Аллельный и гаплотипический полиморфизм локусов MICA/MICB, гаплотипы MIC~HLA-B~HLA-C у доноров гемопоэтических стволовых клеток, русских тема диссертации и автореферата по ВАК РФ 00.00.00, кандидат наук Вавилов Михаил Николаевич
Вавилов Михаил Николаевич
кандидат наук
2025
- Специальность ВАК РФ00.00.00
- Количество страниц 112
Оглавление диссертации кандидат наук Вавилов Михаил Николаевич
ВВЕДЕНИЕ
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Общая характеристика, строение и функции MIC
1.1.1. Доменная структура MIC
1.1.2. Экспрессия и распределение продуктов MIC
1.2. Генетическая структура MIC, генетический полиморфизм
1.2.1. Полиморфизм внешних доменов молекул MICA и MICB
1.2.2. Функциональный диморфизм MICA в позиции
1.2.3. Полиморфизм трансмембранной области молекул MICA и секреторный эффект при шеддинге
1.2.4. Нулевой гаплотип MICA-del~MICBN
1.2.5. Эволюция MIC
1.3. Участие MIC в посттрансплантационных осложнениях при трансплантации гемопоэтических стволовых клеток гематологическим больным
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
2.1. Контингент обследуемых лиц
2.2. Молекулярно-генетическое типирование
2.3. Статистическая обработка результатов
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ
ОБСУЖДЕНИЕ
3.1. Аллельный, трансмембранный и функциональный полиморфизм генов MICA и MICB у потенциальных доноров ГСК русской национальности
3.1.1. Частоты генов MICA у потенциальных доноров ГСК
3.1.2. Частоты генов MICB у потенциальных доноров ГСК
3.1.3. Функциональный диморфизм MICA-129 (rs1051792) Met/Val у потенциальных доноров ГСК русской национальности
3.1.4. Трансмембранный полиморфизм MICA-TM у потенциальных доноров ГСК русской национальности
3.2. Двух-, трех- и четырехлокусные гаплотипы на основании сочетаний генов MICA, MICB, HLA-B, HLA-C у потенциальных доноров ГСК
3.2.1. Гаплотипы HLA-B~MICA у потенциальных доноров ГСК русской национальности
3.2.2. Гаплотипы HLA-B~MICA-129 у доноров ГСК русской национальности
3.3. Аллельный, трансмембранный MICA-TM и функциональный MICA-129 (rs1051792) полиморфизм локуса MICA русских, потенциальных доноров ГСК Челябинской области, в сравнении с мировыми популяциями
3.3.1. Частоты генов MICA в различных популяциях Европы, Азии и Африки
3.3.2. Генетические расстояния между популяциями Челябинской области и популяциями Европы, Азии и Африки
3.3.3. Кластерный анализ методом К-средних для мировых
популяций
Европы, Азии и Африки
3.3.4. Построение дендрограммы на основании попарных
генетических
дистанций между популяциями Европы, Азии и Африки
3.3.5. Диаграмма рассеяния методом MDS на основании генетических дистанций популяций Европы, Азии и Африки
3.3.6. Распределение частот генов трансмембранного полиморфизма MICA-TM и функционального диморфизма MICA-129
у русских Челябинской области в контексте мировых популяций
3.3.7. Сравнение частот аллельных вариантов локуса MICB в русской популяциях, с данными мировых популяций
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
Приложение А. Анкета участника иммуногенетического исследования
Приложение Б. Аллельный полиморфизм MICA на уровне белковых продуктов
на момент проведения исследования 2019 г
Приложение В
Частоты генов MICA, вошедших в исследование мировых популяций Европы,
Азии и Африки
Приложение Г
Частоты генов трансмембранного полиморфизма MICA-TM и функционального
диморфизма MICA-129, вошедших в исследование мировых популяций Европы,
Азии и Африки
Приложение Д
Аллельный, трансмембранный и функциональный полиморфизмы локуса MICA с
указанием наиболее сцепленных гаплотипов HLA-C~HLA-B~MICA
Приложение Е
Частоты самых распространенных и устойчивых гаплотипов MICA~MICA-
TM~MICA-129~HLA-B~HLA-C у русских Челябинской области
Приложение Ж
Дендрограмма на основании попарных генетических дистанций между популяцией русских Челябинской области и популяциями Европы, Азии и
Африки
Приложение И
Многомерное шкалирование по двум осям для 30 популяций
Рекомендованный список диссертаций по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Аллельный и гаплотипический полиморфизм HLA-генов доноров гемопоэтических стволовых клеток регистра, самоопределившихся как русские2022 год, кандидат наук Леонов Евгений Андреевич
Иммуногенетический профиль популяций Челябинской области (русские, татары, башкиры, нагайбаки) в структуре мировых популяций2014 год, кандидат наук Чернова, Мария Сергеевна
Биологические аспекты формирования регистра потенциальных неродственных доноров гемопоэтических стволовых клеток в Российской Федерации2021 год, доктор наук Логинова Мария Александровна
Полиморфизм генов системы HLA II класса малой народности нагайбаков, проживающих в Челябинской области2022 год, кандидат наук Зарипова Ольга Николаевна
Влияние несоответствия HLA аллелей I и II класса донора и реципиента на исход аллогенных неродственных трансплантаций костного мозга2015 год, кандидат наук Кузьмич, Елена Витальевна
Введение диссертации (часть автореферата) на тему «Аллельный и гаплотипический полиморфизм локусов MICA/MICB, гаплотипы MIC~HLA-B~HLA-C у доноров гемопоэтических стволовых клеток, русских»
Актуальность темы исследования
Снижение риска посттранплантационных осложнений при ТГСК, и в частности, реакции трансплантат против хозяина (РТПХ), достигается более полным совпадением пары донор - реципиент по генетической системе HLA. В настоящее время совместимость донора по генам гистосовместимости определяется по меньшей мере по 5 локусам HLA (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1). Но даже при соблюдении таких строгих условий соответствия пары донор - реципиент по 10 генам из 10, частота РТПХ у пациентов после ТГСК остается значительной [19, 81].
В ряде исследований обнаружено, что несоответствие по генам MIC (MICA и MICB), расположенных в регионе MHC I, при подборе донора для трансплантации ГСК значительно увеличивает частоту тяжелой степени острой и хронической РТПХ [41, 93, 112, 123, 166]. Для уменьшения риска таких осложнений один из крупнейших мировых регистров - Немецкий регистр DKMS - уже включил ти-пирование по локусам MICA и MICB в рутинную программу генотипирования потенциальных доноров ГСК. В опубликованном отчете в 2020 году, они сообщили уже о более чем двух миллионах образцов, генотипированых по этим генам [95].
Белки MIC представляют собой стресс-индуцированные молекулы, связанные с мембраной клеток эпителиального происхождения. Они и действуют как лиганд для активирующего рецептора NKG2D, экспрессируемого на поверхности практически всех естественных киллеров человека (NK), Т-лимфоцитов CD8+ и у5Т-лимфоцитов [40].
Известно 7 локусов MIC, из которых только гены MICA и MICB кодируют белковые продукты и обладают существенным аллельным полиморфизмом. Обнаружено 280 вариантов аллелей на уровне белковых продуктов в локусе MICA и около 50 в локусе MICB, и число вновь открытых аллелей продолжает увеличиваться [87]. Существенный аллельный полиморфизм локусов MICA/B и их расположение в регионе HLA предполагает наличие этнических различий в частотах
аллелей MICA и MICB, а также в неравновесном сцеплении и в частотах гаплоти-пов HLA-MIC.
Помимо существенного аллельного полиморфизма, ген MICA имеет микро-сателлитный полиморфизм триплетных повторов (GCT)n в трансмембранной области экзона 5. Этот вид полиморфизма состоит из аллелей с различным повторением GCT в трансмембранном регионе, обозначенных как A4, A5, A6, A7, A8, A9, A10. Особое значение имеет группа аллелей A5.1, продукты которой с гораздо большей вероятностью высвобождаются в составе экзосом, тем самым, вызывая системное подавление рецептора NKG2D на эффекторных клетках. Поскольку высокие уровни растворимых форм MICA и MICB (sMICA/B) обнаруживаются при различных видах онкологических заболеваний, в том числе у онкогематоло-гических больных, считается, что слущивание белков MIC является одной из причин ускользания опухоли от иммунного ответа [24]. Таким образом, sMICA/B являются важным фактором патогенеза онкогематологических заболеваний и могут влиять на развитие посттрансплантационных осложнений. Наличие у реципиента варианта MICAA5.1 в гетерозиготном состоянии связано с повышенной вероятностью РТПХ после ТГСК [22].
В последние годы всесторонне изучается другой важный полиморфизм MICA, так называемый, функциональный диморфизм MICA-129 Met/Val, кодируемый SNP rs1051792 в положении 454, поскольку он разделяет все аллели MICA на аллели, кодирующие продукт, связывающийся с NKG2D-рецептором с низкой (Val) и высокой (Met) аффинностью [89]. Обнаружено, что несовпадение при подборе пары донор - реципиент по функциональным диморфным вариантам MICA-129 повышает риск острой РТПХ при ТГСК [88].
Таким образом, изучение аллельного полиморфизма MICA/MICB, различных полиморфных вариантов MICA - MICA-TM и MICA-129 у потенциальных доноров ГСК русской национальности и установление вариантов генетических сцеплений с классическими локусами представляется актуальной задачей.
Степень разработанности научной темы
В настоящий момент происходит накопление данных по распределению частот генов MICA и MICB мировых популяциях различного происхождения: европейского [79], азиатского [164] и африканского [159] происхождения. Показано наличие региональных и этнических различий в профиле MIC. Однако, наличие и конкретные варианты сцепления данных локусов, как в общей популяции русских, так и среди доноров ГСК до настоящего времени не установлены [5, 6, 7]. Так как русские - это основной этнос Российской Федерации, численность которого составляет 111,016 млн человек, что составляет около 80% населения страны (соответственно 2,830 млн и 81.41% населения Челябинской области) [1], наше исследование направлено на установление профиля генов MIC именно у русских. Результаты нашего исследования могут быть использованы для оценки уровня вероятных расхождений в локусе MICA при подборе пары донор - реципиент по классическим локусам HLA, для оптимизации подбора донора неродственной ТГСК, снижения риска потенциальных посттрансплантационных осложнений.
Цель исследования
Охарактеризовать аллельный, трансмембранный и функциональный полиморфизм неклассических локусов MICA и MICB у потенциальных доноров гемопоэ-тических стволовых клеток русской национальности, проживающих в Челябинской области, и установить параметры неравновесного сцепления с ближайшими классическими генами HLA-B, HLA-C для улучшения качества подбора пар донор-реципиент при проведении неродственной ТГСК и снижения риска возникновения РТПХ.
Задачи исследования
1. Установить частоты генов аллельных вариантов гена MICA и MICB у потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток русской национальности, проживающих в Челябинской области.
2. Установить частоты генов микросателлитного полиморфизма трансмембранного участка MICA-TM и функционального диморфизма MICA-129 этих же доноров.
3. Определить вариабельные гаплотипы генов MIC с ближайшими классическими генами HLA-B, HLA-C с высокой вероятностью несоответствия по аллель-ному и функциональному полиморфизму MICA-129.
4. Провести сравнительный филогенетический популяционный анализ иммуно-генетического профиля локуса MICA у потенциальных доноров ГСК русской национальности Челябинской области с мировыми популяциями.
Научная новизна
Впервые получены данные по распределению частот генов аллельного, трансмембранного и функционального полиморфизмов локусов MICA и MICB у потенциальных доноров ГСК русской национальности, проживающих в Челябинской области. Впервые проведен расчет генов MICA и MICB, в составе двух-, трех-, и четырехлокусных гаплотипов с ближайшими локусами HLA I класса HLA-B и HLA-C у потенциальных доноров ГСК русской национальности. Впервые рассчитаны генетические расстояния, произведено дендрологическое филогенетическое исследование с построением графика рассеяния методом MDS по частотам генов локуса MICA русских доноров Челябинской области и 29 мировых популяций.
Теоретическая и практическая значимость работы
В работе дана подробная характеристика аллельного полиморфизма, трансмембранного полиморфизма и функционального диморфизма аллельных вариантов локусов MIC у русских доноров регистра ГСК. Информация о генетическом профиле популяций по локусам MIC в различных регионах России и подходы в анализе HLA-гаплотипов могут быть востребованы при создании Федерального регистра доноров костного мозга и ГСК ФМБА России. Данные о частотах двух-локусных гаплотипов HLA-B~MICA, могут быть использованы для оценки уровня вероятных расхождений в локусе MICA при подборе пары донор - реципиент по классическим локусам HLA для трансплантации ГСК. Это позволит обеспечить более полную совместимость и осуществить более точный и специфический подбор доноров для нуждающихся в пересадке стволовых клеток костного мозга, снижая риск отторжения трансплантата по неклассическим локусам HLA.
Кроме того, результаты данной работы могут быть востребованы в исследованиях по научным направлениям: «Популяционная иммуногенетика», «Онкоим-мунология», «Репродуктивная иммунология». Данные, полученные автором, могут стать частью направления исследований «HLA и болезнь» в качестве контрольной группы сравнения. Аллельный полиморфизм локусов MIC может быть инструментом филогенетического анализа в популяционных иммуногенетических исследованиях.
Методология и методы исследования
В работе рассчитаны частоты антигенов (Ax/ pf) и генов (Px/ gf) MICA и MICB, рассчитаны частоты и основные параметры неравновесного сцепления (D, D\ X2) двух-, трех- и четырехлокусных гаплотипов локусов MIC с ближайшими генами HLA-B, HLA-C при помощи специализированной компьютерной программы для популяционных исследований Arlequin 3.5.
Произведено филогенетическое исследование методом Neighbor-Joining (NJ) с построением дендрограммы, рассчитаны генетические расстояния (по Нею) между популяцией русских Челябинской области и 29 мировыми популяциями, построен график рассеяния на основании генетических дистанций частот генов MICA, используя метод MDS с привлечением данных кластерного анализа методом К-средних.
Положения, выносимые на защиту
1. Установленные 16 аллельных вариантов локуса MICA и 10 вариантов локуса MICB у потенциальных доноров ГСК русской национальности, проживающих в Челябинской области, относятся к широко распространенными и наиболее часто встречающимися во всех мировых популяциях. Распределение частот генов ал-лельных, трансмембранных вариантов локуса MICA, функционального диморфизма MICA-129 и аллельных вариантов локуса MICB сопоставимо с общеевропейскими тенденциями распределения частот генов MICA и MICB.
2. Локусы MICA и HLA-B у доноров ГСК русской национальности, проживающих в Челябинской области, имеют самое большое число гаплотипов с высокими показателями неравновесного сцепления среди всех сочетаний локусов MICA, MICB, HLA-B, HLA-C.
3. Наличие межпопуляционных отличий в частотах генов MIC и гаплотипов MIC~HLA указывает на необходимость учитывать национальность донора и пациента при подборе донора для неродственной ТГКС для снижения вероятности несовпадения по полиморфным локусам MICA/MICB и уменьшения риска развития РТПХ.
Апробация результатов
Результаты исследования представлены на отечественных и зарубежных конференциях в форме устных докладов, тезисов и стендовых докладов. На оте-
чественных конференциях: «XVII Всероссийская конференция с международным участием «Иммунологические чтения в г. Челябинске»» (Челябинск, 2022); «VIII Всероссийская научно-практическая конференция с международным участием «Актуальные проблемы иммуногенетики в трансплантации гемопоэтических стволовых клеток, тканей и органов»» (Санкт-Петербург, 2023). Участие в «9-й международной летней школе по Иммуногенетике» (Виктор Харбор, Южная Австралия, 2012). Участие в 4-х зарубежных конгрессах под эгидой Европейской федерации иммуногенетики (EFI): 26th Liverpool, UK, 2012; 33th Lisbon, Portugal, 2019; 34th Glasgow, UK, 2021; 35th Amsterdam, Netherlands, 2022.
Соискатель является победителем Губернаторского конкурса исследовательских проектов аспирантов и молодых ученых 2008 года («Распределение ал-лельных вариантов MICB у представителей различных этнических групп Челябинской области»); Исполнитель по гранту РФФИ № 15-04-05176 «Гаплотипы HLA в основных популяциях Южного Урала (русские, татары, башкиры, нагайба-ки)», руководитель Суслова Т.А. (2015).
Соответствие диссертации паспорту научной специальности
Содержание диссертации и результаты проведённого исследования полностью соответствуют паспорту специальности 3.1.28 «Гематология и переливание крови» п. 8.
Внедрение результатов исследования в практику
100 представителей популяции русских, протипированных в ходе исследования по генам MICA и MICB, были включены в состав базы данных потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови», который стал частью «Федерального регистра доноров костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток, донорского костного мозга и гемопоэтических стволовых клеток, реципиентов костного мозга и гемо-
поэтических стволовых клеток» ФМБА России. Результаты работы внедрены в учебный процесс кафедры микробиологии, иммунологии и общей биологии ФГБОУ ВО «ЧелГУ»: дисциплины «Этногеномика и геногеография».
Публикации
Всего по теме диссертационного исследования опубликовано 18 работ: 4 статьи опубликовано в журналах, входящих в перечень ВАК для публикации основных научных результатов диссертаций, 3 статьи опубликованы в журналах, входящих в международные рецензируемые базы данных и системы цитирования (Scopus, Web of Science), 7 - в зарубежных научных изданиях, 2 - в материалах всероссийских, 6 - в материалах международных конференций.
Объем и структура диссертации
Диссертация изложена на 112 страницах и состоит из введения, глав «Обзор литературы», «Материалы и методы исследования», «Результаты собственных исследований», заключения, выводов, списка сокращений и списка литературы, включающего 172 источников, в том числе 15 отечественных и 157 зарубежных источников. Работа иллюстрирована 14 рисунками, содержит 14 таблиц.
Глава 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 1.1. Общая характеристика, строение и функции М1С
Отторжение трансплантата после аллотрансплантации привело к пониманию того, что организмы живых существ обладают способностью различать «своё» и «не своё» [13]. В результате обширных исследований на мышах был выявлен участок генома, ответственный за отторжение трансплантата, идентифицированный как главный комплекс гистосовместимости (МНС). Область МНС содержит многочисленные полиморфные и мультикопийные гены, которые играют важную роль не только в гистосовместимости тканей, но и в других первичных функциях иммунной системы, обеспечивающих защиту от патогенов [12]. Первые продукты МНС были обнаружены на поверхности лейкоцитов, и первоначально МНС человека называли комплексом человеческих лейкоцитарных антигенов (НЬЛ). Гены МНС человека подразделяются на три больших класса: МНС класс I, II и III. Гены МНС класса I (НЬЛ-Л, -В и -О) и класса II (HLA-DR, -DQ и -DP) кодируют анти-генпрезентирующие молекулы, которые экспрессируются на антигенпрезентиру-ющих клетках и стимулируют СЭ8 + и СЭ4 + Т клетки соответственно.
Белки МНС класса III расположенного центрального представляют собой разнообразную группу молекул, которые выполняют различные иммунные функции в организме, такие как белки комплемента, участвующие в реакции антител, и воспалительные цитокины [86].
Помимо антигенпрезентирующих молекул МНС, которые известны как классические молекулы МНС, ряд генов МНС кодируют, так называемые, неклассические молекулы, которые структурно родственны классическим молекулам, но не представляют антигены. Неклассические молекулы МНС класса II (^А^Ы и -DO) регулируют редактирование и загрузку пептидов на классические молекулы МНС класса II [38]. Основные локусы, входящие в МНС регион, представлены на Рисунке 1.
Рисунок 1 - Основные локусы, входящие в MHC регион (HLA Nomenclature:
http://hla.alleles.org)
Однако в 1994 году независимо двумя группами исследователей был идентифицирован новый набор локусов, расположенных в регионе I класса MHC, каждая группа предложила свое название для вновь открытых локусов: Leelayuwat предложили свое название PERB11 - транскриптом 11 бета-блока Перта [102], а Бахрам и его коллеги [28] предложили утвержденное впоследствии номенклатурным комитетом Всемирной организации здравоохранения общепринятое название MIC - гены с MHCI классом Связанные [28, 102, 149].
Рисунок 2 -Локусы семейства ULBP и MIC
В отличие от классических молекул HLA, эти белки не участвуют в презентации антигена Т-клеткам и действуют как лиганды для активирующего рецептора естественных киллеров (NKG2D), который экспрессируется на NK-клетках, ав-Т-клетках (CD8+) и у5-Т-клетках. Взаимодействие белков MIC с NKG2D приводит к активации антигенспецифической цитотоксичности, опосредованной Т-лимфоцитами, ответам NK-клеток и продукции цитокинов [151]. Помимо семейства MIC в дальнейшем было обнаружено еще одно семейство связанных с мем-
бранной, стресс-индуцибельных, сигнальных молекул ULBP, которые так же выступают в качестве лиганда для NKG2D [65]. Однако, MICA и MICB обладают гораздо более выраженным аллельным полиморфизмом, что сближает их с классическими антигенами MHC. Всего область MHC человека охватывает 3,6 Mb на коротком плече хромосомы 6 и содержит 224 локуса [86, 157]. Сравнение основных характеристик молекул семейства ULBP и MIC представлены на рисунке 2.
Гены MIC расположены в области MHC I класса на центромерном конце хромосомы 6 p21.3, центромерно по отношению к локусу HLA-B на расстоянии всего 46,4 т. п. н., и такая непосредственная близость между локусами MIC и HLA-B приводит к сильно выраженному эффекту неравновесного сцепления между ними [140].
К настоящему времени описано всего семь членов семейства MIC, из которых только два экспрессируемых MICA и MICB являются функциональными генами, тогда как пять локусов MICC, MICD, MICE, MICF, MICG являются псевдогенами [30, 86, 157].
1.1.1. Доменная структура MIC
Доменная структура MIC очень похожа на структуру классических молекул HLA класса I с 30%-й гомологией последовательностей и тремя внеклеточными доменами, имеют шесть экзонов, разделенных пятью интронами, из которых первый является самым большим интроном. Домен al кодируется экзоном 2, а2 - экзоном 3, a3 - экзоном 4, трансмембранная область (ТМ) - экзоном 5, а карбоксиконцевой ци-топлазматический хвост - экзоном 6. [30]. Ген MICA охватывает область размером 11,7 т. п. н. и транскрибируется в мРНК размером 1382 п. н., что дает полипептиды из 383 аминокислот с молекулярной массой 43 кДа, включая лидерный пептид [28]. Полипептиды MICA и MICB имеют 84% гомологии аминокислотных последовательностей. Последовательности, ортологичные MIC, сохраняются в геномах всех исследованных видов млекопитающих, за исключением грызунов [72].
Первоначально предполагаемая роль MICA в связывании пептидов и представлении антигена, основанная на сходстве доменов, была отвергнута. В отличие
от молекул HLA I класса, MICA не связывает р2-микроглобулин (р2-ш) и не зависят от какого-либо транспортно-ассоциированного протеина (ТАП) [102, 74]. Попытки выявить пептиды, связанные с MICA, не увенчались успехом.
Открытие кристаллической структуры MICA в результате сотрудничества между группами Strong и Spies дополнительно выявило основу функционального различия между MICA и его классическими аналогами класса I [103]. Дополнительными характеристиками этих молекул являются семь или восемь ^-связанных сайтов гликозилирования, уникальные трансмембранные и цитоплазматические хвостовые последовательности, три дополнительных остатка цистеина в доменах 1 и 3 и отсутствие всех аминокислотных остатков, участвующих в связывании CD8+. В предполагаемых интерфейсах взаимодействия с р2-ш некоторые аминокислотные остатки вступают в противоречие со структурой р2-ш и препятствуют связыванию между молекулами [103]. Структура молекул MICA очень похожа на молекулы HLA класса I, однако одна из спиралей, определяющих связывающие бороздки, не упорядочена и гибка, что делает ее непригодной для связывания пептидов [75]. Кроме того, в отличие от молекул HLA I класса, платформа, образованная al- и а2-областями молекулы MICA, направлена вниз к клеточной мембране под углом 113,5°, тем самым, обнажая свою нижнюю сторону в межклеточное пространство [103]. Однако, когда MICA находится в комплексе со своим рецептором NKG2D, гибкая спираль a2 упорядочивается еще двумя альфа-спиральными витками и домены a1-a2 переворачивается назад на 96,8° в комплексе лиганд-рецептор, указывая на то, что линкер между платформой и ножкой a3 также является гибким [104].
1.1.2. Экспрессия и распределение продуктов MIC
Гены MIC функционально экспрессируются у различных приматов и, предположительно, у большинства других млекопитающих [147].
В отличие от повсеместной экспрессии классических молекул HLA класса I, белки MIC имеют ограниченное распределение в тканях, конститутивно экспрес-сируясь в основном на клетках эпителиального происхождения, особенно на эпи-
телии желудочно-кишечного тракта [31, 75], эндотелиальных клетках, фибробла-стах, моноцитах, кератиноцитах [172].
Хотя, MIC транскрипты были обнаружены во всех основных органах, кроме головного мозга [137] в значительных количествах MICA и MICB экспрессируют-ся на быстро пролиферирующих линиях эпителиальных клеток, но в недостаточном количестве на покоящихся клетках. А дополнительное воздействие теплового шока приводит к максимальной 10-кратной амплификации мРНК MIC и поверхностных белков [75].
Так, Цвирнер и его коллеги продемонстрировали, что молекулы MIC не экспрессируются на покоящихся Т- или В-лимфоцитах и, в отличие от антигенов HLA класса I, не активируются INF-y. Тем не менее экспрессия MIC может быть индуцирована на активированных CD4+ T-клетках посредством IL-2 [31, 116]. MIC может активироваться Toll-подобными рецепторами, которые сильно экс-прессируются при воспалительных и вирусных миопатиях [138]. Хотя мРНК, кодирующая несколько типов молекул MIC, может быть обнаружена и в здоровых клетках, эти молекулы редко экспрессируются на клеточной поверхности при отсутствии патологии [74]. Это разъединение между транскрипцией и трансляцией NKG2D-лиганда регулируется посттранскрипционно, включая miRNA-опосредованную регуляцию [35, 59].
Таким образом, поверхностная экспрессия MIC индуцируется тепловым шоком, повреждением ДНК [154], усиливается в стрессовых условиях, таких как аутоиммунные заболевания [39], ишемически-реперфузионное повреждение [106], вирусные инфекции [76] и воспаление [138], особенно часто MIC обнаруживаются на опухолевых клетках [33]. Экспрессия MICA в трансформированных или раковых клетках может быть опосредована факторами транскрипции (таким как белок специфичности 1, SP1) [21] и ядерными рецепторами (такой как рецептор ретиноевой кислоты) [91].
Кроме того, белки MIC были обнаружены в почечных и панкреатических аллотрансплантатах с признаками острого и хронического отторжения [82]. Благодаря своему выраженному полиморфизму молекулы MIC способным индуциро-
вать выработку антител, которые могут убивать клетки-мишени в присутствии комплемента и могут влиять, таким образом, на выживаемость трансплантатов за счет активации системы комплемента [170].
Таким образом, можно охарактеризовать молекулы MIC как важные белки, участвующие во множестве иммунологических реакций и оказывающих влияние на течение разнообразных патологических процессов.
С одной стороны, поскольку экспрессия антигенов MICA усиливается в стрессовых условиях, считается, что эти молекулы являются маркерами клеточного стресса [70, 74, 75, 76, 138, 155]. С другой стороны, продукты MIC повсеместно обнаруживаются в трансформированных клеточных линиях, это привело к пониманию их роли в качестве опухоль ассоциированных антигенов [172]. И наконец, поскольку антитела против MICA могут убивать клетки в присутствии комплемента, они также могут являться дополнительными генами гистосовместимости [118, 170].
Следовательно, локусы MIC уникальны в том отношении, что они сочетают в себе признаки как классических MHC молекул, так и не классических, играя ключевую роль в связывании врожденного и адаптивного иммунных ответов при вирусных инфекциях, злокачественных новообразованиях, посттрансплантационных осложнениях.
Грох и соавт. [76] продемонстрировали, что взаимодействие MIC-NKG2D усиливает цитотоксический ответ Т-клеток против инфицированных вирусом клеток, когда процессинг и экспрессия антигена MHC класса I нарушаются после продолжительной инфекции.
Вовлечение NKG2D с помощью MIC мощно активирует функции NK-клеток и костимулирует эффекторные Т-клеточные ответы. Таким образом, MIC передают сигнал "индуцированного или поврежденного я", который связан с клеточными изменениями, вызванными микробами или ростом злокачественных клеток, тем самым предупреждая иммунную систему о внутриклеточных патологических процессах [129].
Однако экспрессия регулируется не только транскрипционно, но и происходит на всех уровнях, участвующих в синтезе белка, от транскрипции до стабиль-
ности РНК, от трансляции до посттрансляционных модификаций, и различается между разными семействами NKG2D-лигандов и даже между разными членами семейства молекул MIC [130]. Само собой разумеется, что существование разных мультигенных семейств является источником изменчивости в системе NKG2D, однако реальная сложность на самом деле еще больше из-за дополнительных свойств лигандов: полиморфизма генов, вариаций в регуляции экспрессии, внутриклеточного перемещения и посттрансляционных модификаций.
1.2. Генетическая структура MIC, генетический полиморфизм 1.2.1. Полиморфизм внешних доменов молекул MICA и MICB
Гены MIC обладают существенным аллельным полиморфизмом, связанным с одно нуклеотидными заменами (SNP) в доменной области молекулы, не имеющим однозначного объяснения, и число вновь открытых аллелей продолжает увеличиваться с каждым годом (база данных IMGT/HLA; http://www.ebi.ac.uk/imgt/hla/) [87]. MICA является наиболее полиморфным неклассическим геном MHC/HLA I класса, на данный момент зарегистрировано уже 531 аллелей и 280 варианта на уровне белкового продукта. В отличие от MICA, генетический полиморфизм MICB ограничен 244 аллелями и 47 варианта белкового продукта.
Аллельный полиморфизм MIC отличается от полиморфизма классических генов HLA. Во-первых, величина полиморфизма MIC намного меньше, чем в системе HLA. Во-вторых, в отличие от молекул HLA класса I, где полиморфизм расположен преимущественно вблизи антигенсвязывающей бороздки, полиморфизм MIC распространяется на все три внеклеточных домена с наибольшей вариабельностью в домене a2, кодируемом экзоном 3 [31].
Похожие диссертационные работы по специальности «Другие cпециальности», 00.00.00 шифр ВАК
Разработка системы типирования генов HLA I и II классов на уровне высокого разрешения методом высокопроизводительного секвенирования (NGS)2019 год, кандидат наук Янкевич Татьяна
«Влияние минорных антигенов гистосовместимости и полиморфизмов генов иммунных контрольных точек на иммунный ответ после трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток».2022 год, кандидат наук Романюк Дмитрий Сергеевич
Влияние аллореактивности естественных киллеров донора на исход аллогенной трансплантации гемопоэтических стволовых клеток у детей с острыми лейкозами2020 год, кандидат наук Захарова Виктория Витальевна
Анализ аллельных вариантов генов иммуноглобулин-подобных рецепторов у пациентов со спондилоартропатиями2011 год, кандидат биологических наук Звягин, Иван Владимирович
Мутации генов GJB2 (Сх26), GJB6 (Сх30) и GJB3 (Сх31) у пациентов с врожденными нарушениями слуха в Якутии2017 год, кандидат наук Пшенникова Вера Геннадиевна
Список литературы диссертационного исследования кандидат наук Вавилов Михаил Николаевич, 2025 год
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Бурмистрова, А. Л. Иммуногенетический профиль локусов, сцепленных с Главным комплексом тканевой совместимости MHC (HLA) - MIC (MICA, MICB) у русских Челябинской области / А. Л. Бурмистрова, М. Н. Вавилов, Д. С. Сташ-кевич, Т. А. Суслова // Медицинская Иммунология. - 2022. - Т. 24, № 1. - С. 4152.
2. Вавилов, М. Н. Частота и параметры неравновесного сцепления двухло-кусных гаплотипов Hla-b~mica у русских Челябинской области / М. Н. Вавилов, Т. А. Суслова, А. Л. Бурмистрова // Российский Иммунологический Журнал. -2022. - Т. 25, № 2. - С. 139-146.
3. Всероссийская перепись населения 2010 года. Итоги переписи населения. - URL: https: //www.gks.ru/free_doc/new_site/perepis2010/croc/perepis_itogi 1612. htm (дата обращения: 25.02.2019). - Текст : электронный.
4. Васильева, В. А. Выполнение трансплантаций аллогенных гемопоэтиче-ских стволовых клеток от неродственных доноров из Российского и зарубежного регистров в одном трансплантационном центре / В. А. Васильева, Л. А. Кузьмина, Е. Н. Паровичникова, М. Ю. Дроков, А. А. Дмитрова, О. С. Старикова, Е. Г. Хама-ганова, Б. В. Бидерман, А. А. Ахремцова, Т. В. Гапонова, Л. П. Менделеева, В. Г. Савченко. - DOI 10.35754/0234-5730-2020-65-3-299-311 // Гематология и трансфу-зиология. - 2020. - Т. 65, № 3. - С. 299-311.
5. Зайцева, Г. А. Особенности распределения MICA и MICB генов в разных популяциях населения (обзор литературы) / Г. А. Зайцева, А.Н. Киселева, И.В. Парамонов // Аллергология и иммунология. - 2016. - Т. 17. - № 3. - С. 214-220.
6. Зайцева, Г. А. Полиморфизм генов MICA и MICB в комплексе МНС / Г. А. Зайцева, А. Н. Киселева, И. В. Парамонов // Гематология и трансфузиология. -2016. - Т. 61. - № 2. - С. 100-104.
7. Каневский, Л. М. Распределение аллелей MICA в российской популяции / Л. М. Каневский, М. В. Гречихина, Е. Г. Кузьмина, Т. Ю. Мушкарина, А. А.
Спелков, М. А. Стрельцова, Е. И. Коваленко // Медицинская иммунология. - 2019.
- Т. 21. - № 5. - С. 959-964.
8. Пальцев, М. А. Главный комплекса тканевой совместимости человека (ИЬА) и клиническая трансплантология / М. А. Пальцев, Р. М. Хаитов, Л. П. Алексеев [и др.] // Молекулярная медицина. - 2009. - № 2. - С. 3-13.
9. Самодова, А. В. Роль шеддинга в активности иммунокомпетентных клеток с реагиновым механизмом защиты / А. В. Самодова, Л. К. Добродеева // Физиология человека. - 2012.
10. Суслова, Т. А. Аллельные варианты М1СВ в составе анцестральных гап-лотипов ИЬА русской этнической группы Челябинской области / Т. А Суслова, А. Л. Бурмистрова, М. Н. Вавилов, С. В. Тимофеева, М. С. Чернова // Аллергология и иммунология. - 2009. - Т. 10, № 2.
11. Суслова, Т. А. Иммуногенетический профиль (ИЬА-А, ИЬА-В, ИЬА-С, ИЬА-ОКВ1, ИЬА-ОрВ1) популяции русских Челябинской области / Т. А Суслова, М. Н. Вавилов, Д. С. Сташкевич, С. В. Беляева, Е. Б. Хромова, А. В. Евдокимов, А. К. Горелова, А. Л. Бурмистрова // Гематология и трансфузиология. - 2015. - Т. 60, № 3. - С. 28.
12. Хаитов, Р. М. Иммуногенетика и генодиагностика человека: национальное руководство / Р. М. Хаитов, Л. П. Алексеев, Д. Ю. Трофимов. - М. : ГЭОТАР-Медиа, 2017. - 256 с.
13. Хаитов, Р. М. Проблема трансплантации неродственных кроветворных стволовых клеток человека и биобезопасность / Р. М. Хаитов, Л. П. Алексеев, Н. Ю. Хаманева [и др.] // Молекулярная медицина. - 2010. - № 5. - С. 3-9.
14. Хамаганова, Е. Г. Мультилокусное оптимальное и иное ИЬА-типирование доноров гемопоэтических стволовых клеток базы данных ФГБУ "НМИЦ Гематологии" Минздрава России / Е. Г. Хамаганова, Е. П Кузьминова., А. Р. Абдрахимова, Е. А. Леонов, М. А. Лепехина, С. П. Хижинский, Т. В. Гапонова, Е. Н. Паровичникова / Гематология и трансфузиология. - 2024. - Т. 69. - № 2 S1.
- С. 354-355.
15. Щекина, А. Е. Роль интенсивной терапии при проведении трансплантации аллогенных гемопоэтических стволовых клеток / А. Е. Щекина, Г. М. Гал-стян, М. Ю. Дроков. - DOI 10.35754/0234-5730-2022-67-2-216-239 // Гематология и трансфузиология. - 2022. - Т. 67, № 2. - С. 216-239.
16. Abi-Rached, L. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans / L. Abi-Rached, M. J. Jobin, S. Kulkarni [et al.].
- DOI 10.1126/science.1209202 // Science. - 2011. - Vol. 334. - P. 89-94.
17. Aida, K. High frequency of MIC null haplotype (HLA-B48-MICA-del-MICB*009N) in the Angaite Amerindian community in Paraguay / K. Aida, G. Russo-mando, M. Kikuchi // Immunogenetics. - 2002. - Vol. 54. - P. 439-441.
18. Allele Frequency Net Database / HLA «Allele Frequency Search» Classical.
- URL: http://www. allelefrequencies.net (date of access: 25.02.2018).
19. Anasetti, C. Blood and Marrow Transplant Clinical Trials Network. Peripheral-blood stem cells versus bone marrow from unrelated donors / C. Anasetti, B. R. Logan, S. J. Lee [et al.]. - DOI 10.1056/NEJMoa1203517 // The New England Journal of Medicine. - 2012. - Vol. 367, № 16. - P. 1487-1496.
20. Anderson, E. Limited role of MHC class I chain-related gene A (MICA) typing in assessing graft-versus-host disease risk after fully human leukocyte antigen-matched unrelated donor transplantation / E. Anderson, B. Grzywacz, H. Wang [et al.].
- DOI 10.1182/blood-2009-08-239301 // Blood. - 2009. - Vol. 114, № 21. - P. 47534754.
21. Andresen, L. Molecular regulation of MHC class I chain- related protein A expression after HDAC-inhibitor treatment of Jurkat T cells / L. Andresen, H. Jensen, M. T. Pedersen, K. A. Hansen, S. Skov. - DOI 10.4049/jimmunol.179.12.8235 // The Journal of Immunology. - 2007. - Vol. 179. - P. 8235-8242.
22. Apithy, M.-J. Impact of MICA and NKG2D polymorphisms in HLA-fully matched related and unrelated hematopoietic stem cell transplantation / M.-J. Apithy, A. Charbonnier, J. Desoutter, M. Diouf, P. Morel, L. Garçon, J.-P. Marolleau, N. Guillaume. - DOI 10.1038/s41409-017-0083-3 // Bone Marrow Transplantation. - 2018. -Vol. 53 - P. 918-922.
23. Arlequin ver 3.5.1.3. - Текст : электронный // An Integrated Software for Population Genetics Data Analysis. - URL: http://cmpg.unibe.ch/software/arlequin35/ (дата обращения: 25.02.2022).
24. Ashiru, O. Natural killer cell cytotoxicity is suppressed by exposure to the human NKG2D ligand MICA*008 that is shed by tumor cells in exosomes / O. Ashiru, P. Boutet, L. Fernandez-Messina [et al.] // Cancer Research. - 2010. - Vol. 70, № 2. -P. 481-489.
25. Ashiru, O. A GPI anchor explains the unique biological features of the common NKG2D-ligand allele MICA*008 / O. Ashiru, S. Lopez-Cobo, L. Fernandez-Messina [et al.] // Biochemical Journal. - 2013. - Vol. 454. - P. 295-302.
26. Askar, M. Synergistic effect of major histocompatibility complex class I-related chain a and human leukocyte antigen-DPB1 mismatches in association with acute graft-versus-host disease after unrelated donor hematopoietic stem cell transplantation / M. Askar, Y. Sun, L. Rybicki, A. Zhang, D. Thomas, M. Kalaycio, B. Pohlman, R. Dean, H. Duong, R. Hanna [et al.] // Biology of Blood and Marrow Transplantation. - 2014. - Vol. 20. - P. 1835-1840.
27. Askar, M. MHC class I chain-related gene A (MICA) donor-recipient mismatches and MICA-129 polymorphism in unrelated donor hematopoietic cell transplantations has No impact on outcomes in acute lymphoblastic leukemia, acute myeloid leukemia, or myelodysplastic Syndrome: A center for international blood and marrow transplant research study / M. Askar, R. Sobecks, T. Wang, M. Haagenson, N. Majhail, A. Madbouly [et al.]. - DOI 10.1016/j.bbmt.2016.11.021 // Biology of Blood and Marrow Transplantation. - 2017. - Vol. 23, № 3. - P. 436-444.
28. Bahram, S. A second lineage of mammalian major histocompatibility complex class I genes / S. Bahram, M. Bresnahan, D. E. Geraghty, T. Spies // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1994. - Vol. 91. - P. 6259-6263.
29. Bahram, S. Nucleotide sequence of the human MHC class I MICA gene / S. Bahram, N. Mizuki, H. Inoko, T. Spies // Immunogenetics. - 1996. - Vol. 44, № 1. - P. 80-81.
30. Bahram, S. MIC genes: From genetics to biology / S. Bahram. - DOI 10.1016/s0065-2776(01 )76018-x // Advances in Immunology. - 2001. - Vol. 76, № 1995. - P. 1-60.
31. Baranwal, A. K. Major Histocompatibility Complex Class I Chain-Related A (MICA) Molecules: Relevance in Solid Organ Transplantation / A. K. Baranwal, K. M. Narinder. - DOI 10.3389/fimmu.2017.00182 // Frontiers in Immunology. - 2017. - T .8. - P. 182.
32. Barrett, D. Autologous and allogeneic cellular therapies for high-risk pediatric solid tumors / D. Barrett, J. D. Fish, S. A. Grupp // Pediatric Clinics of North America. - 2010. - Vol. 57, № 1. - P. 47-66.
33. Bauer, S. Activation of NK cells and T cells by NKG2D, a receptor for stress-inducible MICA / S. Bauer, V. Groh, J. Wu, A. Steinle, J. H. Phillips, L. L. Lanier [et al.] // Science. - 1999. - Vol. 285. - P. 727-729.
34. Bhatia, S. Late mortality after allogeneic hematopoietic cell transplantation and functional status of long-term survivors: Report from the bone marrow transplant survivor study / S. Bhatia, L. Francisco, A. Carter, C. L. Sun, K. S. Baker, J. G. Gurney [et al.] // Blood. - 2007. - Vol. 110, № 10. - P. 3784-3792.
35. Boissel, N. BCR/ABL oncogene directly controls MHC class I chain-related molecule: a expression in chronic myelogenous leukemia / N. Boissel, D. Rea, V. Tieng [et al.] // The Journal of Immunology. - 2006. - Vol. 176, № 8. - C. 5108- 5116.
36. Boukouaci, W. MICA-129 genotype, soluble MICA, and anti-MICA antibodies as biomarkers of chronic graft-versus-host disease / W. Boukouaci, M. Busson, R. Peffault de Latour, V. Rocha, C. Suberbielle, D. Bengoufa [et al.]. - DOI 10.1182/blood-2009-04-217430 // Blood - 2009. - Vol. 114, № 25. - P. 5216-5224.
37. Boutet, P. Cutting edge: the metalloproteinase ADAM17/TNF-alpha-converting enzyme regulates proteolytic shedding of the MHC class I-related chain B protein / P. Boutet, S. Aguera-Gonzalez, S. Atkinson [et al.] // The Journal of Immunology. - 2009. - Vol. 182, № 1. - P. 49-53.
38. Brooke, P. HLA-DM, HLA-DO and tapasin: functional similarities and differences / P. Brooke, N. Garbi, F. Momburg, G. J. Hammerling // Current Opinion in Immunology. - 2002. - Vol. 14. - P. 22-29.
39. Caillat-Zucman, S. How NKG2D ligands trigger autoimmunity? / S. Caillat-Zucman. - DOI 10.1016/j.humimm.2006.02.013 // Human Immunology. - 2006. - Vol. 67, № 3. - P. 204-207.
40. Campos-Silva, C NKG2D-ligands: Putting everything under the same umbrella can be misleading / C. Campos-Silva, M. K. Kramer, M. Vales-Gomez. - DOI 10.1111/tan.13246 // HLA. - 2018. - Vol. 91, № 6. - P. 489-500.
41. Carapito, R. Matching for the nonconventional MHC-I MICA gene significantly reduces the incidence of acute and chronic GVHD / R. Carapito, N. Jung, M. Kwemou, M. Untrau, S. Michel, A. Pichot [et al.]. - DOI 10.1182/blood-2016-05-719070 // Blood. - 2016. - Vol. 128. - P. 1979-1986.
42. Carapito, R. Compatibility at amino acid position 98 of MICB reduces the incidence of graft-versus-host disease in conjunction with the CMV status / R. Carapito, I. Aouadi, A. Pichot, P. Spinnhirny, A. Morlon, I. Kotova [et al.]. - DOI 10.1038/s41409-020-0886-5 // Bone Marrow Transplantation. - 2020. - Vol. 55, № 7. -P. 1367-1378.
43. Cattley, S. K. Phylogenetic analysis of primate MIC (PERB11) sequences suggests that the representation of the gene family differs in different primates: comparison of MIC (PERB11) and C4 / S. K. Cattley, N. Longman, R. L. Dawkins, S. Gaudieri, J. K. Kulski, C. Leelayuwat // European Journal of Immunogenetics. - 1999. - Vol. 26. - P. 233-238.
44. Chen, D. MICA polymorphism: biology and importance in cancer / D. Chen, U. Gyllensten. - DOI10.1093/carcin/bgu215 // Carcinogenesis. - 2014. - Vol. 35, № 12. - P. 2633-2642.
45. Chitadze, G. Scand Generation of soluble NKG2D ligands: proteolytic cleavage, exosome secretion and functional implications / G. Chitadze, J. Bhat, M. Lettau, O. Janssen, D. Kabelitz. - DOI 10.1111/sji.12072 // The Journal of Immunology. - 2013. Aug. - Vol. 78, № 2. - P. 120-129.
46. Cho, S. Cytomegalovirus infections after hematopoietic stem cell transplantation: Current status and future immunotherapy / S. Y. Cho, D. G. Lee, H. J. Kim // International Journal of Molecular Sciences. - 2019. - Vol. 20, № 11. - P. 2666.
47. Choi, H.B. MICA 5.1 allele is a susceptibility marker for psoriasis in the Korean population / H. B. Choi, H. Han, J. I. Youn, T. Y. Kim, T. G. Kim // Tissue Antigens - 2000. - Vol. 56. - P. 548-550.
48. Choy, M. K. MICA polymorphism: biology and importance in immunity and disease / M. K. Choy, M. E. Phipps. - DOI 10.1016/j.molmed.2010.01.002 // Trends in Molecular Medicine. - 2010. - Vol. 16, № 3. - P. 97-106.
49. Choy, M. K. Possible polyphyletic origin of major histocompatibility complex class i chain-related gene A (MICA) alleles / M. K. Choy, M. Phipps // Journal of Molecular Evolution - 2003. - Vol. 57. - P. 38-43.
50. Clayton, A. Human tumor-derived exosomes down-modulate NKG2D expression / A. Clayton, J. P. Mitchell, J. Court, S. Linnane, M. D. Mason, Z. Tabi // The Journal of Immunology. - 2008. - Vol. 180, № 11. - P. 7249-7258.
51. Closa, L. High-throughput genotyping of HLA-G, HLA-F, MICA, and MICB and analysis of frequency distributions in healthy blood donors from Catalonia / L. Closa, F. Vidal, M. J. Herrero, J. L. Caro // HLA. - 2021. - Vol. 97. - P. 420-427.
52. Collins, R. High resolution molecular phototyping of MICA and MICB alleles using sequence specific primers / R. Collins, H. Stephens, M. Clare, R. Vaughan // Human Immunology. - 2002. - Vol. 63. - P. 783.
53. Collins, R. W. M. Human MHC class I chain related (MIC) genes: their biological function and relevance to disease and transplantation / R. W. M. Collins. - DOI 10.1111/j.1365-2370.2004.00457.x // European Journal of Immunogenetics. - 2004. -Vol. 31. - P. 105-114.
54. Doubrovina, E. S. Evasion from NK cell immunity by MHC class I chain-related molecules expressing colon adenocarcinoma / E. S. Doubrovina, M. M. Doubrovin, E. Vider [et al.] // The Journal of Immunology. - 2003. - Vol. 171, № 12. -P. 6891- 6899.
55. Douik, H. Association of MICA-129 polymorphism with nasopharyngeal cancer risk in a Tunisian population / H. Douik, B. A. Chaaben, A. N. Romdhane, H. B. Romdhane, T. Mamoghli, C. Fortier [et al.]. - DOI 10.1016/j.humimm.2008.10.008 // Human Immunology - 2009. - Vol. 70. - P. 45-48.
56. Doxiadis, G. G. MIC gene polymorphism and haplotype diversity in rhesus macaques / G. G. M. Doxiadis, C. M. Heijmans, N. Otting, R. E. Bontrop // Tissue Antigens - 2007. - Vol. 69. - P. 212-219.
57. Duquesnoy, R. J. Structurally based epitope analysis of major histocompati-bility complex class I-related chain A (MICA) antibody specificity patterns / R. J. Du-quesnoy, J. Mostecki, J. Hariharan, I. Balazs // Human Immunology. - 2008. - Vol. 69. - P. 826-832.
58. EFI (European Federation for immunogenetics). - URL: http://www.efiweb.eu (дата обращения: 02.12.2024).
59. Elias, S. Battle of the midgets: innate microRNA networking / S. Elias, O. Mandelboim // RNA Biology. - 2012. - Vol. 9, № 6. - P. 792- 798.
60. Elsner H.-A. The nucleotide diversity of MICA and MICB suggests the effect of overdominant selection / H.-A. Elsner, M. Schroeder, R. Blasczyk. - DOI 10.1034/j.1399-0039.2001.580612.x // Tissue Antigens. - 2001. - Vol. 58. - P. 419421.
61. Excoffier, L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. / L. Excoffier, H. E. L. Lischer. - DOI 10.1111/j.1755-0998.2010.02847.x // Mol. Ecol. Res. - 2010. - Vol. 10, № 3. - P. 564.
62. Felsenstein, J. Phylogenies and the Comparative Method / J. Felsenstein // Am. Nat. - 1985. - Vol. 125, № 1. - P. 1-15.
63. Fernandez, V. M. A. Tracking human migrations by the analysis of the distribution of HLA alleles, lineages and haplotypes in closed and open populations / V. M. A. Fernandez, J. A. Hollenbach, K. E. Lyke [et al.]. - DOI 10.1098/rstb.2011.0320 // Philosophical Transactions of the Royal Society Biological sciences. - 2012. - Vol. 367, № 1590. - P. 820-829.
64. Fernandez-Messina, L. Differential mechanisms of shedding of the glyco-sylphosphatidylinositol (GPI)-anchored NKG2D ligands / L. Fernandez-Messina, O. Ashiru, P. Boutet [et al.] // Journal of Biological Chemistry. - 2010. - Vol. 285, № 12. -P. 8543-8551.
65. Fernandez-Messina, L. Human NKG2D-ligands: cell biology strategies to ensure immune recognition / L. Fernandez-Messina, H. T. Reyburn, M. Vales-Gomez. -DOI 10.3389/fimmu.2012.00299 // Frontiers in Immunology. - 2012. Sep. - Vol. 25, № 3. - P. 99.
66. Fodil, N. Allelic repertoire of the human MHC class I MICA gene / N. Fodil, L. Laloux, V. Wanner, P. Pellet, G. Hauptmann, N. Mizuki [et al.] // Immunogenetics. -1996. - № 44. - P. 351-357.
67. Frigoul, A. MICA: standardized IMGT allele nomenclature, polymorphisms and diseases / A. Frigoul, M.-P. Lefranc // Recent Research Developments in Human Genetics. - 2005. - Vol. 3. - P. 95-145.
68. Fuerst, D. Matching for the MICA-129 polymorphism is beneficial in unrelated hematopoietic stem cell transplantation / D. Fuerst, C. Neuchel, D. Niederwieser, D. Bunjes, M. Gramatzki, E. Wagner [et al.]. - DOI 10.1182/blood-2016-05-716357 // Blood. - 2016. - Vol. 128. - P. 3169-3176.
69. Fukami-Kobayashi, K. Genomic evolution of MHC class I region in primates / K. Fukami-Kobayashi, T. Shiina, T. Anzai, K. Sano, M. Yamazaki, H. Inoko, Y. Tateno. - DOI 10.1073/pnas.0500770102 // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2005 Jun 28. - Vol. 102, № 26. - P. 92309234.
70. Gasser, S. The DNA damage pathway regulates innate immune system ligands of the NKG2D receptor / S. Gasser, S. Orsulic, E. J. Brown, D. H. Raulet // Nature. - 2005. - Vol. 436. - P. 1186-1190.
71. Gong, W. Analysis on polymorphism in exons 2, 3 and 4 of the MICA gene in three different Chinese populations / W. Gong, L. Fan, J. Yang, L. Xu, F. Yao // Proceedings of the 13th IHW. - 2006. - Vol. 2. - P. 470-471.
72. González, S. Immunobiology of human NKG2D and its ligands / S. González, V. Groh, T. Spies. - DOI 10.1007/3-540-27743-9_6 // Current Topics in Microbiology and Immunology. - 2006. - Vol. 298. - P. 121-138.
73. Groh, V. Broad tumor-associated expression and recognition by tumor-derived gamma delta T cells of MICA and MICB / V. Groh, R. Rhinehart, H. Secrist [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1999. - Vol. 96. - P. 6879.
74. Groh, V. Cell stress-regulated human major histocompatibility complex class I gene expressed in gastrointestinal epithelium / V. Groh, S. Bahram, S. Bauer, A. Herman, M. Beauchamp, T. Spies // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1996. - Vol. 93. - P. 12445-12450.
75. Groh, V. Recognition of stress-induced MHC molecules by intestinal epithelial gammadelta T cells / V. Groh, A. Steinle, S. Bauer, T. Spies // Science. - 1998. -Vol. 279. - P. 1737-1740.
76. Groh, V. Costimulation of CD8alphabeta T cells by NKG2D via engagement by MIC induced on virus-infected cells / V. Groh, R. Rhinehart, J. Randolph-Habecker, M. S. Topp, S. R. Riddell, T. Spies // Nature Immunology. - 2001. - № 2. - P. 255260.
77. Groh, V. Tumour-derived soluble MIC ligands impair expression of NKG2D and T-cell activation / V. Groh, J. Wu, C. Yee, T. Spies // Nature. - 2002. - Vol. 419, № 6908. - P. 734-738.
78. Groh, V. Stimulation of T cell autoreactivity by anomalous expression of NKG2D and its MIC ligands in rheumatoid arthritis / V. Groh, A. Bruhl, H. El-Gabalawy, J. L. Nelson, T. Spies // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2003. - Vol. 100. - P. 9452-9457.
79. Hadra, B. A. HLA class I chain-related MICA and MICB genes polymorphism in healthy individuals from the Bulgarian population / B. A. Hadra, T. I. Luka-nov, M. I. Ivanova // Human Immunology. - 2022. - Vol. 83, № 7. - P. 551-555.
80. Hammer, 0. PAST : Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis / 0. Hammer, D. A. T. Harper, P. D. Ryan // Palaeontol. Electron. - 2001. - Vol. 4, № 1. - P. 1-9.
81. Hangai, M., Allogeneic Stem Cell Transplantation for Acute Lymphoblastic Leukemia in Adolescents and Young Adults/ M. Hangai, K.Y. Urayama, J. Tanaka, K. Kato, S. Nishiwaki, K. Koh, M. Noguchi, K. Kato, N. Yoshida, M. Sato, H. Goto, Y. Yuza, Y. Hashii, Y. Atsuta, S. Mizuta, M. Kato - DOI 10.1016/j.bbmt.2019.04.014// Biology of blood and marrow transplantation. - 2019. - Vol. 25. - P. 1597-1602..
82. Hankey, K. G. MIC expression in renal and pancreatic allografts / K. G. Hankey, C. B. Drachenberg, J. C. Papadimitriou, D. K. Klassen, B. Philosophe, S. T. Bartlett, V. Groh, T. Spies, D. L. Mann // Transplantation. - 2002. - Vol. 73. - P. 304-306.
83. Henry, A. F. MICA and MICB genes: can the enigma of their polymorphism be resolved? / A. F. Henry, H. Stephens // Trends in Immunology. - 2001. - Vol. 22, № 7. - P. 378-284.
84. Hierlmeier, S. Early and late complications following hematopoietic stem cell transplantation in pediatric patients - a retrospective analysis over 11 years / S. Hierlmeier, M. Eyrich, M. Wölfl, P. G. Schlegel, V. Wiegering // PloS One. - 2018. - Vol. 13, № 10.
85. HLA.Alleles.org. International ImMunoGeneTics project (IMGT) // HLA Database. - URL: http://hla.alleles.org/nomenclature/index.html (дата обращения: 01.02.2022).
86. Horton, R. Gene map of the extended human MHC / R. Horton [et al.] // Nature Reviews Genetics - 2004. - Vol. 5. - P. 889-899.
87. IMGT/HLA. Nomenclature HLA. - URL: http://www.ebi.ac.uk/imgt/hla/ (дата обращения: 01.02.2022).
88. Isernhagen, A. The MICA-129 dimorphism affects NKG2D signaling and outcome of hematopoietic stem cell transplantation / A. Isernhagen, D. Malzahn, E. Viktorova, L. Elsner, S. Monecke, F. von Bonin [et al.]. - DOI 10.15252/emmm.201505246 // EMBO Molecular Medicine - 2015. - Vol. 7. - P. 1480-1502.
89. Isernhagen, A. The MICA-129 Met/Val dimorphism affects plasma membrane expression and shedding of the NKG2D ligand MICA / A. Isernhagen, D. Schil-
ling, S. Monecke, P. Shah, L. Eisner, L. Walter [et al.]. - DOI 10.1007/s00251-015-0884-8 // Immunogenetics - 2016. - Vol. 68. - P. 109-123.
90. Isernhagen, A. Impact of the MICA-129Met/Val Dimorphism on NKG2D-Mediated Biological Functions and Disease Risks / A. Isernhagen, D. Malzahn, H. Bickeböller, R. Dressel. - DOI 10.3389/fimmu.2016.00588 // Frontiers in Immunology. - 2016. - Vol. 7. - C. 588.
91. Jinushi, M. Expression and role of MICA and MICB in human hepatocellular carcinomas and their regulation by retinoic acid / M. Jinushi, T. Takehara, T. Tatsumi, T. Kanto, V. Groh, T. Spies, R. Kimura, T. Miyagi, K. Mochizuki, Y. Sasaki, N. Hayashi // International Journal of Cancer. - 2003. - Vol. 104. - P. 354-361.
92. Kai, S. Allogeneic hematopoietic stem cell transplantation / S. Kai, H. Hara // Therapeutic Apheresis and Dialysis. - 2003. - Vol. 7, № 3. - P. 285-291.
93. Kitcharoen, K. MICA, MICB, and MHC beta block matching in bone marrow transplantation: relevance to transplantation outcome / K. Kitcharoen, C. S. Witt, A. V. Romphruk, F. T. Christiansen, C. Leelayuwat. - DOI 10.1016/j.humimm.2006.02.012 // Human Immunology - 2006. - Vol. 67. - P. 238-246.
94. Klein, J. The conundrum of nonclassical major histocompatibility complex genes / J. Klein, C. O'hUigin // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1994. - Vol. 91. - P. 6251-6252.
95. Klussmeier, A. High-Throughput MICA/B Genotyping of Over Two Million Samples: Workflow and Allele Frequencies / A. Klussmeier, C. Massalski, K. Putke, G. Schäfer, J. Sauter, D. Schefzyk, J. Pruschke, J. Hofmann, D. Fürst, R. Carapito, S. Bahram, A. H. Schmidt, V. Lange // Frontiers in Immunology. - 2020. - Vol. 11. - P. 314.
96. Klussmeier, A. Discovery of a MICA gene duplication with strong linkage to HLA-B*27:02 / A. Klussmeier, C. Massalski1, D. Schefzyk, G Schafer, J. Sauter, A. H. Schmidt, V. Lange // HLA. - 2022. - Vol. 99, № 5. - P. 439.
97. Komatsu-Wakui, M. MIC-A polymorphism in Japanese and a MIC-A-MIC-B null haplotype / M. Komatsu-Wakui, K. Tokunaga, Y. Ishikawa. - DOI 10.1007/ s002510050658 // Immunogenetics. - 1999. - Vol. 49. - P. 620-628.
98. Komatsu-Wakui, M. Wide distribution of the MICA-MICB null haplotype in East Asians / M. Komatsu-Wakui, K. Tokunaga, Y. Ishikawa // Tissue Antigens. -2001. - Vol. 57. - P. 1-8.
99. Kruskal, J. B. Multimensional scaling by optimizing goodness of fit to a nonmetric hypothesis / J. B. Kruskal // Psycometrika. - 1964. - Vol. 9, № 1. - P. 1-27.
100. Kuranov, A.B. Polymorphisms of HLA-DRB1, -DQA1 and -DQB1 in Inhabitants of Astana, the Capital City of Kazakhstan / A. B. Kuranov, C. A. Müller, M. N. Vavilov, G. Zh. Abildinova, A. R. Akilzhanova, A. N. Iskakova, E. V. Zholdyba-yeva, K. T. Momynaliev, M. N. Boldyreva, J. Pinto // PLoS ONE. - 2014. - Vol. 9, № 12. - P. e115265.
101. Lawitschka, A. Long-term effects of myeloablative allogeneic hematopoietic stem cell transplantation in pediatric patients with acute lymphoblastic leukemia / A. Lawitschka, C. Peters // Current Oncology Reports. - 2018. - Vol. 20, № 9. - P. 74.
102. Leelayuwat, C. A new polymorphic and multicopy MHC gene family related to nonmammalian class I / C. Leelayuwat, D. C. Townend, M. A. Degli-Esposti, L. J. Abraham, R. L. Dawkins // Immunogenetics. - 1994. - Vol. 40. - P. 339-351.
103. Li, P. Crystal structure of the MHC class I homolog MIC-A, a gamma delta T cell ligand / P. Li, S. T. Willie, S. Bauer, D. L. Morris, T. Spies, R. K. Strong. - DOI 10.1016/S1074-7613(00)80057-6 // Immunity. - 1999. - Vol. 10. - P. 577-584.
104. Li, P. Complex structure of the activating immunoreceptor NKG2D and its MHC class I-like ligand MICA / P. Li, D. L. Morris, B. E. Willcox [et al.]. - DOI 10.1038/87757 // Natural Immunology. - 2001. - № 2. - P. 443-451.
105. Lopez-Hernandez, R. Association analysis of MICA gene polymorphism and MICA-129 dimorphism with inflammatory bowel disease susceptibility in a Spanish population / R. Lopez-Hernandez, M. Valdes, D. Lucas, J. A. Campillo, P. Martinez-Garcia, H. Salama [et al.]. - DOI 10.1016/j.humimm.2010.02.003 // Human Immunology. - 2010. - Vol. 71. - P. 512-514.
106. Luo, L. The role of HIF-1 in up-regulating MICA expression on human renal proximal tubular epithelial cells during hypoxia/reoxygenation / L. Luo, J. Lu, L.
Wei, D. Long, J. Y. Guo, J. Shan [et al.]. - DOI 10.1186/1471-2121-11-91 // BioMed Central Molecular and Cell Biology. - 2010. - Vol. 11. - P. 91.
107. Luo, L. Role of MICA antibodies in solid organ transplantation / L. Luo, Z. Li, W. Wu [et al.]. - DOI 10.1111/ctr.12295 // Clin. Transplant. - 2014. - Vol. 28, № 2. - P. 152-160.
108. Machuldova, A. Single-nucleotide polymorphisms in MICA and MICB genes could play a role in the outcome in AML patients after HSCT / A. Machuldova, L. Houdova, K. Kratochvilova, M. Leba, P. Jindra, P. Ostasov [et al.]. - DOI 10.3390/jcm10204636 // Journal of Clinical Medicine. - 2021. - Vol. 10, № 20. - P. 4636.
109. Mackay, I. The HLA system. First of two parts / I. Mackay, F. S. Rosen // The New England Journal of Medicine. - 2005. - Vol. 343. - P. 702-709.
110. Malkki, M. Mapping MHC-resident transplantation determinants / M. Malk-ki, T. A. Gooley, M. M. Horowitz [et al.] // Biology of Blood and Marrow Transplantation. - 2007. - Vol. 13, № 8. - P. 986-995.
111. Marsh, S. G. E. Nomenclature for factors of the HLA system, 2010 / S. G. E. Marsh, E. D. Albert, W. F. Bodmer [et al.] // Tissue Antigens. - 2010. - Vol. 75. - P. 291-455.
112. Martin P. J. Genome-wide minor histocompatibility matching as related to the risk of graft-versus-host disease / P. J Martin, D. M. Levine, B. E. Storer, E. H. Warren, X. Zheng, S. C. Nelson, A. G. Smith, B. K. Mortensen, J. A. Hansen. - DOI 10.1182/blood-2016-09-737700 // Blood. - 2017. - Vol. 129, № 6. - P. 791-798.
113. Martin, P. J. Recipient and donor genetic variants associated with mortality after allogeneic hematopoietic cell transplantation / P. J. Martin, D. M. Levine, B. E. Storer, S. C. Nelson, X. Dong, J. A. Hansen. - DOI 10.1182/bloodadvances.2020001927 // Blood Advances. - 2020. - Vol. 4. - P. 32243233.
114. Mason, P. M. HLA class I region sequences / P. M. Mason, P. Parham // Tissue Antigens - 1998. - Vol. 51. - P. 417-466.
115. MIC » MIC-HLA Association Frequency Search // Allele Frequency Net Database. - URL: http://www.allelefrequencies.net/mic6001a.asp (дата обращения: 05.2022).
116. Molinero, L. L. Intracellular expression of MICA in activated CD4 T lymphocytes and protection from NK cell-mediated MICA-dependent cytotoxicity / L. L. Molinero, C. I. Domaica, M. B. Fuertes, M. V. Girart, L. E. Rossi, N. W. Zwirner. -DOI 10.1016/j.humimm.2006.02.010 // Human Immunology. - 2006. - Vol. 67. - P. 170-182.
117. Mincheva-Nilsson, L. Placenta-Derived Soluble MHC Class I Chain-Related Molecules Down-Regulate NKG2D Receptor on Peripheral Blood Mononuclear Cells during Human Pregnancy: A Possible Novel Immune Escape Mechanism for Fetal Survival / L. Mincheva-Nilsson, O. Nagaeva, T. Chen, U. Stendahl, J. Antsiferova, I. Mogren; J. Hernestal, V. Baranov. - DOI 10.4049/jimmunol.176.6.3585 // The Journal of Immunology. - 2006. - Vol. 176, № 6. - P. 3585-3592.
118. Mizutani, K. Serial ten-year follow-up of HLA and MICA antibody production prior to kidney graft failure / K. Mizutani, P. Terasaki, A. Rosen, V. Esquenazi, J. Miller, R. N. J. Shih, R. Pei, M. Ozawa, J. Lee // American Journal of Transplantation. -2005. - Vol. 5. - P. 2265-2272.
119. Oliveira, L. A. [et al.] High frequencies of alleles MICA*020 and MICA*027 in Amerindians and evidence of positive selection on exon 3 / L. A. Oliveira, F. Ribas, M. G. Bicalho, L. T. Tsuneto, M. L. Petzl-Erler // Genes & Immunity. - 2008. - Vol. 9. - P. 697-705.
120. Ota, M. On the MICA deleted-MICB null, HLA-B*4801 haplotype / M. Ota, S. Bahram, Y. Katsuyama, S. Saito, Y. Nose, M. Sada, H. Ando, H. Inoko // Tissue Antigens - 2000. - Vol. 56. - P. 268-271.
121. Parham, P. Immunogenetics of Human Placentation / P. Parham, P. J. Norman, L. Abi-Rached, H. G. Hilton, L. A. Guethlein // Placenta. - 2012. Feb. - Vol. 33. -P. 71-80.
122. Parham, P. Variable NK cell receptors and their MHC class I ligands in immunity, reproduction and human evolution / P. Parham, A. Moffett. - DOI
1G.1G3S/nri337G // Nature Reviews Immunology. - 2G13. Feb. - Vol. 13, № 2. - P. 133-144. Parmar, S. Donor-recipient mismatches in MHC class I chain-related gene A in unrelated donor transplantation lead to increased incidence of acute graft-versus-host disease / S. Parmar, M. Del Lima, Y. Zou, P. A. Patah, P. Liu, P. Cano [et al.]. - DOI 1G.11 S2/blood-2GG9-G5-223172 // Blood. - 2GG9. - Vol. 114. - P. 2SS4-2SS7.
123. Passweg, J. R. Hematopoietic cell transplantation and cellular therapy survey of the EBMT: Monitoring of activities and trends over 3G years / J. R. Passweg, H. Baldomero, C. Chabannon, G. W. Basak, R. de la Cámara, S. Corbacioglu [et al.] // Bone marrow transplantation. - 2G21. - Vol. 56, № 7. - P. 1651-1664.
124. Penn, D. J. MHC heterozygosity confers a selective advantage against multiple-strain infections / D. J. Penn, K. Damjanovich, W. K. Potts // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2GG2. - Vol. 99. - P. 1126G-11264.
125. Petersdorf, E. W. MHC haplotype matching for unrelated hematopoietic cell transplantation / E. W. Petersdorf, M. Malkki, T. A. Gooley, P. J. Martin, Z. Guo // PLoS Med. - 2GG7. - Vol. 4, № 1. - P. eS.
126. PHYLIP Phylogeny Inference // PHYLIP Package Version 3.69. - URL: https: //home.cc.umanitoba.ca/~psgendb/doc/Phylip/main.html (дата обращения: G3.2G21).
127. Raache, R. Association of major histocompatibility complex class 1 chain-related gene a dimorphism with type 1 diabetes and latent autoimmune diabetes in adults in the Algerian population / R. Raache, K. Belanteur, H. Amroun, A. Benyahia, A. Heniche, M. Azzouz [et al.]. - DOI 1G.112S/CVI.G5473-11 // Clinical and Vaccine Immunology. - 2G12. - Vol. 19. - P. 557-561.
12S. Raulet, D. H. Roles of the NKG2D immunoreceptor and its ligands / D. H. Raulet // Nature Reviews Immunology. - 2GG3. - Vol. 3. - P. 7S1-79G.
129. Raulet, D. H. Regulation of ligands for the NKG2D activating receptor / D. H. Raulet, S. Gasser, B. G. Gowen, W. Deng, H. Jung // Annual Review of Immunology. - 2G13. - Vol. 31. - P. 413-441.
130. Rees, M. T. Typing System for the Major Histocompatibility Complex Class I Chain Related Genes A and B Using Polymerase Chain Reaction with Sequence-Specific Primers / M. T. Rees, J. Downing and C. Darke. - DOI 10.1089/gte.2005.9.93 // Genetic testing. - 2005. - Vol. 9, № 2. - P. 93-109.
131. Riccio, M. E. 16th IHIW: Analysis of HLA Population Data, with updated results for 1996 to 2012 workshop data (AHPD project report) / M. E. Riccio, S. Buhler, J. M. Nunes [et al.]. - DOI 10.1111/iji. 12033 // International Journal of Immunogenet-ics. - 2013. - Vol. 40, № 1. - P. 21-30.
132. Russomando, A. K. High frequency of MIC null haplotype (HLA-B48-MICA-del-MICB*0107N) in the Angaite Amerindian community in Paraguay / A. K. Russomando, M. Kikuchi, N. Candia, L. Franco, M. Almiron, R. Ubalee, K. Hirayama // Immunogenetics - 2002. - Vol. 54. - P. 439-441.
133. Salih, H. R. Cutting edge: down-regulation of MICA on human tumors by proteolytic shedding / H. R. Salih, H. G. Rammensee, A. Steinle // Journal of Immunology. - 2002. - Vol. 169. - P. 4098-4102.
134. Sanchez-Mazas, A. Immunogenetics as a tool in anthropological studies / A. Sanchez-Mazas, M. Fernandez-Viña, D. Middleton [et al.]. - DOI 10.1111/j.1365-2567. 2011.03438.x // Immunology. - 2011. - Vol. 133, № 2. - P. 143-164.
135. Schmiedel, D. NKG2D ligands-critical targets for cancer immune escape and therapy / D. Schmiedel, O. Mandelboim // Frontiers in Immunology. - 2018. - Vol. 9. - P. 2040.
136. Schrambach, S. In vivo expression pattern of MICA and MICB and its relevance to auto-immunity and cancer / S. Schrambach, M. Ardizzone, V. Leymarie, J. Si-bilia, S. Bahram // PLoS ONE - 2007. - Vol. 2. - P. e518.
137. Schreiner, B. Expression of toll-like receptors by human muscle cells in vitro and in vivo: TLR3 is highly expressed in inflammatory and HIV myopathies, mediates IL-8 release and up- regulation of NKG2D-ligands / B. Schreiner, J. Voss, J. Wischhusen, Y. Dombrowski, A. Steinle, H. Lochmüller, M. Dalakas, A. Melms, H. Wiendl // Faseb. J. - 2006. - Vol. 20. - P. 118-120.
138. Seo, J. W. Major histocompatibility complex-linked MIC genes in rhesus macaques and other primates / J. W. Seo, R. Bontrop, L. Walter, E. Günther // Immuno-genetics - 1999. - Vol. 50. - P. 358-362.
139. Shiina, T. Molecular dynamics of MHC genesis unraveled by sequence analysis of the 1,796,938-bp HLA class I region / T. Shiina, G. Tamiya, A. Oka, N. Takishima, T. Yamagata, E. Kikkawa, K. Iwata, M. Tomizawa, N. Okuaki [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. -1999. - Vol. 96. - P. 13282-13287.
140. Shiina, T. Rapid evolution of major histocompatibility complex class I genes in primates generates new disease alleles in humans via hitchhiking diversity / T. Shiina, M. Ota, S. Shimizu, Y. Katsuyama, N. Hashimoto [et al.] // Genetics - 2006. - P. 173. - P. 1555-1570.
141. Sohn Y.-H. MICA polymorphisms and haplotypes with HLA-B and HLA-DRB1 in Koreans / Y.-H. Sohn // Tissue Antigens - 2010. - Vol. 75, № 1. - P. 48-55.
142. Siemaszko, J. The impact of NKG2A and NKG2D receptors and HLA-E and MICA ligands polymorphisms on post-transplant complications after paediatric allogeneic HSCT: a single-centre experience / J. Siemaszko, M. Ussowicz, B. Rybka, R. Ryczan-Krawczyk, K. Kalwak, K. Bogunia. - DOI 10.3389/fgene.2023.1186123 // Published online Frontiers in Genetics. - 2023.
143. Song, H. Soluble ULBP suppresses natural killer cell activity via down-regulating NKG2D expression / H. Song, J. Kim, D. Cosman, I. Choi // Cellular Immunology. - 2006. - Vol. 239, № 1. - P. 22-30.
144. Spierings, E. Minor histocompatibility antigens: Past, present, and future / E. Spierings. - DOI 10.1111/tan.12445 // Tissue Antigens. - 2014. - Vol. 84, № 4. - P. 374360.
145. Stastny, P. Introduction: MICA/MICB in Innate Immunity, Adaptive Immunity, Autoimmunity, Cancer, and in the immune response to transplants / P. Stastny. - DOI 10.1016/j.humimm.2006.02.019 // Human Immunology. - 2006. - Vol. 67. - P. 141-144.
146. Steinle, A. Diversification, expression and y5 T-cell recognition of evolutionary distant members of the MIC family of major histocompatibility complex class I-
related molecules / A. Steinle, V. Groh, S. Bauer, T. Spies // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America - 1998. - Vol. 95. - P. 12510— 12515.
147. Steinle, A. Interactions of human NKG2D with its ligands MICA, MICB, and homologs of the mouse RAE-1 protein family / A. Steinle, P. Li, D. L. Morris, V. Groh, L. L. Lanier, R. K. Strong [et al.]. - DOI 10.1007/s002510100325// Immunoge-netics. - 2001. - Vol. 53. - P. 279-287.
148. Stephens, H. A. MICA and MICB genes: can the enigma of their polymorphism be resolved? / H. A. Stephens // Trends in Immunology. - 2001. - Vol. 22, № 7.
- P. 378-385.
149. Strong, R. K. Class (I) will come to order-not / R.K. Strong // Nature Structural & Molecular Biology. - 2000. - Vol. 7. - P. 173-176.
150. Suarez-Alvarez, B. Potential role of NKG2D and its ligands in organ transplantation: new target for immunointervention / B. Suarez-Alvarez, A. Lopez-Vazquez, J. M. Baltar, F. Ortega, C. Lopez-Larrea. - DOI 10.1111/j.1600-6143.2008.02526.x // American Journal of Transplantation. - 2009. - Vol. 9. - P. 251-257.
151. Sumitran-Holgersson, S. Identification of the nonclassical HLA molecules, MICA, as targets for humoral immunity associated with irreversible rejection of kidney allografts / S. Sumitran-Holgersson, H. E .Wilczek, J. Holgersson, K. Soderstrom // Transplantation. - 2002. - Vol. 74. - P. 268-277.
152. Suslova, T. A. HLA gene and haplotype frequencies in Bashkirs, Russians and Tatars, living in the Chelyabinsk region (Russian South Urals) / T. A.Suslova, A. L. Burmistrova, M. S. Chernova, C. Darke [et al.]. - DOI 10.1111/j.1744-313X.2012. 01117.x // International Journal of Immunogenetics. - 2012. - Vol. 39. - P. 394-408.
153. Tang, B. Evaluation of human major histocompatibility complex class I chain-related A as a potential target for tumor imaging / B. Tang, Z. Yang, J. Huang, Z. Hao, W. Li, L. Cui [et al.]. - DOI 10.1016/j.canlet.2007.12.027// Cancer Letters - 2008.
- Vol. 263, № 1. - P. 99-106.
154. Tang, K.-F. Decreased Dicer expression elicits DNA damage and up-regulation of MICA and MICB / K.-F. Tang, H. Ren, J. Cao, G.-L. Zeng, J. Xie, M. Chen, L. Wang, C.-X. He // J. Cell Biol. - 2008. - Vol. 182. - P. 233-239.
155. Terasaki, P. I. Histocompatibility Testing 1980: report of the 8th International Histocompatibility Workshop, February 4-6, 1980, Los Angeles, California / P. I. Terasaki editor. - UCLA Tissue Typing Laboratory, 1980. - 1227 p.
156. The MHC sequencing consortium. Complete sequence and gene map of a human major histocompatibility complex. The MHC sequencing consortium // Nature. -1999. - Vol. 401. - P. 921-923.
157. Thorsby, E. A short history of HLA / E. Thorsby. - D0I:10.1111/j.1399-0039.2009.01291.x // Tissue Antigens. - 2009. - Vol. 74, № 2. - P. 101-116.
158. Tian, W. MICA, HLA-B haplotypic variation in five population groups of sub-Saharan African ancestry / W. Tian, D. A. Boggs, G. Uko, A. Essiet, M. Inyama, B. Banjoko, T. Adewole, W.-Z. Ding, M. Mohseni, R. Fritz, D.-F. Chen, L. J. Palmer, P. A. Fraser // Genes and Immunity. - 2003. - Vol. 4. - P. 500-506.
159. Vavilov, M. N. HLA and MICB alleles in ancestral haplotypes in Russian and Bashkir populations of the Chelyabinsk Region of Russian South Urals / M. N. Vavilov, T. A. Suslova, A. L. Burmisrova, C. Darke [et al.] // Tissue Antigens. - 2012. - Vol. 79, № 6. - P. 531 (P239).
160. Vrooman, L. M., Survival and late effects after allogeneic hematopoietic cell transplantation for hematologic malignancy at less than three years of age / L. M. Vrooman, H. R. Millard, R. Brazauskas, N. S. Majhail, M. Battiwalla, M. E. Flowers [et al.] // Biology of blood and marrow transplantation. - 2017. - Vol. 23, № 8. - P.1327-1334.
161. Wachowiak, J. Development and current use of in hematopoietic stem cell transplantation in children and adolescents in Poland: Report of the Polish pediatric study group for hematopoietic stem cell transplantation of the Polish society for pediat-ric oncology and hematology. / J. Wachowiak, A. Chybicka, J. R. Kowalczyk, M. Wysocki, J. Gozdzik, E. Gorczynska [et al.] // Transfusion and apheresis science. -2018. - Vol. 57, № 3. - P. 316-322.
162. Waldhauer, I. Proteolytic release of soluble UL16-binding protein 2 from tumor cells / I. Waldhauer, A. Steinle // Cancer Research. - 2006. - Vol. 66, № 5. - P. 2520- 2526.
163. Wang, Y. J. MICA/B genotyping of Tujias from Zhangjiajie, Hunan Province / Y. J. Wang, N. J. Zhang, E. Chen, C. J. Chen, Y. H. Bu, P. Yu // Chinese Society for Immunology. - 2016. - Vol. 77, № 4. - P. 340-341.
164. Wang, Q. Associations of MICA polymorphisms with inflammatory rheumatic diseases / Q. Wang, X. Zhou. - DOI 10.2174/1874312901409010094 // The Open Rheumatology Journal. - 2015. - Vol. 9. - P. 94-100.
165. Warren, E. H. Effect of MHC and non-MHC donor/recipient genetic disparity on the outcome of allogeneic HCT / E. H. Warren, X. C. Zhang, S. Li, W. Fan, B. E. Storer, J. W. Chien, M. J. Boeckh, L. P. Zhao, P. J. Martin, J. A. Hansen. -D0I:10.1182/blood-2012-04-347286 // Blood. - 2012. - Vol. 120, № 14. - P .27962806.
166. Wenda, S. The distribution of MICA alleles in an Austrian population: Evidence for increasing polymorphism / S. Wenda, I. Fae, A. Sanchez-Mazas, J. M. Nunes, W. R. Mayr, G. F. Fischer // Human Immunology. - 2013. - Vol. 74, № 10. - P. 1295-1299.
167. Xing, S. NKG2D and MICA/B shedding: a 'tag game' between NK cells and malignant cells / S. Xing, L. Ferrari de Andrade. - DOI 10.1002/cti2.1230 // Clinical & Translational Immunology. - 2020. - Vol. 9, № 12. - P.e1230.
168. Zingoni, A. NKG2D and Its Ligands: "One for All, All for One" / A. Zingo-ni, R. Molfetta, C. Fionda, A. Soriani, R. Paolini, M. Cippitelli, C. Cerboni, A. Santoni. - DOI 10.3389/fimmu.2018.00476 // Frontiers in Immunology. - 2018. - Vol. 9.
169. Zou, Y. MICA is a target for complement-dependent cytotoxicity with mouse monoclonal antibodies and human alloantibodies / Y. Zou, F. Mirbaha, A. Lazaro, Y. Zhang, B. Lavingia, P. Stastny. - DOI 10.1016/S0198-8859(01)00349-4 // Human Immunology. - 2002. - Vol. 63. - P. 30-39.
170. Zou, Y. Role of MICA in the immune response to transplants / Y. Zou, P. Stastny. - DOI 10.1111/j.1399-0039.2010.01527.x // Tissue Antigens. - 2010. - Vol. 76, № 3. - P. 171-176.
171. Zou, Y. Polymorphisms of MICA recognized by human alloantibodies / Y. Zou , Z. Qin, A. Silveus, Y. Fan, P. Stastny // Immunogenetics. - 2009. - Vol. 61. - P. 91-100.
172. Zwirner, N. W. MICA, a new polymorphic HLA-related antigen, is expressed mainly by keratinocytes, endothelial cells, and monocytes / N. W. Zwirner, M. A. Fernández-Viña, P. Stastny // Immunogenetics. - 1998. - Vol. 47. - P. 139-148.
Приложение А. Анкета участника иммуногенетического исследования Анкета участника иммуногенетического исследования
Личные данные
ФИО обследуемого Фамилия: Имя: Отчество:
Дата рождения Пол:
Страна: Область: Город/Село:
Место рождения
Место проживания Страна: Область: Город/Село:
Владение родным языком Говорю: Понимаю:
Национальность
Детализация (родовое имя, клан)
Генеалогические сведения
Фамилии родителей дедушек, бабушек Национальность (заявленная этническая принадлежность) Место рождения (пути миграции / история передвижения) Владение родным языком (говорит /понимает) Известные Заболевания
Отец
Бабушка по отцу
Дедушка по отцу
Мать
Бабушка по матери
Дедушка по матери
Взят биоматериал: Дата: Место:
кровь на ЭДТА
Родственники являются донорами Челябинской ОСПК
сын / дочь
муж / жена
отец / мать
брат / сестра
На проведение иммуногенетического обследования крови и обработку полученных результатов согласен. Дата : Подпись:
Приложение Б.
Аллельный полиморфизм MICA на уровне белковых продуктов на момент проведения исследования 2019 г.
Таблица Б.1 - Аллельный полиморфизм MICA на уровне белковых продуктов на момент проведения исследования 2019 г.
Аллельные варианты MICA (2019 г.)
MICA*001 MICA*018:01 MICA*052
MICA*002:01 MICA*018:02 MICA*053
MICA*002:02 MICA*019:01 MICA*054
MICA*002:03 MICA*019:02 MICA*055
MICA*002:04 MICA*020 MICA*056
MICA*004 MICA*022 MICA*057
MICA*005 MICA*023 MICA*058
MICA*006 MICA*024 MICA*059
MICA*007:01 MICA*025 MICA*060
MICA*007:02 MICA*026 MICA*061
MICA*007:03 MICA*027 MICA*062
MICA*007:04 MICA*028 MICA*063N
MICA*007:05 MICA*029 MICA*064N
MICA*007:06 MICA*030 MICA*065
MICA*007:07 MICA*031 MICA*066
MICA*008:01 MICA*032 MICA*067
MICA*008:02 MICA*033 MICA*068
MICA*008:03 MICA*034 MICA*069
MICA*008:04 MICA*035 MICA*070
MICA*008:05 MICA*036 MICA*072
MICA*009:01 MICA*037 MICA*073
MICA*009:02 MICA*038 MICA*074
MICA*010:01 MICA*039 MICA*075
MICA*010:02 MICA*040 MICA*076
MICA*011 MICA*041 MICA*077
MICA*012:01 MICA*042 MICA*078
Продолжение таблицы Б.1
М1СА*012:02 М1СА*043 М1СА*079
М1СА*012:03 М1СА*044 М1СА*080
М1СА*012:04 М1СА*045 М1СА*081
М1СА*012:05 М1СА*046 М1СА*082
М1СА*013 М1СА*047 М1СА*083
М1СА*014 М1СА*048 М1СА*084
М1СА*015 М1СА*049 М1СА*085
М1СА*016 М1СА*050 М1СА*086
М1СА*017 М1СА*051 М1СА*087
Частоты генов MICA, вошедших в исследование мировых популяций Европы,
Азии и Африки
Таблица В.1 - Частоты генов MICA, вошедших в исследование мировых популяций Европы, Азии и Африки
К Популяции N *001 *002 *004 *006 *007 *008 *009:01 *009:02 *010
k1 «Африка» Нигерия Эфик Нигерия Йоруба Нигерия Игбо США Афроамериканцы 1 США Афроамериканцы 2 США Афроамериканцы 3 32 74 46 201 39 60 0,0 0,0 0,0 1,2 0,0 0,0 17,2 33,1 42,4 27,9 25,6 30,0 21,9 27,0 13,0 18,7 29,5 23,3 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,7 0,0 0,0 35,9 21,0 26,1 32,4 28,2 25,8 0,0 0,0 0,0 4,2 0,0 0,0 7,8 0,7 0,0 1,5 0,0 3,3 0,0 0,0 0,0 0,7 0,0 0,0
(N Бразилия Смешанная 1 Бразилия Смешанная 2 Марокко Металса Испания Майорка Испания Мурсия Турция 201 200 82 165 154 65 2,5 1,8 3.0 5.1 7,8 0,0 18,2 15,4 7,3 14,2 16,1 15,4 11,9 14,6 23,2 17,6 14,9 6,2 1,2 0,8 0,0 1,2 0,0 2,3 1,7 1.3 2.4 4.5 1,2 4.6 28,1 27.2 26,8 28,5 25.3 23,1 10.4 12.5 8,5 9,4 7,1 16,9 0,0 0,0 14,0 0,0 0,0 0,0 4,5 5.7 0,0 1.8 4,5 2,3
k3 «Азия» Бразилия Японцы Япония 1 Япония 3 Китай Баотоу Хан Китай Синьцзян-Уйгуры Китай Шанхай Хан Китай Чжэцзян Хан Китай Чжанцзяцзе Туцзяс Тайланд Северо-Восток Южная Корея Сеул 190 130 114 104 66 183 100 187 255 139 0,3 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 15,0 14.6 12,5 12,0 19,0 14,0 15.5 21.7 17.6 17,6 5,3 9.2 11,1 4,8 3,0 2,0 0,5 0,0 3,5 8.3 0,3 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 1,4 0,0 1,2 0,9 1,4 2,0 7,0 1,0 0,0 0,0 4,4 18,9 30.4 25,2 23,6 35,0 34.0 28.5 29,4 21,4 15.1 16,8 16,5 18,4 12,0 22,0 11,0 8,0 0,0 2,4 3,6 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 0,4 11,0 10,8 12,5 18,8 9.0 23,0 18,5 9.1 18,2 19,4
k4 «Европа» ик Англия 1 ик Англия 2 ИК Англия 3 Великобритания Уэльс Русские Челябинск Словения США Кавказоиды 1 США Кавказоиды 2 250 118 354 166 100 70 242 103 2,2 0,0 0,0 0,9 0,0 2,1 3,0 1,5 8,7 18,0 7,6 9,9 16,0 18,9 13,0 15,3 8,3 10,0 8,6 4.5 7,0 6.6 6,0 5,5 0,2 2,5 0,0 0,3 1,0 0,0 0,0 0,0 3.8 5.1 4.9 4.2 7,0 5,8 2,0 4,0 47,0 48,0 49,7 53,0 36,5 39,0 55,0 37,7 5,9 5.5 6.6 7,8 7.5 11,3 3,0 7.6 0,0 0,0 1,1 0,0 1,0 0,0 0,0 1,0 3,6 5.1 5,8 4.2 9,5 1,4 5,0 7,0
Продолжение таблицы В. 1
К Популяции N *011 *012 *015 *016 *017 *018 *019 *027 *041 *049
к1 «Африка» Нигерия Эфик Нигерия Йоруба Нигерия Игбо США Афроамериканцы 1 США Афроамериканцы 2 США Афроамериканцы 3 32 74 46 201 39 60 0,0 0,0 0,0 1,2 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 1,5 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 2,7 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 2,5 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 1,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 3.1 2,0 9,8 2.2 1,3 15,8 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0
<м Бразилия Смешанная 1 Бразилия Смешанная 2 Марокко Металса Испания Майорка Испания Мурсия Турция 201 200 82 165 154 65 3.7 3,3 3,0 4,5 0,0 3.8 1,5 1,3 0,0 1,8 0,0 3,1 1,0 2,0 1,8 0,6 2,5 0,0 2.7 2.3 1.8 2.4 7.1 9.2 1.7 0,8 1.8 1,2 1,2 0,8 5.0 2,5 2.4 5.1 2.5 7,7 1,0 2,3 1,2 1,8 0,0 0,0 4,7 0,0 0,6 0,0 2,5 0,0 0,0 0,3 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0
к3 «Азия» Бразилия Японцы Япония 1 Япония 3 Китай Баотоу Хан Китай Синьцзян-Уйгуры Китай Шанхай Хан Китай Чжэцзян Хан Китай Чжанцзяцзе Туцзяс Тайланд Северо-Восток Южная Корея Сеул 190 130 114 104 66 183 100 187 255 139 0,5 0,0 0,0 0,5 3.0 0,0 0,0 0,0 0,0 1.1 12,9 12,7 10,9 1,0 5,0 7,0 5.0 10,7 3.1 9,4 о о о о о о о о о о о о о о о о о о о о 1,3 0,0 0,0 1,0 2,0 1,0 0,0 0,0 0,2 0,0 0,5 0,0 0,0 1,9 0,0 0,0 0,0 0,0 2,2 0,4 0,8 0,0 0,0 0,5 0,0 0,0 0,0 0,0 6,1 0,0 2,9 3,5 0,0 3,9 0,0 0,0 9,5 20,6 15,3 0,4 12,1 0,0 0,0 5,3 0,0 0,0 7,0 0,0 0,0 5,0 о о о о о о о о о о о о о 0 о о о о 0 0,5 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 3,5 0,0 0,0 7,9
к4 «Европа» ик Англия 1 ик Англия 2 ИК Англия 3 Великобритания Уэльс Русские Челябинск Словения США Кавказоиды 1 США Кавказоиды 2 250 118 354 166 100 70 242 103 3,2 0,0 2,1 1,5 1,5 1.4 2,0 2.5 1,4 3.4 1,1 1,8 0,5 0,0 2,0 2.5 , , , °о „о о о о о о о о о о о о 5,7 0,8 1,1 0,6 0,5 4,3 2,0 1,0 4,0 0,0 3,5 4,8 3.5 3.6 0,0 2,5 2,2 0,0 3.2 3.3 5,0 6,6 0,0 3,5 0,0 0,0 2,8 2,1 0,0 0,0 0,0 2,5 0,8 0,0 0,0 0,6 2,0 0,7 0,0 4,9 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 0,0 1,0 0,0 0,0 0,0
Частоты генов трансмембранного полиморфизма М1СА-ТМ и функционального диморфизма М1СА-129, вошедших в исследование мировых популяций Европы, Азии и Африки
Таблица Г.1 - Частоты генов трансмембранного полиморфизма М1СА-ТМ и функционального диморфизма М1СА-129. вошедших в исследование мировых популяций Европы, Азии и Африки
М1СА-ТМ М1СА-129
К Популяции N А4т А9т А6т А6у А5.1у А5у Мег Уа1
к1 «Африка» Нигерия Эфик 32 0,0 20,3 0,0 21,9 35,9 7,8 20,3 65,6 к1 «Африка»
Нигерия Иоруба 74 0,0 35,1 0,0 27,0 21,0 0,7 35,1 48,7
Нигерия Игбо 46 0,0 52,2 0,0 13,0 26,1 0,0 52,2 39,1
США Афроамериканцы 1 201 5,9 33,3 1,2 18,7 32,4 7,9 40,4 59,0
США Афроамериканцы 2 39 0,0 26,9 0,0 29,5 28,2 0,0 26,9 57,7
США Афроамериканцы 3 60 0,0 45,8 0,0 23,3 25,8 3,3 45,8 52,4
Бразилия Смешанная 1 201 10,7 20,9 3,7 13,1 28,1 23,3 35,3 64,5
Бразилия Смешанная 2 200 6,9 18,5 3,3 15,4 27,2 22,8 28,7 65,4
Марокко Металса 82 7,8 10,9 3,0 23,2 26,8 26,1 21,7 76,1
Испания Майорка 165 16,5 16,0 4,5 18,8 28,5 15,4 37,0 62,7
Испания Мурсия 154 11,5 19,8 0,0 14,9 25,3 21,2 31,3 61,4
Турция 65 15,4 16,2 3,8 8,5 23,1 28,4 35,4 60,0
к3 «Азия» Бразилия Японцы 190 14,0 15,5 0,5 6,1 18,9 44,1 30,0 69,1 к3 «Азия»
Япония 1 130 13,9 14,6 0,0 9,2 30,4 30,8 28,5 70,4
Япония 3 114 11,8 12,5 0,0 11,1 25,2 30,9 24,3 67,2
Китай Баотоу Хан 104 2,9 13,9 0,5 4,8 23,6 41,5 17,3 69,9
Китай Синьцзян-Уйгуры 66 7,0 19,0 3,0 3,0 35,0 33,0 29,0 71,0
Китай Шанхай Хан 183 14,0 14,0 0,0 2,0 34,0 35,0 28,0 71,0
Китай Чжэцзян Хан 100 6,0 15,5 0,0 4,0 28,5 43,5 21,5 76,0
Китай Чжанцзяцзе Туцзяс 187 11,2 21,7 0,0 0,0 29,4 29,7 32,9 59,1
Тайланд Северо-Восток 255 9,2 19,8 0,0 3,5 21,4 36,1 29,0 61,0
Южная Корея Сеул 139 13,8 18,0 1,1 17,6 15,1 28,8 32,9 61,5
к4 «Европа» ЦК Англия 1 250 9,6 12,7 3,2 8,5 47,0 16,0 25,5 71,5 к4 «Европа»
ЦК Англия 2 118 8,5 18,0 0,0 12,5 48,0 11,4 26,5 71,9
ЦК Англия 3 354 9,2 11,1 2,1 8,6 49,7 17,4 22,4 75,7
Великобритания Уэльс 166 10,2 14,7 1,5 4,8 53,0 15,3 26,4 73,1
Русские Челябинск 100 12,5 19,5 1,5 9,0 36,5 20,5 33,5 66,0
Словения 70 14,5 22,5 1,4 6,6 39,0 17,7 38,4 63,3
США Кавказоиды 1 242 7,0 13,0 2,0 6,0 55,0 10,0 22,0 71,0
США Кавказоиды 2 103 11,5 17,8 2,5 5,5 37,7 24,0 31,8 67,2
Приложение Д.
Аллельный, трансмембранный и функциональный полиморфизмы локуса MICA с указанием наиболее сцепленных гаплотипов HLA-C~HLA-B~MICA
Рисунок Д.1 - Аллельный, трансмембранный и функциональный полиморфизмы локуса MICA с указанием наиболее сцепленных гаплотипов HLA-C~HLA-B~MICA
Частоты самых распространенных и устойчивых гаплотипов М1СА~М1СА-ТМ~МСА-129~ИЬА-Б~ИЬА-С у русских Челябинской области.
Таблица Е.1 - Частоты самых распространенных и устойчивых гаплотипов МСА~М1СА-ТМ~М1СА-129~ИЬА-Б~ИЬА-С у русских Челябинской области.
М1СА-129 М1СА-ТМ М1СА ИЬА-Б ИЬА-С ИР, % п
Уа1 А5.1 М1СА*008 Б*07:02 С*07:02 14 28
Б*08:01 С*07:01 6,5 13
Б*13:02 С*06:02 6 12
В*37:01 1,5 3
В*40:01 С*03:04 3 6
В*44:02 С*07:04 2 4
С*05:01 1,5 3
В*47:01 С*06:02 0,5 1
А5 М1СА*010 Б*15:01 С*03 6,5 13
С*01:02 2 4
М1СА*027 В*40:02 С*03:04 1,5 3
М1СА*009:02 В*50:01 С*06:02 1 2
М1СА*009:01 В*51:01 С*15:02 1 2
С*04:01 1 2
С*01:02 1 2
В*52:01 С*12:02 2,5 5
А6 М1СА*004 В*41:02 С*17:01 2,5 5
В*44:03 С*04:01 1,5 3
В*49:01 С*07:01 1 2
Мег М1СА*011 В*14:02 С*08:02 1,5 3
А4 М1СА*018 В*18 С*12:03 3 6
С*07:01 2 4
М1СА*007 В*27:05 С*02:02 4 8
С*01:02 2 4
М1СА*012 В*55:01 С*03:04 0,5 1
А9 М1СА*002 Б*35 С*04:01 8,5 17
В*38:01 С*12:03 2 4
В*39:01 С*12:03 1 2
С*07:02 1,5 3
В*39:06 С*12:03 0,5 1
В*56:01 С*06:02 0,5 1
М1СА*017 В*57:01 С*06:02 3,5 7
Бе1 Бе1 М!СА*ёе1 В*48:01 С*08:03 0,5 1
Сумма частот и количества гаплотипов 87,5 175
Приложение Ж.
Дендрограмма на основании попарных генетических дистанций между популяцией русских Челябинской области и популяциями Европы, Азии и Африки
пз
О Ф
ш
_I
Рисунок Ж.1 - Дендрограмма на основании попарных генетических дистанций между популяцией русских Челябинской области и популяциями Европы, Азии и Африки
Многомерное шкалирование по двум осям для 30 популяций
OUlOLfJoiooiOO СЧ_ т-_ т-_ 0_ о О т- т- СМ
о о о ср о о о о 0
Z e)eu|pjooo
Рисунок И.1 - График MDS основанный на частотах генов локуса MICA популяции русских Челябинской области и некоторых популяций Европы, Азии и
Африки
Обратите внимание, представленные выше научные тексты размещены для ознакомления и получены посредством распознавания оригинальных текстов диссертаций (OCR). В связи с чем, в них могут содержаться ошибки, связанные с несовершенством алгоритмов распознавания. В PDF файлах диссертаций и авторефератов, которые мы доставляем, подобных ошибок нет.