и козы Дагестана / Л. Д. Лебель, Ю. Г. Зеленский; отв. ред. П. В. Трофимов, под общ. ред. проф. Я. Я. Луса. -Пятигорск: Севкавведиздат, 1936. - 59, [4] с. : ил.; 22*15 см. - (Труды института).

64. Лопырин, А. И. Опыт скрещивания овец и коз с туром и серной / А. И. Лопырин, Н. В. Логинова, А. П. Инякова // Труды Тебердинского гос. заповедника. - 1960. - Вып. 2. - С. 305-309.

65. Лущихин, М. Н. Тонкорунное овцеводство Кыргызстана / М. Н. Лущихин. - Фрунзе: Киргосиздат, 1964. - 231 с.

66. акарова, Е. . инейн й рост коз советской ерстной породы тувинской популяции / Е. Ю. Макарова, Ч. С. Самбу-Хоо, В. Г. Двалишвили // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2018. - № 2. - С. 16-18.

67. Мамонтова, Т. В. Продуктивные и воспроизводительные особенности местных карачаевских коз / Т. В. Мамонтова, З. К. Гаджиев, А-М. М. Айбазов // Сельскохозяйственный журнал. - 2011. - Т. 1, № 4-1. - С. 15-17.

68. арзанов, . . Генетические особенности овец отечественн х и зарубежных тонкорунных пород / Н. С. Марзанов, Х. А. Амерханов, В. С. Фокеев [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2012. - № 2. - С. 14-26.

69. Матюков, В. С. Генетическая структура печорской популяции полутонкорунных овец по аллелям STR локусов / В. С. Матюков, Я. А.

Жариков, Л. А. Канева // Достижения науки и техники АПК. - 2022. - Т. 36, № 3. - С. 91-96. ^01: 10.53859/02352451_2022_36_3_91.

70. Матюков, В. С. Характеристика овец Приполярья по микросателлитам и репродуктивным способностям / В. С. Матюков, Я. А. Жариков, Л. А. Канева // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. -2024. - Т. 54, № 4. - С. 76-87. ^01: 10.26898/0370-8799-2024-4-9.

71. едведев, . В. ткормочные и убойные качества овец куйбышевской породы и ее помесей с мясо-шерстными баранами / М. В. Медведев, А. И. Ерохин // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2004. - № 1. - С. 29-30.

72. Методические указания по патогистологической диагностике прионных инфекций животных. - 1997. - № 13-17-2/939.

73. Мирошина, Т. А. Козлятина: польза и потенциал / Т. А. Мирошина // Вестник Красноярского государственного аграрного университета. - 2024. - № 3 (204). - С. 214-220. ^01: 10.36718/1819-4036-2024-3-214-220.

74. Монгуш, С. С.-О. Продуктивные особенности баранов-производителей с разным типом шерстного покрова / С. С.-О. Монгуш // Вестник Красноярского государственного аграрного университета. - 2022. -№ 7 (184). - С. 171-175. - D0I: 10.36718/1819-4036-2022-7-171-175.

75. Мурзина, Т.В. Становление тонкорунного овцеводства и современное состояние овец в Забайкальском крае / Т. В. Мурзина, В. А. Вершинина // Информационный бюллетень. - 2016. - № 1 (11). - С. 35-41.

76. Мусалаев, X. X. Результаты научных исследований по овцеводству и козоводству Дагестана / Х. Х. Мусалаев, Г. А. Палаганова, Р. А. Абдуллабеков // Горное сельское хозяйство. - 2015. - № 2. - С. 121-124.

77. Мусалаев, Х. Х. Совершенствование продуктивных качеств помесных молочных коз / Х. Х. Мусалаев, Г. А. Палаганова, Р. А. Абдуллабеков // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2016. - № 2. - С. 10-11.

78. Мусалаев, Х. Х. Создание племенного репродуктора по разведению молочных коз зааненской породы в Республике Дагестан / Х. Х.

Мусалаев, Г. А. Палаганова // Горное сельское хозяйство. - 2019. - № 3. - С. 112-114. ^01: 10.25691^Н.2019.3.023.

79. Мусалаев, Х. Х. Состояние и перспективы развития грубошерстного овцеводства и козоводства Республики Дагестан / Х. Х.

усалаев // овы ение конкурентоспособности ивотноводства и актуальные проблемы его научного обеспечения: сб. науч. тр. по материалам международ. науч.-практ. конф. ФГБНУ ВНИИОК. - Ставрополь, 2014. - Т. 3, вып. 7.-С. 88-91.

80. Недашковский, И. С. Влияние уровня гомозиготности по STR-маркерам быков-производителей голштинской породы на показатели наследования типа телосложения их дочерей на основе линейной оценки / И. С. Недашковский, А. Ф. Контэ, В. В. Волкова, А. А. Сермягин // Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса: Наука и высшее профессиональное образование. - 2022. - № 4 (68). - С. 294-302. - D0I: 10.32786/2071-9485-2022-04-35.

81. Недашковский, И. С. Популяционно-генетическая характеристика, оценка геномного инбридинга и гомозиготности крупного рогатого скота черно-пестрой и голштинской пород по STR и ^ИР маркерам в России / И. С. Недашковский, А. А. Сермягин, О. В. Костюнина [и др.] // Вестник Пермского университета. Серия: Биология. - 2021. - № 4. - С. 295-306. ^01: 10.17072/1994-9952-2021-4-295-306.

82. Никипелов, В. И. Разработка мультилокусной STR-панели и оценка достоверности происхождения аквакультурной стерляди (АЫрепэег гаШеп^) / В. И. Никипелов, В. Р. Харзинова, В. В. Волкова [и др.] // Известия Нижневолжского агроуниверситетского комплекса: Наука и высшее профессиональное образование. - 2024. - № 3 (75). - С. 273-283. - D0I: 10.32786/2071-9485-2024-03-32.

83. Новопашина, С. И. Перспективы развития и научного обеспечения молочного и мясного козоводства в России / С. И. Новопашина, Н. Ю. Санников // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2013. - № 2. - С. 61-65.

84. Новопашина, С. И. Состояние и перспективные направления улучшения генетического потенциала мелкого рогатого скота. Научный аналитический обзор / С. И. Новопашина, М. Ю. Санников, С. А. Хататаев, Т. Н. Кузьмина, Г. Н. Хмелевская, Н. Г. Степанова, А. И. Тихомиров, Т. Е. Маринченко. - М., 2019.

85. Новопашина, С. И. Сохранение придонской пуховой породы коз / С. И. Новопашина, М. Ю. Санников // Сельскохозяйственный журнал. - 2007. -Т. 1, № 1-1.-С. 121-123.

86. Овцеводство / Академик М. Ф. Иванов. - 3-е изд., испр. и доп. -Москва: Сельхозгиз, 1935 («Образцовая» тип. и 1 журн. тип. Онти). - 816 с. : ил.; 23^16 см.

87. Озеров, М. Ю. Влияние факторов окружающей среды на генетическую изменчивость грубошерстных пород овец / М. Ю. Озеров, М. Тапио, Ю. Кантанен [и др.] // Российская сельскохозяйственная наука. - 2019. - № 6. - С. 40-44. ^01: 10.31857^2500-26272019640-44.

88. Озеров, М. Ю. Генетическая категоризация полутонкорунных пород овец: приоритеты по их сохранению / М. Ю. Озеров, М. Тапио, Ю. Кантанен [и др.] //Проблемы биологии продуктивных животных. - 2013. - № 3.-С. 16-24.

89. етров, . . сновные направления селекции оренбургских пуховых коз / Н. И. Петров // Животноводство и кормопроизводство. - 2014. -№5(88).-С. 57-60.

90. етров, С. . Генетическая характеристика представителей рода Сарга с использованием STR-маркеров / С. Н. Петров, Т. Е. Денискова, А. В. Доцев // Достижения науки и техники АПК. - 2023. - Т. 37, № 9. - С. 74-79. -D0I: 10.53859/02352451_2023_37_9_74.

91. Петров, С. Н. Разработка мультиплексной STR-панели для контроля достоверности происхо дения и характеристики генетического разнообразия коз / С. Н. Петров, В. Р. Харзинова, Е. А. Гладырь [и др.] //

Достижения науки и техники АПК. - 2018. - Т. 32, № 11. - С. 60-63. - D0I: 10.24811/0235-2451-2018-11116.

92. Пресмаков, В. В. Промышленный переворот в Англии / В. В. Пресмаков, Д. М. Широких // Экономика и социум. - 2014. - № 4-4 (13).

93. Пушкарёв, Н. Н. Перспективы разведения коз оренбургской породы / Н. Н. Пушкарёв // Известия Оренбургского государственного аграрного университета. - 2017. - № 3 (65). - С. 152-154.

94. Решение Коллегии Евразийской экономической комиссии от 2 июня 2020 г. № 74 «Об утверждении Положения о проведении молекулярно-генетической экспертиз племенной продукции государств-членов Евразийского экономического союза».

95. ед х, Т. . арактеристика генетического полиморфизма лошадей башкирской породы / Т. А. Седых, Р. Р. Гизатуллин, Д. И. Гареева [и др.] // Зоотехния. - 2024. - № 10. - С. 14-19. - D0I: 10.25708ZZT.2024.32.22.004.

96. Селионова, М. И. Из истории российского овцеводства и его научного сопровождения / М. И. Селионова. - М.: ФГБНУ ВНИИОК, 2017. -238 с.

97. Селионова, М. И. Полногеномный поиск ассоциаций однонуклеотидных замен с жирнокислотным составом молока карачаевских коз / М. И. Селионова, В. И. Трухачев, А. М. Айбазов [и др.] // Молочное и мясное скотоводство. - 2023. - № 6. - С. 10-15. - D0I: 10.33943/mms.2023.77.99.002.

98. Селионова, М. И. Состояние молочного овцеводства и перспектив применения геномн х методов для улуч ения продуктивности овец и состава молока / М. И. Селионова, А-М. М. Айбазов, М. Ю. Гладких // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2024. - № 1. - С. 3-9. - D0I: 10.26897/20740840-2024-1-3-9.

99. Селионова, М. И. Сохранение и рациональное использование генетических ресурсов овец и коз / М. И. Селионова // Животноводство и

кормопроизводство. - 2019. - Т. 102, № 4. - С. 272-277. - DOI: 10.33284/26583135-102-4-272.

100. Селькин, И. И. Северокавказская мясо-шерстная порода / И. И. Селькин, В. В. Абонеев. - Ставрополь, 2007. - 174 с.

101. Селькин, И. И. Создание и совершенствование полутонкорунных пород овец / И. И. Селькин, А. Н. Соколов // Овцы, козы, шерстяное дело. -2002. -№3.-С. 10-12.

102. Сермягин, А. А. Идентификация SNPs для показателей роста и развития коз (Capra hircus Linnaeus, 1758) из ресурсной популяции в возрастной динамике / А. А. Сермягин, Т. Е. Денискова, И. В. Гусев [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2024. - Т. 59, № 4. - С. 633-648. - DOI: 10.15389/agrobiology.2024.4.633rus.

103. Скобелева, Т. «Промыслы / мягкий и пушистый» / Т. Скобелева, О. Максимова // Прямые инвестиции. - 2008. - № 8. - С. 46-47.

104. Столповский, Ю. А. Анализ генетической изменчивости и филогенетических связей у популяций тувинской короткожирнохвостой овцы с использованием ISSR-маркеров / Ю. А. Столповский, Л. В. Шимиит, Н. В. Кол [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2009. - № 6. - С. 34-43.

105. Столповский, Ю. А. Генетическая структура аборигенного тагильского скота по STR- и SNP-маркерам / Ю. А. Столповский, С. В. Бекетов, Е. В. Солоднева [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2021. -Т. 56, №6.-С. 1123-1133.-DOI: 10.15389/agrobiology.2021.6.1123rus.

106. Столповский, Ю. А. Популяционно-генетические основы сохранения ресурсов генофондов доместицированных видов животных: автореф. дис. ... на соиск. уч. степ. доктора биол. наук: специальность 03.02.07 «Генетика» / Ю. А. Столповский. - М., 2010. - 48 с.

107. Струздюмов, Н. Оренбургский платок. Пуховязальные места и их обитатели: очерки, рассказы / Н. Струздюмов. - М.: Современник, 1985.

108. Суров, А. И. Перспективы развития отрасли молочного овцеводства / А. И. Суров, Н. В. Сулыга, Е. Д. Карпова, Д. Д. Евлагина // Зоотехния. - 2024. - № 9. - С. 22-26. - DOI: 10.25708/ZT.2024.94.92.006.

109. Тайшин, В. А. Аборигенная бурятская овца / В. А. Тайшин, Б. Б. Лхасаранов; отв. ред. С.Н. Балдаев; Рос. акад. наук, Сиб. отд-ние, Бурят. науч. центр, Байкал. ин-т рационального природопользования. - Улан-Удэ: Изд-во БНЦ СО РАН, 1997. - 123, [1] с.: ил.: 21 см. - ISBN 5-7925-0006-1.

110. Траисов, Б. Б. Изучение породных ресурсов и генетической структуры полутонкорунных овец мясо-шерстного направления западного региона Казахстана / Б. Б. Траисов, А. М. Давлетова, Г. К. Есеева [и др.] // Животноводство и ветеринарная медицина. - 2023. - № 2 (49). - С. 33-37.

111. Трухачев, . . олногеномн й поиск ассоциаций однонуклеотидных замен с показателями молока карачаевских коз / В. И. Трухачев, М. И. Селионова, Н. А. Зиновьева [и др.] // Достижения науки и техники АПК. - 2023. - Т. 37, № 12. - С. 17-23. - DOI: 10.53859/02352451_2023_37_12_17.

112. Урусов, С. П. Коза и значение ее в сельскохозяйственном животноводстве: Докл. инспектора сел. хоз-ва кн. С. П. Урусова / Х.О.С.Х. и С.П. обл. съезд по животноводству. - Харьков: типо-лит. И. М. Варшавчика, ценз. 1903.-9 с. : 25.

113. Федосеев, Р. В. Животноводство как важный структурный элемент дворянских хозяйств Среднего Поволжья во второй половине XIX - начале XX в. / Р. В. Федосеев// Экономическая история. -2015. -№ 3 (30). - С. 55-61.

114. Фисинин, В. И. Генетическая дифференциация индеек разных пород по микросателлитным маркерам / В. И. Фисинин, М. И. Селионова, Д. А. Ковалев, Л. А. Шинкаренко // Сельскохозяйственная биология. - 2021. - Т. 56, №4.-С. 651-663. - DOI: 10.15389/agrobiology.2021.4.651rus.

115. Форнара, М. С. Исследование аллелофонда и генетической дифференциации дальневосточных пчел / М. С. Форнара, А. С. Крамаренко,

М. А. Шаров, Н. А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. - 2016. -Т. 30, № 10.-С. 101-104.

116. Хамируев, Т. Н. Ассоциация полиморфизма генов GDF9/G1, CAST, KRT1.2, KAP1.3 с экономически важными признаками пород овец Забайкалья / Т. Н. Хамируев, Г. М. Гончаренко, С. М. Дашинимаев [и др.] // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. - 2024. - Т. 54, № 9 (310). -С. 82-91.-DOI: 10.26898/0370-8799-2024-9-9.

117. Харзинова, В. Р. Изучение популяционной структуры и генетического разнообразия чукотской породы северного оленя на основе анализа микросателлитов / В. Р. арзинова, . В. Кудрявцев, . . Семерикова, Н. А. Зиновьева // Достижения науки и техники АПК. - 2023. -Т. 37, № 9. - С. 87-92. - DOI: 10.53859/02352451_2023_37_9_87.

118. Харзинова, В. Р. Паттерн генетического разнообразия у локальных и коммерческих пород свиней на основе анализа микросателлитов / В. Р. Харзинова, Н. А. Зиновьева // Вавиловский журнал генетики и селекции. -2020. - Т. 24, № 7. - С. 747-754. - DOI: 10.18699/VJ20.669.

119. Харзинова, В. Р. Популяционно-генетическая характеристика некоторых пород коз на основе анализа микросателлитов / В. Р. Харзинова, С. Н. Петров, А. В. Доцев, Н. А. Зиновьева// Овцы, козы, шерстяное дело. - 2019. - № 3. - С. 7-11.

120. Харзинова, В. Р. Применение микросателлитов в популяционно-генетических исследованиях северного оленя (Rangifer tarandus) (обзор) / В. Р. Харзинова, Н. А. Зиновьева // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. - 2024. -Т. 25, № 4. - С. 525-537. - DOI: 10.30766/2072-9081.2024.25.4.525-537.

121. арзинова, . Р. арактеристика генетической структур аквакультурной и дикой популяций стерляди (Acipenser ruthenus Linnaeus, 1758) на основе анализа микросателлитов / В. Р. Харзинова, В. В. Волкова, В. И. Никипелов [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2024. - Т. 59, № 4. -С. 666-679. -DOI: 10.15389/agrobiology.2024.4.666rus.

122. Ходусов, А. А. Показатели тонины пуха тувинских коз в зависимости от возраста / А. А. Ходусов, Р. Ш. Иргит, М. Е. Пономарева [и др.] // Аграрный вестник Северного Кавказа. - 2023. - № 4 (52). - С. 45-51. -DOI: 10.31279/2949-4796-2023-4-52-45-51.

123. Храброва, Л. А. Оценка генеалогической структуры вятской породы лошадей (Equus ferns caballus) с использованием анализа ДНК / Л. А. Храброва, Н. В. Блохина, Н. Ф. Белоусова, Е. Г. Котран // Генетика. - 2022. -Т. 58, № 4. - С. 457-462. - DOI: 10.31857/S0016675822040063.

124. Чикалев, А. И. Качество козьего пуха горноалтайской породы коз / А. И. Чикалев, Ю. А. Юлдашбаев, Н. И. Римиханов // Сельскохозяйственный журнал. - 2009. - Т. 3,№3.-С. 111-115.

125. Широкова, Н. В. Полиморфизм микросателлитных локусов OarCP549, csrd247, FCB20 и MAF65 у овец / Н. В. Широкова, Л. В. Гетманцева, Ю. А. Колосов [и др.] // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. - 2017. - № 5 (60).-С. 57-62. 10.30766/2072-9081.2024.25.4.525-537.

126. Эрнст, Л. К. Генетические ресурсы сельскохозяйственных животных в России и сопредельных странах / Л. К. Эрнст, Н. Г. Дмитриев, И. А. Паронян. - СПб.: ВНИИГРЖ, 1994. - 469 с.

127. Юлдашбаев, Ю. А. Генетическая структура популяции овец казахской тонкорунной породы по молекулярно-генетическим маркерам К / Ю. А. Юлдашбаев, А. Е. Чиндалиев, С. Д. Нурбаев [и др.] // Овцы, козы, шерстяное дело. - 2020. - № 3. - С. 2-7. - DOI: 10.26897/2074-0840-2020-3-27.

128. Яньшина, М. М. Определение функций изделий из козьего пуха (на примере Оренбургского пуховязального промысла) / М. М. Яньшина, А. М. Упине, Н. А. Коробцева, Г. И. Петушкова // Вестник славянских культур. - 2018. - Т. 48, № 2. - С. 302-317.

129. Abdelmanova, A. A. Tracing the Dynamical Genetic Diversity Changes of Russian Livni Pigs during the Last 50 Years with the Museum, Old, and Modern

Samples / A. A. Abdelmanova, T. E. Deniskova, V. R. Kharzinova [et al.] // Animals (Basel). - 2024. - Vol. 14. - P. 1629. - DOI: 10.3390/ani14111629.

130. Abdrisaev, E. Silk Road Today: Kyrgyzstan on the ancient Silk Road / E. Abdrisaev // kabar.kg. - 2017. - Доступ: http://kabar.kg/eng/news/silk-road-today-kyrgyzstan-on-the-ancient-silk-road (дата обращения: 09.03.2019).

131. Abied, A. Genome-wide analysis revealed homozygosity and demographic history of five Chinese sheep breeds adapted to different environments / A. Abied, L. Xu, B. W. Sahlu [et al.] // Genes (Basel). - 2020. - Vol. 11, № 12. -P. 1480.-DOI: 10.3390/genes11121480.

132. Abo-Ismail, M. K. Development and validation of a small SNP panel for feed efficiency in beef cattle / M. K. Abo-Ismail, N. Lansink, E. Akanno [et al.] // J Anim Sci. - 2018. - Vol. 96, № 2. - P. 375-397. - DOI: 10.1093/jas/sky020.

133. Aguzzi, A. Shifts and drifts in prion science / A. Aguzzi, E. De Cecco // Science. - 2020. - Vol. 370, № 6512. - P. 32-34. - DOI: 10.1126/science.abb8577.

134. Ahbara, A. Genome-wide variation and putative candidate regions and genes associated with fat deposition and tail morphology in Ethiopian indigenous sheep / A. Ahbara, H. Bahbahani, F. Almathen [et al.] // Front. Genet. - 2019a. -Vol. 9. - P. 699. - DOI: 10.3389/fgene.2018.00699.

135. Ahbara, A. OP196 Indigenous African sheep genomes reveal insights on fat-tail deposition and morphology / A. Ahbara, H. Clark, E. Robert [et al.] // Proc. 37th International Conference on Anim. Genet. - Lleida, Spain, 2019b. - P. 56.

136. Ahbara, A. M. Genome-wide insights on gastrointestinal nematode resistance in autochthonous Tunisian sheep / A. M. Ahbara, M. Rouatbi, M. Gharbi [et al.] // Sci Rep. - 2021. - Vol. 11. - P. 9250. - DOI: 10.1038/s41598-021-88501-3.

137. Alam, M. B. B. Single nucleotide polymorphisms in candidate genes are significantly associated with resistance to Haemonchus contortus infection in

goats / M. B. B. Alam, A. I. Omar, M. O. Faruque, D. R. [et al.] // J Anim Sci Biotechnol. - 2019. - Vol. 10. - P. 30. - DOI: 10.1186/s40104-019-0327-8.

138. Alexander, D. H. Fast model-based estimation of ancestry in unrelated individuals / D. H. Alexander, J. Novembre, K. Lange // Genome Res. - 2009. - № 19.-P. 1655-1664.-DOI: 10.1101/gr.094052.109.

139. Ali, A. Trophectoderm-Specific Knockdown of LIN28 Decreases Expression of Genes Necessary for Cell Proliferation and Reduces Elongation of Sheep Conceptus / A. Ali, M. D. Stenglein, T. E. Spencer [et al.] // Int J Mol Sci. -2020. - Vol. 21, № 7. - P. 2549. - DOI: 10.3390/ijms21072549.

140. Al-Mamun, H. A. Genome-wide association study of body weight in Australian Merino sheep reveals an orthologous region on OAR6 to human and bovine genomic regions affecting height and weight / H. A. Al-Mamun, S. A. Clark, M. H. Ferdosi [et al.] // Genet Sel Evol. - 2015. - Vol. 47. - P. 66. - DOI: 10.1186/s12711-015-0142-4.

141. Al-Mamun, H. A. Genome-wide linkage disequilibrium and genetic diversity in five populations of Australian domestic sheep / H. A. Al-Mamun, S. A. Clark, P. Kwan, C. Gondro // Genet. Sel. Evol. - 2015. - Vol. 47. - P. 90. - DOI: 10.1186/s12711-015-0169-6.

142. Almeida, O. A. C. Identification of selection signatures involved in performance traits in a paternal broiler line / O. A. C. Almeida, G. C. M. Moreira, F. M. Rezende [et al.] // BMC Genomics. - 2019. - Vol. 20. - P. 449. - DOI: 10.1186/s12864-019-5811-1.

143. Alvarez, L. Identification of a new leucine haplotype (ALQ) at codon 154 in the ovine prion protein gene in Spanish sheep / L. Alvarez, J. J. Arranz, F. San Primitivo // J. Anim. Sci. - 2006. - Vol. 84, № 2. - P. 259-265. - DOI: 10.2527/2006.842259x.

144. Amills, M. Goat domestication and breeding: a jigsaw of historical, biological and molecular data with missing pieces / M. Amills, J. Capote, G. Tosser-Klopp // Anim Genet. - 2017. - Vol. 48, № 6. - P. 631-644. - DOI: 10.1111/age.12598.

145. An, L. Full-Length Transcriptome and Gene Expression Analysis of Different Ovis aries Adipose Tissues Reveals Transcript Variants Involved in Lipid Biosynthesis / L. An, Y. Pan, M. Yuan [et al.] // Animals (Basel). - 2023. - Vol. 14, № 1.-P. 7.-DOI: 10.3390/ani14010007.

146. Anderson, R. Development of a High Density (600K) Illumina Ovine SNP Chip and Its Use to Fine Map the Yellow Fat Locus / R. Anderson, J. McEwan, R. Brauning [et al.] // Proceedings of the International Plant and Animal Genome XII Conference. - San Diego, CA, USA, 12-17 January 2014. - Abstract P611.

147. Argun Karsli, B. Genome-wide discovery of selection signatures in four Anatolian sheep breeds revealed by ddRADseq / B. Argun Karsli, E. Demir, U. Bilginer [et al.] // Sci Rep. - 2024. - Vol. 14, № 1. - P. 20518. - DOI: 10.1038/s41598-024-71617-7.

148. Arianmanesh, M. Ovine corpus luteum proteins, with functions including oxidative stress and lipid metabolism, show complex alterations during implantation / M. Arianmanesh, R. H. McIntosh, R. G. Lea [et al.] // J Endocrinol. - 2011. - Vol. 210, № 1. - P. 47-58. - DOI: 10.1530ATC>E-10-0336.

149. Arnold, M. L. Evolution through genetic exchange. - Oxford University Press, Oxford, UK, 2006.

150. Árnyasi, M. Investigation of polymorphisms and association of the ABCG2 gene with milk production traits in sheep / M. Árnyasi, I. Komlósi, M. Kent [et al.] // Livestock Sci. - 2013. - № 154. - P. 64-68. - DOI: 10.1016/j.livsci.2013.03.010.

151. Arzik, Y. Estimates of genomic heritability and genome-wide association studies for blood parameters in Akkaraman sheep / Y. Arzik, M. Kizilaslan, S. N. White [et al.] // Sci Rep. -2022. - Vol. 12, № 1. - P. 18477. - DOI: 10.1038/s41598-022-22966-8.

152. Atlija, M. Detection and replication of QTL underlying resistance to gastrointestinal nematodes in adult sheep using the ovine 50K SNP array / M. Atlija, J. J. Arranz, M. Martinez-Valladares, B. Gutiérrez-Gil // Genet Sel Evol. - 2016. -Vol. 48. - P. 4. - DOI: 10.1186/s12711-016-0182-4.

153. Ba, N. V. Evaluation of genetic richness among Vietnamese native pig breeds using microsatellite markers / N. V. Ba, A. Arakawa, S. Ishihara [et al.] // Anim. Sci. J.-2020.-Vol. 91, № 1.-P. 13343.-DOI: 10.1111/asj.13343.

154. Baazaoui, I. Refining the genomic profiles of North African sheep breeds through meta-analysis of worldwide genomic SNP data / I. Baazaoui, S. Bedhiaf-Romdhani, S. Mastrangelo [et al.] // Front Vet Sci. - 2024. - Vol. 11. - P. 1339321. -DOI: 10.3389/fvets.2024.1339321.

155. Babelhadj, B. Prion disease in dromedary camels, Algeria / B. Babelhadj, M. A. Di Bari, L. Pirisinu [et al.] // J Emerg Infect Dis. - 2018. - Vol. 24. -P. 1029-1036.-DOI: 10.3201/eid2406.172007.

156. Bagirov, V. Establishment of semen bank of wild Ovis species and their hybrids with domestic sheep / V. Bagirov, B. Iolchiev, M. Zhilinskij [et al.] // Reprod. Domest. Anim. - 2016. - Vol. 51, Suppl. 2. - P. 72-73. - DOI: 10.1111/rda.12801.

157. Bakhtiarizadeh, M. R. RNA-Seq based genetic variant discovery provides new insights into controlling fat deposition in the tail of sheep / M. R. Bakhtiarizadeh, A. A. Alamouti // Sci Rep. - 2020. - Vol. 10, № 1. - P. 13525. -DOI: 10.1038/s41598-020-70527-8.

158. Baldan, S. Genetic characterization of cashmere goat (Capra hircus) populations in Mongolia / S. Baldan, J. Sölkner, K. T. Gebre [et al.] // Front Genet. -2024.-Vol. 15.-P. 1421529.-DOI: 10.3389/fgene.2024.1421529.

159. Banayo, J. B. Genetic diversity and population structure analysis of Philippine native pigs highlight five priority populations for conservation / J. B. Banayo, K. L. V. Manese, K. O. Furusho [et al.] // Ecol Evol. - 2023. - Vol. 13, № 11.-P. e10618. - DOI: 10.1002/ece3.10618.

160. Banerjee, D. Seasonal variation in expression pattern of genes under HSP70: Seasonal variation in expression pattern of genes under HSP70 family in heat- and cold-adapted goats (Capra hircus) / D. Banerjee, R. C. Upadhyay, U. B. Chaudhary [et al.] // Cell Stress and Chaperones. - 2014. - Vol. 19, № 3. - P. 401-408. - DOI: 10.1007/s12192-013-0469-0.

161. Bansal, S. K. Differential genes expression between fertile and infertile spermatozoa revealed by transcriptome analysis / S. K. Bansal, N. Gupta, S. N. Sankhwar, S. Rajender // PLoS One. - 2015. - Vol. 10, № 5. - P. e0127007.

162. Bao, J. Q. UBQLN1 interacts with SPEM1 and participates in spermiogenesis / J. Q. Bao, J. Zhang, H. L. Zheng [et al.] // Mol Cell Endocrinol. -2010.-Vol. 327, № 1-2.-P. 89-97.-DOI: 10.1016/j.mce.2010.06.006.

163. Barani, S. Genome-wide study of linkage disequilibrium, population structure, and inbreeding in Iranian indigenous sheep breeds / S. Barani, A. Nejati-Javaremi, M. H. Moradi [et al.] // PloS one. - 2023. - Vol. 18, № 6. - P. e0286463. - DOI: 10.1371/journal.pone.0286463.

164. Barbato, M. Genomic signatures of adaptive introgression from European mouflon into domestic sheep /M. Barbato, F. Hailer, P. Orozco-terWengel [et al.] // Sci Rep. - 2017. - Vol. 7, № 1. - P. 7623. - DOI: 10.1038/s41598-017-07382-7.

165. Barbato, M. SNeP: a tool to estimate trends in recent effective population size trajectories using genome-wide SNP data / M. Barbato, P. Orozco-terWengel, M. Tapio, M. W. Bruford // Front Genet. - 2015. - Vol. 6. - P. 109. -DOI: 10.3389/fgene.2015.00109.

166. Basler, K. Scrapie and cellular PrP isoforms are encoded by the same chromosomal gene / K. Basler, B. Oesch, M. Scott [et al.] // Cell. - 1986. - Vol. 46, № 3. - P. 417-428. - DOI: 10.1016/0092-8674(86)90662-8.

167. Baumung, R. Genetic characterization and breed assignment in Austrian sheep breeds using microsatellite marker information / R. Baumung, V. Cubric-Curik, K. Schwend [et al.] // J Anim Breed Genet. - 2006. - Vol. 123. - P. 265-271. - DOI: 10.1111/j.1439-0388.2006.00583.x.

168. Becker, G. M. Genetic diversity of United States Rambouillet, Katahdin and Dorper sheep / G. M. Becker, J. W. Thorne, J. M. Burke [et al.] // Genet Sel Evol. -2024.-Vol. 56, № 1.-P. 56.-DOI: 10.1186/s12711-024-00905-7.

169. Ben Sassi-Zaidy, Y. Genetic Variability and Population Structure of the Tunisian Sicilo-Sarde Dairy Sheep Breed Inferred from Microsatellites Analysis

/ Y. Ben Sassi-Zaidy, A. Mohamed-Brahmi, G. Nouairia [et al.] // Genes (Basel). -2022. - Vol. 13, № 2. - P. 304. - DOI: 10.3390/genes13020304.

170. Benestad, S. L. Cases of scrapie with unusual features in Norway and designation of a new type, Nor98 / S. L. Benestad, P. Sarradin, B. Thu [et al.] // Vet Rec. - 2003. - Vol. 153, № 7. - P. 202-208. - DOI: 10.1136/vr.153.7.202.

171. Ben-Jemaa, S. Genome-wide scan for selection signatures reveals novel insights into the adaptive capacity in local North African cattle / S. Ben-Jemaa, M. Mastrangelo, S. H. Lee [et al.] // Sci Rep. - 2020. - Vol. 10, № 1. - P. 19466. - DOI: 10.1038/s41598-020-76576-3.

172. Ben-Jemaa, S. Genome-wide scans for signatures of selection in North African sheep reveals differentially selected regions between fat- and thin-tailed breeds / S. Ben-Jemaa, G. Yahyaoui, S. Kdidi [et al.] // Anim Genet. - 2025. - Vol. 56, № 1.-P. e13487. - DOI: 10.1111/age.13487.

173. Beraldi, D. Mapping quantitative trait loci underlying fitness-related traits in a free-living sheep population / D. Beraldi, A. F. McRae, J. Gratten [et al.] // Evolution. - 2007. - Vol. 61, № 6. - P. 1403-1416. - DOI: 10.1111/j.1558-5646.2007.00106.x.

174. Bertolini, F. Signatures of selection and environmental adaptation across the goat genome post-domestication / F. Bertolini, B Servin, A. Talenti [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2018. - Vol. 50, № 1. - P. 57. - DOI: 10.1186/s12711-018-0421-y.

175. Bertolini, F. Genome-wide patterns of homozygosity provide clues about the population history and adaptation of goats / F. Bertolini, T. F. Cardoso, G. Marras [et al.] // Genet Sel Evol. - 2018. - Vol. 50, № 1. - P. 59. - DOI: 10.1186/s12711-018-0424-8.

176. Bertolini, F. Signatures of selection are present in the genome of two close autochthonous cattle breeds raised in the North of Italy and mainly distinguished for their coat colors / F. Bertolini, G. Moscatelli, G. Schiavo [et al.] // J Anim Breed Genet. - 2022. - Vol. 139, № 3. - P. 307-319. - DOI: 10.1111/jbg.12659.

177. Beynon, S. E. Population structure and history of the Welsh sheep breeds determined by whole genome genotyping / S. E. Beynon, G. T. Slavov, M. Farre [et al.] //BMC Genet. - 2015. - Vol. 16. - P. 65. -DOI:10.1186/s12863-015-0216-x.

178. Bionaz, M. Gene networks driving bovine milk fat synthesis during the lactation cycle/ M. Bionaz, J. J. Loor // BMC Genomics. - 2008. - Vol. 9. - P. 366. -DOI: 10.1186/1471-2164-9-366.

179. Biran M. The Mongol Empire in World History: The State of the Field / M. Biran // Hist. Compass. - 2013. - Vol. 11, № 11. - P. 1021-1033. - DOI: 10.1111/hic3.12095.

180. Biran M. The Mongol transformation: from the steppe to Eurasian empire / M. Biran // Mediev. Encounters. - 2004. - Vol. 10, № 1-3. - P. 339-361. -DOI: 10.1163/1570067043077869.

181. Biscarini, F. DetectRUNS: Detect runs of homozygosity and runs of heterozygosity in diploid genomes: R Package Version 0.9.5 / F. Biscarini, P. Paolo Cozzi, G. Gaspa, G. Marras. - Режим доступа: https://cran.rproject.org/web/packages/detectRUNS/index.html.

182. Boitard, S. Gene banks as reservoirs to detect recent selection: the example of the Asturiana de los Valles bovine breed / S. Boitard, C. Paris, N. Sevane [et al.] // Front. Genet. - 2021. - Vol. 12. - P. 575405. - DOI: 10.3389/fgene.2021.575405.

183. Boivin N. Proto-globalisation and biotic exchange in the Old World / N. Boivin // Human Dispersal and Species Movement: From Prehistory to the Present. - Cambridge: Cambridge Univ. Press, 2017. - P. 349-408. - DOI: 10.1017/9781316686942.015.

184. Bolormaa, S. Multiple-trait QTL mapping and genomic prediction for wool traits in sheep / S. Bolormaa, A. A. Swan, D. J. Brown [et al.] // Genet. Sel. Evol. -2017. - Vol. 49, № 1. - P. 62. - DOI: 10.1186/s12711-017-0337-y.

185. Bonhomme, M. Detecting Selection in Population Trees: The Lewontin and Krakauer Test Extended / M. Bonhomme, C. Chevalet, B. Servin. [et al.] // Genetics. -2010. - Vol. 186. - P. 241-262. - DOI: 10.1534/genetics.110.117275.

186. Borowicz, P. P. Placental growth throughout the last two thirds of pregnancy in sheep: vascular development and angiogenic factor expression / P. P. Borowicz, D. R. Arnold, M. L. Johnson [et al.] // Biol. Reprod. - 2007. - Vol. 76, № 2. - P. 259-267. - DOI: 10.1095/biolreprod.106.054684.

187. Boschmann, M. LMNA mutations, skeletal muscle lipid metabolism, and insulin resistance / M. Boschmann, S. Engeli, C. Moro [et al.] // J. Clin. Endocrinol. Metab. - 2010. - Vol. 95, № 4. - P. 1634-1643. - DOI: 10.1210/jc.2009-1293.

188. Boulet, A. M. Multiple roles of Hoxa11 and Hoxd11 in the formation of the mammalian forelimb zeugopod / A. M. Boulet, M. R. Capecchi // Development. - 2004. - Vol. 131, № 2. - P. 299-309. - DOI: 10.1242/dev.00936.

189. Bravo-Risi, F. Dynamics of CWD prion detection in feces and blood from naturally infected white-tailed deer / F. Bravo-Risi, P. Soto, R. Benavente [et al.] // Sci. Rep. - 2023. - Vol. 13, № 1. - P. 20170. - DOI: 10.1038/s41598-023-46929-9.

190. Brito, L. F. Characterization of linkage disequilibrium, consistency of gametic phase and admixture in Australian and Canadian goats / L. F. Brito, M. Jafarikia, D. A. Grossi [et al.] // BMC Genet. - 2015. - Vol. 16. - P. 67. - DOI: 10.1186/s12863-015-0220-1.

191. Brito, L. F. Genetic diversity and signatures of selection in various goat breeds revealed by genome-wide SNP markers / L. F. Brito, J. W. Kijas, R. V. Ventura, [et al.] // BMC Genomics. - 2017. - Vol. 18. - P. 229. - DOI: 10.1186/s12864-017-3610-0.

192. Brito, L. F. Genetic diversity of a New Zealand multi-breed sheep population and composite breeds' history revealed by a high-density SNP chip / L. F. Brito, J. C. McEwan, S. P. Miller [et al.] // BMC Genet. - 2017. - Vol. 18. - P. 25. - DOI: 10.1186/s12863-017-0492-8.

193. Brown, H. M. Short oestrous cycles in sheep during anoestrus involve defects in progesterone biosynthesis and luteal neovascularisation / H. M. Brown, C. Fabre-Nys, J. Cognié, R. J. Scaramuzzi // Reproduction. - 2014. - Vol. 147, № 3.-P. 357-367.-DOI: 10.1530/REP-13-0400.

194. Bucalossi, C. Assessment of the genetic susceptibility of sheep to scrapie by protein misfolding cyclic amplification and comparison with experimental scrapie transmission studies / C. Bucalossi, G. Cosseddu, C. D'Agostino, [et al.] // J. Virol. - 2011. - Vol. 85, № 16. - P. 8386-8392. - DOI: 10.1128/JVI.00241-11.

195. Buchanan, F. C. Ovine dinucleotide repeat polymorphism at the MAF214 locus / F. C. Buchanan, A. M. Crawford // Anim. Genet. - 1992. - Vol. 23, № 4. - P. 394. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.1992.tb00167.x.

196. Buchanan, F. C. Ovine microsatellites at the OarFCB11, OarFCB128, OarFCB193, OarFCB266 and OarFCB304 loci / F. C. Buchanan, A. M. Crawford // Anim. Genet. - 1993. - Vol. 24, № 2. - P. 145. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.1993.tb00269.x.

197. Buchanan, F. C. Ovine dinucleotide repeat polymorphism at the MAF65 locus / F. C. Buchanan, P. A. Swarbrick, A. M. Crawford // Anim. Genet. - 1992.-Vol. 23, №1.-P. 85.

198. Bumgarner, R. Overview of DNA microarrays: types, applications, and their future / R. Bumgarner // Curr. Protoc. Mol. Biol. - 2013. - Chapter 22, Unit 22.1. -DOI: 10.1002/0471142727.mb2201s101.

199. Burren, A. Genetic diversity analyses reveal first insights into breed-specific selection signatures within Swiss goat breeds / A. Burren, M. Neuditschko, H. Signer-Hasler [et al.] // Anim. Genet. - 2016. - Vol. 47, № 6. - P. 727-739. -DOI: 10.1111/age.12476.

200. Burren, A. Fine-scale population structure analysis of seven local Swiss sheep breeds using genome-wide SNP data / A. Burren, M. Neuditschko, H. Signer-Hasler [et al.] // Anim. Genet. Resour. Genet. - 2014. - Vol. 55. - P. 67-76. - DOI: 10.1017/S2078633614000253.

201. Buschmann, A. Neuronal accumulation of abnomial prion protein in sheep carrying a scrapie-resistant genotype (PrPARR/ARR) / A. Buschmann, G. Lühken, J. Schultz [et al.] // J. Gen. Virol. - 2004. - Vol. 85, Pt. 9. - P. 2727-2733. - DOI: 10.1099/vir.0.79997-0.

202. Butler, S. M. Contributions of VEGF to age-dependent transmural gradients in contractile protein expression in ovine carotid arteries / S. M. Butler, J. M. Abrassart, M. C. Hubbell [et al.] // Am. J. Physiol. Cell Physiol. - 2011. - Vol. 301, № 3. - P. C653-C666. - DOI: 10.1152/ajpcell.00413.2010.

203. Cai, K. Genetic Diversity and Selection Signatures of Lvliang Black Goat Using Genome-Wide SNP Data / K. Cai, W. Wang, X. Wang [et al.] // Animals (Basel). - 2024. - Vol. 14, № 21. - P. 3154. - DOI: 10.3390/ani14213154.

204. Campbell, A. W. Bone density in sheep: genetic variation and quantitative trait loci localization / A. W. Campbell, W. E. Bain, A. F. McRae [et al.] // Bone. - 2003. - Vol. 33, № 4. - P. 540-548. - DOI: 10.1016/S8756-3282(03)00228-X.

205. Canon, J. Geographical partitioning of goat diversity in Europe and the Middle East / J. Canon, D. Garcia, M. A. Garcia-Atance [et al.] // Anim. Genet. -2006.-Vol. 37.-P. 327-334.-DOI: 10.1111/j.1365-2052.2006.01461.X.

206. Cao, G. Analysis on cDNA sequence, alternative splicing and polymorphisms associated with timing of puberty of Lin28B gene in goats / G. Cao, Q. Liu, M. Chu [et al.] // Mol. Biol. Rep. - 2013. - Vol. 40, № 8. - P. 4675-4683. -DOI: 10.1007/s11033-013-2562-Y.

207. Cao, Y. Genome-wide epigenetic dynamics during postnatal skeletal muscle growth in Hu sheep / Y. Cao, Y. Ai, X. Zhang [et al.] // Commun. Biol. -2023.-Vol. 6,№1.-P. 1077.-DOI: 10.1038/s42003-023-05439-0.

208. Cao, Y. Comparative analysis on genome-wide DNA methylation in longissimus dorsi muscle between Small Tailed Han and Dorper x Small Tailed Han crossbred sheep / Y. Cao, H. G. Jin, H. H. Ma, Z. H. Zhao // Asian-Australas. J. Anim. Sci.-2017.-Vol. 30,№ 11.-P. 1529-1539.-DOI: 10.5713/ajas.17.0154.

209. Cao, Y. H. Historical introgression from wild relatives enhanced climatic adaptation and resistance to pneumonia in sheep / Y. H. Cao, S. S. Xu, M. Shen [et al.] // Mol. Biol. Evol. - 2021. - Vol. 38, № 3. - P. 838-855. - DOI: 10.1093/molbev/msaa236.

210. Cassmann, E. D. Pathogenesis, detection, and control of scrapie in sheep / E. D. Cassmann, J. J. Greenlee // Am. J. Vet. Res. - 2020. - Vol. 81, № 7. -P. 600-614. - DOI: 10.2460/ajvr.81.7.600.

211. Castillo-Rodríguez, R. G. Genetic diversity of creole sheep managed by indigenous communities of the central region of Veracruz, Mexico / R. G. Castillo-Rodríguez, O. L. Segura-León, M. Hernández-Rodríguez [et al.] // Animals (Basel). - 2022. - Vol. 12, № 4. - P. 456. - DOI: 10.3390/ani12040456.

212. Cavanagh, C. R. Mapping Quantitative Trait Loci (QTL) in sheep. III. QTL for carcass composition traits derived from CT scans and aligned with a meta-assembly for sheep and cattle carcass QTL / C. R. Cavanagh, E. Jonas, M. Hobbs, [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2010. - Vol. 42, № 1. - P. 36. - DOI: 10.1186/12979686-42-36.

213. Cecchinato, A. Candidate gene association analysis for milk yield, composition, urea nitrogen and somatic cell scores in Brown Swiss cows/ A. Cecchinato, C. Ribeca, S. Chessa [etal.] //Animal. -2014. - Vol. 8. - P. 1062-1070. -DOI: 10.1017/S1751731114001098.

214. Ceccobelli, S. A comprehensive analysis of the genetic diversity and environmental adaptability in worldwide Merino and Merino-derived sheep breeds/ S. Ceccobelli, V. Landi, G. Senczuk [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2023. - Vol. 55, № 1.-P. 24.-DOI: 10.1186/s12711-023-00797-Z.

215. Chakrabarti, R. Protein phosphatase PP1 gamma 2 in sperm morphogenesis and epididymal initiation of sperm motility/ R. Chakrabarti, L. Cheng, P. Puri [et al.] // Asian J. Androl. - 2007. - Vol. 9, № 4. - P. 445-452. - DOI: 10.1111/j.1745-7262.2007.00307.X.

216. Chang, C. C. Second-generation PLINK: rising to the challenge of larger and richer datasets/ C. C. Chang, C. C. Chow, L. C. Tellier [et al.] // Gigascience. -2015. - Vol. 4. - P. 7. -DOI: 10.1186/s13742-015-0047-8.

217. Chen, L. Identification of sheep ovary genes potentially associated with off-season reproduction/ L. Chen, K. Liu, Z. S. Zhao [et al.] // J. Genet. Genomics. - 2012. - Vol. 39, № 4. - P. 181-190. - DOI: 10.1016/j.jgg.2012.03.002.

218. Chen, S. Y. Identifying pleiotropic variants and candidate genes for fertility and reproduction traits in Holstein cattle via association studies based on imputed whole-genome sequence genotypes/ S. Y. Chen, F. S. Schenkel, A. L. P. Melo [et al.] // BMC Genomics. - 2022. - Vol. 23, № 1. - P. 331. - DOI: 10.1186/s12864-022-08555-Z.

219. Chen, Z. Mechanism of prolactin inhibition of miR-135b via methylation in goat mammary epithelial cells/ Z. Chen, J. Luo, C. Zhang [et al.] // J. Cell. Physiol. - 2018. - Vol. 233, № 1. - P. 651-662. - DOI: 10.1002/JCP.25925.

220. Cheng, J. Integrating Genome-Wide CNVs Into QTLs and High Confidence GWAScore Regions Identified Positional Candidates for Sheep Economic Traits / J. Cheng, X. Cao, Q. Hanif [et al.] // Front. Genet. - 2020. - Vol. 11.-P. 569.-DOI: 10.3389/FGENE.2020.00569.

221. Chessari, G. Characterization of heterozygosity-rich regions in Italian and worldwide goat breeds / G. Chessari, A. Criscione, D. Marletta [et al.] // Sci. Rep.-2024.-Vol. 14, № 1.-P. 3.-DOI: 10.1038/S41598-023-49125-X.

222. Chong, A. BSE can propagate in sheep co-infected or pre-infected with scrapie / A. Chong, J. D. Foster, W. Goldmann [et al.] // Sci. Rep. -2021. - Vol. 11, № 1.-P. 1931.-DOI: 10.1038/S41598-021-91397-8.

223. Christian, D. Silk Roads or Steppe Roads? The Silk Roads in World History / D. Christian // J. World Hist. - 2000. - Vol. 11, № 1. - P. 1-26. - DOI: 10.1353/JWH.2000.0004.

224. Ciani, E. Genome-wide analysis of Italian sheep diversity reveals a strong geographic pattern and cryptic relationships between breeds / E. Ciani, P.

Crepaldi, L. Nicoloso [et al.] //Anim. Genet. -2014. - Vol. 45. - P. 256-266. -DOI: 10.1111/age.12106.

225. Ciani, E. Merino and Merino-derived sheep breeds: a genome-wide intercontinental study / E. Ciani, E. Lasagna, M. D'Andrea [et al.] // Genet. Sel. Evol. -2015. - Vol. 47. - P. 64. - DOI: 10.1186/s12711-015-0139-z.

226. Ciani, E. On the origin of European sheep as revealed by the diversity of the Balkan breeds and by optimizing population-genetic analysis tools / E. Ciani, S. Mastrangelo, S. Mastrangelo [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2020. - Vol. 52. - P. 25. - DOI: 10.1186/S12711-020-00545-7.

227. Clarke, S. M. A high-throughput single nucleotide polymorphism multiplex assay for parentage assignment in New Zealand sheep / S. M. Clarke, H. M. Henry, K. G. Dodds [et al.] // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 4. - P. e93392. -DOI: 10.1371/JOURNAL.PONE.0093392.

228. Cohen-Zinder, M. Identification of a missense mutation in the bovine ABCG2 gene with a major effect on the QTL on chromosome 6 affecting milk yield and composition in Holstein cattle / M. Cohen-Zinder, E. Seroussi, D. M. Larkin [et al.] // Genome Res. - 2005. - Vol. 15, № 7. - P. 936-944. - DOI: 10.1101/GR.3806705.

229. Colby, D. W. Prions / D. W. Colby, S. B. Prusiner // Cold Spring Harb. Perspect. Biol. - 2011. - Vol. 3. - P. a006833. - DOI: 10.1101/CSHPERSPECT.A006833.

230. Colli, L. Whole mitochondrial genomes unveil the impact of domestication on goat matrilineal variability / L. Colli, H. Lancioni, I. Cardinali [et al.]//BMC Genomics.-2015.-Vol. 16.-P. 1115.-DOI: 10.1186/S12864-015-2342-2.

231. Colli, L. Genome-wide SNP profiling of worldwide goat populations reveals strong partitioning of diversity and highlights post-domestication migration routes / L. Colli, M. Milanesi, A. Talenti [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2018. - Vol. 50, № 1.-P. 58.-DOI: 10.1186/S12711-018-0422-X.

232. Corbin, L. J. Estimation of historical effective population size using linkage disequilibria with marker data / L. J. Corbin, A. Y. Liu, S. C. Bishop, J. A. Woolliams // J. Anim. Breed. Genet. - 2012. - Vol. 129. - P. 257-270. - DOI: 10.1111/j.1439-0388.2012.01003.x.

233. Cortellari, M. The climatic and genetic heritage of Italian goat breeds with genomic SNP data / M. Cortellari, M. Barbato, A. Talenti [et al.] // Sci. Rep. -2021.-Vol. 11, №1.-P. 10986.-DOI: 10.1038/S41598-021-89900-2.

234. Crawford, A. M. Discovery of quantitative trait loci for resistance to parasitic nematode infection in sheep: I. Analysis of outcross pedigrees / A. M. Crawford, K. A. Paterson, K. G. Dodds [et al.] // BMC Genomics. - 2006. - Vol. 7. -P. 178.-DOI: 10.1186/1471-2164-7-178.

235. Cui, W. Sheep litter size heredity basis using genome-wide selective analysis / W. Cui, H. Wang, J. Li [et al.] // Reprod. Domest. Anim. - 2024. - Vol. 59, №7.-P. e14689. - DOI: 10.1111/RDA.14689.

236. Cuillé, J. La tremblante du mouton est-elle déterminée par un virus filtrable? / J. Cuillé, P.-L. Chelle // Comptes rendus hebdomadaires des séances de l'Académie des Sciences. - 1938. - Vol. 206, April-June (2). - P. 1687-1688.

237. Cunha, S. M. F. Genomic Regions Associated with Resistance to Gastrointestinal Nematode Parasites in Sheep - A Review / S. M. F. Cunha, S. Lam, B. Mallard [et al.] // Genes (Basel). - 2024. - Vol. 15, № 2. - P. 187. - DOI: 10.3390/GENES15020187.

238. Curik, I. Inbreeding and runs of homozygosity: A possible solution to an old problem /1. Curik, M. Ferenczakovic, J. Sölkner // Livest. Sci. - 2014. - Vol. 166. - P. 26-34. - DOI: 10.1016/J.LIVSCI.2014.05.034.

239. Curtin, P. D. Cross-Cultural Trade in World History / P. D. Curtin // Cambridge Univ. Press. - Cambridge, UK, 1985.

240. Da Silva, A. History and genetic diversity of African sheep: Contrasting phenotypic and genomic diversity / A. Da Silva, A. Ahbara, I. Baazaoui [et al.] // Anim. Genet.-2025.-Vol. 56, № 1.-P. e13488.-DOI: 10.1111/AGE.13488.

241. Dadousis, C. Keep Garfagnina alive. An integrated study on patterns of homozygosity, genomic inbreeding, admixture and breed traceability of the Italian Garfagnina goat breed / C. Dadousis, F. Cecchi, M. Ablondi [et al.] // PLoS ONE. -2021.-Vol. 16,№ 1. - P. e0232436. -DOI: 10.1371/JOURNAL.PONE.0232436.

242. Dalvit, C. Genetic diversity and variability in Alpine sheep breeds / C. Dalvit, E. Sacca, M. Cassandro [et al.] // Small Rumin. Res. - 2008. - Vol. 80. - P. 45-51.-DOI: 10.1016/J.SMALLRUMRES.2008.09.005.

243. Daly, K. G. Ancient goat genomes reveal mosaic domestication in the Fertile Crescent / K. G. Daly, P. Maisano Delser, V. E. Mullin [et al.] // Science. -2018.-Vol. 361.-P. 85-8.-DOI: 10.1126/Science.aas9411.

244. Daly, K. G. Ancient genomics and the origin, dispersal, and development of domestic sheep / K. G. Daly, V. E. Mullin, A. J. Hare [et al.] // Science. - 2025. - Vol. 387, № 6733. - P. 492-497. - DOI: 10.1126/Science.adn2094.

245. Darbani, B. Genome evolutionary dynamics meets functional genomics: a case story on the identification of SLC25A44 / B. Darbani // Int J Mol Sci.-2021.-Vol. 22, № 11.-P. 5669.-DOI: 10.3390/IJMS22115669.

246. Dawson, M. Guidance on the use of PrP genotyping as an aid to the control of clinical scrapie. Scrapie Information Group / M. Dawson, L. J. Hoinville, B. D. Hosie, N. Hunter // Vet Rec. - 1998. - Vol. 142. - P. 623-625.

247. de Las Heras-Saldana, S. Gene expression of Hanwoo satellite cell differentiation in longissimus dorsi and semimembranosus / S. de Las HerasSaldana, K. Y. Chung, S. H. Lee, C. Gondro // BMC Genomics. - 2019. - Vol. 20. -P. 156.-DOI: 10.1186/S12864-019-5530-7.

248. de Mello, F. Association of the polymorphism g.8514C > T in the osteopontin gene (SPP1) with milk yield in the dairy cattle breed Girolando / F. de Mello, J. A. Cobuci, M. F. Martins [et al.] // Anim Genet. - 2012. - Vol. 43, № 5. - P. 647-648. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.2011.02312.x.

249. Demars, J. Genome-wide identification of the mutation underlying fleece variation and discriminating ancestral hairy species from modern woolly

sheep / J. Demars, M. Cano, L. Drouilhet [et al.] // Mol Biol Evol. - 2017. - Vol. 34, № 7. - P. 1722-1729. -DOI: 10.1093/molbev/msx114.

250. Dementieva, N. V. Assessing the effects of rare alleles and linkage disequilibrium on estimates of genetic diversity in the chicken populations / N. V. Dementieva, O. V. Mitrofanova, A. P. Dysin [et al.] // Animal. - 2021. - Vol. 15, №3.-P. 100171.-DOI: 10.1016/j.animal.2021.100171.

251. Deniskova, T. Population structure and genetic diversity of sheep breeds in the Kyrgyzstan / T. Deniskova, A. Dotsev, E. Lushihina [et al.] // Front. Genet.-2019.-Vol. 10.-P. 1311.-DOI: 10.3389/fgene.2019.01311.

252. Deniskova, T. E. Genetic diversity in the Orenburg goat breed revealed by single-nucleotide polymorphism (SNP) analysis: initial steps in saving a threatened population / T. E. Deniskova, A. V. Dotsev, A. S. Abdelmanova [et al.] //Genes (Basel). - 2024. - Vol. 15.-P. 1375.-DOI: 10.3390/genes15111375.

253. Deniskova, T. E. SNP-based genotyping provides insight into the west Asian origin of Russian local goats / T. E. Deniskova, A. V. Dotsev, M. I. Selionova [et al.] // Front. Genet. - 2021. - Vol. 12. - P. 708740. - DOI: 10.3389/fgene.2021.708740.

254. Deniskova, T. E. Whole genome SNP scanning of snow sheep (Ovis nivicola) / T. E. Deniskova, I. M. Okhlopkov, A. A. Sermyagin [et al.] // Dokl Biochem Biophys. - 2016. - V. 469, № 1. - P. 288-293. - DOI: 10.1134/S1607672916040141.

255. Dettori, M. L. Association analysis between SPP1, POFUT1 and PRLR gene variation and milk yield, composition and coagulation traits in sarda sheep / M. L. Dettori, M. Pazzola, E. Petretto, G. M. Vacca // Animals (Basel). - 2020. -Vol. 10, №7.-P. 1216.-DOI: 10.3390/ani10071216.

256. Detwiler, L. A. Scrapie / L. A. Detwiler // Rev Sci Tech. - 1992. - Vol. 11, №2.-P. 491-537.-DOI: 10.20506/rst.11.2.607.

257. Di Gerlando, R. Genome-wide association study between CNVs and milk production traits in Valle del Belice sheep / R. Di Gerlando, A. M. Sutera, S.

Mastrangelo [et al.] // PLoS One. - 2019. - Vol. 14, № 4. - P. e0215204. - DOI: 10.1371/journal.pone.0215204.

258. Dinh, J. The microprotein C16orf74/MICT1 promotes thermogenesis in brown adipose tissue / J. Dinh, D. Yi, F. Lin [et al.] // EMBO J. - 2025. - Vol. 44, № 12.-Pp. 3381-3412.-DOI: 10.1038/s44318-025-00444-x.

259. Dominik, S. Detection of quantitative trait loci for internal parasite resistance in sheep. I. Linkage analysis in a Romney x Merino sheep backcross population / S. Dominik, P. W. Hunt, J. McNally [et al.] // Parasitology. - 2010. -Vol. 137, №8.-Pp. 1275-1282.-DOI: 10.1017/S003118201000020X.

260. Dong, Y. Sequencing and automated whole-genome optical mapping of the genome of a domestic goat (Capra hircus) / Y. Dong, M. Xie, Y. U. Jiang [et al.] //Nat Biotechnol. -2013. - Vol. 31. - Pp. 135-141. - DOI: 10.1038/nbt.2478.

261. Dotsev, A. Genome-wide insights into interspecific taxonomy and genetic diversity of argali (Ovis ammon) / A. Dotsev, O. Koshkina, V. Kharzinova [et al.] // Diversity. - 2023. - Vol. 15, № 5. - P. 627. - DOI: 10.3390/d15050627.

262. Dotsev, A. V. Genome-wide SNP analysis unveils genetic structure and phylogeographic history of snow sheep (Ovis nivicola) populations inhabiting the Verkhoyansk Mountains and Momsky Ridge (northeastern Siberia) / A. V. Dotsev, T. E. Deniskova, I. M. Okhlopkov [et al.] // Ecol Evol. - 2018. - Vol. 8, № 16. - P. 8000-8010. - DOI: 10.1002/ece3.4350.

263. Dotsev, A. V. Molecular genetic assessment aids in clarifying phylogenetic status of Iranian Kerman wild sheep / A. V. Dotsev, M. H. Moradi, T. E. Deniskova [et al.] // Animals (Basel). - 2025. - Vol. 15, № 2. - P. 238. - DOI: 10.3390/ani15020238.

264. Drägänsecu, C. A note on Balkan sheep breeds origin and their taxonomy/ C. Drägänsecu// Archive ofZootechnics. -2007. - Vol. 10. -P. 90-101.

265. Drägänsecu, C. An attempt to a fletic classification of Valachian (Zackel) and tsigai breed / C. Drägänsecu // Stocarstv. - 1994. - Vol. 48. - Pp. 395-400.

266. Drägänsecu, C. Origin and relationships between Valachian and Tsigai sheep from the Danube area / C. Drägänsecu // Stocarstvo. - 1995. - Vol. 49. - P. 321-327.

267. Drouilhet, L. The highly prolific phenotype of lacaune sheep is associated with an ectopic expression of the B4GALNT2 gene within the ovary / L. Drouilhet, C. Mansanet, J. Sarry [et al.] // PLoS Genet. - 2013. - Vol. 9, № 9. - P. e1003809. - DOI: 10.1371/journal.pgen.1003809.

268. Du, H. The role of hox genes in female reproductive tract development, adult function, and fertility / H. Du, H. S. Taylor // Cold Spring Harb Perspect Med. -2015.-Vol. 6, № 1. - P. a023002. - DOI: 10.1101/cshperspect.a023002.

269. Duan, C. Cashmere production, skin characteristics, and mutated genes in crimped cashmere fibre goats / C. Duan, L. Zhang, K. Gao [et al.] // Animal. -2022.-Vol. 16, №7.-P. 100565.-DOI: 10.1016/j.animal.2022.100565.

270. Dudiki, T. The protein phosphatase isoform PP1y1 substitutes for PP1y2 to support spermatogenesis but not normal sperm function and fertility / T. Dudiki, N. Joudeh, N. Sinha [et al.] // Biol Reprod. - 2019. - Vol. 100, № 3. - P. 721-736. - DOI: 10.1093/biolre/ioy225.

271. Duffy, P. Letter: Possible person-to-person transmission of CreutzfeldtJakob disease / P. Duffy, J. Wolf, G. Collins [et al.] // N Engl J Med. - 1974. - Vol. 290, № 12.-P. 692-693.

272. Duncan, E. J. Cloning, mapping and association studies of the ovine ABCG2 gene with facial eczema disease in sheep / E. J. Duncan, K. G. Dodds, H. M. Henry, [et al.] // Anim. Genet. - 2007. - Vol. 38, № 2. - P. 126-131. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.2006.01557.x.

273. Dyer, L. M. ATM is required for SOD2 expression and homeostasis within the mammary gland / L. M. Dyer, J. D. Kepple, L. B. Ai [et al.] // Breast Cancer Res. Treat. - 2017. - Vol. 166, №3.-P. 725-741.-DOI: 10.1007/s10549-017-4424-0.

274. Dyrmundsson, O. R. North European short-tailed breeds of sheep: a review / O. R. Dyrmundsson, R. Niznikowski // Animal. - 2010. - Vol. 4. - P. 1275-1282. -DOI: 10.1017/S175173110999156X.

275. Dzomba, E. F. Runs of homozygosity analysis of South African sheep breeds from various production systems investigated using OvineSNP50k data / E. F. Dzomba, M. Chimonyo, R. Pierneef, F. C. Muchadeyi //BMC Genomics. - 2021. -Vol. 22.-P. 7.-DOI: 10.1186/s12864-020-07314-2.

276. Dzomba, E. F. The genomic architecture of South African mutton, pelt, dual-purpose and nondescript sheep breeds relative to global sheep populations / E. F. Dzomba, M. Chimonyo, M. A. Snyman, F. C. Muchadeyi // Anim. Genet. - 2020. -Vol. 51, № 6. - P. 910-923.-DOI: 10.1111/age.12991.

277. Dzomba, E. F. Selection signature analysis and genome-wide divergence of South African Merino breeds from their founders / E. F. Dzomba, M. A. Van Der Nest, J. N. T. Mthembu [et al.] // Front. Genet. - 2023. - Vol. 13. - P. 932272. - DOI: 10.3389/fgene.2022.932272.

278. E, G. X. Current genetic diversity in eight local Chinese sheep populations / G. X. E, Y. H. Ma, M. X. Chu [et al.] // Mol. Biol. Rep. - 2019. - Vol. 46, № 1.-P. 1307-1311.-DOI: 10.1007/s11033-018-4445-8.

279. E, G. X. Desmoglein 4 diversity and correlation analysis with coat color in goat / G. X. E, Y. J. Zhao, Y. H. Ma [et al.] // Genet. Mol. Res. - 2016. - Vol. 15, № 1.-P. 15017814.-DOI: 10.4238/gmr.15017814.

280. Easa, A. A. Identification of genomic regions and candidate genes associated with body weight and body conformation traits in Karachai goats / A. A. Easa, M. Selionova, M. Aibazov [et al.] // Genes (Basel). - 2022. - Vol. 13. - P. 1773. - DOI: 10.3390/genes13101773.

281. Ebert, S. M. Skeletal muscle atrophy: discovery of mechanisms and potential therapies / S. M. Ebert, A. Al-Zougbi, S. C. Bodine, C. M. Adams // Physiology (Bethesda). - 2019. - Vol. 34, № 4. - P. 232-239. - DOI: 10.1152/physiol.00003.2019.

282. Ede, A. J. Ovine microsatellites at the OarCP34, OarCP38, OarCP43, OarCP49, OarCP73, OarCP79 and OarCP99 loci / A. J. Ede, C. A. Pierson, A. M. Crawford // Anim. Genet. - 1995. - Vol. 26, № 2. - P. 130-131. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.1995.tb02656.x.

283. Edea, Z. Genomic signatures of high-altitude adaptation in Ethiopian sheep populations / Z. Edea, H. Dadi, T. Dessie, K. S. Kim // Genes Genom. - 2019.

- Vol. 41. - P. 973-981. - DOI: 10.1007/s13258-019-00820-y.

284. Eid, S. The importance of prion research / S. Eid, S. Lee, C. E. Verkuyl [et al.] // Biochem. Cell Biol. - 2024. - Vol. 102, № 6. - P. 448-471. - DOI: 10.1139/bcb-2024-0018.

285. Eiriksson, J. H. Predicted breeding values for relative scrapie susceptibility for genotyped and ungenotyped sheep / J. H. Eiriksson, ^orarinsdottir, E. Gautason // Genet. Sel. Evol. - 2024. - Vol. 56, № 1. - P. 77. -DOI: 10.1186/s12711-024-00947-x.

286. Ekanayake, D. L. The roles and expression of HOXA/Hoxa10 gene: A prospective marker of mammalian female fertility? / D. L. Ekanayake, M. M. Malopolska, T. Schwarz [et al.] // Reprod. Biol. - 2022. - Vol. 22, № 2. - P. 100647.

- DOI: 10.1016/j .repbio.2022.100647.

287. Elder, L. A. Differential gene expression in peripheral leukocytes of pre-weaned Holstein heifer calves with respiratory disease / L. A. Elder, H. R. Hinnant, C. M. Mandella [et al.] // PLoS ONE. - 2023. - Vol. 18, № 5. - P. e0285876. - DOI: 10.1371/journal.pone.0285876.

288. Epstein, H. The Awassi sheep with special reference to the improved dairy type // FAO animal production and health paper. / H. Epstein - Rome: Food and Agriculture Organization of the United Nations, 1985. - № 57. - 282 p.

289. Ernie Muneerah, M. A. Microsatellite-based genetic characterization of the indigenous Katjang goat in Peninsular Malaysia / M. A. Ernie Muneerah, N. A. Md Tamrin, M. S. Salisi [et al.] // Animals (Basel). - 2021. - Vol. 11, № 5. - P. 1328.-DOI: 10.3390/ani11051328.

290. Estrada-Reyes, Z. M. Signatures of selection for resistance to Haemonchus contortus in sheep and goats / Z. M. Estrada-Reyes, Y. Tsukahara, R. R. Amadeu [et al.] // BMC Genomics. - 2019. - Vol. 20. - P. 735. - DOI: 10.1186/s12864-019-6150-y.

291. Eusebi, P. G. Genomic tools for effective conservation of livestock breed diversity / P. G. Eusebi, A. Martinez, O. Cortes // Diversity. - 2020. - Vol. 12. -P. 8.-DOI: 10.3390/d12010008.

292. Evagelou, S. L. DEAD box protein family member DDX28 is a negative regulator of hypoxia-inducible factor 2a- and eukaryotic initiation factor 4E2-directed hypoxic translation / S. L. Evagelou, O. Bebenek, E. J. Specker, J. Uniacke // Mol Cell Biol. - 2020. - Vol. 40, № 6. - P. e00610-19. - DOI: 10.1128/MCB.00610-19.

293. Eydivandi, S. A selection signatures study among Middle Eastern and European sheep breeds / S. Eydivandi, M. A. Roudbar, S. S. Ardestani [et al.] // J. Anim. Breed. Genet. - 2021. - Vol. 138, № 5. - P. 574-588. - DOI: 10.1111/jbg.12536.

294. Eydivandi, S. Genomic scans for selective sweeps through haplotype homozygosity and allelic fixation in 14 indigenous sheep breeds from Middle East and South Asia / S. Eydivandi, M. A. Roudbar, M. O. Karimi, G. Sahana // Sci. Rep. -2021.-Vol. 11.-P. 2834.-DOI: 10.1038/s41598-021-82625-2.

295. Fan, B. Genome-wide association study identifies loci for body composition and structural soundness traits in pigs / B. Fan, S. K. Onteru, Z. Q. Du [et al.] // PLoS One. - 2011. - Vol. 6, № 2. - P. e14726. - DOI: 10.1371/journal.pone.0014726.

296. Fan, J. B. Highly parallel SNP genotyping / J. B. Fan, A. Oliphant, R. Shen [et al.] // Cold Spring Harb Symp Quant Biol. - 2003. - Vol. 68. - P. 69-78. -DOI: 10.1101/sqb.2003.68.69.

297. Fan, X. Influence of gestational over-feeding on cardiac morphometry and hypertrophic protein markers in fetal sheep / X. Fan, S. Turdi, S. P. Ford [et al.]

// J Nutr Biochem. - 2011. - Vol. 22, № 1. - P. 30-37. - DOI: 10.1016/j.jnutbio.2009.11.006.

298. Fatima, N. A homozygous missense mutation in the fibroblast growth factor 5 gene is associated with the long-hair trait in Angora rabbits / N. Fatima, L. Jia, B. Liu [et al.] // BMC Genomics. - 2023. - Vol. 24, № 1. - P. 298. - DOI: 10.1186/s12864-023-09405-2.

299. Favia, M. The non-gastric H+/K+ ATPase (ATP12A) is expressed in mammalian spermatozoa / M. Favia, A. Gerbino, E. Notario [et al.] // Int. J. Mol. Sci. - 2022. - Vol. 23.-P. 1048.-DOI: 10.3390/ijms23031048.

300. Fay, J. C. Hitchhiking under positive Darwinian selection / J. C. Fay, C. I. Wu // Genetics. - 2000. - Vol. 155. - P. 1405-1413. - DOI: 10.1093/genetics/155.3.1405.

301. Fei, X. Transcriptome reveals key microRNAs involved in fat deposition between different tail sheep breeds / X. Fei, M. Jin, Y. Wang [et al.] // PLoS One. - 2022. - Vol. 17, № 3. - P. e0264804. - DOI: 10.1371/journal.pone.0264804.

302. Feng, Y. Comprehensive analysis of methylome and transcriptome to identify potential genes regulating porcine testis development / Y. Feng, Y. Zhang, J. Wu [et al.] // Int J Mol Sci. - 2024. - Vol. 25, № 16. - P. 9105. - DOI: 10.3390/ijms25169105.

303. Ferrando, A. Genetic relationships between six eastern Pyrenean sheep breeds assessed using microsatellites / A. Ferrando, F. Goyache, P.-M. Parés [et al.] // Span J Agric Res. - 2014. - Vol. 12, № 4. - P. 1029-1037. - DOI: 10.5424/sjar/2014124-6173.

304. Fonseca, L. F. S. Gene expression profiling and identification of hub genes in Nellore cattle with different marbling score levels / L. F. S. S. Fonseca, D. B. dos Santos Silva, D. F. J. Gimenez [et al.] // Genomics. - 2020. - Vol. 112, № 1. -P. 873-879.-DOI: 10.1016/j.ygeno.2019.06.001.

305. Fossat, N. Conditional restoration and inactivation of Rbm47 reveal its tissue-context requirement for viability and growth / N. Fossat, T. Radziewic, V.

Jones [et al.] // Genesis. - 2016. - Vol. 54, № 3. - P. 115-122. - DOI: 10.1002/dvg.22920.

306. Franchetti, M. D. Nomadic ecology shaped the highland geography of Asia's Silk Roads / M. D. Franchetti, C. E. Smith, C. M. Traub, T. Williams // Nature. - 2017. - Vol. 543, № 7644. - P. 193-198. - DOI: 10.1038/nature21696.

307. Francis, R. M. pophelper: An R package and web app to analyze and visualize population structure / R. M. Francis // Mol. Ecol. Resour. - 2017. - Vol. 17, № 1.-P. 27-32.-DOI: 10.1111/1755-0998.12509.

308. Franck, I. The Silk Road /1. Franck, D. Brownstone, 1st US edition. -New York: Facts on File, Inc., 1986. - 39 p.

309. French, D. J. Analysis of multiple single nucleotide polymorphisms closely positioned in the ovine PRNP gene using linear fluorescent probes and melting curve analysis / D. J. French, D. Jones, D. G. McDowell [et al.] // BMC Infect. Dis. - 2007. - Vol. 7. - P. 90. - DOI: 10.1186/1471-2334-7-90.

310. Fu, X. Integrated analysis of lncRNA and mRNA reveals novel insights into cashmere fineness in Tibetan cashmere goats / X. Fu, B. Zhao, K. Tian [et al.] //PeerJ.-2020.-Vol. 8.-P. e10217.-DOI: 10.7717/peerj.10217.

311. Fuller, D. Q. Across the Indian Ocean: the prehistoric movement of plants and animals / D. Q. Fuller, N. Boivin, T. Hoogervorst, R. Allaby // Antiquity. -2011.-Vol. 85.-P. 544-558.-DOI: 10.1017/S0003598X00067934.

312. Gallivan, C. Comparison of Finnish Landrace and Romanov as prolific breeds in a terminal-sire crossbreeding system / C. Gallivan, R. A. Kemp, Y. M. Berger, L. D. Young // J. Anim. Sci. - 1993. - Vol. 71. - P. 2910-2918. - DOI: 10.2527/1993.71112910x.

313. Gambetti, P. Sporadic and familial CJD: Classification and characterization / P. Gambetti, Q. Kong, W. Zou [et al.] // Br Med Bull. - 2003. -Vol. 66. - P. 213-239. - DOI: 10.1093/bmb/66.1.213.

314. Gao, W. Z. Proteomics analysis of the secondary hair follicle cycle in Liaoning cashmere goat / W. Z. Gao, H. L. Xue, J. J. Y. S. R. Yang // Small Rumin Res. -2021. - Vol. 201. - P. 106408. - DOI: 10.1016/j.smallrumres.2021.106408.

315. Gao, Y. Analysis of long non-coding RNA and mRNA expression profiling in immature and mature bovine (Bos taurus) testes / Y. Gao, S. Li, Z. Lai [etal.] //Front Genet. -2019. - Vol. 10. - P. 646. -DOI: 10.3389/fgene.2019.00646.

316. Gao, Y. H. CNV discovery for milk composition traits in dairy cattle using whole-genome resequencing / Y. H. Gao, J. P. Jiang, S. H. Yang [et al.] // BMC Genomics.-2017.-Vol. 18.-P. 265.-DOI: 10.1186/s12864-017-3636-3.

317. García-Fernández, M. The role of bovine causal genes underlying dairy traits in Spanish Churra sheep /M. Garcia-Fernandez, B. Gutierrez-Gil, J. P. Sanchez [et al.] // Anim. Genet. - 2011. - Vol. 42, № 4. - P. 415-420. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.2010.02162.x.

318. Garcia-Gámez, E. Identification of quantitative trait loci underlying milk traits in Spanish dairy sheep using linkage plus combined linkage disequilibrium and linkage analysis approaches / E. Garcia-Gámez, B. Gutiérrez-Gil, A. Suarez-Vera [et al.] // J Dairy Sci. - 2013. - Vol. 96, № 9. - P. 6059-6069. -DOI: 10.3168/jds.2013-6824.

319. Garcia-Gamez, E. Using regulatory and epistatic networks to extend the findings of a genome scan: Identifying the gene drivers of pigmentation in Merino sheep / E. Garcia-Gamez, A. Reverter, V. Whan [et al.] // PLoS One. - 2011. -Vol. 6, №6.-P. e21158. - DOI: 10.1371/journal.pone.0021158.

320. Garud, N.R. Recent selective sweeps in North American Drosophila melanogaster show signatures of soft sweeps / N. R. Garud, P. W. Messer, E. O. Buzbas, D. A. Petrov // PLoS Genet. - 2015. - Vol. 11, № 2. - P. e1005004. - DOI: 10.1371/journal.pgen.1005004.

321. Gaspa, G. Genomic analysis of Sarda sheep raised at diverse temperatures highlights several genes involved in adaptations to the environment and heat stress response / G. Gaspa, A. Cesarani, A. Pauciullo [et al.] // Animals (Basel). - 2024. - Vol. 14, № 24. - P. 3585. - DOI: 10.3390/ani14243585.

322. Gautier, M. A whole genome Bayesian scan for adaptive genetic divergence in West African cattle / M. Gautier, L. Flori, A. Riebler [et al.] // BMC Genomics. - 2009. - Vol. 10.-P. 550.-DOI: 10.1186/1471-2164-10-550.

323. Georgsson, G. Infectious agent of sheep scrapie may persist in the environment for at least 16 years / G. Georgsson, S. Sigurdarson, P. Brown // J. Gen. Virol. - 2006. - Vol. 87, Pt 12. - P. 3737-3740. - DOI: 10.1099/vir.0.82011-0.

324. Gergen, J.P. Filter replicas and permanent collections of recombinant DNA plasmids / J. P. Gergen, R. H. Stern, P. C. Wensink // Nucleic Acids Res. -1979. - Vol. 7. - P. 2115-2136. - DOI: 10.1093/nar/7.8.2115.

325. Gerhold, D. DNA chips: Promising toys have become powerful tools/ D. Gerhold, T. Rushmore, C. T. Caskey // Trends Biochem. Sci. - 1999. - Vol. 24, № 5. - P. 168-173. - DOI: 10.1016/S0968-0004(99)01382-1.

326. Ghobrial, A. ELL2 influences transcription elongation, splicing, Ig secretion and growth / A. Ghobrial, N. Flick, R. Daly [et al.] // J Mucosal Immunol Res.-2019.-Vol. 3,№ 1.-P. 112.

327. Ghoreishifar, S.M. Signatures of selection reveal candidate genes involved in economic traits and cold acclimation in five Swedish cattle breeds / S. M. Ghoreishifar, S. Eriksson, A. M. Johansson [et al.] // Genet. Sel. Evol. - 2020. -Vol. 52, № 1.-P. 52.-DOI: 10.1186/s12711-020-00571-5.

328. Ghoreishifar, S. M. Shared ancestry and signatures of recent selection in Gotland sheep / S. M. Ghoreishifar, C. M. Rochus, S. Moghaddaszadeh-Ahrabi [et al.] // Genes (Basel). - 2021. - Vol. 12, № 3. - P. 433. - DOI: 10.3390/genes12030433.

329. Gibson, J. Extended tracts of homozygosity in outbred human populations / J. Gibson, N. E. Morton, A. Collins // Hum. Mol. Genet. - 2006. - Vol. 15. - P. 789-795. - DOI: 10.1093/hmg/ddi493.

330. Goldmann, W. Two alleles of a neural protein gene linked to scrapie in sheep / W. Goldmann, N. Hunter, J. D. Foster [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1990. - Vol. 87, № 7. - P. 2476-2480. - DOI: 10.1073/pnas.87.7.2476.

331. Goldmann, W. PrP genotype and agent effects in scrapie: Change in allelic interaction with different isolates of agent in sheep, a natural host of scrapie / W. Goldmann, N. Hunter, G. Smith [et al.] // J. Gen. Virol. - 1994. - Vol. 75, Pt 5. - P. 989-995. - DOI: 10.1099/0022-1317-75-5-989.

332. Gómez, A. E. Multiple mechanisms explain genetic effects at the CPED1-WNT16 bone mineral density locus / A. E. Gómez, S. Addish, K. Alvarado [et al.] // Curr. Osteoporos. Rep. - 2023. - Vol. 21, № 2. - P. 173-183. - DOI: 10.1007/s11914-023-00783-w.

333. González, L. Adaptation and evaluation of a rapid test for the diagnosis of sheep scrapie in samples of rectal mucosa / L. González, R. Horton, D. Ramsay [et al.] // J. Vet. Diagn. Invest. - 2008. - Vol. 20, № 2. - P. 203-208. - DOI: 10.1177/104063870802000209.

334. Gonzalez, M.V. A divergent artiodactyl MYADM-like repeat is associated with erythrocyte traits and weight of lamb weaned in domestic sheep / M. V. Gonzalez, M. R. Mousel, D. R. Herndon [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol. 8, № 8. - P. e74700. - DOI: 10.1371/journal.pone.0074700.

335. Gordon, W. S. Advances in veterinary research: Louping-ill, tick-borne fever and scrapie / W. S. Gordon // Vet Rec. - 1946. - Vol. 58, № 47. - P. 516-525.

336. Gorkhali, N. A. Genomic analysis identified a potential novel molecular mechanism for high-altitude adaptation in sheep at the Himalayas / N. A. Gorkhali, K. Dong, M. Yang [et al.] // Sci. Rep. - 2016. - Vol. 6. - P. 29963. - DOI: 10.1038/srep29963.

337. Graham-Paquin, A. L. ZMYM2 is essential for methylation of germline genes and active transposons in embryonic development / A. L. Graham-Paquin, D. Saini, J. Sirois [etal.]//Nucleic Acids Res. -2023. -Vol. 51, № 14.-P. 7314-7329. -DOI: 10.1093/nar/gkad540.

338. Grunstein, M. Colony hybridization: A method for the isolation of cloned DNAs that contain a specific gene / M. Grunstein, D. S. Hogness // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 1975. - Vol. 72, № 10. - P. 3961-3965. - DOI: 10.1073/pnas.72.10.3961.

339. Guan, S. Development and validation of a 54K genome-wide liquid SNP chip panel by target sequencing for dairy goat / S. Guan, W. Li, H. Jin, L. Zhang, G. Liu // Genes (Basel). - 2023. - Vol. 14, № 5. - P. 1122. - DOI: 10.3390/genes14051122.

340. Guo, J. Whole-genome sequencing reveals selection signatures associated with important traits in six goat breeds / J. Guo, H. Tao, P. Li [et al.] // Sci Rep.-2018.-Vol. 8, № 1.-P. 10405.-DOI: 10.1038/s41598-018-28719-w.

341. Gutiérrez-Gil, B. A genome scan for quantitative trait loci affecting body conformation traits in Spanish Churra dairy sheep / B. Gutiérrez-Gil, L. Álvarez, L. F. de la Fuente [et al.] // J. Dairy Sci. - 2011. - Vol. 94, № 8. - P. 4119-4128.-DOI: 10.3168/jds.2010-4027.

342. Gutiérrez-Gil, B. Application of selection mapping to identify genomic regions associated with dairy production in sheep / B. Gutiérrez-Gil, J. J. Arranz, R. Pong-Wong [et al.] // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 5. - P. e94623. - DOI: 10.1371/journal.pone.0094623.

343. Gutiérrez-Gil, B. Quantitative trait loci underlying milk production traits in sheep / B. Gutiérrez-Gil, M. F. El-Zarei, L. Álvarez [et al.] // Anim. Genet. -2009.-Vol. 40, №4.-P. 423-434. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.2009.01856.x.

344. Haase, B. Seven novel KIT mutations in horses with white coat colour phenotypes / B. Haase, S. A. Brooks, T. Tozaki [et al.] // Anim. Genet. - 2009. -Vol. 40, № 5. - P. 623-629. - DOI: 10.1111/j.1365-2052.2009.01903.x.

345. Hagenaars, T. J. Scrapie prevalence in sheep of susceptible genotype is declining in a population subject to breeding for resistance / T. J. Hagenaars, M. B. Melchior, A. Bossers [et al.] // BMC Vet. Res. - 2010. - Vol. 6. - P. 25. - DOI: 10.1186/1746-6148-6-25.

346. Halloran, K. M. Progesterone and interferon tau regulate expression of polyamine enzymes during the ovine peri-implantation period / K. M. Halloran, C. Stenhouse, R. M. Moses [et al.] // Biol. Reprod. - 2022. - Vol. 106, № 5. - P. 865-878. - DOI: 10.1093/biolre/ioac022.

347. Hao, Z. Functional differentiation of the ovine preadipocytes - Insights from gene expression profiling / Z. Hao, X. Jin, J. Wang [et al.] // Funct Integr Genomics. - 2023. - Vol. 23, № 2. - P. 97. - DOI: 10.1007/s10142-023-01034-y.

348. Harrison, R. G. Hybrid zones: Windows on evolutionary process // Oxford Surveys in Evolutionary Biology / Ed. D. Futuyma, J. Antonovics. - Oxford Univ. Press, New York, USA, 1990.

349. Hartl D. L. Principles of Population Genetics. /D. L. Hartl, A. G. Clark - Sunderland, UK: Sinauer Associates, 1997.

350. Hayes, B.J. Novel multilocus measure of linkage disequilibrium to estimate past effective population size / B. J. Hayes, P. M. Visscher, H. C. McPartlan, M. E. Goddard // Genome Res. - 2003. - Vol. 13, № 4. - P. 635-643. -DOI: 10.1101/gr.387103.

351. He, J. Gene network analysis reveals candidate genes related with the hair follicle development in sheep / J. He, B. Zhao, X. Huang [et al.] // BMC Genomics. - 2022. - Vol. 23, № 1. - P. 428. - DOI: 10.1186/s12864-022-08552-2.

352. He, S. Genome-wide scan for runs of homozygosity identifies candidate genes related to economically important traits in Chinese Merino / S. He, J. Di, B. Han [et al.] // Animals (Basel). - 2020. - Vol. 10, № 3. - P. 524. - DOI: 10.3390/ani10030524.

353. He, Z. MicroRNA expression profiles reveal wool development and fineness regulation in Gansu alpine fine-wool sheep / Z. He, H. Sun, F. Zhao [et al.] // Genomics. - 2024. - Vol. 116, № 5. - P. 110922. - DOI: 10.1016/j .ygeno.2024.110922.

354. Heaton, M. P. Ovine reference materials and assays for prion genetic testing / M. P. Heaton, K. A. Leymaster, T. S. Kalbfleisch [et al.] // BMC Vet. Res. -2010. - Vol. 6. - P. 23. - DOI: 10.1186/1746-6148-6-23.

355. Heaton, M. P. SNPs for parentage testing and traceability in globally diverse breeds of sheep / M. P. Heaton, K. A. Leymaster, T. S. Kalbfleisch [et al.] // PLoS One. - 2014. - Vol. 9, № 4. - P. e94851. - DOI: 10.1371/journal.pone.0094851.

356. Hecker, N. Convergent gene losses illuminate metabolic and physiological changes in herbivores and carnivores / N. Hecker, V. Sharma, M.

Hiller // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2019. - Vol. 116, № 8. - P. 3036-3041. -DOI: 10.1073/pnas.1818504116.

357. Hepp, D. Identification of the e allele at the extension locus (MC1R) in Brazilian Creole sheep and its role in wool color variation / D. Hepp, G. L. Gon?alves, G. R. P. Moreira [et al.] // Genet. Mol. Res. - 2012. - Vol. 11, № 3. - P. 2997-3006.

358. Hill, W. G. Estimation of effective population size from data on linkage disequilibrium / W. G. Hill // Genet. Res. - 1981. - Vol. 38. - P. 209-216. - DOI: 10.1017/S0016672300020553.

359. Hitit, M. Sperm long non-coding RNAs as markers for ram fertility / M. Hitit, A. Kaya, E. Memili // Front Vet Sci. - 2024. - Vol. 11. - P. 1337939. -DOI: 10.3389/fvets.2024.1337939.

360. Hoffmann, I. New MoDAD marker sets to be used in diversity studies for the major farm animal species: Recommendations of a joint ISAG/FAO working group /1. Hoffmann, P. Ajmone Marsan, J. S. F. Barker [et al.] // Proceedings of the 29th International Conference on Animal Genetics, Tokyo, Japan, 11-16 Sept. 2004.

- Abstract, p. 123.

361. Hossain, M. N. Cold exposure impacts DNA methylation patterns in cattle sperm / M. N. Hossain, Y. Gao, M. J. Hatfield [et al.] // Front. Genet. - 2024. -Vol. 15.-P. 1346150.-DOI: 10.3389/fgene.2024.1346150.

362. Hu, S. KIT is involved in melanocyte proliferation, apoptosis and melanogenesis in the Rex rabbit / S. Hu, Y. Chen, B. Zhao [et al.] // PeerJ. - 2020.

- Vol. 8. - P. e9402. - DOI: 10.7717/peerj.9402.

363. Hu, T. miR-143 targeting CUX1 to regulate proliferation of dermal papilla cells in Hu sheep / T. Hu, S. Huang, X. Lv [et al.] // Genes (Basel). - 2021.

- Vol. 12, № 12. - P. 2017. - DOI: 10.3390/genes12122017.

364. Hu, X. J. The genome landscape of Tibetan sheep reveals adaptive introgression from argali and the history of early human settlements on the Qinghai-Tibetan plateau / X. J. Hu, J. Yang, X. L. Xie [et al.] // Mol. Biol. Evol. - 2019. -Vol. 36, № 2. - P. 283-303. - DOI: 10.1093/molbev/msy208.

365. Huang, C. Runs of homozygosity detection and selection signature analysis for local goat breeds in Yunnan, China / C. Huang, Q. Zhao, Q. Chen [et al.] // Genes (Basel). - 2024. - Vol. 15. - P. 313. - DOI: 10.3390/genes15030313.

366. Huang, D. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources / D. Huang, B. Sherman, R. Lempicki // Nat Protoc. - 2009. - Vol. 4, № 1. - P. 44-57. - DOI: 10.1038/nprot.2008.211.

367. Hunter, N. Is scrapie solely a genetic disease? / N. Hunter, D. Cairns, J. D. Foster [et al.] // Nature. - 1997. - Vol. 386, № 6621. - P. 137. - DOI: 10.1038/386137a0.

368. Huson, D. H. Application of phylogenetic networks in evolutionary studies / D. H. Huson, D. Bryant // Mol. Biol. Evol. - 2006. - Vol. 23, № 2. - P. 254-267. - DOI: 10.1093/molbev/msj030.

369. Ili§iu, E. The Romanian Tsigai sheep breed, their potential and the challenges for research / E. Ili§iu, S. Daraban, R. Radu [et al.] // Appl Agric Forestry Res. - 2013. - Vol. 2. - P. 161-170. - DOI:10.3220/LBF_2013_161-170.