Молекулярно-генетические аспекты патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 14.03.03, кандидат медицинских наук Нечаев, Илья Николаевич

• Нечаев, Илья Николаевич
• кандидат медицинских наук
• 2013

Оглавление диссертации кандидат медицинских наук Нечаев, Илья Николаевич

Оглавление

Введение

Глава 1. Обзор Литературы

1.1 Классификация и эпидемиология отечной формы рака молочной железы

1.2 История становления ОИФРМЖ самостоятельной нозологией

1.3 Клиническая и патоморфологическая симптоматика ОИФРМЖ

1.4 Молекулярные особенности ОИФРМЖ

1.5 Диагностика ОИФРМЖ

1.6 Лечение ОИФРМЖ

Глава 2. Материалы и методы исследования

2.1 Сбор коллекционного материала

2.2 Методика подготовки образцов биопсийного материала к исследовательским испытаниям

2.3 Протокол проведения обратной транскрипции

2.4 Подбор и разработка праймеров и зондов

2.5 Колличественная ОТ-ПЦР с детекцией продуктов в режиме реального времени

2.6 Определение референсных генов для биопсий РМЖ и клеточных линий MCF7 и SK-BR-3

2.7 Проведение полногеномного транскриптомного анализа

2.8 Культивирование модельных клеточных линий MCF7 и SK-BR-3 и выделение РНК

2.9 Иммуногистохимическое исследование образцов биопсийного материала (ER, PR, HER2)

Глава 3. Определение молекулярно-генетических критериев РМЖ с помощью экспрессионного анализа

3.1 Разработка критериев определения рецепторного статуса эстрогена (ER) и прогестерона (PR) с помощью экспрессионного анализа

3.2 Разработка критериев определения рецепторного статуса эпидермального фактора роста 2 (ERBB2) с помощью экспрессионного анализа

Глава 4. Исследование молекулярно-генетических маркеров патогенеза ОИФРМЖ по данным полногеномного транскриптомного анализа

4.1 Подготовка образцов к полногеномному транскриптомному анализу

4.2 Полногеномный транскриптомный анализ

4.3 Верификация данных, полученных полногеномным транскриптомным анализом, методом количественной ОТ-ПЦР в реальном времени

Глава 5. Поиск и верификация значимых регуляторных пар микроРНК-мРНК

5.1 Анализ антикорреляционных взаимодействий микроРНК-мРНК участвующих в патогенезе ОИФРМЖ

5.2 Верификация данных по микроРНК-мРНК, полученных полногеномным транскриптомным анализом, методом количественной ОТ-ЦПР в реальном времени

Обсуждение

Выводы

Практические рекомендации

Список используемых сокращений

Список литературы

Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Молекулярно-генетические аспекты патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы»

Введение

Актуальность темы

Отечно-инфильтративная форма рака молочной железы (ОИФРМЖ, отечно-инфильтративный РМЖ, маститоподобный РМЖ, inflammatory breast cancer, IBC) относится к диффузно-распространенным формам опухолей и встречается примерно у 5% больных РМЖ [Напсе и др., 2005]. Согласно 7-ому изданию TNM классификации Международного Союза по контролю за раком к ОИФРМЖ относятся первично воспалительная форма (T4d) и вторично воспалительная (T4b) [Sinn, Helmchen, Wittekind, 2010]. Клинически ОИФРМЖ обычно проявляется быстро прогрессирующей эритемой, локальным повышением температуры, отёком и образованием «апельсиновой корки» на коже молочной железы без пальпируемого опухолевого узла в подлежащих тканях [Dirix и др., 2006], и, несмотря на высокоразвитую систему лабораторно-инструментальной диагностики, диагноз ОИФРМЖ ставится только по клиническим признакам. ОИФРМЖ характеризуется высокой злокачественностью, ранним и быстрым лимфогенным и гематогенным метастазированием, высокой летальностью. Средняя 5-летняя выживаемость при ОИФРМЖ составляет около 20% [Piras и др., 2011].

Начальные стадии ОИФРМЖ имеют схожую клиническую симптоматику с местно-воспалительными заболеваниями молочной железы (маститом, рожистым воспалением), что повышает количество ошибочных диагнозов. Стоит учесть, что для ОИФРМЖ не характерно наличие какой-либо определенной гистологической картины, ОИФРМЖ может соответствовать практически любая гистологическая форма РМЖ, что вызывает дополнительные затруднения при постановке диагноза, даже с помощью объективных (лабораторно-инструментальных) методов исследования. Визуальную картину изменения ткани железы, полученную с помощью эхографии, рентгеновской маммографии, компьютерной томографии и магнитно-резонансной томографии при ОИФРМЖ можно интерпретировать по-разному [Сарибекян и др., 2011]. При ОИФРМЖ

первостепенной задачей является своевременная дифференциальная диагностика. Необходимо тщательное исследование региональных лимфоузлов, наличие метастазов в которых в сочетании с клиническими изменениями в молочной железе подтверждает диагноз ОИФРМЖ, однако данный тип диагностики нельзя считать объективным, что требует поиска объективных молекулярно-генетических показателей, способных отличить ОИФРМЖ от других форм РМЖ и от других местно-воспалительных заболеваний молочной железы. На сегодняшний день необходимо добиться, чтобы любые подозрительные случаи подлежали биопсийному исследованию. При клинической картине, схожей с ОИФРМЖ, следует добиваться точного диагноза в связи с тяжелыми последствиями ошибки и несвоевременного диагностирования. К сожалению, на сегодняшний день дифференциальная диагностика ОИФРМЖ с маститом может быть достоверно проведена только после трех месяцев наблюдения. К этому моменту у трети пациентов развиваются отдалённые метастазы [УатаисЫ и др., 2012]. В большинстве случаев ОИФРМЖ хорошо отвечает на химиотерапию, однако этот факт диссонирует с наличием высокого показателя рецидивирования [Моп1а§па и др., 2008]. Необходимы точные показатели для ранней дифференциальной диагностики и прогнозирования ответа ОИФРМЖ на терапию.

Постановка правильного и своевременного диагноза ОИФРМЖ на сегодняшний день не гарантирует безрецидивного исхода данного заболевания. Поэтому с каждым днем все больше внимания уделяется молекулярно-генетическим особенностям ОИФРМЖ. Молекулярные характеристики помогут упростить процедуру диагностики данного заболевания и определить план лечения, а также определить направление для разработки целевой терапии для данной опухоли. Для подбора подходящего плана терапии необходимо знать этиологию и патокинез той формы заболевания, с которой приходится сталкиваться. Большинство авторов указывает, что информации о рецепторном статусе (эстрогеновый, прогестероновый и НЕЯ2/пеи) опухоли в случае с ОИФРМЖ недостаточно, так как данный тип опухоли не имеет характерных

особенностей рецепторного статута, свойственных для других форм РМЖ [ВегШсЫ и др., 2010]. С помощью экспериментальных моделей (клеточные линии 8ЦМ149 и 811М190) удалось выявить несколько аберрантно-активированных сигнальных путей, включающих гены АЯНС и Ц'НРЗ, ассоциированных с инвазивностью и метастатической активностью ОИФРМЖ [К1еег и др., 2004].

В большинстве случаев при ОИФРМЖ нет четко отграниченного, определяемого пальпаторно и на маммограмме опухолевого узла. Отсутствие опухолевого узла сильно повышает шанс забора неракового материала при трепанобиопсии молочной железы. Это значит, что при анализе опухолевого материала доля раковых клеток может быть невелика. Данный факт затрудняет проведение молекулярно-биологических исследований ОИФРМЖ. Перед исследователями долгое время стояла проблема анализа большого числа молекулярных показателей в ограниченном количестве опухолевых клеток, что характерно для ОИФРМЖ, однако данную ситуацию позволило разрешить появление микрочиповых технологий. С их помощью были установлены молекулярные подтипы неотечных форм РМЖ, что значительно повысило эффективность диагностики и подбора терапии [Реггеагё и др., 2006], а также было проведено несколько микрочиповых исследований на образцах ОИФРМЖ, для которых была показана вовлеченность отдельных сосудистых факторов роста и определена повышенная лимфогенная и ангиогенная активность ОИФРМЖ в сравнении с другими формами РМЖ [Вегйюс1 и др., 2010; Воегата и др., 2008]. Однако стоит отметить, что эти исследования были проведены на образцах, неподверженных химиотерапии, что является существенным минусом, так как при ОИФРМЖ внимание врачей-онкологов приковано именно к высокой частоте рецидивирования и низкой выживаемости при ОИФРМЖ. Поэтому изучение лидирующих патогенетических связей в опухоли необходимо проводить на материале после химиотерапевтического лечения, ведь именно область, резистентная к терапии, в будущем даст узлы метастазирования и именно информация о резистентных опухолевых образованиях сможет дать ответ о патогенетических процессах, вовлеченных в функционирование ОИФРМЖ.

Стоит отметить, что в современном учении о патогенезе, особенно в области опухолевых образований появляется все больше сообщений о важности единовременного изучения молекулярно-генетических и эпигенетических особенностей [Wang и др., 2009]. Это показывает, что изучение молекулярно-генетических особенностей патогенеза в отрыве от эпигенетический регуляции должно быть сведено к минимуму. Важно отметить, что аналогичного исследования на примере ОИФРМЖ в мировой науке проведено не было.

Все вышесказанное подводит нас к тому, что на данный момент одной из первостепенных задач специалистов, занимающихся патогенетическими особенностями ОИФРМЖ, остается идентификация специфических изменений в сигнальных путях, которые приводят к развитию ОИФРМЖ, для эффективной дифференциальной диагностики в независимости от особенностей течения и этапа ОИФРМЖ, а также для тактически верного своевременного назначения лечения, что обуславливает высокую актуальность проводимой работы.

Разработанность темы исследования диссертации

В современной науке разработаны определенные предпосылки для формирования патогенетических основ ОИФРМЖ. Существенный вклад в становление ОИФРМЖ как самостоятельной нозологической единицы внесли работы патоморфологов 19 века и начала 20 века [Bell, 1809; Bryant, 1889; Lee, Tannenbaum, 1924; Leitch, 1909]. Работы данных авторов содержат историю развития ОИФРМЖ как самостоятельного заболевания от момента описания первых симптомов до выделения его в отдельную нозологическую единицу.

Целый ряд работ второй половины 20 века был посвящен проблемам разработки различных путей терапии и диагностики ОИФРМЖ [Bonnier и др., 1995; Kleer, Golen van, Merajver, 2000; Levine и др., 1985; Lucas, Perez-Mesa, 1978; Tabbane и др., 1977].

В последние годы активно изучались фундаментальные основы патогенетических механизмов ОИФРМЖ [Bertucci и др., 2004; Bertucci и др., 2012; Dressman и др., 2006; Laere Van и др., 2005; Laere Van и др., 2007; Laere Van

и др., 2006; Laere Van и др., 2013]. Активно проводилось изучение характерных особенностей рецепторных статусов ОИФРМЖ (рецепторы эстрогена, прогестерона, HER2/neu) [Напсе и др., 2005; Iwamoto и др., 2011; Jaiyesimi, Buzdar, Hortobagyi, 1992; McCarthy и др., 2002]. На сегодняшний день большинство работ показывает отсутствие характерных особенностей рецепторного статута ОИФРМЖ.

В настоящее время появление отёка кожи и молочной железы при ОИФРМЖ связывают с бурной инвазией и эмболией раковыми клетками лимфатических сосудов, блоком оттока лимфы из ткани молочной железы [Le и др., 2005; Robbins и др., 1974; Wang, Griscom, 1966]. Однако единого мнения на этот счет нет. Другая группа исследователей считает, что причина развития отёка - это высокий темп роста опухоли, ведущий к нарушению микроциркуляторного обмена продуктов метаболизма [Lee, Tannenbaum, 1924; Tabbane и др., 1977; Tabbane и др., 1989].

В значительной части большинство вышеперечисленных исследований охватывают только процессы, показывающие, что ОИФРМЖ является высокозлокачественной, высокопролиферерирующей опухолью с активным лимфо- и гематогенным метастазированием, не учитывая сигнальные пути, ответственные за зарождение и развитие ОИФРМЖ, а также не рассматривая вклад эпигенетической регуляции в патогенез ОИФРМЖ.

На сегодняшний день одной из главных задач специалистов занимающихся патогенетическими особенностями ОИФРМЖ - идентифицировать специфические изменения в сигнальных путях, которые приводят к развитию ОИФРМЖ, для эффективной дифференциальной диагностики в независимости от особенностей течения и этапа ОИФРМЖ и для тактически верного своевременного назначения лечения.

Цель исследования

Изучение патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы на молекулярно-генетическом уровне.

Задачи исследования

1. Сформировать коллекцию биопсий рака молочной железы и разработать принципы скринингового диагностического исследования биоптатов рака молочной железы на основе их экспрессионного анализа.

2. Исследовать молекулярно-генетические особенности патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы по результатам полногеномного транскриптомного профилирования.

3. Выявить дифференциально-экспрессированные мРНК при отечно-инфильтративной форме рака молочной железы и подтвердить результаты с помощью количественной ОТ-ПЦР в реальном времени.

4. Выявить наиболее характерные для отечно-инфильтративной формы рака молочной железы микроРНК и осуществить биоинформационный поиск их потенциальных мишеней.

Научная новизна

Впервые исследована одна из систем эпигенетической регуляции патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы - регуляторные микроРНК.

Впервые исследованы особенности патогенеза отечно-инфильтративной формы рака молочной железы по результатам полногеномного транскриптомного профилирования ткани опухоли в сочетании с одновременной характеристикой транскриптома микроРНК.

Впервые разработаны принципы скринингового диагностического исследования биоптатов рака молочной железы на основе экспрессионного анализа рецепторов к эстрогену, прогестерону и эпидермальному фактору роста 2.

Теоретическая значимость

Исследование новых молекулярно-генетических аспектов в патогенезе воспалительной формы рака молочной железы позволит приблизиться к пониманию механизмов патогенеза данной формы рака. Полученные данные об аберрантно-активных сигнальных путях при ОИФРМЖ вносят важный вклад в понимание этиологии и патогенеза заболевания и являются основанием для разработки новых патогенетически обоснованных молекулярно-направленных методов её терапии. Материалы исследования могут быть использованы в научно-исследовательских центрах медико-биологического профиля.

Практическая значимость

Разработанные принципы скринингового диагностического исследования биоптатов рака молочной железы на основе экспрессионного анализа рецепторов к эстрогену, прогестерону и эпидермальному фактору роста 2 могут быть реализованы в качестве нового эффективного метода диагностики ОИФРМЖ в клинической практике, что будет способствовать повышению точности диагностики на ранних этапах заболевания.

Методы исследования

В ходе исследования были применены различные молекулярно-генетические методы, позволившие определить основные молекулярно-генетически аспекты патогенеза ОИФРМЖ: выделение тотальной РНК из образцов биопсий, качественная и количественная проверка полученной РНК, подбор праймеров и зондов для соответствующих генов, постановка количественной ОТ-ЦПР в реальном времени, проведение полногеномного транскриптомного анализа на современной технологической платформе А1¥уте1:пх, культивирование клеточных линий 8К-ВЯ-3 и МСБ7, выделение мРНК из клеточных линий, создание нормировочной модели на основе клеточных линий БК-ВК-З и МСР7.

Основные положения, выносимые на защиту

1. Разработанная экспрессионная методика типирования РМЖ по основным молекулярно-генетическим параметрам: для рецепторов эстрогена, прогестерона и эпидермального фактора роста 2, - может быть применена в клинико-лабораторной практике как скрининговый метод совместно с иммуногистохимическим исследованием, что повысит чувствительность и специфичность определения данных рецепторов.

2. Гены ERBB2IP, IGF2, TGFB2, IL20, OLFM4, PROM1, CCL28, C4or/7, FLRT3, MUC15 участвуют в патогенезе ОИФРМЖ.

3. В основе патогенеза ОИФРМЖ лежат нарушения в следующих патофизиологических процессах: регуляция воспаления, миграционный и адгезионный процессы.

4. В регуляцию патогенеза ОИФРМЖ вовлечены микроРНК mir-26b, mirlet-7аЗ, mir-331, находящиеся в антикорреляционной связи с соответствующими мРНК мишенями: GSR, IGF2, KIF23.

Список публикаций

По материалам диссертации опубликовано 9 работ, в том числе 4 тезиса докладов на конференциях, из которых две международные, 4 статьи в рецензируемых научно-практических биолого-медицинских журналах, рекомендованных ВАК, и подана одна заявка на Патент №2012146626 «Способ анализа онкологических заболеваний молочной железы и набор для его осуществления».

Апробация и внедрение результатов

Основные результаты работы доложены на Всероссийской научной конференции молодых ученых-медиков «Инновационные технологии в медицине XXI века», VIII Международной заочной научно-практической конференции

«Научная дискуссия: вопросы медицины», Всероссийской научной конференции молодых ученых-медиков 2012 года, Международной научной конференции студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2013».

Апробация диссертации состоялась на межлабораторной конференции ФГБУ «Научно-исследовательский институт общей патологии и патофизиологии» РАМН 16 апреля 2013 г.

Структура и объем диссертации

Диссертация состоит из введения, обзора литературы, описания материалов и методов исследования, изложения собственных результатов, их обсуждения, выводов и списка литературы. Работа изложена на 126 страницах машинописного текста, содержит 13 рисунков и 19 таблиц. Список литературы включает 174 источника.

Заключение диссертации по теме «Патологическая физиология», Нечаев, Илья Николаевич

Выводы

В результате полногеномного транскриптомного профилирования установлены патогенетически значимые дифференциально-экспрессированные при ОИФРМЖ гены: ERBB2IP, IGF2, TGFB2, IL20, OLFM4 PROM1, CCL28, C4orf7, FLRT3, MUC157.

Установлено, что в основе патогенеза ОИФРМЖ лежат изменения функционирования патофизиологических процессов, регулирующих воспаление, миграцию и адгезию.

По результатам биоинформационного анализа и данным полногеномного транскриптомного профилирования ткани опухоли при ОИФРМЖ выявлена группа дифференциально-экспрессированных микроРНК: mir-26b, mirlet-7a3, mir-331, - которые находятся в антикорреляционном взаимодействии с соответствующими мРНК-мишенями: GSR, IGF2, KIF23.

Проведенная верификация с помощью количественной ОТ-ПЦР в реальном времени показала, что дифференциально-экспрессированные мРНК и микроРНК достоверно соответствуют данным полногеномного транскриптомного анализа.

В целях повышения эффективности диагностики ОИФРМЖ целесообразно исследовать методом количественной ОТ-ПЦР в реальном времени уровень экспрессии генов рецепторов эстрогена, прогестерона и эпидермального фактора роста 2 в ткани опухоли.

Практические рекомендации

1. Разработанные принципы скринингового диагностического исследования биоптатов рака молочной железы на основе экспрессионного анализа рецепторов к эстрогену, прогестерону и эпидермальному фактору роста 2 могут быть реализованы в качестве нового эффективного метода диагностики ОИФРМЖ в клинической практике, что будет способствовать повышению точности диагностики на ранних этапах заболевания.

2. Для ранней дифференциальной диагностики с неотечными формами рака молочной железы рекомендуется использовать измерение экспрессионного уровня генов ERBB2IP, IGF2, TGFB2, IL20, OLFM4 PROM1, OLFM4, C4orf7, FLRT3, MUC15.

3. При разработке новых патогенетически обоснованных молекулярно-направленных методов терапии ОИФРМЖ учесть вклад в патогенез сигнальных путей, ответственных за воспаление, хемотаксис и адгезионный процесс.

Список используемых сокращений

БМ - биологический материал;

ИГХ - иммуногистохимия;

МикроРНК - микрорибонуклеиновая кислота; мРНК - матричная рибонуклеиновая кислота;

ОИФРМЖ - отечно-инфильтративная форма рака молочной железы; ОТ-ПЦР - полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией; ПЦР - полимеразная цепная реакция;

ПЦР-РВ - полимеразная цепная реакция в реальном времени;

РМЖ - рак молочной железы;

РНК - рибонуклеиновая кислота;

РЭФР - рецептор эпидермального фактора роста;

ЭФР - эпидермальный фактор роста;

ER - estrogen receptors (рецепторы эстрогена);

ERBB - семейство генов, кодирующих рецепторы эпидермального фактора роста;

HER2 - мембранный белок, тирозиновая протеинкиназа семейства рецептора эпидермального фактора роста EGFR/ERBB, кодируемый геном человека ERBB2;

IBC - отечная форма рака молочной железы (inflammatory breast cancer); PR - progesterone receptors (рецепторы прогестерона); RNA - ribonucleic acid (рибонуклеиновая кислота); RQI - RNA Quality Index (индекс качества РНК);

TNM - международная классификация стадий развития раковых опухолей (tumor, nodus и metastasis); tPA - tissue plasminogen activator (активатор плазминогена тканевого типа) uPA - urokinase plasminogen activator (активатор плазминогена урокиназного типа). из

Список литературы диссертационного исследования кандидат медицинских наук Нечаев, Илья Николаевич, 2013 год

Список литературы

1. Бассалык Л., Кузьмина 3., Муравьева Н. Содержание рецепторов эстрадиола-17Р, прогестерона и глюкокортикоидов у больных доброкачественными заболеваниями молочной железы // Вопросы онкологии. 1982. Т. 28. №7. С. 3-6.

2. Берштейн Л. Гормональный канцерогенез // Природа. 2000. № 3. С. 1-9.

3. Галицкий В.А. Канцерогенез и механизмы внутриклеточной передачи сигналов // Вопросы онкологии. 2003. Т. 49. № 3. С. 278-293.

4. Геннис Р. Биомембраны: Молекулярная структура и функции. Москва: Мир, 1997.

5. Герштейн Е., Кушлинский Н. Клинические перспективы исследования системы активации плазминогена при раке молочной железы // Вестник Российской академии медицинских наук. 1999. № 8. С. 58-61.

6. Ильичева Т. и др. Содержание рецепторов прогестерона, глюкокортикоидов и глицирризиновой кислоты в опухолевой и нормальной ткани молочной железы человека // Вопросы онкологии. 1998. Т. 44. № 4. С. 390^4.

7. Крайнова H.A. и др. Оценка потенциальных референсных генов для нормализации данных ПЦР-РВ в экспериментах с клетками линии HeLa // Биотехнология. 2013. Т. 1. С. 42-50.

8. Кушлинский Н., Герштейн Е. Современные возможности молекулярно-биохимических методов оценки биологического «поведения» рака молочной железы // Вестник Российской академии медицинских наук. 2001. № 9. С. 65-70.

9. Сарибекян Э.К. и др. Особенности диагностики при подозрении на диффузную форму рака молочной железы // Радиация и Риск. 2011. Т. 8. № 499. С. 64—70.

10. Сарибекян Э.К. и др. Диагностика отечной формы рака молочной железы // Якутский Медицинский Журнал. 2012. Т. 3. С. 49-52.

11. Тупицын H.H. и др. Иммуноморфологическая диагностика микрометастазов рака молочной железы в костный мозг // Опухоли Женской Репродуктивной Системы. 2001. Т. 1. С. 70-73.

12. Цырлина Е., Гамаюнова В., Порошина Т. Гормонально-метаболический статус больных раком молочной железы,подвергшихся сохранной операции: сопоставление с известными прогностическими критериями // Вопросы онкологии. 1999. Т. 45. № 3. С. 261-4.

13. Шкурников М.Ю. и др. Роль пептидогликан-распознающих белков в механизмах врождённого иммунитета//Биотехнология. 2013. Т. 1. С. 26-32.

14. Яшин Д. и др. JIAK клетки убивают Fas раковые клетки с помощью комплекса белков Tag7/Hsp70, секретируемого из аппарата Гольджи // Доклады Академии наук. 2004. Т. 395. С. 132-134.

15. Adams J. и др. Vascular endothelial growth factor (VEGF) in breast cancer: comparison of plasma, serum, and tissue VEGF and microvessel density and effects of tamoxifen. // Cancer Res. 2000. T. 60. № 11. C. 2898-905.

16. Andreasen P.A. и др. Plasminogen activator inhibitors: hormonally regulated serpins. // Mol. Cell. Endocrinol. 1990. T. 68. № 1. C. 1-19.

17. Anne N., Pallapothu R. Lymphoma of the breast: a mimic of inflammatory breast cancer. // World J. Surg. Oncol. 2011. T. 9. C. 125.

18. Ashburner M. и др. Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. // Nat. Genet. 2000. T. 25. № 1. C. 25-9.

19. Auwera I. Van der и др. Increased angiogenesis and lymphangiogenesis in inflammatory versus noninflammatory breast cancer by real-time reverse transcriptase-PCR gene expression quantification. // Clin. Cancer Res. 2004. T. 10. № 23. C. 796571.

20. Bast R.C. и др. 2000 update of recommendations for the use of tumor markers in breast and colorectal cancer: clinical practice guidelines of the American Society of Clinical Oncology. // J. Clin. Oncol. 2001. T. 19. № 6. C. 1865-78.

21. Bekhouche I. и др. High-resolution comparative genomic hybridization of inflammatory breast cancer and identification of candidate genes. // PLoS One. 2011. T. 6. № 2. C. el6950.

22. Bell C. A system of operative surgery, founded on the basis of anatomy. London: Longman, Hurst, Rees, Orme, and Brown, 1809.

23. Benjamini Y. Controlling the False Discovery Rate : A Practical and Powerful Approach to Multiple Testing // J. R. Stat. Soc. 2009. T. 57. № 1. C. 289-300.

24. Benraad T.J. и др. Immunoassays (ELISA) of urokinase-type plasminogen activator (uPA): report of an EORTC/BIOMED-1 workshop. // Eur. J. Cancer. 1996. T. 32A. № 8. C. 1371-81.

25. Bergman D. и др. Insulin-Like Growth Factor 2 in Development and Disease: A Mini-Review. // Gerontology. 2012.

26. Berstein L. h Study of hormone-metabolic status in patients with receptor-negative tumors of the breast and endometrium // Probl. Oncol. 2003. T. 49. № 6. C. 716-24.

27. Bertucci F. h flp. Gene expression profiling for molecular characterization of inflammatory breast cancer and prediction of response to chemotherapy. // Cancer Res. 2004. T. 64. № 23. C. 8558-65.

28. Bertucci F. h ap- Gene expression profiling of inflammatory breast cancer. // Cancer. 2010. T. 116. № 11 Suppl. C. 2783-93.

29. Bertucci F. h flp. Microarray Analysis Identifies an Expression Signature for Inflammatory Breast Cancer // Inflammatory Breast Cancer: An Update / no,a pe^. N.T. Ueno, M. Cristofanilli. Dordrecht: Springer Netherlands, 2012. C. 243-258.

30. Bieche I. h Ap- Molecular profiling of inflammatory breast cancer: identification of a poor-prognosis gene expression signature. // Clin. Cancer Res. 2004. T. 10. №20. C. 6789-95.

31. Boersma B.J. h ^p. A stromal gene signature associated with inflammatory breast cancer. // Int. J. Cancer. 2008. T. 122. № 6. C. 1324-32.

32. Bonnier P. h ,fl,p. Age as a prognostic factor in breast cancer: relationship to pathologic and biologic features. // Int. J. Cancer. 1995. T. 62. № 2. C. 138-44.

33. Brankovic-Magic M. h ^p. Progesterone receptor status of breast cancer metastases. // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2002. T. 128. № 1. C. 55-60.

34. Breslauer K.J. h Ap. Predicting DNA duplex stability from the base sequence // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1986. T. 83. № 11. C. 3746-3750.

35. Bryant T. The diseases of the breast. : Wood's Medical and Surgical Monographs, 1889.

36. Chamadol W., Pesie M., Puapairoj A. Inflammatory carcinoma of the breast in a 12-year-old Thai girl. // J. Med. Assoc. Thai. 1987. T. 70. № 9. C. 543-8.

37. Chang S. h Inflammatory breast carcinoma incidence and survival: the surveillance, epidemiology, and end results program of the National Cancer Institute, 1975-1992. // Cancer. 1998. T. 82. № 12. C. 2366-72.

38. Chatterjee N. h up. Histone deacetylase inhibitors modulate miRNA and mRNA expression, block metaphase, and induce apoptosis in inflammatory breast cancer cells. // Cancer Biol. Ther. 2013. T. 14. № 7. C. 658-71.

39. Cianfrocca M., Gradishar W. New molecular classifications of breast cancer. 11CA. Cancer J. Clin. 2009. T. 59. № 5. C. 303-13.

40. Colpaert C.G. h aP- Inflammatory breast cancer shows angiogenesis with high endothelial proliferation rate and strong E-cadherin expression. // Br. J. Cancer. 2003. T. 88. № 5. C. 718-25.

41. Cuoghi A. h ap. Role of proteomics to differentiate between benign and potentially malignant pancreatic cysts. // J. Proteome Res. 2011. T. 10. № 5. C. 2664— 70.

42. Dairkee S.H. h flp. Immunolocalization of a human basal epithelium specific keratin in benign and malignant breast disease. // Breast Cancer Res. Treat. 1987. T. 10. № 1. C. 11-20.

43. Dieffenbach C.W., Lowe T.M., Dveksler G.S. General concepts for PCR primer design. // PCR Methods Appl. 1993. T. 3. № 3. C. S30-S37.

44. Dirix L.Y. h flp. Inflammatory breast cancer: current understanding. // Curr. Opin. Oncol. 2006. T. 18. № 6. C. 563-71.

45. Dressman H.K. h ,ap. Gene expression profiles of multiple breast cancer phenotypes and response to neoadjuvant chemotherapy. // Clin. Cancer Res. 2006. T. 12. № 3 Pt 1. C. 819-26.

46. Duffy M.J. Biochemical markers in breast cancer: which ones are clinically useful? // Clin. Biochem. 2001. T. 34. № 5. C. 347-52.

47. EBCTCG. Effects of chemotherapy and hormonal therapy for early breast cancer on recurrence and 15-year survival: an overview of the randomised trials. // Lancet. 2005. T. 365. № 9472. C. 1687-717.

48. Ferrara N. The role of VEGF in the regulation of physiological and pathological angiogenesis. // EXS. 2005. № 94. C. 209-31.

49. Gentleman R.C. h ,a,p. Bioconductor: open software development for computational biology and bioinformatics. // Genome Biol. 2004. T. 5. № 10. C. R80.

50. Giordano S.H. Update on Locally Advanced Breast Cancer // Oncologist. 2003. T. 8. № 6. C. 521-530.

51. Giordano S.H., Hortobagyi G.N. Inflammatory breast cancer: clinical progress and the main problems that must be addressed. // Breast Cancer Res. 2003. T. 5. № 6. C. 284-8.

52. Golen K.L. van h ,np. A novel putative low-affinity insulin-like growth factor-binding protein, LIBC (lost in inflammatory breast cancer), and RhoC GTPase correlate with the inflammatory breast cancer phenotype. // Clin. Cancer Res. 1999. T. 5. № 9. C. 2511-9.

53. Grace W.R., Cooperman A.M. Inflammatory breast cancer. // Surg. Clin. North Am. 1985. T. 65. № 1. C. 151-60.

54. Groep P. van der h ap. Molecular profile of ductal carcinoma in situ of the breast in BRCA1 and BRCA2 germline mutation carriers. // J. Clin. Pathol. 2009. T. 62. № 10. C. 926-30.

55. Grover P.K., Hardingham J.E., Cummins A.G. Stem cell marker olfactomedin 4: critical appraisal of its characteristics and role in tumorigenesis. // Cancer Metastasis Rev. 2010. T. 29. № 4. C. 761-75.

56. Gruber C.J. h «p. Anatomy of the estrogen response element. // Trends Endocrinol. Metab. 2004. T. 15. № 2. C. 73-8.

57. Haagensen C.D. Inflammatory carcinoma, disease of the breast. : Philadelphia, PA, 1971.

58. Hance K.W. h ap. Trends in inflammatory breast carcinoma incidence and survival: the surveillance, epidemiology, and end results program at the National Cancer Institute. // J. Natl. Cancer Inst. 2005. T. 97. № 13. C. 966-75.

59. Harris A.L. Anti-angiogenesis therapy and strategies for integrating it with adjuvant therapy. // Recent Results Cancer Res. 1998. T. 152. C. 341-52.

60. Hayes D.F., Picard M.H. Heart of darkness: the downside of trastuzumab. // J. Clin. Oncol. 2006. T. 24. № 25. C. 4056-8.

61. Hellemans J. h flp. qBase relative quantification framework and software for management and automated analysis of real-time quantitative PCR data. // Genome Biol. 2007. T. 8. № 2. C. R19.

62. Hirko K. a h AP- Characterizing inflammatory breast cancer among Arab Americans in the California, Detroit and New Jersey Surveillance, Epidemiology and End Results (SEER) registries (1988-2008). // Springerplus. 2013. T. 2. № 1. C. 3.

63. Holland P.A. h #p. Assessment of hormone dependence of comedo ductal carcinoma in situ of the breast. // J. Natl. Cancer Inst. 1997. T. 89. № 14. C. 1059-65.

64. Hou T. h ap. Atypical chemokine receptors predict lymph node metastasis and prognosis in patients with cervical squamous cell cancer. // Gynecol. Oncol. 2013. T. 130. № 1. C. 181-7.

65. Hsu S.-D. h AP- miRTarBase: a database curates experimentally validated microRNA-target interactions. // Nucleic Acids Res. 2011. T. 39. № Database issue. C. D163-9.

66. Hu Z. h Ap. The molecular portraits of breast tumors are conserved across microarray platforms. // BMC Genomics. 2006. T. 7. C. 96.

67. Huang D.W., Sherman B.T., Lempicki R.A. Systematic and integrative analysis of large gene lists using DAVID bioinformatics resources. // Nat. Protoc. 2009. T. 4. № l.C. 44-57.

68. Ireland H.E. h AP- Measuring the secretion of heat shock proteins from cells. // Methods. 2007. T. 43. № 3. C. 176-83.

69. Iwamoto T. h AP- Different gene expressions are associated with the different molecular subtypes of inflammatory breast cancer. // Breast Cancer Res. Treat. 2011. T. 125. № 3. C. 785-95.

70. Jaiyesimi I. a, Buzdar a U., Hortobagyi G. Inflammatory breast cancer: a review. // J. Clin. Oncol. 1992. T. 10. № 6. C. 1014-24.

71. Jarvinen T.A. h AP- Expression of topoisomerase Ilalpha is associated with rapid cell proliferation, aneuploidy, and c-erbB2 overexpression in breast cancer. // Am. J. Pathol. 1996. T. 148. № 6. C. 2073-82.

72. Kaptain S., Tan L.K., Chen B. Her-2/neu and breast cancer. // Diagn. Mol. Pathol. 2001. T. 10. № 3. C. 139-52.

73. Kauraniemi P. h AP- Amplification of a 280-kilobase core region at the ERBB2 locus leads to activation of two hypothetical proteins in breast cancer. // Am. J. Pathol. 2003. T. 163. № 5. C. 1979-84.

74. Kauraniemi P., Kallioniemi A. Activation of multiple cancer-associated genes at the ERBB2 amplicon in breast cancer. // Endocr. Relat. Cancer. 2006. T. 13. № 1. C. 39^9.

75. Kleer C.G. h Ap. Persistent E-cadherin expression in inflammatory breast cancer. // Mod. Pathol. 2001. T. 14. № 5. C. 458-64.

76. Kleer C.G. h Ap- WISP3 and RhoC guanosine triphosphatase cooperate in the development of inflammatory breast cancer. // Breast Cancer Res. 2004. T. 6. № 1. C. R110-5.

77. Kleer C.G., Golen K.L. van, Merajver S.D. Molecular biology of breast cancer metastasis. Inflammatory breast cancer: clinical syndrome and molecular determinants. // Breast Cancer Res. 2000. T. 2. № 6. C. 423-9.

78. Kopantzev E.P. h ap. Differences in gene expression levels between early and later stages of human lung development are opposite to those between normal lung tissue and non-small lung cell carcinoma. // Lung Cancer. 2008. T. 62. № 1. C. 23-34.

79. Kraus M.H. h ap. Overexpression of the EGF receptor-related proto-oncogene erbB-2 in human mammary tumor cell lines by different molecular mechanisms. // EMBO J. 1987. T. 6. № 3. C. 605-10.

80. Kufe D.W. Mucins in cancer: function, prognosis and therapy. // Nat. Rev. Cancer. 2009. T. 9. № 12. C. 874-85.

81. Laakso M. h ,n,p. Basoluminal carcinoma: a new biologically and prognostically distinct entity between basal and luminal breast cancer. // Clin. Cancer Res. 2006. T. 12. № 14 Pt 1. C. 4185-91.

82. Laere S. Van h flp. Distinct molecular signature of inflammatory breast cancer by cDNA microarray analysis. // Breast Cancer Res. Treat. 2005. T. 93. № 3. C. 23746.

83. Laere S. Van h ap. Distinct molecular phenotype of inflammatory breast cancer compared to non-inflammatory breast cancer using Affymetrix-based genome-wide gene-expression analysis. // Br. J. Cancer. 2007. T. 97. № 8. C. 1165-74.

84. Laere S.J. Van h ap. Nuclear factor-kappaB signature of inflammatory breast cancer by cDNA microarray validated by quantitative real-time reverse transcription-PCR, immunohistochemistry, and nuclear factor-kappaB DNA-binding. // Clin. Cancer Res. 2006. T. 12. № 11 Pt 1. C. 3249-56.

85. Laere S.J. Van h Ap. Uncovering the Molecular Secrets of Inflammatory Breast Cancer Biology: An Integrated Analysis of Three Distinct Affymetrix Gene Expression Datasets. // Clin. Cancer Res. 2013. T. 19. № 17. C. 4685-4696.

86. Lai Z.W. h ap. Cytokine gene expression during ontogeny in murine thymus on activation of the aryl hydrocarbon receptor by 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin. // Mol. Pharmacol. 1997. T. 52. № 1. C. 30-7.

87. Le M.G. h ,a,p. Dermal lymphatic emboli in inflammatory and noninflammatory breast cancer: a French-Tunisian joint study in 337 patients. // Clin. Breast Cancer. 2005. T. 6. № 5. C. 439^15.

88. Lee B.J., Tannenbaum N.E. Inflammatory carcinoma of the breast: a report of twenty- eight cases from the breast clinic of the Memorial Hospital // Surg. Gynecol. Obstet. 1924. T. 39. C. 580-95.

89. Leitch A. Peau d'orange in acute mammary carcinoma: its cause and diagnostic value. // Lancet. 1909. T. 174. № 4490. C. 861-863.

90. Lerebours F. h Ap. Two prognostic groups of inflammatory breast cancer have distinct genotypes. // Clin. Cancer Res. 2003. T. 9. № 11. C. 4184-9.

91. Levine P.H. h AP- Inflammatory breast cancer: the experience of the surveillance, epidemiology, and end results (SEER) program. // J. Natl. Cancer Inst. 1985. T. 74. № 2. C. 291-7.

92. Linderholm B. h Ap- p53 and vascular-endothelial-growth-factor (VEGF) expression predicts outcome in 833 patients with primary breast carcinoma. // Int. J. Cancer. 2000. T. 89. № 1. C. 51-62.

93. Lipinski S. h AP- RNAi screening identifies mediators of NOD2 signaling: implications for spatial specificity of MDP recognition. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2012. T. 109. № 52. C. 21426-31.

94. Liu C. h Ap- Peptidoglycan recognition proteins: a novel family of four human innate immunity pattern recognition molecules. // J. Biol. Chem. 2001. T. 276. № 37. C. 34686-94.

95. Low J. a h AP- Long-term follow-up for locally advanced and inflammatory breast cancer patients treated with multimodality therapy. // J. Clin. Oncol. 2004. T. 22. № 20. C. 4067-74.

96. Lucas F. V, Perez-Mesa C. Inflammatory carcinoma of the breast. // Cancer. 1978. T. 41. № 4. C. 1595-605.

97. Mahooti S. h Ap- Breast carcinomatous tumoral emboli can result from encircling lymphovasculogenesis rather than lymphovascular invasion. // Oncotarget. 2010. T. 1. № 2. C. 131^17.

98. Malzahn K. h AP- Biological and prognostic significance of stratified epithelial cytokeratins in infiltrating ductal breast carcinomas. // Virchows Arch. 1998. T. 433. №2. C. 119-29.

99. McCarthy N.J. h AP- Microvessel density, expression of estrogen receptor alpha, MIB-1, p53, and c-erbB-2 in inflammatory breast cancer. // Clin. Cancer Res. 2002. T. 8. № 12. C. 3857-62.

100. McDonald C. h AP- A role for Erbin in the regulation of Nod2-dependent NF-kappaB signaling. // J. Biol. Chem. 2005. T. 280. № 48. C. 40301-9.

101. McGuire W.L. Hormone receptors: their role in predicting prognosis and response to endocrine therapy. // Semin. Oncol. 1978. T. 5. № 4. C. 428-33.

102. Mignatti P., Rifkin D.B. Plasminogen activators and matrix metalloproteinases in angiogenesis. // Enzyme Protein. 1996. T. 49. № 1-3. C. 117-37.

103. Moghal N., Sternberg P.W. Multiple positive and negative regulators of signaling by the EGF-receptor. // Curr. Opin. Cell Biol. 1999. T. 11. № 2. C. 190-6.

104. Moll R. h ap. The catalog of human cytokeratins: patterns of expression in normal epithelia, tumors and cultured cells. // Cell. 1982. T. 31. № 1. C. 11-24.

105. Moll U.M., Riou G., Levine a J. Two distinct mechanisms alter p53 in breast cancer: mutation and nuclear exclusion. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992. T. 89. № 15. C. 7262-6.

106. Montagna E. h £p. Factors that predict early treatment failure for patients with locally advanced (T4) breast cancer. // Br. J. Cancer. 2008. T. 98. № 11. C. 174552.

107. Mullins M. h Ap. Agreement in breast cancer classification between microarray and quantitative reverse transcription PCR from fresh-frozen and formalin-fixed, paraffin-embedded tissues. // Clin. Chem. 2007. T. 53. № 7. C. 1273-9.

108. Nguyen D.M. h flp. Molecular heterogeneity of inflammatory breast cancer: a hyperproliferative phenotype. // Clin. Cancer Res. 2006. T. 12. № 17. C. 5047-54.

109. Nichini F.M. Inflammatory Carcinoma of the Breast in a 12-Year-Old Girl // Arch. Surg. 1972. T. 105. № 3. C. 505.

110. Nielsen T.O. h ap. Immunohistochemical and clinical characterization of the basal-like subtype of invasive breast carcinoma. // Clin. Cancer Res. 2004. T. 10. № 16. C.5367-74.

111. Nigro J.M. h Ap. Mutations in the p53 gene occur in diverse human tumour types. // Nature. 1989. T. 342. № 6250. C. 705-8.

112. Nolan T., Hands R.E., Bustin S.A. Quantification of mRNA using real-time RT-PCR. // Nat. Protoc. 2006. T. 1. № 3. C. 1559-82.

113. Oestergaard M.Z. h aP- Interactions between genes involved in the antioxidant defence system and breast cancer risk. // Br. J. Cancer. 2006. T. 95. № 4. C. 525-31.

114. Ogata S. h j,p. TGF-beta signaling-mediated morphogenesis: modulation of cell adhesion via cadherin endocytosis. // Genes Dev. 2007. T. 21. № 14. C. 1817-31.

115. Oka H. h ,a,p. Expression of E-cadherin cell adhesion molecules in human breast cancer tissues and its relationship to metastasis. // Cancer Res. 1993. T. 53. № 7. C.1696-701.

116. Parker J.S. h ap. Supervised risk predictor of breast cancer based on intrinsic subtypes. // J. Clin. Oncol. 2009. T. 27. № 8. C. 1160-7.

117. Pauletti G. h /jp. Assessment of methods for tissue-based detection of the HER-2/neu alteration in human breast cancer: a direct comparison of fluorescence in situ hybridization and immunohistochemistry. // J. Clin. Oncol. 2000. T. 18. № 21. C. 3651-64.

118. Perou C.M. h flp. Molecular portraits of human breast tumours. // Nature. 2000. T. 406. № 6797. C. 747-52.

119. Perreard L. h £p. Classification and risk stratification of invasive breast carcinomas using a real-time quantitative RT-PCR assay. // Breast Cancer Res. 2006. T. 8. № 2. C. R23.

120. Piccart-Gebhart M.J. h /tp. Trastuzumab after adjuvant chemotherapy in HER2-positive breast cancer. // N. Engl. J. Med. 2005. T. 353. № 16. C. 1659-72.

121. Piras F. h ^p. Nestin expression associates with poor prognosis and triple negative phenotype in locally advanced (T4) breast cancer // Eur. J. Histochem. 2011. T. 55. № 4. C. 215-220.

122. Prat A. h ap. Phenotypic and molecular characterization of the claudin-low intrinsic subtype of breast cancer. // Breast Cancer Res. 2010. T. 12. № 5. C. R68.

123. Press M.F. h AP- Evaluation of HER-2/neu gene amplification and overexpression: comparison of frequently used assay methods in a molecularly characterized cohort of breast cancer specimens. // J. Clin. Oncol. 2002. T. 20. № 14. C. 3095-105.

124. Rakha E.A. h ^p. Expression profiling technology: its contribution to our understanding of breast cancer. // Histopathology. 2008. T. 52. №> 1. C. 67-81.

125. Reese D.M., Slamon D.J. HER-2/neu signal transduction in human breast and ovarian cancer. // Stem Cells. 1997. T. 15. № 1. C. 1-8.

126. Riou G. h ,qp. Poor prognosis of p53 gene mutation and nuclear overexpression of p53 protein in inflammatory breast carcinoma. // J. Natl. Cancer Inst. 1993. T. 85. № 21. C. 1765-7.

127. Robbins G.F. h ,a,p. Inflammatory carcinoma of the breast. // Surg. Clin. North Am. 1974. T. 54. № 4. C. 801-10.

128. Rosa F.E. h flp. Quantitative real-time RT-PCR and chromogenic in situ hybridization: precise methods to detect HER-2 status in breast carcinoma. // BMC Cancer. 2009. T. 9. C. 90.

129. Rouzier R. h AP- Breast cancer molecular subtypes respond differently to preoperative chemotherapy. // Clin. Cancer Res. 2005. T. 11. № 16. C. 5678-85.

130. Sahlberg K.K. h ap. The HER2 amplicon includes several genes required for the growth and survival of HER2 positive breast cancer cells. // Mol. Oncol. 2012. C. 110.

131. Salven P. h ,a,p. Serum VEGF levels in women with a benign breast tumor or breast cancer. // Breast Cancer Res. Treat. 1999. T. 53. № 2. C. 161-6.

132. Sashchenko L.P. h £p. Peptidoglycan recognition protein tag7 forms a cytotoxic complex with heat shock protein 70 in solution and in lymphocytes. // J. Biol. Chem. 2004. T. 279. № 3. C. 2117-24.

133. Sashchenko L.P. h ap. Cytotoxic T lymphocytes carrying a pattern recognition protein Tag7 can detect evasive, HLA-negative but Hsp70-exposing tumor cells, thereby ensuring FasL/Fas-mediated contact killing. // Blood. 2007. T. 110. № 6. C.1997-2004.

134. Schmitt M. h flp. Clinical impact of the plasminogen activation system in tumor invasion and metastasis: prognostic relevance and target for therapy. // Thromb. Haemost. 1997. T. 78. № 1. C. 285-96.

135. Shatalov Y. V h AP- HSP70 forms a stable cytotoxic complex with Tag7/PGRP-S. // Dokl. Biol. Sci. 2004. T. 395. C. 169-72.

136. Silver N. h /jp- Selection of housekeeping genes for gene expression studies in human reticulocytes using real-time PCR. // BMC Mol. Biol. 2006. T. 7. C. 33.

137. Sinn H.-P., Helmchen B., Wittekind C.H. [TNM classification of breast cancer: changes and comments on the 7th edition]. // Pathologe. 2010. T. 31. № 5. C. 361-6.

138. Slamon D.J. h ,ztp. Use of chemotherapy plus a monoclonal antibody against HER2 for metastatic breast cancer that overexpresses HER2. // N. Engl. J. Med. 2001. T. 344. № 11. C. 783-92.

139. Smyth G.K. Linear models and empirical bayes methods for assessing differential expression in microarray experiments. // Stat. Appl. Genet. Mol. Biol. 2004. T. 3. C. Article3.

140. Sorlie T. h Ap. Repeated observation of breast tumor subtypes in independent gene expression data sets. // Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003. T. 100. № 14. C. 8418-23.

141. Soufi F.G. h AP- Long-term exercise training affects age-induced changes in HSP70 and apoptosis in rat heart. // Gen. Physiol. Biophys. 2008. T. 27. № 4. C. 26370.

142. Staaf J. h AP- High-resolution genomic and expression analyses of copy number alterations in HER2-amplified breast cancer. // Breast Cancer Res. 2010. T. 12. № 3. C. R25.

143. Suh H.-S. h aP- Insulin-like growth factor 1 and 2 (IGF1, IGF2) expression in human microglia: differential regulation by inflammatory mediators. // J. Neuroinflammation. 2013. T. 10. № 1. C. 37.

144. Suzuki T., Higgins P.J., Crawford D.R. Control selection for RNA quantitation. // Biotechniques. 2000. T. 29. № 2. C. 332-7.

145. Tabbane F. h AP- Clinical and prognostic features of a rapidly progressing breast cancer in Tunisia. // Cancer. 1977. T. 40. № 1. C. 376-82.

146. Tabbane F. h AP- Inflammatory symptoms in breast cancer. Correlations with growth rate, clinicopathologic variables, and evolution. // Cancer. 1989. T. 64. № 10. C. 2081-9.

147. Tan-Chiu E. h AP- Assessment of cardiac dysfunction in a randomized trial comparing doxorubicin and cyclophosphamide followed by paclitaxel, with or without trastuzumab as adjuvant therapy in node-positive, human epidermal growth factor receptor 2-overexpressing breast can // J. Clin. Oncol. 2005. T. 23. № 31. C. 7811-9.

148. Tang X. Tumor-associated Macrophages as Potential Diagnostic and Prognostic Biomarkers in Breast Cancer. // Cancer Lett. 2013.

149. Taylor S.L. h AP- Cytoplasmic staining of c-erbB-2 is not associated with the presence of detectable c-erbB-2 mRNA in breast cancer specimens. // Int. J. Cancer. 1998. T. 76. № 4. C. 459-63.

150. Tomlinson J.S., Alpaugh M.L., Barsky S.H. An intact overexpressed E-cadherin/alpha,beta-catenin axis characterizes the lymphovascular emboli of inflammatory breast carcinoma. // Cancer Res. 2001. T. 61. № 13. C. 5231-41.

151. Tonevitsky E.A. h Ap. Changed profile of splicing regulator genes expression in response to exercise. // Bull. Exp. Biol. Med. 2009. T. 147. № 6. C. 7336.

152. Tukey J. Exploratory Data Analysis - Reading- Addison-Wesley // 1977. C.

153. Vandesompele J. h /jp. Accurate normalization of real-time quantitative RT-PCR data by geometric averaging of multiple internal control genes. // Genome Biol. 2002. T. 3. № 7. C. RESEARCH0034.

154. Vergoulis T. h AP- TarBase 6.0: capturing the exponential growth of miRNA targets with experimental support. // Nucleic Acids Res. 2012. T. 40. № Database issue. C. D222-9.

155. Victor B.C. h Ap. Inhibition of cathepsin B activity attenuates extracellular matrix degradation and inflammatory breast cancer invasion. // Breast Cancer Res. 2011. T. 13. № 6. C. R115.

156. Vries T.J. de, Muijen G.N. van, Ruiter D.J. The plasminogen activation system in tumour invasion and metastasis. // Pathol. Res. Pract. 1996. T. 192. № 7. C. 718-33.

157. Wang C. h flp. C4orf7 contributes to ovarian cancer metastasis by promoting cancer cell migration and invasion. // Oncol. Rep. 2010. T. 24. № 4. C. 933-9.

158. Wang C.C., Griscom N.T. Radiotherapy for inflammatory carcinoma of the breast. // Male Nurses. J. 1966. T. 110. C. 13-4.

159. Wang L. h ap. Gene networks and microRNAs implicated in aggressive prostate cancer. // Cancer Res. 2009. T. 69. № 24. C. 9490-7.

160. Wedam S.B. h ,np. Antiangiogenic and antitumor effects of bevacizumab in patients with inflammatory and locally advanced breast cancer. // J. Clin. Oncol. 2006. T. 24. № 5. C. 769-77.

161. Weigelt B. h AP- Molecular portraits and 70-gene prognosis signature are preserved throughout the metastatic process of breast cancer. // Cancer Res. 2005. T. 65. № 20. C. 9155-8.

162. Weigelt B. h a p. Breast cancer molecular profiling with single sample predictors: a retrospective analysis. // Lancet Oncol. 2010. T. 11. № 4. C. 339-49.

163. Wingo P. a h Ap. Population-based statistics for women diagnosed with inflammatory breast cancer (United States). // Cancer Causes Control. 2004. T. 15. № 3. C. 321-8.

164. Wolff A.C. h American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists guideline recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 testing in breast cancer. // Arch. Pathol. Lab. Med. 2007. T. 131. № 1. C. 1843.

165. Woodward W. a h ,ap. Genomic and expression analysis of microdissected inflammatory breast cancer. // Breast Cancer Res. Treat. 2013. C. 761-772.

166. Wu M. h flP- Development and characterization of a novel method for the analysis of gene expression patterns in lymphatic endothelial cells derived from primary breast tissues. // J. Cancer Res. Clin. Oncol. 2010. T. 136. № 6. C. 863-72.

167. Xiao F. h ap. miRecords: an integrated resource for microRNA-target interactions. // Nucleic Acids Res. 2009. T. 37. № Database issue. C. D105-10.

168. Xiao Y. h ,np. The lymphovascular embolus of inflammatory breast cancer expresses a stem cell-like phenotype. // Am. J. Pathol. 2008. T. 173. № 2. C. 561-74.

169. Xiao Y. h pp. The lymphovascular embolus of inflammatory breast cancer exhibits a Notch 3 addiction. // Oncogene. 2011. T. 30. № 3. C. 287-300.

170. Yamamoto T., Iriyama K., Araki T. Male inflammatory breast cancer. // Surg. Today. 1997. T. 27. № 7. C. 669-71.

171. Yamauchi H. h flp. Inflammatory breast cancer: what we know and what we need to learn. // Oncologist. 2012. T. 17. № 7. C. 891-9.

172. Yang Y.H., Speed T.P. Design and Analysis of Comparative Microarray Experiments // Comparative Microarray Experements / no,a, pe^. T.P. Speed. : Chapman & Hall/CRC, 2003. C. 35-92.

173. Zell J. a h flp. Prognostic impact of human epidermal growth factor-like receptor 2 and hormone receptor status in inflammatory breast cancer (IBC): analysis of 2,014 IBC patient cases from the California Cancer Registry. // Breast Cancer Res. 2009. T. 11. № l.C. R9.

174. Zhuo W. h ap. The CXCL12-CXCR4 chemokine pathway: a novel axis regulates lymphangiogenesis. // Clin. Cancer Res. 2012. T. 18. № 19. C. 5387-98.