Индикация факторов вирулентности биопленкообразующих микроорганизмов при болезнях органов пищеварения птиц тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Пономарев Владислав Владимирович

• Пономарев Владислав Владимирович
• кандидат наук
• 2026

Оглавление диссертации кандидат наук Пономарев Владислав Владимирович

ВВЕДЕНИЕ

ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ

Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Особенности формирования микробиоты кишечника птиц

1.2. Причины и особенности формирования дисбактериоза птиц

1.3. Строение биопленок микроорганизмов и роль биопленкообразования в инфекционном процессе

1.4. Клинико-эпизоотологические особенности и дифференциальная диагностика болезней, вызванных Escherichia coli

1.5. Факторы патогенности и вирулентности Escherichia coli

1.6. Краткая характеристика бактерий вида Escherichia coli

1.7. Бактерии вида Escherichia albertii

1.8. Заключение по обзору литературы

СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ

Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

2.1. Оборудование, питательные среды, расходные материалы, используемые для проведения исследований

2.2. Методы проведения исследований

2.2.1. Методы патоморфологических исследований

2.2.2. Методы выделения культур микроорганизмов

2.2.3. Методы идентификации микроорганизмов

2.2.4. Микроскопические методы исследований

2.2.5. Методы изучения факторов вирулентности

2.2.6. Количественные и качественные методы исследований микрофлоры кишечника птиц

2.3. Методы статистической обработки результатов исследований

Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ

3.1. Результаты исследований диссеминации микроорганизмов при

болезнях органов пищеварения птиц

3.2. Индикация и идентификация микроорганизмов, выделенных из патматериала птиц при болезнях органов пищеварения

3.3. Количественный и видовой состав микробиоценозов кишечника птиц

3.4. Выделение и идентификация бактерий вида E. albertii

3.5. Результаты изучения патогенности и вирулентности выделенных изолятов микроорганизмов

3.5.1. Подвижность, гемолитическая и протеолитическая активность

3.5.2. Серологическая типизация и результаты биологических исследований

3.5.3. Бактериоциногенность изолятов E. albertii, L. salivarius и штаммов

L. fermentum, L. plantarum, E. coli

3.5.4. Результаты изучения чувствительности к антибактериальным препаратам выделенных изолятов микроорганизмов

3.5.5. Результаты исследования формирования биопленок микроорганизмов

3.5.6. Адгезивная способность и фагоцитарная устойчивость культур выделенных из кишечника птиц

3.5.7. Результаты определения средней летальной дозы выделенных изолятов микроорганизмов

3.6. Влияние антибактериальных препаратов на биопленки

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ ИССЛЕДОВАНИЙ

ВЫВОДЫ

ПРАКТИЧЕСКИЕ ПРЕДЛОЖЕНИЯ

ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ

СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

ПРИЛОЖЕНИЯ

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Индикация факторов вирулентности биопленкообразующих микроорганизмов при болезнях органов пищеварения птиц»

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы исследования. Содержание популяции на ограниченных площадях, поточная система выращивания птицы, искусственный микроклимат способствуют развитию и широкому распространению болезней органов пищеварения (Джупина С.И., 2002; Бессарабов Б.Ф., 2006; Пирожков М.К. с соавт., 2011; Новикова О.Б., Бартенев А.А., 2015; Ленев С.В., 2016; Фисинин В.И. с соавт., 2016; Грязнева Т.Н., 2018; Белимова С.С., Скворцов В.Н., 2019; Громов И. Н., 2020; Панкратов С.В. с соавт., 2021; Джавадов Э.Д. с соавт., 2023; Макаров В.В., 2023; Курмакаева Т.В., Козак С.С., 2024). Применение антибактериальных средств с низкой эффективностью, нарушение режима дозирования способствует появлению антибиотикоустойчивых микроорганизмов и формированию групп животных, не поддающихся традиционному лечению (Масьянов Ю.Н., 2009; Грозина А.А. с соавт., 2014; Федоров Ю.Н. с соавт., 2015; Скворцов В.Н. с соавт., 2020, 2021).

При нарушении совокупности биологических механизмов, обеспечивающих стабильность нормобиоты кишечника, происходит снижение числа доминантной микросимбионты и увеличение минорных ассоциаций бактерий. Активизация персистентных свойств условно-патогенной микрофлоры обеспечивает переход популяции в «некультивируемое состояние», что обусловливает полиморфизм клинических проявлений и сложности дифференциальной диагностики факторных инфекций (Блинкова Л.П. и др., 2010; Ленченко Е.М. и др., 2019; Пахомов Ю.Д. и др, 2022; Иванова О.Е. и др., 2022; Хайтович А.Б., 2022; Антоневский И.В., Плешакова В.И., 2023). При распространении новых и вариантов известных нозологических форм наблюдается статистически достоверная тенденция возрастания доминирования этиологической значимости бактерий порядка Enterobacterales, характеризующихся высокими эпидемиологическими и эпизоотологическими показателями (Манжурина О. А. с соавт., 2017; Белимова, С. С. с соавт., 2019; Janda J.M., Abbott S.L., 2021; Muchaamba F. et al., 2022; Mirzaei A. et al., 2022; Макавчик C.A. с соавт., 2022; Исакова М.Н. с соавт., 2022; Пирожков

М. К. с соавт., 2022; Тамбиев Т. С. и соавт., 2023; Hirose S. et al., 2024; Курмакаева Т. В., Козак С.С., 2024).

Применение антибактериальных средств с низкой эффективностью, нарушение режима дозирования способствует появлению антибиотикоустойчивых штаммов бактерий и формированию групп животных, не поддающихся традиционному лечению (Масьянов Ю.Н., 2009; Грозина А.А. с соавт., 2014; Федоров Ю.Н. с соавт., 2015; Скворцов В.Н. с соавт., 2020, 2021). Полирезистентные штаммы энтеробактерий причислены к первой категории патогенов критического уровня приоритетности для исследований (WHO Bacterial Priority Pathogens List, 2024). Маркером множественной резистентности APEC (avian pathogenic Escherichia coli) является невосприимчивость к различным классам антибиотиков, в том числе и к социально значимым (колистин, карбапенем, группы Р-лактамы) (Исакова М.Н. с соавт., 2022; Конищева А.С. с соавт., 2022; Прунтова О.В. с соавт., 2022).

Переход условно-патогенных бактерий в некультивируемое состояние после стресса, в том числе вызванного действием антибиотиков, влечет невозможность обнаружения микроорганизмов культуральными методами и влияет на достоверность результатов (Блинкова Л.П. с соавт., 2010; Ленченко Е.М. с соавт., 2019; Пахомов Ю.Д. с соавт., 2022; Хайтович А.Б., 2022).

В настоящее время возрастает инцидентность бактерий E. albertii в спорадических случаях бактериемии и вспышек пищевых токсикоинфекций человека. Эти бактерии обусловливают развитие инфекционного процесса и субклинические инфекции домашних и диких птиц. Дифференциация от таксономически сходных видов многочисленных представителей семейства Enterobacteriaceae сопряжена с лактозоотрицательностью, а также продукцией интимина (Huys G. et al., 2003; Oaks J.L. et al., 2010; Ooka T. et al., 2012; Yamamoto D. et al., 2017; Lima M.P. et al., 2019; Hinenoya А. et al., 2021).

Увеличение числа полирезистентных бактерий и новых патогенов во всем мире бросает вызов для изыскания эффективных методов диагностики,

профилактики и борьбы с болезнями органов пищеварения вызванных представителями условно-патогенной микрофлоры.

Степень разработанности темы. Нарушение совокупности биологических механизмов и изменение количественного и видового состава микробиоценозов, обеспечивающих стабильность гомеостаза, влекут за собой формирование биопленок патогенных микроорганизмов, характеризующихся популяционной изменчивостью, снижением процессов метаболизма и переходом популяции в «некультивируемое состояние» (Ленченко Е.М. с соавт., 2019, Барзыкина С.Н., Борунова С.М., с соавт., 2025). Реализация патогенных свойств энтеробактерий опосредована факторами вирулентности, кодируемыми хромосомными, плазмидными генами и интегрированными в хромосому бактериофагами (Пирожков М. К. и соавт., 2002, 2022; Светоч Э.А. и соавт., 2023; Lenchenko E.M. et al., 2024). Снижение компенсаторных механизмов мукоциллиарного клиренса и колонизационной резистентности кишечника, репрезентация сигнальных молекул Quorum Sensing (QS) способствуют избыточному росту патогенных биопленкообразующих микроорганизмов, характеризующихся убиквитарностью, множественностью факторов вирулентности и переходом популяции в «некультивируемое состояние» (Ленченко Е.М., 2000, 2019; Блинкова Л.П. с соавт., 2010; Пахомов Ю.Д. с соавт., 2022; Хайтович А.Б., 2022).

E. albertii в настоящее время признана энтеропатогеном человека, а также патогеном различных видов птиц (Huys G. et al., 2003; Oaks J.L. et al., 2010; Hinenoya А. et al., 2021). Однако идентификация E. albertii и дифференциация ее от других видов Escherichia и родов Enterobacteriaceae биохимическими методами в настоящее время представляет большие трудности (Ooka T. et al., 2012; Yamamoto D. et al., 2017; Lima M.P. et al., 2019).

Для оптимизации длительной ретроспективной идентификации сходных видов патогенных и условно-патогенных микроорганизмов и разработки способов эрадикации биопленок приоритетным направлением научных изысканий является исследование общих закономерностей многоуровневых алгоритмов

дифференциации популяций микроорганизмов, в том числе и жизнеспособных некультивируемых клеток.

Механизм влияния антибиотиков на планктонные формы бактерий и биопленки существенно отличается. Для изучения данного явления требуются разработки новых высокотехнологичных и наукоемких методов. Цель исследований: индикация факторов вирулентности биопленкообразующих микроорганизмов при болезнях органов пищеварения птиц. Основные задачи:

- изучить количественный и видовой состав микроорганизмов при болезнях органов пищеварения птиц;

- изучить взаимосвязь морфометрических, денситометрических показателей биопленок микроорганизмов и их адгезивности;

- оценить профили резистентности микроорганизмов и изучить влияние антибактериальных препаратов на формирование биопленок изолятов, выделенных при болезнях органов пищеварения птиц;

- определить факторы вирулентности выделенных изолятов биопленкообразующих микроорганизмов.

Научная новизна. Впервые в РФ при индикации микроорганизмов вида E. albertii проведен анализ количественного и видового состава микробиоценозов кишечника птиц. Установлены особенности формирования и структура биопленок микроорганизмов E. albertii при воздействии антибиотиков с помощью конфокальной лазерной сканирующей микроскопии (КЛСМ) биопленок. Выявлены коррелятивные зависимости между индексом адгезивности и оптической плотностью биопленок микроорганизмов. Определены профили антибиотикорезистентности изолятов биопленкообразующих микроорганизмов, в т.ч. E. albertii. Впервые в РФ разработан способ идентификации и дифференциации E. albertii от сходных видов микроорганизмов семейства Enterobacteriaceae. Теоретическая и практическая значимость работы. Совместно с ФГБУ «ВГНКИ» разработан и апробирован научно обоснованный метод обработки биопленок флуоресцентным комплексом гентамицин - акридин оранжевый,

позволяющий проводить исследования в области оценки влияния антибиотиков на микроорганизмы, включая определение влияния времени экспозиции, дозы антибиотика, глубины проникновения антибиотика в биопленку.

Полученные нами данные о видовом и количественном составе микробиоты кишечника, а также о динамике морфологических и патологических изменений расширяют границы теоретических познаний в области общей и частной патологии животных и способствуют усовершенствованию диагностических и противоэпизоотических мероприятий.

Выводы, полученные при проведении исследований, легли в основу методических рекомендаций «Методы выделения и идентификации Escherichia albertii из патологического и клинического материала от птиц», утв. от 21.03.2025 г ФГБУ «ВГНКИ».

Методология и методы исследований. Методологические подходы основаны на анализе результатов репрезентативных выборок птицеводческих объектов, соблюдая принципы рандомизации, учитывая критерии, имеющие эпизоотологическое значение, временные и географические границы распространения инфекционной патологии птиц.

В процессе исследований использовали стандартизованные и разработанные нами методические рекомендации «Методы выделения и идентификации Escherichia albertii из патологического и клинического материала от птиц», утв. 21.03.2025 ФГБУ «ВГНКИ». Основные положения, выносимые на защиту:

1. На степень проявления болезней органов пищеварения птиц влияет количественный и видовой состав микроорганизмов кишечника. Наличие в кишечном содержимом бактерий вида E. albertii изменяет соотношение микроорганизмов и снижает бактериальную нагрузку бактерий вида E. coli;

2. Вирулентность изолятов E. coli О78:К88 выше, чем вирулентность изолятов E. albertii;

3. Профили резистентности микроорганизмов и применение антибактериальных препаратов влияют на формирование биопленок изолятов, выделенных при болезнях органов пищеварения птиц;

4. Оптическая плотность изолятов E. coli O78:K88 превосходит оптическую плотность изолятов E. albertii

Степень достоверности и апробация результатов работы. Результаты научно-исследовательской работы и выводы обоснованы, получены экспериментальным путём и подтверждены большим объёмом лабораторных исследований, степень достоверности которых подтверждается их статистической обработкой и анализом. При проведении научных исследований применяли действующие методики, утвержденные Министерством сельского хозяйства Российской Федерации. Работа проводилась при использовании средств измерений, внесенных во ФГИС Росстандарта и прошедших поверку, согласно ГОСТ Р 8.973-2019, аттестованного в установленном на территории Российской Федерации порядке испытательного оборудования и репрезентативной выборкой. Используемые при проведении исследований питательные среды проверены на качество в соответствии с действующими на территории Российской Федерации методами с использованием типовых штаммов микроорганизмов, полученных из государственных коллекций. Микробиологические исследования биоматериала проводились на базе лицензированной и аккредитованной лаборатории. Достоверность полученных экспериментальных данных обеспечивалась достаточным количеством проведенных микробиологических исследований. Результаты исследований обрабатывались методом статистического анализа с использованием Microsoft Office Excel 16 с пакетом расширений «Анализ данных».

Результаты исследований доложены и обсуждены на: IV Международной научно-практической конференции, Луганск, 2023 г; 73-й Международной научно-практической конференции «Научно-технологические приоритеты в развитии агропромышленного комплекса России», Рязань, 2022 г.

Соответствие паспорту специальности. Диссертационное исследование является завершённой научно-исследовательской работой и соответствует научной

специальности: 4.2.3. Инфекционные болезни и иммунология животных по пунктам 5, 7 и 8.

Публикации. По результатам диссертации опубликованы 8 научных работ, в том числе 5 - в рецензируемых научных журналах, входящих в Перечень ВАК при Министерстве науки и высшего образования Российской Федерации и рекомендованных для публикации основных научных результатов диссертации на соискание ученой степени кандидата наук.

Личный вклад автора. Настоящая диссертационная работа представляет собой авторское научное исследование. Личный вклад диссертанта состоит в непосредственном выполнении научных изысканий: постановке целей и задач; определении объектов и методов изучения; проведении опытной и экспериментальной работы; обработке и интерпретации полученных результатов; формулировке выводов.

Объем и структура диссертации. Материалы диссертации представлены на 188 страницах компьютерного текста и включают введение, литературный обзор, собственные исследования, обсуждение результатов, выводы, библиографию (302 источника, из них законодательные, нормативно-правовые акты, стандарты - 18, электронные ресурсы - 5, 131 отечественных и 147 зарубежных авторов). Работа содержит 23 таблицы, 47 рисунков, 4 приложения.

ОСНОВНАЯ ЧАСТЬ ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

1.1. Особенности формирования микробиоты кишечника птиц

Микробиоценоз кишечника является микроэкологической системой организма. Состояние равновесия этой системы зависит от гомеостаза микробиоты его заселяющей и условий окружающей среды (Бондаренко В. М., Мацулевич Т. В., 2007; Пономарев В. В., Ленченко Е. М., 2022).

Нормофлору рассматривают как интегральную часть макроорганизма, своеобразный экстракорпоральный орган, способный синтезировать и разрушать как собственные, так и чужеродные субстанции, структуру, обеспечивающую транслокацию как полезных, так и потенциально вредных агентов (Коршунов В.М. с соавт., 1997; Хавкин А. И., 2009; Шендеров Б. А., 2004).

Сохранение барьерной функции кишечника обеспечивают сложные взаимодействия микробиоты и иммунные мехинизмы. Иммунная система обеспечивает постоянство микробиома толстого кишечника (Иванова Е. В., 2018; Yoo J. Y. et al., 2020; Camara-Lemarroy C. R. et al., 2018).

Нарушению гомеостаза кишечника препятствует структурно-функциональные компоненты: биологический, биохимический, механический и иммунный барьеры.

Микробиота кишечника как биологический барьер препятствует размножению патогенной микрофлоры посредством выработки специальных веществ - бактериоцинов, лектинов, ацетатов, лактатов, перекиси водорода, сидерофоры и др. (Hertzberger R. et al., 2014; Macfarlane, S., 2003; Morrison, D. J. et al., 2016; Camara-Lemarroy C. R. et al., 2018).

По данным Е.В. Ивановой (2018), Н.Б. Перуновой (2018) Bifidobacterium поддерживают постоянство популяции особым способом узнавания чужеродных бактерий (Иванова Е. В., 2018; Перунова Н. Б., 2018).

Два слоя слизи на поверхности клеток эпителия представлены гликопротеинами, муцинами и секреторными IgA (sIgA), которые вместе образуют

биохимический барьер (Liu Y. et al., 2020; Legrand D. et al., 2005; Litvak Y. et al., 2018; Grondin J. A. et al., 2020; Pietrzak В. et al., 2020; Camara-Lemarroy C. R. et al., 2018).

Эпителиальные клетки (IEC) обеспечивают регуляцию проницаемости кишечника и механическую защиту (Kim D. et al., 2005; Krautkramer K. A. et al., 2021; Lindsay S. et al., 2017; Liu Т. et al., 2012).

Эпителиоциты способны продуцировать цитокины и хемокины, регулирующие воспалительные реакции в кишечнике (Kim D. et al., 2005; Krautkramer K. A. et al., 2021).

Интраэпителиальные лимфоциты (IELs), лимфоидная ткань обеспечивают иммунную защиту (Camara-Lemarroy C. R. et al., 2018; Wells J. M. et al., 2017) и играют ключевую роль в защите от патогенов инфекционной природы (Li Y. et al., 2011; Olivares-Villagomez D., Kaer L., 2018).

Секреторный IgA является важным эффектором мукозального иммунитета кишечника (Salerno-Goncalves R. et al., 2016; Rescigno M., 2014) и обеспечивает функции по агглютинации патогенов и нейтрализации токсинов (Chen K. et al., 2020).

По данным В. Pietrzak et al. (2020) ключевое воздействие на барьерную функцию кишечника оказывает интеракция между микробиотой и sIgA (Pietrzak В., et al., 2020).

Микробиом кишечника представлен широким разнообразием. Микробные ассоциации выполняют ряд жизненно необходимых функций для организма хозяина.

Пищеварительная функция. Бактерии способствуют расщеплению белков, жиров и углеводов, участвуют в метаболизме глютена и лактозы.

Метаболическая функция. Синтез важнейших бактериальных метаболитов: КЦЖК, витаминов, нейромедиаторов. Защитная (барьерная) функция. Формирование колонизационной резистентности путем конкурентного исключения патогенов - синтез бактериоцинов, интерферонов, выработка интерлейкинов, IL10, синтез Ig A.

Представители родов Bifidobacteriaceae и Lactobacillaceae, а также другие комменсальные бактерии, участвуют в иммунной регуляции за счёт активации иммунных структур кишечника, в том числе стимуляции цитокиновой секреции в пейеровых бляшках.

Поддержание регуляторного баланса осуществляется через ось «кишечник-мозг», включая механизмы нейронной и эндокринной регуляции.

Антистрессорная функция обеспечивается специфической особенностью отдельных видов микроорганизмов таких как Bifidobacteriaceae и Lactobacillaceae.

Антиканцерогенная функция. Способность некоторых бактерий синтезировать бутират (ингибиция HDAC), вызывающий апоптоз раковых клеток (Баканов Д. С., Семенчев Д. О., 2024; Бойкова Д. В. с соавт., 2023; Позняковский В. М. с соавт., 2022).

К дисбактериозу кишечника приводит нарушение количественного и видового состава микробиоты, колонизирующей кишечник (Бухарин О. В. с соавт., 2014; Конищева А. С. с соавт., 2021).

Принцип, сформированный Ле-Шателье: «Всякая система подвижного равновесия под действием внешнего воздействия изменяется так, что эффект внешнего воздействия сводится к минимуму» применим и для биологических систем при стрессовом воздействии на нее патогенов (Лебедева Н.В. с соавт, 2002).

Л.И. Железнова (2006), J.C. Clemente et al. (2012), Л.В. Крамарь с соавторами (2014), А. А. Плоскирева, (2015) отмечают, что внедрение патогенных агентов в организм приводит к нарушению видового и количественного состава микробиома (Железнова, Л.И., 2006; Крамарь Л.В. с соавт, 2014; Плоскирева А. А., 2015; Clemente J.C. et al., 2012).

Согласно данным С.В. Ленева с соавторами (2016) и Н.В. Пименова с соавторами (2017), распространению инфекционных болезней способствует нарушение санитарно-зоогигиенических требований, приводящее к заболеваниям органов пищеварения (Ленев С.В. с соавт., 2016; Пименов Н. В., Лаишевцев А. И., 2017; Lenev S.V. et al., 2016).

При изменении микробной экосистемы кишечника формируются предпосылки для нарушения механизмов, обеспечивающих сдерживание роста патогенов. В норме кишечная микробиота представляет собой высокодинамичную и разнообразную экосистему, реализующую комплекс механизмов колонизационной резистентности, включающих конкуренцию за питательные субстраты и метаболические ниши, вытеснение патогенов и индукцию иммунного ответа хозяина (Блинкова Л.П. с соавт., 2010; Иванова О. Е. с соавт., 2022; Ленченко Е.М. с соавт., 2019; Макаров В.В. с соавт., 1993; Субботин В.В. с соавт., 2002; Пахомов, Ю.Д. с соавт., 2022; Хайтович, А.Б., 2022).

Интенсивные технологии содержания и коррекции здоровья, включая медикаментозное воздействие, способствуют нарушению микробного гомеостаза кишечника, приводя к снижению стабильности нормальной микрофлоры и развитию дисбиотических изменений.

Результаты исследований В.В. Салаутина (2004), D.P. Morris et al. (2005), J. Jalanka-Tuovinen et al. (2011) и M. Schmulson et al. (2011), А.А. Грозиной (2014), J. Sundin et al. (2015) свидетельствуют о том, что рост численности патогенной и условно-патогенной микрофлоры ассоциирован с интенсификацией воспалительных процессов в кишечной слизистой. При этом для шигеллёзной инфекции характерна активация тучных клеток и цитокинового ответа, тогда как сальмонеллёз сопровождается преимущественной активацией ТИ2-звена иммунитета. (Салаутин В.В., 2004; Morris D.P., 2005; Jalanka-Tuovinen J. et al., 2011; Schmulson М. et al., 2011; Грозина А. А., 2014; Sundin J. et al., 2015).

Е.М. Ленченко с соавторами (2017), D. J. Morrison et al. (2016), в своих работах подчеркивают, что уменьшение количества бактерий типа Bacteroidetes и бактерий продуцирующих КЦЖК при колонизации кишечной микробиоты сульфитредуцирующими клостридиями (СРК) приводит снижению проницаемости слизисто-эпителиального барьера (Ленченко Е.М. с соавт, 2017; Morrison D.J. et al., 2016).

Р.А. Байматов с соавторами (2019), И. Н. Петухова с соавторами (2019), С. Kwang-Tao et al. (2022) также отмечают, что СРК влечет уменьшение количества

бактерий родов Lactobacillus и Bifidobacterium способных к синтезу бактериоцидных веществ (бактериоцины, органические кислоты) (Байматов Р.А. с соавт, 2019, Chou K.-T. et al., 2022) с одновременным увеличением количества бактерий семейства Enterobacteriaceae, в следствии чего повышается проницаемость эпителиального барьера за счет метаболитов E. coli (Окулич В.К. с соавт., 2022; Петухова И. Н. с соавт., 2019; Тутельян А.В. с соавт., 2019; Плеханов Н. А. с соавт., 2019).

Правильно развитые в онтогенезе кишечные ворсинки и крипты, эффективнее усваивают короткоцепочечные жирные кислоты и другие питательные вещества, регулируют метаболизм птицы, позволяют правильно развить иммунную систему и формируя устойчивость к инфекциям (Awad A.M. et al., 2020).

C.J. Yeoman (2014) своими исследованиями подтверждает наличие микробиоты на протяжении всего пищеварительного тракта, а в особенности в слепой кишке (до 1010-1011 клеток/г содержимого слепой кишки), где более длительный транзитный период пищеварительной жидкости обеспечивает более обширную микробную ферментацию (Yeoman C.J. et al., 2014).

Микробиота желудочно-кишечного тракта играет ключевую роль в обеспечении организма биологически активными соединениями, включая питательные вещества, витамины, белки, гормоноподобные молекулы и другие метаболиты, участвующие в регуляции обменных процессов (Окулич В.К. с соавт., 2022; Тутельян А.В. с соавт., 2019; Плеханов Н.А. с соавт., 2019; Churkina L.N. et al., 2020; Mardanova A.M. et al., 2016).

Формирование и разнообразие микробных сообществ желудочно-кишечного тракта определяется видом животного, его возрастными особенностями и характером кормления (Лобань Г.А. с соавт., 2019).

Микробиота птиц имеет динамический состав, который может изменяться со временем в зависимости от физиологического состояния, возраста, породы, гигиены, кормления и прочих факторов (Ocejo M. et al., 2019).

По данным исследований на курах-несушках, микробиом кишечника демонстрирует выраженную возрастную динамику (P. Videnska et al., 2014). В первую неделю жизни до 50 % микробного сообщества составляют протеобактерии (Enterobacteriaceae, Escherichia), при значительной доле Lachnospiraceae (Firmicutes). Со 2-й по 4-ю неделю содержание протеобактерий снижается до <10 %, а микробиом на 90 % представлен Firmicutes (Lachnospiraceae, Ruminococcaceae). В возрасте 2-6 месяцев доминируют Bacteroidetes (Rikenellaceae, Porphyromonadaceae, Bacteroidaceae), после 7 месяцев их соотношение с Firmicutes выравнивается. К 34 месяцам вновь возрастает доля протеобактерий (~5 %), преимущественно родов Desulfovibrio и Succinivibrio (Videnska Р. et al., 2014).

Т. Н. Артемьева (2004) в результате исследований кишечника птиц выявила микроорганизмы видов: E. coli, S. bovis morbificans, E. agglomerans, P. mirabilis, P. vulgaris, E. intermediusr, C. freundii, K. pneumoniae, P. stuartii, S. rubideae, S. boydii, X. nematophilus, K. cryocrescens, S. lentus. Доминирующими из которых являлись Escherichia, Proteus в количестве 42,0% 24,5% соответственно от числа всех видов выделенной микрофлоры. Из содержимого тонкого кишечника кур выделены S. enteritidis, E. coli, E. agglomerans, C. freundii. При этом количество Escherichia, Enterobacter составило 42,3% и 27% соответственно. Культуры кишечной палочки, имеющие адгезивные антигены F41 и А20 (26,03%) обладают выраженными вирулентными свойствами. У клинически здоровой птицы в тонком кишечнике не обнаружены бактерии рода Proteus, при одновременном выделении данного микроорганизма из feces в 24,5% случаев (Артемьева, Т.Н., 2004).

Рост численности и таксономического разнообразия условно-патогенной микрофлоры кишечника отмечается при снижении колонизационной резистентности. В условиях промышленного животноводства факторные инфекции проявляются широким спектром клинических признаков, что связано с их распространённостью, вариабельностью вирулентных свойств и способностью переходить в некультивируемое состояние. Эти особенности существенно осложняют проведение дифференциальной диагностики (Блинкова Л.П. с соавт.,

2010; Иванова О.Е. с соавт., 2022; Ленченко Е.М. с соавт., 2019; Макаров В.В. с соавт., 1993; Субботин В.В. с соавт., 2002; Пахомов Ю.Д. с соавт., 2022; Хайтович А.Б., 2022).

Бесконтрольное применение антибиотиков в промышленном животноводстве связанное с лечением и профилактикой заболеваний, а также в качестве стимуляторов роста, влечет возникновение бактерий устойчивых антимикробным препаратам, а также к контаминации животноводческой продукции. Употребление в пищу продукции не соответствующей нормам технических регламентов Таможенного союза по остаточному содержанию антибиотиков приводит к развитию аллергий и нарушению нормофлоры кишечника у человека (Масьянов Ю.Н., 2009; Федоров Ю.Н. с соавт., 2015).

По данным ВОЗ, рост устойчивости бактерий к антибиотикам ежегодно приводит к гибели около 25 тыс. человек. В животноводстве антибиотикорезистентность обусловливает преждевременную выбраковку животных и, как следствие, значительные экономические потери (Богуш А.А. с соавт., 2009; Ивашкевич О.П. с соавт., 2012).

В последние годы отмечается рост числа сообщений о выявлении полирезистентных бактериальных штаммов, что рассматривается как одна из глобальных проблем современного здравоохранения. Бактерии в биопленках имеют большую устойчивость к внешним агрессивным воздействиям благодаря внеклеточному матриксу (Бурлаков А.С., Денисенко Т.Е., 2016; Манжурина, О. А. с соавт., 2017; Нефедова Е.В., Даурцева А.А., 2023).

Для штаммов APEC характерно развитие множественной антибиотикорезистентности, проявляющейся устойчивостью к различным классам антимикробных препаратов, в том числе к колистину, карбапенемам и ß-лактамным антибиотикам (Исакова М.Н. с соавт., 2022; Конищева А.С. с соавт., 2022; Прунтова О.В. с соавт., 2022; Павлова А.С. с соавт., 2023).

Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Пономарев Владислав Владимирович, 2026 год

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Законодательные и нормативно-правовые акты

1. Постановление Правительства Белгородской области от 16.02.2009г №50-пп «Об утверждении областной целевой программы «Профилактика сальмонеллезных инфекций в Белгородской области» : [Утвержден Правительством Белгородской области от 20.03.2009] / СПС КонсультантПлюс

Стандарты

2. ГОСТ 1770-74 Посуда мерная лабораторная стеклянная. Цилиндры, мензурки, колбы, пробирки. Общие технические условия. (с Изменениями N 1-10) : Межгосударственный стандарт : дата редакции 2008-05-01. / Федеральное агентство по техническому регулированию. - Изд. официальное - Москва : Стандартинформ, 2008. - 21 с.

3. ГОСТ ISO 11133-2016 Микробиология пищевых продуктов, кормов для животных и воды. Приготовление, производство, хранение и определение рабочих характеристик питательных сред : Межгосударственный стандарт : дата введения 2017-07-01. / Федеральное агентство по техническому регулированию. - Изд. официальное - Москва : Стандартинформ, 2017. - 90 с.

4. ГОСТ Р 51758-2001 Среды питательные для ветеринарных целей. Методы биологических испытаний: Государственный стандарт Российской Федерации : дата введения 2001-06-13. / Госстандарт России. - Изд. официальное - Москва : Стандартинформ, 2001. - 20 с.

5. ГОСТ Р 8.973-2019 Государственная система обеспечения единства измерений (ГСИ). Национальные стандарты на методики поверки. Общие требования к содержанию и оформлению : национальный стандарт Российской Федерации : дата введения 2019-10-30. / Федеральное агентство по техническому регулированию. - Изд. официальное - Москва : Стандартинформ, 2019. - 8 с.

6. Методические рекомендации «Выделение и идентификация бактерий желудочно-кишечного тракта животных», утв. Минсельхоз России №2 13-5-02/1043 от 11.05.2004 г. - Режим доступа: URL: https ://www. consultant.ru/

7. Методические рекомендации МР 4.2.0089—14. Использование метода времяпролетной масс-спектрометрии с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-ToF MS) для индикации и идентификации возбудителей I—II групп патогенности» (п. 5.3) - Режим доступа: URL: https://www. consultant. ru/

8. Методические рекомендации МР Генетическая идентификация бактерий на основе проведения анализа нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК, утв. ФГБУ «ВГНКИ» 23.09.2015 г - Текст непосредственный.

9. Методические рекомендации МР по лабораторной диагностике листериоза животных и людей, утв. Министерством здравоохранения СССР и Госагропромом СССР 04.09.1986 г. и 13.02.1987 г. - Режим доступа: URL: https://www.consultant.ru/

10. Методические указания МУ 4.2.2723-10 Лабораторная диагностика сальмонеллезов, обнаружение сальмонелл в пищевых продуктах и объектах окружающей среды, утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 13.08.2010 г. - Режим доступа: URL: https://www. consultant.ru/

11. Методические указания МУК 4.2.1018-01 Санитарно-микробиологический анализ питьевой воды, утв. Главным государственным санитарным врачом Российской Федерации 09.02.2001 г. - Режим доступа: URL: https ://www. consultant.ru/

12. Методические указания по бактериологической диагностике колибактериоза (эшерихиоза) животных, утв. Минсельхозпрод России №13-7-2/2117 от 27.07.2000 г. - Режим доступа: URL: https://www.consultant.ru/

13. Методические указания по бактериологической диагностике смешанной кишечной инфекции молодняка животных, вызываемой патогенными энтеробактериями, № 13-7-2/1759 от 11.10.99 г. - Режим доступа: URL: https://www. consultant.ru/

14. Методические указания по лабораторной диагностике стрептококкоза животных, утв. Главным управлением ветеринарии Минсельхоза СССР 25.09.1990 г. - Режим доступа: URL: https: //www. consultant. ru/

15. Методические указания по лабораторной диагностике стафилококкоза животных утв. Главным управлением ветеринарии Минсельхоза СССР 29.07.1987 г. - Режим доступа: URL: https: //www. consultant. ru/

16. Методические указания по патоморфологической диагностике болезней животных, птиц и рыб в ветеринарных лабораториях, утв. Минсельхозпродом России № 13-7-2/2137 от 11.09.2000 - Режим доступа: URL: https://www. consultant.ru/

17. Правила исследования кормов, утв. Главным управлением ветеринарии МСХ СССР от 10.06.1975г. - Режим доступа: URL: https://www.consultant.ru/

18. Рекомендации по организации и проведению контроля качества питательных сред для ветеринарных лабораторий, утв. Россельхознадзором от 14.02.2011 г. -Режим доступа: URL: https://www.consultant.ru/

Монографии, книги, статьи, диссертации

19. Антибиотикорезистентность клинических изолятов Escherichia coli, выделенных от животных / М.Н. Исакова, О.В. Соколова, Н.А. Безбородова [и др.] // Ветеринария сегодня. - 2022. - Т.11. - № 1. - С. 14-19. DOI: 10.29326/2304-196X-2022-11-1-14-19.

20. Антимикробная активность фитогенных препаратов в отношении условно-патогенной микрофлоры кишечника кур / Т.С. Тамбиев, Ю.Г. Тамбиева, Е.Г. Дулетов Е. Г., [и др.] // Актуальные вопросы ветеринарной биологии. - 2023. - №2 (58). - С.27-31. DOI: 10.24412/2074-5036-2023-2-27-31

21. Антоневский, И. В. Структурно-функциональные особенности бактериальных биопленок у сельскохозяйственных животных и объектов животноводческой инфраструктуры / И. В. Антоневский, В. И. Плешакова // Вестник Омского государственного аграрного университета. - 2023. - №2 1(49). - С. 74-83. - DOI 10.48136/2222-0364_2023_1_74. - EDN QJTVER.

22. Артемьева, Т. Н. Патогенная и условно-патогенная микрофлора кишечника кур и эффективность нетрадиционных средств антибактериального действия : диссертация ... канд. вет. наук : 16.00.03 / Артемьева Татьяна Николаевна. - С.-Пб, 2004. — 189 с.

23. Байматов, Р. А. Биопленка - как форма существования микроорганизмов / Р. А. Байматов, З. А. Нурузова, З. Н. Эргашева // Re-health Journal. - 2019. - № 3. - С. 58-68. - EDN IMFMSJ.

24. Баканов, Д. С. Микробиом кишечника и его роль в развитии воспалительных заболеваний кишечника / Д. С. Баканов, Д. О. Семенчев // Современный взгляд на проблемы внутренней медицины : Сборник научных трудов по материалам III Международной научно-практической конференции, Курск, 06 декабря 2024 года.

- Курск: Курский государственный медицинский университет, 2024. - С. 41-44.

25. Барановский, А. Ю. Дисбактериоз кишечника / А. Ю. Барановский, Э. А. Кондрашина. — Москва [и др.] : Питер, 2007. — 240 с. : ил.

26. Белимова, С. С. Чувствительность Escherichia coli, выделенных от птиц, к антимикробным препаратам / С. С. Белимова, В. Н. Скворцов // Горинские чтения. Наука молодых - инновационному развитию АПК : Материалы Международной студенческой научной конференции «Горинские чтения, Майский, 28-29 марта 2019 года. Том 1. - Майский: Белгородский государственный аграрный университет имени В.Я. Горина, 2019. - С. 121-122. - EDN OZBPNM.

27. Бессарабов, Б.Ф. Иллюстрированный атлас болезней птиц \\ Гл. редактор Бессарабов. - М.: «Медол». - 2006. - 247 с.

28. Биоплёнки: основные принципы организации и методы исследования: учебное пособие. А.М. Марданова, Д.А.Кабанов, Н.Л. Рудакова, М.Р. Шарипова — Казань: Казанский (Приволжский) федеральный университет, 2016. - 42 с.

29. Биопленки: строение и роль в инфекционной патологии / А. М. Алиев, Т. Н. Соколова, Ю. А. Петровская, В. В. Леонов // Научный медицинский вестник Югры.

- 2021. - Т. 30, № 4. - С. 4-13. - DOI: 10.25017/2306-1367-2021-30-4-4-14. - EDN: GAWKQQ.

30. Бисвас, П. Н. Морфо-биологические и антигенные свойства патогенных эшерихий, выделенных от кур : диссертация ... канд. вет. наук 16.00.03/ Бисвас Паритош Нумар. - Санкт-Петербург, 1994. - 140 с. - Текст : непосредственный.

31. Блинкова, Л. П. Свойства некультивируемых и покоящихся форм микроорганизмов / Л. П. Блинкова, Ю. Д. Пахомов, Л. Г. Стоянова //

Иммунопатология, аллергология, инфектология. - 2010. - № 3. - С. 67-76. - EDN RWTUAV.

32. Богуш, А. А. Мастит коров и меры его профилактики / А. А. Богуш, В. Е. Иванов, Л. М. Бородич; рец. П. А. Красочко, М. В. Якубовский, Н. Ю. Щурова. -Минск: Белпринт. - 2009. - 158 с.

33. Бойкова, Д. В. Изменение микробиома кишечника при воспалительных заболеваниях кишечника / Д. В. Бойкова, Р. М. Габибуллаев, М. А. Идрисова // Аллея науки. - 2023. - Т. 1, № 1(76). - С. 176-187.

34. Бондаренко, В. М. Дисбактериоз кишечника как клинико-лабораторный синдром: современное состояние проблемы / В. М. Бондаренко, Т. В. Мацулевич. -М. : ГЭОТАР-Медиа, 2007. - 300 с.

35. Борьба с устойчивостью к антибиотикам с позиций безопасности пищевых продуктов в Европе / под ред. H. Kruse, F. Racioppi. - Рим: ВОЗ, 2011. - 80 с.

36. Бурлаков, А.С. Антибиотикорезистентность различных видов микроорганизмов, изолируемых от свободно живущих особей Атлантического моржа / А.С. Бурлаков, Т.Е. Денисенко // Материалы международной научно-практической конференции «Фармакологические препараты в профилактике и лечении болезней животных», Москва, МГАВМиБ. - 2016. - С. 18 - 23.

37. Бухарин, О. В. Бифидофлора при ассоциативном симбиозе человека / О.В. Бухарин, Н. Б. Перунова, Е. В. Иванова. - Екатеринбург : УрО РАН, 2014. - 212 с. - Текст: непосредственный

38. Видовой состав микроорганизмов, изолированных из тканей и органов павшей птицы / А. С. Мухаммадиева, Р. С. Мухаммадиев, И. Г. Каримуллина [и др.] // Ветеринария Кубани. - 2024. - № 6. - С. 31-34.

39. Волкова, А. В. Изменение бактериального сообщества в желудочно-кишечном тракте кур в онтогенезе / А. В. Волкова // Традиции и инновации : XIV научная конференция, посвященная 195-й годовщине образования Санкт-Петербургского государственного технологического института (технического университета), в рамках мероприятий по проведению в Российской Федерации Десятилетия науки и технологий, Санкт-Петербург, 20-23 ноября 2023 года. -

Санкт-Петербург: Санкт-Петербургский государственный технологический институт (технический университет), 2023. - С. 335.

40. Герасимова, А.О. Колибактериоз птиц - актуальные вопросы / А.О. Герасимова, О.Б. Новикова, А.А. Савичева // Ветеринария сегодня. - 2023. - Т.12. - №4. - С. 284-292. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2023-12-4-284-292

41. Горелов, А.В. Влияние пробиотического продукта "Актимель" на состояние здоровья детей / А.В. Горелов, Д.В. Усенко // Вопросы современной педиатрии. -2003. - № 4. - С. 87-90.

42. Горковенко, Н. Е. Мониторинг антибиотикорезистентности энтеробактерий / Н. Е. Горковенко, Ю. А. Макаров // Политематический сетевой электронный научный журнал Кубанского государственного аграрного университета. - 2018. -№ 137. - С. 197-206.

43. Гостев, В.В. Бактериальные биопленки и инфекции / В.В. Гостев, С.В. Сидоренко // Журнал инфектологии, 2010. - №2(3). - С. 4-15.

44. Грозина, А. А. Морфологическая оценка стенки кишечника цыплят кросса "КОББ 500" на фоне применения антибиотика и пробиотика / А. А. Грозина, В. В. Пронин, М. С. Дюмин // Российский ветеринарный журнал. Сельскохозяйственные животные. - 2014. - № 4. - С. 16-17. - EDN TBFGGH.

45. Грозина, А. А. Состав микрофлоры желудочно-кишечного тракта у цыплят-бройлеров при воздействии пробиотика и антибиотика (по данным T-RFLP-RT-PCR) / А. А. Грозина // Сельскохозяйственная биология. - 2014. - Т. 49, № 6. - С. 46-58. - DOI 10.15389/agrobiology.2014.6.46rus. - EDN TEPGCX.

46. Громов, И. Н. Патоморфологическая диагностика болезней продуктивной птицы, протекающих с поражением пищеварительного канала / И. Н. Громов, О. Ю. Черных, Л. П. Мищенко, А. С. Сенченкова // Научная жизнь. - 2024. - Т. 19, № 1(133). - С. 101-113.

47. Громов, И. Н. Патоморфологическая и дифференциальная диагностика болезней птиц, протекающих с преимущественным поражением кишечника / И. Н. Громов // Животноводство и ветеринарная медицина. - 2020. - № 2(37). - С. 27-31.

48. Громов, И. Н. Респираторные болезни птиц: патоморфология и диагностика : рекомендации / И. Н. Громов, Д. О. Журов, Е. А. Баршай. - Витебск : ВГАВМ, 2017. - 40 с.; ISBN 978-985-591-024-5. - Текст : непосредственный.

49. Грязнева, Т. Н. Эффективность применения пробиотических кормовых добавок "Сорболин" и "Олин" при желудочнокишечных болезнях новорожденных телят / Т. Н. Грязнева, Е. А. Смирнова, С. Ф. Василевич // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. - 2018. - № 1. - С. 56-60. - EDN YOWONV.

50. Гусейнова, Р.Г. Образование биопленки энтеротоксигенными штаммами Escherichia coli, выделенными у здоровых и больных детей / Р.Г. Гусейнова, Х.М. Алиева // Медицинские новости. - 2023. - № 6(345). - С. 66-69

51. Джупина, С. И. Эпизоотический процесс и его контроль при факторных инфекционных болезнях / С. И. Джупина. - М., 2002. - 70 с.

52. Диагностические наборы ID-STREP и AB-STRВ для диагностики возбудителей стрептококковой инфекции и определения их резистентности к антибиотикам с учетом способности образовывать матрикс биопленки / В. К. Окулич, А. Н. Пинчук, В. Е. Шилин [и др.] // Иммунопатология, аллергология, инфектология. - 2022. - № 1. - С. 17-24. - DOI 10.14427/jipai.2022.1.17. - EDN AYVDCL

53. Дифференцированная тактика использования пробиотиков в лечении атопического дерматита у детей первого года жизни / С. А. Мокия-Сербина, Н. В. Василенко, Т. В. Литвинова, В. А. Вирина // Современная педиатрия. - 2013. - № 1(49). - С. 18. - EDN TTLJDD.

54. Дмитриева, М. Е. Поставили диагноз колибактериоз? Вы не ошиблись? / М. Е. Дмитриева, И. М. Алхлаев // Farm Animals. - 2014. - № 3(7). - С. 62-64.

55. Железнова, Л.И. Клинико-лабораторные особенности микроэкологических нарушений слизистой толстой кишки при острых кишечных инфекциях у детей : диссертация ... канд. биол. наук: 03.00.07 / Железова Людмила Ильинична. - С-Пб, 2006. - 153 с.

56. Зависимость биопленкообразования микроорганизмов от особенностей инфекционного процесса / В.Ю. Земко, В.К. Окулич, А.М. Дзядзько [и др.] // Вестник ВГМУ. - 2021. - Т. 20, № 2. - С. 56-64

57. Иванова, Е. В. Роль бифидофлоры в ассоциативном симбиозе кишечной микробиоты человека : диссертация ... д-ра мед. наук 03.00.07 / Иванова Елена Валерьевна. - Челябинск, 2018. - 295 с. - Текст : непосредственный.

58. Иванова, О. Е. Индикация биопленок и некультивируемых микроорганизмов при мониторинге социально значимых болезней сельскохозяйственных животных / О. Е. Иванова, Д. А. Блюменкранц, А. В. Гончарова // Экономически и социально значимые инфекции сельскохозяйственных животных: меры профилактики и борьбы : Материалы Международной научно-практической конференции, Москва, 15 декабря 2022 года. - Москва: Сельскохозяйственные технологии, 2022. - С. 8087. - EDN XLBHNM.

59. Ивашкевич, О. П. Проблема мастита у коров на современных молочных комплексах / О. П. Ивашкевич, А. А. Богуш, В. Е. Иванов, И. Т. Лучко // Материалы XVI Международного симпозиума по машинному доению сельскохозяйственных животных, Минск - Гомель, 27-29 июня 2012 года / Национальная академия наук Беларуси, Министерство сельского хозяйства и продовольствия Республики Беларусь, РУП "НЦП НАН Беларуси по механизации сельского хозяйства", ОАО "Гомельагрокомплект", РУП "НПЦ НАН Беларуси по животноводству". - Минск -Гомель: Республиканское унитарное предприятие «Научно-практический центр Национальной академии наук Беларуси по механизации сельского хозяйства». -2012. - С. 315-318. - EDN VYDXNB.

60. Изменение бактериального сообщества в желудочно-кишечном тракте кур в онтогенезе / В. И. Фисинин, Г. Ю. Лаптев, И. Н. Никонов [и др.] // Сельскохозяйственная биология. - 2016. - Т. 51, № 6. - С. 883-890.

61. Изучение переносимости энрофлоксацина цыплятами и его использование при лечении экспериментального сальмонеллёза / Д. В. Юрин, В. Н. Скворцов, В. В. Невзорова [и др.] // Актуальные вопросы сельскохозяйственной биологии. -2020. - № 4(18). - С. 46-52. - EDN UXDVAJ.

62. Изучение эффективности кормовой добавки для сельскохозяйственной птицы «ВИТАСИЛ 2 ПЛЮС» / Э.Д. Джавадов, О.Б. Новикова, В.В. Веретенников [и др.] // Международный вестник ветеринарии. - 2023. - Т. (4). - С. 57-67. https://doi.Org/10.52419/issn2072-2419.2023.4.57

63. Иммуномодуляторы и стратегия их применения / Ю. Н. Федоров, В. И. Клюкина, М. Н. Романенко, О. А. Богомолова // Ветеринария. - 2015. - № 7. - С. 37. - EDN UDKRTZ.

64. Иммунотерапия эшерихиоза животных / М. К. Пирожков, А. В. Моторыгин, С. В. Ленев [и др.] // Биология и биотехнология на службе охраны здоровья животных и человека : Материалы Национальной научно-практической конференции молодых ученых, аспирантов и студентов, Москва, 21 октября 2022 года. - Москва: Сельскохозяйственные технологии. - 2022. - С. 104-109. - EDN RFPOPK.

65. Инновационные технологии и биотехнологии в агропромышленной сфере и нутрициологии : коллективная монография / В. М. Позняковский, А. А. Вековцев, М. А. Захаренко, Е. Н. Зиновьева.- Кемерово : Издательство "Лань", 2022. - 373 с.

66. Интенсивность формирования биопленок ризобактериальными штаммами Pseudomonas pseudoalcaligenes / А. С. Хитрова, Н. И. Потатуркина-Нестерова, Р. В. Ишутинов, И. Р. Бахтогаримов // Ульяновский медико-биологический журнал. -2018. - № 1. - С. 104-109. - DOI 10.23648/UMBJ.2018.29.11366. - EDN YUDIGE.

67. Инфекции, связанные с образованием биопленок / И. Н. Петухова, Н. В. Дмитриева, З. В. Григорьевская [и др.] // Злокачественные опухоли. - 2019. - Т. 9, № 3S1. - С. 26-31. - DOI 10.18027/2224-5057-2019-9-3s1-26-31. - EDN OVRDJZ.

68. Инфекционные болезни животных : учебник для студентов высших учебных заведений, обучающихся по специальности "Ветеринария" / Б. Ф. Бессарабов, А. А. Вашутин, Е. С. Воронин [и др.]; под ред. А. А. Сидорчука. — Москва : КолосС, 2007. — 671 с. - ISBN 978-5-9532-0301-2. - Текст : непосредственный.

69. Кадочникова, Е.И. Статистический анализ пространственных данных: учебное пособие / Е.И. Кадочникова, Ю.А. Варламова. - Казань: Издательство Казанского университета, 2023 - 140 с.

70. Капустин, А.В. Этиологическая структура эшерихиоза кур: диссертация ... канд. вет. наук: 16.00.03 / Капустин Андрей Владимирович. - М., 2001. - 185 с.

71. Карцев, Н.Н. Эпидемиология, свойства и лабораторная диагностика энтеротоксигенных Escherichia coli /Н.Н. Карцев, Н.К. Фурсова // Бактериология. -2018. - № 3(1). - С. 45-49.

72. Климов, М.С. Технология применения нового средства в инкубатории / М.С. Климов, А.В. Михайлова, В.Ю. Морозов // Вестник АПК Ставрополья. - 2014. - № 1. - С. 150-154.

73. Клинико-эпизоотологические и патоморфологические особенности проявления ассоциативного течения эймериозной инвазии и колибактероза кур в личных подсобных хозяйствах Аксайского района Ростовской области / Т.С. Тамбиев, Э.Ю. Кобзарь, Н.М. Федоров [и др.] // Международный научно-исследовательский журнал. — 2024. — №7 (145). — URL: https://research-journal.org/archive/7-145-2024-july/10.60797/IRJ.2024.145.101 (дата обращения: 31.05.2025). — DOI: 10.60797/IRJ.2024.145.101

74. Кожевников, С. В. Состояние микробного пейзажа кишечника у цыплят-бройлеров при использовании комплексной кормовой добавки / С. В. Кожевников // Научное обеспечение инновационного развития агропромышленного комплекса регионов РФ : Материалы международной научно-практической конференции, Лесниково, 06 февраля 2018 года. - Лесниково: Курганская государственная сельскохозяйственная академия им. Т.С. Мальцева, 2018. - С. 773-780. - EDN YROODJ.

75. Конищева, А. С. Микробиом кишечника телят при дисбактериозе / А. С. Конищева, В. И. Плешакова, Н. А. Лещева // Вестник Омского государственного аграрного университета. - 2021. - № 3(43). - С. 70-77. - DOI 10.48136/2222-0364_2021_3_70.

76. Конищева, А.С. Микробиологический спектр возбудителей при желудочно-кишечной патологии у животных / А.С. Конищева, Н.А. Лещева, В.И. Плешакова // Вестник КрасГАУ. - 2022. - № 2. - С. 106-112. DOI: 10.36718/1819-4036-2022-2106-112

77. Контаминация семени хряков-производителей микроорганизмами и их влияние на репродуктивные показатели / С. Н. Барзыкина, С. М. Борунова, Б. С. Иолчиев, В. В. Пономарев // Свиноводство. - 2025. - № 1. - С. 22-25. - DOI 10.37925/0039-713X-2025-1 -22-25. - EDN EHJSXB.

78. Коршунов В.М. Нормальная микрофлора кишечника. Диагностика, профилактика и лечение дисбактериозов кишечника: пособие для врачей и студентов / В.М. Коршунов, Н.Н. Володин, Б.А. Ефимов. - М., 1997. - 39 с.

79. Крамарь, Л.В. Микроэкологические особенности кишечного биоценоза детей первого года жизни при острых кишечных инфекциях / Л.В. Крамарь, Н.В. Родионова, А.А. Арова // Фундаментальные исследования - 2014 - №2. - С. 90-93.

80. Курмакаева, Т. В. К вопросу о заболеваемости птицы отдельными бактериальными болезнями и обеспечение биобезопасности / Т.В. Курмакаева, С.С. Козак, Е.С. Баранович // Ветеринария сегодня. - 2024. - Т. 13. - № 2. - С. 171176. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2024-13-2-171-176

81. Лебедева, Н.В. География и мониторинг биоразнообразия. Н.В. Лебедева, Д.А. Криволуцкий, Пузаченко Ю.Г. - Москва : Издательство НУМЦ, 2002. - 432 с.

82. Ленев, С.В. Улучшение выделения и идентификации бактерий Salmonella enterica подвида arizonae / С.В. Ленев, А.И. Лайшевцев, Н.В. Пименов // Российский журнал сельскохозяйственных и социально-экономических наук. -2016. - Т. 50. - №. 2. - С. 14-23.

83. Ленченко, Е. М. Биология и экология иерсиний - возбудителей пищевых токсикоинфекций : диссертация ... д-ра вет. наук: 06.02.02. - Москва: 2000. - 374 с.

84. Ленченко, Е. М. Индикация биопленок и некультивируемых микроорганизмов при мониторинге биологической безопасности пищевого сырья / Е. М. Ленченко, Н. Ю. Сысоева, Д. А. Блюменкранц // Health, Food & Biotechnology. - 2019. - Т. 1, № 3. - С. 35-46. - DOI 10.36107/hfb.2019.i3.s260. - EDN PKVXUS.

85. Ленченко, Е. М. Индикация биопленок изолятов Escherichia coli, Escherichia albertii, Proteus vulgaris, идентифицированных при болезнях органов дыхания и пищеварения птиц. / Е.М. Ленченко, В.В. Пономарев, Н.П. Сачивкина //

Ветеринария сегодня. - 2025. - №14 (2). - С. 186-193. https://doi.org/10.29326/2304-196X-2025-14-2-186-193

86. Ленченко, Е. М. Индикация биопленок микроорганизмов при мониторинге биологической безопасности пищевого сырья и окружающей среды / Е. М. Ленченко, А. М. Абдуллаева, А. А. Покровский // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. - 2024. - № 2(50). - С. 233-238. -DOI 10.36871/vet.san.hyg.ecol.202402009. - EDN XTIVUV.

87. Ленченко, Е. М. Этиологическая структура и дифференциальная диагностика бактериальных болезней телят / Е. М. Ленченко, И. А. Кондакова, Ю. В. Ломова // Аграрная наука. - 2017. - № 5. - С. 27-30. - EDN YSVNPN.

88. Ленченко, Е.М. Динамика изменений бактериологических и морфометрических показателей при снижении колонизационной резистентности кишечника птиц / Е.М. Ленченко, В.В. Пономарев // Вестник Российского университета дружбы народов. Серия: Агрономия и животноводство. - 2025. - Т. 20. № 1. - C. 162—170. doi: 10.22363/2312-797X 2025-20-1-162-170 EDN JBABSN

89. Ленченко, Е.М. Характеристика токсигенности энтеробактерий, выделенных при желудочно-кишечных болезнях сельскохозяйственных животных / Е.М. Ленченко, Е.А. Мансурова, А.В. Моторыгин // Сельскохозяйственная биология. -2014. - № 2. - С. 94-104.

90. Лобань, Г. А. / Уникальные свойства микроорганизмов, которые формируют биопленку полости рта / Г. А. Лобань, М. А. Фаустова, М. Н. Ананьева, Я. А. Басараб // Запорожский медицинский журнал. - 2019. - Т. 21. - № 3(114). - С. 391396. - DOI 10.14739/2310-1210.2019.3.169198. - EDN GTMZCZ

91. Макавчик, С.А. Видовое разнообразие доминирующих этиологически значимых бактерий, циркулирующих в промышленном птицеводстве / С.А. Макавчик, Л.И. Смирнова, А.А. Сухинин, В.А. Кузьмин // Международный вестник ветеринарии. - 2022. - № 1. - С. 22-26. https://doi.org/10.52419/issn2072-2419.2022.1.22

92. Макаров, В. В. Общие вопросы эпизоотологии и альтернативный контроль инфекционных болезней / В. В. Макаров, А. Л. Семенихин, С. Ф. Чевелев, Л. П. Бугацкий // Ветеринария. - 1993. - № 1. - С. 30-39. - EDN PZBHLP.

93. Макаров, В. В. Современное представление о причинности инфекционных заболеваний / В.В. Макаров // Российский ветеринарный журнал. - 2023. - №. 3. - С. 5-13. DOI: https://doi.org/10.32416/2500-4379-2023-3-5-13

94. Макарова, М. А. Использование конфокальной микроскопии для изучения формирования бактериальных биопленок / М. А. Макарова, Н. В. Воложанцев, В. М. Красильникова, В. В. Фирстова // Бактериология. - 2022. - Т. 7, № 3. - С. 47-48. - EDN VVMGIO.

95. Мальцева, Б. М. Роль микрофлоры при заболеваниях органов пищеварения у цыплят [Характер дисбактериозов при различных кишечных инфекциях] / Б. М. Мальцева // Ветеринария. Реферативный журнал. - 2004. - № 4. - С. 1321. - EDN HAICLO.

96. Манжурина, О. А. Современные тенденции антибиотикорезистентности микробиоты домашних и диких животных / О.А. Манжурина, А.М. Скогорева, Б.В. Ромашов, Н.Б. Ромашова // Вестники Воронежского аграрного университета. -2017. - №1 (52). с. 41-45. - DOI 10.17238/issn2071-2243.2017.1.41. - EDN YQUNUV.

97. Масьянов, Ю. Н. Иммунный статус крупного рогатого скота и свиней при наиболее распространенных болезнях и его коррекция : диссертация ... док. вет. наук: 06.02.00 / Масьянов Юрий Николаевич. - Воронеж, 2009. - 410 с. - EDN QFEWFR.

98. Медицинская микробиология (частный курс): учебное пособие / Е.П. Красноженов, М.Р. Карпова, И.Н. Ильинских [и др].; под ред. Е.П. Красноженова, М.Р. Карповой, Ю.Н. Одинцова. - Томск, 2010. - 387 с. - Текст : непосредственный.

99. Методика изучения адгезивного процесса микроорганизмов / В.И. Брилис, Т.А. Брилене, Х.П. Ленцнер [и др.] // Лабораторное дело. - 1986. - № 4. - С. 210212.

100. Методические рекомендации по изучению биопленок условно-патогенных и патогенных микроорганизмов in vitro / И. Б. Павлова, А. Б. Кононенко, Д. А.

Банникова, Е. М. Ленченко // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. - 2018. - № 2(26). - С. 107-112. - DOI 10.25725/vet.san.hyg.ecol.201802019. - EDN YQWWCT.

101. Методологические аспекты исследований состава биопленок in vitro, ex vivo, in vivo / Е. М. Ленченко, И. Б. Павлова, Д. А. Блюменкранц, В.В. Пономарев [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. -2022. - № 1(41). - С. 73-82. - DOI 10.36871/vet.san.hyg.ecol.202201009. - EDN CCUCXE.

102. Научно обоснованная система получения здорового молодняка и профилактики желудочно-кишечных болезней новорожденных телят : (рекомендации) / В. В. Субботин, Н. С. Ивкин, В. Т. Самохин [и др.]. - Москва : Воронежский государственный аграрный университет им. Императора Петра I, 2002. - 20 с. - EDN MBPPDI.

103. Неустроева, А. М. Изучение микрофлоры кишечника кур-несушек при разных способах лечения заболеваний желудочно-кишечного тракта / А. М. Неустроева // Сибирский вестник сельскохозяйственной науки. - 2010. - № 5(209). - С. 85-89. - EDN MNHTNP.

104. Нефедова, Е. В. Влияние препаратов различных фармакологических групп на изменение чувствительности референтного Pr. Vulgaris штамма АТСС 6380 / Е. В. Нефедова, А. А. Даурцева // Приоритетные векторы развития промышленности и сельского хозяйства : материалы VI Международной научно-практической конференции, Макеевка, 06 апреля 2023 года. - Макеевка: Донбасская аграрная академия, 2023. - С. 61-64. - EDN JXNHFI.

105. Нефедова, Е. В. Регуляция биопленкообразования микроорганизмов антибактериальными препаратами / Е. В. Нефедова, Д. М. Табалыкина // Приоритетные векторы развития промышленности и сельского хозяйства : материалы VI Международной научно-практической конференции, Макеевка, 06 апреля 2023 года. - Макеевка: Донбасская аграрная академия, 2023. - С. 65-67. -EDN LLZNGI.

106. Новикова, О. Б. Проблема колибактериоза в птицеводстве / О. Б. Новикова, А. А. Бартенев // Современные тенденции развития науки и технологий. - 2015. -№ 8-4. - С. 35-37.

107. Образование биологических пленок микроорганизмов на пищевых производствах / А.В. Тутельян, Ю.К. Юшина, О.В. Соколова [и др.] // Вопр. питания. - 2019. - Т. 88 - № 3. - С. 32-43. doi: 10.24411/0042-8833-2019-10027.

108. Окулич, В.К. Микробные биопленки в клинической микробиологии и антибактериальной терапии / В.К. Окулич, А.А. Кабанова, Ф.В. Плотников. -Витебск: ВГМУ, 2017. - 300 с. : ил.

109. Оценка риска появления резистентности к антибиотикам условно-патогенной и патогенной микрофлоры, выделяемой из продуктов животного происхождения / А. М. Мендыбаева, М. Рузаускас, Ю. Е. Алешина [и др.] // Вестник КрасГАУ. - 2022. - № 2(179). - С. 147-156.

110. Панкратов, С.В. Респираторный синдром птиц. Этиология, диагностика, меры борьбы и профилактики / С.В. Панкратов, А.А. Сухинин, Т.Н. Рождественская, А.В. Рузина // Птица и птицепродукты. - 2021. - №4. - С. 34-36. DOI 10.30975/2073-4999-2021-23-4-34-36

111. Патологоанатомическая диагностика болезней птиц / А.В. Акулов, В.М. Апатенко, Б.Ф. Бессарабов [и др.]; под ред. В.П. Шишкова [и др.]. - Москва : Колос, 1978. - 440 с. - Текст : непосредственный.

112. Пахомов, Ю.Д. Исследование параметров перехода в некультивируемое состояние антибиотикорезистентных клеток Escherichia coli / Ю. Д. Пахомов, Л. П. Блинкова, А. М. Абдуллаева, Р. К. Валитова // Проблемы медицинской микологии. - 2022. - Т. 24, № 2. - С. 115. - EDN YWMJTU.

113. Перунова, Н. Б. Биорегуляция микросимбионтов в микросимбиоценозе кишечника человека: диссертация . д-ра мед. наук 03.00.07 / Перунова Наталья Борисовна. - Оренбург, 2018. - 300 с. - Текст : непосредственный.

114. Пименов, Н. В. Современные аспекты борьбы с сальмонеллезной инфекцией в птицеводстве / Н. В. Пименов, А. И. Лаишевцев. - М. : Общество с ограниченной

ответственностью "Старая Басманная", 2017. - 172 с. - ISBN 978-5-906470-95-9. -EDN YMBUYN.

115. Пирожков, М. К. Биологические препараты для специфической профилактики и терапии эшерихиоза животных : диссертация ... д-ра вет. наук: 06.02.02. / М. К. Пирожков. - М.: ВГНКИ, 2002. - 322 с.

116. Пирожков, М. К. Диагностика, специфическая профилактика и лечение при бактериальных болезнях животных / М. К. Пирожков, С. В. Ленев, Е. В. Викторова [и др.] // Ветеринария. - 2011. - № 1. - С. 24-28.

117. Пирожков, М.К. Современное состояние отечественного рынка вакцинопрепаратов против колибактериоза животных / М.К. Пирожков, А.А. Галиакбарова, Н.В. // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. - 2022. - №2. - С. 12-20. DOI: 10.36871/vet.zoo.bio.202202002 \ https://s-lib.com/issues/vzb_2022_02_a2/

118. Плеханов, Н. А. Биопленка Vibrio cholerae: механизмы, регулирующие образование, и сигналы внешней среды, способствующие ее формированию / Н. А. Плеханов, С. П. Заднова, А. А. Крицкий // Проблемы особо опасных инфекций. -2019. - № 3. - С. 19-25. - DOI 10.21055/0370-1069-2019-3-19-25. - EDN BJIXGS.

119. Плоскирева, А. А. Системный подход к оценке микробиоценоза желудочно-кишечного тракта при острых кишечных инфекциях у детей / А. А. Плоскирева, А. В. Горелов // Современные проблемы науки и образования. - 2015. - № 5. - С. 151.

120. Пономарев, В. В. Количественный и видовой состав микроорганизмов микробиоценозов кишечника животных / В. В. Пономарев, Е. М. Ленченко // Научно-технологические приоритеты в развитии агропромышленного комплекса России : Материалы 73-й Международной научно-практической конференции, Рязань, 21 апреля 2022 года / Министерство сельского хозяйства Российской Федерации федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Рязанский государственный агротехнологический университет имени П.А. Костычева». Том Часть I. - Рязань: Рязанский государственный агротехнологический университет им. П.А. Костычева, 2022. - С. 251-255. - EDN URFWSU.

121. Пономарев, В. В. Количественный и видовой состав микроорганизмов при болезнях органов пищеварения птиц / В. В. Пономарев, Е. М. Ленченко, У. А. Малюкова // Аграрная наука в обеспечении продовольственной безопасности и развитии сельских территорий : сборник материалов IV международной научно-практической конференции, Луганск, 17 января - 08 2023 года. - Луганск: Луганский государственный аграрный университет имени К.Е. Ворошилова, 2023. - С. 332-334. - EDN ADONMR.

122. Пономарев, В.В. Использование конфокальной микроскопии для анализа проникновения флуоресцентного комплекса через биоплёнки бактерий рода Escherichia / В.В. Пономарев, Б.С. Иолчиев // Вестник Алтайского государственного аграрного университета. - 2025. - № 8 (250). - С. 45 - 51.

123. Пономарев, В.В. Количественный и видовой состав бактерий семейства Enterobacteriaceae в содержимом тонкого и толстого кишечника сельскохозяйственных птиц и идентификация бактерии вида E. albertii / В.В. Пономарев, С.М. Борунова // Ветеринария, зоотехния и биотехнология. - 2025. - № 9. - С. 77-97

124. Пробиотики на основе бактерий рода Bacillus в птицеводстве / Н. В. Феоктистова, А. М. Марданова, Г. Ф. Хадиева, М. Р. Шарипова // Ученые записки Казанского университета. Серия: Естественные науки. - 2017. - Т. 159, № 1. - С. 85-107.

125. Прудников, В.С. Болезни домашних птиц / Прудников В.С., Зелютков Ю.Г // Учебно-методическое пособие. Витебск: ВГАВМ, 2002. — 148 с.

126. Прунтова, О.В. Современное представление о механизмах антимикробной резистентности бактерий (аналитический обзор) / О.В. Прунтова, В.С. Русалеев, Н.Б. Шадрова // Ветеринария сегодня. - 2022. - Т.11. - № 1. - С. 7-13. https://doi.org/10.29326/2304- 196X-2022-11-1-7-13

127. Разработка пилотной технологии получения нетоксичных иммуногенных препаратов липополисахаридов Escherichia coli O157:H7 и Escherichia coli 0104:H4 / Э.А. Светоч, Н.Н. Карцев, Б.В. Ерусланов [и др.] // Материалы VIII Национального конгресса бактериологов. Москва. - 2023. - С. 116

128. Распространение эпизоотически значимых инфекционных болезней сельскохозяйственной птицы / А. С. Тищенко, А. Г. Кощаев, И. В. Сердюченко [и др.] // Труды Кубанского государственного аграрного университета. - 2023. - № 105. - С. 336-341.

129. Распространенность возбудителя колибактериоза сельскохозяйственной птицы в Краснодарском крае / А. С. Тищенко, А. Г. Кощаев, И. В. Сердюченко [и др.] // Ветеринария Кубани. - 2023. - № 3. - С. 16-19.

130. Рыбальченко, О.В. Антимикробные пептиды лактобацилл / О.В. Рыбальченко, О.Г. Орлова, В.М. Бондаренко // Журнал микробиологии. - 2013. -№4. - С. 89-100.

131. Салаутин, В.В. Патоморфология и дифференциальная диагностика сальмонеллеза птиц, вызванного различными серовариантами возбудителя : диссертация ... д-ра вет. наук: 06.02.01, 06.02.02. / Салаутин Владимир Васильевич. - Саратов: 2004. - 443 с.

132. Сачивкина, Н. П. Исследование формирования биопленок Candida albicans и Escherichia coli / Н. П. Сачивкина, Е. М. Ленченко, А. И. Марахова // Фармация. -2019. - Т. 68, № 7. - С. 26-30. - DOI 10.29296/25419218-2019-07-05. - EDN VMPJUW.

133. Сельское хозяйство в России. 2023: Стат.сб./Росстат - Москва, 2023. - 104 с.

134. Смирнова Л.И. Адгезивные свойства кишечной палочки и профилактика колибактериоза птиц: диссертация ... канд. вет. наук: 16.00.03 / Смирнова, Любовь Ивановна. - СПб., 1996. - 124 с.

135. Современные возможности изучения биопленок микроорганизмов различными видами микроскопии / О. С. Кузнецов, А. В. Казанцев, П. С. Ерохин [и др.] // Вестник биотехнологии и физико-химической биологии им. Ю.А. Овчинникова. - 2019. - Т. 15, № 1. - С. 53-58. - EDN DQOKIY.

136. Современные технологии исследования бактериальных биопленок / И.В. Чеботарь, А.Г. Погорелов, В.А. Яшин [и др.] // Современные технологии в медицине. - 2013. - Т. 5, № 1. - С. 14-20. - EDN QBOIVT.

137. Сравнительная возрастная динамика становления микробоценоза слепой кишки кур и перепелов / М. В. Каминськая, О. М. Стефанышин, Г. И. Нечай [и др.] // Бюлопя тварин. - 2014. - Т. 16, № 4. - С. 50-58. - EDN TCFSUF.

138. Сухорукова, К.А. Статистический анализ распространения заразных заболеваний домашней птицы в России / К.А. Сухорукова, К.Н. Горпинченко // Международный научно-исследовательский журнал. — 2025. — №4 (154).

139. Тимошко, М.А. Микрофлора пищеварительного тракта молодняка сельскохозяйственных животных / М. А. Тимошко, И. Г. Пивняк // Ин-т зоологии и физиологии. - Кишинев : Штиинца, 1990. - 187,[2] с. : ил.; 22 см.; ISBN 5-37600691-3 : 2 р. 40 к.

140. Тюкавкина, С. Ю. Особенности формирования микробных биопленок в условиях хирургического стационара / С. Ю. Тюкавкина, Д. В. Глотова // Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний : Сборник научно-практических работ VIII Межрегиональной научно-практической конференции, посвященной 90-летию со дня рождения Заслуженного деятеля науки РФ, профессора, д.м.н. Е.П. Москаленко, Ростов-на-Дону, 15-17 мая 2019 года / Под общей редакцией Г.Г. Харсеевой. - Ростов-на-Дону: Ростовский государственный медицинский университет, 2019. - С. 117 -120. - EDN YWQWNL.)

141. Учебное пособие «Диагностика эшерихиоза животных» / А. А. Шевченко, О. Ю. Черных, Л.В. Шевченко [и др.]. - Краснодар : КубГАУ, 2013. - 22 с.

142. Хавкин, А. И. Нарушения микроэкологии кишечника и энтеросорбция / А. И. Хавкин // Вопросы современной педиатрии. - 2009. - Т. 8, № 2. - С. 94-98. - EDN KXFTTN.

143. Хайтович, А. Б. Некультивируемые формы бактерий / А. Б. Хайтович // Бактериология. - 2022. - Т. 7, № 3. - С. 78. - EDN GZORNZ.

144. Характеристика антибиотикорезистентности нетифоидных сальмонелл, циркулирующих на территории Российской Федерации в период с 2019 по 2022 год / А.С. Павлова, К.В. Кулешов, Н.Е. Крутова [и др.] // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. - 2023. - Т. 100. - №5. - C. 287-301. doi: 10.36233/0372-9311-451

145. Цындрина, Ю. Развитие птицеводства: рост спроса и импортозамещение / Ю. Цындрина // Животноводство России. - 2024. - № 1. - С. 12-14.

146. Частота выделения гемолизирующей кишечной палочки (E. coli Hly+) и ее влияние на бифидобактерии в анализах на дисбактериоз / Е. В. Потап, Т. М. Кускова, А. А. Кутькина [и др.] // Материалы II Национального конгресса бактериологов 2016. - 2016. - Т. 6, № 3. - С. 97-98

147. Черных, М. Н. Эпизоотологические и патоморфологические аспекты колибактериоза в условиях птицехозяйств с промышленной технологией / М. Н. Черных, С. В. Федотов // Вестник Алтайского государственного аграрного университета. - 2009. - № 4(54). - С. 50-53. - EDN JXUNTZ

148. Шендеров, Б. А. Медицинская микробная экология и функциональное питание / Б. А. Шендеров. - М. : Грантъ, 2004. - 234 с.

149. Эффективность левофлоксацина при экспериментальном колибактериозе лабораторных животных и цыплят / А. Д. Мазур, В. Н. Скворцов, Д. В. Юрин, А. А. Моисеева // Международный вестник ветеринарии. - 2021. - № 1. - С. 62-65. -DOI 10.17238/issn2072-2419.2021.1.62. - EDN KLRWGQ.

150. A diffusible cytotoxin of Haemophilus ducreyi / L.D. Cope, S. Lumbley, J.L. Latimer [et al.] // Proc Natl Acad Sci USA. - 1997. - № 94. - P. 4056-4061

151. A plasmid-encoded type IV fimbrial gene of enteropathogenic Escherichia coli associated with localized adherence / M.S. Donnenberg, J.A. Girón, J.P. Nataro, J.B. Kaper // Mol. Microbiol. - 1992. - Vol. 6. - P. 3427-3437.

152. A segmentation clock patterns cellular differentiation in a bacterial biofilm / K.-T. Chou, D.-Y.D. Lee, J.-G. Chiou [et al.] // Cell. - 2022. - Vol. 185, No. 1. - P. 145-157. e13. DOI: 10.1016/j.cell.2021.12.001.

153. Adhesion, hemagglutination, and virulence of Escherichia coli causing urinary tract infections / L. Hagberg, U. Jodal, T.K. Korhonen [et al.] // Infection and Immunity. -1981. - Vol. 31, No. 2. - P. 564-570. - doi: 10.1128/iai.31.2.564-570.1981

154. Alhagi maurorum extract modulates quorum sensing genes and biofilm formation in Proteus mirabilis / A. Mirzaei, B. Nasr Esfahani, M. Ghanadian [et al.] // Scientific Reports. - 2022. - Vol. 12. - Article 13992. - DOI: 10.1038/s41598-022-18362-x.

155. Alkaline pH Is a signal for optimal production and secretion of the heat labile toxin, LT in enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) / L. Gonzales, Z.B. Ali, E. Nygren [et al.] // PLoS One. - 2013. - Vol.18. - No. 8(9). - P. e74069.

156. Amit Romach, E. Microflora ecology of the chicken intestine using 16S ribosomal DNA primers / E. Amit Romach, D. Sklan, Z. Uni // Poultry Science. - 2004. - Vol. 83. - P. 1093-1098.

157. Amyes, S. B. Antibiotic resistance / S. B. Amyes, C. G. Gemmel // J. Med. Microbiol. - 1997. - Vol. 46. - No. 6. - P. 436-470.

158. Anatomical, pathological, and histological features of experimental respiratory infection of birds by biofilm-forming bacteria Staphylococcus aureus / E. Lenchenko, N. Sachivkina, O. Petrukhina [et al.] // Vet. World. - 2024. - № 17(3). - P. 612-619. doi: www. doi.org/10.14202/vetworld.2024.612-619.

159. Antibiofilm activity of papain enzyme against pathogenic Klebsiella pneumoniae / S.M. Mahmoud, M.S. Khalil, S.M. Walaa, M. Mabrouk // Journal of Applied Pharmaceutical Science. - 2018. - No.6 (8). - P. 163-168.

160. Antibody against the carboxyl terminus of intimin alpha reduces enteropathogenic Escherichia coli adherence to tissue culture cells and subsequent induction of actin polymerization / H.M. Carvalho, L.D. Teel, J.F. Kokai-Kun, A.D. O'Brien // Infect. Immun. - 2005. - Vol. 73. - P. 2541-2546.

161. Antimicrobial activity of bacteriocin-producing lactic-acid bacteria isolated from cheeses and yogurts / E. Yang, L. Fan, C. Doucette, S. Fillmore // AMB Express a Springer Open Journal. - Canada. - 2012. - P. 134-139.

162. Arbulu, S. Revisiting the Multifaceted Roles of Bacteriocins / S. Arbulu, M. Kjos // Microbial Ecology. - 2024. - Vol. 87. - P. 41. - doi: 10.1007/s00248-024-02357-4

163. Are Virulence and Antibiotic Resistance Genes Linked? A Comprehensive Analysis of Bacterial Chromosomes and Plasmids / H. Darmancier, C.P.F. Domingues, J.S. Rebelo [et al.] // Antibiotics (Basel). - 2022. - Vol. 11, No. 6. - P. 706. - doi: 10.3390/antibiotics11060706

164. Association of cytolethal distending toxin-II gene-positive Escherichia coli with Escherichia albertii, an emerging enteropathogen / A. Hinenoya, N. Yasuda, N. Mukaizawa [et al.] // Int. J. Med. Microbiol. - 2017. - Vol. 307. - P. 564-571.

165. Audisio, M.C. Virulence analysis of a Salmonella gallinarum strain by oral inoculation of 20-day-old chickens / M.C. Audisio, H.R. Terzolo // Avian Diseases. -2002. - Vol. 46, No. 1. - P. 186-191. - doi: 10.1637/0005-2086(2002)046[0186:VAOASG]2.0.CO;2

166. Avian pathogenic Escherichia coli (APEC): current insights and future challenges / S. Nawaz, Z. Wang, Y. Zhang [et al.] // Poult Sci. - 2024. - Vol. 103. - No. 12. - P. 104359. - doi: 10.1016/j.psj.2024.104359

167. Avian pathogenic Escherichia coli: Epidemiology, virulence and pathogenesis, diagnosis, pathophysiology, transmission, vaccination, and control / A.R. Khairullah, D.A. Afnani, K.H.P. Riwu [et al.] // Vet. World. - 2024. - Vol. 17. - No. 12. - P. 27472762. - doi: 10.14202/vetworld.2024.2747-2762

168. Avian pathogenic, uropathogenic, and newborn meningitis-causing Escherichia coli: how closely related are they? / Ewers C., Li G., Wilking H. [et al.] // International Journal of Medical Microbiology. - 2007. - Vol. 297, No. 3. - P. 163-176. - doi: 10.1016/j.ijmm.2007.01.003.

169. BacDive in 2022: the knowledge base for standardized bacterial and archaeal data. / L.C. Reimer, J. Sardá Carbasse, J. Koblitz, C. Ebeling, A. Podstawka, J. Overmann. // Nucleic Acids Res. - 2022. Vol. - P. 741 - 746.

170. Beceiro, A. Antimicrobial resistance and virulence: a successful or deleterious association in the bacterial world? / A. Beceiro, M. Tomás, G. Bou // Clinical Microbiology Reviews. - 2013. - Vol. 26, No. 2. - P. 185-230. - doi: 10.1128/CMR.00059-12

171. Bergey's Manual of determinative bacteriology (1997) In: Hoult, D., Krig, N., Snit, P., Stali, D. and Williams, S., editor. 9th edition. In 2 vol. Russia, Mir, 1.

172. Biochemical properties of a newly described Escherichia species, Escherichia albertii / S.L. Abbott, J. O'Connor, T. Robin [et al.] // J. Clin. Microbiol. - 2003. - Vol.41.

- No. 10. - P. 4852-4. - doi: 10.1128/JCM.41.10.4852-4854.2003. PMID: 14532241; PMCID: PMC254372.

173. Biofilms and their relevance to veterinary medicine / A.L. Clutterbuck, E.J. Woods, D.C. Knottenbelt [et al.] // [published correction appears in Vet Microbiol. - 2007. - Vol. 15.125(3-4). - P.390]. - Vet Microbiol. - 2007. - Vol. 121(1-2). - P. 1-17. doi:10.1016/j.vetmic.2006.12.029

174. Biofilms: basic research methods: a teaching aid / A.M. Mardanova, D.A. Kabanov, N.L. Rudakova, M.R. Sharipov // Kazan: Kazan (Volga Region) Federal University. -2016. - P. 42.

175. Burns, S.M. Loss of resistance to ingestion and phagocytic killing by O(-) and K(-) mutants of a uropathogenic Escherichia coli O75:K5 strain / S.M. Burns, S.I. Hull // Infection and Immunity. - 1999. - Vol. 67, No. 8. - P. 3757-3762. - doi: 10.1128/IAI.67.8.3757-3762.1999

176. Cepas, V. Relationship between Virulence and Resistance among Gram-Negative Bacteria / V. Cepas, S.M. Soto // Antibiotics. - 2020. - Vol. 9, No. 10. - P. 719. - doi: 10.3390/antibiotics9100719

177. Changing the intestinal microbiota of chickens in ontogenesis / I. N. Nikonov, L. A. Ilina, I. I. Kochish [et al.] // Ukrainian Journal of Ecology. - 2017. - Vol. 7, No. 4. -P. 492-499.

178. Characterisation of Escherichia coli adhesins in patients with symptomatic urinary tract infections / L. Conventi, G. Errico, S. Mastroprimiano [et al.] // Genitourinary Medicine. - 1989. - Vol. 65, No. 3. - P. 183-186. - doi: 10.1136/sti.65.3.183

179. Characterization of atypical enteropathogenic Escherichia coli strains that express typical localized adherence in HeLa cells in the absence of the bundle-forming pilus / R.T. Hernandes, M.A. Vieira, S.M. Carneiro [et al.] // J Clin Microbiol. - 2006. - Vol. 44. - P. 4214-4217

180. Characterization of Escherichia coli pathogenicity and drug resistance in yolk peritonitis / Q. Li, W. Fang, S. Chen [et al.] // Poultry Science. - 2024. - Vol. 103, No. 7.

- P. 103814. - doi: 10.1016/j.psj.2024.103814

181. Clonal structure and virulence factors in strains of Escherichia coli of the classic serogroup O55 / J. Rodrigues, I.C. Scaletsky, L.C. Campos [et al.] // Infect. Immun. -1996. - Vol. 64. - P. 2680-2686.

182. Colicins and Microcins Produced by Enterobacteriaceae: Characterization, Mode of Action, and Putative Applications / K.G. Markovic, M.Z. Grujovic, M.G. Koracevic [et al.] // International Journal of Environmental Research and Public Health. - 2022. -Vol. 19, No. 18. - P. 11825. - doi: 10.3390/ijerph191811825

183. Colitose-containing O-polysaccharide structure and O-antigen gene cluster of Escherichia albertii HK18069 related to those of Escherichia coli O55 and E. coli O128 / H. Zheng, O.I. Naumenko, H. Wang [et al.] // Carbohydr Res. - 2019. - Vol. 480. - P. 73-79. - doi: 10.1016/j.carres.2019.05.013. Epub 2019 Jun 2. PMID: 31176878.

184. Colonization factors of Campylobacter jejuni in the chicken gut / D. Hermans, K. Van Deun, A. Martel, et al. // Veterinary Research. - 2011. - Vol. 42. - P. 82. - doi: 10.1186/1297-9716-42-82 Swarming of Pseudomonas aeruginosa is a complex adaptation leading to increased production of virulence factors and antibiotic resistance / J. Overhage, M. Bains, M.D. Brazas, R.E. Hancock // Journal of Bacteriology. - 2008. -Vol. 190, No. 8. - P. 2671-2679. - doi: 10.1128/JB.01659-07

185. Correlation of biofilm formation, virulence factors, and phylogenetic groups among Escherichia coli strains causing urinary tract infection: A global systematic review and meta-analysis / H.K. Mirzahosseini, F. Najmeddin, A. Najafi [et al.] // Journal of Research in Medical Sciences. - 2023. - Vol. 28. - P. 66. - doi: 10.4103/j rms .j rms_637_22

186. Cryptic lineages of the genus Escherichia / S.T. Walk, E.W. Alm, D.M. Gordon [et al.] // Appl. Environ. Microbiol. - 2009. - Vol. 75. - No. 20. - P. 6534-44. - doi: 10.1128/AEM.01262-09. Epub 2009 Aug 21. PMID: 19700542; PMCID: PMC2765150.

187. Cytokine Response after Stimulation with Key Commensal Bacteria Differ in Post-Infectious Irritable Bowel Syndrome (PI-IBS) Patients Compared to Healthy Controls / J. Sundin, I. Rangel, D. Repsilber, R. J. Brummer // PloS one. - 2015. - Vol. 10(9) - P. e0134836. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0134836

188. Defining the genome features of Escherichia albertii, an emerging enteropathogen closely related to Escherichia coli / T. Ooka, Y. Ogura, K. Katsura [et al.] // Genome Biol. Evol. - 2015. - Vol. 7. - P. 3170-3179.

189. Dibner, J.J. Microbial imprinting in gut development and Health / J.J. Dibner, J.D. Richards, C.D. Knight // J. Appl. Poultry Res., 2008. - Vol.17. - P. 174-188.

190. Dissection of the role of pili and type 2 and 3 secretion systems in adherence and biofilm formation of an atypical enteropathogenic Escherichia coli strain / R.T. Hernandes, M.A. De la Cruz, D. Yamamoto [et al.] // Infect Immun. - 2013. - Vol. 81 -P. 3793-3802.

191. Enteropathogenic E. coli (EPEC) transfers its receptor for intimate adherence into mammalian cells / B. Kenny, R. DeVinney, M. Stein M [et al.] // Cell. - 1997. - Vol. 91. - P. 511-520.

192. Escherichia albertii in wild and domestic birds / J.L. Oaks, T.E. Besser, S.T. Walk [et al.] // Emerg Infect Dis. - 2010. - Vol. 16(4). - P. 638-46. - doi: 10.3201/eid1604.090695. PMID: 20350378; PMCID: PMC3321939.

193. Escherichia albertii sp. nov., a diarrhoeagenic species isolated from stool specimens of Bangladeshi children / G. Huys, M. Cnockaert, J.M. Janda, J Swings // Int. J. Syst. Evol. Microbiol. - 2003. - Vol. 53. (Pt 3). - P. 807-810. doi: 10.1099/ijs.0.02475-0. PMID: 12807204.

194. Escherichia albertii, a novel human enteropathogen, colonizes rat enterocytes and translocates to extra-intestinal sites / D. Yamamoto, R.T. Hernandes, A.M.A. Liberatore [et al.] // PLoS ONE. 2017. - Vol. 12(2). - P. e0171385. -https://doi.org/10.1371/journal.pone.0171385

195. Escherichia coli bacteriocins: antimicrobial efficacy and prevalence among isolates from patients with bacteraemia / M. Budic, M. Rijavec, Z. Petkovsek, D. Zgur-Bertok // PLoS One. - 2011. - Vol. 6, No. 12. - P. e28769. - doi: 10.1371/journal.pone.0028769

196. Evolutionary genetics of a new pathogenic Escherichia species: Escherichia albertii and related Shigella boydii strains / K. E. Hyma, D. W. Lacher, A.M. Nelson [et

al.] // J. Bacteriol. - 2005. - Vol. 187. - No. 2. - P. 619-628. doi: 10.1128/JB.187.2.619-628.2005. PMID: 15629933; PMCID: PMC543563.

197. Exogenous stimuli maintain intraepithelial lymphocytes via aryl hydrocarbon receptor activation / Y. Li, S. Innocentin, D.R. Withers [et al.] // Cell. - 2011. - Vol. 147.

- No. 3. - P. 629-640. - URL: https://doi.org/10.10167j.cell.2011.09.025 (date accessed: 21.07.2023).

198. Flagellar motility is necessary for Aeromonas hydrophila adhesion / Y. Qin, G. Lin, W. Chen [et al.] // Microbial Pathogenesis. - 2016. - Vol. 98. - P. 160-166. - doi: 10.1016/j.micpath.2016.07.006

199. Free and Complexed-Secretory Immunoglobulin A Triggers Distinct Intestinal Epithelial Cell Responses/ R. Salerno-Goncalves, F. Safavie, A. Fasano [et al.] // Clin. Exp. Immunol. - 2016. - Vol. 185. - P. 338-347. - URL: https://doi.org/10.1111/cei.12801 (date accessed: 21.07.2023).

200. Genome sequencing of environmental Escherichia coli expands understanding of the ecology and speciation of the model bacterial species / C. Luo, S.T. Walk, D.M. Gordon [et al.] // Proc. Natl. Acad. Sci USA. - 2011. - Vol. 26. - No. 108(17). - P. 72007205. - doi: 10.1073/pnas.1015622108. Epub 2011 Apr 11. PMID: 21482770; PMCID: PMC3084108

201. Girón, J.A. An inducible bundle-forming pilus of enteropathogenic Escherichia coli / J.A. Girón, A.S. Ho, G.K. Schoolnik // Science. - 1991. - Vol. 254. - P. 710-713.

202. Gonzales, L. The different ecological niches of enterotoxigenic Escherichia coli / L. Gonzales, Á. Sjöling // Environ Microbiol. - 2016. - Vol. 18. - No. 3. - P. 741-751.

203. Gordon, D.M. Bacteriocin diversity and the frequency of multiple bacteriocin production in Escherichia coli / D.M. Gordon, C.L. O'Brien // Microbiology (Reading).

- 2006. - Vol. 152, Pt 11. - P. 3239-3244. - doi: 10.1099/mic.0.28690-0

204. Gordon, D.M. Reservoirs of Infection: the Epidemiological Characteristics of an Emerging Pathogen, Escherichia albertii / D.M. Gordon // Research School of Biology, Australian National University, Canberra, Australia, 2011.

205. Growth and Survival of Escherichia albertii in Food and Environmental Water at Various Temperatures / S. Hirose, N. Konishi, M. Sato [et al.] // J Food Prot. - 2024. -Vol. 7(4). - P. 100249. doi: 10.1016/j.jfp.2024.100249.

206. Gut Microbiota and Immune System Interactions / J. Y. Yoo, M. Groer, S. V. O. Dutra [et al.]. - Text : electronic // Microorganisms. - 2020. - Vol. 8. - No. 10. - P. 1587.

- URL: https://doi.org/10.3390/microorganisms8101587 (date accessed: 17.09.2024).

207. Gyles, C.L. Escherichia coli Enterotoxins. In: Gyles, C.L., Ed., Escherichia coli in Domestic Animals and Humans, CAB International, Wallingford, Oxon, UK, 1994. -337p.

208. H(2)O(2) production in species of the Lactobacillus acidophilus group: a central role for a novel NADH-dependent flavin reductase / R. Hertzberger, J. Arents, H. L. Dekke [et al.] // Appl Environ Microbiol. - 2014. - Vol. 80(7) - P. 2229-2239. -doi:10.1128/AEM.04272-13

209. Haemolysin contributes to virulence of extra-intestinal E. coli infections / R.A. Welch, E.P. Dellinger, B. Minshew, S. Falkow // Nature. - 1981. - Vol. 294, No. 5842.

- P. 665-667. - doi: 10.1038/294665a0

210. Hafnia alvei, a probable cause of diarrhea in humans / M.J. Albert, K. Alam, M. Islam [et al.] // Infect Immun. - 1991. - Vol. 59(4). - P. 1507-1513. - doi: 10.1128/iai.59.4.1507-1513.1991. PMID: 2004829; PMCID: PMC257869.

211. Hall-Stoodley, L. Biofilms: A novel method of microbial life in the natural environment / L. Hall-Stoodley, P. Stoodley // Nat Rev Microbiol. - 2005. - Vol. 3(4). -P. 259-268.

212. Horwitz, M.A. Influence of the Escherichia coli capsule on complement fixation and on phagocytosis and killing by human phagocytes / M.A. Horwitz, S.C. Silverstein // Journal of Clinical Investigation. - 1980. - Vol. 65, No. 1. - P. 82-94. - doi: 10.1172/JCI109663

213. Human extraintestinal pathogenic Escherichia coli strains differ in prevalence of virulence factors, phylogroups, and bacteriocin determinants / L. Micenkova, J. Bosak, M. Vrba, [et al.] // BMC Microbiology. - 2016. - Vol. 16. - P. 218. - doi: 10.1186/s 12866-016-0835-z

214. Identification and Genomic Characterization of Escherichia albertii in Migratory Birds from Poyang Lake, China / Q. Liu, X. Bai, X. Yang [et al.] // Pathogens. - 2022. -Vol. 1. - P. 12.

215. Identification of a cytolethal distending toxin gene locus and features of a virulence-associated region in Actinobacillus actinomycetemcomitans / M.P. Mayer, L.C. Bueno, E.J. Hansen, J.M. DiRienzo // Infect Immun. - 1999. - No. 67. - P. 1227-1237.

216. Identification of cdtB homologues and cytolethal distending toxin activity in enterohepatic Helicobacter spp / C.C. Chien, N.S. Taylor, Z. Ge [et al.] // J Med Microbiol. - 2000. - No. 49. - P. 525-534.

217. In vitro activity of the antibiotic batumin against Candida albicans biofilm / L. N. Churkina, N. B. Perunova, O. V. Bukharin [et al.] // Biotechnologia Acta. - 2020. - Vol. 13. - No. 3. - P. 73-80. - DOI 10.15407/biotech13.03.073. - EDN XAZJVZ

218. Incidence, Pathotyping, and Antibiotic Susceptibility of Avian Pathogenic Escherichia coli among Diseased Broiler Chicks / A. M. Awad, N. A. El-Shall, D. S. Khalil [et al.] // Pathogens. - 2020. - Vol. 9, No. 2. - P. 114. - DOI 10.3390/pathogens9020114. - EDN AEYFCR.

219. Increased Ileal Immunoglobulin A Production and Immunoglobulin A- Coated Bacteria in Diarrhea-Predominant Irritable Bowel Syndrome/ Y. Liu, X. Yuan, L. Li [et al.] // Clin. Transl. Gastroenterol. - 2020. - Vol. 11. - No. 3. - P. e00146. - URL: https://doi.org/10.14309/ctg.0000000000000146 (date accessed: 21.07.2023).

220. Inflammatory Environment and Pathological Changes in Escherichia coli Infected Mice / M. Dai, J. Deng, M. Qiu [et al.] // Heliyon. - 2022. - Vol. 8, No. 12. - P. e12533. - doi: 10.1016/j. heliyon.2022. e12533

221. Influence of environmental factors in the adherence of an atypical enteropathogenic Escherichia coli strain to epithelial cells / F.T. Romao, R.T. Hernandes, D. Yamamoto [et al.] // BMC Microbiol. -2014. - No. 14. - Vol. 1. - P.299.

222. Intestinal Microbiota in Healthy Adults: Temporal Analysis Reveals Individual and Common Core and Relation to Intestinal Symptoms / J. Jalanka-Tuovinen, A. Salonen, J. Nikkilä [et al.] // PLoS one. - 2011. - Vol. 6. - No. 7. - P. e23035. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0023035

223. Invasion of differentiated intestinal Caco-2 cells is a sporadic property among atypical enteropathogenic Escherichia coli strains carrying common intimin subtypes / V.C. Pacheco, D. Yamamoto, C.M. Abe [et al.] // Pathog Dis. - 2014. - No. 70. - P. 167175

224. Invasiveness as a putative additional virulence mechanism of some atypical enteropathogenic Escherichia coli strains with different uncommon intimin types / D. Yamamoto, R.T. Hernandes, M. Blanco [et al.] // BMC Microbiol. - 2009. - P. 1-10.

225. Isolation and characterization of an Escherichia albertii strain producing three different toxins from a child with diarrhea / A . Hinenoya, N. Yasuda, T. Hibino [et al.] // Jpn. J. Infect. - 2017. - Vol. 70. - P. 252-257.

226. Isolation and characterization of Escherichia albertii in poultry at the pre-harvest level / A. Hinenoya, X.P. Li, X. Zeng [et al.] // Zoonoses Public Health. - 2021. - Vol. 68(3). - P. 213-225. - doi: 10.1111/zph.12812. Epub 2021 Feb 2. PMID: 33528112.

227. Isolation and characterization of Escherichia albertii originated from the broiler farms in Mississippi and Alabama / H. Wang, L. Zhang, L. Cao, [et al.] // Vet Microbiol. -2022. - Vol.267. - P.109379.

228. Janda, J.M. Prototypal diarrheagenic strains of Hafnia alvei are actually members of the genus Escherichia / J.M. Janda, S.L. Abbott, M.J. Albert // J. Clin. Microbiol. -1999. - Vol. 37. - No. 8. - P. 2399-2401. doi: 10.1128/JCM.37.8.2399-2401.1999. PMID: 10405374; PMCID: PMC85237.

229. Janda, J.M. The Changing Face of the Family Enterobacteriaceae (Order: "Enterobacterales"): New Members, Taxonomic Issues, Geographic Expansion, and New Diseases and Disease Syndromes / J.M. Janda, S.L. Abbott // Clin. Microbiol. Rev. - 2021. - No. 34. - P. 10.1128/cmr.00174-20. https://doi.org/10.1128/cmr.00174-20

230. Johansson, M.E.V. The gas-trointestinal mucus system in health and disease / M.E.V. Johansson, H. Sjövall, G.C. Hansson // Nat Rev Gastroenterol Hepatol. - 2013. -Vol. 10(6). - P. 352-361.

231. Kamensek, S. Global transcriptional responses to the bacteriocin colicin M in Escherichia coli / S. Kamensek, D. Zgur-Bertok // BMC Microbiology. - 2013. - Vol. 13. - P. 42. - doi: 10.1186/1471-2180-13-42

232. Kaper, J.B. Pathogenic Escherichia coli / J.B. Kaper, J.P. Nataro, H.L. Mobley // Nature Reviews Microbiology. - 2004. - Vol. 2, No. 2. - P. 123-140. - doi: 10.1038/nrmicro818

233. Kim, D. The interplay between host immune cells and gut microbiota in chronic inflammatory diseases / D. Kim, M. Y. Zeng, G. Nunez // Exp Mol Med. - 2017. - Vol. 49. - No. 5. - P. e339. - URL: https://doi.org/10.1038/emm.2017.24 (date accessed: 20.07.2023).

234. Krautkramer, K. A. Gut microbial metabolites as multi-kingdom intermediates / K. A. Krautkramer, J. Fan, F. Bäckhed // Nature reviews. Microbiology. - 2021. - Vol. 19. - No. 2. - P. 77-94. - URL: https://doi.org/10.1038/s41579-020-0438-4 (date accessed: 21.07.2023).

235. Lactoferrin: a modulator of immune and inflammatory responses / D. Legrand, E. Elass, M. Carpentier, J. Mazurier // Cell Mol Life Sci. - 2005. - Vol. 62. - No. 22. - P. 2549-2559. - URL: https://doi.org/10.1007/s00018-005-5370-2 (date accessed: 21.07.2023).

236. Lenev, S.V. Improvement of allocation and identification of salmonella enterica bacteria of arizonae subspecies / S.V. Lenev, A.I. Laishevtcev, N.V. Pimenov // Russian Journal of Agricultural and Socio-Economic Sciences. - 2016. - No. 2(50). - P. 14-23. -DOI 10.18551/rjoas.2016-02.02. - EDN VLYNOB.

237. Lindsay, S. The detrimental impact of extracellular bacterial proteases on wound healing / S. Lindsay, A. Oates, K. Bourdillon // Int Wound J. -2017. - Vol. 14. - No. 6. - P. 1237-1247. - URL: https://doi.org/10.1111/iwj.12790 (date accessed: 21.07.2023).

238. Litvak, Y. Colonocyte Metabolism Shapes the Gut Microbiota / Y. Litvak, M.X. Byndloss, A.J. Bäumle // Science. - 2018. - P. 362. - URL: https://doi.org/10.1126/science.aat9076 (date accessed: 21.07.2023).

239. Macfarlane, S. Regulation of short-chain fatty acid production / S. Macfarlane, G. T. Macfarlane // Proc Nutr Soc. - 2003. - Vol. - 62. - P. 67-72. - URL: https://doi.org/10.1079/PNS2002207 (date accessed: 21.07.2023).

240. Maiorka, A. Broiler adaptation to post-hatching period / A. Maiorka, F. Dahlke, M.S.F de Azevedo Morgulis // Ciencia Rural/ - 2006. - No. 36. - P. 701-708.

241. Marugg, J.D. Bacteriocins, their role in developing natural products II / J.D. Marugg // Food biotechnol. - 1991. - No. 3. - P. 305-312.

242. Mead, G.C. Microbes of the avian cecum: types present and substrates utilized / G.C. Mead // J. Exp. Zool.Suppl. - 1989. - No. 3. - P. 48-54.

243. Microbiology and Epidemiology of Escherichia albertii-An Emerging Elusive Foodborne Pathogen / F. Muchaamba, K. Barmettler, A. Treier [et al.] // Microorganisms.

- 2022. - Vol. 10. - № 5. - P. 875. - Published 2022 Apr 22. doi:10.3390/microorganisms10050875

244. Microbiota, gastrointestinal infections, low-grade inflammation, and antibiotic therapy in irritable bowel syndrome: an evidence-based review / M. Schmulson, M.V. Bielsa, R. Carmona-Sánchez [et al.] // Rev Gastroenterol Mex. - 2014. - Vol. 79. - No. 2. - P. 96-134. doi:10.1016/j.rgmx.2014.01.004.

245. Morris D.P. Biofilm: Why the Sudden Interest? / D.P. Morris, A. Hagr // The Journal of Otolaryngology. - 2005. - Vol. 34. - Suppl. 2. - P. 56-59.

246. Morrison, D. J. Formation of short chain fatty acids by the gut microbiota and their impact on human metabolism / D. J. Morrison, T. Preston // Gut Microbes. - 2016. - Vol. 7. - P. 189-200. - URL: https://doi.org/-10.1080/19490976.2015.1134082 (date accessed: 21.07.2023).

247. Mucins in Intestinal Mucosal Defense and Inflammation: Learning From Clinical and Experimental Studies / J. A. Grondin, Y. H. Kwon, P. M. Far [et al.] // Front Immunol.

- 2020. - Vol. 11. - P. 2054. - URL: https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.02054 (date accessed: 20.07.2023).

248. Muniz, L.R. Intestinal antimicro-bial peptides during homeostasis, infection, and disease / L.R. Muniz, C. Knosp, G. Yeretssian // Front Immunol. - 2012. - Vol. 3. -P.310.

249. Nataro, J.P. Diarrheagenic Escherichia coli / J.P. Nataro, J.B. Kaper // Clinical Microbiology Reviews. - 1998. - Vol. 11. - P. 142-201.

250. Necrotic Enteritis in Broiler Chickens: Disease Characteristics and Prevention Using Organic Antibiotic Alternatives: A Comprehensive Review / M.E. Abd El-Hack,

M.T. El-Saadony, A.R. Elbestawy [et al.] // Poult Sci. - 2022. - Vol.101(2). - P.101590.

- https://doi.Org/10.1016/j.psj.2021.101590

251. Nimri, L.F. Escherichia albertii, a newly emerging enteric pathogen with poorly defined properties / L.F.Nimri // Diagn. Microbiol. Infect. Dis. - 2013. - Vol. 77. - № 2.

- P. 91-95. - doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2013.06.028. Epub 2013 Aug 9. PMID: 23938305.

252. Ocejo, M. 16S rRNA amplicon sequencing characterization of caecal microbiome composition of broilers and free-range slow-growing chickens throughout their productive lifespan / M. Ocejo, B. Oporto & A. Hurtado // Sci. Rep. - 2019. - Vol. 9 (1).

- P. 2506. https://doi.org/10.1038/s41598-019-39323-x.

253. Okuda, J. Distribution of the cytolethal distending toxin A gene (cdtA) among species of Shigella and Vibrio, and cloning and sequencing of the cdt gene from Shigella dysenteriae / J. Okuda, H. Kurazono, Y. Takeda // Microb Pathog. - 1995. - № 18. - P. 167-172.

254. Olivares-Villagomez, D. Intestinal Intraepithelial Lymphocytes: Sentinels of the Mucosal Barrier / D. Olivares-Villagomez, L. van Kaer // Trends Immunol. - 2018. -Vol. 39. - P. 264-275. - URL: https://doi.org/10.1016Zj.it.2017.11.003 (date accessed: 21.07.2023).

255. Oliveira, S. R. Biofilm formation in avian pathogens and its role in chronic infections in poultry / S. R. Oliveira // Avian Pathology. - 2018. - Vol. 47(4). - P. 365374.

256. Ooka, T. Clinical significance of Escherichia albertii / T. Ooka, K. Seto, K. Kawano // Emerg Infect Dis. - 2012. - Vol. 18(3). - P. 488-92. - doi: 10.3201/eid1803.111401. PMID: 22377117; PMCID: PMC3309589.

257. Organised genome dynamics in the Escherichia coli species results in highly diverse adaptive paths / M. Touchon, C. Hoede, O. Tenaillon [et al.] // PLoS Genetics. -2009. - Vol. 5, No. 1. - P. e1000344. - doi: 10.1371/journal.pgen.1000344

258. Patterns of adherence of diarrheagenic Escherichia coli to HEp-2 cells / J.P. Nataro, J.B. Kaper, R. Robins-Browne [et al.] // Pediatr Infect Dis J. - 1987.- № 6. - P. 829-831.

259. Peluffo, C.A. Virulence in mice of epidemic strains of Salmonella typhimurium isolated from children / C.A. Peluffo, K. Irino, S. de Mello // Journal of Infectious Diseases. - 1981. - Vol. 143, No. 3. - P. 465-469. - doi: 10.1093/infdis/143.3.465

260. Phenotypic and genotypic characteristics of Escherichia coli strains of non-enteropathogenic E. coli (EPEC) serogroups that carry EAE and lack the EPEC adherence factor and Shiga toxin DNA probe sequences / M.A. Vieira, J.R. Andrade, L.R. Trabulsi [et al.] // J Infect Dis. - 2001. - №183. - P. 762-772.

261. Phenotypic and molecular characterization of Escherichia albertii: further surrogates to avoid potential laboratory misidentification / A. Hinenoya, H. Ichimura, S.P. Awasthi [et al.] // Int J Med Microbiol. - 2019. - Vol. 309. - P. 108-115.

262. Phenotypic characterization and virulence-related properties of Escherichia albertii strains isolated from children with diarrhea in Brazil / M.P. Lima, D. Yamamoto, A.C.M. Santos [et al.] // Pathog Dis. - 2019. - Vol. 1. - № 77(2). - P. ftz014. - doi: 10.1093/femspd/ftz014. PMID: 30865776.

263. Prevalence of cytolethal distending toxin production in Campylobacter jejuni and relatedness of Campylobacter sp. cdtB gene / C.L. Pickett, E.C. Pesci, D.L. Cottle, [et al.] // Infect Immun. -1996. - № 64. - P. 2070-2078

264. Prevalence of irritable bowel syndrome and functional dyspepsia, overlapping symptoms, and associated factors in a general population of Bangladesh / I. Perveen, M.M. Rahman, M. Saha, M.Q. Hasan // Indian J Gastroenterol. - 2014. - Vol. 33(3). - P. 265-273.

265. Quantification of biofilm in microtiter plates: overview of testing conditions and practical recommendations for assessment of biofilm production by staphylococci / S. Stepanovic, D. Vukovic, V. Hola [et al.] // APMIS. - 2007. - Vol. 115, No. 8. - P. 891899. - doi: 10.1111/j.1600-0463.2007.apm_630.x

266. Rajpaul K. Biofilm in wound care / K. Rajpaul // Br J Community Nursing. - 2015. - Sup.3. - S6.

267. Regulation of hemolysin in uropathogenic Escherichia coli fine-tunes killing of human macrophages / A. M. V. Murthy, M. Phan, K. M. Peters [et al.] // Virulence. -2018. - Vol. 9. - P. 967-980

268. Rescigno, M. Intestinal microbiota and its effects on the immune system/ M. Rescigno // Cell Microbiol. - 2014. -Vol. 16. - P. 1004-1013. - URL: https://doi.org/10.1111/cmi.12301 (date accessed: 21.07.2023).

269. Rethinking Mucosal Antibody Responses: IgM, IgG and IgD Join IgA/ K. Chen, G. Magri, E.K. Grasset, A. Cerutti // Nat. Rev. Immunol. - 2020. - Vol. 20. - P.427-441.

- URL: https://doi.org/10.1038/s41577-019-0261-1 (date accessed: 20.07.2023).

270. Secretory Iga in Intestinal Mucosal Secretions as an Adaptive Barrier against Microbial Cells / B. Pietrzak, K. Tomela, A. Olejnik-Schmidt [et al.] // Int. J. Mol. Sci. -2020. - Vol.21. - P.9254. - URL: https://doi.org/10.3390/ijms21239254 (date accessed: 21.07.2023).

271. Serological cross-reaction between O-antigens of Shigella dysenteriae type 4 and an environmental Escherichia albertii isolate / M. Z. Rahman, S. Akter, N. Azmuda [et al.] // Curr. Microbiol. - 2013. - Vol. 67. - № 5. - P. 590-595. - doi: 10.1007/s00284-013-0405-7. Epub 2013 Jun 9. PMID: 23748967.

272. Sharing of virulence-associated properties at the phenotypic and genetic levels between enteropathogenic Escherichia coli and Hafnia alvei / M.J. Albert, S.M. Faruque, M. Ansaruzzaman [et al.] // J. Med. Microbiol. - 1992. - Vol. 37. - P. 310-314. -https://doi.org/10.1099/00222615-37-5-310.

273. Shiga toxin 2a in Escherichia albertii / L.T. Brandal, H.S. Tunsjo, T.E. Ranheim, [et al.] // J Clin Microbiol - 2015. - Vol. 53. - P. 1454-1455.

274. Shiga toxin 2f-producing Escherichia albertii from a symptomatic human / K. Murakami, Y. Etoh, E. Tanaka [et al.] // Jpn. J. Infect. Dis. - 2014. - Vol. 67. - P. 204208.

275. Shiga, K. Ueber den Dysenterie-bacillus (Bacillus dysenteriae) / K. Shiga // Zentralbl Bakteriol Orig - 2002. - Vol.24. - 913-918.

276. Short-chain fatty acids suppress lipopolysaccharide-induced production of nitric oxide and proinflammatory cytokines through inhibition of NF-kB pathway in RAW264.7 cells / T. Liu, J. Li, Y. Liu [et al.] // Inflammation. - 2012. - Vol. 35. - № 5.

- P. 1676-1684. - URL: https://doi.org/10.1007/s10753-012-9484-z (date accessed: 21.07.2023).

277. Smith, H.W. Observations by the ligated intestinal segment and oral inoculation methods on Escherichia coli infections in pigs, calves, lambs and rabbits / H.W. Smith, S. Halls // J. Pathol. Bacteriol. - 1967. - Vol. 93. - №2 - P. 499-529.

278. Structural and Functional Diversity of Microcins, Gene-Encoded Antibacterial Peptides from Enterobacteria / S. Duquesne, V. Petit, J. Peduzzi, S. Rebuffat // Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology. - 2007. - Vol. 13, No. 4. - P. 200-209. - doi: 10.1159/000104748

279. Structure of the 30S ribosomal decoding complex at ambient temperature / E.H. Dao, F. Poitevin, R.G. [et al.] // RNA. - 2018. - Vol. 24(12). - P. 1667-1676.

280. Stx2f-positive Escherichia albertii isolated from a patient with hemolytic uremic syndrome, August 2016 / S. Iyoda, N. Ishijima, K. Lee [et al.] // Infect. Agents. Surveill. Rep. - 2016. - Vol.37. - P. 255.

281. Succession and Replacement of Bacterial Populations in the Caecum of Egg Laying Hens over Their Whole Life / P. Videnska, K. Sedlar, M. Lukac [et al.] // PLoS One. -2014. - Vol. 9(12). - P. e115142. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0115142

282. The continuing story of class lla bacteriocins / D. Drider, G. Fimland, Y. Hechard, L.M. McMullen // Microbiol. Mol. Biol. Rev. - 2006. - Vol. 70. - No. 2. - P. 564-582.

283. The genomic epidemiology of Escherichia albertii infecting humans and birds in Great Britain / R.J. Bengtsson, K.S. Baker, A.A. Cunningham [et al.] // Nat Commun. -2023. - Vol. 1. - P.14.

284. The gut barrier: new acquisitions and therapeutic approaches / F. Scaldaferri, M. Pizzoferrato, V. Gerardi, [et al.] // J Clin Gas-troenterol. - 2012. - Vol. 46. - P. S12-17.

285. The hemolysin of Escherichia coli / S. Bhakdi, N. Mackman, G. Menestrina [et al.] // European Journal of Epidemiology. - 1988. - Vol. 4, No. 2. - P. 135-143. - doi: 10.1007/BF00144740

286. The impact of the gut microbiota on human health: an integrative view / J.C. Clemente, L. K. Ursell, L.W. Parfrey, R. Knight // Cell. - 2012. - No. 148. - P. 1258-70.

287. The intestinal barrier in multiple sclerosis: implications for pathophysiology and therapeutics / C. R. Camara-Lemarroy, L. Metz, J. B. Meddings [et al.] // Brain. - 2018.

- Vol. 141. - No. 7. - P.1900-1916. - URL: https://doi.org/10.1093/brain/awy131 (date accessed: 20.07.2023).

288. The localized adherence pattern of an atypical enteropathogenic Escherichia coli is mediated by intimin omicron and unexpectedly promotes HeLa cell invasion / R.T. Hernandes, R.M. Silva, S.M. Carneiro [et al.] // Cell Microbiol. - 2008. - No. 10. - P. 415-425.

289. Variation in hemolysin A expression between uropathogenic Escherichia coli isolates determines NLRP3-dependent vs. -independent macrophage cell death and host colonization / A.M.V. Murthy, M.J. Sullivan, N.T.K. Nhu [et al.] // FASEB Journal. -2019. - Vol. 33, No. 6. - P. 7437-7450. - doi: 10.1096/fj.201802100R

290. Veisi, M. Biofilm formation ability and swarming motility are associated with some virulence genes in Proteus mirabilis / M. Veisi, H. Hosseini-Nave, O. Tadjrobehkar // BMC Microbiology. - 2025. - Vol. 25. - P. 388. - doi: 10.1186/s12866-025-04090-5

291. Virulence characteristics and antibiotic resistance analysis of Klebsiella pneumoniae isolated from pig farms in Xinjiang, China: revealing potential zoonotic risks / S.H. Wan, N. Li, P. Zheng [et al.] // Porcine Health Management. - 2025. - Vol. 11. -P. 25. - doi: 10.1186/s40813-025-00424-x

292. Virulence factors of avian pathogenic Escherichia coli isolated from broilers from the south of Brazil / da Rocha A.C., da Silva A.B., de Brito A.B. [et al.] // Avian Diseases.

- 2002. - Vol. 46, No. 3. - P. 749-753. - doi: 10.1637/0005-2086(2002)046[0749:VFOAPE]2.0.CO;2.

293. Virulence properties of atypical EPEC strains / J.S. Pelayo, I.C.A. Scaletsky, M.Z. Pedroso [et al.] // J. Med. Microbiol. - 1999. - Vol. 48. - P. 41-49.

294. Waite, D.W. Characterizing the avian gut microbiota: membership, driving influences, and potential function / D.W. Waite, M.W. Taylor // Front Microbiol. - 2014.

- Vol. 5. - Article 223.

295. Welch, R.A. The Escherichia coli Hemolysin / R.A. Welch // EcoSal Plus. - 2005.

- Vol. 1, No. 2. - P. 10.1128/ecosalplus.8.7.2. - doi: 10.1128/ecosalplus.8.7.2

296. Wells, J. M. Homeostasis of the Gut Barrier and Potential Biomarkers / J. M. Wells, R. J. Brummer, M. Derrien // Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol. - 2017. - Vol.

312. - P. 171-193. - URL: https://doi.org/10.1152/ajpgi.00048.2015 (date accessed: 21.07.2023).

297. Yeoman, C.J. Gastrointestinal tract microbiota and probiotics in production animals / C.J. Yeoman, B.A. White // Annu Rev Anim Biosci. - 2014. - Vol.2. - P. 469486. doi: 10.1146/annurev-animal-022513-114149

Электронные ресурсы

298. ФГБУ «Центр Агроаналитики». Интрернет-сайт: https://specagro.ru/news/202504/proizvodstvo-myasa-pticy-v-rf-v-yanvare-fevrale-vyroslo-na-27 (дата доступа: 01.12.2024).

299. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine (NCBI), BLAST. Интернет-сайт: https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/blast/treeview/treeView.cgi (дата доступа: 11.05.2023).

300. National Library of Medicine; National Institutes of Health; U.S. Department of Health and Human Services. Интернет-сайт: https://www.ncbi.nlm.nih. gov/ (дата доступа: 11.05.2023).

301. The Bacterial Diversity Database BacDive. Интернет-сайт: https://bacdive.dsmz.de/ (BacDive : the core database for prokaryotic strain data I. Schober, J. Koblitz, J. Sarda Carbasse, C. Ebeling [et al.] ) (дата доступа: 11.05.2023).

302. World Health Organization (WHO) : official website. -URL: https://www.who.int/ (дата доступа: 11.05.2023).

ПРИЛОЖЕНИЯ Приложение А

(обязательное)

Титульный и подписной лист Методических рекомендаций «Методы выделения и идентификации Escherichia albertii из патологического и клинического материала от птиц», утв. от 21.03.2025 г. ФГБУ «ВГНКИ»

Москва 2025 г.

Приложение Б

(обязательное)

Акт внедрения в деятельность основных результатов исследования изложенных в диссертационной работе

Приложение Б

(обязательное)

Таблица — Перечень питательных сред, используемых для проведения исследований

Наименование среды Область применения

Производитель Condalab, Испания

Nutrient Broth (Питательный бульон) Для культивирования неприхотливых микроорганизмов в воде, фекалиях и других материалах.

Nutrient Agar ISO (Питательный агар) Для культивирования нестойких микроорганизмов в воде, фекалиях и клинических образцах.

Sodium Selenite Broth (Бульон из селенита натрия / Селенитовый бульон) Для селективного обогащения Salmonella spp. в пищевых продуктах, кале, моче (из клинических образцов) и других материалах, имеющих санитарное значение.

Bismuth Sulfite Agar (Wilson Blair) USP (Висмут-сульфит агар / ВСА) Высокоселективная среда для выделения Salmonella spp, в частности Salmonella thyphi, из клинических образцов.

Triple Sugar Iron Agar (TSI) (Железный агар с тройным сахаром (TSI)) Для идентификации и дифференциации энтеробактерий

Irgasan Ticarcillin and Potassium Chlorate Broth (ITC) ISO (Бульон Иргасана с тикарциллином и хлоратом калия (ITC) ISO) Для селективного обогащения Yersinia enterocolitica

Yersinia Selective Agar Base (CIN) ISO (Иерсиния селективная агаровая основа (CIN) ISO) Селективная среда для Yersinia enterocolitica

TCBS Agar ISO (TCBS Агар ISO) Для селективного выделения вибрионов из различных клинических образцов и других материалов

Listeria Chromogenic Agar Base acc. to Ottaviani and Agosti (ALOA) ISO (Листериевая хромогенная агаровая основа по Оттавиани и Агости (ALOA) ISO) Селективная среда для выявления и подсчета Listeria monocytogenes.

MRS Agar (MRS агар) Для роста лактобацилл

Mueller Hinton Agar (Агар Мюллер Хинтон) Для тестов на чувствительность к антибиотикам и сульфамидам, а также для первичного выделения нейссерии и других патогенных микроорганизмов из клинических образцов

Enterococcus Selective Agar (Энтерококковый селективный агар) Селективная среда для обогащения и выделения энтерококков из различных клинических материалов и сильно загрязненных продуктов, имеющих важное санитарное значение.

Salmonella Shigella Agar (SS Agar) (Сальмонелла Шигелла Агар) Селективная среда для выделения сальмонелл и шигелл

Производитель OXOID, Великобритания

Sabouraud dextrose agar (Декстрозный агар Сабуро) Для культивирования и дифференциации грибов.

Производитель Himedia, Индия

Endo Agar (Агар Эндо, модифицированный) Для дифференциации грамотрицательных бактерий на основе ферментации лактозы с одновременным ингибированием грамположительной микрофлоры

Xylose Lysine Deoxycholate Agar (XLD Agar) (Ксилозо-лизиновый дезоксихолатный агар (XLD -агар)) модифицированный Для идентификации энтеробактерий для микробиологических исследований.

Cetrimide Agar Base (Основа агара с цетримидом) Селективная среда для выделения Pseudomonas aeruginosa из гноя, мокроты, сточных вод и др.

Sabouraud Dextrose Broth (Sabouraud Liquid Medium) (Бульон Сабуро с глюкозой) Селективное обогащение дрожжей и плесневых грибов

Baird Parker Agar Base (Основа агара Бэрда-Паркера) Селективная среда для выделения и подсчёта коагулазо-положительных стафилококков

Columbia Blood Agar Base (Основа колумбийского кровяного агара) Селективное выделение - Staphylococcus. Определение наличия гемолизинов.

Mueller Hinton Agar (Агар Мюллера-Хинтона) Определение резистентнтности к антибиотикам диско-диффузным методом.

Phenylalanine Agar (Фенилаланиновый агар) Дифференциация - Enterobacteria

MRS Agar (Агар МРС (Ман, Рогоза, Шарп)) Селективная среда, состав которой разработали де Ман, Рогосса и Шарпе (de Man, Rogossa and Sharpe), способная поддерживать хороший рост лактобацилл

Bifidobacterium Agar (Агар для бифидобактерий) Среда для выделения и культивирования бифидобактерий

Slanetz & Bartley Medium (Среда Сланеца-Бартли для энтерококков) Высокоселективная среда для выделения энтерококков

SIMMONS Citrate Agar (Цитратный агар по Симмонсу) Дифференциация грамотрицательных кишечных бактерий на основании утилизации цитрата натрия

Iron Agar (Agar Medium M) (Железо-агар с тремя сахарами (Агар М)) Дифференциация кишечных грамотрицательных энтеробактерий на основании ферментации углеводов и образования H2S.

HiCrome E.coli Agar (Хромогенный агар для обнаружения и подсчета E. coli) Агар для обнаружения и подсчета Escherichia coli в пищевых продуктах без дальнейшего подтверждения на мембранных фильтрах или реактивом на индол.

HiCrome UTI Agar (Хромогенный агар для обнаружения и подсчета уропатогенных бактерий) Дифференциации энтеробактерий

Rapid HiColiform Agar Агар для одновременного обнаружения и подтверждения общих колиформных бактерий и Escherichia coli на основе хромогенных и флуорогенных субстратов.

Производитель Merck, Германия

Simmons citrate agar (Цитратный агар Симмонса) Для идентификации энтеробактерий по способности использовать цитрат в качестве единственного источника углерода.

Baird-Parker Agar (Base) (Основа агара Бэйд-Паркера) Для выделения и подсчета коагулаз-положительных стафилококков из пищевых продуктов и других материалов

Cetrimide Agar Pseudomonas selective agar base for microbiology (acc. harm. EP/USP/JP) Для выделения и дифференциации Pseudomonas aeruginosa из различных материалов

GranuCult M.Y.P. (Mannitol Egg Yolk Polymixin) Agar base (Гранукульт® Маннитол яичный желток полимиксин агар (основа)) Для подсчета предполагаемых Bacillus cereus из пищевых продуктов и кормов для животных, а также из проб окружающей среды и других материалов.

mTSB Broth (Триптиказо-соевый бульон) Для селективного накопления энтеропатогенной E.coli (EHEC) в продуктах питания.

Fraser Broth (Base) (Бульон Фрайзера) Для первичного и вторичного обогащения, выделения и подсчета Listeria monocytogenes в пищевых продуктах и кормах для животных.

Bolton Broth Base (Бульон Болтона) Предварительное селективное обогащение Campylobacter spp.

Preston Agar Base (Агар Престона) Для селективного выделения термотолерантных кампилобактеров.

Производитель ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии» Роспотребнадзора, Россия

Питательная среда для выделения возбудителей кишечного иерсиниоза и псевдотуберкулеза сухая (Иерсиния-агар) Для применения в бактериологических исследованиях в санитарной и клинической микробиологии с целью выделения возбудителей кишечного иерсиниоза и псевдотуберкулеза при диагностике инфекционных заболеваний

Питательная среда для селективного выделения и идентификации листерий сухая (ПАЛКАМ-агар) Для выделения листерий из пищевых продуктов.

Питательная среда для выделения энтеробактерий сухая (Агар Эндо-ГРМ) Для выделения энтеробактерий из исследуемого материала и их дифференциация по способности ферментации лактозы

Питательная среда для выделения стафилококков сухая (Стафилококкагар) Для выделения стафилококков

Бульон для выделения стафилококков сухой (Солевой бульон) Для выделения стафилококков при проведении микробиологических исследований.

Среда Вильсона-Блера для бактерий, растущих в анаэробных условиях Для выявления и подсчета сульфитредуцирующих бактерий, растущих в анаэробных условиях

Селенитовый бульон Для селективного накопления сальмонелл из фекалий, мочи, воды, пищевых продуктов и т.д.

Питательный агар для выделения листерий (среда ПАЛ) Для выделения листерий из клинического материала и пищевых продуктов при их бактериологическом исследовании.

Среда для определения сульфитредуцирующих клостридий Железосульфитная среда (ЖСС) Для выявления и определения количества сульфитредуцирующих клостридий в различных видах продовольственного сырья и пищевых продуктов

Производитель ФБУН ГНЦ ПМБ, Россия

Питательная среда для идентификации энтеробактерий сухая (среда Гисса-ГРМ с глюкозой, лактозой, сахарозой, маннитом, мальтозой, инозитом, дульцитом, маннозой, галактозой, арабинозой, рамнозой, ксилозой) Для идентификации энтеробактерий по тесту ферментации одного из углеводов в санитарной и клинической микробиологии.

Производитель ООО «НПЦ «БИОКОМПАС-С», Россия